View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10639_low_16 (Length: 365)

Name: NF10639_low_16
Description: NF10639
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10639_low_16
NF10639_low_16
[»] chr1 (68 HSPs)
chr1 (13-357)||(33680903-33681244)
chr1 (13-357)||(22237523-22237865)
chr1 (13-357)||(52927866-52928195)
chr1 (13-357)||(20248177-20248512)
chr1 (13-357)||(22921753-22922093)
chr1 (13-353)||(21753947-21754272)
chr1 (69-357)||(13988756-13989043)
chr1 (69-357)||(21923276-21923563)
chr1 (69-357)||(23593719-23594007)
chr1 (69-357)||(31612202-31612490)
chr1 (69-357)||(21475072-21475359)
chr1 (188-357)||(22123171-22123340)
chr1 (131-350)||(34509679-34509899)
chr1 (197-355)||(29298029-29298187)
chr1 (69-321)||(14295495-14295745)
chr1 (11-357)||(21896140-21896480)
chr1 (128-350)||(50210212-50210439)
chr1 (69-350)||(22532168-22532451)
chr1 (6-277)||(21861446-21861714)
chr1 (13-234)||(20918620-20918838)
chr1 (79-343)||(45574836-45575103)
chr1 (69-342)||(29776592-29776865)
chr1 (64-308)||(432950-433193)
chr1 (11-357)||(16368168-16368509)
chr1 (64-322)||(21346885-21347144)
chr1 (188-352)||(21711602-21711767)
chr1 (188-342)||(21707071-21707225)
chr1 (179-350)||(20847205-20847376)
chr1 (124-350)||(27250724-27250951)
chr1 (197-322)||(21342021-21342146)
chr1 (64-357)||(35261015-35261302)
chr1 (174-350)||(38801433-38801609)
chr1 (197-321)||(13212974-13213099)
chr1 (197-350)||(20135080-20135240)
chr1 (11-357)||(50686509-50686852)
chr1 (62-357)||(16758547-16758839)
chr1 (11-357)||(50613997-50614341)
chr1 (11-357)||(50621825-50622169)
chr1 (197-338)||(16275476-16275616)
chr1 (240-357)||(27161617-27161735)
chr1 (69-322)||(16361835-16362095)
chr1 (197-352)||(40389050-40389204)
chr1 (128-321)||(21840686-21840885)
chr1 (27-356)||(41049933-41050259)
chr1 (135-337)||(21161635-21161830)
chr1 (249-350)||(21477540-21477643)
chr1 (197-274)||(15860121-15860197)
chr1 (184-321)||(20454609-20454752)
chr1 (197-336)||(22468764-22468910)
chr1 (63-197)||(22130844-22130975)
chr1 (81-357)||(26064835-26065108)
chr1 (124-280)||(21026649-21026806)
chr1 (6-165)||(12271639-12271791)
chr1 (69-183)||(51130631-51130741)
chr1 (72-231)||(16093826-16093987)
chr1 (304-357)||(431648-431701)
chr1 (293-350)||(20916126-20916182)
chr1 (197-246)||(21714546-21714595)
chr1 (64-174)||(1924896-1925005)
chr1 (64-174)||(20923910-20924019)
chr1 (72-138)||(35981631-35981696)
chr1 (64-174)||(41387815-41387924)
chr1 (72-138)||(49261452-49261517)
chr1 (69-168)||(22354511-22354611)
chr1 (72-143)||(20636956-20637026)
chr1 (64-114)||(21477653-21477703)
chr1 (197-247)||(24783160-24783210)
chr1 (293-342)||(15860198-15860247)
[»] chr3 (103 HSPs)
chr3 (6-353)||(16097228-16097572)
chr3 (13-357)||(16103678-16104016)
chr3 (19-357)||(12174152-12174474)
chr3 (13-357)||(15470820-15471160)
chr3 (13-350)||(13210213-13210550)
chr3 (69-357)||(24153148-24153437)
chr3 (69-357)||(17463068-17463355)
chr3 (69-357)||(34159216-34159503)
chr3 (69-342)||(27165154-27165429)
chr3 (69-357)||(16454266-16454553)
chr3 (63-357)||(8898984-8899277)
chr3 (13-357)||(9512818-9513144)
chr3 (69-357)||(13151775-13152063)
chr3 (69-357)||(13154240-13154528)
chr3 (72-357)||(14234375-14234665)
chr3 (69-357)||(16282796-16283083)
chr3 (69-357)||(28848596-28848883)
chr3 (69-357)||(45606892-45607179)
chr3 (13-357)||(9520793-9521119)
chr3 (69-357)||(14972746-14973036)
chr3 (89-357)||(29172587-29172856)
chr3 (69-357)||(9707592-9707879)
chr3 (13-357)||(32307575-32307904)
chr3 (197-358)||(45577950-45578111)
chr3 (197-357)||(55500832-55500992)
chr3 (69-357)||(17446640-17446926)
chr3 (124-357)||(36166487-36166719)
chr3 (13-357)||(49667969-49668299)
chr3 (64-350)||(24340657-24340946)
chr3 (72-324)||(53301492-53301747)
chr3 (69-357)||(10247708-10247995)
chr3 (69-350)||(11424702-11424981)
chr3 (69-354)||(7781332-7781617)
chr3 (69-350)||(17487755-17488038)
chr3 (128-357)||(15977402-15977633)
chr3 (69-357)||(38961876-38962164)
chr3 (124-357)||(21618338-21618570)
chr3 (69-344)||(26686792-26687069)
chr3 (69-357)||(6469119-6469402)
chr3 (69-350)||(13442173-13442456)
chr3 (69-350)||(17499237-17499520)
chr3 (128-350)||(25476384-25476607)
chr3 (69-350)||(43840831-43841114)
chr3 (124-343)||(23083356-23083576)
chr3 (69-357)||(41123780-41124064)
chr3 (128-350)||(40213720-40213942)
chr3 (13-357)||(1644568-1644896)
chr3 (131-350)||(18438432-18438653)
chr3 (68-357)||(52523665-52523953)
chr3 (131-350)||(20698437-20698658)
chr3 (63-343)||(43550457-43550739)
chr3 (197-349)||(10556882-10557035)
chr3 (124-350)||(12399108-12399335)
chr3 (64-350)||(23274585-23274874)
chr3 (11-357)||(37251049-37251392)
chr3 (197-342)||(8499422-8499568)
chr3 (197-342)||(15412333-15412479)
chr3 (69-321)||(55476417-55476668)
chr3 (185-342)||(28194599-28194755)
chr3 (64-320)||(37642199-37642458)
chr3 (197-342)||(12119837-12119983)
chr3 (69-350)||(14576772-14577052)
chr3 (63-342)||(50242728-50243005)
chr3 (13-138)||(49389514-49389639)
chr3 (11-354)||(22110233-22110573)
chr3 (72-350)||(14572490-14572767)
chr3 (197-350)||(12510949-12511110)
chr3 (197-342)||(44494715-44494859)
chr3 (197-342)||(17737142-17737286)
chr3 (72-319)||(22147467-22147717)
chr3 (69-321)||(12567479-12567737)
chr3 (69-321)||(13543944-13544202)
chr3 (69-357)||(42386316-42386592)
chr3 (89-354)||(43925859-43926121)
chr3 (197-350)||(30029731-30029893)
chr3 (197-321)||(46822187-46822318)
chr3 (128-357)||(606324-606549)
chr3 (13-85)||(12934196-12934268)
chr3 (68-188)||(2051137-2051260)
chr3 (128-247)||(17672626-17672744)
chr3 (72-138)||(1465354-1465419)
chr3 (64-174)||(19775998-19776107)
chr3 (64-174)||(37439403-37439512)
chr3 (11-92)||(43927291-43927372)
chr3 (64-231)||(53070633-53070799)
chr3 (134-231)||(12377940-12378039)
chr3 (64-174)||(4107164-4107273)
chr3 (64-174)||(4111016-4111125)
chr3 (308-350)||(10542621-10542663)
chr3 (64-174)||(15965202-15965311)
chr3 (64-174)||(15969126-15969235)
chr3 (64-174)||(15973050-15973159)
chr3 (64-174)||(16749761-16749870)
chr3 (79-174)||(14501198-14501293)
chr3 (64-174)||(8489232-8489341)
chr3 (197-247)||(14665400-14665450)
chr3 (197-247)||(14668556-14668606)
chr3 (197-246)||(856140-856189)
chr3 (64-174)||(12852300-12852413)
chr3 (197-246)||(15878119-15878168)
chr3 (64-149)||(23413186-23413271)
chr3 (198-246)||(26196500-26196548)
chr3 (79-174)||(45797242-45797337)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (13-343)||(10425-10752)
[»] chr5 (71 HSPs)
chr5 (13-357)||(21565438-21565779)
chr5 (13-353)||(19668795-19669134)
chr5 (13-343)||(19660722-19661050)
chr5 (15-357)||(22959421-22959755)
chr5 (6-350)||(21329374-21329715)
chr5 (124-357)||(22412076-22412309)
chr5 (15-357)||(21502041-21502382)
chr5 (69-357)||(29329824-29330111)
chr5 (69-357)||(42245350-42245637)
chr5 (197-357)||(2154726-2154886)
chr5 (69-357)||(32027283-32027570)
chr5 (13-354)||(26011919-26012259)
chr5 (69-357)||(264753-265040)
chr5 (89-357)||(10732944-10733212)
chr5 (69-357)||(20908902-20909189)
chr5 (197-357)||(39245026-39245186)
chr5 (69-357)||(29345870-29346157)
chr5 (131-350)||(24529119-24529339)
chr5 (69-353)||(1096362-1096649)
chr5 (199-357)||(10775790-10775949)
chr5 (142-350)||(21997547-21997756)
chr5 (69-357)||(29348343-29348630)
chr5 (69-357)||(29350816-29351103)
chr5 (68-357)||(11581183-11581472)
chr5 (197-357)||(20918060-20918219)
chr5 (69-350)||(23390435-23390718)
chr5 (69-350)||(24493467-24493750)
chr5 (69-350)||(25421430-25421714)
chr5 (69-350)||(13025209-13025492)
chr5 (69-350)||(13095393-13095676)
chr5 (128-353)||(9077848-9078074)
chr5 (6-357)||(20026817-20027165)
chr5 (64-358)||(22143943-22144236)
chr5 (69-350)||(8286781-8287066)
chr5 (69-350)||(25431293-25431576)
chr5 (149-321)||(36314504-36314678)
chr5 (79-352)||(36154777-36155049)
chr5 (69-321)||(39363310-39363561)
chr5 (124-343)||(21808384-21808604)
chr5 (197-342)||(23064415-23064561)
chr5 (11-357)||(22178101-22178444)
chr5 (128-340)||(38619337-38619553)
chr5 (197-342)||(31060974-31061118)
chr5 (64-319)||(40725782-40726040)
chr5 (124-350)||(22074919-22075145)
chr5 (124-343)||(21729059-21729280)
chr5 (197-342)||(20806854-20806998)
chr5 (178-350)||(37723802-37723975)
chr5 (64-322)||(20901988-20902248)
chr5 (197-344)||(18319146-18319291)
chr5 (179-350)||(21293020-21293191)
chr5 (197-352)||(24067003-24067157)
chr5 (197-321)||(17517269-17517400)
chr5 (204-357)||(27989004-27989153)
chr5 (204-357)||(26740720-26740868)
chr5 (64-174)||(21871507-21871616)
chr5 (64-174)||(21875787-21875896)
chr5 (62-169)||(29448085-29448192)
chr5 (64-174)||(10753594-10753703)
chr5 (197-246)||(26704075-26704124)
chr5 (197-246)||(26973808-26973857)
chr5 (293-352)||(14047978-14048038)
chr5 (82-138)||(21741486-21741541)
chr5 (69-113)||(36314685-36314728)
chr5 (64-174)||(22120131-22120240)
chr5 (225-316)||(22107709-22107802)
chr5 (270-321)||(18418528-18418580)
chr5 (102-240)||(18418590-18418726)
chr5 (124-182)||(20766115-20766173)
chr5 (293-342)||(41095699-41095747)
chr5 (78-150)||(24767287-24767359)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (13-353)||(45676-46013)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (13-353)||(129805-130142)
scaffold0010 (64-277)||(60649-60860)
scaffold0010 (321-357)||(117814-117850)
[»] chr6 (87 HSPs)
chr6 (13-354)||(19652094-19652430)
chr6 (13-350)||(28496358-28496694)
chr6 (13-350)||(29808769-29809105)
chr6 (13-350)||(1561201-1561538)
chr6 (6-357)||(20109032-20109385)
chr6 (69-357)||(18334577-18334864)
chr6 (69-357)||(19004936-19005223)
chr6 (69-353)||(19303480-19303765)
chr6 (69-357)||(24422437-24422724)
chr6 (69-357)||(33861684-33861971)
chr6 (69-354)||(2291165-2291449)
chr6 (69-357)||(1595439-1595726)
chr6 (69-357)||(19858904-19859191)
chr6 (69-357)||(26924625-26924912)
chr6 (69-357)||(33864168-33864455)
chr6 (69-357)||(8054919-8055206)
chr6 (13-357)||(23019300-23019643)
chr6 (69-357)||(12742207-12742494)
chr6 (104-344)||(17287770-17288012)
chr6 (11-353)||(19668272-19668611)
chr6 (197-357)||(1541023-1541183)
chr6 (69-353)||(25629294-25629580)
chr6 (128-350)||(29060438-29060662)
chr6 (63-334)||(22782139-22782410)
chr6 (128-353)||(20593669-20593895)
chr6 (73-350)||(20360903-20361183)
chr6 (104-353)||(20076596-20076843)
chr6 (104-340)||(22780201-22780439)
chr6 (128-353)||(18409826-18410056)
chr6 (131-350)||(20638285-20638506)
chr6 (63-357)||(20556873-20557165)
chr6 (63-342)||(25754715-25754992)
chr6 (197-352)||(25688395-25688552)
chr6 (197-342)||(3852129-3852273)
chr6 (64-319)||(8227445-8227703)
chr6 (197-352)||(25714313-25714470)
chr6 (13-357)||(22080623-22080952)
chr6 (131-350)||(35245484-35245703)
chr6 (197-352)||(16448639-16448793)
chr6 (225-350)||(19773818-19773945)
chr6 (149-247)||(27333238-27333336)
chr6 (149-247)||(27393978-27394076)
chr6 (135-337)||(4185827-4186023)
chr6 (131-339)||(16920634-16920841)
chr6 (64-279)||(25644295-25644508)
chr6 (82-341)||(9098466-9098714)
chr6 (69-320)||(30676695-30676952)
chr6 (184-350)||(22831402-22831569)
chr6 (124-289)||(16496204-16496370)
chr6 (249-350)||(22805647-22805749)
chr6 (187-344)||(11185418-11185568)
chr6 (135-337)||(4186286-4186482)
chr6 (69-321)||(34963292-34963550)
chr6 (197-321)||(19848063-19848194)
chr6 (11-231)||(23076749-23076971)
chr6 (135-320)||(31155403-31155582)
chr6 (11-231)||(35008167-35008389)
chr6 (197-257)||(25656619-25656679)
chr6 (197-321)||(23992349-23992480)
chr6 (240-350)||(25603502-25603612)
chr6 (240-350)||(25611840-25611950)
chr6 (135-192)||(4668217-4668274)
chr6 (135-192)||(4675064-4675121)
chr6 (198-337)||(4738626-4738759)
chr6 (64-231)||(18456735-18456901)
chr6 (20-231)||(18204096-18204309)
chr6 (20-231)||(18177562-18177775)
chr6 (62-169)||(18706387-18706493)
chr6 (64-174)||(22949375-22949484)
chr6 (64-174)||(22953331-22953440)
chr6 (64-174)||(23871819-23871928)
chr6 (64-174)||(23875775-23875884)
chr6 (64-174)||(27325370-27325479)
chr6 (209-266)||(19008787-19008843)
chr6 (128-231)||(18461895-18461997)
chr6 (61-169)||(18696569-18696676)
chr6 (20-231)||(18199306-18199519)
chr6 (303-349)||(13019394-13019439)
chr6 (64-174)||(16760525-16760634)
chr6 (197-231)||(18821912-18821946)
chr6 (27-108)||(28103796-28103877)
chr6 (64-150)||(16624583-16624669)
chr6 (64-174)||(31477577-31477686)
chr6 (197-246)||(18907111-18907160)
chr6 (197-246)||(19862978-19863027)
chr6 (197-246)||(19873120-19873169)
chr6 (152-229)||(33443068-33443146)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (13-357)||(24-365)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (13-353)||(160584-160920)
scaffold0001 (197-349)||(85692-85845)
scaffold0001 (69-321)||(501003-501261)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (6-357)||(8363-8713)
scaffold0621 (15-357)||(6429-6769)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (13-353)||(6718-7046)
scaffold0556 (6-168)||(8097-8259)
[»] chr7 (93 HSPs)
chr7 (13-350)||(34200684-34201020)
chr7 (13-357)||(16219601-16219942)
chr7 (13-350)||(15754773-15755110)
chr7 (13-357)||(67637-67981)
chr7 (13-342)||(11995914-11996242)
chr7 (69-357)||(18456352-18456641)
chr7 (13-357)||(47831698-47832044)
chr7 (13-357)||(811015-811357)
chr7 (15-357)||(44014075-44014409)
chr7 (13-321)||(28505185-28505492)
chr7 (69-357)||(11972386-11972673)
chr7 (69-357)||(14949107-14949394)
chr7 (69-357)||(32125381-32125668)
chr7 (69-357)||(41522807-41523094)
chr7 (69-357)||(41525269-41525556)
chr7 (13-354)||(18005546-18005883)
chr7 (69-357)||(15376698-15376985)
chr7 (69-357)||(21189580-21189867)
chr7 (69-357)||(456211-456498)
chr7 (69-357)||(16232410-16232697)
chr7 (69-357)||(20385108-20385395)
chr7 (69-357)||(24702128-24702415)
chr7 (197-357)||(16409949-16410109)
chr7 (128-357)||(48273281-48273511)
chr7 (69-357)||(11393272-11393559)
chr7 (69-357)||(24704578-24704862)
chr7 (69-357)||(27216750-27217037)
chr7 (64-357)||(44116398-44116691)
chr7 (197-357)||(20110445-20110606)
chr7 (124-350)||(9509088-9509315)
chr7 (79-357)||(18640162-18640440)
chr7 (69-350)||(38227379-38227662)
chr7 (128-344)||(3564363-3564580)
chr7 (6-353)||(16056229-16056571)
chr7 (69-321)||(16495329-16495579)
chr7 (64-357)||(2280053-2280346)
chr7 (69-350)||(12698730-12699014)
chr7 (63-343)||(13647230-13647512)
chr7 (11-280)||(22072882-22073154)
chr7 (64-352)||(17061895-17062183)
chr7 (124-350)||(16386242-16386470)
chr7 (79-342)||(38898370-38898635)
chr7 (197-342)||(13869250-13869396)
chr7 (188-344)||(26356098-26356256)
chr7 (188-344)||(26358550-26358708)
chr7 (124-350)||(10063813-10064041)
chr7 (11-357)||(20220071-20220411)
chr7 (197-342)||(3386239-3386383)
chr7 (128-342)||(13831279-13831491)
chr7 (64-320)||(19486678-19486937)
chr7 (124-350)||(26211894-26212122)
chr7 (197-350)||(10588935-10589092)
chr7 (14-342)||(12901232-12901560)
chr7 (131-344)||(40443296-40443509)
chr7 (218-357)||(15082017-15082154)
chr7 (184-344)||(27847885-27848046)
chr7 (64-354)||(15008433-15008720)
chr7 (68-228)||(12255729-12255892)
chr7 (225-350)||(14258158-14258286)
chr7 (269-357)||(18427422-18427510)
chr7 (69-273)||(18430686-18430889)
chr7 (64-344)||(1867929-1868205)
chr7 (63-357)||(14044644-14044935)
chr7 (63-357)||(14354674-14354965)
chr7 (197-357)||(15144105-15144264)
chr7 (264-350)||(13032657-13032744)
chr7 (6-165)||(15113028-15113187)
chr7 (6-165)||(15116565-15116724)
chr7 (197-275)||(16213656-16213734)
chr7 (128-322)||(24275089-24275289)
chr7 (240-321)||(16213550-16213632)
chr7 (186-357)||(9177723-9177889)
chr7 (306-350)||(16579473-16579517)
chr7 (306-350)||(16586146-16586190)
chr7 (197-246)||(14932802-14932851)
chr7 (197-246)||(15356237-15356286)
chr7 (197-246)||(15360351-15360400)
chr7 (129-165)||(16324135-16324171)
chr7 (306-350)||(16461127-16461171)
chr7 (197-244)||(18154909-18154956)
chr7 (64-174)||(18426070-18426179)
chr7 (64-174)||(39267582-39267691)
chr7 (64-174)||(45169773-45169882)
chr7 (178-224)||(48991206-48991252)
chr7 (197-247)||(2832509-2832559)
chr7 (64-102)||(10063757-10063795)
chr7 (303-357)||(12255992-12256045)
chr7 (81-138)||(9389649-9389705)
chr7 (217-357)||(14323264-14323399)
chr7 (13-58)||(16324197-16324242)
chr7 (197-246)||(19649557-19649606)
chr7 (78-150)||(9751500-9751572)
chr7 (185-277)||(18203789-18203876)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (13-353)||(22558-22890)
scaffold0037 (63-341)||(81978-82255)
[»] chr8 (74 HSPs)
chr8 (13-350)||(5866161-5866496)
chr8 (13-350)||(21490893-21491229)
chr8 (13-357)||(6520260-6520604)
chr8 (13-350)||(17140815-17141150)
chr8 (13-350)||(26355584-26355916)
chr8 (16-342)||(38855139-38855463)
chr8 (69-357)||(5853277-5853564)
chr8 (50-350)||(21255121-21255420)
chr8 (69-357)||(1484292-1484579)
chr8 (69-357)||(4542358-4542645)
chr8 (69-357)||(20046180-20046467)
chr8 (69-357)||(20403117-20403404)
chr8 (50-350)||(21249283-21249582)
chr8 (197-357)||(19896155-19896315)
chr8 (11-357)||(20498459-20498802)
chr8 (72-357)||(23760788-23761069)
chr8 (124-357)||(16092337-16092571)
chr8 (6-357)||(21285492-21285841)
chr8 (69-357)||(15203216-15203503)
chr8 (15-357)||(21673601-21673938)
chr8 (69-357)||(22001644-22001930)
chr8 (124-357)||(26219606-26219838)
chr8 (197-358)||(26225359-26225521)
chr8 (64-350)||(13508019-13508308)
chr8 (197-357)||(45290807-45290968)
chr8 (79-357)||(14823664-14823941)
chr8 (64-357)||(41598078-41598370)
chr8 (69-357)||(22874957-22875246)
chr8 (64-350)||(13597551-13597840)
chr8 (69-350)||(18818348-18818631)
chr8 (84-353)||(22626631-22626902)
chr8 (69-353)||(28648983-28649273)
chr8 (140-350)||(23406278-23406489)
chr8 (140-357)||(6759151-6759368)
chr8 (104-342)||(7372685-7372925)
chr8 (76-349)||(17612056-17612332)
chr8 (69-342)||(14409429-14409702)
chr8 (104-350)||(21923902-21924149)
chr8 (14-357)||(983287-983630)
chr8 (173-350)||(18879276-18879451)
chr8 (124-344)||(20536113-20536334)
chr8 (131-350)||(21389454-21389672)
chr8 (131-350)||(21778780-21778998)
chr8 (124-350)||(21918995-21919222)
chr8 (131-350)||(31971155-31971375)
chr8 (11-353)||(17266874-17267214)
chr8 (131-350)||(16199647-16199866)
chr8 (69-321)||(4483207-4483457)
chr8 (131-350)||(21395984-21396202)
chr8 (131-350)||(21790477-21790695)
chr8 (11-231)||(37116366-37116588)
chr8 (179-350)||(45131047-45131218)
chr8 (197-342)||(25484380-25484524)
chr8 (197-350)||(23648446-23648606)
chr8 (9-357)||(24352919-24353265)
chr8 (62-231)||(17439438-17439609)
chr8 (69-321)||(16413301-16413547)
chr8 (243-342)||(22965608-22965707)
chr8 (197-274)||(19937118-19937194)
chr8 (197-321)||(32121654-32121785)
chr8 (197-321)||(26223841-26223969)
chr8 (9-169)||(22364744-22364903)
chr8 (64-174)||(21383887-21383996)
chr8 (197-277)||(18678170-18678256)
chr8 (64-174)||(18862412-18862521)
chr8 (64-174)||(21387307-21387416)
chr8 (64-174)||(21411180-21411289)
chr8 (64-174)||(21805672-21805781)
chr8 (64-174)||(21827781-21827890)
chr8 (197-234)||(15070571-15070608)
chr8 (178-277)||(19154936-19155032)
chr8 (84-169)||(40492807-40492891)
chr8 (64-231)||(19801362-19801527)
chr8 (293-342)||(19937195-19937244)
[»] chr4 (81 HSPs)
chr4 (19-357)||(39706179-39706518)
chr4 (6-321)||(8846287-8846616)
chr4 (13-350)||(15551716-15552050)
chr4 (6-357)||(43198429-43198776)
chr4 (6-357)||(13727-14075)
chr4 (69-357)||(44615178-44615465)
chr4 (69-357)||(44773072-44773359)
chr4 (13-357)||(12773906-12774234)
chr4 (69-357)||(15118337-15118624)
chr4 (69-357)||(52312400-52312687)
chr4 (197-357)||(50222451-50222611)
chr4 (79-354)||(12301-12577)
chr4 (69-344)||(16377462-16377737)
chr4 (197-357)||(7641294-7641454)
chr4 (197-357)||(18239531-18239691)
chr4 (69-357)||(1837494-1837781)
chr4 (63-357)||(18215253-18215547)
chr4 (72-357)||(44928866-44929153)
chr4 (124-357)||(54798749-54798983)
chr4 (104-342)||(7798681-7798921)
chr4 (69-350)||(16270175-16270458)
chr4 (197-357)||(15355437-15355598)
chr4 (69-350)||(22636334-22636617)
chr4 (125-344)||(52873363-52873583)
chr4 (91-350)||(7893601-7893863)
chr4 (14-357)||(12288094-12288434)
chr4 (124-350)||(44052728-44052955)
chr4 (124-352)||(14280209-14280438)
chr4 (124-357)||(8574864-8575095)
chr4 (69-357)||(14038548-14038830)
chr4 (69-350)||(16239909-16240192)
chr4 (124-350)||(12902656-12902883)
chr4 (79-320)||(44102140-44102382)
chr4 (63-342)||(51463847-51464124)
chr4 (64-357)||(52243128-52243420)
chr4 (13-212)||(16596686-16596882)
chr4 (173-350)||(3096192-3096369)
chr4 (79-331)||(6899808-6900062)
chr4 (197-342)||(12610856-12611000)
chr4 (178-350)||(17046386-17046559)
chr4 (197-342)||(23803377-23803521)
chr4 (133-350)||(14053306-14053523)
chr4 (124-350)||(23374354-23374575)
chr4 (11-350)||(46640337-46640672)
chr4 (131-294)||(7088832-7088996)
chr4 (11-277)||(53082033-53082296)
chr4 (197-342)||(15369925-15370071)
chr4 (197-342)||(15371109-15371255)
chr4 (197-342)||(15402610-15402756)
chr4 (69-321)||(19618157-19618415)
chr4 (197-342)||(15367597-15367743)
chr4 (197-342)||(15373390-15373536)
chr4 (197-342)||(16223439-16223585)
chr4 (197-352)||(20149725-20149879)
chr4 (74-274)||(19242673-19242872)
chr4 (69-275)||(3514979-3515184)
chr4 (197-321)||(14970819-14970950)
chr4 (237-357)||(14927842-14927962)
chr4 (297-357)||(29267510-29267570)
chr4 (197-342)||(22353740-22353886)
chr4 (249-357)||(14157746-14157854)
chr4 (249-357)||(14164451-14164559)
chr4 (64-174)||(630710-630819)
chr4 (64-174)||(3331961-3332070)
chr4 (64-174)||(14953897-14954006)
chr4 (72-138)||(15099461-15099526)
chr4 (72-138)||(15190428-15190493)
chr4 (64-174)||(25690137-25690246)
chr4 (64-168)||(15464865-15464970)
chr4 (78-174)||(13812759-13812854)
chr4 (184-231)||(6190481-6190528)
chr4 (64-174)||(10713083-10713192)
chr4 (64-174)||(10926853-10926962)
chr4 (64-174)||(15225308-15225417)
chr4 (64-174)||(15868645-15868754)
chr4 (69-174)||(12487941-12488045)
chr4 (16-67)||(14164732-14164783)
chr4 (293-342)||(19242623-19242672)
chr4 (69-168)||(7641177-7641276)
chr4 (199-231)||(21815699-21815731)
chr4 (79-174)||(32851450-32851545)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (6-350)||(988-1326)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (13-357)||(919-1263)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (7-357)||(6503-6854)
scaffold0333 (7-357)||(13883-14234)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (13-357)||(12658-13003)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (13-342)||(15570-15895)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (13-357)||(2529-2868)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (13-344)||(34028-34357)
scaffold0175 (197-350)||(172-326)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (6-350)||(10429-10771)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (13-350)||(1895-2231)
scaffold0046 (13-289)||(11252-11526)
scaffold0046 (131-350)||(28312-28533)
scaffold0046 (194-350)||(4450-4608)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (13-357)||(19159-19501)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (13-357)||(31996-32328)
[»] chr2 (68 HSPs)
chr2 (42-342)||(23071865-23072163)
chr2 (13-355)||(25175749-25176087)
chr2 (69-357)||(18808833-18809120)
chr2 (69-357)||(23711998-23712285)
chr2 (69-357)||(26505269-26505556)
chr2 (69-357)||(26507747-26508034)
chr2 (69-357)||(39682203-39682490)
chr2 (69-357)||(23135480-23135767)
chr2 (188-357)||(45029958-45030126)
chr2 (69-357)||(24905617-24905905)
chr2 (69-357)||(24908092-24908380)
chr2 (69-357)||(23709517-23709804)
chr2 (69-357)||(24898180-24898468)
chr2 (69-357)||(24900663-24900951)
chr2 (69-357)||(24903140-24903428)
chr2 (69-357)||(571287-571574)
chr2 (69-357)||(6725885-6726172)
chr2 (69-357)||(28576989-28577276)
chr2 (63-357)||(32039477-32039770)
chr2 (69-357)||(21155045-21155332)
chr2 (188-357)||(24529633-24529802)
chr2 (69-350)||(23060411-23060695)
chr2 (69-357)||(24367663-24367951)
chr2 (84-357)||(7679473-7679750)
chr2 (13-357)||(28405874-28406214)
chr2 (197-357)||(24643062-24643223)
chr2 (69-344)||(23076346-23076624)
chr2 (14-357)||(7617-7957)
chr2 (68-350)||(19671728-19672011)
chr2 (13-357)||(22134101-22134435)
chr2 (14-357)||(18786787-18787127)
chr2 (69-341)||(22105319-22105590)
chr2 (69-332)||(23659940-23660204)
chr2 (124-342)||(298809-299027)
chr2 (69-350)||(22731173-22731456)
chr2 (69-350)||(22738119-22738401)
chr2 (69-321)||(23130788-23131039)
chr2 (69-321)||(23133255-23133506)
chr2 (64-280)||(23708553-23708769)
chr2 (69-321)||(34402507-34402758)
chr2 (124-350)||(23654381-23654609)
chr2 (79-342)||(43137204-43137467)
chr2 (197-343)||(23040257-23040405)
chr2 (69-350)||(22337022-22337297)
chr2 (197-342)||(38967279-38967424)
chr2 (197-350)||(8946555-8946710)
chr2 (11-357)||(23207174-23207517)
chr2 (131-350)||(20309007-20309225)
chr2 (14-357)||(23791170-23791511)
chr2 (64-353)||(22413070-22413357)
chr2 (152-350)||(38138-38337)
chr2 (128-350)||(23103396-23103616)
chr2 (69-321)||(32214906-32215164)
chr2 (6-165)||(22459438-22459598)
chr2 (238-350)||(21900562-21900676)
chr2 (9-231)||(25108906-25109130)
chr2 (124-294)||(23285820-23285987)
chr2 (62-357)||(24697538-24697830)
chr2 (64-357)||(20520127-20520416)
chr2 (197-321)||(25616107-25616238)
chr2 (122-357)||(23004646-23004878)
chr2 (303-357)||(23713058-23713111)
chr2 (64-174)||(1283657-1283766)
chr2 (64-174)||(30344758-30344867)
chr2 (184-231)||(32451984-32452031)
chr2 (308-357)||(10822795-10822843)
chr2 (186-246)||(21916156-21916215)
chr2 (321-357)||(24688477-24688513)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (13-357)||(100271-100611)
scaffold0023 (69-357)||(94301-94588)
scaffold0023 (13-358)||(40058-40399)
scaffold0023 (197-357)||(44344-44504)
scaffold0023 (177-350)||(119774-119948)
scaffold0023 (173-357)||(101397-101576)
scaffold0023 (69-243)||(17425-17598)
scaffold0023 (197-320)||(38547-38672)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (69-353)||(3090-3375)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (69-357)||(20637-20924)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (69-357)||(136570-136857)
scaffold0028 (69-357)||(139039-139326)
scaffold0028 (69-357)||(143977-144264)
scaffold0028 (13-357)||(132556-132888)
scaffold0028 (69-357)||(141508-141795)
scaffold0028 (69-357)||(134101-134388)
scaffold0028 (13-232)||(62216-62432)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (7-357)||(12835-13182)
scaffold0138 (11-169)||(18119-18277)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (69-342)||(38641-38916)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (69-353)||(339889-340172)
scaffold0003 (69-357)||(158435-158723)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (124-357)||(44702-44936)
scaffold0122 (128-243)||(26064-26179)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (69-357)||(37711-37998)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (6-357)||(53425-53773)
scaffold0075 (64-164)||(8230-8330)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (197-357)||(40290-40450)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (69-357)||(13282-13569)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (13-357)||(14581-14923)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (6-355)||(32432-32779)
scaffold0034 (194-231)||(51948-51985)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (15-357)||(5540-5877)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (15-265)||(6009-6259)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (69-357)||(13837-14124)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (6-357)||(12465-12812)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (69-350)||(25794-26077)
scaffold0026 (69-350)||(39756-40039)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (14-357)||(7943-8284)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (132-357)||(15780-16006)
scaffold0020 (197-246)||(178898-178947)
scaffold0020 (7-58)||(15710-15761)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (197-358)||(15306-15468)
scaffold0106 (131-350)||(1188-1406)
scaffold0106 (131-321)||(7193-7383)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (69-350)||(13111-13393)
[»] scaffold0145 (4 HSPs)
scaffold0145 (69-350)||(32840-33123)
scaffold0145 (69-350)||(38659-38942)
scaffold0145 (197-357)||(9638-9799)
scaffold0145 (260-350)||(32374-32465)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (69-350)||(1750-2033)
scaffold0016 (76-150)||(207467-207541)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (69-350)||(8472-8751)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (69-344)||(6060-6340)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (124-354)||(116320-116551)
scaffold0022 (11-357)||(128851-129193)
scaffold0022 (11-357)||(78219-78561)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (69-321)||(1013-1263)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (69-350)||(39376-39658)
scaffold0141 (64-174)||(13854-13963)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (128-350)||(16012-16235)
scaffold0120 (98-353)||(32926-33181)
scaffold0120 (98-353)||(45824-46079)
scaffold0120 (197-353)||(17397-17554)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (69-350)||(75154-75436)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (63-357)||(11953-12241)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (199-352)||(4108-4262)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (64-350)||(17961-18250)
scaffold0247 (197-349)||(2241-2394)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (104-350)||(51812-52060)
scaffold0011 (124-350)||(167973-168200)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (69-354)||(4403-4689)
scaffold0228 (69-354)||(11985-12271)
scaffold0228 (69-354)||(21937-22223)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (144-357)||(23898-24108)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (84-350)||(128650-128917)
scaffold0031 (78-231)||(20372-20524)
scaffold0031 (64-174)||(35853-35962)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (69-350)||(39812-40094)
scaffold0080 (11-354)||(19766-20106)
scaffold0080 (64-174)||(48921-49030)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (184-350)||(121665-121831)
scaffold0021 (178-350)||(174665-174838)
scaffold0021 (14-353)||(136252-136604)
scaffold0021 (14-344)||(144960-145303)
[»] scaffold0628 (3 HSPs)
scaffold0628 (122-357)||(2799-3029)
scaffold0628 (305-357)||(3280-3331)
scaffold0628 (13-59)||(2688-2734)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (128-357)||(16599-16829)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (69-344)||(3375-3652)
scaffold0292 (69-350)||(243-524)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (128-344)||(3185-3406)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (64-342)||(11370-11651)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (64-342)||(38190-38471)
scaffold0124 (64-174)||(21828-21937)
scaffold0124 (64-174)||(24587-24699)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (64-350)||(16034-16317)
scaffold0357 (64-231)||(13147-13316)
scaffold0357 (179-277)||(2638-2732)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (6-357)||(7953-8297)
scaffold0218 (13-203)||(29164-29354)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (64-350)||(27683-27966)
scaffold0165 (225-320)||(3442-3539)
scaffold0165 (225-320)||(7506-7603)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (124-350)||(1043-1270)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (184-350)||(4889-5055)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (128-349)||(17214-17442)
scaffold0056 (197-231)||(79396-79430)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (79-352)||(16677-16952)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (173-350)||(4611-4788)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (131-344)||(8386-8598)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (131-350)||(5132-5350)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (184-344)||(46900-47061)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (124-357)||(930-1158)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (131-349)||(4749-4968)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (131-350)||(31966-32184)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (133-350)||(11447-11666)
scaffold0235 (79-174)||(13638-13733)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (79-349)||(161083-161355)
scaffold0007 (64-167)||(164570-164674)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (178-350)||(10472-10646)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (131-350)||(1053-1271)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (11-357)||(106181-106524)
scaffold0006 (11-357)||(96903-97246)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (124-350)||(1851-2078)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (131-350)||(13395-13615)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (174-355)||(4412-4599)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (63-342)||(12-289)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (63-352)||(1259-1547)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (131-350)||(15466-15686)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (131-350)||(51481-51699)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (223-350)||(32059-32188)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (214-353)||(27771-27913)
scaffold0130 (69-168)||(27912-28012)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (131-343)||(20815-21030)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (11-357)||(1679-2022)
[»] scaffold0420 (4 HSPs)
scaffold0420 (11-231)||(6164-6386)
scaffold0420 (183-231)||(13792-13840)
scaffold0420 (321-357)||(6416-6452)
scaffold0420 (321-357)||(13870-13906)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (69-274)||(22859-23064)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (13-194)||(2102-2283)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (166-357)||(28806-28993)
scaffold0211 (13-93)||(28695-28775)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (14-357)||(103523-103855)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (197-321)||(29856-29982)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (133-350)||(16181-16397)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (223-344)||(2494-2616)
scaffold0161 (13-181)||(2329-2494)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (11-227)||(38339-38557)
scaffold0139 (321-357)||(38290-38326)
scaffold0139 (197-246)||(19980-20029)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (128-321)||(10692-10891)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (69-275)||(4666-4871)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (11-354)||(451-789)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (81-357)||(25005-25276)
scaffold0123 (62-169)||(619-725)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (11-277)||(267637-267900)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (197-321)||(9161-9292)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (13-93)||(2187-2267)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (197-321)||(12361-12492)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (11-169)||(87-245)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (128-321)||(11207-11406)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (204-357)||(30228-30377)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (249-357)||(225346-225455)
scaffold0012 (64-192)||(225465-225593)
scaffold0012 (64-174)||(189144-189253)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (197-244)||(4300-4347)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (298-357)||(10188-10247)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (124-232)||(24297-24406)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (303-357)||(6492-6546)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (135-192)||(9136-9193)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (300-350)||(20907-20957)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (197-246)||(23843-23892)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (197-246)||(36454-36503)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (144-231)||(2694-2783)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (197-231)||(11982-12016)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (64-174)||(627-736)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (78-164)||(6-92)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (64-174)||(11268-11377)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (197-246)||(29558-29607)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (69-174)||(32432-32536)
[»] scaffold1419 (1 HSPs)
scaffold1419 (20-108)||(165-252)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (196-246)||(289-339)
scaffold0327 (69-168)||(3469-3569)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (197-246)||(159-208)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (197-246)||(21871-21920)
scaffold0210 (197-246)||(29763-29812)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (197-246)||(69794-69843)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (78-150)||(12758-12830)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (78-150)||(9784-9856)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 68)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 33681244 - 33680903
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33681244 agaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttctagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 33681145  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    || |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33681144 aattatgtttgatatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 33681045  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatg 311  Q
     |||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | | ||||  ||||||| || | |||||||    
T  33681044 ttgcatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgttccaaattattggacttatataagaggtggttgttctaagtggttaagatgttgtgtccatg 33680948  T
Q  312 cattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33680947 cattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 33680903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22237865 - 22237523
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgat-gttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22237865 agaaactaagttgtttatcttgctgattgttgttccagcgagactgatacatatgaattgatgttgtttctaaagttatataattgtatatacattacat 22237766  T
Q  112 gaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaa 211  Q
    ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  22237765 gaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaa 22237666  T
Q  212 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccat 310  Q
    ||| |||||||||||||||||||   |||||||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||| | | |||| |||||||  || | ||||||    
T  22237665 gcttcatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgtttcaaattattggacttgtataagaggttgttgttctaagttgttaagttgttgtgtccat 22237569  T
Q  311 gcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22237568 gcattagca-ttcatcgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 22237523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Original strand, 52927866 - 52928195
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52927866 agaaactaagttgtttatcttgctattgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 52927965  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    || |||  |||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52927966 aattatgtttgatatttgagatg------------attcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaag 52928053  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatg 311  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | | |||| |||||||  || | |||||||    
T  52928054 ctgcatgagtcggtctaagttg---aagatggtgatgttccaaattattggacttatataagaggttgttgttctaagttgttaagttgttgtgtccatg 52928150  T
Q  312 cattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  52928151 cattaaca-ttcattgttgggggcttggtgccctagagcctttgct 52928195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 20248512 - 20248177
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20248512 agaaactaagttatttatcttgatgttgttgt-ccagtaagactgatgcatatgaatccatgttgtttataatgatatataattgtatatacattacatg 20248414  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    |  |||  ||||||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20248413 acttatgtttgatatttaagttgttgat---ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaag 20248317  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgc 312  Q
     |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| | ||  | | |||| |||||||| || | ||||||||    
T  20248316 ttgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggact-tataagatgatgatgttctaagttgttaagatgttgtgtccatgc 20248221  T
Q  313 attagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20248220 attaaca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcccttgct 20248177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Original strand, 22921753 - 22922093
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22921753 agaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattatat 22921852  T
Q  112 gaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaa 211  Q
    ||| | || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22921853 gaatt-ttgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaa 22921951  T
Q  212 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccat 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||| | || ||||| |||| |  || | ||||||    
T  22921952 gctgcatgagtcggtctaagatgat---gatgatgatgttccaaattattgga-aatataagaggttgttgtttataagaagttatgttgttgtgtccat 22922047  T
Q  311 gcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22922048 gcattaaca-ttcattgttaggggcttgatgccctggagcctttgct 22922093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 21754272 - 21753947
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| |||    
T  21754272 agaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgtt--------gtatatacattaaatg 21754181  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
     | |||  |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754180 gattatg-ttgataattgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaag 21754083  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||| ||||| | ||||||| | ||| | | |||| |||||||| || | ||||||||    
T  21754082 ctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgttgttccaaattattggact-tataagatgatgttgttctaagttgttaagatgttgtgtccatgc 21753987  T
Q  313 attagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 353  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21753986 attagca-tccattgttgggggcttgatgccctagagcctt 21753947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 13989043 - 13988756
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  13989043 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 13988945  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13988944 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 13988847  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13988846 atataagaggttgtcgatttaagatattaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 13988756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 21923276 - 21923563
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  21923276 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 21923374  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21923375 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 21923472  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21923473 atataagaggttgtcgatttaagatattaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 21923563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 23593719 - 23594007
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  23593719 ttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 23593818  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23593819 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 23593916  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23593917 atataagaggttgtcgatttaagatattacgaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 23594007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 31612490 - 31612202
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  31612490 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 31612392  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31612391 gctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 31612294  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31612293 atataagagtttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 31612202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 21475072 - 21475359
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  21475072 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 21475170  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21475171 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 21475268  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21475269 atataagaggttgtcgatttaagatattacgaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 21475359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 188 - 357
Target Start/End: Original strand, 22123171 - 22123340
Alignment:
Q  188 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgattta 287  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123171 tgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgattta 22123270  T
Q  288 agatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22123271 agatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcgttgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 22123340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 131 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 34509899 - 34509679
Alignment:
Q  131 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 229  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||  |||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509899 agatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 34509801  T
Q  230 agttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 328  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509800 agttgatgaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 34509701  T
Q  329 tgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  34509700 tgggggcttgatgccctggagc 34509679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 197 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 29298187 - 29298029
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298187 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtttcaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 29298088  T
Q  297 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttg 355  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29298087 gaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttg 29298029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 69 - 321
Target Start/End: Original strand, 14295495 - 14295745
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 168  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    ||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||    
T  14295495 ttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatg 14295590  T
Q  169 atgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-a 267  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  14295591 atggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaa 14295690  T
Q  268 tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14295691 tataagaggtcgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 14295745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 357
Target Start/End: Original strand, 21896140 - 21896480
Alignment:
Q  11 taagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||| ||||||| ||||    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21896140 taagaaactaagttgtttatcttgttg---ttgtttcagtaagcctgaatattatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattaca 21896236  T
Q  111 tgaagtat-tattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaact 209  Q
    |||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||| ||||||||  ||||||    
T  21896237 tgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaact 21896336  T
Q  210 aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtc 307  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||     | || || |||||||||| ||||| ||||||||||||   | | || ||||||||| ||  || |||||    
T  21896337 aagttgcatgagtcggtctaagatga-----aggaagatgttccaaattattggatttatataagaggccattgtttctaagatgttgagttgttgagtc 21896431  T
Q  308 catgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21896432 catgcattcgca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 21896480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 128 - 350
Target Start/End: Original strand, 50210212 - 50210439
Alignment:
Q  128 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210212 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 50210310  T
Q  227 ctaagttgattaagatgatgaag----ttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    |||||||||| |||||||||| |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50210311 ctaagttgatgaagatgatgatgatgtttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 50210410  T
Q  322 tcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50210411 tcattgttgggggcttgatgccctggagc 50210439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22532451 - 22532168
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||| | |||||| |||| ||| | ||| ||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||    
T  22532451 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcat 22532352  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22532351 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggatt 22532253  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22532252 atataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 22532168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 277
Target Start/End: Original strand, 21861446 - 21861714
Alignment:
Q  6 agagataagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatataca 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||    |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21861446 agaggtaagaaactaagttgtttatcttgctattgttgtttcagtaagcctgaatattatgatatgatgttgtttataatgtgatataattgtatataca 21861545  T
Q  106 ttacatgaagtat-tattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatt 204  Q
    |||| |||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||  |    
T  21861546 ttacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttat 21861645  T
Q  205 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggt 277  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||   |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21861646 tagctaagctgcatgagtcggtctaagatga--aagaagat---gttccaaattattggatttatataagaggt 21861714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20918838 - 20918620
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    ||||||||||| ||||| |||| || |  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918838 agaaactaagtcgtttaccttgttgttaatgttccagtaagactcatgcttatgaattgatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatg 20918739  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    |  ||   |||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20918738 acttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaag 20918642  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttg 234  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20918641 ctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 79 - 343
Target Start/End: Original strand, 45574836 - 45575103
Alignment:
Q  79 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtat-tattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 176  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| | || ||| |||||| |||| ||||||||||| | |||| |||| ||||| || ||| |    
T  45574836 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttg 45574935  T
Q  177 catactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagag 275  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  45574936 catactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgttccaaattattggattaatataagag 45575034  T
Q  276 gttgtcgatttaagatg--ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcc 343  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45575035 gttgtcgaattaagatgttttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgcc 45575103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 69 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 29776865 - 29776592
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  29776865 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 29776767  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | |  ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29776766 gttatttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 29776669  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  29776668 atataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgattggggcttgatgc 29776592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 64 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 433193 - 432950
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 162  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  433193 atgatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 433094  T
Q  163 atcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgtt 261  Q
     || ||||| ||| | ||||| ||| |||||  |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  433093 gtcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgccgtt----atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattatt 432998  T
Q  262 ggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtcc 308  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  432997 ggattatataagaggttgtcaatttaagatgtttaagaggtcgagtcc 432950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 357
Target Start/End: Original strand, 16368168 - 16368509
Alignment:
Q  11 taagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaca 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  16368168 taagaaattaagttgtttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaca 16368267  T
Q  111 tgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaac 208  Q
    |||| ||| |  |||  ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  || || ||||||||| ||||||||  |||||    
T  16368268 tgaattataaacgat-gttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaattgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaac 16368365  T
Q  209 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||     ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |  | | ||||||| ||||  || |||||    
T  16368366 taagctgcatgagtcggtctaagatga-----atgatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcgatgttctaagatgctaagttgttgagtc 16368460  T
Q  308 catgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||   || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16368461 catgcatactca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 16368509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 64 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 21347144 - 21346885
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgtta 161  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||  |||| ||||  ||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||    
T  21347144 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 21347046  T
Q  162 tatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgt 260  Q
    | ||||| || ||| | ||||| | | |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21347045 tgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattat 21346948  T
Q  261 tggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21346947 tggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaattcgagtccatgcattagcattt 21346885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 188 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 21711767 - 21711602
Alignment:
Q  188 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgattta 287  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21711767 tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatacaagagtttgtcgattta 21711669  T
Q  288 agatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc-gggagcct 352  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  21711668 gaatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattttaaagttgagggcttgatgccctgggagcct 21711602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 188 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21707225 - 21707071
Alignment:
Q  188 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgattta 287  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21707225 tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatacaagagtttgtcgattta 21707127  T
Q  288 agatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  21707126 gaatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattttaaagttgagggcttgatgc 21707071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 179 - 350
Target Start/End: Original strand, 20847205 - 20847376
Alignment:
Q  179 tactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggt 277  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  20847205 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggt 20847303  T
Q  278 tgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20847304 tgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 20847376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 124 - 350
Target Start/End: Original strand, 27250724 - 27250951
Alignment:
Q  124 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 222  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  27250724 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagt 27250822  T
Q  223 cggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcat 320  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  27250823 cggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagagattgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca- 27250921  T
Q  321 ttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  27250922 ttcattgataggggcttgatgccctggagc 27250951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 197 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 21342146 - 21342021
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21342146 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaag-tccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttta 21342048  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcattt 322  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  21342047 agaattcgagtccatgcattagcattt 21342021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 357
Target Start/End: Original strand, 35261015 - 35261302
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtat-tattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 162  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| |||| ||| |||  || ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||    
T  35261015 atgatttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgagatgttgat---ttgcatttgatattgttat 35261111  T
Q  163 atcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttg 262  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||  || | |||||||||| |||    
T  35261112 atcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa---gatgaaga--attatgttccaaattattg 35261206  T
Q  263 ga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    || ||||||||||||| || | || ||||||||||||  || ||||||||||||   || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  35261207 gatttatataagaggtcgttgtttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactca-ttcattgttggaggcttgatgccctggagcctttgct 35261302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 174 - 350
Target Start/End: Original strand, 38801433 - 38801609
Alignment:
Q  174 ttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataa 272  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||    
T  38801433 ttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataa 38801531  T
Q  273 gaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  38801532 gaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcataagca-ttcatagttgggggcttgatgccctggagc 38801609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 197 - 321
Target Start/End: Original strand, 13212974 - 13213099
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| || || |||||||| |||    
T  13212974 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattggactatttaagaggtcgttgaattaagatgttta 13213073  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  13213074 agaggtcgagtccatgcattagcatt 13213099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 197 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20135240 - 20135080
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg------atgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaaga 290  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||      |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  20135240 ttgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatataagaggttgtcgaattaaga 20135141  T
Q  291 tgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  20135140 tgtttaagaggtcgagtccatgcatcagcatttcatagttgggggcttgatgccctggagc 20135080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 50686852 - 50686509
Alignment:
Q  11 taagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaca 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||   ||||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  50686852 taagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatccgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaca 50686753  T
Q  111 tgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaac 208  Q
    |||| |||   |||| |||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||  |  |||    ||| |||||||||  |||||||  |||||    
T  50686752 tgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatcatgaactattttatgaactgcctatgttgccgtttgtttattaac 50686653  T
Q  209 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtc 307  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| |   |||||||||| ||||| ||||||||||||| |  | | ||||||||||||  || |||||    
T  50686652 taaactgcatgagtcggtctaagatga--aagatgtt---gttccaaattattggatttatataagaggtcgatgttctaagatgttaagttgttgagtc 50686558  T
Q  308 catgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||   || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  50686557 catgcatactca-ttcattgttgggggcttgatgcccttgagcctttgct 50686509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16758839 - 16758547
Alignment:
Q  62 atatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 161  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   |||   ||| ||||||| ||  ||| ||| ||||||||||    
T  16758839 atatgatttgttgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgtta 16758740  T
Q  162 tatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattg 259  Q
    ||||||||  || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||||||||     
T  16758739 tatcatgaactggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga--aagatgat---gttccaaatta 16758645  T
Q  260 ttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||| || |||| ||||| || | || ||||||| | ||  || ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  16758644 ttggatttttatacgaggtcgttgtttctaagatgctgagtcgttgagtccatgcatttgca-ttcattgtt-ggggcttgatgcccttgagcctttgct 16758547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 357
Target Start/End: Original strand, 50613997 - 50614341
Alignment:
Q  11 taagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaca 110  Q
    |||||||||||||||||| |||| | | ||||  | ||||||| ||||   |||||| ||||||||| |  |||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  50613997 taagaaactaagttgtttgtcttaccgttgttacttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattaca 50614096  T
Q  111 tgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaac 208  Q
    |||| ||| |  ||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |||| ||||||||| ||||||||  |||||    
T  50614097 tgaattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaac 50614196  T
Q  209 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||     | ||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||||||  | || ||||||||||||  || ||||    
T  50614197 taagctgcatgagtcggtctaagatga-----aggatgttgttccaaattattggatttatatgagaggttggtgtttctaagatgttaagttgttgagt 50614291  T
Q  307 ccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||   || |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  50614292 ccatgcatactca-ttcattgttgagggcttgatgccctagagcctttgct 50614341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 357
Target Start/End: Original strand, 50621825 - 50622169
Alignment:
Q  11 taagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaca 110  Q
    |||||||||||||||||| |||| | | ||||  | ||||||| ||||   |||||| ||||||||| |  |||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  50621825 taagaaactaagttgtttgtcttaccgttgttacttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattaca 50621924  T
Q  111 tgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaac 208  Q
    |||| ||| |  ||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |||| ||||||||| ||||||||  |||||    
T  50621925 tgaattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaac 50622024  T
Q  209 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||     | ||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||||||  | || ||||||||||||  || ||||    
T  50622025 taagctgcatgagtcggtctaagatga-----aggatgttgttccaaattattggatttatatgagaggttggtgtttctaagatgttaagttgttgagt 50622119  T
Q  307 ccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||   || |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  50622120 ccatgcatactca-ttcattgttgagggcttgatgccctagagcctttgct 50622169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 197 - 338
Target Start/End: Original strand, 16275476 - 16275616
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 295  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||    
T  16275476 ttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttctaaattattggattatacaaga-gctgtcgatttaagatgttta 16275574  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttg 338  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16275575 agaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttgggggcttg 16275616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 240 - 357
Target Start/End: Original strand, 27161617 - 27161735
Alignment:
Q  240 gatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttg 338  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27161617 gatgatgaagttccaaattattggattatataagagtttgtcgatttaagatgtttaagaggtctagtccatgcattagcatttcattgttgggggctgg 27161716  T
Q  339 atgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||| | ||||||||||    
T  27161717 atgccctgtagcctttgct 27161735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 69 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16362095 - 16361835
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||  ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  16362095 ttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 16361996  T
Q  168 gatgatttgc-atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg------atgaagttccaaattgt 260  Q
    | || |||   |||||   | ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||| |||||||||| |    
T  16361995 gttgtttttatatactgt-tgtgttgctgtc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattat 16361898  T
Q  261 tggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcattt 322  Q
    |||| ||| |||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16361897 tggactatttaagaggtcgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 16361835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 197 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 40389204 - 40389050
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-a 295  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |    
T  40389204 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgattaagatga---agttccaaattattggattatacaagagtttgtcaatttaagatgttaa 40389108  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc-gggagcct 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  40389107 agaggtcgagtccatgcattagcattttaaagttgagggcttgatgccctgggagcct 40389050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 128 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 21840885 - 21840686
Alignment:
Q  128 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 226  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||| | | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21840885 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 21840788  T
Q  227 ctaagttgattaagatgatg------aagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagca 319  Q
    ||||||||||||||||| ||      | |||||||||| ||||| ||| ||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21840787 ctaagttgattaagatgttgataacaatgttccaaattattggactatttaaaaggttgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca 21840688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 356
Target Start/End: Original strand, 41049933 - 41050259
Alignment:
Q  27 ttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgata 126  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||   |||||| |||| |||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| |||   ||||     
T  41049933 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgacgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatg 41050032  T
Q  127 tttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 224  Q
    || ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  |  |||  ||||| ||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||    
T  41050033 tt-gagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcg 41050131  T
Q  225 gtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 322  Q
    ||||||| |||     | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | || ||||||| ||||  || ||||||||||||   || ||    
T  41050132 gtctaagatga-----aggatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttctaagatgctaagttgttgagtccatgcatactca-tt 41050225  T
Q  323 cattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgc 356  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  41050226 cattgttaggggcttgatgccctggaacctttgc 41050259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21161830 - 21161635
Alignment:
Q  135 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 234  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  21161830 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcacgatgatttgcatact-gttttgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttg 21161732  T
Q  235 attaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggg 333  Q
    ||   |||||||| |||||||||| ||||| ||| || || ||||    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    |||||||||    
T  21161731 at---gatgatgatgttccaaattattggactatttacgaagttg----tttaagatgtttaagatgtcaagtccatgcattagcatacatttgttgggg 21161639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 249 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 21477643 - 21477540
Alignment:
Q  249 gttccaaattgttggattat-ataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgg 346  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21477643 gttccaaattattggactattataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctg 21477544  T
Q  347 gagc 350  Q
    ||||    
T  21477543 gagc 21477540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 197 - 274
Target Start/End: Original strand, 15860121 - 15860197
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataaga 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  15860121 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaag-tccaaattattggattatataaga 15860197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 184 - 321
Target Start/End: Original strand, 20454609 - 20454752
Alignment:
Q  184 cctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggt 277  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||| | |||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  20454609 cctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgataatgttccaaattattggactatttaagaggt 20454707  T
Q  278 tgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
     || || |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20454708 cgttgaattaagatgtttaagatgtcgagtccatgcattaacatt 20454752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 197 - 336
Target Start/End: Original strand, 22468764 - 22468910
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga---tgatgaa---gttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaaga 290  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   |||||||   |||||||||| ||||| |||||| ||||||||    ||||||    
T  22468764 ttgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgaagatgttccaaatttttggactatatacgaggttgtttgattaaga 22468863  T
Q  291 tg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggct 336  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  22468864 tgtttaagagatcgagtccatgcattagcatatatttgttgggggct 22468910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 63 - 197
Target Start/End: Original strand, 22130844 - 22130975
Alignment:
Q  63 tatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 162  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||   |||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||    
T  22130844 tatgatttgatgttgcttataatgttatataattgtatatgcattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattat 22130940  T
Q  163 atcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtt 197  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||    
T  22130941 atcatgatggtttggatactgcctatgttgctgtt 22130975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 81 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 26065108 - 26064835
Alignment:
Q  81 ataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgca 178  Q
    ||||||| ||||| ||||||||  ||||| |||| |||   |||| |||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||  |  |||       
T  26065108 ataatgtgatatatttgtatatgtattacttgaattatatatgatctttgagatgttgttgatttgcattgg-tattgttatatcatgaattattttatg 26065010  T
Q  179 tactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggt 277  Q
    |||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||| | |||  |||||||||   ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26065009 tactgcctatgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttggtctatgatga--aagatgatg---ttccaaattattggatttatataagaggt 26064915  T
Q  278 tgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
        | || ||||||||||||  || ||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26064914 caatgtttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 26064835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 124 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21026806 - 21026649
Alignment:
Q  124 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 222  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||  |||  ||||| |||||| | ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21026806 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 21026708  T
Q  223 cggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgt 280  Q
    |||||||||||| | | |||||||| |||||||||| ||||| | |||| |||||||||    
T  21026707 cggtctaagttgttgacgatgatgatgttccaaattattggactaatatgagaggttgt 21026649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 12271791 - 12271639
Alignment:
Q  6 agagataagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatataca 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||       ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  12271791 agaggtaagaaactaagttgtttatcctgctgttattgtttcagtaagactg-------tgagttgatgttatttataatgtgatataattgtatatata 12271699  T
Q  106 ttacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatc 165  Q
    |||| | |  |||   | |   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12271698 ttactttagttatacgtaaatattgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 12271639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 51130741 - 51130631
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 168  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    ||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||    
T  51130741 ttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatg 51130646  T
Q  169 atgatttgcatacta 183  Q
    ||| |||||||||||    
T  51130645 atggtttgcatacta 51130631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 231
Target Start/End: Original strand, 16093826 - 16093987
Alignment:
Q  72 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttg-atgacttgcattcgatattgttatatcatga- 169  Q
    |||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    |||| ||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  16093826 atgttgattttaatgtgatatatttgtatatacattacatgaattacctatgatgtttgagatgttgtttgatttgcatt-gatattgttatatcatgag 16093924  T
Q  170 -tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 231  Q
     || |||  ||||| ||||||||| | ||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16093925 ctgttttctatactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaag 16093987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 304 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 431701 - 431648
Alignment:
Q  304 agtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  431701 agtccatgcattagcatttcattgttggaggcttgatgccctggagcctttgct 431648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 293 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20916182 - 20916126
Alignment:
Q  293 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  20916182 ttaagaggttgagtccatgcattagcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagc 20916126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21714595 - 21714546
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 246  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21714595 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Original strand, 1924896 - 1925005
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  1924896 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 1924995  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  1924996 t-atgatgatt 1925005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Original strand, 20923910 - 20924019
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  20923910 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 20924009  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  20924010 t-atgatgatt 20924019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 138
Target Start/End: Original strand, 35981631 - 35981696
Alignment:
Q  72 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttg 138  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||    
T  35981631 atgttgatgataatgttatataattgcatatacattatatgaatta-tgttgatatttgagatgttg 35981696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Original strand, 41387815 - 41387924
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||  || ||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  41387815 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattaagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 41387914  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  41387915 t-atgatgatt 41387924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 49261517 - 49261452
Alignment:
Q  72 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttg 138  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || || | ||||||||||||||||||    
T  49261517 atgttgatgataatgttatataattgtatatacattatataaatta-tgttgatatttgagatgttg 49261452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 168
Target Start/End: Original strand, 22354511 - 22354611
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  |||||||||||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||    
T  22354511 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcat 22354610  T
Q  168 g 168  Q
    |    
T  22354611 g 22354611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 72 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 20637026 - 20636956
Alignment:
Q  72 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgac 143  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||| |||||| ||||||| ||||    
T  20637026 atgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatgaattatgtttg-tatttgggatgttgttgac 20636956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 21477703 - 21477653
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaa 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||    
T  21477703 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatacgcattacttgaa 21477653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 247
Target Start/End: Original strand, 24783160 - 24783210
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 247  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  24783160 ttgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatga 24783210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 293 - 342
Target Start/End: Original strand, 15860198 - 15860247
Alignment:
Q  293 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  15860198 ttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggcttgatgc 15860247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 103)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 6 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 16097572 - 16097228
Alignment:
Q  6 agagataagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatataca 105  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097572 agagattagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatataca 16097473  T
Q  106 ttacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttattt 205  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16097472 ttacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgatgatgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttattt 16097373  T
Q  206 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcga 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||| |||| | | |||| |||||||| || |     
T  16097372 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggacttatttaagagattgttgttctaagttgttaagatgttgt 16097276  T
Q  305 gtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 353  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16097275 gtccatgaattaaca-ttcattgttgggggcttgatgccctagagcctt 16097228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16104016 - 16103678
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  16104016 agaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactaatccatatgaattgatgttgtttataatgttatataattttatatacattaaatg 16103917  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    || |||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  16103916 aattatgtttgatatttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaag 16103818  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| | ||| | |||||| || ||||| |  | ||||||||    
T  16103817 ctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggact-tataagatgatgttgttttaagttgctaagatgatgtgtccatgc 16103722  T
Q  313 attagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16103721 attaaca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 16103678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 357
Target Start/End: Original strand, 12174152 - 12174474
Alignment:
Q  19 taagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtat 118  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  12174152 taagttgtttagcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaatcaatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgacttat 12174251  T
Q  119 tattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcat 218  Q
      |||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12174252 gtttgatatttgagttgttgtt---ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 12174348  T
Q  219 gagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagc 318  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||| | | |||||||||        | |||||||||||| |    
T  12174349 gagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggact-tataagaggttgttgttctaagatgtt--------gtgtccatgcattaac 12174436  T
Q  319 atttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12174437 a-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 12174474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 15471160 - 15470820
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||   ||||||  | | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15471160 agaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatctaa-gttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatg 15471062  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    || |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15471061 aattatgtttgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaag 15470962  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatg 311  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| | | |||| |||||||  || | ||| |||    
T  15470961 ctgcatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgttccaaattattggacttatttaagaggttgttgttctaagttgttaagttgttgtgtcaatg 15470865  T
Q  312 cattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15470864 cattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 15470820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 350
Target Start/End: Original strand, 13210213 - 13210550
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattga-tgttgtttataatgttatataattgtatatacattacat 111  Q
    |||||||||||||||||||||| || |    |||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13210213 agaaactaagttgtttatcttgttgttaacattccagtaaggctgatgcatatgaattcaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacat 13210312  T
Q  112 gaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaa 211  Q
    ||  |||  ||||||||| || |||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  13210313 gacttatgtttgatatttaagttgttgat---ttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaa 13210409  T
Q  212 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaag--atgttaagaggtcgagtcc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||   | ||||||||||||||||    
T  13210410 gctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgtttcaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagtcgttttaagaggtcgagtcc 13210509  T
Q  309 atgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13210510 atgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 13210550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 24153148 - 24153437
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||| ||  ||| | |||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  24153148 ttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 24153247  T
Q  168 gatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta 267  Q
    | || |||| ||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24153248 gctgttttgtatactacctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatta 24153346  T
Q  268 tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24153347 tataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 24153437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 17463355 - 17463068
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  17463355 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 17463257  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17463256 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 17463159  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17463158 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 17463068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 34159503 - 34159216
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  34159503 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 34159405  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34159404 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 34159307  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34159306 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 34159216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 69 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27165429 - 27165154
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtat-tattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  || ||| | || ||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27165429 ttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttaaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcat 27165330  T
Q  168 gatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta 267  Q
    | || ||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  27165329 gttgttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaggttccaaattattggatta 27165230  T
Q  268 tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  27165229 tataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggcttgatgc 27165154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 16454266 - 16454553
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  16454266 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 16454364  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16454365 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 16454462  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16454463 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 16454553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 63 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 8899277 - 8898984
Alignment:
Q  63 tatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 161  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||    
T  8899277 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 8899179  T
Q  162 tatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgt 260  Q
    | ||||| || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8899178 tgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatgaagttccaaattat 8899081  T
Q  261 tggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8899080 tggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctagagcctttgct 8898984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 9513144 - 9512818
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    ||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||| |||    
T  9513144 agaaactaagttgtttaccttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttttata--------tacattaaatg 9513053  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
     | |||  ||||||  ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  9513052 gattatg-ttgataaatgagatgttgat----tgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaag 9512958  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgc 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| | ||| | |||||| |||||||| || | ||||||||    
T  9512957 ctgcatgagtcggtctaagatgat---gatgatgatgttccaaattattggact-tataagatgatgttgttttaagttgttaagatgttgtgtccatgc 9512862  T
Q  313 attagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9512861 attagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 9512818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 13151775 - 13152063
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  13151775 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 13151873  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat 265  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13151874 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggat 13151971  T
Q  266 tatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13151972 tatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 13152063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 13154240 - 13154528
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  13154240 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 13154338  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat 265  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13154339 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggat 13154436  T
Q  266 tatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13154437 tatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 13154528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 72 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14234665 - 14234375
Alignment:
Q  72 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg 171  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14234665 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg 14234566  T
Q  172 atttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat-----t 266  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||     |    
T  14234565 atttgcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattggatatatat 14234466  T
Q  267 atataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||| ||||||| | || ||||| ||||||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14234465 atataaaaggttgttgtttataagaagttaagttattgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccttggagcctttgct 14234375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 16282796 - 16283083
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| |||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  16282796 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcat 16282894  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  16282895 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgataaagttccaaattattggatt 16282992  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16282993 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcattttattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 16283083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 28848596 - 28848883
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  28848596 ttgatgttgtt-atactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 28848694  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28848695 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 28848792  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28848793 atataagaggttgttgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 28848883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 45606892 - 45607179
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  45606892 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 45606990  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45606991 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 45607088  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45607089 atataagaggttgtcgatttaagatattacgaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 45607179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 9521119 - 9520793
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    ||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||        ||||||| |||    
T  9521119 agaaactaagttgtttaccttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgtgttata--------tacattaaatg 9521028  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
     | |||  ||||||  ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  9521027 gattatg-ttgataaatgagatgttgat----tgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaag 9520933  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgc 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| | ||| | | ||||||||||||| || | ||||||||    
T  9520932 ctgcatgagtcggtctaagatgat---gatgatgatgttccaaattattggact-tataagatgatgttgttctaagatgttaagatgttgtgtccatgc 9520837  T
Q  313 attagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9520836 attagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 9520793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14973036 - 14972746
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||| |||||| |||| ||| | || |||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  14973036 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcat 14972937  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | ||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14972936 gctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggatt 14972838  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  14972837 atataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggattgatgtcctggagcctttgct 14972746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 89 - 357
Target Start/End: Original strand, 29172587 - 29172856
Alignment:
Q  89 atataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacct 186  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | |    
T  29172587 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 29172685  T
Q  187 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgattt 286  Q
     ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29172686 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtttcaaattattggattatataagaggttgtcgattt 29172784  T
Q  287 aagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29172785 aagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 29172856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 9707592 - 9707879
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||    
T  9707592 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcat 9707690  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | ||||| | | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9707691 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 9707788  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9707789 atacaagagtttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 9707879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 32307904 - 32307575
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||        |||||||||||| |||    
T  32307904 agaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttctagtaagactgatgcttatgaattaatgttgtttataatgtt--------gtatatacattaaatg 32307813  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
     | |||  |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32307812 gattatg-ttgataattgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 32307715  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||| ||||| | ||||||| | ||| | | |||| |||||||| ||   ||||||||    
T  32307714 ctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgttgttccaaattattggact-tataagatgatgttgttctaagttgttaagatgttatgtccatgc 32307619  T
Q  313 attagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32307618 attagca-ttcactattgggggcttgatgccctggagcctttgct 32307575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 197 - 358
Target Start/End: Original strand, 45577950 - 45578111
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45577950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattaa 45578049  T
Q  297 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctt 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  45578050 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagtctttgctt 45578111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 197 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 55500992 - 55500832
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  55500992 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattac 55500893  T
Q  297 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55500892 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 55500832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 17446640 - 17446926
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||  ||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  17446640 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 17446738  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17446739 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcg-tctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 17446835  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17446836 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagcccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 17446926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 124 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 36166719 - 36166487
Alignment:
Q  124 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||| | | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36166719 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 36166622  T
Q  224 ggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcattt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  36166621 ggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaagtattggattatataagaggttgtcgatttaagaagttaaagaggccgagttcatgcattagcattt 36166522  T
Q  323 cattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36166521 cattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 36166487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Original strand, 49667969 - 49668299
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |        |||||||| ||| |||    
T  49667969 agaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactgatgcatatgagttgatgttgtatataatgct--------gtatatactttaaatg 49668060  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgtt-gatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaa 211  Q
     | |||  ||||||  ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49668061 gattatg-ttgataaatgagatgtttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa 49668158  T
Q  212 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatg 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| | ||| | | |||| |||||||| || | |||||||    
T  49668159 gctgcatgagtcggtctaagatgat---gatgatgatgttccaaattattggact-tataagatgatgttgttctaagttgttaagatgttgtgtccatg 49668254  T
Q  312 cattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49668255 cattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 49668299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 64 - 350
Target Start/End: Original strand, 24340657 - 24340946
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 162  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||    
T  24340657 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattat 24340756  T
Q  163 atcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttg 262  Q
    ||||||||| | |||||||| | ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||| |||||||||| |||    
T  24340757 atcatgatgttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattg 24340856  T
Q  263 gatta-tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    || || |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  24340857 gactattataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagtgttgggggcttgatgccctggagc 24340946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 72 - 324
Target Start/End: Original strand, 53301492 - 53301747
Alignment:
Q  72 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtat-tattgatatttgagatgttga-tgacttgcattcgatattgttatatcatga 169  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||   | ||| |||| ||| |||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  53301492 atgttgtttatattgtgatataattgtatacgtaatacttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgt 53301591  T
Q  170 tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattata 269  Q
    || ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  53301592 tgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaggttccaaattattggattata 53301691  T
Q  270 taagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 324  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53301692 taagaggttgttgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttca 53301747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 10247708 - 10247995
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  10247708 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 10247806  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | || || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10247807 gctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 10247904  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10247905 atacaagaggttgtcgatttaagatattacgaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 10247995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Original strand, 11424702 - 11424981
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||  ||||  |||||| |||| ||| | || ||| |||||||||||||   ||||  | ||||||||||| ||||    
T  11424702 ttgaagttgtttatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgagatgttgat---ttgctattgatattgttatgtcat 11424798  T
Q  168 gatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta 267  Q
    | || |||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  11424799 gctgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggatta 11424897  T
Q  268 tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11424898 tataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 11424981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 69 - 354
Target Start/End: Original strand, 7781332 - 7781617
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  7781332 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcat 7781430  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7781431 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 7781528  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc-gggagccttt 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  7781529 atataagaggttgtcgatttaagatattacgaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgagggcttgatgccctgggagccttt 7781617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 17488038 - 17487755
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||| |||||| ||||| ||  |||| ||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||    
T  17488038 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcat 17487939  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||  |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17487938 gctgtttttgtatactgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggatt 17487840  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17487839 atataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 17487755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 128 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 15977633 - 15977402
Alignment:
Q  128 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 226  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977633 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 15977536  T
Q  227 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcga---tttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977535 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatacaagaggttgtcgattttttaagatattaagaggtcgagtccatgcattagcatttc 15977436  T
Q  324 attgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15977435 attgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 15977402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 38961876 - 38962164
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  38961876 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 38961974  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  38961975 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatgaagttccaaattattggatt 38962072  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38962073 atataagaggttgtcgatttaagatgtttaagagatcgagtctatgcattagcattacattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 38962164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 124 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 21618570 - 21618338
Alignment:
Q  124 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||   | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21618570 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 21618473  T
Q  224 ggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 322  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21618472 ggtctaagttgattgagaagatgaagttccaaagtattggattatataagaggttgtcgatttaagaagtttaagaggtcgagttcatgcattagcattt 21618373  T
Q  323 cattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21618372 cattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 21618338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 69 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26687069 - 26686792
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| ||||  ||| |||||||  ||| | |||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  26687069 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 26686970  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  26686969 gctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagaagatgatgatgttccaaattattggact 26686871  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 344  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26686870 atataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 26686792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 6469119 - 6469402
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| | || |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  6469119 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 6469217  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6469218 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 6469315  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6469316 atataagaggttgtcgatttaag----taagaggtcgagtccatgcattagcatgtcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 6469402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 13442456 - 13442173
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||| | |||||| ||||| ||  |||| ||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||    
T  13442456 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcat 13442357  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13442356 gttgtttttgtatactgcctatgttgccgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggatt 13442258  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13442257 atataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaatatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 13442173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 17499520 - 17499237
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| || | |||| |||||||  ||||| |||||| ||||| ||  |||| ||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||    
T  17499520 ttgatgttgattttgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcat 17499421  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||  |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17499420 gctgtttttgtatactgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggatt 17499322  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17499321 atataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 17499237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 128 - 350
Target Start/End: Original strand, 25476384 - 25476607
Alignment:
Q  128 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  25476384 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgtt-gttttttaactaagctacatgagtcggt 25476482  T
Q  227 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 325  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476483 ctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 25476582  T
Q  326 tgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||    
T  25476583 tgttgggggtttgatgccctggagc 25476607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 43841114 - 43840831
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| ||||  ||| |||||||  ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  43841114 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 43841015  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  43841014 gctgtttttgtatactgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaagataatgatgttccaaattattggatt 43840916  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43840915 atataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 43840831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 124 - 343
Target Start/End: Original strand, 23083356 - 23083576
Alignment:
Q  124 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 222  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||  || ||| | ||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  23083356 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagt 23083454  T
Q  223 cggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23083455 cggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 23083554  T
Q  322 tcattgttgggggcttgatgcc 343  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  23083555 tcattgttgggggtttgatgcc 23083576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 41124064 - 41123780
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  41124064 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 41123966  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  41123965 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgttgtt----atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgataaagttccaaattattggatt 41123871  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  41123870 atataaaaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgaatccatgcattagcatttcattgatggggccttaatgccctggagcctttgct 41123780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 128 - 350
Target Start/End: Original strand, 40213720 - 40213942
Alignment:
Q  128 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| || || ||||| | | ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  40213720 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactgc-tgtgttgatgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggt 40213817  T
Q  227 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213818 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 40213917  T
Q  326 tgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||| |  ||||||||| || |||||    
T  40213918 tgtggatggcttgatgtcctggagc 40213942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Original strand, 1644568 - 1644896
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| |||    
T  1644568 agaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgtt--------gtatatacattaaatg 1644659  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
     | |||  |||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1644660 gattatg-ttgataattgagatattgttga-ttgtattcgatattgttatataatgatgatttgcatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaag 1644756  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgc 312  Q
    |  ||| ||| |||||||||||||   || ||||  |||||||||| ||||| | ||||||| | ||| | | |||| |||||||| || | ||||||||    
T  1644757 caacataagttggtctaagttgat---gacgatgttgttccaaattattggact-tataagatgatgttgttctaagttgttaagatgttgtgtccatgc 1644852  T
Q  313 attagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  1644853 attagca-ttcattgttaggggcttgatgccctagagcctttgct 1644896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 131 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 18438653 - 18438432
Alignment:
Q  131 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 229  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18438653 agatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtcta 18438555  T
Q  230 agttgattaagatgatgaagttc-caaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 327  Q
    ||||||| |||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18438554 agttgatgaagatgatgatgttttcaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattg 18438455  T
Q  328 ttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||| |||||||||||| |||||    
T  18438454 ttggaggcttgatgccctggagc 18438432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 68 - 357
Target Start/End: Original strand, 52523665 - 52523953
Alignment:
Q  68 attgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtat-tattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatca 166  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| |||  || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  52523665 attgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatca 52523764  T
Q  167 tga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga 264  Q
    |||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||| |||   |||||||||| |||||    
T  52523765 tgaactgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga--cagaagat---gttccaaattattgga 52523859  T
Q  265 -ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
     ||||||||||| ||||   || ||||||||| ||  || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  52523860 tttatataagagtttgttatttctaagatgttgagttgttgagtccatgcattaaca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcccttgct 52523953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 131 - 350
Target Start/End: Original strand, 20698437 - 20698658
Alignment:
Q  131 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 229  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| |||  ||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698437 agatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20698535  T
Q  230 agttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 327  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698536 agttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcattg 20698635  T
Q  328 ttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||| ||| |||||    
T  20698636 ttgggggcttgattccctggagc 20698658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 63 - 343
Target Start/End: Original strand, 43550457 - 43550739
Alignment:
Q  63 tatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 161  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||    
T  43550457 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 43550555  T
Q  162 tatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgt 260  Q
    | ||||| || ||| ||||||| | ||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||| |||||||||| |    
T  43550556 tgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtca-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgttccaaattat 43550654  T
Q  261 tggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg--ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcc 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43550655 tggattaatataagaggttgtcgaattaagatgttttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgcc 43550739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 197 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 10557035 - 10556882
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10557035 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattgaattatataagaggttgtcgatttaagatgttta 10556936  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggag 349  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||| ||||    
T  10556935 agaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggcttgatgccctggag 10556882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 124 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12399335 - 12399108
Alignment:
Q  124 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 222  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12399335 atatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 12399237  T
Q  223 cggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcat 320  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  12399236 cggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca- 12399138  T
Q  321 ttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  12399137 ttcattgttggtggcttgatgccctggagc 12399108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 64 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23274874 - 23274585
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 162  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||| |||| |||   ||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||    
T  23274874 atgatttgatgttgtttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattat 23274775  T
Q  163 atcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttg 262  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||     |||||| ||| ||| |||| | |||    
T  23274774 atcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagtcatcgaagatgttgatgtttcaaagtattg 23274675  T
Q  263 gatta-tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    || || ||||| |||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  23274674 gactattataaaaggttgtcaaattaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagtgttgggggcttgatgccctggagc 23274585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 357
Target Start/End: Original strand, 37251049 - 37251392
Alignment:
Q  11 taagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||   |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  37251049 taagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagtctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaca 37251148  T
Q  111 tgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaac 208  Q
    |||| ||||  ||||  ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  ||||| ||||||||| ||||||||  |||||    
T  37251149 tgaattatttatgat-gttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaac 37251247  T
Q  209 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttg-tcgatttaagatgttaagaggtcgagt 306  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||     || ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| | |   | ||||||||||||  || ||||    
T  37251248 taagctgcatgactcggtctaagatg-----gaagatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcgatttttctaagatgttaagttgttgagt 37251342  T
Q  307 ccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||   || |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  37251343 ccatgcatactca-ttcattgtcgggggcttgatgccctagagcctttgct 37251392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 197 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8499568 - 8499422
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8499568 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaggttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttta 8499469  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  8499468 agaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggcttgatgc 8499422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 197 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15412479 - 15412333
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15412479 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaggttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttta 15412380  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  15412379 agaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggcttgatgc 15412333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 69 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 55476668 - 55476417
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  55476668 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 55476570  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55476569 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 55476472  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55476471 atataagaggttgtcga-ttaagatgtttaagaggtcgagtctatgcattagcatt 55476417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 185 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194599
Alignment:
Q  185 ctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgat 284  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaggttccaaattattggattatacaaga-gttgtcgat 28194657  T
Q  285 ttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  28194656 ttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttgggggtttgatgc 28194599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 320
Target Start/End: Original strand, 37642199 - 37642458
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 162  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   |||| ||||||||||||| | |||| | | ||||||| ||||    
T  37642199 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattat 37642298  T
Q  163 atcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttg 262  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| || |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||| ||| |||||||||| |||    
T  37642299 atcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattg 37642398  T
Q  263 gatta-tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcat 320  Q
    || || |||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  37642399 gactattataagaggttgtcgaattaagacgtttaagaagtcgagtccatgcattagcat 37642458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 197 - 342
Target Start/End: Original strand, 12119837 - 12119983
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 295  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12119837 ttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttta 12119936  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    ||| ||  || ||||||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  12119937 agaagtaaaggccatgcattagcatttcagcgataggggcttgatgc 12119983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Original strand, 14576772 - 14577052
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  14576772 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 14576871  T
Q  168 gatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-tt 266  Q
    | || | |  |||||  |||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||   | |||||| |||||||||| ||||| ||    
T  14576872 gctgttgtttatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgaatgagtcggtctaagttgat---gttgatgatgttccaaattattggactt 14576967  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |  |||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14576968 acttaagaggttgttattttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcatttgcatttcatttttgggggcttgatgccctggagc 14577052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 50243005 - 50242728
Alignment:
Q  63 tatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 161  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||    
T  50243005 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattatta 50242907  T
Q  162 tatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgt 260  Q
    | ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  50242906 tgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatgaagttccaaattat 50242809  T
Q  261 tggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||||||||||    
T  50242808 tggattatacaaga-gttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcatcaac-gttctttgttgggggcttgatgc 50242728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 49389514 - 49389639
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49389514 agaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaaatg 49389613  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttg 138  Q
    || |||  |||||| |||||||||||    
T  49389614 aattatgtttgatagttgagatgttg 49389639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 354
Target Start/End: Original strand, 22110233 - 22110573
Alignment:
Q  11 taagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaca 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||    ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||    
T  22110233 taagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatgatttgaagttgttaataatgtgatataaatgtatacgcattaca 22110332  T
Q  111 tgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaac 208  Q
    |||| | |   |||| || |||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |||| ||||||||| ||||||||  |||||    
T  22110333 tgaattctatatgatgtt-gagatgctgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaac 22110431  T
Q  209 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||     | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | || ||||||||||||  || ||||    
T  22110432 taagctgcatgagtcggtctaagatga-----aggatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttctaagatgttaagttgttgagt 22110526  T
Q  307 ccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagccttt 354  Q
    ||||||||   || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22110527 ccatgcatactca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagccttt 22110573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 72 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14572767 - 14572490
Alignment:
Q  72 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 170  Q
    ||||||||||| |||| |||||||  | | | |||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  || | |||||| |||| ||||| |    
T  14572767 atgttgtttatgatgtgatataatgtttttttcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgct 14572668  T
Q  171 gatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttata 269  Q
    | |||| |||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||  |||||||||| ||||| |||      
T  14572667 gttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat---gttgatgttgttccaaattattggacttact 14572572  T
Q  270 taagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14572571 taagaggatgttgttttaagatgtttaagaggtcgagtctatgcatttgcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 14572490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 197 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12511110 - 12510949
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg------atgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaag 289  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||      |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  12511110 ttgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgataatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcaaattaag 12511011  T
Q  290 atgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12511010 atgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 12510949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 197 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 44494859 - 44494715
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  44494859 ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatgaagttctaaattattgaattatacaaga-gttgtcgatttaagatgttta 44494761  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    ||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  44494760 agaagtcgagtccatgcattaaca-ttctttgttgggggcttgatgc 44494715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 197 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17737286 - 17737142
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| || | ||||||||||||||||| |||    
T  17737286 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaagttattggatcatacaata-gttgtcgatttaagatgttta 17737188  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    ||| |||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  17737187 agaagtcgagtctatgcattatca-ttctttgttgggggcttgatgc 17737142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 72 - 319
Target Start/End: Original strand, 22147467 - 22147717
Alignment:
Q  72 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 170  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| |||||||||||||| | |||| | | ||||||| ||||||||||||    
T  22147467 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 22147566  T
Q  171 gatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-ta 269  Q
    | |||||||||  |||| |||| || |  |||  |||||||||||||||| |||||| |||| | | |||||| ||| |||||||||| ||||| || ||    
T  22147567 gttttgcataccgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgactcggtccaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattggactatta 22147666  T
Q  270 taagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagca 319  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22147667 taagaggttgtcgaattaagacgtttaagaagtcgagtccatgcattagca 22147717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 69 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12567737 - 12567479
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  12567737 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 12567639  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg------atgaagttccaaattgt 260  Q
    |||| ||| | ||| | | | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||| |||||||||| |    
T  12567638 gatgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgtttatgatgttccaaattat 12567541  T
Q  261 tggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    |||| ||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567540 tggactatttaagaggtcgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 12567479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 69 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 13544202 - 13543944
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  13544202 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 13544104  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg------atgaagttccaaattgt 260  Q
    |||| ||| | ||| | | | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||| |||||||||| |    
T  13544103 gatgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgataatgatgttccaaattat 13544006  T
Q  261 tggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    |||| ||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544005 tggactatttaagaggtcgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 13543944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 42386592 - 42386316
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||| |||| | |||| ||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  42386592 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcat 42386493  T
Q  168 gatg-atttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | ||  |||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |  |||| |||   |||||||||  |||||||    
T  42386492 gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagtcaa--aagaggat---gttccaaatcattggatt 42386399  T
Q  267 atataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
       |||||||| || |||| ||||||| |        ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42386398 tattaagaggtcgttgattctaagatgat--------gagtccatgcattagca-tacattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 42386316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 89 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 43926121 - 43925859
Alignment:
Q  89 atataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacct 186  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| | |   |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |||| |||    
T  43926121 atataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatgtactgcct 43926022  T
Q  187 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt 285  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |   |||||||||| ||||| ||||||||||||| |  | ||    
T  43926021 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga--aagatgtt---gttccaaattattggatttatataagaggtcgatgttt 43925927  T
Q  286 -taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagccttt 354  Q
     ||||||| ||||  || ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  43925926 ctaagatg-taagttgttgagtccatgcatactca-ttcattgttgggggcttgatgccctgaagccttt 43925859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 197 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 30029893 - 30029731
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg------atgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaaga 290  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||      |||| |||||||||| ||||| |||| ||||||| || || ||||||    
T  30029893 ttgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgaatgagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatacaagaggtcgttgaattaaga 30029794  T
Q  291 tgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcat--tgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||    
T  30029793 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcatagtgatgggggcttgatgccctggagc 30029731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 197 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 46822318 - 46822187
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg------atgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaaga 290  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||      |||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| || || ||||||    
T  46822318 ttgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgttccaaattattggactatttaagaggtcgttgaattaaga 46822219  T
Q  291 tgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46822218 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 46822187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 128 - 357
Target Start/End: Original strand, 606324 - 606549
Alignment:
Q  128 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 225  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||   | || ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  606324 ttgagatgttgttgaattgcatt-gatattgttatatcatgaactgatttatgtgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 606422  T
Q  226 tctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 324  Q
    | |||| |||     ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |  | | ||||||| |||   || ||||||||||||   || | ||    
T  606423 tataagatga-----atgatgatgttccaaattgttggatttatataagaggtcgatgttctaagatgctaatttgtagagtccatgcatactca-taca 606516  T
Q  325 ttgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  606517 ttgttgggggcttgatgccctggagccattgct 606549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Original strand, 12934196 - 12934268
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataat 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12934196 agaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataat 12934268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 68 - 188
Target Start/End: Original strand, 2051137 - 2051260
Alignment:
Q  68 attgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtat-tattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatca 166  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| |||  || |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2051137 attgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatca 2051236  T
Q  167 tga--tgatttgcatactacctat 188  Q
    |||  || |||||||||| |||||    
T  2051237 tgaactgttttgcatactgcctat 2051260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 128 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17672744 - 17672626
Alignment:
Q  128 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 226  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672744 ttgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 17672647  T
Q  227 ctaagttgattaagatgatga 247  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  17672646 ctaagttgattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 138
Target Start/End: Original strand, 1465354 - 1465419
Alignment:
Q  72 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttg 138  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  1465354 atgttgatgataatgttatacaattgtatatacattacatgaatta-tgttgatatttgagatgttg 1465419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 19776107 - 19775998
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  19776107 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 19776008  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  19776007 t-atgatgatt 19775998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Original strand, 37439403 - 37439512
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  37439403 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 37439502  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  37439503 t-atgatgatt 37439512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 43927372 - 43927291
Alignment:
Q  11 taagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatat 92  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  43927372 taagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatat 43927291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 53070633 - 53070799
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 162  Q
    |||| ||||||||||| | | ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  53070633 atgatttgatgttgtt-agattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 53070731  T
Q  163 atcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 231  Q
     || || || ||| | |||||   ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070732 gtcttgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 134 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12378039 - 12377940
Alignment:
Q  134 tgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 231  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  |  |||  ||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12378039 tgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctattttatatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaag 12377940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Original strand, 4107164 - 4107273
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  || ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  4107164 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 4107263  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  4107264 t-atgatgatt 4107273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Original strand, 4111016 - 4111125
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  || ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  4111016 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 4111115  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  4111116 t-atgatgatt 4111125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 350
Target Start/End: Original strand, 10542621 - 10542663
Alignment:
Q  308 catgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10542621 catgcattatcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 10542663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15965311 - 15965202
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  || ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  15965311 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 15965212  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  15965211 t-atgatgatt 15965202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15969235 - 15969126
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  || ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  15969235 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 15969136  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  15969135 t-atgatgatt 15969126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15973159 - 15973050
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  || ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  15973159 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 15973060  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  15973059 t-atgatgatt 15973050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Original strand, 16749761 - 16749870
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||  || ||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  16749761 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattaagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 16749860  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  16749861 t-atgatgatt 16749870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 14501293 - 14501198
Alignment:
Q  79 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaagt-attattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  || |||||| | || ||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  14501293 ttataatgttatataattggatatatgttgcatgaaattatgattgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 14501198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Original strand, 8489232 - 8489341
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| |||||| |||  |||||  |||||||||||||||| || ||| |  |||||||||    
T  8489232 atgatttgatgatatttataatgttatatatttagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgtatttgtaattgttata 8489331  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  8489332 t-atgatgatt 8489341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14665450 - 14665400
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 247  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||||||||||||||    
T  14665450 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatga 14665400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14668606 - 14668556
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 247  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||||||||||||||    
T  14668606 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatga 14668556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 856189 - 856140
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 246  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  856189 ttgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Original strand, 12852300 - 12852413
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattg----tatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgt 159  Q
    |||| |||||| | ||| ||||||||||||||||    |||||| ||| |||||| |||  |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||    
T  12852300 atgatttgatgatttttttaatgttatataattggatatatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgt 12852399  T
Q  160 tatatcatgatgatt 174  Q
    ||||| |||||||||    
T  12852400 tatat-atgatgatt 12852413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Original strand, 15878119 - 15878168
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 246  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  15878119 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 149
Target Start/End: Original strand, 23413186 - 23413271
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcat 149  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||  || ||||| ||| |||||| |||  |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  23413186 atgatttgatgatatttataatgttatatagatggatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcat 23413271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 198 - 246
Target Start/End: Original strand, 26196500 - 26196548
Alignment:
Q  198 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 246  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  26196500 tgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 26196548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 45797337 - 45797242
Alignment:
Q  79 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaagt-attattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 174  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||  || |||||| | || ||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  45797337 ttataatgttatatagttggatatatgttgcatgaaattatgattgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 45797242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Original strand, 10425 - 10752
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10425 agaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 10524  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10525 aattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 10624  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatg 311  Q
    |||||| |||||||||||||||   |||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | | |||| |||||||| || | |||||||    
T  10625 ctgcataagtcggtctaagttg---aagatggtgatgttccaaattattggacttatataagaggttgttgttctaagttgttaagatgttgtgtccatg 10721  T
Q  312 cattagcatttcattgttgggggcttgatgcc 343  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  10722 catttgca-ttcatcgttgggggcttgatgcc 10752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 71)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 21565779 - 21565438
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21565779 agaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttctagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 21565680  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    || |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  21565679 aattatgtttgatatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttggatactgcctatgttgctatttgttatttaactaag 21565580  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatg 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| | |||| |||||||| || | | |||||    
T  21565579 ctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggacttatttaagaggttgtcgttctaagttgttaagatgttgtgaccatg 21565483  T
Q  312 cattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  21565482 cattagca-ttcattgttgggggcttgacgccctggagcccttgct 21565438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 19669134 - 19668795
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaat--tgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaca 110  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19669134 agaaactaagtcgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaatattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaca 19669035  T
Q  111 tgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaacta 210  Q
     ||  |||  |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  19669034 ggacttatgtttgatatttgagttgttgat---ttgcattcgatattgttatatcacgatgatttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactg 19668938  T
Q  211 agctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtcca 309  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| | | |||| |||||||| || | |||||    
T  19668937 agctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgttccaaattattggacttatttaagaggttgttgttctaagttgttaagatgttgtgtcca 19668838  T
Q  310 tgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 353  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  19668837 tgcattagca-ttcattcttgggggcttgatgccctagagcctt 19668795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Original strand, 19660722 - 19661050
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19660722 agaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatg 19660821  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    |  ||   |||||| ||||| |||||||   ||  |||||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19660822 acttaagtttgataattgagttgttgat---ttatattcgatatcattatatcaagatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 19660918  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccat 310  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||    
T  19660919 ctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggttgagtccat 19661018  T
Q  311 gcattagcatttcattgttgggggcttgatgcc 343  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19661019 gcattagca-ttcattgttgggggcttgatgcc 19661050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Original strand, 22959421 - 22959755
Alignment:
Q  15 aaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaa 114  Q
    |||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22959421 aaaccaagttgtttatcttgttgtttttgttccagtaagactgatgcatatgaatcaatgttggttaaaatgttatataattgtatatacattacatgac 22959520  T
Q  115 gtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagct 214  Q
     |||  |||||||||||| |||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22959521 ttatgtttgatatttgagttgttgat---ttgcattcaatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct 22959617  T
Q  215 gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| | ||| | | |||| |||||||| || | ||||||||||    
T  22959618 gcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggact-tataagatgatgttgttctaagttgttaagatgttgtgtccatgcat 22959713  T
Q  315 tagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  22959714 tagca-ttcattgttgggggcttgatgcccttgagcccttgct 22959755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Original strand, 21329374 - 21329715
Alignment:
Q  6 agagataagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatataca 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21329374 agaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatataca 21329473  T
Q  106 ttacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttattt 205  Q
    ||||||||| |||  ||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  21329474 ttacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttattt 21329573  T
Q  206 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcga 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||   | ||||| ||| ||  || |     
T  21329574 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattgaatttatataagaggttgt---tctaagaggttgagttgttgt 21329670  T
Q  305 gtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21329671 gtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 21329715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 124 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22412309 - 22412076
Alignment:
Q  124 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||    
T  22412309 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttatc-gttatttaactaagctacatgagtc 22412211  T
Q  224 ggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22412210 ggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 22412111  T
Q  323 cattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22412110 cattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 22412076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Original strand, 21502041 - 21502382
Alignment:
Q  15 aaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21502041 aaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatga 21502140  T
Q  114 agtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagc 213  Q
    | |||  ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  21502141 attatgtttgatgtttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagc 21502240  T
Q  214 tgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||   | ||||| ||| ||  || | ||| ||||    
T  21502241 tgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattgaatttatataagaggttgt--ttctaagaggttgagttgttgtgtcaatgc 21502338  T
Q  313 attagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  21502339 attagca-ttcattgttaagggcttgatgccctggagcctttgct 21502382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 29330111 - 29329824
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  29330111 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 29330013  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  29330012 gttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttcgaaattattggatt 29329915  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29329914 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 29329824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 42245350 - 42245637
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  42245350 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 42245448  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42245449 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 42245546  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42245547 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 42245637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 197 - 357
Target Start/End: Original strand, 2154726 - 2154886
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154726 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 2154825  T
Q  297 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2154826 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 2154886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 32027570 - 32027283
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||    
T  32027570 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcat 32027472  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32027471 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 32027374  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32027373 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 32027283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 354
Target Start/End: Original strand, 26011919 - 26012259
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||   |||| |  ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26011919 agaaactaagttgtttatcttgttattgttgtttcagtaagcctgaactatataatctgatgttgttgttgatgttatataattgtatatacattacatg 26012018  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    || |||  ||||| |||||||||||| ||| |  |||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  26012019 aattatgtttgatgtttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgctttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaag 26012118  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat-tatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||  || | ||||||    
T  26012119 ctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgttccaaattattggatatatataagaggttgttgtttataagaggttaagttgttgtgtccat 26012216  T
Q  311 gcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagccttt 354  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  26012217 gcattagca-ttcattgttgggggtttgatgccctggagccttt 26012259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 264753 - 265040
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  264753 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 264851  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  264852 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 264949  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  264950 atataagaggttgttgatttaagatattacgaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 265040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 89 - 357
Target Start/End: Original strand, 10732944 - 10733212
Alignment:
Q  89 atataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacct 186  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||   |    
T  10732944 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 10733042  T
Q  187 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgattt 286  Q
     ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10733043 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgattt 10733141  T
Q  287 aagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  10733142 aagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccttgagcttttgct 10733212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 20909189 - 20908902
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  20909189 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 20909091  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20909090 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 20908993  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20908992 atataagaggttgttgatttaagatattacgaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 20908902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 197 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 39245186 - 39245026
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  39245186 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatactaa 39245087  T
Q  297 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39245086 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 39245026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 29346157 - 29345870
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  29346157 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 29346059  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | || || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29346058 gctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 29345961  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29345960 atataagaggttgtcgatttaagatattacgaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 29345870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 131 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 24529339 - 24529119
Alignment:
Q  131 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 229  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||  |||| ||||| || ||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529339 agatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 24529241  T
Q  230 agttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 328  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24529240 agttgatgaagatgatgaagttccaaattattggattatataagagtttgtcgatttaagatgtttaagaggttgagtccatgcattagcatttcattgt 24529141  T
Q  329 tgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  24529140 tgggggcttgatgccctggagc 24529119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 69 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 1096649 - 1096362
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||| |||||| |||| ||| | || |||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| |||| | ||    
T  1096649 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttat 1096550  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtt-ccaaattgttggat 265  Q
    | || ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||| ||||||    
T  1096549 gttgtttttgcatactacctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgttgatgtttccaaattattggat 1096451  T
Q  266 tatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 353  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1096450 tatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt 1096362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 199 - 357
Target Start/End: Original strand, 10775790 - 10775949
Alignment:
Q  199 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaag 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10775790 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaag 10775889  T
Q  298 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10775890 aggtcgagtccatgcattagcattacattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 10775949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 142 - 350
Target Start/End: Original strand, 21997547 - 21997756
Alignment:
Q  142 acttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 240  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21997547 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 21997645  T
Q  241 atgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttga 339  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21997646 atgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttga 21997745  T
Q  340 tgcccgggagc 350  Q
    ||||| |||||    
T  21997746 tgccctggagc 21997756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 29348630 - 29348343
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  29348630 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 29348532  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | || || ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29348531 gctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgttc-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 29348434  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29348433 atataagaggttgtcgatttaagatattacgaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 29348343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 29351103 - 29350816
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  29351103 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 29351005  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | || || ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29351004 gctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgttc-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 29350907  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29350906 atataagaggttgtcgatttaagatattacgaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccaggagcctttgct 29350816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 68 - 357
Target Start/End: Original strand, 11581183 - 11581472
Alignment:
Q  68 attgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatca 166  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||   ||| || |||||| |||  ||||||||||| |||||| |||| |||    
T  11581183 attgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtca 11581281  T
Q  167 tgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat 265  Q
    || || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11581282 tgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggat 11581379  T
Q  266 tatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  11581380 tatataagaggttttcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgacttagcatttcattgttgggggcttgatgcccttgagcctttgct 11581472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 197 - 357
Target Start/End: Original strand, 20918060 - 20918219
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918060 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaactattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 20918159  T
Q  297 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20918160 gaggtcgagt-catgcattagcatttcagtgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 20918219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Original strand, 23390435 - 23390718
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||| | |||||| ||||| ||  |||| ||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||    
T  23390435 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcat 23390534  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23390535 gttgtttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggatt 23390633  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23390634 atataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 23390718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 24493750 - 24493467
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||| | ||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  24493750 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 24493651  T
Q  168 gatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtt-ccaaattgttggatt 266  Q
    | || |||| ||||| ||||||||| | || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  24493650 gctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtttccaaattattggatt 24493552  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24493551 atataagaggttgtcgaaataagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 24493467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25421714 - 25421430
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  25421714 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcat 25421615  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtt-ccaaattgttggat 265  Q
    | || ||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| || ||||||    
T  25421614 gttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtttccaatttattggat 25421516  T
Q  266 tatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  25421515 tatataagaggttgtcgaattatgatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggctttatgccctggagc 25421430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 13025492 - 13025209
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||  |||| |||||||  ||| |||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||   ||| ||||    
T  13025492 ttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcat 13025393  T
Q  168 gatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtt-ccaaattgttggatt 266  Q
    | || |||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  13025392 gctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtttccaaattattggatt 13025294  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  13025293 atataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcaagtccatgcattagcatttcactgttgggggcttgatgccctggagc 13025209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 13095676 - 13095393
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||  |||| |||||||  ||| |||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||   ||| ||||    
T  13095676 ttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcat 13095577  T
Q  168 gatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtt-ccaaattgttggatt 266  Q
    | || |||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  13095576 gctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtttccaaattattggatt 13095478  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  13095477 atataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcaagtccatgcattagcatttcactgttgggggcttgatgccctggagc 13095393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 128 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 9078074 - 9077848
Alignment:
Q  128 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 226  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  9078074 ttgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgggtcagt 9077976  T
Q  227 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 325  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9077975 ctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgttgttctaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 9077876  T
Q  326 tgttgggggcttgatgcccgggagcctt 353  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9077875 tgttgggggcttgatgccctggagcctt 9077848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 357
Target Start/End: Original strand, 20026817 - 20027165
Alignment:
Q  6 agagataagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatataca 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||| ||||   |||||  || |||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  20026817 agaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgtagttgtttcagtaagcctgaattatatgttttaatgttgttgataatgctatatagttgtatataca 20026916  T
Q  106 ttacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttat 203  Q
    ||||||||| |||  |||||  ||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||  || |||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  20026917 ttacatgaattatgtttgat-gttgtgatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttggatactgcctatgttgctgtttgttat 20027015  T
Q  204 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||   ||| |||||| ||||| ||||||||||||| || | || ||||| ||| ||  ||    
T  20027016 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga--aagaagat---gtttcaaattattggatttatataagaggtcgttgtttataagaggttgagttgt 20027110  T
Q  302 cgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20027111 tgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 20027165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 64 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22144236 - 22143943
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtat-tattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 162  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| |||  || |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||    
T  22144236 atgaattgatgttgtttacaatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttat 22144137  T
Q  163 atcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttg 262  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||   |||||||||| |||    
T  22144136 atcatgttgttttgcatactacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga--aagaagat---gttccaaattattg 22144042  T
Q  263 gat---tatataagaggttgtcgatttaagatgttaag-aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctt 358  Q
    |||   ||||||||||||||| | | |||| |||| ||  | | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  22144041 gatatatatataagaggttgttgttctaagttgttgagttgtttgagtccatgcattagca-ttcattgttgagggcttgatgccctggagcctttgctt 22143943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Original strand, 8286781 - 8287066
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||| | |||||| ||||| ||  ||||| |||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||    
T  8286781 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcat 8286880  T
Q  168 gatgattt--gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga- 264  Q
    | || |||  | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||     
T  8286881 gctgttttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattactggac 8286979  T
Q  265 ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    | ||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8286980 taatataagtggttgtcgaattatgatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 8287066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25431576 - 25431293
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||| | |||||| |||||||| |||||  |||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  25431576 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 25431477  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtt-ccaaattgttggat 265  Q
    | || ||| | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||| || ||||||    
T  25431476 gttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtctaattt-atgaagatgatgatgtttccaatttattggat 25431379  T
Q  266 tatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  25431378 tatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatggcctggagc 25431293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 149 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 36314678 - 36314504
Alignment:
Q  149 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaa 248  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||     
T  36314678 ttcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 36314579  T
Q  249 gttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314578 gttccaaattattggattaatataagaggtcgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 36314504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 79 - 352
Target Start/End: Original strand, 36154777 - 36155049
Alignment:
Q  79 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 176  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |    
T  36154777 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 36154876  T
Q  177 catactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagagg 276  Q
     ||||| | | |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  36154877 tatactgc-tgtgttgttgt----tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatacaagagt 36154971  T
Q  277 ttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc-gggagcct 352  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  36154972 ttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacattttaaagttgagggcttgatgccctgggagcct 36155049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 69 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 39363561 - 39363310
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  39363561 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 39363463  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39363462 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 39363365  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363364 atataagaggttgtcga-ttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 39363310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 124 - 343
Target Start/End: Original strand, 21808384 - 21808604
Alignment:
Q  124 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 222  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21808384 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 21808482  T
Q  223 cggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcat 320  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||      
T  21808483 cggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagc-c 21808581  T
Q  321 ttcattgttgggggcttgatgcc 343  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  21808582 ttcattgttgggggcttgatgcc 21808604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 197 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23064561 - 23064415
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23064561 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatggggttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttta 23064462  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  23064461 agaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggcttgatgc 23064415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 357
Target Start/End: Original strand, 22178101 - 22178444
Alignment:
Q  11 taagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaca 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||  || |   |||||| | ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  22178101 taagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaaacctaaattatatgattggatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaca 22178200  T
Q  111 tgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaac 208  Q
    |||| |||   |||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||  || |||  ||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  22178201 tgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaac 22178300  T
Q  209 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtc 307  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |   |||||||||| ||||||| ||||||||||| |  | || |||||||||||  || |||||    
T  22178301 taagttgcatgagtcggtctaagatga--aagatgtt---gttccaaattattggattgatataagaggtcgatgtttcaagatgttaagttgttgagtc 22178395  T
Q  308 catgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||   || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22178396 catgcatactca-ttcattgttgggggcttgatgccctagagcctttgct 22178444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 128 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 38619553 - 38619337
Alignment:
Q  128 ttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 225  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38619553 ttgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 38619456  T
Q  226 tctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagag---gtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||    
T  38619455 tctaagttgattaagatgatgaggttccaaattatttgattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaattagtcgagtccatgcattagcatt 38619356  T
Q  322 tcattgttgggggcttgat 340  Q
    ||| || | ||||||||||    
T  38619355 tcagtgataggggcttgat 38619337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 197 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31061118 - 31060974
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 295  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  31061118 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatacaaga-gttgtcgatttaagatgttta 31061020  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  31061019 agaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttgggagcttgatgc 31060974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 40726040 - 40725782
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 162  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| |||||||||||||| | |||| | | ||||||| ||||    
T  40726040 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattat 40725941  T
Q  163 atcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttg 262  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |||| || |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||| ||| |||||||||| |||    
T  40725940 atcatgatgctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattg 40725841  T
Q  263 gatta-tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagca 319  Q
    || || |||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  40725840 gactattataagaggttgtcgaattaagacgtttaagaagtcgagtccatgcattagca 40725782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 124 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22075145 - 22074919
Alignment:
Q  124 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 222  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22075145 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgaatgagt 22075047  T
Q  223 cggtctaagttgattaag-atgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagca 319  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22075046 cggtctaagttgttgaagaatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaat--agatgcttaagaggtcgagtccatgcattagca 22074949  T
Q  320 tttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22074948 -ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 22074919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 124 - 343
Target Start/End: Original strand, 21729059 - 21729280
Alignment:
Q  124 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 222  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21729059 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 21729157  T
Q  223 cggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcat 320  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||      
T  21729158 cggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagttcatgcattagc-c 21729256  T
Q  321 ttcattgtt-gggggcttgatgcc 343  Q
     |||||||| ||||||||||||||    
T  21729257 gtcattgttggggggcttgatgcc 21729280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 197 - 342
Target Start/End: Original strand, 20806854 - 20806998
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 295  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  20806854 ttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatgaatttccaaattattggattatacaaga-gttgtcgatttaagatgttta 20806952  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20806953 agaattcgagtccatgcattagca-ttctttgttgggggcttgatgc 20806998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 178 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 37723975 - 37723802
Alignment:
Q  178 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattata-taagagg 276  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||| |||||||||||||| ||||| || | |||||||    
T  37723975 atactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaagatgttgaagttccaaattattggactaaattaagagg 37723876  T
Q  277 ttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  37723875 ttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcatagttgggggcttgatgccctggagc 37723802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 322
Target Start/End: Original strand, 20901988 - 20902248
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatat--ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 161  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||  |||| |||   ||| ||  |||||| |||| ||||||||| | |||||| |||    
T  20901988 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattatta 20902086  T
Q  162 tatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga-ttaagatgatgaagttccaaattg 259  Q
    | ||||| || ||| | ||||| | | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  20902087 tgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaattaagatgatgaagttccaaatta 20902184  T
Q  260 ttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 322  Q
    ||||| ||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20902185 ttggactatttaagaggttgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatacattagcattt 20902248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 197 - 344
Target Start/End: Original strand, 18319146 - 18319291
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||    
T  18319146 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaa---gatgaagttccaaattattggattatacaagagtttgtcaatttaagatgttta 18319242  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||    
T  18319243 agaggtcgagtccatgcattatcattttaaagttgagggcttgatgccc 18319291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 179 - 350
Target Start/End: Original strand, 21293020 - 21293191
Alignment:
Q  179 tactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggt 277  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||| |||||||||| ||||| | || ||||||||    
T  21293020 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatttaagaggt 21293118  T
Q  278 tgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21293119 tgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgaattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 21293191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 197 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 24067157 - 24067003
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-a 295  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |    
T  24067157 ttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgattaagatga---agttccaaattattggattatacaagagtttgtcaatttaagatgttta 24067061  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc-gggagcct 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  24067060 agaggtcgagtccatgcattagcattttaaagttgagggcttgatgccctgggagcct 24067003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 197 - 321
Target Start/End: Original strand, 17517269 - 17517400
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg------atgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaaga 290  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||      |||| ||| |||||| ||||| ||| |||||||| ||||| ||||||    
T  17517269 ttgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgtttcaaattattggactatttaagaggtcgtcgaattaaga 17517368  T
Q  291 tgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17517369 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 17517400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 204 - 357
Target Start/End: Original strand, 27989004 - 27989153
Alignment:
Q  204 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||     ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |  | || ||||||| ||||  ||    
T  27989004 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga-----atgatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcgatgtttctaagatgctaagttgt 27989098  T
Q  302 cgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
     ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27989099 tgagtccatgcatactca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 27989153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 204 - 357
Target Start/End: Original strand, 26740720 - 26740868
Alignment:
Q  204 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |   |||||||||| ||||| ||||||||||||| |  | || ||||||||||||  ||    
T  26740720 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga--aagatgtt---gttccaaattattggagttatataagaggtcgatgtttctaagatgttaagttgt 26740814  T
Q  302 cgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
     |||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26740815 tgagtccatgcataatca-ttca-tgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 26740868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Original strand, 21871507 - 21871616
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  21871507 atgaattgatgatatttataatgttatataattcgatatatattgcatgaattatgtttgatgcttgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 21871606  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  21871607 t-atgatgatt 21871616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Original strand, 21875787 - 21875896
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  21875787 atgaattgatgatatttataatgttatataattcgatatatattgcatgaattatgtttgatgcttgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 21875886  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  21875887 t-atgatgatt 21875896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 29448192 - 29448085
Alignment:
Q  62 atatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 161  Q
    |||||| ||||||||| | |||| || || || |||||||| ||||||||||| ||    |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  29448192 atatgatttgatgttgataataaggtgatgtatttgtatatgcattacatgaattacgtatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtta 29448093  T
Q  162 tatcatga 169  Q
    ||||||||    
T  29448092 tatcatga 29448085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10753703 - 10753594
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  10753703 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 10753604  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  10753603 t-atgatgatt 10753594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 26704124 - 26704075
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 246  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26704124 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26704075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 26973857 - 26973808
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 246  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26973857 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26973808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 293 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 14048038 - 14047978
Alignment:
Q  293 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc-gggagcct 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14048038 ttaagaggtcgagtccatgcattagcattttaaagttgagggcttgatgccctgggagcct 14047978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 21741486 - 21741541
Alignment:
Q  82 taatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||    
T  21741486 taatgttatataattgtatatacattatatgaatta-tgttgatatttgagatgttg 21741541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 36314728 - 36314685
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatga 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314728 ttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatga 36314685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Original strand, 22120131 - 22120240
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||  |||||||||||||||| | |||| |  |||||||||    
T  22120131 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgttcatttgtaattgttata 22120230  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  22120231 t-atgatgatt 22120240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 316
Target Start/End: Original strand, 22107709 - 22107802
Alignment:
Q  225 gtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcatta 316  Q
    |||||||||  | ||||| |||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||| ||||||||    
T  22107709 gtctaagtttttgaagataatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaagtcgagtctatgcatta 22107802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 18418580 - 18418528
Alignment:
Q  270 taagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    |||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18418580 taagaggtcgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 18418528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18418726 - 18418590
Alignment:
Q  102 tacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgtt 201  Q
    |||||||| |||||| |||||||   || |||||||| ||| |||||   |||||| |||| ||||| || |||| ||||| ||||||||| |||| |||    
T  18418726 tacattacttgaagttttattgaatattaagatgttg-tgaattgcaaatgatattattatgtcatgctg-tttgtatactgcctatgttgatgtt-gtt 18418630  T
Q  202 attt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 240  Q
    |||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18418629 attttaactaagttgcacgagtcagtctaagttgattaag 18418590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 182
Target Start/End: Original strand, 20766115 - 20766173
Alignment:
Q  124 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatact 182  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||    
T  20766115 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatact 20766173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 293 - 342
Target Start/End: Original strand, 41095699 - 41095747
Alignment:
Q  293 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  41095699 ttaagaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttggaggcttgatgc 41095747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 78 - 150
Target Start/End: Original strand, 24767287 - 24767359
Alignment:
Q  78 tttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcatt 150  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  24767287 tttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgatgacgtgcatt 24767359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 13 - 353
Target Start/End: Original strand, 45676 - 46013
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45676 agaaactaagttgtttatattgctgtaattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacatcacatg 45775  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    || |||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  45776 aattatgtttgataattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaag 45875  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatg 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| | | |||| |||||||| || | |||||||    
T  45876 ctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggacttatttaagaggttgttgttctaagttgttaagatgttgtgtccatg 45972  T
Q  312 cattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 353  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45973 cattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt 46013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 13 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 130142 - 129805
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130142 agaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttacaatgttatataattgtatatacattacatg 130043  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  130042 aattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaag 129943  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatg 311  Q
     |||||||||||||||||||||||   ||||| || ||||||||||  |||| |||| ||||||||||| | |  ||| |||||||| || | |||||||    
T  129942 atgcatgagtcggtctaagttgat---gatgaagatgttccaaattaatggacttatttaagaggttgttgttccaagttgttaagatgttgtgtccatg 129846  T
Q  312 cattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 353  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  129845 cattagca-ttcattgttgcaggcttgatgccctggagcctt 129805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 277
Target Start/End: Original strand, 60649 - 60860
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtat-tattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 162  Q
    |||| ||||||||||| || |||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||| |||  || |||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||    
T  60649 atgatttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatattggtat 60747  T
Q  163 atcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgt 260  Q
    |||||||  || |||| ||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||   |||||||||| |    
T  60748 atcatgagctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatga--aagatgat---gttccaaattat 60842  T
Q  261 tgga-ttatataagaggt 277  Q
    |||| |||||||||||||    
T  60843 tggatttatataagaggt 60860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 321 - 357
Target Start/End: Original strand, 117814 - 117850
Alignment:
Q  321 ttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  117814 ttcattgttgggggcttgatgccctagagcctttgct 117850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 87)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 13 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 19652430 - 19652094
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  19652430 agaaactaagttgtttatcttgctgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatactttaaatg 19652331  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
     | |||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19652330 gattatg-ttgatgtttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaag 19652233  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatg 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| | | |||| |||||||| || | |||||||    
T  19652232 ctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggagttatttaagaggttgttgttctaagttgttaagatgttgtgtccatg 19652136  T
Q  312 cattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagccttt 354  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19652135 cattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagccttt 19652094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 350
Target Start/End: Original strand, 28496358 - 28496694
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496358 agaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcatatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatg 28496457  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    |  |||  |||||||||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  28496458 acttatgtttgatatttgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaag 28496554  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaag-ttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccat 310  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  28496555 ctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgtttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccat 28496654  T
Q  311 gcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  28496655 gcattagcatttcattgttggaggcttgatgccctggagc 28496694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 350
Target Start/End: Original strand, 29808769 - 29809105
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29808769 agaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcatatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatg 29808868  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    |  |||  |||||||||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  29808869 acttatgtttgatatttgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaag 29808965  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaag-ttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccat 310  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  29808966 ctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgtttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccat 29809065  T
Q  311 gcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  29809066 gcattagcatttcattgttggaggcttgatgccctggagc 29809105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1561538 - 1561201
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattga-tgttgtttataatgttatataattgtatatacattacat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1561538 agaaactaagttgtttatcttgctgttaatattccagtaagactgatgcatatgaatttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacat 1561439  T
Q  112 gaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaa 211  Q
    ||  |||  |||||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1561438 gacttatgtttgatatttgagttgttgat---ttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaa 1561342  T
Q  212 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg--ttaagaggtcgagtcc 308  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||    
T  1561341 gctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaataattggattaatatacgagattgtcgaattaagttgttttaagaggtcgaatcc 1561242  T
Q  309 atgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1561241 atgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 1561201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 20109385 - 20109032
Alignment:
Q  6 agagataagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataat--tgtatata 103  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  20109385 agaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgatgtctttctagtaagactgatgtatatcaattgatgttgtttataatgtgatataatattgtatata 20109286  T
Q  104 cattacatgaagtat-tattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgtta 202  Q
    |||||| |||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  20109285 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttt 20109186  T
Q  203 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagagg 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| || | || ||||| ||| ||  |    
T  20109185 attaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgttccaaattattgaatttatataagaggtcgttgtttctaagaggttgagttg 20109088  T
Q  301 tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20109087 ttgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcatttgct 20109032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 18334577 - 18334864
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  18334577 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 18334675  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18334676 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 18334773  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18334774 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 18334864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 19005223 - 19004936
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  19005223 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 19005125  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19005124 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 19005027  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19005026 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 19004936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 353
Target Start/End: Original strand, 19303480 - 19303765
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||| |||||||| |||| ||| | || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  19303480 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 19303579  T
Q  168 gatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta 267  Q
    | || |||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  19303580 gttgttttgtatacttcctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgttccaaattattggatta 19303678  T
Q  268 tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19303679 tataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagtatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt 19303765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 24422724 - 24422437
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  24422724 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 24422626  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24422625 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 24422528  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24422527 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 24422437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 33861971 - 33861684
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  33861971 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 33861873  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33861872 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 33861775  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33861774 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 33861684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 69 - 354
Target Start/End: Original strand, 2291165 - 2291449
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  2291165 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 2291263  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2291264 gttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 2291361  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagccttt 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2291362 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagccttt 2291449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 1595726 - 1595439
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  1595726 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcat 1595628  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1595627 gttgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 1595530  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1595529 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 1595439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 19858904 - 19859191
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  19858904 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 19859002  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  19859003 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggact 19859100  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19859101 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 19859191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 26924625 - 26924912
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  26924625 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 26924723  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26924724 gctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 26924821  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26924822 atataagaggttgtcgatttaagatattacgaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 26924912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 33864455 - 33864168
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  33864455 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 33864357  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33864356 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 33864259  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33864258 atataagaggttgtcgatttaagatattaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 33864168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 8055206 - 8054919
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  8055206 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 8055108  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8055107 gctgtttttgtatacttt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 8055010  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8055009 atataagaggttgtcgatttaagatattacgaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 8054919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 23019643 - 23019300
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||   |||| |  | |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23019643 agaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaactatataatctaatgtcgttgttaatgttatataattgtatatacattacatg 23019544  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    || |||  ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||| ||||||||  |||||||||    
T  23019543 aattatgtttgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaag 23019444  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat-tatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccat 310  Q
    |||||| |||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||  || | ||||||    
T  23019443 ctgcataagtcggtctaagatga--aagatgatgatgttccaaattattggatatatataagaggttgttgtttataagaggttaagttgttgtgtccat 23019346  T
Q  311 gcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  23019345 gcattaaca-ttcattgttgggggcttaatgctctggagcctttgct 23019300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 12742494 - 12742207
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  12742494 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 12742396  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12742395 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 12742298  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12742297 atataagaggttgttgatttaagatattacaaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 12742207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 104 - 344
Target Start/End: Original strand, 17287770 - 17288012
Alignment:
Q  104 cattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactacctatgttgttgtttgtt 201  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  17287770 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgtt-gtt 17287868  T
Q  202 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagagg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  17287869 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgccgaattaagatgcttaagagg 17287968  T
Q  301 tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17287969 tcgagtccatgcattagcatttcattgttgtgggcttgatgccc 17288012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 19668611 - 19668272
Alignment:
Q  11 taagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||  |  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19668611 taagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctgatgtatatgatgtagtgttgttgataatgttatatagttgtatatacattaca 19668512  T
Q  111 tgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaac 208  Q
    |||| ||    |||| || | ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  19668511 tgaattacgtatgatgtt-gtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgcatactatctatgttgctgtttgttaattaac 19668413  T
Q  209 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||  || ||||    
T  19668412 taagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgat---gttccaaattattggatttatataagaggtcgttgattctaagatgttaagttgttgagt 19668318  T
Q  307 ccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 353  Q
    ||||||||   || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19668317 ccatgcatactca-ttcattgttgggggcttgatgccttggagcctt 19668272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 197 - 357
Target Start/End: Original strand, 1541023 - 1541183
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  1541023 ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattac 1541122  T
Q  297 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1541123 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccttggagcctttgct 1541183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 69 - 353
Target Start/End: Original strand, 25629294 - 25629580
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||  |||||| |||| ||| | || ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  25629294 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcat 25629393  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | ||||| | | ||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25629394 gctgttttcgtatactgcatgtgttcctgtt-gtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggatt 25629492  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 353  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25629493 atataagaagttttcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt 25629580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 128 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 29060662 - 29060438
Alignment:
Q  128 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29060662 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 29060564  T
Q  227 ctaagttgattaagatgatgaagtt-ccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttca 324  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29060563 ctaagctgatgaagatgatgatgtttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 29060464  T
Q  325 ttgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  29060463 ttgttgggggcttgatgccctggagc 29060438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 63 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22782410 - 22782139
Alignment:
Q  63 tatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 161  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||    
T  22782410 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 22782312  T
Q  162 tatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgt 260  Q
    | ||||| || ||| | ||||| | | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  22782311 tgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaatttccaaattat 22782214  T
Q  261 tggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggggg 334  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782213 tggattatatgagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggggg 22782139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 128 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 20593895 - 20593669
Alignment:
Q  128 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  20593895 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgttt-ttatttaactgagctgcatgattcggt 20593797  T
Q  227 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 325  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20593796 ctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggttgagtccatgcattagcatttcat 20593697  T
Q  326 tgttgggggcttgatgcccgggagcctt 353  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||    
T  20593696 tgctgggggcttgatgccctggagcctt 20593669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 73 - 350
Target Start/End: Original strand, 20360903 - 20361183
Alignment:
Q  73 tgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg 171  Q
    ||||| |||| |||| |||||||  ||||| |||||| ||||| ||  |||| ||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| ||    
T  20360903 tgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 20361002  T
Q  172 attt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-ta 269  Q
     ||| | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  20361003 tttttgtatgctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatgatgttccaaattattggattaata 20361101  T
Q  270 taagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20361102 taagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 20361183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 104 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 20076843 - 20076596
Alignment:
Q  104 cattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgtta 202  Q
    |||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||||   ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||  |||| ||||||||| |||| ||||    
T  20076843 cattacttgaagtataattgaatttttaagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttactgcctatgttgctgtt-gtta 20076748  T
Q  203 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||  |    
T  20076747 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgttgttctaagatgtttaagattt 20076648  T
Q  302 cgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 353  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20076647 tgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt 20076596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 104 - 340
Target Start/End: Original strand, 22780201 - 22780439
Alignment:
Q  104 cattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgtt 201  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||| | || ||| | ||| | |||||||| ||||| |||    
T  22780201 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgtt-gtt 22780299  T
Q  202 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagagg 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  22780300 atttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggtagtcgaattaagatgtttaagagg 22780399  T
Q  301 tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgat 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780400 tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgat 22780439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 128 - 353
Target Start/End: Original strand, 18409826 - 18410056
Alignment:
Q  128 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| ||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18409826 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactgagctgcatgagtcggt 18409924  T
Q  227 ctaagttgattaagatgatgaag----ttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    |||||||||| |||||||||| |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18409925 ctaagttgatgaagatgatgatgatgtttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagttcatgcattatcatt 18410024  T
Q  322 tcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 353  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18410025 tcattgttgggggcttgatgccctggagcctt 18410056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 131 - 350
Target Start/End: Original strand, 20638285 - 20638506
Alignment:
Q  131 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 229  Q
    |||||||||| | ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20638285 agatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtcta 20638383  T
Q  230 agttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 327  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20638384 agttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 20638483  T
Q  328 ttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||| |||| |||||    
T  20638484 ttgggggcttgacgccctggagc 20638506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 63 - 357
Target Start/End: Original strand, 20556873 - 20557165
Alignment:
Q  63 tatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 162  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| ||| |||| |||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  20556873 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaaatt-gagacgttgttgacttgcatttgatattattat 20556970  T
Q  163 atcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgtt 261  Q
      |||| || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20556971 gccatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattatt 20557068  T
Q  262 ggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||    
T  20557069 ggattatataagaggttttcaatttaagatgtttaagtggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgtgggcttgatgtcgtggagcctttgct 20557165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 63 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25754992 - 25754715
Alignment:
Q  63 tatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 161  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||    
T  25754992 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattatta 25754894  T
Q  162 tatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgt 260  Q
    | ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25754893 tgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattat 25754796  T
Q  261 tggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  25754795 tggattatacaaga-gttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttgggggcttgatgc 25754715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 197 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 25688552 - 25688395
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||    
T  25688552 ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagataatgaggttccaaattattggattatataagaggttatcgatttacgatgttta 25688453  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc-gggagcct 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  25688452 agaggtcgagtccatgcattagcatttcaaagttgagggcttgatgccctgggagcct 25688395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 197 - 342
Target Start/End: Original strand, 3852129 - 3852273
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 295  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  3852129 ttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatacaaga-gttgtcgatttaagatgttta 3852227  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  3852228 agaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttgggggcttgatgc 3852273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 64 - 319
Target Start/End: Original strand, 8227445 - 8227703
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 162  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   |||| ||||||||||||| | |||| | | ||||||| ||||    
T  8227445 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattat 8227544  T
Q  163 atcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttg 262  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |||| || |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||| |||||||||| |||    
T  8227545 atcatgatgttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatgttccaaattattg 8227644  T
Q  263 gatta-tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagca 319  Q
    || || |||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  8227645 gactattataagaggttgtcgaattaagacgtttaagaagtcgagtccatgcattagca 8227703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 197 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 25714470 - 25714313
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||    
T  25714470 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgccggtttaatatgttta 25714371  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc-gggagcct 352  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||  |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  25714370 agaggtcgagtccatgcattaacttttcaaagttgagggcttgatgccctgggagcct 25714313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Original strand, 22080623 - 22080952
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacat 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||| || | |  ||||||  | ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  22080623 agaaactaagttgcttatcttgctcttgttgtttcagtaagcctaaattgatatgacctaatgatgttgttaatgttatataaatgtatatacattatat 22080722  T
Q  112 gaagtattattgatatttgagatgttgatgact-tgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaacta 210  Q
     || ||| |  ||| |||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||             ||||||    
T  22080723 taattatgac-gatgtttgagatgttgtt--ctgtgcattcgatattgttatatcatgatgttttgcatactgcctatgtt-------------taacta 22080806  T
Q  211 agctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtcca 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||  |  | |||||    
T  22080807 agctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgttccaaattattggacttatataagaggttgttgttttaag-tgttaagttgatgtgtcca 22080905  T
Q  310 tgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22080906 tacattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 22080952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 131 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 35245703 - 35245484
Alignment:
Q  131 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 230  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35245703 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 35245606  T
Q  231 gttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg--ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 327  Q
    | || | |||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||| || | ||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  35245605 gatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgttgaatcaagttgttttaagaggtcgagtctatgcattagca-ttcattg 35245507  T
Q  328 ttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  35245506 ttgggggcttgatgccctggagc 35245484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 197 - 352
Target Start/End: Original strand, 16448639 - 16448793
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||    
T  16448639 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaa---gatgaagttccaaattattggattatacaagagtttgtcaatttaagatgttta 16448735  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc-gggagcct 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16448736 agaggtcgagtccatgcattagcattttaaagttgagggcttgatgccctgggagcct 16448793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 19773818 - 19773945
Alignment:
Q  225 gtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcattt 322  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19773818 gtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 19773917  T
Q  323 cattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19773918 cattgttgggggcttgatgccctggagc 19773945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 149 - 247
Target Start/End: Original strand, 27333238 - 27333336
Alignment:
Q  149 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27333238 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27333336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 149 - 247
Target Start/End: Original strand, 27393978 - 27394076
Alignment:
Q  149 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27393978 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27394076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 135 - 337
Target Start/End: Original strand, 4185827 - 4186023
Alignment:
Q  135 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 234  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4185827 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttg 4185926  T
Q  235 attaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggg 333  Q
    ||   ||||| || |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||    
T  4185927 at---gatgacgatgttccaaattattggactatttaagaagttg----tttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattatcatacatttgttgggg 4186019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 131 - 339
Target Start/End: Original strand, 16920634 - 16920841
Alignment:
Q  131 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 230  Q
    |||||||||||| | | ||| |||||  |||| ||||||||  ||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16920634 agatgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatg--ttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaa 16920731  T
Q  231 gttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 328  Q
    | || | |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||    
T  16920732 gatgttgaagatgatgatgttccaaattgttggactaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcaagtccatgcattagca-ttcatagt 16920830  T
Q  329 tgggggcttga 339  Q
     ||||||||||    
T  16920831 agggggcttga 16920841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 25644508 - 25644295
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtat-tattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 162  Q
    |||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||  |||||| |||| ||| |||  || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  25644508 atgatttgatgttgtttttgatgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttat 25644409  T
Q  163 atcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgtt 261  Q
    |||| | || ||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||   |||||||||| ||    
T  25644408 atcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagaagat---gttccaaattatt 25644314  T
Q  262 gga-ttatataagaggttg 279  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  25644313 ggatttatataagaggttg 25644295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 341
Target Start/End: Original strand, 9098466 - 9098714
Alignment:
Q  82 taatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcat 179  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| || | || |||| |||  |||||| ||||||||||||||||||  || |||||||    
T  9098466 taatgttatataattatatatacattacatgaattatgtttgatgtt-gtgaagttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattgttttgcat 9098564  T
Q  180 actacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggtt 278  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||   |||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  9098565 actgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagaagat---gttccaaattattggatttatataagaggtc 9098659  T
Q  279 gtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatg 341  Q
    || | || |||||||||        ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  9098660 gttgtttctaagatgtt--------gagtccatgcattcgca-ttcattgttgggggcttgatg 9098714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 69 - 320
Target Start/End: Original strand, 30676695 - 30676952
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  30676695 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcat 30676793  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattgt 260  Q
    | || ||| | ||||| | | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||| |    
T  30676794 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattat 30676891  T
Q  261 tggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcat 320  Q
    |||| ||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676892 tggactatttaagaggtcgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 30676952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 184 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22831569 - 22831402
Alignment:
Q  184 cctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcg 282  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||| |    
T  22831569 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgttg 22831470  T
Q  283 atttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  22831469 aattaagttgtttaagaggtcgagtccatacattagca-ttcatagttgggggcttgattccctggagc 22831402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 124 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16496370 - 16496204
Alignment:
Q  124 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 222  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16496370 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 16496272  T
Q  223 cggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaag 289  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  16496271 cggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaag 16496204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 249 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22805749 - 22805647
Alignment:
Q  249 gttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccggg 347  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22805749 gttccaaattattggattatataagaagttgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctgg 22805650  T
Q  348 agc 350  Q
    |||    
T  22805649 agc 22805647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 187 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 11185568 - 11185418
Alignment:
Q  187 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||| ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |    
T  11185568 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag---------atgttgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaat 11185478  T
Q  286 taagatgtt--aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 344  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  11185477 taagttgttttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcatagttgggggcttgatgccc 11185418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 135 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 4186482 - 4186286
Alignment:
Q  135 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 234  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4186482 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttg 4186383  T
Q  235 attaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggg 333  Q
    ||   ||||| ||  ||||||||| ||||| ||| ||||| ||||    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    |||||||||    
T  4186382 at---gatgacgatattccaaattattggactatttaagaagttg----tttaagatgtttaagaggtcgaggtcatgcattagcatacatttgttgggg 4186290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 34963550 - 34963292
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  34963550 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 34963452  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg------atgaagttccaaattgt 260  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      |||| |||||||||| |    
T  34963451 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattat 34963354  T
Q  261 tggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    |||| ||| |||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34963353 tggactatttaagaggtcgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 34963292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 197 - 321
Target Start/End: Original strand, 19848063 - 19848194
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg------atgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaaga 290  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||      |||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||| ||||||    
T  19848063 ttgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgttccaaattattggactatttaagaggtcgtcgaattaaga 19848162  T
Q  291 tgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19848163 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 19848194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23076971 - 23076749
Alignment:
Q  11 taagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaca 110  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||  | |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  23076971 taagaaactaatttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattaca 23076872  T
Q  111 tgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg--atgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaac 208  Q
    |||| |||   |||| ||| || ||||| ||| |  || | |||||| |||||||  |  ||| |||   |||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  23076871 tgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaac 23076772  T
Q  209 taagctgcatgagtcggtctaag 231  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23076771 taagctgcatgagtcggtctaag 23076749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 135 - 320
Target Start/End: Original strand, 31155403 - 31155582
Alignment:
Q  135 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttg-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 233  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||   || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||    
T  31155403 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcacgatgacttgcatactgttta-gttgctgttttgttatttaactaagttgcatgagtcaatccaagtt 31155501  T
Q  234 gattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcat 320  Q
    |||   |||||||| |||||||||| ||||| ||| || || ||||    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  31155502 gat---gatgatgatgttccaaattattggactatttacgaagttg----tttaagatgtttaagatgtcgagtccatgcattagcat 31155582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 35008389 - 35008167
Alignment:
Q  11 taagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaca 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||  | |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  35008389 taagaaactaagttgcttatcttactgttattgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatattcattaca 35008290  T
Q  111 tgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg--atgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaac 208  Q
    |||| |||   |||| ||| || ||||  ||| |  || | |||||| |||||||  |  ||| |||   |||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  35008289 tgaattatatatgatgtttaagttgtttttgattatcacttgatattattatatctggatatgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaac 35008190  T
Q  209 taagctgcatgagtcggtctaag 231  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  35008189 taagctgcatgagtcggtctaag 35008167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 197 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 25656679 - 25656619
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaat 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25656679 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaggttccaaat 25656619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 197 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 23992480 - 23992349
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg------atgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaaga 290  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||      |||| |||||||||| ||||| ||| |||| ||| || |  ||||||    
T  23992480 ttgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgttccaaattattggactatttaagcggtcgttgtattaaga 23992381  T
Q  291 tgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23992380 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 23992349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 240 - 350
Target Start/End: Original strand, 25603502 - 25603612
Alignment:
Q  240 gatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttg 338  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| || || | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25603502 gatgttgatgttccaaattattggactatttaagaggtcgttgaat-aagatgtttaagaggtcgtgtccatgcattagcatttcattgttgagggcttg 25603600  T
Q  339 atgcccgggagc 350  Q
    |||||| |||||    
T  25603601 atgccctggagc 25603612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 240 - 350
Target Start/End: Original strand, 25611840 - 25611950
Alignment:
Q  240 gatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttg 338  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| || || | |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25611840 gatgttgatgttccaaattattggactatttaagaggtcgttgaat-aagatgtttaagaggtcgtgtccatgcattaggatttcattgttgggggcttg 25611938  T
Q  339 atgcccgggagc 350  Q
    |||||| |||||    
T  25611939 atgccctggagc 25611950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 192
Target Start/End: Original strand, 4668217 - 4668274
Alignment:
Q  135 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttg 192  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  4668217 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttg 4668274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 192
Target Start/End: Original strand, 4675064 - 4675121
Alignment:
Q  135 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttg 192  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  4675064 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttg 4675121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 198 - 337
Target Start/End: Original strand, 4738626 - 4738759
Alignment:
Q  198 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgt-taa 296  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||   ||||| || |||||||||| ||||| ||| |||||  |||    |||||||||| |||    
T  4738626 tgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgat---gatgacgatgttccaaattattggactatttaagaaattg----tttaagatgtctaa 4738718  T
Q  297 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggctt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  4738719 gaggtcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctt 4738759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18456901 - 18456735
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 162  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  18456901 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 18456803  T
Q  163 atcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 231  Q
     ||||| || ||| | ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456802 gtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18204309 - 18204096
Alignment:
Q  20 aagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtatt 119  Q
    |||||| ||||  ||||| ||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||  |||| |||     
T  18204309 aagttgcttatactgctgttgttgtttcagtaagtctgatgtaaatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattata 18204210  T
Q  120 attgatatttgaga-tgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgc 216  Q
      |||| ||| ||| || || ||| |  |||| ||||||||||||||||||  || |||   | || ||||||||||||||| ||| || | ||||||||    
T  18204209 tatgatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttttatgtgcttcctatgttgttgtttatta-ttgattaagctgc 18204111  T
Q  217 atgagtcggtctaag 231  Q
    |||||||||||||||    
T  18204110 atgagtcggtctaag 18204096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Original strand, 18177562 - 18177775
Alignment:
Q  20 aagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtatt 119  Q
    |||||| ||||  ||||| ||||||| ||||||| |||||  | |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||  |||| |||     
T  18177562 aagttgcttatactgctgttgttgtttcagtaagtctgatataaatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattata 18177661  T
Q  120 attgatatttgaga-tgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgc 216  Q
      |||| ||| ||| || || ||| |  |||| ||||||||||||||||||  || |||   | || ||||||||||||||| ||| || | ||||||||    
T  18177662 tatgatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttttatgtgcttcctatgttgttgtttatta-ttgattaagctgc 18177760  T
Q  217 atgagtcggtctaag 231  Q
    |||||||||||||||    
T  18177761 atgagtcggtctaag 18177775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 18706493 - 18706387
Alignment:
Q  62 atatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 161  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||   |||| ||| |||||||  ||| |||| || ||||||||||    
T  18706493 atatgatttgatgttgttaataatgtcatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagatgttattgatttgc-tttgatattgtta 18706395  T
Q  162 tatcatga 169  Q
    ||||||||    
T  18706394 tatcatga 18706387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22949484 - 22949375
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  22949484 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 22949385  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  22949384 t-atgatgatt 22949375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22953440 - 22953331
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  22953440 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 22953341  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  22953340 t-atgatgatt 22953331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23871928 - 23871819
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  23871928 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 23871829  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  23871828 t-atgatgatt 23871819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23875884 - 23875775
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  23875884 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 23875785  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  23875784 t-atgatgatt 23875775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Original strand, 27325370 - 27325479
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| || |||  |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  27325370 atgatttgatgatatttataatgttatataattatatatatattgcattaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 27325469  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  27325470 t-atgatgatt 27325479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19008843 - 19008787
Alignment:
Q  209 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19008843 taagctgcatgagttggtccaagttgattaagatgatgaag-tccaaattattggatt 19008787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18461997 - 18461895
Alignment:
Q  128 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 226  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461997 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 18461900  T
Q  227 ctaag 231  Q
    |||||    
T  18461899 ctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 18696676 - 18696569
Alignment:
Q  61 catatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtt 160  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||   |||| || ||||||||  ||| |||| || |||||||||    
T  18696676 catatgatttaatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttggagatgttattgatttgc-tttgatattgtt 18696578  T
Q  161 atatcatga 169  Q
    |||||||||    
T  18696577 atatcatga 18696569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Original strand, 18199306 - 18199519
Alignment:
Q  20 aagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtatt 119  Q
    |||||| ||||  ||||| ||||||| ||||||| |||||  | |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||  |||| |||     
T  18199306 aagttgcttatactgctgttgttgtttcagtaagtctgatataaatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattata 18199405  T
Q  120 attgatatttgaga-tgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgc 216  Q
      |||| ||| ||| || || ||| |  |||| ||||||||||||||||||  || |||   | || ||||||||| ||||| ||| || | ||||||||    
T  18199406 tatgatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttttatgtgcttcctatgttgctgtttatta-ttgattaagctgc 18199504  T
Q  217 atgagtcggtctaag 231  Q
    |||||||||||||||    
T  18199505 atgagtcggtctaag 18199519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 13019439 - 13019394
Alignment:
Q  303 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggag 349  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13019439 gagtccatgcattagcatt-cattgttgggggcttgatgccctggag 13019394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16760634 - 16760525
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  || ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  16760634 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 16760535  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  16760534 t-atgatgatt 16760525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 231
Target Start/End: Original strand, 18821912 - 18821946
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821912 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 108
Target Start/End: Original strand, 28103796 - 28103877
Alignment:
Q  27 ttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacatta 108  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  28103796 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcatta 28103877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 16624669 - 16624583
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcatt 150  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||  || ||||||||||||| ||||||    
T  16624669 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattaagatgttgatgacgtgcatt 16624583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Original strand, 31477577 - 31477686
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| ||| || | |  |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  31477577 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcataaattttgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 31477676  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  31477677 t-atgatgatt 31477686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18907160 - 18907111
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||||||    
T  18907160 ttgttatttaactaagctgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 18907111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19863027 - 19862978
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 246  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19863027 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19873169 - 19873120
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 246  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19873169 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33443146 - 33443068
Alignment:
Q  152 gatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 229  Q
    |||||||||||||| |||  || |||  ||||| ||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33443146 gatattgttatatcttgagatgttttatatactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 365 - 24
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  365 agaaactgagttgtt-atcttgctgttgttgttctagtgagactgatacatatgaattgatgttgtttataatattatataattgtatatacattacatg 267  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    || |||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  266 aattatgtttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaag 167  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat-tatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccat 310  Q
    |||||||| |||||||||||||||   |||||||| |||||||||| |||||| ||  ||||||||||| |||| ||||| ||||||  || | ||||||    
T  166 ctgcatgaatcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggatatacttaagaggttgttgattataagaagttaagttgttgtgtccat 70  T
Q  311 gcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  69 gcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 24  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 160920 - 160584
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  160920 agaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcggtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatatattacatg 160821  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    |  |||  ||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  160820 acttatgtttgatatttgacatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaag 160722  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgg-attatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatg 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||||| |||| ||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| | |||||||    
T  160721 ctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgtcccaaattattggaattatttaagaggttgttgctttaagttgttaagaggttgcgtccatg 160625  T
Q  312 cattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 353  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  160624 cattagca-ttcattgttgggggcttgatgcccttgagcctt 160584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 349
Target Start/End: Original strand, 85692 - 85845
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  85692 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgttgatttaagatgttta 85791  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggag 349  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||| ||||    
T  85792 agaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggcttgatgccctggag 85845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 69 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 501261 - 501003
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  501261 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 501163  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga------tgatgaagttccaaattgt 260  Q
    | || ||| | ||| | | | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||| | |||||||||| |    
T  501162 gttgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgttgattatgttccaaattat 501065  T
Q  261 tggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    |||| ||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  501064 tggactatttaagaggtcgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtctatgcattagcatt 501003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 8713 - 8363
Alignment:
Q  6 agagataagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataat--tgtatata 103  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  8713 agaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgtatatgaattgatgttgtttataatgtgatataatattgtatata 8614  T
Q  104 cattacatgaagtat-tattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgtta 202  Q
    |||||| |||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8613 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtta 8514  T
Q  203 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgg-attatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagagg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||    ||||||||| ||||  |||||||||||||||| | || ||||| ||| ||  |    
T  8513 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagaagat---attccaaattattggttttatataagaggttgttgtttctaagaggttgagtag 8419  T
Q  301 tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  8418 ttgagtccatgcattagca-ttcattgttggtggcttgatgccctggagcctttgct 8363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 6769 - 6429
Alignment:
Q  15 aaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatga 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6769 aaactaagttgtt-atcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga 6671  T
Q  114 agtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagc 213  Q
    | |||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6670 attatg-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagc 6572  T
Q  214 tgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||   || ||||| ||||||  || | ||||||||    
T  6571 tgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgttccaaattattggact-tataagaggttgttttttataagaagttaagttgttgtgtccatgc 6473  T
Q  313 attagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  6472 attagca-ttcattgttgcgggcttgatgccctggagcctttgct 6429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 7046 - 6718
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7046 agaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattaatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 6947  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    |  |||  |||||||||||| |||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  6946 acttatgtttgatatttgagttgttgat---ttgcattcaatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgag 6850  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatg 311  Q
    |||||||||||||||         ||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| | | |||| ||||||||||| | |||||||    
T  6849 ctgcatgagtcggtc---------taagatgatgatgttccaaattattggacttatttaagaggttgttgttctaagttgttaagaggttgtgtccatg 6759  T
Q  312 cattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 353  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6758 cattagca-ttcattgttgggggcttgatgccatggagcctt 6718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 8259 - 8097
Alignment:
Q  6 agagataagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatataca 105  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||   |||| |  | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  8259 agaggtaaggaactaagttgtttatcctgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatataca 8160  T
Q  106 ttacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 168  Q
    ||||||||| |||  ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8159 ttacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatg 8097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 93)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 34201020 - 34200684
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34201020 agaaactaagttgtttaccttgctgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatg 34200921  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    |  ||   |||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34200920 acttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 34200824  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg--ttaagaggtcgagtcca 309  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||    
T  34200823 ctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagttgttttaagaggtcgagtcca 34200724  T
Q  310 tgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34200723 tgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 34200684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Original strand, 16219601 - 16219942
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||   |||| |  | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16219601 agaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatg 16219700  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    || |||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16219701 aattatgtttgatgtttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaag 16219800  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatg 311  Q
    || |||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||| | | |||| |||||||  || | |||||||    
T  16219801 ctacatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgttccaaattattcgacttatataagaggttgttgttctaagttgttaagttgttgtgtccatg 16219897  T
Q  312 cattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16219898 cattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctagagcctttgct 16219942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 350
Target Start/End: Original strand, 15754773 - 15755110
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattga-tgttgtttataatgttatataattgtatatacattacat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15754773 agaaactaagttgtttatcttgctgttaatattccagtaagactgatgcatatgaatttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacat 15754872  T
Q  112 gaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaa 211  Q
    ||  |||  |||||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15754873 gacttatgtttgatatttgagttgttgat---ttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaa 15754969  T
Q  212 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg--ttaagaggtcgagtcc 308  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||    
T  15754970 gctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaataattggattaatatacgagattgtcgaattaagttgttttaagaggtcgaatcc 15755069  T
Q  309 atgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15755070 atgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 15755110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 67981 - 67637
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  67981 agaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtgagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattatat 67882  T
Q  112 gaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaa 211  Q
    ||| |||  |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  67881 gaattatg-ttgatatt-gagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa 67784  T
Q  212 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat-tatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtcca 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | || ||||| ||||||  || | |||||    
T  67783 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattggatatatttaagaggttgttgcttataagaagttaagttgttgtgtcca 67684  T
Q  310 tgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  67683 tgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctagagcctttgct 67637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 11995914 - 11996242
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11995914 agaaactaatttgtttaccttgctgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatg 11996013  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    |  ||   |||||||||||| |||||||   || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11996014 acttaagtttgatatttgagttgttgat---ttacattcaatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttaattaactaag 11996110  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg--ttaagaggtcgagtcca 309  Q
     ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||    
T  11996111 atgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagatgttttaagaggttgagtcca 11996210  T
Q  310 tgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11996211 tgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgc 11996242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 18456352 - 18456641
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  18456352 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 18456451  T
Q  168 gatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta 267  Q
    | || |||| ||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18456452 gttgttttgtatactgcctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatta 18456550  T
Q  268 tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18456551 tataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttaggggcttgatgccctggagcctttgct 18456641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 47832044 - 47831698
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||    ||| |  | |||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47832044 agaaactaagttatttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgtcgctaatgttatataattgtatatacattatatg 47831945  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    || |||  ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47831944 aattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatatgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaag 47831845  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat-tata-taagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtcca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| | || ||||| ||||||  || | |||||    
T  47831844 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattggatatatattaagaggttgttgtttataagaagttaagttgttgtgtcca 47831745  T
Q  310 tgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  47831744 tgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctagagcctttgct 47831698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Original strand, 811015 - 811357
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  811015 agaaactaagttatttatcttgctgttgtagtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatg 811114  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    || |||  ||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  811115 aattatgtttgatgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaag 811214  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | || ||||| ||||||  || | ||||||    
T  811215 ctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggacttatataagaggttgttgtttataagaagttaagttgttgtgtccat 811311  T
Q  311 gcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  811312 gcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctagagcctttgct 811357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 44014409 - 44014075
Alignment:
Q  15 aaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatga 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  44014409 aaactaagttgtt-atcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgtttttaatggtatataactgtatatacattatatga 44014311  T
Q  114 agtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagc 213  Q
    | |||  ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014310 attatg-ttgatatttgagatgttgat---ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagc 44014215  T
Q  214 tgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||| | || ||||| ||||||  || | ||||||||    
T  44014214 tgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggact-tataagaggttgttgtttataagaagttaagttgttgtgtccatgc 44014119  T
Q  313 attagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44014118 attagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 44014075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 321
Target Start/End: Original strand, 28505185 - 28505492
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28505185 agaaactaagttgtttaccttgttgtcaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatg 28505284  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    |  ||   |||||| ||||| || ||||   ||  || ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28505285 acttaagtttgataattgagttgctgat---ttatatccgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 28505381  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccat 310  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  28505382 ctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccat 28505481  T
Q  311 gcattagcatt 321  Q
    |||||||||||    
T  28505482 gcattagcatt 28505492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 11972673 - 11972386
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  11972673 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 11972575  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11972574 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 11972477  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11972476 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 11972386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 14949107 - 14949394
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  14949107 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 14949205  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14949206 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 14949303  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14949304 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 14949394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 32125668 - 32125381
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  32125668 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 32125570  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32125569 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 32125472  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32125471 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 32125381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 41523094 - 41522807
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  41523094 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 41522996  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41522995 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 41522898  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41522897 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 41522807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 41525556 - 41525269
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  41525556 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 41525458  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41525457 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 41525360  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41525359 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 41525269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 18005883 - 18005546
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgca-tatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||  | |||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  18005883 agaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatat 18005784  T
Q  112 gaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaa 211  Q
    ||| |||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18005783 gaattatg-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttccatactgcttatgttgctgtttgttatttaactaa 18005685  T
Q  212 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| |||| ||||| | ||||||||||||| | || ||||| ||||||  || | || |||    
T  18005684 gctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccgaattattggact-tataagaggttgttgtttataagaagttaagttgttgtgttcat 18005589  T
Q  311 gcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagccttt 354  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18005588 gcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagccttt 18005546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 15376698 - 15376985
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  15376698 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 15376796  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15376797 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 15376894  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15376895 atataagaggttgtcgatttaagatattaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 15376985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 21189580 - 21189867
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  21189580 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 21189678  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21189679 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 21189776  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21189777 atataagaggttgtcgatttaagatattaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 21189867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 456498 - 456211
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  456498 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 456400  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  456399 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 456302  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  456301 atataagaggttgtcgatttaagatattacgaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 456211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16232697 - 16232410
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  16232697 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 16232599  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16232598 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 16232501  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16232500 atataagaggttgtcgatttaagatattacgaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 16232410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 20385108 - 20385395
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  20385108 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 20385206  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20385207 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 20385304  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20385305 atataagaggttgtcgatttaagatattacgaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 20385395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 24702415 - 24702128
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  24702415 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 24702317  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24702316 gttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 24702219  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24702218 atataagaggttgtcgatttaagatattacgaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 24702128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 197 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16410109 - 16409949
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410109 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 16410010  T
Q  297 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16410009 gacgtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 16409949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 128 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 48273511 - 48273281
Alignment:
Q  128 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  48273511 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggt 48273413  T
Q  227 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48273412 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaagtattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagttcatgcattagcatttcat 48273313  T
Q  326 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48273312 tgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 48273281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 11393272 - 11393559
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  11393272 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 11393370  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11393371 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatggagttccaaattattggatt 11393468  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11393469 atataagaggttgtcgatttaagatattacgaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 11393559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 24704862 - 24704578
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| || |    
T  24704862 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtctt 24704764  T
Q  168 gatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta 267  Q
    | |  |||| |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24704763 gtt--tttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatta 24704668  T
Q  268 tataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24704667 tataagaggttgtcgatttaagatattacgaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 24704578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 27217037 - 27216750
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  27217037 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 27216939  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27216938 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 27216841  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27216840 atataagaggttgtcgatttaagatattacgaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 27216750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 64 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 44116691 - 44116398
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 162  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||| | |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  44116691 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 44116593  T
Q  163 atcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgtt 261  Q
     ||||| || ||| | ||||| | | ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44116592 gtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattatt 44116495  T
Q  262 ggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44116494 ggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 44116398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 197 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 20110606 - 20110445
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20110606 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttta 20110507  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20110506 agaggtcgagtccatgcattatcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 20110445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 124 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9509315 - 9509088
Alignment:
Q  124 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgat-ttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 222  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || | ||| ||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9509315 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 9509217  T
Q  223 cggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509216 cggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 9509117  T
Q  322 tcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9509116 tcattgttgggggcttgatgccctggagc 9509088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18640440 - 18640162
Alignment:
Q  79 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 176  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |    
T  18640440 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 18640341  T
Q  177 catactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagagg 276  Q
     |||||   | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  18640340 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaaggtccaaattattggactatataagagg 18640243  T
Q  277 ttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18640242 ttgtcgatttaagatattaagagttcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctagagcctttgct 18640162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 38227662 - 38227379
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||  |||| |||||||  ||| |||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  38227662 ttgatgttgattaagatgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 38227563  T
Q  168 gatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtt-ccaaattgttggatt 266  Q
    | || |||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  38227562 gctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatgatgatgtttccaaattattggatt 38227464  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38227463 atataagaggttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagaatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 38227379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 128 - 344
Target Start/End: Original strand, 3564363 - 3564580
Alignment:
Q  128 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 226  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3564363 ttgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 3564461  T
Q  227 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 325  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  3564462 ctaagttgatgaagatgatgaagttctaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagttcatgcattaacatttcat 3564561  T
Q  326 tgttgggggcttgatgccc 344  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3564562 tgttgggggcttgatgccc 3564580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 6 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 16056571 - 16056229
Alignment:
Q  6 agagataagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatataca 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||| ||||   |||| |  | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16056571 agaggtaagaaactaagttgtttatcttgatgttgttgtttcggtaagcctgaatgatataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatataca 16056472  T
Q  106 ttacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttattt 205  Q
    ||||||||| |||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |  |||||||| ||||||||||||    
T  16056471 ttacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttg-tttgcataatgtctatgttgctgtttgttattt 16056373  T
Q  206 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcg 303  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||| |||   |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | || ||||| ||| ||  || |    
T  16056372 aactaaggtgcatcagtcggtctaagttga--aagaagat---gttccaaattattggatttatataagaggttgttgtttctaagaggttgagttgttg 16056278  T
Q  304 agtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 353  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16056277 agtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctgtagcctt 16056229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 69 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 16495579 - 16495329
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 168  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    ||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||    
T  16495579 ttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatg 16495484  T
Q  169 atgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-a 267  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  16495483 atggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaa 16495384  T
Q  268 tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16495383 tataagaggtcgttgaattaagatgtttaagaggtcaagtccatgcattagcatt 16495329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 64 - 357
Target Start/End: Original strand, 2280053 - 2280346
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtat-tattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 162  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||  |||| ||| |||  ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||    
T  2280053 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattat 2280152  T
Q  163 atcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttg 262  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||    
T  2280153 atcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgttccaaattattg 2280250  T
Q  263 ga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
     | ||||||||||||| || | || ||||| ||| ||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2280251 aatttatataagaggtcgttgtttctaagaggttgagttgttgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 2280346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12699014 - 12698730
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||| | |||||| ||||| ||  |||| ||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||    
T  12699014 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcat 12698915  T
Q  168 gatga--tttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat 265  Q
    | ||   |||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12698914 gctgtgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggat 12698816  T
Q  266 tatataagaggttgtcgatttaagatgt-taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  12698815 tatataaaaggttgttgaattaagatgtctaagaggttgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgtcctggagc 12698730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 63 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 13647512 - 13647230
Alignment:
Q  63 tatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 161  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||    
T  13647512 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 13647414  T
Q  162 tatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgt 260  Q
    | ||||| || ||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||| |||||||||| |    
T  13647413 tgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgttccaaattat 13647315  T
Q  261 tggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg--ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcc 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13647314 tggattaatataagaggttgtcgaattaagatgttttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttaatgcc 13647230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22073154 - 22072882
Alignment:
Q  11 taagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaca 110  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||| ||||   |||| |  | ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22073154 taaggaactaagttgtttgtcttgatgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgttatataattgcatatacattaca 22073055  T
Q  111 tgaagt-attattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaac 208  Q
    |||  | ||  ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  22073054 tgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaac 22072955  T
Q  209 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat-tatataagaggttgt 280  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  22072954 taagctgcatgggtcagtctaagttgattaagatgatgatgttccaaactattggatatatataagaggttgt 22072882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 64 - 352
Target Start/End: Original strand, 17061895 - 17062183
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtat-tattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 162  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| | || ||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  17061895 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattat 17061993  T
Q  163 atcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttg 262  Q
     ||||| |  |||| ||||| |  | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  17061994 gtcatgctattttgtatactgctga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtttcaaattattg 17062092  T
Q  263 gattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc-gggagcct 352  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  17062093 gattatacaagagtttgtcgatttaagatgtttaagaggtc-aatccatgcattagcattttaaagttgagggcttgatgccctgggagcct 17062183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 124 - 350
Target Start/End: Original strand, 16386242 - 16386470
Alignment:
Q  124 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 222  Q
    |||||| ||||||||||||  | || | |||||  |||| ||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16386242 atatttaagatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 16386341  T
Q  223 cggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcat 320  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||     
T  16386342 cggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca- 16386440  T
Q  321 ttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16386441 ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 16386470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 79 - 342
Target Start/End: Original strand, 38898370 - 38898635
Alignment:
Q  79 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttg 176  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||  |||| ||||  ||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || |||     
T  38898370 ttatactgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 38898469  T
Q  177 c-atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagag 275  Q
      ||||| | | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38898470 atatactgc-tgtgtcgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatggtgaagttccaaattattggattatataagag 38898567  T
Q  276 gttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  38898568 gttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggcttgatgc 38898635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 197 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13869396 - 13869250
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13869396 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaggttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttta 13869297  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  13869296 agaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggcttgatgc 13869250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 188 - 344
Target Start/End: Original strand, 26356098 - 26356256
Alignment:
Q  188 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcga---t 284  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |    
T  26356098 tgttgttgtt-gttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttt 26356196  T
Q  285 ttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 344  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  26356197 ttaagatattaagaggtcgagtccatgcattagcatttcatagttgagggcttgatgccc 26356256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 188 - 344
Target Start/End: Original strand, 26358550 - 26358708
Alignment:
Q  188 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcga---t 284  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |    
T  26358550 tgttgttgtt-gttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttt 26358648  T
Q  285 ttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 344  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  26358649 ttaagatattaagaggtcgagtccatgcattagcatttcatagttgagggcttgatgccc 26358708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 124 - 350
Target Start/End: Original strand, 10063813 - 10064041
Alignment:
Q  124 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 223  Q
    ||||||||||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  10063813 atatttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatcatgatgttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtc 10063912  T
Q  224 ggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
     |||||||| | | ||| || ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10063913 agtctaagtcgttgaaggtgttgatgttccaaattattggactattataagaggttgtcgaatgaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatt 10064012  T
Q  322 tcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  10064013 tcagtgttgggggcttgatgccctggagc 10064041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 357
Target Start/End: Original strand, 20220071 - 20220411
Alignment:
Q  11 taagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaca 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||  | |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  20220071 taagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttccagtaagcctgatttagatgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattaca 20220170  T
Q  111 tgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaac 208  Q
    |||| |||   |||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  20220171 tgaattatatatgatgtttgagatgttgat---ttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaac 20220267  T
Q  209 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagt 306  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |   |||||||||| ||||| ||||||||||||| |  | || ||||||| ||||  || ||||    
T  20220268 taagctgtatgagtcggtctaagatga--aagatgtt---gttccaaattattggatttatataagaggtcgatgtttctaagatg-taagttgttgagt 20220361  T
Q  307 ccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||   || ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  20220362 ccatgcatactca-ttcattgttgggggcttgatgacctggagcttttgct 20220411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 197 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3386383 - 3386239
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  3386383 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatacaaga-gttgtcgatttaagatgttta 3386285  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  3386284 agaagtcgagttcatgcattagca-ttctttgttgggggcttgatgc 3386239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 128 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13831491 - 13831279
Alignment:
Q  128 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 226  Q
    |||||| |||| |||||||||||  ||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13831491 ttgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccg-tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 13831394  T
Q  227 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 325  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  13831393 ctaaattgattaagatgatgaagttccaaattattggattatacaaga-gttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagca-ttctt 13831296  T
Q  326 tgttgggggcttgatgc 342  Q
     ||||| ||||||||||    
T  13831295 ggttggaggcttgatgc 13831279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 320
Target Start/End: Original strand, 19486678 - 19486937
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 162  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||| |||   |||| ||||||||||||| | |||| | | ||||||| ||||    
T  19486678 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattat 19486777  T
Q  163 atcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttg 262  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| || |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||| ||| |||||||||| |||    
T  19486778 atcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattg 19486877  T
Q  263 gatta-tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcat 320  Q
    || || |||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19486878 gactattataagaggttgtcgaattaagacgtttaagaagtcgagtccatgcattagcat 19486937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 124 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 26212122 - 26211894
Alignment:
Q  124 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 222  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||    
T  26212122 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgtatgagt 26212024  T
Q  223 cggtctaagttgattaag-atgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagca 319  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  26212023 cggtctaagttgttgaagaatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgcttaagaggtcgagtccatgcattagca 26211924  T
Q  320 tttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26211923 -ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 26211894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 197 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10589092 - 10588935
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg-tt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  10589092 ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgtcgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagatgttt 10588993  T
Q  295 aagaggtcgagtccatgcattagca--tttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10588992 aagaggtcgagtccatgcattagcagcattcattgttgggggcttgatgccctggagc 10588935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12901560 - 12901232
Alignment:
Q  14 gaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||  |||   |||||| || ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12901560 gaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaattatatgatttaatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattacatga 12901461  T
Q  114 agtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaa 211  Q
    | |||   |||| || | ||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||  |  |||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12901460 attatgtatgatgtt-gtgatgttgctgttttgcatttgatattgttatatcatgaattattttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaa 12901362  T
Q  212 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgat-ttaagatgttaagaggtcgagtcca 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||| |  || |||||||||| | ||| ||||||||||||| || | |  ||||||||||||  || |||||||    
T  12901361 gctgcatgagtcggtttaagttga--aagaggccgatgttccaaattataggatttatataagaggtcgttgttgctaagatgttaagttgttgagtcca 12901264  T
Q  310 tgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    |||||   || ||||||||||||||||||||||    
T  12901263 tgcatactca-ttcattgttgggggcttgatgc 12901232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 131 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 40443509 - 40443296
Alignment:
Q  131 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 230  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| || ||||  |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40443509 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-tttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaa 40443411  T
Q  231 gttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 328  Q
    | || | ||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40443410 gatgttgaagatgatgatattccaaattattggactaatataaaaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgt 40443312  T
Q  329 tgggggcttgatgccc 344  Q
    ||||||||||||||||    
T  40443311 tgggggcttgatgccc 40443296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 218 - 357
Target Start/End: Original strand, 15082017 - 15082154
Alignment:
Q  218 tgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcatta 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15082017 tgagtcggtctaagttgattaagatga---agttccaaattattggattatacaagagtttgtcaatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcatta 15082113  T
Q  317 gcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  15082114 gcatttcattgtttggggcttgatgccctggagcatttgct 15082154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 184 - 344
Target Start/End: Original strand, 27847885 - 27848046
Alignment:
Q  184 cctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcg 282  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||| ||    
T  27847885 cctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactagtataagaggttgccg 27847984  T
Q  283 atttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 344  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27847985 aattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcatagttgggggcttgatgccc 27848046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 354
Target Start/End: Original strand, 15008433 - 15008720
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| |||   |||| |||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  15008433 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgaggtgttgttgatttgcatt-gatattgttata 15008531  T
Q  164 tcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgtt 261  Q
    ||||||  || |||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||   ||| ||||  |||| |||||||||| ||    
T  15008532 tcatgaactgttttatatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaa---gatgaaga--atgatgttccaaattatt 15008626  T
Q  262 gga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagccttt 354  Q
    ||| |||||||||||||    | || ||||||||||||  || ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15008627 ggatttatataagaggtcaatgtttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactca-ttcattgttgggggcttgatgccctgaagccttt 15008720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 68 - 228
Target Start/End: Original strand, 12255729 - 12255892
Alignment:
Q  68 attgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtat-tattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatca 166  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||| ||| |||  || ||||||||||||  || || |||| |||||||||||||||    
T  12255729 attgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatca 12255828  T
Q  167 tga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 228  Q
    |||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255829 tgaattgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14258286 - 14258158
Alignment:
Q  225 gtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttc 323  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14258286 gtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatacattagcatttc 14258187  T
Q  324 a-ttgtt-gggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    | ||||| |||||| |||||||| |||||    
T  14258186 atttgttggggggcatgatgccctggagc 14258158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 269 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18427510 - 18427422
Alignment:
Q  269 ataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18427510 ataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctgaagcctttgct 18427422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 69 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18430889 - 18430686
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  18430889 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 18430791  T
Q  168 gatgatttgc-atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    |||| |||   |||||   | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18430790 gatgtttttatatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattggatt 18430693  T
Q  267 atataag 273  Q
    |||||||    
T  18430692 atataag 18430686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 344
Target Start/End: Original strand, 1867929 - 1868205
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||   |||| |||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||    
T  1867929 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttcatttgcatt-gatattgttata 1868027  T
Q  164 tcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgtt 261  Q
    ||||||  || |||  ||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |   |||||||||| ||    
T  1868028 tcatgagctgttttatatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgtt---gttccaaattatt 1868122  T
Q  262 gga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 344  Q
    | | ||||||||||||| |  | || ||||||| ||||  || ||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||    
T  1868123 gaatttatataagaggtcgatgtttctaagatg-taagttgttgagtccatgcatactca-ttcattgttgggggcttgatgccc 1868205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 63 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14044935 - 14044644
Alignment:
Q  63 tatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttga-tgacttgcattcgatattgtta 161  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   |||| ||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||    
T  14044935 tatgatttaatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgtta 14044837  T
Q  162 tatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattg 259  Q
    ||||| ||  || |||   |||| ||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |   ||||||||||     
T  14044836 tatcaggagctgttttatgtactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgtt---gttccaaatta 14044742  T
Q  260 ttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||| ||||||||||||| |  | || ||||||| ||||  || ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14044741 ttggatttatataagaggtcgatgtttctaagatg-taagttgttgagtccatgcatactca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 14044644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 63 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14354965 - 14354674
Alignment:
Q  63 tatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttga-tgacttgcattcgatattgtta 161  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   |||| ||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||    
T  14354965 tatgatttaatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgtta 14354867  T
Q  162 tatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattg 259  Q
    ||||| ||  || |||   |||| ||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |   ||||||||||     
T  14354866 tatcaggagctgttttatgtactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgtt---gttccaaatta 14354772  T
Q  260 ttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||| ||||||||||||| |  | || ||||||| ||||  || ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14354771 ttggatttatataagaggtcgatgtttctaagatg-taagttgttgagtccatgcatactca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 14354674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 197 - 357
Target Start/End: Original strand, 15144105 - 15144264
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||| | |||    
T  15144105 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg----agatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgttgtttaaagaggttta 15144200  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcatttcat--tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||||   | |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15144201 agatgtcgagttcatgcattagtatttcatagcgatgggggctagatgccctggagcctttgct 15144264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 264 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 13032744 - 13032657
Alignment:
Q  264 attatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13032744 attatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 13032657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 15113187 - 15113028
Alignment:
Q  6 agagataagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatataca 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  15113187 agaggtaagaaactaagttgtttatcctgctgttattgtttcagtaagactgatttatatgagttgatgttaattataatgtgatataattgtatatata 15113088  T
Q  106 ttacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatc 165  Q
    |||| |||  |||   |||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15113087 ttacttgagttatatgtgaatattgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 15113028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 15116724 - 15116565
Alignment:
Q  6 agagataagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatataca 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||| | ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  15116724 agaggtaagaaactaagttgtttatcctactgttattgtttcagtaagactgatgtatatgagttgatgttatttataatgtgatataattgtatatata 15116625  T
Q  106 ttacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatc 165  Q
    |||| |||  |||   |||   ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  15116624 ttacttgagttatatgtgaatattgagatgttgatgacttgcaattgatattgttatatc 15116565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 197 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16213734 - 16213656
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagag 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16213734 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaggttccaaattattggattatataagag 16213656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 128 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24275289 - 24275089
Alignment:
Q  128 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 226  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275289 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 24275192  T
Q  227 ctaagttgattaaga------tgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagca 319  Q
    |||||||||||||||      |||| | |||||||||| ||||| ||| |||||||| || || |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||    
T  24275191 ctaagttgattaagatgttgttgattatgttccaaattattggactatttaagaggtcgttgaattaagacgtttaagaggtcgagtccatgcattaaca 24275092  T
Q  320 ttt 322  Q
    |||    
T  24275091 ttt 24275089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 16213632 - 16213550
Alignment:
Q  240 gatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16213632 gatgatgatgttccaaattattggactatttaagaggtcattgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 16213550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 357
Target Start/End: Original strand, 9177723 - 9177889
Alignment:
Q  186 tatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgat 284  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||  ||||| | |   |||||||||| ||||| ||||||||||||| |  | |    
T  9177723 tatgttgttgtttattattgaattaagctgcatgagtcggtctatgatg--taagaagtt---gttccaaattattggatttatataagaggtcgatgtt 9177817  T
Q  285 t-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    | ||||||||||||  || ||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9177818 tctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactca-ttca-tgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 9177889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 306 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16579517 - 16579473
Alignment:
Q  306 tccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16579517 tccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 16579473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 306 - 350
Target Start/End: Original strand, 16586146 - 16586190
Alignment:
Q  306 tccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16586146 tccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 16586190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Original strand, 14932802 - 14932851
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 246  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14932802 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 14932851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Original strand, 15356237 - 15356286
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 246  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15356237 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15356286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Original strand, 15360351 - 15360400
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 246  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15360351 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15360400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 16324171 - 16324135
Alignment:
Q  129 tgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatc 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16324171 tgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatc 16324135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 306 - 350
Target Start/End: Original strand, 16461127 - 16461171
Alignment:
Q  306 tccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16461127 tccatgcattagcatttcattgttgggggattgatgccctggagc 16461171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 244
Target Start/End: Original strand, 18154909 - 18154956
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 244  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18154909 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatga 18154956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18426179 - 18426070
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||  || ||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  18426179 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattaagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 18426080  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  18426079 t-atgatgatt 18426070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Original strand, 39267582 - 39267691
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||| ||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  39267582 atgatttgatgatatttataattttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 39267681  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  39267682 t-atgatgatt 39267691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Original strand, 45169773 - 45169882
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  || ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  45169773 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 45169872  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  45169873 t-atgatgatt 45169882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 48991252 - 48991206
Alignment:
Q  178 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 224  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  48991252 atactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 48991206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 247
Target Start/End: Original strand, 2832509 - 2832559
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 247  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||||||||||||||    
T  2832509 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatga 2832559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 102
Target Start/End: Original strand, 10063757 - 10063795
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatat 102  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10063757 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatat 10063795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 357
Target Start/End: Original strand, 12255992 - 12256045
Alignment:
Q  303 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12255992 gagtccatgcattcgcatt-cagtgatgggggcttgatgccctggagcctttgct 12256045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 138
Target Start/End: Original strand, 9389649 - 9389705
Alignment:
Q  81 ataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttg 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| || | ||||||| ||||||||||    
T  9389649 ataatgttatataattgtatatacattgtatgaatta-tgttgatatatgagatgttg 9389705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14323399 - 14323264
Alignment:
Q  217 atgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcat 314  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||   ||||||||| ||||||| ||||||||||| |  | || |||||||| |||  || ||||||||||||    
T  14323399 atgagtcggtctaagttga--aagatgttg---ttccaaattattggatttatataagaggtcgatgtttctaagatgt-aagttgttgagtccatgcat 14323306  T
Q  315 tagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
       |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  14323305 actcatt-cattgttggggggttgatgccctggagcctttgct 14323264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 16324242 - 16324197
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactga 58  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  16324242 agaaactaagttgttgatcttgctgttgttgtttcagtaagcctga 16324197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Original strand, 19649557 - 19649606
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 246  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19649557 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19649606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 78 - 150
Target Start/End: Original strand, 9751500 - 9751572
Alignment:
Q  78 tttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcatt 150  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  9751500 tttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgatgacgtgcatt 9751572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18203876 - 18203789
Alignment:
Q  185 ctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggt 277  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||| |   |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18203876 ctatgttgttgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcgatctaagatga--aagatgtt---gttccaaattattggatttatataagaggt 18203789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 353
Target Start/End: Original strand, 22558 - 22890
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22558 agaaactaagttgtttgtcttgatgttgctgttccagtaagactgatgcatat----tgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 22653  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||    
T  22654 aattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaag 22753  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatg 311  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| | | |||| |||||||| || | |||||||    
T  22754 ctgcatgagtcggtctaagttg---aaggtgatgatgttccaaattattggacttgtataagaggttgttgttctaagttgttaagatgttgtgtccatg 22850  T
Q  312 cattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 353  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  22851 cattagca-ttcatt-ttgggggcttgatgcccttgagcctt 22890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 63 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 82255 - 81978
Alignment:
Q  63 tatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 161  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||    
T  82255 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattatta 82157  T
Q  162 tatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaa-gttccaaattg 259  Q
    | ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  82156 tgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaaggttccaaatta 82059  T
Q  260 ttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatg 341  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  82058 ttggattatacaaga-gttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttgggggcttgatg 81978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 74)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 350
Target Start/End: Original strand, 5866161 - 5866496
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866161 agaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatg 5866260  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    |  ||   |||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5866261 acttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 5866357  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccat 310  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  5866358 ctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccat 5866457  T
Q  311 gcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5866458 gcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 5866496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 21491229 - 21490893
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21491229 agaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcctatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatg 21491130  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    |  ||   |||||| ||||| |||||||   || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21491129 acttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcaatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 21491033  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg--ttaagaggtcgagtcca 309  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  21491032 ctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattgaattaatataagaggttgtcgaattaagatgttttaagaggtcgagtcca 21490933  T
Q  310 tgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  21490932 tgcattagca-ttcgttgttgggggcttgatgccctggagc 21490893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 6520604 - 6520260
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520604 agaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatg 6520505  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    || |||  ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6520504 aattatg-ttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 6520406  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat-tatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | || ||||| ||||||  || | ||||||    
T  6520405 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattggatatatttaagaggttgttgtttataagaagttaagttgttgtgtccat 6520306  T
Q  311 gcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6520305 gcattagca-ttcattgtcgggggcttgatgccctggagcctttgct 6520260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 17141150 - 17140815
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17141150 agaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatg 17141051  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    |  ||   |||||| |||||   ||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17141050 acttaagtttgataattgag---ttgatgatttacattcgatattattatgtcatgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 17140954  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccat 310  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  17140953 ctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccat 17140854  T
Q  311 gcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
     |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17140853 acattagta-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 17140815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 350
Target Start/End: Original strand, 26355584 - 26355916
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    |||||||||||||||||||||  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26355584 agaaactaagttgtttatctttttgttattgttctagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaaatg 26355683  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
     | |||  |||||   |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26355684 gaatatg-ttgatggctgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcgtgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaag 26355781  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatg 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| | | |||   ||||||| || | |||||||    
T  26355782 ctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggacttatttaagaggttgttgttctaaatggttaagatgttgtgtccatg 26355878  T
Q  312 cattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26355879 cattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 26355916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 38855139 - 38855463
Alignment:
Q  16 aactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaag 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  38855139 aactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattatatgaat 38855238  T
Q  116 tattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctg 215  Q
    |||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38855239 tatg-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 38855337  T
Q  216 catgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||  ||   ||||||||||    
T  38855338 catgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattgga-tatataagaggttgttgtttataagaagttaagttgttatgtccatgcat 38855436  T
Q  315 tagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38855437 tagca-ttcattgttgggggcttgatgc 38855463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 5853277 - 5853564
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  5853277 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 5853375  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5853376 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 5853473  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5853474 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 5853564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 50 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 21255420 - 21255121
Alignment:
Q  50 taagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcat 149  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   |||||| ||||| |||||||   || |||    
T  21255420 taagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacat 21255324  T
Q  150 tcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgtt-atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaa 248  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||     
T  21255323 tcgatattattatatcatgatgaattgcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 21255224  T
Q  249 gttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgg 346  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  21255223 gttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctg 21255125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 1484579 - 1484292
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  1484579 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 1484481  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1484480 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 1484383  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1484382 atataagaggttgtcgatttaagatattaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 1484292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 4542358 - 4542645
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  4542358 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 4542456  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | || ||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4542457 gctgtttttgtat-cttgttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 4542554  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4542555 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 4542645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 20046180 - 20046467
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtat-tattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| | |  ||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  20046180 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 20046278  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20046279 gttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 20046376  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20046377 atataagaggttgtcgatttaagatattaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 20046467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 20403404 - 20403117
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  20403404 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 20403306  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20403305 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 20403208  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20403207 atataagaggttgtcgatttaagatattaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 20403117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 50 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 21249582 - 21249283
Alignment:
Q  50 taagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcat 149  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   |||||| ||||| |||||||   || |||    
T  21249582 taagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacat 21249486  T
Q  150 tcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgtt-atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaa 248  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||     
T  21249485 tcgatattattatatcatgatgaattgcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 21249386  T
Q  249 gttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgg 346  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  21249385 gttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggccgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctg 21249287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 197 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 19896315 - 19896155
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896315 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 19896216  T
Q  297 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19896215 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 19896155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 20498802 - 20498459
Alignment:
Q  11 taagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  20498802 taagaaactaagttgtttatcttgatgttgatgtttcggtaagactgatgtatatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattact 20498703  T
Q  111 tgaagtat-tattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaact 209  Q
    |||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| |||||| ||||||||| ||||||||  ||||||    
T  20498702 tgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctattttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaact 20498603  T
Q  210 aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtc 307  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||  |||| |||   |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | || ||||||| | ||  || |||||    
T  20498602 aagttgcatgagtcggtctaagatga--aagaagat---gttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttctaagatgctgagttgttgagtc 20498508  T
Q  308 catgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20498507 catgcattcgca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 20498459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 72 - 357
Target Start/End: Original strand, 23760788 - 23761069
Alignment:
Q  72 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg 171  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  23760788 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgttgatttgaattcaatattgttatatcatgatg 23760886  T
Q  172 atttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatat 270  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  23760887 atttacatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgttccaaattattggacttatat 23760983  T
Q  271 aagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||| | | | |||| |||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23760984 aagaggttattgttctaagttgttaagatgttttgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 23761069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 124 - 357
Target Start/End: Original strand, 16092337 - 16092571
Alignment:
Q  124 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 222  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16092337 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 16092435  T
Q  223 cggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092436 cggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaactattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 16092535  T
Q  322 tcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16092536 tcattgttggaggcttgatgccctggagcctttgct 16092571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 21285841 - 21285492
Alignment:
Q  6 agagataagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatataca 105  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||   |||| |  | || |||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  21285841 agaggtaagaaactaagtgctttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatattgttgttaatgatatataattgtatataca 21285742  T
Q  106 ttacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttattt 205  Q
    ||||||||| |||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21285741 ttacatgaactatgtttgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttattt 21285642  T
Q  206 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcg 303  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | || || || ||| ||  || |    
T  21285641 aacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagaagat---gttccaaattattggatttatataagaggttgttgtttctatgaggttgagtagttg 21285545  T
Q  304 agtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  21285544 agtccatgcattagca-ttcattgctgagggcttgatgccctggagcctttgct 21285492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 15203216 - 15203503
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| |||||| |||| |||||| |||| ||||    
T  15203216 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcat 15203314  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15203315 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 15203412  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15203413 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttgatgcccaggagcctttgct 15203503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 21673938 - 21673601
Alignment:
Q  15 aaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatga 113  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||  ||| |  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  21673938 aaactaagttgtt-atcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattaaataa 21673840  T
Q  114 agtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagc 213  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |     
T  21673839 attat-attgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatga 21673741  T
Q  214 tgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||| | |||||||||| ||||| | ||||||||||||| | || ||||| ||||||  || | ||||||||    
T  21673740 tgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatcatgttccaaattattggact-tataagaggttgttgtttataagaagttaagttgttgtgtccatgc 21673645  T
Q  313 attagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21673644 attagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 21673601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22001930 - 22001644
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  22001930 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 22001832  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22001831 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 22001734  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22001733 atataagaggttgtcgatttaacatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgtt-ggggcttgatgccctggagcctttgct 22001644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 124 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 26219838 - 26219606
Alignment:
Q  124 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||  |  |||| ||||| | | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26219838 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactattttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 26219741  T
Q  224 ggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 322  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219740 ggtctaagttgattatgatgatgaagttccaaagtattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 26219641  T
Q  323 cattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26219640 cattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 26219606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 197 - 358
Target Start/End: Original strand, 26225359 - 26225521
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26225359 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaagtattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttta 26225458  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctt 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26225459 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctt 26225521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 64 - 350
Target Start/End: Original strand, 13508019 - 13508308
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 162  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||    
T  13508019 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattat 13508118  T
Q  163 atcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttg 262  Q
    ||||||||| | |||||| | ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||| |||||||||| |||    
T  13508119 atcatgatgttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgacgttccaaattattg 13508218  T
Q  263 gatta-tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    || || |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  13508219 gactattataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagtgttgggggcttgatgccctggagc 13508308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 197 - 357
Target Start/End: Original strand, 45290807 - 45290968
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45290807 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttta 45290906  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45290907 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 45290968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14823941 - 14823664
Alignment:
Q  79 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 176  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |    
T  14823941 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 14823842  T
Q  177 catactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagagg 276  Q
     |||||   | |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14823841 tatactgt-tgtgttgttgtt-gttatttaactttgctgcatgagt-ggtctaaattgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagagg 14823745  T
Q  277 ttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14823744 ttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 14823664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 64 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 41598370 - 41598078
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 162  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  41598370 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 41598272  T
Q  163 atcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgtt 261  Q
     ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41598271 gtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattatt 41598174  T
Q  262 ggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  41598173 ggattatataagaggttgtcaatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagtctttgct 41598078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22875246 - 22874957
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||  |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  22875246 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 22875147  T
Q  168 gatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta 267  Q
    | || |||| ||||| ||| ||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  22875146 gttgttttgtatactgcctgtgttgctgct-gctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgttccaaattattggacta 22875048  T
Q  268 tataagaggttgtcgatttaagat-gttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22875047 tataagaggttgttgatttaagatatttaagaggtcgagtccatgcattatcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 22874957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 64 - 350
Target Start/End: Original strand, 13597551 - 13597840
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 162  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| |||||| ||||||| | |||||| ||||||||| ||||    
T  13597551 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattat 13597650  T
Q  163 atcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttg 262  Q
    ||||||||| ||||||| || | ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||| |||||||||| |||    
T  13597651 atcatgatgttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgacgttccaaattattg 13597750  T
Q  263 gatta-tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    || || |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  13597751 gactattataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagtgttgggggcttgatgccctggagc 13597840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Original strand, 18818348 - 18818631
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| ||||  ||| |||||||  ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| || | |||||| |||| ||||    
T  18818348 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcat 18818447  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18818448 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggatt 18818546  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18818547 atataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggattgatgccctggagc 18818631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 84 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22626902 - 22626631
Alignment:
Q  84 atgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatact 182  Q
    |||| |||||||  |||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||    
T  22626902 atgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgttttgtatact 22626803  T
Q  183 acctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttc-caaattgttggattatataagaggttgtc 281  Q
     ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22626802 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttttcaaattattggattatataagaggttgtc 22626704  T
Q  282 gatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 353  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22626703 gaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttggaggcttgatgccctggagcctt 22626631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 69 - 353
Target Start/End: Original strand, 28648983 - 28649273
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  |||| ||||||| |||| ||| | || ||| || |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  28648983 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 28649082  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaag----ttccaaattgttg 262  Q
    | || ||| | ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    ||||||||| |||    
T  28649083 gctgttttcgtatactgcctatgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatgtttccaaattattg 28649181  T
Q  263 gattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 353  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  28649182 gattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccttggagcctt 28649273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 140 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23406489 - 23406278
Alignment:
Q  140 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 238  Q
    ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23406489 tgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 23406391  T
Q  239 agatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggctt 337  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406390 agatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggctt 23406291  T
Q  338 gatgcccgggagc 350  Q
    ||||||| |||||    
T  23406290 gatgccctggagc 23406278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 140 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 6759368 - 6759151
Alignment:
Q  140 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 238  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6759368 tgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 6759270  T
Q  239 agatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggctt 337  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759269 agatgatgatgt-ccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggttgagtccatgcattagcatttcattgttgggggctt 6759171  T
Q  338 gatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  6759170 gatgccctggagcctttgct 6759151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 104 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7372925 - 7372685
Alignment:
Q  104 cattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgtt 201  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| |||    
T  7372925 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gtt 7372827  T
Q  202 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagagg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  7372826 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagagg 7372727  T
Q  301 tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  7372726 ttgagtccatgcatcaacatttcattgttgggggcttgatgc 7372685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 76 - 349
Target Start/End: Original strand, 17612056 - 17612332
Alignment:
Q  76 tgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 174  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   |||| ||||||||||||| | |||| | | ||||||| ||||||||||||| ||    
T  17612056 tgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttt 17612155  T
Q  175 tgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataag 273  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  17612156 tgcatactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattggactattataag 17612255  T
Q  274 aggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggag 349  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||| ||||    
T  17612256 aggttgttgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggcttgatgccctggag 17612332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 69 - 342
Target Start/End: Original strand, 14409429 - 14409702
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  14409429 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 14409527  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | ||||| | | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14409528 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaggttccaaattattggatt 14409625  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  14409626 atataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggcttgatgc 14409702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 104 - 350
Target Start/End: Original strand, 21923902 - 21924149
Alignment:
Q  104 cattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgtt 201  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |||||| | || ||||| || ||| | | ||| ||||||||| |||| |||    
T  21923902 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgtt-gtt 21924000  T
Q  202 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagagg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21924001 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatgtaagaggttgtcgaattaagatgtttaagagg 21924100  T
Q  301 tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  21924101 tcaagtccatgcattagcatttcattgtt-ggggcttaatgccctggagc 21924149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 357
Target Start/End: Original strand, 983287 - 983630
Alignment:
Q  14 gaaactaagttgtttatc---ttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaca 110  Q
    ||||||||||||||||||   ||| || ||||||| ||||||| ||||   |||||| |  |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  983287 gaaactaagttgtttatcatgttgttgttgttgtttcagtaagtctgaattatatgattgaatgttgttgataatgttatatagctgtatatacattaca 983386  T
Q  111 tgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaac 208  Q
    |||| |||  ||||| || | ||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||  |  |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  983387 tgaattatgtttgatgtt-gtgatgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaacttgtttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaac 983485  T
Q  209 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||| ||||| || |||||||||| || | || ||||||||||||  || ||||    
T  983486 taagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgat---gttccaaattattggatttttataagaggtcgttgtttctaagatgttaagttgttgagt 983580  T
Q  307 ccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  983581 ccatgcattcgca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagtctttgct 983630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 173 - 350
Target Start/End: Original strand, 18879276 - 18879451
Alignment:
Q  173 tttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataa 272  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  18879276 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataa 18879374  T
Q  273 gaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18879375 gaggttgtc--attaagatgtttaagaggtcgagttcatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 18879451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 124 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20536334 - 20536113
Alignment:
Q  124 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 222  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20536334 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 20536236  T
Q  223 cggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgt-taagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20536235 cggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattgaattatataagagattgttgaattaagatgtctaagaggtctagtccatgcattagcatt 20536136  T
Q  322 tcattgttgggggcttgatgccc 344  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  20536135 tcattgttgggggtttgatgccc 20536113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 131 - 350
Target Start/End: Original strand, 21389454 - 21389672
Alignment:
Q  131 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 230  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389454 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21389551  T
Q  231 gttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattata-taagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 328  Q
    | || | |||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  21389552 gatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactatattaagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcatagt 21389650  T
Q  329 tgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  21389651 tgggggcttgatgccctggagc 21389672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 131 - 350
Target Start/End: Original strand, 21778780 - 21778998
Alignment:
Q  131 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 230  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778780 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21778877  T
Q  231 gttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattata-taagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 328  Q
    | || | |||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  21778878 gatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactatattaagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcatagt 21778976  T
Q  329 tgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  21778977 tgggggcttgatgccctggagc 21778998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 124 - 350
Target Start/End: Original strand, 21918995 - 21919222
Alignment:
Q  124 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 222  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21918995 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 21919093  T
Q  223 cggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcat 320  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  21919094 cggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca- 21919192  T
Q  321 ttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  21919193 ttcattgttgcgggcttgatgccctggagc 21919222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 131 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 31971375 - 31971155
Alignment:
Q  131 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 230  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| || |||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31971375 agatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 31971277  T
Q  231 gttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg--ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 327  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  31971276 gttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgttttaagagatcgagtccatgcattagca-ttcattg 31971178  T
Q  328 ttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  31971177 ttgggggcttgatgccctggagc 31971155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 353
Target Start/End: Original strand, 17266874 - 17267214
Alignment:
Q  11 taagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaca 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| || ||||   |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  17266874 taagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtgagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaca 17266973  T
Q  111 tgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaac 208  Q
     ||| |||   |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||   | |||   |||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  17266974 agaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaaccgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaac 17267073  T
Q  209 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |   |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||   || ||||||||||||  || ||||    
T  17267074 taagctgcatgagtcggtctaagatga--aagatgtt---gttccaaattattggatttatataagaggtcgttttttctaagatgttaagttgttgagt 17267168  T
Q  307 ccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 353  Q
    ||||||||   || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17267169 ccatgcatactca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt 17267214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 131 - 350
Target Start/End: Original strand, 16199647 - 16199866
Alignment:
Q  131 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 230  Q
    |||||| ||||| ||| | | |||||| |||| ||||| || |||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16199647 agatgtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-tttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 16199745  T
Q  231 gttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 328  Q
    | || | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16199746 gatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgt 16199844  T
Q  329 tgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  16199845 tgggggcttgatgccctggagc 16199866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 69 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 4483457 - 4483207
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  4483457 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 4483359  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4483358 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 4483262  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483261 atataagaggttgtcga-ttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 4483207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 131 - 350
Target Start/End: Original strand, 21395984 - 21396202
Alignment:
Q  131 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 230  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21395984 agatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctg--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21396081  T
Q  231 gttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattata-taagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 328  Q
    | || | |||||||||| |||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  21396082 gatgttgaagatgatgatgttccacattattggactatattaagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcatagt 21396180  T
Q  329 tgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||| |||||| |||||    
T  21396181 tgggggctttatgccctggagc 21396202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 131 - 350
Target Start/End: Original strand, 21790477 - 21790695
Alignment:
Q  131 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 230  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21790477 agatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctg--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21790574  T
Q  231 gttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattata-taagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 328  Q
    | || | |||||||||| |||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  21790575 gatgttgaagatgatgatgttccacattattggactatattaagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcatagt 21790673  T
Q  329 tgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||| |||||| |||||    
T  21790674 tgggggctttatgccctggagc 21790695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37116588 - 37116366
Alignment:
Q  11 taagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaca 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||  | |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  37116588 taagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatttagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattaca 37116489  T
Q  111 tgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaac 208  Q
    |||| |||   |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |||| ||||||||| ||||||||  |||||    
T  37116488 tgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaac 37116389  T
Q  209 taagctgcatgagtcggtctaag 231  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  37116388 taagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 179 - 350
Target Start/End: Original strand, 45131047 - 45131218
Alignment:
Q  179 tactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggt 277  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||| ||||| | || ||||||||    
T  45131047 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatttaagaggt 45131145  T
Q  278 tgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45131146 tgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 45131218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 197 - 342
Target Start/End: Original strand, 25484380 - 25484524
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 295  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  25484380 ttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatgaagttctaaattattggattatacaaga-gttgtcgatttaagatgttta 25484478  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  25484479 agaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttgtgggcttgatgc 25484524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 197 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23648606 - 23648446
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg------atgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaaga 290  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||      |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  23648606 ttgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatataagaggttgtcgaattaaga 23648507  T
Q  291 tgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  23648506 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcacagttgggggcttgatgccctggagc 23648446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 24353265 - 24352919
Alignment:
Q  9 gataagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttc---cagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatataca 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||    
T  24353265 gataagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgca 24353166  T
Q  106 ttacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttat 203  Q
    ||||||||| | |    ||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |||| ||||||||| ||||||||      
T  24353165 ttacatgaattgtatacgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgttta 24353067  T
Q  204 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtc 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |   |||||||||| ||||| |||||||||||||    | | ||||||| ||||  ||     
T  24353066 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga--aagatgtt---gttccaaattattggatttatataagaggtccatgttctaagatg-taagttgtt 24352973  T
Q  303 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24352972 gagtccatgcatactca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 24352919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 231
Target Start/End: Original strand, 17439438 - 17439609
Alignment:
Q  62 atatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 161  Q
    |||||| || |||||| | ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||   |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  17439438 atatgatttaatgttgataataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtta 17439537  T
Q  162 tatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 231  Q
    ||||||||  || |||   |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17439538 tatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaag 17439609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 69 - 321
Target Start/End: Original strand, 16413301 - 16413547
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  16413301 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 16413399  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | ||||| | | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||| ||||| |    
T  16413400 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat------gttccaaattattggact 16413491  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    || ||||||||  |  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16413492 atttaagaggtcatttaattaagatgtttaagtggtcgagtccatgcattagcatt 16413547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22965707 - 22965608
Alignment:
Q  243 gatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatg 341  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||    
T  22965707 gatgaagttccaaattattggattatataagaggttgccgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcagtgattggggcttgatg 22965609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 197 - 274
Target Start/End: Original strand, 19937118 - 19937194
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataaga 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  19937118 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaag-tccaaattattggattatataaga 19937194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 197 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 32121785 - 32121654
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg------atgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaaga 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||      |||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| || || ||||||    
T  32121785 ttgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgataatgatgttccaaattattggactatttaagaggtcgttgagttaaga 32121686  T
Q  291 tgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32121685 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 32121654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 197 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 26223969 - 26223841
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga---tgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg- 292  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||     
T  26223969 ttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgattaagatgttgatgatgttccaaattattggactatttaagaggtcgttgaattaagttgt 26223870  T
Q  293 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26223869 ttaagaggtcgagtccatgcattaacatt 26223841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22364903 - 22364744
Alignment:
Q  9 gataagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacatta 108  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| |||| || |||||| ||||||| |||||    
T  22364903 gataataaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataaagtgatataaatgtatatgcatta 22364804  T
Q  109 catgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga 169  Q
    |||||| |||   |||| |||||||||||| ||| || | || ||||||||||||||||||    
T  22364803 catgaattatatatgatgtttgagatgttgttgattttc-tttgatattgttatatcatga 22364744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 21383996 - 21383887
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  21383996 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 21383897  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  21383896 t-atgatgatt 21383887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 277
Target Start/End: Original strand, 18678170 - 18678256
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg------atgaagttccaaattgttggattatataagaggt 277  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||      |||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  18678170 ttgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgttccaaattattggactatttaagaggt 18678256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Original strand, 18862412 - 18862521
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  18862412 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 18862511  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  18862512 t-atgatgatt 18862521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 21387416 - 21387307
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  21387416 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 21387317  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  21387316 t-atgatgatt 21387307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 21411289 - 21411180
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  21411289 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 21411190  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  21411189 t-atgatgatt 21411180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 21805781 - 21805672
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  21805781 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 21805682  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  21805681 t-atgatgatt 21805672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Original strand, 21827781 - 21827890
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  21827781 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 21827880  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  21827881 t-atgatgatt 21827890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15070608 - 15070571
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070608 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 277
Target Start/End: Original strand, 19154936 - 19155032
Alignment:
Q  178 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagagg 276  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||| ||   ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19154936 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatga--aagatgttg--tttccaaattattggatttatataagagg 19155031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 169
Target Start/End: Original strand, 40492807 - 40492891
Alignment:
Q  84 atgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga 169  Q
    |||| ||||| |||||||| || | |||||| ||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  40492807 atgtaatatatttgtatatgcaat-catgaattatttatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatga 40492891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 19801362 - 19801527
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 162  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||  ||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| |||||||| || |||||| ||||    
T  19801362 atgacttgatgttgtt-atattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattat 19801460  T
Q  163 atcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 231  Q
     ||||| || |||| |||||   | ||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19801461 gtcatgctgttttgtatactgt-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 293 - 342
Target Start/End: Original strand, 19937195 - 19937244
Alignment:
Q  293 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  19937195 ttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggcttgatgc 19937244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 81)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 357
Target Start/End: Original strand, 39706179 - 39706518
Alignment:
Q  19 taagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtat 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||   ||||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39706179 taagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcctgaattatatgatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattat 39706278  T
Q  119 tattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcat 218  Q
      ||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39706279 g-ttgatgtttatgatgttcatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcat 39706377  T
Q  219 gagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat-tata-taagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcatt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| | || ||||| ||||||  || | |||||||||||    
T  39706378 gagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattggatatatattaagaggttgttgtttataagaagttaagttgttgtgtccatgcatt 39706477  T
Q  316 agcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39706478 agca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 39706518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 6 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 8846616 - 8846287
Alignment:
Q  6 agagataagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatataca 105  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8846616 agagattagaaactaagttgtttatcttgtagttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatataca 8846517  T
Q  106 ttacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt----------------gttatatcatgatgatttgcatactacctatg 189  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  8846516 ttacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttagcattcgatattgttatctcatgatgatttgcatactgcctatg 8846417  T
Q  190 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaa 288  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| | | |||    
T  8846416 ttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggacttatttaagaggttgttgttctaa 8846320  T
Q  289 gatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    | |||||||| || | |||||||||||||||||    
T  8846319 gttgttaagatgttgtgtccatgcattagcatt 8846287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15552050 - 15551716
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    ||||||||||||||| | | ||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552050 agaaactaagttgtt-accctgctgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaatcaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatg 15551952  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    |  ||   |||||| ||||| |||||||   || | ||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15551951 acttaagtttgataattgagttgttgat---ttaccttcgatattattatatcatgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 15551855  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccat 310  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||    
T  15551854 ctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaataggtcgagtccat 15551755  T
Q  311 gcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15551754 gcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 15551716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 357
Target Start/End: Original strand, 43198429 - 43198776
Alignment:
Q  6 agagataagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatataca 105  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43198429 agaggtaaaaaactaagttgtttatcttgttgttgatgttccagtaagactaatgcatatgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatataca 43198528  T
Q  106 ttacatgaagtat-tattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgtta 202  Q
    |||| |||| ||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  || |||||||| |  |||||||| |||||||||    
T  43198529 ttacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcatgaattgttttgcatattgtctatgttgctgtttgtta 43198628  T
Q  203 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||   |||||||||| ||||| ||||||||||||||||   | ||||| ||| ||  ||    
T  43198629 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagaagat---gttccaaattattggatttatataagaggttgt--ttctaagaggttgagttgt 43198721  T
Q  302 cgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43198722 tgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 43198776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 357
Target Start/End: Original strand, 13727 - 14075
Alignment:
Q  6 agagataagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatataca 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13727 agaggtaagaaactaagttgtttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtttatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatataca 13826  T
Q  106 ttacatgaagtat-tattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatt 204  Q
    |||| |||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||  |    
T  13827 ttacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttat 13926  T
Q  205 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcg-atttaagatgttaagaggtc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||   |||||||||| ||||| ||||||||||||| || |  ||||||||||| ||  ||     
T  13927 taactaagctgcatgagtcggtctaagatga--aagaagat---gttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttttaagatgttgagttgtt 14021  T
Q  303 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14022 gagtccatgcattcaca-ttcattgttgggggcttgatgccctagagcctttgct 14075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 44615465 - 44615178
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  44615465 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 44615367  T
Q  168 gatg-atttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||||| |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44615366 gctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 44615269  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44615268 atataagaggttgttgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 44615178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 44773072 - 44773359
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||  ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  44773072 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 44773170  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44773171 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 44773268  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44773269 atataagaggttgtcgatttaagatattaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 44773359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 12774234 - 12773906
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| |||    
T  12774234 agaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgtt--------gtatatacattaaatg 12774143  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
     | |||  |||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12774142 gattatg-ttgataattgagatgttgttga-ttgtattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 12774045  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| |||||| ||||| | ||||||| | ||| | |||||| |||||||| |  | ||| ||||    
T  12774044 ctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgtt-caaattattggact-tataagatgatgttgttttaagttgttaagatgatgtgtcgatgc 12773950  T
Q  313 attagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  12773949 attaaca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcttttgct 12773906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 15118337 - 15118624
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  15118337 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 15118435  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15118436 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 15118533  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15118534 atataagaggttgtcgatttaagatattaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 15118624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 52312687 - 52312400
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  52312687 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 52312589  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52312588 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 52312491  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52312490 atataagaggttgtcgatttaagatattaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 52312400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 197 - 357
Target Start/End: Original strand, 50222451 - 50222611
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222451 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 50222550  T
Q  297 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50222551 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 50222611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 79 - 354
Target Start/End: Original strand, 12301 - 12577
Alignment:
Q  79 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 176  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |    
T  12301 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 12400  T
Q  177 catactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagagg 276  Q
     |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12401 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagagg 12498  T
Q  277 ttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc-gggagccttt 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12499 ttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctgggagccttt 12577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 69 - 344
Target Start/End: Original strand, 16377462 - 16377737
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||  |||||| |||| ||| | || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  16377462 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 16377561  T
Q  168 gatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta 267  Q
    | || |||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  16377562 gctg-tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagataatgaagttccaaattattggatta 16377659  T
Q  268 tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 344  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377660 tgtaagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 16377737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 197 - 357
Target Start/End: Original strand, 7641294 - 7641454
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7641294 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattaa 7641393  T
Q  297 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7641394 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 7641454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 197 - 357
Target Start/End: Original strand, 18239531 - 18239691
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18239531 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattaa 18239630  T
Q  297 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18239631 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 18239691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 1837494 - 1837781
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| | |||| |||| ||||    
T  1837494 ttgatgttgtt-ataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcat 1837592  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1837593 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 1837690  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1837691 atataagaggttgtcgatttaagatattacgaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 1837781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 357
Target Start/End: Original strand, 18215253 - 18215547
Alignment:
Q  63 tatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 161  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||    
T  18215253 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 18215351  T
Q  162 tatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgt 260  Q
    | ||||| || ||| | ||||| | | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  18215352 tgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtttcaaattat 18215449  T
Q  261 tggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18215450 tggattatatgagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccttggagcctttgct 18215547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 72 - 357
Target Start/End: Original strand, 44928866 - 44929153
Alignment:
Q  72 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 170  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||||| |    
T  44928866 atgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgct 44928965  T
Q  171 gattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattata 269  Q
    | ||| | ||||| | | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44928966 gtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattata 44929064  T
Q  270 taagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  44929065 taagaggttgtcgattaaagatgtttaagaggtcgaatccatggattagcatttcattgttggtggcttgatgccctggagcctttgct 44929153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 124 - 357
Target Start/End: Original strand, 54798749 - 54798983
Alignment:
Q  124 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 222  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  54798749 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagt 54798847  T
Q  223 cggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaaga-tgttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54798848 cggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaagtattggattatataagaggttgtcgatttaagatttttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 54798947  T
Q  322 tcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  54798948 tcattgttgggggcttgatgccctagagcctttgct 54798983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 104 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7798921 - 7798681
Alignment:
Q  104 cattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgtt 201  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| |||    
T  7798921 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gtt 7798823  T
Q  202 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagagg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  7798822 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttctaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagagg 7798723  T
Q  301 tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7798722 tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 7798681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Original strand, 16270175 - 16270458
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| | ||||||||| |||||| |||| ||||    
T  16270175 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcat 16270274  T
Q  168 gatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtt-ccaaattgttggatt 266  Q
    | || |||| ||||| ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  16270275 gctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgtttccaaattattggatt 16270373  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16270374 atataagaggttgtcgaattaagatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 16270458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 197 - 357
Target Start/End: Original strand, 15355437 - 15355598
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  15355437 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgaagttccaaattattggattatataagaggtagtcgatttaagaagttta 15355536  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15355537 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 15355598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22636617 - 22636334
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||| | |||| |||| |||||||  ||||| |||||| ||||| ||  |||| ||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||    
T  22636617 ttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcat 22636518  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | | |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  22636517 gctgtttttgtaaactgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgattttccaaattattggatt 22636419  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgt-taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22636418 atataagaggttgttgaattaagatgtctaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 22636334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 125 - 344
Target Start/End: Original strand, 52873363 - 52873583
Alignment:
Q  125 tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 223  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52873363 tatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 52873461  T
Q  224 ggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 322  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52873462 ggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacattt 52873561  T
Q  323 cattgttgggggcttgatgccc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  52873562 cattgttgggggcttgatgccc 52873583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 91 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7893863 - 7893601
Alignment:
Q  91 ataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctat 188  Q
    ||||| |||| | |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| |||||    
T  7893863 ataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctat 7893764  T
Q  189 gttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtt-ccaaattgttggattatataagaggttgtcgattta 287  Q
    |||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  7893763 gttgctatt-gttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatgtttccaaattattggattatataagaggttgtcgaatta 7893665  T
Q  288 agatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7893664 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 7893601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 357
Target Start/End: Original strand, 12288094 - 12288434
Alignment:
Q  14 gaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||   |||||| || ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12288094 gaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttggtaatgttatatagttgtatatacattacatga 12288193  T
Q  114 agtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaa 211  Q
    | |||  |||||  ||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12288194 attatgtttgat-gttgtgatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa 12288292  T
Q  212 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtcca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||| ||||| ||| ||||||| |  | | || |||||||||| |  || ||||||     
T  12288293 gctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgat---gttccaaattattggatttacataagagatcattgtttctaagatgttaggttgttgagtccc 12288387  T
Q  310 tgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
     ||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  12288388 agcattcgca-ttcattgttgggggcttgatgctctggagcctttgct 12288434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 124 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 44052955 - 44052728
Alignment:
Q  124 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 222  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  44052955 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgtt-gttatttaactgagctgcatgagt 44052857  T
Q  223 cggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || | |||||||||||    
T  44052856 cggcctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgaatctacgcattagcatt 44052757  T
Q  322 tcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44052756 tcattgttgggggcttgatgccctggagc 44052728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 124 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 14280438 - 14280209
Alignment:
Q  124 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 222  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14280438 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 14280341  T
Q  223 cggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280340 cggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatacaagagtttgtcaatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 14280241  T
Q  322 tcattgttgggggcttgatgccc-gggagcct 352  Q
    | |  |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14280240 ttaaagttgagggcttgatgccctgggagcct 14280209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 124 - 357
Target Start/End: Original strand, 8574864 - 8575095
Alignment:
Q  124 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 223  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||   | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8574864 atatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 8574961  T
Q  224 ggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 322  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8574962 ggtctaagttaattaagatgatgaggttccaaagcattggattatataagaggttgtggatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 8575061  T
Q  323 cattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  8575062 cattgtt-ggggcttgatgccctggagcctttgct 8575095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14038830 - 14038548
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||| | |||||| |||| ||| | || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||  |||    
T  14038830 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccat 14038731  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | ||||| | | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        ||||| |||||||    
T  14038730 gttgtttttgtatactgcatgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat--------aaattattggatt 14038640  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14038639 atataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 14038548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Original strand, 16239909 - 16240192
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| || | |||||||  ||| | |||||| | |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  16239909 ttgatgttgattatgatatgatataatgttatttgcattacttaaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 16240008  T
Q  168 gatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtt-ccaaattgttggatt 266  Q
    | || |||| ||||| ||||| ||| | || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| || ||||    
T  16240009 gctgttttgtatactgcctattttgctatt-gttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgtttccaaattattagatt 16240107  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16240108 atataagaggttgtcgaattaagatgtttaacaggtcgagtccatgcattagcatttcattgatgggggcttgatgccctggagc 16240192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 124 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12902883 - 12902656
Alignment:
Q  124 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 222  Q
    |||||| |||||||||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12902883 atatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 12902785  T
Q  223 cggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcat 320  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  12902784 cggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca- 12902686  T
Q  321 ttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12902685 ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 12902656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 79 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 44102382 - 44102140
Alignment:
Q  79 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 176  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| | ||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |    
T  44102382 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 44102283  T
Q  177 catactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagagg 276  Q
     ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  44102282 tatactac-tgtgttattgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatacaagagt 44102185  T
Q  277 ttgtcgatttaagatgt-taagaggtcgagtccatgcattagcat 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44102184 ttgtcgatttaagatgtctaagaggtcgagtccatgcattagcat 44102140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 63 - 342
Target Start/End: Original strand, 51463847 - 51464124
Alignment:
Q  63 tatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 161  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||  |||| |||   ||| || |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||    
T  51463847 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattatta 51463945  T
Q  162 tatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgt 260  Q
    | ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51463946 tgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattat 51464043  T
Q  261 tggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  51464044 tggattatacaaga-gttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttgggggcttgatgc 51464124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 64 - 357
Target Start/End: Original strand, 52243128 - 52243420
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtat-tattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 162  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || | ||| |||  || |||||||||||| ||| || |||| |||||||||||    
T  52243128 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttat 52243227  T
Q  163 atcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgt 260  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||   |||||||||| |    
T  52243228 atcatgaactgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagaagat---gttccaaattat 52243322  T
Q  261 tgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||| |||||||||||||||| | || ||| | ||  ||  || | ||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52243323 tggatttatataagaggttgttgtttctaataggtcgagttgttgtgtccaggcattagca-ttcatttatgggggcttgatgccctggagcctttgct 52243420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16596882 - 16596686
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16596882 agaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttcaagtaagactgatgcttataaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatg 16596783  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    |  ||   |||||| ||||   |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16596782 acttaagtttgataattga---gttgatgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 173 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3096369 - 3096192
Alignment:
Q  173 tttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgtt-ggattatata 271  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || | || |||||    
T  3096369 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattagaataatata 3096271  T
Q  272 agaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3096270 agaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 3096192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899808
Alignment:
Q  79 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc 177  Q
    |||| |||| |||||||  ||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||   ||| || ||||     
T  6900062 ttatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttttgt 6899963  T
Q  178 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaag-ttccaaattgttggattatataagagg 276  Q
    ||||| ||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  6899962 atactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtttccaaattattgaattatataagagg 6899864  T
Q  277 ttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgg 331  Q
    || |||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6899863 ttttcgaattaaaatgtttaagaggtcgaatccatgcattagcatttcattattgg 6899808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 197 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12611000 - 12610856
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||| |||    
T  12611000 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatacaata-gttgtcgatttaagatgttta 12610902  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  12610901 agaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttgggggcttgatgc 12610856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 178 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 17046559 - 17046386
Alignment:
Q  178 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagagg 276  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  17046559 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagagg 17046460  T
Q  277 ttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  17046459 ttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattaaca-ttcatagttgagggcttgatgccctggagc 17046386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 197 - 342
Target Start/End: Original strand, 23803377 - 23803521
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  23803377 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattgaattatacaaga-gttgtcgatttaagatgttta 23803475  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  23803476 agaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttgtgggcttgatgc 23803521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 133 - 350
Target Start/End: Original strand, 14053306 - 14053523
Alignment:
Q  133 atgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 232  Q
    |||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| || |||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||     
T  14053306 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaaga 14053404  T
Q  233 tgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttg 330  Q
    || | |||||||||| |||||||||| ||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14053405 tgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatgtaagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttg 14053503  T
Q  331 ggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  14053504 ggggcttgatgccctggagc 14053523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 124 - 350
Target Start/End: Original strand, 23374354 - 23374575
Alignment:
Q  124 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 222  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||  |||| ||||| |||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23374354 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 23374452  T
Q  223 cggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcat 320  Q
    || ||||||||| | ||||||      ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||     
T  23374453 cgttctaagttgttgaagatg------ttccaaattattggattaatataagaggttgtcgagttaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca- 23374545  T
Q  321 ttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23374546 ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 23374575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 350
Target Start/End: Original strand, 46640337 - 46640672
Alignment:
Q  11 taagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaca 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||||  ||||   |||||| ||||||||||| || |||| |||||| ||||||| |||||||    
T  46640337 taagaaactaagttgcttatcttactgttattgtttcagtaaacctgaattatatgatttgatgttgttaatgatgtgatataaatgtatatgcattaca 46640436  T
Q  111 tgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaac 208  Q
    |||| |||   ||||  ||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||  |||||||| ||||||||  |||||    
T  46640437 tgaattatatatgat-gttgagatgttattgattttcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgtctatgttgctgtttgtttattaac 46640535  T
Q  209 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  || ||| |   ||| |||||| ||||| ||||||||||||| |  | | ||||||||||||| || |||||    
T  46640536 taagctgcatgagtcggtctaagatga--aaaatgtt---gtttcaaattattggatttatataagaggtcgatggtctaagatgttaagatgttgagtc 46640630  T
Q  308 catgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||   || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46640631 catgcatactca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 46640672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 131 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 7088996 - 7088832
Alignment:
Q  131 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 229  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7088996 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 7088898  T
Q  230 agttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatgtt 294  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7088897 agttgatgaagatgatgatgttctaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagatgtt 7088832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Original strand, 53082033 - 53082296
Alignment:
Q  11 taagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaca 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  53082033 taagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaca 53082132  T
Q  111 tgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaac 208  Q
    |||| |||   |||| |||||||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||  || |||   |||| | ||||||| ||||||||  |||||    
T  53082133 tgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcttatgttgctgtttgtttattaac 53082231  T
Q  209 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |   |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  53082232 taagctgcatgagtcggtctaagatga--aagatgtt---gttccaaattattggatttatataagaggt 53082296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 197 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15370071 - 15369925
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatg-tt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15370071 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattggactattataagaggttgtcgaattaagatgttt 15369972  T
Q  295 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  15369971 aagaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttgggggcttgatgc 15369925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 197 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15371255 - 15371109
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatg-tt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15371255 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattggactattataagaggttgtcgaattaagatgttt 15371156  T
Q  295 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  15371155 aagaagtcgagtccatgcattacca-ttctttgttgggggcttgatgc 15371109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 197 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15402756 - 15402610
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagat-gtt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  15402756 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattggactattataagaggttgtcgaattaagatggtt 15402657  T
Q  295 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  15402656 aagaagtcgagtccatgcatttgca-ttctttgttgggggcttgatgc 15402610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 69 - 321
Target Start/End: Original strand, 19618157 - 19618415
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  19618157 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 19618255  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattgt 260  Q
    |||| ||| | ||||| | | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||| | |||||||| | |    
T  19618256 gatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgataatgttccaaactat 19618353  T
Q  261 tggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    |||| ||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618354 tggactatttaagaggtcgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 19618415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 197 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15367743 - 15367597
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15367743 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagatgttt 15367644  T
Q  295 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  15367643 aagaagtcgagtccattcattagca-ttctttgttgggggcttaatgc 15367597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 197 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15373536 - 15373390
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatg-tt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||| ||| |||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15373536 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgtttcaaattattggactattataagaggttgtcgaattaagatgttt 15373437  T
Q  295 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  15373436 aagaagtcgagtccatgcattacca-ttctttgttgggggcttgatgc 15373390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 197 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16223585 - 16223439
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16223585 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagatgttt 16223486  T
Q  295 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  16223485 aagaagtcgagtccattcattagca-ttctttgttgggggcttaatgc 16223439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 197 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 20149879 - 20149725
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 296  Q
    ||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| ||||| || || ||||||||||||||    
T  20149879 ttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatga---agttccaaattattggattatacaagagtttatcaatttaagatgttaa 20149783  T
Q  297 -gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc-gggagcct 352  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20149782 agaggtcgagtccatgcattagcattttaaagttgagggcttgatgccctgggagcct 20149725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 74 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19242872 - 19242673
Alignment:
Q  74 gttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatga 172  Q
    |||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||     
T  19242872 gttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt 19242773  T
Q  173 ttt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatata 271  Q
    ||| | |||||   | ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  19242772 ttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaag-tccaaattattggattatata 19242676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 69 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 3515184 - 3514979
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| || |    
T  3515184 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtctt 3515086  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | ||||| | | ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  3515085 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaggttctaaattattggatt 3514988  T
Q  267 atataagag 275  Q
    |||||||||    
T  3514987 atataagag 3514979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 197 - 321
Target Start/End: Original strand, 14970819 - 14970950
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaaga 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      |||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| || || ||||||    
T  14970819 ttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaaaatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaagaggtcgttgaattaaga 14970918  T
Q  291 tgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  14970919 tgtttaagaggtcgagtcgatgcattagcatt 14970950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 357
Target Start/End: Original strand, 14927842 - 14927962
Alignment:
Q  237 taagatgatgaagttccaaattgttggat-tatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggc 335  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||| | | ||| | ||||||  || | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14927842 taagatgatgatgttccaaattattagatatatataagaggttgttgttataaaaagttaagttgttgtgtccatgcattagcatt-cattgttgggggc 14927940  T
Q  336 ttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  14927941 ttgatgccctggagcctttgct 14927962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 297 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 29267570 - 29267510
Alignment:
Q  297 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29267570 gaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 29267510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 197 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22353886 - 22353740
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga-agttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg-- 292  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | || ||||||| | | ||||||| || |||| ||||||||||  ||| | ||||||||      
T  22353886 ttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatattcccaaattattcgattaatataagagg--gtcaaattaagatgtt 22353789  T
Q  293 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||    
T  22353788 ttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcagtgattggggcttgatgc 22353740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 249 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14157854 - 14157746
Alignment:
Q  249 gttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccggg 347  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||    
T  14157854 gttccaaattattggactatataagatgttgtcgtttctaagaggttgagttgtctagtccatgcattagcata-cattgttgagggcttgatgccctgg 14157756  T
Q  348 agcctttgct 357  Q
    ||||||||||    
T  14157755 agcctttgct 14157746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 249 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14164559 - 14164451
Alignment:
Q  249 gttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccggg 347  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||    
T  14164559 gttccaaattattggactatataagatgttgtcgtttctaagaggttgagttgtctagtccatgcattagcata-cattgttgagggcttgatgccctgg 14164461  T
Q  348 agcctttgct 357  Q
    ||||||||||    
T  14164460 agcctttgct 14164451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Original strand, 630710 - 630819
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| | |||  |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  630710 atgatttgatgttatttataatgttatataattggatatatattgcatgcattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 630809  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  630810 t-atgatgatt 630819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 3332070 - 3331961
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  3332070 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacatgcatttgtaattgttata 3331971  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  3331970 t-atgatgatt 3331961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Original strand, 14953897 - 14954006
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  14953897 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 14953996  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  14953997 t-atgatgatt 14954006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 15099526 - 15099461
Alignment:
Q  72 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttg 138  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||    
T  15099526 atgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatgaatta-tgttgatatttgagatgttg 15099461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 15190493 - 15190428
Alignment:
Q  72 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttg 138  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||    
T  15190493 atgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatgaatta-tgttgatatttgagatgttg 15190428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 25690246 - 25690137
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  25690246 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 25690147  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  25690146 t-atgatgatt 25690137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 168
Target Start/End: Original strand, 15464865 - 15464970
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtat-tattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 162  Q
    |||| ||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| || ||| |||| ||| |||  || |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  15464865 atgatttgatgtcgtttaaaatttgatataattgtatatgcaatacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttat 15464964  T
Q  163 atcatg 168  Q
    ||||||    
T  15464965 atcatg 15464970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 78 - 174
Target Start/End: Original strand, 13812759 - 13812854
Alignment:
Q  78 tttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 174  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  13812759 tttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 13812854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6190528 - 6190481
Alignment:
Q  184 cctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 231  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190528 cctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10713192 - 10713083
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  || ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  10713192 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 10713093  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  10713092 t-atgatgatt 10713083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10926962 - 10926853
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  || ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  10926962 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 10926863  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  10926862 t-atgatgatt 10926853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15225417 - 15225308
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||  || ||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  15225417 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattaagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 15225318  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  15225317 t-atgatgatt 15225308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Original strand, 15868645 - 15868754
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||  | | |  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  15868645 atgaattgatgatatttataatgttatataattggatatttattgcatgaattatggtcgctgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 15868744  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  15868745 t-atgatgatt 15868754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 12488045 - 12487941
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 168  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  || ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||    
T  12488045 ttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atg 12487947  T
Q  169 atgatt 174  Q
    ||||||    
T  12487946 atgatt 12487941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 14164783 - 14164732
Alignment:
Q  16 aactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatga 67  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||  |||||||    
T  14164783 aactaagttgtttatcttgctgttgttgttctagtaagcctgaatcatatga 14164732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 293 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19242672 - 19242623
Alignment:
Q  293 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  19242672 ttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggcttgatgc 19242623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 168
Target Start/End: Original strand, 7641177 - 7641276
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtat-tattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| | |  ||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  7641177 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 7641275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 199 - 231
Target Start/End: Original strand, 21815699 - 21815731
Alignment:
Q  199 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 231  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21815699 gttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 32851545 - 32851450
Alignment:
Q  79 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaagt-attattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 174  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||  || |||||| | || ||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  32851545 ttataatgttatatagttggatatatgttgcatgaaattatgattgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 32851450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1326 - 988
Alignment:
Q  6 agagataagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatataca 105  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  1326 agaggtaagaaactaagttttttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgtatatgatttgatgttgttgttaatgttatatagttgtatataca 1227  T
Q  106 ttacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttattt 205  Q
    || |||||| |||  ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1226 ttccatgaattatgtttgatgtttgaaatgttgatgacctgtattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttattt 1127  T
Q  206 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcga 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||   | ||||| ||| ||  || |     
T  1126 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagaagat---gttccaaattattggatttatataagagattgt---tctaagaggttgagttgttgt 1033  T
Q  305 gtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1032 gtccatgaattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Original strand, 919 - 1263
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaat-tgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacat 111  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||    ||  ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  919 agaaactaagttatttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgta--aatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacat 1016  T
Q  112 gaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaa 211  Q
    ||| |||  ||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1017 gaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatgttgttatatcatgatgatctgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaa 1116  T
Q  212 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat-tatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtcca 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | || ||||| ||||||  || | |||||    
T  1117 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattggatatatttaagaggttgttgtttataagaagttaagttgttgtgtcca 1216  T
Q  310 tgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1217 tgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 1263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 6854 - 6503
Alignment:
Q  7 gagataagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacat 106  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||  |||   ||||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  6854 gagattagaatctaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcttgaattatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacat 6755  T
Q  107 tacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttattta 206  Q
    |||||||| |||  ||||| |||   ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6754 tacatgaattatgtttgatgtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttattta 6655  T
Q  207 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat-tatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcga 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | || ||||| ||||||  || |     
T  6654 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattggatatatttaagaggttgttgcttataagaagttaagttgttgt 6555  T
Q  305 gtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6554 gtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 6503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14234 - 13883
Alignment:
Q  7 gagataagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacat 106  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||  |||   ||||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14234 gagattagaatctaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcttgaattatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacat 14135  T
Q  107 tacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttattta 206  Q
    |||||||| |||  ||||| |||   ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14134 tacatgaattatgtttgatgtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttattta 14035  T
Q  207 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat-tatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcga 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | || ||||| ||||||  || |     
T  14034 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattggatatatttaagaggttgttgcttataagaagttaagttgttgt 13935  T
Q  305 gtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13934 gtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 13883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 13003 - 12658
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13003 agaaactaagtggtttatcttgctgttgttgttccagtaagcctgaattatatgatctaatgttgttattaatgttatataattgtatatacattacatg 12904  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    || |||  ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12903 aattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaag 12804  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgat-ttaagatgttaagaggtcgagtccat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||| | |  ||||| ||||||  || | ||||||    
T  12803 ctgcatgagtcggtctaagttgatgattatgatgatgttccaaatgattggacttatataagaggttgttgttaataagaagttaagttgttgtgtccat 12704  T
Q  311 gcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12703 gcattatca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 12658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15895 - 15570
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |  || ||||||||||||||| | |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15895 agaaactaagttgtttaccttgctgttaatgatccagtaagactgattcttatgaaataatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatg 15796  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    |  ||   |||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15795 acttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 15699  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatg 311  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  15698 ctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatacaaga-gttgtcgatttaagatgtttaagaattcgagtccatg 15600  T
Q  312 cattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
     ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  15599 gattagca-ttctttgttgggggcttgatgc 15570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Original strand, 2529 - 2868
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacat 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  2529 agaaattaagttgtttatcttgctgatgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatat 2628  T
Q  112 gaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaa 211  Q
    ||| |||  |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2629 gaattatg-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcaatattgttataacatgatgatttacatactgcctatgttgatgtttgttatttaactaa 2727  T
Q  212 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatg 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||| | ||||||| ||||||  || | |||||||    
T  2728 gctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggact-tataagaggttgttgttttaagaagttaagttgttgtgtccatg 2823  T
Q  312 cattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2824 cattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 2868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 34357 - 34028
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |  | |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  34357 agaaactaagttgtttaccttgctgttaattttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatatattacttg 34258  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    |  ||   |||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34257 acttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgggttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaag 34161  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccat 310  Q
    ||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||    
T  34160 ctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagttgcttaagaggtcgagtctat 34061  T
Q  311 gcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34060 gcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccc 34028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 197 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 172
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 295  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  326 ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgttta 227  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  226 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10771 - 10429
Alignment:
Q  6 agagataagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatataca 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||   |||| |  | ||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  10771 agaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgtcatataattgtatataca 10672  T
Q  106 ttacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttattt 205  Q
    ||||||||| |||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10671 ttacatgaattatgttcgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttattt 10572  T
Q  206 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat-tatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcg 303  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||  || |    
T  10571 aaaaaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgat-atgttccaaattattggatatatataagaggttgttgtttataagaggttaagttgttg 10475  T
Q  304 agtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
     ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10474 tgtccatggattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 10429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 2231 - 1895
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2231 agaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagtctgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatg 2132  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    |  ||   |||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  2131 acttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaag 2035  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg--ttaagaggtcgagtcca 309  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||| || | ||| ||  ||||||||||||||| |    
T  2034 ctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgttgaatcaagttgttttaagaggtcgagtcta 1935  T
Q  310 tgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1934 tgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 1895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 11526 - 11252
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11526 agaaactaagttgtttaccttggtgttaatgttcaagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataatagtatatacattacatg 11427  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    |  ||   |||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11426 acttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 11330  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaag 289  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11329 ctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaag 11252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 131 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 28533 - 28312
Alignment:
Q  131 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 229  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28533 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 28435  T
Q  230 agttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 327  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28434 agttgatgaagatgatgatgttccaaactattggactaatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 28335  T
Q  328 ttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  28334 ttgggggcttgatgccctggagc 28312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 194 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4450
Alignment:
Q  194 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagatg 4509  T
Q  293 --ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
      || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4508 tttttagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 4450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 19501 - 19159
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgca-tatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacat 111  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||  |||||  | |||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  19501 agaaactaagttgtttatcttgatgttgttgtttcagtaaccctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatat 19402  T
Q  112 gaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaa 211  Q
    ||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19401 gaattatg-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa 19303  T
Q  212 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtcca 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | || ||||| ||||||  ||   |||||    
T  19302 gctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggacttatataagaggttgttgtttataagaagttaagttgttatgtcca 19206  T
Q  310 tgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19205 tgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccttggagcctttgct 19159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 32328 - 31996
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      ||||||||| |||    
T  32328 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaatg 32235  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaa 211  Q
     | |||  |||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  32234 gattatg-ttgataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaa 32137  T
Q  212 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatg 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| | ||| | |||||| |||||||| |  | |||||||    
T  32136 gctgcatgagtcggtctaagatgat---gatgatgatgttccaaattattggact-tataagatgatgttgttttaagttgttaagatgatgtgtccatg 32041  T
Q  312 cattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32040 cattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 31996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 68)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 42 - 342
Target Start/End: Original strand, 23071865 - 23072163
Alignment:
Q  42 tgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatg 141  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   |||||| ||||| || ||||     
T  23071865 tgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgctgat- 23071963  T
Q  142 acttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 241  Q
      ||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  23071964 --ttatattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaaga 23072061  T
Q  242 tgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttga 339  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23072062 tgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttttcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttga 23072160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 25176087 - 25175749
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  25176087 agaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattatatatacgttatat 25175988  T
Q  112 gaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaa 211  Q
    ||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25175987 gaattatg-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa 25175889  T
Q  212 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccat 310  Q
    ||||||||| || ||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||| | || ||||| ||||||  || | ||||||    
T  25175888 gctgcatgaatctgtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggact-tataagaggttgttgtttataagaagttaagttgttgtgtccat 25175793  T
Q  311 gcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttg 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25175792 gcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttg 25175749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18809120 - 18808833
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  18809120 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 18809022  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18809021 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 18808924  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18808923 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 18808833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 23711998 - 23712285
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  23711998 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 23712096  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23712097 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 23712194  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23712195 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 23712285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 26505556 - 26505269
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  26505556 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 26505458  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | |  ||| | ||||| | | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26505457 gctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 26505360  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26505359 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 26505269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 26508034 - 26507747
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  26508034 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 26507936  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | |  ||| | ||||| | | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26507935 gctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 26507838  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26507837 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 26507747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 39682490 - 39682203
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  39682490 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 39682392  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39682391 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 39682294  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39682293 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 39682203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 23135767 - 23135480
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  23135767 ttgatgttgtt-atactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 23135669  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23135668 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 23135571  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23135570 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 23135480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 188 - 357
Target Start/End: Original strand, 45029958 - 45030126
Alignment:
Q  188 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgattta 287  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45029958 tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgattta 45030056  T
Q  288 agatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45030057 agatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 45030126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 24905617 - 24905905
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  24905617 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 24905715  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat 265  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24905716 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggat 24905813  T
Q  266 tatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24905814 tatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 24905905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 24908092 - 24908380
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  24908092 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 24908190  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat 265  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24908191 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggat 24908288  T
Q  266 tatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24908289 tatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 24908380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 23709517 - 23709804
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  23709517 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 23709615  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23709616 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 23709713  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23709714 atataagaggttgtcgatttaagatattacgaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 23709804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 24898180 - 24898468
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  24898180 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 24898278  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat 265  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24898279 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggat 24898376  T
Q  266 tatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24898377 tatataagaggttgttgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 24898468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 24900663 - 24900951
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  24900663 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 24900761  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat 265  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24900762 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggat 24900859  T
Q  266 tatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24900860 tatataagaggttgttgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 24900951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 24903140 - 24903428
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  24903140 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 24903238  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat 265  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24903239 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggat 24903336  T
Q  266 tatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24903337 tatataagaggttgttgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 24903428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 571574 - 571287
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   |||  | |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  571574 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 571476  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  571475 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 571378  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  571377 atataagaggttgtcgatttaagatattacgaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 571287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 6726172 - 6725885
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| |||||| |||| |||||| |||| ||||    
T  6726172 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcat 6726074  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  6726073 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattgaatt 6725976  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6725975 atataagaggttgtcgatgtaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 6725885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 28577276 - 28576989
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| || |||||||| |||||| |||||||||    
T  28577276 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcat 28577178  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   |  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28577177 gctgtttttgtatactgt-tgcgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 28577080  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28577079 atataagaagttgttgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 28576989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 63 - 357
Target Start/End: Original strand, 32039477 - 32039770
Alignment:
Q  63 tatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 161  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||    
T  32039477 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 32039575  T
Q  162 tatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgt 260  Q
    | ||||| || ||| | |||||   | ||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32039576 tgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttactgtt-gttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattat 32039673  T
Q  261 tggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32039674 tggattatataagaggttgtcgatttaagatattacgaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 32039770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 21155045 - 21155332
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  21155045 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 21155143  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  21155144 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgaagaagttccaaattattggatt 21155241  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21155242 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagttcatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctagagcctttgct 21155332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 188 - 357
Target Start/End: Original strand, 24529633 - 24529802
Alignment:
Q  188 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgattta 287  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529633 tgttgttgtt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgattta 24529731  T
Q  288 agatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24529732 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 24529802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23060695 - 23060411
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||| | |||||| |||||||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  23060695 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 23060596  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtt-ccaaattgttggat 265  Q
    | || ||| | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  23060595 gttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtttccaaattattggat 23060497  T
Q  266 tatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23060496 tatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 23060411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 24367951 - 24367663
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  24367951 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 24367853  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  24367852 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatgaagttccaaattattggatt 24367755  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24367754 atataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacattacattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 24367663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 84 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 7679750 - 7679473
Alignment:
Q  84 atgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatacta 183  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| |||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7679750 atgttatataattatatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttacatt-gatattgttatatcatgatgatttgcatactg 7679652  T
Q  184 cctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat----gatgaagttccaaattgttggat-tatataagaggtt 278  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  7679651 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatggatgatgttccaaattattggatatatataagaggtt 7679552  T
Q  279 gtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |  | || ||||| ||||||  || | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7679551 gaagtttataagaagttaagttgttgtgtccatgcattaaca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 7679473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 28406214 - 28405874
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgca-tatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| || ||  | |||||  |  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  28406214 agaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaatggtatataattgtatatacattttat 28406115  T
Q  112 gaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaacta 210  Q
    ||| ||   |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  28406114 gaattaag-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaacta 28406016  T
Q  211 agctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccat 310  Q
    || |||||||||||||||||||||||   ||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||| | ||| | | |||| |||||||| |  | ||||||    
T  28406015 agttgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgattttccaaattattggact-tataagatgatgttgttctaagttgttaagatgatgtgtccat 28405920  T
Q  311 gcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28405919 gcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 28405874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 197 - 357
Target Start/End: Original strand, 24643062 - 24643223
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24643062 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgacgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgatta 24643161  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  24643162 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggaggcttgatgccctagagcctttgct 24643223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 69 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 23076624 - 23076346
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  23076624 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcat 23076525  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtt-ccaaattgttggat 265  Q
    | || ||| | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  23076524 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagatgatgatgtttccaaattattggat 23076426  T
Q  266 tatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 344  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076425 tatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggccgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 23076346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 357
Target Start/End: Original strand, 7617 - 7957
Alignment:
Q  14 gaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatga 113  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||| ||||   |||||| || ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  7617 gaaactaagttgtttatcatgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgttaatgtgatataattgtatatacattacttga 7716  T
Q  114 agtat-tattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
    | ||| |||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  7717 attatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaag 7816  T
Q  213 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccat 310  Q
    |||||||| || ||||||| |||  |||| |||   |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | || ||||| ||| ||  || ||||||||    
T  7817 ctgcatgattcagtctaagatga--aagaagat---gttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttctaagaggttgagttgttgagtccat 7911  T
Q  311 gcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  7912 gcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctatgct 7957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 68 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 19672011 - 19671728
Alignment:
Q  68 attgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   |||   ||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||    
T  19672011 attgatgttgtt-ataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatattgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcat 19671913  T
Q  168 gatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta 267  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||| |||||||||| ||||| ||    
T  19671912 gatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattggacta 19671813  T
Q  268 -tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
     |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  19671812 ttataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaagtcgagtctatgcattagcatttcatggttgggagcttgatgccctggagc 19671728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Original strand, 22134101 - 22134435
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||| |||    
T  22134101 agaaactaagttgtttatcttgctgtcatttttccagtaagactgatgcatatgaattggtgttgtttataatgtt--------gtatatacattaaatg 22134192  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaag 212  Q
     | |||  ||||||  |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  22134193 gattatg-ttgataaatgagatgttattga-ttgcattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctg-ttgatatttaactaag 22134289  T
Q  213 ctgcatgagtcggtct---aagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtcca 309  Q
    ||||||||||||||||   | | |||| | |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| |  || | | |||| |||||||| || | |||||    
T  22134290 ctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatgatgttccaaattattggact-tataagatgaagttgttctaagttgttaagatgttgtgtcca 22134388  T
Q  310 tgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22134389 tgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 22134435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 357
Target Start/End: Original strand, 18786787 - 18787127
Alignment:
Q  14 gaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatga 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| || |   |||||| |  ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18786787 gaaactaagttgtttatcatgctgttgttgtttcagtaagcctaaattatatgattgaatgttattgataatgttatatagttgtatatacattacatga 18786886  T
Q  114 agtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaa 211  Q
    | |||  ||||| || | || |||| ||| ||||||| || |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  18786887 attatgtttgatgtt-gtgacgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaactggtttgcatactacctatgttactgattgttatttaactaa 18786985  T
Q  212 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtcca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | || ||||||||||||  || |||||||    
T  18786986 gctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgat---gttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttctaagatgttaagttgttgagtcca 18787080  T
Q  310 tgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  18787081 tgcattcgca-ttcattgttgggggcttgatgccctgtggcctttgct 18787127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 69 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22105590 - 22105319
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  22105590 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 22105492  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22105491 gctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtttcaaattattggatt 22105393  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatg 341  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  22105392 atacaaga-gttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttggggacttgatg 22105319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 69 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23660204 - 23659940
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||  |||||| |||  ||| ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  23660204 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcat 23660105  T
Q  168 gatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta 267  Q
      || || | ||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23660104 cctgtttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggatta 23660006  T
Q  268 tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggg 332  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23660005 tataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggg 23659940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 124 - 342
Target Start/End: Original strand, 298809 - 299027
Alignment:
Q  124 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 222  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||  |||| ||||| |||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  298809 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 298908  T
Q  223 cggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |    
T  298909 cggtctaagttgattaagatgatgaagtttcaaatttttggattatacaaga-gttgtcgatttaacatgtttaagaagtcgagtccatgcattagca-t 299006  T
Q  322 tcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  299007 tctttgttgggggcttgatgc 299027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Original strand, 22731173 - 22731456
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||| | |||||| ||||| ||  |||| ||||| | |||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||    
T  22731173 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcat 22731272  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | | ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22731273 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgttccaaattattggatt 22731371  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgt-taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||||| || | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  22731372 atataagaggttgttgaataaagatgtctaacaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgattccctggagc 22731456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Original strand, 22738119 - 22738401
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||| | |||||| ||||| ||  |||| ||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||    
T  22738119 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcat 22738218  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | | ||| ||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22738219 gctgtttttgtaaactgcctat-ttaatgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgatgttccaaattattggatt 22738316  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgt-taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22738317 atataagaggttgttgaattaagatgtctaaaaggtcggatccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 22738401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 69 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 23131039 - 23130788
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  23131039 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 23130941  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23130940 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 23130843  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23130842 atataagaggttgtcga-ttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 23130788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 69 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 23133506 - 23133255
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  23133506 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 23133408  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23133407 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 23133310  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133309 atataagaggttgtcga-ttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 23133255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 64 - 280
Target Start/End: Original strand, 23708553 - 23708769
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 162  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||  |||| | |||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||    
T  23708553 atgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttat 23708652  T
Q  163 atcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttg 262  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||    
T  23708653 atcatgttgttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgttccaaattattg 23708750  T
Q  263 ga-ttatataagaggttgt 280  Q
    || ||||||||||||||||    
T  23708751 gatttatataagaggttgt 23708769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 69 - 321
Target Start/End: Original strand, 34402507 - 34402758
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  34402507 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 34402605  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34402606 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 34402703  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402704 atataagaggttgtcga-ttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 34402758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 124 - 350
Target Start/End: Original strand, 23654381 - 23654609
Alignment:
Q  124 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 222  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||||| ||||| || || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23654381 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 23654479  T
Q  223 cggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcat 320  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     
T  23654480 cggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcactagca- 23654578  T
Q  321 ttcattgtt-gggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  23654579 ttcattgttggggggcttgatgccctggagc 23654609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 79 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 43137467 - 43137204
Alignment:
Q  79 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 176  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   |||  | |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |    
T  43137467 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 43137368  T
Q  177 catactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagagg 276  Q
     ||| ||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  43137367 tatattac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgattaagttccaaagtattggattatataagagg 43137270  T
Q  277 ttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  43137269 ttgtcgaattaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttgggggcttgatgc 43137204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 343
Target Start/End: Original strand, 23040257 - 23040405
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  23040257 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagatgttt 23040356  T
Q  295 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcc 343  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23040357 aagaggtcgagtgcatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcc 23040405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22337297 - 22337022
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||  |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||| ||||    
T  22337297 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcat 22337198  T
Q  168 gatgatttgc-atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || |||   ||||  ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||            
T  22337197 gctgtttttatatacagcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaatt-------- 22337107  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22337106 atataagaggttgtcgaattaagaagtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 22337022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 197 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 38967424 - 38967279
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  38967424 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaaatattggattatataggagtttgtcgatttaagatgttta 38967325  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  38967324 agaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttgggggcttgatgc 38967279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 8946710 - 8946555
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaag-ttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 294  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  8946710 ttgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgttt 8946611  T
Q  295 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  8946610 aagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttagggacttgatgccctggagc 8946555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 23207517 - 23207174
Alignment:
Q  11 taagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaca 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||| ||||   |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  23207517 taagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttcaagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaca 23207418  T
Q  111 tgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaac 208  Q
    |||| ||||  | ||  ||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  ||||| ||||||||| ||||||||  |||||    
T  23207417 tgaattatttataat-gttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaac 23207319  T
Q  209 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||||||    | || || |||||||||  || ||||    
T  23207318 taagctgcatgagtcggtctaagatga--aagatgat---gttccaaattattggatttatataagaggtcaatgtttctatgatgttaagttgttgagt 23207224  T
Q  307 ccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||   || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  23207223 ccatgcatactca-ttcattgttgggggcttgatgccctggaccctttgct 23207174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 131 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20309225 - 20309007
Alignment:
Q  131 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 230  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20309225 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 20309128  T
Q  231 gttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 328  Q
    | || | |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  20309127 gatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactattataagaggttgtcgaattaagttgtttaagatgtcgagtccatgcattagca-ttcatagt 20309029  T
Q  329 tgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  20309028 tgggggcttgatgccctggagc 20309007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 23791511 - 23791170
Alignment:
Q  14 gaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  23791511 gaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatga 23791412  T
Q  114 agtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaa 211  Q
    | |||   | || |||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||  || |||   |||| |||||||||||||||| |  ||||||||    
T  23791411 attatatataatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgcttattaactaa 23791312  T
Q  212 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtcca 309  Q
    ||| |||||||||||||||| |||  |||||| |   |||||||||| ||||| |||||||||||||    | || ||||||||||||  || |||||||    
T  23791311 gctacatgagtcggtctaagatga--aagatgtt---gttccaaattattggatttatataagaggtcaatgtttctaagatgttaagttgttgagtcca 23791217  T
Q  310 tgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||   || |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  23791216 tgcatactca-ttcattgttgggggcttggtgccctggagcctctgct 23791170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 64 - 353
Target Start/End: Original strand, 22413070 - 22413357
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatat--tgtta 161  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||| || ||||||||| ||| ||||||| |||||  |||||    
T  22413070 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatgtt-gagatgttgttgatttgcatttgatatattgtta 22413168  T
Q  162 tatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattg 259  Q
    ||||||||  || |||  ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||   ||||||||||     
T  22413169 tatcatgagctgttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatga--aagatgat---gttccaaatta 22413263  T
Q  260 ttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 353  Q
    ||||| |||||||||||||    | ||||||||||||||  || ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22413264 ttggatttatataagaggtcaatgttttaagatgttaagttgttgagtccatgcatactca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt 22413357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 152 - 350
Target Start/End: Original strand, 38138 - 38337
Alignment:
Q  152 gatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtt 251  Q
    |||||| |||| ||||| || |||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||    
T  38138 gatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgtt 38236  T
Q  252 ccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcg-atttaagatg--ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccggg 347  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||| | ||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  38237 ccaaattattggactaatataagaggttgtcgaatttatgttgttttaagaggtggagtccatgcattagca-ttcattgtt-ggggcttgatgccctgg 38334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 128 - 350
Target Start/End: Original strand, 23103396 - 23103616
Alignment:
Q  128 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 227  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||  | || ||||| || |||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23103396 ttgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctg-tttgtatactgcctatgttgctgttt-ttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23103493  T
Q  228 taagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 325  Q
    |||| || | |||||||||| |||||||| | ||||| | || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  23103494 taagatgttgaagatgatgatgttccaaaatattggactaatttaagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ctcat 23103592  T
Q  326 tgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||| |||||||||||||| |||||    
T  23103593 tgtt-ggggcttgatgccctggagc 23103616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 69 - 321
Target Start/End: Original strand, 32214906 - 32215164
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  32214906 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 32215004  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattgt 260  Q
    | || ||| | ||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||| |    
T  32215005 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattat 32215102  T
Q  261 tggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    |||| ||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32215103 tggactatttaagaggtcgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 32215164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Original strand, 22459438 - 22459598
Alignment:
Q  6 agagataagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatataca 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  22459438 agaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttattgtttcagtaagactgatgtatacgagttgatgttatttataatgtgatataattgtatataca 22459537  T
Q  106 ttacatgaagtat-tattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatc 165  Q
    |||| |||  ||| | |  |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  22459538 ttacttgagttatatgtgaatatttgagatgttgatgactttcatttgatgttgttatatc 22459598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 238 - 350
Target Start/End: Original strand, 21900562 - 21900676
Alignment:
Q  238 aagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggc 335  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21900562 aagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcaagtccatgcattagcatttcattgttgggggc 21900661  T
Q  336 ttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||| |||||    
T  21900662 ttgatgccctggagc 21900676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25109130 - 25108906
Alignment:
Q  9 gataagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacatta 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||    
T  25109130 gataagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcatta 25109031  T
Q  109 catgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttattta 206  Q
    |||||| |||   |||| |||||||| ||| ||| ||   || ||||||||||||||||||  |  |||   |||| ||||||||||||||||||  |||    
T  25109030 catgaattatatatgatgtttgagatattgttgattttgctttgatattgttatatcatgaactattttatgtactgcctatgttgttgtttgtttatta 25108931  T
Q  207 actaagctgcatgagtcggtctaag 231  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  25108930 actaagctacatgagtcggtctaag 25108906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 124 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23285987 - 23285820
Alignment:
Q  124 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 223  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| || || |  |||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23285987 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc-tgtt--tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 23285892  T
Q  224 ggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgtt 294  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||| || ||||||||||    
T  23285891 ggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgttgaattaagatgtt 23285820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 62 - 357
Target Start/End: Original strand, 24697538 - 24697830
Alignment:
Q  62 atatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 161  Q
    |||||| || |||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| | |   |||  |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  24697538 atatgattttatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaagtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtta 24697637  T
Q  162 tatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattg 259  Q
    ||||||||  || ||    |||| |||| |||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||| |   |||||||||||    
T  24697638 tatcatgaactgtttgatgtactgcctacgttgttgtttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaagatga--aagatgtt---gttccaaattg 24697732  T
Q  260 ttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||| ||||||||||||| |  | || ||||||| ||||  || ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24697733 ttggatttatataagaggtcgatgtttctaagatg-taagttgttgagtccatgcatactca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 24697830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 357
Target Start/End: Original strand, 20520127 - 20520416
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| |||   |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  20520127 atgatttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttata 20520225  T
Q  164 tcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgtt 261  Q
    ||||||  || |||   |||| | ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||   |||||||||| ||    
T  20520226 tcatgaactgttttatgtactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga--aagataat---gttccaaattatt 20520320  T
Q  262 gga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||| |||||||||||||    | | |||||| |||||  || ||||||||||| |||   ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20520321 ggatttatataagaggtcaatgttctaagatattaagttgttgagtccatgca-tagtcattctttgttgggggcttgatgccctagagcctttgct 20520416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 197 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 25616238 - 25616107
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg------atgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaaga 290  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||      |||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| || || ||||||    
T  25616238 ttgtaatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttaataatgatgttccaaattattggactatttaagaggtcgttgaattaaga 25616139  T
Q  291 tgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25616138 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 25616107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 23004878 - 23004646
Alignment:
Q  122 tgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatg 219  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||| |||  |  |||   |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  23004878 tgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcctgaactattttatgtactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatg 23004779  T
Q  220 agtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattag 317  Q
    ||||||| |||| |||  ||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||| |  | || ||| ||| ||||  || ||||||||||| ||     
T  23004778 agtcggtttaagatga--aagatgat---gttccaaattgttggatttatataagaggtcgatgtttctaaaatg-taagttgttgagtccatgca-tac 23004686  T
Q  318 catttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23004685 tccttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 23004646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 357
Target Start/End: Original strand, 23713058 - 23713111
Alignment:
Q  303 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23713058 gagtccatgcattagcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 23713111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 1283766 - 1283657
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  1283766 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 1283667  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  1283666 t-atgatgatt 1283657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Original strand, 30344758 - 30344867
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  30344758 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 30344857  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  30344858 t-atgatgatt 30344867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 231
Target Start/End: Original strand, 32451984 - 32452031
Alignment:
Q  184 cctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 231  Q
    ||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32451984 cctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 357
Target Start/End: Original strand, 10822795 - 10822843
Alignment:
Q  308 catgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  10822795 catgcattagcatt-cattgtcgggggcttgatgccctagagcctttgct 10822843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 246
Target Start/End: Original strand, 21916156 - 21916215
Alignment:
Q  186 tatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 246  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |  ||| ||||||||||||||    
T  21916156 tatgttgtt-tttgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 21916215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 321 - 357
Target Start/End: Original strand, 24688477 - 24688513
Alignment:
Q  321 ttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24688477 ttcattgttgggagcttgatgccctggagcctttgct 24688513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 100611 - 100271
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacat 111  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| || | |  ||||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  100611 agaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctaaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattatat 100512  T
Q  112 gaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaa 211  Q
    ||| |||  || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  100511 gaattatg-ttaatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa 100413  T
Q  212 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||   || ||||| ||||||  || | ||||||    
T  100412 gctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattgga-tatataagaggttgttttttataagaagttaagttgttgtgtccat 100317  T
Q  311 gcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  100316 gcattagca-ttcattgttgggagcttgatgccctggagcctttgct 100271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 94588 - 94301
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  94588 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 94490  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  94489 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 94392  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  94391 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 94301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 358
Target Start/End: Original strand, 40058 - 40399
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacat 111  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  40058 agaaactaagttgtttaccttgatgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatcttatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatat 40157  T
Q  112 gaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaa 211  Q
    ||| |||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40158 gaattatg-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcctactgcctatgttgctgtttattatttaactaa 40256  T
Q  212 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccat 310  Q
    |||||||||||| ||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||| | || ||||| ||||||  || | ||||||    
T  40257 gctgcatgagtcagtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggact-tataagaggttgttggttataagaagttaagttgttgtgtccat 40352  T
Q  311 gcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctt 358  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  40353 gcattagca-ttcattgttggggacttgatgccgtggagcctttgctt 40399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 197 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 44504 - 44344
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44504 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttcaaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 44405  T
Q  297 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  44404 gaggtcgagtccatgcattagcttttaattgttggggacttgatgccctggagcctttgct 44344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 177 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 119948 - 119774
Alignment:
Q  177 catactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagag 275  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  119948 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagag 119849  T
Q  276 gttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  119848 gttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgagggcttgatgccctggagc 119774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 173 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 101576 - 101397
Alignment:
Q  173 tttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataa 272  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||||| ||||| | |||||    
T  101576 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgat---gatgatgatgttctaaattattggact-tataa 101481  T
Q  273 gaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    || | ||| | |||||| |||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  101480 gatgatgttgttttaagttgttaagatgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcccttgct 101397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 243
Target Start/End: Original strand, 17425 - 17598
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  17425 ttgatgttgtt-atactgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 17523  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 243  Q
    | || ||| | ||||| | | ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17524 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 197 - 320
Target Start/End: Original strand, 38547 - 38672
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga---tgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg- 292  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||   ||||  |||||||| ||||||| ||||||| | ||  || ||||||||     
T  38547 ttgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatt-tataaga-gatgatga-ttaagatgt 38643  T
Q  293 -ttaagaggtcgagtccatgcattagcat 320  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38644 tttaagagatcgagtccatgcattagcat 38672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 353
Target Start/End: Original strand, 3090 - 3375
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||| |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  3090 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 3189  T
Q  168 gatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta 267  Q
    | || |||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  3190 gttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggatta 3288  T
Q  268 tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 353  Q
    ||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3289 tataagaggttgttgttctaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt 3375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 20924 - 20637
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  20924 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 20826  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20825 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 20728  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20727 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 20637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 136857 - 136570
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  136857 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 136759  T
Q  168 gatg-atttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||||| |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  136758 gctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 136661  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  136660 atataagaggttgttgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 136570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 139326 - 139039
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  139326 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 139228  T
Q  168 gatg-atttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||||| |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  139227 gctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 139130  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  139129 atataagaggttgttgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 139039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 144264 - 143977
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  144264 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 144166  T
Q  168 gatg-atttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||||| |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  144165 gctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 144068  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  144067 atataagaggttgttgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 143977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 132888 - 132556
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      ||||||||| |||    
T  132888 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaatg 132795  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaa 211  Q
     | |||  |||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  132794 gattatg-ttgataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaa 132697  T
Q  212 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatg 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| | ||| | |||||| |||||||| |  | |||||||    
T  132696 gctgcatgagtcggtctaagatgat---gatgatgatgttccaaattattggact-tataagatgatgttgttttaagttgttaagatgatgtgtccatg 132601  T
Q  312 cattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  132600 cattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 132556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 141795 - 141508
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  141795 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 141697  T
Q  168 gatg-atttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||||| |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  141696 gctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 141599  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  141598 atataagaggttgttgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 141508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 134388 - 134101
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  134388 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 134290  T
Q  168 gatg-atttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||||| |||||   | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  134289 gctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 134192  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  134191 atataagaggttgttgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccgtggagcctttgct 134101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 62432 - 62216
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |   |||||| | ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  62432 agaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgttatgaactaatgatgttgttaatgttatataattgtatatacattatat 62333  T
Q  112 gaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaa 211  Q
    ||| |||  |||||||||||||||||| ||   ||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  62332 gaattatg-ttgatatttgagatgttgttg---tgcattcgatattattataccatgatgtttttcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaa 62237  T
Q  212 gctgcatgagtcggtctaagt 232  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  62236 gctgcatgagtcggtttaagt 62216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 13182 - 12835
Alignment:
Q  7 gagataagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacat 106  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||     || |  | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  13182 gagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattggataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacat 13083  T
Q  107 tacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttattta 206  Q
    |||| ||| |||  ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13082 tacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttattta 12983  T
Q  207 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgag 305  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||   |||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||| | | |||| |||||||  || |      
T  12982 actgagcagcatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgttcaaaattattggacttatataagaggttgttgttctaagttgttaagttgttgtt 12886  T
Q  306 tccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  12885 tccatgcattagca-ttcattgttgggggcttcatgccctggagcctttgct 12835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 169
Target Start/End: Original strand, 18119 - 18277
Alignment:
Q  11 taagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaca 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||   |||||  |||||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  18119 taagaaactaagttgcttatctcactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgttttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattaca 18218  T
Q  111 tgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga 169  Q
    |||| |||   |||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  18219 tgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatga 18277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 69 - 342
Target Start/End: Original strand, 38641 - 38916
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtat-tattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  || ||| |||| ||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38641 ttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcat 38740  T
Q  168 gatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta 267  Q
    | || ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  38741 gttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatgatgaggttccaaattattggatta 38840  T
Q  268 tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  38841 tataagaggttttcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggcttgatgc 38916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 69 - 353
Target Start/End: Original strand, 339889 - 340172
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  |||| ||||||| |||| ||| | || ||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||    
T  339889 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcat 339987  T
Q  168 gatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta 267  Q
    | || |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  339988 gttgttttgtatactgcctatgttgttgt--gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgacgaagatgatgaagttcaaaattattggatta 340085  T
Q  268 tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  340086 tataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt 340172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 158435 - 158723
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  158435 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 158533  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  158534 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 158631  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  158632 atataagaggttgttgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccttggagcctttgct 158723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 124 - 357
Target Start/End: Original strand, 44702 - 44936
Alignment:
Q  124 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 222  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44702 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 44800  T
Q  223 cggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44801 cagtctaagttgattaagatgatgaagttccaaagtattggattatataagaggttgtcgatttaatatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 44900  T
Q  322 tcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44901 tcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 44936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 243
Target Start/End: Original strand, 26064 - 26179
Alignment:
Q  128 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 226  Q
    |||||| |||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26064 ttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 26162  T
Q  227 ctaagttgattaagatg 243  Q
    |||||||||| ||||||    
T  26163 ctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 151; Significance: 8e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 37998 - 37711
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  37998 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 37900  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37899 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 37802  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37801 atataagaggttgtcgatttaagatattacgaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 37711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 357
Target Start/End: Original strand, 53425 - 53773
Alignment:
Q  6 agagataagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatataca 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  53425 agaggtaagaaactaagttgtttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtttatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatataca 53524  T
Q  106 ttacatgaagtat-tattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatt 204  Q
    |||| |||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||  |    
T  53525 ttacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttat 53624  T
Q  205 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtc 302  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||  |||| |||   |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | || ||||||| | ||  ||     
T  53625 taactaagctgcatgaatcagtctaagatga--aagaagat---gttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttataagatgatgagttgtt 53719  T
Q  303 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  53720 gagtccatgcattcaca-ttcattgttgggggcttgatgccctagagcctttgct 53773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 164
Target Start/End: Original strand, 8230 - 8330
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| |||  ||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  8230 atgatttgatgatatttataatgttatataattaaatatatattgtatgaattatgattgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 8329  T
Q  164 t 164  Q
    |    
T  8330 t 8330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 197 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 40450 - 40290
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 296  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40450 ttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 40351  T
Q  297 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40350 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 40290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 13569 - 13282
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  13569 ttgatgttgtt-atactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 13471  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13470 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 13373  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13372 atataagaggttgtcgatttaagatattacgaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 13282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Original strand, 14581 - 14923
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgca-tatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacat 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||  | |||||  | ||||| ||  ||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  14581 agaaactaagttgtatatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgtttttgttaatggtatataatagtatatacattatat 14680  T
Q  112 gaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaa 211  Q
    ||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14681 gaattatg-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttcttactgcctatgttgctgtttgttagttaactaa 14779  T
Q  212 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat-tatataagaggttgtcg-atttaagatgttaagaggtcgagtcca 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | || ||||| ||||||  || | |||||    
T  14780 gctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggatatatttaagaggttgttgaatataagaagttaagttgttgtgtcca 14876  T
Q  310 tgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14877 tgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 14923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 32779 - 32432
Alignment:
Q  6 agagataagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatataca 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||| ||||   |||| |  | ||||| ||  |||||||||||| |||||||||||    
T  32779 agaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgttattgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgtttttgttaatgttatatagttgtatataca 32680  T
Q  106 ttacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttattt 205  Q
    ||||||||| |||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||  ||    
T  32679 ttacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttatt 32581  T
Q  206 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcg 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| || | || ||||| ||| ||  || |    
T  32580 aactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgttccaaattattgaatttatataagaggtcgttgtttctaagaggttgagttgttg 32483  T
Q  304 agtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttg 355  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32482 agtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttg 32432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 231
Target Start/End: Original strand, 51948 - 51985
Alignment:
Q  194 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 231  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51948 tgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 5877 - 5540
Alignment:
Q  15 aaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatga 113  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  5877 aaactaagtt-tttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga 5779  T
Q  114 agtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagc 213  Q
    | |||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  5778 attatg-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttcatactgcctatgttgctgtttgttattttactaagc 5680  T
Q  214 tgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||| || | |||||||||| ||||||| ||||||||||||| | || || || ||||||  || | ||||||||    
T  5679 tgcatgagtcggtctaagttgat---gataatcatgttccaaattattggatt-tataagaggttgttgtttatatgaagttaagttgttgtgtccatgc 5584  T
Q  313 attagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5583 attagca-tccattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 5540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 265
Target Start/End: Original strand, 6009 - 6259
Alignment:
Q  15 aaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaa 114  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6009 aaactaagttatttatcttgctgttattgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaa 6108  T
Q  115 gtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagct 214  Q
     |||  ||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  6109 ttatgtttgatgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagct 6208  T
Q  215 gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  6209 gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattggat 6259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14124 - 13837
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  14124 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 14026  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14025 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 13928  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13927 atataagaggttgtcgatttaagatattacgagatcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 13837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 12812 - 12465
Alignment:
Q  6 agagataagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatataca 105  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||  ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12812 agaggtaataaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctaatgtgtattatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatataca 12713  T
Q  106 ttacatgaagtat-tattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatt 204  Q
    |||| |||| ||| |||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||  |    
T  12712 ttac-tgaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttat 12614  T
Q  205 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtc 302  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||   |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||   || ||||||||||||  ||     
T  12613 taactaagctacatgagtcggtctaagatga--aagaagat---gttccaaattattggatttatataagaggtcgttttttctaagatgttaagttgtt 12519  T
Q  303 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  12518 gagtccatgcattcgcattt-atcgttgggggcttgatgccctggagcatttgct 12465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 26077 - 25794
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  || || |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||| ||||    
T  26077 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcat 25978  T
Q  168 gatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtt-ccaaattgttggatt 266  Q
    |||  |||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| |||||||    
T  25977 gatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgatgaagataatgatgtttccaaattattggatt 25879  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgt-taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  25878 atataagaggttgtcgaattaagatgtataagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggaggcttgatgccctggagc 25794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 40039 - 39756
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  || || |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||| ||||    
T  40039 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcat 39940  T
Q  168 gatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtt-ccaaattgttggatt 266  Q
    |||  |||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  39939 gatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgtttccaaattattggatt 39841  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  39840 atataagaggttgtcgaattaagttttttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgataccctggagc 39756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 357
Target Start/End: Original strand, 7943 - 8284
Alignment:
Q  14 gaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  7943 gaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtgagactgatgtatatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttga 8042  T
Q  114 agtat-tattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaacta 210  Q
    | ||| |||  || ||| |||||||| ||| || |||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||    
T  8043 attatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctgatttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaatta 8142  T
Q  211 agctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtcca 309  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||  |||| |||   |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||| |   || | |||||    
T  8143 agctgcatgcgtcggtctatgatga--aagaagat---gttccaaattattggatttatataagaggttgttgatctaagttgttgacttgttgtgtcca 8237  T
Q  310 tgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  8238 tgcattagca-ttcattgttgggggattgatgccctggagcctttgct 8284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 132 - 357
Target Start/End: Original strand, 15780 - 16006
Alignment:
Q  132 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15780 gatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15879  T
Q  232 ttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat-tatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgtt 329  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | || ||||| ||||||  || | ||| ||||||||||| |||||||||    
T  15880 ttgattaagatgatgatgttccaaattattggatatatttaagaggttgttgcttataagaagttaagttgttgtgtctatgcattagca-ttcattgtt 15978  T
Q  330 gggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  15979 gggggtttgatgccctggagcctttgct 16006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 178947 - 178898
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 246  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  178947 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 178898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 58
Target Start/End: Original strand, 15710 - 15761
Alignment:
Q  7 gagataagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactga 58  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  15710 gagattagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctga 15761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 197 - 358
Target Start/End: Original strand, 15306 - 15468
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  15306 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagagtttgtcgatttaagatgttta 15405  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctt 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15406 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctt 15468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 131 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1406 - 1188
Alignment:
Q  131 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 230  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||  ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1406 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatg--ttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 1309  T
Q  231 gttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 328  Q
    | || | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  1308 gatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcatagt 1210  T
Q  329 tgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||| |||||| |||||    
T  1209 tgggggcttcatgccctggagc 1188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 131 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 7383 - 7193
Alignment:
Q  131 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 230  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7383 agatgttgatgaattgaatttgatataattatttcatgttg--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 7286  T
Q  231 gttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    | || | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7285 gatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 7193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 13393 - 13111
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||| |||||| ||||| ||  |||| ||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||    
T  13393 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcat 13294  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13293 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggatt 13195  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  13194 atataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgtt-ggggcttgatgccctggagc 13111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 4)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 33123 - 32840
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| | ||||||||| |||||| |||| ||||    
T  33123 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcat 33024  T
Q  168 gatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtt-ccaaattgttggatt 266  Q
    | || |||| ||||| ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  33023 gctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgtttccaaattattggatt 32925  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32924 atataagaggttgtcgaattaagatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 32840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 38942 - 38659
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| | | ||||||| |||||| |||| ||||    
T  38942 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcat 38843  T
Q  168 gatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtt-ccaaattgttggatt 266  Q
    | || |||| ||||| ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  38842 gctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaagatgatgatgtttccaaattattggatt 38744  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38743 atataagaggttgtcgaattaagatgtttaagagttctagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 38659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 197 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 9799 - 9638
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  9799 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcccaaattattggattatataggaggttgtcgatttaagatgttta 9700  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9699 agaggtcgagtccatgcattattttttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 9638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 260 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 32465 - 32374
Alignment:
Q  260 ttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32465 ttggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 32374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 2033 - 1750
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||| | |||||| ||||| ||  |||| ||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||    
T  2033 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcat 1934  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  1933 gttgtttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggatt 1835  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1834 atataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 1750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 150
Target Start/End: Original strand, 207467 - 207541
Alignment:
Q  76 tgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcatt 150  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||  |||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  207467 tgtttataatgttatataattatatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgatgacgtgcatt 207541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Original strand, 8472 - 8751
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| ||||  ||| |||||||  ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  8472 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 8571  T
Q  168 gatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta 267  Q
    | || |||  ||||| ||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  8572 gctgtttttgatactgcctatgttgctgtt----atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggatta 8667  T
Q  268 tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8668 tataagaggttgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 8751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 69 - 344
Target Start/End: Original strand, 6060 - 6340
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||| | |||||| ||||| ||  |||| ||||| |||||||||||| ||||| | |||||| | || ||||    
T  6060 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcat 6159  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtt--tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga 264  Q
    | || ||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  6160 gctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaatttttgga 6259  T
Q  265 ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 344  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6260 ttatataagaggttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtctatgcattagcatttcattgttggaggcttgatgccc 6340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 124 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 116551 - 116320
Alignment:
Q  124 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||| ||||| || |||| |||||   | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  116551 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 116454  T
Q  224 ggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaa-ttgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  116453 ggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaagtatttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 116354  T
Q  322 tcattgttgggggcttgatgccc-gggagccttt 354  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  116353 tcattgttgggggcttgatgccctgggagccttt 116320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 357
Target Start/End: Original strand, 128851 - 129193
Alignment:
Q  11 taagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaca 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||  | |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  128851 taagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatttagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattaca 128950  T
Q  111 tgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaac 208  Q
    |||| |||   |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  128951 tgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtta-ttaac 129049  T
Q  209 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |   |||||||||| ||||| ||||||||||  | |  | || ||||||| ||||  || ||||    
T  129050 taagctgcatgagtcggtctaagatga--aagatgtt---gttccaaattattggatttatataagaattcgatgtttctaagatg-taagttgttgagt 129143  T
Q  307 ccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||   || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  129144 ccatgcatactca-ttcattgttgggggcttgatgccatggagcctttgct 129193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 78561 - 78219
Alignment:
Q  11 taagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaca 110  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  78561 taagcaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaca 78462  T
Q  111 tgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaac 208  Q
    |||| ||| |  |||  ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  || || ||||||||| ||||||||  |||||    
T  78461 tgaattataaacgat-gttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaac 78364  T
Q  209 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtc 307  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||  | || ||||   ||||||||  ||||| ||||||||||||| |  | | ||||||| ||||  || |||||    
T  78363 taagctgcatgagtcggtccaagatga--atgaagatg--tttccaaatgattggatttatataagaggtcgatgttctaagatgctaagttgttgagtc 78268  T
Q  308 catgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||   || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  78267 catgcatactca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 78219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 69 - 321
Target Start/End: Original strand, 1013 - 1263
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 168  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    ||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||    
T  1013 ttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatg 1108  T
Q  169 atgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-a 267  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  1109 atggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaa 1208  T
Q  268 tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1209 tataagaggtcgttgaattaagatgtttaagaggtcaagtccatgcattagcatt 1263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 39658 - 39376
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||| | |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  39658 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 39559  T
Q  168 gatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga-agttccaaattgttggatt 266  Q
    | || |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||| |||||||    
T  39558 gctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgatctttccaaattattggatt 39460  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  39459 atataagaggttgtccaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttaattgtt-ggggcttgatgccctggagc 39376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Original strand, 13854 - 13963
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  || ||  |||||||||||||||  |||||| |  |||||||||    
T  13854 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgaagtgcatttgtaattgttata 13953  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  13954 t-atgatgatt 13963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 128 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16235 - 16012
Alignment:
Q  128 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 226  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| || || ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16235 ttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 16137  T
Q  227 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 325  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16136 ctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttttcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 16037  T
Q  326 tgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  16036 tgttgggggcttgatgccctggagc 16012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 98 - 353
Target Start/End: Original strand, 32926 - 33181
Alignment:
Q  98 tatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtt 197  Q
    ||||| ||||||  ||||||| ||  |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || |||| ||||| ||| ||||| ||||    
T  32926 tatatgcattactcgaagtataatgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgtt 33025  T
Q  198 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 296  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||    
T  33026 -gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgttgttctaagatgtttaa 33124  T
Q  297 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 353  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33125 gaggttgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt 33181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 98 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 46079 - 45824
Alignment:
Q  98 tatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtt 197  Q
    ||||| ||||||  ||||||| ||  |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || |||| ||||| ||| ||||| ||||    
T  46079 tatatgcattactcgaagtataatgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgtt 45980  T
Q  198 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 296  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||    
T  45979 -gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgttgttctaagatgtttaa 45881  T
Q  297 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 353  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45880 gaggttgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt 45824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 197 - 353
Target Start/End: Original strand, 17397 - 17554
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 295  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||    
T  17397 ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgttctaaaatgttta 17496  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 353  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  17497 agaggttgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttaatgccctagagcctt 17554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Original strand, 75154 - 75436
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||| | |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  75154 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 75253  T
Q  168 gatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga-agttccaaattgttggatt 266  Q
    | || |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||| |||||||    
T  75254 gctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgatctttccaaattattggatt 75352  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  75353 atataagaggttgtccaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttaattgtt-ggggcttgatgccctggagc 75436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 63 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 12241 - 11953
Alignment:
Q  63 tatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 161  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||    
T  12241 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 12143  T
Q  162 tatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgt 260  Q
    | ||||| || ||| | |||||  || ||||| ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12142 tgtcatgctgttttagtatact-gctgtgttgctg-------tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattat 12051  T
Q  261 tggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  12050 tggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttggtggcttgatgccctggagcctttgct 11953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 199 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 4262 - 4108
Alignment:
Q  199 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaag 297  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4262 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaag 4163  T
Q  298 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcct 352  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4162 aggtcgagtccatgcattagcattacattgttgggggcttgatgccctggagcct 4108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 64 - 350
Target Start/End: Original strand, 17961 - 18250
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 162  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||    
T  17961 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattat 18060  T
Q  163 atcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttg 262  Q
    ||||||||| | |||||| | | ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||| |||||||||| |||    
T  18061 atcatgatgttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattg 18160  T
Q  263 gatta-tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    || || |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  18161 gactattataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattatcatttcagtgttggggggttgatgccctggagc 18250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 197 - 349
Target Start/End: Original strand, 2241 - 2394
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 295  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  2241 ttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgattaaaatgatgaagttctaaattattggattatataagaggttgtcggtttaaaatgttta 2340  T
Q  296 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggag 349  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||| |||||| ||||    
T  2341 agaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggctttatgccctggag 2394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 104 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 52060 - 51812
Alignment:
Q  104 cattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgtt 201  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||| | ||||||||| |||| |||    
T  52060 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgtt-gtt 51962  T
Q  202 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagagg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||    
T  51961 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggtttttgttttaagatgtttaagagg 51862  T
Q  301 tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51861 tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 51812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 124 - 350
Target Start/End: Original strand, 167973 - 168200
Alignment:
Q  124 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 222  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| |  ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  167973 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 168071  T
Q  223 cggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcat 320  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  168072 cggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca- 168170  T
Q  321 ttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  168171 ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 168200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 69 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 4689 - 4403
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||  |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  4689 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 4590  T
Q  168 gatgatttgc-atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || |||   ||||| | | ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||| |||||||    
T  4589 gctgtttttatatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgttccaaattattggatt 4492  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagccttt 354  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4491 atacaagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagccttt 4403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 69 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 12271 - 11985
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||  |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  12271 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 12172  T
Q  168 gatgatttgc-atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || |||   ||||| | | ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||| |||||||    
T  12171 gctgtttttatatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgttccaaattattggatt 12074  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagccttt 354  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12073 atacaagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagccttt 11985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 69 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 22223 - 21937
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||  |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  22223 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 22124  T
Q  168 gatgatttgc-atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || |||   ||||| | | ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||| |||||||    
T  22123 gctgtttttatatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgttccaaattattggatt 22026  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagccttt 354  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22025 atacaagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagccttt 21937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 144 - 357
Target Start/End: Original strand, 23898 - 24108
Alignment:
Q  144 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||    
T  23898 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg---aagatg 23994  T
Q  244 atgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | | |||| |||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  23995 atgatgttccaaattattggacttatataagaggttgttgttctaagttgttaagatgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggattgatgc 24093  T
Q  343 ccgggagcctttgct 357  Q
    || ||||||||||||    
T  24094 cctggagcctttgct 24108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 84 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 128917 - 128650
Alignment:
Q  84 atgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatact 182  Q
    |||| |||||||  ||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||   |  |    
T  128917 atgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttttttt 128818  T
Q  183 acctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcg 282  Q
       | ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  128817 ttttttgttgct-tttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcg 128719  T
Q  283 atttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  128718 atttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 128650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 78 - 231
Target Start/End: Original strand, 20372 - 20524
Alignment:
Q  78 tttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttg 176  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||    
T  20372 tttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttg 20471  T
Q  177 catactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 231  Q
     |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20472 tatactga-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Original strand, 35853 - 35962
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  || ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  35853 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 35952  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  35953 t-atgatgatt 35962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 40094 - 39812
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||| | |||||| |||||||| ||  | ||||| |||||||  |||| |||||| |||||| |||| ||||    
T  40094 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcat 39995  T
Q  168 gatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta 267  Q
    | || |||| ||||| ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  39994 gttgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggatta 39896  T
Q  268 tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  39895 tataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgggtccatgcattagcatttcattgttggggacttgatgccctggagc 39812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 354
Target Start/End: Original strand, 19766 - 20106
Alignment:
Q  11 taagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaca 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||  |||   |||||| |||||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  19766 taagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttccagtaagcatgaattatatgatttgatgttattaataatgtgatataaatgtatatgcattaca 19865  T
Q  111 tgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaac 208  Q
    |||  ||||  ||||  | ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  ||||| ||||||||| ||||||||  ||||     
T  19866 tgagttatttatgatgct-gagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaat 19964  T
Q  209 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||||||| |  | || ||||| ||||||  || ||||    
T  19965 taagctgcatgagtcggtctaagatga--aagatgat---gttccaaattattggatttatataagaggtcgatgtttctaagaggttaagttgttgagt 20059  T
Q  307 ccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagccttt 354  Q
    ||||||| ||    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20060 ccatgca-tacttattcattgttgggggcttgatgccctggagccttt 20106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Original strand, 48921 - 49030
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  48921 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 49020  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  49021 t-atgatgatt 49030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 184 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 121831 - 121665
Alignment:
Q  184 cctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcga 283  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  121831 cctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcga 121733  T
Q  284 tttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
     |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  121732 attaatatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 121665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 178 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 174838 - 174665
Alignment:
Q  178 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattata-taagagg 276  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||| | |||||||| ||||| || | |||||||    
T  174838 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagttgatgatgctccaaattattggactaaattaagagg 174739  T
Q  277 ttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    || |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  174738 ttatcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcatagttgggggcttgatgccctggagc 174665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 353
Target Start/End: Original strand, 136252 - 136604
Alignment:
Q  14 gaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatga-attgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||   ||||||  || ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  136252 gaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgattttaatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattacatg 136351  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaacta 210  Q
    || |||    |||   || ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || ||||  |||| ||||||| | ||||||||  |||||||    
T  136352 aattatgtacgat-gatgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaacta 136450  T
Q  211 agctgcatgagtcggtctaagttga------ttaag----atgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaaga 298  Q
    || |||||||||||||||||| |||       ||||    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |  | || ||||||||| ||     
T  136451 agttgcatgagtcggtctaagatgaatcggtctaagataaatgatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcgaggtttctaagatgttgagt 136550  T
Q  299 ggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 353  Q
     |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  136551 tgtcgagtccatgcattcgca-ttcattgttgggggcttgatgccctagagcctt 136604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 344
Target Start/End: Original strand, 144960 - 145303
Alignment:
Q  14 gaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatga-attgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||   ||||||  || ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  144960 gaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgattttaatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattacatg 145059  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaacta 210  Q
    || |||    |||   || ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || ||||  |||| ||||||| | ||||||||  |||||||    
T  145060 aattatgtacgat-gatgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaacta 145158  T
Q  211 agctgcatgagtcggtctaagttga------ttaag----atgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaaga 298  Q
    || |||||||||||||||||| |||       ||||    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |  | || ||||||||| ||     
T  145159 agttgcatgagtcggtctaagatgaatcggtctaagataaatgatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcgaggtttctaagatgttgagt 145258  T
Q  299 ggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 344  Q
     |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  145259 tgtcgagtccatgcattcgca-ttcattgttgggggcttgatgccc 145303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 122 - 357
Target Start/End: Original strand, 2799 - 3029
Alignment:
Q  122 tgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgag 221  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2799 tgatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgag 2898  T
Q  222 tcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    |||||||||| ||||   |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| | ||| | |||||| |||||||| |  | ||||||||||||||| |    
T  2899 tcggtctaagatgat---gatgatgatgttccaaattattggact-tataagatgatgttgttttaagttgttaagatgatgtgtccatgcattagca-t 2993  T
Q  322 tcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2994 tcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 3029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 357
Target Start/End: Original strand, 3280 - 3331
Alignment:
Q  305 gtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3280 gtccatgcattagcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 3331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 59
Target Start/End: Original strand, 2688 - 2734
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgat 59  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  2688 agaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgat 2734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 128 - 357
Target Start/End: Original strand, 16599 - 16829
Alignment:
Q  128 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 226  Q
    |||||||| || |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16599 ttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 16697  T
Q  227 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 325  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16698 ctaaattgatgaagatgatgatgtttcaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 16797  T
Q  326 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  16798 tgttggaggcttgatgccctgaagcctttgct 16829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 69 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 3652 - 3375
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||| | |||||| ||||| ||  |||| ||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||    
T  3652 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcat 3553  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | ||||| ||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  3552 gctgtttttgtatactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggatt 3454  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgt-taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 344  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  3453 atataagaggttgttgaattaagatgtctaagaggtcgagtccatgcattagcatttcatttttgggggctagatgccc 3375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 524 - 243
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||| | |||||| |||||||| || || ||||| |||||||| |||||| || | |||||| |||  ||||    
T  524 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcat 425  T
Q  168 gatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta 267  Q
    | |  |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| || || ||    
T  424 gctattttgtatactgcctatgttattgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagatgatgatgttccaaattattagacta 326  T
Q  268 tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  325 tataagagg-tgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttctttgttgggggcttgatgccctggagc 243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 128 - 344
Target Start/End: Original strand, 3185 - 3406
Alignment:
Q  128 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 226  Q
    ||||||||||| ||| || |||| |||||| |||||||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3185 ttgagatgttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 3283  T
Q  227 ctaagttgattaagatgatgaag----ttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    |||||||||| |||||||||| |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  3284 ctaagttgatgaagatgatgatgatgtttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatatttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 3383  T
Q  322 tcattgttgggggcttgatgccc 344  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  3384 tcattgttgggggcttgatgccc 3406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 64 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11651 - 11370
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 162  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   |||| ||||||||||||| | |||| | | ||||||| ||||    
T  11651 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattat 11552  T
Q  163 atcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttg 262  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | | |||||| ||| |||||||||| |||    
T  11551 atcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattg 11452  T
Q  263 gatta-tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||    
T  11451 gactattataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattatcatttcagcgataggggcttgatgc 11370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 64 - 342
Target Start/End: Original strand, 38190 - 38471
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 162  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   |||| ||||||||||||| | |||| | | ||||||| ||||    
T  38190 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattat 38289  T
Q  163 atcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttg 262  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | | |||||| ||| |||||||||| |||    
T  38290 atcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattg 38389  T
Q  263 gatta-tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||    
T  38390 gactattataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattatcatttcagcgataggggcttgatgc 38471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Original strand, 21828 - 21937
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  || ||  ||||||||| |||||| |||||| |  |||||||||    
T  21828 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgtagatgacgtgcatttgtaattgttata 21927  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  21928 t-atgatgatt 21937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Original strand, 24587 - 24699
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattg--tatatacattacatgaagt-attattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtt 160  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||| | ||  |||||  |||||||||||||||| |||||| |  ||||||    
T  24587 atgatttgatgatatttataatgttatataattggatatatatattgcatgaaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgtt 24686  T
Q  161 atatcatgatgatt 174  Q
    |||| |||||||||    
T  24687 atat-atgatgatt 24699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 64 - 350
Target Start/End: Original strand, 16034 - 16317
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtat-tattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 162  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| ||   || |||||||||||| ||| || |||| |||||||||||    
T  16034 atgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttat 16133  T
Q  163 atcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttg 262  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||| |||    
T  16134 atcatgttgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgat---gttccaaattattg 16228  T
Q  263 ga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    || ||||||||||||| || | || ||||||||| ||  || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16229 gatttatataagaggtcgttgtttctaagatgttgagttgttgagtccatgcattcgca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 16317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13316 - 13147
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtat-tattgata-tttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 161  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| |||  ||  ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  13316 atgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgtta 13217  T
Q  162 tatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 231  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13216 tatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2638
Alignment:
Q  179 tactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggt 277  Q
    |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |   |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga--aagatgtt---gttccaaattattggatttatataagaggt 2638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 357
Target Start/End: Original strand, 7953 - 8297
Alignment:
Q  6 agagataagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatataca 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||| ||||   |||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  7953 agaggtaagaaactaagttgtttatcttgctg---ttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgataatgttatatagttgtatataca 8049  T
Q  106 ttacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttat 203  Q
    ||||||||| |||   |||| || | ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||||| ||||||||      
T  8050 ttacatgaattatatatgatgtt-gtgatgttgttgatttgtatttgatattgttatatcatgaactggtttgtatactgcctatgttgctgtttgtttg 8148  T
Q  204 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||| ||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| ||||  |      
T  8149 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgat---gttccaaattattggatttatttaagaggttgatgatttaagatgctaagttgat 8243  T
Q  303 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||| |||  |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8244 gagtccatgcatttgca-ctcatagtggggggcttgatgccctggagcctttgct 8297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Original strand, 29164 - 29354
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttata---atgttatataattgtatatacattac 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||   |||||||||||||||||||||| |||    
T  29164 agaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataattatgttatataattgtatatacagtac 29263  T
Q  110 atgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttat 203  Q
    ||||  ||   |||||| ||||   |||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  29264 atgacttaagtttgataattga---gttgctgatttacattcgatattattatatcatgatagtttgaatactacctatgttgctgtttgttat 29354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 64 - 350
Target Start/End: Original strand, 27683 - 27966
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 162  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| |||   ||| | |||||||||||| ||| || |||| |||||||||||    
T  27683 atgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttat 27782  T
Q  163 atcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttg 262  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||| |||    
T  27783 atcatgctgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgat---gttccaaattattg 27877  T
Q  263 ga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    || ||||||||||||| || | || ||||||||||||  || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27878 gatttatataagaggtcgttgtttctaagatgttaagttgttgagtccatgcattcgca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 27966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 3539 - 3442
Alignment:
Q  225 gtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcat 320  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  3539 gtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaagtcaagtccatgcattagcat 3442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 7603 - 7506
Alignment:
Q  225 gtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcat 320  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  7603 gtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaagtctagtccatgcattagcat 7506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 124 - 350
Target Start/End: Original strand, 1043 - 1270
Alignment:
Q  124 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 222  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| |  ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1043 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 1141  T
Q  223 cggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcat 320  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  1142 cggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca- 1240  T
Q  321 ttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1241 ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 1270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 184 - 350
Target Start/End: Original strand, 4889 - 5055
Alignment:
Q  184 cctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcga 283  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4889 cctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcga 4987  T
Q  284 tttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4988 attaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 5055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 128 - 349
Target Start/End: Original strand, 17214 - 17442
Alignment:
Q  128 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt---gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 224  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||   | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17214 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcg 17312  T
Q  225 gtctaagttgattaagatgatgaag----ttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagca 319  Q
    |||||||||||| |||||||||| |    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  17313 gtctaagttgatgaagatgatgatgatgtttccaaattattggattatatgagaggttgtcgaattaagatgtttacgaggttgagtccatgcattagca 17412  T
Q  320 tttcattgttgggggcttgatgcccgggag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17413 tttcattgttgggggcttgatgccctggag 17442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 231
Target Start/End: Original strand, 79396 - 79430
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79396 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 79 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 16952 - 16677
Alignment:
Q  79 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtat-tattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 176  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| | |  ||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |    
T  16952 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 16853  T
Q  177 catactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagagg 276  Q
     ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  16852 tatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatacaagagt 16755  T
Q  277 ttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc-gggagcct 352  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |  |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16754 tggtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcataataaagttgagggcttgatgccctgggagcct 16677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 173 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 4788 - 4611
Alignment:
Q  173 tttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaag-ttccaaattgttggattatata 271  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  4788 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgtttccaaattattggattatata 4690  T
Q  272 agaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  4689 agaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttaggggcttgatgccctggagc 4611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 131 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 8598 - 8386
Alignment:
Q  131 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 229  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8598 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtcta 8500  T
Q  230 agttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaaga-tgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 328  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  8499 agttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcga-ttaagatttttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcatagt 8402  T
Q  329 tgggggcttgatgccc 344  Q
    ||||||||||||||||    
T  8401 tgggggcttgatgccc 8386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 131 - 350
Target Start/End: Original strand, 5132 - 5350
Alignment:
Q  131 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 230  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5132 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatg--ttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 5229  T
Q  231 gttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 328  Q
    | || | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  5230 gatgttgaagatgatgacgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattaaca-ttcatagt 5328  T
Q  329 tgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  5329 tgggggcttgatgccctggagc 5350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 184 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 47061 - 46900
Alignment:
Q  184 cctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcg 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  47061 cctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcg 46962  T
Q  283 atttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 344  Q
    | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46961 aattaagttgttcaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccc 46900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 124 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 1158 - 930
Alignment:
Q  124 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 223  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1158 atatttgagatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 1059  T
Q  224 ggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 322  Q
    |||||||| |||  |||| |||   |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || | |||| ||  || | ||||||||||||||| ||    
T  1058 ggtctaagatga--aagaagat---gttccaaattattggacttatataagaggttgttgatctatgttgttgagttgttgtgtccatgcattagca-tt 965  T
Q  323 cattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  964 cattgttgggggcttgatgctctggagcctttgct 930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 131 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 4968 - 4749
Alignment:
Q  131 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 229  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4968 agatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaatctgcatgagtcggtcta 4870  T
Q  230 agttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 327  Q
    ||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4869 agttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaatttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattg 4771  T
Q  328 ttgggggcttgatgcccgggag 349  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  4770 ttgggggcttgatgccctggag 4749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 131 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 32184 - 31966
Alignment:
Q  131 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 230  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| || ||||  |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32184 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-tttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 32087  T
Q  231 gttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 328  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32086 gttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgt 31988  T
Q  329 tgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  31987 tgggggcttgatgccctggagc 31966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 133 - 350
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11666
Alignment:
Q  133 atgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 231  Q
    |||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11447 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaag 11545  T
Q  232 ttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaag--atgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 328  Q
    ||| | ||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||   | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11546 ttgttgaagatgaagatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagtcgttttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgt 11644  T
Q  329 tgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  11645 tgggggcttgatgccctggagc 11666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13733 - 13638
Alignment:
Q  79 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaagt-attattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 174  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||  || |||||| | || ||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  13733 ttataatgttatatagttggatatatgttgcatgaaattatgattgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 13638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 79 - 349
Target Start/End: Original strand, 161083 - 161355
Alignment:
Q  79 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt- 175  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||  |||| ||||  ||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||| ||| |||     
T  161083 ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgttttt 161182  T
Q  176 gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagag 275  Q
    | ||||| | | ||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  161183 gtatactgc-tgtgtcgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatgatgaagtttcaaattattggattatataagag 161280  T
Q  276 gttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggag 349  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||  | | |||||||||||||| ||||    
T  161281 gttgtcgatttaaaatgtttaagaagtcgagtccatgcattaacatttcagcgataggggcttgatgccctggag 161355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 167
Target Start/End: Original strand, 164570 - 164674
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattg-atatttgagatgttga-tgacttgcattcgatattgtta 161  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||  |||| ||||  || ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  164570 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattatta 164668  T
Q  162 tatcat 167  Q
    | ||||    
T  164669 tgtcat 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 178 - 350
Target Start/End: Original strand, 10472 - 10646
Alignment:
Q  178 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagagg 276  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  10472 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagagg 10571  T
Q  277 ttgtcgatttaag--atgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||| |||||   | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10572 ttgtcgaattaagtcgttttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 10646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 131 - 350
Target Start/End: Original strand, 1053 - 1271
Alignment:
Q  131 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 230  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1053 agatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatg--ttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 1150  T
Q  231 gttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 328  Q
    | || | |||||||||| |||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1151 gatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactattttaagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgt 1249  T
Q  329 tgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  1250 tgggggcttgatgccctggagc 1271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 106524 - 106181
Alignment:
Q  11 taagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaca 110  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||| ||||||| ||||||| |||||  | |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  106524 taagaaactaagttgcttttcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattaca 106425  T
Q  111 tgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaac 208  Q
    |||| |||   |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |||| ||||||||| ||||| ||  |||||    
T  106424 tgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaac 106325  T
Q  209 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagt 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||  |||||| |   |||||||||| ||||| ||||||||||||| |  | || ||||||||||||  || ||||    
T  106324 taagctgcatgagtgggtctaagatga--aagatgtt---gttccaaattattggatttatataagaggtcgatgtttctaagatgttaagttgttgagt 106230  T
Q  307 ccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||   || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  106229 ccatgcatactca-ttca-tgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 106181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 97246 - 96903
Alignment:
Q  11 taagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaca 110  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||| ||||||| ||||||| |||||  | |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  97246 taagaaactaagttgcttttcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattaca 97147  T
Q  111 tgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaac 208  Q
    |||| |||   |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |||| ||||||||| ||||| ||  |||||    
T  97146 tgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaac 97047  T
Q  209 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagt 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||  |||||| |   |||||||||| ||||| ||||||||||||| |  | || ||||||||||||  || ||||    
T  97046 taagctgcatgagtgggtctaagatga--aagatgtt---gttccaaattattggatttatataagaggtcgatgtttctaagatgttaagttgttgagt 96952  T
Q  307 ccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||   || |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  96951 ccatgcatactca-ttca-tgttgggggcttgatgccctagagcctttgct 96903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 124 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 2078 - 1851
Alignment:
Q  124 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 222  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||  |||| ||||| |||||| | ||||| ||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  2078 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagt 1980  T
Q  223 cggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcat 320  Q
    ||||||||| || | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||     
T  1979 cggtctaagatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca- 1881  T
Q  321 ttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1880 ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 131 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 13615 - 13395
Alignment:
Q  131 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 230  Q
    |||||||||||| | | | | |||||| | || ||||| || |||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13615 agatgttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 13517  T
Q  231 gttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaag--atgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 327  Q
    |||| | ||| |||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||   | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13516 gttgttgaagttgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagtcgttttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattg 13418  T
Q  328 ttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  13417 ttgggggcttgatgccctggagc 13395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 174 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 4599 - 4412
Alignment:
Q  174 ttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa-------gttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  4599 ttgcatactgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctatataagaggttgattaagatgatgatgttccaaattattggatt 4501  T
Q  267 atataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttg 355  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  4500 atatacgaggttgttg-tttaagatgtttaagaggttgagtccatgcattagcatttcattgttgggggattgatgccccggagcctttg 4412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 63 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 289 - 12
Alignment:
Q  63 tatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 161  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||    
T  289 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattatta 191  T
Q  162 tatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgt 260  Q
    | ||||| || ||| | ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  190 tgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttcccaattat 93  T
Q  261 tggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 342  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  92 tggattatacaaga-gttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgtattggca-ttctttgttgggggcttgatgc 12  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 63 - 352
Target Start/End: Original strand, 1259 - 1547
Alignment:
Q  63 tatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgtt 160  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||  |||| |||   ||| || |||||| | |||| |||||||||| |||||| ||    
T  1259 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattatt 1357  T
Q  161 atatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattg 259  Q
    || ||||| || ||| | ||||| | | |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||     
T  1358 atgtcatgctgtttttgtatact-catgtgttattgtt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa---gatgaagttccaaatta 1452  T
Q  260 ttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc-gggagcct 352  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  1453 ttggattatacaagagtttgtcaatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattttaaagttgagggcttgatgccctgggagcct 1547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 131 - 350
Target Start/End: Original strand, 15466 - 15686
Alignment:
Q  131 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 230  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| || |||| ||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15466 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctctt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 15564  T
Q  231 gttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg--ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 327  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | ||| ||  |||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  15565 gttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaatcaagttgttttaagaggtctagtccatgcattaaca-ttcattg 15663  T
Q  328 ttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  15664 ttgggggcttgatgccctggagc 15686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 131 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 51699 - 51481
Alignment:
Q  131 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 230  Q
    |||||||||||| ||| ||| | |||  |||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51699 agatgttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 51602  T
Q  231 gttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 328  Q
    | || | || ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||    
T  51601 gatgttgaaaatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcatgagca-ttcttagt 51503  T
Q  329 tgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    ||||||||| |||||| |||||    
T  51502 tgggggcttaatgccctggagc 51481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 223 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 32188 - 32059
Alignment:
Q  223 cggtctaagttgattaagatgatgaa-gttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcat 320  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  32188 cggtctaagttgatgaagatgatgattgttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcaagtccatgcattagcat 32089  T
Q  321 ttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32088 ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 32059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 214 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 27913 - 27771
Alignment:
Q  214 tgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaag--ttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccat 310  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||| |||||||||||    
T  27913 tgcatgagtcggtctaagtttatgaagatgatgatggtttccaaattattggattatataagaggttgttgttctaagatgtttaagaagtcgagtccat 27814  T
Q  311 gcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27813 gcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt 27771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 28012 - 27912
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||| |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  28012 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 27913  T
Q  168 g 168  Q
    |    
T  27912 g 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 131 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21030 - 20815
Alignment:
Q  131 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 229  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| ||||| | ||||||||| || |||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  21030 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtcta 20931  T
Q  230 agttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 327  Q
    ||| | | |||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  20930 agtcgttgaagatgttgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattaggatttcattg 20831  T
Q  328 ttgggggcttgatgcc 343  Q
    ||||||| ||||||||    
T  20830 ttgggggattgatgcc 20815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 357
Target Start/End: Original strand, 1679 - 2022
Alignment:
Q  11 taagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaca 110  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||||||| ||||   |||||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  1679 taagaaactaagttgcctatcttactattgttgttccagtaagcctgaattatatgatttgacgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaca 1778  T
Q  111 tgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaac 208  Q
    | || |||   ||||  ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  |  |||  ||||||||||||||  |||| |||   ||||    
T  1779 taaattatatatgat-gttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatatactacctatgttaatgttagtttaataac 1877  T
Q  209 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||     | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||   || ||||||||||||  || ||||    
T  1878 taagctgcatgagtcggtctaagatga-----aggatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttttttctaagatgttaagttgttgagt 1972  T
Q  307 ccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||    || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  1973 ccatgcacactca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctgtgct 2022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 231
Target Start/End: Original strand, 6164 - 6386
Alignment:
Q  11 taagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaca 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||   |||||| |||||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  6164 taagaaactaagttgcttatctcactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattaca 6263  T
Q  111 tgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaac 208  Q
    |||| |||   |||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||  || |||  ||||| ||||||||| ||||||||  |||||    
T  6264 tgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaac 6363  T
Q  209 taagctgcatgagtcggtctaag 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  6364 taagttgcatgagtcggtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 231
Target Start/End: Original strand, 13792 - 13840
Alignment:
Q  183 acctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 231  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13792 acctatgttgttgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 357
Target Start/End: Original strand, 6416 - 6452
Alignment:
Q  321 ttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6416 ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 6452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 357
Target Start/End: Original strand, 13870 - 13906
Alignment:
Q  321 ttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13870 ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 13906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 69 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23064 - 22859
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||  |||| |||||||  ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  23064 ttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 22965  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | |||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22964 gctgtttttgtatactgg-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatt 22867  T
Q  267 atataaga 274  Q
    ||||||||    
T  22866 atataaga 22859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 2102 - 2283
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgca-tatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacat 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||  | |||||    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  2102 agaaaataagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatccaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatat 2201  T
Q  112 gaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgtt 194  Q
    ||| |||  | |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2202 gaattatgct-gatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgtt 2283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 166 - 357
Target Start/End: Original strand, 28806 - 28993
Alignment:
Q  166 atgatgatttgcatactacctatgttgttgtt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga 264  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| |||||    
T  28806 atgatgatttgcatactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattgga 28902  T
Q  265 ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
     | || |||| | ||| | | |||| |||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28903 ct-taaaagatgatgttgttctaagttgttaagatgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 28993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 93
Target Start/End: Original strand, 28695 - 28775
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatata 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28695 agaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatata 28775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 357
Target Start/End: Original strand, 103523 - 103855
Alignment:
Q  14 gaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatga 113  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||   |||||| || ||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  103523 gaaactaagttctttatcttcctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgttaatgttatgtagttgtatatacattacatga 103622  T
Q  114 agtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaa 211  Q
    | |||      |||    ||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||    
T  103623 attatg-----tat----gatgttgttgttttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttttatactacctatgttgctgtttatttattaactaa 103713  T
Q  212 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgat-ttaagatgttaagaggtcgagtcca 309  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||| |||   |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | |  ||||||||||||  || |||||||    
T  103714 gctgcattagtcggtctaagttga--aagaggat---gttccaaattattggatttatataagaggtcgttgttgctaagatgttaagttgttgagtcca 103808  T
Q  310 tgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||   || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  103809 tgcatactca-ttcattgttgggggcttgatgccatggagcctttgct 103855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 197 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 29982 - 29856
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt-gattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| || || |||||||| ||    
T  29982 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttcaattaagatgatgaagttccaaattattggactatttaagaggtcgttgaattaagatgttt 29883  T
Q  295 aagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  29882 aagaggtcgattccatgcattagcatt 29856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 133 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16397 - 16181
Alignment:
Q  133 atgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 232  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16397 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 16300  T
Q  233 tgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgt-taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttg 330  Q
    || | |||||||||| |||||||||| || || | || |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  16299 tgttgaagatgatgatgttccaaattattagactaatgtaagaggttgtcgaattaagttgtctaagagatcgagtccatgcaatagca-ttcatagttg 16201  T
Q  331 ggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    || ||||||| ||| |||||    
T  16200 ggcgcttgataccctggagc 16181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 223 - 344
Target Start/End: Original strand, 2494 - 2616
Alignment:
Q  223 cggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcat 320  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||     
T  2494 cggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca- 2592  T
Q  321 ttcattgttgggggcttgatgccc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  2593 ttcattgttgggggcttgatgccc 2616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 181
Target Start/End: Original strand, 2329 - 2494
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 112  Q
    |||||||||||| |||| ||||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2329 agaaactaagttttttaccttgctattaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattaaatg 2428  T
Q  113 aagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 181  Q
    |  ||   |||||| ||||   |||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2429 acttaagtttgataattga---gttgctgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 2494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 38557 - 38339
Alignment:
Q  11 taagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaca 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||   |||||| |||||||||    |||||| |||||  ||||||| |||||||    
T  38557 taagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgagattaatgtgatatatatgtatatgcattaca 38458  T
Q  111 tgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaac 208  Q
    |||| |||   |||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||  || |||  ||||| ||||||||| ||||||||  |||||    
T  38457 tgaattatatatgatgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaac 38358  T
Q  209 taagctgcatgagtcggtc 227  Q
    |||||||||||||||||||    
T  38357 taagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 38326 - 38290
Alignment:
Q  321 ttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38326 ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 38290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20029 - 19980
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 246  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  20029 ttgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 128 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 10891 - 10692
Alignment:
Q  128 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 226  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||| | | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10891 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 10794  T
Q  227 ctaagttgattaagatgatg------aagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagca 319  Q
    ||||||||||||||||| ||      | |||||||||| ||||| ||| ||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10793 ctaagttgattaagatgttgataacaatgttccaaattattggactatttaaaaggttgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca 10694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 69 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 4871 - 4666
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  4871 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 4773  T
Q  168 gatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 266  Q
    | || ||| | ||||| | | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  4772 gttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatgatgaggttccaaattattggatt 4675  T
Q  267 atataagag 275  Q
    |||||||||    
T  4674 atataagag 4666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 789 - 451
Alignment:
Q  11 taagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||| || |  ||||| | |||| | ||||||| |||||||    
T  789 taagaaactaagttgtttatctaactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatcttttaaataatatgatattaatgtatatgcattaca 690  T
Q  111 tgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaac 208  Q
    |||| |||   |||| || | ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  || || ||||||||| ||||||||  |||||    
T  689 tgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaac 592  T
Q  209 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||     || |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |  | | ||||||| ||||  || |||||    
T  591 taagctgcatgagtcggtctaagatga-----attatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcgatgttctaagatgctaagttgttgagtc 497  T
Q  308 catgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagccttt 354  Q
    |||||||   || |||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  496 catgcatactca-ttcattgttgggggctttgtgccctggagccttt 451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 81 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 25276 - 25005
Alignment:
Q  81 ataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgca 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||   |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||  || |||  |    
T  25276 ataatgtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatatcgttatatcatgagctgttttata 25178  T
Q  179 tactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggt 277  Q
    |||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |   ||||||| || ||||| |||||  ||||||    
T  25177 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagaggtt---gttccaatttattggatttataatagaggt 25083  T
Q  278 tgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
     |  | | ||||||| ||||  || ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25082 cgatgttctaagatg-taagttgttgagtccatgcatactca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 25005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 725 - 619
Alignment:
Q  62 atatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 161  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||   |||| |||||||||||  ||| |||| || ||||||||||    
T  725 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgtta 627  T
Q  162 tatcatga 169  Q
    ||||||||    
T  626 tatcatga 619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 267900 - 267637
Alignment:
Q  11 taagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactg-atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattac 109  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| ||||||| ||| ||| |||||| |||||| |||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  267900 taagaaactaagttgcttagcttactgctgttgtttcagtaagcctggatg-atatgatttgatggtgttaataatgtgatataaatgtatatgcattac 267802  T
Q  110 atgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaa 207  Q
    ||||| |||   |||| || ||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  ||||| | ||||||| ||||||||  ||||    
T  267801 atgaattatatatgatgtt-gagatattgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcatatgttgatgtttgtttattaa 267703  T
Q  208 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggt 277  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||   |||||||||| || || |||||||||||||    
T  267702 ctaagttgcatgagtcggtctaagatga--aagatgat---gttccaaattatttgatttatataagaggt 267637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 197 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 9292 - 9161
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg------atgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaaga 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      | || |||||||||| ||||| ||| ||| ||||||| || ||||||    
T  9292 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgataacgatgttccaaattattggactatttaaaaggttgttgaattaaga 9193  T
Q  291 tg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9192 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 9161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 93
Target Start/End: Original strand, 2187 - 2267
Alignment:
Q  13 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatata 93  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2187 agaaactaagttgtttatcttactgatcttatcccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata 2267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 197 - 321
Target Start/End: Original strand, 12361 - 12492
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaaga 290  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      |||||||| || ||||||| ||||| ||| |||||||| || || ||||||    
T  12361 ttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgtaccaaattattggactatttaagaggtcgttgaattaaga 12460  T
Q  291 tg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 321  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12461 tgtttaagaggtcgagtacatgcattagcatt 12492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 245 - 87
Alignment:
Q  11 taagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaca 110  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||| ||||||| ||||||| || |   | |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  245 taagaaactaagttgcatatcttactgttgttgtttcagtaagcctaaattaaatgatttgatgttgttaataatgttatataaatgtatatgcattaca 146  T
Q  111 tgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga 169  Q
    |||| |||   |||| |||||||||||  ||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  145 tgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgcatctgatattgttatatcatga 87  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 128 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 11406 - 11207
Alignment:
Q  128 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 226  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  11406 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 11309  T
Q  227 ctaagttgattaagatgatgaag------ttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagca 319  Q
    |||| |||||||||||| ||| |      ||||||||| ||||| ||| |||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  11308 ctaatttgattaagatgttgatgataatgttccaaattattggactatttaagaggtcgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaaca 11209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 204 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 30377 - 30228
Alignment:
Q  204 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggt 301  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| ||   ||||||||| ||||||| ||||||||||| |  | || |||| ||| |||| ||    
T  30377 ttaattaaactgcatgagtcggtctaagatga--aagatgttg---ttccaaattattggatttatataagaggtcgatgtttctaagttgt-aagacgt 30284  T
Q  302 cgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30283 caagtccatgcattagcattacattgttgggggcttgatgccctggagcctttgct 30228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 249 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 225455 - 225346
Alignment:
Q  249 gttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgg 346  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||| ||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  225455 gttccaaattattggatttatataagaggttgttgtttctaagaggttgagttgttgagtccatgcattagcatt-cattgttgggggcttgatgccctg 225357  T
Q  347 gagcctttgct 357  Q
    |||||||||||    
T  225356 gagcctttgct 225346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 225593 - 225465
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtat-tattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 162  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| |||  || |||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||    
T  225593 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattat 225495  T
Q  163 atcatgatgatttgcatactacctatgttg 192  Q
    |||| | || ||||||||||  ||||||||    
T  225494 atcacgctgttttgcatactgactatgttg 225465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Original strand, 189144 - 189253
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  || ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  189144 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 189243  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  189244 t-atgatgatt 189253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 197 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4347 - 4300
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4347 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 298 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10247 - 10188
Alignment:
Q  298 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  10247 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgtttgggccttgatgccctggagcctttgct 10188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 232
Target Start/End: Original strand, 24297 - 24406
Alignment:
Q  124 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatga--tttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgag 221  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| ||   |||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  24297 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 24395  T
Q  222 tcggtctaagt 232  Q
    |||||||||||    
T  24396 tcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 303 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 6546 - 6492
Alignment:
Q  303 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6546 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctagagcctttgct 6492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9193 - 9136
Alignment:
Q  135 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactacctatgttg 192  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  9193 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttg 9136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20957 - 20907
Alignment:
Q  300 gtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  20957 gtcgagtccatgcattagcatttcattgttggggccttgatgccctggagc 20907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23892 - 23843
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 246  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23892 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36454
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 246  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2783 - 2694
Alignment:
Q  144 ttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  ||||| ||||||||| |||||||   || |||||||||||||||||||||||||    
T  2783 ttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaag 2694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12016 - 11982
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12016 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 736 - 627
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  || ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  736 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 637  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  636 t-atgatgatt 627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 92 - 6
Alignment:
Q  78 tttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatat 164  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||  |||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  92 tttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Original strand, 11268 - 11377
Alignment:
Q  64 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  || ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  11268 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 11367  T
Q  164 tcatgatgatt 174  Q
    | |||||||||    
T  11368 t-atgatgatt 11377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 29607 - 29558
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 246  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29607 ttgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 29558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 174
Target Start/End: Original strand, 32432 - 32536
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 168  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  || ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||    
T  32432 ttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atg 32530  T
Q  169 atgatt 174  Q
    ||||||    
T  32531 atgatt 32536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1419
Description:

Target: scaffold1419; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 252 - 165
Alignment:
Q  20 aagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacatta 108  Q
    ||||||||||| || ||  |||||||| |||||| |||||  | |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  252 aagttgtttatattactattgttgttc-agtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcatta 165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 339 - 289
Alignment:
Q  196 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 246  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  339 tttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 168
Target Start/End: Original strand, 3469 - 3569
Alignment:
Q  69 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 167  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||  |||||| |||| ||| | || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  3469 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 3568  T
Q  168 g 168  Q
    |    
T  3569 g 3569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 208 - 159
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  208 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Original strand, 21871 - 21920
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 246  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  21871 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 21920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Original strand, 29763 - 29812
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 246  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  29763 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 29812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 69843 - 69794
Alignment:
Q  197 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 246  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  69843 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 78 - 150
Target Start/End: Original strand, 12758 - 12830
Alignment:
Q  78 tttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcatt 150  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  12758 tttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgatgacgtgcatt 12830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 78 - 150
Target Start/End: Original strand, 9784 - 9856
Alignment:
Q  78 tttataatgttatataattgtatatacattacatgaagtattattgatatttgagatgttgatgacttgcatt 150  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  9784 tttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgatgacgtgcatt 9856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University