View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10581_low_3 (Length: 379)

Name: NF10581_low_3
Description: NF10581
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10581_low_3
NF10581_low_3
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (13-366)||(15229269-15229622)
chr4 (13-366)||(1901657-1902010)
chr4 (13-366)||(15283446-15283799)
chr4 (13-366)||(15389896-15390249)
chr4 (4-367)||(6571252-6571615)
chr4 (4-367)||(34187469-34187832)
chr4 (4-367)||(5007272-5007635)
chr4 (4-367)||(31125027-31125390)
chr4 (4-366)||(24590864-24591226)
chr4 (4-367)||(36343024-36343387)
chr4 (4-351)||(14666433-14666780)
chr4 (4-367)||(39852037-39852400)
chr4 (52-367)||(18799170-18799485)
chr4 (4-367)||(30755153-30755516)
chr4 (4-367)||(33672307-33672670)
chr4 (4-367)||(54834786-54835149)
chr4 (4-367)||(14099940-14100303)
chr4 (4-367)||(14761813-14762176)
chr4 (4-367)||(21971100-21971463)
chr4 (4-367)||(27161825-27162188)
chr4 (52-367)||(40104195-40104510)
chr4 (4-366)||(24114062-24114424)
chr4 (4-258)||(17014551-17014805)
chr4 (13-81)||(24460281-24460349)
chr4 (267-330)||(14731187-14731250)
[»] chr2 (39 HSPs)
chr2 (13-366)||(19454929-19455281)
chr2 (13-366)||(21701671-21702024)
chr2 (4-367)||(27805087-27805450)
chr2 (4-367)||(27778602-27778965)
chr2 (4-367)||(12588190-12588553)
chr2 (4-367)||(37376541-37376904)
chr2 (13-367)||(9348489-9348843)
chr2 (52-367)||(27818360-27818675)
chr2 (4-367)||(34287734-34288097)
chr2 (4-367)||(34292794-34293157)
chr2 (13-367)||(13935051-13935405)
chr2 (4-367)||(16827836-16828199)
chr2 (4-367)||(16893282-16893645)
chr2 (4-367)||(32051178-32051541)
chr2 (4-367)||(39050320-39050683)
chr2 (4-367)||(40234891-40235254)
chr2 (4-367)||(259251-259614)
chr2 (4-336)||(19414997-19415329)
chr2 (4-367)||(11633683-11634046)
chr2 (4-367)||(12715100-12715463)
chr2 (4-351)||(28883610-28883957)
chr2 (4-367)||(21675680-21676043)
chr2 (14-366)||(23127074-23127426)
chr2 (4-367)||(31877661-31878024)
chr2 (14-366)||(27432952-27433304)
chr2 (14-366)||(12656923-12657275)
chr2 (4-258)||(20839390-20839644)
chr2 (4-367)||(39891454-39891817)
chr2 (4-335)||(34863092-34863423)
chr2 (4-367)||(37949820-37950183)
chr2 (13-81)||(34302968-34303036)
chr2 (4-335)||(37684407-37684738)
chr2 (4-335)||(37699672-37700003)
chr2 (13-81)||(3785162-3785230)
chr2 (13-81)||(27119196-27119264)
chr2 (13-81)||(31890993-31891061)
chr2 (13-81)||(34157518-34157586)
chr2 (248-367)||(11640117-11640236)
chr2 (4-125)||(37926992-37927113)
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (13-366)||(16625160-16625513)
chr3 (13-366)||(18531734-18532087)
chr3 (4-367)||(20575397-20575760)
chr3 (4-366)||(8297318-8297680)
chr3 (4-367)||(29663520-29663883)
chr3 (4-367)||(7074557-7074920)
chr3 (4-351)||(18052623-18052970)
chr3 (4-367)||(18226536-18226899)
chr3 (4-367)||(28114504-28114867)
chr3 (14-367)||(20067388-20067741)
chr3 (14-366)||(15891266-15891618)
chr3 (4-367)||(10397478-10397841)
chr3 (4-366)||(22386128-22386490)
chr3 (13-367)||(5607881-5608235)
chr3 (44-366)||(6193661-6193983)
chr3 (13-367)||(11108908-11109262)
chr3 (4-367)||(4345237-4345600)
chr3 (4-367)||(5015057-5015420)
chr3 (13-367)||(5594916-5595270)
chr3 (4-367)||(18290903-18291266)
chr3 (4-367)||(18306204-18306567)
chr3 (4-366)||(15739644-15740006)
chr3 (4-366)||(29147305-29147667)
chr3 (4-366)||(35882112-35882474)
chr3 (14-366)||(4722977-4723329)
chr3 (4-367)||(31963023-31963386)
chr3 (4-367)||(4418264-4418627)
chr3 (52-367)||(18244084-18244399)
chr3 (4-367)||(18275602-18275965)
chr3 (4-366)||(22869406-22869768)
chr3 (4-366)||(22884465-22884827)
chr3 (13-335)||(5468362-5468684)
chr3 (4-366)||(8288021-8288383)
chr3 (14-367)||(32440499-32440852)
chr3 (104-367)||(48467272-48467535)
chr3 (4-367)||(10644415-10644778)
chr3 (4-367)||(17983506-17983869)
chr3 (4-367)||(24329504-24329867)
chr3 (4-367)||(51783368-51783731)
chr3 (104-351)||(4795303-4795550)
chr3 (4-343)||(18331997-18332336)
chr3 (4-367)||(21676038-21676401)
chr3 (13-367)||(8213083-8213437)
chr3 (4-367)||(6541012-6541375)
chr3 (4-336)||(7997938-7998270)
chr3 (4-367)||(47024798-47025161)
chr3 (53-366)||(28022621-28022934)
chr3 (13-81)||(5652860-5652928)
chr3 (13-81)||(4626417-4626485)
chr3 (13-81)||(5713700-5713768)
chr3 (13-81)||(5724610-5724678)
chr3 (13-81)||(5767690-5767758)
chr3 (13-81)||(17993501-17993569)
chr3 (254-367)||(20441462-20441575)
chr3 (4-125)||(28340766-28340887)
chr3 (4-125)||(36995750-36995871)
chr3 (254-367)||(41438588-41438701)
chr3 (267-330)||(7090873-7090936)
[»] chr5 (52 HSPs)
chr5 (13-366)||(22889863-22890216)
chr5 (13-362)||(25200427-25200776)
chr5 (13-258)||(25264686-25264931)
chr5 (14-366)||(23893600-23893952)
chr5 (14-367)||(15657176-15657529)
chr5 (4-367)||(9318844-9319207)
chr5 (4-367)||(40471955-40472318)
chr5 (14-367)||(41676102-41676455)
chr5 (4-367)||(12133548-12133911)
chr5 (4-367)||(26481784-26482147)
chr5 (14-366)||(11550748-11551100)
chr5 (14-366)||(30936027-30936379)
chr5 (15-367)||(33517749-33518101)
chr5 (4-367)||(3790934-3791297)
chr5 (4-367)||(28650628-28650991)
chr5 (4-367)||(43079645-43080008)
chr5 (4-366)||(33778881-33779243)
chr5 (14-367)||(33293918-33294271)
chr5 (14-366)||(24686573-24686925)
chr5 (14-366)||(24971412-24971764)
chr5 (4-367)||(24682833-24683196)
chr5 (4-367)||(24725360-24725723)
chr5 (4-366)||(23750856-23751218)
chr5 (4-367)||(15757263-15757626)
chr5 (4-367)||(18499136-18499499)
chr5 (4-366)||(22997520-22997882)
chr5 (4-366)||(23716394-23716756)
chr5 (4-367)||(8663881-8664244)
chr5 (4-367)||(13323235-13323598)
chr5 (4-367)||(28958192-28958555)
chr5 (4-367)||(30169862-30170225)
chr5 (4-367)||(37357049-37357412)
chr5 (52-367)||(37669937-37670252)
chr5 (4-367)||(30030808-30031171)
chr5 (4-367)||(30153411-30153774)
chr5 (4-367)||(37756373-37756736)
chr5 (14-367)||(18125811-18126164)
chr5 (4-367)||(6875698-6876061)
chr5 (4-367)||(31824813-31825176)
chr5 (4-367)||(34617911-34618274)
chr5 (4-366)||(31432834-31433196)
chr5 (52-336)||(37769441-37769725)
chr5 (4-367)||(2512444-2512807)
chr5 (13-81)||(13440067-13440135)
chr5 (4-125)||(18373941-18374062)
chr5 (13-81)||(9548116-9548184)
chr5 (13-81)||(11326315-11326383)
chr5 (13-81)||(13184222-13184290)
chr5 (4-125)||(5639422-5639543)
chr5 (13-125)||(32594689-32594801)
chr5 (254-329)||(34467047-34467122)
chr5 (14-83)||(20390438-20390507)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (13-366)||(16042709-16043062)
chr7 (13-366)||(16448402-16448755)
chr7 (4-367)||(5145735-5146098)
chr7 (4-366)||(5129378-5129740)
chr7 (4-367)||(26318264-26318627)
chr7 (13-367)||(26536274-26536628)
chr7 (14-366)||(5160905-5161257)
chr7 (52-367)||(26436642-26436957)
chr7 (4-366)||(10915263-10915625)
chr7 (4-351)||(16501796-16502143)
chr7 (4-367)||(26514166-26514529)
chr7 (4-367)||(31126305-31126668)
chr7 (4-366)||(11423172-11423534)
chr7 (4-367)||(31562785-31563148)
chr7 (14-366)||(2155959-2156311)
chr7 (4-367)||(3446691-3447054)
chr7 (4-367)||(9620036-9620399)
chr7 (4-351)||(16516832-16517179)
chr7 (4-367)||(11442264-11442627)
chr7 (4-367)||(26273489-26273852)
chr7 (4-367)||(16734855-16735218)
chr7 (4-367)||(16749909-16750272)
chr7 (4-367)||(17524917-17525280)
chr7 (4-367)||(17527935-17528298)
chr7 (4-367)||(24590936-24591299)
chr7 (4-335)||(26668309-26668640)
chr7 (13-81)||(2108567-2108635)
chr7 (4-183)||(45388789-45388968)
chr7 (13-81)||(45733973-45734041)
chr7 (260-367)||(18542184-18542291)
chr7 (4-81)||(4201060-4201137)
chr7 (20-81)||(31088033-31088094)
chr7 (254-329)||(800159-800234)
chr7 (4-125)||(4143641-4143762)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (13-366)||(16206549-16206902)
chr1 (180-366)||(20462469-20462655)
chr1 (4-367)||(10964053-10964416)
chr1 (4-367)||(51639601-51639964)
chr1 (4-367)||(28586364-28586727)
chr1 (4-367)||(41791817-41792180)
chr1 (4-367)||(10946462-10946825)
chr1 (4-75)||(20462656-20462727)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (13-366)||(22079379-22079732)
chr8 (14-366)||(16284834-16285186)
chr8 (4-366)||(27607373-27607735)
chr8 (4-366)||(18792092-18792454)
chr8 (4-367)||(19675825-19676188)
chr8 (4-366)||(19206828-19207190)
chr8 (4-351)||(19689498-19689845)
chr8 (4-367)||(9356007-9356370)
chr8 (4-367)||(3327975-3328338)
chr8 (4-366)||(14559009-14559371)
chr8 (4-366)||(2135727-2136089)
chr8 (14-366)||(16278939-16279290)
chr8 (4-366)||(29830707-29831069)
chr8 (52-367)||(12091240-12091555)
chr8 (4-367)||(31355909-31356272)
chr8 (4-367)||(33260107-33260470)
chr8 (52-367)||(28360471-28360786)
chr8 (13-81)||(33245177-33245245)
chr8 (4-183)||(31488341-31488520)
chr8 (13-81)||(19658675-19658743)
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (13-366)||(17090907-17091260)
chr6 (52-366)||(27628206-27628520)
chr6 (4-367)||(16675520-16675883)
chr6 (4-367)||(29550856-29551219)
chr6 (13-367)||(3697462-3697816)
chr6 (4-367)||(26776062-26776425)
chr6 (4-366)||(24303070-24303432)
chr6 (14-366)||(22933342-22933694)
chr6 (14-366)||(23855787-23856139)
chr6 (14-366)||(15422779-15423131)
chr6 (50-366)||(27271078-27271394)
chr6 (4-367)||(29502796-29503159)
chr6 (4-366)||(27020520-27020883)
chr6 (4-367)||(27045769-27046132)
chr6 (260-366)||(20162073-20162179)
chr6 (260-366)||(22170652-22170758)
chr6 (4-366)||(24865099-24865461)
chr6 (14-366)||(13297413-13297765)
chr6 (14-366)||(26919762-26920114)
chr6 (4-366)||(16751236-16751598)
chr6 (4-366)||(27288822-27289184)
chr6 (4-188)||(20162176-20162360)
chr6 (4-188)||(22170471-22170655)
chr6 (52-367)||(26114910-26115225)
chr6 (4-367)||(27009111-27009474)
chr6 (4-367)||(30556468-30556831)
chr6 (4-367)||(4759145-4759508)
chr6 (52-367)||(27486510-27486825)
chr6 (52-367)||(28208835-28209150)
chr6 (4-367)||(4526667-4527030)
chr6 (13-367)||(4544236-4544590)
chr6 (4-367)||(16942479-16942842)
chr6 (173-366)||(26990271-26990464)
chr6 (52-367)||(4722634-4722949)
chr6 (4-367)||(29574394-29574757)
chr6 (26-258)||(34913563-34913795)
chr6 (4-125)||(4774506-4774627)
chr6 (13-81)||(8891930-8891998)
chr6 (13-81)||(8903165-8903233)
chr6 (13-81)||(28163166-28163234)
chr6 (13-81)||(33373875-33373943)
[»] scaffold1697 (1 HSPs)
scaffold1697 (4-367)||(949-1312)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (4-366)||(5746-6108)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (13-111)||(46134-46232)
scaffold0124 (14-366)||(31838-32190)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (14-366)||(31142-31494)
scaffold0089 (14-351)||(45504-45841)
scaffold0089 (26-366)||(38600-38940)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (52-367)||(10950-11265)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (14-351)||(28693-29030)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (4-367)||(7399-7762)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (52-367)||(9333-9648)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (4-367)||(13439-13802)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (4-367)||(24710-25073)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (13-81)||(22073-22141)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (13-81)||(119574-119642)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (13-125)||(7707-7819)
scaffold0159 (13-125)||(21260-21372)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (52-245)||(27711-27904)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 13 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 15229622 - 15229269
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15229622 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtattaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 15229523  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15229522 atagcagtcccagtcttcttaggctccgtaccttcaatagtcaaaccttgaaaggcagttccttcagcagatccagcttcaatgcaagagaaagatgaca 15229423  T
Q  213 gctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15229422 gctggctaaccaaatatgcctcttctccatggactgtaacaagttttccattctttacaaacttcaatttctgatgcagggtagaggttactgcgccagc 15229323  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15229322 atcgtgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 15229269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 13 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 1902010 - 1901657
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1902010 gagaccttccttgtgcttattctcacggagttgtattaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 1901911  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1901910 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaaaccttgaaaggcagttccttcggcagatccagcttcaatgcaagagaaagatgaca 1901811  T
Q  213 gctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1901810 gctggctaaccaaatatgcctcctctccatggactgtaacaagctttccattctttacaaacttcaatttcttatgcagggtagaggttactgcgccagc 1901711  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1901710 atcgtgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 1901657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 13 - 366
Target Start/End: Original strand, 15283446 - 15283799
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15283446 gagaccttctttgtgcttattcccgcggagttgtattaacttgccctagccgacagcctgtccttcttggacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 15283545  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15283546 atagcagccccagccttcttaggctccgtaccttcaatagtcaaaccttgaaaggcagttccttcagcagatccagcttcaatgcaagagaaagatgaca 15283645  T
Q  213 gctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15283646 gctggctaaccaaatatgtctcttctccatggattgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 15283745  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15283746 atcatgtgtccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 15283799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 366
Target Start/End: Original strand, 15389896 - 15390249
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    |||||| ||| ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||  || |||||||| |||||| ||||||| || || ||||| |||    
T  15389896 gagaccctctctgtgcttattcttaaggagttgtattaacttgccccagccggtagcttgaccttcttggacagccctctgagcatccttcaaagaggcc 15389995  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    |||||||  |||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||  |||| || ||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |    
T  15389996 atagcagctccagccctcttgggctccgtaccttcgatagtcaaaccctgaaaagcggttccttctgcagaccctgcttcaatgcaagagaaagatgata 15390095  T
Q  213 gctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15390096 gctggctaaccaaatatgcctcctctccatggattgtaacgagctttccattctttacaaactttaacttctggtgcagggtagaggtcactgccccagc 15390195  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
     ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15390196 gtcatgtatccacggtctttctaggagacagctataagaggcattgatgtccat 15390249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 6571615 - 6571252
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| |||||     
T  6571615 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttc 6571516  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  6571515 aatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaga 6571416  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| | ||||||||| || || |||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| ||||||||    
T  6571415 aagaagtcagctggctgactaagtatgcttcttctccatgaacggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttac 6571316  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  6571315 cgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 6571252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 34187469 - 34187832
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  34187469 ggagaagccaagaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 34187568  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | |||||  ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||  |||| ||||| ||||    
T  34187569 aaagaagccattgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagtcaatccttgaaaagcagtcccctctgcagaccctgcttctatgcaggaga 34187668  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||  || |||||||| |  ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| ||||||||    
T  34187669 aagatgatagctggctaaccaggtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttac 34187768  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  34187769 cgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 34187832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 5007635 - 5007272
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||| | |||||||||| |||||     
T  5007635 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctgaataaccttctgagcatctttc 5007536  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | ||| ||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  | ||||| |||||||    
T  5007535 aatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccctcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcctcaatacaagaga 5007436  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    | || ||||||||||| || || ||||  ||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| ||||||||    
T  5007435 aggaagacagctggctgactaagtatgcctcttccccatgaacggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttac 5007336  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  5007335 cgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 5007272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 31125027 - 31125390
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| || || |||| | |||||||||| |||||     
T  31125027 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccgtcctgaataaccttctgagcatctttc 31125126  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  31125127 aatgaagccatagcagtcccagctttcttaggctccgcaccttcaatggtcaatccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaa 31125226  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    | || || ||||||||||| || ||||  ||||| ||||| |  ||||||||||| |||||| |||  || ||||| ||||| || | ||||||||||||    
T  31125227 aggaagatagctggctaactaagtatgcctcttcaccatgaatggtaacaagctttccattccttatgaatttcaacttctgatgtaaggtagaggttac 31125326  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  31125327 cgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 31125390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Original strand, 24590864 - 24591226
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || || || ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  24590864 ggagaagccaagaccttccttatgtttgttctcacgaagctgtattaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 24590963  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||    
T  24590964 aaagaagccattgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagaga 24591063  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||    
T  24591064 aagatgatagctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcac 24591163  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||| || || || |||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  24591164 tgctcccgcgtcgtgtatccaaggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatgtccat 24591226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 36343024 - 36343387
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || || || ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  36343024 ggagaagccaagaccttccttatgtttgttctcacgaagctgtattaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 36343123  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||    
T  36343124 aaagaagccattgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagaga 36343223  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| |  |||  |||||||| ||||| || | ||| ||||||||    
T  36343224 aagatgatagctggctaaccaagtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccacttcttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttac 36343323  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  36343324 cgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 36343387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 14666780 - 14666433
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| ||||||| |||||||  || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  14666780 ggagaagccaagaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccatccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 14666681  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtct-tcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| |||||||||    
T  14666680 aaagaagccatggcagttcca-tctctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagag 14666582  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  ||||||||||    
T  14666581 aaagatgatagctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtta 14666482  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    | || || || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  14666481 ccgctcccgcgtcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 14666433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 39852400 - 39852037
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| |||||     
T  39852400 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttc 39852301  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  39852300 aatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaa 39852201  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    | || ||||||||||| || || |||| |||||| || || || ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  39852200 aggaagacagctggctgactaagtatgcttcttcaccgtgaacggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 39852101  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  39852100 cgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 39852037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 367
Target Start/End: Original strand, 18799170 - 18799485
Alignment:
Q  52 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 151  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  18799170 cttgccccagccggcagtctgaccctcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 18799269  T
Q  152 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 251  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || ||  |||||||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  18799270 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccccgcttcaatacaagaaaaggacaacagctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 18799369  T
Q  252 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  18799370 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaggtaaccgcgcccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 18799469  T
Q  352 agcattgatgtccatc 367  Q
     ||||| |||||||||    
T  18799470 tgcattaatgtccatc 18799485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30755516 - 30755153
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| |||||     
T  30755516 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccatccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttc 30755417  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  |||||  |||||| ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  30755416 aatgaagccatagcagccccagctttcttaggctccgcaccttcaatggtcaatccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaa 30755317  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    | || ||||||||||| || || ||||  ||||| ||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  30755316 aggaagacagctggctgactaagtatgcctcttcaccatgaatggtaacgagctttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 30755217  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  30755216 cgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 30755153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 33672307 - 33672670
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| |||||     
T  33672307 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttc 33672406  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  33672407 aatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaa 33672506  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  33672507 aagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 33672606  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  33672607 cgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 33672670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 54835149 - 54834786
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | || ||||||| |||||     
T  54835149 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccctctgagcatctttc 54835050  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | |||||||||  |||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  54835049 aatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatgatcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaa 54834950  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    | || ||||||||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  54834949 aggaagacagctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 54834850  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  54834849 cgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 54834786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 14100303 - 14099940
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||     
T  14100303 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttc 14100204  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||     
T  14100203 aaagaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaa 14100105  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  14100104 aaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 14100005  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  14100004 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 14099940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 14761813 - 14762176
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  14761813 ggagaagccaagaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 14761912  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||  ||||||  | ||||| ||||||| ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||    
T  14761913 aaagaagccatggcagttccatccttcttaggttccgttccttcaacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagaga 14762012  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||  |  |||||||| |  ||||||||||| ||| |  |||  |||||||| ||||| || | ||| ||||||||    
T  14762013 aagatgatagctggctaaccaagtatgccttctctccatgaatggtaacaagctttccacttcttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttac 14762112  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  14762113 cgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 14762176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 21971463 - 21971100
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || ||     
T  21971463 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttc 21971364  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||  | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||     
T  21971363 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccctggaacgcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaa 21971265  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  21971264 aaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 21971165  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    | || || ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  21971164 ccgcacctgcatcgtgtatccatggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 21971100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 27161825 - 27162188
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || ||     
T  27161825 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttc 27161924  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||     
T  27161925 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaa 27162023  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  27162024 aaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 27162123  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  27162124 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 27162188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 367
Target Start/End: Original strand, 40104195 - 40104510
Alignment:
Q  52 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 151  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||   ||| | |||||||||     
T  40104195 cttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttagactctgcaccttcaatg 40104294  T
Q  152 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 251  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  40104295 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 40104394  T
Q  252 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  40104395 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 40104494  T
Q  352 agcattgatgtccatc 367  Q
     ||||| |||||||||    
T  40104495 tgcattaatgtccatc 40104510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 24114424 - 24114062
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  24114424 ggagaagccaagaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 24114325  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||  | | ||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || |||||  |||| ||  | || ||||||||||    
T  24114324 aaagaagccattgcagttccatcccttttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctacagaccctgcctctatgcaagaga 24114225  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||    
T  24114224 aagatgatagctggctaaccaggtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcac 24114125  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  24114124 tgctcccgcgtcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaagaggcattaatatccat 24114062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 17014805 - 17014551
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  17014805 ggagaagccaagaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 17014706  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| || || ||  |||| ||||||||||    
T  17014705 aaagaagccatggcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcggaccctgcttctatgcaagaga 17014606  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagctt 258  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||| |  |||||||||||    
T  17014605 aagatgatagctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctt 17014551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 24460281 - 24460349
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  24460281 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 24460349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 267 - 330
Target Start/End: Original strand, 14731187 - 14731250
Alignment:
Q  267 ttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtct 330  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  14731187 ttacaaacttcaatttctgatggagagtagatgtcactgccccagcgtcatgaatccatggtct 14731250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 39)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 13 - 366
Target Start/End: Original strand, 19454929 - 19455281
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19454929 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtattaacttgccccatccggcagcctgtccttcttggacagccttctaagcgtcttttaaagaagcc 19455028  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  19455029 atagcagccccagccttcttaggctccgtaccttcaatagtcaaaccttgaaaggcagttccttcagcagatccagcttcaatgcaaga-aaagatgaca 19455127  T
Q  213 gctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19455128 gctggctaaccaaatatgtctcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccaac 19455227  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19455228 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 19455281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 13 - 366
Target Start/End: Original strand, 21701671 - 21702024
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21701671 gagaccttctttgtgcttattctcacggagttgtattaacttgccccggccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 21701770  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  21701771 atagcagtcccagtcttcttgagctccataccttcaatagtcaaaccttgaaaggcagttccttcagcagatccagcttcaatacaagagaaagacgaca 21701870  T
Q  213 gctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21701871 actggctaaccaaatatgcctcttctccatggactgtaacaagctttccattctttacaaacttaaaattctgatgcagggtagaggttactgcgccagc 21701970  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21701971 atcgtgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 21702024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27805450 - 27805087
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| |||||     
T  27805450 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttc 27805351  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  27805350 aatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaga 27805251  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| | ||||||||| || ||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  27805250 aagaagtcagctggctgactaaatatgcttcttctccatgaacggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtagggtggaggttac 27805151  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| | ||| || || || ||||| |||||||||    
T  27805150 cgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaaacaactgtaggatgcattaatgtccatc 27805087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27778965 - 27778602
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| |||||     
T  27778965 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttc 27778866  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | |||| |||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  27778865 aatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcacctccaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaga 27778766  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| | ||||||||| || ||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| ||||||||    
T  27778765 aagaagtcagctggctgactaaatatgcttcttctccatgaacggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttac 27778666  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  27778665 cgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 27778602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 12588553 - 12588190
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| |||||     
T  12588553 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttc 12588454  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  12588453 aatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaga 12588354  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| | |||||| || || ||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| ||||||||    
T  12588353 aagaagtcagctgactgactaaatatgcttcttctccatgaacggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttac 12588254  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| | ||| || || || ||||| |||||||||    
T  12588253 cgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaaacaactgtaggatgcattaatgtccatc 12588190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 37376904 - 37376541
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  37376904 ggagaagccaagaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtactaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 37376805  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||    
T  37376804 aaagaagccattgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagaga 37376705  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||||  |||||||| ||||| || | ||| ||||||||    
T  37376704 aagatgatagctggctaaccaagtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttac 37376605  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  37376604 cgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 37376541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 367
Target Start/End: Original strand, 9348489 - 9348843
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||    
T  9348489 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagcc 9348588  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||    
T  9348589 atagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtca 9348688  T
Q  213 gctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||    
T  9348689 gctggctgactaaatatgcttcttctccatgaacggtaacaagctttccgttccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgc 9348788  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| | ||| || || || ||||| |||||||||    
T  9348789 atcgtgtatccacggtcttcccagcaaacaactgtaggatgcattaatgtccatc 9348843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27818675 - 27818360
Alignment:
Q  52 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 151  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | |||| ||||     
T  27818675 cttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcacctccaatg 27818576  T
Q  152 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 251  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |  |||||||| || ||||||| |||||||||||| || ||||    
T  27818575 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtgagctggctgactaaatatgcttcttctccatgaacggtaa 27818476  T
Q  252 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  27818475 caagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 27818376  T
Q  352 agcattgatgtccatc 367  Q
     ||||| |||||||||    
T  27818375 tgcattaatgtccatc 27818360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 34288097 - 34287734
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | || ||||||| |||||     
T  34288097 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccctctgagcatctttc 34287998  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || | ||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  34287997 aatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagtagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaga 34287898  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    | || ||||||||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||| ||||||||    
T  34287897 aggaagacagctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttac 34287798  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  34287797 cgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 34287734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 34293157 - 34292794
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | || ||||||| |||||     
T  34293157 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccctctgagcatctttc 34293058  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || | ||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  34293057 aatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagtagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaga 34292958  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    | || ||||||||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||| ||||||||    
T  34292957 aggaagacagctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttac 34292858  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  34292857 cgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 34292794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 367
Target Start/End: Original strand, 13935051 - 13935405
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| || ||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  13935051 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccctcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagcc 13935150  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||    
T  13935151 atagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtca 13935250  T
Q  213 gctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||    
T  13935251 gctggctgactaaatatgcttcttcaccatggattgtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgc 13935350  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| | ||| || || || ||||| |||||||||    
T  13935351 atcgtgtatccacggtcttcccagcaaacaactgtaggatgcattaatgtccatc 13935405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 16827836 - 16828199
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| || || |||| | |||||||||| |||||     
T  16827836 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccgtcctgaataaccttctgagcatctttc 16827935  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  16827936 aatgaagccatagcagtcccagctttcttaggctccgcaccttcaatggtcaatccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaa 16828035  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    | || || ||||||||||| || ||||  ||||| ||||| |  ||||||||||| |||||| |||  || ||||| ||||| || | ||||||||||||    
T  16828036 aggaagatagctggctaactaagtatgcctcttcaccatgaatggtaacaagctttccattccttatgaatttcaacttctgatgtaaggtagaggttac 16828135  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  16828136 cgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 16828199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16893645 - 16893282
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| || || |||| | |||||||||| |||||     
T  16893645 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccgtcctgaataaccttctgagcatctttc 16893546  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  16893545 aatgaagccatagcagtcccagctttcttaggctccgcaccttcaatggtcaatccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaa 16893446  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    | || || ||||||||||| || ||||  ||||| ||||| |  ||||||||||| |||||| |||  || ||||| ||||| || | ||||||||||||    
T  16893445 aggaagatagctggctaactaagtatgcctcttcaccatgaatggtaacaagctttccattccttatgaatttcaacttctgatgtaaggtagaggttac 16893346  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  16893345 cgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 16893282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 32051541 - 32051178
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| || || |||| | |||||||||| |||||     
T  32051541 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccgtcctgaataaccttctgagcatctttc 32051442  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  32051441 aatgaagccatagcagtcccagctttcttaggctccgcaccttcaatggtcaatccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaa 32051342  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    | || || ||||||||||| || ||||  ||||| ||||| |  ||||||||||| |||||| |||  || ||||| ||||| || | ||||||||||||    
T  32051341 aggaagatagctggctaactaagtatgcctcttcaccatgaatggtaacaagctttccattccttatgaatttcaacttctgatgtaaggtagaggttac 32051242  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  32051241 cgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 32051178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 39050320 - 39050683
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| |||||     
T  39050320 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttc 39050419  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  |||||  | || | ||||||||||||||  ||| | || || || || |||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  39050420 aatgaagccatagcagccccagctttcttaggttctgcaccttcaatagtcaaaccttggaaagcggtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaga 39050519  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| | ||||||||| || ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||  ||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  39050520 aagaagtcagctggctgactaaatatgcttcttcaccatggattgtaacaagcttttcattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 39050619  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  39050620 cgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 39050683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 40235254 - 40234891
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| |||||     
T  40235254 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttc 40235155  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  40235154 aatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaga 40235055  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| | || |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  40235054 aagaagtcaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaacttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 40234955  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  40234954 cgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 40234891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 259251 - 259614
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| |||||     
T  259251 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcatcttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttc 259350  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  259351 aatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatggtcaacccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaga 259450  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| | ||||||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  259451 aagaagtcagctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 259550  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  259551 cgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 259614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 336
Target Start/End: Original strand, 19414997 - 19415329
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || ||     
T  19414997 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtattaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttc 19415096  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||     
T  19415097 aaagaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagttccctcagcagaccctgcttcaatacaagaa 19415195  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| ||||  ||||| || || || | |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  19415196 aaagaagacaattggctgactaagtacgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 19415295  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  19415296 ctgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccag 19415329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 11633683 - 11634046
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| || || |||| | |||||||||| |||||     
T  11633683 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccgtcctgaataaccttctgagcatctttc 11633782  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  || ||  |||||| ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  11633783 aatgaagccatagcagccccagcttttttaggctccgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaa 11633882  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    | || ||||||||||| || |  ||||  ||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || |  || ||||||||    
T  11633883 aggaagacagctggctgactaggtatgcctcttcaccatgaacggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaagtggaggttac 11633982  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  11633983 cgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 11634046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 12715100 - 12715463
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| |||||     
T  12715100 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttc 12715199  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  12715200 aatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaga 12715299  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  12715300 aagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 12715399  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  12715400 cgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 12715463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 28883957 - 28883610
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  28883957 ggagaagccaagaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 28883858  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| ||||||| || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||    
T  28883857 aaagaagccatggcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaggcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagaga 28883758  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| ||||||||| |||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||    
T  28883757 aagatgatagctggctagccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcac 28883658  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
     || || || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  28883657 cgcccccgcgtcatgtatccaaggtctacccaagagacagctgtaaga 28883610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 21675680 - 21676043
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||  | ||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||     
T  21675680 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcgcagagctgtatcaccttgccccagccggcggtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttc 21675779  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||||| || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||     
T  21675780 aatgaagccatagcagccccag-cttctttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaa 21675878  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  21675879 aaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 21675978  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  21675979 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 21676043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Original strand, 23127074 - 23127426
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |  || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  23127074 agaccttccttatgcttgttctcacaaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 23127173  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | |||||||||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||||||  |  | ||||||||||||||||| ||    
T  23127174 ttgcagtcccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagatcctgcccctatgcaagagaaagatgatag 23127273  T
Q  214 ctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||||||||  ||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || ||     
T  23127274 ctggctaaccaggtatgcctcctctccatgtatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgcccccgcg 23127373  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  23127374 tcatgtatccaaggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 23127426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 31878024 - 31877661
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || ||     
T  31878024 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccgacagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttc 31877925  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  | |||   ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  31877924 aatgaagccatagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagttccctcagcagaccctgcttcaatacaagaaa 31877825  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| ||||  ||||| || || || | |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  31877824 aagaagacaattggctgactaagtacgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 31877725  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    ||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  31877724 tgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 31877661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Original strand, 27432952 - 27433304
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  27432952 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 27433051  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | | ||  ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  27433052 tggcagttccatcccttttaggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 27433151  T
Q  214 ctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  ||| |||| || || |  ||     
T  27433152 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtaaaggtcaccgctctcgcg 27433251  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  27433252 tcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 27433304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 12657275 - 12656923
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  12657275 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 12657176  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | | ||  ||||||||||||| | ||| |  ||| ||||||| || ||||| | ||| ||  | || ||||||||||||||||| ||    
T  12657175 tggcagttccatcccttttaggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaggcggtcccctctgtagaccctgcctctatgcaagagaaagatgatag 12657076  T
Q  214 ctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || ||     
T  12657075 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgcccccgcg 12656976  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    | ||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  12656975 ttatgtatccacggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 12656923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20839644 - 20839390
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  20839644 ggagaagccaagaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 20839545  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| |||||||||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||    
T  20839544 aaagaagccattgcagtcccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagaga 20839445  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagctt 258  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||| |  |||||||||||    
T  20839444 aagatgatagctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctt 20839390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 39891817 - 39891454
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||     
T  39891817 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcatcttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttc 39891718  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | || ||||||  |||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||     
T  39891717 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcactttcaatgatcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaa 39891619  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |  || || || |    
T  39891618 aaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaagtggaagtaa 39891519  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    |||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  39891518 ctgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 39891454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 34863423 - 34863092
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || ||     
T  34863423 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttc 34863324  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  | |||   ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  34863323 aatgaagccatagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaa 34863224  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| ||||  ||||| || || || | |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  34863223 aagaagacaattggctgactaagtacgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 34863124  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttccca 335  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  34863123 cgcacctgcatcgtgtatccacggtcttccca 34863092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 37949820 - 37950183
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| || || || |  ||  ||||||| |||||     
T  37949820 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccctcctggatggctctctgagcatctttc 37949919  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||| ||||| ||| |  |||||  |||| | | ||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  |||||||    
T  37949920 aatgaagccacagcagccccggctttcttaggctctgcatcttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaga 37950019  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    | || |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| ||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  37950020 aggaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtgacgagttttccattcttcacaaacttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 37950119  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  37950120 cgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 37950183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 34302968 - 34303036
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 81  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  34302968 gagaccctctttgtgcttattctcgcggagttgtattaacttaccccagccggcagcctgtccttcttg 34303036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 335
Target Start/End: Original strand, 37684407 - 37684738
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  || |||| || ||     
T  37684407 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctccgagcatccttc 37684506  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||  | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||     
T  37684507 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccctggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaa 37684605  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| |||| |||||| || || || | |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  37684606 aaagaagacaactggctgactaagtacgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 37684705  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttccca 335  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  37684706 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttccca 37684738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 335
Target Start/End: Original strand, 37699672 - 37700003
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  || |||| || ||     
T  37699672 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctccgagcatccttc 37699771  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||  | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||     
T  37699772 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccctggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaa 37699870  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| |||| |||||| || || || | |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  37699871 aaagaagacaactggctgactaagtacgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 37699970  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttccca 335  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  37699971 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttccca 37700003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 3785230 - 3785162
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  3785230 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 3785162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 27119264 - 27119196
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  27119264 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 27119196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 31890993 - 31891061
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  31890993 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 31891061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 34157586 - 34157518
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  34157586 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 34157518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 367
Target Start/End: Original strand, 11640117 - 11640236
Alignment:
Q  248 gtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctat 347  Q
    ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || |  || |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  11640117 gtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaagtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgt 11640216  T
Q  348 aagaagcattgatgtccatc 367  Q
    | || ||||| |||||||||    
T  11640217 aggatgcattaatgtccatc 11640236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 37927113 - 37926992
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| || ||     
T  37927113 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatccttc 37927014  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccag 125  Q
    || ||||||||||||| |||||    
T  37927013 aatgaagccatagcagccccag 37926992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 366
Target Start/End: Original strand, 16625160 - 16625513
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16625160 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtattaacttgccccagccggcagcctgtccttcttggacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 16625259  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    | ||||| ||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16625260 acagcagccccagccttcttaggctctgtaccttcaatagtcaaaccttgaaaggcagttccttcagcagatccagcttcaatgcaagagaaagatgaca 16625359  T
Q  213 gctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16625360 gctggctaaccaaatatgcctcttatccatggactataacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 16625459  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16625460 atcatgtatccatggtcttcccaggatacagctataagaagcattgatgtccat 16625513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 13 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 18532087 - 18531734
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18532087 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtattaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagatgcc 18531988  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    || |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18531987 atggcagccccagtcttcttaggctccataccttcaatagtcaaaccttgaaaggcagttccttcggtagatccagcttcaatgcaagagaaagatgaca 18531888  T
Q  213 gctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18531887 gctggctaaccaaatatgtctcttctccatggattgtaacaagctttccattctttacaaacttcaatttctgatgcagggtagaggttactgcgccagc 18531788  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18531787 atcgtgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 18531734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 20575397 - 20575760
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | || ||||||| |||||     
T  20575397 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccctctgagcatctttc 20575496  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  |||||  |||||| ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  20575497 aatgaagccatagcagccccagctttcttaggctccgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaga 20575596  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| | ||||||||| || ||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| ||||||||    
T  20575597 aagaagtcagctggctgactaaatatgcttcttctccatgaacggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttac 20575696  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  20575697 cgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 20575760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 8297680 - 8297318
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  8297680 ggagaagccaagaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 8297581  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtct-tcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| |||||||||    
T  8297580 aaagaagccatggcagttcca-tctctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagag 8297482  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| ||||| |||| ||||||||| |    
T  8297481 aaagatgatagctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttctgatgcaaggtagaggtca 8297382  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    | || || || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  8297381 ccgctcccgcgtcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatgtccat 8297318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 29663520 - 29663883
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| |||||     
T  29663520 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttc 29663619  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  29663620 aatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaga 29663719  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| | ||||||||| || ||||||| |||||| ||||| || |||||||||||  ||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| ||||||||    
T  29663720 aagaagtcagctggctgactaaatatgcttcttcaccatgaacggtaacaagcttttcattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttac 29663819  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| | ||| || || || ||||| |||||||||    
T  29663820 cgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaaacaactgtaggatgcattaatgtccatc 29663883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 7074920 - 7074557
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  7074920 ggagaagccaagaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 7074821  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||    
T  7074820 aaagaagccattgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagaga 7074721  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| |||||||| |||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| ||||||||    
T  7074720 aagacgacagctgactaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttac 7074621  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  7074620 cgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 7074557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18052970 - 18052623
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || |||||     
T  18052970 ggagaagccaagaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatctttc 18052871  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||    
T  18052870 aaagaagccattgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcctctatgcaagaga 18052771  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||    
T  18052770 aagatgatagctggctaaccagatatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcac 18052671  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    ||| || || || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  18052670 tgctcccgcgtcgtgtatccacggtctccccaggagacagctgtaaga 18052623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 18226899 - 18226536
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| || || |||| | |||||||||| |||||     
T  18226899 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccgtcctgaataaccttctgagcatctttc 18226800  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  18226799 aatgaagccatagcagtcccagctttcttaggctccgcaccttcaatggtcaatccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaa 18226700  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    | || || ||||||||||| || ||||  ||||| ||||| |  ||||||||||| |||||| |||  || ||||| ||||| || | ||||||||||||    
T  18226699 aggaagatagctggctaactaagtatgcctcttcaccatgaatggtaacaagctttccattccttatgaatttcaacttctgatgtaaggtagaggttac 18226600  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  18226599 cgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 18226536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 28114504 - 28114867
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| || || |||| | |||||||||| |||||     
T  28114504 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccgtcctgaataaccttctgagcatctttc 28114603  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | ||| ||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  | ||||| |||||||    
T  28114604 aatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccctcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcctcaatacaagaga 28114703  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    | || ||||||||||| || || ||||  ||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |  |||||||||| ||||| || | ||| ||||||||    
T  28114704 aggaagacagctggctgactaagtatgcctcttcaccatgaacggtaacaagctttccattcctctcaaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttac 28114803  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  28114804 cgcgcccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 28114867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 20067741 - 20067388
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || |||| ||||||||||| ||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  20067741 agaccttccttatgcttattctcacgaagctgtattaacttgccccggccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 20067642  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  20067641 ttgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgagagttaaaccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 20067542  T
Q  214 ctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| |  |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || |||    
T  20067541 ctggctaaccaagtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccacttcttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgca 20067442  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  20067441 tcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 20067388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Original strand, 15891266 - 15891618
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  15891266 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 15891365  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  ||| ||  ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  15891366 tggcagttccatcctttttaggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 15891465  T
Q  214 ctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || ||     
T  15891466 ctggctaaccagatatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgctcccgcg 15891565  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  15891566 tcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 15891618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 10397841 - 10397478
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| |||||||  || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  10397841 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 10397742  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||  |||| | | ||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  10397741 aaagaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcatcttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaga 10397642  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    | || ||||||||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||| ||||||||    
T  10397641 aggaagacagctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttac 10397542  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  10397541 cgcgcccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 10397478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Original strand, 22386128 - 22386490
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| |  || |||    
T  22386128 ggagaagccaagaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgtatccttt 22386227  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| || || ||  |||| ||||||||||    
T  22386228 aaagaagccatcgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcggaccctgcttctatgcaagaga 22386327  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||    
T  22386328 aagatgatagctggctaaccaggtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcac 22386427  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  22386428 tgctcccgcatcgtgtatccatggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 22386490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 367
Target Start/End: Original strand, 5607881 - 5608235
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  5607881 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 5607980  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||||| || ||| | ||||||||| ||||| ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||    
T  5607981 atagcagccccag-cttctttagactctgcaccttcaatggtcagaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagac 5608079  T
Q  212 agctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    | |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  5608080 aactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 5608179  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  5608180 catcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 5608235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 6193983 - 6193661
Alignment:
Q  44 tgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtac 143  Q
    |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || || ||||| || || || ||||||||||||||||| |||  | ||||| |||||||||    
T  6193983 tgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctttctgtgcatccttcaaagaagccatagcagttccatccctcttgggctccgtac 6193884  T
Q  144 cttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatg 243  Q
    ||||   ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| |||||||||||||| || |||||||||||||  |||| ||| ||||||||    
T  6193883 cttcggcagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagacgatagctggctaaccaggtatgcttcctctccatg 6193784  T
Q  244 gactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacag 343  Q
     |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || || || |||||||| |||||||||| |||||||    
T  6193783 aatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcgtcgtgtatccacggtcttcccaagagacag 6193684  T
Q  344 ctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    || ||||| ||||| || |||||    
T  6193683 ctgtaagaggcattaatatccat 6193661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 367
Target Start/End: Original strand, 11108908 - 11109262
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| || ||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  11108908 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccctcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagcc 11109007  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||    
T  11109008 atagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatggtcaacccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtca 11109107  T
Q  213 gctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  11109108 gctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacccgc 11109207  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  11109208 atcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 11109262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 4345237 - 4345600
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  |||||||||||||     
T  4345237 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcgtctttc 4345336  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| || |  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  4345337 aatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatggttaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaa 4345436  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||| ||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  4345437 aggaagacagctggctaactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccatgcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 4345536  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || || ||||||||||||    
T  4345537 cgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcgttgatgtccatc 4345600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 5015420 - 5015057
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || ||     
T  5015420 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttc 5015321  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  | |||   ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  5015320 aatgaagccatagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagttccctcagcagaccctgcttcaatacaagaaa 5015221  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| ||||  ||||| || || || | |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  5015220 aagaagacaattggctgactaagtacgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 5015121  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    ||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  5015120 tgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 5015057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 367
Target Start/End: Original strand, 5594916 - 5595270
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  5594916 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 5595015  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| || |||    
T  5595016 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaggaagac 5595114  T
Q  212 agctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    | |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  5595115 aactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 5595214  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  5595215 catcgtgtatccatggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 5595270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 18290903 - 18291266
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  18290903 ggagaagccaagaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 18291002  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||  ||||||  | ||||| ||||||| ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||    
T  18291003 aaagaagccatggcagttccatccttcttaggttccgttccttcaacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagaga 18291102  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| |  |||  |||||||| ||||| || | ||| ||||||||    
T  18291103 aagatgatagctggctaaccaagtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccacttcttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttac 18291202  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  18291203 cgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 18291266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 18306204 - 18306567
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  18306204 ggagaagccaagaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 18306303  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||  ||||||  | ||||| ||||||| ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||    
T  18306304 aaagaagccatggcagttccatccttcttaggttccgttccttcaacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagaga 18306403  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| |  |||  |||||||| ||||| || | ||| ||||||||    
T  18306404 aagatgatagctggctaaccaagtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccacttcttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttac 18306503  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  18306504 cgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 18306567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Original strand, 15739644 - 15740006
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||  || || ||     
T  15739644 ggagaagccaagaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctatgcatccttc 15739743  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||  | ||||| | ||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||    
T  15739744 aaagaagccatggcagttccatccctcttgggttccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagaga 15739843  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| ||||| |||| ||||||||| ||    
T  15739844 aagatgatagctggctaaccaggtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttctgatgcaaggtagaggtcac 15739943  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
     || || || ||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  15739944 cgcccccgcgtcatgtatccatggtctccctaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 15740006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Original strand, 29147305 - 29147667
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||||   || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  29147305 ggagaagccaagaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacttgccccagccggcaacttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 29147404  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||  | |||||  |||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||    
T  29147405 aaagaagccattgcagttccatccctcttggactccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccccgcctctatgcaagaga 29147504  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| || ||||||||||  ||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||    
T  29147505 aagatgatagttggctaaccaggtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcac 29147604  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||| || || || |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  29147605 tgctcccgcgtcgtgtatccatggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatgtccat 29147667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 35882474 - 35882112
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||| | || ||  | || || || ||     
T  35882474 ggagaagccaagaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctctcggacggctctatgtgcatccttc 35882375  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| |||||||||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||    
T  35882374 aaagaagccattgcagtcccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcctctatgcaagaga 35882275  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||    
T  35882274 aagatgatagctggctaaccaggtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcac 35882175  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||| || || || |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  35882174 tgctcccgcgtcgtgtatccatggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 35882112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 4723329 - 4722977
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  4723329 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 4723230  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || |||||  |||| ||  | || ||||||||||||||||| ||    
T  4723229 tggcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctacagaccctgcctctatgcaagagaaagatgatag 4723130  T
Q  214 ctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||||||||  ||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || |||    
T  4723129 ctggctaaccaggtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgcccccgca 4723030  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  4723029 tcatgtatccacggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 4722977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 31963023 - 31963386
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || ||     
T  31963023 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttc 31963122  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || |||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||     
T  31963123 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagttccttcagcagaccctgcttcaatacaagaa 31963221  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  31963222 aaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 31963321  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  31963322 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 31963386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4418627 - 4418264
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| || || |||| | |||||||||| |||||     
T  4418627 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccgtcctgaataaccttctgagcatctttc 4418528  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||  | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  4418527 aatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccctggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaa 4418428  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    | || ||||||||||| || |  ||||  ||||| ||||| |  ||||||||||| || ||| |||  || ||||| ||||| || | ||||||||||||    
T  4418427 aggaagacagctggctgactaggtatgcctcttcaccatgaatggtaacaagctttcccttccttatgaatttcaacttctgatgtaaggtagaggttac 4418328  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  4418327 cgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 4418264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 18244399 - 18244084
Alignment:
Q  52 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 151  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  18244399 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 18244300  T
Q  152 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 251  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||||||  ||||||  ||||| ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  18244299 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagatcctgcttcaacacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 18244200  T
Q  252 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  18244199 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 18244100  T
Q  352 agcattgatgtccatc 367  Q
     ||||| |||||||||    
T  18244099 tgcattaatgtccatc 18244084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 18275602 - 18275965
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| ||| |||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  18275602 ggagaagctaagaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgctccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 18275701  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||  ||||||  | ||||| ||||||| ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||    
T  18275702 aaagaagccatggcagttccatccttcttaggttccgttccttcaacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagaga 18275801  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| |  |||  |||||||| ||||| || | ||| ||||||||    
T  18275802 aagatgatagctggctaaccaagtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccacttcttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttac 18275901  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  18275902 cgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 18275965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Original strand, 22869406 - 22869768
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||     
T  22869406 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcatcttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttc 22869505  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||    
T  22869506 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagag 22869604  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  22869605 aaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 22869704  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| ||||||||    
T  22869705 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccat 22869768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Original strand, 22884465 - 22884827
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||     
T  22884465 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcatcttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttc 22884564  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||    
T  22884565 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagag 22884663  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  22884664 aaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 22884763  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| ||||||||    
T  22884764 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccat 22884827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 5468684 - 5468362
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  5468684 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcatcttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagcc 5468585  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||  ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  5468584 atagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaacggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagaca 5468485  T
Q  213 gctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
     |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  5468484 actggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattctttacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgc 5468385  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttccca 335  Q
    ||| |||||||| ||||||||||    
T  5468384 atcgtgtatccacggtcttccca 5468362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Original strand, 8288021 - 8288383
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||| ||||  || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  8288021 ggagaagccaagaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccagcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 8288120  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||  | | ||  ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| || || ||  |||| ||||||||||    
T  8288121 aaagaagccattgcagttccatcccttttaggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctccgccgaccctgcttctatgcaagaga 8288220  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||    
T  8288221 aagatgatagctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcac 8288320  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
     || || || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  8288321 cgctcccgcgtcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 8288383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 32440852 - 32440499
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  32440852 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 32440753  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| || || ||  | || ||||||||||||||||| ||    
T  32440752 tggcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgccgaccctgcctctatgcaagagaaagatgatag 32440653  T
Q  214 ctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||||||||  ||||  ||||||||||| |  ||||||||||| ||| |  |||  |||||||| ||||| || | ||| ||||||||  | || |||    
T  32440652 ctggctaaccaggtatgcctcttctccatgaatggtaacaagctttccacttcttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccacacccgca 32440553  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  32440552 tcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 32440499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 48467535 - 48467272
Alignment:
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  48467535 aaagaagccatagcagtcccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaa 48467436  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    | || ||||||||||| || || |||| |||||| ||||||| ||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  48467435 aggaagacagctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtgacgagttttccattcttcacaaacttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 48467336  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  48467335 cgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 48467272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 10644778 - 10644415
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || ||     
T  10644778 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttc 10644679  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||  | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||     
T  10644678 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccctggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaa 10644580  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  10644579 aaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 10644480  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    |||| || ||||| |||||||| | ||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  10644479 ctgcacctgcatcgtgtatccacgatcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 10644415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 17983506 - 17983869
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || ||     
T  17983506 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttc 17983605  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||  | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||     
T  17983606 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccctggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaa 17983704  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  17983705 aaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 17983804  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  17983805 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 17983869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 24329867 - 24329504
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||     
T  24329867 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttc 24329768  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||     
T  24329767 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaa 24329669  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  24329668 aaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 24329569  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  24329568 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 24329504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 51783731 - 51783368
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||     
T  51783731 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttc 51783632  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||     
T  51783631 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaa 51783533  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  51783532 aaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 51783433  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  51783432 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 51783368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 351
Target Start/End: Original strand, 4795303 - 4795550
Alignment:
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||    
T  4795303 aaagaagccatggcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcctctatgcaagaga 4795402  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||    
T  4795403 aagatgatagctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcac 4795502  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
     || || || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  4795503 cgctcctgcgtcatgtatccaaggtctccccaagagacagctgtaaga 4795550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18332336 - 18331997
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| |||||  | || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  18332336 ggagaagccaagaccttccttatgcttgttctcaagaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 18332237  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||| ||| ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||    
T  18332236 aaagaagtcattgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagaga 18332137  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||| | |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||    
T  18332136 aagatgatagctggctaaccaggtatgcttcctctccacgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcac 18332037  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacag 343  Q
    ||  || || || |||||||||||||| |||| |||||||    
T  18332036 tgttcccgcgtcgtgtatccatggtctccccaagagacag 18331997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 21676401 - 21676038
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| |||||||  || || ||||| || || ||||| || || ||     
T  21676401 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcatcttgccccaaccggcagcttgaccctcttggacggctttctgtgcatccttc 21676302  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||  |||| | | ||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  21676301 aaagaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcatcttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaa 21676202  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    | || ||||||||||| || || |||| |||||| ||||||| ||| || |  || |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  21676201 aggaagacagctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtgacgatttttccattcttcacaaacttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 21676102  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  21676101 cgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 21676038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 8213437 - 8213083
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| |||||||  || || ||||| || || ||||| || || || |||||||||    
T  8213437 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagcttgaccctcttggacggctttctgtgcatccttcaaagaagcc 8213338  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    |||||||  ||||  |||||  |||| | || |||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||    
T  8213337 atagcagctccagctttcttaggctctgcactttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagaca 8213238  T
Q  213 gctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||| | ||||| ||||| ||||| || | ||| ||||| || || || ||    
T  8213237 gctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcgtcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaggtaaccgcacccgc 8213138  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  8213137 atcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 8213083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 6541012 - 6541375
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||| | |||||     
T  6541012 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcatcttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgaacatctttc 6541111  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | || |||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  |||||     
T  6541112 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcactttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaa 6541210  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  6541211 aaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 6541310  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  6541311 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 6541375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 7998270 - 7997938
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||     
T  7998270 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttc 7998171  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||| | ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||     
T  7998170 aatgaagccatagcggccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaacgcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaa 7998072  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| |||| |||||| || || || | |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  7998071 aaagaagacaactggctgactaagtacgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 7997972  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    | || || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  7997971 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccag 7997938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 47025161 - 47024798
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||     
T  47025161 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcatcttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttc 47025062  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | || |||||| ||||  ||| | || |||||||| |||||||| ||  ||||||  |||||     
T  47025061 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcactttcaatggtcaaaccttggaaagcagttccttcagcagaccctgcttcaacacaagaa 47024963  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || | ||| || || |    
T  47024962 aaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttttgatgtaaggtggaagtaa 47024863  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||| ||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  47024862 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtctccccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 47024798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 28022934 - 28022621
Alignment:
Q  53 ttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaata 151  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | | |||||||     
T  28022934 ttgccccagccggcggtctgaccctcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcatcttcaatg 28022836  T
Q  152 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 251  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  | ||||  |||||||| || |||| |||||| || || |||| |||||| ||| ||| |||||    
T  28022835 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcctcaacacaagagaaggaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccacggattgtaa 28022736  T
Q  252 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  28022735 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 28022636  T
Q  352 agcattgatgtccat 366  Q
     ||||| ||||||||    
T  28022635 cgcattaatgtccat 28022621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 5652928 - 5652860
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 81  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  5652928 gagaccctctttgtgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 5652860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 4626485 - 4626417
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  4626485 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 4626417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 5713768 - 5713700
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  5713768 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 5713700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 5724678 - 5724610
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  5724678 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 5724610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 5767690 - 5767758
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  5767690 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 5767758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 17993501 - 17993569
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  17993501 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 17993569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 20441575 - 20441462
Alignment:
Q  254 agcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaag 353  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||  || || |||||||| || || |    
T  20441575 agcttcccattcttcacaaactttaacttctgatgcaaggtagacgttactgcccccgcttcatgaatccagggtcggcctagtagacagctgtaggatg 20441476  T
Q  354 cattgatgtccatc 367  Q
    | | ||||||||||    
T  20441475 cttggatgtccatc 20441462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 28340887 - 28340766
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || ||     
T  28340887 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttcccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttc 28340788  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccag 125  Q
    || ||||||||||||| |||||    
T  28340787 aatgaagccatagcagccccag 28340766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 125
Target Start/End: Original strand, 36995750 - 36995871
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||     
T  36995750 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttc 36995849  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccag 125  Q
    || ||||||||||||| |||||    
T  36995850 aatgaagccatagcagccccag 36995871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 41438701 - 41438588
Alignment:
Q  254 agcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaag 353  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||  || || |||||||| || || |    
T  41438701 agcttcccattcttcacaaactttaacttctgatgcaaggtagacgttactgcccccgcttcatgaatccagggtcggcctagtagacagctgtaggatg 41438602  T
Q  354 cattgatgtccatc 367  Q
    | | ||||||||||    
T  41438601 cttggatgtccatc 41438588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 267 - 330
Target Start/End: Original strand, 7090873 - 7090936
Alignment:
Q  267 ttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtct 330  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  7090873 ttacaaacttcaatttctgatggagagtagatgtcactgccccagcgtcatgaatccatggtct 7090936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 52)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 13 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22890216 - 22889863
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22890216 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtattaacttgccccagccgacagcttgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 22890117  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||| || |    
T  22890116 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaaaccttgaaaggtagttccttcagcagatcctgcttcaatgcaggagaaagacgata 22890017  T
Q  213 gctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  22890016 gctggctaaccaaatatgcttcttctccatggattgtaacaagctttccattctttacaaacttcaatttctgatgcagggtagaggttactgcaccagc 22889917  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22889916 atcgtgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 22889863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 25200776 - 25200427
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  25200776 gagaccttccttgtgcttattctcacggagttggattaacttgccccagccggcagcctgtccttcctgaatagccttctgagcgtctttaaaagaagcc 25200677  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| || |    
T  25200676 atagcagtcccagtcttcttaggttccgtaccttcaatagtcaaaccttgaaaggcagttccttcagcagatccagcttcaatgcaggagaaagacgata 25200577  T
Q  213 gctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25200576 gctggctaaccaaatatgcttcttctccatggactgtaacaagctttccattctttacaaacttcaatttctgatgcagggtagaggttactgcgccagc 25200477  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgt 362  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25200476 atcgtgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgt 25200427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 25264931 - 25264686
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  25264931 gagaccttccttgtgcttattctcacggagttggattaacttgccccagccggcagcctgtccttcctgaatagccttctgagcgtctttaaaagaagcc 25264832  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| || |    
T  25264831 atagcagtcccagtcttcttaggttccgtaccttcaatagtcaaaccttgaaaggcagttccttcagcagatccagcttcaatgcaggagaaagacgata 25264732  T
Q  213 gctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagctt 258  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25264731 gctggctaaccaaatatgcttcttctccatggactgtaacaagctt 25264686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 23893952 - 23893600
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||  ||||||||||||| |  || |||||||| || ||| | || || || || ||||||||||    
T  23893952 agaccttccttatgcttgttctcacggagttgtattaatctgccccagccggcggcttgaccttcttggacggccctatgtgcatccttcaaagaagcca 23893853  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    ||||||  | |  | | ||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || ||||| || ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  23893852 tagcagctcaatcccttttgggctccgtaccttcgacagttaaaccttgaaaagcggttccttctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 23893753  T
Q  214 ctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||||||||  |||| ||| |||||||| | |||||| ||||| ||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| || || |||||     
T  23893752 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaattgtaacgagctttccactctttgcaaactttaacttctggtgcagggtagaggtcaccgccccagcg 23893653  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23893652 tcatgtatccacggtcttcctaagagacagctataagaggcattgatgtccat 23893600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 367
Target Start/End: Original strand, 15657176 - 15657529
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  15657176 agaccttccttatgcttattctcacgaagctgtattaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 15657275  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  15657276 ttgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 15657375  T
Q  214 ctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| |  |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || |||    
T  15657376 ctggctaaccaagtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccacttcttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgca 15657475  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  15657476 tcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaagatgcattaatgtccatc 15657529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9319207 - 9318844
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| |||||     
T  9319207 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtaccaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttc 9319108  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  9319107 aatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaga 9319008  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    | || ||||||||||| || || ||||  ||||| ||||| |  ||||||||||| || ||| |||| || ||||| ||||| || | ||||||||||||    
T  9319007 aggaagacagctggctgactaagtatgcctcttcaccatgaatggtaacaagctttcccttccttacgaatttcaacttctgatgtaaggtagaggttac 9318908  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  9318907 cgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 9318844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 40471955 - 40472318
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| |||||     
T  40471955 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttc 40472054  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||| | |||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  40472055 aatgaagccatagcggccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaga 40472154  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| | ||||||||| || ||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||  |||||||| ||||| || | ||| ||||||||    
T  40472155 aagaagtcagctggctgactaaatatgcttcttctccatgaacggtaacaagctttccgttccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttac 40472254  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| | ||| || || || ||||| |||||||||    
T  40472255 cgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaaacaactgtaggatgcattaatgtccatc 40472318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 41676455 - 41676102
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  41676455 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 41676356  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | |||||  |||||||| ||||| ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  41676355 tggcagttccatccctcttggactccgtacattcaacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 41676256  T
Q  214 ctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || |||    
T  41676255 ctggctgaccaagtatgcttcttctccatgaatggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgca 41676156  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  41676155 tcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 41676102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 12133911 - 12133548
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| |||||     
T  12133911 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttc 12133812  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  12133811 aatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaga 12133712  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    | || ||||||||||| || || ||||  ||||| ||||| |  ||||||||||| || ||| |||| || ||||| ||||| || | ||||||||||||    
T  12133711 aggaagacagctggctgactaagtatgcctcttcaccatgaatggtaacaagctttcccttccttacgaatttcaacttctgatgtaaggtagaggttac 12133612  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  12133611 cgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 12133548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26482147 - 26481784
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| |||||     
T  26482147 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttc 26482048  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  ||||| ||||||| ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  26482047 aatgaagccatagcagccccagctttcttaagctccgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaa 26481948  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    | || || |||||||| || || ||||  ||||| ||||| |  ||||||||||| |||||| |||  || ||||| ||||| || | ||||||||||||    
T  26481947 aggaagatagctggctgactaagtatgcctcttcaccatgaatggtaacaagctttccattccttatgaatttcaacttctgatgtaaggtagaggttac 26481848  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  26481847 cgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 26481784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 11551100 - 11550748
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||| ||||    
T  11551100 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaggcca 11551001  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  11551000 tggcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 11550901  T
Q  214 ctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||||||||| || |||||||  |||||||| ||||| || ||     
T  11550900 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaacttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcg 11550801  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    || |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  11550800 tcgtgtatccatggtctccccacgagacagctgtaagaggcattaatatccat 11550748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 30936379 - 30936027
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  30936379 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 30936280  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  30936279 tggcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 30936180  T
Q  214 ctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || ||     
T  30936179 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgctcccgcg 30936080  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  30936079 tcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 30936027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33518101 - 33517749
Alignment:
Q  15 gaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccat 114  Q
    ||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| || || |||| | |||||||||| ||||| || ||||||||    
T  33518101 gaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccgtcctgaataaccttctgagcatctttcaatgaagccat 33518002  T
Q  115 agcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagc 214  Q
    |||||||||||  |||||  |||||| ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || || |||    
T  33518001 agcagtcccagctttcttaggctccgcaccttcaatggtcaatccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagatagc 33517902  T
Q  215 tggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcat 314  Q
    |||||||| || ||||  ||||| ||||| |  ||||||||||| |||||| |||  || ||||| ||||| || | |||||||||||| || || ||||    
T  33517901 tggctaactaagtatgcctcttcaccatgaatggtaacaagctttccattccttatgaatttcaacttctgatgtaaggtagaggttaccgcacctgcat 33517802  T
Q  315 catgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    | |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  33517801 cgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 33517749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3791297 - 3790934
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | ||||| |||| |||||     
T  3791297 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttccgagcatctttc 3791198  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || |||| |||||||  |||||  |||||  |||| | ||| ||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  3791197 aatgaagtcatagcaaccccagctttcttaggctctgcaccctcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaga 3791098  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| | ||||||||| || ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| ||||||||    
T  3791097 aagaagtcagctggctgactaaatatgcttcttctccatgaatggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttac 3790998  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  3790997 cgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 3790934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 28650991 - 28650628
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| |||||     
T  28650991 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttc 28650892  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || || || || |||||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  28650891 aatgaagccatagcagccccagcttcctttggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcggtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaa 28650792  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| ||||| ||    
T  28650791 aggaagacagctggctaactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaggtgac 28650692  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  28650691 cgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 28650628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 43080008 - 43079645
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| |||||     
T  43080008 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttc 43079909  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || || || || |||||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  43079908 aatgaagccatagcagccccagcttcctttggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcggtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaa 43079809  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| ||||| ||    
T  43079808 aggaagacagctggctaactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaggtgac 43079709  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  43079708 cgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 43079645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 33779243 - 33778881
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  33779243 ggagaagccaagaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 33779144  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||    
T  33779143 aaagaagccatggcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagaga 33779044  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| || |||||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||    
T  33779043 aagacgatagctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatagtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcac 33778944  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||| || || || |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  33778943 tgctcccgcgtcgtgtatccatggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 33778881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33294271 - 33293918
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  33294271 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 33294172  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  33294171 tggcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 33294072  T
Q  214 ctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||||||||  ||||  || |||||||| |  ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || |||    
T  33294071 ctggctaaccaggtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgca 33293972  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| | |||||||    
T  33293971 tcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaacgtccatc 33293918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Original strand, 24686573 - 24686925
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||| |||  || || ||||| || ||  |||| || ||||| ||||||||||    
T  24686573 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacttgccccagccgacagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatctttcaaagaagcca 24686672  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| | ||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||    
T  24686673 ttgcagttccatccctcttgggttccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttatatgcaagagaaagatgatag 24686772  T
Q  214 ctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || ||     
T  24686773 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgcccccgcg 24686872  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  24686873 ttatgtatccatggtctccccaggagacagctgtaagaggcattaatatccat 24686925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 24971764 - 24971412
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  24971764 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 24971665  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| |||||||| |||||||| ||    
T  24971664 ttgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagaaaaagatgatag 24971565  T
Q  214 ctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || ||     
T  24971564 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgcccccgcg 24971465  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  24971464 tcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 24971412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 24683196 - 24682833
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| |||||     
T  24683196 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttc 24683097  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  24683096 aatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaga 24682997  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  24682996 aagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 24682897  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  24682896 cgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 24682833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 24725723 - 24725360
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| |||||     
T  24725723 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttc 24725624  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  24725623 aatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaga 24725524  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  24725523 aagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 24725424  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  24725423 cgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 24725360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Original strand, 23750856 - 23751218
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  23750856 ggagaagccaagaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 23750955  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||    
T  23750956 aaagaagccattgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagaga 23751055  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||    
T  23751056 aagatgatagctggctaaccaggtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcac 23751155  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||| || || || |||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  23751156 tgctcccgcgtcgtgtatccaaggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 23751218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 15757263 - 15757626
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || ||     
T  15757263 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttc 15757362  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || |||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||     
T  15757363 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagttccttcagcagaccctgcttcaatacaagaa 15757461  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  15757462 aaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 15757561  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    |||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  15757562 ctgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 15757626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 18499136 - 18499499
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| |||||||  || || ||||| || || ||||| || |||||     
T  18499136 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagcttgaccctcttggacggctttctgtgcatctttc 18499235  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||  |||| | | ||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  18499236 aaagaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcatcttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaa 18499335  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    | || ||||||||||| || || |||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  18499336 aggaagacagctggctgactaagtatgcttcttctccatgaacggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 18499435  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  18499436 cgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 18499499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Original strand, 22997520 - 22997882
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  22997520 ggagaagccaagaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 22997619  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||| ||||| ||||| |||  | ||||| |||||||||||||   ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||    
T  22997620 aaagaggccattgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcggcagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagaga 22997719  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||    
T  22997720 aagatgatagctggctaaccaggtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcac 22997819  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||| || || || |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  22997820 tgctcccgcgtcgtgtatccatggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 22997882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Original strand, 23716394 - 23716756
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  23716394 ggagaagccaagaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 23716493  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||  | | ||  ||||||||||||| | ||  |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||    
T  23716494 aaagaagccatggcagttccatcccttttaggctccgtaccttcgacagctaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagaga 23716593  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| ||||| |||| ||||||||| ||    
T  23716594 aagatgatagctggctaaccaggtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttctgatgcaaggtagaggtcac 23716693  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
     || || || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  23716694 cgcccccgcgtcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 23716756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 8663881 - 8664244
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || |||    
T  8663881 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcgcagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttt 8663980  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||  |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||     
T  8663981 aatgaagccatagcagccccaa-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaa 8664079  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  8664080 aaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 8664179  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  8664180 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 8664244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 13323235 - 13323598
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| |||||     
T  13323235 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttc 13323334  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||    
T  13323335 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagag 13323433  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  13323434 aaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcataaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 13323533  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  13323534 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 13323598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 28958192 - 28958555
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| |||||     
T  28958192 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttc 28958291  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | | ||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  | ||||  |||||||    
T  28958292 aatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcatcttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcctcaacacaagaga 28958391  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    | || |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  28958392 aggaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 28958491  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  28958492 cgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 28958555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30170225 - 30169862
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || ||     
T  30170225 ggagaacccgagaccttctttgcgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttc 30170126  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  | |||   ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  30170125 aatgaagccatagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaa 30170026  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  30170025 aagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 30169926  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  30169925 cgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 30169862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 37357049 - 37357412
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| |||||     
T  37357049 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttc 37357148  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  ||||| |    
T  37357149 aatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaa 37357248  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  37357249 aagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 37357348  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  37357349 cgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 37357412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 367
Target Start/End: Original strand, 37669937 - 37670252
Alignment:
Q  52 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 151  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  37669937 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 37670036  T
Q  152 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 251  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  37670037 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 37670136  T
Q  252 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  37670137 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 37670236  T
Q  352 agcattgatgtccatc 367  Q
     ||||| |||||||||    
T  37670237 tgcattaatgtccatc 37670252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30031171 - 30030808
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || |||    
T  30031171 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttt 30031072  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||     
T  30031071 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaa 30030973  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  30030972 aaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 30030873  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  30030872 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 30030808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30153774 - 30153411
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || ||     
T  30153774 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttc 30153675  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||     
T  30153674 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaa 30153576  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  30153575 aaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 30153476  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  30153475 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 30153411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 37756736 - 37756373
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| |||||     
T  37756736 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttc 37756637  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  ||||| |    
T  37756636 aatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaa 37756537  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  37756536 aagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 37756437  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||| ||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  37756436 cgcacctgcatcgtgtatccacggtctccccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 37756373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 367
Target Start/End: Original strand, 18125811 - 18126164
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  18125811 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 18125910  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | || || |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||  |||| || || ||||| || || ||  | || ||||||||||||||||| ||    
T  18125911 tggcggttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccctgaaaagcggtcccctctgccgaccctgcctctatgcaagagaaagatgatag 18126010  T
Q  214 ctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||| ||||  ||||  |||| |||||| |  ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || |||    
T  18126011 ctggctgaccaggtatgcctcttttccatgaatggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgca 18126110  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  18126111 tcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 18126164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 6876061 - 6875698
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || ||     
T  6876061 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttc 6875962  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||| ||| ||  ||||||| |||||     
T  6875961 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagtagaccctgcttcaatacaagaa 6875863  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  6875862 aaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 6875763  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  6875762 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 6875698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 31824813 - 31825176
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||     
T  31824813 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttc 31824912  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||     
T  31824913 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaa 31825011  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  31825012 aaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 31825111  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  31825112 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 31825176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 34618274 - 34617911
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||     
T  34618274 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcatcttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttc 34618175  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||     
T  34618174 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaa 34618076  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    || || |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  34618075 aaggaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 34617976  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  34617975 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 34617911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 31433196 - 31432834
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||     
T  31433196 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcatcttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttc 31433097  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||     
T  31433096 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaa 31432998  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| || | |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  31432997 aaagaagataactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 31432898  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||| ||||| || || || || || ||||| ||||||||    
T  31432897 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtctccccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccat 31432834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 336
Target Start/End: Original strand, 37769441 - 37769725
Alignment:
Q  52 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 150  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  || |||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  37769441 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctccgagcatctttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 37769539  T
Q  151 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 250  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  ||||| ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  37769540 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 37769639  T
Q  251 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  37769640 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccag 37769725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 2512807 - 2512444
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || ||     
T  2512807 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttc 2512708  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| || |  ||| | || ||||| || |||| ||| ||  ||||||| |||||     
T  2512707 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggttaaaccttggaaagcagtcccttcagtagaccctgcttcaatacaagaa 2512609  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| ||||  ||||| || || | || |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  2512608 aaagaagacaattggctgactaagtgtgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 2512509  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  2512508 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 2512444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 13440067 - 13440135
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13440067 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccggcagcttgtccttcttg 13440135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 125
Target Start/End: Original strand, 18373941 - 18374062
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || ||     
T  18373941 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttc 18374040  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccag 125  Q
    || ||||||||||||| |||||    
T  18374041 aatgaagccatagcagccccag 18374062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 9548116 - 9548184
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  9548116 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 9548184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 11326383 - 11326315
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  11326383 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 11326315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 13184222 - 13184290
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  13184222 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 13184290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 5639543 - 5639422
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||     
T  5639543 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttc 5639444  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccag 125  Q
    || ||||||||||||| |||||    
T  5639443 aatgaagccatagcagccccag 5639422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 125
Target Start/End: Original strand, 32594689 - 32594801
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| || ||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  32594689 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccctcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagcc 32594788  T
Q  113 atagcagtcccag 125  Q
    ||||||| |||||    
T  32594789 atagcagccccag 32594801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 254 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 34467122 - 34467047
Alignment:
Q  254 agcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtc 329  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||    
T  34467122 agcttcccattcttcacaaactttaacttctgatgcaaggtagacgttactgcccccgcttcatgaatccagggtc 34467047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 20390438 - 20390507
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaa 83  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| ||||||||  |||  | |||||||||||    
T  20390438 agaccttctttgtgcttgttctcgggcagctgtactaacttcccccagccttcagcttttccttcttgaa 20390507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16043062 - 16042709
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  16043062 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtattaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacaaccttctgagcatctttaaaagaagcc 16042963  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    |||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16042962 atagtagccccagtcttcttaggctccgtaccttcaatagtcaaaccttgaaaggcagttccttcagcagatccagcttcaatgcaagagaaagatgaca 16042863  T
Q  213 gctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  16042862 gctggctaaccaaatatgcctcttctccatggaccgtaacgagctttccattcttcacaaacttcaatttctgatgcagggtagaggttattgcgccagc 16042763  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16042762 atcgtgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcgttgatgtccat 16042709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 366
Target Start/End: Original strand, 16448402 - 16448755
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16448402 gagaccttctttgtgcttattctcacggagttgtattaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaaacc 16448501  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  |||||  |||| ||||||||||||||||  ||| | |||| |||| | ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  16448502 atagcagccccagctttcttaggctctgtaccttcaatagtcaaaccttggaaggtagtttcttcagcagatccagattcaatgctagagaaagatgaca 16448601  T
Q  213 gctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16448602 gctggctaaccaaatatgcttcttctccatggaccgtaacaagctttccattctttacaaacttcaatttctgatgcagggtagaggttactgcgccagc 16448701  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448702 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 16448755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 5145735 - 5146098
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| |||||     
T  5145735 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttc 5145834  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||| ||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  5145835 aacgaagccaaagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaga 5145934  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| | ||||||||| || || |||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| ||||||||    
T  5145935 aagaagtcagctggctgactaagtatgcttcttctccatgaacggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttac 5146034  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  5146035 cgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 5146098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 5129740 - 5129378
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  5129740 ggagaagccaagaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 5129641  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||    
T  5129640 aaagaagccattgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagaga 5129541  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| ||||| |||| ||||||||| ||    
T  5129540 aagatgatagctggctaaccaggtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttctgatgcaaggtagaggtcac 5129441  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
     || || || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  5129440 cgcccccgcgtcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 5129378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 26318264 - 26318627
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| |||||     
T  26318264 ggagaaaccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttc 26318363  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  26318364 aatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaga 26318463  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    | || ||||||||||| || || ||||  ||||| ||||| |  ||||||||||| || ||| |||| || ||||| ||||| || | ||||||||||||    
T  26318464 aggaagacagctggctgactaagtatgcctcttcaccatgaatggtaacaagctttcccttccttacgaatttcaacttctgatgtaaggtagaggttac 26318563  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || || || |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  26318564 cgcacctgcgtcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 26318627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 367
Target Start/End: Original strand, 26536274 - 26536628
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| || ||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  26536274 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccctcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagcc 26536373  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||    
T  26536374 atagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggacgaca 26536473  T
Q  213 gctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| ||||| || ||||| ||    
T  26536474 gctggctgactaagtatgcttcttcgccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaggtaaccgcgcccgc 26536573  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  26536574 atcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 26536628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 5161257 - 5160905
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| |  ||  |||| || || || ||||||||||    
T  5161257 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttggccctcttggatggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 5161158  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | |||||  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  || | ||||||||||||||||| ||    
T  5161157 ttgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagtcaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgctactatgcaagagaaagatgatag 5161058  T
Q  214 ctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||||| ||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || ||     
T  5161057 ctggctaatcaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcg 5160958  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  5160957 tcgtgtatccatggtctccccaggagacagctgtaagaggcattaatatccat 5160905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 52 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26436957 - 26436642
Alignment:
Q  52 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 151  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | |||||||||     
T  26436957 cttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatg 26436858  T
Q  152 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 251  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||| |||||| ||||||| ||| |    
T  26436857 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagacagctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtga 26436758  T
Q  252 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    | || || |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  26436757 cgagttttccattcttcacaaacttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 26436658  T
Q  352 agcattgatgtccatc 367  Q
     ||||| |||||||||    
T  26436657 tgcattaatgtccatc 26436642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Original strand, 10915263 - 10915625
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || | ||| ||||| || || |||| |||  |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  10915263 ggagaagccaagaccttccttatacttgttctcacgaagctgtattaatctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 10915362  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||    
T  10915363 aaagaagccattgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaacctgcctctatgcaagaga 10915462  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||| | |||||||||||| ||  | ||| |||| ||||| ||||| |||| ||||||||| ||    
T  10915463 aagatgatagctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaattgtaacaagctttccgctttttgcaaatttcaacttctgatgcaaggtagaggtcac 10915562  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
     || || || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  10915563 cgctcccgcgtcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 10915625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 351
Target Start/End: Original strand, 16501796 - 16502143
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  16501796 ggagaagccaagaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 16501895  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||    
T  16501896 aaagaagccattgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcctctatgcaagaga 16501995  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||    
T  16501996 aagatgatagctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcac 16502095  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
      | || || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  16502096 cacccccgcgtcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 16502143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26514529 - 26514166
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||     
T  26514529 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcatcttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttc 26514430  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  26514429 aatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaga 26514330  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  26514329 aagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 26514230  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  26514229 cgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 26514166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 31126668 - 31126305
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| |||||     
T  31126668 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttc 31126569  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  31126568 aatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaga 31126469  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  31126468 aagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcataaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 31126369  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  31126368 cgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 31126305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Original strand, 11423172 - 11423534
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||| || |  || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  11423172 ggagaagccaagaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccagcggcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 11423271  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||  | ||||| ||| ||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||    
T  11423272 aaagaagccatggcagttccatccctcttgggcttcgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagaga 11423371  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||    
T  11423372 aagatgatagctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcac 11423471  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||| || || || |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  11423472 tgctcccgcgtcgtgtatccatggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 11423534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 31562785 - 31563148
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| |||||     
T  31562785 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttc 31562884  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  ||||| |    
T  31562885 aatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaa 31562984  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  31562985 aagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 31563084  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  31563085 cgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 31563148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 2156311 - 2155959
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || || || ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || |||||||| ||  |||| || || || ||||||||||    
T  2156311 agaccttccttatgtttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttgaacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 2156212  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    |  |||| |||  | ||||  | ||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||    
T  2156211 tgtcagttccatccctcttaggttccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctacctctatgcaagagaaagatgatag 2156112  T
Q  214 ctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || ||     
T  2156111 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcg 2156012  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    || |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  2156011 tcgtgtatccatggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 2155959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3447054 - 3446691
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || ||     
T  3447054 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttc 3446955  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||     
T  3446954 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaa 3446856  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  3446855 aaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 3446756  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  3446755 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 3446691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9620399 - 9620036
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || ||     
T  9620399 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttc 9620300  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||     
T  9620299 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaa 9620201  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  9620200 aaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 9620101  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  9620100 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 9620036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 351
Target Start/End: Original strand, 16516832 - 16517179
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| ||||| || || | || |||| ||||||||| |||||  || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  16516832 ggagaagccaagaccttccttatgcttgttctcacgaagctttattaacctgccccagctggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 16516931  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||    
T  16516932 aaagaagccattgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcctctatgcaagaga 16517031  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||    
T  16517032 aagatgatagctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcac 16517131  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
      | || || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  16517132 cacccccgcgtcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 16517179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 11442627 - 11442264
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| |||||     
T  11442627 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttc 11442528  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||| | |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||     
T  11442527 aatgaagccatagcagccccgg-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaa 11442429  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    || || |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  11442428 aaggaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 11442329  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  11442328 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 11442264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 26273489 - 26273852
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||     
T  26273489 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttc 26273588  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||     
T  26273589 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaa 26273687  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  26273688 aaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 26273787  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  26273788 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 26273852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 16734855 - 16735218
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||     
T  16734855 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttc 16734954  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  | |||   ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  16734955 aatgaagccatagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaa 16735054  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    | || ||||||||||| || |  ||||  ||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  16735055 aggaagacagctggctgactaggtatgcctcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 16735154  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  16735155 cgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 16735218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 16749909 - 16750272
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||     
T  16749909 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttc 16750008  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  | |||   ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  16750009 aatgaagccatagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaa 16750108  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    | || ||||||||||| || |  ||||  ||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  16750109 aggaagacagctggctgactaggtatgcctcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 16750208  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  16750209 cgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 16750272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17525280 - 17524917
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||     
T  17525280 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttc 17525181  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  | |||   ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  17525180 aatgaagccatagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaa 17525081  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    | || ||||||||||| || |  ||||  ||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  17525080 aggaagacagctggctgactaggtatgcctcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 17524981  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  17524980 cgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 17524917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 17527935 - 17528298
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||     
T  17527935 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttc 17528034  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  | |||   ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  17528035 aatgaagccatagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaa 17528134  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    | || ||||||||||| || |  ||||  ||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  17528135 aggaagacagctggctgactaggtatgcctcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 17528234  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  17528235 cgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 17528298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 24590936 - 24591299
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||     
T  24590936 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcggtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttc 24591035  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  | |||   ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  24591036 aatgaagccatagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaa 24591135  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  24591136 aagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 24591235  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  24591236 cgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 24591299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 335
Target Start/End: Original strand, 26668309 - 26668640
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  || |||| || |||    
T  26668309 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctccgagcatccttt 26668408  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||  | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||     
T  26668409 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccctggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaa 26668507  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| |||| |||||| || || || | |||||| ||||||| |||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  26668508 aaagaagacaactggctgactaagtacgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccatttttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 26668607  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttccca 335  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  26668608 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttccca 26668640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 2108567 - 2108635
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 81  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  2108567 gagaccctctttgtgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 2108635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 45388968 - 45388789
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || ||     
T  45388968 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttc 45388869  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcaga 183  Q
    || ||||||||||||| |||||  | |||   ||| | ||||||||| ||||  ||| | || |||||||||||||||||    
T  45388868 aatgaagccatagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagttccctcagcaga 45388789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 45734041 - 45733973
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  45734041 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 45733973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 18542291 - 18542184
Alignment:
Q  260 ccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattga 359  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |    
T  18542291 ccattctttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaa 18542192  T
Q  360 tgtccatc 367  Q
    ||||||||    
T  18542191 tgtccatc 18542184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 4201137 - 4201060
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 81  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  4201137 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 4201060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Original strand, 31088033 - 31088094
Alignment:
Q  20 tctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 81  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  31088033 tctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 31088094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 254 - 329
Target Start/End: Original strand, 800159 - 800234
Alignment:
Q  254 agcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtc 329  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||    
T  800159 agcttcccattcttcacaaactttaacttctgatgcaaggtagacgttactgcccccgcttcatgaatccagggtc 800234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 125
Target Start/End: Original strand, 4143641 - 4143762
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||     
T  4143641 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttc 4143740  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccag 125  Q
    || ||||||||||||| |||||    
T  4143741 aatgaagccatagcagccccag 4143762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 13 - 366
Target Start/End: Original strand, 16206549 - 16206902
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16206549 gagaccttccttatgcttattctcacggagttgtattaacttgccccagccggcagcctgtccttcctgaacagccttctgagcgtctttaaaagaagcc 16206648  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16206649 atagtagccccagtctttttgagctccgtaccttcaatagtcaaaccttgaaaggcagttccttcagcagatccggcttcaatgcaagagaaagatgaca 16206748  T
Q  213 gctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16206749 gctggctaaccaaatatgcctcttctccatggactgtaacaagctttccattcttcacaaacttcaatttctgatgcagggtagaggttactgcgccagc 16206848  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16206849 atcgtgtatccatggtcttcccaagagacagctataataggcattgatgtccat 16206902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 180 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 20462655 - 20462469
Alignment:
Q  180 cagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaa 279  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20462655 cagatccagcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgcctcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaa 20462556  T
Q  280 tttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20462555 ttgttggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatatccat 20462469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 10964416 - 10964053
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||     
T  10964416 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttc 10964317  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||     
T  10964316 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaa 10964218  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  10964217 aaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 10964118  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    |||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  10964117 ctgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 10964053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 51639964 - 51639601
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||     
T  51639964 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcatcttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttc 51639865  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||    
T  51639864 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagag 51639766  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |  || || || |    
T  51639765 aaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaagtggaagtaa 51639666  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    |||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  51639665 ctgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 51639601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 28586727 - 28586364
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || ||     
T  28586727 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttc 28586628  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  | |||   ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  28586627 aatgaagccatagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagttccctcagcagaccctgcttcaatacaagaaa 28586528  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| ||||  ||||| || || || | |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  28586527 aagaagacaattggctgactaagtacgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 28586428  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  28586427 cgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 28586364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 41791817 - 41792180
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || ||     
T  41791817 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttc 41791916  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||| ||| ||  ||||||| |||||     
T  41791917 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagtagaccctgcttcaatacaagaa 41792015  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  41792016 aaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 41792115  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  41792116 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 41792180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 10946825 - 10946462
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  || |||| || ||     
T  10946825 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctccgagcatccttc 10946726  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||  | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||     
T  10946725 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccctggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaa 10946627  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| |||| |||||| || || || | |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  10946626 aaagaagacaactggctgactaagtacgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 10946527  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  10946526 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 10946462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 20462727 - 20462656
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtcc 75  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  20462727 ggagaacccgagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtattaacttgccccatccggcagcctgtcc 20462656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 366
Target Start/End: Original strand, 22079379 - 22079732
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    |||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||||| ||||||| || || ||||| |||    
T  22079379 gagaccctctctgtgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccggtagcttgaccttctaggacagccctctgagcatccttcaaagaggcc 22079478  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    |||||||  |||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||  |||| || ||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |    
T  22079479 atagcagctccagccctcttgggctccgtaccttcgatagtcaaaccctgaaaagcggttccttctgcagaccctgcttcaatgcaagagaaagatgata 22079578  T
Q  213 gctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22079579 gctggctaaccaaatatgcctcctctccatggactgtaacgagctttccattctttacaaactttaacttttggtgcagggtagaggtcactgccccagc 22079678  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22079679 gtcatgtatccacggtcttcctaggagacagctataagaagcattgatgtccat 22079732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16285186 - 16284834
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||  || |||||||  || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  16285186 agaccttccttatgcttgttctcacgaagttgtattaacctgccccagccggcagcttgaccttcttagacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 16285087  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    ||||||| |||  | | ||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || |||||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  16285086 tagcagttccatcccttttgggctccgtaccttcgacagttaaaccttgaaaagcggttccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 16284987  T
Q  214 ctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||||||||  |||| ||| |||||||| | |||||||||||| ||  | ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| || || |||||     
T  16284986 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaattgtaacaagctttccgctttttgcaaacttcaacttctggtgcaaggtagaggtcaccgccccagcg 16284887  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  16284886 tcatgtatccacggtcttcccaagagacagatataagaggcattgatatccat 16284834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Original strand, 27607373 - 27607735
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  27607373 ggagaagccaagaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 27607472  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| || ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||    
T  27607473 aaagaagccatggcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttagtccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagaga 27607572  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| || ||||| |  |||||||| ||    
T  27607573 aagatgatagctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccattttttgcaaatttcaacttttggtgtaaagtagaggtcac 27607672  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||| || || || |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  27607673 tgctcccgcgtcgtgtatccatggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 27607735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 18792454 - 18792092
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  18792454 ggagaagccaagaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 18792355  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||  | ||||  ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||    
T  18792354 aaagaagccatggcagttccatccctcttaggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcctctatgcaagaga 18792255  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||    
T  18792254 aagatgatagctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcac 18792155  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  18792154 tgctcccgcgtcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 18792092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 19676188 - 19675825
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| |||||     
T  19676188 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttc 19676089  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  19676088 aatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctacttcaatacaagaga 19675989  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  19675988 aagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 19675889  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || |||||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  19675888 cgcaccagcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggaggcattaatgtccatc 19675825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Original strand, 19206828 - 19207190
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| |||||     
T  19206828 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttc 19206927  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  ||||| ||||||| ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  19206928 aatgaagccatagcagccccagctttcttaagctccgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaa 19207027  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    | || || |||||||| || || ||||  ||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  19207028 aggaagatagctggctgactaagtatgcctcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 19207127  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||    
T  19207128 cgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccat 19207190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 19689845 - 19689498
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  19689845 ggagaagccaagaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 19689746  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||  | ||||  | ||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||    
T  19689745 aaagaagccatcgcagttccatccctcttaggttccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagaga 19689646  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||    
T  19689645 aagatgatagctggctaaccagatatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcac 19689546  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
     || || || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  19689545 cgctcccgcgtcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 19689498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9356370 - 9356007
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||     
T  9356370 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttc 9356271  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||    
T  9356270 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagag 9356172  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  9356171 aaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattctttacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 9356072  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  9356071 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 9356007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 3327975 - 3328338
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| |||||     
T  3327975 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagttgtatcatcttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttc 3328074  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  ||||| |    
T  3328075 aatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaa 3328174  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  3328175 aagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 3328274  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  3328275 cgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 3328338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14559371 - 14559009
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || | ||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  14559371 ggagaagctaagaccttccttatacttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 14559272  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||| ||   | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||    
T  14559271 aaagaagccattgcagttccctccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagaga 14559172  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| |||||| ||||||  |||| ||| |||||||| | |||||||||||| ||  | ||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||| ||    
T  14559171 aagatgatagctggttaaccaggtatgcttcctctccatgaattgtaacaagctttccgcttttggcaaatttcaacttctgatgcaaggtagaggtcac 14559072  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
     || || || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  14559071 cgctcccgcgtcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 14559009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Original strand, 2135727 - 2136089
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| ||||||| |||||||  || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  2135727 ggagaagccaagaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccaaccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 2135826  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||  | ||||  ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||    
T  2135827 aaagaagccattgcagttccatccctcttaggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagaga 2135926  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| ||||||||||||   |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||    
T  2135927 aagatgatagctggctaaccgggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcac 2136026  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
     || || || ||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  2136027 cgctcccgcgtcatgtatccatggtctccccaagagacaactgtaagaggcattaatatccat 2136089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16279290 - 16278939
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  16279290 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 16279191  T
Q  114 tagcagtcccagtct-tcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    | ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| ||||| | || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |    
T  16279190 tggcagttcca-tctctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaag-cggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgata 16279093  T
Q  213 gctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||||||||  ||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || ||    
T  16279092 gctggctaaccaggtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgcccccgc 16278993  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
     ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  16278992 gtcatgtatccaaggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 16278939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 29831069 - 29830707
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||     
T  29831069 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcatcttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttc 29830970  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||  ||  ||||||| ||||||    
T  29830969 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcaggccctgcttcaatacaagag 29830871  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  29830870 aaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 29830771  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| ||||||||    
T  29830770 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccat 29830707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 367
Target Start/End: Original strand, 12091240 - 12091555
Alignment:
Q  52 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 151  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  12091240 cttgccccagccggtagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 12091339  T
Q  152 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 251  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  ||||| ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  12091340 gtcaacccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 12091439  T
Q  252 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  12091440 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 12091539  T
Q  352 agcattgatgtccatc 367  Q
     ||||| |||||||||    
T  12091540 tgcattaatgtccatc 12091555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 31356272 - 31355909
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||     
T  31356272 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttc 31356173  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||     
T  31356172 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaa 31356074  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  31356073 aaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 31355974  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  31355973 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 31355909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33260470 - 33260107
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| |||||||  || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  33260470 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 33260371  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| || |  ||| | || ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  33260370 aaagaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggttaaaccttggaaagcagttccctcagcagaccctgcttcaatacaagaaa 33260271  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| ||||  ||||| || || || | |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  33260270 aagaagacaattggctgactaagtacgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 33260171  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  33260170 cgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 33260107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 367
Target Start/End: Original strand, 28360471 - 28360786
Alignment:
Q  52 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagc-tccgtaccttcaat 150  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||| | ||||| |||| | ||| || | |||||||||    
T  28360471 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcggccccag-cttccttagcctctgcaccttcaat 28360569  T
Q  151 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 250  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  28360570 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 28360669  T
Q  251 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 350  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  28360670 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 28360769  T
Q  351 aagcattgatgtccatc 367  Q
    | ||||| |||||||||    
T  28360770 atgcattaatgtccatc 28360786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 33245245 - 33245177
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 81  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  33245245 gagaccctctttgtgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 33245177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 183
Target Start/End: Original strand, 31488341 - 31488520
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || ||     
T  31488341 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttc 31488440  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcaga 183  Q
    || ||||||||||||| |||||  | |||   ||| | ||||||||| ||||  ||| | || |||||||||||||||||    
T  31488441 aatgaagccatagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagttccctcagcaga 31488520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 19658675 - 19658743
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 81  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  19658675 gagaccctctttgtgcttattctcaaggagttgtattatcttgccccagccagcagcttgtccttcttg 19658743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 366
Target Start/End: Original strand, 17090907 - 17091260
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  17090907 gagaccttctttgtgtttattctcatagagttgtatcaacttaccccaaccggcagcctgtccttcttgaatagccttctgagcgtccttcaaagaagcc 17091006  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| || |  ||||||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||| ||||| || |||||||||||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  17091007 atagcagccctaaccttcttgggctccgtaccttcaatggtcaatccttgaaaagcagtcccttcagcagatcctgcttcaatacaggagaaggatgaca 17091106  T
Q  213 gctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    | |||||||| || |||| |||||| ||||||||||| || ||||| |||||| | |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  17091107 gttggctaactaagtatgcttcttcaccatggactgtgacgagctttccattcctcacaaactttaacttctggtgcagggtggaggttactgcgcccgc 17091206  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
     ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17091207 gtcatgtatccacggccttcccagaagacagctataagaagcgttgatatccat 17091260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 52 - 366
Target Start/End: Original strand, 27628206 - 27628520
Alignment:
Q  52 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 151  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||  ||||||  ||||||||     
T  27628206 cttgccccagccggcagtctgaccttcttgaataaccctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaggctccgcgccttcaatg 27628305  T
Q  152 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 251  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  27628306 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaggaagacagctggctgactaaatatgcttcttcaccatggactgtaa 27628405  T
Q  252 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    | || || |||||||| |||||||| || ||||| |||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| ||| ||||| || ||    
T  27628406 cgagttttccattcttcacaaactttaacttctgatgcaaggtggaggttaccgcgcccgcgtcatgtatccaaggccttcccaagaggcagctgtatga 27628505  T
Q  352 agcattgatgtccat 366  Q
    |||||| || |||||    
T  27628506 agcattaatatccat 27628520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16675883 - 16675520
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| |||||     
T  16675883 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttc 16675784  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  16675783 aatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaga 16675684  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| | ||||||||| || ||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| ||||||||    
T  16675683 aagaagtcagctggctgactaaatatgcttcttctccatgaacggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttac 16675584  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  16675583 cgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 16675520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 29551219 - 29550856
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  29551219 ggagaagccaagaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtactaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 29551120  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||    
T  29551119 aaagaagccattgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagaga 29551020  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||  || |||||||| |  ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| ||||||||    
T  29551019 aagatgatagctggctaaccaagtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttac 29550920  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  29550919 cgcacccgcatcgtgtatccatggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 29550856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3697816 - 3697462
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||    
T  3697816 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagcc 3697717  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||    
T  3697716 atagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtca 3697617  T
Q  213 gctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || ||||||| |||||| ||||||| ||| || || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| | ||| || || || || || ||    
T  3697616 gctggctgactaaatatgcttcttcaccatggattgtgacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctggtgtaaggtggaagtaaccgcacccgc 3697517  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  3697516 atcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 3697462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 26776062 - 26776425
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| |||||     
T  26776062 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccatccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttc 26776161  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  ||||| ||||||| ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  26776162 aatgaagccatagcagccccagctttcttaagctccgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaa 26776261  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    | || ||||||||||| || || ||||  ||||| ||||| |  ||||| |||||  ||||| |||| || ||||| ||||| || | ||||||||||||    
T  26776262 aggaagacagctggctgactaagtatgcctcttcaccatgaatggtaacgagcttttcattccttacgaatttcaacttctgatgtaaggtagaggttac 26776361  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  26776362 cgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 26776425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Original strand, 24303070 - 24303432
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||  || || ||     
T  24303070 ggagaagccaagaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctatgcatccttc 24303169  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||    
T  24303170 aaagaagccattgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagaga 24303269  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||    
T  24303270 aagatgatagctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcac 24303369  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
     || || || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  24303370 cgctcccgcgtcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 24303432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Original strand, 22933342 - 22933694
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  22933342 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 22933441  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || |||||| |||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  22933442 ttgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctcaacagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 22933541  T
Q  214 ctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || ||||| |  |||||||| || || || ||     
T  22933542 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgtaaagtagaggtcaccgcccccgcg 22933641  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  22933642 tcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 22933694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Original strand, 23855787 - 23856139
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  23855787 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 23855886  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || |||||| |||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  23855887 ttgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctcaacagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 23855986  T
Q  214 ctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || ||||| |  |||||||| || || || ||     
T  23855987 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgtaaagtagaggtcaccgcccccgcg 23856086  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  23856087 tcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 23856139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Original strand, 15422779 - 15423131
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||  || || || ||||||||||    
T  15422779 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctatgcatccttcaaagaagcca 15422878  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | |||||||||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||    
T  15422879 ttgcagtcccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcctctatgcaagagaaagatgatag 15422978  T
Q  214 ctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||||||||  ||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || ||     
T  15422979 ctggctaaccaggtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgctcctgcg 15423078  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  15423079 tcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 15423131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 50 - 366
Target Start/End: Original strand, 27271078 - 27271394
Alignment:
Q  50 aacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaa 149  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| | || ||||||| |||||||| |||||||| ||||  |||  | ||||  ||||   ||||||||    
T  27271078 aacttgccccaaccggcagtctgaccttcctgaataaccctctgagcatcttttaatgaagccatggcagctccatccctcttaggctctacaccttcaa 27271177  T
Q  150 tagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgt 249  Q
    | ||||  ||  | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || |||| |||||| ||||||| |||    
T  27271178 tggtcaaaccctggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaggaagacagctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgt 27271277  T
Q  250 aacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataa 349  Q
     || || || |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| ||| || || ||     
T  27271278 gacgagttttccattcttcacaaactttaatttctgatgcaaggtggaggttaccgcgcccgcgtcatgtatccaaggccttcccaagaggcaactgtat 27271377  T
Q  350 gaagcattgatgtccat 366  Q
    |||||||| || |||||    
T  27271378 gaagcattaatatccat 27271394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 29503159 - 29502796
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||     
T  29503159 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttc 29503060  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||    
T  29503059 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagag 29502961  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    || || |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  29502960 aaggaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 29502861  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    | || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  29502860 ccgcacctgcatcgtgtatccatggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 29502796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 27020883 - 27020520
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  27020883 ggagaagccaagaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 27020784  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    ||||||||||| ||||| |||  | || | || |||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || |||||||||    
T  27020783 aaagaagccatggcagttccatccctccttaggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcctctatgcaagag 27020684  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| |    
T  27020683 aaagatgatagctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtca 27020584  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    |||| || || || |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  27020583 ctgctcccgcgtcgtgtatccatggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 27020520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27046132 - 27045769
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | || ||||||| |||||     
T  27046132 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccctctgagcatctttc 27046033  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | | ||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  27046032 aatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcatcttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaa 27045933  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    | || ||||||||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  27045932 aggaagacagctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 27045833  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  27045832 cgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 27045769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 260 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 20162179 - 20162073
Alignment:
Q  260 ccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattga 359  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20162179 ccattcttcacaaatttcaacttctggtgtagggtagaggttaccgcgccagcgtcatgtatccaaggtcttcccaggagacagctatacgaagcattga 20162080  T
Q  360 tgtccat 366  Q
    | |||||    
T  20162079 tatccat 20162073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 260 - 366
Target Start/End: Original strand, 22170652 - 22170758
Alignment:
Q  260 ccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattga 359  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22170652 ccattcttcacaaatttcaacttctggtgtagggtagaggttaccgcgccagcgtcatgtatccaaggtcttcccaggagacagctatacgaagcattga 22170751  T
Q  360 tgtccat 366  Q
    | |||||    
T  22170752 tatccat 22170758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 24865461 - 24865099
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| ||||||||||| |||  || || ||||| || ||  |||| || || ||     
T  24865461 ggagaagccaagaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccgacagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttc 24865362  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||  | ||||  ||||||| ||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||    
T  24865361 aaagaagccattgcagttccatccctcttaggctccgttccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagacccggcttctatgcaagaga 24865262  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||    
T  24865261 aagatgatagctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcac 24865162  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
     || || || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  24865161 cgctcccgcgtcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 24865099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Original strand, 13297413 - 13297765
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |||| |||| |||||||||||||||  || || |||||||| ||  |||| || || || ||||||||||    
T  13297413 agaccttccttatgcttgttctcgcgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttgaacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 13297512  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | | ||  ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| || || ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  13297513 tggcagttccatcccttttaggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcggaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 13297612  T
Q  214 ctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| |  || |  ||     
T  13297613 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcatcgctctcgcg 13297712  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  13297713 tcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaagaggcgttaatgtccat 13297765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 26920114 - 26919762
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  26920114 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 26920015  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  26920014 ttgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 26919915  T
Q  214 ctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||| |||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || ||     
T  26919914 ctgactaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccattttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcg 26919815  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    || |||||||||||| | |||| ||| || || ||||| ||||| || |||||    
T  26919814 tcgtgtatccatggtttccccaagaggcaactgtaagaggcattaatatccat 26919762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16751598 - 16751236
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| |||||  |||| || || ||     
T  16751598 ggagaagccaagaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacagctctctgtgcatccttc 16751499  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||  | ||||  | ||| ||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||    
T  16751498 aaagaagccatggcagttccatccctcttaggttccataccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcctctatgcaagaga 16751399  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||    
T  16751398 aagatgatagctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcac 16751299  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||| || || || |||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  16751298 tgctcccgcgtcgtgtatccacggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 16751236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Original strand, 27288822 - 27289184
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||  | ||||||||| || |||||||| || ||||| || ||  |||| || |||||     
T  27288822 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacggagctgtatcaccttgccccacccagcagtctgaccctcttggacggctctctgcgcatctttc 27288921  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||  |||  | | ||  |||| |||||||| | ||| |  ||| |||| || |||||||| ||||| ||  |||| ||||| ||||    
T  27288922 aaagaagccatggcagctccatcccttttaggctctgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggttccctctgcagaccctgcttctatgcaggaga 27289021  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| || ||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||    
T  27289022 aagatgatagttggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcac 27289121  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
     || || || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  27289122 cgcccccgcgtcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 27289184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 20162360 - 20162176
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||| ||  |||||||||| | |||||| | ||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| ||     
T  20162360 ggagaatctgagaccttcctttcgcttattctcacagagttggattaacttgccccagtcggcagcctgtccctcctgaacagccttctgggcgtccttc 20162261  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccat 188  Q
    ||||||||||| ||||  |||  ||||||| |||| | |||||| |||| ||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  20162260 aaagaagccattgcagctccaaccttcttgggctctgcaccttccatagacaacccttgaaaagcagttccctcagcagatccat 20162176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Original strand, 22170471 - 22170655
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||| ||  |||||||||| | |||||| | ||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| ||     
T  22170471 ggagaatctgagaccttcctttcgcttattctcacagagttggattaacttgccccagtcggcagcctgtccctcctgaacagccttctgggcgtccttc 22170570  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccat 188  Q
    ||||||||||| ||||  |||  ||||||| |||| | |||||| |||| ||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  22170571 aaagaagccattgcagctccaaccttcttgggctctgcaccttccatagacaacccttgaaaagcagttccctcagcagatccat 22170655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 367
Target Start/End: Original strand, 26114910 - 26115225
Alignment:
Q  52 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 150  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  26114910 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 26115008  T
Q  151 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 250  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||||||  ||||||| |||||||| || |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  26115009 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagatcctgcttcaatacaagagaaggaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 26115108  T
Q  251 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 350  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  26115109 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 26115208  T
Q  351 aagcattgatgtccatc 367  Q
    | ||||| |||||||||    
T  26115209 atgcattaatgtccatc 26115225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27009474 - 27009111
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||     
T  27009474 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcatcttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttc 27009375  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||    
T  27009374 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagag 27009276  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  27009275 aaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcataaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 27009176  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  27009175 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 27009111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 30556468 - 30556831
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || ||     
T  30556468 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttc 30556567  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || || || || |||||||| ||  ||||||| |||||     
T  30556568 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcggtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaa 30556666  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  30556667 aaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 30556766  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  30556767 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 30556831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4759508 - 4759145
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||     
T  4759508 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcatcttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttc 4759409  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  4759408 aatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaga 4759309  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    | || |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |  || || || ||    
T  4759308 aggaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaagtggaagtaac 4759209  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  4759208 cgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 4759145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27486825 - 27486510
Alignment:
Q  52 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 151  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  27486825 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 27486726  T
Q  152 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 251  Q
    ||||  ||| | || ||||| || || ||||||||  ||||||  ||||| ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  27486725 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcggcagatcctgcttcaacacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 27486626  T
Q  252 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  27486625 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagtaggcaactgtagga 27486526  T
Q  352 agcattgatgtccatc 367  Q
     ||||| |||||||||    
T  27486525 tgcattaatgtccatc 27486510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 28209150 - 28208835
Alignment:
Q  52 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 151  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  28209150 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 28209051  T
Q  152 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 251  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  ||||| ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  28209050 gtcaacccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 28208951  T
Q  252 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  28208950 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 28208851  T
Q  352 agcattgatgtccatc 367  Q
     ||||| |||||||||    
T  28208850 tgcattaatgtccatc 28208835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4527030 - 4526667
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| |||||     
T  4527030 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttc 4526931  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| |  |||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  ||||| |    
T  4526930 aatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcgccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaa 4526831  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |  || || || ||    
T  4526830 aagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaagtggaagtaac 4526731  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  4526730 cgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 4526667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 367
Target Start/End: Original strand, 4544236 - 4544590
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  4544236 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagcc 4544335  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||| || ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  ||||| ||||| |||    
T  4544336 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcgatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaaaagaagac 4544434  T
Q  212 agctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    | |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  4544435 aactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 4544534  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  4544535 catcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 4544590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 16942479 - 16942842
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||     
T  16942479 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttc 16942578  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  | |||   ||| | ||||||||  ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  16942579 aatgaagccatagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaacggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaa 16942678  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  16942679 aagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 16942778  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  16942779 cgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 16942842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 173 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 26990464 - 26990271
Alignment:
Q  173 ccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaa 272  Q
    ||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||    
T  26990464 ccctctgcagatcctgcctctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccaggtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaa 26990365  T
Q  273 acttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    | ||||| || |||||||  |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  26990364 atttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgctcccgcgtcatgtatccaaggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 26990271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 367
Target Start/End: Original strand, 4722634 - 4722949
Alignment:
Q  52 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 150  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||| ||    
T  4722634 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcgat 4722732  T
Q  151 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 250  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  ||||| ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  4722733 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 4722832  T
Q  251 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 350  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| || || || || |    
T  4722833 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtctccccagcaggcaactgtagg 4722932  T
Q  351 aagcattgatgtccatc 367  Q
    | ||||| |||||||||    
T  4722933 atgcattaatgtccatc 4722949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 29574757 - 29574394
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||     
T  29574757 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttc 29574658  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||     
T  29574657 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaa 29574559  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| ||||  ||||| || || ||||  ||||| || || | |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  29574558 aaagaagacaattggctgactaagtatgcctcttcaccgtgaattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 29574459  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  29574458 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 29574394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 258
Target Start/End: Original strand, 34913563 - 34913795
Alignment:
Q  26 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 125  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || |  ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  34913563 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgactctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccattgcagttccat 34913662  T
Q  126 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 225  Q
     | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  34913663 ccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaatcag 34913762  T
Q  226 atatgtttcttctccatggactgtaacaagctt 258  Q
     |||| ||| |||||||| |  |||||||||||    
T  34913763 gtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctt 34913795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 4774627 - 4774506
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||     
T  4774627 ggagaacccgagaccttctttatgcttgttctcacagagctgtatcatcttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttc 4774528  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccag 125  Q
    || ||||||||||||| |||||    
T  4774527 aatgaagccatagcagccccag 4774506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 8891930 - 8891998
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  8891930 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 8891998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 8903165 - 8903233
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  8903165 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 8903233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 28163234 - 28163166
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  28163234 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 28163166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 33373875 - 33373943
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  33373875 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 33373943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1697 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1697
Description:

Target: scaffold1697; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 949 - 1312
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| || || ||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||| | | |||||||| |||||     
T  949 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacgaagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctgaataactttctgagcatctttc 1048  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | ||| ||||  ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  1049 aatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccctcaaaggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaga 1148  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    | || ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| |||| ||| ||||||||    
T  1149 aggaagacagctggctgaccaaatatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaactttaacttctgatgcaaggtggaggttac 1248  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || || || |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  1249 cgcacccgcgtcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 1312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Original strand, 5746 - 6108
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| || ||||| | | |||||||||| |||||     
T  5746 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccctcttggataaccttctgagcatctttc 5845  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  5846 aatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaga 5945  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| | ||||||||| || ||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| ||||||||    
T  5946 aagaagtcagctggctgactaaatatgcttcttcaccatgaatggtaacaagttttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttac 6045  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
     || || ||||| |||||||||||||||||||| | ||| || || || ||||| ||||||||    
T  6046 cgcacccgcatcgtgtatccatggtcttcccagcaaacaactgtaggatgcattaatgtccat 6108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Original strand, 46134 - 46232
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46134 gagaccttctttgtgcttattctcacggagttgtattaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagc 46232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 32190 - 31838
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || |||||  |||| || || |||| ||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  32190 agaccttccttatgcttgctctcacgaagctgtattaacttgccccagccggcagcttgaccttcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 32091  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||  ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||    
T  32090 tggcagttccatccctcttaggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcctctatgcaagagaaagatgatag 31991  T
Q  214 ctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || ||     
T  31990 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcg 31891  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    || |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  31890 tcgtgtatccatggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatgtccat 31838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 31494 - 31142
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  31494 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 31395  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | | ||  ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  31394 tggcagttccatcccttttaggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 31295  T
Q  214 ctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| ||||||||||  |||||||| || || || ||     
T  31294 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttctggtgcaaagtagaggtcaccgcccccgcg 31195  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  31194 tcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 31142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Original strand, 45504 - 45841
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  45504 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 45603  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | |||||||||  | | ||  ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| || || ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  45604 ttgcagtcccatcccttttaggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcggaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 45703  T
Q  214 ctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||||||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || ||     
T  45704 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagcttcccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgctcccgcg 45803  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  45804 tcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 45841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 366
Target Start/End: Original strand, 38600 - 38940
Alignment:
Q  26 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 125  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  38600 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccattgcagttccat 38699  T
Q  126 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 225  Q
     | ||||  ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  38700 ccctcttaggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 38799  T
Q  226 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 325  Q
     |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || || ||||||||||||    
T  38800 gtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgctcccgcgtcatgtatccat 38899  T
Q  326 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 366  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  38900 ggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 38940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 11265 - 10950
Alignment:
Q  52 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 151  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  11265 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 11166  T
Q  152 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 251  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||||| ||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  11165 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaggaagacagctagctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 11066  T
Q  252 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || ||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  11065 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacccacatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 10966  T
Q  352 agcattgatgtccatc 367  Q
     ||||| |||||||||    
T  10965 tgcattaatgtccatc 10950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 29030 - 28693
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || | || |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  29030 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctatattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 28931  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  28930 ttgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 28831  T
Q  214 ctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||| ||| || || || ||     
T  28830 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtaggggtcaccgcccccgcg 28731  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  28730 tcatgtatccaaggtctccccaagagacagctgtaaga 28693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 7762 - 7399
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  || |||| || ||     
T  7762 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctccgagcatccttc 7663  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || || || || |||||||| ||  ||||||| |||||     
T  7662 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcggtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaa 7564  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  7563 aaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagctttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 7464  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  7463 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 7399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9648 - 9333
Alignment:
Q  52 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 151  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  9648 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 9549  T
Q  152 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 251  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  ||||| ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  9548 gtcaacccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 9449  T
Q  252 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  9448 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 9349  T
Q  352 agcattgatgtccatc 367  Q
     ||||| |||||||||    
T  9348 tgcattaatgtccatc 9333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 13439 - 13802
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || ||     
T  13439 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttc 13538  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagag 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||  | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||     
T  13539 aatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccctggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaa 13637  T
Q  203 aaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggtta 302  Q
    ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |    
T  13638 aaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaa 13737  T
Q  303 ctgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  13738 ccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 13802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 24710 - 25073
Alignment:
Q  4 ggagaagcagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtctttt 103  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||     
T  24710 ggagaacccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttc 24809  T
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    || ||||||||||||| |||||  | |||   ||| | ||||||||| ||||  ||| | || || || || |||||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  24810 aatgaagccatagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcggtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaa 24909  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    |||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  24910 aagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 25009  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 367  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  25010 cgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 25073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 22141 - 22073
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 81  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22141 gagaccctctttgtgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccggcagcttgtccttcttg 22073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 119574 - 119642
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 81  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  119574 gagaccctctttgtgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccggcagcttgtccttcttg 119642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 125
Target Start/End: Original strand, 7707 - 7819
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  7707 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 7806  T
Q  113 atagcagtcccag 125  Q
    ||||||| |||||    
T  7807 atagcagccccag 7819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 125
Target Start/End: Original strand, 21260 - 21372
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  21260 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 21359  T
Q  113 atagcagtcccag 125  Q
    ||||||| |||||    
T  21360 atagcagccccag 21372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27904 - 27711
Alignment:
Q  52 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 150  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||     
T  27904 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaac 27806  T
Q  151 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatgga 245  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||| ||||  ||||||| ||||| ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| |||||||    
T  27805 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcaaatcctgcttcaatacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatgga 27711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University