View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10691_low_5 (Length: 377)

Name: NF10691_low_5
Description: NF10691
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10691_low_5
NF10691_low_5
[»] chr5 (52 HSPs)
chr5 (1-359)||(10593174-10593530)
chr5 (1-359)||(25078036-25078393)
chr5 (1-359)||(25136005-25136362)
chr5 (1-359)||(40380008-40380363)
chr5 (1-359)||(40382219-40382574)
chr5 (1-359)||(29720280-29720634)
chr5 (1-359)||(29722440-29722794)
chr5 (1-359)||(29751057-29751412)
chr5 (1-350)||(22536197-22536539)
chr5 (1-359)||(16544325-16544683)
chr5 (1-359)||(16546547-16546905)
chr5 (1-359)||(9789121-9789476)
chr5 (1-355)||(16409391-16409743)
chr5 (1-359)||(18441541-18441900)
chr5 (1-355)||(26177799-26178150)
chr5 (2-274)||(25412672-25412947)
chr5 (1-308)||(26170690-26170983)
chr5 (2-355)||(30182499-30182852)
chr5 (2-258)||(13342971-13343232)
chr5 (15-355)||(13239674-13240016)
chr5 (2-274)||(36074024-36074302)
chr5 (104-274)||(37439161-37439328)
chr5 (85-251)||(213465-213630)
chr5 (85-355)||(32636824-32637088)
chr5 (85-251)||(40147261-40147425)
chr5 (85-266)||(28278316-28278494)
chr5 (85-258)||(42428427-42428598)
chr5 (85-249)||(13488203-13488365)
chr5 (2-247)||(30682930-30683178)
chr5 (85-251)||(5058047-5058209)
chr5 (2-274)||(33831590-33831866)
chr5 (85-271)||(533769-533952)
chr5 (88-277)||(8565926-8566111)
chr5 (15-274)||(16452003-16452266)
chr5 (85-249)||(28750661-28750823)
chr5 (88-258)||(39468546-39468714)
chr5 (85-231)||(13695713-13695859)
chr5 (85-234)||(42426255-42426403)
chr5 (85-251)||(27637616-27637781)
chr5 (88-247)||(538028-538185)
chr5 (89-249)||(38747009-38747167)
chr5 (2-274)||(31182883-31183157)
chr5 (85-251)||(27015531-27015687)
chr5 (99-233)||(16640961-16641091)
chr5 (88-243)||(9049354-9049506)
chr5 (91-245)||(316769-316922)
chr5 (88-274)||(3075640-3075823)
chr5 (186-258)||(19806463-19806534)
chr5 (139-249)||(33906035-33906144)
chr5 (139-216)||(42309973-42310048)
chr5 (189-249)||(4160702-4160762)
chr5 (139-188)||(42926922-42926970)
[»] chr1 (70 HSPs)
chr1 (1-359)||(9036333-9036688)
chr1 (1-359)||(44203549-44203904)
chr1 (1-359)||(40282293-40282647)
chr1 (1-359)||(21053874-21054228)
chr1 (1-359)||(20622135-20622490)
chr1 (1-359)||(9987118-9987472)
chr1 (1-355)||(51765304-51765663)
chr1 (84-258)||(13316348-13316521)
chr1 (88-355)||(8550688-8550952)
chr1 (2-274)||(20762582-20762859)
chr1 (85-274)||(3189330-3189517)
chr1 (85-274)||(3198147-3198334)
chr1 (85-274)||(3206986-3207173)
chr1 (85-272)||(28220210-28220394)
chr1 (85-251)||(37168297-37168462)
chr1 (85-251)||(13547093-13547257)
chr1 (2-273)||(3156776-3157050)
chr1 (85-274)||(28265536-28265722)
chr1 (85-266)||(42297963-42298143)
chr1 (88-274)||(834149-834332)
chr1 (85-251)||(13549004-13549168)
chr1 (85-251)||(29136247-29136412)
chr1 (85-251)||(47255343-47255508)
chr1 (85-249)||(44455160-44455322)
chr1 (85-273)||(49918350-49918535)
chr1 (85-251)||(11348698-11348862)
chr1 (85-274)||(4552619-4552805)
chr1 (85-272)||(28223405-28223589)
chr1 (85-251)||(31925711-31925875)
chr1 (85-251)||(7482234-7482399)
chr1 (85-258)||(37033068-37033241)
chr1 (85-258)||(31659238-31659409)
chr1 (85-258)||(45644351-45644523)
chr1 (85-274)||(50167157-50167343)
chr1 (85-274)||(50169192-50169378)
chr1 (85-251)||(47115171-47115337)
chr1 (88-274)||(3847103-3847286)
chr1 (88-274)||(13659318-13659501)
chr1 (85-249)||(19754494-19754657)
chr1 (85-273)||(37503540-37503722)
chr1 (85-273)||(37559850-37560037)
chr1 (85-251)||(193611-193775)
chr1 (85-231)||(1833522-1833667)
chr1 (85-250)||(34603576-34603740)
chr1 (85-234)||(23555286-23555433)
chr1 (88-274)||(46064921-46065104)
chr1 (85-274)||(41360914-41361101)
chr1 (2-247)||(196915-197166)
chr1 (85-273)||(30476429-30476614)
chr1 (85-258)||(19752685-19752857)
chr1 (90-230)||(22079322-22079461)
chr1 (171-251)||(28242391-28242469)
chr1 (90-186)||(12318589-12318685)
chr1 (106-249)||(927982-928123)
chr1 (103-234)||(15820326-15820455)
chr1 (139-215)||(16455676-16455750)
chr1 (139-258)||(13137973-13138089)
chr1 (88-274)||(40122178-40122363)
chr1 (99-166)||(3460710-3460778)
chr1 (139-214)||(6808507-6808581)
chr1 (171-274)||(36683766-36683866)
chr1 (99-217)||(37282728-37282846)
chr1 (88-165)||(8871135-8871213)
chr1 (90-204)||(13938143-13938256)
chr1 (153-251)||(37876770-37876865)
chr1 (85-157)||(37879006-37879079)
chr1 (104-156)||(6378603-6378655)
chr1 (107-172)||(48382441-48382505)
chr1 (103-167)||(32736952-32737015)
chr1 (103-167)||(35109493-35109556)
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (1-359)||(16554785-16555142)
chr6 (1-359)||(16631341-16631698)
chr6 (1-359)||(16653028-16653385)
chr6 (1-359)||(16578413-16578770)
chr6 (1-359)||(16616610-16616967)
chr6 (1-359)||(25421221-25421578)
chr6 (1-359)||(6027164-6027518)
chr6 (1-359)||(34166996-34167352)
chr6 (1-359)||(33341999-33342357)
chr6 (1-356)||(34164774-34165128)
chr6 (1-359)||(27647779-27648124)
chr6 (65-359)||(13153893-13154187)
chr6 (1-355)||(412018-412369)
chr6 (1-346)||(3072670-3073012)
chr6 (1-357)||(6097349-6097693)
chr6 (1-274)||(2171512-2171790)
chr6 (2-274)||(31404656-31404932)
chr6 (2-274)||(5406181-5406456)
chr6 (2-274)||(5410506-5410781)
chr6 (6-274)||(16452310-16452583)
chr6 (2-274)||(30834517-30834794)
chr6 (2-274)||(5413376-5413650)
chr6 (85-251)||(21588931-21589095)
chr6 (85-251)||(21593664-21593828)
chr6 (85-355)||(33160254-33160521)
chr6 (85-263)||(3808699-3808877)
chr6 (85-272)||(9183015-9183199)
chr6 (88-251)||(17758026-17758188)
chr6 (85-251)||(2972943-2973107)
chr6 (85-251)||(17762990-17763155)
chr6 (2-274)||(16568953-16569208)
chr6 (154-274)||(5409051-5409167)
chr6 (85-243)||(28137420-28137576)
chr6 (87-251)||(26830127-26830289)
chr6 (85-251)||(22424829-22424995)
chr6 (88-251)||(5043630-5043792)
chr6 (85-231)||(3038926-3039071)
chr6 (139-262)||(603081-603201)
chr6 (88-258)||(26954283-26954450)
chr6 (85-258)||(33211182-33211353)
chr6 (139-247)||(26800642-26800748)
chr6 (85-204)||(4045423-4045542)
chr6 (210-274)||(21356021-21356084)
[»] chr3 (76 HSPs)
chr3 (1-359)||(3617365-3617722)
chr3 (1-359)||(25637344-25637702)
chr3 (1-359)||(45282899-45283258)
chr3 (1-359)||(54635041-54635395)
chr3 (1-358)||(6716416-6716770)
chr3 (1-359)||(4600640-4600996)
chr3 (1-357)||(4598421-4598775)
chr3 (1-359)||(10211311-10211667)
chr3 (1-359)||(10209091-10209447)
chr3 (1-356)||(10056135-10056489)
chr3 (1-356)||(10058357-10058711)
chr3 (1-356)||(10060579-10060933)
chr3 (1-356)||(10062801-10063155)
chr3 (1-356)||(10065023-10065377)
chr3 (1-357)||(801007-801355)
chr3 (48-357)||(7779903-7780208)
chr3 (1-350)||(23200045-23200396)
chr3 (1-188)||(10067245-10067431)
chr3 (1-346)||(23197850-23198197)
chr3 (2-274)||(45095075-45095350)
chr3 (1-119)||(6718600-6718718)
chr3 (2-274)||(9636106-9636385)
chr3 (2-274)||(5258125-5258402)
chr3 (88-355)||(19683792-19684054)
chr3 (2-274)||(5260304-5260581)
chr3 (85-274)||(37408458-37408645)
chr3 (85-258)||(7762265-7762437)
chr3 (215-356)||(10067435-10067576)
chr3 (2-258)||(9581193-9581454)
chr3 (96-274)||(7764476-7764651)
chr3 (85-274)||(29196368-29196555)
chr3 (85-273)||(34491212-34491397)
chr3 (85-266)||(49199457-49199638)
chr3 (85-249)||(4569952-4570115)
chr3 (88-258)||(39153358-39153526)
chr3 (2-273)||(40735293-40735568)
chr3 (85-266)||(43401789-43401970)
chr3 (2-274)||(760757-761033)
chr3 (88-247)||(22835010-22835167)
chr3 (89-266)||(30236129-30236304)
chr3 (85-258)||(40734498-40734669)
chr3 (85-258)||(44331545-44331716)
chr3 (87-274)||(31314447-31314631)
chr3 (85-251)||(6095603-6095767)
chr3 (85-273)||(5236440-5236624)
chr3 (85-251)||(41819526-41819691)
chr3 (2-258)||(29682269-29682530)
chr3 (85-262)||(43403736-43403913)
chr3 (85-251)||(54593704-54593868)
chr3 (85-258)||(29813063-29813234)
chr3 (89-273)||(51398818-51398999)
chr3 (2-274)||(32744418-32744684)
chr3 (85-243)||(46860474-46860631)
chr3 (139-274)||(16499084-16499215)
chr3 (85-234)||(29810868-29811016)
chr3 (143-266)||(40913352-40913472)
chr3 (85-258)||(44700476-44700646)
chr3 (104-266)||(46173377-46173536)
chr3 (85-247)||(53921511-53921671)
chr3 (85-274)||(23391891-23392077)
chr3 (87-247)||(32891105-32891264)
chr3 (88-274)||(9666448-9666632)
chr3 (88-266)||(47304254-47304430)
chr3 (85-172)||(5433956-5434046)
chr3 (90-274)||(4055745-4055926)
chr3 (145-251)||(55301975-55302079)
chr3 (85-221)||(36018852-36018987)
chr3 (139-274)||(23410311-23410442)
chr3 (187-246)||(27305719-27305777)
chr3 (105-173)||(4386875-4386942)
chr3 (90-213)||(35138746-35138868)
chr3 (90-204)||(1313854-1313968)
chr3 (85-215)||(51352150-51352278)
chr3 (99-172)||(5373247-5373321)
chr3 (97-166)||(28253353-28253423)
chr3 (85-188)||(31340266-31340369)
[»] chr4 (70 HSPs)
chr4 (1-359)||(8395521-8395876)
chr4 (1-359)||(8393312-8393667)
chr4 (1-359)||(7124817-7125174)
chr4 (1-359)||(7122598-7122955)
chr4 (1-347)||(5138206-5138552)
chr4 (1-347)||(5135980-5136327)
chr4 (15-291)||(31495279-31495556)
chr4 (2-274)||(13992274-13992544)
chr4 (2-251)||(29999809-30000063)
chr4 (15-274)||(56178618-56178882)
chr4 (85-274)||(52095344-52095530)
chr4 (85-274)||(48143042-48143230)
chr4 (104-355)||(5369986-5370232)
chr4 (89-266)||(2209717-2209894)
chr4 (85-273)||(9927441-9927626)
chr4 (85-273)||(12739533-12739718)
chr4 (85-251)||(41964415-41964580)
chr4 (85-266)||(26364236-26364415)
chr4 (85-266)||(54883020-54883199)
chr4 (104-273)||(12743908-12744073)
chr4 (104-273)||(12745297-12745462)
chr4 (85-273)||(26175619-26175804)
chr4 (85-258)||(36463386-36463557)
chr4 (85-273)||(34570397-34570582)
chr4 (85-249)||(36994524-36994686)
chr4 (87-274)||(46147373-46147557)
chr4 (85-251)||(46703500-46703666)
chr4 (2-246)||(37740536-37740784)
chr4 (85-251)||(41639426-41639590)
chr4 (85-234)||(8665408-8665556)
chr4 (85-274)||(45687164-45687351)
chr4 (85-249)||(4587958-4588121)
chr4 (85-274)||(48893620-48893810)
chr4 (88-247)||(379383-379541)
chr4 (87-266)||(12119540-12119719)
chr4 (85-251)||(8648139-8648303)
chr4 (85-251)||(12073392-12073557)
chr4 (85-258)||(5429679-5429850)
chr4 (85-246)||(27416974-27417133)
chr4 (139-266)||(50262689-50262814)
chr4 (85-234)||(54199926-54200074)
chr4 (85-249)||(40632445-40632607)
chr4 (103-251)||(6655975-6656120)
chr4 (85-271)||(5871820-5872003)
chr4 (139-251)||(50673851-50673960)
chr4 (88-274)||(52467336-52467519)
chr4 (85-245)||(37229731-37229890)
chr4 (85-274)||(47038393-47038577)
chr4 (85-274)||(6542161-6542349)
chr4 (85-216)||(12747794-12747924)
chr4 (104-223)||(12744078-12744195)
chr4 (85-223)||(12745467-12745604)
chr4 (92-249)||(5207848-5208003)
chr4 (85-274)||(52082645-52082825)
chr4 (85-274)||(31474150-31474337)
chr4 (139-246)||(35662496-35662600)
chr4 (100-249)||(26699447-26699596)
chr4 (85-249)||(51337064-51337226)
chr4 (143-273)||(29254553-29254679)
chr4 (85-204)||(24969112-24969230)
chr4 (146-234)||(13009464-13009550)
chr4 (139-216)||(3913503-3913578)
chr4 (85-174)||(41639263-41639353)
chr4 (89-186)||(48142444-48142542)
chr4 (99-172)||(1983252-1983324)
chr4 (139-228)||(33089933-33090021)
chr4 (139-167)||(22882836-22882864)
chr4 (139-167)||(22934500-22934528)
chr4 (90-157)||(44967924-44967992)
chr4 (85-172)||(55085445-55085532)
[»] chr7 (71 HSPs)
chr7 (1-359)||(32060218-32060577)
chr7 (1-359)||(6594454-6594809)
chr7 (1-359)||(18392092-18392447)
chr7 (1-359)||(6592236-6592591)
chr7 (1-359)||(18388656-18389011)
chr7 (1-350)||(20343813-20344158)
chr7 (1-321)||(24789757-24790074)
chr7 (163-359)||(1560561-1560757)
chr7 (1-355)||(39731285-39731635)
chr7 (1-308)||(43504102-43504407)
chr7 (1-155)||(1562103-1562255)
chr7 (2-274)||(35853825-35854102)
chr7 (1-274)||(25766940-25767213)
chr7 (2-274)||(29990965-29991240)
chr7 (1-274)||(48408711-48408992)
chr7 (15-355)||(25615785-25616119)
chr7 (85-258)||(34310712-34310884)
chr7 (85-258)||(23555039-23555212)
chr7 (85-273)||(22269973-22270158)
chr7 (85-272)||(14069817-14070001)
chr7 (85-272)||(14379845-14380029)
chr7 (85-274)||(41317416-41317602)
chr7 (2-274)||(19502088-19502365)
chr7 (2-274)||(4178685-4178960)
chr7 (85-355)||(27347817-27348081)
chr7 (88-274)||(41648993-41649175)
chr7 (85-247)||(30024740-30024900)
chr7 (85-234)||(48491579-48491727)
chr7 (85-273)||(18126644-18126829)
chr7 (85-251)||(8359319-8359485)
chr7 (103-266)||(2390301-2390461)
chr7 (85-251)||(29608737-29608901)
chr7 (139-251)||(32358058-32358167)
chr7 (85-250)||(6431971-6432134)
chr7 (85-273)||(48489431-48489616)
chr7 (15-246)||(47673953-47674189)
chr7 (85-258)||(8153342-8153513)
chr7 (85-258)||(31732966-31733137)
chr7 (85-274)||(36146390-36146576)
chr7 (85-249)||(2360978-2361140)
chr7 (85-274)||(4253510-4253697)
chr7 (85-249)||(4586161-4586323)
chr7 (85-273)||(26417316-26417501)
chr7 (85-273)||(47676119-47676304)
chr7 (2-274)||(38671204-38671480)
chr7 (85-251)||(3258995-3259159)
chr7 (85-251)||(4508710-4508874)
chr7 (85-251)||(48599338-48599502)
chr7 (85-249)||(43864244-43864406)
chr7 (88-274)||(495965-496148)
chr7 (88-274)||(1113660-1113843)
chr7 (139-266)||(6359941-6360065)
chr7 (88-249)||(31105399-31105558)
chr7 (104-247)||(23565069-23565210)
chr7 (85-244)||(23343975-23344130)
chr7 (110-245)||(2759207-2759339)
chr7 (139-251)||(4510552-4510661)
chr7 (139-251)||(4512394-4512503)
chr7 (90-249)||(22328395-22328556)
chr7 (85-274)||(12097849-12098027)
chr7 (171-274)||(24525484-24525584)
chr7 (85-156)||(24525992-24526065)
chr7 (147-247)||(31518965-31519063)
chr7 (85-249)||(36574522-36574683)
chr7 (186-249)||(30814536-30814598)
chr7 (89-162)||(1360243-1360316)
chr7 (186-249)||(18396418-18396481)
chr7 (85-186)||(31518795-31518896)
chr7 (2-87)||(24514934-24515018)
chr7 (317-359)||(24790230-24790272)
chr7 (104-172)||(28617182-28617249)
[»] chr2 (45 HSPs)
chr2 (1-359)||(12647282-12647637)
chr2 (1-359)||(6266607-6266962)
chr2 (65-359)||(13655925-13656220)
chr2 (1-355)||(4484232-4484590)
chr2 (1-355)||(32289481-32289832)
chr2 (83-355)||(30833342-30833612)
chr2 (2-274)||(45099665-45099941)
chr2 (2-355)||(4503037-4503390)
chr2 (2-274)||(5723237-5723512)
chr2 (2-274)||(36205646-36205921)
chr2 (2-355)||(36987979-36988333)
chr2 (17-274)||(2334399-2334661)
chr2 (85-274)||(6594987-6595175)
chr2 (88-274)||(34139752-34139936)
chr2 (85-355)||(29867869-29868133)
chr2 (103-274)||(723726-723893)
chr2 (88-274)||(14633807-14633991)
chr2 (85-251)||(45726929-45727093)
chr2 (85-258)||(38312240-38312411)
chr2 (2-234)||(42362262-42362500)
chr2 (85-251)||(35446888-35447052)
chr2 (85-274)||(11151573-11151759)
chr2 (85-274)||(36773562-36773748)
chr2 (85-251)||(1631736-1631900)
chr2 (90-249)||(33648176-33648335)
chr2 (85-274)||(36317991-36318177)
chr2 (85-273)||(17057352-17057537)
chr2 (85-273)||(17085335-17085520)
chr2 (85-266)||(24398055-24398238)
chr2 (85-274)||(11067305-11067491)
chr2 (85-274)||(33162432-33162618)
chr2 (88-247)||(11690504-11690661)
chr2 (85-249)||(42288117-42288278)
chr2 (85-249)||(26353184-26353346)
chr2 (139-249)||(17490154-17490261)
chr2 (85-204)||(7815323-7815441)
chr2 (85-220)||(13121769-13121901)
chr2 (85-249)||(11049550-11049716)
chr2 (186-258)||(39284936-39285007)
chr2 (139-251)||(7451173-7451281)
chr2 (143-243)||(28671989-28672088)
chr2 (186-258)||(17450678-17450748)
chr2 (93-186)||(24885669-24885762)
chr2 (94-160)||(24197906-24197974)
chr2 (107-167)||(31417170-31417230)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (1-359)||(2500-2855)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (1-359)||(3622-3977)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (1-359)||(6190-6547)
[»] chr8 (58 HSPs)
chr8 (1-359)||(25689871-25690226)
chr8 (1-359)||(3439420-3439774)
chr8 (1-359)||(15290440-15290796)
chr8 (1-359)||(15470809-15471165)
chr8 (1-359)||(42575221-42575576)
chr8 (1-355)||(2627651-2628002)
chr8 (2-274)||(34254312-34254586)
chr8 (2-274)||(17982563-17982840)
chr8 (2-274)||(31218167-31218444)
chr8 (2-274)||(34256488-34256762)
chr8 (85-355)||(42498193-42498459)
chr8 (2-274)||(44303764-44304042)
chr8 (2-274)||(19945340-19945618)
chr8 (99-274)||(1746200-1746371)
chr8 (85-273)||(15212786-15212971)
chr8 (85-251)||(42434995-42435159)
chr8 (85-258)||(33352150-33352321)
chr8 (85-273)||(43036423-43036608)
chr8 (85-251)||(4283524-4283688)
chr8 (85-258)||(27811278-27811449)
chr8 (99-350)||(12702542-12702787)
chr8 (87-258)||(40321082-40321251)
chr8 (85-251)||(18655400-18655564)
chr8 (85-249)||(40221745-40221907)
chr8 (85-274)||(3303652-3303838)
chr8 (85-273)||(4731658-4731843)
chr8 (85-248)||(18141821-18141981)
chr8 (87-266)||(10930188-10930365)
chr8 (91-234)||(30143346-30143488)
chr8 (88-258)||(6598975-6599143)
chr8 (88-258)||(6674428-6674596)
chr8 (139-258)||(5689326-5689442)
chr8 (85-249)||(8965697-8965859)
chr8 (85-204)||(9765745-9765863)
chr8 (85-246)||(30291606-30291767)
chr8 (88-228)||(40328782-40328922)
chr8 (88-274)||(1345353-1345536)
chr8 (85-274)||(19491680-19491867)
chr8 (88-216)||(44353796-44353923)
chr8 (85-248)||(1292471-1292631)
chr8 (161-274)||(4743196-4743306)
chr8 (139-248)||(41366622-41366727)
chr8 (89-251)||(11383989-11384149)
chr8 (139-249)||(18106087-18106191)
chr8 (139-274)||(10015136-10015265)
chr8 (103-249)||(4162516-4162658)
chr8 (171-249)||(4733792-4733868)
chr8 (90-245)||(29796329-29796485)
chr8 (90-167)||(1822297-1822375)
chr8 (90-167)||(1856742-1856820)
chr8 (90-247)||(7597619-7597776)
chr8 (144-249)||(3073880-3073981)
chr8 (139-243)||(8153813-8153914)
chr8 (139-216)||(11712038-11712114)
chr8 (312-349)||(32902096-32902133)
chr8 (98-166)||(41266982-41267051)
chr8 (89-172)||(41364927-41365011)
chr8 (139-247)||(3772247-3772352)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (1-355)||(11063-11421)
scaffold0491 (83-355)||(8637-8907)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (2-355)||(434443-434798)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (85-274)||(11557-11745)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (2-258)||(827-1087)
[»] scaffold1808 (1 HSPs)
scaffold1808 (224-359)||(3-137)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (85-258)||(114602-114774)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (85-251)||(18007-18171)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (85-355)||(20319-20583)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (85-251)||(7327-7491)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (88-274)||(149079-149262)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (141-249)||(10546-10651)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (89-185)||(80351-80447)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (90-243)||(27453-27606)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 52)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 10593174 - 10593530
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10593174 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggag 10593273  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593274 aagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgg 10593372  T
Q  201 agagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatctt 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10593373 agagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtatttgttttctacttccctctccttgtttatctt 10593472  T
Q  301 gtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593473 gtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 10593530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 25078036 - 25078393
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078036 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 25078135  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattg 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25078136 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 25078234  T
Q  200 gagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  25078235 gagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttg--tatc 25078332  T
Q  299 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078333 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 25078393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 25136005 - 25136362
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136005 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 25136104  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattg 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25136105 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 25136203  T
Q  200 gagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  25136204 gagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttg--tatc 25136301  T
Q  299 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136302 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 25136362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 40380008 - 40380363
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40380008 ctagggtttagggttctttgattagagtatctctcgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 40380105  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattg 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40380106 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaactaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 40380204  T
Q  200 gagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatc 298  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  40380205 gagagttcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttcc--ctccttgtttatc 40380302  T
Q  299 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40380303 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 40380363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 40382219 - 40382574
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40382219 ctagggtttagggttctttgattagagtatctctcgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 40382316  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattg 199  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40382317 aggggtagaagttagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 40382415  T
Q  200 gagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatc 298  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  40382416 gagagttcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttcc--ctccttgtttatc 40382513  T
Q  299 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40382514 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 40382574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 29720280 - 29720634
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29720280 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 29720379  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattg 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29720380 aagggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattg 29720477  T
Q  200 gagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatct 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  29720478 gagagtacaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctcct--tttatct 29720575  T
Q  300 tgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29720576 tgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 29720634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 29722440 - 29722794
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29722440 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 29722539  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattg 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29722540 aagggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattg 29722637  T
Q  200 gagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatct 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  29722638 gagagtacaatctctcctccagagtaggtcaaatttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctcct--tttatct 29722735  T
Q  300 tgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29722736 tgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 29722794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 29751412 - 29751057
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29751412 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 29751313  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29751312 aagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattg 29751215  T
Q  200 gagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt-atttgttttcttcttccctctccttgtttatc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  29751214 gagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtcttttgttttcttcttccctctcct--tttatc 29751117  T
Q  299 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    ||||||||| ||   |||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  29751116 ttgtgattg-tgtactgtgtttctcacttgttttctagattatatctaggtggtgttttgt 29751057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22536539 - 22536197
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22536539 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccctgca--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 22536442  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22536441 aagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattgg 22536344  T
Q  201 agagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatctt 300  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  22536343 ggagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttcttcttccctcccct--tttatctt 22536246  T
Q  301 gtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtg 350  Q
    ||||||| || |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22536245 gtgattg-tgttttgagtttctcacttgtttcctagattagatctaggtg 22536197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 16544325 - 16544683
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16544325 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 16544422  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggatt 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16544423 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttctcataacc-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggatt 16544521  T
Q  199 ggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctcc-ttgttta 296  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16544522 ggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctcctttgttta 16544621  T
Q  297 tcttgtgatt-gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16544622 tcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgt 16544683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 16546547 - 16546905
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16546547 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattaggaa 16546644  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggatt 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16546645 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggatt 16546743  T
Q  199 ggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctcc-ttgttta 296  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16546744 ggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctcctttgttta 16546843  T
Q  297 tcttgtgatt-gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16546844 tcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatttaggtggtgttttgt 16546905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 9789476 - 9789121
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggga 99  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9789476 ctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattggaa 9789378  T
Q  100 aaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggatt 198  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9789377 aaagggtagaaattaaggtt-gttccttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagtggatt 9789280  T
Q  199 ggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttat 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  9789279 ggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccctctcc--gtttat 9789182  T
Q  298 cttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||| ||| ||  ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9789181 cttgtgcttg-tgtattgtgtttttcacttctttcctagattagatctaggtgctgttttgt 9789121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Original strand, 16409391 - 16409743
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggga 99  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16409391 ctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattggaa 16409489  T
Q  100 aaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggatt 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16409490 aaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagtggatt 16409587  T
Q  199 ggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttat 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  16409588 ggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccctctcct--tttat 16409685  T
Q  298 cttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 355  Q
    |||||| ||| || ||| || ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16409686 cttgtgcttg-tgttttatgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgtt 16409743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18441900 - 18441541
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggga 99  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18441900 ctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattggaa 18441802  T
Q  100 aaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggatt 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18441801 aaagggtagaaattagggtt-gttccttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagtggatt 18441704  T
Q  199 ggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttat 297  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  18441703 ggagagttcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccctctcc--gtttat 18441606  T
Q  298 cttgtgattgttgctttgtg----tttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||| ||| ||  |||||    |||  |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18441605 cttgtgcttg-tgtattgtgtttttttttcacttctttcctagattagatctaggtgctgttttgt 18441541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Original strand, 26177799 - 26178150
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggga 99  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26177799 ctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattgg-a 26177896  T
Q  100 aaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggatt 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26177897 aaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagtggatt 26177994  T
Q  199 ggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttat 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  26177995 ggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccctctcct--tttat 26178092  T
Q  298 cttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 355  Q
    |||||| ||| || ||| || ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  26178093 cttgtgcttg-tgttttatgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgtt 26178150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Original strand, 25412672 - 25412947
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 93  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||    
T  25412672 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 25412769  T
Q  94 ttgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatag 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  25412770 ttgggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatag 25412866  T
Q  193 tggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  25412867 tggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggactgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 25412947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 26170690 - 26170983
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggga 99  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26170690 ctagggtttagagt-ctttgattacagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattgg-a 26170787  T
Q  100 aaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggatt 198  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||           |||||||||| |||||||||||    
T  26170788 aaagggtagaaattaggatt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgta-----------agaactcatt-gatagtggatt 26170874  T
Q  199 ggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttat 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  26170875 ggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccctctcct--tttat 26170972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 355
Target Start/End: Original strand, 30182499 - 30182852
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 93  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||    
T  30182499 tagggattagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgcaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 30182596  T
Q  94 ttgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgata 191  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||    
T  30182597 ttgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttctatctctttgg-aagaactcatt-gata 30182693  T
Q  192 gtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctcctt 291  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||   ||||  |||||||     
T  30182694 gtggattggagagttcaatctctcctccagagtatgtcaagtttggaccgaactggatgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctcct- 30182789  T
Q  292 gtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 355  Q
     ||||||||||| ||| || |||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  30182790 -tttatcttgtgcttg-tgttttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgtt 30182852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 258
Target Start/End: Original strand, 13342971 - 13343232
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 93  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||    
T  13342971 tagggtttagggt-ctctgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 13343068  T
Q  94 ttgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgat 190  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||| |||    
T  13343069 ttgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttg--aagaactcatt-gat 13343164  T
Q  191 agtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 258  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  13343165 agtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcatgtttggaccgaactgggtgaacaatct 13343232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 355
Target Start/End: Original strand, 13239674 - 13240016
Alignment:
Q  15 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag-gg 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       |||||||||| ||||  ||    
T  13239674 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaaatgg 13239772  T
Q  106 tagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagag 204  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13239773 tagaaattagggttt-ttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagag 13239869  T
Q  205 tacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtga 304  Q
      |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||   ||||  |||||||  |||||||| ||     
T  13239870 atcaatctctcctccagagtaggtcaaatttggaccgaactgggtgaacaat-ttttggtgtgtttgtttctctctt--ctctcct--tttatcttttgc 13239964  T
Q  305 ttgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 355  Q
    |||| | |||||||||  ||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  13239965 ttgtggttttgtgtttttcactttgattactagattagatctaggtgttgtt 13240016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 36074302 - 36074024
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 93  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||    
T  36074302 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 36074205  T
Q  94 ttgggaaaa----gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttg 188  Q
    |||||||||    ||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||   ||||||||||| |    
T  36074204 ttgggaaaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgcgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg--aagaactcatt-g 36074109  T
Q  189 atagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||    
T  36074108 atagtggattggagagttcaatctctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactggatgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 36074024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 104 - 274
Target Start/End: Original strand, 37439161 - 37439328
Alignment:
Q  104 ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggag 202  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37439161 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggag 37439257  T
Q  203 agtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  37439258 agatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 37439328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Original strand, 213465 - 213630
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  213465 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 213562  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  213563 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 213630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 355
Target Start/End: Original strand, 32636824 - 32637088
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  32636824 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 32636921  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttc 282  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||   |||||    
T  32636922 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctcttc 32637018  T
Q  283 cctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 355  Q
    |||| |    ||||||||||| ||||   |||| ||||  ||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  32637019 cctccc----tttatcttgtgcttgtgattttgagtttttcactttgattactagattagatctaggtgttgtt 32637088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Original strand, 40147261 - 40147425
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  40147261 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcttcgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 40147358  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40147359 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 40147425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 266
Target Start/End: Original strand, 28278316 - 28278494
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||    
T  28278316 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaaaaact 28278413  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 266  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  28278414 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaat-tcttggtgt 28278494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 42428598 - 42428427
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  42428598 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggttt-ttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 42428501  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 258  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  42428500 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 42428427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 249
Target Start/End: Original strand, 13488203 - 13488365
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  13488203 ttggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 13488300  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 249  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13488301 catt-gatagtggattggagagatcaatctctccccgagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 13488365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 30683178 - 30682930
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 93  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||    
T  30683178 tagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgcgaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgaga 30683081  T
Q  94 ttgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaa--ctcatttga 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||| ||    
T  30683080 ttgggaaaaagggtagaaattagggttcttt----gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttcttt-gtaagaatactcatt-ga 30682987  T
Q  190 tagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgg 247  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  30682986 tagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgg 30682930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Original strand, 5058047 - 5058209
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||   |||| |||||  |||||| ||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||    
T  5058047 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttct--gtgagcttgttgaagctattttcttgtatcccatttgtatctcttt-gtaagaact 5058142  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5058143 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 5058209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Original strand, 33831590 - 33831866
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgag 92  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    || || ||||||||||||||||        |||||    
T  33831590 tagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcatttgtgag 33831687  T
Q  93 attgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgat 190  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  33831688 attggaaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactca-ttgat 33831784  T
Q  191 agtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  33831785 agtggattgaagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaatct-ttggtgtttttgttt 33831866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 271
Target Start/End: Original strand, 533769 - 533952
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | | |||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  533769 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttggt-ctttgtgagcttgttgaagctaattttttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 533866  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttg 271  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||    
T  533867 catt-gatagtggattggaaagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtctttg 533952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 88 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 8566111 - 8565926
Alignment:
Q  88 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 185  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  8566111 gtgagattgagaaaatgggtagaacttagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctct-gtaagaactcat 8566014  T
Q  186 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttct 277  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||  ||||||||| ||||||||||    
T  8566013 t-gatagtggattggagagatcaatctctcacccagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaa--tcttggtgtgtttgttttct 8565926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 274
Target Start/End: Original strand, 16452003 - 16452266
Alignment:
Q  15 tctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggt-------gagattgggaaaa-ggg 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||| |       |||||||| |||| |||    
T  16452003 tctttgattagagt-tctcttgggttcggaaacattgtaaacaccttggtaagtgacaatcattgagtgtcttgttcattgatgagattggaaaaatggg 16452101  T
Q  106 tagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagag 204  Q
    ||||||||| | ||||||| |  ||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16452102 tagaaattaag-tttgttctttctgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactca-ttcatagtggattggagag 16452198  T
Q  205 tacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
       ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | | || ||||||||| |||||||    
T  16452199 ataaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaac-atttcttggtgtgtttgttt 16452266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28750823 - 28750661
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  |||| ||||  ||| ||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  28750823 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttatgaaattgttgaagttaatttcctgtaacccatttgtatct-ttttgtaagaact 28750726  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 249  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  28750725 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaattgggt 28750661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 88 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 39468714 - 39468546
Alignment:
Q  88 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 185  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||     
T  39468714 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactca- 39468618  T
Q  186 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 258  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| | ||||| ||  |||||| ||||||||| | ||||||    
T  39468617 ttgatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggttaa-attggactgaactgggtcaacaatct 39468546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13695859 - 13695713
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactc 183  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||    
T  13695859 ttggagagattgggaaaagggtacaaattagggtttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaactc 13695760  T
Q  184 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaa 231  Q
    | || |||||||||| |||||   | ||||||||||| | ||||||||    
T  13695759 a-ttaatagtggattagagagattattctctcctccatagtaggtcaa 13695713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 42426403 - 42426255
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  42426403 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaaattgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 42426306  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtt 234  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||||||    
T  42426305 catt-gatagtggattggagagatcaatctctccccctgattaggtcaagtt 42426255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 27637781 - 27637616
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaac 181  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |  ||| |||||  || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  27637781 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttatgagcttgtttaaactaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 27637684  T
Q  182 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    |||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  27637683 tcatt--atagtggattggagagatcaatctctcctgcagagtaggtcattgttggaccgaactgggtga 27637616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 88 - 247
Target Start/End: Original strand, 538028 - 538185
Alignment:
Q  88 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 185  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| | || | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||     
T  538028 gtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gctctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactca- 538124  T
Q  186 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgg 247  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  538125 ttgatagtagattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgg 538185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 89 - 249
Target Start/End: Original strand, 38747009 - 38747167
Alignment:
Q  89 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatt 186  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| || |||||| |    
T  38747009 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttggaaaaactca-t 38747105  T
Q  187 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 249  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||  |||||||| ||||||| ||||||||    
T  38747106 tgatagaggattggagagatcaatctctccctcagatcaggtcaag-ttggaccaaactgggt 38747167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Original strand, 31182883 - 31183157
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacacctt-gtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgag 92  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||| |   || || |||||||||||||||||       |||||    
T  31182883 tagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttaggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgag 31182980  T
Q  93 attgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgata 191  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| || |||| | ||||  ||||  ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  31182981 attggaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagtttgtttaagttaatttcttgtaaccattt-gtatcccttt-gtaagaactcatt-gata 31183076  T
Q  192 gtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
     ||||||||||||  | |||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | || ||| ||||||| |||||||    
T  31183077 ctggattggagagatctatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacattct-ttggtgtgtttgttt 31183157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Original strand, 27015531 - 27015687
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||        |||| |||||||| |||| |||||||||    
T  27015531 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaat--------acccatttgtatctcttt-gtaagaact 27015620  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    |||| |||||||||||| | ||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27015621 catt-gatagtggattgtacagatcaatctctcctccaaaataggtcaag-ttggaccgaactgggtga 27015687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16641091 - 16640961
Alignment:
Q  99 aaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggat 197  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| | |||| |||||  ||||| ||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||    
T  16641091 aaaatggtagaaattagtgtttgttctttgtgagcttgttgaagctgatttctgataactcttttgtatctcttt-gtaagaact----tgatagtggat 16640997  T
Q  198 tggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagt 233  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16640996 tggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagt 16640961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 88 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 9049506 - 9049354
Alignment:
Q  88 gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatt 186  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||  || ||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |    
T  9049506 gtgagtttgggaaaatgatagaaattagtgtttgtttttg-tgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccattttgtatctc-tttgtaagaactca-t 9049410  T
Q  187 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaa 243  Q
    ||| ||||||||||||||  |||| ||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  9049409 tgacagtggattggagagatcaatatctcccccaaagtaggtgaag-ttggaccgaa 9049354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 245
Target Start/End: Original strand, 316769 - 316922
Alignment:
Q  91 agattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttga 189  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| || |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| ||||    
T  316769 agattgagaaaaaggtagaaattagg-tttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaagaactca-ttga 316866  T
Q  190 tagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaact 245  Q
    || ||||| |||| |  |||||||||| | ||| |||||||   ||||||||||||    
T  316867 taatggatcggagggatcaatctctcccctagagtaggtcattgttggaccgaact 316922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3075823 - 3075640
Alignment:
Q  88 gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 185  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||| | |||| |||| | || ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||      
T  3075823 gtgagattgagaaaataggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgctgaatctaatttcttgtaacccatttgtat-ctttttgtaagaattc-g 3075727  T
Q  186 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||  || | ||||||||| ||||||| || ||||||| | || ||||||||| |||||||    
T  3075726 ttgatagtgaattggagagatcaatctctccctcatagtaggtcaag-ttggaccaaattgggtgaac-atttcttggtgtgtttgttt 3075640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 258
Target Start/End: Original strand, 19806463 - 19806534
Alignment:
Q  186 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 258  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  19806463 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 19806534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33906144 - 33906035
Alignment:
Q  139 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 238  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||| ||||||| ||  |||||||| | | ||| ||||||||  |||||    
T  33906144 aagctaacttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaagaactca-ttgatagtagattggaaagatcaatctcttccctagagtaggtcaatgttgga 33906046  T
Q  239 ccgaactgggt 249  Q
    |||| ||||||    
T  33906045 ccgagctgggt 33906035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 42310048 - 42309973
Alignment:
Q  139 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcc 216  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||| | |||  ||||||||||    
T  42310048 aagctaatttcttgtaactcttttgtatctc-tttgtaagaactta-ttgatagtggattagcgagatcaatctctcc 42309973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 249
Target Start/End: Original strand, 4160702 - 4160762
Alignment:
Q  189 atagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 249  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||   ||||||| ||||||||    
T  4160702 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccaaactgggt 4160762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 188
Target Start/End: Original strand, 42926922 - 42926970
Alignment:
Q  139 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttg 188  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  42926922 aagctaatttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaactcatttg 42926970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 70)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 9036333 - 9036688
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036333 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 9036432  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  9036433 aagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattga 9036530  T
Q  201 agagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatctt 300  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036531 agagtacaatctctcctcgagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatctt 9036630  T
Q  301 gtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036631 gtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 9036688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 44203549 - 44203904
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203549 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 44203646  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattg 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44203647 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 44203745  T
Q  200 gagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  44203746 gagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttg--tatc 44203843  T
Q  299 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203844 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 44203904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 40282293 - 40282647
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282293 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 40282392  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattg 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40282393 aagggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattg 40282490  T
Q  200 gagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatct 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  40282491 gagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctcct--tttatct 40282588  T
Q  300 tgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282589 tgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 40282647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 21053874 - 21054228
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21053874 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagaaaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 21053973  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattg 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21053974 aagtgtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattg 21054071  T
Q  200 gagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatct 299  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21054072 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctcct--tttatct 21054169  T
Q  300 tgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21054170 tgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 21054228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20622490 - 20622135
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20622490 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagggaaaatcattgactgtcttggtgagattgggaa 20622391  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatccc--ttttgtaagaactcatttgatagtggat 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  20622390 aagggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttttgtaagaactc-tttgatagtggat 20622294  T
Q  198 tggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  20622293 tggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctcct--tttat 20622196  T
Q  298 cttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||||||| ||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622195 cttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 20622135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 9987118 - 9987472
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9987118 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 9987217  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattg 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  9987218 aagggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgcaa-ccttttgtatcccttttgcaagaactca-ttgatagtggattg 9987314  T
Q  200 gagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt-atttgttttcttcttccctctccttgtttatc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  9987315 gagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtcttttgttttcttcttccctctcct--tttatc 9987412  T
Q  299 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    ||||||||| ||  | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9987413 ttgtgattg-tgtatagtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 9987472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Original strand, 51765304 - 51765663
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------gtgagat 94  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||| | ||||||||||   || |  |||||||||||||||||      ||  |||    
T  51765304 ctagggtttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttcttggtttgat 51765402  T
Q  95 tggga--aaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgat 190  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||    | | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  51765403 tgggagaaaagggtagaaattagggttgtacctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gat 51765501  T
Q  191 agtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctcct 290  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  51765502 agtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggacaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtctttgttttcctcttccctctcct 51765600  T
Q  291 tgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 355  Q
      ||||||||||| ||| || |||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  51765601 --tttatcttgtgcttg-tggtttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgtt 51765663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 84 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 13316521 - 13316348
Alignment:
Q  84 cttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaac 181  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  13316521 cttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaac 13316424  T
Q  182 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13316423 tcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 13316348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 88 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 8550952 - 8550688
Alignment:
Q  88 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 185  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  8550952 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatcccttt-gtaagaactcat 8550855  T
Q  186 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttct-tcttccc 284  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||| |     
T  8550854 t-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttttctctctt-ct 8550758  T
Q  285 tctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 355  Q
    ||||  | ||||||||||| ||||   |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  8550757 tctc--tctttatcttgtgcttgtgattttgtgtttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgtt 8550688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Original strand, 20762582 - 20762859
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 93  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || ||||||||||| |||||       ||||||    
T  20762582 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtatcttgttcattggtgaga 20762679  T
Q  94 ttgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgat 190  Q
    ||| |||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||    
T  20762680 ttgagaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttc-gtaagaactcatt-gat 20762776  T
Q  191 agtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20762777 agtggattggagagatcaatctctcctacagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct-ttggtgtgtttgttt 20762859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 85 - 274
Target Start/End: Original strand, 3189330 - 3189517
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  3189330 ttggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatct-ttttgtaagaact 3189427  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  3189428 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 3189517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 85 - 274
Target Start/End: Original strand, 3198147 - 3198334
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  3198147 ttggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatct-ttttgtaagaact 3198244  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  3198245 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 3198334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 85 - 274
Target Start/End: Original strand, 3206986 - 3207173
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  3206986 ttggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatct-ttttgtaagaact 3207083  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  3207084 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 3207173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 85 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28220394 - 28220210
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  28220394 ttggtgagattcggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 28220297  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgt 272  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||    
T  28220296 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgt 28220210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Original strand, 37168297 - 37168462
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaac 181  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  37168297 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 37168394  T
Q  182 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37168395 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 37168462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13547257 - 13547093
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  13547257 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctattttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 13547160  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13547159 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 13547093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Original strand, 3156776 - 3157050
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 93  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||| ||   || || |||||||||||||||||       ||||||    
T  3156776 tagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggtttggaaacattgtaaacaccctggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 3156873  T
Q  94 ttgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgata 191  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  3156874 ttgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gata 3156970  T
Q  192 gtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 273  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  3156971 gtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 3157050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 28265722 - 28265536
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  28265722 ttggcgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 28265625  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  28265624 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 28265536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 42298143 - 42297963
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  42298143 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 42298046  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 266  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42298045 catt-gatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgt 42297963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 88 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 834332 - 834149
Alignment:
Q  88 gtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 185  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||     
T  834332 gtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccc-tttgtaagaactca- 834236  T
Q  186 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  834235 ttgatagtggattggagagatctatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 834149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13549168 - 13549004
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagc-taatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| || | ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  13549168 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttaaacctaatttcatgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 13549071  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13549070 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 13549004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Original strand, 29136247 - 29136412
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||| ||||| |||||||  |||| |||||||||    
T  29136247 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttggaacccatttgtatttcttt-gtaagaact 29136344  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  29136345 catt-gatcgtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 29136412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 47255508 - 47255343
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  47255508 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 47255411  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  47255410 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtga 47255343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 249
Target Start/End: Original strand, 44455160 - 44455322
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  || ||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||    
T  44455160 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaactcatttgtatct-ttttgtaagaact 44455257  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 249  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  44455258 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttt-gaccgaactgggt 44455322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 273
Target Start/End: Original strand, 49918350 - 49918535
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  49918350 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 49918447  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 273  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  49918448 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 49918535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Original strand, 11348698 - 11348862
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||    
T  11348698 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttc-taagaact 11348795  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  11348796 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtga 11348862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 4552805 - 4552619
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  4552805 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagg-tttgtcctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccctttgtatccc-tttgtaagaact 4552708  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    || |||||| ||||||||||||  ||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  4552707 ca-ttgataatggattggagagatcaatctctccctcagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 4552619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 85 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28223589 - 28223405
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | || |  |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  28223589 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtt-gatctttctgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 28223492  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgt 272  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||    
T  28223491 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgt 28223405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 31925875 - 31925711
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  31925875 ttggtgagagtggaaaaatgggtagaaattagggat-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 31925778  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  31925777 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtga 31925711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 7482399 - 7482234
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaac 181  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  7482399 ttggtgagattgggtaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 7482302  T
Q  182 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    ||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  7482301 tcatt-gatagtgaattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtga 7482234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 37033241 - 37033068
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaac 181  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||    
T  37033241 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatccattttgcatctcttt-gtaagaac 37033144  T
Q  182 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||   ||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  37033143 tcatt-gatagtggattggagagattaatctcttctccatagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatct 37033068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 258
Target Start/End: Original strand, 31659238 - 31659409
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  31659238 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggct-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 31659335  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 258  Q
     ||| |||||||||||||||||  ||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  31659336 tatt-gatagtggattggagagatcaatctctccctcagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 31659409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 45644523 - 45644351
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||| | |||| |||||||| |||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  45644523 ttggtgagattgagaaaatggatagaaattaagttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgcaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 45644425  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 258  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  45644424 catt-gatagtggattggagagatcaatatctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 45644351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 50167343 - 50167157
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||  | |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||    
T  50167343 ttggtgagattgggaaaattagtagaaattagggtt-gttatttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaaaaact 50167246  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  50167245 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattagctcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 50167157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 50169378 - 50169192
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||    
T  50169378 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagtact 50169281  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||| | | |||||| ||||||| |||||||    
T  50169280 catt-gatagtggattgaagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 50169192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Original strand, 47115171 - 47115337
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaac 181  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||    
T  47115171 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaaaaac 47115268  T
Q  182 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
     |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  47115269 ccatt-gatagtggattggagagatcaatctctgctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtga 47115337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 88 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3847286 - 3847103
Alignment:
Q  88 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 185  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||  ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  3847286 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgtttaagctaaatttttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcat 3847189  T
Q  186 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    | |||||||||||||||||  | |||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  3847188 t-gatagtggattggagagatccatctcttccccagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 3847103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 88 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13659501 - 13659318
Alignment:
Q  88 gtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 185  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  | || | |||||  ||||||||||||||| |||| ||| |||| |||| ||||||||||||    
T  13659501 gtgagattgggaaaacggatagaaattagggtt-gttttttgtaagcttgttgaagctaatttcttgttacccatttatatctcttt-gtaagaactcat 13659404  T
Q  186 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  13659403 t-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtatttgttt 13659318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 249
Target Start/End: Original strand, 19754494 - 19754657
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaac 181  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||    
T  19754494 ttggtgagattgagaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccgatttgtatctcttt-gtaagaac 19754591  T
Q  182 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  19754592 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccctcagattaggtcaag-ttggaccgaagtgggt 19754657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 37503722 - 37503540
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||| |||| |||||||||    
T  37503722 ttggtgagattgggaaaatgggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacc---ttgtatctcttt-gtaagaact 37503628  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 273  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| || |||||| ||||| |||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  37503627 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaag-ttggatcgaactaggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 37503540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 85 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 37560037 - 37559850
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc--aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaac 181  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  37560037 ttggtgagattaggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaac 37559940  T
Q  182 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctcc-agaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 273  Q
    ||  ||||||||| |||||||||  |||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  37559939 tc-gttgatagtgaattggagagatcaatctctccccctagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 37559850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Original strand, 193611 - 193775
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |  | | |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||    
T  193611 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttattagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaataact 193708  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  193709 catt-gatagtggattggagagatcaatctcttctccagagtatgtcaag-ttggaccgaactgggtga 193775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 1833522 - 1833667
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaa-cttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| ||  | ||||||| |||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  1833522 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaatctattgaagctaaattcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 1833619  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaa 231  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  1833620 catt-gatagtggattggagagatcaatctctccaccagattaggtcaa 1833667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 250
Target Start/End: Original strand, 34603576 - 34603740
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaac 181  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  34603576 ttggtgagattgaaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttttatctcttt-gtaagaac 34603673  T
Q  182 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtg 250  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  34603674 tcatt-gatggtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtg 34603740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23555433 - 23555286
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  || |||||||||| |||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  23555433 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttataactcatttgtatctcttt-gtaagaact 23555336  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtt 234  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||    
T  23555335 catt-gatagtggattggagagttcaatctctcc-ccatagtaggtcaagtt 23555286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 88 - 274
Target Start/End: Original strand, 46064921 - 46065104
Alignment:
Q  88 gtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 185  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||| ||||||| | |||| || ||  |||||||||||||||||| | | |||||| |||| ||||||||||||    
T  46064921 gtgagattgggaaaatggataaaaattagg-tttgttctttgtgagctcgttgaagctaatttcttgtaactcatgtgtatctcttt-gtaagaactcat 46065018  T
Q  186 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    |  ||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  46065019 tc-atagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggatcgaactgggtaaacaatct-ttggtgtgtttgttt 46065104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 274
Target Start/End: Original strand, 41360914 - 41361101
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  41360914 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 41361011  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    |  |||||||||||||  ||||  |||| ||||| ||| | |||||| |  |||||||||||| ||| | |||| ||||||||| |||||||    
T  41361012 c-gttgatagtggattaaagagatcaatatctcccccatagtaggtc-atattggaccgaactaggtcaacaatatcttggtgtgtttgttt 41361101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 197166 - 196915
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgag 92  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       |||||    
T  197166 tagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgag 197069  T
Q  93 attgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgat 190  Q
    |||| |||||  |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  ||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  197068 attgagaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagttaatttcttgtaactcatttgtatccc-tttgtaagaactca-ttgat 196972  T
Q  191 agtggattggagagtacaatctct-cctccagaataggtcaagtttggaccgaactgg 247  Q
    ||||||||||||||    |||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  196971 agtggattggagagatttatctctccccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgg 196915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 30476614 - 30476429
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  30476614 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattaggg-ttgttctttatgaacttgttgaagataatttattgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 30476517  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 273  Q
    || |||||| ||||||||| ||  |||||||| | ||| |  |||| ||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  30476516 ca-ttgatactggattggacagatcaatctctaccccatatgaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 30476429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 85 - 258
Target Start/End: Original strand, 19752685 - 19752857
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaac 181  Q
    |||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| |||| | | || |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||    
T  19752685 ttggtgagattgagtaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgcgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccgatttgtatctc-tttgtaagaac 19752782  T
Q  182 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 258  Q
    ||| ||||||| |||||||||||  |||||||||  ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  19752783 tca-ttgatagaggattggagagatcaatctctctcccatattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 19752857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 90 - 230
Target Start/End: Original strand, 22079322 - 22079461
Alignment:
Q  90 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttg 188  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| | ||||||| | |||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||| |||    
T  22079322 gagattggaaaaatggtagaaattatg-tttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaaccattttgtatctctttgtaaagaactca-ttg 22079419  T
Q  189 atagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtca 230  Q
    ||| ||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||||    
T  22079420 atattggattggagagatcaatttctcctccaaagtaggtca 22079461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 171 - 251
Target Start/End: Original strand, 28242391 - 28242469
Alignment:
Q  171 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  28242391 tttgtaagaactcatt--atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtga 28242469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 90 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 12318685 - 12318589
Alignment:
Q  90 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatt 186  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  12318685 gagatttggaaatgggtagaaattagg-tttgttcatggagagcttgttgaagctaatttcttgtaaccattttgtatgtcttctttaagaactcatt 12318589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 928123 - 927982
Alignment:
Q  106 tagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagag 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||| || |||||||||| |||||    
T  928123 tagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttggatctc-tttgtaaaaactca-ttaatagtggattagagag 928026  T
Q  205 tacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 249  Q
      ||| |||| | |||   ||||||||| || |||||||||||||    
T  928025 accaacctcttccccaaggtaggtcaag-ttagaccgaactgggt 927982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 234
Target Start/End: Original strand, 15820326 - 15820455
Alignment:
Q  103 gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 201  Q
    ||||| |||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||| |    
T  15820326 gggtaaaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatctctttt-taagaactca-ttgatagtgcattgaa 15820422  T
Q  202 gagtacaatctctcctccagaataggtcaagtt 234  Q
    |||   |||||||| |||||| |||||||||||    
T  15820423 gagataaatctctcatccagagtaggtcaagtt 15820455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 215
Target Start/End: Original strand, 16455676 - 16455750
Alignment:
Q  139 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctc 215  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16455676 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tgtgtaagaactca-ttgatagtggattggagagatcaatctctc 16455750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 13138089 - 13137973
Alignment:
Q  139 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 238  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| |||||| |  |||||    
T  13138089 aagctaatttcttgtaacccatttgcatctc-tttgtaagaacaca-ttgatagtggattgaagagagcaatctctcccctagagtaggtc-atattgga 13137993  T
Q  239 ccgaactgggtgaccaatct 258  Q
    ||||||||||| | ||||||    
T  13137992 ccgaactgggtcaacaatct 13137973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 40122363 - 40122178
Alignment:
Q  88 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 185  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||| | |||| |||||  ||||||||||||| |||| | |||||||| |||| |||||||||| |    
T  40122363 gtgagattggaaaaatgggtcgaaattaga-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttataactcatttgtatcacttt-gtaagaactc-t 40122267  T
Q  186 ttgata--gtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  40122266 ttgatatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 40122178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 166
Target Start/End: Original strand, 3460710 - 3460778
Alignment:
Q  99 aaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtat 166  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  3460710 aaaagggtagaaattagagtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccttttgtat 3460778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 214
Target Start/End: Original strand, 6808507 - 6808581
Alignment:
Q  139 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctct 214  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  6808507 aagctaacttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcattt-atagtggattggagagatcaatctct 6808581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 274
Target Start/End: Original strand, 36683766 - 36683866
Alignment:
Q  171 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtattt 270  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||| || | | |||||||||||| |||    
T  36683766 tttgtaagaactcatt-gatagtggattgtagaaatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttagaccgaactgagtaaac-atctcttggtgtgttt 36683862  T
Q  271 gttt 274  Q
    ||||    
T  36683863 gttt 36683866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 37282846 - 37282728
Alignment:
Q  99 aaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggat 197  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| | |||| |||||  |||||||||| | |||||||||||| ||| ||||   ||||||||||| | ||||||||    
T  37282846 aaaatggtataaattagggtttgttccttgtgagcttgttgaagctaatttatggtaacccttttgcatctctttgtaaagaactcattag-tagtggat 37282748  T
Q  198 tggagagtacaatctctcct 217  Q
    |||||||   ||||||||||    
T  37282747 tggagagataaatctctcct 37282728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 8871213 - 8871135
Alignment:
Q  88 gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacccttttgta 165  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||  | | | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  8871213 gtgagatttggaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagttcgttgaagctaatttcttgtaaccattttgta 8871135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 204
Target Start/End: Original strand, 13938143 - 13938256
Alignment:
Q  90 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgt-caagctaatttcttgtaacc-cttttgtatcccttttgtaag-aactcatt 186  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||  ||  |||||||||||||||  ||||||||| | |||||||| |||||| |    
T  13938143 gagattgggaaatgggtagaaattagg--ttgttcttggagaacttgtaaaatataatttcttgtaaccttttttgtatctc-tttgtaagaaactca-t 13938238  T
Q  187 tgatagtggattggagag 204  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13938239 tgatagtggattggagag 13938256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 37876865 - 37876770
Alignment:
Q  153 taacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    |||||| |||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||  ||||| ||| ||||||||||||||    
T  37876865 taacccatttgtatctcttt-gtaataactcatt-gatagtggattgcagagatcaatctctcctccagagtacatcaag-ttgaaccgaactgggtga 37876770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 37879079 - 37879006
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 157  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  37879079 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacc 37879006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 156
Target Start/End: Original strand, 6378603 - 6378655
Alignment:
Q  104 ggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaac 156  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  6378603 ggtagaaattagggtttgttcatgttgaacattgt-aagctaattttttgtaac 6378655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 172
Target Start/End: Original strand, 48382441 - 48382505
Alignment:
Q  107 agaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttt 172  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  48382441 agaaattagggtttgatctttgtgaacttgt-aagttaatttcttgtaacctatttgtatcacttt 48382505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 167
Target Start/End: Original strand, 32736952 - 32737015
Alignment:
Q  103 gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 167  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||| | |||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  32736952 gggtagaaattagggtttgttctttatgaactt-ttaagctaattttttgtaacctctttgtatc 32737015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 167
Target Start/End: Original strand, 35109493 - 35109556
Alignment:
Q  103 gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 167  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||| ||| | |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  35109493 gggtagaaattaaggtttgttctttgtgagctttt-aagctaatttcttgtaacctatttgtatc 35109556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 16554785 - 16555142
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16554785 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 16554884  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16554885 aagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgg 16554983  T
Q  201 agagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatct 299  Q
    ||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16554984 agagtgcaaactctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatct 16555083  T
Q  300 tgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16555084 tgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 16555142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 16631341 - 16631698
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631341 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 16631440  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631441 aagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgg 16631539  T
Q  201 agagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatct 299  Q
    ||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631540 agagtgcaaactctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatct 16631639  T
Q  300 tgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631640 tgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 16631698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 16653028 - 16653385
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16653028 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 16653127  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16653128 aagggtaaaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgg 16653226  T
Q  201 agagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatct 299  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16653227 agagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatct 16653326  T
Q  300 tgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16653327 tgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 16653385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16578770 - 16578413
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578770 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacgttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 16578671  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578670 aagggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgg 16578572  T
Q  201 agagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatct 299  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578571 agagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatct 16578472  T
Q  300 tgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578471 tgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 16578413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 16616610 - 16616967
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616610 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacgttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 16616709  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616710 aagggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgg 16616808  T
Q  201 agagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatct 299  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616809 agagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatct 16616908  T
Q  300 tgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616909 tgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 16616967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 25421221 - 25421578
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421221 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 25421320  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattg 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25421321 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 25421419  T
Q  200 gagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25421420 gagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttcc--ctccttgtttatc 25421517  T
Q  299 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421518 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 25421578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 6027164 - 6027518
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027164 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 6027261  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggattg 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6027262 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 6027360  T
Q  200 gagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||  | | ||||||    
T  6027361 gagagtacaatctctcctccagagtatgtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc--cat-tttatc 6027457  T
Q  299 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027458 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 6027518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 34166996 - 34167352
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34166996 ctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 34167093  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggatt 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  34167094 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaacttatttgatagtggatt 34167192  T
Q  199 ggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttat 297  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  34167193 ggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttg--tat 34167290  T
Q  298 cttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34167291 cttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagatttgatctaggtggtgttttgt 34167352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 33342357 - 33341999
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342357 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 33342260  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggatt 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33342259 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtactccttttgtaaagaactcatttgatagtggatt 33342161  T
Q  199 ggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctcc-ttgttta 296  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33342160 ggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctcctttgttta 33342061  T
Q  297 tcttgtgatt-gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342060 tcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 33341999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 34164774 - 34165128
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34164774 ctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 34164871  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggatt 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34164872 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggatt 34164970  T
Q  199 ggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttat 297  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34164971 ggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttat 34165070  T
Q  298 cttgtgatt-gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttt 356  Q
    |||||| || |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  34165071 cttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttt 34165128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 27647779 - 27648124
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27647779 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccatgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 27647876  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27647877 aagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattgg 27647974  T
Q  201 agagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatctt 300  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27647975 agagtacaaactctcctccagagtagatcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttcttcttccctctcct--tttatctt 27648072  T
Q  301 gtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |       ||  ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27648073 g-------tgtattgagtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 27648124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 65 - 359
Target Start/End: Original strand, 13153893 - 13154187
Alignment:
Q  65 agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttg 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  13153893 agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttg 13153991  T
Q  164 tatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttg 262  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13153992 tattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt 13154091  T
Q  263 gtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13154092 gtgtttattgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattcgatctaggtggtgtattgt 13154187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Original strand, 412018 - 412369
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  412018 ctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 412116  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggatt 198  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  412117 aaaggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttatcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactca-ttgatagtggatt 412214  T
Q  199 ggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttat 297  Q
     |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  412215 agagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttcttcttccctctcct--tttat 412312  T
Q  298 cttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgtt 355  Q
    |||||| ||| ||  ||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  412313 cttgtgcttg-tgtattgtgtttttcacttgttacctagattagatctaggtgctgtt 412369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 3073012 - 3072670
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggga 99  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3073012 ctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattggga 3072914  T
Q  100 aaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaaccctttt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggat 197  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  3072913 aaatggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagtgaat 3072816  T
Q  198 tggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttat 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  3072815 tggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcctcttccctctcct--tttat 3072718  T
Q  298 cttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatcta 346  Q
    |||||| ||| || ||| || ||  |||||| |||||||||||||||||    
T  3072717 cttgtgcttg-tgttttatgcttttcacttgtttcctagattagatcta 3072670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 6097693 - 6097349
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||   || || ||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  6097693 ctagggtttagggttctttgattagagtatctctttggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgttttggtgagattggaa 6097594  T
Q  100 aaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggatt 198  Q
    ||| ||||||||||||| || |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||           |||||||||| |||||||||||    
T  6097593 aaatggtagaaattaggatt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgta-----------agaactcatt-gatagtggatt 6097507  T
Q  199 ggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttat 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  6097506 ggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccctctccttg--tat 6097409  T
Q  298 cttgtgattgttgctttgtg-tttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgtttt 357  Q
    |||||||||| ||  ||||| |||  |||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6097408 cttgtgattg-tgtattgtgtttttccacttgttacctagattagatcaaggtgctgtttt 6097349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 2171790 - 2171512
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgag 92  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       |||||    
T  2171790 ctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgag 2171692  T
Q  93 attgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgat 190  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  2171691 attgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttt-gtatctcttt-gtaagaactcatt-gat 2171596  T
Q  191 agtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2171595 agtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtatttgttt 2171512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 31404932 - 31404656
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 93  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||    
T  31404932 tagggtttagggtcttttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatcagtgaga 31404834  T
Q  94 ttgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatag 192  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  31404833 ttgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatag 31404737  T
Q  193 tggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  31404736 tggattggagagatcaatctctcctccagagtaggccaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 31404656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5406456 - 5406181
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 93  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||    
T  5406456 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctctcgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 5406359  T
Q  94 ttgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatag 192  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  5406358 ttgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatag 5406262  T
Q  193 tggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  5406261 tggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 5406181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5410781 - 5410506
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 93  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||    
T  5410781 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctctcgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 5410684  T
Q  94 ttgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatag 192  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  5410683 ttgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatag 5410587  T
Q  193 tggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  5410586 tggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 5410506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16452583 - 16452310
Alignment:
Q  6 gtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgg 97  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||    
T  16452583 gtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgg 16452486  T
Q  98 gaaaa--gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtg 194  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||| | ||||||||||| |||||||    
T  16452485 gaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttcatatctctttgg-aagaactcatt-gatagtg 16452389  T
Q  195 gattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  16452388 gattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 16452310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 30834794 - 30834517
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 93  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||| |   || || |||||||||||||||||       ||||||    
T  30834794 tagggtttatggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacacctcggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 30834697  T
Q  94 ttgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgat 190  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||    
T  30834696 ttgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactcatt-gat 30834600  T
Q  191 agtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||    
T  30834599 agtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaataatct-ttggtgtgtttgttt 30834517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5413650 - 5413376
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 93  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| | |||||| |||   || || |||||||||||||||||       ||||||    
T  5413650 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctctcgggttgggaaacattgtaaacacattggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 5413553  T
Q  94 ttgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatag 192  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  5413552 ttgggaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgcgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatag 5413456  T
Q  193 tggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  5413455 tggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact-ggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 5413376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Original strand, 21588931 - 21589095
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  21588931 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 21589028  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21589029 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 21589095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Original strand, 21593664 - 21593828
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  21593664 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 21593761  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21593762 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 21593828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 33160521 - 33160254
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaac 181  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  33160521 ttggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaac 33160424  T
Q  182 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttctt 281  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||   ||||    
T  33160423 tcatt-gatggtggattggagagatcaatctctcctccagagtatttcaagtttggaccaaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt 33160326  T
Q  282 ccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 355  Q
      |||||||| |||||||| || |||| | |||||| ||  ||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  33160325 --ctctcctt-tttatcttttgtttgtggttttgtgcttttcactttgattactagattagatctaggtgttgtt 33160254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 85 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 3808877 - 3808699
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaac 181  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  3808877 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 3808780  T
Q  182 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttgg 263  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  3808779 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcatgattggaccgaactaggtgaacaatctcttgg 3808699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 85 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 9183199 - 9183015
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  9183199 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaatttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 9183102  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgt 272  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||    
T  9183101 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgt 9183015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 88 - 251
Target Start/End: Original strand, 17758026 - 17758188
Alignment:
Q  88 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 185  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  17758026 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcat 17758123  T
Q  186 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    | |||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  17758124 t-gatagtggattggagagatcaatctcccctctagagtagttcaagtttggaccgaactaggtga 17758188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 2973107 - 2972943
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  2973107 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 2973010  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||||    
T  2973009 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctcaagagtaggtcaag-ttcgaccgaactaggtga 2972943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Original strand, 17762990 - 17763155
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| |||||||    
T  17762990 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatct-ttttggaagaact 17763087  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  17763088 catt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagatcaagtttggaccgaactaggtga 17763155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Original strand, 16568953 - 16569208
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgta-aagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggga 99  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||   ||| || |||||||||||||||||   |||||| ||    
T  16568953 tagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggtttggaaacattgtaaacaccttgggtaagtgaaaatcattgagtgtcttg---agattgaga 16569047  T
Q  100 aaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggat 197  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||             |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16569048 aaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacc-------------tttgtaagaactcatt-gatagtggat 16569133  T
Q  198 tggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  16569134 tggagagatcaatctctcctccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 16569208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 154 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5409167 - 5409051
Alignment:
Q  154 aacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgacc 253  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  5409167 aacccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact-ggtgaac 5409071  T
Q  254 aatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||||| ||||||| |||||||    
T  5409070 aatct-ttggtgtgtttgttt 5409051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 28137576 - 28137420
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||    
T  28137576 ttggtgagaatgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatttcttt-gtaagaact 28137479  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaa 243  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28137478 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaa 28137420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26830289 - 26830127
Alignment:
Q  87 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactca 184  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||    
T  26830289 ggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatccatttgtatctcttt-gtaagaactca 26830192  T
Q  185 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  26830191 tt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaagttt-gactgaactgggtga 26830127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22424995 - 22424829
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccc--ttttgtatcccttttgtaagaa 180  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||    
T  22424995 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttttgtatctcttt-gtaagaa 22424898  T
Q  181 ctcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    ||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||   |||||||| |||||||||    
T  22424897 ctcatt--atagtggattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcattgttggaccgtactgggtga 22424829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 88 - 251
Target Start/End: Original strand, 5043630 - 5043792
Alignment:
Q  88 gtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 185  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||    
T  5043630 gtgagattgagaaaatgagtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcat 5043727  T
Q  186 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    | |||||| ||||||||||  |||||||||||||| | |||||||   ||||||||||||||||||    
T  5043728 t-gatagtagattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcattgttggaccgaactgggtga 5043792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3039071 - 3038926
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  3039071 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttcattgtgagctttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 3038974  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaa 231  Q
    | ||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||    
T  3038973 c-tttaatagtggattggagagattaatctctcccccagattaggtcaa 3038926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 139 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 603201 - 603081
Alignment:
Q  139 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 238  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||| ||||||||| |||||    
T  603201 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactc-gttgatagtggattggagaaatcaatctctccccaagattaggtcaag-ttgga 603105  T
Q  239 ccgaactgggtgaccaatctcttg 262  Q
    ||||||||||| | ||||||||||    
T  603104 ccgaactgggtcaacaatctcttg 603081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 88 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 26954450 - 26954283
Alignment:
Q  88 gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatt 186  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | | |||||| |||| |||||||||||||    
T  26954450 gtgagattgggaaattggtataaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatctgtatctcttt-gtaagaactcatt 26954353  T
Q  187 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 258  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  26954352 -gatagtggattggagagatcaatctctcccccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 26954283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 33211353 - 33211182
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| | |||| |||| | ||| |||||||||||| | | |||||||| |||| |||||||||    
T  33211353 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattatggtt-gttctttgtgagcttgatgaagttaatttcttgtagctcatttgtatctcttt-gtaagaact 33211256  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 258  Q
    ||||| ||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  33211255 cattt-ataatggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 33211182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 247
Target Start/End: Original strand, 26800642 - 26800748
Alignment:
Q  139 aagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgg 237  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||   ||||    
T  26800642 aagctaatttcttgtaactaattttgtatctcttt-gtaagaactcatt--atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttgg 26800738  T
Q  238 accgaactgg 247  Q
    ||||||||||    
T  26800739 accgaactgg 26800748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Original strand, 4045423 - 4045542
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactc 183  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||| |||| | ||||||||||||||||| | |||| |||| ||||   || |||||    
T  4045423 ttggagagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttctttatgagcttgttgaagctaatttcttgtaatcattttatatctctttgtaaataactc 4045522  T
Q  184 atttgatagtggattggagag 204  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  4045523 a-ttgatagtggattggagag 4045542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 210 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21356084 - 21356021
Alignment:
Q  210 tctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  21356084 tctctcctccagattaggtcatatt-ggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttt 21356021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 76)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 3617365 - 3617722
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617365 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 3617464  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattg 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3617465 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 3617563  T
Q  200 gagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  3617564 gagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttg--tatc 3617661  T
Q  299 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617662 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 3617722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 25637344 - 25637702
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637344 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 25637441  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattg 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25637442 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 25637540  T
Q  200 gagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637541 gagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatc 25637640  T
Q  299 ttgtgattg-ttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637641 ttgtgattgtttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 25637702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 45282899 - 45283258
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45282899 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgcaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 45282998  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatccc---ttttgtaagaactcatttgatagtggat 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45282999 aagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatccctttttttgtaagaactcatttgatagtggat 45283097  T
Q  198 tggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45283098 tggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaatctcttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttat 45283197  T
Q  298 cttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||||||| ||  ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45283198 cttgtgattg-tgtattgtgtttctcactagtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 45283258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 54635041 - 54635395
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635041 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 54635140  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54635141 aagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattgg 54635238  T
Q  201 agagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatct 299  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  54635239 agagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctcct--tttatct 54635336  T
Q  300 tgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635337 tgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 54635395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 6716416 - 6716770
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716416 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 6716515  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6716516 aagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattgg 6716613  T
Q  201 agagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatct 299  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  6716614 agagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctcccct--tttatct 6716711  T
Q  300 tgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttg 358  Q
    |||||||||   |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716712 tgtgattgtatttttgagtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttg 6716770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 4600996 - 4600640
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4600996 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 4600899  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggatt 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4600898 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-ttttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggatt 4600800  T
Q  199 ggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttat 297  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4600799 ggagagtacaaactctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttat 4600700  T
Q  298 cttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4600699 cttgtgattgttgatt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgt 4600640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 4598775 - 4598421
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598775 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccctgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 4598678  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggatt 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4598677 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggatt 4598579  T
Q  199 ggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttat 297  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598578 ggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttat 4598479  T
Q  298 cttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgtttt 357  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  4598478 cttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgtttt 4598421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 10211311 - 10211667
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10211311 ctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 10211408  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggatt 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10211409 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggatt 10211507  T
Q  199 ggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttat 297  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10211508 ggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccctctccttgtttat 10211607  T
Q  298 cttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10211608 cttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgt 10211667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 10209091 - 10209447
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10209091 ctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 10209188  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggatt 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10209189 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtagtccttttgtaaagaactcatttgatagtggatt 10209287  T
Q  199 ggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttat 297  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10209288 ggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccctctccttgtttat 10209387  T
Q  298 cttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10209388 cttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgt 10209447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 10056135 - 10056489
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10056135 ctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 10056232  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggatt 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10056233 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggatt 10056331  T
Q  199 ggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttat 297  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10056332 ggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttat 10056431  T
Q  298 cttgtgatt-gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttt 356  Q
    |||||| || |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  10056432 cttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttt 10056489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 10058357 - 10058711
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10058357 ctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 10058454  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggatt 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10058455 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggatt 10058553  T
Q  199 ggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttat 297  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10058554 ggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttat 10058653  T
Q  298 cttgtgatt-gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttt 356  Q
    |||||| || |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  10058654 cttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttt 10058711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 10060579 - 10060933
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10060579 ctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 10060676  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggatt 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10060677 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggatt 10060775  T
Q  199 ggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttat 297  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10060776 ggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttat 10060875  T
Q  298 cttgtgatt-gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttt 356  Q
    |||||| || |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  10060876 cttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttt 10060933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 10062801 - 10063155
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10062801 ctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 10062898  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggatt 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10062899 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggatt 10062997  T
Q  199 ggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttat 297  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10062998 ggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttat 10063097  T
Q  298 cttgtgatt-gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttt 356  Q
    |||||| || |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  10063098 cttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttt 10063155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 10065023 - 10065377
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10065023 ctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 10065120  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggatt 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10065121 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggatt 10065219  T
Q  199 ggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttat 297  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10065220 ggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttat 10065319  T
Q  298 cttgtgatt-gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttt 356  Q
    |||||| || |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  10065320 cttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttt 10065377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 801007 - 801355
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggga 99  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  801007 ctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattggga 801105  T
Q  100 aaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaaccctttt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggat 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  801106 aaagggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagtggat 801203  T
Q  198 tggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  801204 tggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctcct--tttat 801301  T
Q  298 cttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgtttt 357  Q
    ||||||  | |||   ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  801302 cttgtg--tattg---tgtttttc-cacttgtttcctagattagatctaggtgctgtttt 801355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 48 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 7780208 - 7779903
Alignment:
Q  48 tgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaat 146  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||    
T  7780208 tgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttcgtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaat 7780110  T
Q  147 ttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactg 246  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  7780109 ttcttgtaacc-ttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaagtg 7780012  T
Q  247 ggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtg-tttcacacttggttcctagattagatct 345  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||| ||  ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||    
T  7780011 ggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcctcttccctctcct--tttatcttgtgcttg-tgtattgtgttttttcacttgtttcctagattagatct 7779915  T
Q  346 aggtggtgtttt 357  Q
    ||||| ||||||    
T  7779914 aggtgctgtttt 7779903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23200396 - 23200045
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------gtgaga 93  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||      ||||||    
T  23200396 ctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcttggtgaga 23200298  T
Q  94 ttgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgata 191  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  23200297 ttgggaaaaatggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatct-ttttgtaagaactcatt-gata 23200201  T
Q  192 gtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctcctt 291  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  23200200 gtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtctttgttttcttcttccctctcct- 23200103  T
Q  292 gtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcaca-cttggttcctagattagatctaggtg 350  Q
     |||||||| || ||| || |||||||||  ||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  23200102 -tttatcttatgcttg-tggtttgtgtttttcattttgtttcctagattagatctaggtg 23200045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 10067245 - 10067431
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10067245 ctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 10067342  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttg 188  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10067343 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 10067431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 23198197 - 23197850
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------gtgaga 93  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||      ||||||    
T  23198197 ctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcttggtgaga 23198099  T
Q  94 ttgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgata 191  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||| |||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  23198098 ttgggaaaaatggtagaaattagagtt-gttttttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatct-ttttgtaagaactcatt-gata 23198002  T
Q  192 gtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctcctt 291  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||     
T  23198001 gtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtctttgttttcctcttctctctcct- 23197904  T
Q  292 gtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcaca-cttggttcctagattagatcta 346  Q
     ||||||||||| ||| || |||||||||  ||  ||| |||||||||||||||||    
T  23197903 -tttatcttgtgcttg-tggtttgtgtttttcattttgtttcctagattagatcta 23197850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Original strand, 45095075 - 45095350
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 93  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||    
T  45095075 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 45095172  T
Q  94 ttgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatag 192  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  45095173 ttgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatag 45095269  T
Q  193 tggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  45095270 tggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggcgtatttgttt 45095350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 6718600 - 6718718
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6718600 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 6718699  T
Q  101 aagggtagaaattagggtt 119  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6718700 aagggtagaaattagggtt 6718718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9636385 - 9636106
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggt-------gaga 93  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| || | ||||||||||   || || |||||||||||||||||||       ||||    
T  9636385 tagggtttagggt-ctttgattagagtctctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtcattggtgaga 9636287  T
Q  94 ttggga--aaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgat 190  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  9636286 ttgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccttttgtatct-ttttgtaagaactcatt-gat 9636190  T
Q  191 agtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  9636189 agtggattggagagttcaatctctcctccaaagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtgtttgttt 9636106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5258402 - 5258125
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 93  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||    
T  5258402 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 5258305  T
Q  94 ttgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgat 190  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||    
T  5258304 ttgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactcatt-gat 5258208  T
Q  191 agtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  5258207 agtggattggagagttcaatctcttctccagagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 5258125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 88 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 19684054 - 19683792
Alignment:
Q  88 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 185  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19684054 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcat 19683957  T
Q  186 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccct 285  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||   ||||  ||    
T  19683956 t-gatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ct 19683861  T
Q  286 ctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 355  Q
    |||||  |||||||| || |||| | |||||||||  ||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  19683860 ctcct--tttatcttttgcttgtggttttgtgtttttcacttttattcctagattagatctaggtgctgtt 19683792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5260581 - 5260304
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggt-------gaga 93  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||||       ||||    
T  5260581 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtcattggtgaga 5260484  T
Q  94 ttgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgat 190  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||    
T  5260483 ttgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactcatt-gat 5260387  T
Q  191 agtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  5260386 agtggattggagagttcaatctcttctccaaagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 5260304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 85 - 274
Target Start/End: Original strand, 37408458 - 37408645
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  37408458 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaact 37408555  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  37408556 catt-gatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 37408645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 258
Target Start/End: Original strand, 7762265 - 7762437
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  7762265 ttggtgagattgagaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaact 7762362  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 258  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7762363 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 7762437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 215 - 356
Target Start/End: Original strand, 10067435 - 10067576
Alignment:
Q  215 cctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgatt-gttgct 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  10067435 cctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgct 10067534  T
Q  313 ttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttt 356  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  10067535 t--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttt 10067576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 258
Target Start/End: Original strand, 9581193 - 9581454
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgag 92  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       ||| |    
T  9581193 tagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtggg 9581290  T
Q  93 attgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgata 191  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  9581291 attcggaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttttaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcatt-gata 9581387  T
Q  192 gtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 258  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9581388 gtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 9581454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 96 - 274
Target Start/End: Original strand, 7764476 - 7764651
Alignment:
Q  96 gggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtg 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  7764476 gggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtg 7764572  T
Q  195 gattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  7764573 gattggagagatgaatctctcctccagagtaggtcaaatttagaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 7764651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 85 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 29196555 - 29196368
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  29196555 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttggaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 29196457  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  29196456 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 29196368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 85 - 273
Target Start/End: Original strand, 34491212 - 34491397
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  34491212 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 34491309  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 273  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  34491310 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtt 34491397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 49199638 - 49199457
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaac 181  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  49199638 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 49199541  T
Q  182 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 266  Q
    ||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49199540 tcatt-gatagtggattggagagattaatctctcctccagactaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgt 49199457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 249
Target Start/End: Original strand, 4569952 - 4570115
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  4569952 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttattgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 4570049  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 249  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4570050 catt-gatagtggattggagagatcaatctctactccagagtaggtgaagtttggaccgaactgggt 4570115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 88 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 39153526 - 39153358
Alignment:
Q  88 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 185  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||    
T  39153526 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttcattgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatcccttta-taagaactcat 39153429  T
Q  186 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 258  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||    
T  39153428 t-gatagtggattggagagaacaatctctcccccagattaggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaatct 39153358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Original strand, 40735293 - 40735568
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtaaa-gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgag 92  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||| | |||||| | |||||||||| ||| | || |||||||||||||||||       |||||    
T  40735293 tagggttgagggt-ctttgattaaagt-tctcttgggttaggaaacattgtaaacaccttggaaaagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgag 40735390  T
Q  93 attgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgat 190  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  40735391 attgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaaccagtttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gat 40735487  T
Q  191 agtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 273  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  40735488 agtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcagcaatct-ttggtgtatttgtt 40735568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 43401970 - 43401789
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaac 181  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||| |||| |||| ||||||||    
T  43401970 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacgcattttttatctcttt-gtaagaac 43401873  T
Q  182 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43401872 tcatt-gatagtggattggagaaattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgt 43401789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Original strand, 760757 - 761033
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgag 92  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||   |||||||||| |  || || |||||||||||||||||       |||||    
T  760757 tagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattataaacaccttggatgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgag 760854  T
Q  93 attgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgat 190  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | ||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  760855 attgggaaaatgggtagaaattagg-tctgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcatt-gat 760951  T
Q  191 agtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  760952 agtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggactgaaatgggttaacaatct-ttggtgtgtttgttt 761033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 88 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22835167 - 22835010
Alignment:
Q  88 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 185  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||     
T  22835167 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccc-tttgtaagaactca- 22835071  T
Q  186 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgg 247  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  22835070 ttgatagtggattggagagatcaatctctccgccatattaggtcaag-ttggaccgaactgg 22835010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 89 - 266
Target Start/End: Original strand, 30236129 - 30236304
Alignment:
Q  89 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatt 186  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||    
T  30236129 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaactcatt 30236226  T
Q  187 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 266  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||| |||||||||    
T  30236227 -gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatttcttggtgt 30236304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 258
Target Start/End: Original strand, 40734498 - 40734669
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  || ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  40734498 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacacatttgtatcccttt-gtaagaact 40734595  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 258  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  40734596 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 40734669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 258
Target Start/End: Original strand, 44331545 - 44331716
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||    
T  44331545 ttggtgagattaggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaagccatttgtatctcttt-gtaagaact 44331642  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 258  Q
     ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  44331643 tatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 44331716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 274
Target Start/End: Original strand, 31314447 - 31314631
Alignment:
Q  87 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactca 184  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||     
T  31314447 ggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgatcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatct-ttttgtaagaactc- 31314543  T
Q  185 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||||||| |||||||    
T  31314544 tttgatagtggattggagagatcaatatctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 31314631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 6095767 - 6095603
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| | || ||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  6095767 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtaaacttcttgaagttaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 6095670  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  6095669 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgtgtga 6095603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 85 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 5236624 - 5236440
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  5236624 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 5236527  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 273  Q
    || |||||| |||||| |||||  |||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  5236526 ca-ttgataatggattcgagagatcaatctttcc-ccagattaggtcaa-tttggaccaaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 5236440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 41819691 - 41819526
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaac 181  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  | |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  41819691 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgtctaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 41819594  T
Q  182 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    |||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||   ||||||| ||||||||||    
T  41819593 tcatt--atagtggattggagacatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccaaactgggtga 41819526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 258
Target Start/End: Original strand, 29682269 - 29682530
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgag 92  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       |||||    
T  29682269 tagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgtttatttgtgag 29682366  T
Q  93 attgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgat 190  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  29682367 attgggaaaatgggtagaaattatg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtcacccatttgtatccc-tttgtaagaactca-ttgat 29682463  T
Q  191 agtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 258  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  29682464 agtggattggagagatcaatctctcccctagattagatcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 29682530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 43403913 - 43403736
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-ccttttgtatcccttttgtaagaac 181  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| | |||| |||| | ||||| |||||||||||| | | || |||| | |||||||||||    
T  43403913 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaatta-ggcttgttctttgtgagcttgttgaagctcatttcttgtaactcatgttttatctc-tttgtaagaac 43403816  T
Q  182 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttg 262  Q
    ||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43403815 tca-ttgatagtggattggagagattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttg 43403736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Original strand, 54593704 - 54593868
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  54593704 ttggtgagattgggaaaatgtgcagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 54593801  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||    
T  54593802 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtatgtcaag-ttggaccaaactgggtga 54593868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 258
Target Start/End: Original strand, 29813063 - 29813234
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||    
T  29813063 ttggtgagattggaaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgcatctc-tttgtaagaact 29813160  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 258  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||| | |||||||||||||||| | ||||||    
T  29813161 cattt-atagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcatg-ttggaccgaactgggtcaacaatct 29813234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 89 - 273
Target Start/End: Original strand, 51398818 - 51398999
Alignment:
Q  89 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatt 186  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||| |    
T  51398818 tgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttcttagtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaactca-t 51398914  T
Q  187 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 273  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  51398915 tgatagtggattggagagatttatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 51398999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 32744684 - 32744418
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||| |||   || || ||||||||||| | ||| ||||||||  ||    
T  32744684 tagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacacattggtgagtgaaaatcattgagtattttg-tgagattgaaaa 32744588  T
Q  101 aa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggatt 198  Q
    || |||||||||||||  ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  32744587 aatgggtagaaattag--tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatcacttt-gtaagaactc-tttgatagtggatt 32744492  T
Q  199 ggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    | ||||   ||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  32744491 gaagagataaatctatcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 32744418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 243
Target Start/End: Original strand, 46860474 - 46860631
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||    
T  46860474 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaataact 46860571  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaa 243  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  46860572 catt-gatagtggattggagagatcaatctttcctccagagtaggtcattgttggaccgaa 46860631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 274
Target Start/End: Original strand, 16499084 - 16499215
Alignment:
Q  139 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 238  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||    
T  16499084 aagctaatttcttgttacccatttatatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttgga 16499180  T
Q  239 ccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  16499181 ccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtatttgttt 16499215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 234
Target Start/End: Original strand, 29810868 - 29811016
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||| ||||||   ||||||||||| ||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  29810868 ttggtgagattaggaaaatatgtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 29810965  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtt 234  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29810966 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 29811016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 143 - 266
Target Start/End: Original strand, 40913352 - 40913472
Alignment:
Q  143 taatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccga 242  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  40913352 taatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcatc-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccga 40913448  T
Q  243 actgggtgaccaatctcttggtgt 266  Q
    ||||||| | ||||||||||||||    
T  40913449 actgggtcaacaatctcttggtgt 40913472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 44700646 - 44700476
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  44700646 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaact 44700549  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 258  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  44700548 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctcc-ccacattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 44700476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 266
Target Start/End: Original strand, 46173377 - 46173536
Alignment:
Q  104 ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggag 202  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  46173377 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaattcatt-gatagtggattggag 46173473  T
Q  203 agtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 266  Q
    ||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| | | | |||| |||||||||    
T  46173474 agatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactagatcaacaatttcttggtgt 46173536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 53921671 - 53921511
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||  | |||| ||||| || |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||    
T  53921671 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagg-tttgttgtttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaactcatttgtatca-ttttgtaagaact 53921574  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgg 247  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| || || ||| |||||||| |||||||||||    
T  53921573 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccggagtagatcaagttt-gaccgaactgg 53921511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23392077 - 23391891
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||| | ||||||| | |||| |||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||    
T  23392077 ttggtgagtttgggaaaatgagtagaaattaag-tttgttctttgtgagcttgtttaagataatttcttgtaacccatttgtatcacttt-gcaagaact 23391980  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    | ||||||||||||||| ||||   ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  23391979 c-tttgatagtggattgtagagataaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 23391891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 247
Target Start/End: Original strand, 32891105 - 32891264
Alignment:
Q  87 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactca 184  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||     
T  32891105 ggtgagattgagaaaatgggtagaaattaagttttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaactc- 32891202  T
Q  185 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgg 247  Q
     |||||||||||||||||||   ||||||||| || || ||||||| | ||||||||||||||    
T  32891203 gttgatagtggattggagagataaatctctcccccggagtaggtcatg-ttggaccgaactgg 32891264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 88 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9666632 - 9666448
Alignment:
Q  88 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 185  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | ||| || | |||| ||||||| || |    
T  9666632 gtgagattggaaaaatgggtagaaattagattttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttatacctcttt-gtaagaattc-t 9666535  T
Q  186 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  9666534 ttgatagtggattggagagattgatctctcccccagattaggtaaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 9666448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 88 - 266
Target Start/End: Original strand, 47304254 - 47304430
Alignment:
Q  88 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 185  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||| | |||| |||||  ||| |||| ||||||||||| | |||||| |||  ||||||||||||    
T  47304254 gtgagattgagaaaatgggtagaaattatggtt-gttctttgtgagcttgttgaagttaatatcttgtaacccatctgtatctcttc-gtaagaactcat 47304351  T
Q  186 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 266  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||| | |||||||    
T  47304352 t-gatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaagttt-gaccgaactgggtcaacaatttattggtgt 47304430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 5434046 - 5433956
Alignment:
Q  85 ttggtgagattggga--aaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttt 172  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  5434046 ttggtgagattgggagaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccttttatatctcttt 5433956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 4055926 - 4055745
Alignment:
Q  90 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgt-caagctaatttcttgtaacc-cttttgtatcccttttgtaag-aactcatt 186  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||| |    
T  4055926 gagattgggaaatgggtagaaattagg--ttgttcttggagaacttgtaaaagttaatttcttgtaacctcttttgtatctc-tttgtaagaaactca-t 4055831  T
Q  187 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccaga-ataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||||||||||||| ||||  |  ||||||| |||||  |||||||   |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  4055830 tgatagtggattgaagagatc--tctctcccccagatgtaggtcattgttgggccgaactgggtaaccaa-atcttggtgtatttgttt 4055745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 55302079 - 55301975
Alignment:
Q  145 atttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaac 244  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||   |||||||||||    
T  55302079 atttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaattcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcattgttggaccgaac 55301982  T
Q  245 tgggtga 251  Q
    | |||||    
T  55301981 ttggtga 55301975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 221
Target Start/End: Original strand, 36018852 - 36018987
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaac 181  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||| | |||| |||||  ||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||    
T  36018852 ttggtgaaattgggaaaatgggttgaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaactcattttgtatctcttt-gtaagaac 36018949  T
Q  182 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccag 221  Q
    |||||  ||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  36018950 tcatt--atagtggattggagaggtcaatctctcccccag 36018987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23410442 - 23410311
Alignment:
Q  139 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 238  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||| |||| |||||||||| || |||| ||||||||||||   ||||||||| ||| | ||||||||| |||||    
T  23410442 aagctaatttcgtataacccatttgtatcacttt-gtaagaactc-ttagataatggattggagagataaatctctcccccaaattaggtcaag-ttgga 23410346  T
Q  239 ccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
     |||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  23410345 acgaattgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 23410311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27305777 - 27305719
Alignment:
Q  187 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactg 246  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  27305777 tgatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaa-tttggaccgaactg 27305719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 173
Target Start/End: Original strand, 4386875 - 4386942
Alignment:
Q  105 gtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatccctttt 173  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  4386875 gtagaaattaggttttgttctttgtgagctttt-aagctaatttcttgtaacccatttgtatcactttt 4386942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 35138868 - 35138746
Alignment:
Q  90 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttg 188  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| | ||||||| ||||||  ||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||   ||||||||| |||    
T  35138868 gagattgagaaatgggtagaaattatg-tttgttcttggtgagtttgttgaagttaatttcttgcaactcttttgtatctctttgtaaagaactca-ttg 35138771  T
Q  189 atagtggattggagagtacaatctc 213  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||    
T  35138770 atagtggatggaagagaacaatctc 35138746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 90 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 1313968 - 1313854
Alignment:
Q  90 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttg 188  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||| ||| || ||||| || |||||||||||| || ||||||||||  ||||   ||||||||| |||    
T  1313968 gagattgagaaaagggtaaaaattatgttttgttcttggagagcttgttaaagctaatttcttgcaagccttttgtatatctttgaaaagaactca-ttg 1313870  T
Q  189 atagtggattggagag 204  Q
    ||| |||||| |||||    
T  1313869 atattggattagagag 1313854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 51352278 - 51352150
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactc 183  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||| |||| | || | ||| ||||||||||||| || |||||||  | ||||||| |||||    
T  51352278 ttggtgagattaggaaaatgatagaagttagggtttgttcattgtgagctttttaaagttaatttcttgtaa-ccatttgtatttc-tttgtaataactc 51352181  T
Q  184 atttgatagtggattggagagtacaatctctc 215  Q
    | |||| |||||||| |||||  |||||||||    
T  51352180 a-ttgagagtggatttgagagatcaatctctc 51352150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 172
Target Start/End: Original strand, 5373247 - 5373321
Alignment:
Q  99 aaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttt 172  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |  ||| |||| | |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  5373247 aaaagggtagaaattaggctttgttctttttgagcttgttgaagctaatttattgtaacccttttatatctcttt 5373321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 28253423 - 28253353
Alignment:
Q  97 ggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacccttttgtat 166  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||| | ||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  28253423 ggaaaatggtagaaattagggttcgttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacgattttgtat 28253353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 31340369 - 31340266
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||  |||| |||| | |||| |||||  ||||||||||| |||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  31340369 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattgaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcatgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 31340272  T
Q  183 catttg 188  Q
    ||||||    
T  31340271 catttg 31340266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 70)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 8395521 - 8395876
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395521 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 8395618  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395619 aagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtcaagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgg 8395717  T
Q  201 agagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatct 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | | |||||    
T  8395718 agagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccat-tgtatct 8395816  T
Q  300 tgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395817 tgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 8395876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 8393312 - 8393667
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8393312 ctagggtttatggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 8393409  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8393410 aagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtcaagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgg 8393508  T
Q  201 agagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatct 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | | |||||    
T  8393509 agagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccat-tgtatct 8393607  T
Q  300 tgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8393608 tgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 8393667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 7124817 - 7125174
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7124817 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 7124916  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattg 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7124917 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaactaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 7125015  T
Q  200 gagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  7125016 gagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagcaaagaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttcc--ctccttgtttatc 7125113  T
Q  299 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7125114 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 7125174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 7122598 - 7122955
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122598 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 7122697  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattg 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7122698 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaactaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 7122796  T
Q  200 gagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatc 298  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||    ||||||||||||||| |||| |||| |||| | |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  7122797 gagagtacaatctctcctccatagtaggtcaagcaaagaccgaactgggtgaacaatttctttgtgtttattgttttcttcttcc--ctccttgtttatc 7122894  T
Q  299 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122895 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 7122955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 5138206 - 5138552
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5138206 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaataccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 5138303  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggatt 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5138304 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggatt 5138402  T
Q  199 ggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttat 297  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5138403 ggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttat 5138502  T
Q  298 cttgtgatt--gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctag 347  Q
    |||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5138503 cttgtgttttggttgctt--tgtttcacacttggttcctagattagatctag 5138552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 5135980 - 5136327
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaa-catgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5135980 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaaacatgggaaataccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattggga 5136077  T
Q  100 aaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggat 197  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5136078 aaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggat 5136176  T
Q  198 tggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgttta 296  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5136177 tggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgttta 5136276  T
Q  297 tcttgtgatt--gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctag 347  Q
    ||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5136277 tcttgtgttttggttgctt--tgtttcacacttggttcctagattagatctag 5136327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 31495556 - 31495279
Alignment:
Q  15 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaatt 113  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31495556 tctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaatt 31495457  T
Q  114 agggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaaccctttt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatc 211  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  31495456 aggatt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagttgattggagagttcaatc 31495359  T
Q  212 tctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctcctt 291  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  31495358 tctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcctcttccctctcctt 31495279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13992544 - 13992274
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13992544 tagggtttagggt-ctttgattagagtctctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 13992446  T
Q  101 aa--gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggat 197  Q
    ||  ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  13992445 aaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctctt--gtaagaactcatt-gatagtggat 13992350  T
Q  198 tggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  13992349 tggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 13992274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 30000063 - 29999809
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 93  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||   || || |||| ||||||||||||       ||||||    
T  30000063 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggtttggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcgttgagtgtcttgttcattggtgaga 29999966  T
Q  94 ttgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatag 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  29999965 ttgggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacatgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatcttttttgtaagaactcatt-gatag 29999868  T
Q  193 tggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29999867 tggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 29999809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 56178882 - 56178618
Alignment:
Q  15 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-ggg 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| |||    
T  56178882 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaggg 56178784  T
Q  106 tagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagag 204  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  56178783 tagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagag 56178687  T
Q  205 tacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  56178686 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 56178618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 85 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 52095530 - 52095344
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |    
T  52095530 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaaat 52095433  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||    
T  52095432 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg-caagtttggaccgaactgggtgaacaat-ttttggtgtgtttgttt 52095344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 274
Target Start/End: Original strand, 48143042 - 48143230
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaac 181  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||    
T  48143042 ttggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttca-taagaac 48143139  T
Q  182 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  48143140 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 48143230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 104 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 5370232 - 5369986
Alignment:
Q  104 ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa--gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 201  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| | ||    
T  5370232 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggactaga 5370136  T
Q  202 gagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttg 301  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||| |||||||   ||||  |||||||  ||||||||     
T  5370135 gagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaatct-ttgatgtgtttgtttatctctt--ctctcct--tttatcttt 5370041  T
Q  302 tgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 355  Q
    || |||| | |||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  5370040 tgcttgtggttttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgtt 5369986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 89 - 266
Target Start/End: Original strand, 2209717 - 2209894
Alignment:
Q  89 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaactcat 185  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  2209717 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttt-ttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaactcat 2209814  T
Q  186 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 266  Q
    | |||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2209815 t-gatagtggattggagagattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgt 2209894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 85 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 9927626 - 9927441
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  9927626 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 9927529  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 273  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||||||| ||||||    
T  9927528 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 9927441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 12739718 - 12739533
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||| |||||    
T  12739718 ttggtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctattt-gtatgaact 12739621  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 273  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  12739620 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 12739533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Original strand, 41964415 - 41964580
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaac 181  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  41964415 ttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaacccattttgtatcccttt-gtaagaac 41964512  T
Q  182 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41964513 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 41964580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 266
Target Start/End: Original strand, 26364236 - 26364415
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  26364236 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 26364333  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 266  Q
    ||||  ||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||| |||||||||    
T  26364334 catta-atagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttt-gactgaactgggtcaacaatttcttggtgt 26364415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 266
Target Start/End: Original strand, 54883020 - 54883199
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  54883020 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 54883117  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 266  Q
    |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  54883118 catt-gatagtggattggagggatcaatctctcctccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatttcttggtgt 54883199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 12744073 - 12743908
Alignment:
Q  104 ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggag 202  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12744073 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggag 12743977  T
Q  203 agtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 273  Q
    ||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  12743976 agatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 12743908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 12745462 - 12745297
Alignment:
Q  104 ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggag 202  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12745462 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggag 12745366  T
Q  203 agtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 273  Q
    ||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  12745365 agatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 12745297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 26175804 - 26175619
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  26175804 ttggtgagattgggaaaatggggagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 26175707  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 273  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  26175706 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 26175619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 36463557 - 36463386
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  36463557 ttggtgagattgggaaaatggatagaaattagggct-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 36463460  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 258  Q
    | ||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  36463459 c-tttgacagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 36463386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 34570582 - 34570397
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  34570582 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccaattgtatctcttt-gtaagaact 34570485  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 273  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  34570484 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggttaag-ttggatcgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 34570397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 249
Target Start/End: Original strand, 36994524 - 36994686
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  36994524 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatccc-tttgtaagaact 36994621  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 249  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36994622 ca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattagatcaag-ttggaccgaactgggt 36994686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 46147557 - 46147373
Alignment:
Q  87 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactca 184  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||     
T  46147557 ggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactc- 46147461  T
Q  185 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  46147460 tttgatagtggattggagacatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 46147373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Original strand, 46703500 - 46703666
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaac 181  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  46703500 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 46703597  T
Q  182 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||   |||||||||| |||||||    
T  46703598 tcattt-atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaattgggtga 46703666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 246
Target Start/End: Original strand, 37740536 - 37740784
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 93  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || ||||| |||||||||||       ||||||    
T  37740536 tagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgaga 37740633  T
Q  94 ttgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgata 191  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  37740634 tttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gata 37740730  T
Q  192 gtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactg 246  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  37740731 gtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcaag-ttggaccgaactg 37740784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Original strand, 41639426 - 41639590
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||    
T  41639426 ttggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctattt-gtaagaact 41639523  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    |||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  41639524 catc-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtga 41639590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 234
Target Start/End: Original strand, 8665408 - 8665556
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| | | || |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  8665408 ttggtgagaatgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgagagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 8665505  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtt 234  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  8665506 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 8665556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 45687351 - 45687164
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| | |||| |||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||  ||| |||||||||    
T  45687351 ttggtgagattgggaaaatgggaagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttataactcatttgtatctattt-gtaagaact 45687253  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  45687252 catt-gatagtggattggagagatctatctctcctccatattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 45687164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 85 - 249
Target Start/End: Original strand, 4587958 - 4588121
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||||||| | || | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  4587958 ttggtgaaattgggaaaaaaggtagaaattaagatttgttctttgtaagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaact 4588056  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 249  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  4588057 catt-gatagtggattggagagaacaatctctcccccataataggtgaag-ttggaccaaactgggt 4588121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 85 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 48893810 - 48893620
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggt----gaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaag 178  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||    || |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||    
T  48893810 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaag 48893713  T
Q  179 aactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  48893712 aactc-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 48893620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 88 - 247
Target Start/End: Original strand, 379383 - 379541
Alignment:
Q  88 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 185  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  379383 gtgagattgagaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcgcttt-gtaagaactaat 379480  T
Q  186 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgg 247  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  379481 t-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgg 379541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 266
Target Start/End: Original strand, 12119540 - 12119719
Alignment:
Q  87 ggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactca 184  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||    
T  12119540 ggtgagattggaaaaaagagtagaaattatggtttgttctttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaactca 12119639  T
Q  185 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 266  Q
    ||| ||||||||||||||||  |||||||||| | ||| |||||||   |||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  12119640 ttt-atagtggattggagagatcaatctctcc-caagagtaggtcattgttggaccgaactaggtgaacaatttcttggtgt 12119719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Original strand, 8648139 - 8648303
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||  ||||  ||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  8648139 ttggtgagaatgggaaaatggatagaaattagggtt-gttcattgtgagtttgttgaagctaatttcttataacccatttgtatctcttt-gtaagaact 8648236  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  8648237 catt-gatattggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtga 8648303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Original strand, 12073392 - 12073557
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  12073392 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 12073489  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||   |||||||||||| |||||    
T  12073490 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcttccagagtaggtcattgttggaccgaactaggtga 12073557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 258
Target Start/End: Original strand, 5429679 - 5429850
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||    
T  5429679 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtta-ttcttcgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctattt-gtaagaact 5429776  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 258  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  5429777 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 5429850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27417133 - 27416974
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||    
T  27417133 ttggtgagattggtaaaatgtgtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaaaaact 27417036  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactg 246  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  27417035 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactg 27416974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 50262814 - 50262689
Alignment:
Q  139 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 238  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||   |||||| ||||||||| |||||||   |||||    
T  50262814 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagttgattggagatatcaatctttcctccagagtaggtcattgttgga 50262717  T
Q  239 ccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 266  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50262716 ccgaactgggtgaacaatctcttggtgt 50262689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 54200074 - 54199926
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  54200074 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 54199977  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtt 234  Q
    || ||||||||| ||| |||||  || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  54199976 ca-ttgatagtgaattagagagatcattctctcccccagattaggtcaagtt 54199926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 249
Target Start/End: Original strand, 40632445 - 40632607
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  40632445 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaact 40632542  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 249  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | | || |||||| ||||||||||||||||    
T  40632543 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctaaagtaagtcaag-ttggaccgaactgggt 40632607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 103 - 251
Target Start/End: Original strand, 6655975 - 6656120
Alignment:
Q  103 gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 201  Q
    |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6655975 gggtagaaattaaggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattgga 6656071  T
Q  202 gagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    |||  ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  6656072 gagatcaatctctcatccagagtaggtcaag-ttggaccgaattgggtga 6656120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 271
Target Start/End: Original strand, 5871820 - 5872003
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||| ||||||||||||||| ||| |||| |||| | |||||||    
T  5871820 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagcaaatttcttgtaacccatttttatcacttt-gcaagaact 5871917  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttg 271  Q
    | |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||    
T  5871918 c-tttgatagtggattagagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttt-gaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttg 5872003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 139 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 50673960 - 50673851
Alignment:
Q  139 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 238  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  50673960 aagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttgga 50673864  T
Q  239 ccgaactgggtga 251  Q
    ||||||| |||||    
T  50673863 ccgaactaggtga 50673851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 88 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 52467519 - 52467336
Alignment:
Q  88 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 185  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||  |    
T  52467519 gtgaggttgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatatcttgtaacccatttgtatcacttt-gtaataactt-t 52467423  T
Q  186 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  52467422 ttgatagtggattggagagatcaatctctccccgagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 52467336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 37229890 - 37229731
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||| |||| | |||| ||||| ||||||||| |||| |||| | ||||||||||||    
T  37229890 ttggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtgtgttctttgtgagcttgttaaagcaaatttgttgtaaccctttttatatctc-tttgtaagaact 37229792  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaact 245  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  || | ||||||||| ||||||||||||    
T  37229791 cattt-atagtggattggagagatcaatctctccctcatagtaggtcaag-ttggaccgaact 37229731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 47038577 - 47038393
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactc 183  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||  | ||||||| |  |||||||| ||||    
T  47038577 ttggtgagattggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaa-tcatttgtat-ctgtttgtaaggactc 47038481  T
Q  184 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  47038480 a-ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 47038393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 85 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6542349 - 6542161
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaac 181  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  || |||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  6542349 ttggggagattgggaaaaaatggtagaaattaggatttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgttagccttttgtatctcttt-gtaagaac 6542251  T
Q  182 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    || || |||||||||||||||||  |||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| | | || ||||||||| |||||||    
T  6542250 tcgtt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagggtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaac-atttcttggtgtgtttgttt 6542161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 85 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12747924 - 12747794
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |  |||||| |||||    
T  12747924 ttggtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtat-ctatttgtatgaact 12747827  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcc 216  Q
    || |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12747826 ca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcc 12747794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12744195 - 12744078
Alignment:
Q  104 ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggag 202  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12744195 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactca-ttgatagtggattggag 12744099  T
Q  203 agtacaatctctcctccagaa 223  Q
    ||  |||||||| | ||||||    
T  12744098 agatcaatctcttccccagaa 12744078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12745604 - 12745467
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  12745604 ttggcgagattaggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 12745507  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaa 223  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||    
T  12745506 ca-ttgatagtggattggagagatcaatctcttccccagaa 12745467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5208003 - 5207848
Alignment:
Q  92 gattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||| ||| ||||||| | ||| |  |||||||||||||| |||||    
T  5208003 gattggaaaaagggtagaaattagggtttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttattgcaacccttgtatat-ctatttgtaagaactca-ttgat 5207906  T
Q  191 agtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 249  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||  ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||    
T  5207905 agtggattggaaagatcaatctctctcccagagtaggtcaa-tttggactgaattgggt 5207848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 52082825 - 52082645
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |    
T  52082825 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaactagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaaat 52082728  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    | ||||||||||       |||  || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  52082727 c-tttgatagtg-------gagatcattctctcctccagagtaggtcaagtttagaccgatttgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 52082645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 274
Target Start/End: Original strand, 31474150 - 31474337
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||| |  |||  ||||  |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  31474150 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggtcttgttctttttgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaact 31474248  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    || |||||||| ||||||||||   ||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| | | || ||||||||| |||||||    
T  31474249 ca-ttgatagttgattggagagataaatctctccaccagagtagatcaag-ttggaccgaactgggtaaac-atatcttggtgtgtttgttt 31474337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 246
Target Start/End: Original strand, 35662496 - 35662600
Alignment:
Q  139 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 238  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  35662496 aagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatatctcctcaagagtaggtcaag-ttgga 35662592  T
Q  239 ccgaactg 246  Q
    ||||||||    
T  35662593 ccgaactg 35662600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26699596 - 26699447
Alignment:
Q  100 aaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggatt 198  Q
    |||||||| | |||||||||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||||||||| ||| ||||||    
T  26699596 aaagggtatagattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcattt-ataatggatt 26699498  T
Q  199 ggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 249  Q
    ||||||  ||||||||   ||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  26699497 ggagagatcaatctctatcccagagtaggtcattgttggaccgaactgggt 26699447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 249
Target Start/End: Original strand, 51337064 - 51337226
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattaggg-tttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| | |||| ||| | ||| |||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  51337064 ttggtgagattgagaaaaagggtagaaattacggatttgttctttgtgagctttt-aagataatttattataacccttttgtatctctttt-taagaact 51337161  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 249  Q
    || ||||||||| ||| |||||  ||||||||||  || | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  51337162 ca-ttgatagtgtattagagagatcaatctctcccacacattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 51337226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 273
Target Start/End: Original strand, 29254553 - 29254679
Alignment:
Q  143 taatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccga 242  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||| |||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||  ||| | ||||||||| |||||||||    
T  29254553 taatttcttgcaacccatttgtgtctcttt-gtaagaactcgtt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccaaattaggtcaag-ttggaccga 29254649  T
Q  243 actgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 273  Q
    ||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  29254650 actgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 29254679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Original strand, 24969112 - 24969230
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  24969112 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaact 24969209  T
Q  183 catttgatagtggattggagag 204  Q
     | |||||||||||||||||||    
T  24969210 -aattgatagtggattggagag 24969230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13009550 - 13009464
Alignment:
Q  146 tttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtt 234  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||| | |||||||||||    
T  13009550 tttcttgtaaaacatttgtatcccttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcgatctctcctccaaattaggtcaagtt 13009464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Original strand, 3913503 - 3913578
Alignment:
Q  139 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcc 216  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3913503 aagctaatttcttttaacccatttgtatatcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcc 3913578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 174
Target Start/End: Original strand, 41639263 - 41639353
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttg 174  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | || ||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  41639263 ttggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtaaactttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttttg 41639353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 48142542 - 48142444
Alignment:
Q  89 tgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatt 186  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||| ||||||||||||||| | |||| ||||   |||||||||||    
T  48142542 tgagattgggaacatgatagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctagtttcttgtaacccttgtatatctctttgtaaagaactcatt 48142444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 172
Target Start/End: Original strand, 1983252 - 1983324
Alignment:
Q  99 aaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttt 172  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  1983252 aaaaggatagaaattatgttttgttctttgtgagcttg-caagctaatttcttgtaacccctttgtatcacttt 1983324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 228
Target Start/End: Original strand, 33089933 - 33090021
Alignment:
Q  139 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggt 228  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||| || |   ||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| |||||    
T  33089933 aagctaatttattataaccattttgtatctctctgtaaagaactcatt-gatagtggattagagagatcaatctctcctctagagtaggt 33090021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 22882864 - 22882836
Alignment:
Q  139 aagctaatttcttgtaacccttttgtatc 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22882864 aagctaatttcttgtaacccttttgtatc 22882836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 22934528 - 22934500
Alignment:
Q  139 aagctaatttcttgtaacccttttgtatc 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22934528 aagctaatttcttgtaacccttttgtatc 22934500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 44967992 - 44967924
Alignment:
Q  90 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacc 157  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||| || |||| | |||| ||||||||||||||    
T  44967992 gagattgggaaaatggtagaaattaggttttgctcttggagagcttgctgaagccaatttcttgtaacc 44967924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 55085532 - 55085445
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttt 172  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||| |||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  55085532 ttggtgagattggaaaataggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaaccatttgtatctcttt 55085445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 285; Significance: 1e-160; HSPs: 71)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 32060577 - 32060218
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060577 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 32060478  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatccc--ttttgt-aagaactcatttgatagtggat 197  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32060477 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccctttttgtaaagaactcatttgatagtggat 32060379  T
Q  198 tggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgttta 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||  |||||||||||    
T  32060378 tggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttcc--ctccttgttta 32060281  T
Q  297 tcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060280 tcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 32060218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 6594809 - 6594454
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594809 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 6594712  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattg 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6594711 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 6594613  T
Q  200 gagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatc 298  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  6594612 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttcc--ctccttgtttatc 6594515  T
Q  299 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594514 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 6594454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18392447 - 18392092
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392447 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 18392350  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattg 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18392349 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 18392251  T
Q  200 gagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  18392250 gagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttg--tatc 18392153  T
Q  299 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392152 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 18392092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 6592591 - 6592236
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592591 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 6592494  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattg 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6592493 atgggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 6592395  T
Q  200 gagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatc 298  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  6592394 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttcc--ctccttgtttttc 6592297  T
Q  299 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592296 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 6592236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18389011 - 18388656
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18389011 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 18388914  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattg 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18388913 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 18388815  T
Q  200 gagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  18388814 gagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctctttg--tatc 18388717  T
Q  299 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388716 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 18388656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 20343813 - 20344158
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343813 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 20343912  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343913 aagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgg 20344011  T
Q  201 agagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatct 299  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20344012 agagtacaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctcct--tttatct 20344108  T
Q  300 tgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtg 350  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20344109 tgtgattg-tgttttgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtg 20344158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 24789757 - 24790074
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24789757 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtaagattgggaa 24789856  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattg 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  24789857 aagggtaaaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaa-cattttgtatcccttttgtaaaaactc-tttgatagtggattg 24789954  T
Q  200 gagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttg-ttttcttcttccctctccttgtttatc 298  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  24789955 gagagtactatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgtttttcttcttccctctcct--tttatc 24790052  T
Q  299 ttgtgattgttgctttgtgtttc 321  Q
    ||||||||| ||| |||||||||    
T  24790053 ttgtgattg-tgcattgtgtttc 24790074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 163 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 1560757 - 1560561
Alignment:
Q  163 gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttg 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1560757 gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtaaccaatctcttg 1560658  T
Q  263 gtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1560657 gtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 1560561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Original strand, 39731285 - 39731635
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggga 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39731285 ctagggtttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattggaa 39731383  T
Q  100 aaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtca-agctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggatt 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39731384 aaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcagatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagtggatt 39731481  T
Q  199 ggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatc 298  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  39731482 ggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtctttgttttcctcttccctctcct--tttatc 39731578  T
Q  299 ttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 355  Q
    ||||| ||| || |||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  39731579 ttgtgcttg-tggtttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgtt 39731635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 43504407 - 43504102
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggga 99  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43504407 ctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttggcttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcatcgagtgtcttggtgagattggga 43504309  T
Q  100 aaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaaccctttt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggat 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  43504308 aaagggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagtgaat 43504211  T
Q  198 tggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttat 297  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  43504210 tggagagttcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcctcttccctctcct--tttat 43504113  T
Q  298 cttgtgattgt 308  Q
    |||||| ||||    
T  43504112 cttgtgcttgt 43504102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 1562255 - 1562103
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1562255 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 1562158  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1562157 aagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa 1562103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Original strand, 35853825 - 35854102
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||    
T  35853825 tagggtttagggt-ctttgatttgagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 35853922  T
Q  94 ttgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgata 191  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  35853923 ttgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gata 35854019  T
Q  192 gtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  35854020 gtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtgtttgttt 35854102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25767213 - 25766940
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg----gtgagattg 96  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||    |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||     ||||||||    
T  25767213 ctagggtttagggt-ctttgattagagtttctctttggg---aaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgagattg 25767118  T
Q  97 g-gaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-cccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagt 193  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  25767117 gaaaaaagggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttg-aagaactca-ttgatagt 25767021  T
Q  194 ggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  25767020 ggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttagaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtgtttgttt 25766940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Original strand, 29990965 - 29991240
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 93  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||    
T  29990965 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 29991062  T
Q  94 ttgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatag 192  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||| |||||    
T  29991063 ttgggaaaaggatagaaattagggtt-gttatttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttc-taataactcatt-gatag 29991159  T
Q  193 tggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  29991160 tggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 29991240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 48408711 - 48408992
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgag 92  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       |||||    
T  48408711 ctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgag 48408809  T
Q  93 attgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttga 189  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||| |||| | || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||| ||    
T  48408810 attgggaaaaagggtagaaattaatgtt-gttctttgtaaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgaaataactcatt-ga 48408907  T
Q  190 tagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  48408908 tagtggattggagagtttaatctctcctccagagtatgtcaagtttagaccgaactgggtgaacaatttcttggtgtgtttgttt 48408992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 355
Target Start/End: Original strand, 25615785 - 25616119
Alignment:
Q  15 tctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaa-gggtagaaa 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    ||||| |||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||    
T  25615785 tctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagagaaaatcattgagtgtcttg---agattgggaaaatgggtagaaa 25615880  T
Q  112 ttagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaat 210  Q
    ||||| |||||||   |||  |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||    
T  25615881 ttagg-tttgttctatgtgcgcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatca-ttttgtaagaactcatt-gatagtggattagagagatcaat 25615977  T
Q  211 ctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt---tcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg 307  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||   |||||||| |||      ||||||||||| |||    
T  25615978 ctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggcgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctcttcttctctc------tttatcttgtgcttg 25616070  T
Q  308 ttgctttgtgtttcacactt-ggttcctagattagatctaggtggtgtt 355  Q
    | | |||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25616071 tggttttgtgcttttcacttcgattcctagattagatctaggtgttgtt 25616119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 85 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 34310884 - 34310712
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||    
T  34310884 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaaattgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatct-ttttgtaagaact 34310787  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 258  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34310786 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 34310712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 258
Target Start/End: Original strand, 23555039 - 23555212
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaac 181  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||    
T  23555039 ttggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgtacctcttt-gtaagaac 23555136  T
Q  182 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23555137 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 23555212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 85 - 273
Target Start/End: Original strand, 22269973 - 22270158
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  22269973 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 22270070  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 273  Q
     ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  22270071 gatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaac-atctcttggtgtgtttgtt 22270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 85 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 14070001 - 14069817
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  14070001 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 14069904  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgt 272  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||    
T  14069903 catt-gatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgt 14069817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 85 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 14380029 - 14379845
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  14380029 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 14379932  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgt 272  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||    
T  14379931 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgt 14379845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 41317602 - 41317416
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | |||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  41317602 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaatccatttgtatcccttt-gtaagaact 41317505  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  41317504 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 41317416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Original strand, 19502088 - 19502365
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 93  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || ||||||||||||||||||||       ||||||    
T  19502088 tagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgagaatcattgagtgtcttgttcagtggtgaga 19502185  T
Q  94 ttgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgat 190  Q
    ||| |||||  || ||||||||| |||| |||  | |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  19502186 ttgcgaaaaaaggttagaaattaaggtt-gttttttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gat 19502282  T
Q  191 agtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  19502283 agtggattggagagatcaatctctcctccagagtaagtcaagtttggaacgaagtgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 19502365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Original strand, 4178685 - 4178960
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 93  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||    
T  4178685 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 4178782  T
Q  94 ttgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgata 191  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||| | |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| ||||    
T  4178783 ttgggaaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgggaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg--aagaactcatt-gata 4178878  T
Q  192 gtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  4178879 gtggattgaacagttcaatctctcctccagagcaggtcaagtttgaaccaaactaggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 4178960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 85 - 355
Target Start/End: Original strand, 27347817 - 27348081
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  27347817 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 27347914  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttc 282  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||    |||||    
T  27347915 catt-gatagtggattgcagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttcctctcttc 27348011  T
Q  283 cctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 355  Q
     ||| |    |||||||| || |||| | |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  27348012 tctcac----tttatcttttgcttgtggttttgtgtttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgtt 27348081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 88 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 41649175 - 41648993
Alignment:
Q  88 gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatt 186  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |    
T  41649175 gtgagattggaaaaattggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttagctaatttcttgtaacccatttgtatccc-tttgtaagaactca-t 41649079  T
Q  187 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  41649078 tgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 41648993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 85 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 30024900 - 30024740
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  30024900 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 30024803  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgg 247  Q
    | ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  30024802 c-tttgatagtggattggagagatcaatcactcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgg 30024740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 234
Target Start/End: Original strand, 48491579 - 48491727
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||    
T  48491579 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gaaagaact 48491676  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtt 234  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  48491677 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 48491727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 273
Target Start/End: Original strand, 18126644 - 18126829
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgt-caagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  18126644 ttggtgagattggaaaaatgtgtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttcaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 18126741  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 273  Q
    || |||||||||||||||||    |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  18126742 ca-ttgatagtggattggaggaatcaatctctcccccagactaggtcaagttt-gaccgacctgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 18126829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 8359485 - 8359319
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaac 181  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  8359485 ttggggagattgggaaaatgggtagaaattagggttt-ttctttgtgagcttgtttaaactaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 8359388  T
Q  182 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  8359387 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtga 8359319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 103 - 266
Target Start/End: Original strand, 2390301 - 2390461
Alignment:
Q  103 gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 201  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||| | |||||||||||||    
T  2390301 gggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaataactcatat-atagtggattgga 2390397  T
Q  202 gagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 266  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  2390398 gagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaataatctcttggtgt 2390461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Original strand, 29608737 - 29608901
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  29608737 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 29608834  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    |||| ||||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  29608835 catt-gatagtggattggagatatcaatcactcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtga 29608901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 139 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 32358167 - 32358058
Alignment:
Q  139 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 238  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  32358167 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttgga 32358071  T
Q  239 ccgaactgggtga 251  Q
    |||||||||||||    
T  32358070 ccgaactgggtga 32358058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 250
Target Start/End: Original strand, 6431971 - 6432134
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  6431971 ttggttagattgggaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 6432068  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtg 250  Q
    | || |||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6432069 cgtt-gatagtggattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtg 6432134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 85 - 273
Target Start/End: Original strand, 48489431 - 48489616
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |  |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| | || ||||    
T  48489431 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgaaaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gcaataact 48489528  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 273  Q
    ||||  ||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  48489529 cattc-atagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaacaatct-ttggtgtgtttgtt 48489616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 47674189 - 47673953
Alignment:
Q  15 tctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gg 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       ||||||||| ||||| ||    
T  47674189 tctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgg 47674091  T
Q  105 gtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggaga 203  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47674090 gtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactca-ttgatagtggattggaga 47673994  T
Q  204 gtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactg 246  Q
    |  |||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||    
T  47673993 gatcaatctctcc-ccatattaagtcaag-ttggaccgaactg 47673953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 258
Target Start/End: Original strand, 8153342 - 8153513
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| | ||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||    
T  8153342 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtgagattgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaataact 8153439  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 258  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||    
T  8153440 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaatct 8153513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 31733137 - 31732966
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  31733137 ttggtgagactgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttggtgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 31733040  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 258  Q
    || |||||| ||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  31733039 ca-ttgatactggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 31732966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 36146576 - 36146390
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  | |||| |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  36146576 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtttgttatttgtgagcttgttgaagctaatttct-gtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 36146479  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    |||| ||||||||||| |||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  36146478 catt-gatagtggatttgagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 36146390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 2361140 - 2360978
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  2361140 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 2361043  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 249  Q
    |||| ||||||||||| ||||   |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2361042 catt-gatagtggatttgagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 2360978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 4253697 - 4253510
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactc 183  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||||    
T  4253697 ttggtgaaattggtaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcatgtaacccttttatatctctttggaaagaactc 4253598  T
Q  184 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    | |||||| |||||| |||||  ||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||| ||| | | || ||||||||| |||||||    
T  4253597 a-ttgataatggattagagagatcaatctctcccacagagtaggtcaa-tttggaccgaactaggtaaac-atttcttggtgtgtttgttt 4253510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 249
Target Start/End: Original strand, 4586161 - 4586323
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  4586161 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaattttttgtaacccatttttatctcttt-gtaagaact 4586258  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 249  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| | || |||||  ||||||||||||||||    
T  4586259 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccatattatgtcaa-cttggaccgaactgggt 4586323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 273
Target Start/End: Original strand, 26417316 - 26417501
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  26417316 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagataatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 26417413  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 273  Q
    | || |||||||||||||||||  |||||||||| ||||  ||||||||  ||||||| |||||||| | |||| ||||||||| ||||||    
T  26417414 cgtt-gatagtggattggagagatcaatctctcc-ccaggttaggtcaa-attggaccaaactgggtcaacaatttcttggtgtgtttgtt 26417501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 47676304 - 47676119
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  47676304 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaatttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 47676207  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 273  Q
    ||  |||||||||| |||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||| | | |||||| ||||||| ||||||    
T  47676206 ca-atgatagtggaatggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 47676119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 38671480 - 38671204
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgag 92  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       |||||    
T  38671480 tagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagcgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgag 38671383  T
Q  93 attgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgat 190  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  38671382 attgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaacacatttgtatcacttt-gtaagaactcatt-gat 38671286  T
Q  191 agtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||||||||| ||||   ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  38671285 agtggattgaagagataaatctatcccccaaaataggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 38671204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Original strand, 3258995 - 3259159
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||| | |||||||| |||| |||| |||     
T  3258995 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaactagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaactcatttgtatctcttt-gtaaaaacc 3259092  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3259093 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttgaaccgaactgggtga 3259159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 4508874 - 4508710
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| | |||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  4508874 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 4508777  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    || |||| ||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  4508776 ca-ttgagagtggattggagagatcaatctcttcttcagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtga 4508710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 48599502 - 48599338
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| | |||| ||    
T  48599502 ttggtgatattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgg-aagagct 48599405  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||    
T  48599404 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagcagatcaag-ttggaccgaactgggtga 48599338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 249
Target Start/End: Original strand, 43864244 - 43864406
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||| ||||    
T  43864244 ttggtgagattggaaaagtgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaacccatttgtatctcttt-gtaaaaact 43864341  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 249  Q
     ||| |||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  43864342 aatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 43864406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 88 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 496148 - 495965
Alignment:
Q  88 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 185  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| | |||| |||||  |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  496148 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggta-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatctcttta-taagaactcat 496051  T
Q  186 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||| | | | ||||||||| |||||| |||| |||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  496050 t-gatagtggattggagagatcaatctctcccctatagtaggtcaag-ttggacagaaccgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 495965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 88 - 274
Target Start/End: Original strand, 1113660 - 1113843
Alignment:
Q  88 gtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 185  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  1113660 gtgagattgagaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttataacccatttgtatctcttt-gtaagaactcat 1113757  T
Q  186 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    | |||||| ||||||||||  |||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||| || || | |||||| ||||||| |||||||    
T  1113758 t-gatagtagattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttt-gaccgaattgagtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 1113843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6360065 - 6359941
Alignment:
Q  139 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 238  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| | ||| | ||||||||| |||||    
T  6360065 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactca-ttgatagttgattggagagatcaatctcttccccatattaggtcaag-ttgga 6359969  T
Q  239 ccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 266  Q
     |||||||||| | |||| |||||||||    
T  6359968 tcgaactgggtcaacaatttcttggtgt 6359941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 88 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31105558 - 31105399
Alignment:
Q  88 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 185  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||     
T  31105558 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagatttt-ttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat-ctttttgtaagaactca- 31105462  T
Q  186 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 249  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  31105461 ttgatggtggattggagagataaatctctccccaagagtagatcaag-ttggaccgaactgggt 31105399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23565210 - 23565069
Alignment:
Q  104 ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggag 202  Q
    |||||||||||||  |||||| | |||| |||||  || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23565210 ggtagaaattaggtcttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggag 23565113  T
Q  203 agtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgg 247  Q
    ||  |||||||||  | ||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  23565112 agatcaatctctctcctagagtaggtcaag-ttggactgaactgg 23565069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 85 - 244
Target Start/End: Original strand, 23343975 - 23344130
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactc 183  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| | |||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||||||    
T  23343975 ttggtgagatttggaaaagggtagaaattaaggtttattctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccctttagtatatc-tttgtgagaactc 23344073  T
Q  184 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaac 244  Q
    | |||||| | |||||||||    ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23344074 a-ttgataatagattggagaaattaatctctc--ccagagtaggtcaag-ttggaccgaac 23344130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2759339 - 2759207
Alignment:
Q  110 aattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtaca 208  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  2759339 aattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttatatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagatatca 2759243  T
Q  209 atctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaact 245  Q
    |||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2759242 atctcttccccagattaggtcaag-ttggaccgaact 2759207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 4510661 - 4510552
Alignment:
Q  139 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 238  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||  ||| ||||||||| |||||    
T  4510661 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttataagaactca-ttgatagtggattgaagaaatcaatctctcctgtagagtaggtcaag-ttgga 4510565  T
Q  239 ccgaactgggtga 251  Q
    ||| |||||||||    
T  4510564 ccgtactgggtga 4510552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 4512503 - 4512394
Alignment:
Q  139 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 238  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||  ||| ||||||||| |||||    
T  4512503 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttataagaactca-ttgatagtggattgaagaaatcaatctctcctgtagagtaggtcaag-ttgga 4512407  T
Q  239 ccgaactgggtga 251  Q
    ||| |||||||||    
T  4512406 ccgtactgggtga 4512394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 90 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22328556 - 22328395
Alignment:
Q  90 gagattgggaa--aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatt 186  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||| |||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||   | ||| ||| |    
T  22328556 gagattgggaagaaaggttagaaattagagtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgcaaggaagtca-t 22328458  T
Q  187 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 249  Q
    | |||||||||| |||||  |||||||||| | ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  22328457 taatagtggatttgagagatcaatctctcccctagagtaggtcattgttggaccgaactgggt 22328395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12098027 - 12097849
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| ||        ||||    
T  12098027 ttggttagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacccatttgtatctct--------aact 12097937  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    | |||| |||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  12097936 c-tttg-tagtggattggagagatgaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 12097849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24525584 - 24525484
Alignment:
Q  171 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtattt 270  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||| ||||||||| |  ||||| ||||||| |||    
T  24525584 tttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaag-ttggacggaactgggtcaataatct-ttggtgtgttt 24525488  T
Q  271 gttt 274  Q
    ||||    
T  24525487 gttt 24525484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24526065 - 24525992
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 156  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24526065 ttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaac 24525992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 247
Target Start/End: Original strand, 31518965 - 31519063
Alignment:
Q  147 ttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctc-ctccagaataggtcaagtttggaccgaact 245  Q
    |||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  31518965 ttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gacagtggattggagagatcaatctctctccccagagtaggtcaag-ttggaccgaact 31519061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 36574683 - 36574522
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactc 183  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||||    
T  36574683 ttggagagattggggaaagg-tagaaattaagatttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacccttttatatctctttgtaaagaactc 36574585  T
Q  184 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 249  Q
    | |||||||||| ||||||||  |||||  ||| | ||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  36574584 a-ttgatagtggtttggagagatcaatccatcc-ctagagtaggtcaa-tttggaccaaactgggt 36574522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 249
Target Start/End: Original strand, 30814536 - 30814598
Alignment:
Q  186 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 249  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  30814536 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 30814598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 1360316 - 1360243
Alignment:
Q  89 tgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaaccctttt 162  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  1360316 tgagattgggaaaaaggtagaaattaggttttg-tcttggagaacttgttgaagcgaatttcttgtaaccctttt 1360243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 249
Target Start/End: Original strand, 18396418 - 18396481
Alignment:
Q  186 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 249  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  18396418 ttgatagaggattggagagatcaatctctcctcaagagtaggtcaatggtggaccgaactgggt 18396481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 186
Target Start/End: Original strand, 31518795 - 31518896
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaactt-gtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| | |||| |||  | |||||| ||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  31518795 ttggtgagattgggaaaataggtagaaatta-ggtttgttctttgtgagcttattgaagctagtttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaact 31518892  T
Q  183 catt 186  Q
    ||||    
T  31518893 catt 31518896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 24515018 - 24514934
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 87  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||    
T  24515018 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 24514934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 359
Target Start/End: Original strand, 24790230 - 24790272
Alignment:
Q  317 gtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24790230 gtttctcacctgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 24790272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 172
Target Start/End: Original strand, 28617182 - 28617249
Alignment:
Q  104 ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttt 172  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||| ||| | ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  28617182 ggtagaaattaggttttgttctttgtgagctttt-aagctaatttcttgtaaccccattgtatcacttt 28617249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 45)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12647637 - 12647282
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647637 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 12647540  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattg 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12647539 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 12647441  T
Q  200 gagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  12647440 gagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttg--tatc 12647343  T
Q  299 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647342 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 12647282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 6266607 - 6266962
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6266607 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 6266706  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6266707 aagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattg 6266804  T
Q  200 gagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt-atttgttttcttcttccctctccttgtttatc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  6266805 gagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtcttttgttttcttcttccctctcc--gtttatc 6266902  T
Q  299 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    ||||| ||| ||  ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6266903 ttgtgcttg-tgtattgtgtttttcacttctttcctagattagatctaggtgttgttttgt 6266962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 65 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 13656220 - 13655925
Alignment:
Q  65 agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgt 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  13656220 agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgt 13656122  T
Q  165 atcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttgg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13656121 atcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgg 13656022  T
Q  264 tgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656021 tgtttgttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 13655925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 4484590 - 4484232
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------gtgaga 93  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || |  |||||||||||||||||      |||| |    
T  4484590 ctagggtttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttcttggtgaaa 4484492  T
Q  94 ttggga--aaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgat 190  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  4484491 ttgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gat 4484394  T
Q  191 agtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctcct 290  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4484393 agtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggacagaactgggtgaacaatct-ttggtgtctttgttttcttcttccctctcct 4484295  T
Q  291 tgtttatcttgtgattgttg-ctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgtt 355  Q
      ||||||||||| |||| |  ||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  4484294 --tttatcttgtgcttgtggtttttgcttttcac-tttgtttcctagattagatctaggtgttgtt 4484232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Original strand, 32289481 - 32289832
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggga 99  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||| | |||||||| ||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32289481 ctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggtttggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattgg-a 32289578  T
Q  100 aaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggatt 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||    
T  32289579 aaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagtaaatt 32289676  T
Q  199 ggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttat 297  Q
     |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||  |||||    
T  32289677 agagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtccttgttttcctcttccctctcct--tttat 32289774  T
Q  298 cttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 355  Q
    |||||| ||| || ||| || ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  32289775 cttgtgcttg-tgttttatgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgtt 32289832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 83 - 355
Target Start/End: Original strand, 30833342 - 30833612
Alignment:
Q  83 tcttggtgagattggga--aaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaaga 179  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30833342 tcttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaaga 30833440  T
Q  180 actcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttc 279  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  30833441 actcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggactgaactgggtgaacaatct-ttggtgtctttgttttcctc 30833538  T
Q  280 ttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 355  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||| || |||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  30833539 ttccctctcct--tttatcttgtgcttg-tggtttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgtt 30833612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Original strand, 45099665 - 45099941
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 93  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||    
T  45099665 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 45099762  T
Q  94 ttgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgat 190  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||   ||||||||||| |||    
T  45099763 ttgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg--aagaactcatt-gat 45099858  T
Q  191 agtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  45099859 agtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 45099941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 4503390 - 4503037
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggt-------gaga 93  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || ||||||||||||||||| |       ||||    
T  4503390 tagggtttagg-ttctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggagaga 4503293  T
Q  94 ttgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgat 190  Q
    |||||||||   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||   ||||||||||| |||    
T  4503292 ttgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg--aagaactcatt-gat 4503197  T
Q  191 agtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctcct 290  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||   ||||  |||||||    
T  4503196 agtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctcct 4503100  T
Q  291 tgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 355  Q
      ||||||||||| ||| || |||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  4503099 --tttatcttgtgcttg-tgttttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgctgtt 4503037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5723512 - 5723237
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 93  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||    
T  5723512 tagggtttggggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 5723415  T
Q  94 ttgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatag 192  Q
    ||| ||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  5723414 ttgagaaaagggtagaaattaggctt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacctttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatag 5723318  T
Q  193 tggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  5723317 tggattggagagatcaatctctcctctagagtaggttaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 5723237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 36205921 - 36205646
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 93  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||    
T  36205921 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 36205824  T
Q  94 ttgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgata 191  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||   ||||||||||| || |    
T  36205823 ttgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg--aagaactcatt-gaca 36205728  T
Q  192 gtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  36205727 gcggattggagagttcaatctatcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 36205646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 36988333 - 36987979
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 93  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||| ||    
T  36988333 tagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacatagtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtggga 36988236  T
Q  94 ttgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgata 191  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  36988235 ttggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctatgtgagcttgtcaaaactaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gata 36988139  T
Q  192 gtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctcctt 291  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||   ||||  |||||||     
T  36988138 gtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctcct- 36988043  T
Q  292 gtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 355  Q
     |||||||| || |||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  36988042 -tttatcttttgcttgtggctttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgtt 36987979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 2334661 - 2334399
Alignment:
Q  17 tttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggta 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||    
T  2334661 tttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggta 2334563  T
Q  108 gaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagta 206  Q
    ||||| |||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  2334562 gaaataagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttctagtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagat 2334466  T
Q  207 caatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||    
T  2334465 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggggaacaatct-ttggtgtgtttgttt 2334399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 85 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6595175 - 6594987
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaac 181  Q
    ||||||||||| ||||||   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  6595175 ttggtgagattaggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgaatctcttt-gtaagaac 6595078  T
Q  182 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    || || |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||    
T  6595077 tcgtt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 6594987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 88 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 34139936 - 34139752
Alignment:
Q  88 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 185  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  34139936 gtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatatgtatcccttttgtaagaactca- 34139839  T
Q  186 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  34139838 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 34139752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 355
Target Start/End: Original strand, 29867869 - 29868133
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  29867869 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 29867966  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttc 282  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||| ||| ||| |||||||   ||||     
T  29867967 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaataatct-ttgatgtgtttgtttctctctt- 29868062  T
Q  283 cctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 355  Q
     ||||||  |||||||||||| |||| | |||| ||||  ||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  29868063 -ctctcc--gtttatcttgtgcttgtggttttgagtttttcactttgattactagattagatctaggtgttgtt 29868133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 103 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 723893 - 723726
Alignment:
Q  103 gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 201  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  723893 gggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcatt-gatagtggattgga 723797  T
Q  202 gagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    |||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  723796 gagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 723726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 88 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14633991 - 14633807
Alignment:
Q  88 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 185  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| || |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  14633991 gtgagattggtaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttttgtaagaactca- 14633894  T
Q  186 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||||||| |||||||    
T  14633893 tagatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 14633807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Original strand, 45726929 - 45727093
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  45726929 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaact 45727026  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45727027 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 45727093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 258
Target Start/End: Original strand, 38312240 - 38312411
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||    
T  38312240 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagatct 38312337  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 258  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  38312338 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 38312411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Original strand, 42362262 - 42362500
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgag 92  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       |||||    
T  42362262 tagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgag 42362359  T
Q  93 attgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgat 190  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  42362360 attgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccc-tttgtaagaactca-ttgat 42362456  T
Q  191 agtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtt 234  Q
    ||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||    
T  42362457 agtggattggagagatctatctctcccccagattaggtcaagtt 42362500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 35447052 - 35446888
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  35447052 ttggtgagattggtaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgatcttgttgaatctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 35446955  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    |||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35446954 catt-gatagtggattggagagatcactctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 35446888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11151759 - 11151573
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  11151759 ttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattaga-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcacttt-gtaagaact 11151662  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    | || |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  11151661 c-ttagatagtggattggagagatcaacctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 11151573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 274
Target Start/End: Original strand, 36773562 - 36773748
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  36773562 ttggtgagattgggaaaatgggaataaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 36773659  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  36773660 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 36773748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1631900 - 1631736
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||| | |||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  1631900 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatatcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 1631803  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  1631802 catt-gatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtga 1631736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 90 - 249
Target Start/End: Original strand, 33648176 - 33648335
Alignment:
Q  90 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttg 188  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| | |||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||   ||||||||||| |    
T  33648176 gagattgagaaaatggtaaaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcctgtaacccttttgtatttctttgtaaagaactcatt-g 33648274  T
Q  189 atagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 249  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  33648275 atagcggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggt 33648335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 36318177 - 36317991
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  || ||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  36318177 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 36318080  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  36318079 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccttagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 36317991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17057537 - 17057352
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | |  | |||||  |||||||||| ||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  17057537 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgcaagcttgttgaagctaattttttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 17057440  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 273  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  17057439 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagactaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 17057352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17085520 - 17085335
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | |  | |||||  |||||||||| ||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  17085520 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgcaagcttgttgaagctaattttttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 17085423  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 273  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  17085422 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagactaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 17085335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 266
Target Start/End: Original strand, 24398055 - 24398238
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaa--aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaac 181  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||    
T  24398055 ttggtgagattgtgaagaaagggtagaagttaaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaac 24398154  T
Q  182 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 266  Q
    ||| |||||| ||||||||||||  |||||||||| ||| | |||||||   |||||||||||||| ||| ||||  ||||||||    
T  24398155 tca-ttgataatggattggagagatcaatctctcccccatagtaggtcattgttggaccgaactggctgaacaattacttggtgt 24398238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 274
Target Start/End: Original strand, 11067305 - 11067491
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| || | | |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  11067305 ttggtgaaattggaaaaatgggtagaaattagtgtt-gtactttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 11067402  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  11067403 cattt-ataatggattgaagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactcggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 11067491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 33162618 - 33162432
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||    
T  33162618 ttggtgaaattaggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctct-gtaagaact 33162521  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    |||| ||||||||||| |||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  33162520 catt-gatagtggattagagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 33162432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 88 - 247
Target Start/End: Original strand, 11690504 - 11690661
Alignment:
Q  88 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 185  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||      
T  11690504 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccc-tttgtaagaaatc-g 11690600  T
Q  186 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgg 247  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||| | || |||||| ||||||||||||||    
T  11690601 ttgatagtggattggagagatcaacctctcccccatattacgtcaag-ttggaccgaactgg 11690661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 42288278 - 42288117
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||  |||| |||||| ||    
T  42288278 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatttcttt-gtaagagct 42288181  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 249  Q
    |||| |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  42288180 catt-gataatggattggagagatcaatctctcc-ccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 42288117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 249
Target Start/End: Original strand, 26353184 - 26353346
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactc 183  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||    
T  26353184 ttggtgagattgaaaaaagtgtagaaattaaggtttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgtat-ctttttgtaagtactc 26353282  T
Q  184 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 249  Q
    | |||||||||||||||||||  || |||||||   ||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26353283 a-ttgatagtggattggagagatcactctctcccttagagtaggtcaag-ttggaccgaaccgggt 26353346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17490261 - 17490154
Alignment:
Q  139 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 238  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| |||||||| ||||||    
T  17490261 aagctaatttcttgtaactcttttgtaactc-tttgtaagaactca-ttgatagtggattgtagagatcaatctctcccctagagtaggtcaa-tttgga 17490165  T
Q  239 ccgaactgggt 249  Q
    |||||||||||    
T  17490164 ccgaactgggt 17490154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 7815441 - 7815323
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactc 183  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |    | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  7815441 ttggtgagattgagaaaaaggttgaaattagggtttgttctttagaagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctc-tttgtaagaactc 7815343  T
Q  184 atttgatagtggattggagag 204  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  7815342 attt-atagtggattggagag 7815323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 85 - 220
Target Start/End: Original strand, 13121769 - 13121901
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactc 183  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||| |||||||||||||||  |||||||| | ||||||  |||||    
T  13121769 ttggtgagactgggaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagataatttcttgtaacc--tttgtatctc-tttgtagaaactc 13121865  T
Q  184 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctcca 220  Q
    | |||||||||||||| |||   ||||||||||||||    
T  13121866 a-ttgatagtggattgaagaaatcaatctctcctcca 13121901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 249
Target Start/End: Original strand, 11049550 - 11049716
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttca---tggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccctttt-gtatcccttttgtaaga 179  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    | |||| |||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||    
T  11049550 ttggtgagattaggaaaatggtataaattagggtttgttctaatttgtgagcttgttgaagctaatttcttataacccttttagtatctc-tttgtaaga 11049648  T
Q  180 actcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 249  Q
    ||||| |||||||| ||||| | ||  ||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||    
T  11049649 actca-ttgatagtagattgaaaagatcaatctctccttcataataggtcaa-attggactgaactgggt 11049716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 258
Target Start/End: Original strand, 39284936 - 39285007
Alignment:
Q  186 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 258  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  39284936 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 39285007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 251
Target Start/End: Original strand, 7451173 - 7451281
Alignment:
Q  139 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 238  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||| | | ||||||||| |||||    
T  7451173 aagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaataactcatt-gatagtggattgcagagatcaatctctcctctacagtaggtcaag-ttgga 7451269  T
Q  239 ccgaactgggtga 251  Q
     ||||||||||||    
T  7451270 -cgaactgggtga 7451281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 143 - 243
Target Start/End: Original strand, 28671989 - 28672088
Alignment:
Q  143 taatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccga 242  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||   ||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  28671989 taatttcttgttaccgttttgtatctctttacaaagaactcact-gacagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccga 28672087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 258
Target Start/End: Original strand, 17450678 - 17450748
Alignment:
Q  186 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 258  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  17450678 ttgatagtggattggagagatcaatctctcc-acagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaacaatct 17450748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 93 - 186
Target Start/End: Original strand, 24885669 - 24885762
Alignment:
Q  93 attgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatt 186  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||    
T  24885669 attgggaaaatgagtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgta-cccctctgtaagaactcatt 24885762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 160
Target Start/End: Original strand, 24197906 - 24197974
Alignment:
Q  94 ttgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgt--caagctaatttcttgtaaccctt 160  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||| ||| ||||||||   | ||||||||||||||||||||    
T  24197906 ttgggaaaagggtagaaattaaagttttttcttggagaacttgttgaaggctaatttcttgtaaccctt 24197974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 167
Target Start/End: Original strand, 31417170 - 31417230
Alignment:
Q  107 agaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 167  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31417170 agaaattagagtttgttcttgttgaacgttgcacgctaatttcttgtaacctttttgtatc 31417230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 2855 - 2500
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2855 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 2758  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattg 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2757 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 2659  T
Q  200 gagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  2658 gagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttttgtgtttattgttttcttcttccctctccttg--tatc 2561  T
Q  299 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2560 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 2500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 3977 - 3622
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3977 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 3880  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattg 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3879 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 3781  T
Q  200 gagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatc 298  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  3780 gagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttg--tatc 3683  T
Q  299 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3682 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 3622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 6190 - 6547
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 6287  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggattg 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6288 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaagccctt-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 6386  T
Q  200 gagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttg-tttatc 298  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6387 gagagtacaaactctcctccagagtaggttaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgttattgttttcttcttccctctccttgttttatc 6486  T
Q  299 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  6487 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgtattgt 6547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 58)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 25689871 - 25690226
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689871 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 25689970  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25689971 aaaggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattgg 25690068  T
Q  201 agagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatc 298  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  25690069 agagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtttgttgttttcttcttccctcccct--tttatc 25690166  T
Q  299 ttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||| || || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25690167 ttgtgagtg-tgttttgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 25690226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 3439420 - 3439774
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439420 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 3439519  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3439520 aagggtagaaattagggtttgttcattatgaacttggcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattgg 3439617  T
Q  201 agagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatct 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  3439618 agagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggatgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctcct--tttatct 3439715  T
Q  300 tgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||||| || |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439716 tgtgattg-tgttttgagtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 3439774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 15290440 - 15290796
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15290440 ctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 15290537  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggatt 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15290538 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggatt 15290636  T
Q  199 ggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttat 297  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  15290637 ggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgtccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttg--tat 15290734  T
Q  298 cttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15290735 cttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattcgatctaggtggtgtattgt 15290796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 15470809 - 15471165
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470809 ctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 15470906  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggatt 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15470907 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggatt 15471005  T
Q  199 ggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttat 297  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  15471006 ggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgtccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttg--tat 15471103  T
Q  298 cttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15471104 cttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattcgatctaggtggtgtattgt 15471165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 42575576 - 42575221
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42575576 ctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 42575479  T
Q  101 aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggatt 198  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42575478 aggggtagaaattagggattgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggatt 42575380  T
Q  199 ggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttat 297  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  42575379 ggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttg--tat 42575282  T
Q  298 cttgtgatt-gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||| || |||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42575281 cttgtgtttggttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgt 42575221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Original strand, 2627651 - 2628002
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggga 99  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2627651 ctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattggga 2627749  T
Q  100 aaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaaccctttt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggat 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  2627750 aaagggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaactctttttgtatctcttgtgtaagaactcatt-gatagtggat 2627847  T
Q  198 tggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttat 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  2627848 tggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaataatctcttggtgtctttgttttcctcttccctctcct--tttat 2627945  T
Q  298 cttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgtt 355  Q
    |||||| ||| || ||| || ||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  2627946 cttgtgcttg-tgttttatgcttttcacttgtttcctagattagatctaggtgttgtt 2628002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 34254586 - 34254312
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagat 94  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       |||||||    
T  34254586 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttggagacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagat 34254489  T
Q  95 tgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||    
T  34254488 tgggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaacttatt-gatagt 34254392  T
Q  194 ggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  34254391 ggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 34254312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Original strand, 17982563 - 17982840
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 93  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||    
T  17982563 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 17982660  T
Q  94 ttgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgat 190  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||    
T  17982661 ttgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactcatt-gat 17982757  T
Q  191 agtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  17982758 agtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 17982840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Original strand, 31218167 - 31218444
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 93  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||    
T  31218167 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 31218264  T
Q  94 ttgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgat 190  Q
    |||||||||   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||    
T  31218265 ttgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactcatt-gat 31218361  T
Q  191 agtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  31218362 agtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 31218444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 34256762 - 34256488
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagat 94  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||| | ||||||||||    | || |||||||||||||||||       |||||||    
T  34256762 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tatcttgggttggaaacattgtaaacaccttggtgtgtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagat 34256665  T
Q  95 tgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagt 193  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  34256664 tggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagt 34256568  T
Q  194 ggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  34256567 ggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 34256488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 85 - 355
Target Start/End: Original strand, 42498193 - 42498459
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaac 181  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  42498193 ttggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttcttt-gtaagaac 42498290  T
Q  182 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttctt 281  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| | ||||    
T  42498291 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttccctctt 42498388  T
Q  282 ccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 355  Q
      |||||||  |||||||| || |||| | |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  42498389 --ctctcct--tttatcttttgcttgtggttttgtgtttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgtt 42498459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Original strand, 44303764 - 44304042
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 93  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||    
T  44303764 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 44303861  T
Q  94 ttgggaaaa---gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttga 189  Q
    |||||||||   |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  44303862 ttgggaaaaaaagggtagaaattaaggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttt-taagaactcatt-ga 44303958  T
Q  190 tagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  44303959 tagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggatcgaactaggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 44304042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19945618 - 19945340
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 93  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||    
T  19945618 tagggtttagagt-ctttgattagagt-tctcttgggtcgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 19945521  T
Q  94 ttgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttga 189  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||| ||    
T  19945520 ttgggaaaaaagggtagaaattatggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccacttttgtatctctttgg-aagaactcatt-ga 19945424  T
Q  190 tagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  19945423 tagtggattggagagttcaatctctcctcgagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 19945340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 99 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1746371 - 1746200
Alignment:
Q  99 aaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggat 197  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| ||||||||||    
T  1746371 aaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg--aagaactcatt-gatagtggat 1746276  T
Q  198 tggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||    
T  1746275 tggagagttcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatc-gttggtgtgtttgttt 1746200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 85 - 273
Target Start/End: Original strand, 15212786 - 15212971
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  15212786 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 15212883  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 273  Q
    |||| |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  15212884 catt-gataatggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 15212971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 42435159 - 42434995
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  42435159 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 42435062  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42435061 catt-gatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 42434995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 258
Target Start/End: Original strand, 33352150 - 33352321
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  33352150 ttggtgagattgggaaaatgggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 33352247  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 258  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  33352248 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 33352321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 273
Target Start/End: Original strand, 43036423 - 43036608
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  || ||||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||    
T  43036423 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaagaact 43036520  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 273  Q
    |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  43036521 catt-gatagtggatttgagagatcaatctctcctccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 43036608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Original strand, 4283524 - 4283688
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  4283524 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 4283621  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4283622 catt-gatagtggattggagagatcaatctcccctctagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 4283688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 258
Target Start/End: Original strand, 27811278 - 27811449
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||     
T  27811278 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaacc 27811375  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 258  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  27811376 catt-gatagtggattgaagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 27811449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12702787 - 12702542
Alignment:
Q  99 aaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggat 197  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||    
T  12702787 aaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtgtctc-tttgtaagaactca-ttgatattggat 12702691  T
Q  198 tggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttat 297  Q
    |||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||| | |||||||   ||||| ||| |    |||||    
T  12702690 tggagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtatgtttgtttctctcttctctccc----tttat 12702597  T
Q  298 cttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgg--ttcctagattagatctaggtg 350  Q
    |||||| |||| | |||||||||  ||||| |  || ||||||||||||||||||    
T  12702596 cttgtgcttgtggttttgtgtttttcactttgattttctagattagatctaggtg 12702542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 258
Target Start/End: Original strand, 40321082 - 40321251
Alignment:
Q  87 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactca 184  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||| |||||||||||||||| || ||||| |||| |||| |||||     
T  40321082 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacccattagtatctcttt-gtaaaaactc- 40321178  T
Q  185 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 258  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  40321179 tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 40321251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Original strand, 18655400 - 18655564
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  18655400 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 18655497  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18655498 catt-gatagtggattagagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 18655564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 85 - 249
Target Start/End: Original strand, 40221745 - 40221907
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  40221745 ttggtgagattggtaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 40221842  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 249  Q
    | || |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  40221843 cgtt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 40221907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3303838 - 3303652
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| | |||| |||||  || ||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  3303838 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgtgagcttgtttaacctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 3303741  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  3303740 catt-gatagtggattgaagagatcaatctctcccccacagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaacaatct-ttggtgtgtttgttt 3303652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 273
Target Start/End: Original strand, 4731658 - 4731843
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || | |||| |||||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  4731658 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gctctttgtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 4731755  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 273  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||||| | ||||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  4731756 catt-gatagtggattggagagatcgatctctcccccagattcggtcaag-ttggaccgaattgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 4731843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 248
Target Start/End: Original strand, 18141821 - 18141981
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  18141821 ttggtgagattgtgaaaatgggtagaaattagg--ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcacttt-gtaagaact 18141917  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactggg 248  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  18141918 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccaaactggg 18141981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 87 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10930365 - 10930188
Alignment:
Q  87 ggtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactca 184  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| | || | |||| || ||  |||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||| ||    
T  10930365 ggtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gctctttgtgagctcgttgaagctaatttcttgtaacccatttatatctcttt-gtaagaacaca 10930268  T
Q  185 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 266  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  10930267 tt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatttcttggtgt 10930188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 91 - 234
Target Start/End: Original strand, 30143346 - 30143488
Alignment:
Q  91 agattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttg 188  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  30143346 agattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-g 30143442  T
Q  189 atagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtt 234  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||  ||||||||||    
T  30143443 atagtggattggagagatcaatctctcccccagataaggtcaagtt 30143488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 88 - 258
Target Start/End: Original strand, 6598975 - 6599143
Alignment:
Q  88 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 185  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| | | || |||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  6598975 gtgagattgggaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgcgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatac-ttttgtaagaactcat 6599072  T
Q  186 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 258  Q
    | ||||||||||| |||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  6599073 t-gatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 6599143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 88 - 258
Target Start/End: Original strand, 6674428 - 6674596
Alignment:
Q  88 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 185  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| | | || |||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  6674428 gtgagattgggaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgcgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatac-ttttgtaagaactcat 6674525  T
Q  186 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 258  Q
    | ||||||||||| |||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  6674526 t-gatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 6674596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 258
Target Start/End: Original strand, 5689326 - 5689442
Alignment:
Q  139 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 238  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||| |||||    
T  5689326 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcaag-ttgga 5689422  T
Q  239 ccgaactgggtgaccaatct 258  Q
    ||||||||||| | ||||||    
T  5689423 ccgaactgggtcaacaatct 5689442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 85 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8965859 - 8965697
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactc 183  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||  ||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  8965859 ttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttctttatgagtttgttgaagttaatttcttataacccttttatatctcttt-gtaagaactc 8965761  T
Q  184 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 249  Q
    ||| ||||||| || ||||||   ||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  8965760 att-gatagtgcatcggagagataaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 8965697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Original strand, 9765745 - 9765863
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  9765745 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttggcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 9765842  T
Q  183 catttgatagtggattggagag 204  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  9765843 ca-ttgatagtggattggagag 9765863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 246
Target Start/End: Original strand, 30291606 - 30291767
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||| |    
T  30291606 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatcacttt-gtaagaatt 30291704  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctct-cctccagaataggtcaagtttggaccgaactg 246  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||    
T  30291705 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctccctccagattatgccaag-ttggaccgaactg 30291767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 88 - 228
Target Start/End: Original strand, 40328782 - 40328922
Alignment:
Q  88 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaactca 184  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  || ||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||    
T  40328782 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaaactaatttcttgtaactcattttgtatctcttt-gtaagaactca 40328879  T
Q  185 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggt 228  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  40328880 tt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 40328922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 88 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1345536 - 1345353
Alignment:
Q  88 gtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 185  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| | ||||  || |  |||||||||||||||||||| | |||||| |||| | ||||||||||    
T  1345536 gtgagattgggaaaatgtgtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttattgaagctaatttcttgtaacccatatgtatctcttt-gaaagaactcat 1345439  T
Q  186 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    | |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  1345438 t-gatagtggattgaagagttcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttagaccgaactaggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 1345353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19491867 - 19491680
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  19491867 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 19491770  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    |  |||||||||||||  ||||  |||| ||||| ||| | |||||| |  |||||||||||| ||| | |||| ||||||||| |||||||    
T  19491769 c-gttgatagtggattaaagagatcaatatctcccccatagtaggtc-atattggaccgaactaggtcaacaatatcttggtgtgtttgttt 19491680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 88 - 216
Target Start/End: Original strand, 44353796 - 44353923
Alignment:
Q  88 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 185  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||     
T  44353796 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatctc-tttgtaagaactca- 44353892  T
Q  186 ttgatagtggattggagagtacaatctctcc 216  Q
    |||||||||||||| | ||  ||||||||||    
T  44353893 ttgatagtggattgaaaagatcaatctctcc 44353923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 1292631 - 1292471
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  1292631 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaact 1292534  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactggg 248  Q
    || ||||||||||||| ||||    ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1292533 ca-ttgatagtggatttgagaaataaatctctcc-ccagagtaggtcaag-ttggaccgaactggg 1292471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 4743306 - 4743196
Alignment:
Q  161 ttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctct 260  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |    
T  4743306 ttgtaacccatttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-t 4743210  T
Q  261 tggtgtatttgttt 274  Q
    |||||| |||||||    
T  4743209 tggtgtgtttgttt 4743196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 41366727 - 41366622
Alignment:
Q  139 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 238  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||    
T  41366727 aagctaatttcttttaacctatttgtatccc-tttgtaagaactcattt-atagtggattggagagatcaatctctcc-ctagattaggtcaag-ttgga 41366632  T
Q  239 ccgaactggg 248  Q
    ||||||||||    
T  41366631 ccgaactggg 41366622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 89 - 251
Target Start/End: Original strand, 11383989 - 11384149
Alignment:
Q  89 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatt 186  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||| || |    
T  11383989 tgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaaccca-t 11384085  T
Q  187 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    ||||| |||||||||||   | |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  11384086 tgatactggattggagacatcgatctctcctccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtga 11384149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18106191 - 18106087
Alignment:
Q  139 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 238  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18106191 aagctaatttcttgtaactcatttgtat--cttttgtaagaactca-ttgatagt-gtttggagagatcaatctctcc-ccagaataggtcaag-ttgga 18106098  T
Q  239 ccgaactgggt 249  Q
    |||||||||||    
T  18106097 ccgaactgggt 18106087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 274
Target Start/End: Original strand, 10015136 - 10015265
Alignment:
Q  139 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 238  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||  || ||||||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||| | ||||||||| |||||    
T  10015136 aagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt--taggaactca-ttgatagtggattggagagataaatctct-ctccatagtaggtcaag-ttgga 10015230  T
Q  239 ccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    ||||||||||| | | || |||||||||||||||||    
T  10015231 ccgaactgggtaatc-atttcttggtgtatttgttt 10015265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 249
Target Start/End: Original strand, 4162516 - 4162658
Alignment:
Q  103 gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 201  Q
    |||||||| ||||| ||||||| | | ||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  4162516 gggtagaagttagg-tttgttctttgagaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaactca-ttgatag-ggattgga 4162611  T
Q  202 gagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 249  Q
    ||   |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  4162612 gatatcaatctctccccaagagtaggtcaag-ttggaccgaattgggt 4162658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 249
Target Start/End: Original strand, 4733792 - 4733868
Alignment:
Q  171 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 249  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  4733792 tttgtaagaattcatt-gatagtggattggagagatcgatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 4733868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29796485 - 29796329
Alignment:
Q  90 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgt--aagaactcatt 186  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||||||  ||||||| ||  |||||  || ||||||||    
T  29796485 gagattgggaaaagagtagaaatcaaggtttgttcttggagaacttgttgaagctgatttcttgtaacatttttgta-cctatttgtaaaaaaactcatt 29796387  T
Q  187 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaact 245  Q
    | ||| ||||||||||||  |||||||||| |||   |||||||   ||||||||||||    
T  29796386 t-ataatggattggagagatcaatctctcccccaatgtaggtcattgttggaccgaact 29796329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 167
Target Start/End: Original strand, 1822297 - 1822375
Alignment:
Q  90 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatc 167  Q
    |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1822297 gagattgcaaaaaggatagaaattatggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttatatc 1822375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 167
Target Start/End: Original strand, 1856742 - 1856820
Alignment:
Q  90 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatc 167  Q
    |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1856742 gagattgcaaaaaggatagaaattatggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttatatc 1856820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 247
Target Start/End: Original strand, 7597619 - 7597776
Alignment:
Q  90 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttg 188  Q
    |||||||| ||||| | | |||| ||| ||||||| ||| || |||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||   |||||  |||| |    
T  7597619 gagattggaaaaagagaataaatcaggttttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttataatccttttgtatctctttgtaaagaatgcatt-g 7597717  T
Q  189 atagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgg 247  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||| | |||||||   || |||||||||||    
T  7597718 atagtggattggagagatcaatctctcccccatagtaggtcattgttagaccgaactgg 7597776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 3073981 - 3073880
Alignment:
Q  144 aatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaa 243  Q
    |||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||| |||||    
T  3073981 aatttcttgtaacatttttgtatctc-tttgtaagaactca-ttgataatggcttggagagatcaatctctcc-ccatagtaggtcaag-ttgggccgaa 3073886  T
Q  244 ctgggt 249  Q
    ||||||    
T  3073885 ctgggt 3073880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 243
Target Start/End: Original strand, 8153813 - 8153914
Alignment:
Q  139 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 238  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||  |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||| |  |||| ||||||||| |||||    
T  8153813 aagctaaattcgtgtaactcttttgtatatcttt-gtaagaactcatt-gatagttgattggagagatcaatctcttcctcagagtaggtcaag-ttgga 8153909  T
Q  239 ccgaa 243  Q
    |||||    
T  8153910 ccgaa 8153914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11712114 - 11712038
Alignment:
Q  139 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcc 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||   || |||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  11712114 aagctaatttcttgaaacccttttatatctctttgtaaataactca-ttgatagtggattgaagagatcaatctctcc 11712038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 32902133 - 32902096
Alignment:
Q  312 tttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggt 349  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  32902133 tttgtgtttttcacttggttcctagattagatctaggt 32902096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 166
Target Start/End: Original strand, 41266982 - 41267051
Alignment:
Q  98 gaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacccttttgtat 166  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| | | ||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||    
T  41266982 gaaaatggtagaaattaggttttgttcttagagaacttgttgagactaatttcttgtaactcttttgtat 41267051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 41365011 - 41364927
Alignment:
Q  89 tgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttt 172  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  41365011 tgagattgggaaaattggtagaaattagg-tttgttctttgtgagtttgtttaagctaatttcttgtaacacatttgtatcccttt 41364927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 247
Target Start/End: Original strand, 3772247 - 3772352
Alignment:
Q  139 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 238  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||  |||||| ||   |||| ||||||||| |||||    
T  3772247 aagctaatttcttgtaactcatttgtatatcttt-gtaagaatttatt-gatagtggattggagagatcaatctatctctcagagtaggtcaag-ttgga 3772343  T
Q  239 ccgaactgg 247  Q
    || ||||||    
T  3772344 ccaaactgg 3772352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 11421 - 11063
Alignment:
Q  1 ctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------gtgaga 93  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || |  |||||||||||||||||      ||||||    
T  11421 ctagggtttatggt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttcttggtgaga 11323  T
Q  94 ttggga--aaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgat 190  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  11322 ttgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtaaaatctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcgtt-gat 11225  T
Q  191 agtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctcct 290  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  11224 agtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtctttgttttcctcttccctctcct 11126  T
Q  291 tgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 355  Q
      ||||||||||| ||| || |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11125 --tttatcttgtgcttg-tggtttgtgtttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgtt 11063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 83 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 8907 - 8637
Alignment:
Q  83 tcttggtgagattggga--aaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaaga 179  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8907 tcttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttataaaatctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaaga 8809  T
Q  180 actcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttc 279  Q
    |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  8808 actcgtt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtctttgttttcctc 8711  T
Q  280 ttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 355  Q
    |||||||| ||  ||||||||||| ||| || |||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  8710 ttccctcttct--tttatcttgtgcttg-tggtttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgtt 8637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 355
Target Start/End: Original strand, 434443 - 434798
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 93  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||    
T  434443 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacatggtaaataccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 434540  T
Q  94 ttggg--aaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgat 190  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  434541 ttggggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gat 434637  T
Q  191 agtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctcct 290  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||   ||||| ||| |||    
T  434638 agtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatat-ttggtgtgtttgtttctctcttctctc-cct 434735  T
Q  291 tgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 355  Q
      ||||||||||| ||| || |||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  434736 --tttatcttgtgcttg-tgttttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgtt 434798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 85 - 274
Target Start/End: Original strand, 11557 - 11745
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  11557 ttggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 11654  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11655 catt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtatttgttt 11745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 258
Target Start/End: Original strand, 827 - 1087
Alignment:
Q  2 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------gtgagat 94  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||      |||||||    
T  827 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcttggtgagat 924  T
Q  95 tgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgata 191  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||   || |||||||| ||||    
T  925 tgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg--aacaactcatt-gata 1020  T
Q  192 gtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1021 gtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 1087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 224 - 359
Target Start/End: Original strand, 3 - 137
Alignment:
Q  224 taggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttca 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  3 taggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgt--atcttgtgattgttgctttgtgtttca 100  T
Q  323 cacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgt 359  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  101 cacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 85 - 258
Target Start/End: Original strand, 114602 - 114774
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  114602 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattaaggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacgcttttgtatctcttt-gtaagaact 114699  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 258  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  114700 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggttaagtttagaccgaactggatgaacaatct 114774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18171 - 18007
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||    
T  18171 ttggtgagagtgggaaaattggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-aact 18075  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18074 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagggtaggtcaagtttggatcgaactgggtga 18007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 85 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 20583 - 20319
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  20583 ttggtgagattgggaaaatgagcagaaattagg-tttgttttttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 20486  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttc 282  Q
    | ||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||| | ||||||| ||||||    |||||    
T  20485 c-tttgatattggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaat-ttttggtgtgtttgttcctctcttc 20389  T
Q  283 cctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 355  Q
     ||| |    |||||||| || |||| | |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  20388 tctccc----tttatcttttgcttgtggttttgtgtttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgtt 20319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Original strand, 7327 - 7491
Alignment:
Q  85 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 182  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  7327 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 7424  T
Q  183 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 251  Q
    || |||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  7425 ca-ttgatagtggattggaaagatcaatctctcctctagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtga 7491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 88 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 149262 - 149079
Alignment:
Q  88 gtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 185  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  | || | |||||  ||||||||||||||| |||| ||| |||| |||| ||||||||||||    
T  149262 gtgagattgggaaaacggatagaaattagggtt-gttttttgtaagcttgttgaagctaatttcttgttacccatttatatctcttt-gtaagaactcat 149165  T
Q  186 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 274  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  149164 t-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtatttgttt 149079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 249
Target Start/End: Original strand, 10546 - 10651
Alignment:
Q  141 gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggacc 240  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  10546 gctaatttattgtaaccattttgtatctcttt-gtaagaactcgtt-gatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggacc 10642  T
Q  241 gaactgggt 249  Q
    |||||||||    
T  10643 gaactgggt 10651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 80447 - 80351
Alignment:
Q  89 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 185  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  80447 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtat-ctttttgtaagaactcat 80351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 27606 - 27453
Alignment:
Q  90 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttg 188  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |  |||||| ||  || |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| ||||   || |||| ||| |    
T  27606 gagattgtgaaaagagtagaaattatgtattgttcttgaagagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaaataacttatt-g 27508  T
Q  189 atagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaa 243  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||| | |||||||   ||||||||||    
T  27507 atagtggattggagagatcaatctctcccccatagtaggtcattgttggaccgaa 27453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University