View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10538_low_2 (Length: 529)

Name: NF10538_low_2
Description: NF10538
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10538_low_2
NF10538_low_2
[»] chr2 (53 HSPs)
chr2 (242-526)||(22020894-22021178)
chr2 (242-526)||(9185419-9185703)
chr2 (242-526)||(31585935-31586219)
chr2 (242-509)||(5105570-5105837)
chr2 (243-509)||(31427537-31427803)
chr2 (241-526)||(42368705-42368989)
chr2 (242-526)||(11347890-11348174)
chr2 (242-526)||(24234922-24235206)
chr2 (242-526)||(25959683-25959967)
chr2 (243-509)||(25820842-25821107)
chr2 (249-526)||(25138933-25139210)
chr2 (242-526)||(9188647-9188931)
chr2 (242-526)||(37279671-37279955)
chr2 (242-526)||(8888463-8888746)
chr2 (242-526)||(30274763-30275047)
chr2 (242-526)||(43207885-43208168)
chr2 (242-509)||(27266632-27266899)
chr2 (242-526)||(9966364-9966648)
chr2 (242-526)||(24238194-24238478)
chr2 (242-526)||(40781299-40781582)
chr2 (242-507)||(5666364-5666628)
chr2 (242-509)||(45493151-45493417)
chr2 (242-509)||(45500893-45501159)
chr2 (242-486)||(26365800-26366044)
chr2 (245-509)||(45457005-45457269)
chr2 (242-526)||(13971889-13972172)
chr2 (245-509)||(36808440-36808703)
chr2 (243-509)||(33310510-33310776)
chr2 (243-509)||(38015362-38015628)
chr2 (242-526)||(43723527-43723810)
chr2 (243-509)||(16178971-16179236)
chr2 (251-509)||(45453717-45453975)
chr2 (242-473)||(29440375-29440605)
chr2 (242-526)||(25870611-25870894)
chr2 (242-509)||(6826616-6826881)
chr2 (242-507)||(1386417-1386681)
chr2 (242-526)||(25874002-25874291)
chr2 (242-506)||(12219643-12219906)
chr2 (241-509)||(22630685-22630952)
chr2 (242-500)||(3875139-3875397)
chr2 (243-509)||(37937215-37937480)
chr2 (242-509)||(40259134-40259400)
chr2 (242-509)||(16790752-16791020)
chr2 (247-506)||(17876953-17877211)
chr2 (245-509)||(17874585-17874843)
chr2 (243-391)||(10600876-10601024)
chr2 (249-499)||(30926401-30926645)
chr2 (309-495)||(35521423-35521613)
chr2 (288-431)||(34682622-34682764)
chr2 (417-526)||(10600773-10600876)
chr2 (448-509)||(17876211-17876272)
chr2 (365-509)||(11187929-11188073)
chr2 (464-506)||(38427436-38427478)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (242-526)||(23224904-23225188)
chr7 (243-509)||(48645323-48645588)
chr7 (242-526)||(8276817-8277101)
chr7 (242-509)||(45287068-45287334)
chr7 (243-509)||(6603307-6603573)
chr7 (243-507)||(2441278-2441542)
chr7 (242-526)||(20594095-20594378)
chr7 (247-486)||(13449780-13450019)
chr7 (249-509)||(9864732-9864992)
chr7 (242-526)||(26557331-26557614)
chr7 (242-509)||(17730663-17730929)
chr7 (242-526)||(4546701-4546984)
chr7 (243-509)||(16165597-16165863)
chr7 (242-526)||(4596008-4596291)
chr7 (242-509)||(9132759-9133025)
chr7 (246-509)||(13842489-13842751)
chr7 (242-486)||(37415422-37415667)
chr7 (242-509)||(14683443-14683709)
chr7 (242-486)||(9271464-9271700)
chr7 (242-526)||(10468976-10469259)
chr7 (242-509)||(3067976-3068242)
chr7 (242-509)||(26136127-26136393)
chr7 (241-507)||(37166145-37166410)
chr7 (242-509)||(26144507-26144773)
chr7 (242-429)||(45290479-45290665)
chr7 (242-501)||(20080717-20080975)
chr7 (242-399)||(11919864-11920021)
chr7 (245-526)||(5242152-5242435)
chr7 (246-526)||(13809519-13809795)
chr7 (245-524)||(7227361-7227641)
chr7 (242-421)||(4542734-4542912)
chr7 (350-509)||(11398132-11398291)
chr7 (288-509)||(18562577-18562799)
chr7 (309-501)||(5796408-5796600)
chr7 (323-508)||(10345064-10345248)
chr7 (242-372)||(35961076-35961206)
chr7 (246-347)||(4695491-4695592)
chr7 (369-486)||(37423083-37423199)
chr7 (387-526)||(4695356-4695494)
chr7 (408-509)||(22611771-22611872)
chr7 (243-323)||(11398049-11398129)
chr7 (344-509)||(24918043-24918208)
chr7 (243-308)||(22611710-22611775)
chr7 (242-286)||(10345266-10345310)
[»] chr3 (85 HSPs)
chr3 (242-526)||(32287304-32287588)
chr3 (243-509)||(16184669-16184935)
chr3 (242-526)||(2775411-2775695)
chr3 (242-526)||(7486500-7486784)
chr3 (242-526)||(2778654-2778938)
chr3 (242-526)||(45896310-45896594)
chr3 (242-509)||(54723688-54723955)
chr3 (243-509)||(43809526-43809792)
chr3 (242-526)||(2873494-2873777)
chr3 (242-526)||(43926765-43927048)
chr3 (242-501)||(25584631-25584890)
chr3 (242-509)||(29343855-29344122)
chr3 (242-509)||(53815775-53816041)
chr3 (243-509)||(52199860-52200125)
chr3 (242-526)||(24125429-24125712)
chr3 (242-526)||(24128706-24128989)
chr3 (241-526)||(49742899-49743184)
chr3 (243-506)||(27091844-27092106)
chr3 (243-509)||(18644750-18645016)
chr3 (249-509)||(31549118-31549378)
chr3 (243-526)||(3840446-3840729)
chr3 (243-509)||(50461530-50461796)
chr3 (242-506)||(538776-539040)
chr3 (242-526)||(10884787-10885070)
chr3 (242-509)||(6434759-6435025)
chr3 (242-526)||(16243803-16244086)
chr3 (243-495)||(35751401-35751653)
chr3 (242-509)||(11190473-11190740)
chr3 (243-509)||(11784712-11784978)
chr3 (245-509)||(15195286-15195549)
chr3 (242-526)||(20728628-20728911)
chr3 (242-526)||(30690666-30690949)
chr3 (243-509)||(17040004-17040269)
chr3 (242-499)||(28008052-28008307)
chr3 (250-526)||(10106588-10106863)
chr3 (242-526)||(10881410-10881693)
chr3 (245-509)||(23298599-23298863)
chr3 (242-526)||(47051425-47051709)
chr3 (243-509)||(35412462-35412722)
chr3 (243-526)||(55034838-55035125)
chr3 (242-509)||(8461468-8461734)
chr3 (242-509)||(9392681-9392947)
chr3 (245-526)||(19301489-19301769)
chr3 (245-526)||(19304673-19304953)
chr3 (242-526)||(47054855-47055139)
chr3 (242-509)||(12561215-12561481)
chr3 (242-509)||(48064016-48064282)
chr3 (242-509)||(22416815-22417081)
chr3 (242-509)||(46884888-46885153)
chr3 (242-509)||(54719918-54720184)
chr3 (245-509)||(30219989-30220256)
chr3 (242-509)||(17141355-17141621)
chr3 (242-492)||(34983834-34984083)
chr3 (297-509)||(32367165-32367376)
chr3 (243-434)||(18641754-18641945)
chr3 (244-506)||(41976965-41977212)
chr3 (241-509)||(25442839-25443107)
chr3 (243-460)||(54461010-54461227)
chr3 (245-499)||(17545812-17546068)
chr3 (296-509)||(18542497-18542711)
chr3 (245-509)||(22993680-22993946)
chr3 (246-526)||(3292943-3293225)
chr3 (242-509)||(17531637-17531897)
chr3 (243-442)||(55031978-55032181)
chr3 (242-509)||(17528742-17529004)
chr3 (327-501)||(28265832-28266005)
chr3 (246-526)||(22783522-22783812)
chr3 (246-526)||(22787886-22788176)
chr3 (242-374)||(52309596-52309728)
chr3 (355-509)||(52988352-52988505)
chr3 (242-359)||(28266013-28266130)
chr3 (309-509)||(282240-282439)
chr3 (31-156)||(41078357-41078484)
chr3 (242-342)||(52990813-52990913)
chr3 (393-486)||(27308717-27308809)
chr3 (242-308)||(37408828-37408894)
chr3 (396-482)||(27308157-27308243)
chr3 (393-501)||(27298594-27298702)
chr3 (242-293)||(6922682-6922733)
chr3 (242-301)||(10902094-10902153)
chr3 (258-303)||(25486290-25486335)
chr3 (271-331)||(31857847-31857910)
chr3 (427-509)||(6030758-6030840)
chr3 (468-526)||(31857746-31857804)
chr3 (457-509)||(55032183-55032235)
[»] chr6 (55 HSPs)
chr6 (241-526)||(5738077-5738362)
chr6 (241-526)||(3596774-3597059)
chr6 (242-526)||(2379076-2379360)
chr6 (246-526)||(6513102-6513382)
chr6 (241-506)||(1125728-1125993)
chr6 (242-526)||(13005035-13005319)
chr6 (242-526)||(14281514-14281798)
chr6 (242-526)||(9839388-9839672)
chr6 (242-526)||(9953810-9954093)
chr6 (242-526)||(20185591-20185874)
chr6 (242-526)||(22150117-22150400)
chr6 (242-526)||(30655290-30655574)
chr6 (242-507)||(17106604-17106868)
chr6 (242-526)||(26942429-26942712)
chr6 (242-526)||(23384746-23385031)
chr6 (242-509)||(11402120-11402387)
chr6 (245-526)||(22561160-22561441)
chr6 (242-526)||(10289819-10290102)
chr6 (255-486)||(28111773-28112003)
chr6 (243-509)||(11125692-11125956)
chr6 (248-526)||(2846148-2846428)
chr6 (242-526)||(28107781-28108066)
chr6 (242-507)||(19475868-19476132)
chr6 (248-509)||(28230458-28230718)
chr6 (242-509)||(24410162-24410428)
chr6 (242-509)||(13946882-13947148)
chr6 (245-526)||(11247608-11247889)
chr6 (282-509)||(5259800-5260024)
chr6 (242-482)||(7128190-7128429)
chr6 (242-509)||(24400043-24400309)
chr6 (242-509)||(18856019-18856285)
chr6 (270-501)||(23007932-23008163)
chr6 (270-501)||(23780201-23780432)
chr6 (242-509)||(4512336-4512606)
chr6 (318-526)||(12988195-12988403)
chr6 (3-169)||(12839157-12839330)
chr6 (245-526)||(13021249-13021532)
chr6 (288-522)||(28848691-28848926)
chr6 (56-168)||(25993943-25994055)
chr6 (56-168)||(25552777-25552889)
chr6 (242-457)||(26896253-26896467)
chr6 (242-356)||(23842792-23842906)
chr6 (399-529)||(2372169-2372295)
chr6 (355-509)||(24371137-24371292)
chr6 (327-509)||(11192657-11192844)
chr6 (31-158)||(31387576-31387704)
chr6 (243-355)||(32109685-32109797)
chr6 (1-148)||(6428614-6428766)
chr6 (241-358)||(23847783-23847899)
chr6 (242-337)||(2372293-2372383)
chr6 (331-509)||(31072168-31072332)
chr6 (299-349)||(23667721-23667771)
chr6 (1-53)||(25991782-25991834)
chr6 (242-316)||(24155360-24155434)
chr6 (451-509)||(26898071-26898129)
[»] chr4 (73 HSPs)
chr4 (243-509)||(56195388-56195654)
chr4 (242-526)||(39501492-39501776)
chr4 (242-526)||(52530929-52531213)
chr4 (244-526)||(24150516-24150798)
chr4 (242-526)||(5672739-5673023)
chr4 (242-526)||(34017775-34018059)
chr4 (242-526)||(40903077-40903361)
chr4 (242-501)||(18911368-18911626)
chr4 (242-509)||(40616802-40617069)
chr4 (243-509)||(44808950-44809216)
chr4 (242-509)||(5670438-5670705)
chr4 (243-509)||(15812131-15812398)
chr4 (243-509)||(34319912-34320178)
chr4 (243-509)||(12238126-12238392)
chr4 (242-526)||(48637349-48637633)
chr4 (242-526)||(27014107-27014391)
chr4 (242-526)||(48415523-48415807)
chr4 (242-526)||(52006525-52006808)
chr4 (243-509)||(5681289-5681554)
chr4 (244-526)||(19820572-19820853)
chr4 (242-526)||(44164627-44164910)
chr4 (243-509)||(56198714-56198980)
chr4 (249-509)||(29324686-29324946)
chr4 (243-526)||(15431923-15432205)
chr4 (241-509)||(27677048-27677315)
chr4 (242-509)||(12782766-12783032)
chr4 (242-499)||(24044135-24044391)
chr4 (250-509)||(49270544-49270799)
chr4 (242-506)||(19859516-19859779)
chr4 (242-526)||(37103210-37103492)
chr4 (242-526)||(40794846-40795130)
chr4 (242-509)||(3797802-3798068)
chr4 (243-509)||(46955473-46955739)
chr4 (246-509)||(15164053-15164317)
chr4 (243-526)||(3718968-3719250)
chr4 (245-509)||(15405078-15405345)
chr4 (242-507)||(15429850-15430114)
chr4 (243-508)||(33926834-33927099)
chr4 (242-475)||(38283483-38283715)
chr4 (242-506)||(19864511-19864770)
chr4 (242-507)||(15436464-15436728)
chr4 (245-526)||(33408314-33408595)
chr4 (242-509)||(18673076-18673342)
chr4 (242-509)||(11195537-11195803)
chr4 (242-509)||(30392430-30392696)
chr4 (245-506)||(53094371-53094633)
chr4 (242-509)||(53009552-53009818)
chr4 (245-509)||(8877497-8877762)
chr4 (243-507)||(21419652-21419915)
chr4 (243-509)||(25961919-25962185)
chr4 (243-509)||(40493362-40493628)
chr4 (260-509)||(8874772-8875022)
chr4 (297-522)||(22172422-22172648)
chr4 (243-509)||(29544869-29545134)
chr4 (292-509)||(35509826-35510042)
chr4 (304-506)||(15446792-15446993)
chr4 (245-526)||(37739754-37740040)
chr4 (1-169)||(5023930-5024091)
chr4 (243-411)||(5706347-5706519)
chr4 (309-509)||(33493756-33493956)
chr4 (1-169)||(1933659-1933821)
chr4 (364-526)||(27679341-27679502)
chr4 (367-526)||(19827334-19827492)
chr4 (364-506)||(48014168-48014310)
chr4 (36-158)||(22735702-22735826)
chr4 (245-333)||(39498346-39498434)
chr4 (12-148)||(26093834-26093975)
chr4 (287-433)||(5677447-5677594)
chr4 (242-313)||(15445359-15445430)
chr4 (246-318)||(35510043-35510115)
chr4 (242-296)||(19827489-19827543)
chr4 (446-486)||(24410206-24410246)
chr4 (346-440)||(8448654-8448748)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (242-526)||(3782-4066)
[»] chr8 (37 HSPs)
chr8 (242-509)||(14421603-14421871)
chr8 (242-509)||(45155263-45155530)
chr8 (242-526)||(18721275-18721559)
chr8 (242-526)||(25591473-25591756)
chr8 (243-509)||(18824389-18824655)
chr8 (242-526)||(25230922-25231206)
chr8 (242-526)||(38248393-38248676)
chr8 (243-509)||(18825882-18826148)
chr8 (243-509)||(36710631-36710897)
chr8 (246-526)||(25594655-25594935)
chr8 (242-526)||(12582850-12583133)
chr8 (243-509)||(23643678-23643944)
chr8 (246-501)||(12516450-12516706)
chr8 (242-526)||(16953618-16953902)
chr8 (245-509)||(43681867-43682131)
chr8 (242-509)||(10663758-10664024)
chr8 (243-509)||(22173918-22174184)
chr8 (242-509)||(5980307-5980573)
chr8 (243-486)||(21279764-21280006)
chr8 (243-509)||(17930840-17931105)
chr8 (242-509)||(13196716-13196982)
chr8 (242-507)||(10498208-10498472)
chr8 (243-509)||(5538768-5539034)
chr8 (245-509)||(8911506-8911771)
chr8 (242-509)||(31284533-31284799)
chr8 (241-526)||(33419498-33419782)
chr8 (251-509)||(2560411-2560669)
chr8 (242-509)||(23619358-23619624)
chr8 (242-497)||(44027087-44027341)
chr8 (242-399)||(33883344-33883501)
chr8 (290-522)||(4868103-4868330)
chr8 (246-526)||(5613715-5614005)
chr8 (245-522)||(30784775-30785042)
chr8 (242-313)||(20887589-20887660)
chr8 (243-325)||(14589616-14589698)
chr8 (1-102)||(45469511-45469617)
chr8 (242-305)||(5584390-5584462)
[»] chr5 (47 HSPs)
chr5 (242-509)||(41876758-41877025)
chr5 (241-506)||(26752694-26752959)
chr5 (242-509)||(18952555-18952821)
chr5 (242-509)||(20055636-20055902)
chr5 (242-509)||(42062783-42063050)
chr5 (243-509)||(22936932-22937198)
chr5 (242-526)||(7270861-7271144)
chr5 (245-526)||(34831609-34831889)
chr5 (242-509)||(41306521-41306787)
chr5 (242-509)||(43491617-43491884)
chr5 (242-508)||(26895598-26895863)
chr5 (242-526)||(21332674-21332957)
chr5 (242-526)||(21335692-21335975)
chr5 (242-509)||(33551984-33552249)
chr5 (243-509)||(7624964-7625230)
chr5 (242-526)||(4099511-4099794)
chr5 (243-509)||(14016133-14016399)
chr5 (243-509)||(40583111-40583376)
chr5 (243-509)||(14375790-14376068)
chr5 (242-509)||(17664414-17664679)
chr5 (242-526)||(31863545-31863843)
chr5 (242-509)||(12058486-12058752)
chr5 (242-509)||(34132977-34133243)
chr5 (242-509)||(34143208-34143474)
chr5 (242-509)||(12087820-12088086)
chr5 (243-509)||(39192190-39192457)
chr5 (317-509)||(2837165-2837357)
chr5 (242-509)||(26907449-26907715)
chr5 (245-526)||(21914966-21915249)
chr5 (245-526)||(18239492-18239774)
chr5 (243-441)||(22131159-22131357)
chr5 (242-509)||(17748302-17748568)
chr5 (242-509)||(26292653-26292919)
chr5 (1-169)||(22378451-22378619)
chr5 (249-526)||(28787330-28787599)
chr5 (249-396)||(37215019-37215166)
chr5 (1-169)||(17524570-17524731)
chr5 (381-509)||(32837879-32838007)
chr5 (364-509)||(30066204-30066348)
chr5 (242-509)||(11959172-11959431)
chr5 (242-331)||(30066348-30066437)
chr5 (242-349)||(23044163-23044270)
chr5 (288-486)||(18765681-18765880)
chr5 (414-509)||(23044026-23044121)
chr5 (288-496)||(31575288-31575499)
chr5 (364-487)||(563375-563498)
chr5 (437-486)||(22130149-22130198)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (242-526)||(62362-62645)
scaffold0035 (242-509)||(63722-63987)
[»] chr1 (39 HSPs)
chr1 (242-526)||(45941262-45941546)
chr1 (243-509)||(6070948-6071214)
chr1 (242-509)||(28110919-28111186)
chr1 (245-509)||(49498494-49498758)
chr1 (242-506)||(20398719-20398983)
chr1 (245-526)||(23021920-23022201)
chr1 (242-526)||(1950449-1950732)
chr1 (242-526)||(21107285-21107568)
chr1 (242-526)||(673064-673350)
chr1 (242-509)||(2794091-2794357)
chr1 (243-509)||(37183858-37184124)
chr1 (243-509)||(31204701-31204967)
chr1 (243-509)||(45960739-45961005)
chr1 (242-526)||(21018461-21018744)
chr1 (242-526)||(41058296-41058579)
chr1 (256-526)||(49853086-49853355)
chr1 (243-509)||(29643216-29643481)
chr1 (242-509)||(905679-905949)
chr1 (242-509)||(3796820-3797086)
chr1 (245-526)||(34732357-34732638)
chr1 (249-501)||(27355687-27355941)
chr1 (243-471)||(27354939-27355165)
chr1 (250-509)||(2405373-2405631)
chr1 (242-399)||(21111152-21111309)
chr1 (246-522)||(7635495-7635773)
chr1 (296-509)||(21434523-21434737)
chr1 (288-509)||(27331817-27332031)
chr1 (394-526)||(11668171-11668303)
chr1 (245-430)||(13430954-13431141)
chr1 (242-333)||(21114492-21114583)
chr1 (249-400)||(11667001-11667153)
chr1 (286-434)||(42022578-42022720)
chr1 (309-427)||(16055629-16055747)
chr1 (288-403)||(34065202-34065317)
chr1 (406-509)||(34066599-34066702)
chr1 (309-427)||(16056864-16056982)
chr1 (243-302)||(27536526-27536585)
chr1 (249-427)||(16060968-16061148)
chr1 (288-340)||(30938601-30938654)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (242-500)||(1-259)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (242-509)||(292885-293151)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (245-509)||(89631-89895)
[»] scaffold1755 (1 HSPs)
scaffold1755 (242-486)||(6-249)
[»] scaffold0381 (1 HSPs)
scaffold0381 (242-526)||(5392-5676)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (242-526)||(19240-19524)
[»] scaffold0520 (3 HSPs)
scaffold0520 (241-526)||(8212-8496)
scaffold0520 (249-476)||(1549-1775)
scaffold0520 (456-526)||(4187-4257)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (242-526)||(57583-57867)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (242-526)||(197992-198275)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (243-509)||(3277-3543)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (243-509)||(67520-67785)
[»] scaffold0757 (1 HSPs)
scaffold0757 (246-526)||(5197-5476)
[»] scaffold0270 (1 HSPs)
scaffold0270 (243-509)||(58-324)
[»] scaffold1208 (1 HSPs)
scaffold1208 (242-466)||(89-313)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (242-476)||(248413-248646)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (242-508)||(2999-3264)
[»] scaffold1063 (1 HSPs)
scaffold1063 (243-478)||(2385-2628)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (242-475)||(27005-27237)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (243-509)||(10271-10536)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (248-509)||(30956-31216)
[»] scaffold0807 (1 HSPs)
scaffold0807 (242-486)||(2067-2310)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (246-522)||(118443-118719)
scaffold0002 (246-325)||(99233-99312)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (242-486)||(58675-58920)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (1-171)||(188124-188296)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (288-509)||(19217-19431)
[»] scaffold0084 (3 HSPs)
scaffold0084 (242-507)||(29229-29493)
scaffold0084 (242-429)||(19222-19408)
scaffold0084 (453-507)||(19159-19213)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (242-437)||(241434-241628)
[»] scaffold1785 (2 HSPs)
scaffold1785 (257-509)||(1112-1362)
scaffold1785 (242-276)||(1-35)
[»] scaffold2073 (1 HSPs)
scaffold2073 (242-388)||(861-1007)
[»] scaffold1809 (1 HSPs)
scaffold1809 (242-436)||(1-193)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (258-509)||(48411-48664)
[»] scaffold0450 (1 HSPs)
scaffold0450 (355-509)||(14101-14254)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (296-522)||(9786-10014)
[»] scaffold0690 (1 HSPs)
scaffold0690 (242-337)||(7706-7801)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (242-349)||(15433-15540)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (243-288)||(14314-14359)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (242-298)||(3988-4044)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 53)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 22021178 - 22020894
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
22021178 tatgttaccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaac 22021079  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
22021078 cctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttaaaggttttaagtacgttaacctaatatcactaataaacgattatccatt 22020979  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||    
22020978 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcaaaagctatggtcagtagtcattcattctcacgaaatca 22020894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 9185419 - 9185703
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9185419 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 9185518  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
9185519 cctcttctcaaactacagtctctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaaggattattcatt 9185618  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
9185619 cctagactaaccatgattattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 9185703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 31585935 - 31586219
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31585935 tatgttcccctaattggtatactgcatctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 31586034  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
31586035 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaaggattatccatt 31586134  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| | |||||||  |||||| | ||||||    
31586135 cctagactaaccatgattattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggttagtagtcattcattctcactaaatca 31586219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 5105837 - 5105570
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5105837 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcatatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 5105738  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
5105737 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaaggattatccatt 5105638  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | || |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||    
5105637 cctatactaaccatgattattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcat 5105570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Original strand, 31427537 - 31427803
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
31427537 atgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctaattccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggacc 31427636  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
31427637 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaagtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattc 31427736  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
31427737 ctagattaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 31427803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 241 - 526
Target Start/End: Original strand, 42368705 - 42368989
Alignment:
241 ttatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagga 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
42368705 ttatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagga 42368804  T
341 ccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccat 440  Q
    || |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
42368805 ccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccat 42368903  T
441 tcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
42368904 tcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 42368989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 11347890 - 11348174
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
11347890 tatgttcccctaattggtatactgcatctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggac 11347989  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
11347990 cctcttctcaaactacagcccctaatttcttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 11348089  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
11348090 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 11348174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 24235206 - 24234922
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24235206 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgatttcctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 24235107  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
24235106 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 24235007  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||  |||| |||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
24235006 cctagactaaccctgtttattataacaattcaattctgtctaagtagaaagatatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 24234922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 25959683 - 25959967
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25959683 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 25959782  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
25959783 cctcttctcagactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttaaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 25959882  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
25959883 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 25959967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Original strand, 25820842 - 25821107
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25820842 atgttcccctaattgatatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 25820941  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
25820942 ctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctagtatcactaacaaacgattatccattc 25821040  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||    
25821041 ctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtataagttgaaagctagggtcagtagtcat 25821107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 249 - 526
Target Start/End: Original strand, 25138933 - 25139210
Alignment:
249 ccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttc 348  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
25138933 ccctaattggtatactgcacctattcttatgaacgattttcaagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttc 25139032  T
349 tcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagac 448  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
25139033 tcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagac 25139132  T
449 taaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
25139133 taaccatgattatgagaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 25139210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 9188647 - 9188931
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9188647 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagtcaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 9188746  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
9188747 cctcttctcaaactacaacccctaattacttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaaggattatccatt 9188846  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
9188847 cctagactaaccatgattattagaacaattcaattctgtctaagtagaaatctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 9188931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 37279671 - 37279955
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
37279671 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggat 37279770  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
37279771 cctcttctcaaactacagcccctaattccttacgtggtctaataatctttgaaggttttaagaatgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 37279870  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
37279871 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 37279955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 8888746 - 8888463
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
8888746 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagttctaatcaatcccttgagttaggac 8888647  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
8888646 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcatgttaacctaatatcactaacaaacgattattcatt 8888548  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
8888547 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 8888463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 30274763 - 30275047
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
30274763 tatgttctcctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaagac 30274862  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
30274863 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactgataaaggattatccatt 30274962  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
30274963 cctagactaaccatgattattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 30275047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 43207885 - 43208168
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
43207885 tatgttcccctaattggtatactgcatctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagt-aggac 43207983  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
43207984 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaatagtctttgaaggttgtaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcatt 43208083  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
43208084 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 43208168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 27266899 - 27266632
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
27266899 tatgttcccctaattggtataatgcagctattcttatgaatgactttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaataaattccttgagttaggac 27266800  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
27266799 cctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaagttttaagtacgttaacctattatcactaataaacgattatccatt 27266700  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||    
27266699 cttagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaatctatggtcggtagtcat 27266632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 9966364 - 9966648
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
9966364 tatgttcccctaattggtatattgcacctattcttatgaattattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcataatcaaacccttgagttaggac 9966463  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
9966464 cctcttctcaaactacagcccttaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttatgaacgttaacttaacatcacaaataaatgattatccatt 9966563  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
9966564 cctagactaaccatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagtaggaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 9966648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 24238478 - 24238194
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
24238478 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgatttcctagttccacgatagttaacaaaatatacctaatcaatcccttgagttaggac 24238379  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
24238378 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagattttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 24238279  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| |||||||| ||| |||  |||||| | ||||||    
24238278 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagatatggtcagtagccattcattctcactaaatca 24238194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 40781582 - 40781299
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40781582 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 40781483  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||    
40781482 cctcttctcaaactacagcccctaatttcttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttgacctaatattactaacaaacgattatccatt 40781384  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| |||||| |||||||  |||||| | ||||||    
40781383 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctgtggtcagtagtcattcattctcactaaatca 40781299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 242 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 5666628 - 5666364
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
5666628 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattttctagttccaagatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggac 5666529  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
5666528 cctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccatt 5666430  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtc 507  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
5666429 cctagactaaccatgtttattagaactattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtc 5666364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Original strand, 45493151 - 45493417
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
45493151 tatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttctacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaac 45493250  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
45493251 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaacctagtatcactaataaaggattatccatt 45493349  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||||||    
45493350 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagttagggtcagtagtcat 45493417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Original strand, 45500893 - 45501159
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
45500893 tatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttctacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaac 45500992  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
45500993 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaacctagtatcactaataaaggattatccatt 45501091  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||||||    
45501092 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagttagggtcagtagtcat 45501159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 242 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 26366044 - 26365800
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26366044 tatgttcccctaattggtatagtgtacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 26365945  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
26365944 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttatgcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcatt 26365845  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagt 486  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
26365844 cctaaactaaccatgtttattagaaaaattcaattaggtataagt 26365800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 245 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 45457269 - 45457005
Alignment:
245 gttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccat 344  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |    
45457269 gttcccctaattgttatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaagaccct 45457170  T
345 cttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcat 444  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
45457169 cttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataataatagaaggtttaaagaacgttaacctaatatcactaaaaaaagattatccattcat 45457070  T
445 agactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||||    
45457069 agactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaaactagggtcagtagtcat 45457005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 13971889 - 13972172
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
13971889 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttaacttaggac 13971988  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
      |||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
13971989 actcttctcaaaataaaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 13972087  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
13972088 cctagactaaccatgttttttagaaaaatccaattaggtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 13972172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 245 - 509
Target Start/End: Original strand, 36808440 - 36808703
Alignment:
245 gttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccat 344  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |    
36808440 gttcccctaattggtacactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacaatagttaacaaaatagttctaatcaatcccttgagttaagaccct 36808539  T
345 cttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcat 444  Q
    ||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |    
36808540 cttcttaaactacagaccctaattctttaggtggtctaataatctttgaaag-tttaagcacgttaacctaatattactaataaacgattatacattcct 36808638  T
445 agactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
36808639 agactaaccctgtttattagaacaattcaattaggtctaagtagaaagctatggtcagtagtcat 36808703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 33310776 - 33310510
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
33310776 atgttcccctaattggtatactgcaactattcatattaataattttctagttccacggtagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggacc 33310677  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
33310676 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcaagttaacctaatatcactaacaaacgattatccattc 33310577  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
33310576 ctagactaactatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtccaaagctagggtcagtagtcat 33310510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 38015628 - 38015362
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
38015628 atgttcccctaattgatatactgaacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggacc 38015529  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||| || ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||    
38015528 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcaccttaacctaatatcactaacaaatgattatccattc 38015429  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||    
38015428 ctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtcaaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 38015362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 43723810 - 43723527
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||    
43723810 tatgttcccctaattggtatattgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcctttaacttaggac 43723711  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
43723710 cctcgtctcaaactatagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgctaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 43723612  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
43723611 cctagactaaccctgtttattagaacagttcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 43723527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 16179236 - 16178971
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
16179236 atgttcccctaattggtatactgcatatattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagctctaatcaatcccttgagttaggacc 16179137  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     ||||||   | ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
16179136 ctcttctaggattacatcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaataatggattatccattc 16179038  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| |||||||    
16179037 ctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagttagggtcagtagtcat 16178971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 251 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 45453975 - 45453717
Alignment:
251 ctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttctc 350  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
45453975 ctaattggtataatgcacctattcgtattaatgattttctagttccatgatagttaacaaaatagcactaatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 45453876  T
351 aaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagacta 450  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
45453875 aaactacaacccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagacta 45453776  T
451 accatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
45453775 accatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 45453717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 242 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 29440605 - 29440375
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
29440605 tatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttagaac 29440506  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  || ||||||||||||| |||||||||||    
29440505 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaagctagtatcactaataaaggattatccatt 29440407  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattca 473  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||    
29440406 cctagactaaccatgtttattagaacaattca 29440375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 25870894 - 25870611
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
25870894 tatgtttccctaattggtatgctacacctattcttgtgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagttttaatcaatcccttgagttaggac 25870795  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
25870794 cgtcttctcaaactacatcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacaattatccatt 25870696  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
25870695 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaagtctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 25870611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 6826881 - 6826616
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||     
6826881 tatgctcccctaattggtatactgcacctatttttatgaatgattttctagttccacgat-gttaacaaaatagtcctaatcaaacccttgacttaggat 6826783  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
      |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
6826782 tctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatttttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 6826684  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||| |||||||    
6826683 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctttctaagtagaaagctatggtcagtagtcat 6826616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 242 - 507
Target Start/End: Original strand, 1386417 - 1386681
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
1386417 tatgttcccctaattggtatactgcacttattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggac 1386516  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
1386517 cctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccatt 1386615  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtc 507  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
1386616 tctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtc 1386681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 25874291 - 25874002
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
25874291 tatgtttccctaattggtatactacacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagttttaatcaatcccttgagttaggac 25874192  T
342 catcttctcaaactacagtccataa------ttccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgatta 435  Q
    | |||||||||||||||  || |||      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||    
25874191 cgtcttctcaaactacatcccctaaccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacaatta 25874093  T
436 tccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||  |||| |||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
25874092 tccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaagtctgtctaagtagaaagttatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 25874002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 242 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 12219906 - 12219643
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
12219906 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgtttttctagttccacgatagttagcaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggac 12219807  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     || |   | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
12219806 cctcttctagggttatatctcttaattccttatgtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccatt 12219708  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagt 506  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| ||||    
12219707 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtttaagtcgaaagctagggtcagtagt 12219643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 241 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 22630952 - 22630685
Alignment:
241 ttatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagga 340  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
22630952 ttatgttcccttaattggtatactgcacctattcttatgaatgattccctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttagga 22630853  T
341 ccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccat 440  Q
    |||| ||||     ||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| | |||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
22630852 ccattttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataaccgttgaagg-tttaagcatgttaacctaatatcaataataaaatattatccat 22630754  T
441 tcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||    
22630753 tcttagactaacaatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggttagtagtcat 22630685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 242 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 3875397 - 3875139
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattctt-ataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagga 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3875397 tatgttcccctaattggtatactgcacatattctttattaataattcactagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagga 3875298  T
341 ccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccat 440  Q
    |  ||||||     ||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
3875297 cactcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataaccattgaaggttt-aatcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccat 3875199  T
441 tcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtc 500  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
3875198 tcctatactaaccatgtttattagaaaaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 3875139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Original strand, 37937215 - 37937480
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
37937215 atgttcccctaattggtataccgcacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggacc 37937314  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     ||||||     ||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
37937315 ctcttctagggttacagcccccaattccttaggtggtctaataatcgttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattc 37937413  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
37937414 ctaaactaaccatgtttattagaataattcaattatgtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 37937480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Original strand, 40259134 - 40259400
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
40259134 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggac 40259233  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||| |     |||||  | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
40259234 cttcttatagggttacagcgcctaattccttaggtggtataataatcgttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaatgattatccatt 40259332  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||    
40259333 cctaaactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaaactatggtcagtagtcat 40259400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Original strand, 16790752 - 16791020
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || | || || |  |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16790752 tatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaagagtcactagtcttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 16790851  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt--taacttaatatcactaataaacgattatcca 439  Q
    | ||||||    |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||  |||| |||||||||||| ||| |||||||||    
16790852 cctcttctagggctacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgtgttaacctaatatcactaacaaatgattatcca 16790950  T
440 ttcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||    
16790951 ttcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagccgaaagctatggtcagtagtcat 16791020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 247 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 17877211 - 17876953
Alignment:
247 tcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatct 346  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||  |||    
17877211 tcccctaattgatatattgcacctattcttattaatgattctctagttccatgatagttaacaaaatagccaaaatcaatcccttgagttaggactttct 17877112  T
347 tctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatag 446  Q
    ||    | ||||  || ||||| |||||| | ||||| |||||||||| || | ||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||    
17877111 tcgaggattacaacccttaattacttaggggctctaacaatctttgaacgtat-aagcacgttatcctaatatcactaataaaggattatccattcctag 17877013  T
447 actaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagt 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||    
17877012 actaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagt 17876953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 509
Target Start/End: Original strand, 17874585 - 17874843
Alignment:
245 gttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccat 344  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |    
17874585 gttcccctaattggtacactgcacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatgattaacaaaatagtcttagtcaatcccttaagttaggaccct 17874684  T
345 cttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatct-ttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattca 443  Q
    |||||     ||||  || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||     
17874685 cttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaata-tctgttgaaggtt------acgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcc 17874777  T
444 tagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||    
17874778 tagactaaccatgtgtattagaacaattcaattaagtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 17874843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 243 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 10601024 - 10600876
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
10601024 atgttcccctaattgatatactgcacctatttttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaataatcctaatcaatcccttgagttagaacc 10600925  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatcttt 391  Q
     |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
10600924 ctcttctcaaactacagcccttaattccttaggtggtctagtaatcttt 10600876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 249 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 30926645 - 30926401
Alignment:
249 ccctaattggtatactgcacatattct-tataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatctt 347  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| | ||  ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
30926645 ccctaattgatatactgcacctattttctacgaatgattttctagtttcacgatggttagcaaaatagtcctaatcaatccattgacttaggaccctctt 30926546  T
348 ctcaaactacagtccataattcc----ttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattca 443  Q
    |||| |  |||  || |||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||         
30926545 ctcagatgacaacccctaattccttaattaggtggtctaatactctttgaaggttttatgaacgttaacttaatatcacaaataaacgattatcc----- 30926451  T
444 tagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggt 499  Q
          ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
30926450 ------aaccatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggt 30926401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 309 - 495
Target Start/End: Original strand, 35521423 - 35521613
Alignment:
309 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 408  Q
    |||||||| ||||||||  | |||| |||||||| |||||||| | |||| ||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||     
35521423 aaaatagttctaatcaactcattgacttaggaccctcttctcagattacaatccctaatttcttaggtgatctaatattctttgaaggttttaagagcgc 35521522  T
409 taacttaatatcactaataaacgattatcc----attcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagcta 495  Q
    |||| | ||||||| ||||||| |||||||    |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
35521523 taaccttatatcacaaataaacaattatccatatattcctagactaaccatgtttatttgaacaaatcaattaggtctaagttgaaagcta 35521613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 288 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 34682764 - 34682622
Alignment:
288 tctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataa 386  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||     
34682764 tctagtttcacgatggttaaccaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggactctcttctcagattacagtccctaattcctaaggtgatctaatat 34682665  T
387 tctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacg 431  Q
    ||||||  ||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||    
34682664 tctttg--ggttttaagaacgttaacctgatatcacaaataaacg 34682622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 417 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 10600876 - 10600773
Alignment:
417 tatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattct 516  Q
    ||||||||| |||||||||||||      |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||    
10600876 tatcactaacaaacgattatcca------gactaatcatgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattct 10600783  T
517 cgcgaaatca 526  Q
    | | ||||||    
10600782 cactaaatca 10600773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 509
Target Start/End: Original strand, 17876211 - 17876272
Alignment:
448 ctaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||    
17876211 ctaaccatgtgtattagaacaattcaattaagtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 17876272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 365 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 11188073 - 11187929
Alignment:
365 aattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattag 464  Q
    |||| |||||||| ||| ||| | || ||||||||| || | |||||  || | |||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |      
11188073 aatttcttaggtgctctcatattgttcgaaggtttttagaatgttaatatattctcacaattaaacggttatccattcctagactaaccatgtttaatta 11187974  T
465 aacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||  |||| |||||||    
11187973 aacaattcaattaggtataagttgaaagttaatgtcagtagtcat 11187929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 464 - 506
Target Start/End: Original strand, 38427436 - 38427478
Alignment:
464 gaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagt 506  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
38427436 gaacaatttaattagatctaagttaaaagctatggtcaatagt 38427478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 23224904 - 23225188
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23224904 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 23225003  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
23225004 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 23225103  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
23225104 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 23225188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 48645588 - 48645323
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
48645588 atgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatggttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggacc 48645489  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
48645488 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaacctaatatcagtaacaaacgattatccattc 48645390  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
48645389 ctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcaaaagctatggtcagtagtcat 48645323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 8277101 - 8276817
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8277101 tatgttcccctaattggtataatgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 8277002  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||    
8277001 cctcttctcaaactatagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatcaatt 8276902  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
8276901 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 8276817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Original strand, 45287068 - 45287334
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
45287068 tatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaac 45287167  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
45287168 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaacctagtatcactaataaaggattatccatt 45287266  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||||    
45287267 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtcagtagtcat 45287334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 6603573 - 6603307
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
6603573 atgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggacc 6603474  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
6603473 ctcttctcaaactacagcccctaatttcttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattc 6603374  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
6603373 ctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcaatagtcat 6603307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 243 - 507
Target Start/End: Original strand, 2441278 - 2441542
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
2441278 atgttctcctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctaattctacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggacc 2441377  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
2441378 ctcttctcaaactacagtccctaattccttaggtggtttaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattc 2441477  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtc 507  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||    
2441478 ctagactaaccatgtttattagaacaattcaattatgtctaagtcgaaagctagggtcagtagtc 2441542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 20594378 - 20594095
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
20594378 tatgttcccctaattggtatactgcacgtattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggac 20594279  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
20594278 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaaaaaacgattatccatt 20594180  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
20594179 cttacactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagttatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 20594095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 247 - 486
Target Start/End: Original strand, 13449780 - 13450019
Alignment:
247 tcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatct 346  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
13449780 tcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagctctaatcaatcccttgagttaggaccctct 13449879  T
347 tctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatag 446  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||    
13449880 tctcaaactaaagcccttaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctag 13449979  T
447 actaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagt 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13449980 actaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagt 13450019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 249 - 509
Target Start/End: Original strand, 9864732 - 9864992
Alignment:
249 ccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttc 348  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
9864732 ccctaattggtatactacacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttc 9864831  T
349 tcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagac 448  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
9864832 tcaaactacaacccataattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacttaatatcactaacaaacgattatccattcctagac 9864931  T
449 taaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
9864932 taaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 9864992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 26557614 - 26557331
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
26557614 tatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacatagaac 26557515  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
26557514 cctcttctcaaactacagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 26557416  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
26557415 cctaaactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 26557331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 17730929 - 17730663
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
17730929 tatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttaacttaggac 17730830  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
17730829 cctcttctcaaactatagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcattaacaaacgattatccatt 17730731  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||    
17730730 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcat 17730663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 4546984 - 4546701
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
4546984 tatgtttccctaattgatatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaataatcctaatcaatcccttgacttaggac 4546885  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
4546884 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacaattatccatt 4546786  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||| ||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
4546785 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaagcaatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 4546701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 16165863 - 16165597
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
16165863 atgttcccctaattggtatactgcacctatttgtattaatgattctctaattcaacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggacc 16165764  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
16165763 ctcttctcagattacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattacccattc 16165664  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
16165663 ctagattaaccatgtttattagaataattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 16165597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 4596008 - 4596291
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
4596008 tatgttcccctaattggtatacttcacatattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaaaaaaatagtcataatcaatcccttgacttaagac 4596107  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||    
4596108 cctcttctcaaactacagcccctaattccttagttggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacaattattcatt 4596206  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||| | ||||||    
4596207 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaaactatggtcaatagtcattcattctcactaaatca 4596291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Original strand, 9132759 - 9133025
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
9132759 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattcactagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggac 9132858  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
9132859 cctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaataaatgattatccatt 9132957  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
9132958 cctagactaaccatgtttattagaacaattccattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 9133025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 246 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 13842751 - 13842489
Alignment:
246 ttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatc 345  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    
13842751 ttcccgtaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctaattccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgaattaggaccctc 13842652  T
346 ttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcata 445  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||    
13842651 tcctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatctattccta 13842553  T
446 gactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||    
13842552 gactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgagagctagggtcagtagtcat 13842489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 242 - 486
Target Start/End: Original strand, 37415422 - 37415667
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
37415422 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatctcttgagttagaac 37415521  T
342 catcttctcaaactacagtccataatt--ccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatcca 439  Q
    | |||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
37415522 cctcttctcaaactacagcccctaattccccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaacctagtatcactaataaaggattatcca 37415620  T
440 ttcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagt 486  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
37415621 ttcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtataagt 37415667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Original strand, 14683443 - 14683709
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
14683443 tatgttcccctaattggtatactgcatctattcttatgaatgattcactagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggac 14683542  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||   | ||||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
14683543 cctcttctaggattacagcccctaattccataggtggtctaatagttattgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaataaatgattatgcatt 14683641  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
14683642 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcaaaagttatggtcactagtcat 14683709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 242 - 486
Target Start/End: Original strand, 9271464 - 9271700
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |    
9271464 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaagaaaatactcctaatcaatcccttgagttaggtc 9271563  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
9271564 cctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaaccaaatatcactaacaaacgattatccatt 9271662  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagt 486  Q
    | |||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
9271663 cctag-------ttgtttattagaacaattcaattaggtctaagt 9271700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 10469259 - 10468976
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| | |||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
10469259 tatgttcccctaattagtacactgcacctattcttgtgaattcttttctagttccatgatagttaaaaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 10469160  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     ||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||    
10469159 cctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatctatt 10469061  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||   ||||| ||||||||    
10469060 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcacgaaatca 10468976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Original strand, 3067976 - 3068242
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||| |  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3067976 tatgttcccctaattgttatactgcacctattcttgtgaatgactcactagttctatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 3068075  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     ||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
3068076 cctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataatcgttgaaggttt-aagcacattaacctaatatcactaataaaagattatccatt 3068174  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
3068175 cctagactaaccatgtatattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 3068242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Original strand, 26136127 - 26136393
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
26136127 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttcagttaggac 26136226  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
26136227 cctcttctagggttaaagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 26136325  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||    
26136326 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattacgtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 26136393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 241 - 507
Target Start/End: Original strand, 37166145 - 37166410
Alignment:
241 ttatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagga 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
37166145 ttatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaagtagtcctaatcaatcccttgagttagga 37166244  T
341 ccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccat 440  Q
    |  ||||||     ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
37166245 ctctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataacctttgaatgttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaatgattatccat 37166343  T
441 tcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtc 507  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
37166344 tcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtc 37166410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Original strand, 26144507 - 26144773
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
26144507 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttcagttaggac 26144606  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     || || || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
26144607 cctcttctagggttaaagcccctaattccttaggtggtctagtaacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 26144705  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||    
26144706 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattacgtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 26144773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 242 - 429
Target Start/End: Original strand, 45290479 - 45290665
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
45290479 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaac 45290578  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaa 429  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||    
45290579 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaacctagtatcactaataaa 45290665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 242 - 501
Target Start/End: Original strand, 20080717 - 20080975
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20080717 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttctgaatgagtcactagttcaacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 20080816  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    |  |||||     || || || ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
20080817 ccccttctagggttatagaccctaatttcttaggtggtctaataatcgctgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccatt 20080915  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtca 501  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||    
20080916 cctagactaaccatgtttattagaacaactcaattaggtctaagtcgaaagctagggtca 20080975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 242 - 399
Target Start/End: Original strand, 11919864 - 11920021
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11919864 tatgttcccctaattggtatactacacctattcttatgaatgattttctagttccacgataggtaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 11919963  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt 399  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11919964 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt 11920021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 245 - 526
Target Start/End: Original strand, 5242152 - 5242435
Alignment:
245 gttcccctaattggtatactgcacatatt-cttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacca 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||     
5242152 gttcccttaattggtatactgcacctatttcttacgaatgattctctagtttcactatggttaacaaaatatccataaccaatcccttgacttaggaccc 5242251  T
344 tcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaa-gtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
    | |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
5242252 tattctcagactacagcccctaattccttaggtggtctaatattctttgaagattttaaagaacgttaacttaatatcacaaataaatgagtatccattc 5242351  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
     | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||  ||| || ||||||||    
5242352 ttggactaaccatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagctagggtcagcagtcattcattatcacgaaatca 5242435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 246 - 526
Target Start/End: Original strand, 13809519 - 13809795
Alignment:
246 ttcccctaattggtatactgcacatattc-ttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccat 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||  |||  ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |    
13809519 ttcccttaattggtatactgcacctatttattacgaatgattctctagtttcacgatggttaacaaaatagccctgatcaatcccttgacttaggaccct 13809618  T
345 cttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcat 444  Q
    ||||||| | ||||  |  |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
13809619 cttctcatattacaacctctaattccttatgtggcctaatactctttgaaggttttaagaacgttaacttaatatcacaaataaacgattatccattcct 13809718  T
445 agactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    |||||||||||||||||| |||     ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||  ||||||  |||||||    
13809719 agactaaccatgtttatttgaa-----caattaggtctgagttgaaagctatggccaatagtcattcattctcatgaaatca 13809795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 245 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 7227641 - 7227361
Alignment:
245 gttcccctaattggtatactgcacatatt-cttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacca 343  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||     
7227641 gttcccctgattggtatactgcacctatttcttacgaatgattctctagtttcacgatggttaacaaaataaccataatcaatcccttgacttaggaccc 7227542  T
344 tcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattca 443  Q
    | ||||| || ||||| |  ||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||      
7227541 tattctccaattacagcctctaattccttatatgatctaatattctttgaaggttttacgaacgttaacttaatatctcaaataaacgattatccattgc 7227442  T
444 tagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaat 524  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||    
7227441 taggctagccatgtttatttgaacaactcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtcattcattctcacgaaat 7227361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 242 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 4542912 - 4542734
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||| ||    
4542912 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaataattctaatcaatcccttgacctagaac 4542813  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatca 421  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
4542812 cctcttctcaaactacagcccctaattccttagttggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatca 4542734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 350 - 509
Target Start/End: Original strand, 11398132 - 11398291
Alignment:
350 caaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagact 449  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
11398132 caaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccactcttagact 11398231  T
450 aaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
11398232 aaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 11398291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 288 - 509
Target Start/End: Original strand, 18562577 - 18562799
Alignment:
288 tctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataa 386  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||| ||| || ||||| |||| |||||||  |||||||| | |||||||| ||||||||||||||  ||||||     
18562577 tctagttttacgatagttaactaaaatagccctgattaatcctttgacttaggactctcttctcatattacagtccctaattccttaggtgagctaatat 18562676  T
387 tctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagt 486  Q
    | || |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
18562677 tattcgaaggttttaagaacgttaacctaatatcacaaataaacgattatccattcctagactaaccctgtttaattgaacaattcaattaggtctaagt 18562776  T
487 taaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | ||||||||||||| |||||||    
18562777 tgaaagctatggtcagtagtcat 18562799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 309 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 5796600 - 5796408
Alignment:
309 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 408  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | |||| ||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
5796600 aaaatagctctaatcaatcccttgacttaggaccctcttatcatattacaatctctaattccttaggtgatctaatattctttgaaggttttaagaacgt 5796501  T
409 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtca 501  Q
    |||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
5796500 taacattatatcacaaataaacgattattcattcatagactaaccctttttatttgaaaaactcaattaggtctaagttgaaagctatggtca 5796408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 323 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 10345248 - 10345064
Alignment:
323 caatcccttgagttaggaccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcac 422  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |     ||||  || ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
10345248 caatcccttgagttaggaccctcttatagggttacaacccctaattccttagatggtctaataaccgttgaaggttt-aagcacgttaacttaatatcac 10345150  T
423 taataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 508  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||    
10345149 taataaaggattatccattcttagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtca 10345064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 242 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 35961206 - 35961076
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
35961206 tatgttcctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagtcaacaaaatagtcctaatcaatcccttgatttaggac 35961107  T
342 catcttctcaaactacagtccataattcctt 372  Q
    | ||||||||||||| || || |||||||||    
35961106 cctcttctcaaactatagcccctaattcctt 35961076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 246 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 4695592 - 4695491
Alignment:
246 ttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
4695592 ttcccctaattggtatactgcacctattcttatcaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggaccctc 4695493  T
346 tt 347  Q
    ||    
4695492 tt 4695491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 369 - 486
Target Start/End: Original strand, 37423083 - 37423199
Alignment:
369 ccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaaca 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
37423083 ccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagaacgttaacctagtatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaaca 37423181  T
469 attcaattaggtctaagt 486  Q
    |||||||||||| |||||    
37423182 attcaattaggtataagt 37423199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 387 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 4695494 - 4695356
Alignment:
387 tctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagt 486  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
4695494 tctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaaatgtgtctaagt 4695396  T
487 taaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
      ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
4695395 agaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 4695356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 408 - 509
Target Start/End: Original strand, 22611771 - 22611872
Alignment:
408 ttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtc 507  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||    
22611771 ttaacctaatatcactaataaaggattattcattcctagactaaccatgtttattagaataattcaattaggtgtaagtcgaaagctagggtcagtagtc 22611870  T
508 at 509  Q
    ||    
22611871 at 22611872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 243 - 323
Target Start/End: Original strand, 11398049 - 11398129
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatc 323  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
11398049 atgttcccctaattggtatactgtacctattcgtattaatgattttctagttctacgatagttagcaaaatagtcctaatc 11398129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 344 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 24918208 - 24918043
Alignment:
344 tcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattca 443  Q
    |||||||| | |||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| |    |||||| |||||| || | ||||||||||||||||||    
24918208 tcttctcagattacactccctaattccttatgtggtctaatattccctgaaagttttcaaagtgttaacctaatattacaattaaacgattatccattca 24918109  T
444 tagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    ||||| | || |||||| | ||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||    
24918108 tagacaagccctgtttaattgaacaatccaattatgtctaagttgaaagctttggtcagtagtcat 24918043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 308
Target Start/End: Original strand, 22611710 - 22611775
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaac 308  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||    
22611710 atgttcccctaattgatatactgcatctattcttatgaatgattcactagttccacgataattaac 22611775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 10345310 - 10345266
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgatt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
10345310 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgatt 10345266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 85)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 32287304 - 32287588
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
32287304 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttagggc 32287403  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
32287404 cctcttctcaaactataatccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtatgttaacctaatatcactaataaacgattatccatt 32287503  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  |||||| ||||||||    
32287504 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcaaaagctatggttagtagtcattcattctcacgaaatca 32287588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Original strand, 16184669 - 16184935
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16184669 atgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 16184768  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     | |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
16184769 tttttcttaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaaagattatccattc 16184868  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
16184869 ctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 16184935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 2775695 - 2775411
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
2775695 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgaattaggac 2775596  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
2775595 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 2775496  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
2775495 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 2775411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 7486784 - 7486500
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7486784 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 7486685  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
7486684 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 7486585  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
7486584 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 7486500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 2778938 - 2778654
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
2778938 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgaattaggac 2778839  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
2778838 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 2778739  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
2778738 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 2778654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 45896594 - 45896310
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
45896594 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 45896495  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
45896494 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 45896395  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
45896394 cctagactaaccctgtttattagaacaactcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 45896310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 54723955 - 54723688
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
54723955 tatgttcccataattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaac 54723856  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
54723855 cctcttctcaaactacagcccctatttccttaggtggtctaataatctttgaaggttttatgcacgttaacctaatatcattaacaaacgattatccatt 54723756  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
54723755 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 54723688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 43809792 - 43809526
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43809792 atgttcccctaattggtatactgcacctactcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 43809693  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
43809692 ctcttctcaaactacaccccctaattccttaggtggtctaatattctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaaggattattcattc 43809593  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||    
43809592 ctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagttatggtcagtagtcat 43809526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 2873777 - 2873494
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2873777 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctaattccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 2873678  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
2873677 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 2873579  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
2873578 cttagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 2873494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 43927048 - 43926765
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43927048 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 43926949  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
43926948 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 43926850  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
43926849 cctagactaaccttgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 43926765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 242 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 25584890 - 25584631
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25584890 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 25584791  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
25584790 cctcttctcaaactacagcccctaatttcttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 25584691  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtca 501  Q
    | | |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||    
25584690 cctggactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtca 25584631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Original strand, 29343855 - 29344122
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29343855 tatgttcccctaattggtatattgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 29343954  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
29343955 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaaagattattcatt 29344054  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||    
29344055 cctagactaaccatgattattagaataattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcat 29344122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 53816041 - 53815775
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
53816041 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaac 53815942  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
53815941 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaacctagtatcactaataaaggattatccatt 53815843  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||||    
53815842 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtcagtagtcat 53815775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 52200125 - 52199860
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
52200125 atgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgataattaacaaaatagtcctaatcaatcccttgaattaggacc 52200026  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
52200025 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcatgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattc 52199927  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
52199926 ctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 52199860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 24125712 - 24125429
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24125712 tatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 24125613  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
24125612 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcatgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 24125514  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
24125513 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 24125429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 24128989 - 24128706
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24128989 tatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 24128890  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
24128889 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcatgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 24128791  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
24128790 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 24128706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 241 - 526
Target Start/End: Original strand, 49742899 - 49743184
Alignment:
241 ttatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagga 340  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
49742899 ttatgttcccctaattggtatattgcacctattcttatgaacgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagga 49742998  T
341 ccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccat 440  Q
    || |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
49742999 ccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacagacgattatccat 49743098  T
441 tcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    || || ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
49743099 tcctaaactaaccctgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 49743184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 243 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 27092106 - 27091844
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27092106 atgttctcctaattggtatactgcacctattcttattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 27092007  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||||||||||  || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
27092006 -tcttctcaaactacatcccctaatttcttaggcggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaaccttttatcactaataaacgattatccattc 27091908  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagt 506  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
27091907 ctagactaaccatgtttattagaacaagttaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagt 27091844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Original strand, 18644750 - 18645016
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
18644750 atgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaca 18644849  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||| | |||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
18644850 ctcttctcagattacagtccctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattgtccattc 18644949  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||||    
18644950 ctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtttaagtcgaaagctaaggtcagtagtcat 18645016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 249 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 31549378 - 31549118
Alignment:
249 ccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttc 348  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
31549378 ccctaattggtatactgcacctattcttatgaataattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgacttaggaccctcttc 31549279  T
349 tcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagac 448  Q
    | ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||    
31549278 taaaactacagaccctaatttcttaggtggtctaataatctttgaaggttttatgaatgttaacctattatcactaataaacgattatccatttctagac 31549179  T
449 taaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
31549178 taaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtcat 31549118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 243 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 3840729 - 3840446
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
3840729 atgttcccctaattgatatactacacctattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaacagtcctaatcaatcccttgagttagtacc 3840630  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
3840629 ctcttctcaaactacaacccctaattccttagatggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattc 3840530  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
     ||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
3840529 ctagactaaccatgattattagaataattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 3840446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Original strand, 50461530 - 50461796
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
50461530 atgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggacc 50461629  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||| || ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
50461630 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacattaacctaatatcactaacaaacgattattcattc 50461729  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
50461730 ctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 50461796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 242 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 539040 - 538776
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
539040 tatgtttccctaattggtatactacacctattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 538941  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
538940 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaatgttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgaatatccatt 538841  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagt 506  Q
      |||||||| | ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||    
538840 gctagactaaacctgtttatttaaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtcagtagt 538776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 10885070 - 10884787
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
10885070 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttagaac 10884971  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
10884970 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatcttcgaagg-tttaaacacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 10884872  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
10884871 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 10884787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Original strand, 6434759 - 6435025
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
6434759 tatgttcccctaattggtatactgcacctatttttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagatagaac 6434858  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||    
6434859 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaacctagtatcactaataaaggattattcatt 6434957  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||||    
6434958 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtcagtagtcat 6435025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 16244086 - 16243803
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
16244086 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaagac 16243987  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||    
16243986 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtgttctaataatctttgaagg-tttaagcatgttaacctaatatcactaacaaacgattatctatt 16243888  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
16243887 cctagactaaccctatttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 16243803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 243 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 35751653 - 35751401
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35751653 atgttcccctaatttgtatactgcaccttttcgtattaatgattttctagttctacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 35751554  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||    
35751553 ctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagattttaagcacgttaacctaatatcattaacaaacgattattcattc 35751454  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagcta 495  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
35751453 ctagactaaccatgtttattagaacaactcaattaggtctaagttgaaagcta 35751401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 11190740 - 11190473
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
11190740 tatgttcccctaattggtatattgcacctattcttatgaatgattttcttgttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaac 11190641  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||    
11190640 cctcttctcaacctacaacccctaattccttaggtggtctaataattcttgaaggttttatgcacgttaacctaatatcactaacaagtgattatccatt 11190541  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
11190540 cctcgactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 11190473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 11784978 - 11784712
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
11784978 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattcactagttccacgatagttaacaaaatagccctaataaatcccttgagttaggacc 11784879  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||| ||  | ||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
11784878 ctcttatcggattacaacccctaattccttaggtggtctaataatcgttgaaggttttaagcacgttaatctaatatcactaataaaggattatccattc 11784779  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
11784778 ctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctaaggtcagtagtcat 11784712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 245 - 509
Target Start/End: Original strand, 15195286 - 15195549
Alignment:
245 gttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccat 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
15195286 gttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattcactagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagataggaccct 15195385  T
345 cttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcat 444  Q
    |||||   ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |    
15195386 cttctaggactacaacctctaattccttaggtggtctaataatcttcgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaataaaagattatccattcct 15195484  T
445 agactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
15195485 agactaaccatgtttattagcacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 15195549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 20728628 - 20728911
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
20728628 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattttctagttcgatgatatttaacaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggac 20728727  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
20728728 cctcttctcaaactacagcctctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacattaacctaatatcactaacaaaagattatccatt 20728826  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
20728827 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 20728911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 30690949 - 30690666
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
30690949 tatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaataattctaatcaatcccttgagttaggac 30690850  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
30690849 cctcttctcaaattacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 30690751  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
30690750 cctagactaaccctgtttattataacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 30690666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Original strand, 17040004 - 17040269
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
17040004 atgttcccttaattggtatacaacacttattcttatgaatgattctttagtttcatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttaagttaggacc 17040103  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
17040104 ctcttctcaaactacagcccctaattccttagatgatctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacaattatccattc 17040202  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
17040203 ctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcaaaagctatggtcagtagtcat 17040269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 242 - 499
Target Start/End: Original strand, 28008052 - 28008307
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
28008052 tatgttccccaaatttgtatactgcacctattcttatgaattattctctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttatgac 28008151  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |  || |||||||||||||||||||||||||    
28008152 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaatgttgtaagtacgt--atctattatcactaataaacgattatccatt 28008249  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggt 499  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
28008250 cctagactaaccatatttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggt 28008307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 250 - 526
Target Start/End: Original strand, 10106588 - 10106863
Alignment:
250 cctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttct 349  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
10106588 cctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttagaaccctcttct 10106687  T
350 caaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagact 449  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
10106688 caaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatatttgaagg-tgtaagcacgttaacctaatatcactaacaaatgattatccattcctagact 10106786  T
450 aaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
10106787 aaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagttatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 10106863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 10881693 - 10881410
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||    
10881693 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacaatagttaacaaaatagttctaatcaatcctttgacttaagac 10881594  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
10881593 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaagtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 10881495  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| | |||||||  |||||| | ||||||    
10881494 cctagattaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtataaagctatggttagtagtcattcattctcactaaatca 10881410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 245 - 509
Target Start/End: Original strand, 23298599 - 23298863
Alignment:
245 gttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccat 344  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
23298599 gttcccttaattggtatgctgcacctattcttatgaatgactttctagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccct 23298698  T
345 cttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcat 444  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |    
23298699 cttctcaaactacagcccctaatttcttaggtggtctaagaatctttcaaggttttaagaacattaacctaatatcaccaacaaacgattatccattcct 23298798  T
445 agactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
23298799 agactaacgatgtttattagaacaattcaattatgtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 23298863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 47051709 - 47051425
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
47051709 tatgttcccctaactggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagctctaatcaatcccttgagttaggac 47051610  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||    
47051609 cctcttctcaaactacagcccctaattccataggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcagtaacaaacggttatccttt 47051510  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||  |||||| | ||||||    
47051509 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcattctcactaaatca 47051425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 35412722 - 35412462
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35412722 atgttcctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 35412623  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||| | |||||||| |||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||        
35412622 ctcttctcagattacagtccctaattccttaggttagctaatattctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatcc---- 35412527  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||||    
35412526 --agactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtcagtagtcat 35412462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 243 - 526
Target Start/End: Original strand, 55034838 - 55035125
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattc----ttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttag 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
55034838 atgttcccctaattggtatactgcacctattcattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttag 55034937  T
339 gaccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatcc 438  Q
     | | |||||||||||||||  || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
55034938 aatcctcttctcaaactacatcccctaattccttaggtggtttagtaatctttgaaggttttatgcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatcc 55035037  T
439 attcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
55035038 attcctagactaatcatgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 55035125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Original strand, 8461468 - 8461734
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |     
8461468 tatgtttccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgattctatagttccatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgatttagtat 8461567  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
8461568 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaaaaacgttaacctagtatcactaataaaggattatccatt 8461666  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||||    
8461667 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtcagtagtcat 8461734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 9392947 - 9392681
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
9392947 tatgttcccctaattggtatactacacctatacttatgaatgattttctagttccacaatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggac 9392848  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||||||||  || || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
9392847 cctcttctcaaactctagcccctaattccttaagtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaaactaatatcactaacaaacgattatccatt 9392749  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||| | ||| |||||||    
9392748 cctagactaaccatgtttattagaacaaatcaattagatctaagtcgaaagctaggatcagtagtcat 9392681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 245 - 526
Target Start/End: Original strand, 19301489 - 19301769
Alignment:
245 gttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccat 344  Q
    |||||| || ||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
19301489 gttcccgtatttgctacactgcacctattcttatgaatgattttctagttctacgatagttaacaaaatagttctaataaatcccttgagttaggaccct 19301588  T
345 cttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcat 444  Q
    ||||||||||||||  || ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |    
19301589 cttctcaaactacaacccctaatttcttaggtggtttaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaaagattatccattcct 19301687  T
445 agactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||||||  |||||| | ||||||    
19301688 agactaaccatgtttattagaacaattcaattatgtctaagttgaaagctagggtctgtagtcattcattctcactaaatca 19301769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 245 - 526
Target Start/End: Original strand, 19304673 - 19304953
Alignment:
245 gttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccat 344  Q
    ||||||||  |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |    
19304673 gttcccctgcttggtacactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccctgagttacgaccct 19304772  T
345 cttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcat 444  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||| ||| ||| |||||||||||| |    
19304773 cttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaacatcattaacaaatgattatccattcct 19304871  T
445 agactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| | ||||||    
19304872 atactaaccatgttcattagaacaattcatttatgtctaagttgaaagctagggtcaatagtcattcattctcactaaatca 19304953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 47055139 - 47054855
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
47055139 tatgttcccataactagtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagctctaatcaatcccttgagttaggac 47055040  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||    
47055039 cctcttctcaaactaaagcccctaattccataggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcagtaacaaacggttatccttt 47054940  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||  |||||| | ||||||    
47054939 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcattctcactaaatca 47054855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Original strand, 12561215 - 12561481
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | || || |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12561215 tatgttcccctaattgatatactgcacctattcttgtgaaagagtccctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 12561314  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
12561315 cctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccatt 12561413  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
12561414 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 12561481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Original strand, 48064016 - 48064282
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||| |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48064016 tatgttcccctaattggtatactgcatctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 48064115  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     ||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
48064116 cctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataaccgttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccatt 48064214  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||    
48064215 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattagatctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 48064282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Original strand, 22416815 - 22417081
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |  || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22416815 tatgttcccctaattggtatactgcacttattcttgtgaaagagtcactcgttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 22416914  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
22416915 cctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccatt 22417013  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||    
22417014 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaacgctatggtcagtagtcat 22417081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 46885153 - 46884888
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
46885153 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgcttttctagttc-acgatagttagcaaaatagtcctaatcaatcccttgagttgggac 46885055  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
46885054 cctcttctagggttacagcccctaattccttaggtgttctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccatt 46884956  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
46884955 tctagaccaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagctagggtcagtagtcat 46884888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 54720184 - 54719918
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
54720184 tatgtttccataattggtatattgcacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 54720085  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     ||||  || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
54720084 cctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataaccgttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccatt 54719986  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
54719985 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 54719918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 245 - 509
Target Start/End: Original strand, 30219989 - 30220256
Alignment:
245 gttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccat 344  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
30219989 gttcccctaattggtcaactgcacctattcttatgaatgattctctagtttcacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccct 30220088  T
345 cttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtac---gttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    ||||  | | |  |  || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
30220089 cttcatagattgtaacccctaattccttaggtggtctaatattctttgaagcttttaagttgatagttaacttaatatcacaaataaacgattatccatt 30220188  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
30220189 catagactaaccatgtttatttgaacaattcaattaggtttaagttgaaagctatggtcagtagtcat 30220256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 17141621 - 17141355
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17141621 tatgttcccctaattggtatattgcacctattcttatgaatgattcgctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 17141522  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     ||||  ||  |||| ||||||||||||||||| | || |||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
17141521 cctcttctagggttacaaccccaaatttcttaggtggtctaataaccgttaaagg-tttaatcacgttaacctaatatcactaataaaggatcatccatt 17141423  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||    
17141422 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagttatggtcagtagtcat 17141355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 242 - 492
Target Start/End: Original strand, 34983834 - 34984083
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| | |||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
34983834 tatgttcccctgattggtataccgcacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaacaaaagagtcataatcaatcccttgagttaggac 34983933  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    ||||||||     ||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
34983934 catcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataaccgttgaaggttt-aagcactttaacctaatatcactaataaatgattatccatt 34984032  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaag 492  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
34984033 cttagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaag 34984083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 297 - 509
Target Start/End: Original strand, 32367165 - 32367376
Alignment:
297 acgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaagg 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
32367165 acgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaagg 32367264  T
397 ttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctat 496  Q
    ||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
32367265 ttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctat 32367363  T
497 ggtcaatagtcat 509  Q
    ||||| |||||||    
32367364 ggtcagtagtcat 32367376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 243 - 434
Target Start/End: Original strand, 18641754 - 18641945
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
18641754 atgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaca 18641853  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgatt 434  Q
     |||||||| | |||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
18641854 ctcttctcagattacagtccctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgatt 18641945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 244 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 41977212 - 41976965
Alignment:
244 tgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacca 343  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||                 
41977212 tgttctcctaattggtatactgcacttattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatccct------------- 41977126  T
344 tcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattca 443  Q
     ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
41977125 -cttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcatgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattca 41977028  T
444 tagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagt 506  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||    
41977027 tagactaatcatgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagt 41976965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 241 - 509
Target Start/End: Original strand, 25442839 - 25443107
Alignment:
241 ttatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagga 340  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25442839 ttatgttcccctaattggtatattgcacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagga 25442938  T
341 ccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaa-taatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatcca 439  Q
    || ||||||     ||||| || |||||||||||||||||||| ||| | | ||| |||| ||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
25442939 ccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaaataaccgtcgaatgttt-aagcacgttaagctaatatcactaataaaggattatcca 25443037  T
440 ttcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
25443038 ttcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 25443107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 243 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 54461227 - 54461010
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
54461227 atgttccccaaatgggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataattcatcccttgagttaggacc 54461128  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||| | |||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||    
54461127 ctcttctcatattacagtccctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactagtaaaggattatacattc 54461028  T
443 atagactaaccatgttta 460  Q
     |||||||||||||||||    
54461027 ctagactaaccatgttta 54461010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 245 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 17546068 - 17545812
Alignment:
245 gttcccctaattggtatactgcacatatt-cttataaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
17546068 gttcccctaattggtatactgcacctatttcttatgaatgattctctagtttcacgatggttaactaaaatagccctaatcaatcccttgacttatgacc 17545969  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||| | |||| ||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||  |||||||||||||||||||    
17545968 ctcttctcagattacaatccctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcacgttaacctagtatcataaataaacgattatccattc 17545869  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggt 499  Q
     |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
17545868 ctagactaaccctgtttatttgaataattcaattaggtctaagttgaaaactatggt 17545812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 296 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 18542711 - 18542497
Alignment:
296 cacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaa 394  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
18542711 cacgatggttaactaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaagaccttcttctcagattacagtccctaatttcttaggtgatctaatattctttgaa 18542612  T
395 ggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagct 494  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |    
18542611 ggttttaagaacgttaacctaatatcacaaataaacgattatccattcctagactaaccctgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagtt 18542512  T
495 atggtcaatagtcat 509  Q
    ||||||| |||||||    
18542511 atggtcattagtcat 18542497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 245 - 509
Target Start/End: Original strand, 22993680 - 22993946
Alignment:
245 gttcccctaattggtatactgcacatattct-tataaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||   ||| |||  || |||||||  ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
22993680 gttcccctaattggtacactgcacctatttactatgaatacttctctagttttacgatggttaactaaaatatccctaatcaatcccttgacttaggacc 22993779  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
22993780 ctcttctcaaattacagtccctaattccttaggtgatctaatattctttgaaggtttttagaacgttaacctagtatcacaaataaacgattatccattc 22993879  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
22993880 ctaaacttaccatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtcat 22993946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 246 - 526
Target Start/End: Original strand, 3292943 - 3293225
Alignment:
246 ttcccctaattggtatactgcacatatt-cttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccat 344  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||      
3292943 ttcccctaattggtatattgcacctatttcttatgaatgattctatagtttcacgatggttaacaaaatagccctaatcaatcccttgacttaagaccca 3293042  T
345 cttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatat-cactaataaacgattatccattca 443  Q
    ||||||  | ||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||     
3293043 cttctccgattacaacccctaattccttaggtggtctaatattctttgaaggttttaagaacgttaacttaatataaaaaaataaacgattattcattcc 3293142  T
444 tagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||| | |||||||   ||||| ||||||||    
3293143 tagactaaccatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaggctagggttagtagtcattcgttctcacgaaatca 3293225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Original strand, 17531637 - 17531897
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17531637 tatgttcctctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 17531736  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     ||||  || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
17531737 cctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataaccgttgaaggtttaaac-acgttaacctaatatcactaataaa-gattatccatt 17531834  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
17531835 cctagactaaccatgtttatta-----attcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 17531897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 243 - 442
Target Start/End: Original strand, 55031978 - 55032181
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattc----ttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttag 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
55031978 atgttcccctaattggtatactgcacctattcattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttag 55032077  T
339 gaccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatcc 438  Q
     ||| |||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
55032078 aaccctcttctcaaactacatcccctgattccttaggtggtctagtaatctttgaagcttttatgcacgttaacctaatatcactgacaaacgattatcc 55032177  T
439 attc 442  Q
    ||||    
55032178 attc 55032181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Original strand, 17528742 - 17529004
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
17528742 tatgttcccctaattgatatactgcacatattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaataaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 17528841  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     ||||  |  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||    |    
17528842 cctcttctagggttacaaccactaattccttaggtggtttaataaccgttgaaggttt-aagcacattaacctaatatcactaataaaggattat----t 17528936  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||    
17528937 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagagtcaatagtcat 17529004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 327 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 28266005 - 28265832
Alignment:
327 cccttgagttaggaccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaat 426  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||    
28266005 cccttgagatagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagaacgttaacctagtatcactaat 28265907  T
427 aaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtca 501  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||    
28265906 aaaagattatccattcctagactaatcatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtca 28265832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 246 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 22783812 - 22783522
Alignment:
246 ttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatc 345  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||    
22783812 ttcccctaattggcacacatcacatattcttatgaatgattctctagtttcacgatagttaacataatagtcctaataaatcccttgacttaggaccctc 22783713  T
346 ttctcaaa--ctacagtccataattccttaggtggtctaata-atctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
    |||||| |   || || || |||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
22783712 ttctcagattatatagcccctaattccttaggtggtataatatttttttgaaggttttaagaacgttaacttaatatcacaaataaacgattatgcatac 22783613  T
443 atagactaaccatgttta-------ttagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
     |||| ||||||||||||       || |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||  ||||||  |||||| ||||||||    
22783612 ctagaataaccatgtttatttgaattttgaacaattcaattaagtctaagttgaaagttgtggtcagcagtcattcattctcacgaaatca 22783522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 246 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 22788176 - 22787886
Alignment:
246 ttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatc 345  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||    
22788176 ttcccctaattggcacacatcacatattcttatgaatgattctctagtttcacgatagttaacataatagtcctaataaatcccttgacttaggaccctc 22788077  T
346 ttctcaaa--ctacagtccataattccttaggtggtctaata-atctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
    |||||| |   || || || |||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
22788076 ttctcagattatatagcccctaattccttaggtggtataatatttttttgaaggttttaagaacgttaacttaatatcacaaataaacgattatgcatac 22787977  T
443 atagactaaccatgttta-------ttagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
     |||| ||||||||||||       || |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||  ||||||  |||||| ||||||||    
22787976 ctagaataaccatgtttatttgaattttgaacaattcaattaagtctaagttgaaagttgtggtcagcagtcattcattctcacgaaatca 22787886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 242 - 374
Target Start/End: Original strand, 52309596 - 52309728
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
52309596 tatgttcccctaattggtatattgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagctaggac 52309695  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttag 374  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||    
52309696 catcttctcaaactacaacccctaattccttag 52309728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 355 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 52988505 - 52988352
Alignment:
355 tacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaacca 454  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
52988505 tacagttcctaattccttaggtggtctaataaccgttgaaagttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaacca 52988407  T
455 tgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||    
52988406 tgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaacgctatggtcagtagtcat 52988352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 242 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 28266130 - 28266013
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
28266130 tatgttcccctaattggtatactgcacctatttttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagatagaac 28266031  T
342 catcttctcaaactacag 359  Q
    | ||||||||||||||||    
28266030 cctcttctcaaactacag 28266013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 309 - 509
Target Start/End: Original strand, 282240 - 282439
Alignment:
309 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 408  Q
    |||||||| ||||||||||  |||| |||| ||| |||||||| | |||| |   |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||    
282240 aaaatagttctaatcaatca-ttgacttagaaccctcttctcagattacaattactaattccttaggtgatctaatattcttcgaaggttttaagaacgt 282338  T
409 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 508  Q
    | || ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||    
282339 tgacataatatcaccaataaacaattatccattcctagactaaccatgtttattcgaacaattcaattaggtctaagtcaaaagttagggtcagtagtca 282438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 41078484 - 41078357
Alignment:
31 aaagttctaacagcagcagcaagttacaacaccaaaaaa-ctaaagcaaaataacaagggaagcacacacaaacagtccttgagtgctccctgttt---c 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||   |    
41078484 aaagttctaacagcagcagcaagttacatcaccaaaaaaactaaagcaaaataacaagggaagcacacacaa--agtccttgggtgctccctgtttctgc 41078387  T
127 tgcattgctgagacaaaaaactgaataaca 156  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||    
41078386 tgcactgctgagacaaaaaactgaataaca 41078357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 242 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 52990913 - 52990813
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| | |||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
52990913 tatgttcccctaattggtataccgcacctattcttgtgaatgagtctctagttttacgataattaacaaaatagtcgtaatcaatccattgagttaggac 52990814  T
342 c 342  Q
    |    
52990813 c 52990813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 393 - 486
Target Start/End: Original strand, 27308717 - 27308809
Alignment:
393 aaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagt 486  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
27308717 aaggttttaagaacgttaacctaatatcacaaataagcgattatctattcctagact-accatgtttatttgaacaactcaattaggtctaagt 27308809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 242 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 37408894 - 37408828
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
37408894 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattcactagttccacgatagttaac 37408828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 396 - 482
Target Start/End: Original strand, 27308157 - 27308243
Alignment:
396 gttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtct 482  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
27308157 gttttaagaacgttaacctaataacacaaataaacgattatctattccttgattaaccttgtttatttgaacaattcaattaggtct 27308243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 393 - 501
Target Start/End: Original strand, 27298594 - 27298702
Alignment:
393 aaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaag 492  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||   || | ||||||| ||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||    
27298594 aaggttttaagaacgttaacataatatcacaggtatatgattatctattcataaactaaccgtatttatttgaacaattcaattatgtctaagttgtaag 27298693  T
493 ctatggtca 501  Q
    ||| |||||    
27298694 ctagggtca 27298702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 242 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 6922733 - 6922682
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
6922733 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagt 6922682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 242 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10902153 - 10902094
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgat 301  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
10902153 tatgttcccctaattggtatattgcaccgattcttatgaatgattttctagttccacgat 10902094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 25486335 - 25486290
Alignment:
258 gtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatag 303  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
25486335 gtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatag 25486290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 31857910 - 31857847
Alignment:
271 attcttataaatgattttct---agttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatccctt 331  Q
    |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
31857910 attcttatcaatgattttcttctagttccacgatagttaacaaaatagttctaatcaattcctt 31857847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 427 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 6030840 - 6030758
Alignment:
427 aaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| | ||||| || |||||| || ||||| ||||||| | |||||||||||    
6030840 aaacaattattcattcctagactgaccatgtttaattgaacagttaaattagatccaagttgaaagctaagatcaatagtcat 6030758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 468 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 31857804 - 31857746
Alignment:
468 aattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
31857804 aattcaattaggtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 31857746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 457 - 509
Target Start/End: Original strand, 55032183 - 55032235
Alignment:
457 tttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||    
55032183 tttattagaacagttcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcat 55032235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 55)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 241 - 526
Target Start/End: Original strand, 5738077 - 5738362
Alignment:
241 ttatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagga 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5738077 ttatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagga 5738176  T
341 ccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccat 440  Q
    || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
5738177 ccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccat 5738276  T
441 tcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
5738277 tcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 5738362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 241 - 526
Target Start/End: Original strand, 3596774 - 3597059
Alignment:
241 ttatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagga 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3596774 ttatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagga 3596873  T
341 ccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccat 440  Q
    || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
3596874 ccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacattaacctaatatcactaacaaacgattatccat 3596973  T
441 tcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
3596974 tcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatttattctcactaaatca 3597059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 2379360 - 2379076
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2379360 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 2379261  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
2379260 cctcttctcaaactacagcctgtaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 2379161  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
2379160 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 2379076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 246 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 6513382 - 6513102
Alignment:
246 ttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatc 345  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
6513382 ttcccctaattgatatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggactctc 6513283  T
346 ttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcata 445  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
6513282 ttctcaaactacatcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacctaatatcactaataaacgattattcattcgta 6513183  T
446 gactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||  |||||||    
6513182 gactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcattctcatgaaatca 6513102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 241 - 506
Target Start/End: Original strand, 1125728 - 1125993
Alignment:
241 ttatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagga 340  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
1125728 ttatgttctcctaattggtatactggacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaaga 1125827  T
341 ccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccat 440  Q
    || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
1125828 ccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaaggattatccat 1125927  T
441 tcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagt 506  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||    
1125928 tcctagactaaccatgattattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtcagtagt 1125993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 13005319 - 13005035
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
13005319 tatgttcccctaattggtatacttcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttatgac 13005220  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
13005219 cctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaattttttaagtacgttaacctaatatcactaataaacgattatctatt 13005120  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| || |||||||  |||||| ||||||||    
13005119 cctagactaaccatgattattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagttatggccagtagtcattcattctcacgaaatca 13005035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 14281514 - 14281798
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
14281514 tatgttcccctaattgggatactgcacctattcttatgaatgattctcttgtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttaagttaggac 14281613  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
14281614 cctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacctaatatcactaataaacgattatcaatt 14281713  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||  |||||  ||||||||    
14281714 cctagactaaccatgtttattagaacaattgaattaggtctaagtcgaaagttatggtcagtagtcattcattctaacgaaatca 14281798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 9839388 - 9839672
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||    
9839388 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaagtagccctaatcaatcccttgacttaggac 9839487  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
9839488 cctcttctcaaactacagtccctaattccttaggtggtctaataatcttcgaaagttttacgaacgttaacttaatatcacaaataaacgattatccatt 9839587  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||  |||||| | ||||||    
9839588 cctagactaaccatatttatttgaacaattcaattaggtctaagtagaaagctatagtcagtagtcattcattctcactaaatca 9839672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 9954093 - 9953810
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
9954093 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaataattttctaattccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggac 9953994  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
9953993 cctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccatt 9953895  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
9953894 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 9953810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 20185874 - 20185591
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
20185874 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgacttaggac 20185775  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
20185774 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaatgttaacctaatatcactaataaacgattatccatt 20185676  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
20185675 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 20185591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 22150117 - 22150400
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
22150117 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgacttaggac 22150216  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
22150217 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaatgttaacctaatatcactaataaacgattatccatt 22150315  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
22150316 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 22150400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 30655574 - 30655290
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
30655574 tatgttcccctaattggtatactgcacttattcttatgaatgattctctagttccataatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgaattaggac 30655475  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
30655474 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 30655375  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| |||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
30655374 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagttatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 30655290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 242 - 507
Target Start/End: Original strand, 17106604 - 17106868
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
17106604 tatgttcccctaattggtatattgcacatattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggac 17106703  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
17106704 cctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaaaaaacgattatccatt 17106802  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtc 507  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| |||||||| |||||    
17106803 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagttatggtcagtagtc 17106868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 26942429 - 26942712
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26942429 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcctatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 26942528  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
26942529 cctcttctcaaattacagcccctaattccttaggtggtctaataaactttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 26942627  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||| | ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
26942628 cctagactaaccttgtttatcaaaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 26942712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 23384746 - 23385031
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
23384746 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgtttttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgatttaggac 23384845  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgat--tatcca 439  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
23384846 cctcttctcaaactacagcccctaattccttagttgttctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaataaacgattatatcca 23384944  T
440 ttcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
23384945 ttcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 23385031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 11402387 - 11402120
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11402387 tatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgtttttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 11402288  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||| | |||| |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
11402287 cctcttcttatactatatcccctaattccttaggtgttctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 11402188  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||||    
11402187 cctagattaaccctgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtcagtagtcat 11402120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 245 - 526
Target Start/End: Original strand, 22561160 - 22561441
Alignment:
245 gttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccat 344  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
22561160 gttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctggtttcacgatagtcaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccct 22561259  T
345 cttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcat 444  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |    
22561260 cttctcaaactacagcccctaattccttaggtgatctcataatctttgaaggttttacgaacgttaacttaatatcagaaataaacgattatccattcct 22561359  T
445 agactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||| || | |||||||  |||||| | ||||||    
22561360 agactaaccatgtttatttgaacaaatcaattaggtctaagtagaaagctattgttagtagtcattcattctcactaaatca 22561441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 10290102 - 10289819
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
10290102 tatgttccccgaattggtatactgcacttattcttatgaattattttttagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcctttaacttaggac 10290003  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
10290002 cttcttctcaaattacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacattaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 10289904  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
10289903 cctagactaaccttgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 10289819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 255 - 486
Target Start/End: Original strand, 28111773 - 28112003
Alignment:
255 ttggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttctcaaac 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
28111773 ttggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttctacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaac 28111872  T
355 tacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaacca 454  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
28111873 tacatcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagtacgttaacctaatatcactaataaacgattcttcattcctagactaacca 28111971  T
455 tgtttattagaacaattcaattaggtctaagt 486  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
28111972 tgtttattagatcaattcaatttggtctaagt 28112003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Original strand, 11125692 - 11125956
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
11125692 atgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgatct-ctagttccacgatagttaacaaaatagtcctgatcagtcccttgagttaggacc 11125790  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     ||||| ||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||    
11125791 ctcttcacaaactaaagcccatattttcttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaaccaaatatcagtaacaaacgattatccattc 11125889  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
11125890 ctagactaaccatgtttattaaaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 11125956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 248 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 2846428 - 2846148
Alignment:
248 cccctaattggtatactgcacatatt-cttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatct 346  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||| |||    
2846428 cccctaattggtatactgcacctatttcttacgaatgattctctagtttcacgatggttaacaaaatagccataatcaatcccttgacataggaccctct 2846329  T
347 tctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttt-aagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcata 445  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
2846328 tctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaatattctttgaaggttttaaagaacgttaacttaatatcacaaataaaagattatccattccta 2846229  T
446 gactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||  ||| || ||||||||    
2846228 gactaaccatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagctagggtcagtagtcattcattatcacgaaatca 2846148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 28107781 - 28108066
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28107781 tatgttcccctaattggtatactacagctattcttatgaatgattttctagttccacaatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 28107880  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataa---tctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatcc 438  Q
    | |||||||||||||||  || ||||| |||| ||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
28107881 cctcttctcaaactacaacccctaatttcttacgtggtctaataatattctttgaagg-tttaagtacgttaacctaatatgactaataatcgattatcc 28107979  T
439 attcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    ||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||  |||||| | ||||||    
28107980 attccatgactaaccgtgtttattagaacaattcaattaggtctaag-tcaaagctatgatcattagtcattcattctctctaaatca 28108066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 242 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 19476132 - 19475868
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
19476132 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgagtctctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcagtcccttgagttaggac 19476033  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     ||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
19476032 cctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttttaac-acgttaacctactatcactaataaaggattatccatt 19475934  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtc 507  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||    
19475933 cctaggctaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaaactatggtcagtagtc 19475868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 248 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 28230718 - 28230458
Alignment:
248 cccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatctt 347  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |  ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
28230718 cccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccctctt 28230619  T
348 ctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcataga 447  Q
    ||     ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
28230618 ctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattattcattcctaga 28230520  T
448 ctaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
28230519 ctaaccatgtttattagaacaaatcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 28230458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 24410428 - 24410162
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||  ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
24410428 tatgtttccctaattggtatactgcacctattcttgtgaacgattcactagttctacgatagttaacaaataagtcctaatcaatcccttgagtcaggac 24410329  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||| || |   ||||| || ||||||||||||||||||||||| | | | |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
24410328 cctctcctaaggttacagcccctaattccttaggtggtctaataaccgtcggaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccatt 24410230  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
24410229 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 24410162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 13947148 - 13946882
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
13947148 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaattaatcccttgagttatgac 13947049  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||      ||||  || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
13947048 cctcttcgagggttacaacccctaattccttaggtggtttaataacctttgaaggttt-aagcacgttaatctaatatcactaataaaggattatccatt 13946950  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||    
13946949 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagttatggtcagtagtcat 13946882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 245 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 11247889 - 11247608
Alignment:
245 gttcccctaattggtatactgcacatatt-cttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacca 343  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||  ||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||  | ||||||||||||||| |||| ||      
11247889 gttcccctaatttgtatactacacttatttcttacgaatgattctctagtttcatgatggttaacaaaatatccttaatcaatcccttgacttagaactc 11247790  T
344 tcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattca 443  Q
    |||| ||| | ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||     
11247789 tcttatcagattacagccc-taattccttaggtggtctaatattctttgaaggttttaagaacgttaacttaatatcacaaataaacgattattcattcc 11247691  T
444 tagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||| || |||||    
11247690 tagactaaccatgtttatttgaacaattcaattatgtctaagttgaaagctatggtcagtagtcattcattctcacgtaatca 11247608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 282 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 5260024 - 5259800
Alignment:
282 tgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtct 381  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||   || || || ||||||||||||    
5260024 tgattctctagtttcacgatggttaacaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttcttaaaatac---ccctattttcttaggtggtct 5259928  T
382 aataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtc 481  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
5259927 aatactctttgaaggttttaagaacgttaacttaatatcacaaataaacgattacccattcctagactaaccctgtttatttgaacaattcaattaggtc 5259828  T
482 taagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||    
5259827 taagttgaaagctatggtcagtagtcat 5259800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 242 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 7128429 - 7128190
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | || || |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7128429 tatgttcccctaattggtataatgcacatattattgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 7128330  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     ||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
7128329 cctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacatttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 7128231  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtct 482  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
7128230 cctagactaaccatgtttattagaacaattcagttaggtct 7128190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 24400309 - 24400043
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
24400309 tatgtttccctaattggtatactgcacctattcttgtgaacgattcactagttctacgatagttaacaaattagtcctaatcaatcccttaagtgaggac 24400210  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||| || |   ||||  || |||||||| |||||||||||||| | | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
24400209 cctctcctaaggttacaacccctaattcctcaggtggtctaataaccgtcgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccatt 24400111  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||    
24400110 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggttagtagtcat 24400043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Original strand, 18856019 - 18856285
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |  ||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
18856019 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttgcgatagttaacaatatagtcctaatcaatcccttgagttaggaa 18856118  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     ||||   | ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
18856119 cctcttctagggttacaactcctaatttcttaggtggtctgctaacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccatt 18856217  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
18856218 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 18856285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 270 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 23008163 - 23007932
Alignment:
270 tattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttctcaaactacagtccataattc 369  Q
    ||||||| | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | ||||| |  ||||||    
23008163 tattcttgtgaatgattctttagtttcacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttatcagattacagcctctaattc 23008064  T
370 cttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaa 469  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||     
23008063 cttaggtggtctaatattctttaaaggttttaagaacgttaacctgatatcacaaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttatttgaacag 23007964  T
470 ttcaattaggtctaagttaaaagctatggtca 501  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
23007963 ttcagttaggtctaagttgaaagttatggtca 23007932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 270 - 501
Target Start/End: Original strand, 23780201 - 23780432
Alignment:
270 tattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttctcaaactacagtccataattc 369  Q
    ||||||| | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | ||||| |  ||||||    
23780201 tattcttgtgaatgattctttagtttcacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttatcagattacagcctctaattc 23780300  T
370 cttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaa 469  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||     
23780301 cttaggtggtctaatattctttaaaggttttaagaacgttaacctgatatcacaaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttatttgaacag 23780400  T
470 ttcaattaggtctaagttaaaagctatggtca 501  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
23780401 ttcagttaggtctaagttgaaagttatggtca 23780432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 4512606 - 4512336
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
4512606 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattcattagttccacgataattaacaaaatagtcataatcaatccattgagttcggac 4512507  T
342 catcttctcaaactac----agtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatc 437  Q
    | ||||||     |||    || || ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||     
4512506 cctcttctagggttacttgtagcccctaattccttaggtggtctactaacttttgaaggttt-aagcatgttaacctaatatcactaataaatgattatt 4512408  T
438 cattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
4512407 cattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattcagtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 4512336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 318 - 526
Target Start/End: Original strand, 12988195 - 12988403
Alignment:
318 ctaatcaatcccttgagttaggaccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaat 417  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| || | |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||| ||| ||| |||| ||||    
12988195 ctaatcaatcccttgacttaggaccctcttcgcatattacagtccctaattccttaggtgatctaatattcttagaagatttgaagaacgctaacctaat 12988294  T
418 atcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctc 517  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||  ||||||    
12988295 atcacaaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttatttgaacaattcaattatgtctaagttgaaagttatggtcagtagtcattcattctc 12988394  T
518 gcgaaatca 526  Q
     ||||||||    
12988395 acgaaatca 12988403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 169
Target Start/End: Original strand, 12839157 - 12839330
Alignment:
3 taccaacattagcaaagtaaagaaatacaaagttctaacagcagcagcaag-------ttacaacaccaaaaaactaaagcaaaataacaagggaagcac 95  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
12839157 taccaactctagcaaagtaaagaaatacaaagttctaacagcagcaacaagcagcatgttacagcaccaaaagactaaaacaaaataacaagggaagcac 12839256  T
96 acacaaacagtccttgagtgctccctgtttctgcattgctgagacaaaaaactgaataacataggaagctaaag 169  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
12839257 acacaaacagtccttgggtgctccctgtttctgcactgctgatacaaaaaactgaataacatgggaagctaaag 12839330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 526
Target Start/End: Original strand, 13021249 - 13021532
Alignment:
245 gttcccctaattggtatactgcacatatt-cttataaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| || || |||  || |||||||  |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
13021249 gttcccctaattggtacactgcacctatttctcatgaatatttctctagttttacgatgattaactaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggacc 13021348  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||| | || ||||| ||| |||||| ||| ||||||| |||| |||| ||| ||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
13021349 ctcttctcagattatagtccctaactccttaagtgatctaatattcttagaagatttgaagaacattaacctaatatcacaaataaacgattatccattc 13021448  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||  |||||  ||||||||    
13021449 ctagactaacgatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagttatgatcagtagtcattcattcttacgaaatca 13021532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 288 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 28848926 - 28848691
Alignment:
288 tctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataa 386  Q
    |||||||  ||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||     
28848926 tctagttttacgatggttaactaaaatagtcctgataaatcccttgacttagggccctcttctcaaattacagtccctaattccttaggtgatctgatat 28848827  T
387 tctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagt 486  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||    
28848826 tctttgaaggttttgagaacgttaacctattatcacaaataaacgattatctattcctagactaaccttgtttatttgaacaattcaattaggtctgagt 28848727  T
487 taaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaa 522  Q
    | ||||||||| |||  ||||||  |||||| ||||    
28848726 tgaaagctatgttcagcagtcattcattctcacgaa 28848691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 56 - 168
Target Start/End: Original strand, 25993943 - 25994055
Alignment:
56 acaacaccaaaaaactaaagcaaaataacaagggaagcacacacaaacagtccttgagtgctccctgtttctgcattgctgagacaaaaaactgaataac 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
25993943 acaacaccaaaaaactaaagcaaaataacaagggaagcacacacaaacagtccttgggtgctccctgtttctgcactgctgagacaaaaaactgaataac 25994042  T
156 ataggaagctaaa 168  Q
    |||||||||||||    
25994043 ataggaagctaaa 25994055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 56 - 168
Target Start/End: Original strand, 25552777 - 25552889
Alignment:
56 acaacaccaaaaaactaaagcaaaataacaagggaagcacacacaaacagtccttgagtgctccctgtttctgcattgctgagacaaaaaactgaataac 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
25552777 acaacaccaaaaaactaaagcaaaaagacaagggaagcacacacaaacagtccttgggtgctccctgtttctgcactgctaagacaaaaaactgaataac 25552876  T
156 ataggaagctaaa 168  Q
    |||||||||||||    
25552877 ataggaagctaaa 25552889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 242 - 457
Target Start/End: Original strand, 26896253 - 26896467
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||  |||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||  |||    
26896253 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgattcactagttccacaataattaacaaaatagccataatcaatccattgagtttagac 26896352  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     ||||| || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
26896353 cctcttctagggttacagcccctaatttcttaggtggtctcataacctttgaagg-tttaagcacattaacctaatatcactaataaaggattatccatt 26896451  T
442 catagactaaccatgt 457  Q
    | |||| |||||||||    
26896452 cgtagagtaaccatgt 26896467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 242 - 356
Target Start/End: Original strand, 23842792 - 23842906
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
23842792 tatgttcccctaattgttatattgcacttattcttataaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcctttgagttaggac 23842891  T
342 catcttctcaaacta 356  Q
    | |||||||||||||    
23842892 cctcttctcaaacta 23842906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 399 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 2372295 - 2372169
Alignment:
399 ttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatgg 498  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    |    
2372295 ttaaatacgttaacctaatatcactaataaacgattattcattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagc----g 2372200  T
499 tcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgt 529  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
2372199 tcagtagtcatcaattctcacgaaatcacgt 2372169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 355 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 24371292 - 24371137
Alignment:
355 tacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaacca 454  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||     
24371292 tacagtccctaattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacattaacctattatcacaaataaacgattatccattcctagactaaccc 24371193  T
455 tgtttattagaac-aattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
24371192 ggtttatttgaacaaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtcat 24371137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 327 - 509
Target Start/End: Original strand, 11192657 - 11192844
Alignment:
327 cccttgagttaggaccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaat 426  Q
    ||||||| ||| |||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||    
11192657 cccttgacttaagactctcttctcagactacagtccctaattccttaggtgatctaatattctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcacaaat 11192756  T
427 aaacgattatccattcatagac----taaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagt-taaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    ||||||||||||| || |||||    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||    
11192757 aaacgattatccaatcctagactaattaaccctgtttatttgaacatttcaattaggtctaagtgtgaaacctatggtcagtagtcat 11192844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 158
Target Start/End: Original strand, 31387576 - 31387704
Alignment:
31 aaagttctaacagcagcagcaagttacaacaccaaaa-aactaaagcaaaataacaagggaagcacacacaaacagtccttgagtgctccctgttt---c 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||   |    
31387576 aaagttctaacagcagcagcaagttacatcaccaaaaaaactaaagcaaaataacaagggaagcacacacaa--agtccttgggtgctccctgtttctgc 31387673  T
127 tgcattgctgagacaaaaaactgaataacata 158  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
31387674 tgcactgctgagac-aaaaactgaataacata 31387704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 243 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 32109797 - 32109685
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
32109797 atgttcccctaatttgtatgctgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgataattaacaaaatagttctaatcaatcccttgagttatgacc 32109698  T
343 atcttctcaaact 355  Q
     ||||||||||||    
32109697 ctcttctcaaact 32109685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 6428614 - 6428766
Alignment:
1 actaccaacattagcaaagtaaagaaataca----aagttctaacagcagcagcaagttacaacaccaaaa-aactaaagcaaaataacaagggaagcac 95  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||    |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
6428614 actaccaactctagcaaagtaaagaaatacatacaaagttctaacagtagcatcaagttacatcaccaaaaaaactaaagcaaaataagaagggaagcac 6428713  T
96 acacaaacagtccttgagtgctccctgtttctgcattgctgagacaaaaaact 148  Q
    ||||||||| |  ||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
6428714 acacaaacatttgttgggtgcaccctatttctgcactgctgagacaaaaaact 6428766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 241 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 23847899 - 23847783
Alignment:
241 ttatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagga 340  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||     
23847899 ttatattcccctaattggtatactgcacctattct-atgaatgattttctagttccacaatagttaacaaaatagtcttaatcaatctcttgagttaggt 23847801  T
341 ccatcttctcaaactaca 358  Q
    |  |||||||||||||||    
23847800 ctctcttctcaaactaca 23847783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 242 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 2372383 - 2372293
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagtta 337  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2372383 tatgttcccctagttggtatactgcacatattcttatgaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagtta 2372293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 331 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 31072332 - 31072168
Alignment:
331 tgagttaggaccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaac 430  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||  | |||||||| ||| ||||||||              ||||    
31072332 tgagttagggctctcttctcaaactacagcccctaattttttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaac--------------aaac 31072247  T
431 gattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
31072246 gattatccattcctagaccagccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 31072168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 299 - 349
Target Start/End: Original strand, 23667721 - 23667771
Alignment:
299 gatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttct 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
23667721 gatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttct 23667771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 25991782 - 25991834
Alignment:
1 actaccaacattagcaaagtaaagaaatacaaagttctaacagcagcagcaag 53  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
25991782 actaccaactctagcaaagtaaagaaatacaaagttctaacaacagcagcaag 25991834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 242 - 316
Target Start/End: Original strand, 24155360 - 24155434
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |  ||||||  ||||||||||||||| ||||    
24155360 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaagtagt 24155434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 451 - 509
Target Start/End: Original strand, 26898071 - 26898129
Alignment:
451 accatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||| ||||| |||||||    
26898071 accatgtttattagaacaacttaattaggtctaattcgaaagctagggtcagtagtcat 26898129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 73)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 56195654 - 56195388
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
56195654 atgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggacc 56195555  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
56195554 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattc 56195455  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
56195454 ctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 56195388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 39501776 - 39501492
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
39501776 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcctttgagttaggac 39501677  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
39501676 cctcttatcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 39501577  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
39501576 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 39501492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 52530929 - 52531213
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
52530929 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctaattccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 52531028  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
52531029 cctcttctcaaactacatcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagagtgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 52531128  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||    
52531129 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtaaaaagctatggtcaatagtcattcattctcactaaatca 52531213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 244 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 24150798 - 24150516
Alignment:
244 tgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacca 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
24150798 tgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccc 24150699  T
344 tcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattca 443  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||     
24150698 tcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcc 24150599  T
444 tagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
24150598 tggactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 24150516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 5673023 - 5672739
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
5673023 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttgtgaatgcttttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggac 5672924  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
5672923 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 5672824  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
5672823 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaaactatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 5672739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 34017775 - 34018059
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
34017775 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctggttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttagaac 34017874  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
34017875 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 34017974  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
34017975 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 34018059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 40903077 - 40903361
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
40903077 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggac 40903176  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
      |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||    
40903177 tctcttctcaaactacagcccttaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaaggattatcaatt 40903276  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
40903277 cctagactaaccatgattattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 40903361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 242 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 18911626 - 18911368
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18911626 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 18911527  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
18911526 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctattatcactaacaaacgattatccatt 18911428  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtca 501  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
18911427 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtca 18911368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Original strand, 40616802 - 40617069
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40616802 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgcttttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 40616901  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
40616902 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaaaatcactaacaaacgattatccatt 40617001  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||| |||||||    
40617002 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctctctaagtagaaagctatggtcagtagtcat 40617069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Original strand, 44808950 - 44809216
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
44808950 atgttctcctaattggtatattgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggacc 44809049  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
44809050 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgatcatccattc 44809149  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
44809150 ctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 44809216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 5670705 - 5670438
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
5670705 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttgtgaatgcttttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggac 5670606  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
5670605 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 5670506  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||  ||| ||||||||| |||||||    
5670505 cctagactaaccctgtttattagaacaatttaattctgtctaagtagaaaactatggtcagtagtcat 5670438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Original strand, 15812131 - 15812398
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaa-tcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
15812131 atgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttctacaatagttaacaaaatagtcctaaatcaatctcttgagttaggac 15812230  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
15812231 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaaaaaacgattatccatt 15812330  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
15812331 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 15812398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Original strand, 34319912 - 34320178
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
34319912 atgttcccttaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctaattccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggacc 34320011  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
34320012 ctcttctcaaactaaagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaagttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattc 34320111  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
34320112 ctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 34320178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 12238392 - 12238126
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
12238392 atgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttagaacc 12238293  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||| | |||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
12238292 ctcttctcagattacagtctctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaaacacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattc 12238193  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
12238192 ctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 12238126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 48637633 - 48637349
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48637633 tatgtttccctaattggtatactgcacctatgcttatgaatgattttctaattccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 48637534  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaat-aatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccat 440  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
48637533 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataaatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccat 48637435  T
441 tcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
48637434 tcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 48637349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 27014391 - 27014107
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
27014391 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcctttgagttaagac 27014292  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
27014291 cctcttctcaaactacagcccctgattccttaggtggtctaataatctttgaaagttttaagaacgttagcctaatatcactaataaaggattatccatt 27014192  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
27014191 cctagactaaccatgattattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 27014107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 48415523 - 48415807
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
48415523 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagtcaggac 48415622  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
      ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
48415623 tctcttctcaaactacagctcctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcaataataaatgattatccatt 48415722  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
48415723 cctagactaaccattattattagaaaaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 48415807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 52006525 - 52006808
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
52006525 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgacttaagac 52006624  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
52006625 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgtcaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 52006723  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
52006724 cctagactaaacctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 52006808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 5681554 - 5681289
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5681554 atgttcccttaattggtatactgaaactattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 5681455  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
5681454 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctagtatcactaacaaacgattatccattc 5681356  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
5681355 ctacactaaccatgcttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 5681289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 244 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 19820853 - 19820572
Alignment:
244 tgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacca 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
19820853 tgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggaccc 19820754  T
344 tcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattca 443  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||     
19820753 tcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcatcttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcc 19820655  T
444 tagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||| |||| |||||||  |||||| | ||||||    
19820654 tagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatagtcagtagtcattcattctcactaaatca 19820572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 44164910 - 44164627
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
44164910 tatgttcccctaattggtatactacacatattcttatgaatgattttatagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgacttaggac 44164811  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
44164810 cctcttctcaaactacaatccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcaggttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 44164712  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||| |||| |||||||  |||||| | ||||||    
44164711 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaagctatagtcagtagtcattcattctcactaaatca 44164627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 56198980 - 56198714
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
56198980 atgttcccctaattggtatactgcacctatttgtattaatcattttctagttctaagatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 56198881  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     ||||||| |||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
56198880 ctcttctctaactacaacccctgattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcatgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattc 56198781  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
56198780 ctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 56198714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 249 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 29324946 - 29324686
Alignment:
249 ccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttc 348  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
29324946 ccctaattggtatattgcacctattcatattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttatgaccattttc 29324847  T
349 tcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagac 448  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
29324846 tcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagac 29324747  T
449 taaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
29324746 taaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 29324686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 243 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 15432205 - 15431923
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
15432205 atgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagtaccacgatagttaacaaaatagttctaatcaatcccttgagttaggacc 15432106  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
15432105 ctcttctcaaactacatcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaatctaatatcactaacaaacgattatccattc 15432007  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||| |||||||  |||||| | ||||||    
15432006 ctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatgatcagtagtcattcattctcactaaatca 15431923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 241 - 509
Target Start/End: Original strand, 27677048 - 27677315
Alignment:
241 ttatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagga 340  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
27677048 ttatgttcctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccaccatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttagaa 27677147  T
341 ccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccat 440  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
27677148 ccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcgctaacaaacgattatccat 27677246  T
441 tcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    || |||||||||| |||||||||||| |||| ||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||    
27677247 tcctagactaaccttgtttattagaataatttaattttgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcat 27677315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 12783032 - 12782766
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
12783032 tatgttcctctaattggtatactgcacctattcttataaatgattttctagtttcattagagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggac 12782933  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | | |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
12782932 ccttttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatccctaacaaacgattatccatt 12782834  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||    
12782833 catagactaaccctgtttattagaacaattcaattccgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcat 12782766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 242 - 499
Target Start/End: Original strand, 24044135 - 24044391
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
24044135 tatgttcccctaattggtatactacacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggac 24044234  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
      |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
24044235 actcttctcaaactacagcccctaatttcttaggtggtctaataatctttaaagg-tttaaacacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 24044333  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggt 499  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||    
24044334 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggt 24044391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 250 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 49270799 - 49270544
Alignment:
250 cctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttct 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
49270799 cctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattatctagttcaacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc-ttgagttaggaccctcttct 49270701  T
350 caaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagact 449  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||    
49270700 caaactacagtccctaattccctaggtggtctaataat---tgaaggttttaagaatgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcatatact 49270604  T
450 aaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||    
49270603 aaccatgtttatgagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatgatcagtagtcat 49270544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 242 - 506
Target Start/End: Original strand, 19859516 - 19859779
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
19859516 tatgatcccctaattggtatactgcacatattcttatgaattattttctagttccacgataattaataaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggac 19859615  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
19859616 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcatgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 19859714  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagt 506  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| | ||||| || |||||  ||||||||||||| ||||    
19859715 cctagactaaccatgtttattaaaacaacttaattaagtttaagtagaaagctatggtcagtagt 19859779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 37103210 - 37103492
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||    
37103210 tatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcctttgacttagaac 37103309  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
37103310 cctcttctcaaactacagcccctaattcctttggtggtctaataatcttcgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 37103408  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
37103409 cctagactaacc-tgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 37103492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 40795130 - 40794846
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||| |||    
40795130 tatgtttccctaattggtatactacacctattcttatgaatgattttctagttacacgatagttaacagaatagtcctgatcaattccttgacttaagac 40795031  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
40795030 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 40794931  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||  |||| |||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
40794930 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtttaagtagaaagttatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 40794846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Original strand, 3797802 - 3798068
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
3797802 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttattaatgattcactagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaagac 3797901  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
3797902 cctcttctcacactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcatt 3798000  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||||| |||||||    
3798001 cctagattaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaaatagaaagctatggtcagtagtcat 3798068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Original strand, 46955473 - 46955739
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
46955473 atgttcccctaattggtatactgcacctatttgtattaatgattctctaattcaacgatagttaacaaaatagctctaatcaatcccttgagttaggacc 46955572  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
46955573 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggactaataatctttgaatgttttaaaaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattc 46955672  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||| |||||||    
46955673 ctagattaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaaatcgaaagttatggtcagtagtcat 46955739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 246 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 15164317 - 15164053
Alignment:
246 ttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatc 345  Q
    |||| |||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
15164317 ttcctctaattggtatattgcccctattcttatgaatgattatctagttccatgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctc 15164218  T
346 ttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatcca-ttcat 444  Q
    |||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
15164217 ttcttaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcagattaacctaatatcactaacaaacgattatccatttcct 15164118  T
445 agactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
15164117 agactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctaaggtcagtagtcat 15164053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 243 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 3719250 - 3718968
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
3719250 atgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgatttgctagttccacaatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttggcttaggacc 3719151  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
3719150 ctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaa-gatttaaacacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattc 3719052  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| || ||||  |||||| | ||||||    
3719051 ctagactaaccctgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaagctatggtcagtaatcattcattctcactaaatca 3718968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 245 - 509
Target Start/End: Original strand, 15405078 - 15405345
Alignment:
245 gttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccat 344  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |    
15405078 gttcccctaattgatatactgcacctatttgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatccattgagttaggaccct 15405177  T
345 cttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatcc---att 441  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||   |||    
15405178 cttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattatt 15405277  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
15405278 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattcggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 15405345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 242 - 507
Target Start/End: Original strand, 15429850 - 15430114
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||    
15429850 tatgttcccctaattggtatactacacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatccatcccttgacttgggac 15429949  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    |  ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
15429950 ccacttctcaaactactgcccctaattccttaggtggtctaattatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaaaaaacgattatccatt 15430048  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtc 507  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| |||||||| |||||    
15430049 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagttatggtcagtagtc 15430114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 243 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 33927099 - 33926834
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
33927099 atgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccataatcaatcccttgagttaggacc 33927000  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||  |  ||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
33926999 ctcttctaaaactacagcccctaattcctcaggtggtctaataattctcaaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattc 33926900  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 508  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||||||    
33926899 ctagactaatcatgtttattagaacagttcaattagatctaagtcgaaagctagggtcagtagtca 33926834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 242 - 475
Target Start/End: Original strand, 38283483 - 38283715
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
38283483 tatgttcccctaattggtatactgcatctattcttatgaatgattttctagttccatgatagtaaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggac 38283582  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
      |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
38283583 tctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttt-agcacgttaacctaatatcactaacaaaggattatccatt 38283681  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaat 475  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
38283682 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaat 38283715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 242 - 506
Target Start/End: Original strand, 19864511 - 19864770
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19864511 tatgatcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttc----atagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 19864606  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
19864607 cctcttctcaaactacagcccctaatttcttagatggtctaataatctttgaagg-tttaagcatgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 19864705  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagt 506  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| | ||||| || |||||  ||||||||||||| ||||    
19864706 cctagactaaccatgtttattaaaacaacttaattaagtttaagtagaaagctatggtcagtagt 19864770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 242 - 507
Target Start/End: Original strand, 15436464 - 15436728
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||    
15436464 tatgttcccctaattggtatactacacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatccatcccttgacttgggac 15436563  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    |  ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||    
15436564 ccacttctcaaactactgcccctaattccttaggtggtctaattatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcaataaaaaacgattatacatt 15436662  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtc 507  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| |||||||| |||||    
15436663 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagttatggtcagtagtc 15436728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 245 - 526
Target Start/End: Original strand, 33408314 - 33408595
Alignment:
245 gttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccat 344  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
33408314 gttcccctaatcggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatggttaataaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccct 33408413  T
345 cttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcat 444  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |    
33408414 cttctcaaactataacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttacgaacgttaacttaatatcacaaataactgattatctattcct 33408513  T
445 agactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||| || ||||  |||||| | ||||||    
33408514 agactaacaatgtttatttgaacaactcaattaggtctaagtagacagctatggtcagtaatcattcattctcactaaatca 33408595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Original strand, 18673076 - 18673342
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18673076 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 18673175  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
18673176 cctcttctagggttaaagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 18673274  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||    
18673275 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattacgtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 18673342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 11195803 - 11195537
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
11195803 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattcactagttccacgatagttaacaaaacagtcctaatcaatcccttgagttaggac 11195704  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||    
11195703 cctcttctagggttaaagcccctaatttcttaggtggtctaataacctttgaagg-tttaggcacgttaacctattatcactaataaatgattattcatt 11195605  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
11195604 cctaaactaaccatgtttattagaacaattcaagtaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 11195537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 30392696 - 30392430
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
30392696 tatgttcccctaattggtatattgcacctatttttatgaatgattcgctagttccacgatagttaacaaaataatcctaatcaatcccttgaattaggac 30392597  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     ||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
30392596 cctcttctagggttacaacccctaattcctaaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaagtattattcatt 30392498  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||    
30392497 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaattcaaaagctagggtcagtagtcat 30392430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 245 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 53094633 - 53094371
Alignment:
245 gttcccctaattggtatactgcacatatt-cttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacca 343  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
53094633 gttcccctaattggtatactgcacctatttcttacgaatgattctctagtttcacgatgattaacaaaataggcctaatcaatcccttgacttaggaccc 53094534  T
344 tcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattca 443  Q
    |||||||| | ||||  || ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||     
53094533 tcttctcatagtacaacccctaactccttaggtggtctaatactctttgaatgttttatgaacgttaacttaatatcagaaataaacgattatccattcc 53094434  T
444 tagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagt 506  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
53094433 tagactaaccctgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaaactatggtcagtagt 53094371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Original strand, 53009552 - 53009818
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
53009552 tatgttcccctaattagtatactgcacctattcttgtgaatgattcactagttccacgatagttaacaaaatagtcctaattaatctcttgagttaggac 53009651  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     ||||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||  |||    
53009652 cctcttctagggttacagcccctaatttcttaggtggtctaataaccgttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaataaatggttataaatt 53009750  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
53009751 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 53009818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 245 - 509
Target Start/End: Original strand, 8877497 - 8877762
Alignment:
245 gttcccctaattggtatactgcacatatt-cttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacca 343  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||| ||||| ||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||      
8877497 gttcccctatttagtatactgcacctatttcttatgaatgactctctagtttcacgatggttaacaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggactc 8877596  T
344 tcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattca 443  Q
    |||||||  |  |||  || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
8877597 tcttctccgatcacaacccctaatttcttaggtggtctaatattctttgaaggttttaagaatgttaacttaatatcacaaataaacgattatccattcc 8877696  T
444 tagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||    
8877697 tagactaaccatgtttatttgaacaattcaattaaatctaagttgaaagctatggtcagtagtcat 8877762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 243 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 21419915 - 21419652
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||| | |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
21419915 atgttcccctaattggtataccacacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaacc 21419816  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     ||||||     ||||   | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
21419815 ctcttctagggttacatcacctaattccttaggtggtctaataaccgttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaagattatccattc 21419717  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtc 507  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||    
21419716 ctagactaaccatgcttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtc 21419652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 25962185 - 25961919
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
25962185 atgttctcctaattggtataccgcacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaacaaaatattcctaatcaatcccttgagttaggacc 25962086  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaa-taatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
     ||||||     ||||| || |||||||||||||||||||| ||| | | ||| |||| ||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
25962085 ctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaaataaccgtcgaatgttt-aagcacgttaagctaatatcactaataaaggattatccatt 25961987  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
25961986 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 25961919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Original strand, 40493362 - 40493628
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttga-gttaggac 341  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
40493362 atgttcccctaattggtataccacacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaaaaaaatagtcctaatcaatcccttgaagttacgac 40493461  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     ||||  || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
40493462 cctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataaccgttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatacatt 40493560  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
40493561 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 40493628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 260 - 509
Target Start/End: Original strand, 8874772 - 8875022
Alignment:
260 atactgcacatatt-cttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttctcaaactaca 358  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||| | |||||||||  |||| |||| ||| |||||||  | ||||    
8874772 atactgcacctatttcttatgaatgattctctagtttcaagatggttaacaaaatagccataatcaatcgattgacttagaaccctcttctccgattaca 8874871  T
359 gtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtt 458  Q
    | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
8874872 gcccctaattccttaggtggtctaatattctttgaaggttttaagaacattaacttaatataacaaataaacgactatccattcctagactaaccatgtt 8874971  T
459 tattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
8874972 tatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcggtagtcat 8875022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 297 - 522
Target Start/End: Original strand, 22172422 - 22172648
Alignment:
297 acgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaag 395  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||  |||||| |||| ||||    
22172422 acgatagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaggaccctcttctcagattacagtccctaattccttaggtgaactaatattcttcgaag 22172521  T
396 gttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagcta 495  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
22172522 gttttaagaacgttaacctaatatcgcaaataaacgattatccattcatagactaaccctgtttatttgaacaattcaataaggtctaagttgaaagcta 22172621  T
496 tggtcaatagtcatcaattctcgcgaa 522  Q
    |||||| || ||||  |||||| ||||    
22172622 tggtcagtaatcattcattctcacgaa 22172648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Original strand, 29544869 - 29545134
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||| || | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||     
29544869 atgttcctctaattggtatattgcacctattattgtgaatgattaactagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttatgact 29544968  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||| |     ||||  || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
29544969 ctcttatagggttacaacccctaattccttaggaggtctaataacctttgaaggttt-aagcacattaacctaatatcactaataaaggattatccattc 29545067  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||    
29545068 ctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtgtaagtcaaaagttagggccagtagtcat 29545134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 292 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 35510042 - 35509826
Alignment:
292 gttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatcttt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     ||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||    
35510042 gttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataaccatt 35509943  T
392 gaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaa 491  Q
     ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
35509942 aaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaacgatgtttattagaacaattcaattaggtctaattcgaaa 35509844  T
492 gctatggtcaatagtcat 509  Q
    |||| ||||| |||||||    
35509843 gctagggtcagtagtcat 35509826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 304 - 506
Target Start/End: Original strand, 15446792 - 15446993
Alignment:
304 ttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaag 403  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||    
15446792 ttaaccaaatagttataatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtccaataatcttagaaggttt-aag 15446890  T
404 tacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaat 503  Q
     |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| |||||||| |    
15446891 cacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgtttattagaacaattcaattcagtctaagtagaaagttatggtcagt 15446990  T
504 agt 506  Q
    |||    
15446991 agt 15446993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 526
Target Start/End: Original strand, 37739754 - 37740040
Alignment:
245 gttcccctaattggtatactgcacatat-tcttataaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||| |||  || ||||||| |||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
37739754 gttcctctaattggtacactgcacctatgtcttatgaatatttctctagtttcacgatggttagctaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggacc 37739853  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaac---ttaatatcactaataaacgattatcca 439  Q
     |||| ||| | ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||    ||||||||| ||||||||||||||||    
37739854 ctcttatcagattactgtccctaattccttaggtgatctaataatctttgaaggttttacaaacattaacctaataatatcacaaataaacgattatcca 37739953  T
440 ttcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    |||||||| |||||  ||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||  |||||| ||||||||    
37739954 ttcatagattaacccagtttatttgaaaaattcgattaggtctaagttgaaagctatggttagtagtcattcattctcacgaaatca 37740040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 5024091 - 5023930
Alignment:
1 actaccaacattagcaaagtaaagaaatacaaagttctaacagcagcagcaagttacaacaccaaaaaactaaagcaaaataacaagggaagcacacaca 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5024091 actaccaactctagcaaagtaaagaaatacaaagttttaacagcagc-------tacatcaccaaaaaactaaagcaaaataacaagggaagcacacaca 5023999  T
101 aacagtccttgagtgctccctgtttctgcattgctgagacaaaaaactgaataacataggaagctaaag 169  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
5023998 aacagtccttaggtgctccctgtttctgcactgctgagacaaaaaaccgaataacatatgaagctaaag 5023930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 243 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 5706519 - 5706347
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaat-agtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
5706519 atgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaataagtcctaatcaatcccttgagttaggac 5706420  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataa-tctttg-aaggttttaag-tacgttaa 411  Q
      |||||||| | |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
5706419 actcttctcagattacagtccctaattccttaggtgagctaataattctttgtaaggttttaagctacgttaa 5706347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 309 - 509
Target Start/End: Original strand, 33493756 - 33493956
Alignment:
309 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 408  Q
    |||||||||||| | ||| |||| | ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||    
33493756 aaaatagtcctatttaattccttaacttaggaccatcttctcagattacagtccctaattccttaggtgatctaatattctttgaatgtttaaagaacgt 33493855  T
409 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 508  Q
    |||| || |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||    
33493856 taacatattatcacaaataaacgattatctattcctagactaactctgtttatttgaacaattcaattaggtctaaattgtaagctatggtcagtagtca 33493955  T
509 t 509  Q
    |    
33493956 t 33493956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 1933659 - 1933821
Alignment:
1 actaccaacattagcaaagtaaagaaatacaaagttctaacagcagcagcaagttacaacaccaaaa-aactaaagcaaaataacaagggaagcacacac 99  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||       |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
1933659 actaccaactctagcaaagtaaagaaatacaaagttataacaacagc-------tacatcaccaaaaaaactaaagcaaaataacaagggaagcacacac 1933751  T
100 aaacagtccttgagtgctccctgtttctgcattgctgagacaaaaaactgaataacataggaagctaaag 169  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
1933752 aaacagtccttgggtgctccctatttctgcactgctgagacaaaaaaccgaataacataggaagctaaag 1933821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 364 - 526
Target Start/End: Original strand, 27679341 - 27679502
Alignment:
364 taattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttatta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
27679341 taattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccttgtttatta 27679439  T
464 gaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    |||||||||||||  || |||||  ||||||||| ||| |||||||  |||||| | ||||||    
27679440 gaacaattcaattctgtataagtagaaagctatgttcagtagtcattcattctcactaaatca 27679502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 367 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 19827492 - 19827334
Alignment:
367 ttccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
19827492 ttccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaa 19827394  T
467 caattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    |||||| |||  ||||||||  ||||||||||| | |||||||  |||||| | ||||||    
19827393 caattccattcagtctaagtagaaagctatggttagtagtcattcattctcactaaatca 19827334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 364 - 506
Target Start/End: Original strand, 48014168 - 48014310
Alignment:
364 taattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttatta 463  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||     
48014168 taattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaatgtcacaaataaacgattatccattcctaaactaaccctgtttattt 48014267  T
464 gaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagt 506  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||    
48014268 gaacaattcaattaggtcaaagttgaaagttatggtcagtagt 48014310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 158
Target Start/End: Original strand, 22735702 - 22735826
Alignment:
36 tctaacagcagcagcaagttacaacaccaaaa-aactaaagcaaaataacaagggaagcacacacaaacagtccttgagtgctccctgttt---ctgcat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||   |||||     
22735702 tctaacagcagcagcaagttacatcaccaaaaaaactaaagcaaaataacaagggaagcacacacaa--agtccttgggtgctccctgtttctgctgcac 22735799  T
132 tgctgagacaaaaaactgaataacata 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
22735800 tgctgagacaaaaaactgaataacata 22735826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 245 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 39498434 - 39498346
Alignment:
245 gttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttga 333  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39498434 gttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttga 39498346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 148
Target Start/End: Original strand, 26093834 - 26093975
Alignment:
12 tagcaaagtaaagaaa----tacaaagttctaacagcagcagcaagttacaacaccaaaa-aactaaagcaaaataacaagggaagcacacacaaacagt 106  Q
    ||||||||||||||||    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
26093834 tagcaaagtaaagaaacacatacaaaattctaacagtagcagcaagttacatcaccaaaaaaactaaagcaaaataacaagggaagcaaacacaaacatt 26093933  T
107 ccttgagtgctccctgtttctgcattgctgagacaaaaaact 148  Q
    | ||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
26093934 cgttgggtgcaccctgtttctgcactgctaagacaaaaaact 26093975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 287 - 433
Target Start/End: Original strand, 5677447 - 5677594
Alignment:
287 ttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaata 385  Q
    |||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||| |||||||    
5677447 ttctagtttcacgatggctaactaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggaccatcttctcagattacagtccctaattccttaagtgatctaata 5677546  T
386 atctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgat 433  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| |||| |||||    
5677547 ttctttgaaggttttaaggacgttaaccttgtatcacaaatatacgat 5677594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 242 - 313
Target Start/End: Original strand, 15445359 - 15445430
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
15445359 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctacttccacgatagttaacaaaat 15445430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 246 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 35510115 - 35510043
Alignment:
246 ttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcc 318  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
35510115 ttcccctaattggtatactacacctattcttatgaatgattcactagttccacgttagttaacaaaatagtcc 35510043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 242 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 19827543 - 19827489
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttcc 296  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
19827543 tatgttcccctaattggtataatgcacatattcttatgaatgattttctagttcc 19827489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 446 - 486
Target Start/End: Original strand, 24410206 - 24410246
Alignment:
446 gactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagt 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24410206 gactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagt 24410246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 346 - 440
Target Start/End: Original strand, 8448654 - 8448748
Alignment:
346 ttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccat 440  Q
    ||||| |||||||| || ||||| | |||||| ||||||||||||| ||||| |||   |||||||  ||||||||| || ||| ||||||||||    
8448654 ttctccaactacagcccctaatttcataggtgatctaataatctttaaaggtattacaaacgttaagctaatatcacaaacaaaggattatccat 8448748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 3782 - 4066
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3782 tatgttaccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 3881  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
3882 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacattaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 3981  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
3982 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 4066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 37)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 14421871 - 14421603
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattctta-taaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagga 340  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14421871 tatgttcccctaattgatatactgcacctattcttactgaatgattttttagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagga 14421772  T
341 ccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccat 440  Q
    || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
14421771 ccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctgataatctttgaaggttttaagaacgttaacctagtatcactaataaaggattatccat 14421672  T
441 tcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
14421671 tcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtcat 14421603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Original strand, 45155263 - 45155530
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
45155263 tatgttcccctaattggtatattgcacctattcttatgaatgattctctagtttcgcgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaagac 45155362  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
45155363 cctcttctcaaactaaaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaagttttaagtacgttaacctaatatcactaataaacgattatccatt 45155462  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
45155463 cctagactaaccatgtttaatagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 45155530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 18721275 - 18721559
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
18721275 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttatgac 18721374  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
      |||||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
18721375 tctcttctcatactacagcccctaatttcttagttggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 18721474  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
18721475 cctagactaaccatgtttattagaataattcaattttgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 18721559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 25591473 - 25591756
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
25591473 tatgttcccctaattggtatactgcacctatttttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaagac 25591572  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
      |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
25591573 tctcttctcaaactacagcccctaattccttagatggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaaggattatccatt 25591672  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
25591673 cctagactaaccatgattattagaacaattcaattttgtctaag-taaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 25591756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Original strand, 18824389 - 18824655
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
18824389 atgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgatcttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggacc 18824488  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
18824489 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattc 18824588  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
18824589 ctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 18824655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 25231206 - 25230922
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
25231206 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggac 25231107  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||||||||| || |  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
25231106 cctcttctcaaactaaagcctctaattccttgggtgttctaataatatttgaaggttttaagtatgttaacctaatatcactaataaacgattatccatt 25231007  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| |||||||  |||||| ||||||||    
25231006 cctaagctaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagttacggtcagtagtcattcattctcacgaaatca 25230922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 38248393 - 38248676
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
38248393 tatgttcccctaattggtatattgcacatattcttatgaatgattctctagttccacgatagctaacaaaatagtcctaatcaatctcttgagttaggac 38248492  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
      |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      
38248493 attcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaagtttt-agtacgttaacctaatatcactaataaacgattatccaaa 38248591  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||    
38248592 cctagactatctatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgtaagctatggtcagtagtcattcattctcacgaaatca 38248676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Original strand, 18825882 - 18826148
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
18825882 atgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgatcttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggacc 18825981  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
18825982 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattc 18826081  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
18826082 ctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 18826148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Original strand, 36710631 - 36710897
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
36710631 atgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggacc 36710730  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
36710731 ctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattc 36710830  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||    
36710831 ctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtccaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 36710897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 246 - 526
Target Start/End: Original strand, 25594655 - 25594935
Alignment:
246 ttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatc 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
25594655 ttcccctaattagtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaagactctc 25594754  T
346 ttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcata 445  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
25594755 ttctcaaactacagcccataattccttagatggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcagtaataaaggattatccattccta 25594854  T
446 gactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
25594855 gactaaccatgattattagaacaaatcaattttgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 25594935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 12583133 - 12582850
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
12583133 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttgacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggac 12583034  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||    
12583033 cctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtgtaataatctttgaagg-tttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacaattatctatt 12582935  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
12582934 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 12582850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 23643944 - 23643678
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
23643944 atgttcccctaattggtatactgcacttctttgtatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatctcttgagttatgacc 23643845  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||| | ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
23643844 ctcttctcagattacagcctctaattccttaggtggtctaataatctttaaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattc 23643745  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
23643744 ctagactaaacatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcaaaagctagggtcagtagtcat 23643678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 246 - 501
Target Start/End: Original strand, 12516450 - 12516706
Alignment:
246 ttcccctaattggtatactgcacatattcttata-aatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccat 344  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
12516450 ttcccctaattggtatactgcacctattcttttggaatggttttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccct 12516549  T
345 cttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcat 444  Q
    ||||| | | |||| ||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |    
12516550 cttcttagattacaatccctaattccttagttgatctaatattctttgaaggttttatgcactttaacataatatcactaacaaacgattatccattcct 12516649  T
445 agactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtca 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12516650 agactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtca 12516706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 16953902 - 16953618
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16953902 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 16953803  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
16953802 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggcggtctaataattctcgaaggtttaaagcacattaacctaatatcattaacaaacgattatccatt 16953703  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| | |||||||  |||||| | ||||||    
16953702 cctagactaaccctgtttataagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtaagtagtcattcattctcactaaatca 16953618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 245 - 509
Target Start/End: Original strand, 43681867 - 43682131
Alignment:
245 gttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccat 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
43681867 gttcccctaattggtatactacacttattcttatgaatgattttctagttccacaatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccct 43681966  T
345 cttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcat 444  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |    
43681967 cttctcatattacagtccctaattccgtaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcatgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcct 43682066  T
445 agactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||    
43682067 agactaaccatgtttattagaacatttcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcggtagtcat 43682131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 10664024 - 10663758
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
10664024 tatgtttccctaattggtatactacacctattcttatgaatgattctctagttctatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaac 10663925  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
10663924 cctcttctcaaactacagcccttaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacattaacctagtatcactaataaaggattatccatt 10663826  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||||    
10663825 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtcagtagtcat 10663758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Original strand, 22173918 - 22174184
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| ||| ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
22173918 atgttcccctaattggtatactacacctatttgtattaattattctctaattcaacgttagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggacc 22174017  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
22174018 ctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattc 22174117  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
22174118 ctagattaaccatgtttattagaacaatttaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 22174184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Original strand, 5980307 - 5980573
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
5980307 tatgttcccttaattggtatactacacctattcttatggatgattttctagttccacaatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggac 5980406  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||     
5980407 cctcttctcaaactacagtccgtaatttcttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccata 5980505  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
      |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||    
5980506 tctagactaaacttgtttattagaacaagtcaattaggtctaagtcgaaagttatggtcagtagtcat 5980573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 243 - 486
Target Start/End: Original strand, 21279764 - 21280006
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
21279764 atgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttacatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaagact 21279863  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
21279864 ctcttcttaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcatgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattc 21279962  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagt 486  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21279963 ctagaccaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagt 21280006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 17931105 - 17930840
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
17931105 atgtttccgtaattggtatattgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttacgacc 17931006  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  | |||||||||| ||||||||||||||||    
17931005 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttgatcttatatcactaacaaacgattatccattc 17930907  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
17930906 ctatactaaccatgtttactagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 17930840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 13196982 - 13196716
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
13196982 tatgttctcttaattggtatactgcacttattcttatgaatgattttctagttccaagatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggac 13196883  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||| |||||||  || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
13196882 cctcttctcgaactacaacccctaatttcttaggtagtctaataatctttgaagg-tttgagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 13196784  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||  |||||||    
13196783 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtttaagtcgaaagttatggtcggtagtcat 13196716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 242 - 507
Target Start/End: Original strand, 10498208 - 10498472
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10498208 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 10498307  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
10498308 cctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagtacgttaacctaatatcactaataaaggattatccatt 10498406  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtc 507  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||    
10498407 ccaagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatgatcagtagtc 10498472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Original strand, 5538768 - 5539034
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
5538768 atgttccccaaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttgcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcctttgagttagaacc 5538867  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||||||||||  || ||||||| |||||||| || | |||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
5538868 ctcttctcaaactacaacccctaattccgtaggtggtttagtgatctttgaaggttttatgcacattaacctaatatcactaacaaacgattattcattc 5538967  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||    
5538968 ctagactaatcatgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcat 5539034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 245 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 8911771 - 8911506
Alignment:
245 gttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccat 344  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| |    
8911771 gttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgattcactagttctatgatagttaacaaaatagtcctaataaatccctcgagtttagaccct 8911672  T
345 cttctcaaactacagtcca-taattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattca 443  Q
    |||||    |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||     
8911671 cttctagggctacaaccccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttttaagcacgttaacataatatcactaataaaggattatgcattcc 8911572  T
444 tagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
8911571 tagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 8911506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 31284799 - 31284533
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| |  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31284799 tatgttcccctaattggtataccgcacctattcttgtgaatgagtccctagttctatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 31284700  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     ||||  || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
31284699 cctcttctagggttacatcccctaattccttaggtggtctaataaccgttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccatt 31284601  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||    
31284600 cctagactaaccatgtttattacaacaattcaattaggtctaagtcgaaggctatggtcagtagtcat 31284533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 241 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 33419782 - 33419498
Alignment:
241 ttatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagga 340  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
33419782 ttatgttcccctaatttgtatactgcacctattcttatgaatgattcactagttccacgatagttaacaaaatattcataatcaatcccttgagttagga 33419683  T
341 ccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccat 440  Q
    || ||||||     ||||  || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| |  |||||||||||||||| |||||| |||    
33419682 ccctcttctagggttacaacccctaattccttatgtggtctaataacctttgaaggttt-aagcatgtttatctaatatcactaataaaggattatacat 33419584  T
441 tcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| |||||||  |||||| | ||||||    
33419583 tcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattcggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcattctcactaaatca 33419498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 251 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 2560669 - 2560411
Alignment:
251 ctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagtt-aggaccatcttct 349  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |||  ||||||    
2560669 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattatctagttccacgatagttaacaaaatagccataatcaatcacttgagtttaagactctcttct 2560570  T
350 caaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagact 449  Q
    || | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
2560569 cagattacac-ccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggctttaagcacgttaaactaatatcattaataaaggattatccattcctagact 2560471  T
450 aaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | ||||||| |||||||    
2560470 aaccatctgtattagaacaattcagttaggtctaagtcgaaaaccatggtcagtagtcat 2560411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Original strand, 23619358 - 23619624
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |  ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||    
23619358 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaatagttctaatcaattcattgagttagaac 23619457  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     |  || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
23619458 cctcttctagggttgaagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatttcactaataaatgattatccatt 23619556  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||    
23619557 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattatgtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 23619624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 242 - 497
Target Start/End: Original strand, 44027087 - 44027341
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
44027087 tatgttcccctaattgatataatgcacatattcttgtgaatgattaactagttctacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 44027186  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     ||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||    
44027187 cctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataatcgttgaagg-tttaaacacgttaacctaatgtcactaataaatgattattcatt 44027285  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatg 497  Q
    | ||  |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||    
44027286 cctaacctaatcatgtttattagaaaaattcaattaagtctaagtcaaaaactatg 44027341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 242 - 399
Target Start/End: Original strand, 33883344 - 33883501
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
33883344 tatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttagaac 33883443  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt 399  Q
    | |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33883444 cctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt 33883501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 290 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 4868330 - 4868103
Alignment:
290 tagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatct 389  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  | |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||    
4868330 tagtttcacgatggttaactaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcggattacagttcataattccttaggtgatctaatattct 4868231  T
390 ttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaa 489  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||     |||||| |||||||||||||||| ||||||| |    
4868230 ttgaaggttttaagaacgttcacctaatatcacaaataaaaaattatccattcctagactaa-----tttatttgaacaattcaattaggcctaagttga 4868136  T
490 aagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaa 522  Q
    ||| ||||||||||||||||  |||||| ||||    
4868135 aagttatggtcaatagtcattcattctcacgaa 4868103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 246 - 526
Target Start/End: Original strand, 5613715 - 5614005
Alignment:
246 ttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatc 345  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||    
5613715 ttcccctaattggcacacatcacatattcttatgaatgattctctagtttcacgatagttaacataatagtcctaataaatcccttgacttaggaccctc 5613814  T
346 ttctcaaa--ctacagtccataattccttaggtggtctaata-atctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
    |||||| |   || || || |||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
5613815 ttctcagattatatagcccctaattccttaggtggtataatatttttttgaaggttttaagaacgttaacttaatatcacaaataaacgattatgcatac 5613914  T
443 atagactaaccatgttta-------ttagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
     |||| ||||||||||||       || |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||  ||||||  |||||| ||||||||    
5613915 ctagaataaccatgtttatttgaattttgaacaattcaattaagtctaagttgaaagttgtggtcagcagtcattcattctcacgaaatca 5614005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 245 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 30785042 - 30784775
Alignment:
245 gttcccctaattggtatactgcacatatt-cttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacca 343  Q
    |||||||||||||||||| || || |||| ||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||  |||||||     
30785042 gttcccctaattggtatattgtacctatttcttacgaatgattctctagtttcacgatagttaacaaaataaccctaatcaatccatggacgtaggaccc 30784943  T
344 tcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattca 443  Q
    |||||||  | |||||||  |||||||||||||| | |||   ||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||            ||||||||     
30784942 tcttctcggattacagtctctaattccttaggtgatttaaagttctctgaaggttttacgaacgttaacctaatatcac-----------aatccattcc 30784854  T
444 tagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaa 522  Q
    |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
30784853 tagattattcatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagtagaaagctatggtcaatagtcattcattctcacgaa 30784775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 242 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20887660 - 20887589
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20887660 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaat 20887589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 243 - 325
Target Start/End: Original strand, 14589616 - 14589698
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaa 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
14589616 atgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatcgttaacaaaatagccctaatcaa 14589698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 45469617 - 45469511
Alignment:
1 actaccaacattagcaaagtaaagaaataca----aagttctaacagcagcagcaagttacaacaccaaaaaa-ctaaagcaaaataacaagggaagcac 95  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||    || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
45469617 actaccaactctagcaaagtaaggaaatacatacaaacttctaacagcagcagcaagttacatcgccaaaaaaactaaagcaaaataacaagggaagcac 45469518  T
96 acacaaa 102  Q
    |||||||    
45469517 acacaaa 45469511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 305
Target Start/End: Original strand, 5584390 - 5584462
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattc---------ttataaatgattttctagttccacgatagtt 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||         |||| ||||||||||||||||||||||||||    
5584390 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcataaaattcttatgaatgattttctagttccacgatagtt 5584462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 47)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Original strand, 41876758 - 41877025
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41876758 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaataattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 41876857  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
41876858 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 41876957  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||    
41876958 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcat 41877025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 241 - 506
Target Start/End: Original strand, 26752694 - 26752959
Alignment:
241 ttatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagga 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26752694 ttatgttcccctaattggtatactgcaccttttcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagga 26752793  T
341 ccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccat 440  Q
    || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
26752794 ccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccat 26752893  T
441 tcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagt 506  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||    
26752894 tcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagt 26752959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 18952821 - 18952555
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
18952821 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggac 18952722  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
18952721 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacaattatccatt 18952623  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||    
18952622 cctaaactaaccatgtttattagaacaattcaattagatctaagtcgaaagctatggtcattagtcat 18952555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 20055902 - 20055636
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
20055902 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaataatcctaatcaatcccgtgagttaggac 20055803  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
20055802 cgtcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-ttaaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 20055704  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
20055703 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattaggtctaagtagaaagctatggtcagtagtcat 20055636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 42063050 - 42062783
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
42063050 tatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatctcttgagttaggac 42062951  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||| | |||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
42062950 cctcttctcatattacagtccctaattccttaggtgaactaatattctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 42062851  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
42062850 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 42062783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Original strand, 22936932 - 22937198
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
22936932 atgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatccctttagttaggacc 22937031  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||| | |||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
22937032 ctcttctcagattacagtccctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattc 22937131  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
22937132 ctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 22937198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 7271144 - 7270861
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
7271144 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccatgatagttaacaaaatagttctaatcaatcccttgagttaggac 7271045  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||    
7271044 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctgataatctttgaagg-tttaaacacgttagcccaatatcactaacaaacgattatccatt 7270946  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
7270945 catagactaaccatgtttgttagaacaattcaattaggtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 7270861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 245 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 34831889 - 34831609
Alignment:
245 gttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccat 344  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
34831889 gttcccctaattggtataatgcacctattcttatgaataattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccct 34831790  T
345 cttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcat 444  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |    
34831789 cttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcct 34831691  T
445 agactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
34831690 agactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 34831609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Original strand, 41306521 - 41306787
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41306521 tatgttcccctaattggtatactgcacctatttttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 41306620  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||     
41306621 cctcttttcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcatgttaacctaatatcactaacaaacgattatccata 41306719  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||    
41306720 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcat 41306787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 43491884 - 43491617
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
43491884 tatgttcccctaatcggtatattgcatctatttttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagttctaatcaatcccttgagttagaac 43491785  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||||||||| |  || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
43491784 cctcttctcaaactagaccccctaattccttaggtggtttaataatctttgaagattttatgcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 43491685  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
43491684 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 43491617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 242 - 508
Target Start/End: Original strand, 26895598 - 26895863
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
26895598 tatgttcccctaattggtatgttgcacctattcttatgaatgattttttagttcaacgataattaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaagac 26895697  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
      |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
26895698 tctcttctcaaactacagcctctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 26895796  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 508  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||    
26895797 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattatgtctaagtcgaaagctatggtcagtagtca 26895863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 21332674 - 21332957
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||| ||    
21332674 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaataaaatagtcctaatcaattcattgacttagaac 21332773  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
21332774 cctcttctcaaactacagcccctaattccttagatgatctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 21332872  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||  |||||| | ||||||    
21332873 catagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatagtcagtagtcatttattctcactaaatca 21332957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 21335692 - 21335975
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||    
21335692 tatgttcccctaatttgtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcctttgacttagaac 21335791  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
21335792 cgtcttctcaaactacagcccctaattccttaggtgatctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 21335890  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||| |||| |||||||  |||||| | ||||||    
21335891 tatagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagttatagtcagtagtcattcattctcactaaatca 21335975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 33552249 - 33551984
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
33552249 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctaattccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggac 33552150  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||  || |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
33552149 cctcttctcaaactacaacccctaattccttaagtggtct-ataatctttgaagg-tttaagcacattaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 33552052  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
33552051 cctagactgaccatatttgttagaacaattcaattaggtctaagtagaaagctatggtcagtagtcat 33551984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 7625230 - 7624964
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
7625230 atgttcccctaattggtatactacacctatttgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggact 7625131  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
7625130 ctcttctcaaactacagcctctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattc 7625031  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
7625030 ctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 7624964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 4099511 - 4099794
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
4099511 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttgcacgatagttagcaaaatagtcataatcaatcccttgacttaagac 4099610  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
4099611 cctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataatatttgaa-gatttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 4099709  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
4099710 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtataagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 4099794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Original strand, 14016133 - 14016399
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
14016133 atgttcccctaattggtatagtgcacctattcgtattaatgattttctagttccacggtagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggacc 14016232  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||||||||||  || ||||| |||||||||| |||||||  | |||||||| ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
14016233 ctcttctcaaactacaacccctaatttcttaggtggtttaataattctcgaaggtttaaagcactttaacctaatatcactaacaaacgattatccattc 14016332  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
14016333 ctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 14016399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 40583376 - 40583111
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
40583376 atgttctcctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctataattccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttatgacc 40583277  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
40583276 ctcttcttaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatcttcgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaagaaacgattatctattc 40583178  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
40583177 ctagactaaccatctttattagaacaatttaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 40583111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Original strand, 14375790 - 14376068
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14375790 atgttcccctaattggtatactgcacctatttttatgaatgattttctagttccatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 14375889  T
343 at-------------cttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaa 429  Q
     |             || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||  |||    
14375890 ttgagttaggaccctctactcaaactacagaccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactagcaaa 14375988  T
430 cgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
14375989 cgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 14376068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 17664679 - 17664414
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
17664679 tatgttcccctaattggtatactgcacctattct-atgtatgattcactagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggac 17664581  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||| | | ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||    
17664580 cctcttctaagattacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatcgatt 17664482  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||    
17664481 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattagatctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 17664414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 31863843 - 31863545
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
31863843 tatgttcccctaattgatatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggat 31863744  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaac----------- 430  Q
    | ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||               
31863743 cctcttctcaaactatagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgatcactaaca 31863644  T
431 ---gattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
       |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
31863643 aatgattatccattcctagactaaccatgtttattagaataattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 31863545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Original strand, 12058486 - 12058752
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12058486 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtccctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 12058585  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
12058586 cctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccatt 12058684  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||    
12058685 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtttaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 12058752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Original strand, 34132977 - 34133243
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34132977 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 34133076  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
34133077 cctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccatt 34133175  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||    
34133176 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaacgctatggtcagtagtcat 34133243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Original strand, 34143208 - 34143474
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34143208 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 34143307  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
34143308 cctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccatt 34143406  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||    
34143407 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaacgctatggtcagtagtcat 34143474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 12088086 - 12087820
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12088086 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 12087987  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     ||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
12087986 cctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccatt 12087888  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||    
12087887 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaacgctatggtcagtagtcat 12087820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 39192457 - 39192190
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttct--agttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagga 340  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
39192457 atgttcccctaattgatataatgcacgtattcttatgaatgattctctctagttgcacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaaga 39192358  T
341 ccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccat 440  Q
    || |||||| ||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||    
39192357 ccctcttcttaaactacaacccctaattccttaggtggtataataatctttcaaggttt-aagcacattaacctaatatcactaacaaacgattatctat 39192259  T
441 tcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||    
39192258 tcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattagatctaggtcgaaagctatggtcaatagtcat 39192190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 317 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 2837357 - 2837165
Alignment:
317 cctaatcaatcccttgagttaggaccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaa 416  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||     
2837357 cctaatcaatcccttgatttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttatgaacgttaacctat 2837258  T
417 tatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
2837257 tatcactaataaacgattatccattcataaactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtcat 2837165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Original strand, 26907449 - 26907715
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||   |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
26907449 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattcattagttctacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggac 26907548  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     ||||  |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
26907549 cctcttctagggttacaacctgtaattccttaggtggtctaataaccgttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcaccaataaaggattatccatt 26907647  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
26907648 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaagtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 26907715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 245 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 21915249 - 21914966
Alignment:
245 gttcccctaattggtatactgcacatatt-cttataaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||| |||  || |||| || |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
21915249 gttcccctaattggtacactacacctatttcttatgaatatttctctaatttcacgatggttaactaaaatagccctaatcaatcccttgacttatgacc 21915150  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
21915149 ctcttctcagattacagtccctaattccttaggtgatctaatattctttgaaggtttgaagaacgttaacctaatatcacaaataaacgattattcattc 21915050  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
     |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||    
21915049 ctagactaaccctgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtcattcattctcacgaaatca 21914966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 245 - 526
Target Start/End: Original strand, 18239492 - 18239774
Alignment:
245 gttcccctaattggtatactgcacatatt-cttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacca 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||   ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
18239492 gttcccctaattggtgtactgcacctatttctttcgaatgattctctagtttcacgataattaacaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccc 18239591  T
344 tcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattca 443  Q
     ||| ||| | || |  || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||     
18239592 ccttgtcagagtaaaacccctaatttcttaggtggtctaatactctttgaaggttttaagaacgttaacttaatattacatataaacgattatccattcc 18239691  T
444 tagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||    
18239692 tagactagccttgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttcaaagctatggtcagtagtcattcattctcacgaaatca 18239774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 243 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 22131357 - 22131159
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
22131357 atgttcccctaattggtatactgcacctattcgtatgaatgattctctagttctacgatagttaacaaaatattcctaatcaatctcttgagttaggacc 22131258  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
     |||||||||||||||   | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
22131257 ctcttctcaaactacaacacctaattccttaggtggtttaataatccttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaataaacgattatccatt 22131159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 17748568 - 17748302
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| || | ||||| |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17748568 tatgttcccctaattggtataccgcacctatttttgtgaatgagtccctagtttaacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 17748469  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     ||||| || ||||| |||| ||| |||||||| | | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
17748468 cctcttctagggttacagcccctaatttcttaagtgatctaataaccgtcgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccatt 17748370  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||    
17748369 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattagttctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 17748302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 26292919 - 26292653
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||    
26292919 tatgctcctctaattggtatactgcacctattcttatcaatgattcgctagttccatgatagttaaccaaatagtccgaaccaatcccttgagttacgac 26292820  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||| |     ||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
26292819 cctcttatagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatacatt 26292721  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||    
26292720 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcggtagtcat 26292653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22378619 - 22378451
Alignment:
1 actaccaacattagcaaagtaaagaaatacaaagttctaacagcagcagcaagttacaacaccaaaaaactaaagcaaaataacaagggaagcacacaca 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
22378619 actaccaactctagcaaagtaaagaaatacaaagttctaacagcagcagcaagttagagcaccaaaaaactaatgcaaaataagaagggaagcacacaca 22378520  T
101 aacagtccttgagtgctccctgtttctgcattgctgagacaaaaaactgaataacataggaagctaaag 169  Q
    ||||||||||  || | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22378519 aacagtcctttggttcgccctatttctgcactgctgagacaaaaaactgaataacataggaagctaaag 22378451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 249 - 526
Target Start/End: Original strand, 28787330 - 28787599
Alignment:
249 ccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaa--tcaatcccttgagttaggaccatct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||| |||| |||    
28787330 ccctaattggtatactgcacctattctgatgaatgattttctaattccacaatagttaacaaaatagtcttaatttcaatcccttgactta-gaccctct 28787428  T
347 tctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatag 446  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||         | |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||    
28787429 tctcaaactacaacccataattccttagctggtctaataa---------ggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctag 28787519  T
447 actaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| ||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
28787520 actaaccttgtttattagaacaattcaattatgtccaagtagaaaactatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 28787599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 249 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 37215166 - 37215019
Alignment:
249 ccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttc 348  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
37215166 ccctaattggtatattgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttc 37215067  T
349 tcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaagg 396  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
37215066 tcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg 37215019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 17524570 - 17524731
Alignment:
1 actaccaacattagcaaagtaaagaaatacaaagttctaacagcagcagcaagttacaacaccaaaaaactaaagcaaaataacaagggaagcacacaca 100  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17524570 actaccaactctagcaaagtaaataaatacaaagttttaacagcagc-------tacaacaccaaaaaactaaagcaaaataacaagggaagcacacaca 17524662  T
101 aacagtccttgagtgctccctgtttctgcattgctgagacaaaaaactgaataacataggaagctaaag 169  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17524663 aacagtccttgggtactccgtgtttctgcactgctgagacaaaaaactgaataacataggaagctaaag 17524731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 381 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 32838007 - 32837879
Alignment:
381 taataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggt 480  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32838007 taataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggt 32837908  T
481 ctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    ||||||  ||||||||||||| |||||||    
32837907 ctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 32837879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 364 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 30066348 - 30066204
Alignment:
364 taattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttatta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||    
30066348 taattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagaacgttaacctaatatctctaacaaacgattatccactcctagactaaccatgtttgtta 30066250  T
464 gaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
30066249 gaacaattcatttaggtctaagtagaaagctatggtcagtagtcat 30066204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Original strand, 11959172 - 11959431
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| |  ||||||| | ||||||||||    ||||  |||||||||| ||||||||| ||    
11959172 tatgttcccctaattggtataccgcacctattcttgtgaatgagtccctagttctatgatagttaac----tagttataatcaatcctttgagttagaac 11959267  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     ||||| || |||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||    
11959268 cctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtgtaataaccgttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatc--tt 11959364  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaatt-aggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||| | |||||||    
11959365 --tagactaaccatgtttattagaacaattcaattaaggtctaagtcgaacgctatggttagtagtcat 11959431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 242 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 30066437 - 30066348
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatccctt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
30066437 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccgcgatagttaacaaaatagtgctaatcaatccctt 30066348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 242 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 23044270 - 23044163
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
23044270 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattcagtagtttcacgatagttaacaaaataatcttaatcaatgccttgagttaggac 23044171  T
342 catcttct 349  Q
    | ||||||    
23044170 cctcttct 23044163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 288 - 486
Target Start/End: Original strand, 18765681 - 18765880
Alignment:
288 tctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataa 386  Q
    |||||||  ||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  || |||| | |   ||||   | |||||||||| ||||||||| |     
18765681 tctagttttacgatggttaactaaaatagttataatcaatcccttgagttagatccctcttgttagcttacaactcctaattccttaagtggtctaacat 18765780  T
387 tctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagt 486  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||| ||||||  |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
18765781 tcttcgaaggttttaagagcgttaacctaatatcacaaataaatgattatttattcctagactaaccctgtttatttgaacaattcaaataggtctaagt 18765880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 414 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 23044121 - 23044026
Alignment:
414 taatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || || |||||||    
23044121 taatatcactaataaaggattattcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggccagtagtcat 23044026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 288 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 31575499 - 31575288
Alignment:
288 tctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatccctt-gagttaggaccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaata 385  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| || || ||||  |||||||||| |||||||  ||||||| |||||  |||||||    
31575499 tctagtttcacgatggttaactaaaatagctctaatcaatccctttgacttgggactctcttctcaaattacagtctctaattccctaggtaatctaata 31575400  T
386 atctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattag--gtcta 483  Q
     ||||||||| |   ||| | |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||  ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||    
31575399 ttctttgaag-taaaaagaaagttaacctaatatcacaaataaacgaatatccattctcagaataaccctgtttatttgaacaattcaattaggtgtcta 31575301  T
484 agttaaaagctat 496  Q
    |||| ||||||||    
31575300 agttgaaagctat 31575288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 364 - 487
Target Start/End: Original strand, 563375 - 563498
Alignment:
364 taattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttatta 463  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||  |||||||| |   | ||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |     
563375 taattctttaggtgatctaatattcttcaaaggttttcaaagcattaacataatatcacaattaaacgattattcattcctagactaaccttgtttagtt 563474  T
464 gaacaattcaattaggtctaagtt 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
563475 gaacaattcaattaggtctaagtt 563498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 437 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 22130198 - 22130149
Alignment:
437 ccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagt 486  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22130198 ccattcctaaactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagt 22130149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 62645 - 62362
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
62645 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 62546  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
62545 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 62447  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
62446 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 62362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 63987 - 63722
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
63987 tatgttcccctaatcggtatactgcacctattcttgtgaatgcttttctagttccacaatagttaacaaaatagtctgaatcaatcccttgagttaggac 63888  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||| |     || || || |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
63887 cctcttatagggttatagcccctaattccttaggtggtataataaccttcgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccatt 63789  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |  ||||||| ||||| |||||||    
63788 cctagactaaccatgtttattaaaacaatacaattaggtctaa-tcgaaagctagggtcagtagtcat 63722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 39)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 45941546 - 45941262
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
45941546 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 45941447  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
45941446 ccttttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 45941347  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
45941346 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 45941262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Original strand, 6070948 - 6071214
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6070948 atgttcccctaattggtatattgcacctattcgtattaatgattttctatttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 6071047  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
6071048 ctcttctcaaactacatcccctaatttcttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattc 6071147  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
6071148 ctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 6071214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 28111186 - 28110919
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
28111186 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaacagtcctaatcaatcccttgagttaggac 28111087  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
28111086 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacattaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 28110987  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | || ||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||    
28110986 cctatactaaccctatttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcat 28110919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 245 - 509
Target Start/End: Original strand, 49498494 - 49498758
Alignment:
245 gttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccat 344  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
49498494 gttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttatagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccct 49498593  T
345 cttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcat 444  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |    
49498594 cttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcct 49498692  T
445 agactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtc-taagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||||||||||| |||||||    
49498693 agactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtcttaagtagaaagctatggtcagtagtcat 49498758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 242 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 20398983 - 20398719
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
20398983 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaac 20398884  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
20398883 cctcttctcagactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 20398784  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagt 506  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||| ||||    
20398783 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtcaaagtagaaagctatggtcagtagt 20398719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 245 - 526
Target Start/End: Original strand, 23021920 - 23022201
Alignment:
245 gttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccat 344  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
23021920 gttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgatattctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccct 23022019  T
345 cttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcat 444  Q
    ||||| | || |||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |    
23022020 cttcttagaccacagcccctaattccttaggtgatcaaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcct 23022119  T
445 agactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
23022120 agactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 23022201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 1950449 - 1950732
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
1950449 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttagaac 1950548  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
1950549 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatcttcgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 1950647  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
1950648 cctagactaaccctgtttattagaacaatacaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 1950732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 21107285 - 21107568
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
21107285 tatgttcacctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggac 21107384  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
21107385 cctcttctcaaactacagcccctaattccttagatggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 21107483  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||| ||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
21107484 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaagcaatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 21107568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 673064 - 673350
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaa--tagtcctaatcaatcccttgagttagg 339  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||||||||      
673064 tatgtttccctaattggtatactgcacctattcttgtaaatgattttctagttccacgatagttaaaaaaaaatagtctcaatcaatcccttgagttaat 673163  T
340 accatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatcca 439  Q
    ||| |||||||||||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
673164 accctcttctcaaactacaacccctaattttttaggtggtctaataatctttgaagggtttaagtacgttaacataatatcactaataaacgattattca 673263  T
440 ttcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||    
673264 ttcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcaatagtcattcattctcactaaatca 673350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 2794357 - 2794091
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
2794357 tatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttagaac 2794258  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  || ||||||||||||| |||||||||||    
2794257 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaagctagtatcactaataaaggattatccatt 2794159  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||||    
2794158 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtcagtagtcat 2794091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Original strand, 37183858 - 37184124
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
37183858 atgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggacc 37183957  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
37183958 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaaacggttatccattc 37184057  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||    
37184058 ctagactaactatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctaggatcagtagtcat 37184124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 31204967 - 31204701
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
31204967 atgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctaattccacgatagttaacaaaatatccctaatcaatcccttgagttaggacc 31204868  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
31204867 ctcttctcaaactacatcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaaacacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattc 31204768  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
31204767 ctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 31204701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Original strand, 45960739 - 45961005
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
45960739 atgttcccctaattggtataatgcacctatttgtattaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagctctaatcaatcccttgagttaggacc 45960838  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
45960839 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattc 45960938  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
45960939 ctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 45961005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 21018461 - 21018744
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
21018461 tatgttcccctaatttgtatactgaacctattcttatgaatggttttttagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttatgac 21018560  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
21018561 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 21018659  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
21018660 cctagactaaccctgtttattaaaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 21018744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 41058296 - 41058579
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
41058296 tatgttcctctaattggtatgctgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgatttaggac 41058395  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||    
41058396 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtagtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctattatcactaacaaacaattatccatt 41058494  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
41058495 cctagactaaccctatttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 41058579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 256 - 526
Target Start/End: Original strand, 49853086 - 49853355
Alignment:
256 tggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttctcaaact 355  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
49853086 tggtatattgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgacagttaacaaaatagtcctaatcaatcacttgacttaggaccctcttctcaaact 49853185  T
356 acagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccat 455  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |    
49853186 acagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcaataacaaacgattatccattcctagactaaccct 49853284  T
456 gtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| | |||||||  |||||| | ||||||    
49853285 gtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggttagtagtcattcattctcactaaatca 49853355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Original strand, 29643216 - 29643481
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
29643216 atgttcccctaactagtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggacc 29643315  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     ||||||   | ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
29643316 ctcttctaggattacaacctctaattccttaggtggtctaataatcttcgaaggttt-aagcatgttaacctaatatcactaataaaggattatccattc 29643414  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| |||||||    
29643415 ctagattaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagttagggtcagtagtcat 29643481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Original strand, 905679 - 905949
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
905679 tatgtttccctaattggtatactgcacttattcttatgaatgattcactagttccacgatagttaacaaaatagttttaatcaatcccttgagttaggac 905778  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatat----cactaataaacgattatc 437  Q
    | ||||||     ||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||    |||||||||| |||||||    
905779 cctcttctatggttacaacccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatatatcactaataaaggattatc 905877  T
438 cattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
905878 cattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagctagggtcagtagtcat 905949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Original strand, 3796820 - 3797086
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||   || || |  ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
3796820 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgcgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggac 3796919  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
3796920 cctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccatt 3797018  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
3797019 cctaaactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 3797086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 245 - 526
Target Start/End: Original strand, 34732357 - 34732638
Alignment:
245 gttcccctaattggtatactgcacatatt-cttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacca 343  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||  ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||     
34732357 gttcccctaattggtatactgcaattatttcttacgaatgattctctagtttcacgatggttaacaaaatagcccta-tcaatcccttgacttaggaccc 34732455  T
344 tcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattca 443  Q
    |||||||||| ||||  || |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||     
34732456 tcttctcaaagtacatcccctaatttgttaggtggtctaatactctttgaaggttttaagaacgttaacttaatatcacaaataaacgattattcattcc 34732555  T
444 tagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||  ||||||  |||||||    
34732556 tagactaactatgtttatttgaacaattcaattaggtttaagttgaaagttatggtcagtagtcattcattctcaggaaatca 34732638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 249 - 501
Target Start/End: Original strand, 27355687 - 27355941
Alignment:
249 ccctaattggtatactgcacatatt-cttataaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatct 346  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |||  || ||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
27355687 ccctaattggtacactgcacctatttcctatgaatatttctctagtttcacgatggttaactaaaataggcctaatcaatcccttgacttaggaccctct 27355786  T
347 tctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatag 446  Q
    ||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
27355787 tctcatattacagtccctaattcattaggtgatctaatattttttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcacaaataaacgattatccattcctag 27355886  T
447 actaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtca 501  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
27355887 actaaccctgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtca 27355941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 243 - 471
Target Start/End: Original strand, 27354939 - 27355165
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
27354939 atgttctcctaattggtatattgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcataaccaatcccttgagttaggacc 27355038  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
27355039 ctcttcttaaactaca-accctaattccttaggtggtctattaatcttcgaagg-tttaaacacgttaacctaatatcactaacaaacgattatctattc 27355136  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaatt 471  Q
     || |||||||||||||||||||||||||    
27355137 ctacactaaccatgtttattagaacaatt 27355165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 250 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 2405631 - 2405373
Alignment:
250 cctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttct 349  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||    
2405631 cctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgattccctagttctacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcaattgagttaggaccctctcct 2405532  T
350 caaactacagtccataattccttaggtggtctaataatcttt-gaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagac 448  Q
         ||||  || |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
2405531 agggttacatcccttaattccttaggtggtctaata-tctgtcgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagac 2405434  T
449 taaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||| |||||||    
2405433 taaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaacgttatggtcagtagtcat 2405373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 242 - 399
Target Start/End: Original strand, 21111152 - 21111309
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
21111152 tatgttctcctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttaacttaggac 21111251  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt 399  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21111252 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt 21111309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 246 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 7635773 - 7635495
Alignment:
246 ttcccctaattggtatactgcacata-ttcttataaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacca 343  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| || ||| ||| |||  || ||||||| ||||||  ||||| ||||||  |||||||||| |||||| ||||||||     
7635773 ttcccataattggtacactgcacctacttcctatgaatatttctctagtttcacgatgattaactaaaataaccctaatcaataccttgacttaggaccc 7635674  T
344 tcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattca 443  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |  ||| || |||||||||||||| ||||     
7635673 tcttctcagattacagtccataattccttaggtgatctaatattctttgaaggttttaagaacgttaacctcttattacaaataaacgattatctattcc 7635574  T
444 tagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaa 522  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||  |||||| ||||    
7635573 tagactgaccctgtttatttgaacaattcaatcaggtctaagttgaaagttatgatcaatagtcattcattctcacgaa 7635495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 296 - 509
Target Start/End: Original strand, 21434523 - 21434737
Alignment:
296 cacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaa 394  Q
    ||||| ||||||| ||||||| | |||||||||| |||| ||| |||  |||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||    
21434523 cacgacagttaactaaaatagccataatcaatccattgacttaagacactcttctcagattacagtccctaattccttaggtgatctaatattatttgaa 21434622  T
395 ggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagct 494  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
21434623 ggttttaagaacgttaacctaatataacaaataaacgattattcattcctagactaaccctgtttatttgaacaattcaattaggtataagttgaaagct 21434722  T
495 atggtcaatagtcat 509  Q
    ||||||| |||||||    
21434723 atggtcagtagtcat 21434737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 288 - 509
Target Start/End: Original strand, 27331817 - 27332031
Alignment:
288 tctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataa 386  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| | ||||||||  |||         |||| ||||||| |||||||     
27331817 tctagtttcacgatggttaactaaaatagccctaataaatcccttgacttaggaacctcttctcagccta---------attcattaggtgatctaatat 27331907  T
387 tctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatcca-ttcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaag 485  Q
    | ||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
27331908 tttttgaaggttttaacaacgttaacctaatatcacaaataaacgattattcaattcctagactaaccatgtttatttgaacaattcaattaggtctaag 27332007  T
486 ttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    || |||| |||||||| |||||||    
27332008 ttgaaagttatggtcagtagtcat 27332031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 394 - 526
Target Start/End: Original strand, 11668171 - 11668303
Alignment:
394 aggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagc 493  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||    
11668171 aggttttaagaacgttaacttaatatcacaaataaacgattatccattcctagagtaaccatatttatttgaaaaattcaattcggtctaagttgaaagc 11668270  T
494 tatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||    
11668271 tatggtcagtagtcattaattctcacaaaatca 11668303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 245 - 430
Target Start/End: Original strand, 13430954 - 13431141
Alignment:
245 gttcccctaattggtatactgcacata-ttcttataaatgattttctagttccacgatagttaaca-aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||| || |||  || |||||||  ||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||     
13430954 gttcccctaattggtacactgcacttagttctcatgaatatttctctagttttacgatggttaacttaaatagccctaatcaatcccttgacttaggact 13431053  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaac 430  Q
     |||||||| | |||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
13431054 ctcttctcatattacagtctctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttacgaacgttaacttaatatcacaaataaac 13431141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 242 - 333
Target Start/End: Original strand, 21114492 - 21114583
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttga 333  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
21114492 tatgttctcctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttga 21114583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 249 - 400
Target Start/End: Original strand, 11667001 - 11667153
Alignment:
249 ccctaattggtatactgcacatatt-cttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatctt 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||| | |||| || ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||    
11667001 ccctaattggtatactgcacctatttcttacgaatgaatctctaatttcacaatggttaacaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggatcctctt 11667100  T
348 ctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttt 400  Q
    |||| | ||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
11667101 ctcagattacagcccctaattccttaggtggtctaatattatttgaaggtttt 11667153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 286 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 42022720 - 42022578
Alignment:
286 tttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaata 385  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  || |||     |||||| |||||||    
42022720 tttctagttccactatagttaacaaaatagttttaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactataacccctaa-----taggtgatctaata 42022626  T
386 atctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgatt 434  Q
    || |||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||    
42022625 atttttgaaggttttaattacgttatcctaatatcact-ataaacgatt 42022578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 309 - 427
Target Start/End: Original strand, 16055629 - 16055747
Alignment:
309 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 408  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||  || ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| | ||    
16055629 aaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcagattacaacccctaaatccttaggtgatctaatattctttgaaggtttgaagaatgt 16055728  T
409 taacttaatatcactaata 427  Q
    |||| ||||||||| ||||    
16055729 taacctaatatcacaaata 16055747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 288 - 403
Target Start/End: Original strand, 34065202 - 34065317
Alignment:
288 tctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataat 387  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||| | |||||||| || ||||| | |||||||  |||| |||| |||| |||||||||    
34065202 tctagtttcacgatggttaaccaaatagccctaatcaatctcttaacttaggaccctcctctcatattacagtctctaatacctttggtgatctaataat 34065301  T
388 ctttgaaggttttaag 403  Q
    ||||||||||||||||    
34065302 ctttgaaggttttaag 34065317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 406 - 509
Target Start/End: Original strand, 34066599 - 34066702
Alignment:
406 cgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatag 505  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||  |||||||||| | |||    
34066599 cgttaacttgatatcacaaataagcagttatccattcctagactaaccatgtttatttgaacaatcaaattaggtataagttgtaagctatggttagtag 34066698  T
506 tcat 509  Q
    ||||    
34066699 tcat 34066702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 309 - 427
Target Start/End: Original strand, 16056864 - 16056982
Alignment:
309 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 408  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||  ||| |||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||  ||||    
16056864 aaaatagctctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcagattacgatccctaattccttaggtgatctaatatactttaaaggtttgaataacgt 16056963  T
409 taacttaatatcactaata 427  Q
    |||| ||||||||| ||||    
16056964 taacctaatatcacaaata 16056982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 243 - 302
Target Start/End: Original strand, 27536526 - 27536585
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgata 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
27536526 atgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccaggata 27536585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 249 - 427
Target Start/End: Original strand, 16060968 - 16061148
Alignment:
249 ccctaattggtatactgcacatatt-cttataaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatct 346  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| || || |||  || |||||||  |||||  ||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||   |||    
16060968 ccctaattggtacactgcacctatttctcatgaatatttctctagttttacgatgattaactaaaatagccctaatcaatccattgacttaggattctct 16061067  T
347 tctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaata 427  Q
    ||||| | |||| ||| |||||||||||||| |||||||  ||||  |||||| ||| || ||||| ||||||||| ||||    
16061068 tctcatattacaatccctaattccttaggtgatctaatatactttataggtttgaagaacattaacctaatatcacaaata 16061148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 340
Target Start/End: Original strand, 30938601 - 30938654
Alignment:
288 tctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttagga 340  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
30938601 tctagtttcacgatggttaactaaaatagtcataatcaatcccttgacttagga 30938654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 242 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 259 - 1
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
259 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 160  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
159 cctcttctcaaactacagcccctaatttcttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 60  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtc 500  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||    
59 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 293151 - 292885
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
293151 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaac 293052  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
293051 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaacctagtatcactaataaaggattatccatt 292953  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||    
292952 cctatactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatcgtcagtagtcat 292885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 245 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 89895 - 89631
Alignment:
245 gttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccat 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |    
89895 gttcccctaattggtatactgcacatattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggactct 89796  T
345 cttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcat 444  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
89795 cttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttgaagcacgttaacttaatatcactaacaaacgattatccattcct 89696  T
445 agactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||    
89695 agactaaccatgtttattaaaacaattcaattaggtctaagtcaaaagttagggtcagtagtcat 89631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1755 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold1755
Description:

Target: scaffold1755; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 242 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 249 - 6
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
249 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaacatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 150  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
149 cctcttctcaaacttcagtccctaattgcttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaaggattatccatt 51  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagt 486  Q
    | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
50 cctagactaaccctatttattagaacaattcaattaggtctaagt 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 5392 - 5676
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
5392 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcctttgagttaagac 5491  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
5492 cctcttctcaaactacagcccctgattccttaggtggtctaataatctttgaaagttttaagaacgttagcctaatatcactaataaaggattatccatt 5591  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
5592 cctagactaaccatgattattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 5676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 19524 - 19240
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
19524 tatgttcctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttagaac 19425  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
      |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
19424 tctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataaactttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatt 19325  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
19324 cctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 19240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520 (Bit Score: 178; Significance: 9e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0520
Description:

Target: scaffold0520; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 241 - 526
Target Start/End: Original strand, 8212 - 8496
Alignment:
241 ttatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagga 340  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
8212 ttatgtttccctaattggtatactacacctattcttatgaatgattttctatttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcgatcccttgacttagga 8311  T
341 ccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccat 440  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
8312 ccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcacaaacaaacgattatccat 8410  T
441 tcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
8411 tcctagactaaccaagtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 8496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 249 - 476
Target Start/End: Original strand, 1549 - 1775
Alignment:
249 ccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttc 348  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
1549 ccctaattggtaaactgcacctattcttatgaatgattgtctagttacacaatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgacttaggaccgtcttc 1648  T
349 tcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagac 448  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
1649 tcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttaaaag-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagac 1747  T
449 taaccatgtttattagaacaattcaatt 476  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||    
1748 taaccctgtttattagaataattcaatt 1775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 456 - 526
Target Start/End: Original strand, 4187 - 4257
Alignment:
456 gtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
4187 gtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 4257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 173; Significance: 9e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Original strand, 57583 - 57867
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |    
57583 tatgttcacataattggtatattgcacctattcttatgaacgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatctatccattgagttagggc 57682  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||  || | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
57683 cctcttctcaaactacatcccctgattgcttaggtggtctaatactctttgaaggttttacgaacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 57782  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
57783 tctagactaaccatttttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 57867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 173; Significance: 9e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 242 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 198275 - 197992
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
198275 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaataattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggac 198176  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
198175 cctcttctcaaactatagcctctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaatgattatccatt 198077  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    | |||||||  | ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
198076 cctagactattcctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 197992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Original strand, 3277 - 3543
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
3277 atgttcccataattggtataatgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaacc 3376  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||| | |||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
3377 ctcttctcatattacagtccctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcatgtttacctaatatcactaacaaacgattatccattc 3476  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
3477 ctaggttaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 3543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Original strand, 67520 - 67785
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
67520 atgttcccctaattggtatactgcacctattgttatgattgattctctagtaccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 67619  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||| ||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
67620 ctcttcttaaactacaactcctaattccttaggtggtctaataatcttcgaagg-tttaagcatgttaacttaatatcactaacaaacgattatatattc 67718  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
67719 ctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcggtagtcat 67785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0757 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0757
Description:

Target: scaffold0757; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 246 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 5476 - 5197
Alignment:
246 ttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatc 345  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
5476 ttcccctaattgatatagtgcacctattcttatgaatgattttttagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggaccctc 5377  T
346 ttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcata 445  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||    
5376 ttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgatcatccattccta 5278  T
446 gactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 526  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
5277 gactaaccctatttattagaacaatttaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 5197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Original strand, 58 - 324
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
58 atgttcccttaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctaattccacgatagttaacaaaatagccctaataaatcccttgagttaggacc 157  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
     |||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
158 ctcttctcaaactacagcccctaatttcttaggcggtctaataatctttcaaggtttttagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattc 257  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||||| |||||||    
258 ctagactaaccatgtttatcagaacaattcaattatatctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1208 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold1208
Description:

Target: scaffold1208; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 242 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 313 - 89
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
313 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttttacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaagac 214  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
      |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
213 tctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaaggattattcatt 114  T
442 catagactaaccatgtttattagaa 466  Q
    | ||||||||||||| ||| |||||    
113 cctagactaaccatgattagtagaa 89  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 242 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 248646 - 248413
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
248646 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgagtgattttctagttccacgacagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgacttaggac 248547  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
248546 cctcttcacaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaatcatgttaacctaatatcactaacaaacgattattcatt 248448  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaatt 476  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
248447 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaatt 248413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 242 - 508
Target Start/End: Original strand, 2999 - 3264
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
2999 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaccaaaatagtcctaatcaatccattgagttaggac 3098  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     ||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
3099 cctcttctagtgttacaacccctaattccttaggtggtctaataatcgttgaaggttt-aagcatgttaacctaatatcactaataaaggattatccatt 3197  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 508  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||    
3198 cgtagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtca 3264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1063 (Bit Score: 150; Significance: 5e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold1063
Description:

Target: scaffold1063; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 243 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 2628 - 2385
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttata------aatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagtt 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
2628 atgttcccctaattggtatactgcacctattcttattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagtt 2529  T
337 aggaccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattat 436  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
2528 aggaccctcttctcatactacagtccctaattccttaggtgagctaatattctttgaacgttttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattat 2429  T
437 ccattcatagac--taaccatgtttattagaacaattcaattag 478  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
2428 ccattcctagactataaccatgtttattagaacaattcagttag 2385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 150; Significance: 5e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 242 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 27237 - 27005
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
27237 tatgttcccctaattggtatactgcatctattcttatgaatgattctctagttccatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatccattgacttaagac 27138  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
27137 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtgtaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcacgaacaaacgattatccatt 27039  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaat 475  Q
    | |||||||||| | |||||||||||||||||||    
27038 cctagactaaccctatttattagaacaattcaat 27005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 143; Significance: 7e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 10536 - 10271
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
10536 atgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggacc 10437  T
343 atcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattc 442  Q
    |||||||     ||||  || ||||| |||||| || ||||||| | |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
10436 atcttctagggttacaacccctaatttcttaggcggactaataaccgttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattc 10338  T
443 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
10337 cttgactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 10271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 248 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 31216 - 30956
Alignment:
248 cccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatctt 347  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |  ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
31216 cccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccctctt 31117  T
348 ctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcataga 447  Q
    ||     ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
31116 ctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatacattcctaga 31018  T
448 ctaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
31017 ctaaccatgtttattagaacaaatcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 30956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0807 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0807
Description:

Target: scaffold0807; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 242 - 486
Target Start/End: Original strand, 2067 - 2310
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
2067 tatgttctccgaattggtatattgcacctattcttatgaatgattttctaattccacgatacttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttgggac 2166  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
      ||||||   | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
2167 tctcttctaggattacagcccgtaatttcttaggtggtctaataatcttcgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccatt 2265  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagt 486  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2266 cctagattaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagt 2310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 246 - 522
Target Start/End: Original strand, 118443 - 118719
Alignment:
246 ttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatc 345  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||  |||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||    
118443 ttcccttaattggtccactgcacctattcttatgaatgattcgctagtttcaggatagttaacaaaatagcactaatcaatcccttgacttaggaccctc 118542  T
346 ttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcata 445  Q
    ||| |    ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
118543 ttcgcgggttacagtctataattccttagatgatctaatattctttgaaggttttacatgcgttaacctaatatcacaaataaacgattatccattccta 118642  T
446 gactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaa 522  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||| ||||    
118643 gactaaccatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtcattcattctcacgaa 118719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 325
Target Start/End: Original strand, 99233 - 99312
Alignment:
246 ttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaa 325  Q
    |||| |||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
99233 ttcctctaattggttcactgcacctattcttatgaatgattctctagtttcacgatagttaacaaaatagccataatcaa 99312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 242 - 486
Target Start/End: Original strand, 58675 - 58920
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
58675 tatgttcccctaatttgtatactgcacctattcttgtgaatgcttttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 58774  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     ||||| || |||||||||| |  ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
58775 cctcttctagggttacagcccctaattccttatgcagtctaataacctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccatt 58873  T
442 catagactaaccatgtttattag--aacaattcaattaggtctaagt 486  Q
    | |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
58874 cctagactaaccatgtttattagaaaaaaattcaattaggtctaagt 58920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 188124 - 188296
Alignment:
1 actaccaacattagcaaagtaaagaaatacaaagttctaacagcagcagcaagttacaacaccaaaa-aactaaagcaaaataacaagggaagcacacac 99  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
188124 actaccaactctagcaaagtaaagaaatacaaagttctaacagcagcagcaagttacagcaccaaaaaaactaaagcaaaataacaagggaagcacacac 188223  T
100 aaacagtccttgagtgctccctgtttctgcattgctgagac-aaaaaactgaataacataggaagctaaagtt 171  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
188224 aaacagtccttgggtgctccctgtttctgcactgctgagacaaaaaaactgaataacataggaagctaaagtt 188296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 288 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 19431 - 19217
Alignment:
288 tctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataat 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
19431 tctagttccacgatagttaacaaaatagttctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtgatctaataat 19332  T
388 ctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtt 487  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||     
19331 ctttgaaggttttatgcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaacca-------tagaacaattcaattaggtctcagtc 19239  T
488 aaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
     |||| |||||||| |||||||    
19238 gaaagttatggtcagtagtcat 19217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 242 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 29493 - 29229
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||| |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29493 tatgttcccctaatttttatactgcacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 29394  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatt 441  Q
    | ||||||     ||||  || |||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
29393 cctcttctagggttacaacccctaattcctcacgtggtctaataacttttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccatt 29295  T
442 catagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtc 507  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||    
29294 cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagttatggtcagtagtc 29229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 242 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 19408 - 19222
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||| |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19408 tatgttcacctcattggtatactgcacctattcttgtgaatgactccctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 19309  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaa 429  Q
    | ||||||  |  ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
19308 cctcttctagagttacaacccctaattccttagatggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaataaa 19222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 453 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 19213 - 19159
Alignment:
453 catgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtc 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||    
19213 catgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctatggtcagtagtc 19159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 242 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 241628 - 241434
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
241628 tatgttcccctaattggtatactgcacctatttttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcgtaatcaatcccttgagttaggac 241529  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatc 437  Q
    | |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || ||||||||| ||| |||||||    
241528 cctcttctcaaactgcaggccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacattaacctagtatcactaacaaatgattatc 241434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1785 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold1785
Description:

Target: scaffold1785; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 257 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 1362 - 1112
Alignment:
257 ggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttctcaaacta 356  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |     ||    
1362 ggtatactgcacctattcttgtgaatgcttttctagttccacaatagttaacaaaatagtctgaatcaatcccttgagttaggaccctcttatagggtta 1263  T
357 cagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatg 456  Q
     || || |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
1262 tagcccctaattccttaggtggtataataaccttcgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatg 1164  T
457 tttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |  ||||||| ||||| |||||||    
1163 tttattaaaacaatacaattaggtctaa-tcgaaagctagggtcagtagtcat 1112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1785; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 35 - 1
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattctt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
35 tatgttcccctaattggtatactgcacctattctt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2073 (Bit Score: 111; Significance: 9e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold2073
Description:

Target: scaffold2073; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 242 - 388
Target Start/End: Original strand, 861 - 1007
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
861 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattatctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgggttaggac 960  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatc 388  Q
    | |||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
961 cctcttttcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatc 1007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1809 (Bit Score: 111; Significance: 9e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1809
Description:

Target: scaffold1809; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 242 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 193 - 1
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
193 tatgttcccctaattggtatactacac-tgttcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcagtcccttgacttaggac 95  T
342 catcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattat 436  Q
    | | |||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||    
94 cctattctcaaactacaacccctaatttcttaggtggtcaaataatctttgaaag-tttaagcatgttaacctaatatcactaacaaacgattat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 258 - 509
Target Start/End: Original strand, 48411 - 48664
Alignment:
258 gtatactgcacatatt-cttataaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttctcaaact 355  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||  || ||||||| |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||| | |    
48411 gtatactgcacctatttcctataaatatttctctagtttcacgatggtcaactaaaatagtcataatcaatcccttgacgtaggaccctcttctcagatt 48510  T
356 acagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccat 455  Q
    || |||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| | | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
48511 acggtccctaattccttaggtgatccaatattctttgaaggttttatgaatgttaacataatatcacaaataaacgattatccattcctaggctaacctt 48610  T
456 gtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    ||||| | |||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||| |||||||    
48611 gtttacttgaacaattcaattaggtcaaagttgtaagctagggtcagtagtcat 48664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 355 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 14254 - 14101
Alignment:
355 tacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaacca 454  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||| | | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
14254 tacagcccctaattccttaggtgatctaataaccgtcgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaacca 14156  T
455 tgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
14155 tgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 14101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 296 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 10014 - 9786
Alignment:
296 cacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccatcttctcaaactacagtccataattccttaggtggtctaataatctttgaa 394  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||| ||| | ||||| | ||||||    
10014 cacgatggttaaccaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcagattagagtccctaattccttatgtgttataatattatttgaa 9915  T
395 ggttttaagtacgttaac-ttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagc 493  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||| |||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||     
9914 ggttttaagaaagttaaccttaatatcacaaataaacaattaccaattcctagactaactctgtttattcgatcaattcaattaggtctaagttgaaagt 9815  T
494 tatggtcaatagtcatcaattctcgcgaa 522  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| ||||    
9814 tatggtcaataatcattcattctcacgaa 9786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0690 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0690
Description:

Target: scaffold0690; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 242 - 337
Target Start/End: Original strand, 7706 - 7801
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagtta 337  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7706 tatgttcccctaattggtatattgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagtta 7801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 242 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15540 - 15433
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 341  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||| |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15540 tatgttcccctaattgggatactgcacctattcttgtgaatgagtcgctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 15441  T
342 catcttct 349  Q
    | ||||||    
15440 cctcttct 15433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 288
Target Start/End: Original strand, 14314 - 14359
Alignment:
243 atgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgatttt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||    
14314 atgttcccctaattggtatactgcacctatttgtattaatgatttt 14359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 242 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 4044 - 3988
Alignment:
242 tatgttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattttctagttccac 298  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||||||    
4044 tatgtttctctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgattcactagttccac 3988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University