View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10739_high_19 (Length: 259)

Name: NF10739_high_19
Description: NF10739
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10739_high_19
NF10739_high_19
[»] chr6 (14 HSPs)
chr6 (16-259)||(35014970-35015214)
chr6 (16-255)||(19983109-19983349)
chr6 (16-259)||(18583515-18583759)
chr6 (17-172)||(15742120-15742275)
chr6 (16-172)||(26089933-26090091)
chr6 (16-172)||(18002395-18002553)
chr6 (16-172)||(23995121-23995279)
chr6 (16-171)||(4991271-4991427)
chr6 (17-150)||(15889628-15889762)
chr6 (17-148)||(22585470-22585602)
chr6 (17-148)||(22590301-22590433)
chr6 (16-148)||(15004831-15004963)
chr6 (17-172)||(25640456-25640611)
chr6 (195-255)||(15079523-15079582)
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (16-255)||(25119024-25119264)
chr4 (16-255)||(5682345-5682584)
chr4 (16-172)||(14951960-14952117)
chr4 (16-172)||(15272211-15272369)
chr4 (140-255)||(54118085-54118200)
chr4 (71-172)||(15135907-15136010)
chr4 (16-148)||(19559557-19559690)
chr4 (16-124)||(49071885-49071994)
chr4 (22-96)||(34177617-34177691)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (16-255)||(21860209-21860449)
chr1 (16-255)||(44034788-44035028)
chr1 (80-255)||(41218667-41218843)
chr1 (16-171)||(15861327-15861483)
chr1 (140-255)||(41394527-41394642)
chr1 (16-96)||(22367216-22367296)
chr1 (142-213)||(27675120-27675191)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (16-255)||(31097-31337)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (16-255)||(41507-41747)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (16-255)||(80062-80302)
[»] chr7 (14 HSPs)
chr7 (16-255)||(1936834-1937074)
chr7 (16-255)||(126613-126853)
chr7 (16-242)||(32493876-32494103)
chr7 (16-255)||(111086-111326)
chr7 (16-172)||(2029119-2029276)
chr7 (16-172)||(3049780-3049937)
chr7 (16-172)||(42056188-42056346)
chr7 (16-160)||(2190097-2190243)
chr7 (34-160)||(15516773-15516901)
chr7 (140-255)||(3060271-3060386)
chr7 (141-255)||(7283873-7283987)
chr7 (17-124)||(13352151-13352259)
chr7 (17-96)||(39291486-39291565)
chr7 (138-255)||(13377849-13377966)
[»] chr8 (14 HSPs)
chr8 (16-255)||(24716679-24716919)
chr8 (17-255)||(274642-274881)
chr8 (17-255)||(640968-641207)
chr8 (17-255)||(826774-827013)
chr8 (16-254)||(39115473-39115712)
chr8 (16-172)||(41506709-41506866)
chr8 (16-172)||(24385652-24385809)
chr8 (140-255)||(16404817-16404932)
chr8 (17-148)||(17502360-17502492)
chr8 (17-148)||(23218076-23218208)
chr8 (17-172)||(21259391-21259547)
chr8 (16-82)||(22321437-22321503)
chr8 (17-124)||(4234054-4234162)
chr8 (138-255)||(31194135-31194251)
[»] chr3 (21 HSPs)
chr3 (16-255)||(7854180-7854420)
chr3 (16-255)||(55513068-55513308)
chr3 (17-255)||(45581830-45582069)
chr3 (16-254)||(3992748-3992987)
chr3 (16-255)||(2844389-2844629)
chr3 (16-241)||(17955811-17956041)
chr3 (16-242)||(54037954-54038181)
chr3 (17-255)||(28558370-28558609)
chr3 (16-172)||(30153140-30153297)
chr3 (16-172)||(23492571-23492728)
chr3 (16-160)||(33342079-33342224)
chr3 (16-172)||(38168112-38168269)
chr3 (16-160)||(54685213-54685358)
chr3 (16-172)||(53771239-53771397)
chr3 (16-172)||(16261651-16261809)
chr3 (140-255)||(19232089-19232204)
chr3 (140-255)||(15857080-15857195)
chr3 (140-255)||(16743958-16744073)
chr3 (16-150)||(18970119-18970254)
chr3 (17-96)||(48421776-48421855)
chr3 (17-205)||(15550797-15550986)
[»] chr2 (10 HSPs)
chr2 (16-242)||(22274920-22275147)
chr2 (16-242)||(22284153-22284380)
chr2 (55-224)||(15633451-15633621)
chr2 (16-172)||(9652796-9652953)
chr2 (16-165)||(21273955-21274106)
chr2 (22-171)||(25213252-25213403)
chr2 (140-255)||(19794546-19794661)
chr2 (140-259)||(20627151-20627270)
chr2 (140-255)||(43642798-43642913)
chr2 (17-96)||(7321716-7321795)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (18-255)||(166081-166319)
scaffold0016 (18-214)||(162036-162233)
scaffold0016 (138-213)||(116410-116485)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (39-255)||(42575-42789)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (27-255)||(5694-5923)
scaffold0686 (16-230)||(5925-6140)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (16-255)||(30292-30532)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (16-226)||(298-508)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (16-172)||(55779-55936)
scaffold0032 (70-172)||(108075-108179)
[»] chr5 (8 HSPs)
chr5 (16-171)||(11342883-11343039)
chr5 (16-172)||(2032008-2032165)
chr5 (16-159)||(21205124-21205268)
chr5 (16-172)||(21650893-21651050)
chr5 (22-172)||(16105847-16105999)
chr5 (141-255)||(11584374-11584488)
chr5 (17-95)||(22662653-22662731)
chr5 (21-96)||(25005019-25005094)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (15-172)||(6443-6601)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (17-172)||(12418-12574)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (18-160)||(17316-17459)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (16-172)||(9882-10040)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (16-172)||(13285-13443)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (16-172)||(878-1035)
[»] scaffold0303 (2 HSPs)
scaffold0303 (16-172)||(4346-4504)
scaffold0303 (16-96)||(5-85)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (22-171)||(130760-130911)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (56-173)||(193396-193514)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (141-255)||(1701-1815)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (141-255)||(15284-15398)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (141-255)||(19767-19881)
scaffold0122 (141-255)||(24071-24185)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (141-255)||(94-208)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (141-255)||(20493-20607)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (141-255)||(6221-6335)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (16-105)||(15147-15236)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (17-150)||(44036-44170)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (17-96)||(305-384)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (17-96)||(1478-1557)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (17-176)||(3732-3897)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 14)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 35015214 - 35014970
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  35015214 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 35015115  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35015114 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 35015015  T
Q  215 gattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctccaac 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35015014 gattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctccaac 35014970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19983349 - 19983109
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19983349 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattggattcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 19983250  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19983249 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 19983150  T
Q  215 gattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19983149 gattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 19983109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 259
Target Start/End: Original strand, 18583515 - 18583759
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||    
T  18583515 acatcaaattaacatattcaaacacatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaatgatgcata 18583614  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  18583615 gaacaggagaaaaagaattaactaaatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctat 18583714  T
Q  215 gattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctccaac 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18583715 gattcttcaaactcttgaattcttcaagttcctcttctctccaac 18583759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 15742275 - 15742120
Alignment:
Q  17 catcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgctaga 116  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  15742275 catcaaattaacataatcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatga 15742176  T
Q  117 acaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 172  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  15742175 acaagagaaaaagaattaaccaaaggattatgataaagactaacccccttacctta 15742120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Original strand, 26089933 - 26090091
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26089933 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 26090032  T
Q  115 gaa-caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 172  Q
    ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  26090033 gaatcaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 26090091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 18002553 - 18002395
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  18002553 acatcaaatgaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttatgcccataatcaattatgcata 18002454  T
Q  115 gaa-caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 172  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  18002453 gaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 18002395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Original strand, 23995121 - 23995279
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23995121 acatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaattccaaatattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 23995220  T
Q  115 gaa-caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 172  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  23995221 gaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 23995279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 171
Target Start/End: Original strand, 4991271 - 4991427
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4991271 acatcaaat-aacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 4991369  T
Q  115 gaa-caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctt 171  Q
     || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  4991370 aaatcaagagaaaaagaattaaacaaatgattatgataaagactaacccccttacctt 4991427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 15889762 - 15889628
Alignment:
Q  17 catcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-tag 115  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||  |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||  |||| || |||||| |||    
T  15889762 catcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaggttgggttcacaataatcacgtattcaaataaacacttatgcatag 15889663  T
Q  116 aacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgat 150  Q
    || |||||| ||  |||||||||| ||||||||||    
T  15889662 aaaaagagagaagaaattaactaagtgattatgat 15889628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 22585602 - 22585470
Alignment:
Q  17 catcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-tag 115  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| || |||||| |||    
T  22585602 catcaaattaaaatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcaaaataatcacttattcaaataagcacttatgcatag 22585503  T
Q  116 aacaagagaaaaagaattaactaaatgattatg 148  Q
    || |||||| ||  || ||||||| ||||||||    
T  22585502 aaaaagagagaagaaactaactaagtgattatg 22585470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 22590433 - 22590301
Alignment:
Q  17 catcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-tag 115  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| || |||||| |||    
T  22590433 catcaaattaaaatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcaaaataatcacttattcaaataagcacttatgcatag 22590334  T
Q  116 aacaagagaaaaagaattaactaaatgattatg 148  Q
    || |||||| ||  || ||||||| ||||||||    
T  22590333 aaaaagagagaagaaactaactaagtgattatg 22590301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 15004963 - 15004831
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||  |||| || |||||| ||    
T  15004963 acatcaaatta-catactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcacaataatctcttattcaaataagcacttatgcata 15004865  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatg 148  Q
    ||| |||||| ||  || ||||||| ||||||||    
T  15004864 gaaaaagagagaagaaactaactaagtgattatg 15004831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 25640611 - 25640456
Alignment:
Q  17 catcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-tag 115  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||  |||| |||| |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||  |||| || |||||| |||    
T  25640611 catcaaattaacatactcaaacatatc-ctacaacatgagcacgaatttcaaaagttgggttcacaataatcacttattcaaataagcacttatgcatag 25640513  T
Q  116 aacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 172  Q
    || ||||||  |  ||||| |||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||    
T  25640512 aaaaagagagtagaaattacctaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 25640456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15079582 - 15079523
Alignment:
Q  195 agcttcacttttgctcctatgattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 255  Q
    |||||||||||||||||||    ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15079582 agcttcacttttgctcctagctctcttccaatccttga-ttcttcaagttcctcttctctc 15079523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 25119264 - 25119024
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  25119264 acatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacgaattttcaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 25119165  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 214  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25119164 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaaaactaactcccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 25119065  T
Q  215 gattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25119064 gattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 25119024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 5682584 - 5682345
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5682584 acatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 5682485  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 214  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5682484 gaacaagaggaaaa-aattaactaaatgattatgataaaaactaacccacttaccttaattatcaccaactattagctcatgcttcacttttgctcctat 5682386  T
Q  215 gattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5682385 gattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 5682345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Original strand, 14951960 - 14952117
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14951960 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 14952059  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  14952060 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 14952117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 15272369 - 15272211
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15272369 acatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 15272270  T
Q  115 gaa-caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 172  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  15272269 gaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 15272211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 140 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 54118200 - 54118085
Alignment:
Q  140 atgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattcttcaaacccttgaattcttc 239  Q
    ||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54118200 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcttatgattcttcaaacccttgaattcttc 54118101  T
Q  240 aagttcctcttctctc 255  Q
    ||||| ||||||||||    
T  54118100 aagtttctcttctctc 54118085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 15136010 - 15135907
Alignment:
Q  71 attgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-tagaa-caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttac 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  15136010 attgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttac 15135911  T
Q  169 ctta 172  Q
    ||||    
T  15135910 ctta 15135907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 148
Target Start/End: Original strand, 19559557 - 19559690
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||  |||| |||| |||| ||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||  |||| || |||||| ||    
T  19559557 acatcaaattaacatgctcaaacatatcactacaacatgagcaggaatttcaaaagttgggtacataataatcacttattcaaataagcacttatgcata 19559656  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatg 148  Q
    ||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||    
T  19559657 gaaaaagagagaagaaattaactaattgattatg 19559690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 124
Target Start/End: Original strand, 49071885 - 49071994
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||  |||| | || |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||||||  |||| || |||||| ||    
T  49071885 acatcaaattaacatactcaaacatatcactacaatatgagcacgaatttcaacggttgggttcacaatgatcacttattcaaataagcacttatgcata 49071984  T
Q  115 gaacaagaga 124  Q
    ||| ||||||    
T  49071985 gaaaaagaga 49071994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 34177691 - 34177617
Alignment:
Q  22 aattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 96  Q
    |||||||||| ||||| ||||  |||| |||| |||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  34177691 aattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaattttcaagattggattcacaataatcacttattc 34177617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 21860209 - 21860449
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  21860209 acatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagtacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 21860308  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 214  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21860309 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 21860408  T
Q  215 gattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21860409 gattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 21860449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 44035028 - 44034788
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44035028 acatcaaattaacatattcaaacatatatctacaacataaacaagaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 44034929  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44034928 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 44034829  T
Q  215 gattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 255  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44034828 aattcttcaaactcttgaattcttcaagttcctcttctctc 44034788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 80 - 255
Target Start/End: Original strand, 41218667 - 41218843
Alignment:
Q  80 atgataatcacttattctcataatcaattatgc-tagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatc 178  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  41218667 atgagaatcacttattcccataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgatcatgatgaaaactaacccccttaccttaattatc 41218766  T
Q  179 tccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 255  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41218767 accaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 41218843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 15861483 - 15861327
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  15861483 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 15861384  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctt 171  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  15861383 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctt 15861327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 140 - 255
Target Start/End: Original strand, 41394527 - 41394642
Alignment:
Q  140 atgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattcttcaaacccttgaattcttc 239  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41394527 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcactttagctcctatgattctccaaacccttgaattcttc 41394626  T
Q  240 aagttcctcttctctc 255  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  41394627 aagctcctcctctctc 41394642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 96
Target Start/End: Original strand, 22367216 - 22367296
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 96  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22367216 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 22367296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 213
Target Start/End: Original strand, 27675120 - 27675191
Alignment:
Q  142 gattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctccta 213  Q
    ||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||| |  |||| | ||||||||||| |||||||    
T  27675120 gattatgataaattctaacccccttaccttaattatctccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 27675191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 31337 - 31097
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31337 acatcaaattaacatattcaaacacatgtctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 31238  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 214  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31237 gaacaagagaaaatgaattaactaaatgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 31138  T
Q  215 gattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31137 gattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 31097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 41507 - 41747
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41507 acatcaaattaacatattcaaacacatgtctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 41606  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 214  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41607 gaacaagagaaaatgaattaactaaatgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 41706  T
Q  215 gattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41707 gattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 41747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 80062 - 80302
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  80062 acatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacaaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 80161  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  80162 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctcaagcttcacttttgctcctat 80261  T
Q  215 gattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 255  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80262 gattctttaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 80302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 14)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1937074 - 1936834
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1937074 acatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 1936975  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  1936974 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacctccttaccttaattatctccaactattaactctagcttcacttttgcttctat 1936875  T
Q  215 gattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1936874 gattcttcaaacccttgaattcttcgagttcctcttctctc 1936834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 126613 - 126853
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  126613 acatcaaattaacatattcaaacatatctctgcaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 126712  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  126713 gaacaatagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcatttttgctcctat 126812  T
Q  215 gattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  126813 gattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 126853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 32494103 - 32493876
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  32494103 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataaacacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 32494004  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32494003 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 32493904  T
Q  215 gattcttcaaacccttgaattcttcaag 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32493903 gattcttcaaacccttgaattcttcaag 32493876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 111326 - 111086
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  111326 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaatattgggttcatgataatcacttattttcataatcaattatgcata 111227  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  111226 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaacttttagctcaagcttcacttttgctcctat 111127  T
Q  215 gattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  111126 gattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 111086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Original strand, 2029119 - 2029276
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2029119 acatcaaattaacatattcaaacatatatctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 2029218  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  2029219 gaacaagagaaaaaaaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 2029276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Original strand, 3049780 - 3049937
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3049780 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaatataaacacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 3049879  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  3049880 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 3049937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 42056346 - 42056188
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42056346 acatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 42056247  T
Q  115 gaa-caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 172  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  42056246 gaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 42056188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 2190243 - 2190097
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2190243 acatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggtacatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 2190144  T
Q  115 gaa-caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaac 160  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2190143 gaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaaaactaac 2190097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 34 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 15516901 - 15516773
Alignment:
Q  34 caaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-tagaa-caagagaaaaagaa 131  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15516901 caaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaatcaagagaaaaagaa 15516802  T
Q  132 ttaactaaatgattatgataaaaactaac 160  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15516801 ttaaccaaatgattatgataaagactaac 15516773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 140 - 255
Target Start/End: Original strand, 3060271 - 3060386
Alignment:
Q  140 atgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattcttcaaacccttgaattcttc 239  Q
    |||||||||||||| ||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3060271 atgattatgataaagacttacccccttaccttcattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctacgattcttcaaacccttgaattcttc 3060370  T
Q  240 aagttcctcttctctc 255  Q
    ||||||||||||||||    
T  3060371 aagttcctcttctctc 3060386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 141 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 7283987 - 7283873
Alignment:
Q  141 tgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattcttcaaacccttgaattcttca 240  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7283987 tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaattattaactcaagcttcacttttgctcctatgattcttcaaacccttgaattcttca 7283888  T
Q  241 agttcctcttctctc 255  Q
    |||||||||||||||    
T  7283887 agttcctcttctctc 7283873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 124
Target Start/End: Original strand, 13352151 - 13352259
Alignment:
Q  17 catcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-tag 115  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||  |||| |||| |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||  |||| || |||||| |||    
T  13352151 catcaaattaacatactgaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaagggttgggttcacaataatcacttattcaaataaacacttatgcatag 13352250  T
Q  116 aacaagaga 124  Q
    || ||||||    
T  13352251 aaaaagaga 13352259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 39291565 - 39291486
Alignment:
Q  17 catcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 96  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||  |||| |||| |||||||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||    
T  39291565 catcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaagttaggttcacaataatcacttattc 39291486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 255
Target Start/End: Original strand, 13377849 - 13377966
Alignment:
Q  138 aaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgat-tcttcaaacccttgaattc 236  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||| |||| |  |||| | ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||  ||| || ||    
T  13377849 aaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcctaagatctcttccaattctt-aaatc 13377947  T
Q  237 ttcaagttcctcttctctc 255  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  13377948 ttcaagctcctcttctctc 13377966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 14)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 24716919 - 24716679
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24716919 acatcaaattaacatattcaaacatatctctaccatataaccacgaatttcaaagatcgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 24716820  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716819 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 24716720  T
Q  215 gattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716719 gattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 24716679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 255
Target Start/End: Original strand, 274642 - 274881
Alignment:
Q  17 catcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-tag 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  274642 catcaaattaacatattcaaacatatctctaccacatacgcacgaatttcaaagattgggttcatgataataacttattctcataatcaattatgcatag 274741  T
Q  116 aacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 215  Q
     ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  274742 gacaagagaaaatggattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 274841  T
Q  216 attcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 255  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  274842 attcttcaaacatttgaattcttcaagttcctcttctctc 274881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 641207 - 640968
Alignment:
Q  17 catcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-tag 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  641207 catcaaattaacatattcaaacatatctctaccacatacgcacgaatttcaaagattgggttcatgataataacttattctcataatcaattatgcatag 641108  T
Q  116 aacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 215  Q
     ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  641107 gacaagagaaaatggattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 641008  T
Q  216 attcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 255  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  641007 attcttcaaacatttgaattcttcaagttcctcttctctc 640968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 827013 - 826774
Alignment:
Q  17 catcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-tag 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  827013 catcaaattaacatattcaaacatatctctaccacatacgcacgaatttcaaagattgggttcatgataataacttattctcataatcaattatgcatag 826914  T
Q  116 aacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 215  Q
     ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  826913 gacaagagaaaatggattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 826814  T
Q  216 attcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 255  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  826813 attcttcaaacatttgaattcttcaagttcctcttctctc 826774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 254
Target Start/End: Original strand, 39115473 - 39115712
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  39115473 acatcaaattaacatattcaaacatatctttacaacataagcacgaatgtcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 39115572  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39115573 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgatgaaaactaacacccttaccttaattattaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctat 39115672  T
Q  215 gattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctct 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39115673 gattcttcaaacccttgaattcttcaagtttctcttctct 39115712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 41506866 - 41506709
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  41506866 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacggatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 41506767  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  41506766 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgatgaaaactaacccccttacctta 41506709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 24385809 - 24385652
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24385809 acatcaaattatcatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcataataatcacttattctcataatcaattatgcata 24385710  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 172  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  24385709 gaacaagagaaaaggaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 24385652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 140 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16404932 - 16404817
Alignment:
Q  140 atgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattcttcaaacccttgaattcttc 239  Q
    ||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16404932 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattcttcaaacccttgaattcttc 16404833  T
Q  240 aagttcctcttctctc 255  Q
    |||||||| |||||||    
T  16404832 aagttcctattctctc 16404817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 148
Target Start/End: Original strand, 17502360 - 17502492
Alignment:
Q  17 catcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-tag 115  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||  |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||| |||    
T  17502360 catcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacaaatttcaaagattgggttcataataatcacttattcaaataagcacttatgcatag 17502459  T
Q  116 aacaagagaaaaagaattaactaaatgattatg 148  Q
    || |||||| ||  || ||||||| ||||||||    
T  17502460 aaaaagagagaagaaactaactaagtgattatg 17502492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 148
Target Start/End: Original strand, 23218076 - 23218208
Alignment:
Q  17 catcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-tag 115  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||  |||| || |||||| |||    
T  23218076 catcaaattaacatactcaaacatatcactaccacataagcacgaatttcaaaagttgggttcacaataatcacttattcaaataagcacttatgcatag 23218175  T
Q  116 aacaagagaaaaagaattaactaaatgattatg 148  Q
    || |||||| ||  || ||||||| ||||||||    
T  23218176 aaaaagagagaagaaactaactaagtgattatg 23218208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 21259547 - 21259391
Alignment:
Q  17 catcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-tag 115  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||  |||| |||| |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||  |||| || |||||| |||    
T  21259547 catcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaagttgggttcacaataatcacttattcaaataagcacttatgcatag 21259448  T
Q  116 aacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 172  Q
    || ||||||  |  |||||||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||    
T  21259447 aaaaagagagtagaaattaactaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 21259391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 22321503 - 22321437
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatg 82  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321503 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacctgagcacgaatttcaaagattgggttcatg 22321437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 124
Target Start/End: Original strand, 4234054 - 4234162
Alignment:
Q  17 catcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-tag 115  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||  || | |||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| || |||||| |||    
T  4234054 catcaaattaacatactcaaacatatcactgcaacatgagcacaaatttcaaagattgggttcacaataatcacttattcaaataagcacttatgcatag 4234153  T
Q  116 aacaagaga 124  Q
    || ||||||    
T  4234154 aaaaagaga 4234162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 31194251 - 31194135
Alignment:
Q  138 aaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattcttcaaacccttgaattct 237  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||  |  |   | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||     
T  31194251 aaatgattatgatgaaaactaacccccttaccttagttagattaattcactagcttaagcttcacttttgctcctatgattcttcaaatctttgaa-tcc 31194153  T
Q  238 tcaagttcctcttctctc 255  Q
    |||||||| |||||||||    
T  31194152 tcaagttcttcttctctc 31194135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 21)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 7854180 - 7854420
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  7854180 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 7854279  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7854280 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctat 7854379  T
Q  215 gattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7854380 gattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 7854420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 55513068 - 55513308
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  55513068 acatcgaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttatttccataatcaattatgcata 55513167  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55513168 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 55513267  T
Q  215 gattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55513268 gattcttcaaacccttgaattcttcaagctcctcttctctc 55513308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 255
Target Start/End: Original strand, 45581830 - 45582069
Alignment:
Q  17 catcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-tag 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  45581830 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcatag 45581929  T
Q  116 aacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaa-ctcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  45581930 aacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaaccccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttca-tttttctcctat 45582028  T
Q  215 gattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45582029 gattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 45582069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 254
Target Start/End: Original strand, 3992748 - 3992987
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  3992748 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacggatttcaaaggttgagttcatgataattacttattctcataatcaattatgcata 3992847  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3992848 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 3992947  T
Q  215 gattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctct 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  3992948 gattcttcaaacccttgaattctttaagttcctctcctct 3992987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 2844389 - 2844629
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  2844389 acatcaaattaacatattaaaacaaaaatctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcgcttattcccataatcaattatgcata 2844488  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 214  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2844489 gaataagagaaaaagaatcaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctcaaactattagctctagcttcacttttgctcctat 2844588  T
Q  215 gattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2844589 gattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 2844629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17956041 - 17955811
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17956041 acatcaaattaacatattcagacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcgattatgcata 17955942  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagct----ctagcttcacttttgctc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  17955941 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctacctagcttcacttttgctc 17955842  T
Q  211 ctatgattcttcaaacccttgaattcttcaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17955841 ctatgattcttcaaacccttgaattcttcaa 17955811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 54038181 - 54037954
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  54038181 acatcaaattaacatattcaaacatatatctacaatataagcacgaatgtcaaacattgagttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 54038082  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54038081 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctat 54037982  T
Q  215 gattcttcaaacccttgaattcttcaag 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54037981 gattcttcaaacccttgaattcttcaag 54037954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 255
Target Start/End: Original strand, 28558370 - 28558609
Alignment:
Q  17 catcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-tag 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  28558370 catcaaattaacatattcaaacatatctctatcacataagcacgaatttcaaagattaggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatgg 28558469  T
Q  116 aacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta-------attatctccaactattagctctagcttcacttttgc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||       ||||   |||||  ||||     |||||| ||||||    
T  28558470 aacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaaccctcttaccttagataaagattaatcccaac--ttag-----gcttcaattttgc 28558562  T
Q  209 tcctatgattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28558563 tcctatgattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 28558609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Original strand, 30153140 - 30153297
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30153140 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 30153239  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 172  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  30153240 gaacaagagaaaaagaattaattaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 30153297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Original strand, 23492571 - 23492728
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  23492571 acatcaaattaacacattcaaacatatctctacaacataagcaagaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 23492670  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  23492671 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 23492728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 160
Target Start/End: Original strand, 33342079 - 33342224
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  33342079 acatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacattagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 33342178  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaac 160  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  33342179 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaac 33342224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Original strand, 38168112 - 38168269
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  38168112 acatcaaattaacatattcaaacatatttctacaacataagtacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 38168211  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 172  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  38168212 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 38168269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 54685358 - 54685213
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  54685358 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 54685259  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaac 160  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  54685258 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatcataaagactaac 54685213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Original strand, 53771239 - 53771397
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  53771239 acatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 53771338  T
Q  115 gaa-caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 172  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  53771339 gaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 53771397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Original strand, 16261651 - 16261809
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  16261651 acatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattacgcata 16261750  T
Q  115 gaa-caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 172  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  16261751 gaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 16261809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 140 - 255
Target Start/End: Original strand, 19232089 - 19232204
Alignment:
Q  140 atgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattcttcaaacccttgaattcttc 239  Q
    ||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19232089 atgattaagataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattcttcaaacccttgaattcttc 19232188  T
Q  240 aagttcctcttctctc 255  Q
    ||||||||||||||||    
T  19232189 aagttcctcttctctc 19232204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 140 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15857195 - 15857080
Alignment:
Q  140 atgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattcttcaaacccttgaattcttc 239  Q
    ||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15857195 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaagtattagctctagcttcactttagctcctatgattcatcaaacccttgaattcttc 15857096  T
Q  240 aagttcctcttctctc 255  Q
    ||||||||||||||||    
T  15857095 aagttcctcttctctc 15857080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 140 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16744073 - 16743958
Alignment:
Q  140 atgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattcttcaaacccttgaattcttc 239  Q
    ||||||||| |||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  16744073 atgattatggtaaagactaacctcgttaccttaattatctccaactattagctctagcttcactttagctcctatgattctccaaatccttgaattcttc 16743974  T
Q  240 aagttcctcttctctc 255  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  16743973 aagctcctcctctctc 16743958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 150
Target Start/End: Original strand, 18970119 - 18970254
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||    
T  18970119 acatcaaattaacatacttaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcataataatcacttattcaaataatcacttatgcata 18970218  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgat 150  Q
    ||| |||||||||  || ||||||| || |||||||    
T  18970219 gaaaaagagaaaagaaactaactaagtggttatgat 18970254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 96
Target Start/End: Original strand, 48421776 - 48421855
Alignment:
Q  17 catcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 96  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||  |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  48421776 catcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcatgaatttcaaagattgggttcacaataatcacttattc 48421855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 205
Target Start/End: Original strand, 15550797 - 15550986
Alignment:
Q  17 catcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-tag 115  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||  |||| |||| |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||  || | || |||||| ||     
T  15550797 catcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaagttgggttcacaataatcacttattcaaattagcacttatgcataa 15550896  T
Q  116 aacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 205  Q
    ||  |||||  |  |||||||||| |||||||||| ||  ||||| || ||| |||||||||| |||| |  |||| | |||||||||||    
T  15550897 aaagagagagtagaaattaactaagtgattatgatgaattctaacccccttatcttaattatcaccaattcctagcccaagcttcacttt 15550986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 10)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 242
Target Start/End: Original strand, 22274920 - 22275147
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22274920 acatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 22275019  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22275020 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaggctaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 22275119  T
Q  215 gattcttcaaacccttgaattcttcaag 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22275120 gattcttcaaacccttgaattcttcaag 22275147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 242
Target Start/End: Original strand, 22284153 - 22284380
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  22284153 acattaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgagttcatgataatcacttattctcataatcaaatatgcata 22284252  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22284253 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttttgctcctat 22284352  T
Q  215 gattcttcaaacccttgaattcttcaag 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22284353 gattcttcaaacccttgaattcttcaag 22284380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 55 - 224
Target Start/End: Original strand, 15633451 - 15633621
Alignment:
Q  55 agcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-tagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaa 153  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15633451 agcacgaaattcaagaattgggttcattataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaagtgattatgataaa 15633550  T
Q  154 aactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattcttcaa 224  Q
     ||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15633551 gactaacctccttaccttaattatctccaactattaactctagcttcacttttgctcctatgattcttcaa 15633621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 9652953 - 9652796
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  9652953 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataaccacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 9652854  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 172  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  9652853 gaacaagaaaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 9652796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 21274106 - 21273955
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21274106 acatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 21274007  T
Q  115 gaa-caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctt 165  Q
    ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21274006 gaatcaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccctt 21273955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 171
Target Start/End: Original strand, 25213252 - 25213403
Alignment:
Q  22 aattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-tagaa-ca 119  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  25213252 aattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaatca 25213351  T
Q  120 agagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctt 171  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  25213352 agagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctt 25213403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 140 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19794661 - 19794546
Alignment:
Q  140 atgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattcttcaaacccttgaattcttc 239  Q
    ||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19794661 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcttatgattcttcaaacccttgaattcttc 19794562  T
Q  240 aagttcctcttctctc 255  Q
    ||||||||||||||||    
T  19794561 aagttcctcttctctc 19794546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 140 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20627270 - 20627151
Alignment:
Q  140 atgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattcttcaaacccttgaattcttc 239  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20627270 atgattatgataaagactaaccccgttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattcttcaaacccttgaattcttc 20627171  T
Q  240 aagttcctcttctctccaac 259  Q
    ||| | ||| ||| ||||||    
T  20627170 aagcttctcctctgtccaac 20627151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 140 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 43642913 - 43642798
Alignment:
Q  140 atgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattcttcaaacccttgaattcttc 239  Q
    |||||||||||||| ||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43642913 atgattatgataaagactaacctccttcccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattcttcaaacccttgaattcttc 43642814  T
Q  240 aagttcctcttctctc 255  Q
    |||||||| |||||||    
T  43642813 aagttcctattctctc 43642798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 96
Target Start/End: Original strand, 7321716 - 7321795
Alignment:
Q  17 catcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 96  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||  |||| |||| |||||||||||||||  |||||||||  ||| ||||||||||    
T  7321716 catcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaagttgggttcacaatagtcacttattc 7321795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 166319 - 166081
Alignment:
Q  18 atcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-taga 116  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  166319 atcaaattaacatattcaaacacatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcataga 166220  T
Q  117 acaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166219 acaagagaaaaagaattaactagatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 166120  T
Q  217 ttcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 255  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  166119 ttcttcaaaccattgaattcttcaagttcctcttctctc 166081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 162233 - 162036
Alignment:
Q  18 atcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-taga 116  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  162233 atcaaattaacatattcaaacacatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcataga 162134  T
Q  117 acaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 214  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  162133 acaagagaaaaagaattaactagatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 162036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 116485 - 116410
Alignment:
Q  138 aaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctccta 213  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| |||| |  |||| | ||||||||||| |||||||    
T  116485 aaatgattatgatgaaatctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 116410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Original strand, 42575 - 42789
Alignment:
Q  39 atatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-tagaacaagagaaaaagaattaact 137  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42575 atatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaact 42674  T
Q  138 aaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattcttcaaacccttgaattct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42675 aaatgattatgataaaaactaacccccttacctt---tatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattcttcaaacccttgaattct 42771  T
Q  238 tcaagttcctcttctctc 255  Q
    ||||||||||||||||||    
T  42772 tcaagttcctcttctctc 42789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 27 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 5923 - 5694
Alignment:
Q  27 acatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-tagaacaagagaa 125  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5923 acatattcaaacacatctctacaacagaagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaa 5824  T
Q  126 aaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattcttcaaa 225  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5823 aaagaattaactatatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctataattcttcaaa 5724  T
Q  226 cccttgaattcttcaagttcctcttctctc 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5723 cccttgaattcttcaagttcctcttctctc 5694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6140 - 5925
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6140 acatcaaattaacatattcaaacacatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 6041  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6040 gaacaagagaaaaagaattaactatatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 5941  T
Q  215 gattcttcaaaccctt 230  Q
     |||||||||||||||    
T  5940 aattcttcaaaccctt 5925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 30292 - 30532
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  30292 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcatgaatttcaaagatagggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 30391  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 214  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  30392 gaacaagagaaaaataattaactaaatgattatgatgaaaaataacccccttaccttaattatcaccaattattaactcaagcttcacttttgcttctat 30491  T
Q  215 gattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30492 gattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctc 30532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 508 - 298
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  508 acatcaaattaacatattcaaatatatctctacaacataagcacaaatttcaaatattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 409  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  408 gaacaagag-aaaagaattaactagatgattatgataaagaataaccccgttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctat 310  T
Q  215 gattcttcaaac 226  Q
    ||||||||||||    
T  309 gattcttcaaac 298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Original strand, 55779 - 55936
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  55779 acatcaaattaacatattcaaacatatatctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 55878  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  55879 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 55936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 108179 - 108075
Alignment:
Q  70 gattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-tagaa-caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactccttta 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||    
T  108179 gattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaatgaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaaccccctta 108080  T
Q  168 cctta 172  Q
    |||||    
T  108079 cctta 108075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 8)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 171
Target Start/End: Original strand, 11342883 - 11343039
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11342883 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 11342982  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctt 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11342983 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctt 11343039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Original strand, 2032008 - 2032165
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  2032008 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 2032107  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  2032108 gaacaagagaaaaagaattaactaaacgattatgatgaaaactaacccccttacctta 2032165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 159
Target Start/End: Original strand, 21205124 - 21205268
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21205124 acatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 21205223  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaa 159  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  21205224 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaa 21205268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Original strand, 21650893 - 21651050
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |    
T  21650893 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaactatgcaca 21650992  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 172  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||||||    
T  21650993 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaatattaacccccttacctta 21651050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 172
Target Start/End: Original strand, 16105847 - 16105999
Alignment:
Q  22 aattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-tagaa-ca 119  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  16105847 aattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaatca 16105946  T
Q  120 agagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 172  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  16105947 agagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 16105999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 141 - 255
Target Start/End: Original strand, 11584374 - 11584488
Alignment:
Q  141 tgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattcttcaaacccttgaattcttca 240  Q
    |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11584374 tgattatgatgaattctaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatgattattcacacccttgaattcttca 11584473  T
Q  241 agttcctcttctctc 255  Q
    |||||||||||||||    
T  11584474 agttcctcttctctc 11584488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 22662731 - 22662653
Alignment:
Q  17 catcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttatt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22662731 catcaaattaacatattcaaatatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcacaataatcacttatt 22662653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 96
Target Start/End: Original strand, 25005019 - 25005094
Alignment:
Q  21 aaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 96  Q
    ||||||||| | ||||| ||||  || | |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25005019 aaattaacacactcaaacatatcacttcaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcacaataatcacttattc 25005094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 6601 - 6443
Alignment:
Q  15 gacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-t 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |    
T  6601 gacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataagcacctattatcataatcaattatgcat 6502  T
Q  114 agaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  6501 agaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 6443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 12574 - 12418
Alignment:
Q  17 catcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-tag 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||    
T  12574 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacaaatttcaaagattgggttcatgataataacttattcccataatcaattatgcatag 12475  T
Q  116 aacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12474 aacaaaagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 12418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 17459 - 17316
Alignment:
Q  18 atcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-taga 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17459 atcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcactaatttcaaagattgggttcatgataatcaattattctcataatcaattatgcataga 17360  T
Q  117 acaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaac 160  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  17359 acaagagaaaaagaattacctaaatgattatgataaagactaac 17316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 10040 - 9882
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaa-ttatgc-t 113  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  10040 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattttcataatcaatttatgcat 9941  T
Q  114 agaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 172  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  9940 agaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 9882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 13443 - 13285
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13443 acatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 13344  T
Q  115 gaa-caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 172  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  13343 gaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 13285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 1035 - 878
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  1035 acatcaaattaacatattaaaacaaacctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 936  T
Q  115 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  935 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 4504 - 4346
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-ta 114  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  4504 acatcaaattaacatatttaaacatatctctacaacataagcactaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 4405  T
Q  115 gaa-caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 172  Q
    |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| || ||||||||    
T  4404 gaatgaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagtctaacccccttacctta 4346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 85 - 5
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 96  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 171
Target Start/End: Original strand, 130760 - 130911
Alignment:
Q  22 aattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-tagaa-ca 119  Q
    ||||||| ||| |||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  130760 aattaacgtatccaaacatatctctacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaatca 130859  T
Q  120 agagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctt 171  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  130860 agagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctt 130911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 56 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 193514 - 193396
Alignment:
Q  56 gcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-tagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaa 154  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  193514 gcacgaatttcaatgattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaag 193415  T
Q  155 actaactcctttaccttaa 173  Q
    |||||| || |||||||||    
T  193414 actaacccccttaccttaa 193396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 141 - 255
Target Start/End: Original strand, 1701 - 1815
Alignment:
Q  141 tgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattcttcaaacccttgaattcttca 240  Q
    |||||||||| || |||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1701 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatgattcttcaaacccttgaattcttca 1800  T
Q  241 agttcctcttctctc 255  Q
    |||||||||||||||    
T  1801 agttcctcttctctc 1815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 141 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15398 - 15284
Alignment:
Q  141 tgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattcttcaaacccttgaattcttca 240  Q
    |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15398 tgattatgatgaatgctaacccccttaccttaattatctccaactattagcccaagcttcacttttgctcctatgattcttcaaacccttgaattcttca 15299  T
Q  241 agttcctcttctctc 255  Q
    |||||||||||||||    
T  15298 agttcctcttctctc 15284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 141 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19881 - 19767
Alignment:
Q  141 tgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattcttcaaacccttgaattcttca 240  Q
    |||||||||| || |||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19881 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatgattcttcaaacccttgaattcttca 19782  T
Q  241 agttcctcttctctc 255  Q
    || ||||||||||||    
T  19781 agctcctcttctctc 19767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 141 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 24185 - 24071
Alignment:
Q  141 tgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattcttcaaacccttgaattcttca 240  Q
    |||||||||| || |||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24185 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcatttttgctcctatgattcttcaaacccttgaattcttca 24086  T
Q  241 agttcctcttctctc 255  Q
    || ||||||||||||    
T  24085 agctcctcttctctc 24071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 141 - 255
Target Start/End: Original strand, 94 - 208
Alignment:
Q  141 tgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattcttcaaacccttgaattcttca 240  Q
    |||||||||| || |||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  94 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctccaatgattattcaaacccttgaattcttca 193  T
Q  241 agttcctcttctctc 255  Q
    |||||||||||||||    
T  194 agttcctcttctctc 208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 141 - 255
Target Start/End: Original strand, 20493 - 20607
Alignment:
Q  141 tgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattcttcaaacccttgaattcttca 240  Q
    |||||||||| || |||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20493 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcatttttgctcctatgattcttcaaacccttgaattcttca 20592  T
Q  241 agttcctcttctctc 255  Q
    || ||||||||||||    
T  20593 agctcctcttctctc 20607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 141 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 6335 - 6221
Alignment:
Q  141 tgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattcttcaaacccttgaattcttca 240  Q
    |||||||||| || |||||| || |||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6335 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcacccactattaactcaagcttcacttttgctcctatgattattcaaacccttgaattcttca 6236  T
Q  241 agttcctcttctctc 255  Q
    ||||| |||||||||    
T  6235 agttcatcttctctc 6221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 15147 - 15236
Alignment:
Q  16 acatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatca 105  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15147 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacgacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatca 15236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 44170 - 44036
Alignment:
Q  17 catcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc-tag 115  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||  |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||    
T  44170 catcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattaggttcacaataatcacttattcaaataatcacttatgcatag 44071  T
Q  116 aacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgat 150  Q
     | |||||| ||  |||||||||| ||||||||||    
T  44070 caaaagagagaagaaattaactaagtgattatgat 44036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 96
Target Start/End: Original strand, 305 - 384
Alignment:
Q  17 catcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 96  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||  |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  305 catcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcaagaatttcaaagattgggttcacaataatcacttattc 384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 1557 - 1478
Alignment:
Q  17 catcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 96  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  1557 catcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcacaataatcatttattc 1478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3897 - 3732
Alignment:
Q  17 catcaaattaacatattcaaatatatat----ctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc 112  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||    |||| |||| |||||||||||||||  |||| ||||  ||||||||||||||  |||| || ||||||    
T  3897 catcaaattaacatactcaaacatatatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaagttggtttcacaataatcacttattcaaataagcacttatgc 3798  T
Q  113 -tagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatg-ataaaaactaactcctttaccttaatta 176  Q
     ||||| |||||| ||  || ||||||| ||||||||  | ||| ||||| ||||||||| |||||    
T  3797 atagaaaaagagagaagaaactaactaagtgattatgcttgaaatctaacccctttacctcaatta 3732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University