View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10841_low_35 (Length: 357)

Name: NF10841_low_35
Description: NF10841
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10841_low_35
NF10841_low_35
[»] chr3 (31 HSPs)
chr3 (8-343)||(55478208-55478543)
chr3 (8-343)||(25432427-25432762)
chr3 (8-343)||(20491622-20491957)
chr3 (17-343)||(4370954-4371280)
chr3 (17-343)||(4380673-4380999)
chr3 (8-343)||(4024557-4024892)
chr3 (8-343)||(12152-12487)
chr3 (8-343)||(6421869-6422205)
chr3 (8-343)||(16335606-16335942)
chr3 (17-343)||(8972423-8972749)
chr3 (17-343)||(8982978-8983304)
chr3 (17-343)||(9536712-9537038)
chr3 (17-343)||(9547038-9547364)
chr3 (8-343)||(10012392-10012727)
chr3 (17-343)||(1685416-1685742)
chr3 (21-343)||(5655791-5656113)
chr3 (8-337)||(6432309-6432639)
chr3 (8-198)||(10508468-10508656)
chr3 (81-318)||(12376170-12376405)
chr3 (99-240)||(4783255-4783395)
chr3 (99-240)||(19828518-19828658)
chr3 (99-240)||(2489846-2489986)
chr3 (264-346)||(24793273-24793355)
chr3 (99-240)||(13120245-13120385)
chr3 (264-346)||(17733934-17734016)
chr3 (264-346)||(19035203-19035285)
chr3 (99-240)||(20745350-20745490)
chr3 (99-215)||(13113140-13113256)
chr3 (224-326)||(21542463-21542565)
chr3 (173-218)||(20292867-20292912)
chr3 (99-218)||(18560623-18560742)
[»] chr4 (43 HSPs)
chr4 (8-343)||(15668755-15669090)
chr4 (8-343)||(16252980-16253315)
chr4 (8-343)||(26330793-26331128)
chr4 (17-343)||(16249023-16249349)
chr4 (17-343)||(3487788-3488114)
chr4 (17-343)||(3497111-3497437)
chr4 (11-344)||(17160809-17161142)
chr4 (17-343)||(18105581-18105908)
chr4 (17-343)||(21845680-21846006)
chr4 (17-343)||(21855272-21855598)
chr4 (17-343)||(21901543-21901869)
chr4 (17-343)||(21911135-21911461)
chr4 (17-343)||(40921420-40921746)
chr4 (17-342)||(5293255-5293580)
chr4 (17-342)||(5302914-5303239)
chr4 (17-342)||(27680918-27681243)
chr4 (17-342)||(27690573-27690898)
chr4 (17-343)||(6691795-6692121)
chr4 (17-343)||(6702201-6702527)
chr4 (11-343)||(13403202-13403533)
chr4 (12-343)||(17985030-17985362)
chr4 (74-343)||(16241695-16241964)
chr4 (8-326)||(52498698-52499017)
chr4 (12-337)||(9836231-9836556)
chr4 (8-343)||(6405989-6406322)
chr4 (174-337)||(13793231-13793394)
chr4 (172-343)||(11476653-11476824)
chr4 (12-343)||(14600868-14601199)
chr4 (8-343)||(1292925-1293259)
chr4 (99-240)||(17838171-17838311)
chr4 (254-326)||(19917979-19918051)
chr4 (99-240)||(17828780-17828920)
chr4 (83-318)||(53946492-53946724)
chr4 (99-218)||(7847058-7847176)
chr4 (162-318)||(16211376-16211530)
chr4 (99-218)||(16629168-16629287)
chr4 (264-326)||(26458170-26458232)
chr4 (255-341)||(41525672-41525757)
chr4 (83-314)||(2829181-2829410)
chr4 (264-326)||(17421506-17421568)
chr4 (102-296)||(16472311-16472503)
chr4 (271-326)||(30651390-30651445)
chr4 (264-324)||(16058066-16058126)
[»] chr1 (34 HSPs)
chr1 (8-343)||(42033759-42034098)
chr1 (8-343)||(8539818-8540154)
chr1 (8-343)||(21885881-21886216)
chr1 (8-343)||(8605057-8605393)
chr1 (8-343)||(13964463-13964798)
chr1 (8-343)||(2115568-2115903)
chr1 (8-343)||(30549763-30550098)
chr1 (8-343)||(25019035-25019371)
chr1 (17-343)||(21458205-21458531)
chr1 (8-343)||(16154450-16154786)
chr1 (8-343)||(2370565-2370900)
chr1 (8-343)||(18382930-18383264)
chr1 (8-277)||(1968905-1969174)
chr1 (8-343)||(1186578-1186911)
chr1 (8-343)||(18062378-18062712)
chr1 (8-242)||(41544399-41544634)
chr1 (17-326)||(34822603-34822911)
chr1 (8-337)||(22956125-22956452)
chr1 (225-343)||(41544268-41544386)
chr1 (8-122)||(22406646-22406761)
chr1 (99-218)||(21782349-21782468)
chr1 (99-240)||(26193724-26193864)
chr1 (69-218)||(21821739-21821889)
chr1 (99-240)||(20308505-20308645)
chr1 (99-240)||(25867917-25868057)
chr1 (99-318)||(18097139-18097356)
chr1 (267-326)||(1989673-1989732)
chr1 (264-326)||(52955473-52955535)
chr1 (267-326)||(1982255-1982314)
chr1 (99-218)||(20328673-20328792)
chr1 (99-240)||(20314189-20314329)
chr1 (154-240)||(20318328-20318412)
chr1 (99-240)||(27065724-27065864)
chr1 (224-326)||(50940948-50941049)
[»] scaffold0690 (1 HSPs)
scaffold0690 (8-343)||(4376-4711)
[»] chr6 (32 HSPs)
chr6 (8-343)||(29540025-29540360)
chr6 (8-343)||(14791170-14791506)
chr6 (17-343)||(12454630-12454956)
chr6 (8-343)||(24922158-24922494)
chr6 (17-343)||(16897523-16897849)
chr6 (17-343)||(16908176-16908502)
chr6 (8-343)||(20911849-20912185)
chr6 (8-343)||(24931194-24931530)
chr6 (17-343)||(31357137-31357463)
chr6 (17-343)||(31366865-31367191)
chr6 (17-343)||(18159638-18159964)
chr6 (17-343)||(18169450-18169776)
chr6 (14-343)||(3285418-3285748)
chr6 (99-343)||(18200876-18201119)
chr6 (81-343)||(14044956-14045217)
chr6 (69-343)||(27787726-27788000)
chr6 (99-240)||(16320945-16321085)
chr6 (99-240)||(26021389-26021529)
chr6 (224-324)||(9761632-9761732)
chr6 (99-318)||(1596091-1596309)
chr6 (255-324)||(28092398-28092467)
chr6 (161-240)||(16333155-16333233)
chr6 (162-240)||(791505-791582)
chr6 (264-346)||(8563405-8563487)
chr6 (264-326)||(22223775-22223837)
chr6 (264-326)||(22249610-22249672)
chr6 (92-314)||(16923219-16923439)
chr6 (99-218)||(18712578-18712697)
chr6 (99-239)||(24505686-24505825)
chr6 (173-318)||(26161616-26161760)
chr6 (83-318)||(30658341-30658573)
chr6 (273-326)||(24361878-24361931)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (8-337)||(7938-8267)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (8-343)||(15416-15751)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (8-343)||(93018-93353)
[»] chr7 (42 HSPs)
chr7 (8-343)||(14943875-14944210)
chr7 (8-343)||(15371468-15371803)
chr7 (8-343)||(42620747-42621082)
chr7 (8-343)||(9535399-9535735)
chr7 (8-343)||(9545682-9546018)
chr7 (19-343)||(26348308-26348632)
chr7 (17-343)||(5381974-5382300)
chr7 (17-343)||(5391612-5391938)
chr7 (17-343)||(5926712-5927038)
chr7 (17-343)||(8500626-8500952)
chr7 (17-343)||(8511096-8511422)
chr7 (17-343)||(46496691-46497017)
chr7 (17-343)||(46507303-46507629)
chr7 (17-342)||(6544382-6544707)
chr7 (17-343)||(43983054-43983380)
chr7 (17-342)||(6534083-6534408)
chr7 (19-326)||(26363360-26363667)
chr7 (17-343)||(44896894-44897220)
chr7 (17-343)||(44907297-44907623)
chr7 (8-343)||(32097947-32098283)
chr7 (8-343)||(32108384-32108720)
chr7 (17-343)||(11626523-11626848)
chr7 (17-343)||(16132073-16132399)
chr7 (17-343)||(16142622-16142948)
chr7 (8-324)||(14248719-14249034)
chr7 (8-343)||(2992074-2992409)
chr7 (8-344)||(9006474-9006808)
chr7 (8-103)||(22964652-22964747)
chr7 (224-326)||(33090976-33091078)
chr7 (224-326)||(40701709-40701811)
chr7 (266-346)||(41027368-41027448)
chr7 (264-346)||(15988833-15988915)
chr7 (99-240)||(24541107-24541247)
chr7 (99-218)||(45552832-45552951)
chr7 (269-343)||(7034912-7034986)
chr7 (264-326)||(12827543-12827605)
chr7 (264-326)||(13285969-13286031)
chr7 (264-346)||(42595179-42595261)
chr7 (99-318)||(27988150-27988368)
chr7 (99-216)||(19585411-19585528)
chr7 (264-326)||(31824544-31824606)
chr7 (299-343)||(12491146-12491190)
[»] chr2 (35 HSPs)
chr2 (12-343)||(24696661-24696992)
chr2 (17-343)||(2998773-2999099)
chr2 (17-343)||(18650795-18651121)
chr2 (17-343)||(18662913-18663239)
chr2 (10-343)||(45014301-45014635)
chr2 (17-342)||(4457772-4458097)
chr2 (17-342)||(4467397-4467722)
chr2 (8-343)||(38957894-38958230)
chr2 (17-343)||(9502837-9503163)
chr2 (17-343)||(9514203-9514529)
chr2 (17-342)||(5337212-5337537)
chr2 (17-342)||(5347065-5347390)
chr2 (10-343)||(45024378-45024712)
chr2 (8-343)||(38930558-38930895)
chr2 (8-337)||(17488257-17488587)
chr2 (8-342)||(72294-72626)
chr2 (174-343)||(44639102-44639270)
chr2 (8-140)||(44639277-44639409)
chr2 (196-343)||(29423126-29423268)
chr2 (8-242)||(24239418-24239639)
chr2 (99-312)||(12570221-12570433)
chr2 (264-346)||(19342105-19342187)
chr2 (264-346)||(23721735-23721817)
chr2 (224-326)||(40409216-40409318)
chr2 (99-240)||(22687952-22688092)
chr2 (264-346)||(22901908-22901990)
chr2 (99-240)||(45190472-45190612)
chr2 (264-337)||(22908957-22909030)
chr2 (99-240)||(573895-574035)
chr2 (99-240)||(16934571-16934711)
chr2 (99-240)||(17005231-17005371)
chr2 (155-218)||(15940399-15940462)
chr2 (115-218)||(24942578-24942681)
chr2 (264-314)||(16135335-16135385)
chr2 (249-314)||(16327821-16327886)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (8-344)||(791304-791640)
chr8 (12-343)||(7757335-7757666)
chr8 (17-343)||(9325192-9325518)
chr8 (17-343)||(21202970-21203296)
chr8 (17-343)||(21213386-21213712)
chr8 (17-343)||(21333875-21334201)
chr8 (8-343)||(17268409-17268744)
chr8 (17-343)||(21997630-21997956)
chr8 (17-343)||(21988096-21988422)
chr8 (8-343)||(2690448-2690781)
chr8 (69-322)||(5867569-5867821)
chr8 (8-186)||(20098382-20098559)
chr8 (265-326)||(37295701-37295762)
chr8 (250-326)||(37816670-37816746)
chr8 (99-240)||(13673889-13674029)
chr8 (99-240)||(14881971-14882111)
chr8 (99-240)||(14894321-14894461)
chr8 (255-324)||(18536406-18536475)
chr8 (170-326)||(14437096-14437259)
chr8 (99-318)||(20531525-20531742)
chr8 (99-240)||(31999524-31999664)
chr8 (99-240)||(33774415-33774555)
chr8 (267-326)||(26362544-26362603)
chr8 (96-218)||(31991744-31991866)
chr8 (296-326)||(12841689-12841719)
[»] chr5 (39 HSPs)
chr5 (11-342)||(22244285-22244616)
chr5 (17-343)||(18360854-18361180)
chr5 (17-343)||(21753020-21753346)
chr5 (17-343)||(21762307-21762633)
chr5 (17-343)||(33938894-33939220)
chr5 (17-343)||(33949294-33949620)
chr5 (8-343)||(27411715-27412051)
chr5 (17-343)||(18389811-18390137)
chr5 (17-343)||(26192159-26192485)
chr5 (17-343)||(26202763-26203089)
chr5 (8-343)||(32070007-32070343)
chr5 (17-343)||(8765523-8765849)
chr5 (17-343)||(11411267-11411592)
chr5 (8-343)||(31104981-31105315)
chr5 (12-343)||(23378741-23379071)
chr5 (16-343)||(21484192-21484518)
chr5 (99-240)||(30944266-30944406)
chr5 (99-240)||(30953688-30953828)
chr5 (99-240)||(37299295-37299435)
chr5 (99-240)||(37549085-37549225)
chr5 (99-318)||(31916447-31916665)
chr5 (99-218)||(20896588-20896707)
chr5 (105-318)||(4038382-4038594)
chr5 (99-216)||(13572183-13572300)
chr5 (264-326)||(19548653-19548715)
chr5 (99-240)||(27274661-27274801)
chr5 (99-240)||(37651883-37652023)
chr5 (105-240)||(22173730-22173864)
chr5 (250-326)||(36316170-36316246)
chr5 (105-218)||(18210313-18210426)
chr5 (105-218)||(18219651-18219764)
chr5 (99-240)||(19888834-19888974)
chr5 (105-218)||(21681284-21681397)
chr5 (99-318)||(34130892-34131111)
chr5 (99-218)||(20763995-20764113)
chr5 (117-218)||(20905033-20905134)
chr5 (270-318)||(205879-205926)
chr5 (99-240)||(37817233-37817375)
chr5 (162-242)||(42090995-42091074)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (8-343)||(310184-310520)
scaffold0005 (12-343)||(216179-216510)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (8-332)||(74894-75218)
[»] scaffold0014 (4 HSPs)
scaffold0014 (17-343)||(234154-234480)
scaffold0014 (99-318)||(146328-146546)
scaffold0014 (99-240)||(153795-153934)
scaffold0014 (99-240)||(114793-114932)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (17-343)||(8008-8334)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (54-343)||(21321-21610)
[»] scaffold0277 (1 HSPs)
scaffold0277 (8-343)||(19541-19877)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (70-343)||(55985-56262)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (137-343)||(17452-17658)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (12-343)||(13394-13724)
[»] scaffold1705 (1 HSPs)
scaffold1705 (6-198)||(415-607)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (8-333)||(198868-199191)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (12-259)||(29010-29254)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (8-337)||(65255-65583)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (8-193)||(1143-1327)
[»] scaffold0406 (1 HSPs)
scaffold0406 (105-343)||(15046-15284)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (224-326)||(241867-241969)
[»] scaffold0265 (1 HSPs)
scaffold0265 (69-218)||(10920-11070)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (99-240)||(112061-112201)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (99-218)||(23010-23129)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (224-348)||(40754-40878)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (105-318)||(18402-18614)
[»] scaffold0553 (1 HSPs)
scaffold0553 (99-240)||(1136-1276)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (110-218)||(4430-4538)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (99-215)||(24108-24224)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (161-240)||(13720-13798)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (270-318)||(54459-54506)
scaffold0018 (270-318)||(58411-58458)
scaffold0018 (270-318)||(59839-59886)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 31)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 55478543 - 55478208
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55478543 aagcatagatcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatgtccaggaaa 55478444  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 207  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  55478443 gtacttttgcatggatcaatcaagcaataaagacatatacaaagattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagactatgaatattgatatacta 55478344  T
Q  208 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  55478343 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 55478244  T
Q  308 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  55478243 aatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 55478208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Original strand, 25432427 - 25432762
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25432427 aagcatagatcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaggtcatgcaatgcacatgtgacatggatatatgtccaggaaa 25432526  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25432527 gtacatttgcatggattaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaatgatatccaatgttcatttaagactatgaacattgatgtacta 25432626  T
Q  208 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  25432627 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattattgtttcactaataggatttgattacatcaaatgatagtcttaca 25432726  T
Q  308 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  25432727 aatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 25432762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Original strand, 20491622 - 20491957
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20491622 aagcatagattagaaggttgttcttatataagccaagaatctcaagaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatgtccaggaaa 20491721  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 207  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20491722 gtacatttgcatggatcaatctagcaataaaagcatatacaaggattatgtcaaaaaggatactcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtacta 20491821  T
Q  208 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20491822 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatataacttctcttcattgttgttttactatttggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 20491921  T
Q  308 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  20491922 aatcatgctaagtgaaacagatggaacattctgatg 20491957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 4370954 - 4371280
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  4370954 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacacttg 4371053  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  4371054 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatatccaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 4371153  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  4371154 cacaagggaatatcatcctagatgttaatagcactgctcttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 4371253  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  4371254 aagtgaaacagatggaacattctgatg 4371280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 4380673 - 4380999
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  4380673 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacacttg 4380772  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  4380773 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatatccaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 4380872  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  4380873 cacaagggaatatcatcctagatgttaatagcactgctcttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 4380972  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  4380973 aagtgaaacagatggaacattctgatg 4380999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 4024892 - 4024557
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  4024892 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaaaacaagaatctcaagaacattgatcaagttcatgcaaggcacatgtgacattgatatatgttcaggaaa 4024793  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 207  Q
    ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4024792 gtagatttacatggatcaatcaagcaataaaggcatatgcaaggattatgtcaaaaaggatactcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtacta 4024693  T
Q  208 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  4024692 ggaatattccacaagggaatatcatcctagaggttaatatcactactcttcattgttgtttcactattaggatttgattacatctaatggtagtcttaca 4024593  T
Q  308 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  4024592 aatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 4024557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 12487 - 12152
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  12487 aagcagagatcagaatgttgttcttatacaagccgagagtctcaagaactttgatcaagatcatgcaagacacatgtgacatgggtatatgtccaggaaa 12388  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12387 gtacatttgcatggatcaatcaacaaataaaagcatatacaaggattatgtcaaagaaggtattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtacta 12288  T
Q  208 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  12287 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaaaatcattgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 12188  T
Q  308 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  12187 aatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 12152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Original strand, 6421869 - 6422205
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6421869 aagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaagacacatgtgacatgggtatatgtccaggaa 6421968  T
Q  107 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6421969 agtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 6422068  T
Q  207 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 306  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  6422069 aggaatatttcacaagggaatatcatcctagatgttattattactgctcttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttac 6422168  T
Q  307 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6422169 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattttgatg 6422205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16335942 - 16335606
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  16335942 aagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtcctggaa 16335843  T
Q  107 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 206  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16335842 agtacatttgcatgaatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 16335743  T
Q  207 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 306  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16335742 aggaatattccacaaggggatatcatcctaggtgttaaaatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttac 16335643  T
Q  307 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  16335642 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 16335606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 8972423 - 8972749
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  8972423 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 8972522  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  8972523 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 8972622  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  8972623 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 8972722  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  8972723 aagtgaaacagatggaacattctgatg 8972749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 8982978 - 8983304
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  8982978 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 8983077  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  8983078 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 8983177  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  8983178 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 8983277  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  8983278 aagtgaaacagatggaacattctgatg 8983304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 9536712 - 9537038
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  9536712 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 9536811  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  9536812 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 9536911  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  9536912 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 9537011  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  9537012 aagtgaaacagatggaacattctgatg 9537038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 9547038 - 9547364
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  9547038 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 9547137  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  9547138 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 9547237  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  9547238 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 9547337  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  9547338 aagtgaaacagatggaacattctgatg 9547364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10012727 - 10012392
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||   |||| |||||||||    
T  10012727 aagcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaggtcatgcacgacacatgtgacatgtgaatatgtccaggaaa 10012628  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10012627 gtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatatcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtacta 10012528  T
Q  208 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  10012527 ggaatattccacaagagaatatcatcctagatgttaaaatcactgctcttcattattgtttcaccattaggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 10012428  T
Q  308 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  10012427 aatcgtcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 10012392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1685742 - 1685416
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  1685742 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatcgcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 1685643  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  1685642 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 1685543  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  1685542 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 1685443  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  1685442 aagtgaaacagatggaacattctgatg 1685416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 21 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 5656113 - 5655791
Alignment:
Q  21 aaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttgcatg 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5656113 aaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttgcatg 5656014  T
Q  121 gataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattccaca 220  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5656013 gatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatatttcaca 5655914  T
Q  221 agggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagt 320  Q
    | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  5655913 aaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagt 5655814  T
Q  321 gaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||| |||||||||| |||||    
T  5655813 gaaacagatggaacattctgatg 5655791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 8 - 337
Target Start/End: Original strand, 6432309 - 6432639
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6432309 aagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccaggaa 6432408  T
Q  107 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6432409 agtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 6432508  T
Q  207 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 306  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  6432509 aggaatatttcacaagggaatatcatcctagatgttattattactgcttttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttac 6432608  T
Q  307 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacatt 337  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6432609 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacatt 6432639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10508656 - 10508468
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||| ||||| ||||| | |||| ||| || ||||||  ||| |||| |||| |||||||| ||| || ||||| |||    
T  10508656 aagcagagttcagaaggttgtctttacacaagccaagagtttcaagaacatt-atcaagagcattcaagtcacacgtgacatgaataaatgtccagaaaa 10508558  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacatt 198  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10508557 gtacattttcatggatcaatcaagcaatgaagacatttacaaggttaatgtcaaaaaggatattcaatgttca-ttaagactatgaacatt 10508468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 81 - 318
Target Start/End: Original strand, 12376170 - 12376405
Alignment:
Q  81 atgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttca 180  Q
    |||||||||  || ||| |||||||||| || |||| |||||| ||||||| | | ||||||| ||||||    ||||| ||| | || || ||||||||    
T  12376170 atgtgacataaatgtatgtccaggaaagcacctttgaatggatcaatcaagaagttaaggcatttacaagagaaatgtctaaatg-atctttaatgttca 12376268  T
Q  181 tttaagattatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttca-ttgttgtttcactattagga 279  Q
    | ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||    ||||||| ||||| ||||   || ||||||||||    
T  12376269 tctaagactatgaacattaaagtactaggaatattcca-atgagaatattatcctagatgttgcattcactgcacttcagttgtgtctttactattagga 12376367  T
Q  280 tttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaa 318  Q
     ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  12376368 -ttgattacatcaaaagtaagtcttacaaatcatcctaa 12376405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 4783395 - 4783255
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||  ||||| ||||||||    
T  4783395 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgt-aaaaaggatctttaatgttcatccaagatgatgaacat 4783297  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  4783296 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 4783255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19828658 - 19828518
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  19828658 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 19828560  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  19828559 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 19828518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 2489986 - 2489846
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  2489986 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatgaacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 2489888  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  2489887 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 2489846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 346
Target Start/End: Original strand, 24793273 - 24793355
Alignment:
Q  264 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatgtcc 346  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||    
T  24793273 tgtttcactattaggatttgattacatcaaataagagtcttgcaaatcatcctaagtgaaacaaaaggaacattctgaagtcc 24793355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13120385 - 13120245
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  13120385 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatgaacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 13120287  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    | | |||||||||||||| || | | |||||| ||||||||||    
T  13120286 taaagtactaggaatatttca-atgagaatattatcctagatg 13120245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 346
Target Start/End: Original strand, 17733934 - 17734016
Alignment:
Q  264 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatgtcc 346  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||    
T  17733934 tgtttcactattatgatttgattacatcaaataagagtcttacaaattatcctaagtgaaacaaaaggaacattctgaagtcc 17734016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 346
Target Start/End: Original strand, 19035203 - 19035285
Alignment:
Q  264 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatgtcc 346  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||    
T  19035203 tgtttcactattatgatttgattacatcaaataagagtcttacaaattatcctaagtgaaacaaaaggaacattctgaagtcc 19035285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20745490 - 20745350
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  20745490 tccagaaaagttcatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 20745392  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  20745391 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 20745350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13113256 - 13113140
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  13113256 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatgaacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 13113158  T
Q  198 tgatgtactaggaatatt 215  Q
    | | ||||||||||||||    
T  13113157 taaagtactaggaatatt 13113140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21542565 - 21542463
Alignment:
Q  224 gaatatcatcctagatgtta-atatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtga 322  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||| |  ||||||| |||| ||||| ||||||||||||| || ||| |  |||||||||||| |||||||||||    
T  21542565 gaatatcatcctagatgttacacat-actacatttcattgatgttacactactaggatttgattacattaaatgagagtcttacaaataatcctaagtga 21542467  T
Q  323 aaca 326  Q
    ||||    
T  21542466 aaca 21542463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 218
Target Start/End: Original strand, 20292867 - 20292912
Alignment:
Q  173 aatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattcca 218  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  20292867 aatgttcattcaagactatgaacattaaagtactaggaatattcca 20292912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 218
Target Start/End: Original strand, 18560623 - 18560742
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||  |||||  |||||||||||  |||| ||  ||||| |||||| || || |||||||||  |||| |||||||||    
T  18560623 tccagaaaagtacatctgcatagatctatcaacaaataaaggcatggacaaagaactatgtaaaaaag-atctttaatgttcatccaagactatgaacat 18560721  T
Q  198 tgatgtactaggaatattcca 218  Q
    | | |||||||||||||||||    
T  18560722 taaagtactaggaatattcca 18560742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 43)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Original strand, 15668755 - 15669090
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15668755 aagcagatatcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaggttatgtaaggcacatgtgacatggatatatgtccaggaaa 15668854  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15668855 gtacatttgcatggatcaatcaagtaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtacta 15668954  T
Q  208 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15668955 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaaaatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 15669054  T
Q  308 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  15669055 aatcatccaaagtgaaacaaatggaacattctgatg 15669090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Original strand, 16252980 - 16253315
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16252980 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccaggaaa 16253079  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16253080 gtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaggctattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtacta 16253179  T
Q  208 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  16253180 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaaaattactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 16253279  T
Q  308 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  16253280 aatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 16253315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Original strand, 26330793 - 26331128
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  26330793 aagcagagatcagaaggatgttcttatacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatgtacaggaaa 26330892  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 207  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  26330893 gtacatctgcatggatcaattaagcaataaagacatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagaccatgaacattgatgtacta 26330992  T
Q  208 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 307  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  26330993 ggaatattctacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 26331092  T
Q  308 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  26331093 aatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 26331128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 16249023 - 16249349
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  16249023 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacacttg 16249122  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  16249123 catggataaattaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 16249222  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  16249223 cacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 16249322  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  16249323 aagtgaaacagatggaacattctgatg 16249349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 3488114 - 3487788
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  3488114 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacacttg 3488015  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  3488014 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatatccaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 3487915  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  3487914 cacaagggaatatcatcctagatgttaatagcactgctcttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 3487815  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  3487814 aagtgaaacagatggaacattctgatg 3487788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 3497437 - 3497111
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  3497437 tcagaagattgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacacttg 3497338  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  3497337 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatatccaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 3497238  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  3497237 cacaagggaatatcatcctagatgttaatagcactgctcttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 3497138  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  3497137 aagtgaaacagatggaacattctgatg 3497111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 11 - 344
Target Start/End: Original strand, 17160809 - 17161142
Alignment:
Q  11 cagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagta 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17160809 cagagattagaaggttgttcttatacaagtcaagaatgtaaagaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacacggatatatatctaggaaagta 17160908  T
Q  111 catttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactagga 210  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17160909 catttgcatggatcaatcaatcaataaaggcatatacaataattatgtcaaaaaggatattcgatgttcatttaagactatgaacattgatgtactagga 17161008  T
Q  211 atattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  17161009 atattccacaagggaatatcatcttagatgttaatatcattgttcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttataaat 17161108  T
Q  311 catcctaagtgaaacatatggaacattttgatgt 344  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  17161109 catcctaagtgaaacagatggaacattctgatgt 17161142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18105908 - 18105581
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18105908 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 18105809  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaagga-ttatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatatt 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18105808 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatatt 18105709  T
Q  216 ccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcc 315  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  18105708 tcacaagggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcc 18105609  T
Q  316 taagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  18105608 taagtgaaacagatggaacattctgatg 18105581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 21845680 - 21846006
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21845680 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 21845779  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  21845780 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 21845879  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  21845880 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 21845979  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  21845980 aagtgaaacagatggaacattctgatg 21846006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 21855272 - 21855598
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21855272 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 21855371  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  21855372 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 21855471  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  21855472 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 21855571  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  21855572 aagtgaaacagatggaacattctgatg 21855598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 21901543 - 21901869
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21901543 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 21901642  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  21901643 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 21901742  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  21901743 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 21901842  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  21901843 aagtgaaacagatggaacattctgatg 21901869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 21911135 - 21911461
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21911135 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 21911234  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  21911235 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 21911334  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  21911335 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 21911434  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  21911435 aagtgaaacagatggaacattctgatg 21911461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 40921420 - 40921746
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  40921420 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 40921519  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  40921520 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 40921619  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  40921620 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 40921719  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  40921720 aagtgaaacagatggaacattctgatg 40921746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 17 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5293580 - 5293255
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  5293580 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtggtcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 5293481  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  5293480 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 5293381  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  5293380 cacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 5293281  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgat 342  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||    
T  5293280 aagtgaaacagatggaacattctgat 5293255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 17 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5303239 - 5302914
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  5303239 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtggtcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 5303140  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  5303139 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 5303040  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  5303039 cacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 5302940  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgat 342  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||    
T  5302939 aagtgaaacagatggaacattctgat 5302914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 17 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27681243 - 27680918
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  27681243 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacataaatatatgtccaggaaagtacatttg 27681144  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  27681143 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 27681044  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  27681043 cacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 27680944  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgat 342  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||    
T  27680943 aagtgaaacagatggaacattctgat 27680918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 17 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27690898 - 27690573
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  27690898 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacataaatatatgtccaggaaagtacatttg 27690799  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  27690798 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 27690699  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  27690698 cacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 27690599  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgat 342  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||    
T  27690598 aagtgaaacagatggaacattctgat 27690573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 6691795 - 6692121
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  6691795 tcagaaggttattcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 6691894  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  6691895 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 6691994  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  6691995 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 6692094  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  6692095 aagtgaaacagatggaacattctgatg 6692121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 6702201 - 6702527
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  6702201 tcagaaggttattcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 6702300  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  6702301 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 6702400  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  6702401 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 6702500  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  6702501 aagtgaaacagatggaacattctgatg 6702527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 13403533 - 13403202
Alignment:
Q  11 cagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagta 110  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||| ||||||||    
T  13403533 cagagatcaggaggttgttcttgcacaagccaagaatctcaagaacattgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgattaaatgtcctggaaagta 13403434  T
Q  111 catttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactagga 210  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  13403433 catt-gcatggatcaatcaagcaataaagacatatataaggattatggcaaaaaggatattcaatgttcatttaagactatgaacattgaagtactagga 13403335  T
Q  211 atattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaat 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  13403334 atattccaaaagggaatatcatcctagatgttaaaatcactgttcttcattgttgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaat 13403235  T
Q  311 catcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  13403234 catcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 13403202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 12 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 17985362 - 17985030
Alignment:
Q  12 agagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||    
T  17985362 agagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccagaagagta 17985263  T
Q  111 catttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactagga 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  17985262 catttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagggttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactataaacattgatgtactagga 17985163  T
Q  211 atattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaat 310  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  17985162 atatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaat 17985063  T
Q  311 catcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  17985062 catcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 17985030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 74 - 343
Target Start/End: Original strand, 16241695 - 16241964
Alignment:
Q  74 aaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattca 173  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16241695 aaggcacatgtgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaggttattca 16241794  T
Q  174 atgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcacta 273  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16241795 atgttcatttaagactatgaacattgatatactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaaaatcactgctcttcattattgtttcacta 16241894  T
Q  274 ttaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  16241895 ttaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 16241964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 8 - 326
Target Start/End: Original strand, 52498698 - 52499017
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccagg-aa 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  52498698 aagcagagatcagaaggttgttcttatgcaagccaataatctcaagaacattggtcgaagtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatgtccagggaa 52498797  T
Q  107 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  52498798 agtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattaatgtact 52498897  T
Q  207 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 306  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  52498898 atgaatattccataagggaatatcatcctaaatattaatatcattgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttac 52498997  T
Q  307 aaatcatcctaagtgaaaca 326  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  52498998 aaatcatcctaagtgaaaca 52499017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 9836556 - 9836231
Alignment:
Q  12 agagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtac 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| || ||| |||||||| |||||||||| ||||  || |||| ||| || | ||||||| |||    
T  9836556 agagatcagaaggttgttcttatacaagcacataatcttaagaacattgatcaaagtcatgcaagacacacatgtcatgaataaatgttcaggaaaatac 9836457  T
Q  112 atttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaa 211  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  9836456 atttgcatggatcaatcaagcaataaagacatatacaaggattatgtcaaaaaggatactcaatgttcatttaagactatgaacattgaagtactaggaa 9836357  T
Q  212 tattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatc 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9836356 tattccaaaagggaatatcatcctagatgttttaatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattatatcaaatggtagtcttacaaatc 9836257  T
Q  312 atcctaagtgaaacatatggaacatt 337  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||    
T  9836256 atcctaagtgaaacaaaaggaacatt 9836231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 6406322 - 6405989
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| || || |||  | ||||||  |||||||||||||  ||||||| ||| || |||||||||    
T  6406322 aagcagagttcagaaggttgttcttatacaagcccagaaactaaagaacaat-atcaagaacatgcaaggcacacttgacatgaataaatgtccaggaaa 6406224  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 207  Q
     ||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| ||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  6406223 atacattttcatggatcaattaagcaattaagacatttacaaggttaatgtcaaaaatgatattcaatgttcattaaagactatgaacattgaagtacta 6406124  T
Q  208 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 307  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  | |||||||||    
T  6406123 ggaatattcca-aagagaatatcttcctagatgttacaatcattgatcttcattgttgtttcactattagaatttgattacatcaaatagaagtcttaca 6406025  T
Q  308 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||    
T  6406024 aatcatcataagtgaaacaaaaggaacattctgatg 6405989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 174 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 13793394 - 13793231
Alignment:
Q  174 atgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcacta 273  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13793394 atgttcatttaagactatgaacattgaagtactaggattattttaaaagggaatatcatcctagatgttacaatcactgctcttcattgttgtttcacta 13793295  T
Q  274 ttaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacatt 337  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  13793294 ttaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaaatgaaacaaaaggaacatt 13793231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 172 - 343
Target Start/End: Original strand, 11476653 - 11476824
Alignment:
Q  172 caatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcac 271  Q
    |||||||||||||  | || ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  11476653 caatgttcatttataactacgaacattgaagtgctaggaatattccaaaagggaatatcatcctagatgtttcaatcactgctcttcattgttgtttcac 11476752  T
Q  272 tattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||| |||| |||| |||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  11476753 tattagaattttattacatcaaatggtattcttacagattatcctaagtgaaacaaaaggaacattctgatg 11476824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14601199 - 14600868
Alignment:
Q  12 agagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtac 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||  |||||||| ||  ||||| ||| | | || ||||| |||||||    
T  14601199 agaggtcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaagaacatt-atcaagaacatgcaagtcatttgtgatatgaacaaatgtccagaaaagtac 14601101  T
Q  112 atttgcatggataaatc-aagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactagg 209  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| || || | |  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||| |    
T  14601100 gtttgcatggatcaatcaaagcaataaagacatttataaagttaaatgtcaaaaaggatattcaatgttca-ttaagactataaacattgaagtactaag 14601002  T
Q  210 aatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttc-attgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaa 308  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||||||   || ||||| |||| ||| |  |||||||||||||| ||||||| |||||     ||||||||||    
T  14601001 aatattcca-atgtgaatatcatcctagatgttgcaattactgcacttcaattatgttttcactattagga-ttgattacatcaagtacaagtcttacaa 14600904  T
Q  309 atcatcctaagt-gaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||    
T  14600903 atcatcctatgtaaaaacaaatggaacattctgatg 14600868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Original strand, 1292925 - 1293259
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||| || ||||||  |||||||| ||| | ||||||| | | || ||||  |||    
T  1292925 aagcaaaggtcagaaagttgttcttatgcaagtcaataatctcaagaacatt-atcaagaacatgcaagtcacttatgacatgaacaaatgtccataaaa 1293023  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 206  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||| | |  ||| ||||| |||||||||||| ||| | |||| |||||||||||| |||||    
T  1293024 gtacatttgcatggatcaatcaaacaataaagacatttacaaagttaaatgacaaaagggatattcaatgatca-tcaagactatgaacattgaagtact 1293122  T
Q  207 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttca-ttgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtctta 305  Q
    |||||||||||| |   |||||||||| ||||||||   || ||||| ||||| || |  |||||||||||||| ||||||| |||||     |||||||    
T  1293123 aggaatattcca-atttgaatatcatcttagatgttgcaattactgcacttcagttatgttttcactattagga-ttgattacatcaagtacaagtctta 1293220  T
Q  306 caaatcatcctaagtg-aaacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||||| || ||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  1293221 caaataatactaagtgaaaacaaatggaacattctgatg 1293259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17838311 - 17838171
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  17838311 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 17838213  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  17838212 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 17838171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 254 - 326
Target Start/End: Original strand, 19917979 - 19918051
Alignment:
Q  254 tcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 326  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19917979 tcttcattattgtttcactattaggaattgattacatcaaatggatgtcttgcaaatcatcctaagtgaaaca 19918051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17828920 - 17828780
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||  |||  |||||||||    
T  17828920 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaaggctatgaacat 17828822  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  17828821 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 17828780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 53946724 - 53946492
Alignment:
Q  83 gtgacatggatatatatccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggatta-tgtcaaaaaggatattcaatgttcat 181  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |  ||||| |  | ||||||||||| | ||||| ||||||    
T  53946724 gtgacataaatatatgtccaggaaagtacatttgcatggatgtatc-agcaataaaggcttggacaagcaaaagtgtcaaaaagg-tgttcaaggttcat 53946627  T
Q  182 ttaagattatgaaca-ttgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttc-actattagga 279  Q
    | |||| |||||||| |||| || |||||||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||| | | ||||| ||||| |  ||| || |||| |||||    
T  53946626 tcaagactatgaacacttgaagttctaggaatattcca-aagaggatattatcttagatgttact-ttactgcacttcagttgtgtctctactagtagga 53946529  T
Q  280 tttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaa 318  Q
     ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  53946528 -ttgattacatcaaaa-gtagtcctacaaatcatcctaa 53946492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7847176 - 7847058
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||| |||| ||||  |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  7847176 tccagaaaagtacatttgcatggatctatcaacaaataaaggcatgaacaaggatctatgccaaa--ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 7847079  T
Q  198 tgatgtactaggaatattcca 218  Q
    | | |||||||||||||||||    
T  7847078 taaagtactaggaatattcca 7847058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16211530 - 16211376
Alignment:
Q  162 aaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcatt 261  Q
    ||||||| || ||||||||  ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||| | | ||||| ||||| |    
T  16211530 aaaggatctttaatgttcacctaagactatgaacattaaagtactaggaatattcca-atgagaatattatcctagatgttact-ttactgcacttcagt 16211433  T
Q  262 gttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggt-agtcttacaaatcatcctaa 318  Q
      ||||| ||||||| || ||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  16211432 tgtgttttactatta-gagttgattacatcaaaagttaagtcttacaaatcaacctaa 16211376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 218
Target Start/End: Original strand, 16629168 - 16629287
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  16629168 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 16629266  T
Q  198 tgatgtactaggaatattcca 218  Q
    | | |||||||||||||||||    
T  16629267 taaagtactaggaatattcca 16629287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 326
Target Start/End: Original strand, 26458170 - 26458232
Alignment:
Q  264 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 326  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26458170 tgtttcactattaggagttgattacatcaaataagagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 26458232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 341
Target Start/End: Original strand, 41525672 - 41525757
Alignment:
Q  255 cttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttga 341  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  41525672 cttcatttatgttttactattaggatttaattacatcaaatggatgtcttacaaatcatcctaagtaaaacaaat-gaacattttga 41525757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 314
Target Start/End: Original strand, 2829181 - 2829410
Alignment:
Q  83 gtgacatggatatatatccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggatta-tgtcaaaaaggatattcaatgttcat 181  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||  |||| | ||||||||| |  ||||| |  | ||||||||||| | ||||| ||||||    
T  2829181 gtgacataaatatatatccaggaaagtacaattacatggatgtatca-gtaataaaggcttggacaagcaaaagtgtcaaaaagg-tcttcaaggttcat 2829278  T
Q  182 ttaagattatgaaca-ttgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttc-actattagga 279  Q
    | |||| |||||||| |||| || ||||||||||| || ||| | |||| || ||||| |||| | | ||||| ||||| |  ||| || ||||||||||    
T  2829279 tcaagactatgaacacttgaagttctaggaatatttca-aagaggatattattctagaggttacttt-actgcacttcagttatgtctctactattagga 2829376  T
Q  280 tttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatc 314  Q
    || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  2829377 tt-gattacatcaaaaagtagtcttacaaatcatc 2829410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 17421568 - 17421506
Alignment:
Q  264 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 326  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17421568 tgtttcactattaggaattgattacatcaattacaagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 17421506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 296
Target Start/End: Original strand, 16472311 - 16472503
Alignment:
Q  102 aggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggatta-tgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaaca-ttg 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||| || ||||| |  | ||||||||||| | ||||| ||||||| |||| |||||||| |||    
T  16472311 aggaaagtacaattgcatggatggatc-agcaataaaggcttagacaagcaaaagtgtcaaaaagg-tcttcaaggttcattcaagactatgaacacttg 16472408  T
Q  200 atgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttc-actattaggatttgattagatcaaaag 296  Q
    | || |||||||||||||| ||| | |||| |||| ||| |||| | | ||||| ||||||| |||| || |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16472409 aagttctaggaatattcca-aagaggatattatcccagaggttact-ttactgcacttcatttttgtctctactattagga-ttgattacatcaaaag 16472503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 271 - 326
Target Start/End: Original strand, 30651390 - 30651445
Alignment:
Q  271 ctattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 326  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30651390 ctattagaatttgattacatcaaataagagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 30651445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 324
Target Start/End: Original strand, 16058066 - 16058126
Alignment:
Q  264 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaa 324  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||    | |||||||||||||||||| |||||    
T  16058066 tgttccactattaggatttgattacatcaaataagaatcttacaaatcatcctaattgaaa 16058126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 34)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Original strand, 42033759 - 42034098
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42033759 aagcagagatcagaaggttgttcttatgcaagccaagaatctcaagaactttgatcaagatcatgcaaggcacatgtgacatggatatatgtccaggaaa 42033858  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 207  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42033859 gtacatttgcatagatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtacta 42033958  T
Q  208 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatg----ttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  42033959 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaattaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattacatcagatggtagtct 42034058  T
Q  304 tacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  42034059 tacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 42034098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Original strand, 8539818 - 8540154
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8539818 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaataatctcaagaactttgatcaaggtcatgcaaggcatatgtgacatggatatatgtccaggaaa 8539917  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaa-aggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  8539918 gtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatataaggattatgtaaaaaaaggatattcaatgttaatttaagaccatgaacattgatgtact 8540017  T
Q  207 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  8540018 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttac 8540117  T
Q  307 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  8540118 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 8540154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Original strand, 21885881 - 21886216
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21885881 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagagtctcaagaactttgatcaagatcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccaggaaa 21885980  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21885981 gtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggtattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtacta 21886080  T
Q  208 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  21886081 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaaaatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 21886180  T
Q  308 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  21886181 aatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 21886216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Original strand, 8605057 - 8605393
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8605057 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaataatctcaagaactttgatcaaggtcatgcaaggcatatgtgacatggatatatgtccaggaaa 8605156  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaa-aggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  8605157 gtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatataaggattatgtaaaaaaaggatattcaatgttaatttaagaccatgaacattgatgtact 8605256  T
Q  207 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  8605257 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttaagtattaggatttgattacatcaaatggtagtcttac 8605356  T
Q  307 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  8605357 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 8605393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Original strand, 13964463 - 13964798
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||    
T  13964463 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaaaacaagaatctcaagaacattgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacattgatatatgtttaggaaa 13964562  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 207  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13964563 gtagatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatgcaaggattatgtcaaaaaggatactcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtacta 13964662  T
Q  208 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  13964663 ggaatattccacaagggaatatcatcctagaggttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattacatctaatggtagtcttaca 13964762  T
Q  308 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  13964763 aatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 13964798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Original strand, 2115568 - 2115903
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  2115568 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagagtctcaagaactttgatcaagatcatgcaaggcacatgtgacatgggaatatgtccaggaaa 2115667  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  2115668 gtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatataaaaggattatgttaaagaaggtattcaatgttcatttaagactatcaacattgatgtacta 2115767  T
Q  208 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  2115768 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaaaatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 2115867  T
Q  308 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  2115868 aatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 2115903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 30550098 - 30549763
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  30550098 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagagtctcaagaactttgatcaagatcatgcaagtcacatgtgacatgtgtatatgtccaggaaa 30549999  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30549998 gtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggtattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtacta 30549899  T
Q  208 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  30549898 ggaatattccacaagggaatatcatgctagatgttaaaatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 30549799  T
Q  308 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  30549798 aatcatcttaagtgaaacagatggaacattctgatg 30549763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Original strand, 25019035 - 25019371
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25019035 aagcagagattagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccaggaa 25019134  T
Q  107 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  25019135 agtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgaagtact 25019234  T
Q  207 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 306  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  25019235 aggaatatttcacaagggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttac 25019334  T
Q  307 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  25019335 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 25019371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 21458205 - 21458531
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21458205 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 21458304  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  21458305 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 21458404  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  21458405 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 21458504  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  21458505 aagtgaaacagatggaacattctgatg 21458531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Original strand, 16154450 - 16154786
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |     
T  16154450 aagcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccagaag 16154549  T
Q  107 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 206  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16154550 agtatatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagggttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 16154649  T
Q  207 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 306  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  16154650 aggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttac 16154749  T
Q  307 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  16154750 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 16154786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 2370900 - 2370565
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| || || ||||||    
T  2370900 aagcatagatcaaaaggttgttcttatacaagcccaaaatctcaagaacattgatcaaggtcatggaatgcacatgtgacatgaataaatgtcaaggaaa 2370801  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  2370800 gtacatttgcatggatcaatcaagcaataatggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatactcaatgttcatttaagactatgaacattgaagtacta 2370701  T
Q  208 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 307  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  2370700 gaaatattccaaaagggaatatcatcctagatgttaaaatcattgctcttcattgttttttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttata 2370601  T
Q  308 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  2370600 aatcatcataagtgaaacaaaaagaacattttgatg 2370565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Original strand, 18382930 - 18383264
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  18382930 aagcagagatcagaaagttgttcttacacaagccaagaatctcaagaacattgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggttaaatgtccaggaaa 18383029  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 207  Q
     |||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  18383030 atacatt-gcatagatcaatcaagcaataatggcatatacaaggattatgtcaaaaaagatattcaatgttcatttaagacaatgaacattgaagtacta 18383128  T
Q  208 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 307  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||    
T  18383129 gaaatattccaaaagggaatatcatcctagatgttaaattcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttaattacatcaaatgatagtcttaca 18383228  T
Q  308 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  18383229 aatcatcctaagtgaaacaaaaggaacgttctgatg 18383264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Original strand, 1968905 - 1969174
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  1968905 aagcagagatcagaaggttattcttatacaagccaagaatctcaagaacattgattaaggtcatgcaaggcacatgtgatatggatatatgtctaggaaa 1969004  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 207  Q
    |||||  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1969005 gtacaaattcatggatcaatcaagcaataaaggaatatacaaggattatgtcaaaaaagatacttaatgttcatttaagattatggacattgatgtacta 1969104  T
Q  208 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattag 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1969105 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattag 1969174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1186911 - 1186578
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||| || ||||||  ||| |||||||||||| ||||| ||| || | ||| |||    
T  1186911 aagcagatttcataaggttgttcttatgcaagcccagaaactcaagaacatt-atcaagaacatacaaggcacatgtaacatgaataaatgttcagtaaa 1186813  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 207  Q
    |||||||  |||| || |||||| |||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  1186812 gtacattatcatgtatcaatcaaacaataaagacatttacaagaataatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagactatgaacattgaagtacta 1186713  T
Q  208 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 307  Q
    | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  1186712 gaaatattcca-aagagaatatcatcctagatgttacaatctctgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattacatcaaatggaagtcttaca 1186614  T
Q  308 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||    
T  1186613 aatcatcataagtgaaacaaaaggaacattctgatg 1186578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18062712 - 18062378
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| || ||||||  ||||||||  | | |||||||| | | || |||||||||    
T  18062712 aagcagagttcaaaaggttgttcttatacaagcctagaatctcaagaacatt-atcaagaacatgcaagctatacgtgacatgaacaaatgtccaggaaa 18062614  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 207  Q
    |||||| | ||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18062613 gtacatctccatggatcaatgaagcaataaagacatttataaggttaatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagactatgaacattgaagtacta 18062514  T
Q  208 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 307  Q
      ||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  18062513 taaatattccaaaagggaatatcatcttatatgttaaaatcactgctcttcattgttgttccactgttagaatttgattacatcaaatggtagtcttaca 18062414  T
Q  308 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||| ||||||||||||||| | | |||||| |||||    
T  18062413 aataatcctaagtgaaacaaaagaaacattctgatg 18062378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 41544634 - 41544399
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  41544634 aagcaaagattagaaggttgttcttacacaaaccaagaatctcaagaacattgatcaaggtcatgcaagacacatgtgacatggatatatgtccacgaaa 41544535  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaa-gcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 206  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  41544534 gtacatttgcatggatctatcaaagcaacaaaggcatatacaaggactatgtcaaaaaggatgctcaatgttcatttaagactatgaacgttgatgtact 41544435  T
Q  207 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgtt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41544434 aggaatattccacaagggaatattatcctagatgtt 41544399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Original strand, 34822603 - 34822911
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| |||   ||  || ||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |  | ||| ||||||||||      
T  34822603 tcagaaggttgttcttatacaagcccagaagctcgtgaatatt-atcaagaacatgcaaggcacatgtgacatgaataaaggttcagtaaagtacattgt 34822701  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacatt-gatgtactaggaatatt 215  Q
    | ||||| |||||||||||||||| || ||||||  | |||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  34822702 cttggatcaatcaagcaataaaggaatttacaagattaatgtcaaaaaagatcttcattgttcatttaagactatgaacatttgaagtactaggaatatt 34822801  T
Q  216 ccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcc 315  Q
    | | ||| ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  34822802 cta-aagagaatatcatactagatgttacaaacactgcacttcattgttgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcc 34822900  T
Q  316 taagtgaaaca 326  Q
    |||||||||||    
T  34822901 taagtgaaaca 34822911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 337
Target Start/End: Original strand, 22956125 - 22956452
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    |||||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| || || ||||||    
T  22956125 aagcagagttcagaagggttctcttatacaagccaagaatctcaagaacatt-atcaagatcatgcaagtcacacgtgacatgaataaatgtctaggaaa 22956223  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 207  Q
    |||||||| |||| || |||||| ||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22956224 gtacattttcatgaatcaatcaaacaatagaggcatttacaaggttaatgtcaaaaaggatatttaaggttcatttaagactatgaacattgaagtacta 22956323  T
Q  208 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttca-ttgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 306  Q
     |||||||||| |   |||||||||||||||||||   |||||||| ||||| || |  |||||||||||||| ||| ||| ||||||    ||||||||    
T  22956324 agaatattcca-ataagaatatcatcctagatgttgcaatcactgcacttcagttatgttttcactattagga-ttgtttacatcaaatacaagtcttac 22956421  T
Q  307 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacatt 337  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22956422 aaatcatcctaagtgaaacaaatggaacatt 22956452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 225 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 41544386 - 41544268
Alignment:
Q  225 aatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaa 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41544386 aatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcagtgttgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaa 41544287  T
Q  325 catatggaacattttgatg 343  Q
    || |||||||||| |||||    
T  41544286 cagatggaacattctgatg 41544268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 22406761 - 22406646
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |     
T  22406761 aagcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgaccaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatacgtccagaag 22406662  T
Q  107 agtacatttgcatgga 122  Q
    ||||||||||||||||    
T  22406661 agtacatttgcatgga 22406646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 218
Target Start/End: Original strand, 21782349 - 21782468
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaaca-t 197  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| | ||||| ||||||| |||| ||| |||| |    
T  21782349 tccagtaaagtacatctacatggatcaatcaagcaataaaggcatttacaagaataatgtcaaaaagg-tcttcaaggttcattcaagactataaacact 21782447  T
Q  198 tgatgtactaggaatattcca 218  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  21782448 tgaagtactaggaatattcca 21782468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26193864 - 26193724
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  26193864 tccagtaaagtacatttgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 26193766  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    | | ||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||    
T  26193765 taaagtactaggaatattcca-atgagaatattatcctagatg 26193724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 69 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21821889 - 21821739
Alignment:
Q  69 catgcaaggcacatgtgacatggatata-tatccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaagga 167  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||| | | ||||| ||||||||| | | || || ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |     
T  21821889 catgcaacgtacatgtgacatgaataaaatgtccagtaaagtacatctacttgaatcaatcaagcaataaaggcatttacaagaataatgtcaaaaaag- 21821791  T
Q  168 tattcaatgttcatttaagattatgaaca-ttgatgtactaggaatattcca 218  Q
    | ||||| ||||||| |||| |||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  21821790 tcttcaaagttcattcaagactatgaagacttgaagtactaggaatattcca 21821739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Original strand, 20308505 - 20308645
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  20308505 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 20308603  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  20308604 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 20308645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Original strand, 25867917 - 25868057
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  25867917 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 25868015  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  25868016 taaggtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 25868057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 18097356 - 18097139
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacatt 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |  ||||||  ||||| |  ||||| ||| | || || ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18097356 tccaggaaagtacagttgcatggatcaatcaagaacttgaggcattcacaagaacaatgtctaaatg-atctttaatgttcatctaagactatgaacatt 18097258  T
Q  199 gatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgt---ttcactattaggatttgattagatcaaaa 295  Q
     | ||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||    ||||||| |||  | |||||   |||||||||| || |||| || |||||||    
T  18097257 aaagtactaggaatattcca-atgagaatattatcctagatgttgcattcactgcactt--tggttgtatcttcactatta-gaattgactacatcaaaa 18097162  T
Q  296 ggtagtcttacaaatcatcctaa 318  Q
    |  ||||||||||||||||||||    
T  18097161 gtaagtcttacaaatcatcctaa 18097139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 1989732 - 1989673
Alignment:
Q  267 ttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 326  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1989732 ttcactattaggatttgattacatcaaatacaagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 1989673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 52955535 - 52955473
Alignment:
Q  264 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52955535 tgtttcactattagaatttgattacatcaaataagagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 52955473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 1982314 - 1982255
Alignment:
Q  267 ttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 326  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1982314 ttcactattaggatttgattacatcaaatacaagtcttacaaatcattctaagtgaaaca 1982255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20328792 - 20328673
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||  |||||  |||||||||||  | |||||  |||||||||| |||| || |||||| || ||||| |||||||||    
T  20328792 tccagaaaagtacatatgcatgaatctatcaacaaataaaggcatggaaaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgtttatctaagactatgaacat 20328694  T
Q  198 tgatgtactaggaatattcca 218  Q
    | | |||||||||||||||||    
T  20328693 taaagtactaggaatattcca 20328673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Original strand, 20314189 - 20314329
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||| ||||| | |||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||| ||  |||| |||||||||    
T  20314189 tccagaaaattacatatacatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgtttatccaagactatgaacat 20314287  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  20314288 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 20314329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20318412 - 20318328
Alignment:
Q  154 tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    |||||||||||| || || |||||||||  |||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  20318412 tatgtcaaaaag-atctttaatgttcatccaagactatgaacattaaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 20318328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Original strand, 27065724 - 27065864
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaagg-attatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||  |||||  |||||||||||  |||||| | |||||| |||||||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  27065724 tccagaaaagtacatctacatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtc-aaaaggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 27065822  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    | | | |||| |||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  27065823 taaagcactaagaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 27065864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 326
Target Start/End: Original strand, 50940948 - 50941049
Alignment:
Q  224 gaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaa 323  Q
    ||||||||||||||||||||  |  | ||| |||| ||| ||||| |||||||  ||| | ||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  50940948 gaatatcatcctagatgttatgaaaattgcacttcgttgatgttttactattaaaattgg-ttacatcaaatggaagtcttacaaattatcctaagtgaa 50941046  T
Q  324 aca 326  Q
    |||    
T  50941047 aca 50941049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0690 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0690
Description:

Target: scaffold0690; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 4711 - 4376
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4711 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagaatcacaagaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatgtccaggaaa 4612  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  4611 gtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgtgcatttgagactatgaacattgatgtacta 4512  T
Q  208 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 307  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  4511 ggaatattccataagggaatatcatcctagatgttaaaatcactgctcttcattgtagtttcactattaagatttgattacatcaaatggtagtcttaca 4412  T
Q  308 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  4411 aatcatcctaagtgaaatagatggaacattctgatg 4376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 32)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Original strand, 29540025 - 29540360
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29540025 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaggtcatgcaaagcacatgtgacatggatatatgtccaggaaa 29540124  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29540125 gtacatttgcatggatcaatcaagcaataaagacatatacaagaattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtacta 29540224  T
Q  208 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 307  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  29540225 ggaatatcccacaagggaatatcatcctagatgttaacatcattactcttcattcttgtttcactattagaatttgattacatcaaatggtagtcttaca 29540324  T
Q  308 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  29540325 aatcatcctaagtgaaacaaatggaacattctgatg 29540360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Original strand, 14791170 - 14791506
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14791170 aagcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccaggaa 14791269  T
Q  107 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14791270 agtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 14791369  T
Q  207 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  14791370 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaaaatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttac 14791469  T
Q  307 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  14791470 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattatgatg 14791506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 12454630 - 12454956
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  12454630 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 12454729  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  12454730 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 12454829  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  12454830 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 12454929  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  12454930 aagtgaaacagatggaacattctgatg 12454956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24922494 - 24922158
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24922494 aagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggacatgcaaggcacatgtgacatagatatatgtccaggaa 24922395  T
Q  107 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24922394 agtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 24922295  T
Q  207 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 306  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  24922294 aggaatatttcacaagggaatatcatcctagatgttattattactgctcttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttac 24922195  T
Q  307 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  24922194 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 24922158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 16897523 - 16897849
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16897523 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 16897622  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  16897623 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 16897722  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||    
T  16897723 cacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgttcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcattct 16897822  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  16897823 aagtgaaacagatggaacattctgatg 16897849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 16908176 - 16908502
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16908176 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 16908275  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  16908276 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 16908375  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||    
T  16908376 cacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgttcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcattct 16908475  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  16908476 aagtgaaacagatggaacattctgatg 16908502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Original strand, 20911849 - 20912185
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |     
T  20911849 aagcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccagaag 20911948  T
Q  107 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 206  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20911949 agtacatttgcatgaatcaatcaagcaataaaggcatatacaagggttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 20912048  T
Q  207 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 306  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  20912049 aggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttac 20912148  T
Q  307 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  20912149 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 20912185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24931530 - 24931194
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24931530 aagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaatagtctcaagaactttgatcaaaggacatgcaaggcacatgtgacatagatatatgtccaggaa 24931431  T
Q  107 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24931430 agtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 24931331  T
Q  207 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 306  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  24931330 aggaatatttcacaagggaatatcatcctagatgttattattactgctcttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttac 24931231  T
Q  307 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  24931230 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 24931194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 31357137 - 31357463
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  31357137 tcagaaggtagttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacataaatatatgtccaggaaagtacatttg 31357236  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  31357237 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 31357336  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||    
T  31357337 cacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcagcct 31357436  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  31357437 aagtgaaacagatggaacattctgatg 31357463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 31366865 - 31367191
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  31366865 tcagaaggtagttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacataaatatatgtccaggaaagtacatttg 31366964  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  31366965 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 31367064  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||    
T  31367065 cacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcagcct 31367164  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  31367165 aagtgaaacagatggaacattctgatg 31367191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 18159638 - 18159964
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18159638 tcagaaggttattcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 18159737  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||     
T  18159738 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaatactatgaacattgatgtactaggaatattt 18159837  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||    
T  18159838 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcagcct 18159937  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  18159938 aagtgaaacagatggaacattctgatg 18159964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 18169450 - 18169776
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18169450 tcagaaggttattcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 18169549  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||     
T  18169550 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaatactatgaacattgatgtactaggaatattt 18169649  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||    
T  18169650 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcagcct 18169749  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  18169750 aagtgaaacagatggaacattctgatg 18169776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 343
Target Start/End: Original strand, 3285418 - 3285748
Alignment:
Q  14 agatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaag-gtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtaca 112  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3285418 agatcagaaggttgttcttaaaaaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaagtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccaggaaagtaca 3285517  T
Q  113 tttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaa-aaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaa 211  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3285518 tttgcatggatcaatcaagaaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaagga-attcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaa 3285616  T
Q  212 tattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatc 311  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  3285617 tatttcacaaggaaatatcatcctagatgttagttttactgctcttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatc 3285716  T
Q  312 atcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  3285717 atcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 3285748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 99 - 343
Target Start/End: Original strand, 18200876 - 18201119
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacatt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  18200876 tccaggaaagtacatttgcatggatcaataaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatatccaatgttcatttaagactatgaagatt 18200975  T
Q  199 gatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  18200976 gatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattacatc-aaaggt 18201074  T
Q  299 agtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  18201075 agtcttacaaatcatcctaagtgatacagatggaacattctgatg 18201119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 81 - 343
Target Start/End: Original strand, 14044956 - 14045217
Alignment:
Q  81 atgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttca 180  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044956 atgtgacatggatacttgtctaggaaag-atatttgcatcgatcaatcaagcaataaagacatatataagaattatgtcaaaaaggatattcaatgttca 14045054  T
Q  181 tttaagattatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggat 280  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  14045055 tttaagactatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgtttttcattgttgtttcactattaggat 14045154  T
Q  281 ttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  14045155 ttgattacatcaaaagatagtctcacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattatgatg 14045217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 69 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27788000 - 27787726
Alignment:
Q  69 catgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggat 168  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||| || | |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  27788000 catgcaaggcacacatgacatgaataaatgttcaggaaagtacacttgtatggatcaatcaagcaataaaggcatttacaaggttaatgtcaaaaaggat 27787901  T
Q  169 attcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgttt 268  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27787900 attcaatgttcatttaagactatgaacattgaagtactaggaatattccaaaagggaatatcatcctagatgttacaatcactgctcttcattgttgttt 27787801  T
Q  269 cactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  27787800 cactattaggatatgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaaggaacattctgatg 27787726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Original strand, 16320945 - 16321085
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || ||||||||| ||||| |||||||||    
T  16320945 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatgaacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatctaagactatgaacat 16321043  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    | | ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  16321044 taaagtactaggaatattcca-atgagaatatcatcctagatg 16321085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26021529 - 26021389
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  26021529 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 26021431  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  26021430 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 26021389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 224 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 9761732 - 9761632
Alignment:
Q  224 gaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaa 323  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||| ||||||  | | |||||||||||||||||||||||    
T  9761732 gaatatcatcctagatgttatacacactgcacttcattgatgttttactgttaagatttgattacatcaaatagaaatcttacaaatcatcctaagtgaa 9761633  T
Q  324 a 324  Q
    |    
T  9761632 a 9761632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 318
Target Start/End: Original strand, 1596091 - 1596309
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  1596091 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatgaacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatacaagactatgaacat 1596189  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaagg 297  Q
    | | |||||||||||||| || | | |||||| |||||||||| |    ||||||| ||||| |  ||| | ||||||||| |||||||| || |||||     
T  1596190 taaagtactaggaatatttca-atgagaatattatcctagatgatgcattcactgcacttcagttgtgtcttactattagg-tttgattacattaaaagt 1596287  T
Q  298 t-agtcttacaaatcatcctaa 318  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  1596288 taagtcttacaaatcaacctaa 1596309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 255 - 324
Target Start/End: Original strand, 28092398 - 28092467
Alignment:
Q  255 cttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaa 324  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| || |||||||||||||    
T  28092398 cttcattgatgtttcactattaggatttgattacatcaaatgagagtcttacacataatcctaagtgaaa 28092467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 240
Target Start/End: Original strand, 16333155 - 16333233
Alignment:
Q  161 aaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  16333155 aaaaggatctttaatgttcatctaagactatgaacattaaagtactaggaatattcca-atgagaatatcatcctagatg 16333233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 791582 - 791505
Alignment:
Q  162 aaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    ||||||| || |||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  791582 aaaggatctttaatgttcattcaagactatgaacattaaagtactaggaatattcca-atgagaatatcatcctagatg 791505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 8563487 - 8563405
Alignment:
Q  264 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatgtcc 346  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||     |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||    
T  8563487 tgtttcaatattaggatttgattacatcaattaagagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaaggaacattctgaagtcc 8563405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22223837 - 22223775
Alignment:
Q  264 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22223837 tgtttcactattaggatttgattacatcaattaaaagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 22223775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22249672 - 22249610
Alignment:
Q  264 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22249672 tgtttcactattaggatttgattacatcaattaaaagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 22249610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 314
Target Start/End: Original strand, 16923219 - 16923439
Alignment:
Q  92 atatatatccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggatta-tgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagatta 190  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||| |  ||||| |  | |||||||||| ||  |||| ||| ||| |||| ||    
T  16923219 atatatgtccaggaaagtacaattgcatggatgtatca-gcaataaaggcttggacaagcaaaagtgtcaaaaag-atcctcaaggttaattcaagacta 16923316  T
Q  191 tgaaca-ttgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttc-actattaggatttgattag 288  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||| ||| | |||| |||||||| |||| | | ||||| ||||| |  ||| || |||||||||||| |||||     
T  16923317 tgaacacttgaagttctaggaatattcca-aagaggatattatcctagaggttacttt-actgcacttcagttatgtctctactattaggatt-gattac 16923413  T
Q  289 atcaaaaggtagtcttacaaatcatc 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16923414 atcaaaaagtagtcttacaaatcatc 16923439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18712697 - 18712578
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaagg-attatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||| | |||||| |||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||    
T  18712697 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtc-aaaaggatctttaatgttcatctaagactatgaacat 18712599  T
Q  198 tgatgtactaggaatattcca 218  Q
    | |  ||||| ||||||||||    
T  18712598 taaactactatgaatattcca 18712578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24505825 - 24505686
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||  |||||  |||||| ||||  |||||||  ||||| ||||||||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  24505825 tccagaaaagtacatctgcatagatctatcaacaaataaaagcatggacaaggaactatgt-aaaaaggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 24505727  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagat 239  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||    
T  24505726 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagat 24505686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 318
Target Start/End: Original strand, 26161616 - 26161760
Alignment:
Q  173 aatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcact 272  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| | ||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| |    ||||||| ||||| |  ||||| |||    
T  26161616 aatgttcaatcaagactatgaacattaaagtactaggaatattcca-atgagaatataatcctagatgatgcattcactgcacttcagttgtgttttact 26161714  T
Q  273 attaggatttgattagatcaaaaggt-agtcttacaaatcatcctaa 318  Q
    |||| || ||||||| || ||||| | |||||||||||||| |||||    
T  26161715 atta-gagttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaa 26161760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30658573 - 30658341
Alignment:
Q  83 gtgacatggatatatatccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggatta-tgtcaaaaaggatattcaatgttcat 181  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||| |   |||| |  | ||||||||||| | ||||| ||||||    
T  30658573 gtgacataaatatatgtccaggaaagtacaattgcatggatgtatca-gcaataaaggcttgggcaagcaaaagtgtcaaaaagg-tcttcaaggttcat 30658476  T
Q  182 ttaagattatgaaca-ttgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttc-actattagga 279  Q
    | |||| |||||||| |||| || ||||||||||| || |  ||| ||| |||||||| |||| | | || || ||||| |  ||| || ||||||||||    
T  30658475 tcaagactatgaacacttgaagttctaggaatatttcatagagga-tattatcctagaggttacttt-accgcacttcagttgtgtctctactattagga 30658378  T
Q  280 tttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaa 318  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30658377 tt-gattacatcaaaag-tagtcttacaaatcatcctaa 30658341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 24361931 - 24361878
Alignment:
Q  273 attaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 326  Q
    ||||||||||||||| |||||     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24361931 attaggatttgattacatcaattaaaagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 24361878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 8 - 337
Target Start/End: Original strand, 7938 - 8267
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  7938 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaggtcatgcaagacacatgtgacatgggtatatgtccaggaaa 8037  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8038 gtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcataaacaaggattatgtcaaagaggttattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtacta 8137  T
Q  208 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  8138 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaaaatcactgctcttcataattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 8237  T
Q  308 aatcatcctaagtgaaacatatggaacatt 337  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8238 aatcatcctaagtgaaacagatggaacatt 8267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Original strand, 15416 - 15751
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15416 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaggtcatgcacggcatatgtgacatgggtatatgtccaggaaa 15515  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15516 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggaatatgtcaaagaggttattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgaacta 15615  T
Q  208 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 307  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15616 ggaatattccacaagggaacatcatcctagatgttaaaatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 15715  T
Q  308 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  15716 aatcatcctaagtgaaacaaatggaacattctgatg 15751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 93353 - 93018
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  93353 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagagtctaaagaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtctaggaaa 93254  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  93253 gtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacagggattatgtcaaagaggttattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtacta 93154  T
Q  208 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 307  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  93153 ggaatattccaaaagggaatatcatcctagatgttaaaatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatagtagtcttaca 93054  T
Q  308 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  93053 aatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 93018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Original strand, 14943875 - 14944210
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14943875 aagcagagatcggaaggtttttcctatacaggccaagaatctcaagaacattgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatctgtccaggaaa 14943974  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 207  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14943975 gtacatttgcatggatcaattaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatactcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtacta 14944074  T
Q  208 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 307  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  14944075 ggaacattccacaagggaatatcatcctatatgttaatataactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 14944174  T
Q  308 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  14944175 aatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 14944210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Original strand, 15371468 - 15371803
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  15371468 aagcagagatcggaaggtttttcctatacaggccaagaatctcaagaacattgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgtatatttgtccaggaaa 15371567  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 207  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15371568 gtacatttgcatggatcaattaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatactcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtacta 15371667  T
Q  208 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 307  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15371668 ggaacattccacaagggaatatcatcctatatgttaatataactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 15371767  T
Q  308 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  15371768 aatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 15371803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Original strand, 42620747 - 42621082
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||    
T  42620747 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagagtctcaagaactttgatcaagatcatgcaaggcacatgtgacatgagaatatgtccaggaaa 42620846  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||    
T  42620847 gtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatataaaaggattatgtaaaaaaagaaattcaatgttcatataagaatataaacattaatgtacta 42620946  T
Q  208 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  42620947 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaaaatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 42621046  T
Q  308 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  42621047 aatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 42621082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9535735 - 9535399
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9535735 aagcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaatagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccaggaa 9535636  T
Q  107 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9535635 agtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcattgttcatttaagactatgaacattgatgtact 9535536  T
Q  207 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 306  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  9535535 aggaatatttcacaagggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttac 9535436  T
Q  307 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  9535435 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 9535399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9546018 - 9545682
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9546018 aagcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccaggaa 9545919  T
Q  107 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9545918 agtacatttgcatggatcaatcaagaaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcattgttcatttaagactatgaacattgatgtact 9545819  T
Q  207 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 306  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  9545818 aggaatatttcacaagggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttac 9545719  T
Q  307 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  9545718 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 9545682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 19 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26348632 - 26348308
Alignment:
Q  19 agaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttgca 118  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26348632 agaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttgca 26348533  T
Q  119 tggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattcca 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26348532 tggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatatttca 26348433  T
Q  219 caagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaa 318  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26348432 caaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaa 26348333  T
Q  319 gtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||| |||||||||| |||||    
T  26348332 gtgaaacagatggaacattctgatg 26348308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 5382300 - 5381974
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  5382300 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 5382201  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  5382200 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 5382101  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  5382100 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 5382001  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  5382000 aagtgaaacagatggaacattctgatg 5381974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 5391938 - 5391612
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  5391938 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 5391839  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  5391838 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 5391739  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  5391738 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 5391639  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  5391638 aagtgaaacagatggaacattctgatg 5391612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 5926712 - 5927038
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  5926712 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 5926811  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  5926812 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 5926911  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  5926912 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 5927011  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  5927012 aagtgaaacagatggaacattctgatg 5927038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 8500626 - 8500952
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  8500626 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 8500725  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  8500726 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 8500825  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  8500826 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 8500925  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  8500926 aagtgaaacagatggaacattctgatg 8500952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 8511096 - 8511422
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  8511096 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 8511195  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  8511196 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 8511295  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  8511296 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 8511395  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  8511396 aagtgaaacagatggaacattctgatg 8511422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 46496691 - 46497017
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  46496691 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 46496790  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  46496791 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 46496890  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  46496891 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 46496990  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  46496991 aagtgaaacagatggaacattctgatg 46497017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 46507303 - 46507629
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  46507303 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 46507402  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  46507403 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 46507502  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  46507503 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 46507602  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  46507603 aagtgaaacagatggaacattctgatg 46507629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 17 - 342
Target Start/End: Original strand, 6544382 - 6544707
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  6544382 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 6544481  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  6544482 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 6544581  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  6544582 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 6544681  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgat 342  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||    
T  6544682 aagtgaaacagatggaacattctgat 6544707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 43983054 - 43983380
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  43983054 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 43983153  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  43983154 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 43983253  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||    
T  43983254 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcagcct 43983353  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  43983354 aagtgaaacagatggaacattctgatg 43983380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 342
Target Start/End: Original strand, 6534083 - 6534408
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  6534083 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 6534182  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  6534183 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactataaacattgatgtactaggaatattt 6534282  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  6534283 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 6534382  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgat 342  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||    
T  6534383 aagtgaaacagatggaacattctgat 6534408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 26363667 - 26363360
Alignment:
Q  19 agaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttgca 118  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26363667 agaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttgca 26363568  T
Q  119 tggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattcca 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26363567 tggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatatttca 26363468  T
Q  219 caagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaa 318  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26363467 caaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaa 26363368  T
Q  319 gtgaaaca 326  Q
    ||||||||    
T  26363367 gtgaaaca 26363360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 44896894 - 44897220
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  44896894 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtggtcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 44896993  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |     
T  44896994 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatactt 44897093  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  44897094 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 44897193  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  44897194 aagtgaaacagatggaacattctgatg 44897220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 44907297 - 44907623
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  44907297 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtggtcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 44907396  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |     
T  44907397 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatactt 44907496  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  44907497 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 44907596  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  44907597 aagtgaaacagatggaacattctgatg 44907623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Original strand, 32097947 - 32098283
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |     
T  32097947 aagcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatacgtccagaag 32098046  T
Q  107 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32098047 agtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagggttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 32098146  T
Q  207 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 306  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||    
T  32098147 aggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattgcatcaaatgatagtcttac 32098246  T
Q  307 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  32098247 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 32098283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Original strand, 32108384 - 32108720
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |     
T  32108384 aagcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatacgtccagaag 32108483  T
Q  107 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32108484 agtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagggttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 32108583  T
Q  207 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 306  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||    
T  32108584 aggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattgcatcaaatgatagtcttac 32108683  T
Q  307 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  32108684 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 32108720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 11626848 - 11626523
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  11626848 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 11626749  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  11626748 catg-atcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 11626650  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||    
T  11626649 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattgcatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 11626550  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  11626549 aagtgaaacagatggaacattctgatg 11626523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16132399 - 16132073
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  16132399 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacataaatatatgtccaggaaagtacatttg 16132300  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  16132299 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgacgtactaggaatattt 16132200  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
      ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  16132199 ttcaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 16132100  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  16132099 aagtgaaacagatggaacattctgatg 16132073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16142948 - 16142622
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  16142948 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacataaatatatgtccaggaaagtacatttg 16142849  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  16142848 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgacgtactaggaatattt 16142749  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
      ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  16142748 ttcaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 16142649  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  16142648 aagtgaaacagatggaacattctgatg 16142622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 14249034 - 14248719
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||| ||| | |||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||  ||| || |||| ||||    
T  14249034 aagcagagttcagaaggctattcttatataagcccagaaactcaagaacattgatcaagatcatgcaaggcacacgtgaaattaataaatgtccaagaaa 14248935  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  14248934 gtacatttgcatggatcaatcaagaaataaaggcatatacaagatttatgtcaaaaatgatactcaatgttcatttaagactatgaacattgaagtacta 14248835  T
Q  208 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 307  Q
      ||||||||| | | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  14248834 taaatattcca-aggagaatatcatcctagatgttacaatcactgctcttcattgttgtttcactataaggattcgattacatcaaatggtagtcttaca 14248736  T
Q  308 aatcatcctaagtgaaa 324  Q
    |||||||| ||||||||    
T  14248735 aatcatcccaagtgaaa 14248719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 2992409 - 2992074
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||| || ||||||   |||||||||||| |||||||| ||| ||   |||||||    
T  2992409 aagcagagttcagaatgttgttcttatacaagtccagaaactcaagaacatt-atcaagagtatgcaaggcacacgtgacatgaataaatgcgcaggaaa 2992311  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgt--caaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtac 205  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||    
T  2992310 gtaaacttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatttacaag-attaaattgcaaaaaggatattcaatgttcatttaagactatagacattgaagtac 2992212  T
Q  206 taggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtctta 305  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  2992211 taggaatatttcaaaagggaatatcatcctagatgttacaatcacttctcttcattgttgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtctta 2992112  T
Q  306 caaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
     |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||    
T  2992111 gaaatcatcctaaatgaaacaaaaggaacattctgatg 2992074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 9006474 - 9006808
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| ||| || ||||||  ||||||||| |||  ||||||| ||| || ||||  |||    
T  9006474 aagcagagttcagaagattgttcttataaaagcccagaatctcaagaacatt-atcaagaacatgcaaggtacacatgacatgaataaatgtccattaaa 9006572  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaaca-ttgatgtact 206  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||  ||||    
T  9006573 gtacattggcatggatcaatcaagcaataaaggtatttacaagattaatgtcaaaaaggatattcaatgttcattcaagactatgaacacttgaaatact 9006672  T
Q  207 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 306  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  9006673 agaaatattcca-aagagaatatcatcctagatgttgcaatcacttctcttcattgttgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttac 9006771  T
Q  307 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatgt 344  Q
    ||||| | |||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  9006772 aaatccttctaagtgaaacagat-gaacattatgatgt 9006808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 22964747 - 22964652
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccag 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22964747 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagagtctcaagaactttgatcaagatcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccag 22964652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 224 - 326
Target Start/End: Original strand, 33090976 - 33091078
Alignment:
Q  224 gaatatcatcctagatgtta-atatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtga 322  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  33090976 gaatatcatcctagatgttacatat-actgcacttcatcaatgtttcactattaggatttgattacatcaaatgagagtcttacaaatcatcctaagtga 33091074  T
Q  323 aaca 326  Q
    ||||    
T  33091075 aaca 33091078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 224 - 326
Target Start/End: Original strand, 40701709 - 40701811
Alignment:
Q  224 gaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaa 323  Q
    ||||||||| ||||||||||    |||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40701709 gaatatcattctagatgttatacacactgcacttcaatgatgtttcattattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaattatcctaagtgaa 40701808  T
Q  324 aca 326  Q
    |||    
T  40701809 aca 40701811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 346
Target Start/End: Original strand, 41027368 - 41027448
Alignment:
Q  266 tttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatgtcc 346  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  41027368 tttcactattaggatttgattacatcaaataagagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaatggaacattctgaagtcc 41027448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 264 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 15988915 - 15988833
Alignment:
Q  264 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatgtcc 346  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||    
T  15988915 tgtttcactattaggatttgattacatcaaataacagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaaggaacattctgaagtcc 15988833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24541247 - 24541107
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  24541247 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 24541149  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  24541148 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 24541107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 218
Target Start/End: Original strand, 45552832 - 45552951
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  45552832 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatcaaagactatgaacat 45552930  T
Q  198 tgatgtactaggaatattcca 218  Q
    | | |||||||||||||||||    
T  45552931 taaagtactaggaatattcca 45552951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 7034986 - 7034912
Alignment:
Q  269 cactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  7034986 cactataaggatttgattacatcaaatggtagtctaacaaattatcctaagtgaaatagatggaacattctgatg 7034912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 12827605 - 12827543
Alignment:
Q  264 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12827605 tgtttcactattaggatttgattacatcaaataagagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 12827543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 13286031 - 13285969
Alignment:
Q  264 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13286031 tgtttcactattaggatttgattacatcaaataagagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 13285969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 346
Target Start/End: Original strand, 42595179 - 42595261
Alignment:
Q  264 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatgtcc 346  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||    
T  42595179 tgtttcactattaggatttgattacatcaattaagagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaaggaacattctgaagtcc 42595261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 318
Target Start/End: Original strand, 27988150 - 27988368
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  | |||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||  |||||||||    
T  27988150 tccaggaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggataaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagcctatgaacat 27988248  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaagg 297  Q
    | | ||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| |    ||||||| ||||| |  ||| | ||||||||| |||||||| || |||||     
T  27988249 taaagtactaggaatattcca-atgagaatattatcctagatgatgcattcactgcacttcagttgtgtcttactattagg-tttgattacattaaaagt 27988346  T
Q  298 t-agtcttacaaatcatcctaa 318  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  27988347 taagtcttacaaatcaacctaa 27988368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 216
Target Start/End: Original strand, 19585411 - 19585528
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||||| || || |||||||||  |||| |||||||||    
T  19585411 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatgaacaaggaactatgtcaaaaag-atctttaatgttcatccaagactatgaacat 19585509  T
Q  198 tgatgtactaggaatattc 216  Q
    | | |||||||||||||||    
T  19585510 taaagtactaggaatattc 19585528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 326
Target Start/End: Original strand, 31824544 - 31824606
Alignment:
Q  264 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31824544 tgtttcactattaggatttgattacatcaattacaagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 31824606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 299 - 343
Target Start/End: Original strand, 12491146 - 12491190
Alignment:
Q  299 agtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  12491146 agtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 12491190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 12 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24696992 - 24696661
Alignment:
Q  12 agagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtac 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  24696992 agagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaagatcatgcaaggcacatgtgacatgggaatatgtccaggaaagtac 24696893  T
Q  112 atttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaa 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24696892 atttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggtattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaa 24696793  T
Q  212 tattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  24696792 tattccacaagggaatatcatcctagatgttaaaatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatc 24696693  T
Q  312 atcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  24696692 atcctaagtgaaacagaaggaacattctgatg 24696661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 2999099 - 2998773
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  2999099 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 2999000  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  2998999 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 2998900  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  2998899 cacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 2998800  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  2998799 aagtgaaacagatggaacattctgatg 2998773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 18650795 - 18651121
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18650795 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 18650894  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  18650895 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 18650994  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  18650995 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 18651094  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  18651095 aagtgaaacagatggaacattctgatg 18651121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 18662913 - 18663239
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18662913 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 18663012  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  18663013 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 18663112  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  18663113 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 18663212  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  18663213 aagtgaaacagatggaacattctgatg 18663239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Original strand, 45014301 - 45014635
Alignment:
Q  10 gcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaag 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||    
T  45014301 gcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccagtagag 45014400  T
Q  109 tacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactag 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45014401 tacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactag 45014500  T
Q  209 gaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaa 308  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  45014501 gaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaa 45014600  T
Q  309 atcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  45014601 atcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 45014635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 17 - 342
Target Start/End: Original strand, 4457772 - 4458097
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  4457772 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacataaatatatgtccaggaaagtacatttg 4457871  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  4457872 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 4457971  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  4457972 cacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 4458071  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgat 342  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||    
T  4458072 aagtgaaacagatggaacattctgat 4458097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 17 - 342
Target Start/End: Original strand, 4467397 - 4467722
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  4467397 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacataaatatatgtccaggaaagtacatttg 4467496  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  4467497 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 4467596  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  4467597 cacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 4467696  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgat 342  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||    
T  4467697 aagtgaaacagatggaacattctgat 4467722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 38958230 - 38957894
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  38958230 aagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgtaaggcacatgtgacatgggtatatgtccaggaa 38958131  T
Q  107 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38958130 agtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatgtacgaggattatgtcaaagaagacattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 38958031  T
Q  207 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 306  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  38958030 agaaatattccacaagggaatatcattctagatgttaaaatcaccgctcttcattattgtttcactattaggatttgattatatcaaatggtagtcttac 38957931  T
Q  307 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  38957930 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 38957894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9503163 - 9502837
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  9503163 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 9503064  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  9503063 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatattcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 9502964  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  9502963 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 9502864  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  9502863 aagtgaaacagatggaacattctgatg 9502837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9514529 - 9514203
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  9514529 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 9514430  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  9514429 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatattcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 9514330  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  9514329 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 9514230  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  9514229 aagtgaaacagatggaacattctgatg 9514203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5337537 - 5337212
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  5337537 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 5337438  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  5337437 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 5337338  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||    
T  5337337 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcagcct 5337238  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgat 342  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||    
T  5337237 aagtgaaacagatggaacattctgat 5337212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5347390 - 5347065
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  5347390 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 5347291  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  5347290 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 5347191  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||    
T  5347190 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcagcct 5347091  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgat 342  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||    
T  5347090 aagtgaaacagatggaacattctgat 5347065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Original strand, 45024378 - 45024712
Alignment:
Q  10 gcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaag 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||    
T  45024378 gcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaaatttgatcaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccagtagag 45024477  T
Q  109 tacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactag 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45024478 tacatttgcatggatcaatcaagcaataaagacatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactag 45024577  T
Q  209 gaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaa 308  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  45024578 gaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaa 45024677  T
Q  309 atcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  45024678 atcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 45024712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 38930895 - 38930558
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaa-gaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccagga 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  38930895 aagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccagga 38930796  T
Q  106 aagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtac 205  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38930795 aagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatgtacaaggattttgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtac 38930696  T
Q  206 taggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtctta 305  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  38930695 taggaatatttcacaagagaatatcatcctagatgttaaaatcattgctcttcattattgcttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtctta 38930596  T
Q  306 caaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  38930595 caaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 38930558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 8 - 337
Target Start/End: Original strand, 17488257 - 17488587
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |     
T  17488257 aagcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaattttgatcaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatacgtccagaag 17488356  T
Q  107 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17488357 agtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagggttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 17488456  T
Q  207 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 306  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  17488457 aggaatatttcacaaagaaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttac 17488556  T
Q  307 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacatt 337  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17488557 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacatt 17488587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 72626 - 72294
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||  | ||||||  ||||||||| |||  ||||||| ||| || ||||| |||    
T  72626 aagcagagttcaaaaggttgttcttatacaagcccagaatctcaagaacaat-atcaagaacatgcaaggtacacatgacatgaataaatgtccagtaaa 72528  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggatta-tgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaaca-ttgatgtac 205  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  72527 gtacattggcatggatcaatcaagcaataaagacatttaca-ggattaatgtcaaagaaaatattcaatgttcatttaagattatgaacacttgaagtac 72429  T
Q  206 taggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtctta 305  Q
    |||| ||||| || ||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  72428 tagggatatttca-aagagaatatcatcttagatgttgcaatcactgctcttcgttgctgtttcactattaggatttaattacatcaaatggtagtctta 72330  T
Q  306 caaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgat 342  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  72329 caaatcattctaagtgaaacaaat-gaacattttgat 72294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 174 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 44639270 - 44639102
Alignment:
Q  174 atgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcacta 273  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  44639270 atgttcatttaagactatgaacattgatttaataggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctctatattgttgtttaacta 44639171  T
Q  274 ttaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
     ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||    
T  44639170 ctaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcttaagtgaaaca-aaggaacattctgatg 44639102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 44639409 - 44639277
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44639409 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagattctcaagaacattgatcaaggtcatccaaggcacatgtgatatggatatatgtccaggaaa 44639310  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaagg 140  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44639309 gtacatttgcatggatcaatcaagcaataaagg 44639277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 196 - 343
Target Start/End: Original strand, 29423126 - 29423268
Alignment:
Q  196 attgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaa 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     ||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  29423126 attgatgtactaggaatattccacaaggaaatatcat-----atgttaatatcactcttctttattattgtttcactattaggatttgattacatcaaat 29423220  T
Q  296 ggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  29423221 ggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 29423268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 24239639 - 24239418
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||             ||||||| ||  ||||||||| | | || ||||| |||    
T  24239639 aagcagaggtcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaac-------------atgcaagtcatttgtgacatgaaaaaatgtccagaaaa 24239553  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatc-aagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtac 205  Q
    | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || || | |  |||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||| || |    
T  24239552 gaacatttgcatggatcaatcaaagcaataaaggcatttataaagttaaatgtaaaaaaggatattcaatgttca-tcaagactatgaaaattgaagtgc 24239454  T
Q  206 taggaatattccacaagggaatatcatcctagatgtt 242  Q
    | ||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  24239453 tgggaatattcca-atgagaatatcatcctagatgtt 24239418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 312
Target Start/End: Original strand, 12570221 - 12570433
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  ||||||| |||  |||||||  |||||||||| |||| || ||||||||| ||||| |||||||||    
T  12570221 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaagacatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatataagactatgaacat 12570319  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaagg 297  Q
    | | ||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||    ||||||| ||||| |  ||||| ||||||| || ||||||| || |||||     
T  12570320 taaagtactaggaatattcca-atgagaatattatcctagatgttgcattcactgcacttcagttgtgttttactatta-gagttgattacattaaaagt 12570417  T
Q  298 t-agtcttacaaatca 312  Q
    | ||||||||||||||    
T  12570418 taagtcttacaaatca 12570433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 264 - 346
Target Start/End: Original strand, 19342105 - 19342187
Alignment:
Q  264 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatgtcc 346  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||    
T  19342105 tgtttcactattaggatttgattacatcaaataagagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaaggaacattctgaagtcc 19342187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 264 - 346
Target Start/End: Original strand, 23721735 - 23721817
Alignment:
Q  264 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatgtcc 346  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||    
T  23721735 tgtttcactattaggatttgattacatcaaataagagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaaggaacattatgaagtcc 23721817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 224 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 40409318 - 40409216
Alignment:
Q  224 gaatatcatcctagatgtta-atatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtga 322  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||| | |||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||| |  ||||||||||||| ||||||||||    
T  40409318 gaatatcatcctagatgttacacat-actacacttcattgatgtttcactattagagtttgattacatcaaatgagagtcttacaaatcttcctaagtga 40409220  T
Q  323 aaca 326  Q
    ||||    
T  40409219 aaca 40409216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22688092 - 22687952
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  22688092 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcataaaagactatgaacat 22687994  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    | | ||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||    
T  22687993 taaagtactaggaatattcca-atgagaatattatcctagatg 22687952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 346
Target Start/End: Original strand, 22901908 - 22901990
Alignment:
Q  264 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatgtcc 346  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||| ||||    
T  22901908 tgtttcactattaggatttgattacatcaaataagagtcttacaaatcatcctaactgaaacaaaaggaacattctgaagtcc 22901990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Original strand, 45190472 - 45190612
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  45190472 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 45190570  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  45190571 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 45190612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 264 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22909030 - 22908957
Alignment:
Q  264 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacatt 337  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  22909030 tgtttcattattaggatttgattacatcaaataagagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaaggaacatt 22908957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Original strand, 573895 - 574035
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||| ||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  573895 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaagcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 573993  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  573994 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 574035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16934711 - 16934571
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  16934711 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatgaacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 16934613  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    | | |||||||||||||| || | | |||||| ||||||||||    
T  16934612 taaagtactaggaatatttca-atgagaatattatcctagatg 16934571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17005371 - 17005231
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  17005371 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatgaacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 17005273  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    | | |||||||||||||| || | | |||||| ||||||||||    
T  17005272 taaagtactaggaatatttca-atgagaatattatcctagatg 17005231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 218
Target Start/End: Original strand, 15940399 - 15940462
Alignment:
Q  155 atgtcaaaaagg-atattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattcca 218  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15940399 atgtcaaaaagggatattcaatgttcatc-aagactatgaacattgaagtgctaggaatattcca 15940462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 218
Target Start/End: Original strand, 24942578 - 24942681
Alignment:
Q  115 tgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaata 213  Q
    |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  24942578 tgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagattatgaacattaaagtactaggaaaa 24942676  T
Q  214 ttcca 218  Q
    |||||    
T  24942677 ttcca 24942681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16135385 - 16135335
Alignment:
Q  264 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatc 314  Q
    ||||||||| |||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  16135385 tgtttcactgttaggattcgattgcatcaaatggtagtcttacaaatcatc 16135335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 314
Target Start/End: Original strand, 16327821 - 16327886
Alignment:
Q  249 actgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatc 314  Q
    ||||| |||||| | ||||||||| || ||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  16327821 actgcacttcatcgatgtttcactgttgggattcgattgcatcaaatggtagtcttacaaatcatc 16327886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 791304 - 791640
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||||    
T  791304 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaatcatgcaaggcacatgtgatacgggaatatgtccaggaaa 791403  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  791404 gtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggtattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtacta 791503  T
Q  208 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  791504 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaaaatctctgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 791603  T
Q  308 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatgt 344  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  791604 aatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatgt 791640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 12 - 343
Target Start/End: Original strand, 7757335 - 7757666
Alignment:
Q  12 agagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtac 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  7757335 agagatcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaacattgatcaaggtcatgcaaggcacatgagacatggatatatgtctaggaaagtac 7757434  T
Q  112 atttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaa 211  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  7757435 atttgcatggatcaatcaagcaataaagacatatacaagaattatgtcaaaaaggatactcaatgttcatttaagactatgaactttgatgtactaggaa 7757534  T
Q  212 tattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  7757535 tattccacaagggaatatcatcctagatattaatatcattgctcttcattgtcgtttcactattagtatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatc 7757634  T
Q  312 atcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  7757635 atcctaagtaaaacagatggaacattctgatg 7757666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9325518 - 9325192
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  9325518 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 9325419  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  9325418 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 9325319  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  9325318 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 9325219  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  9325218 aagtgaaacagatggaacattctgatg 9325192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21203296 - 21202970
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21203296 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 21203197  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  21203196 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 21203097  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  21203096 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 21202997  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  21202996 aagtgaaacagatggaacattctgatg 21202970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21213712 - 21213386
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21213712 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 21213613  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  21213612 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 21213513  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  21213512 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 21213413  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  21213412 aagtgaaacagatggaacattctgatg 21213386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 21333875 - 21334201
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21333875 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 21333974  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  21333975 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 21334074  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  21334075 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 21334174  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  21334175 aagtgaaacagatggaacattctgatg 21334201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Original strand, 17268409 - 17268744
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||     
T  17268409 aagcagagatcagaaaattgttcttatacaagtcaagaatctcaagaacattgatcaagatcatgcaaggcacatgtgatatggataaatttccaggaag 17268508  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  17268509 gtacatttgcatggatcaatcaagcaacaaaggcatatacaaagattatgtcaaaaaggatactcaatgttcatttaagactatgaacattgaagtactg 17268608  T
Q  208 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 307  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  17268609 ggaatattccaaaagggaatatcatcctagatgttgaagtcactgctcttcattgttgtttcattattaggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 17268708  T
Q  308 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  17268709 aatcatcctaagtgaaacaaaaggaacattctgatg 17268744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21997956 - 21997630
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21997956 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaagatcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 21997857  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  21997856 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 21997757  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  21997756 cacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattactgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 21997657  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  21997656 aagtgaaacagatggaacattctgatg 21997630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21988422 - 21988096
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21988422 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaagatcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 21988323  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  21988322 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 21988223  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  21988222 cacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattactgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 21988123  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||    
T  21988122 atgtgaaacagatggaacattctgatg 21988096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 2690781 - 2690448
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||| || || ||   |||||||| |||| |||||||| |||  ||||||| |||    
T  2690781 aagcagagttcagaaggttggtcttatacaagccaagaaactcaagaacatt-ataaaaaacatgcaagtcacacgtgacatgaataagtatccagaaaa 2690683  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 207  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| || ||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  2690682 gtacaattgcatggatcaatcaagcaatagaggtatttacaaagttaatgtcaaagaggatattcaatgttcattttagactatgaacattgaagtacta 2690583  T
Q  208 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttca-ttgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 306  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| || |  |||||||||||||| ||||||| | ||||    ||||||||    
T  2690582 ggaatattcca-atgagaatatcatcctagatattacaatcactgcacttcagttatattttcactattagga-ttgattacaccaaatacaagtcttac 2690485  T
Q  307 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  2690484 aaatcatcctaagtgaaacaaatgaaacattctgatg 2690448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 69 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 5867821 - 5867569
Alignment:
Q  69 catgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattat-gtcaaaaagga 167  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||| ||  |||| ||||||||||   | |||| ||||||| ||||||||||| |  | ||||||  |||||||||||    
T  5867821 catgcaaggcacacgtaacatgaataaatg-ccagtaaagtacattgagaaggatcaatcaaggaataaaggcattttta-ggattaaagtcaaaaagga 5867724  T
Q  168 tattcaatgttcatttaagattatgaacatt-gatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgt 266  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||  | | |||||||||||||| ||||  | || ||| |||||| | |||    
T  5867723 tcttcaatgttcatttaagactatgaacatttgaagtactaggaatattccaataag-aatatcatcctagacgttacaaacattgcccttcatcgatgt 5867625  T
Q  267 ttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtga 322  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  5867624 ttcactattaggatttgattacattaaatgagagtcttacaaatcatcctaagtga 5867569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 186
Target Start/End: Original strand, 20098382 - 20098559
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| | | ||  |||| ||| |  ||||||  |||||||||||||  ||||||| ||| || |||||||||    
T  20098382 aagcagagttaagaaggttgttcttatacaagcccataaaatcaagaacatc-atcaagagcatgcaaggcacacatgacatgaataaatgtccaggaaa 20098480  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaag 186  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20098481 gtacacttgcatggatcaatcaagcaataaaagcatttacaagattaatgtcaaaaaagatattcaatgttcatttaag 20098559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 326
Target Start/End: Original strand, 37295701 - 37295762
Alignment:
Q  265 gtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37295701 gtttcactattaggatttgattatatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 37295762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 250 - 326
Target Start/End: Original strand, 37816670 - 37816746
Alignment:
Q  250 ctgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 326  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37816670 ctgcacttcattgatgtttcactattagaatttgattacatcaaatgagagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 37816746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Original strand, 13673889 - 13674029
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  13673889 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 13673987  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  13673988 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 13674029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14882111 - 14881971
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  14882111 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 14882013  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  14882012 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 14881971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14894461 - 14894321
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  14894461 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 14894363  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  14894362 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 14894321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 255 - 324
Target Start/End: Original strand, 18536406 - 18536475
Alignment:
Q  255 cttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaa 324  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18536406 cttcattgatgtttcactattagaatttgattacatcaaatgagagttttacaaatcatcctaagtgaaa 18536475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 326
Target Start/End: Original strand, 14437096 - 14437259
Alignment:
Q  170 ttcaatgttcatttaagattatgaaca-ttgatgtac-------taggaatattcca-caagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcat 260  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||       ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||  |    |||| ||||||    
T  14437096 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacattaggaatattccatcaag--aatatcatcctagatgtttttcatgctgcacttcat 14437193  T
Q  261 tgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 326  Q
       |||||||||||||||||||||||| |||||     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14437194 aaatgtttcactattaggatttgattacatcaattacaagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 14437259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 20531742 - 20531525
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaagga-ttatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||| || ||||||||||   ||| || |||||||| | ||||||||||||||    
T  20531742 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatgaacaaagaattatgtcaaat--gatctttaatgttcaatcaagattatgaacat 20531645  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaagg 297  Q
    | | ||| ||||||||||| | | | |||||| |||||||||| |    ||||||| ||||| |  ||||| ||||||||| |||||||| || |||||     
T  20531644 taaagtattaggaatattcta-atgagaatattatcctagatgatgcattcactgcacttcagttgtgttttactattagg-tttgattacattaaaagt 20531547  T
Q  298 t-agtcttacaaatcatcctaa 318  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  20531546 taagtcttacaaatcaacctaa 20531525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 31999664 - 31999524
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaagg-attatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||| | |||||| |||||||| || |||||||||| |||| |||||||||    
T  31999664 tccagaaaagttcatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtc-aaaaggatctttaatgttcattcaagactatgaacat 31999566  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    | | |||||| |||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  31999565 taaagtactaagaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 31999524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 33774555 - 33774415
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  | |||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  33774555 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaagtaaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 33774457  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  33774456 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 33774415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 26362603 - 26362544
Alignment:
Q  267 ttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 326  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26362603 ttcactattaggatttgattacatcaattacaagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 26362544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 31991866 - 31991744
Alignment:
Q  96 atatccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaa 194  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||  |||||  |||||| ||||  | |||||  |||||||||| |||| || |||||||||| |||| ||||||    
T  31991866 atatccagaaaagttcatctgcatggatctatcaacaaataaatgcatggaaaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcattcaagactatgaa 31991768  T
Q  195 cattgatgtactaggaatattcca 218  Q
    |||| | |||||||||||||||||    
T  31991767 cattaaagtactaggaatattcca 31991744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 12841719 - 12841689
Alignment:
Q  296 ggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12841719 ggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 12841689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 39)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 11 - 342
Target Start/End: Original strand, 22244285 - 22244616
Alignment:
Q  11 cagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||    
T  22244285 cagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaacactgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgatatgaatatatgtccaggaaatta 22244384  T
Q  111 catttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactagga 210  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22244385 catttgcatggatcaatcaatcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatactcaatgttcatttaagactatggacattgatgtactagga 22244484  T
Q  211 atattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaat 310  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  22244485 atattccacaaggaaatatcatcctaaatgttaatatcactgctcttcgtttttgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaat 22244584  T
Q  311 catcctaagtgaaacatatggaacattttgat 342  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22244585 catcctaagtgaaacagatggaacattctgat 22244616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 18360854 - 18361180
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18360854 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 18360953  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  18360954 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 18361053  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  18361054 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 18361153  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  18361154 aagtgaaacagatggaacattctgatg 18361180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 21753020 - 21753346
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21753020 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 21753119  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  21753120 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 21753219  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  21753220 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 21753319  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  21753320 aagtgaaacagatggaacattctgatg 21753346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 21762307 - 21762633
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21762307 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 21762406  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  21762407 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 21762506  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  21762507 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 21762606  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  21762607 aagtgaaacagatggaacattctgatg 21762633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 33938894 - 33939220
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  33938894 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 33938993  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  33938994 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 33939093  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  33939094 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 33939193  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  33939194 aagtgaaacagatggaacattctgatg 33939220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 33949294 - 33949620
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  33949294 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 33949393  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  33949394 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 33949493  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  33949494 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 33949593  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  33949594 aagtgaaacagatggaacattctgatg 33949620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Original strand, 27411715 - 27412051
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |     
T  27411715 aagcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccagaag 27411814  T
Q  107 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27411815 agtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagggttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 27411914  T
Q  207 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 306  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  27411915 aggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttac 27412014  T
Q  307 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  27412015 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 27412051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 18389811 - 18390137
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18389811 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 18389910  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  18389911 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 18390010  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||    
T  18390011 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttagaaatcatcct 18390110  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  18390111 aagtgaaacagatggaacattctgatg 18390137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26192485 - 26192159
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  26192485 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaaactcaagaactgtgatcaaggccatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 26192386  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  26192385 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 26192286  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  26192285 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 26192186  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  26192185 aagtgaaacagatggaacattctgatg 26192159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26203089 - 26202763
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  26203089 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaaactcaagaactgtgatcaaggccatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 26202990  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  26202989 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 26202890  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  26202889 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 26202790  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  26202789 aagtgaaacagatggaacattctgatg 26202763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Original strand, 32070007 - 32070343
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |     
T  32070007 aagcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccagaag 32070106  T
Q  107 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 206  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32070107 agtacatttgcatggaacaatcaaacaataaaggcatatacaagggttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 32070206  T
Q  207 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 306  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  32070207 aggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttac 32070306  T
Q  307 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  32070307 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 32070343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 8765849 - 8765523
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  8765849 tcagaaggttgctcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 8765750  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||     
T  8765749 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttcagactatgaacattgatgtactaggaacattt 8765650  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  8765649 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 8765550  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  8765549 aagtgaaacagatggaacattctgatg 8765523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 11411592 - 11411267
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||     
T  11411592 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccagaaaagtacattta 11411493  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||     
T  11411492 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgt-ctagtaatattt 11411394  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  11411393 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 11411294  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  11411293 aagtgaaacagatggaacattctgatg 11411267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Original strand, 31104981 - 31105315
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||| | ||||||| || ||| || || |||  ||||||||| ||| |||||||| ||| || ||||| |||    
T  31104981 aagcagagttcataaggttgttcttatgcaagcctagaatctgaagaacatt-ataaagaacatgcaaggtacacgtgacatgaataaatgtccagtaaa 31105079  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 207  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||    
T  31105080 gtacattggtatggatcaatcaagcaataaagtcatttacaagattaatgccaaaaaggatattcaatgttcatttaagactatgaacattgaagtgcta 31105179  T
Q  208 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 307  Q
    ||| ||||||| || |||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  31105180 ggattattccaaaaaggaatatcatcctagatgtataaatcactactcttcattgttgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 31105279  T
Q  308 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  31105280 aatcatcctaagtgaaacaaaaggaacattctgatg 31105315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 23379071 - 23378741
Alignment:
Q  12 agagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtac 111  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| | |||| ||||| ||| || ||||||  |||||||| ||||  |||| || ||| || ||  | |||||||    
T  23379071 agagctcagaaggttgtccttatacaagcctagaaactcaagaacatt-atcaagaacatgcaagacacacatgacttgaataaatttcaggtaaagtac 23378973  T
Q  112 atttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaa 211  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  23378972 atttgcatcgatcaatcaagcaataaagacaattacaaggttaatgtcaaaaaggatattcgatgttcatttaagactatgaacattaaagtactaggaa 23378873  T
Q  212 tattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatc 311  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  23378872 tattcaaaaagggaatatcatcctagatgttacattcactgctcttcattgttgtttcactattacgatttgattacatcaaatggaagtcttacaaatc 23378773  T
Q  312 atcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||| |||||| | ||| |||| |||||    
T  23378772 atcctaagagaaacaaaaggaccattctgatg 23378741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21484518 - 21484192
Alignment:
Q  16 atcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacattt 115  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||| || || |||  ||| |||  ||| ||||||||| ||| || || || ||||||| |||    
T  21484518 atcagaaggttgttcttaaataagccaagaatctcaagaacatt-ataaagaacatacaactcacttgtgacatgaataaatgtctagaaaagtacgttt 21484420  T
Q  116 gcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatatt 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21484419 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatttacaaggttaatgtaaaaaaggatatgcaatgttcatttaagactatgaacattgaagtactgggaatatt 21484320  T
Q  216 ccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttca-ttgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatc 314  Q
    ||| | | |||||||||| ||||||||   |||||| | ||||| || |  |||||||||||||| ||||||| ||||||    ||||||||||||||||    
T  21484319 cca-atgagaatatcatcttagatgttgcaatcactccacttcagttatgttttcactattagga-ttgattacatcaaatacaagtcttacaaatcatc 21484222  T
Q  315 ctaagtg-aaacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||| ||| ||||| |||||||||| |||||    
T  21484221 ctaggtgaaaacaaatggaacattctgatg 21484192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 30944406 - 30944266
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  30944406 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 30944308  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  30944307 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 30944266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 30953828 - 30953688
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  30953828 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 30953730  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  30953729 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 30953688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37299435 - 37299295
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  37299435 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 37299337  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  37299336 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 37299295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37549225 - 37549085
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  37549225 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 37549127  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  37549126 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 37549085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 318
Target Start/End: Original strand, 31916447 - 31916665
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  31916447 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 31916545  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaagg 297  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||| |    ||||||| ||||| |  ||| | ||||||||| |||||||| || |||||     
T  31916546 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatgatgcattcactgcacttcagttgtgtcttactattagg-tttgattacattaaaagt 31916643  T
Q  298 t-agtcttacaaatcatcctaa 318  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  31916644 taagtcttacaaatcaacctaa 31916665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 218
Target Start/End: Original strand, 20896588 - 20896707
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaaca-t 197  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||| | | ||||| ||||||| |||| |||||||| |    
T  20896588 tccagtaaagtacatctacatggatcaatcaagcaataaagacatttacaagaataatgtcaaaaaag-tcttcaaggttcattcaagactatgaacact 20896686  T
Q  198 tgatgtactaggaatattcca 218  Q
    ||| |||||||||| ||||||    
T  20896687 tgaagtactaggaaaattcca 20896707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 4038594 - 4038382
Alignment:
Q  105 aaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||| | ||    
T  4038594 aaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacattaaagt 4038496  T
Q  204 actaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggt-agtc 302  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||| |    ||||||| ||||| |  | | ||||||||||| |||||||| || ||||| | ||||    
T  4038495 actaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatgatgcattcactgcacttcagttgtatctcactattagg-tttgattacattaaaagttaagtc 4038398  T
Q  303 ttacaaatcatcctaa 318  Q
    |||||||||| |||||    
T  4038397 ttacaaatcaacctaa 4038382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13572300 - 13572183
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  13572300 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 13572202  T
Q  198 tgatgtactaggaatattc 216  Q
    | | |||||||||||||||    
T  13572201 taaagtactaggaatattc 13572183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 19548715 - 19548653
Alignment:
Q  264 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19548715 tgtttcactattaggatttgattacatcaaataagagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 19548653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27274801 - 27274661
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  27274801 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 27274703  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||    
T  27274702 taaagtactaggaatattcca-aagagaatactatcctagatg 27274661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37652023 - 37651883
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||| ||||  |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  37652023 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaatgcatggacaaggatctatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 37651925  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  37651924 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 37651883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22173864 - 22173730
Alignment:
Q  105 aaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||| | ||    
T  22173864 aaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacattaaagt 22173766  T
Q  204 actaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  22173765 actaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 22173730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 326
Target Start/End: Original strand, 36316170 - 36316246
Alignment:
Q  250 ctgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 326  Q
    |||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36316170 ctgcacttcatcgatgttccactattaggatttgattacatcaaataagagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 36316246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18210426 - 18210313
Alignment:
Q  105 aaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||| | ||    
T  18210426 aaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacattaaagt 18210328  T
Q  204 actaggaatattcca 218  Q
    |||||||||||||||    
T  18210327 actaggaatattcca 18210313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18219764 - 18219651
Alignment:
Q  105 aaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||| | ||    
T  18219764 aaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacattaaagt 18219666  T
Q  204 actaggaatattcca 218  Q
    |||||||||||||||    
T  18219665 actaggaatattcca 18219651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19888974 - 19888834
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  19888974 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatgaacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 19888876  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    | | |||||||||||||| || | | |||||| ||||||||||    
T  19888875 taaagtactaggaatatttca-atgagaatattatcctagatg 19888834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 218
Target Start/End: Original strand, 21681284 - 21681397
Alignment:
Q  105 aaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||| | ||    
T  21681284 aaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacattaaagt 21681382  T
Q  204 actaggaatattcca 218  Q
    |||||||||||||||    
T  21681383 actaggaatattcca 21681397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 34131111 - 34130892
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || ||| |||||  || | |||||||||    
T  34131111 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatattcatccaaaactatgaacat 34131013  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaagg 297  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||| |    ||||||||||||| |  | | | ||||||||| ||| |||| || |||||     
T  34131012 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatgatgcattcactgctcttcagttgtatcttactattaggtttttattacattaaaagt 34130914  T
Q  298 t-agtcttacaaatcatcctaa 318  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  34130913 taagtcttacaaatcaacctaa 34130892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 218
Target Start/End: Original strand, 20763995 - 20764113
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaagg-attatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||| | |||||| |||||||| || ||||||||| |||||  ||||||||    
T  20763995 tccagaaaagtacatatgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtc-aaaaggatctttaatgttcatctaaga-catgaacat 20764092  T
Q  198 tgatgtactaggaatattcca 218  Q
    | | |||||||||||||||||    
T  20764093 taaagtactaggaatattcca 20764113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20905134 - 20905033
Alignment:
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaaca-ttgatgtactaggaatatt 215  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||| | | ||||| ||||||| |||| |||||| | |||| |||||| |||||||    
T  20905134 catggatcaataaagcaataaaggcatttacaagaataatgtcaaaaaag-tcttcaaggttcattcaagactatgaaaacttgaagtactaagaatatt 20905036  T
Q  216 cca 218  Q
    |||    
T  20905035 cca 20905033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 205926 - 205879
Alignment:
Q  270 actattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaa 318  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  205926 actattaggatt-gattacatcaaaaagtagtcttacaaatcatcctaa 205879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Original strand, 37817233 - 37817375
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaa-ggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgtt-catttaagattatgaac 195  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||| |||||  |||||||| |||||||||| |||| || |||||| |||  |||| |||||||    
T  37817233 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaaggcatggacaaggatctatgtcaaaa-ggatctttaatgtttcatccaagactatgaac 37817331  T
Q  196 attgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    ||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  37817332 attaaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 37817375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 42091074 - 42090995
Alignment:
Q  162 aaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgtt 242  Q
    ||||||| || |||||||||| || | ||||| |||| | ||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||    
T  42091074 aaaggatctttaatgttcattcaatactatgatcattaaagtactaggaatattcca-atgagaatattatcctagatgtt 42090995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 310520 - 310184
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  310520 aagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccaggaa 310421  T
Q  107 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  310420 agtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatgtaagactatgagcattgatgtact 310321  T
Q  207 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  310320 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaaaatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttac 310221  T
Q  307 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  310220 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 310184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 343
Target Start/End: Original strand, 216179 - 216510
Alignment:
Q  12 agagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtac 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||  |||||||| ||  ||||| ||| | | || ||||| |||||||    
T  216179 agaggtcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaagaacatt-atcaagaacatgcaagtcatttgtgatatgaacaaatgtccagaaaagtac 216277  T
Q  112 atttgcatggataaatc-aagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactagg 209  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| || || | |  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||| |    
T  216278 gtttgcatggatcaatcaaagcaataaagacatttataaagttaaatgtcaaaaaggatattcaatgttca-ttaagactataaacattgaagtactaag 216376  T
Q  210 aatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttc-attgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaa 308  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||||||   || ||||| |||| ||| |  |||||||||||||| ||||||| |||||     ||||||||||    
T  216377 aatattcca-atgtgaatatcatcctagatgttgcaattactgcacttcaattatgttttcactattagga-ttgattacatcaagtacaagtcttacaa 216474  T
Q  309 atcatcctaagt-gaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||    
T  216475 atcatcctatgtaaaaacaaatggaacattctgatg 216510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 75218 - 74894
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  75218 aagcacagatcataagcttgttcttatacaagccaagagtctcaagaactttgatcaagatcatgcaaggcacatgtgacatgggaatatgtccaggaaa 75119  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  75118 gtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggtattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtacta 75019  T
Q  208 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  75018 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaaaatcactgatcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 74919  T
Q  308 aatcatcctaagtgaaacatatgga 332  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  74918 aatcatcctaagtgaaacagatgga 74894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 4)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 234480 - 234154
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  234480 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 234381  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  234380 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 234281  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  234280 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 234181  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  234180 aagtgaaacagatggaacattctgatg 234154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 318
Target Start/End: Original strand, 146328 - 146546
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||  |||||  |||||||||||  | |||||  |||||||||| |||| || ||||||||| ||||| |||||||||    
T  146328 tccagaaaagtacatttgaatggatctatcaacaaataaaggcatggaaaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatctaagactatgaacat 146426  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaagg 297  Q
    | | ||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| |    ||||||| || || |  ||||| ||||||||| |||||||| || |||||     
T  146427 taaagtactaggaatattcca-atgagaatattatcctagatgatgcattcactgcactccagttgtgttttactattagg-tttgattacattaaaagt 146524  T
Q  298 t-agtcttacaaatcatcctaa 318  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  146525 taagtcttacaaatcaacctaa 146546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 153934 - 153795
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcat-atacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |  ||| ||||||||  ||||||| || |||||||| | |||| || ||||||    
T  153934 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggtcaaagaattatgtc--aaaggatctttaatgttcaatcaagactacgaacat 153837  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    | | ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  153836 taaagtactaggaatattcca-atgagaatatcatcctagatg 153795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 114932 - 114793
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcat-atacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |  ||| ||||||||  ||||||| || |||||||| | |||| || ||||||    
T  114932 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggtcaaagaattatgtc--aaaggatctttaatgttcaatcaagactaagaacat 114835  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    | | ||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||    
T  114834 taaagtactaggaatattcca-atgagaatatcatcttagatg 114793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 8334 - 8008
Alignment:
Q  17 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  8334 tcagaaggttattcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 8235  T
Q  117 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  8234 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 8135  T
Q  217 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  8134 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 8035  T
Q  317 aagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  8034 aagtgaaacagatggaacattctgatg 8008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21610 - 21321
Alignment:
Q  54 aactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat 153  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21610 aactttgatcaaggtcgtgcaaggcacatgtgacatggatatatgtctaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggat 21511  T
Q  154 tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgc 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21510 tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagaatatgaacattgttgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaaaatcactgc 21411  T
Q  254 tcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  21410 tcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaattggtattcttacaaatcatcccaaatgaaacagatggaacattctgatg 21321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19877 - 19541
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 106  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  19877 aagctgagatcagaaggttgtttttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccagaaa 19778  T
Q  107 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19777 agtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcacatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 19678  T
Q  207 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 306  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  19677 aggaatatttcacaagggaatatcatcctagatgttattattactgctcttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttac 19578  T
Q  307 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19577 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 19541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 70 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 56262 - 55985
Alignment:
Q  70 atgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggata 169  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  56262 atgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaattaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaggtta 56163  T
Q  170 ttcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgt----taatatcactgctcttcattgttg 265  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  56162 ttcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaattaatatcactgctcttcattgttg 56063  T
Q  266 tttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  56062 tttcactattaggatttgattacatcagatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 55985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 171; Significance: 9e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 137 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 17658 - 17452
Alignment:
Q  137 aaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatccta 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17658 aaggcatatacaaggattatgtcaaaaatgatattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatccta 17559  T
Q  237 gatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacat 336  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17558 gatgttaaaatcactgctctttattgttgtttcactattaggatttgattacattaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacat 17459  T
Q  337 tttgatg 343  Q
    | |||||    
T  17458 tctgatg 17452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 343
Target Start/End: Original strand, 13394 - 13724
Alignment:
Q  12 agagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtac 111  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| | |||| ||||| ||| || ||||||  |||||||| ||||  |||| || ||| || ||  | |||||||    
T  13394 agagctcagaaggttgtccttatacaagcctagaaactcaagaacatt-atcaagaacatgcaagacacacatgacttgaataaatttcaggtaaagtac 13492  T
Q  112 atttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaa 211  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  13493 atttgcatcgatcaatcaagcaataaagacaattacaaggttaatgtcaaaaaggatattcgatgttcatttaagactatgaacattaaagtactaggaa 13592  T
Q  212 tattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatc 311  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  13593 tattcaaaaagggaatatcatcctagatgttacattcactgctcttcattgttgtttcactattacgatttgattacatcaaatggaagtcttacaaatc 13692  T
Q  312 atcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 343  Q
    |||||||| |||||| | ||| |||| |||||    
T  13693 atcctaagagaaacaaaaggaccattctgatg 13724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1705 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold1705
Description:

Target: scaffold1705; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 198
Target Start/End: Original strand, 415 - 607
Alignment:
Q  6 agaagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccagga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  415 agaagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtaacatggatatatgtccagga 514  T
Q  106 aagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaagg-attatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacatt 198  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||| || |||||||||  |||| ||||||||||    
T  515 aagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatataaggaactatgtc-aaaaggatctttaatgttcatccaagactatgaacatt 607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 199191 - 198868
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| ||| || |||||| ||||||||| |||| |||||||| |||  |||||||||||    
T  199191 aagcagagttcagaaggtttctcttatataagccaagaatctcaagaacatt-atcaagatcatgcaagtcacacgtgacatgaataagtatccaggaaa 199093  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 207  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  199092 gtacatttgcatgaatcaatcaaacaatagaggcatttacaaggttaatgtcaaaaaggatatttaaggttcatttaagactatgaacattgaagtacta 198993  T
Q  208 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttca-ttgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 306  Q
     |||||||||| |   |||||||||||||||||||   |||||||| ||||| || |  |||||||||||||| ||| ||| ||||||    ||||||||    
T  198992 tgaatattcca-ataagaatatcatcctagatgttgcaatcactgcacttcagttatgttttcactattagga-ttgtttacatcaaatacaagtcttac 198895  T
Q  307 aaatcatcctaagtgaaacatatggaa 333  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  198894 aaatcatcctaagtgaaacaaatggaa 198868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 29254 - 29010
Alignment:
Q  12 agagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtac 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||| || ||||||  |||||||| ||| ||||||||  ||| || ||||  |||||||    
T  29254 agagatcagaaggttgttcttaaacaagcaaagaatctcaataacatt-atcaagaacatgcaagtcacttgtgacataaataaatttccataaaagtac 29156  T
Q  112 atttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaa 211  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||    
T  29155 atttgcatgg-tcaatcaagcaataaatgcatttacaaggttaatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagactatgaacattgaaatactagcaa 29057  T
Q  212 tattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttca 259  Q
    ||||||| | | |||||||||||||||||||   |||||||| |||||    
T  29056 tattcca-atgagaatatcatcctagatgttgcaatcactgcacttca 29010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 337
Target Start/End: Original strand, 65255 - 65583
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||  ||| || ||||||  ||||  ||||||| || |||||  || || ||||  |||    
T  65255 aagcagagttcagaaggttgttcttatacaagcccagaagctcatgaacatt-atcaagaacatgagaggcacacgtaacatgagtaaatgtccaataaa 65353  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacatt-gatgtact 206  Q
    |||||||  ||||||  ||||||||||||||  ||| ||||||  | |||||||||| ||| |||| |||||||| |||| |||||||||| || |||||    
T  65354 gtacattgacatggaacaatcaagcaataaatacatttacaagattaatgtcaaaaaagatcttcagtgttcattcaagactatgaacatttgaagtact 65453  T
Q  207 aggaatattcca-caagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtctta 305  Q
    |||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||  | || | | |||| ||| |||||||||||||  ||||||||| || ||| || | |||||    
T  65454 aggaatattcgaacaag--aatatcatcctagatgttacaaacattccacttctttgatgtttcactattaatatttgattacatgaaatggaaatctta 65551  T
Q  306 caaatcatcctaagtgaaacatatggaacatt 337  Q
    || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  65552 catatcatcctaagtgaaacaaaaggaacatt 65583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1327 - 1143
Alignment:
Q  8 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||| ||| || ||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| || ||||| |||    
T  1327 aagcagagttcagaaggttgttcttatagaagcccataatctcaagaacatt-atcaagaacatgcaaggtacatgtgacatgaataaatgtccagcaaa 1229  T
Q  108 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatga 193  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||  | || | |||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  1228 gtacattggaatggatcaatcaagcaataaaggcatttacaagattaatataaaaaaggatattcaattttcattcaagactatga 1143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0406 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:

Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 343
Target Start/End: Original strand, 15046 - 15284
Alignment:
Q  105 aaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaaca-ttgatgt 203  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||  | |||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| |||||||| |||| ||    
T  15046 aaagtacatctgcatggatcaatcaagaaataaagacatttacaagactaatgtcaaaaa-gatcttcaaggttcattcaagactatgaacacttgaagt 15144  T
Q  204 actaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttca-ttgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtc 302  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||| || ||||||   ||||| | ||||| || |  ||| |||||||||| ||||||| |||||||   ||||    
T  15145 actaggaatattcca-aagagaatattatcatatatgttacattcactacacttcagttatgtttttactattagga-ttgattacatcaaaaacaagtc 15242  T
Q  303 ttacaaatcatcctaagtga-aacatatggaacattttgatg 343  Q
    ||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| |||||    
T  15243 ttacaaatcattctaagtaagaacaaatggaacattctgatg 15284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 224 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 241969 - 241867
Alignment:
Q  224 gaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaa 323  Q
    ||||||||||||||||||||    |||| | |||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  241969 gaatatcatcctagatgttatacacactacacttcattgatgtattactattaggatctgattacatcaaatagaagtcttacaaatcatcctaagtgaa 241870  T
Q  324 aca 326  Q
    |||    
T  241869 aca 241867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0265 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0265
Description:

Target: scaffold0265; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 69 - 218
Target Start/End: Original strand, 10920 - 11070
Alignment:
Q  69 catgcaaggcacatgtgacatggatata-tatccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaagga 167  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||| | | ||||| ||||||||| | | || || ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |     
T  10920 catgcaacgtacatgtgacatgaataaaatgtccagtaaagtacatctacttgaatcaatcaagcaataaaggcatttacaagaataatgtcaaaaaag- 11018  T
Q  168 tattcaatgttcatttaagattatgaaca-ttgatgtactaggaatattcca 218  Q
    | ||||| ||||||| |||| |||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  11019 tcttcaaagttcattcaagactatgaagacttgaagtactaggaatattcca 11070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 112201 - 112061
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  112201 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 112103  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  112102 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 112061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 218
Target Start/End: Original strand, 23010 - 23129
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  23010 tccagaaaagtacatctgcatagatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 23108  T
Q  198 tgatgtactaggaatattcca 218  Q
    | | |||||||||||||||||    
T  23109 taaagtactaggaatattcca 23129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 40878 - 40754
Alignment:
Q  224 gaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaa 323  Q
    |||||||||||||||||||  |   | ||| |||||||| | ||||| ||| | |||||  ||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  40878 gaatatcatcctagatgtttttcatattgcacttcattgatatttcattatgaagatttccttacatcaaatgggagtctcacaaatcatcctaagtgaa 40779  T
Q  324 acatatggaacattttgatgtccat 348  Q
    ||| | |||||||| ||| ||||||    
T  40778 acaaaaggaacattatgaagtccat 40754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 318
Target Start/End: Original strand, 18402 - 18614
Alignment:
Q  105 aaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgt 203  Q
    ||||| ||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| ||  ||||||||  |||| |||||||||| | ||    
T  18402 aaagttcatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttgatgttcatccaagactatgaacattaaagt 18500  T
Q  204 actaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggt-agtc 302  Q
    ||||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |    ||||||| ||||| |||||  | ||||||||| |||||||| || ||||| | ||||    
T  18501 actaggaatattcca-ataagaatattatcctagatgatgcattcactgcacttcagtgttggcttactattagg-tttgattacattaaaagttaagtc 18598  T
Q  303 ttacaaatcatcctaa 318  Q
    |||||||||| |||||    
T  18599 ttacaaatcaacctaa 18614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1276 - 1136
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| ||||| ||| ||||| |||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  1276 tccagaaaagttcatctgcatagatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 1178  T
Q  198 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  1177 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 1136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4538 - 4430
Alignment:
Q  110 acatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactag 208  Q
    |||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||| | |||||||    
T  4538 acatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacattaaagtactag 4440  T
Q  209 gaatattcca 218  Q
    ||||||||||    
T  4439 gaatattcca 4430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24224 - 24108
Alignment:
Q  99 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 197  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  24224 tccagaaaagcacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 24126  T
Q  198 tgatgtactaggaatatt 215  Q
    | | ||||||||||||||    
T  24125 taaagtactaggaatatt 24108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13798 - 13720
Alignment:
Q  161 aaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 240  Q
    |||||||| || |||||||||  |||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  13798 aaaaggatctttaatgttcatccaagactatgaacattaaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 13720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 318
Target Start/End: Original strand, 54459 - 54506
Alignment:
Q  270 actattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaa 318  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  54459 actattaggatt-gattacatcaaaagtaagtcttacaaatcatcctaa 54506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 318
Target Start/End: Original strand, 58411 - 58458
Alignment:
Q  270 actattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaa 318  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  58411 actattaggatt-gattacatcaaaagtaagtcttacaaatcatcctaa 58458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 318
Target Start/End: Original strand, 59839 - 59886
Alignment:
Q  270 actattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaa 318  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  59839 actattaggatt-gattacatcaaaagtaagtcttacaaatcatcctaa 59886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University