View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10637_low_4 (Length: 381)

Name: NF10637_low_4
Description: NF10637
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10637_low_4
NF10637_low_4
[»] chr7 (12 HSPs)
chr7 (20-368)||(15653823-15654171)
chr7 (17-360)||(46623375-46623719)
chr7 (20-359)||(12378852-12379191)
chr7 (20-368)||(3104577-3104926)
chr7 (70-363)||(13439777-13440070)
chr7 (65-367)||(45942570-45942872)
chr7 (65-363)||(45235669-45235967)
chr7 (23-293)||(43104988-43105258)
chr7 (65-170)||(28327075-28327180)
chr7 (17-77)||(21277460-21277520)
chr7 (65-204)||(30385919-30386057)
chr7 (35-105)||(26714207-26714277)
[»] chr8 (10 HSPs)
chr8 (17-368)||(7452023-7452374)
chr8 (17-368)||(19384828-19385179)
chr8 (65-363)||(2871909-2872207)
chr8 (101-368)||(35405460-35405727)
chr8 (65-346)||(412502-412787)
chr8 (70-363)||(16421133-16421425)
chr8 (17-77)||(12218426-12218486)
chr8 (58-123)||(30501680-30501745)
chr8 (66-176)||(7555167-7555277)
chr8 (67-216)||(27083336-27083485)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (17-368)||(36305455-36305806)
chr1 (17-368)||(36928838-36929189)
chr1 (17-368)||(21527832-21528183)
chr1 (17-368)||(48265836-48266187)
chr1 (17-321)||(4644684-4644987)
chr1 (17-176)||(47115959-47116118)
chr1 (65-363)||(14119484-14119787)
chr1 (70-363)||(48073554-48073848)
chr1 (17-150)||(14365961-14366094)
chr1 (65-363)||(32353420-32353718)
chr1 (65-363)||(37530283-37530583)
chr1 (92-363)||(3692373-3692644)
chr1 (65-174)||(38231406-38231515)
chr1 (17-76)||(52336333-52336392)
chr1 (17-75)||(25639874-25639932)
[»] chr3 (13 HSPs)
chr3 (17-368)||(49732050-49732402)
chr3 (17-368)||(30167463-30167814)
chr3 (20-363)||(9378771-9379114)
chr3 (65-367)||(6176597-6176899)
chr3 (65-363)||(7146760-7147058)
chr3 (65-363)||(23601492-23601790)
chr3 (17-150)||(13448149-13448282)
chr3 (20-295)||(28675119-28675395)
chr3 (65-360)||(29309127-29309422)
chr3 (65-363)||(2813623-2813921)
chr3 (65-363)||(25873233-25873533)
chr3 (17-104)||(32004651-32004738)
chr3 (275-363)||(14904289-14904377)
[»] chr6 (14 HSPs)
chr6 (17-368)||(33629768-33630119)
chr6 (17-368)||(1682717-1683062)
chr6 (70-367)||(25317578-25317875)
chr6 (70-367)||(26205072-26205369)
chr6 (70-363)||(15673549-15673842)
chr6 (65-363)||(23347589-23347887)
chr6 (65-363)||(8872949-8873247)
chr6 (20-321)||(19256719-19257019)
chr6 (70-298)||(19348989-19349219)
chr6 (20-176)||(4406686-4406842)
chr6 (49-149)||(33745798-33745898)
chr6 (70-203)||(13755189-13755322)
chr6 (82-128)||(14528109-14528155)
chr6 (82-128)||(14532835-14532881)
[»] chr4 (13 HSPs)
chr4 (17-368)||(47540596-47540947)
chr4 (17-368)||(3130097-3130448)
chr4 (17-368)||(7663357-7663707)
chr4 (17-364)||(8655195-8655542)
chr4 (23-368)||(23279284-23279629)
chr4 (65-363)||(23873599-23873897)
chr4 (65-363)||(8487104-8487402)
chr4 (65-363)||(55298342-55298637)
chr4 (17-117)||(1121013-1121113)
chr4 (65-363)||(2631117-2631415)
chr4 (209-363)||(20674885-20675039)
chr4 (65-149)||(20673428-20673512)
chr4 (67-126)||(13159132-13159191)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (17-368)||(7346-7697)
[»] chr5 (10 HSPs)
chr5 (17-368)||(10487038-10487375)
chr5 (65-363)||(15499769-15500067)
chr5 (20-368)||(32917991-32918340)
chr5 (65-363)||(6264321-6264619)
chr5 (65-363)||(34480675-34480973)
chr5 (20-299)||(6020412-6020691)
chr5 (81-312)||(31862328-31862559)
chr5 (71-121)||(34858058-34858108)
chr5 (20-149)||(587190-587319)
chr5 (224-293)||(587394-587463)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (17-330)||(134792-135105)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (17-330)||(312619-312932)
scaffold0002 (17-330)||(328073-328386)
[»] chr2 (13 HSPs)
chr2 (17-368)||(45421189-45421541)
chr2 (20-367)||(13549798-13550145)
chr2 (20-368)||(31085755-31086103)
chr2 (65-363)||(33547591-33547889)
chr2 (65-363)||(22052346-22052644)
chr2 (20-303)||(26180109-26180391)
chr2 (65-363)||(43627218-43627516)
chr2 (65-363)||(9949387-9949685)
chr2 (20-143)||(31774358-31774481)
chr2 (65-134)||(26681600-26681669)
chr2 (23-75)||(25784588-25784640)
chr2 (65-126)||(31594273-31594334)
chr2 (65-129)||(35694352-35694416)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (17-77)||(12279-12339)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (20-85)||(22614-22679)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 12)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 20 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15654171 - 15653823
Alignment:
Q  20 gacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15654171 gacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacagacgattatttcgttcattccacacaactcatgcacaaagaa 15654072  T
Q  120 gccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccga 219  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||     
T  15654071 gccatataagttgcataaaagaacgtctagaaacagcaccacctatcaaataagtaaactgaagaaaatggtcggaaatattatcagcatccacccccgc 15653972  T
Q  220 gcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgaca 319  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15653971 acaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaccaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgaca 15653872  T
Q  320 cataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaattagtct 368  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15653871 cataaggacatatcagtcggcaacacccgtcgagcaatcaagttagtct 15653823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 17 - 360
Target Start/End: Original strand, 46623375 - 46623719
Alignment:
Q  17 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || || |||||||    
T  46623375 aaggacaacatcttaaccttgtctaacaaacggggaatgagagttattacattattaaacagacgattatttcgttcatttcacacgacccatgcacaaa 46623474  T
Q  117 gaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccc 216  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  46623475 gaagccatataagttgcataaaagaacgtctagaaacaacaccacctgtcaaataagtaaactgaagaaaatggtcgaaaatattatcagcatccacccc 46623574  T
Q  217 cgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaac-aaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagc 315  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46623575 cgcacaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagtgaaccaaaagtgttacataacaaaaaaaagatgttgagccgattcaggatgaccgcaaccagc 46623674  T
Q  316 gacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  46623675 gacacataaggacatatcagtcggcaacacccttcgagcaatcaa 46623719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12379191 - 12378852
Alignment:
Q  20 gacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaa 119  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  12379191 gacaacaacttaacattgtctaataaacaggggatgggagtaactacattattaaacaggcatttatttcgttcattccacacaacgcaggcacacagaa 12379092  T
Q  120 gccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccga 219  Q
    ||||||  ||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||| |||||  ||||| |||| |||||||| | | ||||||||  |    
T  12379091 gccatacgagttgcataaaagaacgtctagctttaccaccacctgtaaaataagtaaactgtaaaaaatgttcgggaatattatcagcttccaccccata 12378992  T
Q  220 gcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgaca 319  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||| |  || ||||| |||    
T  12378991 gcaccctatccaatcacgcaccatatgccaaattgaaccaaaagtgttacacaataaaaagaggtgttgcgccgtttcagaatgtctacagccagcaaca 12378892  T
Q  320 cataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatca 359  Q
    ||  | ||||| ||||||| ||||||| ||| | ||||||    
T  12378891 cacgatgacatgtcagtcgtcaacacctgtctagcaatca 12378852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 368
Target Start/End: Original strand, 3104577 - 3104926
Alignment:
Q  20 gacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaa 119  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||| |||| |||||| |  ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| | ||    
T  3104577 gacaacatcttaaccttgtctagcaaacatggaatgggagttataacatcattaaataggcgattgtttcgttcattccaaacaacacaggcacacataa 3104676  T
Q  120 gccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgt--agtaaatggtcggaaatattattaacatccaccccc 217  Q
    | ||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||||  |  ||||||||||||||||||  |   ||||||||     
T  3104677 gacataatagttgcataaaagaacgtctagcattagcaccacttgtcaaatgaataaactgtaaaaaaaatggtcggaaatattaccagtgtccacccca 3104776  T
Q  218 gagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcga 317  Q
     |||| ||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| ||| | |    
T  3104777 tagcagccaatccaatcgcg-aacatatgccaaagggaaccaaaagtattacacaataaaaagaggtgttgtcccgtttcaggatgtccgcagccaacaa 3104875  T
Q  318 cacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaattagtct 368  Q
    |||| |||||||| |||| || || |||||||| | | |||||||| ||||    
T  3104876 cacacaaggacatgtcagccgccagcacccgtctagctatcaaatttgtct 3104926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 70 - 363
Target Start/End: Original strand, 13439777 - 13440070
Alignment:
Q  70 attaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaa 169  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |  | |||||||| |||||    
T  13439777 attaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacaaagaagccagattagttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccacctatcaaa 13439876  T
Q  170 taagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttac 269  Q
    | ||| | |||||  |||||  | ||||||||||     ||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||| | ||    
T  13439877 tgagtgaactgtaaaaaatgagctgaaatattatctgtgtccaccccaaagcaaccgatccaatcacgcaccaaatgccacagagaaccaaaagtatcac 13439976  T
Q  270 acaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaatt 363  Q
    |||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  13439977 acaataaaaatagatgtcgagccgattcaggatgaccgcagccagcaacacacgaagacatgtcagacgacaacacccgtcgagcaatcaaatt 13440070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 65 - 367
Target Start/End: Original strand, 45942570 - 45942872
Alignment:
Q  65 acattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctg 164  Q
    |||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| || ||| |  | |||||||||    
T  45942570 acatgattaaacaaatggttatttcgttcattccacacaacccagacacaaagaagccaaattagttgcataaaagaatgtgtagcaacaccaccacctg 45942669  T
Q  165 tcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagt 264  Q
    |||||| ||||| |||||  ||||| ||||||||||||||    ||||||||  ||||||||||| |||| ||||||| ||| || || ||  |||||||    
T  45942670 tcaaatgagtaaactgtaaaaaatgatcggaaatattatttgtgtccaccccatagcaaccaatcaaatctcgcaccagatggcacagagagccaaaagt 45942769  T
Q  265 gttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaatta 364  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| | |||||  |||| || |||| |||||||||||||  | |||||||||||    
T  45942770 attacacaataaaaagagatgttgcgccgactcaggatgaccacaaccaacaacacacgaggatatgtcaggcgacaacacccgtttagcaatcaaatta 45942869  T
Q  365 gtc 367  Q
    |||    
T  45942870 gtc 45942872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 65 - 363
Target Start/End: Original strand, 45235669 - 45235967
Alignment:
Q  65 acattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctg 164  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |  |||||||||    
T  45235669 acatgattaaacaaacggttatttcattcattccaaacaacccagacacatggaagccatattagttgcataaaagaacgtctagcaattccaccacctg 45235768  T
Q  165 tcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagt 264  Q
    |||||| ||||| ||||   ||||  || ||||||||||   | ||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||| || || ||| |||||||    
T  45235769 tcaaatgagtaaactgtcaaaaattatcagaaatattatccgcgtccaccccatagcaaccaatccaatctcgcaccaaatgtcacagagaaccaaaagt 45235868  T
Q  265 gttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaatt 363  Q
     |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||| | |||||  ||||||| |||| ||||| ||||||||   ||||||||||    
T  45235869 attacacaataaaaagagatgttgtactgtttcaggatgaccacaaccaacaacacacgaggacatgtcaggcgacatcacccgtcttgcaatcaaatt 45235967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 293
Target Start/End: Original strand, 43104988 - 43105258
Alignment:
Q  23 aacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagcc 122  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||  ||||| ||| |||||||||| ||||  || || || | |||||    
T  43104988 aacatcttaaccttgtctaataaacggggaatgggagtaaccacattattaaacaggcgattgttttgttcattccaaacaagccaagcgcacaaaagcc 43105087  T
Q  123 atataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccgagca 222  Q
    | || |||| || |||||  |||| ||   || ||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||||||| |   |  || ||  | ||    
T  43105088 aaatgagttacataaaagcccgtcgagctctaccaccacctgtcaaatgagtaaactgcagaaaatggtcagatatattatcagtgttgactccacaaca 43105187  T
Q  223 accaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccg 293  Q
      |||||||||| |||||||  |||||||| ||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  43105188 ctcaatccaatcccgcaccaagtgccaaagtgaaccaaaagagttgcacaataaaaagagatgttgcgccg 43105258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 170
Target Start/End: Original strand, 28327075 - 28327180
Alignment:
Q  65 acattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctg 164  Q
    |||| ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||     
T  28327075 acatgattaaacattcggttattacgttcattccaaacaacccaagcacaaagaagccaaataagttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccaccta 28327174  T
Q  165 tcaaat 170  Q
    ||||||    
T  28327175 tcaaat 28327180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 21277520 - 21277460
Alignment:
Q  17 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaaca 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  21277520 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacggaggataggagttattacattattaaaca 21277460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 204
Target Start/End: Original strand, 30385919 - 30386057
Alignment:
Q  65 acattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctg 164  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||| |  | |||||||||    
T  30385919 acatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccagacacatagaagccatataagttgc-ataaagaatgtctagcaacaccaccacctg 30386017  T
Q  165 tcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattatt 204  Q
    |||||| ||| | |||||  | ||| || |||||||||||    
T  30386018 tcaaatgagtgaactgtaaaacatgatctgaaatattatt 30386057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 105
Target Start/End: Original strand, 26714207 - 26714277
Alignment:
Q  35 ttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaac 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  26714207 ttgtctaacaatcggggaattggagtaacaacattattaaacagacgattatttcgttctttcgacacaac 26714277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 10)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 368
Target Start/End: Original strand, 7452023 - 7452374
Alignment:
Q  17 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  7452023 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacgggggatgggagttataacattattaaacagacgattattttgttcattccacacaacccagtcacaaa 7452122  T
Q  117 gaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccc 216  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||||||||||   ||||||||||    
T  7452123 gtagccatataagttgcataaaagaacgtctagaaacagcaccacctgtcaaataagtaaactgaagaaaatgatctgaaatattatcggcatccacccc 7452222  T
Q  217 cgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcg 316  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7452223 cgtgcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaccaaaagtgttacacaacagaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcg 7452322  T
Q  317 acacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaattagtct 368  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7452323 acacataaggacatatcaggcaacaacacccgtcgagcaatcaaattagtct 7452374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 17 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 19385179 - 19384828
Alignment:
Q  17 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  19385179 aaggacaacatcttgaccttgtctaagaaacggggaatgagagttattacattattaaacagacgattatttcgttcattccacacaacacaggcacaga 19385080  T
Q  117 gaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccc 216  Q
     |||| | |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||| | ||||||||||    
T  19385079 taagctaaataagttgcataaaagaacgtctggacttagcaccacctgtcaaataagtaaactgaagaaaatggtcagataaattatcagcatccacccc 19384980  T
Q  217 cgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcg 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19384979 cgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaccaaaagtattacacaacaagaatagatgttgggccgtttccggatgaccgcaaccagcg 19384880  T
Q  317 acacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaattagtct 368  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  19384879 acacataaggacatgtcattcgataacacccgtcgagcaatcaaattagtct 19384828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 65 - 363
Target Start/End: Original strand, 2871909 - 2872207
Alignment:
Q  65 acattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctg 164  Q
    |||| |||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |  | ||||||||     
T  2871909 acatgattaaacatctgattattacgttcattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagttgcataaaagaacgtccagcaacaccaccaccta 2872008  T
Q  165 tcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagt 264  Q
    |||||| ||| | |||||  ||||| || ||||||||||     ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| |||||| || ||| |||||||    
T  2872009 tcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaaatattatctgtgtccaccccaaagcaaccgatccagtcacgcaccaaatgccacagagaaccaaaagt 2872108  T
Q  265 gttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaatt 363  Q
     | |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  | |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  2872109 atcacacaataaaaatagatgtcgagccgattcaggatgaccacaatcagcaacacacgaagacatatcaggcgacaacacccgtctagcaatcaaatt 2872207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 101 - 368
Target Start/End: Original strand, 35405460 - 35405727
Alignment:
Q  101 acaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatat 200  Q
    ||||| ||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||||||||| ||||| ||| |  ||||| ||||||||||    
T  35405460 acaacccagacacatagaaaccatataagttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctgtcaaatgagtaaactgaaaaaaatgatcggaaatat 35405559  T
Q  201 tattaacatccacccccgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcagg 300  Q
    |||   | ||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||||| || ||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  35405560 tatctgcgtccaccccatagcaaccaatccaatcctgcaccaaatgccacagagaaccaaaaatattacacaataaaaagagatgttgtgccgtttcagg 35405659  T
Q  301 atgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaattagtct 368  Q
    |||||| |||||||| |||||  ||||||| || | ||||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  35405660 atgaccacaaccagcaacacacgaggacatgtcgggcgacaacacccgtcttgcaatcaaatttgtct 35405727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 412787 - 412502
Alignment:
Q  65 acattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctg 164  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||| |   |  | ||||||||     
T  412787 acatgattaaacagacggttatttcgttcattccaaacaacccagacacaaagaagcaatattagttgcataaaagaccgtttgacaacaccaccaccta 412688  T
Q  165 tcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaa-- 262  Q
    |||||| ||| | |||||  ||||| |||||||||||||  || ||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||  |||||      
T  412687 tcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatcggaaatattatctacgtccaccccatagcaaccaatccaatctcgcaccaaatgccacagagagccaaaatt 412588  T
Q  263 --gtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcgacaacacc 346  Q
      || | |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  412587 aagtatcacacaataaatagagatgttgagccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacgaggacatatcagacgacaacacc 412502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 16421425 - 16421133
Alignment:
Q  70 attaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaa 169  Q
    |||||||| ||| || || || |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||||||||    
T  16421425 attaaacaaacggttgttacgctcattccacacaacccaaacacatagaagccatattagttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccacctgtcaaa 16421326  T
Q  170 taagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttac 269  Q
    | ||| | ||| |  ||||| || || |||||||     ||||||||  | |||||||||||| | ||||||| |||||| || ||| ||||||| | ||    
T  16421325 tgagtgaactggaa-aaatgatctgatatattatcggtgtccaccccacaacaaccaatccaagctcgcaccaaatgccacagagaaccaaaagtatcac 16421227  T
Q  270 acaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaatt 363  Q
    |||||||||| ||| || | |||| |||||||||||| || ||||| |||||  ||||||| || | |||||||||||||| | ||||||||||    
T  16421226 acaacaaaaatagacgtcgtgccgattcaggatgaccacagccagcaacacacgaggacatgtccggcgacaacacccgtctagcaatcaaatt 16421133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 12218486 - 12218426
Alignment:
Q  17 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaaca 77  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  12218486 aaggacaatatcttttccttgtctaataaacgggaaatgagagttattacattattaaaca 12218426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 123
Target Start/End: Original strand, 30501680 - 30501745
Alignment:
Q  58 agttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagcca 123  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  30501680 agttataacattattaaacagacggttattacgttcattccacaaaacccaagcacaaagaagcca 30501745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 176
Target Start/End: Original strand, 7555167 - 7555277
Alignment:
Q  66 cattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgt 165  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||| |||| || |||||| | ||||||||| || || || |||| ||| ||||||||||  ||| || || ||||    
T  7555167 cattattaaacagacggttattacgttcgttccgcaaaactcaagtacaaagaagtcagattagctgcagaaacgaacgtctagctttaccaacatctgt 7555266  T
Q  166 caaataagtaa 176  Q
    || ||||||||    
T  7555267 catataagtaa 7555277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Original strand, 27083336 - 27083485
Alignment:
Q  67 attattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtc 166  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || | ||| || || || || || ||||  || |||||| |||  ||| || ||||||||    
T  27083336 attattgaaaatacggttgttacgttcattccacacaacccaagtacacagtagtcaaattagctgcaggaacgaacgtttagctttaccaacacctgtc 27083435  T
Q  167 aaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccc 216  Q
    | |||||||| ||| |  ||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  27083436 atataagtaaactgcaccaaatgatcggaaatattattagaatccacccc 27083485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 17 - 368
Target Start/End: Original strand, 36305455 - 36305806
Alignment:
Q  17 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  36305455 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacggagaatgggagttattacattattaaacagacgattatttcgttcattccacacaacccagacacaaa 36305554  T
Q  117 gaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccc 216  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  || || ||||| || ||||||||||   ||||||||||    
T  36305555 gtagccatataagttgcataaaagaacgtctagaaacagcaccacctgtcaaataagtaaattgaagaaaatgatctgaaatattatcggcatccacccc 36305654  T
Q  217 cgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcg 316  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36305655 cgtgcaaccaatccaatcacgcagcatatgccaaagcaaaccaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgatcgcaaccagcg 36305754  T
Q  317 acacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaattagtct 368  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  36305755 acacataaggacatatcaggcgacaacacctgtcgagcaatcaaattagtct 36305806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 368
Target Start/End: Original strand, 36928838 - 36929189
Alignment:
Q  17 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  36928838 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacgagggatgggagttataacattattaaacagacgattatttcgttcattccacacaacccaagcacaaa 36928937  T
Q  117 gaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccc 216  Q
    | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  || || ||||| || ||||||||||   ||||||||||    
T  36928938 gtagccaaataagttgcataaaagaacgtctagaaacagcaccacctgtcaaataagtaaattgaagaaaatgatctgaaatattatcggcatccacccc 36929037  T
Q  217 cgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcg 316  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36929038 cgtgcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaccaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccatttcaggatgaccgcaaccagcg 36929137  T
Q  317 acacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaattagtct 368  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  36929138 acacataaggacatatcaggcaacaacactcgtcgagcaatcaaattagtct 36929189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 368
Target Start/End: Original strand, 21527832 - 21528183
Alignment:
Q  17 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaa 116  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  21527832 aaggataacatcttgaccttatctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacagtcgattatttcgctcattccacacaacccaggcacaga 21527931  T
Q  117 gaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccc 216  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||| || |||||||| || ||||||| | ||| ||||||    
T  21527932 gaagccaaataagttgcataaaagaacgtctagacttagcaccacctgtcaaatgaataaactgaagaaaatggtcagatatattatcagcatgcacccc 21528031  T
Q  217 cgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcg 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  21528032 cgagcaaccaatccaatcacgcaccatataccaaagcgaaccaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgggccgtttccggatgaccgtaaccagcg 21528131  T
Q  317 acacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaattagtct 368  Q
     ||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  21528132 gcacataaggacatgtcattcgataacacccgacgagcaatcaaattagtct 21528183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 48266187 - 48265836
Alignment:
Q  17 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |    
T  48266187 aaggacaacatcttgaccttgcctaacaaacggggaatgagagttattacattattaaacagacgattatttcgctcattccacacaacccagacacaga 48266088  T
Q  117 gaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccc 216  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||| || ||||||| | ||||||||||    
T  48266087 gaagccaaataagttgcataaaataacatctagacttagcatcacctgtcaaataagtaaactgaagaaaatggtcagatatattatcagcatccacccc 48265988  T
Q  217 cgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcg 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  48265987 cgagcaaccaatccaatcacgcaccaaatgccaaagcgaaccaaaagtgttacacaacaaaaaaagatattgggccgtttctggatgaccgcaactagcg 48265888  T
Q  317 acacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaattagtct 368  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  48265887 acacataaggacatgtcattcgataacacccgtcgagcaatcaaattagtct 48265836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 321
Target Start/End: Original strand, 4644684 - 4644987
Alignment:
Q  17 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  4644684 aaggacaacatcttgaccttgtctaacaaactgggaatggaagttattacattattaaacagatgattatttcgttcattccacacaacccaggcacaga 4644783  T
Q  117 gaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccc 216  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||| |  ||||| |||    
T  4644784 gaagccaaacaagttgcataaaagaacgtctagaattagcaccatctgtcaaataagtaaactgtagaaaatggtaagaaatattatcagtatcca-ccc 4644882  T
Q  217 cgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcg 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4644883 cgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaccaaaagtgttacacaacaaaaaaaaatgttgagccgtttctagatgaccgcaaccagcg 4644982  T
Q  317 acaca 321  Q
    |||||    
T  4644983 acaca 4644987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 176
Target Start/End: Original strand, 47115959 - 47116118
Alignment:
Q  17 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47115959 aaggacaacatctttaccttgtctgacaaacagggaatgagagttattacattattaaacagacgattattttgttcattccacacaactcaggcacaaa 47116058  T
Q  117 gaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaa 176  Q
     ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47116059 aaagtcatataaattgcataaaagaacgtctagaattaacaccacctgtcaaataagtaa 47116118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 65 - 363
Target Start/End: Original strand, 14119484 - 14119787
Alignment:
Q  65 acattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctg 164  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |  | |||||||||    
T  14119484 acatgattaaacagacgattatttcgttcattccaaacaacccagacacataaaagccatattagttgcataaaagaccgtctagcaacaccaccacctg 14119583  T
Q  165 tcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccgagcaa-----ccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaaca 259  Q
    |||||| ||||| |||||  ||||| |||||||||||||   | ||||||||  |||||     ||||||||||| ||||||| |||||| || ||| ||    
T  14119584 tcaaatgagtaaactgtaaaaaatgatcggaaatattatctgcgtccaccccatagcaaccaatccaatccaatctcgcaccaaatgccacagagaacca 14119683  T
Q  260 aaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatca 359  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| | |||||  ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||    
T  14119684 aaagtattacacaataaaaagagatgttgcgccgattcaggatgaccacaaccaacaacacacgaggacatgtcaggcgacaacacccgtctagcaatca 14119783  T
Q  360 aatt 363  Q
    ||||    
T  14119784 aatt 14119787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 48073848 - 48073554
Alignment:
Q  70 attaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaa 169  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |  | |||||||| |||||    
T  48073848 attaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacaaagaagccagattagttgcataaaagaacgtctaacagcaccaccacctatcaaa 48073749  T
Q  170 taagtaagctgtagtaaa-tggtcggaaatattattaacatccacccccgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgtta 268  Q
    | ||| | |||||  ||| ||  | ||||||||||     ||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||| | |    
T  48073748 tgagtgaactgtaaaaaaatgagctgaaatattatctgtgtccaccccaaagcaaccgatccaatcacgcaccaaatgccacagagaaccaaaagtatca 48073649  T
Q  269 cacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaatt 363  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||| | ||||| |||||  | ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  48073648 cacaataaaaatagatgtcgagccgattcaggatgaccgtagccagcaacacacgaagacatgtcagacgacaacacccgtcgagcaatcaaatt 48073554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 14366094 - 14365961
Alignment:
Q  17 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |    
T  14366094 aaggacaacatcttgaccttgtctaacaaacggggaatgagagttattacattattaaacagacgattatttcgctcattccacacaacccaagcacaga 14365995  T
Q  117 gaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctaga 150  Q
    ||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  14365994 gaagctaaataagttgcataaaagaacgtctaga 14365961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 32353718 - 32353420
Alignment:
Q  65 acattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctg 164  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||     
T  32353718 acataattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacaaagaagccagattagttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccaccta 32353619  T
Q  165 tcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagt 264  Q
    |||||| ||| | || ||  ||||| || ||||||||||     ||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||| || ||| |||||||    
T  32353618 tcaaatgagtgaactataaaaaatgatctgaaatattatctgtgtccaccccaaagcaaccgatccaatctcgcaccaaatgccacagagaaccaaaagt 32353519  T
Q  265 gttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaatt 363  Q
     | |||||  ||||| |||||| || ||| |||||||||||| ||  |||| ||||   | ||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  32353518 atcacacattaaaaatagatgtcgatccgattcaggatgaccacattcagcaacactcgaagacatgtcaggcgacaacacccgtctagcaatcaaatt 32353420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 65 - 363
Target Start/End: Original strand, 37530283 - 37530583
Alignment:
Q  65 acattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattag--caccacc 162  Q
    |||| |||||||| |||||||||  |||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  |   |||||||    
T  37530283 acatgattaaacaaacgattattaagttcattccaaacaacccagacacatagaagccatattagttgcataaaagaacgtctagcagaacaccaccacc 37530382  T
Q  163 tgtcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaa 262  Q
    |||||||| ||| | |||||  ||||| ||| |||||||||   | ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||     
T  37530383 tgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatcgaaaatattatctgcgtccaccccatagcatccaatccaatctcgcaccaaatgccacagcgaaccaaag 37530482  T
Q  263 gtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaat 362  Q
    || | |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||| |||||||| || ||  ||||||| |||| ||| | |||||||| |  ||||||||    
T  37530483 gtatcacacaataaaaaaaggtgttgtgccgattcaggatgaccacaaccagcaacgcacgaggacatgtcaggcgatagcacccgtctagaaatcaaat 37530582  T
Q  363 t 363  Q
    |    
T  37530583 t 37530583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 92 - 363
Target Start/End: Original strand, 3692373 - 3692644
Alignment:
Q  92 tcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgtagtaaatggt 191  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||||||||| ||| | ||| |  ||||| |    
T  3692373 tcattccacacaacccaggcacatagaagccatattagttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccacctgtcaaatgagtgaactggaaaaaatgat 3692472  T
Q  192 cggaaatattattaacatccacccccgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagc 291  Q
      || |||||||     ||||||||  |||||||||||||| | ||||||| |||||| || ||  ||||||| | || ||| ||||| |||||| | ||    
T  3692473 atgatatattatcggtgtccaccccacagcaaccaatccaagctcgcaccaaatgccacagagagtcaaaagtatcacgcaataaaaatagatgtcgtgc 3692572  T
Q  292 cgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaatt 363  Q
    || |||||||||||| || ||||| |||||  ||||||| || | |||||||||||||| | ||||||||||    
T  3692573 cgattcaggatgaccacagccagcaacacacgaggacatgtccggcgacaacacccgtctagcaatcaaatt 3692644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 174
Target Start/End: Original strand, 38231406 - 38231515
Alignment:
Q  65 acattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctg 164  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |  | |||||||||    
T  38231406 acatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaactcaggcacatagaagtcatattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctg 38231505  T
Q  165 tcaaataagt 174  Q
    ||||| ||||    
T  38231506 tcaaaaaagt 38231515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 76
Target Start/End: Original strand, 52336333 - 52336392
Alignment:
Q  17 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaac 76  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  52336333 aaggacaacatcttgaccttgtctaacaaacggggaatgaaagttattacattattaaac 52336392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 25639932 - 25639874
Alignment:
Q  17 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaa 75  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25639932 aaggacaacatcttaaccttatctaacaaacggggaatgagagttattacattattaaa 25639874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 13)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 49732402 - 49732050
Alignment:
Q  17 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |    
T  49732402 aaggacaacatcttgaccttgtctaacaaacggggaatgagagttattacattattaaacagacgattatttcgctcgttccacacaacccgggcacaga 49732303  T
Q  117 gaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccc 216  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  49732302 gaagccaaataagttgcataaaagaacgtctagacttagcaccacctgtcaaataagtaaactgaagaaaatggtcggatatattatcagcatccacccc 49732203  T
Q  217 cgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccg-tttcaggatgaccgcaaccagc 315  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  49732202 cgagcaaccaatccaatcacgtaccacatgccaaagcgaaccaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgggccgttttccggatgaccgcaaccagc 49732103  T
Q  316 gacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaattagtct 368  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  49732102 gacacataaggacatgtcattcgataacacccgtcgagcaatcaaattagtct 49732050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 30167814 - 30167463
Alignment:
Q  17 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaa 116  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  30167814 aaggacaacatcttaactttgtctaacaaacggggaatgagagttattacattattaaacagacgattattgcgttcattccacacaacccatgcacaaa 30167715  T
Q  117 gaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccc 216  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||   ||||||||||    
T  30167714 gaagccatataagttgcataaaagaacgtctagaaacagcaccacccgtcaaataagtaaactgaagaaaatgatcggaaatattatctgcatccacccc 30167615  T
Q  217 cgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcg 316  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  30167614 cgcacaaccaatccaatcacgcaccaaatgccaaagcgaaccaaaagtgttacaaaacaaaaaaagatgtgtagccgattcaggctgaccgcaaccagcg 30167515  T
Q  317 acacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaattagtct 368  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  30167514 acacataaggagatatcagtcggcaacacccttcgagcaatcaagttagtct 30167463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 363
Target Start/End: Original strand, 9378771 - 9379114
Alignment:
Q  20 gacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaa 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  9378771 gacaacatcttaaccttgtctaataaacgggggatgggagtaacaacattattaaacagacgatagtttcattcattccaaacaacccaggcacacagaa 9378870  T
Q  120 gccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccga 219  Q
    | ||||| ||||||| ||||||||| |||  |||| |||||| ||||| || ||||| |||||  |||||||||||||||||||   | ||||||||       
T  9378871 gtcatatgagttgcataaaagaacgactatcattaccaccacttgtcatatgagtaaactgtaacaaatggtcggaaatattatccgcgtccaccccatt 9378970  T
Q  220 gcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgaca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | | |    
T  9378971 gcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaatcgaaccaaaagtgttacacaataaaaagaggtgttgtgccgtttcaggatgaccacaaccatcaata 9379070  T
Q  320 cataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaatt 363  Q
    || |||||||| | || |||||||||| ||| | ||||||||||    
T  9379071 cacaaggacatgtaagacgacaacacctgtctaacaatcaaatt 9379114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 65 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 6176899 - 6176597
Alignment:
Q  65 acattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctg 164  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  | |||||||||    
T  6176899 acatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacataaaagccatattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctg 6176800  T
Q  165 tcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagt 264  Q
    |||||| ||| | |||||  ||||| || ||||||||||    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||  ||||||    
T  6176799 tcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaaatattatctgtatccaccccatagcaaccaatccaatctcgcaccaaatgccacagagaactaaaagt 6176700  T
Q  265 gttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaatta 364  Q
     | |||||| ||||| |||||  | |||| |||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  6176699 atcacacaataaaaatagatggcgtgccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacgaggacatgtcaggcgacaacacccgtctagcaatcaaatta 6176600  T
Q  365 gtc 367  Q
    |||    
T  6176599 gtc 6176597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 65 - 363
Target Start/End: Original strand, 7146760 - 7147058
Alignment:
Q  65 acattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctg 164  Q
    |||| ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||     
T  7146760 acatgattaaacatccggttattacgttcattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagcagcaccaccaccta 7146859  T
Q  165 tcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagt 264  Q
    |||||| ||| | |||||  ||||| || ||||||||||     ||||||||  ||||| | ||||| |||||||||| |||||| || ||| |||||||    
T  7146860 tcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaaatattatctgtgtccaccccaaagcaatcgatccagtcacgcaccaaatgccacagagaaccaaaagt 7146959  T
Q  265 gttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaatt 363  Q
     | |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  | ||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  7146960 atcacacaataaaaatagatgtcgagccgattcaggatgaccacaatcagcaacacacgaagacatgtcaggcgacaacacccgtctagcaatcaaatt 7147058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 65 - 363
Target Start/End: Original strand, 23601492 - 23601790
Alignment:
Q  65 acattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctg 164  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||     
T  23601492 acatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacaaagaagccagattagttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccaccta 23601591  T
Q  165 tcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagt 264  Q
    |||||| ||| | |||||  ||||| || |||||||||| |   ||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||| || ||| |||||||    
T  23601592 tcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaaatattatcagtgtccaccccaaagcaaccgatccaatctcgcaccaaatgccacagagaaccaaaagt 23601691  T
Q  265 gttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaatt 363  Q
     | |||||| ||||| |||||| || ||| |||||||||||| ||| |||| |||||  | ||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  23601692 atcacacaataaaaatagatgtcgaaccgattcaggatgaccacaaacagcaacacacgaagacatgtcaggcgacaacacccgtctagcaatcaaatt 23601790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 150
Target Start/End: Original strand, 13448149 - 13448282
Alignment:
Q  17 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaa 116  Q
    ||||||||||  || |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13448149 aaggacaacaatttgaccttgcctaacaagcgggaaatgggagttattacattattaaacagacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaga 13448248  T
Q  117 gaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctaga 150  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  13448249 gaagccaaataagttgcataaaagaacgtctaga 13448282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 28675395 - 28675119
Alignment:
Q  20 gacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaa 119  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||    
T  28675395 gacaacatcttaaccttgtctaacaatcgaggaatgggagtaacaacattattaaataggcgattatttcgttaattccacacaacacagacacacagaa 28675296  T
Q  120 gccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccga 219  Q
    | || || ||||||| ||||||||||||||  ||| || ||||| ||| || |||||  || | ||||||||| |||||||||| |  ||||||||   |    
T  28675295 gtcaaatgagttgcataaaagaacgtctagctttaccatcacctatcatatgagtaaattgcaataaatggtccgaaatattataagtatccaccctgaa 28675196  T
Q  220 gcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaag-tgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtt 295  Q
     ||||||||||| |||||||| || |||||||  ||| |||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  28675195 acaaccaatccagtcacgcacaatctgccaaaatgaaccaaaggttgttacacaataaaaagagatgttgtgccgtt 28675119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 360
Target Start/End: Original strand, 29309127 - 29309422
Alignment:
Q  65 acattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctg 164  Q
    |||| |||||||||||| || || || |||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |  | |||||||||    
T  29309127 acatgattaaacatacggttgttacgctcattccacacaacccagacacatagaagtcatattagttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccacctg 29309226  T
Q  165 tcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagt 264  Q
    |||||| ||| | |||||  ||||| || || ||||||||    ||||||||  |||||||||||||| | ||||||| ||| || || ||| |||||||    
T  29309227 tcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgatatattatttgtgtccaccccacagcaaccaatccaagctcgcaccaaatgtcacagagaaccaaaagt 29309326  T
Q  265 gttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaa 360  Q
     | |||||| ||||| |||||| | |||| |||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||| ||||| |||||||| | |||||||    
T  29309327 atcacacaataaaaatagatgtcgtgccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacgaggacatgtcaggcgacagcacccgtctagcaatcaa 29309422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 65 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 2813921 - 2813623
Alignment:
Q  65 acattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctg 164  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||| |  | |||||||||    
T  2813921 acatgattaaacatacggttattacgttcattccagactacccaggcacatagaagtcatattagttgcataaacgaacgtctagcaacaccaccacctg 2813822  T
Q  165 tcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagt 264  Q
    |||||| ||| | |||||  ||||| |  ||||||||||    |||||||||  | || ||||||||||| ||||||| |||||| || ||| |||||||    
T  2813821 tcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatttgaaatattatctgtatccaccccatatcacccaatccaatcgcgcaccaaatgccacagagaatcaaaagt 2813722  T
Q  265 gttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaatt 363  Q
     |  ||||| ||||| |||||| | |||| |||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||| ||||| |||||||| | ||||||||||    
T  2813721 atcgcacaataaaaatagatgtcgtgccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacgaggacatgtcaggcgacagcacccgtctagcaatcaaatt 2813623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 25873533 - 25873233
Alignment:
Q  65 acattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctg 164  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |  | |||||||||    
T  25873533 acatgattaaacagacgattattacgttcattccaaacaacccagacacatagaagccatatgagttgcataaaagaacgcctagcagcaccaccacctg 25873434  T
Q  165 tcaaataagtaagctgt-agtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaag 263  Q
     ||||| ||| | |||| |  ||||| |||||||||||||   | ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||| |    
T  25873433 ccaaatgagtgaactgtaaaaaaatgatcggaaatattatctgcgtccaccccatagcatccaatccaatctcgcaccaaatgccacatcgaaccaaagg 25873334  T
Q  264 tgttacac-aacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaat 362  Q
    | | |||| |  ||||| || ||||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||  | ||||| |||  ||| |||||||||| |  ||||||||    
T  25873333 tatcacacgataaaaaaaaggtgttgtgccgattcaggatgaccacacccagcaacacacgaagacatgtcaagcgataacacccgtctagaaatcaaat 25873234  T
Q  363 t 363  Q
    |    
T  25873233 t 25873233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 104
Target Start/End: Original strand, 32004651 - 32004738
Alignment:
Q  17 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaa 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||    
T  32004651 aaggacaacatcttgaccttgtctaacaaacggggaatgagagttattgcattattaaacagacgattatttcgctctatccacacaa 32004738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 14904377 - 14904289
Alignment:
Q  275 aaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaatt 363  Q
    ||||| |||||| | |||| |||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||| |||| | ||| |||||||| | ||||||||||    
T  14904377 aaaaatagatgtcgtgccgattcaggatgaccacaaccagcaacatacgaggacatgtcaggcaacagcacccgtctagcaatcaaatt 14904289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 14)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 368
Target Start/End: Original strand, 33629768 - 33630119
Alignment:
Q  17 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaa 116  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |    
T  33629768 aaggacaacaatttgaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattatattattaaacaggcgattatttcgttaattccacacaacccaggcacaga 33629867  T
Q  117 gaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccc 216  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||| | ||||||||||    
T  33629868 gaagccaaataagttgcataaaagaacgtctagacttagcaccatctgtcaaataagtaaactgaagaaaatggtcagataaattatcagcatccacccc 33629967  T
Q  217 cgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcg 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  33629968 cgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaccaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgggccgtttccggatgaccgcaaccagcg 33630067  T
Q  317 acacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaattagtct 368  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  33630068 acacataaggacatgtcattcgataacacccgtcgagcaatcaaattagtct 33630119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 17 - 368
Target Start/End: Original strand, 1682717 - 1683062
Alignment:
Q  17 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaa 116  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  1682717 aaggacaacaatttgaccttgtctaacaaacggggaatgagagttattacattattaaacagacgattatttcgttcattccacacaacccaggcacaga 1682816  T
Q  117 gaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccc 216  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||      ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||| | ||||||||||    
T  1682817 gaagccaaataagttgcataaaagaacgtctag------caccacctgtcaaataagtaaactgaagaaaatggtcagataaattatcagcatccacccc 1682910  T
Q  217 cgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcg 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  1682911 cgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgtcaaagcgaaccaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgggccgtttccgaatgaccgcaaccagcg 1683010  T
Q  317 acacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaattagtct 368  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  1683011 acacataaggacatgtcattcgataacacccgtcgagcaatcaaattagtct 1683062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 367
Target Start/End: Original strand, 25317578 - 25317875
Alignment:
Q  70 attaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaa 169  Q
    |||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||||||||    
T  25317578 attaaagagacggttatttctttcattccacacaactcatgcacaaagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctgtcaaa 25317677  T
Q  170 taagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttac 269  Q
    | ||||| |||||  ||||| ||| |||||||||     ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| |||||| || ||| ||||||| ||||    
T  25317678 tgagtaaactgtaaaaaatgatcgaaaatattatctgtgtccaccccatagcagccaatccaatctcgcaccagatgccacagagaaccaaaagtattac 25317777  T
Q  270 acaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaattagtc 367  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25317778 acaataaaaagagatgttgcgccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacgaggacatgtcaggcgacaacacccgtctagcaatcaaattagtc 25317875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 367
Target Start/End: Original strand, 26205072 - 26205369
Alignment:
Q  70 attaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaa 169  Q
    |||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||||||||    
T  26205072 attaaagagacggttatttctttcattccacacaactcatgcacaaagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctgtcaaa 26205171  T
Q  170 taagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttac 269  Q
    | ||||| |||||  ||||| ||| |||||||||     ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| |||||| || ||| ||||||| ||||    
T  26205172 tgagtaaactgtaaaaaatgatcgaaaatattatctgtgtccaccccatagcagccaatccaatctcgcaccagatgccacagagaaccaaaagtattac 26205271  T
Q  270 acaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaattagtc 367  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  26205272 acaataaaaagagatgttgcgccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacgaggacatgtcaggcgacaacacccgtctagcaatcaaattagtc 26205369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 70 - 363
Target Start/End: Original strand, 15673549 - 15673842
Alignment:
Q  70 attaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaa 169  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||||||||    
T  15673549 attaaacaaacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctgtcaaa 15673648  T
Q  170 taagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttac 269  Q
    | ||| | |||||  ||||| || ||||||||||     ||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||| ||||||| | ||    
T  15673649 tgagtgaactgtaaaaaatgatctgaaatattatctgtgtccaccccatagcaaccaatccaatctcgcaccaaatgccacagagaaccaaaagtatcac 15673748  T
Q  270 acaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaatt 363  Q
    |||| ||||| | |||| | |||| |||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||| || | ||||||||||    
T  15673749 acaataaaaataaatgtcgtgccgattcaggatgaccacaaccagcaacacaagaggacatgtcaggcgacaacacccttctagcaatcaaatt 15673842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 65 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 23347887 - 23347589
Alignment:
Q  65 acattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctg 164  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  | |||| ||||    
T  23347887 acatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacataaaagccatattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccgcctg 23347788  T
Q  165 tcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagt 264  Q
    |||||| ||| | |||||  ||||| || ||||||||||    |||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| |||||| || ||| |||||||    
T  23347787 tcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaaatattatctgtatccaccccatagcatccaatccaatctcgcaccaaatgccacagagaaccaaaagt 23347688  T
Q  265 gttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaatt 363  Q
     | |||||| ||||| |||||| | |||| |||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||| |||   |||||||| | ||||||||||    
T  23347687 atcacacaataaaaatagatgtcgtgccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacgaggacatgtcaggcgatggcacccgtctagcaatcaaatt 23347589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 65 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 8873247 - 8872949
Alignment:
Q  65 acattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctg 164  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |  | |||||||||    
T  8873247 acatgattaaacagacggttatttcgttcattccaaacaacccagacacatagaagccatattagttgcataaaagaacgtctaacagcaccaccacctg 8873148  T
Q  165 tcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagt 264  Q
    |||||| ||| | |||||  ||||| ||| |||||||||   | ||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||| || || ||| |||||||    
T  8873147 tcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatcgaaaatattatctgcgtccaccccatagcaagcaatccaatctcgcaccaaatgtcacagagaaccaaaagt 8873048  T
Q  265 gttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaatt 363  Q
    || |||||| |||||  |||| || |||| ||| |||||||| |||||||| || ||  ||||||| |||| |||||||||||||| |  |||||||||    
T  8873047 gtcacacaataaaaaaggatgatgtgccgattcgggatgaccacaaccagcaacgcacgaggacatgtcaggcgacaacacccgtctagaaatcaaatt 8872949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Original strand, 19256719 - 19257019
Alignment:
Q  20 gacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaa 119  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |  || |  ||||||||||| |  | |||||||||||||||||| |||||  || |||| ||||    
T  19256719 gacaacatattaaccttgtctaataaacggggaatagacgtaacaacattattaaagaggcaattatttcgttcattccaaacaacctagacacacagaa 19256818  T
Q  120 gccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccga 219  Q
    |||| || ||||||| |||||| |||||||  ||| || | ||||||| |  ||||   || |  ||||| || ||||| |||| |  ||| |||||  |    
T  19256819 gccaaatgagttgcataaaagagcgtctagctttaccagcccctgtcagaagagtacattgcaaaaaatgatctgaaatgttatgattatctaccccgca 19256918  T
Q  220 gcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgaca 319  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| |||||| ||||||| || ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19256919 acaaccaatccaatcacgcaccatatgccataaagaaccaaaagtattacac-acaaaaaaaggtgttgtgccgtttcaggaagaccgtaaccagcgaca 19257017  T
Q  320 ca 321  Q
    ||    
T  19257018 ca 19257019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 298
Target Start/End: Original strand, 19348989 - 19349219
Alignment:
Q  70 attaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaa 169  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |  | ||||||||||||||    
T  19348989 attaaacatacggttatttcgttcattccaaacaacccaggcacagagaagccatattagttgcataaaagaccgtctagcaacaccaccacctgtcaaa 19349088  T
Q  170 taagtaa--gctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgtt 267  Q
    | |||||    ||||  ||||| |||||||||||||     | ||||||  |||||||||| ||||| | ||||| |||||| ||  || |||| || ||    
T  19349089 tgagtaaattgtgtaaaaaatgatcggaaatattatccgtgtacaccccatagcaaccaattcaatctcacaccaaatgccacagaaaaccaaatgtatt 19349188  T
Q  268 acacaacaaaaagagatgttgagccgtttca 298  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  19349189 acacaataaaaagagatgttgcgccgattca 19349219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 176
Target Start/End: Original strand, 4406686 - 4406842
Alignment:
Q  20 gacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaa 119  Q
    |||||||| || ||||| || ||||| |||||| | ||||||    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4406686 gacaacattttaaccttatccaacaaccggggagtaggagttgcatcattattaaacagacgattgtttcgttcattccacacaacccaggcacaaagaa 4406785  T
Q  120 gccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaa 176  Q
    | ||||| || |||| ||| ||||||||||  ||| |||||||| ||| || |||||    
T  4406786 gtcatattagctgcagaaacgaacgtctagctttaccaccacctatcatatgagtaa 4406842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 149
Target Start/End: Original strand, 33745798 - 33745898
Alignment:
Q  49 gggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtcta 148  Q
    ||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || || | ||| |||||||||    
T  33745798 gggaatgggagttacataattattaaacagacgattatttcgctcattccacacaacccaagcacaaagaagccatatgagctgaagaaatgaacgtcta 33745897  T
Q  149 g 149  Q
    |    
T  33745898 g 33745898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 203
Target Start/End: Original strand, 13755189 - 13755322
Alignment:
Q  70 attaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaa 169  Q
    |||||||||||| || || || |||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||||||||    
T  13755189 attaaacatacggttgttacgctcattccacacaacccagacacatagaagtcatattagttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccacctgtcaaa 13755288  T
Q  170 taagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattat 203  Q
    | ||| | |||||  ||||| || || |||||||    
T  13755289 tgagtgaactgtaaaaaatgatctgatatattat 13755322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 128
Target Start/End: Original strand, 14528109 - 14528155
Alignment:
Q  82 attatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataa 128  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  14528109 attattacgttcattccacacaaccaaggcacaaagaagccatataa 14528155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 128
Target Start/End: Original strand, 14532835 - 14532881
Alignment:
Q  82 attatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataa 128  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  14532835 attattacgttcattccacacaaccaaggcacaaagaagtcatataa 14532881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 13)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 368
Target Start/End: Original strand, 47540596 - 47540947
Alignment:
Q  17 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  47540596 aaggacaacatcttgaccttgtctaacaaacgggaaatgagagttattacattattaaacagacgattatttcgttcattccacacaacccaggcacaga 47540695  T
Q  117 gaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccc 216  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||| | ||||||||||    
T  47540696 gaagccaaataagttgcataaaagaacgtctagacttagcaccacctgtcaaataagtaaactgaagaaaatggtcagataaattatcagcatccacccc 47540795  T
Q  217 cgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcg 316  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  47540796 cgagcaaccaatccaaccacgcaccatatgccaaagcgaaccaaaagtgttacacaacaagaatagatgttgggccgtttccggatgaccgcatccagcg 47540895  T
Q  317 acacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaattagtct 368  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  47540896 acacataaggacatgtcattcgataacacccgtcgagcaatcaaattagtct 47540947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 3130448 - 3130097
Alignment:
Q  17 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaa 116  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  3130448 aaggacaacaatttgaccttgtctaacaagcggggaatgagagttattacattattaaacagacgattattttgttcattccacacaacccaggcacaaa 3130349  T
Q  117 gaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccc 216  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| || | ||||| | ||||||||||    
T  3130348 gaagccaaataagttgcataaaagaacgtctagacttagcaccacctgtcaactaagtaaactgaagaaaatggtcagataaattatcagcatccacccc 3130249  T
Q  217 cgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcg 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  3130248 cgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaccaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgggccgtttctggatgaccgcaaccagct 3130149  T
Q  317 acacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaattagtct 368  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  3130148 acacataaagacatgtcattcgataacacccgtcgagcaatcaaattagtct 3130097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 7663707 - 7663357
Alignment:
Q  17 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  7663707 aaggacaacatcttaaccttgtctaacaaacggggaatgagagttattacattattaaacagacgattattgcgttcattccacacaacccatgcacaaa 7663608  T
Q  117 gaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccc 216  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||  || |  ||||| |||||||||||||   ||||||||||    
T  7663607 gaagccatataagttgcataaaagaacgtctagaaacaaaaccacctgtcaaataagtaaaatgaataaaatgatcggaaatattatctgcatccacccc 7663508  T
Q  217 cgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcg 316  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7663507 cgcacaaccaatccaatcacgcaccaaatgccaaagcgaaccaaaagtgttgcacaa-aaaaaaaaatgttgagccgattcaggatgaccgcaaccagcg 7663409  T
Q  317 acacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaattagtct 368  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  7663408 acacataaggacatatcagtcggcaacacccttcgagcaatcaagttagtct 7663357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 8655542 - 8655195
Alignment:
Q  17 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  8655542 aaggacaacatcttgaccttatctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacaggcgattatttcgctcattccacacaacccaggcacaga 8655443  T
Q  117 gaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccc 216  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || || || ||| |||||| ||||| | ||| ||| || ||||||||  | ||||||| | ||||||| ||    
T  8655442 gaagccaaataagttgcataaaagaacgccttgactttgcatcacctgccaaatgaataaactgaagaaaatggtcatatatattatcagcatccactcc 8655343  T
Q  217 cgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcg 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  8655342 cgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaccaaaagtgttacacgataaaaagagatgttgagccgtttccagatgaccacaaccagcg 8655243  T
Q  317 acacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaatta 364  Q
    |||||||||||||| | |  ||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  8655242 acacataaggacatgtgatgcgataacacccgacgagcaatcaaatta 8655195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 23 - 368
Target Start/End: Original strand, 23279284 - 23279629
Alignment:
Q  23 aacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagcc 122  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  23279284 aacatcttaaccttgtctaataaacgggggatgggagtaacaacattattaaacagacgattatttcgttcgttccacacaacccacacacaaagaagcc 23279383  T
Q  123 atataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccgagca 222  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||| ||||| ||||||  | ||    
T  23279384 atataagttgcataaaagagcatctagagtgagcactacctgtcaaataagtaaactgtaaaaaatggtcagaaatattatcaacattcaccccacaaca 23279483  T
Q  223 accaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacat 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||| | ||||||    
T  23279484 accaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaacttaaagagttacacaataaaaagagatgttgtgtcgtttcaggttgaccgcagccaacaacacat 23279583  T
Q  323 aaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaattagtct 368  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  23279584 aaggacaaatcattcgacagcacccgtcgatcaaccaaattagtct 23279629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 65 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 23873897 - 23873599
Alignment:
Q  65 acattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctg 164  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |  | | ||||||     
T  23873897 acatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacaaagaagccagattagttgcataaaagaacgtctagcagcacctccaccta 23873798  T
Q  165 tcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagt 264  Q
    |||||| ||| | |||||  ||||| || ||||||||||     ||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||    
T  23873797 tcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaaatattatctgtgtccaccccaaagcaaccgatccaatcacgcaccaaatgccacagagaaccaaaagt 23873698  T
Q  265 gttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaatt 363  Q
     | |||||| ||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23873697 atcacacaataaaaatagatgacgagccgattcaggatgaccgcaaccagcaacacacgaagacatgtcagacgacaacacccgtcgagcaatcaaatt 23873599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 65 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 8487402 - 8487104
Alignment:
Q  65 acattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctg 164  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  | |||||||||    
T  8487402 acatgattaaacatacggttattacgttcagtccaaacaacccaggcacataaaagccatattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctg 8487303  T
Q  165 tcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagt 264  Q
    |||||||||| | |||||  ||||| || ||||||||||    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||| || ||| || ||| |||||||    
T  8487302 tcaaataagtgaactgtaagaaatgatctgaaatattatctgtatccaccccatagcaaccaatccaatctcgcaccaaataccacagagaaccaaaagt 8487203  T
Q  265 gttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaatt 363  Q
     | |||||| ||||| |||||  | |||| |||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  8487202 atcacacaataaaaatagatggcgtgccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacgaggacatgtcaggcgacaacacccgtctagcaatcaaatt 8487104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 65 - 363
Target Start/End: Original strand, 55298342 - 55298637
Alignment:
Q  65 acattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctg 164  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||  || |    ||||||||     
T  55298342 acatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacaaagaagccagattagttgcataaaagaacgtgcagcac---caccaccta 55298438  T
Q  165 tcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagt 264  Q
    |||||| ||| | |||||  |||||  | ||||||||||     ||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||    
T  55298439 tcaaatgagtgaactgtaaaaaatgagctgaaatattatctgtgtccaccccaaagcaaccgatccaatcacgcaccaaatgccacagagaaccaaaagt 55298538  T
Q  265 gttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaatt 363  Q
     | |||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  55298539 atcacacaataaaaatagatgtcgagccgattcaggatgaccgcagccagcaacacacgaagacatgtcagacgacaacacccgtcgagcaatcaaatt 55298637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 1121113 - 1121013
Alignment:
Q  17 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1121113 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacgggggatgtgagttattacattattaaacagacgattatttcgttcattccacacaatccaggcacaaa 1121014  T
Q  117 g 117  Q
    |    
T  1121013 g 1121013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 65 - 363
Target Start/End: Original strand, 2631117 - 2631415
Alignment:
Q  65 acattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctg 164  Q
    |||| |||||||| ||| || || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  | |||||||||    
T  2631117 acatgattaaacaaacggttgttacgctcattccacacaacccatgcacatagaagccatattagttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccacctg 2631216  T
Q  165 tcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagt 264  Q
    |||||| ||| | ||| |  ||||| || || |||||||     ||||||||  | |||||||||||| | ||||||| |||||| || ||| |||||||    
T  2631217 tcaaatgagtgaactggaaaaaatgatctgatatattatcggtgtccaccccacaacaaccaatccaagctcgcaccaaatgccacagagaaccaaaagt 2631316  T
Q  265 gttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaatt 363  Q
     | |||||| ||||| |||||| | ||||  ||||||||||| || ||| | |||||  ||||||| || | |||||||||||||| | ||||||||||    
T  2631317 atcacacaataaaaatagatgtcgtgccgactcaggatgaccacatccaccaacacacgaggacatgtctggcgacaacacccgtctagcaatcaaatt 2631415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 363
Target Start/End: Original strand, 20674885 - 20675039
Alignment:
Q  209 tccacccccgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgc 308  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||| ||||||| | |||||| ||||| |||||| | |||| |||||||||||| |    
T  20674885 tccaccccatagcaaccaatccaatctcgcaccaaatgccacagagaaccaaaagtatcacacaataaaaatagatgtcgtgccgattcaggatgaccac 20674984  T
Q  309 aaccagcgacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaatt 363  Q
    ||||||| |||||  | ||||| |||| ||| | ||||| || | ||||||||||    
T  20674985 aaccagcaacacacgaagacatgtcaggcgaaagcacccatctagcaatcaaatt 20675039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 149
Target Start/End: Original strand, 20673428 - 20673512
Alignment:
Q  65 acattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctag 149  Q
    |||| |||||||||||| |||||  |||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  20673428 acatgattaaacatacggttattatgttcattccaaacaacctaggcacatagaagccatattagttgcataaaagaacgtctag 20673512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 13159191 - 13159132
Alignment:
Q  67 attattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatat 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  13159191 attattaaacattcgattatttcgctcattctacacaacccaggcaaaaagaagccatat 13159132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 368
Target Start/End: Original strand, 7346 - 7697
Alignment:
Q  17 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  7346 aaggacaacatcttaaccttgtctaacaaacggggaatgagagttattacattattaaacagacgattattgcgttcattccacacaacccatgcacaaa 7445  T
Q  117 gaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccc 216  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||  || |  ||||| |||||||||||||   ||||||||||    
T  7446 gaagccatataagttgcataaaagaacgtctagaaacaaaaccacctgtcaaataagtaaaatgaataaaatgatcggaaatattatctgcatccacccc 7545  T
Q  217 cgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcg 316  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7546 cgcacaaccaatccaatcacgcaccaaatgccaaagcgaaccaaaagtgttgcacaaaaaaaaaaaatgttgagccgattcaggatgaccgcaaccagcg 7645  T
Q  317 acacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaattagtct 368  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  7646 acacataaggacatatcagtcggcaacacccttcgagcaatcaagttagtct 7697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 10)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 10487375 - 10487038
Alignment:
Q  17 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  10487375 aaggacaacatcttgaccttatctaacaaacggagaatggaagttattacattattaaacagacgattatttcgctcattccacacaacccaggcacaaa 10487276  T
Q  117 gaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccc 216  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || || |||||||| || |||||||                 
T  10487275 gaagccaaataagttgcataaaagaacgtctagacttagcaccacctgtcaaataaataaattgaagaaaatggtcagatatattat------------- 10487189  T
Q  217 cgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcg 316  Q
      |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  10487188 -cagcatccaatccaatcacgcaccatataccaaagcgaaccaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgggccgtttccggatgaccgcaaccagcg 10487090  T
Q  317 acacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaattagtct 368  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10487089 acacataaggacatgtcattcgataacacccgacgagcaatcaaattagtct 10487038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 65 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 15500067 - 15499769
Alignment:
Q  65 acattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctg 164  Q
    |||| |||||||| | | ||||||||||||||||| | ||| ||| |||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||| |  | |||||||||    
T  15500067 acatgattaaacagatggttatttcgttcattccagataacccagacacatagaagccaaatgagttgcaaaaaagaccgtctagcaacaccaccacctg 15499968  T
Q  165 tcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagt 264  Q
     ||||| ||||| ||| || ||||| ||||||||||||||    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||    
T  15499967 acaaatgagtaaactgaagaaaatgatcggaaatattatttgtgtccaccccacagcaaccaatccaatcacgcaccaaatgccacagagaaccaaaagt 15499868  T
Q  265 gttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaatt 363  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||| |  ||||||||||| | ||||||||||    
T  15499867 attacacaataaaaagagatgttgcgccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacgaggacatgtcaggcaccaacacccgtctagcaatcaaatt 15499769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 368
Target Start/End: Original strand, 32917991 - 32918340
Alignment:
Q  20 gacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaa 119  Q
    ||||||||||| | ||| ||||| ||||  || ||||| || |  |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  32917991 gacaacatcttaatcttatctaataaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacagacggttatttcgttcattccaaacaacccaggcacatagaa 32918090  T
Q  120 gccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccga 219  Q
    |||| || ||||||| |||||| ||||||| |  | ||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| || ||||||||||     ||||||||  |    
T  32918091 gccaaattagttgcataaaagaccgtctagcaacaccaccacctgtcaaatgagtaaactgtaaaaaatgatcagaaatattatctgtgtccaccccata 32918190  T
Q  220 gcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaa-gtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgac 318  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| || |  ||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  32918191 gcaaccaatccaatctcgcaccaaatggcacatagaaccaaaaggtattacacaataaaaagagatgttgcgccgattcaggatgaccacaaccagcaac 32918290  T
Q  319 acataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaattagtct 368  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  32918291 acacaaggacatgtcaggcgacaacacccgtctagcaatcaaatttgtct 32918340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 65 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 6264619 - 6264321
Alignment:
Q  65 acattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctg 164  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |  | |||||||||    
T  6264619 acatgattaaacagacggttatttcgttcattccaaacaacccagacacatagaagccatattagttgcataaaagaacgtttagcagcaccaccacctg 6264520  T
Q  165 tcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagt 264  Q
    |||||| ||| | |||||  ||||| ||| |||||||||   | ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| |||||| || ||| |||||||    
T  6264519 tcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatcgaaaatattatcggcgtccaccccatagcaaccaatacaatctcgcaccaaatgccatagagaatcaaaagt 6264420  T
Q  265 gttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaatt 363  Q
     | |||||| ||||| |||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||| |  ||||||| |||| |||||||||||||| |  |||||||||    
T  6264419 atcacacaataaaaaaagatgttgtgccgattcgggatgaccacaaccagcaacatacgaggacatgtcaggcgacaacacccgtctagaaatcaaatt 6264321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 363
Target Start/End: Original strand, 34480675 - 34480973
Alignment:
Q  65 acattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctg 164  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  | |||||||||    
T  34480675 acatgattaaacagacgattattacgttcattccaaacaacccagacacatagaagccatataagttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccacctg 34480774  T
Q  165 tcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagt 264  Q
     ||||  ||| | |||||  ||||| | |||||||||||     ||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||| ||    
T  34480775 ccaaaagagtgaactgtaaaaaatgattggaaatattatctgtgtccaccccatagcaaccaatccaatctcgcaccaaatgccacatcgaaccaaaggt 34480874  T
Q  265 gttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaatt 363  Q
     | |||| | || || || ||||| |||| |||||||| ||| |  ||||| |||||  | ||||| |||| ||| | |||||||| |  |||||||||    
T  34480875 atcacacgataagaaaaggtgttgggccgattcaggataaccacccccagcaacacacgaagacatgtcaggcgatagcacccgtctagaaatcaaatt 34480973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 299
Target Start/End: Original strand, 6020412 - 6020691
Alignment:
Q  20 gacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaa 119  Q
    ||||||||||| || ||||  | ||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||  |||||||| || |||||||||||||| ||| || |||| |    
T  6020412 gacaacatcttaactttgttgagcaaacggggtatgtgagtgattatattattaaacaagcgattattacgctcattccacacaacccagacataaagga 6020511  T
Q  120 gccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccga 219  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||  ||| | |||||||||| || ||| | |||  ||||||| || ||||||| ||  |  ||||||||  |    
T  6020512 gccatataagttgctgaaaagaacatctagctttacctccacctgtcatatgagtgaactgctgtaaatgatcagaaatatcatcgaagtccaccccgta 6020611  T
Q  220 gcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcag 299  Q
      ||||||||||||||||  | |   ||||||  ||| |||| |||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  6020612 aaaaccaatccaatcacgtgcaagccgccaaatagaaccaaaggtgtcacacgaaaaaaagagatgttgggccgtttcag 6020691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 312
Target Start/End: Original strand, 31862328 - 31862559
Alignment:
Q  81 gattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctg 180  Q
    |||||||  |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||  ||  |||||||||||| || ||||| |||    
T  31862328 gattattatgttcattccacaaaacccagacacaaagaagccatattagttgcatgaaagaccgtctagctttgccaccacctgtcatatgagtaaactg 31862427  T
Q  181 tagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccgagca-accaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaacaaaaa 279  Q
     | |||||| ||  ||||||||| |  ||||| ||||||| | | ||||||| |  ||||| |  |||||||  ||| ||||||||  ||||   |||||    
T  31862428 caataaatgatcaaaaatattatgagaatcca-ccccgagaatatcaatccacttgcgcacaagctgccaaatagaaccaaaagtgggacacgttaaaaa 31862526  T
Q  280 gagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaacc 312  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  31862527 gagatattaagccttttcaggatgaccgcaacc 31862559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 34858108 - 34858058
Alignment:
Q  71 ttaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagc 121  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  34858108 ttaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacaaagaagc 34858058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 149
Target Start/End: Original strand, 587190 - 587319
Alignment:
Q  20 gacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaa 119  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||  | ||||||||||| |  |||||  |||| |  |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| | ||    
T  587190 gacaacatcttaactttgtctaataagagaggaatgggagtaacaacatttctaaagaggcgattattacgttcgttccatacaactcaagcacacaaaa 587289  T
Q  120 gccatataagttgcaaaaaagaacgtctag 149  Q
    |||| || |||||||  ||||| |||||||    
T  587290 gccaaatgagttgcatgaaagagcgtctag 587319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 293
Target Start/End: Original strand, 587394 - 587463
Alignment:
Q  224 ccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccg 293  Q
    |||||||| ||||||||||  | ||| | |||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  587394 ccaatccagtcacgcaccagctcccataacgatccaaaagtgttacacaacagaaagaggtgttgagccg 587463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 135105 - 134792
Alignment:
Q  17 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| |    
T  135105 aaggacaacatcttgaccttatctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacaggcgattatttcgctcattcgacacaacccaagcacaga 135006  T
Q  117 gaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccc 216  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| || || |||||||||| ||||| | ||| |||  | ||||||||  | ||||||| | ||||||| ||    
T  135005 gaagccaaataagttgcataaaagaacgtcttgactttgcaccacctgccaaatgaataaactgacgaaaatggtcacatatattatcatcatccactcc 134906  T
Q  217 cgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcg 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  134905 cgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaccaaacgtgttacacaataaaaagagatgttgagccgtttccggatgaccacaaccagcg 134806  T
Q  317 acacataaggacat 330  Q
    ||||||||||||||    
T  134805 acacataaggacat 134792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 312932 - 312619
Alignment:
Q  17 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| |    
T  312932 aaggacaacatcttgaccttatctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacaggcgattatttcgctcattcgacacaacccaagcacaga 312833  T
Q  117 gaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccc 216  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| || || |||||||||| ||||| | ||| |||  | ||||||||  | ||||||| | ||||||| ||    
T  312832 gaagccaaataagttgcataaaagaacgtcttgactttgcaccacctgccaaatgaataaactgacgaaaatggtcacatatattatcatcatccactcc 312733  T
Q  217 cgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcg 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  312732 cgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaccaaacgtgttacacaataaaaagagatgttgagccgtttccggatgaccacaaccagcg 312633  T
Q  317 acacataaggacat 330  Q
    ||||||||||||||    
T  312632 acacataaggacat 312619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 328386 - 328073
Alignment:
Q  17 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| |    
T  328386 aaggacaacatcttgaccttatctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacaggcgattatttcgctcattcgacacaacccaagcacaga 328287  T
Q  117 gaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccc 216  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| || || |||||||||| ||||| | ||| |||  | ||||||||  | ||||||| | ||||||| ||    
T  328286 gaagccaaataagttgcataaaagaacgtcttgactttgcaccacctgccaaatgaataaactgacgaaaatggtcacatatattatcatcatccactcc 328187  T
Q  217 cgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcg 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  328186 cgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaccaaacgtgttacacaataaaaagagatgttgagccgtttccggatgaccacaaccagcg 328087  T
Q  317 acacataaggacat 330  Q
    ||||||||||||||    
T  328086 acacataaggacat 328073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 13)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 368
Target Start/End: Original strand, 45421189 - 45421541
Alignment:
Q  17 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaa 116  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  45421189 aaggacaacatcttaactttgtctaacaaacgtggaatgtgagttattacattattaaacagacgattattgcgttcattccacacaacccatgcacaaa 45421288  T
Q  117 gaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccc 216  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||  || |  ||||| ||| |||||||||   ||||||||||    
T  45421289 gaagccatataagttgcataaaagaacgtctagaaacattaccacctgtcaaataagtaaattgaataaaatgatcgtaaatattatctgcatccacccc 45421388  T
Q  217 cgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaa-caaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagc 315  Q
    ||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||| || ||  ||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  45421389 cgcacaaccaatccaatcactctccaaatgccaaagcgaaccaaaagtgtttcataataaaaaaaatatgtttagccgattcaggatgaccgcaaccagc 45421488  T
Q  316 gacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaattagtct 368  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  45421489 gacacataaggacatatcagtcggcaacacccttcgagcaatcaagttagtct 45421541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 367
Target Start/End: Original strand, 13549798 - 13550145
Alignment:
Q  20 gacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaa 119  Q
    ||||||||||| | ||| ||||| ||||  || ||||| || |  |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13549798 gacaacatcttaatcttatctaataaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacagacggttatttcgttcattccacacaacccaggcacaaagaa 13549897  T
Q  120 gccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccga 219  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| |||||||||||||     ||||||||  |    
T  13549898 gccaaataagttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctgtcaaatgagtaaactgtaaaaaatgatcggaaatattatatgtgtccaccccata 13549997  T
Q  220 gcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgaca 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||  |||    
T  13549998 gcaaccaatccaatcacgcaccagatgccacagagagccaaaagtattacacaataaaaagagatgttgcaccgattcaggatgaccacaaccagtaaca 13550097  T
Q  320 cataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaattagtc 367  Q
    ||  ||||||| |||  |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  13550098 cacgaggacatgtcatgcgacaacacccgtctagcaatcaaattagtc 13550145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 31086103 - 31085755
Alignment:
Q  20 gacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaa 119  Q
    |||||| |||| | ||||||||| ||||  || |||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| | ||    
T  31086103 gacaacgtcttaatcttgtctaataaacacgggatgggagtaacaacattattaaacatgcggttatttcgttaattccaaacaacccaggcacacaaaa 31086004  T
Q  120 gccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccga 219  Q
    | ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||  ||||| || ||||||||||   | ||||||||  |    
T  31086003 ggcatatgagttgcataaaagaacgtctagcattaccaccacctgacaaatgagtaaactgtaaaaaatgatcagaaatattatccgcgtccaccccata 31085904  T
Q  220 gcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgaca 319  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  31085903 gcaaccgatccaatcactcaccaaatgccaaagcgaaccaaaagtatttcacaataaaaagagatgttgtgccgtttcaggatgtccgcacccagcaaca 31085804  T
Q  320 cataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaattagtct 368  Q
    ||  ||||||| |||| ||||| |||||||| | |||||||||| ||||    
T  31085803 cacgaggacatgtcagacgacagcacccgtctagcaatcaaatttgtct 31085755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 65 - 363
Target Start/End: Original strand, 33547591 - 33547889
Alignment:
Q  65 acattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctg 164  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||     
T  33547591 acatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacaaagaagccagattagttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccaccta 33547690  T
Q  165 tcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagt 264  Q
    |||||| ||| | |||||  |||||  | |||||||||||    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||    
T  33547691 tcaaatgagtgaactgtaaaaaatgagctgaaatattatttgtgtccaccccaaagcaaccgatccaatcacgcaccaaatgccacagagaaccaaaagt 33547790  T
Q  265 gttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaatt 363  Q
     | |||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  33547791 atcacacaataaaaatagatgtcgagccgattcaggatgaccgcagccagcaacacacaaagacatgtcagacgacaacacccgtcgagcaatcaaatt 33547889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 65 - 363
Target Start/End: Original strand, 22052346 - 22052644
Alignment:
Q  65 acattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctg 164  Q
    |||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| | ||| ||| |||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||| |  | |||||||||    
T  22052346 acatgattaaactgacggttatttcgttcattccagataacccagacacatagaagccaaatgagttgcaaaaaagaccgtctagcaacaccaccacctg 22052445  T
Q  165 tcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagt 264  Q
     ||||| ||||| ||| || ||||| ||||||||||||||    || |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||    
T  22052446 acaaatgagtaaactgaagaaaatgatcggaaatattatttgtgtctaccccacagcaaccaatccaatcacgcaccaaatgccacagagaaccaaaagt 22052545  T
Q  265 gttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaatt 363  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||| |  |||||||| || | ||||||||||    
T  22052546 attacacaataaaaagagatgttgcgccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacgaggacatatcaggcaccaacacccttctagcaatcaaatt 22052644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 26180391 - 26180109
Alignment:
Q  20 gacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaa 119  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||| | |  ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||    
T  26180391 gacatcatcttaaccttgtctaataaacgggggatgggagtaacaacattattataaaggcgattatttcgtttatttcatacaactcaggcacacagaa 26180292  T
Q  120 gccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctgtcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccga 219  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||||||  ||||  ||||||| ||||||||||| | | ||||||||  |    
T  26180291 gccatatgagttgcagaaaagaacgcctagcattaccaccacctgccaaaaaagtaaattgtaaaaaatggt-ggaaatattatcagcgtccaccccaca 26180193  T
Q  220 gcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagtgttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatg 303  Q
     || || ||||||||||| ||||| |||||||||||| || | || |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  26180192 acatccgatccaatcacgaaccatctgccaaagcgaaccacatgtattacacaataaaaagaggtgttgtgtcgtttcaggatg 26180109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 65 - 363
Target Start/End: Original strand, 43627218 - 43627516
Alignment:
Q  65 acattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctg 164  Q
    |||| ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||     
T  43627218 acatgattaaacatccggttattacgttcattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccaccta 43627317  T
Q  165 tcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagt 264  Q
    |||||| ||| | |||||  ||||| |  ||||||||||     ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| |||||| |  ||| |||||||    
T  43627318 tcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatatgaaatattatctgtgtccaccccaaagcaaccgatccagtcacgcaccaaatgccacaaagaaccaaaagt 43627417  T
Q  265 gttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaatt 363  Q
     | |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||| |||| ||||   | ||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  43627418 atcacacaataaaaatagatgtcgagccgattcaggatgaccacaatcagcaacacgcgaagacatgtcaggcgacaacacccgtctagcaatcaaatt 43627516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 65 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 9949685 - 9949387
Alignment:
Q  65 acattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgcaaaaaagaacgtctagaattagcaccacctg 164  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  | ||||||| |    
T  9949685 acatgattaaacagacgattattacgttcattccaaacaacccagacacatagaagccatataagttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccaccag 9949586  T
Q  165 tcaaataagtaagctgtagtaaatggtcggaaatattattaacatccacccccgagcaaccaatccaatcacgcaccatatgccaaagcgaaacaaaagt 264  Q
     ||||  ||| | |||||  ||||| |||||||||||||     ||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||| ||    
T  9949585 ccaaaagagtgaactgtaaaaaatgatcggaaatattatctgtgtccaccccatagcaaccaatccaatctcgcaccaaatgccacatcgaaccaaaggt 9949486  T
Q  265 gttacacaacaaaaagagatgttgagccgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcgacaacacccgtcgatcaatcaaatt 363  Q
     | |||| | || || || ||||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||  | ||||| |||| ||| | |||||||| |  |||||||||    
T  9949485 atcacacgataagaaaaggtgttgggccgattcaggatgaccacacccagcaacacacgaagacatgtcaggcgatagcacccgtctagaaatcaaatt 9949387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Original strand, 31774358 - 31774481
Alignment:
Q  20 gacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaa 119  Q
    ||||||||||| ||||| || | ||||| |||||||||||| || ||||| |||||||  ||| |||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31774358 gacaacatcttaaccttatcaagcaaacagggaatgggagtaataacatttttaaacaagcgactattgccctcattccacacaactcaagcacaaagaa 31774457  T
Q  120 gccatataagttgcaaaaaagaac 143  Q
    | || || |||||||  |||||||    
T  31774458 gtcagatgagttgcatgaaagaac 31774481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 134
Target Start/End: Original strand, 26681600 - 26681669
Alignment:
Q  65 acattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataagttgca 134  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  26681600 acatgattaaacagacggttatttcgttcattccaaacaacccagacacatagaagccatattagttgca 26681669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 75
Target Start/End: Original strand, 25784588 - 25784640
Alignment:
Q  23 aacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaa 75  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25784588 aacatcttgaccttatctaacaatcggggaatgagagttattacattattaaa 25784640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 126
Target Start/End: Original strand, 31594273 - 31594334
Alignment:
Q  65 acattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatat 126  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||    
T  31594273 acatgattaaacagacggttatttcgttcattccaaacaacccagacacatagaagccatat 31594334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 129
Target Start/End: Original strand, 35694352 - 35694416
Alignment:
Q  65 acattattaaacatacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacaaagaagccatataag 129  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||| ||||    
T  35694352 acatgattaaacacacggttatttcgttcattccaaacaactcaagcacgtagaagccatgtaag 35694416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 12339 - 12279
Alignment:
Q  17 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaaca 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  12339 aaggacaacatctttaccttgtctaacaaacgggggataggagttattacattattaaaca 12279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 22679 - 22614
Alignment:
Q  20 gacaacatctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacatacgatta 85  Q
    |||||||| || ||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22679 gacaacattttgacctaatctaacaaacggagaatgagagttattacattattaaagagacgatta 22614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University