View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10757_high_3 (Length: 339)

Name: NF10757_high_3
Description: NF10757
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10757_high_3
NF10757_high_3
[»] chr8 (54 HSPs)
chr8 (22-329)||(26452325-26452635)
chr8 (22-328)||(24861344-24861653)
chr8 (22-329)||(2416915-2417224)
chr8 (77-329)||(41275394-41275649)
chr8 (24-293)||(15032232-15032499)
chr8 (35-327)||(41363658-41363952)
chr8 (22-329)||(43693137-43693448)
chr8 (70-293)||(33799503-33799726)
chr8 (70-326)||(38033877-38034136)
chr8 (70-293)||(42168912-42169135)
chr8 (24-329)||(485166-485472)
chr8 (24-327)||(34614955-34615262)
chr8 (22-293)||(43638580-43638852)
chr8 (70-329)||(40415257-40415519)
chr8 (70-329)||(40414610-40414870)
chr8 (39-329)||(44943001-44943295)
chr8 (77-329)||(28706101-28706356)
chr8 (116-329)||(41856972-41857188)
chr8 (22-182)||(22549232-22549389)
chr8 (116-329)||(18440293-18440509)
chr8 (116-329)||(42603454-42603670)
chr8 (116-328)||(19242160-19242375)
chr8 (116-328)||(19315344-19315559)
chr8 (153-326)||(26484580-26484756)
chr8 (123-293)||(40702399-40702569)
chr8 (28-327)||(31171727-31172028)
chr8 (215-329)||(22548263-22548380)
chr8 (28-277)||(3589175-3589425)
chr8 (22-105)||(24861817-24861900)
chr8 (195-326)||(16575695-16575829)
chr8 (22-105)||(44050914-44050997)
chr8 (23-104)||(26452800-26452881)
chr8 (22-105)||(2417447-2417530)
chr8 (24-105)||(484915-484996)
chr8 (26-105)||(15031981-15032060)
chr8 (26-105)||(41017405-41017484)
chr8 (25-105)||(38033581-38033661)
chr8 (26-105)||(40415736-40415815)
chr8 (24-97)||(28705805-28705878)
chr8 (26-91)||(40415087-40415152)
chr8 (24-105)||(42168615-42168696)
chr8 (26-105)||(22549557-22549636)
chr8 (26-105)||(43637420-43637499)
chr8 (35-105)||(18439951-18440021)
chr8 (43-100)||(16576152-16576209)
chr8 (35-100)||(28167326-28167391)
chr8 (22-62)||(2417388-2417428)
chr8 (35-98)||(41856635-41856698)
chr8 (35-98)||(42603939-42604002)
chr8 (116-158)||(26486847-26486889)
chr8 (27-142)||(16575870-16575983)
chr8 (35-98)||(40702849-40702912)
chr8 (29-100)||(41856391-41856462)
chr8 (35-100)||(26487161-26487226)
[»] chr1 (110 HSPs)
chr1 (22-329)||(51269792-51270102)
chr1 (22-328)||(29762127-29762436)
chr1 (22-329)||(44337225-44337535)
chr1 (22-329)||(27486596-27486906)
chr1 (22-329)||(44597691-44598001)
chr1 (22-329)||(29435963-29436273)
chr1 (22-293)||(49427416-49427686)
chr1 (22-293)||(13635204-13635474)
chr1 (24-327)||(35576331-35576638)
chr1 (22-329)||(39224102-39224413)
chr1 (70-329)||(42571730-42571992)
chr1 (24-298)||(45689143-45689418)
chr1 (70-329)||(12791227-12791489)
chr1 (70-293)||(48568358-48568581)
chr1 (77-293)||(39856867-39857083)
chr1 (24-293)||(19160346-19160613)
chr1 (70-327)||(49262942-49263202)
chr1 (69-293)||(21484597-21484820)
chr1 (70-293)||(46180234-46180458)
chr1 (22-329)||(27035223-27035534)
chr1 (35-329)||(14173676-14173974)
chr1 (115-329)||(35586928-35587145)
chr1 (70-293)||(47487991-47488214)
chr1 (70-318)||(3658474-3658725)
chr1 (22-293)||(41874789-41875061)
chr1 (78-293)||(50068221-50068436)
chr1 (116-329)||(38046434-38046650)
chr1 (75-326)||(30309791-30310039)
chr1 (116-293)||(36909590-36909767)
chr1 (124-329)||(24270371-24270579)
chr1 (45-329)||(6435762-6436050)
chr1 (116-329)||(17686361-17686577)
chr1 (116-293)||(13972953-13973130)
chr1 (116-293)||(49926380-49926557)
chr1 (116-297)||(37778104-37778285)
chr1 (116-329)||(18170015-18170231)
chr1 (111-326)||(48215191-48215409)
chr1 (35-326)||(49396697-49396992)
chr1 (116-293)||(23342670-23342847)
chr1 (116-326)||(35184963-35185177)
chr1 (116-329)||(17697036-17697252)
chr1 (128-293)||(35526189-35526354)
chr1 (70-291)||(49598845-49599049)
chr1 (68-293)||(13283734-13283957)
chr1 (78-293)||(5765235-5765449)
chr1 (110-327)||(18842431-18842651)
chr1 (116-329)||(41780683-41780899)
chr1 (28-293)||(17372756-17373019)
chr1 (66-293)||(24363752-24363977)
chr1 (79-196)||(29707504-29707621)
chr1 (22-105)||(29436437-29436520)
chr1 (24-142)||(22527687-22527803)
chr1 (22-99)||(27486355-27486432)
chr1 (22-101)||(29761826-29761905)
chr1 (24-105)||(44336978-44337059)
chr1 (24-105)||(47487694-47487775)
chr1 (26-105)||(49427854-49427933)
chr1 (191-276)||(13148365-13148450)
chr1 (24-105)||(19160783-19160864)
chr1 (24-105)||(22527973-22528054)
chr1 (24-105)||(49262654-49262735)
chr1 (26-105)||(30309490-30309569)
chr1 (24-102)||(3658940-3659018)
chr1 (27-105)||(50067916-50067994)
chr1 (76-327)||(16532051-16532304)
chr1 (24-105)||(45689587-45689668)
chr1 (24-105)||(46179937-46180018)
chr1 (159-291)||(16081316-16081448)
chr1 (26-105)||(48227006-48227085)
chr1 (116-206)||(40533286-40533376)
chr1 (26-105)||(29707196-29707275)
chr1 (26-105)||(39223856-39223934)
chr1 (26-105)||(51270270-51270349)
chr1 (24-105)||(49598545-49598629)
chr1 (26-105)||(13634956-13635036)
chr1 (26-105)||(27034975-27035055)
chr1 (26-105)||(41874543-41874622)
chr1 (26-85)||(46924958-46925017)
chr1 (26-105)||(48568063-48568142)
chr1 (52-121)||(48226760-48226831)
chr1 (24-100)||(12790936-12791012)
chr1 (24-100)||(17697487-17697563)
chr1 (40-108)||(21484432-21484500)
chr1 (35-100)||(35525860-35525925)
chr1 (24-100)||(18170493-18170569)
chr1 (35-100)||(17686021-17686086)
chr1 (22-62)||(29761924-29761964)
chr1 (25-97)||(42571442-42571514)
chr1 (125-220)||(19262422-19262517)
chr1 (35-98)||(49926046-49926108)
chr1 (36-98)||(38044857-38044919)
chr1 (35-100)||(14173421-14173486)
chr1 (35-100)||(17685779-17685844)
chr1 (35-100)||(24269786-24269851)
chr1 (35-100)||(24270028-24270093)
chr1 (35-100)||(36910038-36910103)
chr1 (35-100)||(37778557-37778622)
chr1 (47-100)||(49397134-49397187)
chr1 (47-98)||(6436262-6436313)
chr1 (41-100)||(18170669-18170728)
chr1 (47-98)||(23343130-23343181)
chr1 (37-100)||(24363475-24363538)
chr1 (29-100)||(35525617-35525688)
chr1 (29-100)||(49397359-49397430)
chr1 (28-98)||(18842924-18842994)
chr1 (35-100)||(12790693-12790758)
chr1 (47-100)||(13973414-13973467)
chr1 (35-100)||(17373202-17373267)
chr1 (47-100)||(35185461-35185514)
chr1 (44-100)||(13284188-13284244)
[»] chr4 (104 HSPs)
chr4 (26-326)||(39588922-39589225)
chr4 (26-327)||(9489671-9489974)
chr4 (22-326)||(1042744-1043049)
chr4 (22-329)||(28082228-28082537)
chr4 (24-329)||(21017088-21017394)
chr4 (24-329)||(40353684-40353990)
chr4 (22-297)||(21711555-21711831)
chr4 (75-327)||(25762590-25762845)
chr4 (24-293)||(55796772-55797039)
chr4 (22-329)||(37866396-37866708)
chr4 (24-329)||(41794473-41794779)
chr4 (70-329)||(51027722-51027984)
chr4 (70-329)||(51428147-51428409)
chr4 (24-329)||(6177226-6177532)
chr4 (22-329)||(49063969-49064280)
chr4 (24-329)||(56138900-56139206)
chr4 (70-328)||(14330649-14330910)
chr4 (70-293)||(31824584-31824807)
chr4 (24-329)||(49094735-49095041)
chr4 (22-329)||(242322-242633)
chr4 (40-293)||(20778795-20779047)
chr4 (70-326)||(20901623-20901882)
chr4 (40-326)||(32937829-32938116)
chr4 (27-326)||(45939518-45939822)
chr4 (75-293)||(1226188-1226406)
chr4 (79-329)||(33163508-33163761)
chr4 (116-329)||(26591686-26591902)
chr4 (24-275)||(27759374-27759626)
chr4 (116-329)||(22436901-22437117)
chr4 (116-329)||(34529797-34530013)
chr4 (22-293)||(46816431-46816701)
chr4 (117-329)||(34153288-34153503)
chr4 (35-329)||(21169441-21169739)
chr4 (116-329)||(43889500-43889716)
chr4 (116-329)||(49791937-49792153)
chr4 (119-328)||(2773000-2773212)
chr4 (116-329)||(47657356-47657572)
chr4 (116-293)||(957456-957633)
chr4 (113-326)||(6282321-6282537)
chr4 (35-328)||(49817563-49817860)
chr4 (40-327)||(24606744-24607032)
chr4 (116-293)||(36776520-36776697)
chr4 (77-327)||(17211258-17211511)
chr4 (116-329)||(4785423-4785639)
chr4 (116-329)||(44560181-44560397)
chr4 (116-327)||(42886255-42886472)
chr4 (116-293)||(49423759-49423936)
chr4 (110-327)||(3393296-3393516)
chr4 (76-297)||(10312297-10312517)
chr4 (77-293)||(18412624-18412839)
chr4 (117-293)||(11288324-11288499)
chr4 (28-293)||(31324203-31324467)
chr4 (110-283)||(13866302-13866475)
chr4 (75-329)||(13850739-13850995)
chr4 (22-105)||(1043213-1043296)
chr4 (26-105)||(28082705-28082784)
chr4 (24-105)||(56139376-56139457)
chr4 (26-105)||(21711999-21712078)
chr4 (24-105)||(6176975-6177056)
chr4 (24-105)||(21016837-21016918)
chr4 (24-105)||(45939993-45940074)
chr4 (25-104)||(20901335-20901414)
chr4 (26-100)||(49064449-49064523)
chr4 (24-105)||(27759795-27759876)
chr4 (24-105)||(49095211-49095292)
chr4 (24-101)||(55797209-55797286)
chr4 (26-105)||(39589397-39589476)
chr4 (26-105)||(46816183-46816262)
chr4 (23-105)||(40353433-40353515)
chr4 (24-98)||(51427858-51427932)
chr4 (26-105)||(38132778-38132857)
chr4 (24-105)||(25763066-25763147)
chr4 (26-91)||(51027439-51027504)
chr4 (24-100)||(14330358-14330434)
chr4 (24-87)||(31824305-31824368)
chr4 (34-105)||(37866884-37866955)
chr4 (35-100)||(34152950-34153015)
chr4 (35-100)||(34529460-34529525)
chr4 (40-108)||(32937581-32937649)
chr4 (41-100)||(24607212-24607271)
chr4 (35-98)||(26591581-26591644)
chr4 (47-98)||(49571599-49571650)
chr4 (24-82)||(1226545-1226603)
chr4 (70-170)||(17292114-17292213)
chr4 (24-100)||(41794227-41794303)
chr4 (47-98)||(2773499-2773550)
chr4 (35-98)||(22437389-22437452)
chr4 (29-100)||(42886738-42886809)
chr4 (76-199)||(49817159-49817281)
chr4 (27-96)||(242105-242173)
chr4 (68-105)||(885318-885355)
chr4 (35-100)||(21169929-21169994)
chr4 (55-100)||(36776183-36776228)
chr4 (47-100)||(43889165-43889218)
chr4 (44-100)||(49817307-49817363)
chr4 (29-100)||(34152708-34152779)
chr4 (45-96)||(49423425-49423476)
chr4 (47-98)||(49791602-49791653)
chr4 (68-102)||(37867024-37867058)
chr4 (55-100)||(4785088-4785133)
chr4 (35-100)||(14289864-14289929)
chr4 (28-96)||(17211760-17211829)
chr4 (54-98)||(957121-957165)
chr4 (35-91)||(42887000-42887056)
[»] chr7 (77 HSPs)
chr7 (22-328)||(40588542-40588851)
chr7 (22-329)||(45363157-45363458)
chr7 (22-293)||(17839354-17839625)
chr7 (69-328)||(34140858-34141120)
chr7 (24-329)||(20564751-20565057)
chr7 (22-329)||(39477144-39477455)
chr7 (75-291)||(41217647-41217863)
chr7 (69-290)||(18237598-18237819)
chr7 (78-293)||(48220705-48220918)
chr7 (24-293)||(10523099-10523367)
chr7 (70-329)||(47268891-47269152)
chr7 (77-291)||(30360550-30360763)
chr7 (116-329)||(48270640-48270856)
chr7 (70-293)||(17183243-17183469)
chr7 (79-329)||(20378665-20378918)
chr7 (116-293)||(41048814-41048991)
chr7 (24-240)||(9367029-9367243)
chr7 (116-329)||(21187298-21187514)
chr7 (66-327)||(21614710-21614973)
chr7 (116-326)||(36393823-36394036)
chr7 (70-232)||(2205990-2206152)
chr7 (116-329)||(15337904-15338120)
chr7 (116-293)||(48315179-48315356)
chr7 (119-329)||(46862196-46862409)
chr7 (116-329)||(43351099-43351314)
chr7 (116-293)||(30354814-30354991)
chr7 (70-328)||(2356282-2356543)
chr7 (116-329)||(42735255-42735470)
chr7 (113-327)||(21650518-21650735)
chr7 (74-327)||(1642545-1642800)
chr7 (116-329)||(28114392-28114608)
chr7 (155-326)||(28979060-28979234)
chr7 (24-211)||(13920419-13920604)
chr7 (22-158)||(34139332-34139467)
chr7 (177-329)||(26603265-26603420)
chr7 (70-171)||(26601731-26601832)
chr7 (26-105)||(17839780-17839859)
chr7 (22-105)||(40589015-40589098)
chr7 (27-105)||(17183688-17183766)
chr7 (24-105)||(9366778-9366859)
chr7 (28-105)||(10523541-10523618)
chr7 (79-188)||(17320163-17320272)
chr7 (24-105)||(18238034-18238115)
chr7 (24-105)||(20565227-20565308)
chr7 (25-105)||(13920775-13920855)
chr7 (22-130)||(28978956-28979065)
chr7 (22-105)||(45362910-45362993)
chr7 (208-329)||(13916825-13916949)
chr7 (24-103)||(30360985-30361064)
chr7 (31-105)||(26601435-26601509)
chr7 (22-99)||(34157032-34157108)
chr7 (24-105)||(48220401-48220482)
chr7 (26-105)||(34157276-34157354)
chr7 (26-105)||(41218084-41218163)
chr7 (228-329)||(42682948-42683052)
chr7 (24-105)||(34141334-34141415)
chr7 (26-105)||(39476898-39476977)
chr7 (35-100)||(15337567-15337632)
chr7 (70-170)||(3380628-3380727)
chr7 (40-100)||(21614447-21614507)
chr7 (33-105)||(28978872-28978944)
chr7 (33-100)||(21651001-21651068)
chr7 (35-100)||(10224547-10224612)
chr7 (35-100)||(21186961-21187026)
chr7 (35-100)||(28114055-28114120)
chr7 (35-100)||(46861856-46861921)
chr7 (47-100)||(48271140-48271193)
chr7 (35-98)||(30354479-30354542)
chr7 (35-100)||(20877471-20877536)
chr7 (29-102)||(42735693-42735766)
chr7 (110-170)||(11824847-11824907)
chr7 (116-220)||(28066359-28066463)
chr7 (47-98)||(36393489-36393540)
chr7 (35-100)||(17183936-17184001)
chr7 (35-100)||(21614122-21614187)
chr7 (35-100)||(28113813-28113878)
chr7 (122-170)||(18149681-18149729)
[»] chr6 (40 HSPs)
chr6 (22-329)||(29066547-29066857)
chr6 (22-329)||(29075560-29075870)
chr6 (22-329)||(29108134-29108444)
chr6 (22-329)||(29110531-29110842)
chr6 (24-329)||(27640174-27640480)
chr6 (24-329)||(6205478-6205784)
chr6 (27-293)||(11692484-11692748)
chr6 (22-329)||(801160-801468)
chr6 (75-293)||(35058693-35058911)
chr6 (39-329)||(13402527-13402821)
chr6 (35-329)||(32027545-32027843)
chr6 (116-329)||(32037686-32037902)
chr6 (116-286)||(12396816-12396986)
chr6 (116-329)||(34802895-34803111)
chr6 (79-293)||(14115070-14115283)
chr6 (147-293)||(22305829-22305975)
chr6 (116-267)||(30257578-30257729)
chr6 (24-188)||(24021006-24021168)
chr6 (24-188)||(2192535-2192697)
chr6 (75-196)||(3765745-3765867)
chr6 (22-105)||(29067021-29067104)
chr6 (22-105)||(29108608-29108691)
chr6 (24-105)||(6205954-6206035)
chr6 (24-105)||(11692921-11693002)
chr6 (24-105)||(27640650-27640730)
chr6 (26-105)||(35058392-35058471)
chr6 (24-100)||(801634-801710)
chr6 (24-105)||(24020755-24020836)
chr6 (35-98)||(12397258-12397321)
chr6 (24-105)||(2192867-2192942)
chr6 (35-100)||(13403297-13403362)
chr6 (117-164)||(35021237-35021284)
chr6 (35-100)||(32027047-32027112)
chr6 (35-100)||(32027290-32027355)
chr6 (35-100)||(32037106-32037171)
chr6 (35-100)||(32037349-32037414)
chr6 (70-170)||(17465289-17465388)
chr6 (29-100)||(4495600-4495671)
chr6 (54-105)||(14123102-14123153)
chr6 (35-98)||(35020901-35020964)
[»] chr3 (114 HSPs)
chr3 (22-329)||(43477061-43477371)
chr3 (22-328)||(49218641-49218950)
chr3 (77-329)||(49610493-49610748)
chr3 (77-329)||(51695566-51695821)
chr3 (70-327)||(34693243-34693503)
chr3 (22-328)||(13895774-13896084)
chr3 (75-327)||(44927469-44927724)
chr3 (22-293)||(42949924-42950196)
chr3 (24-329)||(2646785-2647091)
chr3 (24-329)||(3494938-3495244)
chr3 (24-329)||(49139963-49140269)
chr3 (24-329)||(54390446-54390752)
chr3 (24-293)||(2268403-2268670)
chr3 (22-326)||(24702176-24702483)
chr3 (24-291)||(34049772-34050037)
chr3 (24-329)||(4003996-4004302)
chr3 (24-329)||(46403007-46403313)
chr3 (27-293)||(39416857-39417124)
chr3 (45-329)||(47065691-47065978)
chr3 (22-293)||(48087456-48087728)
chr3 (24-293)||(36135051-36135317)
chr3 (75-293)||(42383094-42383312)
chr3 (70-317)||(19453182-19453432)
chr3 (70-329)||(25576545-25576806)
chr3 (70-329)||(53826649-53826911)
chr3 (24-268)||(50997456-50997698)
chr3 (78-293)||(42382314-42382529)
chr3 (70-328)||(44835440-44835701)
chr3 (116-329)||(46414333-46414549)
chr3 (116-326)||(34472075-34472288)
chr3 (116-329)||(51013277-51013493)
chr3 (116-293)||(41577949-41578126)
chr3 (116-326)||(51015284-51015497)
chr3 (116-329)||(30192542-30192758)
chr3 (116-329)||(55206883-55207099)
chr3 (116-327)||(34647266-34647480)
chr3 (116-329)||(2428491-2428707)
chr3 (116-329)||(41803906-41804122)
chr3 (116-326)||(45100464-45100677)
chr3 (116-329)||(52569408-52569623)
chr3 (116-293)||(37281495-37281672)
chr3 (121-329)||(43569914-43570125)
chr3 (116-328)||(49273404-49273619)
chr3 (116-296)||(42323388-42323568)
chr3 (116-329)||(14631449-14631665)
chr3 (116-329)||(47759890-47760106)
chr3 (116-293)||(7246137-7246314)
chr3 (116-293)||(10053274-10053447)
chr3 (118-326)||(36721390-36721601)
chr3 (77-327)||(6754210-6754463)
chr3 (45-327)||(7954209-7954496)
chr3 (28-297)||(8633275-8633539)
chr3 (116-329)||(50458690-50458906)
chr3 (117-325)||(6464345-6464556)
chr3 (70-293)||(774292-774514)
chr3 (110-293)||(27186991-27187174)
chr3 (110-326)||(33449144-33449351)
chr3 (117-237)||(46346612-46346732)
chr3 (24-105)||(50997868-50997949)
chr3 (77-287)||(20375843-20376052)
chr3 (24-105)||(2268152-2268233)
chr3 (24-105)||(4003745-4003826)
chr3 (24-105)||(25576248-25576329)
chr3 (24-105)||(34050207-34050288)
chr3 (24-105)||(46403483-46403564)
chr3 (24-105)||(49139712-49139793)
chr3 (24-105)||(54390922-54391003)
chr3 (26-105)||(42383534-42383613)
chr3 (27-105)||(11378634-11378712)
chr3 (70-293)||(25887562-25887786)
chr3 (24-105)||(44835144-44835225)
chr3 (26-98)||(19452811-19452883)
chr3 (25-105)||(36135488-36135568)
chr3 (26-105)||(13895527-13895606)
chr3 (26-105)||(24701929-24702008)
chr3 (24-105)||(2646534-2646615)
chr3 (24-105)||(3494687-3494768)
chr3 (24-100)||(37281934-37282010)
chr3 (77-208)||(18440873-18441003)
chr3 (77-208)||(19485947-19486077)
chr3 (26-105)||(34692947-34693026)
chr3 (26-105)||(44927946-44928025)
chr3 (110-329)||(14265412-14265631)
chr3 (24-97)||(36721053-36721126)
chr3 (22-102)||(49218396-49218477)
chr3 (25-105)||(47066170-47066248)
chr3 (35-100)||(41578397-41578462)
chr3 (26-105)||(39416604-39416683)
chr3 (33-100)||(27187803-27187870)
chr3 (35-98)||(52569073-52569136)
chr3 (54-100)||(46346274-46346320)
chr3 (35-100)||(7246586-7246651)
chr3 (35-100)||(14631937-14632002)
chr3 (35-100)||(34646929-34646994)
chr3 (35-100)||(49273895-49273960)
chr3 (35-98)||(30193030-30193093)
chr3 (29-100)||(45099894-45099965)
chr3 (47-98)||(45100139-45100190)
chr3 (55-100)||(2428999-2429044)
chr3 (47-100)||(8633027-8633080)
chr3 (45-102)||(36720754-36720811)
chr3 (61-105)||(43477556-43477600)
chr3 (47-91)||(43570414-43570458)
chr3 (54-98)||(51012951-51012995)
chr3 (54-97)||(46413999-46414042)
chr3 (35-98)||(51015769-51015832)
chr3 (35-100)||(10053048-10053113)
chr3 (35-100)||(34471738-34471803)
chr3 (47-100)||(42323052-42323105)
chr3 (247-326)||(15637031-15637113)
chr3 (45-100)||(25887273-25887329)
chr3 (54-98)||(41804413-41804457)
chr3 (29-97)||(51015998-51016066)
chr3 (35-99)||(55268650-55268713)
[»] chr2 (69 HSPs)
chr2 (27-329)||(39393885-39394190)
chr2 (77-329)||(3941731-3941986)
chr2 (24-329)||(3936970-3937276)
chr2 (75-293)||(10360154-10360372)
chr2 (24-329)||(43982850-43983156)
chr2 (24-293)||(17424822-17425089)
chr2 (24-329)||(12968205-12968514)
chr2 (22-329)||(42241000-42241311)
chr2 (24-293)||(29067762-29068029)
chr2 (77-327)||(5420465-5420718)
chr2 (70-293)||(42120045-42120268)
chr2 (116-329)||(35491629-35491845)
chr2 (22-329)||(16581816-16582129)
chr2 (24-293)||(22001867-22002134)
chr2 (68-326)||(29111155-29111415)
chr2 (24-293)||(29906615-29906885)
chr2 (117-329)||(10364634-10364849)
chr2 (77-329)||(22493265-22493520)
chr2 (22-291)||(32734682-32734952)
chr2 (116-329)||(19471630-19471846)
chr2 (116-327)||(27130505-27130719)
chr2 (35-329)||(2919279-2919577)
chr2 (116-327)||(37312491-37312705)
chr2 (116-329)||(41499090-41499306)
chr2 (45-297)||(17796034-17796281)
chr2 (116-329)||(34521680-34521896)
chr2 (116-329)||(6976832-6977046)
chr2 (66-326)||(33404012-33404273)
chr2 (110-327)||(6901962-6902182)
chr2 (116-268)||(40677371-40677523)
chr2 (22-137)||(39799772-39799886)
chr2 (201-329)||(34638960-34639090)
chr2 (22-189)||(18393486-18393655)
chr2 (110-293)||(20148151-20148334)
chr2 (178-293)||(39799900-39800015)
chr2 (184-293)||(18392070-18392179)
chr2 (26-105)||(8557380-8557459)
chr2 (24-105)||(17425259-17425340)
chr2 (26-105)||(39799525-39799604)
chr2 (24-105)||(3936719-3936800)
chr2 (27-104)||(10359854-10359931)
chr2 (24-105)||(22002304-22002385)
chr2 (26-101)||(18393823-18393898)
chr2 (70-220)||(27650378-27650527)
chr2 (28-105)||(42120488-42120565)
chr2 (24-105)||(22493743-22493824)
chr2 (45-174)||(43491602-43491732)
chr2 (70-170)||(31991887-31991986)
chr2 (26-105)||(16582297-16582376)
chr2 (33-98)||(35492114-35492179)
chr2 (26-96)||(32735120-32735191)
chr2 (29-100)||(34521162-34521233)
chr2 (40-105)||(29111600-29111665)
chr2 (70-170)||(18036113-18036212)
chr2 (28-170)||(15891555-15891697)
chr2 (35-98)||(43491932-43491995)
chr2 (208-282)||(16253520-16253594)
chr2 (35-100)||(6977318-6977383)
chr2 (47-100)||(10364296-10364349)
chr2 (77-174)||(16253607-16253703)
chr2 (35-96)||(19471297-19471358)
chr2 (35-100)||(24108218-24108283)
chr2 (27-100)||(33404485-33404558)
chr2 (45-105)||(29111704-29111764)
chr2 (54-98)||(41498755-41498799)
chr2 (29-100)||(19471045-19471116)
chr2 (35-98)||(34521407-34521470)
chr2 (35-100)||(5420863-5420928)
chr2 (116-197)||(18878633-18878714)
[»] chr5 (72 HSPs)
chr5 (22-329)||(8537943-8538252)
chr5 (22-329)||(11346698-11347007)
chr5 (22-293)||(30709626-30709896)
chr5 (77-329)||(541598-541853)
chr5 (24-329)||(7141-7447)
chr5 (24-329)||(19400352-19400661)
chr5 (70-327)||(1971356-1971616)
chr5 (24-329)||(19036586-19036892)
chr5 (22-293)||(38854186-38854455)
chr5 (24-329)||(8576053-8576359)
chr5 (24-293)||(28881019-28881286)
chr5 (24-287)||(27661289-27661550)
chr5 (70-329)||(3601330-3601592)
chr5 (76-293)||(11027805-11028022)
chr5 (116-327)||(1400304-1400518)
chr5 (116-329)||(4724076-4724292)
chr5 (116-329)||(18308249-18308465)
chr5 (103-293)||(40009556-40009746)
chr5 (110-327)||(33370645-33370865)
chr5 (116-329)||(35565261-35565476)
chr5 (22-206)||(7082336-7082521)
chr5 (116-290)||(6793388-6793562)
chr5 (116-329)||(36350316-36350523)
chr5 (147-293)||(35927470-35927616)
chr5 (158-329)||(3169593-3169766)
chr5 (116-251)||(1694859-1694994)
chr5 (45-171)||(3458940-3459066)
chr5 (24-188)||(22283704-22283866)
chr5 (113-293)||(17366735-17366915)
chr5 (24-105)||(6890-6971)
chr5 (24-105)||(19400830-19400911)
chr5 (24-105)||(40012083-40012164)
chr5 (27-105)||(1971835-1971913)
chr5 (24-105)||(8575802-8575883)
chr5 (24-105)||(19036335-19036416)
chr5 (24-105)||(27661038-27661119)
chr5 (26-105)||(3170002-3170081)
chr5 (26-105)||(8538420-8538499)
chr5 (26-105)||(30710064-30710143)
chr5 (26-105)||(38854623-38854702)
chr5 (24-105)||(3459257-3459338)
chr5 (27-108)||(3601811-3601892)
chr5 (70-174)||(17195316-17195419)
chr5 (24-105)||(28881456-28881536)
chr5 (28-108)||(33371099-33371179)
chr5 (153-327)||(2599210-2599387)
chr5 (216-293)||(3458864-3458941)
chr5 (26-98)||(11347175-11347247)
chr5 (27-105)||(22284039-22284116)
chr5 (110-174)||(12742819-12742883)
chr5 (77-170)||(18920885-18920977)
chr5 (26-100)||(7082689-7082763)
chr5 (246-318)||(1693381-1693456)
chr5 (35-100)||(18308737-18308801)
chr5 (110-174)||(12805637-12805701)
chr5 (27-97)||(1171616-1171685)
chr5 (54-100)||(6793141-6793187)
chr5 (28-98)||(17366398-17366468)
chr5 (35-100)||(35565748-35565813)
chr5 (47-100)||(36349990-36350043)
chr5 (29-100)||(1399727-1399798)
chr5 (125-220)||(19748169-19748263)
chr5 (29-100)||(25498796-25498867)
chr5 (54-100)||(1695286-1695332)
chr5 (28-98)||(10398260-10398330)
chr5 (70-108)||(40011830-40011868)
chr5 (35-100)||(1695510-1695575)
chr5 (28-96)||(12805974-12806043)
chr5 (35-100)||(20196555-20196620)
chr5 (54-99)||(25498503-25498547)
chr5 (35-100)||(35565991-35566056)
chr5 (35-98)||(34683592-34683656)
[»] scaffold0589 (2 HSPs)
scaffold0589 (70-327)||(2261-2521)
scaffold0589 (54-105)||(4784-4835)
[»] scaffold0176 (2 HSPs)
scaffold0176 (69-328)||(1783-2045)
scaffold0176 (24-105)||(2259-2340)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (22-317)||(17821-18119)
scaffold0192 (24-98)||(17581-17655)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (24-188)||(85462-85624)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (153-327)||(24899-25076)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (40-174)||(64099-64231)
scaffold0004 (204-329)||(63968-64095)
[»] scaffold0268 (2 HSPs)
scaffold0268 (24-188)||(14604-14766)
scaffold0268 (24-105)||(14936-15017)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (24-105)||(2423-2504)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (26-105)||(11420-11499)
[»] scaffold1700 (1 HSPs)
scaffold1700 (24-82)||(67-125)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (123-220)||(5453-5550)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 54)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 26452635 - 26452325
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26452635 gagcgaaatgtttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtatgacaattgttgcagttggaatacaccttaccctaactaatg 26452536  T
Q  122 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaac 221  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26452535 acgatcttctagcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaac 26452436  T
Q  222 atgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctct 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||     
T  26452435 atgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaaggtgttccaccctcc 26452336  T
Q  319 ttgtgtctctg 329  Q
    |||||||||||    
T  26452335 ttgtgtctctg 26452325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 22 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 24861653 - 24861344
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  24861653 gagcgaaatgcttgagtcatgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgcagatggaatgcaccttaccctaactaatg 24861554  T
Q  122 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaac 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  24861553 acgatcttctggcagaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcaatccaattgaacatgttgtgctcccaaaac 24861454  T
Q  222 atgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctct 318  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||     
T  24861453 atgctcgtcacattttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgatactctccccccgtcgagcgttggacgtttataccgaaggtgttccaccctcc 24861354  T
Q  319 ttgtgtctct 328  Q
    ||||||||||    
T  24861353 ttgtgtctct 24861344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 2417224 - 2416915
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2417224 gagcgaaatgcttgagtcctattgtttggcaggttt-aatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 2417126  T
Q  122 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaac 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  2417125 acgatcttctggtggaatcaagttgttgatgatatcttcggttgatctcatcaacgtcacctgcatatcgatcaactggaacatgttgtgctcccaaaac 2417026  T
Q  222 atgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctct 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||   || ||||||||||||||||||     
T  2417025 atgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgaaactctccccttgtcgaatgttggacgtttataccgaaggtgttccaccctcc 2416926  T
Q  319 ttgtgtctctg 329  Q
    |||||| ||||    
T  2416925 ttgtgtttctg 2416915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 77 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 41275649 - 41275394
Alignment:
Q  77 gtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatc 176  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41275649 gtaagacaattattgcagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaac 41275550  T
Q  177 gtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcc 276  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41275549 gtcacccgcatatcgatccattggaacatgttgtgctctcaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcc 41275450  T
Q  277 cctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctctg 329  Q
    |||||||||||||| || ||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41275449 cctcgtcgagcgtttgacgtttataccgaaggtgttccaccctccttgtgtctctg 41275394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 24 - 293
Target Start/End: Original strand, 15032232 - 15032499
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| | | |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15032232 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaaatgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 15032329  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacat 223  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15032330 gatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacat 15032429  T
Q  224 gctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15032430 gctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttgga 15032499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 35 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 41363952 - 41363658
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggc 134  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||  ||||| || ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41363952 gagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgcctcatccagaga-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctgga 41363854  T
Q  135 ggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41363853 ggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtaacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacat 41363754  T
Q  235 tttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctc 327  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||   || |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  41363753 tttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttagacgtgtataccgaacgtgttccaccctccttgtgtctc 41363658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 43693448 - 43693137
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcct-gttgtttggcaggtttgaatttatctcatt-caaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaa 119  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| | | |||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43693448 gagcgaaatgcttgagtccttgccgtttggcaagtttgaatt-accccatttcagaggtaagaaaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaa 43693350  T
Q  120 tgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaa 219  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43693349 tgacgatcttctggaggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaa 43693250  T
Q  220 acatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |  ||||||||| ||||||||||| ||   || |||| ||||||||||||    
T  43693249 acatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaattccacccaaatgaatgatatcctcccctcgccgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccct 43693150  T
Q  317 ctttgtgtctctg 329  Q
    | |||||||||||    
T  43693149 ccttgtgtctctg 43693137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 70 - 293
Target Start/End: Original strand, 33799503 - 33799726
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33799503 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 33799602  T
Q  170 cagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaa 269  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||     
T  33799603 cagcaacgttatccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgat 33799702  T
Q  270 actctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  33799703 actctcccctcgtcgagcgttgga 33799726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 70 - 326
Target Start/End: Original strand, 38033877 - 38034136
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  38033877 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttccggcggaatcaagctattgatgatatcttcagttgatct 38033976  T
Q  170 cagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaa 269  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  38033977 cagcaacgttacccgcatatcgatccactagaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaggtgaatgat 38034076  T
Q  270 actctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtct 326  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||   || |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  38034077 actctcccctcgtagagcgttgaacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtgtct 38034136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 70 - 293
Target Start/End: Original strand, 42168912 - 42169135
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42168912 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcatcttatcctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatct 42169011  T
Q  170 cagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaa 269  Q
    | ||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||     
T  42169012 ctgcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgttgttcgttaattccacccaagggaatgat 42169111  T
Q  270 actctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  42169112 actttcccctcgtcgagcgttgga 42169135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 24 - 329
Target Start/End: Original strand, 485166 - 485472
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  485166 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-acctcattcaaagg-aatacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 485263  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacat 223  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  485264 gatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcatccgcatatcgatccactagaacatgctgtgctcccaaaacat 485363  T
Q  224 gctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctcttt 320  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   || | || |||||||||| || ||    
T  485364 ggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgtgttccaccatcctt 485463  T
Q  321 gtgtctctg 329  Q
    |||||||||    
T  485464 gtgtctctg 485472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 24 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 34615262 - 34614955
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttggcaggtttgaatttatctcattcaa-aggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    |||||||||||||||| || | ||||| || ||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  34615262 gcgaaatgcttgagtcatggtcgtttgtcaagtttgaatt-accccatttaagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatt 34615164  T
Q  122 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaac 221  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  34615163 actatcttctggtggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcaatccactggatcatgttgtgctcccaaaac 34615064  T
Q  222 atgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctct 318  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||   || |||| |||||||||||||     
T  34615063 atgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaatttcacccaagtgaatgatactttcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcc 34614964  T
Q  319 ttgtgtctc 327  Q
    |||||||||    
T  34614963 ttgtgtctc 34614955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 293
Target Start/End: Original strand, 43638580 - 43638852
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgt-tgtttggcaggtttgaatttatctcatt-caaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||| | | |||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43638580 gagcgaaatgcttgagtcctggctatttggcaagtttgaatt-accccatttcagaggtaagacaattattgtagttggaatgcaccttaccctaactaa 43638678  T
Q  120 tgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaa 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43638679 tgacgatcttctggcgaaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacgcgcatatcgatgcactggaacatgttgtgctcccaaa 43638778  T
Q  220 acatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  43638779 acatgctcgtcacattttcgtcgttctttaactccacccaagtgaaggatactctcccctcgtcgagcgttgga 43638852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 70 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 40415519 - 40415257
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  40415519 ttcataggtaagagaattgttgtagttgaaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctgacggaatcaagctgttgatgatatcttaagttgatct 40415420  T
Q  170 cagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaa 269  Q
    || || ||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  40415419 caacaacgtcacctgcatatcgatccacgggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaattccacccaagtgaatgat 40415320  T
Q  270 actctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctctg 329  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  40415319 accctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtgtctctg 40415257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 70 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 40414870 - 40414610
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40414870 ttcagaggtaagagaattgttgtagttggaatgcaccttaccct--ctaatgacgatcttctggtggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatct 40414773  T
Q  170 cagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaa 269  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  40414772 cagcaacgtcacccgcatatcaatcaactgaaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaattccacccaagtgaatgat 40414673  T
Q  270 actctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctctg 329  Q
    || |||||||||||||| ||| || ||   || |||| |||||||||| || |||||||||||    
T  40414672 accctcccctcgtcgagtgttagacgtttataccgaacgtgttccaccttccttgtgtctctg 40414610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 39 - 329
Target Start/End: Original strand, 44943001 - 44943295
Alignment:
Q  39 cctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcg 135  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| || |||||  ||||  | | || || |||||||| |||||||||||    
T  44943001 cctgtcgtttggcaagtttgaatt-atctcattcaaacg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcatacattccgtacctaatgacaatcttctggcg 44943098  T
Q  136 gaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgtt 235  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44943099 gaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgtt 44943198  T
Q  236 ttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| ||||| |||| || |||||||||||    
T  44943199 ttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatatcgaacgtgttacaccatccttgtgtctctg 44943295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 77 - 329
Target Start/End: Original strand, 28706101 - 28706356
Alignment:
Q  77 gtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatc 176  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  28706101 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacaatcttctggcggaatcaagcggttgatgatatcttcagttgatctcaacaac 28706200  T
Q  177 gtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcc 276  Q
    || || ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||| ||||||||||| | |||||    
T  28706201 gttacacgcatatcgatccactaaaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgttgttctttaactccactcaagtgaatgatattctcc 28706300  T
Q  277 cctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||||||||||||||| ||   || |||| || |||||||||| ||| |||||||    
T  28706301 cctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgcgtctctg 28706356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Original strand, 41856972 - 41857188
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  41856972 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 41857071  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||    
T  41857072 caaaatatgctcgtcacattttcgtcgttcgttaattccacccaagttaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 41857171  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| || ||||||||    
T  41857172 ccctccttctgtctctg 41857188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 22 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 22549389 - 22549232
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22549389 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatacaccttaccctaactaatg 22549290  T
Q  122 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacc 182  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22549289 acgatcttctggcggaatcaa---gttgatgatatcttcagttgatgtcagcaacgtcacc 22549232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Original strand, 18440293 - 18440509
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  18440293 ctaatgacgatcttctcgcgtaatcaaacttttgatgatatcttcagtttatctcagcaacgtcaccctcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 18440392  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||    
T  18440393 taaaacatgctcgtcacgttttcatcgttcgttaattctacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 18440492  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| |||||||||||    
T  18440493 ccctccttgtgtctctg 18440509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 42603670 - 42603454
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  42603670 ctaatgacgatcttttggcggaatcaaacttttgatgatatattcggttgatttcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgatgtgctcc 42603571  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||   || |||| |||||||     
T  42603570 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgataccctcccctcgtcgagcattggacgtttataccgaacgtgttccg 42603471  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| || ||||||||    
T  42603470 ccctccttctgtctctg 42603454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 116 - 328
Target Start/End: Original strand, 19242160 - 19242375
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||| ||||||| |  |||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||    
T  19242160 ctaatgacaatcttctcgtagaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatcttagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtattcc 19242259  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||    
T  19242260 caaaacatgctcgtcacgtttttgtcgttccttaattacacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 19242359  T
Q  313 ccctctttgtgtctct 328  Q
    ||||| ||||||||||    
T  19242360 ccctccttgtgtctct 19242375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 116 - 328
Target Start/End: Original strand, 19315344 - 19315559
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||| ||||||| |  |||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||    
T  19315344 ctaatgacaatcttctcgtagaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatcttagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtattcc 19315443  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||    
T  19315444 caaaacatgctcgtcacgtttttgtcgttccttaattacacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 19315543  T
Q  313 ccctctttgtgtctct 328  Q
    ||||| ||||||||||    
T  19315544 ccctccttgtgtctct 19315559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 153 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 26484756 - 26484580
Alignment:
Q  153 atatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaatt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |  ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26484756 atatcttcagttgatctcagcaatgttatgcgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaatt 26484657  T
Q  253 ccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtct 326  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  26484656 ccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtgtct 26484580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 123 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 40702569 - 40702399
Alignment:
Q  123 cgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaaca 222  Q
    ||||||| ||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  40702569 cgatcttttggcggaatcaaacttttgatgatatattcagttgatctcagcaacgtcatccgcatatcgatccactggaacatgttttgttcccaaaaca 40702470  T
Q  223 tgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  40702469 tgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatattctcccttcgtcgaacgttgga 40702399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 327
Target Start/End: Original strand, 31171727 - 31172028
Alignment:
Q  28 aatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcatt-caaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgat 126  Q
    ||||||||||  |||||||||  || ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |  | || || || ||||| |||||    
T  31171727 aatgcttgagaactgttgtttaacaagtttgaatt-atctcatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaaggtgcatt-ccatacctaatcacgat 31171824  T
Q  127 cttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgct 226  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||| |  ||| ||| |    
T  31171825 cttctggcggaatcaaactgttgataatattttcagttgatctcagcaacgtcacccacatatcgatccacggtaacatgctgtgcttctgaaaaatgtt 31171924  T
Q  227 cgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtg 323  Q
     |||| ||  ||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| ||||||| ||   || |||| || |||||||||| |||||    
T  31171925 tgtcatgtcgtcgtcgttcattaattccacccaactgaatgatattctcccatcgtcgaacgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtg 31172024  T
Q  324 tctc 327  Q
    ||||    
T  31172025 tctc 31172028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 215 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 22548380 - 22548263
Alignment:
Q  215 ccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| |||||||    
T  22548380 ccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcatttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatatcgaatgtgttcc 22548281  T
Q  312 accctctttgtgtctctg 329  Q
    |||||| |||||||||||    
T  22548280 accctccttgtgtctctg 22548263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 3589175 - 3589425
Alignment:
Q  28 aatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaa---aggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacg 124  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||  |   ||||||||||||||||| |||| ||| |  | || ||||| ||||| |||    
T  3589175 aatgcttgagaactgttgtttagcaagtttgaatt-atctcatttcagagaggtaagacaattgttgtagtttgaaggtgcatt-ccctacctaatcacg 3589272  T
Q  125 atcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatg 224  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| ||  || || ||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  3589273 atcttctggcggaatcaaactgttgataatgtcttcagttgatctcaacaatgttacacgcatatcgatccactggaacatcctgtgctcccaaaacatg 3589372  T
Q  225 ctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctccc 277  Q
    | | ||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  3589373 cccatcacgttatcgtcgttcattaattccacccaactgaatgatattctccc 3589425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 105
Target Start/End: Original strand, 24861817 - 24861900
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24861817 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggaaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 24861900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 195 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16575829 - 16575695
Alignment:
Q  195 cactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggat 294  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  16575829 cactggaacatgttgtggtcccaaaacatgctcatcccgttttcgttgttcgttaattccacccaactgaatgaaactctcctctcgtcgagcgttggac 16575730  T
Q  295 gt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtct 326  Q
    ||   || |||| || |||||||||| ||||||||    
T  16575729 gtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtct 16575695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 105
Target Start/End: Original strand, 44050914 - 44050997
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  44050914 gagcgaaatgcttgagtcttgttgtttgacaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgtggcagttggaatgcac 44050997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 104
Target Start/End: Original strand, 26452800 - 26452881
Alignment:
Q  23 agcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgca 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26452800 agcgaaatgcttgagtcatgttgtttgacaggtttgaatttatctcattaaaaggtaagacaattgttgcagttggaatgca 26452881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 105
Target Start/End: Original strand, 2417447 - 2417530
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  2417447 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagttttaatttatctcattcaaaggtaagacaattgtggcagttggaatgcac 2417530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 484996 - 484915
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  484996 gcgaaatgcttgagtcctgttgttttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcac 484915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 15032060 - 15031981
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  15032060 gaaatgcttgagtcgtgttgttttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgcagttggaatgcac 15031981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 41017484 - 41017405
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  41017484 gaaatgctcgagtcctgttgtttgacaggattgaatctatctcattcaaaggtaagacaattgttgtagttgaaatgcac 41017405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 38033661 - 38033581
Alignment:
Q  25 cgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38033661 cgaaatgtttgagtcctgttgtttggtaagtttgaatttactacattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 38033581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Original strand, 40415736 - 40415815
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40415736 gaaatgtttgagtgatgttgtttggcaggtttgaatttaccctattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 40415815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 28705878 - 28705805
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttg 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28705878 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaattttccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttg 28705805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 91
Target Start/End: Original strand, 40415087 - 40415152
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttg 91  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  40415087 gaaatgattgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttaccctattcaaaggtaagacaattgttg 40415152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 42168696 - 42168615
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || | ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  42168696 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaagtttgactgtaccccattcgaaggtaggacaattgttgtagttggaatgcac 42168615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Original strand, 22549557 - 22549636
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22549557 gaaatgtttgagtcctgctgtttggcaagtttgaattgaccccatttaaaggtaagacaattgttgcagttggaatgcac 22549636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 43637499 - 43637420
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||    
T  43637499 gaaatgtttgagtcttgttgtttggcaggtttgaatttaccgcattcaaaggtaaggcaattgttatagttgaaatgcac 43637420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 18440021 - 18439951
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18440021 gagtcctgctgcttggcaagtttgaatttacctcattcaaagataagacaattgttgtagttggaaggcac 18439951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 100
Target Start/End: Original strand, 16576152 - 16576209
Alignment:
Q  43 ttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16576152 ttgtttggcaagtttgaatttacctcattcaaaggtaagataattgttgtagttggaa 16576209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Original strand, 28167326 - 28167391
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  28167326 gagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaa 28167391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 62
Target Start/End: Original strand, 2417388 - 2417428
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatt 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2417388 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggcttgaatt 2417428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 41856698 - 41856635
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgg 98  Q
    |||||||| || |||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41856698 gagtcctgctgcttggtaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttgg 41856635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 98
Target Start/End: Original strand, 42603939 - 42604002
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgg 98  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  42603939 gagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttgg 42604002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 26486889 - 26486847
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatct 158  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  26486889 ctaatgacgatcttctgacggaatcaagctgttgatgatatct 26486847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 16575983 - 16575870
Alignment:
Q  27 aaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgat 126  Q
    ||||||||| |  |||| |||||||| || |||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  | || ||||  ||||| ||||     
T  16575983 aaatgcttgggaactgtcgtttggcaagtatgaatt-acctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcatttccctgcctaatcacgaa 16575886  T
Q  127 cttctggcggaatcaa 142  Q
    ||||||||||||||||    
T  16575885 cttctggcggaatcaa 16575870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 98
Target Start/End: Original strand, 40702849 - 40702912
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgg 98  Q
    ||||| ||||| |||| | ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  40702849 gagtcatgttgcttggaaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttgg 40702912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 41856462 - 41856391
Alignment:
Q  29 atgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||  | ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  41856462 atgctggagtcctgttgtttagcaagtttgaattttccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaa 41856391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Original strand, 26487161 - 26487226
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  26487161 gagtcctgctgcttggcaagtttgaatttacccaattcaaaggtaagataaatgttgcagttggaa 26487226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 110)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 51270102 - 51269792
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51270102 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttagcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 51270003  T
Q  122 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  51270002 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatcccagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaac 51269903  T
Q  222 atgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctct 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||  |||||||||||||||||     
T  51269902 atgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaactgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacagaaggtgttccaccctcc 51269803  T
Q  319 ttgtgtctctg 329  Q
    |||||||||||    
T  51269802 ttgtgtctctg 51269792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 22 - 328
Target Start/End: Original strand, 29762127 - 29762436
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29762127 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 29762226  T
Q  122 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaac 221  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29762227 atgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatattttcagttgatctcatcaacgtcacccgtatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaac 29762326  T
Q  222 atgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctct 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||     
T  29762327 atgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaaggtgttccaccctcc 29762426  T
Q  319 ttgtgtctct 328  Q
    ||||||||||    
T  29762427 ttgtgtctct 29762436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Original strand, 44337225 - 44337535
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  44337225 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgcatttgaaatgcaccttaccctaactaatg 44337324  T
Q  122 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaac 221  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  44337325 acgatcttctggcggaatcatattgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatgttgtgcacccaaaac 44337424  T
Q  222 atgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctct 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||||||||||||||| ||     
T  44337425 atgctcgtcacgttttcgtcgtttgtgaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaaggtgttccaccatcc 44337524  T
Q  319 ttgtgtctctg 329  Q
    |||||||||||    
T  44337525 ttgtgtctctg 44337535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Original strand, 27486596 - 27486906
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27486596 gagcggaatgcttgagttctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattaaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatg 27486695  T
Q  122 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaac 221  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27486696 acgatcttcaggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccaatggaacatgttgtgctcccaaaac 27486795  T
Q  222 atgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctct 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   || |||||||| || ||||||     
T  27486796 atgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaattaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaaggtgatctaccctcc 27486895  T
Q  319 ttgtgtctctg 329  Q
    |||||||||||    
T  27486896 ttgtgtctctg 27486906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 44598001 - 44597691
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44598001 gagcgaaatgcaaaagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcactttaccctaactaatg 44597902  T
Q  122 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaac 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  44597901 acgatcttccggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcatcaacgtcacccacatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaac 44597802  T
Q  222 atgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctct 318  Q
    || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||     
T  44597801 atactcatcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaaggtgttccaccctcc 44597702  T
Q  319 ttgtgtctctg 329  Q
    |||||||||||    
T  44597701 ttgtgtctctg 44597691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 29436273 - 29435963
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29436273 gagcgaaatgcttgagtcatgttgtttggcaggtttgaatttatttcattcaaaggtaagaaaattgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaatg 29436174  T
Q  122 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaac 221  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  29436173 acgatcttctggcttaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcgtatcgatccactggaacatgctgtactcccaaaac 29436074  T
Q  222 atgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctct 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||   || |||| |||||||||||||     
T  29436073 atgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccatcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcc 29435974  T
Q  319 ttgtgtctctg 329  Q
    |||||||||||    
T  29435973 ttgtgtctctg 29435963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 22 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 49427686 - 49427416
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49427686 gagcgaaatgctcgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatg 49427588  T
Q  122 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaac 221  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49427587 acgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaac 49427488  T
Q  222 atgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49427487 atgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccgcccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttgga 49427416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 22 - 293
Target Start/End: Original strand, 13635204 - 13635474
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13635204 gagcgaaatgctcgagtcctgttgtttggcaggtttaaattgatctcattcaaagg-aagacaattgttgtggttggaatgcaccttaccctaactaatg 13635302  T
Q  122 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaac 221  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13635303 acgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaaccaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaac 13635402  T
Q  222 atgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13635403 atggtcgtgacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttgga 13635474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 24 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 35576638 - 35576331
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttggcaggtttgaatttatctcatt-caaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||| ||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35576638 gcgaaatgcttgagtcatggccgtttggcaagtttgaatt-acctcatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatg 35576540  T
Q  122 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaac 221  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  35576539 acgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccaccggaacatgctgtgctcccaaaac 35576440  T
Q  222 atgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctct 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||   || |||| |||||||||||||     
T  35576439 atgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatattctcccctcatcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcc 35576340  T
Q  319 ttgtgtctc 327  Q
    |||||||||    
T  35576339 ttgtgtctc 35576331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Original strand, 39224102 - 39224413
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttggcaggtttgaatttatctcatt-caaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| | | |||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39224102 gagcgaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaatt-accccatttcagaggtaagagaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaa 39224200  T
Q  120 tgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaa 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39224201 tgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatatttagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaa 39224300  T
Q  220 acatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccct 316  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| || ||   || |||| ||||||||||||    
T  39224301 acatgctcgtcacgttttcgtcattctttaattccacccaagtgaatgataccctcccctcgttgagcgttagacgtttataccgaacgtgttccaccct 39224400  T
Q  317 ctttgtgtctctg 329  Q
    | |||||||||||    
T  39224401 ccttgtgtctctg 39224413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 70 - 329
Target Start/End: Original strand, 42571730 - 42571992
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42571730 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccttaagtaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 42571829  T
Q  170 cagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaa 269  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||     
T  42571830 cagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgat 42571929  T
Q  270 actctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctctg 329  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||   || |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  42571930 actctcccctcgtcgagcattggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtgtctctg 42571992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 24 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 45689418 - 45689143
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcct-gttgtttggcaggtttgaatttatctca-ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||| ||||||| |||||  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45689418 gcgaaatgcttgagtcatggccgtttggcaagtttgaa-ttatccaatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatg 45689320  T
Q  122 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaac 221  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45689319 acgatcttatggcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatccatccactggaacatgttgtgctcccaaaac 45689220  T
Q  222 atgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgtta 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  45689219 atgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatattctccccccgtcgagcgttggacgtta 45689143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 70 - 329
Target Start/End: Original strand, 12791227 - 12791489
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  12791227 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttatcctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 12791326  T
Q  170 cagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaa 269  Q
    ||  | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  12791327 caaaaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctccaaaaaaatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgat 12791426  T
Q  270 actctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctctg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  12791427 actctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctacttgtgtctctg 12791489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 70 - 293
Target Start/End: Original strand, 48568358 - 48568581
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48568358 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacaatcttctggcgaaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 48568457  T
Q  170 cagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaa 269  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||| |||||||||||||||||     
T  48568458 cagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcatcattctttaactccacccaagtgaatgat 48568557  T
Q  270 actctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  48568558 attctcccctcgtcgagcgttgga 48568581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 77 - 293
Target Start/End: Original strand, 39856867 - 39857083
Alignment:
Q  77 gtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatc 176  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39856867 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcagaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaac 39856966  T
Q  177 gtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcc 276  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  39856967 gtcacccgcatatcgatccactggaacatgtcgtgctcccaaaacatgatcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtggatgatactctcc 39857066  T
Q  277 cctcgtcgagcgttgga 293  Q
    ||||||||||| |||||    
T  39857067 cctcgtcgagcattgga 39857083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 24 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 19160613 - 19160346
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19160613 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 19160516  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacat 223  Q
     ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  19160515 aatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgttcccaaaacat 19160416  T
Q  224 gctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  19160415 agtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctccccttgtcaagcgttgga 19160346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 327
Target Start/End: Original strand, 49262942 - 49263202
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49262942 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccataactaatgaagatattctagaggaatcaagatgttgatgatatcttcagttgatct 49263041  T
Q  170 cagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaa 269  Q
    || || ||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  49263042 caacaacgttaccagcatatagatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcttttgttaattccactcaagtgaatgat 49263141  T
Q  270 actctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctc 327  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   || |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  49263142 actctcccctcgttgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctacttgtgtctc 49263202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 69 - 293
Target Start/End: Original strand, 21484597 - 21484820
Alignment:
Q  69 attcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatc 168  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  21484597 attcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctacctaatgacgatcttctggtgaaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatc 21484695  T
Q  169 tcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatga 268  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21484696 tcagcaacgtcactcgcatatcgatccactggaacatgttgtgctccaaaaacatgctcgtcacattttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatga 21484795  T
Q  269 aactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  21484796 tactctcccctcgtcgagcgttgga 21484820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 70 - 293
Target Start/End: Original strand, 46180234 - 46180458
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  46180234 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcagaatcaagctgttgatgatatcttcaattgatct 46180333  T
Q  170 cagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccaccca-agtgaatga 268  Q
    || || ||| |||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||    
T  46180334 caacaacgttacccacatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccagagtgaatga 46180433  T
Q  269 aactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  46180434 tactctcccctcgtcgagcgttgga 46180458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Original strand, 27035223 - 27035534
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgt-tgtttggcaggtttgaatttatctcatt-caaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaa 119  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27035223 gagcgaaatgtttgagtcctggctgtttggcaagtttgaatt-accccatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttatcctaactaa 27035321  T
Q  120 tgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaa 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| || ||| ||| ||||||||    
T  27035322 tgacgatcttctggtggaatcaagttgttgatgatatcttaagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaatatggtgttctcccaaa 27035421  T
Q  220 acatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccct 316  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||   || || | || |||||||||    
T  27035422 acatactcgtcacgttttcgtcattctttaactccacccaagtgaatgatacccttccctcgtcgagcgttggacgtttataccggacgtattccaccct 27035521  T
Q  317 ctttgtgtctctg 329  Q
    | |||||||||||    
T  27035522 ccttgtgtctctg 27035534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 35 - 329
Target Start/End: Original strand, 14173676 - 14173974
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttct 131  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| || |||||  ||||  | |||| || ||||||||||||||||    
T  14173676 gagtcctgccgtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcattcataccgtacctaatgacgatcttct 14173773  T
Q  132 ggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtca 231  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14173774 ggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtcctcccaaaacatgctcgtca 14173873  T
Q  232 cgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctct 328  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||   || |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  14173874 cgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatattctcccctcatcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtgtctct 14173973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 115 - 329
Target Start/End: Original strand, 35586928 - 35587145
Alignment:
Q  115 actaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  35586928 actaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaaggtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctc 35587027  T
Q  215 ccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcc 311  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || |||| |||||||    
T  35587028 ccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcc 35587127  T
Q  312 accctctttgtgtctctg 329  Q
    |||||| |||||||||||    
T  35587128 accctccttgtgtctctg 35587145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 70 - 293
Target Start/End: Original strand, 47487991 - 47488214
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  47487991 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccataactaatgacgatcttctggcgaaatcaagctgttgatgacatcttcagttgatct 47488090  T
Q  170 cagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaa 269  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||| |||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||     
T  47488091 cagcaacgttacccgcatatcgatcaactagaaaatattgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgat 47488190  T
Q  270 actctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  47488191 attctcccctcgtcgagcgttgga 47488214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 3658725 - 3658474
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  3658725 ttcagaggtaagacgattgttgtagttggaatgcaccttaccctacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 3658626  T
Q  170 cagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaa 269  Q
    ||||| ||| ||  |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  3658625 cagcaacgttacttgcatatcgatccactagaacatgttgtgctcccaaaacacgttcgtcacgtttttgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgat 3658526  T
Q  270 actctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctct 318  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||||||||    
T  3658525 actctctcctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctct 3658474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 293
Target Start/End: Original strand, 41874789 - 41875061
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttggcaggtttgaatttatctcatt-caaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaa 119  Q
    |||| ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  41874789 gagcaaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaatt-accccatttcagaggtaagacaattgttgtagtttgaatgcaccttaccctaactaa 41874887  T
Q  120 tgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaa 219  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  41874888 taacgatcttctggcggaatcaagttgctaatgatatctttagttgatctcagcaacattacccgcatatcgatccactagaacatgttgtgctcccaaa 41874987  T
Q  220 acatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  41874988 acatgctcgtcacattttcgtcgttatttaactccacccaagtgaatgatactctcccctcttcgagcattgga 41875061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 78 - 293
Target Start/End: Original strand, 50068221 - 50068436
Alignment:
Q  78 taagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcg 177  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  50068221 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttactctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagctgttgacgatatcttcagttgatctcagcaacg 50068320  T
Q  178 tcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctccc 277  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  50068321 ttacccgcatatcgatccactggaacatgatgtgctcccaaaacatgttcgtcacatttttgtcgttctttaaatccacccaagtgaatgatactctcca 50068420  T
Q  278 ctcgtcgagcgttgga 293  Q
    ||||||||| ||||||    
T  50068421 ctcgtcgagtgttgga 50068436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Original strand, 38046434 - 38046650
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  38046434 ctaatgacgatcttctggtggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcaccggcatattgatcgactggaacatgttgtgctcc 38046533  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||    
T  38046534 caaaacatgcttgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 38046633  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| |||||||||||    
T  38046634 ccctccttgtgtctctg 38046650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 75 - 326
Target Start/End: Original strand, 30309791 - 30310039
Alignment:
Q  75 aggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagca 174  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||          
T  30309791 aggtaagataattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagctgttgatgatatattcagttgatc------ 30309884  T
Q  175 tcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactct 274  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||    
T  30309885 tcgtcacccgcatatcgatccactgaaacgtcctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaattccacccaagtgaatgataccct 30309984  T
Q  275 cccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtct 326  Q
    |||| ||||||| |||||| ||   || |||| ||||||||||||| || |||||    
T  30309985 ccccccgtcgagtgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttatgtct 30310039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 116 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 36909767 - 36909590
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  36909767 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 36909668  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  36909667 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatgctcttccctcgtcgagcgttgga 36909590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 124 - 329
Target Start/End: Original strand, 24270371 - 24270579
Alignment:
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacat 223  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24270371 gatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcctaaaacat 24270470  T
Q  224 gctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctcttt 320  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||   || |||| ||||||||||||| ||    
T  24270471 gctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcatcgagtgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcctt 24270570  T
Q  321 gtgtctctg 329  Q
    |||||||||    
T  24270571 gtgtctctg 24270579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 6436050 - 6435762
Alignment:
Q  45 gtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatca 141  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| || |||||  ||||  | | || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  6436050 gtttggcaagtttgaatt-acctcattcaaagg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatca 6435953  T
Q  142 agttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtc 241  Q
    |  | ||||||||||||||| ||||||||| || |||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6435952 aacttttgatgatatcttcacttgatctcaacaacgtcactcacatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacttgctcgtcacgttttcgtc 6435853  T
Q  242 gtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || |||| || |||||||||| |||||||||||    
T  6435852 gttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgttttccaccctccttgtgtctctg 6435762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Original strand, 17686361 - 17686577
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  17686361 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagctacgtcacccgcatatcgatccactggaagatgttgtgctcc 17686460  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || |||| |||||| |    
T  17686461 caaaacatgctcttcacgttttcgtcattcgttaattcaacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcta 17686560  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| |||||||||||    
T  17686561 ccctccttgtgtctctg 17686577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 116 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13973130 - 13972953
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13973130 ctaatgacgatcttatggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaatgtcacccgcatattgatccactggaacatgttgtgctcc 13973031  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  13973030 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctagtcgagtgttgga 13972953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 116 - 293
Target Start/End: Original strand, 49926380 - 49926557
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  49926380 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacctgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 49926479  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49926480 caaaacatgctcctcacgttttcgtcgttcgttaattccgcacaagtgaatgacactctcccctcgtcgagcgttgga 49926557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 116 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 37778285 - 37778104
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||    
T  37778285 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatcaactggaacatgttgttctcc 37778186  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgtt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  37778185 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtcctttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcaagcgttggttgtt 37778104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 18170231 - 18170015
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||    
T  18170231 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacctttgatgatatcttcagttgagctcagcaatgtcacccgcatatcgatctactggaacatgatgtgctcc 18170132  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||   || |||| ||||||||    
T  18170131 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttgaacgtttataccgaacgtgttcca 18170032  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| |||||||||||    
T  18170031 ccctccttgtgtctctg 18170015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 111 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 48215409 - 48215191
Alignment:
Q  111 cctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgt 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  48215409 cctaactaatgactatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgt 48215310  T
Q  211 gctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtg 307  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || |||| |||    
T  48215309 gctccaaaaatatgctcgtcatgttttcgtcgttcgttaattccactcaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtg 48215210  T
Q  308 ttccaccctctttgtgtct 326  Q
    ||||||| || ||||||||    
T  48215209 ttccaccatccttgtgtct 48215191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 49396992 - 49396697
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttct 131  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| || |||||  ||||  | | || || ||||||||||||||||    
T  49396992 gagtcatgtcgtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccatacctaatgacgatcttct 49396895  T
Q  132 ggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtca 231  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49396894 ggcggaatcaaacttttgttgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcaatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtca 49396795  T
Q  232 cgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtct 326  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| ||   || |||| ||||||||||||| || |||||    
T  49396794 cgttttcgttgttcgttaattccactcaagtgaatgatactctcccctcgtaaatcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttatgtct 49396697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 116 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23342847 - 23342670
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  |||||  ||||||||    
T  23342847 ctaatgacgatcttctggaggaatcaaacttttgatgatatcttcagtttatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactcgaacataatgtgctcc 23342748  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23342747 aaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattcaacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttgga 23342670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 116 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 35185177 - 35184963
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  35185177 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatttcagcaacgtcacctgcatatcgatccactggaacatgccgtgctcc 35185078  T
Q  216 c-aaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcc 311  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || |||| |||||||    
T  35185077 ccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccatcaaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcc 35184978  T
Q  312 accctctttgtgtct 326  Q
    |||||| ||||||||    
T  35184977 accctccttgtgtct 35184963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 17697252 - 17697036
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  17697252 ctaatcacgatcttctggcggaatcagactcttgataatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 17697153  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||| || || |||| ||||||| ||||| ||   || | || ||||||||    
T  17697152 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtactttaactccacccaagtgaatgataccctacccttgtcgagcattggacgtttataccaaacgtgttcca 17697053  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| || ||||||||    
T  17697052 ccctccttatgtctctg 17697036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 128 - 293
Target Start/End: Original strand, 35526189 - 35526354
Alignment:
Q  128 ttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctc 227  Q
    |||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||    
T  35526189 ttctagcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgcaacattctgtgctcccaaaacatggtc 35526288  T
Q  228 gtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  35526289 gtctcgttttcgacgttcgttaattccacccaggtgaatgatactctctcctcgtcgagcgttgga 35526354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 70 - 291
Target Start/End: Original strand, 49598845 - 49599049
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                ||||    
T  49598845 ttcagaggtaagacgattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttg----------------atct 49598928  T
Q  170 cagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaa 269  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||     
T  49598929 cagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgcttgtcacg-tttcgtcattctttaactccactcaagtgaatgat 49599027  T
Q  270 actctcccctcgtcgagcgttg 291  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  49599028 actctcccctcgtcgagtgttg 49599049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 68 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13283957 - 13283734
Alignment:
Q  68 cattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgat 167  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  | || | ||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| |||| ||||||||||    
T  13283957 cattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcatt-ctctacctaatcacgatcttctggcggaatcagactgttgataatatattcagttgat 13283860  T
Q  168 ctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatg 267  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| | ||||    
T  13283859 ctcagcaacgttacctgcatatcgatccactagaacatgctgcgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcatcgttcgttaatttcacccaactaaatg 13283760  T
Q  268 aaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  13283759 atactctcccctcgtcgagcgttgga 13283734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 78 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5765449 - 5765235
Alignment:
Q  78 taagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcg 177  Q
    |||||||||||||| |||||||| |  | || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    |||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  5765449 taagacaattgttgtagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcagacggttgataatatcttcatttgatctcagcaacg 5765351  T
Q  178 tcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctccc 277  Q
    | |||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||| ||    
T  5765350 ttacccgcatatcgatccactagaacatgttctgctcccaaaacatgctcatcaagtttttgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatattcttcc 5765251  T
Q  278 ctcgtcgagcgttgga 293  Q
     |||||||||||||||    
T  5765250 atcgtcgagcgttgga 5765235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 110 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 18842651 - 18842431
Alignment:
Q  110 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttg 209  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||| ||||   | ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  18842651 ccctacctaatcccgatcttctggcgggatcagactcttgacaatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgccg 18842552  T
Q  210 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | ||| ||||| |||||||||||| ||   || |||| ||    
T  18842551 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactaaatgatattcttccctcatcgagcgttggacgtttataccgaacgt 18842452  T
Q  307 gttccaccctctttgtgtctc 327  Q
     |||||||||| |||||||||    
T  18842451 attccaccctccttgtgtctc 18842431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 41780899 - 41780683
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||  ||| |||| |||||| ||||||||    
T  41780899 ctaatgacgaacttctggcgaaatcaaacttttgatgatatattcagttgatcttagcaacgtcacctgcatatctatctactggaacatgctgtgctcc 41780800  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||    
T  41780799 caaaatatattcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatattatcctctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 41780700  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||  |||||||||||    
T  41780699 cccttcttgtgtctctg 41780683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 17373019 - 17372756
Alignment:
Q  28 aatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatc 127  Q
    |||| ||||||||||  ||||  || ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  | || || || ||||||||||||    
T  17373019 aatgtttgagtcctgccgtttaacaagtttgaatt-acctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcatttccatacctaatgacgatc 17372922  T
Q  128 ttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctc 227  Q
    |||||||| ||| ||  | | ||||||||||||||||||||||| || ||| || || |||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||    
T  17372921 ttctggcgaaattaaactttcgatgatatcttcagttgatctcatcaacgttacacgtatatcgatccactggaatatggtgtgctcccaaaacatgttc 17372822  T
Q  228 gtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
     |||| ||||||||||| | |||||||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||||||    
T  17372821 ttcacattttcgtcgttcgctaattccacctaagtggattatattctcccctcgtcgagcgttgga 17372756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 66 - 293
Target Start/End: Original strand, 24363752 - 24363977
Alignment:
Q  66 ctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttg 165  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  | || ||||| ||||| ||||||||||  |||||||||  | ||||| |||||||||||||    
T  24363752 ctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcacgatcttctaacggaatcaaactcttgataatatcttcagttg 24363849  T
Q  166 atctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaa 265  Q
     ||||| || ||| | |||||||| ||||||||  |||||  ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||     
T  24363850 ctctcaacaacgttaaccgcatatcgatccactagaacatactgtgcccccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttcattaattctacccaagtgat 24363949  T
Q  266 tgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  24363950 tgatattctcccctcgtcgagcgttgga 24363977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 196
Target Start/End: Original strand, 29707504 - 29707621
Alignment:
Q  79 aagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgt 178  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  29707504 aagacaattgttgcagttgtaatgcaccttgccctaacttatgacgatcttctagcggaatcaaacttttgatgatatctttagttgatctcagcaacgt 29707603  T
Q  179 cacccgcatattgatcca 196  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  29707604 cacccgcatatcgatcca 29707621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 105
Target Start/End: Original strand, 29436437 - 29436520
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  29436437 gagcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaaaacaattgttgtagttggaatgcac 29436520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 22527803 - 22527687
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22527803 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgat 22527706  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaa 142  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  22527705 gatcttctggcgaaatcaa 22527687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 27486432 - 27486355
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgga 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27486432 gagcgaaatgcttgagttctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttggagttgga 27486355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 29761905 - 29761826
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  29761905 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggcttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgtggcagttggaat 29761826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 44337059 - 44336978
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44337059 gcgaaatgcgtgactcatgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgcagttggaatgcac 44336978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 47487775 - 47487694
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47487775 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 47487694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Original strand, 49427854 - 49427933
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  49427854 gaaatgcttgagtcctgttgtttgacaggtttgaatctatctcattcaaaggtaagacaattgttggagttgtaatgcac 49427933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 191 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 13148450 - 13148365
Alignment:
Q  191 gatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcc 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13148450 gatccactggaacatgttgtgctctcaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcc 13148365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Original strand, 19160783 - 19160864
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  19160783 gcgaaatgcttgagtcctgttgttttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcac 19160864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Original strand, 22527973 - 22528054
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  22527973 gcgaaattcttgagtcttgttgttttgcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaatgcac 22528054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 49262735 - 49262654
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  49262735 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattcttgtagttggaatgcac 49262654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 30309569 - 30309490
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30309569 gaaatgcttgagtcatgttgtttggcaggtttgaatttaccccattcacaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 30309490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 102
Target Start/End: Original strand, 3658940 - 3659018
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3658940 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttgtaatg 3659018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 50067994 - 50067916
Alignment:
Q  27 aaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50067994 aaatgcttgagtcctgttgtttggcaagtttgaatttgccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 50067916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 327
Target Start/End: Original strand, 16532051 - 16532304
Alignment:
Q  76 ggtaagacaattgttgaagttggaa--tgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagc 173  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||   | || || ||||| |||||||||| ||| |||||   | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16532051 ggtaagacaattgttgtagttggaagatgca---ttccatacctaatcacgatcttctagcgaaatcagactattgataatatcttcagttgatctcagc 16532147  T
Q  174 atcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactc 273  Q
    | ||| || |||||||  ||||| |  | |||| | |||||||| || |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | ||    
T  16532148 aacgttacacgcatatcaatccattagagcatgctctgctcccataatatgctcatcacattttcgtcgttcgttaattccacccaacttaatgatattc 16532247  T
Q  274 tcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctc 327  Q
    || |||| |||||||||| | ||   ||||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  16532248 tctcctcatcgagcgttgtacgtttatatcgaacgtattccatcctccttgtgtctc 16532304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Original strand, 45689587 - 45689668
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  45689587 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttagcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagtaggaatgcac 45689668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 46180018 - 46179937
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  46180018 gcgaaatgcttgagtcatgttgtttggccagtttgaatttacctcattcaaaggtaagacaattgttgtagttgaaatgcac 46179937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16081448 - 16081316
Alignment:
Q  159 tcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccaccc 258  Q
    |||||||||  ||||| ||| || ||||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||     
T  16081448 tcagttgattgcagcaacgttacacgcatatcgatcaactagaacatgttgtgctccaaaaacatgctcctcatgttatcgtcgttcgttaattccacct 16081349  T
Q  259 aagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttg 291  Q
    || ||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  16081348 aactgaatgatatcctcccctcgtcgagcgttg 16081316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Original strand, 48227006 - 48227085
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  48227006 gaaatgttggagtcctgttgtttgacaggtttgaatctatctcattcaaaggtaagacaattgttggagtttgaatgcac 48227085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 206
Target Start/End: Original strand, 40533286 - 40533376
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  40533286 ctaatgacgatcttctggcggaattaaacttttgatgatatcttcagttgatctcggcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatg 40533376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 29707275 - 29707196
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29707275 gaaatgcttgagtcatgttgtttagcaagtttgaattgaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 29707196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 39223934 - 39223856
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39223934 gaaatgcttgagtcatgttgtttgacaggtttgaattta-cccattcaaatgtaagacaattgttgtagttggaatgcac 39223856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Original strand, 51270270 - 51270349
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51270270 gaaatgtttgagtcttgttgtttggcaagtttgaattgaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 51270349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 49598629 - 49598545
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaag---acaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||    
T  49598629 gcgaaatgcttgagtcatgttgtttggccagtttgaatttacctcattcaaaggtaagacaacaattgttgtagttggaatgcac 49598545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 13635036 - 13634956
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaa-ttgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||    
T  13635036 gaaatgcttgagccctattgttttgcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaacacaatttgttgtggttggaatgcac 13634956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 27035055 - 27034975
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctca-ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  27035055 gaaatgcttgagtcatgttgtttggcaagtttgaatttaccccatttcaaaggtaagacaattattgtagttggaatgcac 27034975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 41874622 - 41874543
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41874622 gaaatgcttgagtcatgttgtttagcaagtttgaatttgctccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 41874543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 46925017 - 46924958
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaa 85  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  46925017 gaaatgtttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaa 46924958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 48568142 - 48568063
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||| || ||||||||  || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48568142 gaaatgcttgattcatgttgtttcacaagtttgaatttgcctcattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 48568063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 48226831 - 48226760
Alignment:
Q  52 aggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaa---ttgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48226831 aggtttgaatttatctcattcaaagg-aagacaacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatg 48226760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 12791012 - 12790936
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  12791012 gcgaaattcttgagtcctgttgtttggtaagtttgaatttaccccattcagaggtaacacaattgttggagttggaa 12790936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 100
Target Start/End: Original strand, 17697487 - 17697563
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||| ||||||||    
T  17697487 gcgaaatgcttgagtcatgttgtttggcgagtttgaatttatcccattcaggggcaagacaattgttgtagttggaa 17697563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 21484500 - 21484432
Alignment:
Q  40 ctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcacctt 108  Q
    |||||||||||||  |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21484500 ctgttgtttggcaattttgaatttgcctcatttaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacctt 21484432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 35525925 - 35525860
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  35525925 gagtcctgctgcttggcaagtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaa 35525860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 100
Target Start/End: Original strand, 18170493 - 18170569
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  18170493 gcgaaatgtttgagtcttgttgtttggccagtttgaatttaccccattcagaggtaacacaattgttgtagttggaa 18170569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 17686086 - 17686021
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  17686086 gagtcctgatgcttggcaagtttgaatttacctcattcagaggtaacacaattgttgtagttggaa 17686021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 29761964 - 29761924
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatt 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29761964 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggcttgaatt 29761924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 42571514 - 42571442
Alignment:
Q  25 cgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttg 97  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  42571514 cgaaatgtttgagtcatattgtttggcaagtttgaatttacccaattcaaaggtaacacaattgttgtagttg 42571442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 220
Target Start/End: Original strand, 19262422 - 19262517
Alignment:
Q  125 atcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaa 220  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||||| | | |||||| |||||| ||||||    
T  19262422 atcttcaggcggaatcaaactgttgagaatatcttcagttgatctcagcaacgtgacaaacatattgatcctcgggaacatgatgtgctgccaaaa 19262517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 49926108 - 49926046
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgg 98  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  49926108 gagtcctgctgcttggcaagtttgaattta-ctcattcaaaggtaacacaattgttgtagttgg 49926046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 38044919 - 38044857
Alignment:
Q  36 agtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgg 98  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  38044919 agtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttgg 38044857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 14173486 - 14173421
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  14173486 gagtcctgctgcttggcaagtttgaatttactgcattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaa 14173421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 17685844 - 17685779
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||| ||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  17685844 gagttctgctgtttagcaagtttgaatttatcccattcagaggtaagataattgttgtagttggaa 17685779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24269851 - 24269786
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24269851 gagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgcccaattcaaaggtaagataattgttgaagttggaa 24269786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24270093 - 24270028
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  24270093 gagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattggtgtagttggaa 24270028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Original strand, 36910038 - 36910103
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||| || ||||||  |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  36910038 gagtcctgctgcttggcaattttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaa 36910103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Original strand, 37778557 - 37778622
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  37778557 gagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccacattcagaggtaacacaattgttgtagttggaa 37778622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 100
Target Start/End: Original strand, 49397134 - 49397187
Alignment:
Q  47 ttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  49397134 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttggagttggaa 49397187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 98
Target Start/End: Original strand, 6436262 - 6436313
Alignment:
Q  47 ttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgg 98  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  6436262 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaaaacaattgttgtagttgg 6436313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 41 - 100
Target Start/End: Original strand, 18170669 - 18170728
Alignment:
Q  41 tgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  18170669 tgttgtttggccagtttgaatttaccccattcagaggtaacacaattgttgtagttggaa 18170728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 98
Target Start/End: Original strand, 23343130 - 23343181
Alignment:
Q  47 ttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgg 98  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  23343130 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttgg 23343181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24363538 - 24363475
Alignment:
Q  37 gtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  24363538 gtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcagagataagacaattgttgtagttggaa 24363475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 35525688 - 35525617
Alignment:
Q  29 atgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||| | ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  35525688 atgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcaggggtaagataattgttgcagttggaa 35525617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 100
Target Start/End: Original strand, 49397359 - 49397430
Alignment:
Q  29 atgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    ||||| |||||||| |||||| || ||||||||||| | |||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  49397359 atgctggagtcctgctgtttgacaagtttgaatttaccccattcagagataagataattgttgcagttggaa 49397430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Original strand, 18842924 - 18842994
Alignment:
Q  28 aatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgg 98  Q
    ||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  18842924 aatgcttgagagatgttgtttagcaagtttgaatttaccccattcaggggtaagacaattgttgtagttgg 18842994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 12790758 - 12790693
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| | |||| | |||||||| |||||||| ||||||||    
T  12790758 gagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccatttagaggtaagataattgttgcagttggaa 12790693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 100
Target Start/End: Original strand, 13973414 - 13973467
Alignment:
Q  47 ttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||| |||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13973414 ttggcaagtttgaatttactacattcaaaggtaaaacaattgttgtagttggaa 13973467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Original strand, 17373202 - 17373267
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||  ||| |||||||| ||| ||||||||    
T  17373202 gagtcctgctgtttagcaagtttgaatttacctcattcaggggttagacaattattgtagttggaa 17373267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 100
Target Start/End: Original strand, 35185461 - 35185514
Alignment:
Q  47 ttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  35185461 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtgacacaattgttgtagttggaa 35185514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 100
Target Start/End: Original strand, 13284188 - 13284244
Alignment:
Q  44 tgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    ||||| ||| ||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  13284188 tgtttagcaagtttgaatttgccccattcaagggtaagacaattgttgtagttggaa 13284244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 104)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 26 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 39589225 - 39588922
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacga 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39589225 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccccaactaatgacga 39589126  T
Q  126 tcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgc 225  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  39589125 tcttctagcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcatccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgc 39589026  T
Q  226 tcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgt 322  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||   ||  ||||||||||||||||| ||||    
T  39589025 tcgtcacattttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctccccccgtcgagcgttggacgtttatactgaaggtgttccaccctccttgt 39588926  T
Q  323 gtct 326  Q
    ||||    
T  39588925 gtct 39588922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 26 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 9489974 - 9489671
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacga 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9489974 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgcagttggaatgcactttaccctaactaatgacga 9489875  T
Q  126 tcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgc 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  9489874 tcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcaataacgtcacccgcatatcaatccactggaacatgctgtgct-ccaaaacatgc 9489776  T
Q  226 tcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgt 322  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||  ||||||||||||||||| ||||    
T  9489775 tcgtcacattttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatactgaaggtgttccaccctccttgt 9489676  T
Q  323 gtctc 327  Q
    |||||    
T  9489675 gtctc 9489671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 22 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 1043049 - 1042744
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1043049 gagcgaaatgcttgagtcatgttgtttggccgatttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgcagttggaatgtaccttaccctaactaatg 1042950  T
Q  122 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaac 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  1042949 acgatcttctggcggaatcaagttgttgattatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaac 1042850  T
Q  222 atgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatg-ttatcgaaggtgttccaccctcttt 320  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||  |||| ||||||||||| ||    
T  1042849 atgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtctagcgttggacgtttatacaaggcgttccaccctcctt 1042750  T
Q  321 gtgtct 326  Q
    ||||||    
T  1042749 gtgtct 1042744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 28082537 - 28082228
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28082537 gagcgaaatgctcgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatg 28082439  T
Q  122 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaac 221  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || | | ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  28082438 acgatcttctggcggaatcaaatttttgatgatatcttcagttgatctaagtaacttcacctgcatattgatccactgaaacatgatgtgctcccaaaac 28082339  T
Q  222 atgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctct 318  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||   || | || |||||||||| ||     
T  28082338 atgctcgtcatgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcatcgagcgttggacgtttataccaaacgtgttccaccatcc 28082239  T
Q  319 ttgtgtctctg 329  Q
    |||||||||||    
T  28082238 ttgtgtctctg 28082228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 24 - 329
Target Start/End: Original strand, 21017088 - 21017394
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21017088 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-acctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 21017185  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacat 223  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21017186 gatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacat 21017285  T
Q  224 gctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctcttt 320  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || | || |||||||||| || ||    
T  21017286 ggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgtgttccaccatcctt 21017385  T
Q  321 gtgtctctg 329  Q
    |||||||||    
T  21017386 gtgtctctg 21017394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 24 - 329
Target Start/End: Original strand, 40353684 - 40353990
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40353684 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaggtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 40353781  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacat 223  Q
     ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40353782 aatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacat 40353881  T
Q  224 gctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctcttt 320  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || | || |||||||||| || ||    
T  40353882 ggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgtgttccaccatcctt 40353981  T
Q  321 gtgtctctg 329  Q
    |||||||||    
T  40353982 gtgtctctg 40353990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 22 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 21711831 - 21711555
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttggcaggtttgaatttatctcatt-caaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| | | |||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21711831 gagcgaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaatt-accccatttcagaggtaagagaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaa 21711733  T
Q  120 tgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaa 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21711732 tgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatctttagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaa 21711633  T
Q  220 acatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgtt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  21711632 acatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaattccacccaagtgaatgataccctcccctcgtcgagcgttagatgtt 21711555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 75 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 25762845 - 25762590
Alignment:
Q  75 aggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagca 174  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25762845 aggtaagacaattgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagca 25762746  T
Q  175 tcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactct 274  Q
     ||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25762745 acgttacccgcatatcgatccaccagaacatgttgtgctcccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactct 25762646  T
Q  275 cccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctc 327  Q
    ||||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  25762645 cccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaatgtgttccaccctccttgtgtctc 25762590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 24 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 55797039 - 55796772
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55797039 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-agcccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 55796942  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacat 223  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  55796941 gatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacat 55796842  T
Q  224 gctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55796841 ggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttgga 55796772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 37866708 - 37866396
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttggcaggtttgaatttatctcatt-caaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| | | |||| || ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37866708 gagcgaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaatt-accccatttcagaggtaagacgactgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaa 37866610  T
Q  120 tgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctccc-aa 218  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  37866609 tgacgatcttctagcggaatcaagatattgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccgaa 37866510  T
Q  219 aacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccc 315  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   || |||| |||||||||||    
T  37866509 aacatgctcatcacgttttcgtcgctcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggatgtttataccgaatgtgttccaccc 37866410  T
Q  316 tctttgtgtctctg 329  Q
    |  |||||||||||    
T  37866409 ttcttgtgtctctg 37866396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 24 - 329
Target Start/End: Original strand, 41794473 - 41794779
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41794473 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-acctcattcaaagg-aatacaaatgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 41794570  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacat 223  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41794571 gatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacat 41794670  T
Q  224 gctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctcttt 320  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   || | || |||||||||| || ||    
T  41794671 ggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgtgttccaccatcctt 41794770  T
Q  321 gtgtctctg 329  Q
    |||||||||    
T  41794771 gtgtctctg 41794779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 70 - 329
Target Start/End: Original strand, 51027722 - 51027984
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51027722 ttcagaggtacgacaattgttgtagttggagtgcaccttaccctaactaatgacgatcttatggtggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 51027821  T
Q  170 cagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaa 269  Q
    || || ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  51027822 caacaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgat 51027921  T
Q  270 actctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctctg 329  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||   || |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  51027922 actctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccactctccttgtgtctctg 51027984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 70 - 329
Target Start/End: Original strand, 51428147 - 51428409
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51428147 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttcttgcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatct 51428246  T
Q  170 cagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaa 269  Q
    || || ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||     
T  51428247 caacaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaactccacacaagtgaatgat 51428346  T
Q  270 actctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||   || |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  51428347 actctcccctcgttgagcgttgaacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtgtctctg 51428409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 24 - 329
Target Start/End: Original strand, 6177226 - 6177532
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6177226 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-acctcattcaaagg-aatacaaatgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 6177323  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacat 223  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  6177324 gatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacat 6177423  T
Q  224 gctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctcttt 320  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   || | || |||||||||| || ||    
T  6177424 ggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgtgttccaccatcctt 6177523  T
Q  321 gtgtctctg 329  Q
    |||||||||    
T  6177524 gtgtctctg 6177532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 49064280 - 49063969
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttggcaggtttgaatttatctcattcaa-aggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49064280 gagcgaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaatt-accccatttaagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaa 49064182  T
Q  120 tgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaa 219  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  49064181 tgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacgtcacccgcatatcgatccacggaaacatgttgtgctccaaaa 49064082  T
Q  220 acatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||   || |||| ||||||||| ||    
T  49064081 acatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaattccacccaagtgaatgacaccctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccgaacgtgttccactct 49063982  T
Q  317 ctttgtgtctctg 329  Q
    | |||||||||||    
T  49063981 ccttgtgtctctg 49063969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 24 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 56139206 - 56138900
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56139206 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-acctcattcaaagg-aatacaaatgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 56139109  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacat 223  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  56139108 gatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacat 56139009  T
Q  224 gctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctcttt 320  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   || | || |||||||||| || ||    
T  56139008 ggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgtgttccaccatcctt 56138909  T
Q  321 gtgtctctg 329  Q
    |||||||||    
T  56138908 gtgtctctg 56138900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 70 - 328
Target Start/End: Original strand, 14330649 - 14330910
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  14330649 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccttaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 14330748  T
Q  170 cagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaa 269  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  14330749 cagcaacgttacccgcatatcgatccattggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaattccacccaagtgaatgat 14330848  T
Q  270 actctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctct 328  Q
    || |||||||||||||| |||||| ||   || |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  14330849 accctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccgaaagtgttccaccctccttgtgtctct 14330910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 70 - 293
Target Start/End: Original strand, 31824584 - 31824807
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31824584 ttcaaatgtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctagcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatct 31824683  T
Q  170 cagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaa 269  Q
     |||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||     
T  31824684 aagcaacgttacccgcatattgatccactagaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgat 31824783  T
Q  270 actctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  31824784 attctcccctcgtcgagcgttgga 31824807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 24 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 49095041 - 49094735
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49095041 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-acctcattcaaagg-aatacaaatgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 49094944  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacat 223  Q
    |||||| ||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49094943 gatcttgtggcggaatcaaacttttgacgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacat 49094844  T
Q  224 gctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctcttt 320  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   || | || |||||||||| || ||    
T  49094843 ggtcgtcacgtttttgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgtgttccaccatcctt 49094744  T
Q  321 gtgtctctg 329  Q
    |||||||||    
T  49094743 gtgtctctg 49094735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Original strand, 242322 - 242633
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||   ||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  242322 gagcgaaatgcttgagtcctgcccgtttggcaagtttgaattaccctatttcagaggtaagacaattgttatagttggaatgcaccttactttaactaat 242421  T
Q  121 gacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaa 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  242422 gacgatcttctggcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgatgtgctcccaaaa 242521  T
Q  221 catgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctc 317  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||   || |||| |||||||||||||    
T  242522 catgctcgtcacgttttcatcgttctttaactccacctaagtgaatgatgctctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctc 242621  T
Q  318 tttgtgtctctg 329  Q
     |||||||||||    
T  242622 cttgtgtctctg 242633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 40 - 293
Target Start/End: Original strand, 20778795 - 20779047
Alignment:
Q  40 ctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaat 139  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20778795 ctgttgtttggcaagtttgaatttgcctcattcaaagg-aagacaattgttgtggttggaatgcaccttaccctacctaatgacgatcttttggcggaat 20778893  T
Q  140 caagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcg 239  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20778894 caaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgaaacccgcatatcgatccattggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcg 20778993  T
Q  240 tcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  20778994 tcgttcgttaattccacccaaatgaatgatactctcccctcgtagagcgttgga 20779047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 70 - 326
Target Start/End: Original strand, 20901623 - 20901882
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901623 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttcaggtggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 20901722  T
Q  170 cagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaa 269  Q
    |||||  || |||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  20901723 cagcagtgttacccgcatatcgatccactagaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgat 20901822  T
Q  270 actctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtct 326  Q
    | ||||| |||||||| ||||||| ||   || |||| |||||| |||||| ||||||||    
T  20901823 attctccactcgtcgaacgttggacgtttataccgaacgtgttctaccctccttgtgtct 20901882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 40 - 326
Target Start/End: Original strand, 32937829 - 32938116
Alignment:
Q  40 ctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaat 139  Q
    |||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32937829 ctgtcgtttgacaagtttgaatt-acctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctatctaatgacgatcttctggcggaat 32937926  T
Q  140 caagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcg 239  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32937927 caaatttttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccgaaacatgctcgtcacgttttcg 32938026  T
Q  240 tcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtct 326  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||| |||||| ||   || |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  32938027 tcgttcgttaattccacccaactgaatgatattctcccttcgtcgagtgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtgtct 32938116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 27 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 45939822 - 45939518
Alignment:
Q  27 aaatgcttgagtcctgtt-gtttggcaggtttgaatttatctcatt-caaaggtaagacaatt-gttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    ||||||||||||| || | |||||||| ||||||||| | | |||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45939822 aaatgcttgagtcatggtcgtttggcaagtttgaatt-accccatttcagaggtaagacaattagttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 45939724  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacat 223  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45939723 gatcttatggaagaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttactcgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacat 45939624  T
Q  224 gctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctcttt 320  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| | ||   ||||||| ||||||||||||| ||    
T  45939623 gctcgtcacattatcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgataatctcctctcgtcgagcgttgaacgtttatatcgaacgtgttccaccctcctt 45939524  T
Q  321 gtgtct 326  Q
    ||||||    
T  45939523 gtgtct 45939518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 75 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 1226406 - 1226188
Alignment:
Q  75 aggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagca 174  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1226406 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagca 1226307  T
Q  175 tcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactct 274  Q
     ||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || ||    
T  1226306 acgttacccgcatatcgatccactagaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgtcgttctttaattccacacaagtgaatgataccct 1226207  T
Q  275 cccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1226206 cccctcgtcgagcgttgga 1226188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 79 - 329
Target Start/End: Original strand, 33163508 - 33163761
Alignment:
Q  79 aagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgt 178  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  33163508 aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgt 33163607  T
Q  179 cacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccc 278  Q
     |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  33163608 tacccacatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgttactctcccc 33163707  T
Q  279 tcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctctg 329  Q
    |||| |||||||||| ||   || |||| || |||||||||| ||| |||||||    
T  33163708 tcgttgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctcattgcgtctctg 33163761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Original strand, 26591686 - 26591902
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  26591686 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatcttagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 26591785  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| ||||||||    
T  26591786 caaaatatgttcgtcacgtttttgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatatcgaacgtgttcca 26591885  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| |||||||||||    
T  26591886 ccctccttgtgtctctg 26591902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 27759626 - 27759374
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcct-gttgtttggcaggtttgaatttatctca-ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||| ||||||| ||| | || |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27759626 gcgaaatgcttgagtcatagccgtttggcaagtttgaa-ttaccccatttcagaggtaagacaattgttgtagttgaaatgcaccttaccctaactaatg 27759528  T
Q  122 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaac 221  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  27759527 acgatcttctggcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttactcgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaac 27759428  T
Q  222 atgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctc 275  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27759427 atgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctc 27759374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 22437117 - 22436901
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  22437117 ctaatgacgatcttccggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 22437018  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||    
T  22437017 caaaacatgctcgtcacgttttcatcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 22436918  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| |||||||||||    
T  22436917 ccctccttgtgtctctg 22436901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Original strand, 34529797 - 34530013
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  34529797 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacctgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 34529896  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   || |||||||||||||    
T  34529897 caaaaaatgctcgtcacattttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaaggtgttcca 34529996  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||  |||||||||||    
T  34529997 cccttcttgtgtctctg 34530013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 293
Target Start/End: Original strand, 46816431 - 46816701
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttggcaggtttgaatttatctcat-tcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaa 119  Q
    |||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||||||| | | ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  46816431 gagcgaaatgcttgagtcttggccgtttggcaagtttgaatt-accccatctcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttgccctaactaa 46816529  T
Q  120 tgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaa 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||| || ||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46816530 tgacgatcttctggcggaatcaagctattgatgatatcttca--tgatctcaacaacgttacctgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaa 46816627  T
Q  220 acatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  46816628 acatgctcgtcacgtttttgtcgttctttaactccacccaagtgaatgataccctcccctcgtcgagcattgga 46816701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 117 - 329
Target Start/End: Original strand, 34153288 - 34153503
Alignment:
Q  117 taatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctccc 216  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34153288 taatgacgatcttctggcagaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcaccaacgtcatccgcatattgatccactggaacatgttgtgctccc 34153387  T
Q  217 aaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccac 313  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || |||| |||||||||    
T  34153388 aaaacatgatcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccac 34153487  T
Q  314 cctctttgtgtctctg 329  Q
    |||| |||||||||||    
T  34153488 cctccttgtgtctctg 34153503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 21169739 - 21169441
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttct 131  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||||||    
T  21169739 gagtcctgccgtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttct 21169642  T
Q  132 ggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtca 231  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  21169641 ggcggaatcaaatttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacctgcatatcgatccactggtacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcg 21169542  T
Q  232 cgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctct 328  Q
    ||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21169541 cgtattcatcgtccgttaattcgacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggatgtttatatcgaacgtgttccaccctccttgtgtctct 21169442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Original strand, 43889500 - 43889716
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  43889500 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgattatatcttcagttgatctcaacaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgatgtgctcc 43889599  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||    
T  43889600 caaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 43889699  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| |||||||||||    
T  43889700 ccctccttgtgtctctg 43889716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Original strand, 49791937 - 49792153
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  49791937 ctaatgatgatcttttggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacctgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 49792036  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||    
T  49792037 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcattcgttaattccacccaagtgaataatactctcccatcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 49792136  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| |||||||||||    
T  49792137 ccctccttgtgtctctg 49792153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 119 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 2773212 - 2773000
Alignment:
Q  119 atgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaa 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2773212 atgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatggtatcttcagttgatctcaataacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaa 2773113  T
Q  219 aacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccc 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||   || |||| ||||||||||     
T  2773112 aacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtagagcgttggacgtttataacgaacgtgttccacca 2773013  T
Q  316 tctttgtgtctct 328  Q
    || ||||||||||    
T  2773012 tccttgtgtctct 2773000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Original strand, 47657356 - 47657572
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  47657356 ctaatgacgatcttctggtggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 47657455  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||   || |||| ||||||||    
T  47657456 caaaatatgctcgtcacgttttggtcgttcgttaattccatccaagtgaatgatactctcccatcgtcgagcgttggatgtttataccgaacgtgttcca 47657555  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||| | |||||||||||    
T  47657556 cccaccttgtgtctctg 47657572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 116 - 293
Target Start/End: Original strand, 957456 - 957633
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  957456 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatctttagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcc 957555  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  957556 taaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatacgctcccctcgtcgagcgttgga 957633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 113 - 326
Target Start/End: Original strand, 6282321 - 6282537
Alignment:
Q  113 taactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgc 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  6282321 taactaatgacgatcttctggcagaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatcttagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 6282420  T
Q  213 tcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgtt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||| ||   || |||| |||||    
T  6282421 tcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcattcgttaattccacccaagtgaatgatactctctccttgtcgagtgttggacgtttataccgaacgtgtt 6282520  T
Q  310 ccaccctctttgtgtct 326  Q
    |||||||| || |||||    
T  6282521 ccaccctccttctgtct 6282537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 328
Target Start/End: Original strand, 49817563 - 49817860
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcacctta---ccctaactaatgacgatcttct 131  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| | | |||||||| | ||||||||||||| ||||| || | || ||    || || ||||||||||||||||    
T  49817563 gagtcctgctgtttggcaagtttgaatt-accccattcaaatg-aagacaattgttgtagttgaaaggtacattcattccgtacctaatgacgatcttct 49817660  T
Q  132 ggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtca 231  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  49817661 ggcggaatcagactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactagaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtaa 49817760  T
Q  232 cgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctct 328  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||   ||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  49817761 cgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgttactctcccctcgtagagcgttggacgtttatactgaacgtgttccaccctccttgtgtctct 49817860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 40 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24607032 - 24606744
Alignment:
Q  40 ctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaat 139  Q
    |||| |||||| | ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24607032 ctgtcgtttggaaagtttgaatt-acctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgtacatttacctacctaatcacgatcttctggcggaat 24606935  T
Q  140 caagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcg 239  Q
    ||   | ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||  |||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24606934 cagactcttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccacatatcaatccacgggaacatgatgtgctcccaatacatgctcgtcacgttttcg 24606835  T
Q  240 tcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga---tgttatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctc 327  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||| | ||||||| || |||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24606834 tcgttcgttaattctacccaactgaataatactctccgcttgtcgagcgttggacatttatatcgaacgtgttccaccctccttgtgtctc 24606744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 116 - 293
Target Start/End: Original strand, 36776520 - 36776697
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  36776520 ctaatgacgatctttcagcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgccgtgctcc 36776619  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  36776620 caaaccatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattctacccaagtgaataatactctcccctcgtcgagcgttgga 36776697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 77 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 17211511 - 17211258
Alignment:
Q  77 gtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatc 176  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    | || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  17211511 gtaagacaattgttgtagttggaagatgcatttccctacctaatcacgatcttctggcggaatcagactgttgataatatctttagttgatctcagcaac 17211412  T
Q  177 gtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcc 276  Q
    || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||| ||||||| | ||| |    
T  17211411 gttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgtttttatcgttcgttaattcgactcaaatgaatgatattcttc 17211312  T
Q  277 cctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctc 327  Q
    ||||||||| ||||||| ||   || |||| || |||||||||| |||||||||    
T  17211311 cctcgtcgaacgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctc 17211258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Original strand, 4785423 - 4785639
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  4785423 ctaatgacgatcttgtggcggaatcaaactgttgataatatcttcagttgatatcagcaacgttccccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 4785522  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| || ||| || ||   || |||| ||||||||    
T  4785523 caaaacatgttcttcacgtttttgtcgttcgttaattccaccaaagtgaatgatgctctcccctcgtcaagggtttgacgtttataccgaatgtgttcca 4785622  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| |||||||||||    
T  4785623 ccctccttgtgtctctg 4785639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Original strand, 44560181 - 44560397
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    ||||||||||||||  || | ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||| |||||| | ||||||    
T  44560181 ctaatgacgatcttaaggagaaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcaatacactggaacatgctttgctcc 44560280  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||   ||  ||| ||||||||    
T  44560281 caaaacatgcttgtcacgttttcgtcgttcgttaattccatccaagtgaatgatattctcccctcgtcgagcgttggacgtttatactgaacgtgttcca 44560380  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| |||||||||||    
T  44560381 ccctccttgtgtctctg 44560397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 116 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 42886472 - 42886255
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||  || |||||||||||     
T  42886472 ctaatgatgatcttctggcggaatcagactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcgtatcgatccactagaaaatgttgtgctct 42886373  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatga---aactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgtt 309  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||   || |||| |||||    
T  42886372 caaagcatgctcgtcatgttttcgtcgttggttaattccacccaagtgaatgatagtactctcccctcgtcgagcgttggaagtttataacgaacgtgtt 42886273  T
Q  310 ccaccctctttgtgtctc 327  Q
    |||||||| |||||||||    
T  42886272 ccaccctccttgtgtctc 42886255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 116 - 293
Target Start/End: Original strand, 49423759 - 49423936
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||  |||||||    
T  49423759 ctaatgacgatcttatggcagaatcaaacttttgatgatttcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccacttgaacatgccgtgctcc 49423858  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  49423859 cagaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccatccaagtgaatgataatctcccctcgtcgagcgctgga 49423936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 110 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 3393516 - 3393296
Alignment:
Q  110 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttg 209  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||| ||||||||  |||||||||    
T  3393516 ccctacctaatcatgatcttctggcggaatcagactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacatgcatatcgatccactagaacatgttg 3393417  T
Q  210 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggt 306  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | |||||| || |||||||||||| ||   ||||||| ||    
T  3393416 tgctcccaaaacatgctcctcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactaaatgataatctcccatcctcgagcgttggacgtttatatcgaacgt 3393317  T
Q  307 gttccaccctctttgtgtctc 327  Q
     |||||||||| |||||||||    
T  3393316 attccaccctccttgtgtctc 3393296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 76 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 10312517 - 10312297
Alignment:
Q  76 ggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcat 175  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |    || ||||| ||||| |||||||||  ||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| | ||     
T  10312517 ggtaagacaattgttgtagttggaaggtgaatt-ccctacctaatcacgatcttccagcggaattagattgttgataatatcttcagttgatcttaacaa 10312419  T
Q  176 cgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctc 275  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | ||||    
T  10312418 cgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactaaatgatattctc 10312319  T
Q  276 ccctcgtcgagcgttggatgtt 297  Q
    || |||||||| |||| |||||    
T  10312318 ccatcgtcgagtgttgtatgtt 10312297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 77 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18412839 - 18412624
Alignment:
Q  77 gtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatc 176  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |  | || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  18412839 gtaagacaattgttgtagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcacgatcttctggcagaatcaaattgttgataatatattcagttgatctcagcaac 18412741  T
Q  177 gtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcc 276  Q
    || || ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||| || ||||||| | ||| |    
T  18412740 gttacacgcatatcgatccactgaaacatggtgtgctcccaaaacatgctcctcacgttatcgtcgttcattaattccaccgaactgaatgatattcttc 18412641  T
Q  277 cctcgtcgagcgttgga 293  Q
    | |||||||||||||||    
T  18412640 catcgtcgagcgttgga 18412624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 117 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 11288499 - 11288324
Alignment:
Q  117 taatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctccc 216  Q
    |||| ||||||||||  | ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  11288499 taatcacgatcttctaacagaatcaaattgt-gataatatcttcagttgatctcagcaacgttactcgcatatcgatccactggaacatgatgtgctccc 11288401  T
Q  217 aaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  11288400 aaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactaaatgatattctcccctcgtcgaccgttgga 11288324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 31324467 - 31324203
Alignment:
Q  28 aatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcatt-caaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgat 126  Q
    ||||||||||  |||| |||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |  | || ||||| ||||| | |||    
T  31324467 aatgcttgagagctgtcgtttagcaagtttgaatt-atctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcatgat 31324370  T
Q  127 cttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgct 226  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||  || ||||||||||||||||||| | | || | ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31324369 cttctagcggaatcaaactgttgagaatgtcttcagttgatctcagcaactttacacacatatcgatccacggtaacatgttgtgctccaaaaacatgct 31324270  T
Q  227 cgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    ||||||||  | |||||| ||||||||||||||| ||||| | | |||||| ||||||| |||||||    
T  31324269 cgtcacgtcattgtcgttcgttaattccacccaactgaataatattctcccatcgtcgaacgttgga 31324203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 110 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13866475 - 13866302
Alignment:
Q  110 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttg 209  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||   |||||  |||||| |||||||||||    
T  13866475 ccctacctaatcacggtcttctggcggaatcaaactgttgagaatatcttcagttgatctcagcaacgttacatacatatcaatccacggtaacatgttg 13866376  T
Q  210 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtc 283  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||| |||||    
T  13866375 tgctcccaaaacatgttcgtcacgtcgtcgtcgtttgttaattccatccaactgaatgatattctcccatcgtc 13866302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 13850995 - 13850739
Alignment:
Q  75 aggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagca 174  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  13850995 aggtaagataattgttgtagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcacggtcttctggcggaatcaaactgttgagaatatctttagttgatctcagca 13850897  T
Q  175 tcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactct 274  Q
      || ||   ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || |||| ||||||| | |||    
T  13850896 atgttacatacatatcgatccacggtaacatgttgtgctcccaaaacatgttcgtcacgtcgtcgtcgtttgttaatttcatccaactgaatgatattct 13850797  T
Q  275 cccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||| ||||| | ||||||| ||   || | || || |||||||||| |||||||||||    
T  13850796 cccatcgtcaaacgttggacgtttataccaaacgtattccaccctccttgtgtctctg 13850739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 105
Target Start/End: Original strand, 1043213 - 1043296
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1043213 gagcgaaattcttgagtcctgttgtttgacaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgcagttggaatgcac 1043296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Original strand, 28082705 - 28082784
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28082705 gaaatgcttgagtcctgttgtttgacaggtttgaatctatctcattcaaaggtaagacaattgttggagttggaatgcac 28082784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Original strand, 56139376 - 56139457
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  56139376 gcgaaatgcttgagtcctgttgttttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaatgcac 56139457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Original strand, 21711999 - 21712078
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21711999 gaaatgcttgagtactgttgtttggcacgtttgaatttacctcattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 21712078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 6177056 - 6176975
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  6177056 gcgaaatgcttgagtcctgttgttttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcac 6176975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 21016918 - 21016837
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  21016918 gcgaaatgcttgagtcctgttgttttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcac 21016837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Original strand, 45939993 - 45940074
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45939993 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaagtttgactttacctcattcgaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 45940074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 20901414 - 20901335
Alignment:
Q  25 cgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgca 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20901414 cgaaatgcttgagtcatgttgtttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgca 20901335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 100
Target Start/End: Original strand, 49064449 - 49064523
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  49064449 gaaacgcttgagtcctgttgtttggcaagtttgaatttatctcattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaa 49064523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Original strand, 27759795 - 27759876
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  27759795 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggccagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgctgtagttggaatgcac 27759876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Original strand, 49095211 - 49095292
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  49095211 gcgaaatgcttgagtcttgttgttttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttggggttggaatgcac 49095292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 101
Target Start/End: Original strand, 55797209 - 55797286
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  55797209 gcgaaatgcttgagtcctgttgttttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtggttggaat 55797286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Original strand, 39589397 - 39589476
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39589397 gaaatgtttgagtcttgttgtttggcaagtttgaattgaccccattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 39589476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 46816262 - 46816183
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  46816262 gaaatgcttgagtcttgttgtttcgcaagtttgaatttacctcattcaaaggtaagacaattgttgtagttagaatgcac 46816183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 40353515 - 40353433
Alignment:
Q  23 agcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  40353515 agcgtaatgcttgagccctgttgttttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcac 40353433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 51427932 - 51427858
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  51427932 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttgg 51427858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 38132857 - 38132778
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  38132857 gaaatgcttgagtcatgttgtttggcaagtttgaatttgccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttgaaatgcac 38132778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Original strand, 25763066 - 25763147
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25763066 gcgaaatgcttgagtcttgttgtttgacaagtttgactttaccccattcgaaggtaagacaattgttggagttggaatgcac 25763147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 51027504 - 51027439
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttg 91  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  51027504 gaaatgcttgagtcctgttgttttgcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttg 51027439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 14330434 - 14330358
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14330434 gcgaaatgcttgagtcctattgtttgaccagtttgaattaacctcattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 14330358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 31824368 - 31824305
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaatt 87  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31824368 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggccagtttgaatttacctcattcaaaggtaagacaatt 31824305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 105
Target Start/End: Original strand, 37866884 - 37866955
Alignment:
Q  34 tgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37866884 tgagtcctgttgtttgacaagtttgaattgaccccattcaaaggtaagacaattgttgcagttggaatgcac 37866955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 34153015 - 34152950
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  34153015 gagtcctgctgcttggcaagtttgaatttacctcattcaaaggtaagacaattgttgttgttggaa 34152950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 34529525 - 34529460
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  34529525 gagtcctgctgcttggcaagtttgaatttacctcattcaaaggtaacacaattgttggagttggaa 34529460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 32937649 - 32937581
Alignment:
Q  40 ctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcacctt 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  32937649 ctgttgtttggcaagtttgaatttgcctcattcaacggtaagataattgttgtagttggagtgcacctt 32937581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 100
Target Start/End: Original strand, 24607212 - 24607271
Alignment:
Q  41 tgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  24607212 tgttgtttggcaagtttgaatttacctcattcaaaggtaagataattgttttagttggaa 24607271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 26591644 - 26591581
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgg 98  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26591644 gagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttgg 26591581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 98
Target Start/End: Original strand, 49571599 - 49571650
Alignment:
Q  47 ttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgg 98  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49571599 ttggcaagtttgaatttacctcattcaaaggtaagacaattgttgcagttgg 49571650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 82
Target Start/End: Original strand, 1226545 - 1226603
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaaga 82  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1226545 gcgaaatgcttgagtcatgttgtttgaccagtttgaatttacctcattcaaaggtaaga 1226603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 17292213 - 17292114
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||| |  | || |||||  |||| |||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||    
T  17292213 ttcagaggtaaaacaattgttgtagttggaaggtgcatt-ccctacataatcacgatcttctggcggaatcaaactgttgagaatatcttcagttgatct 17292115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 41794303 - 41794227
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||  |||||||  ||||||| || |||||    
T  41794303 gcgaaatgcttgagtcctgttgttttgcaggtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaa 41794227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 98
Target Start/End: Original strand, 2773499 - 2773550
Alignment:
Q  47 ttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgg 98  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2773499 ttggcaagtttaaatttacctcattcaaaggtaagacaattgttgtagttgg 2773550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 98
Target Start/End: Original strand, 22437389 - 22437452
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgg 98  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22437389 gagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttgg 22437452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 100
Target Start/End: Original strand, 42886738 - 42886809
Alignment:
Q  29 atgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  42886738 atgctggagtcatgctgtttggcaagtttgaatttaccccattcagaggtaacacaattgttggagttggaa 42886809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 199
Target Start/End: Original strand, 49817159 - 49817281
Alignment:
Q  76 ggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcat 175  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |  | || ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||   ||||||| ||||||||| ||||||||| ||     
T  49817159 ggtaagacaattattgtagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcacgatcttttggcagaatcagactgttgataatatcttcatttgatctcatcaa 49817257  T
Q  176 cgtcacccgcatattgatccactg 199  Q
    ||| || ||||||| |||||||||    
T  49817258 cgttacacgcatatcgatccactg 49817281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 242173 - 242105
Alignment:
Q  27 aaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagtt 96  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| | | ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  242173 aaatgcttgagtcatgttgtttggcaagtttgaaatta-ccccttcaaaggtaacacaattgttgtagtt 242105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 105
Target Start/End: Original strand, 885318 - 885355
Alignment:
Q  68 cattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  885318 cattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 885355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Original strand, 21169929 - 21169994
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||| || |||| | |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  21169929 gagtcctgctgcttggaaagtttaaatttacctcattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaa 21169994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 36776228 - 36776183
Alignment:
Q  55 tttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  36776228 tttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaa 36776183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 43889218 - 43889165
Alignment:
Q  47 ttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  43889218 ttggcaagtttgaatttacctcattcaaaggtaacacgattgttggagttggaa 43889165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 49817363 - 49817307
Alignment:
Q  44 tgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  49817363 tgtttggcaagtttgaatttaccccattcaggggtaagacaattgttgtagttggaa 49817307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 34152779 - 34152708
Alignment:
Q  29 atgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||| ||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  34152779 atgctggagtcatgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcaagggtaagataattgttgcagttggaa 34152708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 49423476 - 49423425
Alignment:
Q  45 gtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagtt 96  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  49423476 gtttggcaagtttgaatttaccacattcaaaggtaacacaattgttgtagtt 49423425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 49791653 - 49791602
Alignment:
Q  47 ttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgg 98  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  49791653 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagccaattgttgtagttgg 49791602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 102
Target Start/End: Original strand, 37867024 - 37867058
Alignment:
Q  68 cattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37867024 cattcaaaggtaagacaattgttgcagttggaatg 37867058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 4785133 - 4785088
Alignment:
Q  55 tttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  4785133 tttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaa 4785088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 14289929 - 14289864
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||| | |||| || ||||||| |||||||| ||||||||    
T  14289929 gagtcctgttgtttaggaagtttgaatttaccccattaaagggtaagataattgttgcagttggaa 14289864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 96
Target Start/End: Original strand, 17211760 - 17211829
Alignment:
Q  28 aatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctca-ttcaaaggtaagacaattgttgaagtt 96  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  17211760 aatgtttgagtcatgttgtttagcaagtttgaatttaccccatttcagaggtaagacaattgttgtagtt 17211829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 957165 - 957121
Alignment:
Q  54 gtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgg 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  957165 gtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaatttttgtagttgg 957121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Original strand, 42887000 - 42887056
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttg 91  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||    
T  42887000 gagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcagaggtaagataattgttg 42887056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 77)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 22 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 40588851 - 40588542
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40588851 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgcagttggaatgcaccttaccctgactaatg 40588752  T
Q  122 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaac 221  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40588751 acgatcttctggccgaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaac 40588652  T
Q  222 atgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctct 318  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||     
T  40588651 atgctcatcatgttttcgtcgttcgttaattccacccaagcgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaaggtgttccaccctcc 40588552  T
Q  319 ttgtgtctct 328  Q
    ||||||||||    
T  40588551 ttgtgtctct 40588542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Original strand, 45363157 - 45363458
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45363157 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaatg 45363256  T
Q  122 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||         ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  45363257 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacg---------tatcgatccactggaacatgatgtgctcccaaaac 45363347  T
Q  222 atgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctct 318  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||   ||  |||||||||||||||||     
T  45363348 atgctcgtcacgttttcgtcatttgttaattccacccaagtgaatgaaactctctgctcgtcgagcgttggacgtttatactgaaggtgttccaccctcc 45363447  T
Q  319 ttgtgtctctg 329  Q
    |||||||||||    
T  45363448 ttgtgtctctg 45363458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 17839625 - 17839354
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17839625 gagcgaaatgctcgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatg 17839527  T
Q  122 acgatcttct-ggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaa 220  Q
    |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17839526 acgatctttttggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaa 17839427  T
Q  221 catgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17839426 catgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcatcgagcgttgga 17839354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 69 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 34141120 - 34140858
Alignment:
Q  69 attcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatc 168  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  34141120 attcagaggtaagagaattgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttatggcgaaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatc 34141021  T
Q  169 tcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatga 268  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34141020 tcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgtccgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaaatgaatga 34140921  T
Q  269 aactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctct 328  Q
     |||||||||||||||||||||||||||   || ||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  34140920 tactctcccctcgtcgagcgttggatgtttataccgaaattgttccaccctccttgtgtctct 34140858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 24 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 20565057 - 20564751
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20565057 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-acctcattcaaagg-aatacaaatgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 20564960  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacat 223  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  20564959 gatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacat 20564860  T
Q  224 gctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctcttt 320  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   || | || |||||||||| || ||    
T  20564859 ggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgtgttccaccatcctt 20564760  T
Q  321 gtgtctctg 329  Q
    |||||||||    
T  20564759 gtgtctctg 20564751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Original strand, 39477144 - 39477455
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttggcaggtttgaatttatctcatt-caaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| | | |||| ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39477144 gagcgaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaatt-accccatttcagcggtaagataattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaa 39477242  T
Q  120 tgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaa 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39477243 tgacgatcttctggcggaatcaagttgttaatgatatctttagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaa 39477342  T
Q  220 acatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccct 316  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||   ||  ||| ||||||||||||    
T  39477343 acatgctcgtcatgttttcgtcgttctttaattccacccaagtgaatgatatcctcccctcgtcgagcgttggacgtttatactgaacgtgttccaccct 39477442  T
Q  317 ctttgtgtctctg 329  Q
    | |||||| ||||    
T  39477443 ccttgtgtatctg 39477455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 75 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 41217863 - 41217647
Alignment:
Q  75 aggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagca 174  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41217863 aggtaagacaattgctgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggtggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagca 41217764  T
Q  175 tcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactct 274  Q
     ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  41217763 acgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcactttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactct 41217664  T
Q  275 cccctcgtcgagcgttg 291  Q
    |||||||||||||||||    
T  41217663 cccctcgtcgagcgttg 41217647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18237819 - 18237598
Alignment:
Q  69 attcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatc 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18237819 attcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaactgttgatgatatcttcagttgatc 18237720  T
Q  169 tcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatga 268  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  18237719 tcagcaacgttacccgcataccgatccactggaacatgatgtgctcccaaaatatgctcgtcatgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatga 18237620  T
Q  269 aactctcccctcgtcgagcgtt 290  Q
      ||||||||| ||||||||||    
T  18237619 tcctctccccttgtcgagcgtt 18237598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 78 - 293
Target Start/End: Original strand, 48220705 - 48220918
Alignment:
Q  78 taagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcg 177  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48220705 taagataattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttatggtggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctcagcaccg 48220804  T
Q  178 tcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctccc 277  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  48220805 tcacctgcatattgatccactggaacatgctgtgctccc--aacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccaccaaagtgaatgatactctccc 48220902  T
Q  278 ctcgtcgagcgttgga 293  Q
    ||||||||||||||||    
T  48220903 ctcgtcgagcgttgga 48220918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 24 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 10523367 - 10523099
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10523367 gcgaaatgcttgagtccttttgtttgacaagtttgaatt-accacattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatacaccttaccctaactaatgac 10523270  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccact-gtaacatgttgtgctcccaaaaca 222  Q
    ||| ||| |||||||||||  | |||||||||| |||||||||||| || | | |||||||||||| |||||||  | ||||||| ||||||||||||||    
T  10523269 gattttcaggcggaatcaaacttttgatgatatattcagttgatctaagaaacttcacccgcatatcgatccacaagaaacatgtggtgctcccaaaaca 10523170  T
Q  223 tgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10523169 tgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccaacaaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttgga 10523099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 47269152 - 47268891
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||| |||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||    
T  47269152 ttcacaggtaagctaattgttgtagttggaatgcatcttaccctaattaatgacgatcttttggcggaatcaaattgttgatgatatttttagttaatct 47269053  T
Q  170 cagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaa 269  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||     
T  47269052 cagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgat 47268953  T
Q  270 actctcccctcgtcgagcgttggatg-ttat-cgaaggtgttccaccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||| |||| || |||||||||| ||| |||||||    
T  47268952 actctcccctcgtcgagcgctggacgtttatacgaacgtattccaccctccttgcgtctctg 47268891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 30360763 - 30360550
Alignment:
Q  77 gtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatc 176  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||| |    
T  30360763 gtaagacaatagttatagttggaatgcacattaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaactttttatgatatcttcagttgatctcagcaac 30360664  T
Q  177 gtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcc 276  Q
    | |||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30360663 g-cacccgcatatcaatccactagaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgttacgttttcgtcgttttttaattccacccaagtgaatgatactctcc 30360565  T
Q  277 cctcgtcgagcgttg 291  Q
    |||||||||||||||    
T  30360564 cctcgtcgagcgttg 30360550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 48270856 - 48270640
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  48270856 ctaacgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 48270757  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||    
T  48270756 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccactcaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtctataccgaacgtgttcca 48270657  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| || ||||||||    
T  48270656 ccctccttttgtctctg 48270640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 70 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 17183469 - 17183243
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgat---cttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttga 166  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  17183469 ttcagaggtaagacaattgttgcagttggaatgcacctcaccctaactaatgacgatgatcttctggcagaatcaaacttttgatgatatcttcagttga 17183370  T
Q  167 tctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaat 266  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17183369 tctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgcttccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaat 17183270  T
Q  267 gaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    || | ||| ||||||||||| ||||||    
T  17183269 gatattcttccctcgtcgagtgttgga 17183243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 79 - 329
Target Start/End: Original strand, 20378665 - 20378918
Alignment:
Q  79 aagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgt 178  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | |    
T  20378665 aagacaattgttgtagttggaatgcaccttactctaactaatgatgatcttctggcggaatcaagttgttaattatatcttcagttgatctcagcaacat 20378764  T
Q  179 cacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccc 278  Q
    |||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  20378765 cacccgcatatctgtccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgataccctcccc 20378864  T
Q  279 tcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctctg 329  Q
    |||| | || ||||| ||   || |||| || |||||||||| |||||||||||    
T  20378865 tcgttgtgcattggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctctg 20378918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 116 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 41048991 - 41048814
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  41048991 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 41048892  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  41048891 caaaacatgctcgtcgcgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcacctcgtcgagcgttgga 41048814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Original strand, 9367029 - 9367243
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9367029 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-acctcattcaaagg-aatacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 9367126  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacat 223  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9367127 gatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacat 9367226  T
Q  224 gctcgtcacgttttcgt 240  Q
    | |||||||||||||||    
T  9367227 ggtcgtcacgttttcgt 9367243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Original strand, 21187298 - 21187514
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  21187298 ctaatgacgatcttctgacggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactagaacatgttgtgctcc 21187397  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || |||| ||||| ||    
T  21187398 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcaatcgttaattctacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgtttca 21187497  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| |||||||||||    
T  21187498 ccctccttgtgtctctg 21187514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 327
Target Start/End: Original strand, 21614710 - 21614973
Alignment:
Q  66 ctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttg 165  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |  | || ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  21614710 ctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttgaaaggtgcatttccctacctaatcacgaacttctggcggaatcaaaattttgatgatatcttcagttg 21614808  T
Q  166 atctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaa 265  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  21614809 atctcagcaacgttacccgcatatcgatccactagaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcgcgttttcgtcgttcgttaattccacccaaatgaa 21614908  T
Q  266 tgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctc 327  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||| | ||   ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21614909 tgatactcttccctcgtcgagcgttgaacgtttatatcgaacgtgttccaccctccttgtgtctc 21614973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 116 - 326
Target Start/End: Original strand, 36393823 - 36394036
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  36393823 ctaatgaagatcttatggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatattgtgctcc 36393922  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||   || |||| ||||||||    
T  36393923 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacacaagtgaatgatattctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccgaacgtgttcca 36394022  T
Q  313 ccctctttgtgtct 326  Q
    ||||| ||||||||    
T  36394023 ccctccttgtgtct 36394036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 232
Target Start/End: Original strand, 2205990 - 2206152
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2205990 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttatcctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatct 2206089  T
Q  170 cagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcac 232  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2206090 cagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatattgtgctcccaaaacatgctcgtcac 2206152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Original strand, 15337904 - 15338120
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  15337904 ctaatgacgatcttctggcggaatcagactgtttataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactgaaacatgttgtgctcc 15338003  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga---tgttatcgaaggtgttcca 312  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |   |  || |||| ||||||||    
T  15338004 caaaacatgctcatcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgttgagcgttgaacatttataccgaacgtgttcca 15338103  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| |||||||||||    
T  15338104 ccctccttgtgtctctg 15338120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 116 - 293
Target Start/End: Original strand, 48315179 - 48315356
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  48315179 ctaatgacgatcttatggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatctactggaacatgttgtgctcc 48315278  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||    
T  48315279 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatgctctcctctcgttgagcgttgga 48315356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 119 - 329
Target Start/End: Original strand, 46862196 - 46862409
Alignment:
Q  119 atgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaa 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  46862196 atgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatcatatcttcagttaatctcagcaacgtcactcgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaa 46862295  T
Q  219 aacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccc 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || |||| |||||||||||    
T  46862296 aacaagctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccatccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccc 46862395  T
Q  316 tctttgtgtctctg 329  Q
    || || ||||||||    
T  46862396 tccttctgtctctg 46862409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Original strand, 43351099 - 43351314
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||| |||||||     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  43351099 ctaatgacgatcttctggtggaatcagacatttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcaccc-catatcgatccactggaacatgttgtgctcc 43351197  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||| ||||||||    
T  43351198 caaaacatgctcgtcatgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcatcgagcgttggacgtttatactgaacgtgttcca 43351297  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| |||||||||||    
T  43351298 ccctccttgtgtctctg 43351314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 116 - 293
Target Start/End: Original strand, 30354814 - 30354991
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  30354814 ctaatgacgatcttttggcagaatcaaacttttgatgatatcttcagctgatctcagcaacgtcatccacatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 30354913  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  30354914 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatacgctcccctcgtcgaacgttgga 30354991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 70 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 2356543 - 2356282
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||    | || ||||| ||||| ||| |||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  2356543 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaagatgcatttccctacctaatcacggtcttatagcggaatcaaatttttgatgatatcttcagttgatct 2356444  T
Q  170 cagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaa 269  Q
    || || ||| || ||||||| |||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  2356443 caacaacgttactcgcatatcgatccattggaacatgctgttctcccaaaacatgctcgtcacatttttgtcgttcgttaattccatccaagtgaatgat 2356344  T
Q  270 actctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctct 328  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||   || |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  2356343 actctcccctcttcgagcgttggatgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtgtctct 2356282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 42735470 - 42735255
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||  || ||||||||||||    
T  42735470 ctaatgacgatcttcttgcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgattcactagaatatgttgtgctcc 42735371  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |||||||||||| ||   || |||| ||||||||    
T  42735370 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgataatcttccc-catcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 42735272  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| || ||||||||    
T  42735271 ccctccttctgtctctg 42735255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 113 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 21650735 - 21650518
Alignment:
Q  113 taactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgc 212  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||     
T  21650735 taactaatgatgatcttatggcggaatcagactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccacatatcgatccactggaacatgttgtga 21650636  T
Q  213 tcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgtt 309  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   ||  ||| |||||    
T  21650635 tcccataacatgctcgtcacattttcgtcgttcgttaattcctcccaactgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataatgaacgtgtt 21650536  T
Q  310 ccaccctctttgtgtctc 327  Q
    |||||||| |||||||||    
T  21650535 ccaccctccttgtgtctc 21650518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 74 - 327
Target Start/End: Original strand, 1642545 - 1642800
Alignment:
Q  74 aaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagc 173  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |  | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  1642545 aaggtaagacaattgttgtagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcaaactgttgataatatcttcagttgatctcaac 1642643  T
Q  174 atcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactc 273  Q
    | ||| || ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| | ||    
T  1642644 aacgttacacgcatatcgatccacttgaacatgttgtgctcccaaaacatgctcctcacgttttcatcgttcgttaattccacccaactaaatgatattc 1642743  T
Q  274 tcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctc 327  Q
    ||||||||||||| |||| | ||   |||| || || |||||||||| |||||||||    
T  1642744 tcccctcgtcgagtgttgaacgtttatatcaaacgtattccaccctccttgtgtctc 1642800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Original strand, 28114392 - 28114608
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||| ||||| || | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| || |||||||||||||||    
T  28114392 ctaatgacaatcttttgacagaatcaaatttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccacatttcgatccattggaacatgttgtgctcc 28114491  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||   || |||| ||||||||    
T  28114492 taaaacatgctcgtcatgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgggcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 28114591  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| |||| ||||||    
T  28114592 ccctccttgtttctctg 28114608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 155 - 326
Target Start/End: Original strand, 28979060 - 28979234
Alignment:
Q  155 atcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattcc 254  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |    
T  28979060 atcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgtttttgtcgctcgttaatttc 28979159  T
Q  255 acccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtct 326  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  28979160 acccaagtgaatgatactctcctctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtgtct 28979234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 13920604 - 13920419
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13920604 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcatcttaccctaactaatgac 13920507  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtg 211  Q
    |||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  13920506 gatcttatggcgaaatcaaatttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacctgcatatcgatccactgtaatatgctgtg 13920419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 34139467 - 34139332
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34139467 gagcgaaatgctcgagtcctattgcttgacaggtttgaatttatctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatg 34139369  T
Q  122 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatct 158  Q
    ||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||    
T  34139368 acgatcttctggcagaatcaaacttttgatgatatct 34139332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 177 - 329
Target Start/End: Original strand, 26603265 - 26603420
Alignment:
Q  177 gtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcc 276  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  26603265 gtcacccacatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgctctttaattccacccaagtgaatgataccctcc 26603364  T
Q  277 cctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctctg 329  Q
    | ||||||||||||||| ||   || |||| || |||||||||| |||||||||||    
T  26603365 cttcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctctg 26603420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 171
Target Start/End: Original strand, 26601731 - 26601832
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  26601731 ttcagaggtaagataattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaactattgatgatatcttcagttgatct 26601830  T
Q  170 ca 171  Q
    ||    
T  26601831 ca 26601832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Original strand, 17839780 - 17839859
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  17839780 gaaatgcttgagtcctgttgtttgacaggtttgaatctatctcattcaaaggtaacacaattgttggagttggaatgcac 17839859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 105
Target Start/End: Original strand, 40589015 - 40589098
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  40589015 gagcgaaatacttgagtcctgttgtttgacaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaaaatttgaagttggaatgcac 40589098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 105
Target Start/End: Original strand, 17183688 - 17183766
Alignment:
Q  27 aaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17183688 aaatgcttgagtcctgttgtttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 17183766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 9366859 - 9366778
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  9366859 gcgaaatgcttgagtcctgttgttttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcac 9366778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 105
Target Start/End: Original strand, 10523541 - 10523618
Alignment:
Q  28 aatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  10523541 aatgcttgagtcctgttgttttgcaggtttgaatttatcacattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaatgcac 10523618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Original strand, 17320163 - 17320272
Alignment:
Q  79 aagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgt 178  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | ||||||||||||| ||||||||| |||| | |    
T  17320163 aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgattttatggcagaatcaaacttttgatgatatcttaagttgatctaagcaactt 17320262  T
Q  179 cacccgcata 188  Q
    || |||||||    
T  17320263 caaccgcata 17320272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Original strand, 18238034 - 18238115
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18238034 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggctagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 18238115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Original strand, 20565227 - 20565308
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  20565227 gcgaaatgcttgagtcctgttgttttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcac 20565308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 105
Target Start/End: Original strand, 13920775 - 13920855
Alignment:
Q  25 cgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  13920775 cgaaatgcttgagtcctgtagttttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttggagttggaatgcac 13920855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 130
Target Start/End: Original strand, 28978956 - 28979065
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgt-tgtttggcaggtttgaatttatctcatt-caaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaa 119  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28978956 gagcgaaatgctttagtcctggctgtttggcaagtttgaatt-accccatttcagaggtaagacaattgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaa 28979054  T
Q  120 tgacgatcttc 130  Q
    |||||||||||    
T  28979055 tgacgatcttc 28979065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 45362993 - 45362910
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  45362993 gagcgaaatgtttgagtcctgttgtttaacaagtttgaatttatctcatttaaaggtaagacaattgttgcagttagaatgcac 45362910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 208 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 13916949 - 13916825
Alignment:
Q  208 tgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaag 304  Q
    ||||||||||||||||| || |||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || | ||     
T  13916949 tgtgctcccaaaacatggtcatcacatttttgtcattcgttaattcaacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaat 13916850  T
Q  305 gtgttccaccctctttgtgtctctg 329  Q
    |||||||||| || |||||||||||    
T  13916849 gtgttccaccatccttgtgtctctg 13916825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 103
Target Start/End: Original strand, 30360985 - 30361064
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30360985 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcgaatttgaatttacccaattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgc 30361064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 26601509 - 26601435
Alignment:
Q  31 gcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  26601509 gcttgagtcctgttgtttggcaagtttgaatttaccccattaaaaggtaagacaattgttgtacttggaatgcac 26601435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 34157108 - 34157032
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgga 99  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  34157108 gagcgaaatgctcgagtcctattgcttgacaggtttgaatttatctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttgga 34157032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 48220482 - 48220401
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  48220482 gcgaaatgcttgagtcttattgtttggcaagtttgaatttgccccattcaaaggtgagacaattgttgtagttggaatgcac 48220401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Original strand, 34157276 - 34157354
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  34157276 gaaatgcttgagtcttgttgtttgacaagtttgaatctatctcattcaaaggtaaca-aattgttgtagttggaatgcac 34157354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Original strand, 41218084 - 41218163
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41218084 gaaatgcttgagtcatgttgcttggcaagtttaaatttggcccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 41218163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 228 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 42683052 - 42682948
Alignment:
Q  228 gtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgt 324  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||  ||||||| ||   || |||| ||||||||||||| ||||||    
T  42683052 gtcacgttttcgttgttcgttaattccaccaaagtgaatgatattctcccctcgtcgttcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtgt 42682953  T
Q  325 ctctg 329  Q
    |||||    
T  42682952 ctctg 42682948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Original strand, 34141334 - 34141415
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  34141334 gcgaaatacttgagtcctgttgttaggccagtttgaatttactccattcaaaggtaagacaattgttgtagttgaaatgcac 34141415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 39476977 - 39476898
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||| || ||||||| |||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  39476977 gaaatgttttagtcctgctgtttgacaagtttgaatttacatcattcaaaggtaagacaattgttatagttggaatgcac 39476898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 15337632 - 15337567
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15337632 gagtcctgctgtttggcaagtttaaatttacctcattcagaggtaagacaattgttgtagttggaa 15337567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 170
Target Start/End: Original strand, 3380628 - 3380727
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| |  | || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  3380628 ttcagaggtaagacaattgttgtcgttggaaggtgcatt-ccctacctaatcacgatcttctggcagaatcaaattgttgagaatatcttcagttgatct 3380726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 21614507 - 21614447
Alignment:
Q  40 ctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21614507 ctgttgtttgacaagtttgaatttacctcattcaaaggtaagataattgttgtagttggaa 21614447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 28978944 - 28978872
Alignment:
Q  33 ttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28978944 ttgagtcctattgtttgacaagtttgaattgacccaattcaaaggtaagacaattgttggagttggaatgcac 28978872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 100
Target Start/End: Original strand, 21651001 - 21651068
Alignment:
Q  33 ttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  21651001 ttgagtcctgctgcttggcaagtttgaatttatcccattcagaggtaacacaattgttgtagttggaa 21651068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Original strand, 10224547 - 10224612
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  10224547 gagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaa 10224612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 21187026 - 21186961
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||| || |||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21187026 gagtcctgctgcttgggaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 21186961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 28114120 - 28114055
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  28114120 gagtcatgttgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttggagttggaa 28114055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 46861921 - 46861856
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||| || |||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46861921 gagtcctgctgcttggaaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgcagttggaa 46861856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 100
Target Start/End: Original strand, 48271140 - 48271193
Alignment:
Q  47 ttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48271140 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 48271193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 30354542 - 30354479
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgg 98  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  30354542 gagtcctgctgcttggcaagtttgaatttacctcattcaaaggtaacacagttgttgtagttgg 30354479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 20877536 - 20877471
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||| ||||||||    
T  20877536 gagtcctgctgtttagcaagtttgaatttacctcatttagaggtaagataattgttgtagttggaa 20877471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 102
Target Start/End: Original strand, 42735693 - 42735766
Alignment:
Q  29 atgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatg 102  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||| ||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  42735693 atgctggagtcatgctgttttgcaagtttgaatttaccccattcaagggtaagataattgttgcagttggaatg 42735766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 11824907 - 11824847
Alignment:
Q  110 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctc 170  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||    
T  11824907 ccctacctaatcacgatcttctagcggaatcaaactgttgaaaatatcttcagttgatctc 11824847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28066463 - 28066359
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||  | ||||  ||||||||||  |||||||||| ||| ||   ||||| ||||||| | ||||||||||||| |    
T  28066463 ctaatcacgatgttctggcggaatcaaacttttgagaatatcttcagacgatctcagcaacgtgacaaacatatcgatccacaggaacatgttgtgctgc 28066364  T
Q  216 caaaa 220  Q
    |||||    
T  28066363 caaaa 28066359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 36393540 - 36393489
Alignment:
Q  47 ttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgg 98  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  36393540 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttggagttgg 36393489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Original strand, 17183936 - 17184001
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||| || || ||| ||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  17183936 gagtcctgctggttagcaagtttgaatttgccccattcaaaggcaagacaattgttgtagttggaa 17184001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 21614187 - 21614122
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||| || |||||||| || |||||    
T  21614187 gagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcaaaggtatgataattgttgtaggtggaa 21614122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 28113878 - 28113813
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| | |||| | |||||||| |||||||| ||||||||    
T  28113878 gagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccatttagaggtaagataattgttgcagttggaa 28113813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 18149729 - 18149681
Alignment:
Q  122 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctc 170  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||    
T  18149729 acgatcttctggcgcaatcaaactgttgagaatatcttcagttgatctc 18149681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 40)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 29066857 - 29066547
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29066857 gagcgaaatgcttgagtcatgttgtttggcaggtttgaatttatatcattcaaagataagaaaattgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaatg 29066758  T
Q  122 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaac 221  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  29066757 acgatctactggcggaatcaagttgttgatcatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaac 29066658  T
Q  222 atgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctct 318  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||     
T  29066657 atgctcttcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaaggtgttccaccctcc 29066558  T
Q  319 ttgtgtctctg 329  Q
    |||||||||||    
T  29066557 ttgtgtctctg 29066547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 29075870 - 29075560
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29075870 gagcgaaatgcttgagtcatgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaacgataagaaaattgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaatg 29075771  T
Q  122 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaac 221  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  29075770 acgatctgctggcggaatcaagttgttgatcatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaac 29075671  T
Q  222 atgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctct 318  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||     
T  29075670 atgctcttcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaaggtgttccaccctcc 29075571  T
Q  319 ttgtgtctctg 329  Q
    |||||||||||    
T  29075570 ttgtgtctctg 29075560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 29108444 - 29108134
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29108444 gagcgaaatgcttgagtcatgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaacgataagaaaattgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaatg 29108345  T
Q  122 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaac 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  29108344 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatcatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaac 29108245  T
Q  222 atgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctct 318  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   || |  |||||||||||||||     
T  29108244 atgctcttcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccacaggtgttccaccctcc 29108145  T
Q  319 ttgtgtctctg 329  Q
    |||||||||||    
T  29108144 ttgtgtctctg 29108134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 29110842 - 29110531
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29110842 gagcgaaatgcttgagtcatgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaacgataagaaaattgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaatg 29110743  T
Q  122 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaac 221  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  29110742 acgatctgctggcggaatcaagttgttgatcatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaac 29110643  T
Q  222 atgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccc-tc 317  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   || |||||||||||||||| ||    
T  29110642 atgctcttcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaaggtgttccacccatc 29110543  T
Q  318 tttgtgtctctg 329  Q
     |||||||||||    
T  29110542 cttgtgtctctg 29110531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 24 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 27640480 - 27640174
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27640480 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-acctcattcaaagg-aagacaaatgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 27640383  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacat 223  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  27640382 gatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgcttccaaaacat 27640283  T
Q  224 gctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctcttt 320  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || | || |||||||||| || ||    
T  27640282 ggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaatgtgttccaccatcctt 27640183  T
Q  321 gtgtctctg 329  Q
    |||||||||    
T  27640182 gtgtctctg 27640174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 24 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 6205784 - 6205478
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6205784 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-acctcattcaaagg-aatacaaatgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 6205687  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacat 223  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  6205686 gatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacat 6205587  T
Q  224 gctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctcttt 320  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   || | || |||||||||| || ||    
T  6205586 ggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgtgttccaccatcctt 6205487  T
Q  321 gtgtctctg 329  Q
    |||||||||    
T  6205486 gtgtctctg 6205478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 27 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 11692748 - 11692484
Alignment:
Q  27 aaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgat 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11692748 aaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-acctcattcaaagg-aatacaaatgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgat 11692651  T
Q  127 cttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgct 226  Q
    ||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |    
T  11692650 cttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgcttccaaaacatgtt 11692551  T
Q  227 cgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  11692550 cgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctccccttgtcgagtgttgga 11692484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 801468 - 801160
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaat 120  Q
    |||||||||||||||||| ||   |||| ||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  801468 gagcgaaatgcttgagtcttggccgtttcgcaagtttgaatt-acctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaat 801371  T
Q  121 gacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaa 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  801370 gacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaa 801271  T
Q  221 catgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctc 317  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||   || | || || ||||||||||    
T  801270 catggtcgtcacgttttcgtcgttctttaactctacccaagtgaatgacac-ctcccctcgtcgagctttggacgtttataccaaacgtattccaccctc 801172  T
Q  318 tttgtgtctctg 329  Q
     |||||||||||    
T  801171 cttgtgtctctg 801160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 75 - 293
Target Start/End: Original strand, 35058693 - 35058911
Alignment:
Q  75 aggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagca 174  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35058693 aggtaagacaattgttgtagttggaatgtaccttaccctaactaatgacgatcttcttgtggaattaagatgttgatgatatctttagttgatctcagca 35058792  T
Q  175 tcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactct 274  Q
     ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  35058793 acgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtaacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactct 35058892  T
Q  275 cccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    |||||||||||||||||||    
T  35058893 cccctcgtcgagcgttgga 35058911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 39 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 13402821 - 13402527
Alignment:
Q  39 cctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcg 135  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| || |||||  ||||  | | || || ||||||||||||||||||||    
T  13402821 cctgtcgtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttctggcg 13402724  T
Q  136 gaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgtt 235  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13402723 gaatcaaatttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgggctcccaaaacatgctcgtcacgtt 13402624  T
Q  236 ttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga---tgttatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||  ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  13402623 ttcgtcgttcgttaattccactcaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacatttatacagaacgtgttccaccctccttgtgtctctg 13402527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 329
Target Start/End: Original strand, 32027545 - 32027843
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttct 131  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| || |||||  ||||  | | || || ||||||||||||||||    
T  32027545 gagtcctgccgtttggcatgtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttct 32027642  T
Q  132 ggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtca 231  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027643 ggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcaatccactagaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtca 32027742  T
Q  232 cgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctct 328  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||   || |||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  32027743 cgttttcgtcattcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgaatgttggacgtttataccgaacgtgttcaaccctccttgtgtctct 32027842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Original strand, 32037686 - 32037902
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||    
T  32037686 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcaatccactagaacatgttgtgctcc 32037785  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||   || |||| |||||| |    
T  32037786 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcattcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgaatgttggacgtttataccgaacgtgttcaa 32037885  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| |||||||||||    
T  32037886 ccctccttgtgtctctg 32037902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 116 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 12396986 - 12396816
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  12396986 ctaatgacgatcttttggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagtagatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcc 12396887  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgag 286  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12396886 caaaacatgctcgtcatgttttcgtcgttcgttaattccacccaattgaatgatactctcccctcgtcgag 12396816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Original strand, 34802895 - 34803111
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  34802895 ctaatgacgatcttttggcgaaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatttactggaacatgttgtgctcc 34802994  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||    
T  34802995 ctgaacatgctcatcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtcaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 34803094  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| |||||||||||    
T  34803095 ccctccttgtgtctctg 34803111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 79 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 14115283 - 14115070
Alignment:
Q  79 aagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgt 178  Q
    ||||||||||||| |||||||| |  | || ||||| ||||| || |||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  14115283 aagacaattgttgtagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcactatcttctggcagaatcagactcttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgt 14115185  T
Q  179 cacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccc 278  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  14115184 tacccgcatattgatccactggaacatgttgtgctcccagaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttacttccacccaagtgaatgatactctcccc 14115085  T
Q  279 tcgtcgagcgttgga 293  Q
    |||||||||||||||    
T  14115084 tcgtcgagcgttgga 14115070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 147 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22305975 - 22305829
Alignment:
Q  147 ttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  22305975 ttgatgatatcttcagttgatctaaccaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatggtcgtgacgttttcgtcgttcg 22305876  T
Q  247 ttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22305875 ttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttgga 22305829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 116 - 267
Target Start/End: Original strand, 30257578 - 30257729
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  |||||| ||||||||    
T  30257578 ctaatgacgatcttctagcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccacatatcgatccactagaacatgatgtgctcc 30257677  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatg 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  30257678 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaattccacccaactgaatg 30257729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 188
Target Start/End: Original strand, 24021006 - 24021168
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24021006 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 24021103  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcata 188  Q
    ||| || ||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||    
T  24021104 gattttatggcggaatcaaacttttgatgatatcttaagttgatctaagcaacttcacccgcata 24021168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 2192697 - 2192535
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2192697 gcgaaatgctcgagtcctgttgttcgacaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 2192600  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcata 188  Q
    ||| || ||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||    
T  2192599 gattttatggcggaatcaaaattttgatgatatcttaagttgatctaagcaacttcacccgcata 2192535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 196
Target Start/End: Original strand, 3765745 - 3765867
Alignment:
Q  75 aggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatc-aagttgttgatgatatcttcagttgatctcagc 173  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  3765745 aggtaagacaattgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaatgatgatcttctggtggaatttaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagc 3765844  T
Q  174 atcgtcacccgcatattgatcca 196  Q
    | |||||||||||||| ||||||    
T  3765845 aacgtcacccgcatatcgatcca 3765867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 105
Target Start/End: Original strand, 29067021 - 29067104
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29067021 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaggtttgaatttatctcattcaaatgtaagacaattgttgcagttggaatgcac 29067104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 105
Target Start/End: Original strand, 29108608 - 29108691
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29108608 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaggtttgaatttatctcattcaaatgtaagacaattgttgcagttggaatgcac 29108691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Original strand, 6205954 - 6206035
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  6205954 gcgaaatgcttgagtcctgttgttttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaatgcac 6206035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Original strand, 11692921 - 11693002
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  11692921 gcgaaatgcttgagtcctgttgttttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcac 11693002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Original strand, 27640650 - 27640730
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  27640650 gcgaaatgtttgagtcctgttgttttgcaggtttgaatt-atctcattcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcac 27640730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 35058471 - 35058392
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35058471 gaaatgcctgagtcctgttgtttggagagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 35058392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 100
Target Start/End: Original strand, 801634 - 801710
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  801634 gcgaaatgcttgagtcctgtcgttttgccagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 801710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 24020836 - 24020755
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||    
T  24020836 gcgaagtgcttgagtcctgttgttttccaagtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtggttgaaatgcac 24020755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 98
Target Start/End: Original strand, 12397258 - 12397321
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgg 98  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12397258 gagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttgg 12397321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Original strand, 2192867 - 2192942
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||      |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||    
T  2192867 gcgaaatgcttgagtcctgttgttt------tttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtggttgaaatgcac 2192942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Original strand, 13403297 - 13403362
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||| || ||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13403297 gagtcctgctgcttgacaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 13403362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 164
Target Start/End: Original strand, 35021237 - 35021284
Alignment:
Q  117 taatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagtt 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  35021237 taatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagtt 35021284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 32027112 - 32027047
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  32027112 gagtcctgttgtttagcaagtttgaatttaccacattcaggggtaagataattgttgcagttggaa 32027047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 32027355 - 32027290
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    ||||| ||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  32027355 gagtcatgttgcttgacaagtttgaatttacctcattcaaaggtaacataattgttgtagttggaa 32027290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 32037171 - 32037106
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  32037171 gagtcctgttgtttagcaagtttgaatttaccacattcaggggtaagataattgttgcagttggaa 32037106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 32037414 - 32037349
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    ||||| ||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  32037414 gagtcatgttgcttgacaagtttgaatttacctcattcaaaggtaacataattgttgtagttggaa 32037349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 170
Target Start/End: Original strand, 17465289 - 17465388
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |    || | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||    
T  17465289 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaaggtgtatt-ctctacctaatcacgatcttttggcggaatcaaactgttgagaatatcttcagttgatct 17465387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 100
Target Start/End: Original strand, 4495600 - 4495671
Alignment:
Q  29 atgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  4495600 atgctggagtcatgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcagaggtaagacaattattgcagttggaa 4495671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 105
Target Start/End: Original strand, 14123102 - 14123153
Alignment:
Q  54 gtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  14123102 gtttgaatttaccccatttaaaggtaagacaatttttgtagttggaatgcac 14123153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 35020964 - 35020901
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgg 98  Q
    |||||||| || ||| || ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  35020964 gagtcctgctgcttgtcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttgg 35020901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 114)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 43477371 - 43477061
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  43477371 gagcgaaatgcttgactcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacagttgttgaagttggaatgcacattaccctaattaatg 43477272  T
Q  122 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  43477271 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcggttgatctcatcaacgtcacctgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaac 43477172  T
Q  222 atgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctct 318  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   || | ||||||||||||||||     
T  43477171 atgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaaggtgttccaccctcc 43477072  T
Q  319 ttgtgtctctg 329  Q
    |||||||||||    
T  43477071 ttgtgtctctg 43477061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 22 - 328
Target Start/End: Original strand, 49218641 - 49218950
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49218641 gagcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacatgtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgcagttggaatgcactttaccctaactaatg 49218740  T
Q  122 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaac 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  49218741 acgatcttctggcggaatcaagttgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgtcactcgcatatcgatccactggaacatgttgcgctcccaaaac 49218840  T
Q  222 atgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctct 318  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||   || | ||||||||||||||||     
T  49218841 atgttcgtcacgttttcgccgtttgttaattccacccaagtgaatgatattctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaaggtgttccaccctcc 49218940  T
Q  319 ttgtgtctct 328  Q
    ||||||||||    
T  49218941 ttgtgtctct 49218950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 77 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 49610748 - 49610493
Alignment:
Q  77 gtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatc 176  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  49610748 gtaagacaattgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaac 49610649  T
Q  177 gtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcc 276  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49610648 gtcacccgcatatcgacccactggaacatactgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcc 49610549  T
Q  277 cctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49610548 cctcgtcgagcgttggacgtttatatcgaaggtgttccaccctccttgtgtctctg 49610493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 77 - 329
Target Start/End: Original strand, 51695566 - 51695821
Alignment:
Q  77 gtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatc 176  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51695566 gtaagacaattattgcagttggaatgcaccttaccctaactaatgatgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaac 51695665  T
Q  177 gtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcc 276  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  51695666 gtcacccgcatatcgatccactggaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcacgtattcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaacttttc 51695765  T
Q  277 cctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||||||||||||||| ||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51695766 cctcgtcgagcgttggacgtttataccgaaggtgttccaccctccttgtgtctctg 51695821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 70 - 327
Target Start/End: Original strand, 34693243 - 34693503
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  34693243 ttcagaggtaagacaattgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaagttttgatgatatcttcagttgatct 34693342  T
Q  170 cagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaa 269  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34693343 cagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgat 34693442  T
Q  270 actctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctc 327  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||   ||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  34693443 actcaaccctcgtcgagcgttggacgtttatactgaaggtgttccaccctccttgtgtctc 34693503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 328
Target Start/End: Original strand, 13895774 - 13896084
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttggcaggtttgaatttatctcatt-caaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||| || ||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  13895774 gagcgaaatgcttgagtcctggccgtttgacaagtttgaatt-accccatttcagaggtaagacaattgttgcagttggaatgcaccttaccttaactaa 13895872  T
Q  120 tgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaa 219  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  13895873 tgacgatcttctagcggaatcaagcttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaa 13895972  T
Q  220 acatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||||||    
T  13895973 acatgctcgtcacgttttcgtcgctcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccct 13896072  T
Q  317 ctttgtgtctct 328  Q
    | ||||||||||    
T  13896073 ccttgtgtctct 13896084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 75 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 44927724 - 44927469
Alignment:
Q  75 aggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagca 174  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44927724 aggtaagacaattgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcaaca 44927625  T
Q  175 tcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactct 274  Q
     |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  44927624 acgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatattct 44927525  T
Q  275 cccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctc 327  Q
    ||||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  44927524 cccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtgtctc 44927469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 293
Target Start/End: Original strand, 42949924 - 42950196
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcct-gttgtttggcaggtttgaatttatctcatt-caaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaa 119  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42949924 gagcgaaatgcttgagtcctaggcgtttggcaagtttgaatt-atcccatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaa 42950022  T
Q  120 tgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaa 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42950023 tgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtaaaccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaa 42950122  T
Q  220 acatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  42950123 acatgctcgtcacgttttcgtcattctttaactccatccaagtgaatgatactcttccctcgtcgagcgttgga 42950196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 24 - 329
Target Start/End: Original strand, 2646785 - 2647091
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2646785 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaggtttgaatt-accccattcaaatg-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 2646882  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacat 223  Q
    |||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  2646883 gatcttctagcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacat 2646982  T
Q  224 gctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctcttt 320  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||   || | || |||||||||| || ||    
T  2646983 ggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccatcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgtgttccaccatcctt 2647082  T
Q  321 gtgtctctg 329  Q
    |||||||||    
T  2647083 gtgtctctg 2647091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 24 - 329
Target Start/End: Original strand, 3494938 - 3495244
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3494938 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgaaaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 3495035  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacat 223  Q
    ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3495036 gatcttctggcagaatcaaacttttgatgatatcttaagttgatctaaacaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacat 3495135  T
Q  224 gctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctcttt 320  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   |||| || |||||||||| || ||    
T  3495136 ggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatatcaaacgtgttccaccatcctt 3495235  T
Q  321 gtgtctctg 329  Q
    |||||||||    
T  3495236 gtgtctctg 3495244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 24 - 329
Target Start/End: Original strand, 49139963 - 49140269
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49139963 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-acctcattcaaagg-aatacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 49140060  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacat 223  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  49140061 gatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacat 49140160  T
Q  224 gctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctcttt 320  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   || | || |||||||||| || ||    
T  49140161 ggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgtgttccaccatcctt 49140260  T
Q  321 gtgtctctg 329  Q
    |||||||||    
T  49140261 gtgtctctg 49140269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 24 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 54390752 - 54390446
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54390752 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-acctcattcaaagg-aatacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 54390655  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacat 223  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  54390654 gatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacat 54390555  T
Q  224 gctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctcttt 320  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   || | || |||||||||| || ||    
T  54390554 ggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgtgttccaccatcctt 54390455  T
Q  321 gtgtctctg 329  Q
    |||||||||    
T  54390454 gtgtctctg 54390446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 24 - 293
Target Start/End: Original strand, 2268403 - 2268670
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2268403 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 2268500  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacat 223  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  2268501 gatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatctactggaacatgatgtgctcccaaaacat 2268600  T
Q  224 gctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2268601 gcccgtcacgttttcgtcgttcgttaattccatccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttgga 2268670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 22 - 326
Target Start/End: Original strand, 24702176 - 24702483
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttggcaggtttgaatttatctcatt-caaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24702176 gagcgaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaatt-accccatttcagaggtaagacaattgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaa 24702274  T
Q  120 tgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaa 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24702275 tgacgatcttctggcggaatcaagcttttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgtcacctgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaa 24702374  T
Q  220 acatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccct 316  Q
    |||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||||||    
T  24702375 acatgtccgtcacgttttcgtcgttcg-taattccacccaagtgaatgatattctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccct 24702473  T
Q  317 ctttgtgtct 326  Q
    | ||||||||    
T  24702474 ccttgtgtct 24702483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 24 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 34050037 - 34049772
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34050037 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-acctcattcaaagg-aatacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 34049940  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacat 223  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  34049939 gatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacat 34049840  T
Q  224 gctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttg 291  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  34049839 ggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttg 34049772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 24 - 329
Target Start/End: Original strand, 4003996 - 4004302
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4003996 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttactctaactaatgac 4004093  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacat 223  Q
    ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  4004094 gatcttctggcagaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacat 4004193  T
Q  224 gctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgtt---atcgaaggtgttccaccctcttt 320  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||   | | || |||||||||| || ||    
T  4004194 gctcgtcacgtttttgtcgttcgttaattccacccacgtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttgaatgtttataccaaacgtgttccaccatcctt 4004293  T
Q  321 gtgtctctg 329  Q
    |||||||||    
T  4004294 gtgtctctg 4004302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 24 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 46403313 - 46403007
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46403313 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-acctcattcaaagg-aatacaaatgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 46403216  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacat 223  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  46403215 gatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacat 46403116  T
Q  224 gctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctcttt 320  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   || | || |||||||||| || ||    
T  46403115 ggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgtgttccaccatcctt 46403016  T
Q  321 gtgtctctg 329  Q
    |||||||||    
T  46403015 gtgtctctg 46403007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 27 - 293
Target Start/End: Original strand, 39416857 - 39417124
Alignment:
Q  27 aaatgcttgagtcctgtt-gtttggcaggtttgaatttatctcattcaa-aggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacg 124  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39416857 aaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaatt-atcccattttagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacg 39416955  T
Q  125 atcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatg 224  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39416956 atcttctggcgaaatcaagctattgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatg 39417055  T
Q  225 ctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    ||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39417056 ctcatcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttgga 39417124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 45 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 47065978 - 47065691
Alignment:
Q  45 gtttggcaggtttgaatttatctcatt-caaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaag 143  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47065978 gtttggcaagtttgaatt-acctcatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaag 47065880  T
Q  144 ttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgt 243  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  47065879 ttgttaatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactagaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcctcgt 47065780  T
Q  244 ttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctctg 329  Q
    |  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||   ||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  47065779 tctttaactccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcaagcgttggacgtttatactgaacgtattccaccctccttgtgtctctg 47065691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 293
Target Start/End: Original strand, 48087456 - 48087728
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttggcaggtttgaatttatctcattcaa-aggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  48087456 gagcgaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaatt-accccattttagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaattaa 48087554  T
Q  120 tgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaa 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  48087555 tgacgatcttctggtggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaatatgttgtgctcccaaa 48087654  T
Q  220 acatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48087655 acatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaggtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttgga 48087728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 24 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 36135317 - 36135051
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  36135317 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcatcttactctaactaatgac 36135220  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacat 223  Q
     ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  36135219 aatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatctactgaaacatgatgtgctcccaaaacat 36135120  T
Q  224 gctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  36135119 gctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatact-tcccctcgtcgagcgttgga 36135051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 75 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 42383312 - 42383094
Alignment:
Q  75 aggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagca 174  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42383312 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttgtcccaactaatgacgatcttctggcggaatcaacttgttgatgatatcttcagttgatctcagca 42383213  T
Q  175 tcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactct 274  Q
     ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  42383212 acgttacccgcatatcgatccactggaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactct 42383113  T
Q  275 cccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  42383112 cccctcgtcgagtgttgga 42383094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 70 - 317
Target Start/End: Original strand, 19453182 - 19453432
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  | ||||||||||||| |||||||||    
T  19453182 ttcagaggtaagagaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgatgatcttctggtggaatcaaacttttgatgatatctttagttgatct 19453281  T
Q  170 cagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaa 269  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  19453282 cagcaacgtcacccgcatatcgatccattggaacatgttgtgctcccataacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgat 19453381  T
Q  270 actctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctc 317  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||   ||||||| |||||||||||||    
T  19453382 actctccccttgtcgagcattggacgtttatatcgaacgtgttccaccctc 19453432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 70 - 329
Target Start/End: Original strand, 25576545 - 25576806
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  25576545 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaaataatgacgatcttctgacggaatcaagctattgatgatatcttcagttgatct 25576644  T
Q  170 cagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaa 269  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||     
T  25576645 cagcaacgttacccgcatatcgatcca-tggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgat 25576743  T
Q  270 actctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctctg 329  Q
    | |||||||||||||||||||||||||   || |||| || |||||||||| ||| |||||||    
T  25576744 aatctcccctcgtcgagcgttggatgtttataccgaacgtattccaccctccttgcgtctctg 25576806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 70 - 329
Target Start/End: Original strand, 53826649 - 53826911
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53826649 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 53826748  T
Q  170 cagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaa 269  Q
    ||||| ||| ||  |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||| || ||||||||||||||     
T  53826749 cagcaacgttacatgcatatcgatccattggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcatcacattttcgtcgttctttaactctacccaagtgaatgat 53826848  T
Q  270 actctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctctg 329  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||   || |||| || |||||||||| ||| |||||||    
T  53826849 actctcccctcgtcgagcattggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgcgtctctg 53826911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 24 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 50997698 - 50997456
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| | | |||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50997698 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-accccattcaaaag-aatacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 50997601  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacat 223  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  50997600 gatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatcaactggaacatgttgtgctcccaaaacat 50997501  T
Q  224 gctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  50997500 gctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccactcaagtgaatga 50997456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 78 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 42382529 - 42382314
Alignment:
Q  78 taagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcg 177  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42382529 taagacaattgttgtagttggaatgcacattgtcccaactaatgacgatcttctggcggaatcaacttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacg 42382430  T
Q  178 tcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctccc 277  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  42382429 ttacccgcatatcgatccactggaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccc 42382330  T
Q  278 ctcgtcgagcgttgga 293  Q
    ||||||||| ||||||    
T  42382329 ctcgtcgagtgttgga 42382314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 70 - 328
Target Start/End: Original strand, 44835440 - 44835701
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  44835440 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctgacggaatcaagctgttgatgatattttcagttgatct 44835539  T
Q  170 cagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaa 269  Q
    || || | | ||||||||||  |||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||     
T  44835540 caacaaccttacccgcatatccatccactggaacattctatgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaaatgaatgat 44835639  T
Q  270 actctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctct 328  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||   ||||||| || |||||||||| ||| ||||||    
T  44835640 actctcccctcgtcgaacgttgaatgtttatatcgaacgtattccaccctccttgcgtctct 44835701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Original strand, 46414333 - 46414549
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  46414333 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttaagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactagaacatgttgtgctcc 46414432  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||    
T  46414433 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctccactcgtcgagcgttggatgtttataccgaacgtgttcca 46414532  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| |||||||||||    
T  46414533 ccctccttgtgtctctg 46414549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 116 - 326
Target Start/End: Original strand, 34472075 - 34472288
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  34472075 ctaatgacgatcttctggcggaataaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 34472174  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||   || |||| ||||||||    
T  34472175 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtagagcgttggacgtttataccgaatgtgttcca 34472274  T
Q  313 ccctctttgtgtct 326  Q
    ||||| ||||||||    
T  34472275 ccctccttgtgtct 34472288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Original strand, 51013277 - 51013493
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||    
T  51013277 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatcttagcaacgtcacccgcatatcgatacactggaacatgttgtgttcc 51013376  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||   || |||| ||||||||    
T  51013377 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgttgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 51013476  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| |||||||||||    
T  51013477 ccctccttgtgtctctg 51013493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 116 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 41578126 - 41577949
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  41578126 ctaatgatgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcactcgcatattgatccactggaacatgctgtgctcc 41578027  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41578026 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttgga 41577949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 116 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 51015497 - 51015284
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  51015497 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtttcccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 51015398  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||    
T  51015397 caaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatacactcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 51015298  T
Q  313 ccctctttgtgtct 326  Q
    ||||| ||||||||    
T  51015297 ccctccttgtgtct 51015284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 30192758 - 30192542
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| ||| ||||    
T  30192758 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactagaacatgatgtactcc 30192659  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||    
T  30192658 caaaacatgctagacacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 30192559  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| |||||||||||    
T  30192558 ccctccttgtgtctctg 30192542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Original strand, 55206883 - 55207099
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  55206883 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 55206982  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||   || |||| ||||| ||    
T  55206983 caaaacatgctcgtcacattttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcacctcgtcgagcattggacgtttataccgaacgtgtttca 55207082  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| || ||||||||    
T  55207083 ccctccttctgtctctg 55207099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 116 - 327
Target Start/End: Original strand, 34647266 - 34647480
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  34647266 ctaatgacgatcttctagcgtaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcaatccactggaacatgttgtgctcc 34647365  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   ||  ||| ||||||||    
T  34647366 cgaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatactgaacgtgttcca 34647465  T
Q  313 ccctctttgtgtctc 327  Q
    ||||| |||||||||    
T  34647466 ccctccttgtgtctc 34647480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 2428707 - 2428491
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||    
T  2428707 ctaatgacgatcttctagcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactagaaaatgttgtgctcc 2428608  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||    
T  2428607 caaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatattatcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 2428508  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| || ||||||||    
T  2428507 ccctccttctgtctctg 2428491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 41804122 - 41803906
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||| ||||||||| || |||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  41804122 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgattatatcttcatttgatctcatcaacgtcactctcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 41804023  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||   || |||| ||||||||    
T  41804022 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttgaacgtttataccgaacgtgttcca 41803923  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| || ||||||||    
T  41803922 ccctccttttgtctctg 41803906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 116 - 326
Target Start/End: Original strand, 45100464 - 45100677
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  45100464 ctaatgacgatattatggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 45100563  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||    
T  45100564 caaaacatgctcgtcacatttttgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcccttcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 45100663  T
Q  313 ccctctttgtgtct 326  Q
    ||||| ||||||||    
T  45100664 ccctccttgtgtct 45100677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Original strand, 52569408 - 52569623
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  52569408 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaactcttgatgatatcttcagttgatctcagcaatgtcacccgcatatcgattcaccggaacatgttgtgctcc 52569507  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||    
T  52569508 caaaacatgctcgtcac-ttttcgtcgttcgttaattccacccaagcgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaatgtgttcca 52569606  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    || || || ||||||||    
T  52569607 ccatccttttgtctctg 52569623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 116 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 37281672 - 37281495
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  37281672 ctaatgacgatcttctggcggaattaaacttttgatgatatcttccgttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatgttgtgctcc 37281573  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||    
T  37281572 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaattccacccaagtgaatgataccctaccctcgtcgagtgttgga 37281495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 43570125 - 43569914
Alignment:
Q  121 gacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaa 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  43570125 gacgatcttctggcgaaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaa 43570026  T
Q  221 catgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctc 317  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || |||| |||||||||||||    
T  43570025 catgctcgtcacgttttcgtcgttcgttagttccacccaagtaaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctc 43569926  T
Q  318 tttgtgtctctg 329  Q
     || ||||||||    
T  43569925 cttctgtctctg 43569914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 116 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 49273619 - 49273404
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  49273619 ctaatgacgatattctggaagaatcaaacttttgatgatatattcagttgatctcagcaacgtcacccacatattgatcaactggaacatgttgtgctcc 49273520  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||    
T  49273519 cagaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcattaattccacccaagtgaatgatactctgccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaatgtgttcca 49273420  T
Q  313 ccctctttgtgtctct 328  Q
    ||||| ||||||||||    
T  49273419 ccctccttgtgtctct 49273404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 116 - 296
Target Start/End: Original strand, 42323388 - 42323568
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||| |||||    
T  42323388 ctaatgacgatcttccagtggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcaccagcatatcgatccactgaaacattttgagctcc 42323487  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  42323488 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcaagcgttggatgt 42323568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 14631665 - 14631449
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||    
T  14631665 ctaatgacgatcttctggcagaatcaaacttttgatgatatctttagttgatctcaacaacgtcacccgcatatcaatccactggaacatgttttgctcc 14631566  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||    
T  14631565 caaaacatgctcgtcacgttttcgttgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctttactcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 14631466  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| |||||||||||    
T  14631465 ccctccttgtgtctctg 14631449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Original strand, 47759890 - 47760106
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||| |||||| |||| |||    
T  47759890 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatctttagttgatctcagcaacgtcacccgtacatcgatccactggaacatgctgtgttcc 47759989  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   ||  ||| ||||||||    
T  47759990 caaaacatgtttgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaggtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacggaacgtgttcca 47760089  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| |||||||||||    
T  47760090 ccctccttgtgtctctg 47760106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 116 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 7246314 - 7246137
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |  |||    
T  7246314 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacgtcacccgcatatcgatacactggaacatgttataatcc 7246215  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  7246214 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtcaatgatattctcccctcgtcgagcgttgga 7246137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 116 - 293
Target Start/End: Original strand, 10053274 - 10053447
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||   |||||    
T  10053274 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatat-ttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgt---gctcc 10053369  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10053370 caaaacatgctcatcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaattgaatgatactctcccctcgtcgagcgttgga 10053447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 326
Target Start/End: Original strand, 36721390 - 36721601
Alignment:
Q  118 aatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctccca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  36721390 aatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcaccagcatatcgatccactagaacatgttgtgctccca 36721489  T
Q  218 aaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga---tgttatcgaaggtgttccacc 314  Q
    ||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |  || |||| ||||||||||    
T  36721490 aacattgctcgtcacgttttcgtcgttcgtttattccaatcaagtgaatgatactctcctctcgtcgagcgttggacatttataccgaacgtgttccacc 36721589  T
Q  315 ctctttgtgtct 326  Q
    ||| ||||||||    
T  36721590 ctccttgtgtct 36721601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 77 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 6754463 - 6754210
Alignment:
Q  77 gtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatc 176  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |  | || |||||  |||| |||||||||| || ||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  6754463 gtaagacagttgttgtagttggaaggtgcatttccctacataatcacgatcttctagcagaatcagactgttgataatatcttcagttgatctcagcaac 6754364  T
Q  177 gtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcc 276  Q
    || |||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | |||||    
T  6754363 gttacccgcatatcgatcaactagaacatgttgtactcccaaaacatgatcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaacttaatgatattctcc 6754264  T
Q  277 cctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctc 327  Q
    ||||||||||||||||| ||   || |||| || ||||||||||||||||||||    
T  6754263 cctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctctttgtgtctc 6754210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 45 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 7954496 - 7954209
Alignment:
Q  45 gtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatca 141  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||  | | || || |||||||||||||||| |||||||||    
T  7954496 gtttggcaagtttgaatt-acctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttagaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttctagcggaatca 7954399  T
Q  142 agttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtc 241  Q
      |||||||| ||||||||||||||||| |||| | | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7954398 gattgttgataatatcttcagttgatcttagcaactttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgtc 7954299  T
Q  242 gtttgttaattccacccaagtgaatgaaactct-cccctcgtcgagcgttggatg-ttat--cgaaggtgttccaccctctttgtgtctc 327  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || || |||||| ||||| |||||| | ||||  |||| || |||||||||| |||||||||    
T  7954298 gtttgttaattccacccaactaaatgataccctccccctcatcgagtgttggacgtttatgccgaacgtattccaccctccttgtgtctc 7954209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 297
Target Start/End: Original strand, 8633275 - 8633539
Alignment:
Q  28 aatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatc 127  Q
    |||||| ||||||||  ||||| || ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||   | |  || ||||||||||||    
T  8633275 aatgctggagtcctgccgtttgacaagtttgaatt-acctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttggggtgca---ttcggtacctaatgacgatc 8633369  T
Q  128 ttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctc 227  Q
    ||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||| || || ||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||  |||||||| ||  ||    
T  8633370 ttctggcggaatcagactgttgataatatcttcagatgatcgcaacaacgttacccgcatatcgatccactggaacacgttgtcatcccaaaaaatattc 8633469  T
Q  228 gtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgtt 297  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8633470 gtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggatgtt 8633539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Original strand, 50458690 - 50458906
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  50458690 ctaatgacgatcttcaggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagtttatctcaacaacgtcacccgcatatctatccactggaacatgttgtgctcc 50458789  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga---tgttatcgaaggtgttcca 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||   |  ||||||  |||| |||    
T  50458790 caaaacatgctcgtcaagttttcgtcgttcgtagattccacccaattaaacgatactctcccctcgtcgagcgttggacacttatatcgaccgtgtccca 50458889  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| |||||||||||    
T  50458890 ccctccttgtgtctctg 50458906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 117 - 325
Target Start/End: Original strand, 6464345 - 6464556
Alignment:
Q  117 taatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctccc 216  Q
    |||| |||||||||| || ||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  6464345 taatcacgatcttcttgcagaatcagactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccacatatcgatccactggaacatgttgtgctccc 6464444  T
Q  217 aaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccac 313  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||   || | || || ||||||    
T  6464445 aaaacatgattgtcacgttttcgtcgttcattaattccacccaactgaatgatattctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgtattccac 6464544  T
Q  314 cctctttgtgtc 325  Q
    ||||||||||||    
T  6464545 cctctttgtgtc 6464556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 70 - 293
Target Start/End: Original strand, 774292 - 774514
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |  | || ||||| ||||| |||||||||||| |||||||   | |||||||||||||||||||||||    
T  774292 ttcagaggtaagacaattgttgcagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcacgatcttctggtggaatcagactcttgatgatatcttcagttgatct 774390  T
Q  170 cagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaa 269  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||     
T  774391 cagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgcagtgctccgaaaacatgttcttcacgttttcatcgttcgttaattccatccaactgaatgat 774490  T
Q  270 actctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    | |||||| |||||||||||||||    
T  774491 attctcccgtcgtcgagcgttgga 774514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 110 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 27187174 - 27186991
Alignment:
Q  110 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttg 209  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| || |||||||||    
T  27187174 ccctacctaatcacgatattatggcggaatcagattgttgataatatctttagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccaatggaacatgttg 27187075  T
Q  210 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | |||||||||  ||||| |||||    
T  27187074 tgctcccaaaacatgttcgtcatgttttcgtcgttcgttaattccacccaactaaatgatattctcccctctacgagcattgga 27186991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 110 - 326
Target Start/End: Original strand, 33449144 - 33449351
Alignment:
Q  110 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttg 209  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||            || ||||||||| |||||| ||    
T  33449144 ccctacctaattacgatcttctggcggaatcaaactttggatgatatcttcagttgatctcagcat------------atcgatccactggaacatgatg 33449231  T
Q  210 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggt 306  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||   ||||||| ||    
T  33449232 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgtttgacgtttatatcgaacgt 33449331  T
Q  307 gttccaccctctttgtgtct 326  Q
     || ||||||| ||||||||    
T  33449332 atttcaccctccttgtgtct 33449351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 117 - 237
Target Start/End: Original strand, 46346612 - 46346732
Alignment:
Q  117 taatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctccc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  46346612 taatgacaatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctccc 46346711  T
Q  217 aaaacatgctcgtcacgtttt 237  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  46346712 agaacatgctcgtcacgtttt 46346732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Original strand, 50997868 - 50997949
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50997868 gcgaaatgcttgagtcctgttgttttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaagacaattgttggagttggaatgcac 50997949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 287
Target Start/End: Original strand, 20375843 - 20376052
Alignment:
Q  77 gtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatc 176  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |  | || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||   |||| |  |||||| | |||||||||||| |    
T  20375843 gtaagacaatttttgtagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcacgatattttggcggaatcaaacagttgttattatcttaaattgatctcagcaac 20375941  T
Q  177 gtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcc 276  Q
    || || ||||||| |||| |||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  20375942 gttacacgcatatcgatctacttgaacatgttgtgctctcaaaacatactcctcacgttatcgtcgttctttaattccacccaactgaatgatattctcc 20376041  T
Q  277 cctcgtcgagc 287  Q
    | |||||||||    
T  20376042 catcgtcgagc 20376052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 2268233 - 2268152
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  2268233 gcgaaatgtttgagtcctgttgttttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaagacaattgtcgtagttggaatgcac 2268152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 4003826 - 4003745
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  4003826 gcgaaatgcttgagtcatgttgtttgacaggtttgaatctatctcattcaaaggtaacacaattgttggagttggaatgcac 4003745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 25576329 - 25576248
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25576329 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggccagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 25576248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Original strand, 34050207 - 34050288
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  34050207 gcgaaatgcttgagtcctgttgttttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcac 34050288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Original strand, 46403483 - 46403564
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  46403483 gcgaaatgcttgagtcctgttattttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgaggttggaatgcac 46403564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 49139793 - 49139712
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  49139793 gcgaaatgcttgagtcctgttgttttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcac 49139712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Original strand, 54390922 - 54391003
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  54390922 gcgaaatgcttgagtcctgttgttttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcac 54391003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Original strand, 42383534 - 42383613
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  42383534 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaagtttgaatttatccaattcaaagataagacaattgttgtagttggaatgcac 42383613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 11378712 - 11378634
Alignment:
Q  27 aaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  11378712 aaatgcttgagtcctgttgtttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggcaagacaattgttggagttggaatgcac 11378634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 293
Target Start/End: Original strand, 25887562 - 25887786
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa--tgca--ccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttg 165  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||  || |||| ||| |||| ||||| |||| ||||||||||  ||| ||  |||||||||||||    
T  25887562 ttcataggtaagacaattgttgtagttggaaggtgcattccctacc-taa-taatcacgatattctagcggaatcaaactgtggagaatatcttcagttg 25887659  T
Q  166 atctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaa 265  Q
    |||||| || |||  | | ||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| || |||| |  |||||||||||||||||||||||| |||     
T  25887660 atctcaacaacgttccacacatat-gatccacgagaacatgttgtgctcccaaaacatggtcctcacatcctcgtcgtttgttaattccacccaactgag 25887758  T
Q  266 tgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  25887759 tgatattctcccatcgtcgaacgttgga 25887786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 44835225 - 44835144
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44835225 gcgaaatgtttgagtcctgttgtttggtaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 44835144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 19452883 - 19452811
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19452883 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttgg 19452811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 105
Target Start/End: Original strand, 36135488 - 36135568
Alignment:
Q  25 cgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  36135488 cgaaatgtttgagtcttgttgtttgacaggtttgaatctatctcattcaaaggtaacacaattgttggagttggaatgcac 36135568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 13895606 - 13895527
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13895606 gaaatgtttgagtcctgttgtttggcaagtttgaattgaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 13895527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 24702008 - 24701929
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24702008 gaaatgcttgagtcaggttgtttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 24701929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 2646615 - 2646534
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  2646615 gcgaaatgcgtgagtcatgttgttttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttggggttggaatgcac 2646534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 3494768 - 3494687
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  3494768 gcgaaatgcttgagtcatgttgttttgcaagtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgttgttggaatgcac 3494687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 100
Target Start/End: Original strand, 37281934 - 37282010
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  37281934 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggccagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaa 37282010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18441003 - 18440873
Alignment:
Q  77 gtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatc 176  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |  | || | ||| ||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  18441003 gtaagacaattgttgtagttggaaggtgcatt-ctctacctaatcacgatcttctggtggaatcaaactgttgataatatcttcagttgatctcagcaac 18440905  T
Q  177 gtcacccgcatattgatccactgtaacatgtt 208  Q
    || || | ||||| ||||||||| ||||||||    
T  18440904 gttacacacatatcgatccactggaacatgtt 18440873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19486077 - 19485947
Alignment:
Q  77 gtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatc 176  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |  | || | ||| ||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  19486077 gtaagacaattgttgtagttggaaggtgcatt-ctctacctaatcacgatcttctggtggaatcaaactgttgataatatcttcagttgatctcagcaac 19485979  T
Q  177 gtcacccgcatattgatccactgtaacatgtt 208  Q
    || || | ||||| ||||||||| ||||||||    
T  19485978 gttacacacatatcgatccactggaacatgtt 19485947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 34693026 - 34692947
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34693026 gaaatgtttgagtcctgttgtttggcaagtttgaattgaccccattcacaggtaagacaattgttggagttggaatgcac 34692947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Original strand, 44927946 - 44928025
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44927946 gaaatgtttgagtcctgttgcttggcaagtttgaattgaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 44928025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 14265631 - 14265412
Alignment:
Q  110 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttg 209  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||  | | ||  ||||||| |||| ||||||| | ||| || | || || ||||||| |||||||||||    
T  14265631 ccctacctaatcacgatcttcaggcggaatcaaactctggagaatatctttagttaatctcagtaacgttacacacaaatcgatccacggtaacatgttg 14265532  T
Q  210 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggt 306  Q
    || |||||||||||| ||||||||   ||||||||  |||||| || |||| ||||||| | || ||| ||||||| ||||||||||   || |||| ||    
T  14265531 tggtcccaaaacatgttcgtcacg---tcgtcgttccttaatttcatccaactgaatgatattcacccatcgtcgaacgttggatgtttataccgaacgt 14265435  T
Q  307 gttccaccctctttgtgtctctg 329  Q
     ||||||| || |||||||||||    
T  14265434 attccaccttccttgtgtctctg 14265412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 36721126 - 36721053
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttg 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36721126 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgggcagattgaatttacctcattcaaaggtaagacaattgttgtagttg 36721053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 49218477 - 49218396
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgt-tgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatg 102  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  49218477 gagcgaaatgcttgagtccagtatgtttggtaggtttgaatttatcacattcaaatgtaagataattgttggagttggaatg 49218396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 105
Target Start/End: Original strand, 47066170 - 47066248
Alignment:
Q  25 cgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47066170 cgaaatgcttgagtcctgttgtt-ggcatgtttaaatttacc-cattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 47066248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Original strand, 41578397 - 41578462
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41578397 gagtcctgctgcttggcaagtttgaatttacctcattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 41578462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 39416683 - 39416604
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  39416683 gaaatgtttgagtcatgttgtttgggaagtttgaatttgccccattcaaaggtaagataattgttgtagttggaatgcac 39416604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 100
Target Start/End: Original strand, 27187803 - 27187870
Alignment:
Q  33 ttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||||| | ||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27187803 ttgagtcctgctatttagcaagtttgaatttacctcattcagaggtaagacaattgttgtagttggaa 27187870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 52569136 - 52569073
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgg 98  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  52569136 gagtcctgctgcttggcaagtttgaatttacctcattcacaggtaagacaattgttgtagttgg 52569073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 46346320 - 46346274
Alignment:
Q  54 gtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46346320 gtttgaatttacctcattcaaaggtaagacaattgttggagttggaa 46346274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Original strand, 7246586 - 7246651
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||| || || ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7246586 gagtcctgctgcttcgcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 7246651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Original strand, 14631937 - 14632002
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  14631937 gagtcctgctgcttggcatgtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaa 14632002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 34646994 - 34646929
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  34646994 gagtcatgttgtttgacaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaa 34646929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Original strand, 49273895 - 49273960
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  49273895 gagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaa 49273960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 98
Target Start/End: Original strand, 30193030 - 30193093
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgg 98  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  30193030 gagtcctgttgcttggcaagtttgaatttaccacattcaaatgtaacacaattgttggagttgg 30193093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 45099965 - 45099894
Alignment:
Q  29 atgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  45099965 atgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttatcccattcaggggtaagataattgttgcagttggaa 45099894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 45100190 - 45100139
Alignment:
Q  47 ttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgg 98  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  45100190 ttggcaagtttgaatttacctcattcaaaggtaacacaattgttgtagttgg 45100139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 100
Target Start/End: Original strand, 2428999 - 2429044
Alignment:
Q  55 tttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2428999 tttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 2429044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 8633080 - 8633027
Alignment:
Q  47 ttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  8633080 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaa 8633027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 36720811 - 36720754
Alignment:
Q  45 gtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatg 102  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  36720811 gtttagcaagtttgaatttacctcattcaagggtaagataattgttgcagttggaatg 36720754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 105
Target Start/End: Original strand, 43477556 - 43477600
Alignment:
Q  61 tttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  43477556 tttatctcattcaaaggtaagacaactgtggcagttggaatgcac 43477600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 91
Target Start/End: Original strand, 43570414 - 43570458
Alignment:
Q  47 ttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttg 91  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  43570414 ttggcaagtttgaatttacctcattcaaaggcaagacaattgttg 43570458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 51012995 - 51012951
Alignment:
Q  54 gtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgg 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  51012995 gtttgaatttacctcattcaaaggtaacacaattgttgtagttgg 51012951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 46414042 - 46413999
Alignment:
Q  54 gtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttg 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  46414042 gtttgaatttacctcattcaaaggtaacacaattgttgtagttg 46413999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 98
Target Start/End: Original strand, 51015769 - 51015832
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgg 98  Q
    |||||||| || ||||||  |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  51015769 gagtcctgctgcttggcaaatttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttggagttgg 51015832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 10053113 - 10053048
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||  ||| |||||||| | |||||||| ||||||||    
T  10053113 gagtcctgctgcttggcaagtttgaatttatcctattgaaaggtaacaaaattgttgtagttggaa 10053048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 34471803 - 34471738
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    ||||| ||||| ||| || ||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  34471803 gagtcatgttgcttgacaagtttgaatttaccccattcaaaggaaacacaattgttgtagttggaa 34471738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 42323105 - 42323052
Alignment:
Q  47 ttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||| |||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  42323105 ttggcaagtttgaatttactccattcaaaggtaacacaattgttggagttggaa 42323052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 247 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15637113 - 15637031
Alignment:
Q  247 ttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtct 326  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||| |||||| ||   || |||| || |||||||||| ||||||||    
T  15637113 ttaattccacccaactgaatgatattctcccatcgtcgagtgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtct 15637031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 25887329 - 25887273
Alignment:
Q  45 gtttggcaggtttgaatttatctcatt-caaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  25887329 gtttagcaagtttgaatttacctcatttcaaaggtaagataattgttgtagttggaa 25887273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 98
Target Start/End: Original strand, 41804413 - 41804457
Alignment:
Q  54 gtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgg 98  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  41804413 gtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttgg 41804457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 97
Target Start/End: Original strand, 51015998 - 51016066
Alignment:
Q  29 atgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttg 97  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||| | ||||||| |||||||  ||||||| |||||    
T  51015998 atgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcaagggtaagatgattgttgcagttg 51016066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 99
Target Start/End: Original strand, 55268650 - 55268713
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgga 99  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  55268650 gagtcctgttgtttagcaagtttgaatttgccccattcagagg-aagacaattgttgcagttgga 55268713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 69)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 27 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 39394190 - 39393885
Alignment:
Q  27 aaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgat 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39394190 aaatgcttgagtcatgttgtttgacatgtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgcagttggaatgcaccttatcctaactaatgacgat 39394091  T
Q  127 cttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgct 226  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  39394090 cttctgacggaatcaagttgttaatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactagaacatgttgtgctcccaaaacatgct 39393991  T
Q  227 cgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtg 323  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   || |||||||||| ||||||| |||||    
T  39393990 cgtcacgttttcgtcgtttgttgattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaaggtgttacaccctccttgtg 39393891  T
Q  324 tctctg 329  Q
    ||||||    
T  39393890 tctctg 39393885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 77 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 3941986 - 3941731
Alignment:
Q  77 gtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatc 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  3941986 gtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcatcaac 3941887  T
Q  177 gtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcc 276  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3941886 gtcacccgcatatcgatccactggaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgaaactctcc 3941787  T
Q  277 cctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3941786 cctcgtcgagcgttggacgtttatactgaaggtgttccaccctccttgtgtctctg 3941731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 24 - 329
Target Start/End: Original strand, 3936970 - 3937276
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3936970 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-acctcattcaaagg-aatacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 3937067  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacat 223  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3937068 gatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacat 3937167  T
Q  224 gctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctcttt 320  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   || | || |||||||||| || ||    
T  3937168 ggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgtgttccaccatcctt 3937267  T
Q  321 gtgtctctg 329  Q
    |||||||||    
T  3937268 gtgtctctg 3937276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 75 - 293
Target Start/End: Original strand, 10360154 - 10360372
Alignment:
Q  75 aggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagca 174  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10360154 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagctgttgatgaaatcttcagttgatctcagca 10360253  T
Q  175 tcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactct 274  Q
     | | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10360254 acattacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcatcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactct 10360353  T
Q  275 cccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10360354 cccctcgtcgagcgttgga 10360372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 24 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 43983156 - 43982850
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43983156 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-acctcattcaaagg-aatacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 43983059  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacat 223  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  43983058 gatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacat 43982959  T
Q  224 gctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctcttt 320  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   || | || |||||||||| || ||    
T  43982958 ggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgtgttccaccatcctt 43982859  T
Q  321 gtgtctctg 329  Q
    |||||||||    
T  43982858 gtgtctctg 43982850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 24 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 17425089 - 17424822
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17425089 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-acctcattcaaagg-aagacaaatgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 17424992  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacat 223  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17424991 gatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactagaacatgttgtgctcccaaaacat 17424892  T
Q  224 gctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  17424891 ggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttgga 17424822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 24 - 329
Target Start/End: Original strand, 12968205 - 12968514
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttggcaggtttgaatttatctcatt-caaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12968205 gcgaaatgcttgagtcatggtcgtttggcaagtttgaatt-accccatttcagaggtaagacaattgttgtagttggagtgcaccttaccctaactaatg 12968303  T
Q  122 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaac 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  12968304 acgatcttctggaggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccaatggaacatgttgtgctcccaaaac 12968403  T
Q  222 atgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctct 318  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||   || |||| || ||||||||||     
T  12968404 atgctcgtaacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcattggacgtttataccgaacgtattccaccctcc 12968503  T
Q  319 ttgtgtctctg 329  Q
    |||||||||||    
T  12968504 ttgtgtctctg 12968514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Original strand, 42241000 - 42241311
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttggcaggtttgaatttatctcatt-caaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||| || ||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42241000 gagcgaaatgcttgagtcctggccgtttgacaagtttgaatt-acctcatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaa 42241098  T
Q  120 tgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaa 219  Q
    |||||||||| |||| |||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  42241099 tgacgatcttatggcagaatcaaacttttggtgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatcaactgaaacatgttgtgctcccaaa 42241198  T
Q  220 acatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccct 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||   || |||| ||||| ||||||    
T  42241199 acatgctcgtcacgttttcgttgttctttaattccacccaagtgaatgataccctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaatgtgtttcaccct 42241298  T
Q  317 ctttgtgtctctg 329  Q
    | |||||||||||    
T  42241299 ccttgtgtctctg 42241311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 24 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29068029 - 29067762
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29068029 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagctggaatgcaccttaccctaactaatgac 29067932  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacat 223  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  29067931 gatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacat 29067832  T
Q  224 gctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    | ||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  29067831 ggtcgtcacattttcgtcattcgttaattgcacccaagtgaatgatattctcccctcgtcgagcgttgga 29067762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 77 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 5420718 - 5420465
Alignment:
Q  77 gtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatc 176  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  5420718 gtaagacaattgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttcaggtggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatatcagcaac 5420619  T
Q  177 gtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcc 276  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5420618 gtcacccgcatatcgatccattggaacatgctgtgctcacaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccactcaagtgaatgatactctcc 5420519  T
Q  277 cctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctc 327  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  5420518 cctcgtcgagcgttggacgtttatatcgaacgtgttccaccctccttgtgtctc 5420465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 70 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 42120268 - 42120045
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42120268 ttcagaggtaagacaatcgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatct 42120169  T
Q  170 cagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaa 269  Q
    ||||| ||| |||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||| |||||||||||||     
T  42120168 cagcaacgttacccacatatcaatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgtcgttctttaactccgcccaagtgaatgat 42120069  T
Q  270 actctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  42120068 actctcccctcgtcgagcgttgga 42120045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 35491845 - 35491629
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  35491845 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 35491746  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||    
T  35491745 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 35491646  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| |||||||||||    
T  35491645 ccctccttgtgtctctg 35491629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 16582129 - 16581816
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttggcaggtttgaatttatctcatt-caaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaa 119  Q
    ||||||||| |||||||||||   |||||||| ||||||||| | | |||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16582129 gagcgaaatacttgagtcctggccgtttggcaagtttgaatt-accccatttcagaggtaagccaattgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaa 16582031  T
Q  120 tgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcata--ttgatccactgtaacatgttgtgctccca 217  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||| || |||||| ||||||||||    
T  16582030 tgaagatcttctagcggaatcaagcttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatctcgatccaatggaacatgatgtgctccca 16581931  T
Q  218 aaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccacc 314  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||   || |||| ||||||||||    
T  16581930 aaacatgctcgacacattttcgtcgctcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcattggacgtttataccgaacgtgttccacc 16581831  T
Q  315 ctctttgtgtctctg 329  Q
    ||| |||||||||||    
T  16581830 ctccttgtgtctctg 16581816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 24 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22002134 - 22001867
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  22002134 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-acctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcaacttacaataactaatgac 22002037  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacat 223  Q
     ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| || |||||| || |||||||||||||    
T  22002036 aatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttaagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccattggaacatgctgagctcccaaaacat 22001937  T
Q  224 gctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22001936 ggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattcctcccaagtgaatgatattctcccctcgtcgagcgttgga 22001867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 68 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 29111415 - 29111155
Alignment:
Q  68 cattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgat 167  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||    
T  29111415 cattcaaagg-aagataattgttgtagttggaatgcactttaccctacctagtgacgttattctggcggaattaaatttttgatgatatcttcggttgat 29111317  T
Q  168 ctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatg 267  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29111316 ctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatg 29111217  T
Q  268 aaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtct 326  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||   ||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  29111216 atactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatactgaacgtgttccaccctccttgtgtct 29111155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29906885 - 29906615
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcct-gttgtttggcaggtttgaatttatctca-ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||| ||||||| ||| | || |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29906885 gcgaaatgcttgagtcatggccgtttggcaagtttgaa-ttaccccatttcagaggtaagacagttgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatg 29906787  T
Q  122 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaac 221  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29906786 ctgatcttctggcagaatcaagttgttgatgatattttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaac 29906687  T
Q  222 atgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    ||| | |||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  29906686 atgtttgtcacgttttcgtcgttctttaacttcacccaagtgaatgatactctccccacgtcgagcgttgga 29906615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 117 - 329
Target Start/End: Original strand, 10364634 - 10364849
Alignment:
Q  117 taatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctccc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  10364634 taatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctccc 10364733  T
Q  217 aaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccac 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || |||| |||||||||    
T  10364734 aaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccac 10364833  T
Q  314 cctctttgtgtctctg 329  Q
    |||| |||||||||||    
T  10364834 cctccttgtgtctctg 10364849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 77 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 22493520 - 22493265
Alignment:
Q  77 gtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatc 176  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  22493520 gtaagacagttgttgtagttggaatgcatcttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatctttagttgatctcaggaac 22493421  T
Q  177 gtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcc 276  Q
    || ||||||||||  |||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  22493420 gttacccgcatatcaatccactggaacattctgtactcccaaaacatgctcgtcacgttttcgccgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcc 22493321  T
Q  277 cctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||||||||||||||| ||   || |||| || |||||||||| ||| |||||||    
T  22493320 cctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgcgtctctg 22493265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 32734952 - 32734682
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttggcaggtttgaatttatctcattcaa-aggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||| ||||  | |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  32734952 gagcgaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaatt-atcccattttagaggtaagactgttgttgtagttggaatgcaccttaccttaactaa 32734854  T
Q  120 tgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaa 219  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32734853 tgactatcttttggcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatatcaacaacgttacccgcatatcgatccactgtaacatgttgtgctcccaaa 32734754  T
Q  220 acatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttg 291  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  32734753 acatgcttgtcacattttcgtagttctttaactccacccaagtgaatgataccctcccctcgtcgagcgttg 32734682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Original strand, 19471630 - 19471846
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||    
T  19471630 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatcttagcaacgtcacccgcatatcgatacactggaacatgctgtgctcc 19471729  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||    
T  19471730 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 19471829  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| |||||||||||    
T  19471830 ccctccttgtgtctctg 19471846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 116 - 327
Target Start/End: Original strand, 27130505 - 27130719
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  27130505 ctaatgactatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 27130604  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||   || |||| ||||||||    
T  27130605 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatattctcccctcgttgagcgttggacgtttataccgaatgtgttcca 27130704  T
Q  313 ccctctttgtgtctc 327  Q
    ||||| |||||||||    
T  27130705 ccctccttgtgtctc 27130719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 329
Target Start/End: Original strand, 2919279 - 2919577
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttct 131  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| || |||||  ||||  | | || || |||||||||||||| |    
T  2919279 gagtcatgtcgtttggcaagtttgaatt-accacattcaaagg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctttt 2919376  T
Q  132 ggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtca 231  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2919377 ggcggaatcaaacttttaatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatctactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtca 2919476  T
Q  232 cgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctct 328  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  2919477 cgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcatcgagcgttggacgtttatacagaacgtgttccaccctccttgtgtctct 2919576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 116 - 327
Target Start/End: Original strand, 37312491 - 37312705
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  37312491 ctaatgacgatcttctggcagaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 37312590  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||    
T  37312591 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgataatctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 37312690  T
Q  313 ccctctttgtgtctc 327  Q
     |||| |||||||||    
T  37312691 tcctccttgtgtctc 37312705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Original strand, 41499090 - 41499306
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  41499090 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcaccctcatatcgatccactggaacatgctgtgctcc 41499189  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||    
T  41499190 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaggttaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 41499289  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| || ||||||||    
T  41499290 ccctccttctgtctctg 41499306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 297
Target Start/End: Original strand, 17796034 - 17796281
Alignment:
Q  45 gtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagt 144  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||| || ||||| |||||||||| |||||| ||||| |||      
T  17796034 gtttggcaagtttgaatt-acctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaagacacatttccctacctaatgacgagcttctgacggaaccaaac 17796131  T
Q  145 tgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtt 244  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  |||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17796132 ttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactagaacatgt---gctcccaaaacatgctcttcacgttttcgtcgtt 17796228  T
Q  245 tgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgtt 297  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17796229 cgttaattccacccaactgaatgatactctccactcgtcgagcgttggatgtt 17796281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Original strand, 34521680 - 34521896
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  34521680 ctaatgacgatcttatgagggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 34521779  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||   || |||| ||||| ||    
T  34521780 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgttgagcgtttgacgtttataccgaacgtgtttca 34521879  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| |||||||||||    
T  34521880 ccctccttgtgtctctg 34521896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 6977046 - 6976832
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  6977046 ctaatgacgatcttctcgcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcc 6976947  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||| ||   || ||||  |||||||    
T  6976946 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaatttcacccaagtgaatgatacact--cctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacatgttcca 6976849  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| |||||||||||    
T  6976848 ccctccttgtgtctctg 6976832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 66 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 33404273 - 33404012
Alignment:
Q  66 ctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttg 165  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  | || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||   ||||||| |||||||||||||    
T  33404273 ctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcacgatcttctggcgacatcagactgttgataatatcttcagttg 33404176  T
Q  166 atctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaa 265  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  33404175 atctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacacaactgaa 33404076  T
Q  266 tgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtct 326  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||| ||   || |||| || |||||||||||||||||||    
T  33404075 tgatactattccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctctttgtgtct 33404012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 110 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 6902182 - 6901962
Alignment:
Q  110 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttg 209  Q
    ||||| ||||| | |||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| || ||| || ||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  6902182 ccctacctaatcatgatcttctcgcggaatcagactgttgataatatcttcagttgatctcaacaacgttactcgcatatcgattcactggaacatgttg 6902083  T
Q  210 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatg-ttat--cgaaggt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||  |||| ||    
T  6902082 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatattctcccctcgtcgagcgttggacgtttatgccgaatgt 6901983  T
Q  307 gttccaccctctttgtgtctc 327  Q
    |||| |||||| |||||||||    
T  6901982 gttcaaccctccttgtgtctc 6901962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 116 - 268
Target Start/End: Original strand, 40677371 - 40677523
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||    
T  40677371 ctaatgacgatcttctagcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactagaacatgtcgtgctcc 40677470  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatga 268  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  40677471 cagaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtggatga 40677523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 137
Target Start/End: Original strand, 39799772 - 39799886
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  39799772 gagcgaaatgctcgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaagg-aagacaattgttgtggttggaatgcacattaccctaactaatg 39799870  T
Q  122 acgatcttctggcgga 137  Q
    ||||||||||||||||    
T  39799871 acgatcttctggcgga 39799886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 201 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 34639090 - 34638960
Alignment:
Q  201 aacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---t 297  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   |    
T  34639090 aacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgttgagcgttggacgtttat 34638991  T
Q  298 atcgaaggtgttccaccctctttgtgtctctg 329  Q
    | ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  34638990 accgaaggtgttcca-cctccttgtgtctctg 34638960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18393655 - 18393486
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcct-gttgtttggcaggtttgaatttatctcatt-caaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaa 119  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||   |  ||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  18393655 gagcgaaatacttgagtcctagtcgtttggcaagtttgaattaccccnatttcagaggtaagacaatttttgtagttggaatgcaccttaccctcactaa 18393556  T
Q  120 tgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatat 189  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  18393555 tgacgatcttctggcagaatcaagttgtttatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacacgcatat 18393486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 110 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20148334 - 20148151
Alignment:
Q  110 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttg 209  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||||  |||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  20148334 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcagactgttgaaaatatcttcagctaatctcagcaacgttacccgcatatcgatctactggaacatgttg 20148235  T
Q  210 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| ||||| | ||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  20148234 tgctcctaaaacatgctagtcatgttttcgtcgttctttaattccccccaactaaatgatattctcccctcgttgagcgttgga 20148151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 178 - 293
Target Start/End: Original strand, 39799900 - 39800015
Alignment:
Q  178 tcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctccc 277  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39799900 tcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtgacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctccc 39799999  T
Q  278 ctcgtcgagcgttgga 293  Q
    || |||||||||||||    
T  39800000 cttgtcgagcgttgga 39800015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 184 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18392179 - 18392070
Alignment:
Q  184 gcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtc 283  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18392179 gcatatcgatccactggaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtaaatgatactctcccctcgtc 18392080  T
Q  284 gagcgttgga 293  Q
     |||||||||    
T  18392079 aagcgttgga 18392070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 8557459 - 8557380
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8557459 gaaatgtttgagtcatgttgtttggcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 8557380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Original strand, 17425259 - 17425340
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  17425259 gcgaaatgcttgagtcctgttgttttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcac 17425340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 39799604 - 39799525
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  39799604 gaaatgcttgagtcctgttgttttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcac 39799525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 3936800 - 3936719
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||    
T  3936800 gcgaaatgcttgagtcctgttgttttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacagaattgttgtggttggaatgcac 3936719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 10359931 - 10359854
Alignment:
Q  27 aaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgca 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10359931 aaatgcttgagtcatgttgtttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgca 10359854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Original strand, 22002304 - 22002385
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||    
T  22002304 gcgaaatgcttgagtcatgttgttttgcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaacacaattgttgtgattggaatgcac 22002385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 101
Target Start/End: Original strand, 18393823 - 18393898
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18393823 gaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaat 18393898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 220
Target Start/End: Original strand, 27650378 - 27650527
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||||| |  | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||    
T  27650378 ttcagaggtaagtcaattgttgtagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcaaactgttgagaatatcttcagttgatct 27650476  T
Q  170 cagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaa 220  Q
    ||||| ||| ||   ||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  27650477 cagcaacgtgacaaacatatcgatccacggtaacatgttgtgttgccaaaa 27650527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 105
Target Start/End: Original strand, 42120488 - 42120565
Alignment:
Q  28 aatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42120488 aatgcttgagtcatgttgtttggcaagtttgaattttccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 42120565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Original strand, 22493743 - 22493824
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgt-ttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22493743 gcgaaatgcttgagtcatgttgtgttggcaagtttgaattt-tcccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 22493824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 43491732 - 43491602
Alignment:
Q  45 gtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatca 141  Q
    |||||||| ||||||||| | | |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||  ||||  ||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  43491732 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aaggcaattgttgtagttggaaggtgcattctttccgtacctaatgacgatcttctggcggaatca 43491635  T
Q  142 agttgttgatgatatcttcagttgatctcagca 174  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43491634 aacttttgatgatatcttcagttgatctcagca 43491602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 170
Target Start/End: Original strand, 31991887 - 31991986
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |  | || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  31991887 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcaaattgttgagaatatcttcagttgatct 31991985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Original strand, 16582297 - 16582376
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| | | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16582297 gaaatgtttgagtcatgttgtttggcaagtttgaactgaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 16582376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 33 - 98
Target Start/End: Original strand, 35492114 - 35492179
Alignment:
Q  33 ttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgg 98  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35492114 ttgagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccacattcaaaggtaagacaattgttgtagttgg 35492179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 96
Target Start/End: Original strand, 32735120 - 32735191
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctca-ttcaaaggtaagacaattgttgaagtt 96  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  32735120 gaaatgcttgagtcatgttgtttggcaagtttgaatttaccccatttcagaggtaagacaattgttgtagtt 32735191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 34521233 - 34521162
Alignment:
Q  29 atgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  34521233 atgctcgagtcctgctgtttagcaagtttgaatttacctcattcaagggtaagataattgttgcagttggaa 34521162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 105
Target Start/End: Original strand, 29111600 - 29111665
Alignment:
Q  40 ctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  29111600 ctgttgtttggcgagtttgaatttgcctcatttaaaggtaagataattgttgtagttggaatgcac 29111665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 170
Target Start/End: Original strand, 18036113 - 18036212
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |  | || || || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| || |||||||||    
T  18036113 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaaggtgcatttcc-tacctaatcacgatcttctggcggaatcaaattgttgagaatatttttagttgatct 18036211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 170
Target Start/End: Original strand, 15891555 - 15891697
Alignment:
Q  28 aatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaa-aggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgat 126  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||| |||||||||||||  ||| || | ||| ||||||||||| |||||||| |  | || ||||| ||||| |||||    
T  15891555 aatgcttgagaactgttatttagcaagtttgaatttatccaatttaagaagtatgacaattgttgtagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcacgat 15891653  T
Q  127 cttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctc 170  Q
     |||| ||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||    
T  15891654 attctagcggaatcaaactgttgagaatatcttcagttgatctc 15891697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 98
Target Start/End: Original strand, 43491932 - 43491995
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgg 98  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  43491932 gagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttgg 43491995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16253594 - 16253520
Alignment:
Q  208 tgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgt 282  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||    
T  16253594 tgtgctcccaaaacatgctgctcacgttatcgtcgttctttaattccacccaacttaatgatattctcccatcgt 16253520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Original strand, 6977318 - 6977383
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  6977318 gagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgtttgagttggaa 6977383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 10364349 - 10364296
Alignment:
Q  47 ttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10364349 ttggcaagtttgaattttccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 10364296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16253703 - 16253607
Alignment:
Q  77 gtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagca 174  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |    || ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16253703 gtaagacaattgttgtagttggaaggtgtatt-ccctacctaatcacgatcttctggtggaatcaaactgtcgataatatctttagttgatctcagca 16253607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 19471358 - 19471297
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagtt 96  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  19471358 gagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagtt 19471297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24108283 - 24108218
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  24108283 gagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcaagggtaagataattgttgcagttggaa 24108218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 100
Target Start/End: Original strand, 33404485 - 33404558
Alignment:
Q  27 aaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  33404485 aaatgtttgagtcctgatgtttagcaagtttgaatttacccaattcagaggtaagacaattgttgtatttggaa 33404558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 29111764 - 29111704
Alignment:
Q  45 gtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||  ||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  29111764 gtttggccagtttgaatttgcctcatttaaaggtaagataattgttgtagttggaatgcac 29111704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 41498799 - 41498755
Alignment:
Q  54 gtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgg 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  41498799 gtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtagttgg 41498755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 19471116 - 19471045
Alignment:
Q  29 atgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||   ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  19471116 atgctggagtcctgttgtttagcaagtttgaatttactccattcaggggtaagataattgttgcagttggaa 19471045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 34521470 - 34521407
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgg 98  Q
    |||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  34521470 gagtcctgctgcttggcaagtttcaatttacctcattcaaaggtaacataattgttgtagttgg 34521407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Original strand, 5420863 - 5420928
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||| || || ||| ||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  5420863 gagtcctgctggttagcaagtttgaatttgcctcattcagaggcaagacaattgttgcagttggaa 5420928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18878714 - 18878633
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccac 197  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||  |||||||||| ||| ||   |||||||||||||    
T  18878714 ctaatgataatcttctgtcggaatcaaattgttgagaatatcttcaggcgatctcagcaacgtgacaaacatattgatccac 18878633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 72)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 8538252 - 8537943
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8538252 gagcgaaatgctcgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatg 8538154  T
Q  122 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaac 221  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8538153 acgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaac 8538054  T
Q  222 atgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctct 318  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||   || |||| |||||||||| ||     
T  8538053 atgctcgtcatgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttgaacgtttataccgaacgtgttccaccatcc 8537954  T
Q  319 ttgtgtctctg 329  Q
    |||||||||||    
T  8537953 ttgtgtctctg 8537943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 11347007 - 11346698
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11347007 gagcgaaatgctcgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatg 11346909  T
Q  122 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaac 221  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  11346908 acgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcactcgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaac 11346809  T
Q  222 atgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctct 318  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || | || |||||||||| ||     
T  11346808 atgctcgtcacgttttcgtcgttcattaatttcacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgtgttccaccatcc 11346709  T
Q  319 ttgtgtctctg 329  Q
    |||||||||||    
T  11346708 ttgtgtctctg 11346698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 22 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 30709896 - 30709626
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30709896 gagcgaaatgctcgagtcctgttgtttggcaggtttgaattgatctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatg 30709798  T
Q  122 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaac 221  Q
    ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  30709797 acgatcttccggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaaccaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaac 30709698  T
Q  222 atgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30709697 atggtcgtcacgttttcgtcattcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttgga 30709626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 77 - 329
Target Start/End: Original strand, 541598 - 541853
Alignment:
Q  77 gtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatc 176  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  541598 gtaagacaattgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcgaaatcaagttgttgatgatatctccagttgatctcagcaac 541697  T
Q  177 gtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcc 276  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  541698 gtcacccgcatatcgatccactggaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcccgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcc 541797  T
Q  277 cctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||||||||||||||| ||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  541798 cctcgtcgagcgttggacgtttataccgaaggtgttccaccctccttgtgtctctg 541853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 24 - 329
Target Start/End: Original strand, 7141 - 7447
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7141 gcgaaatgctcgagtcatgttgtttgacaaatttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 7238  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacat 223  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  7239 gatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacat 7338  T
Q  224 gctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctcttt 320  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || | || |||||||||| || ||    
T  7339 gctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgtgttccaccatcctt 7438  T
Q  321 gtgtctctg 329  Q
    |||||||||    
T  7439 gtgtctctg 7447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 24 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 19400661 - 19400352
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcct-gttgtttggcaggtttgaatttatctca-ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||  |||||| ||| | || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19400661 gcgaaatgcttgagtcatggtcgtttggcaaatttgaa-ttaccccatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatg 19400563  T
Q  122 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaac 221  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  19400562 acgatattctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcaccaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaac 19400463  T
Q  222 atgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctct 318  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||   || |||| || ||||||| ||     
T  19400462 atgctcgtcacattttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgacactctcccctcatcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccatcc 19400363  T
Q  319 ttgtgtctctg 329  Q
    |||||||||||    
T  19400362 ttgtgtctctg 19400352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 70 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 1971616 - 1971356
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1971616 ttcagaggcaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccataactaatgatgattttctggcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatct 1971517  T
Q  170 cagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaa 269  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||     
T  1971516 cagcaacgttacccgcatattgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccaccgaagtgaatgat 1971417  T
Q  270 actctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   || | || ||||||||||||| |||||||||    
T  1971416 actctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgtgttccaccctccttgtgtctc 1971356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 24 - 329
Target Start/End: Original strand, 19036586 - 19036892
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19036586 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-acctcattcaaagg-aatacaaatgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 19036683  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacat 223  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19036684 gatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacat 19036783  T
Q  224 gctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctcttt 320  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   || | || |||||||||| || ||    
T  19036784 ggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgtgttccaccatcctt 19036883  T
Q  321 gtgtctctg 329  Q
    |||||||||    
T  19036884 gtgtctctg 19036892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 22 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 38854455 - 38854186
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatg 121  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  38854455 gagcgaaatgctcgagtcatgttgtttggcaggtttgaattgatctcattcaaagg-aagacaattgttgtggttggaatgcaccttacc-taactaatg 38854358  T
Q  122 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaac 221  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  38854357 acggtcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaaccaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgatgtgctcccaaaac 38854258  T
Q  222 atgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38854257 atggtcgtgacgttttcgtcgttcgttaattccacccaattgaatgatactctcccctcgtcgagcgttgga 38854186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 24 - 329
Target Start/End: Original strand, 8576053 - 8576359
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8576053 gcgaaatgctcgagtcttgttgtttgacaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 8576150  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacat 223  Q
     ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  8576151 aatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccaccggaacatgttgtgctcccaaaacat 8576250  T
Q  224 gctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctcttt 320  Q
    | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || | || |||||||||| || ||    
T  8576251 ggtcgtcacgttttcttcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgtgttccaccatcctt 8576350  T
Q  321 gtgtctctg 329  Q
    |||||||||    
T  8576351 gtgtctctg 8576359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 24 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 28881286 - 28881019
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| | | |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28881286 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-accccattcaaaga-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 28881189  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacat 223  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28881188 gatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacat 28881089  T
Q  224 gctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28881088 ggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagcgttgga 28881019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 24 - 287
Target Start/End: Original strand, 27661289 - 27661550
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27661289 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 27661386  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacat 223  Q
     ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27661387 aatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatctttagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacat 27661486  T
Q  224 gctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagc 287  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27661487 ggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtaaatgatactctcccctcgtcgagc 27661550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 70 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 3601592 - 3601330
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  3601592 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttactctaactaatgacgatcttctgacggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 3601493  T
Q  170 cagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaa 269  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  3601492 cagcaacgtcacccgcatatcgaaacactggaacatgttgtgctcttaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgat 3601393  T
Q  270 actctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctctg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   || ||||  ||||| |||||| |||||||||||    
T  3601392 actctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaatatgttctaccctccttgtgtctctg 3601330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 76 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 11028022 - 11027805
Alignment:
Q  76 ggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcat 175  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||| | ||     
T  11028022 ggtaagacaattgttgtggttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaactttcgatgatatcttcagttgatctaaccaa 11027923  T
Q  176 cgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctc 275  Q
    | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11027922 cttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtgacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctc 11027823  T
Q  276 ccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11027822 ccctcgtcgagcgttgga 11027805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 116 - 327
Target Start/End: Original strand, 1400304 - 1400518
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  1400304 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatggatccactggaacatgatgtgctcc 1400403  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||    
T  1400404 caaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 1400503  T
Q  313 ccctctttgtgtctc 327  Q
    ||||| |||||||||    
T  1400504 ccctccttgtgtctc 1400518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Original strand, 4724076 - 4724292
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  4724076 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 4724175  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||   || |||| ||||||||    
T  4724176 caaaacatgctcgtcacgtttttgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcatcgagcgttggacgtttataccgaatgtgttcca 4724275  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    |  || |||||||||||    
T  4724276 ctttccttgtgtctctg 4724292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 18308465 - 18308249
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  18308465 ctaatgtcaatctactggcggaatcaaatttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 18308366  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||    
T  18308365 caaaacatgctcgtcatgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 18308266  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| |||||||||||    
T  18308265 ccctccttgtgtctctg 18308249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 103 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 40009746 - 40009556
Alignment:
Q  103 caccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  40009746 caccttaccctaactaatgacgatcttcttgtggaatcaagctgttgatgatgtcttcagttgatctcaacaacgttacccacatatcgatccactgtaa 40009647  T
Q  203 catgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40009646 catgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttgga 40009556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 110 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 33370865 - 33370645
Alignment:
Q  110 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttg 209  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  33370865 ccctacctaatcatgatcttctggcggaatcagactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 33370766  T
Q  210 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||| | ||   ||||||| ||    
T  33370765 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactaaatgatattctcccctcgtcgagcgttgaacgtttatatcgaacgt 33370666  T
Q  307 gttccaccctctttgtgtctc 327  Q
     |||||||||| |||||||||    
T  33370665 attccaccctccttgtgtctc 33370645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 35565476 - 35565261
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  35565476 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttctgatgatatctttagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactagaacatgttgtgctcc 35565377  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||   || |||| ||||||||    
T  35565376 caaaacatgctcgtcacg-tttcatcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttagacgtttataccgaacgtgttcca 35565278  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| || ||||||||    
T  35565277 ccctccttatgtctctg 35565261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7082521 - 7082336
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaat 120  Q
    ||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||||||   |   |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7082521 gagcgaaatgcttgagttctatccgtttggcaagtttgaattaccccttttcagaggtaagagaattgttgtagttggaatgcaccttaccataactaat 7082422  T
Q  121 gacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  7082421 gacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatg 7082336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 116 - 290
Target Start/End: Original strand, 6793388 - 6793562
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||    
T  6793388 ctaatgacgatcttctggctgaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacctcatccgcatatcgattcactagaacatgttgtgctcc 6793487  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgtt 290  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  6793488 caaaacatgctcgtcacattttcgtcgttcgttaattccactcaagtgaatgatactcactcctcgtcgagcgtt 6793562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Original strand, 36350316 - 36350523
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  36350316 ctaatgacgatcttctggtggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacctacatatcgatccactggaacatgttgtgc--- 36350412  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttcca 312  Q
          |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||   || |||| ||||||||    
T  36350413 ------atgctcgtcacgttttcgtcgttcattaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttgaacgtttataccgaacgtgttcca 36350506  T
Q  313 ccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||| |||||||||||    
T  36350507 ccctccttgtgtctctg 36350523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 147 - 293
Target Start/End: Original strand, 35927470 - 35927616
Alignment:
Q  147 ttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttg 246  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  35927470 ttgatgatatctttagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaagatgatgtgctcccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcg 35927569  T
Q  247 ttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  35927570 ttaattccacccaactaaatgatactcttccctcgtcgagcattgga 35927616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 158 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 3169766 - 3169593
Alignment:
Q  158 ttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacc 257  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3169766 ttcagctgatctcagcaacgtcacccgcataccgatccactggaacatgttgtgctcttaaaatatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacc 3169667  T
Q  258 caagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||   || |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  3169666 caagtgaatgatactct-ccctcgtcgagcgttagacgtttataccgaacgtgttccaccctctttatgtctctg 3169593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 116 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1694994 - 1694859
Alignment:
Q  116 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||| || |||||| ||||||||    
T  1694994 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgtcacccgcatatcgttccagtgaaacatgctgtgctcc 1694895  T
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  1694894 caaaacatgctcgtcacgttttcgttgttcgttaat 1694859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 3459066 - 3458940
Alignment:
Q  45 gtttggcaggtttgaatttatctcatt-caaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaag 143  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3459066 gtttggcaagtttgaatt-acctcatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctagcggaatcaag 3458968  T
Q  144 ttgttgatgatatcttcagttgatctca 171  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3458967 ctgttgatgatatcttcaattgatctca 3458940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 22283866 - 22283704
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  22283866 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttatcctaactaaggac 22283769  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcata 188  Q
    ||| || ||| ||||||||  | ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||    
T  22283768 gattttatggtggaatcaaacttttgatgatatcttaagttgatctaagcaacttcacccgcata 22283704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 293
Target Start/End: Original strand, 17366735 - 17366915
Alignment:
Q  113 taactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgc 212  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||   | ||||| ||||||| ||||||||||| || ||  ||||||||||  |||||||  ||||||||||||    
T  17366735 taactaatcacgatattctggcagaatcagactcttgataatatctttagttgatctcaacaacggtacccgcatatcaatccactagaacatgttgtgc 17366834  T
Q  213 tcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | ||| ||||| ||||| ||||||    
T  17366835 tcccaaaacatgtttgtcacattttcgtcgttcgttaattccacccaactaaatgatattcttccctcatcgagggttgga 17366915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 6971 - 6890
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  6971 gcgaaatgcttgagtcctgttgttttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgcagttggaatgcac 6890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Original strand, 19400830 - 19400911
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19400830 gcgaaatgcttgagtcttgttgtttggcaagtttgaatttacctcattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 19400911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Original strand, 40012083 - 40012164
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40012083 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 40012164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 105
Target Start/End: Original strand, 1971835 - 1971913
Alignment:
Q  27 aaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1971835 aaatgcttgagtcctgttgtttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 1971913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 8575883 - 8575802
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  8575883 gcgaaatgcttgagtcctgttgttttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcac 8575802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 19036416 - 19036335
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  19036416 gcgaaatgcttgagtcctgttgttttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcac 19036335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 27661119 - 27661038
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  27661119 gcgaaatgcttgagtcctgttgttttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgcggttggaatgcac 27661038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Original strand, 3170002 - 3170081
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3170002 gaaatgcttgagtcatgttgtttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 3170081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Original strand, 8538420 - 8538499
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8538420 gaaatgcttgagtcctattgtttgacaggtttgaatctatctcgttcaaaggtaagacaattgttggagttggaatgcac 8538499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Original strand, 30710064 - 30710143
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  30710064 gaaatgcttgagtcctgttgttttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacataattgttggagttggaatgcac 30710143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Original strand, 38854623 - 38854702
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  38854623 gaaatgcttgagtcctgttgttttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgcggttggaatgcac 38854702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Original strand, 3459257 - 3459338
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  3459257 gcgaaatgcttgagtcatgttgtttggccagtttaaatttacctcattcaaaggtaagacaattgttgtagttagaatgcac 3459338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 108
Target Start/End: Original strand, 3601811 - 3601892
Alignment:
Q  27 aaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcacctt 108  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3601811 aaatgcttgagtcatattgtttggcaaatttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacctt 3601892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 174
Target Start/End: Original strand, 17195316 - 17195419
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa--tgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgat 167  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||   | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  17195316 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaagatgca---ttccctacctaatcacgatcttctggcggaatcaaattgttgataatatctttagttgat 17195412  T
Q  168 ctcagca 174  Q
    |||||||    
T  17195413 ctcagca 17195419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Original strand, 28881456 - 28881536
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  28881456 gcgaaatgcttgagtcctgttgttttgcaggtttgaatttatcccattc-aaggtaacacaattgttgtggttggaatgcac 28881536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 108
Target Start/End: Original strand, 33371099 - 33371179
Alignment:
Q  28 aatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcacctt 108  Q
    ||||||||||  |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  33371099 aatgcttgagagctgttgtttgacaagtttgaatttacctcattcaaaggtaagataattgttgtagttggaatgcacctt 33371179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 2599387 - 2599210
Alignment:
Q  153 atatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaatt 252  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||| || | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||   ||| ||| | |||||    
T  2599387 atatcatcagttaatctcagcaacgttacacacatatcgatccacggtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcttcatgtcgccgttgttcgctaatt 2599288  T
Q  253 ccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctc 327  Q
    |||||||| ||||||| | |||| | |||||||  |||||| ||   || |||| || |||||||||| |||||||||    
T  2599287 ccacccaactgaatgatattctctcatcgtcgaatgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctc 2599210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 3458941 - 3458864
Alignment:
Q  216 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga 293  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3458941 caaaacatactcgtcacgttttcgtcgttctttaactcaacccaagtgaatgatactctcccctcgtcaagcgttgga 3458864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 98
Target Start/End: Original strand, 11347175 - 11347247
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgg 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11347175 gaaatgcttgagtcctgttgtttgacaggtttaaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttgg 11347247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 105
Target Start/End: Original strand, 22284039 - 22284116
Alignment:
Q  27 aaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||    
T  22284039 aaatgcttgagtcctgttgtttt-caagtttgaatttatctcattcaaaggtaacacaattgttgtggttgaaatgcac 22284116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 12742883 - 12742819
Alignment:
Q  110 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagca 174  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742883 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcagactgttgatgatatcttcagttgatctcagca 12742819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 18920977 - 18920885
Alignment:
Q  77 gtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctc 170  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |  | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||    
T  18920977 gtaagacaattgttgtagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcaaactgttgagaatatcttcagttgatctc 18920885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 100
Target Start/End: Original strand, 7082689 - 7082763
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  7082689 gaaatgcttgagtcatgttgtatgacaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaatttttgtagttggaa 7082763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 1693456 - 1693381
Alignment:
Q  246 gttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctct 318  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||||||||    
T  1693456 gttaattccacccaagtgagtgatactctcctctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctct 1693381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Original strand, 18308737 - 18308801
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18308737 gagtcttgttgcttggcatgtttgaatttacc-cattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 18308801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 12805701 - 12805637
Alignment:
Q  110 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagca 174  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||  |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12805701 ccctacctaatcacgatcttctggcataatcagactgttgatgatatcttcagttgatctcagca 12805637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 97
Target Start/End: Original strand, 1171616 - 1171685
Alignment:
Q  27 aaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttg 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||| |||||| | |||||||| |||||    
T  1171616 aaatgcttgagtcctgttgtttggccagtttgaatttaccccattcagaggtaaca-aattgttgtagttg 1171685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 6793187 - 6793141
Alignment:
Q  54 gtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  6793187 gtttgaatttacctcattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaa 6793141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 17366468 - 17366398
Alignment:
Q  28 aatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgg 98  Q
    ||||||||||  ||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  17366468 aatgcttgagagctgatgtttagcaagtttgaatttacctcattcagaggtaagataattgttgtagttgg 17366398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Original strand, 35565748 - 35565813
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  35565748 gagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattattgtagttggaa 35565813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 36350043 - 36349990
Alignment:
Q  47 ttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  36350043 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaa 36349990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 1399798 - 1399727
Alignment:
Q  29 atgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||| | ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  1399798 atgctagagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcaggggtaagataattgttgcagttggaa 1399727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19748263 - 19748169
Alignment:
Q  125 atcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||  |||||||||| ||| ||   ||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  19748263 atcttatggcggaatcaaattgttgagaatatcttcaggcgatctcagcaacgt-acaaacatatcgatccacggaaacatgttgtgctgccaaaa 19748169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 100
Target Start/End: Original strand, 25498796 - 25498867
Alignment:
Q  29 atgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||| | ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  25498796 atgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcaggggtaagataattgttgcagttggaa 25498867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 100
Target Start/End: Original strand, 1695286 - 1695332
Alignment:
Q  54 gtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  1695286 gtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaa 1695332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Original strand, 10398260 - 10398330
Alignment:
Q  28 aatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgg 98  Q
    ||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  10398260 aatgcttgagagatgttgtttagcaagtttgaatttaccccattcaggggtaagacaattgttgtagttgg 10398330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 40011868 - 40011830
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcacctt 108  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40011868 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacctt 40011830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Original strand, 1695510 - 1695575
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| | |||| | |||||||| |||||||| ||||||||    
T  1695510 gagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccatttagaggtaagaaaattgttgcagttggaa 1695575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 96
Target Start/End: Original strand, 12805974 - 12806043
Alignment:
Q  28 aatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctca-ttcaaaggtaagacaattgttgaagtt 96  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  12805974 aatgcttgagagctgttgtttagcaagtttgaatttaccacatttcagaggtaagacaattgttgtagtt 12806043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Original strand, 20196555 - 20196620
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  20196555 gagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacggtttttgtagttggaa 20196620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 99
Target Start/End: Original strand, 25498503 - 25498547
Alignment:
Q  54 gtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgga 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  25498503 gtttgaatttacctcattcaaagg-aagacaattgttgcagttgga 25498547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Original strand, 35565991 - 35566056
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 100  Q
    ||||| || ||||| ||| ||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  35565991 gagtcgtgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcagaggtaagataattgttgcagttggaa 35566056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 34683656 - 34683592
Alignment:
Q  35 gagtcctgttgtttggcaggtttgaatttat-ctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgg 98  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  34683656 gagtcctgctgcttggcaagtttgaatttatccccattcaaaggtaacacaattggtgtagttgg 34683592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 70 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 2521 - 2261
Alignment:
Q  70 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  2521 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttttggcggaatcaagctgttgatgatatcttcaattgatct 2422  T
Q  170 cagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaa 269  Q
    || || ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  2421 catcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgat 2322  T
Q  270 actctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctc 327  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   || |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2321 actctcccctcgttgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtgtctc 2261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 105
Target Start/End: Original strand, 4784 - 4835
Alignment:
Q  54 gtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4784 gtttgactttaccccattctaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 4835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 69 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 2045 - 1783
Alignment:
Q  69 attcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatc 168  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  2045 attcagaggtaagagaattgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttatggcgaaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatc 1946  T
Q  169 tcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatga 268  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1945 tcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgtccgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaaatgaatga 1846  T
Q  269 aactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctct 328  Q
     |||||||||||||||||||||||||||   || ||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  1845 tactctcccctcgtcgagcgttggatgtttataccgaaattgttccaccctccttgtgtctct 1783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Original strand, 2259 - 2340
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  2259 gcgaaatacttgagtcctgttgttaggccagtttgaatttactccattcaaaggtaagacaattgttgtagttgaaatgcac 2340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 17821 - 18119
Alignment:
Q  22 gagcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttggcaggtttgaatttatctcatt-caaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| ||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17821 gagcgaaatgcttgagtcctaaccgtttggcaagtttgaatt-atcccatttcagaggtaagacaattgttgtagttgaaatgcaccttaccctaactaa 17919  T
Q  120 tgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaa 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17920 tgacgatcttctggcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactataacatgttgtgctcccaaa 18019  T
Q  220 acatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccct 316  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||   || |||| ||||||||||||    
T  18020 acatgctcatcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactct-ccctcgtcgagtgttggacgtttataccgaacgtgttccaccct 18118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 17655 - 17581
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttgg 98  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| | |||| |||||| | |||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  17655 gcgaaatgcttaagtcatgttgtttggaaagtttaaatttaccccattcaaaagtaacacaattgttgtagttgg 17581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 85624 - 85462
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85624 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 85527  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcata 188  Q
    ||| || |||| |||||||  | ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||    
T  85526 gattttatggctgaatcaaacttttgatgatatcttaagttgatctaagcaacttcacccgcata 85462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 153 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 25076 - 24899
Alignment:
Q  153 atatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaatt 252  Q
    ||||||||||||||||| ||||  || | ||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  25076 atatcttcagttgatcttagcaatgttatccgcaaatagatccactagaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttcgttaatt 24977  T
Q  253 ccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggatgt---tatcgaaggtgttccaccctctttgtgtctc 327  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||| | ||   || |||| || |||||||||| |||||||||    
T  24976 ccacccaactgaatgctactctcccctcctcgagcgttgtacgtctataccgaacgtattccaccctccttgtgtctc 24899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 40 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 64231 - 64099
Alignment:
Q  40 ctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaat 139  Q
    |||| |||||||| |||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  64231 ctgtcgtttggcaagtttgaattact-tcattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgtaccttaccctacctaatgacgatcttctggtggaat 64134  T
Q  140 caagttgttgatgatatcttcagttgatctcagca 174  Q
    |||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  64133 caaacttttgatgatatcttcagttgatctcagca 64099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 204 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 64095 - 63968
Alignment:
Q  204 atgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttgga---tgttatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||   |  || |    
T  64095 atgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcattgattccactcaactgaatgatactct-cccttgtcgagcgttggacatttatacc 63997  T
Q  301 gaaggtgttccaccctctttgtgtctctg 329  Q
    ||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  63996 gaacgtgctccaccctccttgtgtctctg 63968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0268
Description:

Target: scaffold0268; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 14766 - 14604
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  14766 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcacgttaccctaactaacgac 14669  T
Q  124 gatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcata 188  Q
    |||||| |||||| ||||   | ||||||| ||||| ||||||||| |||| | |||||| ||||    
T  14668 gatcttatggcggtatcatacttttgatgaaatcttaagttgatctaagcaacttcacccacata 14604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Original strand, 14936 - 15017
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  14936 gcgaaatgctcgagtcctgttgttttgcaggtttgaatttaacccattcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcac 15017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Original strand, 2423 - 2504
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2423 gcgaaatgcttgagtcttgttttttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 2504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 11499 - 11420
Alignment:
Q  26 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11499 gaaatgcttgagtcctgctgtttgacaggtttgaatctatcttgttcaaaggtaagacaattgttggagttggaatgcac 11420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1700 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1700
Description:

Target: scaffold1700; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 82
Target Start/End: Original strand, 67 - 125
Alignment:
Q  24 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaaga 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  67 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttcgccagtttgaatttaccccattcaaaggtaaga 125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5550 - 5453
Alignment:
Q  123 cgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcatcgtcacccgcatattgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaa 220  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||  ||||||| || ||| ||   ||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||    
T  5550 cgatcttctggcgaaatcaaactgttgagaatatcttcaggcgatctcaacaacgtgacaaacatattgatccatgggaacatgttgtgctgccaaaa 5453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University