View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10569_12 (Length: 352)

Name: NF10569_12
Description: NF10569
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10569_12
NF10569_12
[»] chr6 (88 HSPs)
chr6 (1-340)||(30676444-30676783)
chr6 (1-340)||(34963462-34963801)
chr6 (1-340)||(24422636-24422974)
chr6 (1-340)||(33861883-33862221)
chr6 (1-340)||(33864367-33864705)
chr6 (7-340)||(12742406-12742739)
chr6 (1-340)||(18334327-18334665)
chr6 (7-340)||(1540652-1540984)
chr6 (1-340)||(8055118-8055457)
chr6 (1-340)||(26924375-26924713)
chr6 (7-340)||(25688591-25688924)
chr6 (1-340)||(2290915-2291253)
chr6 (1-340)||(22782316-22782654)
chr6 (1-340)||(19858657-19858992)
chr6 (1-233)||(17377582-17377814)
chr6 (1-266)||(28289071-28289334)
chr6 (1-340)||(19847706-19848023)
chr6 (1-220)||(1598266-1598484)
chr6 (1-219)||(18914142-18914360)
chr6 (1-267)||(12942363-12942617)
chr6 (1-219)||(31630275-31630493)
chr6 (7-245)||(23992604-23992844)
chr6 (144-340)||(19005135-19005330)
chr6 (1-219)||(19005361-19005579)
chr6 (7-195)||(25535641-25535829)
chr6 (161-340)||(25656718-25656897)
chr6 (1-136)||(1899-2034)
chr6 (1-136)||(8858-8993)
chr6 (215-340)||(1595638-1595763)
chr6 (1-136)||(1598542-1598677)
chr6 (1-136)||(19005637-19005772)
chr6 (1-136)||(19847513-19847648)
chr6 (1-135)||(27557016-27557150)
chr6 (144-246)||(31630524-31630626)
chr6 (144-262)||(18913994-18914111)
chr6 (1-135)||(23415258-23415392)
chr6 (1-132)||(18914422-18914553)
chr6 (237-340)||(25754898-25755001)
chr6 (1-136)||(30676251-30676386)
chr6 (144-266)||(15875469-15875590)
chr6 (1-113)||(31630082-31630194)
chr6 (93-219)||(15875621-15875737)
chr6 (1-136)||(25688988-25689123)
chr6 (250-340)||(18456808-18456898)
chr6 (7-136)||(1598735-1598864)
chr6 (7-132)||(18914615-18914740)
chr6 (7-136)||(25689181-25689310)
chr6 (1-89)||(15892143-15892231)
chr6 (1-136)||(107-242)
chr6 (237-340)||(20556864-20556965)
chr6 (1-132)||(26924182-26924313)
chr6 (251-328)||(3852001-3852078)
chr6 (17-136)||(25737128-25737247)
chr6 (255-340)||(16448514-16448600)
chr6 (41-136)||(22981321-22981416)
chr6 (41-136)||(23806992-23807087)
chr6 (197-262)||(18937252-18937317)
chr6 (280-340)||(18461968-18462028)
chr6 (250-330)||(8227448-8227529)
chr6 (1-74)||(17883232-17883305)
chr6 (267-340)||(25644414-25644487)
chr6 (18-113)||(19984130-19984225)
chr6 (7-113)||(16240299-16240405)
chr6 (7-113)||(16556945-16557051)
chr6 (7-113)||(16633501-16633607)
chr6 (7-113)||(16650175-16650281)
chr6 (7-105)||(27654597-27654695)
chr6 (252-340)||(20109231-20109322)
chr6 (7-113)||(25904477-25904584)
chr6 (46-113)||(35016043-35016110)
chr6 (145-219)||(35056707-35056781)
chr6 (267-340)||(25629310-25629383)
chr6 (18-62)||(10905416-10905460)
chr6 (46-113)||(22226608-22226676)
chr6 (45-113)||(22593620-22593688)
chr6 (97-136)||(18334230-18334269)
chr6 (18-105)||(21776107-21776194)
chr6 (97-136)||(24423032-24423071)
chr6 (97-136)||(33864763-33864802)
chr6 (47-105)||(1555538-1555596)
chr6 (47-105)||(16826408-16826466)
chr6 (181-211)||(17883303-17883333)
chr6 (7-113)||(19609583-19609689)
chr6 (1-43)||(25737028-25737070)
chr6 (145-203)||(32259078-32259136)
chr6 (145-222)||(15875565-15875642)
chr6 (267-340)||(20360915-20360988)
chr6 (250-302)||(23076862-23076915)
[»] chr8 (98 HSPs)
chr8 (1-340)||(16413050-16413389)
chr8 (1-340)||(1484491-1484829)
chr8 (1-340)||(14409179-14409517)
chr8 (1-340)||(4483369-4483708)
chr8 (1-340)||(5853027-5853365)
chr8 (1-316)||(24485778-24486093)
chr8 (7-340)||(14823862-14824196)
chr8 (1-340)||(22001842-22002180)
chr8 (1-340)||(20045930-20046268)
chr8 (1-340)||(4542108-4542446)
chr8 (1-340)||(15070647-15070988)
chr8 (1-246)||(27472151-27472395)
chr8 (1-245)||(32121912-32122156)
chr8 (1-245)||(18677799-18678043)
chr8 (7-208)||(25657893-25658094)
chr8 (144-340)||(20403316-20403511)
chr8 (1-208)||(16198115-16198322)
chr8 (2-217)||(16401660-16401875)
chr8 (144-340)||(15203109-15203304)
chr8 (7-219)||(38549745-38549957)
chr8 (1-199)||(24048841-24049038)
chr8 (1-219)||(1326666-1326884)
chr8 (144-340)||(19896357-19896553)
chr8 (1-222)||(15202913-15203134)
chr8 (144-340)||(45290572-45290768)
chr8 (10-222)||(45290385-45290597)
chr8 (1-219)||(19936642-19936850)
chr8 (144-306)||(32810054-32810215)
chr8 (2-222)||(20403486-20403706)
chr8 (7-226)||(19896524-19896743)
chr8 (1-137)||(15202720-15202856)
chr8 (145-337)||(19936882-19937076)
chr8 (1-136)||(19896807-19896942)
chr8 (2-136)||(20403765-20403899)
chr8 (1-136)||(27471958-27472093)
chr8 (7-136)||(32122214-32122343)
chr8 (1-135)||(14397475-14397609)
chr8 (15-136)||(16401287-16401408)
chr8 (1-136)||(38549546-38549681)
chr8 (1-108)||(45290282-45290389)
chr8 (144-246)||(38549988-38550090)
chr8 (7-136)||(15071046-15071175)
chr8 (7-136)||(15202533-15202662)
chr8 (1-113)||(16401466-16401578)
chr8 (1-136)||(38549354-38549488)
chr8 (1-136)||(16412857-16412992)
chr8 (7-128)||(24049104-24049225)
chr8 (250-340)||(41598277-41598367)
chr8 (7-136)||(19897000-19897129)
chr8 (144-246)||(20982604-20982710)
chr8 (237-340)||(25484245-25484348)
chr8 (144-219)||(13425336-13425411)
chr8 (144-219)||(20982498-20982573)
chr8 (144-266)||(1326915-1327042)
chr8 (7-136)||(19936455-19936584)
chr8 (252-328)||(19801367-19801443)
chr8 (144-255)||(16401908-16402020)
chr8 (250-340)||(26224008-26224098)
chr8 (4-113)||(11361025-11361134)
chr8 (155-219)||(13425241-13425305)
chr8 (250-328)||(13508022-13508101)
chr8 (250-328)||(13597554-13597633)
chr8 (7-62)||(32810263-32810318)
chr8 (261-330)||(17612059-17612128)
chr8 (250-340)||(20498655-20498746)
chr8 (18-113)||(24717722-24717817)
chr8 (7-113)||(15319989-15320095)
chr8 (7-113)||(15500358-15500464)
chr8 (47-113)||(29759432-29759498)
chr8 (148-219)||(21513636-21513707)
chr8 (145-219)||(18815609-18815683)
chr8 (29-111)||(21493050-21493132)
chr8 (252-340)||(18818348-18818437)
chr8 (97-136)||(14824260-14824299)
chr8 (46-105)||(17150655-17150714)
chr8 (47-113)||(13663129-13663195)
chr8 (47-113)||(22007126-22007192)
chr8 (220-266)||(35026849-35026895)
chr8 (145-219)||(36733302-36733376)
chr8 (145-219)||(38988730-38988804)
chr8 (145-219)||(39019827-39019901)
chr8 (97-136)||(1484887-1484926)
chr8 (152-219)||(5083001-5083068)
chr8 (97-136)||(5852930-5852969)
chr8 (97-136)||(14409082-14409121)
chr8 (97-136)||(20045833-20045872)
chr8 (46-113)||(22089412-22089479)
chr8 (250-340)||(37116442-37116532)
chr8 (46-105)||(39114426-39114485)
chr8 (7-105)||(223305-223403)
chr8 (7-105)||(688076-688174)
chr8 (7-105)||(736928-737026)
chr8 (7-105)||(860823-860921)
chr8 (220-266)||(2418860-2418906)
chr8 (145-222)||(19936829-19936906)
chr8 (267-340)||(22875157-22875230)
chr8 (284-340)||(21923900-21923956)
chr8 (145-209)||(38549936-38550000)
[»] scaffold0716 (2 HSPs)
scaffold0716 (1-340)||(4783-5122)
scaffold0716 (1-136)||(5180-5315)
[»] chr4 (96 HSPs)
chr4 (1-340)||(3515096-3515435)
chr4 (7-340)||(14970447-14970780)
chr4 (1-340)||(15118087-15118425)
chr4 (1-340)||(44615377-44615716)
chr4 (1-340)||(50222074-50222412)
chr4 (1-340)||(19242788-19243128)
chr4 (7-340)||(44772824-44773160)
chr4 (1-340)||(7640921-7641265)
chr4 (1-267)||(15534343-15534609)
chr4 (1-328)||(1837254-1837570)
chr4 (1-266)||(36038033-36038298)
chr4 (1-266)||(49547508-49547773)
chr4 (1-219)||(52872807-52873025)
chr4 (1-266)||(14048740-14049005)
chr4 (2-219)||(362390-362607)
chr4 (97-340)||(18239250-18239492)
chr4 (1-219)||(15495908-15496126)
chr4 (9-219)||(19617809-19618019)
chr4 (144-340)||(18215152-18215347)
chr4 (144-340)||(19618050-19618245)
chr4 (1-212)||(29267570-29267781)
chr4 (144-340)||(12185-12380)
chr4 (144-340)||(52312599-52312794)
chr4 (1-219)||(14746246-14746464)
chr4 (1-219)||(19857798-19858006)
chr4 (144-340)||(15355202-15355398)
chr4 (1-222)||(11989-12210)
chr4 (1-222)||(52312769-52312989)
chr4 (90-219)||(18214992-18215121)
chr4 (7-136)||(18214751-18214880)
chr4 (1-136)||(19858064-19858199)
chr4 (1-136)||(52872614-52872749)
chr4 (1-134)||(362668-362801)
chr4 (7-136)||(362859-362988)
chr4 (7-136)||(3515493-3515622)
chr4 (7-136)||(52313240-52313369)
chr4 (28-136)||(14185621-14185729)
chr4 (115-219)||(15355067-15355171)
chr4 (1-136)||(14970248-14970383)
chr4 (1-136)||(19617608-19617743)
chr4 (2-136)||(15495716-15495850)
chr4 (144-266)||(15496949-15497070)
chr4 (144-265)||(52873056-52873176)
chr4 (7-136)||(52313047-52313176)
chr4 (237-340)||(12611032-12611135)
chr4 (1-136)||(14746053-14746188)
chr4 (237-340)||(51463838-51463941)
chr4 (144-266)||(14746495-14746618)
chr4 (237-340)||(23803235-23803338)
chr4 (1-155)||(30147189-30147343)
chr4 (250-328)||(21815568-21815646)
chr4 (250-340)||(44102303-44102393)
chr4 (256-340)||(22353926-22354010)
chr4 (250-340)||(15367782-15367873)
chr4 (250-340)||(15402795-15402886)
chr4 (144-226)||(19857685-19857767)
chr4 (178-246)||(362268-362336)
chr4 (250-340)||(15371294-15371385)
chr4 (250-340)||(15373575-15373666)
chr4 (255-340)||(20149918-20150004)
chr4 (250-340)||(15370110-15370200)
chr4 (261-328)||(44928873-44928940)
chr4 (18-136)||(22725284-22725401)
chr4 (253-321)||(16223644-16223712)
chr4 (250-340)||(13788-13879)
chr4 (19-113)||(14951273-14951367)
chr4 (65-132)||(14745924-14745991)
chr4 (250-340)||(52243131-52243222)
chr4 (46-113)||(55377225-55377292)
chr4 (214-266)||(19857607-19857659)
chr4 (252-339)||(43198492-43198580)
chr4 (18-113)||(25120046-25120141)
chr4 (15-113)||(43281694-43281792)
chr4 (1-44)||(12778417-12778460)
chr4 (269-340)||(15464888-15464959)
chr4 (46-113)||(18293695-18293762)
chr4 (47-113)||(14995647-14995713)
chr4 (7-113)||(15287859-15287965)
chr4 (7-113)||(15294969-15295075)
chr4 (7-105)||(18247750-18247848)
chr4 (7-105)||(47357194-47357292)
chr4 (267-340)||(12902850-12902923)
chr4 (267-340)||(16377478-16377551)
chr4 (7-104)||(16731688-16731785)
chr4 (18-113)||(5683367-5683462)
chr4 (14-113)||(9198559-9198658)
chr4 (97-136)||(15117990-15118029)
chr4 (18-105)||(22355071-22355158)
chr4 (7-105)||(10643757-10643855)
chr4 (47-105)||(17146320-17146378)
chr4 (252-340)||(7798867-7798956)
chr4 (267-340)||(14038741-14038814)
chr4 (145-222)||(19617998-19618075)
chr4 (267-340)||(22636528-22636601)
chr4 (99-136)||(44772723-44772760)
chr4 (250-302)||(53082089-53082142)
[»] scaffold0230 (4 HSPs)
scaffold0230 (1-340)||(14036-14375)
scaffold0230 (7-220)||(23271-23484)
scaffold0230 (1-136)||(22912-23047)
scaffold0230 (50-136)||(23121-23207)
[»] chr2 (101 HSPs)
chr2 (1-340)||(39682402-39682741)
chr2 (1-340)||(18809032-18809370)
chr2 (1-340)||(23130951-23131290)
chr2 (1-340)||(23133418-23133757)
chr2 (1-340)||(23711748-23712086)
chr2 (1-340)||(34402256-34402595)
chr2 (1-340)||(32214665-32214994)
chr2 (1-340)||(28577188-28577526)
chr2 (1-340)||(571486-571825)
chr2 (1-340)||(23709267-23709605)
chr2 (1-340)||(24897930-24898268)
chr2 (1-340)||(24905367-24905705)
chr2 (1-340)||(24900413-24900751)
chr2 (1-340)||(24902890-24903228)
chr2 (1-340)||(24907842-24908180)
chr2 (1-340)||(26505468-26505806)
chr2 (1-340)||(26507946-26508284)
chr2 (8-340)||(32039240-32039571)
chr2 (1-340)||(23135679-23136007)
chr2 (1-267)||(20261381-20261647)
chr2 (1-340)||(24529281-24529602)
chr2 (2-266)||(10684498-10684764)
chr2 (1-219)||(23706951-23707169)
chr2 (7-219)||(24918350-24918562)
chr2 (1-219)||(24642483-24642701)
chr2 (1-219)||(24671235-24671453)
chr2 (1-219)||(24681654-24681872)
chr2 (144-340)||(6726084-6726279)
chr2 (29-245)||(25616365-25616581)
chr2 (148-340)||(21154942-21155133)
chr2 (1-219)||(38967689-38967907)
chr2 (144-340)||(22105502-22105697)
chr2 (7-222)||(22105672-22105887)
chr2 (1-203)||(45027639-45027840)
chr2 (144-340)||(24367863-24368058)
chr2 (1-222)||(24368033-24368254)
chr2 (144-340)||(24642732-24642929)
chr2 (2-222)||(6726254-6726474)
chr2 (1-222)||(21154742-21154963)
chr2 (1-222)||(41523807-41524028)
chr2 (144-340)||(38967463-38967658)
chr2 (197-340)||(45029784-45029927)
chr2 (1-136)||(41523614-41523749)
chr2 (6-136)||(24529093-24529223)
chr2 (7-136)||(6726533-6726662)
chr2 (1-113)||(23931776-23931888)
chr2 (7-136)||(24918626-24918755)
chr2 (4-132)||(41523424-41523552)
chr2 (1-136)||(22105951-22106086)
chr2 (9-136)||(24368312-24368439)
chr2 (7-136)||(21154555-21154684)
chr2 (7-136)||(24671511-24671640)
chr2 (7-136)||(21154362-21154491)
chr2 (144-266)||(23707200-23707323)
chr2 (7-136)||(24681930-24682059)
chr2 (7-136)||(23706573-23706702)
chr2 (7-136)||(23709080-23709209)
chr2 (144-266)||(24918196-24918319)
chr2 (1-134)||(32214471-32214604)
chr2 (7-134)||(45027452-45027579)
chr2 (1-131)||(23706759-23706889)
chr2 (7-133)||(23931949-23932075)
chr2 (147-266)||(24671081-24671201)
chr2 (144-266)||(24681500-24681623)
chr2 (251-340)||(43137388-43137477)
chr2 (237-306)||(22173799-22173868)
chr2 (252-328)||(19671935-19672010)
chr2 (71-135)||(31345490-31345554)
chr2 (252-340)||(23708558-23708647)
chr2 (45-113)||(67342-67410)
chr2 (261-337)||(22459511-22459587)
chr2 (250-290)||(29601478-29601518)
chr2 (47-113)||(16900818-16900884)
chr2 (47-113)||(16994209-16994275)
chr2 (145-219)||(21368365-21368439)
chr2 (7-113)||(24686598-24686704)
chr2 (267-340)||(7688-7761)
chr2 (84-136)||(24642373-24642425)
chr2 (46-113)||(27261335-27261402)
chr2 (47-113)||(12727714-12727780)
chr2 (7-105)||(19887275-19887373)
chr2 (145-219)||(23799457-23799531)
chr2 (47-113)||(34823753-34823819)
chr2 (29-78)||(34135070-34135119)
chr2 (150-226)||(22686145-22686221)
chr2 (97-136)||(18809428-18809467)
chr2 (97-136)||(23131347-23131386)
chr2 (97-136)||(23711651-23711690)
chr2 (250-340)||(23791368-23791458)
chr2 (97-136)||(26505864-26505903)
chr2 (97-136)||(26508342-26508381)
chr2 (97-136)||(27920402-27920441)
chr2 (97-136)||(32039136-32039175)
chr2 (97-136)||(34402160-34402199)
chr2 (144-187)||(41524003-41524045)
chr2 (250-302)||(20520130-20520183)
chr2 (48-113)||(22274025-22274090)
chr2 (267-340)||(23060606-23060679)
chr2 (267-340)||(23076535-23076608)
chr2 (18-62)||(24788042-24788086)
chr2 (18-62)||(44584588-44584632)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-340)||(20836-21175)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (1-340)||(37910-38249)
scaffold0134 (97-136)||(38307-38346)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (1-340)||(94500-94838)
scaffold0023 (7-340)||(17180-17513)
scaffold0023 (28-136)||(17008-17116)
scaffold0023 (270-340)||(44544-44614)
scaffold0023 (97-136)||(94896-94935)
[»] chr7 (96 HSPs)
chr7 (1-340)||(456410-456749)
chr7 (1-340)||(27216949-27217288)
chr7 (1-340)||(15376448-15376786)
chr7 (1-340)||(20384858-20385196)
chr7 (2-328)||(16213785-16214111)
chr7 (1-340)||(16232609-16232948)
chr7 (1-340)||(41523006-41523345)
chr7 (1-340)||(41525468-41525807)
chr7 (1-340)||(14948857-14949195)
chr7 (9-340)||(21189338-21189668)
chr7 (1-340)||(32125580-32125918)
chr7 (21-340)||(11393041-11393360)
chr7 (1-340)||(16410148-16410486)
chr7 (1-340)||(24702327-24702656)
chr7 (1-340)||(24704774-24705103)
chr7 (7-340)||(18640361-18640693)
chr7 (1-340)||(13869435-13869776)
chr7 (1-340)||(18430801-18431139)
chr7 (1-340)||(26355716-26356056)
chr7 (1-340)||(26358168-26358508)
chr7 (1-267)||(11303409-11303675)
chr7 (1-266)||(23664687-23664952)
chr7 (7-278)||(18627717-18627987)
chr7 (1-266)||(16108423-16108688)
chr7 (1-219)||(14269691-14269909)
chr7 (2-266)||(29796771-29797037)
chr7 (2-266)||(29800590-29800856)
chr7 (1-219)||(8940489-8940711)
chr7 (1-219)||(15081576-15081794)
chr7 (1-217)||(45847389-45847605)
chr7 (7-219)||(8468945-8469157)
chr7 (144-340)||(11972585-11972780)
chr7 (7-222)||(11972755-11972970)
chr7 (37-209)||(13841274-13841446)
chr7 (144-317)||(15081825-15081999)
chr7 (7-136)||(38897775-38897904)
chr7 (1-135)||(25926864-25926998)
chr7 (2-136)||(8940769-8940902)
chr7 (144-266)||(14269940-14270061)
chr7 (1-136)||(14156620-14156755)
chr7 (1-136)||(14269305-14269440)
chr7 (170-284)||(13841157-13841270)
chr7 (7-136)||(16214170-16214299)
chr7 (9-136)||(10501136-10501263)
chr7 (1-136)||(14269498-14269633)
chr7 (4-130)||(15081386-15081512)
chr7 (7-136)||(21189143-21189272)
chr7 (7-135)||(1856970-1857097)
chr7 (237-340)||(13647418-13647521)
chr7 (144-246)||(45847638-45847739)
chr7 (7-136)||(8940962-8941091)
chr7 (144-266)||(38898106-38898229)
chr7 (1-135)||(13918137-13918272)
chr7 (1-103)||(10500962-10501064)
chr7 (30-136)||(14156838-14156944)
chr7 (144-266)||(8940335-8940458)
chr7 (250-340)||(44116598-44116688)
chr7 (178-266)||(8468803-8468891)
chr7 (252-340)||(20110635-20110723)
chr7 (139-219)||(38897995-38898075)
chr7 (250-340)||(12756654-12756744)
chr7 (250-340)||(17061898-17061988)
chr7 (251-340)||(3386422-3386511)
chr7 (1-136)||(17985119-17985254)
chr7 (18-136)||(45847213-45847331)
chr7 (49-137)||(11310239-11310327)
chr7 (280-340)||(24275260-24275320)
chr7 (250-340)||(38898359-38898450)
chr7 (250-330)||(19486681-19486762)
chr7 (250-340)||(2280056-2280147)
chr7 (46-113)||(11286979-11287046)
chr7 (261-340)||(15116573-15116651)
chr7 (47-113)||(125968-126034)
chr7 (252-340)||(12255730-12255819)
chr7 (145-224)||(13745569-13745648)
chr7 (261-340)||(15113036-15113114)
chr7 (144-219)||(15119918-15119993)
chr7 (267-340)||(3564319-3564392)
chr7 (250-302)||(15008436-15008489)
chr7 (250-302)||(20220127-20220180)
chr7 (145-209)||(38294567-38294631)
chr7 (97-136)||(15376351-15376390)
chr7 (97-136)||(16410544-16410583)
chr7 (97-136)||(18628051-18628090)
chr7 (97-136)||(18640757-18640796)
chr7 (97-136)||(20384761-20384800)
chr7 (97-136)||(26355619-26355658)
chr7 (97-136)||(26358071-26358110)
chr7 (47-105)||(15760779-15760837)
chr7 (30-104)||(16202778-16202852)
chr7 (250-302)||(1867932-1867985)
chr7 (267-340)||(18456368-18456441)
chr7 (18-98)||(10000996-10001076)
chr7 (7-39)||(20110747-20110779)
chr7 (7-39)||(23461832-23461864)
chr7 (145-209)||(43747672-43747736)
[»] chr3 (108 HSPs)
chr3 (1-340)||(13544114-13544451)
chr3 (1-340)||(12567649-12567987)
chr3 (1-340)||(17463267-17463605)
chr3 (1-340)||(45606641-45606980)
chr3 (1-340)||(34159415-34159753)
chr3 (1-340)||(55476580-55476918)
chr3 (1-340)||(7781081-7781420)
chr3 (1-340)||(16454015-16454354)
chr3 (1-340)||(6468869-6469207)
chr3 (1-340)||(13153990-13154328)
chr3 (1-340)||(10247458-10247796)
chr3 (1-340)||(27165340-27165680)
chr3 (1-316)||(53301238-53301554)
chr3 (7-340)||(13151531-13151863)
chr3 (1-340)||(8499607-8499948)
chr3 (7-340)||(28848362-28848684)
chr3 (1-340)||(15412518-15412859)
chr3 (7-245)||(46822445-46822683)
chr3 (1-266)||(54520985-54521250)
chr3 (1-266)||(15977696-15977960)
chr3 (1-264)||(29544576-29544839)
chr3 (1-219)||(12119388-12119606)
chr3 (5-246)||(10557091-10557332)
chr3 (1-208)||(13436520-13436727)
chr3 (144-340)||(8899183-8899378)
chr3 (144-328)||(9707484-9707668)
chr3 (58-259)||(12305315-12305516)
chr3 (144-328)||(16282689-16282872)
chr3 (144-340)||(41123976-41124171)
chr3 (144-340)||(38961769-38961964)
chr3 (1-222)||(41124146-41124367)
chr3 (7-195)||(24513910-24514098)
chr3 (1-222)||(16282492-16282714)
chr3 (1-222)||(17444498-17444719)
chr3 (2-222)||(38961573-38961794)
chr3 (2-209)||(25237063-25237270)
chr3 (1-153)||(20629926-20630078)
chr3 (2-209)||(25229476-25229683)
chr3 (1-135)||(15465448-15465582)
chr3 (2-143)||(10379613-10379754)
chr3 (7-136)||(38961385-38961514)
chr3 (1-135)||(26054999-26055133)
chr3 (1-136)||(27165738-27165873)
chr3 (1-136)||(53301045-53301180)
chr3 (1-136)||(55319038-55319173)
chr3 (1-136)||(10557394-10557529)
chr3 (1-135)||(5223677-5223811)
chr3 (226-340)||(17446614-17446728)
chr3 (15-137)||(36528447-36528569)
chr3 (10-136)||(55318854-55318980)
chr3 (7-133)||(8500009-8500135)
chr3 (2-136)||(46822747-46822881)
chr3 (7-136)||(13937520-13937649)
chr3 (7-136)||(14567432-14567561)
chr3 (7-136)||(41124425-41124554)
chr3 (237-340)||(50242911-50243014)
chr3 (237-340)||(43550448-43550551)
chr3 (144-266)||(11913928-11914051)
chr3 (7-136)||(20629739-20629868)
chr3 (250-340)||(53070636-53070726)
chr3 (28-136)||(16358236-16358344)
chr3 (250-340)||(17672715-17672805)
chr3 (7-136)||(16282305-16282434)
chr3 (250-340)||(29172565-29172656)
chr3 (7-136)||(17444311-17444440)
chr3 (29-137)||(3264323-3264431)
chr3 (144-224)||(17444694-17444773)
chr3 (1-136)||(17393201-17393336)
chr3 (250-340)||(12119707-12119798)
chr3 (250-313)||(17248224-17248287)
chr3 (250-328)||(24340660-24340739)
chr3 (250-330)||(37642202-37642283)
chr3 (144-211)||(25237009-25237075)
chr3 (252-340)||(2051138-2051227)
chr3 (261-330)||(22147474-22147543)
chr3 (72-136)||(15007988-15008052)
chr3 (1-60)||(15007868-15007927)
chr3 (252-325)||(52523666-52523740)
chr3 (250-328)||(23274792-23274871)
chr3 (46-113)||(51158683-51158750)
chr3 (47-113)||(16934851-16934917)
chr3 (1-51)||(36528340-36528390)
chr3 (267-340)||(14576788-14576861)
chr3 (7-105)||(14528625-14528723)
chr3 (298-340)||(15977604-15977646)
chr3 (47-113)||(25058301-25058367)
chr3 (145-219)||(25201323-25201397)
chr3 (251-340)||(42386503-42386593)
chr3 (47-113)||(49231771-49231837)
chr3 (47-113)||(54039167-54039233)
chr3 (48-113)||(30152453-30152518)
chr3 (252-340)||(43841025-43841114)
chr3 (1-37)||(10555766-10555802)
chr3 (1-57)||(16358402-16358458)
chr3 (97-136)||(17463663-17463702)
chr3 (97-136)||(34159811-34159850)
chr3 (97-136)||(55476976-55477015)
chr3 (7-105)||(8276474-8276572)
chr3 (189-219)||(11913867-11913897)
chr3 (145-203)||(15025934-15025992)
chr3 (47-113)||(17956869-17956935)
chr3 (29-111)||(21026101-21026183)
chr3 (220-257)||(15977663-15977700)
chr3 (144-209)||(17044330-17044395)
chr3 (267-340)||(17487949-17488022)
chr3 (267-340)||(17499431-17499504)
chr3 (252-340)||(26686980-26687069)
chr3 (267-340)||(40213676-40213749)
[»] chr1 (61 HSPs)
chr1 (1-340)||(13988955-13989293)
chr1 (1-340)||(21474821-21475160)
chr1 (1-340)||(21840856-21841194)
chr1 (1-340)||(21923026-21923364)
chr1 (1-340)||(16362006-16362346)
chr1 (4-340)||(23593471-23593808)
chr1 (1-321)||(15859743-15860062)
chr1 (1-219)||(16274990-16275209)
chr1 (144-340)||(29776777-29776972)
chr1 (1-209)||(27161321-27161529)
chr1 (1-222)||(29776947-29777168)
chr1 (144-340)||(29298225-29298420)
chr1 (1-209)||(29298461-29298669)
chr1 (7-222)||(22122755-22122970)
chr1 (144-340)||(16275240-16275437)
chr1 (144-340)||(22122945-22123140)
chr1 (144-340)||(31612402-31612597)
chr1 (7-222)||(31612572-31612787)
chr1 (7-222)||(22050577-22050792)
chr1 (1-163)||(13227129-13227291)
chr1 (1-163)||(29535317-29535479)
chr1 (7-136)||(29298727-29298856)
chr1 (7-136)||(31612851-31612980)
chr1 (4-136)||(31613044-31613176)
chr1 (7-136)||(16274803-16274932)
chr1 (144-244)||(22050767-22050866)
chr1 (1-136)||(15859537-15859672)
chr1 (7-136)||(22122561-22122691)
chr1 (7-136)||(27161134-27161263)
chr1 (1-129)||(9044739-9044867)
chr1 (1-136)||(16401407-16401542)
chr1 (1-136)||(29777226-29777361)
chr1 (237-328)||(45574812-45574903)
chr1 (250-340)||(433099-433190)
chr1 (145-233)||(27161518-27161605)
chr1 (250-340)||(13212844-13212935)
chr1 (250-340)||(21347050-21347141)
chr1 (7-126)||(40129387-40129506)
chr1 (250-340)||(21707256-21707346)
chr1 (250-340)||(21711798-21711888)
chr1 (250-340)||(21342185-21342276)
chr1 (255-340)||(40389243-40389329)
chr1 (1-61)||(43543269-43543329)
chr1 (66-136)||(10812612-10812682)
chr1 (213-266)||(43543214-43543267)
chr1 (253-340)||(21861510-21861598)
chr1 (250-340)||(21896193-21896284)
chr1 (144-209)||(29298408-29298473)
chr1 (261-308)||(16758775-16758822)
chr1 (46-113)||(21858595-21858662)
chr1 (48-113)||(44035860-44035925)
chr1 (250-321)||(35261018-35261090)
chr1 (97-136)||(13989351-13989390)
chr1 (47-113)||(21650910-21650976)
chr1 (47-105)||(22366538-22366596)
chr1 (145-226)||(12710130-12710211)
chr1 (267-340)||(27250684-27250757)
chr1 (250-302)||(41049973-41050026)
chr1 (250-301)||(16368224-16368276)
chr1 (47-107)||(16655942-16656002)
chr1 (9-105)||(18060577-18060673)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-340)||(11377-11717)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (1-340)||(9331-9669)
[»] chr5 (71 HSPs)
chr5 (1-340)||(20909101-20909439)
chr5 (1-340)||(264503-264841)
chr5 (1-340)||(39363473-39363812)
chr5 (1-340)||(10732675-10733013)
chr5 (1-340)||(39245225-39245563)
chr5 (2-340)||(42245101-42245438)
chr5 (1-340)||(29346069-29346407)
chr5 (1-340)||(29348542-29348880)
chr5 (1-340)||(29351015-29351353)
chr5 (1-340)||(38619523-38619864)
chr5 (1-340)||(23064600-23064941)
chr5 (1-340)||(2154366-2154687)
chr5 (1-245)||(17516898-17517142)
chr5 (1-266)||(37804637-37804902)
chr5 (1-219)||(20901655-20901873)
chr5 (7-266)||(9776521-9776780)
chr5 (144-328)||(32027494-32027677)
chr5 (144-328)||(20917830-20918013)
chr5 (144-340)||(29330023-29330215)
chr5 (1-209)||(20917581-20917789)
chr5 (1-222)||(32027652-32027873)
chr5 (1-222)||(29330190-29330410)
chr5 (144-340)||(20901904-20902082)
chr5 (1-136)||(17516512-17516647)
chr5 (1-136)||(20901462-20901597)
chr5 (7-136)||(32028124-32028254)
chr5 (7-136)||(29330468-29330597)
chr5 (7-136)||(32028511-32028640)
chr5 (1-136)||(296009-296144)
chr5 (7-136)||(17516711-17516840)
chr5 (11-136)||(295826-295951)
chr5 (7-136)||(2154179-2154308)
chr5 (4-136)||(20917391-20917523)
chr5 (1-136)||(32027931-32028066)
chr5 (250-340)||(36154766-36154856)
chr5 (1-136)||(32028318-32028453)
chr5 (252-340)||(11581184-11581272)
chr5 (255-340)||(18319021-18319107)
chr5 (250-340)||(10775659-10775749)
chr5 (255-340)||(24067196-24067282)
chr5 (250-340)||(31061157-31061248)
chr5 (250-330)||(40725956-40726037)
chr5 (267-340)||(22144142-22144215)
chr5 (46-113)||(27183208-27183275)
chr5 (7-113)||(22883904-22884010)
chr5 (148-219)||(18743965-18744036)
chr5 (7-105)||(11914-12012)
chr5 (7-105)||(25426188-25426286)
chr5 (7-105)||(43444009-43444107)
chr5 (47-113)||(1220384-1220450)
chr5 (145-219)||(1628169-1628243)
chr5 (7-113)||(7424880-7424986)
chr5 (47-113)||(10778832-10778898)
chr5 (144-222)||(20917777-20917855)
chr5 (47-105)||(21074249-21074307)
chr5 (48-113)||(23511130-23511195)
chr5 (147-219)||(21399896-21399968)
chr5 (97-136)||(264406-264445)
chr5 (97-136)||(20909497-20909536)
chr5 (97-136)||(39245621-39245660)
chr5 (97-136)||(39363869-39363908)
chr5 (47-113)||(1168832-1168898)
chr5 (47-113)||(11212734-11212800)
chr5 (19-105)||(11342201-11342287)
chr5 (7-105)||(22367095-22367193)
chr5 (267-340)||(9078045-9078118)
chr5 (267-340)||(25421625-25421698)
chr5 (267-340)||(25431487-25431560)
chr5 (145-209)||(20198507-20198571)
chr5 (47-107)||(28901495-28901555)
chr5 (47-107)||(28937890-28937950)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (1-340)||(134300-134638)
scaffold0028 (1-340)||(136769-137107)
scaffold0028 (1-340)||(139238-139576)
scaffold0028 (1-340)||(141707-142045)
scaffold0028 (1-340)||(144176-144514)
[»] scaffold0444 (2 HSPs)
scaffold0444 (1-340)||(13481-13820)
scaffold0444 (96-136)||(13878-13918)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (1-340)||(40489-40827)
scaffold0044 (7-113)||(37863-37968)
scaffold0044 (96-136)||(40885-40925)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (1-306)||(6070-6374)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (59-340)||(10862-11142)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (2-266)||(3186-3450)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (2-340)||(501173-501491)
scaffold0001 (10-136)||(501550-501676)
scaffold0001 (250-340)||(85562-85653)
scaffold0001 (18-74)||(139589-139645)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (7-340)||(38396-38730)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (7-266)||(53612-53873)
scaffold0022 (250-301)||(78453-78505)
[»] scaffold0741 (4 HSPs)
scaffold0741 (1-266)||(4037-4304)
scaffold0741 (1-136)||(3844-3979)
scaffold0741 (1-132)||(3651-3782)
scaffold0741 (84-136)||(3541-3593)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (28-266)||(1591-1829)
[»] scaffold0306 (4 HSPs)
scaffold0306 (9-266)||(15083-15342)
scaffold0306 (1-178)||(11074-11251)
scaffold0306 (7-136)||(10887-11016)
scaffold0306 (7-136)||(15398-15526)
[»] scaffold0043 (4 HSPs)
scaffold0043 (9-219)||(10001-10211)
scaffold0043 (1-136)||(10277-10412)
scaffold0043 (4-136)||(10470-10602)
scaffold0043 (144-178)||(9936-9970)
[»] scaffold0317 (2 HSPs)
scaffold0317 (1-266)||(6670-6937)
scaffold0317 (7-136)||(6483-6612)
[»] scaffold0494 (3 HSPs)
scaffold0494 (1-219)||(258-476)
scaffold0494 (212-340)||(12194-12322)
scaffold0494 (144-219)||(507-582)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (1-219)||(30229-30447)
scaffold0149 (146-340)||(30021-30196)
scaffold0149 (1-136)||(30505-30640)
[»] scaffold1792 (3 HSPs)
scaffold1792 (7-220)||(416-629)
scaffold1792 (1-136)||(853-988)
scaffold1792 (50-136)||(693-779)
[»] scaffold0747 (4 HSPs)
scaffold0747 (12-219)||(799-1006)
scaffold0747 (1-136)||(1075-1210)
scaffold0747 (144-266)||(645-768)
scaffold0747 (7-106)||(1225-1323)
[»] scaffold0574 (2 HSPs)
scaffold0574 (1-208)||(6682-6879)
scaffold0574 (1-136)||(6937-7072)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (19-211)||(13379-13571)
scaffold0040 (9-166)||(43002-43159)
scaffold0040 (7-136)||(43225-43354)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (1-163)||(68227-68389)
[»] scaffold0278 (3 HSPs)
scaffold0278 (1-168)||(8000-8167)
scaffold0278 (1-136)||(8225-8360)
scaffold0278 (1-133)||(8421-8553)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (45-202)||(57708-57865)
[»] scaffold1296 (2 HSPs)
scaffold1296 (7-136)||(1740-1869)
scaffold1296 (1-49)||(1634-1682)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (7-136)||(8311-8440)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (1-136)||(18423-18558)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (1-135)||(17947-18081)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (1-135)||(39626-39760)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (1-135)||(31497-31631)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (144-260)||(27958-28073)
scaffold0114 (80-222)||(28048-28190)
[»] scaffold0145 (2 HSPs)
scaffold0145 (144-340)||(9838-10016)
scaffold0145 (146-208)||(10005-10067)
[»] scaffold0711 (3 HSPs)
scaffold0711 (1-135)||(7424-7558)
scaffold0711 (12-136)||(7243-7367)
scaffold0711 (41-134)||(7079-7172)
[»] scaffold0151 (2 HSPs)
scaffold0151 (10-136)||(36749-36875)
scaffold0151 (7-136)||(36939-37068)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (7-135)||(19829-19957)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (237-340)||(195-298)
[»] scaffold0513 (2 HSPs)
scaffold0513 (132-219)||(10647-10734)
scaffold0513 (144-266)||(10765-10886)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (237-340)||(12147-12250)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (237-340)||(82161-82264)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (1-135)||(33465-33599)
scaffold0138 (251-340)||(18176-18265)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (250-340)||(158433-158523)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (144-266)||(15150-15273)
scaffold0106 (120-219)||(15030-15119)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (250-340)||(4386-4476)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (250-340)||(16873-16963)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (250-328)||(79267-79345)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (250-340)||(20363-20452)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (237-340)||(1250-1354)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (156-266)||(35955-36065)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (250-340)||(4303-4393)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (250-340)||(2111-2202)
scaffold0247 (250-328)||(17964-18043)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (250-340)||(164573-164664)
scaffold0007 (250-340)||(161072-161163)
[»] scaffold0599 (2 HSPs)
scaffold0599 (144-266)||(1204-1327)
scaffold0599 (189-219)||(1143-1173)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (272-340)||(13097-13165)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (250-323)||(12039-12112)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (250-340)||(27686-27777)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (31-113)||(113332-113414)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (250-330)||(11567-11648)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (250-330)||(38193-38274)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (250-340)||(16037-16128)
scaffold0357 (250-308)||(13254-13313)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (250-340)||(53486-53577)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (7-113)||(6196-6302)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (250-325)||(225514-225590)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (7-113)||(8569-8675)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (7-113)||(30473-30579)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (1-51)||(75639-75689)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (45-113)||(12519-12587)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (250-340)||(7996-8087)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (7-113)||(728-834)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (267-340)||(3485-3558)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (48-113)||(15781-15846)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (252-340)||(8559-8650)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (250-325)||(60652-60728)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (18-113)||(32118-32213)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (145-224)||(15282-15361)
[»] scaffold0123 (3 HSPs)
scaffold0123 (146-209)||(16263-16326)
scaffold0123 (250-302)||(667-720)
scaffold0123 (250-302)||(25237-25289)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (18-113)||(40631-40726)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (46-113)||(39968-40035)
scaffold0034 (46-113)||(45451-45518)
scaffold0034 (46-113)||(79006-79073)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (47-113)||(1378-1444)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (47-113)||(913-979)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (47-113)||(6970-7036)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (47-113)||(1296-1362)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (7-113)||(110065-110171)
scaffold0035 (7-113)||(118566-118672)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (267-340)||(3106-3179)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (252-340)||(13185-13274)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (267-340)||(27923-27996)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (252-340)||(8472-8561)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (46-113)||(871-938)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (250-340)||(6220-6310)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (250-340)||(12661-12751)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (46-105)||(53957-54016)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (46-113)||(19939-20006)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (7-50)||(398-441)
scaffold0021 (267-340)||(124678-124751)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (261-340)||(52006-52085)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (250-340)||(97100-97190)
scaffold0006 (250-340)||(106378-106468)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (47-113)||(18208-18274)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (7-113)||(28472-28578)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (267-340)||(435-508)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (267-340)||(22975-23048)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (267-340)||(4600-4673)
scaffold0228 (267-340)||(12182-12255)
scaffold0228 (267-340)||(22134-22207)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (267-340)||(13304-13377)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (267-340)||(39569-39642)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (267-340)||(26020-26093)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (267-340)||(75170-75243)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (267-340)||(25988-26061)
scaffold0026 (267-340)||(39950-40023)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 88)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 30676444 - 30676783
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30676444 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaataatttatagaacttgag 30676543  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676544 ttatggtaaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 30676643  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676644 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 30676743  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  30676744 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 30676783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 34963801 - 34963462
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34963801 gtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 34963702  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963701 ttatggtcaaattactgcacatagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 34963602  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963601 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 34963502  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  34963501 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 34963462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24422974 - 24422636
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422974 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 24422875  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24422874 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 24422776  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24422775 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 24422676  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24422675 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 24422636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 33862221 - 33861883
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33862221 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 33862122  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  33862121 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 33862023  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33862022 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 33861923  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  33861922 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 33861883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 33864705 - 33864367
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864705 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 33864606  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  33864605 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 33864507  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33864506 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 33864407  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  33864406 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 33864367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12742739 - 12742406
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12742739 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 12742640  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 206  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  12742639 tcaaattactgcaagtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgaccttgtccatgattgat 12742540  T
Q  207 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtga 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12742539 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 12742440  T
Q  307 ataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12742439 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 12742406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 18334327 - 18334665
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334327 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 18334426  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18334427 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 18334525  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18334526 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 18334625  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18334626 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 18334665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 1540652 - 1540984
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1540652 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 1540751  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 206  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1540752 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 1540850  T
Q  207 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtga 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1540851 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtga 1540950  T
Q  307 ataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  1540951 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 1540984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 8055457 - 8055118
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8055457 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 8055358  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  || | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8055357 ttatggtcaaattactgaatgtaggtcacaatgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 8055258  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8055257 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 8055158  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  8055157 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 8055118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 26924375 - 26924713
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26924375 gtacagaattgttcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 26924474  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  26924475 ttatggtcaaattactgcacgtacgtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 26924573  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26924574 attgatgaagtgttatatgtacatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 26924673  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26924674 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 26924713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 25688924 - 25688591
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  25688924 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttgtaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaaattgagttatgg 25688825  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 206  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  25688824 tcaaattactgcacgtaggtgacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatttttgtgaatacgatattgtccatgattgag 25688725  T
Q  207 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtga 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25688724 gaagtgttatatgtataaatgatgttttaagatgttgattaccatttggtgttgttatattgtgatatgattatatatgtattacttgaattatatgtga 25688625  T
Q  307 ataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  25688624 ataattgagacgttgttgacttgcagttgatatt 25688591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 2290915 - 2291253
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2290915 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagag 2291014  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2291015 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 2291113  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2291114 actgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 2291213  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  2291214 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 2291253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22782654 - 22782316
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  22782654 gtacagaattggtcttaggtgtaagtaggaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaatttgag 22782555  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  22782554 ttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatatgatattgtccatg 22782456  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22782455 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 22782356  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22782355 gtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 22782316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 19858657 - 19858992
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858657 gtacataattgatcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgt---ctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 19858753  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  19858754 ttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgct-gtgaatacgatattgtccatg 19858852  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19858853 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattgttatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 19858952  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19858953 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 19858992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 17377582 - 17377814
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17377582 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaagtatttatagaacttgag 17377681  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17377682 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaaatagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatg 17377781  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17377782 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 17377814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 28289071 - 28289334
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28289071 gtacataattggtctcaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 28289170  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||   ||||||||| ||||    
T  28289171 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtga--gcgatattgtccatg 28289268  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28289269 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgtcgttatat 28289334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 19847706 - 19848023
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847706 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgc----tagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 19847801  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19847802 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 19847901  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19847902 attgatgaagtgttatatgtatatatgatg-------------------atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattat 19847982  T
Q  301 atgtg-aataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||| |||| || |||  ||||||| || |||||||||||    
T  19847983 atgtgaaatatttaagatattgttgaattgcaattgatatt 19848023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1598484 - 1598266
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598484 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 1598385  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    | || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1598384 tcatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 1598286  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1598285 attgatgaagtgttatatgt 1598266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18914360 - 18914142
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18914360 gtacataattggtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaactttctaatgctgttggtttaacttcaaaaggatgtatagaacttgag 18914261  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18914260 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtaaatacgatattgttcatg 18914161  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18914160 attgatgaagtgttatatg 18914142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 12942617 - 12942363
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||            |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12942617 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta------------agctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 12942530  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  12942529 ttatggtcgaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatg 12942430  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12942429 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 12942363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 31630275 - 31630493
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31630275 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgtaggtatagacgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 31630374  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31630375 ttatggtcaaattattgcacgtatgtcacaatgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 31630474  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  31630475 attgataaagtgttatatg 31630493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23992844 - 23992604
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23992844 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtcagctttctaatgttgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 23992745  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 206  Q
    |||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23992744 tcaatttactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 23992646  T
Q  207 gaagtgttatatgtatat---atgatgttttaagatgttgat 245  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  23992645 gaagtgttatatgtatatatgatgatgttttaagatgttgat 23992604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 144 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 19005330 - 19005135
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005330 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 19005232  T
Q  244 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19005231 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 19005135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19005579 - 19005361
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005579 gtacataattagtcttaggtgtaaacacaaaaattgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 19005480  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||     
T  19005479 ttatggtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattactataggtatgtatatgtttgtgaatgcgatattgttcata 19005380  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  19005379 attgatgaaatgttatatg 19005361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 25535829 - 25535641
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25535829 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 25535730  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgt 195  Q
    |||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25535729 tcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 25535641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 161 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 25656897 - 25656718
Alignment:
Q  161 tatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg 260  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25656897 tatatgtatgtatatatttgtgactacgatattgtccaagattgatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgttt 25656798  T
Q  261 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||    
T  25656797 ttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatatt 25656718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 1899 - 2034
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  1899 gtacataattggtcttaggtgtacacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 1998  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1999 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 2034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 8858 - 8993
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  8858 gtacataattggtcttaggtgtacacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 8957  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8958 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 8993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 215 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 1595763 - 1595638
Alignment:
Q  215 atatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattga 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1595763 atatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattga 1595664  T
Q  315 gacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||| || || ||||||||    
T  1595663 gacgttgttgaattgcatttgatatt 1595638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 1598677 - 1598542
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  1598677 gtacataaatggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacatcaaaacaatttatagaacttgag 1598578  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1598577 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1598542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 19005772 - 19005637
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19005772 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacttcaaaacgatttatagaacttgag 19005673  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  19005672 ttatgttcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19005637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 19847513 - 19847648
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  19847513 gtacataattggtcctaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattagtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 19847612  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  19847613 ttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19847648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 27557150 - 27557016
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||||||||||||||    
T  27557150 gtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacgttaaaacaatttatagaacttgag 27557051  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaa 135  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  27557050 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 27557016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 144 - 246
Target Start/End: Original strand, 31630524 - 31630626
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31630524 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 31630623  T
Q  244 att 246  Q
    |||    
T  31630624 att 31630626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 144 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18914111 - 18913994
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18914111 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtta-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 18914013  T
Q  244 attaccatttgatgttgtt 262  Q
    ||||  |||||||||||||    
T  18914012 attattatttgatgttgtt 18913994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 23415392 - 23415258
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  23415392 gtacagaatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccattggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgag 23415293  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaa 135  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  23415292 ttatggtcaagttactgcacgtaggtcactgtgaa 23415258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 18914553 - 18914422
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||  |||||| |||| ||||||||||||    
T  18914553 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaataccgttggtctgaagtcaaaacgattgatagaacttgag 18914454  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagt 132  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  18914453 ttatggtcaaagtactgcacgtaggtcacagt 18914422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 237 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 25755001 - 25754898
Alignment:
Q  237 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattga 336  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  25755001 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 25754902  T
Q  337 tatt 340  Q
    ||||    
T  25754901 tatt 25754898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 30676251 - 30676386
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  30676251 gtacataattggtcttaggtgataagactaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttgctctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 30676350  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  30676351 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 30676386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 144 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15875590 - 15875469
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15875590 tatgattgatgaattattatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtaaatgattaatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 15875492  T
Q  244 attaccatttgatgttgttatat 266  Q
    ||||  |||||||||||||||||    
T  15875491 attattatttgatgttgttatat 15875469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 31630082 - 31630194
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  31630082 gtacatagttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagttatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 31630181  T
Q  101 ttatggtcaaatt 113  Q
    |||||||||||||    
T  31630182 ttatggtcaaatt 31630194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 93 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15875737 - 15875621
Alignment:
Q  93 aacttgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatat 192  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||    
T  15875737 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtaaataattgaatatgattgatgaattagtat----------atgtttgtgaatacgatat 15875648  T
Q  193 tgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  15875647 tgttcatgattgatgaagtgttatatg 15875621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25689123 - 25688988
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||  |||||||||||||| |    
T  25689123 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtcggacgtcaaaaaaatttatagaacttgcg 25689024  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||    
T  25689023 ttatggtcatattactgcacgtaggtcatagtgaat 25688988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18456898 - 18456808
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18456898 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 18456808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 1598864 - 1598735
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||| || ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1598864 aattggtcataagtgtaaacattaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgacgttaaaacgatttatagaacttgagttatgg 1598765  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1598764 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1598735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 18914740 - 18914615
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| | ||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18914740 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgtcgttggtctgacatcaaaaaaatttatagaacttgagttatgg 18914641  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagt 132  Q
    |||||||  |||||||||||||||||    
T  18914640 tcaaattactgcacgtaggtcacagt 18914615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25689310 - 25689181
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| | ||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25689310 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtgtggatgtcagcattctaatgacgttggtctgacatcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 25689211  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  25689210 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 25689181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 15892143 - 15892231
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggattta 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15892143 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattta 15892231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 107 - 242
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  107 gtacaaaattggtcttaggtgtatacacgaaagttgaaggtatggatgttagttttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatataacttgag 206  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||    
T  207 ttatggtcaaagtactgcacgtaggtcatagtgaat 242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 237 - 340
Target Start/End: Original strand, 20556864 - 20556965
Alignment:
Q  237 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattga 336  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||    
T  20556864 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga--aattgagacgttgttgacttgcatttga 20556961  T
Q  337 tatt 340  Q
    ||||    
T  20556962 tatt 20556965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 26924182 - 26924313
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||| | ||| |||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  26924182 gtacagaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 26924281  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagt 132  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26924282 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 26924313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 251 - 328
Target Start/End: Original strand, 3852001 - 3852078
Alignment:
Q  251 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactt 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3852001 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactt 3852078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25737247 - 25737128
Alignment:
Q  17 aggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattgtt 116  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||  |    
T  25737247 aggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacatgagttatggtcatattact 25737148  T
Q  117 gcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  25737147 gcatgtaggtcacagtgaat 25737128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 255 - 340
Target Start/End: Original strand, 16448514 - 16448600
Alignment:
Q  255 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  16448514 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 16448600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 136
Target Start/End: Original strand, 22981321 - 22981416
Alignment:
Q  41 tatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  22981321 tatggatgttagctttctaatgccgttggtcgggcgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 22981416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23807087 - 23806992
Alignment:
Q  41 tatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  23807087 tatggatgttagctttctaatgccgttggtcgggcgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23806992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 197 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18937317 - 18937252
Alignment:
Q  197 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18937317 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 18937252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 280 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18462028 - 18461968
Alignment:
Q  280 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18462028 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 18461968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 250 - 330
Target Start/End: Original strand, 8227448 - 8227529
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttac 330  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||    
T  8227448 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttac 8227529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 17883232 - 17883305
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttga 74  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  17883232 gtacagaattggtctttggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcattctaatgtcgttggtttga 17883305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 25644487 - 25644414
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  25644487 tgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatatt 25644414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 113
Target Start/End: Original strand, 19984130 - 19984225
Alignment:
Q  18 ggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19984130 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatgactttggtttgacctccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 19984225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 16240405 - 16240299
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||| ||||||||||||     
T  16240405 aattggacttcggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttaggacttgagttatga 16240306  T
Q  107 tcaaatt 113  Q
    |||||||    
T  16240305 tcaaatt 16240299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 16556945 - 16557051
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  16556945 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 16557044  T
Q  107 tcaaatt 113  Q
    |||||||    
T  16557045 tcaaatt 16557051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 16633501 - 16633607
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  16633501 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 16633600  T
Q  107 tcaaatt 113  Q
    |||||||    
T  16633601 tcaaatt 16633607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 16650175 - 16650281
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| || || ||||||||||||||||     
T  16650175 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgaattttagaacttgagttatga 16650274  T
Q  107 tcaaatt 113  Q
    |||||||    
T  16650275 tcaaatt 16650281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Original strand, 27654597 - 27654695
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 105  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||||||| ||    |||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  27654597 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 27654695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 252 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20109322 - 20109231
Alignment:
Q  252 ttgatgttgtt-atattgtgatataat--tatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| || ||||||||    
T  20109322 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatatt 20109231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 25904584 - 25904477
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaagga-tttatagaacttgagttatg 105  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| || ||| ||||||||||||||||    
T  25904584 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttttagaacttgagttatg 25904485  T
Q  106 gtcaaatt 113  Q
     |||||||    
T  25904484 atcaaatt 25904477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 113
Target Start/End: Original strand, 35016043 - 35016110
Alignment:
Q  46 atgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  35016043 atgttagctttctaatggctttgctttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 35016110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 35056781 - 35056707
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||  ||| || ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  35056781 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgattatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 35056707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Original strand, 25629310 - 25629383
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  25629310 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatatt 25629383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 62
Target Start/End: Original strand, 10905416 - 10905460
Alignment:
Q  18 ggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 62  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10905416 ggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaatg 10905460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 113
Target Start/End: Original strand, 22226608 - 22226676
Alignment:
Q  46 atgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaagga-tttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| || ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22226608 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttttagaacttgagttatgatcaaatt 22226676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 113
Target Start/End: Original strand, 22593620 - 22593688
Alignment:
Q  45 gatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  22593620 gatgttagctttctaatggatttagtttgacttccaaatgatttttataacttgagttatgatcaaatt 22593688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Original strand, 18334230 - 18334269
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18334230 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18334269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 105
Target Start/End: Original strand, 21776107 - 21776194
Alignment:
Q  18 ggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 105  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  21776107 ggtgtaaacatgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggctttggtttgacgccaaaatgatttttagaacttgagatatg 21776194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 24423071 - 24423032
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24423071 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24423032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 33864802 - 33864763
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  33864802 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 33864763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 1555596 - 1555538
Alignment:
Q  47 tgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 105  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  1555596 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 1555538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 105
Target Start/End: Original strand, 16826408 - 16826466
Alignment:
Q  47 tgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 105  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  16826408 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 16826466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 211
Target Start/End: Original strand, 17883303 - 17883333
Alignment:
Q  181 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17883303 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 17883333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 19609689 - 19609583
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || |||  |||| ||||||||||| ||||     
T  19609689 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaataatttttagaacttgagatatga 19609590  T
Q  107 tcaaatt 113  Q
    |||||||    
T  19609589 tcaaatt 19609583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 25737070 - 25737028
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtat 43  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25737070 gtacagaattcgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 25737028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 32259136 - 32259078
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgatt 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||    
T  32259136 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgatt 32259078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15875642 - 15875565
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 222  Q
    |||||||||||| |  |||||| | |||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  15875642 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattattatatgtat 15875565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Original strand, 20360915 - 20360988
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||    
T  20360915 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 20360988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 23076915 - 23076862
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 302  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  23076915 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatat 23076862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 98)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 16413050 - 16413389
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16413050 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgacagttgtaggtatggatgttagcttgctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 16413149  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413150 ttatggtcaaattacttcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 16413249  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413250 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 16413349  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16413350 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 16413389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 1484829 - 1484491
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484829 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 1484730  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  1484729 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 1484631  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1484630 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 1484531  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  1484530 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 1484491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 14409179 - 14409517
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409179 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 14409278  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  14409279 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 14409377  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14409378 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 14409477  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  14409478 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 14409517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 4483708 - 4483369
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483708 gtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 4483609  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4483608 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacactgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatg 4483509  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4483508 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 4483409  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  4483408 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 4483369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 5853027 - 5853365
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5853027 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagag 5853126  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  5853127 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 5853225  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5853226 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 5853325  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  5853326 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 5853365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 24485778 - 24486093
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24485778 gtacagaattggtcttgggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttataaaacttgag 24485877  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24485878 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 24485977  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24485978 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttctaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 24486077  T
Q  301 atgtgaataattgaga 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  24486078 atgtgaataattgaga 24486093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 14824196 - 14823862
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14824196 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 14824097  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 206  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  14824096 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatg-ttgtaaatacgatattatccatgattgat 14823998  T
Q  207 gaagtgttatatg--tatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgt 304  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14823997 gaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgt 14823898  T
Q  305 gaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  14823897 gaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 14823862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22002180 - 22001842
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22002180 gtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgag 22002081  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22002080 ttatagtcaaattactgcacgtaggtaacattgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 22001982  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22001981 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 22001882  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22001881 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 22001842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 20045930 - 20046268
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20045930 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttcacttcaaaaggatttatagaacttgag 20046029  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  20046030 ttatagtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattttccatg 20046128  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20046129 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 20046228  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20046229 atgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 20046268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 4542108 - 4542446
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  4542108 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttcgcttgacttcaaaatgatttatagaactagag 4542207  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  4542208 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcgcagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 4542306  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  4542307 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaactat 4542406  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  4542407 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 4542446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15070988 - 15070647
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  15070988 gtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttaaaaatgatttatacaacttgag 15070889  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15070888 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 15070789  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatta 299  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  15070788 attgatgaagttttatatgtatttatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattcagatataattgtatatgcatcaattagatta 15070689  T
Q  300 tatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatatt 340  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  15070688 tctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 15070647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 27472151 - 27472395
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27472151 gtacataattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 27472250  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27472251 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 27472350  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 246  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27472351 attgatgaagttttatatgtatatatgatg-tttaagatgttgatt 27472395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32122156 - 32121912
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32122156 gtacagaattgttcttaggtgtaaacacgaatgttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 32122057  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32122056 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgcatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 32121957  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 245  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32121956 attgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgat 32121912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 18677799 - 18678043
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18677799 gtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgag 18677898  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  18677899 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatgtatatgtatatgtttgtgaatacgatattatccatg 18677998  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 245  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18677999 attgatgaagtgttatatttatgtatgatgttttaagatgttgat 18678043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Original strand, 25657893 - 25658094
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25657893 aattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgtttgtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 25657992  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 206  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  25657993 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatttgatattgttcatgattgat 25658092  T
Q  207 ga 208  Q
    ||    
T  25658093 ga 25658094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 144 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20403511 - 20403316
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403511 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 20403413  T
Q  244 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20403412 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 20403316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16198322 - 16198115
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  16198322 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccgttggtttgactttaaaaatatttatagaacttgag 16198223  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16198222 ttatggtccaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 16198123  T
Q  201 attgatga 208  Q
    ||||||||    
T  16198122 attgatga 16198115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 217
Target Start/End: Original strand, 16401660 - 16401875
Alignment:
Q  2 tacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16401660 tacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattgatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagt 16401759  T
Q  102 tatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatga 201  Q
    ||| |||| |||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16401760 tatagtcagattacagcaggtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatactatattgttcatga 16401859  T
Q  202 ttgatgaagtgttata 217  Q
    ||||||||||||||||    
T  16401860 ttgatgaagtgttata 16401875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 144 - 340
Target Start/End: Original strand, 15203109 - 15203304
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203109 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaataagatattatccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 15203207  T
Q  244 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15203208 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatatt 15203304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Original strand, 38549745 - 38549957
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38549745 aattggtcttaggtataaacacaaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 38549844  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 206  Q
    ||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38549845 tcaaaatactgcacgtatgtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 38549944  T
Q  207 gaagtgttatatg 219  Q
    ||| | |||||||    
T  38549945 gaatttttatatg 38549957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 24049038 - 24048841
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24049038 gtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaacaatttatagaacttgag 24048939  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcat 199  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24048938 ttatggtcaaattactgca-gtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtncat 24048841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 1326666 - 1326884
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  1326666 gtacagaattggtcttaagtgtaaaaacgaaagttgtaggtatgaatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttataaaacttgag 1326765  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  1326766 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtacatgtttgtaaatacgatattgtttatg 1326865  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1326866 attgatgaagtgttatatg 1326884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 144 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 19896553 - 19896357
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttt-aagatgtt 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19896553 tatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatatttttaagatgtt 19896455  T
Q  243 gattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19896454 gattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 19896357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 15202913 - 15203134
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15202913 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgag 15203012  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||| || ||| || || |||    
T  15203013 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttatttatg 15203112  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtat 222  Q
    ||||||||| |  |||||||||    
T  15203113 attgatgaattagtatatgtat 15203134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 144 - 340
Target Start/End: Original strand, 45290572 - 45290768
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290572 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 45290670  T
Q  244 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  45290671 attattatttgacgttgttatactgtgatataattgtatctgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattggcttacatttgatatt 45290768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 222
Target Start/End: Original strand, 45290385 - 45290597
Alignment:
Q  10 tggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtca 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290385 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtca 45290484  T
Q  110 aattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  45290485 aattactgcacgtagatcatagtgaataattgaatatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 45290584  T
Q  210 gtgttatatgtat 222  Q
     |  |||||||||    
T  45290585 ttagtatatgtat 45290597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 19936642 - 19936850
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19936642 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgtcattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 19936741  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
     ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||          |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19936742 gtatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgtttatgattgatgaatta----------gtatatgtttgtgaatattatattgttcatg 19936831  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19936832 attgatgaagtgttatatg 19936850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 144 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 32810215 - 32810054
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32810215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatgttg 32810117  T
Q  244 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtga 306  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32810116 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 32810054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20403706 - 20403486
Alignment:
Q  2 tacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagt 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20403706 tacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttgaaaaggatttatagaacttgagt 20403607  T
Q  102 tatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatga 201  Q
    ||| |||| |||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| || ||| ||||| ||||    
T  20403606 tattgtcatattactgcgcgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatga 20403507  T
Q  202 ttgatgaagtgttatatgtat 222  Q
    |||||||| |  |||||||||    
T  20403506 ttgatgaattagtatatgtat 20403486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19896743 - 19896524
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19896743 aattggtcttaggtgtaaacacgaaaattgtaggtatgaattttaactttctagcgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 19896644  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 206  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||    
T  19896643 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatgtgattgatgaattaggatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 19896544  T
Q  207 gaagtgttatatgtatatat 226  Q
    ||| |  |||||||||||||    
T  19896543 gaattagtatatgtatatat 19896524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 15202720 - 15202856
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15202720 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgctattggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgag 15202819  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaata 137  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15202820 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaata 15202856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 145 - 337
Target Start/End: Original strand, 19936882 - 19937076
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaa--gatgtt 242  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||    
T  19936882 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgtt 19936980  T
Q  243 gattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgat 337  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  19936981 gattatcatttgatgttgttatattgtgatataactgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattgagacgttgattgacttgcatttgat 19937076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 19896942 - 19896807
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19896942 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaacgatttatagaacttgag 19896843  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  19896842 ttatggtcaaattactgcaagtaggtcacagtgaat 19896807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 20403899 - 20403765
Alignment:
Q  2 tacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20403899 tacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaggatttatagaacttgagt 20403800  T
Q  102 tatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20403799 tatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20403765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 27471958 - 27472093
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27471958 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 27472057  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27472058 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27472093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 32122343 - 32122214
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32122343 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 32122244  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  32122243 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 32122214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 14397475 - 14397609
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14397475 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagctgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttgtagaacttgag 14397574  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaa 135  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14397575 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 14397609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 136
Target Start/End: Original strand, 16401287 - 16401408
Alignment:
Q  15 ttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattg 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16401287 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaatta 16401386  T
Q  115 ttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
      ||||||||||||||||||||    
T  16401387 cagcacgtaggtcacagtgaat 16401408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 38549546 - 38549681
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38549546 gtacagaattgatcttaggtataaacacggaagttgtaggtatggatgttagctttttaattccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 38549645  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  38549646 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 38549681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 45290282 - 45290389
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290282 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 45290381  T
Q  101 ttatggtc 108  Q
    ||||||||    
T  45290382 ttatggtc 45290389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 144 - 246
Target Start/End: Original strand, 38549988 - 38550090
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38549988 tatgattgatgaattagtatacgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 38550087  T
Q  244 att 246  Q
    |||    
T  38550088 att 38550090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 15071175 - 15071046
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15071175 aattgatcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 15071076  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  || ||||||||||||||||||    
T  15071075 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 15071046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Original strand, 15202533 - 15202662
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15202533 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 15202632  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  15202633 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 15202662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 16401466 - 16401578
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16401466 gtacgtaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaacgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 16401565  T
Q  101 ttatggtcaaatt 113  Q
    |||||||||||||    
T  16401566 ttatggtcaaatt 16401578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 38549354 - 38549488
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  38549354 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctaatgtcgttggtatgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 38549453  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  38549454 ttatggtcaaattactgcacgtagg-cacagtgaat 38549488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 16412857 - 16412992
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||  |||||| |||||||||||||||||    
T  16412857 gtacagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaaagatttatagaacttgag 16412956  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  16412957 ttatggtcaaattactatacgtaggtcacagtgaat 16412992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 24049225 - 24049104
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24049225 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatgg 24049126  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtca 128  Q
    |||||||  |||||||||||||    
T  24049125 tcaaattactgcacgtaggtca 24049104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 41598367 - 41598277
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  41598367 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 41598277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 19897129 - 19897000
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19897129 aattggtcttagctgtaaatacaaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 19897030  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  19897029 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 19897000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 144 - 246
Target Start/End: Original strand, 20982604 - 20982710
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgt----tatatgtatatatgatgttttaagat 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20982604 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatatatatatatatgatgttttaagat 20982703  T
Q  240 gttgatt 246  Q
    |||||||    
T  20982704 gttgatt 20982710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 237 - 340
Target Start/End: Original strand, 25484245 - 25484348
Alignment:
Q  237 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattga 336  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  25484245 gatgttgattatgatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 25484344  T
Q  337 tatt 340  Q
    ||||    
T  25484345 tatt 25484348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Original strand, 13425336 - 13425411
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13425336 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 13425411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Original strand, 20982498 - 20982573
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20982498 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 20982573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 144 - 266
Target Start/End: Original strand, 1326915 - 1327042
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgt------tatatgtatatatgatgttttaag 237  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||      |||||||||||| |||||||| ||    
T  1326915 tatgattgatgaattggtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatatatatgtatatacgatgttttgag 1327013  T
Q  238 atgttgattaccatttgatgttgttatat 266  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1327014 atgttgattattatttgatgttgttatat 1327042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Original strand, 19936455 - 19936584
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||| || | | |||| ||||||||||||||||||||||     
T  19936455 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtagctatggatattagctttctaattccgttggtctggcgttaaaacgatttatagaacttgagttatgc 19936554  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  19936555 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 19936584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 252 - 328
Target Start/End: Original strand, 19801367 - 19801443
Alignment:
Q  252 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactt 328  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19801367 ttgatgttgttatattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactt 19801443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 255
Target Start/End: Original strand, 16401908 - 16402020
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  16401908 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 16402006  T
Q  242 tgattaccatttga 255  Q
    |||||| |||||||    
T  16402007 tgattatcatttga 16402020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26224098 - 26224008
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  26224098 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatatt 26224008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 11361134 - 11361025
Alignment:
Q  4 cataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  11361134 cataattggtcttaggtgtaaacacaaaacttgtaggtatggatgttagctttctaatactgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttaagtta 11361035  T
Q  104 tggtcaaatt 113  Q
    | || |||||    
T  11361034 tagttaaatt 11361025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 155 - 219
Target Start/End: Original strand, 13425241 - 13425305
Alignment:
Q  155 aattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13425241 aattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 13425305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 328
Target Start/End: Original strand, 13508022 - 13508101
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactt 328  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  13508022 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttactt 13508101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 328
Target Start/End: Original strand, 13597554 - 13597633
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactt 328  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||    
T  13597554 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttactt 13597633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 32810318 - 32810263
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 62  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32810318 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttgtaatg 32810263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 261 - 330
Target Start/End: Original strand, 17612059 - 17612128
Alignment:
Q  261 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttac 330  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||    
T  17612059 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttac 17612128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20498746 - 20498655
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||||| || ||||||||    
T  20498746 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatatt 20498655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 113
Target Start/End: Original strand, 24717722 - 24717817
Alignment:
Q  18 ggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||   ||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  24717722 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagatttctaatgcctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 24717817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 15319989 - 15320095
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  15319989 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataactatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 15320088  T
Q  107 tcaaatt 113  Q
    |||||||    
T  15320089 tcaaatt 15320095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 15500358 - 15500464
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  15500358 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataactatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 15500457  T
Q  107 tcaaatt 113  Q
    |||||||    
T  15500458 tcaaatt 15500464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 29759498 - 29759432
Alignment:
Q  47 tgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  29759498 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 29759432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21513707 - 21513636
Alignment:
Q  148 attgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  21513707 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatg 21513636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 219
Target Start/End: Original strand, 18815609 - 18815683
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||||||| ||| || | |||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  18815609 atgattgatgaattattatgtgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatg 18815683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 111
Target Start/End: Original strand, 21493050 - 21493132
Alignment:
Q  29 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaa 111  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  21493050 gaaagttgaagatatggatgttagctttcatttgccattggttggacttcatttagatttatagaacttgagttatgatcaaa 21493132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 340
Target Start/End: Original strand, 18818348 - 18818437
Alignment:
Q  252 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||||||||||||    
T  18818348 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatatt 18818437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14824299 - 14824260
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14824299 tgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 14824260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 105
Target Start/End: Original strand, 17150655 - 17150714
Alignment:
Q  46 atgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 105  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17150655 atgttagctttctaatggctttggttggacttccaaatgatttttagaacttgagttatg 17150714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 113
Target Start/End: Original strand, 13663129 - 13663195
Alignment:
Q  47 tgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  13663129 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 13663195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 113
Target Start/End: Original strand, 22007126 - 22007192
Alignment:
Q  47 tgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22007126 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 22007192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 266
Target Start/End: Original strand, 35026849 - 35026895
Alignment:
Q  220 tatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  35026849 tatatatgatgttttaagatgttgattatcgtttgatattgttatat 35026895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 219
Target Start/End: Original strand, 36733302 - 36733376
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||| ||| |||||| | |||||||||  |||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  36733302 atgattgatgatttattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtttttcatgattgatgaagtattatatg 36733376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 38988804 - 38988730
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||  |||||| |||  ||||||||||||||||| | |||||||    
T  38988804 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatgttcatgattgatgaattattatatg 38988730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 39019901 - 39019827
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||  |||||| |||  ||||||||||||||||| | |||||||    
T  39019901 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatgttcatgattgatgaattattatatg 39019827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 1484926 - 1484887
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1484926 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1484887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 219
Target Start/End: Original strand, 5083001 - 5083068
Alignment:
Q  152 atgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  5083001 atgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 5083068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Original strand, 5852930 - 5852969
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5852930 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 5852969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Original strand, 14409082 - 14409121
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  14409082 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14409121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Original strand, 20045833 - 20045872
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20045833 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20045872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 46 - 113
Target Start/End: Original strand, 22089412 - 22089479
Alignment:
Q  46 atgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||    
T  22089412 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatattaagaacttgagttatgatcaaatt 22089479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 37116532 - 37116442
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| || || ||||||||    
T  37116532 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 37116442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 46 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 39114485 - 39114426
Alignment:
Q  46 atgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 105  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  39114485 atgttagttttctaatggctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatg 39114426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Original strand, 223305 - 223403
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 105  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  223305 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 223403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Original strand, 688076 - 688174
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 105  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  688076 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 688174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Original strand, 736928 - 737026
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 105  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  736928 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 737026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Original strand, 860823 - 860921
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 105  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  860823 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 860921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 266
Target Start/End: Original strand, 2418860 - 2418906
Alignment:
Q  220 tatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 266  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  2418860 tatatatgatgtttcaagatgttgattatcgtttgatattgttatat 2418906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 222
Target Start/End: Original strand, 19936829 - 19936906
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 222  Q
    |||||||||||| |  |||||| | |||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  19936829 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgttcatgattgatgaattagtatatgtat 19936906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22875230 - 22875157
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  22875230 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 22875157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 284 - 340
Target Start/End: Original strand, 21923900 - 21923956
Alignment:
Q  284 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21923900 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatatt 21923956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Original strand, 38549936 - 38550000
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    ||||||||||||||  |||||| | |||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  38549936 atgattgatgaatttttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 38550000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 2)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 5122 - 4783
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5122 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccaatggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 5023  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5022 ttatagtcaaattacagcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 4923  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4922 attgatgaagtgttatatgtatatatgttgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 4823  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  4822 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 4783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 5315 - 5180
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  5315 gtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagttttcttatgccgttggtctgacgtcaaaacgatatatagaacttgag 5216  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5215 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 5180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 96)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3515435 - 3515096
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3515435 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 3515336  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
     ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3515335 ctatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattattatatgtatgtatatttttgtgaatacgatattgttcatg 3515236  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515235 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 3515136  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  3515135 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 3515096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 14970447 - 14970780
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14970447 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 14970546  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 206  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14970547 tcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcataattgat 14970646  T
Q  207 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14970647 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtga 14970746  T
Q  307 ataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  14970747 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 14970780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 15118087 - 15118425
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118087 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 15118186  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15118187 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 15118285  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15118286 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 15118385  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15118386 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 15118425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 44615716 - 44615377
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44615716 gtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaatttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagag 44615617  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44615616 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 44615517  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44615516 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 44615417  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  44615416 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 44615377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 50222074 - 50222412
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50222074 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagatgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagag 50222173  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  50222174 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 50222272  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50222273 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatattgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 50222372  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  50222373 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 50222412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 19243128 - 19242788
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  19243128 gtacagaattagtcttaggtataaacaagaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 19243029  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||| |||||  || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19243028 ttatggttaaattactgaacgtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 19242929  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatta 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242928 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttggagttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatta 19242829  T
Q  300 tatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19242828 tatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 19242788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 44772824 - 44773160
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  44772824 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaagatttatagaacttgagttatag 44772923  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 206  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44772924 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatacgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 44773022  T
Q  207 gaagtgttatatg----tatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 302  Q
    |||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  44773023 gaagtgttatatgtatatatatatgatattttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattattt 44773122  T
Q  303 gtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  44773123 gtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 44773160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 7640921 - 7641265
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7640921 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccattggtttcacttcaaaaggatttatagaacttgag 7641020  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| || |||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  7641021 ttatagttaaattactgcctgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatatttttcatg 7641119  T
Q  201 attgatgaagtgt------tatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 294  Q
    |||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7641120 attgatgaagtgttatatatatatatatatatgatattttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 7641219  T
Q  295 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7641220 aattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 7641265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15534609 - 15534343
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15534609 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 15534510  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  15534509 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatg 15534410  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15534409 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 15534343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 1837254 - 1837570
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  1837254 gtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttaaaaaggatttatagaactagag 1837353  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||| |||||||||| ||||    
T  1837354 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg-----------ttgtgaaaacgatattgtccatg 1837442  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1837443 attgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattat 1837542  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgactt 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837543 atgtgaataattgagacgttgttgactt 1837570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 36038298 - 36038033
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36038298 gtacagaattggccttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 36038199  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  36038198 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaagatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatg 36038099  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36038098 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 36038033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 49547508 - 49547773
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49547508 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 49547607  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  49547608 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaagaattatttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatg 49547707  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 266  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49547708 attgatgaagtgttatatgtatctatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatat 49547773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 52872807 - 52873025
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52872807 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 52872906  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52872907 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 52873006  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  52873007 attgatgatgtgttatatg 52873025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14049005 - 14048740
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  14049005 gtacataattggttttaggtgtaaacatgaaagttgtgggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttacagaacttgtg 14048906  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  14048905 ttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgataaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtcaatg 14048806  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 266  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14048805 attgatgaggtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 14048740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 362607 - 362390
Alignment:
Q  2 tacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagt 101  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  362607 tacaaaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttagtttgacttcaaaacgatttatagaacttgatt 362508  T
Q  102 tatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatga 201  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362507 tatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatga 362408  T
Q  202 ttgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  362407 ttgatgaagtgttatatg 362390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 97 - 340
Target Start/End: Original strand, 18239250 - 18239492
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 196  Q
    |||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||     
T  18239250 tgagttattgtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaatttttgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtc 18239348  T
Q  197 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18239349 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaa 18239448  T
Q  297 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18239449 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 18239492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 15495908 - 15496126
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||    
T  15495908 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttaaattcgaaaggttttatagaacttgag 15496007  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15496008 ttatggtcaaattactgcacgtaagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttctgaatacgatattgttcatg 15496107  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15496108 attgatgaagtgttatatg 15496126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 219
Target Start/End: Original strand, 19617809 - 19618019
Alignment:
Q  9 ttggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtc 108  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19617809 ttggtcttaggtgttaacacaaaagttataggtatggatgttagctttctaatgctgttggtgtgacttcaaaaggatttatagaagttgagttatggtc 19617908  T
Q  109 aaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 208  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19617909 aaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatga 19618008  T
Q  209 agtgttatatg 219  Q
    |||||||||||    
T  19618009 agtgttatatg 19618019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 144 - 340
Target Start/End: Original strand, 18215152 - 18215347
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215152 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 18215250  T
Q  244 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18215251 attatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 18215347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 144 - 340
Target Start/End: Original strand, 19618050 - 19618245
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618050 tatgattgatgaattggtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 19618148  T
Q  244 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19618149 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 19618245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 29267781 - 29267570
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29267781 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 29267682  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  29267681 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgcgaatacgatattgtccatg 29267582  T
Q  201 attgatgaagtg 212  Q
    ||||||||||||    
T  29267581 attgatgaagtg 29267570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 144 - 340
Target Start/End: Original strand, 12185 - 12380
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12185 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 12283  T
Q  244 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12284 attattattggatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 12380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 144 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 52312794 - 52312599
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312794 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 52312696  T
Q  244 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  52312695 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 52312599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 14746246 - 14746464
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||| |||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14746246 gtacagaattggtcttcggtgtaaggacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgactttaaaaggatttatagaacttgag 14746345  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  14746346 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatatatgtatatgtttgtgaatactattatgttcatg 14746445  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14746446 attgatgaagtgttatatg 14746464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19858006 - 19857798
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  19858006 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaataatttatagaacttgat 19857907  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||    
T  19857906 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat----------atgtttgtgaatacgatattgttcatg 19857817  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19857816 attgatgaagtgttatatg 19857798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 144 - 340
Target Start/End: Original strand, 15355202 - 15355398
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355202 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 15355300  T
Q  244 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  15355301 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 15355398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 11989 - 12210
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11989 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatcaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 12088  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||  ||  || ||||| |||    
T  12089 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgtgtattatgttgtttatg 12188  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtat 222  Q
    ||||||||| |  |||||||||    
T  12189 attgatgaattagtatatgtat 12210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 52312989 - 52312769
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52312989 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggttttacttcaaaaggatttatagaacttgag 52312890  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| || ||| ||||| |||    
T  52312889 ttatagtc-aattactgcacgcaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatg 52312791  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtat 222  Q
    ||||||||| |  |||||||||    
T  52312790 attgatgaattagtatatgtat 52312769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 90 - 219
Target Start/End: Original strand, 18214992 - 18215121
Alignment:
Q  90 tagaacttgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacga 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  18214992 tagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttattaatacga 18215091  T
Q  190 tattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215092 tattgttcatgattgatgaagtgttatatg 18215121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Original strand, 18214751 - 18214880
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18214751 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 18214850  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  18214851 tcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 18214880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 19858199 - 19858064
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  19858199 gtacagaattggtcttaggtgcaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 19858100  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19858099 ttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 19858064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 52872614 - 52872749
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  52872614 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattctgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 52872713  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  52872714 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52872749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 362801 - 362668
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  362801 gtacagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacatcaaaaagatttatagaacttgag 362702  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtga 134  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  362701 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtga 362668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 362988 - 362859
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  362988 aattggtcttaggtgtaaacccgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaatttgagttatgg 362889  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  362888 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 362859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 3515622 - 3515493
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3515622 aattggtcttaggcgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctcacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 3515523  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3515522 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 3515493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 52313369 - 52313240
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52313369 aattgatcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 52313270  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  52313269 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52313240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14185729 - 14185621
Alignment:
Q  28 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14185729 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgaacgtaggtc 14185630  T
Q  128 acagtgaat 136  Q
    |||||||||    
T  14185629 acagtgaat 14185621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 115 - 219
Target Start/End: Original strand, 15355067 - 15355171
Alignment:
Q  115 ttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgtt 214  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355067 ttgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgtt 15355166  T
Q  215 atatg 219  Q
    |||||    
T  15355167 atatg 15355171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 14970248 - 14970383
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  14970248 gtacacaattggtcttaggtgataacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 14970347  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  14970348 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14970383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 19617608 - 19617743
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||  ||||| ||||||| |||||||||    
T  19617608 gtacataattggtcttaggtgtagacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctaacgccaaaatgatttattgaacttgag 19617707  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  19617708 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19617743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 136
Target Start/End: Original strand, 15495716 - 15495850
Alignment:
Q  2 tacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagt 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  15495716 tacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagt 15495815  T
Q  102 tatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15495816 tatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15495850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 144 - 266
Target Start/End: Original strand, 15496949 - 15497070
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15496949 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtt-gtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 15497047  T
Q  244 attaccatttgatgttgttatat 266  Q
    ||||  |||||||||||||||||    
T  15497048 attattatttgatgttgttatat 15497070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 144 - 265
Target Start/End: Original strand, 52873056 - 52873176
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873056 tatgattgatgaattaatatacgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 52873154  T
Q  244 attaccatttgatgttgttata 265  Q
    ||||  ||||||||||||||||    
T  52873155 attattatttgatgttgttata 52873176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 52313176 - 52313047
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  52313176 aattgatcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgcctttggtatgacgtcaaaacgatttatagaacttgatttatgg 52313077  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  52313076 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52313047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 237 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12611135 - 12611032
Alignment:
Q  237 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattga 336  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  12611135 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 12611036  T
Q  337 tatt 340  Q
    ||||    
T  12611035 tatt 12611032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 14746053 - 14746188
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  14746053 gtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 14746152  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||    
T  14746153 ttatggtcaaattactgcacgtagatcatagtgaat 14746188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 237 - 340
Target Start/End: Original strand, 51463838 - 51463941
Alignment:
Q  237 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattga 336  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  51463838 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 51463937  T
Q  337 tatt 340  Q
    ||||    
T  51463938 tatt 51463941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 144 - 266
Target Start/End: Original strand, 14746495 - 14746618
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  14746495 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 14746593  T
Q  242 tgattaccatttgatgttgttatat 266  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  14746594 tgattatcatttgatgttgttatat 14746618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 237 - 340
Target Start/End: Original strand, 23803235 - 23803338
Alignment:
Q  237 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattga 336  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||    
T  23803235 gatgttgattatgattttatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttga 23803334  T
Q  337 tatt 340  Q
    ||||    
T  23803335 tatt 23803338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 30147343 - 30147189
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |  ||   |||| ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  30147343 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaagtatggatataaaattaaaaatgacattggtatgacaacaaaaagatttatagaacttgag 30147244  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatga 155  Q
    |||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30147243 ttatggtcaaattactacacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatga 30147189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 250 - 328
Target Start/End: Original strand, 21815568 - 21815646
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactt 328  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21815568 atttgatgttgttatattatgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactt 21815646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 44102393 - 44102303
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  44102393 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatatt 44102303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 256 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22354010 - 22353926
Alignment:
Q  256 tgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  22354010 tgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatatt 22353926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15367873 - 15367782
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  15367873 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 15367782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15402886 - 15402795
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  15402886 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 15402795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19857767 - 19857685
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19857767 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattttatatatatat 19857685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 178 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 362336 - 362268
Alignment:
Q  178 ttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 246  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362336 ttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 362268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15371385 - 15371294
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||    
T  15371385 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatatt 15371294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15373666 - 15373575
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||    
T  15373666 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatatt 15373575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 255 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20150004 - 20149918
Alignment:
Q  255 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||    
T  20150004 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatatt 20149918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15370200 - 15370110
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  15370200 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgc-gtagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 15370110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 261 - 328
Target Start/End: Original strand, 44928873 - 44928940
Alignment:
Q  261 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactt 328  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  44928873 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgactt 44928940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 136
Target Start/End: Original strand, 22725284 - 22725401
Alignment:
Q  18 ggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattgttg 117  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||    ||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  22725284 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttctaat-ccgttggtttgacatcaaaatgatttataggacttgagttatggtcaaattactg 22725382  T
Q  118 cacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  22725383 cacgtaggtcacactgaat 22725401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 253 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 16223712 - 16223644
Alignment:
Q  253 tgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16223712 tgatgttgttatattgtgatataattgtatatgggttagttgaattatatgtgaataattgagacgttg 16223644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Original strand, 13788 - 13879
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| || ||||||||    
T  13788 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatatt 13879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 14951367 - 14951273
Alignment:
Q  19 gtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  14951367 gtgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 14951273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 132
Target Start/End: Original strand, 14745924 - 14745991
Alignment:
Q  65 attggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagt 132  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14745924 attggtctgacgtcaaaacgatttatagcacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 14745991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Original strand, 52243131 - 52243222
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| |||||||| || || ||||||||    
T  52243131 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatatt 52243222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 113
Target Start/End: Original strand, 55377225 - 55377292
Alignment:
Q  46 atgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  55377225 atgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 55377292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19857659 - 19857607
Alignment:
Q  214 tatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19857659 tatatatatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 19857607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 339
Target Start/End: Original strand, 43198492 - 43198580
Alignment:
Q  252 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatat 339  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||| || |||||||    
T  43198492 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatat 43198580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 113
Target Start/End: Original strand, 25120046 - 25120141
Alignment:
Q  18 ggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  25120046 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 25120141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 113
Target Start/End: Original strand, 43281694 - 43281792
Alignment:
Q  15 ttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    |||||||| |||  |||| ||||||||   |||||||||||||||||| |  |||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  43281694 ttaggtgttaacatgaaaattgtaggttaagatgttagctttctaatggctatggttttacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 43281792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 12778417 - 12778460
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatg 44  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12778417 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatg 12778460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 340
Target Start/End: Original strand, 15464888 - 15464959
Alignment:
Q  269 tgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| || || ||||||||    
T  15464888 tgatataattgtatatgcaatacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 15464959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 113
Target Start/End: Original strand, 18293695 - 18293762
Alignment:
Q  46 atgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18293695 atgttagatttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 18293762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 14995713 - 14995647
Alignment:
Q  47 tgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  14995713 tgttagctttctaatgtcgttggtttgaggtctaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 14995647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 15287859 - 15287965
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  15287859 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 15287958  T
Q  107 tcaaatt 113  Q
    |||||||    
T  15287959 tcaaatt 15287965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 15294969 - 15295075
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  15294969 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 15295068  T
Q  107 tcaaatt 113  Q
    |||||||    
T  15295069 tcaaatt 15295075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 18247848 - 18247750
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 105  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  18247848 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 18247750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 47357292 - 47357194
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 105  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  47357292 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggccttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagatatg 47357194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12902923 - 12902850
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  12902923 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatatt 12902850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Original strand, 16377478 - 16377551
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  16377478 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatatt 16377551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 16731785 - 16731688
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 104  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||| ||| ||   ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||    
T  16731785 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctctctaatggctttggtttgacttccaaatgattttttgaacttgagttat 16731688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 113
Target Start/End: Original strand, 5683367 - 5683462
Alignment:
Q  18 ggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||    ||||||||||| ||||   |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  5683367 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttccaatggttttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 5683462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 9198658 - 9198559
Alignment:
Q  14 cttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    ||||| |||||||  ||||||| ||  |||||||||||  |||||||||   ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  9198658 cttagttgtaaacatgaaagttttatatatggatgttatatttctaatggatttggtcttacttcaaaatgatttctacaacttgatttatggtcaaatt 9198559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Original strand, 15117990 - 15118029
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15117990 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15118029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 105
Target Start/End: Original strand, 22355071 - 22355158
Alignment:
Q  18 ggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 105  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  22355071 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 22355158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 10643855 - 10643757
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 105  Q
    |||||| ||| |||| ||||  ||||||||||| ||   |||||||||||||||||   |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  10643855 aattggactttggtgcaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggttttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagatatg 10643757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 105
Target Start/End: Original strand, 17146320 - 17146378
Alignment:
Q  47 tgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 105  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  17146320 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 17146378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 7798956 - 7798867
Alignment:
Q  252 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||| |||||| |||||||||||    
T  7798956 ttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatatt 7798867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 14038814 - 14038741
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||   || |||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  14038814 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatatt 14038741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 222
Target Start/End: Original strand, 19617998 - 19618075
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 222  Q
    |||||||||||| |  |||||| | |||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  19617998 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattggtatatgtat 19618075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22636601 - 22636528
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||    
T  22636601 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 22636528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 136
Target Start/End: Original strand, 44772723 - 44772760
Alignment:
Q  99 agttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  44772723 agttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 44772760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Original strand, 53082089 - 53082142
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 302  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  53082089 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 53082142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 4)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 14375 - 14036
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14375 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgaacgttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 14276  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14275 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 14176  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14175 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 14076  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  14075 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 14036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Original strand, 23271 - 23484
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23271 aattagtctaaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 23370  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 206  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23371 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 23470  T
Q  207 gaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||    
T  23471 gaagtgttatatgt 23484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 22912 - 23047
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  22912 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacatgag 23011  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  23012 ttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 23047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 136
Target Start/End: Original strand, 23121 - 23207
Alignment:
Q  50 tagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  23121 tagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 23207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 101)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 39682741 - 39682402
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39682741 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 39682642  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39682641 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 39682542  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39682541 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 39682442  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  39682441 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 39682402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18809370 - 18809032
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809370 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 18809271  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18809270 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 18809172  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18809171 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 18809072  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18809071 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 18809032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23131290 - 23130951
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23131290 gtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 23131191  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23131190 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatg 23131091  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23131090 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 23130991  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23130990 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 23130951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23133757 - 23133418
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133757 gtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 23133658  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23133657 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatg 23133558  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23133557 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 23133458  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23133457 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 23133418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 23711748 - 23712086
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23711748 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 23711847  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  23711848 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 23711946  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23711947 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 23712046  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23712047 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 23712086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 34402256 - 34402595
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402256 gtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 34402355  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  34402356 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatg 34402455  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34402456 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 34402555  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  34402556 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 34402595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 32214665 - 32214994
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32214665 gtacaaaattgttcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 32214764  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||| |||||||||||||||||    
T  32214765 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat----------atgtttgtgtatacgatattgttcatg 32214854  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214855 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 32214954  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  32214955 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 32214994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 28577526 - 28577188
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577526 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 28577427  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  28577426 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacaatattgtccatg 28577328  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28577327 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 28577228  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  28577227 atgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatatt 28577188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 571825 - 571486
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  571825 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacgtcaaaaggatttatagaatttgag 571726  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  571725 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 571626  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  571625 attaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 571526  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  571525 atgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 571486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 23709267 - 23709605
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709267 gtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgcagttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 23709366  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  23709367 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaagaattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 23709465  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23709466 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 23709565  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23709566 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 23709605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 24897930 - 24898268
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24897930 gtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 24898029  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24898030 ttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 24898128  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24898129 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 24898228  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24898229 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 24898268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 24905367 - 24905705
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905367 gtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 24905466  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24905467 ttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 24905565  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24905566 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 24905665  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24905666 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 24905705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 24900413 - 24900751
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900413 gtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 24900512  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24900513 ttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatttatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 24900611  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24900612 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 24900711  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24900712 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 24900751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 24902890 - 24903228
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24902890 gtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 24902989  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24902990 ttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatttatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 24903088  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24903089 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 24903188  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24903189 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 24903228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 24907842 - 24908180
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24907842 gtacataattggtcataggtgtaaacatgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 24907941  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24907942 ttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 24908040  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24908041 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 24908140  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24908141 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 24908180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26505806 - 26505468
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  26505806 gtacagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaactagag 26505707  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  26505706 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattttccatg 26505608  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26505607 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 26505508  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26505507 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 26505468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26508284 - 26507946
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  26508284 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaagaatttatagaactagag 26508185  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  26508184 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattttccatg 26508086  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26508085 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 26507986  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26507985 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 26507946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 8 - 340
Target Start/End: Original strand, 32039240 - 32039571
Alignment:
Q  8 attggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggt 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  32039240 attggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaattttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttaagttatggt 32039339  T
Q  108 caaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatg 207  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||| |||||| ||||    
T  32039340 caaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatctgatattgtccatgatcgatg 32039438  T
Q  208 aagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039439 aagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaa 32039538  T
Q  308 taattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  32039539 taattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 32039571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23136007 - 23135679
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23136007 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatcccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagag 23135908  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||| ||||    
T  23135907 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt-----------tgtgaatacgatattgtccatg 23135819  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23135818 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgctgattatcatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattat 23135719  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23135718 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 23135679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20261647 - 20261381
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20261647 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 20261548  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  20261547 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatg 20261448  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20261447 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 20261381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 24529281 - 24529602
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24529281 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttacctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagcacttgag 24529380  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
     |||||| |||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24529381 atatggtgaaattactaaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 24529480  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||                   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24529481 attgatgaagtgttatatgtgtatatgatg-------------------atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattat 24529561  T
Q  301 atgtg-aataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    || || |||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  24529562 atatgaaataattgagacgttgttaacttgcacttgatatt 24529602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 266
Target Start/End: Original strand, 10684498 - 10684764
Alignment:
Q  2 tacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagt 101  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10684498 tacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagc 10684597  T
Q  102 tatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatga 201  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  10684598 tatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatga 10684697  T
Q  202 ttgatgaagtgttatatg--tatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 266  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10684698 ttgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 10684764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 23706951 - 23707169
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23706951 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 23707050  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23707051 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatg 23707150  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23707151 attgatgaagtgttatatg 23707169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24918562 - 24918350
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24918562 aattggtcttaagtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 24918463  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 206  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24918462 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgat 24918363  T
Q  207 gaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||    
T  24918362 gaagtgttatatg 24918350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 24642483 - 24642701
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24642483 gtacagaattgctcttaggtgtaaacccaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttaag 24642582  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24642583 ttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatg 24642682  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24642683 attgatgaagtgttatatg 24642701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24671453 - 24671235
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24671453 gtacagaattggtcttaggtgtaaaaacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgttgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 24671354  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24671353 ttattgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatg 24671254  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24671253 attgatgaagtgttatatg 24671235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24681872 - 24681654
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  24681872 gtacagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttgggcttccaaaggatttatagaacttgag 24681773  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24681772 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatg 24681673  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24681672 attgatgaagtgttatatg 24681654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 144 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 6726279 - 6726084
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726279 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 6726181  T
Q  244 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6726180 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatatt 6726084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 29 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25616581 - 25616365
Alignment:
Q  29 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtca 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||    
T  25616581 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatcgtcaaattacttcacgtaggtca 25616482  T
Q  129 cagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatga 228  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25616481 caatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatga 25616382  T
Q  229 tgttttaagatgttgat 245  Q
    |||||||||||||||||    
T  25616381 tgttttaagatgttgat 25616365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 148 - 340
Target Start/End: Original strand, 21154942 - 21155133
Alignment:
Q  148 attgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 247  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21154942 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 21155040  T
Q  248 ccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21155041 ttatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatatt 21155133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 38967907 - 38967689
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38967907 gtacataattggtcttaggtgtaaatacgaaagttgtagatatggatgttaggtttctaatgtcgttggtttgacttcaaaagtatttatagaacttgag 38967808  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| || |||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38967807 ttatagtgaaattactgcacgcagctcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatg 38967708  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  38967707 attgttgaagtgttatatg 38967689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 144 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22105697 - 22105502
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105697 tatgattgatgaattagtatatgtatgtaaatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 22105599  T
Q  244 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  22105598 attataatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatatt 22105502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22105887 - 22105672
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22105887 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 22105788  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 206  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||    
T  22105787 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 22105688  T
Q  207 gaagtgttatatgtat 222  Q
    ||| |  |||||||||    
T  22105687 gaattagtatatgtat 22105672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 45027639 - 45027840
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45027639 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgaa 45027738  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  45027739 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 45027837  T
Q  201 att 203  Q
    |||    
T  45027838 att 45027840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 144 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24368058 - 24367863
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24368058 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattttccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatgttg 24367960  T
Q  244 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24367959 gttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 24367863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24368254 - 24368033
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24368254 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 24368155  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||  || ||||| |||    
T  24368154 ttatagttaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatcatgttgtttatg 24368055  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtat 222  Q
    ||||||||| |  |||||||||    
T  24368054 attgatgaattagtatatgtat 24368033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 144 - 340
Target Start/End: Original strand, 24642732 - 24642929
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaa--gatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  24642732 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 24642830  T
Q  242 tgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24642831 tgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 24642929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6726474 - 6726254
Alignment:
Q  2 tacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagt 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6726474 tacataagtggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttaagt 6726375  T
Q  102 tatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatga 201  Q
    ||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||| || ||| ||||| ||||    
T  6726374 tatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatga 6726275  T
Q  202 ttgatgaagtgttatatgtat 222  Q
    |||||||| |  |||||||||    
T  6726274 ttgatgaattagtatatgtat 6726254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 21154742 - 21154963
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21154742 gtacagaatttgtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 21154841  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| || ||| ||||| ||     
T  21154842 ttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttata 21154941  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtat 222  Q
    ||||||||| |  |||||||||    
T  21154942 attgatgaattagtatatgtat 21154963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 41523807 - 41524028
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523807 gtacagaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaacgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 41523906  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||| || ||| ||||| |||    
T  41523907 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatacgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatg 41524006  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtat 222  Q
    ||||||||| |  |||||||||    
T  41524007 attgatgaattagtatatgtat 41524028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 144 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 38967658 - 38967463
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38967658 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtcttaagatgttg 38967560  T
Q  244 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||    
T  38967559 attattatttgatgttg-tatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatatt 38967463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 197 - 340
Target Start/End: Original strand, 45029784 - 45029927
Alignment:
Q  197 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  45029784 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgatgattattatttcatgttgttatattgtgatataaatgtatatgcattacttgaa 45029883  T
Q  297 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  45029884 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 45029927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 41523614 - 41523749
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41523614 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtatggatgttatctttataatgcccttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 41523713  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41523714 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 41523749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 136
Target Start/End: Original strand, 24529093 - 24529223
Alignment:
Q  6 taattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24529093 taattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatg 24529192  T
Q  106 gtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  24529193 gtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 6726662 - 6726533
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6726662 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 6726563  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  6726562 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 6726533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 23931888 - 23931776
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23931888 gtacataattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtattgatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 23931789  T
Q  101 ttatggtcaaatt 113  Q
    |||||||||||||    
T  23931788 ttatggtcaaatt 23931776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 24918755 - 24918626
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24918755 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaataccgttggtctgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 24918656  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24918655 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24918626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Original strand, 41523424 - 41523552
Alignment:
Q  4 cataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 103  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  41523424 cataattggtcttacgtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagtta 41523523  T
Q  104 tggtcaaattgttgcacgtaggtcacagt 132  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  41523524 tggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 41523552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 22106086 - 22105951
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||||||||||||||    
T  22106086 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaatgatttatagaacttgag 22105987  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  22105986 ttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 22105951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 24368439 - 24368312
Alignment:
Q  9 ttggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24368439 ttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaacgatttatagaacttaagttatggtc 24368340  T
Q  109 aaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||    
T  24368339 aaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24368312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Original strand, 21154555 - 21154684
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  21154555 aattggtcctaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaatttgagttacgg 21154654  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  21154655 tcaaattactgcacgtagatcacagtgaat 21154684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 24671640 - 24671511
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24671640 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtgtggatgttagctttctaatgccatttatttgacatcaaaaatatttatagaacttgagttatgg 24671541  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  24671540 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 24671511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Original strand, 21154362 - 21154491
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||||||||||||| || | |    
T  21154362 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaatgatttatagaacttgacttttag 21154461  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  21154462 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 21154491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 144 - 266
Target Start/End: Original strand, 23707200 - 23707323
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  23707200 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 23707298  T
Q  242 tgattaccatttgatgttgttatat 266  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  23707299 tgattatcatttgatgttgttatat 23707323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 24682059 - 24681930
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || || |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  24682059 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtgtggatgttagcattctaatgccgttagtctgacatcaaaaagatttatagagcttgagttatgg 24681960  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24681959 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24681930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Original strand, 23706573 - 23706702
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||  |  ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23706573 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatggtgttggttctatgtcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 23706672  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  23706673 tcaagttactgcacgtaggtcacagtgaat 23706702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Original strand, 23709080 - 23709209
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23709080 aattcgtcctaggtgtaaacacgtaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 23709179  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    || ||||  ||||| |||||||||||||||    
T  23709180 tctaattactgcacataggtcacagtgaat 23709209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 144 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24918319 - 24918196
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  24918319 tatgattgatgaattagtatatgtatgcatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 24918221  T
Q  242 tgattaccatttgatgttgttatat 266  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  24918220 tgattatcatttgatgttgttatat 24918196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 32214471 - 32214604
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||  ||||||||||||| ||    
T  32214471 gtacaaaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgctctgacgtcaaaacaatttatagaacttaag 32214570  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtga 134  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  32214571 ttatggtcaaattacagcacgtaggtcacagtga 32214604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 134
Target Start/End: Original strand, 45027452 - 45027579
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  45027452 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttcgaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaactttagttatgg 45027551  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtga 134  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||    
T  45027552 tcaaattactacacgtaggtcacagtga 45027579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 23706759 - 23706889
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| |||||| || ||||||||||||||    
T  23706759 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttatagttatggatgttacctttctaatgccgtaggtctgacgtcaaaacgaattatagaacttgag 23706858  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacag 131  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  23706859 ttatggtcaaattactgcacgtaagtcacag 23706889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23932075 - 23931949
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23932075 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatttcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaactttagttatgg 23931976  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtg 133  Q
    |||| ||  | ||| ||||||||||||    
T  23931975 tcaatttacttcacttaggtcacagtg 23931949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 147 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24671201 - 24671081
Alignment:
Q  147 gattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttga 244  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |   ||||||||    
T  24671201 gattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgtttaagttgatgttga 24671103  T
Q  245 ttaccatttgatgttgttatat 266  Q
    ||| |||||||| |||||||||    
T  24671102 ttatcatttgatattgttatat 24671081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 144 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24681623 - 24681500
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |   |||||    
T  24681623 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattagatgtatatatgatgtttaagttgatgt 24681525  T
Q  242 tgattaccatttgatgttgttatat 266  Q
    |||| | ||||||||||||||||||    
T  24681524 tgatcatcatttgatgttgttatat 24681500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 251 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 43137477 - 43137388
Alignment:
Q  251 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  43137477 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 43137388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 306
Target Start/End: Original strand, 22173799 - 22173868
Alignment:
Q  237 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtga 306  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22173799 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 22173868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 252 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19672010 - 19671935
Alignment:
Q  252 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactt 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  19672010 ttgatgttgttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaat-attgagatgttgtttactt 19671935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 31345554 - 31345490
Alignment:
Q  71 ttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaa 135  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  31345554 ttgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 31345490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 252 - 340
Target Start/End: Original strand, 23708558 - 23708647
Alignment:
Q  252 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| || | ||| || |||||||||||    
T  23708558 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatatt 23708647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 67410 - 67342
Alignment:
Q  45 gatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  67410 gatgttagatttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 67342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 337
Target Start/End: Original strand, 22459511 - 22459587
Alignment:
Q  261 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgat 337  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||| || |||||    
T  22459511 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgagttatatgtgaatatttgagatgttgatgactttcatttgat 22459587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 29601518 - 29601478
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcatta 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29601518 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcatta 29601478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 16900884 - 16900818
Alignment:
Q  47 tgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16900884 tgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 16900818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 16994275 - 16994209
Alignment:
Q  47 tgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16994275 tgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 16994209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21368439 - 21368365
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  21368439 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 21368365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 24686598 - 24686704
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||||     
T  24686598 aattggtctttggtgtaaacatgaaagttttagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgcgttatga 24686697  T
Q  107 tcaaatt 113  Q
    |||||||    
T  24686698 tcaaatt 24686704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Original strand, 7688 - 7761
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||||| || ||||||||    
T  7688 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatatt 7761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 136
Target Start/End: Original strand, 24642373 - 24642425
Alignment:
Q  84 gatttatagaacttgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  24642373 gatttatagaacttgagttatggtcaaataactacacgtaggtcacagtgaat 24642425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 27261402 - 27261335
Alignment:
Q  46 atgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||  |||| || ||||||||||||| |||||||    
T  27261402 atgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaataatttttataacttgagttatgatcaaatt 27261335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 12727780 - 12727714
Alignment:
Q  47 tgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  12727780 tgttagctttctaatggccttgggttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 12727714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Original strand, 19887275 - 19887373
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 105  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  19887275 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 19887373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23799531 - 23799457
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||  |||||| ||| || ||||||||||||||| | |||||||    
T  23799531 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgttgaatatgatgttattcatgattgatgaattattatatg 23799457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 34823819 - 34823753
Alignment:
Q  47 tgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  34823819 tgttagctttctaatgacgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 34823753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 78
Target Start/End: Original strand, 34135070 - 34135119
Alignment:
Q  29 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttc 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  34135070 gaaagttgtaggtatggaagttagctttctaattgctttggtttgacttc 34135119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22686221 - 22686145
Alignment:
Q  150 tgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatat 226  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||  |||||| ||| || ||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  22686221 tgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtttttcatgattgatgaattattatatgaatatat 22686145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18809467 - 18809428
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18809467 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18809428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23131386 - 23131347
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  23131386 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23131347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Original strand, 23711651 - 23711690
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  23711651 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23711690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23791458 - 23791368
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||  |||||| |||||||| || || ||||||||    
T  23791458 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatat-aatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 23791368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 26505903 - 26505864
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26505903 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26505864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 26508381 - 26508342
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26508381 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26508342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Original strand, 27920402 - 27920441
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27920402 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27920441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Original strand, 32039136 - 32039175
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  32039136 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 32039175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Original strand, 34402160 - 34402199
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  34402160 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 34402199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 187
Target Start/End: Original strand, 41524003 - 41524045
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatac 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  41524003 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatac 41524045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Original strand, 20520130 - 20520183
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 302  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20520130 atttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatat 20520183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 22274090 - 22274025
Alignment:
Q  48 gttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  22274090 gttagctttctaatggccttggtttgatgtctaaatgatttttaaaacttgagttatgatcaaatt 22274025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23060679 - 23060606
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23060679 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatatt 23060606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23076608 - 23076535
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || |||  |||||||||| |||||||||||    
T  23076608 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttgacttgcaattgatatt 23076535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 24788086 - 24788042
Alignment:
Q  18 ggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 62  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24788086 ggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttatctttccaatg 24788042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 62
Target Start/End: Original strand, 44584588 - 44584632
Alignment:
Q  18 ggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 62  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  44584588 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgtatgttagctttccaatg 44584632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21175 - 20836
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21175 gtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 21076  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21075 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 20976  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20975 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 20876  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20875 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 20836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 38249 - 37910
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38249 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 38150  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38149 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 38050  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38049 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 37950  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  37949 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 37910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 38346 - 38307
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  38346 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 38307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 94838 - 94500
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94838 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 94739  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  94738 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 94640  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  94639 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 94540  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  94539 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 94500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 17180 - 17513
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17180 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatttttgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 17279  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 206  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17280 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatagttgaatatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgttcatgattgat 17379  T
Q  207 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtga 306  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17380 gaagtgtcatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatactgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtga 17479  T
Q  307 ataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17480 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 17513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 136
Target Start/End: Original strand, 17008 - 17116
Alignment:
Q  28 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||  |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  17008 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgatatcaaaaaggtttatagaacttgagttatgatcaaattaatgcacgtaggtc 17107  T
Q  128 acagtgaat 136  Q
    | |||||||    
T  17108 atagtgaat 17116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 270 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 44614 - 44544
Alignment:
Q  270 gatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  44614 gatataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatatt 44544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 94935 - 94896
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  94935 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 94896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 96)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 456749 - 456410
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  456749 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 456650  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  456649 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 456550  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  456549 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 456450  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  456449 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 456410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27217288 - 27216949
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27217288 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 27217189  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27217188 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 27217089  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27217088 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 27216989  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  27216988 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 27216949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 15376448 - 15376786
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376448 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 15376547  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15376548 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 15376646  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15376647 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 15376746  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15376747 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 15376786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 20384858 - 20385196
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20384858 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 20384957  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20384958 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 20385056  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20385057 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 20385156  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20385157 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 20385196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 2 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16214111 - 16213785
Alignment:
Q  2 tacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagt 101  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16214111 tacagaattggtcttacgtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagt 16214012  T
Q  102 tatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatga 201  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16214011 tatggtcaaatgactgcacgtaggtcacagtgaataattgaataagattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatga 16213912  T
Q  202 ttgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattata 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213911 ttgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttcatatgttgattaccatttgatgttgttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattata 16213812  T
Q  302 tgtgaataattgagacgttgttgactt 328  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16213811 tgtgaataattaagacgttgttgactt 16213785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16232948 - 16232609
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16232948 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgaattcaaaaggatttatagaatttgag 16232849  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16232848 ttattgtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 16232749  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16232748 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 16232649  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16232648 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 16232609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 41523345 - 41523006
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41523345 gtacagaattggtcttaggtgtaaacataaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 41523246  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41523245 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 41523146  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41523145 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 41523046  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  41523045 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 41523006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 41525807 - 41525468
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41525807 gtacagaattggtcttaggtgtaaacataaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 41525708  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41525707 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 41525608  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41525607 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 41525508  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  41525507 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 41525468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 14948857 - 14949195
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14948857 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagag 14948956  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  14948957 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 14949055  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14949056 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 14949155  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  14949156 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 14949195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 9 - 340
Target Start/End: Original strand, 21189338 - 21189668
Alignment:
Q  9 ttggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtc 108  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21189338 ttggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgaatgttagctttttaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtc 21189437  T
Q  109 aaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 208  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21189438 aaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtata-gtttgtgaatacgatattgtccatgattgatga 21189536  T
Q  209 agtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189537 agtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaat 21189636  T
Q  309 aattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21189637 aattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 21189668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 32125918 - 32125580
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32125918 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagag 32125819  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  32125818 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 32125720  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32125719 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 32125620  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  32125619 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 32125580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 21 - 340
Target Start/End: Original strand, 11393041 - 11393360
Alignment:
Q  21 gtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattgttgcac 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||    
T  11393041 gtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaac 11393140  T
Q  121 gtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11393141 gtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 11393240  T
Q  221 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393241 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 11393340  T
Q  321 gttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||| || ||||||||    
T  11393341 gttgacttgcatttgatatt 11393360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16410486 - 16410148
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410486 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 16410387  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16410386 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatcaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 16410288  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16410287 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactatgatataattgtatatgtattacttgaattat 16410188  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16410187 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 16410148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24702656 - 24702327
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702656 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 24702557  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||    
T  24702556 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattcatgaattagtatatgt----------ttgtgaatacgatattgttcatg 24702467  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24702466 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 24702367  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24702366 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 24702327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24705103 - 24704774
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24705103 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 24705004  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||    
T  24705003 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattcatgaattagtatatgt----------ttgtgaatacgatattgttcatg 24704914  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24704913 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 24704814  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24704813 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 24704774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18640693 - 18640361
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  18640693 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttataatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatag 18640594  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 206  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  18640593 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattactatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattttccatgattgat 18640495  T
Q  207 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtga 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18640494 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattattttatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 18640395  T
Q  307 ataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18640394 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 18640361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13869776 - 13869435
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869776 gtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 13869677  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13869676 ttatggttaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 13869577  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatta 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  13869576 attgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgcatcaattagatta 13869477  T
Q  300 tatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatatt 340  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  13869476 tctttgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 13869435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18431139 - 18430801
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18431139 gtacagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatcttaggtttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagag 18431040  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  |||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18431039 ttatagtcaaattactgcacgtagaacatagtgaataattgaatctgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 18430941  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18430940 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 18430841  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  18430840 atgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatatt 18430801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 26355716 - 26356056
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26355716 gtacagaattggtcttatgtgttaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 26355815  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||| |||     
T  26355816 ttatagtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatg-ttgtaaatacgatattgtccata 26355914  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg--tatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatt 298  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26355915 attgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaatt 26356014  T
Q  299 atatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26356015 atatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 26356056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 26358168 - 26358508
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26358168 gtacagaattggtcttatgtgttaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 26358267  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||| |||     
T  26358268 ttatagtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatg-ttgtaaatacgatattgtccata 26358366  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg--tatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatt 298  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26358367 attgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaatt 26358466  T
Q  299 atatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26358467 atatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 26358508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 11303675 - 11303409
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11303675 gtacataattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 11303576  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  11303575 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatg 11303476  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11303475 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 11303409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 23664687 - 23664952
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23664687 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 23664786  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  23664787 ttatggtcaaattattgcatgtaggtcacagtgaagaattgttgatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatg 23664886  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 266  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23664887 attgatgaaaggttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 23664952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 7 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18627987 - 18627717
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  18627987 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatag 18627888  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 206  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||    
T  18627887 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattattatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattttccgtgattgat 18627789  T
Q  207 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18627788 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattagtatttgatcttgttatattgtgatataatt 18627717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 16108423 - 16108688
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16108423 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgctgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 16108522  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  | |||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||  |||    
T  16108523 ttatggtcaaattactacacgtacgtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacaatattgtcaatg 16108622  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16108623 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccgtttgatgttgttatat 16108688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 14269691 - 14269909
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  14269691 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggttcgacttcaaaaggatttatagaaattgag 14269790  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269791 ttatggtcaaatttttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 14269890  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14269891 attgatgaagtgttatatg 14269909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 29797037 - 29796771
Alignment:
Q  2 tacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagt 101  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  29797037 tacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagc 29796938  T
Q  102 tatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatga 201  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  29796937 tatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatga 29796838  T
Q  202 ttgatgaagtgttatatgtat--atatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 266  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29796837 ttgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 29796771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 29800856 - 29800590
Alignment:
Q  2 tacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagt 101  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  29800856 tacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagc 29800757  T
Q  102 tatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatga 201  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  29800756 tatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatga 29800657  T
Q  202 ttgatgaagtgttatatgtat--atatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 266  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29800656 ttgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 29800590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8940711 - 8940489
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgc----gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaact 96  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940711 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 8940612  T
Q  97 tgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 196  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  8940611 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgtt 8940512  T
Q  197 catgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  8940511 catgattgatgaagtgttatatg 8940489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 15081576 - 15081794
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15081576 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgag 15081675  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15081676 ttatggtcaaattactgcacgtaggtctaagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatg 15081775  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15081776 attgatgaagtgttatatg 15081794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 45847389 - 45847605
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45847389 gtacaaaattggtcttaggtataaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaactctgttagtttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 45847488  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45847489 ttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattggtatatgtatgtatatgtctgtgaatacgatattgttcatg 45847588  T
Q  201 attgatgaagtgttata 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  45847589 attgatgaagtgttata 45847605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8469157 - 8468945
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8469157 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatagatgttagttttctaatgacgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatga 8469058  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 206  Q
    |||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8469057 tcaaattactgcatgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttttgaatacgatattgttcatgattgat 8468958  T
Q  207 gaagtgttatatg 219  Q
    ||| |||||||||    
T  8468957 gaaatgttatatg 8468945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 144 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11972780 - 11972585
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  11972780 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgcccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatattg 11972682  T
Q  244 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  11972681 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 11972585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11972970 - 11972755
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  11972970 aatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatctatagaacttgagttatag 11972871  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 206  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||    
T  11972870 tcaaattactgtacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgcatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 11972771  T
Q  207 gaagtgttatatgtat 222  Q
    ||| |  |||||||||    
T  11972770 gaattagtatatgtat 11972755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13841446 - 13841274
Alignment:
Q  37 taggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  13841446 taggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 13841347  T
Q  137 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  13841346 aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 13841274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 144 - 317
Target Start/End: Original strand, 15081825 - 15081999
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaa--gatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  15081825 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 15081923  T
Q  242 tgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 317  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15081924 tgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagac 15081999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Original strand, 38897775 - 38897904
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38897775 aattggtcttaggtgtaaactcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 38897874  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  38897875 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 38897904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 25926864 - 25926998
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||    
T  25926864 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaaagagttatagaacttgag 25926963  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaa 135  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25926964 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 25926998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 8940902 - 8940769
Alignment:
Q  2 tacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  8940902 tacataattggtcttaggtgtaaacaa-aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagt 8940804  T
Q  102 tatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8940803 tatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 8940769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 144 - 266
Target Start/End: Original strand, 14269940 - 14270061
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269940 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 14270038  T
Q  244 attaccatttgatgttgttatat 266  Q
    ||||  |||||||||||||||||    
T  14270039 attattatttgatgttgttatat 14270061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 14156620 - 14156755
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14156620 gtacagaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgac 14156719  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||| |||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  14156720 ttatgatcaaattaccgcatgtaggtcacagtgaat 14156755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 14269305 - 14269440
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  14269305 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgatgtcaaaacgatttatagaacttgag 14269404  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  14269405 ttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14269440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 170 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 13841270 - 13841157
Alignment:
Q  170 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgt 269  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13841270 gtatatgttt-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgt 13841172  T
Q  270 gatataattatatat 284  Q
    ||||||||| |||||    
T  13841171 gatataattgtatat 13841157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16214299 - 16214170
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16214299 aattggtcttaggtgtaaacacaaaggttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 16214200  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  16214199 tcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 16214170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 136
Target Start/End: Original strand, 10501136 - 10501263
Alignment:
Q  9 ttggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtc 108  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10501136 ttggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtttgacttcaaatggatttatagaacttgagttatggtc 10501235  T
Q  109 aaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||  |||||| |||||| |||||||    
T  10501236 aaattactgcacgaaggtcatagtgaat 10501263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 14269498 - 14269633
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  14269498 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgcctttggtatgacgtcaaaaaaatttatagaacttgag 14269597  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  14269598 ttatcatcaaattattgcacgcaggtcagagtgaat 14269633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Original strand, 15081386 - 15081512
Alignment:
Q  4 cataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 103  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15081386 cataattggtcttagaagtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagtta 15081485  T
Q  104 tggtcaaattgttgcacgtaggtcaca 130  Q
    |||| |||||  |||||||||||||||    
T  15081486 tggttaaattactgcacgtaggtcaca 15081512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Original strand, 21189143 - 21189272
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21189143 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttttaatgccgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 21189242  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  21189243 tcaaattactgcacgtaggtcagagtgaat 21189272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 135
Target Start/End: Original strand, 1856970 - 1857097
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1856970 aattggtcttaggtgtaaacacgaa-gttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcattggtctgacgtcaaaacgatttatataacttgagttatgg 1857068  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaa 135  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1857069 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 1857097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 237 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13647521 - 13647418
Alignment:
Q  237 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattga 336  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  13647521 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 13647422  T
Q  337 tatt 340  Q
    ||||    
T  13647421 tatt 13647418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 144 - 246
Target Start/End: Original strand, 45847638 - 45847739
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45847638 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatatgatg-tttaagatgttg 45847736  T
Q  244 att 246  Q
    |||    
T  45847737 att 45847739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 8941091 - 8940962
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  8941091 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgaagtcaaaatgatttatagaacttgagttatgc 8940992  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||| |  ||||| |||||| ||||||||    
T  8940991 tcaaactactgcacataggtcgcagtgaat 8940962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 144 - 266
Target Start/End: Original strand, 38898106 - 38898229
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  38898106 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 38898204  T
Q  242 tgattaccatttgatgttgttatat 266  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  38898205 tgattatcatttgatgttgttatat 38898229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 13918137 - 13918272
Alignment:
Q  1 gtacataattggtctt-aggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttga 99  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  13918137 gtacagaattggtctttaggtgtaaacacgaaaactgtaggtatgaatgttagctttctaattccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttga 13918236  T
Q  100 gttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaa 135  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  13918237 gttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 13918272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 10500962 - 10501064
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10500962 gtacagaattggtcttaggtgataacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 10501061  T
Q  101 tta 103  Q
    |||    
T  10501062 tta 10501064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 136
Target Start/End: Original strand, 14156838 - 14156944
Alignment:
Q  30 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcac 129  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  14156838 aaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacgtgagttatgttcaaattactgcacgtaggtcac 14156937  T
Q  130 agtgaat 136  Q
    |||||||    
T  14156938 agtgaat 14156944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 144 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8940458 - 8940335
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  8940458 tatgattgatgaattagtatatttatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 8940360  T
Q  242 tgattaccatttgatgttgttatat 266  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  8940359 tgattatcatttgatgttgttatat 8940335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 44116688 - 44116598
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  44116688 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 44116598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 178 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8468891 - 8468803
Alignment:
Q  178 ttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 266  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8468891 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttatgatgttgattattatttgatgttgttatat 8468803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 252 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20110723 - 20110635
Alignment:
Q  252 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  20110723 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatatt 20110635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 139 - 219
Target Start/End: Original strand, 38897995 - 38898075
Alignment:
Q  139 ttgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38897995 ttgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 38898075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Original strand, 12756654 - 12756744
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  12756654 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatatt 12756744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Original strand, 17061898 - 17061988
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  17061898 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatatt 17061988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 251 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3386511 - 3386422
Alignment:
Q  251 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  3386511 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 3386422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 17985119 - 17985254
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  |||||||||   ||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||    
T  17985119 gtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtaaggatgttaaatttctaatggagttggtttgattccaaaatgatatttagaacttgag 17985218  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||    
T  17985219 ttatagtcaaattactacacgtaggtcatagtgaat 17985254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 136
Target Start/End: Original strand, 45847213 - 45847331
Alignment:
Q  18 ggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattgttg 117  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||    ||||| |||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  45847213 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttaactttctaatgtcgttggtatgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 45847312  T
Q  118 cacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||||    
T  45847313 cacgtaggtcacagtgaat 45847331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11310327 - 11310239
Alignment:
Q  49 ttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaata 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  11310327 ttagctttctaatgccattggtttgacgtctaaatgaattatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaata 11310239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 280 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24275320 - 24275260
Alignment:
Q  280 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24275320 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 24275260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Original strand, 38898359 - 38898450
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||    
T  38898359 atttgacgttgttatactgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatatt 38898450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 250 - 330
Target Start/End: Original strand, 19486681 - 19486762
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttac 330  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||    
T  19486681 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttac 19486762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Original strand, 2280056 - 2280147
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| || || ||||||||    
T  2280056 atttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 2280147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 11287046 - 11286979
Alignment:
Q  46 atgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  11287046 atgttagctttctaatggctttggtttgtcttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 11286979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15116651 - 15116573
Alignment:
Q  261 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  15116651 ttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttgatgacttgcaattgatatt 15116573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 126034 - 125968
Alignment:
Q  47 tgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||| |||||||    
T  126034 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgagttttagaacttgagttatgatcaaatt 125968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 340
Target Start/End: Original strand, 12255730 - 12255819
Alignment:
Q  252 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||| ||||| || || || ||||||||    
T  12255730 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatatt 12255819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 224
Target Start/End: Original strand, 13745569 - 13745648
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatat 224  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||||| ||||    
T  13745569 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattaatgaattattatatgaatat 13745648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15113114 - 15113036
Alignment:
Q  261 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||||||||    
T  15113114 ttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttgatgacttgcatttgatatt 15113036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Original strand, 15119918 - 15119993
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||| |||||||| |||||| | |||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  15119918 tatgatttatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 15119993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Original strand, 3564319 - 3564392
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  3564319 tgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatatt 3564392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Original strand, 15008436 - 15008489
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 302  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15008436 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatat 15008489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Original strand, 20220127 - 20220180
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 302  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20220127 atttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 20220180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 38294631 - 38294567
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    ||||||||||||||| | |||| | ||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  38294631 atgattgatgaattattctatgaatgtatatgttggcgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 38294567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Original strand, 15376351 - 15376390
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15376351 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15376390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16410583 - 16410544
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16410583 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16410544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18628090 - 18628051
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18628090 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18628051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18640796 - 18640757
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18640796 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18640757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Original strand, 20384761 - 20384800
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20384761 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20384800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Original strand, 26355619 - 26355658
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26355619 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26355658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Original strand, 26358071 - 26358110
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26358071 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26358110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 105
Target Start/End: Original strand, 15760779 - 15760837
Alignment:
Q  47 tgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 105  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  15760779 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 15760837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 104
Target Start/End: Original strand, 16202778 - 16202852
Alignment:
Q  30 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 104  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||  | ||||| ||||| |||||||||    
T  16202778 aaagttgtaggtagtgatgttagatttctaatggctttggttttacttcatgatgatttctagaatttgagttat 16202852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Original strand, 1867932 - 1867985
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 302  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  1867932 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatat 1867985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Original strand, 18456368 - 18456441
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  18456368 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatt 18456441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 98
Target Start/End: Original strand, 10000996 - 10001076
Alignment:
Q  18 ggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttg 98  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||    
T  10000996 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttg 10001076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 20110779 - 20110747
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtag 39  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20110779 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 20110747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 23461832 - 23461864
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtag 39  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23461832 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 23461864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 43747736 - 43747672
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    |||||||||||| || |||||| | |||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  43747736 atgattgatgaagtattatatgaaagtatatgttgatgaatatgatgttgttcataattgatgaa 43747672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 108)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13544451 - 13544114
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544451 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 13544352  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13544351 ttatagtcaaatact-gcacgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 13544254  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544253 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 13544154  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  13544153 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 13544114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12567987 - 12567649
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12567987 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 12567888  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  12567887 ttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 12567789  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567788 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 12567689  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12567688 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 12567649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 17463605 - 17463267
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463605 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 17463506  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  17463505 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 17463407  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17463406 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 17463307  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17463306 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 17463267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 45606641 - 45606980
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45606641 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 45606740  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45606741 ttatggtcaaattactgaatgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 45606840  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45606841 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 45606940  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  45606941 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 45606980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 34159753 - 34159415
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159753 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 34159654  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  34159653 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 34159555  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34159554 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 34159455  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  34159454 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 34159415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 55476918 - 55476580
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  55476918 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagag 55476819  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  55476818 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 55476720  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  55476719 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 55476620  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  55476619 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 55476580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 7781081 - 7781420
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781081 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaacgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 7781180  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7781181 ttatggtcaaattactgaacataggtcacagtgaataattgattatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 7781280  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7781281 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 7781380  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  7781381 atgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatatt 7781420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 16454015 - 16454354
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaa-ggatttatagaacttga 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  16454015 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatggatttatagaactata 16454114  T
Q  100 gttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcat 199  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  16454115 gttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccat 16454213  T
Q  200 gattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatta 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16454214 gattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaatta 16454313  T
Q  300 tatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16454314 tatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 16454354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 6468869 - 6469207
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6468869 gtacagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttggaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgag 6468968  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6468969 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 6469067  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6469068 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttcaattat 6469167  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  6469168 atgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 6469207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 13153990 - 13154328
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13153990 gtacagaattggtcataggtgtaaacacgaaagttttaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 13154089  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13154090 ttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 13154188  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13154189 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 13154288  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  13154289 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 13154328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 10247458 - 10247796
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  10247458 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgat 10247557  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10247558 ttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 10247656  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10247657 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 10247756  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  10247757 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 10247796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27165680 - 27165340
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165680 gtacagaattggtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatcttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 27165581  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27165580 ttatgatcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 27165481  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatta 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||    
T  27165480 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttaaatta 27165381  T
Q  300 tatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||| |||||| ||||||  ||| |||||| || ||||||||    
T  27165380 tatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatt 27165340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 53301238 - 53301554
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53301238 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 53301337  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53301338 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtacatg 53301437  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatta 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||    
T  53301438 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccattttatgttgtttatattgtgatataattgtatacgtaatacttgaatta 53301537  T
Q  300 tatgtgaataattgaga 316  Q
    ||| |||||| ||||||    
T  53301538 tatatgaatatttgaga 53301554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 13151531 - 13151863
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13151531 aattggtcataggtgtaaacacgaaagttttaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 13151630  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 206  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||    
T  13151631 tcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaaggtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgcctgat 13151729  T
Q  207 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtga 306  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13151730 gaagtgtgatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 13151829  T
Q  307 ataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  13151830 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 13151863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 8499948 - 8499607
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499948 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatatggaagttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 8499849  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||| |||||   | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8499848 ttatggtgaaattacggaacataggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 8499749  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatta 299  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||    
T  8499748 attaatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattaattagatta 8499649  T
Q  300 tatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatatt 340  Q
    | |||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||    
T  8499648 tctgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatatt 8499607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 28848362 - 28848684
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  28848362 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 28848461  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 206  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  28848462 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg-----------ttgtgaatacgatattttccatgattgat 28848550  T
Q  207 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtga 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28848551 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtga 28848650  T
Q  307 ataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  28848651 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 28848684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15412859 - 15412518
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15412859 gtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgat 15412760  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15412759 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgtataattgattatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 15412660  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatta 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  15412659 attgatgaagttttatatgtatatatgaagttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgcatcaattagatta 15412560  T
Q  300 tatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatatt 340  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  15412559 tctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 15412518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 46822683 - 46822445
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822683 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 46822584  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 206  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46822583 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 46822484  T
Q  207 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 245  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46822483 gaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgat 46822445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 54521250 - 54520985
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54521250 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtgggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 54521151  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  54521150 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatg 54521051  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54521050 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 54520985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15977960 - 15977696
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15977960 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgag 15977861  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15977860 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 15977762  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 266  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  15977761 attgataaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttatat 15977696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 29544576 - 29544839
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  29544576 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgatttcaaaagaatttatagaacttgag 29544675  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| || | ||||||||  |||    
T  29544676 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatctatatatttgttaaaatgatattgtcaatg 29544775  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttat 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29544776 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttat 29544839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 12119388 - 12119606
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119388 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 12119487  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119488 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 12119587  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  12119588 attgatgaagtattatatg 12119606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 5 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 10557332 - 10557091
Alignment:
Q  5 ataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 104  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10557332 ataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttagttttacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 10557233  T
Q  105 ggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattg 204  Q
    ||||| |||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10557232 ggtcagattactgcacataggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaattcgatattgtccatgattg 10557133  T
Q  205 atgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 246  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10557132 atgaagttttatatgtatatatgatgttttgagatgttgatt 10557091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 13436727 - 13436520
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436727 gtacataattggtcttaggtataaatacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 13436628  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436627 ttatggtccaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 13436528  T
Q  201 attgatga 208  Q
    ||||||||    
T  13436527 attgatga 13436520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 144 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 8899378 - 8899183
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899378 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 8899280  T
Q  244 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  8899279 attatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 8899183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 144 - 328
Target Start/End: Original strand, 9707484 - 9707668
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707484 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 9707583  T
Q  244 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactt 328  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707584 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactt 9707668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 58 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12305516 - 12305315
Alignment:
Q  58 taatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaat 157  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  12305516 taatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaat 12305417  T
Q  158 tagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatg 257  Q
    || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12305416 taatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatg 12305317  T
Q  258 tt 259  Q
    ||    
T  12305316 tt 12305315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 144 - 328
Target Start/End: Original strand, 16282689 - 16282872
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282689 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 16282787  T
Q  244 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactt 328  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282788 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactt 16282872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 144 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 41124171 - 41123976
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124171 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattggtgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 41124073  T
Q  244 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  41124072 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 41123976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 144 - 340
Target Start/End: Original strand, 38961769 - 38961964
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961769 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatgttg 38961867  T
Q  244 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  38961868 gttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 38961964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 41124367 - 41124146
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124367 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgatttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 41124268  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||| || ||| ||||| |||    
T  41124267 ttatagtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaactagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatg 41124168  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtat 222  Q
    ||||||||| |  |||||||||    
T  41124167 attgatgaattagtatatgtat 41124146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24514098 - 24513910
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24514098 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 24513999  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgt 195  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  24513998 tcaaattactgcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgt 24513910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 16282492 - 16282714
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282492 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 16282591  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattg-ttcat 199  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| || ||| ||| || ||    
T  16282592 ttattgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgttttat 16282691  T
Q  200 gattgatgaagtgttatatgtat 222  Q
    |||||||||| |  |||||||||    
T  16282692 gattgatgaattagtatatgtat 16282714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 17444498 - 17444719
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17444498 gtacagaattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttattgaacttgag 17444597  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| || ||| ||||| |||    
T  17444598 ttatagtcaaatttttgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatg 17444697  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtat 222  Q
    ||||||||| |  |||||||||    
T  17444698 attgatgaattagtatatgtat 17444719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 38961573 - 38961794
Alignment:
Q  2 tacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg-ccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961573 tacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagccttctaatggccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 38961672  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| || ||| ||||| |||    
T  38961673 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatg 38961772  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtat 222  Q
    ||||||||| |  |||||||||    
T  38961773 attgatgaattagtatatgtat 38961794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25237270 - 25237063
Alignment:
Q  2 tacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagt 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25237270 tacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgttggtatgaatgttaggtttctaatgccgtgtgtttaacttcaaaaggatttatagaacttgagt 25237171  T
Q  102 tatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatga 201  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| || ||| ||||| ||||    
T  25237170 tatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatga 25237071  T
Q  202 ttgatgaa 209  Q
    ||||||||    
T  25237070 ttgatgaa 25237063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 20629926 - 20630078
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20629926 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 20630025  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgat 153  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630026 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgat 20630078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25229683 - 25229476
Alignment:
Q  2 tacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagt 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25229683 tacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgttggtatgaatgttaggtttctaatgccgtgtgtttaacttcaaaaggatttatagaacttgagt 25229584  T
Q  102 tatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatga 201  Q
    ||| ||||||||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| || ||| ||||| ||||    
T  25229583 tatagtcaaattactacacataagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatga 25229484  T
Q  202 ttgatgaa 209  Q
    ||||||||    
T  25229483 ttgatgaa 25229476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 15465582 - 15465448
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  15465582 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 15465483  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaa 135  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15465482 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 15465448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 10379754 - 10379613
Alignment:
Q  2 tacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagt 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  10379754 tacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagt 10379655  T
Q  102 tatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 143  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10379654 tatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 10379613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Original strand, 38961385 - 38961514
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38961385 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 38961484  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38961485 tcaaattgctgcacgtaggtcacagtgaat 38961514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 26054999 - 26055133
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  26054999 gtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgcctttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 26055098  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaa 135  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  26055099 ttatggtaaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 26055133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 27165873 - 27165738
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27165873 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 27165774  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27165773 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27165738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 53301045 - 53301180
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  53301045 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 53301144  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  53301145 ttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaat 53301180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 55319038 - 55319173
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||     
T  55319038 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgaa 55319137  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  55319138 ttatggtcaaattactgcacgtaagtcacagtgaat 55319173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 10557529 - 10557394
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  10557529 gtacagaattggtcttagttgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtcggacgtcaaaacgatttatagaacttgag 10557430  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10557429 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10557394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 5223811 - 5223677
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  5223811 gtacagaattcgtcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 5223712  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaa 135  Q
    ||||| |||||||  | ||||||||||||||||||    
T  5223711 ttatgatcaaattactccacgtaggtcacagtgaa 5223677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 226 - 340
Target Start/End: Original strand, 17446614 - 17446728
Alignment:
Q  226 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 325  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17446614 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttga 17446713  T
Q  326 cttacaattgatatt 340  Q
    ||| || ||||||||    
T  17446714 cttgcatttgatatt 17446728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 36528569 - 36528447
Alignment:
Q  15 ttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattg 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||     
T  36528569 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacgtctaaatgaattatagaacttgagttatggtcaaatta 36528470  T
Q  115 ttgcacgtaggtcacagtgaata 137  Q
     ||||||||||||| ||||||||    
T  36528469 ctgcacgtaggtcatagtgaata 36528447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 55318854 - 55318980
Alignment:
Q  10 tggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtca 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  55318854 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatggtagctttctaatgccgttggtatgacatcaaaacgatttatagaacttgagttatggtca 55318953  T
Q  110 aattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||    
T  55318954 aattactgcacgtaggtcgcagtgaat 55318980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 8500135 - 8500009
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8500135 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 8500036  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtg 133  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||||    
T  8500035 tcaagttactgcacgtaggtcacagtg 8500009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 46822881 - 46822747
Alignment:
Q  2 tacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  46822881 tacataattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagt 46822782  T
Q  102 tatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  46822781 tatcgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 46822747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Original strand, 13937520 - 13937649
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  13937520 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgtgttatgg 13937619  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  |||||||||| ||| ||||||    
T  13937620 tcaaattactgcacgtaggccacggtgaat 13937649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Original strand, 14567432 - 14567561
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14567432 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctaacatcaaaaggatttatagaacttgagttatag 14567531  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  14567532 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 14567561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 41124554 - 41124425
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  41124554 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatga 41124455  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41124454 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 41124425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 237 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 50243014 - 50242911
Alignment:
Q  237 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattga 336  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  50243014 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 50242915  T
Q  337 tatt 340  Q
    ||||    
T  50242914 tatt 50242911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 237 - 340
Target Start/End: Original strand, 43550448 - 43550551
Alignment:
Q  237 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattga 336  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  43550448 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 43550547  T
Q  337 tatt 340  Q
    ||||    
T  43550548 tatt 43550551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 144 - 266
Target Start/End: Original strand, 11913928 - 11914051
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  11913928 tatgattgatgaattagtatatgtatgtacatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 11914026  T
Q  242 tgattaccatttgatgttgttatat 266  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  11914027 tgattatcatttgatgttgttatat 11914051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Original strand, 20629739 - 20629868
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| | |||  |||||||||||||||||||||||    
T  20629739 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttataggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacattaaagcgatttatagaacttgagttatgg 20629838  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  20629839 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 20629868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Original strand, 53070636 - 53070726
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  53070636 atttgatgttgttagattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 53070726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 136
Target Start/End: Original strand, 16358236 - 16358344
Alignment:
Q  28 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||    
T  16358236 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaacggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcgcataggtc 16358335  T
Q  128 acagtgaat 136  Q
    ||| |||||    
T  16358336 acattgaat 16358344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 17672805 - 17672715
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  17672805 atttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatatt 17672715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Original strand, 16282305 - 16282434
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||   || || |||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16282305 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatagatgttatctttttaatgttgttagtctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 16282404  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  16282405 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 16282434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Original strand, 29172565 - 29172656
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  29172565 atttgatgttgatagtattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 29172656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Original strand, 17444311 - 17444440
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||| | || ||||||  ||||||| |||||||| |||||    
T  17444311 aattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgtaagtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctaacgtcaaaacaatttatacaacttgagctatgg 17444410  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  17444411 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 17444440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 137
Target Start/End: Original strand, 3264323 - 3264431
Alignment:
Q  29 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtca 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  3264323 gaaagttgtaggtatggatgttagatttctaaggccgttgatttgacgtctaaatgaattatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtca 3264422  T
Q  129 cagtgaata 137  Q
    |||||||||    
T  3264423 cagtgaata 3264431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 224
Target Start/End: Original strand, 17444694 - 17444773
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatat 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17444694 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatat 17444773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 17393336 - 17393201
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||||| | ||    
T  17393336 gtacagaattggtcttagatgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttacctttccaatggcgttggtttgactccaaaatgatttttagaacattag 17393237  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||| ||||||||  | ||| ||||||| |||||||    
T  17393236 ttatagtcaaattactacacataggtcatagtgaat 17393201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Original strand, 12119707 - 12119798
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  12119707 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 12119798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 250 - 313
Target Start/End: Original strand, 17248224 - 17248287
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17248224 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaataattg 17248287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 328
Target Start/End: Original strand, 24340660 - 24340739
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactt 328  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  24340660 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttactt 24340739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 250 - 330
Target Start/End: Original strand, 37642202 - 37642283
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttac 330  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||    
T  37642202 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttac 37642283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 25237075 - 25237009
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25237075 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 25237009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 252 - 340
Target Start/End: Original strand, 2051138 - 2051227
Alignment:
Q  252 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| || || ||||||||    
T  2051138 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 2051227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 261 - 330
Target Start/End: Original strand, 22147474 - 22147543
Alignment:
Q  261 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttac 330  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||    
T  22147474 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttac 22147543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 15008052 - 15007988
Alignment:
Q  72 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  15008052 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 15007988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 15007927 - 15007868
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaa 60  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15007927 gtacaaaattggttttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaa 15007868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 325
Target Start/End: Original strand, 52523666 - 52523740
Alignment:
Q  252 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 325  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||    
T  52523666 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga 52523740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 23274871 - 23274792
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactt 328  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  23274871 atttgatgttgtttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttactt 23274792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 113
Target Start/End: Original strand, 51158683 - 51158750
Alignment:
Q  46 atgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  51158683 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 51158750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 113
Target Start/End: Original strand, 16934851 - 16934917
Alignment:
Q  47 tgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16934851 tgttagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 16934917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 36528390 - 36528340
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgtta 51  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36528390 gtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 36528340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Original strand, 14576788 - 14576861
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14576788 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatatt 14576861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Original strand, 14528625 - 14528723
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 105  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||| ||| ||   |||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||    
T  14528625 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggatttggtttgacttccaaatgatttttagaactttagttatg 14528723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15977646 - 15977604
Alignment:
Q  298 tatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15977646 tatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 15977604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 25058367 - 25058301
Alignment:
Q  47 tgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  25058367 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 25058301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25201397 - 25201323
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||| ||  |||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  25201397 atgattgatgaattattatatgaatgtatatattgatgaatatgatattgttcatgattaatgaattattatatg 25201323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 42386593 - 42386503
Alignment:
Q  251 tttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  42386593 tttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 42386503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 49231837 - 49231771
Alignment:
Q  47 tgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  49231837 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 49231771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 113
Target Start/End: Original strand, 54039167 - 54039233
Alignment:
Q  47 tgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  54039167 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgatcaaatt 54039233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 30152518 - 30152453
Alignment:
Q  48 gttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  30152518 gttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaatttgagttatgatcaaatt 30152453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 43841114 - 43841025
Alignment:
Q  252 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| |||||||||||    
T  43841114 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatatt 43841025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 10555802 - 10555766
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgt 37  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10555802 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgt 10555766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 16358402 - 16358458
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttc 57  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  16358402 gtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttttagatatagatgttagctttc 16358458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 17463702 - 17463663
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  17463702 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 17463663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 34159850 - 34159811
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  34159850 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 34159811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 55477015 - 55476976
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  55477015 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 55476976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Original strand, 8276474 - 8276572
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 105  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  8276474 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtcgaaatgatttttagaacttgagatatg 8276572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 219
Target Start/End: Original strand, 11913867 - 11913897
Alignment:
Q  189 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11913867 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 11913897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 203
Target Start/End: Original strand, 15025934 - 15025992
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgatt 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  15025934 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgatgatgaatatgatattgttcatgatt 15025992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 113
Target Start/End: Original strand, 17956869 - 17956935
Alignment:
Q  47 tgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||| || ||| ||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  17956869 tgttagctttccaatggctttggtttgacatctaaatgatatttagaacttgagttatgatcaaatt 17956935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 21026183 - 21026101
Alignment:
Q  29 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||  ||| || ||| |  ||| ||||||||||| |||||    
T  21026183 gaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatggctttgttttgaagtcataatgatgttcagatcttgagttatgatcaaa 21026101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15977700 - 15977663
Alignment:
Q  220 tatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatg 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15977700 tatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatg 15977663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17044395 - 17044330
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |||||| ||   ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  17044395 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatattgacgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 17044330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 17488022 - 17487949
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||    
T  17488022 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 17487949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 17499504 - 17499431
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||    
T  17499504 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 17499431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26687069 - 26686980
Alignment:
Q  252 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||   ||||| || ||| | ||||||||| |||||||||||    
T  26687069 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatatt 26686980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Original strand, 40213676 - 40213749
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||| |||||   || |||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  40213676 tgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatatt 40213749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 61)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13989293 - 13988955
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989293 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 13989194  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13989193 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 13989095  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13989094 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 13988995  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  13988994 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 13988955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 21474821 - 21475160
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21474821 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 21474920  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21474921 ttatggtcaaattactaaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 21475020  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21475021 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 21475120  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21475121 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 21475160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21841194 - 21840856
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21841194 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 21841095  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  21841094 ttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatatgatattgtccatg 21840996  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21840995 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattat 21840896  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21840895 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 21840856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 21923026 - 21923364
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21923026 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagag 21923125  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  21923126 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 21923224  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21923225 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 21923324  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21923325 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 21923364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16362346 - 16362006
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  16362346 gtacagaattggtcttgggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaatgcggttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttaag 16362247  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16362246 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataatttattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgttaatacgatattgtccatg 16362147  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatta 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16362146 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatta 16362047  T
Q  300 tatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16362046 tttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 16362006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 4 - 340
Target Start/End: Original strand, 23593471 - 23593808
Alignment:
Q  4 cataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||  |||||||||||||| ||||    
T  23593471 cataattagtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaataatttatagaacttgcgtta 23593570  T
Q  104 tggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgatt 203  Q
    | || |||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23593571 tagttaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgatt 23593670  T
Q  204 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 302  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593671 aatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 23593770  T
Q  303 gtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23593771 gtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 23593808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 15859743 - 15860062
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15859743 gtacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatacaacttgag 15859842  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| ||||    
T  15859843 ttatggtcaaataactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat-cttgcgaatacgatattgtccatg 15859941  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  15859942 gttgatgaagtgttatatgtatatatgatgtcttaagatgttgattaccatctgatgttgttatattgtgatataattgtatgtgcattgattgaattat 15860041  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttg 321  Q
     ||||| ||||| ||||||||    
T  15860042 ttgtgagtaattaagacgttg 15860062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 16274990 - 16275209
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaa-tgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16274990 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaaatgtcattggtttcacttcaaaaggatttatagaacttga 16275089  T
Q  100 gttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcat 199  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16275090 gttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatacgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaattcgatattgttcat 16275189  T
Q  200 gattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16275190 gattgatgaagtgttatatg 16275209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 144 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 29776972 - 29776777
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776972 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 29776874  T
Q  244 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  29776873 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 29776777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 27161321 - 27161529
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27161321 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 27161420  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||    
T  27161421 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttatgaataaaatattgttaatg 27161520  T
Q  201 attgatgaa 209  Q
    |||||||||    
T  27161521 attgatgaa 27161529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29777168 - 29776947
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29777168 gtacataattggtcttaggtgtaatcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgggttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 29777069  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| || ||| ||||| |||    
T  29777068 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatg 29776969  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtat 222  Q
    ||||||||| |  |||||||||    
T  29776968 attgatgaattagtatatgtat 29776947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 144 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 29298420 - 29298225
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298420 tatgattgatgaattagtatatatatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 29298322  T
Q  244 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  29298321 attattatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 29298225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29298669 - 29298461
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298669 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 29298570  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| || ||| ||||| |||    
T  29298569 ttatagtcaaattactgcacataagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatg 29298470  T
Q  201 attgatgaa 209  Q
    |||||||||    
T  29298469 attgatgaa 29298461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 222
Target Start/End: Original strand, 22122755 - 22122970
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  22122755 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaacgatttatagaacttgggttatag 22122854  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 206  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||    
T  22122855 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 22122954  T
Q  207 gaagtgttatatgtat 222  Q
    ||| || |||||||||    
T  22122955 gaattggtatatgtat 22122970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 144 - 340
Target Start/End: Original strand, 16275240 - 16275437
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16275240 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttcaagatattg 16275339  T
Q  244 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16275340 attattatttgatgttgttatattgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatatt 16275437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 144 - 340
Target Start/End: Original strand, 22122945 - 22123140
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22122945 tatgattgatgaattggtatatgtatgtttatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatattg 22123043  T
Q  244 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  22123044 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatatt 22123140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 144 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 31612597 - 31612402
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31612597 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatattg 31612499  T
Q  244 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  31612498 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatatt 31612402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 31612787 - 31612572
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31612787 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttcaaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 31612688  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 206  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | | || ||||||||| |||||||||    
T  31612687 tcaaattactgcacgtaggtcaaagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatcagtatgatattgtttatgattgat 31612588  T
Q  207 gaagtgttatatgtat 222  Q
    ||| |  |||||||||    
T  31612587 gaattagtatatgtat 31612572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 222
Target Start/End: Original strand, 22050577 - 22050792
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22050577 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcaatggtctaatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 22050676  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 206  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||    
T  22050677 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 22050776  T
Q  207 gaagtgttatatgtat 222  Q
    ||| |  |||||||||    
T  22050777 gaattagtatatgtat 22050792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 13227291 - 13227129
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13227291 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttttatgtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 13227192  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 163  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13227191 ttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 13227129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 29535479 - 29535317
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29535479 gtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctagtgtcgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgag 29535380  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 163  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29535379 ttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 29535317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 29298856 - 29298727
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  29298856 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgttctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatgg 29298757  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  29298756 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 29298727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 31612980 - 31612851
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31612980 aattggtcttaggtgtaaacactaaagttataggtatggatttaagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 31612881  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  31612880 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 31612851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 31613176 - 31613044
Alignment:
Q  4 cataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  31613176 cataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaggtttctaataccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagtta 31613077  T
Q  104 tggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  31613076 tggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 31613044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Original strand, 16274803 - 16274932
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16274803 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatatcattggtctgacgtcaaaactatttatagaacttgagttatgg 16274902  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  16274903 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 16274932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 144 - 244
Target Start/End: Original strand, 22050767 - 22050866
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22050767 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 22050865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 15859537 - 15859672
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  15859537 gtacagaattggtcttaggtgtatacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacctcaaaactatttatagaacttgag 15859636  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15859637 ttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15859672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Original strand, 22122561 - 22122691
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaa-gttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 105  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22122561 aattggtcttaggtgtaaacactaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttttacttcaaaacgatttgtagaacttgagttatg 22122660  T
Q  106 gtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||||||||||    
T  22122661 gtcaaattactgcacatagatcacagtgaat 22122691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Original strand, 27161134 - 27161263
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27161134 aattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatactgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgaattatgg 27161233  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  27161234 tcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 27161263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 9044739 - 9044867
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| | || |||||| |||||||||||||||||    
T  9044739 gtacagaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagttttctaatgccgttggtctaacgtcaaaacgatttatagaacttgag 9044838  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcac 129  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9044839 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcac 9044867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16401542 - 16401407
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | || |  |||||||||||| ||||||||    
T  16401542 gtacagaattggtcttaggtgtagacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctatttccattggtctaacgtggaaaggatttatataacttgag 16401443  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16401442 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16401407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 29777361 - 29777226
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  29777361 gtacagaattagtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacgttaaaacgatttatagaacttgag 29777262  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||| |||||    
T  29777261 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacaatgaat 29777226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 237 - 328
Target Start/End: Original strand, 45574812 - 45574903
Alignment:
Q  237 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactt 328  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45574812 gatgttgattatgatttgatgttcttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgactt 45574903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 433190 - 433099
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  433190 atttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatatt 433099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 233
Target Start/End: Original strand, 27161518 - 27161605
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 233  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27161518 atgattgatgaattagtatatatatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 27161605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Original strand, 13212844 - 13212935
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  13212844 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 13212935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21347141 - 21347050
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  21347141 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 21347050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 40129506 - 40129387
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  40129506 aattgatcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgtcgttggtctggcatcaaaacgatttatagaacttgagttatag 40129407  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggt 126  Q
    |||||||  |||||||||||    
T  40129406 tcaaattactgcacgtaggt 40129387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21707346 - 21707256
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21707346 atttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 21707256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21711888 - 21711798
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21711888 atttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 21711798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21342276 - 21342185
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  21342276 atttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 21342185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 255 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 40389329 - 40389243
Alignment:
Q  255 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||    
T  40389329 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatatt 40389243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 43543329 - 43543269
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaat 61  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43543329 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaat 43543269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 66 - 136
Target Start/End: Original strand, 10812612 - 10812682
Alignment:
Q  66 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10812612 ttggtttgacttcaaaatgatttataaaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10812682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 43543267 - 43543214
Alignment:
Q  213 ttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43543267 ttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 43543214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 340
Target Start/End: Original strand, 21861510 - 21861598
Alignment:
Q  253 tgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||||| || ||||||||    
T  21861510 tgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatatt 21861598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Original strand, 21896193 - 21896284
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||| |||| |||||| || ||||||||    
T  21896193 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatatt 21896284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29298473 - 29298408
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  29298473 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 29298408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16758822 - 16758775
Alignment:
Q  261 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaat 308  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16758822 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaat 16758775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 21858662 - 21858595
Alignment:
Q  46 atgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21858662 atgttagctttctaacggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 21858595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 113
Target Start/End: Original strand, 44035860 - 44035925
Alignment:
Q  48 gttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  44035860 gttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttataacttgagttatgatcaaatt 44035925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 321
Target Start/End: Original strand, 35261018 - 35261090
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg 321  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||  |||||| ||||    
T  35261018 atttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgagatgttg 35261090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 13989390 - 13989351
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  13989390 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 13989351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 113
Target Start/End: Original strand, 21650910 - 21650976
Alignment:
Q  47 tgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  21650910 tgttagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttaaaactagagttatgatcaaatt 21650976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 22366596 - 22366538
Alignment:
Q  47 tgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 105  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  22366596 tgttagctttctaatgactttggtttgacatcgaaatgatttttagaacttgagatatg 22366538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12710211 - 12710130
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatat 226  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||  |||||| ||| ||||||| ||||| || | | ||||||| ||||||    
T  12710211 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcacgattgctggattattatatgaatatat 12710130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Original strand, 27250684 - 27250757
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||    
T  27250684 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 27250757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Original strand, 41049973 - 41050026
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 302  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  41049973 atttgacgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatat 41050026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 301
Target Start/End: Original strand, 16368224 - 16368276
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattata 301  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  16368224 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattata 16368276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 16656002 - 16655942
Alignment:
Q  47 tgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggt 107  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||    
T  16656002 tgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggt 16655942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 105
Target Start/End: Original strand, 18060577 - 18060673
Alignment:
Q  9 ttggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 105  Q
    |||| ||| |||||||||  ||||||| ||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| |||||  | |||||||| ||||    
T  18060577 ttggcctttggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttaaaaacttgagatatg 18060673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11717 - 11377
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11717 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgatacttgtaggtatggatgttagctttctattgccgttgggttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 11618  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11617 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagttaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 11518  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatata-tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatta 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11517 attgatgaagtgttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgattttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatca 11418  T
Q  300 tatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  11417 tatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 11377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 9669 - 9331
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9669 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctctctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 9570  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  9569 ttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatatgatattgtccatg 9471  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9470 attgatgaagtgttatatgtatatttgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattat 9371  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  9370 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 9331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 71)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20909439 - 20909101
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909439 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 20909340  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  20909339 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 20909241  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20909240 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 20909141  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20909140 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 20909101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 264503 - 264841
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264503 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 264602  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  264603 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 264701  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  264702 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 264801  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  264802 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 264841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 39363812 - 39363473
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39363812 gtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttgatttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 39363713  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  39363712 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacactgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatg 39363613  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39363612 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 39363513  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  39363512 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 39363473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 10732675 - 10733013
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10732675 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagag 10732774  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  10732775 ttatagtcaaattactgcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgattttgtccatg 10732873  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10732874 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatacggtgatataattgtatatgcattacttgaattat 10732973  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  10732974 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 10733013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 39245563 - 39245225
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39245563 gtacataattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgat 39245464  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  39245463 ttatagttaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 39245365  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  39245364 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattat 39245265  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||    
T  39245264 atgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatatt 39245225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 2 - 340
Target Start/End: Original strand, 42245101 - 42245438
Alignment:
Q  2 tacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagt 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  42245101 tacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaatggatttatagaactatagt 42245200  T
Q  102 tatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatga 201  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  42245201 tatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatga 42245299  T
Q  202 ttgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattata 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42245300 ttgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattata 42245399  T
Q  302 tgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  42245400 tgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 42245438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 29346407 - 29346069
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  29346407 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgat 29346308  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  29346307 ttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 29346209  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29346208 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 29346109  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  29346108 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 29346069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 29348880 - 29348542
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  29348880 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcaaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgat 29348781  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  29348780 ttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 29348682  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29348681 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 29348582  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  29348581 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 29348542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 29351353 - 29351015
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  29351353 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcaaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgat 29351254  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  29351253 ttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 29351155  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29351154 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 29351055  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  29351054 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 29351015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 38619864 - 38619523
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619864 gtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 38619765  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38619764 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 38619665  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatta 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  38619664 attgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattggaatataattgtatatgcatcaattagatta 38619565  T
Q  300 tatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatatt 340  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  38619564 tctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 38619523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23064941 - 23064600
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064941 gtacagaattggtcttagatataaacacgaaagttgtaggtatggatgtcagctttctagtgccgttcgtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 23064842  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23064841 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataatttattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 23064742  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatta 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  23064741 attgatgaagttttatatgtatatattatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgcatcaattagatta 23064642  T
Q  300 tatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatatt 340  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  23064641 tctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 23064600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 2154366 - 2154687
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154366 gtacagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatgaatattagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 2154465  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  2154466 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatactgtccatg 2154565  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  2154566 attgatgaagtgttatatgtatatatgatg-------------------atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattat 2154646  T
Q  301 atgtg-aataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  2154647 atgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatatt 2154687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 17516898 - 17517142
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17516898 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 17516997  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17516998 ttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 17517097  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 245  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17517098 attgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgat 17517142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 37804637 - 37804902
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37804637 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgag 37804736  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  37804737 ttatggtcaaattaatgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatg 37804836  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 266  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  37804837 attaatgaagcgttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattagaatttgatgttgttatat 37804902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 20901655 - 20901873
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901655 gtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 20901754  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901755 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 20901854  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20901855 attgatgaagtgttatatg 20901873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9776780 - 9776521
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||   |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9776780 aattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagctatgg 9776681  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 206  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  9776680 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattggt 9776581  T
Q  207 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 266  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9776580 gaagggttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 9776521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 144 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 32027677 - 32027494
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027677 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 32027579  T
Q  244 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactt 328  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027578 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactt 32027494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 144 - 328
Target Start/End: Original strand, 20917830 - 20918013
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917830 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatcttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 20917928  T
Q  244 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactt 328  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917929 attattatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgctttacttgaattagatgtgaataattgagacgttgttgactt 20918013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 144 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 29330215 - 29330023
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  29330215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgatt 29330117  T
Q  244 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  29330116 atta---tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 29330023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 20917581 - 20917789
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917581 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 20917680  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| || ||| ||||| |||    
T  20917681 ttatagtcaaattactgcacgtaagtcacggtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatg 20917780  T
Q  201 attgatgaa 209  Q
    |||||||||    
T  20917781 attgatgaa 20917789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 32027873 - 32027652
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027873 gtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 32027774  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| || ||| ||||| |||    
T  32027773 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatg 32027674  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtat 222  Q
    ||||||||| |  |||||||||    
T  32027673 attgatgaattagtatatgtat 32027652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29330410 - 29330190
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29330410 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgctgttggtttgatttcaaaaggatttatagaacttgag 29330311  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  || || ||| ||||| |||    
T  29330310 ttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaa-aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttacgagtatgatgttgtttatg 29330212  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtat 222  Q
    ||||||||| |  |||||||||    
T  29330211 attgatgaattagtatatgtat 29330190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 144 - 340
Target Start/End: Original strand, 20901904 - 20902082
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  20901904 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg------------- 20901990  T
Q  244 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtg-aataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20901991 ------atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatatt 20902082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 17516512 - 17516647
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||||||||||||||    
T  17516512 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaacgatttatagaacttgag 17516611  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  17516612 ttatggtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 17516647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 20901462 - 20901597
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  20901462 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgaacgttgtaggtatggatgtcagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaactttag 20901561  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20901562 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20901597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 32028254 - 32028124
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattgg-tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  32028254 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttttgacgtcaaaacgatttatagagcttgagttatg 32028155  T
Q  106 gtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  32028154 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 32028124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 29330597 - 29330468
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29330597 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaaggccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 29330498  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  29330497 tcaaattaatgcacgtatgtcacagtgaat 29330468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 32028640 - 32028511
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  32028640 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatatcgttggtctgacatcaaaacgatttatagagcttgagttatgg 32028541  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  32028540 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 32028511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 296009 - 296144
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  296009 gtacagaattggtcttaggtgtatacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgag 296108  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  296109 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacactgaat 296144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Original strand, 17516711 - 17516840
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  17516711 aattggtcctaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatcg 17516810  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    || ||||  ||||| |||||||||||||||    
T  17516811 tcgaattactgcacataggtcacagtgaat 17516840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 136
Target Start/End: Original strand, 295826 - 295951
Alignment:
Q  11 ggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaa 110  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  295826 ggtcttaggtgtaaccatgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgatctgacatcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaa 295925  T
Q  111 attgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||  |||||||||||||||||||||    
T  295926 attactgcacgtaggtcacagtgaat 295951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Original strand, 2154179 - 2154308
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  2154179 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttttaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttaagttatag 2154278  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  |||||||| ||||| ||||||    
T  2154279 tcaaattactgcacgtatgtcacggtgaat 2154308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Original strand, 20917391 - 20917523
Alignment:
Q  4 cataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 103  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||  ||||||| |||||||||||    
T  20917391 cataattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgctggtctgacgtcaaaatcatttataaaacttgagtta 20917490  T
Q  104 tggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  20917491 tggtcaaattactacacgtaggtcacaatgaat 20917523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 32028066 - 32027931
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  32028066 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaaattgtatttatggatgttagctttctaatgccattggtcggacgtcaaaacgatttatagagcttgag 32027967  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||| |||||    
T  32027966 ttatggtcaaattactgcacgtaagtcacaatgaat 32027931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Original strand, 36154766 - 36154856
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  36154766 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 36154856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 32028453 - 32028318
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||  ||||| |||| ||||||  ||||||||| ||||||    
T  32028453 gtacagaattggttttaggtgaaaacacgaaagttgtaggtatatatgttagctttctagtgctgttggtctgacgtcaaaacaatttatagagcttgag 32028354  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  32028353 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 32028318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 252 - 340
Target Start/End: Original strand, 11581184 - 11581272
Alignment:
Q  252 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  11581184 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatatt 11581272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 255 - 340
Target Start/End: Original strand, 18319021 - 18319107
Alignment:
Q  255 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  18319021 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 18319107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Original strand, 10775659 - 10775749
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  10775659 atttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 10775749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 255 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24067282 - 24067196
Alignment:
Q  255 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||    
T  24067282 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatatt 24067196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 31061248 - 31061157
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||    
T  31061248 atttgatgttgttatattgtgatataattttatatgcattaattaaattatttgtgaataattgatacgttgattgacttgcatttgatatt 31061157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 250 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 40726037 - 40725956
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttac 330  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||    
T  40726037 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttac 40725956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22144215 - 22144142
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  22144215 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatatt 22144142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 113
Target Start/End: Original strand, 27183208 - 27183275
Alignment:
Q  46 atgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  27183208 atgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 27183275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 22883904 - 22884010
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||| ||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  22883904 aattggccttgggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagctttctaatggctttggtttgacgttcaaatgatttttagaacttgagttatga 22884003  T
Q  107 tcaaatt 113  Q
    |||||||    
T  22884004 tcaaatt 22884010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18744036 - 18743965
Alignment:
Q  148 attgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  18744036 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatg 18743965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 12012 - 11914
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 105  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||||||| ||    |||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  12012 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 11914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 25426286 - 25426188
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 105  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||||||| ||    |||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  25426286 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 25426188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Original strand, 43444009 - 43444107
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 105  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  43444009 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 43444107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 113
Target Start/End: Original strand, 1220384 - 1220450
Alignment:
Q  47 tgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  1220384 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 1220450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 219
Target Start/End: Original strand, 1628169 - 1628243
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||| || |||||| | |||||||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  1628169 atgattgatgaactattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttaatgattgatgaagtattatatg 1628243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 7424986 - 7424880
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  7424986 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 7424887  T
Q  107 tcaaatt 113  Q
    |||||||    
T  7424886 tcaaatt 7424880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 113
Target Start/End: Original strand, 10778832 - 10778898
Alignment:
Q  47 tgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  10778832 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 10778898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 222
Target Start/End: Original strand, 20917777 - 20917855
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||  || ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  20917777 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtattatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 20917855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 105
Target Start/End: Original strand, 21074249 - 21074307
Alignment:
Q  47 tgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  21074249 tgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 21074307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 23511195 - 23511130
Alignment:
Q  48 gttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23511195 gttagctttttaatggctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 23511130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 219
Target Start/End: Original strand, 21399896 - 21399968
Alignment:
Q  147 gattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||  |||||| ||| ||||||||| |||||||| | |||||||    
T  21399896 gattgatgaattattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgttgttcatggttgatgaattattatatg 21399968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Original strand, 264406 - 264445
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  264406 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 264445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 20909536 - 20909497
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20909536 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20909497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 39245660 - 39245621
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  39245660 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39245621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 39363908 - 39363869
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  39363908 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39363869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 113
Target Start/End: Original strand, 1168832 - 1168898
Alignment:
Q  47 tgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||| | | |||||||||||| |||||||    
T  1168832 tgttagctttctaatggctttggtttggcttccaaatgattttttggacttgagttatgatcaaatt 1168898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 113
Target Start/End: Original strand, 11212734 - 11212800
Alignment:
Q  47 tgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||| || || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  11212734 tgttagctttcttatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 11212800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 11342287 - 11342201
Alignment:
Q  19 gtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 105  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  11342287 gtgtaaacatgaaagttgtagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 11342201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Original strand, 22367095 - 22367193
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 105  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| || |||||||| ||||    
T  22367095 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttaaaacttgagatatg 22367193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 9078118 - 9078045
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  9078118 tgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatatt 9078045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 25421698 - 25421625
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| |||||||||||    
T  25421698 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatatt 25421625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 25431560 - 25431487
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||| | || ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25431560 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatatt 25431487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Original strand, 20198507 - 20198571
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    |||||||||||| || |||||| | |||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  20198507 atgattgatgaagtattatatgaaggtatatgttaatgaatatgatgttgttcataattgatgaa 20198571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 28901555 - 28901495
Alignment:
Q  47 tgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggt 107  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||    
T  28901555 tgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggt 28901495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 28937950 - 28937890
Alignment:
Q  47 tgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggt 107  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||    
T  28937950 tgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggt 28937890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 134638 - 134300
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  134638 gtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagag 134539  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  134538 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 134440  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  134439 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 134340  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  134339 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 134300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 137107 - 136769
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  137107 gtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagag 137008  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  137007 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 136909  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  136908 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 136809  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  136808 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 136769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 139576 - 139238
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  139576 gtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagag 139477  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  139476 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 139378  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  139377 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 139278  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  139277 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 139238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 142045 - 141707
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  142045 gtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagag 141946  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  141945 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 141847  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  141846 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 141747  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  141746 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 141707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 144514 - 144176
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  144514 gtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagag 144415  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  144414 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 144316  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  144315 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 144216  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  144215 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 144176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 2)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13820 - 13481
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13820 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaatgttatctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 13721  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13720 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 13621  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13620 attgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattat 13521  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  13520 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 13481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 13918 - 13878
Alignment:
Q  96 ttgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  13918 ttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 13878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 40827 - 40489
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40827 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 40728  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  40727 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 40629  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  40628 attgatgaagtgttatatgtatatatgaagttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaatttt 40529  T
Q  301 atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  40528 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 40489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 37968 - 37863
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||| ||| ||   |||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  37968 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttcaaatggctttggtttgacttccaaatgattt-tagaacttgagttatga 37870  T
Q  107 tcaaatt 113  Q
    |||||||    
T  37869 tcaaatt 37863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 40925 - 40885
Alignment:
Q  96 ttgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  40925 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 40885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 6374 - 6070
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6374 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 6275  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6274 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 6176  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  6175 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatttaattgcatatgcattacttgaattat 6076  T
Q  301 atgtga 306  Q
    ||||||    
T  6075 atgtga 6070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 59 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11142 - 10862
Alignment:
Q  59 aatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatt 158  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11142 aatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaatt 11043  T
Q  159 agtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgt 258  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11042 agtatatgtatgtatatgtt-gtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgt 10944  T
Q  259 tgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  10943 tgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 10862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 3450 - 3186
Alignment:
Q  2 tacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagt 101  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3450 tacataattgttcttagttgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagt 3351  T
Q  102 tatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatga 201  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  3350 tatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtcaatga 3251  T
Q  202 ttgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 266  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3250 ttgatgaagtgttatatgtagatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 3186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 501491 - 501173
Alignment:
Q  2 tacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagt 101  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  501491 tacagaattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtagg-atagatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagt 501393  T
Q  102 tatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatga 201  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||                   || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501392 tatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatg-------------------tatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatga 501312  T
Q  202 ttgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattata 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501311 ttgatgatgtgttatatgtatatataatgttttaagatgttgattactatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattata 501212  T
Q  302 tgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  501211 tgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 501173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 501676 - 501550
Alignment:
Q  10 tggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtca 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  501676 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtca 501577  T
Q  110 aattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||    
T  501576 aattactgcacgtaggtcacagtgaat 501550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Original strand, 85562 - 85653
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||    
T  85562 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatatt 85653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 74
Target Start/End: Original strand, 139589 - 139645
Alignment:
Q  18 ggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttga 74  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||    
T  139589 ggtgtaaacatgaaagtcgtaggtatgaaagttagctttctaatggctttggtttga 139645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 38396 - 38730
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    ||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  38396 aattgatcttagggctaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaatttgagttatgt 38495  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 206  Q
    |||||||  || | ||  |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38496 tcaaattactgtatgtttgtcatattgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 38595  T
Q  207 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtg 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |     
T  38596 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttgaattatatata 38695  T
Q  306 aataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||| ||||||  ||| |||||| || ||||||||    
T  38696 aatatttgagatattgatgacttgcatttgatatt 38730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 7 - 266
Target Start/End: Original strand, 53612 - 53873
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  53612 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacgtcaaagggatttatagaacttgagatatgg 53711  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 206  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  53712 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatattatattgttcatgattgat 53811  T
Q  207 gaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53812 gaagtgttatatgtatatatgatgtttaagtagatgttgattatcatttgatgttgttatat 53873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 78505 - 78453
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattata 301  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  78505 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattata 78453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 4)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 4037 - 4304
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4037 gtacagaattggtcataggtgtaaacatgaaaggtgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 4136  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  4137 ttatggtcaaattactgcacgtgggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatattatattgtccatg 4236  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4237 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 4304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 3844 - 3979
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||  |||||| |||||||  ||||||||    
T  3844 gtacagaattggtcttaggtggaaacacgaaagttgtaggtattgatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaacgatttatgaaacttgag 3943  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3944 ttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 3979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 3651 - 3782
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||||  ||||||||    
T  3651 gtacagaattggtcttagctgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgaggtcaaaacgatttatgtaacttgag 3750  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagt 132  Q
    ||||| |||||||  || ||||||||||||||    
T  3751 ttatgctcaaattactgaacgtaggtcacagt 3782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 136
Target Start/End: Original strand, 3541 - 3593
Alignment:
Q  84 gatttatagaacttgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||    
T  3541 gatttatagaacttgagttatggtcaaaatactgcacgtaggtcactgtgaat 3593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 28 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1829 - 1591
Alignment:
Q  28 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1829 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtc 1730  T
Q  128 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatg 227  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1729 acagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatttatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatg 1630  T
Q  228 atgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 266  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1629 attttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 1591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 4)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15342 - 15083
Alignment:
Q  9 ttggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtc 108  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15342 ttggtcttaggtgtaaccacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgctggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtc 15243  T
Q  109 aaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 208  Q
    |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15242 aaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatttatatgtttgtgaatactatattgtccatgattgatga 15143  T
Q  209 agtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15142 agtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 15083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 11074 - 11251
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  11074 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttccaatgccgttggtccgacgtcaaaacgatttatagtacttgag 11173  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtt 178  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11174 ttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 11251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Original strand, 10887 - 11016
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10887 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtctgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 10986  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10987 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 11016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 15526 - 15398
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15526 aattggtcttag-tgtaaacacgaaagttgtaggtatggacgttagctttctaatgtcgttggtctgacatcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 15428  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15427 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 4)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10211 - 10001
Alignment:
Q  9 ttggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtc 108  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10211 ttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtc 10112  T
Q  109 aaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 208  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10111 aaattatttcatgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtgtgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 10012  T
Q  209 agtgttatatg 219  Q
    |||||||||||    
T  10011 agtgttatatg 10001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 10412 - 10277
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  10412 gtacataattggtcttatgtgtcaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtctgacatcaaaacgatttatagaacttgag 10313  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10312 ttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 10602 - 10470
Alignment:
Q  4 cataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  10602 cataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgcgtta 10503  T
Q  104 tggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||| |||||    
T  10502 tggtcaaattactgcatgtaggtcacaatgaat 10470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 9970 - 9936
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtt 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9970 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 9936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 6670 - 6937
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  6670 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttccaatgccgttggtccgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 6769  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  6770 ttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgtccatg 6869  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  6870 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgagtatcatttaatgttgttatat 6937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Original strand, 6483 - 6612
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6483 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtctgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 6582  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  6583 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 6612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 3)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 258 - 476
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  258 gtacataaatggtcttaggtgtaaacaagaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaagatttatagaacttgag 357  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  358 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 457  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  458 attgataaagtgttatatg 476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 212 - 340
Target Start/End: Original strand, 12194 - 12322
Alignment:
Q  212 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataat 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12194 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataat 12293  T
Q  312 tgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12294 tgagacgttgttgacttgcatttgatatt 12322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Original strand, 507 - 582
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  507 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 30447 - 30229
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  30447 gtacagaattggtcttcggtgtaaacattaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtttcacttcaaaaggatttgtagtacttgag 30348  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30347 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 30248  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  30247 attgatgaagtgttatatg 30229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 146 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 30196 - 30021
Alignment:
Q  146 tgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
T  30196 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg--------------- 30112  T
Q  246 taccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30111 ----atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatatt 30021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 30640 - 30505
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||| ||    
T  30640 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaatgccattggtgtgacgtcaaaacgatttataaaactttag 30541  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  30540 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 30505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 3)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 629 - 416
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  629 aattagtctaaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 530  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 206  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  529 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtaagtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 430  T
Q  207 gaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||    
T  429 gaagtgttatatgt 416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 988 - 853
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  988 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 889  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  888 ttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 779 - 693
Alignment:
Q  50 tagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  779 tagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 4)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1006 - 799
Alignment:
Q  12 gtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaa 111  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  1006 gtcttaggagtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaattatttatagaacttgagttatggtcaaa 907  T
Q  112 ttgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 211  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  906 ttactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaatttgtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 807  T
Q  212 gttatatg 219  Q
     |||||||    
T  806 tttatatg 799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 1210 - 1075
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||  |||||| |||||||||||||||||    
T  1210 gtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaaagatttatagaacttgag 1111  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||  | |||| |||||| |||||||    
T  1110 ttatggtcaaattactacacgcaggtcatagtgaat 1075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 144 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 768 - 645
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgt 241  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  768 tatgattgattaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 670  T
Q  242 tgattaccatttgatgttgttatat 266  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  669 tgattatcatttgatgttgttatat 645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 1323 - 1225
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1323 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttct-atgccgttggtctgacgtctaaacgatttatagaacttgagttatgg 1225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 6879 - 6682
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6879 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 6780  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||    
T  6779 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat----------atgtttgtgaatacgatattgttcatg 6690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 7072 - 6937
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  7072 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacgtcaaaatgatttatagaacttgag 6973  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  6972 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 6937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 211
Target Start/End: Original strand, 13379 - 13571
Alignment:
Q  19 gtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattgttgc 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  13379 gtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcttactagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattactga 13478  T
Q  119 acgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 211  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  13479 acgtaggtcacaatgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 13571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 43159 - 43002
Alignment:
Q  9 ttggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  43159 ttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagggtttatagaacttgagttatagtc 43060  T
Q  109 aaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg 166  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43059 aaattagtgcacgtaggtcacagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatg 43002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 43354 - 43225
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43354 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 43255  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  43254 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 43225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 68389 - 68227
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  68389 gtacaaaattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctagtgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 68290  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 163  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  68289 ttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 68227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 8167 - 8000
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  8167 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgaa 8068  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 168  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8067 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgta 8000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 8360 - 8225
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  8360 gtacataactggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatccccttggtttgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 8261  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  8260 ttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 8225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 8553 - 8421
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  8553 gtacataattggtcttacgtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaattccattggtatgacgtcaaaaagatttatacaacttgag 8454  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtg 133  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  8453 ttatggtgaaattactgcacgtaggtcacagtg 8421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 57865 - 57708
Alignment:
Q  45 gatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaat 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  57865 gatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatacttgaat 57766  T
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgat 202  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57765 atgagtgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgat 57708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 1869 - 1740
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1869 aattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 1770  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1769 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 1682 - 1634
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgt 49  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1682 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgt 1634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 8440 - 8311
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8440 aattgctcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgctattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 8341  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    | |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  8340 taaaattactgcacgttggtcacagtgaat 8311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18558 - 18423
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  18558 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 18459  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  18458 ttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 18423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 18081 - 17947
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  18081 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccattggtctgacgtcaaaatgatttatagaacttgag 17982  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaa 135  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  17981 ttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaa 17947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 39760 - 39626
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||    
T  39760 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagttatggatgttagctttctaatgccattggtctaacgtcaaaacgatttatagaacttgag 39661  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaa 135  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  39660 ttatggtcaaattattacacgtaggtcacagtgaa 39626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 31631 - 31497
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  31631 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattaatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 31532  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaa 135  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  31531 ttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 31497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 144 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 28073 - 27958
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28073 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 27975  T
Q  244 attaccatttgatgttg 260  Q
    ||||  |||||||||||    
T  27974 attattatttgatgttg 27958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 80 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28190 - 28048
Alignment:
Q  80 aaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgttt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  28190 aaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 28091  T
Q  180 gtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 222  Q
     ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  28090 atgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 28048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 144 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10016 - 9838
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||                    
T  10016 tatgattgatgagttagtatatgtatgtataagtttgtgaatacgatattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatatg---------------- 9933  T
Q  244 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtg-aataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  9932 ---acgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatatt 9838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 10067 - 10005
Alignment:
Q  146 tgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 208  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  10067 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtacgatgttgtttatgattgatga 10005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0711
Description:

Target: scaffold0711; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 7424 - 7558
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  7424 gtacagaattggtcttgggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacatcaaaatgatttatagaacttgag 7523  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaa 135  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  7524 ttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaa 7558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Original strand, 7243 - 7367
Alignment:
Q  12 gtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaa 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | |||||||| | ||||| |||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  7243 gtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttatccttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttataaaacttgagttatggtcaaa 7342  T
Q  112 ttgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  7343 ttattgcacgtaggtcacagtgaat 7367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 134
Target Start/End: Original strand, 7079 - 7172
Alignment:
Q  41 tatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  7079 tatggatgttagctttctaatgccgttgctctgccgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtga 7172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 36749 - 36875
Alignment:
Q  10 tggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtca 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36749 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaactttctaatgttgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtca 36848  T
Q  110 aattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||    
T  36849 aattactgcacgtaggtcacagtgaat 36875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Original strand, 36939 - 37068
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36939 aattagtcatagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 37038  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||  ||||||||| ||| |||||||    
T  37039 tcaaattactgcacgtagatcatagtgaat 37068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 135
Target Start/End: Original strand, 19829 - 19957
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||| |||||||||||| |    
T  19829 aattggtcttaggtgtaaacgcaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgaattatataacttgagttatcg 19928  T
Q  107 tcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaa 135  Q
    |||||||  | ||||||||||| ||||||    
T  19929 tcaaattactacacgtaggtcatagtgaa 19957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 237 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 298 - 195
Alignment:
Q  237 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattga 336  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  298 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 199  T
Q  337 tatt 340  Q
    ||||    
T  198 tatt 195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 132 - 219
Target Start/End: Original strand, 10647 - 10734
Alignment:
Q  132 tgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10647 tgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 10734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 144 - 266
Target Start/End: Original strand, 10765 - 10886
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10765 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatactgtccataattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaaatgttg 10863  T
Q  244 attaccatttgatgttgttatat 266  Q
    | ||  |||||||||||||||||    
T  10864 agtattatttgatgttgttatat 10886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 237 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12250 - 12147
Alignment:
Q  237 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattga 336  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  12250 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 12151  T
Q  337 tatt 340  Q
    ||||    
T  12150 tatt 12147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 237 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 82264 - 82161
Alignment:
Q  237 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattga 336  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  82264 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 82165  T
Q  337 tatt 340  Q
    ||||    
T  82164 tatt 82161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 33599 - 33465
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  33599 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtctgacgtaaaaacgatttatagaacttgag 33500  T
Q  101 ttatggtcaaattgttgcacgtaggtcacagtgaa 135  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  33499 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacggtgaa 33465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 340
Target Start/End: Original strand, 18176 - 18265
Alignment:
Q  251 tttgatgttgttat-attgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| || || ||||||||    
T  18176 tttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 18265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Original strand, 158433 - 158523
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  158433 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 158523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 144 - 266
Target Start/End: Original strand, 15150 - 15273
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  15150 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 15248  T
Q  242 tgattaccatttgatgttgttatat 266  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  15249 tgattatcatttgatgttgttatat 15273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 219
Target Start/End: Original strand, 15030 - 15119
Alignment:
Q  120 cgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||          |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15030 cgtaggtcatagtgaataattgaatatgattaatgaattagtat----------atgtttgtgaatactatattgttcataattgatgaagtgttatatg 15119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 4476 - 4386
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  4476 atttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatatt 4386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16963 - 16873
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16963 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 16873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 250 - 328
Target Start/End: Original strand, 79267 - 79345
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactt 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79267 atttgatgttgttatattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactt 79345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Original strand, 20363 - 20452
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20363 atttgatgtt-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 20452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 237 - 340
Target Start/End: Original strand, 1250 - 1354
Alignment:
Q  237 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattg 335  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||    
T  1250 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttg 1349  T
Q  336 atatt 340  Q
    |||||    
T  1350 atatt 1354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 266
Target Start/End: Original strand, 35955 - 36065
Alignment:
Q  156 attagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa-gtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttg 254  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  35955 attagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatatgatattgtccatgattgatgaaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattttttg 36053  T
Q  255 atgttgttatat 266  Q
    ||||| ||||||    
T  36054 atgttcttatat 36065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 4393 - 4303
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  4393 atttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 4303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Original strand, 2111 - 2202
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt-gttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  2111 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttaattgacttgcatttgatatt 2202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 328
Target Start/End: Original strand, 17964 - 18043
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactt 328  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  17964 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttactt 18043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Original strand, 164573 - 164664
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||    
T  164573 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatatt 164664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Original strand, 161072 - 161163
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||    
T  161072 atttgatattgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatatt 161163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 266
Target Start/End: Original strand, 1204 - 1327
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgt 241  Q
    ||||||| || |||||||||||| |  || ||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  1204 tatgattaataaattagtatatgaatataaatgtt-gagaataagatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 1302  T
Q  242 tgattaccatttgatgttgttatat 266  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  1303 tgattatcatttgatgttgttatat 1327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 219
Target Start/End: Original strand, 1143 - 1173
Alignment:
Q  189 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1143 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 1173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 272 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13165 - 13097
Alignment:
Q  272 tataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  13165 tataattatatatgcattacttcaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 13097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 250 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 12112 - 12039
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 323  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12112 atttgatactgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgaggcgttgtt 12039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Original strand, 27686 - 27777
Alignment:
Q  250 atttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  27686 atttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatatt 27777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 113414 - 113332
Alignment:
Q  31 aagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  113414 aagttgtaggtatggatgttacatttctaatgacgttggtttgactccaaaatgagttttagaacttgagttatggtcaaatt 113332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 250 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 11648 - 11567
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttac 330  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||    
T  11648 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttac 11567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 250 - 330
Target Start/End: Original strand, 38193 - 38274
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttac 330  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||    
T  38193 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttac 38274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Original strand, 16037 - 16128
Alignment:
Q  250 atttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  16037 atttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatatt 16128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 13313 - 13254
Alignment:
Q  250 atttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaat 308  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13313 atttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaat 13254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Original strand, 53486 - 53577
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| || ||||||||    
T  53486 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatatt 53577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 6196 - 6302
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  6196 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttatagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctaaatgatttttagaacttgagttatga 6295  T
Q  107 tcaaatt 113  Q
    |||||||    
T  6296 tcaaatt 6302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 225590 - 225514
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 325  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||    
T  225590 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga 225514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 8675 - 8569
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||     
T  8675 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctagatgatttttagaacttgagttatga 8576  T
Q  107 tcaaatt 113  Q
    |||||||    
T  8575 tcaaatt 8569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 30579 - 30473
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  30579 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 30480  T
Q  107 tcaaatt 113  Q
    |||||||    
T  30479 tcaaatt 30473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 75639 - 75689
Alignment:
Q  1 gtacataattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgtta 51  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  75639 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 75689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 113
Target Start/End: Original strand, 12519 - 12587
Alignment:
Q  45 gatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  12519 gatgttagctttctaatggctttgggttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Original strand, 7996 - 8087
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||| || || ||||||||    
T  7996 atttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatatt 8087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 834 - 728
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||||||| ||   | ||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  834 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattacgttagctttctaatggctttggtctgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 735  T
Q  107 tcaaatt 113  Q
    |||||||    
T  734 tcaaatt 728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Original strand, 3485 - 3558
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  3485 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatatt 3558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 15846 - 15781
Alignment:
Q  48 gttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  15846 gttagatttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 15781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 252 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8559
Alignment:
Q  252 ttgatgttgtt-atattgtgatataat--tatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| || ||||||||    
T  8650 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatatt 8559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 250 - 325
Target Start/End: Original strand, 60652 - 60728
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatat-tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 325  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||    
T  60652 atttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga 60728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 113
Target Start/End: Original strand, 32118 - 32213
Alignment:
Q  18 ggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||   | ||||||||||||||| | ||||||| || || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  32118 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 32213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15361 - 15282
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatat 224  Q
    ||||||||||||||| ||| || | ||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  15361 atgattgatgaattattatttgaatgtatatgtcgatgaatatgatattgttcatgattgatgaattattatatgaatat 15282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16326 - 16263
Alignment:
Q  146 tgattgatgaattagtatatgtacgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16326 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 16263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 720 - 667
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 302  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  720 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 25289 - 25237
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 302  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||    
T  25289 atttgatgttgtaataatgtgatatatttgtatatacattacatgaattatat 25237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 40726 - 40631
Alignment:
Q  18 ggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||   | ||||||||||||||| | ||||||| || || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  40726 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 40631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 40035 - 39968
Alignment:
Q  46 atgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  40035 atgtcagctttctaatggctttggttttacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 39968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 45518 - 45451
Alignment:
Q  46 atgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||  |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  45518 atgttagctttctaatggctttggttttacttccaaataatttttagaacttgagttatgatcaaatt 45451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 79073 - 79006
Alignment:
Q  46 atgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  79073 atgttagctttctaattgctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 79006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 1444 - 1378
Alignment:
Q  47 tgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| || || |||||||||||||||| |||||||    
T  1444 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgagttttagaacttgagttatgatcaaatt 1378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 979 - 913
Alignment:
Q  47 tgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| || ||||||| ||||| |||||||    
T  979 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttataacttgaattatgatcaaatt 913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 113
Target Start/End: Original strand, 6970 - 7036
Alignment:
Q  47 tgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  6970 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 7036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 113
Target Start/End: Original strand, 1296 - 1362
Alignment:
Q  47 tgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  1296 tgttagctttctaatggttttggtttgatttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 1362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 110065 - 110171
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | ||| |||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  110065 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattacgttagctttctaatggctttgatttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatga 110164  T
Q  107 tcaaatt 113  Q
    |||||||    
T  110165 tcaaatt 110171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 118566 - 118672
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | ||| |||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  118566 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattacgttagctttctaatggctttgatttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatga 118665  T
Q  107 tcaaatt 113  Q
    |||||||    
T  118666 tcaaatt 118672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Original strand, 3106 - 3179
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  3106 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 3179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13274 - 13185
Alignment:
Q  252 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| |||||||||||    
T  13274 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatatt 13185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27996 - 27923
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  27996 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 27923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 340
Target Start/End: Original strand, 8472 - 8561
Alignment:
Q  252 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| |||||||||||    
T  8472 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatatt 8561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 46 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 938 - 871
Alignment:
Q  46 atgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  938 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtgcaaatgatttttagaacctgagttatgatcaaatt 871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Original strand, 6220 - 6310
Alignment:
Q  250 atttgatgttgttat-attgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| || || ||||||||    
T  6220 atttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 6310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12751 - 12661
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| | | || |||||| |||| |||||| || ||||||||    
T  12751 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattac-tgaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatatt 12661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 46 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 54016 - 53957
Alignment:
Q  46 atgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 105  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  54016 atgttaactttctaatggctttggtttgactttcaaatgatttttagaacttgagttatg 53957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 46 - 113
Target Start/End: Original strand, 19939 - 20006
Alignment:
Q  46 atgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19939 atgttagctttccaatggctttggtttgaagtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatt 20006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 441 - 398
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgtt 50  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  441 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagtcgtacgtatggatgtt 398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 124751 - 124678
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || | |||||| ||| || |||||||||||    
T  124751 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaacgttgatgaattgcaattgatatt 124678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 261 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 52085 - 52006
Alignment:
Q  261 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| |||||||||||    
T  52085 ttatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatatt 52006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 97190 - 97100
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| || || ||||||||    
T  97190 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 97100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 250 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 106468 - 106378
Alignment:
Q  250 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| || || ||||||||    
T  106468 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 106378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 18274 - 18208
Alignment:
Q  47 tgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 113  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||  || ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  18274 tgttagctttctaatggctttggtttgaggtccaaatgatttttataacttgagttatgatcaaatt 18208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 28578 - 28472
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaacgcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 106  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||||||| ||    | |||| ||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| || |||||||||||||     
T  28578 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataatttttttagttttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttataacttgagttatga 28479  T
Q  107 tcaaatt 113  Q
    |||||||    
T  28478 tcaaatt 28472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 508 - 435
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||   ||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  508 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatatt 435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23048 - 22975
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  23048 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatt 22975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 4673 - 4600
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  4673 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 4600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12255 - 12182
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  12255 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 12182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22207 - 22134
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  22207 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 22134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13377 - 13304
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||    
T  13377 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 13304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 39642 - 39569
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  39642 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 39569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Original strand, 26020 - 26093
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||||||   || ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26020 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatatt 26093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Original strand, 75170 - 75243
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  75170 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 75243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26061 - 25988
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||| |||| || ||||||||    
T  26061 tgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatatt 25988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 40023 - 39950
Alignment:
Q  267 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 340  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||| |||| || ||||||||    
T  40023 tgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatatt 39950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University