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 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10625_low_10 (Length: 395)

Name: NF10625_low_10
Description: NF10625
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10625_low_10
NF10625_low_10
[»] chr3 (36 HSPs)
chr3 (61-333)||(19868636-19868919)
chr3 (61-327)||(4250045-4250322)
chr3 (61-189)||(9157797-9157925)
chr3 (61-189)||(42354593-42354721)
chr3 (166-333)||(25491857-25492014)
chr3 (60-194)||(30158212-30158346)
chr3 (61-189)||(9154624-9154752)
chr3 (61-189)||(10963216-10963344)
chr3 (61-189)||(10966725-10966853)
chr3 (61-189)||(18883022-18883150)
chr3 (61-189)||(44508617-44508745)
chr3 (61-194)||(2783925-2784058)
chr3 (61-189)||(27054679-27054807)
chr3 (61-184)||(10959714-10959837)
chr3 (61-184)||(29233768-29233890)
chr3 (61-189)||(28327252-28327380)
chr3 (61-189)||(28330577-28330705)
chr3 (61-184)||(5887164-5887286)
chr3 (61-184)||(2279800-2279923)
chr3 (61-184)||(5897148-5897270)
chr3 (61-184)||(16314770-16314892)
chr3 (61-184)||(16414936-16415058)
chr3 (61-184)||(18495764-18495886)
chr3 (61-184)||(18515910-18516032)
chr3 (61-184)||(23374910-23375032)
chr3 (61-189)||(3305658-3305786)
chr3 (61-189)||(6173533-6173661)
chr3 (61-155)||(54736312-54736406)
chr3 (61-153)||(4226033-4226125)
chr3 (61-189)||(20536759-20536886)
chr3 (61-189)||(18551477-18551605)
chr3 (61-103)||(25888650-25888692)
chr3 (198-295)||(3305540-3305635)
chr3 (198-295)||(28327134-28327229)
chr3 (198-295)||(28330459-28330554)
chr3 (187-221)||(20536898-20536932)
[»] chr5 (20 HSPs)
chr5 (61-333)||(1810590-1810873)
chr5 (61-298)||(33920829-33921078)
chr5 (61-189)||(17944459-17944587)
chr5 (61-194)||(4732013-4732146)
chr5 (61-189)||(19685978-19686106)
chr5 (61-189)||(34652937-34653065)
chr5 (61-189)||(2500190-2500318)
chr5 (61-189)||(19689361-19689489)
chr5 (61-184)||(26337796-26337919)
chr5 (61-194)||(26547897-26548030)
chr5 (61-194)||(26551456-26551589)
chr5 (61-194)||(28562541-28562674)
chr5 (61-194)||(28566109-28566242)
chr5 (61-189)||(33321106-33321234)
chr5 (62-295)||(9690453-9690698)
chr5 (65-194)||(40800102-40800231)
chr5 (61-184)||(26726760-26726882)
chr5 (89-189)||(3194967-3195067)
chr5 (61-184)||(25185200-25185323)
chr5 (144-188)||(2453142-2453186)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (61-327)||(13251-13528)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (58-194)||(27863733-27863869)
chr8 (61-194)||(14187805-14187938)
chr8 (61-194)||(5964060-5964193)
chr8 (61-189)||(9466936-9467064)
chr8 (61-184)||(20262369-20262492)
chr8 (61-184)||(21048999-21049122)
chr8 (61-194)||(22654066-22654199)
chr8 (61-189)||(30645282-30645410)
chr8 (61-184)||(31981162-31981285)
chr8 (67-189)||(39660145-39660267)
chr8 (61-295)||(5827717-5827963)
chr8 (61-184)||(13331902-13332025)
chr8 (61-188)||(31984799-31984926)
chr8 (61-184)||(17013214-17013337)
chr8 (61-184)||(17543864-17543987)
chr8 (61-184)||(24434846-24434968)
chr8 (61-184)||(24903666-24903789)
chr8 (61-184)||(24444892-24445014)
chr8 (201-289)||(14627143-14627229)
chr8 (125-184)||(18696171-18696231)
[»] chr4 (19 HSPs)
chr4 (61-189)||(11702769-11702897)
chr4 (61-327)||(56089496-56089773)
chr4 (61-189)||(10247629-10247757)
chr4 (61-194)||(18859582-18859715)
chr4 (61-189)||(13978942-13979070)
chr4 (61-189)||(15850981-15851109)
chr4 (61-184)||(3719678-3719801)
chr4 (61-181)||(3734131-3734250)
chr4 (61-184)||(14701719-14701842)
chr4 (61-184)||(49639998-49640120)
chr4 (61-189)||(26703673-26703801)
chr4 (61-181)||(49636705-49636824)
chr4 (61-188)||(10385760-10385881)
chr4 (99-327)||(19928563-19928802)
chr4 (86-189)||(33400539-33400642)
chr4 (107-194)||(17670221-17670308)
chr4 (58-189)||(23653089-23653223)
chr4 (198-295)||(13978824-13978919)
chr4 (61-219)||(11560578-11560750)
[»] chr2 (17 HSPs)
chr2 (61-188)||(1503615-1503742)
chr2 (61-188)||(1506819-1506946)
chr2 (61-193)||(18011755-18011887)
chr2 (61-194)||(13518108-13518241)
chr2 (61-189)||(30719583-30719711)
chr2 (61-189)||(38326453-38326581)
chr2 (61-194)||(11059603-11059736)
chr2 (61-189)||(4577661-4577788)
chr2 (61-189)||(38316229-38316357)
chr2 (61-189)||(40677954-40678082)
chr2 (61-184)||(15704152-15704275)
chr2 (61-184)||(18938709-18938831)
chr2 (61-184)||(22592328-22592451)
chr2 (61-184)||(29435564-29435687)
chr2 (93-189)||(38326178-38326274)
chr2 (125-184)||(15719470-15719529)
chr2 (198-295)||(40678105-40678200)
[»] scaffold0401 (1 HSPs)
scaffold0401 (62-327)||(3918-4194)
[»] scaffold0214 (3 HSPs)
scaffold0214 (64-189)||(19864-19989)
scaffold0214 (61-189)||(13415-13543)
scaffold0214 (61-189)||(27431-27559)
[»] chr7 (25 HSPs)
chr7 (61-194)||(20100447-20100580)
chr7 (61-194)||(22257061-22257194)
chr7 (61-189)||(22083625-22083752)
chr7 (61-327)||(3541350-3541625)
chr7 (61-194)||(22232809-22232942)
chr7 (61-194)||(22253797-22253930)
chr7 (61-192)||(748223-748354)
chr7 (61-184)||(26152964-26153087)
chr7 (61-194)||(8397648-8397781)
chr7 (61-194)||(5826890-5827023)
chr7 (61-189)||(6964095-6964223)
chr7 (61-189)||(38431201-38431329)
chr7 (61-189)||(44017974-44018102)
chr7 (61-184)||(23598945-23599067)
chr7 (61-184)||(26460280-26460402)
chr7 (61-184)||(710199-710322)
chr7 (61-184)||(2251685-2251807)
chr7 (61-184)||(12803447-12803569)
chr7 (61-184)||(26182116-26182238)
chr7 (61-189)||(43549001-43549129)
chr7 (61-184)||(11825537-11825660)
chr7 (106-194)||(2349276-2349364)
chr7 (97-187)||(23467349-23467440)
chr7 (198-295)||(44018125-44018220)
chr7 (245-295)||(17601382-17601432)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (61-194)||(14969471-14969604)
chr6 (61-295)||(12746496-12746742)
chr6 (58-189)||(34502151-34502282)
chr6 (61-327)||(35027315-35027592)
chr6 (61-189)||(31262579-31262707)
chr6 (61-184)||(13095880-13096003)
chr6 (61-189)||(9313967-9314095)
chr6 (61-189)||(5618491-5618618)
chr6 (61-185)||(28117652-28117776)
chr6 (61-189)||(28894663-28894791)
chr6 (61-189)||(2330438-2330566)
chr6 (61-184)||(11410578-11410701)
chr6 (61-184)||(17231669-17231792)
chr6 (61-184)||(22920343-22920465)
chr6 (65-189)||(33679375-33679498)
chr6 (61-189)||(2331090-2331218)
chr6 (61-189)||(17696397-17696526)
chr6 (61-153)||(15579097-15579189)
chr6 (61-122)||(5618396-5618457)
chr6 (132-194)||(3827069-3827131)
chr6 (62-114)||(11296321-11296373)
chr6 (86-189)||(31123238-31123341)
chr6 (94-128)||(3827018-3827052)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (61-189)||(7046-7174)
[»] chr1 (19 HSPs)
chr1 (61-194)||(37641671-37641804)
chr1 (61-184)||(28918188-28918311)
chr1 (61-189)||(3087907-3088035)
chr1 (61-184)||(17902969-17903092)
chr1 (61-184)||(24200426-24200548)
chr1 (61-189)||(18392201-18392329)
chr1 (61-189)||(33898134-33898262)
chr1 (61-189)||(34552866-34552994)
chr1 (61-184)||(16839115-16839237)
chr1 (61-184)||(16849045-16849167)
chr1 (61-184)||(20981173-20981296)
chr1 (61-189)||(23441466-23441594)
chr1 (61-184)||(49719667-49719791)
chr1 (65-184)||(20964270-20964389)
chr1 (61-184)||(49716184-49716309)
chr1 (61-189)||(6195626-6195754)
chr1 (61-149)||(50197142-50197230)
chr1 (198-295)||(23441617-23441712)
chr1 (198-295)||(33898016-33898111)
[»] scaffold0911 (2 HSPs)
scaffold0911 (61-189)||(4371-4499)
scaffold0911 (198-295)||(4255-4350)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (61-327)||(52778-53055)
scaffold0083 (61-327)||(28981-29258)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (61-184)||(27061-27184)
[»] scaffold0067 (1 HSPs)
scaffold0067 (61-184)||(27176-27298)
[»] scaffold0062 (2 HSPs)
scaffold0062 (61-184)||(53064-53187)
scaffold0062 (125-184)||(68027-68086)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (61-188)||(227157-227284)
[»] scaffold1048 (1 HSPs)
scaffold1048 (61-184)||(1216-1338)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (61-184)||(28842-28965)
[»] scaffold0360 (2 HSPs)
scaffold0360 (61-148)||(2298-2385)
scaffold0360 (61-160)||(6123-6222)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (68-166)||(2022-2120)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (198-327)||(20018-20144)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 36)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 61 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19868919 - 19868636
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19868919 tatctctaggttcctatgttgaattaaacataattactatttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 19868820  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat---------------gaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaaga 245  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||   || ||    
T  19868819 gaagaagctagggttaatagtcatgcaaagcaatcatatgaaaagcaacaaacacaaataattctgaataaagactaggattccattgaatt---aagga 19868723  T
Q  246 gagttcaaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatgactctgattaatctaagagcttaactactcatgttcat 333  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  19868722 gagtttaaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatgactc-gattaatctaggagcttagctactcatgttcat 19868636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 61 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 4250322 - 4250045
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4250322 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaagattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 4250223  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgc--------------aaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagag 246  Q
     |||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  |   ||||||    
T  4250222 aaagaagttagggttaatagtcatgcaaacaatcatacgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagactaggttttcattga--tgtcaaagag 4250125  T
Q  247 agttc-aaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatgactctgattaatctaagagcttaactactcat 327  Q
    ||| |  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| ||| ||||||||    
T  4250124 agtacttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatgact-taatcaatctaagagtttagctactcat 4250045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 9157925 - 9157797
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9157925 tatctctaggttcctatgttgaattaaatagaattactatttcatgattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 9157826  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9157825 caagaagttagggttactagtcatgcaaa 9157797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Original strand, 42354593 - 42354721
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42354593 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 42354692  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42354693 caagaagctagggttaatagtcatgcaaa 42354721  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 166 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 25492014 - 25491857
Alignment:
Q  166 agttagggttaatagtcatgcaaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttcaaacaaattacatg 265  Q
    |||||||||||||||||||      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  25492014 agttagggttaatagtcat------caatgaacacaaataattttgaataaagactaggattccgttgaattaaata---gagttcaaacaaattacatg 25491924  T
Q  266 gttcatagatcacaatagattcatctcatgactctgattaatctaagagcttaactactcatgttcat 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25491923 gttcatagatcacaatagattcatctcatggctc-gattaatctaagagcttagctactcatgttcat 25491857  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 60 - 194
Target Start/End: Original strand, 30158212 - 30158346
Alignment:
Q  60 atatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaatt 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  30158212 atatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcataatatcaattcatgtaatt 30158311  T
Q  160 gcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 194  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  30158312 gcacgaagctagggttaatagtcatacaaagcaat 30158346  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 9154752 - 9154624
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9154752 tatctctaggttcctatgttgaattaaatataattactatttcatgattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 9154653  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  9154652 caagaagttaggattactagtcatgcaaa 9154624  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10963344 - 10963216
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  10963344 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 10963245  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
    || |||| |||||||||||||||| ||||    
T  10963244 cacgaagctagggttaatagtcatacaaa 10963216  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10966853 - 10966725
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  10966853 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 10966754  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
    || |||| |||||||||||||||| ||||    
T  10966753 cacgaagctagggttaatagtcatacaaa 10966725  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18883150 - 18883022
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18883150 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcatttaatccctaagatcaatttatgtgattg 18883051  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18883050 taagaagctagggttaatagtcatgcaaa 18883022  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 44508745 - 44508617
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  44508745 tatctctaggttcctgtgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctcgggttagtagtcattcaattcttaagatcaatttatgtgattg 44508646  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44508645 caagaagctagggttaatagtcatgcaaa 44508617  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 2784058 - 2783925
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  2784058 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatatcaggattaaaagctagtgttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtagttg 2783959  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 194  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  2783958 cacgaagctagggttaatagtcatacaaagcaat 2783925  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 27054807 - 27054679
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  27054807 tatctctaggttcctatattgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcatttaattcctaagatcaatttatgtgattg 27054708  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  27054707 aaagaagttagggttagtagtcatacaaa 27054679  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 10959837 - 10959714
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  10959837 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcagaattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 10959738  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    || |||| ||||||| ||||||||    
T  10959737 cacgaagctagggttgatagtcat 10959714  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Original strand, 29233768 - 29233890
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  29233768 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 29233866  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  29233867 caagaagctagggttaatagtcat 29233890  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 28327380 - 28327252
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  28327380 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctagcatcaatttatgtgattg 28327281  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
     |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  28327280 aaagaagctagggttagtagtcatacaaa 28327252  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 28330705 - 28330577
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  28330705 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctagcatcaatttatgtgattg 28330606  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
     |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  28330605 aaagaagctagggttagtagtcatacaaa 28330577  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Original strand, 5887164 - 5887286
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  5887164 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaagagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 5887262  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  5887263 caagaagctagggttaatagtcat 5887286  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Original strand, 2279800 - 2279923
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  2279800 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaaaattactaattcaggattaaaagttagggttagtagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattt 2279899  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||| || |||||||||||||    
T  2279900 caagaagctaaggttaatagtcat 2279923  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Original strand, 5897148 - 5897270
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  5897148 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaagagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 5897246  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
     |||||| ||||||||||||||||    
T  5897247 taagaagctagggttaatagtcat 5897270  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Original strand, 16314770 - 16314892
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  16314770 tatctctaggttcctatgttgaatcgaacagaattactaattcaggattaaaatctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 16314868  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  16314869 caagaagctagggttaatagtcat 16314892  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Original strand, 16414936 - 16415058
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| || |||||     
T  16414936 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaagattaaaagctagggttaatagtcatttaattcataatatcaattcatataatt- 16415034  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  16415035 caagaagctagggttaatagtcat 16415058  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Original strand, 18495764 - 18495886
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  18495764 tatctctaggttcctatgttgaatcgaacagaattactaattcaggattaaaatctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 18495862  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  18495863 caagaagctagggttaatagtcat 18495886  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Original strand, 18515910 - 18516032
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| || |||||     
T  18515910 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaagattaaaagctagggttaatagtcatttaattcataatatcaattcatataatt- 18516008  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  18516009 caagaagctagggttaatagtcat 18516032  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Original strand, 23374910 - 23375032
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  23374910 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagatagggttaaaagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 23375008  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  23375009 caagaagctagggttaatagtcat 23375032  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 3305786 - 3305658
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||| |||  |||||||||||| ||||    
T  3305786 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcattattaaaagttagggttagtagtcattcaatttctattatcaatttatgtgattg 3305687  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
     |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  3305686 aaagaagctagggttagtagtcatacaaa 3305658  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Original strand, 6173533 - 6173661
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  6173533 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacatgattactaattcaggattaaaatctagggttagtggtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattt 6173632  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6173633 caagaagctagggttaatagtcatacaaa 6173661  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 155
Target Start/End: Original strand, 54736312 - 54736406
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgt 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  54736312 tatctctaggttcctatattgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctaggattagtagcgattcaattcttaagatcaatttatgt 54736406  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 61 - 153
Target Start/End: Original strand, 4226033 - 4226125
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||    
T  4226033 tatctctaggttcctatgttgaattaaacaaaattactatttcaggattaaaagctagggttagcaatcattcaatttctaagatcaatttat 4226125  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Original strand, 20536759 - 20536886
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||| ||| |||||  | | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||| || | ||||    
T  20536759 tatctctagtttcatatgtaaagttaaacagaattactatttcaggattaaaagatagggttaatagtcaattaattcctaagatcaattaatatgattg 20536858  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20536859 -aagaagttagggttaatagtcatacaaa 20536886  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18551605 - 18551477
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||| ||| |||||  | ||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||| |||| | | || |||||||||||||| ||  |||||    
T  18551605 tatctctagtttcatatgtaaagtcaaacagaatcactatttcaggtttaatagctagggttagtagtcaattaactcctaagatcaattaatacaattg 18551506  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
     |||||| |||||||| ||| ||| ||||    
T  18551505 aaagaagctagggttagtagccatacaaa 18551477  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 103
Target Start/End: Original strand, 25888650 - 25888692
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25888650 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttc 25888692  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3305635 - 3305540
Alignment:
Q  198 cacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttca-aacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 295  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  | |||  ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  3305635 cacaaataattctgaataaagactaggttttcattgatgtcaaa--gagagttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatg 3305540  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 28327229 - 28327134
Alignment:
Q  198 cacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttca-aacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 295  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  | |||  ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  28327229 cacaaataattctgaataaagactaggttttcattgatgtcaaa--gagagttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatg 28327134  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 28330554 - 28330459
Alignment:
Q  198 cacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttca-aacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 295  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  | |||  ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  28330554 cacaaataattctgaataaagactaggttttcattgatgtcaaa--gagagttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatg 28330459  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 221
Target Start/End: Original strand, 20536898 - 20536932
Alignment:
Q  187 aaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagact 221  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20536898 aaagcaatgaacacaaataattttgaataaagact 20536932  T

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Target: chr5 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 20)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 61 - 333
Target Start/End: Original strand, 1810590 - 1810873
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1810590 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattacaatttcaggattaaaagttagggttaatagtcattcaatttctaagatcaatttatgtaattg 1810689  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgc---------------aaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaaga 245  Q
     |||||||||||||||||||||||||               ||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||   |||||    
T  1810690 taagaagttagggttaatagtcatgcaaaacaatcatatgaaaaacaatgaacacaaataattctcaataaagactaggaatccattgaatt---aaaga 1810786  T
Q  246 gagttcaaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatgactctgattaatctaagagcttaactactcatgttcat 333  Q
    || |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  1810787 gacttcaaacaaatttcatgattcatagatcataatagattcatctcatgactc-gattaatctaggagcttaactactcatattcat 1810873  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 61 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 33921078 - 33920829
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33921078 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 33920979  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgc--------------aaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagag 246  Q
     |||||| ||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  |   ||||||    
T  33920978 aaagaagctagggttaatagtcatgcaaacaatcatacgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagactaggttttcattga--tgtcaaagag 33920881  T
Q  247 agttc-aaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatgact 298  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  33920880 agttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatgact 33920829  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 17944587 - 17944459
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17944587 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 17944488  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17944487 caagaagctagggttaatagtcatgcaaa 17944459  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 61 - 194
Target Start/End: Original strand, 4732013 - 4732146
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4732013 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacatgattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtcatccaattcctaatatcaattcatgtaattg 4732112  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 194  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  4732113 caagaagctagggttaatagtcatacaaagcaat 4732146  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19686106 - 19685978
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19686106 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttattagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 19686007  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19686006 taagaagctagggttaatagtcatgcaaa 19685978  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Original strand, 34652937 - 34653065
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34652937 tatctctaggttcctatgttgaattaaacaaaattattatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 34653036  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34653037 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 34653065  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Original strand, 2500190 - 2500318
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2500190 tatcactaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 2500289  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  2500290 aaagaagttagggttagtagtcatacaaa 2500318  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19689489 - 19689361
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19689489 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagttagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 19689390  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19689389 taagaagctagggttaatagtcatgcaaa 19689361  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 26337919 - 26337796
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26337919 tatctctaggttcttatgttgaattaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 26337820  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
     |||||  ||||||||||||||||    
T  26337819 aaagaaactagggttaatagtcat 26337796  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 26548030 - 26547897
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26548030 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatatcaggattaaaagctagtgttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 26547931  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 194  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  26547930 cacgaagctagggttaatagtcatacaaaacaat 26547897  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 26551589 - 26551456
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26551589 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatatcaggattaaaagctagtgttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 26551490  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 194  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  26551489 cacgaagctagggttaatagtcatacaaaacaat 26551456  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 194
Target Start/End: Original strand, 28562541 - 28562674
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  28562541 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatatcaggattaaaagctagtgttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtagttg 28562640  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 194  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  28562641 cacgaagctagggttaatagtcatacaaagcaat 28562674  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 194
Target Start/End: Original strand, 28566109 - 28566242
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  28566109 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatatcaggattaaaagctagtgttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtagttg 28566208  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 194  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  28566209 cacgaagctagggttaatagtcatacaaagcaat 28566242  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Original strand, 33321106 - 33321234
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33321106 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagttagggctagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 33321205  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  33321206 aaagaagttagggttagtagtcatacaaa 33321234  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 62 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 9690698 - 9690453
Alignment:
Q  62 atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  9690698 atctctaggttcctatgttgaattaaacataattactatttcaggattaaaaactagggttagtagtcgttcaattcctaagatcaatttatgtgattga 9690599  T
Q  162 aagaagttagggttaatagtcatgc--------------aaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagaga 247  Q
    || ||| ||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  |   |||||||    
T  9690598 aataagctagggttaatagtcatgcaaacaatcgtacgaaaagcaatgaacacaaataattatgaataaagactaggttttcattga--tgtcaaagaga 9690501  T
Q  248 gttc-aaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 295  Q
    ||||  ||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  9690500 gttcgtaacaaattatatggttcacaaatcacaa-agattcatctcatg 9690453  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 65 - 194
Target Start/End: Original strand, 40800102 - 40800231
Alignment:
Q  65 tctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  40800102 tctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaaggtagtgttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcacg 40800201  T
Q  165 aagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 194  Q
    ||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  40800202 aagctagggttaatagtcatacaaaacaat 40800231  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 26726882 - 26726760
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  26726882 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagatttactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 26726784  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||| || |||||||||||||    
T  26726783 caagaagctatggttaatagtcat 26726760  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 89 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 3195067 - 3194967
Alignment:
Q  89 cagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaa 188  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3195067 cagaattattatttcaggattaaaagctaaggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaa 3194968  T
Q  189 a 189  Q
    |    
T  3194967 a 3194967  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 25185323 - 25185200
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||  || ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25185323 tatctctaggttcctatgatgaattaaacagagctagtattttaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaaaatcaatttatgtgattg 25185224  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||| |||||||| |||||||    
T  25185223 caagaagctagggttattagtcat 25185200  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 2453186 - 2453142
Alignment:
Q  144 atcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaa 188  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2453186 atcaatttatgtggttgcaagaagttagggttaatagtcatgcaa 2453142  T

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Target: scaffold0043 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 61 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 13528 - 13251
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13528 tatctctaggttcctatgttgaattaaatagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcatttaattcctaagatcaatttatgtgattg 13429  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgc--------------aaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagag 246  Q
     |||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  |   ||||||    
T  13428 aaagaagttagggttaatagtcatgcaaacaattatacaaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagactaggttttcattga--tgtcaaagag 13331  T
Q  247 agttc-aaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatgactctgattaatctaagagcttaactactcat 327  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || | || |||||||||| ||| ||||||||    
T  13330 agttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatggct-taatcaatctaagagtttagctactcat 13251  T

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Target: chr8 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 58 - 194
Target Start/End: Original strand, 27863733 - 27863869
Alignment:
Q  58 tcatatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaa 157  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27863733 tcatatccctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcaggattaaaagttagggttaatagtcattcaattcctaagatcaattcatgtaa 27863832  T
Q  158 ttgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 194  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  27863833 ttgcaagaagctagggttaatagtcatacaaaacaat 27863869  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 61 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14187938 - 14187805
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  14187938 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactacttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 14187839  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 194  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  14187838 caagaagttagggtttatagtcatacaaagcaat 14187805  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 61 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 5964193 - 5964060
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5964193 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagtgttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 5964094  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 194  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5964093 cacgaagctagggttaatagtcatacaaagcaat 5964060  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 9467064 - 9466936
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9467064 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 9466965  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9466964 aaagaagttagggttagtagtcatacaaa 9466936  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 20262492 - 20262369
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  20262492 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttctggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattt 20262393  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20262392 caagaagttagggttaatagtcat 20262369  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 21049122 - 21048999
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  21049122 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttctggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattt 21049023  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  21049022 caagaagttagggttaatagtcat 21048999  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22654199 - 22654066
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22654199 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaagattactatttcaggattaaaagttggggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 22654100  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 194  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  22654099 caagaagctagggttaatagtcatacaaagcaat 22654066  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 30645410 - 30645282
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30645410 tatctctaggttcttatgttgaattaaacagaattactatttcaaaattaaaagttagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 30645311  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30645310 taagaagttagggttaatagtcatgcaaa 30645282  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 31981285 - 31981162
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  31981285 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaatatcaatttatgtgattg 31981186  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
     |||||| || |||||||||||||    
T  31981185 taagaagctatggttaatagtcat 31981162  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 189
Target Start/End: Original strand, 39660145 - 39660267
Alignment:
Q  67 taggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaa 166  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  39660145 taggttcctatgttgaattaaacaaaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaa 39660244  T
Q  167 gttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
    |||||||||| ||||||| ||||    
T  39660245 gttagggttagtagtcatacaaa 39660267  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5827963 - 5827717
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  5827963 tatctcgaggttcctatgttgaattaaacagaattactctttcagaattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagattaatttatgtgattg 5827864  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgc--------------aaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagag 246  Q
     |||||| ||||||||||||||| ||              |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || | ||||  |  |||||||    
T  5827863 aaagaagctagggttaatagtcaagcaaacaatcataagaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagactaggttttctttga--tgtaaaagag 5827766  T
Q  247 agttc-aaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 295  Q
    | |||  |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  5827765 aattcttaacaaactacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatg 5827717  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13332025 - 13331902
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13332025 tatctctaggttcctatgatgaattaaacagaattactatttcagaattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 13331926  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
     |||||| |||||||| |||||||    
T  13331925 aaagaagctagggttagtagtcat 13331902  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 31984926 - 31984799
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31984926 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattattatttcaggattaaaagctatgattagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 31984827  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaa 188  Q
     |||||| || |||||||||||||||||    
T  31984826 taagaagctatggttaatagtcatgcaa 31984799  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Original strand, 17013214 - 17013337
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| || ||| |     
T  17013214 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcataatatcaattcatataaatt 17013313  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||    
T  17013314 caataagctagggttaatagtcat 17013337  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17543987 - 17543864
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| || ||| |     
T  17543987 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcataatatcaattcatataaatt 17543888  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||    
T  17543887 caataagctagggttaatagtcat 17543864  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 24434968 - 24434846
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  24434968 tatctctaggttcctatgttgaaccaaacagaattattaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 24434870  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  24434869 caagaagctagggttaatagtcat 24434846  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Original strand, 24903666 - 24903789
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || ||| |     
T  24903666 tatctctagcttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaatatcaattcatataaatt 24903765  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  24903766 caagaagctagggttaatagtcat 24903789  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 24445014 - 24444892
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  24445014 tatctctaggttcctatgttgaaccaaacagaattattaattcaggattaaaagctaggattaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 24444916  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  24444915 caagaagctagggttaatagtcat 24444892  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 14627229 - 14627143
Alignment:
Q  201 aaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttcaaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcat 289  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| ||||| |||  ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  14627229 aaataattatgaataatgactaggtttccaatga--tatcaaagggagttcaaacaaattacatggttcacagattacaatagattcat 14627143  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 184
Target Start/End: Original strand, 18696171 - 18696231
Alignment:
Q  125 tagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaa-gaagttagggttaatagtcat 184  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  18696171 tagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaatttcaaggaagttagggttaatagtcat 18696231  T

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Target: chr4 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 19)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Original strand, 11702769 - 11702897
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11702769 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 11702868  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11702869 caagaagctagggttaatagtcatgcaaa 11702897  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 61 - 327
Target Start/End: Original strand, 56089496 - 56089773
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  56089496 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaagattaaaagctagggttagtggtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 56089595  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgc--------------aaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagag 246  Q
     |||||| ||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  |   ||||||    
T  56089596 aaagaagctagggttaatagtcatgcaaacaatcatacgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagactaggttttcattga--tgtcaaagag 56089693  T
Q  247 agttc-aaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatgactctgattaatctaagagcttaactactcat 327  Q
    |||||  ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| || | || |||||||||| ||| ||||||||    
T  56089694 agttcttaacaaattacatgattcacagatcacaa-agattcatttcatggct-taatcaatctaagagtttagctactcat 56089773  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10247757 - 10247629
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10247757 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattattatttcaggattaaaagttagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 10247658  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247657 taagaagttagggttaatagtcatgcaaa 10247629  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18859715 - 18859582
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  18859715 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagtgttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 18859616  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 194  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  18859615 cacgaagctagggttaatagtcatacaaatcaat 18859582  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 13979070 - 13978942
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13979070 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtggtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 13978971  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
     |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  13978970 aaagaagctagggttagtagtcatacaaa 13978942  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15851109 - 15850981
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15851109 tatcactaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagataaatttatgtgattg 15851010  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15851009 aaagaagttagggttattagtcatacaaa 15850981  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Original strand, 3719678 - 3719801
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||| |     
T  3719678 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataaatt 3719777  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  3719778 caagaagctagggttaatagtcat 3719801  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 3734250 - 3734131
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  3734250 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 3734152  T
Q  161 caagaagttagggttaatagt 181  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  3734151 caagaagctagggttaatagt 3734131  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 14701842 - 14701719
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || ||| |     
T  14701842 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaatatcaattcatataaatt 14701743  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  14701742 caagaagctagggttaatagtcat 14701719  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Original strand, 49639998 - 49640120
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  49639998 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaagagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 49640096  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  49640097 caagaagctagggttaatagtcat 49640120  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Original strand, 26703673 - 26703801
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  26703673 tatctctaggttcctatgttgaattaaacataattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatatgattg 26703772  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
     |||||| ||| |||| ||||||| ||||    
T  26703773 aaagaagctagagttagtagtcatacaaa 26703801  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 61 - 181
Target Start/End: Original strand, 49636705 - 49636824
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  49636705 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaagagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 49636803  T
Q  161 caagaagttagggttaatagt 181  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  49636804 caagaagctagggttaatagt 49636824  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 10385881 - 10385760
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||      |||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10385881 tatctctaggttcctatgttgaattaaa------tactatatcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 10385788  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaa 188  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10385787 caagaagctagggttaatagtcatgcaa 10385760  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 99 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 19928802 - 19928563
Alignment:
Q  99 atttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat-------------- 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||                  
T  19928802 atttcatgattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagctagggttagtagtcatacaaacaatcagaa 19928703  T
Q  185 gcaaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttc-aaacaaattacatggttcatagatcacaatag 283  Q
    | |||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  |   |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  19928702 gaaaagcattaagcacaaataattctgaataaagactaggttttcattga--tgtcaaagagagttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-ag 19928606  T
Q  284 attcatctcatgactctgattaatctaagagcttaactactcat 327  Q
    ||||||||||| ||| | || |||||||||| ||| ||||||||    
T  19928605 attcatctcattact-taatcaatctaagagtttagctactcat 19928563  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 189
Target Start/End: Original strand, 33400539 - 33400642
Alignment:
Q  86 aaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatg 185  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  33400539 aaacaaaattactatttcagaattaaaagttagggttagtagtcattcaattactaagatcaatttatgtgattgcaagaagctagggttaatagtcaag 33400638  T
Q  186 caaa 189  Q
    ||||    
T  33400639 caaa 33400642  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 17670308 - 17670221
Alignment:
Q  107 attaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 194  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  17670308 attaaaaggtagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcacgaagctagggttaatagtcatacaaaacaat 17670221  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23653223 - 23653089
Alignment:
Q  58 tcatatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagt-aatt--caattcctaagatcaatttatg 154  Q
    |||||||||||| ||| |||||  | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||   ||| ||| ||||||||| |      
T  23653223 tcatatctctagtttcatatgtaaagttaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcaattaataatacctgagatcaattaaca 23653124  T
Q  155 taattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23653123 tgattgaaagaagttaggtttaatagtcatgcaaa 23653089  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 13978919 - 13978824
Alignment:
Q  198 cacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttca-aacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 295  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  | |||  ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  13978919 cacaaataattctgaataaagactaggttttcattgatgtcaaa--gagagttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatg 13978824  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11560750 - 11560578
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||| ||| |||||  | | ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||| | | ||| |||||| |||||| |  | | |     
T  11560750 tatctctagtttcatatgtaaagttaaacataattactattttaggattaaaagatagggttactagtcaattaatacctaaggtcaattaacatgacta 11560651  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa--------------gcaatgaacacaaataatcttgaataaaga 219  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11560650 aaagaagttagggttaatagtcatgcaaacaatcataataaaagcaatgaacacaaataattttgaataaaga 11560578  T

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Target: chr2 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 17)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Original strand, 1503615 - 1503742
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1503615 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 1503714  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaa 188  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1503715 caagaagctagggttaatagtcatgcaa 1503742  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Original strand, 1506819 - 1506946
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1506819 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 1506918  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaa 188  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1506919 caagaagctagggttaatagtcatgcaa 1506946  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 61 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18011887 - 18011755
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  18011887 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagttagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 18011788  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaa 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  18011787 caagaagctagggttaatagtcatacaaagcaa 18011755  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 61 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 13518241 - 13518108
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  13518241 tatctctaggttcttatgttgaatcaaacaggattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 13518142  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 194  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  13518141 cacgaagctagggttaatagtcatacaaatcaat 13518108  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 30719711 - 30719583
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30719711 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactattttaggattaaaagttagagttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 30719612  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30719611 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 30719583  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Original strand, 38326453 - 38326581
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38326453 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattattatttcaggattaaaagctagggttggtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 38326552  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38326553 caagaagctagggttaatagtcatgcaaa 38326581  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 11059736 - 11059603
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  11059736 tatctctaggttcttatgttgaatcaaacaggattactatttcatgattaaaagttagtgttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 11059637  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 194  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  11059636 cacgaagctagggttaatagtcatacaaagcaat 11059603  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4577788 - 4577661
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4577788 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagg-ttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 4577690  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||    
T  4577689 taagaagatagggttaatagtcatgcaaa 4577661  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Original strand, 38316229 - 38316357
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38316229 tatctctaagttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 38316328  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
     |||||| || ||||| ||||||| ||||    
T  38316329 aaagaagctacggttagtagtcatacaaa 38316357  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Original strand, 40677954 - 40678082
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  40677954 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctagcatcaatttatgtgattg 40678053  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
     |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  40678054 aaagaagctagggttagtagtcatacaaa 40678082  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Original strand, 15704152 - 15704275
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  15704152 tatctctaggttcccatattgaatcaaacactattactatttcaagattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattt 15704251  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  15704252 caggaagttagggttaatagtcat 15704275  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 18938831 - 18938709
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  18938831 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaagagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 18938733  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  18938732 caagaagctagggttaatagtcat 18938709  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22592451 - 22592328
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||| |     
T  22592451 tatctctaagttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcatgattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatctcaattcatataaatt 22592352  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  22592351 caagaagctagggttaatagtcat 22592328  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 29435687 - 29435564
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  29435687 tatctctaggttcctatgttgaaacaaacaggattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcaatcaattcctaatatcaattcatgtaattt 29435588  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  29435587 caagaagctagggttaatagtcat 29435564  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 38326274 - 38326178
Alignment:
Q  93 attactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38326274 attattatttcaggattaaaagctagggttggtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgcaagaagctagggttaatagtcatgcaaa 38326178  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 184
Target Start/End: Original strand, 15719470 - 15719529
Alignment:
Q  125 tagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15719470 tagtcattcaactcctaatatcaattcatgtgatttcaagaagttagggttaatagtcat 15719529  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 295
Target Start/End: Original strand, 40678105 - 40678200
Alignment:
Q  198 cacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttca-aacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 295  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  | |||  ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  40678105 cacaaataattctgaataaagactaggttttcattgatgtcaaa--gagagttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatg 40678200  T

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Target: scaffold0401 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0401
Description:

Target: scaffold0401; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 62 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 4194 - 3918
Alignment:
Q  62 atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  4194 atctctaggttcctatgttgaatgaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattga 4095  T
Q  162 aagaagttagggttaatagtcatgc--------------aaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagaga 247  Q
    |||||| ||||||||||||||||||              ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  |   |||||||    
T  4094 aagaagctagggttaatagtcatgcaaccaatcatacgaaaaccaatgaacacaaataattctgaataaagactaggttttcattga--tgtcaaagaga 3997  T
Q  248 gttc-aaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatgactctgattaatctaagagcttaactactcat 327  Q
    ||||  |||||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||||| || | ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  3996 gttcttaacaaattacatggtttacatatcacaa-agattcttctcatggct-taattaatctaagagtttagctactcat 3918  T

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Target: scaffold0214 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0214
Description:

Target: scaffold0214; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 64 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19989 - 19864
Alignment:
Q  64 ctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaa 163  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  19989 ctctaggttcctatgttgaattaaacataattactatttcatgattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgtaa 19890  T
Q  164 gaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  19889 gaagttagggttaatagtcatgcaaa 19864  T

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Target: scaffold0214; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 13543 - 13415
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13543 tatctctaggttcctatgttgaattaaacataattcctatttgaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 13444  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13443 taagaagttagggttaatagtcatgcaaa 13415  T

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Target: scaffold0214; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 27559 - 27431
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27559 tatctctaggttcctatgttgaattaaacataatttttattttatgattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 27460  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27459 taagaagttagggttaatagtcatgcaaa 27431  T

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Target: chr7 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 25)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 61 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20100580 - 20100447
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  20100580 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaatttctaatatcaattcatgtaattg 20100481  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 194  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  20100480 caagaagctagggttaatagtcatacaaagcaat 20100447  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 61 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22257194 - 22257061
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22257194 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 22257095  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 194  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  22257094 caagaagctagggttaatagtcatacaaagcaat 22257061  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Original strand, 22083625 - 22083752
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22083625 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctaga-ttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 22083723  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22083724 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 22083752  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 327
Target Start/End: Original strand, 3541350 - 3541625
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  3541350 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcatttaattcctaagatcaatttatgtgattg 3541449  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat--------------gcaaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagag 246  Q
     |||||| ||||||||||||||||              | |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| || ||||||  |   ||||||    
T  3541450 aaagaagctagggttaatagtcattcaaacaatcatacgaaaagcaatgaacacaaataattctgaatgaagactaggttttcattga--tgttaaagag 3541547  T
Q  247 agttcaaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatgactctgattaatctaagagcttaactactcat 327  Q
    |||||   |||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| ||| ||||||||    
T  3541548 agttc-ttcaaattacatggtcaacagatcacaa-agattcatctcatgact-taatcaatctaagagtttagctactcat 3541625  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 194
Target Start/End: Original strand, 22232809 - 22232942
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22232809 tatctctaggtttctatgttgaatcaaacagaattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcatttaattcctaatatcaattcatgtaattg 22232908  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 194  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  22232909 caagaagctagggttaatagtcatacaaaacaat 22232942  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22253930 - 22253797
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22253930 tatctctaggtttctatgttgaatcaaacagaattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcatttaattcctaatatcaattcatgtaattg 22253831  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 194  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  22253830 caagaagctagggttaatagtcatacaaaacaat 22253797  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 192
Target Start/End: Original strand, 748223 - 748354
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  748223 tatctctaggtatctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 748322  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagca 192  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  748323 caagaagctagggttaaaagtcatacaaagca 748354  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 26153087 - 26152964
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26153087 tatctctaagttcctatgttgaataaaacagaattactatttcaagattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 26152988  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  26152987 aaagaagttagggttagtagtcat 26152964  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 8397781 - 8397648
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  8397781 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacatgattactatttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 8397682  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 194  Q
    || |||| ||||||||||| |||| |||| ||||    
T  8397681 cacgaagctagggttaataatcatacaaaacaat 8397648  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 194
Target Start/End: Original strand, 5826890 - 5827023
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  5826890 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagttagggttaacagtcattcaattcataatatcaattcatgtaattg 5826989  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 194  Q
    || |||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  5826990 cacgaagctatggttaatagtcatacaaagcaat 5827023  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 6964223 - 6964095
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6964223 tatctctaggttcctatgttgaattaaacaaaattactatttcaggattaaaagttagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 6964124  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
     |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  6964123 aaagaaggtagggttagtagtcatacaaa 6964095  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 38431329 - 38431201
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  38431329 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttggtagtcattcaatttctaagatcaatttatgtgattg 38431230  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
     |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  38431229 aaagaagctagggttagtagtcatacaaa 38431201  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Original strand, 44017974 - 44018102
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  44017974 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctagcatcaatttatgtgattg 44018073  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
     |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  44018074 aaagaagctagggttagtagtcatacaaa 44018102  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Original strand, 23598945 - 23599067
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  23598945 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 23599043  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||| || |||||||||||||    
T  23599044 caagaagctatggttaatagtcat 23599067  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 26460402 - 26460280
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  26460402 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaagagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 26460304  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  26460303 caagaagctagggttaatagtcat 26460280  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Original strand, 710199 - 710322
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || ||| |     
T  710199 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaatctagggttagtagtcattcaattcctaatatcaattcatataaatt 710298  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  710299 caagaagctagggttaatagtcat 710322  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 2251807 - 2251685
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  2251807 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattagtaattcaggattaaaaactagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 2251709  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  2251708 caagaagctagggttaatagtcat 2251685  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Original strand, 12803447 - 12803569
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12803447 tatctctaggttcctatgttgaattaaacaaaattactatttcaggattaaaagctaggg-tagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 12803545  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
     |||||| |||||||| |||||||    
T  12803546 aaagaagctagggttagtagtcat 12803569  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 26182238 - 26182116
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| || |||||     
T  26182238 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaaaattactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcttaatatcaattcatataatt- 26182140  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  26182139 caagaagctagggttaatagtcat 26182116  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 43549129 - 43549001
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  43549129 tatctttagattcctatgttgaattaaacataattactatttcatgattaaaagctagggttagtagtcaatcaattcctaagttcaatttatgtgattg 43549030  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
     |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  43549029 aaagaagctagggttagtagtcatacaaa 43549001  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Original strand, 11825537 - 11825660
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||| |   |||||||||    
T  11825537 tatctctaggtttctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagttagggttaatagtcattcaattcctgatatcgagacatgtaattg 11825636  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    || |||| ||||||||||||||||    
T  11825637 cacgaagctagggttaatagtcat 11825660  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 2349364 - 2349276
Alignment:
Q  106 gattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  2349364 gattaaaagctagggttaatagtcattcaatttctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctagggttaatagtcatacaaaacaat 2349276  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 187
Target Start/End: Original strand, 23467349 - 23467440
Alignment:
Q  97 ctatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaatt-cctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgca 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23467349 ctatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattaaatttcctaagatcaatttatgtgattgtaagaagttagggttaatagtcatgca 23467440  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 198 - 295
Target Start/End: Original strand, 44018125 - 44018220
Alignment:
Q  198 cacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttca-aacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 295  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||| || ||||||  | |||  ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  44018125 cacaaataattctgaataaagattaggttttcattgatgtcaaa--gagagttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatg 44018220  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 17601432 - 17601382
Alignment:
Q  245 agagttcaaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 295  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| | || |||||||||||||||||||    
T  17601432 agagttcaaacaagttacattgttcacatattacaatagattcatctcatg 17601382  T

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Target: chr6 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 61 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14969604 - 14969471
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  14969604 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 14969505  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 194  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  14969504 cacgaagctagggttaatagtcatacaaagcaat 14969471  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 61 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12746742 - 12746496
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12746742 tatctctaggttcatatgttgaattaaacagaattactatttcacgattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 12746643  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgc--------------aaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagag 246  Q
     |||||| ||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  |   ||||||    
T  12746642 aaagaagctagggttaatagtcatgcaaacaatcatacgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagactaggttttcattga--tgtcaaagag 12746545  T
Q  247 agtt-caaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 295  Q
    ||||   |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  12746544 agttattaacaaattacatggttcacagatcacaa-agatccatctcatg 12746496  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 58 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 34502282 - 34502151
Alignment:
Q  58 tcatatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaa 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  34502282 tcatatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactacttcaagattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtga 34502183  T
Q  158 ttgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  34502182 ttgtaagaagctagggttaatagtcatgcaaa 34502151  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 61 - 327
Target Start/End: Original strand, 35027315 - 35027592
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35027315 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 35027414  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat--------------gcaaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagag 246  Q
     |||||| |||||||| |||||||              | |||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  |   ||||||    
T  35027415 aaagaagctagggttagtagtcatataaacaatcataagaaaagcattaagcacaaataattctgaataaagactaggttttcattga--tgtcaaagag 35027512  T
Q  247 agttc-aaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatgactctgattaatctaagagcttaactactcat 327  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || | || |||||||||||||| ||||||||    
T  35027513 agttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatggct-taatcaatctaagagcttagctactcat 35027592  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31262707 - 31262579
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31262707 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaactactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 31262608  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  31262607 caagaagttagagttaataatcatgcaaa 31262579  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Original strand, 13095880 - 13096003
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  13095880 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcatgattaaaagttagggttagtagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattt 13095979  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13095980 caagaagttagggttaatagtcat 13096003  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Original strand, 9313967 - 9314095
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9313967 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaagagctatggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 9314066  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  9314067 caataagctagggttaatagtcatgcaaa 9314095  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Original strand, 5618491 - 5618618
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  5618491 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagaagtcattcaattcttaa-atcaatttatgtgattg 5618589  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5618590 caagaagctagggttaatagtcatgcaaa 5618618  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 28117776 - 28117652
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  28117776 tatctctaggttcctatgttgaattaaacaaaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaaaatcaatttatgtgattg 28117677  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatg 185  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||    
T  28117676 caagaagctagggttaataatcatg 28117652  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Original strand, 28894663 - 28894791
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28894663 tatctctaggtttctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagttagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 28894762  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  28894763 aaagaagttagggttagtagtcatacaaa 28894791  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 2330566 - 2330438
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2330566 tatctctaggttcctatgttgaattaaatagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaatttctaagatcaatttatgttattg 2330467  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
     |||||  ||| |||||||||||||||||    
T  2330466 aaagaatctagagttaatagtcatgcaaa 2330438  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 11410701 - 11410578
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  11410701 tatctctaggatcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcaatcaattcctaatatcaattcatgtaattt 11410602  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  11410601 caagaagctagggttaatagtcat 11410578  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17231792 - 17231669
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  17231792 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattacaatttcagaattaaaagatagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattt 17231693  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  17231692 caagaagatagggttaatagtcat 17231669  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22920465 - 22920343
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  22920465 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggataaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 22920367  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  22920366 caagaagctagggttaatagtcat 22920343  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 65 - 189
Target Start/End: Original strand, 33679375 - 33679498
Alignment:
Q  65 tctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaag 164  Q
    |||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  33679375 tctaggttcctaggttgaattaa-cataattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagataaatttatgtgattgaaag 33679473  T
Q  165 aagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  33679474 aagttagggttaatagtcatgcaaa 33679498  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 2331218 - 2331090
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2331218 tatctctaggttcctacgttgaattaaacagaattgatatttcatgattaaaagctggtgttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgttattg 2331119  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
     |||||| |||| | ||||||||||||||    
T  2331118 aaagaagctaggatcaatagtcatgcaaa 2331090  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 17696526 - 17696397
Alignment:
Q  61 tatctctaggttccta-tgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaatt 159  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||| |||||| ||| |||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  17696526 tatctctaggttcctagtgttgagttaaacagaattacaatttcaggattaagagccagggctagtagtcattcaatttctaagatcaatttatgtgatt 17696427  T
Q  160 gcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17696426 gcaagaagttagggttaatagtcatacaaa 17696397  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 61 - 153
Target Start/End: Original strand, 15579097 - 15579189
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttat 153  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15579097 tatctctaggttcatatgttgaattaaatagatttactatttcatgattaaaatatagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttat 15579189  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 122
Target Start/End: Original strand, 5618396 - 5618457
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtt 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5618396 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggtt 5618457  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 132 - 194
Target Start/End: Original strand, 3827069 - 3827131
Alignment:
Q  132 tcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 194  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3827069 tcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatacaaagcaat 3827131  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 114
Target Start/End: Original strand, 11296321 - 11296373
Alignment:
Q  62 atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11296321 atctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcatgattaaaag 11296373  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31123341 - 31123238
Alignment:
Q  86 aaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatg 185  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| | | ||| ||||||||||||| |  | |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  31123341 aaacacaattactatttcaggattaaaagctagggaaagtagtcaattaatacctaagatcaattaacatgattgaaagaagctagggttaatagtcatg 31123242  T
Q  186 caaa 189  Q
    ||||    
T  31123241 caaa 31123238  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 128
Target Start/End: Original strand, 3827018 - 3827052
Alignment:
Q  94 ttactatttcatgattaaaagctagggttaatagt 128  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3827018 ttactatttcaggattaaaagctagggttaatagt 3827052  T

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Target: scaffold0134 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 7174 - 7046
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7174 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaatttctaagatcaatttatgtgattg 7075  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7074 caagaagctagggttaatagtcatgcaaa 7046  T

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Target: chr1 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 19)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 61 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 37641804 - 37641671
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  37641804 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagttagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 37641705  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 194  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  37641704 cacgaagctagggttaatagtcatacaaagcaat 37641671  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 28918311 - 28918188
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  28918311 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaatttatttaattt 28918212  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    || || | ||||||||||||||||    
T  28918211 catgatgctagggttaatagtcat 28918188  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Original strand, 3087907 - 3088035
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  3087907 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagttattcaattcctaagatcaatttatatggttg 3088006  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  3088007 aaagaagttagggttattagtcatacaaa 3088035  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Original strand, 17902969 - 17903092
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  17902969 tatctctagattcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagttagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattt 17903068  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  17903069 caagaagctagggttaatagtcat 17903092  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Original strand, 24200426 - 24200548
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  24200426 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 24200524  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  24200525 caagaagctagggttaatagtcat 24200548  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18392329 - 18392201
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18392329 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagttagggttagtagtcattcaatttctaagatcaatttatgtgattg 18392230  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
     |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  18392229 aaagaagctagggttagtagtcatacaaa 18392201  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 33898262 - 33898134
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  33898262 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactaattcaagattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaacatcaatttatgtgattg 33898163  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
     |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  33898162 aaagaagctagggttagtagtcatacaaa 33898134  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Original strand, 34552866 - 34552994
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  34552866 tatctctaggttcctatgttgaataaaacagaattactatttcaggattaaaagatagggttaatagtcattcaattactaagatcaatttatgtgattg 34552965  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
     |||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  34552966 aaagaaactagggttagtagtcatacaaa 34552994  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Original strand, 16839115 - 16839237
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  16839115 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaagagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 16839213  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  16839214 caagaagctagggttaatagtcat 16839237  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Original strand, 16849045 - 16849167
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  16849045 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaagagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 16849143  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  16849144 caagaagctagggttaatagtcat 16849167  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 20981296 - 20981173
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||     
T  20981296 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaaaattattaattcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcttaatatcaattcatgtaattt 20981197  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20981196 caagaagttagggttaatagtcat 20981173  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Original strand, 23441466 - 23441594
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  23441466 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggataaaaagctagggttagtagtcattcaattcctagcatcaatttatgtgattg 23441565  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
     |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  23441566 aaagaagctagggttagtagtcatacaaa 23441594  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 49719791 - 49719667
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactattt-catgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaatt 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  49719791 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagtattacttttttcaagattaaaagctagggttagtagtcaatcaattcctaatatcaattcatgtaatt 49719692  T
Q  160 gcaagaagttagggttaatagtcat 184  Q
     ||||||| ||||||||||||||||    
T  49719691 tcaagaagctagggttaatagtcat 49719667  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 65 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 20964389 - 20964270
Alignment:
Q  65 tctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaag 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||    
T  20964389 tctaggttcctatgttgaatcaaacaaaattactaattcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaatatcaatacatgtaatttcaag 20964290  T
Q  165 aagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||| || |||||||||||||    
T  20964289 aagctatggttaatagtcat 20964270  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 49716309 - 49716184
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctat--gttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaat 158  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  49716309 tatctctaggtttctatatgttgaatcaaacagtattactatttcaagattaaaagctagggttagtagtcaatcaattcctaatatcaattcatgtaat 49716210  T
Q  159 tgcaagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||    
T  49716209 ttcaagaagctagggttaatagtcat 49716184  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 6195754 - 6195626
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6195754 tatctctaggttcctatgttgaattaaacataattactatttcaagattaaaagttatggttggtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 6195655  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
     ||||||  ||||||| ||||||| ||||    
T  6195654 aaagaagccagggttagtagtcatacaaa 6195626  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 149
Target Start/End: Original strand, 50197142 - 50197230
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaat 149  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  50197142 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaataactatttcaagattaaaagctagagttagtagtcattcaattcctaagatcaat 50197230  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 295
Target Start/End: Original strand, 23441617 - 23441712
Alignment:
Q  198 cacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttca-aacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 295  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||  |||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  23441617 cacaaataattctgaataaagactaggttttcattgaagtcaaaaagag--ttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatatcatg 23441712  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 33898111 - 33898016
Alignment:
Q  198 cacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttca-aacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 295  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  | |||  ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  33898111 cacaaataattctgaataaagactaggttttcattgatgtcaaa--gagagttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatg 33898016  T

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Target: scaffold0911 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0911
Description:

Target: scaffold0911; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4499 - 4371
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4499 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 4400  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 189  Q
     |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  4399 aaagaagctagggttagtagtcatacaaa 4371  T

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Target: scaffold0911; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 4350 - 4255
Alignment:
Q  198 cacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttca-aacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 295  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  | |||  ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  4350 cacaaataattctgaataaagactaggttttcattgatgtcaaa--gagagttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatg 4255  T

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Target: scaffold0083 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 53055 - 52778
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53055 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattattatttcaagattaaaagatagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 52956  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgc--------------aaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagag 246  Q
     |||||| |||| |||||||||||||              |||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  |   ||||||    
T  52955 aaagaagctaggattaatagtcatgcaaacaatcatacgaaaagctttgaacacaaataattctgaataaagactaggttttcattga--tgtcaaagag 52858  T
Q  247 agttc-aaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatgactctgattaatctaagagcttaactactcat 327  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || | || |||||||||| ||| ||||||||    
T  52857 agttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agatacatctcatgtct-taatcaatctaagagtttagctactcat 52778  T

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Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 61 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 29258 - 28981
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29258 tatctctaggttcccaggttgaattaaacagaattactatttcaggaataaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 29159  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgc--------------aaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagag 246  Q
     |||||| |||| |||||||||||||              ||| |  ||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  |   ||||||    
T  29158 aaagaagctaggtttaatagtcatgcaatcaatcatatgaaaatctttgaacacaaataattctgaataaagactaggttttcattga--tgtcaaagag 29061  T
Q  247 agttc-aaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatgactctgattaatctaagagcttaactactcat 327  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || | || |||||||||| ||| ||||||||    
T  29060 agttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatggct-taatcaatctaagagtttagctactcat 28981  T

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Target: scaffold0012 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Original strand, 27061 - 27184
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||| |     
T  27061 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataaatt 27160  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  27161 caagaagttagggttaatagtcat 27184  T

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Target: scaffold0067 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 27298 - 27176
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  27298 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagttagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 27200  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  27199 caagaagctagggttaatagtcat 27176  T

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Target: scaffold0062 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Original strand, 53064 - 53187
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  53064 tatctctaggttcccatattgaatcaaacactattactatttcaagattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattt 53163  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  53164 caggaagttagggttaatagtcat 53187  T

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Target: scaffold0062; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 184
Target Start/End: Original strand, 68027 - 68086
Alignment:
Q  125 tagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  68027 tagtcattcaactcctaatatcaattcatgtgatttcaagaagttagggttaatagtcat 68086  T

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Target: scaffold0014 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 227284 - 227157
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  227284 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattattatttcaggattaaaagctatgattagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 227185  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcatgcaa 188  Q
     |||||| || |||||||||||||||||    
T  227184 taagaagctatggttaatagtcatgcaa 227157  T

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Target: scaffold1048 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1048
Description:

Target: scaffold1048; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 1338 - 1216
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  1338 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagatttactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 1240  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||    
T  1239 caaaaagctagggttaatagtcat 1216  T

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Target: scaffold0175 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Original strand, 28842 - 28965
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  28842 tatctttaggttcctatgttgaatcaaacaggattactaattcaagattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaatatcaattcatataattt 28941  T
Q  161 caagaagttagggttaatagtcat 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  28942 caagaagctagggttaatagtcat 28965  T

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Target: scaffold0360 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0360
Description:

Target: scaffold0360; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 2385 - 2298
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaa 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  2385 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaatatcaa 2298  T

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Target: scaffold0360; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 6222 - 6123
Alignment:
Q  61 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  6222 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattcctatttcagaattaaaagctagagttagtagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 6123  T

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Target: scaffold0637 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 68 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 2120 - 2022
Alignment:
Q  68 aggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaa 166  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2120 aggttcttatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcagttcctaagatcaatttatgtgattgaaagaa 2022  T

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Target: scaffold0273 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 327
Target Start/End: Original strand, 20018 - 20144
Alignment:
Q  198 cacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttca-aacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatga 296  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  | |||  ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  20018 cacaaataattctgaataaagactaggttttcattgatgtcaaa--gagagttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatgg 20114  T
Q  297 ctctgattaatctaagagcttaactactcat 327  Q
    || | || |||||||||| ||| ||||||||    
T  20115 ct-taatcaatctaagagtttagctactcat 20144  T

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