View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1068_low_5 (Length: 518)

Name: NF1068_low_5
Description: NF1068
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1068_low_5
NF1068_low_5
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (69-306)||(21017057-21017294)
chr6 (69-308)||(3879884-3880123)
chr6 (69-308)||(5627391-5627630)
chr6 (69-308)||(4318767-4319007)
chr6 (75-268)||(15491655-15491848)
chr6 (69-293)||(29182178-29182403)
chr6 (69-314)||(1945827-1946073)
chr6 (69-317)||(7234980-7235227)
chr6 (69-276)||(7055160-7055367)
chr6 (96-268)||(33892975-33893146)
chr6 (69-310)||(6091127-6091368)
chr6 (69-308)||(8513233-8513467)
chr6 (69-306)||(30353303-30353540)
chr6 (69-306)||(6088910-6089142)
chr6 (71-208)||(20768184-20768319)
chr6 (132-278)||(33618864-33619010)
chr6 (193-293)||(18498448-18498549)
[»] chr5 (55 HSPs)
chr5 (69-310)||(40133383-40133624)
chr5 (69-308)||(36860423-36860663)
chr5 (69-309)||(36866761-36867001)
chr5 (69-309)||(21088702-21088942)
chr5 (69-280)||(699178-699389)
chr5 (69-306)||(26268076-26268313)
chr5 (69-306)||(27318423-27318660)
chr5 (68-268)||(30969259-30969459)
chr5 (69-306)||(5837557-5837794)
chr5 (82-308)||(8741835-8742062)
chr5 (69-308)||(19119859-19120098)
chr5 (69-280)||(22980821-22981032)
chr5 (71-310)||(23116160-23116399)
chr5 (68-306)||(25500861-25501099)
chr5 (69-308)||(12910350-12910594)
chr5 (68-312)||(15724486-15724728)
chr5 (69-308)||(39572819-39573058)
chr5 (71-308)||(38528175-38528411)
chr5 (69-293)||(5112250-5112473)
chr5 (96-280)||(22019660-22019844)
chr5 (69-276)||(14919464-14919671)
chr5 (69-255)||(23954725-23954912)
chr5 (69-280)||(31786582-31786793)
chr5 (96-268)||(28416490-28416662)
chr5 (114-293)||(1429126-1429305)
chr5 (96-307)||(32563150-32563361)
chr5 (96-278)||(9200263-9200445)
chr5 (69-280)||(27330334-27330543)
chr5 (83-247)||(6824429-6824595)
chr5 (69-268)||(17157967-17158165)
chr5 (77-306)||(7208808-7209037)
chr5 (69-317)||(22255172-22255421)
chr5 (75-229)||(15992482-15992636)
chr5 (69-307)||(31705548-31705785)
chr5 (96-309)||(7693229-7693442)
chr5 (68-293)||(35933917-35934136)
chr5 (71-246)||(35504427-35504602)
chr5 (114-276)||(24886136-24886298)
chr5 (69-309)||(5829896-5830131)
chr5 (71-310)||(35511420-35511654)
chr5 (69-308)||(22974018-22974257)
chr5 (69-268)||(33908273-33908472)
chr5 (114-280)||(8466773-8466938)
chr5 (116-310)||(14409310-14409503)
chr5 (69-308)||(35826422-35826658)
chr5 (96-247)||(42342794-42342942)
chr5 (87-266)||(43308606-43308784)
chr5 (71-186)||(13956300-13956415)
chr5 (154-247)||(25668710-25668803)
chr5 (69-304)||(8436970-8437204)
chr5 (171-266)||(11898044-11898139)
chr5 (71-157)||(2888383-2888469)
chr5 (213-317)||(13956425-13956529)
chr5 (69-102)||(24886293-24886326)
chr5 (231-311)||(16004474-16004555)
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (71-293)||(9864162-9864384)
chr8 (69-308)||(36694918-36695157)
chr8 (69-314)||(12876102-12876348)
chr8 (69-310)||(6098470-6098711)
chr8 (69-309)||(13307621-13307861)
chr8 (71-308)||(16446829-16447066)
chr8 (69-293)||(37970471-37970695)
chr8 (69-308)||(40862418-40862657)
chr8 (69-308)||(1204926-1205165)
chr8 (68-276)||(11727055-11727263)
chr8 (69-308)||(38643977-38644216)
chr8 (68-309)||(10555155-10555394)
chr8 (69-311)||(23854383-23854625)
chr8 (69-308)||(27082790-27083029)
chr8 (69-268)||(43025741-43025940)
chr8 (69-308)||(43643547-43643786)
chr8 (75-309)||(5299904-5300138)
chr8 (68-308)||(16222862-16223102)
chr8 (68-247)||(1149583-1149762)
chr8 (69-276)||(30654535-30654742)
chr8 (96-293)||(465856-466053)
chr8 (69-309)||(41910940-41911180)
chr8 (69-280)||(8803769-8803973)
chr8 (71-276)||(31933840-31934045)
chr8 (71-308)||(34894966-34895198)
chr8 (104-308)||(1150092-1150296)
chr8 (114-308)||(34952028-34952222)
chr8 (115-308)||(41362517-41362707)
chr8 (69-181)||(4132638-4132749)
chr8 (69-235)||(39099071-39099237)
chr8 (69-231)||(1953940-1954104)
chr8 (69-203)||(33906316-33906450)
chr8 (69-233)||(7890909-7891073)
chr8 (71-219)||(35459665-35459813)
chr8 (68-278)||(44869525-44869736)
chr8 (92-161)||(18259229-18259298)
chr8 (114-181)||(7998420-7998488)
chr8 (70-126)||(12585297-12585353)
chr8 (154-208)||(33197948-33198002)
chr8 (69-126)||(24823338-24823395)
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (71-293)||(34132941-34133163)
chr3 (69-293)||(24488908-24489132)
chr3 (71-309)||(37203057-37203295)
chr3 (69-242)||(11466881-11467054)
chr3 (69-306)||(46297708-46297945)
chr3 (71-309)||(37157698-37157935)
chr3 (68-314)||(4015445-4015691)
chr3 (75-308)||(35844317-35844550)
chr3 (69-275)||(47481546-47481752)
chr3 (72-293)||(3655151-3655372)
chr3 (69-280)||(7327428-7327640)
chr3 (70-237)||(42506022-42506189)
chr3 (99-280)||(29099374-29099555)
chr3 (69-276)||(4761594-4761802)
chr3 (97-309)||(51212955-51213167)
chr3 (69-276)||(2007956-2008162)
chr3 (69-268)||(33378731-33378930)
chr3 (69-308)||(48354932-48355171)
chr3 (69-276)||(3362276-3362485)
chr3 (69-314)||(21193591-21193837)
chr3 (69-311)||(44891495-44891727)
chr3 (68-293)||(53229097-53229323)
chr3 (69-293)||(52040868-52041093)
chr3 (96-247)||(14586643-14586794)
chr3 (71-308)||(39282644-39282880)
chr3 (111-276)||(44186489-44186654)
chr3 (69-280)||(53176074-53176284)
chr3 (70-247)||(21009749-21009926)
chr3 (69-278)||(45174524-45174736)
chr3 (68-280)||(54505827-54506038)
chr3 (69-268)||(25579770-25579969)
chr3 (69-308)||(26941206-26941445)
chr3 (69-308)||(40552205-40552444)
chr3 (69-238)||(43348319-43348487)
chr3 (114-293)||(11357355-11357535)
chr3 (71-238)||(24708063-24708230)
chr3 (76-187)||(33698265-33698376)
chr3 (69-276)||(54828647-54828853)
chr3 (69-305)||(22446011-22446247)
chr3 (69-266)||(32373505-32373700)
chr3 (71-216)||(46994609-46994754)
chr3 (71-219)||(38591778-38591926)
chr3 (69-308)||(22450959-22451198)
chr3 (114-293)||(40935997-40936175)
chr3 (71-181)||(22622666-22622776)
chr3 (96-269)||(43975861-43976034)
chr3 (96-205)||(29163912-29164021)
chr3 (130-276)||(20373303-20373449)
chr3 (69-188)||(11835573-11835693)
chr3 (69-183)||(1089809-1089924)
chr3 (112-220)||(27480368-27480476)
chr3 (69-181)||(36012255-36012368)
chr3 (218-293)||(2613896-2613971)
chr3 (69-142)||(20373190-20373263)
chr3 (69-107)||(27480312-27480350)
chr3 (242-308)||(55343403-55343469)
chr3 (69-109)||(11357096-11357136)
chr3 (224-268)||(33698219-33698263)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (69-314)||(4166916-4167161)
chr2 (69-306)||(3176941-3177178)
chr2 (69-311)||(33550951-33551192)
chr2 (69-309)||(44913661-44913903)
chr2 (71-308)||(17071703-17071940)
chr2 (69-308)||(4264040-4264280)
chr2 (69-308)||(29242102-29242341)
chr2 (71-247)||(4763692-4763868)
chr2 (96-276)||(27349930-27350109)
chr2 (68-275)||(43648208-43648415)
chr2 (69-293)||(39167333-39167551)
chr2 (69-276)||(37905740-37905949)
chr2 (69-277)||(19424592-19424800)
chr2 (68-268)||(44285989-44286189)
chr2 (71-308)||(17054062-17054299)
chr2 (96-310)||(19313850-19314063)
chr2 (69-306)||(36641988-36642227)
chr2 (69-280)||(13711492-13711698)
chr2 (69-280)||(19289287-19289498)
chr2 (69-278)||(31570698-31570907)
chr2 (69-275)||(4478402-4478604)
chr2 (69-280)||(11366345-11366556)
chr2 (96-276)||(43770830-43771010)
chr2 (69-268)||(33709196-33709395)
chr2 (71-293)||(26357592-26357814)
chr2 (71-209)||(41960939-41961077)
chr2 (97-266)||(33660360-33660529)
chr2 (69-250)||(33902124-33902305)
chr2 (69-280)||(41463814-41464025)
chr2 (71-268)||(2325344-2325533)
chr2 (96-247)||(5881600-5881750)
chr2 (69-312)||(35958905-35959135)
chr2 (69-211)||(45327817-45327959)
chr2 (75-293)||(18494251-18494456)
chr2 (114-238)||(7006930-7007054)
chr2 (71-207)||(41465602-41465738)
chr2 (69-166)||(18258251-18258348)
chr2 (71-188)||(31861972-31862089)
chr2 (133-205)||(19501768-19501839)
chr2 (163-280)||(41051263-41051381)
chr2 (69-102)||(19500879-19500912)
[»] chr7 (57 HSPs)
chr7 (69-309)||(4582893-4583133)
chr7 (70-308)||(32432432-32432665)
chr7 (69-308)||(43686016-43686254)
chr7 (68-308)||(21991611-21991851)
chr7 (69-268)||(6546534-6546733)
chr7 (69-308)||(32821000-32821239)
chr7 (68-307)||(38258521-38258760)
chr7 (69-308)||(18797304-18797541)
chr7 (69-309)||(37109846-37110088)
chr7 (69-310)||(8861258-8861499)
chr7 (69-308)||(7334769-7335008)
chr7 (70-276)||(30055534-30055740)
chr7 (96-309)||(12165726-12165939)
chr7 (69-293)||(22687229-22687453)
chr7 (69-309)||(27283718-27283958)
chr7 (69-308)||(17842531-17842772)
chr7 (69-293)||(23111180-23111406)
chr7 (69-307)||(43925081-43925315)
chr7 (69-310)||(5657428-5657669)
chr7 (69-274)||(9355773-9355978)
chr7 (68-276)||(31579010-31579223)
chr7 (69-268)||(10481619-10481819)
chr7 (69-276)||(27421327-27421533)
chr7 (114-280)||(26980326-26980492)
chr7 (114-280)||(29173543-29173709)
chr7 (69-242)||(15612706-15612879)
chr7 (68-280)||(24211744-24211956)
chr7 (69-293)||(41765025-41765249)
chr7 (69-293)||(48928511-48928734)
chr7 (69-188)||(15672709-15672828)
chr7 (68-236)||(11071253-11071421)
chr7 (114-317)||(12390622-12390825)
chr7 (69-280)||(48928244-48928454)
chr7 (69-310)||(10359161-10359402)
chr7 (69-293)||(25691491-25691716)
chr7 (69-188)||(37704252-37704371)
chr7 (69-188)||(44598761-44598880)
chr7 (69-293)||(37347012-37347235)
chr7 (94-292)||(44413351-44413550)
chr7 (69-266)||(33688209-33688406)
chr7 (114-293)||(31520716-31520894)
chr7 (69-164)||(26588031-26588126)
chr7 (69-175)||(37703445-37703551)
chr7 (68-175)||(46481075-46481182)
chr7 (69-135)||(35353256-35353322)
chr7 (198-276)||(38053493-38053571)
chr7 (202-266)||(34362228-34362292)
chr7 (69-107)||(38053637-38053675)
chr7 (159-308)||(26524364-26524513)
chr7 (242-306)||(8299192-8299256)
chr7 (393-441)||(29603566-29603614)
chr7 (69-100)||(29173706-29173737)
chr7 (114-261)||(32593181-32593327)
chr7 (69-107)||(32593153-32593191)
chr7 (159-268)||(35353123-35353233)
chr7 (400-441)||(29749687-29749728)
chr7 (213-268)||(37704182-37704238)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (69-308)||(134-373)
scaffold0002 (71-285)||(94331-94545)
scaffold0002 (69-247)||(408375-408552)
[»] chr4 (50 HSPs)
chr4 (69-306)||(17167715-17167952)
chr4 (69-306)||(17173292-17173529)
chr4 (69-308)||(35021007-35021246)
chr4 (70-306)||(27396618-27396854)
chr4 (70-278)||(19089426-19089634)
chr4 (96-280)||(32592121-32592305)
chr4 (96-307)||(37775670-37775879)
chr4 (70-237)||(37663714-37663881)
chr4 (68-310)||(49375964-49376207)
chr4 (68-293)||(25701027-25701253)
chr4 (91-308)||(9139247-9139462)
chr4 (69-310)||(28002958-28003199)
chr4 (69-242)||(33341465-33341637)
chr4 (69-310)||(55241077-55241317)
chr4 (68-276)||(879519-879727)
chr4 (69-308)||(25184113-25184352)
chr4 (69-308)||(38011854-38012093)
chr4 (69-308)||(50697242-50697480)
chr4 (69-308)||(55477863-55478106)
chr4 (69-306)||(36493661-36493897)
chr4 (69-254)||(4934174-4934360)
chr4 (69-280)||(7703545-7703748)
chr4 (69-266)||(23761114-23761310)
chr4 (77-280)||(54499217-54499422)
chr4 (69-280)||(29584172-29584381)
chr4 (69-306)||(47253751-47253979)
chr4 (69-308)||(32912552-32912791)
chr4 (69-308)||(34361464-34361702)
chr4 (69-276)||(42199761-42199968)
chr4 (69-293)||(34948067-34948293)
chr4 (68-280)||(6864063-6864275)
chr4 (96-293)||(30002631-30002820)
chr4 (68-186)||(3042741-3042859)
chr4 (71-293)||(46888132-46888353)
chr4 (69-188)||(1815421-1815540)
chr4 (69-293)||(35025568-35025784)
chr4 (96-280)||(4598021-4598203)
chr4 (69-312)||(19440620-19440864)
chr4 (69-247)||(5047938-5048115)
chr4 (104-310)||(39397916-39398113)
chr4 (111-268)||(33816547-33816704)
chr4 (69-188)||(17272084-17272203)
chr4 (69-280)||(32579472-32579685)
chr4 (133-247)||(50764791-50764905)
chr4 (203-308)||(4205116-4205221)
chr4 (68-276)||(37287766-37287968)
chr4 (223-308)||(4396326-4396411)
chr4 (69-109)||(33816488-33816528)
chr4 (201-308)||(3042611-3042718)
chr4 (69-109)||(7152176-7152216)
[»] chr1 (52 HSPs)
chr1 (69-306)||(238454-238690)
chr1 (69-309)||(38823209-38823449)
chr1 (68-312)||(42721031-42721275)
chr1 (69-308)||(10181949-10182188)
chr1 (69-311)||(15752022-15752264)
chr1 (69-293)||(47279200-47279424)
chr1 (69-308)||(15382929-15383168)
chr1 (69-310)||(27267141-27267378)
chr1 (69-280)||(7079004-7079226)
chr1 (72-308)||(18422647-18422883)
chr1 (69-279)||(51128884-51129094)
chr1 (71-308)||(2959744-2959981)
chr1 (96-268)||(48620673-48620845)
chr1 (69-276)||(23999375-23999582)
chr1 (69-268)||(32216091-32216290)
chr1 (69-293)||(47682435-47682658)
chr1 (68-280)||(32267058-32267270)
chr1 (69-276)||(10922755-10922962)
chr1 (71-285)||(9902997-9903211)
chr1 (75-280)||(27532928-27533132)
chr1 (94-268)||(3534968-3535142)
chr1 (69-230)||(27227426-27227587)
chr1 (69-308)||(16415641-16415881)
chr1 (69-309)||(30326893-30327133)
chr1 (69-261)||(4330323-4330516)
chr1 (69-285)||(28564724-28564938)
chr1 (69-293)||(37451297-37451520)
chr1 (69-280)||(30254448-30254658)
chr1 (69-308)||(8222127-8222363)
chr1 (115-280)||(11742338-11742502)
chr1 (68-220)||(25160716-25160868)
chr1 (69-268)||(27563846-27564045)
chr1 (85-308)||(39393379-39393603)
chr1 (69-308)||(19899710-19899949)
chr1 (69-308)||(1547283-1547514)
chr1 (69-208)||(15168192-15168331)
chr1 (69-247)||(40884870-40885048)
chr1 (71-308)||(34012325-34012557)
chr1 (94-306)||(41926161-41926373)
chr1 (69-309)||(31621495-31621734)
chr1 (69-268)||(46931447-46931644)
chr1 (69-208)||(33725541-33725680)
chr1 (71-209)||(22170806-22170944)
chr1 (453-513)||(7254228-7254288)
chr1 (72-278)||(28769679-28769885)
chr1 (69-317)||(3309135-3309388)
chr1 (69-220)||(38759613-38759768)
chr1 (111-307)||(14758038-14758234)
chr1 (69-268)||(27763252-27763450)
chr1 (160-250)||(21289726-21289816)
chr1 (96-280)||(37618860-37619048)
chr1 (69-109)||(1359876-1359916)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (70-280)||(7915-8125)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (69-306)||(145962-146199)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (68-279)||(43986-44196)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (68-279)||(154591-154801)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (68-256)||(267335-267525)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (69-280)||(11935-12148)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (217-268)||(42388-42439)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 69 - 306
Target Start/End: Original strand, 21017057 - 21017294
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  21017057 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataacgtaggataaaattagattaagtttattcttgttagt 21017156  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21017157 ctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccattgtacaaataatggggtgttactcacaacattttttatactacaatgttaacttca 21017256  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||    
T  21017257 ccaaaaaagtcattttcgtgacttcaccgtataatttt 21017294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Original strand, 3879884 - 3880123
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| | ||| | |||||||||||||    
T  3879884 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagaataagtatattcttgttagt 3879983  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| |||||| || || | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  3879984 ctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggtgttactcacaacacttttgatactataatgttaacttca 3880083  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
     || |||||||| | |||||||||| |  |||||||||||    
T  3880084 ccagaaaagtcattctcgtgacttcaccatagaattttcc 3880123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 5627630 - 5627391
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||  |||| || ||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||      
T  5627630 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaac 5627531  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    |||||||||||||||||||| |  | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||  |||| |||||||||||    
T  5627530 ctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcattatattttttatgttatagtgttaacttca 5627431  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
     ||||||||||| | |  ||||||| |  |||||||||||    
T  5627430 ccaaaaaagtcattcttatgacttcaccttagaattttcc 5627391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Original strand, 4318767 - 4319007
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaa-ttatattaattgtattcttgttag 167  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||     
T  4318767 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaa 4318866  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
    ||| |||||||||| |||||| || |  | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||  |||| ||||||||||    
T  4318867 tctaatgaattgatgatactatgggggttgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcataacacttttgatgttatagtgttaacttc 4318966  T
Q  268 aacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
    | ||||||||||| | || ||||||| |  |||||||||||    
T  4318967 accaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 4319007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 75 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15491848 - 15491655
Alignment:
Q  75 tgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatg 174  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||    
T  15491848 tgatatcatgtgatatttttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgcattcttgttaatctgatg 15491749  T
Q  175 aattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||| |||||| |  | || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  || |||||||||||||    
T  15491748 aattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccactgtacaaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttacaatgttaacttca 15491655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29182403 - 29182178
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcgggg-tgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||     
T  29182403 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatgggggtgttacacttaaaatatggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaa 29182304  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||  |||| ||||||||||    
T  29182303 tctgatgaattgatgataatatggagactgaacttttgatgacactgtataaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttc 29182204  T
Q  268 aacaaaaaagtcaatttcgtgacttc 293  Q
    | ||| ||| ||| | || |||||||    
T  29182203 atcaataaaatcattctcatgacttc 29182178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 69 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 1946073 - 1945827
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||| || ||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||      
T  1946073 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaac 1945974  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
     ||||||||| || |||||| |  | || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  1945973 ttgatgaattcatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 1945874  T
Q  269 ac-aaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttccatattt 314  Q
     | |||||||||| | |  ||||||| | |||||||||||| |||||    
T  1945873 ccaaaaaaagtcattcttatgacttcaccgtagaattttccttattt 1945827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 69 - 317
Target Start/End: Original strand, 7234980 - 7235227
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || | |||||||| |    
T  7234980 agttgatgatattatgcgatagtcttaagcgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaat 7235079  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||| ||  |||| |||| ||||||    
T  7235080 ctgatgaattgataatacta-tgagactgaacttttgatggcaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttca 7235178  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttccatatttaaa 317  Q
     |  |||||||| | || | ||||| |  |||||||||||||| |||||    
T  7235179 ccggaaaagtcattctcataacttcaccatagaattttccataattaaa 7235227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 69 - 276
Target Start/End: Original strand, 7055160 - 7055367
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  | |||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||      
T  7055160 agttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtagcgtgttacacttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaac 7055259  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| |||||| |  | || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |  | |||||||||  |||| |||||||||||    
T  7055260 ctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtgaggtgttactaattatattttttatgttatagtgttaacttca 7055359  T
Q  269 acaaaaaa 276  Q
     |||||||    
T  7055360 ccaaaaaa 7055367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 96 - 268
Target Start/End: Original strand, 33892975 - 33893146
Alignment:
Q  96 agtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagac 195  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||    
T  33892975 agtgttacactttgtggggtgttatacataaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaagg-gac 33893073  T
Q  196 taaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||| |||||||||||    
T  33893074 tgaacttttaatatcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttca 33893146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 69 - 310
Target Start/End: Original strand, 6091127 - 6091368
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtctt-aagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||| | ||||||     
T  6091127 agttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgttgggtgttacgcttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaa 6091226  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
    ||| |||||||||| ||||||||   ||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||  ||  ||||||||||     
T  6091227 tctaatgaattgatgatactacgagtactgaacttttgatggcattgtacaaacaatggtgtgttactcactacattttttatgtta-catgttaacttt 6091325  T
Q  268 aacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttccat 310  Q
    | ||||||| | | |||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  6091326 accaaaaaaattattttcatgacttcacaatagaatttcccat 6091368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 8513467 - 8513233
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaa-ttatattaattgtattcttgttag 167  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||      ||| ||||||| |||||| ||| || || |||||||||||||     
T  8513467 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgtta------aaacaaggtaggataaaaattagatcaagtgtattcttgttaa 8513374  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
    | |||||||||||| ||| || || |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||    
T  8513373 tatgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatattatagtgttaacttc 8513274  T
Q  268 aacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
    | || |||||||| | || ||||||| |  |||||||||||    
T  8513273 accagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 8513233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 69 - 306
Target Start/End: Original strand, 30353303 - 30353540
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||| |  ||||||||| ||||| ||||||||||||  |    
T  30353303 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggcatgataaaattagattaagtgtattcttgtttat 30353402  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
     |||||||||||| |||||| ||||||| |||| | |||| || |||||||| |||| | | |||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  30353403 atgatgaattgatgatactatggagactgaactatcgatgccactgtacaaacagtgagatattactcgcaacacttttgatgttataatgttaacttca 30353502  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaatttt 306  Q
     || |||||||| | || ||||||| |  |||||||||    
T  30353503 ccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 30353540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 69 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 6089142 - 6088910
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaa-ttatattaattgtattcttgttag 167  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||  | ||||||      ||| ||||||| |||||| ||| || ||   |||||||||||     
T  6089142 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttataccttgtagagtgtta------aaacaaggtaggataaaaattagatcaaggatattcttgttaa 6089049  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| || | |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  6089048 tctgatgaattgatgatactatggtgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggggcgttactcacaacacttttgatactatagtgttaacttc 6088949  T
Q  268 aacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaatttt 306  Q
    | || |||| ||| | || ||||||| |  |||||||||    
T  6088948 accagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaatttt 6088910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 71 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20768319 - 20768184
Alignment:
Q  71 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtct 170  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||  ||| |||||||| |||    
T  20768319 ttgatgatattatgcgatgatcttaagtgttacactttatgggatgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaa--gtaatcttgttaatct 20768222  T
Q  171 gatgaattgataatactacggagactaaacttttgatg 208  Q
    |||||||| || |||||| |  |||| |||||||||||    
T  20768221 gatgaattaatgatactatgaggactgaacttttgatg 20768184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 33619010 - 33618864
Alignment:
Q  132 ggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgt 231  Q
    ||||| ||||||||| ||||| || | |||||||| |||||||||||||| |||||| |   ||| ||||||||||| ||  ||||||||| |||| ||     
T  33619010 ggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgccaccgtacaaataatgggttgc 33618911  T
Q  232 tactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagt 278  Q
    ||||||| ||| |||| || | ||| |||| |||||| || ||||||    
T  33618910 tactcactacacttttgatgcgatagtgttgacttcaccagaaaagt 33618864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18498549 - 18498448
Alignment:
Q  193 gactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtgggg-tgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtcaatttcgtgact 291  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||  |||||| |||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||| | || |||||    
T  18498549 gactgaacttttgatgccactgtacaaactgtgggggtgttgctcactacacttttgatgctataatgttaacttcaccaggaaagtcattctcatgact 18498450  T
Q  292 tc 293  Q
    ||    
T  18498449 tc 18498448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 158; Significance: 8e-84; HSPs: 55)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 40133624 - 40133383
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  40133624 agttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagt 40133525  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||| | ||| || || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40133524 ctgatgaattgttgatattatggggactgaacttttgatgccattgtacaaatagtggggtgttactcacaacatttttgatactataatgttaacttca 40133425  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttccat 310  Q
     || |||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  40133424 ccacaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccat 40133383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 36860663 - 36860423
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataa-ggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  36860663 agttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaaaaaaggtaggataaaattagattaaatgtactcttgttag 36860564  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
    | |||||||||| | |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36860563 tatgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacattttttatactatagtgttaacttc 36860464  T
Q  268 aacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
    | || |||| ||| |||||||||||| |  |||||||||||    
T  36860463 accagaaaaatcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 36860423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 69 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 36867001 - 36866761
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  36867001 agttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagt 36866902  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||| | ||||||  | |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||    
T  36866901 ctgatgaattgttgatactatcgggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaatatttttgatattatagtgttaacttca 36866802  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcca 309  Q
     || |||| ||| |||||||||||| |  ||||||||||||    
T  36866801 ccagaaaaatcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 36866761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 69 - 309
Target Start/End: Original strand, 21088702 - 21088942
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  21088702 agttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaagttagattaaatgtattcttgttagt 21088801  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
     |||||||||| | |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  21088802 atgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgtcactcacaacattttttatactacagt-ttaacttca 21088900  T
Q  269 ac-aaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcca 309  Q
     | |||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  21088901 ccaaaaaaagtcattttcgtgacttcatcgtagaattttcca 21088942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 69 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 699389 - 699178
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  699389 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtggagtgttacacttaaaataaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 699290  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| ||| || |  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  699289 ctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcactagattttttatgctatagtgttaacttca 699190  T
Q  269 acaaaaaagtca 280  Q
     || ||||||||    
T  699189 tcagaaaagtca 699178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 69 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26268313 - 26268076
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  26268313 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgcggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaatttgattaattgtattcttgttaat 26268214  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  26268213 ctgatgaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactcaaaacacttttgatgctatagtgttaacttca 26268114  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaatttt 306  Q
     || |||| ||| | || ||||||| | ||||||||||    
T  26268113 ccagaaaaatcattctcatgacttcactgtagaatttt 26268076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 69 - 306
Target Start/End: Original strand, 27318423 - 27318660
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  27318423 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 27318522  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
     |||||||||||| |||||  |   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||    
T  27318523 atgatgaattgatgatactgtgagaactaaacttttgatgtcattgtacaaacagtggtgtgttactcactacattttttatgttttagtgttaacttca 27318622  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaatttt 306  Q
     || |||| ||| | || ||||||| | || |||||||    
T  27318623 ccagaaaaatcattctcatgacttcaccgttgaatttt 27318660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 68 - 268
Target Start/End: Original strand, 30969259 - 30969459
Alignment:
Q  68 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  30969259 aagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaa 30969358  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
    |||||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||| ||||||||||    
T  30969359 tctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtataaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttc 30969458  T
Q  268 a 268  Q
    |    
T  30969459 a 30969459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 69 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5837794 - 5837557
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| || |||| || |||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  5837794 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaatgtaggattaaattagattaagtgtattcttgttaat 5837695  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
     |||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||| |||||    
T  5837694 atgatgaattgatgatactatggagactgaaattttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaccttca 5837595  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaatttt 306  Q
     || |||||||| | || ||| ||| | ||||||||||    
T  5837594 ccagaaaagtcattctcatgaattcaccgtagaatttt 5837557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 82 - 308
Target Start/End: Original strand, 8741835 - 8742062
Alignment:
Q  82 atgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgat 181  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  8741835 atgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtatgacaaaattagattaattgtattcttgttaatttgatgaattgat 8741934  T
Q  182 aatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagt-ggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtca 280  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  8741935 gatactatggagactgaacttttgatgccattgtacaaacaatgggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtca 8742034  T
Q  281 atttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
     | || ||||||| |  |||||||||||    
T  8742035 ttctcatgacttcaccatagaattttcc 8742062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 19120098 - 19119859
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | ||| | ||||||||||| |    
T  19120098 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttatacttaaaacaaggtaggataaaattagagtaagtttattcttgttaat 19119999  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| | |||| || |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  19119998 ctgatgaattgatgacactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactagcaacacttttgatgctatagtgttaacttca 19119899  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
     || |||||||| | || ||||||| |  |||||||||||    
T  19119898 ccacaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 19119859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 69 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22981032 - 22980821
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  22981032 agtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 22980933  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||   |||||| |||||||| |||||||||||    
T  22980932 ctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcattgctcaaacagtggggtattactcactgtatttttgatactatagtgttaacttca 22980833  T
Q  269 acaaaaaagtca 280  Q
     || ||||||||    
T  22980832 ccagaaaagtca 22980821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 71 - 310
Target Start/End: Original strand, 23116160 - 23116399
Alignment:
Q  71 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtct 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| | |||||| |||    
T  23116160 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatattgttaatct 23116259  T
Q  171 gatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaac 270  Q
    ||||||||||| |||||| | | ||| ||||||||||  || |||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||||      
T  23116260 gatgaattgatgatactatgtaaactgaacttttgattccactgtacaaacagtggggtgctactcactacagttttgatgttataatgttaacttcata 23116359  T
Q  271 aaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttccat 310  Q
    |||||||||| |||| |||| || |  |||||||||||||    
T  23116360 aaaaaagtcattttcatgacgtcaccatagaattttccat 23116399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 68 - 306
Target Start/End: Original strand, 25500861 - 25501099
Alignment:
Q  68 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    |||||| |||||| |||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||     
T  25500861 aagttgctgatatcatgtgatgatcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtttattcttgttaa 25500960  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
    |||||||||||||| ||||||  | |||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| |||||||| |||| || ||||| |||||||||     
T  25500961 tctgatgaattgatgatactatagggacttaacttttgatggcagtgtacaaacagtgaggtgttattcacaacacttttgatgctatagtgttaacttt 25501060  T
Q  268 aacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaatttt 306  Q
    | || |||||||| | || ||||||| |  |||||||||    
T  25501061 accagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 25501099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 12910594 - 12910350
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| || ||||| |    
T  12910594 agttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcatgttaat 12910495  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtc-----attgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaa 263  Q
    ||||||||||||  |||||| |  |||| |||||||||||||     | |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||| ||  |||| | ||||    
T  12910494 ctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtactgtacaaacagtggggtgttacgcactatatttttgatgttatagttttaa 12910395  T
Q  264 cttcaacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||    
T  12910394 cttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcc 12910350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 68 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 15724728 - 15724486
Alignment:
Q  68 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||| || || |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  15724728 aagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaa 15724629  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
    | |||||||||||| ||| || || |||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||| ||  |||| ||||||||||    
T  15724628 tttgatgaattgatgatattatgg-gactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaacttc 15724531  T
Q  268 aacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttccatat 312  Q
    | ||||||||||| | || | ||||| |  |||||||||||||||    
T  15724530 accaaaaaagtcattctcataacttcaccatagaattttccatat 15724486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 39573058 - 39572819
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  39573058 agttgttgatatcatgtgatagtctcgagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaat 39572959  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    |||||||||| || |||||| |   ||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |    
T  39572958 ctgatgaatttatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgcacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatattatagtattaacttaa 39572859  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
      | |||||||| | || ||||||| |  |||||||||||    
T  39572858 ctagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 39572819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 308
Target Start/End: Original strand, 38528175 - 38528411
Alignment:
Q  71 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtct 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||| ||||| || | |||||||| |||    
T  38528175 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaagataaaattagattaagtgcagtcttgttaatct 38528274  T
Q  171 gatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaac 270  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||  ||| |||| ||  |||| ||||||||||| |    
T  38528275 gatgaattgatgatacta-tgagactgaacttttgatgtcactgtataaacaatggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatc 38528373  T
Q  271 aaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
    | ||||  || |||| ||||||| |  |||||||||||    
T  38528374 agaaaaaccattttcatgacttcaccatagaattttcc 38528411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 69 - 293
Target Start/End: Original strand, 5112250 - 5112473
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| | ||||  ||||||||| ||||| | || |||||||| |    
T  5112250 agttgatgatattatgtgaaagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacatggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaat 5112348  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
     | |||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||  |||| | |||||||||    
T  5112349 ttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttca 5112448  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttc 293  Q
     ||||||||||| |||| |||||||    
T  5112449 ccaaaaaagtcattttcatgacttc 5112473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22019844 - 22019660
Alignment:
Q  96 agtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagac 195  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||| |||| |||||| || |||    
T  22019844 agtgttatactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaagtgatgatactaaggggac 22019745  T
Q  196 taaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtca 280  Q
    | |||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||| |||| || ||||| | ||||||||| || ||||||||    
T  22019744 ttaacttttgatgtcactatacaaacaatggggtgttactcacaacacttttgattctatagttttaacttcaccagaaaagtca 22019660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 69 - 276
Target Start/End: Original strand, 14919464 - 14919671
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||| | |||||| |    
T  14919464 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacaatttgtgaggtgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaat 14919563  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
     |||||| ||||| |||||| |  |||| |||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||  |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  14919564 atgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattatataaacagtgaggtgttactcattacatttttgatgttataatgttaacttca 14919663  T
Q  269 acaaaaaa 276  Q
     |||||||    
T  14919664 tcaaaaaa 14919671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 69 - 255
Target Start/End: Original strand, 23954725 - 23954912
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  23954725 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 23954824  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtca-ttgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactat 255  Q
     |||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| || | ||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  23954825 atgatgaattgatgatactatggaaactgaacttttgatgccactagtaaaaacagtggggtgttactcactatattttttatgctat 23954912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 69 - 280
Target Start/End: Original strand, 31786582 - 31786793
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| || | |||||||| |    
T  31786582 agttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaagtgcagtcttgttaat 31786681  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| |||||| |  || | ||||||||||| || |||||||| |||||||   | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||    
T  31786682 ctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggcagtgctcactacatttttcatgctatagtgttaacttca 31786781  T
Q  269 acaaaaaagtca 280  Q
     |||||||||||    
T  31786782 ccaaaaaagtca 31786793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 96 - 268
Target Start/End: Original strand, 28416490 - 28416662
Alignment:
Q  96 agtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagac 195  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||     
T  28416490 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggcagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggagat 28416589  T
Q  196 taaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    | ||||||||||  || |||||||| |||||| |||||||||||| | |||| ||| |||| |||||||||||    
T  28416590 tgaacttttgattccactgtacaaacagtgggatgttactcacaatacttttgatattatagtgttaacttca 28416662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 114 - 293
Target Start/End: Original strand, 1429126 - 1429305
Alignment:
Q  114 gtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcatt 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| || |    
T  1429126 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatggagactgaatttttgatgccagt 1429225  T
Q  214 gtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtcaatttcgtgacttc 293  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  1429226 gtacaaacagtggggtgttactcactatatttttgatgctatagtgttaacttcaccaaaagagtcattttcatgacttc 1429305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 96 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 32563361 - 32563150
Alignment:
Q  96 agtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagac 195  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| || || |||    
T  32563361 agtgttacactttgtgggctgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggac 32563262  T
Q  196 taaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtcaatttcgtgacttccc 295  Q
    | |||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||| |||| ||  |||| ||||||||||| || |||| ||| |||  ||||||| |    
T  32563261 tgaacttttgatgtcactgtacagacagtggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaaatcattttaatgacttcac 32563162  T
Q  296 agtagaattttc 307  Q
      ||||||||||    
T  32563161 catagaattttc 32563150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 96 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 9200445 - 9200263
Alignment:
Q  96 agtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagac 195  Q
    ||||||| |||||| ||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |  |||    
T  9200445 agtgttacactttgtggaatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaagaggac 9200346  T
Q  196 taaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagt 278  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||  |||| ||||||||||| || ||||||    
T  9200345 taaacttttgatgtcactgtacaaactgtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagt 9200263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 69 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 27330543 - 27330334
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |    
T  27330543 agttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcatggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaat 27330444  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||  ||||| |||| ||  |||| |||||||||||    
T  27330443 ctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccattgtacaaacagtaaggtgttact--caacacttttgatgttatagtgttaacttca 27330346  T
Q  269 acaaaaaagtca 280  Q
     || ||||||||    
T  27330345 ccagaaaagtca 27330334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 247
Target Start/End: Original strand, 6824429 - 6824595
Alignment:
Q  83 tgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgata 182  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||     
T  6824429 tgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaattgatg 6824528  T
Q  183 atactacggagact--aaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttt 247  Q
    |||||| | |||||  | ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  6824529 atactatgaagactgaacacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtgttactcacaacactttt 6824595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 69 - 268
Target Start/End: Original strand, 17157967 - 17158165
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||| ||| |||| |||||||| |    
T  17157967 agttgataatattatgtgatggtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataataaggtaagatacaattatactaagtgtagtcttgttaat 17158066  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    |||||||||| || ||||||    |||  |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||||    
T  17158067 ctgatgaattaatgatactataatgac-gaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttca 17158165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 77 - 306
Target Start/End: Original strand, 7208808 - 7209037
Alignment:
Q  77 atattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaa 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||  ||| || ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  7208808 atattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgtttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaa 7208907  T
Q  177 ttgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaac-aaaaa 275  Q
    ||||| |||||| |  |||| |||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||    ||||||||||  || ||||||||||||| | |||||    
T  7208908 ttgatgatacta-gaggactgaacttttgatgtcaatgtacaaacggtagggtgttactcgttgcattttttatgttacaatgttaacttcaccaaaaaa 7209006  T
Q  276 agtcaatttcgtgacttcccagtagaatttt 306  Q
    ||||| |||  ||||||| | ||||||||||    
T  7209007 agtcatttttatgacttcaccgtagaatttt 7209037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 69 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22255421 - 22255172
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||| || ||  |||  |||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  22255421 agttgatgatattatgtaatagttttaagtgttacactttgtgtggtgttacgcttataacaaaataggctaaaattagattaagtgtagtcttgttaat 22255322  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacatttttt-atactataatgttaacttc 267  Q
    ||||||||||||| ||| || |   ||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  22255321 ctgatgaattgatgataatatgagaactgaacttttgatgccattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttgatgttataatgttaacttc 22255222  T
Q  268 aacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttccatatttaaa 317  Q
    | ||||||||| | |||  ||||||| | ||||| |||||| | ||||||    
T  22255221 accaaaaaagttatttttatgacttcaccgtagagttttccttctttaaa 22255172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 229
Target Start/End: Original strand, 15992482 - 15992636
Alignment:
Q  75 tgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatg 174  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||    
T  15992482 tgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttgcactcaaatcaaggtagaataaaattagatcaagtgtattcttgttaatctgatg 15992581  T
Q  175 aattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggt 229  Q
    ||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15992582 aattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggt 15992636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 69 - 307
Target Start/End: Original strand, 31705548 - 31705785
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| | | |||||| |||| || ||||||  ||||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  31705548 agttgatgatattatgtgatggtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 31705647  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| |||||| |  ||||  ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||   |||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  31705648 ctgatgaattgatgatacta-gaggactggacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaacttca 31705746  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttc 307  Q
     ||||||| ||| |||  ||||||| |  ||||||||||    
T  31705747 ccaaaaaaatcatttttatgacttcaccatagaattttc 31705785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 96 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 7693442 - 7693229
Alignment:
Q  96 agtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagac 195  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||| |||||| |  ||     
T  7693442 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagcgtattcatgttaatctaatgaattgatgatactaagaggat 7693343  T
Q  196 taaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtcaatttcgtgacttccc 295  Q
    | ||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||  |||| ||||||||||| || |||||||| |||  ||||||| |    
T  7693342 tgaacttttgatgccactgtacaaacagtgggatgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttaatgacttcac 7693243  T
Q  296 agtagaattttcca 309  Q
      ||||||||||||    
T  7693242 catagaattttcca 7693229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 68 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 35934136 - 35933917
Alignment:
Q  68 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaat-aaaattatattaattgtattcttgtta 166  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || |||| || ||||| |||||||||||||    
T  35934136 aagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaactagattaagtgtattcttgtta 35934037  T
Q  167 gtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaactt 266  Q
     |||||||||||||| |||||| || ||||  |||||||||| || |        |||| |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||    
T  35934036 atctgatgaattgatgatactatggtgactggacttttgatgccact-------aagtgaggtgttactcacaacacttttgattctatagtgttaactt 35933944  T
Q  267 caacaaaaaagtcaatttcgtgacttc 293  Q
    || ||||||| ||| | || |||||||    
T  35933943 catcaaaaaaatcattctcatgacttc 35933917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 71 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 35504602 - 35504427
Alignment:
Q  71 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtct 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| | |    
T  35504602 ttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataatatggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatat 35504503  T
Q  171 gatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacatttt 246  Q
    ||||||||||| ||||||    || | |||||||||||||||  ||||||  ||| |||||||||||  |||||||    
T  35504502 gatgaattgatgatactataatgattgaacttttgatgtcatcatacaaacggtgaggtgttactcattacatttt 35504427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 114 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 24886298 - 24886136
Alignment:
Q  114 gtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcatt 213  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| | |||||| ||||| |||||| |  |||| ||||||||||||||||    
T  24886298 gtgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 24886199  T
Q  214 gtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaa 276  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||  |||| | ||||||||| |||||||    
T  24886198 gtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaa 24886136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 5830131 - 5829896
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||| || ||||||  ||||||| | ||||| |||| |||||||       
T  5830131 agttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaagataaaatgagattaagtgtagtcttgtt--- 5830035  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttat----actataatgttaac 264  Q
          ||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||    | ||||||||||||    
T  5830034 ------aattgatgatactatgaggactaaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcattacattttttatgttaattataatgttaac 5829941  T
Q  265 ttcaacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcca 309  Q
    |||| ||||||| ||| |||   |||||| |  ||||||||||||    
T  5829940 ttcaccaaaaaaatcatttttacgacttcaccctagaattttcca 5829896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 71 - 310
Target Start/End: Original strand, 35511420 - 35511654
Alignment:
Q  71 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtct 170  Q
    |||||||||||||||||||||     |||||| | |||| |||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||    
T  35511420 ttgatgatattatgtgatagt-----gtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatct 35511514  T
Q  171 gatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaac 270  Q
    ||||||||| | ||| || |  |||| |||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||| ||| | || ||  |||||||||||||||| |    
T  35511515 gatgaattggtgatagtatgatgactgaacttttgatgtcactttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttataatgttaacttcatc 35511614  T
Q  271 aaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttccat 310  Q
    | ||| |||| |||| ||||||| |  ||| |||||||||    
T  35511615 agaaacgtcattttcatgacttcaccataggattttccat 35511654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Original strand, 22974018 - 22974257
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||| | |||||||| |||| || ||| ||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  22974018 agttgataatattatgtaatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacgcttataacaagataggataaaattagattaagtgtagtcttgttatt 22974117  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||| ||||| ||| || |   | | |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||  || ||||| ||  |||| |||||||||||    
T  22974118 ctgatgagttgatgataatatgagaattgaacttttgatgttattgtacaaacagtgggatgttactcattacttttttgatgttatagtgttaacttca 22974217  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
     ||||||| ||| | || | ||||| |  |||||||||||    
T  22974218 ccaaaaaaatcattctcataacttcaccatagaattttcc 22974257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 69 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 33908472 - 33908273
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||| ||||| || | |||||||| |    
T  33908472 agttgacgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctggggtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaat 33908373  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||  ||||||| |||||| |  |||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||| ||||||| ||| |||| ||  |||| |||| ||||||    
T  33908372 ctgaataattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggagtgctactcactacacttttgatgatatagtgttgacttca 33908273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 114 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 8466938 - 8466773
Alignment:
Q  114 gtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcatt 213  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| || || | ||||||||||  || |    
T  8466938 gtgttacatttaaaacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgataccact 8466839  T
Q  214 gtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtca 280  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| |||| ||  || | ||||||||||| || ||||||||    
T  8466838 gtacaaagag-ggggtgttattcacaacacttttgatgttacagtgttaacttcaccagaaaagtca 8466773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 116 - 310
Target Start/End: Original strand, 14409310 - 14409503
Alignment:
Q  116 gttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgt 215  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||| ||  ||    
T  14409310 gttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-tgagactgaacttttgatgccaccgt 14409408  T
Q  216 acaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttccat 310  Q
    |  || ||||||||| ||||||| |||||||| ||  |||| |||| |||||| || |||| ||| | || ||||||| |  |||||||||||||    
T  14409409 attaagagtggggtgctactcactacatttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttccat 14409503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Original strand, 35826422 - 35826658
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||| |||||| || ||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||| |||  | |||||| |    
T  35826422 agttgatgatattatg--ataatcttaagggttacactttgtggagtgttacgcttaaaacaatgtagaataaaattagattaaatgtggtattgttaat 35826519  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    || ||||| |||| |||||| |  |||| |||||||||||||| |||||||| | ||  ||||||||||  |||||||| ||  |||| | |||||||||    
T  35826520 ct-atgaactgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatgaagtgttactcagtacatttttgatgttatagtattaacttca 35826618  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
      |||||||||| | || ||||||| |  |||||||||||    
T  35826619 caaaaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattttcc 35826658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 42342942 - 42342794
Alignment:
Q  96 agtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagac 195  Q
    ||||||| |||||| || || |||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||     
T  42342942 agtgttacactttgtggtgtattacacttaaaacaagtaaga-taaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaagggga- 42342845  T
Q  196 taaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttt 247  Q
     ||  ||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  42342844 -aattttttgatgtcactgtataaacagtggggtattactcacaacattttt 42342794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 87 - 266
Target Start/End: Original strand, 43308606 - 43308784
Alignment:
Q  87 atagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatac 186  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| || ||||||  ||||||||| ||||| | || | ||||||  ||||||| ||||| ||||    
T  43308606 atagtcttaagtgttacacttttcagggtgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaagtatagttttgttaagctgatgagttgatgatac 43308705  T
Q  187 tacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaactt 266  Q
    || |  |||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||| |||  |||||||| ||  ||||||||||||||    
T  43308706 tatgaggactgaacttttgatgccattgtacgaacagt-gggtgttattcattacatttttgatgttataatgttaactt 43308784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Original strand, 13956300 - 13956415
Alignment:
Q  71 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtct 170  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||| ||| ||| || |||||||||| ||||| || | | |||||| |||    
T  13956300 ttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacgctttgtagggtgttacacttgaaacaagataaaataaaattagattaagtgaagttttgttaatct 13956399  T
Q  171 gatgaattgataatac 186  Q
    ||||||||||| ||||    
T  13956400 gatgaattgatgatac 13956415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 25668803 - 25668710
Alignment:
Q  154 tgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttt 247  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25668803 tgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgttcaaacagtggggtgttactcacaacactttt 25668710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 69 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 8437204 - 8436970
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||   |||||||| |||| || ||||||||| |||||   || | |||| | |    
T  8437204 agttgatcatattatgtgataatcttaagtgttacacattgtggggtgtataacttaaaacaaggcaggataaaattagattaagcatagttttgtaaat 8437105  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||  ||||| |||  | |  |||| |||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||| ||| |||  |  ||||| |||||| ||||    
T  8437104 ctgatg-gttgatgatataatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatgggatgttactcactacactttggaagctatagtgttaatttca 8437006  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaatt 304  Q
     ||||||| ||| | || ||||||| || |||||||    
T  8437005 ccaaaaaaatcattctcatgacttcacattagaatt 8436970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11898139 - 11898044
Alignment:
Q  171 gatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaactt 266  Q
    ||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||   || |||| || ||||||| |||||||    
T  11898139 gatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgtcactgtacaactagtagggtgttactcagtgcacttttgatgctataatattaactt 11898044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 157
Target Start/End: Original strand, 2888383 - 2888469
Alignment:
Q  71 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgta 157  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||  ||||| |||| ||| |||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  2888383 ttgatgatattatctgatagtcttaagtgttacactttatggaatgttaaacttgaaacaaggtaaaataaaattagattaagtgta 2888469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 317
Target Start/End: Original strand, 13956425 - 13956529
Alignment:
Q  213 tgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttccatat 312  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||| |||| ||  |||| |||||||||||  | |||||||| |||| ||||||| | |||||||||||| ||     
T  13956425 tgtacaaacagtgaggtgttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttcatgagaaaagtcattttcatgacttcaccgtagaattttccttaa 13956524  T
Q  313 ttaaa 317  Q
    |||||    
T  13956525 ttaaa 13956529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 24886326 - 24886293
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24886326 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 24886293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 311
Target Start/End: Original strand, 16004474 - 16004555
Alignment:
Q  231 ttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtcaatt-tcgtgacttcccagtagaattttccata 311  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||  |  ||||||||||||||    
T  16004474 ttactcacaacatttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcaattctcatgactttaccatagaattttccata 16004555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 71 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 9864384 - 9864162
Alignment:
Q  71 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtct 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  9864384 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtgtattcttattagtct 9864285  T
Q  171 gatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaac 270  Q
    ||||||||||| ||| || || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |    
T  9864284 gatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatactatagtgttaatttcacc 9864185  T
Q  271 aaaaaagtcaatttcgtgacttc 293  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  9864184 aaaaaagtcattttcgtgacttc 9864162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Original strand, 36694918 - 36695157
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  36694918 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagt 36695017  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  36695018 ctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattatagtgttaacttca 36695117  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
     || |||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||    
T  36695118 tcagaaaagtcattttcctgacttcaccatagaattttcc 36695157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 69 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12876348 - 12876102
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtctt-aagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||| |||     
T  12876348 agttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtatccttcttaa 12876249  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
    |||||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12876248 tctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagttgggtgttactcacaacattttttatattatagtgttaacttc 12876149  T
Q  268 aacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttccatattt 314  Q
    | || |||||||| |||||||||||  |  |||||||||||| ||||    
T  12876148 atcagaaaagtcattttcgtgacttaaccatagaattttccaaattt 12876102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 69 - 310
Target Start/End: Original strand, 6098470 - 6098711
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  6098470 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaaatgtagtcttgttaat 6098569  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||  |||||| || |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || ||||| | |||||||||    
T  6098570 ctgatgaattgacgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcactatatttttgatgctatagtattaacttca 6098669  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttccat 310  Q
     ||||||||| | |||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  6098670 ccaaaaaagttattttcatgacttcaccatagaattttccat 6098711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 69 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 13307861 - 13307621
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||| || |    
T  13307861 agttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgctaat 13307762  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||  |||| |||||||||||    
T  13307761 ctgatgaattgataatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaatagtgaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttca 13307662  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcca 309  Q
     || |||| ||| | || ||||||| |  ||||||||||||    
T  13307661 ccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcca 13307621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 71 - 308
Target Start/End: Original strand, 16446829 - 16447066
Alignment:
Q  71 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtct 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||    
T  16446829 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacgctttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatct 16446928  T
Q  171 gatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaac 270  Q
    ||||||||||| ||| || || |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||  |||| ||||||||| | |    
T  16446929 gatgaattgatgatagtatggggactaaacttttgatgccattatacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaactttatc 16447028  T
Q  271 aaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
    | |||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||    
T  16447029 agaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcc 16447066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 69 - 293
Target Start/End: Original strand, 37970471 - 37970695
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  37970471 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 37970570  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    |  |||||||||| |||||| |  | || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  37970571 catatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatggcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 37970670  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttc 293  Q
     ||||||||||| | || |||||||    
T  37970671 ccaaaaaagtcattctcatgacttc 37970695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 40862657 - 40862418
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| || || |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  40862657 agttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttacacttagaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgttagt 40862558  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacatttttt-atactataatgttaacttc 267  Q
     |||  ||||||| |||| |  |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  40862557 atgaaaaattgatgatacca-tgagactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaacattttttgatattatagtgttaacttc 40862459  T
Q  268 aacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
    | || |||||| | |||||||||||| |  |||||||||||    
T  40862458 accagaaaagttattttcgtgacttcactatagaattttcc 40862418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 1205165 - 1204926
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  1205165 agttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtaatcttgttaat 1205066  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
     ||||||| |||| |||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||    
T  1205065 atgatgaactgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgatgtgttactcactacattttttatgttatagtgttaacttca 1204966  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
     || |||||||| | || ||||||| | ||| ||||||||    
T  1204965 ccagaaaagtcattctcatgacttcaccgtaaaattttcc 1204926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 68 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 11727263 - 11727055
Alignment:
Q  68 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  11727263 aagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaa 11727164  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
    | |||||||||||| ||| || |  |||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||  |||| ||||||||||    
T  11727163 tttgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccactatacaaatagtggggtgttacttacaacacttttgatgttatagtgttaacttc 11727064  T
Q  268 aacaaaaaa 276  Q
    | |||||||    
T  11727063 accaaaaaa 11727055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 38644216 - 38643977
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| || |||||||||| ||||||| |||||  || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  38644216 agttgctgatatcatatgatagtcttgagtgttacactttatggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaat 38644117  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||  |||| ||||||||| |    
T  38644116 ctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccactagacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttga 38644017  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
     ||||||||||| | || ||| ||| |  |||||||||||    
T  38644016 ccaaaaaagtcattctcatgatttcaccatagaattttcc 38643977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 68 - 309
Target Start/End: Original strand, 10555155 - 10555394
Alignment:
Q  68 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||   |||| | |||||| | |||| || ||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||     
T  10555155 aagttgatgatattatgtgatagtc--aagtgttacgttttgtgaggtgttgcgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaa 10555252  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
    |||||||||||||| |||||| |  || | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  10555253 tctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttc 10555352  T
Q  268 aacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcca 309  Q
    | ||||||||||| | || ||||||| | |||||||||||||    
T  10555353 accaaaaaagtcattctcatgacttcaccgtagaattttcca 10555394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 311
Target Start/End: Original strand, 23854383 - 23854625
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||||||||| ||  |||||  ||||||||| |||||||||| | |||||| |    
T  23854383 agttgatgatattatgtgattgtcttaagtgttacactttatgcggtgttacacttataactaggtaagataaaattagattaattgtagtattgttaat 23854482  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    || |||| ||||| |||||| |  |||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||||    
T  23854483 ctaatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgcacaaacagttgggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttca 23854582  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttccata 311  Q
     ||||||||||| | || ||||||| | ||||| |||||||||    
T  23854583 ccaaaaaagtcattctcatgacttcaccgtagacttttccata 23854625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Original strand, 27082790 - 27083029
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||  ||||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  27082790 agtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgcggggtgttagacttaaaacatggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 27082889  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
     |||||||||||| |||||| |  |||| ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  27082890 ttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttaatgccactgcacaaacagtggggtgttactcactacacttttgatgctatagtgttaacttca 27082989  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
     || |||||||| | |  ||||||| |  |||||||||||    
T  27082990 ccagaaaagtcagtctgatgacttcaccatagaattttcc 27083029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 69 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 43025940 - 43025741
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  43025940 agttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacattttgtggggtgttacagttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattcttcttagt 43025841  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| ||| ||     ||| ||||||| ||  ||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||||    
T  43025840 ctgatgaattgatgatattatatgaactgaacttttaataccattgtacaaagagtggggtattaatcacaacacttttgatactatatcgttaacttca 43025741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Original strand, 43643547 - 43643786
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| || ||||||| ||||||||| || || |||| |||||||| |    
T  43643547 agttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaat 43643646  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||| ||||| |||||| | ||| | |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  43643647 ctgatgagttgatgatactatgaagattgaactttggatgtcattgtacaaacagtagagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 43643746  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
     ||||| ||||| | || ||||||| |  |||||||||||    
T  43643747 ccaaaatagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 43643786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 309
Target Start/End: Original strand, 5299904 - 5300138
Alignment:
Q  75 tgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatg 174  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5299904 tgatatcatttgataatcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatg 5300003  T
Q  175 aattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaa 274  Q
    ||||||| ||||||    |||| ||||||||||| || |||||||| ||| | ||| |||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||  ||||    
T  5300004 aattgatgatactataaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtagagtgctacttacaacacttttgatgctatagtgttaacttcattaaaa 5300103  T
Q  275 aagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcca 309  Q
    |||||| | || ||||||| |  ||||||||||||    
T  5300104 aagtcattctcatgacttcaccatagaattttcca 5300138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 68 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16223102 - 16222862
Alignment:
Q  68 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||| |||| || ||||||||| ||||| |||| ||||||||     
T  16223102 aagttgatgatattatgtgatactcttaagtgttacactttttggggtgttacgtttaaaacaaggaaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaa 16223003  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
    || ||||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||   ||||||| | |||||||||  |||| |||||| |||    
T  16223002 tcggatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaactgtggggaactactcactatattttttatgttatagtgttaaattc 16222903  T
Q  268 aacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
    | || |||||||| | || ||| ||| | ||||||||||||    
T  16222902 accagaaaagtcattctcatgatttcaccgtagaattttcc 16222862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 68 - 247
Target Start/End: Original strand, 1149583 - 1149762
Alignment:
Q  68 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| || ||||||  ||||||||| ||||| |||| ||||||||     
T  1149583 aagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaa 1149682  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttt 247  Q
    |||||||| ||||| |||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||    
T  1149683 tctgatgagttgatgatactatgaggacagaacttttgatgtcattgtacaaacagtgggttgttactcattacattttt 1149762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 69 - 276
Target Start/End: Original strand, 30654535 - 30654742
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||| || |||   |||||||| ||||| |||| ||||||||      
T  30654535 agtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaatgtatggtaaaattaaattaagtgtagtcttgttaac 30654634  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    |||||||| |||| |||||| | || || ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||||    
T  30654635 ctgatgaagtgatgatactatgaaggctgaacttttgatgtcattcaacaaacagtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttca 30654734  T
Q  269 acaaaaaa 276  Q
     |||||||    
T  30654735 ccaaaaaa 30654742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 96 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 466053 - 465856
Alignment:
Q  96 agtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagac 195  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||    
T  466053 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggac 465954  T
Q  196 taaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtcaatttcgtgacttc 293  Q
    | || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||  |||  ||||||||||| || |||||||| |||  |||||||    
T  465953 tgaatttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatcgtgttaacttcaccacaaaagtcattttaatgacttc 465856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 69 - 309
Target Start/End: Original strand, 41910940 - 41911180
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  41910940 agttggtgatatcatgtgatagtattaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaat 41911039  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagt-ggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
    ||||||||||||| |||||| |  |||| || ||||||||  | |||   |||||| |||||||||||||| ||| |||| ||  |||| | ||||||||    
T  41911040 ctgatgaattgatgatactatgttgactgaatttttgatgctactgttataatagtgggggtgttactcacgacacttttgatgatatagtattaacttc 41911139  T
Q  268 aacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcca 309  Q
    | ||||||| || || || |||||||   |||||||||||||    
T  41911140 accaaaaaaatc-atatcatgacttcatcgtagaattttcca 41911180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 69 - 280
Target Start/End: Original strand, 8803769 - 8803973
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||| |||| || ||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||      
T  8803769 agttgatgatattatgtgatagtattaagtgttacactttttagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaac 8803868  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||| ||||||| ||       || || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  8803869 ctgataaattgatgat-------aggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 8803961  T
Q  269 acaaaaaagtca 280  Q
     |||||||||||    
T  8803962 ccaaaaaagtca 8803973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 276
Target Start/End: Original strand, 31933840 - 31934045
Alignment:
Q  71 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtct 170  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| | ||| |||  |||| || ||||||  ||||||||| ||||| |||| |||||||| ||     
T  31933840 ttgatgatattatgtgataattttaagtgttacactttgtgcggtattatgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcg 31933939  T
Q  171 gatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaac 270  Q
    ||||||||||| ||||||    |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | |||||| |||  ||| ||||||||||| |    
T  31933940 gatgaattgatgatactataatgactgaacttttgatgtcattgtataaagagtggggtgttactcattatatttttgatatcatagtgttaacttcacc 31934039  T
Q  271 aaaaaa 276  Q
    ||||||    
T  31934040 aaaaaa 31934045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 34895198 - 34894966
Alignment:
Q  71 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtct 170  Q
    |||||||||||||||||||||     |||||| | |||| |||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||    
T  34895198 ttgatgatattatgtgatagt-----gtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatct 34895104  T
Q  171 gatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaac 270  Q
    ||||||||||| ||| || |  |||| ||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||| ||| | || ||  |||| ||||||||||| |    
T  34895103 gatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttatagtgttaacttcatc 34895004  T
Q  271 aaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
    | |||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||    
T  34895003 agaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcc 34894966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 308
Target Start/End: Original strand, 1150092 - 1150296
Alignment:
Q  104 actttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagactaaacttt 203  Q
    |||||| |||||||||| |||| || ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| |  |||| ||||||    
T  1150092 actttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaacttt 1150191  T
Q  204 tgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaat 303  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||  |||||||| ||  ||||  |||||||||| ||||||||||| | |  ||||||| |  ||||||    
T  1150192 tgatgtcgttgtacaaacagtgggatgttactcattacatttttgatgttatagcgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaat 1150291  T
Q  304 tttcc 308  Q
    |||||    
T  1150292 tttcc 1150296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 308
Target Start/End: Original strand, 34952028 - 34952222
Alignment:
Q  114 gtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcatt 213  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||  | |||| |||||||||||||| |    
T  34952028 gtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatttgatgaattgatgatactaaagggactgaacttttgatgtcact 34952127  T
Q  214 gtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||  |||| ||||||||| | || |||||||| |||  ||||||  |  |||||||||||    
T  34952128 gtacaaacagtgggctgttactcacaacacttttgatgatatagtgttaacttgaccagaaaagtcattttaatgactttactatagaattttcc 34952222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 41362707 - 41362517
Alignment:
Q  115 tgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattg 214  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||||| || | || |||||||| |||||||||||||| |||||| |  | || |||||||||||||| |     
T  41362707 tgttacacttaaaacaaggtatgataaaattatatcaagtttagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggtctgaacttttgatgtcacta 41362608  T
Q  215 tacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||   ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| |  |||||||||||    
T  41362607 tacaaatagtggggtgttactcactacattttt-atgctag--tgttaacttcaccaaaaaagtcattttcataacttcaccatagaattttcc 41362517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 69 - 181
Target Start/End: Original strand, 4132638 - 4132749
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  4132638 agttgatgatattatgtgatagtcttatgtgttacactttgtggggtgttacactt-aaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 4132736  T
Q  169 ctgatgaattgat 181  Q
     ||||||||||||    
T  4132737 ttgatgaattgat 4132749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 69 - 235
Target Start/End: Original strand, 39099071 - 39099237
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||| | ||||  ||||||||| ||||| |||||| |||||| |    
T  39099071 agttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgatactttgtgggatgttacacttaaaacagggtaagataaaattagattaagtgtatttttgttaat 39099170  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttact 235  Q
    ||||||||||||  |||||| |  |||| |||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||    
T  39099171 ctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgctagtgtacaaagagtggggtgttact 39099237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 69 - 231
Target Start/End: Original strand, 1953940 - 1954104
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcgggg-tgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||| | |||| || | |||     
T  1953940 agttgatgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagatttagtgtagtcatattaa 1954039  T
Q  168 tctgatgaattgata-atactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgt 231  Q
    ||||||||||||||| |||||| |  | || ||||||||||| || ||| |||||||| ||||||    
T  1954040 tctgatgaattgatagatactatgagggctgaacttttgatgccactgtccaaatagtagggtgt 1954104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 33906450 - 33906316
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||  |||||| ||||||| ||||||  ||||||||| ||||| || | |||||||| |    
T  33906450 agttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttttggaatgttacccttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaat 33906351  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttt 203  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||    
T  33906350 ctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttt 33906316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 69 - 233
Target Start/End: Original strand, 7890909 - 7891073
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||| |||| || || |||  |||||| || ||| | |||| |||||||| |    
T  7890909 agttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacacgttgtggggtgttacgcttataacaaagtaagataaaactagattgagtgtagtcttgttaat 7891008  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgtta 233  Q
    ||||||||||||| ||| || |  |||  ||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||    
T  7891009 ctgatgaattgatgatattatgaggaccgaacttttgatgccattgtacaaacggtggagtgtta 7891073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 219
Target Start/End: Original strand, 35459665 - 35459813
Alignment:
Q  71 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtct 170  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | | || ||| ||||||| ||| || || |||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||    
T  35459665 ttgatgatattatgtaatagtcttaagtgttataatctgtgggatgttacatttataacaaagtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatct 35459764  T
Q  171 gatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaa 219  Q
    ||||| ||||| ||| || |  |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  35459765 gatgagttgatgatattatgaggactgaacttttaatgtcattgtacaa 35459813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 44869736 - 44869525
Alignment:
Q  68 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaa-ttatattaattgtattcttgtta 166  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||    |||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||||||    
T  44869736 aagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacactttgtggggaca-acacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattattgtta 44869638  T
Q  167 gtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacat--tttttatactataatgttaac 264  Q
     |||||| ||||||| |||||| |  || | |||||||||||||||||| |||| |||||||  | |||||||| ||  |||| ||  |||| |||||||    
T  44869637 atctgataaattgatgatactatgacgattgaacttttgatgtcattgtgcaaacagtgggg-atcactcacaaaatacttttaatgttatagtgttaac 44869539  T
Q  265 ttcaacaaaaaagt 278  Q
    |||| |||||||||    
T  44869538 ttcaccaaaaaagt 44869525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 18259298 - 18259229
Alignment:
Q  92 cttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattct 161  Q
    |||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||    
T  18259298 cttaggtgttacactttgtgggatgttacacttaaaataaggtatgataaaattaaattaaatgtattct 18259229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 7998488 - 7998420
Alignment:
Q  114 gtgttacacttaaaataaggtagaataaaa-ttatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgat 181  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  7998488 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgtattgat 7998420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 12585353 - 12585297
Alignment:
Q  70 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaa 126  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  12585353 gttgatgatgttatgtgatagtattaagtgttagattttgtggggtgttacacttaa 12585297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 33198002 - 33197948
Alignment:
Q  154 tgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatg 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||    
T  33198002 tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatggagactgaacttttgatg 33197948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 126
Target Start/End: Original strand, 24823338 - 24823395
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaa 126  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  24823338 agttgttgatatcatgtgataatcttgagtattatactttgtggggtgttacacttaa 24823395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 71 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 34133163 - 34132941
Alignment:
Q  71 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtct 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  34133163 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtgtattcttattagtct 34133064  T
Q  171 gatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaac 270  Q
    ||||||||||| ||| || || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |    
T  34133063 gatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatactatagtgttaatttcacc 34132964  T
Q  271 aaaaaagtcaatttcgtgacttc 293  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  34132963 aaaaaagtcattttcgtgacttc 34132941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 69 - 293
Target Start/End: Original strand, 24488908 - 24489132
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  24488908 agttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgttacaccttgtgaggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttagt 24489007  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| ||| || || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  24489008 ctgatgaattgatgataatatggggactgaacttttgatgtcattgtgcaaacagtggaatgttactcacaacatttttaatactatagtcttaacttca 24489107  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttc 293  Q
      |||||| ||| ||||||||||||    
T  24489108 caaaaaaaatcattttcgtgacttc 24489132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 71 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 37203295 - 37203057
Alignment:
Q  71 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtct 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||    
T  37203295 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgatacactaaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatct 37203196  T
Q  171 gatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaac 270  Q
     |||||||||| |||||| |  |||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||  |||| ||||||||||| |    
T  37203195 tatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaacttcatc 37203096  T
Q  271 aaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcca 309  Q
    |||||| ||| |||  ||||||| |  ||||||||||||    
T  37203095 aaaaaaatcatttttatgacttcaccatagaattttcca 37203057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 69 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 11467054 - 11466881
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  11467054 agttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaat 11466955  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaaca 242  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11466954 ctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaaca 11466881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 69 - 306
Target Start/End: Original strand, 46297708 - 46297945
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||| |||| | |||||| |    
T  46297708 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaagtttgattaagtgtagttttgttaat 46297807  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    || |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||    
T  46297808 ctaatgaattgatgatactacggggactgaacttttgacgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactatatttttgatgttatagtgttaacttca 46297907  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaatttt 306  Q
     || |||||||| |||| ||||||| |  |||||||||    
T  46297908 ccagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatttt 46297945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 71 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 37157935 - 37157698
Alignment:
Q  71 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtct 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||    
T  37157935 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatct 37157836  T
Q  171 gatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaac 270  Q
     || ||||||| |||||| |  |||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||| |||| ||  |||| ||||||||||| |    
T  37157835 tataaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgccactgtac-aacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaacttcatc 37157737  T
Q  271 aaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcca 309  Q
    ||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  37157736 aaaaaagccattttcatgacttcaccatagaattttcca 37157698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 68 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4015691 - 4015445
Alignment:
Q  68 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    |||||| |||||  ||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||     
T  4015691 aagttgttgatacaatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagactaattatattcttgttaa 4015592  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
    | |||||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||    
T  4015591 tatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactctacaaacagttgggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttc 4015492  T
Q  268 aacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttccatattt 314  Q
    | || |||||||| | || ||||||| |  |||||||||||||||||    
T  4015491 atcagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccatattt 4015445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 75 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 35844550 - 35844317
Alignment:
Q  75 tgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaa-ttatattaattgtattcttgttagtctgat 173  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  35844550 tgatatcatgtgata-tcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaactaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 35844452  T
Q  174 gaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaa 273  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |  |||| ||||||||||| || |    
T  35844451 gaattgatgatactatggggactaaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcacaacatttttgttgttatagtgttaacttcaccaga 35844352  T
Q  274 aaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
    ||||||| | || ||||||| |  |||||||||||    
T  35844351 aaagtcattatcatgacttcaccatagaattttcc 35844317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 47481752 - 47481546
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||      
T  47481752 agtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaataaggtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaac 47481653  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
     |||||||||||| |||||| |  | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  47481652 atgatgaattgatgatactatgagggctaaacttttgatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 47481553  T
Q  269 acaaaaa 275  Q
     ||||||    
T  47481552 ccaaaaa 47481546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 72 - 293
Target Start/End: Original strand, 3655151 - 3655372
Alignment:
Q  72 tgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctg 171  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||| || ||||||| |||  || ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  3655151 tgatgatatcatgtgatagttttaagtgttacattttgtggtgtgttacgcttctaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctg 3655250  T
Q  172 atgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaaca 271  Q
    |||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||||| | ||    
T  3655251 atgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactttatca 3655350  T
Q  272 aaaaagtcaatttcgtgacttc 293  Q
    ||||||||| |||  |||||||    
T  3655351 aaaaagtcatttttatgacttc 3655372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 69 - 280
Target Start/End: Original strand, 7327428 - 7327640
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||| |    
T  7327428 agttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacactagaaagaaggtaggataaaaataaattaagtgtattcttgttaat 7327527  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatg-ttaacttc 267  Q
    | ||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||  |||| || ||||||||    
T  7327528 ccgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaataatggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgtttaacttc 7327627  T
Q  268 aacaaaaaagtca 280  Q
    |  ||||||||||    
T  7327628 actaaaaaagtca 7327640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 70 - 237
Target Start/End: Original strand, 42506022 - 42506189
Alignment:
Q  70 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtc 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |  ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| ||    
T  42506022 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatc 42506121  T
Q  170 tgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactca 237  Q
    |||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  42506122 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtattactca 42506189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 99 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 29099555 - 29099374
Alignment:
Q  99 gttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagactaa 198  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| || |||| |    
T  29099555 gttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggcacgataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactga 29099456  T
Q  199 acttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtca 280  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||||||    
T  29099455 actttagatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacgacattttttatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtca 29099374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 69 - 276
Target Start/End: Original strand, 4761594 - 4761802
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcgggg-tgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||     
T  4761594 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttatactttgtgggggtgttatacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaa 4761693  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
    || ||||| ||||| |||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||  |||||||| ||| |||| | ||||||||    
T  4761694 tcagatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaagtgttactcattacatttttgatattatagtattaacttc 4761793  T
Q  268 aacaaaaaa 276  Q
    | |||||||    
T  4761794 accaaaaaa 4761802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 309
Target Start/End: Original strand, 51212955 - 51213167
Alignment:
Q  97 gtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagact 196  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| |  ||||    
T  51212955 gtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggact 51213054  T
Q  197 aaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtcaatttcgtgacttccca 296  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||  || | ||||||||||| ||||||||||| | || ||||||| |     
T  51213055 caacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttgctcattacattttttatgttacagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcacc 51213154  T
Q  297 gtagaattttcca 309  Q
     ||||||||||||    
T  51213155 atagaattttcca 51213167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 69 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 2008162 - 2007956
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||  |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||| |    
T  2008162 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgt-acacttaaaacgaggtaggataaaattagattaagtatattcttgttaat 2008064  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| || ||| || || | ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||| |||||||||||    
T  2008063 ctgatgaattgatgatgctatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttaacgctatagtgttaacttca 2007964  T
Q  269 acaaaaaa 276  Q
    | ||||||    
T  2007963 aaaaaaaa 2007956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 69 - 268
Target Start/End: Original strand, 33378731 - 33378930
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || | |||||||| |    
T  33378731 agttgatgagattatgcgatagtcttaagtattacacttcttggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaat 33378830  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||    
T  33378831 ctgatgaattgataatactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaatattggggtactactcactacacttttgatactatagtgttgacttca 33378930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 48355171 - 48354932
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||| ||| || ||||||| ||||||||| | ||| |||| |||||||| |    
T  48355171 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggtatgttacatttataacaaggtaggataaaattagactaagtgtagtcttgttaat 48355072  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||| ||||| |||||| |   ||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  48355071 ctgatgagttgatgatactatgagaactgaacttttgatgccattgtacaaacaatggggtgttactcattacatttttaatattatagtgttaacttca 48354972  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
     || |||| ||| | || ||||||| |  |||||||||||    
T  48354971 ccataaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcc 48354932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 69 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3362485 - 3362276
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaat--tgtattcttgtta 166  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||    
T  3362485 agttgatgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgtttcacttaaaataaggtaggataaaattagattaatagtgtagtcttgtta 3362386  T
Q  167 gtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaactt 266  Q
       |||||||||||| |||| | |  || | ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| | |||| | || ||||| |||||||||    
T  3362385 acatgatgaattgatgataccatgaggagtgaacttttgatgccactgtacaaatagtgggatgttactcactatatttctgatgctatagtgttaactt 3362286  T
Q  267 caacaaaaaa 276  Q
    || |||||||    
T  3362285 caccaaaaaa 3362276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 69 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21193837 - 21193591
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtctt-aagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    ||||| |||||| || |||||||||| ||||||||  ||||  || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  21193837 agttgctgatatcatatgatagtctttaagtgttatcctttatggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaa 21193738  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
    ||||||||||| || |||| | || |||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || | | | ||||||||||    
T  21193737 tctgatgaattaatgataccatggggactgaacttttgatgtcactctacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgattcaacagtgttaacttc 21193638  T
Q  268 aacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttccatattt 314  Q
    | || |||||||| | || ||||||  |  ||||||||||| |||||    
T  21193637 accagaaaagtcattctcatgactttaccatagaattttccttattt 21193591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 69 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 44891727 - 44891495
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  44891727 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaat 44891628  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||| |         | |||||| |||||||||||||| |||| ||  |||| ||||||||||     
T  44891627 ctgattaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgcc---------acagtgggatgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttc- 44891538  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttccata 311  Q
    || ||||||||| |||| ||||||| | ||| |||||||||||    
T  44891537 accaaaaagtcattttcatgacttcaccgtataattttccata 44891495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 68 - 293
Target Start/End: Original strand, 53229097 - 53229323
Alignment:
Q  68 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||     
T  53229097 aagttgatgatactatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggagttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaactgtagtcttgttaa 53229196  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtg-gggtgttactcacaacattttttatactataatgttaactt 266  Q
    |||||||||||||| ||| || |  |||| |||||||||||  | |||||||| | || ||||||| ||||| ||| |||| || ||||| |||||| ||    
T  53229197 tctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgatgcaactgtacaaacattgagggtgttgctcactacacttttgatgctatagtgttaattt 53229296  T
Q  267 caacaaaaaagtcaatttcgtgacttc 293  Q
    || || |||| | | |||| |||||||    
T  53229297 caccagaaaaataattttcatgacttc 53229323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 69 - 293
Target Start/End: Original strand, 52040868 - 52041093
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  52040868 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactatgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaat 52040967  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaata-gtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
    ||||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||||| || | |||||| |  ||||| ||||||||| ||| |||| ||  |||| | ||||||||    
T  52040968 ctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgccactatacaaacatttggggagttactcactacacttttgatgttatagtattaacttc 52041067  T
Q  268 aacaaaaaagtcaatttcgtgacttc 293  Q
    | || |||||||| | || |||||||    
T  52041068 accagaaaagtcattctcatgacttc 52041093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 96 - 247
Target Start/End: Original strand, 14586643 - 14586794
Alignment:
Q  96 agtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagac 195  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||    
T  14586643 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaagttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggac 14586742  T
Q  196 taaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttt 247  Q
     ||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  14586743 aaaacttttgatatcactgtataaatagtgaggtgttactcacaacactttt 14586794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 39282880 - 39282644
Alignment:
Q  71 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtct 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||    
T  39282880 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatct 39282781  T
Q  171 gatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaac 270  Q
    ||||||| ||| ||| || |   ||| ||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| ||| |||| ||  |||| |||||| || | |    
T  39282780 gatgaatggatgataatatgagaactgaacttttgatgccactgtataaacagtggggtattactcac-acagttttgatgttatagtgttaattttatc 39282682  T
Q  271 aaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
    | |||| ||| |||| ||||||| |  |||||||||||    
T  39282681 agaaaaatcattttcatgacttcaccatagaattttcc 39282644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 111 - 276
Target Start/End: Original strand, 44186489 - 44186654
Alignment:
Q  111 ggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtc 210  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||| | |||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||    
T  44186489 ggggtgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatttgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtc 44186588  T
Q  211 attgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaa 276  Q
    | |||| ||| || |||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  44186589 actgtataaacagcggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccaaaaaa 44186654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 69 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 53176284 - 53176074
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| | ||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  53176284 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttatatttaaaatgaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaat 53176185  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||| |||||||||| |||||    ||||| ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||    
T  53176184 ctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgttattgtacaaacagtggaca-ttacttacaacatttttgatgttatgatgttaacttca 53176086  T
Q  269 acaaaaaagtca 280  Q
     || ||||||||    
T  53176085 tcagaaaagtca 53176074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 21009749 - 21009926
Alignment:
Q  70 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtc 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||  |||| || ||| ||  ||||||||||||||| |||| ||||||||  |    
T  21009749 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagagtgttatgcttagaacaagttatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacc 21009848  T
Q  170 tgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttt 247  Q
    |||||||||||| ||| || |  | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21009849 tgatgaattgatgataatatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcattacattttt 21009926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 69 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 45174736 - 45174524
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaa-ttatattaattgtattcttgttag 167  Q
    ||||| |||||| || | |||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||     
T  45174736 agttgctgatatcatattatagtcttaagtgttacactttgtagagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattaaattaaatgtattcttgttaa 45174637  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttact--cacaacattttttatactataatgttaact 265  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||  | |||||||| ||||  ||||||||  ||||||| |||| ||  |||| ||||||||    
T  45174636 tctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgctactgtacaaacagtgaagtgttactcacacaacacttttgatgttatagtgttaact 45174537  T
Q  266 tcaacaaaaaagt 278  Q
    ||| |||||||||    
T  45174536 tcaccaaaaaagt 45174524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 68 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 54506038 - 54505827
Alignment:
Q  68 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||  |||| || ||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||     
T  54506038 aagtagatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagagtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaa 54505939  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
     | |||| ||| || ||||||  ||| || || ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||||||| ||  |||| ||||||||||    
T  54505938 cccgatgtatttatgatacta-tgaggctgaatttttgatgtcattctataaataatggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttc 54505840  T
Q  268 aacaaaaaagtca 280  Q
    |||||||||||||    
T  54505839 aacaaaaaagtca 54505827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 69 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25579969 - 25579770
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||| |    
T  25579969 agttgctgatatcatgtaatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacactaaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaat 25579870  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    || || || |||| ||| || || |||| |||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||| |||||||| |||| || ||||| | |||||||||    
T  25579869 ctaataaactgatgataatatggggactgaacttttgatgtcactgtataaatagtagaatgttattcacaacacttttgatgctatagtattaacttca 25579770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Original strand, 26941206 - 26941445
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||  | ||| |||| |||| || ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  26941206 agttgatgatattatatgatagttttaagtgttacactttatgaggtattacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 26941305  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    |||||||||| || |||| | |  |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | | |||| ||  |||| |||||||||||    
T  26941306 ctgatgaattaatgataccatgaggactgaacttttgatgtcattatacaaacagtggggtgttactcattataattttgattttatagtgttaacttca 26941405  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
     ||||||| ||| | |  ||||||| |  |||||||||||    
T  26941406 ccaaaaaaatcattcttatgacttcaccatagaattttcc 26941445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Original strand, 40552205 - 40552444
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||| || ||| ||| |||||| |||| || ||| ||  ||||||||| ||||| |||| | |||||| |    
T  40552205 agttgatgatattatgtgacaatcctaagtgttacacgttgtgggatgttacgcttataacaagctaagataaaattaaattaagtgtagtgttgttaat 40552304  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| ||| || |  |||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||  |||||||| ||  |||| ||||||||||     
T  40552305 ctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttct 40552404  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
     ||||||||||| | || ||||||| |  |||||||||||    
T  40552405 ccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 40552444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 69 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 43348487 - 43348319
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||  ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  43348487 agttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgtcacactttatgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaat 43348388  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcac 238  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||||| || |  ||||| ||||||||||| |||||    
T  43348387 ctgatgaattgatgatacta-aaagactgaacttttgatgccactaaacaaacagtggggtgttgctcac 43348319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 114 - 293
Target Start/End: Original strand, 11357355 - 11357535
Alignment:
Q  114 gtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||  | |    
T  11357355 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgcaact 11357454  T
Q  214 gtacaaatagt-ggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtcaatttcgtgacttc 293  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| | | |||| || ||||| ||||||||||| || |||||||| | || |||||||    
T  11357455 gtacaaacagtgggggtgttactcactatacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttc 11357535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 71 - 238
Target Start/End: Original strand, 24708063 - 24708230
Alignment:
Q  71 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatat--taattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||   || |||| |||||||| |    
T  24708063 ttgatgatattatgtgattgttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagatcaaaagtgtagtcttgttaat 24708162  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcac 238  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||||||||||||    
T  24708163 ctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcactgtac--acagtgaggtgttactcac 24708230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 76 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 33698376 - 33698265
Alignment:
Q  76 gatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatga 175  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  33698376 gatatcatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 33698277  T
Q  176 attgataatact 187  Q
    |||||| |||||    
T  33698276 attgatgatact 33698265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 276
Target Start/End: Original strand, 54828647 - 54828853
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||  |    
T  54828647 agttgatgatattatttgatagttttaagtgttacactttgtgggatgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttcat 54828746  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
     |||||||||||| || ||| | ||| | || |||||||||| ||||  |||  |||||||||||||||  ||| |||||||  |||| ||||||||| |    
T  54828747 atgatgaattgatgatgctatgaagaatgaatttttgatgtcgttgtttaaacggtggggtgttactcattaca-tttttatgttatagtgttaacttta 54828845  T
Q  269 acaaaaaa 276  Q
     |||||||    
T  54828846 ccaaaaaa 54828853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 305
Target Start/End: Original strand, 22446011 - 22446247
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||| | | |||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||  |    
T  22446011 agttgatgatattatatgatagtcttgagtgttatacattgtgag-tgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtcttatttat 22446109  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacg-gagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
     |||||||||||| |||||| | | |  | ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||    
T  22446110 atgatgaattgatgatactatgagggtttgaacttttgatgccactgtacaaa-agtggggtgttactcactatatttttgatgatataatgttaacttc 22446208  T
Q  268 aac-aaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattt 305  Q
    | | |||||||||| |||| ||||||| | |||||||||    
T  22446209 accaaaaaaagtcattttcatgacttcaccgtagaattt 22446247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 32373700 - 32373505
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  32373700 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtcacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaat 32373601  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaactt 266  Q
     |||||||||||| |||| |  | |    ||||||||||| || |||||||| |||  || ||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||    
T  32373600 atgatgaattgatgataccattggggtggaacttttgatgccactgtacaaacagt--ggagttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactt 32373505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 71 - 216
Target Start/End: Original strand, 46994609 - 46994754
Alignment:
Q  71 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtct 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| ||     
T  46994609 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggcgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatca 46994708  T
Q  171 gatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgta 216  Q
     |||| ||||| |||||| |  |||| |||||||||||||||||||    
T  46994709 tatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgta 46994754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 38591926 - 38591778
Alignment:
Q  71 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtct 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |   |||| ||||| |||||||| ||| ||| ||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||    
T  38591926 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtcacgttttgtggggtattacacttgaaacaagataggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatct 38591827  T
Q  171 gatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaa 219  Q
    ||||| ||||||||| || |  |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  38591826 gatgagttgataataatatgtggacttaacttttgatgccattgtacaa 38591778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22451198 - 22450959
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||| ||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||   |||||||| ||||| || | |||||||| |    
T  22451198 agttgatgatattatacgatagtgttaaatgttacacttactggggtgttacacttaaaacaaggtaaggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaat 22451099  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
     |||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||   |||||| |||| |||| ||||||| ||| |||| || ||||| |||| ||||||    
T  22451098 atgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccaccatacaaacagtgaggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttca 22450999  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
     || |||| ||| | || ||||||| |  |||||||||||    
T  22450998 ccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcc 22450959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 40936175 - 40935997
Alignment:
Q  114 gtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcatt 213  Q
    ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |  |||| |||||||||||||| |    
T  40936175 gtgttacacttaaaaaaagttgga-taaaattatattaagtgtattcttgttaatctgatgaatagatgatactatgaggactgaacttttgatgtcact 40936077  T
Q  214 gtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtcaatttcgtgacttc 293  Q
    ||| ||| | || |||||||||| ||||| |||| || ||||| ||||||||||| || |||| ||| | || |||||||    
T  40936076 gtataaacaatgaggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttc 40935997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 71 - 181
Target Start/End: Original strand, 22622666 - 22622776
Alignment:
Q  71 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtct 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||| ||||| |||| | |||||| |||    
T  22622666 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacgctttgtggggtgttacacttgaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatct 22622765  T
Q  171 gatgaattgat 181  Q
    |||||||||||    
T  22622766 gatgaattgat 22622776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 269
Target Start/End: Original strand, 43975861 - 43976034
Alignment:
Q  96 agtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagac 195  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||| || | | |||||| |||||||||||||| ||| || |  ||     
T  43975861 agtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaagataagataaaattagattaagtgcaattttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggat 43975960  T
Q  196 taaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaa 269  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||| || ||||| |||| |||||||    
T  43975961 taaacttttgatgtcatcgtacaaatagtggagtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaa 43976034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 96 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 29164021 - 29163912
Alignment:
Q  96 agtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagac 195  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |  |||    
T  29164021 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgatactaagaggac 29163922  T
Q  196 taaacttttg 205  Q
    | ||||||||    
T  29163921 tgaacttttg 29163912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 130 - 276
Target Start/End: Original strand, 20373303 - 20373449
Alignment:
Q  130 aaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggt 229  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||| | |   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20373303 aaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgataccatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggt 20373402  T
Q  230 gttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaa 276  Q
    |||||||   |||||||| ||  |||| | ||||||||| |||||||    
T  20373403 gttactcgttacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaa 20373449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 69 - 188
Target Start/End: Original strand, 11835573 - 11835693
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaa-attatattaattgtattcttgttag 167  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||  || |||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||| |||||| ||||||     
T  11835573 agttgatgatatcatgtgatagtcttaattgttacactttgtaggttgttacacttaaaacaaggtaggataaatattagattaagtgtatttttgttaa 11835672  T
Q  168 tctgatgaattgataatacta 188  Q
    | |||| ||||||| ||||||    
T  11835673 tatgataaattgatgatacta 11835693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 69 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 1089924 - 1089809
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcgggg-tgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| | |||| || ||||      
T  1089924 agttgttgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatttaatgtagtcctgttga 1089825  T
Q  168 tctgatgaattgataa 183  Q
    |||||| |||||||||    
T  1089824 tctgataaattgataa 1089809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 112 - 220
Target Start/End: Original strand, 27480368 - 27480476
Alignment:
Q  112 gggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtca 211  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| || | |||||||| | |||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||    
T  27480368 gggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtca 27480467  T
Q  212 ttgtacaaa 220  Q
      |||||||    
T  27480468 ccgtacaaa 27480476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 36012368 - 36012255
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaat-aaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||| |||| ||||||| || ||||||| ||||  ||||||||||||      
T  36012368 agttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtgggatgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaggtgtattcttgttca 36012269  T
Q  168 tctgatgaattgat 181  Q
    ||||||||||||||    
T  36012268 tctgatgaattgat 36012255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 2613971 - 2613896
Alignment:
Q  218 aaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtcaatttcgtgacttc 293  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||  |  |||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  2613971 aaatagtgtggtgttactcacaacacttttggtgttatagtgttaacttcaacaaaaaagtcattttaatgacttc 2613896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 142
Target Start/End: Original strand, 20373190 - 20373263
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaa 142  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||| | |||| |||| || ||||||| |||||    
T  20373190 agttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttatgggatattacgcttataacaaggtaggataaa 20373263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 107
Target Start/End: Original strand, 27480312 - 27480350
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactt 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27480312 agttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactt 27480350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 308
Target Start/End: Original strand, 55343403 - 55343469
Alignment:
Q  242 attttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |  |||||||||||    
T  55343403 atttttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 55343469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 109
Target Start/End: Original strand, 11357096 - 11357136
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttg 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  11357096 agttgatgatattatatgatagtcttgagtgttacactttg 11357136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 224 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 33698263 - 33698219
Alignment:
Q  224 tggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  33698263 tggggtgttactcacaacatttttgatgttatagtgttaacttca 33698219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 69 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4167161 - 4166916
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  4167161 agttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagt 4167062  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||| | |||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4167061 ctgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactataatgttaacttca 4166962  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttccatattt 314  Q
     || |||||||| |||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  4166961 ccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccttattt 4166916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 69 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 3177178 - 3176941
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  3177178 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttcttagt 3177079  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||| ||| |||| | |||||||||    
T  3177078 ctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagttgcgtgttactcaaaacatttttgatattatagtattaacttca 3176979  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaatttt 306  Q
     || |||||||| |||||| ||||| |  |||||||||    
T  3176978 tcagaaaagtcattttcgtaacttcaccatagaatttt 3176941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 69 - 311
Target Start/End: Original strand, 33550951 - 33551192
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| || |||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  33550951 agttgatgatattatacg-tagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaacgtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 33551049  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  33551050 ctgatgaattgatgatactatgaagaccgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcactacatttttgatgttatagtgttaacttca 33551149  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttccata 311  Q
      |||||||||| | || ||||||| | |||||||||||||||    
T  33551150 ctaaaaaagtcattctcatgacttcaccgtagaattttccata 33551192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 69 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 44913903 - 44913661
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcgggg-tgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  44913903 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggggtgttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtattcttgttag 44913804  T
Q  168 tctgatgaattgataatacta-cggagactaaacttttgatgtcattgtacaaa-tagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaact 265  Q
    |||||||||||||| ||||||  || || | ||||||| |||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  44913803 tctgatgaattgatgatactatgggggattgaactttttatgtcattttacaaacaagtgaggtgttactcacaacatttttgatactacagtgttaact 44913704  T
Q  266 tcaacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcca 309  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||    
T  44913703 tc-acataaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 44913661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 71 - 308
Target Start/End: Original strand, 17071703 - 17071940
Alignment:
Q  71 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtct 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||    
T  17071703 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatct 17071802  T
Q  171 gatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaac 270  Q
    ||||||||||| |||||| | | ||  ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| || ||||||||  |  |||| ||||||||||| |    
T  17071803 gatgaattgatgatactatgaataccgaacttttgatgtcattgtacaaataatgagatgttacttactacatttttgttgttatagtgttaacttcacc 17071902  T
Q  271 aaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
    |||||||||| |  | ||||||| |  |||||||||||    
T  17071903 aaaaaagtcattcgcatgacttcaccatagaattttcc 17071940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Original strand, 4264040 - 4264280
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgt-gatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||     
T  4264040 agttgctgatatcatgttgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaaacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttcttaa 4264139  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||     
T  4264140 tatgatgaattgataatactatggagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttt 4264239  T
Q  268 aacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
    | || |||||||| | |  ||||||| |  |||||||||||    
T  4264240 accagaaaagtcattatgatgacttcaccatagaattttcc 4264280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Original strand, 29242102 - 29242341
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| | |||||| |    
T  29242102 agttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaat 29242201  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||  || |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||  |||| | |||||||||    
T  29242202 ctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgataccactgtacaaacagtggggtgttacgcactatattttttatgttatagttttaacttca 29242301  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
     |||||||  || |||| ||||||| |  |||||||||||    
T  29242302 ccaaaaaaaccattttcatgacttcaccatagaattttcc 29242341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 71 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4763868 - 4763692
Alignment:
Q  71 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtct 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||| |||    
T  4763868 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgctacacttgaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagttttgttaatct 4763769  T
Q  171 gatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttt 247  Q
    ||||||||||| |||||| ||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4763768 gatgaattgattatactatgggaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcactacagtttt 4763692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Original strand, 27349930 - 27350109
Alignment:
Q  96 agtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagac 195  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||    
T  27349930 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaagg-gac 27350028  T
Q  196 taaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaa 276  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  27350029 tgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgtggtgttactcacaacatttttgatgctatagtgttaacttcaccaaaaaa 27350109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 68 - 275
Target Start/End: Original strand, 43648208 - 43648415
Alignment:
Q  68 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| || ||||||  ||||||||| ||||| |||| ||||||||     
T  43648208 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttatactttgtgtggtgttacacttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaa 43648307  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
    |||||||| ||||| |||||| |  |||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||  |||| ||||||||||    
T  43648308 tctgatgagttgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcattatacaaacagtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttc 43648407  T
Q  268 aacaaaaa 275  Q
    | ||||||    
T  43648408 accaaaaa 43648415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 293
Target Start/End: Original strand, 39167333 - 39167551
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||      ||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||| |    
T  39167333 agttgatgatattatgtgatagt------tgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtataataaaattagaataagtgtattcttgttact 39167426  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    || |||||||||| |||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||| |||||||  |||||||||||    
T  39167427 ctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaggtgttactcacaatacttttgatactattctgttaacttca 39167526  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttc 293  Q
     ||||||| ||| | ||||||||||    
T  39167527 tcaaaaaaatcattctcgtgacttc 39167551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 69 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 37905949 - 37905740
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcgggg--tgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgtta 166  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||  |||||| |||| || ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37905949 agttaatgatattatgcgatagttttaagtgttacactttgtggggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgtta 37905850  T
Q  167 gtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaactt 266  Q
     |||||||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||   |||||||||||  |||| |||||||||    
T  37905849 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcgttacattttttatgttatagtgttaactt 37905750  T
Q  267 caacaaaaaa 276  Q
    || |||||||    
T  37905749 caccaaaaaa 37905740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 69 - 277
Target Start/End: Original strand, 19424592 - 19424800
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||  |||||||||||| |    
T  19424592 agttgctgatatcatgtgatagtcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagcgtattcttgttaat 19424691  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||| || | || ||| | ||||||||||||||||||| |||| ||  |||| |||||||||||    
T  19424692 ctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccactatataaacaatggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttca 19424791  T
Q  269 acaaaaaag 277  Q
     || |||||    
T  19424792 ccagaaaag 19424800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 68 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 44286189 - 44285989
Alignment:
Q  68 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||     
T  44286189 aagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattattgttaa 44286090  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
    ||||||||||| || |||||| |  |||||||||||||||| || | |||||| |||| | | || ||| ||||| |||| || ||||| ||||||||||    
T  44286089 tctgatgaatttatgatactatgtggactaaacttttgatgccactatacaaacagtgagatattgctcgcaacacttttgatgctatagtgttaacttc 44285990  T
Q  268 a 268  Q
    |    
T  44285989 a 44285989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 71 - 308
Target Start/End: Original strand, 17054062 - 17054299
Alignment:
Q  71 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtct 170  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||  |||||||| |||    
T  17054062 ttgatgatattatgtgatagtnttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatct 17054161  T
Q  171 gatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaac 270  Q
    ||||||||||| ||| || | | ||   |||||||||||||||||||||| | || | ||||||| || |||||||| ||  |||| | ||||||||| |    
T  17054162 gatgaattgatgatattatgaataccgnacttttgatgtcattgtacaaacaatgagatgttacttactacatttttgatgttatagtattaacttcacc 17054261  T
Q  271 aaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
    |||||||||| |  | ||||||| |  |||||||||||    
T  17054262 aaaaaagtcattcgcatgacttcaccatagaattttcc 17054299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 96 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19314063 - 19313850
Alignment:
Q  96 agtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagac 195  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  | |||    
T  19314063 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattcgattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatag-gac 19313965  T
Q  196 taaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtcaatttcgtgacttccc 295  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| || |||||||| | |  ||||||| |    
T  19313964 tgaacttttgatgtcactgtataaatagtaaggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaacttcaccagaaaagtcattctaatgacttcac 19313865  T
Q  296 agtagaattttccat 310  Q
      |||||||||||||    
T  19313864 catagaattttccat 19313850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 69 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 36642227 - 36641988
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaa--ttatattaattgtattcttgtta 166  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||||||||    
T  36642227 agttgctggtatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaaattagattaagtgtattcttgtta 36642128  T
Q  167 gtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaactt 266  Q
     | |||||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||| |||| || ||||| | |||| ||    
T  36642127 atttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtattaattt 36642028  T
Q  267 caacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaatttt 306  Q
    || || |||||||| | || ||||||| |  |||||||||    
T  36642027 caccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 36641988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 69 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13711698 - 13711492
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| | ||| |||||  |||||||||||||||||| | |     ||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  13711698 agttgctgatatcatgtcatagtcttaactattatactttatggggtgttacacttaaaacatg-----ataaaattagattaaatgtattcttgttaat 13711604  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| |||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  13711603 ctgatgaattgatgataccatgtggactaaacttttgatgtcactgtacaaactgtggggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaacttca 13711504  T
Q  269 acaaaaaagtca 280  Q
     || ||||||||    
T  13711503 ccagaaaagtca 13711492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 69 - 280
Target Start/End: Original strand, 19289287 - 19289498
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||| || || |||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||| |    
T  19289287 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacatttataacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtcttattaat 19289386  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||| ||||| |||||  |   ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||||| ||  |||| |||||||||||    
T  19289387 ctgatgagttgatgatactgtgagaacttaacttttgatgtcattgtacaaacaatggggtgttactcattatatttttgatgttatagtgttaacttca 19289486  T
Q  269 acaaaaaagtca 280  Q
     |||||||||||    
T  19289487 tcaaaaaagtca 19289498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 69 - 278
Target Start/End: Original strand, 31570698 - 31570907
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  31570698 agttgttgatatcatgtgacagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaat 31570797  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    |||||||||| || |||||| |  |||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||| |||| ||  |||| |||||| ||||    
T  31570798 ctgatgaattcatgatactatgtggactgaacttttgatgtcactataaaaatagtggggtgttacttacaacacttttaatgttatagtgttaatttca 31570897  T
Q  269 acaaaaaagt 278  Q
     || ||||||    
T  31570898 ccagaaaagt 31570907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 69 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 4478604 - 4478402
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaa-ttatattaattgtattcttgttag 167  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||     |||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||     
T  4478604 agttggtgatatcatgtgatagacttaagtgttacactttg-----tgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaa 4478510  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
    |||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||  |||| ||||||||||    
T  4478509 tctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccactgtacaaacaatggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttc 4478410  T
Q  268 aacaaaaa 275  Q
    | ||||||    
T  4478409 accaaaaa 4478402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 69 - 280
Target Start/End: Original strand, 11366345 - 11366556
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||   ||| || ||| ||  ||||||||||||||| |||| ||||||||      
T  11366345 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgtttagaacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttgttaac 11366444  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| |||||| |  | || |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||  |||||||| ||  |||| |||||| ||||    
T  11366445 ctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattatacaaatagtgagatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaatttca 11366544  T
Q  269 acaaaaaagtca 280  Q
     |||||||||||    
T  11366545 ccaaaaaagtca 11366556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Original strand, 43770830 - 43771010
Alignment:
Q  96 agtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagac 195  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| || || |||    
T  43770830 agtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggcaggataaaattaaattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggac 43770929  T
Q  196 taaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaa 276  Q
    | ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||  |||| ||||||||||| |||||||    
T  43770930 tgaacttttgatgccactgtataaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaa 43771010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 69 - 268
Target Start/End: Original strand, 33709196 - 33709395
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||| |    
T  33709196 agttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagcgtattcttgttaat 33709295  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||  | ||||| |||||| || |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||| |||| ||  |||| |||||||||||    
T  33709296 ctgaatatttgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtactaacagtggagtgttactcgcaacacttttgatgttatagtgttaacttca 33709395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 71 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 26357814 - 26357592
Alignment:
Q  71 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtct 170  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| |||  |||||||| | |    
T  26357814 ttgataatattatgtgatagttttaagtgttacaatttgtgggatgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtgatcttgttaatat 26357715  T
Q  171 gatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaac 270  Q
    |||||||||||||  |||     ||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||| |||| ||  |||| ||||||||||| |    
T  26357714 gatgaattgataactctataagaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttcatc 26357615  T
Q  271 aaaaaagtcaatttcgtgacttc 293  Q
    | |||||||| |||| |||||||    
T  26357614 agaaaagtcattttcatgacttc 26357592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 71 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 41961077 - 41960939
Alignment:
Q  71 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtct 170  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||    
T  41961077 ttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatct 41960978  T
Q  171 gatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgt 209  Q
    ||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||||||    
T  41960977 gatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgt 41960939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 266
Target Start/End: Original strand, 33660360 - 33660529
Alignment:
Q  97 gtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagact 196  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||| |  ||||    
T  33660360 gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcctgttaatctaatgaattgatgatactaagaggact 33660459  T
Q  197 aaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaactt 266  Q
     ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||| |||||||||    
T  33660460 gaacttttgatgccactgtacaaacagttgggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 33660529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 69 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 33902305 - 33902124
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||||| | || |||||||| |    
T  33902305 agttaatgatattatgtgatactattaagtgttacactttgtggggtgctacccttaaaacaaggtaggataaaattcgattaaatatagtcttgttaat 33902206  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttat 250  Q
    |||||||| |||| |||||  |  |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  33902205 ctgatgaactgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattttacaaacagtggggtattactcactacattttttat 33902124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 69 - 280
Target Start/End: Original strand, 41463814 - 41464025
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| | |||| | ||||||||| |||||| || |||  |||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  41463814 agttgttgatatcatgtgatagtcttaaatgttacattttgtgaggtgttacaattaaaacaaagtatgataaaattatattaaaagtattcttgttaat 41463913  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
     |||||||||||| |||||| |  || | ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||    
T  41463914 atgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgattttatagtattaacttca 41464013  T
Q  269 acaaaaaagtca 280  Q
     |||||| ||||    
T  41464014 ccaaaaatgtca 41464025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 268
Target Start/End: Original strand, 2325344 - 2325533
Alignment:
Q  71 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtct 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||        
T  2325344 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgtta---- 2325439  T
Q  171 gatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
        | ||||| |||||| |  |||| ||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||  |||||| | ||  |||| |||||||||||    
T  2325440 ----atttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccagtgtacaaacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatattgttaacttca 2325533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5881750 - 5881600
Alignment:
Q  96 agtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagac 195  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| || |||    
T  5881750 agtgttacactttgtgaggtattacacttaaaacaaggtatgataaa-ttagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggac 5881652  T
Q  196 taaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttt 247  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  5881651 tcaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacactttt 5881600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 69 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 35959135 - 35958905
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||| || ||||||| || |||||||||||| || | |||||||| |    
T  35959135 agttgatgatattatgtgatagtcttaactgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggat-aaattatattaagtgcagtcttgttaat 35959037  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
     ||||||||||||             || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||  |||| ||  |||||||    
T  35959036 atgatgaattgat------------gctgaacttttaatgtcattgtacaaacagtggggtgttgctcattacattttttatgttatagtggcaacttca 35958949  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttccatat 312  Q
     ||||||||||| |||  |||||||    |||||||||||||||    
T  35958948 ccaaaaaagtcatttttatgacttcatcatagaattttccatat 35958905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 69 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 45327959 - 45327817
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || | |||||||| |    
T  45327959 agtttatgatattatgcgatagtcttatgtgttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaat 45327860  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtca 211  Q
    ||||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||||||||    
T  45327859 ctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtca 45327817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 75 - 293
Target Start/End: Original strand, 18494251 - 18494456
Alignment:
Q  75 tgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatg 174  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |  ||||| | ||| |||||||||| | ||||||| ||||||||| || || |||||||| || | |||||||    
T  18494251 tgatatcatgtgatagtcttaagtgtgactctttgtgaggt-ttacacttaatacaaggtaggataaaattagatcaagtgtattctagtgaatctgatg 18494349  T
Q  175 aattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaa 274  Q
    ||||||| |||||| |  |||| |||||||||||||            |||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||| || ||    
T  18494350 aattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtc------------gtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaa 18494437  T
Q  275 aagtcaatttcgtgacttc 293  Q
    |||||| |||| |||||||    
T  18494438 aagtcattttcatgacttc 18494456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 7006930 - 7007054
Alignment:
Q  114 gtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcatt 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| || ||||||| |||||| ||  |||||||||||||||  | |    
T  7006930 gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatcttataaattgatgatactatgggaactaaacttttgatgctact 7007029  T
Q  214 gtacaaatagtggggtgttactcac 238  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||    
T  7007030 gtacaaacagtgggatgttactcac 7007054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 41465738 - 41465602
Alignment:
Q  71 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtct 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |  | |||||| | |||    
T  41465738 ttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagttcagtcttgtgaatct 41465639  T
Q  171 gatgaattgataatactacggagactaaacttttgat 207  Q
     |||||||||| ||| ||  | |||| ||||||||||    
T  41465638 aatgaattgatgatattatagggactgaacttttgat 41465602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 166
Target Start/End: Original strand, 18258251 - 18258348
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgtta 166  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  18258251 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttacacttaaaaaaatgtaggataaaattagattaagtttattcttgtta 18258348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 31862089 - 31861972
Alignment:
Q  71 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtct 170  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||| |||| || || |||   |||||||| ||||| |||| |||||||| |||    
T  31862089 ttgatgatattatgtgataattttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaatgtatgttaaaattagattaagtgtagtcttgttaatct 31861990  T
Q  171 gatgaattgataatacta 188  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  31861989 gatgaattgatgatacta 31861972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 205
Target Start/End: Original strand, 19501768 - 19501839
Alignment:
Q  133 gtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttg 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| | |||||| |||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||    
T  19501768 gtagaataaaattagattaaatgtagt-ttgttaatctgatgaattgatgatactatagagactgaacttttg 19501839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 280
Target Start/End: Original strand, 41051263 - 41051381
Alignment:
Q  163 gttagtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtca-ttgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgtt 261  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||||| || | ||||||||||||  ||||||  ||||||| |||| || ||||| | ||    
T  41051263 gttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactggtacaaatagtgaagtgttatacacaacacttttgatgctatagtatt 41051362  T
Q  262 aacttcaacaaaaaagtca 280  Q
    | ||||| || ||||||||    
T  41051363 agcttcatcagaaaagtca 41051381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 102
Target Start/End: Original strand, 19500879 - 19500912
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19500879 agttgataatattatgtgatagtcttaagtgtta 19500912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 153; Significance: 7e-81; HSPs: 57)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 69 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 4583133 - 4582893
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  4583133 agttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagt 4583034  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||| | |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  4583033 ctgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacatttttgatactatagtattaacttca 4582934  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcca 309  Q
     || |||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||    
T  4582933 ccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 4582893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 32432665 - 32432432
Alignment:
Q  70 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtc 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32432665 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattatattaactgtattcttgttagtc 32432566  T
Q  170 tgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaa 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||      ||| |||||||||||     
T  32432565 tgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatggggtgttactcacaacattttt-----gatagtgttaacttcac 32432471  T
Q  270 caaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
    || |||| ||| |||||||||||| |  |||||||||||    
T  32432470 cagaaaaatcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 32432432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 43686254 - 43686016
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  43686254 agttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagt 43686155  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||| | ||||||  | |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  43686154 ctgatgaattgttgatactatagggactgaacttttgatgccattgtacaaacagt-gggtgttactcacaacatttttgatattatagtgttaacttca 43686056  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
     | ||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||    
T  43686055 cccaaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 43686016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 68 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21991851 - 21991611
Alignment:
Q  68 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  21991851 aagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaa 21991752  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| || ||||| ||||||||||    
T  21991751 tctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgacactgtacaaacagtggggtgttactcgcaacaattttgatgctatagtgttaacttc 21991652  T
Q  268 aacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
    | || |||| ||| | || ||||||| |  |||||||||||    
T  21991651 accataaaaatcattctcatgacttcaccctagaattttcc 21991611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 69 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 6546733 - 6546534
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| |||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  6546733 agttgctgatatcatgtgataatattaagtgttatactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaat 6546634  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  6546633 ctgatgaattgatgatactatggatagtaaacttttgatgttactgtacaaatagtggggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtgttaacttca 6546534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Original strand, 32821000 - 32821239
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| ||||||| |||||| || ||||| |||| |||||||| |    
T  32821000 agttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaactaaattaactgtagtcttgttaat 32821099  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    || |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  32821100 ctaatgaattgatgatactacgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttatattgttaacttca 32821199  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
     ||||||| ||| |||| ||||||| |  |||||||||||    
T  32821200 ccaaaaaaatcattttcatgacttcaccatagaattttcc 32821239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 68 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 38258760 - 38258521
Alignment:
Q  68 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| || ||||||| ||||||||| ||||| || | ||||||||     
T  38258760 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaa 38258661  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
    |||||||||||||| |||||| |  || | |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  38258660 tctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacggtgtggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttc 38258561  T
Q  268 aacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttc 307  Q
    | ||||||| ||| |||  ||||||| | |||||||||||    
T  38258560 accaaaaaaatcatttttatgacttcaccgtagaattttc 38258521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 18797541 - 18797304
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  18797541 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 18797442  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||| ||||| |||||| |  || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    || |||||||||||    
T  18797441 ctgatgagttgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacattttttat--gttagtgttaacttca 18797344  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
     ||||||||||| | || ||||||| |  |||||||||||    
T  18797343 ccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 18797304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 69 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 37110088 - 37109846
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtaga--ataaaattatattaattgtattcttgtta 166  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| || |||||| |  ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  37110088 agttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtataggataaaattatattaagtgtagtcttgtta 37109989  T
Q  167 gtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaactt 266  Q
     |||||||||||||| ||| ||    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
T  37109988 atctgatgaattgatgatattataatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactt 37109889  T
Q  267 caacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcca 309  Q
    || ||||||||||| |||  ||||||| |  ||||||||||||    
T  37109888 caccaaaaaagtcatttttatgacttcaccatagaattttcca 37109846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 69 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8861499 - 8861258
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||| |    
T  8861499 agttgctgatatcatgtgatggtcttgagtgttacactttgcggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattgttgttaat 8861400  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||| ||||||| |||||| || |||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||| |||| |||| || ||||| ||||||||||     
T  8861399 ctgattaattgatgatactatggggacttaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttattcataacacttttgatgctatagtgttaacttcg 8861300  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttccat 310  Q
      | |||||||| | || ||||||| |  |||||||||||||    
T  8861299 cgagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccat 8861258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 7335008 - 7334769
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||      
T  7335008 agttgatgatattatctgataatcttaagtgttacactctgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaag 7334909  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||| ||||| |||||| |   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||  |||| |||||||||||    
T  7334908 ctgatgagttgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatattttatgttatagtgttaacttca 7334809  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
     ||||||||||| | ||  |||||| | ||||||||||||    
T  7334808 tcaaaaaagtcattctcacgacttcaccgtagaattttcc 7334769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 70 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 30055740 - 30055534
Alignment:
Q  70 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtc 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||| |  ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| ||    
T  30055740 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatc 30055641  T
Q  170 tgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaa 269  Q
    ||||||||| || |||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||| |||| |||||||||||     
T  30055640 tgatgaattaatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatattatagtgttaacttcat 30055541  T
Q  270 caaaaaa 276  Q
    |||||||    
T  30055540 caaaaaa 30055534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 96 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 12165939 - 12165726
Alignment:
Q  96 agtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagac 195  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||   | |||    
T  12165939 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacttaagggac 12165840  T
Q  196 taaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtcaatttcgtgacttccc 295  Q
    | ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || ||||| ||||||||||| || |||||||| |||   |||||| |    
T  12165839 ttaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacactttggatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttaacgacttcac 12165740  T
Q  296 agtagaattttcca 309  Q
     |||||||||||||    
T  12165739 cgtagaattttcca 12165726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 69 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22687453 - 22687229
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||| |    
T  22687453 agttgttgatatcatgagatagtcttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattattgttaat 22687354  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||  || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  22687353 ctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgataccactgcacaaacagtggagtgttactcacaacatttttgatgttatagtgttaacttca 22687254  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttc 293  Q
     || |||||||| | || |||||||    
T  22687253 tcagaaaagtcattctcatgacttc 22687229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 69 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27283958 - 27283718
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||| | || |||||||| |    
T  27283958 agttgataatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtatagtcttgttaat 27283859  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||| |||||||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  27283858 ctgataaattgataatactatgaggactgaacttttgatttcattgtacaaacggtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 27283759  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcca 309  Q
     ||||||| ||| |||  | ||||| |  ||||||||||||    
T  27283758 ccaaaaaaatcatttttataacttcaccatagaattttcca 27283718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Original strand, 17842531 - 17842772
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtaga--ataaaattatattaattgtattcttgtta 166  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||| || |||||| |  ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  17842531 agttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacgcttataacaaggtataggataaaattatattaagtgtagtcttgtta 17842630  T
Q  167 gtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaactt 266  Q
     |||||||||||||| ||| ||    |||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
T  17842631 atctgatgaattgatgatattataatgactgagcttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactt 17842730  T
Q  267 caacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
    || ||||||||||| |||  ||||||| |  |||||||||||    
T  17842731 caccaaaaaagtcatttttatgacttcaccatagaattttcc 17842772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23111406 - 23111180
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggta-ga-ataaaattatattaattgtattcttgtta 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| || ||| || ||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  23111406 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaagtatgatataaaattagattaagtgtagtcttgtta 23111307  T
Q  167 gtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaactt 266  Q
     ||| |||||||||| ||||||||  |  | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||  |||| |||||||||    
T  23111306 atctaatgaattgatgatactacgatggttgaacttttgatgccattgtacaaatagtggtgtgttactcacaatatttttgatgttatagtgttaactt 23111207  T
Q  267 caacaaaaaagtcaatttcgtgacttc 293  Q
    || || |||| ||| |||| |||||||    
T  23111206 caccagaaaaatcattttcatgacttc 23111180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 43925315 - 43925081
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||| | |||||| ||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  43925315 agttgatgatattatgtgattgtattaagtattaaacgttgtgaggtgttgcacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattattgttagt 43925216  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43925215 ctgat-agttgatgatactatgtagactgaacttttgatgtcattgtac----agtgaggtgttactcacaacattttttatactacaatgttaacttca 43925121  T
Q  269 -acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttc 307  Q
       |||||| ||| |||||||||||  | |||||||||||    
T  43925120 ctaaaaaaaatcattttcgtgactttaccgtagaattttc 43925081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 310
Target Start/End: Original strand, 5657428 - 5657669
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||| |    
T  5657428 agttgctgatatcatgcgatagtcttaagtattacactttgtgggctgttacacttaaaacaaagtaggataaaattaaattaagtgtatttttgttaat 5657527  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
     |||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||  |||| |||||||||||    
T  5657528 atgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttca 5657627  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttccat 310  Q
      | |||||||| | || ||||||| |  |||||||||||||    
T  5657628 ctagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccat 5657669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 274
Target Start/End: Original strand, 9355773 - 9355978
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  9355773 agttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtcttgttaat 9355872  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    |||||||||| |  ||| || |   |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  9355873 ctgatgaattaacgataatatgagaactaaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtattgctcactacattttttatgctatagtgttaaattca 9355972  T
Q  269 acaaaa 274  Q
     |||||    
T  9355973 ccaaaa 9355978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 68 - 276
Target Start/End: Original strand, 31579010 - 31579223
Alignment:
Q  68 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||     
T  31579010 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatagggtgttatacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaa 31579109  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaat-----agtggggtgttactcacaacattttttatactataatgtta 262  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||     ||||||||||||||||  |||||||| ||  |||| |||||    
T  31579110 tctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcattgtataaattaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtta 31579209  T
Q  263 acttcaacaaaaaa 276  Q
    |||||| |||||||    
T  31579210 acttcaccaaaaaa 31579223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 69 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 10481819 - 10481619
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| |||||  ||| |||||||| |    
T  10481819 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaagcgtagtcttgttaat 10481720  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagt-ggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  | |||||||||  |||| ||||||||||    
T  10481719 ctgatgaattgatgatactataaagactgaatttttgatgtcattgtacaaacagtgggggtgttactcattatattttttatgttatagtgttaacttc 10481620  T
Q  268 a 268  Q
    |    
T  10481619 a 10481619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 69 - 276
Target Start/End: Original strand, 27421327 - 27421533
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  27421327 agttgctgatatcatacgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaat 27421426  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||| |||| || ||| ||  | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||  |||| |||||||||||    
T  27421427 ctgataaatttatgatattatag-gactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttca 27421525  T
Q  269 acaaaaaa 276  Q
     |||||||    
T  27421526 ccaaaaaa 27421533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 114 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 26980492 - 26980326
Alignment:
Q  114 gtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcatt 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||| || || |||| ||||||||||| || |    
T  26980492 gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgccact 26980393  T
Q  214 gtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtca 280  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26980392 gtacaaaccgtggggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaacttcaccataaaagtca 26980326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 114 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 29173709 - 29173543
Alignment:
Q  114 gtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcatt 213  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||||||||||    
T  29173709 gtgtaacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 29173610  T
Q  214 gtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtca 280  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||| || ||||||||    
T  29173609 gtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgatactacagtgttaacttcaccagaaaagtca 29173543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 69 - 242
Target Start/End: Original strand, 15612706 - 15612879
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  15612706 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaat 15612805  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaaca 242  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||| ||||||||||| || | |||||| | |||||||||||||| ||||    
T  15612806 ctgatgaattgatgatattatagggactgaacttttgatgccactctacaaacactggggtgttactcataaca 15612879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 68 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24211956 - 24211744
Alignment:
Q  68 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || ||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||     
T  24211956 aagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtaggatgttacacttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaa 24211857  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
     ||||||||||||| |||||| |  | || ||||||||||| |||| || ||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||  |||| ||||||||||    
T  24211856 cctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccattctataaacagtagggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttc 24211757  T
Q  268 aacaaaaaagtca 280  Q
    | |||||||||||    
T  24211756 accaaaaaagtca 24211744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 69 - 293
Target Start/End: Original strand, 41765025 - 41765249
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | |||||||| |    
T  41765025 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtagagtaaaattagattaagtgcagtcttgttaat 41765124  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| |||||| |  ||||  |||||||||| ||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||| || ||||| | || |||| |    
T  41765125 ctgatgaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagtattgacttta 41765224  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttc 293  Q
     || |||||||| | || |||||||    
T  41765225 tcagaaaagtcattctcatgacttc 41765249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 69 - 293
Target Start/End: Original strand, 48928511 - 48928734
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| || | |||||||| |    
T  48928511 agttgatgatattatgcgatagtcttaagcattacactttctgaggtgttacacttaaaataatgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaat 48928610  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||  |||| |||| ||||||    
T  48928611 ctgatgaattgataatactatgg-gactgaacttttgatggcaccgtacaaatagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttca 48928709  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttc 293  Q
     || |||||||| | || |||||||    
T  48928710 ccagaaaagtcattctcatgacttc 48928734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 69 - 188
Target Start/End: Original strand, 15672709 - 15672828
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15672709 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagt 15672808  T
Q  169 ctgatgaattgataatacta 188  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  15672809 ctgatgaattgatgatacta 15672828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 68 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11071421 - 11071253
Alignment:
Q  68 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  ||| | ||||||     
T  11071421 aagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagcgtagtgttgttaa 11071322  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactc 236  Q
    |||||||||||||| |||||| |   ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  11071321 tctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtgttactc 11071253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 114 - 317
Target Start/End: Original strand, 12390622 - 12390825
Alignment:
Q  114 gtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcatt 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||| |    
T  12390622 gtgttacacttaaaagaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggacataacttttgatgtcact 12390721  T
Q  214 gtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttccatatt 313  Q
    | ||||| |||||| |||||||||  ||| |||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||| || |  ||||||| |  ||||||||||| | ||    
T  12390722 gcacaaacagtgggatgttactcattacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcgatctgatgacttcaccatagaattttccttttt 12390821  T
Q  314 taaa 317  Q
    ||||    
T  12390822 taaa 12390825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 69 - 280
Target Start/End: Original strand, 48928244 - 48928454
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||  | |||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| || | |||||||| |    
T  48928244 agttgatgatattatgcgatagtcttaagcattacactttctgaggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaat 48928343  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||  |||| |||| ||||||    
T  48928344 ctgatgaattgataatactatgg-gactgaacttttgatggcaccgtacaaatagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttca 48928442  T
Q  269 acaaaaaagtca 280  Q
     || ||||||||    
T  48928443 ccagaaaagtca 48928454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 69 - 310
Target Start/End: Original strand, 10359161 - 10359402
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattata-ttaattgtattcttgttag 167  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| | |||| |||| |||||||      
T  10359161 agttgatgttgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagatttaagtgtagtcttgttga 10359260  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
    |||||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||| ||| |||| || ||||||  |||| ||     
T  10359261 tctgatgaattgatgatacta-tcagactgaacttttgatgtcactgtataaatagtaggatgttactcactacacttttgatgctataagattaatttt 10359359  T
Q  268 aacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttccat 310  Q
    | || |||||||| | || ||||||| |  |||||||||||||    
T  10359360 accagaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattttccat 10359402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 69 - 293
Target Start/End: Original strand, 25691491 - 25691716
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||| |    
T  25691491 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtatttttgttaat 25691590  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggt-gttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
     |||||||||||||||||||     ||| |||| |||||| || |||||||| |||| |||  |||||||||| | |||| ||  |||| ||||||||||    
T  25691591 atgatgaattgataatactataagaactgaactgttgatgccactgtacaaacagtgaggtaattactcacaatacttttgatgttatagtgttaacttc 25691690  T
Q  268 aacaaaaaagtcaatttcgtgacttc 293  Q
    |  | |||||||| | || |||||||    
T  25691691 acgagaaaagtcattctcatgacttc 25691716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 69 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 37704371 - 37704252
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  37704371 agttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaat 37704272  T
Q  169 ctgatgaattgataatacta 188  Q
    ||||| ||||||| ||||||    
T  37704271 ctgataaattgatgatacta 37704252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 69 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 44598880 - 44598761
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  44598880 agttgttgatatcatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaaatgtattcttgttaat 44598781  T
Q  169 ctgatgaattgataatacta 188  Q
    |||||||||| || ||||||    
T  44598780 ctgatgaatttatgatacta 44598761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 69 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 37347235 - 37347012
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||| || |||  ||||||||| ||||| |||| || ||||| |    
T  37347235 agttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggagt-ttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcctgttaat 37347137  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
     | || ||||||| |||||| |  |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||  | |||||| ||  |||| | |||||||||    
T  37347136 ttaataaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcattatatttttgatggtatagtattaacttca 37347037  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttc 293  Q
     ||||||| ||| |||| |||||||    
T  37347036 ccaaaaaaatcattttcatgacttc 37347012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 94 - 292
Target Start/End: Original strand, 44413351 - 44413550
Alignment:
Q  94 taagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggag 193  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| ||||  ||||||| | |||||||||||  |||||| ||||    
T  44413351 taagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagccttgttaatttgatgaattgaagatactatggag 44413450  T
Q  194 actaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca-acaaaaaagtcaatttcgtgactt 292  Q
    ||  |||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||   |||||||||| |||| ||||||    
T  44413451 accgaacttttgatttcagtgtacaaacattggggtgttactcactatatttttgatgttatagtgttaacttcattaaaaaaagtcattttcatgactt 44413550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 69 - 266
Target Start/End: Original strand, 33688209 - 33688406
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| || |||||||||| | ||||| |||||  || ||||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  33688209 agttgctgatatcatatgatagtcttgaatgttacactttatggagtgttacacttaaaacaaagtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaat 33688308  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaactt 266  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||| || || ||||| ||| || ||||||||| |||| |||| ||  |||| |||||||||    
T  33688309 ctgatgaattgatgatactatagagactgaacttttgatgccactggacaaacagtaggatgttactcataacacttttgatgttatagtgttaactt 33688406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 293
Target Start/End: Original strand, 31520716 - 31520894
Alignment:
Q  114 gtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcatt 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||| |||||||| | | |||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||| |    
T  31520716 gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatgg-gactgaacttttgatgtcact 31520814  T
Q  214 gtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtcaatttcgtgacttc 293  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||| | |||||| ||  |||| | ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  31520815 gtacaaacaatggagtgttactcactatatttttgatggtatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttc 31520894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 164
Target Start/End: Original strand, 26588031 - 26588126
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgt 164  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26588031 agttgttgatatcatgtgatagtcttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgt 26588126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 175
Target Start/End: Original strand, 37703445 - 37703551
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| |||| |||| ||| |    
T  37703445 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtggtacactttgtgggatgttacacttaaaataagatatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 37703544  T
Q  169 ctgatga 175  Q
    |||||||    
T  37703545 ctgatga 37703551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 175
Target Start/End: Original strand, 46481075 - 46481182
Alignment:
Q  68 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||||||||| || |||||||||||||| || || | || ||||||||     
T  46481075 aagttaatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatgagatgttacacttaaaacaatgtagaataaaattacatcaagtatagtcttgttaa 46481174  T
Q  168 tctgatga 175  Q
    ||||||||    
T  46481175 tctgatga 46481182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 35353322 - 35353256
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggta 135  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  35353322 agttgatgatattatgagatagtcttaagtgttacattttctggggtgttacacttaaaacaaggta 35353256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 198 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 38053571 - 38053493
Alignment:
Q  198 aacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaa 276  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||  |||||||||||  |||| | ||||||||| |||||||    
T  38053571 aacttttgatgtcattgtacaaacagtagggttttactcattacattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaa 38053493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 266
Target Start/End: Original strand, 34362228 - 34362292
Alignment:
Q  202 tttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaactt 266  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||    
T  34362228 tttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactt 34362292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 38053675 - 38053637
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38053675 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 38053637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 159 - 308
Target Start/End: Original strand, 26524364 - 26524513
Alignment:
Q  159 tcttgttagtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataat 258  Q
    |||||||| | |||| ||||||| |||||| |  ||||  |||||||||| || || ||||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||  |||| |    
T  26524364 tcttgttaatatgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccactgcacaaacaatggagtgttagtcacaacatttttgatgttatagt 26524463  T
Q  259 gttaacttcaacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
    |||||| ||| || |||||||| | || ||||||| |  |||||||||||    
T  26524464 gttaacatcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 26524513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8299256 - 8299192
Alignment:
Q  242 attttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaatttt 306  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  8299256 atttttgatactatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 8299192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 29603614 - 29603566
Alignment:
Q  393 ccttttgcttcaaccatttctgctcctcaccaaactcaataaccaatca 441  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  29603614 cctttggcttcaaccatttcagctcctcaccaaattcaaaaaccaatca 29603566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 29173737 - 29173706
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29173737 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 29173706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 261
Target Start/End: Original strand, 32593181 - 32593327
Alignment:
Q  114 gtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcatt 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| || | | ||| || |||||||||||||| |||||   |||||| ||||||||||  ||      
T  32593181 gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaaatgcagttttgataatctgatgaattgatgatact-gtgagactgaacttttgataccacc 32593279  T
Q  214 gtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgtt 261  Q
     || ||| ||||||||| ||||||| ||| |||| || ||||| ||||    
T  32593280 atataaacagtggggtgctactcactacacttttaatgctatagtgtt 32593327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 107
Target Start/End: Original strand, 32593153 - 32593191
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactt 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  32593153 agttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactt 32593191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 35353233 - 35353123
Alignment:
Q  159 tcttgttagtctgatgaattgataatactacggagact-aaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataa 257  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||| || |||  |||||||||||  ||| ||||||| | ||||||| ||||||| ||| |||| || |||||     
T  35353233 tcttgttaatctgatgaattggtgatactatggggacagaaacttttgattccatcgtacaaacaatggggtgctactcactacacttttgatgctatag 35353134  T
Q  258 tgttaacttca 268  Q
    |||| ||||||    
T  35353133 tgttgacttca 35353123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 400 - 441
Target Start/End: Original strand, 29749687 - 29749728
Alignment:
Q  400 cttcaaccatttctgctcctcaccaaactcaataaccaatca 441  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  29749687 cttcaaccatttcagctcctcaccaaattcaaaaaccaatca 29749728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 213 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 37704238 - 37704182
Alignment:
Q  213 tgtacaaatagtggggtgttactcacaaca-ttttttatactataatgttaacttca 268  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  37704238 tgtacaaacaatggggtgttactcactacatttttttatgctatagtgttaacttca 37704182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 148; Significance: 7e-78; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 373 - 134
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  373 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttacacttaaaataagataggataaaattagattaaatgtattcttgttagt 274  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  273 ctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatactacagtgttaacttca 174  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
     || |||||||| |||||||||||| |  |||||||||||    
T  173 ccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 71 - 285
Target Start/End: Original strand, 94331 - 94545
Alignment:
Q  71 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtct 170  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||    
T  94331 ttgatgatattatgtaatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaagctagaataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatct 94430  T
Q  171 gatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaac 270  Q
     |||||||||| ||| || || ||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||| |    
T  94431 catgaattgatgatagtatggggaccaaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttataatgttaacttcatc 94530  T
Q  271 aaaaaagtcaatttc 285  Q
    | |||||||| ||||    
T  94531 agaaaagtcattttc 94545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 247
Target Start/End: Original strand, 408375 - 408552
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| | |||||||| |||| || ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  408375 agttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgttccactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 408474  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttt 247  Q
    ||||||||||||| |||||| |  |||| |||||||||| ||||| ||||||  ||  |||||||||||  ||||||||    
T  408475 ctgatgaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatttcattttacaaacggtaaggtgttactcattacattttt 408552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 50)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 69 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17167952 - 17167715
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  17167952 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagt 17167853  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    |||||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  17167852 ctgatgaattaatgatactatggagaatgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattataatgttaacttca 17167753  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaatttt 306  Q
     || |||||||| |||||| ||||| |  |||||||||    
T  17167752 tcagaaaagtcattttcgtaacttcaccatagaatttt 17167715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 69 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17173529 - 17173292
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  17173529 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagt 17173430  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    |||||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  17173429 ctgatgaattaatgatactatggagattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattataatgttaacttca 17173330  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaatttt 306  Q
     || |||||||| |||||| ||||| |  |||||||||    
T  17173329 tcagaaaagtcattttcgtaacttcaccatagaatttt 17173292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Original strand, 35021007 - 35021246
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| | |||||| |    
T  35021007 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaat 35021106  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    || |||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  35021107 ctaatgaattgatgatactacgaggacgaaacttttgacgccaatgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttataatgttaacttca 35021206  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
     || |||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||    
T  35021207 ccagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcc 35021246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 70 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27396854 - 27396618
Alignment:
Q  70 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtc 169  Q
    |||| |||||| ||| ||| ||||||||||| | |||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  27396854 gttgctgatatcatgcgatggtcttaagtgtgacactttatgggatgttacacttaaaacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatc 27396755  T
Q  170 tgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaa 269  Q
    |||||||||||| |||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||     
T  27396754 tgatgaattgatgatactatgaggacgaaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggtgttactcataacacttttaatgctataatgttaacttcac 27396655  T
Q  270 caaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaatttt 306  Q
    || |||||||| | || ||||||| |  |||||||||    
T  27396654 cagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 27396618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 70 - 278
Target Start/End: Original strand, 19089426 - 19089634
Alignment:
Q  70 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtc 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| | || |  ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| ||    
T  19089426 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcatatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatc 19089525  T
Q  170 tgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaa 269  Q
    |||||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||| |||| |||||||||||     
T  19089526 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattatacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatattatagtgttaacttcat 19089625  T
Q  270 caaaaaagt 278  Q
    |||||||||    
T  19089626 caaaaaagt 19089634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 32592305 - 32592121
Alignment:
Q  96 agtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagac 195  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||    
T  32592305 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggac 32592206  T
Q  196 taaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtca 280  Q
    | |||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  32592205 tgaacttttgatgtcactatacaaacagtggagtgttactctcaacacttttgatactgtagtgttaacttcatcaaaaaagtca 32592121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 96 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 37775879 - 37775670
Alignment:
Q  96 agtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagac 195  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |      
T  37775879 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaagggg-- 37775782  T
Q  196 taaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtcaatttcgtgacttccc 295  Q
      ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||| ||| |||  ||||||| |    
T  37775781 ggaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttaatattatagtgctaacttcaccaaaaaaatcattttaatgacttcac 37775682  T
Q  296 agtagaattttc 307  Q
     |||||||||||    
T  37775681 cgtagaattttc 37775670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 70 - 237
Target Start/End: Original strand, 37663714 - 37663881
Alignment:
Q  70 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtc 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |  ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| ||    
T  37663714 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatc 37663813  T
Q  170 tgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactca 237  Q
    |||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37663814 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactca 37663881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 68 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 49376207 - 49375964
Alignment:
Q  68 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||   |||||||  |||| |||||||||||| || ||  ||| ||||||||     
T  49376207 aagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacacattgtggggtgtataacttaaatcaaggcagaataaaattagatcaagcgtaatcttgttaa 49376108  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||    
T  49376107 tctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaagcagtggggtgttactcacgacacttttgatgctataatgttaacttc 49376008  T
Q  268 aaca-aaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttccat 310  Q
    | || ||||||||| | || ||||||| | ||||||||||||||    
T  49376007 accagaaaaagtcattctcatgacttcaccgtagaattttccat 49375964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 68 - 293
Target Start/End: Original strand, 25701027 - 25701253
Alignment:
Q  68 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcgggg-tgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgtta 166  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| | |||| || |||||    
T  25701027 aagttgatgatgttatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatttagtgtagtcctgtta 25701126  T
Q  167 gtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaactt 266  Q
     |||||||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  25701127 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtagggtgttactcactacacttttgatgttataatgttaactt 25701226  T
Q  267 caacaaaaaagtcaatttcgtgacttc 293  Q
     | ||||||||||| | || |||||||    
T  25701227 taccaaaaaagtcattatcatgacttc 25701253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 91 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 9139462 - 9139247
Alignment:
Q  91 tcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacg 190  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| |    
T  9139462 tcttaagtgttacactttgtagggtgttacagttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatg 9139363  T
Q  191 gagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtcaatttcgtgac 290  Q
    | || | ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  9139362 gggattgaactttttatgtcactgtacaaacggtggggtgttactcac--tattttttatgctataacgttaacttcaccaaaaaagtcaatttcatgac 9139265  T
Q  291 ttcccagtagaattttcc 308  Q
    ||| |  |||||||||||    
T  9139264 ttcaccatagaattttcc 9139247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 69 - 310
Target Start/End: Original strand, 28002958 - 28003199
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || | |||||||| |    
T  28002958 agttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaat 28003057  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    | ||||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||  |||| || ||| |||| || ||||| |||| ||||||    
T  28003058 ccgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtactactgactacacttttgatgctatagtgttgacttca 28003157  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttccat 310  Q
     || |||||||| | || ||||||| |  |||||||||||||    
T  28003158 ccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccat 28003199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 69 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 33341637 - 33341465
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  33341637 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtatattcttgttaat 33341538  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaaca 242  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  33341537 ctgatgaattgatgatactatgg-gactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttcctcgcaaca 33341465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 69 - 310
Target Start/End: Original strand, 55241077 - 55241317
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| ||||||||| ||| |    
T  55241077 agttgctgacatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttctta-t 55241175  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||| ||||||| |||||| || |||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| | |||||||||    
T  55241176 ctgataaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcgcaacaattttgataatatagtattaacttca 55241275  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttccat 310  Q
      | |||||||| | || ||||||| |  |||||||||||||    
T  55241276 ctagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccat 55241317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 68 - 276
Target Start/End: Original strand, 879519 - 879727
Alignment:
Q  68 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||| || ||||||| ||||||||| ||||  |||| ||||||||     
T  879519 aagttgatgatattatgtgatagtcttaaatgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattatgtgtagtcttgttaa 879618  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
    |||||||| ||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||  |||||||| ||  |||| |||| |||||    
T  879619 tctgatgagttgatgatactatgaagattaaacttttgatgtcattgtacaaacaatgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtttacttc 879718  T
Q  268 aacaaaaaa 276  Q
    | |||||||    
T  879719 accaaaaaa 879727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 25184352 - 25184113
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| || ||||||| ||||||||| || || |||| |||||||| |    
T  25184352 agttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaat 25184253  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||| ||||| |||||| | ||| | |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  25184252 ctgatgagttgatgatactatgaagattgaactttggatgtcattgtacaaacagtagagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 25184153  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
     ||||| ||||| | || ||||||| |  |||||||||||    
T  25184152 ccaaaatagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 25184113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 38012093 - 38011854
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  38012093 agttgatgatattatgtgatagtcttaagcgttacactttctgggatgttacacttaaaacaaggtataataaaattaaattaagtgtagtcttgttaat 38011994  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| || |||| ||| |||| ||  |||| |||| ||||||    
T  38011993 ctgatgaattgataatattatggggactgaacttttgatggcaccgtacaaacagtggggtgctattcactacacttttgatgttatagtgttgacttca 38011894  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
     || |||||||| | || ||| ||| |  |||||||||||    
T  38011893 ccagaaaagtcattctcatgatttcaccatagaattttcc 38011854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 50697480 - 50697242
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  50697480 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtgtggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaat 50697381  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| ||||||  || | | |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||   | |||||||||  |||| |||| ||||||    
T  50697380 ctgatgaattgatgatactagaga-attgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttatattttttatgttatagtgtttacttca 50697282  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
      |||||| ||| |||  ||||||| | ||||||||||||    
T  50697281 ctaaaaaaatcatttttatgacttcaccgtagaattttcc 50697242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Original strand, 55477863 - 55478106
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  55477863 agttgatgatattatgtgatagtcttcagtgttacacgttgtggggtgttacacttataacaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 55477962  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgt----acaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaac 264  Q
    ||||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||| |||||||||   |||||||| ||  |||| |||||||    
T  55477963 ctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaaacagtggagtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaac 55478062  T
Q  265 ttcaacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
    |||| ||||||| ||| | || ||||||| |  |||||||||||    
T  55478063 ttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcc 55478106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 69 - 306
Target Start/End: Original strand, 36493661 - 36493897
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||| || |||  ||||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  36493661 agttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggagt-ttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 36493759  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
     | |||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| | |||||| ||  |||| | |||||||||    
T  36493760 ttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcactatatttttgatggtatagtattaacttca 36493859  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaatttt 306  Q
     ||||||||| | |||| ||||||| |  |||||||||    
T  36493860 ccaaaaaagttattttcatgacttcaccatagaatttt 36493897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 69 - 254
Target Start/End: Original strand, 4934174 - 4934360
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  4934174 agttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttggacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 4934273  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagt-ggggtgttactcacaacattttttatacta 254  Q
    |||||||| |||| |||||| |  || | ||||||||||| || |||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4934274 ctgatgaaatgatgatactatgaggattgaacttttgatgccagtgtacaaacaatgggggtgttactcactacattttttatacta 4934360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 69 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 7703748 - 7703545
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  7703748 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaat 7703649  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||        |||||| || |||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||  |||| |||||||||||    
T  7703648 ctgatg--------atactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactgacaacacttttgatgttatagtgttaacttca 7703557  T
Q  269 acaaaaaagtca 280  Q
     || ||||||||    
T  7703556 ccagaaaagtca 7703545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 69 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23761310 - 23761114
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||| ||| | |||||  | |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  23761310 agttgctgatatcatgcgatagtcttaaatgtgacactttatgaggtgttacacttaaaacaaggtaga-taaaattagattaagtgtattcttgttaat 23761212  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaactt 266  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||  |||| |||||||||    
T  23761211 ctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactatacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 23761114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 77 - 280
Target Start/End: Original strand, 54499217 - 54499422
Alignment:
Q  77 atattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaa-ttatattaattgtattcttgttagtctgatga 175  Q
    |||| |||||||||||||||  |||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||| | ||||||||||| | ||||||    
T  54499217 atatcatgtgatagtcttaaaagttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaaattagattaagtatattcttgttaatatgatga 54499316  T
Q  176 attgataatactacggagactaaacttttgatgtcatt-gtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaa 274  Q
    |||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||| || ||    
T  54499317 attgatgatactatagagactgaacttttgatgtcattagtacaaacggtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaa 54499416  T
Q  275 aagtca 280  Q
    ||||||    
T  54499417 aagtca 54499422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 69 - 280
Target Start/End: Original strand, 29584172 - 29584381
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| | ||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |    
T  29584172 agttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcatggggtgtaacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaat 29584271  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||| ||  |||| |||||||||||    
T  29584272 ctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccattgtacaaacagtgaggtgttact--caacacttttgatgttatagtgttaacttca 29584369  T
Q  269 acaaaaaagtca 280  Q
     || ||||||||    
T  29584370 ccagaaaagtca 29584381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 69 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 47253979 - 47253751
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  47253979 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaat 47253880  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||        |||||| |  |||| |||||||||||||| |||| ||| | | ||||||||||||||||| |||| ||  |||| |||||||||||    
T  47253879 ctgatg--------atactatgaggactgaacttttgatgtcactgtataaacaat-gggtgttactcacaacacttttgatgatatagtgttaacttca 47253789  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaatttt 306  Q
     ||||||||||| | || ||||||| |  |||||||||    
T  47253788 ccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 47253751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Original strand, 32912552 - 32912791
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||| || ||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||      
T  32912552 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaac 32912651  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||| ||||||| ||| || |    || |||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||  |||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  32912652 ctgataaattgatgatattatgagtgctgaacttttgatatcattctacaaatactagggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 32912751  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
     ||||||||||| | |  ||||||| |  |||||||||||    
T  32912752 ccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcc 32912791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Original strand, 34361464 - 34361702
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||  ||||||||| |||| || ||||||  ||||||||||||||| |||| | ||||||      
T  34361464 agttgatgatattatgtgatagctttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtaattttgttaac 34361563  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    | ||||||||||| ||| || | || || ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||||    
T  34361564 cggatgaattgatgatattatg-aggctgaacttttaatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttca 34361662  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
     ||||||||||| | |  ||||||| |  |||||||||||    
T  34361663 ccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcc 34361702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 69 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 42199968 - 42199761
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  |||| || ||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  42199968 agtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaat 42199869  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| |||||| |  | || ||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||  |||||||| ||  |||| | |||||||||    
T  42199868 ctgatgaattgatgatactatgagggctgaactttttatgtcattctacaaataatggggtattactcattacatttttgatgttatagtattaacttca 42199769  T
Q  269 acaaaaaa 276  Q
     |||||||    
T  42199768 ccaaaaaa 42199761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 69 - 293
Target Start/End: Original strand, 34948067 - 34948293
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagt--gttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgtta 166  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  34948067 agttgttgatatcatgtgatagtcttaagtacgttacactttgtggggtgttgcactttaaacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgtta 34948166  T
Q  167 gtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaactt 266  Q
     | |||||||||||| ||| || |  |||| ||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||  |||| |||||||||    
T  34948167 atatgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccactttacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 34948266  T
Q  267 caacaaaaaagtcaatttcgtgacttc 293  Q
    |  || |||||||| | || |||||||    
T  34948267 cgccagaaaagtcattctcatgacttc 34948293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 68 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 6864275 - 6864063
Alignment:
Q  68 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||| || ||||||  ||||||||| ||||| |||| ||||||||     
T  6864275 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtatgataaaattaaattaaatgtagtcttgttaa 6864176  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
    |||||| ||||||| |||||| |  ||||  ||||||||||  |||||||||| ||| || ||||| |||  | |||||| ||  |||| || |||||||    
T  6864175 tctgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgctattgtacaaaaagttggatgttattcattaaatttttgatgttatagtgataacttc 6864076  T
Q  268 aacaaaaaagtca 280  Q
    | |||||||||||    
T  6864075 accaaaaaagtca 6864063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 293
Target Start/End: Original strand, 30002631 - 30002820
Alignment:
Q  96 agtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagac 195  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||        |||||| | ||||    
T  30002631 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatg--------atactaagaagac 30002722  T
Q  196 taaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtcaatttcgtgacttc 293  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||| || |||| ||| |||  |||||||    
T  30002723 tgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgatgctacagtgttaacttcaccagaaaaatcattttaatgacttc 30002820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 68 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 3042859 - 3042741
Alignment:
Q  68 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||     
T  3042859 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataataaggtatgataaaattatattaagtgtaatcttgttaa 3042760  T
Q  168 tctgatgaattgataatac 186  Q
    | |||||||||||| ||||    
T  3042759 tatgatgaattgatgatac 3042741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 71 - 293
Target Start/End: Original strand, 46888132 - 46888353
Alignment:
Q  71 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtct 170  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| | |||||| |||    
T  46888132 ttgatgatattatgtgatagtct-aagtgttacgttttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatct 46888230  T
Q  171 gatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaac 270  Q
    |||||||| |  ||| || || |||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||  |||| | ||||||||| |    
T  46888231 gatgaattaacgatagtatggggactgaacttttgatgccgctgtacaaatagtggggtattactcactacaattttgatgttatagtattaacttcatc 46888330  T
Q  271 aaaaaagtcaatttcgtgacttc 293  Q
    | |||||| | |||| |||||||    
T  46888331 agaaaagttattttcttgacttc 46888353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 1815540 - 1815421
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||| |||| |||||||| |    
T  1815540 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacccttaaaacaaggtaggataaaattagagtaaatgtagtcttgttaat 1815441  T
Q  169 ctgatgaattgataatacta 188  Q
     |||||||||||| ||||||    
T  1815440 atgatgaattgatgatacta 1815421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 293
Target Start/End: Original strand, 35025568 - 35025784
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  35025568 agttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctggggtgtgacacttaaaacaagataggataaaattatattaaatgcagtcttgttaat 35025667  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||        ||||||||  |||| ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| ||||||| ||| |||| || ||||| |||| ||||||    
T  35025668 ctgatg--------atactacgaggactgaacttttgatgtcaacgtataaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttca 35025759  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttc 293  Q
     || |||| ||| |||| |||||||    
T  35025760 ccagaaaaatcattttcatgacttc 35025784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 4598203 - 4598021
Alignment:
Q  96 agtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagac 195  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||  || ||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |  ||| || |||    
T  4598203 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaagc-aggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgagtctaaggggac 4598105  T
Q  196 taaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtca 280  Q
    | ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||  |||| ||||||||||| || ||||||||    
T  4598104 tgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaaca-ctttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtca 4598021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 69 - 312
Target Start/End: Original strand, 19440620 - 19440864
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||| |||| || ||| |||||||||| |||| || ||| ||  ||||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  19440620 agttgatgatattatgttataaacttaagggttacacgttgtggggtgttacgcttataacaagctaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 19440719  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| ||| || |  |||| ||||||||||| |||||||||||  |||| |||||| |||  |||||||| ||  |||| ||||||| |||    
T  19440720 ctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacggtggagtgttaatcattacatttttgatgttatagtgttaacatca 19440819  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgac-ttcccagtagaattttccatat 312  Q
     ||||||||||| | || |||| ||| |  |||||||||||||||    
T  19440820 ccaaaaaagtcattctcatgactttcaccatagaattttccatat 19440864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 69 - 247
Target Start/End: Original strand, 5047938 - 5048115
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || | |||||||| |    
T  5047938 agtttatgatatcatgtgatagtcttaagtgttacattttgcggg-tattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgcagtcttgttaat 5048036  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttt 247  Q
    || |||||||||| |||||| ||  ||| |||||||||| |||| ||||||| |||| |||  ||||||| ||| ||||    
T  5048037 ctcatgaattgatgatactatgggaactgaacttttgatatcatcgtacaaacagtgtggtcctactcactacactttt 5048115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 39398113 - 39397916
Alignment:
Q  104 actttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagactaaacttt 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||         |||||| |||||  | ||||| ||||||    
T  39398113 actttgtggggtgttacacttaaaataaggcaggataaaattagattaagtgtattcttgtta---------attgatgatactgagaagactgaacttt 39398023  T
Q  204 tgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaat 303  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||  |||| ||||||||||| || |||||||| | |  ||||||| |  ||||||    
T  39398022 tgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcacaacacttttaatgttatagtgttaacttcaccataaaagtcattctaatgacttcaccatagaat 39397923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 111 - 268
Target Start/End: Original strand, 33816547 - 33816704
Alignment:
Q  111 ggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtc 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || | |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  33816547 ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgataaattgatgatactatggagactgaacttttgatgcc 33816646  T
Q  211 attgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    |  ||| |||||||| |||| ||||||| ||| |||| || ||| |||||| ||||||    
T  33816647 accgtataaatagtgaggtgctactcactacacttttgatgctacaatgttgacttca 33816704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 17272203 - 17272084
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |    
T  17272203 agttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcatggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaat 17272104  T
Q  169 ctgatgaattgataatacta 188  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  17272103 ctgatgaattgatgatacta 17272084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 69 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 32579685 - 32579472
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||  | ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |  | || ||||| |    
T  32579685 agttgatgatattataagatagtcttaagagttacactttctgaggtcttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtacagtcatgttaat 32579586  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgt---acaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaact 265  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||  ||   ||||| | ||||||| |||||||  || |||| ||  ||||||||| |||    
T  32579585 ctgatgaactgataatacta-tgagactaaacttttgatggcaccgtacaacaaacactggggtgctactcactgcacttttgatgttataatgttgact 32579487  T
Q  266 tcaacaaaaaagtca 280  Q
    ||| || ||||||||    
T  32579486 tcaccagaaaagtca 32579472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 50764905 - 50764791
Alignment:
Q  133 gtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgtt 232  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |  || | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  50764905 gtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgtt 50764806  T
Q  233 actcacaacattttt 247  Q
    |||||||||| ||||    
T  50764805 actcacaacactttt 50764791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 203 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 4205221 - 4205116
Alignment:
Q  203 ttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaa 302  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| |  |||||    
T  4205221 ttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttattcagaacatttttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcctgacttcaccatagaa 4205122  T
Q  303 ttttcc 308  Q
    ||||||    
T  4205121 ttttcc 4205116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 37287968 - 37287766
Alignment:
Q  68 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggt-gttacacttaaaataaggtagaataaaa-ttatattaattgtattcttgtt 165  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| | |||| ||||  ||||||||||||| || ||||  ||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  37287968 aagttgctgatatcatgtgctagtcttaagtgttacattttgtgggggcgttacacttaaaacaaagtaggttaaaaattagattaagtgtattcttgtt 37287869  T
Q  166 agtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaact 265  Q
    | ||| ||||        || || |  || | ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||  |||| ||||||||    
T  37287868 aatcttatga--------tattatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaact 37287777  T
Q  266 tcaacaaaaaa 276  Q
    | | |||||||    
T  37287776 ttaccaaaaaa 37287766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 4396411 - 4396326
Alignment:
Q  223 gtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||||  |||||||||| |||  ||||||| |  |||||||||||    
T  4396411 gtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcactaaaaaagtcatttttatgacttcactatagaattttcc 4396326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 109
Target Start/End: Original strand, 33816488 - 33816528
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttg 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33816488 agttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttg 33816528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 3042718 - 3042611
Alignment:
Q  201 ttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtag 300  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||  ||||||| |||  |||| ||||||||||| ||||||| ||| |||  ||| ||| |  |||    
T  3042718 ttttgatgtcattgtataaacggtggggtattactcattacattttgtatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttatgatttcaccatag 3042619  T
Q  301 aattttcc 308  Q
    ||||||||    
T  3042618 aattttcc 3042611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 109
Target Start/End: Original strand, 7152176 - 7152216
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttg 109  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7152176 agttgatgatgttatgtgatagtattaagtgttatactttg 7152216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 52)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 69 - 306
Target Start/End: Original strand, 238454 - 238690
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  238454 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttagt 238553  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||| ||||| | |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  238554 ctgattaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt-ggatgttactcacaacatttttaatactatagtgttaacttca 238652  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaatttt 306  Q
     ||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||    
T  238653 ccaaaaaagttattttcgtgacttcactatagaatttt 238690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 69 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 38823449 - 38823209
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  38823449 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgttgggtgttacacttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaat 38823350  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| |||||| || || | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||| ||||||||| |    
T  38823349 ctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgacactgtacaaatagtggggtgttactcgcaacaattttgatgctatagtgttaacttaa 38823250  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcca 309  Q
     || |||||||| | || ||||||| |  ||||||||||||    
T  38823249 ccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcca 38823209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 68 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 42721275 - 42721031
Alignment:
Q  68 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||     
T  42721275 aagttgatgatattacgtgataatcttaagtgttatactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaa 42721176  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
    |||||||||||||| |||||| || || | |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||  ||||  | |||||||    
T  42721175 tctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgttactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgatatagggctaacttc 42721076  T
Q  268 aacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttccatat 312  Q
    | ||||||| ||| |||| ||||||| |  |||||||||||||||    
T  42721075 accaaaaaaatcattttcatgacttcaccatagaattttccatat 42721031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Original strand, 10181949 - 10182188
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  10181949 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaat 10182048  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||  |||||| |  |||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||| ||| | |||||||||  || | | |||||||||    
T  10182049 ctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggcgtgttacgcactatattttttatgttacagttttaacttca 10182148  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
     ||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||    
T  10182149 ccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcc 10182188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 69 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15752264 - 15752022
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  15752264 agttaatgatattatgtgatactcttaagtgttacactttatggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 15752165  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||  |||| |||||||||||    
T  15752164 ctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtgaggtgttactcactatattttttatgttatagtgttaacttca 15752065  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttccata 311  Q
     ||||||||||| | || ||||||| |  ||||||||| ||||    
T  15752064 ccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttttcata 15752022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 69 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 47279424 - 47279200
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  47279424 agttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatgggatgttacaattaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaat 47279325  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| |||||| |  |||| |||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  47279324 ctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttcgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatagtataatgttaacttca 47279225  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttc 293  Q
     ||||||| ||| | || |||||||    
T  47279224 ccaaaaaaatcattctcatgacttc 47279200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 15383168 - 15382929
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||| || ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  15383168 agttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 15383069  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||| ||  |||| |||||| ||||    
T  15383068 ctgatgaattgatgatactacgatgactgaacttttgatgacattgtacaaacggtgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaatttca 15382969  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
     ||||||||||| |||  | ||||| |  |||||||||||    
T  15382968 ccaaaaaagtcatttttataacttcaccatagaattttcc 15382929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 69 - 310
Target Start/End: Original strand, 27267141 - 27267378
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||| ||||| |||| |||||||| |    
T  27267141 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtggggtgttacactcaaaacaaggtagattaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaat 27267239  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |  || |||||||||||    
T  27267240 ctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttaatgccactgtacaaacagtggggtgtcactcactacattttttatgc--tagtgttaacttca 27267337  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttccat 310  Q
     ||||||| ||| | || ||||||| || || ||||||||||    
T  27267338 ccaaaaaaatcattctcatgacttcaca-tataattttccat 27267378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 69 - 280
Target Start/End: Original strand, 7079004 - 7079226
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  7079004 agttgttgatatcatgtgatagtcttaagtcttatactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaat 7079103  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaa-----------tagtggggtgttactcacaacattttttatactataa 257  Q
     |||||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||     
T  7079104 ttgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaggtgttagtggggtgttactcacaacacttttgatattatag 7079203  T
Q  258 tgttaacttcaacaaaaaagtca 280  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  7079204 tgttaacttcaccaaaaaagtca 7079226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 18422883 - 18422647
Alignment:
Q  72 tgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctg 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | || || ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||    
T  18422883 tgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcatataacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctg 18422784  T
Q  172 atgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaaca 271  Q
    |||||||||| ||| || |  |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||   | |||||| ||  |||| ||||||||||| ||    
T  18422783 atgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcgttatatttttgatgttatagtgttaacttcacca 18422684  T
Q  272 aaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
    ||||||||| |||  ||||||| |  |||||||||||    
T  18422683 aaaaagtcatttttatgacttcaccatagaattttcc 18422647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 51129094 - 51128884
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  51129094 agttgatgatattatgtgatagttttaattgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaat 51128995  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
     |||||||||||| ||||||    |||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||||    
T  51128994 atgatgaattgatgatactataatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttca 51128895  T
Q  269 acaaaaaagtc 279  Q
      |||||||||    
T  51128894 ctaaaaaagtc 51128884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 71 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 2959981 - 2959744
Alignment:
Q  71 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtct 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| |||  |||||||| |||    
T  2959981 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacaatttgtgggatgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatct 2959882  T
Q  171 gatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaac 270  Q
    ||||||||||| | |||| |  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| || ||| |||| ||  |||| ||||||||||| |    
T  2959881 gatgaattgatgacactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttacttactacagttttgatgttatagtgttaacttcatc 2959782  T
Q  271 aaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
    | |||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||    
T  2959781 agaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcc 2959744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 96 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 48620845 - 48620673
Alignment:
Q  96 agtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagac 195  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||    
T  48620845 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggac 48620746  T
Q  196 taaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||  |||| |||||||||||    
T  48620745 tgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatattgttaacttca 48620673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 69 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 23999582 - 23999375
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  |||| || ||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||      
T  23999582 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaac 23999483  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    |||||||||||||||||||| |  | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   | |||||||||  | || |||||||||||    
T  23999482 ctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcgttatattttttatgttgtagtgttaacttca 23999383  T
Q  269 acaaaaaa 276  Q
     |||||||    
T  23999382 ccaaaaaa 23999375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 69 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 32216290 - 32216091
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| | || | |||||| |    
T  32216290 agtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatttgattaagtttagttttgttaat 32216191  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    || |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  32216190 ctaatgaattgatgatactacgaggactgaacttttgacgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttatagtgttaacttca 32216091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 69 - 293
Target Start/End: Original strand, 47682435 - 47682658
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||| |||| |||||||| |    
T  47682435 agttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggcagaataaaattagtttaaatgtagtcttgttaat 47682534  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggg-gtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
    ||||||||||||| |||||| |  || | ||||||||||  || |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||    
T  47682535 ctgatgaattgatgatactatgaggaatgaacttttgataccactgtacaagcagtgggagtgttactcacaacattttttatgc--tagtgttaacttc 47682632  T
Q  268 aacaaaaaagtcaatttcgtgacttc 293  Q
    | ||||||||||| | || |||||||    
T  47682633 accaaaaaagtcactctcatgacttc 47682658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 68 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 32267270 - 32267058
Alignment:
Q  68 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||| |||| || ||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||     
T  32267270 aagttgatgatattatgtgatagtcttgagtgttacactttgtggagtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaa 32267171  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
    |||||||  ||||| ||| || |  || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||  |||| ||||||||||    
T  32267170 tctgatgggttgatgataatatgaggagtgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatattgttaacttc 32267071  T
Q  268 aacaaaaaagtca 280  Q
    |  ||||||||||    
T  32267070 acaaaaaaagtca 32267058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 69 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 10922962 - 10922755
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| || ||||||  ||||||| | ||||| |||| |||||||| |    
T  10922962 agttgatgatattatgtgacagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacccttataacaaggtatgataaaataagattaagtgtagtcttgttaat 10922863  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||| ||||| |||||| |  || | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||  |||| |||||||||||    
T  10922862 ctgatgagttgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtcttactcattacattttttatgttatagtgttaacttca 10922763  T
Q  269 acaaaaaa 276  Q
     |||||||    
T  10922762 ccaaaaaa 10922755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 71 - 285
Target Start/End: Original strand, 9902997 - 9903211
Alignment:
Q  71 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtct 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||| || |||  ||||||||| ||||| |||| |||||||| | |    
T  9902997 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaattt 9903096  T
Q  171 gatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaac 270  Q
    ||||||||||| ||| || |  || | |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||  |||| ||||||||||| |    
T  9903097 gatgaattgatgatagtatgtggattgaacttttgatgtcactgtacaaacagcggggtgttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttcatc 9903196  T
Q  271 aaaaaagtcaatttc 285  Q
    |||||||||| ||||    
T  9903197 aaaaaagtcattttc 9903211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 280
Target Start/End: Original strand, 27532928 - 27533132
Alignment:
Q  75 tgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatg 174  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  27532928 tgatatcatgtgatagtcttgagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattg-attaagtgtattcttgttaatctgatg 27533026  T
Q  175 aattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaa 274  Q
    ||||||| |||||| || || | ||||||||||| || |||||||| |||||| |||||| ||||| | |||| || ||||| ||||||||||| || ||    
T  27533027 aattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaagagtgggttgttacccacaatacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaa 27533126  T
Q  275 aagtca 280  Q
    ||||||    
T  27533127 aagtca 27533132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3535142 - 3534968
Alignment:
Q  94 taagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggag 193  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |    
T  3535142 taagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggcaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgataatattaagggg 3535043  T
Q  194 actaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| |||  |||||||||||||||| |||| ||  |||| |||||||||||    
T  3535042 actgaacttttgatgtcactgcacaaacagtaaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttca 3534968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 69 - 230
Target Start/End: Original strand, 27227426 - 27227587
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  27227426 agttgatgatatcatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaat 27227525  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtg 230  Q
    ||||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||||    
T  27227526 ctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtgaggtg 27227587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16415881 - 16415641
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  16415881 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacaatatgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 16415782  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaata-gtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
    || |||||||||| |||||| |  | || ||||||||||| || |||||||| |  | ||||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||||||||    
T  16415781 ctaatgaattgatgatactatgatggctgaacttttgatgccactgtacaaacatttagggtgttactcactacacttttgatgctatagtgttaacttc 16415682  T
Q  268 aacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
    | || |||||||| | || ||||||| |  |||||||||||    
T  16415681 accagaaaagtcattctcatgacttcaccttagaattttcc 16415641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 69 - 309
Target Start/End: Original strand, 30326893 - 30327133
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||| || ||||||| ||||||| | ||||| |||| | |||||| |    
T  30326893 agttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagttttgttaat 30326992  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||  ||||||||||  || |||| |||||||  |||||||| ||  |||| |||||| ||||    
T  30326993 ctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgctattgtacaaacggttgggtattactcattacatttttgatgttatagtgttaaattca 30327092  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcca 309  Q
      |||||||||| |||  ||||||| |  ||||||||||||    
T  30327093 caaaaaaagtcatttttatgacttcactatagaattttcca 30327133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 69 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 4330516 - 4330323
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || | |||||||| |    
T  4330516 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaat 4330417  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagt-ggggtgttactcacaacattttttatactataatgtt 261  Q
    ||||| ||||||| |||||| |  |||| ||||||||||  || |||||||| | | |||||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||    
T  4330416 ctgataaattgatgatactatgatgactgaacttttgatcccactgtacaaacattgggggtgttactcactacacttttgatgctatagtgtt 4330323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 69 - 285
Target Start/End: Original strand, 28564724 - 28564938
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| || |||| |  ||||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  28564724 agttgatgatattatgtgatagt--taagtgttacactttacggggtgttatgcttataacaaggcatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 28564821  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
     |||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  |||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  28564822 atgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtaaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 28564921  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttc 285  Q
     ||||||| ||| ||||    
T  28564922 tcaaaaaaatcattttc 28564938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 69 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 37451520 - 37451297
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||| || |||||   ||||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  37451520 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttttgaggtgttacacttataacaaggtcagataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 37451421  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
     |||| ||||||| |||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |  |||||||| ||  |||| ||||||||| |    
T  37451420 atgataaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttacttattacatttttgatgttatagtgttaacttta 37451322  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttc 293  Q
     ||||||||||| |||  |||||||    
T  37451321 ccaaaaaagtcatttttatgacttc 37451297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 69 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 30254658 - 30254448
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||   ||||||||  |||| || ||||||| ||||||||| ||||| | || |||||||| |    
T  30254658 agttgatgttattatgtgacagtcttaagtgttacactttatagggtgttatgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtctagtcttgttaat 30254559  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| |||||  |  |||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||  |||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  30254558 ctgatgaattgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt-gtgtattactcattacatttttgatgttatattgttaacttca 30254460  T
Q  269 acaaaaaagtca 280  Q
    ||||||||||||    
T  30254459 acaaaaaagtca 30254448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 8222363 - 8222127
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||| || ||||||| ||||||| | ||||| |||| |||||||| |    
T  8222363 agttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttgttaat 8222264  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
     |||||||||||| |||||| |   ||| ||||||||||| |||||||   |  ||| |||||||||||  |||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  8222263 atgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgccattgta---acggtgtggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 8222167  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
      ||||| |||| |||  ||||||| | ||||||||||||    
T  8222166 ctaaaaaggtcatttttatgacttcaccgtagaattttcc 8222127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 115 - 280
Target Start/End: Original strand, 11742338 - 11742502
Alignment:
Q  115 tgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattg 214  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||| || || |||| |||||||||||||| ||    
T  11742338 tgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatattatgg-gactgaacttttgatgtcactg 11742436  T
Q  215 tacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtca 280  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| |||| ||||||||||| || ||||||||    
T  11742437 tacaaacagtggggtgttacttacaacacttttgataatatagtgttaacttcaccagaaaagtca 11742502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 68 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25160868 - 25160716
Alignment:
Q  68 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||| | ||||| |||| |||| |||     
T  25160868 aagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttattaa 25160769  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaa 220  Q
    ||| |||||||||| |||||| |  |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25160768 tctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaa 25160716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 69 - 268
Target Start/End: Original strand, 27563846 - 27564045
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  27563846 agttgatgaaattatatgatagtcttaagtgttcctctttgtggggtattatacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 27563945  T
Q  169 ctgatgaattgataatacta-cggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||| | |||||| |   |||| ||||||||||    
T  27563946 ctgatgaattgataatattatcgga-actgaacttttgatgtcactatacaaacagtggagtgttactcactatatttttaaagttatagtgttaacttc 27564044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 39393603 - 39393379
Alignment:
Q  85 tgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaa-ttatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataa 183  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||| ||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  39393603 tgatagtcttaagtgttacactttgtaggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagatgaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatga 39393504  T
Q  184 tactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtcaatt 283  Q
    ||||| || || ||||||||||||| || |||||||| | ||  || |||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||  | |||||||| |     
T  39393503 tactatggggattaaacttttgatgccactgtacaaacaatgaagtattactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcattagaaaagtcattc 39393404  T
Q  284 tcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
    || | ||||| | ||||||||||||    
T  39393403 tcataacttcaccgtagaattttcc 39393379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Original strand, 19899710 - 19899949
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||| || || |||  ||||||||||||||| |||| ||||||||      
T  19899710 agttggtgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaatgtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaac 19899809  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| |||||| |  |  | ||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||   |||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  19899810 ctgatgaattgatgatactatgagggttgaacttttgatgccattctacaaacagtgaggtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaacttca 19899909  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
     ||||||| ||| | |  ||||||| |  |||||||||||    
T  19899910 ccaaaaaaatcattattatgacttcaccatagaattttcc 19899949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 1547514 - 1547283
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| |||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||| |    
T  1547514 agttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaat 1547415  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||        |||||| |   ||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  1547414 ctgatg--------atactatgagaactgaacttttgatgccactgcacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatgttatagtgttaacttca 1547323  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
     || |||||||| | || ||||||| |  |||||||||||    
T  1547322 ccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 1547283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15168331 - 15168192
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || | |||||||| |    
T  15168331 agttgatgatattatgcgatagccttaagtgttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaactgcagtcttgttaat 15168232  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatg 208  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||    
T  15168231 ctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatg 15168192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 40885048 - 40884870
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||| || | |||||||| |    
T  40885048 agttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacacttttcggaatgttacacttaaaacaagataggataaaactagattaagtgcaatcttgttaat 40884949  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttt 247  Q
    ||||||||||||  ||||||  | |||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  40884948 ctgatgaattgaagatactatagggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgctactcactacactttt 40884870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 71 - 308
Target Start/End: Original strand, 34012325 - 34012557
Alignment:
Q  71 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtct 170  Q
    |||||||||||||||||||||     |||||| | |||| |||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||    
T  34012325 ttgatgatattatgtgatagt-----gtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatct 34012419  T
Q  171 gatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaac 270  Q
    ||||||||||| ||| || |  |||| ||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||| ||| | || ||  |||| ||||||||||| |    
T  34012420 gatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttatagtgttaacttcatc 34012519  T
Q  271 aaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcc 308  Q
    | ||| |||| |||| ||||||| |  |||||||||||    
T  34012520 ataaacgtcattttcatgacttcaccatagaattttcc 34012557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 94 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 41926373 - 41926161
Alignment:
Q  94 taagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggag 193  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||  | |    
T  41926373 taagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactataggg 41926274  T
Q  194 actaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtcaatttcgtgacttc 293  Q
    ||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| | |||||||| | |||||| ||  |||| | ||||||||| ||||||| ||| |||| | |||||    
T  41926273 actgaacttgtgatgccactgtacaaacagtgggatattactcactatatttttgatgttatagtattaacttcatcaaaaaaatcattttcataacttc 41926174  T
Q  294 ccagtagaatttt 306  Q
     |  |||||||||    
T  41926173 accatagaatttt 41926161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 69 - 309
Target Start/End: Original strand, 31621495 - 31621734
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||   ||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || | |||||||| |    
T  31621495 agttgttgatattatgcgatagtcttaagtgtcacacttct-ggggtattgcacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaat 31621593  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||| || |||||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||  |||  ||| ||  |||| |||| ||||||    
T  31621594 ctgatgaattgatgatactatggggactgaatttttgatgccaccgtacaaatagcggggtgctactcaatacacctttgatgttatagtgttgacttca 31621693  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttcca 309  Q
      | |||||||| | || ||||||| | |||||||||||||    
T  31621694 ctagaaaagtcattctcatgacttcaccgtagaattttcca 31621734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 69 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 46931644 - 46931447
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||   || ||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||      
T  46931644 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgct--gaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaac 46931547  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| ||| || |  | || || |||||||| | || |||||| |||||||| |||||||  |||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  46931546 ctgatgaattgatgatattatgagggctgaatttttgatgccgttctacaaacagtggggtattactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 46931447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 69 - 208
Target Start/End: Original strand, 33725541 - 33725680
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| || | |||||||| |    
T  33725541 agttgatgatattatgcgatagtcttaaatgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaat 33725640  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatg 208  Q
     |||||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||    
T  33725641 atgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 33725680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 71 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22170944 - 22170806
Alignment:
Q  71 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtct 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||| ||||| |||| | || ||| |||    
T  22170944 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttgaaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtgttattaatct 22170845  T
Q  171 gatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgt 209  Q
     |||||||||| ||| || | ||||| ||||||||||||    
T  22170844 aatgaattgatgatattatgtagactgaacttttgatgt 22170806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 453 - 513
Target Start/End: Original strand, 7254228 - 7254288
Alignment:
Q  453 acaaacaggtacttcaaattttatttattgacaataagtacttattaattgattacttcat 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7254228 acaaacaggtacttcaaattttatttattgacaataagtacttattaattgattacttcat 7254288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 28769885 - 28769679
Alignment:
Q  72 tgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcgggg-tgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtct 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||  ||| || ||||||  ||||||||| ||||| |||| |||||||| | |    
T  28769885 tgatgatattatgtgatagtcttaagcgttacactttgtgggggtgttacgtttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatat 28769786  T
Q  171 gatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaac 270  Q
    ||||||||||| |||||| |  |||  ||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||  |||||||| ||   ||| |||||||||||      
T  28769785 gatgaattgatgatactatgaggaccgaacctttgatgccattgtacaaacggt-gggtgttactcattacatttttgatgtcatagtgttaacttcaca 28769687  T
Q  271 aaaaaagt 278  Q
    ||||||||    
T  28769686 aaaaaagt 28769679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 3309388 - 3309135
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcgg-----ggtgttacacttaaaataaggtagaataaaa-ttatattaattgtattctt 162  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||| | |      ||||||||| |||||| || ||||  ||||| ||| ||||| |||||||||    
T  3309388 agttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacacttagtgtagtgaggtgttacatttaaaacaaagtaggttaaaaattagattaagtgtattctt 3309289  T
Q  163 gttagtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgtta 262  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| | ||| | ||||||||||  || |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||| |||||    
T  3309288 gttaatctgatgaattgatgatactatgaagattgaacttttgataccactgtacaaacagt-gggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgtta 3309190  T
Q  263 acttcaacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttccatatttaaa 317  Q
    |||| | || |||||||| | || ||||||  |  ||||||||||||| ||||||    
T  3309189 actttaccagaaaagtcattctcatgactttaccatagaattttccatttttaaa 3309135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 38759768 - 38759613
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| |||| | || ||| |    
T  38759768 agttggtgatattatctgatagtctcaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataagatatgataaaattaaattaaatgtagttttattaat 38759669  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagacta----aacttttgatgtcattgtacaaa 220  Q
     |||||||||||| ||| |||| |||||     |||||||||||||| ||||||||    
T  38759668 atgatgaattgatgatattacgaagactggctgaacttttgatgtcactgtacaaa 38759613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 111 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 14758234 - 14758038
Alignment:
Q  111 ggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtc 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || | |||||||| ||| |||||||||| | |||| || |||| ||||||||||| |    
T  14758234 ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctaatgaattgatgaaactatggggactgaacttttgatgcc 14758135  T
Q  211 attgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaattttc 307  Q
    |  ||||||| ||| | ||| ||||||| ||| |||| ||  |||| |||| |||||| || |||||||| | || ||||||| | ||| |||||||    
T  14758134 accgtacaaacagttgtgtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccgtaaaattttc 14758038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 69 - 268
Target Start/End: Original strand, 27763252 - 27763450
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||| |||| ||  |||||  ||||||||| ||||| |||| ||||||||      
T  27763252 agttgattatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtagggtgttacgcttagaactaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaac 27763351  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||| ||||||| |||||| |  | ||  ||||||||||||||| ||||||   | ||||||||||||  |||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  27763352 ctgataaattgatgatactatgagggctggacttttgatgtcattctacaaactat-gggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 27763450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21289816 - 21289726
Alignment:
Q  160 cttgttagtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttat 250  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||  | |||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21289816 cttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacattttttat 21289726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Original strand, 37618860 - 37619048
Alignment:
Q  96 agtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtctgatgaattgataata--ctacggag 193  Q
    ||||||| |||||  ||| |||||  |||| || ||||||| ||||||||| ||||| |||| | |||||| |||||||||||||| |||  ||| |       
T  37618860 agtgttacactttatgggatgttatgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtattgttaatctgatgaattgatgatatactatgaga 37618959  T
Q  194 actaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtg--ttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaacaaaaaagtca 280  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||  | |||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  37618960 actgaacttttgatgtcattttacaaacagtggggtgttttactcattaaatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtca 37619048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 109
Target Start/End: Original strand, 1359876 - 1359916
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttg 109  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  1359876 agttgatgatattatatgataatcttaagtgttacactttg 1359916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 70 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 8125 - 7915
Alignment:
Q  70 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagtc 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |  ||| ||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| ||    
T  8125 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatc 8026  T
Q  170 tgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttcaa 269  Q
    |||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||  |||| |||||||||||     
T  8025 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcat 7926  T
Q  270 caaaaaagtca 280  Q
    |||||||||||    
T  7925 caaaaaagtca 7915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 106; Significance: 8e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 69 - 306
Target Start/End: Original strand, 145962 - 146199
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  |||| || ||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||      
T  145962 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaac 146061  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    ||||||||||||| |||||| | || || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| |    
T  146062 ctgatgaattgatgatactatgaaggctgaacttttgatgtcattctacaaataatggggtgttactcattacattttttatgttataatgttaacttaa 146161  T
Q  269 acaaaaaagtcaatttcgtgacttcccagtagaatttt 306  Q
     ||||||| ||| | |  ||||||| | ||||||||||    
T  146162 ccaaaaaaatcattcttatgacttcaccgtagaatttt 146199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 44196 - 43986
Alignment:
Q  68 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||  |||| || ||| ||  ||||||||||||||| |||| |||| |||     
T  44196 aagttgatgatattatgtgatag-cttaagtgttacactttgtggggtgttaagcttataacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttattaa 44098  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
    |||||||||||||| |||||| |  |||| ||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||||||||  |||||||| ||| ||||  |||||||||    
T  44097 tctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaacaacggggtgttactcattacatttttgatattatagcgttaacttc 43998  T
Q  268 aacaaaaaagtc 279  Q
    | ||||||||||    
T  43997 accaaaaaagtc 43986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 279
Target Start/End: Original strand, 154591 - 154801
Alignment:
Q  68 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttag 167  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||  |||| || ||| ||  ||||||||||||||| |||| |||| |||     
T  154591 aagttgatgatattatgtgatag-cttaagtgttacactttgtggggtgttaagcttataacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttattaa 154689  T
Q  168 tctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttc 267  Q
    |||||||||||||| |||||| |  |||| ||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||||||||  |||||||| ||| ||||  |||||||||    
T  154690 tctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaacaacggggtgttactcattacatttttgatattatagcgttaacttc 154789  T
Q  268 aacaaaaaagtc 279  Q
    | ||||||||||    
T  154790 accaaaaaagtc 154801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 68 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 267525 - 267335
Alignment:
Q  68 aagttgatgatattatgtgatagtctt-aagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgtta 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||| ||    
T  267525 aagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgtgggatgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgcta 267426  T
Q  167 gtctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattgtac-aaatagtggggtgttactcacaacattttttatactata 256  Q
     ||| |||||||||| ||| ||  |||||| ||||||||||| || ||||| ||| ||| || |||||||||| | |||||| || |||||    
T  267425 atctaatgaattgatgatattatagagactgaacttttgatgacactgtacaaaacagttggatgttactcactatatttttgatgctata 267335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 69 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12148 - 11935
Alignment:
Q  69 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaaactttgcggggtgttacacttaaaataaggtagaataaaattatattaattgtattcttgttagt 168  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  12148 agttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgttaat 12049  T
Q  169 ctgatgaattgataatactacggagactaaacttttgatgtcattg-tacaaatagt-ggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaactt 266  Q
    ||||||||||||| ||| || |  |||| ||||||||||  || || |||||| | | |||||||||||||||||| |||| ||  |||  |||||| ||    
T  12048 ctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgataccactgatacaaacaatgggggtgttactcacaacacttttaatgttatggtgttaattt 11949  T
Q  267 caacaaaaaagtca 280  Q
    || || ||||||||    
T  11948 caccagaaaagtca 11935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 42439 - 42388
Alignment:
Q  217 caaatagtggggtgttactcacaacattttttatactataatgttaacttca 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||| |||||||||||    
T  42439 caaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttca 42388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University