View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10625_low_42 (Length: 256)

Name: NF10625_low_42
Description: NF10625
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10625_low_42
NF10625_low_42
[»] chr8 (63 HSPs)
chr8 (1-236)||(40518456-40518690)
chr8 (18-239)||(30359497-30359720)
chr8 (14-236)||(8918814-8919037)
chr8 (26-232)||(45122902-45123108)
chr8 (14-179)||(147718-147880)
chr8 (63-239)||(3669994-3670171)
chr8 (63-193)||(1013964-1014095)
chr8 (18-155)||(18372502-18372640)
chr8 (63-194)||(18372348-18372480)
chr8 (14-237)||(45122521-45122733)
chr8 (122-239)||(45122104-45122221)
chr8 (128-239)||(3669687-3669798)
chr8 (123-237)||(9608740-9608854)
chr8 (79-239)||(9309303-9309466)
chr8 (18-239)||(18371708-18371925)
chr8 (63-236)||(4154331-4154505)
chr8 (20-193)||(18372792-18372966)
chr8 (80-239)||(34835160-34835320)
chr8 (84-239)||(34835427-34835586)
chr8 (84-239)||(34835693-34835852)
chr8 (123-239)||(30359266-30359382)
chr8 (123-239)||(34834871-34834987)
chr8 (30-238)||(9482652-9482856)
chr8 (126-237)||(45121959-45122070)
chr8 (123-237)||(3038339-3038453)
chr8 (18-210)||(18373007-18373200)
chr8 (123-189)||(41972153-41972219)
chr8 (81-177)||(6731856-6731953)
chr8 (123-239)||(6876909-6877026)
chr8 (14-117)||(3038099-3038201)
chr8 (123-239)||(8794106-8794222)
chr8 (130-236)||(25561865-25561972)
chr8 (123-236)||(5420646-5420759)
chr8 (122-238)||(1513963-1514079)
chr8 (123-239)||(33113414-33113530)
chr8 (128-239)||(1014292-1014403)
chr8 (131-237)||(147454-147560)
chr8 (165-239)||(9483234-9483308)
chr8 (128-239)||(20870620-20870733)
chr8 (135-236)||(70324-70425)
chr8 (131-220)||(3037774-3037865)
chr8 (165-237)||(9507819-9507891)
chr8 (165-237)||(32305514-32305586)
chr8 (123-189)||(4154763-4154829)
chr8 (123-177)||(12283868-12283922)
chr8 (128-239)||(30441081-30441196)
chr8 (123-233)||(9308972-9309084)
chr8 (130-239)||(37544537-37544646)
chr8 (123-223)||(9620739-9620839)
chr8 (131-239)||(43274826-43274934)
chr8 (79-193)||(45121749-45121865)
chr8 (135-193)||(41416264-41416322)
chr8 (123-180)||(20995507-20995564)
chr8 (123-237)||(40518064-40518180)
chr8 (132-239)||(18380064-18380171)
chr8 (138-193)||(25561737-25561792)
chr8 (14-60)||(9482870-9482916)
chr8 (14-60)||(9483033-9483079)
chr8 (151-237)||(9609108-9609194)
chr8 (1-42)||(9609006-9609047)
chr8 (195-236)||(12156708-12156749)
chr8 (132-193)||(43398164-43398225)
chr8 (123-155)||(18645718-18645750)
[»] chr4 (66 HSPs)
chr4 (3-237)||(2740945-2741180)
chr4 (2-239)||(54108789-54109023)
chr4 (63-239)||(36629172-36629348)
chr4 (1-236)||(20826090-20826325)
chr4 (4-230)||(49076503-49076732)
chr4 (13-236)||(3244499-3244721)
chr4 (1-193)||(44621296-44621491)
chr4 (14-239)||(39404288-39404509)
chr4 (38-238)||(44620568-44620769)
chr4 (1-236)||(45489380-45489618)
chr4 (4-109)||(22028163-22028268)
chr4 (123-239)||(34646694-34646810)
chr4 (123-239)||(39792905-39793021)
chr4 (1-126)||(16889314-16889440)
chr4 (123-239)||(3340802-3340918)
chr4 (123-239)||(36608706-36608822)
chr4 (129-236)||(16888864-16888971)
chr4 (123-237)||(4955364-4955478)
chr4 (128-237)||(6975503-6975612)
chr4 (123-239)||(1731692-1731808)
chr4 (123-239)||(25483331-25483447)
chr4 (123-239)||(36572014-36572130)
chr4 (99-239)||(52884856-52884999)
chr4 (125-236)||(54017643-54017754)
chr4 (123-193)||(2740695-2740765)
chr4 (63-155)||(18932889-18932981)
chr4 (123-239)||(52884690-52884807)
chr4 (123-239)||(10245915-10246030)
chr4 (123-239)||(41707510-41707625)
chr4 (126-239)||(49302902-49303017)
chr4 (123-239)||(50002421-50002537)
chr4 (131-239)||(50459724-50459832)
chr4 (123-235)||(54741227-54741339)
chr4 (128-235)||(41370357-41370464)
chr4 (128-239)||(50630800-50630911)
chr4 (128-239)||(55933169-55933280)
chr4 (123-237)||(22183311-22183425)
chr4 (96-236)||(3341093-3341236)
chr4 (123-191)||(3700360-3700428)
chr4 (128-239)||(49880160-49880271)
chr4 (123-239)||(54936195-54936307)
chr4 (123-193)||(4390192-4390262)
chr4 (105-237)||(43174480-43174616)
chr4 (123-229)||(51768115-51768221)
chr4 (123-236)||(32941171-32941284)
chr4 (123-239)||(22028006-22028122)
chr4 (123-239)||(49076876-49076991)
chr4 (63-110)||(41707340-41707387)
chr4 (137-236)||(44620362-44620461)
chr4 (129-239)||(16889581-16889691)
chr4 (14-84)||(43174410-43174479)
chr4 (137-239)||(44621011-44621113)
chr4 (123-239)||(20825831-20825947)
chr4 (143-239)||(45496820-45496916)
chr4 (123-236)||(54017750-54017865)
chr4 (123-239)||(22028414-22028532)
chr4 (4-82)||(23817501-23817580)
chr4 (123-237)||(28034224-28034338)
chr4 (123-237)||(39404013-39404127)
chr4 (123-167)||(12197373-12197417)
chr4 (121-193)||(34004675-34004746)
chr4 (150-236)||(3271806-3271895)
chr4 (138-193)||(54343092-54343147)
chr4 (123-193)||(44620291-44620361)
chr4 (123-156)||(45050596-45050629)
chr4 (128-180)||(50788087-50788139)
[»] scaffold0391 (3 HSPs)
scaffold0391 (1-239)||(1153-1394)
scaffold0391 (20-179)||(3092-3254)
scaffold0391 (14-121)||(1466-1574)
[»] chr2 (65 HSPs)
chr2 (13-240)||(28531360-28531584)
chr2 (14-237)||(40679678-40679894)
chr2 (2-239)||(6421989-6422221)
chr2 (19-193)||(7598500-7598674)
chr2 (20-193)||(38796311-38796487)
chr2 (1-182)||(36785667-36785850)
chr2 (14-154)||(3672968-3673111)
chr2 (63-239)||(5542672-5542849)
chr2 (14-190)||(42514901-42515078)
chr2 (27-239)||(37894739-37894957)
chr2 (97-239)||(37106156-37106299)
chr2 (63-193)||(40733815-40733948)
chr2 (89-239)||(40733475-40733628)
chr2 (123-237)||(42514644-42514758)
chr2 (123-236)||(962593-962706)
chr2 (96-235)||(36178320-36178460)
chr2 (63-237)||(30313111-30313286)
chr2 (63-237)||(30323397-30323573)
chr2 (67-236)||(33561501-33561670)
chr2 (63-237)||(14745343-14745517)
chr2 (128-239)||(36178652-36178763)
chr2 (63-166)||(41678487-41678592)
chr2 (123-239)||(28254284-28254400)
chr2 (128-239)||(5543045-5543156)
chr2 (123-237)||(15880258-15880372)
chr2 (130-239)||(6421387-6421496)
chr2 (128-237)||(14745716-14745825)
chr2 (123-239)||(37895108-37895224)
chr2 (123-234)||(35580776-35580886)
chr2 (128-239)||(37105924-37106035)
chr2 (123-239)||(15511542-15511656)
chr2 (23-139)||(35580532-35580650)
chr2 (123-235)||(16542444-16542556)
chr2 (95-236)||(29873587-29873730)
chr2 (110-236)||(33953821-33953947)
chr2 (123-237)||(36005929-36006042)
chr2 (123-233)||(38796673-38796783)
chr2 (146-239)||(36178218-36178311)
chr2 (139-239)||(40163419-40163520)
chr2 (128-237)||(41283524-41283633)
chr2 (123-193)||(31899519-31899589)
chr2 (125-193)||(1769889-1769957)
chr2 (79-182)||(29676851-29676957)
chr2 (123-167)||(33954380-33954424)
chr2 (123-239)||(37632644-37632760)
chr2 (130-193)||(6712978-6713041)
chr2 (84-150)||(40734231-40734300)
chr2 (6-55)||(6421641-6421690)
chr2 (123-240)||(12910223-12910340)
chr2 (124-237)||(29874072-29874185)
chr2 (123-238)||(31259664-31259782)
chr2 (123-237)||(5367450-5367564)
chr2 (123-177)||(31468855-31468909)
chr2 (123-165)||(43443103-43443145)
chr2 (95-144)||(7281384-7281433)
chr2 (123-156)||(16590883-16590916)
chr2 (123-179)||(9231244-9231300)
chr2 (123-210)||(12529104-12529191)
chr2 (71-126)||(34481588-34481643)
chr2 (63-106)||(40734188-40734231)
chr2 (125-231)||(7598225-7598331)
chr2 (133-239)||(33731653-33731759)
chr2 (123-155)||(3672714-3672746)
chr2 (203-239)||(3672776-3672812)
chr2 (14-50)||(23346502-23346538)
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (41-239)||(10074038-10074235)
chr6 (14-239)||(29518806-29519031)
chr6 (14-210)||(16107948-16108145)
chr6 (4-239)||(10073663-10073894)
chr6 (89-239)||(10074410-10074560)
chr6 (63-239)||(2378061-2378237)
chr6 (63-237)||(16454839-16455016)
chr6 (14-188)||(2579203-2579382)
chr6 (14-239)||(2578490-2578725)
chr6 (26-180)||(33605875-33606027)
chr6 (96-239)||(3409627-3409771)
chr6 (95-239)||(8481892-8482037)
chr6 (128-239)||(29518503-29518614)
chr6 (128-239)||(32741179-32741290)
chr6 (41-193)||(2975466-2975617)
chr6 (104-239)||(2578882-2579016)
chr6 (128-239)||(3409259-3409370)
chr6 (18-239)||(2579539-2579760)
chr6 (63-237)||(6071065-6071241)
chr6 (123-239)||(16107673-16107789)
chr6 (123-237)||(16454570-16454684)
chr6 (128-237)||(1127360-1127469)
chr6 (130-239)||(2377756-2377865)
chr6 (133-236)||(32460630-32460733)
chr6 (128-239)||(35210204-35210315)
chr6 (123-239)||(2579919-2580035)
chr6 (127-238)||(593757-593868)
chr6 (128-239)||(3058226-3058337)
chr6 (132-239)||(3415462-3415569)
chr6 (128-238)||(14748386-14748496)
chr6 (121-238)||(9062398-9062514)
chr6 (123-236)||(10911560-10911674)
chr6 (128-236)||(26544049-26544157)
chr6 (128-239)||(1846748-1846859)
chr6 (121-193)||(6999889-6999961)
chr6 (63-120)||(12092201-12092260)
chr6 (125-236)||(5958653-5958764)
chr6 (131-193)||(1950278-1950340)
chr6 (130-239)||(5832074-5832182)
chr6 (123-156)||(7588354-7588387)
chr6 (123-180)||(33605649-33605706)
chr6 (132-193)||(17135162-17135223)
chr6 (203-239)||(11637768-11637804)
chr6 (121-165)||(12071812-12071856)
[»] chr1 (61 HSPs)
chr1 (4-239)||(41157249-41157486)
chr1 (26-237)||(22077544-22077753)
chr1 (63-239)||(44290505-44290682)
chr1 (14-239)||(37555995-37556222)
chr1 (30-237)||(66136-66345)
chr1 (13-234)||(30630690-30630910)
chr1 (63-193)||(3537240-3537371)
chr1 (63-239)||(48588535-48588712)
chr1 (21-239)||(34364816-34365036)
chr1 (38-239)||(26661569-26661773)
chr1 (13-186)||(47379885-47380055)
chr1 (123-239)||(24600361-24600477)
chr1 (26-165)||(22077243-22077380)
chr1 (129-239)||(3550721-3550831)
chr1 (63-155)||(50051782-50051875)
chr1 (14-114)||(41184198-41184297)
chr1 (102-236)||(11977251-11977388)
chr1 (128-239)||(32594763-32594874)
chr1 (123-239)||(17294572-17294688)
chr1 (123-239)||(26661945-26662061)
chr1 (123-239)||(39066247-39066363)
chr1 (128-239)||(44290871-44290983)
chr1 (63-114)||(3537495-3537546)
chr1 (165-239)||(44043819-44043893)
chr1 (123-236)||(31767211-31767324)
chr1 (123-235)||(5320016-5320128)
chr1 (123-239)||(29798194-29798310)
chr1 (131-239)||(50052070-50052178)
chr1 (128-239)||(41759483-41759594)
chr1 (123-193)||(66565-66635)
chr1 (123-237)||(3875380-3875494)
chr1 (123-236)||(34364502-34364615)
chr1 (111-180)||(50469187-50469256)
chr1 (123-239)||(37850647-37850763)
chr1 (126-237)||(41142370-41142482)
chr1 (123-239)||(41156986-41157102)
chr1 (123-236)||(9955902-9956017)
chr1 (123-238)||(40082402-40082516)
chr1 (63-237)||(24448213-24448386)
chr1 (17-86)||(34649708-34649776)
chr1 (124-193)||(45084378-45084447)
chr1 (133-237)||(3537648-3537752)
chr1 (136-239)||(14318875-14318978)
chr1 (123-210)||(41184501-41184588)
chr1 (123-193)||(44685451-44685522)
chr1 (83-146)||(47380258-47380323)
chr1 (123-192)||(24132079-24132148)
chr1 (130-235)||(38804406-38804511)
chr1 (130-234)||(34649440-34649544)
chr1 (123-159)||(35154166-35154202)
chr1 (63-129)||(1188388-1188452)
chr1 (150-237)||(10351182-10351269)
chr1 (123-237)||(1188637-1188751)
chr1 (123-193)||(21378134-21378204)
chr1 (143-237)||(44091909-44092003)
chr1 (123-167)||(19283574-19283618)
chr1 (121-193)||(22077921-22077993)
chr1 (138-229)||(5528811-5528902)
chr1 (134-193)||(5575110-5575169)
chr1 (123-177)||(22793273-22793327)
chr1 (203-239)||(50051735-50051771)
[»] chr5 (53 HSPs)
chr5 (17-237)||(13415809-13416030)
chr5 (2-237)||(24489255-24489483)
chr5 (16-239)||(3295062-3295287)
chr5 (102-239)||(26074193-26074330)
chr5 (63-239)||(26074544-26074723)
chr5 (24-236)||(38427453-38427655)
chr5 (4-239)||(624072-624307)
chr5 (63-239)||(6500757-6500933)
chr5 (72-237)||(26074830-26074999)
chr5 (26-151)||(13785744-13785868)
chr5 (63-180)||(36522002-36522119)
chr5 (123-239)||(12662699-12662815)
chr5 (128-239)||(9498701-9498812)
chr5 (63-167)||(31509556-31509662)
chr5 (123-239)||(41632777-41632893)
chr5 (130-237)||(18603169-18603276)
chr5 (123-237)||(36568616-36568730)
chr5 (65-239)||(36522284-36522459)
chr5 (124-239)||(40296362-40296477)
chr5 (123-237)||(34753074-34753188)
chr5 (121-239)||(35150000-35150117)
chr5 (128-236)||(32487394-32487501)
chr5 (123-237)||(1028566-1028680)
chr5 (134-239)||(41170640-41170745)
chr5 (123-239)||(36492264-36492380)
chr5 (123-237)||(299484-299598)
chr5 (128-237)||(29549304-29549413)
chr5 (123-239)||(6224191-6224307)
chr5 (123-239)||(15370094-15370210)
chr5 (131-239)||(25327938-25328046)
chr5 (123-239)||(42405643-42405759)
chr5 (123-223)||(42508607-42508707)
chr5 (128-239)||(6500451-6500561)
chr5 (63-118)||(9498417-9498472)
chr5 (130-193)||(26074320-26074383)
chr5 (128-239)||(27502083-27502194)
chr5 (123-229)||(26075219-26075325)
chr5 (123-193)||(300954-301024)
chr5 (123-236)||(11417027-11417138)
chr5 (14-118)||(35150613-35150719)
chr5 (128-233)||(5723844-5723949)
chr5 (123-167)||(36527202-36527246)
chr5 (123-236)||(3295395-3295506)
chr5 (131-235)||(2411010-2411114)
chr5 (165-237)||(15370439-15370511)
chr5 (123-237)||(19275527-19275637)
chr5 (123-155)||(35150742-35150774)
chr5 (123-155)||(35151033-35151065)
chr5 (131-235)||(41635242-41635346)
chr5 (123-193)||(39309679-39309749)
chr5 (128-193)||(26591003-26591068)
chr5 (128-180)||(623818-623870)
chr5 (97-140)||(15370380-15370426)
[»] chr3 (55 HSPs)
chr3 (14-234)||(21832395-21832612)
chr3 (2-239)||(54017863-54018102)
chr3 (42-239)||(22304482-22304680)
chr3 (18-239)||(37990686-37990908)
chr3 (26-239)||(9240047-9240260)
chr3 (123-237)||(29644630-29644744)
chr3 (63-193)||(32462651-32462785)
chr3 (123-239)||(12114609-12114725)
chr3 (14-239)||(3135120-3135346)
chr3 (123-239)||(43346838-43346954)
chr3 (83-237)||(42342139-42342296)
chr3 (79-236)||(15773140-15773300)
chr3 (123-237)||(29644951-29645065)
chr3 (123-239)||(32462947-32463064)
chr3 (123-236)||(42342438-42342551)
chr3 (96-239)||(4823622-4823766)
chr3 (63-237)||(41359814-41359986)
chr3 (95-182)||(22304212-22304300)
chr3 (123-239)||(35946517-35946633)
chr3 (128-239)||(39389070-39389181)
chr3 (125-239)||(15772851-15772965)
chr3 (123-193)||(33175757-33175827)
chr3 (83-225)||(33809069-33809213)
chr3 (123-236)||(52634671-52634783)
chr3 (14-118)||(8328265-8328368)
chr3 (123-239)||(49336734-49336850)
chr3 (124-234)||(1634366-1634477)
chr3 (123-234)||(32589699-32589809)
chr3 (84-167)||(2299930-2300015)
chr3 (123-237)||(33803301-33803415)
chr3 (128-236)||(50612497-50612610)
chr3 (123-239)||(8327899-8328015)
chr3 (14-78)||(8328160-8328223)
chr3 (123-239)||(39914247-39914363)
chr3 (124-218)||(7767382-7767476)
chr3 (123-237)||(25755389-25755503)
chr3 (63-167)||(12747871-12747976)
chr3 (123-236)||(25739475-25739588)
chr3 (138-239)||(42584869-42584970)
chr3 (123-239)||(37991024-37991140)
chr3 (123-239)||(45395700-45395816)
chr3 (123-235)||(53118026-53118137)
chr3 (123-189)||(31190012-31190078)
chr3 (95-159)||(22304075-22304142)
chr3 (128-193)||(37726504-37726569)
chr3 (123-236)||(46546375-46546488)
chr3 (126-239)||(54018245-54018358)
chr3 (123-182)||(3135565-3135624)
chr3 (121-164)||(39336351-39336394)
chr3 (123-182)||(43346645-43346704)
chr3 (110-237)||(47964567-47964694)
chr3 (123-239)||(45901708-45901825)
chr3 (123-179)||(53577359-53577415)
chr3 (137-236)||(39935005-39935104)
chr3 (124-193)||(11661531-11661600)
[»] chr7 (51 HSPs)
chr7 (14-239)||(7553909-7554136)
chr7 (14-236)||(45434520-45434744)
chr7 (63-239)||(14681443-14681621)
chr7 (65-239)||(30244204-30244381)
chr7 (14-239)||(1085295-1085525)
chr7 (74-239)||(30245020-30245188)
chr7 (26-178)||(40094502-40094652)
chr7 (123-237)||(118350-118464)
chr7 (21-193)||(30245385-30245559)
chr7 (123-239)||(7517575-7517691)
chr7 (123-239)||(34218081-34218197)
chr7 (14-126)||(48243240-48243351)
chr7 (26-145)||(37345815-37345933)
chr7 (123-239)||(45433236-45433352)
chr7 (14-93)||(47129360-47129438)
chr7 (123-237)||(1085665-1085779)
chr7 (38-237)||(22566711-22566912)
chr7 (123-239)||(8128488-8128604)
chr7 (96-239)||(37533058-37533201)
chr7 (123-239)||(45754711-45754826)
chr7 (123-239)||(23424-23540)
chr7 (63-193)||(30244633-30244766)
chr7 (128-239)||(29157565-29157676)
chr7 (100-193)||(30255308-30255404)
chr7 (123-237)||(40094823-40094937)
chr7 (121-239)||(40230338-40230456)
chr7 (130-239)||(6054562-6054671)
chr7 (123-239)||(16569191-16569307)
chr7 (123-239)||(16596355-16596471)
chr7 (123-210)||(28301619-28301706)
chr7 (126-239)||(36939780-36939893)
chr7 (63-147)||(45697846-45697929)
chr7 (136-239)||(19122740-19122842)
chr7 (63-141)||(10342193-10342271)
chr7 (123-237)||(24177430-24177544)
chr7 (26-103)||(8128288-8128364)
chr7 (14-121)||(28300366-28300470)
chr7 (135-239)||(11845198-11845302)
chr7 (123-239)||(22567086-22567201)
chr7 (123-191)||(43241490-43241558)
chr7 (123-193)||(36109010-36109080)
chr7 (123-237)||(36534833-36534947)
chr7 (131-239)||(37533411-37533519)
chr7 (123-223)||(41910657-41910757)
chr7 (133-236)||(30032572-30032675)
chr7 (131-236)||(24838751-24838857)
chr7 (121-155)||(36622953-36622987)
chr7 (123-193)||(41854630-41854699)
chr7 (130-239)||(47129097-47129206)
chr7 (174-237)||(28300302-28300366)
chr7 (172-239)||(30253536-30253603)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (63-239)||(5289-5468)
scaffold0078 (123-239)||(4977-5093)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (14-221)||(5661-5870)
scaffold0734 (123-239)||(5391-5508)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (63-193)||(235-365)
scaffold0702 (130-239)||(561-670)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (82-239)||(17501-17663)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (63-167)||(39772-39877)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (124-239)||(47356-47471)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (130-193)||(10204-10267)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 63)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 40518456 - 40518690
Alignment:
Q  1 cggcggtacaagtgtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatg 100  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  40518456 cggcggtacaaacatgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatacaagcaagta-agagcttccacttgaggggggagcatgatgaattgatg 40518554  T
Q  101 gactcacacttgagggggagtattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||  || ||    
T  40518555 gactcacacttgagggggagtattgtgttcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagaggaccca 40518654  T
Q  201 ttaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtg 236  Q
    | |||||| |  |||||| |||||||||||||||||    
T  40518655 taaacccaatgacttaaggttttgggtaagagtgtg 40518690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Original strand, 30359497 - 30359720
Alignment:
Q  18 cggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggg 117  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||  || ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  30359497 cggtccgtttgcacagacaccagcaacgacgataaaaccaatta-agagcttccgcttgaagggggagcatgataaattgatggactcacacttgagggg 30359595  T
Q  118 ga---gtattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatct 214  Q
    ||    | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| | ||    
T  30359596 gaatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccataacct 30359695  T
Q  215 taagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  30359696 taagattttgggtaagagtgtggtg 30359720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8919037 - 8918814
Alignment:
Q  14 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttga 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  8919037 gtgtcggtccgtttgcgaagaaatcagcaacggcgatacaagcaagtt-agagcttccgcttaaaggggga-catgatgaatagatggactcacacttga 8918940  T
Q  114 gggggagtattgt---gtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccatt 210  Q
    |||||||| ||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||| ||||||||| | ||||||||||  || ||| |||| |||    
T  8918939 gggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttacatgtcccacatcagatagcagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacctatt 8918840  T
Q  211 atcttaagattttgggtaagagtgtg 236  Q
      |||||| |||||||||||||||||    
T  8918839 gacttaaggttttgggtaagagtgtg 8918814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 232
Target Start/End: Original strand, 45122902 - 45123108
Alignment:
Q  26 ttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtat-- 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |      
T  45122902 ttgcagagaaaccagcaacgacgatacaagcaagta-agagcttccgcttgaagggggaacatgatgaatagatggacttacacttgagggggagtgttg 45123000  T
Q  124 -tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||| |||||||  |||||||||  || ||| |||| ||| ||||||| |||    
T  45123001 ctgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacacct--taagtaagatgacccataaacctattttcttaaggttt 45123098  T
Q  223 tgggtaagag 232  Q
    ||||||||||    
T  45123099 tgggtaagag 45123108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 179
Target Start/End: Original strand, 147718 - 147880
Alignment:
Q  14 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |     ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  147718 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccaacaacgacgatacaagta-----agagcttccgcttaaagggggagc-tgatgaattgatggactcacacttga 147811  T
Q  114 gggggag---tattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaaca 179  Q
    |||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  147812 gggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaaaagtaaatgttgaaca 147880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 63 - 239
Target Start/End: Original strand, 3669994 - 3670171
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattg 161  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  3669994 agagcttctgcttgaagggtgagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggactgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataa 3670093  T
Q  162 aaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    || |||||| ||| ||||||| ||||||| ||  || ||| |||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3670094 aatagtaaaggtttaacaccttataagtatgaggacccataaacctatttccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 3670171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 63 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1014095 - 1013964
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtatt-gtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattg 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||      
T  1014095 agagcttccgcttgaagggggagtatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgttccacatcggataa 1013996  T
Q  162 aaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    || |||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  1013995 aatagtaaaagttgaacaccctataagtaaga 1013964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 18372640 - 18372502
Alignment:
Q  18 cggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||| |||||||||| |||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  18372640 cggtccgtttgcggagaaaccagcagcggcgattcaaacaaataaagagcttccccttgaaggggaagcacgataaagtgatggactcacacttgagggg 18372541  T
Q  118 gagtattg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatc 155  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18372540 gagtgttgttgtgaaagtgtgagttatatgtcccacatc 18372502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 63 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18372480 - 18372348
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattg 161  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||      
T  18372480 agagcttccccttgaagggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgaaagtgtgagttatatgtctcacatcggataa 18372381  T
Q  162 aaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaa 194  Q
    || |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18372380 aatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaa 18372348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 45122521 - 45122733
Alignment:
Q  14 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttga 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||| |||| |||     |||||||||| |||||||||||||||||| | || | ||||||||||||    
T  45122521 gtgtcggtccgtttgcggaggaaccaacaacatcgatacaagtaag-----agcttccgctggaagggggagcatgatgaatagaagaactcacacttga 45122615  T
Q  114 gggggagtattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatc 213  Q
    |||||||| |||||||||||||      ||||| ||| |||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||| |||| ||    
T  45122616 gggggagtgttgtgtgcaagtg------atatggcccgcatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtc 45122709  T
Q  214 ttaagattttgggtaagagtgtgg 237  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    
T  45122710 ttaaggttttgggtatgagtgtgg 45122733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 122 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 45122221 - 45122104
Alignment:
Q  122 attgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagatt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  || |||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |||| ||||||| ||    
T  45122221 attgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattttcttaaggtt 45122122  T
Q  222 ttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45122121 ttgggtaagagtgtggtg 45122104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 128 - 239
Target Start/End: Original strand, 3669687 - 3669798
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| ||||  |||||| ||||||||    
T  3669687 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggt 3669786  T
Q  228 aagagtgtggtg 239  Q
    ||||||||||||    
T  3669787 aagagtgtggtg 3669798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Original strand, 9608740 - 9608854
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||| | |||||| |||    
T  9608740 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcaccttaaggttt 9608839  T
Q  223 tgggtaagagtgtgg 237  Q
    |||||| ||||||||    
T  9608840 tgggtatgagtgtgg 9608854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 239
Target Start/End: Original strand, 9309303 - 9309466
Alignment:
Q  79 gggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattgt---gtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttg 175  Q
    ||||||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||    
T  9309303 gggggagcacgataaagtgatggactcacaattgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttg 9309402  T
Q  176 aacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    ||||||| ||||||||||  || | | ||| ||||  |||||| | | ||||||||||||||||    
T  9309403 aacaccttataagtaagaggacccttaaactcattgccttaaggtgtcgggtaagagtgtggtg 9309466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18371925 - 18371708
Alignment:
Q  18 cggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggg 117  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||||||| ||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  18371925 cggttcgtttgcggagaaaccagcagcggcgatacaaacaaataaagagcttccgcttgaagggggggcacgataaagtgatggactcacacttgagggg 18371826  T
Q  118 gagtattg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatctta 216  Q
    ||||  || |||| |   |||||||||||||| |||||| |||  || |||||| |||||||    | |||||||||| || ||| |||||| |  ||||    
T  18371825 gagtgctgttgtgtagaagtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaac----attaagtaagaagacccataaaccca-tgcctta 18371731  T
Q  217 agattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  18371730 aggttttgggtaagagtgtggtg 18371708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 63 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4154505 - 4154331
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgaggggg--agtattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatt 160  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||     
T  4154505 agagcttctgcttgaggggtgagcatgaagttttgatggactcacacttgagggggaaattgttgtgtgcaaatgtgagttatatgtcctacatcagata 4154406  T
Q  161 gaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtg 236  Q
    |||||||  | ||||||||| | |||||| || | || ||| ||| ||||  ||||| |||||||||||| |||||    
T  4154405 gaaaagtggaggttgaacactttataagtgag-agacccataaactcattgccttaatattttgggtaagtgtgtg 4154331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18372966 - 18372792
Alignment:
Q  20 gtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgc-ttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgaggggg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||| | || ||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |     
T  18372966 gtccgtttgcggagaaaccagcagcggcgatacaaacaaataaagagcttcccccttcaagggggagcacgataaagtgatggactcacacttgaggag- 18372868  T
Q  119 agtattgt-gtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    ||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18372867 agtgttgttgtgaaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 18372792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 239
Target Start/End: Original strand, 34835160 - 34835320
Alignment:
Q  80 ggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattg---tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttga 176  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||   ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||  || |||||| |||||    
T  34835160 ggggggcatgatgaattgatggactcac--ttgagggggagtgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttga 34835257  T
Q  177 acacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||| ||||||||||  || ||| ||| ||||  |||||  ||||||||||||||||||||    
T  34835258 acaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtg 34835320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 239
Target Start/End: Original strand, 34835427 - 34835586
Alignment:
Q  84 agcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtat---tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacat-cagattgaaaagtaaatgttgaaca 179  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| |||| |||||||||||||||||| | | |||  || |||||| ||| ||||    
T  34835427 agcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaaca 34835526  T
Q  180 cctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    ||| ||||||||||  || ||| ||| ||||  |||||  ||||||||||||||||||||    
T  34835527 ccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtg 34835586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 239
Target Start/End: Original strand, 34835693 - 34835852
Alignment:
Q  84 agcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtat---tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacat-cagattgaaaagtaaatgttgaaca 179  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| |||| |||||||||||||||||| | | |||  || |||||| ||| ||||    
T  34835693 agcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaaca 34835792  T
Q  180 cctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    ||| ||||||||||  || ||| ||| ||||  |||||  ||||||||||||||||||||    
T  34835793 ccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtg 34835852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Original strand, 30359266 - 30359382
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||  || |||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||| |||||||   |||||| |||    
T  30359266 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagcaagaggacccataaacccatagccttaaggttt 30359365  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  30359366 tgggtaagagtgtggtg 30359382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Original strand, 34834871 - 34834987
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||| ||| ||||  |||||| |||    
T  34834871 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagatgactcataaactcattgccttaaggttt 34834970  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  34834971 tgggtaagagtgtggtg 34834987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 9482856 - 9482652
Alignment:
Q  30 ggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattgt-gt 128  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  ||   ||| ||| |||||||||  |||||||||||| |||| ||    
T  9482856 ggagaaaccagcaacggcgatacaagcaagta-agagcttccgcttgaagggggcacag--tgaattgttggactcac--ttgagggggagtgttgttgt 9482762  T
Q  129 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggta 228  Q
    | |   ||||||||||||| ||||||  |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||  || |||||||||  ||    
T  9482761 gtacaagtgagttatatgttccacatgggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctaaagattttgtata 9482662  T
Q  229 agagtgtggt 238  Q
    ||||||||||    
T  9482661 agagtgtggt 9482652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 45122070 - 45121959
Alignment:
Q  126 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||  || |||||| ||||||||| | ||||||||||  |||||| ||| ||||  |||||||||||||    
T  45122070 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcattgccttaagattttgg 45121971  T
Q  226 gtaagagtgtgg 237  Q
    |||| |||||||    
T  45121970 gtaacagtgtgg 45121959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3038453 - 3038339
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||| | |||||||| |  || ||| ||||||||  |||||| |||    
T  3038453 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggttt 3038354  T
Q  223 tgggtaagagtgtgg 237  Q
    |||||||||||||||    
T  3038353 tgggtaagagtgtgg 3038339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18373200 - 18373007
Alignment:
Q  18 cggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggg 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  | |||| ||| ||| || ||||||||| ||||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||  |    
T  18373200 cggttcgtttgcggagaaaccagcaggg-cgatacaaacaaatgaagagcttccccttgatgggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagatg 18373102  T
Q  118 gagtattg-tgtgca-agtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccatt 210  Q
    |||| ||| |||| | ||||||| ||||||||||||| || |||  || |||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||| ||| ||||    
T  18373101 gagtgttgttgtgtacagtgtgatttatatgtcccacttcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggactcataaactcatt 18373007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 189
Target Start/End: Original strand, 41972153 - 41972219
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  41972153 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagt 41972219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 177
Target Start/End: Original strand, 6731856 - 6731953
Alignment:
Q  81 gggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaa 177  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||    
T  6731856 gggagcatgatgaatagatggactcacatttgagggggagtgttgttttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaa 6731953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 6877026 - 6876909
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatat-gtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagatt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||| |||| |||||  || |||  || |||| ||||| | ||    
T  6877026 ttgtgtgcaagtgtgagttatatagtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagatgacccatacactcattgtcttagggtt 6876927  T
Q  222 ttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6876926 ttgggtaagagtgtggtg 6876909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 3038201 - 3038099
Alignment:
Q  14 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgc-aagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttg 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||  |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||     
T  3038201 gtgtcggtccgtttgaggagaaaccagcaacggcgatacaaagcaagt-aagagcttccgcttg-agggggagctcgatgaattgatggactcacacttt 3038104  T
Q  113 agggg 117  Q
    |||||    
T  3038103 agggg 3038099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Original strand, 8794106 - 8794222
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||  || | ||||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||| | ||||||||| |||    
T  8794106 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagaataaatgttgaacatcttataagtaagaggactcataaacctaatatcttaaggttt 8794205  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    ||||| |||||| ||||    
T  8794206 tgggtgagagtgcggtg 8794222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 25561972 - 25561865
Alignment:
Q  130 caagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagatttt-gggta 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||| |||| ||||||| |||| |||||    
T  25561972 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttggggta 25561873  T
Q  229 agagtgtg 236  Q
    ||||||||    
T  25561872 agagtgtg 25561865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 123 - 236
Target Start/End: Original strand, 5420646 - 5420759
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||  |||||| |||    
T  5420646 ttgtatgcaagtgtgtattatatgtcccacatcggatagaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttt 5420745  T
Q  223 tgggtaagagtgtg 236  Q
    |  |||||||||||    
T  5420746 tttgtaagagtgtg 5420759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1514079 - 1513963
Alignment:
Q  122 attgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagatt 221  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || | | ||||||| | |||||| ||    
T  1514079 attgtgtacaagtatgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccttaaacccataaccttaaggtt 1513980  T
Q  222 ttgggtaagagtgtggt 238  Q
    |||||||| ||||||||    
T  1513979 ttgggtaaaagtgtggt 1513963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 33113530 - 33113414
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||  || |||||| |||||||  || ||||||||||  || ||| ||| ||||  ||||||||||    
T  33113530 ttgtgtacaagtttgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacgtcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagattt 33113431  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  33113430 tgggtaagagtgtggtg 33113414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1014403 - 1014292
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggt 227  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || | | ||| | ||| |||||  ||||||||    
T  1014403 tgcaagtgtgagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccgtaaactcgttaccttaaagttttgggt 1014304  T
Q  228 aagagtgtggtg 239  Q
    ||||||||||||    
T  1014303 aagagtgtggtg 1014292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 237
Target Start/End: Original strand, 147454 - 147560
Alignment:
Q  131 aagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaag 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| |||| |||||  || ||| |||| |||  |||||  |||||||||||    
T  147454 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctattgccttaaagttttgggtaag 147553  T
Q  231 agtgtgg 237  Q
    |||||||    
T  147554 agtgtgg 147560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9483308 - 9483234
Alignment:
Q  165 agtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9483308 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtg 9483234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20870733 - 20870620
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgg 225  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||  || |||||| |||||||| || ||||||||||  || ||| |||||| |  |||||||||||||    
T  20870733 tgcaagtgtgagttatatatgttccacatcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaagattttgg 20870634  T
Q  226 gtaagagtgtggtg 239  Q
     |||||||||||||    
T  20870633 ataagagtgtggtg 20870620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 70425 - 70324
Alignment:
Q  135 gtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtg 234  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||| || ||||||||||  || ||| |||||| |  |||||| |||| ||||||||||    
T  70425 gtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttaggtaagagtg 70326  T
Q  235 tg 236  Q
    ||    
T  70325 tg 70324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3037865 - 3037774
Alignment:
Q  131 aagtgtgagttatat--gtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagat 220  Q
    |||||||||||||||  || ||||||| |||  || |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||    
T  3037865 aagtgtgagttatatatgttccacatcggatgaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgtcttaagat 3037774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Original strand, 9507819 - 9507891
Alignment:
Q  165 agtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtgg 237  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  9507819 agtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtgg 9507891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Original strand, 32305514 - 32305586
Alignment:
Q  165 agtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtgg 237  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  32305514 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacctataaacccattaccttaagattttggataagagtgtgg 32305586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4154829 - 4154763
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  | ||||||||| | ||||||    
T  4154829 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgatagaaaagtggaggttgaacactttataagt 4154763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 177
Target Start/End: Original strand, 12283868 - 12283922
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaa 177  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  12283868 ttgtgtgcaagtgtaagttatatgtcccacgtcagataaaaaagtaaatgttgaa 12283922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 128 - 239
Target Start/End: Original strand, 30441081 - 30441196
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacc----taataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagatttt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |  || |||||| ||||||||||    | ||||||||||   | ||| ||||||||  |||||| ||||    
T  30441081 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggctaaaatagtaaaggttgaacaccttaattataagtaagagggcccataaacccattgccttaaggtttt 30441180  T
Q  224 gggtaagagtgtggtg 239  Q
    ||||||||||||||||    
T  30441181 gggtaagagtgtggtg 30441196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 233
Target Start/End: Original strand, 9308972 - 9309084
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcc--cacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  || |||||| ||||||||  | ||||||||||  || ||| ||||||||  || ||| |    
T  9308972 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacacatcagataaaagagtaaaagttgaacatgttataagtaagaggacccataaacccattgcctaaaggt 9309071  T
Q  221 tttgggtaagagt 233  Q
    |||||| ||||||    
T  9309072 tttgggcaagagt 9309084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 37544646 - 37544537
Alignment:
Q  130 caagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaa 229  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||  || |||||| ||||||||| | ||||| ||||  || ||| || ||||||  ||||| ||||||||||    
T  37544646 caagtgtgagttataagtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagaaagaggacccataaatccattactttaaggttttgggtaa 37544547  T
Q  230 gagtgtggtg 239  Q
    ||||||||||    
T  37544546 gagtgtggtg 37544537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9620839 - 9620739
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| | ||||| ||| | |||||| |||  || ||| ||| ||||  ||||||||||    
T  9620839 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacaacagatagaaaagtagaagttgatcactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaagattt 9620740  T
Q  223 t 223  Q
    |    
T  9620739 t 9620739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 131 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 43274934 - 43274826
Alignment:
Q  131 aagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaag 230  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||  || |||||| |||||| |  | ||||||||||  || ||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||    
T  43274934 aagtgtgagttatatgtttcacatcagataaaagagtaaaggttgaatatattataagtaagaggacccataaacctattgtcttaaggttttgagtaag 43274835  T
Q  231 agtgtggtg 239  Q
    |||||||||    
T  43274834 agtgtggtg 43274826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 45121865 - 45121749
Alignment:
Q  79 gggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggag---tattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttg 175  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||   | |||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||  || |||||| ||||    
T  45121865 gggggagcacgataaagtgatggactcacacttaagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttgt-tgtcccacatcggataaaagagtaaaggttg 45121767  T
Q  176 aacacctaataagtaaga 193  Q
    | ||||| ||||||||||    
T  45121766 atcaccttataagtaaga 45121749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 135 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 41416322 - 41416264
Alignment:
Q  135 gtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41416322 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 41416264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 20995564 - 20995507
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacac 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||  | |||||||||    
T  20995564 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaaaagtggaggttgaacac 20995507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Original strand, 40518064 - 40518180
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagat--tgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagat 220  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||    ||||||||| ||||||||||| ||||||||    || ||| |||||| |  |||||| |    
T  40518064 ttgtgttcaagtgtgagttatatgttccacattggataaaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaaatggacccataaacccaatgccttaaggt 40518163  T
Q  221 tttgggtaagagtgtgg 237  Q
    |||||||||||||||||    
T  40518164 tttgggtaagagtgtgg 40518180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18380171 - 18380064
Alignment:
Q  132 agtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaaga 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||  || |||||| ||||||||||| |||||||||    |  || |||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  18380171 agtgtgagttatatatcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggggcctataaacccactaccttaaggttttgagtaaga 18380072  T
Q  232 gtgtggtg 239  Q
    ||||||||    
T  18380071 gtgtggtg 18380064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25561792 - 25561737
Alignment:
Q  138 agttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    |||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25561792 agttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 25561737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 9482916 - 9482870
Alignment:
Q  14 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagt 60  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  9482916 gtgtcggtccgtttgcggagaaagcatcaacggcgatacaagcaagt 9482870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 9483079 - 9483033
Alignment:
Q  14 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagt 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  9483079 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccatcaacggcgatataagcaagt 9483033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 237
Target Start/End: Original strand, 9609108 - 9609194
Alignment:
Q  151 acatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtgg 237  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||  || ||| |||||||   |||||  |||| |||||||||||||    
T  9609108 acatcagatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaatgttttcggtaagagtgtgg 9609194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 9609006 - 9609047
Alignment:
Q  1 cggcggtacaagtgtgtcggtccgtttgcggagaaaccagca 42  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  9609006 cggcggtacaagcgtgtcggtccgtttgcgcagaaagcagca 9609047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12156749 - 12156708
Alignment:
Q  195 aactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtg 236  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12156749 aactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 12156708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 132 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 43398225 - 43398164
Alignment:
Q  132 agtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    |||||||||||||| || || ||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  43398225 agtgtgagttatatatctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataaga 43398164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 18645750 - 18645718
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18645750 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatc 18645718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 66)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 237
Target Start/End: Original strand, 2740945 - 2741180
Alignment:
Q  3 gcggtacaagtgtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggg-gagcatgatgatttgatgg 101  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  2740945 gcggtacaatcgtgtcggtccgtttgcagagaaaccagcaacggcgatacgagcaaagtaagagcttccgcttgaaggggagagcatgatgaattgatgg 2741044  T
Q  102 actcacacttgagggggagtattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcat 201  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||| ||||||||||  || |||    
T  2741045 actcacacttgaaggggagtgttatgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccat 2741144  T
Q  202 taacccattatcttaagattttgggtaagagtgtgg 237  Q
     |  |||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  2741145 aactccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 2741180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 239
Target Start/End: Original strand, 54108789 - 54109023
Alignment:
Q  2 ggcggtacaagt-gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatg 100  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  54108789 ggcggtacaagtagtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggcgatacaagcaagta-agagcttccgcttgaagggggagcatgatgaattaata 54108887  T
Q  101 gactcacacttgagggggagtattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactca 200  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||    
T  54108888 gactcacacttaagggggagtgttgtgtgcaagtgtcagt--tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 54108985  T
Q  201 ttaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    | ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  54108986 taaacccattgccttaag-ttttgggtaagagtgtggtg 54109023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 63 - 239
Target Start/End: Original strand, 36629172 - 36629348
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattga 162  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  36629172 agagcttccgcttgaaggtggagcatgatgaattgatgggctcacacttgagggggagtgttgtgttcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataga 36629271  T
Q  163 aaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||||||  || ||| ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  36629272 aaagtaaaagttaaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 36629348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 20826090 - 20826325
Alignment:
Q  1 cggcggtacaagt-gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgat 99  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  20826090 cggcggtacaagcagtgttgatccgtttgcggagaaaccagcaacggcgatacaagcaagta-atagcgtccgcttgaagggggagcatgatgaatagat 20826188  T
Q  100 ggactcacacttgagggggagtattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactc 199  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||| | |||||||||| ||| |    
T  20826189 ggactcacacttgagggggagtgttatgtagaaatgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacacgttataagtaagagaaccc 20826288  T
Q  200 attaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtg 236  Q
    || |||||||   ||||| ||||| ||||||||||||    
T  20826289 ataaacccatagccttaacattttaggtaagagtgtg 20826325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 49076732 - 49076503
Alignment:
Q  4 cggtacaagtgtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatt--tgatgg 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||    ||||||    
T  49076732 cggtacaaacgtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacgacaatacaagcaagta-agagtttccgcttgaagggggaacatgatgaaaagtgatgg 49076634  T
Q  102 actcacacttgagggggagtattgt---gtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaact 198  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||     
T  49076633 actcacacttgaggaggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtaccatatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 49076534  T
Q  199 cattaacccattatcttaagattttgggtaag 230  Q
     || |||||||| |||||| | ||||||||||    
T  49076533 tataaacccattgtcttaa-agtttgggtaag 49076503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3244721 - 3244499
Alignment:
Q  13 tgtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttg 112  Q
    ||||||||||| || || ||||||  || ||||||||| ||||||||   |||||||  | ||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||     
T  3244721 tgtgtcggtccattggcagagaaagtagaaacgacgatacaagcaagca-agagcttgtgtttgaagggggaacatgatgaatagatggactcacgctta 3244623  T
Q  113 agggggagtattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattat 212  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||  || ||| ||| |||| |    
T  3244622 agggagagtgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcattgt 3244523  T
Q  213 cttaagattttgggtaagagtgtg 236  Q
    |||||  |||||||||||| ||||    
T  3244522 cttaaagttttgggtaagaatgtg 3244499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 44621296 - 44621491
Alignment:
Q  1 cggcggtacaagt-gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgat 99  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||    
T  44621296 cggcgatacaagtagtgtcggtccatttgcagagacaccagcaacgacgatacaaacaagtaaagagcttccgctttt-gggggagcacgatgaattgat 44621394  T
Q  100 ggactcacacttgagggggagt---attgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  || |||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  44621395 ggactcacacttgagggggagtgtcgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtccaacatgggataaaacagtaaaggttaaacaccttataagtaaga 44621491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Original strand, 39404288 - 39404509
Alignment:
Q  14 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |     |||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  39404288 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccatcaacggcgatacaagta-----agagcttccgcttg-agggagagcacgatgaattgatggact-acacttga 39404380  T
Q  114 gggggag---tattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccatt 210  Q
    || ||||   | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| || |||||||| ||||||||||  || ||| |||| ||     
T  39404381 ggaggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggtggaacaccttataagtaagaggacccataaacctata 39404480  T
Q  211 atcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
      |||||| ||||||| |||| |||||||    
T  39404481 gccttaaggttttgggcaagaatgtggtg 39404509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 238
Target Start/End: Original strand, 44620568 - 44620769
Alignment:
Q  38 cagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtat---tgtgtgcaagt 134  Q
    |||| ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |   |||||||||||    
T  44620568 cagccacggcgatacaaacaagtaaagagcttccgctttt-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgaggtggagtgtcgttgtgtgcaagt 44620666  T
Q  135 gtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtg 234  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  || |||| | ||||||||| | ||||||||||  || || ||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  44620667 gtgagttatatgtcccacatcggatgaaatagtagaggttgaacactttataagtaagaggaccca-taaaccataaccttaaggttttgggtaagagtg 44620765  T
Q  235 tggt 238  Q
    ||||    
T  44620766 tggt 44620769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 45489618 - 45489380
Alignment:
Q  1 cggcggtacaagt-gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgattt-ga 98  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||    ||    
T  45489618 cggcggtacaagaagtgtcggtccgtttgcggagaacccagcaatagcgatacaagcaagta-agagcttccgcttgaagagg-agcatgatgaaaacga 45489521  T
Q  99 tggactcacacttgag-ggggag---tattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaa 194  Q
    |||||||||||||||| ||||||   | |||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||  || |||||| ||||||||||  ||||||||||     
T  45489520 tggactcacacttgaggggggagtgttgttgtgtacaagtgtgaattatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaagag 45489421  T
Q  195 aactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtg 236  Q
    ||||| | |||| | | | |||||||||| ||||||||||||    
T  45489420 aactcttaaacctactgt-ttaagatttttggtaagagtgtg 45489380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 22028268 - 22028163
Alignment:
Q  4 cggtacaagt-gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatgga 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||||    
T  22028268 cggtacaagtagtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgattcaagcaagt-aagagctttcgcttgaagggggagcacgatgaaaagatgga 22028170  T
Q  103 ctcacac 109  Q
    |||||||    
T  22028169 ctcacac 22028163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 34646810 - 34646694
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| ||| ||||  |||||| |||    
T  34646810 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataactaagaggactcataaactcattgccttaaggttt 34646711  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  34646710 tgggtaagagtgtggtg 34646694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 39793021 - 39792905
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |  | | ||| ||||  |||||| |||    
T  39793021 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagaaagaggaaccgtaaactcattgccttaaggttt 39792922  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  39792921 tgggtaagagtgtggtg 39792905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 16889440 - 16889314
Alignment:
Q  1 cggcggtacaagt-gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatga-tgatttga 98  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||| |||||||||| || | |  |||    
T  16889440 cggcggtacaagtagtgtccgtccgtttgaggagaaaccagcaacgacgatacaaacaagtaaagagcttccgcttg-agggggagcacgattaaagtga 16889342  T
Q  99 tggactcacacttgagggggagtattgt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16889341 tggactcacacttgagggggagtgttgt 16889314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Original strand, 3340802 - 3340918
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||| ||||| ||||| ||||||||||  || ||| |||||| |  |||||| |||    
T  3340802 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccgcatcagatgaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttt 3340901  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  3340902 tgggtaagagtgtggtg 3340918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 36608822 - 36608706
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  |  ||| || ||||| ||||||| |||    
T  36608822 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctcataagtaagaggatccataaatccattgtcttaaggttt 36608723  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  36608722 tgggtaagagtgtggtg 36608706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16888971 - 16888864
Alignment:
Q  129 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggta 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||  || ||| |||| ||||| | |||||||||    
T  16888971 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagagaacctataaactcattgtcttacggttttgggta 16888872  T
Q  229 agagtgtg 236  Q
    ||||||||    
T  16888871 agagtgtg 16888864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4955478 - 4955364
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  || ||| || ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||  |||||| |||    
T  4955478 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcatatcggataaaatagttaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttt 4955379  T
Q  223 tgggtaagagtgtgg 237  Q
    |||||||||||||||    
T  4955378 tgggtaagagtgtgg 4955364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 128 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6975612 - 6975503
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggt 227  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| |||  || |||||| |||||| | || ||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  6975612 tgcaaatgtgagttatatgtctcacatccgataaaatagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggactcataaatccattatcttaagattttgggt 6975513  T
Q  228 aagagtgtgg 237  Q
    ||||||||||    
T  6975512 aagagtgtgg 6975503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1731808 - 1731692
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||| || |||| |||||  || ||| |||| |||  |||||| |||    
T  1731808 ttgtgtgcaaatgtgagttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaacatcttataaataagaggacccataaaccaattgccttaaggttt 1731709  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  1731708 tgggtaagagtgtggtg 1731692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Original strand, 25483331 - 25483447
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  || |||||| |||||||| || ||||||||||  |  ||| ||||||||  |||||| |||    
T  25483331 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttt 25483430  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  25483431 tgggtaagagtgtggtg 25483447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Original strand, 36572014 - 36572130
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||  || |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| || |||||  |||||| |||    
T  36572014 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaagacccataaatccattgccttaaggttt 36572113  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    ||||| ||||| |||||    
T  36572114 tgggttagagtatggtg 36572130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 239
Target Start/End: Original strand, 52884856 - 52884999
Alignment:
Q  99 tggactcacacttgagggg-gagta-ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  |    
T  52884856 tggactcacacttgaggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 52884955  T
Q  197 ctcattaacccattatcttaagatttt-gggtaagagtgtggtg 239  Q
      ||| ||||||||  |||||| |||| |||||||| |||||||    
T  52884956 tccataaacccattgccttaaggttttggggtaagaatgtggtg 52884999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 54017754 - 54017643
Alignment:
Q  125 gtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||| |||||||| || ||||||||||  || ||| ||||||||  |||||| ||||     
T  54017754 gtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacgtcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttta 54017655  T
Q  225 ggtaagagtgtg 236  Q
    ||||||||||||    
T  54017654 ggtaagagtgtg 54017643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 193
Target Start/End: Original strand, 2740695 - 2740765
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2740695 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 2740765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 63 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 18932981 - 18932889
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtatt-gtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatc 155  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| || || || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18932981 agagtttccgcttgaagggggagcatgatgaatagatagactcacacttgaggggg-gtgttggtttgcaagtctgagttatatgtcccacatc 18932889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Original strand, 52884690 - 52884807
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  |   || ||||||||  |||||| |||    
T  52884690 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgatcgataaacccattgccttaaggttt 52884789  T
Q  223 t-gggtaagagtgtggtg 239  Q
    | ||||||||||||||||    
T  52884790 tggggtaagagtgtggtg 52884807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Original strand, 10245915 - 10246030
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||    |||||| |||    
T  10245915 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgccccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggac-cataaacccaaagccttaaggttt 10246013  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  10246014 tgggtaagagtgtggtg 10246030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 41707625 - 41707510
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||  |||||||| | ||| ||| ||| |||| ||||||| |||    
T  41707625 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaaaagaacccataaactcattgtcttaaggttt 41707526  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    | |||||||||||||||    
T  41707525 t-ggtaagagtgtggtg 41707510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 126 - 239
Target Start/End: Original strand, 49302902 - 49303017
Alignment:
Q  126 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaat--aagtaagaaaactcattaacccattatcttaagatttt 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| || ||  ||||||||  || ||| ||||||||  |||||| ||||    
T  49302902 tgtgtaagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaagtaaaggttgaacatcttataaaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 49303001  T
Q  224 gggtaagagtgtggtg 239  Q
    ||||||||||||||||    
T  49303002 gggtaagagtgtggtg 49303017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Original strand, 50002421 - 50002537
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||  || |||||| ||||||||| |  |||||||||  || ||| || ||||| ||||||| |||    
T  50002421 ttgtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttttaagtaagaggacccataaatccattgtcttaaggttt 50002520  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  50002521 tgggtaagagtgtggtg 50002537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 131 - 239
Target Start/End: Original strand, 50459724 - 50459832
Alignment:
Q  131 aagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaag 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | |  || |||||| |||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  50459724 aagtgtgagttatatgttccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattatcttaaggttttaggtaag 50459823  T
Q  231 agtgtggtg 239  Q
    || ||||||    
T  50459824 agcgtggtg 50459832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 54741339 - 54741227
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || |||  ||  ||| ||||||| |||    
T  54741339 ttgtgtgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatacacagattgtcttaaggttt 54741240  T
Q  223 tgggtaagagtgt 235  Q
    ||| |||||||||    
T  54741239 tggataagagtgt 54741227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Original strand, 41370357 - 41370464
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||| ||||||||  |||||  ||||||||    
T  41370357 tgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcggataaaatagtaaatgttgaaaaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaagttttgggt 41370456  T
Q  228 aagagtgt 235  Q
    ||||||||    
T  41370457 aagagtgt 41370464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 50630911 - 50630800
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggt 227  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||  || |||||| ||||||||| | ||||||||||  || ||| ||||||||  |||||| ||||||||    
T  50630911 tgcaagcgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 50630812  T
Q  228 aagagtgtggtg 239  Q
    ||||||||||||    
T  50630811 aagagtgtggtg 50630800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 55933280 - 55933169
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggt 227  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||  || |||||  ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||  |||||  ||||||||    
T  55933280 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaagggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaagttttgggt 55933181  T
Q  228 aagagtgtggtg 239  Q
    ||||||||||||    
T  55933180 aagagtgtggtg 55933169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22183425 - 22183311
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  || |||||||||||||||  | |||||||| |  || ||| ||||||||  |||||| |||    
T  22183425 ttgtgtgcaagtgtgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaatttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggttt 22183326  T
Q  223 tgggtaagagtgtgg 237  Q
    ||| |||||||||||    
T  22183325 tggataagagtgtgg 22183311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 236
Target Start/End: Original strand, 3341093 - 3341236
Alignment:
Q  96 tgatggactcacacttgagggggag---tattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaag 192  Q
    ||||||||||||||||||||  |||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||| ||| ||||| | |||||||||    
T  3341093 tgatggactcacacttgaggcagagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttaaacactttataagtaag 3341192  T
Q  193 aaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtg 236  Q
    |  || ||| |   |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  3341193 aggacccataacatcattgttttaagattttgggtaagagtgtg 3341236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 191
Target Start/End: Original strand, 3700360 - 3700428
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaa 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  3700360 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaa 3700428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 239
Target Start/End: Original strand, 49880160 - 49880271
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||| |  |||||| ||||||||    
T  49880160 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttgggt 49880259  T
Q  228 aagagtgtggtg 239  Q
    ||||| ||||||    
T  49880260 aagagcgtggtg 49880271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Original strand, 54936195 - 54936307
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||| ||||||||||||||    ||||||||||||  || |||||| |||||||||||  |||||||||  || ||| ||||||||  |||||| |||    
T  54936195 ttgtgtacaagtgtgagttat----cccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 54936290  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  54936291 tgggtaagagtgtggtg 54936307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 4390262 - 4390192
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4390262 ttgtgtgcaagtgtgagttacatatcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 4390192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 237
Target Start/End: Original strand, 43174480 - 43174616
Alignment:
Q  105 cacacttgagggggagtattgt---gtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaa-agtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactca 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||   || ||||||||||||||||| | ||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||    
T  43174480 cacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgccacacatcagataaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacaca 43174579  T
Q  201 ttaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtgg 237  Q
    | |||| || | |||||  | ||||||||||||||||    
T  43174580 taaacctatgaccttaaagtgttgggtaagagtgtgg 43174616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 51768221 - 51768115
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||  ||  || |||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| ||| |||| ||||||| |||    
T  51768221 ttgtgtgcaaatgtgagttatatgtcctatatcgaatataagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggactcataaactcattgtcttaaggttt 51768122  T
Q  223 tgggtaa 229  Q
    |||||||    
T  51768121 tgggtaa 51768115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 32941284 - 32941171
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||| |||||| ||||||||||| |||| |||||   ||||| ||| ||||  |||||| |||    
T  32941284 ttgtctgcaagtgtgagttatatgtcttacatcggaaagaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagggctcataaactcattgccttaaggttt 32941185  T
Q  223 tgggtaagagtgtg 236  Q
    ||||||||||||||    
T  32941184 tgggtaagagtgtg 32941171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22028122 - 22028006
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  || |  ||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| |||  |||  |||||| |||    
T  22028122 ttgtgtgcaagtgtgacttatatgtcccacatcggataaaatacgaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacatattgccttaaggttt 22028023  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    ||||||||| |||||||    
T  22028022 tgggtaagaatgtggtg 22028006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 49076991 - 49076876
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |  || |||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| | |||||| |||    
T  49076991 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccatattggctaaaatagtaaaggttgaacaccttata-gtaagagaacccataaacccataaccttaaggttt 49076893  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    ||||| |||||||||||    
T  49076892 tgggttagagtgtggtg 49076876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 63 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 41707387 - 41707340
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacact 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41707387 agagcttccccttgaagggggagcatgatgaattgatggactcacact 41707340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 137 - 236
Target Start/End: Original strand, 44620362 - 44620461
Alignment:
Q  137 gagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtg 236  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  || |||||| ||||||||||| |||| ||||| | | ||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  44620362 gagttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagagcccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 44620461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16889691 - 16889581
Alignment:
Q  129 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggta 228  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||  | |||| |||| | |  |||||  |||||||||    
T  16889691 gcaagtgtgagttatatgtctcaaatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagaggattcataaacctactgccttaaagttttgggta 16889592  T
Q  229 agagtgtggtg 239  Q
    ||||| |||||    
T  16889591 agagtatggtg 16889581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 84
Target Start/End: Original strand, 43174410 - 43174479
Alignment:
Q  14 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaaggggga 84  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  43174410 gtgtcggtctgtttgcggagaaaccaacaacggcgatacaaacaagt-aagagcttccgcttgaaggggga 43174479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 239
Target Start/End: Original strand, 44621011 - 44621113
Alignment:
Q  137 gagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtg 236  Q
    ||||| |||| |||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||   | ||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  44621011 gagttgtatgacccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcacataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 44621110  T
Q  237 gtg 239  Q
    |||    
T  44621111 gtg 44621113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Original strand, 20825831 - 20825947
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||  || |||||| ||||||||||| |||| |||||  || ||| ||||  |   |||||| |||    
T  20825831 ttgtgtacaaatgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagagcacccataaacctttagccttaaggttt 20825930  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  20825931 tgggtaagagtgtggtg 20825947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 143 - 239
Target Start/End: Original strand, 45496820 - 45496916
Alignment:
Q  143 tatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    ||||||||||||| |||  ||  ||||| ||||||||||| ||||||||||  ||  || ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45496820 tatgtcccacatcggataaaatcgtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtg 45496916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 54017865 - 54017750
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgt--cccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagat 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  |||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || |||   |||||| ||||||| |    
T  54017865 ttgtgtgcaaatgtgagttatatatatcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatattcccattgtcttaaggt 54017766  T
Q  221 tttgggtaagagtgtg 236  Q
    ||| ||||||||||||    
T  54017765 tttaggtaagagtgtg 54017750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22028532 - 22028414
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaag--taaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagat 220  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||  ||||   |||| ||||||||||| || |||||||  || ||| ||| |||| ||||||  |    
T  22028532 ttgtgtgcaagtgttacttatatgtcctacatcggataaaaaaaaataaaggttgaacaccttattagtaagaggacccataaactcattgtcttaatgt 22028433  T
Q  221 tttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22028432 tttgggtaagagtgtggtg 22028414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 23817580 - 23817501
Alignment:
Q  4 cggtacaagt-gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggg 82  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| ||| |||||  ||||||||||||||| ||||    
T  23817580 cggtacaagtagtgtcggtctgtttctggagaaaccagcaacaacgatacaaacaagtaaagagcttccgcttgaggggg 23817501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Original strand, 28034224 - 28034338
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||  | ||||||||| | |||||| ||| ||| ||| |||  |||   ||||| |||    
T  28034224 ttgtgtgcaagtgtgaattatatgtcccgcatcggatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagagaacccataaacttattgctttaaggttt 28034323  T
Q  223 tgggtaagagtgtgg 237  Q
    | |||||||||||||    
T  28034324 taggtaagagtgtgg 28034338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Original strand, 39404013 - 39404127
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||   ||  || |||||| ||||||||| | ||||||||||  |||||| ||| |||    ||||| |||    
T  39404013 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcctacattgaataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcatagcattaaggttt 39404112  T
Q  223 tgggtaagagtgtgg 237  Q
    |||||||||||||||    
T  39404113 tgggtaagagtgtgg 39404127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 167
Target Start/End: Original strand, 12197373 - 12197417
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagt 167  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  12197373 ttgtgtgcaagtgtgagttataggtcccacatcaaatagaaaagt 12197417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 34004746 - 34004675
Alignment:
Q  121 tattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  34004746 tattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatatga-taaaaactaaaggttgaacaacttataagtaaga 34004675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 150 - 236
Target Start/End: Original strand, 3271806 - 3271895
Alignment:
Q  150 cacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaat---aagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtg 236  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||   |||||||| ||| ||| |||| |||  |||||| |||||||||||||||||    
T  3271806 cacatcagatagaaaagtaaaagttaaacaccttattataagtaagagaacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 3271895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 54343147 - 54343092
Alignment:
Q  138 agttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    |||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  54343147 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 54343092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 193
Target Start/End: Original strand, 44620291 - 44620361
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||||  |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44620291 ttgtgtacaaatatgagttatatgtcccacatgggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 44620361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 156
Target Start/End: Original strand, 45050596 - 45050629
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatca 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45050596 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatca 45050629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 50788139 - 50788087
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacac 180  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||  || |||||| |||||||||    
T  50788139 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 50788087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1394 - 1153
Alignment:
Q  1 cggcggtacaagt-gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgat 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |   |||    
T  1394 cggcggtacaagtagtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatacaagcaagt-aagagcttccgctcgaagggggagcatgatcaaaagat 1296  T
Q  100 ggactcacacttgaggggga---gtattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||    | |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||| ||||||||||| ||||| || |  |    
T  1295 ggactcacacttgagggggaatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagaaaaagga 1196  T
Q  197 ctcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    ||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||    
T  1195 ctcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtatggtg 1153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 3254 - 3092
Alignment:
Q  20 gtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaag-caagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgaggggg 118  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3254 gtccgtttgcggagaacccaacaacggcgatacaaatcaagta-agagcttccgcttgaagggggagcatgatgagttgatggactcacacttgaggggg 3156  T
Q  119 ag---tattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaaca 179  Q
    ||   | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||    
T  3155 agtgttgttgtgtgcaggtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaaca 3092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 1574 - 1466
Alignment:
Q  14 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacg--atgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacactt 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  |  || |||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  1574 gtgtaggtccgtttgcggagaaaccagcaacgttgtgatacaagcaagtaaa-agctttcgctggaagggggagcatgatgaatcgattgactcacactt 1476  T
Q  112 gagggggagt 121  Q
    ||||||||||    
T  1475 gagggggagt 1466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 65)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28531584 - 28531360
Alignment:
Q  13 tgtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttg 112  Q
    |||||| ||||||||  ||||||| || |||||||||| |||||||||  | ||||||| |||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28531584 tgtgtcagtccgtttatggagaaagcaacaacgacgatacaagcaagta-atagcttccacttgaaggg--agcatgatgaactgatggactcacacttg 28531488  T
Q  113 agggggagtattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattat 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||   | ||| ||| ||||      
T  28531487 agggggagtgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagcaaaggttgaacaccttataagtaagaggtcccataaactcattgc 28531388  T
Q  213 cttaagattttgggtaagagtgtggtga 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28531387 cttaagattttgggtaagagtgtggtga 28531360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40679894 - 40679678
Alignment:
Q  14 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttga 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  | || ||||||||     ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  40679894 gtgtcggtccgtt-gcggagaaaccagcaactgcaatacaagcaag-----agcttccgcttga-gggggagcatgatgaatagatggactcacacttga 40679802  T
Q  114 gggggagtattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatc 213  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||   |    
T  40679801 gggggagtgttgtgtgcaaatgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaagggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacccatcgcc 40679702  T
Q  214 ttaagattttgggtaagagtgtgg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  40679701 ttaagattttgggtaagagtgtgg 40679678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 239
Target Start/End: Original strand, 6421989 - 6422221
Alignment:
Q  2 ggcggtacaagt-gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatg 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||  | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6421989 ggcggtacaagtagtgtcggttcgtttgcggagaaaccagcaacgacaatacaagctagtaaaaaacttccgcttgaagggggagcatgatgaattgatg 6422088  T
Q  101 gactcacacttgagggggagtattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactca 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||      ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| | |||| |||||  || ||    
T  6422089 gactcacacttgagggggagtcttgtgtgcaaatgtg------atgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacacattataattaagaggaccca 6422182  T
Q  201 ttaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    | |||||||   |||||| |||| |||||||||||||||    
T  6422183 taaacccatagccttaaggttttaggtaagagtgtggtg 6422221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 193
Target Start/End: Original strand, 7598500 - 7598674
Alignment:
Q  19 ggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgaggggg 118  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  7598500 ggtctgtttacggagaaaccaacaacgacgatacaagcaagtaaagagcttccgcttgaaggggg-gcatgatgaatagatggactcacacttgagaggg 7598598  T
Q  119 agtattg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7598599 agtgttggtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 7598674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 38796487 - 38796311
Alignment:
Q  20 gtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgattt-gatggactcacacttgaggggg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  38796487 gtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatacaagcaagta-agatcttccgcttgaagggggagcatgatgaaaaagatggactcacacttgaggggg 38796389  T
Q  119 agtattgt---gtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    ||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38796388 agtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaaga 38796311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 36785850 - 36785667
Alignment:
Q  1 cggcggtacaagt-gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgat 99  Q
    ||||||||||||  || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  36785850 cggcggtacaagcagtatcgatccgtttgcagagaaaccagcaacgacgatacaaccaagta-agagcttccgcttga-gggggagcatgatgaattgat 36785753  T
Q  100 ggactcacacttgagggggagtattgt---gtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacct 182  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| |||||||||||    
T  36785752 ggactcacactttagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct 36785667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 3672968 - 3673111
Alignment:
Q  14 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3672968 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacaatacatgcaaagtaaaagcttccgcttgaagagggagcatgatgaattgatggactcacacttga 3673067  T
Q  114 gggggag---tattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacat 154  Q
    || ||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3673068 ggaggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacat 3673111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 63 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 5542849 - 5542672
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtatt-gtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattg 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||  ||      
T  5542849 agagcttccgcttgaaggggaagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccatatcgaataa 5542750  T
Q  162 aaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| |||| |||  |||||| |||| |||||||||||||||    
T  5542749 aatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaggtttttggtaagagtgtggtg 5542672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Original strand, 42514901 - 42515078
Alignment:
Q  14 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttga 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  42514901 gtgtcggtccgtt-gcggagaaaccagcaacagcgatacaagcaagta-agagcttccgcttga-gagggagcatgatgaatagatggactcacatttga 42514997  T
Q  114 gggggagtattgtgtgcaagtgtgagtta----tatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagta 190  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  42514998 gggggagtgttgtgtgcaggtgtgagttatatgtatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacaccttataagta 42515078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 37894957 - 37894739
Alignment:
Q  27 tgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagt-ggagagcttccgcttgaagggggag-----catgatgatttgatggactcacacttgagggggag 120  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||| || ||| ||     |||||||| | |||||||||| |||| ||||||||    
T  37894957 tgcggagaaatcagcaacgacgatacaagtaagtaagagagcttccgctttaaagggaagcataacatgatgaatagatggactcatacttaagggggag 37894858  T
Q  121 tattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagat 220  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||   || |||||||||| | | || |||| ||||||||||| |||||| || |||||  ||||||||    
T  37894857 tattgtgtgcaaatgtgagttatatgtcccacattgaatagaaaagtaaaggctaaaaaccttataagtaagaagactcataaatccattgccttaagat 37894758  T
Q  221 tttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    ||||| ||| |||||||||    
T  37894757 tttggttaaaagtgtggtg 37894739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 239
Target Start/End: Original strand, 37106156 - 37106299
Alignment:
Q  97 gatggactcacacttgagggggagtattg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||      
T  37106156 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 37106255  T
Q  196 actcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    || ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  37106256 acccataaacccatttccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 37106299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 63 - 193
Target Start/End: Original strand, 40733815 - 40733948
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggag---tattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  40733815 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaat 40733914  T
Q  160 tgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
      || ||||||  || ||||||| ||||||||||    
T  40733915 aaaagagtaaagatttaacaccttataagtaaga 40733948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 89 - 239
Target Start/End: Original strand, 40733475 - 40733628
Alignment:
Q  89 gatgatttgatggactcacacttgagggggagt---attgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaat 185  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  40733475 gatgaattgatagactcacacttgaggggaagtgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaatgttgaacaccttat 40733574  T
Q  186 aagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    ||||||||  || ||| |||| |  | |||||  ||||||||||||||||||||    
T  40733575 aagtaagaggacccataaacctacaaccttaaagttttgggtaagagtgtggtg 40733628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Original strand, 42514644 - 42514758
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||   ||||||||||    
T  42514644 ttgtatgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgccttaagattt 42514743  T
Q  223 tgggtaagagtgtgg 237  Q
    |||||||||||||||    
T  42514744 tgggtaagagtgtgg 42514758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 123 - 236
Target Start/End: Original strand, 962593 - 962706
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||  || ||| |||||||| ||||||| |||    
T  962593 ttgtatgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgtcttaaggttt 962692  T
Q  223 tgggtaagagtgtg 236  Q
    ||||||||||||||    
T  962693 tgggtaagagtgtg 962706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 36178460 - 36178320
Alignment:
Q  96 tgatggactcacacttgagggggagtattg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||  || |||||| || |||||||| |||||||||      
T  36178460 tgatggactcacacttgagggggactgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacttcggataaaatagtaaaggtggaacaccttataagtaaggg 36178361  T
Q  195 aactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgt 235  Q
     |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  36178360 gactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 36178320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 63 - 237
Target Start/End: Original strand, 30313111 - 30313286
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggag--tattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatt 160  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||     
T  30313111 agagcttccgcttgaggggtgagcatgatgaattgttggactcacacttgaggggaagattgttgtgtgcaagcgtgtgttatatgtctcacatcggata 30313210  T
Q  161 gaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtgg 237  Q
    |||||||  | ||||||||| || ||||| |||  || ||  ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  30313211 gaaaagtggaggttgaacactta-taagtgagaggacccaaaaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtgg 30313286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 63 - 237
Target Start/End: Original strand, 30323397 - 30323573
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggag--tattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatt 160  Q
    ||||| ||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||     
T  30323397 agagcatccgcttgagggatgagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagattgttgtgtgcaagtgtgtgttatatgtcccaaatcagata 30323496  T
Q  161 gaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtgg 237  Q
    ||||| |  | ||||||||| | | |||| |||  ||  || ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  30323497 gaaaattggaggttgaacactttagaagtgagaggacctataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 30323573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 33561670 - 33561501
Alignment:
Q  67 cttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaag 166  Q
    ||||| ||||| |||||||   ||||| ||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  33561670 cttccccttgaggggggagtgcgatgaattgatggacacgcacttgatggggaatgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcagatagaaaag 33561571  T
Q  167 taaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtg 236  Q
    |  | ||| ||||| | |||||| |||  || ||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  33561570 tggaggttaaacactttataagtgagaggacccataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 33561501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 63 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14745517 - 14745343
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtatt-gtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattg 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||| ||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||  ||      
T  14745517 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgaatagatgtactcaaacttga-ggggagtgttggtttgcaactgtgagttatatgtcccacatcgaataa 14745419  T
Q  162 aaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtgg 237  Q
    || |||||  |||||||| ||  |||||| ||  || ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  14745418 aatagtaatggttgaacatcttgtaagtatgaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 14745343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 128 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 36178763 - 36178652
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||  |||||| ||||||||    
T  36178763 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 36178664  T
Q  228 aagagtgtggtg 239  Q
    ||||||||||||    
T  36178663 aagagtgtggtg 36178652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 63 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 41678592 - 41678487
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattgtgtgcaagtgtgagtt--atatgtcccacatcagatt 160  Q
    ||||||||||||||| | | |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||     
T  41678592 agagcttccgcttgaggagagagcattatgaattgatggactcacacttgaaggggagtgttgtgtgcaagtgtgagttatatatgtctcacatcagata 41678493  T
Q  161 gaaaag 166  Q
    ||||||    
T  41678492 gaaaag 41678487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 28254400 - 28254284
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||  || ||| ||| ||||  |||||| |||    
T  28254400 ttgtgtgccagtgtgacttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttt 28254301  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  28254300 tgggtaagagtgtggtg 28254284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 128 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 5543156 - 5543045
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  |  ||| |||| |||  |||||||||||||||    
T  5543156 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaagattttgggt 5543057  T
Q  228 aagagtgtggtg 239  Q
    ||||||||||||    
T  5543056 aagagtgtggtg 5543045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Original strand, 15880258 - 15880372
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||  |||||| |||    
T  15880258 ttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 15880357  T
Q  223 tgggtaagagtgtgg 237  Q
    |||||||||||||||    
T  15880358 tgggtaagagtgtgg 15880372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 130 - 239
Target Start/End: Original strand, 6421387 - 6421496
Alignment:
Q  130 caagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| ||||  ||| || ||||||||||    
T  6421387 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttgaggttttgggtaa 6421486  T
Q  230 gagtgtggtg 239  Q
    ||||||||||    
T  6421487 gagtgtggtg 6421496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 128 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14745825 - 14745716
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||  |||||| ||||||||    
T  14745825 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 14745726  T
Q  228 aagagtgtgg 237  Q
    ||||||||||    
T  14745725 aagagtgtgg 14745716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 37895224 - 37895108
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||| |||| | |||||| | ||| ||| ||||||||  |||||| |||    
T  37895224 ttgtgtgcgagtttgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaagttgaaaaccttaaaagtaaaagaacacataaacccattgccttaaggttt 37895125  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  37895124 tgggtaagagtgtggtg 37895108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35580886 - 35580776
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || | |||||||||||||||| |||||| |||  || ||| ||||||||  |||||| |||    
T  35580886 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacaataaatgttgaacaccttataagtgagaggac-cataaacccattgccttaaggttt 35580788  T
Q  223 tgggtaagagtg 234  Q
    ||||||||||||    
T  35580787 tgggtaagagtg 35580776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 239
Target Start/End: Original strand, 37105924 - 37106035
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||  || |||||| ||||||||||| |||||||||   || ||| ||| ||||  |||||||||||||||    
T  37105924 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaggggacccataaactcattgccttaagattttgggt 37106023  T
Q  228 aagagtgtggtg 239  Q
    ||||||||||||    
T  37106024 aagagtgtggtg 37106035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15511656 - 15511542
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||| | |||  || |||||| ||||||||| | ||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||||    
T  15511656 ttgtgtgcaagtg--agttatatgtcacacaacggataaaagagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaagattt 15511559  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  15511558 tgggtaagagtgtggtg 15511542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 35580650 - 35580532
Alignment:
Q  23 cgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggag-- 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||  | ||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||      
T  35580650 cgtttgcggagaaaccaacaacgacaatacgagcaagtaaa-agcttccccttgaaggaggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggagagtg 35580552  T
Q  121 -tattgtgtgcaagtgtgag 139  Q
     | |||||||||||||||||    
T  35580551 ctgttgtgtgcaagtgtgag 35580532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Original strand, 16542444 - 16542556
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| |||| |||||  ||| || ||| ||||  ||||||||||    
T  16542444 ttgtgtgcaagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacttataaactcattgccttaagattt 16542543  T
Q  223 tgggtaagagtgt 235  Q
    || ||||||||||    
T  16542544 tgagtaagagtgt 16542556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29873730 - 29873587
Alignment:
Q  95 ttgatggactcacacttgagggggag--tattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaag 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||  | ||||||  |    
T  29873730 ttgatggactcacacttgagggggagattgttgtgtgcaagggtgtgttacatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacattttataagtggg 29873631  T
Q  193 aaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtg 236  Q
    |  |||||| ||| ||||  |||||| ||||| |||||||||||    
T  29873630 aggactcataaactcattgccttaaggttttgagtaagagtgtg 29873587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 33953947 - 33953821
Alignment:
Q  110 ttgagggggagtattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccat 209  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  | |||||||||   |||||| |||  || ||| ||||  |    
T  33953947 ttgagggggagtgttgtgtgcaaatgtgagttataagtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactatataagtgagaggacccataaacctgt 33953848  T
Q  210 tatcttaagattttgggtaagagtgtg 236  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  33953847 tgccttaaaattttgggtaagagtgtg 33953821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 36006042 - 36005929
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||| ||||  |||||| |||    
T  36006042 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaa-gtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttt 36005944  T
Q  223 tgggtaagagtgtgg 237  Q
    ||||||| |||||||    
T  36005943 tgggtaaaagtgtgg 36005929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 38796783 - 38796673
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || | |||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| |||| | |  |||||| |||    
T  38796783 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaacaataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaaggttt 38796684  T
Q  223 tgggtaagagt 233  Q
    |||||||||||    
T  38796683 tgggtaagagt 38796673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 146 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 36178311 - 36178218
Alignment:
Q  146 gtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| |||||||||  ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  36178311 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggaacccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtg 36178218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 40163520 - 40163419
Alignment:
Q  139 gttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatc-ttaagattttgggtaagagtgtgg 237  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || |||||||| | | || ||||| |||||||||| |||||||    
T  40163520 gttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccattaacctagtgtctttaaggttttgggtaaaagtgtgg 40163421  T
Q  238 tg 239  Q
    ||    
T  40163420 tg 40163419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 128 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41283633 - 41283524
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||| ||||  |||||| |||| |||    
T  41283633 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttaggt 41283534  T
Q  228 aagagtgtgg 237  Q
    ||||||||||    
T  41283533 aagagtgtgg 41283524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 31899589 - 31899519
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31899589 ttgtgtgaaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaaga 31899519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 193
Target Start/End: Original strand, 1769889 - 1769957
Alignment:
Q  125 gtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1769889 gtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaaga 1769957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 182
Target Start/End: Original strand, 29676851 - 29676957
Alignment:
Q  79 gggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattgt---gtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttg 175  Q
    ||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| || ||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| |||     
T  29676851 gggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggggtgtgttgttgtgtgcaggtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttt 29676950  T
Q  176 aacacct 182  Q
    |||||||    
T  29676951 aacacct 29676957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 33954424 - 33954380
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagt 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33954424 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagt 33954380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 37632760 - 37632644
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || |||||| |||  |||  | ||||||||||  || ||| ||||||| |  ||||| |||    
T  37632760 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggtttgacattttataagtaagaggacccataaacccataactttaaggttt 37632661  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  37632660 tgggtaagagtgtggtg 37632644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 193
Target Start/End: Original strand, 6712978 - 6713041
Alignment:
Q  130 caagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||  || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6712978 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaaga 6713041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 150
Target Start/End: Original strand, 40734231 - 40734300
Alignment:
Q  84 agcatgatgatttgatggactcacacttgagggggag---tattgtgtgcaagtgtgagttatatgtccc 150  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40734231 agcacgatgaattgatggaatcacacttgagggggagtgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtccc 40734300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 55
Target Start/End: Original strand, 6421641 - 6421690
Alignment:
Q  6 gtacaagtgtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaag 55  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6421641 gtacaagcgtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacaacgatacaag 6421690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Original strand, 12910223 - 12910340
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||| | ||||||| ||| |||||| | |  ||| || ||  |||| ||||||| |||    
T  12910223 ttgtgtgtaagtttgagttatatgttccacatcggatggaaaagtacaggttgaaccccttataagtgaaatgacttataaattcattgtcttaaggttt 12910322  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtga 240  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  12910323 tgggtaagagtgtagtga 12910340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29874185 - 29874072
Alignment:
Q  124 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagatttt 223  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||| | |||| |  ||  || ||| ||||||||  |||||| ||||    
T  29874185 tgtgtacaagtgtgtgttatatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataattgggaggacccataaacccattgccttaaggtttt 29874086  T
Q  224 gggtaagagtgtgg 237  Q
    || |||||||||||    
T  29874085 ggataagagtgtgg 29874072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 31259782 - 31259664
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatca---gattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaaga 219  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||   |||  || |||||| ||| ||||||| ||||||||||  || ||| |||| || | ||||||     
T  31259782 ttgtgtgtaagtgcgagttatatgtctcacatcatcggataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagatgacccataaacctatcaccttaagg 31259683  T
Q  220 ttttgggtaagagtgtggt 238  Q
    |||||||||||||||||||    
T  31259682 ttttgggtaagagtgtggt 31259664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Original strand, 5367450 - 5367564
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||| ||| |||  || || ||| ||||||||||| ||||||||||  |  ||| ||| ||| | |||||| |||    
T  5367450 ttgtgtacaagtgtgatatatatgtcccagatcggataaaagagcaaaggttgaacaccttataagtaagatgatccatgaacacataaccttaaggttt 5367549  T
Q  223 tgggtaagagtgtgg 237  Q
    |||||||||||||||    
T  5367550 tgggtaagagtgtgg 5367564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 31468909 - 31468855
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaa 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||    
T  31468909 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaa 31468855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 43443145 - 43443103
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaa 165  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  43443145 ttgtgtgcaagtgtaagttatatgtcccacatcagatagaaaa 43443103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 7281433 - 7281384
Alignment:
Q  95 ttgatggactcacacttgagggggagtattgtgtgcaagtgtgagttata 144  Q
    |||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  7281433 ttgatgaactcacacttgatggagaatattgtgtgcaagtgtgagttata 7281384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 156
Target Start/End: Original strand, 16590883 - 16590916
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatca 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16590883 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatca 16590916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 179
Target Start/End: Original strand, 9231244 - 9231300
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaaca 179  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  9231244 ttgtgtgtaagtatgagttatatgtctcatatcagatagaaaagtaaaggttgaaca 9231300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12529191 - 12529104
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccatt 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  || ||||||  |||||||||  ||||||||||  |||||| ||| ||||    
T  12529191 ttgtatgcaagtgtgagttatatgtcctacatcaaataaaacagtaaagattgaacaccgtataagtaagaggactcataaactcatt 12529104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 71 - 126
Target Start/End: Original strand, 34481588 - 34481643
Alignment:
Q  71 cgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattgt 126  Q
    ||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  34481588 cgcttgaggcgggagcgtgatgaattgatggactcacacttgagggagagtgttgt 34481643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 106
Target Start/End: Original strand, 40734188 - 40734231
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactca 106  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  40734188 agagcttccgcttgaagggagaacatgatgaattgatggactca 40734231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 231
Target Start/End: Original strand, 7598225 - 7598331
Alignment:
Q  125 gtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttg 224  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||  || |||||||||| ||| ||||||| |||| |||||  || ||| ||| |||   |||||| |||||    
T  7598225 gtgtgcaagtgtgaattatatgttctacatcgaatagaaaagtaaaggttcaacaccttataaataagaggacccataaactcatagccttaaggttttg 7598324  T
Q  225 ggtaaga 231  Q
    |||||||    
T  7598325 ggtaaga 7598331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 239
Target Start/End: Original strand, 33731653 - 33731759
Alignment:
Q  133 gtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagag 232  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||  || |||||| ||||| ||||| ||||||||||  |  ||| |||| |||  |||||| |||||||||||||    
T  33731653 gtgtgagttatatatctcacatcggataaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaaggttttgggtaagag 33731752  T
Q  233 tgtggtg 239  Q
    | |||||    
T  33731753 tatggtg 33731759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 155
Target Start/End: Original strand, 3672714 - 3672746
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatc 155  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3672714 ttgtgtgcaagtatgagttatatgtcccacatc 3672746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 239
Target Start/End: Original strand, 3672776 - 3672812
Alignment:
Q  203 aacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  3672776 aacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtg 3672812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 50
Target Start/End: Original strand, 23346502 - 23346538
Alignment:
Q  14 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgat 50  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  23346502 gtgtcggtctgtttgcggagaaaccagcaacggcgat 23346538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10074235 - 10074038
Alignment:
Q  41 caacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattgtgtgcaagtgtgagt 140  Q
    ||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10074235 caacggcgatacaagcaagta-agagcttccgcttgaagggggagcatgatgaattgatagactcgcacttgagggggagtgttgtgtgcaagggtgagt 10074137  T
Q  141 tatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||    
T  10074136 tatatatcccacatcggatagaaaagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaaagtgtggtg 10074038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Original strand, 29518806 - 29519031
Alignment:
Q  14 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttga 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||  || ||||    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29518806 gtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttga 29518904  T
Q  114 gggggagtattg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattat 212  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||     
T  29518905 gggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattac 29519004  T
Q  213 cttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  29519005 cttaaggttttgggtaagagtgtggtg 29519031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 210
Target Start/End: Original strand, 16107948 - 16108145
Alignment:
Q  14 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttga 113  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16107948 gtgtcggtctgtttgcgaagaaaccagcaacggcgatgcaagaaagta-agagcttccgcttgaagggg-agcatgatgaattgatggactcacacttga 16108045  T
Q  114 gggggagtattgt---gtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccatt 210  Q
    |||||||| ||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  16108046 gggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcagataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatt 16108145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10073894 - 10073663
Alignment:
Q  4 cggtacaagtgtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggac 103  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||   ||| |||| ||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  10073894 cggtacaaacgtgtcggtccgtt-gcggagaaaccatcaacagtgatacaagaaagta-agaccttccgcttgaagggggaacatgatgaattgatggac 10073797  T
Q  104 tcacacttgagggggagtattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcatta 203  Q
    |||||||| || ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |  ||| |    
T  10073796 tcacacttaagagggggtgttgtgtgcaagtgttagttatatgtcccacatcgga--gaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataa 10073699  T
Q  204 acccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    || ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  10073698 actcattggcttaagattttgggtaagagtgtggtg 10073663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 89 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10074560 - 10074410
Alignment:
Q  89 gatgatttgatggactcacacttgagggggagtattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataag 188  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  10074560 gatgaattgatggactcacacttaagggggagtgttgtgtgcaagtgtgagttagaggtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataag 10074461  T
Q  189 taagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||  || ||| ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10074460 taagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 10074410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 63 - 239
Target Start/End: Original strand, 2378061 - 2378237
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattg 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  2378061 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgaataaatggactcacatttg-gggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataa 2378159  T
Q  162 aaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||    
T  2378160 aatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttaggtaagaatgtggtg 2378237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 63 - 237
Target Start/End: Original strand, 16454839 - 16455016
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattgt---gtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  16454839 agagcttccgcttgaagggggagcatgctgaattgatggagtcacagttgagggggagtgttgttgtgtacaaatgtgagttatgtgtcccacatcagat 16454938  T
Q  160 tgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtgg 237  Q
      || |||||| ||||||||||| |||||||| |  || ||| |||| |||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  16454939 aaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaataggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 16455016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 2579382 - 2579203
Alignment:
Q  14 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagca---tgatgatttgatggactcacact 110  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||   |||||| | ||||||||||||||    
T  2579382 gtgtcggtctgtttgcagagaaaccagcaacggcgatacaaacaagta-agagcttccgcttgaaaggggagcaacatgatgaatagatggactcacact 2579284  T
Q  111 tgagggggagtattgt---gtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataag 188  Q
    ||||||||||| ||||   || ||||||| |||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| |||||    
T  2579283 tgagggggagtgttgttgtgtacaagtgttagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataag 2579203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2578725 - 2578490
Alignment:
Q  14 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtg-gaga----gcttccgcttgaagggggagca---tgatgatttgatggactc 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  |||     |||||||||||||  |||||||   |||||| | |||||||||    
T  2578725 gtgtcggtctgtttgcggagaaaccaacaacggcgatacaagcaagtaagagcttccgcttccgcttgaaaagggagcagcatgatgaatagatggactc 2578626  T
Q  106 acacttgagggggagtattgt---gtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcatt 202  Q
    |||||||||||||||| ||||   || |||||||||||||||||||||||| | |||  || |||||| ||||||||| | ||||||||||  || |||     
T  2578625 acacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccaca-cggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccata 2578527  T
Q  203 aacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||   |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2578526 aacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 2578490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 180
Target Start/End: Original strand, 33605875 - 33606027
Alignment:
Q  26 ttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||  || ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  33605875 ttgcggagaaaccagcaacgacgatacaagcaagta-agagcttccgctcgaagaagg-gcacggtgaattgatggactcacacttgagggggagtgatg 33605972  T
Q  126 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacac 180  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||  | |||||||||    
T  33605973 tgtgcaaatgtaagttatatgtcccacatcgaatagaaaagtggaggttgaacac 33606027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 239
Target Start/End: Original strand, 3409627 - 3409771
Alignment:
Q  96 tgatggactcacacttgagggggagtattg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||| |||||||| || ||||||||||     
T  3409627 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtaccacatcagataaaatagtaaaagttgaacatcttataagtaagag 3409726  T
Q  195 aactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
     || ||| ||||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  3409727 gacccataaacccattgcctttattttttgggtaagagtgtggtg 3409771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 95 - 239
Target Start/End: Original strand, 8481892 - 8482037
Alignment:
Q  95 ttgatggactcacacttgagggggag--tattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaag 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||  | ||||||||| | |||| | ||    
T  8481892 ttgatggactcacacttgagggggagattgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcagatataaaagtggaggttgaacactttataaatgag 8481990  T
Q  193 aaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  8481991 atgactcataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggtg 8482037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 128 - 239
Target Start/End: Original strand, 29518503 - 29518614
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  29518503 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 29518602  T
Q  228 aagagtgtggtg 239  Q
    ||||||||||||    
T  29518603 aagagtgtggtg 29518614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 128 - 239
Target Start/End: Original strand, 32741179 - 32741290
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  32741179 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 32741278  T
Q  228 aagagtgtggtg 239  Q
    ||||||||||||    
T  32741279 aagagtgtggtg 32741290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 193
Target Start/End: Original strand, 2975466 - 2975617
Alignment:
Q  41 caacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattgtgtgcaagtgtgagt 140  Q
    |||||||||| | |||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  |||||| |||    
T  2975466 caacgacgatacgagcaagta-agagcttccgcttaaagggggaacatgatgaatagatgcactcacacttg-gggggagtgttgtgtttaagtgtaagt 2975563  T
Q  141 tat-atgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
     || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  2975564 aattatgtcccacatcaaatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagcaaga 2975617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2579016 - 2578882
Alignment:
Q  104 tcacacttgagggggagtattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcatta 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||| || | |||||||||||||||| |||| |||| |||||  |  ||| |    
T  2579016 tcacacttgagggggagtgttgtgagcaagtgtgatttatatgtccctcatcgga-taaaaagtaaatgttgaataccttataaataagaggatccataa 2578918  T
Q  204 acccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2578917 actcattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 2578882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 128 - 239
Target Start/End: Original strand, 3409259 - 3409370
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||| ||||  |||||| ||||||||    
T  3409259 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggt 3409358  T
Q  228 aagagtgtggtg 239  Q
    ||||||||||||    
T  3409359 aagagtgtggtg 3409370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2579760 - 2579539
Alignment:
Q  18 cggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||   ||| ||| |||    ||||||| |||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||     
T  2579760 cggtccatttgcggagaaaccaacaacagagatacaaacaaagtaagagctttcgcttgaagggggaccatgatgaatagacggactcacacttgaggga 2579661  T
Q  118 gagtattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaa 217  Q
    |||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| || | | |||| ||||||||||   | ||| ||| ||||  |||||    
T  2579660 gagtgttgttagcaggtgtgagttatatgtcccacatcggacaaaaaagtaaaggtcggataccttataagtaagagggcccataaactcattgccttaa 2579561  T
Q  218 gattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    | |||||||||| ||| |||||    
T  2579560 ggttttgggtaaaagtatggtg 2579539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 63 - 237
Target Start/End: Original strand, 6071065 - 6071241
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggag--tattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatt 160  Q
    |||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||     
T  6071065 agagcttccgtttaaggggtgagcatgatgaattgatggactcacatttgaggggaagattgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaata 6071164  T
Q  161 gaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtgg 237  Q
    |||||||  | ||||||||| | |||||| |||  |  ||| ||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  6071165 gaaaagtggaggttgaacactttataagtgagatgatccataaactcattgccttaagattttggataagagtgtgg 6071241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Original strand, 16107673 - 16107789
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||  ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||  |||||| |||    
T  16107673 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtgtcacatcggataaaaaagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttt 16107772  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  16107773 tgggtaagagtgtggtg 16107789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Original strand, 16454570 - 16454684
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  || | |||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||  ||||||||||    
T  16454570 ttgtgtacaagtgtgagttatgtgtcccacatcagataaaagaataaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattt 16454669  T
Q  223 tgggtaagagtgtgg 237  Q
    ||| |||||||||||    
T  16454670 tggataagagtgtgg 16454684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 128 - 237
Target Start/End: Original strand, 1127360 - 1127469
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggt 227  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| | |  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  1127360 tgcaactgtgagttatatatcccacatcgggtaaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaaggttttgggt 1127459  T
Q  228 aagagtgtgg 237  Q
    ||||||||||    
T  1127460 aagagtgtgg 1127469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 130 - 239
Target Start/End: Original strand, 2377756 - 2377865
Alignment:
Q  130 caagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||  |||||| ||||||||||    
T  2377756 caagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 2377855  T
Q  230 gagtgtggtg 239  Q
    ||||||||||    
T  2377856 gagtgtggtg 2377865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 32460733 - 32460630
Alignment:
Q  133 gtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagag 232  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  32460733 gtgtgagttatatgtcccacatcgtataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 32460634  T
Q  233 tgtg 236  Q
    ||||    
T  32460633 tgtg 32460630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 239
Target Start/End: Original strand, 35210204 - 35210315
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggt 227  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| || |||||  |||||| ||||||||    
T  35210204 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaaccattgccttaaggttttgggt 35210303  T
Q  228 aagagtgtggtg 239  Q
    ||||||||||||    
T  35210304 aagagtgtggtg 35210315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2580035 - 2579919
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||| | ||||||||||  || ||| ||||||    |||||| |||    
T  2580035 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccacagccttaaggttt 2579936  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    ||||||||| |||||||    
T  2579935 tgggtaagaatgtggtg 2579919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 593868 - 593757
Alignment:
Q  127 gtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttggg 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| | |  |||||| |||||||    
T  593868 gtgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaaccgactgccttaaggttttggg 593769  T
Q  227 taagagtgtggt 238  Q
    ||| ||||||||    
T  593768 taatagtgtggt 593757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 239
Target Start/End: Original strand, 3058226 - 3058337
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggt 227  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||| ||  |  ||| ||||||||  |||||| ||||||||    
T  3058226 tgcaagtgttagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtatgaggatccataaacccattgccttaaggttttgggt 3058325  T
Q  228 aagagtgtggtg 239  Q
    ||||||||||||    
T  3058326 aagagtgtggtg 3058337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 239
Target Start/End: Original strand, 3415462 - 3415569
Alignment:
Q  132 agtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaaga 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||||  ||||||||||  || ||| ||||||||  |||||| |||| |||||||    
T  3415462 agtgtgagttatatgtcccacatcacataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggtaaga 3415561  T
Q  232 gtgtggtg 239  Q
    ||||||||    
T  3415562 gtgtggtg 3415569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14748496 - 14748386
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| |||| |||||  || ||| ||| ||||   ||||| ||||||||    
T  14748496 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaactcattgcgttaaggttttgggt 14748397  T
Q  228 aagagtgtggt 238  Q
    |||||||||||    
T  14748396 aagagtgtggt 14748386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 121 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 9062514 - 9062398
Alignment:
Q  121 tattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagat 220  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||  || |||||| |||||||| || ||||||||||  |||||| ||| |||| ||||||| |    
T  9062514 tattgtgtataaatgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaactcattgtcttaag-t 9062416  T
Q  221 tttgggtaagagtgtggt 238  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  9062415 tttgggtaaaagtgtggt 9062398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 236
Target Start/End: Original strand, 10911560 - 10911674
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagat-tgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagatt 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| ||||  |||||  ||    
T  10911560 ttgtatgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaagtt 10911659  T
Q  222 ttgggtaagagtgtg 236  Q
    |||  ||||||||||    
T  10911660 ttgaataagagtgtg 10911674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 236
Target Start/End: Original strand, 26544049 - 26544157
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||| | ||||||||||  || ||| ||||||    |||||| ||||| ||    
T  26544049 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccaccgccttaaggttttgagt 26544148  T
Q  228 aagagtgtg 236  Q
    |||||||||    
T  26544149 aagagtgtg 26544157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 239
Target Start/End: Original strand, 1846748 - 1846859
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggt 227  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| || |||||  |||||| |||||| |    
T  1846748 tgcaagtgtgaattctatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagcacccataaatccattgccttaaggttttggat 1846847  T
Q  228 aagagtgtggtg 239  Q
    ||||||||||||    
T  1846848 aagagtgtggtg 1846859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 6999961 - 6999889
Alignment:
Q  121 tattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  6999961 tattgtgtataagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaaaagtaaaagttgaacaccttatatgtaaga 6999889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 12092260 - 12092201
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaaggggg--agcatgatgatttgatggactcacacttgagggggag 120  Q
    |||||||||||| || |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12092260 agagcttccgctagaggggggtgagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggag 12092201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5958764 - 5958653
Alignment:
Q  125 gtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttg 224  Q
    |||||||| ||||||||||||||   ||||| |||  || |||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||| |||| ||||||  |||||    
T  5958764 gtgtgcaattgtgagttatatgtgttacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagaactcataaactcattgtcttaaagttttg 5958665  T
Q  225 ggtaagagtgtg 236  Q
    ||  ||||||||    
T  5958664 ggatagagtgtg 5958653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 131 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1950340 - 1950278
Alignment:
Q  131 aagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  1950340 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttacaagtaaga 1950278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 5832182 - 5832074
Alignment:
Q  130 caagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaa 229  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| || |||    |||||||||||||||||    
T  5832182 caagtgtaagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaagcca-ccccttaagattttgggtaa 5832084  T
Q  230 gagtgtggtg 239  Q
     |||||||||    
T  5832083 aagtgtggtg 5832074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 7588387 - 7588354
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatca 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7588387 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatca 7588354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 180
Target Start/End: Original strand, 33605649 - 33605706
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacac 180  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||  | |||||||||    
T  33605649 ttgtgtgcaagtgtgagctatatgtctcacatcagatagaaaagtggaggttgaacac 33605706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 132 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 17135223 - 17135162
Alignment:
Q  132 agtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||| || |||| ||||| ||||    
T  17135223 agtgtgagttatatgtctcacatcggatagagaagtaaatgtttaataccttataagcaaga 17135162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 11637804 - 11637768
Alignment:
Q  203 aacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  11637804 aacccattgtcttaagattttggataagagtgtggtg 11637768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 12071856 - 12071812
Alignment:
Q  121 tattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaa 165  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  12071856 tattttgtgcaagtgtgagttatatgtctcgcatcagatagaaaa 12071812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 61)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Original strand, 41157249 - 41157486
Alignment:
Q  4 cggtacaagt-gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatgga 102  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||    ||||||||| ||| | ||||||||    
T  41157249 cggtacaagtagtgtcagtccgtttgcggagaaaccaacaacgacgatacaaacaagtagagagcttccgctct--gggggagcacgataaattgatgga 41157346  T
Q  103 ctcacacttgagggggagtattgt---gtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactc 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || |    
T  41157347 ctcacacttaagggggagtattgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggaccc 41157446  T
Q  200 attaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    || ||||||||  ||| || ||||| ||||||||||||||    
T  41157447 ataaacccattgcctttaggttttgagtaagagtgtggtg 41157486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22077753 - 22077544
Alignment:
Q  26 ttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattg 125  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  22077753 ttgcggagaaaccagtaacgacgatacaagcaatta-agagcttccgcttgatgggg-agcatgatgaatacatggactcacacttgagggggagtgttg 22077656  T
Q  126 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||| | |   |||||| ||||||    
T  22077655 tgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcgtagccttaaggttttgg 22077556  T
Q  226 gtaagagtgtgg 237  Q
    ||||||||||||    
T  22077555 gtaagagtgtgg 22077544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 44290682 - 44290505
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattg 161  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  44290682 agagcttccccttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataa 44290583  T
Q  162 aaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    || |||||| |||||||| || ||||||||||  || ||| ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||    
T  44290582 aatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtatggtg 44290505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Original strand, 37555995 - 37556222
Alignment:
Q  14 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||  |||||||||||| ||| ||| |  ||||||||||||||||||    
T  37555995 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacggcgatagaagcaagt-aagagctttagcttgaagggggggcaggataaagtgatggactcacacttga 37556093  T
Q  114 gggggag---tattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaa-agtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccat 209  Q
    |||||||   | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||| |||||||| || ||||||||||  || ||| |||||||    
T  37556094 gggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggac-cataaacccat 37556192  T
Q  210 tatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
       |||||| ||||||||||||||||||||    
T  37556193 agccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 37556222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 66345 - 66136
Alignment:
Q  30 ggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattgtgtg 129  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  66345 ggagaagccagcaacggcgatacaagcaagataagagcttccgcttgatgggggaacatgatgaatagatggactcacacttgaggggaagtgttgtgtg 66246  T
Q  130 caagtgtgagttat-atgtcccacatcagattgaaaagtaaatg-ttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggt 227  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||| ||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||  || ||| |||| ||   |||||| ||||||||    
T  66245 caagtgtgagtaatcatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggtttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctatggccttaaggttttgggt 66146  T
Q  228 aagagtgtgg 237  Q
    ||||||||||    
T  66145 aagagtgtgg 66136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30630910 - 30630690
Alignment:
Q  13 tgtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30630910 tgtgttggtccgtttgcggagaaagtagtaacaacgatacaagcaagta-agtgcttcctcttgaagggggagcatgatgaattgatggactcacacttg 30630812  T
Q  113 agggggagtattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattat 212  Q
    || |||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||  |||| |||| |||  |||| | |||||||||| ||| ||| ||| ||||      
T  30630811 agagggagtgttatgtgcaagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaaaattaaaggtttgacactttataagtaagagaacccataaacacattgc 30630712  T
Q  213 cttaagattttgggtaagagtg 234  Q
    |||||  |||||||||||||||    
T  30630711 cttaaagttttgggtaagagtg 30630690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3537371 - 3537240
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtatt-gtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattg 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  3537371 agagcttccgcttgaagggggagcaagatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataa 3537272  T
Q  162 aaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    || |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3537271 aatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 3537240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 63 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 48588712 - 48588535
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtatt-gtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattg 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||| ||||| |||      
T  48588712 agagcttccgcttgaaggggtagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttctatgtccgacatcggataa 48588613  T
Q  162 aaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    || |||||| ||||||||||| ||||||||||| || | | ||  ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  48588612 aatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccgtaaattcattgccttaaggttttgggtaagagtgcggtg 48588535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 239
Target Start/End: Original strand, 34364816 - 34365036
Alignment:
Q  21 tccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgattt-gatggactcacacttgaggggga 119  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||  |||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  34364816 tccgtttgcggaaaaaccagcaacagcgacacaagcaagta-agagcttccgattga-gggggagcatgatgaaaaagatggactcacacttgaggggga 34364913  T
Q  120 gtattgt---gtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatctta 216  Q
    || ||||   |||||||||||||||||||||| |||||| |||  || | |||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||   ||||    
T  34364914 gtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatagcctta 34365013  T
Q  217 agattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  34365014 aggttttgggtaagagtgtggtg 34365036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 26661773 - 26661569
Alignment:
Q  38 cagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattgt---gtgcaagt 134  Q
    ||||||||||||| || ||||    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||   || |||||    
T  26661773 cagcaacgacgatacatgcaaagtaagagcttccgcttgaagggagagtatgatgaatagatggactcacacttaagggggagtgttgttgtgtacaagt 26661674  T
Q  135 gtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtg 234  Q
    ||||||||||||||||||||| | |  || |||||| ||||||||||| |||||| |||  || ||| ||| ||||  |||||| |||||||||||||||    
T  26661673 gtgagttatatgtcccacatcgggtaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtg 26661574  T
Q  235 tggtg 239  Q
    |||||    
T  26661573 tggtg 26661569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 47380055 - 47379885
Alignment:
Q  13 tgtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttg 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||| ||| |||    
T  47380055 tgtgtcggtctgtt-gcggagaaagcagcaacgacgatacaagcaagta-agaacttccgcttgaggggggagcacgatgaattgttggacttacatttg 47379958  T
Q  113 agggggagtattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaata 186  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||  | ||||||||| |||||    
T  47379957 agggggagtgttga-tgcaagtgtgagttatatatcccacatcggatagaaaagtggaggttgaacacttaata 47379885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24600477 - 24600361
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||  | |||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| |||    
T  24600477 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacatattataagtaagagaactcataaactcattgtcttaaggttt 24600378  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    || ||||||||||||||    
T  24600377 tgtgtaagagtgtggtg 24600361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 22077380 - 22077243
Alignment:
Q  26 ttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattg 125  Q
    ||||||||||||| ||| || |||| |||||||||  ||||||| |||||||  | | |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22077380 ttgcggagaaaccggcagcggcgatacaagcaagta-agagctttcgcttgatagcg-agcatgatgaatagatggacacacacttgagggggagtgttg 22077283  T
Q  126 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaa 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  22077282 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaa 22077243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 129 - 239
Target Start/End: Original strand, 3550721 - 3550831
Alignment:
Q  129 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggta 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||  |||||  |||||||||    
T  3550721 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaagttttgggta 3550820  T
Q  229 agagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||    
T  3550821 agagtgtggtg 3550831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 63 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 50051875 - 50051782
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtatt-gtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatc 155  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50051875 agagcttctgcttgaagggggagcatgatgaattaatggactcacacttgagggggaatgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatc 50051782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 41184297 - 41184198
Alignment:
Q  14 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttga 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  41184297 gtgtcggtccgtttgcggaaaaaccagcaacgacgatacaaacaagtaaagagcttccgcttg-agggggagcacgatgaagtgatggactcacacttga 41184199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 236
Target Start/End: Original strand, 11977251 - 11977388
Alignment:
Q  102 actcacacttgagggggagtattg---tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaact 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||||||||||||| | |  || |||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  11977251 actcacacttgagggggagtgttgctgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgggtaaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagagcact 11977350  T
Q  199 cattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtg 236  Q
    ||| |||| | |  |||||| |||||||||||||||||    
T  11977351 cataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgtg 11977388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 128 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 32594874 - 32594763
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggt 227  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||| |||| ||||||| ||||||||    
T  32594874 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttgggt 32594775  T
Q  228 aagagtgtggtg 239  Q
    ||||||||||||    
T  32594774 aagagtgtggtg 32594763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Original strand, 17294572 - 17294688
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||| | ||||||||||  || ||| ||||||||  |||||| |||    
T  17294572 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 17294671  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  17294672 tgggtaagagtgtggtg 17294688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 26662061 - 26661945
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||| |||| |||  |||||| |||    
T  26662061 ttgtgtacaagtgtgagttatatatcccatatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaagacccataaaccgattgccttaaggttt 26661962  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  26661961 tgggtaagagtgtggtg 26661945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 39066363 - 39066247
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||  || ||| ||  |||| ||||||| |||    
T  39066363 ttgtgtgcaagtgtgagttatatattccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagatgacccataaaatcattgtcttaaggttt 39066264  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    ||| |||||||||||||    
T  39066263 tggataagagtgtggtg 39066247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 44290983 - 44290871
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||  |||||| ||||||||    
T  44290983 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 44290884  T
Q  228 -aagagtgtggtg 239  Q
     ||||||||||||    
T  44290883 aaagagtgtggtg 44290871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 3537546 - 3537495
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537546 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgag 3537495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 44043893 - 44043819
Alignment:
Q  165 agtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44043893 agtaaatgttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccattgtcttaagattttgggtaagagtgtggtg 44043819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31767324 - 31767211
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || |||||||| | |  |||||| |||    
T  31767324 ttgtgtgcaagtgtgggttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccattaacctaatgccttaaggttt 31767225  T
Q  223 tgggtaagagtgtg 236  Q
    ||||||||||||||    
T  31767224 tgggtaagagtgtg 31767211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5320128 - 5320016
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||  || ||| ||| |||   |||||| |||    
T  5320128 ttgtatgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcatagccttaaggttt 5320029  T
Q  223 tgggtaagagtgt 235  Q
    |||||||||||||    
T  5320028 tgggtaagagtgt 5320016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Original strand, 29798194 - 29798310
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||  |||||| | |    
T  29798194 ttgtatgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggtct 29798293  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    ||| |||||||||||||    
T  29798294 tggataagagtgtggtg 29798310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 131 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 50052178 - 50052070
Alignment:
Q  131 aagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaag 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| |||||||| || ||||||||||  || ||| |||| ||| ||||||  |||||||||||    
T  50052178 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacctattttcttaaagttttgggtaag 50052079  T
Q  231 agtgtggtg 239  Q
    |||||||||    
T  50052078 agtgtggtg 50052070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 239
Target Start/End: Original strand, 41759483 - 41759594
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggt 227  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  |  ||| || |||||  |||||| ||||||||    
T  41759483 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagatgatccataaatccattgccttaaggttttgggt 41759582  T
Q  228 aagagtgtggtg 239  Q
    ||||||||||||    
T  41759583 aagagtgtggtg 41759594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 66635 - 66565
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  66635 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 66565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3875494 - 3875380
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||  ||||||||| |||| |||||| ||||||||||  |||||| ||||||||  |||||| |||    
T  3875494 ttgtgtgcaagagtcagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgtacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttt 3875395  T
Q  223 tgggtaagagtgtgg 237  Q
    | ||||||| |||||    
T  3875394 taggtaagaatgtgg 3875380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 123 - 236
Target Start/End: Original strand, 34364502 - 34364615
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  |  | | |||||||   |||||| |||    
T  34364502 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccgtaaacccatagccttaaggttt 34364601  T
Q  223 tgggtaagagtgtg 236  Q
    ||||||||||||||    
T  34364602 tgggtaagagtgtg 34364615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 50469256 - 50469187
Alignment:
Q  111 tgagggggagtattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacac 180  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||    
T  50469256 tgagggggagtgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataataaagtaaaggttgaacac 50469187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 37850763 - 37850647
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  || |||| | ||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||| | | | ||||| |||    
T  37850763 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacctaatgttttaaggttt 37850664  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
     || |||||||||||||    
T  37850663 cggataagagtgtggtg 37850647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 237
Target Start/End: Original strand, 41142370 - 41142482
Alignment:
Q  126 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| |||||||| |  || ||| ||||||||  |||||| |||| |    
T  41142370 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggtttttg 41142469  T
Q  226 gt-aagagtgtgg 237  Q
    || ||||||||||    
T  41142470 gtaaagagtgtgg 41142482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Original strand, 41156986 - 41157102
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | | |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||| ||||   ||||| |||    
T  41156986 ttgtgtgcaagtgtgaattatatgtcccataacggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggttt 41157085  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  41157086 tgggtaagagtgtggtg 41157102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 236
Target Start/End: Original strand, 9955902 - 9956017
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagat-tgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcatt-aacccattatcttaagat 220  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| | ||||||||||  || |||| |||| |||  |||||| |    
T  9955902 ttgtgtgttagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccattaaaccaattgccttaaggt 9956001  T
Q  221 tttgggtaagagtgtg 236  Q
    ||||||||||||||||    
T  9956002 tttgggtaagagtgtg 9956017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 238
Target Start/End: Original strand, 40082402 - 40082516
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||| ||  ||||  |||||| |||    
T  40082402 ttgtgcgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-tcataaattcattgccttaaggttt 40082500  T
Q  223 tgggtaagagtgtggt 238  Q
    ||||||||||||||||    
T  40082501 tgggtaagagtgtggt 40082516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 237
Target Start/End: Original strand, 24448213 - 24448386
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattga 162  Q
    ||||||| ||||||| |||  |||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||   |||||  |  ||    
T  24448213 agagctttcgcttga-gggaaagcacgatgaattgatgggctcacaattgagggggagtgttgtgtgcaagtgtaagttatatgttagacatctcaaaga 24448311  T
Q  163 aaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtgg 237  Q
    |||||  | ||||||||  | |||||| |||   ||||| ||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  24448312 aaagtggaagttgaacattttataagtgagagggctcataaactcattgtcttaagattttggataaaagtgtgg 24448386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Original strand, 34649708 - 34649776
Alignment:
Q  17 tcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagc 86  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  34649708 tcggtccatttgcggagaaaccagcaacgacgatacaagcaagt-aagagctttcgcttgaagggagagc 34649776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 193
Target Start/End: Original strand, 45084378 - 45084447
Alignment:
Q  124 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45084378 tgtgtgcaagtgtgagttatatctcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 45084447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3537752 - 3537648
Alignment:
Q  133 gtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagag 232  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| || |||||||  ||  || ||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  3537752 gtgttagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttatgagtaagaggacctataaacccattggcttaaggttttgggtaagag 3537653  T
Q  233 tgtgg 237  Q
    |||||    
T  3537652 tgtgg 3537648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 136 - 239
Target Start/End: Original strand, 14318875 - 14318978
Alignment:
Q  136 tgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgt 235  Q
    |||||||||||| |||| || |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| || | |||  |||||| ||||||||||||||||    
T  14318875 tgagttatatgttccacgtcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaatctattgccttaaggttttgggtaagagtgt 14318974  T
Q  236 ggtg 239  Q
    ||||    
T  14318975 ggtg 14318978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 41184588 - 41184501
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccatt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  || |||||| ||||||||| | ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  41184588 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccatt 41184501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 193
Target Start/End: Original strand, 44685451 - 44685522
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatg-ttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| | ||||| |||| ||||||||||    
T  44685451 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggtttgaaaaccttataagtaaga 44685522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 47380323 - 47380258
Alignment:
Q  83 gagcatgatgatttgatggactcacacttgagggg--gagtattgtgtgcaagtgtgagttatatg 146  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||    
T  47380323 gagcatgatgaattgatggattcacacttgaggggaagattgttgtgtgcaagtgtgagttatatg 47380258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 24132148 - 24132079
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaag 192  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  24132148 ttgtatgcaactgtgagttatatgtccctcatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataag 24132079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 38804511 - 38804406
Alignment:
Q  130 caagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaa 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||  || |||||| ||||||||| | ||||||||||  |  ||| ||||||| | |||||| ||||||||||    
T  38804511 caagtgtgagttatacgtcccacatcgaataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggatccataaacccataaccttaaggttttgggtaa 38804412  T
Q  230 gagtgt 235  Q
    ||||||    
T  38804411 gagtgt 38804406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 234
Target Start/End: Original strand, 34649440 - 34649544
Alignment:
Q  130 caagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||   | ||| ||| |||| | |  |||||| ||||||||||    
T  34649440 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgcaagaacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 34649539  T
Q  230 gagtg 234  Q
    |||||    
T  34649540 gagtg 34649544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 35154202 - 35154166
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagat 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35154202 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagat 35154166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 1188452 - 1188388
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattgtgtg 129  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  1188452 agagcttccacttgaaggg--agcatgatgaattgatggactcacacttgaggatgagtgttgtgtg 1188388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 237
Target Start/End: Original strand, 10351182 - 10351269
Alignment:
Q  150 cacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtgg 237  Q
    |||||||||| ||||| || | ||||||||| | |||||| ||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10351182 cacatcagatagaaaaatagaggttgaacactttataagtgagagaacccataaacacattactttaagattttgggtaagagtgtgg 10351269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1188751 - 1188637
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||  | |||||| |  | |||||| |||| |||||| ||| ||||   ||||| |||    
T  1188751 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtggaggttgaatattttataagtgagaagactcataaactcattgctttaaggttt 1188652  T
Q  223 tgggtaagagtgtgg 237  Q
    ||||||| |||||||    
T  1188651 tgggtaaaagtgtgg 1188637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21378204 - 21378134
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||| |||||| |||||| | || ||||||||||    
T  21378204 ttgtgtgcaagtgtcagttatatgtcccagatcggatagaacagtaaaggttgaatatcttataagtaaga 21378134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 143 - 237
Target Start/End: Original strand, 44091909 - 44092003
Alignment:
Q  143 tatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtgg 237  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||| | |||||| ||| ||| ||| || | | ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  44091909 tatgtcacacatcagatgtaaaagtaaaggttgaacactttataagtgagagaacccataaatctaatattttaagattgtgggtaagagtgtgg 44092003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 19283618 - 19283574
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagt 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  19283618 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggatagaaaagt 19283574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22077993 - 22077921
Alignment:
Q  121 tattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||| ||||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  22077993 tattgtgtgcaagtgtgagttatatgttttaaatcggatagaaaaataaaggttgaacatcttataagtaaga 22077921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5528902 - 5528811
Alignment:
Q  138 agttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaa 229  Q
    ||||||||||| |||||| |||  || |||||| |||||||| || |||| |||||  |||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  5528902 agttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataaataagaggactcataaactcattttcttaaggttttgggtaa 5528811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 134 - 193
Target Start/End: Original strand, 5575110 - 5575169
Alignment:
Q  134 tgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5575110 tgtgaattatatgtcccacgtcggatagaagagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 5575169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 177
Target Start/End: Original strand, 22793273 - 22793327
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaa 177  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| | ||||||    
T  22793273 ttgtgagcaagtgtgagttatatgtcccacatcgtatagaaaagtagaggttgaa 22793327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 50051771 - 50051735
Alignment:
Q  203 aacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  50051771 aacccattatcttaaggttttgcgtaagagtgtggtg 50051735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 53)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13416030 - 13415809
Alignment:
Q  17 tcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgaggg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  13416030 tcggtccgtttgcggagaaaccatcaacagcgatacaagcaagta-agagcttccgcttgaagggggagcatgctgaatagatggactcacacttgaggg 13415932  T
Q  117 g-gag-tattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatct 214  Q
    | | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |  |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| |||| |||| ||    
T  13415931 gagtgctgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaattagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattacct 13415832  T
Q  215 taagattttgggtaagagtgtgg 237  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  13415831 taaggttttgggtaagagtgtgg 13415809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24489483 - 24489255
Alignment:
Q  2 ggcggtacaagtgtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatgg 101  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||   |||  | |||||| | |||| |||| |||||||||| |||||||    
T  24489483 ggcggtataaatgagtcggtccgtt-gcggagaagccagcaacggcgatacaa---agtaaaaagcttctggttga-ggggtagcatgatgaattgatgg 24489389  T
Q  102 actcacacttgagggggagtattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcat 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||| || ||||||  ||| |||    
T  24489388 actcacacttgagggggagtgttgtgttcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagaaaaggttaaacaccttattagtaag--aacccat 24489291  T
Q  202 taacccattatcttaagattttgggtaagagtgtgg 237  Q
     ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  24489290 aaacccattgccttaagattttgcgtaagagtgtgg 24489255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 3295287 - 3295062
Alignment:
Q  16 gtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagg 115  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||  |  ||||||||||||||||||||    
T  3295287 gtcggtccgtttgcgcagaaagcagcaacggcgatacaagcaagt-aagagcttccgctt-aagggggagcacgaaaaagtgatggactcacacttgagg 3295190  T
Q  116 gggagtat-----tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccatt 210  Q
    |||||| |     |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||    
T  3295189 gggagtgttgttgtgtgtgcaagtgtgag-tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaacccatt 3295091  T
Q  211 atcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
      ||| || ||||||||| ||||||||||    
T  3295090 gccttgaggttttgggtatgagtgtggtg 3295062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 102 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 26074330 - 26074193
Alignment:
Q  102 actcacacttgagggggagtattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcat 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  || |||    
T  26074330 actcacacttgagggggagtgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgaacacctcatatgtaagaggacccat 26074231  T
Q  202 taacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
     ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26074230 gaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 26074193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 63 - 239
Target Start/End: Original strand, 26074544 - 26074723
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtatt---gtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagat 159  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  26074544 agagcttccacttgaaggagtagcatgatcaattgatggactcacacttgagggggagtgtttttgtgtacaagtgtgagttatatgttccatatcggat 26074643  T
Q  160 tgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
      || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26074644 aaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 26074723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Original strand, 38427453 - 38427655
Alignment:
Q  24 gtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtat 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||| |||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |    
T  38427453 gtttgcgcagaaaccagcaacgacgatacaagcaagta-agagcttcctcttgaaaggggtgcatcatgaatagatggactcacacttgagggggagtgt 38427551  T
Q  124 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagatttt 223  Q
    |        ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||| || |||||| |||  || |||||| ||||| ||||||| ||||    
T  38427552 t--------gtgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagt-agaggacccattaatccattgtcttaaggtttt 38427642  T
Q  224 gggtaagagtgtg 236  Q
    | |||||||||||    
T  38427643 gtgtaagagtgtg 38427655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Original strand, 624072 - 624307
Alignment:
Q  4 cggtacaagt-gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgc-aagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatgg 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||| |||  ||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||    
T  624072 cggtacaagtagtgtcggtccgtttgcggagaacccagcaacggcgatacaaagcgagt-aagagcttccgctt-aaaggggagcatgatgaatagatgg 624169  T
Q  102 actcacacttgagggggagtatt-gtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactca 200  Q
    | |||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||   ||  || |||||| ||||||||| | ||||||||||  || ||    
T  624170 a-tcacacttgaggggaagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattgtataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagatgaccca 624268  T
Q  201 ttaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    | |||||||   ||| || ||||||||||||||||||||    
T  624269 taaacccatagccttgaggttttgggtaagagtgtggtg 624307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 63 - 239
Target Start/End: Original strand, 6500757 - 6500933
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtatt-gtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattg 161  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||      
T  6500757 agagcttccccttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgatggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgt-ccacatcggataa 6500855  T
Q  162 aaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    || |||||| ||||||||||| |||| ||| |  || ||| ||| ||||  |||||| |||||| |||||||||||||    
T  6500856 aatagtaaaggttgaacaccttataaataaaaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtg 6500933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26074999 - 26074830
Alignment:
Q  72 gcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggag---tattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagta 168  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||    
T  26074999 gcttgaagggggagcttgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagta 26074900  T
Q  169 aatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggt-aagagtgtgg 237  Q
    || |||||||||   ||||||| ||  || ||| |||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  26074899 aaggttgaacacaatataagtaggaggacccataaacctattgtcttaaggttttgggtaaagagtgtgg 26074830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 13785868 - 13785744
Alignment:
Q  26 ttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattg 125  Q
    ||||||||||| |||||||  |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||| | ||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  13785868 ttgcggagaaagcagcaacaccgatacaagcaagta-agagcttccgcttgaaggggaaacatgatgaatagatagactcacatttgagggggagtgttg 13785770  T
Q  126 tgtgcaagtgtgagttatatgtccca 151  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  13785769 tgtggaagtgtgagttatatgtccca 13785744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 63 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 36522119 - 36522002
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattga 162  Q
    ||||||||||||||| | ||||  | ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36522119 agagcttccgcttgaggtgggataacgatgaattgatggactcacacttgagggagagtgttgtgcgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataga 36522020  T
Q  163 aaagtaaatgttgaacac 180  Q
    |||||  | |||||||||    
T  36522019 aaagttgaggttgaacac 36522002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12662815 - 12662699
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||| || ||||| ||||||| |||    
T  12662815 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacattttataagtaagaaaacccataaatccattgtcttaagtttt 12662716  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  12662715 tgggtaagagtgtggtg 12662699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 128 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9498812 - 9498701
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggt 227  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  9498812 tgcaaatgtgagttatatgtctcacatcagatagaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattttgggt 9498713  T
Q  228 aagagtgtggtg 239  Q
    ||||||||||||    
T  9498712 aagagtgtggtg 9498701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 167
Target Start/End: Original strand, 31509556 - 31509662
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggag--tattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatt 160  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  31509556 agagcttccgcttgaggggtgagcatgatgaattgatggactcacacttgagggagagattgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggata 31509655  T
Q  161 gaaaagt 167  Q
    |||||||    
T  31509656 gaaaagt 31509662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Original strand, 41632777 - 41632893
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||| |   |||||||||    
T  41632777 ttgtgtgcaagtgtaagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccaatgctttaagattt 41632876  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  41632877 tgggtaagagtgtggtg 41632893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 130 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18603276 - 18603169
Alignment:
Q  130 caagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaa 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||  |||||| ||||||||||    
T  18603276 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 18603177  T
Q  230 gagtgtgg 237  Q
    ||||||||    
T  18603176 gagtgtgg 18603169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 36568730 - 36568616
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||  || | | ||||||||  |||||| |||    
T  36568730 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagatgacccgtaaacccattgccttaaggttt 36568631  T
Q  223 tgggtaagagtgtgg 237  Q
    | |||||||||||||    
T  36568630 ttggtaagagtgtgg 36568616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 65 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 36522459 - 36522284
Alignment:
Q  65 agcttccgcttgaaggg-ggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaa 163  Q
    ||||||||||||| ||| ||| || ||||| |||||||| | ||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||  ||| |||    
T  36522459 agcttccgcttgaggggaggaacacgatgaattgatggatttacaattgagggggagtgttgtatgaaagtgtgagttatatgtctcacattggatagaa 36522360  T
Q  164 aagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    || |  | ||||||||  | |||||| |||  ||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36522359 aaatggaagttgaacattttataagtgagaggaccaataaacccattatcttaaggttttgggtaagagtgtggtg 36522284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 124 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 40296477 - 40296362
Alignment:
Q  124 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagatttt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || || ||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||  ||| || ||||    
T  40296477 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttgaggtttt 40296378  T
Q  224 gggtaagagtgtggtg 239  Q
    ||||||||||||||||    
T  40296377 gggtaagagtgtggtg 40296362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34753188 - 34753074
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| |||  |||||| |||    
T  34753188 ttgtgtacaaatgtaagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtaagaagacccataaaccgattgccttaaggttt 34753089  T
Q  223 tgggtaagagtgtgg 237  Q
    |||||||||||||||    
T  34753088 tgggtaagagtgtgg 34753074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Original strand, 35150000 - 35150117
Alignment:
Q  121 tattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||| || ||||||||||| ||||||||| | || ||| || ||||| ||||||| |    
T  35150000 tattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtcaaggttgaacaccttataagtaag-agacccataaatccattgtcttaaggt 35150098  T
Q  221 tttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  35150099 tttgggtaaaagtgtggtg 35150117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 236
Target Start/End: Original strand, 32487394 - 32487501
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||  |||||| ||||||||    
T  32487394 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct-ataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 32487492  T
Q  228 aagagtgtg 236  Q
    |||||||||    
T  32487493 aagagtgtg 32487501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1028680 - 1028566
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||||||||||  || ||| |||| || | |||||| |||    
T  1028680 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggatgaacactttataagtaagaggacccataaacctataaccttaaggttt 1028581  T
Q  223 tgggtaagagtgtgg 237  Q
    | |||||||||||||    
T  1028580 ttggtaagagtgtgg 1028566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 239
Target Start/End: Original strand, 41170640 - 41170745
Alignment:
Q  134 tgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagt 233  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  || |||||| |||||||| || ||||||||||  || ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  41170640 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 41170739  T
Q  234 gtggtg 239  Q
    ||||||    
T  41170740 gtggtg 41170745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 36492380 - 36492264
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||  || ||| ||||| ||| || |||    
T  36492380 ttgtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccaataaacacattacctttaggttt 36492281  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    ||| |||||||||||||    
T  36492280 tggataagagtgtggtg 36492264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Original strand, 299484 - 299598
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||| |||   |||||| |||    
T  299484 ttgtgcgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaactcatagccttaaggttt 299583  T
Q  223 tgggtaagagtgtgg 237  Q
    || ||||||||||||    
T  299584 tgtgtaagagtgtgg 299598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 128 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29549413 - 29549304
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggt 227  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||| | ||||||||  ||||||||||| || ||| ||| ||||| |||||| |||||| |    
T  29549413 tgcaagtgtgagttatatgttccatatcagataaaatagtaaaggatgaacaccatataagtaagaagacccataaacacattaccttaaggttttggat 29549314  T
Q  228 aagagtgtgg 237  Q
    ||||||||||    
T  29549313 aagagtgtgg 29549304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Original strand, 6224191 - 6224307
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||| |||   |||||| |||    
T  6224191 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacttcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcatcgccttaaggttt 6224290  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    | |||||||||||||||    
T  6224291 ttggtaagagtgtggtg 6224307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Original strand, 15370094 - 15370210
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  || |||||| |||||||| || ||||||||||  || ||| || |||    |||||| |||    
T  15370094 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaatccacagccttaaggttt 15370193  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  15370194 tgggtaagagtgtggtg 15370210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 239
Target Start/End: Original strand, 25327938 - 25328046
Alignment:
Q  131 aagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaag 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| |||| | |  |||||| |||||||||||    
T  25327938 aagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaacagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaag 25328037  T
Q  231 agtgtggtg 239  Q
    |||||||||    
T  25328038 agtgtggtg 25328046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 42405759 - 42405643
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||  || |||||| ||||||||||| | |||||| |  |||||| |||| | |  |||||| |||    
T  42405759 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttacaagtaaaaggactcataaacctaatgccttaaggttt 42405660  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  42405659 tgggtaagagtgtggtg 42405643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Original strand, 42508607 - 42508707
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||| ||||||||  |||||| |||    
T  42508607 ttgtgtacaagtgtgaattatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacatctaataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttt 42508706  T
Q  223 t 223  Q
    |    
T  42508707 t 42508707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 239
Target Start/End: Original strand, 6500451 - 6500561
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggt 227  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||   | ||||||||  |||||| ||||||||    
T  6500451 tgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctttaaacccattgccttaaggttttgggt 6500549  T
Q  228 aagagtgtggtg 239  Q
    ||||||||||||    
T  6500550 aagagtgtggtg 6500561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 9498472 - 9498417
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgaggggg 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9498472 agagcttccccttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgaggggg 9498417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 130 - 193
Target Start/End: Original strand, 26074320 - 26074383
Alignment:
Q  130 caagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||||||    
T  26074320 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaactaaagattgaacaccttataagtaaga 26074383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27502194 - 27502083
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||| ||| ||||||| ||||||||||  || ||| |||| |||  ||||||||||| |||    
T  27502194 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaagatttttggt 27502095  T
Q  228 aagagtgtggtg 239  Q
    || |||||||||    
T  27502094 aaaagtgtggtg 27502083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26075325 - 26075219
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||  |||||| |||    
T  26075325 ttgtgtacaagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 26075226  T
Q  223 tgggtaa 229  Q
    |||||||    
T  26075225 tgggtaa 26075219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 193
Target Start/End: Original strand, 300954 - 301024
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  300954 ttgtgtacaagtgtgggttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaataccttataagtaaga 301024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11417138 - 11417027
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  |  ||| ||||||||  |||||| |||    
T  11417138 ttgtgtgcaagtg--agttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttt 11417041  T
Q  223 tgggtaagagtgtg 236  Q
    || |||||||||||    
T  11417040 tgtgtaagagtgtg 11417027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 118
Target Start/End: Original strand, 35150613 - 35150719
Alignment:
Q  14 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaa-gcaagtggaga-gcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacactt 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||| ||||||  | | ||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35150613 gtgtcggtccgtttgcggagaacccagcaacggtgatacaaagcaagtaaaaaagcttccgctttgggggtgagcatgatgaattgatggactcacactt 35150712  T
Q  112 gaggggg 118  Q
    | |||||    
T  35150713 ggggggg 35150719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5723949 - 5723844
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  || | |||| ||||||||| | ||| |||||| ||| ||||||   ||| ||||||| |||||||     
T  5723949 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaataataaaagttgaacacattatatgtaagagaacccattaatttattgtcttaaggttttggga 5723850  T
Q  228 aagagt 233  Q
    ||||||    
T  5723849 aagagt 5723844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 36527246 - 36527202
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagt 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36527246 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagt 36527202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3295506 - 3295395
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| |||| |||  |||||| |||    
T  3295506 ttgtgtggaagtgtgagt-atatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccaattgccttaaggttt 3295408  T
Q  223 tgggtaagagtgtg 236  Q
    | ||||||||||||    
T  3295407 t-ggtaagagtgtg 3295395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 235
Target Start/End: Original strand, 2411010 - 2411114
Alignment:
Q  131 aagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaag 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||| || ||||||| |||||||| ||  ||||||||| ||| ||| |||  |||  |||||| ||||| |||||    
T  2411010 aagtgtgagttatatgtcctacattggatagagaagtaaaagttgaacatcttgtaagtaagagaacccataaacttattgccttaaggttttgagtaag 2411109  T
Q  231 agtgt 235  Q
    |||||    
T  2411110 agtgt 2411114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Original strand, 15370439 - 15370511
Alignment:
Q  165 agtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtgg 237  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||   |||||| ||||| ||||||||||||    
T  15370439 agtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgcgtaagagtgtgg 15370511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Original strand, 19275527 - 19275637
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    ||||||||||||||||   |||||||  | ||||||| |||||||| | ||||||||| || |||| ||||| || ||| ||  |||| |||||||||||    
T  19275527 ttgtgtgcaagtgtga---atatgtcttaaatcagatagaaaagtagaggttgaacactta-taaggaagaagacccataaattcattgtcttaagattt 19275622  T
Q  223 tgggtaagagtgtgg 237  Q
    ||||||||| |||||    
T  19275623 tgggtaagattgtgg 19275637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 155
Target Start/End: Original strand, 35150742 - 35150774
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35150742 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatc 35150774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 155
Target Start/End: Original strand, 35151033 - 35151065
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35151033 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatc 35151065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41635346 - 41635242
Alignment:
Q  131 aagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaag 230  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||||  || |||||||||||||||||| |||| |||||  |  ||| || ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  41635346 aagtatgagttatatgtttcccatcagataaaagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggatccataaatccattgtcttaaaattttaggtaag 41635247  T
Q  231 agtgt 235  Q
    |||||    
T  41635246 agtgt 41635242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 193
Target Start/End: Original strand, 39309679 - 39309749
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||  ||||||||||||||| | |||| |||||    
T  39309679 ttgtgtacaagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagggtaaatgttgaacacattataaataaga 39309749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 26591068 - 26591003
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||| |||  || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26591068 tgcaagtgtgatttaaatgttccatatcgaatcgaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 26591003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 180
Target Start/End: Original strand, 623818 - 623870
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacac 180  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||  || |||||| |||||||||    
T  623818 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatataatagtaaaggttgaacac 623870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 140
Target Start/End: Original strand, 15370380 - 15370426
Alignment:
Q  97 gatggactcacacttgagggggag---tattgtgtgcaagtgtgagt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||    
T  15370380 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagt 15370426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 55)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21832612 - 21832395
Alignment:
Q  14 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttga 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||  ||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  21832612 gtgtcggtccgtt-gcggagaaaccagcaacgacgatacaagcaagt-atgagcttccatttg-atggggagcatgatgaatagatggactcacacttga 21832516  T
Q  114 gggggagtattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatc 213  Q
    || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||   |    
T  21832515 ggcggagtgttatgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcatagcc 21832416  T
Q  214 ttaagattttgggtaagagtg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  21832415 ttaaggttttgggtaagagtg 21832395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 54018102 - 54017863
Alignment:
Q  2 ggcggtacaagtgtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatgg 101  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||   ||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||   |||||    
T  54018102 ggcggtacaaacgtgtcagtccgtttgcggagaaaccaacaacagtgatacaagcaagtaaagagcttccgcttga-gggggaacatgatgaaaagatgg 54018004  T
Q  102 actcacacttgagggggagtattgt---gtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaact 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  |||    
T  54018003 actcacacttgagggggagtattgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggact 54017904  T
Q  199 cattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    ||| |||| |    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  54017903 cataaacctaacgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 54017863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 42 - 239
Target Start/End: Original strand, 22304482 - 22304680
Alignment:
Q  42 aacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtatt-gtgtgcaagtgtgagt 140  Q
    ||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||     
T  22304482 aacgacgatacaagcaaagtaagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagc 22304581  T
Q  141 tatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    ||||||||||||||| |||  || |||||| |||||| |||| ||||||||||  || ||| ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22304582 tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 22304680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 37990908 - 37990686
Alignment:
Q  18 cggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggg 117  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| || ||||    | ||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  37990908 cggttcgtttgcgcagaaaccagcaacggcgatacatgcaaagtaaaagcttccgcttgagggggg--catgatgaattgatggactcacagttgagggg 37990811  T
Q  118 gagtattgt---gtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatct 214  Q
    |||| ||||   || |||||||||||||||||| ||||||| |||  || |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| ||||  ||    
T  37990810 gagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgcct 37990711  T
Q  215 taagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  37990710 taaggttttgggtaagagtgtggtg 37990686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 239
Target Start/End: Original strand, 9240047 - 9240260
Alignment:
Q  26 ttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaa-gcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtatt 124  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||| ||| ||||||  |||| |||||||||| ||| |||||| | || | ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  9240047 ttgcgcagaaagcagcaacgatgatacaaagcaagta-agagtttccgcttgaggggagagcataacgaatggatggactcacacttgaggaggagtgtt 9240145  T
Q  125 gtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||| | ||||||||| ||||||||||  || ||| || |||||| |||||||||| |    
T  9240146 gtgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagagaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattaccttaagatttcg 9240245  T
Q  225 ggtaagagtgtggtg 239  Q
    | ||||| |||||||    
T  9240246 gataagaatgtggtg 9240260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29644744 - 29644630
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||| |||    
T  29644744 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggattaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacccattgtcttaaggttt 29644645  T
Q  223 tgggtaagagtgtgg 237  Q
    |||||||||||||||    
T  29644644 tgggtaagagtgtgg 29644630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 63 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 32462785 - 32462651
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggag---tattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagat 159  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  32462785 agagctttcgcttgaagggggagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatc-gaa 32462687  T
Q  160 tgaaa-agt-aaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  32462686 tgaaagagtaaaaggttgaacaccttataagtaaga 32462651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12114725 - 12114609
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||| ||||||| |||    
T  12114725 ttgtgtgcaagtgtaagttatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttt 12114626  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  12114625 tgggtaagagtgtggtg 12114609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 3135346 - 3135120
Alignment:
Q  14 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagag-cttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttg 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  || | |||||||| || ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  3135346 gtgtcggtctgtttgcggagaaaccagcaacgacgatacaaacaagtaaagtggcttccgctaga-gggggagcacgatgaattgatg-actcacacttg 3135249  T
Q  113 agggggagtatt----gtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaaccca 208  Q
    | || |||| ||    |||| ||||||  |||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||||    
T  3135248 atggtgagtgtttgttgtgtacaagtg--agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaaaagaacccataaaccca 3135151  T
Q  209 ttatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
     |  | |||| ||||| ||||||||||||||    
T  3135150 ctgccataaggttttgagtaagagtgtggtg 3135120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 43346954 - 43346838
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| ||||  |||||| |||    
T  43346954 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttt 43346855  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  43346854 tgggtaagagtgtggtg 43346838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 83 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 42342296 - 42342139
Alignment:
Q  83 gagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattgt---gtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaaca 179  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||| | |||||| ||||||| |||  || |||||||||| ||      
T  42342296 gagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgattcatatgttccacatcggataaaagagtaaatgttcaatg 42342197  T
Q  180 cctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtgg 237  Q
    ||| ||||||||||  |||||| ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  42342196 ccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 42342139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 236
Target Start/End: Original strand, 15773140 - 15773300
Alignment:
Q  79 gggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattgt---gtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttg 175  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||  ||  || |||||| ||||    
T  15773140 gggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaaagttg 15773239  T
Q  176 aacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtg 236  Q
    |||| || ||||||||||  |||||| | | ||||  |||||  |||||||||||||||||    
T  15773240 aacatcttataagtaagaggactcataagctcattgccttaaagttttgggtaagagtgtg 15773300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29645065 - 29644951
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  || |||||| ||| ||||||| ||||||||||  || ||| |||||||| ||||||| |||    
T  29645065 ttgtgtgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttt 29644966  T
Q  223 tgggtaagagtgtgg 237  Q
    |||||||||||||||    
T  29644965 tgggtaagagtgtgg 29644951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 32463064 - 32462947
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatg-ttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagatt 221  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| | ||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||    
T  32463064 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaagagtaaaaggttgaataccttataagtaagaagactcataaacccattgccttaaggtt 32462965  T
Q  222 ttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  32462964 ttgagtaagagtgtggtg 32462947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 123 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 42342551 - 42342438
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||| ||||||| ||||||||||  || ||| || ||||| ||||||| |||    
T  42342551 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgtcttaaggttt 42342452  T
Q  223 tgggtaagagtgtg 236  Q
    ||||||||||||||    
T  42342451 tgggtaagagtgtg 42342438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 96 - 239
Target Start/End: Original strand, 4823622 - 4823766
Alignment:
Q  96 tgatggactcacacttgagggggagtattg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaa 194  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| |||||| |||  || |||||| ||| ||||||| ||||||| ||     
T  4823622 tgatggactcacacttgaaggggagtgttggtttgcaagtgtgagttataagtctcacatcggataaaatagtaaaagttaaacaccttataagtaggag 4823721  T
Q  195 aactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
     || ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4823722 gacccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggtg 4823766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 63 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41359986 - 41359814
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattgt---gtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagat 159  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| ||||   |||||||||||||||||    |||||||| |||    
T  41359986 agagcttccacttgaagggagagcatgatgaatagatg-actcacacttaagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttat----cccacatcggat 41359892  T
Q  160 tgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtgg 237  Q
      || |||||| |||||| |||| ||||||||||  || ||| ||||||||  |||||| |||||||||||| |||||    
T  41359891 acaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagaatgtgg 41359814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 182
Target Start/End: Original strand, 22304212 - 22304300
Alignment:
Q  95 ttgatggactcacacttgagggggagtattg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacct 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| |||||||||||    
T  22304212 ttgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct 22304300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Original strand, 35946517 - 35946633
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||| ||  |||||| |||    
T  35946517 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccgttgccttaaggttt 35946616  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    ||||||| |||||||||    
T  35946617 tgggtaaaagtgtggtg 35946633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 239
Target Start/End: Original strand, 39389070 - 39389181
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggt 227  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||  || |||||| ||||||||||| | || |||||  || ||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  39389070 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttaaaactaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 39389169  T
Q  228 aagagtgtggtg 239  Q
    ||||||||||||    
T  39389170 aagagtgtggtg 39389181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 239
Target Start/End: Original strand, 15772851 - 15772965
Alignment:
Q  125 gtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||| ||||   ||||| |||||    
T  15772851 gtgtgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggttttg 15772950  T
Q  225 ggtaagagtgtggtg 239  Q
    | |||||||||||||    
T  15772951 gataagagtgtggtg 15772965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 33175827 - 33175757
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33175827 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 33175757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 33809213 - 33809069
Alignment:
Q  83 gagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggag--tattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacac 180  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||   | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |  || ||||||||    
T  33809213 gagcatgatgaattgatggactcacacttcagagagaaattgttgtgtgcaagtgtaagttatatgtcccacatcagatagaaaattgcatattgaacac 33809114  T
Q  181 ctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgg 225  Q
     | || |||||||||||| || ||| | || ||||||| ||||||    
T  33809113 tttatgagtaagaaaactaataaactcgttgtcttaaggttttgg 33809069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 236
Target Start/End: Original strand, 52634671 - 52634783
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||| ||| ||||||||| | || ||| ||||||||  |||||| |||    
T  52634671 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacgccttataagtaag-agacccataaacccattgccttaaggttt 52634769  T
Q  223 tgggtaagagtgtg 236  Q
    ||||||||||||||    
T  52634770 tgggtaagagtgtg 52634783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 118
Target Start/End: Original strand, 8328265 - 8328368
Alignment:
Q  14 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttga 113  Q
    |||||| || |||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||  |||||||||||||||||||    
T  8328265 gtgtcgatcagtttgcggagaaaccaacaacggtgatacaagcaagta-agagcttccgcttgaagggggagatcgatgcattgatggactcacacttga 8328363  T
Q  114 ggggg 118  Q
    |||||    
T  8328364 ggggg 8328368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 49336850 - 49336734
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  || ||| |||||||  ||||||  ||     
T  49336850 ttgtgtacaagtgtgagttacatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaccaccttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaagttc 49336751  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  49336750 tgggtaagagtgtggtg 49336734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1634477 - 1634366
Alignment:
Q  124 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagt-aaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| ||| ||||| | ||||||||||  || ||| ||||||||  |||||| |||    
T  1634477 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaaggttaaacacattataagtaagaggacccataaacccattggcttaaggttt 1634378  T
Q  223 tgggtaagagtg 234  Q
    ||||||||||||    
T  1634377 tgggtaagagtg 1634366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 234
Target Start/End: Original strand, 32589699 - 32589809
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  || | |||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||  |||||| |||    
T  32589699 ttgtgtgcaagtgtgagt-atatgtcccacataagataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 32589797  T
Q  223 tgggtaagagtg 234  Q
    ||||||||||||    
T  32589798 tgggtaagagtg 32589809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 84 - 167
Target Start/End: Original strand, 2299930 - 2300015
Alignment:
Q  84 agcatgatgatttgatggactcacacttgagggggag--tattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagt 167  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  2299930 agcatgataaattgatggactcacacttgagggggatattgttgtgtgcaagtgtgggttatatgtcccacgtcagatagaaaagt 2300015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33803415 - 33803301
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||  ||||||||||  || ||| ||||||||   ||||| | |    
T  33803415 ttgtgtgcaattgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgcattaaggtat 33803316  T
Q  223 tgggtaagagtgtgg 237  Q
    |||||||||||||||    
T  33803315 tgggtaagagtgtgg 33803301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 128 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 50612610 - 50612497
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcat-----taacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||     ||||  ||||||||||| |||    
T  50612610 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagattgaacaccttataagtaagaggactcataaatctaacatattatcttaaggttt 50612511  T
Q  223 tgggtaagagtgtg 236  Q
    ||||||||||||||    
T  50612510 tgggtaagagtgtg 50612497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Original strand, 8327899 - 8328015
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| | |||| | || |||||||||| ||| ||| |||  | |  |||||| |||    
T  8327899 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggatgaatatcttataagtaagagaacccataaacgtaatgccttaaggttt 8327998  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  8327999 tgggtaagagtgtggtg 8328015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 78
Target Start/End: Original strand, 8328160 - 8328223
Alignment:
Q  14 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaa 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  8328160 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacggcgatacaagcaagt-aagagcttccgcttgaa 8328223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Original strand, 39914247 - 39914363
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||| | ||||||||||| |||| |||||  || ||| |||| | |  ||||| ||||    
T  39914247 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaacagtagaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctaatgccttaatattt 39914346  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    ||| |||||||||||||    
T  39914347 tggataagagtgtggtg 39914363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7767476 - 7767382
Alignment:
Q  124 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaag 218  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||| |||||||| |||||||    
T  7767476 tgtgtgtaagtctgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttggacactttataactaagaggactcataaacccattgtcttaag 7767382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Original strand, 25755389 - 25755503
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||| |||||| |||| ||||||||||  |||||| || ||||| || |||  ||     
T  25755389 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaatccattgtcctaaagttg 25755488  T
Q  223 tgggtaagagtgtgg 237  Q
    ||||||| |||||||    
T  25755489 tgggtaaaagtgtgg 25755503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 12747976 - 12747871
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgaggggg-agtattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattg 161  Q
    ||||||| || |||| ||| ||||||||||| || | |||||||| |||||| ||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  12747976 agagctttcgtttgaggggtgagcatgatgaatttacggactcacgcttgagaggatattgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatag 12747877  T
Q  162 aaaagt 167  Q
    ||||||    
T  12747876 aaaagt 12747871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 25739588 - 25739475
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| |||||||| |  ||||||||||  || ||| ||| ||||   || || |||    
T  25739588 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgcttttaggttt 25739489  T
Q  223 tgggtaagagtgtg 236  Q
    ||||||||||||||    
T  25739488 tgggtaagagtgtg 25739475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 42584970 - 42584869
Alignment:
Q  138 agttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtgg 237  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||  |||||||||| ||||||||||  |  ||| |||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  42584970 agttatatgtcccacatcggatagaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggatccataaaccaattgtcttaagattttgagaaagagtgtgg 42584871  T
Q  238 tg 239  Q
    ||    
T  42584870 tg 42584869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 37991140 - 37991024
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||  || ||| |||   |||||| |||    
T  37991140 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcatcgccttaaggttt 37991041  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  37991040 tgggtaagagtgtggtg 37991024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 45395816 - 45395700
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||  || |||||| ||| ||||| | ||||||||||  |  ||| |||||||| ||||||  |||    
T  45395816 ttgtgtgcaagtgtaagttatatatcccacatcgaataaaagagtaaaggttaaacacgttataagtaagaggatccataaacccattgtcttaatgttt 45395717  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  45395716 tgggtaagagtgtggtg 45395700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 53118137 - 53118026
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||  || |||||| ||||||||||| |||||| |||  | |||  ||||||||  ||||||||||    
T  53118137 ttgtgggcaagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggattca-aaacccattgccttaagattt 53118039  T
Q  223 tgggtaagagtgt 235  Q
    |||||||||||||    
T  53118038 tgggtaagagtgt 53118026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 189
Target Start/End: Original strand, 31190012 - 31190078
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagt 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||    
T  31190012 ttgtgtgcaagtgtgagtgatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagt 31190078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 22304142 - 22304075
Alignment:
Q  95 ttgatggactcacacttgaggggga---gtattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagat 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304142 ttgatggactcacacttgagggagaatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagat 22304075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 193
Target Start/End: Original strand, 37726504 - 37726569
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||  || ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  37726504 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaataccttataagtaaga 37726569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 46546488 - 46546375
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||  | ||||||||| | |||||| ||| ||  ||| ||||||||  |||||| |||    
T  46546488 ttgtgtgtaagtgtgagttatatgtcctacattggattgaaatgtggaggttgaacactttataagttagagaatccataaacccattgccttaaggttt 46546389  T
Q  223 tgggtaagagtgtg 236  Q
    || |||||||||||    
T  46546388 tgtgtaagagtgtg 46546375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 54018358 - 54018245
Alignment:
Q  126 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||  || ||||||  |||||||||| ||||||||||  || ||| |||| |    |||||| ||||||    
T  54018358 tgtgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcggataaaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaacgccttaaggttttgg 54018259  T
Q  226 gtaagagtgtggtg 239  Q
    ||||||||||||||    
T  54018258 gtaagagtgtggtg 54018245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 3135624 - 3135565
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacct 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||| |||||||||||    
T  3135624 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacctcagataaaagagtaaaagttgaacacct 3135565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 39336394 - 39336351
Alignment:
Q  121 tattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaa 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  39336394 tattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaa 39336351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 182
Target Start/End: Original strand, 43346645 - 43346704
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacct 182  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||| |||||||||||    
T  43346645 ttgtgtgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct 43346704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 47964694 - 47964567
Alignment:
Q  110 ttgagggggagtattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccat 209  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||| ||  | ||||||| |   |||||| |||  || ||| |||| ||    
T  47964694 ttgagggcgagtgttgtgtgcaagtgtgagttgtatgtcccgcatcggatagaaatgtggaggttgaacgctatataagtgagaggacccataaacctat 47964595  T
Q  210 tatcttaagattttgggtaagagtgtgg 237  Q
    |  |||||| ||||||||||||||||||    
T  47964594 tgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 47964567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Original strand, 45901708 - 45901825
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaa-aagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagatt 221  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  || ||  ||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||| |||   |||||  ||    
T  45901708 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagaaaaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacgcataaactcatggccttaaagtt 45901807  T
Q  222 ttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    || |||||||||||||||    
T  45901808 tttggtaagagtgtggtg 45901825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 179
Target Start/End: Original strand, 53577359 - 53577415
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaaca 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  || |||||| ||||||||    
T  53577359 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaacagtaaaggttgaaca 53577415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 39935104 - 39935005
Alignment:
Q  137 gagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtg 236  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  |  ||| ||||||||  |||||  ||||| |||||||||||    
T  39935104 gagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaagttttgagtaagagtgtg 39935005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 193
Target Start/End: Original strand, 11661531 - 11661600
Alignment:
Q  124 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||  ||| |||| || ||||||||||    
T  11661531 tgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaacggttaaacatcttataagtaaga 11661600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 51)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Original strand, 7553909 - 7554136
Alignment:
Q  14 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttga 113  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||  || ||||    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7553909 gtgttggtccgtttgcagagaaaccagcaacggcgacacatgcaaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttga 7554007  T
Q  114 gggggagtattgt---gtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccatt 210  Q
    |||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  |  ||| |||||||     
T  7554008 gggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccata 7554107  T
Q  211 atcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||    
T  7554108 gccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 7554136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 45434520 - 45434744
Alignment:
Q  14 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggaga-gcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttg 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  45434520 gtgtcggtctgtttgcggagaaactagcaacggcgatacaagcaagtaaaaaagcttccgcttgaagggggagcatgatgaattgaaggactcacacttg 45434619  T
Q  113 agggggagta-ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccatta 211  Q
     ||||| ||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| |||  | |     
T  45434620 ggggggtgttgttgtgtacaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttactg 45434719  T
Q  212 tcttaagattttgggtaagagtgtg 236  Q
     |||||| |||||||||||||||||    
T  45434720 ccttaaggttttgggtaagagtgtg 45434744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 63 - 239
Target Start/End: Original strand, 14681443 - 14681621
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaaggggg-agcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatt 160  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  14681443 agagcttccgcttgaaggggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtaagttatatgtcccacatcagata 14681542  T
Q  161 gaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
     || |||||| |||||||||||  |||||||||   | ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14681543 aaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagagggcccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtg 14681621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 239
Target Start/End: Original strand, 30244204 - 30244381
Alignment:
Q  65 agcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattgt---gtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattg 161  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||   || |||||||||||||||||||||||||| |||      
T  30244204 agcttccgcttgaagagggagcatgatgactagatgaactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataa 30244303  T
Q  162 aaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    || |||||| |||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  30244304 aagagtaaaggttgaagaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 30244381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1085525 - 1085295
Alignment:
Q  14 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggac--tcacactt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||||  ||||||||    
T  1085525 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacagcgatacaagcaagta-agagcttccccttgaaggggtagcatgatgaaaagatggacactcacactt 1085427  T
Q  112 gagggggagtattgt---gtgcaagtgtgagttat-atgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaaccc 207  Q
    || ||||||| ||||   ||||||||||||||| | |||||||| ||| |||  || |||||| |||||||| || |||||||||| ||| ||| ||| |    
T  1085426 gaaggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagtttttatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacaactcataagtaagagaacccataaactc 1085327  T
Q  208 attatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  1085326 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 1085295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 74 - 239
Target Start/End: Original strand, 30245020 - 30245188
Alignment:
Q  74 ttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattgt---gtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaa 170  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||   || |||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||||||    
T  30245020 ttgaagggggagcatgatgattagatggactcgcacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaa 30245119  T
Q  171 tgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
     ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  30245120 ggttgaacaccttataagtaagacgacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 30245188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 40094652 - 40094502
Alignment:
Q  26 ttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattg 125  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| |||| |||||| | ||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  40094652 ttgcggataaaccagcaacaacgatacaagcaagta-agagcttccgcttga-gggagagcgtgatgaatagatggactcacactttaggaggagtgttg 40094555  T
Q  126 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaac 178  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||    
T  40094554 tgtgcaagtgtgagttatatgtccaacatcagataaaagagtaaaggttgaac 40094502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 118464 - 118350
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||| ||||||||| | |||| |||    
T  118464 ttgtgtgcaagtgtaagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacacctaataagtaagaggatccataaacccattaccgtaaggttt 118365  T
Q  223 tgggtaagagtgtgg 237  Q
    |||||||||||||||    
T  118364 tgggtaagagtgtgg 118350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 193
Target Start/End: Original strand, 30245385 - 30245559
Alignment:
Q  21 tccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgattt-gatggactcacacttgaggggga 119  Q
    |||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    || |||| |||||||||||||||    
T  30245385 tccgtttgcgcagagagcagcaacggcgatacaagcaagta-agagcttccgcttga-gggggagcatgatgaaaaagacggacacacacttgaggggga 30245482  T
Q  120 gtattgt---gtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
     | ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30245483 ctgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 30245559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Original strand, 7517575 - 7517691
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||  |||||| |||    
T  7517575 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 7517674  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  7517675 tgggtaagagtgtggtg 7517691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 34218197 - 34218081
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||| |||||||| ||||||| |||    
T  34218197 ttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttt 34218098  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  34218097 tgggtaagagtgtggtg 34218081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 48243351 - 48243240
Alignment:
Q  14 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttga 113  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  48243351 gtgtcggttcgttggcggagaaaccagcaacggcgatacaagcaagta-agaacttccacttgaagggggagcatgatgaattgatggattcacacttga 48243253  T
Q  114 gggggagtattgt 126  Q
    |||||||| ||||    
T  48243252 gggggagtgttgt 48243240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 145
Target Start/End: Original strand, 37345815 - 37345933
Alignment:
Q  26 ttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattg 125  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  37345815 ttgcggagaaagcagcaacggcgatacaagcaagtaaa-agcttccacttgacgggggagcacgatgaattgatgaactcacacttgaaggggagtgttg 37345913  T
Q  126 tgtgcaagtgtgagttatat 145  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  37345914 tgtgcaagtgtgagttatat 37345933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Original strand, 45433236 - 45433352
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||  || |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||  ||||||||||    
T  45433236 ttgtgtacaagtgtgagttatatgatccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaactcataaacctattgccttaagattt 45433335  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  45433336 tgggtaagagtgtggtg 45433352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Original strand, 47129360 - 47129438
Alignment:
Q  14 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatga 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47129360 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacaatacaagcaagt-aagagcttccgcttgaagggggagcatgatga 47129438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1085779 - 1085665
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||| | ||||||||||  || ||| ||||||||  |||||| |||    
T  1085779 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 1085680  T
Q  223 tgggtaagagtgtgg 237  Q
    |||||||||||||||    
T  1085679 tgggtaagagtgtgg 1085665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22566912 - 22566711
Alignment:
Q  38 cagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgct-tgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattgtg---tgcaag 133  Q
    |||||||||| || |||||||||  | |||||||||| ||  ||||||||| ||| |  |||| |||| ||| |||||||||||| ||||    ||||||    
T  22566912 cagcaacgacaatacaagcaagtaaaaagcttccgctctg--gggggagcacgataaagtgatagactaacatttgagggggagtgttgttgtatgcaag 22566815  T
Q  134 tgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagt 233  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  22566814 tgtgagtaatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 22566715  T
Q  234 gtgg 237  Q
    ||||    
T  22566714 gtgg 22566711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8128604 - 8128488
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||  || ||| ||||||| | |||||| |||    
T  8128604 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaaataaaggttgaacaccttatatgtaagaggacccataaacccataaccttaaggttt 8128505  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    ||| |||||||||||||    
T  8128504 tggttaagagtgtggtg 8128488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 96 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 37533201 - 37533058
Alignment:
Q  96 tgatggactcacacttgagggggagtattg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaa 194  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  37533201 tgatggactcacgcttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 37533102  T
Q  195 aactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
     || ||| ||| ||||  |||||| |||||||||| |||||||||    
T  37533101 gacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa-agtgtggtg 37533058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Original strand, 45754711 - 45754826
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||  || |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||   |||||| |||    
T  45754711 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgactcataaacccatagccttaaggttt 45754809  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  45754810 tgggtaagagtgtggtg 45754826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23540 - 23424
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| |||| |||  |||||| |||    
T  23540 ttgtgtgcaattgtgagttatatgttccacatcggatacaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaggttt 23441  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  23440 tgggtaagagtgtggtg 23424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 193
Target Start/End: Original strand, 30244633 - 30244766
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgattt-gatggactcacacttgagggggagtattgt---gtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcaga 158  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  30244633 agagcttccgcttcaagggg-agcatgatgaaaaagatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattgga 30244731  T
Q  159 ttgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    |  || |||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  30244732 taaaagagtaaaggttgaacaccttataaataaga 30244766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 239
Target Start/End: Original strand, 29157565 - 29157676
Alignment:
Q  128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| || |||||  |||||| ||||||||    
T  29157565 tgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagacgacccataaatccattgccttaaggttttgggt 29157664  T
Q  228 aagagtgtggtg 239  Q
    ||||||||||||    
T  29157665 aagagtgtggtg 29157676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Original strand, 30255308 - 30255404
Alignment:
Q  100 ggactcacacttgagggggagtattgt---gtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30255308 ggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgcgttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 30255404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40094937 - 40094823
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  || |||||| ||| ||||||| ||||||||||  || ||| |||||||  ||||||| |||    
T  40094937 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgtcttaaggttt 40094838  T
Q  223 tgggtaagagtgtgg 237  Q
    |||||||||||||||    
T  40094837 tgggtaagagtgtgg 40094823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 40230456 - 40230338
Alignment:
Q  121 tattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagat 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  ||||||||| |||||||| || ||||||||||  || ||| |||||||  ||||||| |    
T  40230456 tattgtgtgcaagtgtaagttatatgtcccacatcgaataaaaaagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaggt 40230357  T
Q  221 tttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    ||||||||| ||| |||||    
T  40230356 tttgggtaaaagtctggtg 40230338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 130 - 239
Target Start/End: Original strand, 6054562 - 6054671
Alignment:
Q  130 caagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaa 229  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||  || |||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||| ||||  |||||| ||||||||||    
T  6054562 caagtgttagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttgggtaa 6054661  T
Q  230 gagtgtggtg 239  Q
    ||||||||||    
T  6054662 gagtgtggtg 6054671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Original strand, 16569191 - 16569307
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||| |||||| |||| ||||||||||  || ||| ||||||||  |||||| |||    
T  16569191 ttgtatgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 16569290  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    | |||||||||| ||||    
T  16569291 ttggtaagagtgcggtg 16569307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16596471 - 16596355
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||| |||||| |||| ||||||||||  || ||| ||||||||  |||||| |||    
T  16596471 ttgtatgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 16596372  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    | |||||||||| ||||    
T  16596371 ttggtaagagtgcggtg 16596355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 28301706 - 28301619
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccatt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  28301706 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatt 28301619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 36939893 - 36939780
Alignment:
Q  126 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| || |||||  |||||| ||||||    
T  36939893 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcgtataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttgg 36939794  T
Q  226 gtaagagtgtggtg 239  Q
    |||| |||||||||    
T  36939793 gtaaaagtgtggtg 36939780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 147
Target Start/End: Original strand, 45697846 - 45697929
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattgtgtgcaagtgtgagttatatgt 147  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  45697846 agagcttccgcttgaagggg-agcatgatgaatagataaactcacacttgaggaggagtgttgtgtgcaagtgtcatttatatgt 45697929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 239
Target Start/End: Original strand, 19122740 - 19122842
Alignment:
Q  136 tgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| || |||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  19122740 tgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaatccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 19122838  T
Q  236 ggtg 239  Q
    ||||    
T  19122839 ggtg 19122842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 141
Target Start/End: Original strand, 10342193 - 10342271
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattgtgtgcaagtgtgagtt 141  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  10342193 agagcttccacttgagggggcagcatgatgaattggcggactcatacttgagggggagtgtggtgtgcaagtgtgagtt 10342271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Original strand, 24177430 - 24177544
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  || |||||| | ||||||||| |||||||||   || ||| ||||||||  |||||  |||    
T  24177430 ttgtgtgcaagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggctgaacaccttataagtaagcggacccataaacccattgccttaaagttt 24177529  T
Q  223 tgggtaagagtgtgg 237  Q
    | |||||||||||||    
T  24177530 ttggtaagagtgtgg 24177544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 8128364 - 8128288
Alignment:
Q  26 ttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||    
T  8128364 ttgcggagaaaccagcaacgacgatacaaacaagt-aagagcttccgcttgaaagggaagcatgatgaatagatggac 8128288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 28300470 - 28300366
Alignment:
Q  14 gtgtcggtccgtttgc-ggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaaggg-ggagcatgatgatttgatggactcacactt 111  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |     |||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  28300470 gtgtcggtccatttgctggagaaaccagcaacgacgttacaagcaaggg-----cttccgcttgaaaggaggagcatgatgaatagatggactcacactt 28300376  T
Q  112 gagggggagt 121  Q
    ||| ||||||    
T  28300375 gagagggagt 28300366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 239
Target Start/End: Original strand, 11845198 - 11845302
Alignment:
Q  135 gtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtg 234  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| || |||||  |||||| |||||| ||||||||    
T  11845198 gtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttggataagagtg 11845297  T
Q  235 tggtg 239  Q
    |||||    
T  11845298 tggtg 11845302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22567201 - 22567086
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||| ||||  |||||| |||    
T  22567201 ttgtatgcaagtgtgagtaatatgtcc-acatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttt 22567103  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    | |||||||||||||||    
T  22567102 ttggtaagagtgtggtg 22567086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 191
Target Start/End: Original strand, 43241490 - 43241558
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaa 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  43241490 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaaaaataaaggttgaacaccttataagtaa 43241558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 36109080 - 36109010
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36109080 ttgtgtgcaagtgtgagttatatttctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 36109010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 36534947 - 36534833
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| || |||  || |||| | ||||||||||| ||||||||||  || ||| |||| |   ||||||| |||    
T  36534947 ttgtgtgcaagtgtaacttatatgtcccacctcggataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaaagtcttaaggttt 36534848  T
Q  223 tgggtaagagtgtgg 237  Q
    |||||||||||||||    
T  36534847 tgggtaagagtgtgg 36534833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 131 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 37533519 - 37533411
Alignment:
Q  131 aagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaag 230  Q
    ||||||||||||||||| | ||||   ||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| || |||||  |||||| |||||||||||    
T  37533519 aagtgtgagttatatgttctacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttgggtaag 37533420  T
Q  231 agtgtggtg 239  Q
    |||||||||    
T  37533419 agtgtggtg 37533411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 41910757 - 41910657
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| |||||| |||| |||| | |||  || ||| ||||||||  ||||||||||    
T  41910757 ttgtgtgtaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaataccttataactgagaggacccataaacccattggcttaagattt 41910658  T
Q  223 t 223  Q
    |    
T  41910657 t 41910657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 236
Target Start/End: Original strand, 30032572 - 30032675
Alignment:
Q  133 gtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagag 232  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  || ||||| |||||||||||| ||||||||||  |  ||| |||| ||   |||||| |||||||||||||    
T  30032572 gtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaagtgttgaacaccttataagtaagagtatccataaacctatagccttaaggttttgggtaagag 30032671  T
Q  233 tgtg 236  Q
    ||||    
T  30032672 tgtg 30032675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 131 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24838857 - 24838751
Alignment:
Q  131 aagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaa-aactcattaacccattatcttaagattttgggtaa 229  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||  ||  || |||||| ||||||||||| |||||||||||  |  ||| ||||| || ||||||| ||||||||||    
T  24838857 aagtgtaagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaaggatccataaacccgttgtcttaaggttttgggtaa 24838758  T
Q  230 gagtgtg 236  Q
    |||||||    
T  24838757 gagtgtg 24838751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 121 - 155
Target Start/End: Original strand, 36622953 - 36622987
Alignment:
Q  121 tattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36622953 tattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatc 36622987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 193
Target Start/End: Original strand, 41854630 - 41854699
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || |||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  41854630 ttgtgtgcaagtatgagttatatgtcccacatcag-taaaagagtaaaggttgaacaccttataagcaaga 41854699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 239
Target Start/End: Original strand, 47129097 - 47129206
Alignment:
Q  130 caagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||  || |||||| |||||||  || ||||||||||  || ||| |||||||    ||||| |||||||||     
T  47129097 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacctcttataagtaagaggacccataaacccatcgctttaaggttttgggtag 47129196  T
Q  230 gagtgtggtg 239  Q
    ||||||||||    
T  47129197 gagtgtggtg 47129206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28300366 - 28300302
Alignment:
Q  174 tgaacacctaataagtaagaaaactc-attaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtgg 237  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| | || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28300366 tgaacaccttataagtaagagaaccccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtgg 28300302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 239
Target Start/End: Original strand, 30253536 - 30253603
Alignment:
Q  172 gttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||| ||| ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  30253536 gttgaagaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 30253603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 63 - 239
Target Start/End: Original strand, 5289 - 5468
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattgt---gtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  5289 agagcttccgcttgaagggggagcacgatgaactgatggactcacacttgagggagagttttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcggat 5388  T
Q  160 tgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaagagtgtggtg 239  Q
     ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5389 agaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattttggataagagtgtggtg 5468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Original strand, 4977 - 5093
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattt 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||  ||| |||||| ||| || | || |||||||| || || ||| ||| ||||  |||| | |||    
T  4977 ttgtgtgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggagagaacagtaaaggtttaatatcttataagtaaaaagacccataaactcattgccttatggttt 5076  T
Q  223 tgggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  5077 tgggtaagagtgtggtg 5093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 221
Target Start/End: Original strand, 5661 - 5870
Alignment:
Q  14 gtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatgcaagcaagtggagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttga 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||  || ||||    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5661 gtgtcggtccgtttgcagagaaaccagtaacggcgacacatgcaaagtaagagcttccgcttga-gggggagcaagatgaattgatggactcacacttga 5759  T
Q  114 gggggagtattgt---gtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccatt 210  Q
    |||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  5760 gggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatt 5859  T
Q  211 atcttaagatt 221  Q
      |||||||||    
T  5860 gccttaagatt 5870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Original strand, 5391 - 5508
Alignment:
Q  123 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatctt-aagatt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||   | ||| |||  ||| |||| ||| ||    
T  5391 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccataaacatattgtcttaaagttt 5490  T
Q  222 ttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5491 ttgggtaagagtgtggtg 5508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 63 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 365 - 235
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattg 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  365 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgaataaatggactcacatttg-gggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataa 267  T
Q  162 aaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    || |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  266 aatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 130 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 670 - 561
Alignment:
Q  130 caagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagattttgggtaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |  || |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||  |||||| ||||||||||    
T  670 caagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 571  T
Q  230 gagtgtggtg 239  Q
    ||||||||||    
T  570 gagtgtggtg 561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 82 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17663 - 17501
Alignment:
Q  82 ggagcatgatgatttgatggactcacacttgagggggagtattgt---gtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaac 178  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||| |||||||    
T  17663 ggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcagataaaatagtaaaggttgaac 17564  T
Q  179 acctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaag--attttgggtaagagtgtggtg 239  Q
    ||||  |||||||||  || ||| |||||||   ||||||   |||||||||||||| |||||    
T  17563 accttgtaagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttttgggtaagagtatggtg 17501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 63 - 167
Target Start/End: Original strand, 39772 - 39877
Alignment:
Q  63 agagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgaggggg-agtattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattg 161  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  39772 agagcttccgcttgaggggtgagcatgatgaattgatgaactcacacttgagggggaattgttgtgttcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatag 39871  T
Q  162 aaaagt 167  Q
    ||||||    
T  39872 aaaagt 39877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 239
Target Start/End: Original strand, 47356 - 47471
Alignment:
Q  124 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaagaaaactcattaacccattatcttaagatttt 223  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||  || ||||||  |||||||||| |||||||||| ||  ||| ||||||||  |||||  ||||    
T  47356 tgtgtgcaagtgtgaattaaatgtctcacatccgataaaatagtaaagtttgaacaccttataagtaagagaatccataaacccattgccttaaagtttt 47455  T
Q  224 gggtaagagtgtggtg 239  Q
    |||||| | |||||||    
T  47456 gggtaaaaatgtggtg 47471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10267 - 10204
Alignment:
Q  130 caagtgtgagttatatgtcccacatcagattgaaaagtaaatgttgaacacctaataagtaaga 193  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||  ||  ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10267 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatggtaaaagttgaacaccttataagtaaga 10204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University