View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1084_low_61 (Length: 328)

Name: NF1084_low_61
Description: NF1084
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1084_low_61
NF1084_low_61
[»] chr6 (33 HSPs)
chr6 (37-328)||(25315424-25315715)
chr6 (37-328)||(26202918-26203209)
chr6 (37-328)||(30799217-30799507)
chr6 (37-326)||(24369266-24369555)
chr6 (37-326)||(24362647-24362935)
chr6 (37-267)||(29159148-29159379)
chr6 (37-254)||(16223510-16223728)
chr6 (37-254)||(25463920-25464138)
chr6 (58-267)||(19096626-19096836)
chr6 (37-258)||(34133814-34134040)
chr6 (37-195)||(1070697-1070855)
chr6 (37-157)||(15332072-15332192)
chr6 (37-157)||(17309753-17309873)
chr6 (47-177)||(22406712-22406842)
chr6 (37-159)||(8069641-8069764)
chr6 (37-177)||(4106776-4106913)
chr6 (37-136)||(94465-94564)
chr6 (46-183)||(10470660-10470797)
chr6 (46-136)||(27767447-27767537)
chr6 (82-127)||(14582927-14582972)
chr6 (56-127)||(19300639-19300708)
chr6 (82-136)||(10464185-10464240)
chr6 (82-136)||(12447172-12447227)
chr6 (46-136)||(13128242-13128332)
chr6 (82-136)||(17207714-17207769)
chr6 (82-136)||(23021325-23021380)
chr6 (82-136)||(29925817-29925872)
chr6 (75-127)||(14133011-14133064)
chr6 (82-137)||(13940556-13940612)
chr6 (81-127)||(8768145-8768191)
chr6 (81-126)||(19726765-19726810)
chr6 (82-129)||(17027156-17027204)
chr6 (84-127)||(18786230-18786274)
[»] chr5 (60 HSPs)
chr5 (37-328)||(5454518-5454809)
chr5 (37-278)||(18894834-18895075)
chr5 (37-278)||(15461501-15461743)
chr5 (37-281)||(5582112-5582357)
chr5 (37-281)||(30781094-30781340)
chr5 (37-281)||(40010807-40011052)
chr5 (37-281)||(43029070-43029315)
chr5 (37-281)||(10686174-10686417)
chr5 (39-272)||(25846375-25846611)
chr5 (37-254)||(1111540-1111758)
chr5 (37-254)||(14614812-14615030)
chr5 (37-281)||(7507851-7508095)
chr5 (37-281)||(20340569-20340812)
chr5 (37-159)||(24794974-24795096)
chr5 (37-159)||(24800341-24800463)
chr5 (37-157)||(22248201-22248321)
chr5 (37-157)||(38013763-38013883)
chr5 (37-281)||(20347173-20347416)
chr5 (37-177)||(14882254-14882395)
chr5 (37-177)||(14888931-14889072)
chr5 (37-157)||(37539918-37540038)
chr5 (37-157)||(37547462-37547582)
chr5 (45-159)||(24008089-24008203)
chr5 (37-180)||(25853005-25853150)
chr5 (37-157)||(17938843-17938964)
chr5 (37-157)||(11995166-11995286)
chr5 (37-177)||(19508192-19508333)
chr5 (37-254)||(597303-597522)
chr5 (37-185)||(22501008-22501155)
chr5 (37-185)||(22507589-22507736)
chr5 (37-136)||(29746573-29746673)
chr5 (37-159)||(18566619-18566740)
chr5 (37-136)||(19800320-19800420)
chr5 (82-181)||(16774978-16775078)
chr5 (46-136)||(41877985-41878075)
chr5 (82-187)||(37566161-37566267)
chr5 (239-328)||(25853149-25853237)
chr5 (82-136)||(5341700-5341755)
chr5 (46-136)||(18941195-18941284)
chr5 (82-136)||(19362721-19362776)
chr5 (46-136)||(20990389-20990479)
chr5 (82-136)||(23076272-23076327)
chr5 (82-136)||(23081720-23081775)
chr5 (82-136)||(23544842-23544897)
chr5 (46-136)||(28259854-28259944)
chr5 (46-136)||(41877815-41877905)
chr5 (82-136)||(19801866-19801921)
chr5 (82-135)||(22379604-22379658)
chr5 (82-281)||(26650524-26650724)
chr5 (82-281)||(26922109-26922309)
chr5 (56-127)||(23112708-23112777)
chr5 (56-127)||(34829167-34829236)
chr5 (46-136)||(7773629-7773719)
chr5 (84-136)||(24057724-24057777)
chr5 (82-127)||(25419943-25419988)
chr5 (82-136)||(39608854-39608909)
chr5 (81-126)||(20937754-20937799)
chr5 (81-126)||(22312801-22312846)
chr5 (66-127)||(10035266-10035325)
chr5 (84-127)||(23444167-23444211)
[»] chr4 (52 HSPs)
chr4 (37-328)||(39265999-39266291)
chr4 (37-328)||(29382528-29382818)
chr4 (37-281)||(391194-391440)
chr4 (37-281)||(52500579-52500824)
chr4 (37-328)||(3259754-3260045)
chr4 (37-254)||(21396845-21397063)
chr4 (58-328)||(50082269-50082539)
chr4 (37-254)||(3266455-3266673)
chr4 (37-254)||(49240680-49240898)
chr4 (37-254)||(49749394-49749612)
chr4 (37-157)||(23435916-23436036)
chr4 (37-157)||(26395713-26395833)
chr4 (37-279)||(1583938-1584182)
chr4 (37-157)||(29448610-29448730)
chr4 (37-157)||(29455294-29455414)
chr4 (37-159)||(11937186-11937309)
chr4 (37-195)||(7359276-7359434)
chr4 (37-177)||(11202343-11202484)
chr4 (45-195)||(5938961-5939111)
chr4 (37-159)||(45959672-45959795)
chr4 (37-136)||(45142503-45142603)
chr4 (37-127)||(34772196-34772286)
chr4 (37-136)||(47872376-47872475)
chr4 (46-136)||(2972687-2972777)
chr4 (46-136)||(20895032-20895122)
chr4 (46-183)||(31665098-31665235)
chr4 (37-127)||(54844912-54845001)
chr4 (82-136)||(19128297-19128352)
chr4 (82-136)||(20889448-20889503)
chr4 (82-136)||(36037636-36037691)
chr4 (82-136)||(49548538-49548593)
chr4 (82-136)||(899666-899721)
chr4 (82-136)||(21881665-21881720)
chr4 (82-136)||(30396269-30396324)
chr4 (82-136)||(33097166-33097221)
chr4 (46-136)||(35462566-35462656)
chr4 (82-136)||(42955976-42956031)
chr4 (46-136)||(49548323-49548413)
chr4 (83-136)||(41404662-41404716)
chr4 (37-82)||(391154-391199)
chr4 (56-127)||(14910723-14910792)
chr4 (46-136)||(33221408-33221498)
chr4 (82-136)||(42220504-42220559)
chr4 (82-136)||(46044825-46044880)
chr4 (59-127)||(27905352-27905418)
chr4 (37-93)||(7356283-7356339)
chr4 (56-127)||(14485649-14485717)
chr4 (81-127)||(18212297-18212343)
chr4 (81-127)||(26077682-26077728)
chr4 (81-126)||(17000139-17000184)
chr4 (67-127)||(30237898-30237958)
chr4 (84-127)||(10972873-10972917)
[»] chr7 (53 HSPs)
chr7 (37-326)||(26113558-26113847)
chr7 (37-328)||(26120169-26120460)
chr7 (37-278)||(32627477-32627718)
chr7 (37-328)||(18436967-18437258)
chr7 (37-328)||(33404733-33405024)
chr7 (37-328)||(11899110-11899401)
chr7 (37-328)||(11339851-11340142)
chr7 (37-328)||(17726140-17726424)
chr7 (39-328)||(642632-642920)
chr7 (37-328)||(2438964-2439255)
chr7 (37-281)||(11879147-11879392)
chr7 (37-328)||(30602661-30602953)
chr7 (37-254)||(749923-750141)
chr7 (37-254)||(1317846-1318064)
chr7 (37-254)||(26089824-26090042)
chr7 (37-254)||(8197073-8197291)
chr7 (37-254)||(48987794-48988012)
chr7 (37-254)||(40684636-40684854)
chr7 (37-252)||(5187118-5187335)
chr7 (37-279)||(13963849-13964094)
chr7 (37-267)||(37285289-37285521)
chr7 (37-272)||(2281166-2281402)
chr7 (37-156)||(11299626-11299745)
chr7 (37-156)||(11307990-11308109)
chr7 (39-157)||(40922894-40923012)
chr7 (37-177)||(49150665-49150806)
chr7 (37-177)||(49157355-49157496)
chr7 (37-185)||(20019614-20019763)
chr7 (37-157)||(42058629-42058750)
chr7 (37-157)||(2026196-2026316)
chr7 (37-315)||(49158822-49159101)
chr7 (37-156)||(17468226-17468344)
chr7 (37-156)||(17584870-17584988)
chr7 (37-156)||(37379971-37380089)
chr7 (37-159)||(21757373-21757494)
chr7 (37-174)||(13453756-13453892)
chr7 (37-100)||(8213299-8213362)
chr7 (37-136)||(2388551-2388649)
chr7 (37-136)||(46174405-46174504)
chr7 (46-136)||(46649858-46649948)
chr7 (82-136)||(15838736-15838791)
chr7 (82-136)||(16843865-16843920)
chr7 (82-204)||(30271705-30271831)
chr7 (82-136)||(12461640-12461695)
chr7 (82-136)||(19439434-19439489)
chr7 (82-136)||(23521124-23521179)
chr7 (82-136)||(13019830-13019885)
chr7 (68-127)||(16073934-16073993)
chr7 (81-127)||(18607025-18607071)
chr7 (81-126)||(14281617-14281662)
chr7 (84-136)||(32771662-32771715)
chr7 (81-126)||(35962709-35962754)
chr7 (56-127)||(15166912-15166983)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (37-281)||(18359-18603)
[»] chr1 (39 HSPs)
chr1 (37-297)||(20277028-20277288)
chr1 (37-328)||(28556248-28556538)
chr1 (37-328)||(18026497-18026788)
chr1 (39-281)||(18418205-18418449)
chr1 (58-281)||(36211843-36212066)
chr1 (37-254)||(6740597-6740815)
chr1 (37-254)||(48427932-48428150)
chr1 (37-254)||(31535118-31535336)
chr1 (37-254)||(31563835-31564053)
chr1 (58-254)||(20396691-20396888)
chr1 (37-159)||(39189595-39189717)
chr1 (37-157)||(39094400-39094520)
chr1 (37-159)||(38907968-38908090)
chr1 (37-159)||(37682165-37682288)
chr1 (37-159)||(37675472-37675595)
chr1 (45-254)||(20292767-20292978)
chr1 (37-143)||(22185534-22185640)
chr1 (45-254)||(20299401-20299607)
chr1 (45-177)||(20570828-20570961)
chr1 (94-279)||(17149454-17149641)
chr1 (38-185)||(42626280-42626426)
chr1 (37-159)||(4231267-4231390)
chr1 (37-267)||(20076753-20076987)
chr1 (37-159)||(21963084-21963207)
chr1 (37-93)||(3652679-3652735)
chr1 (46-136)||(21920884-21920974)
chr1 (46-136)||(29602229-29602319)
chr1 (56-127)||(19961273-19961342)
chr1 (82-136)||(36615058-36615113)
chr1 (82-136)||(49328155-49328210)
chr1 (37-98)||(17146336-17146397)
chr1 (46-136)||(29596794-29596884)
chr1 (82-125)||(43088514-43088557)
chr1 (212-281)||(19046091-19046160)
chr1 (82-136)||(47484229-47484284)
chr1 (81-127)||(20242693-20242739)
chr1 (81-126)||(23066673-23066718)
chr1 (83-127)||(20824329-20824373)
chr1 (84-127)||(21698261-21698305)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (37-328)||(104367-104658)
[»] chr2 (35 HSPs)
chr2 (37-281)||(4077501-4077746)
chr2 (37-281)||(44090895-44091140)
chr2 (37-254)||(24426674-24426892)
chr2 (37-281)||(27729589-27729834)
chr2 (37-281)||(27037325-27037571)
chr2 (37-254)||(2385756-2385973)
chr2 (37-281)||(31828693-31828937)
chr2 (37-281)||(31834045-31834289)
chr2 (37-272)||(36984381-36984617)
chr2 (37-258)||(4071370-4071596)
chr2 (58-254)||(71347-71544)
chr2 (37-157)||(1067177-1067297)
chr2 (37-157)||(21604845-21604965)
chr2 (37-157)||(24481531-24481651)
chr2 (37-157)||(30196446-30196566)
chr2 (37-159)||(20850270-20850393)
chr2 (37-157)||(1061794-1061914)
chr2 (37-157)||(11360175-11360291)
chr2 (37-177)||(34131-34272)
chr2 (37-152)||(22013048-22013164)
chr2 (37-254)||(28292800-28293020)
chr2 (37-159)||(35243963-35244086)
chr2 (37-136)||(11466152-11466251)
chr2 (82-183)||(27272376-27272478)
chr2 (82-162)||(17592466-17592547)
chr2 (82-136)||(36800680-36800735)
chr2 (82-136)||(45028632-45028687)
chr2 (82-127)||(14563956-14564001)
chr2 (82-136)||(13101133-13101188)
chr2 (82-136)||(15643249-15643304)
chr2 (82-136)||(25590161-25590216)
chr2 (82-136)||(32911442-32911497)
chr2 (173-254)||(22012968-22013050)
chr2 (81-127)||(9241492-9241538)
chr2 (81-127)||(22810042-22810088)
[»] chr8 (45 HSPs)
chr8 (37-328)||(35541129-35541420)
chr8 (37-281)||(16887102-16887348)
chr8 (37-254)||(14736652-14736871)
chr8 (37-254)||(23224579-23224797)
chr8 (37-254)||(9205182-9205400)
chr8 (37-281)||(26485824-26486070)
chr8 (37-281)||(3224487-3224733)
chr8 (37-327)||(28980805-28981097)
chr8 (37-281)||(28986025-28986272)
chr8 (37-157)||(27909514-27909634)
chr8 (37-157)||(27955933-27956053)
chr8 (37-157)||(36800372-36800492)
chr8 (37-156)||(14563622-14563741)
chr8 (37-157)||(14765668-14765788)
chr8 (37-159)||(214023-214146)
chr8 (37-159)||(238108-238231)
chr8 (37-159)||(727646-727769)
chr8 (37-159)||(800147-800270)
chr8 (37-159)||(851540-851663)
chr8 (37-157)||(4520663-4520784)
chr8 (37-177)||(23117290-23117431)
chr8 (37-177)||(3697724-3697865)
chr8 (37-177)||(10956595-10956735)
chr8 (37-185)||(27345797-27345944)
chr8 (82-177)||(10948513-10948608)
chr8 (37-177)||(14746428-14746570)
chr8 (37-185)||(6588151-6588298)
chr8 (37-159)||(40144223-40144344)
chr8 (37-159)||(16266797-16266920)
chr8 (46-183)||(27873842-27873979)
chr8 (46-183)||(27948630-27948767)
chr8 (82-187)||(11392506-11392612)
chr8 (46-183)||(27889972-27890109)
chr8 (46-136)||(14416525-14416615)
chr8 (82-136)||(29299030-29299085)
chr8 (82-136)||(29305576-29305631)
chr8 (46-136)||(29328284-29328374)
chr8 (117-159)||(807966-808008)
chr8 (45-127)||(25701529-25701610)
chr8 (81-127)||(22063558-22063604)
chr8 (81-127)||(22176030-22176076)
chr8 (66-127)||(39363631-39363692)
chr8 (84-136)||(20006386-20006439)
chr8 (56-127)||(8728980-8729051)
chr8 (45-136)||(43687487-43687577)
[»] chr3 (54 HSPs)
chr3 (37-328)||(54832985-54833274)
chr3 (37-328)||(10767818-10768110)
chr3 (37-281)||(21151299-21151544)
chr3 (37-281)||(2498886-2499131)
chr3 (37-281)||(45611728-45611963)
chr3 (37-254)||(28758961-28759179)
chr3 (37-254)||(43723933-43724151)
chr3 (37-254)||(47121209-47121427)
chr3 (37-254)||(47128577-47128795)
chr3 (37-254)||(50142638-50142856)
chr3 (69-281)||(6927383-6927596)
chr3 (37-272)||(3782603-3782839)
chr3 (37-157)||(50655955-50656075)
chr3 (37-157)||(53571201-53571321)
chr3 (37-159)||(10382001-10382124)
chr3 (37-159)||(10410654-10410777)
chr3 (37-159)||(29493615-29493738)
chr3 (37-176)||(9771863-9772003)
chr3 (37-179)||(12271339-12271482)
chr3 (39-154)||(14845137-14845253)
chr3 (45-177)||(38743004-38743137)
chr3 (37-159)||(48774582-48774705)
chr3 (46-183)||(16331535-16331672)
chr3 (46-183)||(16833305-16833442)
chr3 (46-183)||(54091678-54091815)
chr3 (46-136)||(3802581-3802671)
chr3 (46-136)||(15374724-15374814)
chr3 (46-136)||(54520130-54520220)
chr3 (82-136)||(29545151-29545206)
chr3 (82-136)||(8373914-8373969)
chr3 (46-136)||(9691396-9691486)
chr3 (82-136)||(11956585-11956640)
chr3 (46-136)||(20187825-20187915)
chr3 (46-136)||(20377229-20377319)
chr3 (82-136)||(30596848-30596903)
chr3 (46-136)||(54520345-54520435)
chr3 (82-127)||(19344151-19344196)
chr3 (46-267)||(3802743-3802966)
chr3 (82-136)||(32388006-32388061)
chr3 (82-127)||(18961077-18961122)
chr3 (82-127)||(49163272-49163317)
chr3 (56-127)||(13313907-13313976)
chr3 (82-136)||(12725113-12725168)
chr3 (82-136)||(29551042-29551097)
chr3 (82-136)||(46071099-46071154)
chr3 (125-254)||(16414152-16414281)
chr3 (56-127)||(13324819-13324888)
chr3 (56-127)||(38312118-38312187)
chr3 (81-127)||(23173921-23173967)
chr3 (67-127)||(12274375-12274435)
chr3 (75-127)||(17512698-17512751)
chr3 (56-127)||(20249105-20249175)
chr3 (56-127)||(13303231-13303300)
chr3 (84-127)||(15934960-15935004)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (37-281)||(12062-12307)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (37-281)||(18255-18499)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (39-157)||(50083-50201)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (37-159)||(13486-13609)
[»] scaffold0279 (1 HSPs)
scaffold0279 (37-177)||(5661-5802)
[»] scaffold0276 (1 HSPs)
scaffold0276 (101-281)||(21922-22101)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (37-159)||(31720-31843)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (45-177)||(4579-4710)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (45-158)||(25128-25240)
[»] scaffold0320 (1 HSPs)
scaffold0320 (37-136)||(972-1072)
[»] scaffold0103 (2 HSPs)
scaffold0103 (37-159)||(19688-19809)
scaffold0103 (37-136)||(23798-23897)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (37-159)||(512493-512614)
scaffold0001 (82-136)||(179126-179181)
scaffold0001 (84-127)||(488350-488394)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (37-159)||(975-1098)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (46-281)||(9842-10078)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (37-136)||(15182-15281)
[»] scaffold1427 (2 HSPs)
scaffold1427 (46-136)||(712-802)
scaffold1427 (56-127)||(976-1045)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (82-183)||(19337-19439)
scaffold0113 (82-183)||(15239-15341)
[»] scaffold0214 (1 HSPs)
scaffold0214 (37-136)||(15179-15278)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (46-125)||(12948-13026)
scaffold0310 (46-107)||(7801-7861)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (46-136)||(2102-2192)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (82-136)||(184-239)
scaffold0076 (81-127)||(51672-51718)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (46-136)||(65284-65374)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (82-136)||(74112-74167)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (82-136)||(137199-137254)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (56-127)||(11912-11981)
[»] scaffold0261 (3 HSPs)
scaffold0261 (56-127)||(24472-24541)
scaffold0261 (84-127)||(10626-10670)
scaffold0261 (84-127)||(18805-18849)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (82-183)||(24770-24873)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (82-136)||(20102-20157)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (82-136)||(30955-31010)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (82-136)||(247142-247197)
scaffold0009 (82-136)||(253656-253711)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (82-136)||(41353-41408)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (46-136)||(101645-101734)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (56-127)||(72367-72436)
scaffold0034 (81-127)||(10076-10122)
scaffold0034 (56-127)||(17372-17440)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (81-127)||(139-185)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (90-127)||(5377-5415)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (81-127)||(7409-7455)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (81-127)||(36789-36835)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (81-127)||(41588-41634)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (81-127)||(20489-20535)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (81-126)||(14469-14514)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (81-126)||(42090-42135)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (81-122)||(50948-50989)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (81-126)||(17637-17682)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (84-127)||(6293-6337)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (84-127)||(4091-4135)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (82-129)||(19439-19487)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (84-127)||(55912-55956)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (84-127)||(38723-38767)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 33)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 37 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 25315715 - 25315424
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25315715 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 25315616  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaac 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25315615 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattaaaacaac 25315516  T
Q  237 caaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacgttcaatcaccactattcaagctagctaaacaactctcaggaactgt 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  25315515 caaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacattcaaccaccactattcaagctagcaaaaccacactcaggaactgt 25315424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 37 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 26203209 - 26202918
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26203209 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 26203110  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaac 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26203109 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattaaaacaac 26203010  T
Q  237 caaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacgttcaatcaccactattcaagctagctaaacaactctcaggaactgt 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  26203009 caaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacattcaaccaccactattcaagctagcaaaaccacactcaggaactgt 26202918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 37 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 30799507 - 30799217
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30799507 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 30799408  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaac 236  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  30799407 atgcaactccatgcgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcaataatcatcaatccagcaattcaatcgac 30799308  T
Q  237 caaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacgttcaatcaccactattcaagctagctaaacaactctcaggaactgt 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  30799307 caaaataatgcataattatatataaccatgctcaaaaacaacaac-atcaaccactactattcaagctagcaaaacaacattcaggaactgt 30799217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 37 - 326
Target Start/End: Original strand, 24369266 - 24369555
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24369266 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 24369365  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| |||||||  |||||| | | ||| |||    
T  24369366 atgcaactcaatatgactccactttaataatatgtatgattcaacaattagcatacatttcaaccatcatcagtaatcattaatccagtagtccaatcaa 24369465  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacgttcaatcaccactattcaagctagctaaacaactctcaggaact 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  24369466 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaaaaacaacaac-atcaaccactactattcaagctagcaaaacatcattcaggaact 24369555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 37 - 326
Target Start/End: Original strand, 24362647 - 24362935
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24362647 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 24362746  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| |||||||  |||||| | | ||| |||    
T  24362747 atgcaactcaatatgactccactttaataatatgtatgattcaacaattagcatacatttcaaccatcatcagtaatcattaatccagtagtccaatcaa 24362846  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacgttcaatcaccactattcaagctagctaaacaactctcaggaact 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  24362847 ccaaaataatgcataattatatataacca-gctcaaaaacaacaac-atcaaccactactattcaagctagcaaaacatcattcaggaact 24362935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 37 - 267
Target Start/End: Original strand, 29159148 - 29159379
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29159148 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 29159247  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    |||||||||||| ||| ||||||  || || ||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||||||||  ||||||| || ||||||| ||| |||    
T  29159248 atgcaactccatatgattccacttaaacaacatgtatgattcgataattagcatacacttcaatcatcatcagaaatcatcaattcagcaatccaatcaa 29159347  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgc 267  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  29159348 ccaaaataatgcataattacatgaaaccatgc 29159379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16223728 - 16223510
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16223728 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 16223629  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||  || || |||||||||||||||  |  |||||| ||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||    
T  16223628 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 16223529  T
Q  236 ccaaaataatgcataatta 254  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  16223528 ccacaataatgcataatta 16223510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Original strand, 25463920 - 25464138
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25463920 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 25464019  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||  || || ||||||||||| |||  |  |||||| ||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||    
T  25464020 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcgatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 25464119  T
Q  236 ccaaaataatgcataatta 254  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  25464120 ccacaataatgcataatta 25464138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 58 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 19096836 - 19096626
Alignment:
Q  58 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19096836 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgactcca 19096737  T
Q  158 ctataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaaccaaaataatgcataattata 256  Q
    ||  || || ||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||||||||  ||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |    
T  19096736 cttaaacaacatgtatgattcgataattagcatacacttcaatcatcatcagaaatcatcaattcagcaatccaatcaaccaaaataatgcataattaca 19096637  T
Q  257 tataaccatgc 267  Q
    |  ||||||||    
T  19096636 tgaaaccatgc 19096626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 34134040 - 34133814
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34134040 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 34133941  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaat-aacatac-attca---accatcatcaataatcatcgatccagcaattcaa 231  Q
    ||||||||||||||||||| |||  || || |||||||||||||||  | ||||||| || ||   | |||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  34133940 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcaatacttaaacatacaatgcattcatcatcattaatcatcatcaatccagcaattcaa 34133841  T
Q  232 acaaccaaaataatgcataattatata 258  Q
     ||| || || ||||||||||||||||    
T  34133840 tcaatcacaacaatgcataattatata 34133814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 195
Target Start/End: Original strand, 1070697 - 1070855
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1070697 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 1070796  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacatt 195  Q
    ||||||||  |||||||||||||  || || |||||||||||||||  || ||||||||    
T  1070797 atgcaactaaatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaatatttagcatacatt 1070855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 15332192 - 15332072
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15332192 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 15332093  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcca 157  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15332092 atgcaactccatgtgactcca 15332072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 157
Target Start/End: Original strand, 17309753 - 17309873
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17309753 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 17309852  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcca 157  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  17309853 atgcaactccatgtgactcca 17309873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 177
Target Start/End: Original strand, 22406712 - 22406842
Alignment:
Q  47 aactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactc 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22406712 aactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctact-gtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactc 22406810  T
Q  146 catgtgactccactataataatatgtatgatt 177  Q
    ||| ||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  22406811 catatgactccacttaactaacatgtatgatt 22406842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 8069764 - 8069641
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8069764 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 8069665  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccact 159  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  8069664 atgcaaactccatgtgactccact 8069641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 4106776 - 4106913
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4106776 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagccctctccgctgttttatgcatatgccatggacc----tgtgtatgtctacatacaactgaccatgca 4106871  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccactataataatatgtatgatt 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||  || || ||||||||||    
T  4106872 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 4106913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 94564 - 94465
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  94564 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 94466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 10470797 - 10470660
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  10470797 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatac 10470700  T
Q  144 tccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataa 183  Q
    ||||| ||||||||||   | || ||||||||||||||||    
T  10470699 tccatatgactccacttatacaacatgtatgattcaataa 10470660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 27767447 - 27767537
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27767447 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 27767537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 127
Target Start/End: Original strand, 14582927 - 14582972
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14582927 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaact 14582972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 19300708 - 19300639
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  19300708 tccaagaccgaagccctcaccgct--tttatgcttatgcaattgacccacttatgtatatctacatacaact 19300639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 10464240 - 10464185
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10464240 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 10464185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 12447227 - 12447172
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12447227 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 12447172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 13128332 - 13128242
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13128332 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atggatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 13128242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 17207769 - 17207714
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17207769 tttatgcatatgcaatggaccaactagtgtatatctacatacaacttgaccatgca 17207714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23021380 - 23021325
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23021380 tttatgcatatgcaatggacccccttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 23021325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 29925817 - 29925872
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29925817 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 29925872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 14133064 - 14133011
Alignment:
Q  75 ccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  14133064 ccgctgttttatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 14133011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Original strand, 13940556 - 13940612
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaa 137  Q
    ||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13940556 tttatgcatatgttatggacccaattgtgtatatctacatacaacatgaccatgcaa 13940612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 8768191 - 8768145
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8768191 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 8768145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Original strand, 19726765 - 19726810
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19726765 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 19726810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 17027204 - 17027156
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaactga 129  Q
    ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17027204 tttatgcttatgcaatgaactccacttgtgtatatctacatacaactga 17027156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Original strand, 18786230 - 18786274
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18786230 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 18786274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 60)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 37 - 328
Target Start/End: Original strand, 5454518 - 5454809
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5454518 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 5454617  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaac 236  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5454618 atgcaactccatgtgacttcactataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaac 5454717  T
Q  237 caaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacgttcaatcaccactattcaagctagctaaacaactctcaggaactgt 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  5454718 caaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacattcaaccaccactattcaagctagcaaaaccacactcaggaactgt 5454809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 37 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18895075 - 18894834
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18895075 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 18894976  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaac 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18894975 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaac 18894876  T
Q  237 caaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaac 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18894875 caaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaac 18894834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 37 - 278
Target Start/End: Original strand, 15461501 - 15461743
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15461501 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaacggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 15461600  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15461601 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacatttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 15461700  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaac 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15461701 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaac 15461743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 37 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 5582357 - 5582112
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5582357 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 5582258  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||| ||| |||    
T  5582257 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacatttcaaccatcatcagtattcatcaatccaacaatccaatcaa 5582158  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaac 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5582157 ccaaaataatgtataattatatacaaccatgctcaaatacaacaac 5582112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 37 - 281
Target Start/End: Original strand, 30781094 - 30781340
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30781094 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 30781193  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  30781194 atgcaactccatgtgactccactttaacaatatgtatgattcaataattaacatacatttcaaccatcatcaataatcatcaatccaacaattcaatcaa 30781293  T
Q  236 -ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaac 281  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30781294 cccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaaatccaacaac 30781340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 37 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 40011052 - 40010807
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40011052 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatgaacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 40010953  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||| || ||||| |||||||||| ||| |||    
T  40010952 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttaaatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 40010853  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaac 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  40010852 ccaaaataatgtataattatatacaaccatgctcagatacaacaac 40010807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 37 - 281
Target Start/End: Original strand, 43029070 - 43029315
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43029070 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 43029169  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||| || ||||| || ||||||| ||| |||    
T  43029170 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttaaatcatcatcagtattcatcaattcagcaatccaatcaa 43029269  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaac 281  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||    
T  43029270 ccaaaacaatgtataattatatacaaccatgcttagatacaacaac 43029315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 37 - 281
Target Start/End: Original strand, 10686174 - 10686417
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10686174 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccataca 10686273  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||| || ||||| |||||||||| ||| |||    
T  10686274 atgcaacttcatgtgattccact-taacaacatgtatgattcaataattaacatacatttaaatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 10686372  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaac 281  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||    
T  10686373 ccaaaacaatgcataattaaatataactatacccaaa-acaacaac 10686417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 39 - 272
Target Start/End: Original strand, 25846375 - 25846611
Alignment:
Q  39 tgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaat 138  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25846375 tgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaat 25846474  T
Q  139 gcaactc--catgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    |||||||   || |||||||||| ||| || ||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||| |||    
T  25846475 gcaactcaatatatgactccactttaacaacatgtatgattcaacaattggcatacatttcaaccatcatcagtaatcattaatccagtagttcaatcaa 25846574  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaa 272  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25846575 cccaaataatgcataattatatataaccatgctcaaa 25846611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 1111758 - 1111540
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1111758 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 1111659  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||  |  |||||| ||||  |||||||| || ||||| || |||||||  || |||    
T  1111658 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtactcatcaattcagcaatcaaatcaa 1111559  T
Q  236 ccaaaataatgcataatta 254  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  1111558 ccacaataatgcataatta 1111540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14615030 - 14614812
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14615030 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 14614931  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||| ||  |  |||||| ||||  |||||||| |||||||| || |||||||  || |||    
T  14614930 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcactactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 14614831  T
Q  236 ccaaaataatgcataatta 254  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  14614830 ccacaataatgcataatta 14614812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 7508095 - 7507851
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7508095 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgc 7507996  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||||||| |||| |||||  ||| | |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||    || ||||| | ||| |||    
T  7507995 aatgcaactccatatgacaccacttaaatgacatgtatgactcaataaatagcatacaatcaaccatcatcagtattcggtaatgcagcactccaatcaa 7507896  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaac 281  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  7507895 ccaaaacaatgcatgattatatatacccatgctcaaa-acaacaac 7507851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 281
Target Start/End: Original strand, 20340569 - 20340812
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340569 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatgaacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 20340668  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  || || |||| |||||||||||||||||| ||||   |  |||||| |||||||| |||||||||| ||| ||     
T  20340669 atgcaaactccatgtgacaccacttaaacaacatgtgtgattcaataaataacatccatt--tcagtcatcattaatcatcaatccagcaatccaatcat 20340766  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaac 281  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||    
T  20340767 cccaaataatgcataattacatataaccatgctcaaaaactacaac 20340812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 24795096 - 24794974
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24795096 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 24794997  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccact 159  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  24794996 atgcaactccatgtgactccact 24794974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 24800463 - 24800341
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24800463 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 24800364  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccact 159  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  24800363 atgcaactccatgtgactccact 24800341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22248321 - 22248201
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22248321 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 22248222  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcca 157  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22248221 atgcaactccatgtgactcca 22248201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 157
Target Start/End: Original strand, 38013763 - 38013883
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38013763 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 38013862  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcca 157  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  38013863 atgcaactccatgtgactcca 38013883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 281
Target Start/End: Original strand, 20347173 - 20347416
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20347173 gctgttgagcaactagtactccaggacatgaatcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 20347272  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  || || |||| |||||||||||||||||| ||||   |  |||||| |||||||| |||||||||| ||| ||     
T  20347273 atgcaaactccatgtgacaccacttaaacaacatgtgtgattcaataaataacatccatt--tcagtcatcattaatcatcaatccagcaatccaatcat 20347370  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaac 281  Q
    || ||||||| |||||||| |||||||||||| |||| || |||||    
T  20347371 cccaaataattcataattacatataaccatgctcaaaaactacaac 20347416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14882395 - 14882254
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14882395 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 14882296  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  14882295 aatgcaactccatgtgactccacttaactaacatgtatgatt 14882254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14889072 - 14888931
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14889072 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 14888973  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  14888972 aatgcaactccatgtgactccacttaactaacatgtatgatt 14888931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 37540038 - 37539918
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37540038 gctgttgagtaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 37539939  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcca 157  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  37539938 atgcaactccatgtgactcca 37539918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 37547582 - 37547462
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37547582 gctgttgagtaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 37547483  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcca 157  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  37547482 atgcaactccatgtgactcca 37547462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 45 - 159
Target Start/End: Original strand, 24008089 - 24008203
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaact 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24008089 gcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacatgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaact 24008188  T
Q  145 ccatgtgactccact 159  Q
    |||||||||||||||    
T  24008189 ccatgtgactccact 24008203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 180
Target Start/End: Original strand, 25853005 - 25853150
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25853005 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 25853104  T
Q  137 atgcaactc--catgtgactccactataataatatgtatgattcaa 180  Q
    |||||||||   || |||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  25853105 atgcaactcaatatatgactccactttaacaacatgtatgattcaa 25853150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 17938964 - 17938843
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17938964 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 17938865  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactcca 157  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17938864 aatgcaactccatgtgactcca 17938843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 157
Target Start/End: Original strand, 11995166 - 11995286
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11995166 gctgttgagcaactagtactctaggaccgaagccctcaccgcagttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 11995265  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcca 157  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11995266 atgcaactccatgtgactcca 11995286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 19508192 - 19508333
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19508192 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgccatagacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 19508291  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccactataataatatgtatgatt 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||  || || ||||||||||    
T  19508292 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 19508333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Original strand, 597303 - 597522
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  597303 gctgttgagcaactagtactcctggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 597402  T
Q  137 atgc-aactccatgt-gactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcaataatc-atcgatccagcaattcaaac 233  Q
    |||| |||||||| |  |||||||| ||| || ||||||| || |||||  | ||||||||||  |||||||| ||||| ||| || |||||||  || |    
T  597403 atgcaaactccatataaactccactttaacaacatgtatggtt-aataataagcatacattcagtcatcatcagtaatcaatcaattcagcaatcaaatc 597501  T
Q  234 aaccaaaataatgcataatta 254  Q
    | ||| |||||||||||||||    
T  597502 atccagaataatgcataatta 597522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Original strand, 22501008 - 22501155
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22501008 gctgttgagcaactagtgctccaagacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 22501106  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaat 185  Q
        |||||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||    
T  22501107 tacaaactccatgtgactccacttaaacaacatatatgattcaataaat 22501155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Original strand, 22507589 - 22507736
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22507589 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtatatatctacatacaactgaccatgca 22507687  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaat 185  Q
        |||||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||    
T  22507688 tacaaactccatgtgactccacttaaacaacatctatgattcaataaat 22507736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 29746673 - 29746573
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29746673 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 29746574  T
Q  136 a 136  Q
    |    
T  29746573 a 29746573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Original strand, 18566619 - 18566740
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18566619 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaattgaccatgca 18566717  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccact 159  Q
        |||||| ||||||||||||    
T  18566718 tacaaactccttgtgactccact 18566740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 19800420 - 19800320
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19800420 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccactgttttatgcatatgcagtggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 19800321  T
Q  136 a 136  Q
    |    
T  19800320 a 19800320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 16775078 - 16774978
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccactataataatatgtatgattca 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| ||||||||||  ||||| |||||| |||||    
T  16775078 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttaaataacatgtataattca 16774980  T
Q  180 at 181  Q
    ||    
T  16774979 at 16774978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 41878075 - 41877985
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41878075 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 41877985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 187
Target Start/End: Original strand, 37566161 - 37566267
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgca-actccatgtgactccactataataatatgtatgattca 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||| |||||||| |   | || ||||||| ||||    
T  37566161 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca-tacatactccatatgactccaattatacaacatgtatggttca 37566259  T
Q  180 ataaataa 187  Q
    ||||||||    
T  37566260 ataaataa 37566267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 239 - 328
Target Start/End: Original strand, 25853149 - 25853237
Alignment:
Q  239 aaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacgttcaatcaccactattcaagctagctaaacaactctcaggaactgt 328  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  25853149 aaatcatgcataattatatataaccatgctcaaaaacaacaac-atcaaccactactattcaagctagcaaaacaacattcaggaactgt 25853237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 5341755 - 5341700
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5341755 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 5341700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18941284 - 18941195
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18941284 caactagtgctccaggacatgagccctc-ccgctgttt-atgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 18941195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 19362721 - 19362776
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19362721 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 19362776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 20990389 - 20990479
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20990389 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 20990479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23076327 - 23076272
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23076327 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 23076272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23081775 - 23081720
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23081775 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 23081720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23544897 - 23544842
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23544897 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 23544842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 28259944 - 28259854
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28259944 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 28259854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 41877905 - 41877815
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41877905 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 41877815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 19801921 - 19801866
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19801921 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 19801866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 135
Target Start/End: Original strand, 22379604 - 22379658
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22379604 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 22379658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 281
Target Start/End: Original strand, 26650524 - 26650724
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccactata-ataatatgtatgattc 178  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  || ||| |||||||| | || | || |||||||||||    
T  26650524 tttatgcatatgctatggactcactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacattcttcatatgactccaatttacacaacatgtatgattc 26650622  T
Q  179 aataaat--aacatacattcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaaccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaataca 276  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||  |||| | | |||||||| |||  | ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |||| |||    
T  26650623 aataaataaaacatacattcaaccatcaacaa-catcaac-aaccagcaatccaacaatccagaataatgcacaattaaatataactatgctcaaa-aca 26650719  T
Q  277 acaac 281  Q
    |||||    
T  26650720 acaac 26650724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 281
Target Start/End: Original strand, 26922109 - 26922309
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccactata-ataatatgtatgattc 178  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  || ||| |||||||| | || | || |||||||||||    
T  26922109 tttatgcatatgctatggactcactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacattcttcatatgactccaatttacacaacatgtatgattc 26922207  T
Q  179 aataaat--aacatacattcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaaccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaataca 276  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||  |||| | | |||||||| |||  | ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |||| |||    
T  26922208 aataaataaaacatacattcaaccatcaacaa-catcaac-aaccagcaatccaacaatccagaataatgcacaattaaatataactatgctcaaa-aca 26922304  T
Q  277 acaac 281  Q
    |||||    
T  26922305 acaac 26922309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 23112777 - 23112708
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23112777 tccaggaccgaggccatcaccgct--tttatgcttatgcaaatgacccacttgtgtatatctacatacaact 23112708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Original strand, 34829167 - 34829236
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||| | ||||||||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34829167 tccaggaccgaggtcctcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 34829236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 7773719 - 7773629
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  7773719 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgaaatggacccactcgtgtatttctacatacaactagaccatgca 7773629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 136
Target Start/End: Original strand, 24057724 - 24057777
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24057724 tatgcatatgctatggacccacttgtgtatatcaacatacaacttgaccatgca 24057777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 127
Target Start/End: Original strand, 25419943 - 25419988
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25419943 tttatgcatatgttatggacccacttgtgtatatctacatacaact 25419988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 39608909 - 39608854
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39608909 tttatgcatatgttatggactcacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 39608854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Original strand, 20937754 - 20937799
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20937754 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 20937799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 22312846 - 22312801
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22312846 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 22312801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 66 - 127
Target Start/End: Original strand, 10035266 - 10035325
Alignment:
Q  66 aagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||||||   |||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10035266 aagccctcaccgct---ttatgtttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 10035325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 23444211 - 23444167
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23444211 tatgcttatgcaatggactctacttgtgtatatctacataaaact 23444167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 52)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 37 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 39266291 - 39265999
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39266291 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 39266192  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaac 236  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39266191 atgcaactccatgtgactccaccataataatatgtatgattcactaaataacatacattcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaac 39266092  T
Q  237 c-aaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacgttcaatcaccactattcaagctagctaaacaactctcaggaactgt 328  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39266091 caaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacattcaaccaccactattcaagctagttaaacaactctcaggaactgt 39265999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 37 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 29382818 - 29382528
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29382818 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcacatgcaatggatctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 29382719  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| |||    
T  29382718 atgcaactcaatatgactccactttaataatatgtatgattcaacaattggcatacatttcaaccatcatcagtaatcattaatccagcagttcaatcaa 29382619  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacgttcaatcaccactattcaagctagctaaacaactctcaggaactgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  29382618 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaaa-acaacaac-atcaaccactactattcaagctagcaaaacaacattcaggaactgt 29382528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 37 - 281
Target Start/End: Original strand, 391194 - 391440
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  391194 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 391293  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacatt--caaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaaca 234  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   || |||||||| || ||||| |||||||||| ||| ||    
T  391294 atgcaactccatgtgactccactttaataatatgtatgattcaataattaacatacatttaaaatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatca 391393  T
Q  235 accaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaac 281  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  391394 accaaaataatgtgtaattatatacaaccatgctcaaatacaacaac 391440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 37 - 281
Target Start/End: Original strand, 52500579 - 52500824
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52500579 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 52500678  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacatt-caaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| || ||||| |||||||||| ||| |||    
T  52500679 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacattaaaatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 52500778  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaac 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  52500779 ccaaaataatgtataattatatacaaccatgctcaaatacaacaac 52500824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 37 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 3260045 - 3259754
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3260045 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatataactgaccatgca 3259946  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||  || |||    
T  3259945 atgcaacttcatgtgactccactttaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttcaatcatcattagtaatcatcaatccaacaatcaaatcaa 3259846  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacgttcaatcaccactattcaagctagctaaacaactctcaggaactgt 328  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| |  || ||| |||||||| |||||| |  |||| ||||||||||||    
T  3259845 ccaaaacaatgcataattacatataaccttgctcaaa-acaacaacatcaaaccactactattcatgctagcaagtcaacactcaggaactgt 3259754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Original strand, 21396845 - 21397063
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21396845 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 21396944  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||| |||| || |||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||| ||| |||    
T  21396945 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcgataattagcatacatttcaatcatcatcagtaatcatcaattcagcaatccaatcaa 21397044  T
Q  236 ccaaaataatgcataatta 254  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21397045 ccaaaataatgcataatta 21397063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 58 - 328
Target Start/End: Original strand, 50082269 - 50082539
Alignment:
Q  58 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  50082269 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgccacggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactcaatatgactcca 50082368  T
Q  158 ctataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaaccaaaataatgcataattata 256  Q
    || |||||||||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||  |    
T  50082369 ctttaataatatgtatgattcaacaattggcatacatttcaaccatcatcagtaatcattaatccagtagttcaatcaaccgaaataatgcataattgca 50082468  T
Q  257 tataaccatgcccaaatacaacaacgttcaatcaccactattcaagctagctaaacaactctcaggaactgt 328  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  50082469 tataaccatgctcaaaaacaacaac-atcaaccactactattcaagctagcaaaacaacattcaggaactgt 50082539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3266673 - 3266455
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3266673 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 3266574  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||  || || |||||||||||||||  |  |||||| ||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||    
T  3266573 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 3266474  T
Q  236 ccaaaataatgcataatta 254  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  3266473 ccacaataatgcataatta 3266455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 49240898 - 49240680
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49240898 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 49240799  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||  || || |||||||||||| ||  |  |||||| ||||  ||||||||  ||||||| |||||| |||  ||||||    
T  49240798 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcattactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagaaatcaaaacaa 49240699  T
Q  236 ccaaaataatgcataatta 254  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  49240698 ccacaataatgcataatta 49240680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 49749612 - 49749394
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49749612 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 49749513  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||  || || |||||||||||| ||  |  |||||| ||||  ||||||||  ||||||| |||||| |||  ||||||    
T  49749512 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcattactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagaaatcaaaacaa 49749413  T
Q  236 ccaaaataatgcataatta 254  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  49749412 ccacaataatgcataatta 49749394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 23436036 - 23435916
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23436036 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 23435937  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcca 157  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23435936 atgcaactccatgtgactcca 23435916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 157
Target Start/End: Original strand, 26395713 - 26395833
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26395713 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 26395812  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcca 157  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26395813 atgcaactccatgtgactcca 26395833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 279
Target Start/End: Original strand, 1583938 - 1584182
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1583938 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcatctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 1584037  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaaca 234  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| |||| |||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||||||| ||  ||    
T  1584038 atgcaaactccatgtgacaccact-taacaacatgtatgattcaatcaatagcatacatttcagtcatcatcagtaatcatcaatccagcaatccattca 1584136  T
Q  235 acca-aaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaaca 279  Q
     ||| |||||||||| |||||  ||||||||||| |||| ||||||    
T  1584137 tccagaaataatgcacaattaagtataaccatgctcaaaaacaaca 1584182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 29448730 - 29448610
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29448730 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgga 29448631  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcca 157  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  29448630 atgcaactccatgtgactcca 29448610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 29455414 - 29455294
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29455414 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 29455315  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcca 157  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  29455314 atgcaactccatatgactcca 29455294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Original strand, 11937186 - 11937309
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11937186 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccttcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 11937285  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccact 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  11937286 aatgcaactccatgtgactccact 11937309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 195
Target Start/End: Original strand, 7359276 - 7359434
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7359276 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 7359375  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacatt 195  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||  || ||||||||    
T  7359376 atgcaaactccatgtgacaccact-taacaacatgtatgattcaatagttagcatacatt 7359434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 11202484 - 11202343
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11202484 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctcaccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacagctgaccatgca 11202385  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccactataataatatgtatgatt 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||  || || ||||||||||    
T  11202384 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 11202343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 5938961 - 5939111
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aac 143  Q
    ||||||||||||||| |||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5938961 gcaactagtactccaagacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaac 5939060  T
Q  144 tccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacatt 195  Q
    |||||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||  || ||||||||    
T  5939061 tccatgtgacaccact-taacagcatgtatgattcaatagttagcatacatt 5939111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 45959795 - 45959672
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45959795 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 45959696  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccact 159  Q
    |    |||||||| ||||||||||    
T  45959695 atacaaactccatatgactccact 45959672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 45142603 - 45142503
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45142603 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 45142504  T
Q  136 a 136  Q
    |    
T  45142503 a 45142503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 127
Target Start/End: Original strand, 34772196 - 34772286
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34772196 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 34772286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 47872475 - 47872376
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47872475 gctgttgagcaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 47872377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 2972777 - 2972687
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2972777 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 2972687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 20895032 - 20895122
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20895032 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 20895122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 183
Target Start/End: Original strand, 31665098 - 31665235
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||    
T  31665098 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctatatacaacttgaccatgc-atacatac 31665195  T
Q  144 tccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataa 183  Q
    ||||| |||||||| |  || || ||||||||||||||||    
T  31665196 tccatatgactccatttaaacaacatgtatgattcaataa 31665235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 54845001 - 54844912
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54845001 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatacaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 54844912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 19128352 - 19128297
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19128352 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 19128297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 20889448 - 20889503
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20889448 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 20889503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 36037636 - 36037691
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36037636 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 36037691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 49548593 - 49548538
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49548593 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 49548538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 899666 - 899721
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  899666 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 899721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 21881665 - 21881720
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21881665 tttatgcatatgcaatggacctactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 21881720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 30396269 - 30396324
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30396269 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 30396324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 33097166 - 33097221
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33097166 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 33097221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 35462656 - 35462566
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35462656 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 35462566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 42956031 - 42955976
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42956031 tttatgcatatgcaacggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 42955976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 49548413 - 49548323
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49548413 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggaccaactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 49548323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 41404716 - 41404662
Alignment:
Q  83 ttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41404716 ttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 41404662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 82
Target Start/End: Original strand, 391154 - 391199
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtt 82  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  391154 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtt 391199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Original strand, 14910723 - 14910792
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14910723 tccaggaccgaggccctcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 14910792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 33221408 - 33221498
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  33221408 caactagtgctccaggacacgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctatatacaactagaccatgca 33221498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 42220504 - 42220559
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42220504 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 42220559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 46044880 - 46044825
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46044880 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 46044825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 127
Target Start/End: Original strand, 27905352 - 27905418
Alignment:
Q  59 aggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27905352 aggaccgaggccctcaccgct--tttatgcttattcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 27905418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 93
Target Start/End: Original strand, 7356283 - 7356339
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatg 93  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||||||    
T  7356283 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatg 7356339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Original strand, 14485649 - 14485717
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||| ||||||||||| |||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14485649 tccagggccgaagccctc-ccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 14485717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Original strand, 18212297 - 18212343
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18212297 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 18212343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 26077728 - 26077682
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26077728 ttttatgcttatgtaattgacccacttgtgtatatctacatacaact 26077682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 17000184 - 17000139
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17000184 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 17000139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 127
Target Start/End: Original strand, 30237898 - 30237958
Alignment:
Q  67 agccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  30237898 agccctcaccgct-ttatatgcttatgaaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 30237958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 10972917 - 10972873
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10972917 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 10972873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 53)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 37 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 26113847 - 26113558
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26113847 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttaatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 26113748  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaac 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26113747 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcaataatcatcgatccagcagttcaaacaac 26113648  T
Q  237 caaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacgttcaatcaccactattcaagctagctaaacaactctcaggaact 326  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||    
T  26113647 caatataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacattcaaccaccactattaaagctagcaaaaccacactcaggaact 26113558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 37 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 26120460 - 26120169
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26120460 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtggatatctacatacaactgaccatgca 26120361  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaac 236  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26120360 atgcaacaacatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcaataatcatcgatccagcagttcaaacaac 26120261  T
Q  237 caaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacgttcaatcaccactattcaagctagctaaacaactctcaggaactgt 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  26120260 caaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacatacaaccaccactattcaagctagcaaaaccacactcaggaactgt 26120169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 37 - 278
Target Start/End: Original strand, 32627477 - 32627718
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32627477 gctgttgagcaactagtactccagaaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 32627576  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaac 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32627577 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaac 32627676  T
Q  237 caaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaac 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32627677 caaaataatgcataattatatataaccatgcctaaatacaac 32627718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 37 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18437258 - 18436967
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18437258 gctgttgagcaactagtactccaggactgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 18437159  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  18437158 atgcaactccatatgactccactttaacaatatgtatgattcaataattagcatacatttcaaccatcatcagtaatcatcaatccagtaattcaatcaa 18437059  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacgttcaatcaccactattcaagctagctaaacaactctcaggaactgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  18437058 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaaaaacaacaac-atcaaccactactattcaagctagcaaaacaacactcaggaactgt 18436967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 37 - 328
Target Start/End: Original strand, 33404733 - 33405024
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33404733 gctgttgagcaactagtactctaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 33404832  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  33404833 atgcaactccatatgactccactttaacaatatgtatgattcaataattagcatacatttcaaccatcatcagtaatcatcaatccagtaattcaatcaa 33404932  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacgttcaatcaccactattcaagctagctaaacaactctcaggaactgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  33404933 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaaaaacaacaac-atcaaccactactattcaagctagcaaaacaacactcaggaactgt 33405024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 37 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11899401 - 11899110
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11899401 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 11899302  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatga-ttcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaaca 234  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||    
T  11899301 atgcaactccatatgactccactttaacaatatgtatgatttcaataattagcatacatttcaaccatcatcagtaatcatcaatccagtaattcaatca 11899202  T
Q  235 accaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacgttcaatcaccactattcaagctagctaaacaactctcaggaactgt 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||  || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  11899201 accaaaataatgcataattatatataaccatgctcaaaaacaacaac-atcaacaactactattcaagctagc-aaacaacactcaggaactgt 11899110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 37 - 328
Target Start/End: Original strand, 11339851 - 11340142
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11339851 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 11339950  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||| |||    
T  11339951 atgcaactcaatatgactccactttaataatatgtatgattcaacaattggcatacatttcaaccatcatcagtaatcattaatccagtagttcaatcaa 11340050  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacgttcaatcaccactattcaagctagctaaacaactctcaggaactgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||| |||||||||| |||| |||||||  |||||||||||    
T  11340051 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaaaaacaacaac-atcaaacactactattcaagttagcaaaacaacattcaggaactgt 11340142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 37 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 17726424 - 17726140
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17726424 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 17726325  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||| |||    
T  17726324 atgcaactccatatgattccactttaacaatatgtatgattcaataattagcatacatttcaaccatcatcagtaatcatcaattcagtaattcaatcaa 17726225  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacgttcaatcaccactattcaagctagctaaacaactctcaggaactgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||       ||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  17726224 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaaaaacaacaac-------cactactactcaagctagc-aaacaacactcaggaactgt 17726140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 39 - 328
Target Start/End: Original strand, 642632 - 642920
Alignment:
Q  39 tgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaat 138  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  642632 tgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaaatgaccatgcaat 642731  T
Q  139 gcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaacca 238  Q
    ||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| ||||| |  |||||| | ||||| ||||||    
T  642732 gcaactcaatatgactccactttaacaatatgtatgattcaacaattgacatacattcaactatcatcagtaatcgttaatccagtagttcaatcaacca 642831  T
Q  239 aaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacgttcaatcaccactattcaagctagctaaacaactctcaggaactgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  642832 aaataatgcataattatatataaccatgctaaaaaacaacaac-atcaaccactactattcaagctagcaaaacaacattcaggaactgt 642920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 37 - 328
Target Start/End: Original strand, 2438964 - 2439255
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2438964 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctatatacaactgaccatgca 2439063  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataa-tatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaaca 234  Q
    |||||||||  | |||||||||| |||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || |||| ||    
T  2439064 atgcaactcattatgactccactttaataattatgtatgattcaatgattagcatacatttcaaccatcatcagtaatcatcaatccagtaaatcaatca 2439163  T
Q  235 accaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacgttcaatcaccactattcaagctagctaaacaactctcaggaactgt 328  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2439164 accaaagtaatgcataattatatgtaaccatgctcaaaaacaacaac-atcaaccactactattcaagctagc-aaacaacactcaggaactgt 2439255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 37 - 281
Target Start/End: Original strand, 11879147 - 11879392
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11879147 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttcatgcatatgcaatggacctacttgtttatatctacatacaactgaccatgca 11879246  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||| ||| |||    
T  11879247 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattatataagtaacatacatttcaaccatcatcagtattcatcaatccaacaatccaatcaa 11879346  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaac 281  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  11879347 ccaaaataatgtgtaattatatacaaccatgctcaaatacaacaac 11879392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 37 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 30602953 - 30602661
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30602953 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 30602854  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||| ||||||||| |||  || || |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| || ||||  || ||||||| ||| |||    
T  30602853 atgcaactctatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcaataattagcatacatttcaaccatcatcagtattcattaatgcagcaatccaatcaa 30602754  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacgttcaatcaccactattcaagctagctaaacaactctcaggaactgt 328  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |  || ||| | ||||||||| ||| |  |||| ||||||||||||    
T  30602753 ccaaaacaatgcataattatatataaccatgctaaaaaacaacaacatcaaaccactattattcaagcaagcaattcaacactcaggaactgt 30602661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Original strand, 749923 - 750141
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  749923 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 750022  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| |||  |  |||||| ||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||    
T  750023 atgcaactccatgtgactcaactttaacaacatgtatgattcgatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 750122  T
Q  236 ccaaaataatgcataatta 254  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  750123 ccacaataatgcataatta 750141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Original strand, 1317846 - 1318064
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1317846 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 1317945  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||  || || |||||||||||||||  |  |||||| ||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||    
T  1317946 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 1318045  T
Q  236 ccaaaataatgcataatta 254  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  1318046 ccacaataatgcataatta 1318064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26090042 - 26089824
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090042 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 26089943  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||  || || |||||||||||||||  |  |||||| ||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||    
T  26089942 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 26089843  T
Q  236 ccaaaataatgcataatta 254  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  26089842 ccacaataatgcataatta 26089824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8197291 - 8197073
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8197291 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 8197192  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||  |  |||||| ||||  |||||||| || ||||| || |||||||  || |||    
T  8197191 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtactcatcaattcagcaatcaaatcaa 8197092  T
Q  236 ccaaaataatgcataatta 254  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  8197091 ccacaataatgcataatta 8197073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 48988012 - 48987794
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48988012 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 48987913  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||  || || ||||||||||| |||  |  |||||| ||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||    
T  48987912 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcgatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 48987813  T
Q  236 ccaaaataatgcataatta 254  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  48987812 ccacaataatgcataatta 48987794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 40684854 - 40684636
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40684854 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 40684755  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||  || || ||||||||||| |||  |  |||||| ||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||  | ||||    
T  40684754 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcgatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaacacaa 40684655  T
Q  236 ccaaaataatgcataatta 254  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  40684654 ccacaataatgcataatta 40684636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 5187335 - 5187118
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5187335 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgcgtatatctacatacaactgaccatgc 5187236  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaaca 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||  |  |||||| ||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||  |||||    
T  5187235 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaaca 5187136  T
Q  235 accaaaataatgcataat 252  Q
    |||| |||||||||||||    
T  5187135 accacaataatgcataat 5187118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 13964094 - 13963849
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13964094 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 13963995  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaaca 234  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||| |||| ||| ||    
T  13963994 atgcaaactccatgtgacaccacttaaacaacatgtatgattcaataaataacatacatttcagtcatcatcagtaatcatcaatccaacaatccaatca 13963895  T
Q  235 acca-aaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaaca 279  Q
     ||| |||||||||| |||||  ||||||||||| |||| ||||||    
T  13963894 tccagaaataatgcacaattaagtataaccatgctcaaaaacaaca 13963849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 267
Target Start/End: Original strand, 37285289 - 37285521
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37285289 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcatctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 37285388  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaaca 234  Q
    |||| |||| |||||||| |||||  || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||    
T  37285389 atgcaaacttcatgtgacaccacttaaacaacatgtgtgattcaataaataacatacatttcagtcatcatcagtaatcatcaatccagcaatccaatca 37285488  T
Q  235 accaaaataatgcataattatatataaccatgc 267  Q
     || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37285489 tcccaaataatgcataattacatataaccatgc 37285521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Original strand, 2281166 - 2281402
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2281166 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctatttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgc 2281265  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||||||| |||| |||||  ||| | |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||    ||   ||| | ||| |||    
T  2281266 aatgcaactccatatgacaccacttaaatgacatgtatgactcaataaatagcatacaatcaaccatcatcagtattcggtaatgtggcactccaatcaa 2281365  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaa 272  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  2281366 ccaaaacaatgcatgattatatatacccatgctcaaa 2281402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 11299745 - 11299626
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11299745 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 11299646  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcc 156  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11299645 atgcaactccatgtgactcc 11299626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 11308109 - 11307990
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11308109 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 11308010  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcc 156  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11308009 atgcaactccatgtgactcc 11307990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 39 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 40923012 - 40922894
Alignment:
Q  39 tgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaat 138  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40923012 tgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaat 40922913  T
Q  139 gcaactccatgtgactcca 157  Q
    |||||||||||||||||||    
T  40922912 gcaactccatgtgactcca 40922894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 49150665 - 49150806
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49150665 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 49150764  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgatt 177  Q
    |||||||||||||||||| |||||  | ||| ||||||||||    
T  49150765 aatgcaactccatgtgaccccacttaactaacatgtatgatt 49150806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 49157355 - 49157496
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49157355 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 49157454  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgatt 177  Q
    |||||||||||||||||| |||||  | ||| ||||||||||    
T  49157455 aatgcaactccatgtgaccccacttaactaacatgtatgatt 49157496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 20019763 - 20019614
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20019763 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 20019664  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaat 185  Q
    |    |||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||    
T  20019663 atacaaactccatgtgactccacttaaaaaacatgtatgattcaataaat 20019614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 157
Target Start/End: Original strand, 42058629 - 42058750
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42058629 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 42058728  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactcca 157  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  42058729 aatgcaactccatgtgactcca 42058750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 2026316 - 2026196
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2026316 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagctctcaccgttgttttatgcatatggaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 2026217  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcca 157  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2026216 atgcaactccatgtgactcca 2026196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 315
Target Start/End: Original strand, 49158822 - 49159101
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49158822 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 49158921  T
Q  137 atgc-aactccatgt-gactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcaataatc-atcgatccagcaattcaaac 233  Q
    |||| |||||||| |  |||||||| ||| || ||||||| || |||||  | ||||||||||  ||||||||  |||| ||| || |||||||  || |    
T  49158922 atgcaaactccatataaactccactttaacaacatgtatggtt-aataataagcatacattcagtcatcatcagcaatcaatcaattcagcaatcaaatc 49159020  T
Q  234 aaccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacgttcaatcaccactattcaagctagctaaacaac 315  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||  ||| |||| | || |||||||| || |||||| || ||||| || ||| |||||||    
T  49159021 atccagaataatgcataattacatgaaactatgctc-aacacaacaacattaaatcactaccattcatgcaagcaaaacaac 49159101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 17468344 - 17468226
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17468344 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 17468246  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcc 156  Q
        ||||||||||||||||    
T  17468245 tacaaactccatgtgactcc 17468226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Original strand, 17584870 - 17584988
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17584870 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 17584968  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcc 156  Q
        ||||||||||||||||    
T  17584969 tacaaactccatgtgactcc 17584988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Original strand, 37379971 - 37380089
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37379971 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 37380069  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcc 156  Q
        ||||||||||||||||    
T  37380070 tacaaactccatgtgactcc 37380089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Original strand, 21757373 - 21757494
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21757373 gctgttgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 21757471  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccact 159  Q
        |||||||||||||||||||    
T  21757472 tacaaactccatgtgactccact 21757494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13453892 - 13453756
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13453892 gctgttgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 13453794  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatg 174  Q
        |||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  13453793 tacaaacttcatgtgactccacttaaataacatgtatg 13453756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 8213362 - 8213299
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatgga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8213362 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatgga 8213299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 2388649 - 2388551
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||   || |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2388649 gctgttgagcaactagtgctccagaacatgagtcctctctgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 2388551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 136
Target Start/End: Original strand, 46174405 - 46174504
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46174405 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcccctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacatgaccatgc 46174503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 46649858 - 46649948
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46649858 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 46649948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 15838736 - 15838791
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15838736 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 15838791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16843920 - 16843865
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16843920 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 16843865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 30271831 - 30271705
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccactata-ataatatgtatgattc 178  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  || ||| |||||||| | || | || |||||||||||    
T  30271831 tttatgcatatgctgtggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacattcttcatatgactccaatttacacaacatgtatgattc 30271733  T
Q  179 aataa--ataacatacattcaaccatca 204  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||||    
T  30271732 aataaatataacatacattcaagcatca 30271705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 12461640 - 12461695
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12461640 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 12461695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 19439434 - 19439489
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19439434 tttatgcatattctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 19439489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 23521124 - 23521179
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23521124 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 23521179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 13019830 - 13019885
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13019830 tttatgcatatgttatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 13019885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 16073993 - 16073934
Alignment:
Q  68 gccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16073993 gccctcaccgct-ttatatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 16073934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Original strand, 18607025 - 18607071
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18607025 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 18607071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 14281662 - 14281617
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14281662 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 14281617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 136
Target Start/End: Original strand, 32771662 - 32771715
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  32771662 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaacttacaatgca 32771715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 35962754 - 35962709
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35962754 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 35962709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Original strand, 15166912 - 15166983
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||||| ||||| || | |||||||| |||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15166912 tccaggaccgaagtcctcatcgtt-ttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaact 15166983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 37 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 18603 - 18359
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18603 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccttgca 18504  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaac 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18503 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaac 18404  T
Q  237 caaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaac 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18403 caaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaac 18359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 39)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 37 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 20277288 - 20277028
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20277288 gctgttgagcaactagtactccaggaccaaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 20277189  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaac 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20277188 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcaataatcatcaatccagcaattcaaacaac 20277089  T
Q  237 caaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacgttcaatcaccactat 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  20277088 caaaataatgcataactatatataaccatgcccaaatacaacaacattcaaccaccactat 20277028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 37 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 28556538 - 28556248
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28556538 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 28556439  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaac 236  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  28556438 atgcaactccatgcgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacatgcaaccatcatcaataatcatcaatccagcaattcaatcgac 28556339  T
Q  237 caaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacgttcaatcaccactattcaagctagctaaacaactctcaggaactgt 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  28556338 caaaataatgcataattatatataaccatgctcaaatacaacaac-atcaacctccactattcaagctagcaaaataacactcaggaactgt 28556248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 37 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18026788 - 18026497
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18026788 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 18026689  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  18026688 atgcaactccatatgactccactttaacaatatgtatgattcaataattagcatacatttcaaccatcatcagtaatcatcaatccagtaattcaatcaa 18026589  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacgttcaatcaccactattcaagctagctaaacaactctcaggaactgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  18026588 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaaaaacaacaac-atcaaccactactattcaagctagcaaaacaacactcaggaactgt 18026497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 39 - 281
Target Start/End: Original strand, 18418205 - 18418449
Alignment:
Q  39 tgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaat 138  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18418205 tgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaac 18418304  T
Q  139 gcaactccatgtgactccac-tataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaac 236  Q
    |||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||    
T  18418305 gcaactccatgtgactccacttaaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttaaatcatcatcagtattcatcaatccagcaaatcaaacaac 18418404  T
Q  237 caaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaac 281  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  18418405 caacataatgcataattataaataaccatgctcaaaaacaacaac 18418449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 58 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 36212066 - 36211843
Alignment:
Q  58 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36212066 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 36211967  T
Q  158 ctataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaaccaaaataatgcataattata 256  Q
    ||  || || |||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  36211966 cttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttaaatcatcatcagtattcatcaatctagcaatccaatcaaccaaaacaatgcataattaaa 36211867  T
Q  257 tataaccatgcccaaatacaacaac 281  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||    
T  36211866 tataactatgcccaaa-acaacaac 36211843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Original strand, 6740597 - 6740815
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6740597 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 6740696  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||  || || |||||||||||||||  |  |||||| ||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||    
T  6740697 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 6740796  T
Q  236 ccaaaataatgcataatta 254  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  6740797 ccacaataatgcataatta 6740815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Original strand, 48427932 - 48428150
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48427932 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 48428031  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||  || || |||||||||||||||  |  |||||| ||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||    
T  48428032 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 48428131  T
Q  236 ccaaaataatgcataatta 254  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  48428132 ccacaataatgcataatta 48428150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 31535336 - 31535118
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31535336 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 31535237  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||  || || ||||||||||| |||  |  |||||| ||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||    
T  31535236 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcgatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 31535137  T
Q  236 ccaaaataatgcataatta 254  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  31535136 ccacaataatgcataatta 31535118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 31564053 - 31563835
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31564053 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 31563954  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||  || || ||||||||||| |||  |  |||||| ||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||    
T  31563953 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcgatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 31563854  T
Q  236 ccaaaataatgcataatta 254  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  31563853 ccacaataatgcataatta 31563835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 58 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 20396888 - 20396691
Alignment:
Q  58 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20396888 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 20396789  T
Q  158 ctataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaaccaaaataatgcataatta 254  Q
    ||  || || |||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  20396788 cttaaacaacatgtatgattcaataattagcatacatttcaatcatcatcagtaatcatcaattcaacaatccaatcaaccaaaataatgcaaaatta 20396691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 39189717 - 39189595
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39189717 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 39189618  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccact 159  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  39189617 atgcaactccatgtgactccact 39189595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 157
Target Start/End: Original strand, 39094400 - 39094520
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39094400 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 39094499  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcca 157  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  39094500 atgcaactccatgtgactcca 39094520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 38908090 - 38907968
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38908090 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 38907991  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccact 159  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  38907990 atgcaacttcatgtgactccact 38907968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Original strand, 37682165 - 37682288
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37682165 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 37682264  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccact 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  37682265 aatgcaactccatgtgactccact 37682288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Original strand, 37675472 - 37675595
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37675472 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccttcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 37675571  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccact 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  37675572 aatgcaactccatgtgactccact 37675595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 45 - 254
Target Start/End: Original strand, 20292767 - 20292978
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aac 143  Q
    |||||||||||||||||||   || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20292767 gcaactagtactccaggacatgagtcatctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaac 20292866  T
Q  144 tccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaaccaaaat 242  Q
    ||||||| || |||||  || || |||||||||||||||| || |||||| || |  |||||||| |||||||| || || |||||||| || |||||||    
T  20292867 tccatgtaacaccacttaaacaacatgtatgattcaataattagcatacattttagtcatcatcagtaatcatcaattcaacaattcaatcatccaaaat 20292966  T
Q  243 aatgcataatta 254  Q
    ||||||||||||    
T  20292967 aatgcataatta 20292978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 22185640 - 22185534
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22185640 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 22185541  T
Q  137 atgcaac 143  Q
    |||||||    
T  22185540 atgcaac 22185534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 45 - 254
Target Start/End: Original strand, 20299401 - 20299607
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaact 144  Q
    |||||||||||||||||||   || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |    
T  20299401 gcaactagtactccaggacatgagtcatctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatg----t 20299496  T
Q  145 ccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaaccaaaata 243  Q
    ||||||||| |||||  || || |||||||||||||||| || |||||| ||||  |||||||| |||||||| || ||||||| ||| || ||||||||    
T  20299497 ccatgtgacaccacttaaacaacatgtatgattcaataattagcatacatttcagtcatcatcagtaatcatcaattcagcaatccaatcatccaaaata 20299596  T
Q  244 atgcataatta 254  Q
    |||||||||||    
T  20299597 atgcataatta 20299607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 177
Target Start/End: Original strand, 20570828 - 20570961
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aac 143  Q
    |||||||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20570828 gcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaac 20570927  T
Q  144 tccatgtgactccactataataatatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||  || || ||||||||||    
T  20570928 tccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 20570961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 279
Target Start/End: Original strand, 17149454 - 17149641
Alignment:
Q  94 caatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatac 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| |||| |||||    
T  17149454 caatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgacaccact-taacaacatgtatgattcaatcaatagcatac 17149552  T
Q  193 a-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaacca-aaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaaca 279  Q
    | ||||  |||||||| |||||||| |||||||||| ||  || ||| |||||||||| |||||  ||||||||||| |||| ||||||    
T  17149553 atttcagtcatcatcagtaatcatcaatccagcaatccagtcatccagaaataatgcacaattaagtataaccatgctcaaaaacaaca 17149641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 38 - 185
Target Start/End: Original strand, 42626280 - 42626426
Alignment:
Q  38 ctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaa 137  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||    | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42626280 ctgttgagcaactagtgctccaggacatgggtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcat 42626378  T
Q  138 tgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaat 185  Q
       |||||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||    
T  42626379 acaaactccatgtgactccacttaaacaacatctatgattcaataaat 42626426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Original strand, 4231267 - 4231390
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4231267 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 4231366  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccact 159  Q
    |    |||||||| ||||||||||    
T  4231367 atacaaactccatatgactccact 4231390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20076987 - 20076753
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20076987 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctctgctgttttatgcatatgcaatggacttacttgtgtatatctacatacaacatgaccatgc 20076888  T
Q  136 aatgca-actccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataa--catacatt--caaccatcatcaataatcatcgatccagcaattca 230  Q
     || || ||||||| ||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||  ||||||||  |||||||||  || | ||||| || ||||||| ||    
T  20076887 -atacatactccatatgactccacttaaataacatgtatggtt-aataaataaagcatacatttccaaccatcagtaacattcatcaatgcagcaatcca 20076790  T
Q  231 aacaaccaaaataatgcataattatatataaccatgc 267  Q
    | || ||| || |||||| ||||| ||||||| ||||    
T  20076789 atcatccagaacaatgcacaattaaatataactatgc 20076753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Original strand, 21963084 - 21963207
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21963084 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 21963183  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccact 159  Q
    |    |||||||| ||||||||||    
T  21963184 atacaaactccatatgactccact 21963207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 3652735 - 3652679
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatg 93  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3652735 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgttgttttatgcatatg 3652679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 21920884 - 21920974
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21920884 caactagtactccaggacataagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatgaaccaactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 21920974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 29602319 - 29602229
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29602319 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 29602229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Original strand, 19961273 - 19961342
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19961273 tccaggaccgaggccctcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 19961342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 36615058 - 36615113
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36615058 tttatgcatatgcaatggacccccttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 36615113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 49328155 - 49328210
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49328155 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 49328210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 98
Target Start/End: Original strand, 17146336 - 17146397
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17146336 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatg 17146397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 29596884 - 29596794
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  29596884 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgtaatggacccactcgtgtatttctacatacaactagaccatgca 29596794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 43088514 - 43088557
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa 125  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  43088514 tttatgcatatgcaatggacccccttgtgtatatctacatacaa 43088557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 19046160 - 19046091
Alignment:
Q  212 tcatcgatccagcaattcaaacaaccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaac 281  Q
    ||||| |||||||||| ||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||    
T  19046160 tcatcaatccagcaatccaatcatcccaaataatgcataattacatataaccatgctcaaaaactacaac 19046091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 47484229 - 47484284
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47484229 tttatgcatatgctatagacccactagtgtatatctacatacaacttgaccatgca 47484284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Original strand, 20242693 - 20242739
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20242693 ttttatgcttatgcaaatgacccacttgtgtatatctacatacaact 20242739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 23066718 - 23066673
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23066718 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 23066673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 20824373 - 20824329
Alignment:
Q  83 ttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20824373 ttatgcttatgcaactaacctacttgtgtatatctacatacaact 20824329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Original strand, 21698261 - 21698305
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  21698261 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 21698305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 37 - 328
Target Start/End: Original strand, 104367 - 104658
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  104367 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 104466  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||| |||    
T  104467 atgcaactcaatatgactccactttaataatatgtatgattcaacaattggcatacatttcaaccatcatcagtaatcattaatccagtaattcaatcaa 104566  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacgttcaatcaccactattcaagctagctaaacaactctcaggaactgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  104567 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaaaaacaacaac-atcaaccactactattcaagctagcaaaacaacactcaggaactgt 104658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 37 - 281
Target Start/End: Original strand, 4077501 - 4077746
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4077501 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 4077600  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||| ||| |||    
T  4077601 atgcaactccatgtgactccactataataatacgtatgagtcaataaataacatacatttcaaccatcatcagtattcatcaatccaacaatccaatcaa 4077700  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaac 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  4077701 ccaaaataatgtataattatatacaaccatgctcaaatacaacaac 4077746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 37 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 44091140 - 44090895
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44091140 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 44091041  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||| ||| ||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||    
T  44091040 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcactaattaacatacatttaaatcatcatcagtaatcatcaatccagcaatccaatcaa 44090941  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaac 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  44090940 ccaaaataatgtataattatatacaaccatgctcaaatacaacaac 44090895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24426892 - 24426674
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24426892 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 24426793  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    |||||||||||| ||||||||||  || || ||||||||||| |||| || |||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||| ||| |||    
T  24426792 atgcaactccatatgactccacttaaacaacatgtatgattcgataattagcatacatttcaatcatcatcagtaatcatcaattcagcaatccaatcaa 24426693  T
Q  236 ccaaaataatgcataatta 254  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24426692 ccaaaataatgcataatta 24426674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 37 - 281
Target Start/End: Original strand, 27729589 - 27729834
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27729589 gctgttgagcaactagtactctagggccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttatgtatatctacatacaactgaccatgca 27729688  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||| ||||||||| || || | |||||| |  ||||| |||||||||| ||| |||    
T  27729689 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttaaatcttcatcagtgttcatcaatccagcaatccaatcaa 27729788  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaac 281  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  27729789 ccaaaataatgtataattatgtacaaccatgctcaaatacaacaac 27729834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 281
Target Start/End: Original strand, 27037325 - 27037571
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27037325 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 27037424  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaaca 234  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||    
T  27037425 atgcaaactccatgtgacaccacttaaacaacatgtatgattcaataaataacatacatttcagtcatcatcagtaatcatcaatccagcaatccaatca 27037524  T
Q  235 accaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaac 281  Q
     || |||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||    
T  27037525 tcccaaataatgcataattacatataaccatgctcaaaaactacaac 27037571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 2385973 - 2385756
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2385973 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 2385874  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    |||||||||||| ||||||||||  || || ||||||||||| | || || |||||| ||||| ||||||||||||||||  || ||||||| ||| | |    
T  2385873 atgcaactccatatgactccacttaaacaacatgtatgattcga-aattagcatacatttcaatcatcatcaataatcattaattcagcaatccaatcca 2385775  T
Q  236 ccaaaataatgcataatta 254  Q
     ||||||||||||||||||    
T  2385774 tcaaaataatgcataatta 2385756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 281
Target Start/End: Original strand, 31828693 - 31828937
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31828693 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgc 31828792  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||||||| |||| |||||  ||| | |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||    || ||||| | ||| |||    
T  31828793 aatgcaactccatatgacaccacttaaatgacatgtatgactcaataaatagcatacaatcaaccatcatcagtattcggtaatgcagcactccaatcaa 31828892  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaac 281  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  31828893 ccaaaacaatgcatgattatatatacccatgctcaaa-acaacaac 31828937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 281
Target Start/End: Original strand, 31834045 - 31834289
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31834045 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgc 31834144  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||||||| |||| |||||  ||| | |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||    || ||||| | ||| |||    
T  31834145 aatgcaactccatatgacaccacttaaatgacatgtatgactcaataaatagcatacaatcaaccatcatcagtattcggtaatgcagcactccaatcaa 31834244  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaac 281  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  31834245 ccaaaacaatgcatgattatatatacccatgctcaaa-acaacaac 31834289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 36984617 - 36984381
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36984617 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgc 36984518  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||||||| |||| |||||  ||| | |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||    || ||||| | ||| |||    
T  36984517 aatgcaactccatatgacaccacttaaatgacatgtatgactcaataaatagcatacaatcaaccatcatcagtattcggtaatgcagcactccaatcaa 36984418  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaa 272  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  36984417 ccaaaacaatgcatgattatatatacccatgctcaaa 36984381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 4071596 - 4071370
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4071596 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 4071497  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaat-aacatac-attca---accatcatcaataatcatc-gatccagcaattc 229  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||| ||||| | ||||||| || ||   | |||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  4071496 aatgcaactccaagtgactccacttaaataacatgtatgatt-aataattaaacatacaatgcattcatcatcatcaatcatcatcaaatccagcaattc 4071398  T
Q  230 aaacaaccaaaataatgcataattatata 258  Q
    || ||| | ||||||||||||||||||||    
T  4071397 aatcaatc-aaataatgcataattatata 4071370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 71544 - 71347
Alignment:
Q  58 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  71544 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 71445  T
Q  158 ctataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaaccaaaataatgcataatta 254  Q
    ||  || || |||||||||||| ||  |  |||||| ||||  |||||||| |||||||| || |||||||  || |||||| |||||||||||||||    
T  71444 cttaaacaacatgtatgattcactactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaaccacaataatgcataatta 71347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 157
Target Start/End: Original strand, 1067177 - 1067297
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1067177 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 1067276  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcca 157  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1067277 atgcaactccatgtgactcca 1067297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 157
Target Start/End: Original strand, 21604845 - 21604965
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21604845 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 21604944  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcca 157  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21604945 atgcaactccatgtgactcca 21604965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 24481651 - 24481531
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24481651 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 24481552  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcca 157  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  24481551 atgcaactccatgtgactcca 24481531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 30196566 - 30196446
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30196566 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgca 30196467  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcca 157  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  30196466 atgcaactccatgtgactcca 30196446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Original strand, 20850270 - 20850393
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20850270 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 20850369  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccact 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20850370 aatgcaactccatgtgactccact 20850393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 157
Target Start/End: Original strand, 1061794 - 1061914
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1061794 gctgttgagcaactactactccaggaccgaagccctcatcgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 1061893  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcca 157  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1061894 atgcaactccatgtgactcca 1061914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 11360291 - 11360175
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11360291 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttat----atgcaatggacctacttgtgtatatctatatacaactgaccatgca 11360196  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcca 157  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11360195 atgcaactccatgtgactcca 11360175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 34131 - 34272
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34131 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 34230  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccactataataatatgtatgatt 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||  || || ||||||||||    
T  34231 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 34272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 22013164 - 22013048
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22013164 gctgttgagcaactaatactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggaactacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 22013065  T
Q  137 atgc-aactccatgtga 152  Q
    |||| ||||||||||||    
T  22013064 atgcaaactccatgtga 22013048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Original strand, 28292800 - 28293020
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  28292800 gctgttgagcaactagtactccaggacaaaagacatcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccttgc 28292899  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataa-ataacatacat-tcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaac 233  Q
    |    |||||||| |||||||||| | | || ||||||| || ||||| | | |||||||  |||||||||  || | ||| | || ||||||| ||| |    
T  28292900 atacaaactccatatgactccacttttacaacatgtatgtttaaataacaaatcatacatcacaaccatcagtaacattcaacaattcagcaatccaatc 28292999  T
Q  234 aaccaaaataatgcataatta 254  Q
    | ||| |||||||||||||||    
T  28293000 acccagaataatgcataatta 28293020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 35244086 - 35243963
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35244086 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 35243987  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccact 159  Q
    |    |||||||| ||||||||||    
T  35243986 atacaaactccatatgactccact 35243963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 136
Target Start/End: Original strand, 11466152 - 11466251
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11466152 gctgttgagcaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 11466250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 183
Target Start/End: Original strand, 27272376 - 27272478
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccactataataatatgtatgattca 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| ||||||||||  || || || |||||||||    
T  27272376 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttaaacaacatatatgattca 27272474  T
Q  180 ataa 183  Q
    ||||    
T  27272475 ataa 27272478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17592547 - 17592466
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccactata 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||||||    
T  17592547 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccactata 17592466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 36800680 - 36800735
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36800680 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 36800735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 45028632 - 45028687
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45028632 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 45028687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 127
Target Start/End: Original strand, 14563956 - 14564001
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14563956 tttatgcatatgcaatgaacctacttgtgtatatctacatacaact 14564001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 13101188 - 13101133
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13101188 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 13101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 15643304 - 15643249
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15643304 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 15643249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25590216 - 25590161
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25590216 tttatgcatatgaaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 25590161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 32911497 - 32911442
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32911497 tttatgcatatgctatgcacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 32911442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22013050 - 22012968
Alignment:
Q  173 tgattcaataaataacatacatt-caaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaaccaaaataatgcataatta 254  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||  |||||||| |||||||| || ||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  22013050 tgattcaataattagcatacatttcagtcatcatcagtaatcatcaattcagcaatccaatcatccaaaataatgcataatta 22012968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Original strand, 9241492 - 9241538
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9241492 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 9241538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Original strand, 22810042 - 22810088
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22810042 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 22810088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 45)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 37 - 328
Target Start/End: Original strand, 35541129 - 35541420
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35541129 gctgttgagcaactcgtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 35541228  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||| |||    
T  35541229 atgcaactcaatatgactcccctttaataatatgtatgattcaacaattggcatacatttcaaccatcatcagtaaccattaatccagtagttcaatcaa 35541328  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacgttcaatcaccactattcaagctagctaaacaactctcaggaactgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  35541329 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaaaaacaacaac-atcaaccactactattcaagctagcaaaacaacattcaggaactgt 35541420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 37 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 16887348 - 16887102
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16887348 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 16887249  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaac--catcatcaataatcatcgatccagcaattcaaaca 234  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||| ||||||||||  ||   |||||||| || ||||| |||||||||| ||| ||    
T  16887248 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatctaaaatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatca 16887149  T
Q  235 accaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaac 281  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16887148 accaaaataatgtataattatatacaaccatgctcaaatacaacaac 16887102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14736871 - 14736652
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14736871 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctattttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 14736772  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccac-tataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaaca 234  Q
    |||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  14736771 atgcaactccatgtgactccacttaaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttaaatcatcatcaatattcatcaatccagcaattcaaaca 14736672  T
Q  235 accaaaataatgcataatta 254  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  14736671 accaacataatgcataatta 14736652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23224797 - 23224579
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23224797 gctgttgagcaactagtactccaggaacgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 23224698  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||| |||| ||| |  ||||||| ||| |||    
T  23224697 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattagcatacatttcaatcatcatcagtaattatcaactcagcaatccaatcaa 23224598  T
Q  236 ccaaaataatgcataatta 254  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23224597 ccaaaataatgcataatta 23224579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 9205400 - 9205182
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9205400 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 9205301  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||  || || |||||||||||||||  |  |||||| ||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||    
T  9205300 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 9205201  T
Q  236 ccaaaataatgcataatta 254  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  9205200 ccacaataatgcataatta 9205182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 26486070 - 26485824
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26486070 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccactgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaattgaccatgca 26485971  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaaca 234  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||| |||| ||| ||    
T  26485970 atgcaaactccatgtgacaccacttaaacaacatgtatgattcaataaataacatacacttcagtcatcatcagtaatcatcaatccaacaatccaatca 26485871  T
Q  235 accaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaac 281  Q
     || |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  26485870 tcccaaataatgcataattacatataaccatgctcaaaaacaacaac 26485824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 3224733 - 3224487
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3224733 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 3224634  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaaca 234  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||| || |||||||| |||||||||| ||| ||    
T  3224633 atgcaaactccatgtgacaccacttgaacaacatgtatgattcaataaatagcatacatttcagtcatcaacagtaatcatcaatccagcaatccaatca 3224534  T
Q  235 accaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaac 281  Q
     || ||||||| |||||||| |||||||||||| |||| || |||||    
T  3224533 tcccaaataatacataattacatataaccatgctcaaaaactacaac 3224487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 327
Target Start/End: Original strand, 28980805 - 28981097
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28980805 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 28980904  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataat--aatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaac 233  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||  || |||||||||||||||  |  |||||| ||||  |||||||| || ||||| || |||||||  || |    
T  28980905 atgcaactccatgtgactccaattaaatacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtactcatcaattcagcaatcaaatc 28981004  T
Q  234 aaccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacgttcaatcaccactattcaagctagctaaacaactctcaggaactg 327  Q
    || || ||||||| |||||||||   |||||| | |||||||||||||   ||| ||| |||| |||||||||| |||| || ||| |||||||    
T  28981005 aatcacaataatgtataattatacgcaaccatactcaaatacaacaac-accaaccactactaatcaagctagcaaaactacactctggaactg 28981097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 281
Target Start/End: Original strand, 28986025 - 28986272
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28986025 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 28986124  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataat--aatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaac 233  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||  || |||||||||||||||  |  |||||| ||||  |||||||| || ||||| || |||||||  || |    
T  28986125 atgcaactccatgtgactccaattaaatacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtactcatcaattcagcaatcaaatc 28986224  T
Q  234 aaccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaac 281  Q
    || || ||||||| |||||||||   |||||| | |||||||||||||    
T  28986225 aatcacaataatgtataattatacgcaaccatactcaaatacaacaac 28986272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 27909634 - 27909514
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27909634 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 27909535  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcca 157  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27909534 atgcaactccatgtgactcca 27909514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 27956053 - 27955933
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27956053 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 27955954  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcca 157  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27955953 atgcaactccatgtgactcca 27955933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 36800492 - 36800372
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36800492 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 36800393  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcca 157  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  36800392 atgcaactccatgtgactcca 36800372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Original strand, 14563622 - 14563741
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14563622 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 14563721  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcc 156  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14563722 atgcaactccatgtgactcc 14563741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 157
Target Start/End: Original strand, 14765668 - 14765788
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14765668 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccactgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 14765767  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcca 157  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14765768 atgcaactccatgtgactcca 14765788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Original strand, 214023 - 214146
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  214023 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 214122  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccact 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  214123 aatgcaactccatgtgactccact 214146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 238231 - 238108
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  238231 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 238132  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccact 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  238131 aatgcaactccatgtgactccact 238108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Original strand, 727646 - 727769
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  727646 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 727745  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccact 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  727746 aatgcaactccatgtgactccact 727769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Original strand, 800147 - 800270
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  800147 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 800246  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccact 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  800247 aatgcaactccatgtgactccact 800270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Original strand, 851540 - 851663
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  851540 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 851639  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccact 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  851640 aatgcaactccatgtgactccact 851663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 4520784 - 4520663
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4520784 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 4520685  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactcca 157  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4520684 aatgcaactccatgtgactcca 4520663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 23117290 - 23117431
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23117290 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 23117389  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccactataataatatgtatgatt 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||  || || ||||||||||    
T  23117390 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 23117431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 3697724 - 3697865
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3697724 gctgttgagcaactagtactccagtacatgagtcctcaccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 3697823  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccactataataatatgtatgatt 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||  || || ||||||||||    
T  3697824 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 3697865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10956735 - 10956595
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |   || |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10956735 gctgttgagcaactagtactccagggcatgagtcctctccgttgttttatgcatatgcaatggatctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 10956636  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgatt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||    
T  10956635 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 10956595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Original strand, 27345797 - 27345944
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27345797 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 27345895  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaat 185  Q
        |||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||    
T  27345896 tacaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataaat 27345944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10948608 - 10948513
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||    
T  10948608 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 10948513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14746570 - 14746428
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14746570 gctgttgagcaactagtgctccaggacttgagtcctctccgctgtttttatgcatatgcaatcgacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 14746471  T
Q  136 aatgc-aactccatgtgactccactataataatatgtatgatt 177  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  || || ||||||||||    
T  14746470 aatgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 14746428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Original strand, 6588151 - 6588298
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6588151 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 6588249  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaat 185  Q
        |||||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||    
T  6588250 tacaaactccatgtgactccacttaaacaacatctatgattcaataaat 6588298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 40144344 - 40144223
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40144344 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 40144246  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccact 159  Q
        |||||||||||||||||||    
T  40144245 tacaaactccatgtgactccact 40144223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 16266920 - 16266797
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgt--atatctacatacaactgaccatg 134  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16266920 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatatctacatacaactgaccatg 16266822  T
Q  135 caatgcaactccatgtgactccact 159  Q
    ||    |||||||||||||||||||    
T  16266821 catacaaactccatgtgactccact 16266797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 183
Target Start/End: Original strand, 27873842 - 27873979
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  27873842 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatac 27873939  T
Q  144 tccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataa 183  Q
    ||||| ||||||||||   | || ||||||||||||||||    
T  27873940 tccatatgactccacttatacaacatgtatgattcaataa 27873979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 183
Target Start/End: Original strand, 27948630 - 27948767
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  27948630 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatac 27948727  T
Q  144 tccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataa 183  Q
    ||||| ||||||||||   | || ||||||||||||||||    
T  27948728 tccatatgactccacttatacaacatgtatgattcaataa 27948767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 11392612 - 11392506
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccactataataatatgtatgattca 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| ||||||||||   | || ||||||| ||||    
T  11392612 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttatacaacatgtatggttca 11392514  T
Q  180 ataaataa 187  Q
    ||||||||    
T  11392513 ataaataa 11392506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 183
Target Start/End: Original strand, 27889972 - 27890109
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatac-aactgaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || || ||    
T  27889972 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaaattgaccatgc-atacatac 27890069  T
Q  144 tccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataa 183  Q
    ||||| ||||||||||   | || ||||||||||||||||    
T  27890070 tccatatgactccacttatacaacatgtatgattcaataa 27890109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14416615 - 14416525
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14416615 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 14416525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 29299085 - 29299030
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29299085 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 29299030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 29305631 - 29305576
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29305631 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 29305576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 29328284 - 29328374
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29328284 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 29328374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 808008 - 807966
Alignment:
Q  117 tacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccact 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  808008 tacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccact 807966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 25701610 - 25701529
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||| |||||||||   || |||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25701610 gcaactagtgctccaggacatgagtcctttccgctgttt-atgcttatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 25701529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 22063604 - 22063558
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22063604 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 22063558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 22176076 - 22176030
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22176076 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 22176030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 127
Target Start/End: Original strand, 39363631 - 39363692
Alignment:
Q  66 aagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||||| ||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  39363631 aagccctcac-gcttttatatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 39363692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 136
Target Start/End: Original strand, 20006386 - 20006439
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20006386 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaacttacaatgca 20006439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 8729051 - 8728980
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||||| ||||| || | |||||||| |||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  8729051 tccaggaccgaagtcctcatcgtt-ttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaact 8728980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 136
Target Start/End: Original strand, 43687487 - 43687577
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||| |||||||   ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43687487 gcaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgttt-atgcatatgtaatggactcccttatgtatatctacatacaacttgaccatgca 43687577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 54)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 37 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 54833274 - 54832985
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54833274 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgttgttttatgcacatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 54833175  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||| |||    
T  54833174 atgcaactcaatatgactccactttaataatatgtatgattcaacaattggcatacatttcaaccatcatcagtaatcattaatccagtagttcaatcaa 54833075  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacgttcaatcaccactattcaagctagctaaacaactctcaggaactgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  54833074 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaaa-acaacaac-atcaaccactactattcaagctagc-aaacaacactcaggaactgt 54832985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 37 - 328
Target Start/End: Original strand, 10767818 - 10768110
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10767818 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgttgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 10767917  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||| |||    
T  10767918 atgcaactcaatatgactccactttattaatatgtatgattcaacaattgacatacatttcaaccatcatcagtaatcatttatccagtagttcaatcaa 10768017  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacgttcaatcaccactattcaagctagc-taaacaactctcaggaactgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||||||    
T  10768018 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaaaaacaacaac-atcaaccactactattcaagctagcaaaaacaacattcaggaactgt 10768110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 37 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 21151544 - 21151299
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21151544 gctgttgagcaactattactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 21151445  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||| |  ||||| |||||||||| ||| |||    
T  21151444 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttaaatcatcatcagtgttcatcaatccagcaatccaatcaa 21151345  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaac 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21151344 ccaaaataatgtataattatatacaaccatgctcaaatacaacaac 21151299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 37 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 2499131 - 2498886
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2499131 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 2499032  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccac-tataataatatgtatgattcaataaataacatacattca-accatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaaca 234  Q
    |||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||| || ||||| |||||||||| ||| ||    
T  2499031 atgcaactccatgtgactccacttaaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatca 2498932  T
Q  235 accaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaac 281  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  2498931 accaaaacaatgcatagttaaatataactatgcccaaa-acaacaac 2498886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 37 - 281
Target Start/End: Original strand, 45611728 - 45611963
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45611728 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 45611827  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    |||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||| ||| |||    
T  45611828 atgca----------actccactataataatatgtatgattcaataaatagcatacatttcaaccatcatcagtattcatcaatccaacaatccaatcaa 45611917  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaac 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  45611918 ccaaaataatgtataattatatacaaccatgctcaaatacaacaac 45611963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Original strand, 28758961 - 28759179
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28758961 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 28759060  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||  || || |||||||||||| ||  |  |||||| ||||  ||||||||  ||||||| |||||| |||  ||||||    
T  28759061 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcattactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagaaatcaaaacaa 28759160  T
Q  236 ccaaaataatgcataatta 254  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  28759161 ccacaataatgcataatta 28759179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 43724151 - 43723933
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43724151 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 43724052  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  || || |||||||||||||||  |  |||||| ||||  ||||| ||  ||||||| ||||||||||  ||||||    
T  43724051 atgcaactccatgagactcaacttaaacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcaccagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 43723952  T
Q  236 ccaaaataatgcataatta 254  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  43723951 ccacaataatgcataatta 43723933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Original strand, 47121209 - 47121427
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47121209 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatccacatacaactgaccatgca 47121308  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||  || || |||||||||||| ||  |  |||||| ||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||    
T  47121309 atgcaactccatgtgactcgacttaaacaacatgtatgattcattactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 47121408  T
Q  236 ccaaaataatgcataatta 254  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  47121409 ccacaataatgcataatta 47121427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Original strand, 47128577 - 47128795
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47128577 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatccacatacaactgaccatgca 47128676  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||  || || |||||||||||| ||  |  |||||| ||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||    
T  47128677 atgcaactccatgtgactcgacttaaacaacatgtatgattcattactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 47128776  T
Q  236 ccaaaataatgcataatta 254  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  47128777 ccacaataatgcataatta 47128795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 50142856 - 50142638
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50142856 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 50142757  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||  || || |||||||||||| ||  |  |||||| ||||  ||||||||  ||||||| |||||| |||  ||||||    
T  50142756 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcattactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagaaatcaaaacaa 50142657  T
Q  236 ccaaaataatgcataatta 254  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  50142656 ccacaataatgcataatta 50142638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 69 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 6927596 - 6927383
Alignment:
Q  69 ccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccac-tataataat 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||     
T  6927596 ccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaaacaac 6927497  T
Q  168 atgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaaccaaaataatgcataattatatataaccatg 266  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||| || ||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||| || |||| |||    
T  6927496 atgtatgattcaataattaacatacatttaaatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaaacaatgtataattaaatgtaactatg 6927397  T
Q  267 cccaaatacaacaac 281  Q
    |||||| ||||||||    
T  6927396 cccaaa-acaacaac 6927383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3782839 - 3782603
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3782839 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgc 3782740  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||||||| |||| |||||  ||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||| || ||    || ||||| | ||| |||    
T  3782739 aatgcaactccatatgacaccacttaaatgacatgtatgactcaataaatagcatacaatcaatcatcatcagtattcggtaatgcagcactccaatcaa 3782640  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaa 272  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  3782639 ccaaaacaatgcatgattatatatacccatgctcaaa 3782603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 50656075 - 50655955
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50656075 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 50655976  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcca 157  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  50655975 atgcaactccatgtgactcca 50655955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 53571321 - 53571201
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53571321 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgca 53571222  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcca 157  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  53571221 atgcaactccatgtgactcca 53571201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Original strand, 10382001 - 10382124
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10382001 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 10382100  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccact 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  10382101 aatgcaactccatgtgactccact 10382124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Original strand, 10410654 - 10410777
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10410654 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 10410753  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccact 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  10410754 aatgcaactccatgtgactccact 10410777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Original strand, 29493615 - 29493738
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29493615 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 29493714  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccact 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  29493715 aatgcaactccatgtgactccact 29493738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9772003 - 9771863
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9772003 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 9771904  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccactataataatatgtatgat 176  Q
    |||| |||||||||||||||||||  || || |||||||||    
T  9771903 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgat 9771863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 12271482 - 12271339
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12271482 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcatcaccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 12271383  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccactataataatatgtatgattca 179  Q
    |||| |||||||||||||||||||  || || ||||||||||||    
T  12271382 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattca 12271339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 14845253 - 14845137
Alignment:
Q  39 tgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaa 137  Q
    ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14845253 tgttgagcaactagtgctccagaaccgaagccctcactgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaa 14845154  T
Q  138 tgcaactccatgtgact 154  Q
    |||||||||||| ||||    
T  14845153 tgcaactccatgagact 14845137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 177
Target Start/End: Original strand, 38743004 - 38743137
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aac 143  Q
    ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  38743004 gcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacgtacaactgaccatgcaatgcaaac 38743103  T
Q  144 tccatgtgactccactataataatatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||  || || ||||||||||    
T  38743104 tccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 38743137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 48774705 - 48774582
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48774705 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccactgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 48774606  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccact 159  Q
    |    |||||||| ||||||||||    
T  48774605 atacaaactccatatgactccact 48774582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16331672 - 16331535
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  16331672 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatac 16331575  T
Q  144 tccatgtgactccactataat-aatatgtatgattcaataa 183  Q
    ||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  16331574 tccatatgactccact-taatcaacatgtatgattcaataa 16331535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 183
Target Start/End: Original strand, 16833305 - 16833442
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  16833305 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatac 16833402  T
Q  144 tccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataa 183  Q
    ||||| ||||||||||   | || ||||||||||||||||    
T  16833403 tccatatgactccacttatacaacatgtatgattcaataa 16833442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 54091815 - 54091678
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  54091815 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatac 54091718  T
Q  144 tccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataa 183  Q
    ||||| ||||||||||   | || ||||||||||||||||    
T  54091717 tccatatgactccacttatacaacatgtatgattcaataa 54091678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 3802581 - 3802671
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3802581 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 3802671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 15374724 - 15374814
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15374724 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacatgaccatgca 15374814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 54520130 - 54520220
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54520130 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 54520220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 29545206 - 29545151
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29545206 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 29545151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 8373969 - 8373914
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8373969 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 8373914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 9691486 - 9691396
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9691486 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 9691396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 11956640 - 11956585
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11956640 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 11956585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 20187825 - 20187915
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20187825 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 20187915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 20377319 - 20377229
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20377319 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 20377229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 30596903 - 30596848
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30596903 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 30596848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 54520345 - 54520435
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54520345 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggaccaactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 54520435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 19344196 - 19344151
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19344196 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaact 19344151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 267
Target Start/End: Original strand, 3802743 - 3802966
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||  |    
T  3802743 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggactcactcgtgtatatctacatacaactagaccatgc-atacattc 3802840  T
Q  144 tccatgtgactccactata-ataatatgtatgattcaataaataa--catacat-tcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaaccaa 239  Q
    ||||| |||||||| | || | || ||||||| ||||||||||||  |||||||  || |||||| |||  |||| | | ||||||||||||  | ||||    
T  3802841 tccatatgactccaatttatacaacatgtatggttcaataaataaatcatacatcacagccatcaacaa-catcaac-aaccagcaattcaacaatccaa 3802938  T
Q  240 aataatgcataattatatataaccatgc 267  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  3802939 aataatgcataattaaatataactatgc 3802966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 32388061 - 32388006
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32388061 tttatgcatatgttatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 32388006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 127
Target Start/End: Original strand, 18961077 - 18961122
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18961077 tttatgcatatgcaatggactcacttgtgtatatctacatacaact 18961122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 127
Target Start/End: Original strand, 49163272 - 49163317
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49163272 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaact 49163317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 13313976 - 13313907
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||| | |||||||||||||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13313976 tccagggcagaagccctcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 13313907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 12725168 - 12725113
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12725168 tttatgcatatgaaatggacccactagtgtatatctacatacaacttgaccatgca 12725113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 29551042 - 29551097
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  29551042 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatttacatacaacatgaccatgca 29551097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 46071154 - 46071099
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  46071154 tttatgcatatgcaatggacccactcgtatatatctacatacaactagaccatgca 46071099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16414281 - 16414152
Alignment:
Q  125 actgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacatt-caaccatcatcaataatcatcgatccag 223  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |  |||||||||||||||| |  ||| |||| ||  |||||| | |||||||| ||  ||    
T  16414281 actgaccatgcaatgca-ctccatgtgactccacttaaacatcatgtatgattcaataatttgcatgcatttcattcatcatgagtaatcatcaattaag 16414183  T
Q  224 caattcaaacaaccaaaataatgcataatta 254  Q
    |||  ||| |||||| |||||||||||||||    
T  16414182 caaaccaatcaaccacaataatgcataatta 16414152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 13324888 - 13324819
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||| | |||||||||||||||  ||||| | |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13324888 tccagggcagaagccctcaccgct--tttatacttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 13324819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 38312187 - 38312118
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||| | ||||||||||  ||||||| |||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  38312187 tccaggaccgaggtcctcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatttacatacaact 38312118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Original strand, 23173921 - 23173967
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23173921 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 23173967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 127
Target Start/End: Original strand, 12274375 - 12274435
Alignment:
Q  67 agccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  12274375 agccctccccgct-ttatatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 12274435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 127
Target Start/End: Original strand, 17512698 - 17512751
Alignment:
Q  75 ccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17512698 ccgcttttatatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 17512751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 20249175 - 20249105
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||||| ||||| || |  ||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  20249175 tccaggaccgaagtcctcatcgtt--tttatgcttatgcaattgactccacttgtgtatatctacatacaact 20249105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 13303300 - 13303231
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||| | |||||||||||||||  ||||||  |||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  13303300 tccagggcagaagccctcaccgct--tttatgtttatgcaactgacccacttgtatatatctacatacaact 13303231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 15935004 - 15934960
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15935004 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 15934960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 37 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 12307 - 12062
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12307 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 12208  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatac-attcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    ||||||||| |||||||||||||  || || |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| || ||||| | |||||||| ||| |||    
T  12207 atgcaactctatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattagcatacaattcaaccatcatcagtattcatcaacccagcaatccaatcaa 12108  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaac 281  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12107 ccaaaacaatgcatagttatatataaccatgcccaaaaacaacaac 12062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 37 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 18499 - 18255
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18499 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcc 18400  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||| || ||||| |||||||||| ||| |||    
T  18399 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttaaatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 18300  T
Q  236 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaac 281  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  18299 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaac 18255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 39 - 157
Target Start/End: Original strand, 50083 - 50201
Alignment:
Q  39 tgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaat 138  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50083 tgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaat 50182  T
Q  139 gcaactccatgtgactcca 157  Q
    |||||||||||||||||||    
T  50183 gcaactccatgtgactcca 50201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Original strand, 13486 - 13609
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13486 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatccaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 13585  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccact 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13586 aatgcaactccatgtgactccact 13609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0279 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0279
Description:

Target: scaffold0279; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 5802 - 5661
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5802 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctcaccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 5703  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccactataataatatgtatgatt 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||  || || ||||||||||    
T  5702 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 5661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0276 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0276
Description:

Target: scaffold0276; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 101 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 22101 - 21922
Alignment:
Q  101 cctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaacc 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||| | |||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  22101 cctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgacaccacttaaatgacatgtatgactcaataaatagcatacaatcaacc 22002  T
Q  201 atcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaaccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaac 281  Q
    ||||||| || ||    || ||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  22001 atcatcagtattcggtaatgcagcactccaatcaaccaaaacaatgcatgattatatatacccatgctcaaa-acaacaac 21922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Original strand, 31720 - 31843
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31720 gctgttgagcaactagtactccaggacaaaagacctcaccgctgtttaatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttaaccatgc 31819  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccact 159  Q
    |    |||||||| ||||||||||    
T  31820 atacaaactccatatgactccact 31843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4710 - 4579
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaact 144  Q
    ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||    
T  4710 gcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcatacaaact 4612  T
Q  145 ccatgtgactccactataataatatgtatgatt 177  Q
    || ||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  4611 ccttgtgactccacttaaataacatgtatgatt 4579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 158
Target Start/End: Original strand, 25128 - 25240
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaact 144  Q
    ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  25128 gcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgtaatggatcaacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc-atacaact 25226  T
Q  145 ccatgtgactccac 158  Q
    ||||||||||||||    
T  25227 ccatgtgactccac 25240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0320 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0320
Description:

Target: scaffold0320; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 136
Target Start/End: Original strand, 972 - 1072
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  972 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 1071  T
Q  136 a 136  Q
    |    
T  1072 a 1072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Original strand, 19688 - 19809
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19688 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-attcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 19786  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccact 159  Q
        |||||||| ||||||||||    
T  19787 tacaaactccatatgactccact 19809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23897 - 23798
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23897 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-attcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 23799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 512614 - 512493
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  512614 gctgttgagcaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 512516  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccact 159  Q
        |||||| ||||||||||||    
T  512515 tacaaactccttgtgactccact 512493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 179126 - 179181
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  179126 tttatgcatatgcaatggacccacttttgtatatctacatacaacttgaccatgca 179181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 488394 - 488350
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  488394 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 488350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 1098 - 975
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1098 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttctatgcatatgcaatcgacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 999  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccact 159  Q
    |    |||||||| ||||||||||    
T  998 atacaaactccatatgactccact 975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 281
Target Start/End: Original strand, 9842 - 10078
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||  |    
T  9842 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgc-atacattc 9939  T
Q  144 tccatgtgactcc-actataataatatgtatgattcaataaat--aacatacattcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaaccaaa 240  Q
    | ||| ||||||| |||   | || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||  |||| | | ||||||||||||  | ||| |    
T  9940 ttcatatgactccaacttatacaacatgtatgattcaataaataaaacatacattcaaccatcaacaa-catcaac-aaccagcaattcaacaatccaga 10037  T
Q  241 ataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaac 281  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||||| || ||||||||    
T  10038 ataatgcacaattaaatataactatgccccaaaacaacaac 10078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 136
Target Start/End: Original strand, 15182 - 15281
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15182 gctgttgagcaactagtgctccaggaaatgagtcctccccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 15280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 712 - 802
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  712 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Original strand, 976 - 1045
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||| || |||||||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  976 tccaggaccgaggcactcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 1045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 183
Target Start/End: Original strand, 19337 - 19439
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccactataataatatgtatgattca 179  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||| |  || || ||||||||||||    
T  19337 tttatgcatatgaaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatgtgactccatttaaacaacatgtatgattca 19435  T
Q  180 ataa 183  Q
    ||||    
T  19436 ataa 19439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 183
Target Start/End: Original strand, 15239 - 15341
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgca-actccatgtgactccactataataatatgtatgattca 179  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||| |  || || ||||||||||||    
T  15239 tttacgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgatcatgca-tacatactccatgtgactccatttaaacaacatgtatgattca 15337  T
Q  180 ataa 183  Q
    ||||    
T  15338 ataa 15341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0214
Description:

Target: scaffold0214; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 15278 - 15179
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15278 gctgttgagtaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctatttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 15180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 125
Target Start/End: Original strand, 12948 - 13026
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa 125  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12948 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa 13026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 107
Target Start/End: Original strand, 7801 - 7861
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctactt 107  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7801 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctactt 7861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 2102 - 2192
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2102 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 2192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 184 - 239
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  184 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 51718 - 51672
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51718 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 51672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 65374 - 65284
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  65374 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatgaaactacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 65284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 74167 - 74112
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  74167 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 74112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 137199 - 137254
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  137199 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 137254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 11981 - 11912
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11981 tccaggaccgaggccctcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 11912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 24541 - 24472
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24541 tccaggaccgaggccctcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 24472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 10670 - 10626
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10670 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 10626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18849 - 18805
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18849 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 18805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 183
Target Start/End: Original strand, 24770 - 24873
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccactat-aataatatgtatgattc 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || || ||||||| |||||||| | | || || |||||||||||    
T  24770 tttatgcatatgcaatggacctacttgtttatatctacatagaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccattttaaacaacatgtatgattc 24868  T
Q  179 aataa 183  Q
    |||||    
T  24869 aataa 24873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 20157 - 20102
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20157 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 20102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 30955 - 31010
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30955 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 31010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 247142 - 247197
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  247142 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 247197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 253656 - 253711
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  253656 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 253711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 41353 - 41408
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41353 tttatgcatatgatatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 41408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 101734 - 101645
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  101734 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtg-atatctacatacaacatgaccatgca 101645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Original strand, 72367 - 72436
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  72367 tccaggaccgaggccctcaccgct--tttatgcttatgaaactaacccacttgtgtatatctacatacaact 72436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 10122 - 10076
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10122 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 10076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 17440 - 17372
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||| ||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17440 tccagggccgaagccctc-ccgct--tttatgcttatgtaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 17372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 185 - 139
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  185 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 5415 - 5377
Alignment:
Q  90 tatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5415 tatgcaatggactctacttgtgtatatctacatacaact 5377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Original strand, 7409 - 7455
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7409 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 7455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 36835 - 36789
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36835 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 36789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 41634 - 41588
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41634 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 41588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 20535 - 20489
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20535 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 20489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 14514 - 14469
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14514 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 14469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Original strand, 42090 - 42135
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  42090 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 42135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 50989 - 50948
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacata 122  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  50989 ttttatgcttatgcaactgacctacttgtgtatatctacata 50948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Original strand, 17637 - 17682
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17637 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 17682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Original strand, 6293 - 6337
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  6293 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 6337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 4135 - 4091
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  4135 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 4091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 129
Target Start/End: Original strand, 19439 - 19487
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaactga 129  Q
    ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  19439 tttatgcttatgcaatgaactccacttgtgtatatctacatacaactga 19487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 55956 - 55912
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  55956 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 55912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 38767 - 38723
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggacct-acttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  38767 tatgcttatgcaatggacttcacttgtgtatatctacatacaact 38723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University