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Alignment Overview

Query: NF10671_low_19 (Length: 343)

Name: NF10671_low_19
Description: NF10671
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10671_low_19
NF10671_low_19
[»] chr3 (35 HSPs)
chr3 (1-330)||(16743998-16744328)
chr3 (1-214)||(17912483-17912695)
chr3 (20-287)||(13838962-13839232)
chr3 (48-214)||(2449238-2449404)
chr3 (1-287)||(14842487-14842775)
chr3 (82-287)||(2049941-2050147)
chr3 (82-287)||(12030073-12030279)
chr3 (152-330)||(19231982-19232164)
chr3 (20-240)||(15858996-15859219)
chr3 (20-224)||(51158008-51158213)
chr3 (1-207)||(15936634-15936841)
chr3 (82-214)||(13975722-13975853)
chr3 (168-287)||(19260749-19260869)
chr3 (82-214)||(45860937-45861068)
chr3 (67-214)||(13954890-13955036)
chr3 (1-207)||(15938476-15938683)
chr3 (253-330)||(15857120-15857198)
chr3 (82-202)||(55316351-55316471)
chr3 (256-330)||(3992873-3992948)
chr3 (20-180)||(16821207-16821369)
chr3 (256-330)||(55513193-55513268)
chr3 (82-202)||(41270207-41270327)
chr3 (256-330)||(2844514-2844589)
chr3 (90-170)||(15614973-15615053)
chr3 (256-330)||(54037981-54038056)
chr3 (256-330)||(17955837-17955916)
chr3 (256-330)||(7854305-7854380)
chr3 (256-316)||(45581954-45582016)
chr3 (157-198)||(14080715-14080756)
chr3 (276-328)||(12031852-12031904)
chr3 (276-328)||(17205024-17205076)
chr3 (117-207)||(11986173-11986263)
chr3 (118-207)||(54651625-54651714)
chr3 (276-328)||(17191884-17191936)
chr3 (276-328)||(38810868-38810920)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (1-214)||(22907214-22907427)
chr8 (20-287)||(16193643-16193911)
chr8 (48-214)||(5238184-5238350)
chr8 (48-214)||(24661248-24661414)
chr8 (48-214)||(43685643-43685809)
chr8 (82-330)||(16404857-16405107)
chr8 (82-287)||(24928716-24928923)
chr8 (22-287)||(43373392-43373661)
chr8 (82-214)||(17345700-17345832)
chr8 (82-202)||(6774258-6774378)
chr8 (82-198)||(21844576-21844692)
chr8 (82-202)||(24549113-24549233)
chr8 (82-198)||(21851969-21852085)
chr8 (256-330)||(274766-274841)
chr8 (256-330)||(641008-641083)
chr8 (256-330)||(826814-826889)
chr8 (256-330)||(24716719-24716794)
chr8 (82-202)||(30120854-30120974)
chr8 (82-202)||(16674392-16674512)
chr8 (256-330)||(39115598-39115673)
chr8 (157-198)||(23149985-23150026)
chr8 (157-198)||(23226076-23226117)
chr8 (276-328)||(17285548-17285600)
chr8 (276-328)||(21198005-21198057)
[»] chr4 (21 HSPs)
chr4 (1-214)||(26680250-26680463)
chr4 (20-330)||(54118125-54118439)
chr4 (82-287)||(122020-122226)
chr4 (48-214)||(10488659-10488825)
chr4 (48-214)||(16327926-16328092)
chr4 (20-287)||(13246498-13246769)
chr4 (1-287)||(15675009-15675303)
chr4 (16-287)||(10104170-10104449)
chr4 (67-214)||(13048221-13048368)
chr4 (1-187)||(31115678-31115865)
chr4 (152-287)||(33240901-33241043)
chr4 (20-198)||(10644287-10644467)
chr4 (256-330)||(25119064-25119139)
chr4 (16-198)||(40885570-40885753)
chr4 (67-202)||(47357771-47357906)
chr4 (256-330)||(5682385-5682460)
chr4 (182-287)||(31132545-31132657)
chr4 (82-199)||(7850131-7850248)
chr4 (157-197)||(13809511-13809551)
chr4 (276-328)||(41165808-41165860)
chr4 (276-328)||(47534933-47534985)
[»] chr1 (21 HSPs)
chr1 (82-330)||(41394353-41394602)
chr1 (48-214)||(51452589-51452755)
chr1 (67-287)||(20931461-20931682)
chr1 (82-287)||(20913161-20913367)
chr1 (20-287)||(20445747-20446019)
chr1 (20-287)||(37844374-37844646)
chr1 (20-275)||(20531512-20531770)
chr1 (20-287)||(20893551-20893821)
chr1 (82-202)||(2116386-2116506)
chr1 (82-202)||(45051554-45051674)
chr1 (83-203)||(22227941-22228061)
chr1 (83-203)||(22232638-22232758)
chr1 (256-330)||(21860334-21860409)
chr1 (256-329)||(44034829-44034903)
chr1 (82-202)||(5072388-5072508)
chr1 (82-202)||(18601118-18601238)
chr1 (276-330)||(41218749-41218803)
chr1 (276-328)||(27675139-27675191)
chr1 (272-328)||(20177513-20177570)
chr1 (157-198)||(22143361-22143402)
chr1 (276-328)||(13376711-13376763)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (1-214)||(37066-37279)
scaffold0078 (256-330)||(41632-41707)
[»] chr7 (30 HSPs)
chr7 (1-214)||(7293066-7293279)
chr7 (20-328)||(3060034-3060344)
chr7 (48-214)||(11516324-11516490)
chr7 (48-214)||(15441564-15441730)
chr7 (48-214)||(30262129-30262295)
chr7 (82-287)||(16211897-16212103)
chr7 (20-287)||(13036938-13037209)
chr7 (20-287)||(11580661-11580934)
chr7 (82-287)||(36052795-36053003)
chr7 (20-214)||(47481031-47481226)
chr7 (1-207)||(18253842-18254049)
chr7 (82-214)||(25292338-25292470)
chr7 (1-213)||(13321063-13321278)
chr7 (82-196)||(16478968-16479082)
chr7 (82-198)||(13572808-13572924)
chr7 (82-202)||(10989541-10989661)
chr7 (86-279)||(295900-296094)
chr7 (256-330)||(32493903-32493978)
chr7 (83-203)||(2437590-2437710)
chr7 (90-202)||(13911024-13911136)
chr7 (256-330)||(126738-126813)
chr7 (256-330)||(1936874-1936949)
chr7 (172-214)||(14113989-14114031)
chr7 (172-214)||(14423639-14423681)
chr7 (256-330)||(111126-111201)
chr7 (276-328)||(13377872-13377924)
chr7 (276-328)||(13389698-13389750)
chr7 (276-330)||(7283913-7283967)
chr7 (118-198)||(16914928-16915009)
chr7 (276-328)||(16919874-16919926)
[»] chr2 (21 HSPs)
chr2 (82-330)||(20627195-20627445)
chr2 (20-330)||(19794586-19794899)
chr2 (1-330)||(43642838-43643171)
chr2 (20-287)||(462806-463075)
chr2 (48-214)||(19689401-19689567)
chr2 (48-214)||(23820168-23820334)
chr2 (48-214)||(14906440-14906606)
chr2 (1-287)||(36982364-36982655)
chr2 (48-214)||(20015108-20015274)
chr2 (20-281)||(8891310-8891574)
chr2 (1-287)||(24341309-24341603)
chr2 (82-214)||(25265390-25265522)
chr2 (82-214)||(17396653-17396784)
chr2 (192-287)||(22863169-22863267)
chr2 (256-330)||(22275045-22275120)
chr2 (256-330)||(22284278-22284353)
chr2 (257-330)||(15633538-15633612)
chr2 (83-164)||(7507894-7507975)
chr2 (82-202)||(19886661-19886781)
chr2 (272-328)||(19660217-19660273)
chr2 (276-328)||(43646237-43646289)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (20-287)||(1192-1462)
scaffold0266 (1-287)||(3508-3796)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (82-287)||(48729-48935)
scaffold0023 (67-180)||(36210-36323)
[»] chr5 (26 HSPs)
chr5 (48-214)||(20623066-20623232)
chr5 (48-214)||(21233528-21233694)
chr5 (51-214)||(37052844-37053007)
chr5 (48-214)||(16536294-16536460)
chr5 (20-287)||(23507033-23507302)
chr5 (48-212)||(25900408-25900571)
chr5 (20-287)||(27182471-27182742)
chr5 (1-287)||(18530988-18531281)
chr5 (1-287)||(22053753-22054047)
chr5 (82-214)||(34939408-34939540)
chr5 (82-202)||(29188284-29188404)
chr5 (84-198)||(27009975-27010089)
chr5 (20-202)||(4199985-4200169)
chr5 (67-202)||(22366481-22366616)
chr5 (82-199)||(43443398-43443515)
chr5 (67-199)||(18777995-18778127)
chr5 (82-202)||(19500031-19500151)
chr5 (82-202)||(25426760-25426880)
chr5 (82-202)||(12506-12626)
chr5 (82-202)||(21073595-21073715)
chr5 (276-330)||(11584394-11584448)
chr5 (117-207)||(32950861-32950951)
chr5 (157-198)||(21310709-21310750)
chr5 (157-198)||(23981516-23981557)
chr5 (118-198)||(29918131-29918212)
chr5 (276-328)||(21222462-21222514)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (20-287)||(171973-172242)
scaffold0001 (20-287)||(177676-177945)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (48-214)||(26892-27058)
scaffold0141 (48-207)||(22637-22796)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (48-214)||(1582-1748)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (24-288)||(36836-37104)
scaffold0077 (276-330)||(15324-15378)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (82-275)||(51121-51314)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (1-279)||(19255-19537)
scaffold0195 (1-214)||(21339-21553)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (22-287)||(41799-42066)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (67-287)||(882-1103)
[»] chr6 (21 HSPs)
chr6 (23-287)||(23153518-23153786)
chr6 (83-243)||(14626089-14626249)
chr6 (1-214)||(1657748-1657961)
chr6 (82-214)||(15862602-15862734)
chr6 (82-214)||(35009439-35009571)
chr6 (82-202)||(1650105-1650225)
chr6 (256-330)||(19983149-19983224)
chr6 (256-330)||(35015014-35015089)
chr6 (219-287)||(23148266-23148335)
chr6 (67-202)||(25175680-25175815)
chr6 (67-202)||(27653983-27654118)
chr6 (131-214)||(27751605-27751688)
chr6 (16-214)||(29665937-29666137)
chr6 (77-202)||(16825752-16825879)
chr6 (256-330)||(18583640-18583715)
chr6 (276-328)||(21623511-21623563)
chr6 (157-198)||(16887792-16887833)
chr6 (118-198)||(18629608-18629689)
chr6 (157-198)||(33324898-33324939)
chr6 (157-198)||(35136013-35136054)
chr6 (276-328)||(22361619-22361671)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (20-287)||(12183-12450)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (82-287)||(5990-6196)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (20-287)||(247366-247637)
[»] scaffold0162 (3 HSPs)
scaffold0162 (20-287)||(26340-26610)
scaffold0162 (82-214)||(8180-8312)
scaffold0162 (276-328)||(6877-6929)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (20-287)||(272093-272362)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (20-278)||(4996-5256)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (1-287)||(128095-128382)
scaffold0008 (90-180)||(31697-31787)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (20-287)||(123087-123359)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (82-287)||(89378-89586)
scaffold0028 (163-287)||(107708-107835)
scaffold0028 (157-198)||(79745-79786)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (1-287)||(8927-9215)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (20-276)||(8917-9180)
scaffold0025 (20-246)||(148789-149018)
scaffold0025 (188-287)||(146838-146938)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (67-214)||(13622-13769)
scaffold0132 (256-330)||(42677-42749)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (1-207)||(48236-48443)
scaffold0049 (276-330)||(20513-20567)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (82-207)||(5660-5785)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (1-207)||(107796-108003)
scaffold0026 (82-198)||(64527-64648)
scaffold0026 (157-199)||(89863-89905)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (84-214)||(534-664)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (83-214)||(41780-41911)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
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[»] scaffold0529 (1 HSPs)
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[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (82-202)||(13325-13445)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
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[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (82-180)||(9371-9469)
scaffold0215 (82-180)||(16269-16367)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (67-179)||(43114-43226)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
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scaffold0022 (157-197)||(102923-102963)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (82-202)||(1304-1424)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (256-330)||(80187-80262)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
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[»] scaffold0016 (3 HSPs)
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[»] scaffold0184 (1 HSPs)
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[»] scaffold0686 (2 HSPs)
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[»] scaffold0342 (1 HSPs)
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[»] scaffold0369 (1 HSPs)
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[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (125-214)||(3364-3453)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (89-207)||(56106-56226)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
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scaffold0066 (16-164)||(45094-45244)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (276-330)||(1721-1775)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (276-330)||(19807-19861)
scaffold0122 (276-330)||(24111-24165)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (157-198)||(1546-1587)
scaffold0456 (157-198)||(8691-8732)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (157-198)||(8216-8257)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
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[»] scaffold0013 (1 HSPs)
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[»] scaffold0876 (1 HSPs)
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[»] scaffold0409 (2 HSPs)
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scaffold0409 (160-198)||(9603-9641)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (276-330)||(6261-6315)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (89-207)||(10338-10458)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (157-198)||(22422-22463)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (157-198)||(93773-93814)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
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[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (276-328)||(1363-1415)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (157-197)||(10868-10908)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (276-328)||(76699-76751)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 35)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16744328 - 16743998
Alignment:
Q  1 aacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttc 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16744328 aacatttattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactataacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttt 16744229  T
Q  101 tcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttag 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16744228 tcatttttacatatttaaaaatgtaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatggatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttaa 16744129  T
Q  201 caacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacc-ccttaccttaattatctccaac 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16744128 caacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacctcgttaccttaattatctccaac 16744029  T
Q  300 tactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744028 tattagctctagcttcactttagctcctatg 16743998  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17912695 - 17912483
Alignment:
Q  1 aacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttc 100  Q
    |||||| |||| || ||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  17912695 aacatcaattaacaacaataacatcgattgaacatgaatcatagctcaattcaactacaacatatcaaattcatcaattttgcacaattttcataacttt 17912596  T
Q  101 tcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttag 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17912595 tcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatc-aagttggagcacgaatttag 17912497  T
Q  201 caacaatcatccat 214  Q
    ||||||| ||||||    
T  17912496 caacaattatccat 17912483  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 287
Target Start/End: Original strand, 13838962 - 13839232
Alignment:
Q  20 aacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |    
T  13838962 aacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttga 13839061  T
Q  119 acatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc 218  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  13839062 acatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattattcataatc 13839161  T
Q  219 aaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  13839162 aaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 13839232  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2449404 - 2449238
Alignment:
Q  48 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacact 147  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  2449404 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 2449305  T
Q  148 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2449304 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 2449238  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14842775 - 14842487
Alignment:
Q  1 aacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataactt 99  Q
    |||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  14842775 aacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcataactt 14842676  T
Q  100 ctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta 199  Q
     |||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14842675 atcatttttacacatttgaacatgcaatttcaccaacaatcatacaattatcttcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattta 14842576  T
Q  200 gcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 287  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  14842575 gcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatttgcaaagtgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 14842487  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 82 - 287
Target Start/End: Original strand, 2049941 - 2050147
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    |||||||||||| || || |||| | ||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||     
T  2049941 gcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcaggcatacaaacatatcgtcac 2050040  T
Q  182 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-cccct 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  2050041 agttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattgatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaaccccct 2050140  T
Q  281 tacctta 287  Q
    |||||||    
T  2050141 tacctta 2050147  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 82 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12030279 - 12030073
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| || ||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  12030279 gcacaactttcacaacttatcacttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcac 12030180  T
Q  182 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-cccct 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  12030179 agttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaagtcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataatgattaaccccct 12030080  T
Q  281 tacctta 287  Q
    |||||||    
T  12030079 tacctta 12030073  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 152 - 330
Target Start/End: Original strand, 19231982 - 19232164
Alignment:
Q  152 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaa 248  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19231982 atcaattcatgaatataaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaa 19232081  T
Q  249 aatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  19232082 aatgatgatgattaagataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg 19232164  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15859219 - 15858996
Alignment:
Q  20 aacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| |    
T  15859219 aacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcatatttga 15859120  T
Q  119 acatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat- 217  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||     
T  15859119 acatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatg 15859020  T
Q  218 -caaaattcatacaacatttgaaa 240  Q
      ||||||||||||||| ||||||    
T  15859019 caaaaattcatacaacaattgaaa 15858996  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 51158213 - 51158008
Alignment:
Q  20 aacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |    
T  51158213 aacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttga 51158114  T
Q  119 acatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc 218  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  51158113 acatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagc 51158014  T
Q  219 aaaatt 224  Q
    ||||||    
T  51158013 aaaatt 51158008  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15936841 - 15936634
Alignment:
Q  1 aacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataactt 99  Q
    |||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | ||||| |||| | |||  |||||||||||| |||||    
T  15936841 aacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaactt 15936742  T
Q  100 ctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta 199  Q
     |||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  15936741 atcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaattta 15936642  T
Q  200 gcaacaat 207  Q
    | ||||||    
T  15936641 gtaacaat 15936634  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13975853 - 13975722
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| | || | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13975853 gcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaa 13975755  T
Q  182 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13975754 agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13975722  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 168 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 19260869 - 19260749
Alignment:
Q  168 aaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggta 267  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  19260869 aaacatatcatcataattagagcacgaatttagcaacaattatccataaaaaaaattcatacaacatttgaaaacttacaaaatgatgatgattatgata 19260770  T
Q  268 aagactaa-ccccttacctta 287  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  19260769 aagactaacccccttacctta 19260749  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 214
Target Start/End: Original strand, 45860937 - 45861068
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| | || | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  45860937 gcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaa 45861035  T
Q  182 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45861036 agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 45861068  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 67 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13955036 - 13954890
Alignment:
Q  67 aaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcata 166  Q
    ||||||||| |||  ||||||| |||||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| | || | |||||||||||||    
T  13955036 aaattcatcaattgagcacaatattcataactgatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcata 13954937  T
Q  167 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13954936 c-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13954890  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15938683 - 15938476
Alignment:
Q  1 aacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataactt 99  Q
    |||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | ||||| |||| | |||  |||||||||||| |||||    
T  15938683 aacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaactt 15938584  T
Q  100 ctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta 199  Q
     |||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  15938583 atcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgattacaaacatatcattacagttggagcacgtattta 15938484  T
Q  200 gcaacaat 207  Q
    | ||||||    
T  15938483 gtaacaat 15938476  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 253 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15857198 - 15857120
Alignment:
Q  253 atgatgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15857198 atgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaagtattagctctagcttcactttagctcctatg 15857120  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 202
Target Start/End: Original strand, 55316351 - 55316471
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  55316351 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcac 55316450  T
Q  182 agttggagcacgaatttagca 202  Q
    ||   ||||||||||||||||    
T  55316451 agcaagagcacgaatttagca 55316471  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 330
Target Start/End: Original strand, 3992873 - 3992948
Alignment:
Q  256 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  3992873 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 3992948  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 180
Target Start/End: Original strand, 16821207 - 16821369
Alignment:
Q  20 aacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 117  Q
    ||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| |  |  ||||||| | |||| |||||||  ||||| |||  ||||| |||||||||     
T  16821207 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacatttttacatatttg 16821306  T
Q  118 aacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 180  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16821307 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgcatacaaacataacatca 16821369  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 330
Target Start/End: Original strand, 55513193 - 55513268
Alignment:
Q  256 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  55513193 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 55513268  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 202
Target Start/End: Original strand, 41270207 - 41270327
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||||  |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  41270207 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaattccaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcac 41270306  T
Q  182 agttggagcacgaatttagca 202  Q
    ||   ||||||||||||||||    
T  41270307 agcaagagcacgaatttagca 41270327  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 330
Target Start/End: Original strand, 2844514 - 2844589
Alignment:
Q  256 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  2844514 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctcaaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 2844589  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 90 - 170
Target Start/End: Original strand, 15614973 - 15615053
Alignment:
Q  90 ttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaa 170  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  15614973 ttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcctacaattatcatcaattcatgcatacaaa 15615053  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 54038056 - 54037981
Alignment:
Q  256 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  54038056 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatg 54037981  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 17955916 - 17955837
Alignment:
Q  256 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagct----ctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    ||||||||||||| |||||||||    
T  17955916 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctacctagcttcacttttgctcctatg 17955837  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 330
Target Start/End: Original strand, 7854305 - 7854380
Alignment:
Q  256 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7854305 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatg 7854380  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 316
Target Start/End: Original strand, 45581954 - 45582016
Alignment:
Q  256 atgattatggtaaagactaacccc--ttaccttaattatctccaactactagctctagcttca 316  Q
    ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45581954 atgattatgataaaaactaaccccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttca 45582016  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 198
Target Start/End: Original strand, 14080715 - 14080756
Alignment:
Q  157 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14080715 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 14080756  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 328
Target Start/End: Original strand, 12031852 - 12031904
Alignment:
Q  276 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 328  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  12031852 ccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 12031904  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 328
Target Start/End: Original strand, 17205024 - 17205076
Alignment:
Q  276 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 328  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  17205024 ccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 17205076  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 11986263 - 11986173
Alignment:
Q  117 aaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 207  Q
    ||||||| ||||| | | ||||||||||| |||| || || ||||||| || || ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  11986263 aaacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcattaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat 11986173  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 207
Target Start/End: Original strand, 54651625 - 54651714
Alignment:
Q  118 aacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 207  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||| |||| ||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||    
T  54651625 aacatgcaatttcactcacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaat 54651714  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 328
Target Start/End: Original strand, 17191884 - 17191936
Alignment:
Q  276 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 328  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||| | | |||||||||||||||||    
T  17191884 ccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaaacttcactttagctccta 17191936  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 38810920 - 38810868
Alignment:
Q  276 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 328  Q
    |||||||||||| ||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  38810920 ccccttaccttagttatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 38810868  T

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Target: chr8 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22907427 - 22907214
Alignment:
Q  1 aacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22907427 aacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttt 22907328  T
Q  101 tcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttag 200  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907327 tcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttag 22907228  T
Q  201 caacaatcatccat 214  Q
    ||||||| ||||||    
T  22907227 caacaattatccat 22907214  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16193911 - 16193643
Alignment:
Q  20 aacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 118  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||  || |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |    
T  16193911 aacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaatttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttga 16193812  T
Q  119 acatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc 218  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16193811 acatgtaatttccccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataagc 16193712  T
Q  219 aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaaccccttacctta 287  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16193711 aaaattcatacaatatttgaaaatttaccaaatgatgatgattatgataaagactaaccccttacctta 16193643  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Original strand, 5238184 - 5238350
Alignment:
Q  48 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacact 147  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  5238184 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 5238283  T
Q  148 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5238284 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 5238350  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24661414 - 24661248
Alignment:
Q  48 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacact 147  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  24661414 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 24661315  T
Q  148 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24661314 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 24661248  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Original strand, 43685643 - 43685809
Alignment:
Q  48 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacact 147  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  43685643 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 43685742  T
Q  148 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43685743 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 43685809  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 82 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16405107 - 16404857
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| | | ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  16405107 gcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcac 16405008  T
Q  182 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccc 278  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| | |||||||| |||    
T  16405007 agttggagcacgaatttagcaataattatccatcatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaataatgatgattatgatgaagactaacccc 16404909  T
Q  279 cttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  16404908 cttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 16404857  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 82 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24928923 - 24928716
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||     
T  24928923 gcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatataatcac 24928824  T
Q  182 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccc- 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||     
T  24928823 agttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgacgatgattatgataaagactaacccca 24928724  T
Q  280 ttacctta 287  Q
    ||||||||    
T  24928723 ttacctta 24928716  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 43373661 - 43373392
Alignment:
Q  22 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 120  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||    
T  43373661 catcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaac 43373562  T
Q  121 atggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--c 218  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||       
T  43373561 atgtaatttcaccaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagcacgaatttagcattaattatccattataca 43373462  T
Q  219 aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 287  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  43373461 aaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 43373392  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 82 - 214
Target Start/End: Original strand, 17345700 - 17345832
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||  |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  17345700 gcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatataaacataacatcac 17345799  T
Q  182 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  17345800 agttagagcacgaatttcgcaacaattatccat 17345832  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 82 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 6774378 - 6774258
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  6774378 gcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcac 6774279  T
Q  182 agttggagcacgaatttagca 202  Q
    |||  |||||||||| |||||    
T  6774278 agtaagagcacgaatctagca 6774258  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21844692 - 21844576
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  21844692 gcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcac 21844593  T
Q  182 agttggagcacgaattt 198  Q
    ||   ||||||||||||    
T  21844592 agcaagagcacgaattt 21844576  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 202
Target Start/End: Original strand, 24549113 - 24549233
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  24549113 gcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcac 24549212  T
Q  182 agttggagcacgaatttagca 202  Q
    |||  |||||||||| |||||    
T  24549213 agtaagagcacgaatctagca 24549233  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 82 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21852085 - 21851969
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  21852085 gcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatttaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcac 21851986  T
Q  182 agttggagcacgaattt 198  Q
    ||   ||||||||||||    
T  21851985 agcaagagcacgaattt 21851969  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 330
Target Start/End: Original strand, 274766 - 274841
Alignment:
Q  256 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  274766 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 274841  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 641083 - 641008
Alignment:
Q  256 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  641083 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 641008  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 826889 - 826814
Alignment:
Q  256 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  826889 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 826814  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 24716794 - 24716719
Alignment:
Q  256 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24716794 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 24716719  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 202
Target Start/End: Original strand, 30120854 - 30120974
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||  ||  || |||||||||||||||||||| |||||     
T  30120854 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcatacaaacataacatcac 30120953  T
Q  182 agttggagcacgaatttagca 202  Q
    ||   ||||||||||||||||    
T  30120954 agcaagagcacgaatttagca 30120974  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16674512 - 16674392
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||  ||  || |||||||||||| ||||||| |||||     
T  16674512 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcataaaaacataacatcac 16674413  T
Q  182 agttggagcacgaatttagca 202  Q
    ||   ||||||||||||||||    
T  16674412 agaaagagcacgaatttagca 16674392  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 330
Target Start/End: Original strand, 39115598 - 39115673
Alignment:
Q  256 atgattatggtaaagactaac-cccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    ||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  39115598 atgattatgatgaaaactaacacccttaccttaattattaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatg 39115673  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 198
Target Start/End: Original strand, 23149985 - 23150026
Alignment:
Q  157 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 198  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  23149985 ttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattt 23150026  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 23226117 - 23226076
Alignment:
Q  157 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  23226117 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacaaattt 23226076  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 328
Target Start/End: Original strand, 17285548 - 17285600
Alignment:
Q  276 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 328  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||| | | |||||||||||||||||||    
T  17285548 ccccttaccttaattatcaccaattcctaacccaagcttcactttagctccta 17285600  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21198057 - 21198005
Alignment:
Q  276 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 328  Q
    ||||||| |||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  21198057 ccccttatcttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 21198005  T

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Target: chr4 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 21)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 26680250 - 26680463
Alignment:
Q  1 aacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  26680250 aacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatctattttgcacaattttcataacttt 26680349  T
Q  101 tcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttag 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680350 tcatttttacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttag 26680449  T
Q  201 caacaatcatccat 214  Q
    ||||||| ||||||    
T  26680450 caacaattatccat 26680463  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 54118439 - 54118125
Alignment:
Q  20 aacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||| || | | ||||| |    
T  54118439 aacatcaattgaacaagaatcataactaaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaattgttcctatttga 54118340  T
Q  119 acatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat- 217  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||     
T  54118339 acatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatg 54118240  T
Q  218 -caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttc 315  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54118239 caaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaataatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttc 54118140  T
Q  316 actttagctcctatg 330  Q
    ||||| |||| ||||    
T  54118139 acttttgctcttatg 54118125  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 82 - 287
Target Start/End: Original strand, 122020 - 122226
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  122020 gcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcac 122119  T
Q  182 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-cccct 280  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  122120 agttggagcacaaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaatcccct 122219  T
Q  281 tacctta 287  Q
    |||||||    
T  122220 tacctta 122226  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Original strand, 10488659 - 10488825
Alignment:
Q  48 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacact 147  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  10488659 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 10488758  T
Q  148 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10488759 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 10488825  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16328092 - 16327926
Alignment:
Q  48 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacact 147  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  16328092 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 16327993  T
Q  148 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16327992 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16327926  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 287
Target Start/End: Original strand, 13246498 - 13246769
Alignment:
Q  20 aacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |    
T  13246498 aacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttga 13246597  T
Q  119 acatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat- 217  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||     
T  13246598 acatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcattaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgtagcacgaatttaacaacaattatccattatg 13246697  T
Q  218 -caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 287  Q
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  13246698 caaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 13246769  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15675303 - 15675009
Alignment:
Q  1 aacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataactt 99  Q
    |||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||    
T  15675303 aacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaactt 15675204  T
Q  100 ctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta 199  Q
    | ||||| |||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15675203 cacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattta 15675104  T
Q  200 gcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaa----atgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 287  Q
    |||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| |  ||||    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  15675103 gcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 15675009  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 10104449 - 10104170
Alignment:
Q  16 caacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatat 114  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  10104449 caacaacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataa 10104350  T
Q  115 ttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca- 213  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  10104349 ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacggatttagcaacaattatccaa 10104250  T
Q  214 -taatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaa----atgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 287  Q
     ||   ||||||||||| ||||||||||| |   |||    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  10104249 ttatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgtaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 10104170  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13048368 - 13048221
Alignment:
Q  67 aaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcata 166  Q
    ||||||||| |||  ||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||    
T  13048368 aaattcatcaattgagcacaatattcataacttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaatcatgcata 13048269  T
Q  167 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13048268 caaacatatcattgaagttggagcatgaatttagcaacaattatccat 13048221  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 31115678 - 31115865
Alignment:
Q  1 aacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccattttgcacaattttcataactt 99  Q
    |||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  ||| |||||||| |||||    
T  31115678 aacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttaggaaaattcaccaattgagcataattttcacaactt 31115777  T
Q  100 ctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 187  Q
    | ||||| |||||| |  |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31115778 cacatttttacataatggaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 31115865  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 287
Target Start/End: Original strand, 33240901 - 33241043
Alignment:
Q  152 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaa 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| |  ||||    
T  33240901 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaaa 33241000  T
Q  250 ----atgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 287  Q
        ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  33241001 aatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 33241043  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Original strand, 10644287 - 10644467
Alignment:
Q  20 aacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 117  Q
    ||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| |  |  ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  ||||| |||||||||     
T  10644287 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttg 10644386  T
Q  118 aacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 198  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  10644387 aacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 10644467  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 25119139 - 25119064
Alignment:
Q  256 atgattatggtaaagactaac-cccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  25119139 atgattatgataaaaactaactcccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 25119064  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 40885753 - 40885570
Alignment:
Q  16 caacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacata- 113  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| | ||| |  |||| |||| | |||  ||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||     
T  40885753 caacaacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagcaaagttcaccaattgagcataattt-cataacttgacatttatacatac 40885655  T
Q  114 tttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 198  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||| || |||| | ||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  40885654 tttgaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacatagcaccacagttggagtacgaattt 40885570  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 202
Target Start/End: Original strand, 47357771 - 47357906
Alignment:
Q  67 aaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcata 166  Q
    ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||| |||||  ||  |||||| ||||||||    
T  47357771 aaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatccatgcata 47357870  T
Q  167 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 202  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  47357871 caaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 47357906  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 5682460 - 5682385
Alignment:
Q  256 atgattatggtaaagactaaccc-cttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||    
T  5682460 atgattatgataaaaactaacccacttaccttaattatcaccaactattagctcatgcttcacttttgctcctatg 5682385  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 287
Target Start/End: Original strand, 31132545 - 31132657
Alignment:
Q  182 agttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaa----atgatgatgattatggtaaagactaa 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| |  ||||    |||||||| |||||| | ||||||||    
T  31132545 agttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgataattatgatgaagactaa 31132644  T
Q  276 -ccccttacctta 287  Q
     ||||||||||||    
T  31132645 cccccttacctta 31132657  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 199
Target Start/End: Original strand, 7850131 - 7850248
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||  ||||  ||||  ||||||||||| ||| || | |||||| ||| ||| |||||||| ||||      
T  7850131 gcacaattttcataacttcacattttcacataattggacatacaattccaccaacaatcacacagttttcatcaatacattcattcaaacataacatctc 7850230  T
Q  182 agttggagcacgaattta 199  Q
      ||||||||||||||||    
T  7850231 cattggagcacgaattta 7850248  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13809551 - 13809511
Alignment:
Q  157 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  13809551 ttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaatt 13809511  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 41165860 - 41165808
Alignment:
Q  276 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 328  Q
    |||||||| ||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  41165860 ccccttacgttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 41165808  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 47534985 - 47534933
Alignment:
Q  276 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 328  Q
    |||||||||||||||||| |||| | || || | |||||||||||||||||||    
T  47534985 ccccttaccttaattatcaccaattcctcgcccaagcttcactttagctccta 47534933  T

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Target: chr1 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 21)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 82 - 330
Target Start/End: Original strand, 41394353 - 41394602
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| || || ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||     
T  41394353 gcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaacttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgcatacaaacatatcatcat 41394452  T
Q  182 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-cccct 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  41394453 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaaccccct 41394552  T
Q  281 taccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394553 taccttaattatctccaactattagctctagcttcactttagctcctatg 41394602  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Original strand, 51452589 - 51452755
Alignment:
Q  48 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacact 147  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  51452589 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 51452688  T
Q  148 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  51452689 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgaagcacgaatttagcaacaattatccat 51452755  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 67 - 287
Target Start/End: Original strand, 20931461 - 20931682
Alignment:
Q  67 aaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcata 166  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||| ||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  20931461 aaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcata 20931560  T
Q  167 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggt 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||| |    
T  20931561 caaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaacttcatacaacaattgaaaatttgcaaaatgaggatgattatgat 20931660  T
Q  267 aaagactaa-ccccttacctta 287  Q
    |||| |||| ||||||||||||    
T  20931661 aaaggctaacccccttacctta 20931682  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 82 - 287
Target Start/End: Original strand, 20913161 - 20913367
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||| ||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  20913161 gcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcac 20913260  T
Q  182 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-cccct 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||| |||||    
T  20913261 agttggagcacgaatttagcaacaattatccgtaagcaaaattcatacaacaattgaaaatttgcaaaatgaggatgattacgataaagactaaccccct 20913360  T
Q  281 tacctta 287  Q
    |||||||    
T  20913361 tacctta 20913367  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 287
Target Start/End: Original strand, 20445747 - 20446019
Alignment:
Q  20 aacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  ||||||||||||  |||| |||||| | | || || |    
T  20445747 aacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttga 20445846  T
Q  119 acatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat- 217  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||     
T  20445847 acatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatg 20445946  T
Q  218 -caaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaac-cccttacctta 287  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20445947 caaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaactcccttacctta 20446019  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 37844646 - 37844374
Alignment:
Q  20 aacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttca-taacttctcatttctacatattta 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||||  |||  |||||||||||| ||  || |||||| | | || ||     
T  37844646 aacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctacttg 37844547  T
Q  118 aacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 217  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  37844546 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcatgaatttagcaacaattatccattat 37844447  T
Q  218 --caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 287  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  37844446 gcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 37844374  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 275
Target Start/End: Original strand, 20531512 - 20531770
Alignment:
Q  20 aacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  ||||||||||||  |||| |||||| | | || || |    
T  20531512 aacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttga 20531611  T
Q  119 acatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat- 217  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||     
T  20531612 acatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacatttggagcacgaatttagcaacaattatccattatg 20531711  T
Q  218 -caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa 275  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20531712 caaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatgataaagactaa 20531770  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 20893821 - 20893551
Alignment:
Q  20 aacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |    
T  20893821 aacatcaattgaacaagaatcataaatcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttga 20893722  T
Q  119 acatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat- 217  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||     
T  20893721 acatgtaatttcaacaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcaagaatttagcaacaattatccattatg 20893622  T
Q  218 -caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 287  Q
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  20893621 caaaaattcatacaacatttgaaaatt-acaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 20893551  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 82 - 202
Target Start/End: Original strand, 2116386 - 2116506
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Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  2116386 gcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcac 2116485  T
Q  182 agttggagcacgaatttagca 202  Q
    |||   ||||||||| |||||    
T  2116486 agtaaaagcacgaatctagca 2116506  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 82 - 202
Target Start/End: Original strand, 45051554 - 45051674
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||     
T  45051554 gcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcac 45051653  T
Q  182 agttggagcacgaatttagca 202  Q
    |||  || ||||||| |||||    
T  45051654 agtaagaacacgaatctagca 45051674  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 83 - 203
Target Start/End: Original strand, 22227941 - 22228061
Alignment:
Q  83 cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa 182  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||| |  || ||| ||||| |    
T  22227941 cacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcaca 22228040  T
Q  183 gttggagcacgaatttagcaa 203  Q
    |   |||||||||||||||||    
T  22228041 gcaagagcacgaatttagcaa 22228061  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 83 - 203
Target Start/End: Original strand, 22232638 - 22232758
Alignment:
Q  83 cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa 182  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||| |  || ||| ||||| |    
T  22232638 cacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcaca 22232737  T
Q  183 gttggagcacgaatttagcaa 203  Q
    |   |||||||||||||||||    
T  22232738 gcaagagcacgaatttagcaa 22232758  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 330
Target Start/End: Original strand, 21860334 - 21860409
Alignment:
Q  256 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  21860334 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 21860409  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 44034903 - 44034829
Alignment:
Q  256 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctat 329  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  44034903 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 44034829  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 5072508 - 5072388
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  5072508 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatataaacataacatcac 5072409  T
Q  182 agttggagcacgaatttagca 202  Q
    ||   ||||||||||||||||    
T  5072408 agcaagagcacgaatttagca 5072388  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18601238 - 18601118
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  18601238 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcac 18601139  T
Q  182 agttggagcacgaatttagca 202  Q
    ||   ||||| ||||||||||    
T  18601138 agcaagagcatgaatttagca 18601118  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 330
Target Start/End: Original strand, 41218749 - 41218803
Alignment:
Q  276 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  41218749 ccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatg 41218803  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 276 - 328
Target Start/End: Original strand, 27675139 - 27675191
Alignment:
Q  276 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 328  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  27675139 ccccttaccttaattatctccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 27675191  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 328
Target Start/End: Original strand, 20177513 - 20177570
Alignment:
Q  272 ctaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 328  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  20177513 ctaaccccattaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 20177570  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22143402 - 22143361
Alignment:
Q  157 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 198  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  22143402 ttcatgcatacaaacacatcatcatagttagagcacgaattt 22143361  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 13376763 - 13376711
Alignment:
Q  276 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 328  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||| | | |||||||||||||||||    
T  13376763 ccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaaacttcactttagctccta 13376711  T

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Target: scaffold0078 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37279 - 37066
Alignment:
Q  1 aacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37279 aacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatccaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttt 37180  T
Q  101 tcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttag 200  Q
    ||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37179 tcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttag 37080  T
Q  201 caacaatcatccat 214  Q
    ||||||| ||||||    
T  37079 caacaattatccat 37066  T

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Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 330
Target Start/End: Original strand, 41632 - 41707
Alignment:
Q  256 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    |||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  41632 atgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 41707  T

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Target: chr7 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 30)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 7293066 - 7293279
Alignment:
Q  1 aacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7293066 aacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttt 7293165  T
Q  101 tcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttag 200  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293166 tcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattattaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttag 7293265  T
Q  201 caacaatcatccat 214  Q
    ||||||| ||||||    
T  7293266 caacaattatccat 7293279  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 328
Target Start/End: Original strand, 3060034 - 3060344
Alignment:
Q  20 aacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| ||||||  ||| |||||||| || || |||||| |||||||||     
T  3060034 aacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttaacaaaattca-ccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatatttg 3060132  T
Q  118 aacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 217  Q
    |||||| ||||| ||||||| |  |||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  3060133 aacatgtaatttcaccaacagtattacaattatcatcaattaatgcatacaaatatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 3060232  T
Q  218 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagac-taaccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttca 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3060233 caaaattcatataacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagacttacccccttaccttcattatctccaactattagctctagcttca 3060332  T
Q  317 ctttagctccta 328  Q
    |||| |||||||    
T  3060333 cttttgctccta 3060344  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Original strand, 11516324 - 11516490
Alignment:
Q  48 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacact 147  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  11516324 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 11516423  T
Q  148 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11516424 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 11516490  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15441730 - 15441564
Alignment:
Q  48 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacact 147  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  15441730 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 15441631  T
Q  148 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15441630 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 15441564  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30262295 - 30262129
Alignment:
Q  48 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacact 147  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  30262295 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 30262196  T
Q  148 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30262195 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 30262129  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 82 - 287
Target Start/End: Original strand, 16211897 - 16212103
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| || ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  16211897 gcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcac 16211996  T
Q  182 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-cccct 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  16211997 agttggagcacgaatttagcaacaattgtccataagcaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaaccccct 16212096  T
Q  281 tacctta 287  Q
    |||||||    
T  16212097 tacctta 16212103  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 13037209 - 13036938
Alignment:
Q  20 aacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |    
T  13037209 aacattaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttga 13037110  T
Q  119 acatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat- 217  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||     
T  13037109 acatgcaatttcatcaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatg 13037010  T
Q  218 -caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 287  Q
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  13037009 caaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatggtgaagactaacccccttacctta 13036938  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11580934 - 11580661
Alignment:
Q  20 aacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |    
T  11580934 aacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttga 11580835  T
Q  119 acatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat- 217  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||     
T  11580834 acatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccattatg 11580735  T
Q  218 --caaaattcatacaacatttgaaaattcac-aaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 287  Q
       ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  11580734 caaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaatgatgatgattatgataaagactaatccccttacctta 11580661  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 82 - 287
Target Start/End: Original strand, 36052795 - 36053003
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  36052795 gcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaattttaccaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcac 36052894  T
Q  182 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccc 278  Q
    |||||||| |  |||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  36052895 agttggagtataaatttagcaacaattatccattatacaaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccc 36052994  T
Q  279 cttacctta 287  Q
    |||||||||    
T  36052995 cttacctta 36053003  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 47481226 - 47481031
Alignment:
Q  20 aacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||   ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |    
T  47481226 aacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttga 47481127  T
Q  119 acatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47481126 acatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 47481031  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18254049 - 18253842
Alignment:
Q  1 aacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataactt 99  Q
    |||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||    
T  18254049 aacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaactt 18253950  T
Q  100 ctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta 199  Q
     |||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18253949 atcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaattta 18253850  T
Q  200 gcaacaat 207  Q
    | ||||||    
T  18253849 gtaacaat 18253842  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25292470 - 25292338
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    ||||||| |||||| ||| || ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  25292470 gcacaatattcatagcttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatacatacaaacatatcatcaa 25292371  T
Q  182 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25292370 agttggagcacaaatttagcaacaattatccat 25292338  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 13321063 - 13321278
Alignment:
Q  1 aacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaacta-caacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataact 98  Q
    |||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| | |||| |  |||| |||| | |||  ||||||||| |||||||    
T  13321063 aacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaatcaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattt-cataact 13321161  T
Q  99 tctcatttctacatattt--aaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaat 196  Q
    |  ||||| |||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  13321162 tgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaat 13321261  T
Q  197 ttagcaacaatcatcca 213  Q
    ||||||||||| |||||    
T  13321262 ttagcaacaattatcca 13321278  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 82 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 16479082 - 16478968
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||      
T  16479082 gcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcgc 16478983  T
Q  182 agttggagcacgaat 196  Q
    |||  ||||||||||    
T  16478982 agtaagagcacgaat 16478968  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 82 - 198
Target Start/End: Original strand, 13572808 - 13572924
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  13572808 gcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcac 13572907  T
Q  182 agttggagcacgaattt 198  Q
    ||   ||||||||||||    
T  13572908 agcaagagcacgaattt 13572924  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 202
Target Start/End: Original strand, 10989541 - 10989661
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  10989541 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcac 10989640  T
Q  182 agttggagcacgaatttagca 202  Q
    ||   ||||||||||||||||    
T  10989641 agcaagagcacgaatttagca 10989661  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 296094 - 295900
Alignment:
Q  86 aattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagtt 185  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| || |||||| ||||| |||||||||||||   |||| ||| ||||||||| ||||||||| || |  | ||    
T  296094 aatttttataacttctcatttttacataattcaacatgaaatttcaccaacaatcataacattatcatcgattcatgcacacaaacataacacctcaatt 295995  T
Q  186 ggagcacgaatttagcaacaatcatccataat-caaaa-ttcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccc 279  Q
     || |||||||||||||||||| || ||| || ||||| |||||||||  ||||||||| || ||||||||||  |||||| | ||||| ||||||    
T  295994 agaacacgaatttagcaacaattattcattatgcaaaatttcatacaaagtttgaaaatgca-aaaatgatgagaattatgttgaagacaaacccc 295900  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 32493978 - 32493903
Alignment:
Q  256 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  32493978 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 32493903  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 203
Target Start/End: Original strand, 2437590 - 2437710
Alignment:
Q  83 cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa 182  Q
    |||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  2437590 cacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcaca 2437689  T
Q  183 gttggagcacgaatttagcaa 203  Q
        |||||||||||||||||    
T  2437690 acaagagcacgaatttagcaa 2437710  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 13911136 - 13911024
Alignment:
Q  90 ttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggag 189  Q
    |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |    |||    
T  13911136 ttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagag 13911037  T
Q  190 cacgaatttagca 202  Q
    |||||||||||||    
T  13911036 cacgaatttagca 13911024  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 330
Target Start/End: Original strand, 126738 - 126813
Alignment:
Q  256 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  126738 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcatttttgctcctatg 126813  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 1936949 - 1936874
Alignment:
Q  256 atgattatggtaaagactaacc-ccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||    
T  1936949 atgattatgataaaaactaacctccttaccttaattatctccaactattaactctagcttcacttttgcttctatg 1936874  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14114031 - 14113989
Alignment:
Q  172 atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14114031 atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14113989  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14423681 - 14423639
Alignment:
Q  172 atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14423681 atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14423639  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 111201 - 111126
Alignment:
Q  256 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  111201 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaacttttagctcaagcttcacttttgctcctatg 111126  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 328
Target Start/End: Original strand, 13377872 - 13377924
Alignment:
Q  276 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 328  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  13377872 ccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 13377924  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 328
Target Start/End: Original strand, 13389698 - 13389750
Alignment:
Q  276 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 328  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  13389698 ccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 13389750  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 7283967 - 7283913
Alignment:
Q  276 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    |||||||||||||||||| |||| || || ||| ||||||||||| |||||||||    
T  7283967 ccccttaccttaattatcaccaattattaactcaagcttcacttttgctcctatg 7283913  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16915009 - 16914928
Alignment:
Q  118 aacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 198  Q
    |||||| ||||| ||||||||  || || |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  16915009 aacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 16914928  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 328
Target Start/End: Original strand, 16919874 - 16919926
Alignment:
Q  276 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 328  Q
    ||||||| |||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  16919874 ccccttatcttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 16919926  T

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Target: chr2 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 21)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 82 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 20627445 - 20627195
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    |||||||||||| || || |||||| |||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  20627445 gcacaattttcacaagttatcatttttacatatttggacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcgtgcatacaaacatatcatcac 20627346  T
Q  182 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccc- 279  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  20627345 agttggagcacgaatttaacaacaattatccataatcataattcatacaatatttgaaaattttacaaaatgatgatgattatgataaagactaaccccg 20627246  T
Q  280 ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  20627245 ttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 20627195  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 19794899 - 19794586
Alignment:
Q  20 aacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |    
T  19794899 aacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttga 19794800  T
Q  119 acatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat- 217  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||     
T  19794799 acatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacgacaattatccattatg 19794700  T
Q  218 -caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttc 315  Q
      ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19794699 caaaaattcatacaacatttg-aaatttacaaaataatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttc 19794601  T
Q  316 actttagctcctatg 330  Q
    ||||| |||| ||||    
T  19794600 acttttgctcttatg 19794586  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 43643171 - 43642838
Alignment:
Q  1 aacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac-atgtcaaattcatccattttgcacaattttcataactt 99  Q
    |||||| |||| || ||| | ||||||||| |||||||||||| ||||| | ||  ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||    
T  43643171 aacatcaattaacagcaatagcatcaattgaacaagaatcatatctcaaattaataacaactaagaaaaattcaccaattgagcacaattttcacaactt 43643072  T
Q  100 ctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta 199  Q
      ||||| | | ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  43643071 aacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacaaattta 43642972  T
Q  200 gcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacc-ccttaccttaattatctcc 296  Q
    |||||||| |||||  ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  43642971 gcaacaattatccactatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacctccttcccttaattatctcc 43642872  T
Q  297 aactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  43642871 aactattagctctagcttcacttttgctcctatg 43642838  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 287
Target Start/End: Original strand, 462806 - 463075
Alignment:
Q  20 aacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||   ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |    
T  462806 aacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttga 462905  T
Q  119 acatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc 218  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  462906 acatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagc 463005  T
Q  219 aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  463006 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 463075  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19689567 - 19689401
Alignment:
Q  48 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacact 147  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  19689567 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 19689468  T
Q  148 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19689467 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 19689401  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Original strand, 23820168 - 23820334
Alignment:
Q  48 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacact 147  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  23820168 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 23820267  T
Q  148 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23820268 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 23820334  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14906606 - 14906440
Alignment:
Q  48 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacact 147  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  14906606 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 14906507  T
Q  148 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14906506 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14906440  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 36982655 - 36982364
Alignment:
Q  1 aacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataactt 99  Q
    |||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||    
T  36982655 aacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaactt 36982556  T
Q  100 ctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta 199  Q
     |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36982555 atcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccagcaatcttacaattatcatcaattcatgaatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattta 36982456  T
Q  200 gcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcac-aaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 287  Q
    |||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  36982455 gcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 36982364  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Original strand, 20015108 - 20015274
Alignment:
Q  48 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacact 147  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  20015108 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaat 20015207  T
Q  148 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20015208 tattatcaattcatgcatgcaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20015274  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 281
Target Start/End: Original strand, 8891310 - 8891574
Alignment:
Q  20 aacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |    
T  8891310 aacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttga 8891409  T
Q  119 acatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat- 217  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||     
T  8891410 acatgtaatttcgccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatg 8891509  T
Q  218 -caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccctt 281  Q
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8891510 caaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccctt 8891574  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24341603 - 24341309
Alignment:
Q  1 aacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataactt 99  Q
    |||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||    
T  24341603 aacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaactt 24341504  T
Q  100 ctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta 199  Q
    | ||||| |||||| || |||||  ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  24341503 cacatttttacataattgaacatataatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcatgaattta 24341404  T
Q  200 gcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaa----atgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 287  Q
    |||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| |  ||||    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  24341403 gcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 24341309  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25265522 - 25265390
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25265522 gcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaa 25265423  T
Q  182 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25265422 agttagagcacgaatttagcaacaattatccat 25265390  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 82 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17396784 - 17396653
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  17396784 gcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaa 17396686  T
Q  182 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17396685 agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17396653  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 192 - 287
Target Start/End: Original strand, 22863169 - 22863267
Alignment:
Q  192 cgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 287  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22863169 cgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacaattgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 22863267  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 330
Target Start/End: Original strand, 22275045 - 22275120
Alignment:
Q  256 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22275045 atgattatgataaaggctaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 22275120  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 330
Target Start/End: Original strand, 22284278 - 22284353
Alignment:
Q  256 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  22284278 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg 22284353  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 257 - 330
Target Start/End: Original strand, 15633538 - 15633612
Alignment:
Q  257 tgattatggtaaagactaacc-ccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  15633538 tgattatgataaagactaacctccttaccttaattatctccaactattaactctagcttcacttttgctcctatg 15633612  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 7507975 - 7507894
Alignment:
Q  83 cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 164  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7507975 cacaattttcataacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 7507894  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19886781 - 19886661
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    ||||||| |||||||||| ||| || | ||||| | |||||| ||||| ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  19886781 gcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcac 19886682  T
Q  182 agttggagcacgaatttagca 202  Q
    ||   ||||||||||||||||    
T  19886681 agcaagagcacgaatttagca 19886661  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 328
Target Start/End: Original strand, 19660217 - 19660273
Alignment:
Q  272 ctaaccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 328  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  19660217 ctaaccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 19660273  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 328
Target Start/End: Original strand, 43646237 - 43646289
Alignment:
Q  276 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 328  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  43646237 ccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 43646289  T

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Target: scaffold0266 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 287
Target Start/End: Original strand, 1192 - 1462
Alignment:
Q  20 aacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 118  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |    
T  1192 aacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttga 1291  T
Q  119 acatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc 218  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  1292 acatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatactaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccataaga 1391  T
Q  219 aaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  1392 aaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 1462  T

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Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3796 - 3508
Alignment:
Q  1 aacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataactt 99  Q
    |||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| || | | |||  |||||||||||| |||||    
T  3796 aacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaactt 3697  T
Q  100 ctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta 199  Q
     |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3696 atcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattta 3597  T
Q  200 gcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 287  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  3596 gcaacaattatctataatcaaaattcatacaacttttgaaaatttacaaaatgaagatgattatgacaaagactaacccccttacctta 3508  T

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Target: scaffold0023 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 82 - 287
Target Start/End: Original strand, 48729 - 48935
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  48729 gcacaattttcacaacttatcattttttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcac 48828  T
Q  182 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-cccct 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  48829 agttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaaccccct 48928  T
Q  281 tacctta 287  Q
    |||||||    
T  48929 tacctta 48935  T

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Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 180
Target Start/End: Original strand, 36210 - 36323
Alignment:
Q  67 aaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcata 166  Q
    ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | || ||| ||||| |||||||||||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  36210 aaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatacata 36309  T
Q  167 caaacatatcatca 180  Q
    |||||||| |||||    
T  36310 caaacataacatca 36323  T

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Target: chr5 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 26)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Original strand, 20623066 - 20623232
Alignment:
Q  48 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacact 147  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  20623066 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 20623165  T
Q  148 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20623166 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20623232  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21233694 - 21233528
Alignment:
Q  48 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacact 147  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  21233694 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 21233595  T
Q  148 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21233594 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21233528  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 51 - 214
Target Start/End: Original strand, 37052844 - 37053007
Alignment:
Q  51 tcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttat 150  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  37052844 tcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattat 37052943  T
Q  151 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37052944 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 37053007  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Original strand, 16536294 - 16536460
Alignment:
Q  48 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacact 147  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  16536294 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 16536393  T
Q  148 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16536394 tattataaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16536460  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 287
Target Start/End: Original strand, 23507033 - 23507302
Alignment:
Q  20 aacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 118  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |    
T  23507033 aacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttga 23507132  T
Q  119 acatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc 218  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  23507133 acatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattatccataagc 23507232  T
Q  219 aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23507233 aaaattcatacaacatttgaaatcttacaaaatggagatgattatgataaagactaacccccttacctta 23507302  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25900571 - 25900408
Alignment:
Q  48 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacact 147  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |    
T  25900571 aattcaacaacaacatgtcaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaat 25900473  T
Q  148 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcc 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25900472 tatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatcc 25900408  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27182742 - 27182471
Alignment:
Q  20 aacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |    
T  27182742 aacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttga 27182643  T
Q  119 acatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat- 217  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||     
T  27182642 acatgtaatttcatcaacaatcatacaattatcatcagttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcatgaatttagcaacaattatccattatg 27182543  T
Q  218 -caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 287  Q
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  27182542 caaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 27182471  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18531281 - 18530988
Alignment:
Q  1 aacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataactt 99  Q
    |||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||   ||||||||||| |||||    
T  18531281 aacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaactt 18531182  T
Q  100 ctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta 199  Q
    | ||||| |||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18531181 cacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattta 18531082  T
Q  200 gcaacaatcatcc-ataatcaaa-attcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgat---gattatggtaaagactaa-ccccttacctta 287  Q
    |||||||| |||| || || ||| |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||   ||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  18531081 gcaacaattatccaattatgaaacattcataccacatttgaaaaattgcaaaatgatgatgacgattatgatgaagactaacccccttacctta 18530988  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22054047 - 22053753
Alignment:
Q  1 aacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataactt 99  Q
    |||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||    
T  22054047 aacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaactt 22053948  T
Q  100 ctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta 199  Q
    | ||||| |||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22053947 cacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactatcatcaattcatacatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattta 22053848  T
Q  200 gcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaa--ttcacaaa--atgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 287  Q
    |||||||| |||||  ||   ||||||||||| |||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  22053847 gcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaatttcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 22053753  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 214
Target Start/End: Original strand, 34939408 - 34939540
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||  |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  34939408 gcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcac 34939507  T
Q  182 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  34939508 agttagagcacgaatttagcaacagttatccat 34939540  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 29188404 - 29188284
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  29188404 gcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcac 29188305  T
Q  182 agttggagcacgaatttagca 202  Q
    |||  |||||||||| |||||    
T  29188304 agtaagagcacgaatctagca 29188284  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 84 - 198
Target Start/End: Original strand, 27009975 - 27010089
Alignment:
Q  84 acaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaag 183  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27009975 acaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacactcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacag 27010074  T
Q  184 ttggagcacgaattt 198  Q
       ||||||||||||    
T  27010075 caagagcacgaattt 27010089  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 4200169 - 4199985
Alignment:
Q  20 aacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 117  Q
    ||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||  |  ||||||| | |||| ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| |     
T  4200169 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacataagagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatg 4200070  T
Q  118 aacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 202  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |    ||||||||||||||||    
T  4200069 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagca 4199985  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22366616 - 22366481
Alignment:
Q  67 aaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcata 166  Q
    ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||| |||||  ||  |||||||||||||||    
T  22366616 aaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 22366517  T
Q  167 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 202  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  22366516 caaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 22366481  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 43443515 - 43443398
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  43443515 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcac 43443416  T
Q  182 agttggagcacgaattta 199  Q
    ||   |||||||||||||    
T  43443415 agcaagagcacgaattta 43443398  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18778127 - 18777995
Alignment:
Q  67 aaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcata 166  Q
    ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||| |||||  ||  |||||||||||||||    
T  18778127 aaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 18778028  T
Q  167 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattta 199  Q
    |||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  18778027 caaacataacatcacagcaagagcacgaattta 18777995  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 202
Target Start/End: Original strand, 19500031 - 19500151
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  19500031 gcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcac 19500130  T
Q  182 agttggagcacgaatttagca 202  Q
    ||   ||||||||||||||||    
T  19500131 agcaagagcacgaatttagca 19500151  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 202
Target Start/End: Original strand, 25426760 - 25426880
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  25426760 gcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcac 25426859  T
Q  182 agttggagcacgaatttagca 202  Q
    ||   ||||||||||||||||    
T  25426860 agcaagagcacgaatttagca 25426880  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 202
Target Start/End: Original strand, 12506 - 12626
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    ||||||| |||||||||| ||| || | ||||| | |||||| ||||| ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  12506 gcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcac 12605  T
Q  182 agttggagcacgaatttagca 202  Q
    ||   ||||||||||||||||    
T  12606 agcaagagcacgaatttagca 12626  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 21073715 - 21073595
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||| |||||  ||  ||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  21073715 gcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatccattcatgcatacaaacataacatcac 21073616  T
Q  182 agttggagcacgaatttagca 202  Q
    ||   ||||||||||||||||    
T  21073615 agcaagagcacgaatttagca 21073595  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 330
Target Start/End: Original strand, 11584394 - 11584448
Alignment:
Q  276 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||    
T  11584394 ccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatg 11584448  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 207
Target Start/End: Original strand, 32950861 - 32950951
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Q  117 aaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 207  Q
    ||||||| ||||| | | ||||||||||| |||| ||||| |||| || || || ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  32950861 aaacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcatcaaatcatacacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat 32950951  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21310750 - 21310709
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Q  157 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 198  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  21310750 ttcatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 21310709  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 23981557 - 23981516
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Q  157 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  23981557 ttcatgcatacaaacatatcatcataattagagcacgaattt 23981516  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 198
Target Start/End: Original strand, 29918131 - 29918212
Alignment:
Q  118 aacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 198  Q
    |||||| ||||| ||||||||  || || |||| ||||||| |||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  29918131 aacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtattcaaacatatcatcataattggagcacgaattt 29918212  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21222514 - 21222462
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Q  276 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 328  Q
    |||| ||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  21222514 ccccataccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 21222462  T

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Target: scaffold0001 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 287
Target Start/End: Original strand, 171973 - 172242
Alignment:
Q  20 aacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 118  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |    
T  171973 aacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttga 172072  T
Q  119 acatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc 218  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  172073 acatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccataatc 172172  T
Q  219 aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  172173 aaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 172242  T

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Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 287
Target Start/End: Original strand, 177676 - 177945
Alignment:
Q  20 aacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 118  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |    
T  177676 aacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttga 177775  T
Q  119 acatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc 218  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  177776 acatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccataatc 177875  T
Q  219 aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  177876 aaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 177945  T

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Target: scaffold0141 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Original strand, 26892 - 27058
Alignment:
Q  48 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacact 147  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  26892 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 26991  T
Q  148 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26992 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 27058  T

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Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 48 - 207
Target Start/End: Original strand, 22637 - 22796
Alignment:
Q  48 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacact 147  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  22637 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 22736  T
Q  148 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22737 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 22796  T

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Target: scaffold0124 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1748 - 1582
Alignment:
Q  48 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacact 147  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  1748 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 1649  T
Q  148 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1648 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 1582  T

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Target: scaffold0077 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 37104 - 36836
Alignment:
Q  24 tcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacat 122  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||| |||| ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  37104 tcaattgaacaagattcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacat 37005  T
Q  123 ggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caa 220  Q
    | ||||| |||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||   ||    
T  37004 gtaatttcaccaacaagcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccattatgcaaa 36905  T
Q  221 aattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttaccttaa 288  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  36904 aattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaa 36836  T

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Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15378 - 15324
Alignment:
Q  276 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||    
T  15378 ccccttaccttaattatctccaactattagcccaagcttcacttttgctcctatg 15324  T

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Target: scaffold0018 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 82 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 51314 - 51121
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  51314 gcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcac 51215  T
Q  182 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51214 agttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaa 51121  T

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Target: scaffold0195 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 19255 - 19537
Alignment:
Q  1 aacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataactt 99  Q
    |||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||    
T  19255 aacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaactt 19354  T
Q  100 ctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta 199  Q
     |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19355 atcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattta 19454  T
Q  200 gcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcac-aaaatgatgatgattatggtaaagactaacccc 279  Q
    |||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  19455 gcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaattatgatgattatgatgaagactaacccc 19537  T

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Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 21339 - 21553
Alignment:
Q  1 aacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataactt 99  Q
    |||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||    
T  21339 aacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaactt 21438  T
Q  100 ctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta 199  Q
     |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21439 atcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattta 21538  T
Q  200 gcaacaatcatccat 214  Q
    |||||||| ||||||    
T  21539 gcaacaattatccat 21553  T

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Target: scaffold0106 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 287
Target Start/End: Original strand, 41799 - 42066
Alignment:
Q  22 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 120  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| || || |||||| ||||||||| | |    
T  41799 catcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcatttttacatatttgagc 41898  T
Q  121 atggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaa 220  Q
    ||| ||||| |||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  41899 atgtaatttcaccaacaatatgacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaa 41998  T
Q  221 aattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  41999 aattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagaccaacccccttacctta 42066  T

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Target: scaffold0175 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 67 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1103 - 882
Alignment:
Q  67 aaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcata 166  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  1103 aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcata 1004  T
Q  167 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggt 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||   ||| ||| |||||||||| |    
T  1003 caaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatttgtaaagtgaagatgattatgat 904  T
Q  267 aaagactaa-ccccttacctta 287  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  903 aaagactaacccccttacctta 882  T

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Target: chr6 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 21)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 23153518 - 23153786
Alignment:
Q  23 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 121  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| ||||    
T  23153518 atcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaaca 23153617  T
Q  122 tggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--ca 219  Q
    || ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||   |    
T  23153618 tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagaaacaattatccattatgcaa 23153717  T
Q  220 aaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  23153718 aaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 23153786  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 83 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14626249 - 14626089
Alignment:
Q  83 cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa 182  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  14626249 cacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaca 14626150  T
Q  183 gttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 243  Q
    |   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  14626149 gcaagagcacgaatttagcaataattatccataatcacaattcaaacaacatttgagaatt 14626089  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1657961 - 1657748
Alignment:
Q  1 aacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattc-atccattttgcacaattttcataactt 99  Q
    |||||| |||| || ||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||| | | ||| |  |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  1657961 aacatcaattaacaacaataacatcaactgaacaagaatcataactcaattca-caataacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataactt 1657863  T
Q  100 ctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta 199  Q
    | ||||| |||||| || ||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  1657862 cacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatccaaacataacatcacagttagagcacgaattta 1657763  T
Q  200 gcaacaatcatccat 214  Q
    |||||||| ||||||    
T  1657762 gcaacaattatccat 1657748  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 214
Target Start/End: Original strand, 15862602 - 15862734
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||  |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  15862602 gcacaattttcataacttcacatttatacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcac 15862701  T
Q  182 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15862702 agttagagcacgaatttagtaacaattatccat 15862734  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 35009571 - 35009439
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||     
T  35009571 gcacaattttcaaaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacttaacatcac 35009472  T
Q  182 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35009471 agttagagcacgaatttagcaacaattatccat 35009439  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 82 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1650225 - 1650105
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||     
T  1650225 gcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcac 1650126  T
Q  182 agttggagcacgaatttagca 202  Q
    |||  |||||||||| |||||    
T  1650125 agtaagagcacgaatctagca 1650105  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 19983224 - 19983149
Alignment:
Q  256 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  19983224 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 19983149  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 35015089 - 35015014
Alignment:
Q  256 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  35015089 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 35015014  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 219 - 287
Target Start/End: Original strand, 23148266 - 23148335
Alignment:
Q  219 aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  23148266 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 23148335  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 202
Target Start/End: Original strand, 25175680 - 25175815
Alignment:
Q  67 aaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcata 166  Q
    ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||| |||||  ||  |||||||||||||||    
T  25175680 aaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 25175779  T
Q  167 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 202  Q
    |||||||| || || ||   ||||||||||||||||    
T  25175780 caaacataacaacacagcaagagcacgaatttagca 25175815  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27654118 - 27653983
Alignment:
Q  67 aaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcata 166  Q
    ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||| |||||  ||  |||||||||||||||    
T  27654118 aaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 27654019  T
Q  167 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 202  Q
    ||| |||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  27654018 caagcataacatcacagcaagagcacgaatttagca 27653983  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 214
Target Start/End: Original strand, 27751605 - 27751688
Alignment:
Q  131 accaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  27751605 accaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataacatcacaattagagcacgaatttagctacatttatccat 27751688  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 29665937 - 29666137
Alignment:
Q  16 caacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatat 114  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| ||||| |  |||| |||| | |||  | ||||||| ||||||||  ||||| | ||||     
T  29665937 caacaacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagtacaattt-cataacttgacatttatgcatac 29666035  T
Q  115 tt--aaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcc 212  Q
    ||  ||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||  || ||| ||||| || | ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  29666036 tttgaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatcc 29666135  T
Q  213 at 214  Q
    ||    
T  29666136 at 29666137  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16825879 - 16825752
Alignment:
Q  77 attttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatca--tacacttattatcaattcatgcatacaaacata 174  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||| |  ||||  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  16825879 atttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattaattacaactaacatcaattcatgcatacaaacata 16825780  T
Q  175 tcatcaaagttggagcacgaatttagca 202  Q
     ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  16825779 acatcacagcaagagcacgaatttagca 16825752  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 330
Target Start/End: Original strand, 18583640 - 18583715
Alignment:
Q  256 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||    
T  18583640 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatg 18583715  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 328
Target Start/End: Original strand, 21623511 - 21623563
Alignment:
Q  276 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 328  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  21623511 ccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 21623563  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16887833 - 16887792
Alignment:
Q  157 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  16887833 ttcatgcatacaaacatattatcatagttagagcacgaattt 16887792  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18629689 - 18629608
Alignment:
Q  118 aacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 198  Q
    |||||| ||||| ||||||||  || || |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  18629689 aacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 18629608  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 198
Target Start/End: Original strand, 33324898 - 33324939
Alignment:
Q  157 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  33324898 ttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattt 33324939  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 35136054 - 35136013
Alignment:
Q  157 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  35136054 ttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattt 35136013  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22361671 - 22361619
Alignment:
Q  276 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 328  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||  | |||||||||||||||||||    
T  22361671 ccccttaccttaattatcaccaattcctaggccaagcttcactttagctccta 22361619  T

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Target: scaffold0302 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 287
Target Start/End: Original strand, 12183 - 12450
Alignment:
Q  20 aacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 118  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||||  || ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||    
T  12183 aacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt--acaacaacttaacaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttaa 12280  T
Q  119 acatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc 218  Q
    ||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12281 acatgtattttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccataatc 12380  T
Q  219 aaaa-ttcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 287  Q
    |||| |||||||| ||||||||| || ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  12381 aaaatttcatacagcatttgaaagtt-acaaaattaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 12450  T

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Target: scaffold0413 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 82 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 6196 - 5990
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    |||||||||| | ||||| | |||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  6196 gcacaatttttacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcac 6097  T
Q  182 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-cccct 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||    
T  6096 agttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatttgcaaagtgaaaatgattatgataaagactaaccccct 5997  T
Q  281 tacctta 287  Q
    |||||||    
T  5996 tacctta 5990  T

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Target: scaffold0012 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 247637 - 247366
Alignment:
Q  20 aacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| || | | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |    
T  247637 aacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttga 247538  T
Q  119 acatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat- 217  Q
    ||||| ||||| |||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||     
T  247537 acatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatg 247438  T
Q  218 -caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 287  Q
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  247437 caaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 247366  T

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Target: scaffold0162 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26610 - 26340
Alignment:
Q  20 aacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| |  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  | |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |    
T  26610 aacatcaattgaacaagaatcataactcattctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttga 26511  T
Q  119 acatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat- 217  Q
    ||||| | ||| ||||| |||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||     
T  26510 acatgtactttcaccaataatcttacaattatcatcaattcacgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatacattatg 26411  T
Q  218 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  26410 aaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatcatgattatgataaagactaacccccttacctta 26340  T

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Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 82 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8312 - 8180
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||| || ||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||     
T  8312 gcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgtaatttcaccaacaatcatacaattatcaccaattcatgcatacaaacataacatcac 8213  T
Q  182 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8212 agttagagcacgaatttagcaacaattatccat 8180  T

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Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 6929 - 6877
Alignment:
Q  276 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 328  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||| ||||||    
T  6929 ccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttaactccta 6877  T

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Target: scaffold0009 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 287
Target Start/End: Original strand, 272093 - 272362
Alignment:
Q  20 aacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 118  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |    
T  272093 aacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttga 272192  T
Q  119 acatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc 218  Q
    ||||| |||||  ||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||| | | ||||||||||    
T  272193 acatgtaatttctccatcaatcatacaattatcatcaattcattcatacaaacatatcattacagttggagtacgtatttagcaatatttatccataatc 272292  T
Q  219 aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 287  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  272293 aaaatttatacaatatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 272362  T

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Target: scaffold0218 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 5256 - 4996
Alignment:
Q  20 aacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| |  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |    
T  5256 aacatcaattgaacaagaatcataactcattctaacaacaactttgcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttga 5157  T
Q  119 acatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat- 217  Q
    ||||| | ||| |||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||     
T  5156 acatgtactttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcacgcatacaaacatatcgtcacagttggagtacgaatttagcaacaattatccattatg 5057  T
Q  218 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaaccc 278  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5056 aaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgataatgattatgataaagactaaccc 4996  T

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Target: scaffold0008 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 128382 - 128095
Alignment:
Q  1 aacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataactt 99  Q
    |||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||| ||||| |  |||| |||  | |||  |||||||||||| |||||    
T  128382 aacatccattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaacaacctaacaaaattcgccaattgagcacaattttcacaactt 128284  T
Q  100 ctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta 199  Q
      ||  | |||| |||| |||||| ||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  128283 aacacctttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcacgaattta 128184  T
Q  200 gcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 287  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  128183 gcaacaattatccataagcaaaattcatacaacttttgaaaatttgcaaaatgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 128095  T

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Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 31787 - 31697
Alignment:
Q  90 ttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 180  Q
    |||||||||| |||||| | ||||| | || ||| ||||| |||||||||||||||  ||  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  31787 ttcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcattcaaacataacatca 31697  T

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Target: scaffold0011 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 123359 - 123087
Alignment:
Q  20 aacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |    
T  123359 aacatcaattgaacaagaatcataacttaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttga 123260  T
Q  119 acatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat- 217  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||     
T  123259 acatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatg 123160  T
Q  218 -caaaattcatacaacatttgaaaattcac-aaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 287  Q
      ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  123159 caaaaattcatacaacatttgcaaatttacaaaaattatgatgattatggtgaagactaacccccttacctta 123087  T

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Target: scaffold0028 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 82 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 89586 - 89378
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    |||||||||||| ||||| | |||| | | ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  89586 gcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcac 89487  T
Q  182 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccc 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||    
T  89486 agttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatagaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatcatgatgaagactaacccc 89387  T
Q  279 cttacctta 287  Q
    |||||||||    
T  89386 cttacctta 89378  T

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Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 163 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 107835 - 107708
Alignment:
Q  163 catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgat 260  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  107835 catacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaaaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 107736  T
Q  261 tatggtaaagactaa-ccccttacctta 287  Q
     ||| | |||||||| ||||||||||||    
T  107735 catgatgaagactaacccccttacctta 107708  T

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Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 198
Target Start/End: Original strand, 79745 - 79786
Alignment:
Q  157 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  79745 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagtgcacgaattt 79786  T

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Target: scaffold0498 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 8927 - 9215
Alignment:
Q  1 aacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataactt 99  Q
    |||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||    
T  8927 aacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaactt 9026  T
Q  100 ctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta 199  Q
      ||||| |||||| || |||||| ||||| |||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||    
T  9027 aacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcgattcatgcatacaaacataacatcacaaatggagcacgaattta 9126  T
Q  200 gcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 287  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  9127 gcaacaattttccataagcaaaattcgtacaacttttgaaaatttgcaaaatgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 9215  T

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Target: scaffold0025 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 276
Target Start/End: Original strand, 8917 - 9180
Alignment:
Q  20 aacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 118  Q
    ||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |    
T  8917 aacatcaattgaacattaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattga 9016  T
Q  119 acatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taa 216  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||  ||     
T  9017 acatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagatggagcacgaatttagcaacaattatccaattat 9116  T
Q  217 tcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaa----atgatgatgattatggtaaagactaac 276  Q
      ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||    ||||||||||||||| | |||||||||    
T  9117 gaaaaatacataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaac 9180  T

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Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 246
Target Start/End: Original strand, 148789 - 149018
Alignment:
Q  20 aacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 118  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |    
T  148789 aacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttga 148888  T
Q  119 acatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat- 217  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||| || ||     
T  148889 acatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttaacaacaattatcaattatg 148988  T
Q  218 -caaaattcatacaacatttgaaaattcac 246  Q
      |||||||||||||||||||||| |||||    
T  148989 caaaaattcatacaacatttgaaatttcac 149018  T

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Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 188 - 287
Target Start/End: Original strand, 146838 - 146938
Alignment:
Q  188 agcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctt 286  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  146838 agcatgaatttaggaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 146937  T
Q  287 a 287  Q
    |    
T  146938 a 146938  T

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Target: scaffold0132 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 214
Target Start/End: Original strand, 13622 - 13769
Alignment:
Q  67 aaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcata 166  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  13622 aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcata 13721  T
Q  167 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13722 caaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 13769  T

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Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 330
Target Start/End: Original strand, 42677 - 42749
Alignment:
Q  256 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  42677 atgattatgataaaaactaacccccttacctt---tatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 42749  T

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Target: scaffold0049 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 48236 - 48443
Alignment:
Q  1 aacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataactt 99  Q
    |||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||    
T  48236 aacatcaattaacatctataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaactt 48335  T
Q  100 ctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta 199  Q
     |||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  48336 atcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaattta 48435  T
Q  200 gcaacaat 207  Q
    ||||||||    
T  48436 gcaacaat 48443  T

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Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 330
Target Start/End: Original strand, 20513 - 20567
Alignment:
Q  276 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| ||| |||||||||    
T  20513 ccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcatttttgctcctatg 20567  T

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Target: scaffold0772 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 82 - 207
Target Start/End: Original strand, 5660 - 5785
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5660 gcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaa 5759  T
Q  182 agttggagcacgaatttagcaacaat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5760 agttggagcacgaatttagcaacaat 5785  T

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Target: scaffold0026 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 107796 - 108003
Alignment:
Q  1 aacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataactt 99  Q
    |||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | ||||| |||| | |||  |||||||||| | |||||    
T  107796 aacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaatttttacaactt 107895  T
Q  100 ctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta 199  Q
     |||||| | || |||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  107896 atcatttttgcacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaattta 107995  T
Q  200 gcaacaat 207  Q
    | ||||||    
T  107996 gtaacaat 108003  T

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Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 64648 - 64527
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatc-----aattcatgcatacaaacatatc 176  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||     |||||||||||| ||||||| |    
T  64648 gcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaatataattcatgcatataaacataac 64549  T
Q  177 atcaaagttggagcacgaattt 198  Q
    |||| ||   ||||||||||||    
T  64548 atcacagcaagagcacgaattt 64527  T

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Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 89905 - 89863
Alignment:
Q  157 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  89905 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 89863  T

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Target: scaffold1542 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 84 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 664 - 534
Alignment:
Q  84 acaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaag 183  Q
    |||||||||| ||||  |||||| | | ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  664 acaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacag 565  T
Q  184 ttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  564 ttggagcacgaatttagcaacaattatccat 534  T

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Target: scaffold0125 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 83 - 214
Target Start/End: Original strand, 41780 - 41911
Alignment:
Q  83 cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa 182  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  41780 cacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaca 41879  T
Q  183 gttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41880 gttagagcacgaatttaacaacaattatccat 41911  T

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Target: scaffold0075 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34639 - 34460
Alignment:
Q  36 gaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaacca 134  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  | |||||||||| ||||||  |||| |||| | || |||||| ||||| ||||    
T  34639 gaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattgaacatgtaatttcacca 34540  T
Q  135 acaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  34539 acaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaataattatccat 34460  T

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Target: scaffold0529 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 203
Target Start/End: Original strand, 3047 - 3215
Alignment:
Q  36 gaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaacca 134  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| ||||| ||||    
T  3047 gaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcacca 3146  T
Q  135 acaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaa 203  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||||||    
T  3147 acaatcatacaattatcatcaattcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa 3215  T

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Target: scaffold0420 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 82 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 13445 - 13325
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  13445 gcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcac 13346  T
Q  182 agttggagcacgaatttagca 202  Q
    | |  |||||||||| |||||    
T  13345 actaagagcacgaatctagca 13325  T

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Target: scaffold0116 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 82 - 198
Target Start/End: Original strand, 167 - 283
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  167 gcacaatatacataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcac 266  T
Q  182 agttggagcacgaattt 198  Q
    ||   ||||||||||||    
T  267 agcaagagcacgaattt 283  T

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Target: scaffold0215 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 82 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 9469 - 9371
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 180  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9469 gcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 9371  T

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Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 82 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 16367 - 16269
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 180  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16367 gcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 16269  T

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Target: scaffold0076 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 179
Target Start/End: Original strand, 43114 - 43226
Alignment:
Q  67 aaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcata 166  Q
    ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  43114 aaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcata 43213  T
Q  167 caaacatatcatc 179  Q
     ||||||| ||||    
T  43214 gaaacataacatc 43226  T

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Target: scaffold0022 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 5335 - 5254
Alignment:
Q  83 cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 164  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5335 cacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 5254  T

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Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 102963 - 102923
Alignment:
Q  157 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  102963 ttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaatt 102923  T

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Target: scaffold1711 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1424 - 1304
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 181  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  1424 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcac 1325  T
Q  182 agttggagcacgaatttagca 202  Q
    ||   ||||||||||||||||    
T  1324 agcaagagcacgaatttagca 1304  T

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Target: scaffold0034 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 330
Target Start/End: Original strand, 80187 - 80262
Alignment:
Q  256 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  80187 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatg 80262  T

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Target: scaffold0139 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 14181 - 14083
Alignment:
Q  82 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 180  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| || |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14181 gcacaatcttcataacttatcatttttacatatttcaacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacagacataacatca 14083  T

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Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21233 - 21115
Alignment:
Q  85 caattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagt 184  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| || |||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |      
T  21233 caatcttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattaatggatacaaacataacatcacaac 21134  T
Q  185 tggagcacgaatttagcaa 203  Q
      |||||||||||||||||    
T  21133 aagagcacgaatttagcaa 21115  T

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Target: scaffold0016 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 255 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 166197 - 166121
Alignment:
Q  255 gatgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    |||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  166197 gatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 166121  T

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Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 255 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 162111 - 162036
Alignment:
Q  255 gatgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctat 329  Q
    |||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  162111 gatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 162036  T

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Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 116462 - 116410
Alignment:
Q  276 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 328  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  116462 ccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 116410  T

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Target: scaffold0184 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 31212 - 31137
Alignment:
Q  256 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    |||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  31212 atgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 31137  T

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Target: scaffold0686 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 5809 - 5735
Alignment:
Q  256 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctat 329  Q
    ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5809 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 5735  T

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Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 6015 - 5941
Alignment:
Q  256 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctat 329  Q
    ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  6015 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 5941  T

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Target: scaffold0342 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 255 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 385 - 309
Alignment:
Q  255 gatgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  385 gatgattatgataaagaataaccccgttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatg 309  T

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Target: scaffold0369 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 164
Target Start/End: Original strand, 3854 - 3936
Alignment:
Q  83 cacaattttcataacttctcatttct-acatatttaaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 164  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3854 cacaatttccataacttatcattttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 3936  T

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Target: scaffold0361 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 214
Target Start/End: Original strand, 3364 - 3453
Alignment:
Q  125 aatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 214  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  3364 aatttcaccaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagctagagcacgaatttagcatcaattatccat 3453  T

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Target: scaffold0084 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 56226 - 56106
Alignment:
Q  89 tttcataacttctcatttctacatattt--aaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttg 186  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||| ||||| | | ||||||||||| |||| ||||| ||||||| || || ||| ||||| ||||     
T  56226 tttcataacttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcagccacaatcatacaattatcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagtta 56127  T
Q  187 gagcacgaatttagcaacaat 207  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  56126 gagcacgaatttaacaacaat 56106  T

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Target: scaffold0066 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 164
Target Start/End: Original strand, 54480 - 54630
Alignment:
Q  16 caacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatat 114  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||| | |||| |||||| ||||||| ||||| |||| | |||  | ||||||| ||||||||  ||||| ||||||     
T  54480 caacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaattt-cataacttgacatttatacatac 54578  T
Q  115 tt--aaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 164  Q
    ||  ||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  54579 tttgaaacatgcaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgca 54630  T

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Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 164
Target Start/End: Original strand, 45094 - 45244
Alignment:
Q  16 caacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatat 114  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||| | |||| |||||| ||||||| ||||| |||| | |||  | ||||||| || |||||  ||||| ||||||     
T  45094 caacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaattt-caaaacttgacatttatacatac 45192  T
Q  115 tt--aaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 164  Q
    ||  ||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  45193 tttgaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgca 45244  T

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Target: scaffold1164 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 330
Target Start/End: Original strand, 1721 - 1775
Alignment:
Q  276 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||    
T  1721 ccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatg 1775  T

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Target: scaffold0122 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 19861 - 19807
Alignment:
Q  276 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||    
T  19861 ccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatg 19807  T

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Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 24165 - 24111
Alignment:
Q  276 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| ||| |||||||||    
T  24165 ccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcatttttgctcctatg 24111  T

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Target: scaffold0456 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1587 - 1546
Alignment:
Q  157 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1587 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 1546  T

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Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 8732 - 8691
Alignment:
Q  157 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  8732 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8691  T

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Target: scaffold0123 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 198
Target Start/End: Original strand, 8216 - 8257
Alignment:
Q  157 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  8216 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8257  T

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Target: scaffold0058 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 70348 - 70307
Alignment:
Q  157 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  70348 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagtacgaattt 70307  T

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Target: scaffold0013 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 328
Target Start/End: Original strand, 35821 - 35873
Alignment:
Q  276 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 328  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  35821 ccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 35873  T

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Target: scaffold0876 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 326
Target Start/End: Original strand, 114 - 164
Alignment:
Q  276 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcc 326  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| |||||    
T  114 ccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcc 164  T

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Target: scaffold0409 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1386 - 1348
Alignment:
Q  160 atgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 198  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1386 atgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 1348  T

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Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9641 - 9603
Alignment:
Q  160 atgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 198  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  9641 atgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 9603  T

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Target: scaffold0310 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 6315 - 6261
Alignment:
Q  276 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 330  Q
    |||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||||||| |||||||||    
T  6315 ccccttaccttaattatcacccactattaactcaagcttcacttttgctcctatg 6261  T

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Target: scaffold0467 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10458 - 10338
Alignment:
Q  89 tttcataacttctcatttctacatattt--aaacatggaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttg 186  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||| ||||| ||| |||| |||||  | || ||||||||||||| |  || ||||||||| ||       
T  10458 tttcataacttagcatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagcaa 10359  T
Q  187 gagcacgaatttagcaacaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10358 gagcacgaatttagcaacaat 10338  T

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Target: scaffold0151 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22463 - 22422
Alignment:
Q  157 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  22463 ttcatgcatacaaacatatcatcatatttagagcacgaattt 22422  T

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Target: scaffold0032 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 93814 - 93773
Alignment:
Q  157 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  93814 ttcatgcatacatacatatcatcataattggagcacgaattt 93773  T

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Target: scaffold1295 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 328
Target Start/End: Original strand, 447 - 499
Alignment:
Q  276 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 328  Q
    |||||||||| | ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  447 ccccttacctcagttatcaccaattcctagctcaagcttcactttagctccta 499  T

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Target: scaffold0507 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 1415 - 1363
Alignment:
Q  276 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 328  Q
    |||||||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  1415 ccccttacctcaattatcaccaattcctagctcaagcttcactttagttccta 1363  T

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Target: scaffold0389 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 197
Target Start/End: Original strand, 10868 - 10908
Alignment:
Q  157 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  10868 ttcatgcatacaaacatatcatcatagatagagcacgaatt 10908  T

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Target: scaffold0053 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 76751 - 76699
Alignment:
Q  276 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 328  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  76751 ccccttaccttaattatcagcaattcctagcccaagcttcactttagctccta 76699  T

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