View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10542_low_6 (Length: 383)

Name: NF10542_low_6
Description: NF10542
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10542_low_6
NF10542_low_6
[»] chr1 (106 HSPs)
chr1 (18-375)||(44454992-44455351)
chr1 (24-375)||(3156705-3157056)
chr1 (19-368)||(28220210-28220560)
chr1 (19-368)||(28223405-28223755)
chr1 (19-366)||(31659072-31659420)
chr1 (19-375)||(49918183-49918541)
chr1 (24-375)||(37503534-37503883)
chr1 (24-374)||(10925062-10925416)
chr1 (24-375)||(37559844-37560198)
chr1 (67-369)||(834150-834453)
chr1 (67-369)||(3847104-3847407)
chr1 (19-369)||(3189165-3189516)
chr1 (19-369)||(3197982-3198333)
chr1 (19-369)||(3206821-3207172)
chr1 (19-315)||(1833356-1833652)
chr1 (65-369)||(50169193-50169498)
chr1 (67-369)||(8550769-8551073)
chr1 (19-375)||(30476423-30476782)
chr1 (19-369)||(20762506-20762858)
chr1 (67-366)||(196893-197194)
chr1 (68-369)||(4552620-4552922)
chr1 (65-369)||(28265537-28265854)
chr1 (68-369)||(13659319-13659621)
chr1 (67-343)||(23555275-23555551)
chr1 (67-369)||(13137959-13138260)
chr1 (67-369)||(46064800-46065103)
chr1 (67-369)||(15820189-15820492)
chr1 (67-369)||(40122179-40122484)
chr1 (65-369)||(50167158-50167476)
chr1 (67-369)||(45644337-45644641)
chr1 (129-365)||(19754438-19754676)
chr1 (60-351)||(927977-928271)
chr1 (139-351)||(13547090-13547302)
chr1 (142-355)||(19752643-19752857)
chr1 (139-351)||(37168252-37168465)
chr1 (20-369)||(51765230-51765583)
chr1 (139-315)||(47255378-47255553)
chr1 (139-343)||(11348653-11348857)
chr1 (139-351)||(13549001-13549213)
chr1 (127-369)||(41360857-41361100)
chr1 (140-315)||(31925745-31925919)
chr1 (139-315)||(29136202-29136377)
chr1 (139-315)||(42298013-42298188)
chr1 (139-313)||(37033112-37033286)
chr1 (148-320)||(16455585-16455756)
chr1 (139-313)||(193566-193739)
chr1 (139-313)||(47115126-47115300)
chr1 (139-315)||(7482268-7482445)
chr1 (139-315)||(34603530-34603707)
chr1 (185-369)||(13316334-13316520)
chr1 (20-369)||(40282218-40282564)
chr1 (20-357)||(9987044-9987375)
chr1 (139-258)||(37879006-37879124)
chr1 (143-315)||(37282729-37282901)
chr1 (190-315)||(22079322-22079447)
chr1 (69-369)||(20622218-20622515)
chr1 (19-153)||(13316518-13316652)
chr1 (69-313)||(44650202-44650448)
chr1 (199-309)||(3460709-3460821)
chr1 (20-369)||(21053799-21054145)
chr1 (129-313)||(6808389-6808581)
chr1 (25-369)||(9036264-9036603)
chr1 (189-369)||(36683694-36683865)
chr1 (230-313)||(9109459-9109543)
chr1 (200-319)||(13938152-13938270)
chr1 (254-315)||(37876804-37876865)
chr1 (222-316)||(2263011-2263106)
chr1 (18-153)||(47098554-47098690)
chr1 (18-153)||(47102568-47102704)
chr1 (19-153)||(3281939-3282074)
chr1 (19-153)||(21536300-21536435)
chr1 (19-153)||(29652045-29652180)
chr1 (19-153)||(37069999-37070134)
chr1 (140-320)||(8871095-8871259)
chr1 (192-313)||(2926516-2926637)
chr1 (202-303)||(32471478-32471579)
chr1 (163-290)||(12318585-12318713)
chr1 (21-153)||(22819663-22819795)
chr1 (262-315)||(28242382-28242434)
chr1 (235-314)||(5459956-5460035)
chr1 (19-153)||(13598632-13598767)
chr1 (23-357)||(44203478-44203806)
chr1 (65-127)||(777110-777172)
chr1 (19-153)||(13604352-13604487)
chr1 (139-293)||(25652040-25652195)
chr1 (19-156)||(26644627-26644766)
chr1 (199-290)||(41135834-41135926)
chr1 (126-303)||(6398587-6398764)
chr1 (200-293)||(16914234-16914329)
chr1 (21-152)||(9022638-9022770)
chr1 (119-167)||(777177-777225)
chr1 (205-306)||(4535527-4535629)
chr1 (123-293)||(1050503-1050674)
chr1 (18-153)||(27104130-27104266)
chr1 (156-256)||(44646881-44646981)
chr1 (309-370)||(19072914-19072976)
chr1 (309-370)||(19120804-19120866)
chr1 (20-54)||(19358563-19358597)
chr1 (20-54)||(19361152-19361186)
chr1 (20-54)||(19366027-19366061)
chr1 (197-269)||(35109486-35109557)
chr1 (206-297)||(30670114-30670206)
chr1 (197-268)||(32736945-32737015)
chr1 (88-141)||(43342468-43342521)
chr1 (121-153)||(16124347-16124379)
chr1 (218-258)||(49982183-49982223)
[»] chr8 (79 HSPs)
chr8 (19-375)||(15212620-15212977)
chr8 (24-375)||(43036262-43036614)
chr8 (19-375)||(33351984-33352341)
chr8 (18-375)||(4731491-4731849)
chr8 (19-375)||(30143176-30143531)
chr8 (19-366)||(27811112-27811460)
chr8 (19-369)||(42498028-42498380)
chr8 (24-369)||(12702617-12702967)
chr8 (19-369)||(17982487-17982839)
chr8 (67-366)||(6598854-6599154)
chr8 (67-366)||(6674307-6674607)
chr8 (19-369)||(34254313-34254662)
chr8 (67-369)||(3303653-3303956)
chr8 (19-369)||(34256489-34256838)
chr8 (19-369)||(31218091-31218443)
chr8 (65-369)||(5689151-5689456)
chr8 (19-369)||(44303688-44304041)
chr8 (18-369)||(1746201-1746553)
chr8 (19-369)||(19945341-19945694)
chr8 (77-369)||(1345354-1345647)
chr8 (65-369)||(40320947-40321265)
chr8 (85-351)||(18141720-18141987)
chr8 (67-345)||(1292471-1292749)
chr8 (85-317)||(4162400-4162628)
chr8 (88-366)||(41366601-41366879)
chr8 (68-349)||(18106084-18106363)
chr8 (139-362)||(40221700-40221923)
chr8 (94-369)||(4743197-4743462)
chr8 (65-370)||(9765627-9765930)
chr8 (139-351)||(42434992-42435204)
chr8 (77-369)||(30291484-30291793)
chr8 (127-369)||(19491681-19491924)
chr8 (139-318)||(44353747-44353926)
chr8 (139-312)||(4283479-4283651)
chr8 (139-351)||(18655355-18655567)
chr8 (139-353)||(10930198-10930412)
chr8 (67-274)||(41364926-41365133)
chr8 (67-304)||(10929683-10929907)
chr8 (20-369)||(2627577-2627923)
chr8 (140-351)||(8965692-8965904)
chr8 (139-351)||(11383941-11384152)
chr8 (139-315)||(40328734-40328910)
chr8 (155-311)||(3772162-3772318)
chr8 (18-153)||(4733638-4733777)
chr8 (77-313)||(8153653-8153886)
chr8 (263-375)||(4733784-4733897)
chr8 (223-346)||(10015119-10015241)
chr8 (175-317)||(1822282-1822425)
chr8 (175-317)||(1856727-1856870)
chr8 (19-153)||(7412572-7412707)
chr8 (65-316)||(11712037-11712291)
chr8 (65-319)||(29796354-29796611)
chr8 (219-320)||(7597648-7597750)
chr8 (67-149)||(10015030-10015112)
chr8 (19-153)||(5702210-5702345)
chr8 (18-141)||(19948533-19948656)
chr8 (20-357)||(25689798-25690128)
chr8 (90-357)||(3439416-3439677)
chr8 (19-156)||(23799306-23799444)
chr8 (245-351)||(3073875-3073981)
chr8 (19-153)||(4456260-4456395)
chr8 (24-153)||(4696343-4696473)
chr8 (235-318)||(32902208-32902292)
chr8 (219-294)||(10240188-10240264)
chr8 (78-293)||(41266860-41267078)
chr8 (119-289)||(3231859-3232031)
chr8 (43-153)||(19752148-19752259)
chr8 (230-302)||(11137070-11137146)
chr8 (233-305)||(30909416-30909487)
chr8 (79-160)||(3318741-3318824)
chr8 (18-153)||(3051352-3051489)
chr8 (309-372)||(4696645-4696708)
chr8 (276-312)||(38863949-38863985)
chr8 (309-370)||(5702532-5702593)
chr8 (87-145)||(5990361-5990418)
chr8 (197-273)||(9054786-9054861)
chr8 (226-292)||(40585754-40585822)
chr8 (65-109)||(32902431-32902475)
chr8 (77-183)||(38863762-38863868)
[»] chr4 (112 HSPs)
chr4 (19-375)||(26175613-26175970)
chr4 (36-370)||(9927440-9927775)
chr4 (18-375)||(34570391-34570749)
chr4 (24-369)||(56178619-56178965)
chr4 (19-375)||(5429513-5429870)
chr4 (19-375)||(12739527-12739884)
chr4 (19-375)||(37740460-37740816)
chr4 (65-375)||(54199884-54200194)
chr4 (19-370)||(29254328-29254680)
chr4 (36-353)||(36994375-36994693)
chr4 (19-369)||(52095345-52095696)
chr4 (19-369)||(48142875-48143229)
chr4 (67-367)||(5871702-5872003)
chr4 (19-317)||(12747792-12748090)
chr4 (67-369)||(47038394-47038695)
chr4 (65-369)||(52467337-52467643)
chr4 (19-319)||(12745470-12745770)
chr4 (19-295)||(52082715-52082991)
chr4 (67-311)||(24968993-24969238)
chr4 (19-351)||(29999806-30000139)
chr4 (18-375)||(5370059-5370421)
chr4 (67-362)||(36463379-36463688)
chr4 (134-369)||(48893621-48893861)
chr4 (20-369)||(13992275-13992620)
chr4 (67-366)||(13009430-13009717)
chr4 (65-369)||(45687165-45687484)
chr4 (80-369)||(6542162-6542455)
chr4 (129-315)||(40632389-40632575)
chr4 (139-353)||(54882975-54883189)
chr4 (157-362)||(27416955-27417160)
chr4 (94-369)||(31474059-31474336)
chr4 (173-353)||(26364224-26364405)
chr4 (174-369)||(46147374-46147570)
chr4 (145-365)||(3913408-3913628)
chr4 (119-369)||(4587892-4588144)
chr4 (199-375)||(12743902-12744079)
chr4 (199-375)||(12745291-12745468)
chr4 (139-314)||(6655911-6656085)
chr4 (77-319)||(5207876-5208119)
chr4 (139-315)||(8665362-8665538)
chr4 (139-315)||(2209668-2209844)
chr4 (139-315)||(35662395-35662571)
chr4 (139-343)||(41639381-41639585)
chr4 (139-315)||(46703454-46703631)
chr4 (139-314)||(12073347-12073521)
chr4 (67-351)||(37229722-37230022)
chr4 (119-374)||(51336998-51337254)
chr4 (20-369)||(31495297-31495643)
chr4 (139-315)||(379333-379510)
chr4 (139-346)||(41964369-41964578)
chr4 (139-351)||(50673848-50674059)
chr4 (141-351)||(8648095-8648306)
chr4 (139-316)||(12119492-12119671)
chr4 (143-353)||(21688207-21688418)
chr4 (205-319)||(12744081-12744195)
chr4 (139-311)||(50262743-50262911)
chr4 (85-316)||(48142412-48142647)
chr4 (139-276)||(55085442-55085578)
chr4 (139-273)||(41639218-41639351)
chr4 (139-313)||(26699482-26699659)
chr4 (85-307)||(53345116-53345340)
chr4 (19-132)||(52093885-52093998)
chr4 (123-369)||(29056295-29056544)
chr4 (78-312)||(6677360-6677597)
chr4 (24-153)||(10047613-10047743)
chr4 (144-315)||(33089837-33090009)
chr4 (19-153)||(5268930-5269065)
chr4 (158-312)||(22882791-22882946)
chr4 (158-312)||(22934455-22934610)
chr4 (67-153)||(3909989-3910075)
chr4 (234-315)||(33989893-33989975)
chr4 (198-290)||(5349923-5350016)
chr4 (185-357)||(8393394-8393568)
chr4 (185-357)||(8395603-8395777)
chr4 (19-153)||(3777781-3777916)
chr4 (19-153)||(16623023-16623158)
chr4 (19-149)||(36314960-36315091)
chr4 (19-149)||(36329169-36329300)
chr4 (19-153)||(5396401-5396536)
chr4 (19-153)||(6743145-6743280)
chr4 (19-153)||(8689226-8689361)
chr4 (19-156)||(25861763-25861901)
chr4 (20-153)||(31985365-31985498)
chr4 (18-112)||(54867453-54867547)
chr4 (233-306)||(34112865-34112939)
chr4 (67-127)||(46147581-46147641)
chr4 (65-317)||(21703871-21704116)
chr4 (219-320)||(37754993-37755095)
chr4 (19-149)||(5147914-5148045)
chr4 (19-153)||(16628602-16628737)
chr4 (163-289)||(32091456-32091583)
chr4 (19-152)||(5143493-5143627)
chr4 (233-319)||(44967863-44967949)
chr4 (205-306)||(16422653-16422755)
chr4 (205-320)||(52065617-52065731)
chr4 (23-357)||(5135910-5136239)
chr4 (205-277)||(34788851-34788923)
chr4 (65-154)||(39593957-39594049)
chr4 (19-153)||(39774034-39774170)
chr4 (205-291)||(44570427-44570514)
chr4 (80-153)||(5112469-5112543)
chr4 (231-305)||(40975057-40975131)
chr4 (198-236)||(42234319-42234357)
chr4 (65-164)||(37755112-37755213)
chr4 (23-357)||(5138136-5138464)
chr4 (309-375)||(3796568-3796635)
chr4 (65-112)||(6375955-6376002)
chr4 (65-153)||(23042989-23043079)
chr4 (20-54)||(28468257-28468291)
chr4 (197-273)||(37781935-37782010)
chr4 (200-257)||(33706593-33706649)
chr4 (219-274)||(1983272-1983325)
[»] chr3 (106 HSPs)
chr3 (18-375)||(5236434-5236792)
chr3 (19-375)||(40734332-40734689)
chr3 (19-375)||(51398648-51399005)
chr3 (19-375)||(29810702-29811059)
chr3 (19-375)||(29812897-29813254)
chr3 (24-369)||(37408297-37408644)
chr3 (67-369)||(19683871-19684175)
chr3 (19-369)||(7762098-7762451)
chr3 (65-375)||(40735263-40735574)
chr3 (19-369)||(45094999-45095349)
chr3 (67-366)||(22834989-22835288)
chr3 (19-369)||(5260305-5260657)
chr3 (67-369)||(760729-761032)
chr3 (67-366)||(39153347-39153647)
chr3 (67-369)||(29682241-29682544)
chr3 (43-355)||(44331413-44331716)
chr3 (27-369)||(5258126-5258470)
chr3 (68-369)||(16498913-16499214)
chr3 (67-369)||(29196369-29196687)
chr3 (67-369)||(9581165-9581468)
chr3 (65-369)||(7764348-7764650)
chr3 (77-369)||(9666449-9666744)
chr3 (20-369)||(23200120-23200470)
chr3 (67-318)||(53921538-53921789)
chr3 (65-369)||(44700462-44700780)
chr3 (20-369)||(23197921-23198271)
chr3 (119-369)||(31314379-31314630)
chr3 (19-369)||(9636107-9636462)
chr3 (67-369)||(32744419-32744712)
chr3 (79-318)||(32890997-32891237)
chr3 (119-369)||(23391892-23392143)
chr3 (139-353)||(30236080-30236294)
chr3 (139-372)||(34491168-34491400)
chr3 (90-369)||(23410312-23410593)
chr3 (139-313)||(4569906-4570080)
chr3 (139-315)||(54593659-54593834)
chr3 (139-343)||(6095608-6095812)
chr3 (129-311)||(46860416-46860600)
chr3 (143-353)||(47304210-47304420)
chr3 (139-315)||(43401839-43402015)
chr3 (139-315)||(49199507-49199683)
chr3 (139-353)||(46173321-46173526)
chr3 (139-315)||(43403782-43403958)
chr3 (139-315)||(41819561-41819737)
chr3 (67-237)||(26386597-26386767)
chr3 (139-319)||(36018806-36018986)
chr3 (65-369)||(800978-801279)
chr3 (139-286)||(31340268-31340414)
chr3 (244-357)||(40913352-40913466)
chr3 (77-304)||(5373115-5373353)
chr3 (139-277)||(5433952-5434091)
chr3 (188-369)||(7779985-7780168)
chr3 (202-320)||(55302005-55302132)
chr3 (25-357)||(6716346-6716673)
chr3 (144-312)||(35138746-35138915)
chr3 (165-314)||(51352150-51352298)
chr3 (25-357)||(54634971-54635298)
chr3 (65-255)||(2075156-2075357)
chr3 (200-319)||(4055799-4055917)
chr3 (19-153)||(40592501-40592636)
chr3 (19-153)||(47923623-47923758)
chr3 (19-156)||(21711451-21711588)
chr3 (24-153)||(27974676-27974806)
chr3 (19-153)||(39032274-39032408)
chr3 (65-293)||(8166516-8166747)
chr3 (19-153)||(1736023-1736158)
chr3 (19-153)||(24694885-24695020)
chr3 (20-153)||(33386395-33386529)
chr3 (19-153)||(16264581-16264716)
chr3 (18-153)||(6794433-6794569)
chr3 (199-319)||(20937670-20937790)
chr3 (25-357)||(45282827-45283160)
chr3 (19-153)||(8370208-8370343)
chr3 (23-357)||(25637273-25637601)
chr3 (144-302)||(26323124-26323283)
chr3 (219-314)||(33191866-33191960)
chr3 (19-153)||(36029325-36029460)
chr3 (19-153)||(48438448-48438582)
chr3 (20-153)||(26928320-26928453)
chr3 (24-156)||(40844884-40845017)
chr3 (190-302)||(54739004-54739116)
chr3 (19-153)||(30709516-30709643)
chr3 (207-306)||(25491014-25491114)
chr3 (20-153)||(27986177-27986310)
chr3 (185-357)||(3617449-3617624)
chr3 (220-312)||(4075511-4075605)
chr3 (22-153)||(27453192-27453321)
chr3 (20-153)||(32143555-32143688)
chr3 (279-351)||(2075076-2075149)
chr3 (80-156)||(4386757-4386834)
chr3 (20-119)||(7782375-7782474)
chr3 (31-153)||(27026938-27027061)
chr3 (19-153)||(27038283-27038418)
chr3 (19-153)||(37725907-37726042)
chr3 (219-305)||(1313852-1313939)
chr3 (233-290)||(2020187-2020245)
chr3 (80-153)||(3323471-3323545)
chr3 (197-273)||(4386866-4386941)
chr3 (45-153)||(26299220-26299329)
chr3 (200-306)||(3148037-3148144)
chr3 (321-372)||(47923958-47924008)
chr3 (205-274)||(28253346-28253416)
chr3 (286-315)||(27305748-27305777)
chr3 (259-288)||(31340242-31340271)
chr3 (309-372)||(25795765-25795829)
chr3 (230-293)||(41510307-41510371)
[»] chr5 (82 HSPs)
chr5 (19-370)||(42428412-42428764)
chr5 (19-367)||(533603-533952)
chr5 (41-375)||(39468526-39468862)
chr5 (19-375)||(28750632-28750990)
chr5 (19-369)||(32636658-32637009)
chr5 (36-375)||(13488053-13488394)
chr5 (19-375)||(42426212-42426569)
chr5 (65-366)||(537905-538207)
chr5 (19-369)||(25412596-25412946)
chr5 (19-375)||(30682900-30683254)
chr5 (19-369)||(13239586-13239937)
chr5 (67-369)||(33831562-33831865)
chr5 (67-369)||(31182855-31183156)
chr5 (19-369)||(13342895-13343246)
chr5 (19-369)||(36074025-36074378)
chr5 (67-369)||(8565930-8566233)
chr5 (67-374)||(16451963-16452270)
chr5 (25-369)||(30182429-30182774)
chr5 (67-369)||(3075641-3075944)
chr5 (20-357)||(16409317-16409649)
chr5 (67-282)||(5887487-5887702)
chr5 (19-369)||(37438982-37439327)
chr5 (139-351)||(213420-213633)
chr5 (20-357)||(26177725-26178056)
chr5 (90-375)||(19806289-19806554)
chr5 (65-320)||(42309968-42310223)
chr5 (20-357)||(9789218-9789550)
chr5 (20-357)||(18441642-18441974)
chr5 (139-366)||(28278271-28278498)
chr5 (139-351)||(40147216-40147428)
chr5 (139-355)||(38746960-38747176)
chr5 (139-351)||(5058002-5058212)
chr5 (20-357)||(26170616-26170936)
chr5 (139-315)||(27637651-27637827)
chr5 (18-197)||(42926725-42926905)
chr5 (139-365)||(27015487-27015704)
chr5 (119-319)||(9049376-9049576)
chr5 (140-320)||(13695723-13695904)
chr5 (140-315)||(16640978-16641153)
chr5 (20-369)||(29720206-29720551)
chr5 (20-369)||(29722366-29722711)
chr5 (25-357)||(29751154-29751481)
chr5 (88-314)||(3325816-3326043)
chr5 (205-317)||(316782-316895)
chr5 (185-357)||(22536284-22536457)
chr5 (24-369)||(10593104-10593445)
chr5 (19-153)||(14520462-14520597)
chr5 (200-319)||(10054850-10054969)
chr5 (19-153)||(11916702-11916837)
chr5 (200-313)||(33906070-33906184)
chr5 (23-357)||(25077966-25078295)
chr5 (23-357)||(25135935-25136264)
chr5 (20-153)||(9353065-9353197)
chr5 (234-286)||(42926916-42926968)
chr5 (20-153)||(15464766-15464900)
chr5 (36-153)||(31300342-31300460)
chr5 (144-293)||(35616129-35616278)
chr5 (259-369)||(42926965-42927076)
chr5 (199-303)||(22097878-22097981)
chr5 (18-118)||(16649857-16649958)
chr5 (234-316)||(8445764-8445847)
chr5 (24-153)||(11181568-11181697)
chr5 (197-290)||(30802841-30802934)
chr5 (19-111)||(12083907-12083999)
chr5 (23-357)||(40379938-40380265)
chr5 (23-357)||(40382149-40382476)
chr5 (191-320)||(10700683-10700809)
chr5 (18-153)||(24553255-24553392)
chr5 (42-153)||(42127123-42127235)
chr5 (144-292)||(6016968-6017115)
chr5 (20-153)||(36932080-36932213)
chr5 (80-153)||(28832489-28832563)
chr5 (301-369)||(5887417-5887486)
chr5 (288-370)||(11917001-11917082)
chr5 (244-306)||(30793195-30793258)
chr5 (309-370)||(42127459-42127520)
chr5 (337-370)||(10281737-10281770)
chr5 (233-306)||(32576344-32576417)
chr5 (234-290)||(32609584-32609641)
chr5 (77-164)||(5007443-5007530)
chr5 (65-117)||(9049591-9049643)
chr5 (197-259)||(33030889-33030950)
[»] chr6 (59 HSPs)
chr6 (18-368)||(9183015-9183366)
chr6 (19-369)||(5406182-5406532)
chr6 (19-369)||(5410507-5410857)
chr6 (18-375)||(30834512-30834871)
chr6 (19-369)||(33211168-33211519)
chr6 (67-319)||(28137442-28137694)
chr6 (19-369)||(16452311-16452663)
chr6 (19-369)||(31404657-31405008)
chr6 (19-369)||(5413377-5413726)
chr6 (20-375)||(2171507-2171864)
chr6 (19-369)||(33160334-33160688)
chr6 (67-361)||(26954277-26954571)
chr6 (67-319)||(3038937-3039201)
chr6 (139-351)||(21593619-21593831)
chr6 (139-351)||(26830124-26830337)
chr6 (173-351)||(21588919-21589098)
chr6 (139-315)||(2972977-2973152)
chr6 (67-369)||(16568925-16569207)
chr6 (139-357)||(603083-603293)
chr6 (139-315)||(3808746-3808922)
chr6 (139-320)||(5043582-5043762)
chr6 (139-315)||(17762944-17763120)
chr6 (173-312)||(17758011-17758150)
chr6 (139-315)||(22424864-22425041)
chr6 (20-369)||(3072740-3073084)
chr6 (20-357)||(6097445-6097767)
chr6 (119-319)||(4045356-4045558)
chr6 (20-357)||(411945-412276)
chr6 (67-253)||(16567088-16567265)
chr6 (144-314)||(25073528-25073698)
chr6 (255-369)||(5409052-5409167)
chr6 (228-315)||(26800630-26800717)
chr6 (25-357)||(27647709-27648034)
chr6 (185-357)||(16554869-16555043)
chr6 (185-357)||(16631425-16631599)
chr6 (185-357)||(16578512-16578686)
chr6 (185-357)||(16616694-16616868)
chr6 (185-357)||(16653112-16653286)
chr6 (24-153)||(5757213-5757343)
chr6 (19-153)||(5017226-5017361)
chr6 (19-153)||(31086204-31086339)
chr6 (19-153)||(5571974-5572108)
chr6 (23-357)||(6027094-6027421)
chr6 (19-112)||(18234357-18234450)
chr6 (185-357)||(25421305-25421480)
chr6 (28-112)||(10076930-10077014)
chr6 (18-153)||(31936807-31936943)
chr6 (80-153)||(31979744-31979818)
chr6 (19-97)||(5407164-5407242)
chr6 (19-97)||(5411489-5411567)
chr6 (80-153)||(24435763-24435836)
chr6 (233-312)||(2908506-2908586)
chr6 (262-313)||(9572667-9572719)
chr6 (19-153)||(22963931-22964065)
chr6 (19-153)||(23824328-23824462)
chr6 (19-110)||(23896628-23896719)
chr6 (321-370)||(5017531-5017579)
chr6 (121-153)||(22709242-22709274)
chr6 (65-121)||(30517898-30517954)
[»] chr7 (96 HSPs)
chr7 (18-370)||(48491411-48491764)
chr7 (18-375)||(48489263-48489622)
chr7 (24-375)||(47676113-47676465)
chr7 (24-369)||(1113495-1113842)
chr7 (24-370)||(18126483-18126830)
chr7 (24-368)||(14069817-14070162)
chr7 (24-368)||(14379845-14380190)
chr7 (24-375)||(4586000-4586352)
chr7 (24-375)||(43864083-43864435)
chr7 (19-375)||(31732946-31733303)
chr7 (27-375)||(47673921-47674269)
chr7 (18-366)||(30024718-30025067)
chr7 (36-375)||(26417168-26417507)
chr7 (19-369)||(23554874-23555226)
chr7 (67-369)||(38671205-38671508)
chr7 (19-369)||(35853749-35854101)
chr7 (19-369)||(29990889-29991239)
chr7 (113-375)||(27347745-27348008)
chr7 (67-369)||(41648994-41649295)
chr7 (60-369)||(495966-496276)
chr7 (67-317)||(31105429-31105679)
chr7 (65-369)||(41317417-41317735)
chr7 (36-369)||(19502028-19502364)
chr7 (67-369)||(36146391-36146708)
chr7 (25-369)||(4178615-4178959)
chr7 (119-366)||(8153276-8153524)
chr7 (20-369)||(25766941-25767287)
chr7 (20-369)||(39731211-39731555)
chr7 (20-369)||(48408638-48408991)
chr7 (67-369)||(12097850-12098158)
chr7 (139-364)||(2360960-2361185)
chr7 (139-362)||(34310705-34310929)
chr7 (65-266)||(4538627-4538828)
chr7 (143-370)||(22269931-22270159)
chr7 (67-369)||(25615745-25616039)
chr7 (67-295)||(31518677-31518905)
chr7 (65-316)||(4253565-4253818)
chr7 (139-315)||(6431926-6432101)
chr7 (139-313)||(4508746-4508919)
chr7 (139-315)||(8359354-8359530)
chr7 (139-357)||(2390237-2390455)
chr7 (139-343)||(29608691-29608896)
chr7 (139-315)||(48599372-48599547)
chr7 (19-216)||(2761439-2761636)
chr7 (67-264)||(24525985-24526183)
chr7 (77-310)||(36574558-36574792)
chr7 (65-314)||(23565100-23565348)
chr7 (139-351)||(3258949-3259162)
chr7 (19-202)||(24514912-24515094)
chr7 (65-316)||(23343854-23344106)
chr7 (139-315)||(4510586-4510761)
chr7 (139-315)||(4512428-4512603)
chr7 (20-369)||(43504135-43504481)
chr7 (211-366)||(2759183-2759339)
chr7 (228-353)||(6359951-6360077)
chr7 (218-351)||(32358055-32358189)
chr7 (139-317)||(22328426-22328611)
chr7 (259-369)||(24525485-24525596)
chr7 (193-369)||(31518911-31519088)
chr7 (25-357)||(20343741-20344070)
chr7 (279-370)||(30814530-30814621)
chr7 (25-369)||(24789689-24790028)
chr7 (234-320)||(5116653-5116740)
chr7 (120-249)||(5514113-5514243)
chr7 (18-153)||(2580622-2580757)
chr7 (120-316)||(3904654-3904851)
chr7 (19-153)||(21989140-21989275)
chr7 (22-152)||(6570430-6570561)
chr7 (23-357)||(6592334-6592661)
chr7 (19-153)||(49091921-49092056)
chr7 (36-153)||(33332197-33332315)
chr7 (18-153)||(20284321-20284457)
chr7 (19-153)||(44847855-44847990)
chr7 (24-153)||(2479568-2479698)
chr7 (23-357)||(6594552-6594877)
chr7 (25-153)||(2647433-2647562)
chr7 (185-357)||(18388754-18388929)
chr7 (185-357)||(18392190-18392365)
chr7 (42-153)||(23402765-23402878)
chr7 (119-196)||(30843389-30843467)
chr7 (18-112)||(79662-79756)
chr7 (19-153)||(46516038-46516170)
chr7 (144-278)||(1360226-1360361)
chr7 (80-153)||(9184965-9185039)
chr7 (261-315)||(18396393-18396448)
chr7 (271-369)||(1560647-1560749)
chr7 (20-256)||(1562103-1562330)
chr7 (185-357)||(32060316-32060493)
chr7 (205-306)||(43363518-43363622)
chr7 (80-153)||(9189797-9189872)
chr7 (20-54)||(18413982-18414016)
chr7 (309-370)||(33332499-33332560)
chr7 (120-153)||(9235414-9235447)
chr7 (237-293)||(27073868-27073925)
chr7 (237-293)||(27204388-27204445)
chr7 (309-352)||(42223403-42223447)
[»] chr2 (89 HSPs)
chr2 (19-375)||(38312074-38312431)
chr2 (19-375)||(17057346-17057703)
chr2 (19-375)||(17085329-17085686)
chr2 (19-374)||(36317987-36318343)
chr2 (67-369)||(723727-724030)
chr2 (19-369)||(2334400-2334751)
chr2 (19-369)||(29867703-29868054)
chr2 (67-369)||(11151574-11151877)
chr2 (19-369)||(36988058-36988409)
chr2 (67-369)||(42362234-42362533)
chr2 (67-366)||(11690383-11690683)
chr2 (67-369)||(34139753-34140057)
chr2 (19-369)||(6594988-6595340)
chr2 (65-369)||(33162433-33162738)
chr2 (67-369)||(14633808-14634112)
chr2 (19-369)||(45099589-45099940)
chr2 (19-369)||(5723238-5723588)
chr2 (18-369)||(4503115-4503467)
chr2 (65-369)||(36773429-36773747)
chr2 (24-369)||(36205647-36205992)
chr2 (20-369)||(4484312-4484664)
chr2 (128-369)||(11067248-11067490)
chr2 (20-369)||(30833180-30833532)
chr2 (19-229)||(39284719-39284929)
chr2 (139-351)||(45726884-45727096)
chr2 (139-343)||(1631741-1631945)
chr2 (67-317)||(14202448-14202693)
chr2 (20-357)||(32289407-32289738)
chr2 (139-351)||(35446885-35447097)
chr2 (139-349)||(42288114-42288323)
chr2 (107-287)||(24885583-24885763)
chr2 (120-315)||(13121703-13121897)
chr2 (119-315)||(7815311-7815508)
chr2 (157-320)||(24398027-24398193)
chr2 (144-362)||(17450550-17450755)
chr2 (119-317)||(17490184-17490376)
chr2 (77-293)||(12123644-12123861)
chr2 (120-315)||(11049484-11049684)
chr2 (20-357)||(6266533-6266865)
chr2 (179-316)||(26353178-26353315)
chr2 (144-315)||(33648129-33648302)
chr2 (232-315)||(7451165-7451248)
chr2 (144-319)||(30218078-30218254)
chr2 (279-355)||(39284930-39285007)
chr2 (19-149)||(33528354-33528485)
chr2 (19-153)||(23078201-23078336)
chr2 (19-153)||(14698739-14698874)
chr2 (19-153)||(33118367-33118502)
chr2 (19-153)||(17865437-17865571)
chr2 (24-153)||(36757497-36757627)
chr2 (85-196)||(5700279-5700392)
chr2 (23-357)||(12647380-12647707)
chr2 (19-153)||(21630177-21630312)
chr2 (19-153)||(34389083-34389218)
chr2 (233-320)||(42019903-42019993)
chr2 (20-153)||(8389880-8390014)
chr2 (185-357)||(13656026-13656200)
chr2 (206-314)||(42261524-42261633)
chr2 (19-153)||(28258907-28259042)
chr2 (18-149)||(40015161-40015293)
chr2 (191-306)||(41454241-41454356)
chr2 (204-311)||(24197915-24198023)
chr2 (25-153)||(20522454-20522583)
chr2 (19-153)||(10706982-10707117)
chr2 (190-293)||(34811281-34811385)
chr2 (18-153)||(13569561-13569698)
chr2 (19-111)||(2837086-2837178)
chr2 (231-315)||(28671976-28672061)
chr2 (190-305)||(41446144-41446260)
chr2 (65-158)||(12632908-12633005)
chr2 (77-153)||(3278232-3278310)
chr2 (155-306)||(7597057-7597210)
chr2 (197-273)||(15903839-15903913)
chr2 (65-153)||(41586326-41586416)
chr2 (197-256)||(28770723-28770781)
chr2 (284-317)||(42412117-42412150)
chr2 (230-305)||(3897035-3897111)
chr2 (85-117)||(7815523-7815555)
chr2 (65-117)||(11049417-11049468)
chr2 (234-277)||(4561137-4561180)
chr2 (20-153)||(40739066-40739198)
chr2 (65-127)||(11067172-11067234)
chr2 (337-375)||(14202398-14202436)
chr2 (20-54)||(25409973-25410007)
chr2 (80-153)||(8040296-8040372)
chr2 (288-372)||(10707281-10707364)
chr2 (89-153)||(39483165-39483230)
chr2 (197-273)||(2869641-2869717)
chr2 (288-370)||(23078499-23078582)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (24-375)||(20392-20744)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (25-369)||(434373-434719)
scaffold0002 (206-314)||(490359-490468)
[»] scaffold0006 (4 HSPs)
scaffold0006 (68-369)||(149080-149382)
scaffold0006 (19-153)||(5917-6052)
scaffold0006 (19-153)||(2726-2860)
scaffold0006 (19-153)||(133009-133144)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (20-366)||(741-1098)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (20-369)||(11143-11495)
scaffold0491 (20-369)||(8717-9069)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (36-369)||(114440-114788)
[»] scaffold0286 (2 HSPs)
scaffold0286 (129-375)||(11502-11750)
scaffold0286 (20-121)||(22179-22280)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (139-315)||(7282-7457)
[»] scaffold0176 (2 HSPs)
scaffold0176 (139-351)||(18004-18216)
scaffold0176 (85-153)||(17483-17552)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (139-298)||(80338-80496)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (163-351)||(10468-10656)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (233-320)||(27475-27563)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (25-153)||(36568-36697)
scaffold0087 (19-153)||(43691-43826)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (19-149)||(85919-86050)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (23-355)||(2600-2925)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (205-306)||(25073-25175)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (23-303)||(6120-6391)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (20-153)||(8148-8282)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (20-153)||(45430-45565)
[»] scaffold0129 (1 HSPs)
scaffold0129 (93-171)||(19121-19199)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (185-357)||(3720-3895)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (20-54)||(17671-17705)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 106)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 18 - 375
Target Start/End: Original strand, 44454992 - 44455351
Alignment:
Q  18 actatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgatta 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44454992 actatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagagagagaaacttggtaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgatta 44455091  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattag 216  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44455092 gagttttcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaaccattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattag 44455191  T
Q  217 agttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44455192 ggttgttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaactcatttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 44455291  T
Q  317 cca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    |||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  44455292 ccagattaggtcaagtttgaccgaactgggtcaacgatctttggtgtgtttgttcctctc 44455351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 24 - 375
Target Start/End: Original strand, 3156705 - 3157056
Alignment:
Q  24 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttc 122  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3156705 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagagctggaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttc 3156803  T
Q  123 tcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgt 222  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  3156804 tcttgggtttggaaacattgtaaacaccctg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgt 3156902  T
Q  223 tctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat-t 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3156903 tctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatat 3157002  T
Q  322 taggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  3157003 taggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctc 3157056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 28220560 - 28220210
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28220560 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattag 28220462  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  28220461 agttctcttgggttgggaagcattgaaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattcggaaaatgggtagaaattagg 28220362  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28220361 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 28220262  T
Q  318 ca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgt 368  Q
    ||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28220261 cagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgt 28220210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 28223755 - 28223405
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28223755 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattag 28223657  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  28223656 agttctcttgggttgggaaacattgaagacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattatg 28223557  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28223556 gttgatctttctgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 28223457  T
Q  318 cat-ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgt 368  Q
    ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28223456 catattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgt 28223405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Original strand, 31659072 - 31659420
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31659072 ctatataagtgttctt-tgcagattttgagagagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattag 31659170  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31659171 agttctcttgggttcggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagg 31659270  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31659271 gctgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaacttattgatagtggattggagagatcaatctctccct 31659370  T
Q  318 ca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgttt 366  Q
    ||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31659371 cagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgttt 31659420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 19 - 375
Target Start/End: Original strand, 49918183 - 49918541
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49918183 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaagtagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaaggtctttgattag 49918281  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaa-caccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattag 216  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  49918282 agttctcttggattgggaaacattataaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattag 49918381  T
Q  217 agttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49918382 ggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 49918481  T
Q  317 cc-atttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    || | |||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  49918482 ccaaattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctc 49918541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 24 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 37503883 - 37503534
Alignment:
Q  24 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttc 122  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37503883 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagaggttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtgactttagggttgagggtctttgattagagttc 37503785  T
Q  123 tcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgt 222  Q
    | ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  37503784 tattgggttggaaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtaaaaattagggttgt 37503685  T
Q  223 tctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  37503684 tctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacc---ttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagat 37503588  T
Q  322 taggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    || |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  37503587 tatgtcaagttggatcgaactaggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctc 37503534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 24 - 374
Target Start/End: Original strand, 10925062 - 10925416
Alignment:
Q  24 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttc 122  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10925062 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttggaaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattatagttc 10925160  T
Q  123 tcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgt 222  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||    
T  10925161 tcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgaaaaaatggatagaaattatggttgt 10925260  T
Q  223 tctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt---aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  10925261 tctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaagaattcattgatagtggattggagaaatcaatctctccccta 10925360  T
Q  320 -tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatct 374  Q
      |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  10925361 gattaggtaaagttggatcgaactgggtcaacaatctttgatgtgtttgtttatct 10925416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 24 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 37560198 - 37559844
Alignment:
Q  24 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttc 122  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | || ||| ||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37560198 taagtgttctt-tgcagattttgaagtaaagcttgaagagagagaaacttgagaaatcaaatgaggtaactttaaggttgagggtctttgattagagttc 37560100  T
Q  123 tcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgt 222  Q
    |||||||||   ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  37560099 tcttgggtttgaaaacattgtaaacacattaggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattaggaaaatgggtagaaattagagttgt 37560000  T
Q  223 tctttgtgaacttgttg-aagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccc--a 319  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||       
T  37559999 tctttgtgaacttgttgaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtgaattggagagatcaatctctccccctag 37559900  T
Q  320 tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
     |||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  37559899 attaggtcaagttggaccgaacttggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctc 37559844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 67 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 834453 - 834150
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  834453 aaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattaaagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgcgtgaaaat 834354  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  834353 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgta 834254  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtt 365  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  834253 tccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatctatctctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtt 834154  T
Q  366 tgtt 369  Q
    ||||    
T  834153 tgtt 834150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 67 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 3847407 - 3847104
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3847407 aaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggtcgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 3847308  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  3847307 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtttaagctaaatttttgtaacccatttgta 3847208  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtt 365  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  3847207 tccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatccatctcttccccagattaggtcaagttggaccgaacttggtcaacaatctttggtgtgtt 3847108  T
Q  366 tgtt 369  Q
    ||||    
T  3847107 tgtt 3847104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Original strand, 3189165 - 3189516
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3189165 ctatataagtgttctt-tgaagattttgaaggagagcatgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattaa 3189263  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||     
T  3189264 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagg 3189362  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  3189363 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcatc 3189462  T
Q  318 ca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    ||   |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3189463 cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 3189516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Original strand, 3197982 - 3198333
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3197982 ctatataagtgttctt-tgaagattttgaaggagagcatgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattaa 3198080  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||     
T  3198081 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagg 3198179  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  3198180 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcatc 3198279  T
Q  318 ca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    ||   |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3198280 cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 3198333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Original strand, 3206821 - 3207172
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3206821 ctatataagtgttctt-tgaagattttgaaggagagcatgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattaa 3206919  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||     
T  3206920 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagg 3207018  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  3207019 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcatc 3207118  T
Q  318 ca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    ||   |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3207119 cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 3207172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 315
Target Start/End: Original strand, 1833356 - 1833652
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1833356 ctatataagtattctt-tgcagattttgaatgagagattgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggagataactttaaggttgagggtctttgattag 1833454  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  1833455 agttctcttggattgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg 1833554  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1833555 gttgttctttgtgaatctattgaagctaaattcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 1833652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 65 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 50169498 - 50169193
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaa 164  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  50169498 agaaactagggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggttttttattagggttatcttgggttgggaaacattgtaaataccttgggtgagtgaaa 50169399  T
Q  165 atcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttg 264  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  50169398 atcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttg 50169299  T
Q  265 tatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtg 363  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||    
T  50169298 tatctctttgtaagtactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactggatcaacaatctttggtgtg 50169199  T
Q  364 tttgtt 369  Q
    ||||||    
T  50169198 tttgtt 50169193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 67 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 8551073 - 8550769
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  8551073 aaacttgggaaatcaaaggagttaactttagggttaagggtctttgattagagttctcttgggttaagaaacattgtaaacacattgggtgagtgaaaat 8550974  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  8550973 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgta 8550874  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgt 364  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8550873 tccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgt 8550774  T
Q  365 ttgtt 369  Q
    |||||    
T  8550773 ttgtt 8550769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30476782 - 30476423
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| || ||||  |||||| ||||||| |||||||||    
T  30476782 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaatgatgtaatgttagggctgagggtatttgattag 30476684  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttca---ttggtgagattggaaaaatgggtagaaatt 214  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30476683 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgggtgaaaatcattgagt-tcttgttcaatattggtgagattgggaaaataggtagaaatt 30476585  T
Q  215 agagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 314  Q
    || |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  30476584 agggttgttctttatgaacttgttgaagataatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatactggattggacagatcaatctcta 30476485  T
Q  315 ccccat-ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    |||||| | |||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  30476484 ccccatatgaggttaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctc 30476423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Original strand, 20762506 - 20762858
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20762506 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaagagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggtctttgattag 20762604  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattg-gaaaaatgggtagaaattag 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  20762605 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtatcttgttcattggtgagattgagaaaaaagggtagaaattag 20762703  T
Q  217 agttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20762704 ggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttcgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcct 20762803  T
Q  317 cca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
     ||   |||||||||||| || |||||| ||| | |||||| |||||||||||||    
T  20762804 acagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctttggtgtgtttgtt 20762858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 67 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 197194 - 196893
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  197194 aaacttggaaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 197095  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  197094 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagttaatttcttgtaactcatttgta 196995  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccc--atttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgt 364  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    |||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  196994 tccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatttatctctccccccagattaggtcaagttggaccgaactggatcaacaatctttggtgtgt 196895  T
Q  365 tt 366  Q
    ||    
T  196894 tt 196893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 68 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 4552922 - 4552620
Alignment:
Q  68 aacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatc 167  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  4552922 aacttgggaaattaaaggaggtaactttagggttgagggtctttaattgaggttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgggtgagggaaaatc 4552823  T
Q  168 attgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat 267  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4552822 attgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggtttgtcctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccctttgtat 4552723  T
Q  268 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgttt 366  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4552722 ccctttgtaagaactcattgataatggattggagagatcaatctctccctcagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgttt 4552623  T
Q  367 gtt 369  Q
    |||    
T  4552622 gtt 4552620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 65 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28265854 - 28265537
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattaga------------gttctcttgggttgagaaacattgtaaacacctt 152  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28265854 agaaactagggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattaggttctcttgaggggttctcttaggttgggaaacattgtaaacacctt 28265755  T
Q  153 gagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttctt 252  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  28265754 gggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggcgagattgggaaaataggtagaaattagggttgttcattgtgagcttgttgaagctaatttctt 28265655  T
Q  253 gtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaaca 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  28265654 gtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 28265555  T
Q  352 atctctggtgtgtttgtt 369  Q
    |||| |||||||||||||    
T  28265554 atctttggtgtgtttgtt 28265537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 68 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 13659621 - 13659319
Alignment:
Q  68 aacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatc 167  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  13659621 aacttgggaaatcaaaggaggtaacttgtgggttgagggtctttgattagagttctcttaggttgagaaacattgtaaacaccttggggtagtgaaaatc 13659522  T
Q  168 attgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat 267  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  13659521 attgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaacggatagaaattagggttgttttttgtaagcttgttgaagctaatttcttgttacccatttatat 13659422  T
Q  268 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgttt 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  13659421 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtattt 13659322  T
Q  367 gtt 369  Q
    |||    
T  13659321 gtt 13659319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 67 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 23555551 - 23555275
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  23555551 aaacttgggaaatcaaaggaggtaacttcagggttgaggatctttgattaaagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgaatgaaaat 23555452  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
     |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  23555451 tattgagtgtcttattctttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttataactcatttgta 23555352  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatttaggtcaagtttgatcgaactg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||    
T  23555351 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctccccatagtaggtcaagttggatcgaactg 23555275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 67 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 13138260 - 13137959
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13138260 aaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagggttctcttggggtgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 13138161  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13138160 cattgagtgtcttgttcattggtgagatt-gaaaaatggatagaaattag-gtcgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgca 13138063  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtt 365  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |   |||||||  || || ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  13138062 tctctttgtaagaacacattgatagtggattgaagagagcaatctctcccctagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctttgatgtgtt 13137963  T
Q  366 tgtt 369  Q
    ||||    
T  13137962 tgtt 13137959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 67 - 369
Target Start/End: Original strand, 46064800 - 46065103
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46064800 aaacttgggaaatcaaagaaggtaactttattgttgagggtctttgattatggttctcttggggtggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 46064899  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  46064900 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatggataaaaattaggtttgttctttgtgagctcgttgaagctaatttcttgtaactcatgtgta 46064999  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  46065000 tctctttgtaagaactcattcatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaagttggatcgaactgggtaaacaatctttggtgtgtt 46065099  T
Q  366 tgtt 369  Q
    ||||    
T  46065100 tgtt 46065103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 67 - 369
Target Start/End: Original strand, 15820189 - 15820492
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15820189 aaacttgggaaatcaaaagaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgagttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 15820288  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15820289 cattgagtgtcttgttctttggtgatattggaaagatgggtaaaaattaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacacatttgta 15820388  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtt 365  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||  |||   ||||||||||| ||||||||| ||| |||| |   |||||||||    
T  15820389 tctctttttaagaactcattgatagtgcattgaagagataaatctctcatccagagtaggtcaagttggatcgaactaggtaaacatttattggtgtgtt 15820488  T
Q  366 tgtt 369  Q
    ||||    
T  15820489 tgtt 15820492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 67 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 40122484 - 40122179
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  40122484 aaacttgggaaatcaaaggaggtaactttatggttgaggatcattaattagagttatcttggattgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtaaaaat 40122385  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  40122384 cattgaatgtcttgttcatttgtgagattggaaaaatgggtcgaaattagatttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttataactcatttgta 40122285  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattg--atagtggattggagagatcaatctctcccccat-ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtg 363  Q
    || |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||    
T  40122284 tcactttgtaagaactctttgatatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaatctttggtgtg 40122185  T
Q  364 tttgtt 369  Q
    ||||||    
T  40122184 tttgtt 40122179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 65 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 50167476 - 50167158
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttg-------------ggttgagaaacattgtaaacacct 151  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||             ||||| ||||||||||||||||||    
T  50167476 agaaactagggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagggttctcttgaggggttctcttgggttgggaaacattgtaaacacct 50167377  T
Q  152 tgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttct 251  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  50167376 tgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattagtagaaattagggttgttatttgtgagcttgtcaaagctaatttct 50167277  T
Q  252 tgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaac 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| || |||||| |||||||    
T  50167276 tgtaacccatttgtatctctttgtaaaaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattagctcaagttggaccgaactaggtcaac 50167177  T
Q  351 aatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  50167176 aatctttggtgtgtttgtt 50167158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 67 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 45644641 - 45644337
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  45644641 aaactagggaaatcaaaggagataactttagggttgagggtctttgattagggttctcttaggttggaaaacattgtaaacatcttgggtgagtgaaaat 45644542  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaatt-agagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgt 265  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||| |||||||    
T  45644541 cattaagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatggatagaaattaagttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgcaactcatttgt 45644442  T
Q  266 atctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgt 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||     
T  45644441 atctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatatctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgc 45644342  T
Q  365 ttgtt 369  Q
    |||||    
T  45644341 ttgtt 45644337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 129 - 365
Target Start/End: Original strand, 19754438 - 19754676
Alignment:
Q  129 gttgagaaacatt-gtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattg-gaaaaatgggtagaaattagagttgttctt 226  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19754438 gttgggaaacattcgtaaacaccttgagagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaaatgggtagaaattagggttgttctt 19754536  T
Q  227 tgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttagg 325  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  19754537 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccgatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccctcagattagg 19754636  T
Q  326 tcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtt 365  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||| | |||||||||    
T  19754637 tcaagttggaccgaagtgggtcaacaatttttggtgtgtt 19754676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 60 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 928271 - 927977
Alignment:
Q  60 agagaagaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacatt-gtaaacaccttgagtga 158  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  928271 agagaaaaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttatggttgaaggtctttgattaggattctcttgggttgggaaacatttgtaaacaccttgggtga 928172  T
Q  159 gtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaac 257  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||  | |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  928171 gtgaaaatcaatgagtgtcttgttctttggtgatattggaaaaaatgatagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaac 928072  T
Q  258 ccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctc-tcccccatttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaaca 351  Q
    || |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||| ||| ||||| |  ||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  928071 ccttttggatctctttgtaaaaactcattaatagtggattagagagaccaacctcttccccaaggtaggtcaagttagaccgaactgggtaaaca 927977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 139 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 13547302 - 13547090
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13547302 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 13547204  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatc 337  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| || |    
T  13547203 gaagctattttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 13547104  T
Q  338 gaactgggtcaaca 351  Q
    ||||||||| ||||    
T  13547103 gaactgggtgaaca 13547090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 142 - 355
Target Start/End: Original strand, 19752643 - 19752857
Alignment:
Q  142 gtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattg-gaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttga 240  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  19752643 gtaaacaccttgagagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgagtaaaatgggtagaaattagggttgttctttgcgagcttgttga 19752741  T
Q  241 agctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat-ttaggtcaagtttgatcga 339  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||    
T  19752742 agctaatttcttgtaaccgatttgtatctctttgtaagaactcattgatagaggattggagagatcaatctctctcccatattaggtcaagttggaccga 19752841  T
Q  340 actgggtcaacaatct 355  Q
    ||| ||||||||||||    
T  19752842 actaggtcaacaatct 19752857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 139 - 351
Target Start/End: Original strand, 37168252 - 37168465
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37168252 attgtaaacaccttgagagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 37168350  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaaccca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgat 336  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| ||     
T  37168351 taagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggac 37168450  T
Q  337 cgaactgggtcaaca 351  Q
    |||||||||| ||||    
T  37168451 cgaactgggtgaaca 37168465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Original strand, 51765230 - 51765583
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattaga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||  ||||||||||| ||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  51765230 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaagg-gagttggaagagtgagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggtctttgattaga 51765328  T
Q  119 g-ttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaa-aaatgggtagaaattag 216  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||  |||||| | ||| |||||||||||||    
T  51765329 gcttctcttgggttg-gaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtttgattgggagaaaagggtagaaattag 51765425  T
Q  217 agttgttc-tttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctct 313  Q
     ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51765426 ggttgtacctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctct 51765525  T
Q  314 ccccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    || |||   |||| ||||||| || |||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  51765526 cctccagagtaggacaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtctttgtt 51765583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 139 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 47255553 - 47255378
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||  ||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  47255553 attgtaaatgccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 47255455  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47255454 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 47255378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 139 - 343
Target Start/End: Original strand, 11348653 - 11348857
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11348653 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 11348751  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| || |    
T  11348752 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttctaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 11348851  T
Q  338 gaactg 343  Q
    ||||||    
T  11348852 gaactg 11348857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 139 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 13549213 - 13549001
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13549213 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 13549115  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatc 337  Q
     || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| || |    
T  13549114 aaacctaatttcatgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 13549015  T
Q  338 gaactgggtcaaca 351  Q
    ||||||||| ||||    
T  13549014 gaactgggtgaaca 13549001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 127 - 369
Target Start/End: Original strand, 41360857 - 41361100
Alignment:
Q  127 gggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctt 226  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  41360857 gggttgggaaacatcgtaaacatcttgggtgagtgaaaat-attgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctt 41360955  T
Q  227 tgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat-ttagg 325  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||    
T  41360956 tgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattaaagagatcaatatctcccccatagtagg 41361055  T
Q  326 tcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctc-tggtgtgtttgtt 369  Q
    |||  || || |||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  41361056 tcatattggaccgaactaggtcaacaatatcttggtgtgtttgtt 41361100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 140 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 31925919 - 31925745
Alignment:
Q  140 ttgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttg 239  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||    
T  31925919 ttgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagagtggaaaaatgggtagaaattagggatgttcattgtgagcttgttg 31925821  T
Q  240 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31925820 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 31925745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 139 - 315
Target Start/End: Original strand, 29136202 - 29136377
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29136202 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 29136300  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29136301 gaagctaatttcttggaacccatttgtatttctttgtaagaactcattgatcgtggattggagagatcaatctctcc 29136377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 139 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 42298188 - 42298013
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  42298188 attgtaaacaccttgggagagtaaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttttttgtgagcttgtt 42298090  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42298089 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcc 42298013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 139 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 37033286 - 37033112
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37033286 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 37033188  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaaccca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctct 313  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37033187 gaagctaatttcttgtaatccattttgcatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagattaatctct 37033112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 148 - 320
Target Start/End: Original strand, 16455585 - 16455756
Alignment:
Q  148 accttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaat 247  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| || ||||  |||| |||||||||||||||    
T  16455585 accttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggtaaaatggtgagaaattagattttttcta-gtgagcttgttgaagctaat 16455683  T
Q  248 ttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat 320  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16455684 ttcttgtaacccatttgtatctctgtgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccat 16455756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 139 - 313
Target Start/End: Original strand, 193566 - 193739
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||    
T  193566 attgtaaacaccttgggagggtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttattagcttgtt 193664  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctct 313  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193665 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattggagagatcaatctct 193739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 139 - 313
Target Start/End: Original strand, 47115126 - 47115300
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  47115126 attgtaaacatcttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 47115224  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaaccca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctct 313  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47115225 taagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaaaaacccattgatagtggattggagagatcaatctct 47115300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 139 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 7482445 - 7482268
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7482445 attgtaaacaccttgggaaagtgaaaattcatgagtgtattgttcattggtgagattgggtaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 7482346  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaaccca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7482345 taagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtgaattggagagatcaatctctcc 7482268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 139 - 315
Target Start/End: Original strand, 34603530 - 34603707
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||   || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  34603530 attgtaaacaccttgggaaagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgaaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 34603629  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaaccca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  34603630 taagctaatttcttgtaacccattttttatctctttgtaagaactcattgatggtggattgaagagatcaatctctcc 34603707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 185 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 13316520 - 13316334
Alignment:
Q  185 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactca 284  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13316520 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 13316421  T
Q  285 ttgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||| || |||||||||| |||||||| | ||| |||||||    
T  13316420 ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttagtgagtttgtt 13316334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Original strand, 40282218 - 40282564
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaag-gagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggt-ctttgatta 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | ||||| ||||||||||| ||||||| |  | |||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  40282218 tatttaagtgttcttgtgcagattt-gaagagagagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgatta 40282316  T
Q  117 gagt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaatta 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||||       |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  40282317 gagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaatta 40282406  T
Q  216 gagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctct 313  Q
    | ||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  40282407 gggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct 40282505  T
Q  314 ccccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctc-tggtgtgtttgtt 369  Q
    || |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  40282506 cctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgtt 40282564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Original strand, 9987044 - 9987375
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggt-ctttgattag 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | | ||||| | | ||||||| ||||||| |  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  9987044 tatttaagtgttcttgtgcagattt-gaaggtgagttggaagagagatagacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattag 9987142  T
Q  118 agt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattag 216  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||||       |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  9987143 agtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattag 9987232  T
Q  217 agttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
     ||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9987233 ggttgttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgcaacct-tttgtatcccttttgcaagaactcattgatagtggattggagagtacaatctctcc 9987331  T
Q  316 ccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
     |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  9987332 tccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 9987375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 139 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 37879124 - 37879006
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37879124 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaataggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 37879026  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  37879025 gaagctaatttcttgtaacc 37879006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 143 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 37282901 - 37282729
Alignment:
Q  143 taaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaa 241  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
T  37282901 taaacaccttgtatgagtgaaaaccattgagtgtcttgttcattggagagattg-aaaaatgg-tataaattagggtttgttccttgtgagcttgttgaa 37282804  T
Q  242 gctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    |||||||| | ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  37282803 gctaatttatggtaacccttttgcatctctttgtaaagaactcattagtagtggattggagagataaatctctcc 37282729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 190 - 315
Target Start/End: Original strand, 22079322 - 22079447
Alignment:
Q  190 gagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattga 288  Q
    |||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22079322 gagattggaaaaatgg-tagaaattatgtttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaaccattttgtatctctttgtaaagaactcattga 22079420  T
Q  289 tagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    || |||||||||||||||||| |||||    
T  22079421 tattggattggagagatcaatttctcc 22079447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 69 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20622515 - 20622218
Alignment:
Q  69 acttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||| ||||||| |  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||   ||| ||||||    
T  20622515 acttgggaaatcaaatggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagggaaaat 20622418  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    |||||  |||||||       |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||| || ||||||    
T  20622417 cattgactgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaa-ccttttgta 20622327  T
Q  267 tc---tctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctc-tggt 360  Q
    ||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||    
T  20622326 tcccttttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggt 20622227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 13316652 - 13316518
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |  | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  13316652 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaagatgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggtagcaactttagggtttagggtctttgattag 13316554  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13316553 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 13316518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 69 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 44650448 - 44650202
Alignment:
Q  69 acttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacatt-gtaaacaccttgagtgagtgaaaatc 167  Q
    ||||||| ||||||| |||  || ||||||| |||| ||||||| | || ||||||||  ||||  ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||     
T  44650448 acttgggaaatcaaaggagaaaattttagggatgagagtctttggtgagggttctcttaagttggaaaacatttgtaaacactttgggtgagtgaaaatt 44650349  T
Q  168 attgggtgtcttgttcattggtgagattg-gaaaaatgggtagaaatta-gagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgt 265  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| |||||| |  |||||||||||||  ||||| | |||||||| ||||||  | ||| |    
T  44650348 attgagtgtcttgttcattggagagattgagaaaaat--gtaaaaattatggtttgttctttgtgagtttgttaacgctaatttattgtaaatcttttat 44650251  T
Q  266 atctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctct 313  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  44650250 atctctttgtaaataattcattaatagtggattgaagagatcaatctct 44650202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 199 - 309
Target Start/End: Original strand, 3460709 - 3460821
Alignment:
Q  199 aaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggat 296  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||  ||||||||| |||    
T  3460709 aaaaagggtagaaattagagtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccttttgtatatctttgtaaagaacatattgatagtcgat 3460808  T
Q  297 tggagagatcaat 309  Q
    |||||||||||||    
T  3460809 tggagagatcaat 3460821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Original strand, 21053799 - 21054145
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaag-gagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggt-ctttgatta 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | ||||| ||| ||||||| ||||||| |  | |||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  21053799 tatttaagtgttcttgtgcagattt-gaagtgagagttggaagagagagagacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgatta 21053897  T
Q  117 gagt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaatta 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||   |||  |||||||||| ||||||||       |||||||||| |||| | ||||||||||    
T  21053898 gagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagaaaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gtgtagaaatta 21053987  T
Q  216 gagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctct 313  Q
    | ||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  21053988 gggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaaactct 21054086  T
Q  314 ccccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctc-tggtgtgtttgtt 369  Q
    || |||   |||||||||||| || |||||||||| | ||||||| |||||| ||||||    
T  21054087 cctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 21054145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 129 - 313
Target Start/End: Original strand, 6808389 - 6808581
Alignment:
Q  129 gttgagaaacattgt-aaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggt-gagattggaaaaatgggtagaaattag----ag--tt 220  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| | |||||||||| |||| |||||||||||||  || |||||| |  |||||| ||||||||||    ||  ||    
T  6808389 gttgagaaacattgggaaacactttgggagagtgaaaattattgagtgtcttgttcatgagtagagattagggaaatgg-tagaaattaggattaggttt 6808487  T
Q  221 gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctct 313  Q
    |||||| | || |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6808488 gttcttggagagcttgttgaagctaacttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctct 6808581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Original strand, 9036264 - 9036603
Alignment:
Q  25 aagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgta-gaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt- 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||| ||| | |||| ||| ||||||| ||||||| | || |||| ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  9036264 aagtgttcttgtgcagattt-gaagaggagtttgaaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 9036361  T
Q  121 tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt 220  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||    || || |||||||| ||||||||       |||||||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  9036362 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtt 9036451  T
Q  221 -gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccc 318  Q
     |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||| |     
T  9036452 tgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcg 9036549  T
Q  319 a-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctc-tggtgtgtttgtt 369  Q
    |   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  9036550 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtatttgtt 9036603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 369
Target Start/End: Original strand, 36683694 - 36683865
Alignment:
Q  189 tgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattga 288  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||  || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||          ||||||||||||||||||    
T  36683694 tgagattgggaaaataggtagaaattaggtttattctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaactca----------tttgtaagaactcattga 36683783  T
Q  289 tagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctc-tggtgtgtttgtt 369  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||| || ||| ||||| |||||||||||||    
T  36683784 tagtggattgtagaaatcaatctctcccccagagtaggtcaagttagaccgaactgagtaaac-atctcttggtgtgtttgtt 36683865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 230 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 9109543 - 9109459
Alignment:
Q  230 gaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctct 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9109543 gaacttgttgaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaacacgttgatagtgtattggagagatcaatctct 9109459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 200 - 319
Target Start/End: Original strand, 13938152 - 13938270
Alignment:
Q  200 aaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctctttgtaagaa-ctcattgatagtggatt 297  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||  ||  |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13938152 aaatgggtagaaattag-gttgttcttggagaacttgtaaaatataatttcttgtaaccttttttgtatctctttgtaagaaactcattgatagtggatt 13938250  T
Q  298 ggagagatcaatctctccccca 319  Q
    |||||||||  |||||||||||    
T  13938251 ggagagatc--tctctccccca 13938270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 254 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 37876865 - 37876804
Alignment:
Q  254 taacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37876865 taacccatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattgcagagatcaatctctcc 37876804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 222 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2263106 - 2263011
Alignment:
Q  222 ttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  2263106 ttcttggtgagcttgttgaagataatttcttgtaacccttttatatctttttgtaaagaacttattgatagtggattgaagagatcaatctttccc 2263011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 153
Target Start/End: Original strand, 47098554 - 47098690
Alignment:
Q  18 actatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgatta 116  Q
    ||||| ||||||||  | ||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| |||||||        
T  47098554 actatataagtgtttctttgcagattttgaatgagagcttttagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagc 47098652  T
Q  117 ga-gttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47098653 gaggttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 47098690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 153
Target Start/End: Original strand, 47102568 - 47102704
Alignment:
Q  18 actatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-att 115  Q
    ||||| ||||||||  | ||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  47102568 actatataagtgtttctttgcagattttgaatgagagcttttagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagt 47102666  T
Q  116 agagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47102667 gaggttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 47102704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 3282074 - 3281939
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||| | | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| | |     
T  3282074 ctatataagtgttcttatgcagattttgaaggagagcttgaagtgagagaaacttggatta-caaatgaggtaactttatggttgagtgtctttgtagtg 3281976  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3281975 aggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 3281939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 21536300 - 21536435
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |     
T  21536300 ctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagtgagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtg 21536398  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | |||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  21536399 aggatctcttaggttggaaaacattgtaaacaccttg 21536435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 29652180 - 29652045
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |     
T  29652180 ctatataagtgtttttgtgcagattttgaaggagagcttgaaaagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtg 29652082  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29652081 aggatcttttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 29652045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 37070134 - 37069999
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| | |     
T  37070134 ctatataagtgttcttgtgcagattttgaagtagagctggaagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttatggttgagtgtctttgtagtg 37070036  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37070035 aggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 37069999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 140 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 8871259 - 8871095
Alignment:
Q  140 ttgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||| |  |||||||||| || |||||||| | ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||  | |||    
T  8871259 ttgtaaacaccttggatgagcgaaaatcatag--tgtcttgttcttttgtgagatttggaaaatgg-tagaaattagggtttgttctttgtgagttcgtt 8871163  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat 320  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8871162 gaagctaatttcttgtaaccattttgtaactc--------------ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccat 8871095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 313
Target Start/End: Original strand, 2926516 - 2926637
Alignment:
Q  192 gattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgata 290  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||| |||   ||||||||| ||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| || ||| |||||| ||    
T  2926516 gattggaaaaatgg-tagaaattaggtttgtgcttgaagaacttgttaaagttaatttattgtaacctttttgcatctctttgaaacgaattcattggta 2926614  T
Q  291 gtggattggagagatcaatctct 313  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  2926615 gtggattggagagatcaatctct 2926637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 202 - 303
Target Start/End: Original strand, 32471478 - 32471579
Alignment:
Q  202 atgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaag-aactcattgatagtggattgga 300  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  32471478 atgggtataaattaggtttgttctttgagaact-gttgaagttaatttattgcaactcttttgtatctctttgtaagaaactcattgatagtggattcga 32471576  T
Q  301 gag 303  Q
    |||    
T  32471577 gag 32471579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 163 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12318713 - 12318585
Alignment:
Q  163 aaatcattgggtgtcttgttcattggt-gagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccat 261  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||| |||||| | ||| ||||||||||||||  |||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  12318713 aaatcattgagtttcttgttcatgggtagagatttggaaa-tgggtagaaattaggtttgttcatggagagcttgttgaagctaatttcttgtaaccatt 12318615  T
Q  262 ttgtatctctt-tgtaagaactcattgata 290  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  12318614 ttgtatgtcttctttaagaactcattgata 12318585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 22819795 - 22819663
Alignment:
Q  21 atttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagagaagaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-attagag 119  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||   |||| |||||||||||||| || || ||||||| | |   |    
T  22819795 atttaagtgtttctgttcaaattttgaaggagagtttgaagaga-gaaacttgggtttacaaaggaggtaactttaggatttagtgtctttgtagtgagg 22819697  T
Q  120 ttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22819696 ttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 22819663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 262 - 315
Target Start/End: Original strand, 28242382 - 28242434
Alignment:
Q  262 ttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28242382 ttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctcc 28242434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 235 - 314
Target Start/End: Original strand, 5459956 - 5460035
Alignment:
Q  235 tgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 314  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5459956 tgttgaagctaatttcttgtaacat-tttatatttctttgtaaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctc 5460035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 13598767 - 13598632
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||| | | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| | |     
T  13598767 ctatataaatgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaaattggatta-caaaggaggtaactttatggttgagtgtctttgtagtg 13598669  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  13598668 aggatctcttgggttggcaaacattgtaaacaccttg 13598632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 357
Target Start/End: Original strand, 44203478 - 44203806
Alignment:
Q  23 ttaagtgttcttgtgcagattttgaagg---agaggttgtagagaagaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaga 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||   |||| | | ||||| || ||||||| ||||||| | || | || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  44203478 ttaagtgttcttgtgcagattt-gaagggtgagagttggaagaga-gagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattaga 44203574  T
Q  119 gt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    || ||||||||||||| |||||| | ||||||||||    || || |||||||| ||||||||       |||||||||| |||  |||||||||||||     
T  44203575 gtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattagg 44203662  T
Q  218 gtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctct 313  Q
    ||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  44203663 gtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctct 44203760  T
Q  314 ccccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    || |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  44203761 cctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 44203806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 127
Target Start/End: Original strand, 777110 - 777172
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttg 127  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  777110 agaaactagggaaatcaaaggaggtaactttagggttgatggtctttgattagggttctcttg 777172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 13604352 - 13604487
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  ||||| |||||||||| | | |||| |||| |||||||||||||||  |||||| | |     
T  13604352 ctatataagtgttcttgtgcaaattttggaggagagcttaaagagagagaaacttggatta-caaaggagggaactttagggttgagtatctttgtagtg 13604450  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13604451 aggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 13604487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 293
Target Start/End: Original strand, 25652040 - 25652195
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagt-tgttctttgtgaacttgt 237  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| || | ||||||||  |  |   | || |||| ||||||||||| ||| |||| |||| ||  ||||    
T  25652040 attgtaaacaccttaagtgtgtgaaaatcattgagtattttgttcatgagaaaatattgagaaattggtagaaatta-agtgtgttatttgagagtttgt 25652138  T
Q  238 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 293  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  25652139 tgaagctaatttcttgtaactctcttgtatctctttgtaaagaactctttgatagtg 25652195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 156
Target Start/End: Original strand, 26644627 - 26644766
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaa-ggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-att 115  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||| |||||||||| | | |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||| | |    
T  26644627 ctatataagtgttcttatgcagattttgaaaggagagcctgaagagagagaaacttggatta-caaaggagataattttagggttgagtgtctttgtagt 26644725  T
Q  116 agagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagt 156  Q
      || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26644726 gaagatcttttgggttgggaaacattgtaaacaccttgagt 26644766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 290
Target Start/End: Original strand, 41135834 - 41135926
Alignment:
Q  199 aaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgata 290  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||   |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  41135834 aaaaagggtagaaattagatttgttcttgaagaactttttgaagttaatttcttgtaaaccttttgtatctatttgtaaagaactcgttgata 41135926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 303
Target Start/End: Original strand, 6398587 - 6398764
Alignment:
Q  126 tgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattgg-tgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttc 224  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||  || || |||||||||| ||  ||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||    
T  6398587 tgggttgggaaacattgtaaacacctcacatgagtgaaaatctgtgagtttcttgttcatgggaagagattgg-gaaatgagtagaaattag-gttgttc 6398684  T
Q  225 tttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaag-aactcattgatagtggattggagag 303  Q
    || | |||||| |||| | ||||| ||| |  | | || |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  6398685 ttggagaacttattgaggttaattacttttttctctttagtatatctttgtaagaaactcattgatagtgaattggagag 6398764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16914329 - 16914234
Alignment:
Q  200 aaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaa-tttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 293  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| | || | |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16914329 aaatgggtaaaaattatgtttgttcttggagagcctgttgaagctaagtttcttctaacccttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtg 16914234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 152
Target Start/End: Original strand, 9022638 - 9022770
Alignment:
Q  21 atttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagag 119  Q
    |||||||||||   || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||   |||| |||||| |||| || ||||  |||||||    |||    
T  9022638 atttaagtgtttcagttcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggtttacaaaggaggtatcttttgg-ttgaatgtctttgtagtgag 9022736  T
Q  120 -ttctcttgggttgagaaacattgtaaacacctt 152  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9022737 gttctcttgggttgagaaacattgtaaacacctt 9022770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 119 - 167
Target Start/End: Original strand, 777177 - 777225
Alignment:
Q  119 gttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatc 167  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  777177 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacactttgggtgagtgaaaatc 777225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 4535629 - 4535527
Alignment:
Q  205 ggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagag 303  Q
    |||||||||||   |||||||| | || ||| ||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||    
T  4535629 ggtagaaattaagtttgttcttggagagcttattgaagtcaatttcttgtaacatttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagttaagtggagag 4535530  T
Q  304 atc 306  Q
    |||    
T  4535529 atc 4535527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 1050674 - 1050503
Alignment:
Q  123 tcttgggttgagaaacatt-gtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcat-tggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt 220  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||| |||| ||||||||| | |||| || |||||||||| ||  |||||||| ||| |||||  |||||||   |    
T  1050674 tcttgggttgggaaacatttgtacacacattgaatgagtgaaatt-attgagtctcttgttcatgtgaagagattgggaaa-tgggtgaaaattaggtgt 1050577  T
Q  221 gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 293  Q
    |||||| | || ||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| || ||||| |||||||||    
T  1050576 gttcttcgagagcttattgaagctaatttcttgtaacatttttgtgtctctttgtaaataactcgttgatagtg 1050503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 153
Target Start/End: Original strand, 27104130 - 27104266
Alignment:
Q  18 actatttaagtgttcttgtgcagattttgaag-gagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgatt 115  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||  || ||||| || |||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||| ||||||| |||||||       
T  27104130 actatttaagtgtttctttgcagatttttgagagagagcttttagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttaaggttgagtgtctttgtag 27104228  T
Q  116 agagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
     ||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  27104229 tgaggtctcttgggttgggaaacattataagcaccttg 27104266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 44646981 - 44646881
Alignment:
Q  156 tgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattg-gaaaaatgggtagaaatta-gagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttg 253  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| |||||| |  |||||||||||||  ||||| | |||||||| |||    
T  44646981 tgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattggagagattgagaaaaat--gtaaaaattatggtttgttctttgtgagtttgttaacgctaatttattg 44646884  T
Q  254 taa 256  Q
    |||    
T  44646883 taa 44646881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 19072976 - 19072914
Alignment:
Q  309 tctctcccccat-ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttc 370  Q
    |||||||||||  ||||||||  || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19072976 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttc 19072914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 19120866 - 19120804
Alignment:
Q  309 tctctcccccat-ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttc 370  Q
    |||||||||||  ||||||||  || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19120866 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttc 19120804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 54
Target Start/End: Original strand, 19358563 - 19358597
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagag 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19358563 tatttaagtgttcttgtgcagattttggaggagag 19358597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 54
Target Start/End: Original strand, 19361152 - 19361186
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagag 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19361152 tatttaagtgttcttgtgcagattttggaggagag 19361186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 54
Target Start/End: Original strand, 19366027 - 19366061
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagag 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19366027 tatttaagtgttcttgtgcagattttggaggagag 19366061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 269
Target Start/End: Original strand, 35109486 - 35109557
Alignment:
Q  197 gaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatct 269  Q
    ||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35109486 gaaaattgggtagaaattaaggtttgttctttgtgagctttt--aagctaatttcttgtaacctatttgtatct 35109557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 297
Target Start/End: Original strand, 30670114 - 30670206
Alignment:
Q  206 gtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacc-catttgtatctctttgtaag-aactcattgatagtggatt 297  Q
    ||||||||||| |||||| || | ||| |||||||||||||||| ||||| |  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  30670114 gtagaaattag-gttgtttttggagaatttgttgaagctaattttttgtatcgtcttttgtatctctttgtaagaaagtcattgatactggatt 30670206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 268
Target Start/End: Original strand, 32736945 - 32737015
Alignment:
Q  197 gaaaaatgggtagaaattagag-ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc 268  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||  || |||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  32736945 gaaaaatgggtagaaattagggtttgttctttatgaact--tttaagctaattttttgtaacctctttgtatc 32737015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 43342521 - 43342468
Alignment:
Q  88 gtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacatt 141  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  43342521 gtaacttttgggatgagggtctttggtgagagttctcttcggttgggaaacatt 43342468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 153
Target Start/End: Original strand, 16124347 - 16124379
Alignment:
Q  121 tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16124347 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 16124379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 49982223 - 49982183
Alignment:
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacc 258  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49982223 gttgttcttagagaatttgttgaagctaatttcttgtaacc 49982183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 79)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 19 - 375
Target Start/End: Original strand, 15212620 - 15212977
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15212620 ctatataagtgttctt-tacagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaatgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 15212718  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  15212719 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg 15212818  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15212819 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgataatggattggagagatcaatctctcccc 15212918  T
Q  318 ca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    ||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15212919 cagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctc 15212977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 24 - 375
Target Start/End: Original strand, 43036262 - 43036614
Alignment:
Q  24 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttc 122  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43036262 taagtgttctt-tgcagattttgaatgagaggttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttc 43036360  T
Q  123 tcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgt 222  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  43036361 tcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgt 43036460  T
Q  223 tctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tt 321  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |    
T  43036461 tctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatttgagagatcaatctctcctccagat 43036560  T
Q  322 taggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  43036561 taggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctc 43036614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 19 - 375
Target Start/End: Original strand, 33351984 - 33352341
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||| ||||| |||| |||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33351984 ctatataagttttctt-tgcaaattttgaaggtgaggtggaagagagagaaacttgggaaatcaaagaaggtaactttagggttgagggtctttgattag 33352082  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  33352083 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgattgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtaaaaattagg 33352182  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33352183 gttgttctttgtgaacttgttgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 33352282  T
Q  318 ca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    ||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  33352283 cagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttgatgtgtttgttcctctc 33352341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 18 - 375
Target Start/End: Original strand, 4731491 - 4731849
Alignment:
Q  18 actatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgatta 116  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4731491 actatataagtgttctt-tgtagattttgaaggagcggttgaagagagagaaacttgaaaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgatta 4731589  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattag 216  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4731590 gagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattag 4731689  T
Q  217 agttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
     |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4731690 ggttgctctttgtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcgatctctccc 4731789  T
Q  317 cca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    |||  || ||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4731790 ccagattcggtcaagttggaccgaattgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctc 4731849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 19 - 375
Target Start/End: Original strand, 30143176 - 30143531
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30143176 ctatataagtgttctt-tgtagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattag 30143274  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||     
T  30143275 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattg--tgtcttgttcattggccagattgggaaaatgggtagaaattagg 30143372  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30143373 gttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 30143472  T
Q  318 ca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    ||  | ||||||||||  |  |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  30143473 cagataaggtcaagttgaactgaactgagtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctc 30143531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Original strand, 27811112 - 27811460
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||| || | | ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27811112 ctatataagtgttctt-tgcatattttgaaggaaagctggaagagagagaaaattgggaaatcaaaggaggtaaatttagggttgagggtctttgattag 27811210  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  27811211 agttctcttaggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg 27811310  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27811311 gttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaacccattgatagtggattgaagagatcaatctctcccc 27811410  T
Q  318 ca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgttt 366  Q
    ||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27811411 cagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgttt 27811460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Original strand, 42498028 - 42498380
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42498028 ctatataactgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattaa 42498126  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattgg-aaaaatgggtagaaattag 216  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  42498127 agttctcttgggttgggaaacgttgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattag 42498225  T
Q  217 agttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42498226 ggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcct 42498325  T
Q  317 cca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    |||   |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  42498326 ccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 42498380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 24 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 12702967 - 12702617
Alignment:
Q  24 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttc 122  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12702967 taagtgttctt-tgcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaaatttagggttgagggtctttgattagagttc 12702869  T
Q  123 tcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattgg-----aaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||     ||||| |||||||||||||     
T  12702868 tcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattaagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaaaagggtagaaattagg 12702770  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12702769 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtgtctctttgtaagaactcattgatattggattggagagatcaatctctcccc 12702670  T
Q  318 ca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
     |  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  12702669 tagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtatgtttgtt 12702617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Original strand, 17982487 - 17982839
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  17982487 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggtctttgattag 17982585  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattgg-aaaaatgggtagaaattag 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  17982586 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattag 17982684  T
Q  217 agttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
     ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  17982685 ggttgttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcct 17982784  T
Q  317 cca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    |||   |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17982785 ccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 17982839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 67 - 366
Target Start/End: Original strand, 6598854 - 6599154
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6598854 aaacttgggaaatcaaaggagataactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 6598953  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6598954 cattaagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaagtttgttctttgcgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgta 6599053  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat-ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtt 365  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6599054 tacttttgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtt 6599153  T
Q  366 t 366  Q
    |    
T  6599154 t 6599154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 67 - 366
Target Start/End: Original strand, 6674307 - 6674607
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6674307 aaacttgggaaatcaaaggagataactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 6674406  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6674407 cattaagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaagtttgttctttgcgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgta 6674506  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat-ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtt 365  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6674507 tacttttgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtt 6674606  T
Q  366 t 366  Q
    |    
T  6674607 t 6674607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 34254662 - 34254313
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  34254662 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggtctttgattag 34254564  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||     
T  34254563 agttctcttgggttg-gagacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagg 34254467  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34254466 gttgttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaacttattgatagtggattggagagatcaatctctcctc 34254367  T
Q  318 ca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
     |   |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  34254366 tagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 34254313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 67 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 3303956 - 3303653
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3303956 aaacttgggaaatcaaaggaggtaactttacggttgagggtctttgattagggttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 3303857  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  3303856 cattgagtatcttgtttattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaagtttgttctttgtgagcttgtttaacctaatttcttgtaactcatttgta 3303757  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  3303756 tctctttgtaagaactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcccccacagtaggtcaagttggaccgaactgggtaaacaatctttggtgtgtt 3303657  T
Q  366 tgtt 369  Q
    ||||    
T  3303656 tgtt 3303653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 34256838 - 34256489
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| | | ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  34256838 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagaaagataaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggtctttgattag 34256740  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  34256739 agttatcttgggttg-gaaacattgtaaacaccttg-gtgtgtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgg-tagaaattagg 34256643  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34256642 gttgttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctc 34256543  T
Q  318 ca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
     |   |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  34256542 tagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 34256489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Original strand, 31218091 - 31218443
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  31218091 ctatataagtgttctt-tgtagattttgaagaagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggtctttgattag 31218189  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattgg-aaaaatgggtagaaattag 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  31218190 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattag 31218288  T
Q  217 agttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  31218289 ggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcct 31218388  T
Q  317 cca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    |||   |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31218389 ccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 31218443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 65 - 369
Target Start/End: Original strand, 5689151 - 5689456
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaa 164  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5689151 agaaactagggaaatcaaaggagataactttagggttgagggtctttgattagggttctcttgagtttggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaa 5689250  T
Q  165 atcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  5689251 atcattgagtgtcttgttcattaatgagattggaaaaatgggtagaaattaaggtggtgctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttg 5689350  T
Q  265 tatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtg 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||    
T  5689351 tatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttgatgtg 5689450  T
Q  364 tttgtt 369  Q
    ||||||    
T  5689451 tttgtt 5689456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Original strand, 44303688 - 44304041
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||| | ||||||| ||   |||||||||||| |||||||||||||||    
T  44303688 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaagagagcttgaagagagagaaacttgagaaatcaaaggaaacaactttagggtttagggtctttgattag 44303786  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattgg--aaaaatgggtagaaatta 215  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  44303787 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaagggtagaaatta 44303885  T
Q  216 gagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
      ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44303886 aggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttttaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcc 44303985  T
Q  316 ccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
     |||   |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  44303986 tccagagtaggtcaagtttggatcgaactaggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 44304041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1746553 - 1746201
Alignment:
Q  18 actatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgatta 116  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| | | ||||| ||||||||||| ||||||| || | |||||||||||| |||||| |||||||    
T  1746553 actatataagtgttctt-tgcagattttgaagaagagctggaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggtccttgatta 1746455  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattg-gaaaaatgggtagaaatta 215  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||    
T  1746454 gagttctctttggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgaaaaaaaaaggtagaaatta 1746356  T
Q  216 gagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1746355 gggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcc 1746257  T
Q  316 cccat-ttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
     ||||  |||||||||||| || |||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  1746256 tccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatcgttggtgtgtttgtt 1746201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19945694 - 19945341
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||||| || | |||||||||||| || ||||||||||||    
T  19945694 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagacaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagagtctttgattag 19945596  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagatt-ggaaaaatgggtagaaattag 216  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  19945595 agttctcttgggtcgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattat 19945497  T
Q  217 agttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacc-catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
     ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19945496 ggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccacttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcc 19945397  T
Q  316 ccca-tttaggtcaagtttg-atcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
     | |   ||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  19945396 tcgagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 19945341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 77 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1345647 - 1345354
Alignment:
Q  77 aatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgt 176  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  1345647 aatcaaaggatgtaactttagggttgagggtttttgattagagttctcttgagttgggaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgt 1345548  T
Q  177 cttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgta 276  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  1345547 cttgttcatttgtgagattgggaaaatgtgtagaaattagggttgttctttgtgagtttattgaagctaatttcttgtaacccatatgtatctctttgaa 1345448  T
Q  277 agaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   ||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  1345447 agaactcattgatagtggattgaagagttcaatctctcccccagagtaggtcaagttagaccgaactaggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 1345354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 65 - 369
Target Start/End: Original strand, 40320947 - 40321265
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttggg-------------ttgagaaacattgtaaacacct 151  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |             ||| ||||||||||||||||||    
T  40320947 agaaactagggaaatcaaaggaggtaactttcgggttgagggtctttgattagggttctcttgaggggttctcttgagttgggaaacattgtaaacacct 40321046  T
Q  152 tgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttct 251  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  40321047 tgagtgactgaaaatcattgagtgtcttgttcataggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtgagcttgttgaagttaatttct 40321146  T
Q  252 tgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaac 350  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  40321147 tgtaacccattagtatctctttgtaaaaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaac 40321246  T
Q  351 aatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    ||||| || ||||||||||    
T  40321247 aatctttgatgtgtttgtt 40321265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 85 - 351
Target Start/End: Original strand, 18141720 - 18141987
Alignment:
Q  85 gaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacatt-gtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttc 183  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  18141720 gaggtaattttagggttgagggtctttgattagggttctcttaggttgggaaacatttgtaaacaccttgggcgagtgaaaatcattgagtgtcttgttc 18141819  T
Q  184 attggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactc 283  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18141820 attggtgagattgtgaaaatgggtagaaattag-gttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcactttgtaagaactc 18141918  T
Q  284 attgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaaca 351  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || | ||||||| |||||    
T  18141919 tttgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaagttggaccaaactgggccaaca 18141987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 67 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1292749 - 1292471
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  1292749 aaacttggaaaatcaaatgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttcttttgggttgggaaacactgtgaacaccttgggtgagtgaaaat 1292650  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1292649 tattgagtgtcttgttctttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaagtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgta 1292550  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatttaggtcaagtttgatcgaactggg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||    ||||||||||| || |||||||||    
T  1292549 tctctttgtaagaactcattgatagtggatttgagaaataaatctctccccagagtaggtcaagttggaccgaactggg 1292471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 4162400 - 4162628
Alignment:
Q  85 gaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttca 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4162400 gaggtaactttagggttgagggtctttgattagggttctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgagcgagtgaaaatcattgagtgtcttgttca 4162499  T
Q  185 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactca 284  Q
    || ||||||   | ||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4162500 ttagtgaga---ggaaaatgggtagaagttaggtttgttctttgagaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactca 4162596  T
Q  285 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  4162597 ttgatag-ggattggagatatcaatctctcccc 4162628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 88 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 41366879 - 41366601
Alignment:
Q  88 gtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattg 187  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||       
T  41366879 gtaactttagggttgaggatctttgattagagttctcttagattgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcaaga 41366780  T
Q  188 gtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattg 287  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||   ||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  41366779 ctgagattgagaaaatgggtagaaattatgtttgttctttgtaagcttgtttaagctaatttcttttaacctatttgtatccctttgtaagaactcattt 41366680  T
Q  288 atagtggattggagagatcaatctctcccccatttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgttt 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  41366679 atagtggattggagagatcaatctctccctagattaggtcaagttggaccgaactgggacaacaatctttggtgtgttt 41366601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 68 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 18106363 - 18106084
Alignment:
Q  68 aacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatc 167  Q
    |||||||| ||||||| |||  ||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  18106363 aacttgggaaatcaaaggagagaactttaggatagagggtctttaattagatttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatt 18106264  T
Q  168 attgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat 267  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18106263 gttgagtgtcttgttcatcggtgagattggaaaaatggatagaaactatagttgttctttgcgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtat 18106164  T
Q  268 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaa 349  Q
    || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    ||||||||||| || |||||||||||||    
T  18106163 ct-tttgtaagaactcattgatagt-gtttggagagatcaatctctccccagaataggtcaagttggaccgaactgggtcaa 18106084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 139 - 362
Target Start/End: Original strand, 40221700 - 40221923
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40221700 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttctttggtgagattggtaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 40221798  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatc 337  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |    
T  40221799 gaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggacc 40221898  T
Q  338 gaactgggtcaacaatctctggtgt 362  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||    
T  40221899 gaactgggtcaataatctttggtgt 40221923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 94 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 4743462 - 4743197
Alignment:
Q  94 ttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgaga 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4743462 ttagggttgagggtctttgattaggaatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagcgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 4743363  T
Q  194 ttggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtg 293  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||          |||||||||||||||||||||||    
T  4743362 ttggaaaaatgggtag-aattaggtttgttctttgtgtgtttgttgaagctaaaatcttgtaaccca----------tttgtaagaactcattgatagtg 4743274  T
Q  294 gattggagagatcaatctctccccc-atttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4743273 gattggagagatcaatctctcccccaaagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 4743197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 65 - 370
Target Start/End: Original strand, 9765627 - 9765930
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttg--ggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtga 162  Q
    ||||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |   |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9765627 agaaacttgggaatacaaaggaggtaacttgagggttgagtgtctttgagtgaggttctcttgagggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtga 9765726  T
Q  163 aaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatt 262  Q
    ||    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||    
T  9765727 aa----ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttggcaaagctaatttcttgtaacccatt 9765822  T
Q  263 tgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtg 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||  ||||||||  || || ||||||||||||||||||  |||||    
T  9765823 tgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagct-gctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcattggtg 9765921  T
Q  362 tgtttgttc 370  Q
    |||||||||    
T  9765922 tgtttgttc 9765930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 139 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 42435204 - 42434992
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  42435204 attgtaaacactttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 42435106  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatc 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   ||||||||||| || |    
T  42435105 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 42435006  T
Q  338 gaactgggtcaaca 351  Q
    ||||||||| ||||    
T  42435005 gaactgggtgaaca 42434992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 77 - 369
Target Start/End: Original strand, 30291484 - 30291793
Alignment:
Q  77 aatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttg-------------ggttgagaaacatt-gtaaacaccttgagtgagtga 162  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||             ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||    
T  30291484 aatcaaaggaggtaactttagggttgatggtctttgattagggttctcttgaggggtttttttgggttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgattga 30291583  T
Q  163 aaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccat 261  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30291584 aaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcat 30291683  T
Q  262 ttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc-cca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctgg 359  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| | |||||| || |||||||  |||||||||| |||    
T  30291684 ttgtatcactttgtaagaattctttgatagtggattggagagatcaatctctccctccagattatgccaagttggaccgaactgaatcaacaatctttgg 30291783  T
Q  360 tgtgtttgtt 369  Q
    ||||||||||    
T  30291784 tgtgtttgtt 30291793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 127 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19491924 - 19491681
Alignment:
Q  127 gggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctt 226  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19491924 gggttgggaaacatcgtaaacatcttgggtgagtgaaaat-attgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctt 19491826  T
Q  227 tgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat-ttagg 325  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||    
T  19491825 tgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattaaagagatcaatatctcccccatagtagg 19491726  T
Q  326 tcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctc-tggtgtgtttgtt 369  Q
    |||  || || |||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  19491725 tcatattggaccgaactaggtcaacaatatcttggtgtgtttgtt 19491681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 139 - 318
Target Start/End: Original strand, 44353747 - 44353926
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44353747 attgtaaacacattgggtgagtaaaaatcattgagtatcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 44353846  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccc 318  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  44353847 gaagctaatttcttgtaacacatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgaaaagatcaatctctccccc 44353926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 139 - 312
Target Start/End: Original strand, 4283479 - 4283651
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  4283479 attgtaaacaccttaggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttttttgtgagcttgtt 4283577  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4283578 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctc 4283651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 139 - 351
Target Start/End: Original strand, 18655355 - 18655567
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  18655355 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgttttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgagcttgtt 18655453  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc-cccatttaggtcaagtttgatc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  ||||||||||| || |    
T  18655454 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaagttggacc 18655553  T
Q  338 gaactgggtcaaca 351  Q
    ||||||||| ||||    
T  18655554 gaactgggtgaaca 18655567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 139 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 10930412 - 10930198
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||  ||| | ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||| || |||    
T  10930412 attgtaaacattttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcatcggtgagattgggaaaatggatagaaattagggttgctctttgtgagctcgtt 10930314  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |    
T  10930313 gaagctaatttcttgtaacccatttatatctctttgtaagaacacattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggacc 10930214  T
Q  338 gaactgggtcaacaat 353  Q
    ||||||||||||||||    
T  10930213 gaactgggtcaacaat 10930198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 67 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 41365133 - 41364926
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41365133 aaacttgtgaaatcaaatgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttcttttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 41365034  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||| ||||||||||||    ||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  41365033 cattgagtgtcttgttcaagactgagattgggaaaattggtagaaattaggtttgttctttgtgagtttgtttaagctaatttcttgtaacacatttgta 41364934  T
Q  267 tctctttg 274  Q
    || |||||    
T  41364933 tccctttg 41364926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 67 - 304
Target Start/End: Original strand, 10929683 - 10929907
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | |||||||||    
T  10929683 aaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttg-gggtctttgattagagttctcttgggttgggaa-cattgtaaacaccttggattagtgaaaat 10929780  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||              
T  10929781 cattgagtgtcttgttctttggtgagatatggaaaatgggtagaaattatgtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaa---------- 10929870  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaga 304  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10929871 -ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaga 10929907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Original strand, 2627577 - 2627923
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattaga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  2627577 tatttaagtgttcttgtgcagattt-gaaggagagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagtctttgattaga 2627675  T
Q  119 g-ttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    | ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||       |||||||||| |||| |||||||||||||     
T  2627676 gcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaa-gagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagg 2627766  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctctt-tgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    ||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2627767 gttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaactctttttgtatctcttgtgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcc 2627866  T
Q  316 ccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctc-tggtgtgtttgtt 369  Q
     |||   |||||||||||| || |||||||||| || |||||| |||||| ||||||    
T  2627867 tccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaataatctcttggtgtctttgtt 2627923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 140 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 8965904 - 8965692
Alignment:
Q  140 ttgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgtt 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||| |||  |||||    
T  8965904 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttctttatgagtttgtt 8965806  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat-ttaggtcaagtttgatc 337  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  8965805 gaagttaatttcttataacccttttatatctctttgtaagaactcattgatagtgcatcggagagataaatctctcccccatattaggtcaagttggacc 8965706  T
Q  338 gaactgggtcaaca 351  Q
    ||||||||| ||||    
T  8965705 gaactgggtaaaca 8965692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 139 - 351
Target Start/End: Original strand, 11383941 - 11384152
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  11383941 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcatta-tgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 11384038  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatc 337  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||   ||||| ||||| || |    
T  11384039 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaacccattgatactggattggagacatcgatctctcctccagagtaggttaagttggacc 11384138  T
Q  338 gaactgggtcaaca 351  Q
    ||||||||| ||||    
T  11384139 gaactgggtgaaca 11384152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 139 - 315
Target Start/End: Original strand, 40328734 - 40328910
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  40328734 attgtaaacatcttgggagagtgaaaatcat-gaatgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtt 40328832  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaaccca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
     || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40328833 taaactaatttcttgtaactcattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 40328910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 155 - 311
Target Start/End: Original strand, 3772162 - 3772318
Alignment:
Q  155 gtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgt 254  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||  ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  3772162 gtgagtgaaaatgattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaattgatagaaattaggtttgttctttgtgagcttatttaagctaatttcttgt 3772261  T
Q  255 aacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatct 311  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3772262 aactcatttgtatatctttgtaagaatttattgatagtggattggagagatcaatct 3772318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 153
Target Start/End: Original strand, 4733638 - 4733777
Alignment:
Q  18 actatttaagtgttcttgt-gcagattttgaaggagaggttgtagaga---agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttga 113  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4733638 actatataagtgttctttttgcagattttgaaggagaggttgaagagagagagaaacttgggaaatcaaaagaggtaactttagggttgagggtctttga 4733737  T
Q  114 ttagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4733738 ttagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 4733777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 77 - 313
Target Start/End: Original strand, 8153653 - 8153886
Alignment:
Q  77 aatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaaca-ttgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcatt--ggg 173  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||  | |    
T  8153653 aatcaaaggaggtaattttaaggttgagagtctttgattaatgttcttttgggttgggaaacatttgtatacaccttggatgagtgaaaatcattgagtg 8153752  T
Q  174 tgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaac-ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctt 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |      ||| ||| | ||||||||||||| ||| |||||| | ||||||| ||||    
T  8153753 tgtcatgttcattggtgagattgagaaaat-ggtagaaattaggg------tttctgagctttgttgaagctaaattcgtgtaactcttttgtatatctt 8153845  T
Q  273 tgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctct 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8153846 tgtaagaactcattgatagttgattggagagatcaatctct 8153886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 263 - 375
Target Start/End: Original strand, 4733784 - 4733897
Alignment:
Q  263 tgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtg 361  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||    
T  4733784 tgtatctctttgtaagaattcattgatagtggattggagagatcgatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacagtctttggtg 4733883  T
Q  362 tgtttgttcatctc 375  Q
    ||||||||| ||||    
T  4733884 tgtttgttcctctc 4733897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 223 - 346
Target Start/End: Original strand, 10015119 - 10015241
Alignment:
Q  223 tctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccattt 322  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    |    
T  10015119 tctttgtgtgcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-taggaactcattgatagtggattggagagataaatctctctccatagt 10015217  T
Q  323 aggtcaagtttgatcgaactgggt 346  Q
    |||||||||| || ||||||||||    
T  10015218 aggtcaagttggaccgaactgggt 10015241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 175 - 317
Target Start/End: Original strand, 1822282 - 1822425
Alignment:
Q  175 gtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 273  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||| || |||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  1822282 gtcttgttcatttgagagattgcaaaaa-ggatagaaattatggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttatatctattt 1822380  T
Q  274 gt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    || || |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1822381 gtaaataactcactaatagtgaattggagagatcaatctctcccc 1822425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 175 - 317
Target Start/End: Original strand, 1856727 - 1856870
Alignment:
Q  175 gtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 273  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||| || |||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  1856727 gtcttgttcatttgagagattgcaaaaa-ggatagaaattatggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttatatctattt 1856825  T
Q  274 gt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    || || |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1856826 gtaaataactcactaatagtgaattggagagatcaatctctcccc 1856870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 7412707 - 7412572
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| |||||||   ||    
T  7412707 ctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagag 7412609  T
Q  118 a-gttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7412608 aggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 7412572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11712291 - 11712037
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagag-ttctcttgggttgagaaacatt-gtaaacaccttgagtgagtga 162  Q
    |||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || |||||||||  ||| |||| ||||||| ||||  |||||||    
T  11712291 agaaacttagggtatcaaatgaggtaactttagggttgagtgtctttggtgagaggttttcttgggttccgaagcatttgtaaacatcttggatgagtga 11712192  T
Q  163 aaatcattgggtgtcttgttcattggt-gagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaaccca 260  Q
    || |||||| || | |||||| ||||  |||||||  |||||   || |||||||  || |||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||     
T  11712191 aa-tcattgagtcttttgttctttggaagagattgagaaaataa-tataaattaggttttgttccttgagagcttgttgaagctaatttcttgaaaccct 11712094  T
Q  261 tttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11712093 tttatatctctttgtaaataactcattgatagtggattgaagagatcaatctctccc 11712037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 29796611 - 29796354
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacatt-gtaaacaccttgagtgagtgaa 163  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   || |||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| | |||||||    
T  29796611 agaaacttgagaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggatctttggcgagggttctcttgggttgggaaacatttgtaaatatcttgggcgagtgaa 29796512  T
Q  164 aatcattgggtgtcttgttcattggt-gagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccat 261  Q
      |||||| || |||||||| |  |  |||||||| |||| | |||||||| |  ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  29796511 t-tcattgagtctcttgttcttgagaagagattgggaaaa-gagtagaaatcaaggtttgttcttggagaacttgttgaagctgatttcttgtaacattt 29796414  T
Q  262 ttgtatctctttgtaagaa--ctcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca 319  Q
    ||||| || ||||||| ||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29796413 ttgtacctatttgtaaaaaaactcatttataatggattggagagatcaatctctccccca 29796354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 219 - 320
Target Start/End: Original strand, 7597648 - 7597750
Alignment:
Q  219 ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    |||||||| | || |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7597648 ttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttataatccttttgtatctctttgtaaagaatgcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 7597747  T
Q  318 cat 320  Q
    |||    
T  7597748 cat 7597750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 149
Target Start/End: Original strand, 10015030 - 10015112
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacac 149  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10015030 aaacttgggaaatcaaaggacgtaactttatggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacac 10015112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 5702210 - 5702345
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |     
T  5702210 ctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgaagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtg 5702308  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  5702309 aggatctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttg 5702345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 19948656 - 19948533
Alignment:
Q  18 actatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgatta 116  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| || | |||||||||||| || |||||||||||    
T  19948656 actatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagagtctttgatta 19948558  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacatt 141  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||    
T  19948557 gagttcttttgagttgggaaacatt 19948533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Original strand, 25689798 - 25690128
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggt-ctttgattag 117  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| | ||| ||| ||||||| ||||||| |  | | || ||||||| ||||| ||||||||||    
T  25689798 tatttaagtgttcttgtgcatcttt-gaagaagaggttgga-agagagagacttgggaaatcaaagggagaagctctagggtttagggttctttgattag 25689895  T
Q  118 agt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattag 216  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||    || || |||||||| ||||||||       |||||||||| |||| || ||||||||||    
T  25689896 agtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattag 25689985  T
Q  217 agtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 314  Q
     ||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  25689986 ggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaaactctc 25690083  T
Q  315 cccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    | |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  25690084 ctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 25690128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 90 - 357
Target Start/End: Original strand, 3439416 - 3439677
Alignment:
Q  90 aactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattg 187  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||    || ||||||||||| ||||||||           
T  3439416 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagaaaatcattgagtgtcttg------- 3439506  T
Q  188 gtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcat 285  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||| || ||||||||   |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |    
T  3439507 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattatgaacttggc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 3439603  T
Q  286 tgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||   |||||||||||| || |||||||| | ||||||||||    
T  3439604 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggatgaacaatctct 3439677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 156
Target Start/End: Original strand, 23799306 - 23799444
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| |||||||   ||    
T  23799306 ctatataagtgttcttgtgcatattttgaaggatagcttgaagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagag 23799404  T
Q  118 agt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagt 156  Q
    ||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  23799405 aggatctcttgggttggggaacattgtaaacaccttgagt 23799444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 245 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 3073981 - 3073875
Alignment:
Q  245 aatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatttaggtcaagtttgatcgaactgg 344  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |  ||||||||    
T  3073981 aatttcttgtaacatttttgtatctctttgtaagaactcattgataatggcttggagagatcaatctctccccatagtaggtcaagttgggccgaactgg 3073882  T
Q  345 gtcaaca 351  Q
    || ||||    
T  3073881 gtaaaca 3073875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 4456395 - 4456260
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| |||| || | |     
T  4456395 ctatataagtgttcttgtgcagattttgaagaagagcttgaagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctctgtagtg 4456297  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4456296 aggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 4456260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 153
Target Start/End: Original strand, 4696343 - 4696473
Alignment:
Q  24 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-attagagtt 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| | | |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| | |   | |    
T  4696343 taagggttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttggatta-caaaggagataactttagggttgagtgtctttgtagtgaggat 4696441  T
Q  122 ctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4696442 ctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 4696473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 235 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 32902292 - 32902208
Alignment:
Q  235 tgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  32902292 tgttgaagctaatttcttgtaacttttttgtatctctttctaaagaattcattgatagtgaatttgagagatcaatctctccccc 32902208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 219 - 294
Target Start/End: Original strand, 10240188 - 10240264
Alignment:
Q  219 ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtgg 294  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10240188 ttgttctttgtgagcttgttgaatctaatttcttgtaaccatgttggatctctttgtaaagaactcattgatagtgg 10240264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 78 - 293
Target Start/End: Original strand, 41266860 - 41267078
Alignment:
Q  78 atcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattaga-gttctcttgggttgagaaaca-ttgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtg 175  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||| || ||| ||||||| || ||| ||||||| ||||||||| ||     
T  41266860 atcaaatgaggtaactttagggttgaatgtctttggtgagaggttctcttgggttgggagacagttgtaaatactttgggtgagtg-aaatcattgagtc 41266958  T
Q  176 tcttgttcattgg-tgagattggaaaaatgggtagaaatta-gagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 273  Q
    |||||||| | ||  ||| |||  ||||| ||||||||||| |  |||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  41266959 tcttgttcttaggaagagtttgagaaaat-ggtagaaattaggttttgttcttagagaacttgttgagactaatttcttgtaactcttttgtatttcttt 41267057  T
Q  274 gt-aagaactcattgatagtg 293  Q
     | |||||||  |||||||||    
T  41267058 ctaaagaacttcttgatagtg 41267078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 3232031 - 3231859
Alignment:
Q  119 gttctcttgggttgagaaacatt-gtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggt-gagattg-gaaaaatgggtagaaatta 215  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||  |||||| || |||||||| | ||  ||||||| ||||||||  |||||||||    
T  3232031 gttctcttgagttgggaaacattagtaaacaccttgggtgggtgaat-tcattgagtctcttgttcttaggaagagattgagaaaaatg--tagaaatta 3231935  T
Q  216 gagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgat 289  Q
    |  || |||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  3231934 ggctttgttcttcgtgagcttgttgaagctaattttttttaaccattttgtatctctttgtaaagaacttattgat 3231859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 19752148 - 19752259
Alignment:
Q  43 tttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-attagagttctcttgggttgagaaacat 140  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |   |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |   |||||||||||||| |||| ||    
T  19752148 tttgaaggagaggttttagagagagaaacttggatcg-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttgtgaaatat 19752246  T
Q  141 tgtaaacaccttg 153  Q
    |||||||||||||    
T  19752247 tgtaaacaccttg 19752259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 302
Target Start/End: Original strand, 11137070 - 11137146
Alignment:
Q  230 gaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt----aagaactcattgatagtggattggaga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    || ||||||||||||||| ||||||||    
T  11137070 gaacttgttgaagctaatttcttataaccgttttgtatctctttgtaaaaaaaaactcattgatagtgaattggaga 11137146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 233 - 305
Target Start/End: Original strand, 30909416 - 30909487
Alignment:
Q  233 cttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 305  Q
    |||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||    
T  30909416 cttgtttaaactaatttcttgtaactc-tttgtatctctttgtaatgactcgttgatagtgaattggagagat 30909487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 3318824 - 3318741
Alignment:
Q  79 tcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattaga-gttctcttgggttgagaaaca-ttgtaaacaccttgagtgagt 160  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  3318824 tcaaatgaggtaactttagggttgagggtctttggtgggaggttctcttgggttaggaaacatttgaaaacaccttgggtgagt 3318741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 3051489 - 3051352
Alignment:
Q  18 actatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-att 115  Q
    ||||| ||||||||  | ||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||     ||| |||  ||||||||||||||| ||||||| | |    
T  3051489 actatataagtgtttctatgcagattttgaaagagagcttgaagagagagaaacttgggactataaaggagagaactttagggttgagtgtctttgtagt 3051390  T
Q  116 agagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
     | ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  3051389 ggggttctcttgagttgggaaacattgtaaacatcttg 3051352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 372
Target Start/End: Original strand, 4696645 - 4696708
Alignment:
Q  309 tctctcccccat-ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcat 372  Q
    |||||||||||  ||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4696645 tctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatct-tggtgtgtttgttcat 4696708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 312
Target Start/End: Original strand, 38863949 - 38863985
Alignment:
Q  276 aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctc 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38863949 aagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctc 38863985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 370
Target Start/End: Original strand, 5702532 - 5702593
Alignment:
Q  309 tctctcccccat-ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttc 370  Q
    |||||||||||| ||||||||  || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5702532 tctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct-tggtgtgtttgttc 5702593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 145
Target Start/End: Original strand, 5990361 - 5990418
Alignment:
Q  87 ggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaa 145  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  5990361 ggtaactttagggttgagtgtctttagtgag-gttctcttgggttgggaaacattgtaa 5990418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 273
Target Start/End: Original strand, 9054786 - 9054861
Alignment:
Q  197 gaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 273  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  9054786 gaaaaatgggtagaaattagattttgttctttgtgcgctttt--aagctaatttcttgtaaccactttgtatcacttt 9054861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 292
Target Start/End: Original strand, 40585754 - 40585822
Alignment:
Q  226 ttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa--gaactcattgatagt 292  Q
    |||||| ||||||||| | ||||| |||||| || ||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  40585754 ttgtgagcttgttgaaacgaattttttgtaagccttttgtatctttttgtaaaagaactcattgatagt 40585822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 32902475 - 32902431
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtct 109  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  32902475 agaaacttgggaaatcagatgaggtaactttagggttgaggatct 32902431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 183
Target Start/End: Original strand, 38863762 - 38863868
Alignment:
Q  77 aatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag-agttctcttgggttgagaaaca-ttgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggt 174  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||  | || ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| | |||| |||||||||| ||    
T  38863762 aatcaaatgagctaactttaaggttgagtgtctttagtgaggagttctcttgggttgggaaacatttgtaaacatcttg-gagagt-aaaatcattgagt 38863859  T
Q  175 gtcttgttc 183  Q
     ||||||||    
T  38863860 ctcttgttc 38863868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 112)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 19 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 26175970 - 26175613
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  26175970 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagagttgagggtctttgattaa 26175872  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||     
T  26175871 agttctgttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggggagaaattagg 26175772  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26175771 gttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 26175672  T
Q  318 ca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    ||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26175671 cagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctc 26175613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 36 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 9927775 - 9927440
Alignment:
Q  36 tgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgag 134  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  9927775 tgcagattttgaaggagggcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattaaagttctcttgggttggg 9927676  T
Q  135 aaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaact 234  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9927675 aaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcactgagtgtcttattcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaact 9927577  T
Q  235 tgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagttt 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  9927576 tgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttg 9927477  T
Q  334 gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttc 370  Q
    || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  9927476 gaccgaactgagtcaacaatctttggtgtgtttgttc 9927440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 34570749 - 34570391
Alignment:
Q  18 actatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgatta 116  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| | | | ||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34570749 actatatatgtgttctt-tgcagattttgaaggagagctggaacagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtagctttagggttgagggtctttgatta 34570651  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattag 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  34570650 gagttctcttgggttgggaaacattgaaaacatcttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaataggtagaaattag 34570551  T
Q  217 agttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34570550 ggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccaattgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 34570451  T
Q  317 cca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    |||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  34570450 ccagattaggttaagttggatcgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctc 34570391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 24 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 56178965 - 56178619
Alignment:
Q  24 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttc 122  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  56178965 taagtgttctt-tgcagattttgaaagagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaaggtctttgattagagttc 56178867  T
Q  123 tcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgt 222  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  56178866 tcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgt 56178768  T
Q  223 tctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       
T  56178767 tctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagag 56178668  T
Q  322 taggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  56178667 taggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 56178619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 19 - 375
Target Start/End: Original strand, 5429513 - 5429870
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5429513 ctatataagtgttctt-tgcagaccttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagtaactttagggttgagggtctttgattag 5429611  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||     
T  5429612 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgagtagaaattagg 5429711  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5429712 gttattcttcgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctatttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 5429811  T
Q  318 ca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    ||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  5429812 cagattaggttaagttggaccgaactgggtcaacaatctttgatgtgtttgttcctctc 5429870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 19 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12739884 - 12739527
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12739884 ctatataagtgttctt-tacagattttgaagtggaggttgaagagagagaaacttgagaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattag 12739786  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  12739785 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttaggtgagtggaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggatagaaattagg 12739686  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12739685 gttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctatttgtatgaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 12739586  T
Q  318 ca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    ||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12739585 cagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctc 12739527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 19 - 375
Target Start/End: Original strand, 37740460 - 37740816
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37740460 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcatgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaagtttagggttgagggtctttgattag 37740558  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||     
T  37740559 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagg 37740657  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37740658 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 37740757  T
Q  318 ca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    ||  || ||||||||| || ||||||| ||||||||| | | |||||||||||| ||||    
T  37740758 cagatttggtcaagttggaccgaactgtgtcaacaattttttgtgtgtttgttcctctc 37740816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 65 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 54200194 - 54199884
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaa 164  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  54200194 agaaacttaggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacattgggtgagtgaaa 54200095  T
Q  165 atcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54200094 atcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttg 54199995  T
Q  265 tatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtg 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||    
T  54199994 tatctctttgtaagaactcattgatagtgaattagagagatcattctctcccccagattaggtcaagttgga-cgaactgggtcaacaatttttggtgtg 54199896  T
Q  364 tttgttcatctc 375  Q
    ||||||| ||||    
T  54199895 tttgttcctctc 54199884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 370
Target Start/End: Original strand, 29254328 - 29254680
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  29254328 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggtgaggttgtagagagagaaacttgggaaatcaaaggagataactttagggttgaaggtctttgagtag 29254426  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  29254427 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacacattgggtgaatgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaattgggtagaaattaga 29254526  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc-cc 316  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29254527 gttgttttttatgagcttgttgaagttaatttcttgcaacccatttgtgtctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctctcc 29254626  T
Q  317 ccatttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttc 370  Q
    | | |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29254627 caaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttc 29254680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 36 - 353
Target Start/End: Original strand, 36994375 - 36994693
Alignment:
Q  36 tgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgag 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||      
T  36994375 tgcagattttgaaggagaggttgaagagagagaaacttggaaaatcaaaggaggtaacttttgg-ttgagggtctttgattagagttctcttgatttggc 36994473  T
Q  135 aaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaact 234  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  36994474 aaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgagct 36994573  T
Q  235 tgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat-ttaggtcaagttt 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||     
T  36994574 tgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattagatcaagttg 36994673  T
Q  334 gatcgaactgggtcaacaat 353  Q
    || |||||||||||||||||    
T  36994674 gaccgaactgggtcaacaat 36994693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 52095696 - 52095345
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52095696 ctatataagtgttctt-tgtagattttgaaggacagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggactttgattag 52095598  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  52095597 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg 52095498  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52095497 gttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaaatctttgatagtggattggagagatcaatctctcctc 52095398  T
Q  318 ca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    ||   |||| ||||||| || |||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  52095397 cagagtagg-caagtttggaccgaactgggtgaacaatttttggtgtgtttgtt 52095345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Original strand, 48142875 - 48143229
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaag-gagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgatta 116  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | | ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48142875 ctatataagtgttctt-tgcagtttttgaagagagagctagaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgatta 48142973  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagatt-ggaaaaatgggtagaaatta 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  48142974 gagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaggtagaaatta 48143073  T
Q  216 gagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48143074 gggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttcataagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 48143173  T
Q  316 ccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
     |||   |||||||||||| || | |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  48143174 tccagagtaggtcaagtttggaccaaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 48143229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 67 - 367
Target Start/End: Original strand, 5871702 - 5872003
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5871702 aaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttatgggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 5871801  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  5871802 cattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagcaaatttcttgtaacccattttta 5871901  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtt 365  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5871902 tcactttgcaagaactctttgatagtggattagagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtttgaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtt 5872001  T
Q  366 tg 367  Q
    ||    
T  5872002 tg 5872003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 12748090 - 12747792
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12748090 ctatataagtgttctt-tacagattttgaagtggaggttgaagagagagaaacttgagaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattag 12747992  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  12747991 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttaggtgagtggaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggatagaaattagg 12747892  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12747891 gttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctatttgtatgaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 12747792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 67 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 47038695 - 47038394
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  47038695 aaactggggaaatcaaaggagttaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattataaacaccttgggtgagtgaaaat 47038596  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  47038595 cattgagtgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaa-tcatttgta 47038498  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtt 365  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47038497 tctgtttgtaaggactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtt 47038398  T
Q  366 tgtt 369  Q
    ||||    
T  47038397 tgtt 47038394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 65 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 52467643 - 52467337
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacatt-gtaaacaccttgagtgagtgaa 163  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  52467643 agaaactagggtaatcaaaggaggtaattttagggttgagggtctttgattagggttctcttgggttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaa 52467544  T
Q  164 aatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccattt 263  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52467543 aatcattgagtgtcttgttcatttgtgaggttgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatatcttgtaacccattt 52467444  T
Q  264 gtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgt 362  Q
    ||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  52467443 gtatcactttgtaataactttttgatagtggattggagagatcaatctctccccgagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgt 52467344  T
Q  363 gtttgtt 369  Q
    |||||||    
T  52467343 gtttgtt 52467337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 12745770 - 12745470
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12745770 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaagttgaggttgaagagagagaaacttgggaaaaaaaaggaggtaactttagagttgagggtctttgattag 12745672  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||     
T  12745671 agttctcttggtttgggaaacaatgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggcgagattaggaaaatgggtagaaattagg 12745572  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12745571 gttgttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctcttccc 12745472  T
Q  318 ca 319  Q
    ||    
T  12745471 ca 12745470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 52082991 - 52082715
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52082991 ctatataagtgttctt-tgcaaattttgaaggacagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattag 52082893  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  52082892 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgactgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaactagg 52082793  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtgga 295  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  52082792 gttgttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaaatctttgatagtgga 52082715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 67 - 311
Target Start/End: Original strand, 24968993 - 24969238
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacatt-gtaaacaccttgagtgagtgaaaa 165  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24968993 aaacttgggaaatcaaaggaggtaactttaaggttgacggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaa 24969092  T
Q  166 tcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgt 265  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24969093 tcattgagagtcttgttctttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagatttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgt 24969192  T
Q  266 atctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatct 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24969193 atctctttgtaagaactaattgatagtggattggagagataaatct 24969238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 30000139 - 29999806
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  30000139 ctatataagtgttttt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggagacaactttagggtttagggtctttgattag 30000041  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||     
T  30000040 agttctcttgggtttggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcgttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagg 29999943  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29999942 gttgttctttgtgaacatgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatcttttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcct 29999843  T
Q  317 cca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaaca 351  Q
    |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  29999842 ccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 29999806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 5370421 - 5370059
Alignment:
Q  18 actatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgatta 116  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||| | ||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5370421 actatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagaacttgaagagagagaaacttgagaaatcaaaggagacaactttagggtttagggtctttgatta 5370323  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatg---ggtagaaat 213  Q
     |||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||    
T  5370322 tagttctcttgggctgggaaacattgtaaacactttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaaaaagaggtagaaat 5370224  T
Q  214 tagagttgttctttgtgaacttgttgaa-gctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctc 312  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  5370223 tagggttgttctttgtgaacttgtcaaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggactagagagatcaatctc 5370124  T
Q  313 tccccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    ||| |||   |||||||||||| || ||||||| || |||||||| || |||||||||| |||||    
T  5370123 tcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaatctttgatgtgtttgtttatctc 5370059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 67 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 36463688 - 36463379
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgatta----------ga---gttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||          ||   ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  36463688 aaacttgggaaatcataggaggtaactttaggattgagggtctttgattaaggttttcttgagaggttctcttgagttgggaaacattgtaaacaccttg 36463589  T
Q  154 agtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttg 253  Q
     |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  36463588 ggtgagtgaaattcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggatagaaattagggctgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttg 36463489  T
Q  254 taacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaa 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  36463488 taacccatttgtatctctttgtaagaactctttgacagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 36463389  T
Q  353 tctctggtgt 362  Q
    ||| ||||||    
T  36463388 tctttggtgt 36463379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 134 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 48893861 - 48893621
Alignment:
Q  134 gaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttc----tttgt 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    |||||    
T  48893861 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtttgt 48893762  T
Q  230 gaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtca 328  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  48893761 gagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtca 48893662  T
Q  329 agtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48893661 agttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 48893621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 13992620 - 13992275
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattaga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |  | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13992620 tatttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggtagcaactttagggtttagggtctttgattaga 13992521  T
Q  119 gt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattgg-aaaaatgggtagaaattag 216  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  13992520 gtctctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaaagggtagaaattag 13992429  T
Q  217 agttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
     ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  13992428 ggttgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctc-ttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcct 13992330  T
Q  317 cca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    |||   |||||||||||| || |||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  13992329 ccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 13992275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 67 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13009717 - 13009430
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13009717 aaacttgggaaatcaaatgaggtaactttagggttaagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 13009618  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||| |||| |             ||||||||||  ||||||||    
T  13009617 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattgtgaaaatgggtagaaattaggtttgttcttcgtgagc-------------tttcttgtaaaacatttgta 13009531  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc-cccatttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtt 365  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  13009530 tccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcgatctctcctccaaattaggtcaagttagaccgaactgtgtcaacaatctttggcgtgtt 13009431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 65 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 45687484 - 45687165
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttg-------------ggttgagaaacattgtaaacacct 151  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||             ||||| ||||||||||||||||||    
T  45687484 agaaactagggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagggttctcttgaggggttctcttgggttgggaaacattgtaaacacct 45687385  T
Q  152 tgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttc 250  Q
    || |||||||||| |  |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  || ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  45687384 tgggtgagtgaaattttttgattgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggaagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttc 45687285  T
Q  251 ttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat-ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaa 349  Q
    || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||| || |||||||||||||    
T  45687284 ttataactcatttgtatctatttgtaagaactcattgatagtggattggagagatctatctctcctccatattatgtcaagttggaccgaactgggtcaa 45687185  T
Q  350 caatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  45687184 caatctttggtgtgtttgtt 45687165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 80 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 6542455 - 6542162
Alignment:
Q  80 caaacgaggtaactttagggttgagggtctttg--attagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtc 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||  || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  6542455 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtaatgag-gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtc 6542357  T
Q  178 ttgttcattggtgagattgg-aaaaatgggtagaaattag-agttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt 275  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  6542356 ttgttcattggggagattgggaaaaaatggtagaaattaggatttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgttagccttttgtatctctttgt 6542257  T
Q  276 aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||||| |||| |   |||||||||||||    
T  6542256 aagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagggtaggtcaagttggaccgaactgggtaaacatttcttggtgtgtttgtt 6542162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 129 - 315
Target Start/End: Original strand, 40632389 - 40632575
Alignment:
Q  129 gttgagaaaca-ttgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttcttt 227  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40632389 gttgagaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttcttt 40632487  T
Q  228 gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40632488 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 40632575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 139 - 353
Target Start/End: Original strand, 54882975 - 54883189
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  54882975 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttttttgtgagcttgtt 54883073  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| |||||||| || |    
T  54883074 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagggatcaatctctcctccagattaagtcaagttggacc 54883173  T
Q  338 gaactgggtcaacaat 353  Q
    ||||||||||||||||    
T  54883174 gaactgggtcaacaat 54883189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 157 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 27417160 - 27416955
Alignment:
Q  157 gagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaa 256  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27417160 gagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattggtaaaatgtgtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaa 27417062  T
Q  257 cccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatct 355  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  27417061 cccatttgtatctctttgtaaaaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgagtcaacaatct 27416962  T
Q  356 ctggtgt 362  Q
     ||||||    
T  27416961 ttggtgt 27416955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 94 - 369
Target Start/End: Original strand, 31474059 - 31474336
Alignment:
Q  94 ttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgaga 193  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||  || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31474059 ttagggttgagggtctttgattaaggttctcttggagtgggaaacattgtaaacactttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 31474158  T
Q  194 ttggaaaaatgggtagaaatta-gagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagt 292  Q
    |||  ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31474159 ttgagaaaatgggtagaaattaggtcttgttctttttgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagt 31474258  T
Q  293 ggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaaca-atctctggtgtgtttgtt 369  Q
     |||||||||||| ||||||||| |||   ||| ||||||| || |||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  31474259 tgattggagagataaatctctccaccagagtagatcaagttggaccgaactgggtaaacatatct-tggtgtgtttgtt 31474336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 173 - 353
Target Start/End: Original strand, 26364224 - 26364405
Alignment:
Q  173 gtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26364224 gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctt 26364323  T
Q  273 tgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaat 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26364324 tgtaagaactcattaatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtttgactgaactgggtcaacaat 26364405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 174 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 46147570 - 46147374
Alignment:
Q  174 tgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 273  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46147570 tgtcttgttcatcggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt 46147471  T
Q  274 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccc-atttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46147470 gtaagaactctttgatagtggattggagacatcaatctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 46147374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 145 - 365
Target Start/End: Original strand, 3913408 - 3913628
Alignment:
Q  145 aacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagct 244  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  3913408 aacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgagtagaaattagagctgttctttgtgagtttgttgaagct 3913507  T
Q  245 aatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatttaggtcaagtttgatcgaactgg 344  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     || || |||||  ||||||||||    
T  3913508 aatttcttttaacccatttgtatatctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccctagagtatgtaaagttgtatcgaactgg 3913607  T
Q  345 gtcaacaatctctggtgtgtt 365  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  3913608 gtcaacaatctttggtgtgtt 3913628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 119 - 369
Target Start/End: Original strand, 4587892 - 4588144
Alignment:
Q  119 gttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaatta-ga 217  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||    
T  4587892 gttctcatgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcatgttcattggtgaaattgggaaaaaaggtagaaattaaga 4587991  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
     ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4587992 tttgttctttgtaagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagaacaatctctcccc 4588091  T
Q  318 cat-ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    |||  ||||| ||||| || | |||||||| |||| |   |||||||||||||    
T  4588092 cataataggtgaagttggaccaaactgggtaaacatttcatggtgtgtttgtt 4588144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 199 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12744079 - 12743902
Alignment:
Q  199 aaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattg 298  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12744079 aaaataggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattg 12743980  T
Q  299 gagagatcaatctctcccccat-ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12743979 gagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctc 12743902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 199 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12745468 - 12745291
Alignment:
Q  199 aaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattg 298  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12745468 aaaataggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattg 12745369  T
Q  299 gagagatcaatctctcccccat-ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12745368 gagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctc 12745291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 139 - 314
Target Start/End: Original strand, 6655911 - 6656085
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  6655911 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcacttgtgagattgaaaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgaacttgtt 6656009  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6656010 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 6656085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 77 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 5208119 - 5207876
Alignment:
Q  77 aatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacatt-gtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtg 175  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  5208119 aatcaaaggaggtaactatagggttgcgggtctttggtgagggttctcttggattgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcatttagtg 5208020  T
Q  176 tcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttg 274  Q
     |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | | ||||| ||||    
T  5208019 acttgttcattggagtgattggaaaaa-gggtagaaattagggtttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttattgcaacccttgtatatctatttg 5207921  T
Q  275 taagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  5207920 taagaactcattgatagtggattggaaagatcaatctctctccca 5207876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 139 - 315
Target Start/End: Original strand, 8665362 - 8665538
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  8665362 attgtaaacaccttggaagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagaatgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgagagcttgtt 8665461  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8665462 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 8665538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 139 - 315
Target Start/End: Original strand, 2209668 - 2209844
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  2209668 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgttgagattgggaaaatgggtagaaattagggtttttctttgtgagcttgtt 2209766  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaaccca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2209767 gaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagattaatctctcc 2209844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 139 - 315
Target Start/End: Original strand, 35662395 - 35662571
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaa-tcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgt 237  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||    
T  35662395 attgtaaacaccttgagagtgtgaaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgaaaaaatgggtagaaattagggttgttctttatgagtttgt 35662493  T
Q  238 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35662494 tgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatatctcc 35662571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 139 - 343
Target Start/End: Original strand, 41639381 - 41639585
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||  | |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  41639381 attgtaaacaccttaggagagtgaaaatcac-gagtgtcttgtttattggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttttt 41639479  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| || |    
T  41639480 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctatttgtaagaactcatcgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 41639579  T
Q  338 gaactg 343  Q
    ||||||    
T  41639580 gaactg 41639585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 139 - 315
Target Start/End: Original strand, 46703454 - 46703631
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  46703454 attgtaaacaccttgggagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 46703553  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaaccca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46703554 taagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctctcc 46703631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 139 - 314
Target Start/End: Original strand, 12073347 - 12073521
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  12073347 attgtaaacaccttgggagtgtgaaaatcat-gagtgtcttgcttattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtt 12073445  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 314  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12073446 gaagctaatttattgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 12073521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 67 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 37230022 - 37229722
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagtt-------------ctcttgggttgagaaacatt-gtaaacacctt 152  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||             |||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  37230022 aaacttgagaaatcaaaggaggtaactttagggtttagggtctttgattagggttatcttgagaggttctcttgggttggaaaacatttgtaaacacctt 37229923  T
Q  153 gagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagt-tgttctttgtgaacttgttgaagctaatttct 251  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||| ||||| |    
T  37229922 gggtgagtgaaaatcaatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-ggtagaaattagggtgtgttctttgtgagcttgttaaagcaaatttgt 37229824  T
Q  252 tgtaaccc-atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat-ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaa 349  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| || |||||| ||| ||    
T  37229823 tgtaaccctttttatatctctttgtaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctctccctcatagtaggtcaagttggaccgaactaggtaaa 37229724  T
Q  350 ca 351  Q
    ||    
T  37229723 ca 37229722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 119 - 374
Target Start/End: Original strand, 51336998 - 51337254
Alignment:
Q  119 gttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaatta--g 216  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||  |    
T  51336998 gttctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcctgttcattggtgagattgagaaaaagggtagaaattacgg 51337097  T
Q  217 agttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
    | ||||||||||||| ||  || ||| |||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  51337098 atttgttctttgtgagct--tttaagataatttattataacccttttgtatctctttttaagaactcattgatagtgtattagagagatcaatctctccc 51337195  T
Q  317 cca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatct 374  Q
     ||  |||||||||||| || |||||||||| |||| |   ||||||||||||| ||||    
T  51337196 acacattaggtcaagttggaccgaactgggtaaacatttcgtggtgtgtttgtttatct 51337254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31495643 - 31495297
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattaga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  31495643 tatttaagtgttcttgtgcagattt-gaaggagagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttatagtctttgattaga 31495545  T
Q  119 g-ttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    | ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||       |||||||||| |||| |||||||||||||     
T  31495544 gcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaa-gagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagg 31495454  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
     |||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  31495453 attgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagttgattggagagttcaatctctcc 31495354  T
Q  316 ccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctc-tggtgtgtttgtt 369  Q
     |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  31495353 tccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgtt 31495297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 139 - 315
Target Start/End: Original strand, 379333 - 379510
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaat-cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgt 237  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| || |  || ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  379333 attgtaaacaccttgggagagtgaaaattcaattagtatcttgttcatttgtgagattgagaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgt 379432  T
Q  238 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  379433 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcgctttgtaagaactaattgatagtggattggagagatcaatctctcc 379510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 139 - 346
Target Start/End: Original strand, 41964369 - 41964578
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||   || ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41964369 attgtaaacaccttgggaaagtgaaaattcatgagtgtcttgttcgttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 41964468  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaaccca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgat 336  Q
     |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| ||     
T  41964469 taagctaatttattgtaacccattttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggac 41964568  T
Q  337 cgaactgggt 346  Q
    ||||||||||    
T  41964569 cgaactgggt 41964578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 139 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 50674059 - 50673848
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||||||    
T  50674059 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcgtgttcatttgtgagattgagaaaatgagtagaaattaggattgt-ctttgtgagcttgtt 50673962  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatc 337  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| || |    
T  50673961 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 50673862  T
Q  338 gaactgggtcaaca 351  Q
    ||||| ||| ||||    
T  50673861 gaactaggtgaaca 50673848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 141 - 351
Target Start/End: Original strand, 8648095 - 8648306
Alignment:
Q  141 tgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttga 240  Q
    |||||||||||||   ||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  8648095 tgtaaacaccttggaagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagaatgggaaaatggatagaaattagggttgttcattgtgagtttgttga 8648194  T
Q  241 agctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcga 339  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| || | |    
T  8648195 agctaatttcttataacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatattggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaa 8648294  T
Q  340 actgggtcaaca 351  Q
    ||||||| ||||    
T  8648295 actgggtgaaca 8648306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 139 - 316
Target Start/End: Original strand, 12119492 - 12119671
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgt 237  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||| |    
T  12119492 attgtaaataccttgggagagtgaaaatcaatgagtgtcttgttcataggtgagattggaaaaaagagtagaaattatggtttgttctttgtgaactttt 12119591  T
Q  238 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119592 tgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctctccc 12119671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 143 - 353
Target Start/End: Original strand, 21688207 - 21688418
Alignment:
Q  143 taaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattg-gaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaa 241  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21688207 taaacaccttgggggagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcatcggtgagattgagaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaa 21688305  T
Q  242 gctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaa 340  Q
     ||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||| || ||||    
T  21688306 actaattttttgtaactcatttgtatctcttcggaagaactcattgataatgaattggagagatcaatccctcccctagattaggtcaagttagaccgaa 21688405  T
Q  341 ctgggtcaacaat 353  Q
     || |||||||||    
T  21688406 ttgagtcaacaat 21688418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 205 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 12744195 - 12744081
Alignment:
Q  205 ggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaga 304  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12744195 ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaga 12744096  T
Q  305 tcaatctctccccca 319  Q
    ||||||||| |||||    
T  12744095 tcaatctcttcccca 12744081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 139 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 50262911 - 50262743
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||| | |||||||||| ||||   ||||||| ||||||| | |||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  50262911 attgtaaataccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgtttattg---agattgggaaaatggatcgaaattacggttgttctttgtgagcttgtt 50262816  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatct 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  50262815 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagttgattggagatatcaatct 50262743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 85 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 48142647 - 48142412
Alignment:
Q  85 gaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaaca-ttgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttc 183  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| || ||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  48142647 gaggtaactttagggttgatggtctttgattagggttctcttgagttgggaaacatttttaaacacttcgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgccc 48142548  T
Q  184 attggtgagattggaaaaatgggtagaaattagag-ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaac 281  Q
    |||| ||||||||| || || | |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||    
T  48142547 attgatgagattgggaacat-gatagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctagtttcttgtaacccttgtatatctctttgtaaagaac 48142449  T
Q  282 tcattg--atagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
    ||||||  ||||| |||| || |||||||||||||||    
T  48142448 tcattgatatagtagatttgaaagatcaatctctccc 48142412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 139 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 55085578 - 55085442
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  55085578 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgactgtcttgttcattggtgagattggaaaa-taggtagaaattaaggttgttctttgtgagcttgtt 55085480  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgta 276  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55085479 gaagctaatttcttgtaaaccatttgtatctctttgta 55085442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 139 - 273
Target Start/End: Original strand, 41639218 - 41639351
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||  | |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  41639218 attgtaaacaccttaggagagtgaaaatcac-gagtgtcttgtttattggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtaaacttttt 41639316  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41639317 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 41639351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 139 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26699659 - 26699482
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattg-gaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttg 236  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||  ||| || ||||| | ||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  26699659 attgtaaacactttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttgtttattagagagattcagaagaaagggtatagattagggtttgttctttgtgagcttg 26699560  T
Q  237 ttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctct 313  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  26699559 ttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcatttataatggattggagagatcaatctct 26699482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 307
Target Start/End: Original strand, 53345116 - 53345340
Alignment:
Q  85 gaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacatt-gtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttc 183  Q
    |||||||||||| |||||||  | || | | |||||||||||||| ||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  53345116 gaggtaactttaaggttgagaattttcggtgagagttctcttggggtgagaaaaatttgttaacactttaagtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttt 53345215  T
Q  184 attggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttg-ttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaac 281  Q
    || || |||||||  ||||||  |||||||||  |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||    
T  53345216 atcggagagattgagaaaatga-tagaaattaaggttgattctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccttttatatctttttgtaaagaac 53345314  T
Q  282 tcattgatagtggattggagagatca 307  Q
    ||||| ||| ||||||| || |||||    
T  53345315 tcattaatattggattgtagggatca 53345340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 52093998 - 52093885
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52093998 ctatataagtgttctt-tgcaaattttgaaggacagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattag 52093900  T
Q  118 agttctcttgggttg 132  Q
    |||||||||||||||    
T  52093899 agttctcttgggttg 52093885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 123 - 369
Target Start/End: Original strand, 29056295 - 29056544
Alignment:
Q  123 tcttgggttgagaaacatt-gtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt- 220  Q
    ||||| |||| |||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||||||| ||| ||||||||||     
T  29056295 tcttgtgttgggaaacatttggaaacaccttgggtgagtaaaaatcattgagtgttttgttcattagagagattgggaaaatgg-taggaattagagttt 29056393  T
Q  221 gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaa-ctcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca 319  Q
    ||||||||||  ||||||  | ||||||||||| || || ||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||| | ||||||| ||||    
T  29056394 gttctttgtgtgcttgttagaactaatttcttgcaatccttttatatctctttgtaacaacctcattgataatggattagagagacctatctctcaccca 29056493  T
Q  320 -tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
     | |||||| | ||||| ||||||| || |||| |   |||||||||||||    
T  29056494 gtgtaggtccattttgaccgaactgtgtaaacacttcttggtgtgtttgtt 29056544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 78 - 312
Target Start/End: Original strand, 6677360 - 6677597
Alignment:
Q  78 atcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagag-ttctcttgggttgagaaacatt-gtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtg 175  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | || | ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||  ||||||||| | |||| ||     
T  6677360 atcaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgttcaggggttctcttgggttgggaaacatttgtaaacacattggatgagtgaaa-taattgagtc 6677458  T
Q  176 tcttgttcattggt-gagattggaaaaatgggtagaaattagagttgtt--ctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctt 272  Q
    |||||||| | ||  || |||||||||   ||||||||||||  || ||  ||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  6677459 tcttgttcttgggaagaaattggaaaat--ggtagaaattaggttttttttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatatctt 6677556  T
Q  273 tgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctc 312  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  6677557 tgtaaagaagtctttgataatggatttgagagatcaatctc 6677597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 10047743 - 10047613
Alignment:
Q  24 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg--attagagt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| |||||||  || || |     
T  10047743 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtaatgag-ga 10047646  T
Q  121 tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10047645 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 10047613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 315
Target Start/End: Original strand, 33089837 - 33090009
Alignment:
Q  144 aaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggt-gagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaag 242  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||| | | |||  |||||||||   |||||||| | || ||||||||||    
T  33089837 aaacaccttggaagagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatgggaagagattg-agagatgaatagaaattatgtttgttcttggagagcttgttgaag 33089935  T
Q  243 ctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    ||||||| || |||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33089936 ctaatttattataaccattttgtatctctctgtaaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcc 33090009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 5268930 - 5269065
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |     
T  5268930 ctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtg 5269028  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5269029 aggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 5269065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 158 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22882946 - 22882791
Alignment:
Q  158 agtgaaaatcattgggtgtcttgttcattg-gtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaa 256  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| |   |||||| ||||||||| || |||||||  |||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||    
T  22882946 agtgaaaatcattgagtgccttgttcatggaaagagatt-gaaaaatggataaaaattaggtttgttcttggagagtttgttgaagctaatttcttgtaa 22882848  T
Q  257 cccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctc 312  Q
    ||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  22882847 cccttttgtatctcttcgtaaagaactcattggtagtggattagagaaatcaatctc 22882791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 158 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22934610 - 22934455
Alignment:
Q  158 agtgaaaatcattgggtgtcttgttcattg-gtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaa 256  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| |   |||||| ||||||||| || |||||||  |||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||    
T  22934610 agtgaaaatcattgagtgccttgttcatggaaagagatt-gaaaaatggataaaaattaggtttgttcttggagagtttgttgaagctaatttcttgtaa 22934512  T
Q  257 cccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctc 312  Q
    ||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  22934511 cccttttgtatctcttcgtaaagaactcattggtagtggattagagaaatcaatctc 22934455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 153
Target Start/End: Original strand, 3909989 - 3910075
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3909989 aaactagggaaatcaaaggaggtaacttaagggtttagggcctttgattagagttctcttaggttgagaaacattgtaaacaccttg 3910075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 234 - 315
Target Start/End: Original strand, 33989893 - 33989975
Alignment:
Q  234 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33989893 ttgttgaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaataactcgttaatagtggattggagagatcaatctctcc 33989975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 198 - 290
Target Start/End: Original strand, 5349923 - 5350016
Alignment:
Q  198 aaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgata 290  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | | ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5349923 aaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgaacttgtcgaagctaattccttgtagctcgtttgtatctctttgtaaagaactcgttgata 5350016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 357
Target Start/End: Original strand, 8393394 - 8393568
Alignment:
Q  185 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 282  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||| | |||||| |||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  8393394 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 8393490  T
Q  283 catt-gatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  8393491 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 8393568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 357
Target Start/End: Original strand, 8395603 - 8395777
Alignment:
Q  185 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 282  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||| | |||||| |||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  8395603 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 8395699  T
Q  283 catt-gatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  8395700 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 8395777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 3777916 - 3777781
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |     
T  3777916 ctatataaatgttcttgtgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtg 3777818  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3777817 aggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 3777781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 16623023 - 16623158
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |     
T  16623023 ctatataagtgtttttgtgcagattttgaaggagagctagaagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtg 16623121  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16623122 aggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 16623158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 149
Target Start/End: Original strand, 36314960 - 36315091
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| | | |||| ||||||||||||||||| || |||||||   ||    
T  36314960 ctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagataaacttggatta-caaaggaggtaactttagggtttagtgtctttgtagag 36315058  T
Q  118 a-gttctcttgggttgagaaacattgtaaacac 149  Q
    | | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36315059 aggatctcttgggttgggaaacattgtaaacac 36315091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 149
Target Start/End: Original strand, 36329169 - 36329300
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| | | |||| ||||||||||||||||| || |||||||   ||    
T  36329169 ctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagataaacttggatta-caaaggaggtaactttagggtttagtgtctttgtagag 36329267  T
Q  118 a-gttctcttgggttgagaaacattgtaaacac 149  Q
    | | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36329268 aggatctcttgggttgggaaacattgtaaacac 36329300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 5396401 - 5396536
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||| | | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||| | |     
T  5396401 ctatataagtgttcttgagcagattttgaaggagagctggaagagagagaaacttggatta-caaaggaggttactttagggttgagtgtctttgtagtg 5396499  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5396500 aggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 5396536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 6743145 - 6743280
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| | | |||| |||||||||| ||| ||||| |||||||    |    
T  6743145 ctatataagtgttcttgtgcagattttgaagtagagcttgaagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaacttgaggtttgagtgtctttgtagcg 6743243  T
Q  118 a-gttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6743244 aggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 6743280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 8689226 - 8689361
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||| | | |||| ||||||||||||||||| || ||||||| | |     
T  8689226 ctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagtgagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggtttagtgtctttgtagtg 8689324  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  8689325 aggatctcttgggttgggaaacattttaaacaccttg 8689361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 156
Target Start/End: Original strand, 25861763 - 25861901
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| ||||||||  | ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| | | ||||  ||||||||||||||||||| ||||||| | |     
T  25861763 ctatataagtgtttctttgcagattttgaaggagagcttttagagagagaaacttggatta-caaagaaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtg 25861861  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagt 156  Q
      | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25861862 aggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgagt 25861901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 153
Target Start/End: Original strand, 31985365 - 31985498
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-attag 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||| |||||||||| | | |||| |||| ||||||||||||||| || |||| |||      
T  31985365 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaa-gtgagcttgaagagagagaaacttggatta-caaaggagggaactttagggttgagtgtttttgtattga 31985462  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31985463 ggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 31985498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 54867547 - 54867453
Alignment:
Q  18 actatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  54867547 actatataagtgttcttgtgcagattttggaggagagcttgaagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttg 54867453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 233 - 306
Target Start/End: Original strand, 34112865 - 34112939
Alignment:
Q  233 cttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatc 306  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  34112865 cttgttgaagctaatttcatgtaacccttttgcatctctttgtaaagaactcattgatagtgaagtggagagatc 34112939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 46147641 - 46147581
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttg 127  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  46147641 aaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagggttttcttg 46147581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21704116 - 21703871
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacatt-gtaaacaccttgagtgagtgaa 163  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||         ||||||||    
T  21704116 agaaacttgagaaatcaaatgaggtaactttaaggttgaaagtctttggtgagggttctcttgggttgagaaacatttgtaaa---------tgagtgaa 21704026  T
Q  164 aatcattgggtgtcttgttcattggt-gagattg-gaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaaccca 260  Q
    | |||||  || | |||||| | ||  ||||||| ||||||  ||||||||||||  || |||||| |  | |||||||||| | |||||||||| ||      
T  21704025 a-tcattaagtctattgttcttgggaagagattgagaaaaa--ggtagaaattaggttttgttcttagaaagcttgttgaagatgatttcttgtaccctt 21703929  T
Q  261 tttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21703928 tttgtatctttttgtaaagaactcattgacagtggattggagatatcaatctatcccc 21703871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 37755095 - 37754993
Alignment:
Q  219 ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaa-ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    |||||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| || |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  37755095 ttgttcttagagaatttggtgaagataatttcttgtaacctttttttatctctttctaaaaaactcattgataatggtttgaagagatcaatctctcccc 37754996  T
Q  318 cat 320  Q
    |||    
T  37754995 cat 37754993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 5148045 - 5147914
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || |||||||||| | | || | ||||||||||||||||| || ||||||| | ||    
T  5148045 ctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaaatgagagaaacttggatta-cacaggaggtaactttagggtttagtgtctttgtagta 5147947  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacac 149  Q
      | ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5147946 aggatctcttgagttgggaaacattgtaaacac 5147914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 16628602 - 16628737
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| | | ||||| ||||| |||| |   |||| |||||||||||||||||||| |||||||    |    
T  16628602 ctatataagtgtttttgttcagattttgaaggagagctagaagagagagaaaattggattg-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtg 16628700  T
Q  118 agt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16628701 aggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 16628737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 289
Target Start/End: Original strand, 32091456 - 32091583
Alignment:
Q  163 aaatcattgggtgtcttgttcattggtga-gattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccat 261  Q
    ||||||||| || |||||||||| || || |||||| ||||||  ||||||||||  |||||||| | ||  |||||||| ||||||||||||||| | |    
T  32091456 aaatcattgagtctcttgttcatgggagaagattgggaaaatgc-tagaaattaggtttgttcttggagagtttgttgaaactaatttcttgtaactctt 32091554  T
Q  262 ttgtatctctttgt-aagaactcattgat 289  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32091555 ttgtatctctttgtaaagaacacattgat 32091583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 5143627 - 5143493
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtag-agaagaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |  |||||||||| | | || | |||||||||||||||||||| ||||||| | |     
T  5143627 ctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagtaagagaaacttggatta-cagaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtg 5143529  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacacctt 152  Q
      | |||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  5143528 aggatctcttggattgggaaactttgtaaacacctt 5143493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 44967949 - 44967863
Alignment:
Q  233 cttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaa-ctcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca 319  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  44967949 cttgctgaagccaatttcttgtaacc-atttgtatctctttgtaaaaaactcgttgagagtagattagagggatcaatctctccccca 44967863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16422755 - 16422653
Alignment:
Q  205 ggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagag 303  Q
    |||||||||||   ||||| |||| || ||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||    
T  16422755 ggtagaaattatgtttgttttttgagagctttttgaagctaatttctagaaacccttttgtatatctttgtaatgaactcatggatagtgaagtggagag 16422656  T
Q  304 atc 306  Q
    |||    
T  16422655 atc 16422653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 320
Target Start/End: Original strand, 52065617 - 52065731
Alignment:
Q  205 ggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctctttgtaagaa-ctcattgatagtggattggaga 302  Q
    |||||||||||| ||||||||| | || ||| ||||||||| |||  |||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||    
T  52065617 ggtagaaattag-gttgttcttagagagcttattgaagctatttttctgtaaccccttttgtatctctttgttagaaactcattgatagtgaagtggaga 52065715  T
Q  303 gatcaatctctcccccat 320  Q
    ||||  ||||||||||||    
T  52065716 gatc--tctctcccccat 52065731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 357
Target Start/End: Original strand, 5135910 - 5136239
Alignment:
Q  23 ttaagtgttcttgtgcagattttgaag-gagaggtt-gtagagaagaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgaggg-tctttgattagag 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||| | || | || ||||||| |||| |||||||||||||    
T  5135910 ttaagtgttcttgtgcaga-tttgaagagagaggttggaagag-agaaacttgggaaatcaaa-ggggaagctctagggtttagggttctttgattagag 5136006  T
Q  120 t-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagag 218  Q
    | ||||||||||||| |||||| | ||| ||||||    || || |||||||| |||||       |||||||||||||  ||| ||||||||||||| |    
T  5136007 tatctcttgggttgaaaaacatgggaaataccttg---tagagagaatcattgagtgtc-------ttggtgagattgg-gaaaggggtagaaattaggg 5136095  T
Q  219 -ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta-tctctttgt-aagaactca-ttgatagtggattggagagatcaatctctc 314  Q
     |||||| | |||||| |  | ||||||||||||||||| ||  ||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  5136096 tttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctc 5136194  T
Q  315 cccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    | |||   |||||||||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  5136195 ctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctct 5136239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 34788923 - 34788851
Alignment:
Q  205 ggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa 277  Q
    ||||||||||||  ||| |||| | || |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  34788923 ggtagaaattaggattgctcttggagagcttgttgaagttaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaa 34788851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 39594049 - 39593957
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattaga-gttctcttgggtt-gagaaaca-ttgtaaacaccttga 154  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||| | | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  39594049 agaaccttgggaaatcaaatgaggtaactttaaggttgggagtctttgatgataggttctcttgggttggagaaacatttgtaaacaccttga 39593957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 39774034 - 39774170
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||  ||| |||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||  | ||||    |    
T  39774034 ctatataagtgtttatgttcagattttgaagtagagtttaaagagagagaaacttgggtttacaaaggaggtaactttagggttgagattatttgtaacg 39774133  T
Q  118 a-gttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  39774134 aggttctcttgagttgggaaacattgtaaacaccttg 39774170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 44570514 - 44570427
Alignment:
Q  205 ggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatag 291  Q
    |||||||||||   ||||| || | || ||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44570514 ggtagaaattatgtttgttgttggagagcttgttgaaactaatttcttgtaacatttttgtatctctttgtaaagaactcattgatag 44570427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 5112543 - 5112469
Alignment:
Q  80 caaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagag-ttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||| ||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5112543 caaaggaggtaattttaggtttgagtgtctttgttgtgaggttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 5112469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 40975131 - 40975057
Alignment:
Q  231 aacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 305  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||  |||| |||||||| |||| |||||||    
T  40975131 aacttgttgaagttaatttctggtaactctattgtatctctttgtaatgactctttgatagtagattagagagat 40975057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 236
Target Start/End: Original strand, 42234319 - 42234357
Alignment:
Q  198 aaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttg 236  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42234319 aaaaatgagtagaaattagagttgttctttgtgaacttg 42234357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 37755213 - 37755112
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattaga-gttctcttgggttgagaaaca-ttgtaaacaccttgagtgagtga 162  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||||||||| ||  |||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  37755213 agaaacttggaaaatcaaaggaggtaactttaggattgagagtctttggtgagaggttctcttggattatgaaatatttgtaaacaccttaggtgagtga 37755114  T
Q  163 aa 164  Q
    ||    
T  37755113 aa 37755112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 357
Target Start/End: Original strand, 5138136 - 5138464
Alignment:
Q  23 ttaagtgttcttgtgcagattttgaag-gagaggtt-gtagagaagaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgaggg-tctttgattagag 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||| | || | || ||||||| |||| |||||||||||||    
T  5138136 ttaagtgttcttgtgcaga-tttgaagagagaggttggaagag-agaaacttgggaaatcaaa-ggggaagctctagggtttagggttctttgattagag 5138232  T
Q  120 t-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagag 218  Q
    | ||||||||||||| |||||| | ||| ||||||    || || |||||||| |||||       |||||||||||||  ||| ||||||||||||| |    
T  5138233 tatctcttgggttga-aaacatgggaaataccttg---tagagagaatcattgagtgtc-------ttggtgagattgg-gaaaggggtagaaattaggg 5138320  T
Q  219 -ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta-tctctttgt-aagaactca-ttgatagtggattggagagatcaatctctc 314  Q
     |||||| | |||||| |  | ||||||||||||||||| ||  ||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  5138321 tttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctc 5138419  T
Q  315 cccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    | |||   |||||||||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  5138420 ctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctct 5138464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 309 - 375
Target Start/End: Original strand, 3796568 - 3796635
Alignment:
Q  309 tctctcccccat-ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    |||||||||||| ||||||||  || ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  3796568 tctctcccccatattaggtcatattggacggaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctc 3796635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 112
Target Start/End: Original strand, 6375955 - 6376002
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg 112  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6375955 agaatcttgggaaatcaaaggaggtaattttagggttgagggtctttg 6376002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 23043079 - 23042989
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattaga-gttctcttgggttgagaaaca-ttgtaaacaccttg 153  Q
    ||||||||| | ||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||    
T  23043079 agaaacttgagaaatcaaaagatttaactttagggttgaaggtctttggtaagaggttctcttagattgggaaacatttgtaaacaccttg 23042989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 54
Target Start/End: Original strand, 28468257 - 28468291
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagag 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28468257 tatttaagtgttcttgtgcagattttggaggagag 28468291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 37782010 - 37781935
Alignment:
Q  197 gaaaaatgggtagaaatta-gagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 273  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  37782010 gaaaaatgggtagaaattaagatttgttctttgtgagttttt--aagctaatttcttgtaacctctttgtatcacttt 37781935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 33706649 - 33706593
Alignment:
Q  200 aaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaac 257  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  33706649 aaatgggtagaaatta-agtttttcattgagatcttgttgaagctaatttcttataac 33706593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 274
Target Start/End: Original strand, 1983272 - 1983325
Alignment:
Q  219 ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttg 274  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  1983272 ttgttctttgtgagcttgc--aagctaatttcttgtaacccctttgtatcactttg 1983325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 106)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 18 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 5236792 - 5236434
Alignment:
Q  18 actatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgatta 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||| ||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5236792 actatttaagtgttcttgtgcagattttgaagtggggcttgaagagagagaaacttgggaaatcgaaggaggtaactttagggttgagggtctttgatta 5236693  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattag 216  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5236692 gagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattag 5236593  T
Q  217 agttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  5236592 ggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgataatggattcgagagatcaatctttccc 5236493  T
Q  317 ccatttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    |   ||||||||| || || | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5236492 cagattaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctc 5236434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 19 - 375
Target Start/End: Original strand, 40734332 - 40734689
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40734332 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagacagaaacttggaaaatcaaaggagataactttagggttgagggtctttgattag 40734430  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  40734431 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg 40734530  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40734531 gttgttctttgtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacacatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 40734630  T
Q  318 c-atttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    | | |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  40734631 caaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggagtgtttgttcctctc 40734689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 19 - 375
Target Start/End: Original strand, 51398648 - 51399005
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51398648 ctatataagtgttctt-tgtagattttgaaggagaggttgaagagatagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagagtctttgattag 51398746  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  51398747 agttttcttgggttgggaaatattgtaaacaccttggatgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgatgagattggaaaaatgggtagaaattagg 51398846  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  51398847 gttgttcttagtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatttatctctcccc 51398946  T
Q  318 ca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    ||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  51398947 cagattaggtcaagttggaccgaacttggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctc 51399005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 19 - 375
Target Start/End: Original strand, 29810702 - 29811059
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||| ||| | | ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29810702 ctatataagtgttctt-tgcatattttgaagaaaaggttgaagaaagaaaaacttgggaaatcaaaggaggtaattttagggttgagggtctttgattag 29810800  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||    
T  29810801 agttcttttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttattcattggtgagattaggaaaatatgtagaaattaga 29810900  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29810901 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 29811000  T
Q  318 ca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    ||  ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29811001 cagattaggtcaagttaaaccgaattgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcatctc 29811059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 19 - 375
Target Start/End: Original strand, 29812897 - 29813254
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29812897 ctatataagtgttctt-tgtagattttgaagaagaggttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattaa 29812995  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  29812996 agttctcttgggttgggaagcattgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgaggggcttgttaattggtgagattggaaaaataggtagaaattagg 29813095  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29813096 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgcatctctttgtaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctctcccc 29813195  T
Q  318 ca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    ||  || ||||| ||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  29813196 cagatttggtcatgttggaccgaactgggtcaacaatctttgatgtgtttgttcctctc 29813254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 24 - 369
Target Start/End: Original strand, 37408297 - 37408644
Alignment:
Q  24 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttc 122  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  37408297 taagtgttcttgtgaagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttatggtctttgattagagttc 37408396  T
Q  123 tcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgt 222  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  37408397 tcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-agtgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgt 37408495  T
Q  223 tctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tt 321  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||       
T  37408496 tctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcctccagag 37408595  T
Q  322 taggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  37408596 taggtcaagtttggatcgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 37408644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 67 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19684175 - 19683871
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19684175 aaacttgggaaatcaaaggagttaactttagggttaagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 19684076  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    |||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  19684075 cattgaatgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgta 19683976  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat-ttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgt 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19683975 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgt 19683876  T
Q  365 ttgtt 369  Q
    |||||    
T  19683875 ttgtt 19683871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Original strand, 7762098 - 7762451
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga---agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgatt 115  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||| || ||| |||||   ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7762098 ctatataagtgttctt-tgcaaattttgaaggaaagcttgaagagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgatt 7762196  T
Q  116 agagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaatta 215  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  7762197 agagttctcttgggttgggaaatattgtgaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattgagaaaaagggtagaaatta 7762295  T
Q  216 gagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7762296 gggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 7762395  T
Q  316 ccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
     |||   |||||||||||| || |||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  7762396 tccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctatgatgtgtttgtt 7762451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 65 - 375
Target Start/End: Original strand, 40735263 - 40735574
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaa 164  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    |||||||    
T  40735263 agaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattaaagttctcttgggttaggaaacattgtaaacaccttggaaaagtgaaa 40735362  T
Q  165 atcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  40735363 atcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaaccagtttg 40735462  T
Q  265 tatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtg 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||     
T  40735463 tatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcagcaatctttggtgta 40735562  T
Q  364 tttgttcatctc 375  Q
    ||||||| ||||    
T  40735563 tttgttcctctc 40735574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Original strand, 45094999 - 45095349
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  45094999 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaagatgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaggcaactttagggtttagggtctttgattag 45095097  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  45095098 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagg 45095195  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45095196 gttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctc 45095295  T
Q  318 ca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
     |   |||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||| || ||||||    
T  45095296 tagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggcgtatttgtt 45095349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 67 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22835288 - 22834989
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  22835288 aaacttggaaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgtgttgggaaacattgtaatcaccttgggtgagtgaaaat 22835189  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22835188 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgta 22835089  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat-ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtt 365  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||| |||||||||| | |||||||||    
T  22835088 tccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccgccatattaggtcaagttggaccgaact-ggtcaacaatatttggtgtgtt 22834990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 5260657 - 5260305
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  5260657 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggtctttgattag 5260559  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattgg-aaaaatgggtagaaattag 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5260558 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattag 5260460  T
Q  217 agttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctc-tcc 315  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||     
T  5260459 ggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctcttct 5260360  T
Q  316 cccatttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    || |  |||||||||||| || |||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  5260359 ccaaagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 5260305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 67 - 369
Target Start/End: Original strand, 760729 - 761032
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  760729 aaacttgggaaatcaaaggagttaactttagggttaagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattataaacaccttggatgagtgaaaat 760828  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  760829 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtctgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgta 760928  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtt 365  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  ||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  760929 tccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggactgaaatgggttaacaatctttggtgtgtt 761028  T
Q  366 tgtt 369  Q
    ||||    
T  761029 tgtt 761032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 67 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 39153647 - 39153347
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  39153647 aaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgaatgaaaat 39153548  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  39153547 cattgagtgtcttgttcatgtgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttcattgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgta 39153448  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtt 365  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || ||||||    
T  39153447 tccctttataagaactcattgatagtggattggagagaacaatctctcccccagattaggtcaagttggactgaactgggtcaacaatctttgttgtgtt 39153348  T
Q  366 t 366  Q
    |    
T  39153347 t 39153347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 67 - 369
Target Start/End: Original strand, 29682241 - 29682544
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29682241 aaacttgggaaatcaaaggagttaaatttagggttaagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 29682340  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  29682341 cattgagtgtcttgtttatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattatgtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtcacccatttgta 29682440  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtt 365  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  29682441 tccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattagatcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgta 29682540  T
Q  366 tgtt 369  Q
    ||||    
T  29682541 tgtt 29682544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 43 - 355
Target Start/End: Original strand, 44331413 - 44331716
Alignment:
Q  43 tttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacatt 141  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44331413 tttgaaggagagcttg-agagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttga----------ttagagttctcttgggttgggaaacatt 44331501  T
Q  142 gtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaa 241  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  44331502 gtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattaggaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtgagcttgttgaa 44331601  T
Q  242 gctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaa 340  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||    
T  44331602 gctaatttcttgtaagccatttgtatctctttgtaagaacttattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaa 44331701  T
Q  341 ctgggtcaacaatct 355  Q
    |||||||||||||||    
T  44331702 ctgggtcaacaatct 44331716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 27 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 5258470 - 5258126
Alignment:
Q  27 gtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctct 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||| | ||||||| |  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5258470 gtgttctt-tgcagattttgaaggagagctagaagagagagaaacttgagaaatcaaagggagaaactttagggtttagggtctttgattagagttctct 5258372  T
Q  126 tgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattgg-aaaaatgggtagaaattagagttgttc 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5258371 tgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttc 5258273  T
Q  225 tttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-ttta 323  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||   ||    
T  5258272 tttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctcttctccagagta 5258173  T
Q  324 ggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    |||||||||| || |||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  5258172 ggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 5258126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 68 - 369
Target Start/End: Original strand, 16498913 - 16499214
Alignment:
Q  68 aacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatc 167  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  16498913 aacttgggaaatcaaaggaggtaacttgtgggttgagggtctttgattagagttctcttaggttgagaaacattgtaaacaccttggggtagtgaaaatc 16499012  T
Q  168 attgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat 267  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  16499013 attgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaacggatagaaattagggttgtt-tttgtaagcttgttgaagctaatttcttgttacccatttatat 16499111  T
Q  268 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgttt 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  16499112 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtattt 16499211  T
Q  367 gtt 369  Q
    |||    
T  16499212 gtt 16499214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 67 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 29196687 - 29196369
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagtt-------------ctcttgggttgagaaacatt-gtaaacacctt 152  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||             ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  29196687 aaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagggttttcttgagaggttctcttgggttgggaaacatttgtaaacacctt 29196588  T
Q  153 gagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttct 251  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  29196587 gggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttct 29196488  T
Q  252 tgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccc-atttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaac 350  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  29196487 tggaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaac 29196388  T
Q  351 aatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  29196387 aatctttggtgtgtttgtt 29196369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 67 - 369
Target Start/End: Original strand, 9581165 - 9581468
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9581165 aaacttgggaaatcaaaggagttaactttagggttaagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 9581264  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  9581265 cattgagtgtcttgttcatttgtgggattcg-gaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttttaacccatttgta 9581363  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgt 364  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||| || |||||||||| |||||||| || |||||    
T  9581364 tccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttgatgtgt 9581463  T
Q  365 ttgtt 369  Q
    |||||    
T  9581464 ttgtt 9581468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 65 - 369
Target Start/End: Original strand, 7764348 - 7764650
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaa 164  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7764348 agaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagagttgagggtctttgattagatttctcttgggttaggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaa 7764446  T
Q  165 atcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttg 264  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||    
T  7764447 atcattgagtgtcttgttcattggtgagag-ggaaaa--gggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttaaagctaatttcttgtaactcttttg 7764543  T
Q  265 tatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||| ||| || |||||||||| |||||||| ||||||    
T  7764544 tatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatgaatctctcctccagagtaggtcaaatttagaccgaactgggtgaacaatctttggtgt 7764643  T
Q  363 gtttgtt 369  Q
    |||||||    
T  7764644 gtttgtt 7764650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 77 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 9666744 - 9666449
Alignment:
Q  77 aatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacatt-gtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtg 175  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  9666744 aatcaaatgaggtaactttagggttgagggtctttgattagggttctcttcagttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtg 9666645  T
Q  176 tcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttg 274  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  9666644 tcttgttcatttgtgagattggaaaaatgggtagaaattagattttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttatacctctttg 9666545  T
Q  275 taagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9666544 taagaattctttgatagtggattggagagattgatctctcccccagattaggtaaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 9666449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23200470 - 23200120
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattaga 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | | ||||| ||||||||||| ||||||| |  | |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23200470 tatttaagtgtttttgtgcagattttgaag-agagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggtctttgattaga 23200372  T
Q  119 gtt-ctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  23200371 gtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtgagattgggaaaaatggtagaaattaga 23200274  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  23200273 gttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtgaattggagagttcaatctctcctc 23200174  T
Q  318 ca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    ||   |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  23200173 cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtctttgtt 23200120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 67 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 53921789 - 53921538
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  53921789 aaacttgggaaatcaaatgaggtaactttagggttgagagtctttgattagggttttcttgggttggaaaacattgtaaaaaccttgggtgagtgaaaat 53921690  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  53921689 cattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaggtttgttgtttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaactcatttgta 53921590  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccc 318  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53921589 tcattttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccc 53921538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 65 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 44700780 - 44700462
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagtt-------------ctcttgggttgagaaacatt-gtaaacacc 150  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||             ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  44700780 agaaactagggaaatcaaaggaggtaactttagggttgatggtctttgattagggttatcttgaggggttctcttgggttgggaaacatttgtaaacacc 44700681  T
Q  151 ttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttc 250  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  44700680 ttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttc 44700581  T
Q  251 ttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaac 350  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| || |||||| |||||||    
T  44700580 ttgtaacctatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctccccacattaggtcaagttggaccgaactaggtcaac 44700481  T
Q  351 aatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    ||||| | |||||||||||    
T  44700480 aatctttcgtgtgtttgtt 44700462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23198271 - 23197921
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattaga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||| ||||||||||  ||||||| |  | |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23198271 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaag-agagttggaagagagagaaacttggaaaatcaaagggagcaactctagggtttagggtctttgattaga 23198173  T
Q  119 gtt-ctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  23198172 gtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtgagattgggaaaaatggtagaaattaga 23198075  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  23198074 gttgttttttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtgaattggagagttcaatctctcctc 23197975  T
Q  318 ca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    ||   |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  23197974 cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtctttgtt 23197921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 119 - 369
Target Start/End: Original strand, 31314379 - 31314630
Alignment:
Q  119 gttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagag 218  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  31314379 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacactttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcataggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggg 31314478  T
Q  219 ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccc 318  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31314479 ttgttcattgtgatcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctttttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatatctccccc 31314578  T
Q  319 at-ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    || |||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  31314579 atattaggtcaagttggaccgaactgagtcaacaatctttggtgtgtttgtt 31314630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 9636462 - 9636107
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaag-gagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgatta 116  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| | | ||||| ||||||||||| ||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  9636462 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaagagtgagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagaaactttagggtttagggtctttgatta 9636364  T
Q  117 gagt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaa-aaatgggtagaaatt 214  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  9636363 gagtctctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtcattggtgagattgggagaaaagggtagaaatt 9636265  T
Q  215 agagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 314  Q
    || ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9636264 agggttgttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctc 9636165  T
Q  315 c-cccatttaggtcaagtttg-atcgaactgggtcaacaatctc-tggtgtgtttgtt 369  Q
    | || |  ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  9636164 ctccaaagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtgtttgtt 9636107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 67 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 32744712 - 32744419
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  32744712 aaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacattg-gtgagtgaaaat 32744614  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||| || | ||||        ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  32744613 cattgagtattttgt--------gagattgaaaaaatgggtagaaattagt-ttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgta 32744523  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtt 365  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32744522 tcactttgtaagaactctttgatagtggattgaagagataaatctatcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtt 32744423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 79 - 318
Target Start/End: Original strand, 32890997 - 32891237
Alignment:
Q  79 tcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtct 178  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  32890997 tcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagggttctcttggggtgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtaaaaatcattgagtgtct 32891096  T
Q  179 tgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaatt-agagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa 277  Q
    ||||| | ||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32891097 tgttcttcggtgagattgagaaaatgggtagaaattaagttttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaa 32891196  T
Q  278 gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccc 318  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32891197 gaactcgttgatagtggattggagagataaatctctccccc 32891237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 119 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23392143 - 23391892
Alignment:
Q  119 gttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagag 218  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||       
T  23392143 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcatttagtgtctttttcattggtgagtttgggaaaatgagtagaaattaagt 23392044  T
Q  219 ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccc 318  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  23392043 ttgttctttgtgagcttgtttaagataatttcttgtaacccatttgtatcactttgcaagaactctttgatagtggattgtagagataaatctctccccc 23391944  T
Q  319 -atttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
     | |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23391943 aaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 23391892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 139 - 353
Target Start/End: Original strand, 30236080 - 30236294
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30236080 attgtaaacaccttgggatagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgatgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 30236178  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatc 337  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |    
T  30236179 gaagctaatttcttgtaacctatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggacc 30236278  T
Q  338 gaactgggtcaacaat 353  Q
    ||||| ||||||||||    
T  30236279 gaactaggtcaacaat 30236294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 139 - 372
Target Start/End: Original strand, 34491168 - 34491400
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||  || |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  34491168 attgtaaacaccttgggagagtgaaattc--tgagtgtgttattcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 34491265  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatc 337  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| || |    
T  34491266 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 34491365  T
Q  338 gaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcat 372  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  34491366 gaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgttcat 34491400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 90 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23410593 - 23410312
Alignment:
Q  90 aactttagggttgagggtctttgattagag-ttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattgg 188  Q
    ||||||||||||||| |||||||    ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  23410593 aactttagggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattag 23410494  T
Q  189 tgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattga 288  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||   || |||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  23410493 tgaaatttggaaaatgggtagaaattatgtttattctttgtgagcttgtttaagctaatttcgtataacccatttgtatcactttgtaagaactcttaga 23410394  T
Q  289 tagtggattggagagatcaatctctccccc-atttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  23410393 taatggattggagagataaatctctcccccaaattaggtcaagttggaacgaattgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 23410312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 139 - 313
Target Start/End: Original strand, 4569906 - 4570080
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||    
T  4569906 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgttttgttctttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtgagcttatt 4570005  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctct 313  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4570006 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctct 4570080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 139 - 315
Target Start/End: Original strand, 54593659 - 54593834
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  54593659 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgtgcagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 54593757  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54593758 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 54593834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 139 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 6095812 - 6095608
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  6095812 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttattcattggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggttgttctttgtaaacttctt 6095714  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatc 337  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| || |    
T  6095713 gaagttaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 6095614  T
Q  338 gaactg 343  Q
    ||||||    
T  6095613 gaactg 6095608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 129 - 311
Target Start/End: Original strand, 46860416 - 46860600
Alignment:
Q  129 gttgagaaaca-ttgtaaacaccttgagtgagtgaaaat-cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctt 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  46860416 gttgagaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaattcaatgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggtttgttctt 46860515  T
Q  227 tgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatct 311  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46860516 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattggagagatcaatct 46860600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 143 - 353
Target Start/End: Original strand, 47304210 - 47304420
Alignment:
Q  143 taaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaag 242  Q
    |||||||| || | ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  47304210 taaacaccctgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatgggtagaaattatggttgttctttgtgagcttgttgaag 47304308  T
Q  243 ctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaac 341  Q
     |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||    
T  47304309 ttaatatcttgtaacccatctgtatctcttcgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaagtttgaccgaac 47304408  T
Q  342 tgggtcaacaat 353  Q
    ||||||||||||    
T  47304409 tgggtcaacaat 47304420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 139 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 43402015 - 43401839
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43402015 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 43401917  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaaccca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  43401916 gaagctaatttcttgtaacgcattttttatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaaattaatctctcc 43401839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 139 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 49199683 - 49199507
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  49199683 attgtaaacactttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcgttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgagcttgtt 49199585  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaaccca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49199584 gaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagattaatctctcc 49199507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 139 - 353
Target Start/End: Original strand, 46173321 - 46173526
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||         ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  46173321 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggt---------aaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 46173410  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatc 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |    
T  46173411 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaattcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggacc 46173510  T
Q  338 gaactgggtcaacaat 353  Q
    ||||| | ||||||||    
T  46173511 gaactagatcaacaat 46173526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 139 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 43403958 - 43403782
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  43403958 attgtaaacactttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggcttgttctttgtgagcttgtt 43403860  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccat-ttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    |||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43403859 gaagctcatttcttgtaactcatgttttatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagattaatctctcc 43403782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 139 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 41819737 - 41819561
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||     
T  41819737 attgtaaacaccttgggagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttttttgtgagcttgtc 41819638  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaaccca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41819637 taagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagacatcaatctctcc 41819561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26386767 - 26386597
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| || ||| ||||||||||||    
T  26386767 aaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagagtctttgattagagttctcttaggttgggaaacagggtaaatactttgggtgagtgaaaat 26386668  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgt 237  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  26386667 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgt 26386597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 139 - 319
Target Start/End: Original strand, 36018806 - 36018986
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |  | ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  36018806 attgtaaacaccttgggagagtgaaaattaacgagtgacttgttcattggtgaaattgggaaaatgggttgaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 36018905  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaaccca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca 319  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36018906 gaagttaatttcttgtaactcattttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagaggtcaatctctccccca 36018986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 65 - 369
Target Start/End: Original strand, 800978 - 801279
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagag-ttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaa 163  Q
    ||||||||||| ||||||| || | |||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||  ||| |||    
T  800978 agaaacttgggaaatcaaaggaagaaactctagggtttagagtctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaa-gagagaa 801076  T
Q  164 aatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccattt 263  Q
    |||||||| ||||||||       |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| | |||    
T  801077 aatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttt 801168  T
Q  264 -gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctc-tg 358  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||    
T  801169 tgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttg 801268  T
Q  359 gtgtgtttgtt 369  Q
    |||| ||||||    
T  801269 gtgtctttgtt 801279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 139 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 31340414 - 31340268
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||| ||||||    
T  31340414 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgttttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattgaggttgttctttgtgagcttgtt 31340316  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcatt 286  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31340315 gaagctaatttcatgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcatt 31340268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 244 - 357
Target Start/End: Original strand, 40913352 - 40913466
Alignment:
Q  244 taatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaact 342  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||    
T  40913352 taatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcatcgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaact 40913451  T
Q  343 gggtcaacaatctct 357  Q
    |||||||||||||||    
T  40913452 gggtcaacaatctct 40913466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 77 - 304
Target Start/End: Original strand, 5373115 - 5373353
Alignment:
Q  77 aatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattg-taaacacctt-------gagtgagtgaaaatca 168  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| | |  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||       | ||||| ||||||||    
T  5373115 aatcaaaggaggtaactttaaggttgagagtctttggtgaaggttctcttgggttgggaaacattggtaaacaccttattgggtgggtgagggaaaatca 5373214  T
Q  169 ttgggtgtcttgttcattggtgagattgg-aaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||| |||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||  || ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  5373215 ttgagtgtcttgttcattgaagagattgggaaaaaagggtagaaattaggctttgttctttttgagcttgttgaagctaatttattgtaacccttttata 5373314  T
Q  267 tctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagaga 304  Q
    ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||    
T  5373315 tctctttgtaaggaactcattgccaatggattggagaga 5373353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 139 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 5434091 - 5433952
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaa-aaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttg 236  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  5434091 attgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggagaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttg 5433993  T
Q  237 ttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa 277  Q
    || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  5433992 ttaaagctaatttcttgtaacccttttatatctctttgtaa 5433952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 188 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 7780168 - 7779985
Alignment:
Q  188 gtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt 286  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  7780168 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaacct-tttgtatctcttttgtaagaactcatt 7780071  T
Q  287 gatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctc-tggtgtgtttgtt 369  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||| || | || ||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  7780070 gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaagtgggtgaacaatctcttggtgtctttgtt 7779985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 202 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 55302132 - 55302005
Alignment:
Q  202 atgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgta---------acccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagt 292  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||         ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55302132 atgggtagaaattagggttgttctttgtaagtttgttgaagctaatttcttgtatttcttgtaacctatttgtatctctttgtaagaattcattgatagt 55302033  T
Q  293 ggattggagagatcaatctctcccccat 320  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55302032 ggattggagagatcaatctctcctccat 55302005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 357
Target Start/End: Original strand, 6716346 - 6716673
Alignment:
Q  25 aagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgta-gaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt- 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |  ||||| | |||| ||| ||||||| ||||||| |  |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  6716346 aagtgttcttgtgcagattt-gaagaaagggttggaagagagagagacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggttctttgattagagta 6716444  T
Q  121 tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt 220  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||    || || |||||||| ||||||||       |||||||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  6716445 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtt 6716534  T
Q  221 -gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccc 318  Q
     |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||    
T  6716535 tgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaaactctcctcc 6716632  T
Q  319 a-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    |   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  6716633 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 6716673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 35138915 - 35138746
Alignment:
Q  144 aaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggt-gagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaag 242  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |   ||||||| | ||||||||||||||||   |||||||| ||||  |||||||||    
T  35138915 aaacaccttgggagagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatggaaagagattg-agaaatgggtagaaattatgtttgttcttggtgagtttgttgaag 35138817  T
Q  243 ctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctc 312  Q
     |||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  35138816 ttaatttcttgcaactcttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtggatggaagagaacaatctc 35138746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 165 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 51352298 - 51352150
Alignment:
Q  165 atcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccattt 263  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||  ||||| |||| ||| |||| |||||| ||| || ||| ||||||||||||||| ||||    
T  51352298 atcattgagtgtcttgtttattggtgagattaggaaaatga-tagaagttagggtttgttcattgtgagctttttaaagttaatttcttgtaacc-attt 51352201  T
Q  264 gtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 314  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  51352200 gtatttctttgtaataactcattgagagtggatttgagagatcaatctctc 51352150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 357
Target Start/End: Original strand, 54634971 - 54635298
Alignment:
Q  25 aagtgttcttgtgcagattttgaag-gagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt- 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||| | | ||||| ||| ||||||| ||||||| |  | |||| ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  54634971 aagtgttcttgtgcagattt-gaagagggagttggaagagagagagacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagta 54635069  T
Q  121 tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt 220  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||    || || |||||||| ||||||||       |||||||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  54635070 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtt 54635159  T
Q  221 -gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccc 318  Q
     |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||    
T  54635160 tgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaaactctcctcc 54635257  T
Q  319 a-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    |   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  54635258 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 54635298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 2075357 - 2075156
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttct-------------cttgggttgagaaacattg-taaacacc 150  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||             ||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  2075357 agaaacttgggaaatcaaatgag-taactttagggttgagagtctttgattagagttcttttgagaagttatcttgggttgggaaacatttataaacacc 2075259  T
Q  151 ttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaattt 249  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||| ||||||||||| ||  || ||||||||||    
T  2075258 ttgc-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgatattgggaaaaatggtagtaattagagttggttctttgtgagct--tttaagctaattt 2075162  T
Q  250 cttgta 255  Q
     |||||    
T  2075161 attgta 2075156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 200 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 4055917 - 4055799
Alignment:
Q  200 aaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacc-catttgtatctctttgtaagaa-ctcattgatagtggatt 297  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||  ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4055917 aaatgggtagaaattag-gttgttcttggagaacttgtaaaagttaatttcttgtaacctcttttgtatctctttgtaagaaactcattgatagtggatt 4055819  T
Q  298 ggagagatcaatctctccccca 319  Q
    | |||||||  |||||||||||    
T  4055818 gaagagatc--tctctccccca 4055799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 40592501 - 40592636
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |     
T  40592501 ctatataagtgttcttgtgcagattttgaatgagagcttgaagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtg 40592599  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40592600 aggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 40592636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 47923623 - 47923758
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||||| ||||| |||||||    |    
T  47923623 ctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttaggattgagtgtctttgtagtg 47923721  T
Q  118 ag-ttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47923722 agaatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 47923758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 21711588 - 21711451
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |     
T  21711588 ctatgtaagtgttcttgtgcagattttgaa-gagagcttgaagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtg 21711491  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagt 156  Q
      | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21711490 aggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgagt 21711451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 153
Target Start/End: Original strand, 27974676 - 27974806
Alignment:
Q  24 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-attagagtt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |   | |    
T  27974676 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggat 27974774  T
Q  122 ctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  27974775 ctcttgggtcgggaaacattgtaaacaccttg 27974806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 39032274 - 39032408
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| |||||||    |    
T  39032274 ctatataagtgttcttgtgcagtttttgaagtagagcttgaagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtg 39032372  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    || ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  39032373 agatctcttgggttggtaaacattgtaaacaccttg 39032408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 8166747 - 8166516
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagag-ttctcttgggttgagaaacatt-gtaaacaccttgagtgagtga 162  Q
    ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||  | | || |||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||||    
T  8166747 agaaatttgggaaataaaatgaggtaactttagggttgagggt-tttcttgaaaggttctcttgagttgaaaaacatttgtaaacacattgggtgggtga 8166649  T
Q  163 aaatcattgggtgt--cttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaaccca 260  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||| |  ||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||| | ||  ||||||||| |||| |||| |||||      
T  8166648 aaatcattgagtgtgtcttgttcatggaagagattg-ataaatgagtagaaattaggtttgttcttggagagtttgttgaagttaatatcttataacctt 8166550  T
Q  261 tttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 293  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  8166549 tttgtatctctttgtaaagaacttgttgatagtg 8166516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 1736023 - 1736158
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |     
T  1736023 ctatataagtgttcttatgcagattttgaaggagagtttggagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtg 1736121  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1736122 aggatctattgggttgggaaacattgtaaacaccttg 1736158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 24694885 - 24695020
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||| | | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |     
T  24694885 ctatataagtgttcttgtgcagattttgaagaagagcttgaagagagagaaatttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtg 24694983  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24694984 aggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 24695020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 153
Target Start/End: Original strand, 33386395 - 33386529
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-attag 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| |||||||||| | | |||| |||  ||||||||||||||| ||||||| | |      
T  33386395 tatttaagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagagagagaaacttggatta-caaaggagagaactttagggttgagtgtctttgtagtga 33386493  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33386494 ggatctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 33386529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16264716 - 16264581
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtag-agaagaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg--att 115  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |  |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||     
T  16264716 ctatataagtgttcttgtgcagtttttgaaggagagcttgaagtaagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtaatg 16264618  T
Q  116 agagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16264617 ag-gatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 16264581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 153
Target Start/End: Original strand, 6794433 - 6794569
Alignment:
Q  18 actatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-att 115  Q
    ||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| ||| ||| | |    
T  6794433 actatataagtgtttctttgcagattttgaaggagaggttttagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtcattgtagt 6794531  T
Q  116 agagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
       ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  6794532 gaggttctcttgagttgggaaacattgtaaacaccttg 6794569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 199 - 319
Target Start/End: Original strand, 20937670 - 20937790
Alignment:
Q  199 aaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttg-taagaactcattgatagtggatt 297  Q
    ||||| |||||||||||   ||||| || | || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||    
T  20937670 aaaataggtagaaattatgtttgtttttggagagcttgttgaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttgaaaagaactcattgata-tagatt 20937768  T
Q  298 ggagagatcaatctctccccca 319  Q
    |||||||||||||  |||||||    
T  20937769 ggagagatcaatcgttccccca 20937790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 357
Target Start/End: Original strand, 45282827 - 45283160
Alignment:
Q  25 aagtgttcttgtgcagattttgaag-gagaggttgtagaga---agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagag 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| | | |||||   ||| ||||||| ||||||| |  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  45282827 aagtgttcttgtgcagattt-gaagagagagttggaagagagagagagacttggggaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagag 45282925  T
Q  120 t-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagag 218  Q
    | ||||||||||||| |||||| | ||||||||||    || || |||||||| ||||||||       |||||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  45282926 tatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgcaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattaggg 45283015  T
Q  219 tt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt----gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctc 312  Q
    || |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  45283016 tttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatccctttttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctc 45283113  T
Q  313 tccccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    ||| |||   |||||||||||| || ||||||| || ||||||||||    
T  45283114 tcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaatctct 45283160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 8370208 - 8370343
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |     
T  8370208 ctatataagcgttcttgtgcagattttgaagaagagcttgaagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtg 8370306  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  8370307 aggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttg 8370343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 357
Target Start/End: Original strand, 25637273 - 25637601
Alignment:
Q  23 ttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgta-gaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagag 119  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | |||| ||| ||||||| ||||||| | |||| || ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  25637273 ttaagtgttcttgtgcagattt-gaagaggaggttggaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggtatctctagggtttagggttctttgattagag 25637370  T
Q  120 t-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagag 218  Q
    | ||||||||||||| |||||| | ||||||||||    || || |||||||| ||||||||       |||||||||| |||  ||||||||||||| |    
T  25637371 tatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattaggg 25637458  T
Q  219 tt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctc 314  Q
    || |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  25637459 tttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctc 25637556  T
Q  315 cccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    | |||   |||||||||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  25637557 ctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctct 25637601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 26323283 - 26323124
Alignment:
Q  144 aaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattgg-tgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaag 242  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| || ||||||| || ||| ||||| |||||||  ||||| ||   ||  |||||||||    
T  26323283 aaacaccttgagtgagtgaacatcattaagtgtcttgttcatgggatgagatt-gagaaaagggtaaaaattaggtttgtttttgaagagtttgttgaag 26323185  T
Q  243 ctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggaga 302  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||| || || ||||||||||||||| | ||||||    
T  26323184 ctaatttcttgtaacctttttgtatatcttggtaaaaaactcattgatagtgaagtggaga 26323124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 219 - 314
Target Start/End: Original strand, 33191866 - 33191960
Alignment:
Q  219 ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 314  Q
    |||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33191866 ttgttcttagagagcttgttgaagctaagttcttgtaacc-attt-tatgtctttgtaaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctc 33191960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 36029460 - 36029325
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtag-agaagaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |  |||||||||| | | |||| ||||||| |||||||||||| ||||||| | |     
T  36029460 ctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagtaagagaaacttggatta-caaaggaggtaaatttagggttgagtgtctttgtagtg 36029362  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36029361 aggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 36029325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 48438582 - 48438448
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||| |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  48438582 ctatataagtgttcttgtgcaaattttgaaggagagcttgaatagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagta 48438484  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  48438483 aggatctctt-ggttgggaaacattgtaaacaccttg 48438448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 153
Target Start/End: Original strand, 26928320 - 26928453
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-attag 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | |||||||| | | ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| | |      
T  26928320 tatttaagtgttcttgtgcagattttggaggaga-gttgaagagagaaaaacttggatta-caaacgagggaactctagggttgagtgtctttgtagtga 26928417  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26928418 ggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 26928453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 40845017 - 40844884
Alignment:
Q  24 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagt-t 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||| | |||||||| | | | |||| |||||||||||||||||||| |||||||    |||  |    
T  40845017 taagtgttcttgtgcaaattttgaaggagagttttaagatagagaaacttagatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggat 40844919  T
Q  122 ctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagt 156  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40844918 ctattgggttgagaaacattgtaaacaccttgagt 40844884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 54739116 - 54739004
Alignment:
Q  190 gagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattg 287  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  54739116 gagattgaaaaaatgg-tagaaattagtgtttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttat-gtaactcttttatatctctctgtaaagaactcattg 54739019  T
Q  288 atagtggattggaga 302  Q
    |||||||||||||||    
T  54739018 atagtggattggaga 54739004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 30709516 - 30709643
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| | | |||| ||||||||||||| |||||| |||  |||        
T  30709516 ctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagacagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagagttgagtgtcgatga---- 30709610  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
       ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30709611 ---tcttttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 30709643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 25491114 - 25491014
Alignment:
Q  207 tagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagat 305  Q
    ||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||  || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  25491114 tagaaattaggtttgttctttgagagcttgttgaagctgatttcttatactccttttgtatctctttgtaaagaaatcattgatagtgaagtggagagat 25491015  T
Q  306 c 306  Q
    |    
T  25491014 c 25491014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 153
Target Start/End: Original strand, 27986177 - 27986310
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-attag 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | | ||||| |||||||||| | | |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| | |      
T  27986177 tatttaagtgttcttgtgcagatttggaa-gagagttggaagagagagaaacttggatta-caaaggagggaactttagggttgagtgtctttgtagtga 27986274  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27986275 ggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 27986310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 357
Target Start/End: Original strand, 3617449 - 3617624
Alignment:
Q  185 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 281  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||| ||||    
T  3617449 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaac 3617545  T
Q  282 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  3617546 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 3617624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 4075605 - 4075511
Alignment:
Q  220 tgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacc-catttgtatctctttgtaagaa-ctcattgatagtggattggagagatcaatctc 312  Q
    ||||||| | ||||||||  ||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4075605 tgttcttagagaacttgtaaaagttaatttcttgtaacctcttttgtatcactttgtaagaaactctttgatagtggattggagagatcactctc 4075511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 27453321 - 27453192
Alignment:
Q  22 tttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagt 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||| | | |||| |||| ||||||||||||||| |||| |  | || |     
T  27453321 tttaagtgttcttgtgcagtttttgaa-gagagcttgaagagagagaaacttggatta-caaaggagggaactttagggttgagtgtctgtagtgag-ga 27453225  T
Q  121 tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27453224 tctcttgggttggcaaacattgtaaacaccttg 27453192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 32143688 - 32143555
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-attag 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| |||| | | |||| |||| |||| |||||||||| ||||||| | |      
T  32143688 tatttaagtgttcttgtgcagattttggaggaga-gttgaagagagagaaatttggatta-caaaggagggaactctagggttgagtgtctttgtagtga 32143591  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
     | ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  32143590 tgatctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttg 32143555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 2075149 - 2075076
Alignment:
Q  279 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaaca 351  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  2075149 aactaattgatagtggatttgagagatcaatctctccccgagagtaggtcaagttggatcgaactgggtaaaca 2075076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 156
Target Start/End: Original strand, 4386757 - 4386834
Alignment:
Q  80 caaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagag-ttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagt 156  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||    ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4386757 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttgggaaacattgtaatcaccttgagt 4386834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 7782474 - 7782375
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattaga 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | | ||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||| |||| || || |||||||||||||    
T  7782474 tatttaagtgttcttgtgcaga-tttgaaggacagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctaggttttagagtctttgattaga 7782376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 27027061 - 27026938
Alignment:
Q  31 tcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-attagagttctcttgg 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| | |||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |   | ||||||||    
T  27027061 tcttgtgcagattttgaagaagagcttgaagagagaaaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtactgaggatctcttgg 27026963  T
Q  129 gttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
     | | ||||||||||||||||||||    
T  27026962 atagggaaacattgtaaacaccttg 27026938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 27038418 - 27038283
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| | |||||||| | | |||| ||| |||||||||||||||| | ||||| | |     
T  27038418 ctatataagtgttcttgtgtagattttgaagaagagcttgaagagagaaaaacttggatta-caaaggagataactttagggttgagtgcctttgtagtg 27038320  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  27038319 aggatctcttgggtagggaaacattgtaaacaccttg 27038283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 37726042 - 37725907
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| ||| ||||| |||||||||| | | |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| | |     
T  37726042 ctatataagtgttcttgtgcagattttggaagtgagcttgaagagagagaaacttggatta-caaaggaggaaactttagggttgagtgtctttgtagtg 37725944  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | |||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  37725943 aggatctcttgggtggggaaacattataaacaccttg 37725907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 1313939 - 1313852
Alignment:
Q  219 ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttg-taagaactcattgatagtggattggagagat 305  Q
    |||||||| | || |||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  1313939 ttgttcttggagagcttgttaaagctaatttcttgcaagccttttgtatatctttgaaaagaactcattgatattggattagagagat 1313852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 290
Target Start/End: Original strand, 2020187 - 2020245
Alignment:
Q  233 cttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgata 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2020187 cttgttgaagctaatttcttataaccgttttgtatttctttgtaaagaactcattgata 2020245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Original strand, 3323471 - 3323545
Alignment:
Q  80 caaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagag-ttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||     ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3323471 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttatagtgaggttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 3323545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 273
Target Start/End: Original strand, 4386866 - 4386941
Alignment:
Q  197 gaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 273  Q
    |||||||| |||||||||||  || ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4386866 gaaaaatgagtagaaattaggttttgttctttgtgagctttt--aagctaatttcttgtaacccatttgtatcacttt 4386941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 26299329 - 26299220
Alignment:
Q  45 tgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagt-tctcttgggttgagaaacattg 142  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||  |||||||    |||  |||||||||||| |||||||||    
T  26299329 tgaaggagagcttttagagagagaaacttggattat-aaaggaggtaactttagggttgaatgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattg 26299231  T
Q  143 taaacaccttg 153  Q
    |||||||||||    
T  26299230 taaacaccttg 26299220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 3148144 - 3148037
Alignment:
Q  200 aaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaa-ctcattgatagtggattg 298  Q
    |||||| ||||||||||  || |||||   || ||||||||||||||||||||||||||   |||||| | |||||||||| ||||||||| ||| | ||    
T  3148144 aaatggatagaaattaggtttcttcttgaagagcttgttgaagctaatttcttgtaaccttattgtatttgtttgtaagaatctcattgattgtgaagtg 3148045  T
Q  299 gagagatc 306  Q
     |||||||    
T  3148044 cagagatc 3148037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 321 - 372
Target Start/End: Original strand, 47923958 - 47924008
Alignment:
Q  321 ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcat 372  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47923958 ttaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatct-tggtgtgtttgttcat 47924008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 28253416 - 28253346
Alignment:
Q  205 ggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttg 274  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||    
T  28253416 ggtagaaattagggttcgttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacgattttgtatttctttg 28253346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27305777 - 27305748
Alignment:
Q  286 tgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27305777 tgatagtggattggagagatcaatctctcc 27305748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 31340271 - 31340242
Alignment:
Q  259 catttgtatctctttgtaagaactcattga 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31340271 catttgtatctctttgtaagaactcattga 31340242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 25795829 - 25795765
Alignment:
Q  309 tctctcccccat-ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcat 372  Q
    |||||||||||  ||||||||  || || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25795829 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctttggtgtgtttgttcat 25795765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 293
Target Start/End: Original strand, 41510307 - 41510371
Alignment:
Q  230 gaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| | || |||| ||||||||||    
T  41510307 gaacatgttgaagctaatttcttgtaactcgtttgtatctttttataaataactaattgatagtg 41510371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 82)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 19 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 42428764 - 42428412
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42428764 ctatataaatgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggagataactttagggttgaaggtctttgattag 42428666  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  42428665 agttctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattatg 42428566  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42428565 gtttttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 42428466  T
Q  318 cat-ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttc 370  Q
    ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  42428465 catattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttagtgtgtttgttc 42428412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 19 - 367
Target Start/End: Original strand, 533603 - 533952
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  533603 ctatataagtgttttt-tgcagattttgaaggagaggttgaagagagagaaatttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgggggtctttgattag 533701  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  533702 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgcgtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg 533801  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  533802 gttggtctttgtgagcttgttgaagctaattttttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggaaagatcaatctctcccc 533901  T
Q  318 cat-ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttg 367  Q
    ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  533902 catattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtctttg 533952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 41 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 39468862 - 39468526
Alignment:
Q  41 attttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaaca 139  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  39468862 attttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttcattagagttctcttgggttgggaaaca 39468763  T
Q  140 ttgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39468762 ttgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattagtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttg 39468663  T
Q  240 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat-ttaggtcaagtttgatcg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || || ||  |    
T  39468662 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggttaaattggactg 39468563  T
Q  339 aactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  39468562 aactgggtcaacaatctttagtgtgtttgttcctctc 39468526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 19 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 28750990 - 28750632
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28750990 ctatataagtgttcttatgcagattttgaaagagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattag 28750891  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  28750890 agttctcttgggttgggaaacattgaaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg 28750791  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28750790 gttgttctttatgaaattgttgaagttaatttcctgtaacccatttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 28750691  T
Q  318 ca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    ||  |||||||||||| || |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  28750690 cagattaggtcaagttggaccgaattgggtcaataatctttggtgtgtttgttcctctc 28750632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Original strand, 32636658 - 32637009
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32636658 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttggagagagagaaacttgagaaatcaaaggaggtaactttagggttaagggtctttgattag 32636756  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  32636757 agttctcttgggtagtgaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattatg 32636856  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32636857 gttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccc 32636956  T
Q  318 ca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    ||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32636957 cagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 32637009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 36 - 375
Target Start/End: Original strand, 13488053 - 13488394
Alignment:
Q  36 tgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgag 134  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  13488053 tgcagattttgaaggagagctagaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgga 13488152  T
Q  135 aaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaact 234  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13488153 aaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaact 13488252  T
Q  235 tgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagttt 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||     
T  13488253 tgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccgagattaggtcaagttg 13488352  T
Q  334 gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    || ||||||||||||| ||||| | |||| ||||||| ||||    
T  13488353 gaccgaactgggtcaataatcttttgtgtctttgttcctctc 13488394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 19 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 42426569 - 42426212
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42426569 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaaaagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattag 42426471  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||     
T  42426470 agttctcttagattgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagg 42426371  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42426370 gttgttctttgtgaaattgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 42426271  T
Q  318 c-atttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    |   |||||||||||| ||  ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  42426270 ctgattaggtcaagttggactgaactaggtcaacaatcttttgtgtgtttgttcctctc 42426212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 65 - 366
Target Start/End: Original strand, 537905 - 538207
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaa 164  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  537905 agaaacttggaaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttggcttgggaaacatcgtaaacaccttgggtgagtgaaa 538004  T
Q  165 atcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttg 264  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  538005 atcattgcgtgtcttgttcattagtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggttgctctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttg 538104  T
Q  265 tatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat-ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtg 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||    
T  538105 tatctctttgtaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactggatcaacaatctttggtgtg 538204  T
Q  364 ttt 366  Q
    |||    
T  538205 ttt 538207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Original strand, 25412596 - 25412946
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  25412596 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaacattagggtttagggtctttgattag 25412694  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||     
T  25412695 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagg 25412792  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25412793 gttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctc 25412892  T
Q  318 ca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    ||   |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  25412893 cagagtaggtcaagtttggactgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 25412946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30683254 - 30682900
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30683254 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcagaggaggtaattttagggttgagggtctttgattag 30683156  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||     
T  30683155 agttctcttgggttgcgaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaaagggtagaaattag- 30683058  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaga--actcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30683057 --ggttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttctttgtaagaatactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 30682960  T
Q  316 ccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    ||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  30682959 cccagattaggtcaagttggaccgaact-ggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctc 30682900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Original strand, 13239586 - 13239937
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13239586 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaagtagagtttgaagagagagaaacttagaaaatcaaaggaggtaactttatggttgagggtctttgattag 13239684  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  13239685 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaaatggtagaaattagg 13239783  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13239784 gtttttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctc 13239883  T
Q  318 ca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    ||   |||||||| ||| || |||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  13239884 cagagtaggtcaaatttggaccgaactgggtgaacaatttttggtgtgtttgtt 13239937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 67 - 369
Target Start/End: Original strand, 33831562 - 33831865
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33831562 aaacttgggaaatcaaaggagttaattttagggttaagggtctttgattagagttctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 33831661  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33831662 cattgagtgtcttattcatttgtgagattggaaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgta 33831761  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat-ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||| ||    
T  33831762 tctctttgtaagaactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggactgaactgggtcaacaatctttggtgtttt 33831861  T
Q  366 tgtt 369  Q
    ||||    
T  33831862 tgtt 33831865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 67 - 369
Target Start/End: Original strand, 31182855 - 31183156
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31182855 aaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttaggtgagtgaaaat 31182954  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31182955 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattgg-aaaatgggtagaaattaggattgttctttgtgagtttgtttaagttaatttcttgtaa-ccatttgta 31183052  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat-ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtt 365  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  31183053 tccctttgtaagaactcattgatactggattggagagatctatctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacattctttggtgtgtt 31183152  T
Q  366 tgtt 369  Q
    ||||    
T  31183153 tgtt 31183156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Original strand, 13342895 - 13343246
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| || | |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  13342895 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggtctctgattag 13342993  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagatt-ggaaaaatgggtagaaattag 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  13342994 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattag 13343092  T
Q  217 agttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
     ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  13343093 ggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcct 13343191  T
Q  317 cca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    |||   ||||||| |||| || |||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  13343192 ccagagtaggtcatgtttggaccgaactgggtgaacaatctttgatgtgtttgtt 13343246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 36074378 - 36074025
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  36074378 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggtctttgattag 36074280  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattgg---aaaaatgggtagaaatt 214  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||    
T  36074279 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaagggtagaaatt 36074181  T
Q  215 agagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 314  Q
    || ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36074180 agggttgttctttgcgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctc 36074082  T
Q  315 c-cccatttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    | || |  |||||||||||| || |||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  36074081 ctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactggatgaacaatctttggtgtgtttgtt 36074025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 67 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 8566233 - 8565930
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggt-tgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaa 165  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8566233 aaacttgggaaatcaaatgaggtaactttagggcatgagggtctttgattagagttctcttgggttcggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaa 8566134  T
Q  166 tcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgt 265  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8566133 tcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatgggtagaacttaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgt 8566034  T
Q  266 atctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgt 364  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  8566033 atccctctgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcacccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaatct-tggtgtgt 8565935  T
Q  365 ttgtt 369  Q
    |||||    
T  8565934 ttgtt 8565930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 67 - 374
Target Start/End: Original strand, 16451963 - 16452270
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  16451963 aaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggatctttgattagagttctcttgggttcggaaacattgtaaacaccttg-gtaagtgacaat 16452061  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16452062 cattgagtgtcttgttcattgatgagattggaaaaatgggtagaaattaagtttgttctttctgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 16452161  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || |||||||||| |||| |   |||||||||    
T  16452162 tctctttgtaagaactcattcatagtggattggagagataaatctctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtaaacatttcttggtgtgtt 16452261  T
Q  366 tgttcatct 374  Q
    |||| ||||    
T  16452262 tgtttatct 16452270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Original strand, 30182429 - 30182774
Alignment:
Q  25 aagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttct 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| || | |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  30182429 aagtgttctt-tgcagattttgaatgagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggattagggtctttgattagagttct 30182527  T
Q  124 cttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgtt 223  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||    
T  30182528 cttgggttgggaaacattgcaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggttgtt 30182626  T
Q  224 ctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-ttt 322  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |    
T  30182627 ctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttctatctctttggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 30182726  T
Q  323 aggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    | ||||||||| || |||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  30182727 atgtcaagtttggaccgaactggatgaacaatctttggtgtgtttgtt 30182774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 67 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 3075944 - 3075641
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  3075944 aaactttggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattaaagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctttgatgagtgaaaat 3075845  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3075844 cattgagtgtctcgttcatttgtgagattgagaaaataggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgctgaatctaatttcttgtaacccatttgta 3075745  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat-ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtt 365  Q
    ||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| || | || ||||| |||| |   |||||||||    
T  3075744 tctttttgtaagaattcgttgatagtgaattggagagatcaatctctccctcatagtaggtcaagttggaccaaattgggtgaacatttcttggtgtgtt 3075645  T
Q  366 tgtt 369  Q
    ||||    
T  3075644 tgtt 3075641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Original strand, 16409317 - 16409649
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattaga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  16409317 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaag-agagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagtctttgattaga 16409415  T
Q  119 g-ttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||     
T  16409416 gcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattggaaaaa-gggtagaaattagg 16409506  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  16409507 gttgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcct 16409606  T
Q  317 cca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  16409607 ccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 16409649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 67 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 5887702 - 5887487
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5887702 aaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtatttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 5887603  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    |||||  ||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  5887602 cattgaatgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatggatagaaattagatttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgcaacccatttgta 5887503  T
Q  267 tctctttgtaagaact 282  Q
    || |||||||||||||    
T  5887502 tcactttgtaagaact 5887487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Original strand, 37438982 - 37439327
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||            
T  37438982 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttggaaaatcaaatgaggtaactttagggttgagggtct-------- 37439072  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattgg-----aaaaatg---ggtag 209  Q
          ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     ||||||    |||||    
T  37439073 ------cttgggttgggaaacattgtaaacactttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattgggaaggaaaaataaaaggtag 37439165  T
Q  210 aaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaat 309  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37439166 aaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaat 37439265  T
Q  310 ctctccccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    |||||| |||   |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  37439266 ctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 37439327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 139 - 351
Target Start/End: Original strand, 213420 - 213633
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  213420 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 213518  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat-ttaggtcaagttt-gat 336  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||     
T  213519 aaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggac 213618  T
Q  337 cgaactgggtcaaca 351  Q
    |||||||||| ||||    
T  213619 cgaactgggtgaaca 213633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Original strand, 26177725 - 26178056
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattaga 118  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  26177725 tatttaagtgttcttgcgcagattttgaag-agagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagtctttgattaga 26177823  T
Q  119 g-ttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||  |||||||||||||     
T  26177824 gcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattggaaaa--gggtagaaattagg 26177913  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  26177914 gttgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcct 26178013  T
Q  317 cca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  26178014 ccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 26178056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 90 - 375
Target Start/End: Original strand, 19806289 - 19806554
Alignment:
Q  90 aactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggt 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  19806289 aacttgagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtg-aaatcattgagtgtcttgttcattggt 19806387  T
Q  190 gagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||                   |||||||| |||||    
T  19806388 gagattggaaaaatgggtagaaattag-gttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttctaa-------------------aagaactccttgat 19806467  T
Q  290 agtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  19806468 agtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggggtgtttgttcctctc 19806554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 65 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 42310223 - 42309968
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaa 164  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||  ||| || |||||||    
T  42310223 agaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggtttatggtctttgattagggttctctttggttggaaaacattgtaaacattttgggtaagtgaaa 42310124  T
Q  165 atcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttg 264  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||| |   ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  42310123 atcattgagtgtcttgctcattggtgagattgagaaattgggtagaaatcaagtttgatctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttg 42310024  T
Q  265 tatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat 320  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  42310023 tatctctttgtaagaacttattgatagtggattagcgagatcaatctctcccccat 42309968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 9789550 - 9789218
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattaga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  9789550 tatttaagtgttcttgtgcagattt-gaaggagagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagtctttgattaga 9789452  T
Q  119 g-ttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    | ||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||      
T  9789451 gcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattggaaaaa-gggtagaaattaag 9789361  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
    ||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  9789360 gttgttccttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcct 9789261  T
Q  317 cca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  9789260 ccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 9789218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18441974 - 18441642
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattaga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  18441974 tatttaagtgttcttgtgcagattt-gaaggagagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagtctttgattaga 18441876  T
Q  119 g-ttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    | ||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||     
T  18441875 gcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattggaaaaa-gggtagaaattagg 18441785  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
    ||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  18441784 gttgttccttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcct 18441685  T
Q  317 cca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    | |   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  18441684 ctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 18441642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 139 - 366
Target Start/End: Original strand, 28278271 - 28278498
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  28278271 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggttgttctttgtgagcttgtt 28278369  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| || |    
T  28278370 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaaaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 28278469  T
Q  338 gaactgggtcaacaatctctggtgtgttt 366  Q
    ||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  28278470 gaactgggtgaacaattcttggtgtgttt 28278498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 139 - 351
Target Start/End: Original strand, 40147216 - 40147428
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  40147216 attgtaaacaccttgggagagtggaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttcgtgagcttgtt 40147314  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatc 337  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| || |    
T  40147315 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 40147414  T
Q  338 gaactgggtcaaca 351  Q
    ||||||||| ||||    
T  40147415 gaactgggtgaaca 40147428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 139 - 355
Target Start/End: Original strand, 38746960 - 38747176
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | || |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  38746960 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtatcttgttcattaatgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 38747058  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatc 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| || |    
T  38747059 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttggaaaaactcattgatagaggattggagagatcaatctctccctcagatcaggtcaagttggacc 38747158  T
Q  338 gaactgggtcaacaatct 355  Q
     ||||||||||| |||||    
T  38747159 aaactgggtcaataatct 38747176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 139 - 351
Target Start/End: Original strand, 5058002 - 5058212
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||    
T  5058002 attgtaaacaccttggaagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttct--gtgagcttgtt 5058098  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatc 337  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   ||||||||||| || |    
T  5058099 gaagctattttcttgtatcccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagttggacc 5058198  T
Q  338 gaactgggtcaaca 351  Q
    ||||||||| ||||    
T  5058199 gaactgggtgaaca 5058212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Original strand, 26170616 - 26170936
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattaga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||| ||||||| || ||||||||||| |    
T  26170616 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaa-gagagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagtctttgattaca 26170714  T
Q  119 g-ttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||       |||||||||||||||||  |||||||||||||     
T  26170715 gcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtc-------ttggtgagattggaaaa--gggtagaaattagg 26170804  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
     |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||         ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  26170805 attgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaac---------tct-tttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctc 26170894  T
Q  318 ca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    ||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  26170895 cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 26170936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 139 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27637827 - 27637651
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||| |||||||||   ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  27637827 attgtgaacaccttggaagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttatgagcttgtt 27637728  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaaccca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
     || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27637727 taaactaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctcc 27637651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Original strand, 42926725 - 42926905
Alignment:
Q  18 actatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgatta 116  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||| | ||||| ||  ||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  42926725 actatttaagtgtttctgttcagattttggatgagagcttcaagagagaaaaacttgggaaatcaaatgaggtaactttaggattgatggtctttgatta 42926824  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattgg 197  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  42926825 gagttctcttggattgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttctttggtgagattgg 42926905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 139 - 365
Target Start/End: Original strand, 27015487 - 27015704
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27015487 attgtaaacatcttgggagagtgaaaatcat-gagtgt-ttggtcattggtgagattgggaaaataggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 27015584  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc-cccatttaggtcaagtttgatc 337  Q
    |||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |  ||||||||||| || |    
T  27015585 gaagctaat--------acccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgtacagatcaatctctcctccaaaataggtcaagttggacc 27015676  T
Q  338 gaactgggtcaacaatctctggtgtgtt 365  Q
    ||||||||| |||| | | |||||||||    
T  27015677 gaactgggtgaacattttttggtgtgtt 27015704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 119 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 9049576 - 9049376
Alignment:
Q  119 gttctcttgggttgagaaacatt-gtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    |||||||||  ||| |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||| || |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||  ||||||||||     
T  9049576 gttctcttgatttgggaaacatttgtaaacactttgggtgagtaaaaatcactgagtgtcttgttgattagtgagtttgggaaaatga-tagaaattagt 9049478  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  9049477 gtttgtttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccattttgtatctctttgtaagaactcattgacagtggattggagagatcaatatctcccc 9049378  T
Q  318 ca 319  Q
    ||    
T  9049377 ca 9049376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 140 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 13695904 - 13695723
Alignment:
Q  140 ttgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgtt 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| |||| |||||||| |||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  13695904 ttgtaaacaccttgtgtgagtgaaaatcattgagtatctttttctttggagagattgggaaaa-gggtacaaattagggtttgttctttgtgagcttgtt 13695806  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat 320  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||    
T  13695805 aaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaactcattaatagtggattagagagattattctctcctccat 13695723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 140 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16641153 - 16640978
Alignment:
Q  140 ttgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagatt--ggaaaaatgggtagaaattagag-ttgttctttgtgaacttg 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||  | |||||  |||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  16641153 ttgtaaacaccttgagtgagtgaaattcattaagtgtcttgttcattggcgagattgagaaaaaaatggtagaaattagtgtttgttctttgtgagcttg 16641054  T
Q  237 ttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    |||||||| ||||||  |||| | |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16641053 ttgaagctgatttctgataactcttttgtatctctttgtaagaac---ttgatagtggattggagagatcaatctctcc 16640978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Original strand, 29720206 - 29720551
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggt-ctttgattag 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | ||||| ||||||||||| ||||||| |  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  29720206 tatttaagtgttcttgtgcaaattt-gaaggagagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattag 29720304  T
Q  118 agt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattag 216  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||||       |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29720305 agtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattag 29720394  T
Q  217 agtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 314  Q
     ||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29720395 ggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctc 29720493  T
Q  315 cccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctc-tggtgtgtttgtt 369  Q
    | | |   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  29720494 ctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgtt 29720551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Original strand, 29722366 - 29722711
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggt-ctttgattag 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | | ||| ||||||||||| ||||||| |  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  29722366 tatttaagtgttcttgtgcagattt-gaaggagagttggaaaagagagaaacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattag 29722464  T
Q  118 agt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattag 216  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||||       |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29722465 agtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattag 29722554  T
Q  217 agtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 314  Q
     ||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29722555 ggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctc 29722653  T
Q  315 cccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctc-tggtgtgtttgtt 369  Q
    | |||   |||||||| ||| || |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  29722654 ctccagagtaggtcaaatttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgtt 29722711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 29751481 - 29751154
Alignment:
Q  25 aagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-t 121  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||| | | ||||| ||| ||||||| ||||||| |  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  29751481 aagtgttcttgtgcatcttt-gaaggagagttggaagagagagagacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtat 29751383  T
Q  122 ctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt- 220  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||||       |||||||||| |||| ||||||||||||| |||     
T  29751382 ctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttt 29751293  T
Q  221 gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca 319  Q
    |||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  29751292 gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctcca 29751194  T
Q  320 -tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
       |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  29751193 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 29751154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 88 - 314
Target Start/End: Original strand, 3325816 - 3326043
Alignment:
Q  88 gtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacatt-gtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcatt 186  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||| | || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| |     
T  3325816 gtaattttagggtcgagtgtctttggtgagtgttctcttgagttgagaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaac-cattgggtatcttgttctta 3325914  T
Q  187 ggt-gagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactca 284  Q
    ||  || |||| ||||| || ||||||||||  ||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||    
T  3325915 ggaagaaattgaaaaaaagg-tagaaattagttttgttcttgaagagcttgttgaagctaatttcttgtaaccattgtgtatctctttgtaaagaactca 3326013  T
Q  285 ttgatagtggattggagagatcaatctctc 314  Q
     |||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  3326014 atgatggtggattagagagatcaatatctc 3326043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 205 - 317
Target Start/End: Original strand, 316782 - 316895
Alignment:
Q  205 ggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagag 303  Q
    ||||||||||||  |||||||| | || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  316782 ggtagaaattaggtttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaagaactcattgataatggatcggaggg 316881  T
Q  304 atcaatctctcccc 317  Q
    ||||||||||||||    
T  316882 atcaatctctcccc 316895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22536457 - 22536284
Alignment:
Q  185 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 282  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  22536457 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 22536361  T
Q  283 cattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    | ||||||||||||||| |||  |||||||||| |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  22536360 ctttgatagtggattggggagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 22536284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 369
Target Start/End: Original strand, 10593104 - 10593445
Alignment:
Q  24 taagtgttcttgtgcagattttgaag-gagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt 120  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | ||||| ||| ||||||| ||||||| | || |||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  10593104 taagtgttcttgtgcagattt-gaagagagagttggaagagagagagacttgggaaatcaaaggggg-aactctagggtttagggttctttgattagagt 10593201  T
Q  121 -tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagt 219  Q
     |||||||||| || |||||| | ||||||||||    || || |||||||| ||||||||       |||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  10593202 atctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggagaa-gggtagaaattagggt 10593291  T
Q  220 t-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
    | |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||     
T  10593292 ttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcct 10593389  T
Q  317 cca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctc-tggtgtgtttgtt 369  Q
    |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  10593390 ccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtatttgtt 10593445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 14520597 - 14520462
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | | | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |     
T  14520597 ctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttagatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtg 14520499  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14520498 aggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 14520462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 10054969 - 10054850
Alignment:
Q  200 aaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattg 298  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||   ||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10054969 aaatgggtagaaattatgtttgttcttgaagagtttgttgaagctaatttcttataacct-tttgtatctctttgtaatgaactcattgatagtgtattg 10054871  T
Q  299 gagagatcaatctctccccca 319  Q
    |||| |||||| |||||||||    
T  10054870 gagatatcaatatctccccca 10054850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 11916702 - 11916837
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||  |||||| | |     
T  11916702 ctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagtgagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtttctttgtagtg 11916800  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11916801 aggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 11916837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 33906184 - 33906070
Alignment:
Q  200 aaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattg 298  Q
    ||||||||| |||||||  | || ||| | || ||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  33906184 aaatgggtataaattaggttagtgcttggagagcttgtcgaagctaacttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtagattg 33906085  T
Q  299 gagagatcaatctct 313  Q
    || ||||||||||||    
T  33906084 gaaagatcaatctct 33906070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 357
Target Start/End: Original strand, 25077966 - 25078295
Alignment:
Q  23 ttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||| | ||| ||| ||||||| ||||||| | || | || ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  25077966 ttaagtgttcttgtgcagatttgaagggagaggttgga-agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagt 25078063  T
Q  121 -tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagt 219  Q
     ||||||||||||| |||||| | ||||||||||    || || |||||||| ||||||||       |||||||||| |||  ||||||||||||| ||    
T  25078064 atctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggt 25078153  T
Q  220 t-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    | |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25078154 ttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcc 25078251  T
Q  316 ccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
     |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  25078252 tccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 25078295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 357
Target Start/End: Original strand, 25135935 - 25136264
Alignment:
Q  23 ttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||| | ||| ||| ||||||| ||||||| | || | || ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  25135935 ttaagtgttcttgtgcagatttgaagggagaggttgga-agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagt 25136032  T
Q  121 -tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagt 219  Q
     ||||||||||||| |||||| | ||||||||||    || || |||||||| ||||||||       |||||||||| |||  ||||||||||||| ||    
T  25136033 atctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggt 25136122  T
Q  220 t-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    | |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25136123 ttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcc 25136220  T
Q  316 ccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
     |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  25136221 tccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 25136264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 153
Target Start/End: Original strand, 9353065 - 9353197
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-attag 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| |||||||||| | | |||| ||||||||||||||||| || ||||||| | |      
T  9353065 tatttaagtgttcttgtgcagattttg--ggagaggatgaagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttaagtgtctttgtagtga 9353161  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9353162 ggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 9353197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 234 - 286
Target Start/End: Original strand, 42926916 - 42926968
Alignment:
Q  234 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcatt 286  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42926916 ttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcatt 42926968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 15464900 - 15464766
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-attag 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||| | | ||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| | |      
T  15464900 tatttaagtgttcttgtgcagattttggaggagagcttgaagagagagaaacttggatta-caaagaaggaaactttagggttgagtgtctttgtagtga 15464802  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
     | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15464801 ggatctcttgggttgggaaacatcgtaaacaccttg 15464766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 153
Target Start/End: Original strand, 31300342 - 31300460
Alignment:
Q  36 tgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagag-ttctcttgggttga 133  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |   |||| |||||||||||| ||||||| |||||||    ||| ||||||||||||||    
T  31300342 tgcagattttgaagaagaggttttagagagagaaacttggattg-caaaggaggtaactttaaggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttga 31300440  T
Q  134 gaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31300441 gaaacattgtaaacaccttg 31300460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 293
Target Start/End: Original strand, 35616129 - 35616278
Alignment:
Q  144 aaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggt-gagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaag 242  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||  ||  ||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||| | || || ||| |||    
T  35616129 aaacaccttgggtgagtgaaa-tcattgagtctcttgttcacgggaagagattg-agaaatgagtagaaattaggtttgttcttggagagctcgtttaag 35616226  T
Q  243 ctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 293  Q
     |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  35616227 ttaatttcttgtaacccttttgtatttctttgtaaagaactcattgatagtg 35616278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 259 - 369
Target Start/End: Original strand, 42926965 - 42927076
Alignment:
Q  259 catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat-ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||| | |||  ||||||||||| || |||||||||| |||| |   |    
T  42926965 catttgtatctctttgtaagaactcattgacagtggattgaagaaataaatctctctctcatagtaggtcaagttggaccgaactgggtaaacatttctt 42927064  T
Q  358 ggtgtgtttgtt 369  Q
    ||||||||||||    
T  42927065 ggtgtgtttgtt 42927076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 199 - 303
Target Start/End: Original strand, 22097878 - 22097981
Alignment:
Q  199 aaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggatt 297  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  22097878 aaaaagggtagaaattagggttgttcttggagaatttgttgaagttaatttcttataaccc--ttgtatctatttgtaaaaaactcattgatagtggatt 22097975  T
Q  298 ggagag 303  Q
     |||||    
T  22097976 agagag 22097981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 16649958 - 16649857
Alignment:
Q  18 actatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagagaagaaa-cttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgatta 116  Q
    ||||| ||||||||  | ||||||||||||| || |||||  ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16649958 actatataagtgtttctttgcagattttgaatgataggttcaagagaggaaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgatggtctttgatta 16649859  T
Q  117 ga 118  Q
    ||    
T  16649858 ga 16649857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 234 - 316
Target Start/End: Original strand, 8445764 - 8445847
Alignment:
Q  234 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| ||||||||| |||| || |||| ||||||||||    
T  8445764 ttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttctttataaagaactaattgatagtagattagaaagatgaatctctccc 8445847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 153
Target Start/End: Original strand, 11181568 - 11181697
Alignment:
Q  24 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagag-tt 121  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||| ||||||| |||||||    ||| ||    
T  11181568 taagtgttctt-tgcagtttttgaagtagagcttgaagagagagaaacttggttta-caaaggaggtaactttatggttgagtgtctttgtagtgaggtt 11181665  T
Q  122 ctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11181666 ctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 11181697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Original strand, 30802841 - 30802934
Alignment:
Q  197 gaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgata 290  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  30802841 gaaaaatgggtagaa-ttaggtttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttattgtaatccttttgtatctatttgtaaagaactcgttgata 30802934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 111
Target Start/End: Original strand, 12083907 - 12083999
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtcttt 111  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12083907 ctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagctagaagtgagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtcttt 12083999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 357
Target Start/End: Original strand, 40379938 - 40380265
Alignment:
Q  23 ttaagtgttcttgtgcagattttgaag-gagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagag 119  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||| ||| ||||||| ||||||| | || | || ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40379938 ttaagtgttcttgtgcagattt-gaagagagaggttgga-agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagag 40380034  T
Q  120 t-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagag 218  Q
    | ||||| ||||||| |||||| | ||||||||||    || || |||||||| ||||||||       |||||||||| |||  ||||||||||||| |    
T  40380035 tatctctcgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattaggg 40380122  T
Q  219 tt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctc 314  Q
    || |||| | ||||||||||  || ||||||||||||||||  || ||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  40380123 tttgttcatagtgaacttgtcaaa-ctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaaactctc 40380220  T
Q  315 cccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    | |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  40380221 ctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 40380265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 357
Target Start/End: Original strand, 40382149 - 40382476
Alignment:
Q  23 ttaagtgttcttgtgcagattttgaag-gagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagag 119  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||| ||| ||||||| ||||||| | || | || ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40382149 ttaagtgttcttgtgcagattt-gaagagagaggttgga-agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagag 40382245  T
Q  120 t-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagag 218  Q
    | ||||| ||||||| |||||| | ||||||||||    || || |||||||| ||||||||       |||||||||| |||  |||||||| |||| |    
T  40382246 tatctctcgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaagttaggg 40382333  T
Q  219 tt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctc 314  Q
    || |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  40382334 tttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaaactctc 40382431  T
Q  315 cccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    | |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  40382432 ctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 40382476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 10700809 - 10700683
Alignment:
Q  191 agattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgat 289  Q
    |||||||||||| || ||||||||||  |||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  10700809 agattggaaaaaagg-tagaaattaggtttgttcttagagagcttgttgaagctaa-ttcttataacatttttgtatctctttaaaaagaactcattgat 10700712  T
Q  290 agtggattggagagatcaatctctcccccat 320  Q
    |||| | ||||||||||  ||||||||||||    
T  10700711 agtgaagtggagagatc--tctctcccccat 10700683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 153
Target Start/End: Original strand, 24553255 - 24553392
Alignment:
Q  18 actatttaagtgttcttgtgcagatttt-gaaggagaggttgtagagaa-gaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgatt 115  Q
    ||||| ||||||||  | |||||||||| ||||||||  || ||||||| ||||||||| | | |||| |||||||||| ||||||||| |||||||       
T  24553255 actatataagtgtttctttgcagatttttgaaggagaacttttagagaaagaaacttggatta-caaaggaggtaacttaagggttgagtgtctttgtag 24553353  T
Q  116 agag-ttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24553354 tgaggttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 24553392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 153
Target Start/End: Original strand, 42127123 - 42127235
Alignment:
Q  42 ttttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagag-ttctcttgggttgagaaaca 139  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||| | | |||| |||||||||||| |||||||  ||||||    ||| ||||||||||||||||||||    
T  42127123 ttttgaaggagaggttttagagtgagaaacttggatta-caaaggaggtaactttaaggttgagtatctttgtagtgaggttctcttgggttgagaaaca 42127221  T
Q  140 ttgtaaacaccttg 153  Q
    ||||| ||||||||    
T  42127222 ttgtatacaccttg 42127235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 292
Target Start/End: Original strand, 6016968 - 6017115
Alignment:
Q  144 aaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattgg-tgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaag 242  Q
    |||||||||||  ||||||||||  ||| || ||||||||||| | ||| ||||||||  | |||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||    
T  6016968 aaacaccttgaa-gagtgaaaattcttgagtctcttgttcattagatgaaattggaaa--ttggtagaaattag-gttcttctttgagaacctgttgaag 6017063  T
Q  243 -ctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaag-aactcattgatagt 292  Q
     ||||||||||||||||  ||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  6017064 actaatttcttgtaacctttttttatttcttcgtaagaaactcattgatagt 6017115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 153
Target Start/End: Original strand, 36932080 - 36932213
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattaga 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||| |||||||||| |   |||| |||| ||||||||||||||| ||||||     ||    
T  36932080 tatttaagtgttcttgtgcagtttttggaggagagct-gaagagagagaaacttggattg-caaaggagggaactttagggttgagtgtctttatagtga 36932177  T
Q  119 -gttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36932178 tgatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 36932213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 28832563 - 28832489
Alignment:
Q  80 caaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagag-ttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||||    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28832563 caaaggaggtaactttagagttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 28832489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 301 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 5887486 - 5887417
Alignment:
Q  301 gagatcaatctctcccccat-ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  5887486 gagatctatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaattggatcaacaatctttggtgtgtttgtt 5887417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 288 - 370
Target Start/End: Original strand, 11917001 - 11917082
Alignment:
Q  288 atagtggattggagagatcaatctctcccccat-ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttc 370  Q
    |||||||||||||||| |   |||||||||||| ||||||||  || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11917001 atagtggattggagagctgc-tctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctc-ggtgtgtttgttc 11917082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 244 - 306
Target Start/End: Original strand, 30793195 - 30793258
Alignment:
Q  244 taatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatc 306  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  30793195 taatttattgtaaccattttgtatctctttgtaaagaactaattgatagtgaagtggagagatc 30793258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 370
Target Start/End: Original strand, 42127459 - 42127520
Alignment:
Q  309 tctctcccccat-ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttc 370  Q
    |||||||||||  ||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42127459 tctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatct-tggtgtgtttgttc 42127520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 10281770 - 10281737
Alignment:
Q  337 cgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttc 370  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10281770 cgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttc 10281737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 32576417 - 32576344
Alignment:
Q  233 cttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatc 306  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||  ||||||| ||| |||||| | | ||||||||    
T  32576417 cttgttgaagctaattacttataaccattttgtatctcttttaaagaactaattaatagtgaagttgagagatc 32576344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 290
Target Start/End: Original strand, 32609584 - 32609641
Alignment:
Q  234 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgata 290  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  32609584 ttgttgaagttaatttcttgtaactcttttgtatttctttgtaaagaacttattgata 32609641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 164
Target Start/End: Original strand, 5007443 - 5007530
Alignment:
Q  77 aatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaaca-ttgtaaacaccttgagtgagtgaaa 164  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||| ||||| | | | |||||||||||||  ||||||||||    
T  5007443 aatcaaaggaggtaactttagggttgagtatctttggtgag-gttctcttgagttgaaacatatttgtaaacaccttaggtgagtgaaa 5007530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 9049643 - 9049591
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    ||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9049643 agaaacttgagaaatcaaaggagataactttagggttgaaagtctttgattag 9049591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 259
Target Start/End: Original strand, 33030889 - 33030950
Alignment:
Q  197 gaaaaatgggtagaaatta-gagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaaccc 259  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  33030889 gaaaaatgggtagaaattatgttttgttctttgtgagctttt--aagctaatttcttgtaaccc 33030950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 59)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 18 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 9183366 - 9183015
Alignment:
Q  18 actatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgatta 116  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9183366 actatataagttttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgatta 9183268  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattag 216  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9183267 gagttctcctgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattag 9183168  T
Q  217 agttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9183167 ggttgttctttgtgaatttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcct 9183068  T
Q  317 cca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgt 368  Q
    |||  ||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9183067 ccagattatgtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgt 9183015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 5406532 - 5406182
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  5406532 ctatataagtgttatt-tgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggtctttgattag 5406434  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  5406433 agttctctcgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagg 5406336  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5406335 gttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctc 5406236  T
Q  318 ca-tttaggtcaagtttg-atcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    ||   ||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5406235 cagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 5406182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 5410857 - 5410507
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  5410857 ctatataagtgttatt-tgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggtctttgattag 5410759  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  5410758 agttctctcgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagg 5410661  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5410660 gttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctc 5410561  T
Q  318 ca-tttaggtcaagtttg-atcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    ||   ||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5410560 cagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 5410507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 18 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30834871 - 30834512
Alignment:
Q  18 actatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgatta 116  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| | ||||||| || | |||||||||||| | ||||||||||||    
T  30834871 actatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgagaaatcaaaggaagcaactttagggtttatggtctttgatta 30834773  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattgg-aaaaatgggtagaaatta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30834772 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacacctcg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaatta 30834674  T
Q  216 gagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30834673 gggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcc 30834574  T
Q  316 ccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
     |||   |||||||||||| || |||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||    
T  30834573 tccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaataatctttggtgtgtttgtttatctc 30834512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 33211519 - 33211168
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  33211519 ctatataagtgttctt-tgcagattgtgaaggagaagttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttacagttgagggtctttgattag 33211421  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||      
T  33211420 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtcactgaaaatcattgagtgttttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattatg 33211321  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33211320 gttgttctttgtgagcttgatgaagttaatttcttgtagctcatttgtatctctttgtaagaactcatttataatggattggagagatcaatctctcccc 33211221  T
Q  318 ca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    ||   ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  33211220 cagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtatgtttgtt 33211168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 67 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 28137694 - 28137442
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28137694 aaacttggaaaatcaaaggagttaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 28137595  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28137594 cattgagtgtcttgttcattggtgagaatgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgta 28137495  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca 319  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28137494 tttctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca 28137442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16452663 - 16452311
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||  | | |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16452663 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaagtaagcaactttagagtttagggtctttgattag 16452565  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattgg-aaaaatgggtagaaattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16452564 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattag 16452466  T
Q  217 agttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  16452465 ggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttcatatctctttggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcct 16452366  T
Q  317 cca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    |||   |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16452365 ccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 16452311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31405008 - 31404657
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtcttt-gatta 116  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  31405008 ctatataagtgttatt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggtcttttgatta 31404910  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattag 216  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  31404909 gagttctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatcagtgagattgggaaaatgg-tagaaattag 31404812  T
Q  217 agttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31404811 ggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcct 31404712  T
Q  317 cca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    |||   |||| ||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31404711 ccagagtaggccaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 31404657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 5413726 - 5413377
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  5413726 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggtgagcttgaagatagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggtctttgattag 5413628  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||     
T  5413627 agttctctcgggttgggaaacattgtaaacacattg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagg 5413530  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5413529 gttgttctttgcgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctc 5413430  T
Q  318 ca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    ||   |||||||||||| || |||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  5413429 cagagtaggtcaagtttggaccgaact-ggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 5413377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 20 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 2171864 - 2171507
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattaga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | | ||||| ||||||||||| ||||||| |  | |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  2171864 tatttaagtgttcttgtgcagattt-gaaggtgagctagaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggtctttgattaga 2171766  T
Q  119 gtt-ctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||     
T  2171765 gtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagg 2171667  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  2171666 gttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccc-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctc 2171568  T
Q  318 ca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctc-tggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    ||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  2171567 cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtatttgtttatctc 2171507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 33160688 - 33160334
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaa-cttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgatta 116  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | | ||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33160688 ctatataagtgttctt-tgcagattttgatggagagctggaagagagagaaaacttggggaatcaaaggaggtaactttagggttgagagtctttgatta 33160590  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaa-tcattgggtgtcttgttcattggtgagattgg-aaaaatgggtagaaatt 214  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  33160589 gagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattgggaaaaaaaggtagaaatt 33160491  T
Q  215 agagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 314  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33160490 agagttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatggtggattggagagatcaatctctc 33160391  T
Q  315 cccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    | |||   ||  |||||||| || | |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  33160390 ctccagagtatttcaagtttggaccaaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 33160334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 67 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 26954571 - 26954277
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  26954571 aaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagagtctttgattagagttatcttaggttgggaaacattgtaaacacctttggggagtgaaaat 26954472  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  26954471 cattgagtgtcttgttcatatgtgagattgggaaattgg-tataaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatctgta 26954373  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccc-atttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtg 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||    
T  26954372 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaagtaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaatctttggtg 26954277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 67 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 3039201 - 3038937
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagtt-------------ctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||             ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3039201 aaacttggg-aatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagggttttcttgagaggttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 3039103  T
Q  154 agtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttg 253  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3039102 agtgagtgaaaatcattgaatgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcattgtgagctttttgaagctaatttcttg 3039003  T
Q  254 taacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3039002 taacccatttgtatctctttgtaagaactctttaatagtggattggagagattaatctctccccca 3038937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 139 - 351
Target Start/End: Original strand, 21593619 - 21593831
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21593619 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 21593717  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| || |    
T  21593718 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 21593817  T
Q  338 gaactgggtcaaca 351  Q
    ||||||||| ||||    
T  21593818 gaactgggtgaaca 21593831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 139 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 26830337 - 26830124
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattgg-tgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgt 237  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26830337 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 26830239  T
Q  238 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc-cccatttaggtcaagtttgat 336  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||     
T  26830238 tgaagctaatttcttgtaatccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaagtttgac 26830139  T
Q  337 cgaactgggtcaaca 351  Q
     ||||||||| ||||    
T  26830138 tgaactgggtgaaca 26830124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 173 - 351
Target Start/End: Original strand, 21588919 - 21589098
Alignment:
Q  173 gtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21588919 gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctt 21589018  T
Q  273 tgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaaca 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  21589019 tgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 21589098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 139 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 2973152 - 2972977
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  2973152 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcataag-tgtcgtgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtt 2973054  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2973053 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 2972977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 67 - 369
Target Start/End: Original strand, 16568925 - 16569207
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||| ||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16568925 aaacttgggaaatcaaaggaattaaatttagggttaagggtctttgattagagttctcttgggtttggaaacattgtaaacaccttgggtaagtgaaaat 16569024  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgt 265  Q
    ||||| ||||||||          ||||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||           
T  16569025 cattgagtgtcttg----------agattgagaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacc------- 16569107  T
Q  266 atctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgt 364  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16569108 -----tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 16569202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 139 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 603293 - 603083
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||        ||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  603293 attgtaaacaccttgggatagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgg--------gtagaaatttgtgttgttctttgtgagcttgtt 603203  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| || |    
T  603202 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagaaatcaatctctccccaagattaggtcaagttggacc 603103  T
Q  338 gaactgggtcaacaatctct 357  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  603102 gaactgggtcaacaatctct 603083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 139 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 3808922 - 3808746
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3808922 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-caagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaataggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 3808824  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaaccca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3808823 gaaactaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 3808746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 139 - 320
Target Start/End: Original strand, 5043582 - 5043762
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  5043582 attgtaaacaccttgtgagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattcgtgagattgagaaaatgagtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtt 5043680  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat 320  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  5043681 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcctccat 5043762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 139 - 315
Target Start/End: Original strand, 17762944 - 17763120
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17762944 attgtaaacactttgagagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 17763043  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17763044 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctttttggaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcc 17763120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 173 - 312
Target Start/End: Original strand, 17758011 - 17758150
Alignment:
Q  173 gtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctt 272  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17758011 gtgtcttcttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctt 17758110  T
Q  273 tgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17758111 tgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctc 17758150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 139 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22425041 - 22424864
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||   || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22425041 attgtaaacactttgggagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcgttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 22424942  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaaccca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
     |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22424941 taagctaatttcttgtaacccatttttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctcc 22424864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 3073084 - 3072740
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagagaagaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagag 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | ||||| |||||||||| ||||||| |  | |||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  3073084 tatttaagtgttcttgtgcagatttggaag-agagttggaagaga-gaaacttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagagtctttgattagag 3072987  T
Q  120 -ttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagag 218  Q
     ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||       |||||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  3072986 cttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaa-gagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaatgg-tagaaattaggg 3072896  T
Q  219 ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
    |||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||     
T  3072895 ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtgaattggagagttcaatctctcct 3072796  T
Q  317 cca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctc-tggtgtgtttgtt 369  Q
    |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  3072795 ccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgtt 3072740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 6097767 - 6097445
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgaggg-tctttgattag 117  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||||||| ||||||||||| ||||||| |  | |||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  6097767 tatttaagtgttcttgtgcaga-tttgaaggtgagagagtagagagagaaacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattag 6097669  T
Q  118 agt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattag 216  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6097668 agtatctctttggttgggaaacatggtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgt-------tttggtgagattggaaaaat-ggtagaaattag 6097578  T
Q  217 agttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
      |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||         ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  6097577 gattgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaac---------tct-tttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcct 6097488  T
Q  317 cca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  6097487 ccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 6097445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 119 - 319
Target Start/End: Original strand, 4045356 - 4045558
Alignment:
Q  119 gttctcttgggttgagaaacatt-gtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||     
T  4045356 gttctcttgagttgggaaacatttgtaaacacctagggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgtttattggagagattgggaaaat-ggtagaaattagg 4045454  T
Q  218 g-ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  4045455 gtttgttctttatgagcttgttgaagctaatttcttgtaatcattttatatctctttgtaaataactcattgatagtggattggagagatcaatttctac 4045554  T
Q  316 ccca 319  Q
    ||||    
T  4045555 ccca 4045558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Original strand, 411945 - 412276
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattaga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | | ||||| ||||||||| | ||||||| |  |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  411945 tatttaagtgttcttgtgcagattt-gaagg-gagttggaagagagagaaacttgagaaatcaaagggagtaactctagggtttagagtctttgattaga 412042  T
Q  119 g-ttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    | |||||||||||||| |||||| | |||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||       |||||||||| |||| || ||||||||||     
T  412043 gcttctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgaa-gagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagg 412132  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    ||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  412133 gttgttcattgtgaacttatcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcc 412232  T
Q  316 ccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
     |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  412233 tccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 412276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 253
Target Start/End: Original strand, 16567088 - 16567265
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16567088 aaacttgggaaatcaaaggagttaactttagggttaagggtctttgattagagttctcttgggtttggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 16567187  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaatta-gagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttg 253  Q
    ||||| ||||||          ||||||||| ||||||| ||||||||| |  ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16567188 cattgagtgtct----------tgagattgggaaaatggttagaaattaggttttgttttttgtgagcttgtttaagctaatttcttg 16567265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 144 - 314
Target Start/End: Original strand, 25073528 - 25073698
Alignment:
Q  144 aaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtg-agattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaag 242  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||| || |||||||||| || | |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  25073528 aaacatcttgggtgagtgaaa-tcattgagtatcttgttcatgggaggagattgaaaaaatgg-tagaaattagatttattcttcgtgagcttgttaaag 25073625  T
Q  243 ctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 314  Q
    ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  25073626 ctattttattgtaacccttttgtatctctatgtaaagaactcattgatagtggattagagaaatcaatctctc 25073698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 255 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 5409167 - 5409052
Alignment:
Q  255 aacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaa 352  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||| || |||||| ||| |||||    
T  5409167 aacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact-ggtgaacaa 5409069  T
Q  353 tctctggtgtgtttgtt 369  Q
    ||| |||||||||||||    
T  5409068 tctttggtgtgtttgtt 5409052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 228 - 315
Target Start/End: Original strand, 26800630 - 26800717
Alignment:
Q  228 gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26800630 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactaattttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctcc 26800717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 357
Target Start/End: Original strand, 27647709 - 27648034
Alignment:
Q  25 aagtgttcttgtgcagattttgaag-gagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt- 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| | | ||||| ||| ||||||| ||||||| |  | |||| ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  27647709 aagtgttcttgtgcagattt-gaagagagagttggaagagagagagacttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagta 27647807  T
Q  121 tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt 220  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||| ||    || || |||||||| ||||||||       |||||||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  27647808 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccatgt---agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtt 27647895  T
Q  221 -gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccc 318  Q
     |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||    
T  27647896 tgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaaactctcctcc 27647993  T
Q  319 a-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    |   ||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  27647994 agagtagatcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 27648034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 357
Target Start/End: Original strand, 16554869 - 16555043
Alignment:
Q  185 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 282  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||    
T  16554869 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaact 16554965  T
Q  283 ca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcc-cccatttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    || |||||||||||||||||||  ||| |||||| || |  |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  16554966 catttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 16555043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 357
Target Start/End: Original strand, 16631425 - 16631599
Alignment:
Q  185 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 282  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||    
T  16631425 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaact 16631521  T
Q  283 ca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcc-cccatttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    || |||||||||||||||||||  ||| |||||| || |  |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  16631522 catttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 16631599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16578686 - 16578512
Alignment:
Q  185 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 282  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  16578686 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 16578590  T
Q  283 catt-gatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| |||||| |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  16578589 catttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 16578512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 357
Target Start/End: Original strand, 16616694 - 16616868
Alignment:
Q  185 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 282  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||    
T  16616694 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaact 16616790  T
Q  283 ca-ttgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    || |||||||||||||||||||  ||| |||||| |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  16616791 catttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 16616868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 357
Target Start/End: Original strand, 16653112 - 16653286
Alignment:
Q  185 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 282  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||    
T  16653112 ttggtgagattgggaaaa-gggtaaaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaact 16653208  T
Q  283 ca-ttgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    || |||||||||||||||||||  ||| |||||| |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  16653209 catttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 16653286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 153
Target Start/End: Original strand, 5757213 - 5757343
Alignment:
Q  24 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-attagagtt 121  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| | | ||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||   | |    
T  5757213 taagtgtttttgtgcagattttggaggagagctggaagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtatttaggat 5757311  T
Q  122 ctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5757312 ctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 5757343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 5017226 - 5017361
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| | |||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |     
T  5017226 ctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggaaaaagaaagagaaacttggatta-caaacgagataactttagggttgagtgtctttgtagtg 5017324  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5017325 aggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 5017361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 31086204 - 31086339
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||| |||||||||| | | |||| | |||||||||||||||||| ||||||| | |     
T  31086204 ctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggtgagctggaagagagagaaacttggatta-caaagggggtaactttagggttgagtgtctttgtagtg 31086302  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31086303 aggatctcttaggttgagaaacattgtaaacaccttg 31086339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 5571974 - 5572108
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||| |||||||||| | | |||  |||||||||||||||||| | ||||||| | |     
T  5571974 ctatataagtgttcttgtggagtttttgaaggagagctt-tagagagagaaacttggatta-caatggaggtaactttagggttgggtgtctttgtagtg 5572071  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5572072 gggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 5572108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 357
Target Start/End: Original strand, 6027094 - 6027421
Alignment:
Q  23 ttaagtgttcttgtgcagattttgaag-gagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagag 119  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||| ||| ||||||| ||||||| | || | || ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  6027094 ttaagtgttcttgtgcagattt-gaagagagaggttgga-agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagag 6027190  T
Q  120 t-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagag 218  Q
    | ||||||||||||| |||||| | ||||||||||    || || |||||||| ||||||||       |||||||||| |||  ||||||||||||| |    
T  6027191 tatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattaggg 6027278  T
Q  219 tt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctc 314  Q
    || |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  6027279 tttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctc 6027376  T
Q  315 cccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    | |||   || ||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  6027377 ctccagagtatgtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 6027421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 18234450 - 18234357
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagag-aagaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg 112  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| | | |||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18234450 ctatataagtgttcttgtgcagtttttgaaggagagcttgaagagaaagaaacttggatta-caaaggaggtagctttagggttgagtgtctttg 18234357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 357
Target Start/End: Original strand, 25421305 - 25421480
Alignment:
Q  185 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 281  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||| ||||    
T  25421305 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaac 25421401  T
Q  282 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  25421402 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 25421480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 112
Target Start/End: Original strand, 10076930 - 10077014
Alignment:
Q  28 tgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  10076930 tgttcttgtgcagattttgaaggagagctttaagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttg 10077014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 18 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 31936943 - 31936807
Alignment:
Q  18 actatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-att 115  Q
    ||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |   |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  31936943 actatataagtgtttctttgcagattttgaagtagaggttttagagagagaaacttggattg-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagt 31936845  T
Q  116 agagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
       | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31936844 gaggatctattgggttgggaaacattgtaaacaccttg 31936807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 31979818 - 31979744
Alignment:
Q  80 caaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagag-ttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31979818 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggttcttttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 31979744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 5407242 - 5407164
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttag 97  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  5407242 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttag 5407164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 5411567 - 5411489
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttag 97  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  5411567 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttag 5411489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Original strand, 24435763 - 24435836
Alignment:
Q  80 caaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||  |   ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  24435763 caaaggagataactttagggttgagtgtctttgtgtgaggttctcttgagttgggaaacattgtaaacaccttg 24435836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 312
Target Start/End: Original strand, 2908506 - 2908586
Alignment:
Q  233 cttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctc 312  Q
    |||||||||| |||||| ||  ||| | |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  2908506 cttgttgaagataattttttacaactcttttgtatcttattgtaaagaactcattgatagtggattgaagaaatcaatctc 2908586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 313
Target Start/End: Original strand, 9572667 - 9572719
Alignment:
Q  262 ttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctct 313  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9572667 ttgtaactctttgttaagaacccattgatagtggattgcagagatcaatctct 9572719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 22964065 - 22963931
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| | ||| |||||||| | | | |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| | |     
T  22964065 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaactagagcttgaaaagagagaaactttgatta-caaaagagctaactttagggttgagtgtctttgtagtg 22963968  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
     || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  22963967 aagatctcttggattgggaaacattgtaaacaccttg 22963931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 23824328 - 23824462
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| | ||| |||||||| | | | |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| | |     
T  23824328 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaactagagcttgaaaagagagaaactttgatta-caaaagagctaactttagggttgagtgtctttgtagtg 23824425  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
     || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  23824426 aagatctcttggattgggaaacattgtaaacaccttg 23824462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 23896719 - 23896628
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctt 110  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| | | |||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  23896719 ctatataagagttcttgtgcatattttgaagaagagcttgaagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagagttgagtgtctt 23896628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 370
Target Start/End: Original strand, 5017531 - 5017579
Alignment:
Q  321 ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttc 370  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5017531 ttaggtcatatttgaccgaactgggtcaacaatct-tggtgtgtttgttc 5017579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 22709274 - 22709242
Alignment:
Q  121 tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22709274 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 22709242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 121
Target Start/End: Original strand, 30517898 - 30517954
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagtt 121  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| | ||||||    
T  30517898 agaaacttgggaaatcaaatgagggaactttagagttgagtgtctttggtgagagtt 30517954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 96)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 18 - 370
Target Start/End: Original strand, 48491411 - 48491764
Alignment:
Q  18 actatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgatta 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48491411 actatttaagtgttcttgtgcagattttgaagaagaggttgaagagagagaaacttgataaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgatta 48491510  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattag 216  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48491511 gagttctcttgggttgggaaacattgtaaacactttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattag 48491610  T
Q  217 agttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48491611 ggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgaaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 48491710  T
Q  317 cca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttc 370  Q
    |||  |||||||||| |||  | |||| ||| |||||||| || |||||||||||    
T  48491711 ccagattaggtcaag-ttggccaaacttggtaaacaatctttgatgtgtttgttc 48491764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 375
Target Start/End: Original strand, 48489263 - 48489622
Alignment:
Q  18 actatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgatta 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48489263 actatttaagtgttcttgtgcagattttgaagaagagattgaagatagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgatggtctttgatta 48489362  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattag 216  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48489363 gagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaaatgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattag 48489462  T
Q  217 agttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
     |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48489463 ggttgttctttgaaaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgcaataactcattcatagtggattggagagatcaatctctccc 48489562  T
Q  317 cca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    |||  |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  48489563 ccagattaggtcaagttggaccgaactgggtaaacaatctttggtgtgtttgttcctctc 48489622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 24 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 47676465 - 47676113
Alignment:
Q  24 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttc 122  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47676465 taagtgttctt-tgcagattttgaagaggagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggagataactttagggttgagggtctttgattagagttc 47676367  T
Q  123 tcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgt 222  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  47676366 tcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcaatgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgt 47676267  T
Q  223 tctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat-t 321  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  47676266 tctttgtgaatttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcaatgatagtggaatggagagatcaatctctcccccatat 47676167  T
Q  322 taggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  47676166 taggtcaagttggaccgaactggatcaacaatctttggtgtgtttgttcctctc 47676113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 24 - 369
Target Start/End: Original strand, 1113495 - 1113842
Alignment:
Q  24 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttc 122  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1113495 taagtgtttctgtgcagattttgaagaagaggttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagtaactttagggttgagggtctttgattagagttc 1113594  T
Q  123 tcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgt 222  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||    
T  1113595 tcttgggttgggaaacattgtaaacaacttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatggatagaaattagggttgt 1113694  T
Q  223 tctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat-t 321  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1113695 tctttgtgagcttgttgaagctaatttcttataacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcccccatat 1113794  T
Q  322 taggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  1113795 taggtcaagtttgaccgaattgagtcaacaatctttggtgtgtttgtt 1113842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 24 - 370
Target Start/End: Original strand, 18126483 - 18126830
Alignment:
Q  24 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttc 122  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18126483 taagtgttctt-tgcagattttgaagaagagcttgaatagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttc 18126581  T
Q  123 tcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgt 222  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18126582 tcatgggttgggaaacattgtaaacaacttgggtgagtgaaaatcattgagtgttttgttcattggtgagattggaaaaatgtgtagaaattagggttgt 18126681  T
Q  223 tctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tt 321  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||       
T  18126682 tctttgtgaacttgttcaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggaggaatcaatctctcccccagac 18126781  T
Q  322 taggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttc 370  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18126782 taggtcaagtttgaccgacctgggtcaacaatctttggtgtgtttgttc 18126830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 24 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 14070162 - 14069817
Alignment:
Q  24 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttc 122  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14070162 taagtgttctt-tgccgattttaaaggagggcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggctgagggtctttgattagagttc 14070064  T
Q  123 tcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgt 222  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  14070063 tcttgggttgggtaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgt 14069964  T
Q  223 tctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tt 321  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  14069963 tctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccaagat 14069864  T
Q  322 taggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgt 368  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14069863 taggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgt 14069817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 24 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 14380190 - 14379845
Alignment:
Q  24 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttc 122  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14380190 taagtgttctt-tgccgattttaaaggagggcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggctgagggtctttgattagagttc 14380092  T
Q  123 tcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgt 222  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  14380091 tcttgggttgggtaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgt 14379992  T
Q  223 tctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tt 321  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  14379991 tctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccctagat 14379892  T
Q  322 taggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgt 368  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14379891 taggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgt 14379845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 24 - 375
Target Start/End: Original strand, 4586000 - 4586352
Alignment:
Q  24 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttc 122  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||| | ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4586000 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagagttagaagagagaaaaacttgggaaatcaaaggatgtaactttagggttgaggctctttgattagagttc 4586098  T
Q  123 tcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgt 222  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  4586099 tcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgt 4586198  T
Q  223 tctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat-t 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4586199 tctttgtgaacttgttgaagctaattttttgtaacccatttttatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatat 4586298  T
Q  322 taggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    || ||||| || || ||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||    
T  4586299 tatgtcaacttggaccgaactgggtcgacaatctttcgtgtgtttgttcctctc 4586352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 24 - 375
Target Start/End: Original strand, 43864083 - 43864435
Alignment:
Q  24 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttc 122  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | || ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43864083 taagtgttctt-tgtagattttgaagaatagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattaaagttc 43864181  T
Q  123 tcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgt 222  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  43864182 tcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaagtgggtagaaattagggttgt 43864281  T
Q  223 tctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tt 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  43864282 tctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaacccatttgtatctctttgtaaaaactaattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagat 43864381  T
Q  322 taggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||    
T  43864382 taggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatagatggtgtgtttgttcctctc 43864435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 19 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31733303 - 31732946
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| | || | | ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31733303 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaagaaaagctggaagagagagaaacttgagaaatcaaaagaggtaactttagagttgagggtctttgattag 31733205  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||     
T  31733204 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagactgagaaaatgggtagaaattagg 31733105  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31733104 gttgttctttgtgagcttggtgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatactggattggagagatcaatctctcccc 31733005  T
Q  318 c-atttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    | | |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  31733004 caaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgagtttgttcctctc 31732946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 27 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 47674269 - 47673921
Alignment:
Q  27 gtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctct 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  47674269 gtgttctt-tgcagattttgaagaggagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaacttcaaggttgaaggtctttgattagagttctct 47674171  T
Q  126 tgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttct 225  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  47674170 tgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttct 47674071  T
Q  226 ttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatttagg 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |    
T  47674070 ttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccatattaag 47673971  T
Q  326 tcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    ||||||| || |||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  47673970 tcaagttggaccgaactgaatcaacaatctttggtgtgtttgttcctctc 47673921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 18 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 30025067 - 30024718
Alignment:
Q  18 actatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgatta 116  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30025067 actatataagtgttctt-tgcagattttgaatgagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgatta 30024969  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattag 216  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30024968 gagttctcttaggttgaaaaacgttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattag 30024869  T
Q  217 agttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
     ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30024868 ggttgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatcactccc 30024769  T
Q  317 cca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgttt 366  Q
    |||   ||||||||||| || |||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  30024768 ccagagtaggtcaagttggaccgaactggatcaacaatctttagtgtgttt 30024718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 36 - 375
Target Start/End: Original strand, 26417168 - 26417507
Alignment:
Q  36 tgcagattttgaaggagaggttgtagagaagaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgaga 135  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||  ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  26417168 tgcagattttgaagaagagcttgaagagat-aaacttgagaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttggattggga 26417266  T
Q  136 aacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaactt 235  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  26417267 aacattgtaaacaccttgagcgggtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagctt 26417366  T
Q  236 gttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatttaggtcaagtttga 335  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || ||    
T  26417367 gttgaagataatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctccccaggttaggtcaaattgga 26417466  T
Q  336 tcgaactgggtcaacaatctc-tggtgtgtttgttcatctc 375  Q
     | ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  26417467 ccaaactgggtcaacaatttcttggtgtgtttgttcctctc 26417507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Original strand, 23554874 - 23555226
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23554874 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaacttcagggttgaaggtctttgattag 23554972  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattgg-aaaaatgggtagaaattag 216  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  23554973 agttctcttgagttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattag 23555071  T
Q  217 agttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23555072 ggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgtacctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcct 23555171  T
Q  317 cca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    |||   |||||||||||| || |||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  23555172 ccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttgatgtgtttgtt 23555226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 67 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 38671508 - 38671205
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  38671508 aaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagcgaaaat 38671409  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  38671408 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaacacatttgta 38671309  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccc-atttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtt 365  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |  ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38671308 tcactttgtaagaactcattgatagtggattgaagagataaatctatcccccaaaataggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtt 38671209  T
Q  366 tgtt 369  Q
    ||||    
T  38671208 tgtt 38671205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Original strand, 35853749 - 35854101
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| || ||||||| |  | |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  35853749 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaagaagagcttgaagagagagaaacttaggaaatcaaaggtagcaactttagggtttagggtctttgatttg 35853847  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||     
T  35853848 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagg 35853946  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  35853947 gttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctc 35854046  T
Q  318 ca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctc-tggtgtgtttgtt 369  Q
    ||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  35854047 cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtgtttgtt 35854101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Original strand, 29990889 - 29991239
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  29990889 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggtgagtttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggagacaactttagggtttagggtctttgattag 29990987  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||     
T  29990988 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaa-ggatagaaattagg 29991085  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29991086 gttgttatttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttctaataactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctc 29991185  T
Q  318 ca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    ||   |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  29991186 cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 29991239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 113 - 375
Target Start/End: Original strand, 27347745 - 27348008
Alignment:
Q  113 attagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaa 212  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27347745 attagagttctcttaggttgggaaacattgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaa 27347844  T
Q  213 ttagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctc 312  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27347845 ttaggattgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgcagagatcaatctc 27347944  T
Q  313 tccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    |||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27347945 tcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctc 27348008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 67 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 41649295 - 41648994
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  41649295 aaacttgggaaatcaaaggagttaactttagggttaagg-tcttttattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtaagtgaaaat 41649197  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  41649196 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattggaaaaattggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtt-tagctaatttcttgtaacccatttgta 41649098  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccc-atttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtt 365  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41649097 tccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtt 41648998  T
Q  366 tgtt 369  Q
    ||||    
T  41648997 tgtt 41648994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 60 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 496276 - 495966
Alignment:
Q  60 agagaagaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgag 159  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  496276 agagaaaaaacttgggaaatcaaatgaggtaactttaaggttgagggtctttgattagagttctcttggattgggaaacattgtaaaaaccttgggtgag 496177  T
Q  160 tgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaaccc 259  Q
    |||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  496176 tgaaaatcatttagtgttttgttaatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtagttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgcaaccc 496077  T
Q  260 atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat-ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctg 358  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| ||    
T  496076 atttgtatctctttataagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccctatagtaggtcaagttggacagaaccgggtcaacaatctttg 495977  T
Q  359 gtgtgtttgtt 369  Q
    |||||||||||    
T  495976 gtgtgtttgtt 495966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 67 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 31105679 - 31105429
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31105679 aaacttgagaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattatagttatcttggggtgagaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 31105580  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31105579 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagattttttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 31105480  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  31105479 tctttttgtaagaactcattgatggtggattggagagataaatctctcccc 31105429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 65 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 41317735 - 41317417
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttg-------------ggttgagaaacattgtaaacacct 151  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||             ||||| ||||||||||||||||||    
T  41317735 agaaactagggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagggttctcttgaggggttctcttgggttgggaaacattgtaaacacct 41317636  T
Q  152 tgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttct 251  Q
    ||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  41317635 tggatgagtgaaaatcattgagtctcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttct 41317536  T
Q  252 tgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaac 350  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  41317535 tgtaatccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaac 41317436  T
Q  351 aatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  41317435 aatctttggtgtgtttgtt 41317417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 36 - 369
Target Start/End: Original strand, 19502028 - 19502364
Alignment:
Q  36 tgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgag 134  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||| | ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19502028 tgcagattttgaaggagagcttaaagagagacaaacttgagaaatcaaatgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttggg 19502127  T
Q  135 aaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattg-gaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaac 233  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||  |||||| ||||||| |    
T  19502128 aaacattgtaaacaccttg-gtgagtgagaatcattgagtgtcttgttcagtggtgagattgcgaaaaaaggttagaaattaaggttgttttttgtgagc 19502226  T
Q  234 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtt 332  Q
    ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||||||||    
T  19502227 ttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaagtcaagtt 19502326  T
Q  333 t-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    | || |||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  19502327 tggaacgaagtgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 19502364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 67 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 36146708 - 36146391
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgatta------------gag-ttctcttgggttgagaaacatt-gtaaacacctt 152  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||            ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  36146708 aaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagtgttgagggtctttgattatggttttcttgagaggttctcttgggttgggaaacatttgtaaacacctt 36146609  T
Q  153 gagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagag-ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttct 251  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  36146608 gggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtttgttatttgtgagcttgttgaagctaatttc- 36146510  T
Q  252 tgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat-ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaac 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||    
T  36146509 tgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatttgagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactaggtcaac 36146410  T
Q  351 aatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  36146409 aatctttggtgtgtttgtt 36146391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Original strand, 4178615 - 4178959
Alignment:
Q  25 aagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttct 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| | ||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4178615 aagtgttctt-tgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgagaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggtctttgattagagttct 4178713  T
Q  124 cttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgtt 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||    
T  4178714 cttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaggtagaaattagggttgtt 4178812  T
Q  224 ctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-ttt 322  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||        
T  4178813 ctttgtgaacttgggaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-aagaactcattgatagtggattgaacagttcaatctctcctccagagc 4178911  T
Q  323 aggtcaagtttg-atcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    |||||||||||| | | |||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  4178912 aggtcaagtttgaaccaaactaggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 4178959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 119 - 366
Target Start/End: Original strand, 8153276 - 8153524
Alignment:
Q  119 gttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagag 218  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  8153276 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgagtagaaattaggg 8153375  T
Q  219 ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccc 318  Q
    |||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8153376 ttgttctttgtgagattgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccc 8153475  T
Q  319 a-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgttt 366  Q
    |  |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8153476 agattaggtcaagttggactgaactgggtcaacaatctttggtgtgttt 8153524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 25767287 - 25766941
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattaga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||| | ||||||| |  | |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  25767287 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagagct-gaagagagagaaacttgagaaatcaaagggagcaactctagggtttagggtctttgattaga 25767189  T
Q  119 gtt-ctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||| ||||| ||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||     
T  25767188 gtttctctttgg----gaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg---agattggaaaaaagggtagaaattagg 25767097  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaa-cccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  25767096 gttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcct 25766997  T
Q  317 cca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctc-tggtgtgtttgtt 369  Q
    |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  25766996 ccagagtaggtcaagtttagaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtgtttgtt 25766941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Original strand, 39731211 - 39731555
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattaga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  39731211 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaag-agagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggtctttgattaga 39731309  T
Q  119 g-ttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||     
T  39731310 gcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattggaaaaa-gggtagaaattagg 39731400  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
    ||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  39731401 gttgttctttgtgaacttgtcagatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcct 39731500  T
Q  317 cca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    |||   |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  39731501 ccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtctttgtt 39731555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Original strand, 48408638 - 48408991
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattaga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||| ||||||| |  | |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  48408638 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaag-agagcg-gaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggtctttgattaga 48408735  T
Q  119 gtt-ctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||      
T  48408736 gtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattaat 48408834  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaa-cccatttgtatctc-tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  48408835 gttgttctttgtaaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgaaataactcattgatagtggattggagagtttaatctctcc 48408934  T
Q  316 ccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctc-tggtgtgtttgtt 369  Q
     |||   || ||||||||| || |||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  48408935 tccagagtatgtcaagtttagaccgaactgggtgaacaatttcttggtgtgtttgtt 48408991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 67 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 12098158 - 12097850
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagtt-------------ctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||             ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  12098158 aaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagggttttcttgagaggttctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttg 12098059  T
Q  154 agtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttg 253  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12098058 ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggttagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttg 12097959  T
Q  254 taacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaa 352  Q
    ||||||||||||||||||       ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  12097958 taacccatttgtatctct-------aactctttg-tagtggattggagagatgaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 12097867  T
Q  353 tctctggtgtgtttgtt 369  Q
    ||| |||||||||||||    
T  12097866 tctttggtgtgtttgtt 12097850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 139 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 2361185 - 2360960
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2361185 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 2361087  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatc 337  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||  | |    
T  2361086 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatttgagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaacc 2360987  T
Q  338 gaactgggtcaacaatctctggtgtgt 364  Q
    |||||||||||| || || ||||||||    
T  2360986 gaactgggtcaataacctttggtgtgt 2360960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 139 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 34310929 - 34310705
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  34310929 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaaattgtt 34310831  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagttt-gat 336  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||| ||     
T  34310830 gaagctaatttcttgtaacacatttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 34310731  T
Q  337 cgaactgggtcaacaatctctggtgt 362  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||    
T  34310730 cgaactgggtgaacaatctttggtgt 34310705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 65 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 4538828 - 4538627
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaa 164  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4538828 agaaacttgggaaatcaaaggaggtaattttaaggttgagagtctttgattagaattctcttgggttgggaaaaattgtaaacaccttgggtgagtgaaa 4538729  T
Q  165 atcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttg 264  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  4538728 atcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttatgaaattttttaagctaatttcttgtaacccatttg 4538629  T
Q  265 ta 266  Q
    ||    
T  4538628 ta 4538627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 143 - 370
Target Start/End: Original strand, 22269931 - 22270159
Alignment:
Q  143 taaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaag 242  Q
    ||||||||||| | ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22269931 taaacaccttgggagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaag 22270030  T
Q  243 ctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaac 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| || |||||    
T  22270031 ctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactgattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaac 22270130  T
Q  342 tgggtcaacaatctc-tggtgtgtttgttc 370  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  22270131 tgggtgaac-atctcttggtgtgtttgttc 22270159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 67 - 369
Target Start/End: Original strand, 25615745 - 25616039
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    |||||| || ||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25615745 aaacttaggaaatcaaaggagttaactttaaggttaagggtctttgattagagttctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagagaaaat 25615844  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||| ||||||||          ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25615845 cattgagtgtcttg----------agattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctatgtgcgcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgta 25615934  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgt 364  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||||||| || |||||||||  |||||||| ||||||||    
T  25615935 tcattttgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggcgaacaatctttggtgtgt 25616034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 67 - 295
Target Start/End: Original strand, 31518677 - 31518905
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    |||||| || ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  31518677 aaactttggaaatcaaaggagataactttagggttaagggtctttgattatggttcttttgggttggaaaacatcgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 31518776  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31518777 catcgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaataggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttattgaagctagtttcttgtaactcatttgta 31518876  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtgga 295  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31518877 tctctttgtaagaactcattgacagtgga 31518905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 65 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 4253818 - 4253565
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaaca-ttgtaaacaccttgagtgagtgaa 163  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  4253818 agaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtatttggtgagggttctcttgggttggaaaacatttgtaaacaccttaggtgagtgaa 4253719  T
Q  164 aatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagag-ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatt 262  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  4253718 aatcattgagtttcttgttcattggtgaaattggtaaaat-ggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcatgtaacccttt 4253620  T
Q  263 tgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  4253619 tatatctctttggaaagaactcattgataatggattagagagatcaatctctccc 4253565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 139 - 315
Target Start/End: Original strand, 6431926 - 6432101
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  6431926 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggttagattgggaaaatgggtagaaattaggattgttctttgtgagcttgtt 6432024  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6432025 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctcc 6432101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 139 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 4508919 - 4508746
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  4508919 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttgattggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggttgttctttgtgagcttatt 4508821  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctct 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4508820 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgagagtggattggagagatcaatctct 4508746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 139 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8359530 - 8359354
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  8359530 attgtaaacaccttgagagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggggagattgggaaaatgggtagaaattagggtttttctttgtgagcttgtt 8359432  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaaccca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
     || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8359431 taaactaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 8359354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 139 - 357
Target Start/End: Original strand, 2390237 - 2390455
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||  | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2390237 attgtaaacaccttgggagagcgaaaatcataag-tgtcttgttcattggtgaaattcgaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 2390335  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| || |    
T  2390336 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaataactcatatatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 2390435  T
Q  338 gaactgggtcaacaatctct 357  Q
    ||||| ||| || |||||||    
T  2390436 gaactaggtgaataatctct 2390455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 139 - 343
Target Start/End: Original strand, 29608691 - 29608896
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |   || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29608691 attgtaaacaccttgagagagcgaaacttcatgagtgtcttgttctttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 29608790  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatc 337  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||   ||||||||||| || |    
T  29608791 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatcactcctccagagtaggtcaagttggacc 29608890  T
Q  338 gaactg 343  Q
    ||||||    
T  29608891 gaactg 29608896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 139 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 48599547 - 48599372
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  48599547 attgtaaacaccttggaggagtgaaaatcat-gattgtcttgttcattggtgatattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 48599449  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48599448 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttggaagagctcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 48599372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2761636 - 2761439
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  2761636 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagataaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgatgatatttgattag 2761538  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattag 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  2761537 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacacattgggtgagtgaaaatcatcgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattag 2761439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 67 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 24526183 - 24525985
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24526183 aaactagggaaatcaaaggagataactttagggttgagggtctttgattatggttctcttaggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 24526084  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaatta-gagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttg 264  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  24526083 cattgagtgtcttgttcattggtgaaattgggaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttg 24525985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 77 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 36574792 - 36574558
Alignment:
Q  77 aatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacatt-gtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtg 175  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||  |||||||||||| || | |||    
T  36574792 aatcaaaggaggtaactttagggttgacggtctttgatgagggttctcttgggttggaaaacatttgtaaacaccttaggtgagtgaaaattatcgagtg 36574693  T
Q  176 tcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaatta-gagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttg 274  Q
    ||||||| ||||| ||||||||  |||  ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  36574692 tcttgtttattggagagattggggaaa--ggtagaaattaagatttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacccttttatatctctttg 36574595  T
Q  275 t-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatc 310  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36574594 taaagaactcattgatagtggtttggagagatcaatc 36574558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 65 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23565348 - 23565100
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacatt-gtaaacaccttgagtgagtgaa 163  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||   ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23565348 agaaacttgggatatcaaaggaggtaactttagg-ttaagggtctttgattag-gttctcttggtttagaaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaa 23565251  T
Q  164 aatcattgggtgtcttgttcattggtgagattgg--aaaaatgggtagaaattagag-ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaaccca 260  Q
     || |    ||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |     
T  23565250 catgaa---gtgtcttgttcattggtgagattaggaaaaaataggtagaaattaggtcttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaactct 23565154  T
Q  261 tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23565153 tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 23565100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 139 - 351
Target Start/End: Original strand, 3258949 - 3259162
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||   || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  3258949 attgtaaacaccttgggaaagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaactagggttgttctttgtgagcttgtt 3259048  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatc 337  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||  | |    
T  3259049 taagctaatttattgtaactcatttgtatctctttgtaaaaacccattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttgaacc 3259148  T
Q  338 gaactgggtcaaca 351  Q
    ||||||||| ||||    
T  3259149 gaactgggtgaaca 3259162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 24515094 - 24514912
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  24515094 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggggagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggtctttgattag 24514996  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24514995 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaa 24514912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 65 - 316
Target Start/End: Original strand, 23343854 - 23344106
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaa-caccttgagtgagtgaa 163  Q
    |||| |||||| ||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||  ||| ||||||| |||||||||    
T  23343854 agaatcttgggaaatcaaaggatgtaactttagggtcgagagtctttgattagggttctcttaggtttggaaacatttcaaaacaccttgggtgagtgaa 23343953  T
Q  164 aatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttg-ttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatt 262  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23343954 aatcattgaatgtctagttcattggtgagatttggaaaa-gggtagaaattaaggtttattctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttt 23344052  T
Q  263 tgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
     |||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||    
T  23344053 agtatatctttgtgagaactcattgataatagattggagaaattaatctctccc 23344106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 139 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 4510761 - 4510586
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||  || ||    
T  4510761 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgccttgttgattggtgagatttggaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgagtttatt 4510663  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  4510662 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttataagaactcattgatagtggattgaagaaatcaatctctcc 4510586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 139 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 4512603 - 4512428
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||  || ||    
T  4512603 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgccttgttgattggtgagatttggaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgagtttatt 4512505  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  4512504 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttataagaactcattgatagtggattgaagaaatcaatctctcc 4512428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 43504481 - 43504135
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattaga 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| || | | | ||||| ||||||||||| ||||||| |  | |||| ||||||| || |||||||||||||    
T  43504481 tatttaagtgttcctgtgcagattt-gaagaagggttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagagtctttgattaga 43504383  T
Q  119 g-ttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    | ||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||  ||| ||||||||| | ||||||||       |||||||||| |||| |||||||||||||     
T  43504382 gcttctcttggcttgggaaacatgggaaacaccttgaa-gagagaaaatcatcgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagg 43504292  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    ||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  43504291 gttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtgaattggagagttcaatctctcc 43504192  T
Q  316 cccat-ttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctc-tggtgtgtttgtt 369  Q
     ||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  43504191 tccatagtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgtt 43504135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 211 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 2759339 - 2759183
Alignment:
Q  211 aattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatc 310  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2759339 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttatatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatc 2759240  T
Q  311 tctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgttt 366  Q
    ||| |||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  2759239 tcttccccagattaggtcaagttggaccgaacttggtcaacaatcattggtgtgttt 2759183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 228 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 6360077 - 6359951
Alignment:
Q  228 gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat-ttaggt 326  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  6360077 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagttgattggagagatcaatctcttccccatattaggt 6359978  T
Q  327 caagtttgatcgaactgggtcaacaat 353  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  6359977 caagttggatcgaactgggtcaacaat 6359951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 218 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 32358189 - 32358055
Alignment:
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32358189 gttgtgctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctc 32358090  T
Q  318 ca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaaca 351  Q
    ||   ||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  32358089 cagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 32358055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 139 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22328611 - 22328426
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgtt----cattggtgagattggaaa-aatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaa 232  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    |||| | |||||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||     
T  22328611 attgtaaacaccttgagggaatgaaaatcattgagtgtcttgtttgttcattagagagattgggaagaaaggttagaaattagagtttgttctttgtgag 22328512  T
Q  233 cttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22328511 cttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgcaaggaagtcattaatagtggatttgagagatcaatctctcccc 22328426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 259 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 24525596 - 24525485
Alignment:
Q  259 catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| |    
T  24525596 catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaagttggacggaactgggtcaataatcttt 24525497  T
Q  358 ggtgtgtttgtt 369  Q
    ||||||||||||    
T  24525496 ggtgtgtttgtt 24525485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 193 - 369
Target Start/End: Original strand, 31518911 - 31519088
Alignment:
Q  193 attggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagt 292  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| ||||| ||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31518911 attgggaaaataggtagaaattaggtttgttctctgtgagcttattgaagctagtt-cttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgacagt 31519009  T
Q  293 ggattggagagatcaatctctc-cccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||| || |||||||| | |||| |   |||||||||||||    
T  31519010 ggattggagagatcaatctctctccccagagtaggtcaagttggaccgaactggataaacatttcttggtgtgtttgtt 31519088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 357
Target Start/End: Original strand, 20343741 - 20344070
Alignment:
Q  25 aagtgttcttgtgcagattttgaag-gagaggtt--gtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagag 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||||| |  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  20343741 aagtgttcttgtgcagattt-gaagagagagttttggaagagagagagacttggggaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagag 20343839  T
Q  120 t-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagag 218  Q
    | ||||||||||||| |||||| | ||||||||||    || || |||||||| ||||||||       |||||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  20343840 tatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattaggg 20343929  T
Q  219 tt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20343930 tttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcc 20344027  T
Q  316 cccatt-taggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
     |||   ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  20344028 tccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacaatctct 20344070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 279 - 370
Target Start/End: Original strand, 30814530 - 30814621
Alignment:
Q  279 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat-ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  30814530 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaat-tttggtgtgtttgttc 30814621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Original strand, 24789689 - 24790028
Alignment:
Q  25 aagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-t 121  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||| ||| ||||||| ||||||| |  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  24789689 aagtgttcttgtgcatcttt-gaaggagaggttgga-agagagagacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtat 24789786  T
Q  122 ctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt- 220  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||||       || ||||||| |||| ||||| ||||||| |||     
T  24789787 ctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtaagattgggaaaa-gggtaaaaattagggttt 24789876  T
Q  221 gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca 319  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |  |||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | |||||||| |||    
T  24789877 gttcattgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaa-cattttgtatcccttttgtaaaaactctttgatagtggattggagagtactatctctcctcca 24789975  T
Q  320 -tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctc-tggtgtgtttgtt 369  Q
       |||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  24789976 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgtt 24790028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 234 - 320
Target Start/End: Original strand, 5116653 - 5116740
Alignment:
Q  234 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat 320  Q
    ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5116653 ttgttgaagataatttattgtaaaccttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtgaattggagagataaatctctcccccat 5116740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 120 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5514243 - 5514113
Alignment:
Q  120 ttctcttgggttgagaaaca-ttgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaatta-ga 217  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||   |||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||| | |||||||||| |     
T  5514243 ttctcttgggttgggaaacacttgtaaacaccttcgatgagtgaaaatcattgagtttcttgttcatttgagagatt-gaaaaaagagtagaaattatgt 5514145  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaattt 249  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5514144 tttgttctttgtgagcttgttgaagctaattt 5514113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 2580757 - 2580622
Alignment:
Q  18 actatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgatta 116  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |   |||| |||||||||||||||||||| |||||||  |     
T  2580757 actatttaagtgtttctttgcagattttgaagtagaggttttagagagagaaacttggattg-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtgtg 2580659  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  2580658 aggttctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttg 2580622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 120 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3904851 - 3904654
Alignment:
Q  120 ttctcttgggttgagaaacatt-gtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggt-gagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| || |||||||| | ||  |||||||| ||||||| ||||||||||     
T  3904851 ttctcttgagttaagaaacatttgtaaacaccttgggcgagtgaaa-tcattgagtctcttgttcttaggaagagattgggaaaatgg-tagaaattagg 3904754  T
Q  218 gtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
     || |||||||| || | | |||||  |||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  3904753 ttttgttctttgagagcctattgaatgtaatttcttgtaacacttttgcatctctttgtaaagaactcattgatagt-gatcagagagatcaatctctcc 3904655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21989275 - 21989140
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||| | | |||| |||||||||||||| ||||| ||||||| | |     
T  21989275 ctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagtgagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttaggtttgagtgtctttgtagtg 21989177  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21989176 aggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 21989140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 152
Target Start/End: Original strand, 6570430 - 6570561
Alignment:
Q  22 tttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagagaagaaa-cttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagt 120  Q
    ||||||||||  | |||| |||||||||||||| ||  ||||  |||| |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||    
T  6570430 tttaagtgtttctttgcatattttgaaggagagcttaaagaggggaaaacttgagaaatcaaaggaggtaactttaggattgagtgtctttgactagggt 6570529  T
Q  121 tctcttgggttgagaaacattgtaaacacctt 152  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6570530 tctcttggggtgggaaacattgtaaacacctt 6570561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 6592661 - 6592334
Alignment:
Q  23 ttaagtgttcttgtgcagattttgaag-gagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagag 119  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||| ||| ||||||| ||||||| | || | || ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  6592661 ttaagtgttcttgtgcagattt-gaagagagaggttgga-agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagag 6592565  T
Q  120 t-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagag 218  Q
    | ||||||||||||| |||||| | ||||||||||    || || |||||||| ||||||||       |||||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  6592564 tatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaa-tgggtagaaattaggg 6592477  T
Q  219 tt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctc 314  Q
    || |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||    
T  6592476 tttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctc 6592379  T
Q  315 cccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    | |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  6592378 ctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 6592334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 49092056 - 49091921
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| | |     
T  49092056 ctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttaaggttgagtgtctttgtactg 49091958  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | | |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  49091957 aggatatcttgggttgggaaacattgaaaacaccttg 49091921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 153
Target Start/End: Original strand, 33332197 - 33332315
Alignment:
Q  36 tgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-attagagttctcttgggttga 133  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| || |||| | ||  |||||||||||||||    
T  33332197 tgcagattttgaaggagagctttgagagatagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtttttgtagtaaggttctcttgggttga 33332295  T
Q  134 gaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  33332296 gaaacattgtaaacatcttg 33332315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20284457 - 20284321
Alignment:
Q  18 actatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-att 115  Q
    ||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  20284457 actatataagtgtttctttgcaaattttgaaggagagttttgagagagagaaacttggattat-aaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagt 20284359  T
Q  116 agagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20284358 gaggttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 20284321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 44847855 - 44847990
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||  | |||| ||| ||||| |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |     
T  44847855 ctatataagtgttcttgtgtagattttggtgaagagcttgaagagagagaaacttggattat-aaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtg 44847953  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44847954 aggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 44847990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 2479698 - 2479568
Alignment:
Q  24 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtcttt-gattagagtt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| |||||||||| | | |||| |||| ||||||||||||||| ||||||  | |   | |    
T  2479698 taagtgttcttgtgcagattttggagaagagcttgaagagagagaaacttggatta-caaaggagggaactttagggttgagtgtctttatagtgaggat 2479600  T
Q  122 ctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2479599 ctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 2479568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 6594877 - 6594552
Alignment:
Q  23 ttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||| ||| ||||||| ||||||| | || | || ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6594877 ttaagtgttcttgtgcagattt-gaag-agaggttgga-agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagt 6594782  T
Q  121 -tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagt 219  Q
     ||||||||||||| |||||| | ||||||||||    || || |||||||| ||||||||       |||||||||| |||  ||||||||||||| ||    
T  6594781 atctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggt 6594694  T
Q  220 t-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    | |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  6594693 ttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcc 6594596  T
Q  316 ccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
     |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  6594595 tccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 6594552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 153
Target Start/End: Original strand, 2647433 - 2647562
Alignment:
Q  25 aagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-attagagttc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||   | |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| | |   | ||    
T  2647433 aagtgttcttgtgcagattttgaaggagagattttagagagagaaacttggacta-caaaggagataactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatc 2647531  T
Q  123 tcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  2647532 tcttgggttgggaaacatggtaagcaccttg 2647562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18388929 - 18388754
Alignment:
Q  185 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 281  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||| ||||    
T  18388929 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaac 18388833  T
Q  282 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  18388832 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 18388754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18392365 - 18392190
Alignment:
Q  185 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 281  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||| ||||    
T  18392365 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaac 18392269  T
Q  282 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  18392268 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 18392190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 153
Target Start/End: Original strand, 23402765 - 23402878
Alignment:
Q  42 ttttgaaggagaggttgt-agaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagag-ttctcttgggttgagaaac 138  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| |||||||    ||| ||||||||||||| |||||    
T  23402765 ttttgaaggagaggttttgagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttgggaaac 23402863  T
Q  139 attgtaaacaccttg 153  Q
    |||||||||||||||    
T  23402864 attgtaaacaccttg 23402878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 30843467 - 30843389
Alignment:
Q  119 gttctcttgggttgagaaacatt-gtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  30843467 gttctcttgggttgagaaacatttgtaaacaccttagatgagttaaaatcattgagtatcttgttcattggagagattg 30843389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 79756 - 79662
Alignment:
Q  18 actatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg 112  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||| | ||||| |||||||    
T  79756 actatatatgtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttaagattgagtgtctttg 79662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 46516038 - 46516170
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagagaagaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-attag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |      
T  46516038 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggggagcttagagaga-gaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtga 46516134  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
     | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  46516135 ggatctcttgagttgggaaacattgtaaacaccttg 46516170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 1360361 - 1360226
Alignment:
Q  144 aaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattgg-tgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaag 242  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||| || |||||||||| |  ||||||||| |||| || ||||||||||  ||  |||| | |||||||||||||    
T  1360361 aaacacctttggtgagtgaaa-tcattgagtctcttgttcatggaatgagattgggaaaaagg-tagaaattaggttttgtcttggagaacttgttgaag 1360264  T
Q  243 ctaatttcttgtaaccc--atttgtatctctttgtaag 278  Q
    | |||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  1360263 cgaatttcttgtaacccttttttgtatctctttgtaag 1360226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Original strand, 9184965 - 9185039
Alignment:
Q  80 caaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-attagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||| | ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9184965 caaaggaggtaactttagggttgagtatctttgtagtaaggttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 9185039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 315
Target Start/End: Original strand, 18396393 - 18396448
Alignment:
Q  261 tttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18396393 tttgtatctctttataaagaattcattgatagaggattggagagatcaatctctcc 18396448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1560749 - 1560647
Alignment:
Q  271 tttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctc-tggtgtgttt 366  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||   |||||||||||| || |||||||||| | ||||||| |||||| |||    
T  1560749 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtaaccaatctcttggtgtattt 1560650  T
Q  367 gtt 369  Q
    |||    
T  1560649 gtt 1560647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 1562330 - 1562103
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagag-gttgta-gaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggt-ctttgatt 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||| ||| ||||||| ||||||| | || | || ||||||| ||||| ||||||||    
T  1562330 tatttatgtgttcttgtgcagattt-gaaggagagagttggaagagagagagacttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgatt 1562233  T
Q  116 agagt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaatt 214  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||    || || |||||||| ||||||||       |||||||||| |||| |||||||||||    
T  1562232 agagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaatt 1562145  T
Q  215 agagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaa 256  Q
    || ||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1562144 agggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa 1562103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 32060493 - 32060316
Alignment:
Q  185 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc---tttgtaa-ga 279  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |   ||||||| ||    
T  32060493 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccctttttgtaaaga 32060397  T
Q  280 actcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||   |||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||    
T  32060396 actcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaatctct 32060316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 43363622 - 43363518
Alignment:
Q  205 ggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc--tttgt-aagaactcattgatagtggattggag 301  Q
    ||||||||||||  |||||||| | || ||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| | ||||     
T  43363622 ggtagaaattaggtttgttcttggagagcttgttgaaactaatttattgtaactcttttgtatctctatttgtaaataactcattgatagtgaagtggat 43363523  T
Q  302 agatc 306  Q
    |||||    
T  43363522 agatc 43363518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Original strand, 9189797 - 9189872
Alignment:
Q  80 caaacgaggtaactttagggttgagggt-ctttg-attagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| || ||||| | ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9189797 caaaggagataactttagggttgagtgttctttgtagtaaggttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 9189872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 18414016 - 18413982
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagag 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18414016 tatttaagtgttcttgtgcagattttggaggagag 18413982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 370
Target Start/End: Original strand, 33332499 - 33332560
Alignment:
Q  309 tctctcccccat-ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttc 370  Q
    |||||||||||  ||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33332499 tctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatct-tggtgtgtttgttc 33332560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 153
Target Start/End: Original strand, 9235414 - 9235447
Alignment:
Q  120 ttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9235414 ttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 9235447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 27073868 - 27073925
Alignment:
Q  237 ttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 293  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  27073868 ttgaagttaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcgttgacagtg 27073925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 27204445 - 27204388
Alignment:
Q  237 ttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 293  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  27204445 ttgaagttaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcgttgacagtg 27204388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 352
Target Start/End: Original strand, 42223403 - 42223447
Alignment:
Q  309 tctctcccccatt-taggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaa 352  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42223403 tctctcccccatactaggtcaattttgatcgaactgggtcaacaa 42223447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 89)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 19 - 375
Target Start/End: Original strand, 38312074 - 38312431
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38312074 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaatttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggttctttgattag 38312172  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  38312173 agttctcttgggttgggaaacattgtatacaccttgtgtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg 38312272  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38312273 gttgttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagatctcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 38312372  T
Q  318 ca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    ||  ||| |||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  38312373 cagattatgtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttgatgtgtttgttcctctc 38312431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 19 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 17057703 - 17057346
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || || ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17057703 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagtttgaagagagagaaaatttggaaatcaacggaggtaactttagggttgaaggtctttgattag 17057605  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17057604 agttctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagg 17057505  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17057504 gttgttctttgcaagcttgttgaagctaattttttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 17057405  T
Q  318 ca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    ||   ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17057404 cagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctc 17057346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 19 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 17085686 - 17085329
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || || ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17085686 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagtttgaagagagagaaaatttggaaatcaacggaggtaactttagggttgaaggtctttgattag 17085588  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17085587 agttctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagg 17085488  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17085487 gttgttctttgcaagcttgttgaagctaattttttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 17085388  T
Q  318 ca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    ||   ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17085387 cagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctc 17085329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 19 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 36318343 - 36317987
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36318343 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagaggtaaaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaatgtctttgattag 36318245  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36318244 agttatcttgggttgggaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagg 36318145  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36318144 gttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccct 36318045  T
Q  318 ca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatct 374  Q
     |   ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  36318044 tagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtttatct 36317987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 67 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 724030 - 723727
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  724030 aaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttcttttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 723931  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  723930 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattggaaaactgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgta 723831  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtt 365  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  723830 tccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtt 723731  T
Q  366 tgtt 369  Q
    ||||    
T  723730 tgtt 723727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 2334751 - 2334400
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2334751 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtatttgattag 2334653  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||     
T  2334652 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaataagg 2334554  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2334553 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttctagtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctc 2334454  T
Q  318 ca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    ||   |||||||||||| || |||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  2334453 cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggggaacaatctttggtgtgtttgtt 2334400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Original strand, 29867703 - 29868054
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||  ||||| |||||||| || |||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  29867703 ctatataagtgttctt-tgcagtttttgaaagagagcttaaagagagagaaactttgggaatcaaagaaggtaactattgggttgagggtctttgattag 29867801  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  29867802 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg 29867901  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29867902 gttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccc 29868001  T
Q  318 c-atttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    | | |||||||||||| || ||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  29868002 caaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaataatctttgatgtgtttgtt 29868054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 67 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 11151877 - 11151574
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11151877 aaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 11151778  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11151777 cattgagtctcttgttcattggtgaaattgggaaaatgggtagaaattagatttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgta 11151678  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtt 365  Q
    || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11151677 tcactttgtaagaactcttagatagtggattggagagatcaacctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtt 11151578  T
Q  366 tgtt 369  Q
    ||||    
T  11151577 tgtt 11151574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 36988409 - 36988058
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36988409 ctatataagtgttctt-tgcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattag 36988311  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  36988310 agttctcttgggttgggaaacatagtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgggattggaaaaaagggtagaaattagg 36988212  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    |||||||| ||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36988211 gttgttctatgtgagcttgtcaaaactaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctc 36988112  T
Q  318 ca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    ||   |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  36988111 cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 36988058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 67 - 369
Target Start/End: Original strand, 42362234 - 42362533
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42362234 aaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 42362333  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42362334 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgta 42362433  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtt 365  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    | || ||||||||||||||| |||||||||    
T  42362434 tccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatctatctctcccccagattaggtcaagt----tggacctgggtcaacaatctttggtgtgtt 42362529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 67 - 366
Target Start/End: Original strand, 11690383 - 11690683
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11690383 aaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattatagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 11690482  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11690483 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgta 11690582  T
Q  267 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat-ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtt 365  Q
    || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  11690583 tccctttgtaagaaatcgttgatagtggattggagagatcaacctctcccccatattacgtcaagttggaccgaactggatcaacaatctttggtgtgtt 11690682  T
Q  366 t 366  Q
    |    
T  11690683 t 11690683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 67 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 34140057 - 34139753
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34140057 aaacttggaaaatcaaaggaggtaactttagggttgaaagtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 34139958  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  34139957 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatatgta 34139858  T
Q  267 tctc-tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgt 364  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34139857 tcccttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 34139758  T
Q  365 ttgtt 369  Q
    |||||    
T  34139757 ttgtt 34139753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 6595340 - 6594988
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6595340 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttaggaaatcaaatgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 6595242  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagatt-ggaaaaatgggtagaaattag 216  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  6595241 agttctcttgggctgggaaaaattgtaaacactttg-gagagtgagaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattaggaaaaaatggtagaaattag 6595143  T
Q  217 agttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6595142 ggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgaatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctcct 6595043  T
Q  317 cca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    |||   |||||||||||| || ||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  6595042 ccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaatctttggtgtgtttgtt 6594988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 65 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 33162738 - 33162433
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaa 164  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  33162738 agaaacttgggaaatcaaaggaggtaattttagggttgagggtctttgattagggttctcttgagttgggaaacattgtaaacaccttgggtgattgaaa 33162639  T
Q  165 atcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttg 264  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33162638 atcatcgagtgtcttgttcattggtgaaattaggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttg 33162539  T
Q  265 tatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtg 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||    
T  33162538 tatctctctgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaatctttggtgtg 33162439  T
Q  364 tttgtt 369  Q
    ||||||    
T  33162438 tttgtt 33162433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 67 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14634112 - 14633808
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14634112 aaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagagttgagggtttttgattagagttcttttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 14634013  T
Q  167 cattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 266  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14634012 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattggtaaaatgggtagaaattaggattgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgta 14633913  T
Q  267 tctc-tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgt 364  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14633912 tcccttttgtaagaactcatagatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgagtcaacaatctttggtgtgt 14633813  T
Q  365 ttgtt 369  Q
    |||||    
T  14633812 ttgtt 14633808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Original strand, 45099589 - 45099940
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  45099589 ctatataagtgttctt-tgtagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggtctttgattag 45099687  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagatt-ggaaaaatgggtagaaattag 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  45099688 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattag 45099786  T
Q  217 agttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  45099787 ggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcct 45099885  T
Q  317 cca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    |||   |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  45099886 ccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 45099940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 5723588 - 5723238
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  5723588 ctatataaatgttctt-tgcagattttgaagaagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttggggtctttgattag 5723490  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||     
T  5723489 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaa-gggtagaaattagg 5723392  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5723391 cttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacctttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctc 5723292  T
Q  318 ca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
     |   ||||| |||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5723291 tagagtaggttaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 5723238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 4503467 - 4503115
Alignment:
Q  18 actatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgatta 116  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||| ||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4503467 actatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagctagaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttaggttctttgatta 4503369  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagatt-ggaaaaatgggtagaaatta 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||    
T  4503368 gagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggagagattgggaaaaaatggtagaaatta 4503270  T
Q  216 gagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4503269 gggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcc 4503171  T
Q  316 ccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
     |||   |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  4503170 tccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 4503115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 65 - 369
Target Start/End: Original strand, 36773429 - 36773747
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttc-------------tcttgggttgagaaacattgtaaacacct 151  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||             |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36773429 agaaactagggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagggttctcttgaggggttctcttgggttgggaaacattgtaaacacct 36773528  T
Q  152 tgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttct 251  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36773529 tgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggaataaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttct 36773628  T
Q  252 tgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaac 350  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  36773629 tgtaactcatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaagttggaccgaactgggtcaac 36773728  T
Q  351 aatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  36773729 aatctttggtgtgtttgtt 36773747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 24 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 36205992 - 36205647
Alignment:
Q  24 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttc 122  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36205992 taagtgttctt-tgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggtctttgattagagttc 36205894  T
Q  123 tcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgt 222  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||    
T  36205893 tcttgggttgggaaacatggtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggttgt 36205795  T
Q  223 tctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tt 321  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| |||       
T  36205794 tctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg-aagaactcattgacagcggattggagagttcaatctatcctccagag 36205696  T
Q  322 taggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  36205695 taggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 36205647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 4484664 - 4484312
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattaga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | | ||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  4484664 tatttaagtgttcttgtgcagattt-gaaagagagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggtctttgattaga 4484566  T
Q  119 g-ttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaa-aaatgggtagaaattag 216  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||||||||    
T  4484565 gcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtgaaattgggagaaaagggtagaaattag 4484468  T
Q  217 agttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4484467 ggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcc 4484368  T
Q  316 ccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
     |||   |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  4484367 tccagagtaggtcaagtttggacagaactgggtgaacaatctttggtgtctttgtt 4484312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 128 - 369
Target Start/End: Original strand, 11067248 - 11067490
Alignment:
Q  128 ggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttcttt 227  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  11067248 ggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgaaattggaaaaatgggtagaaattagtgttgtacttt 11067347  T
Q  228 gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggt 326  Q
    |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  11067348 gtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcatttataatggattgaagagatcaatctctcccccagattaggt 11067447  T
Q  327 caagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  11067448 caagttggaccgaactcggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 11067490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Original strand, 30833180 - 30833532
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagagaa-gaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattaga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | | |||||| |||||||||| ||||||| |  |||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  30833180 tatttaagtgttcttgtgcagattt-gaaggtgagctggaagagaaagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggtttttgattaga 30833278  T
Q  119 g-ttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaa-aaatgggtagaaattag 216  Q
    | || |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  30833279 gcttatcttgggttgggaaacattgtaaacactttg-gtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtgagattgggagaaaagggtagaaattag 30833376  T
Q  217 agttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
     ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30833377 ggttgttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcc 30833476  T
Q  316 ccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
     |||   |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  30833477 tccagagtaggtcaagtttggactgaactgggtgaacaatctttggtgtctttgtt 30833532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 39284719 - 39284929
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39284719 ctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagaggttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattag 39284817  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39284818 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtatcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagg 39284917  T
Q  218 gttgttctttgt 229  Q
    |||| |||||||    
T  39284918 gttgctctttgt 39284929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 139 - 351
Target Start/End: Original strand, 45726884 - 45727096
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45726884 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttattcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgtt 45726982  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatc 337  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| || |    
T  45726983 gaagctaatttcttgtaacctatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 45727082  T
Q  338 gaactgggtcaaca 351  Q
    ||||||||| ||||    
T  45727083 gaactgggtgaaca 45727096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 139 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1631945 - 1631741
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  1631945 attgtaaacaccttgagagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaggattgttctttgtgagcttgtt 1631847  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatc 337  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   ||||||||||| || |    
T  1631846 gaagctaatatcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 1631747  T
Q  338 gaactg 343  Q
    ||||||    
T  1631746 gaactg 1631741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 67 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14202693 - 14202448
Alignment:
Q  67 aaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14202693 aaacttgggaaatcaaatgaggtaactttatggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 14202594  T
Q  167 catt--gggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttg 264  Q
     |||  | ||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||       
T  14202593 tattgagtgtgtctttttcatttctgagattgggaaaatgggtagaaattatgtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcat--- 14202497  T
Q  265 tatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
         ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14202496 ----cctttgtaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcccc 14202448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Original strand, 32289407 - 32289738
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattaga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  32289407 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaagg-gagatggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagtctttgattaga 32289505  T
Q  119 g-ttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga 217  Q
    | ||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||  |||||||||||||     
T  32289506 gcttctcttgggtttggaaacatggtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattggaaaa--gggtagaaattagg 32289595  T
Q  218 gttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||     
T  32289596 gttgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtaaattagagagatcaatctctcct 32289695  T
Q  317 cca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  32289696 ccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 32289738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 139 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 35447097 - 35446885
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  35447097 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattggtaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgatcttgtt 35446999  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatc 337  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   ||||||||||| || |    
T  35446998 gaatctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcactctctcctccagagtaggtcaagttggacc 35446899  T
Q  338 gaactgggtcaaca 351  Q
    ||||||||| ||||    
T  35446898 gaactgggtgaaca 35446885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 139 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 42288323 - 42288114
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  42288323 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcac-gagtgtcttgtgcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgagcttgtt 42288225  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatttaggtcaagtttgatcg 338  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| || ||    
T  42288224 gaagctaatttattgtaacccatttgtatttctttgtaagagctcattgataatggattggagagatcaatctctccccagattaggtcaagttggaccg 42288125  T
Q  339 aactgggtcaa 349  Q
    |||||||||||    
T  42288124 aactgggtcaa 42288114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 107 - 287
Target Start/End: Original strand, 24885583 - 24885763
Alignment:
Q  107 tctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatggg 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||| |||||| |    
T  24885583 tctttgattagagttctcatgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtaaaattgggaaaatgag 24885682  T
Q  207 tagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattg 287  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  24885683 tagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtacccctctgtaagaactcattg 24885763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 120 - 315
Target Start/End: Original strand, 13121703 - 13121897
Alignment:
Q  120 ttctcttgggttgagaaacatt-gtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagag 218  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |    
T  13121703 ttctcttgggttgggaaacatttgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagactgggaaaat-ggtagaaattaggg 13121801  T
Q  219 -ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
     ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  13121802 tttgttctttgtgagcttgttgaagataatttcttgtaacc--tttgtatctctttgtagaaactcattgatagtggattgaagaaatcaatctctcc 13121897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 119 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 7815508 - 7815311
Alignment:
Q  119 gttctcttgggttgagaaacatt-gtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattg-gaaaaatgggtagaaattag 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||    
T  7815508 gttctattgggttgagaaacatttgtaaacaccttaggtgggtgaaaatcattgcgtgtcttgttcattggtgagattgagaaaaa--ggttgaaattag 7815411  T
Q  217 agtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
     ||| |||||||   | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  7815410 ggtttgttctttagaagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcatttatagtggattggagagattaatctctcc 7815311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 157 - 320
Target Start/End: Original strand, 24398027 - 24398193
Alignment:
Q  157 gagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattg-gaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgt 254  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24398027 gagtgaaaatcaatgagtgtcttgttcattggtgagattgtgaagaaagggtagaagttaaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgt 24398126  T
Q  255 aacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat 320  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24398127 aacccttttgtatctctttgtaaagaactcattgataatggattggagagatcaatctctcccccat 24398193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 144 - 362
Target Start/End: Original strand, 17450550 - 17450755
Alignment:
Q  144 aaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagc 243  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  17450550 aaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagatttgaaaaatgggtagagattaggcttgttctttgtgagcttgttgaagc 17450649  T
Q  244 taatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatttaggtcaagtttgatcgaactg 343  Q
    |||||| |||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| || ||||||     
T  17450650 taattt-ttgtaacccatttgt------------gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccacagagtaggtcaagttggaccgaacta 17450736  T
Q  344 ggtcaacaatctctggtgt 362  Q
    ||| |||||||| ||||||    
T  17450737 ggtgaacaatctttggtgt 17450755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 119 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 17490376 - 17490184
Alignment:
Q  119 gttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagag 218  Q
    ||||||||| ||||  |||||||| ||||||  || ||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||        
T  17490376 gttctcttgagttggaaaacattgcaaacacagtgggtgggtgaaaatcattgaatgtcttgttcattgttgagattggaaaat--ggtagaaatt---- 17490283  T
Q  219 ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17490282 ttattctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtaactctttgtaagaactcattgatagtggattgtagagatcaatctctcccc 17490184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 77 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 12123861 - 12123644
Alignment:
Q  77 aatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattg-taaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtg 175  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| | |||    
T  12123861 aatcaaagtaggtaactttaaggttgatggtctttggttagagttctcttaggttgggaaacatttataaacaccttggatgagtgaaaatcatcgagtg 12123762  T
Q  176 tcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt 275  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||    
T  12123761 tcttgttcatttgagagattggaaaa-tgagtataaattagagttgttctttatgattttgttgaagcttatttcttgtaactcttttgtatcattttgt 12123663  T
Q  276 -aagaactcattgatagtg 293  Q
     ||||||||| ||||||||    
T  12123662 aaagaactcaatgatagtg 12123644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 120 - 315
Target Start/End: Original strand, 11049484 - 11049684
Alignment:
Q  120 ttctcttgggttgagaaacatt-gtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagag 218  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||||||| || ||||||| |    
T  11049484 ttctcttgtgttgggaaacatttgtaaacaccttgggtaagtgaaaatcattgagtgtcttgttttttggtgagattaggaaaatgg-tataaattaggg 11049582  T
Q  219 tt-gttct---ttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctct 313  Q
    || |||||   |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  11049583 tttgttctaatttgtgagcttgttgaagctaatttcttataacccttttagtatctctttgtaagaactcattgatagtagattgaaaagatcaatctct 11049682  T
Q  314 cc 315  Q
    ||    
T  11049683 cc 11049684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Original strand, 6266533 - 6266865
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggt-ctttgattag 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | ||||| ||| ||||||| ||||||| |  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  6266533 tatttaagtgttcttgtgcagattt-gaaggagagtgggaagagagagagacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattag 6266631  T
Q  118 agt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattag 216  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||||       |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  6266632 agtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattag 6266721  T
Q  217 agtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 314  Q
     ||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  6266722 ggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctc 6266820  T
Q  315 cccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    | |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  6266821 ctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 6266865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 179 - 316
Target Start/End: Original strand, 26353178 - 26353315
Alignment:
Q  179 tgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa 277  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  26353178 tgttctttggtgagattgaaaaaa-gtgtagaaattaaggtttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgtatctttttgtaa 26353276  T
Q  278 gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 316  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26353277 gtactcattgatagtggattggagagatcactctctccc 26353315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 315
Target Start/End: Original strand, 33648129 - 33648302
Alignment:
Q  144 aaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtg-agattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaa 241  Q
    ||||| |||| | |||||||||| |||| ||||||||| |||  | | ||||||  ||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  33648129 aaacatcttgggagagtgaaaataattgagtgtcttgtacatgagaggagattgagaaaatgg-taaaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaa 33648227  T
Q  242 gctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33648228 gctaatttcctgtaacccttttgtatttctttgtaaagaactcattgatagcggattggagagatcaatctctcc 33648302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 232 - 315
Target Start/End: Original strand, 7451165 - 7451248
Alignment:
Q  232 acttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7451165 acttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattgcagagatcaatctctcc 7451248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 30218254 - 30218078
Alignment:
Q  144 aaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtg-agattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaag 242  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| |  | |||||| | |||||||||||| ||||  |||||||| | || ||| ||||||    
T  30218254 aaacaccttgacagagtggaaatcattgagtgtcttgttcatggaaggagattg-agaaatgggtagaagttaggtttgttcttggagagcttattgaag 30218156  T
Q  243 ctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca 319  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||    
T  30218155 ctaatttcttgtaaccattttgtatctctttgtaaataattcattgatagtgggttgaaaagatcaatcactccccca 30218078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 279 - 355
Target Start/End: Original strand, 39284930 - 39285007
Alignment:
Q  279 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatct 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  39284930 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatct 39285007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 149
Target Start/End: Original strand, 33528354 - 33528485
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |     
T  33528354 ctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtg 33528452  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacac 149  Q
      | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33528453 aggatctcttgggttgggaaacattgtaaacac 33528485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 23078201 - 23078336
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg--att 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||| | | |||| ||||||||||| |||||||| |||||||  ||     
T  23078201 ctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagtgagagaaacttggatta-caaaggaggtaacttttgggttgagtgtctttgtgatg 23078299  T
Q  116 agagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23078300 agaat-ctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 23078336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 14698739 - 14698874
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |     
T  14698739 ctatataagtgttcttgtgtagattttgaaggagagcttttagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtg 14698837  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  14698838 aggatctctcgggttgggaaacattgtaaacaccttg 14698874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 33118502 - 33118367
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |     
T  33118502 ctatataagtgttcttgtgcagattttgaagaagagcttttagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtg 33118404  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  33118403 aggatctcttgggttggggaacattgtaaacaccttg 33118367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 17865571 - 17865437
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagagaagaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-attag 117  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||   ||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |      
T  17865571 ctatataagtgttcttgtgcaaattttgaagaagagcttgaagagacagaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtga 17865473  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17865472 agatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 17865437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 153
Target Start/End: Original strand, 36757497 - 36757627
Alignment:
Q  24 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-attagagtt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||  | | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |   | |    
T  36757497 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagtgagagaaacttgaatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggat 36757595  T
Q  122 ctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36757596 ctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 36757627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 5700392 - 5700279
Alignment:
Q  85 gaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctc-ttgggttgagaaacatt-gtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgtt 182  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || |  |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  5700392 gaggtaactttagggttgaggatcattaatgatggttctcgttgggttgagaaacatttgtaaacactttgggtgaatgaaaaacattgagtgtcttgtt 5700293  T
Q  183 cattggtgagattg 196  Q
    |||||| |||||||    
T  5700292 cattggagagattg 5700279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 12647707 - 12647380
Alignment:
Q  23 ttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagag-gttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagag 119  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||| ||| ||||||| ||||||| | || | || ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12647707 ttaagtgttcttgtgcagattt-gaaggagagagttgga-agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagag 12647611  T
Q  120 t-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagag 218  Q
    | ||||||||||||| |||||| | ||||||||||    || || |||||||| ||||||||       |||||||||| |||  ||||||||||||| |    
T  12647610 tatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattaggg 12647523  T
Q  219 tt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctc 314  Q
    || |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  12647522 tttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctc 12647425  T
Q  315 cccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    | |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  12647424 ctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 12647380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21630312 - 21630177
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || || |||||||||| | | |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| | |     
T  21630312 ctatataagtgttcttgtgtagattttgaaggagagcttgaagggagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagtgttgagtgtctttgtagtg 21630214  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21630213 aggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 21630177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 34389218 - 34389083
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | || |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||| | ||||||| | |     
T  34389218 ctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgatgtgagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgtgtgtctttgtagtg 34389120  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34389119 aggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 34389083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 233 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 42019993 - 42019903
Alignment:
Q  233 cttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt---aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat 320  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  42019993 cttgtagaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaaaaaaactcattgatagtgaatttgagagatcaatctcttccccat 42019903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 153
Target Start/End: Original strand, 8389880 - 8390014
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-attag 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | | ||||| |||||||||| | | |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |      
T  8389880 tatttaagtgttcctgtgcagattttgaagtagagctggaagagagagaaacttggatta-caaaggagataactttagggttgagggtctttgtagtga 8389978  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
     | |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8389979 tgatctcttgggttaggaaacattgtaaacaccttg 8390014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 13656200 - 13656026
Alignment:
Q  185 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 282  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  13656200 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 13656104  T
Q  283 catt-gatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||   |||||||||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  13656103 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctct 13656026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 206 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 42261633 - 42261524
Alignment:
Q  206 gtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagaga 304  Q
    ||||||||||   |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |  |||||||    
T  42261633 gtagaaattaagtttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatatctttgtaaagtactcattgatagtgaagcggagaga 42261534  T
Q  305 tcaatctctc 314  Q
    ||| ||||||    
T  42261533 tcattctctc 42261524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 28258907 - 28259042
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtcttt-gatta 116  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| ||||||  | |     
T  28258907 ctatataagtgttcttgtgtagattttgaagaagagcttgaagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttatagtg 28259005  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  28259006 aggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttg 28259042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 40015293 - 40015161
Alignment:
Q  18 actatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgatta 116  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| || |||   |||| |||||||||||||||||||| || ||  |||     
T  40015293 actatttaagtgtttctgttcagattttgaagtagagcttgaagagagagaaatttaggtttacaaaggaggtaactttagggttgagtgttttgtattg 40015194  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacac 149  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40015193 aggttctcttgggttgggaaacattgtaaacac 40015161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 306
Target Start/End: Original strand, 41454241 - 41454356
Alignment:
Q  191 agattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgat 289  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  41454241 agattcgaaaaatgg-tagaaattagatttgttttttgagagcttgttgaagctaatttctagcaactcttttgtatatatttgtaaagaactcattgat 41454339  T
Q  290 agtggattggagagatc 306  Q
    |||| | |||| |||||    
T  41454340 agtgaagtggacagatc 41454356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 204 - 311
Target Start/End: Original strand, 24197915 - 24198023
Alignment:
Q  204 gggtagaaattagagttgtt-ctttgtgaacttgttgaag-ctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaa-ctcattgatagtggattgga 300  Q
    |||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||    
T  24197915 gggtagaaattaaagttttttcttggagaacttgttgaaggctaatttcttgtaaccc--ttgtatctctttgcaagaaactctttgataatggattgga 24198012  T
Q  301 gagatcaatct 311  Q
    |||||| ||||    
T  24198013 gagatctatct 24198023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20522583 - 20522454
Alignment:
Q  25 aagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagt-tc 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| | | | |||| |||||||||||||||||||| |||||||    |||| ||    
T  20522583 aagtgttcttctgcagattttgaaggtgagcttggagagagagaaacttagatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgagtatc 20522485  T
Q  123 tcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  20522484 tcttgggttgggaagcattgtaaacaacttg 20522454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 10706982 - 10707117
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||| |||||||| | | | |||| ||||||||||||||||| |   ||||||    |    
T  10706982 ctatataagtgttcttgtgcagattttgaagaagagctggaagagagagaaacttagatta-caaaggaggtaactttagggtttattatctttgtagtg 10707080  T
Q  118 agt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10707081 aggatctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 10707117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 34811385 - 34811281
Alignment:
Q  190 gagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaag-aactcattga 288  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||   ||| |||| | || ||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  34811385 gagatttgaaaaaatggtagaaattaagattgctcttagagagcttgttgaagctaatttattgtaactcttttatatctctttgtaagaaactcattga 34811286  T
Q  289 tagtg 293  Q
    |||||    
T  34811285 tagtg 34811281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 13569698 - 13569561
Alignment:
Q  18 actatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggtt-gtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-at 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||| | | |||| ||| ||||||||||||| || ||||||| |     
T  13569698 actatataagtgttcttgtgcagattttaaaggagagcttgggagagagagaaacttggatta-caaatgagataactttagggttaagtgtctttgtag 13569600  T
Q  115 tagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    |   | |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  13569599 tgaggatctcttgggttgggaaacattataaacaccttg 13569561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 2837178 - 2837086
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtcttt 111  Q
    |||| ||||||||||| || | |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||    
T  2837178 ctatataagtgttctt-tgtaaattttgaaggagagtttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaattttaaggttgaggatcttt 2837086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 315
Target Start/End: Original strand, 28671976 - 28672061
Alignment:
Q  231 aacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    |||||||| | | ||||||||||| |||  |||||||||||||  || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28671976 aacttgttaaggttaatttcttgttaccgttttgtatctctttacaaagaactcactgacagtggattggagagatcaatctctcc 28672061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 190 - 305
Target Start/End: Original strand, 41446144 - 41446260
Alignment:
Q  190 gagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattga 288  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||   |||||||||| || |||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||| | |||||||  ||||    
T  41446144 gagattcgaaaaaaaggtagaaattatgtttgttctttgagagcttgttgaagctaattttaagtaacccttttgtatctctttataaagaactggttga 41446243  T
Q  289 tagtggattggagagat 305  Q
     |||| | |||||||||    
T  41446244 cagtgaagtggagagat 41446260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 12633005 - 12632908
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttc---tcttgggttgagaaaca-ttgtaaacaccttgagtga 158  Q
    ||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||    | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12633005 agaaacttgggaaaccaaaggagataactttagggttgagtgtctttaatgagagtttatttattgggttgagaaacatttgtaaacaccttgggtga 12632908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 3278310 - 3278232
Alignment:
Q  77 aatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagag-ttctcttgggttgagaaaca-ttgtaaacaccttg 153  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  3278310 aatcaaatgaggtaactttagggttgagtatcgttgatgagagattctcttgggttggaaaacatttgtaaacaccttg 3278232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 7597210 - 7597057
Alignment:
Q  155 gtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattgg-tgagattggaaaaatgggtagaaatta-gagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttctt 252  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||| ||  |||||| || |||||  ||||||||| |  |||||| || ||||||||| ||| ||||||||||    
T  7597210 gtgagtgaaaatcactcagtgtcttgttcatgggaagagatt-gagaaatgaatagaaattaggttttgttccttatgaacttgtcgaaactaatttctt 7597112  T
Q  253 gtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatc 306  Q
    ||||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||  |||||||||    
T  7597111 gtaagtcttttgtatctttttgtaaagaactcattgattgtagaacggagagatc 7597057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 273
Target Start/End: Original strand, 15903839 - 15903913
Alignment:
Q  197 gaaaaatgggtagaaattag-agttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 273  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15903839 gaaaaatgggtagaaattagaatttgttctttgtgagcttgt--aagct-atttcttgtaacccctttgtatcacttt 15903913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 153
Target Start/End: Original strand, 41586326 - 41586416
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagag-ttctcttgggttgagaaaca-ttgtaaacaccttg 153  Q
    ||||||||||  ||||| | || ||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  41586326 agaaacttggtaaatcagatgatgtaactttagggttgagtgtctttggtgagagcttctcttgggttggaaaacagttgtaaacaccttg 41586416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 256
Target Start/End: Original strand, 28770723 - 28770781
Alignment:
Q  197 gaaaaatgggtagaaattagag-ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaa 256  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||    
T  28770723 gaaaaatgggtagaaattagagtttgttctttgtgagct--tttaagctaatttcttgtaa 28770781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 284 - 317
Target Start/End: Original strand, 42412117 - 42412150
Alignment:
Q  284 attgatagtggattggagagatcaatctctcccc 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42412117 attgatagtggattggagagatcaatctctcccc 42412150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 305
Target Start/End: Original strand, 3897035 - 3897111
Alignment:
Q  230 gaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagat 305  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  3897035 gaactcgttgaagctaattttttgtaactcttttgtataattttgtaaagaactcattgaaagtggattagagagat 3897111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 7815555 - 7815523
Alignment:
Q  85 gaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7815555 gaggtaactttagggttgagggtctttgattag 7815523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 117
Target Start/End: Original strand, 11049417 - 11049468
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattag 117  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  11049417 agaaacttgggaaatcaaaggaggtaa-tttagggttgatggtctttgattag 11049468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 234 - 277
Target Start/End: Original strand, 4561137 - 4561180
Alignment:
Q  234 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  4561137 ttgttgaagctaatttcttgtaacatttttgtatctctttgtaa 4561180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 40739198 - 40739066
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagatttt-gaaggagaggttgtagagaagaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattaga 118  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | || |||| ||| ||||| ||||||||| | | |||| |||| |||| |||||||||| |||||||    ||    
T  40739198 tatttaagtgttcttgtgcagttttttggagtagag-ttgaagaga-gaaacttggatta-caaaggagggaactctagggttgagtgtctttgtagtga 40739102  T
Q  119 gt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40739101 ggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 40739066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 127
Target Start/End: Original strand, 11067172 - 11067234
Alignment:
Q  65 agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttg 127  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  11067172 agaaactagggaaatcaaaggaggtaactttatggttgattgtctttgattaaggttctcttg 11067234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 337 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 14202436 - 14202398
Alignment:
Q  337 cgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  14202436 cgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtttatctc 14202398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 25410007 - 25409973
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagag 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25410007 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaagtagag 25409973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 8040372 - 8040296
Alignment:
Q  80 caaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-attagagttctcttg--ggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| | |  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8040372 caaaggaggtaactttatggttgagtgtctttgtagtgaagttctcttgagggttgggaaacattgtaaacaccttg 8040296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 372
Target Start/End: Original strand, 10707281 - 10707364
Alignment:
Q  288 atagtggattggagagatcaatctctcccccat-ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcat 372  Q
    |||||||||||||||| |   |||||||||||| ||||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10707281 atagtggattggagagttgt-tctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctc-ggtgtgtttattcat 10707364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 39483230 - 39483165
Alignment:
Q  89 taactttagggttgagggtctttgattagagt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |  |||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  39483230 taactttagggttgagtgtctttgttgtgaggatctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttg 39483165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 273
Target Start/End: Original strand, 2869641 - 2869717
Alignment:
Q  197 gaaaaatgggtagaaattagagtt--gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 273  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  2869641 gaaaaatgggtagaaattaggtttttgttctttgtgagctttt--aagctaatttcttgtaactcctttgtatcacttt 2869717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 370
Target Start/End: Original strand, 23078499 - 23078582
Alignment:
Q  288 atagtggattggagagatcaatctctcccccat-ttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatc-tctggtgtgtttgttc 370  Q
    |||||||||||||||| |   |||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  23078499 atagtggattggagagttgt-tctctcccccatattaggtcatattggatcgaactgggtcaacattcttttggtgtgtttgttc 23078582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 24 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20744 - 20392
Alignment:
Q  24 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttc 122  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20744 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagagctagaagagagagaaactttggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagtta 20646  T
Q  123 tcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgt 222  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||  ||||    
T  20645 tcttgggttgggagacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtttattattcattggtgagattgggaaaatgagcagaaattaggtttgt 20546  T
Q  223 tctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tt 321  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  20545 tttttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgatattggattggagagatcaatctctcccccagat 20446  T
Q  322 taggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  20445 taggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatttttggtgtgtttgttcctctc 20392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Original strand, 434373 - 434719
Alignment:
Q  25 aagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttct 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  434373 aagtgttctt-tgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggtctttgattagagttct 434471  T
Q  124 cttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattgga-aaaatgggtagaaattagagttgt 222  Q
    |||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||    
T  434472 cttgggttggaaaacatggtaaataccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggggaaaaagggtagaaattagggttgt 434570  T
Q  223 tctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tt 321  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||       
T  434571 tctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagag 434670  T
Q  322 taggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  434671 taggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatatttggtgtgtttgtt 434719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 206 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 490468 - 490359
Alignment:
Q  206 gtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagaga 304  Q
    ||||||||||   |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |  |||||||    
T  490468 gtagaaattaagtttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatatctttgtaaagtactcattgatagtgaagcggagaga 490369  T
Q  305 tcaatctctc 314  Q
    ||| ||||||    
T  490368 tcattctctc 490359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 4)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 68 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 149382 - 149080
Alignment:
Q  68 aacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatc 167  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  149382 aacttgggaaatcaaaggaggtaacttgtgggttgagggtctttgattagagttctcttaggttgagaaacattgtaaacaccttggggtagtgaaaatc 149283  T
Q  168 attgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat 267  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  149282 attgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaacggatagaaattagggttgttttttgtaagcttgttgaagctaatttcttgttacccatttatat 149183  T
Q  268 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgttt 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  149182 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtattt 149083  T
Q  367 gtt 369  Q
    |||    
T  149082 gtt 149080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 6052 - 5917
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||| | | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| | |     
T  6052 ctatataaatgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaaattggatta-caaaggaggtaactttatggttgagtgtctttgtagtg 5954  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5953 aggatctcttgggttggcaaacattgtaaacaccttg 5917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 2860 - 2726
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||| | | ||||  |||||||||||||||| ||  |||||| | |     
T  2860 ctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaa-ttggatta-caaaaaaggtaactttagggttaagtttctttgtagtg 2763  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2762 aggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 2726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 133009 - 133144
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  ||||| |||||||||| | | |||| |||| |||||||||||||||  |||||| | |     
T  133009 ctatataagtgttcttgtgcaaattttggaggagagcttaaagagagagaaacttggatta-caaaggagggaactttagggttgagtttctttgtagtg 133107  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  133108 aggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 133144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 366
Target Start/End: Original strand, 741 - 1098
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgta----------gaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |          |||| ||||||||||| ||||||| |  | |||||||||||| ||||||    
T  741 tatttaagtgttcttgtgcagattttggaggagagcttggatgagctagaagagagagaaacttgggaaatcaaaggcagcaactttagggtttagggtc 840  T
Q  109 tttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagatt-ggaaaaatgggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  841 tttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtgagattgggaaaaaagggt 938  T
Q  208 agaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  939 agaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-aacaactcattgatagtggattggagagttca 1037  T
Q  308 atctctccccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgttt 366  Q
    |||||||| |||   |||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  1038 atctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgttt 1098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 11495 - 11143
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattaga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  11495 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaag-agagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttatggtctttgattaga 11397  T
Q  119 g-ttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaa-aaatgggtagaaattag 216  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  11396 gcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtgagattgggagaaaagggtagaaattag 11299  T
Q  217 agttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
     ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11298 ggttgttctttgtgaacttgtaaaatctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcgttgatagtggattggagagttcaatctctcc 11199  T
Q  316 ccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
     |||   |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  11198 tccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtctttgtt 11143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 9069 - 8717
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattaga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  9069 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaag-agagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctaggctttagggtctttgattaga 8971  T
Q  119 g-ttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaa-aaatgggtagaaattag 216  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  8970 gcttctcttgggttgggaaacattgtaaagaccttg-gtgagtgtaaaccattgagtgtcttgttc-ttggtgagattgggagaaaagggtagaaattag 8873  T
Q  217 agttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
     |||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8872 ggttgttctttgtgaacttataaaatctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcgttgatagtggattggagagttcaatctctcc 8773  T
Q  316 ccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
     |||   |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  8772 tccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtctttgtt 8717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 36 - 369
Target Start/End: Original strand, 114440 - 114788
Alignment:
Q  36 tgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttg------- 127  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||           
T  114440 tgcagattttgaatgtgagcttgaagagagagaaacttgagaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagggttctcttgaggggtt 114539  T
Q  128 ------ggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttg 221  Q
          ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||    
T  114540 ctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattaaggttg 114638  T
Q  222 ttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-t 320  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  114639 ttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacgcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccaga 114738  T
Q  321 ttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctctggtgtgtttgtt 369  Q
     ||||| |||||| || |||||||| | |||||||| ||||||| |||||    
T  114739 gtaggttaagtttagaccgaactggatgaacaatctttggtgtgcttgtt 114788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 129 - 375
Target Start/End: Original strand, 11502 - 11750
Alignment:
Q  129 gttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttg 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  11502 gttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggttgttctttg 11600  T
Q  229 tgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtc 327  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||    
T  11601 tgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtc 11700  T
Q  328 aagttt-gatcgaactgggtcaacaatctc-tggtgtgtttgttcatctc 375  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  11701 aagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtatttgtttatctc 11750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 121
Target Start/End: Original strand, 22179 - 22280
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttgattaga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | | ||||| ||||||||||| ||||||| |  | |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22179 tatttaagtgttcttgtgcagattt-gaaggtgagctagaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggtctttgattaga 22277  T
Q  119 gtt 121  Q
    |||    
T  22278 gtt 22280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 139 - 315
Target Start/End: Original strand, 7282 - 7457
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  7282 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgagcttgtt 7380  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7381 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggaaagatcaatctctcc 7457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 139 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18216 - 18004
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  18216 attgtaaacactttgggagagtgaaaatcat-gagtgttttgttcattggtgagagtgggaaaattggtagaaattagggttgttcattgtgagcttgtt 18118  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagttt-gat 336  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||| |||    
T  18117 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaa-aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagggtaggtcaagtttggat 18019  T
Q  337 cgaactgggtcaaca 351  Q
    |||||||||| ||||    
T  18018 cgaactgggtgaaca 18004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 17552 - 17483
Alignment:
Q  85 gaggtaactttagggttgagggtctttg-attagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| | | ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17552 gaggtaactttacggttgagtgtctttgtagtggagatctcttggattgggaaacattgtaaacaccttg 17483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 139 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 80496 - 80338
Alignment:
Q  139 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 238  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  80496 attgtgaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgctgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 80398  T
Q  239 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattg 298  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  80397 gaagctaatttcttgcaacccatttgtatctttttgtaagaactcatagatagtgaattg 80338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Original strand, 10468 - 10656
Alignment:
Q  163 aaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccat 261  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||  | || ||||||| ||| ||||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||||  |    
T  10468 aaatctttgagtgtcttgttcatttgtgagattggaaaaaaagatataaattagggtttgttctttgtgagctc-ttgt-gctaatttattgtaaccatt 10565  T
Q  262 ttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagtttgatcgaactgggtcaaca 351  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||   ||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  10566 ttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtaaaca 10656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 233 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 27563 - 27475
Alignment:
Q  233 cttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27563 cttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaaataacttattgatagtggattggagagatcaatctctcccccat 27475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 153
Target Start/End: Original strand, 36568 - 36697
Alignment:
Q  25 aagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-attagagttc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |   | ||    
T  36568 aagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatc 36666  T
Q  123 tcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  36667 tcttgggttggaaaacattgtaaacaccttg 36697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 43691 - 43826
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| | | ||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |     
T  43691 ctatataagtgtttttgtgcagattttggaggagagctggaagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtg 43789  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43790 aggatcttttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 43826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 86050 - 85919
Alignment:
Q  19 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-atta 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| || || |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |     
T  86050 ctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggatagcttgaagtgagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtg 85952  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacac 149  Q
      | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  85951 aggatctcttgggttgggaaacattgtaaacac 85919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 2925 - 2600
Alignment:
Q  23 ttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagag-gttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagag 119  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||| ||| ||||||| ||||||| | || | || ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  2925 ttaagtgttcttgtgcagattt-gaaggagagagttgga-agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagag 2829  T
Q  120 t-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagag 218  Q
    | ||||||||||||| |||||| | ||||||||||    || || |||||||| ||||||||       |||||||||| |||  ||||||||||||| |    
T  2828 tatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattaggg 2741  T
Q  219 tt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctc 314  Q
    || |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  2740 tttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctc 2643  T
Q  315 cccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatct 355  Q
    | |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  2642 ctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 2600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 205 - 306
Target Start/End: Original strand, 25073 - 25175
Alignment:
Q  205 ggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagag 303  Q
    |||||||| |||  |||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||    
T  25073 ggtagaaactagttttgttctttgagagtttgttgaaggtaatttcttgtaacctttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtgaagtagagag 25172  T
Q  304 atc 306  Q
    |||    
T  25173 atc 25175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 6120 - 6391
Alignment:
Q  23 ttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggtt-gtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgaggg-tctttgattagag 119  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||| | || |||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  6120 ttaagtgttcttgtgcaga-tttgaa-gagaggttggaagagagagagacttgggaaatcaaa-ggggcaactctagggtttagggttctttgattagag 6216  T
Q  120 t-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagag 218  Q
    | ||||||||||||| |||||| | ||||||||||    || || |||||||| |||||       |||||||||||||  ||| ||||||||||||| |    
T  6217 tatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttg---tagagagaatcattgagtgtc-------ttggtgagattgg-gaaaggggtagaaattaggg 6304  T
Q  219 -ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgt-aagaactca-ttgatagtggattggagag 303  Q
     |||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||| ||  ||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6305 tttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaagcc-cttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagag 6391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 153
Target Start/End: Original strand, 8148 - 8282
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtctttg-attag 117  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| | | ||||| |||||||||| | | |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| | |      
T  8148 tatttaagtgttcgtgtgcagttttcggaggagagctggaagagagagaaacttggatta-caaaggagggaactttagggttgagtgtctttgtagtga 8246  T
Q  118 agttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8247 ggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 8282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 45565 - 45430
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagaga-agaaacttgggtaatcaaacgaggtaactttagggttgagggtcttt--gatta 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  |||| ||| ||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||  ||||||   | |     
T  45565 tatttaagtgttcttgtgcaaattttggaaaagagcttgaagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgaatgtcttttgtagtg 45467  T
Q  117 gagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttg 153  Q
      | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45466 aggatctcttgggttgtgaaacattgtaaacaccttg 45430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0129 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0129
Description:

Target: scaffold0129; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 19199 - 19121
Alignment:
Q  93 tttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaaca-ttgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattg 171  Q
    ||||||| |||| ||||||| | || |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  19199 tttagggctgagagtctttggtgagggttctcttgggttgggaaacatttgtaaaca-cttgggtgagtgaaaatcattg 19121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 3895 - 3720
Alignment:
Q  185 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 281  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||| | |||||| |||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  3895 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 3799  T
Q  282 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccccca-tttaggtcaagttt-gatcgaactgggtcaacaatctct 357  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  3798 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctct 3720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 54
Target Start/End: Original strand, 17671 - 17705
Alignment:
Q  20 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagag 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17671 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagag 17705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University