View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10786_10 (Length: 384)

Name: NF10786_10
Description: NF10786
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10786_10
NF10786_10
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (1-374)||(41394230-41394602)
chr1 (4-331)||(20931356-20931682)
chr1 (4-331)||(20913048-20913367)
chr1 (1-245)||(5072388-5072632)
chr1 (1-245)||(18601118-18601362)
chr1 (5-331)||(20893551-20893877)
chr1 (4-331)||(37844374-37844703)
chr1 (4-331)||(20445690-20446019)
chr1 (4-331)||(20531455-20531783)
chr1 (1-330)||(22227817-22228146)
chr1 (1-330)||(22232514-22232843)
chr1 (4-245)||(2116265-2116506)
chr1 (59-332)||(45051489-45051759)
chr1 (110-257)||(51452608-51452755)
chr1 (299-374)||(21860334-21860409)
chr1 (299-373)||(44034829-44034903)
chr1 (265-372)||(27675086-27675191)
chr1 (299-374)||(41218728-41218803)
chr1 (315-372)||(13376711-13376768)
chr1 (315-372)||(20177513-20177570)
chr1 (299-330)||(15861327-15861358)
chr1 (200-240)||(16646118-16646158)
chr1 (299-331)||(51452809-51452841)
[»] chr6 (33 HSPs)
chr6 (1-245)||(25175571-25175815)
chr6 (1-245)||(27653983-27654227)
chr6 (1-245)||(16825752-16825998)
chr6 (4-331)||(23153458-23153786)
chr6 (4-330)||(14626045-14626370)
chr6 (4-332)||(1650020-1650345)
chr6 (4-257)||(1657748-1657999)
chr6 (4-257)||(35009439-35009691)
chr6 (4-257)||(15862484-15862734)
chr6 (262-331)||(23148266-23148335)
chr6 (299-374)||(19983149-19983224)
chr6 (299-374)||(35015014-35015089)
chr6 (299-374)||(18583640-18583715)
chr6 (61-257)||(29665941-29666137)
chr6 (172-257)||(27751603-27751688)
chr6 (315-372)||(21623506-21623563)
chr6 (157-241)||(29605612-29605696)
chr6 (315-372)||(22361619-22361676)
chr6 (300-372)||(14152632-14152704)
chr6 (299-331)||(18002395-18002427)
chr6 (299-331)||(23995247-23995279)
chr6 (299-331)||(26090059-26090091)
chr6 (299-330)||(4991396-4991427)
chr6 (159-241)||(18629608-18629691)
chr6 (301-331)||(15742120-15742150)
chr6 (157-239)||(17083200-17083282)
chr6 (299-331)||(1657661-1657693)
chr6 (299-331)||(15862789-15862821)
chr6 (200-240)||(18399144-18399184)
chr6 (299-331)||(18823283-18823315)
chr6 (299-331)||(18839138-18839170)
chr6 (299-331)||(27751742-27751774)
chr6 (299-331)||(32276659-32276691)
[»] chr5 (37 HSPs)
chr5 (1-245)||(25426636-25426880)
chr5 (1-245)||(12382-12626)
chr5 (1-245)||(19499907-19500151)
chr5 (1-245)||(22366481-22366725)
chr5 (1-242)||(18777995-18778236)
chr5 (1-245)||(21073595-21073839)
chr5 (4-331)||(23506976-23507302)
chr5 (1-242)||(43443398-43443639)
chr5 (4-331)||(27182471-27182799)
chr5 (3-245)||(4199985-4200227)
chr5 (1-241)||(27009849-27010089)
chr5 (4-331)||(22053753-22054085)
chr5 (4-331)||(18530988-18531319)
chr5 (45-245)||(29188284-29188483)
chr5 (4-257)||(34939289-34939540)
chr5 (110-257)||(20623085-20623232)
chr5 (110-257)||(21233528-21233675)
chr5 (111-255)||(25900408-25900552)
chr5 (110-257)||(16536313-16536460)
chr5 (110-257)||(37052860-37053007)
chr5 (300-374)||(11584374-11584448)
chr5 (299-372)||(5450695-5450768)
chr5 (315-372)||(21222462-21222519)
chr5 (157-241)||(29918127-29918212)
chr5 (161-250)||(32950862-32950951)
chr5 (299-331)||(16105967-16105999)
chr5 (299-331)||(20623286-20623318)
chr5 (299-331)||(21233442-21233474)
chr5 (299-331)||(25900320-25900352)
chr5 (299-331)||(37053061-37053093)
chr5 (159-241)||(21310709-21310792)
chr5 (159-240)||(5450844-5450926)
chr5 (4-37)||(29190482-29190515)
chr5 (299-331)||(108728-108760)
chr5 (299-331)||(9730278-9730310)
chr5 (299-331)||(16536514-16536546)
chr5 (200-240)||(16595713-16595753)
[»] chr2 (38 HSPs)
chr2 (1-245)||(19886661-19886905)
chr2 (4-331)||(462749-463075)
chr2 (4-374)||(20627195-20627565)
chr2 (1-374)||(19794586-19794959)
chr2 (4-374)||(43642838-43643209)
chr2 (4-331)||(8891253-8891581)
chr2 (4-331)||(36982364-36982693)
chr2 (1-257)||(17396653-17396908)
chr2 (4-331)||(24341309-24341641)
chr2 (4-257)||(25265390-25265642)
chr2 (1-207)||(7507894-7508099)
chr2 (110-257)||(19689401-19689548)
chr2 (110-257)||(23820187-23820334)
chr2 (110-257)||(14906440-14906587)
chr2 (235-331)||(22863169-22863267)
chr2 (110-257)||(20015127-20015274)
chr2 (299-374)||(22275045-22275120)
chr2 (299-374)||(22284278-22284353)
chr2 (300-374)||(15633538-15633612)
chr2 (315-372)||(43646232-43646289)
chr2 (159-240)||(68156-68238)
chr2 (299-332)||(19689314-19689347)
chr2 (299-331)||(9652796-9652828)
chr2 (299-331)||(14906354-14906386)
chr2 (320-372)||(19660221-19660273)
chr2 (299-331)||(23820388-23820420)
chr2 (299-330)||(25213372-25213403)
chr2 (159-240)||(22775206-22775288)
chr2 (159-240)||(22780584-22780666)
chr2 (299-372)||(19666848-19666921)
chr2 (315-372)||(25305769-25305826)
chr2 (265-372)||(31146032-31146138)
chr2 (299-331)||(7507757-7507789)
chr2 (299-331)||(17396567-17396599)
chr2 (299-331)||(20015328-20015360)
chr2 (299-331)||(28031134-28031166)
chr2 (299-331)||(33128372-33128404)
chr2 (161-240)||(43646059-43646139)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (1-331)||(3508-3837)
scaffold0266 (4-331)||(1135-1462)
[»] chr7 (46 HSPs)
chr7 (4-372)||(3059977-3060344)
chr7 (1-245)||(10989418-10989661)
chr7 (4-331)||(16211777-16212103)
chr7 (1-246)||(2437465-2437710)
chr7 (4-331)||(13036938-13037266)
chr7 (4-331)||(11580661-11580991)
chr7 (1-245)||(13911024-13911269)
chr7 (1-241)||(13572684-13572924)
chr7 (4-331)||(36052678-36053003)
chr7 (1-257)||(25292338-25292593)
chr7 (1-250)||(18253842-18254090)
chr7 (4-257)||(47481031-47481283)
chr7 (1-220)||(16478987-16479205)
chr7 (1-257)||(7293025-7293279)
chr7 (110-257)||(11516343-11516490)
chr7 (4-256)||(13321025-13321278)
chr7 (110-257)||(15441564-15441711)
chr7 (110-257)||(30262129-30262276)
chr7 (299-374)||(32493903-32493978)
chr7 (299-374)||(126738-126813)
chr7 (299-374)||(1936874-1936949)
chr7 (299-374)||(111126-111201)
chr7 (136-329)||(295893-296087)
chr7 (265-372)||(13377819-13377924)
chr7 (300-374)||(7283913-7283987)
chr7 (315-372)||(13389693-13389750)
chr7 (225-331)||(36024372-36024485)
chr7 (159-240)||(13377693-13377775)
chr7 (299-331)||(2029244-2029276)
chr7 (299-331)||(7293333-7293365)
chr7 (299-331)||(11516544-11516576)
chr7 (299-331)||(14113903-14113935)
chr7 (299-331)||(15441478-15441510)
chr7 (262-331)||(15709428-15709501)
chr7 (316-372)||(16919870-16919926)
chr7 (299-331)||(30262043-30262075)
chr7 (299-331)||(42056188-42056220)
chr7 (159-241)||(16914928-16915011)
chr7 (299-331)||(371417-371449)
chr7 (299-331)||(3049905-3049937)
chr7 (299-331)||(13321334-13321366)
chr7 (225-257)||(14113989-14114021)
chr7 (225-257)||(14423639-14423671)
chr7 (299-327)||(15516765-15516793)
chr7 (299-331)||(25124450-25124482)
chr7 (299-331)||(47480944-47480976)
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (1-245)||(47357662-47357906)
chr4 (4-374)||(54118125-54118496)
chr4 (4-331)||(13246441-13246769)
chr4 (1-241)||(10644227-10644467)
chr4 (93-331)||(121989-122226)
chr4 (1-257)||(13048221-13048477)
chr4 (4-331)||(15675009-15675341)
chr4 (61-331)||(10104170-10104445)
chr4 (1-257)||(26680209-26680463)
chr4 (4-230)||(31115640-31115865)
chr4 (110-257)||(10488678-10488825)
chr4 (110-257)||(16327926-16328073)
chr4 (194-331)||(33240900-33241043)
chr4 (299-374)||(25119064-25119139)
chr4 (4-90)||(111406-111492)
chr4 (225-331)||(31132545-31132657)
chr4 (299-374)||(5682385-5682460)
chr4 (61-241)||(40885570-40885749)
chr4 (299-372)||(41165808-41165881)
chr4 (159-240)||(15044992-15045074)
chr4 (315-372)||(47534933-47534990)
chr4 (299-331)||(14952085-14952117)
chr4 (299-331)||(15135907-15135939)
chr4 (299-331)||(15272211-15272243)
chr4 (299-331)||(16327840-16327872)
chr4 (299-331)||(16609013-16609045)
chr4 (299-331)||(26680517-26680549)
chr4 (159-240)||(15109350-15109432)
chr4 (299-331)||(8045272-8045304)
chr4 (299-331)||(16523146-16523178)
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (1-331)||(14842487-14842816)
chr3 (1-245)||(55316227-55316471)
chr3 (4-331)||(13838905-13839232)
chr3 (1-245)||(41270083-41270327)
chr3 (4-331)||(2049821-2050147)
chr3 (4-331)||(12030073-12030399)
chr3 (110-374)||(16743998-16744262)
chr3 (1-220)||(16821147-16821366)
chr3 (1-257)||(13975722-13975977)
chr3 (1-257)||(45860813-45861068)
chr3 (4-267)||(51158008-51158270)
chr3 (4-294)||(15858986-15859276)
chr3 (1-257)||(13954890-13955145)
chr3 (1-250)||(15936634-15936882)
chr3 (1-250)||(15938476-15938724)
chr3 (194-374)||(19231981-19232164)
chr3 (4-332)||(15614845-15615170)
chr3 (4-257)||(17912483-17912733)
chr3 (211-331)||(19260749-19260869)
chr3 (110-257)||(2449238-2449385)
chr3 (296-374)||(15857120-15857198)
chr3 (299-374)||(3992873-3992948)
chr3 (299-374)||(55513193-55513268)
chr3 (299-374)||(2844514-2844589)
chr3 (299-374)||(54037981-54038056)
chr3 (299-374)||(17955837-17955916)
chr3 (299-374)||(7854305-7854380)
chr3 (299-360)||(45581954-45582016)
chr3 (315-372)||(17205019-17205076)
chr3 (299-372)||(38810868-38810941)
chr3 (317-372)||(12031849-12031904)
chr3 (161-250)||(11986173-11986262)
chr3 (299-372)||(13301323-13301396)
chr3 (299-372)||(13311979-13312052)
chr3 (200-241)||(14080715-14080756)
chr3 (315-372)||(17191879-17191936)
chr3 (299-331)||(2449152-2449184)
chr3 (157-241)||(4145814-4145898)
chr3 (299-331)||(16261777-16261809)
chr3 (299-331)||(16933869-16933901)
chr3 (299-331)||(17912398-17912430)
chr3 (299-331)||(23492696-23492728)
chr3 (299-331)||(38168237-38168269)
chr3 (299-331)||(53771365-53771397)
chr3 (159-240)||(30207380-30207462)
chr3 (4-106)||(47984661-47984763)
chr3 (4-106)||(47993948-47994050)
chr3 (4-106)||(48003235-48003337)
chr3 (4-106)||(48012521-48012623)
chr3 (315-372)||(3576290-3576347)
chr3 (157-241)||(6228625-6228710)
chr3 (300-365)||(15550922-15550987)
chr3 (299-331)||(11986080-11986112)
chr3 (299-331)||(13954804-13954836)
chr3 (200-240)||(14059214-14059254)
chr3 (299-331)||(14285289-14285321)
chr3 (299-331)||(19947026-19947058)
chr3 (299-331)||(30153265-30153297)
chr3 (299-331)||(33342204-33342236)
chr3 (299-331)||(45861122-45861154)
chr3 (299-331)||(51961031-51961063)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (4-331)||(48609-48935)
scaffold0023 (1-220)||(36101-36320)
scaffold0023 (299-331)||(61122-61154)
[»] chr8 (35 HSPs)
chr8 (4-331)||(16193643-16193968)
chr8 (5-245)||(30120734-30120974)
chr8 (4-331)||(43373392-43373720)
chr8 (1-183)||(222753-222935)
chr8 (1-183)||(736376-736558)
chr8 (1-183)||(860271-860453)
chr8 (4-331)||(24928716-24929043)
chr8 (1-245)||(16674392-16674636)
chr8 (4-374)||(16404857-16405224)
chr8 (5-241)||(21844576-21844812)
chr8 (5-241)||(21851969-21852205)
chr8 (4-245)||(6774258-6774498)
chr8 (4-245)||(24548993-24549233)
chr8 (4-257)||(17345581-17345832)
chr8 (1-257)||(22907214-22907468)
chr8 (110-257)||(5238203-5238350)
chr8 (110-257)||(24661248-24661395)
chr8 (110-257)||(43685662-43685809)
chr8 (299-374)||(274766-274841)
chr8 (299-374)||(641008-641083)
chr8 (299-374)||(826814-826889)
chr8 (299-374)||(24716719-24716794)
chr8 (121-183)||(691908-691970)
chr8 (299-374)||(39115598-39115673)
chr8 (315-372)||(17285543-17285600)
chr8 (315-372)||(21198005-21198062)
chr8 (299-331)||(5238404-5238436)
chr8 (299-331)||(22907128-22907160)
chr8 (299-331)||(24385652-24385684)
chr8 (299-331)||(24661162-24661194)
chr8 (299-331)||(43685863-43685895)
chr8 (159-241)||(26011658-26011741)
chr8 (299-331)||(2545265-2545297)
chr8 (299-331)||(3431176-3431208)
chr8 (299-331)||(22886654-22886686)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-331)||(5990-6318)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (1-331)||(882-1210)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (4-331)||(8889-9215)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (4-331)||(171916-172242)
scaffold0001 (4-331)||(177619-177945)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (1-331)||(12123-12450)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (4-331)||(247366-247694)
scaffold0012 (299-331)||(34075-34107)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (4-331)||(41740-42066)
[»] scaffold0162 (3 HSPs)
scaffold0162 (8-331)||(26340-26663)
scaffold0162 (110-257)||(8180-8327)
scaffold0162 (315-372)||(6877-6934)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (4-332)||(36836-37165)
scaffold0077 (300-374)||(15324-15398)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (1-220)||(43005-43224)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (4-328)||(19217-19543)
scaffold0195 (4-257)||(21301-21553)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (4-331)||(128095-128420)
scaffold0008 (1-220)||(31700-31920)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (4-321)||(4996-5313)
[»] scaffold0772 (2 HSPs)
scaffold0772 (17-250)||(5552-5785)
scaffold0772 (299-331)||(5846-5878)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (4-331)||(123087-123416)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (4-331)||(272036-272362)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (4-241)||(46-283)
scaffold0116 (299-374)||(30417-30492)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (1-241)||(64527-64772)
scaffold0026 (1-250)||(107755-108003)
scaffold0026 (200-242)||(89863-89905)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (111-329)||(51110-51328)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (1-250)||(48195-48443)
scaffold0049 (300-374)||(20493-20567)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (1-246)||(21115-21359)
scaffold0139 (1-220)||(14086-14304)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (4-283)||(148732-149012)
scaffold0025 (4-331)||(8860-9192)
scaffold0025 (231-331)||(146838-146938)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (111-331)||(89378-89600)
scaffold0028 (206-331)||(107708-107835)
scaffold0028 (299-330)||(130880-130911)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-207)||(5254-5458)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (4-220)||(9374-9589)
scaffold0215 (4-220)||(16272-16487)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (1-207)||(3730-3936)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (99-245)||(1304-1450)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (6-257)||(534-784)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (1-257)||(34460-34716)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (4-246)||(2973-3215)
[»] scaffold0132 (3 HSPs)
scaffold0132 (124-257)||(13636-13769)
scaffold0132 (299-374)||(42677-42749)
scaffold0132 (299-331)||(13824-13856)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (4-257)||(41659-41911)
scaffold0125 (291-331)||(41957-41997)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (1-257)||(37066-37320)
scaffold0078 (299-374)||(41632-41707)
scaffold0078 (299-331)||(36980-37012)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (89-245)||(13325-13480)
[»] scaffold0141 (4 HSPs)
scaffold0141 (110-257)||(26911-27058)
scaffold0141 (110-250)||(22656-22796)
scaffold0141 (299-331)||(22857-22889)
scaffold0141 (299-331)||(27112-27144)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (110-257)||(1582-1729)
scaffold0124 (299-331)||(1496-1528)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (1-99)||(9-107)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (1-99)||(48522-48620)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (299-374)||(80187-80262)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (298-374)||(166121-166197)
scaffold0016 (298-373)||(162036-162111)
scaffold0016 (299-372)||(116410-116483)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (299-374)||(31137-31212)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (299-373)||(5735-5809)
scaffold0686 (299-373)||(5941-6015)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (298-374)||(309-385)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (4-90)||(9393-9479)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (164-257)||(3360-3453)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (300-374)||(1701-1775)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (300-374)||(19807-19881)
scaffold0122 (300-374)||(24111-24185)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (300-370)||(94-164)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (300-374)||(6261-6335)
scaffold0310 (300-337)||(4-41)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (299-372)||(1363-1436)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (161-250)||(56106-56195)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (315-372)||(35816-35873)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (159-241)||(8174-8257)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (159-240)||(2317-2399)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (315-372)||(442-499)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (315-372)||(76699-76756)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (299-332)||(193396-193429)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (299-331)||(6443-6475)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (299-331)||(878-910)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (299-331)||(9882-9914)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (299-331)||(13285-13317)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (299-331)||(57392-57424)
scaffold0058 (200-241)||(70307-70348)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (299-331)||(55904-55936)
scaffold0032 (299-331)||(108075-108107)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (288-331)||(18015-18058)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (161-207)||(45198-45244)
scaffold0066 (299-331)||(45338-45370)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (315-372)||(632-689)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (315-372)||(6999-7056)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (200-241)||(1546-1587)
scaffold0456 (200-241)||(8691-8732)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (315-372)||(43651-43708)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (315-372)||(31357-31414)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (200-240)||(8011-8051)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (299-331)||(17209-17241)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (299-331)||(5476-5508)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (299-331)||(4346-4378)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (299-331)||(17304-17336)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (299-331)||(5549-5581)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (299-331)||(34308-34340)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (200-240)||(3525-3565)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (299-331)||(12418-12450)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Original strand, 41394230 - 41394602
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||  |||||| |    
T  41394230 atccatgaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaacataacaata 41394329  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    |||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||    
T  41394330 acttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaacttcaccaacaatcatacaattatcatcaat 41394428  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgat 300  Q
    | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394429 ttatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgat 41394528  T
Q  301 gattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394529 gattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcactttagctcctatg 41394602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Original strand, 20931356 - 20931682
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  20931356 catgaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaatt 20931455  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||    
T  20931456 tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattca 20931554  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 303  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  20931555 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaacttcatacaacaattgaaaatttgcaaaatgaggatgat 20931654  T
Q  304 tatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20931655 tatgataaaggctaacccccttacctta 20931682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Original strand, 20913048 - 20913367
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||       ||||||||||||||    
T  20913048 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatca-------aattaacaacaact 20913140  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    | | | |||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||    
T  20913141 ttgca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattca 20913239  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 303  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  20913240 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccgtaagcaaaattcatacaacaattgaaaatttgcaaaatgaggatgat 20913339  T
Q  304 tatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  20913340 tacgataaagactaacccccttacctta 20913367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5072632 - 5072388
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  5072632 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaaca 5072533  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5072532 acttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaat 5072433  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 245  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  5072432 tcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 5072388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18601362 - 18601118
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  18601362 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaaca 18601263  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18601262 acttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaat 18601163  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 245  Q
    |||||||||||||||||||| || ||   ||||| ||||||||||    
T  18601162 tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcatgaatttagca 18601118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20893877 - 20893551
Alignment:
Q  5 atgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaactt 104  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  20893877 atgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatctaacaacaactt 20893778  T
Q  105 aggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcat 204  Q
    || | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||    
T  20893777 agca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaattatcatcaattcat 20893679  T
Q  205 gcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatga 302  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20893678 gcatacaaacatatcatcacagttggagcaagaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaa-ttacaaaatgatgatga 20893580  T
Q  303 ttatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20893579 ttatgatgaagactaacccccttacctta 20893551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 37844703 - 37844374
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  37844703 catgaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 37844604  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttca-taacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattc 202  Q
    ||| | |||||||    || |||||||| |||| ||  ||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  37844603 tagca-aaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattc 37844505  T
Q  203 atgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgat 300  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37844504 atgcatacaaacatatcatcatagttggagcatgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgat 37844405  T
Q  301 gattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37844404 gattatgataaagactaacccccttacctta 37844374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Original strand, 20445690 - 20446019
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| | ||||||||||    
T  20445690 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaact 20445789  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| ||||  ||||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  20445790 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 20445888  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattt-acaaaatgatgat 300  Q
    |||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20445889 tgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgat 20445988  T
Q  301 gattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20445989 gattatgataaagactaactcccttacctta 20446019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Original strand, 20531455 - 20531783
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| | ||||||||||    
T  20531455 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaact 20531554  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| ||||  ||||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  20531555 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 20531653  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 301  Q
    ||||||||||||||  | || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20531654 tgcatacaaacatattatcacatttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatg 20531753  T
Q  302 attatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||    
T  20531754 attatgataaagactaatttccttacctta 20531783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 22227817 - 22228146
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  22227817 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaaca 22227916  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    |||||| | ||||||| |  ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||    
T  22227917 acttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaat 22228015  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatga 299  Q
    ||||||| |  || |||||| || ||   ||||||||||||||||| |||  | ||| || | |  ||||||||||||  ||||||  | ||| ||   |    
T  22228016 tcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtaca 22228115  T
Q  300 tgattatgataaagactaacccccttacctt 330  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22228116 tgattatgataataactaacccccttacctt 22228146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 22232514 - 22232843
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  22232514 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaaca 22232613  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    |||||| | ||||||| |  ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||    
T  22232614 acttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaat 22232712  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatga 299  Q
    ||||||| |  || |||||| || ||   ||||||||||||||||| |||  | ||| || | |  ||||||||||||  ||||||  | ||| ||   |    
T  22232713 tcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtaca 22232812  T
Q  300 tgattatgataaagactaacccccttacctt 330  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22232813 tgattatgataataactaacccccttacctt 22232843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 245
Target Start/End: Original strand, 2116265 - 2116506
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaac-tcaaattaacaacaac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||| |||    
T  2116265 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaaatatcaaattaacaataac 2116364  T
Q  103 ttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattc 202  Q
    |||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  2116365 ttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattc 2116463  T
Q  203 atgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 245  Q
    |||||||||||||||||| || |||   ||||||||| |||||    
T  2116464 atgcatacaaacataacatcacagtaaaagcacgaatctagca 2116506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 59 - 332
Target Start/End: Original strand, 45051489 - 45051759
Alignment:
Q  59 ataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatata 158  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| | ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| |||||     
T  45051489 ataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatt 45051587  T
Q  159 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat- 257  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| || |||  || ||||||| |||||  |||  | |||     
T  45051588 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagaacacgaatctagcatgaattgttcatc 45051687  T
Q  258 aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaa 332  Q
    || | |  ||||||||||||  |||||  | |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45051688 aacccattttcatacaacatgagaaaa--tgcaaaatca-catgattatgataaagactaacccccttaccttaa 45051759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 257
Target Start/End: Original strand, 51452608 - 51452755
Alignment:
Q  110 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 209  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  51452608 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 51452707  T
Q  210 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  51452708 caaacatatcatcaaagttgaagcacgaatttagcaacaattatccat 51452755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 299 - 374
Target Start/End: Original strand, 21860334 - 21860409
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  21860334 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 21860409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 299 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 44034903 - 44034829
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctat 373  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  44034903 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 44034829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 372
Target Start/End: Original strand, 27675086 - 27675191
Alignment:
Q  265 attcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 364  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |  |  | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  27675086 attcatacaacaattgaaaatttacactaaaa--acgattatgataaattctaacccccttaccttaattatctccaattcctagcccaagcttcacttt 27675183  T
Q  365 agctccta 372  Q
    ||||||||    
T  27675184 agctccta 27675191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 299 - 374
Target Start/End: Original strand, 41218728 - 41218803
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  41218728 atgatcatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatg 41218803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 13376768 - 13376711
Alignment:
Q  315 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | | |||||||||||||||||    
T  13376768 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaaacttcactttagctccta 13376711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 372
Target Start/End: Original strand, 20177513 - 20177570
Alignment:
Q  315 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 372  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  20177513 ctaaccccattaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 20177570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 299 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15861358 - 15861327
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861358 atgattatgataaagactaacccccttacctt 15861327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 240
Target Start/End: Original strand, 16646118 - 16646158
Alignment:
Q  200 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 240  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16646118 ttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 16646158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 51452809 - 51452841
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51452809 atgattaagataaagactaacccccttacctta 51452841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 33)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 25175571 - 25175815
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175571 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 25175670  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175671 acttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 25175770  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 245  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||    
T  25175771 tcatgcatacaaacataacaacacagcaagagcacgaatttagca 25175815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27654227 - 27653983
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27654227 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcattggaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 27654128  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27654127 acttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 27654028  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 245  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  27654027 tcatgcatacaagcataacatcacagcaagagcacgaatttagca 27653983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16825998 - 16825752
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825998 atccatgaatatgcataacaaagcaattattcatcaatcataatatcagataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 16825899  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatta--tacaactaacatca 198  Q
    | ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16825898 aattaggagaaatccaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattaattacaactaacatca 16825799  T
Q  199 attcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 245  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  16825798 attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 16825752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Original strand, 23153458 - 23153786
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || || ||||| |||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  23153458 catgaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 23153557  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  23153558 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 23153656  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 301  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23153657 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagaaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 23153756  T
Q  302 attatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23153757 attatgatgaagactaacccccttacctta 23153786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 14626370 - 14626045
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  14626370 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaagttaacaacaact 14626271  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | || ||||||  ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  14626270 tagcataa-ttcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 14626172  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 303  Q
    ||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||  ||| ||| ||||||    
T  14626171 tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattatccataatcacaattcaaacaacatttgagaatttgtaaagtgaagatgat 14626072  T
Q  304 tatgataaagactaacccccttacctt 330  Q
    | ||||||  |||||||||||||||||    
T  14626071 tgtgataataactaacccccttacctt 14626045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1650345 - 1650020
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| | ||||    
T  1650345 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataact 1650246  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  1650245 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 1650147  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatga 302  Q
    ||||||||||| ||||| || |||  |||||||||| |||||  |||  | ||| || | |  ||||||||||||  |||||  | |||||| |  ||||    
T  1650146 tgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaa--tgcaaaatta-catga 1650050  T
Q  303 ttatgataaagactaacccccttaccttaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1650049 ttatgataaagactaacccccttaccttaa 1650020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 1657999 - 1657748
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   |||||||||  ||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    
T  1657999 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact 1657901  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  1657900 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 1657802  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    ||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1657801 tgcatccaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 1657748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 35009691 - 35009439
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  || | |||||||||     
T  35009691 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaaca 35009592  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  35009591 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 35009493  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35009492 tgcatacaaacttaacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 35009439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 15862484 - 15862734
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| || ||   ||||||| | | |||||||||||| ||||||| || |||| ||||    
T  15862484 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattatcagcaataacataaat-gaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact 15862581  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||| | ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  15862582 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 15862680  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15862681 tgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagtaacaattatccat 15862734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 262 - 331
Target Start/End: Original strand, 23148266 - 23148335
Alignment:
Q  262 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23148266 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 23148335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 299 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 19983224 - 19983149
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  19983224 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 19983149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 299 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 35015089 - 35015014
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  35015089 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 35015014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 299 - 374
Target Start/End: Original strand, 18583640 - 18583715
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||    
T  18583640 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatg 18583715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 257
Target Start/End: Original strand, 29665941 - 29666137
Alignment:
Q  61 aacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tat 159  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||  | ||||||||||||| | |||||||||  || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||| | |    
T  29665941 aacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagtacaat-ttcataacttgacatttatgcatacttt 29666038  T
Q  160 gaa-catgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| ||||  || |||||| || || | ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  29666039 gaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatccat 29666137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 172 - 257
Target Start/End: Original strand, 27751603 - 27751688
Alignment:
Q  172 tcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    ||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  27751603 tcaccaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataacatcacaattagagcacgaatttagctacatttatccat 27751688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 372
Target Start/End: Original strand, 21623506 - 21623563
Alignment:
Q  315 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  21623506 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 21623563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 157 - 241
Target Start/End: Original strand, 29605612 - 29605696
Alignment:
Q  157 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||| || ||  ||||||||||| |||||||| || |||| || ||||||||||||    
T  29605612 tatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcactaattcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaattt 29605696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 22361676 - 22361619
Alignment:
Q  315 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||  | |||||||||||||||||||    
T  22361676 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctaggccaagcttcactttagctccta 22361619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 372
Target Start/End: Original strand, 14152632 - 14152704
Alignment:
Q  300 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 372  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| | | || | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  14152632 tgattatgatgaagaataacccccttgccttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctccta 14152704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18002427 - 18002395
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18002427 atgattatgataaagactaacccccttacctta 18002395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 23995247 - 23995279
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23995247 atgattatgataaagactaacccccttacctta 23995279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 26090059 - 26090091
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090059 atgattatgataaagactaacccccttacctta 26090091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 299 - 330
Target Start/End: Original strand, 4991396 - 4991427
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991396 atgattatgataaagactaacccccttacctt 4991427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18629691 - 18629608
Alignment:
Q  159 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 241  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || |||||||| ||||||| |||||||| || |||| || ||||||||||||    
T  18629691 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 18629608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15742150 - 15742120
Alignment:
Q  301 gattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15742150 gattatgataaagactaacccccttacctta 15742120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17083282 - 17083200
Alignment:
Q  157 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaat 239  Q
    |||||||||  ||||||||||||||  || ||| || || |||||||||||| |||||||| || |||| || ||||||||||    
T  17083282 tatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaat 17083200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1657693 - 1657661
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1657693 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 1657661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 15862789 - 15862821
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15862789 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 15862821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 240
Target Start/End: Original strand, 18399144 - 18399184
Alignment:
Q  200 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 240  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18399144 ttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 18399184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18823315 - 18823283
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18823315 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 18823283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18839170 - 18839138
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18839170 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 18839138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 27751742 - 27751774
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27751742 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 27751774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 32276691 - 32276659
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32276691 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 32276659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 37)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 25426636 - 25426880
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426636 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 25426735  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426736 acttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 25426835  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 245  Q
    |||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  25426836 tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 25426880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 12382 - 12626
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12382 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 12481  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12482 acttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 12581  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 245  Q
    |||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  12582 tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 12626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 19499907 - 19500151
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19499907 atccatgaatatgcataccaaagcaattattaatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 19500006  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500007 acttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 19500106  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 245  Q
    |||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  19500107 tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19500151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22366725 - 22366481
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22366725 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacaactcaaattaacaaca 22366626  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366625 acttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 22366526  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 245  Q
    |||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  22366525 tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 22366481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18778236 - 18777995
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778236 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 18778137  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778136 acttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 18778037  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattta 242  Q
    |||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||    
T  18778036 tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 18777995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21073839 - 21073595
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073839 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattgataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 21073740  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21073739 acttagaagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatccat 21073640  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 245  Q
    |||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  21073639 tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 21073595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Original strand, 23506976 - 23507302
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  23506976 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaact 23507075  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  23507076 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 23507174  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 303  Q
    |||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||    
T  23507175 tgcatacaaacatatcatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaatcttacaaaatggagatgat 23507274  T
Q  304 tatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23507275 tatgataaagactaacccccttacctta 23507302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 43443639 - 43443398
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  43443639 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagactcacatctcaaatcaacaaca 43443540  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    |||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43443539 acttagaagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaat 43443440  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattta 242  Q
    |||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||    
T  43443439 tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 43443398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 27182799 - 27182471
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  27182799 catgaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 27182700  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||    
T  27182699 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaattatcatcagttca 27182601  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 301  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27182600 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcatgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 27182501  T
Q  302 attatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27182500 attatgatgaagactaacccccttacctta 27182471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4200227 - 4199985
Alignment:
Q  3 ccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaac 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  4200227 ccatgaatatgcaaacccaagcaatcattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac 4200128  T
Q  103 ttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattc 202  Q
     || ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4200127 ataagagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattc 4200028  T
Q  203 atgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 245  Q
    |||||||||||||||||| || |    ||||||||||||||||    
T  4200027 atgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagca 4199985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 27009849 - 27010089
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27009849 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaaca 27009948  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||  || || ||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||    
T  27009949 acttaggagaaattcaccaattgagtacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacactcatacaatcatcatcaat 27010048  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 241  Q
    |||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||    
T  27010049 tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 27010089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22054085 - 22053753
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| | ||||||||||    
T  22054085 catgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaact 22053986  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22053985 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactatcatcaattca 22053887  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgat 297  Q
    | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||||    |||||    
T  22053886 tacatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaatttcaaaaatgatgat 22053787  T
Q  298 gatgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22053786 gatgattatgatgaagactaacccccttacctta 22053753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18531319 - 18530988
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| | ||||||||||    
T  18531319 catgaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaact 18531220  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  18531219 tagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 18531121  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcc-ataatcaaa-attcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgat- 300  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||     
T  18531120 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaacattcataccacatttgaaaaattgcaaaatgatgatg 18531021  T
Q  301 --gattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18531020 acgattatgatgaagactaacccccttacctta 18530988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 45 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29188483 - 29188284
Alignment:
Q  45 atcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttat 144  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||    
T  29188483 atcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttat 29188385  T
Q  145 catttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagc 244  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||| ||||    
T  29188384 catttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagc 29188285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 34939289 - 34939540
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   |||||||||  ||||||||||||| ||||||| || ||||  |||    
T  34939289 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaatgact 34939387  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  34939388 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 34939486  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  34939487 tgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacagttatccat 34939540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 257
Target Start/End: Original strand, 20623085 - 20623232
Alignment:
Q  110 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 209  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  20623085 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 20623184  T
Q  210 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20623185 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20623232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21233675 - 21233528
Alignment:
Q  110 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 209  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  21233675 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 21233576  T
Q  210 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21233575 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21233528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 111 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 25900552 - 25900408
Alignment:
Q  111 aattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 210  Q
    |||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   ||||| |||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  25900552 aattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac 25900453  T
Q  211 aaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcc 255  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25900452 aaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatcc 25900408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 257
Target Start/End: Original strand, 16536313 - 16536460
Alignment:
Q  110 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 209  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  || ||||||||||||    
T  16536313 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattataaattcatgcata 16536412  T
Q  210 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16536413 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16536460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 257
Target Start/End: Original strand, 37052860 - 37053007
Alignment:
Q  110 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 209  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||   |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  37052860 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 37052959  T
Q  210 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37052960 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 37053007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 374
Target Start/End: Original strand, 11584374 - 11584448
Alignment:
Q  300 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||    
T  11584374 tgattatgatgaattctaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatg 11584448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 5450768 - 5450695
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 372  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||   ||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  5450768 atgattatgatgaattctaacccccttaccttaattattatcaattcctagcccaagcttcactttagctccta 5450695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 21222519 - 21222462
Alignment:
Q  315 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 372  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  21222519 ctaacccccataccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 21222462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 241
Target Start/End: Original strand, 29918127 - 29918212
Alignment:
Q  157 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||| || |||||||| |||| || |||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  29918127 tatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtattcaaacatatcatcataattggagcacgaattt 29918212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 250
Target Start/End: Original strand, 32950862 - 32950951
Alignment:
Q  161 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 250  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||| || |||||| |||| || || || |||||| || |||| ||||||||||||| |||||||    
T  32950862 aacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcatcaaatcatacacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat 32950951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 16105967 - 16105999
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16105967 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16105999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 20623286 - 20623318
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623286 atgattatgataaagactaacccccttacctta 20623318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21233474 - 21233442
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233474 atgattatgataaagactaacccccttacctta 21233442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25900352 - 25900320
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25900352 atgattatgataaagactaacccccttacctta 25900320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 37053061 - 37053093
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37053061 atgattatgataaagactaacccccttacctta 37053093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21310792 - 21310709
Alignment:
Q  159 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 241  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||||| ||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  21310792 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 21310709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 5450926 - 5450844
Alignment:
Q  159 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  5450926 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaatt 5450844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 29190515 - 29190482
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29190515 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaa 29190482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 108760 - 108728
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  108760 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 108728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 9730310 - 9730278
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9730310 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 9730278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 16536514 - 16536546
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16536514 atgattatgataaagactaacccccttatctta 16536546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 240
Target Start/End: Original strand, 16595713 - 16595753
Alignment:
Q  200 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 240  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16595713 ttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 16595753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 38)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19886905 - 19886661
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886905 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 19886806  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886805 acttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 19886706  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 245  Q
    |||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  19886705 tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19886661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Original strand, 462749 - 463075
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  462749 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 462848  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||    
T  462849 tagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattca 462947  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 303  Q
    |||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  462948 tgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 463047  T
Q  304 tatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  463048 tatgataaagactaacccccttacctta 463075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 20627565 - 20627195
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || || | ||| |||||  ||||| |||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  20627565 catgaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaaccataaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaattaacaacaact 20627466  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||  | |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||     
T  20627465 taaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttggacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcg 20627367  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaa-tttacaaaatgatgatga 302  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20627366 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccataatcataattcatacaatatttgaaaattttacaaaatgatgatga 20627267  T
Q  303 ttatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  20627266 ttatgataaagactaaccccgttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 20627195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 19794959 - 19794586
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| ||||    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  19794959 atccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatcaattaacggaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaaca 19794860  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    |||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||    
T  19794859 acttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaat 19794761  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatg 298  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  19794760 tcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacgacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaa-tttacaaaataatg 19794662  T
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19794661 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcttatg 19794586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 43643209 - 43642838
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   ||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  43643209 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaactacaacatcaattaacagcaatagcatcaattgaacaagaatcatatctcaaattaataacaact 43643110  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
     || | |||||||||  || |||||||| |||| |||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  43643109 aagaa-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 43643011  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 301  Q
    |||||||||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43643010 tgcatacaaacatatcatcacaattggagcacaaatttagcaacaattatccactatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatg 43642911  T
Q  302 attatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  43642910 attatgataaagactaacctccttcccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 43642838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Original strand, 8891253 - 8891581
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  8891253 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 8891352  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||    
T  8891353 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcgccaacaatcatacaattatcatcaattca 8891451  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 301  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8891452 tgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 8891551  T
Q  302 attatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8891552 attatgataaagactaacccctttacctta 8891581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 36982693 - 36982364
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||    
T  36982693 catgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaact 36982594  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    | | | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| || ||||||||||    
T  36982593 tggca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccagcaatcttacaattatcatcaattca 36982495  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaaatgatgat 300  Q
    || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36982494 tgaatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaatgatgat 36982395  T
Q  301 gattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36982394 gattatgataaagactaacccccttacctta 36982364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17396908 - 17396653
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||    
T  17396908 atccatgaatatgcaaacccaagcaattatccattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgaca 17396809  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||||    
T  17396808 acttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaat 17396709  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    |||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17396708 tcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17396653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24341641 - 24341309
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| | ||||||||||    
T  24341641 catgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaact 24341542  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  24341541 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatataatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 24341443  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgat 297  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||||    |||||    
T  24341442 tgcatacaaacatatcatcacagttgaagcatgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgat 24341343  T
Q  298 gatgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24341342 gatgattatgatgaagactaacccccttacctta 24341309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 25265642 - 25265390
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  || | |||||||||     
T  25265642 catgaatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaaca 25265543  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  25265542 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 25265444  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25265443 tgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 25265390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7508099 - 7507894
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaaattaacaac 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | ||||| ||||||||    
T  7508099 atccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaa-ttaacaac 7508001  T
Q  100 aacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa 199  Q
    |||||||   |||||||||  || | |||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  7508000 aacttagcc-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa 7507902  T
Q  200 ttcatgca 207  Q
    ||||||||    
T  7507901 ttcatgca 7507894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 19689548 - 19689401
Alignment:
Q  110 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 209  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  19689548 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 19689449  T
Q  210 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19689448 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 19689401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 257
Target Start/End: Original strand, 23820187 - 23820334
Alignment:
Q  110 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 209  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  23820187 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 23820286  T
Q  210 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23820287 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 23820334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14906587 - 14906440
Alignment:
Q  110 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 209  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  14906587 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 14906488  T
Q  210 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14906487 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14906440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 235 - 331
Target Start/End: Original strand, 22863169 - 22863267
Alignment:
Q  235 cgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22863169 cgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacaattgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 22863267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 257
Target Start/End: Original strand, 20015127 - 20015274
Alignment:
Q  110 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 209  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| | |||| ||  ||||||||||||||     
T  20015127 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaattattatcaattcatgcatg 20015226  T
Q  210 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20015227 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20015274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 299 - 374
Target Start/End: Original strand, 22275045 - 22275120
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22275045 atgattatgataaaggctaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 22275120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 299 - 374
Target Start/End: Original strand, 22284278 - 22284353
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  22284278 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg 22284353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 300 - 374
Target Start/End: Original strand, 15633538 - 15633612
Alignment:
Q  300 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  15633538 tgattatgataaagactaacctccttaccttaattatctccaactattaactctagcttcacttttgctcctatg 15633612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 372
Target Start/End: Original strand, 43646232 - 43646289
Alignment:
Q  315 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  43646232 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 43646289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 68156 - 68238
Alignment:
Q  159 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  68156 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 68238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 19689347 - 19689314
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19689347 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 19689314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 9652828 - 9652796
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9652828 atgattatgataaagactaacccccttacctta 9652796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 14906386 - 14906354
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14906386 atgattatgataaagactaacccccttacctta 14906354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 372
Target Start/End: Original strand, 19660221 - 19660273
Alignment:
Q  320 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 372  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  19660221 ccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 19660273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 23820388 - 23820420
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23820388 atgattatgataaagactaacccccttacctta 23820420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 299 - 330
Target Start/End: Original strand, 25213372 - 25213403
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25213372 atgattatgataaagactaacccccttacctt 25213403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22775288 - 22775206
Alignment:
Q  159 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 240  Q
    |||||||| | ||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22775288 tgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 22775206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22780666 - 22780584
Alignment:
Q  159 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 240  Q
    |||||||| | ||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22780666 tgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 22780584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 299 - 372
Target Start/End: Original strand, 19666848 - 19666921
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 372  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| | | || | ||||| | | |||||||||||||||||    
T  19666848 atgattatgatgaattctaacccccttaccttaattagcacaaattcctagcccaaacttcactttagctccta 19666921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 372
Target Start/End: Original strand, 25305769 - 25305826
Alignment:
Q  315 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||| | |||||||||||| ||||||    
T  25305769 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcatagcccaagcttcactttaactccta 25305826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 31146138 - 31146032
Alignment:
Q  265 attcatacaaca-tttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactt 363  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||  || |    ||||| | ||||||||||    
T  31146138 attcatacaacaatttgaaaatttacacaa--aagatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaattctctagcccaagcttcactt 31146041  T
Q  364 tagctccta 372  Q
    |||||||||    
T  31146040 tagctccta 31146032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 7507789 - 7507757
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7507789 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 7507757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 17396599 - 17396567
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17396599 atgattatggtaaagactaacccccttacctta 17396567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 20015328 - 20015360
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20015328 atgatcatgataaagactaacccccttacctta 20015360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 28031166 - 28031134
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28031166 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 28031134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 33128372 - 33128404
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33128372 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 33128404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 240
Target Start/End: Original strand, 43646059 - 43646139
Alignment:
Q  161 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 240  Q
    |||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  43646059 aacatgaaatttcaccaacaacaatccaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcaacataattagagcacgaatt 43646139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3837 - 3508
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  3837 atccatcaatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaaca 3738  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    |||||| | ||||| |||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  3737 acttagca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat 3639  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgat 300  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  3638 tcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatctataatcaaaattcatacaacttttgaaaatttacaaaatgaagat 3539  T
Q  301 gattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3538 gattatgacaaagactaacccccttacctta 3508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Original strand, 1135 - 1462
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  1135 catgaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaact 1234  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||    
T  1235 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaattca 1333  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt-acaaaatgatgatga 302  Q
    ||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1334 tgcatactaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagaaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatga 1433  T
Q  303 ttatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1434 ttatgataaagactaacccccttacctta 1462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 372
Target Start/End: Original strand, 3059977 - 3060344
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  3059977 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 3060076  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||  | |||||||||  || |||| ||| |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||| || |||||||| |    
T  3060077 taaca-aaattcaccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacagtattacaattatcatcaattaa 3060175  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 303  Q
    |||||||||| |||  | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3060176 tgcatacaaatatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatataacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 3060275  T
Q  304 tatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 372  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  3060276 tatgataaagacttacccccttaccttcattatctccaactattagctctagcttcacttttgctccta 3060344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 10989418 - 10989661
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10989418 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta-caaca 10989516  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10989517 acttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaat 10989616  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 245  Q
    |||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  10989617 tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 10989661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Original strand, 16211777 - 16212103
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16211777 catgaatatgcatacccaagcaatgaatcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatttaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaact 16211876  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||| || ||||||||||    
T  16211877 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatcatcaattca 16211975  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 303  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16211976 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattgtccataagcaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgat 16212075  T
Q  304 tatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16212076 tatgataaagactaacccccttacctta 16212103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 2437465 - 2437710
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  2437465 atccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcaaatctcatattaacaaca 2437564  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    |||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2437565 acttaggaaaaattcaccaattgaacacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaat 2437664  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaa 246  Q
    |||||||||||||||||||| || |    |||||||||||||||||    
T  2437665 tcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaa 2437710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13037266 - 13036938
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  13037266 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatattcataacattaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 13037167  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||    
T  13037166 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaattatcatcaattca 13037068  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 301  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13037067 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 13036968  T
Q  302 attatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13036967 attatggtgaagactaacccccttacctta 13036938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 11580991 - 11580661
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  11580991 catgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 11580892  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  11580891 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 11580793  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat---caaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaaatgatga 299  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11580792 tgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccattatgcaaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaatgatga 11580693  T
Q  300 tgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11580692 tgattatgataaagactaatccccttacctta 11580661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13911269 - 13911024
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  13911269 atccatgaatatgcaaacccaagaaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca 13911170  T
Q  101 actt-aggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa 199  Q
    |||| ||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  13911169 actttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattaacatcaa 13911070  T
Q  200 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 245  Q
    ||||||||||||||||||||| || |    ||||||||||||||||    
T  13911069 ttcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagca 13911024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 13572684 - 13572924
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  13572684 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaaca 13572783  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||  | |||||||    
T  13572784 acttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatcatcatcaat 13572883  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 241  Q
    |||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||    
T  13572884 tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 13572924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Original strand, 36052678 - 36053003
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  || ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||   |    
T  36052678 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccacaacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaac---t 36052774  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||||||||    
T  36052775 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaattttaccaacaatcatataattatcatcaattca 36052873  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 301  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| |  |||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  36052874 tgcatacaaacgtatcatcacagttggagtataaatttagcaacaattatccattatacaaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatg 36052973  T
Q  302 attatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36052974 attatgataaagactaacccccttacctta 36053003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 25292593 - 25292338
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||    
T  25292593 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattagtcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacgaca 25292494  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    || |||||| ||||||||  || |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||||    
T  25292493 acctaggag-aattcaccaattgagcacaatattcatagcttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaat 25292395  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    |||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25292394 tcatacatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaattatccat 25292338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18254090 - 18253842
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  18254090 atccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaaca 18253991  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    |||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  18253990 acttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat 18253892  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 250  Q
    ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18253891 tcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 18253842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 47481283 - 47481031
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| ||| |   ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  47481283 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaact 47481184  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||    
T  47481183 tagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattca 47481085  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47481084 tgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 47481031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16479205 - 16478987
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||| || |    
T  16479205 atccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaaaata 16479106  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    |||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  16479105 acttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat 16479007  T
Q  201 tcatgcatacaaacataaca 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16479006 tcatgcatacaaacataaca 16478987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 7293025 - 7293279
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | |||||||    
T  7293025 atccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaacaaca 7293124  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    || |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  || |||    
T  7293125 acat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattattaat 7293222  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7293223 tcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 7293279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 257
Target Start/End: Original strand, 11516343 - 11516490
Alignment:
Q  110 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 209  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  11516343 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 11516442  T
Q  210 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11516443 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 11516490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 256
Target Start/End: Original strand, 13321025 - 13321278
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaa-caac 102  Q
    ||||||| |||| |||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| | ||||| ||||    
T  13321025 catgaatgtgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaatcaac 13321124  T
Q  103 ttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tatgaa-catgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    |||| | |||||||||  || |||||||| ||||||||||  ||||| | |||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  13321125 ttagca-aaattcaccaattgagcacaat-ttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat 13321222  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca 256  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  13321223 tcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatcca 13321278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15441711 - 15441564
Alignment:
Q  110 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 209  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  15441711 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 15441612  T
Q  210 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15441611 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 15441564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 30262276 - 30262129
Alignment:
Q  110 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 209  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  30262276 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 30262177  T
Q  210 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30262176 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 30262129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 299 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 32493978 - 32493903
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  32493978 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 32493903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 299 - 374
Target Start/End: Original strand, 126738 - 126813
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  126738 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcatttttgctcctatg 126813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 299 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 1936949 - 1936874
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||    
T  1936949 atgattatgataaaaactaacctccttaccttaattatctccaactattaactctagcttcacttttgcttctatg 1936874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 299 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 111201 - 111126
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  111201 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaacttttagctcaagcttcacttttgctcctatg 111126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 296087 - 295893
Alignment:
Q  136 ataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcac 235  Q
    ||||||| |||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||| |||  | || |||| ||||||||| |||||||||||| |  | || || |||    
T  296087 ataacttctcatttttacataattcaacatgaaatttcaccaacaatcataacattatcatcgattcatgcacacaaacataacacctcaattagaacac 295988  T
Q  236 gaatttagcaacaatcatccataat-caaaa-ttcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacct 329  Q
    ||||||||||||||| || ||| || ||||| |||||||||  |||||||||  | ||||||||||  |||||| | ||||| |||||||||||||    
T  295987 gaatttagcaacaattattcattatgcaaaatttcatacaaagtttgaaaatgca-aaaatgatgagaattatgttgaagacaaacccccttacct 295893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 265 - 372
Target Start/End: Original strand, 13377819 - 13377924
Alignment:
Q  265 attcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 364  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |  |  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||    
T  13377819 attcatacaacaattgaaaatttacactaaaa--atgattatgatgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcacttt 13377916  T
Q  365 agctccta 372  Q
    ||||||||    
T  13377917 agctccta 13377924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 7283987 - 7283913
Alignment:
Q  300 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| || || ||| ||||||||||| |||||||||    
T  7283987 tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaattattaactcaagcttcacttttgctcctatg 7283913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 372
Target Start/End: Original strand, 13389693 - 13389750
Alignment:
Q  315 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  13389693 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 13389750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 331
Target Start/End: Original strand, 36024372 - 36024485
Alignment:
Q  225 agttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaa 318  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| ||  |||    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  36024372 agttggagcacgaatttagaaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgtaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaa 36024471  T
Q  319 -cccccttacctta 331  Q
     |||||||||||||    
T  36024472 ccccccttacctta 36024485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 13377693 - 13377775
Alignment:
Q  159 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  13377693 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 13377775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 2029244 - 2029276
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2029244 atgattatgataaagactaacccccttacctta 2029276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 7293333 - 7293365
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293333 atgattatgataaagactaacccccttacctta 7293365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 11516544 - 11516576
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11516544 atgattatgataaagactaacccccttacctta 11516576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 14113935 - 14113903
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14113935 atgattatgataaagactaacccccttacctta 14113903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15441510 - 15441478
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441510 atgattatgataaagactaacccccttacctta 15441478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 331
Target Start/End: Original strand, 15709428 - 15709501
Alignment:
Q  262 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaat----gatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||    ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  15709428 aaaattcataccacatttgaaaaattgcaaaattgatgatgatgattatgatgaagactaatcctcttacctta 15709501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 372
Target Start/End: Original strand, 16919870 - 16919926
Alignment:
Q  316 taacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 372  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  16919870 taacccccttatcttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 16919926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 30262075 - 30262043
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30262075 atgattatgataaagactaacccccttacctta 30262043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 42056220 - 42056188
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056220 atgattatgataaagactaacccccttacctta 42056188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16915011 - 16914928
Alignment:
Q  159 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 241  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || |||||||| ||||||| |||||||| || |||| || ||||||||||||    
T  16915011 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 16914928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 371417 - 371449
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  371417 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 371449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 3049905 - 3049937
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3049905 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 3049937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 13321334 - 13321366
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13321334 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 13321366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14114021 - 14113989
Alignment:
Q  225 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14114021 agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14113989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14423671 - 14423639
Alignment:
Q  225 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14423671 agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14423639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15516793 - 15516765
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttac 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516793 atgattatgataaagactaacccccttac 15516765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 25124450 - 25124482
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25124450 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 25124482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 47480976 - 47480944
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47480976 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 47480944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 47357662 - 47357906
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357662 atccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 47357761  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357762 acttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 47357861  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 245  Q
     ||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  47357862 ccatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 47357906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 54118496 - 54118125
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||| |||| ||  |||||||||||    
T  54118496 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaactataacatcaattgaacaagaatcataactaaatctaacaacaact 54118397  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| ||||||||| || | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  54118396 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaattgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 54118298  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 301  Q
    |||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  54118297 tgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaataatgatg 54118198  T
Q  302 attatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  54118197 attatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcttatg 54118125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Original strand, 13246441 - 13246769
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  13246441 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 13246540  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||    
T  13246541 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcattaattca 13246639  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 301  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13246640 tgcatacaaacatatcatcacagttgtagcacgaatttaacaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 13246739  T
Q  302 attatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13246740 attatgataaagactaacccccttacctta 13246769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 10644227 - 10644467
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  10644227 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca 10644326  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||    
T  10644327 acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaat 10644426  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 241  Q
    |||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||    
T  10644427 tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 10644467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 93 - 331
Target Start/End: Original strand, 121989 - 122226
Alignment:
Q  93 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 192  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  121989 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 122087  T
Q  193 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 292  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  122088 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 122187  T
Q  293 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  122188 atgatgatgattatgataaagactaatccccttacctta 122226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13048477 - 13048221
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  13048477 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatctaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaactaacaaca 13048378  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||     
T  13048377 acttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataacttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaa 13048278  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    ||||||||||||||||| ||    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13048277 tcatgcatacaaacatatcattgaagttggagcatgaatttagcaacaattatccat 13048221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15675341 - 15675009
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| | ||||||||||    
T  15675341 catgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaact 15675242  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  15675241 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 15675143  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgat 297  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||||    |||||    
T  15675142 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgat 15675043  T
Q  298 gatgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15675042 gatgattatgatgaagactaacccccttacctta 15675009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 61 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 10104445 - 10104170
Alignment:
Q  61 aacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatg 160  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||| | ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||    
T  10104445 aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg 10104347  T
Q  161 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--ta 258  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||    
T  10104346 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacggatttagcaacaattatccaatta 10104247  T
Q  259 atcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
       ||||||||||| ||||||||||| ||  |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10104246 tgaaaaattcataccacatttgaaaaattgtaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 10104170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 26680209 - 26680463
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||    
T  26680209 atccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactaca 26680308  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    || |  |  ||||||| |  ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||    
T  26680309 acat--gtcaaattcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaat 26680406  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26680407 tcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 26680463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 230
Target Start/End: Original strand, 31115640 - 31115865
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| | ||||||||||    
T  31115640 catgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaact 31115739  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||||| |||||||||  || |||| ||| |||| |||||  ||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  31115740 tagga-aaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 31115838  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttgg 230  Q
    |||||||||||||| || || ||||||    
T  31115839 tgcatacaaacatatcatcacagttgg 31115865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 257
Target Start/End: Original strand, 10488678 - 10488825
Alignment:
Q  110 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 209  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  10488678 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 10488777  T
Q  210 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10488778 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 10488825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16328073 - 16327926
Alignment:
Q  110 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 209  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  16328073 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 16327974  T
Q  210 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16327973 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16327926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 194 - 331
Target Start/End: Original strand, 33240900 - 33241043
Alignment:
Q  194 catcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 291  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  33240900 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaa 33240999  T
Q  292 a----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33241000 aaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 33241043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 299 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 25119139 - 25119064
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  25119139 atgattatgataaaaactaactcccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 25119064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 90
Target Start/End: Original strand, 111406 - 111492
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaa 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  111406 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaa 111492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 331
Target Start/End: Original strand, 31132545 - 31132657
Alignment:
Q  225 agttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaa 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||||    |||||||| |||||||| ||||||||    
T  31132545 agttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgataattatgatgaagactaa 31132644  T
Q  319 cccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||    
T  31132645 cccccttacctta 31132657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 299 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 5682460 - 5682385
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||    
T  5682460 atgattatgataaaaactaacccacttaccttaattatcaccaactattagctcatgcttcacttttgctcctatg 5682385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 40885749 - 40885570
Alignment:
Q  61 aacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tat 159  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||| | ||||| ||||||| | || ||||||  || |||| ||| ||||||||||  ||||| | |||| | |    
T  40885749 aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagca-aagttcaccaattgagcataat-ttcataacttgacatttatacatacttt 40885652  T
Q  160 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||| || || ||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  40885651 gaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacatagcaccacagttggagtacgaattt 40885570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 41165881 - 41165808
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 372  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  41165881 atgattatgatgaattctaacccccttacgttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 41165808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 15044992 - 15045074
Alignment:
Q  159 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15044992 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 15045074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 47534990 - 47534933
Alignment:
Q  315 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | || || | |||||||||||||||||||    
T  47534990 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctcgcccaagcttcactttagctccta 47534933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 14952085 - 14952117
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952085 atgattatgataaagactaacccccttacctta 14952117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15135939 - 15135907
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15135939 atgattatgataaagactaacccccttacctta 15135907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15272243 - 15272211
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272243 atgattatgataaagactaacccccttacctta 15272211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16327872 - 16327840
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16327872 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16327840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16609045 - 16609013
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16609045 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16609013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 26680517 - 26680549
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680517 atgattatgataaagactaacccccttacctta 26680549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15109432 - 15109350
Alignment:
Q  159 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  15109432 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaatt 15109350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 8045272 - 8045304
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8045272 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 8045304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 16523146 - 16523178
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16523146 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 16523178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 14842816 - 14842487
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  14842816 atccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaaca 14842717  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    |||||| | |||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||||| || | |||||    
T  14842716 acttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttgaacatgcaatttcaccaacaatcatacaattatcttcaat 14842618  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgat 300  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||    
T  14842617 tcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatttgcaaagtgaagat 14842518  T
Q  301 gattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14842517 gattatgataaagactaacccccttacctta 14842487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 55316227 - 55316471
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  55316227 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaaca 55316326  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55316327 acttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaat 55316426  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 245  Q
    |||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  55316427 tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 55316471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Original strand, 13838905 - 13839232
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||   ||| ||||||    
T  13838905 catgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaact 13839004  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  13839005 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca 13839103  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt-acaaaatgatgatga 302  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13839104 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattattcataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatga 13839203  T
Q  303 ttatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13839204 ttatgatgaagactaacccccttacctta 13839232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 41270083 - 41270327
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  41270083 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaaca 41270182  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  41270183 acttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaattccaccaacaatcatacaactaacatcaat 41270282  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 245  Q
    |||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  41270283 tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 41270327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Original strand, 2049821 - 2050147
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  2049821 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaattaacaacaact 2049920  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||    
T  2049921 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattca 2050019  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 303  Q
     ||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  2050020 ggcatacaaacatatcgtcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattgatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgat 2050119  T
Q  304 tatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2050120 tatgataaagactaacccccttacctta 2050147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12030399 - 12030073
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  12030399 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaattaacaataact 12030300  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||  |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||    
T  12030299 tagca-aaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattca 12030201  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 303  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12030200 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaagtcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgat 12030101  T
Q  304 tatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||    
T  12030100 tatgataatgattaacccccttacctta 12030073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 110 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16744262 - 16743998
Alignment:
Q  110 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 209  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||||| ||||||||| |||||  ||  ||||||||||| |||    
T  16744262 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaaaatgtaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatggata 16744163  T
Q  210 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgat 309  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16744162 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttaacaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatggt 16744063  T
Q  310 aaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744062 aaagactaacctcgttaccttaattatctccaactattagctctagcttcactttagctcctatg 16743998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 16821147 - 16821366
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  16821147 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca 16821246  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  16821247 acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat 16821346  T
Q  201 tcatgcatacaaacataaca 220  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  16821347 ttatgcatacaaacataaca 16821366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13975977 - 13975722
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||    
T  13975977 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgaca 13975878  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  | || ||||    
T  13975877 acttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaat 13975778  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    |||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13975777 tcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13975722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 45860813 - 45861068
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||    
T  45860813 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgaca 45860912  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  | || ||||    
T  45860913 acttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaat 45861012  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    |||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45861013 tcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 45861068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 51158270 - 51158008
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  51158270 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 51158171  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  51158170 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 51158072  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaatt 267  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  51158071 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaatt 51158008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15859276 - 15858986
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  15859276 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaact 15859177  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  15859176 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 15859078  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaat 294  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15859077 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacaattg-aaatttacaaaat 15858986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13955145 - 13954890
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||    
T  13955145 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgaca 13955046  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  | || ||||    
T  13955045 acttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataactgatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaat 13954946  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    |||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13954945 tcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13954890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15936882 - 15936634
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  15936882 atccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaaca 15936783  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    |||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  15936782 acttatca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat 15936684  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 250  Q
    ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  15936683 tcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 15936634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15938724 - 15938476
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  15938724 atccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaaca 15938625  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    |||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  15938624 acttatca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat 15938526  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 250  Q
    |||||  |||||||||| ||  | |||||||||||| |||||| ||||||    
T  15938525 tcatgattacaaacatatcattacagttggagcacgtatttagtaacaat 15938476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Original strand, 19231981 - 19232164
Alignment:
Q  194 catcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaattt-aca 290  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19231981 catcaattcatgaatataaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcaca 19232080  T
Q  291 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  19232081 aaatgatgatgattaagataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg 19232164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 332
Target Start/End: Original strand, 15614845 - 15615170
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | | ||||||||||| ||||    
T  15614845 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaacaataact 15614944  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||    
T  15614945 tagca-aaattcaccaattgagcaccatattcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcctacaattatcatcaattca 15615043  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatga 302  Q
    |||||||||| |||||| || |||  |||||| ||| |||||  |||  | ||| || | |  ||||||||||||  |||||  | |||||| |  ||||    
T  15615044 tgcatacaaatataacaccacagtaagagcacaaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaa--tgcaaaatta-catga 15615140  T
Q  303 ttatgataaagactaacccccttaccttaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15615141 ttatgataaagactaacccccttaccttaa 15615170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17912733 - 17912483
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||  ||||||| |||||| | ||||| | ||| |||||     
T  17912733 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcgattgaacatgaatcatagctcaattcaactacaaca 17912634  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||  |  |||||| |  ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  17912633 tatca--aattcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 17912536  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17912535 tgcatacaaacatatcatca-agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17912483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 211 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 19260869 - 19260749
Alignment:
Q  211 aaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgata 310  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19260869 aaacatatcatcataattagagcacgaatttagcaacaattatccataaaaaaaattcatacaacatttgaaaacttacaaaatgatgatgattatgata 19260770  T
Q  311 aagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19260769 aagactaacccccttacctta 19260749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 2449385 - 2449238
Alignment:
Q  110 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 209  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  2449385 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 2449286  T
Q  210 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2449285 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 2449238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 296 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15857198 - 15857120
Alignment:
Q  296 atgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15857198 atgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaagtattagctctagcttcactttagctcctatg 15857120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 299 - 374
Target Start/End: Original strand, 3992873 - 3992948
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  3992873 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 3992948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 299 - 374
Target Start/End: Original strand, 55513193 - 55513268
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  55513193 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 55513268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 299 - 374
Target Start/End: Original strand, 2844514 - 2844589
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  2844514 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctcaaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 2844589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 299 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 54038056 - 54037981
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  54038056 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatg 54037981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 299 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 17955916 - 17955837
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagct----ctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    ||||||||||||| |||||||||    
T  17955916 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctacctagcttcacttttgctcctatg 17955837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 299 - 374
Target Start/End: Original strand, 7854305 - 7854380
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7854305 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatg 7854380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 299 - 360
Target Start/End: Original strand, 45581954 - 45582016
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccc-cttaccttaattatctccaactactagctctagcttca 360  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45581954 atgattatgataaaaactaaccccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttca 45582016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 372
Target Start/End: Original strand, 17205019 - 17205076
Alignment:
Q  315 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  17205019 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 17205076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 38810941 - 38810868
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 372  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  38810941 atgattatgatgaattctaacccccttaccttagttatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 38810868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 317 - 372
Target Start/End: Original strand, 12031849 - 12031904
Alignment:
Q  317 aacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 372  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  12031849 aacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 12031904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 11986262 - 11986173
Alignment:
Q  161 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 250  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||| || ||| || ||||||| || || |||||| || |||| ||||||||||||| |||||||    
T  11986262 aacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcattaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat 11986173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 13301396 - 13301323
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 372  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| | | || | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  13301396 atgattatgatgaattctaacccccttaccttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctccta 13301323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 13312052 - 13311979
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 372  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| | | || | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  13312052 atgattatgatgaattctaacccccttaccttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctccta 13311979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 241
Target Start/End: Original strand, 14080715 - 14080756
Alignment:
Q  200 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 241  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  14080715 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 14080756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 372
Target Start/End: Original strand, 17191879 - 17191936
Alignment:
Q  315 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | | |||||||||||||||||    
T  17191879 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaaacttcactttagctccta 17191936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 2449184 - 2449152
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2449184 atgattatgataaagactaacccccttacctta 2449152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4145898 - 4145814
Alignment:
Q  157 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 241  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || ||| || || ||||||||| || |||||||| || |||| |||||| ||||||||    
T  4145898 tatgaacatgtaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaattcatgtattcaaacatatcaccataattggagtacgaattt 4145814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 16261777 - 16261809
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261777 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16261809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16933901 - 16933869
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933901 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16933869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 17912430 - 17912398
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17912430 atgattatgataaagactaacccccttacctta 17912398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 23492696 - 23492728
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23492696 atgattatgataaagactaacccccttacctta 23492728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 38168237 - 38168269
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38168237 atgattatgataaagactaacccccttacctta 38168269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 53771365 - 53771397
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771365 atgattatgataaagactaacccccttacctta 53771397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 30207380 - 30207462
Alignment:
Q  159 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 240  Q
    |||||||| | ||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  30207380 tgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 30207462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 106
Target Start/End: Original strand, 47984661 - 47984763
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| |||||   ||||||||||    
T  47984661 catgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaact 47984760  T
Q  104 tag 106  Q
    |||    
T  47984761 tag 47984763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 106
Target Start/End: Original strand, 47993948 - 47994050
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| |||||   ||||||||||    
T  47993948 catgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaact 47994047  T
Q  104 tag 106  Q
    |||    
T  47994048 tag 47994050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 106
Target Start/End: Original strand, 48003235 - 48003337
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| |||||   ||||||||||    
T  48003235 catgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaact 48003334  T
Q  104 tag 106  Q
    |||    
T  48003335 tag 48003337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 106
Target Start/End: Original strand, 48012521 - 48012623
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| |||||   ||||||||||    
T  48012521 catgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaact 48012620  T
Q  104 tag 106  Q
    |||    
T  48012621 tag 48012623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 3576347 - 3576290
Alignment:
Q  315 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || | ||||| | |||||||||||| ||||||    
T  3576347 ctaacccccttaccttaattatcacaaattcctagcccaagcttcactttacctccta 3576290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6228710 - 6228625
Alignment:
Q  157 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||| || || ||| |||||| || |||||||| || |||| || ||||||||||||    
T  6228710 tatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattagagcacgaattt 6228625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 365
Target Start/End: Original strand, 15550922 - 15550987
Alignment:
Q  300 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttta 365  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||||    
T  15550922 tgattatgatgaattctaacccccttatcttaattatcaccaattcctagcccaagcttcacttta 15550987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 11986112 - 11986080
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11986112 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 11986080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13954836 - 13954804
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13954836 atgattatggtaaagactaacccccttacctta 13954804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14059254 - 14059214
Alignment:
Q  200 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 240  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14059254 ttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 14059214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 14285289 - 14285321
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14285289 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 14285321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 19947026 - 19947058
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19947026 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 19947058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 30153265 - 30153297
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30153265 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 30153297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 33342204 - 33342236
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33342204 atgattatgataaagactaaccctcttacctta 33342236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 45861122 - 45861154
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45861122 atgattatggtaaagactaacccccttacctta 45861154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 51961063 - 51961031
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51961063 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 51961031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Original strand, 48609 - 48935
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||||||    
T  48609 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctagcaacaact 48708  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||   | |||||||| |||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  48709 tagca-aaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 48807  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 303  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48808 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 48907  T
Q  304 tatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48908 tatgataaagactaacccccttacctta 48935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 36101 - 36320
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  36101 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcatattatcaaataacattcataacatctattgaacatgaatcacatctcaaattaacaaca 36200  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36201 acttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaat 36300  T
Q  201 tcatgcatacaaacataaca 220  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  36301 tcatacatacaaacataaca 36320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 61154 - 61122
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  61154 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 61122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 35)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16193968 - 16193643
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  16193968 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaatt 16193869  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    | | | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||    
T  16193868 tggca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttccccaacaatcatacaattatcatcaattca 16193770  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 303  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16193769 tgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataagcaaaattcatacaatatttgaaaatttaccaaatgatgatgat 16193670  T
Q  304 tatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16193669 tatgataaagactaa-ccccttacctta 16193643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 245
Target Start/End: Original strand, 30120734 - 30120974
Alignment:
Q  5 atgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaactt 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  30120734 atgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaattaacaacaactt 30120833  T
Q  105 aggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcat 204  Q
    ||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  30120834 aggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcat 30120933  T
Q  205 gcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 245  Q
    |||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  30120934 gcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 30120974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 43373720 - 43373392
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  43373720 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaact 43373621  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||    
T  43373620 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatataattatcatcaattca 43373522  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 301  Q
    ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  43373521 tgcatacaaacgtatcatcacagttggagcacgaatttagcattaattatccattatacaaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatg 43373422  T
Q  302 attatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43373421 attatgataaagactaacccccttacctta 43373392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 222935 - 222753
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222935 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 222836  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 183  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222835 acttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 222753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 736558 - 736376
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736558 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 736459  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 183  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736458 acttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 736376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 860453 - 860271
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860453 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 860354  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 183  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860353 acttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 860271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24929043 - 24928716
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||| ||| ||||||||||  || |||||||   ||| ||||||    
T  24929043 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacaaccataacctcaattgaacaagagacataactcaatccaaccacaact 24928944  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    |||  ||||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  24928943 tagc-gaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 24928845  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt-acaaaatgatgatga 302  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24928844 tgcatacaaacatataatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgacgatga 24928745  T
Q  303 ttatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24928744 ttatgataaagactaaccccattacctta 24928716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16674636 - 16674392
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  16674636 atccatgaatatgcaaactcaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaaca 16674537  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  16674536 acttaggagaaattcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaat 16674437  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 245  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  16674436 tcatgcataaaaacataacatcacagaaagagcacgaatttagca 16674392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16405224 - 16404857
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||| |  |||| ||||||||   |    
T  16405224 catgaatttgcatacccaagcagtgattcatcaactaaaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaagaatcatatgtcaatttaacaac---t 16405128  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  16405127 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 16405029  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 301  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16405028 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccatcatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaataatgatg 16404930  T
Q  302 attatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  16404929 attatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 16404857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21844812 - 21844576
Alignment:
Q  5 atgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaactt 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21844812 atgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaaaaatcacatctcaaattaacaacaactt 21844713  T
Q  105 aggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcat 204  Q
    ||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||    
T  21844712 aggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcat 21844613  T
Q  205 gcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 241  Q
    |||||||||||||||| || ||   ||||||||||||    
T  21844612 gcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 21844576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21852205 - 21851969
Alignment:
Q  5 atgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaactt 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21852205 atgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacatctcaaattaacaacaactt 21852106  T
Q  105 aggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcat 204  Q
    ||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||    
T  21852105 aggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatttaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcat 21852006  T
Q  205 gcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 241  Q
    |||||||||||||||| || ||   ||||||||||||    
T  21852005 gcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 21851969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6774498 - 6774258
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  6774498 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataact 6774399  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  6774398 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 6774300  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 245  Q
    ||||||||||||||||| || |||  |||||||||| |||||    
T  6774299 tgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 6774258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 245
Target Start/End: Original strand, 24548993 - 24549233
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | | ||||||||||| ||||    
T  24548993 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaacaataact 24549092  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  24549093 tagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 24549191  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 245  Q
    ||||||||||||||||| || |||  |||||||||| |||||    
T  24549192 tgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 24549233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 17345581 - 17345832
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   |||| ||||  ||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    
T  17345581 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataatatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact 17345679  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  17345680 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 17345778  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    |||||| |||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  17345779 tgcatataaacataacatcacagttagagcacgaatttcgcaacaattatccat 17345832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22907468 - 22907214
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||    
T  22907468 atccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactaca 22907369  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    || |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||    
T  22907368 acat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaat 22907271  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22907270 tcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 22907214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 257
Target Start/End: Original strand, 5238203 - 5238350
Alignment:
Q  110 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 209  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  5238203 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 5238302  T
Q  210 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5238303 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 5238350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 24661395 - 24661248
Alignment:
Q  110 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 209  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  24661395 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 24661296  T
Q  210 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24661295 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 24661248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 257
Target Start/End: Original strand, 43685662 - 43685809
Alignment:
Q  110 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 209  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  43685662 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 43685761  T
Q  210 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43685762 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 43685809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 299 - 374
Target Start/End: Original strand, 274766 - 274841
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  274766 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 274841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 299 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 641083 - 641008
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  641083 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 641008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 299 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 826889 - 826814
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  826889 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 826814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 299 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 24716794 - 24716719
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24716794 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 24716719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 691970 - 691908
Alignment:
Q  121 tttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  691970 tttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 691908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 299 - 374
Target Start/End: Original strand, 39115598 - 39115673
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  39115598 atgattatgatgaaaactaacacccttaccttaattattaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatg 39115673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 372
Target Start/End: Original strand, 17285543 - 17285600
Alignment:
Q  315 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | | |||||||||||||||||||    
T  17285543 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctaacccaagcttcactttagctccta 17285600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 21198062 - 21198005
Alignment:
Q  315 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 372  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  21198062 ctaacccccttatcttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 21198005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 5238404 - 5238436
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5238404 atgattatgataaagactaacccccttacctta 5238436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22907160 - 22907128
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907160 atgattatgataaagactaacccccttacctta 22907128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24385684 - 24385652
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385684 atgattatgataaagactaacccccttacctta 24385652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24661194 - 24661162
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661194 atgattatgataaagactaacccccttacctta 24661162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 43685863 - 43685895
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43685863 atgattatgataaagactaacccccttacctta 43685895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 26011658 - 26011741
Alignment:
Q  159 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| |||||||| || |||| || ||||||||||||    
T  26011658 tgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 26011741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 2545265 - 2545297
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2545265 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 2545297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3431208 - 3431176
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3431208 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 3431176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 22886654 - 22886686
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22886654 atgattatgattaagactaacccccttacctta 22886686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6318 - 5990
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  6318 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-ttaacaaca 6220  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    |||||| | |||||||||  || |||||||| || | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  6219 acttagca-aaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat 6121  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgat 300  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||  ||    
T  6120 tcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatttgcaaagtgaaaat 6021  T
Q  301 gattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6020 gattatgataaagactaacccccttacctta 5990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1210 - 882
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||||||||| | | ||||| |||||||||    
T  1210 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaataaaatctcaa-ttaacaaca 1112  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    |||||| | ||||||| |  || |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  1111 acttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat 1013  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgat 300  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| ||| |||    
T  1012 tcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatttgtaaagtgaagat 913  T
Q  301 gattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  912 gattatgataaagactaacccccttacctta 882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Original strand, 8889 - 9215
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  8889 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaact 8988  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||| |||||    
T  8989 taaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcgattca 9087  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 303  Q
    ||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  9088 tgcatacaaacataacatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattttccataagcaaaattcgtacaacttttgaaaatttgcaaaatgaagatgat 9187  T
Q  304 tatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9188 tatgataaagactaacccccttacctta 9215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Original strand, 171916 - 172242
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||    
T  171916 catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact 172015  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  172016 tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca 172114  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 303  Q
    | |||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  172115 tccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 172214  T
Q  304 tatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  172215 tatgataaagactaacccccttacctta 172242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Original strand, 177619 - 177945
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||    
T  177619 catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact 177718  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  177719 tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca 177817  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 303  Q
    | |||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  177818 tccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 177917  T
Q  304 tatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  177918 tatgataaagactaacccccttacctta 177945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 12123 - 12450
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |  ||||||    
T  12123 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt--acaaca 12220  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    |||||  | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| || || | |||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  12221 acttaaca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttaaacatgtattttcaccaacaatcatacaattatcatcaat 12319  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaa-ttcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatga 299  Q
    ||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||| | ||    
T  12320 tcatgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccataatcaaaatttcatacagcatttg-aaagttacaaaattaaga 12418  T
Q  300 tgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12419 tgattatgataaagactaacccccttacctta 12450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 247694 - 247366
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  247694 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 247595  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | ||||| |||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||| |||||||||  |||| |||||| || ||||||||||    
T  247594 tagca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattca 247496  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 301  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  247495 tgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 247396  T
Q  302 attatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  247395 attatgataaagactaacccccttacctta 247366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 34107 - 34075
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34107 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 34075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Original strand, 41740 - 42066
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||   | || | ||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  41740 catgaatatgcatacccaaccaatgattcatcatctacaacaacaattaacagccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 41839  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||    
T  41840 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcatttttacatatttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatcatcaattca 41938  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 303  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41939 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 42038  T
Q  304 tatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  42039 tatgataaagaccaacccccttacctta 42066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 8 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 26663 - 26340
Alignment:
Q  8 aatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttagg 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||     
T  26663 aatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattctaacaacaacttagc 26564  T
Q  108 agaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgca 207  Q
    | |||||||||  || || ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||  ||||| || |||||||||| |||    
T  26563 a-aaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaataatcttacaattatcatcaattcacgca 26465  T
Q  208 tacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat-caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattat 306  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26464 tacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatacattatgaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatcatgattat 26365  T
Q  307 gataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26364 gataaagactaacccccttacctta 26340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8327 - 8180
Alignment:
Q  110 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 209  Q
    |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||    
T  8327 aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgtaatttcaccaacaatcatacaattatcaccaattcatgcata 8228  T
Q  210 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8227 caaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 6934 - 6877
Alignment:
Q  315 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||| ||||||    
T  6934 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttaactccta 6877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 37165 - 36836
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||| ||| |||||||||| ||| |||||||   ||| ||||||    
T  37165 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacgtcaattgaacaagattcataactcaatccaaccacaact 37066  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| || ||||||||||    
T  37065 tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaagcttacaattatcatcaattca 36967  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 301  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  36966 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatg 36867  T
Q  302 attatgataaagactaacccccttaccttaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36866 attatgataaagactaacccccttaccttaa 36836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 300 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15398 - 15324
Alignment:
Q  300 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||    
T  15398 tgattatgatgaatgctaacccccttaccttaattatctccaactattagcccaagcttcacttttgctcctatg 15324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 43005 - 43224
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  43005 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcacttgaacacgaatcacatctcaaattaacaaca 43104  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  43105 acttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat 43204  T
Q  201 tcatgcatacaaacataaca 220  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  43205 tcatgcatagaaacataaca 43224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 328
Target Start/End: Original strand, 19217 - 19543
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||    
T  19217 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaact 19316  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||    
T  19317 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattca 19415  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaaatgatgat 300  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  19416 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaattatgat 19515  T
Q  301 gattatgataaagactaacccccttacc 328  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19516 gattatgatgaagactaacccccttacc 19543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 21301 - 21553
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||    
T  21301 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaact 21400  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||    
T  21401 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattca 21499  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21500 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 128420 - 128095
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||     
T  128420 catgaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaa-ttaacaacaacc 128322  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||  | |||||| ||  || |||||||| |||| |||||| ||  ||| || || ||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||    
T  128321 taaca-aaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattca 128223  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 303  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  128222 tgcatacaaacatatcatcacagttgaagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacttttgaaaatttgcaaaatgaagatgat 128123  T
Q  304 tatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  128122 tatgataaagactaacccccttacctta 128095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 31920 - 31700
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  31920 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatattaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca 31821  T
Q  101 actt-aggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa 199  Q
    |||| ||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31820 actttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaa 31721  T
Q  200 ttcatgcatacaaacataaca 220  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  31720 ttcatgcattcaaacataaca 31700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 5313 - 4996
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  5313 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattctaacaacaact 5214  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    | | | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||    
T  5213 ttgca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaacaatcttacaattatcatcaattca 5115  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat-caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatga 302  Q
     ||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5114 cgcatacaaacatatcgtcacagttggagtacgaatttagcaacaattatccattatgaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgataatga 5015  T
Q  303 ttatgataaagactaaccc 321  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5014 ttatgataaagactaaccc 4996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 5552 - 5785
Alignment:
Q  17 acccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattca 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5552 acccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattca 5651  T
Q  117 cccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacat 216  Q
    ||  || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  5652 ccaattgagcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacat 5751  T
Q  217 aacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 250  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  5752 aacatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 5785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 5846 - 5878
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5846 atgattatggtaaagactaacccccttacctta 5878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 123416 - 123087
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||| ||  |||||||||||    
T  123416 catgaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataacttaatctaacaacaact 123317  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  123316 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 123218  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaaatgatgat 300  Q
    |||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  123217 tgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgcaaatttacaaaaattatgat 123118  T
Q  301 gattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  123117 gattatggtgaagactaacccccttacctta 123087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Original strand, 272036 - 272362
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||   |||||| || |||||||||||||| |||||||   ||| ||||||    
T  272036 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagctataacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaact 272135  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  272136 tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttctccatcaatcatacaattatcatcaattca 272234  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 303  Q
    | |||||||||||| ||  | |||||||| ||| ||||||||| | | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  272235 ttcatacaaacatatcattacagttggagtacgtatttagcaatatttatccataatcaaaatttatacaatatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 272334  T
Q  304 tatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  272335 tatgataaagactaacccccttacctta 272362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 46 - 283
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  46 catgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaact 145  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    |||||||||||||||  || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  146 taggagaaattcaccaattgagcacaatatacataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattca 245  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 241  Q
    ||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||    
T  246 tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 299 - 374
Target Start/End: Original strand, 30417 - 30492
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||| || || ||| ||||||||||| ||| |||||    
T  30417 atgattatgatgaaaaataacccccttaccttaattatcaccaattattaactcaagcttcacttttgcttctatg 30492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 64772 - 64527
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  64772 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaaca 64673  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc--- 197  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||       
T  64672 acttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaat 64573  T
Q  198 --aattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 241  Q
      |||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||||||    
T  64572 ataattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaattt 64527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 107755 - 108003
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  107755 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaaca 107854  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    |||||  | |||||||||  || |||||||| || | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  107855 acttatca-aaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat 107953  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 250  Q
    ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  107954 tcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 108003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 89905 - 89863
Alignment:
Q  200 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattta 242  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  89905 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 89863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 111 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 51328 - 51110
Alignment:
Q  111 aattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 210  Q
    ||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  51328 aattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatac 51229  T
Q  211 aaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgata 310  Q
    ||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51228 aaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgata 51129  T
Q  311 aagactaacccccttacct 329  Q
    |||||||| | ||||||||    
T  51128 aagactaatctccttacct 51110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 48195 - 48443
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  48195 atccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatctataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaaca 48294  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    |||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  48295 acttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat 48393  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 250  Q
    ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  48394 tcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaat 48443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 374
Target Start/End: Original strand, 20493 - 20567
Alignment:
Q  300 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| ||| |||||||||    
T  20493 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcatttttgctcctatg 20567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21359 - 21115
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  21359 atccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaataacattcataacatcaattgaacaagaatccaatctcaaattaacaaca 21260  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    |||||||| |||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| || || |||||||    
T  21259 acttagga-aaattcaccaattgagctcaatcttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaat 21161  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaa 246  Q
    | ||| |||||||||||||| || |    |||||||||||||||||    
T  21160 taatggatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaa 21115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14304 - 14086
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||  | ||||||||| |||||    
T  14304 atccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaacaacattcataacattaattgaacaagaatccaatctcaaattatcaaca 14205  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    |||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| ||| || || |||||||    
T  14204 acttagga-aaattcaccaattgagcacaatcttcataacttatcatttttacatatttcaacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaat 14106  T
Q  201 tcatgcatacaaacataaca 220  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  14105 tcatgcatacagacataaca 14086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 283
Target Start/End: Original strand, 148732 - 149012
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||  |||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  148732 catgaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaact 148831  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||    
T  148832 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattca 148930  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaa 283  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||| ||| || ||   ||||||||||||||||||||||    
T  148931 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttaacaacaattatcaattatgcaaaaattcatacaacatttgaaa 149012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Original strand, 8860 - 9192
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| ||| |   ||||||||| |||||||  ||||| | ||||| | ||||||||||    
T  8860 catgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataacatcaattgaacattaatcatatctcaattcaacaacaact 8959  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  8960 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 9058  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgat 297  Q
    |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||  ||   ||||| ||||| ||||||||||| || ||||    |||||    
T  9059 tgcatacaaacatatcatcacagatggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaatacataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgat 9158  T
Q  298 gatgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  9159 gatgattatgatgaagactaacacacttacctta 9192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 231 - 331
Target Start/End: Original strand, 146838 - 146938
Alignment:
Q  231 agcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 330  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146838 agcatgaatttaggaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 146937  T
Q  331 a 331  Q
    |    
T  146938 a 146938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 89600 - 89378
Alignment:
Q  111 aattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 210  Q
    ||||||||  || |||||||| |||| ||||||| |||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  89600 aattcaccaattgagcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac 89501  T
Q  211 aaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatga 308  Q
    ||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  89500 aaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatagaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatcatga 89401  T
Q  309 taaagactaacccccttacctta 331  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  89400 tgaagactaacccccttacctta 89378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 206 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 107835 - 107708
Alignment:
Q  206 catacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 303  Q
    |||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  107835 catacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaaaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 107736  T
Q  304 tatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||    
T  107735 catgatgaagactaacccccttacctta 107708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 299 - 330
Target Start/End: Original strand, 130880 - 130911
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130880 atgattatgataaagactaacccccttacctt 130911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5458 - 5254
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  5458 atccatgaatatgca-acccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaaca 5360  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    ||| || | |||||||||  || | |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  5359 actcagca-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat 5261  T
Q  201 tcatgca 207  Q
    |||||||    
T  5260 tcatgca 5254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9589 - 9374
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  9589 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataact 9490  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  9489 tagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 9391  T
Q  204 tgcatacaaacataaca 220  Q
    |||||||||||||||||    
T  9390 tgcatacaaacataaca 9374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16487 - 16272
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  16487 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataact 16388  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  16387 tagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 16289  T
Q  204 tgcatacaaacataaca 220  Q
    |||||||||||||||||    
T  16288 tgcatacaaacataaca 16272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 3730 - 3936
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  3730 atccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaaca 3829  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatca-tttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa 199  Q
    |||||| | |||||||||  ||   |||||| | |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  3830 acttagca-aaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa 3928  T
Q  200 ttcatgca 207  Q
    ||||||||    
T  3929 ttcatgca 3936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1450 - 1304
Alignment:
Q  99 caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 198  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1450 caacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatca 1351  T
Q  199 attcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 245  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  1350 attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 1304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 784 - 534
Alignment:
Q  6 tgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaactta 105  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| || ||  |||||||||| || ||||||||||| |||| ||  |||||  ||||||    
T  784 tgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccataacatcaattaaacaagaatcataacttaatctaacagtaactta 685  T
Q  106 ggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatg 205  Q
    | | |||||||||  || || ||||| |||| |||| ||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  684 gca-aaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg 586  T
Q  206 catacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  585 catacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 34716 - 34460
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaaattaacaac 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | ||||| | ||||||    
T  34716 atccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaacaac 34617  T
Q  100 aacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa 199  Q
    ||||||| | |||||||||  || || ||||| |||| |||||   |||||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  34616 aacttagca-aaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa 34518  T
Q  200 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  34517 ttcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaataattatccat 34460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Original strand, 2973 - 3215
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaaattaacaacaac 102  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | ||||| | |||||||||    
T  2973 catgaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaacaacaac 3072  T
Q  103 ttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattc 202  Q
    |||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  3073 ttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattc 3171  T
Q  203 atgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaa 246  Q
    ||| |||||||||||||| || ||   |||||||||||||||||    
T  3172 atggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa 3215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 124 - 257
Target Start/End: Original strand, 13636 - 13769
Alignment:
Q  124 agcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaaca 223  Q
    |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13636 agcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 13735  T
Q  224 tagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13736 aagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 13769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 299 - 374
Target Start/End: Original strand, 42677 - 42749
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  42677 atgattatgataaaaactaacccccttacctt---tatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 42749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 13824 - 13856
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13824 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 13856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 41659 - 41911
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||  |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  || | |||||||||     
T  41659 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaaca 41758  T
Q  104 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 203  Q
    ||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  41759 tagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 41857  T
Q  204 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41858 tgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaattatccat 41911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 331
Target Start/End: Original strand, 41957 - 41997
Alignment:
Q  291 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41957 aaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttacctta 41997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 37320 - 37066
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | |||||   ||| |||    
T  37320 atccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatccaactaca 37221  T
Q  101 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 200  Q
    || |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||    
T  37220 acat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaat 37123  T
Q  201 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37122 tcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 37066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 299 - 374
Target Start/End: Original strand, 41632 - 41707
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  41632 atgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 41707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 37012 - 36980
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37012 atgattatgataaagactaacccccttacctta 36980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 89 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13480 - 13325
Alignment:
Q  89 aaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattataca 188  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13480 aaattaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcataca 13382  T
Q  189 actaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 245  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| || | |  |||||||||| |||||    
T  13381 attatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacactaagagcacgaatctagca 13325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 4)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 257
Target Start/End: Original strand, 26911 - 27058
Alignment:
Q  110 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 209  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  26911 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 27010  T
Q  210 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27011 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 27058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 110 - 250
Target Start/End: Original strand, 22656 - 22796
Alignment:
Q  110 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 209  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  22656 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 22755  T
Q  210 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 250  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22756 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 22796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 22857 - 22889
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22857 atgattatgataaagactaacccccttacctta 22889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 27112 - 27144
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27112 atgattatgataaagactaacccccttacctta 27144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 1729 - 1582
Alignment:
Q  110 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 209  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  1729 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 1630  T
Q  210 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1629 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 1582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1528 - 1496
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1528 atgattatgataaagactaacccccttacctta 1496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 107 - 9
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaac 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  107 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataatatcatttgaacaagaatcaaatatcaaattaacaac 9  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 48522 - 48620
Alignment:
Q  1 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaac 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  48522 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaagtgaacaagaatcaaatctcaaattaacaac 48620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 299 - 374
Target Start/End: Original strand, 80187 - 80262
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  80187 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatg 80262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 298 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 166197 - 166121
Alignment:
Q  298 gatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  166197 gatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 166121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 298 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 162111 - 162036
Alignment:
Q  298 gatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctat 373  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  162111 gatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 162036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 299 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 116483 - 116410
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 372  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  116483 atgattatgatgaaatctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 116410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 299 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 31212 - 31137
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  31212 atgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 31137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 299 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 5809 - 5735
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctat 373  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5809 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 5735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 299 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 6015 - 5941
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctat 373  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  6015 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 5941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 298 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 385 - 309
Alignment:
Q  298 gatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  385 gatgattatgataaagaataaccccgttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatg 309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 90
Target Start/End: Original strand, 9393 - 9479
Alignment:
Q  4 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaa 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  9393 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaa 9479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 257
Target Start/End: Original strand, 3360 - 3453
Alignment:
Q  164 atgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  3360 atgtaatttcaccaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagctagagcacgaatttagcatcaattatccat 3453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 300 - 374
Target Start/End: Original strand, 1701 - 1775
Alignment:
Q  300 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||    
T  1701 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatg 1775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 300 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 19881 - 19807
Alignment:
Q  300 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||    
T  19881 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatg 19807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 24185 - 24111
Alignment:
Q  300 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| ||| |||||||||    
T  24185 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcatttttgctcctatg 24111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 370
Target Start/End: Original strand, 94 - 164
Alignment:
Q  300 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcc 370  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| |||||    
T  94 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcc 164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 6335 - 6261
Alignment:
Q  300 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 374  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||||||| |||||||||    
T  6335 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcacccactattaactcaagcttcacttttgctcctatg 6261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 41 - 4
Alignment:
Q  300 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 337  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  41 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 1436 - 1363
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 372  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  1436 atgattatgatgaattctaacccccttacctcaattatcaccaattcctagctcaagcttcactttagttccta 1363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 56195 - 56106
Alignment:
Q  161 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 250  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||| || |||||| ||||||| || || |||||| || |||| ||||||||||||| |||||||    
T  56195 aacatgtaatttcagccacaatcatacaattatcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat 56106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 372
Target Start/End: Original strand, 35816 - 35873
Alignment:
Q  315 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  35816 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 35873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 8174 - 8257
Alignment:
Q  159 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 241  Q
    |||||||| || |||||||||||  || ||| || |||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  8174 tgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 2399 - 2317
Alignment:
Q  159 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2399 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 2317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 372
Target Start/End: Original strand, 442 - 499
Alignment:
Q  315 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 372  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  442 ctaacccccttacctcagttatcaccaattcctagctcaagcttcactttagctccta 499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 76756 - 76699
Alignment:
Q  315 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 372  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  76756 ctaacccccttaccttaattatcagcaattcctagcccaagcttcactttagctccta 76699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 193429 - 193396
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193429 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 193396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6475 - 6443
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6475 atgattatgataaagactaacccccttacctta 6443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 910 - 878
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  910 atgattatgataaagactaacccccttacctta 878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 9914 - 9882
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9914 atgattatgataaagactaacccccttacctta 9882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13317 - 13285
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 13285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 57424 - 57392
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57424 atgattatgataaagactaacccccttacctta 57392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 70348 - 70307
Alignment:
Q  200 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 241  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  70348 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagtacgaattt 70307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 55904 - 55936
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55904 atgattatgataaagactaacccccttacctta 55936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 108107 - 108075
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108107 atgattatgataaagactaacccccttacctta 108075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 288 - 331
Target Start/End: Original strand, 18015 - 18058
Alignment:
Q  288 acaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18015 acaaaataattatgattatgatgaagactaacccccttacctta 18058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 207
Target Start/End: Original strand, 45198 - 45244
Alignment:
Q  161 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgca 207  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  45198 aacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgca 45244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 45338 - 45370
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45338 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 45370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 372
Target Start/End: Original strand, 632 - 689
Alignment:
Q  315 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 372  Q
    |||||||||||||| |||||||| | || | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  632 ctaacccccttaccataattatcactaattcctagcccaagcttcactttagctccta 689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 372
Target Start/End: Original strand, 6999 - 7056
Alignment:
Q  315 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 372  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| | ||||| | | |||||||||||||||||    
T  6999 ctaacccccttaccataattatcaccaattcctagcccaaccttcactttagctccta 7056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1587 - 1546
Alignment:
Q  200 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 241  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  1587 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 1546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8732 - 8691
Alignment:
Q  200 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 241  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  8732 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 43708 - 43651
Alignment:
Q  315 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 372  Q
    ||||||||||||||||||||| | | || | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  43708 ctaacccccttaccttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctccta 43651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 372
Target Start/End: Original strand, 31357 - 31414
Alignment:
Q  315 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 372  Q
    ||||||||||||||||||||| | | || | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  31357 ctaacccccttaccttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctccta 31414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 240
Target Start/End: Original strand, 8011 - 8051
Alignment:
Q  200 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 240  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8011 ttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 8051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 17241 - 17209
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17241 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 17209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 5508 - 5476
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5508 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 5476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 4378 - 4346
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4378 atgattatgataaagtctaacccccttacctta 4346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 17336 - 17304
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17336 atgattatgataaagactaacccgcttacctta 17304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 5549 - 5581
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5549 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 5581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 34340 - 34308
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34340 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 34308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 240
Target Start/End: Original strand, 3525 - 3565
Alignment:
Q  200 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 240  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  3525 ttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 3565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12450 - 12418
Alignment:
Q  299 atgattatgataaagactaacccccttacctta 331  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12450 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 12418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University