View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10541_low_15 (Length: 288)

Name: NF10541_low_15
Description: NF10541
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10541_low_15
NF10541_low_15
[»] chr2 (29 HSPs)
chr2 (11-274)||(17037060-17037326)
chr2 (11-274)||(17025383-17025649)
chr2 (11-274)||(17091568-17091834)
chr2 (11-274)||(10821439-10821705)
chr2 (12-274)||(16883716-16883981)
chr2 (12-274)||(17041406-17041671)
chr2 (11-274)||(1515225-1515491)
chr2 (15-274)||(4811342-4811605)
chr2 (14-274)||(14752976-14753239)
chr2 (11-274)||(1993290-1993556)
chr2 (11-274)||(28501942-28502208)
chr2 (11-274)||(6343078-6343344)
chr2 (11-274)||(26821411-26821677)
chr2 (20-274)||(36633321-36633578)
chr2 (11-274)||(9916924-9917190)
chr2 (11-274)||(14323562-14323828)
chr2 (11-274)||(33664030-33664296)
chr2 (12-274)||(16724584-16724849)
chr2 (32-274)||(28380238-28380483)
chr2 (20-274)||(30567100-30567357)
chr2 (20-274)||(30570785-30571042)
chr2 (11-274)||(45205253-45205519)
chr2 (32-274)||(45398554-45398799)
chr2 (11-273)||(19167879-19168144)
chr2 (14-274)||(18092957-18093211)
chr2 (18-274)||(42885189-42885448)
chr2 (11-274)||(21097490-21097756)
chr2 (107-274)||(35286575-35286745)
chr2 (13-103)||(11448159-11448249)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (11-274)||(9701974-9702240)
chr5 (11-274)||(3210431-3210695)
chr5 (11-274)||(31295905-31296171)
chr5 (11-270)||(10513336-10513598)
chr5 (11-274)||(21029830-21030096)
chr5 (11-274)||(1852161-1852427)
chr5 (11-274)||(12588511-12588777)
chr5 (11-274)||(19395078-19395344)
chr5 (11-274)||(3150835-3151101)
chr5 (31-274)||(3397369-3397615)
chr5 (20-274)||(20349654-20349911)
chr5 (11-274)||(7285399-7285665)
chr5 (11-274)||(20996175-20996441)
chr5 (30-274)||(41780569-41780816)
chr5 (11-274)||(33611371-33611637)
chr5 (11-274)||(2194887-2195153)
chr5 (11-274)||(19447725-19447991)
chr5 (11-274)||(26321306-26321572)
chr5 (11-274)||(4881995-4882260)
chr5 (11-274)||(30689031-30689297)
chr5 (18-274)||(3028480-3028742)
chr5 (107-274)||(33929612-33929782)
chr5 (107-274)||(17996398-17996568)
chr5 (107-274)||(38934295-38934465)
chr5 (11-134)||(290330-290453)
chr5 (111-274)||(20757783-20757949)
chr5 (182-274)||(290447-290539)
chr5 (11-226)||(27065622-27065838)
chr5 (35-137)||(287345-287447)
chr5 (198-274)||(33707010-33707086)
chr5 (182-266)||(19222794-19222877)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (11-274)||(38434787-38435053)
chr7 (11-274)||(42996213-42996474)
chr7 (11-274)||(9226458-9226724)
chr7 (11-274)||(9149121-9149387)
chr7 (11-274)||(27735286-27735552)
chr7 (11-274)||(47573690-47573956)
chr7 (11-274)||(3795270-3795536)
chr7 (11-274)||(42245093-42245359)
chr7 (11-274)||(47163790-47164055)
chr7 (12-274)||(17477650-17477915)
chr7 (12-274)||(17575299-17575564)
chr7 (13-274)||(47174238-47174501)
chr7 (11-274)||(6911712-6911978)
chr7 (11-274)||(33030556-33030822)
chr7 (33-274)||(42827612-42827856)
chr7 (18-274)||(5962464-5962722)
chr7 (11-274)||(23766676-23766942)
chr7 (11-274)||(42687312-42687578)
chr7 (11-274)||(8926128-8926394)
chr7 (12-274)||(17482097-17482362)
chr7 (12-274)||(17570852-17571117)
chr7 (11-274)||(33638912-33639178)
chr7 (13-274)||(23299957-23300221)
chr7 (11-261)||(14308690-14308943)
chr7 (117-274)||(4481624-4481784)
chr7 (111-274)||(17469607-17469773)
chr7 (111-274)||(17583441-17583607)
chr7 (164-274)||(42917710-42917820)
chr7 (111-274)||(11499718-11499884)
chr7 (11-162)||(19520926-19521077)
chr7 (11-101)||(42917610-42917700)
chr7 (204-274)||(19521082-19521152)
[»] chr8 (30 HSPs)
chr8 (11-274)||(23626565-23626831)
chr8 (11-274)||(12250420-12250681)
chr8 (11-274)||(39444526-39444787)
chr8 (11-274)||(45293798-45294064)
chr8 (11-274)||(41907358-41907623)
chr8 (11-274)||(19247612-19247878)
chr8 (11-274)||(19320796-19321062)
chr8 (11-274)||(23966741-23967007)
chr8 (11-274)||(29433539-29433805)
chr8 (11-274)||(39204131-39204397)
chr8 (11-274)||(6300838-6301104)
chr8 (11-274)||(44939942-44940208)
chr8 (11-274)||(37029338-37029604)
chr8 (11-274)||(14079051-14079317)
chr8 (23-274)||(22333342-22333596)
chr8 (11-274)||(41156139-41156405)
chr8 (11-274)||(41976959-41977225)
chr8 (33-274)||(30825973-30826217)
chr8 (11-274)||(33424479-33424745)
chr8 (19-274)||(41628399-41628657)
chr8 (11-274)||(42061015-42061281)
chr8 (29-266)||(12759994-12760233)
chr8 (11-274)||(6477714-6477979)
chr8 (11-274)||(42811157-42811422)
chr8 (47-274)||(19395784-19396014)
chr8 (12-274)||(38961676-38961935)
chr8 (12-274)||(38992020-38992279)
chr8 (107-274)||(23522863-23523033)
chr8 (132-274)||(22947023-22947168)
chr8 (11-130)||(44383308-44383427)
[»] chr4 (35 HSPs)
chr4 (11-274)||(26870537-26870798)
chr4 (11-274)||(1944266-1944533)
chr4 (14-274)||(3839619-3839882)
chr4 (11-274)||(15520491-15520757)
chr4 (11-274)||(740658-740924)
chr4 (11-274)||(40621923-40622188)
chr4 (12-274)||(47720317-47720582)
chr4 (11-274)||(54331891-54332157)
chr4 (11-274)||(13627827-13628093)
chr4 (11-274)||(33503246-33503512)
chr4 (11-274)||(34056811-34057077)
chr4 (12-274)||(574395-574659)
chr4 (18-274)||(19831645-19831904)
chr4 (20-274)||(37701847-37702104)
chr4 (11-273)||(55998946-55999211)
chr4 (11-274)||(35707876-35708142)
chr4 (11-274)||(38007619-38007885)
chr4 (11-274)||(14829759-14830025)
chr4 (11-270)||(23478685-23478947)
chr4 (11-274)||(39742994-39743260)
chr4 (19-274)||(17698959-17699217)
chr4 (19-274)||(35495791-35496049)
chr4 (18-267)||(36856870-36857122)
chr4 (11-274)||(28135314-28135580)
chr4 (55-274)||(41984481-41984703)
chr4 (11-255)||(17739815-17740061)
chr4 (11-274)||(53342185-53342450)
chr4 (11-270)||(7644044-7644298)
chr4 (26-274)||(8530620-8530857)
chr4 (107-274)||(2776163-2776333)
chr4 (107-274)||(5272523-5272693)
chr4 (107-274)||(22116288-22116458)
chr4 (111-274)||(21352974-21353140)
chr4 (198-274)||(47557673-47557749)
chr4 (228-274)||(53991495-53991541)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (11-274)||(1095-1356)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (11-274)||(64867-65134)
scaffold0006 (11-274)||(152388-152653)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (11-274)||(15315014-15315280)
chr1 (11-274)||(18111350-18111616)
chr1 (11-274)||(43254905-43255171)
chr1 (11-274)||(50395319-50395585)
chr1 (11-274)||(34687351-34687617)
chr1 (11-274)||(50560806-50561072)
chr1 (11-274)||(18813983-18814249)
chr1 (11-274)||(28565939-28566205)
chr1 (32-274)||(16031825-16032070)
chr1 (14-274)||(52309601-52309864)
chr1 (11-274)||(13662626-13662891)
chr1 (11-274)||(31619453-31619719)
chr1 (11-274)||(51965953-51966219)
chr1 (11-274)||(10763146-10763412)
chr1 (32-274)||(36681029-36681274)
chr1 (32-274)||(17671092-17671336)
chr1 (11-274)||(29840907-29841173)
chr1 (11-274)||(48340093-48340359)
chr1 (14-272)||(12714244-12714505)
chr1 (32-274)||(45004518-45004763)
chr1 (11-274)||(34691879-34692145)
chr1 (11-274)||(52521788-52522054)
chr1 (11-274)||(42682154-42682416)
chr1 (18-274)||(41963150-41963409)
chr1 (11-274)||(41830269-41830535)
chr1 (19-235)||(38845483-38845702)
chr1 (107-274)||(12246061-12246231)
chr1 (112-274)||(24294394-24294559)
chr1 (107-274)||(44406235-44406405)
chr1 (185-274)||(39760370-39760459)
chr1 (205-272)||(47135361-47135428)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (11-274)||(30230-30496)
[»] chr6 (21 HSPs)
chr6 (11-274)||(13457085-13457351)
chr6 (11-274)||(14831225-14831491)
chr6 (11-274)||(1073504-1073770)
chr6 (14-274)||(33321694-33321957)
chr6 (11-274)||(15275398-15275664)
chr6 (11-274)||(18599227-18599493)
chr6 (18-274)||(17939269-17939528)
chr6 (11-266)||(34320832-34321090)
chr6 (18-274)||(34855702-34855961)
chr6 (11-274)||(14888178-14888444)
chr6 (11-274)||(22374082-22374348)
chr6 (32-274)||(4424247-4424492)
chr6 (11-274)||(2520903-2521170)
chr6 (32-274)||(11934921-11935166)
chr6 (107-274)||(35040944-35041114)
chr6 (14-217)||(1931776-1931975)
chr6 (107-274)||(18311643-18311812)
chr6 (32-202)||(28228824-28228997)
chr6 (165-274)||(4425404-4425513)
chr6 (143-274)||(25539945-25540079)
chr6 (11-101)||(7219281-7219371)
[»] chr3 (34 HSPs)
chr3 (11-274)||(5252607-5252873)
chr3 (11-274)||(8242455-8242721)
chr3 (11-275)||(54793197-54793464)
chr3 (11-274)||(40827268-40827534)
chr3 (11-274)||(48521255-48521521)
chr3 (18-274)||(52840766-52841025)
chr3 (14-274)||(55295012-55295275)
chr3 (11-274)||(39796706-39796972)
chr3 (19-274)||(54512542-54512799)
chr3 (32-274)||(32755262-32755507)
chr3 (11-274)||(16495646-16495911)
chr3 (11-274)||(35088071-35088337)
chr3 (11-274)||(51248116-51248382)
chr3 (33-274)||(36165244-36165488)
chr3 (11-274)||(31369250-31369516)
chr3 (11-274)||(6104359-6104625)
chr3 (11-274)||(22477463-22477729)
chr3 (11-249)||(2845115-2845356)
chr3 (12-274)||(11598197-11598462)
chr3 (20-274)||(48976449-48976705)
chr3 (18-274)||(23193224-23193483)
chr3 (18-274)||(50771480-50771739)
chr3 (11-274)||(52853675-52853941)
chr3 (18-274)||(50741115-50741374)
chr3 (11-274)||(11951208-11951474)
chr3 (55-274)||(52463165-52463387)
chr3 (12-274)||(21699806-21700068)
chr3 (18-274)||(49112837-49113087)
chr3 (31-265)||(11325886-11326123)
chr3 (14-159)||(19893722-19893867)
chr3 (26-134)||(35436666-35436774)
chr3 (182-274)||(35436768-35436860)
chr3 (146-274)||(11383009-11383139)
chr3 (14-86)||(11382927-11382999)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (11-274)||(13164-13430)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (11-266)||(119796-120054)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (14-227)||(49808-50024)
scaffold0051 (223-274)||(61267-61318)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (11-274)||(26593-26859)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (11-274)||(9684-9950)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (11-274)||(174-440)
[»] scaffold0385 (1 HSPs)
scaffold0385 (99-274)||(4412-4590)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (125-274)||(53201-53348)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (128-274)||(10843-10992)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (32-202)||(29322-29495)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (179-266)||(100527-100614)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 29)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 17037060 - 17037326
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  17037060 cagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgcagagaacgtgtcatgg 17037159  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17037160 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaaatagatctttgctgctgaactatttgaact 17037259  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17037260 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgt 17037326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 17025383 - 17025649
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  17025383 cagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgcagagaacgtgtcatgg 17025482  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17025483 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaaatagatctttgctgctgaacnatttgaact 17025582  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17025583 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgt 17025649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 17091568 - 17091834
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  17091568 cagagaaagtataagtgtcgcctcattaccaccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgcagagaacgtgtcatgg 17091667  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17091668 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaaatagatctttgctgctgaactatttgaact 17091767  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17091768 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgt 17091834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 10821705 - 10821439
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  10821705 cagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttaggttggcagtggttcaatttctgcagagaacgtgtgatgg 10821606  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||   |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10821605 aagaaggtggtaagttcatctttgatctcgaaaagtcatcgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaaatagatctttgctgctgaactatttgaact 10821506  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  10821505 tctactatgttggcgtatcgctttggactataatcgtaaattatcttgactctgggatgtcatttgt 10821439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 16883716 - 16883981
Alignment:
Q  12 agagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgga 111  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  16883716 agagaaagtataagtgtcgtctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggcattggttcaatttctgcagagaacgtgtgatgga 16883815  T
Q  112 agaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaactt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16883816 agaaggtggtaagctcatctttgatctcggaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccacaatagatctttgctgctgaactatttgaactt 16883915  T
Q  209 ctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  16883916 ctactattttggcctatcactttggactgtaatcttaaaatatctcgactttgggatgtcatttgt 16883981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 17041406 - 17041671
Alignment:
Q  12 agagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgga 111  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  17041406 agagaaagtataagtgtcgtctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggcattggttcaatttctgcagagaacgtgtgatgga 17041505  T
Q  112 agaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaactt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17041506 agaaggtggtaagctcatctttgatctcggaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccacaatagatctttgctgctgaactatttgaactt 17041605  T
Q  209 ctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  17041606 ctactattttggcctatcactttggactgtaatcttaaaatatctcgactttgggatgtcatttgt 17041671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1515491 - 1515225
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||    
T  1515491 cagagaaaatataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagaaagctatgaaaaatacttgggtggacagtggttcaatttctgcaaagaacgtgtgatgg 1515392  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||     ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1515391 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcatgtttgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttgaact 1515292  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    | ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  1515291 tatactattttgatgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgttatttgt 1515225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 274
Target Start/End: Original strand, 4811342 - 4811605
Alignment:
Q  15 gaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttgga-tgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaag 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||| |  ||||| ||  |||||||    
T  4811342 gaaagtataaatgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttggggtgggcaatgattcaatttctacatagaacgtgcgatggaag 4811441  T
Q  114 aaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttct 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4811442 aaggtggtaagctcatctctgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatctttgctgctgaactatttgaacttct 4811541  T
Q  211 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  4811542 actattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgt 4811605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 274
Target Start/End: Original strand, 14752976 - 14753239
Alignment:
Q  14 agaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaag 113  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  || |||| ||| ||||||||||||||| || ||||||  || |||||||    
T  14752976 agaaagtataagtgtcgcttcattaccgccgaaagagcaagctatgaaatttatttgggtggacagtggttcaatttcagcagagaactagtgatggaag 14753075  T
Q  114 aaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||   |||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14753076 aaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcatcgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagtaaatctttgttgctgaactatttgaacttct 14753175  T
Q  211 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  14753176 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgtgatgtcatttgt 14753239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1993556 - 1993290
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| |||||| ||| |||     
T  1993556 cagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatttctgcagagaacgtgtgatga 1993457  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1993456 tagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaact 1993357  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  1993356 tctactattttgacatatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgt 1993290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 28501942 - 28502208
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| |||||| ||| |||     
T  28501942 cagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatttctgcagagaacgtgtgatga 28502041  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28502042 tagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaact 28502141  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  28502142 tctattattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgt 28502208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6343344 - 6343078
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| |||||| ||| |||     
T  6343344 cagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatttctgcagagaacgtgtgatga 6343245  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  6343244 tagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgttgaactatttgaact 6343145  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  6343144 tctactattttgacgtatcgctttgggctgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgt 6343078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 26821411 - 26821677
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  || ||||    
T  26821411 cagagacagtataattgtcatctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagataacgagtgatgg 26821510  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||||    
T  26821511 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaagtcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaact 26821610  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26821611 tctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcataaactatcttgactttgggatgtcatttgt 26821677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 36633578 - 36633321
Alignment:
Q  20 tataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaaggtg 119  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||| || |||||||||||||    
T  36633578 tataattgtcacctcattactgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggtttaatttctgcagataacaagtgatggaagaaggtg 36633479  T
Q  120 gtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactatt 216  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  36633478 gtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcacgttcgagttgttccaacgtagatctttgttgttgaactatttgaacttctactatt 36633379  T
Q  217 ttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  36633378 ttgatgtatcactttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgt 36633321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9917190 - 9916924
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||    
T  9917190 cagagaaaatataagtgtcgtctcattactgccgaaagagaaagctatgaaaaatacttgggtgggcagtgattcaatttctgcaaagaacgtgtgatgg 9917091  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  9917090 aagaaggtggtaagctcatctttgatttcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctggtgaagtatttgaact 9916991  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  9916990 tttactattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttaggatgccatttgt 9916924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14323828 - 14323562
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||| ||| |||||| ||| |||     
T  14323828 cagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatttttgcagagaacgtgtgatga 14323729  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||  || || |||||||||||||||||||||||    
T  14323728 tagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtatatatttgctgctgaactatttgaact 14323629  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  14323628 tctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcataaactattttgactttgtgatgtcatttgt 14323562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 33664296 - 33664030
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||||| | | |||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||  || ||||    
T  33664296 cagagacagtataactgtcacctcattaccgccaataaagcaagctatgaaaattacttgggtgggcaatggttcaatttctacagagaacgagtgatgg 33664197  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33664196 aagaaggtggtaaactcatccttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgctgttgaactatttgaact 33664097  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33664096 tctactattttgacgaatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 33664030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16724849 - 16724584
Alignment:
Q  12 agagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgga 111  Q
    ||||| ||||||| ||||  ||||||| ||| || |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||   || |||||    
T  16724849 agagacagtataactgtcatctcattatcgcagatagagcaagctatgaaaattacttggttgggcagtggttcaatttctgcagataatgagtgatgga 16724750  T
Q  112 agaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaactt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| |||||    
T  16724749 agaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaactt 16724650  T
Q  209 ctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16724649 ctactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 16724584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 32 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 28380483 - 28380238
Alignment:
Q  32 ctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaaggtggtaagctcatct 131  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| ||||| ||    
T  28380483 ctcattatcaccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaaagtgtgatggaagaaggtggtacgctcaact 28380384  T
Q  132 ttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgc 228  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28380383 ttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgc 28380284  T
Q  229 tttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
     |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||    
T  28380283 attggactgtaatcgtaaattatattgactttgggatgccatttgt 28380238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 30567357 - 30567100
Alignment:
Q  20 tataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaaggtg 119  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  || || ||||||||||    
T  30567357 tataattgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagataacgagtgattgaagaaggtg 30567258  T
Q  120 gtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactatt 216  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  30567257 gtaagctcatctttgatctcgaaaagacacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatcttttttgttgaactatttgaacttctactatt 30567158  T
Q  217 ttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  30567157 ttgacgcatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgattttaggatgtcatttgt 30567100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 30571042 - 30570785
Alignment:
Q  20 tataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaaggtg 119  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  || || ||||||||||    
T  30571042 tataattgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagataacgagtgattgaagaaggtg 30570943  T
Q  120 gtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactatt 216  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  30570942 gtaagctcatctttgatctcgaaaagacacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatcttttttgttgaactatttgaacttctactatt 30570843  T
Q  217 ttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  30570842 ttgacgcatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgattttaggatgtcatttgt 30570785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 45205519 - 45205253
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||| | ||||| |||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  45205519 cagagacagtataactatcgccacattacagccgatcgagcaagctatgaaaaatacttgggtgagcagtggttcaatttctgcagagaacgagtgatgg 45205420  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |   |||||||||||||  |||||||||| || | |||||||||||||    
T  45205419 aagaaggtggtaagttcatctttgatctcaaaaagtcacagaagaacttgcgcgttcgagttgttccaaagtagatctttgttgttaaactatttgaact 45205320  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  45205319 tctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgt 45205253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 32 - 274
Target Start/End: Original strand, 45398554 - 45398799
Alignment:
Q  32 ctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaaggtggtaagctcatct 131  Q
    ||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||    
T  45398554 ctcattatcaccgacagagcaagctatgaaaaatacttgggtggacaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtacgctcaact 45398653  T
Q  132 ttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgc 228  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  45398654 ttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgttgctgaactatttgaacttctagtattttgatgtatcgc 45398753  T
Q  229 tttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||    
T  45398754 tttggactgtaatcgtaaattatattgactttgggatgccatttgt 45398799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19168144 - 19167879
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| | ||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||  || |  |    
T  19168144 cagagacaatataactgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaagtacttgggtgggcagtggttcaatttatgcagataacgagtgacag 19168045  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||  || |||||||||||||||    
T  19168044 aagaaggtggtaagctcatatttgatctcaaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttattgttgaactatttgaact 19167945  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttg 273  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19167944 tctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcacaaactatcttgactttgggatgtcatttg 19167879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18093211 - 18092957
Alignment:
Q  14 agaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaag 113  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||         ||    
T  18093211 agaaaatataagtgtcgcctcattaccaccgaaagagaaagctatgaaaaatacttgggtggacagtggttcaatttctgcaaagaaca---------ag 18093121  T
Q  114 aaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttct 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18093120 aaggtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgttgctgaactatttgaacttct 18093021  T
Q  211 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  18093020 actattttgacgcatcgttttggactgtaatcataaactatcttgacttcgggatgccatttgt 18092957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 274
Target Start/End: Original strand, 42885189 - 42885448
Alignment:
Q  18 agtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaagg 117  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| || || |||  || |||||||| ||    
T  42885189 agtataatcgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtggacagtggttcaatttcggcagataacgagtgatggaagatgg 42885288  T
Q  118 tggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctacta 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||| ||  |||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||    
T  42885289 tggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttctaaagtagatctttgttgtcgaactatctgaacttctacta 42885388  T
Q  215 ttttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42885389 ttttgacgtatcactttgcaatgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 42885448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 21097490 - 21097756
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| | ||||| ||||  ||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||  | |||  || ||||    
T  21097490 cagagacaatataactgtcatctcattatcgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggtagtggttcaaattctgcaaataacgagtgatgg 21097589  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||| ||||| ||||    
T  21097590 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaagtattttaact 21097689  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  21097690 tctactattttgacgtatcgctttggaatgtagtcgtaaactatctttactttgggatgtcatttgt 21097756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 35286745 - 35286575
Alignment:
Q  107 atggaagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  35286745 atggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacggaagaacttgcacgttcgagttgttcaaaagtagatctttggtgcttaactatttg 35286646  T
Q  204 aacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  35286645 aacatcttttattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatattgactttgggatgccatttgt 35286575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 103
Target Start/End: Original strand, 11448159 - 11448249
Alignment:
Q  13 gagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacat 103  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  11448159 gagacagtataattgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaaatatttaggtgggcagtggttcaatttatgccgagaacat 11448249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 9701974 - 9702240
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9701974 cagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccaaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgcagagaacgtgtcatgg 9702073  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9702074 aagaagatggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaaatagatctttgctgctgaactatttgaact 9702173  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9702174 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgt 9702240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3210695 - 3210431
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  3210695 cagagaaagtataagtgtcgcctcattgccgctgaaagagtaagctatgaaaaatacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagagaacatg--atgg 3210598  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||  |||||||||||||   |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3210597 aagaatgtggtaagctcatctttgatctcaaaaagtcatcgaagaacttgcacgttcgagttgtcccaaaatagatctttgctgctaaactatttgaact 3210498  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3210497 tctattattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 3210431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 31296171 - 31295905
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| |||||| ||| |||     
T  31296171 cagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatttctgcagagaacgtgtgatga 31296072  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31296071 tagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaact 31295972  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  31295971 tctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgt 31295905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 10513598 - 10513336
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||  || ||||    
T  10513598 cagagacagtataactgtcacctcattaccgccaagagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggcagtggttcaatttttgcagagaacgagtgatgg 10513499  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||    
T  10513498 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacaaaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaact 10513399  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcat 270  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10513398 tctactattttgacgtatcgctttggaatgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcat 10513336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 21029830 - 21030096
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| | ||||| |||| |||||||||| |||| || ||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||  || ||||    
T  21029830 cagagacaatataactgtcacctcattaccaccgatagtgcaagctatgaaaattacttgggtgggtagtggttcaatttctgcagataacgagtgatgg 21029929  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||    
T  21029930 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcactgaagaacttgcaagttcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaact 21030029  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21030030 tctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 21030096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1852427 - 1852161
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||  || ||||    
T  1852427 cagagacagtataactgtcacctcattaccgctgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtgattcaatttctgcagataacgagtgatgg 1852328  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||    |||||||||||||  ||||| |||| || |||||||||||||||    
T  1852327 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacataagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatatttgttgttgaactatttgaact 1852228  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1852227 tctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 1852161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12588777 - 12588511
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||    
T  12588777 cagagaaaatataagtgtcgtctcattaccgccgaaagagaaaactatgaaaaatacttgggtgggcagtgattcaatttctgcaaagaacgtgtgatgg 12588678  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12588677 aagaaggtggtaagctcatctttgattttgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctggtgaactatttgaact 12588578  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    | |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  12588577 tttactattttgacgcatcactttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgt 12588511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 19395078 - 19395344
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||||||||  || || ||| |||     
T  19395078 cagagaaagtataagcgtcgcctcattaccgcagaaagagcaagctatggaaaatacttgggtgggctatggatcaatttctgcaaagcacgtgtgatga 19395177  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||||||   | |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19395178 tagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcaagttgttctaaagtagatctttgctgctgaactatttgaact 19395277  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19395278 tctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 19395344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3151101 - 3150835
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||   || ||||    
T  3151101 cagagacagtataatcgtcacctcattaccgccgatggagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagataaagagtgatgg 3151002  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||    
T  3151001 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaact 3150902  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  3150901 tctaccattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatattgactttgggatatcatttgt 3150835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 31 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3397615 - 3397369
Alignment:
Q  31 cctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaaggtggtaagctcatc 130  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  3397615 cctcattaccaccgatagagcaagctatcaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatc 3397516  T
Q  131 tttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcg 227  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3397515 tttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcg 3397416  T
Q  228 ctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  3397415 ctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttggaatgtcatttgt 3397369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 274
Target Start/End: Original strand, 20349654 - 20349911
Alignment:
Q  20 tataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaaggtg 119  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  || || ||||||||||    
T  20349654 tataattgtcacctcattaccgccaatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagagaacgagtgatagaagaaggtg 20349753  T
Q  120 gtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactatt 216  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||     |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  20349754 gtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgttccaaaatagatctttgttgttgaactatttgaacttctactatt 20349853  T
Q  217 ttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||  | |||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20349854 ttaacatatcgctttgcactgtagtcataaactatcttgactttgggatgtcatttgt 20349911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 7285399 - 7285665
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| |||||||  |||  ||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  || ||||    
T  7285399 cagagacagtataacagtcatctcattatcgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagataacgagtgatgg 7285498  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||||    
T  7285499 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaact 7285598  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7285599 tctactattttgacgtatcactttgaactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 7285665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 20996441 - 20996175
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| | ||||| |||| ||||||||||||| | ||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  | |||  || ||||    
T  20996441 cagagacaatataactgtcacctcattaccgccaatagagcaaactatgaaaattacttaggtgggcagtggttcaatttctgcaaataacgagtgatgg 20996342  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||    
T  20996341 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcacgttcgagttgttccaacgtagatctttgttgttgaactatttgaact 20996242  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  20996241 tctactattttgacgtatcgctttgaactgtaatcgtaaaccatcttgactttgggatgccatttgt 20996175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 274
Target Start/End: Original strand, 41780569 - 41780816
Alignment:
Q  30 gcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaaggtggtaagctcat 129  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||  |||| | ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  41780569 gcctcattaccaccgaaagagcaaactatgaaaaatactttggtggacaatggttcaatttctggagagagcgtgtgatggaataaggtggtaagctcat 41780668  T
Q  130 ctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatc 226  Q
    |||| ||| ||| ||||||  |||||||| ||||   |||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41780669 cttttatctcgaaaagtcatcgaagaactagcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgatactgaactatttgaacttctactattttgacgtatc 41780768  T
Q  227 gctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41780769 gctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 41780816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 33611637 - 33611371
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||| ||||  ||||||||| || | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||  || ||||    
T  33611637 cagagacagtataactgtcatctcattaccaccaatagagcaagctatgaaaattacttggatgggcagtggttcaatttctgtagataacgagtgatgg 33611538  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||||    
T  33611537 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaact 33611438  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  33611437 tctaatattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttggaatgtcatttgt 33611371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 2194887 - 2195153
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||  ||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||  || ||||    
T  2194887 cagagacagtataactgtcatctcattatcgccgatggagcaagctatgaaaattacttgggtgggtagtggttcaatttctgcagataacgagtgatgg 2194986  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||    ||||||||||| |  |||||||||  || |||||||||| ||||    
T  2194987 aagaaggtggtaagctcatcttggatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccgaagtagatctttattgttgaactattttaact 2195086  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2195087 tctactattttgatgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 2195153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 19447725 - 19447991
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| || || |||  || ||||    
T  19447725 cagagacagtataactgccacctcattaccgccgatagagcaagctatcaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttcggcagataacgagtgatgg 19447824  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||    
T  19447825 aagaaggtgataagctcatctttgatttcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaact 19447924  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||    
T  19447925 tctattattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttaattttgggatgccatttgt 19447991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 26321572 - 26321306
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| || ||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| || |||  || ||||    
T  26321572 cagagacagtataactgtcatctcattaccgccgatagtgcacgctatgaaaattatttgggtgggcagtggttcaatttctgcagataacgagtgatgg 26321473  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||| |    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||||    
T  26321472 aagaaggtggtaagctcatctttgatcccgaaaagtcatagaagaacttggaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaact 26321373  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  26321372 tctactattttgatgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttaactttgggatgtcatttgt 26321306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 4881995 - 4882260
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| | ||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||| |||||||| || |||  || ||||    
T  4881995 cagagacaatataactgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtggtcaatggttcgatttctgcagataacgagtgatgg 4882094  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |    |||||||||||||  |||||||||| || | |||||||||||||    
T  4882095 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgaaaattcgagttgttccaaattagatctttgttgttaaactatttgaact 4882194  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| || ||||||||    
T  4882195 tctactattttgacgtatcgctttgg-ctgtagtcgtaaactatcttgaatttggaatatcatttgt 4882260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 30689031 - 30689297
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| |||| || ||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||  || ||||    
T  30689031 cagagacagtacaactgtcatctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtggtcagtggttcaatttctgcagataacgagtgatgg 30689130  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  ||||    |||||||||||||  ||||| |||| || |||||||||| ||||    
T  30689131 aagaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaaagtgcaaattcgagttgttccaaagtagatatttgttgttgaactattttaact 30689230  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  30689231 tctactattttgatgtatcgctttggactgaagtcgtaaactatcttgattttgggatgtcatttgt 30689297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 274
Target Start/End: Original strand, 3028480 - 3028742
Alignment:
Q  18 agtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaagg 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||| || |||  || |||||||||||    
T  3028480 agtataattgtcacctcattaccgccgatagagcaagttatgaaaattacttgggtggggagtggttcaatttttgcagataacgagtgatggaagaagg 3028579  T
Q  118 tggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagat----ctttgctgctgaactatttgaacttct 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||    ||||||||| |||  |||||     |||| || ||||||||||||||||||    
T  3028580 tggtaagctcatctttgatctcgaaaag-cacagaagaacttgcaaattcgagttgttacaaagtagatattaatttgttgttgaactatttgaacttct 3028678  T
Q  211 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  3028679 actattttgtcgtatcgttttggactgtagtcgtaaactatcttgactttggaatgtcatttgt 3028742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 33929612 - 33929782
Alignment:
Q  107 atggaagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  33929612 atggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttcaaaagtagatctttggtgcttaactatttg 33929711  T
Q  204 aacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  33929712 aacatctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatattgactttgggatgccatttgt 33929782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 17996398 - 17996568
Alignment:
Q  107 atggaagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttg 203  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||    
T  17996398 atggaagaaggtggtaaactcatatttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttg 17996497  T
Q  204 aacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17996498 aacttctactattttgacgtaccgctttggactgtagtcgcaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 17996568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 38934295 - 38934465
Alignment:
Q  107 atggaagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||  |||||| |||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||    
T  38934295 atggaagaaggtggtaagctcatatttgatctcgaaaagtcatagaagaaattgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttg 38934394  T
Q  204 aacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38934395 aacttctactattttgacgtatcgctttggattgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 38934465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 134
Target Start/End: Original strand, 290330 - 290453
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  290330 cagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatatttgggtggccagtggttcaatttcagcagagaacatgtgatgg 290429  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttg 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  290430 aagaaggtggtaagctcatctttg 290453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 111 - 274
Target Start/End: Original strand, 20757783 - 20757949
Alignment:
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||  |||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||    
T  20757783 aagaaggtggtaagatcatatttgatctcgaaaagtcacataagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaact 20757882  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20757883 tctactattttggcgtactgctttggactgtagtcgcaaactatcttaactttgggatgtcatttgt 20757949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 182 - 274
Target Start/End: Original strand, 290447 - 290539
Alignment:
Q  182 atctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  290447 atctttgttgctgaactatttgaacttctacaattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 290539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 27065622 - 27065838
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||||| | |||| | |||| |||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||  || ||||    
T  27065622 cagagacagtataactgtcacctcattatcaccgataaagcaagctacgaaaattacttgggtggacagtggttcaatttctgcagataacgagtgatgg 27065721  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||| |||||| || ||    ||||||||| |||  |||||||||| || |||||||||||||||    
T  27065722 aagaaggtggtaag--catctttgatctcgaaaagtcacagaagaatttacaaattcgagttgttgcaaagtagatctttgttgttgaactatttgaact 27065819  T
Q  208 tctactattttggcgtatc 226  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  27065820 tctactattttgacgtatc 27065838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 287447 - 287345
Alignment:
Q  35 attaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaaggtggtaagctcatctttg 134  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  287447 attaccgacgaaagagaaagctatgaaaaatatttgggagggcagtggttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttg 287348  T
Q  135 atc 137  Q
    |||    
T  287347 atc 287345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 198 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 33707086 - 33707010
Alignment:
Q  198 tatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  33707086 tattttaacttctactattttgatgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgt 33707010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 266
Target Start/End: Original strand, 19222794 - 19222877
Alignment:
Q  182 atctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatg 266  Q
    |||||||||| || |||||||||  || | ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||    
T  19222794 atctttgctgatgcactatttgacattatgctattttggtgtatcactt-ggactgtaatcttaaaatatctcatctttgggatg 19222877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 38435053 - 38434787
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  38435053 cagagaaagtataagtgtcacctcattaacgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgcagagaacgtgtcatgg 38434954  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38434953 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaaatagatctttgctgctgaactatttgaact 38434854  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38434853 tctactattttggcgtatagctttggactgtaatagtaaactatcttgtctttgggatgccatttgt 38434787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 42996213 - 42996474
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  42996213 cagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgcagagaacgtgtcatgg 42996312  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||     || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42996313 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcactgaagaacttgcacgttcgagtt-----aaaatagatctttgctgctgaactatttgaact 42996407  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42996408 tctactattttggcataccgttttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgt 42996474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9226724 - 9226458
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |  |||||| ||| ||||    
T  9226724 cagagaaagtataagtgtcgcctcattaccaccgaaagagcaagctatgaaaaatatttgggtgggcagtgattcaatttcagtagagaacgtgtgatgg 9226625  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||   |||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  9226624 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaaagaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgttgcagaactatttgaact 9226525  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9226524 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 9226458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 9149121 - 9149387
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||| ||| || |    
T  9149121 cagagaaaatataagtgtcgcctcattaccgccgtaagagaaagctatgaaaaatacttgggtggacagtggttcaatttctgcaaagaacgtgtgattg 9149220  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9149221 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcatcgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttgaact 9149320  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  9149321 tctactattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgt 9149387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27735552 - 27735286
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||    
T  27735552 cagagaaaatataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagaaagctatgaaaaatacttgggtggacagtgattcaatttctgcaaagaacgtgtgatgg 27735453  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27735452 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttgaact 27735353  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  27735352 tctactattttgacgcatcgctttgaactgtaatcgtaaactatcttaactttgggatgccatttgt 27735286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 47573956 - 47573690
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| |||||| ||| |||     
T  47573956 cagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatttctgcagagaacgtgtgatga 47573857  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47573856 tagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaact 47573757  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  47573756 tctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgt 47573690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 3795270 - 3795536
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||    
T  3795270 cagagaaaatataagtgtcgtctcattaccgtcgaaagagaaaactatgaaaaatacttgggtgggcagtgattcaatttctgcaaagaacgtgtgatgg 3795369  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3795370 aagaaggtggtaagctcatctttgatttcgaaaagtcaccgaagaacttgcattttcgagttgttccaaaatagatctttgctggtgaactatttgaact 3795469  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    | |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  3795470 tttactattttgacgcatcactttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgt 3795536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 42245359 - 42245093
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||    
T  42245359 cagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagagaacgtctaatgg 42245260  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||    
T  42245259 aagaaggtggtaagctcatctttaatctggaaaagtcaccgaagaacttccacgttcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaact 42245160  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||| |||||| |||||||  |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  42245159 tctaatattttagcgtatctttttggattgtaattgtaaattatcttgactttgggatgccatttgt 42245093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 47164055 - 47163790
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| | ||  || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||| |||||| | | ||||    
T  47164055 cagagaaagtataagtatcaactaattaccgtcgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggttgacagtggttcaatt-ctgcagagaacgtctgatgg 47163957  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47163956 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcctcgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaaatagatctttgctgctaaactatttgaact 47163857  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47163856 tcaactattttggcgtatcactttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 47163790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 17477650 - 17477915
Alignment:
Q  12 agagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgga 111  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||    
T  17477650 agagacagtataactgtcacctcattaccgccaatagagcaagctatgaaaattacttggatgggcagtggttcaatttctgcagagaacgagtgatgga 17477749  T
Q  112 agaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaactt 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  17477750 agaaggtgataagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaactt 17477849  T
Q  209 ctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17477850 ctactattttaacatatcgctttggactgtagtcataaactatcttgactttgggatgtcatttgt 17477915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17575564 - 17575299
Alignment:
Q  12 agagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgga 111  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||    
T  17575564 agagacagtataactgtcacctcattaccgccaatagagcaagctatgaaaattacttggatgggcagtggttcaatttctgcagagaacgagtgatgga 17575465  T
Q  112 agaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaactt 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  17575464 agaaggtgataagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaactt 17575365  T
Q  209 ctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17575364 ctactattttaacatatcgctttggactgtagtcataaactatcttgactttgggatgtcatttgt 17575299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 274
Target Start/End: Original strand, 47174238 - 47174501
Alignment:
Q  13 gagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaa 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | ||| ||||| || ||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  47174238 gagaaagtataagtgtcgcctcattaccgcagaaagagcaagctatgaaaaatgcttaggtgg-cagtgatttaatttctgcagagaacgtgtgatggaa 47174336  T
Q  113 gaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  47174337 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaaaaacttgcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctattgaactatttaaacttc 47174436  T
Q  210 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  47174437 tactattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgt 47174501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6911978 - 6911712
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| |||||  |||| |||||| ||| |||     
T  6911978 cagagaaagtataagtgttgcctcattactgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatgactgcagagaacgtgtgatga 6911879  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6911878 tagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaact 6911779  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  6911778 tctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgt 6911712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 33030556 - 33030822
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| | ||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||| || ||||    
T  33030556 cagagacaatataactgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaaatacttgggtggacagtggttcaatttctgcagataacaagtgatgg 33030655  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || ||||||| |||||||    
T  33030656 aagaaggtggtaagttcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactaattgaact 33030755  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  33030756 tctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaatcatcttgactttgggatgtcatttgt 33030822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 33 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 42827856 - 42827612
Alignment:
Q  33 tcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaaggtggtaagctcatctt 132  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  42827856 tcattaccaccgaaacagcaagctatgaaaaatacttgggtggacaattgttcaatttctgcagagaacatgtgatggaagaaggtgataagctcatctt 42827757  T
Q  133 tgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgct 229  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42827756 tgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctactgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgct 42827657  T
Q  230 ttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||    
T  42827656 ttgaactgtaatcgtaaactatattgactttgagatgccatttgt 42827612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 274
Target Start/End: Original strand, 5962464 - 5962722
Alignment:
Q  18 agtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaagg 117  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||    
T  5962464 agtataaatgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggttggcagtggttcaatttctgcagataacaagtgatggaagaagg 5962563  T
Q  118 tggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctacta 214  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||  |||||| ||| |    |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  5962564 tggtaagctcatctttgatcttgaaaagtcatagaagaagttgtaaattcgagttgttccaag-tagatctttgttgttgaactatttgaacttctacta 5962662  T
Q  215 ttttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5962663 ttttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 5962722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23766942 - 23766676
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| |||| | |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  || ||||    
T  23766942 cagagacagtataactgtcatctcattaccgccgatagagtaagctatgaaatttacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagataacgagtgatgg 23766843  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||||    
T  23766842 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaact 23766743  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23766742 tctactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 23766676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 42687312 - 42687578
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| || |||  || ||||    
T  42687312 cagagacagtataattgtcacctcattaccgccgatagagcaagctataaaaattacttaggtgggcagtggttcaatttctgcagataacgagtgatgg 42687411  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||    
T  42687412 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcggaaagtcacagaagaaattgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaact 42687511  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42687512 tctaccattttgacgtatcgctttggacagtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 42687578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8926394 - 8926128
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||  || ||||    
T  8926394 cagagacagtataactgtcatctcattactgccgatagagcaagctatgaaaattacttggatgggtagtggttcaatttctgcagataacgagtgatgg 8926295  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    ||||||||| |||  |||||||||| || |||||||||| ||||    
T  8926294 aagaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgtttcaaagtagatctttgttgttgaactattttaact 8926195  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8926194 tctactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 8926128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 17482097 - 17482362
Alignment:
Q  12 agagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgga 111  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||||| | | |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||    
T  17482097 agagacagtataactgtcacctcattaccgtcaatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagagaacgagtgatgga 17482196  T
Q  112 agaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaactt 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  17482197 agaaggtgataagctcatctttgatctcgaaaagtcatagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaactt 17482296  T
Q  209 ctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17482297 ctactattttaacatatcgctttggactgtagtcataaactatcttgactttgggatgtcatttgt 17482362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17571117 - 17570852
Alignment:
Q  12 agagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgga 111  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||||| | | |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||    
T  17571117 agagacagtataactgtcacctcattaccgtcaatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagagaacgagtgatgga 17571018  T
Q  112 agaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaactt 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  17571017 agaaggtgataagctcatctttgatctcgaaaagtcatagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaactt 17570918  T
Q  209 ctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17570917 ctactattttaacatatcgctttggactgtagtcataaactatcttgactttgggatgtcatttgt 17570852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 33639178 - 33638912
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||| ||| ||||    
T  33639178 cagagaaaatataagtgtcgcctcattgccaccgaaagagaaatctatgaaaaatacttgggtgggcagtgattcaatttctacaaagaacgtgtgatgg 33639079  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||| || ||    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33639078 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcgccgaagaatttacatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttgaact 33638979  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||| ||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  33638978 tctattattttgacgcatcgctttgaactataatcgtaaactatcttgactttggaatgtcatttgt 33638912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23300221 - 23299957
Alignment:
Q  13 gagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaa 112  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  23300221 gagaaaatataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagaaagctatgaaaaatacttgggagggcagtggttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaa 23300122  T
Q  113 gaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  ||||||||||||    |||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23300121 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaaatcatcgaagaacttgcatgttcgagttgttcgaaagtagatctttgatgctgaactatttgaacttc 23300022  T
Q  210 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
     ||||||||| || ||||||||||| ||||| | || ||||||||   ||||||||| |||||||    
T  23300021 aactattttgacgcatcgctttggattgtaaccatatactatcttaagtttgggatgccatttgt 23299957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 261
Target Start/End: Original strand, 14308690 - 14308943
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| | ||||||||||  |||||||||||||| |||| |  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  || ||||    
T  14308690 cagagacaatataattgtcatctcattaccgccgatagagaaatctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagataacgagtgatgg 14308789  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||||    
T  14308790 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaact 14308889  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttg 261  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  14308890 tctactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttg 14308943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 117 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 4481784 - 4481624
Alignment:
Q  117 gtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctact 213  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||   |||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  4481784 gtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaaattgcacgttcgagttgttccaaagtagacctttgttgctgaactatttgaacttctatt 4481685  T
Q  214 attttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4481684 attttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 4481624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 111 - 274
Target Start/End: Original strand, 17469607 - 17469773
Alignment:
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| | |||    |||| ||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||    
T  17469607 aagaaggtggtaagctcatattttatctcgaaaagtcacagaagaaatagcaaattcgagctgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaact 17469706  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  17469707 tctactattttgacgtaccgctttggactgtagtcgcaaactatcatgactttgggatgtcatttgt 17469773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 111 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17583607 - 17583441
Alignment:
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| | |||    |||| ||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||    
T  17583607 aagaaggtggtaagctcatattttatctcgaaaagtcacagaagaaatagcaaattcgagctgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaact 17583508  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  17583507 tctactattttgacgtaccgctttggactgtagtcgcaaactatcatgactttgggatgtcatttgt 17583441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 164 - 274
Target Start/End: Original strand, 42917710 - 42917820
Alignment:
Q  164 cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttggg 263  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  42917710 cgagttcttccaaagtagatctttgctgctgaagtatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcacaaactatcttgactttggg 42917809  T
Q  264 atgtcatttgt 274  Q
    ||| |||||||    
T  42917810 atgacatttgt 42917820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 111 - 274
Target Start/End: Original strand, 11499718 - 11499884
Alignment:
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||||    
T  11499718 aagaaggtggtaagctcgtctttgatctcgaaaggtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaact 11499817  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| | |||| | ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  11499818 tctactattttgacgtatcgatttgcattgtagtggtaaactattttgactttgggatctcatttgt 11499884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 162
Target Start/End: Original strand, 19520926 - 19521077
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| | ||||| ||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| ||| || |||  || ||||    
T  19520926 cagagacaatataaatgtcaactcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtggccagtgattcaatttatgcagataacgagtgatgg 19521025  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca 162  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||  ||||||||||||    
T  19521026 aagaaggtggtaagctcatctttaatctcgaaaagtcatagaagaacttgca 19521077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 101
Target Start/End: Original strand, 42917610 - 42917700
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaac 101  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  42917610 cagagaaagtataagcgtcgcctcattaccgccgaaagagaaagctatgaaaaatacttggttgggcagtgattcaatttctgcagagaac 42917700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 204 - 274
Target Start/End: Original strand, 19521082 - 19521152
Alignment:
Q  204 aacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19521082 aacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagttgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 19521152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23626831 - 23626565
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |    
T  23626831 cagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggaagggcagtggttcaatttctgcagagaacgtgtcatag 23626732  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23626731 aagaaggtgataagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaaatagatctttgctgctgaactatttgaact 23626632  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23626631 tctactattttggcgtatggctttggactgtaatagtaaactatcttgtctttgggatgccatttgt 23626565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12250681 - 12250420
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  12250681 cagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgcagagaacgtgtcatgg 12250582  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||     || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12250581 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcactgaagaacttgcacgttcgagtt-----aaaatagatctttgctgctgaactatttgaact 12250487  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12250486 tctactattttggcataccgttttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgt 12250420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 39444526 - 39444787
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  39444526 cagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgcagagaacgtgtcatgg 39444625  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||     || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39444626 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcactgaagaacttgcacgttcgagtt-----aaaatagatctttgctgctgaactatttgaact 39444720  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39444721 tctactattttggcataccgttttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgt 39444787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 45294064 - 45293798
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||| || |    
T  45294064 cagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggcagtgattcaatttctgcagagaacgtgtgatag 45293965  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45293964 aagaaagtggtaagctcatctttgatcttgaaaagtcactaaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttgaact 45293865  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  45293864 tctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgacatttgt 45293798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 41907358 - 41907623
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||| ||| ||||    
T  41907358 cagacaaagtataattgtcgcctcattactgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtagtggttcaatttcagcagagaacgtgtgatgg 41907457  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41907458 aagaaggtggtaagttcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttgaact 41907557  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  41907558 tctactattttggcgtatcgctttggattgtaatcgtaaactatc-tgactttgggatgccatttgt 41907623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 19247612 - 19247878
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  19247612 cagagaaagtataagtgtcgcctcattactgccgaaatagcaagctatgaaaaatacttgggtgggcaatgattcaatttctgcagagaacatgtgatgg 19247711  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||  |||||||| ||    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19247712 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcaaaaagtcaccaaagaacttacatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaattatttgaact 19247811  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  19247812 tctactattttgacgtatcgctttggactgtaattgtaaactatcttgactttgggatgacatttgt 19247878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 19320796 - 19321062
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  19320796 cagagaaagtataagtgtcgcctcattactgccgaaatagcaagctatgaaaaatacttgggtgggcaatgattcaatttctgcagagaacatgtgatgg 19320895  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||  |||||||| ||    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19320896 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcaaaaagtcaccaaagaacttacatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaattatttgaact 19320995  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  19320996 tctactattttgacgtatcgctttggactgtaattgtaaactatcttgactttgggatgacatttgt 19321062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23967007 - 23966741
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| |||||| ||| |||     
T  23967007 cagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatttctgcagagaacgtgtgatga 23966908  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23966907 tagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaact 23966808  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23966807 tctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgt 23966741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 29433539 - 29433805
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  29433539 cagagaaagtataagtgtcgcctcattaccaccgaaagagcgagctatgaaaaatacttgggtgggcaatggttcaatttctgcagagaacgtgtaatgg 29433638  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||| || |||   |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29433639 aagaaggtggtaagctcatctttgatctggaaaagtcaccgaagaatttccacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttaaact 29433738  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  29433739 tctactattttggcgtatcgctttcgactgtaatcataaattatcttgactttgggatgccatttgt 29433805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 39204131 - 39204397
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||    
T  39204131 cagagaaagtataagtgtcgcctcattgccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggcagtggttcaatttctgtagagaacgtgtgatgg 39204230  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  39204231 aagaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagtcatcgaagaacttgcacgttcgagttgttgcaaaatagatctttgttgctaaactatttgaact 39204330  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  39204331 tctattattttggcgcatcgccttggactgtaatcgtaatctatcttgactttgggatgccatttgt 39204397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6301104 - 6300838
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| |||||| ||| |||     
T  6301104 cagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatttctgcagagaacgtgtgatga 6301005  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6301004 tagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaact 6300905  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  6300904 tctactattttgacgtatcgctttggtctgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgt 6300838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 44939942 - 44940208
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| | |||||| ||| |||     
T  44939942 cagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatttctacagagaacgtgtgatga 44940041  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44940042 tagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaact 44940141  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  44940142 tctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgt 44940208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 37029338 - 37029604
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| |||||| ||| |||     
T  37029338 cagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatttctgcagagaacgtgtgatga 37029437  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  37029438 tagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttaaact 37029537  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  37029538 tctactattttgacgtatcgttttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgt 37029604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14079317 - 14079051
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  || ||||    
T  14079317 cagagacagtataactgtcatctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagataacgagtgatgg 14079218  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||||    
T  14079217 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaact 14079118  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14079117 tctactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 14079051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22333596 - 22333342
Alignment:
Q  23 aattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaaggtggta 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  || |||||| |||||||||    
T  22333596 aattgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaaaaaggtggta 22333497  T
Q  123 agctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttg 219  Q
    | ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  ||| | |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  22333496 aactcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagttatttgttgttgaactatttgaacttctactattttg 22333397  T
Q  220 gcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
     |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22333396 acgtatcactttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 22333342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 41156139 - 41156405
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||   ||||| |||  ||     
T  41156139 cagagaaaatataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagaaagctatgaaaaatacttgggtggacagtggctcaatttctgtaaagaacgtgtgttga 41156238  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  41156239 aagaaggtggtaagctcatttttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctatgttgctgaaatatttgaact 41156338  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  41156339 tctactattttgacgcatcgttttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgt 41156405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 41976959 - 41977225
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  || || ||| ||||    
T  41976959 cagagaaaatataagtgtcgcctcattaccgccgaaagataaagttatgaaaaatacctgggtgggtagtggttcaatttctgcaaaggacgtgtgatgg 41977058  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||     ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41977059 aagaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgtttgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttgaact 41977158  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || | |||||||    
T  41977159 tctactattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgtgacgccatttgt 41977225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 33 - 274
Target Start/End: Original strand, 30825973 - 30826217
Alignment:
Q  33 tcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaaggtggtaagctcatctt 132  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  30825973 tcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtggacagtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctt 30826072  T
Q  133 tgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgct 229  Q
    ||||| | | ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  30826073 tgatctcaaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgct 30826172  T
Q  230 ttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30826173 ttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 30826217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 33424745 - 33424479
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||| ||||   ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||| | || |||  || ||||    
T  33424745 cagagacagtataactgtcatatcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcggtgattcaatttctacagataacgagtgatgg 33424646  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||||    
T  33424645 aagaaagtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaact 33424546  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33424545 tctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 33424479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 274
Target Start/End: Original strand, 41628399 - 41628657
Alignment:
Q  19 gtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaaggt 118  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  ||  |  ||||||||||||    
T  41628399 gtataactgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggtagtggttcaatttctgcagattacgagagatggaagaaggt 41628498  T
Q  119 ggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactat 215  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||    
T  41628499 ggtaagctcatccttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttattgaactatttgaacttttactat 41628598  T
Q  216 tttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  41628599 tttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgagatgtcatttgt 41628657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 42061281 - 42061015
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| |||||   ||| |||||| ||| |||     
T  42061281 cagagaaagtataagtgtcgcctcattatcgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaataaatgcagagaacgtgtgatga 42061182  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  42061181 tagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttaaact 42061082  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  42061081 tctaataaattgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgt 42061015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 266
Target Start/End: Original strand, 12759994 - 12760233
Alignment:
Q  29 cgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaaggtggtaagctca 128  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  12759994 cgcctcattacggccgaaagagaaagctatgaaaaatatttgggcgg-cagtggttcaatttctgcaaagaacctgtgatggaagaaggtggtaagctca 12760092  T
Q  129 tctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtat 225  Q
    ||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||     ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||    
T  12760093 tctttgatttcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgtttgagttgttccaaagtagatctttgttgctgaactatttgaacttatactattttgacgcat 12760192  T
Q  226 cgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatg 266  Q
     | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12760193 tgttttggactgtaatcgtaaattatcttgactttgggatg 12760233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6477979 - 6477714
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| || |||| ||||  ||||||||| |||| | |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||||    
T  6477979 cagagacagcataactgtcatctcattaccaccgataaagcaagctatgaaaattatttggatgggcagtggttcaatttctgcagataacgagtgatgg 6477880  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    | |||| |    || |||||||||| || |||||||||||||||    
T  6477879 aaaaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcaagttatctatag-tagatctttgttgttgaactatttgaact 6477781  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  6477780 tctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgtgatgtcatttgt 6477714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 42811422 - 42811157
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||| |||||  |||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| || || |||  || ||||    
T  42811422 cagagacaatataattgtcacctcattatcgccgttagagcaagctatgaaaattacttgcgtgggcagtggttcaatttc-gcagataacgagtgatgg 42811324  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcacc---gagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||     ||||||||||||  |||||||||| || |||| ||||||||||    
T  42811323 aagaaggtggtaaactcatctttgatatcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaattatttgaact 42811224  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  42811223 tctactattttgacgtatcactttggattgtagtcgtaaactatcttcactttgggatgtcatttgt 42811157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19396014 - 19395784
Alignment:
Q  47 agagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagt 146  Q
    |||||| |||||||||| | ||| | |||| ||||||||||||||| |  | |||   | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  19396014 agagcaagctatgaaaatttctttggtggggagtggttcaatttctacaaataacgaatgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagt 19395915  T
Q  147 cactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcg 243  Q
    ||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||    
T  19395914 cacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttaaacttctaccattttgacgcatcgctttggactgtagtcg 19395815  T
Q  244 taaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  19395814 taaactatcttaactttgggatatcatttgt 19395784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 38961676 - 38961935
Alignment:
Q  12 agagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgga 111  Q
    ||||| ||||||| |||| ||| |||||||  || ||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||  || |||||    
T  38961676 agagacagtataactgtcaccttattaccgttgatagagcaaactatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttatgcagataacgagtgatgga 38961775  T
Q  112 agaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaactt 208  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||  ||| |||||||    |||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  38961776 agaaggtggtgatctcatctttgatctcgaaaagtcacataagtacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaactt 38961875  T
Q  209 ctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||      | || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38961876 ctactattttgacgtatcgttttg------agtcataaactatcttgactttgggatgtcatttgt 38961935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 38992020 - 38992279
Alignment:
Q  12 agagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgga 111  Q
    ||||| ||||||| |||| ||| |||||||  || ||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||  || |||||    
T  38992020 agagacagtataactgtcaccttattaccgttgatagagcaaactatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttatgcagataacgagtgatgga 38992119  T
Q  112 agaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaactt 208  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||  ||| |||||||    |||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  38992120 agaaggtggtgatctcatctttgatctcgaaaagtcacataagtacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaactt 38992219  T
Q  209 ctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||      | || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38992220 ctactattttgacgtatcgttttg------agtcataaactatcttgactttgggatgtcatttgt 38992279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23523033 - 23522863
Alignment:
Q  107 atggaagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||| ||||||||  |||||||||| || |||||||||||    
T  23523033 atggaagaaggtggtaagctcatatttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagctgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttg 23522934  T
Q  204 aacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  23522933 aacttctactattttgacgtaccgctttggactgtagtcgcaaactatcaagactttgggatgtcatttgt 23522863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22947168 - 22947023
Alignment:
Q  132 ttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgc 228  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||  |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22947168 ttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttcaaaagtagatctttggtgcttaactatttgaacatctactattttgacgtatcgc 22947069  T
Q  229 tttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||    
T  22947068 tttgcactgtaatcgtaaactatattgactttgggaagccatttgt 22947023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 44383427 - 44383308
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    ||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||  | | ||||||||||||||  | ||| ||| ||||    
T  44383427 cagagaaaaaataagtgtcgcttcattaccgccgaaagagaaagatatgaaaaatacttgggtgaacgggggttcaatttctgcaaaaaacgtgtgatgg 44383328  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatc 130  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  44383327 aagaaggtggtaagctcatc 44383308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 35)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 26870798 - 26870537
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  26870798 cagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgcagagaacgtgtcatgg 26870699  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||     || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26870698 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcactgaagaacttgcacattcgagtt-----aaaatagatctttgctgctgaactatttgaact 26870604  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26870603 tctactattttggcataccgttttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgt 26870537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 1944266 - 1944533
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaattt-ctgctgagaacatgtcatg 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||| || ||| ||| |||    
T  1944266 cagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatactttggttggcagtggttcaattttctgcagaaaacgtgtgatg 1944365  T
Q  110 gaagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcacc---gagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaac 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||    |||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1944366 gaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcatcgaagaacttgcacgtttgagttgatccaaaatagatctttgttgttgaactatttgaac 1944465  T
Q  207 ttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1944466 ttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 1944533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3839882 - 3839619
Alignment:
Q  14 agaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaag 113  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||    
T  3839882 agaaagcataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagagagcgtgtgatggaag 3839783  T
Q  114 aaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttct 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || || |||| ||| ||||| |||   |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3839782 aaggtggtaagctcatctttgatctggaaaattcaccgaaaaacttccacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttaaacttct 3839683  T
Q  211 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  3839682 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaattatcttgactttgggatgccatttgt 3839619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 15520491 - 15520757
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| |||||| ||| |||     
T  15520491 cagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatttctgcagagaacgtgtgatga 15520590  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15520591 tagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttaaact 15520690  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  15520691 tctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgt 15520757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 740924 - 740658
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| |||||| ||| |||     
T  740924 cagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatttctgcagagaacgtgtgatga 740825  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||  || || |||||||||||||||||||||||    
T  740824 tagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtaaatatttgctgctgaactatttgaact 740725  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  740724 tctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcataaactattttgactttgggatgtcatttgt 740658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 40621923 - 40622188
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  40621923 cagagaaaatataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagaaagttatgaaaaatacttgggtggacagtgtttcaatttctgcacagaacatgtgatgg 40622022  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40622023 aagaaggtggtaa-ctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttgaact 40622121  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    | | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40622122 ttttctattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgagtttgggatgtcatttgt 40622188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 47720582 - 47720317
Alignment:
Q  12 agagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgga 111  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||| |||||    
T  47720582 agagaaaatataagtgtcgccccattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttggatggacagtggttcaatttcagcagagaacgtgtgatgga 47720483  T
Q  112 agaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaactt 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||   ||||||||||||   |||||||||| ||  |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  47720482 agaaggtggtaagcttatctttgatctcgaaaagtcatcaaagaacttgcacgttcgagttgttcaaaagtagatctttgttgttgaactatttgaactt 47720383  T
Q  209 ctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  47720382 ctactattttagcgtatcgctttggattgttatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgt 47720317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 54332157 - 54331891
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  || ||||    
T  54332157 cagagacagtataattgtcatctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagataacgagtgatgg 54332058  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||||    
T  54332057 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcaaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaact 54331958  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54331957 tctactattttgacgtatcgctttgaactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 54331891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 13627827 - 13628093
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||| || |||| || ||||    
T  13627827 cagagacagtataattgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttaggtgggcggtggttcaatttctgcagataacaagtgatgg 13627926  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||| |    |||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||    
T  13627927 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagacacagaagaacttgaaaattcgagttgttccaaggtagatctttgttcttgaactatttgaact 13628026  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  13628027 tctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttaagatgtcatttgt 13628093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 33503512 - 33503246
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  || ||||    
T  33503512 cagagaaagtataactgtcacctcattaccgccgatagagcaagctacgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagataacgagtgatgg 33503413  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||  |||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||    
T  33503412 aagaaggtgataagctcatctttgatttcgaaaagtcacataagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaact 33503313  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  33503312 tctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttaactttgggatgtcatttgt 33503246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 34057077 - 34056811
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  || ||||    
T  34057077 cagagacagtataactgtcatctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagataacgagtgatgg 34056978  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||||    
T  34056977 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaact 34056878  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34056877 tctactattttgatgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 34056811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 574659 - 574395
Alignment:
Q  12 agagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgga 111  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  574659 agagaaaatataagtgtcgtctcat-atcgccgaaatagaaagctatgaaaaatacttgggtgggcagtgattcaatttctgcaaagaacatgtgatgga 574561  T
Q  112 agaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaactt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  574560 agaaggtggtaagctcatctttgatttcgaaaaatcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctggtgaactatttgaactt 574461  T
Q  209 ctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  574460 ctactattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatatcatttgt 574395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19831904 - 19831645
Alignment:
Q  18 agtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaagg 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  || |||  || |||||||||||    
T  19831904 agtataattgtcacctcattaccgtcgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgtagataacgagtgatggaagaagg 19831805  T
Q  118 tggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctacta 214  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  || ||||||| || |||||||||||||||||| |||    
T  19831804 tggtaagctcatatttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtaaatctttgttgttgaactatttgaacttcttcta 19831705  T
Q  215 ttttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19831704 ttttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 19831645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 37702104 - 37701847
Alignment:
Q  20 tataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaaggtg 119  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||  || |||  || |||||||||||||    
T  37702104 tataattgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggaagtggttcaatttctgtagataacgagtgatggaagaaggtg 37702005  T
Q  120 gtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactatt 216  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  37702004 gtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttaaactatttgaacttctactatt 37701905  T
Q  217 ttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37701904 ttgacgtattgctttggactgtagccgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 37701847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 55999211 - 55998946
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| | ||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  || || |    
T  55999211 cagagacattataactgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagataacgagtgatag 55999112  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||||    
T  55999111 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttcaact 55999012  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttg 273  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  55999011 tctactagtttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaattatcttgactttgggatgtcatttg 55998946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 35708142 - 35707876
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||    
T  35708142 cagagaaaatataagtgtcgtctcattaccgccgaaagagaaaactatgaaaaatacttgggtgggcagtgattcaatttctgcaaagaacgtgtgatgg 35708043  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  35708042 aagaaggtggtatgctcatctttgatttcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctggtgaaatatttgaact 35707943  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  35707942 tttactattttgacgcatcactttgaactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgt 35707876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 38007619 - 38007885
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| | ||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||  || ||||    
T  38007619 cagagacaatataactgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaaatacttggatgggcagcgattcaatttctgcagataacgagtgatgg 38007718  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||    
T  38007719 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaact 38007818  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| |||||| || || |||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  38007819 tctactattttgacgtatctctctgtactgtagtcgtaaactatcttaacttagggatgtcatttgt 38007885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14830025 - 14829759
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  || ||||    
T  14830025 cagagacagtataattgtcatctcattatcgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagataacgagtgatgg 14829926  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  ||||| |||| || |||||||||| ||||    
T  14829925 gagaaggtggtaagctcatctttgatctcaaaaagtcacagaagaacttgcaagttcgagttgttccaaagtagatatttgttgttgaactattttaact 14829826  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14829825 tttactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 14829759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 270
Target Start/End: Original strand, 23478685 - 23478947
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||| || |||  || ||||    
T  23478685 cagagacagtataaatgtcatctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgagcagtggttcaatttatgcagataacgagtgatgg 23478784  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||||    
T  23478785 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacaaaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaact 23478884  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcat 270  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23478885 tctactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcat 23478947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 39743260 - 39742994
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| || |||  ||  |||    
T  39743260 cagagacagtataactgtcacctcattaccgccgatagagcaagttatgaaaattacttaggtgggcagtggttcaatttctgcagataacgagtggtgg 39743161  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcaccg---agttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||      |||||||||||  |||||||||| || |||||| ||||||||    
T  39743160 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacaaaagaacttgcaaatttaagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactgtttgaact 39743061  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39743060 tctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 39742994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 274
Target Start/End: Original strand, 17698959 - 17699217
Alignment:
Q  19 gtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaaggt 118  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||| | |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  || || |||||||||    
T  17698959 gtataactgtcacctcattacggccgataaagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagataacgagtgatagaagaaggt 17699058  T
Q  119 ggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactat 215  Q
     |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||| |||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  17699059 agtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaaaaactagcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttctactat 17699158  T
Q  216 tttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17699159 tttgacgtatcgctttagactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 17699217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 35496049 - 35495791
Alignment:
Q  19 gtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaaggt 118  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||  || ||||||||||||    
T  35496049 gtataactgtcacctcattaccgacgatagagcaagctatgaaaattacttgggtggacagtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggt 35495950  T
Q  119 ggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactat 215  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||| ||  |||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||    
T  35495949 ggtaaactcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcaaaagtagatctttgttgttgaactatttaaacatctactat 35495850  T
Q  216 tttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35495849 tttgacgtatcgctttggaatgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 35495791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 267
Target Start/End: Original strand, 36856870 - 36857122
Alignment:
Q  18 agtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaagg 117  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  || ||||||||| |    
T  36856870 agtataactgccacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaag 36856969  T
Q  118 tggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctacta 214  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||  |||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  36856970 tggtaagctcatctttgatatcgaaaagtcacaaaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttctacta 36857069  T
Q  215 ttttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgt 267  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  36857070 ttttgacgtatcactttggactgtagttgtaaactatcttgactttgggatgt 36857122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 28135580 - 28135314
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| | ||||| |||| ||||||||||| ||| ||| || |||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||  | |||  || ||||    
T  28135580 cagagacaatataactgtcacctcattaccgtcgatagaacaagctatgaaagttacttaggtgggcagtggttcaatttctgcatataacgagtgatgg 28135481  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||    
T  28135480 aagaagttggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttacaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaact 28135381  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28135380 tctactattttgacgtattgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 28135314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 55 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 41984703 - 41984481
Alignment:
Q  55 ctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaag 154  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||| || |    
T  41984703 ctatgaaacatacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagagaaagtgtgaaggaagaaggtagtaagctcatcattgatcttgaaaagtcaccgatg 41984604  T
Q  155 aacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactat 251  Q
    |||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41984603 aacttgcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacatatcgctttggactgtaatcataaactat 41984504  T
Q  252 cttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||| |||| ||||| |||||||    
T  41984503 cttgacttttggatgccatttgt 41984481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 255
Target Start/End: Original strand, 17739815 - 17740061
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  ||||  ||| ||||    
T  17739815 cagagaaaatataagtgtcgtctcattaccgtcgaaagagaaagctatgaaaaatacttgg-tggatagtggttcaatttctgcaaagaatgtgtgatgg 17739913  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||| ||||||| ||||    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  17739914 aagaaggtggtaagctcatatttgatctggaaaagtcaccgaagaacatgcatgttcgagttgttccaaagtatatctttgctgctgaactatttgaact 17740013  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttg 255  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17740014 tctactattttgacgcatctctttggaatgtaatcgtaaactatcttg 17740061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 53342185 - 53342450
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||| ||  || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || || |||  || ||||    
T  53342185 cagagacagtataactgtcacctcattaccgacgatag--caagctaagaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttccgcagataacgagtgatgg 53342282  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgct-gaactatttgaac 206  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| |  | |||||||||||||    
T  53342283 aagaaggaggtaagctcatctttgatctcgagaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttttttgaactatttgaac 53342382  T
Q  207 ttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  53342383 ttctactattttgacgcatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgt 53342450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 7644298 - 7644044
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||| |||| | |||||||| | || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||        || || |||  || ||||    
T  7644298 cagagacagtataactgtcacttcattacctctgatagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggcagtggtt--------gcagataacgagtgatgg 7644207  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||    
T  7644206 aagaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaact 7644107  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcat 270  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  7644106 tctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgcgatgtcat 7644044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 274
Target Start/End: Original strand, 8530620 - 8530857
Alignment:
Q  26 tgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaaggtggtaagc 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||| ||||||||     
T  8530620 tgtcgcctcattaccgtcgaaagagaaagctatgaaaaatatttgggtgggcagtggttcaatttctgcaaagaacgtgtgatggaagaaagtggtaagt 8530719  T
Q  126 tcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcg 222  Q
    |||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||              |||||||||||||||| ||    
T  8530720 tcatctttgatctcgaaaattcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgc--------------aacttctactattttgacg 8530805  T
Q  223 tatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  8530806 catcgctttggactgtaatcgtaaacaatcttgactttgggatgtcatttgt 8530857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 2776163 - 2776333
Alignment:
Q  107 atggaagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||    
T  2776163 atggaagaaggtggtaagctcatatttgatctcgaaaagtcacagaagaaattgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttg 2776262  T
Q  204 aacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2776263 aacttctactattttgacgtaccgctttggactgtagtcacaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 2776333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5272693 - 5272523
Alignment:
Q  107 atggaagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||     
T  5272693 atggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcgcagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttt 5272594  T
Q  204 aacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  5272593 aacttctactattttgatgtatcgctttagactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgt 5272523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22116458 - 22116288
Alignment:
Q  107 atggaagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  ||||| |||| || |||||||||||    
T  22116458 atggaagaaggtggtaagctcatatttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatatttgttgttgaactatttg 22116359  T
Q  204 aacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22116358 aacttctactattttgacgtaccgctttggactgtagtcacaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 22116288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 111 - 274
Target Start/End: Original strand, 21352974 - 21353140
Alignment:
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||| |    
T  21352974 aagaaggtggtaagcccatatttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaaat 21353073  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21353074 tctactattttgacgtaccgctttggactgtagtcacaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 21353140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 198 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 47557749 - 47557673
Alignment:
Q  198 tatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  47557749 tattttaacttctactattttgatgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgt 47557673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 53991541 - 53991495
Alignment:
Q  228 ctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||    
T  53991541 ctttggactgtaatcgtaaactatcttgattttggaatgccatttgt 53991495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 1095 - 1356
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  1095 cagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgtagagaacgtgtcatgg 1194  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||     || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1195 aagaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagtcactgaagaacttgcacgttcgagtt-----aaaatagatctttgctgctgaactatttgaact 1289  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1290 tctactattttggcataccgttttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgt 1356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 65134 - 64867
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaattt-ctgctgagaacatgtcatg 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||| || ||| ||| |||    
T  65134 cagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatactttggttggcagtggttcaattttctgcagaaaacgtgtgatg 65035  T
Q  110 gaagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcacc---gagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaac 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||    |||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  65034 gaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcatcgaagaacttgcacgtttgagttgatccaaaatagatctttgttgttgaactatttgaac 64935  T
Q  207 ttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  64934 ttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 64867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 152653 - 152388
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||  | ||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||    
T  152653 cagagaaagtataagtgtcgcctcattacctccgaaagagcaagctatgaaaaatactaggg-gcgcagtggtttaatttctgcagagaacgtgtgatgg 152555  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |  |||||||||||||   |||| |||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  152554 aagaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagttatcgaagaacttgcacgttcgagctgttccaaaatatatctttgctgttaaactatttgaact 152455  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  152454 tctactattttggcgtatccctttggactgtaatcgtaacctatcttgactttggaatgtcatttgt 152388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 15315014 - 15315280
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| | |||||| ||| ||||    
T  15315014 cagagaaagtataagtgtcgcgtcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttaggtgggcattggttcaatttctacagagaacgtgtgatgg 15315113  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15315114 aagaaggtggaaagctcatctttgatctcgaaaagtcatcgaagaatttgcacgttcgagttgttccaaaatagatctttgctgctgaactatttgaact 15315213  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  15315214 tctactattttgacatatcggtttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgt 15315280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 18111350 - 18111616
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| |||||| ||| |||     
T  18111350 cagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatttctgcagagaacgtgtgatga 18111449  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18111450 tagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaact 18111549  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18111550 tctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgt 18111616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 43255171 - 43254905
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| |||||| ||| |||     
T  43255171 cagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatttctgcagagaacgtgtgatga 43255072  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43255071 tagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaact 43254972  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  43254971 tctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgt 43254905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 50395585 - 50395319
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| |||||| ||| |||     
T  50395585 cagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatttctgcagagaacgtgtgatga 50395486  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50395485 tagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaact 50395386  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  50395385 tctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgt 50395319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 34687351 - 34687617
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  || ||||    
T  34687351 cagagacagtataactgtcatctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagataacgagtgatgg 34687450  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||||    
T  34687451 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaact 34687550  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34687551 tctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 34687617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 50560806 - 50561072
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||    
T  50560806 cagagaaaatataagtgtcgcctcattacccccgaaagagaaagctatgaaaaatacttgagtgggcagtggttcaatttctgcaaagaacgtgtgatgg 50560905  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||| || |||  ||||||||||||   ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50560906 aagaagatggtaaactcatctttgatctcgaaaattcagcgaagaacttgcatgtccgagttgttctaaagtagatctttgctgctgaactatttgaact 50561005  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  50561006 tctactattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgt 50561072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 18813983 - 18814249
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  || ||||    
T  18813983 cagagacagtataactgtcatctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagataacgagtgatgg 18814082  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||||    
T  18814083 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaact 18814182  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18814183 tctactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 18814249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 28566205 - 28565939
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| || | || ||||||||||| ||||| | |||||| ||| ||||    
T  28566205 cagaaaaagtataagtgtcgcctcattacctccgaaagatcaagctatgaaaaataattaggtgtgcagtggttcagtttcttcagagaacgtgtgatgg 28566106  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||   |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28566105 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagttattgaagaacttgcacgttcgagctgttccaaaatatatctttgctgctgaactatttgaact 28566006  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  28566005 tctactattttggcgtatctctttggactataatcgtaacctatcttgactttgggatgccatttgt 28565939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 32 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16032070 - 16031825
Alignment:
Q  32 ctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaaggtggtaagctcatct 131  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||  | ||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16032070 ctcattaccaccgaaagagcaagctatgaaaaatatttgggcgagcaatggttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatct 16031971  T
Q  132 ttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgc 228  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16031970 ttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagtagatcttttctactgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgc 16031871  T
Q  229 tttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  16031870 tttggactgtaatcgtaaactatattgactttgggatgccatttgt 16031825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 274
Target Start/End: Original strand, 52309601 - 52309864
Alignment:
Q  14 agaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaag 113  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||||||    
T  52309601 agaaaatataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagaaagctatgaaaaatacttgggtggacagtgtttcaatttctgcaaagaacgtgtgatggaag 52309700  T
Q  114 aaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  52309701 aaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagttgatatttgctgatgaactatttgaacttct 52309800  T
Q  211 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||    
T  52309801 actattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttaagaagtcatttgt 52309864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13662891 - 13662626
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||  | ||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||    
T  13662891 cagagaaagtataagtgtcgcctcattacctccgaaagagcaagctatgaaaaatactaggg-gcgcagtggtttaatttctgcagagaacgtgtgatgg 13662793  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |  |||||||||||||   |||| |||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  13662792 aagaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagttatcgaagaacttgcacgttcgagctgttccaaaatatatctttgctgttaaactatttgaact 13662693  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  13662692 tctactattttggcgtatccctttggactgtaatcgtaacctatcttgactttggaatgtcatttgt 13662626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 31619453 - 31619719
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  || ||||    
T  31619453 cagagacagtataattgtcatctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagataacgagtgatgg 31619552  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||||    
T  31619553 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaagttcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaact 31619652  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31619653 tttactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgattttgggatgtcatttgt 31619719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 51966219 - 51965953
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttgga-tgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatg 109  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||    
T  51966219 cagagaaaatataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagaaagctatgaaaaatacttggggtgggcagtggttcaatttctgcaaagaacgtgtgatg 51966120  T
Q  110 gaagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaac 206  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||    |||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  51966119 gaa-aaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaaattgcatgttcgagtttttccaaagtagatctttgttgctgaactatttgaac 51966021  T
Q  207 ttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  51966020 ttctactattttgacgcatcactttggattgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgt 51965953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 10763146 - 10763412
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |  ||||| ||| ||||    
T  10763146 cagagaaaatataagtgtcgtctcattaccgccgaaagagaaaactatgaaaaatactcgggtgggcagtgattcaatttctacaaagaacgtgtgatgg 10763245  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10763246 aagaaggtggtaagctcatctttgatttcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctggtgaactatttgaact 10763345  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    | |||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10763346 tttactattttgacgcatcattttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 10763412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 32 - 274
Target Start/End: Original strand, 36681029 - 36681274
Alignment:
Q  32 ctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaaggtggtaagctcatct 131  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  36681029 ctcattaccaccgaaagagcaagctatgaaaaatagttgggtgggcaatggttcaatttctacggagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagttcatct 36681128  T
Q  132 ttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgc 228  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||||   | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |    
T  36681129 ttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcaagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactattttaacttctactattttgatgtatctc 36681228  T
Q  229 tttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  36681229 tttggactgtaatcgtaaactatattgactttggaatgtcatttgt 36681274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 32 - 274
Target Start/End: Original strand, 17671092 - 17671336
Alignment:
Q  32 ctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaaggtggtaagctcatct 131  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |    
T  17671092 ctcattaacaccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggcaatggttcaatttca-cagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcacat 17671190  T
Q  132 ttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgc 228  Q
    || ||| ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17671191 tttatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacatatcgc 17671290  T
Q  229 tttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  17671291 tttggactgtaatcgtaaactatattgactttgggatgccatttgt 17671336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 29841173 - 29840907
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||    
T  29841173 cagagaaaatataagtgtcgtctcattaccgtcgaaagagaaaactatgaaaaatacttgggtgggcagtgattcaatttctgcaaagaacgtgtgatgg 29841074  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29841073 aagaaggtggtaagctcatctttgatttcgaaaaatcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctagtgaactatttgaact 29840974  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    | |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  29840973 tttactattttgacgcatcactttggactgtaatcgtaaactattttgactttggtatgtcatttgt 29840907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 48340093 - 48340359
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  48340093 cagagacagtataactgtcgccacattacagccgatcgagcaagctatgaaaaatacttgggtgagcagtggttcaatttctgcagagaacgagtgatgg 48340192  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||  |||||||||||||   ||||||||| |||  |||||||| | || |||||||||||||||    
T  48340193 aagaaggtggtaagttcatctttgatctcaaaaagtcatagaagaacttgcacgttcgagttgtttcaaagtagatcttagttgttgaactatttgaact 48340292  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  48340293 tctactattttgacgtatcgctttggactgtagttgtaaactatcttgactttgggatgccatttgt 48340359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Original strand, 12714244 - 12714505
Alignment:
Q  14 agaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaag 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  12714244 agaaagtataagtgtcgcctcattacctccgaaagagcaagctttgaaaaatacttaggtgcgcagtggttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaag 12714343  T
Q  114 aaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || | |  |||||||||||||   |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12714344 aaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaatttatcgaagaacttgcacgttcgagctgttccaaaatatatctttgatgctgaactatttgaacttct 12714443  T
Q  211 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcattt 272  Q
    ||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||    
T  12714444 actattttttcgtattgctttgggatgtaatcgtaacttatcttgactttgggatgccattt 12714505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 32 - 274
Target Start/End: Original strand, 45004518 - 45004763
Alignment:
Q  32 ctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaaggtggtaagctcatct 131  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  45004518 ctcattaccaccgaaagagcaagctatgaaaaatagttgggtggacaatggttcaatttctacagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagttcatct 45004617  T
Q  132 ttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgc 228  Q
    |||||| ||| |||||||  ||||||||||||   | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||| |    
T  45004618 ttgatctcgaaaagtcaccaaagaacttgcacgttcaagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactattttaacttctactcttttgatgtatctc 45004717  T
Q  229 tttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  45004718 tttggactgtaatcgtaaactatattgactttgggatgtcatttgt 45004763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 34691879 - 34692145
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||| ||||  ||||||||| || | |||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||  || |||  || ||||    
T  34691879 cagagacagtataactgtcatctcattaccaccaatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggaagtggttcaatttctgtagataacgagtgatgg 34691978  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||||    
T  34691979 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaact 34692078  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34692079 tctaatattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 34692145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 52522054 - 52521788
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||| ||| ||||  ||||||||| ||||  ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  || ||||    
T  52522054 cagagacagtgtaactgtcatctcattaccaccgatggagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagataacgagtgatgg 52521955  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||  ||||    
T  52521954 aagaaggtggcaaactcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattataact 52521855  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52521854 tctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 52521788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 42682154 - 42682416
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||    
T  42682154 cagagaaaatataagtgtcgtctcattaccgccgaaagagaaaactatgaaaaatacttgggtgggcagtgattcaatttctgcaaagaacgtgtgatgg 42682253  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    |||||||||||||||||||    |||   || ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42682254 aagaaggtggtaagctcat----gattttgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctggtgaactatttgaact 42682349  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    | |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  42682350 tttactattttgacgcatcactttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgt 42682416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 41963409 - 41963150
Alignment:
Q  18 agtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaagg 117  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||   || |||||||||||    
T  41963409 agtataactgtcatctcattaccgccgatagagcaaactatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagataaagagtgatggaagaagg 41963310  T
Q  118 tggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctacta 214  Q
     | ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    ||| |||||||||  |||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  41963309 agttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgatttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaacttctacta 41963210  T
Q  215 ttttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41963209 ttttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 41963150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 41830535 - 41830269
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||| || |||  || ||||    
T  41830535 cagagacagtataactgtcatctcattaccgccgatacagcaagctatgaaaattacttgggtgggcactagttcaatttatgcagataacgagtgatgg 41830436  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||||    
T  41830435 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaact 41830336  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  41830335 tctactattttgatgtatcactttggtctgtagtcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgt 41830269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 38845702 - 38845483
Alignment:
Q  19 gtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaaggt 118  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| || | |  || ||||||||||||    
T  38845702 gtataactgtcacctcattaccgccgatagagcaagctataaaaattacttgggtgggaagtggttcaatttctgcagatagcgagtgatggaagaaggt 38845603  T
Q  119 ggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactat 215  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||| ||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  38845602 ggtaagctcatctctgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttattccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttctactat 38845503  T
Q  216 tttggcgtatcgctttggac 235  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  38845502 tttgacgtatcgctttggac 38845483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12246231 - 12246061
Alignment:
Q  107 atggaagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  12246231 atggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttcaaaagtagatctttggtgcttaactatttg 12246132  T
Q  204 aacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  12246131 aacatctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatattgactttgggatgccatttgt 12246061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 112 - 274
Target Start/End: Original strand, 24294394 - 24294559
Alignment:
Q  112 agaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaactt 208  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24294394 agaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaactt 24294493  T
Q  209 ctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24294494 ctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttaactttgggatgtcatttgt 24294559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 44406235 - 44406405
Alignment:
Q  107 atggaagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttg 203  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||    
T  44406235 atggaagaacgtggtaaactcatatttgatctcgaaaagtcacagaataacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttg 44406334  T
Q  204 aacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44406335 aacttctactattttgacgtaccgctttggactgtagtcgcaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 44406405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 185 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 39760459 - 39760370
Alignment:
Q  185 tttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  39760459 tttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttaactttgggatgtcatttgt 39760370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 272
Target Start/End: Original strand, 47135361 - 47135428
Alignment:
Q  205 acttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcattt 272  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  47135361 acttgtactattttgacgcatcgctttggaccgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccattt 47135428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 30496 - 30230
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  30496 cagagaaagtataagtgtcacctcattaccgccaaaagagcaagctatgaaaaatacttggatgggcagtgattcaatttctgcagagaacgtgtgatgg 30397  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||  |||||||||||     ||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  30396 aagaaggtgataagctcatctttgatcttgaaaagtcaccaaagaacttgcatgtttgagttgttccaaagtagatctttactgctaaactatttgaact 30297  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  30296 tctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgacatttgt 30230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 21)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13457351 - 13457085
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| |||||| ||| |||     
T  13457351 cagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatttctgcagagaacgtgtgatga 13457252  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13457251 tagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaact 13457152  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  13457151 tctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgt 13457085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 14831225 - 14831491
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||| ||| ||||    
T  14831225 cagagaaaatataagtgtcacctcattaccgccgaaagagaaagctatgaaaaatacttgggtggacagtggttcaatttcttcaaagaacgtgtgatgg 14831324  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||    
T  14831325 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcactgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaact 14831424  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14831425 tctactattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgt 14831491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1073770 - 1073504
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  || ||||    
T  1073770 cagagacagtataactgtcatctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagataacgagtgatgg 1073671  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||||    
T  1073670 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaact 1073571  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1073570 tctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 1073504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 33321957 - 33321694
Alignment:
Q  14 agaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaag 113  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || |||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||    
T  33321957 agaaaatataagtgtcgcctcattatcgtcgaatgagaaagctatgaaaaatacttgggtgggcagtggttcaatttctgcaaagaacgtgtgatggaag 33321858  T
Q  114 aaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttct 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33321857 aaggtggtaagttcatctttgatctcgagaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgttgctgaactatttgaacttct 33321758  T
Q  211 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33321757 actattttgacgcatcgctttggactgtaatcataaactatcttgagtttgggatgtcatttgt 33321694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 15275398 - 15275664
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  15275398 cagagacattataattgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaaatacttgggtgagcagtggttcaatttctgcagagaacgagtgatgg 15275497  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||     ||||||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||||    
T  15275498 aagaaagtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcactgaagaacttgcatatttgagttgttcgaaagtagatctttgttgttgaactatttgaact 15275597  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15275598 tatattattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 15275664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18599493 - 18599227
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  || ||||    
T  18599493 cagagacagtataactgtcatctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagataacgagtgatgg 18599394  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||||    
T  18599393 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaact 18599294  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18599293 tctactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 18599227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 274
Target Start/End: Original strand, 17939269 - 17939528
Alignment:
Q  18 agtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaagg 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||    
T  17939269 agtataattgtcacctcattaccgccaatagagcaagctatgaaaattacttgggtgagcagtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaagg 17939368  T
Q  118 tggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctacta 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17939369 tggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaataacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttctacta 17939468  T
Q  215 ttttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17939469 ttttgacgtatcgttttggactttagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 17939528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 266
Target Start/End: Original strand, 34320832 - 34321090
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||||  ||| ||||    
T  34320832 cagagaaagtataagtgtcgtctcattaccgccgaaagagcatgctgtgaaaaatacttggaagggcaatgattcaatttctgcatagaatgtgtgatgg 34320931  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| || ||||  |||||||||||    ||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34320932 aagaaggtgataatctcatctttgatctcgaaaaatcaccaaagaacttgcatgttcgagttgttccatagtagatctttgttgctgaactatttgaact 34321031  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatg 266  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34321032 tctactattttgacgtatcgctttggattgtaatcgtaaactatcttgactttgggatg 34321090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 274
Target Start/End: Original strand, 34855702 - 34855961
Alignment:
Q  18 agtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaagg 117  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||    
T  34855702 agtataactgtcatctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaagg 34855801  T
Q  118 tggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctacta 214  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  34855802 tggtaagctcattttttatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaacttctacta 34855901  T
Q  215 ttttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34855902 ttttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 34855961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14888444 - 14888178
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  || ||||    
T  14888444 cagagacagtataactgtcatctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagataacgagtgatgg 14888345  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||||    
T  14888344 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcatagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaact 14888245  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14888244 tctactattttgatgtatcgctttggattttattcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 14888178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22374348 - 22374082
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||| || || |||  || ||||    
T  22374348 cagagacagtataactgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaaatacttgcgcgggcagtggttcattttcagcagataacgagtgatgg 22374249  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||     ||||||||||||  |||||||||  || |||||||||||||||    
T  22374248 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgttccaaagtagatcttttttgttgaactatttgaact 22374149  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22374148 tctactattttgacgtatcgctttggattgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 22374082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 32 - 274
Target Start/End: Original strand, 4424247 - 4424492
Alignment:
Q  32 ctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaaggtggtaagctcatct 131  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||  || || ||||||||||||||||||||||    
T  4424247 ctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcatataacgagtgatagaagaaggtggtaagctcatct 4424346  T
Q  132 ttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgc 228  Q
    |||||| | | |||| ||  |||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  4424347 ttgatctccaaaagttacaaaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcga 4424446  T
Q  229 tttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4424447 tttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 4424492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 2520903 - 2521170
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||| ||||  ||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | || |||  || ||||    
T  2520903 cagagacagtataactgtcatctcattaccaccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctacagataacgagtgatgg 2521002  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatc-tttgctgctgaactatttgaac 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||    ||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||| |||    
T  2521003 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacataagaacttgcaaattcgagttgttccaaaatagatcttttgttgttgaactattttaac 2521102  T
Q  207 ttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||| |||||||  |||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2521103 ttctattattttgatgtatcgttttggattgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 2521170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11935166 - 11934921
Alignment:
Q  32 ctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaaggtggtaagctcatct 131  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||| |||| ||||||| ||| || |||||| |||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  11935166 ctcattacctccgatagagcaagctattaaaattacttgggtggtcattggttctatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatct 11935067  T
Q  132 ttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgc 228  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  || ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  11935066 ttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtaaatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgacgtatcgc 11934967  T
Q  229 tttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11934966 tttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 11934921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 35040944 - 35041114
Alignment:
Q  107 atggaagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||  ||||||||||||   ||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||    
T  35040944 atggaagaaggtggtaagctcatatttgatctcgaaaagtcagagaagaacttgcaaatccgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttg 35041043  T
Q  204 aacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35041044 aacttctactattttgacataccgctttggactgtagtcgcaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 35041114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 1931776 - 1931975
Alignment:
Q  14 agaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaag 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||    
T  1931776 agaaagtataagtgtcgcctcattacctccgaaagagcaagctatgaaaaatatttgggtgggcagtggttcaatttcagcagagaacatgtgatagaag 1931875  T
Q  114 aaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttct 210  Q
    ||||||||||||||||||       ||| ||||||  |||||||||||||   |||||||||| ||  |||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  1931876 aaggtggtaagctcatct-------cgaaaagtcatcgaagaacttgcacgttcgagttgttcaaaagtagatctttattgttgaactatttgaacttct 1931968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 18311643 - 18311812
Alignment:
Q  107 atggaagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttg 203  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||    
T  18311643 atggaagaaggtggta-gctcatatttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttg 18311741  T
Q  204 aacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18311742 aacttctactattttgacgtaccgctttggactgtagtcgcaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 18311812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 28228997 - 28228824
Alignment:
Q  32 ctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaaggtggtaagctcatct 131  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  28228997 ctcattaccaccgaaagagaaagctatgaaaaatacttgggtggacaatagttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtgataagctcatct 28228898  T
Q  132 ttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactattt 202  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||  ||   |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  28228897 ttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttatacgttcgagttgttccaaagtagatctttgttgctgaactattt 28228824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 165 - 274
Target Start/End: Original strand, 4425404 - 4425513
Alignment:
Q  165 gagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttggga 264  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4425404 gagttgttccaaagtagatctttgctactgaactatttgaactattactattttggcgtaccgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttggga 4425503  T
Q  265 tgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||    
T  4425504 tgtcatttgt 4425513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 143 - 274
Target Start/End: Original strand, 25539945 - 25540079
Alignment:
Q  143 aagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgta 239  Q
    ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  25539945 aagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaactttttaaacttctactattttgacacatcgctttggactgta 25540044  T
Q  240 atcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25540045 atcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgt 25540079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 7219371 - 7219281
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaac 101  Q
    |||||| ||||||| |||| | |||| || |||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7219371 cagagacagtataactgtcacatcatcacagccgatcgagcaagctatgaaaaatacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagagaac 7219281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 34)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5252873 - 5252607
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| |||||||||| |||     
T  5252873 cagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatttctgcagagaacatgtgatga 5252774  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  5252773 tagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttaaact 5252674  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  5252673 tctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgt 5252607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 8242455 - 8242721
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  8242455 cagagaaagtataggtgtcgcctcattaccgctaaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtggacagtggttcaatttctgcagagaacgtgtaatgg 8242554  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  8242555 aagagggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagtggatcttttctgctgaactatttgaact 8242654  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  8242655 tctactattttgacgtatcggtttggactgtaatcgtaaacaatcttgcctttgggatgccatttgt 8242721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 54793464 - 54793197
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  54793464 cagagaaagtataagtgtcgcctcattacctccgaaagaacaagctatgaaaaatacttaggtgcgcagtggttcaatttctgcagagaacgtgtgatgg 54793365  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |  |||||||||||||   |||| |||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  54793364 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagttatcgaagaacttgcacgttcgagctgttccaaaatatatatttgttgctgaactatttgaact 54793265  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgtg 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  54793264 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaatctatattgactttgggatgccatttgtg 54793197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 40827534 - 40827268
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||    
T  40827534 cagagaaaatataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagaaagctatgaaaaatacttgggtgggcagtggttcaatttctgcaaagaacgtgtgatgg 40827435  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40827434 aagaatgtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttgaact 40827335  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    | | |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  40827334 ttttctattttgacgcatctctttggactgtaatcgtaaactatcttgatttttggatgtcatttgt 40827268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 48521521 - 48521255
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||    
T  48521521 cagagaaaatataagtgtcgcctcattaccgccaaaagagaaagctatgaaaaatacttgggtggatagtggttcaatttctgcaaagaacgtgtgatgg 48521422  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  48521421 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttactactgaactatttgaact 48521322  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  48521321 tctactattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgt 48521255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 52841025 - 52840766
Alignment:
Q  18 agtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaagg 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  || |||||||||||    
T  52841025 agtataattgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggcagtagttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaagg 52840926  T
Q  118 tggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctacta 214  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  52840925 tggtaatctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatatttgttgttgaactatttgaacttctacta 52840826  T
Q  215 ttttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  52840825 ttttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttggaatgtcatttgt 52840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 55295275 - 55295012
Alignment:
Q  14 agaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaag 113  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||| ||  |||||||    
T  55295275 agaaaatataagtgtcgcctcattaccgctgaaagagaaagctatgaaaaatacttgggtggacagtggttcaatttctgcaaagaacgtgcgatggaag 55295176  T
Q  114 aaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttct 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55295175 aaggtggtaagcttatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttgaacttct 55295076  T
Q  211 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  55295075 actattttgacgcatcgctttgaactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgt 55295012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 39796972 - 39796706
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||| ||| |||||| ||| |||     
T  39796972 cagagaaagtataagtgttgcctcattaccgccgaaagagcaggctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatttatgcagagaacgtgtgatga 39796873  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39796872 tagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaact 39796773  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  39796772 tctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgt 39796706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 274
Target Start/End: Original strand, 54512542 - 54512799
Alignment:
Q  19 gtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaaggt 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||   | ||||||||||||    
T  54512542 gtataactgtcgcctcattaccgccgatagagcaggctatgaaaaatacttgggtgggtagtggttcaatttctgcagagaacgaatgatggaagaaggt 54512641  T
Q  119 ggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactat 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  54512642 ggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcatagaagaacttgcacgttcgagttgttccaaggtagatctttgttgttgaactatttgaacttctactat 54512741  T
Q  216 tttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  54512742 ttt-gcgtatcgctttggactgtagtcaaaaactatcttgattttgggatgtcatttgt 54512799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 32 - 274
Target Start/End: Original strand, 32755262 - 32755507
Alignment:
Q  32 ctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaaggtggtaagctcatct 131  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| || |||  || ||||||||||||||||||||||| |    
T  32755262 ctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtggacagtgattcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatat 32755361  T
Q  132 ttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgc 228  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32755362 ttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagtacatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgc 32755461  T
Q  229 tttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  32755462 tttggactgtagtcgtaaactatattgactttgggatgccatttgt 32755507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 16495646 - 16495911
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||  | ||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||    
T  16495646 cagagaaagtataagtgtcgcctcattacctccgaaagagcaagctatgaaaaatactaggg-gcgcagtggtttaatttctgcagagaacgtgtgatgg 16495744  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |  |||||||||||||   |||| |||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  16495745 aagaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagttatcgaagaacttgcacgttcgagctgttccaaaatatatctttgctgttaaactatttgaact 16495844  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  16495845 tctactattttggcgtatccctttggactgtaatcgtaacctatcttgactttggaatgtcatttgt 16495911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 35088337 - 35088071
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| | ||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  || |||  || ||||    
T  35088337 cagagacaatataattgtcatctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgtagataacgagtgatgg 35088238  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  ||||| |||| || |||||||||| ||||    
T  35088237 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatatttgttgttgaactattttaact 35088138  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35088137 tctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 35088071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 51248116 - 51248382
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  || ||||    
T  51248116 cagagacagtataactgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagataacgagtgatgg 51248215  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| | | ||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||  ||||||||||  | |||||||||||||||    
T  51248216 aagaatgtggtaagttcatctttgatctcaaaaagtcacagaagaactttcacattcgagttgttccaaagtagatctttgtcgttgaactatttgaact 51248315  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51248316 tctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 51248382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 33 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 36165488 - 36165244
Alignment:
Q  33 tcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaaggtggtaagctcatctt 132  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36165488 tcattaccaccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtagtggttcaattttagcatagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctt 36165389  T
Q  133 tgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgct 229  Q
    ||||| ||| ||||||  |||||||||||||   |||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36165388 tgatctcgaaaagtcatcgaagaacttgcacattcgagttgttccaaagtagatctttgttgctgaacgatttgaacttctactattttggtgtatcgct 36165289  T
Q  230 ttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  36165288 ttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggataccatttgt 36165244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 31369516 - 31369250
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||| ||||  ||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||  || ||||    
T  31369516 cagagacagtataactgtcatctcattaccaccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggtagtggttcaatttctgcagataacgagtgatgg 31369417  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||||    
T  31369416 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaact 31369317  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31369316 tctactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 31369250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6104625 - 6104359
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| |||| || ||||  ||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||  || ||||    
T  6104625 cagagacagtagaactgtcatctcattaccaccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcaaataacgagtgatgg 6104526  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||||    
T  6104525 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaact 6104426  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6104425 tctactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 6104359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 22477463 - 22477729
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||    
T  22477463 cagagaaaatataagtgtcgtctcattaccgccgaaagagaaaactatgaaaaatacttgggtgggcagtgattcaatttctgcaaagaacgtgtgatgg 22477562  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22477563 aagaaggtggtatgctcctctttgatttcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctggtgaactatttgaact 22477662  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    | || ||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22477663 tttattattttgacgcatcactttggactgtaaccgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 22477729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 2845356 - 2845115
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||    
T  2845356 cagagaaagtataagtgtcgcctcattacccccgatagagcaagctatgaaaaaaacttggatgggcagtggttcaatttctgtcgagaacgtgtgatgg 2845257  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||  || ||||||  ||||||||||||||||||    
T  2845256 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcaaaaagtcaccgaagaacttgcacgatcgagttgttcaaaagtatatcttttgtgctgaactatttgaact 2845157  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaact 249  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2845156 tctactattttgatgtataactttggactgtaatcgtaaact 2845115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11598462 - 11598197
Alignment:
Q  12 agagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgga 111  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  11598462 agagaaaatataagtgtcgcctcattactgccgaaagagaaagctatgaaaaatatttgggtggaaagtggttcaatttctgcaaagaacgtgtaatgga 11598363  T
Q  112 agaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaactt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||    |||||||||| ||  ||||||||| || || ||||||||||||||    
T  11598362 agaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagtacttgcatgttcgagttgttcaaaagtagatcttttctactaaactatttgaactt 11598263  T
Q  209 ctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11598262 ctactattttgacgcattgctttggactgttatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 11598197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 274
Target Start/End: Original strand, 48976449 - 48976705
Alignment:
Q  20 tataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaaggtg 119  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||  || |||||||||||||    
T  48976449 tataattgtcaccttattaccgccgatagagcaggctatgaaaattacttgggtgggcagtcgttcaatttctgcaga-aacgagtgatggaagaaggtg 48976547  T
Q  120 gtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactatt 216  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||    |||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  48976548 gtaagctcatatttgatctcgaaaagtcacagaagaagttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttctactatt 48976647  T
Q  217 ttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  48976648 ttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgagatgtcatttgt 48976705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 274
Target Start/End: Original strand, 23193224 - 23193483
Alignment:
Q  18 agtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaagg 117  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||  ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||  |  |||||||||||    
T  23193224 agtataaatgtcgcctcattacagccgatcgagcaagttatgaaaaatacttgggtgggcagtggttcaatttctatagagaacgagcgatggaagaagg 23193323  T
Q  118 tggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctacta 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||||||  |||||||||| || ||||| |||||| |||||||||    
T  23193324 tggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgatgttgaacaatttgaccttctacta 23193423  T
Q  215 ttttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23193424 ttttgacgtatcgctttagactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgt 23193483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 50771739 - 50771480
Alignment:
Q  18 agtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaagg 117  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||   || |||||||||||    
T  50771739 agtataactgtcacctcattaccgccaatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagagaatgagtgatggaagaagg 50771640  T
Q  118 tggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctacta 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||| ||||| |||||||||||    
T  50771639 tggtaagctcatctttgatctcgaaaaatcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaattatttaaacttctacta 50771540  T
Q  215 ttttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50771539 ttttaacatatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 50771480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 52853941 - 52853675
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | || |||  || ||||    
T  52853941 cagagacagtataactgtcacctcattacagccgatagagcaagccatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctacagataacgagtgatgg 52853842  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | ||||||||||||    |||||||||||||  ||||| |||| || |||||||||||||||    
T  52853841 aagaaggtggtaagctcatctttgatcttgaaaagtcgcagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatatttgttgttgaactatttgaact 52853742  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52853741 tctactattttgacgtaccgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 52853675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 274
Target Start/End: Original strand, 50741115 - 50741374
Alignment:
Q  18 agtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaagg 117  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||   || |||||||||||    
T  50741115 agtataactgtcacctcattaccgccaatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagataatgagtgatggaagaagg 50741214  T
Q  118 tggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctacta 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| || |||| ||||| |||||||||||    
T  50741215 tggtaagctcatctttgatctcgaaaattcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaattatttaaacttctacta 50741314  T
Q  215 ttttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50741315 ttttaacatatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 50741374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11951474 - 11951208
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||     
T  11951474 cagagaaaatataagcgtcgtctcattaccgccgaaagagaaagctatgaaaaatactttggtgggcagtgattcaatttctgcaaagaacgtgtgatga 11951375  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||    |||||||||||||  | ||||||||||| || ||||||||||||    
T  11951374 aagaagttggtaagctcatctttgatttcgaaaaatcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagttgatctttgctggtgtactatttgaact 11951275  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  11951274 tctactattttgacgcatcactttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgagatgtcatttgt 11951208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 55 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 52463387 - 52463165
Alignment:
Q  55 ctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaag 154  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||  ||| | |||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| |    
T  52463387 ctatgaaaaatacttgggtggacagtggttcaatttctgcaaagaaagtgtgaaggaagaaggtggtaagctcattattgatctcgaaaagtcgctgatg 52463288  T
Q  155 aacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactat 251  Q
    |||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52463287 aacttgcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactat 52463188  T
Q  252 cttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||| ||| |||||| |||||||    
T  52463187 cttgacttagggatgccatttgt 52463165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21700068 - 21699806
Alignment:
Q  12 agagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgga 111  Q
    ||||| ||||||| |||| |||| ||||||| || || ||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||  || |||||    
T  21700068 agagacagtataactgtcacctctttaccgc-gatagggcaagctatgaaaattacttgggtgggaagtggttcaatttctgcagataacgagtgatgga 21699970  T
Q  112 agaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaactt 208  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||    |||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  21699969 agaaggtgg--agctcatctttgatctcgaaaagtcacagaaaaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatatttgttgttgaactatttgaactt 21699872  T
Q  209 ctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21699871 ctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgagatgtcatttgt 21699806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 274
Target Start/End: Original strand, 49112837 - 49113087
Alignment:
Q  18 agtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaagg 117  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| || |||  || |||||||||||    
T  49112837 agtataactgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtggacagtggttcaacttctgcagataacgagtgatggaagaagg 49112936  T
Q  118 tggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctacta 214  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| ||         | ||||||||||||    
T  49112937 tggtaagctcatcttggatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttg---------tcgaacttctacta 49113027  T
Q  215 ttttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49113028 ttttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 49113087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 11326123 - 11325886
Alignment:
Q  31 cctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaaggtggtaagctcatc 130  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||| || || |||  || ||||||||||||| |||||| |||    
T  11326123 cctcattaccgtcgatagagcaagctatcaaaattacttgggtgggaagtggttcaatttcagcagataacgagtgatggaagaaggtgataagcttatc 11326024  T
Q  131 tttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcg 227  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||  ||  |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  11326023 tttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgtttgaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttctattattttgacatatcg 11325924  T
Q  228 ctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggat 265  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  11325923 ctttggactgtagtcgtaaactatcttgacgttgggat 11325886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 19893867 - 19893722
Alignment:
Q  14 agaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaag 113  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||    
T  19893867 agaaaatataagtgtcgcctcattaccaccgaaagagaaagctatgaagaatacttgggtggacagtggttcaatttctgcaaagaacgtgtgatggaag 19893768  T
Q  114 aaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaactt 159  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||    
T  19893767 aaggtggtaagctcatcttggatctcgaaaagtcacagaagaactt 19893722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 134
Target Start/End: Original strand, 35436666 - 35436774
Alignment:
Q  26 tgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaaggtggtaagc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  35436666 tgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatatttgggtgggtagtggttcaatttcagcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagc 35436765  T
Q  126 tcatctttg 134  Q
    |||||||||    
T  35436766 tcatctttg 35436774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 182 - 274
Target Start/End: Original strand, 35436768 - 35436860
Alignment:
Q  182 atctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  35436768 atctttgttgctgaactatttgaacttctacaattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcctgactttgggatgtcatttgt 35436860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 146 - 274
Target Start/End: Original strand, 11383009 - 11383139
Alignment:
Q  146 tcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatc 242  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  11383009 tcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagtagacctttactgctgaactatttgaccttctactattttggcgtatcgc-ttggattgtaatc 11383107  T
Q  243 gtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
     |||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  11383108 ctaaactatcttgaccttgagatgtcatttgt 11383139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 86
Target Start/End: Original strand, 11382927 - 11382999
Alignment:
Q  14 agaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttca 86  Q
    ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11382927 agaaaatataagtgtcgcagcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtggacagtggttca 11382999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13430 - 13164
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||  ||||| ||| ||||    
T  13430 cagagaaaatataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagaaagctatgaaaaatacttgggtgagcagttgttcaatttctgcaaagaacgtgtgatgg 13331  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  13330 aagaaggtggtaagctcatctttaatctcgaaaagtcactgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgttgctgaactatttgagct 13231  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13230 tctactattttgacgcatcactttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgt 13164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 266
Target Start/End: Original strand, 119796 - 120054
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  119796 cagagaaagtataagtgtcacctcattaccgcagaaagagcaagctatgaaaaatgcttgggtgggcagtggttcaatttctgcagagaacgtgtgatgg 119895  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||||||  || || |||||| ||||||||||||||||    
T  119896 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacattcgagttgttccaaagtaaatttttgctactgaactatttgaact 119995  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatg 266  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  119996 tctactattttaacgtatcgctttggaatctaatcgtaaactatcttgactttgggatg 120054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 49808 - 50024
Alignment:
Q  14 agaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaag 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  49808 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtggacagtggttcaatttcagcagagaacatgtgatggaag 49907  T
Q  114 aaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |  |||||||||||||   |||||||||| ||  |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  49908 aaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtaatcgaagaacttgcacgttcgagttgttcaaaagtagatctttattgctgaactatttgaacttct 50007  T
Q  211 actattttggcgtatcg 227  Q
    |||||||||||||||||    
T  50008 actattttggcgtatcg 50024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 223 - 274
Target Start/End: Original strand, 61267 - 61318
Alignment:
Q  223 tatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  61267 tatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgt 61318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 26859 - 26593
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  || ||||    
T  26859 cagagacagtataattgtcatctcattatcgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagataacgagtgatgg 26760  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  ||||| |||| || |||||||||| ||||    
T  26759 gagaaggtggtaagctcatctttgatctcaaaaagtcacagaagaacttgcaagttcgagttgttccaaagtagatatttgttgttgaactattttaact 26660  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26659 tttactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 26593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 9684 - 9950
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| ||||||| ||||  ||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  || ||||    
T  9684 cagagacagtataactgtcatctcattatcgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagataacgagtgatgg 9783  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  ||||| |||| || |||||||||| ||||    
T  9784 gagaaggtggtaagctcatctttgatctcaaaaagtcacagaagaacttgcaagttcgagttgttccaaagtagatatttgttgttgaactattttaact 9883  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9884 tttactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 9950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 174 - 440
Alignment:
Q  11 cagagaaagtataattgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatgg 110  Q
    |||||| | ||||| ||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  || ||||    
T  174 cagagacaatataactgtcatctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagataacgagtgatgg 273  T
Q  111 aagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgca---ccgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||| |    ||||||||| |||  |||||||||| || |||||| ||| ||||    
T  274 aagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacataagaacttgaaaattcgagttgtttcaaagtagatctttgttgttgaactgttttaact 373  T
Q  208 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  374 tctactattttgatatatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgagatgtcatttgt 440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0385
Description:

Target: scaffold0385; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 99 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 4590 - 4412
Alignment:
Q  99 aacatgtcatggaagaaggtggtaagctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  4590 aacatgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatttcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctggtga 4491  T
Q  196 actatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  4490 actatttgaacttttactattttgacgcatctctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggataccatttgt 4412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 125 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 53348 - 53201
Alignment:
Q  125 ctcatctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggc 221  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53348 ctcatctttgatctcgaaaagtcactgaagaacttgcacgttcgagtt-----aaaatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggc 53254  T
Q  222 gtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
     || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53253 ataccgttttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgt 53201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 128 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 10992 - 10843
Alignment:
Q  128 atctttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgta 224  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  10992 atctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttacatattcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttaacgca 10893  T
Q  225 tcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgtcatttgt 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  10892 tcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgt 10843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 29495 - 29322
Alignment:
Q  32 ctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtggttcaatttctgctgagaacatgtcatggaagaaggtggtaagctcatct 131  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  29495 ctcattaccaccgaaagagaaagctatgaaaaatacttgggtggacaatagttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtgataagctcatct 29396  T
Q  132 ttgatcacgacaagtcactgaagaacttgcac---cgagttgttccaagatagatctttgctgctgaactattt 202  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||  ||   |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  29395 ttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttatacgttcgagttgttccaaagtagatctttgttgctgaactattt 29322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 179 - 266
Target Start/End: Original strand, 100527 - 100614
Alignment:
Q  179 tagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatg 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  100527 tagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgtaccgctttggactgtaatcgtaaactatattgactttgggatg 100614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University