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Alignment Overview

Query: NF10647_low_5 (Length: 228)

Name: NF10647_low_5
Description: NF10647
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10647_low_5
NF10647_low_5
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (3-228)||(18897641-18897866)
chr6 (5-228)||(8029025-8029248)
chr6 (5-228)||(7053704-7053927)
chr6 (5-228)||(1316741-1316964)
chr6 (5-228)||(2657422-2657645)
chr6 (5-211)||(10246259-10246465)
chr6 (7-228)||(16968649-16968870)
chr6 (8-220)||(14170740-14170951)
chr6 (117-228)||(7344209-7344320)
chr6 (59-224)||(345961-346127)
chr6 (2-223)||(6705896-6706104)
chr6 (21-125)||(7344723-7344827)
chr6 (11-125)||(21008208-21008322)
chr6 (24-189)||(14781776-14781940)
chr6 (1-162)||(8314612-8314773)
chr6 (2-82)||(9762312-9762392)
chr6 (177-223)||(10849914-10849961)
chr6 (169-219)||(21008158-21008208)
[»] chr1 (70 HSPs)
chr1 (3-228)||(14788444-14788669)
chr1 (7-228)||(32202439-32202660)
chr1 (1-228)||(25789482-25789709)
chr1 (6-228)||(20260212-20260434)
chr1 (6-228)||(9115561-9115783)
chr1 (5-228)||(46666431-46666654)
chr1 (2-215)||(8331734-8331947)
chr1 (3-228)||(52630494-52630719)
chr1 (8-224)||(9832000-9832216)
chr1 (3-228)||(12190303-12190528)
chr1 (5-228)||(6911208-6911431)
chr1 (5-228)||(32824644-32824868)
chr1 (9-228)||(51445205-51445424)
chr1 (5-203)||(5806427-5806625)
chr1 (5-228)||(36361506-36361728)
chr1 (5-228)||(50190891-50191113)
chr1 (6-220)||(39930181-39930395)
chr1 (7-214)||(1597482-1597689)
chr1 (8-228)||(2430223-2430442)
chr1 (9-228)||(4683500-4683718)
chr1 (6-228)||(38964805-38965027)
chr1 (8-228)||(48916148-48916368)
chr1 (5-228)||(2632576-2632798)
chr1 (8-228)||(35187181-35187402)
chr1 (51-228)||(49823022-49823199)
chr1 (5-181)||(47031582-47031758)
chr1 (7-224)||(37436750-37436966)
chr1 (5-224)||(5518634-5518852)
chr1 (78-228)||(3572691-3572841)
chr1 (62-228)||(6978550-6978716)
chr1 (12-228)||(13653581-13653797)
chr1 (84-228)||(39329410-39329554)
chr1 (5-228)||(29091395-29091612)
chr1 (21-224)||(52699596-52699798)
chr1 (8-217)||(48462258-48462465)
chr1 (6-224)||(47677368-47677585)
chr1 (5-223)||(24116466-24116683)
chr1 (4-128)||(25473977-25474101)
chr1 (149-228)||(47037324-47037403)
chr1 (8-225)||(1228007-1228225)
chr1 (5-224)||(9011291-9011511)
chr1 (3-224)||(46960349-46960569)
chr1 (51-228)||(30240782-30240956)
chr1 (9-224)||(38519190-38519405)
chr1 (90-181)||(1007579-1007669)
chr1 (7-162)||(19923655-19923810)
chr1 (3-162)||(37261540-37261699)
chr1 (6-220)||(3939225-3939437)
chr1 (8-228)||(31806880-31807093)
chr1 (1-161)||(49627293-49627454)
chr1 (73-220)||(13440186-13440332)
chr1 (21-128)||(45813620-45813727)
chr1 (2-82)||(52186269-52186349)
chr1 (11-228)||(13521053-13521267)
chr1 (8-162)||(13932068-13932218)
chr1 (120-213)||(52186170-52186262)
chr1 (8-214)||(29769230-29769443)
chr1 (169-218)||(11014577-11014626)
chr1 (173-228)||(17475447-17475502)
chr1 (174-228)||(19083231-19083285)
chr1 (174-228)||(19131119-19131173)
chr1 (4-101)||(17475562-17475659)
chr1 (7-63)||(39329347-39329403)
chr1 (138-218)||(13048402-13048485)
chr1 (138-218)||(13053399-13053482)
chr1 (1-38)||(1007534-1007571)
chr1 (10-55)||(49824022-49824067)
chr1 (9-49)||(11014842-11014882)
chr1 (130-162)||(37336635-37336667)
chr1 (5-101)||(45771815-45771911)
[»] chr7 (52 HSPs)
chr7 (9-228)||(45045352-45045571)
chr7 (3-228)||(45265174-45265399)
chr7 (3-228)||(11329713-11329938)
chr7 (1-228)||(43948963-43949190)
chr7 (2-228)||(33378553-33378779)
chr7 (6-228)||(35488315-35488537)
chr7 (3-228)||(27248013-27248238)
chr7 (5-228)||(44565767-44565990)
chr7 (11-228)||(39553910-39554128)
chr7 (10-228)||(44819981-44820199)
chr7 (7-228)||(34930593-34930814)
chr7 (6-228)||(27213981-27214203)
chr7 (43-228)||(8419715-8419900)
chr7 (7-228)||(27419350-27419571)
chr7 (5-228)||(48341086-48341308)
chr7 (3-228)||(48313842-48314067)
chr7 (3-214)||(28904326-28904537)
chr7 (6-220)||(48160707-48160921)
chr7 (3-228)||(25924763-25924988)
chr7 (21-228)||(38543932-38544139)
chr7 (11-228)||(25097796-25098014)
chr7 (3-228)||(41632490-41632710)
chr7 (1-228)||(9947116-9947344)
chr7 (6-228)||(45448665-45448887)
chr7 (5-228)||(38396492-38396714)
chr7 (9-228)||(37534229-37534447)
chr7 (50-228)||(40212656-40212834)
chr7 (9-220)||(30686126-30686336)
chr7 (41-228)||(9814340-9814527)
chr7 (1-220)||(31921861-31922079)
chr7 (116-228)||(16825480-16825592)
chr7 (6-224)||(6656601-6656819)
chr7 (3-224)||(45722879-45723090)
chr7 (11-224)||(18823890-18824086)
chr7 (119-224)||(6656353-6656457)
chr7 (2-157)||(17276355-17276511)
chr7 (97-221)||(41684155-41684278)
chr7 (2-161)||(40385820-40385979)
chr7 (12-228)||(22156306-22156520)
chr7 (12-228)||(22212221-22212435)
chr7 (9-158)||(31598449-31598598)
chr7 (8-224)||(45440637-45440848)
chr7 (5-224)||(5543261-5543479)
chr7 (133-215)||(25045756-25045837)
chr7 (69-224)||(11000483-11000643)
chr7 (6-224)||(43446013-43446229)
chr7 (101-214)||(43569825-43569937)
chr7 (2-57)||(16916182-16916237)
chr7 (45-219)||(38528840-38529012)
chr7 (117-218)||(47246201-47246300)
chr7 (10-67)||(24769241-24769298)
chr7 (5-113)||(20601051-20601158)
[»] chr5 (32 HSPs)
chr5 (2-228)||(22936038-22936264)
chr5 (1-228)||(28602274-28602501)
chr5 (5-228)||(4765686-4765909)
chr5 (5-228)||(8406616-8406839)
chr5 (5-228)||(14206947-14207170)
chr5 (5-228)||(18411931-18412154)
chr5 (7-228)||(555832-556053)
chr5 (8-228)||(11855781-11856001)
chr5 (4-228)||(32535658-32535882)
chr5 (9-228)||(19065631-19065850)
chr5 (5-228)||(29543141-29543364)
chr5 (5-228)||(12970656-12970879)
chr5 (3-224)||(6091435-6091656)
chr5 (8-225)||(27481082-27481299)
chr5 (9-228)||(8646517-8646735)
chr5 (63-228)||(36703654-36703819)
chr5 (8-224)||(1664456-1664671)
chr5 (7-157)||(36703506-36703656)
chr5 (3-228)||(6930362-6930586)
chr5 (7-203)||(27480735-27480930)
chr5 (5-161)||(26637213-26637370)
chr5 (65-224)||(20962373-20962531)
chr5 (21-224)||(35348654-35348858)
chr5 (8-228)||(42012305-42012530)
chr5 (2-228)||(17251533-17251757)
chr5 (5-220)||(43347029-43347243)
chr5 (9-228)||(31583188-31583404)
chr5 (5-145)||(28429450-28429591)
chr5 (9-79)||(20962286-20962356)
chr5 (9-83)||(36978404-36978478)
chr5 (91-224)||(40275885-40276017)
chr5 (7-71)||(40276524-40276587)
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (3-228)||(37392672-37392897)
chr8 (6-228)||(38363804-38364026)
chr8 (3-228)||(35818550-35818775)
chr8 (3-224)||(25837631-25837852)
chr8 (3-228)||(38132864-38133089)
chr8 (5-228)||(7930961-7931184)
chr8 (1-228)||(12710363-12710590)
chr8 (7-228)||(18297836-18298057)
chr8 (8-228)||(42755592-42755812)
chr8 (3-228)||(16313633-16313858)
chr8 (5-228)||(32661059-32661283)
chr8 (3-228)||(26061864-26062089)
chr8 (10-214)||(10896356-10896560)
chr8 (5-220)||(3049731-3049946)
chr8 (5-228)||(26602063-26602286)
chr8 (7-228)||(18726746-18726967)
chr8 (21-228)||(1554480-1554688)
chr8 (2-184)||(40197223-40197405)
chr8 (8-224)||(5020623-5020837)
chr8 (77-228)||(41228840-41228990)
chr8 (8-220)||(21137266-21137476)
chr8 (5-223)||(15226688-15226905)
chr8 (7-220)||(19160875-19161088)
chr8 (62-224)||(7317156-7317316)
chr8 (6-214)||(31117670-31117874)
chr8 (34-224)||(6805753-6805946)
chr8 (7-228)||(33444750-33444969)
chr8 (51-214)||(35394159-35394321)
chr8 (90-224)||(29421619-29421752)
chr8 (8-214)||(41432464-41432672)
chr8 (5-221)||(16219076-16219290)
chr8 (3-203)||(43872117-43872316)
chr8 (2-161)||(33533585-33533744)
chr8 (7-215)||(37981925-37982134)
chr8 (5-112)||(25899381-25899488)
chr8 (5-127)||(34672083-34672207)
chr8 (8-159)||(38437203-38437353)
chr8 (3-64)||(35394078-35394139)
chr8 (7-219)||(12649859-12650072)
chr8 (7-82)||(37124073-37124148)
[»] chr4 (60 HSPs)
chr4 (3-228)||(41859172-41859397)
chr4 (3-228)||(45595992-45596217)
chr4 (5-228)||(13230115-13230338)
chr4 (5-228)||(35999412-35999635)
chr4 (7-225)||(27763028-27763246)
chr4 (5-228)||(23686513-23686736)
chr4 (1-228)||(42773670-42773897)
chr4 (5-228)||(48873747-48873970)
chr4 (5-228)||(48879051-48879274)
chr4 (3-228)||(25932165-25932390)
chr4 (7-228)||(40435628-40435849)
chr4 (3-228)||(43722988-43723213)
chr4 (5-228)||(39730419-39730642)
chr4 (1-228)||(55968126-55968353)
chr4 (3-228)||(27555151-27555375)
chr4 (12-228)||(48519017-48519233)
chr4 (1-228)||(47670084-47670311)
chr4 (5-228)||(39835433-39835656)
chr4 (13-228)||(50673031-50673245)
chr4 (3-220)||(18405367-18405584)
chr4 (7-228)||(41744347-41744568)
chr4 (5-228)||(6280047-6280270)
chr4 (5-220)||(8321971-8322186)
chr4 (5-228)||(45747922-45748144)
chr4 (13-226)||(34238082-34238295)
chr4 (5-228)||(32953249-32953472)
chr4 (2-228)||(935849-936075)
chr4 (8-214)||(18931482-18931688)
chr4 (7-228)||(27942465-27942686)
chr4 (51-228)||(34049723-34049900)
chr4 (6-214)||(31938010-31938217)
chr4 (44-220)||(39498590-39498766)
chr4 (44-220)||(39501929-39502105)
chr4 (92-228)||(25916159-25916295)
chr4 (6-224)||(36858135-36858351)
chr4 (9-209)||(52469427-52469628)
chr4 (6-228)||(38394634-38394856)
chr4 (6-228)||(7258691-7258912)
chr4 (103-228)||(38414032-38414156)
chr4 (13-228)||(37014511-37014724)
chr4 (5-224)||(51968505-51968722)
chr4 (8-162)||(10400973-10401126)
chr4 (68-214)||(47426382-47426520)
chr4 (96-219)||(36858512-36858634)
chr4 (15-228)||(44309497-44309709)
chr4 (119-228)||(30415743-30415851)
chr4 (5-113)||(38413902-38414010)
chr4 (29-228)||(48059805-48060004)
chr4 (11-155)||(14796295-14796439)
chr4 (117-224)||(18405592-18405698)
chr4 (117-228)||(32384520-32384630)
chr4 (2-76)||(18405126-18405200)
chr4 (6-146)||(30790275-30790414)
chr4 (51-228)||(24805210-24805394)
chr4 (11-113)||(52413959-52414061)
chr4 (6-82)||(36860028-36860104)
chr4 (4-113)||(12276151-12276260)
chr4 (117-220)||(18094087-18094189)
chr4 (9-54)||(30415706-30415751)
chr4 (7-71)||(18094012-18094075)
[»] chr3 (48 HSPs)
chr3 (3-228)||(48339883-48340108)
chr3 (1-228)||(11239246-11239473)
chr3 (5-228)||(8476434-8476657)
chr3 (9-228)||(47114983-47115202)
chr3 (7-228)||(29512324-29512544)
chr3 (1-220)||(20297511-20297730)
chr3 (5-228)||(33218039-33218262)
chr3 (7-228)||(1098923-1099143)
chr3 (4-225)||(46359673-46359894)
chr3 (5-228)||(26848744-26848967)
chr3 (7-228)||(20414591-20414812)
chr3 (3-228)||(40907986-40908210)
chr3 (5-228)||(44952030-44952253)
chr3 (5-228)||(6231627-6231850)
chr3 (9-228)||(31611111-31611330)
chr3 (11-228)||(28124562-28124779)
chr3 (5-228)||(24574289-24574512)
chr3 (1-228)||(9320574-9320802)
chr3 (8-224)||(43132287-43132502)
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chr3 (8-228)||(43719056-43719271)
chr3 (7-214)||(26849286-26849492)
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chr3 (77-220)||(19532939-19533081)
chr3 (7-220)||(12228390-12228601)
chr3 (8-220)||(40584336-40584547)
chr3 (6-224)||(28770340-28770557)
chr3 (10-228)||(49216027-49216244)
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chr3 (8-203)||(24783934-24784129)
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chr3 (9-82)||(6927817-6927890)
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chr3 (92-218)||(32071256-32071380)
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chr3 (28-228)||(1247028-1247225)
chr3 (60-220)||(2565593-2565744)
chr3 (7-87)||(32070994-32071074)
chr3 (175-224)||(12931070-12931119)
chr3 (171-224)||(18460827-18460880)
chr3 (1-158)||(28693627-28693784)
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chr3 (117-162)||(21925641-21925686)
chr3 (171-220)||(33647837-33647886)
chr3 (2-38)||(19532908-19532944)
[»] chr2 (58 HSPs)
chr2 (5-228)||(346471-346694)
chr2 (2-228)||(4559278-4559504)
chr2 (5-228)||(6171513-6171736)
chr2 (5-228)||(41729256-41729479)
chr2 (3-228)||(2050586-2050811)
chr2 (9-228)||(26309993-26310212)
chr2 (1-228)||(37192240-37192467)
chr2 (10-228)||(9733972-9734190)
chr2 (3-228)||(21737534-21737759)
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chr2 (6-228)||(5770236-5770458)
chr2 (30-228)||(41750276-41750474)
chr2 (7-228)||(638318-638538)
chr2 (5-228)||(37533675-37533897)
chr2 (8-224)||(28311827-28312042)
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chr2 (42-228)||(2521434-2521620)
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chr2 (6-224)||(20426613-20426830)
chr2 (8-228)||(3902182-3902401)
chr2 (59-228)||(39995265-39995434)
chr2 (28-228)||(34356826-34357024)
chr2 (5-228)||(18713783-18714005)
chr2 (13-221)||(27358096-27358303)
chr2 (13-221)||(45408981-45409188)
chr2 (5-228)||(7007307-7007529)
chr2 (8-224)||(14832536-14832751)
chr2 (44-224)||(1988073-1988252)
chr2 (2-224)||(45693908-45694129)
chr2 (13-222)||(4875506-4875715)
chr2 (5-224)||(40569740-40569961)
chr2 (9-162)||(3254284-3254437)
chr2 (21-157)||(11763597-11763733)
chr2 (7-220)||(39819414-39819630)
chr2 (11-214)||(13790018-13790221)
chr2 (13-228)||(41298044-41298255)
chr2 (1-161)||(5003028-5003188)
chr2 (13-208)||(13539399-13539593)
chr2 (147-228)||(11763497-11763577)
chr2 (9-113)||(1623078-1623181)
chr2 (46-219)||(4684945-4685113)
chr2 (173-225)||(8868790-8868842)
chr2 (11-83)||(14253254-14253326)
chr2 (69-126)||(14253340-14253397)
chr2 (5-127)||(14403431-14403555)
chr2 (5-82)||(25444922-25444999)
chr2 (116-220)||(1623217-1623320)
chr2 (176-224)||(25724918-25724966)
chr2 (173-224)||(3254194-3254245)
chr2 (117-220)||(37851692-37851794)
chr2 (12-78)||(25625054-25625120)
chr2 (13-82)||(45212662-45212731)
chr2 (7-71)||(37851617-37851680)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
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scaffold0006 (12-228)||(143342-143558)
scaffold0006 (11-220)||(119051-119257)
[»] scaffold0189 (1 HSPs)
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[»] scaffold0662 (1 HSPs)
scaffold0662 (3-224)||(4186-4409)
[»] scaffold0702 (1 HSPs)
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[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (11-155)||(43292-43436)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Original strand, 18897641 - 18897866
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18897641 taagggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaat 18897740  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18897741 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaataggaattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 18897840  T
Q  203 ttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  18897841 ttccacccttttccttgggaaatttt 18897866  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 8029025 - 8029248
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8029025 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatggaaattttattccaagaaatttaggaaaaatat 8029124  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8029125 gtttggttggctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 8029224  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  8029225 ccacccttttctttgggaaatttt 8029248  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7053927 - 7053704
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  7053927 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaatatgggaattttattccaaggaatttatgaaaaatat 7053828  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7053827 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 7053728  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||    
T  7053727 ccaccattttccttgggaaatttt 7053704  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 1316741 - 1316964
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1316741 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattctttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 1316840  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  1316841 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattc 1316940  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  1316941 ccacccttttccttgggaaatttt 1316964  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 2657422 - 2657645
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2657422 agggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 2657521  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2657522 gtttggttaactttataatattcctagtaatcataaaaatatggattataataggaaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 2657621  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  2657622 ccacccttttccttgggaaatttt 2657645  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10246465 - 10246259
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  10246465 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 10246366  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10246365 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaattagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 10246266  T
Q  205 ccaccct 211  Q
    |||||||    
T  10246265 ccaccct 10246259  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Original strand, 16968649 - 16968870
Alignment:
Q  7 ggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgt 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16968649 ggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatttctaggaataacattctttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgt 16968748  T
Q  107 ttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcc 206  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  16968749 ttggttagctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccataggaactttattccc 16968848  T
Q  207 acccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  16968849 acccttttccttgggaaatttt 16968870  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 220
Target Start/End: Original strand, 14170740 - 14170951
Alignment:
Q  8 gtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtt 107  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  14170740 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtt 14170839  T
Q  108 tggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcca 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  14170840 tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattgtaataggtaaactatttatgaatttatt-ccatctccatgggaactttattccca 14170938  T
Q  208 cccttttctttgg 220  Q
    |||||||| ||||    
T  14170939 cccttttccttgg 14170951  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 117 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7344320 - 7344209
Alignment:
Q  117 ttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttct 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  7344320 ttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttcc 7344221  T
Q  217 ttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||||    
T  7344220 ttgggaaatttt 7344209  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 59 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 346127 - 345961
Alignment:
Q  59 gaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattccta--gaaaccataaaaatagggattataat 156  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||||| |||   |||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  346127 gaatataaagatgagaattttattctaagacatttagaaaaaagatgtttgcttaacattataacattcctgaggaaaccataaaaataggaattttaat 346028  T
Q  157 aggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgggaaa 224  Q
    ||| ||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  346027 agg-aaattactcatgaatttattctcatctccattggaactttattcccacccttttctttgggaaa 345961  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6706104 - 6705896
Alignment:
Q  2 ctaagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaa 101  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||  |||  |||||| |||||    
T  6706104 ctaagggtatgtttgtttcaagtttaccaattttatttctaggaataacattccttgaaatataaagatgagaattttattctaaggtatttagaaaaaa 6706005  T
Q  102 tatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta 201  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||||  ||| |||||            || ||||||| ||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  6706004 tatatttggttaactttataatattcctaagaactataaa------------aacaggtaaa-tacatatgaaattattctcatctccatgggaacttta 6705918  T
Q  202 tttccacccttttctttgggaa 223  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  6705917 ttcccacccttttctttgggaa 6705896  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 7344827 - 7344723
Alignment:
Q  21 aagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttat 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7344827 aagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaatatgagaattttattctaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttat 7344728  T
Q  121 aatat 125  Q
    |||||    
T  7344727 aatat 7344723  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 21008322 - 21008208
Alignment:
Q  11 tgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttgg 110  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||    
T  21008322 tgtttgtttcaagtttattaaatttatttttatgaataacatttcttggaatataaagatgagaattttattccaaggcatttagaaaaaatatgtttgg 21008223  T
Q  111 ttaggtttataatat 125  Q
    |||  ||||||||||    
T  21008222 ttaactttataatat 21008208  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 14781940 - 14781776
Alignment:
Q  24 tttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttataat 123  Q
    |||| ||||||||||  | ||||||| |||| || ||| ||||||||| |||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||| |||   |||||||    
T  14781940 tttaccaaatttattcctgggaataacattcattggaacataaagatgagaattttattccaaggtatttagaaaaaagatgtttgcttaacattataat 14781841  T
Q  124 attcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctcc 189  Q
    |||||| | |||||||||| ||||  ||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||    
T  14781840 attcctgggaaccataaaagtaggatttataataggt-aattactcatgaatttattcccatctcc 14781776  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 8314612 - 8314773
Alignment:
Q  1 actaagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaa 100  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||  ||| | ||| ||| |||  |||||| | |||  |||||||||  |||| |||||| ||||    
T  8314612 actaagggtacgtttgttttaagtttatcaaatttattcctagaattaacattacttgcaatatacacatgtaaattttattctaagatatttagaaaaa 8314711  T
Q  101 atatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaa 162  Q
    | |||||| ||||   |||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8314712 aaatgtttagttaacattataataattcaaggaaccttaaaaatagggattataataggtaa 8314773  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 9762392 - 9762312
Alignment:
Q  2 ctaagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatt 82  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||| ||||||||||    
T  9762392 ctaacggtgtgtttgtttcaagtttaccaagtttattattaggaataacattccttggattataaatatgtgaattttatt 9762312  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10849961 - 10849914
Alignment:
Q  177 tattcccatctccatgggaactttatttccaccc-ttttctttgggaa 223  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  10849961 tattcccatcttcatgggaactttattcccaccctttttctttgggaa 10849914  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21008208 - 21008158
Alignment:
Q  169 tatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttg 219  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||| ||||    
T  21008208 tatgaatttattcccatctctatgagaactttattcccacctttttgtttg 21008158  T

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Target: chr1 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 70)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Original strand, 14788444 - 14788669
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  14788444 taagggtgtgtttgttttaagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttatttcaaggaatttaggcaaaat 14788543  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14788544 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 14788643  T
Q  203 ttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||    
T  14788644 tcccacccttttccttgggaaatttt 14788669  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32202660 - 32202439
Alignment:
Q  7 ggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgt 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32202660 ggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatttttaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaagaaatttaggaaaaatatgt 32202561  T
Q  107 ttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcc 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32202560 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattccc 32202461  T
Q  207 acccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  32202460 acccttttccttgggaaatttt 32202439  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 25789482 - 25789709
Alignment:
Q  1 actaagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25789482 actatgggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaa 25789581  T
Q  101 atatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25789582 atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 25789681  T
Q  201 atttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25789682 attcccacccttttccttgggaaatttt 25789709  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20260434 - 20260212
Alignment:
Q  6 gggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatg 105  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20260434 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaagaaatttaggaaaaatatg 20260335  T
Q  106 tttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttc 205  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20260334 tttgcttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcc 20260235  T
Q  206 cacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  20260234 cacccttttccttgggaaatttt 20260212  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 9115561 - 9115783
Alignment:
Q  6 gggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatg 105  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  9115561 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatg 9115660  T
Q  106 tttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttc 205  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9115661 tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcc 9115760  T
Q  206 cacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  9115761 cacccttttccttgggaaatttt 9115783  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 46666431 - 46666654
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  46666431 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattctaaggaatttaggaaaaatat 46666530  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  46666531 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 46666630  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  46666631 ccacccttttccttgggaaatttt 46666654  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Original strand, 8331734 - 8331947
Alignment:
Q  2 ctaagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaa 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  8331734 ctaagggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaagaatttaggaaaaa 8331833  T
Q  102 tatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8331834 tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaacttta 8331933  T
Q  202 tttccacccttttc 215  Q
    || |||||||||||    
T  8331934 ttcccacccttttc 8331947  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Original strand, 52630494 - 52630719
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  52630494 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaat 52630593  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52630594 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaataggaattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttat 52630693  T
Q  203 ttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||    
T  52630694 tcccacccttttctttgagaaatttt 52630719  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9832216 - 9832000
Alignment:
Q  8 gtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtt 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  9832216 gtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattcctcggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt 9832117  T
Q  108 tggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcca 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9832116 tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattccca 9832017  T
Q  208 cccttttctttgggaaa 224  Q
    |||||||| ||||||||    
T  9832016 cccttttccttgggaaa 9832000  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12190528 - 12190303
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  12190528 taagggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaagaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaat 12190429  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 202  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12190428 atgtttggttagctttataatattccaaggaaccataaaaatagggattataataggaaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttat 12190329  T
Q  203 ttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  12190328 tcccaccattttccttgggaaatttt 12190303  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 6911208 - 6911431
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  6911208 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttatgaaaaatat 6911307  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  6911308 gtttggttagctttttaatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctctatgggaactttattc 6911407  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||    
T  6911408 ccaccattttccttgggaaatttt 6911431  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 32824644 - 32824868
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| || ||||  |||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  32824644 agggtgtgtttgtttcaaatttacgaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 32824743  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  32824744 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattc 32824843  T
Q  205 ccaccctttt-ctttgggaaatttt 228  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  32824844 ccacccttttcctttgggaaatttt 32824868  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 51445424 - 51445205
Alignment:
Q  9 tgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgttt 108  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  51445424 tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatatatagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgttt 51445325  T
Q  109 ggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccac 208  Q
    |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  51445324 ggttacctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccac 51445225  T
Q  209 ccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  51445224 ccttttccttgggaaatttt 51445205  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 5806625 - 5806427
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5806625 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 5806526  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatt 203  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5806525 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttatttccatctccatgggaactttatt 5806427  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 36361506 - 36361728
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  36361506 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaaaatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 36361605  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  36361606 gtttggttagctttataatattcctatgaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttactctcatctccatgggaacttta-tt 36361704  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    || |||||||| ||||||||||||    
T  36361705 ccccccttttccttgggaaatttt 36361728  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 50191113 - 50190891
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  50191113 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttagaatataaagatgagaattttatttcgaggaatttaggaaaaatat 50191014  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||     
T  50191013 gtttgattagctttataatattcctaggaatcataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttatt-ccatcttcatgggaactttattc 50190915  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||    
T  50190914 ccacctttttccttgggaaatttt 50190891  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 220
Target Start/End: Original strand, 39930181 - 39930395
Alignment:
Q  6 gggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatg 105  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  39930181 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattctttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaagaaaaatatg 39930280  T
Q  106 tttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttc 205  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  39930281 tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatggaaactttattcc 39930380  T
Q  206 cacccttttctttgg 220  Q
    |||||||||| ||||    
T  39930381 cacccttttccttgg 39930395  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1597689 - 1597482
Alignment:
Q  7 ggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgt 106  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  1597689 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttttaggaataacattccttgaaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgt 1597590  T
Q  107 ttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcc 206  Q
    |||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  1597589 ttggttaactttataatattcttaggaaccataaaaatatggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattccc 1597490  T
Q  207 accctttt 214  Q
    ||||||||    
T  1597489 accctttt 1597482  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 2430223 - 2430442
Alignment:
Q  8 gtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtt 107  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||  |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  2430223 gtgtgtttgtttcaagtttactaaatttattcctaggaataacgttccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaattatgtt 2430322  T
Q  108 tggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcca 207  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2430323 tggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataagtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattccca 2430421  T
Q  208 cccttttctttgggaaatttt 228  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  2430422 cccttttccttgggaaatttt 2430442  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4683718 - 4683500
Alignment:
Q  9 tgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgttt 108  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||  || |||||| |||  || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  4683718 tgtgattgtttcaagtttatcaaatttatttctaagaataacattttttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgttt 4683619  T
Q  109 ggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccac 208  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  4683618 ggttagctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcacatctccatgggaacttta-ttcccc 4683520  T
Q  209 ccttttctttgggaaatttt 228  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  4683519 ccttttttttgggaaatttt 4683500  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38965027 - 38964805
Alignment:
Q  6 gggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatg 105  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||     
T  38965027 gggtgtgtttgttttaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaatatatc 38964928  T
Q  106 tttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttc 205  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  38964927 tttggatagctttataatattcctaataaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattccaatctccatgggaactttattcc 38964828  T
Q  206 cacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||   ||||||||||||    
T  38964827 caccctttctcttgggaaatttt 38964805  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 48916368 - 48916148
Alignment:
Q  8 gtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttag-gaaaaatatgt 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||  ||||||||||    
T  48916368 gtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcttaggaataacattccttagaatataaagatgagaattttattccaaggtatttagaaaaaaatatgt 48916269  T
Q  107 ttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcc 206  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48916268 ttggttaactttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataatagg-caactacatatgaatttattcccatctccatgggaactttattccc 48916170  T
Q  207 acccttttctttgggaaatttt 228  Q
    | |||| |||||||||||||||    
T  48916169 atccttatctttgggaaatttt 48916148  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 2632576 - 2632798
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||    
T  2632576 agggtgtatttgtttcaagtttactaaatttatttctaggaataacattccttagaatataaatatgggaattttattccagcgaatttaggaaaaatat 2632675  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  2632676 gtttggttaactttataatatttctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcacatctccatgggaacttta-tt 2632774  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||    
T  2632775 ccaccattttccttgggaaatttt 2632798  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 35187181 - 35187402
Alignment:
Q  8 gtgtgtttgtttgaa-gtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgt 106  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| ||||||    
T  35187181 gtgtgtttgtttcaaagtttaccaaatttattcttaggaataatatttcttgaaatataaagatggaaattttattctaaagaatttaggaaatatatgt 35187280  T
Q  107 ttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcc 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  35187281 ttggttagttttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaacttattcttatctccatgggaactttattccc 35187380  T
Q  207 acccttttctttgggaaatttt 228  Q
    |||||| || ||||||||||||    
T  35187381 acccttctccttgggaaatttt 35187402  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 51 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 49823199 - 49823022
Alignment:
Q  51 attccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggat 150  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49823199 attccttggaatataaagatgggaattttattccatggaatttagaaaaaatatgtttggttaggtttataatattcctaggaaccataaaaatagggat 49823100  T
Q  151 tataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  49823099 tataataggtaaattatttatgaatttattatcatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttt 49823022  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 181
Target Start/End: Original strand, 47031582 - 47031758
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  47031582 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 47031681  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattc 181  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47031682 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattc 47031758  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 37436966 - 37436750
Alignment:
Q  7 ggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgt 106  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  37436966 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaagaataacattccttggaatataaatatggaaattttatttcaaggtgtttaggaaaaatatgt 37436867  T
Q  107 ttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcc 206  Q
    |||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  37436866 ttggttaactttataatattcttaggaaccataaaaataaggattataatagat-aactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattctc 37436768  T
Q  207 acccttttctttgggaaa 224  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37436767 acccttttctttgggaaa 37436750  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5518852 - 5518634
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  5518852 agggtctgtttgtttgaagtttaccaaatttattcattggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggtatttaggaaaaatat 5518753  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    ||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  5518752 gttcggttaactttataacattcctaggaaccataaaaatagggattataataggt-aactatatataaatttattctcatctccatgggaactttattc 5518654  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaa 224  Q
    ||||| ||||| ||||||||    
T  5518653 ccacctttttccttgggaaa 5518634  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 78 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3572841 - 3572691
Alignment:
Q  78 ttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaattt 177  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3572841 ttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaattt 3572742  T
Q  178 attcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  3572741 attcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttt 3572691  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 62 - 228
Target Start/End: Original strand, 6978550 - 6978716
Alignment:
Q  62 tataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggta 161  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6978550 tataaagatgagaattttattccaagaaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaattagggattataataggta 6978649  T
Q  162 aactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  6978650 aactatttatgaatttattctcatctccatggaaactttattcccacccttttccttgagaaatttt 6978716  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 13653581 - 13653797
Alignment:
Q  12 gtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaatttt-atttcaagaaatttaggaaaaatatgtttgg 110  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||| | ||||||||||||||    
T  13653581 gtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaatttttatttcaaggtatttggaaaaaatatgtttgg 13653680  T
Q  111 ttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccaccc 210  Q
    |||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     
T  13653681 ttaactttataatattcctaggaaccataaaattagggattataataggt-aactacatatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacca 13653779  T
Q  211 ttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13653780 ttttctttgggaaatttt 13653797  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 84 - 228
Target Start/End: Original strand, 39329410 - 39329554
Alignment:
Q  84 caagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattccc 183  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39329410 caaggaatttagaaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattccc 39329509  T
Q  184 atctccatgggaactttatttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||    
T  39329510 atctccatgggaactttattcccaccctttttcatgggaaatttt 39329554  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 29091395 - 29091612
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||||||    
T  29091395 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttaaaatataaagatgggaattttattccaaggtatttataaaaaatat 29091494  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||     |||||||||||||||||||     
T  29091495 gtttggttaactttataatattactaggaaccataaaaatagggtttataataggt-aactatgtgtaaatttat-----tctccatgggaactttattc 29091588  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||| |||| |||||||||||||    
T  29091589 ccacctttttttttgggaaatttt 29091612  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 52699798 - 52699596
Alignment:
Q  21 aagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttat 120  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||| ||||||| ||||| |||   ||||    
T  52699798 aagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggtatttagaaaaaataagtttgcttaacattat 52699699  T
Q  121 aatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgg 220  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52699698 aatattcctgggaaccatgaaaataggaattataatagg-aaattactcatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttctttgg 52699600  T
Q  221 gaaa 224  Q
    ||||    
T  52699599 gaaa 52699596  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 217
Target Start/End: Original strand, 48462258 - 48462465
Alignment:
Q  8 gtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtt 107  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||| || || |||||||||| ||||| |||| ||| | |||||| |||||||||||    
T  48462258 gtgtatttgttttaagtttatcaaatttatttttatgaataacattctttggagtataaagatgagaattatattccaa-atatttagaaaaaatatgtt 48462356  T
Q  108 tggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcca 207  Q
    ||||||  |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||    
T  48462357 tggttaactttataatatttgtaggaaccataaaaataaggattataataggt-aactatttatgaatttattcccaattccatgggaactttataccca 48462455  T
Q  208 cccttttctt 217  Q
     |||||||||    
T  48462456 tccttttctt 48462465  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 224
Target Start/End: Original strand, 47677368 - 47677585
Alignment:
Q  6 gggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatg 105  Q
    |||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||  |||||||||    
T  47677368 gggtgtgtttatttaaagtttatgaaatttattcttaggaataaaatttcttggaatataaagatgagaattttattccaagatatttaaaaaaaatatg 47677467  T
Q  106 tttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttc 205  Q
    ||||||||  ||| ||||||||  || |||| |||||||||||||||||||| || || ||   || | ||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  47677468 tttggttaactttgtaatattctaaggaaccttaaaaatagggattataatatgt-aattacacataattttattcccatcttcatgggaactttattcc 47677566  T
Q  206 cacccttttctttgggaaa 224  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  47677567 catcctttcctttgggaaa 47677585  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24116683 - 24116466
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||| ||||| ||    
T  24116683 agggtgtgtttgttttaagtttaacaaatttattcttaagaataacattccttagaatataaagatgagaattttatttcaaggtatatagaaaaaagat 24116584  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    ||||| |||   ||| ||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||   || ||| ||||| ||||| ||||||| |||||||     
T  24116583 gtttgcttaacattaaaatatttttggaaaccataaaaataggaattataataggt-aattacacataaatatattctcatcttcatgggagctttattc 24116485  T
Q  205 ccacccttttctttgggaa 223  Q
    || ||||||||||||||||    
T  24116484 cctcccttttctttgggaa 24116466  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 25473977 - 25474101
Alignment:
Q  4 aagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaata 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  25473977 aagggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaagaatttaggaaaaata 25474076  T
Q  104 tgtttggttaggtttataatattcc 128  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  25474077 tgtttggttagctttataatattcc 25474101  T

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Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 149 - 228
Target Start/End: Original strand, 47037324 - 47037403
Alignment:
Q  149 attataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  47037324 attataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttt 47037403  T

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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1228225 - 1228007
Alignment:
Q  8 gtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttag--gaaaaatatg 105  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  || ||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||   |||||||||    
T  1228225 gtgtgtttgttttaagtttaccaaatttatttctatgaataaccttccttggaatataaagatgagaattttattccaaagaatttagaaaaaaaatatg 1228126  T
Q  106 tttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttc 205  Q
    |||||| |  ||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||| || | |  || | |||||||  |||| ||||||||||||||| |    
T  1228125 tttggtgaactttataatatttcaaggaaccttaaaaatagggattataataggt-aattctacataattttattctaatcttcatgggaactttattcc 1228027  T
Q  206 cacccttttctttgggaaat 225  Q
    |  |||||||||| ||||||    
T  1228026 cgaccttttctttcggaaat 1228007  T

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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9011511 - 9011291
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttag---gaaaaa 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||  |||||| ||  ||   ||||||    |||||    
T  9011511 agggtgtgtttgttttaagtttatcaaatttatttttaggaataatattcctcggaacataaagatgaaaattttcttctaaagtatttagaaaaaaaaa 9011412  T
Q  102 tatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta 201  Q
     ||||||| |||   ||||||||||||| || ||||| |||||| | ||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  9011411 aatgtttgcttaacattataatattcctggagaccat-aaaataagaattataatagg-aaattactcatgaatttattcccaccactatgggaacttta 9011314  T
Q  202 tttccacccttttctttgggaaa 224  Q
    || | ||||||||||||||||||    
T  9011313 ttccgacccttttctttgggaaa 9011291  T

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Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 224
Target Start/End: Original strand, 46960349 - 46960569
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttag-gaaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||  |||||    
T  46960349 taagggtgtgtttgtttcaaatttatcaaatttattcctaggaataacattctttggaatataaagatgagaaatttattccaagatatttagaaaaaaa 46960448  T
Q  102 tatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta 201  Q
     |||||||||||   |||||||||||| |  |||| ||||||||| | ||||||||||| || ||   |  | ||||||  ||||| |||||||||||||    
T  46960449 gatgtttggttaacattataatattccaatgaaccttaaaaatagagtttataataggt-aattacacacaattttatt-tcatcttcatgggaacttta 46960546  T
Q  202 tttccacccttttctttgggaaa 224  Q
    || ||||||||||| ||||||||    
T  46960547 ttcccacccttttcattgggaaa 46960569  T

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Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 51 - 228
Target Start/End: Original strand, 30240782 - 30240956
Alignment:
Q  51 attccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggat 150  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||||| ||| | |||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  30240782 attccttgaaatataaaaatggaaattttattccaa-atatttaa-aaaaatatgtttggttaactttataatattcctaagaaccataaaagtagggat 30240879  T
Q  151 tataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    |||||||||| || ||  ||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||    
T  30240880 tataataggt-aattacatataaatttattctcatcttcatgagaactttattctcactcttttctttgggaattttt 30240956  T

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Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 38519405 - 38519190
Alignment:
Q  9 tgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgttt 108  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||  ||||||||| |||  || ||| ||||| |||  ||||||||| |||   |||||| ||||| ||||||    
T  38519405 tgtgtttgtttcaaatttaccaaatttattcgtaggaataacattttttggaacataaaaatgaaaattttattccaatgtatttagaaaaaagatgttt 38519306  T
Q  109 ggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcc-a 207  Q
    | |||   ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||| |||| |  | ||||||||||||||| || |    
T  38519305 gtttaacattataatattcttggaaaccataaaaatagggattataataggtaatttatacatgaattt-ttcctaatttcatgggaactttattcccaa 38519207  T
Q  208 cccttttctttgggaaa 224  Q
     ||||||||||||||||    
T  38519206 accttttctttgggaaa 38519190  T

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Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 181
Target Start/End: Original strand, 1007579 - 1007669
Alignment:
Q  90 atttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattc 181  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1007579 atttaggaaaaatatgtttgattaactttataatattcttaggaaccataaaaatatggattataataggt-aactatttatgaatttattc 1007669  T

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Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 19923810 - 19923655
Alignment:
Q  7 ggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgt 106  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||| ||||||||||    
T  19923810 ggtgtgtttgttttaagttcatcaaatttatttttagaaataacatttcttagaacataaagatgagaattttattctaagatatttagaaaaaatatgt 19923711  T
Q  107 ttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaa 162  Q
    ||| |||   ||||||| ||  |   ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  19923710 ttgtttaacattataatgtttttgagaaccaaaaaagtagggattataataggtaa 19923655  T

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Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 162
Target Start/End: Original strand, 37261540 - 37261699
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||| |||| || ||||||||| ||| ||||||||||   ||| |||||| |||||     
T  37261540 taaggatgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatttttatgattaacattcattggaatataaatatgtgaattttattcttagatatttagaaaaaag 37261639  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaa 162  Q
    |||||||||||   |||||||||||| |  |||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  37261640 atgtttggttaatattataatattccaaagaacgttaaaaatatggattataataggtaa 37261699  T

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Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 220
Target Start/End: Original strand, 3939225 - 3939437
Alignment:
Q  6 gggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatg 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||| || ||||||||| | | ||||||||||| |||| |||||  ||||| |||    
T  3939225 gggtgtgtttgttttaagtttatcaaatatatttttaggaataacattctttggaatataaaaaagtgaattttattttaagatatttaaaaaaaacatg 3939324  T
Q  106 tttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttc 205  Q
    |||| |||   ||||||||||   || || | ||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||| |    
T  3939325 tttgattaacattataatattttaaggaa-cttaaaaatatagattataataggt-aaccatgtatgaatttattctcatcttaatggaaacttgattcc 3939422  T
Q  206 cacccttttctttgg 220  Q
     || |||||||||||    
T  3939423 tacacttttctttgg 3939437  T

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Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31807093 - 31806880
Alignment:
Q  8 gtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtt 107  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||||||  || |||||||||| ||| ||| |||||||||  |||||||||  |||  |||||| |||||||||||    
T  31807093 gtgtgtttatttcaagttgatcaaatttatttctaagaataatatttcttggaacataaagatgaaaattttattctaaggtatttagaaaaaatatgtt 31806994  T
Q  108 tggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcca 207  Q
    || |||   ||||||||||    | ||||||||||||      |||||||| |||  ||   |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31806993 tgcttaacattataatatttgcgggaaccataaaaat------tataatagataat-tacacatgaatttgttctcatcttcatgggaactttatttcca 31806901  T
Q  208 cccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||| |||||||| ||||    
T  31806900 cccttttatttgggaattttt 31806880  T

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Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 49627293 - 49627454
Alignment:
Q  1 actaagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatt-tcaagaaatttaggaaa 99  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||| ||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  || | || |   ||    
T  49627293 actaaggatgtgtttgtttcaaatttaccaaatttatttttaagaataacatttcttggaatataaagatgggaattttattgtagagtatttaaaagaa 49627392  T
Q  100 aatatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggta 161  Q
    || |||||||||||   |||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49627393 aaaatgtttggttaacattataatatttcaaagaaccataaaaatatggattataataggta 49627454  T

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Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 220
Target Start/End: Original strand, 13440186 - 13440332
Alignment:
Q  73 gaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatg 172  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||| |   ||||||||||||  | |||  ||| |||| |||||||||||||||   ||  ||||    
T  13440186 gaattttatttcaagatatttagaaaaaaggtgttcggtgaacattataatattccatggaactttaagaatatggattataataggtagt-tacatatg 13440284  T
Q  173 aatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgg 220  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13440285 aatttattctcatcttcatggaaactttatttccacccttttctttgg 13440332  T

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Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 45813727 - 45813620
Alignment:
Q  21 aagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttat 120  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||  |||||| ||||| || ||| |||| | ||||    
T  45813727 aagtttatcaaatttattcttaggaataacattcattgaaatataaagatgtgaattttattttaaggtatttagaaaaaagatattttgttaagattat 45813628  T
Q  121 aatattcc 128  Q
    ||||||||    
T  45813627 aatattcc 45813620  T

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Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 52186349 - 52186269
Alignment:
Q  2 ctaagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatt 82  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  52186349 ctaatggtgtatttgttttaagtttaccaaatttattttaaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttatt 52186269  T

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Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Original strand, 13521053 - 13521267
Alignment:
Q  11 tgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttgg 110  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| |||  ||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||  ||||| |    
T  13521053 tgtttgatttaagtttaccaaatttattcttaaaaataacattcactagaatataaagatgtgaattttatttcaag-tatttagaaaaaaggtgtttcg 13521151  T
Q  111 ttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccaccc 210  Q
    | |    |||||||||||  | |||| ||| ||||||||||||||||  | |  ||    || |||||||| |||||   ||| ||||||||||||||||    
T  13521152 tgaacactataatattccccggaaccttaagaatagggattataataaat-agttacacctg-atttattctcatctttctggaaactttatttccaccc 13521249  T
Q  211 ttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13521250 ttttctttgggaaatttt 13521267  T

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Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 13932218 - 13932068
Alignment:
Q  8 gtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttag--gaaaaatatg 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||| ||  ||||||||||||| || |||||||||||  ||| ||   |||||||||    
T  13932218 gtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatttcaaggaataacattcattgaaatataaagatggaaactttatttcaaggtattcagaaaaaaaatatg 13932119  T
Q  106 tttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaa 162  Q
    ||||||||  |||||| |||     | |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  13932118 tttggttaattttatagtat-----ggaaccttaaaaata-ggattataataggtaa 13932068  T

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Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 52186262 - 52186170
Alignment:
Q  120 taatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttt 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||| ||| |||||| ||| |||||||||    
T  52186262 taatattcttagaaaccataaaaatagaaattataataggt-aactatgtagaaatttattcacatctcaatgtgaacttaattcccacccttt 52186170  T

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Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 214
Target Start/End: Original strand, 29769230 - 29769443
Alignment:
Q  8 gtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattag--gaataata---ttccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttagga---aa 99  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||| |||   ||||||||   ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |   ||    
T  29769230 gtgtgtttgttttaagtttactaaatttattcttatatgaataataacattctttggaatataaagatgtgaattttatttcaagatatttagaagaaaa 29769329  T
Q  100 aatatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt 199  Q
    || |||||| ||||   |||||||||| | || |||| || ||| |  |||||||||||||||  ||   |||||||||||  ||||| ||||| |||||    
T  29769330 aaaatgtttagttaacattataatatttcaaggaaccttagaaacatagattataataggtaat-tacacatgaatttattttcatcttcatggaaactt 29769428  T
Q  200 tatttccaccctttt 214  Q
    |||| ||||||||||    
T  29769429 tattcccaccctttt 29769443  T

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Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11014626 - 11014577
Alignment:
Q  169 tatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttcttt 218  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11014626 tatgaatttattctcatcttcatgagaactttatttccacccttttcttt 11014577  T

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Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17475502 - 17475447
Alignment:
Q  173 aatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  17475502 aatttactcccatctctattggaactttattcccactcttttctttgggaaatttt 17475447  T

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Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19083285 - 19083231
Alignment:
Q  174 atttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    |||||||| ||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19083285 atttattctcatatgcctggaaactttatttccacccttttctttgggaaatttt 19083231  T

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Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19131173 - 19131119
Alignment:
Q  174 atttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    |||||||| ||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19131173 atttattctcatatgcctggaaactttatttccacccttttctttgggaaatttt 19131119  T

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Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 17475659 - 17475562
Alignment:
Q  4 aagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaa 101  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  || |||||| ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| ||||  |||||| |||||    
T  17475659 aagggtgtgttcgtttcaagtttatcaaatttattcctaagaataacattctatggaaaataaaaatggaaattttattccaaggtatttagaaaaaa 17475562  T

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Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 63
Target Start/End: Original strand, 39329347 - 39329403
Alignment:
Q  7 ggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaata 63  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||    
T  39329347 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaata 39329403  T

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Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13048485 - 13048402
Alignment:
Q  138 taaaaatagggattataataggtaaactatttatgaattta----ttcccatctccatgggaactttatttccacccttttcttt 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||  |||||||||    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13048485 taaaaataaggattataataggtaat-tatacatgaatttaattattcccatattcatggaaactttatttccacccttttcttt 13048402  T

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Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13053482 - 13053399
Alignment:
Q  138 taaaaatagggattataataggtaaactatttatgaattta----ttcccatctccatgggaactttatttccacccttttcttt 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||  |||||||||    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13053482 taaaaataaggattataataggtaat-tatacatgaatttaattattcccatattcatggaaactttatttccacccttttcttt 13053399  T

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Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 1007534 - 1007571
Alignment:
Q  1 actaagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttatt 38  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1007534 actatgggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatt 1007571  T

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Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 49824067 - 49824022
Alignment:
Q  10 gtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattcc 55  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  49824067 gtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattcc 49824022  T

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Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 11014882 - 11014842
Alignment:
Q  9 tgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataa 49  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11014882 tgtgtttgttttaaatttatcaaatttatttttaggaataa 11014842  T

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Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 37336667 - 37336635
Alignment:
Q  130 agaaaccataaaaatagggattataataggtaa 162  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37336667 agaaaccataaaaatagagattataataggtaa 37336635  T

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Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 101
Target Start/End: Original strand, 45771815 - 45771911
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaa 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||   | ||||||  || ||| ||| |||||| || |||||||||| ||||  |||||| |||||    
T  45771815 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcccatgaataacctttcttggaacataaaggtgagaattttattccaaggtatttagaaaaaa 45771911  T

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Target: chr7 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 52)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 45045352 - 45045571
Alignment:
Q  9 tgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgttt 108  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  45045352 tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaggaataatattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgttt 45045451  T
Q  109 ggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccac 208  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45045452 ggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccac 45045551  T
Q  209 ccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  45045552 ccttttccttgggaaatttt 45045571  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45265399 - 45265174
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  45265399 taagggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaat 45265300  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45265299 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttat 45265200  T
Q  203 ttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||    
T  45265199 tcccacccttttccttgggaaatttt 45265174  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Original strand, 11329713 - 11329938
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  11329713 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaat 11329812  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329813 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 11329912  T
Q  203 ttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||    
T  11329913 tcccacccttttccttgggaaatttt 11329938  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 43948963 - 43949190
Alignment:
Q  1 actaagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  43948963 actaagggtgtatttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaa 43949062  T
Q  101 atatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43949063 atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaacttt 43949162  T
Q  201 atttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  43949163 attcccacccttttccttgggaaatttt 43949190  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 228
Target Start/End: Original strand, 33378553 - 33378779
Alignment:
Q  2 ctaagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaa 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  33378553 ctaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttatgaaaaa 33378652  T
Q  102 tatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33378653 tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta 33378752  T
Q  202 tttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  33378753 ttcccaccattttccttgggaaatttt 33378779  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35488537 - 35488315
Alignment:
Q  6 gggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatg 105  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  35488537 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatg 35488438  T
Q  106 tttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttc 205  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  35488437 tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattcc 35488338  T
Q  206 cacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  35488337 cacccttttccttgggaaatttt 35488315  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Original strand, 27248013 - 27248238
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  27248013 taaggatgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttagaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaat 27248112  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27248113 atgtttggttagctttataatattcctatgaactataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 27248212  T
Q  203 ttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||    
T  27248213 tcccacccttttccttgggaaatttt 27248238  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 44565767 - 44565990
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  44565767 agggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatggaaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 44565866  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
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T  44565867 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatatggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattc 44565966  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  44565967 ccacccttttccttgggaaatttt 44565990  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Original strand, 39553910 - 39554128
Alignment:
Q  11 tgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaa-tatgtttg 109  Q
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T  39553910 tgtttgtttgaagtttatcaaatttattcttagtaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaaatatttttg 39554009  T
Q  110 gttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacc 209  Q
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T  39554010 gttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacc 39554109  T
Q  210 cttttctttgggaaatttt 228  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  39554110 cttttccttgggaaatttt 39554128  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 44819981 - 44820199
Alignment:
Q  10 gtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttg 109  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  44819981 gtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttttaggaataacattccttaaaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatatttg 44820080  T
Q  110 gttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacc 209  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44820081 gttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggactataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacc 44820180  T
Q  210 cttttctttgggaaatttt 228  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  44820181 cttttccttgggaaatttt 44820199  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34930814 - 34930593
Alignment:
Q  7 ggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgt 106  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  34930814 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttatgaaaaatatgt 34930715  T
Q  107 ttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcc 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34930714 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagataaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattccc 34930615  T
Q  207 acccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||  ||||||||||||    
T  34930614 accctttttcttgggaaatttt 34930593  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27214203 - 27213981
Alignment:
Q  6 gggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatg 105  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  27214203 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttatgaaaaatatg 27214104  T
Q  106 tttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttc 205  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  27214103 tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaacagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccataggaactttattcc 27214004  T
Q  206 cacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  27214003 cacccttttccttgggaaatttt 27213981  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 43 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8419900 - 8419715
Alignment:
Q  43 ggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaa 142  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  8419900 ggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaagaaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaa 8419801  T
Q  143 atagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  8419800 atagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttt 8419715  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27419571 - 27419350
Alignment:
Q  7 ggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgt 106  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||    
T  27419571 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttttaggaataacatttcttggaatataaagatgggaattttattccaaagaatttagaaaaaatatgt 27419472  T
Q  107 ttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcc 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27419471 ttggttagctttataatattcctagggaccataaaaatagagattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattccc 27419372  T
Q  207 acccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  27419371 acccttttccttgggaaatttt 27419350  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 48341086 - 48341308
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  48341086 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaaga-gggaattttattccaaggaatttatgaaaaatat 48341184  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48341185 gtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 48341284  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||    
T  48341285 ccaccattttccttgggaaatttt 48341308  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Original strand, 48313842 - 48314067
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  48313842 taagggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatttctaggaataacatttcttggaatataaagatgagaattttattctaaggaatttaggaaaaat 48313941  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 202  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48313942 atgtttggttagctttataatattccaaggaaccataaaaatagggattataataggaaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttat 48314041  T
Q  203 ttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  48314042 tcccaccattttccttgggaaatttt 48314067  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28904537 - 28904326
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  28904537 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattctaaggaatttaggaaaaat 28904438  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 202  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28904437 atgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatatggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 28904338  T
Q  203 ttccaccctttt 214  Q
    | ||||||||||    
T  28904337 tcccaccctttt 28904326  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 48160921 - 48160707
Alignment:
Q  6 gggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatg 105  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  48160921 gggtgtgtttgtttcaagtttactaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttatgaaaaatatg 48160822  T
Q  106 tttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttc 205  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48160821 tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcc 48160722  T
Q  206 cacccttttctttgg 220  Q
    |||| ||||| ||||    
T  48160721 caccattttccttgg 48160707  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25924988 - 25924763
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||  || |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  25924988 taagggtgtgtttgtttcatgtttaccaaatttattcctaagaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaat 25924889  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25924888 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatatggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctctatgggaactttat 25924789  T
Q  203 ttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||    
T  25924788 tcccacccttttcctggggaaatttt 25924763  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Original strand, 38543932 - 38544139
Alignment:
Q  21 aagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttat 120  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38543932 aagtttactaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaagaaatttaggaaaaatatgtttggttagctttat 38544031  T
Q  121 aatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgg 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||     
T  38544032 aatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccatttttcttga 38544131  T
Q  221 gaaatttt 228  Q
    ||||||||    
T  38544132 gaaatttt 38544139  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Original strand, 25097796 - 25098014
Alignment:
Q  11 tgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttag-aatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttg 109  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||  || | |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  25097796 tgtttgttttaagtttaccaaatttattcctaggaataatatttttttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttg 25097895  T
Q  110 gttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacc 209  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25097896 gttagctttataatattcctaggaaccataaatatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacc 25097995  T
Q  210 cttttctttgggaaatttt 228  Q
    |||||| || |||||||||    
T  25097996 cttttccttaggaaatttt 25098014  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41632710 - 41632490
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||      ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  41632710 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattc-----aataacattcctttgaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaat 41632616  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41632615 atgtttggttagctttataatattcctatgaaccataaaaatatggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttat 41632516  T
Q  203 ttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    | ||||||||||  ||||||||||||    
T  41632515 tcccaccctttttcttgggaaatttt 41632490  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9947344 - 9947116
Alignment:
Q  1 actaagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||    
T  9947344 actaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctaggaataacattccttgtaatataaagatgggaattttattccaaggaatgtagaaaaa 9947245  T
Q  101 a-tatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt 199  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  9947244 aatatgtttggttagctttataatattcataggaaccataaaaatagggattgtaataggtaaactatttatgaatttaatctcatctccatgggaactt 9947145  T
Q  200 tatttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  9947144 tattcccacccttttccttgggaaatttt 9947116  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 45448665 - 45448887
Alignment:
Q  6 gggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatg 105  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||    
T  45448665 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctatgaataacattccttggaatataaagatgggaattttattctaaagaatttaggaaaaatatg 45448764  T
Q  106 tttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttc 205  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  45448765 tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaataaggattataatagataaactatttatgaatttattcccctctctatgggaactttattcc 45448864  T
Q  206 cacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    |||||||||  ||||||||||||    
T  45448865 caccctttttcttgggaaatttt 45448887  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38396714 - 38396492
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||  |||| || |||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  38396714 agggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaatagcattcattggaatataa-gataggaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 38396616  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  38396615 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggaaaattatttatgaatttattcccatctccgtgggaactttattc 38396516  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||    
T  38396515 ccaccattttccttgggaaatttt 38396492  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37534447 - 37534229
Alignment:
Q  9 tgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgttt 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  37534447 tgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatttctagaaataacattccttggaatataaagatgagaattttatttcaaggtatttaggaaaaatatgttt 37534348  T
Q  109 ggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccac 208  Q
    |||||  |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  37534347 ggttaactttataatattcttaggaactataataatagggattataataagt-aactatttatgaatttattcacatctccatgggaactttattcccac 37534249  T
Q  209 ccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  37534248 ccttttccttgggaaatttt 37534229  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Original strand, 40212656 - 40212834
Alignment:
Q  50 tattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaataggga 149  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40212656 tattcctaggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaataggga 40212755  T
Q  150 ttataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  40212756 ttataatagataaactatttatgaatttattcccatctccatgagaactttattcccaccctttttcttgggaaatttt 40212834  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 30686336 - 30686126
Alignment:
Q  9 tgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgttt 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  30686336 tgtgtttgttttaagtttatcaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagatgaaaattttattgcaaggtatttaggaaaaatatgttt 30686237  T
Q  109 ggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccac 208  Q
    |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  30686236 ggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagcgattataataagt-aactatttatgaatttattcccatctccctaggaactttattcccac 30686138  T
Q  209 ccttttctttgg 220  Q
    | ||||| ||||    
T  30686137 ctttttccttgg 30686126  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 41 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9814527 - 9814340
Alignment:
Q  41 taggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataa 140  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||||||  |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  9814527 taggaataacatttcttggaatataaagatgacaattttattctaaggaatttaggaaaaatatgtttgattagctttataatattcctaggaaccataa 9814428  T
Q  141 aaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  9814427 aaatagagattataatagataaactatttatgaatttattcccatctccatgagaactttattcccaccctttttcttgggaaatttt 9814340  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 31922079 - 31921861
Alignment:
Q  1 actaagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatggga--attttatttcaagaaatttaggaa 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||| |||| || ||||||||| ||||||  |||||||| ||||  |||||| ||    
T  31922079 actaagggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattaccatgaataacattctttggaatataaatatgggagaattttattccaaggtatttagaaa 31921980  T
Q  99 aaatatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaact 198  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||   ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  31921979 aaatatgtatggttaactttataatatttctaggaaccataaaaatagacattataatagg---actatatatgaatttattctcatctctatgggaact 31921883  T
Q  199 ttatttccacccttttctttgg 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  31921882 ttattcccacccttttctttgg 31921861  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 116 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16825592 - 16825480
Alignment:
Q  116 tttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttc 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16825592 tttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttc 16825493  T
Q  216 tttgggaaatttt 228  Q
     ||||||||||||    
T  16825492 cttgggaaatttt 16825480  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6656819 - 6656601
Alignment:
Q  6 gggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataat-attccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    |||||||||| ||| |||||||  ||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| ||| ||| |||||||||| ||||  |||| | ||||||||    
T  6656819 gggtgtgtttctttcaagtttactaaatttattcttaggaataaacattccttggaatagaaatatgagaattttattccaaggtatttggaaaaaatat 6656720  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||| ||||  ||||||||||| |||  ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  6656719 gttttgttaactttataatatttctaagaaccaaaaaaatatagattataataggt-aactatttatgactttattcccatctccatgggaactttattc 6656621  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaa 224  Q
    |||   ||||| ||||||||    
T  6656620 ccatatttttcattgggaaa 6656601  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 224
Target Start/End: Original strand, 45722879 - 45723090
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||         | ||||||    
T  45722879 taagggtgtctttatttcaagtttaccaaatttatttttaggaataacattccttgaaatataaagatggaaattttattcca---------gaaaaaat 45722969  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 202  Q
    ||||||  |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||    
T  45722970 atgtttaattaactttataatattcctagaaatcataaaaatatggattataataggt-aactatttatgaatttatttctattttcatgggaactttat 45723068  T
Q  203 ttccacccttttctttgggaaa 224  Q
    | ||||| ||||  ||||||||    
T  45723069 tcccaccatttttcttgggaaa 45723090  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 18823890 - 18824086
Alignment:
Q  11 tgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttgg 110  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||    
T  18823890 tgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattctttggaatataaagatgagaattttattctaaggtatttaggaaaaatatgtttgg 18823989  T
Q  111 ttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccaccc 210  Q
    |||  ||||||||||||               |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  18823990 ttaactttataatattc---------------atagggattataataggt-aattatttatgaatttattcccatctccat-ggaactttattcccacct 18824072  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 119 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6656457 - 6656353
Alignment:
Q  119 ataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttcttt 218  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  6656457 ataatattcttaggaaccaaaaaaatacagattataataggtaa-ctatttatgattttattcccatctccatggaaactttatttccaccctttttatt 6656359  T
Q  219 gggaaa 224  Q
    ||||||    
T  6656358 gggaaa 6656353  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 17276511 - 17276355
Alignment:
Q  2 ctaagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaa 101  Q
    |||||||||||||||||| || ||||  |||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||| |||||  ||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  17276511 ctaagggtgtgtttgtttcaattttacaaaatttatttctaggaataacattccttggaatatatagatgtaaattttattccaagatatttagaaaaaa 17276412  T
Q  102 tatgtttgg-ttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataata 157  Q
     |||||||| |||   |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  17276411 gatgtttggtttaacattataatattccaagaaaccttaaaaataaggattacaata 17276355  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 97 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41684278 - 41684155
Alignment:
Q  97 aaaaatatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaa 196  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| ||||||||  |||||||||| |||    
T  41684278 aaaaatatgtttggttaattttataatatttataggaaccataaaaatagagattataataggt-aactacatataaatttattttcatctccatgagaa 41684180  T
Q  197 ctttatttccacccttttctttggg 221  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||    
T  41684179 ctttattcccactcttttctttggg 41684155  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 40385979 - 40385820
Alignment:
Q  2 ctaagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaa 101  Q
    |||| ||||||| | ||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| |||  || ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||  |||||    
T  40385979 ctaaaggtgtgtctctttcaagtgtatcaaatttattcttagtaataacattttttggaatataaagatgagaattttattttaaggtatttaaaaaaaa 40385880  T
Q  102 tatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggta 161  Q
     || ||||||||   ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40385879 gatatttggttaacattataatattcctaagaaccataaaaatatggattataataggta 40385820  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22156520 - 22156306
Alignment:
Q  12 gtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggt 111  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||  || ||||||||||||  ||||||||||  |||  || ||| ||||| ||||||| |    
T  22156520 gtttgtttcaaatttatcaaatttatttttaggaataacattttttggaatataaagataagaattttattctaaggtatatagaaaaaa-atgtttgtt 22156422  T
Q  112 taggtttataatattc-ctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccaccc 210  Q
    ||    |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||  |||||| |||||| |||||| ||| |||||||||| | ||||    
T  22156421 taacagtataatattcacgagaa-ccataaaaatatggattataatatgtaat-tacatatgaacttattctcatctctatgagaactttattcctaccc 22156324  T
Q  211 ttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22156323 ttttctttgggaaatttt 22156306  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22212435 - 22212221
Alignment:
Q  12 gtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggt 111  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||  || ||||||||||||  ||||||||||  |||  || ||| ||||| ||||||| |    
T  22212435 gtttgtttcaaatttatcaaatttatttttaggaataacattttttggaatataaagataagaattttattctaaggtatatagaaaaaa-atgtttgtt 22212337  T
Q  112 taggtttataatattc-ctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccaccc 210  Q
    ||    |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||  |||||| |||||| |||||| ||| |||||||||| | ||||    
T  22212336 taacagtataatattcacgagaa-ccataaaaatatggattataatatgtaat-tacatatgaacttattctcatctctatgagaactttattcctaccc 22212239  T
Q  211 ttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22212238 ttttctttgggaaatttt 22212221  T

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Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 158
Target Start/End: Original strand, 31598449 - 31598598
Alignment:
Q  9 tgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgttt 108  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||| ||||||    
T  31598449 tgtgtttgttttaagtttaccaaatttatttttgggaataacatttcttggaatataaagataggaattttatttcaaggtatttaaaaaaaagatgttt 31598548  T
Q  109 ggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataatag 158  Q
    | |||   ||||||||| ||| | || ||||||||||||  |||||||||    
T  31598549 gtttaacattataatatacctgggaatcataaaaataggatttataatag 31598598  T

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Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Original strand, 45440637 - 45440848
Alignment:
Q  8 gtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtt 107  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||  ||| ||||| ||| |||||||||||  ||||  ||||||||| ||||| |||||  ||||| |||||    
T  45440637 gtgtgtttgtttca-gtttaccaaatttattcatagtaataacatttcttagaatata--gatgtaaattttattccaagatatttaa-aaaaagatgtt 45440732  T
Q  108 tggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcca 207  Q
    || |||   |||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||| || |||  |||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  45440733 tgattaacattataatattccaagtaaccttaaaactagggattataataggt-aattatacatgatttttttcccatctccatgagaactttattccca 45440831  T
Q  208 cccttttctttgggaaa 224  Q
    |   |||||||||||||    
T  45440832 ctactttctttgggaaa 45440848  T

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Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5543479 - 5543261
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  || |||||  |||  ||  || ||||||||| |||||||||| ||||  |||||| ||||| ||    
T  5543479 agggtgtgtttgttttaagtttaccaaatttatttctaagaatatcattatttgaaacataaagatgagaattttatt-caaggtatttagaaaaaagat 5543381  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    ||||| |||   ||||||| ||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||     
T  5543380 gtttgcttaacattataatgttcccgggaaccataaaaatatggattataataggtaat-tacacatgaatttgttcccatcttcatgggaactttattc 5543282  T
Q  205 ccac-ccttttctttgggaaa 224  Q
    ||||   ||||||||||||||    
T  5543281 ccactatttttctttgggaaa 5543261  T

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Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 133 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25045837 - 25045756
Alignment:
Q  133 aaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttc 215  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25045837 aaccatgaaaatatggattataatatgtaat-tatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttc 25045756  T

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Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 69 - 224
Target Start/End: Original strand, 11000483 - 11000643
Alignment:
Q  69 atgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattccta-gaa------accataaaaatagggattataataggta 161  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||||  ||||||||||||||| |||      ||||||||||||||||||||||||||      
T  11000483 atggaaattttattccaagatatttaagaaaa-tatgttaggttaactttataatattcctaagaagtaagaaccataaaaatagggattataataggcg 11000581  T
Q  162 aactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgggaaa 224  Q
    | ||   ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11000582 a-cttcatatgaatttattctcatatgcatgggaactttattcccacccttttctttgggaaa 11000643  T

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Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 43446229 - 43446013
Alignment:
Q  6 gggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatg 105  Q
    |||| ||||||||| |||| || |||||| |||  || |||||| |||  |  |||||||||||| |||||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  43446229 gggtttgtttgtttaaagtgtaccaaattgatttctatgaataacatttatcggaatataaagataggaattttattttaaggtatttag-aaaaatatg 43446131  T
Q  106 tttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttc 205  Q
    ||||||||   |||||||||||  |  |||  |||| ||||| | ||||||||||||  ||   || | ||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  43446130 tttggttaacattataatattctaaagaacattaaagataggaaatataataggtaat-tacacataattttattctcatctccatgagaactttattcc 43446032  T
Q  206 cacccttttctttgggaaa 224  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  43446031 caccattttctttgggaaa 43446013  T

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Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 101 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 43569937 - 43569825
Alignment:
Q  101 atatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 200  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||  |||| ||| |||    
T  43569937 atatgtttgattaactttataatatttttagaaatcataaaaatagggattataatagat-aattatttatgaatttatttacatcctcatgtgaatttt 43569839  T
Q  201 atttccaccctttt 214  Q
    ||| ||||||||||    
T  43569838 attcccaccctttt 43569825  T

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Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 16916237 - 16916182
Alignment:
Q  2 ctaagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattcctt 57  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  16916237 ctaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattcctt 16916182  T

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Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 38529012 - 38528840
Alignment:
Q  45 aataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaat 144  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||  |||||||||||||   |||||  ||||| |||||||||||   |||||||||||  ||||||  |||||||    
T  38529012 aataacatttcttggaatataaaaatgtaaattttatttcaacttatttaaaaaaaa-atgtttggttaacattataatattctgagaaactttaaaaat 38528914  T
Q  145 agggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttg 219  Q
    ||||||||||||| |  || ||   || ||||||||| ||||| |||| ||||||||||  |||| |||||||||    
T  38528913 agggattataatatg-caattacacataaatttattctcatcttcatgagaactttattctcacctttttctttg 38528840  T

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Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 47246300 - 47246201
Alignment:
Q  117 ttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttct 216  Q
    |||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| ||   ||   |||||||||||| ||| | |||||||||||||||  |||||||||||    
T  47246300 ttataatactcctaga--ccttaaaaatagggattataatagatagtttacacatgaatttattctcatattcatgggaactttattctcacccttttct 47246203  T

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Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 67
Target Start/End: Original strand, 24769241 - 24769298
Alignment:
Q  10 gtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaa 67  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  24769241 gtgtttgtttgaaatttatcaaatttatttttaagaataatattttttaaaatataaa 24769298  T

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Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 113
Target Start/End: Original strand, 20601051 - 20601158
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||  || ||||| ||||| |  ||||||||| | |||| |||||||||  || |||||  ||||| ||    
T  20601051 agggtgtgtttgttttaagtttattaaacttatttctaagaatattattcttgggaatataaataagggagttttatttctggacattta-aaaaaaaat 20601149  T
Q  105 gtttggtta 113  Q
    |||||||||    
T  20601150 gtttggtta 20601158  T

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Target: chr5 (Bit Score: 179; Significance: 9e-97; HSPs: 32)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22936264 - 22936038
Alignment:
Q  2 ctaagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaa 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22936264 ctaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaa 22936165  T
Q  102 tatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22936164 tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta 22936065  T
Q  202 tttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||    
T  22936064 ttcccacccttttccttgggaaatttt 22936038  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 28602274 - 28602501
Alignment:
Q  1 actaagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  28602274 actaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttttaggaataacattccttggaatataaagataggaattttattccaaggaatttaggaaaa 28602373  T
Q  101 atatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28602374 atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccatacaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 28602473  T
Q  201 atttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  28602474 attcccacccttttccttgggaaatttt 28602501  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4765909 - 4765686
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  4765909 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattctaaggaatttaggaaaaatat 4765810  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4765809 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 4765710  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  4765709 ccacccttttccttgggaaatttt 4765686  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 8406616 - 8406839
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  8406616 agggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 8406715  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8406716 gtttggttagctttataatattccaaggaaccaaaaaaatagggattataataggaaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 8406815  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||    
T  8406816 ccaccattttccttgggaaatttt 8406839  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14207170 - 14206947
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14207170 agggtgtgtttgtttcaagtttacaaaatttattcctaggaataacattcattggaatataaagatgagaattttatttcaaggaatttaggaaaaatat 14207071  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14207070 gtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 14206971  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  14206970 ccacccttttccttgggaaatttt 14206947  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 18411931 - 18412154
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18411931 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 18412030  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  18412031 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattc 18412130  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||    
T  18412131 ccacctttttccttgggaaatttt 18412154  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 556053 - 555832
Alignment:
Q  7 ggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgt 106  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  556053 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgt 555954  T
Q  107 ttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcc 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  555953 ttggttagctttataatattcctaggaaccatcaaattagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatggaaactttattccc 555854  T
Q  207 acccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  555853 acccttttccttgggaaatttt 555832  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11856001 - 11855781
Alignment:
Q  8 gtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtt 107  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  11856001 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtt 11855902  T
Q  108 tggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcca 207  Q
    ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  11855901 tggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatggaaactttattccca 11855802  T
Q  208 cccttttctttgggaaatttt 228  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  11855801 cccttttccttgggaaatttt 11855781  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 228
Target Start/End: Original strand, 32535658 - 32535882
Alignment:
Q  4 aagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaata 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  32535658 aagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttaatccaaggaatttaggaaaaata 32535757  T
Q  104 tgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatt 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32535758 tgtttggttagctttataatattctcaggaaccataaaaataggggttataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatt 32535857  T
Q  204 tccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
     ||||||||||| || |||||||||    
T  32535858 cccacccttttccttaggaaatttt 32535882  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19065850 - 19065631
Alignment:
Q  9 tgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgttt 108  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||    
T  19065850 tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttagaaaatatatgttt 19065751  T
Q  109 ggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccac 208  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19065750 ggttagctttataatattcctaggaaccataaatatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccac 19065651  T
Q  209 ccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  19065650 ccttttccttgggaaatttt 19065631  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29543364 - 29543141
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  29543364 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttagaaaaaatat 29543265  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  29543264 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattc 29543165  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||   |||||||||||    
T  29543164 ccaccctttttcatgggaaatttt 29543141  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12970879 - 12970656
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12970879 agggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 12970780  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  12970779 gtttggttagctttataatattcataggaaccataaaaatagggattgtaataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatggaaactttattc 12970680  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||    
T  12970679 ccacccttttccttaagaaatttt 12970656  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 224
Target Start/End: Original strand, 6091435 - 6091656
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  6091435 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaat 6091534  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6091535 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaataggaattataataggtaaattatttatgaatttattctcatctccatgggaactttat 6091634  T
Q  203 ttccacccttttctttgggaaa 224  Q
    | |||| |||||| ||||||||    
T  6091635 tcccactcttttccttgggaaa 6091656  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 225
Target Start/End: Original strand, 27481082 - 27481299
Alignment:
Q  8 gtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtt 107  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  27481082 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtt 27481181  T
Q  108 tggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcca 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  27481182 tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagagattataatatgtaaactatttatgaatttattctcatcttcatgggaactttattccca 27481281  T
Q  208 cccttttctttgggaaat 225  Q
    |||||||| |||||||||    
T  27481282 cccttttccttgggaaat 27481299  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8646735 - 8646517
Alignment:
Q  9 tgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgttt 108  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  8646735 tgtgtttgtttcaagtttactaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagataggaattttattccaaggaatttaggaaaattatgttt 8646636  T
Q  109 ggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccac 208  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  8646635 ggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccac 8646537  T
Q  209 ccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  8646536 ccttttccttgggaaatttt 8646517  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 63 - 228
Target Start/End: Original strand, 36703654 - 36703819
Alignment:
Q  63 ataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaa 162  Q
    ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36703654 ataaagatgagaattttattccaaagaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccatcaaaatagggattataataggtaa 36703753  T
Q  163 actatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  36703754 actatttatgaatttattctcatctccataggaactttattcccaccctttttcttgggaaatttt 36703819  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Original strand, 1664456 - 1664671
Alignment:
Q  8 gtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtt 107  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  |  |||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  1664456 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctgagaataatatttcttgaaatataaagatgagaattttatttcaaggtatttagaaaaaatatgtt 1664555  T
Q  108 tggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcca 207  Q
    ||||||  |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||| || ||| |||    
T  1664556 tggttaactttataatattcttatgaaccataaaaatagggattataataggt-aactacatataaatttattctcatctccatgggaatttaattccca 1664654  T
Q  208 cccttttctttgggaaa 224  Q
    ||| |||||||||||||    
T  1664655 cccgtttctttgggaaa 1664671  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 157
Target Start/End: Original strand, 36703506 - 36703656
Alignment:
Q  7 ggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgt 106  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36703506 ggtgtgtttgtttcaaatttaccaaatttattcataggaataacattccttggaatttaaagatgagaattttatttcaaggaatttaggaaaaatatgt 36703605  T
Q  107 ttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataata 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36703606 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataata 36703656  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Original strand, 6930362 - 6930586
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||| |||||||  ||||| |||||| ||||||||||| |||  |||||  ||||||    
T  6930362 taagggtgtgtttgttttaagtttatcaaatttattcatatgaataacattccttgaaatatcaagatgagaattttattttaaggtatttaaaaaaaat 6930461  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 202  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||| | |||||  ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  6930462 atgtttggttaactttataatattcctagaaaccttacagatagagattataatagat-aactagatataaatttatttccatcttcatgggaactttat 6930560  T
Q  203 ttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||    
T  6930561 tcccacaattttctttgggaaatttt 6930586  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 203
Target Start/End: Original strand, 27480735 - 27480930
Alignment:
Q  7 ggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgt 106  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||     
T  27480735 ggtgtgtttattttaagtttaccaaatttatttttaggaataatatttcttgaaatataaagatgagaattttatttcaaggtatttagaaaaaatatgc 27480834  T
Q  107 ttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatt 203  Q
    |||||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  27480835 ttggttaactttataatatttctatgaaccataaaaatagaaattataataggt-agctatttatgaatttattctcatctccatggaaactttatt 27480930  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 26637370 - 26637213
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||| |    
T  26637370 agggtgtgtttatttcaagtttatcaaatttatttttaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggtatttagaaaaaatgt 26637271  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccata-aaaatagggattataataggta 161  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  26637270 gtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaaatatggattataataggta 26637213  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 224
Target Start/End: Original strand, 20962373 - 20962531
Alignment:
Q  65 aaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaac 164  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||| |||   |||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  20962373 aaagatgggaattttattccaaggcatttaaaaaaaatatgtttgcttaacattataatatttctgggaaccataaaaataggaattataatagg-aaat 20962471  T
Q  165 tatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgggaaa 224  Q
    || | || ||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  20962472 tactcattaatttattctcatctccatgagaactttactcccacccttttccttgggaaa 20962531  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 35348858 - 35348654
Alignment:
Q  21 aagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaata--tgtttggttaggttt 118  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||| ||||||||| ||||||||||| |||  ||  || ||||| |  |||||  |||   ||    
T  35348858 aagtttatcaaatttattcttaagaataacattcattggaacataaagatgagaattttattttaaggtatacagaaaaaaaaaatgtttttttaacatt 35348759  T
Q  119 ataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttcttt 218  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||| | ||||||||||||||  ||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35348758 ataatattcccgggaaccataaaaatatgaattataataggtaat-tacatgtgaatttattctcatcttcatgggaactttattcccacccttttcttt 35348660  T
Q  219 gggaaa 224  Q
    ||||||    
T  35348659 gggaaa 35348654  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 42012530 - 42012305
Alignment:
Q  8 gtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtt 107  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||| |||  || ||||| ||||||||||||||| ||  |||  |||| | |||||||||      
T  42012530 gtgtgtttgtttcaagtttactaaatttatttttaggaataacattttttggaataaaaagatgggaattttgttctaaggtatttggaaaaaatatgga 42012431  T
Q  108 tggt--taggtt----tataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta 201  Q
    |  |  |||||     ||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  42012430 ttataataggtaactatataatactccttggaaccataaaaatatggattataataggtaa-ctatataagaatttattctgatctccatgtgaacttta 42012332  T
Q  202 tttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    || ||||||||||| || |||||||||    
T  42012331 ttcccacccttttccttcggaaatttt 42012305  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 228
Target Start/End: Original strand, 17251533 - 17251757
Alignment:
Q  2 ctaagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttag-gaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||  ||  ||||| ||| ||| |||||||| ||| |||||||| || ||||  ||||||  ||||    
T  17251533 ctaagggtgtgtttgtttcaaatttaccaaatttattccta-caataacatttcttggaatataaggataggaatttttttccaaggtatttagataaaa 17251631  T
Q  101 atatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 200  Q
    | |||||||||||   || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |  ||   |||||||||||  ||||| ||||| ||||||    
T  17251632 agatgtttggttaacattttaatattcctag-aaccataaaaatagggattataatatat-agttacacatgaatttattttcatcttcatggaaacttt 17251729  T
Q  201 atttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  17251730 attcccatcattttctttgggaaatttt 17251757  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 43347243 - 43347029
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||| |||  || ||||||||||||| ||| ||||||  |||  |||||| ||||| |     
T  43347243 agggtgtgtttgtttcaagttttcgaaatttattcttaggaataacatttattggaatataaagatgagaagtttattctaaggtatttagaaaaaaaaa 43347144  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||    | ||||||||  || |||| ||||||||||||||| ||||||| || ||   || | ||||||| ||||| |||||||||||||||     
T  43347143 gtttggttaacaatgtaatattcgaaggaaccttaaaaatagggattaaaataggt-aattacgcataattttattctcatcttcatgggaactttattc 43347045  T
Q  205 ccacccttttctttgg 220  Q
    ||||||||||| ||||    
T  43347044 ccacccttttcattgg 43347029  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31583404 - 31583188
Alignment:
Q  9 tgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgttt 108  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||  || |||||| |||| ||  || |||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||| || ||     
T  31583404 tgtgtttgttttaagtttactaaatttatttctacgaataacattctttgaaacataaagatggaaatattatttcaagatatttagaaaaaa-atattg 31583306  T
Q  109 ggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccac 208  Q
    | |||   |||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||| |  ||  |||||| ||||| ||||||   ||||||||||||| ||||    
T  31583305 gtttaacattataatattctcaggaaccgtaaaaatagggattataataggt-acttacatatgaa-ttatttccatctttgtgggaactttattcccac 31583208  T
Q  209 ccttttctttgggaaatttt 228  Q
    | |||||||||| |||||||    
T  31583207 ctttttctttggaaaatttt 31583188  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Original strand, 28429450 - 28429591
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttc-aagaaatttaggaaaaata 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||| | ||| | || |  ||||| |    
T  28429450 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctagaaataacattccttgaaatataaagatgtgaattttattccaaagtatttaaaaaaaaaga 28429549  T
Q  104 tgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaata 145  Q
    ||||||||||   |||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  28429550 tgtttggttaacattataatattctcagaaaccttaaaaata 28429591  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 79
Target Start/End: Original strand, 20962286 - 20962356
Alignment:
Q  9 tgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaatttt 79  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  20962286 tgtgtttgttttaagtttatcaaatttattcataggaataacattccttggaacataaagatggaaatttt 20962356  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 36978478 - 36978404
Alignment:
Q  9 tgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttattt 83  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  36978478 tgtgtttgtttcaagtttattaaatttatttataggaataacattctttagaatataaatatgagaattttattt 36978404  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40276017 - 40275885
Alignment:
Q  91 tttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctcca 190  Q
    ||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||||||| |  ||   || | ||||||||||||| ||    
T  40276017 tttagaaaaaagatgtttggttaatattataatattccatggaaccttaaaaatagggattttaataggttat-tagagataattttattcccatcttca 40275919  T
Q  191 tgggaactttatttccacccttttctttgggaaa 224  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  40275918 tgggaactttattcccatcattttctttgggaaa 40275885  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 40276587 - 40276524
Alignment:
Q  7 ggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatg 71  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||| || | ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  40276587 ggtgtgtttgtttcaagtttactaaatttattcttggtaataacattcctt-gaatataaagatg 40276524  T

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Target: chr8 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37392897 - 37392672
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  37392897 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaat 37392798  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37392797 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 37392698  T
Q  203 ttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||    
T  37392697 tcccacccttttccttgggaaatttt 37392672  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 38363804 - 38364026
Alignment:
Q  6 gggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatg 105  Q
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T  38363804 gggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatg 38363903  T
Q  106 tttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttc 205  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38363904 tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcc 38364003  T
Q  206 cacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    |||||||||  ||||||||||||    
T  38364004 caccctttttcttgggaaatttt 38364026  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35818775 - 35818550
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  35818775 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaat 35818676  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35818675 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 35818576  T
Q  203 ttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||    
T  35818575 tcccacccttttccttgggaaatttt 35818550  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 224
Target Start/End: Original strand, 25837631 - 25837852
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  25837631 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttttaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaat 25837730  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25837731 atgtttggttagctttataatattcctatgaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttat 25837830  T
Q  203 ttccacccttttctttgggaaa 224  Q
    | |||||||||| |||||||||    
T  25837831 tgccacccttttttttgggaaa 25837852  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38133089 - 38132864
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  38133089 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaat 38132990  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  38132989 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcacatctccatgagaactttat 38132890  T
Q  203 ttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||    
T  38132889 tcccacccttttccttgggaaatttt 38132864  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 7930961 - 7931184
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  7930961 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctaggaataacattctttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 7931060  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7931061 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 7931160  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  7931161 ccacccttttccttgggaaatttt 7931184  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 12710363 - 12710590
Alignment:
Q  1 actaagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12710363 actaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaagaaatgtaggaaaa 12710462  T
Q  101 atatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 200  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12710463 atatgtttcgttagctttataatattcctaggaaccataaaaataaggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaacttt 12710562  T
Q  201 atttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12710563 attcccacccttttccttgggaaatttt 12710590  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Original strand, 18297836 - 18298057
Alignment:
Q  7 ggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgt 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  18297836 ggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgt 18297935  T
Q  107 ttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcc 206  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||    
T  18297936 ttggttagctttataatatttctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatttccatgggaactttattccc 18298035  T
Q  207 acccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  18298036 acccttttccttgggaaatttt 18298057  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 42755592 - 42755812
Alignment:
Q  8 gtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtt 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  42755592 gtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttggaatatgaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatatt 42755691  T
Q  108 tggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcca 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  42755692 tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgagaactttattccca 42755791  T
Q  208 cccttttctttgggaaatttt 228  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  42755792 cccttttccttgggaaatttt 42755812  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16313858 - 16313633
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16313858 taagggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatttttaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaat 16313759  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16313758 atgtttggttagctttataatattcctaggaatcataaaaatagggattataataggaaaattatttatgaatttattctcatctccatgggaactttat 16313659  T
Q  203 ttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  16313658 tcccaccatttttcttgggaaatttt 16313633  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32661283 - 32661059
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  32661283 agggtgtgtttgtttcaagtttactaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttatgaaaaatat 32661184  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32661183 gtttggttagctttataatattcctaagaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 32661084  T
Q  205 ccaccctttt-ctttgggaaatttt 228  Q
    |||||||||| | ||||||||||||    
T  32661083 ccacccttttcccttgggaaatttt 32661059  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Original strand, 26061864 - 26062089
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  26061864 taagggtgtgtttgttttaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttgtaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaat 26061963  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 202  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26061964 atgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 26062063  T
Q  203 ttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    | ||||||||||  ||||||| ||||    
T  26062064 tcccaccctttttcttgggaattttt 26062089  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10896560 - 10896356
Alignment:
Q  10 gtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttg 109  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  10896560 gtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttg 10896461  T
Q  110 gttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacc 209  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10896460 gttagctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacc 10896361  T
Q  210 ctttt 214  Q
    |||||    
T  10896360 ctttt 10896356  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 3049731 - 3049946
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||    
T  3049731 agggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcataggaataacattccttgaaatataaagatgggaattttattcgaaggaatttagaaaaaatat 3049830  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  3049831 gtttggttatctttataatattcctaggaatcataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattc 3049930  T
Q  205 ccacccttttctttgg 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  3049931 ccacccttttctttgg 3049946  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26602286 - 26602063
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  26602286 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattgctagaaataacattccttgaaacataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 26602187  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  26602186 gtttggttagctttataatattccttggaaccataaaaatagggattataatagctaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattc 26602087  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  26602086 ccacccttttccttgggaaatttt 26602063  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18726967 - 18726746
Alignment:
Q  7 ggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgt 106  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||  || |||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  18726967 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctaggaataacattaattggaatataaagatgaaaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgt 18726868  T
Q  107 ttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcc 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  18726867 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttatttccatctccatgagaactttattccc 18726768  T
Q  207 acccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  18726767 acccttttccttgggaaatttt 18726746  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1554688 - 1554480
Alignment:
Q  21 aagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaa-gatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggttta 119  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  1554688 aagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatggttggttagtttta 1554589  T
Q  120 taatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttg 219  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  1554588 taatattcctaggaaccataaaattagggattataataggtaaattatgtatgaatttattcccatctccatggaaactttattcccacccttttccttg 1554489  T
Q  220 ggaaatttt 228  Q
     ||||||||    
T  1554488 agaaatttt 1554480  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 40197405 - 40197223
Alignment:
Q  2 ctaagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaa 101  Q
    |||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  40197405 ctaagggtttgtttgcttcaagtttaccaaatttattcctaggaataatattctttggaatataaagatgggaattttattctaaggaatttaggaaaaa 40197306  T
Q  102 tatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattccca 184  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40197305 tatgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattccca 40197223  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5020837 - 5020623
Alignment:
Q  8 gtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtt 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||  |||||||||  |||  ||||||||||||||||||    
T  5020837 gtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatttttaggaataacattctttggaatataaagatgataattttattctaaggtatttaggaaaaatatgtt 5020738  T
Q  108 tggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcca 207  Q
    ||||||  ||||||||||| || | || |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  5020737 tggttaactttataatatt-ctgggaatcataaaaatatggattataataggt-aactacttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattccca 5020640  T
Q  208 cccttttctttgggaaa 224  Q
    |||||||| ||||||||    
T  5020639 cccttttccttgggaaa 5020623  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 77 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41228990 - 41228840
Alignment:
Q  77 tttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatt 176  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41228990 tttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatt 41228891  T
Q  177 tattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    |||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  41228890 tatt-ctatctccataggaactttattcccacccttttcctcgggaaatttt 41228840  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21137476 - 21137266
Alignment:
Q  8 gtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtt 107  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||| |||  || ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||  |||||||||||    
T  21137476 gtgtgtttgtttttagtttatcaaatttattactag-aataacattttttggaatataaagatgagaattttattttaaggtatttaaaaaaaatatgtt 21137378  T
Q  108 tggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcca 207  Q
    ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  21137377 tggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatacggattataataggt-aactacatatgaatttattctcatctccacgagaactttatttcca 21137279  T
Q  208 cccttttctttgg 220  Q
    || ||||||||||    
T  21137278 ccattttctttgg 21137266  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 223
Target Start/End: Original strand, 15226688 - 15226905
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    |||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  15226688 agggtgcgtttgtttcaattttaccaaatttattattaggaataactttccttggaatataaagatgagaattttatttcaaggtatttagaaaaaatat 15226787  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||  ||||||| | ||| || |||| ||||||||||||||||||||||| || |    || | ||||||| ||||| |||||||||||||||     
T  15226788 gtttggttaactttataaaaatccaaggaaccttaaaaatagggattataataggt-aattccacataattttattctcatcttcatgggaactttattc 15226886  T
Q  205 ccacccttttctttgggaa 223  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15226887 ccacccttttctttgggaa 15226905  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19161088 - 19160875
Alignment:
Q  7 ggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaa-tatg 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||| |||| || ||||||||||||| ||| ||||||||| |  |||||| ||||| ||||    
T  19161088 ggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattctcaagaataacattctttggaatataaagatgagaaatttatttcagggtatttagaaaaaaatatg 19160989  T
Q  106 tttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttc 205  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||| |||| ||||||||||  ||||||||| |    
T  19160988 tttggttagcattataatattcttaggaaccataaaaatagggattataataggt-aattacatatgaattcattctcatctccatgacaactttattcc 19160890  T
Q  206 cacccttttctttgg 220  Q
    |||||||||||||||    
T  19160889 cacccttttctttgg 19160875  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 62 - 224
Target Start/End: Original strand, 7317156 - 7317316
Alignment:
Q  62 tataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggta 161  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  7317156 tataaagatgtgaattttattctaaggtatttaggaaaaatatgtttggttaactttataatattcctag-aaccatgaaaatagggattataataggt- 7317253  T
Q  162 aactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgggaaa 224  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  7317254 aactatttacgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccatttttcttgggaaa 7317316  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31117874 - 31117670
Alignment:
Q  6 gggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaa---at 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||   ||    
T  31117874 gggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatatttaggaataacattcattggaatataaagatgagaattttatttcaaagtatttagaaaaaaatat 31117775  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 202  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||      ||| |||||||||||||||    
T  31117774 atgcttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagatattataataggt-aactatttatgaattt------atccccatgggaactttat 31117682  T
Q  203 ttccaccctttt 214  Q
    | ||||||||||    
T  31117681 tcccaccctttt 31117670  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6805946 - 6805753
Alignment:
Q  34 ttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaag----aaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattcct 129  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||     
T  6805946 ttatttttaagaataacattccttgaaatataaagatgggaattttattccaaggtatatatttaggaaaaatatgtttggttaactttataatattccc 6805847  T
Q  130 agaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgggaaa 224  Q
    || |||||| ||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  6805846 aggaaccatgaaaatagagattttaataggt-atctatttatgaatttattctcatctccatgagaactttattctcacccttttctttaggaaa 6805753  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33444969 - 33444750
Alignment:
Q  7 ggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgt 106  Q
    ||||||||||||| |||||||   ||||||||  || |||||| ||| | | |||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  33444969 ggtgtgtttgtttcaagtttactgaatttattcataagaataacatttcatggaatataaagatgaaaattttatttcaaggtatttagaaaaaatatgt 33444870  T
Q  107 ttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcc 206  Q
    |||||||  |||||||||||||||| || |||| |||||| |||| |||||||| |||||  |||||| ||| || ||||| ||||||||||||||| ||    
T  33444869 ttggttaactttataatattcctagcaatcatacaaatagtgattctaataggt-aactacatatgaaatta-tctcatcttcatgggaactttattccc 33444772  T
Q  207 acccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  33444771 accattttctttgggcaatttt 33444750  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 51 - 214
Target Start/End: Original strand, 35394159 - 35394321
Alignment:
Q  51 attccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggat 150  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  35394159 attccttgaaatataaagatgagaattttattccaaggtatttaagaaaaatatgtttggttaactttataatattcctatgaaccataaaaataaggat 35394258  T
Q  151 tataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccaccctttt 214  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||    
T  35394259 tataataggt-aactatatatgagtttgttcccatctccttaggaactttattcccaccatttt 35394321  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 90 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29421752 - 29421619
Alignment:
Q  90 atttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctcc 189  Q
    |||||| |||||||| |||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||    
T  29421752 atttagaaaaaatatatttgattaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggt-aactacatataaatttattctcatctcc 29421654  T
Q  190 atgggaactttatttccacccttttctttgggaaa 224  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29421653 atgggaactttattcccaccattttctttgggaaa 29421619  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 214
Target Start/End: Original strand, 41432464 - 41432672
Alignment:
Q  8 gtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaa--atatg 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||  || |||||||||| ||||||||| ||||  |||||  ||||  |||||    
T  41432464 gtgtgtttgttttaagtttatcaaatttatttttaggaataacatttcttgaaacataaagatggaaattttattccaaggcatttaaaaaaaatatatg 41432563  T
Q  106 tttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattc-ccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||| |||   ||||||||||| | | | ||||||||||||| ||||||||||| ||| || | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  41432564 tttgcttaacattataatattcttgggagccataaaaataggaattataatagg-aaattactcatgaatttattctcaatctccatgggaactttattt 41432662  T
Q  205 ccaccctttt 214  Q
    ||||||||||    
T  41432663 ccaccctttt 41432672  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16219290 - 16219076
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||| |||  |||||||| |||||||||| ||||  |||||| ||||| ||    
T  16219290 agggtgtgtttgttttaagtttatccaatttattcctaggaataacgttccttggaacttaaagatgagaattttattccaaggtatttagaaaaaagat 16219191  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||   ||||||||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||||| || ||    || |||||||||||||| ||||||||  |||||     
T  16219190 gtttggttaacattataatattcttgggaaccatgaaaatggggattataataggt-aattacacgtggatttattcccatcttcatgggaagattattc 16219092  T
Q  205 ccacccttttctttggg 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  16219091 cca-ccttttctttggg 16219076  T

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Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 43872316 - 43872117
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||||  |||||| |||||  ||||||||| ||||  |||||| |||||     
T  43872316 taagggtgtgtttgtttcaagtttgccaaatttatttctaggaataacattccttgaaatatatagatgtaaattttattccaaggtatttagaaaaaag 43872217  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 202  Q
    |||||||||||   ||||||| || | || ||||  ||||||||||||||||||||||||  |||   ||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  43872216 atgtttggttaacattataatgtttcaaggaacctcaaaaatagggattataataggtaat-tatacgtgattttattcccatctccatatgaactttat 43872118  T

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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 33533744 - 33533585
Alignment:
Q  2 ctaagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaa 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||   |||||| | |||    
T  33533744 ctaagggtgtgtttgtttcaagtttgtcaaatttattcctaggaatattattcctttgaatataaagatgtgaattttattccaatgtatttagaataaa 33533645  T
Q  102 tatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggta 161  Q
     ||||||| |||   |||| ||||||  |  |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  33533644 gatgtttgattaacattatgatattctcaagaaccttaaaaataggaattataataggta 33533585  T

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Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 37982134 - 37981925
Alignment:
Q  7 ggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaa-ttttatttcaagaaattt--aggaaaaata 103  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||  |  ||||| |    
T  37982134 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttttaggaataacattcctt-gaacataaagatgagaatttttattccaaggtatttaaaaaaaaaaga 37982036  T
Q  104 tgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatt 203  Q
    |||||| |||   ||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||| | || || ||  ||| ||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  37982035 tgtttgcttaacattataatatttatgggaaccataaaaatagggattataacaagt-aattacatataaatttattctcattttcataggaactttatt 37981937  T
Q  204 tccacccttttc 215  Q
    ||||||||||||    
T  37981936 tccacccttttc 37981925  T

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Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 112
Target Start/End: Original strand, 25899381 - 25899488
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||  |||||| ||||| ||    
T  25899381 agggtgtgtttgtttcaagtgtaacaaatttatttttaggaataacattccttggaatataaagataggaattttattctaaggtatttagaaaaaagat 25899480  T
Q  105 gtttggtt 112  Q
    ||||||||    
T  25899481 gtttggtt 25899488  T

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Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 127
Target Start/End: Original strand, 34672083 - 34672207
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatat--aaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||  |||||  |||||||| ||||||||   |||   ||||| ||||||    
T  34672083 agggtgtgtttgttttaagtttatcaaatttatttttagaaataacagtccttgaaatataaaaagatggaaattttatactaaggtttttagaaaaaat 34672182  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattc 127  Q
    || ||||||||  ||||||||||||    
T  34672183 atttttggttaactttataatattc 34672207  T

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Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 159
Target Start/End: Original strand, 38437203 - 38437353
Alignment:
Q  8 gtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtt 107  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||  |||||||||  ||  ||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||    
T  38437203 gtgtgtttgtttcaagtttattaaattcattcttaaaaataatatt-tttttaatataaggatgagaattttattccaagatatttagaaaaaagatgtt 38437301  T
Q  108 tggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataatagg 159  Q
    || |||    || | |||| || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  38437302 tgtttaacactacagtatttctgggaaccataaaaataggaattataatagg 38437353  T

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Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 35394078 - 35394139
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatat 64  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||| || ||||||    
T  35394078 taagggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcttagtaataacattctttggaatat 35394139  T

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Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Original strand, 12649859 - 12650072
Alignment:
Q  7 ggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaattt--aggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  || |||||| | |||||  |||| || |||| ||||||||||||||   ||||  |  ||||| ||    
T  12649859 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctacgaataacaatccttgtaatacaatgatgtgaattttatttcaaattatttaaaaaaaaaagat 12649958  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    ||||| |||   ||||||||||| ||| |||   |||||||| ||||||||||||| |  ||  | ||||||||||  ||| | |||||||||||||||     
T  12649959 gtttgattaacattataatattcttaggaacttaaaaaatagagattataataggt-agttacatgtgaatttattttcattttcatgggaactttattc 12650057  T
Q  205 ccacccttttctttg 219  Q
    ||||  |||||||||    
T  12650058 ccactattttctttg 12650072  T

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Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 82
Target Start/End: Original strand, 37124073 - 37124148
Alignment:
Q  7 ggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatt 82  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||  ||||| | |  || ||||||||||||| ||||||||||    
T  37124073 ggtgtgtttattttaagtttatcaaatttattgttaaaaataacaatatttggaatataaagatgagaattttatt 37124148  T

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Target: chr4 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 60)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41859397 - 41859172
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41859397 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttatttcaaggaatttaggaaaaat 41859298  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41859297 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 41859198  T
Q  203 ttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||    
T  41859197 tcccacccttttccttgggaaatttt 41859172  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Original strand, 45595992 - 45596217
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  45595992 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaat 45596091  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45596092 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatttccatgggaactttat 45596191  T
Q  203 ttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||    
T  45596192 tcccacccttttccttgggaaatttt 45596217  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13230338 - 13230115
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  13230338 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 13230239  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13230238 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 13230139  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  13230138 ccacccttttccttgggaaatttt 13230115  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 35999412 - 35999635
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  35999412 agggtttgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaagaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 35999511  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35999512 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 35999611  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  35999612 ccacccttttccttgggaaatttt 35999635  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 7 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27763246 - 27763028
Alignment:
Q  7 ggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgt 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  27763246 ggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagataggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgt 27763147  T
Q  107 ttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcc 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27763146 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattccc 27763047  T
Q  207 acccttttctttgggaaat 225  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  27763046 acccttttccttgggaaat 27763028  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 23686513 - 23686736
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23686513 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttgaaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 23686612  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23686613 gtttggttagttttataatattcctaggaaccataaaaatatgaattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 23686712  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  23686713 ccacccttttccttgggaaatttt 23686736  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 42773670 - 42773897
Alignment:
Q  1 actaagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaa 100  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  42773670 actaagggcgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctagaaataacattccttggagtataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaa 42773769  T
Q  101 atatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42773770 atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 42773869  T
Q  201 atttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  42773870 attcccacccttttccttgggaaatttt 42773897  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 48873747 - 48873970
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  48873747 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaatattattccaaggaatgtaggaaaaatat 48873846  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48873847 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 48873946  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  48873947 ccacccttttccttgggaaatttt 48873970  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 48879051 - 48879274
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  48879051 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaatattattccaaggaatgtaggaaaaatat 48879150  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48879151 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 48879250  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  48879251 ccacccttttccttgggaaatttt 48879274  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Original strand, 25932165 - 25932390
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  25932165 taagggtgtgtttgtttcaagtttcccaaatttattcctaggaataacattccttgaaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaat 25932264  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 202  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25932265 atgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 25932364  T
Q  203 ttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||    
T  25932365 tcccacccttttccttgggaaatttt 25932390  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Original strand, 40435628 - 40435849
Alignment:
Q  7 ggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgt 106  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  40435628 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttttaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgt 40435727  T
Q  107 ttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcc 206  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  40435728 ttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagagattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctctatgggaactttattccc 40435827  T
Q  207 acccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  40435828 acccttttccttgggaaatttt 40435849  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Original strand, 43722988 - 43723213
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  43722988 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaagaatttaggaaaaat 43723087  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43723088 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttat 43723187  T
Q  203 ttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||    
T  43723188 tctcacccttttccttgggaaatttt 43723213  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39730642 - 39730419
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  39730642 agggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 39730543  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  39730542 gtttggttaactttataatattcctaggaaccatgaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgtgaactttattc 39730443  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  39730442 ccacccttttccttgggaaatttt 39730419  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 55968353 - 55968126
Alignment:
Q  1 actaagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  55968353 actaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttagaaaaa 55968254  T
Q  101 atatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 200  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55968253 atatgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 55968154  T
Q  201 atttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||| ||||||||||   |||||||||||    
T  55968153 attcccaccctttttcatgggaaatttt 55968126  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Original strand, 27555151 - 27555375
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  27555151 taagggtgtgtttgtttcaagtttactaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaat 27555250  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 202  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27555251 atgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 27555349  T
Q  203 ttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||    
T  27555350 tcccacccttttccttgggaaatttt 27555375  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 48519233 - 48519017
Alignment:
Q  12 gtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggt 111  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  48519233 gtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgtgaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggt 48519134  T
Q  112 taggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccaccct 211  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48519133 tagctttataatattcctaggaaccataaaaataggtattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct 48519034  T
Q  212 tttctttgggaaatttt 228  Q
    |||| ||||||||||||    
T  48519033 tttccttgggaaatttt 48519017  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 47670084 - 47670311
Alignment:
Q  1 actaagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  47670084 actaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaa 47670183  T
Q  101 atatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 200  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  47670184 atatatttggttatctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatcttcatggaaacttt 47670283  T
Q  201 atttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  47670284 atttccaccattttccttgggaaatttt 47670311  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39835656 - 39835433
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  39835656 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctatgaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 39835557  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  39835556 gtttggttaactttataatattcctagaaatcataaaaataaggattataataggtaaactatttatgaatttattctaatctccatgggaactttattc 39835457  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  39835456 ccacccttttccttgggaaatttt 39835433  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 50673245 - 50673031
Alignment:
Q  13 tttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggtt 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50673245 tttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttgaaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggtt 50673146  T
Q  113 aggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccaccctt 212  Q
    || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50673145 agctttataatattcctaggaaccat-aaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctt 50673047  T
Q  213 ttctttgggaaatttt 228  Q
    ||| ||||||||||||    
T  50673046 ttccttgggaaatttt 50673031  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18405584 - 18405367
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||   || ||||||||||||||    
T  18405584 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaagatggaaattttattctcaggaatttaggaaaaat 18405485  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18405484 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttat 18405385  T
Q  203 ttccacccttttctttgg 220  Q
    |  |||||||||| ||||    
T  18405384 tctcacccttttccttgg 18405367  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41744568 - 41744347
Alignment:
Q  7 ggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgt 106  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  41744568 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctaggaataacattcattggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgt 41744469  T
Q  107 ttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcc 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  41744468 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactaattatgaatttattctcatctccataggaactttattccc 41744369  T
Q  207 acccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  41744368 acccttttccttgggaaatttt 41744347  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6280270 - 6280047
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  6280270 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcataggaataacattccttggaatataaaaataggaattttattccaaggaatttatgaaaaatat 6280171  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
     ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  6280170 atttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgagaactttattc 6280071  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  6280070 ccacccttttccttgggaaatttt 6280047  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 8321971 - 8322186
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  8321971 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttttaggaataacattctttggaatataaagatgagaattttattacaaggaatttaggaaaaatat 8322070  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  8322071 gtttggttagctttataatattcataggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattc 8322170  T
Q  205 ccacccttttctttgg 220  Q
    ||||||||||| ||||    
T  8322171 ccacccttttccttgg 8322186  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45748144 - 45747922
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  45748144 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttagaaaaaatat 45748045  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  45748044 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagagattataat-ggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattc 45747946  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    || |||||||| ||||||||||||    
T  45747945 ccccccttttccttgggaaatttt 45747922  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 34238295 - 34238082
Alignment:
Q  13 tttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggtt 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  34238295 tttgtttcaagtttatcaaatttattcataggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggtt 34238196  T
Q  113 aggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccaccctt 212  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34238195 agctttataatattcctaggaacaaaaaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccctt 34238096  T
Q  213 ttctttgggaaatt 226  Q
    ||| ||||||||||    
T  34238095 ttccttgggaaatt 34238082  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 32953249 - 32953472
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  32953249 agggtatgtttgtttcaagtttatctaatttatttctagaaataatattcattggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 32953348  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  32953349 gtttggttagctttataatatttcaaggaaccataaaaatagggattataataggaaaactatttatgaatttattcccatctccatgagaactttattc 32953448  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||    
T  32953449 ccaccattttccttgggaaatttt 32953472  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 228
Target Start/End: Original strand, 935849 - 936075
Alignment:
Q  2 ctaagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaa 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  935849 ctaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaagaataacatttcttggaatataaagataggaattttattccaaagaatttaggaaaaa 935948  T
Q  102 tatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  935949 tatgtttggttagctttataatattcctaggaactataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatttccatgggaacttta 936048  T
Q  202 tttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    || ||||||||||  ||| ||||||||    
T  936049 ttcccaccctttttcttgtgaaatttt 936075  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 214
Target Start/End: Original strand, 18931482 - 18931688
Alignment:
Q  8 gtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtt 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  18931482 gtgtgtttgttttaagtttatcaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaagatagaaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt 18931581  T
Q  108 tggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcca 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18931582 tggttagctttataatattcctatgaactataaaaatagggattataataggaaaattatttataaatttattcccatctccatgggaactttattccca 18931681  T
Q  208 ccctttt 214  Q
    || ||||    
T  18931682 ccatttt 18931688  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Original strand, 27942465 - 27942686
Alignment:
Q  7 ggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgt 106  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||  |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  27942465 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacatttttaggaatataaatatgagaattttatttcaaggaatttagaaaaaatatgt 27942564  T
Q  107 ttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcc 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||    
T  27942565 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaataaggattataataggtaaattatttatgaatttattctcatttcaatgggaactttattccc 27942664  T
Q  207 acccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  27942665 acccttttccttgggaaatttt 27942686  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 51 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34049900 - 34049723
Alignment:
Q  51 attccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggat 150  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  34049900 attccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttagaaaaaatatgtttggttagctttataatattccaaggaaccataaaaatagggat 34049801  T
Q  151 tataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  34049800 tataataggaaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccatttttcttgggaaatttt 34049723  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31938217 - 31938010
Alignment:
Q  6 gggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatg 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  31938217 gggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcataggaataacattccttggaatttaaagatgaaaattttattccaaggtatttaggaaaaatatg 31938118  T
Q  106 tttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttc 205  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  31938117 tttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaataaggattataataggt-aactgtttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcc 31938019  T
Q  206 caccctttt 214  Q
    |||||||||    
T  31938018 caccctttt 31938010  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 44 - 220
Target Start/End: Original strand, 39498590 - 39498766
Alignment:
Q  44 gaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaa 143  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  39498590 gaataacattccttggaatataaagatgagaattttattctaaggaatttaggaaaaatatatttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaa 39498689  T
Q  144 tagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  39498690 tagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctctatgagaactttatttccacccttttccttgg 39498766  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 44 - 220
Target Start/End: Original strand, 39501929 - 39502105
Alignment:
Q  44 gaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaa 143  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  39501929 gaataacattccttggaatataaagatgagaattttattctaaggaatttaggaaaaatatatttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaa 39502028  T
Q  144 tagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  39502029 tagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctctatgagaactttatttccacccttttccttgg 39502105  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 92 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25916295 - 25916159
Alignment:
Q  92 ttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccat 191  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25916295 ttagaaaaaatatgtttgattagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatcttcat 25916196  T
Q  192 gggaactttatttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25916195 gggaactttattcccacccttttccttgggaaatttt 25916159  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 224
Target Start/End: Original strand, 36858135 - 36858351
Alignment:
Q  6 gggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatg 105  Q
    ||||||| |||||  |||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||  |||| | |||||||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||    
T  36858135 gggtgtgcttgttacaagtttataaaatttattcttaagaataacattccttgtaatacacagatgggaatttcatt-caaggtatttaagaaaaatatg 36858233  T
Q  106 tttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttc 205  Q
    ||||| ||  ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  36858234 tttggataactttgtaatattcctaggaaccataaaaataaggattataacaggtaa-ctatatatgaatttattcccatctccatgagaattttattcc 36858332  T
Q  206 cacccttttctttgggaaa 224  Q
    |||||||||||||||||||    
T  36858333 cacccttttctttgggaaa 36858351  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 209
Target Start/End: Original strand, 52469427 - 52469628
Alignment:
Q  9 tgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttag-aatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat-atgt 106  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| | ||||||||  ||| | |||||| |||||  ||||    
T  52469427 tgtgtttgttttaagttaatcaaatttattcttaggaataacattcctttggaatataaagattgaaattttataccaaaatatttagaaaaaaacatgt 52469526  T
Q  107 ttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcc 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  52469527 ttggttagctttataatattcctatgaaccataaatatagagattataataggt-aactatattggaatttatttccatctccatgggaactttattccc 52469625  T
Q  207 acc 209  Q
    |||    
T  52469626 acc 52469628  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 38394634 - 38394856
Alignment:
Q  6 gggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatg 105  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  || || ||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||    
T  38394634 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctaagactaatatttcttagaacataaatatgagaattttatttcaaggtatttagaaaaaagatg 38394733  T
Q  106 tttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttc 205  Q
    |||| |||   ||||||||||  | | ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || | ||||||||||| ||||||| ||  |||||||||| |    
T  38394734 tttgcttaatattataatatttttgggaaccataaaaataggaattataatagg-aaattactcatgaatttatttccatctctatcagaactttattcc 38394832  T
Q  206 ca-cccttttctttgggaaatttt 228  Q
    || |||||||||||||||| ||||    
T  38394833 caccccttttctttgggaattttt 38394856  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 7258691 - 7258912
Alignment:
Q  6 gggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatg 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||    |||| |||    
T  7258691 gggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattctcaggaataacattccttggaatataaatatgggaattttattccaaggtatttgaataaaagatg 7258790  T
Q  106 tttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttc 205  Q
    ||||||||   || ||||||||| || ||||||||||||  ||| ||||||| || |  ||   |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  7258791 tttggttaacattttaatattccaaggaaccataaaaattaggactataataagt-agttacaaatgaatttattcccatattcatgggaactttattcc 7258889  T
Q  206 cacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||| ||||||||| |||||||||    
T  7258890 cactcttttcttttggaaatttt 7258912  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 103 - 228
Target Start/End: Original strand, 38414032 - 38414156
Alignment:
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 202  Q
    |||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38414032 atgtttgggtaactttataatattcttagaaaccataaaaataggaattataataggtaa-ctacatatgaatttattaccatctccatgagaactttat 38414130  T
Q  203 ttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||    
T  38414131 tcccacccttttccttgggaaatttt 38414156  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37014724 - 37014511
Alignment:
Q  13 tttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggtt 112  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||  || ||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  37014724 tttgtttcaagtttacaaaatttattcctaagaataatattttttggaatataaagatgcgaattttattcgaagatatttagaaaaaagatgtttggtt 37014625  T
Q  113 aggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccaccctt 212  Q
    |   |||||||||| | ||||| | |||||||| | |||||| || | ||| ||   |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  37014624 aacattataatatttc-agaaatcttaaaaataagaattatagtaag-aaattacacatgaatttattctcatcttcatgagaactttatttccactctt 37014527  T
Q  213 ttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  37014526 ttctttgggaaatttt 37014511  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Original strand, 51968505 - 51968722
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| | |  |||||||| |||||||||| ||||  || ||| ||||| ||    
T  51968505 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttcgtacgtaaagatgagaattttattccaaggtatatagaaaaaagat 51968604  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    ||||| |||   |||||||||| ||   ||||||||||||| ||||||||||  || || ||  |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||     
T  51968605 gtttgtttaacattataatatttctgagaaccataaaaataaggattataat--gt-aattacatatgaaattatttccatcttcatgggaactttattc 51968701  T
Q  205 ccaccc-ttttctttgggaaa 224  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  51968702 ccaccctttttctttgggaaa 51968722  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 10401126 - 10400973
Alignment:
Q  8 gtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtt 107  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  | | ||||| |||| ||  | |||||| ||| |||||||||| ||||| || ||| ||||| |||||    
T  10401126 gtgtgtttgttttaagtttaccaaatttatttctggaaataacattctttgaagtataaaaatgagaattttattccaagatatatagaaaaaacatgtt 10401027  T
Q  108 tggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaa 162  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10401026 tggttag-tttataatattcctcggaaccataaaaataaggattataataggtaa 10400973  T

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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 68 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 47426520 - 47426382
Alignment:
Q  68 gatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactat 167  Q
    |||||||||||||||  |||  |||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||       ||||||||||||||||||| ||||    
T  47426520 gatgggaattttattcaaaggtatttagaaaaaatatatttggttaactttataatattcctaggaacc-------tagggattataataggtaa-ctat 47426429  T
Q  168 ttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccaccctttt 214  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  47426428 ttatgaatttattttcatcttcatgggaactttattgccaccctttt 47426382  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 36858634 - 36858512
Alignment:
Q  96 gaaaaatatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatggga 195  Q
    |||||||||||||| |||   ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || || ||  |||||| |||||| ||||| |||||||    
T  36858634 gaaaaatatgtttgtttaacattataatattcccggaaaccataaaaatagggattataatatgt-aattacatatgaaattattctcatcttcatggga 36858536  T
Q  196 actttatttccacccttttctttg 219  Q
    |||||||| |||||||||| ||||    
T  36858535 actttattcccacccttttatttg 36858512  T

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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 228
Target Start/End: Original strand, 44309497 - 44309709
Alignment:
Q  15 tgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttag 114  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||    |||||||||||||||| ||||||     
T  44309497 tgtttgaagtttactaaatttatttttaagaataatatttcttagaacataaagatgagaatttaatttcaaagtgtttaggaaaaatatgtatggttaa 44309596  T
Q  115 gtttataatattc-ctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttt 213  Q
      ||||||||||| | ||||  | |||||||||||||||||| || | || ||   || |||  |||  ||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  44309597 cattataatattctcgagaatac-taaaaatagggattataacagat-aattacacattaataaattttcatattcatgggaactttattcccacccttt 44309694  T
Q  214 tctttgggaaatttt 228  Q
    ||||| |||||||||    
T  44309695 tctttaggaaatttt 44309709  T

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Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 228
Target Start/End: Original strand, 30415743 - 30415851
Alignment:
Q  119 ataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttcttt 218  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||  |||||  |||| || |||||| ||||| ||||||||    
T  30415743 ataatattcttaggaaccataaaaatagggattataataggt-aattatttatgaaattattttcatctttatggaaattttattcccaccattttcttt 30415841  T
Q  219 gggaaatttt 228  Q
    ||||||||||    
T  30415842 gggaaatttt 30415851  T

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Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 113
Target Start/End: Original strand, 38413902 - 38414010
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||| ||||||||    
T  38413902 agggcgtgtttgtttcaagtttaccaaatttaattttagaaataacattccttggaatataaagatgagaatttaattccaaggtatttagaaaaaatat 38414001  T
Q  105 gtttggtta 113  Q
    |||||||||    
T  38414002 gtttggtta 38414010  T

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Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 228
Target Start/End: Original strand, 48059805 - 48060004
Alignment:
Q  29 caaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttag-gaaaaatatgtttggttaggtttataatattc 127  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| |   ||||||  ||||||||||||  |||  |||||||||||     
T  48059805 caaatttattcttacgaataatattttttagaatataatgatgagaattttatttcgatgtatttagaaaaaaatatgtttaattaattttataatattt 48059904  T
Q  128 ctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgggaaattt 227  Q
    |||| ||  ||||||||| | |||||||||||| || ||| ||||||||||||   || |  ||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  48059905 ctaggaattataaaaataagaattataataggt-aattatatatgaatttatttatatttttatgagaactttattcccaccattttatttgggaaattt 48060003  T

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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Original strand, 14796295 - 14796439
Alignment:
Q  11 tgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttgg 110  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||   |||||| ||||| |||||||     
T  14796295 tgtttattttaagtttgtcaaatttatttttaggaataatattttttagaatataaagatgtgaattttattttaaagtatttagaaaaaagatgtttgt 14796394  T
Q  111 ttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataa 155  Q
    |||   |||| |||||  ||| |||| ||||||||  ||||||||    
T  14796395 ttaacattatgatatttttaggaaccttaaaaataaagattataa 14796439  T

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Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 224
Target Start/End: Original strand, 18405592 - 18405698
Alignment:
Q  117 ttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttct 216  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||   ||| ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  18405592 ttataatatttctaggaaccataaaaatagagattataataggtaat-tacacatggatttattcccatcttaatgagaactttattcccacccttttct 18405690  T
Q  217 ttgggaaa 224  Q
    || |||||    
T  18405691 ttaggaaa 18405698  T

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Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32384630 - 32384520
Alignment:
Q  117 ttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttct 216  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |    || ||||| |||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  32384630 ttataatattcctggaaaccataaaattagggattataataggt-aattgcacataaatttgttccaatctttatgggaattttattcccacccttttct 32384532  T
Q  217 ttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||||    
T  32384531 ttgggaaatttt 32384520  T

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Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 76
Target Start/End: Original strand, 18405126 - 18405200
Alignment:
Q  2 ctaagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaat 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  18405126 ctaagggtgtgtttgttttaagtttgccaaatttattcttaggaataacattccttgaaatataaagatgggaat 18405200  T

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Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 146
Target Start/End: Original strand, 30790275 - 30790414
Alignment:
Q  6 gggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatg 105  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||| ||| |||| || ||||||||||||| ||| |||||| |||   |||||  ||||| |||    
T  30790275 gggtgtgtttgtttcaagtttagcaaatttatttctaggagtaacattc-ttggaatataaagatgagaaatttattccaaagtatttaaaaaaaagatg 30790373  T
Q  106 tttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatag 146  Q
    ||||||||   |||||||||||| || |||| |||||||||    
T  30790374 tttggttaacattataatattccaaggaaccttaaaaatag 30790414  T

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Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24805394 - 24805210
Alignment:
Q  51 attccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattcctag-------aaaccataaaaa 143  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||||||| || |||  |||||| ||||| ||||||| |||   |||||||||| || |       ||||||||||||    
T  24805394 attccttggaacataaagatgtgaattttactttaaggtatttagaaaaaagatgtttgcttaacattataatattactgggaaccataaaccataaaaa 24805295  T
Q  144 tagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta-tttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    |||||| ||||||||||||  ||   ||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  24805294 tagggaatataataggtaat-tacacatggatttattcccatattcatgggaactttattttccaccattttctttgtgaaatttt 24805210  T

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Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 113
Target Start/End: Original strand, 52413959 - 52414061
Alignment:
Q  11 tgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttgg 110  Q
    |||||| || || |||| |||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  52413959 tgtttgcttcaaatttaccaaatttattcttagaaataacaacccttggaatataaagatgtgaattttatttcaagcgaattagaaaaaatatgtttgg 52414058  T
Q  111 tta 113  Q
    |||    
T  52414059 tta 52414061  T

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Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 36860104 - 36860028
Alignment:
Q  6 gggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatt 82  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||| ||||| |||| |||||||||    
T  36860104 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaacataaaaatggaaattttatt 36860028  T

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Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 12276260 - 12276151
Alignment:
Q  4 aagggtgtg-tttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||  ||||||||| |||  || ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||  ||    
T  12276260 aagggtgtgatttgtttcaagtttactaaatttatttataggaataacatttttt-gaatataaagatgtgaattttatttcaaaatatttagaaagcat 12276162  T
Q  103 atgtttggtta 113  Q
    ||||| |||||    
T  12276161 atgttcggtta 12276151  T

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Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 220
Target Start/End: Original strand, 18094087 - 18094189
Alignment:
Q  117 ttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttct 216  Q
    ||||||||||  ||| || |||||||||| | |||||||||||||   ||   |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||| ||||||    
T  18094087 ttataatatttttaggaatcataaaaatatgaattataataggtagt-tacacatgaatttattctcatcttcatgggaactttattctcaccattttct 18094185  T
Q  217 ttgg 220  Q
    ||||    
T  18094186 ttgg 18094189  T

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Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Original strand, 30415706 - 30415751
Alignment:
Q  9 tgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattc 54  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  30415706 tgtgtttgtttgaagattactaaatttattcttaggaataatattc 30415751  T

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Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 71
Target Start/End: Original strand, 18094012 - 18094075
Alignment:
Q  7 ggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatg 71  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  18094012 ggtgtgtttgttttaaatttatcaaatctattttcaggaataacattcattagaat-taaagatg 18094075  T

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Target: chr3 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 48)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 48340108 - 48339883
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  48340108 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttagaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaat 48340009  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48340008 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 48339909  T
Q  203 ttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||    
T  48339908 tcccacccttttccttgggaaatttt 48339883  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11239473 - 11239246
Alignment:
Q  1 actaagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  11239473 actaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaa 11239374  T
Q  101 atatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11239373 atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 11239274  T
Q  201 atttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11239273 attcccacccttttccttgggaaatttt 11239246  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8476657 - 8476434
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  8476657 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagatggaaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 8476558  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8476557 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 8476458  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  8476457 ccacccttttccttgggaaatttt 8476434  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 47115202 - 47114983
Alignment:
Q  9 tgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgttt 108  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  47115202 tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgttt 47115103  T
Q  109 ggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccac 208  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47115102 ggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccac 47115003  T
Q  209 ccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||| ||||||| ||||    
T  47115002 ccttttccttgggaattttt 47114983  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Original strand, 29512324 - 29512544
Alignment:
Q  7 ggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgt 106  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29512324 ggtgtgtttgtttcaaatttaccaaatttattcctaggaataacattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatacgt 29512423  T
Q  107 ttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcc 206  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  29512424 ttggttagctttataatattcataggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttatt-ccatctctatgggaactttatttcc 29512522  T
Q  207 acccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  29512523 acccttttccttgggaaatttt 29512544  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 20297511 - 20297730
Alignment:
Q  1 actaagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20297511 actaagggtgtgtttgttttaagtttaccaaatttattcttaggaataacattctttggaatataaagatgggaattttatttcaaggaatttaggaaaa 20297610  T
Q  101 atatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 200  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20297611 atatgtttggttgactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 20297710  T
Q  201 atttccacccttttctttgg 220  Q
    ||| ||||||||||| ||||    
T  20297711 attcccacccttttccttgg 20297730  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33218262 - 33218039
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  33218262 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 33218163  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  33218162 gtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctctatgggaactttattc 33218063  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  33218062 ccacccttttccttgggaaatttt 33218039  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Original strand, 1098923 - 1099143
Alignment:
Q  7 ggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgt 106  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  1098923 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgt 1099022  T
Q  107 ttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcc 206  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1099023 ttggctagctttataatatttctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaa-tatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattccc 1099121  T
Q  207 acccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  1099122 acccttttccttgggaaatttt 1099143  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 225
Target Start/End: Original strand, 46359673 - 46359894
Alignment:
Q  4 aagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaata 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  46359673 aagggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttatgaaaaata 46359772  T
Q  104 tgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatt 203  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46359773 tgtttggttagctttataatattcctaggaatcataaaaatagggattataataggaaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatt 46359872  T
Q  204 tccacccttttctttgggaaat 225  Q
     ||||||||||| |||||||||    
T  46359873 cccacccttttccttgggaaat 46359894  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 26848744 - 26848967
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  26848744 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 26848843  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  26848844 gtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatttccatgggaactttattc 26848943  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||| || |||||||||    
T  26848944 ccacccttttccttaggaaatttt 26848967  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20414812 - 20414591
Alignment:
Q  7 ggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgt 106  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  20414812 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaagaatttaggaaaaatatgt 20414713  T
Q  107 ttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcc 206  Q
    ||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20414712 ttgattagctttataatattcctaagaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattccc 20414613  T
Q  207 acccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||| ||||||| ||||    
T  20414612 acccttttccttgggaattttt 20414591  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Original strand, 40907986 - 40908210
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  40907986 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttgaaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaat 40908085  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 202  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40908086 atgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttat 40908184  T
Q  203 ttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||    
T  40908185 tcccacccttttccttgggaaatttt 40908210  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 44952030 - 44952253
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  44952030 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 44952129  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcc-tagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatt 203  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44952130 gtttggttaactttataatattccttaggaa-cataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttatt 44952228  T
Q  204 tccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
     ||||||||||| ||||||||||||    
T  44952229 cccacccttttccttgggaaatttt 44952253  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6231850 - 6231627
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  6231850 agggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttgaaatataaagataggaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 6231751  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6231750 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggaaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 6231651  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||    
T  6231650 ccaccattttcattgggaaatttt 6231627  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31611330 - 31611111
Alignment:
Q  9 tgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgttt 108  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  31611330 tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttatgaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttagaaaaaatatgttt 31611231  T
Q  109 ggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccac 208  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  31611230 ggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattcccac 31611131  T
Q  209 ccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||   |||||||||||    
T  31611130 cctttttcatgggaaatttt 31611111  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28124779 - 28124562
Alignment:
Q  11 tgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttgg 110  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  28124779 tgtttgtttcaagtttaccaaatttatttttaggattaacattccttggaatataaatatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttgg 28124680  T
Q  111 ttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccaccc 210  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  28124679 ttagctttataatattcctaagaaccataaaaatagggattataatatgtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcccaccc 28124580  T
Q  211 ttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  28124579 ttttccttgggaaatttt 28124562  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 24574289 - 24574512
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  24574289 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcataggaataacattccttgaaatataaagatgagaattttattccaaggaatttatgaaaaatat 24574388  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  24574389 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaataaggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattc 24574488  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  24574489 ccaccatttttcttgggaaatttt 24574512  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9320802 - 9320574
Alignment:
Q  1 actaagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttc-aagaaatttaggaaa 99  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||    
T  9320802 actacgggtgtgtttgtttcaagtttatgaaatttattcataggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattcctaaggaatttaggaaa 9320703  T
Q  100 aatatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9320702 aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggatcataataagtaaactatttatgaatttatttccatctccatgggaactt 9320603  T
Q  200 tatttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||||    
T  9320602 tattcccacctttttccttaggaaatttt 9320574  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 43132502 - 43132287
Alignment:
Q  8 gtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtt 107  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  43132502 gtgtgtttgtttcaagtttactaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggtatttaggaaaaatatgtt 43132403  T
Q  108 tggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcca 207  Q
    ||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||| |||    
T  43132402 tggttaactttataatattcctaggaaccatgaaaatagggattataataggt-aactatttatgaatttaatctcatctccgtgggaactctattccca 43132304  T
Q  208 cccttttctttgggaaa 224  Q
    |||||||| ||||||||    
T  43132303 cccttttccttgggaaa 43132287  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10823068 - 10822844
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  10823068 taagggtgtgtttgtttcaagtttagcaaatttatttctaggaataacattccttacaatataaagatgagaattttattccaaggtatttaggaaaaat 10822969  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 202  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  10822968 atgtttggttaactttataatattcttaggaaccatacaaatagggattattatagat-aactatttatgattttattcccatctccatgaaaactttat 10822870  T
Q  203 ttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||    
T  10822869 tcccacccttttcctagggaaatttt 10822844  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 43719271 - 43719056
Alignment:
Q  8 gtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtt 107  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  43719271 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagttgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtt 43719172  T
Q  108 tggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcca 207  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||     |||||||||||||| ||||||| |||    
T  43719171 tggttagctttataatattcttaggaaccataaaaatatggattataataagtaaattatttatgaatt-----ccatctccatgggatctttattccca 43719077  T
Q  208 cccttttctttgggaaatttt 228  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  43719076 cccttttccttgggaaatttt 43719056  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26849492 - 26849286
Alignment:
Q  7 ggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgt 106  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  26849492 ggtgtgtttgttttaagtttaccaaatttatttttaggaataatatttcttggaatataaagatggaaattttatttcaaggtatttagaaaaaatatgt 26849393  T
Q  107 ttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcc 206  Q
    |||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||| ||    
T  26849392 ttggttaactttataatattcataggaaccataaaaatagagattataataggt-aactatttatgaatttattctcatctctgtaggaactttattccc 26849294  T
Q  207 accctttt 214  Q
    ||| ||||    
T  26849293 accatttt 26849286  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 53166073 - 53165865
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  || |||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  53166073 agggtgtgtttgtttcaagtttatccaatttatttctaagaataacattccttgaaatataaagatgggtattttattccaaggtatttaggaaaaatat 53165974  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||   ||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  53165973 gtttggttaaccttataatattcctaggaatcataaaaatagatattataataggt-aactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattc 53165875  T
Q  205 ccaccctttt 214  Q
    ||||||||||    
T  53165874 ccaccctttt 53165865  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31436269 - 31436053
Alignment:
Q  7 ggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgt 106  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | | ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||| ||||| ||||    
T  31436269 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctggaaataacattctttagaatataaagataggaattttattccaaggtatatagaaaaaacatgt 31436170  T
Q  107 ttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcc 206  Q
    |||||||| ||||||||||| || | || |||||||||| |||||||||||||| |||||  |  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  31436169 ttggttagttttataatatttcttggaatcataaaaataaggattataataggt-aactacattagaatttattctcatctccatgggaactttattccc 31436071  T
Q  207 acccttttctttgggaaa 224  Q
    |||  |||||||||||||    
T  31436070 accaatttctttgggaaa 31436053  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 77 - 220
Target Start/End: Original strand, 19532939 - 19533081
Alignment:
Q  77 tttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatt 176  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19532939 tttattccaaggtatttaggaaaaatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccatgaaaatagggattataataggt-aactatttatgaatt 19533037  T
Q  177 tattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgg 220  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19533038 tattcccatctccaaggaaactttattcccacccttttccttgg 19533081  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12228601 - 12228390
Alignment:
Q  7 ggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgt 106  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||| |||  ||  |||||||||||| ||||||||||  |||  |||||  ||||||||||    
T  12228601 ggtgtgtttgttacaagtttatcaaatttattcttgggaataacattatttgaaatataaagatgagaattttattctaaggtatttaaaaaaaatatgt 12228502  T
Q  107 ttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcc 206  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||| || |||||||||| | |||||||||| | |||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  12228501 ttggttagttttatgatattcttaggaatcataaaaataagtattataatagat-aactacatatgattttattctcatctccatgggaactttattctc 12228403  T
Q  207 acccttttctttgg 220  Q
    | ||||||||||||    
T  12228402 a-ccttttctttgg 12228390  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 220
Target Start/End: Original strand, 40584336 - 40584547
Alignment:
Q  8 gtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtt 107  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||||  || |||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||| |||||    
T  40584336 gtgtgtttgtttcaagtgtaacaaatttattcctaagaataacattccttcaaatataaagataggaattttatttcaaggtatttaaaaaaaagatgtt 40584435  T
Q  108 tggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcca 207  Q
    ||||||   |||||||||||| || |||| |||||||||| | ||||||||||  | ||   || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40584436 tggttaacattataatattccaaggaaccttaaaaataggaaatataataggt-gattacacataattttattcccatctccatgggaactttattccca 40584534  T
Q  208 cccttttctttgg 220  Q
    || ||||||||||    
T  40584535 ccattttctttgg 40584547  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 28770557 - 28770340
Alignment:
Q  6 gggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatg 105  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||| |||| |||| |||||||||| ||||  || ||| ||||  |||    
T  28770557 gggtgtgtttgtttcaaatttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaacataatgatgagaattttattccaaggtatatagaaaaatgatg 28770458  T
Q  106 tttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttc 205  Q
    |||| |||   ||||||||||    | |||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| | |||||||||| |||| |||||||||| |    
T  28770457 tttgtttaacgttataatattatcgggaaccataaaaatagggattataataggt-aattacatatgaaatcattcccatcttcatgagaactttattcc 28770359  T
Q  206 cacccttttctttgggaaa 224  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  28770358 caccattttctttgggaaa 28770340  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 49216027 - 49216244
Alignment:
Q  10 gtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttg 109  Q
    |||||||||| ||||||  |||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||    
T  49216027 gtgtttgttttaagttttccaaaattattcttaggaataatgttccttggaatataaagatgggaattttattccaaggtatttagaaaaaatatgtttg 49216126  T
Q  110 gttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacc 209  Q
    ||||   |||||| ||||| |  |||| ||||||||  ||||||||||||| || |    || | |||||| ||||||  |||| |||||||||   |||    
T  49216127 gttaaccttataaaattccaaagaaccttaaaaatatagattataataggt-aattccacataattttattaccatctttatggaaactttattcttacc 49216225  T
Q  210 cttttctttgggaaatttt 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  49216226 cttttctttgggaaatttt 49216244  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 6832275 - 6832114
Alignment:
Q  1 actaagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||  || |||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||| ||||    
T  6832275 actaagggtgtgtttgtttcaaatttaccaaatttattcctaagaataacattacttggaatataaagatgagaattttattccaaggtatttagaaaaa 6832176  T
Q  101 atatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaa 162  Q
    |||||||||||||  || ||| |||||| |  |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  6832175 atatgtttggttaacttcatagtattccaaagaaccttaaaaataaggattataataggtaa 6832114  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 224
Target Start/End: Original strand, 27822994 - 27823215
Alignment:
Q  6 gggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaata-- 103  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| || ||| ||||| ||| ||||||||||| |||  |||||| ||||| |      
T  27822994 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttttaggaataacattctttcgaacataaatatgagaattttattttaaggtatttagaaaaaaaaaa 27823093  T
Q  104 --tgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta 201  Q
      | |||| |||   |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||  ||   |||||||| ||| ||||| |||| ||| ||||    
T  27823094 aatatttgcttaacattataatattcctagaaatcataaaaatatggattataacaggtaat-tacacatgaatttgttctcatcttcatgagaatttta 27823192  T
Q  202 tttccacccttttctttgggaaa 224  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  27823193 ttcccacccttttctttgggaaa 27823215  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 203
Target Start/End: Original strand, 24783934 - 24784129
Alignment:
Q  8 gtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtt 107  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  || |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||  |||||  |||||||||||    
T  24783934 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcataagaataacattccttggaatataaagatgagaattttattctaaggtatttaaaaaaaatatgtt 24784033  T
Q  108 tggtt-aggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatt 203  Q
    ||||| |  |||| |||||||| || |||| ||||||||  ||||||||||||| || ||   || | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24784034 tggttaaactttagaatattccaaggaaccttaaaaataaagattataataggt-aattacacataattttattcccatcttcatgggaactttatt 24784129  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 38140710 - 38140504
Alignment:
Q  12 gtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggt 111  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||  || ||| ||||| ||||||| |    
T  38140710 gtttgtttcaattttataaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaaggtgtgaattttattccaaggtatatagaaaaaagatgtttgat 38140611  T
Q  112 taggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccaccct 211  Q
    ||   ||||||||||||| | ||||  ||||||| ||||||||||||| ||| ||   ||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||  ||||||    
T  38140610 taacattataatattcctgggaacctaaaaaataaggattataatagg-aaattacacatgaacttattctcatcttcat-ggaactttattctcaccct 38140513  T
Q  212 tttctttgg 220  Q
    |||||||||    
T  38140512 tttctttgg 38140504  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 31267694 - 31267540
Alignment:
Q  7 ggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgt 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||| |||| |||  |||||| ||||| ||||    
T  31267694 ggtgtgtttgttttaagtttatcggatttatttttaggaataacatttcttaaaatataaagatgtgaatttcattttaaggtatttagaaaaaagatgt 31267595  T
Q  107 ttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggta 161  Q
    || || |   |||||||||| | | ||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  31267594 ttagtcaacattataatatttccataaactttaaaaataaggattataataggta 31267540  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 82
Target Start/End: Original strand, 6927817 - 6927890
Alignment:
Q  9 tgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatt 82  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  6927817 tgtgtttgttttaagtttatcaaatttattactaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttatt 6927890  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 182
Target Start/End: Original strand, 18460582 - 18460750
Alignment:
Q  12 gtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggt 111  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  || |||||| |||  |   |||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||  | |||||| ||||||    
T  18460582 gtttgtttcaagtttatcaaatttatttctacgaataacatttttcgaaatataaagatgagaatttgattacaaggtatttaaaagaaatatatttggt 18460681  T
Q  112 taggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcc 182  Q
    ||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||    
T  18460682 taactttataatattcatag-aaccataaaaacagggattataatcggt-aactacatatgaatttattcc 18460750  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 92 - 218
Target Start/End: Original strand, 32071256 - 32071380
Alignment:
Q  92 ttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccat 191  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||  ||  ||||||||| |||||||||    
T  32071256 ttagaaaaaatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaataaagattataataggt-aactacatacaaatttattctcatctccat 32071354  T
Q  192 gggaactttatttccacccttttcttt 218  Q
     | |||||||||  | |||||||||||    
T  32071355 -gtaactttattctcgcccttttcttt 32071380  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 87
Target Start/End: Original strand, 27093769 - 27093833
Alignment:
Q  23 gtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaag 87  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27093769 gtttatcaaatttattcttaaaaataatattccttagaatataaagatgtgaattttatttcaag 27093833  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1247225 - 1247028
Alignment:
Q  28 tcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattc 127  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||  |||||||| | ||||| ||||||||||  ||   |||   ||||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  1247225 tcaaatttacttttaggaataacattttttagaataaatagatgagaattttattctaaagtattcgagaaaaatatgtttggttaactctataatactc 1247126  T
Q  128 ctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgggaaattt 227  Q
    || |  || ||||||||| |||||||||||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||  |||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  1247125 cttggtactataaaaatatggattataatagat-aactatataagaatttattccgatctccatgtgaac--tattcccacctttttccttcggaaattt 1247029  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2565744 - 2565593
Alignment:
Q  60 aatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataatagg 159  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||  |||||||||||| ||||  |||||||||||| ||  |||||||          ||||||||||    
T  2565744 aatacaaagatgagaattttatttcaaggtatttaa-aaaaatatgtttagttaactttataatattcatatgaaccata----------ttataatagg 2565656  T
Q  160 taa--actatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgg 220  Q
    |||  ||||  |||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2565655 taactactacgtatgaatttactctcatcttcatgggaactttattcccaccattttctttgg 2565593  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 87
Target Start/End: Original strand, 32070994 - 32071074
Alignment:
Q  7 ggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaag 87  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||  || |||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  32070994 ggtgggtttgttttaaatttatcaaatttattcctatgaataacatttcttggaatataaagatgagaattttattccaag 32071074  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12931119 - 12931070
Alignment:
Q  175 tttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgggaaa 224  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  12931119 tttattcccatctctatgggaactttattcccaccattttctttgagaaa 12931070  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 224
Target Start/End: Original strand, 18460827 - 18460880
Alignment:
Q  171 tgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgggaaa 224  Q
    ||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18460827 tgaatttattttcatctccaagagaactttatttccaccattttctttgggaaa 18460880  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 28693784 - 28693627
Alignment:
Q  1 actaagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||  ||| |||||| ||||||  ||  | |||||| |||||||||||||||   | ||| ||||    
T  28693784 actaagggtgtgtttgtttcaaatttactaaatttattcctagaaataattttccttgaaactttaagatgagaattttatttcaaggtttatagaaaaa 28693685  T
Q  101 atatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataatag 158  Q
    | ||||||  |||   |||||||||| |  |||||||||||||||   ||||||||||    
T  28693684 agatgtttatttaacattataatatttccggaaaccataaaaataaaaattataatag 28693627  T

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Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 33650357 - 33650217
Alignment:
Q  11 tgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttgg 110  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| |||  ||  ||| |||||||| ||||||||||  |||  ||| |  ||||| |||||||     
T  33650357 tgtttgtttcaagtttaccaaatttatttttatgaataacattatttgaaatctaaagatgagaattttattctaaggtattgaataaaaaaatgtttgc 33650258  T
Q  111 ttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggatt 151  Q
    |||   |||||||||||   |||||||||||||||| ||||    
T  33650257 ttaacattataatattctcggaaaccataaaaatagagatt 33650217  T

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Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 21925686 - 21925641
Alignment:
Q  117 ttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaa 162  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21925686 ttataatattctcaaaaaccataaaaatagggattataatatgtaa 21925641  T

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Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 33647886 - 33647837
Alignment:
Q  171 tgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgg 220  Q
    ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||    
T  33647886 tgaatttattctcatcttcaaggaaactttatttccactcttttctttgg 33647837  T

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Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 38
Target Start/End: Original strand, 19532908 - 19532944
Alignment:
Q  2 ctaagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttatt 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19532908 ctaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatt 19532944  T

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Target: chr2 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 58)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 346694 - 346471
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  346694 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 346595  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  346594 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 346495  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  346494 ccacccttttccttgggaaatttt 346471  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 228
Target Start/End: Original strand, 4559278 - 4559504
Alignment:
Q  2 ctaagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaa 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  4559278 ctaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctaagaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaa 4559377  T
Q  102 tatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4559378 tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta 4559477  T
Q  202 tttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||    
T  4559478 ttcccacccttttccttgggaaatttt 4559504  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 6171513 - 6171736
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  6171513 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 6171612  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6171613 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 6171712  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||    
T  6171713 ccaccattttccttgggaaatttt 6171736  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41729479 - 41729256
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  41729479 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 41729380  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  41729379 gtttggttagctttataatattcctagtaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatggaaactttattc 41729280  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  41729279 ccacccttttccttgggaaatttt 41729256  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Original strand, 2050586 - 2050811
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2050586 taagggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatttttaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaat 2050685  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2050686 atgtttggttagctttataatattcctaggaatcataaaaataggaattataataggaaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 2050785  T
Q  203 ttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||    
T  2050786 tcccacccttttccttgggaaatttt 2050811  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 26309993 - 26310212
Alignment:
Q  9 tgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgttt 108  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  26309993 tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaatagcattccttggaatataaagatgggaattttattacaagaaatttaggaaaaatatggtt 26310092  T
Q  109 ggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccac 208  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26310093 ggttagctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccac 26310192  T
Q  209 ccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26310193 ccttttctttgggaaatttt 26310212  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 37192240 - 37192467
Alignment:
Q  1 actaagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  37192240 actaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaa 37192339  T
Q  101 atatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  37192340 atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattccaatctccatggaaacttt 37192439  T
Q  201 atttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  37192440 attcccacccttttccttgggaaatttt 37192467  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9734190 - 9733972
Alignment:
Q  10 gtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttg 109  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  9734190 gtgtttgttttaagtttaccaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttg 9734091  T
Q  110 gttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacc 209  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9734090 gttggctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacc 9733991  T
Q  210 cttttctttgggaaatttt 228  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  9733990 cttttccttgggaaatttt 9733972  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21737759 - 21737534
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  21737759 taaggatgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaatatgggaattttattccaaggaatttatgaaaaat 21737660  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21737659 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 21737560  T
Q  203 ttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  21737559 tcccaccattttccttgggaaatttt 21737534  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 13760692 - 13760912
Alignment:
Q  8 gtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtt 107  Q
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T  13760692 gtgtgtttgtttcaagtttgccaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttagaaaaaatatgtt 13760791  T
Q  108 tggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcca 207  Q
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T  13760792 tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattccca 13760891  T
Q  208 cccttttctttgggaaatttt 228  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  13760892 cccttttccttgggaaatttt 13760912  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14777847 - 14777624
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14777847 agggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 14777748  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
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T  14777747 gtttggttagctttataatattcctaggaactataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaattttattc 14777648  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||    
T  14777647 ccaccattttccttgggaaatttt 14777624  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Original strand, 17965707 - 17965928
Alignment:
Q  7 ggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgt 106  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  17965707 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgt 17965806  T
Q  107 ttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcc 206  Q
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T  17965807 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctctatgggaactttattccc 17965906  T
Q  207 acccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||   |||||||||||    
T  17965907 accctttttcatgggaaatttt 17965928  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 42675012 - 42674787
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  42675012 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacatttcttggaatataaagataggaattttattccaaggaatttaggaaaaat 42674913  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42674912 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatttccatgggaactttat 42674813  T
Q  203 ttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    | ||||||||||  ||||||||||||    
T  42674812 tcccaccctttttcttgggaaatttt 42674787  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 11071327 - 11071550
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11071327 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcataggaataacattccttgaaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 11071426  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
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T  11071427 gtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatatggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattc 11071526  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||  ||||||||||||    
T  11071527 ccaccctttttcttgggaaatttt 11071550  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5770458 - 5770236
Alignment:
Q  6 gggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatg 105  Q
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T  5770458 gggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagataggaattttattccaaggaatttaagaaaaatatg 5770359  T
Q  106 tttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttc 205  Q
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T  5770358 tttggttagctttataatattcctagcaaccataaaaatagggattataataggaaaattatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcc 5770259  T
Q  206 cacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    |||| ||||  ||||||||||||    
T  5770258 caccatttttcttgggaaatttt 5770236  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 228
Target Start/End: Original strand, 41750276 - 41750474
Alignment:
Q  30 aaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattcct 129  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  41750276 aaatttattcctaggaataacattccttgaaatataaagatgggaattttatttcaaggaatttaggaaaaatatgtttggttaactttataatattcct 41750375  T
Q  130 agaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
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T  41750376 aagaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttt 41750474  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Original strand, 638318 - 638538
Alignment:
Q  7 ggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgt 106  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  638318 ggtgtgtttgatttaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt 638417  T
Q  107 ttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcc 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  638418 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgagaacttta-ttcc 638516  T
Q  207 acccttttctttgggaaatttt 228  Q
     |||||||| ||||||||||||    
T  638517 ccccttttccttgggaaatttt 638538  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 37533675 - 37533897
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||  ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  37533675 agggtgtgtttgtttcaagtttactaaatttatttctaggaataacattccttggaataaaaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaattat 37533774  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37533775 gtttggttagctttata-tattcctgggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 37533873  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  37533874 ccacccttttttttgggaaatttt 37533897  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 28312042 - 28311827
Alignment:
Q  8 gtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtt 107  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  28312042 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcataggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggtatttaggaaaaatatgtt 28311943  T
Q  108 tggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcca 207  Q
    ||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  28311942 tggttaactttataatattcctaggaaccatgaaaatagggattataataggt-aactatttatgaatttattcccatctccacgggaactttattccca 28311844  T
Q  208 cccttttctttgggaaa 224  Q
    |||||||| ||||||||    
T  28311843 cccttttccttgggaaa 28311827  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 37233155 - 37233369
Alignment:
Q  8 gtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtt 107  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  37233155 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggtatttaggaaaaatatgtt 37233254  T
Q  108 tggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcca 207  Q
    ||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37233255 tggttaactttataatattcctaggaaccatgaaaataaggattataataggt-aactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattccca 37233353  T
Q  208 cccttttctttgggaa 223  Q
    |||||||| |||||||    
T  37233354 cccttttccttgggaa 37233369  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 42 - 228
Target Start/End: Original strand, 2521434 - 2521620
Alignment:
Q  42 aggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaa 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  2521434 aggaataacattccttggaatataaagatggaaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaa 2521533  T
Q  142 aatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  2521534 aatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaattttattcccacccttttccttgggaaatttt 2521620  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 23943885 - 23944108
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||    
T  23943885 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattgtaaagaatttagaaaaaatat 23943984  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  23943985 gtttggttacctttataatattcctaggaaccataaaaataaagattataataggtaaattatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattc 23944084  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||    
T  23944085 ccacccttttcgttgagaaatttt 23944108  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 40951208 - 40950993
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||| ||||||||| || |||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  40951208 agggtatgtttgtttcaaatttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgaaaattttattccaaagaatttaggaaaaatat 40951109  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  40951108 gtttggttagctttataatattcctaagaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattc 40951009  T
Q  205 ccacccttttctttgg 220  Q
    ||||||||||| ||||    
T  40951008 ccacccttttccttgg 40950993  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20426830 - 20426613
Alignment:
Q  6 gggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatg 105  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||    
T  20426830 gggtgtgtttgtttaaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttatttcaatgtatttagaaaaaatatg 20426731  T
Q  106 tttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttc 205  Q
    ||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||      
T  20426730 tttggttaactttataatattcctaccaaccataaaaatagagattataataggt-aactatttatgaatttattctcatctccataggaactttattct 20426632  T
Q  206 cacccttttctttgggaaa 224  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  20426631 cacccttttccttgggaaa 20426613  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 3902182 - 3902401
Alignment:
Q  8 gtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtt 107  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  3902182 gtgtgtttgtttcaagtttaccatatttatttttaggaataacattccttgaaatataaagatgggaattttattccaagatatttagaaaaaatatgtt 3902281  T
Q  108 tggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcca 207  Q
    ||||||  ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  3902282 tggttaactttataatattcacaggaaccataaaaatagggattataataggt-aactatatatgaatttattctcatctccaagggaactttattccca 3902380  T
Q  208 cccttttctttgggaaatttt 228  Q
    || ||||||||||||| ||||    
T  3902381 ccattttctttgggaattttt 3902401  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 59 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39995434 - 39995265
Alignment:
Q  59 gaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataatag 158  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39995434 gaatataaagatggaaattttattccaaggaatttatgaaaaatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatag 39995335  T
Q  159 gtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  39995334 gtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccattttccttgggaaatttt 39995265  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34357024 - 34356826
Alignment:
Q  28 tcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattc 127  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34357024 tcaaatttattcttaggaatagcattccttggaatataa-gataggaattttattccaagaaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattc 34356926  T
Q  128 ctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgggaaattt 227  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  34356925 ctaggaaccataaaaatagagattataataggaaaattatttatgaatttattcccat-tccgtgggaactttattcccaccattttccttgggaaattt 34356827  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18714005 - 18713783
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    |||||||||||| || ||| ||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  18714005 agggtgtgtttgattcaagcttaccaaatttatttataggaataacattccttggaatataaagatgagaatattattccaagatatttagaaaaaatat 18713906  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||  ||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  18713905 gtttggttaactttataatattcctatgaaccataaaaatagggtttataataggt-tactacgtataaatttatttccatctccatgggaactttattc 18713807  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  18713806 ccacccttttctttgggaaatttt 18713783  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27358303 - 27358096
Alignment:
Q  13 tttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggtt 112  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||  || ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||    
T  27358303 tttgttttaagtttaccaaatttattcctaggaataacatttattggaatataaagatgagaattttatttcaaggtatttagcaaaaatatgtttgatt 27358204  T
Q  113 aggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccaccctt 212  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27358203 aaatttataatattcctaggaaccataaaaataaggattataataggt-aactatttatgaatttattctcatctctatgggaactttattcccaccctt 27358105  T
Q  213 ttctttggg 221  Q
    ||| |||||    
T  27358104 ttccttggg 27358096  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 45408981 - 45409188
Alignment:
Q  13 tttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggtt 112  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||  || ||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| ||    
T  45408981 tttgttttaagtttaccaaatttattcctaggaataacatttattggaatataaagatgagaattttattccaaggtatttagcaaaaatatgtttgatt 45409080  T
Q  113 aggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccaccctt 212  Q
    |  ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45409081 aaatttataatatttctaggaaccataaaaataaggattataataggt-aactatttatgaatttatttccatctccatgggaactttattcccaccctt 45409179  T
Q  213 ttctttggg 221  Q
    ||| |||||    
T  45409180 ttccttggg 45409188  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 7007307 - 7007529
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||| ||||||||||  ||   |||||| ||||||||    
T  7007307 agggtgtgtttgttttaagtttaccaaatttattattaggaataacatttcttgaaatataaagatgagaattttattctaaagtatttagaaaaaatat 7007406  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattt 204  Q
    |||||||||  |||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||     
T  7007407 gtttggttaactttataatattcctaagaaccattaaaatagggagtataataggt-aactacatatgaatttattctcatctccatggtaattttattc 7007505  T
Q  205 ccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||    
T  7007506 ccaccattttctttgggaattttt 7007529  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Original strand, 14832536 - 14832751
Alignment:
Q  8 gtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtt 107  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||   | |||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||    
T  14832536 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttccaagaataacattccttaaaatataaagatgataattttattcctagatatttagaaaaaatatgtt 14832635  T
Q  108 tggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcca 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||  ||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||    
T  14832636 tggttagctttataatattcctatgaaccataaaaataaggattataatagg-aaattacgtataaatttattctcatctcaatgagaactttattccca 14832734  T
Q  208 cccttttctttgggaaa 224  Q
    |||||||||||||||||    
T  14832735 cccttttctttgggaaa 14832751  T

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Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 44 - 224
Target Start/End: Original strand, 1988073 - 1988252
Alignment:
Q  44 gaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaa 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||| |||||    
T  1988073 gaataacattccttagaatataaatatgagaattttattccaagatttttgggaaaaatatgtttggttaactttataatattccttggaaccaaaaaaa 1988172  T
Q  144 tagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgggaaa 224  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  1988173 tagggattataataggt-aactatataagaatttattctcatctccatggaaactttattcccacccttttccttgagaaa 1988252  T

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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 45693908 - 45694129
Alignment:
Q  2 ctaagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaa 101  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||  ||||   |||||    
T  45693908 ctaaggatgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttggaacataaagatgagaattttattccaaggcattttaaaaaaa 45694007  T
Q  102 tatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta 201  Q
     ||||||| |||   ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||  | ||| || | |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  45694008 aatgtttgcttaacattataatattcctgggaaccataaaaataggaattataat-tgcaaattactcatgaatttattttcatctccatgggaacttta 45694106  T
Q  202 tttccacccttttctttgggaaa 224  Q
    || ||||||||||| ||||||||    
T  45694107 ttcccacccttttccttgggaaa 45694129  T

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Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 222
Target Start/End: Original strand, 4875506 - 4875715
Alignment:
Q  13 tttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttag-gaaaaatatgtttggt 111  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||   ||||||  ||||||||||||  |    
T  4875506 tttgtttcaagtttgtcaaatttattcttaggaataatattctttggaatataaagatgtgaattttattccaatgtatttagaaaaaaatatgttttct 4875605  T
Q  112 taggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccaccct 211  Q
    ||   ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||     
T  4875606 taacattataatatgccgaggaaccataaaaatagggattataatatgt-aattacatatgaatttattctcatcttcatgggaactttattcccacccg 4875704  T
Q  212 tttctttggga 222  Q
    |||||||||||    
T  4875705 tttctttggga 4875715  T

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Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Original strand, 40569740 - 40569961
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||| | |||  ||||||||| ||||  |||||| ||||| ||    
T  40569740 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctaggaataacattccttggaatatatatatgtaaattttattccaaggtatttagaaaaaagat 40569839  T
Q  105 gtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaa---cttta 201  Q
    |||||||||   ||||||| |||| || ||||  |||||||||||||||||||||| || |||  |||| ||||||||||| ||||||||||   |||||    
T  40569840 gtttggttaacattataatgttccaaggaacctcaaaaatagggattataataggt-aattatacatgattttattcccatttccatgggaacttcttta 40569938  T
Q  202 tttccacccttttctttgggaaa 224  Q
    || ||||| ||||||||||||||    
T  40569939 ttcccaccattttctttgggaaa 40569961  T

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Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 3254437 - 3254284
Alignment:
Q  9 tgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgttt 108  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||| ||| ||||||||||  |||  |||||| ||||||||||||    
T  3254437 tgtgtttgttttaagtttaccaaatttatttttaggaataacattctttggaatataaaaatgagaattttattctaaggtatttagaaaaaatatgttt 3254338  T
Q  109 ggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaa 162  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  3254337 ggttaacttcataatattcctagaaaccataaaaataagggttataataagtaa 3254284  T

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Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 11763733 - 11763597
Alignment:
Q  21 aagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttat 120  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||  || ||| ||||||||||||| |||  |||||    
T  11763733 aagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggtatctagaaaaaatatgtttgattaattttat 11763634  T
Q  121 aatattcctagaaaccataaaaatagggattataata 157  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  11763633 aatattcctaagaaccataaaaatagggattataata 11763597  T

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Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Original strand, 39819414 - 39819630
Alignment:
Q  7 ggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgt 106  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| | ||  |||||| ||||||||||    
T  39819414 ggtgtgtttgtttcaaatttaccaaatttattcataggaataacattctttggaatataaagatggaaattttattcccaggtatttagaaaaaatatgt 39819513  T
Q  107 ttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaac---tatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatt 203  Q
    ||||||   ||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||| |||||||||    || ||| | |||| || ||||| |||| ||||||||||    
T  39819514 ttggttgactttataatattccaaggaaccttaaaaataaggattatattaggtaaacaaacatatataattttactctcatcttcatgagaactttatt 39819613  T
Q  204 tccacccttttctttgg 220  Q
     ||||| ||||||||||    
T  39819614 cccaccattttctttgg 39819630  T

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Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Original strand, 13790018 - 13790221
Alignment:
Q  11 tgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat-atgtttg 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||  |||||| |||||  |||||||||  |||  |||||  |||||  |||||||    
T  13790018 tgtttgtttcaagtttatcaaatttatttgtaggaataacattccttgaaatatatagatgtaaattttattctaaggtatttaaaaaaaaagatgtttg 13790117  T
Q  110 gttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatt-tatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccac 208  Q
     |||   |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13790118 attaacattataatattccaaggaaccttaaaaatagggattataataggtaa--tattacatgattttattcccatctccatgggaactttattcccac 13790215  T
Q  209 cctttt 214  Q
    | ||||    
T  13790216 cgtttt 13790221  T

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Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41298255 - 41298044
Alignment:
Q  13 tttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggtt 112  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||      |||||  ||||| ||||||| ||    
T  41298255 tttgttttaagtatatcaaatttatttttaggaataacattcattggaatataaagatgagaattttattttgt---atttaaaaaaaagatgtttgttt 41298159  T
Q  113 aggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccaccctt 212  Q
    |   |||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||  |||  |||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||  |||||||    
T  41298158 aacattataatattccaaggaaccataagaatagagattataataggtaat-tataaatgaatatattctcatcttcatgagaactttattcacaccctt 41298060  T
Q  213 ttctttgggaaatttt 228  Q
    | ||||||||||||||    
T  41298059 tgctttgggaaatttt 41298044  T

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Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 5003188 - 5003028
Alignment:
Q  1 actaagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaa 100  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||  |||| |  |||    
T  5003188 actaaaggtgtgtttgtttaaaatttaccaaatttatttataggaataacattccttggaatataaagatgcgaattttattccaaggtatttggataaa 5003089  T
Q  101 atatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggta 161  Q
    | |||||||||||   || |||||||   || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5003088 agatgtttggttaacattttaatattttcaggaaccataaaaatatggattataataggta 5003028  T

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Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Original strand, 13539399 - 13539593
Alignment:
Q  13 tttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggtt 112  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| || |  |||| ||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||  || | |||||| ||||| ||||||| ||    
T  13539399 tttgtttcaagtttaccaaatttatttttggtgataacatttcttggaacataaagatgagaattttattctaaaatatttagaaaaaagatgtttgctt 13539498  T
Q  113 aggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccac 208  Q
    |   ||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||| | || ||   |||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  13539499 aacattatagtattctcagaaaccataaaaataaggattataatagat-aattacacatgaatctattcccatgttcatgggaactttattcccac 13539593  T

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Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11763577 - 11763497
Alignment:
Q  147 ggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||    
T  11763577 ggattataataggtaa-ctatttatgaatttattctcatcttcatggaaactttattcccacctttttcctttggaaatttt 11763497  T

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Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 113
Target Start/End: Original strand, 1623078 - 1623181
Alignment:
Q  9 tgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgttt 108  Q
    ||||||||||| || ||||  |||||||||  ||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  1623078 tgtgtttgtttcaattttactaaatttattcctagtaataacatttcttggaatataaagatgagaattttatttcaag-tatttagaaaatatatgttt 1623176  T
Q  109 ggtta 113  Q
    |||||    
T  1623177 ggtta 1623181  T

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Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 219
Target Start/End: Original strand, 4684945 - 4685113
Alignment:
Q  46 ataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaata 145  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| | ||  |||||| |||||||| |||| |||   ||||||||| | | | | |||||||||||    
T  4684945 ataacattctttagaacataaagatgagaattttattcctaggtatttagtaaaaatatatttgcttaacattataatat-cttcggatccataaaaata 4685043  T
Q  146 gggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttg 219  Q
     | ||||||||||||    ||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  4685044 tgaattataataggt----tacacatgaatttgttcccatcttcatgggaactttattcacacccttttctttg 4685113  T

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Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8868842 - 8868790
Alignment:
Q  173 aatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgggaaat 225  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8868842 aatttatacccatcttcatgggaactttattcccacccttttctttgggaaat 8868790  T

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Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 83
Target Start/End: Original strand, 14253254 - 14253326
Alignment:
Q  11 tgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttattt 83  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||| |||| || |||||||| |||| |||||||||||    
T  14253254 tgtttgttttaaatttaccaaatttatttttaggaataacattctttggaatataaggatgagaattttattt 14253326  T

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Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 126
Target Start/End: Original strand, 14253340 - 14253397
Alignment:
Q  69 atgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttggttaggtttataatatt 126  Q
    |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14253340 atggaaattttattccaaaatatttaggaaaaatatgtttggttaactttataatatt 14253397  T

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Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 14403555 - 14403431
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatat--aaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| | | |||  |||||  |||||||| ||||||||   |||   ||||| ||||||    
T  14403555 agggtgagtttgttttaagtttatcaaatttatttttagaaataacagttcttgaaatataaaaagatggaaattttatactaaggtttttagaaaaaat 14403456  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattc 127  Q
    || ||||||||  ||||||||||||    
T  14403455 atttttggttaactttataatattc 14403431  T

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Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 82
Target Start/End: Original strand, 25444922 - 25444999
Alignment:
Q  5 agggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatt 82  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| |||  || |||||||||||||  |||||||||    
T  25444922 agggtgtgtatgttttaagtttgtcaaatttattttaaggaataacattttttggaatataaagatgataattttatt 25444999  T

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Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 220
Target Start/End: Original strand, 1623217 - 1623320
Alignment:
Q  116 tttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttc 215  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| ||| | ||| | ||||||||| || || | |||    
T  1623217 tttatattattcgtaggaaccataaaaatagagattataattggt-aactacatatgaatttattctcatattcattgaaactttattcccgccatgttc 1623315  T
Q  216 tttgg 220  Q
    |||||    
T  1623316 tttgg 1623320  T

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Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 224
Target Start/End: Original strand, 25724918 - 25724966
Alignment:
Q  176 ttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgggaaa 224  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25724918 ttattctcatcttcatgagaactttattcccacccttttctttgggaaa 25724966  T

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Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3254245 - 3254194
Alignment:
Q  173 aatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttctttgggaaa 224  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  3254245 aatttattctcatcttcatgggaactttattcccaccatttcctttgggaaa 3254194  T

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Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 220
Target Start/End: Original strand, 37851692 - 37851794
Alignment:
Q  117 ttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttct 216  Q
    ||||||||||  ||| || |||||||||| | |||||||||||||   ||   |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||| ||||||    
T  37851692 ttataatatttttaggaatcataaaaatatgaattataataggtagt-tacacatgaatttattctcatcttcatgggaactttattctcaccattttct 37851790  T
Q  217 ttgg 220  Q
    ||||    
T  37851791 ttgg 37851794  T

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Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 78
Target Start/End: Original strand, 25625054 - 25625120
Alignment:
Q  12 gtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattt 78  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||  ||||||| ||| ||||||    
T  25625054 gtttgttttaaatttatcaaatttatttttaggaataacatttcttaacatataaaaatgtgaattt 25625120  T

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Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 82
Target Start/End: Original strand, 45212662 - 45212731
Alignment:
Q  13 tttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatt 82  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | |||| ||  ||| |||||||| ||||||||||    
T  45212662 tttgttttaaatttatcaaatttatttttaggaattacattctttgaaatgtaaagatgagaattttatt 45212731  T

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Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 71
Target Start/End: Original strand, 37851617 - 37851680
Alignment:
Q  7 ggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatg 71  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  37851617 ggtgtgtttgttttaaatttatcaaatctattttcaggaataacattcattagaat-taaagatg 37851680  T

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Target: scaffold0006 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Original strand, 201646 - 201870
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  201646 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattctaaggaatttaggaaaaat 201745  T
Q  103 atgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 202  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  201746 atgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattctcatctccatgggaactttat 201844  T
Q  203 ttccacccttttctttgggaaatttt 228  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||    
T  201845 tcccacccttttccttgggaaatttt 201870  T

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Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 143342 - 143558
Alignment:
Q  12 gtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaatttt-atttcaagaaatttaggaaaaatatgtttgg 110  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||| | ||||||||||||||    
T  143342 gtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaatttttatttcaaggtatttggaaaaaatatgtttgg 143441  T
Q  111 ttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccaccc 210  Q
    |||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     
T  143442 ttaactttataatattcctaggaaccataaaattagggattataataggt-aactacatatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacca 143540  T
Q  211 ttttctttgggaaatttt 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  143541 ttttctttgggaaatttt 143558  T

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Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 220
Target Start/End: Original strand, 119051 - 119257
Alignment:
Q  11 tgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttgg 110  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| |||  ||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||  |||||||    
T  119051 tgtttgctttaagtttaccaaatttattcttaaaaataacattcattggaatataaagatgtgaattttatttc-agatatttagaaaaaaggtgtttgg 119149  T
Q  111 ttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccaccc 210  Q
    | |    |||||||||||  | |||| ||| ||||||||||||||||||| |  ||   ||| |||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||    
T  119150 tgaacactataatattccccggaaccttaagaatagggattataataggt-agttacacatg-atttattctcatctgcctgaaaactttatttccaccc 119247  T
Q  211 ttttctttgg 220  Q
    ||||||||||    
T  119248 ttttctttgg 119257  T

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Target: scaffold0189 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:

Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29298 - 29078
Alignment:
Q  8 gtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtt 107  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||| |||  || |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  29298 gtgtgtttattttaagtttatcaaatttattcctatgaataacattttttggaatataaagataggaattttattccaaggaatttagaaaaaatatgtt 29199  T
Q  108 tggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttcca 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||    
T  29198 tggttagctttataatattcctaggaattataaaaatagggattataataggaaaactatttatgaatttattctcatttccatgggaactttattccca 29099  T
Q  208 cccttttctttgggaaatttt 228  Q
    |||||||| ||| ||||||||    
T  29098 cccttttccttgagaaatttt 29078  T

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Target: scaffold0662 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0662
Description:

Target: scaffold0662; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 224
Target Start/End: Original strand, 4186 - 4409
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttagg-aaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||  || |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| |||||    
T  4186 taagggtgtgtttgtttcaagtgcaccaaatttattcctatgaataacattccttggaatataaagataggaattttattccaaggtatttaggaaaaaa 4285  T
Q  102 tatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaa----actatttatgaatttattcccatctccatgggaac 197  Q
     |||||| ||||   |||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||    |||||| ||   ||||||  |||||||||||||||    
T  4286 aatgtttcgttaacattataatattccaaggaaccttaaaaatagggaatataataggtaattacactattaat---tttattttcatctccatgggaac 4382  T
Q  198 tttatttccacccttttctttgggaaa 224  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  4383 tttattcccaccattttctttgagaaa 4409  T

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Target: scaffold0702 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3916 - 3695
Alignment:
Q  3 taagggtgtgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttagga-aaaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||  || |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||    
T  3916 taagggtgtgtttgtttcaagtgcaccaaatttattcctatgaataacattccttggaatataaagataggaattttattccaaggtatttaggaaaaaa 3817  T
Q  102 tatgtttggttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta 201  Q
     |||||| ||||   |||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||| || ||   || | ||||||  |||||||||||||||||||    
T  3816 aatgtttcgttaacattataatattccaaggaaccttaaaaatagggaatataataggt-aattacacataattttattttcatctccatgggaacttta 3718  T
Q  202 tttccacccttttctttgggaaa 224  Q
    || ||||| ||||||||| ||||    
T  3717 ttcccaccattttctttgagaaa 3695  T

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Target: scaffold0005 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 43436 - 43292
Alignment:
Q  11 tgtttgtttgaagtttatcaaatttattattaggaataatattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatatgtttgg 110  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||   |||||| ||||| |||||||     
T  43436 tgtttattttaagtttgtcaaatttatttttaggaataatattttttagaatataaagatgtgaattttattttaaagtatttagaaaaaagatgtttgt 43337  T
Q  111 ttaggtttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataa 155  Q
    |||   |||| |||||  ||| |||| ||||||||  ||||||||    
T  43336 ttaacattatgatatttttaggaaccttaaaaataaagattataa 43292  T

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