View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10855A_low_273 (Length: 254)

Name: NF10855A_low_273
Description: NF10855A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10855A_low_273
NF10855A_low_273
[»] scaffold0328 (2 HSPs)
scaffold0328 (7-254)||(14991-15241)
scaffold0328 (66-192)||(13056-13182)
[»] chr6 (38 HSPs)
chr6 (7-192)||(9238975-9239163)
chr6 (7-192)||(34147346-34147534)
chr6 (7-192)||(34159962-34160150)
chr6 (7-192)||(11448871-11449059)
chr6 (7-192)||(15360107-15360295)
chr6 (7-192)||(3222645-3222831)
chr6 (14-192)||(654155-654336)
chr6 (7-192)||(21982330-21982517)
chr6 (7-192)||(21148520-21148707)
chr6 (7-192)||(1344937-1345123)
chr6 (7-192)||(9843938-9844126)
chr6 (7-192)||(28672067-28672255)
chr6 (7-192)||(5360080-5360268)
chr6 (47-175)||(12390465-12390596)
chr6 (19-192)||(11007177-11007353)
chr6 (19-188)||(17081067-17081239)
chr6 (15-192)||(11840909-11841088)
chr6 (7-120)||(12591637-12591750)
chr6 (7-113)||(13753240-13753346)
chr6 (19-187)||(9208264-9208435)
chr6 (18-192)||(14212903-14213070)
chr6 (13-192)||(9690647-9690829)
chr6 (7-90)||(22576067-22576150)
chr6 (7-176)||(33499474-33499647)
chr6 (31-175)||(17149482-17149629)
chr6 (13-192)||(33718478-33718649)
chr6 (30-192)||(17706328-17706481)
chr6 (24-113)||(28968133-28968222)
chr6 (7-98)||(8479312-8479403)
chr6 (105-192)||(15730504-15730594)
chr6 (7-158)||(31039020-31039173)
chr6 (7-192)||(10377715-10377904)
chr6 (135-192)||(14504091-14504148)
chr6 (139-176)||(32596211-32596248)
chr6 (136-187)||(27866217-27866268)
chr6 (119-191)||(21903629-21903703)
chr6 (32-97)||(28741948-28742013)
chr6 (58-98)||(6385921-6385961)
[»] chr3 (75 HSPs)
chr3 (8-192)||(26174114-26174301)
chr3 (7-192)||(52821645-52821832)
chr3 (7-192)||(53424186-53424373)
chr3 (7-186)||(35492911-35493093)
chr3 (13-192)||(15566509-15566690)
chr3 (7-192)||(30807162-30807350)
chr3 (7-192)||(8456159-8456347)
chr3 (7-192)||(45529764-45529951)
chr3 (7-192)||(46576348-46576536)
chr3 (7-192)||(25379761-25379949)
chr3 (7-192)||(30257624-30257812)
chr3 (7-192)||(40133458-40133646)
chr3 (7-192)||(49258271-49258459)
chr3 (7-192)||(21362943-21363131)
chr3 (7-192)||(25289724-25289911)
chr3 (7-192)||(48977388-48977576)
chr3 (7-192)||(18176896-18177084)
chr3 (7-192)||(45272425-45272613)
chr3 (19-192)||(53233920-53234095)
chr3 (24-192)||(10190751-10190922)
chr3 (7-192)||(31537847-31538035)
chr3 (7-192)||(34492584-34492772)
chr3 (24-192)||(10083828-10083999)
chr3 (28-192)||(39041861-39042028)
chr3 (14-157)||(26108299-26108445)
chr3 (13-183)||(29915288-29915460)
chr3 (13-183)||(29964441-29964613)
chr3 (7-192)||(40940825-40941013)
chr3 (13-192)||(32151430-32151612)
chr3 (7-192)||(52455658-52455846)
chr3 (7-192)||(7485540-7485722)
chr3 (7-173)||(7470244-7470412)
chr3 (47-192)||(8097288-8097436)
chr3 (7-192)||(4462633-4462820)
chr3 (55-192)||(24407309-24407449)
chr3 (31-192)||(33398477-33398641)
chr3 (13-189)||(53288725-53288903)
chr3 (58-192)||(2511306-2511443)
chr3 (106-192)||(24165724-24165812)
chr3 (36-192)||(1692863-1693021)
chr3 (13-192)||(19857058-19857239)
chr3 (7-192)||(11390602-11390790)
chr3 (7-188)||(25344071-25344254)
chr3 (30-192)||(8958044-8958210)
chr3 (39-175)||(51532821-51532960)
chr3 (7-192)||(4252405-4252593)
chr3 (14-93)||(9853623-9853702)
chr3 (134-192)||(53848443-53848501)
chr3 (7-192)||(26158818-26158999)
chr3 (7-91)||(55287803-55287887)
chr3 (60-188)||(17579148-17579280)
chr3 (7-175)||(50582992-50583162)
chr3 (13-192)||(55371303-55371476)
chr3 (13-120)||(38732972-38733079)
chr3 (63-192)||(1178228-1178358)
chr3 (29-175)||(34844400-34844548)
chr3 (106-192)||(54475780-54475869)
chr3 (21-97)||(49167070-49167146)
chr3 (61-120)||(48972795-48972854)
chr3 (7-93)||(9842921-9843006)
chr3 (134-192)||(48105007-48105065)
chr3 (70-170)||(1242036-1242139)
chr3 (139-192)||(4048085-4048138)
chr3 (140-192)||(50731246-50731298)
chr3 (140-192)||(50781556-50781608)
chr3 (14-186)||(14343304-14343478)
chr3 (119-176)||(33793567-33793624)
chr3 (7-192)||(6041679-6041869)
chr3 (13-91)||(10445123-10445205)
chr3 (34-98)||(25017542-25017606)
chr3 (153-192)||(3747730-3747769)
chr3 (7-52)||(16140297-16140342)
chr3 (135-188)||(25017620-25017672)
chr3 (119-171)||(26599429-26599481)
chr3 (7-75)||(36660770-36660838)
[»] chr7 (65 HSPs)
chr7 (7-192)||(7175871-7176059)
chr7 (7-192)||(7275281-7275469)
chr7 (7-192)||(22119892-22120080)
chr7 (7-192)||(40542919-40543107)
chr7 (7-192)||(2751275-2751463)
chr7 (13-192)||(21835161-21835343)
chr7 (7-192)||(21217842-21218030)
chr7 (7-183)||(10091192-10091371)
chr7 (13-192)||(11997859-11998041)
chr7 (7-180)||(2103059-2103234)
chr7 (20-192)||(22703503-22703678)
chr7 (7-192)||(18044111-18044299)
chr7 (7-192)||(28089820-28090011)
chr7 (7-192)||(17196959-17197147)
chr7 (13-192)||(23012517-23012699)
chr7 (45-192)||(654714-654863)
chr7 (7-192)||(17212057-17212245)
chr7 (7-192)||(2344303-2344491)
chr7 (7-192)||(27312156-27312344)
chr7 (7-192)||(27704006-27704193)
chr7 (13-192)||(28950878-28951063)
chr7 (13-192)||(42913522-42913704)
chr7 (7-192)||(27009363-27009552)
chr7 (43-192)||(16374034-16374186)
chr7 (30-192)||(31273941-31274105)
chr7 (7-132)||(7799902-7800029)
chr7 (7-192)||(22638296-22638480)
chr7 (7-192)||(19421235-19421423)
chr7 (55-192)||(29861722-29861862)
chr7 (13-192)||(39145661-39145843)
chr7 (7-117)||(13332510-13332620)
chr7 (7-192)||(31197595-31197782)
chr7 (7-192)||(32849595-32849783)
chr7 (17-98)||(22299863-22299944)
chr7 (7-190)||(25333423-25333593)
chr7 (7-192)||(43785308-43785496)
chr7 (74-192)||(23092167-23092288)
chr7 (58-192)||(41907523-41907659)
chr7 (87-192)||(3851841-3851949)
chr7 (35-192)||(36772312-36772471)
chr7 (7-120)||(42814868-42814981)
chr7 (7-75)||(23854400-23854468)
chr7 (13-188)||(9683836-9684014)
chr7 (7-192)||(31712911-31713092)
chr7 (7-192)||(23330748-23330936)
chr7 (7-192)||(28646973-28647161)
chr7 (13-120)||(9718071-9718178)
chr7 (31-155)||(14199713-14199839)
chr7 (7-80)||(21370601-21370674)
chr7 (13-98)||(22696330-22696415)
chr7 (7-98)||(40332103-40332194)
chr7 (31-192)||(22643351-22643515)
chr7 (106-192)||(8943410-8943500)
chr7 (7-98)||(8435801-8435892)
chr7 (7-93)||(12211646-12211732)
chr7 (7-192)||(21574111-21574300)
chr7 (19-69)||(28003852-28003902)
chr7 (122-192)||(33137834-33137904)
chr7 (71-120)||(6491675-6491724)
chr7 (7-51)||(577683-577727)
chr7 (58-102)||(21558187-21558231)
chr7 (135-192)||(1766153-1766210)
chr7 (82-175)||(21373789-21373885)
chr7 (31-84)||(22264622-22264675)
chr7 (7-98)||(3951096-3951188)
[»] chr5 (62 HSPs)
chr5 (7-192)||(8484670-8484858)
chr5 (8-192)||(38684209-38684395)
chr5 (7-192)||(11926510-11926699)
chr5 (7-192)||(15641115-15641302)
chr5 (7-192)||(27498740-27498928)
chr5 (7-192)||(32059449-32059637)
chr5 (13-192)||(33709512-33709692)
chr5 (24-192)||(19456220-19456389)
chr5 (31-192)||(18207231-18207395)
chr5 (7-192)||(30485828-30486016)
chr5 (7-192)||(13038464-13038651)
chr5 (7-192)||(13108459-13108646)
chr5 (18-192)||(37495058-37495242)
chr5 (12-192)||(42193490-42193671)
chr5 (7-192)||(34310142-34310330)
chr5 (7-192)||(36954818-36955006)
chr5 (13-192)||(31287955-31288137)
chr5 (13-192)||(11464917-11465098)
chr5 (7-192)||(19145421-19145608)
chr5 (15-192)||(7085635-7085815)
chr5 (13-192)||(6014289-6014471)
chr5 (7-192)||(4603777-4603965)
chr5 (7-192)||(23270531-23270719)
chr5 (13-192)||(10869574-10869756)
chr5 (7-156)||(25586932-25587085)
chr5 (13-179)||(15971144-15971313)
chr5 (7-192)||(38630988-38631158)
chr5 (7-192)||(27487563-27487752)
chr5 (24-192)||(12398457-12398628)
chr5 (7-118)||(1827616-1827727)
chr5 (7-192)||(22392701-22392876)
chr5 (7-192)||(25750622-25750808)
chr5 (7-157)||(15931059-15931211)
chr5 (7-192)||(12317164-12317347)
chr5 (58-188)||(5049188-5049320)
chr5 (76-192)||(35425082-35425201)
chr5 (7-174)||(34049822-34049981)
chr5 (13-192)||(21236371-21236553)
chr5 (134-192)||(22693065-22693123)
chr5 (87-192)||(9659320-9659428)
chr5 (119-192)||(41351113-41351186)
chr5 (24-115)||(7151346-7151437)
chr5 (17-188)||(26009277-26009451)
chr5 (134-192)||(13659254-13659312)
chr5 (7-187)||(10399773-10399957)
chr5 (135-190)||(5067392-5067447)
chr5 (21-192)||(28614495-28614667)
chr5 (20-192)||(36895438-36895613)
chr5 (7-97)||(37397713-37397803)
chr5 (7-192)||(930495-930682)
chr5 (7-84)||(5067301-5067378)
chr5 (13-98)||(40330639-40330724)
chr5 (7-175)||(15485317-15485489)
chr5 (24-192)||(17015428-17015593)
chr5 (7-58)||(3715055-3715106)
chr5 (150-192)||(10631298-10631340)
chr5 (60-98)||(21589349-21589387)
chr5 (8-45)||(19230476-19230513)
chr5 (7-116)||(22253233-22253342)
chr5 (139-192)||(42006868-42006921)
chr5 (14-74)||(16616126-16616186)
chr5 (7-51)||(42006793-42006837)
[»] chr1 (68 HSPs)
chr1 (13-192)||(7766736-7766918)
chr1 (7-192)||(4621246-4621434)
chr1 (7-192)||(24674393-24674581)
chr1 (7-192)||(24122023-24122211)
chr1 (7-192)||(46607810-46607998)
chr1 (7-192)||(15059411-15059599)
chr1 (7-192)||(27454873-27455063)
chr1 (7-190)||(8077647-8077832)
chr1 (7-192)||(7197256-7197443)
chr1 (7-192)||(30677176-30677364)
chr1 (7-192)||(34778342-34778527)
chr1 (15-192)||(17935777-17935957)
chr1 (29-192)||(9500364-9500530)
chr1 (7-192)||(168201-168389)
chr1 (17-192)||(7578419-7578597)
chr1 (13-192)||(1378904-1379085)
chr1 (7-192)||(23734116-23734305)
chr1 (7-192)||(23741308-23741497)
chr1 (29-192)||(45859052-45859218)
chr1 (18-172)||(7946855-7947011)
chr1 (7-192)||(32729545-32729732)
chr1 (13-192)||(21726735-21726917)
chr1 (22-192)||(37351462-37351643)
chr1 (7-192)||(18646853-18647041)
chr1 (31-192)||(36155897-36156061)
chr1 (24-192)||(33905519-33905690)
chr1 (14-158)||(23232304-23232455)
chr1 (7-111)||(46113495-46113599)
chr1 (7-192)||(2272344-2272532)
chr1 (55-192)||(8254761-8254901)
chr1 (31-192)||(8779745-8779909)
chr1 (7-97)||(20487297-20487387)
chr1 (7-192)||(25496503-25496685)
chr1 (7-175)||(29057364-29057534)
chr1 (6-192)||(32930748-32930937)
chr1 (14-93)||(14258538-14258617)
chr1 (134-192)||(48699889-48699947)
chr1 (13-98)||(25237095-25237180)
chr1 (7-192)||(18533733-18533921)
chr1 (7-192)||(1486420-1486608)
chr1 (7-99)||(24216978-24217070)
chr1 (123-188)||(26513161-26513226)
chr1 (7-79)||(1818734-1818806)
chr1 (58-181)||(2537749-2537870)
chr1 (63-192)||(40145890-40146027)
chr1 (87-192)||(45331630-45331739)
chr1 (134-192)||(22910001-22910059)
chr1 (134-192)||(35138118-35138176)
chr1 (21-98)||(19034492-19034569)
chr1 (7-95)||(1378745-1378833)
chr1 (124-192)||(27159205-27159273)
chr1 (58-192)||(16539659-16539795)
chr1 (137-192)||(23041655-23041710)
chr1 (29-116)||(39964534-39964621)
chr1 (7-97)||(1138579-1138669)
chr1 (61-98)||(16899557-16899594)
chr1 (7-52)||(47091690-47091735)
chr1 (13-52)||(6776150-6776189)
chr1 (7-98)||(52135130-52135221)
chr1 (134-172)||(12876965-12877003)
chr1 (134-192)||(47091751-47091809)
chr1 (138-192)||(50202680-50202733)
chr1 (13-98)||(809228-809313)
chr1 (151-192)||(5315478-5315519)
chr1 (155-192)||(14603947-14603984)
chr1 (29-98)||(15581119-15581188)
chr1 (139-192)||(52135261-52135314)
chr1 (135-191)||(43769975-43770031)
[»] chr8 (57 HSPs)
chr8 (7-192)||(4718649-4718837)
chr8 (7-192)||(28193478-28193666)
chr8 (7-192)||(34237664-34237852)
chr8 (7-192)||(39349260-39349448)
chr8 (7-192)||(3734632-3734820)
chr8 (7-191)||(2618190-2618377)
chr8 (14-192)||(21603241-21603422)
chr8 (7-192)||(19471613-19471802)
chr8 (7-192)||(19542537-19542726)
chr8 (7-192)||(19589970-19590159)
chr8 (7-191)||(15259416-15259603)
chr8 (29-192)||(8765535-8765701)
chr8 (7-192)||(20305912-20306100)
chr8 (7-192)||(21092545-21092733)
chr8 (7-192)||(32879283-32879471)
chr8 (7-192)||(264409-264596)
chr8 (7-192)||(651325-651512)
chr8 (7-192)||(837060-837247)
chr8 (7-192)||(42643127-42643315)
chr8 (7-188)||(27746348-27746532)
chr8 (7-192)||(42328009-42328196)
chr8 (24-192)||(14632975-14633146)
chr8 (13-192)||(28088296-28088478)
chr8 (13-192)||(4698732-4698914)
chr8 (29-192)||(20469943-20470108)
chr8 (13-188)||(26168862-26169039)
chr8 (7-192)||(7557960-7558140)
chr8 (7-158)||(18532111-18532265)
chr8 (58-188)||(6953021-6953153)
chr8 (22-192)||(34610696-34610869)
chr8 (31-192)||(2166727-2166888)
chr8 (19-192)||(24018398-24018575)
chr8 (61-192)||(25248407-25248538)
chr8 (13-182)||(21667560-21667731)
chr8 (7-188)||(28964037-28964220)
chr8 (7-200)||(34694576-34694773)
chr8 (134-192)||(2639420-2639478)
chr8 (56-188)||(10292108-10292242)
chr8 (58-158)||(24999289-24999392)
chr8 (7-192)||(36848759-36848946)
chr8 (7-192)||(8042658-8042834)
chr8 (19-117)||(34639295-34639391)
chr8 (58-188)||(18128568-18128701)
chr8 (120-175)||(12312965-12313020)
chr8 (131-192)||(13749187-13749248)
chr8 (13-98)||(15974916-15974999)
chr8 (13-98)||(41070771-41070856)
chr8 (13-94)||(3794801-3794882)
chr8 (7-98)||(8387550-8387641)
chr8 (13-182)||(3403521-3403693)
chr8 (134-192)||(33747016-33747074)
chr8 (63-188)||(1219409-1219537)
chr8 (139-192)||(16990722-16990775)
chr8 (11-84)||(35690055-35690131)
chr8 (119-188)||(42332025-42332094)
chr8 (134-191)||(43817759-43817816)
chr8 (58-102)||(6536579-6536623)
[»] chr4 (71 HSPs)
chr4 (13-192)||(33696288-33696470)
chr4 (7-192)||(32986197-32986385)
chr4 (7-192)||(34844767-34844955)
chr4 (7-192)||(40058861-40059049)
chr4 (7-192)||(52983619-52983807)
chr4 (7-192)||(19660541-19660729)
chr4 (13-192)||(27528804-27528986)
chr4 (7-192)||(46714392-46714581)
chr4 (7-192)||(5609211-5609399)
chr4 (7-192)||(20566349-20566538)
chr4 (7-192)||(54127351-54127539)
chr4 (7-192)||(25852214-25852403)
chr4 (7-192)||(45787713-45787900)
chr4 (29-192)||(20077993-20078159)
chr4 (7-192)||(44343513-44343702)
chr4 (13-192)||(35229174-35229356)
chr4 (21-192)||(49287872-49288045)
chr4 (13-192)||(51535619-51535809)
chr4 (24-192)||(7391974-7392143)
chr4 (7-192)||(36131519-36131707)
chr4 (7-175)||(13873321-13873492)
chr4 (13-120)||(22625154-22625261)
chr4 (7-186)||(32942370-32942552)
chr4 (7-188)||(34835529-34835713)
chr4 (56-192)||(34723848-34723987)
chr4 (13-151)||(33992632-33992773)
chr4 (14-186)||(1985843-1986017)
chr4 (7-156)||(35674786-35674938)
chr4 (60-188)||(32990488-32990619)
chr4 (20-192)||(18875526-18875700)
chr4 (45-192)||(27574356-27574506)
chr4 (14-118)||(2351020-2351124)
chr4 (58-192)||(9517650-9517787)
chr4 (31-192)||(12500068-12500231)
chr4 (7-115)||(43719154-43719262)
chr4 (13-188)||(13550214-13550392)
chr4 (14-188)||(55961767-55961932)
chr4 (31-192)||(30879175-30879338)
chr4 (13-120)||(13584338-13584445)
chr4 (39-187)||(20527048-20527198)
chr4 (54-192)||(21387496-21387635)
chr4 (134-192)||(4064990-4065048)
chr4 (138-192)||(23639758-23639812)
chr4 (138-192)||(23645416-23645470)
chr4 (7-117)||(41621684-41621793)
chr4 (33-192)||(25969512-25969673)
chr4 (7-80)||(42245746-42245819)
chr4 (139-192)||(52494623-52494676)
chr4 (13-192)||(4911928-4912114)
chr4 (134-192)||(9978518-9978576)
chr4 (134-192)||(43719096-43719154)
chr4 (7-59)||(34722170-34722222)
chr4 (135-190)||(55158354-55158409)
chr4 (130-192)||(33289180-33289242)
chr4 (58-111)||(3392759-3392811)
chr4 (87-192)||(22488037-22488145)
chr4 (58-98)||(22630292-22630332)
chr4 (140-192)||(23131445-23131497)
chr4 (140-192)||(37302623-37302675)
chr4 (58-97)||(38740901-38740940)
chr4 (29-91)||(38869797-38869860)
chr4 (120-182)||(4585732-4585793)
chr4 (137-175)||(9646242-9646280)
chr4 (134-188)||(13017843-13017897)
chr4 (138-192)||(13716459-13716513)
chr4 (17-78)||(12710189-12710250)
chr4 (139-192)||(12824535-12824588)
chr4 (30-98)||(28635726-28635795)
chr4 (135-192)||(51595153-51595210)
chr4 (8-48)||(10125783-10125823)
chr4 (140-192)||(17637861-17637912)
[»] scaffold0576 (1 HSPs)
scaffold0576 (7-192)||(5091-5279)
[»] chr2 (65 HSPs)
chr2 (7-192)||(44946062-44946250)
chr2 (7-192)||(11941219-11941407)
chr2 (7-192)||(33827582-33827770)
chr2 (7-192)||(15037959-15038147)
chr2 (7-192)||(17324766-17324952)
chr2 (7-182)||(44976172-44976351)
chr2 (13-192)||(25293172-25293347)
chr2 (7-192)||(30466839-30467027)
chr2 (7-192)||(24196004-24196190)
chr2 (7-192)||(19054025-19054214)
chr2 (20-175)||(10582018-10582174)
chr2 (38-192)||(35171831-35171988)
chr2 (24-192)||(43374339-43374505)
chr2 (7-192)||(4567438-4567634)
chr2 (23-192)||(34516423-34516589)
chr2 (24-192)||(36242321-36242492)
chr2 (7-192)||(41313992-41314179)
chr2 (7-192)||(41329843-41330030)
chr2 (17-145)||(27290598-27290729)
chr2 (54-192)||(2140495-2140633)
chr2 (7-192)||(8192361-8192548)
chr2 (23-192)||(8258913-8259085)
chr2 (7-192)||(36390578-36390763)
chr2 (24-192)||(5394034-5394205)
chr2 (24-185)||(1191530-1191694)
chr2 (7-192)||(27269353-27269547)
chr2 (24-192)||(13266507-13266677)
chr2 (7-98)||(32845091-32845182)
chr2 (7-81)||(18976548-18976622)
chr2 (7-92)||(4852558-4852643)
chr2 (24-192)||(45271401-45271572)
chr2 (80-192)||(28668946-28669061)
chr2 (58-192)||(3943791-3943928)
chr2 (16-153)||(23787056-23787196)
chr2 (135-192)||(18976464-18976521)
chr2 (13-98)||(19605951-19606036)
chr2 (14-98)||(6714387-6714471)
chr2 (7-190)||(14946779-14946964)
chr2 (31-192)||(29361578-29361736)
chr2 (134-192)||(18692090-18692148)
chr2 (94-192)||(31778114-31778219)
chr2 (19-120)||(40997434-40997535)
chr2 (61-192)||(19174817-19174950)
chr2 (21-188)||(19849847-19850017)
chr2 (134-192)||(14486955-14487013)
chr2 (134-192)||(44929855-44929913)
chr2 (7-119)||(918782-918896)
chr2 (13-94)||(4618795-4618876)
chr2 (29-98)||(28194239-28194308)
chr2 (135-191)||(4852660-4852716)
chr2 (137-192)||(39957891-39957946)
chr2 (107-185)||(44610139-44610220)
chr2 (61-173)||(19525428-19525539)
chr2 (36-120)||(5608118-5608202)
chr2 (7-78)||(32526211-32526282)
chr2 (13-91)||(3405265-3405343)
chr2 (134-192)||(9400970-9401028)
chr2 (57-91)||(33569842-33569876)
chr2 (23-73)||(44610090-44610140)
chr2 (134-192)||(45132417-45132475)
chr2 (24-117)||(29698164-29698256)
chr2 (136-192)||(6714304-6714360)
chr2 (58-98)||(12086106-12086146)
chr2 (160-192)||(27290730-27290762)
chr2 (134-182)||(32845206-32845254)
[»] scaffold0623 (1 HSPs)
scaffold0623 (7-192)||(1066-1253)
[»] scaffold0366 (2 HSPs)
scaffold0366 (7-192)||(9309-9496)
scaffold0366 (7-183)||(12019-12197)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (7-192)||(7318-7506)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (7-192)||(40325-40512)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (7-192)||(10704-10890)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (29-192)||(161831-161997)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (14-192)||(52880-53061)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (7-192)||(97375-97563)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (7-192)||(41654-41841)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (46-192)||(39131-39280)
[»] scaffold0199 (2 HSPs)
scaffold0199 (7-98)||(8513-8604)
scaffold0199 (139-192)||(8460-8513)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (61-192)||(32342-32475)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (14-192)||(66769-66942)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (31-192)||(20246-20409)
[»] scaffold0460 (1 HSPs)
scaffold0460 (7-97)||(8286-8376)
[»] scaffold0717 (1 HSPs)
scaffold0717 (13-158)||(1-149)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (14-192)||(29152-29332)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (7-192)||(27776-27958)
[»] scaffold1175 (1 HSPs)
scaffold1175 (106-192)||(2435-2524)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (14-74)||(12884-12944)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (7-97)||(26650-26740)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (29-91)||(11557-11620)


Alignment Details
Target: scaffold0328 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 254
Target Start/End: Original strand, 14991 - 15241
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  14991 tttggggttggcctagtggttggcctgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattccctctggtgctaatttcggtgggttaagtcc 15090  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgcgttt-nn 202  Q
    || |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||       
T  15091 atccagagcttgctctggctttaaatgggccccccgcaagtgggcgg-gggattggtctcctcggattagtcaattcttggatcggataacaagtttaaa 15189  T
Q  203 nnnnntgacaatattataagatggtaaatttaaaaaatgctattgatgatga 254  Q
         |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15190 aaaaatgacaatattataagatggtaaatttgaaaaatgctattgatgatga 15241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 13182 - 13056
Alignment:
Q  66 ggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccc 164  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  13182 ggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagtccatacagagcttgct-actttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattgatcccc 13084  T
Q  165 tcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||    
T  13083 tcagattagttgattcttggatcggata 13056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 38)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 9238975 - 9239163
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |    
T  9238975 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagtcc 9239074  T
Q  107 atacagagcttgc--tggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9239075 atatagagcttgctttggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 9239163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 34147346 - 34147534
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  34147346 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcttccagaagtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 34147445  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34147446 atacagagcttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 34147534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 34159962 - 34160150
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  34159962 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcttccagaagtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 34160061  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34160062 atacagagcttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 34160150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 11448871 - 11449059
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  11448871 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 11448970  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11448971 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttgaatcggata 11449059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15360295 - 15360107
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  15360295 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 15360196  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15360195 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 15360107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3222831 - 3222645
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  3222831 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttgcagtttgctcctc-agaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 3222733  T
Q  107 atacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3222732 atacagagcttgctctgtctttaaacggggccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 3222645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 654336 - 654155
Alignment:
Q  14 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacaga 113  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||    
T  654336 ttggcctagtggctgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaga 654237  T
Q  114 gcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||  |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  654236 gcttgctctggctttaaacggggctcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattattggatcggata 654155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 21982517 - 21982330
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||| | |    
T  21982517 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttgaagtttgctcctccagaggtctgaggttcgattcccgatggtgccaatttcagtgggctaagtcc 21982418  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21982417 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcggattagtcgattcttggatcggata 21982330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 21148707 - 21148520
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||| | |    
T  21148707 tttggagttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctttttcagaggtctcaagttcgattccctctagtgccaatttcgatgggctaagtcc 21148608  T
Q  107 atacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21148607 atacagagcttgctctgactttaaacggggccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttgaatcggata 21148520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 1344937 - 1345123
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| | |    
T  1344937 tttggggttgacctagtggttgg--tgggatcttggagtttgttcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggctaagtcc 1345034  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1345035 atacaaagcttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtggacggtgggattggtccccttggattagtcgattcttggatcggata 1345123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 9843938 - 9844126
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||  ||||| |||||||||| | |    
T  9843938 tttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgacttcctctggtgtcaattttggtgggttaagtcc 9844037  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9844038 atacagagcttgttctggctttaaacggggccccctcaagtgggcggtgagattggtcccttcggattagtcgattcttggatcggata 9844126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 28672067 - 28672255
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| | |    
T  28672067 tttggggttggcctagtggttgacttgagatcttggagtttgctcctctagaggtcttaggttcgattccctctggtgtcaattttggtgggctaagtcc 28672166  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||   ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28672167 atacagagcttgttttggctttaaacgggcccctcgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcagata 28672255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 5360268 - 5360080
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||| | |    
T  5360268 tttggagttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgcttctcaagaggtctcaggttcgattccctctaatgccaatttcggtgggctaagtcc 5360169  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  5360168 atacagagcttgctctgactttaaacggaacccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttagatcggata 5360080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Original strand, 12390465 - 12390596
Alignment:
Q  47 tgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaag 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||    
T  12390465 tgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaag 12390564  T
Q  144 tgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 175  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12390565 tgggcggtgggattggtcccctcggattagtc 12390596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 192
Target Start/End: Original strand, 11007177 - 11007353
Alignment:
Q  19 ctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg 118  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |   |||||||||||| ||| | |||||| ||||||    
T  11007177 ctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattcactctgctctcaatttcggtgggctaagtccatacaaagcttg 11007276  T
Q  119 --ctggctttaa-atggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
      || |||||||   || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  11007277 ctctagctttaagcggggcccccgcaagtgggcggtgggattggccccctcggattagtcgattctttgatcggata 11007353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 17081239 - 17081067
Alignment:
Q  19 ctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg 118  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  17081239 ctagtggttggcttaggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaagtttgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttg 17081140  T
Q  119 --ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 188  Q
      ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||   |||||||||||    
T  17081139 ctctgactttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaataagttgtttcttggatcg 17081067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Original strand, 11840909 - 11841088
Alignment:
Q  15 tggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagag 114  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||    
T  11840909 tggccaagtggttggcttgggatattagaatttgctcctccagaggtctcaggctcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagtccatacaaag 11841008  T
Q  115 cttgc--tggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||  ||| |||||| ||  ||||  |||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  11841009 cttgctttggttttaaacggggccccataagtggacggtgggattagtcccctcgaattagtcgattattggatcggata 11841088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 120
Target Start/End: Original strand, 12591637 - 12591750
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||| | |    
T  12591637 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctcgtgccaatttcagtgggctaagtcc 12591736  T
Q  107 atacagagcttgct 120  Q
    ||||||||||||||    
T  12591737 atacagagcttgct 12591750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 13753240 - 13753346
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  13753240 tttggggttggcctagtggttggctttggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattctctctggtgccaatttcggtgggctaaatcc 13753339  T
Q  107 atacaga 113  Q
    |||||||    
T  13753340 atacaga 13753346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 187
Target Start/End: Original strand, 9208264 - 9208435
Alignment:
Q  19 ctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagag-ctt 117  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  || | ||||||||| |||    
T  9208264 ctagtggttggattgggatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaggttcgattccccctggtgccaatttcggtggg-caagtccatacagagcctt 9208362  T
Q  118 gc--tggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatc 187  Q
    ||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| |||||||||||    
T  9208363 gctttggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtctcctcagaatagtcgattcttggatc 9208435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 192
Target Start/End: Original strand, 14212903 - 14213070
Alignment:
Q  18 cctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagctt 117  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| | |||| ||||||     
T  14212903 cctaatggttggctcgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggctaagtccatatagagct- 14213001  T
Q  118 gctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
          || ||  ||  ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14213002 ------ttaaacgggggccccgcaagtgggtggtgggattggtccactcggattagtcgattcttggatcggata 14213070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9690829 - 9690647
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||| |||  |||||||||||| ||| | |||||||    
T  9690829 gttgacctagtggttggtttgagattttggagtttgctcttccagaggtcttaggttcgatttcttctagtgtcaatttcggtgggctaagtccatacag 9690730  T
Q  113 agcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||  |||||||||||  || ||| | ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9690729 agcttgctctggctttaaacggggccctcacaagtggacggtgggattggtcctctcggattagtcgattcttggatcggata 9690647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 90
Target Start/End: Original strand, 22576067 - 22576150
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatt 90  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22576067 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcagattcgattccctctggtgccaatt 22576150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 33499474 - 33499647
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttc-gattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 105  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| | | |     
T  33499474 tttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaggttcagattccctctggtgtcaatttcggtgggct-agtc 33499572  T
Q  106 catacagagc-ttgc--tggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtca 176  Q
    |||||| | | ||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33499573 catacaaatctttgctttggctttaaatgggccctccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtca 33499647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 17149629 - 17149482
Alignment:
Q  31 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagag-cttgc--tggcttta 127  Q
    ||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || | ||||||||| |||||  ||||||||    
T  17149629 ttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggttgg-caagtccatacagagccttgctttggcttta 17149531  T
Q  128 aat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 175  Q
    ||| || ||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  17149530 aatggggcccccgcaagtgaacggtgggattggtcccctcgaattagtc 17149482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 33718649 - 33718478
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||   ||| | |||||||    
T  33718649 gttggtctagtggttggtttgggatcttggagtttacttctccagagatctcaggttcgattctctctggtgcaaattttggtgaactaagtacatacag 33718550  T
Q  113 agcttgctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||         ||||||  || || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33718549 ag---------tttaaacggggcctctgcaagtggacggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttggatcggata 33718478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 17706481 - 17706328
Alignment:
Q  30 cttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgctggctttaaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||  ||| ||        |||  |||||||||||    
T  17706481 cttgggatcttggagtttgctcctccagaagtctcaagttcgattccttctggtgtcaatttcggtggactaattt--------gct--ctggctttaaa 17706392  T
Q  130 -tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
     ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17706391 ctgggccctcgcaagtggacggtgtgattggtttcctcggataagtcaattcttggatcggata 17706328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 28968222 - 28968133
Alignment:
Q  24 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacaga 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||| | |  |||||||||||||||| | ||||||||    
T  28968222 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcagattcgattctctctagcgtcaatttcggtgggttaagtccatacaga 28968133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 98
Target Start/End: Original strand, 8479312 - 8479403
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 98  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |   || | |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  8479312 tttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtgtgctcctcttaagatttcaggttcgatttcctctggtgtcaatttcggtggg 8479403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15730594 - 15730504
Alignment:
Q  105 tcatacagagcttg--ctggctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| | | ||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15730594 tcatacagagcttgttctggctttaaacgtggcccccacacgtgggcggtgggattggtcacctcggattagtcgattctttgatcggata 15730504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 158
Target Start/End: Original strand, 31039020 - 31039173
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||| || ||| ||| |||| | ||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| |||||||||| ||   ||||||| |||| ||| | |    
T  31039020 tttggggttgacccagtagttggctttgaatcttggagtttgctccaccaaagatctcaagtttgattccctctagtatcaatttcgatgggctaagtcc 31039119  T
Q  107 atacagagcttgc--tggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattg 158  Q
    |||||||| ||||  ||||| | ||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  31039120 atacagagtttgctatggctatgaatggacccccacaagtgggcggtgtgattg 31039173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 10377715 - 10377904
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||      ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||  || | |    
T  10377715 tttggggttggcccagttgttggcttgagatcttggagtgtgctcatgtcaaggtctcaggttcaattccctatggtgccaatttcggtgggc-aagtcc 10377813  T
Q  107 atacagagcttg---ctggctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||| |||||    ||| ||| ||| ||  |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  | ||||||| |||||    
T  10377814 atacatagctttgctctgacttaaaacggggccccccacaagtgggcggtggcattggtcccctcggagtagtcggtccttggattggata 10377904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 14504148 - 14504091
Alignment:
Q  135 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| || |||| ||||||||    
T  14504148 ccccgcaagtgggcggtgggattgatcctctcgaattagtcgatccttgtatcggata 14504091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 176
Target Start/End: Original strand, 32596211 - 32596248
Alignment:
Q  139 gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtca 176  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32596211 gcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtca 32596248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27866268 - 27866217
Alignment:
Q  136 cccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatc 187  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  27866268 cccgcaagtgggcggtgggattagtcccctcgaattagtcgatttttggatc 27866217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21903703 - 21903629
Alignment:
Q  119 ctggctttaaatggcccccc-gcaagtgggcggtgggattgttcccc-tcggattagtcaattcttggatcggat 191  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  21903703 ctggctttaaatggggcaccagcaagtgggcggtgggaatggtccccctcagattagtcgattcttggatcggat 21903629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 32 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 28742013 - 28741948
Alignment:
Q  32 tgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgg 97  Q
    |||||||||||||| |||||| |   ||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||    
T  28742013 tgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattcgttctggtgttaattttggtgg 28741948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 98
Target Start/End: Original strand, 6385921 - 6385961
Alignment:
Q  58 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 98  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  6385921 aggtctcaggttcgattctctccggtgctaatttgggtggg 6385961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 75)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 26174114 - 26174301
Alignment:
Q  8 ttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattca 107  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  26174114 ttggagttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtgggttaagtcca 26174213  T
Q  108 tacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26174214 tacagagcttgctctggctttaaatagggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 26174301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 52821832 - 52821645
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| | |    
T  52821832 tttggtgttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgagctaagtcc 52821733  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52821732 atacagagcttgctctggctttaaacggggccccgtaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 52821645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 53424373 - 53424186
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| | |    
T  53424373 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagtcc 53424274  T
Q  107 atacagagcttgc--tggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||| ||||  |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53424273 atacagagtttgctatggctttaaacgggcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 53424186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 186
Target Start/End: Original strand, 35492911 - 35493093
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  35492911 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 35493010  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggat 186  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  35493011 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggat 35493093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15566690 - 15566509
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| | |||||||    
T  15566690 gttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacag 15566591  T
Q  113 agcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  15566590 agcttgctctggctttaaacgggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggata 15566509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 30807350 - 30807162
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  30807350 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 30807251  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30807250 atacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcggtaggattggt-ccctcggattagtcgattcttggatcggata 30807162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8456347 - 8456159
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  8456347 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 8456248  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  8456247 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcagtgggattggtcccctcggattagtcgattcttgaatcggata 8456159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 45529951 - 45529764
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||| | |    
T  45529951 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcgatgggctaagtcc 45529852  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  45529851 atacagagcttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggata 45529764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 46576348 - 46576536
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| | |    
T  46576348 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggctaagtcc 46576447  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  46576448 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtcggattggtccccttggattagtcgattcttggatcggata 46576536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 25379761 - 25379949
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||| ||| | |    
T  25379761 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccttctagtgccaatttcggagggctaagtcc 25379860  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25379861 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagcgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 25379949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 30257624 - 30257812
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||  ||| | |    
T  30257624 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcgatggactaagtcc 30257723  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30257724 atacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtggcattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 30257812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 40133646 - 40133458
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |    
T  40133646 tttggggttggcctagtggttggcttgggattttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtcc 40133547  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  40133546 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 40133458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 49258459 - 49258271
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| | |    
T  49258459 tttggggtttgcctagtggttggcttgggatcttgcagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtcc 49258360  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49258359 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 49258271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 21362943 - 21363131
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||| | |    
T  21362943 tttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtaggctaagtcc 21363042  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  21363043 atacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattggttccctcggattaatcgattcttggatcggata 21363131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 25289911 - 25289724
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| | |    
T  25289911 tttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtcc 25289812  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  25289811 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcgaattagtcgattcttggatcggata 25289724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 48977388 - 48977576
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |    
T  48977388 tttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccttctggtgccaatttcggtgggttaagtcc 48977487  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  48977488 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccctgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggata 48977576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18177084 - 18176896
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| | |    
T  18177084 tttggggttggcctagtggttgacttgagatcttggagtttgctcttccagaggtatcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggactaagtcc 18176985  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18176984 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccatcggattagtcgattcttggatcggata 18176896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 45272613 - 45272425
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  45272613 tttggggttggcctagtcgttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcagtttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 45272514  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||| |||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  45272513 atacggagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgactcttggatcggata 45272425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 53234095 - 53233920
Alignment:
Q  19 ctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg 118  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  53234095 ctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaagtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttg 53233996  T
Q  119 --ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
      |||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  53233995 ctctggctctaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggata 53233920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 10190922 - 10190751
Alignment:
Q  24 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||  |||    
T  10190922 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagggctcaggtttgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 10190823  T
Q  122 gctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10190822 gctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 10190751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 31538035 - 31537847
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |      
T  31538035 tttggggttggcctagtggttggcttaggatcttggagtttgctcctccagaggtctcatgtttgattccctctggtgccaattttggtgggctaagtct 31537936  T
Q  107 atacagagctt--gctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||   ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31537935 atacagagcttactctggctttaaacggagcccctgcaagtgggcggtgagattggtcccctcgaattagtcaattcttggatcggata 31537847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 34492772 - 34492584
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||| | |    
T  34492772 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcatgttcgattccctctgctgccaatttcgttgggctaagtcc 34492673  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||  ||||||||||| ||||    
T  34492672 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtccattcagattagttgattcttggatctgata 34492584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 10083999 - 10083828
Alignment:
Q  24 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||  |||    
T  10083999 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagggctcaggtttgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 10083900  T
Q  122 gctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||  || ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10083899 gctttaaacggggcccccacaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 10083828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 39042028 - 39041861
Alignment:
Q  28 agcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctt 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | ||| |||||||||  |||||||    
T  39042028 agcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatgcagagcttgctctggctt 39041929  T
Q  126 taaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||  || |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39041928 taaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtccactcggattagtcgattcttggatcggata 39041861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 26108299 - 26108445
Alignment:
Q  14 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacaga 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||    
T  26108299 ttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaga 26108398  T
Q  114 gcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggatt 157  Q
    |||||  |||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  26108399 gcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggctgtgggatt 26108445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 29915460 - 29915288
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||| ||| | |||||||    
T  29915460 gttgacctaatggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcttctggtgccattttcggtgggctaagtacatacag 29915361  T
Q  113 agcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttg 183  Q
    ||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||    
T  29915360 agcttgccctggctttaaacgggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccatcgaattagtcgattcttg 29915288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 29964613 - 29964441
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||| ||| | |||||||    
T  29964613 gttgacctaatggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcttctggtgccattttcggtgggctaagtacatacag 29964514  T
Q  113 agcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttg 183  Q
    ||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||    
T  29964513 agcttgccctggctttaaacgggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccatcgaattagtcgattcttg 29964441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 40940825 - 40941013
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| | |    
T  40940825 tttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggactaagtcc 40940924  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||  || ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||| ||| ||||    
T  40940925 atacagagcttgctctgactttaaacggggcccccacaagtgggtggtaggattggtcccctcgaattactcaattcttgaatcagata 40941013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 32151430 - 32151612
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||  |||||||| |||| |||| |||||||||||| |||  ||||||||    
T  32151430 gttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtttcaaattcgattctctctagtgccaatttcggtgggctaagctcatacag 32151529  T
Q  113 agcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  32151530 agcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgagattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 32151612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 52455846 - 52455658
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |      
T  52455846 tttggggttggcctagtggttggctagggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggctaagtct 52455747  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    | ||||||||||  ||| |||||||  || ||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  52455746 acacagagcttgctctgactttaaacggggcccccgcaagtgactggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggattggata 52455658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 7485722 - 7485540
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||    
T  7485722 tttggggttggcatagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtgggctaagttc 7485623  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||    ||||||  |||||||||||  | |||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7485622 at----agcttgatctggctttaaacaggcccctgcaagtggccggtgggattggt-ccctcggattagtcgattcttggatcggata 7485540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 7470412 - 7470244
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||| |||    
T  7470412 tttggggtttgcctagtggttgacttgagatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctaatgccaatttcggtgggctaagttc 7470313  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattag 173  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||  ||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  7470312 atacagagcttgctctggctttaaacggggccctgcaagtgggcagtgggattggtcccctcagattag 7470244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8097436 - 8097288
Alignment:
Q  47 tgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaag 143  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||||| ||||  ||||||||| ||  ||||||||||    
T  8097436 tgctcctccagaggcctcaggttcgattccctcttgtgctaatttcgatgggctaagtccatacagagcatgctctggctttaaacggggcccccgcaag 8097337  T
Q  144 tgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8097336 tgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 8097288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 4462633 - 4462820
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |  || | |||||| ||||||||||||||||  | ||||||| |||| ||| |||    
T  4462633 tttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctacttcaaaagtctcatgttcgattccctctggcaccaatttcgatgggctaagttc 4462732  T
Q  107 atacagagctt--gctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||   || |||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| |||||    
T  4462733 atacagagcttactctagctttaaacggggccccgcaagtggacggtgggattgatccactcggattagtttattcttggattggata 4462820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 55 - 192
Target Start/End: Original strand, 24407309 - 24407449
Alignment:
Q  55 cagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggccccc-cgcaagtgggcggt 151  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  |||||  | ||||||| ||  ||  ||||||||||||||    
T  24407309 cagaggtctcagattcgattctctctggtgctaatttcggtgggttaagtatatacagaatttgctctgactttaaacggggccatcgcaagtgggcggt 24407408  T
Q  152 gggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24407409 gggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 24407449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 33398641 - 33398477
Alignment:
Q  31 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgctg--gctttaa 128  Q
    ||||||||||| |||||||||  | | || ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||  | |||||||||||||||   |||||||    
T  33398641 ttgggatcttgtagtttgctcttctaaagatctcaagttcgattccctctagtgccaattttggtgggttatgtccatacagagcttgctctagctttaa 33398542  T
Q  129 atggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    | ||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  33398541 acggggcccccgcaagtgggcggtgggattggttccctcgaattagtcgattcttggatcggata 33398477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 53288903 - 53288725
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||| | ||||||     
T  53288903 gttggccaagtggttggtttgggatattagagtttgctcctccaaaggtctcaggctcgattccctctggtgccaatttcggtggactaagtccatacaa 53288804  T
Q  113 agcttgc--tggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcgg 189  Q
    |||||||  |||||||||| ||  ||||||||  || ||||| ||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  53288803 agcttgctttggctttaaacggggccccgcaaacggacggtgagattagtcccctcgaattagtcgattattggatcgg 53288725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 58 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 2511443 - 2511306
Alignment:
Q  58 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtggg 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||| |||||||  || || ||||||||||||||||||    
T  2511443 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagctcgctctgactttaaacgggacctccgcaagtgggcggtggg 2511344  T
Q  155 attgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||| || ||||| ||||||  ||||||| ||||||||    
T  2511343 attggtctcctcgaattagtagattcttgaatcggata 2511306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 24165812 - 24165724
Alignment:
Q  106 catacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24165812 catacagagcttgctctggctttaaacggggccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcgattcttggatcggata 24165724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 192
Target Start/End: Original strand, 1692863 - 1693021
Alignment:
Q  36 atcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaatggc 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||  |||||||||||  ||| |  ||||||| ||||  ||||||||| |  |     
T  1692863 atcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccatttagtgtcaatttcggtggactaagtctatacagaacttgctctggctttagacagg 1692962  T
Q  134 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  1692963 cccccgcaagtgggcggtgggatttgccccctcagattagtcgattcttgaatcggata 1693021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 19857058 - 19857239
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| ||||   ||    
T  19857058 gttggcctggtggttggcttgg-atcttggagtttgctcctccagatgtctcaggttcgattccctttggtgtcaatttcggtgggctaagttcagttag 19857156  T
Q  113 agcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||  ||  |||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||| ||||||| || |||||    
T  19857157 agcttgctctaactttaaatggggtctccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcgcaatagtcgattcttgaattggata 19857239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 11390602 - 11390790
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||| ||| || | ||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||| ||| | |    
T  11390602 tttggggttggcctagtggttggtttgagatcttggagttttctcctccaaagatttcaggtttgatttcctctggtgtcaattttggtgggctaagtcc 11390701  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||| || || |||||| ||    ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11390702 atacagagcttgctctgtctttaaatgggtcctccgcaaatgattcgtgagattattcccctcggattagtcgattcttggatcggata 11390790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25344254 - 25344071
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||  |||||  ||||  ||| | |    
T  25344254 tttggggttggcctagtggttgacttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggtttgattccctttggtgtcaatttttgtggtctaagtcc 25344155  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 188  Q
    |||||||| |||  |||||||||||  || ||||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||||| |||||    
T  25344154 atacagagtttgctctggctttaaacggggcccccgctagtgggcgatgggattggt-tcctcggattagtcgattcttagatcg 25344071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8958210 - 8958044
Alignment:
Q  30 cttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgctg--gcttta 127  Q
    |||||||||||||||| ||||||  || |||||| | |||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||| | |||||| ||||||||   ||||||    
T  8958210 cttgggatcttggagtctgctccttcaaaggtcttatgttcgatttcctctggtgtcaattttggtgggctaagtccatacaaagcttgctctagcttta 8958111  T
Q  128 aat--ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||   || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||    
T  8958110 aaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctctgattaatcgattcttggatcagata 8958044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 175
Target Start/End: Original strand, 51532821 - 51532960
Alignment:
Q  39 ttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaat-ggccc 135  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||  |||||||| || ||    
T  51532821 ttggagtttgcttctccaaaggtctcatgttcgattctctctaatgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctaactttaaatgggacc 51532920  T
Q  136 cccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 175  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  51532921 cccgcaagtggacggtgggattggtcccctcagattagtc 51532960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 4252593 - 4252405
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |   |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| || | | || | |    
T  4252593 tttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaagtttgattccctctggtgccaatttcagt-gatcaagtcc 4252495  T
Q  107 atacagagctt---gctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||| |||||    |||| ||  || || |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  4252494 atacaaagctttactctggtttagaacggcccccccacaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcgatccttggatcggata 4252405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Original strand, 9853623 - 9853702
Alignment:
Q  14 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcg 93  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  9853623 ttggtctagtggttagtttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattcccaccggtgccaatttcg 9853702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 53848501 - 53848443
Alignment:
Q  134 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53848501 cccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 53848443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 26158818 - 26158999
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||||||||   ||| ||||| ||||||||||| |||||| |   ||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||| || | |    
T  26158818 tttggggttggcctatgtgttggcttgagatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggtttcattccctttggtgccaatttcggtgggt-aagtcc 26158916  T
Q  107 atacagagcttgctggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||  ||  |||||||  || ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  26158917 atacag--ct--ctggcttagaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcggtccttggatcggata 26158999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 91
Target Start/End: Original strand, 55287803 - 55287887
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaattt 91  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55287803 tttggggttggcatagtggttggcttggaatcttagagtttgctccttcagaggtttcaggttcgattccctctggtgccaattt 55287887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 17579280 - 17579148
Alignment:
Q  60 gtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgctg--gctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcggtggga 155  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||| |||||| |||||| ||| | |||||||||||||||   |||||||| ||  ||| |||||||||||||||| ||    
T  17579280 gtctcaggtttgatttcctctagtgttaattttggtgggctaagtccatacagagcttgctttagctttaaacgggaccctccgcaagtgggcggtgaga 17579181  T
Q  156 ttgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 188  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  17579180 ttggtcccctcagattagtcgatttttggatcg 17579148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 175
Target Start/End: Original strand, 50582992 - 50583162
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |   |||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||| ||| | |    
T  50582992 tttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctcttaaggtttcaggttcgatttcctctgttgccaatttcgttggg-taagtcc 50583090  T
Q  107 atacagagctt---gctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 175  Q
    ||||| | |||     || ||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  50583091 atacaaaactttgatttgactttaaatggagccccgtaagtgagcggtgggattggtcctctcgaattagtc 50583162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 55371476 - 55371303
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||| | |   |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||   || ||||||       
T  55371476 gttggcctagtggttggcttgcgattttggagtatgcttctctcaaggtctcatgttcgattccctttggtgccaatttcggcggac-aagttcata--- 55371381  T
Q  113 agcttgctggctttaaatggccccc-cgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
     |||  ||||||| ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  55371380 -gct--ctggcttaaaacggggccctcgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgatccttggatcggata 55371303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Original strand, 38732972 - 38733079
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    ||||| ||| |||||  ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||  |||||||||||| | | |||||||||    
T  38732972 gttgggctaatggttgacttggaatcttggagtttgttcctccagaggtctcaggtccgattctctctgttgtcaatttcggtgggctgagttcatacag 38733071  T
Q  113 agcttgct 120  Q
    || |||||    
T  38733072 aggttgct 38733079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 192
Target Start/End: Original strand, 1178228 - 1178358
Alignment:
Q  63 tcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg---ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgt 159  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||  || | |||||||| |||    ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||     
T  1178228 tcaggttcgattctccctggtgccaatttcggtgggc-aagtccatacagaactttgctctggctttaaatggggccccacacgtgggcggtgggattgg 1178326  T
Q  160 tcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    | |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  1178327 t-ccctcggattagtcgaatcttggatcggata 1178358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 175
Target Start/End: Original strand, 34844400 - 34844548
Alignment:
Q  29 gcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagctt-gct--ggctt 125  Q
    ||||| || |||||||| |||||| |   ||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||  ||  | |||||||||||| |||  |||||    
T  34844400 gcttgagaccttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattccctccagagccaatttcggtggactag-tacatacagagctttgctatggctt 34844498  T
Q  126 taaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 175  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||    
T  34844499 taaatgggcccccgcaagtggatggtgggattggacccctcggattagtc 34844548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 192
Target Start/End: Original strand, 54475780 - 54475869
Alignment:
Q  106 catacagagcttgct--ggctttaaatggcccc-ccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  54475780 catacagagcttgctttggctttaaacggggccaccgcaagtgggcggtgggattggtccccttggattagtcgattcttggatcagata 54475869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Original strand, 49167070 - 49167146
Alignment:
Q  21 agtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgg 97  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  49167070 agtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccaaagatatcaggttcgattctctctggtgtcaatttcggtgg 49167146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 61 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 48972854 - 48972795
Alignment:
Q  61 tctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||| |||||    
T  48972854 tctcaggttcgattccctctggtgccaatttcgatgggttaagttcatatagagtttgct 48972795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 93
Target Start/End: Original strand, 9842921 - 9843006
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcg 93  Q
    ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||  |||||||    
T  9842921 tttggggttggtctagtggttggtttgggatcttggagttttctcctccagaggtctc-gattcgattcccactggtgtcaatttcg 9843006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 192
Target Start/End: Original strand, 48105007 - 48105065
Alignment:
Q  134 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48105007 cccccacaagtgggcggtgagattggtcccttcggattagtcgattcttggatcggata 48105065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 170
Target Start/End: Original strand, 1242036 - 1242139
Alignment:
Q  70 cgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagctt---gctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctc 166  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| | ||||||||||||    ||||||||||| ||   |||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  1242036 cgattccctctggtgccaattttggtgggctaagtccatacagagctttgctctggctttaaacggggtcccgcaagtgggcggtggaattggtcccctt 1242135  T
Q  167 ggat 170  Q
    ||||    
T  1242136 ggat 1242139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 192
Target Start/End: Original strand, 4048085 - 4048138
Alignment:
Q  139 gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4048085 gcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagttgattcttggatcggata 4048138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 50731298 - 50731246
Alignment:
Q  140 caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  50731298 caagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgatccttggatcggata 50731246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Original strand, 50781556 - 50781608
Alignment:
Q  140 caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  50781556 caagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgatccttggatcggata 50781608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 14343478 - 14343304
Alignment:
Q  14 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacaga 113  Q
    |||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| | ||||  || ||||||  |||| ||| | ||||||||    
T  14343478 ttggtctattggttggtttgagatcttggagtttgctcctccagatgtctcagattcgatttcatctgacgccaatttcaatgggctaagtccatacaga 14343379  T
Q  114 gcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggat 186  Q
     ||||  ||| ||||||| ||   ||| |||||| ||||| | |||| ||||||  |||||||| ||||||||||    
T  14343378 acttgctctgcctttaaacggtatcccacaagtgagcggtagaattgatccccttagattagtcgattcttggat 14343304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 176
Target Start/End: Original strand, 33793567 - 33793624
Alignment:
Q  119 ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtca 176  Q
    ||||||| ||| || | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33793567 ctggcttaaaaagggctcccgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtca 33793624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 6041869 - 6041679
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||| |||| |||||  ||||  ||||||||||||||||| |   |||  ||| |||||||| || || |||| ||||||||||| |||| | |    
T  6041869 tttggggttgccctaatggttgacttgaaatcttggagtttgctcctctcaaggagtcatgttcgattgcccctagtgccaatttcggtggattaagtcc 6041770  T
Q  107 atacagagct-tgct--ggctttaaatg--gccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||| | ||||  | ||||||| |  ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||  |||||||||| ||||    
T  6041769 atacagagttatgctctgactttaaacgaagcccccctcaaatgggcggtgagattgttccccttagattagtcggttcttggatcagata 6041679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 10445205 - 10445123
Alignment:
Q  13 gttggcctagtgg---ttagcttgggatcttggagtttgctccccca-gaggtctcaggttcgattccctctggtgctaattt 91  Q
    |||||||||||||   || |||||||| || ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10445205 gttggcctagtggcaattggcttgggacctgggagtgtgctcctcctcgaggtctcaggttcgattctctctggtgctaattt 10445123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 98
Target Start/End: Original strand, 25017542 - 25017606
Alignment:
Q  34 ggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||| ||| |||  ||||||||||||    
T  25017542 ggatcttggagtttgctcctccaaagatcttaggttcgattccatctagtgtcaatttcggtggg 25017606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 192
Target Start/End: Original strand, 3747730 - 3747769
Alignment:
Q  153 ggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3747730 ggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 3747769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 52
Target Start/End: Original strand, 16140297 - 16140342
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcc 52  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  16140297 tttggggttggcctagtgattagtttgggatcttggagcttgctcc 16140342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 135 - 188
Target Start/End: Original strand, 25017620 - 25017672
Alignment:
Q  135 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 188  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25017620 ccccgcaagtgggcggtgggattggt-tccttggattagtcgattcttggatcg 25017672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 171
Target Start/End: Original strand, 26599429 - 26599481
Alignment:
Q  119 ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggatt 171  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  |||||| ||||    
T  26599429 ctggctttaaatggcgccccacaagtggacggtgggattggacccctcagatt 26599481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 75
Target Start/End: Original strand, 36660770 - 36660838
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattc 75  Q
    ||||| |||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| ||||    
T  36660770 tttggggttgacctagtggttggtttaggatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaggttcaattc 36660838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 65)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 7176059 - 7175871
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  7176059 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 7175960  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7175959 atacagagcttgctctggctttaaacaggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 7175871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 7275281 - 7275469
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  7275281 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 7275380  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7275381 atacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 7275469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 22119892 - 22120080
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  22119892 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 22119991  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22119992 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 22120080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 40543107 - 40542919
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  40543107 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 40543008  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40543007 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 40542919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 2751275 - 2751463
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  2751275 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 2751374  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2751375 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 2751463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 21835161 - 21835343
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||    
T  21835161 gttgacctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacag 21835260  T
Q  113 agcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21835261 agcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 21835343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 21218030 - 21217842
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| | |    
T  21218030 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtgggctaagtcc 21217931  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  || ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21217930 atacagagcttgctctagctttaaacgggccccccacaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagttgattcttggatcggata 21217842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 10091192 - 10091371
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| | |    
T  10091192 tttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaagtcc 10091291  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttg 183  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  10091292 atacagagcttgctctggctttaaatggggtccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 10091371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 11997859 - 11998041
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| | ||||||     
T  11997859 gttgggctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggttggctaagtccatacat 11997958  T
Q  113 agcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  11997959 agcttgctctggctttaaactgggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 11998041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 180
Target Start/End: Original strand, 2103059 - 2103234
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| | |    
T  2103059 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaagtcc 2103158  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattc 180  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  2103159 atacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcggattagtcgattc 2103234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 192
Target Start/End: Original strand, 22703503 - 22703678
Alignment:
Q  20 tagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg- 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |||||| ||||||     
T  22703503 tagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacaaagcttgc 22703602  T
Q  119 -ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
     |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  22703603 tctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattctttgatcggata 22703678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 18044111 - 18044299
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| | |    
T  18044111 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcccaggttcgattccctcttgtgccaatttcggtgggctaagtcc 18044210  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18044211 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccacaagtgggtggtggaattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggata 18044299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 28089820 - 28090011
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| | |    
T  28089820 tttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagatgtctcaggttcgataccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtcc 28089919  T
Q  107 ataca----gagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||    |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28089920 atacaaagtgagcttgctctggctttaaatgggcccccgcaagtgggcgatgagattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 28090011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 17197147 - 17196959
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| || |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| | |    
T  17197147 tttggggtcggcctagtggttggtttgcgatcttggagtttgctcctccataggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgagctaagtcc 17197048  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  17197047 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 17196959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23012699 - 23012517
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||| | |||||||    
T  23012699 gttggcccagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtcttaggtttgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacag 23012600  T
Q  113 agcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  23012599 agcttgctctggctttaaatggggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcgtattagtcaattcattgatcggata 23012517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 654863 - 654714
Alignment:
Q  45 tttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaa 142  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||    
T  654863 tttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggcccccgcaa 654764  T
Q  143 gtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  654763 gtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggttcttggatcggata 654714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 17212057 - 17212245
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  17212057 tttggggttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 17212156  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||| |||  ||||||| |||  || |||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17212157 atacagagattgctctggcttaaaacgggacccctgcaagtgagtggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcagata 17212245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 2344303 - 2344491
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| | |    
T  2344303 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaagctctcagattcgattccttctggtgccaattttggtgggctaagtcc 2344402  T
Q  107 atacagagc--ttgctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||  ||  ||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  2344403 atacagagctttttttggctttaaacgggacccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggata 2344491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 27312156 - 27312344
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| || |  || | |    
T  27312156 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtttcaggttcgattccctctagtgccaatttcgatgtgccaagtcc 27312255  T
Q  107 atacagagct--tgctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||    ||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  27312256 atacagagctacctctgactttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggata 27312344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 27704006 - 27704193
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||| | |    
T  27704006 tttggagttggtccagtggttggcttgagatcttgaagtttgctcctacagaggtctcaggttcgatttcctttggtgccaatttcggtgggctaagtcc 27704105  T
Q  107 atacagagcttgc--tggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||    
T  27704106 atagagagcttgctttggctttaaatggacccccgcaagtgggtggtgtgattgatcccctcagattagtcgattcttgaatcagata 27704193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 28950878 - 28951063
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagt---ttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcata 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||   |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  28950878 gttggcctagtggttggcttggggtcttggagtagtttgctccttcagaggtctcaggttcgactccctctggtgccaatttcggtgggctaagttcata 28950977  T
Q  110 cagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
     ||||||||  |||||||||||  || ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  28950978 tagagcttgctctggctttaaacgggtccctcgcaagtcggcggtgggattggtcccctcgaactagacaattcttggatcggata 28951063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 42913704 - 42913522
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||| |||| ||| | ||||| |    
T  42913704 gttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgatttcatatggtgccaatttcgatgggataagtccatacgg 42913605  T
Q  113 agcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    | ||||  |||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  42913604 aacttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagttgattcttagatcggata 42913522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 27009363 - 27009552
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  27009363 tttggggttggcctagtggttggcttcggatcttggagtttgctcatccagaggtctcaggttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 27009462  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgc-aagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||  || |||| || |||||| ||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||| |||||    
T  27009463 atacagagcttgctctgactttaaacggggcccctgcaaagtggacggtgggattggtcccctcaaattagtcgattcttggattggata 27009552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 43 - 192
Target Start/End: Original strand, 16374034 - 16374186
Alignment:
Q  43 agtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgc--tggctttaaa-tggccccccg 139  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||  ||||  ||||||||||  || ||||||    
T  16374034 agtttgctcctccagaggtctcagattcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagtccatacagaatttgctatggctttaaacgggacccccg 16374133  T
Q  140 caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16374134 caaatggacggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 16374186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Original strand, 31273941 - 31274105
Alignment:
Q  30 cttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggcttta 127  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||  |||||||||    
T  31273941 cttgggatcttggagtttgctcctccagagctctcaagttcgattccctctggagctaatttcggcgggctaagtccatacagagcttgctctggcttta 31274040  T
Q  128 aatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    || ||  | |||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  31274041 aacggggctccgcaagtgggcagtgagattggtcccctcgaattagtcgattcttggaccggata 31274105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 7800029 - 7799902
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |    
T  7800029 tttggggttgacctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggttaagtcc 7799930  T
Q  107 atacagagcttgc--tggctttaaatgg 132  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||    
T  7799929 atagagagcttgctatggctttaaatgg 7799902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 22638296 - 22638480
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |||| |||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22638296 tttggggttggtctagtggttgacttgagatcttagagtttgctctttcaaaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaagttc 22638395  T
Q  107 atacagagcttgct--ggctttaaatggcccc-ccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |    |||||||||  ||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22638396 a----gagcttgctctggctttaaacggggcctccgcaagtgggcggtgggattgatctcctcgaattagtcgattcttggatcggata 22638480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 19421235 - 19421423
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||| |||| ||| | |    
T  19421235 tttggggttgacttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgatttcttctggtgtcaatttcgatgggctaagtcc 19421334  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  19421335 atacagagcttgctctgactttaaatggggcgcccacaagtgggcggtgggattggtctcctcggattagtcgattcttgaatcagata 19421423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 192
Target Start/End: Original strand, 29861722 - 29861862
Alignment:
Q  55 cagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||| ||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  29861722 cagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagaacttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggt 29861821  T
Q  152 gggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  29861822 gggattgatcccctcgaattagtcgattcttagatcggata 29861862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 39145843 - 39145661
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcat-aca 111  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |  || |||    
T  39145843 gttgacctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagatgtcttcggttcgattccctgtggtgccaatttcggtgggctaagtcaataaca 39145744  T
Q  112 gagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||  ||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  39145743 gagcttgctctggctttaaacgggcccctgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttgaatcagata 39145661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 13332620 - 13332510
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||| | |    
T  13332620 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctcctgaggtctcaggtacgattccctctggagccaatttcggtgggctaagtcc 13332521  T
Q  107 atacagagctt 117  Q
    |||||||||||    
T  13332520 atacagagctt 13332510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 31197595 - 31197782
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||  | || ||  ||||||||||| |||| | |    
T  31197595 tttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcatccagatgtctcaggtttgattcattatg-tgtcaatttcggtggattaagtcc 31197693  T
Q  107 atacagagcttgctg--gctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||| ||||||   |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  31197694 atacagatcttgctcttgctttaaacggggcccccgcaagtggtcggtgggattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggata 31197782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 32849595 - 32849783
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||   ||||| |||||| ||| | |    
T  32849595 tttggggttagcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcgggtttgattccctctagtctcaattttggtgggctaagtcc 32849694  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    | || |||||||  |||||||||||| || | |||  |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  32849695 acactgagcttgctctggctttaaatgggactcccataagtgggcagtgggattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggata 32849783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 98
Target Start/End: Original strand, 22299863 - 22299944
Alignment:
Q  17 gcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 98  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22299863 gcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtggg 22299944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 190
Target Start/End: Original strand, 25333423 - 25333593
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||| |      
T  25333423 tttggggttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgataccctctggcaccaatttcgttgggttaact-- 25333520  T
Q  107 atacagagcttgctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcgga 190  Q
                ||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25333521 ------------ctgactttaaacaggccccccgcaagtgggcagtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcgga 25333593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 43785496 - 43785308
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||| |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||| | |    
T  43785496 tttggggttgacctaatggttggcttgggatctttgagattgctcctccaaaggtctcaagttcgattcccacttgtgctaatttcagtggactaagtcc 43785397  T
Q  107 atacagagctt--gctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||   |||| ||||||  || || |||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  43785396 atacagagcttactctggttttaaacggggcctccgcaagtggacggtgagattggtccccttggattagtcgatttttggatcggata 43785308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 74 - 192
Target Start/End: Original strand, 23092167 - 23092288
Alignment:
Q  74 tccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggat 170  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23092167 tccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatggacggtgggattggtcccctcggat 23092266  T
Q  171 tagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||| |||| |||||||||||    
T  23092267 tagtcgattcatggatcggata 23092288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 58 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 41907659 - 41907523
Alignment:
Q  58 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtggg 154  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||| | ||||||||| |||  ||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||    
T  41907659 aggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcagtgggctaagtccatacagaggttgctctggctttaaacgtggcccccgcaagtgggtggtggg 41907560  T
Q  155 attgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  41907559 attggtcccc-cagattagtcgattcttggatcggata 41907523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 87 - 192
Target Start/End: Original strand, 3851841 - 3851949
Alignment:
Q  87 aatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttg 183  Q
    |||||||||||| ||| | |||| ||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  3851841 aatttcggtgggctaagtccatatagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 3851940  T
Q  184 gatcggata 192  Q
    |||||||||    
T  3851941 gatcggata 3851949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 36772471 - 36772312
Alignment:
Q  35 gatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tg 131  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| || ||  ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||  |    
T  36772471 gatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggtttgatttcccct-atgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacgg 36772373  T
Q  132 gccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    | ||||||  |||||||||||| |||  ||| |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  36772372 ggcccccgggagtgggcggtggaattagtcctctcggattagtcgattctttgatcggata 36772312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 120
Target Start/End: Original strand, 42814868 - 42814981
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |    
T  42814868 tttggagttggcttagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctcttgaagtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtcc 42814967  T
Q  107 atacagagcttgct 120  Q
    ||||| ||||||||    
T  42814968 atacaaagcttgct 42814981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 75
Target Start/End: Original strand, 23854400 - 23854468
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattc 75  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23854400 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattc 23854468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 188
Target Start/End: Original strand, 9683836 - 9684014
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| | ||||| |    
T  9683836 gttggcctagtggttgacttgagatctgggagtttgctcctctagaggtctcaggcctaattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccataccg 9683935  T
Q  113 agctt--gctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 188  Q
    |||||   |||||||||||  ||  |||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  9683936 agcttactctggctttaaacggggtccccacaagtgggcggtaggataggtcccctcggattaatcgattcttggatcg 9684014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 31713092 - 31712911
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||| |||||||||| |||        | ||| | |    
T  31713092 tttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctcgagaggtctcaggattgatttcctctggtgccaata-------gataagtcc 31713000  T
Q  107 atacagagcttgct--ggctttaaatggccccc-cgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||  |||| ||  ||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31712999 atacaacgcttactctggctttaagcgggaccctcgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 31712911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23330936 - 23330748
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||||| || |||| |||||| |   ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  || | |    
T  23330936 tttggggttagcctagtggttggcttgggattttagagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgactccctccggtgccaatttcggtggg-caagtcc 23330838  T
Q  107 atacagagctt---gctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||    ||||||| |||  || || |||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  23330837 atacagagctttgctctggcttaaaacgggacctccgcaagtgggcggtaagattggtcccctcaaattagtcaatccttggatcggata 23330748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 28646973 - 28647161
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||| | |   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |      
T  28646973 tttggggttggcctagtgattgacttgggatcttggagtgtgcttctctcaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggg-caagtca 28647071  T
Q  107 atacagagctt---gctggctt-taaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||| ||    ||||||| |||  || ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||  | |||||||||||||    
T  28647072 atacagagttttgctctggcttataacggggcccccacaagtgggcggtgggattggttccctcgaattagtctgtccttggatcggata 28647161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 9718178 - 9718071
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    ||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| | |||| ||    
T  9718178 gttggcctagtggttggcctgagatattggagtttgctcctccaaaagtctcaagttcgattccctctggtgtcaatttcgatgggctaagtccatagag 9718079  T
Q  113 agcttgct 120  Q
    ||||||||    
T  9718078 agcttgct 9718071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 14199839 - 14199713
Alignment:
Q  31 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaa 128  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||| ||| |  ||| ||||||||  ||| ||||||    
T  14199839 ttggaatcttggagtttcctcctccagaggtctcaggttcgattccctctaatgccaattttggtgggctaagtctatatagagcttgctctgcctttaa 14199740  T
Q  129 atggccccccgcaagtgggcggtggga 155  Q
    | ||  ||||||||||||| |||||||    
T  14199739 acggggccccgcaagtgggtggtggga 14199713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 80
Target Start/End: Original strand, 21370601 - 21370674
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctct 80  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  21370601 tttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttactccttcagatgtctcaggttcgattccctct 21370674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Original strand, 22696330 - 22696415
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 98  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22696330 gttggcctagtggttgatttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtggg 22696415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 98
Target Start/End: Original strand, 40332103 - 40332194
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 98  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||    
T  40332103 tttggagttggtctagtggttggcttgaaatcttggagtttgctcctctaaaggtctcaggttcgatttcctctggtgtcaatttcgatggg 40332194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 22643515 - 22643351
Alignment:
Q  31 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaa 128  Q
    ||||||||||| ||||| |||| | |||||||| | |||||||| |||||| ||  ||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| ||||||    
T  22643515 ttgggatcttgaagtttactccactagaggtcttatgttcgatttcctctgatgtcaatttcggtaggctaagtccatacagagcttgctctgactttaa 22643416  T
Q  129 atgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    | ||  ||| ||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||| || |||||| |||| ||||    
T  22643415 acggagccctcgcaagtggccggtgtgattagtcccctcggattaatcgattctttgatcagata 22643351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8943500 - 8943410
Alignment:
Q  106 catacagagcttg--ctggctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  8943500 catacagagcttggtctggttttaaacgggcccccccgcaagtgggcggtgtgattggtccccttgaattagtcgattcttggatcggata 8943410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 8435892 - 8435801
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 98  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||     || ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8435892 tttggggttggtctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctttgaagatcttaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtggg 8435801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 12211732 - 12211646
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcg 93  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |   || ||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  12211732 tttggggttggcctagtggttggcttaggatcttggagtgtgctcctctcaagatctcaggtttgatttcctctggtgccaatttcg 12211646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 21574300 - 21574111
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgatt-ccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||| |   ||||| ||||||||||| |||| |||||| || |||||||||  || |     
T  21574300 tttggggttggcctagtggttggtttgggattttggagtgtgctcctctcaaggtcacaggttcgattcccctttggtgccaacttcggtggg-caagtc 21574202  T
Q  106 catacagagctt---gctggctt-taaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||    | |||||  ||  || ||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  21574201 catacagagctttgcccaggcttagaacggggcccccacaagtaggcggtgagattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggata 21574111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 69
Target Start/End: Original strand, 28003852 - 28003902
Alignment:
Q  19 ctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggtt 69  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  28003852 ctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaagtcttaggtt 28003902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 122 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 33137904 - 33137834
Alignment:
Q  122 gctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  33137904 gctttaaatggggccctgcaagtgggcggtgaaattggtcccctcgaattagtcgattcttagatcggata 33137834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 120
Target Start/End: Original strand, 6491675 - 6491724
Alignment:
Q  71 gattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct 120  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  6491675 gattccctctggtgtcaatttcgatgggctaaattcatacagagcttgct 6491724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 51
Target Start/End: Original strand, 577683 - 577727
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctc 51  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  577683 tttggggttggcctagtggtttgcttgggatcttagagtttgctc 577727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 102
Target Start/End: Original strand, 21558187 - 21558231
Alignment:
Q  58 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaa 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21558187 aggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttaggtgggttaa 21558231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 135 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 1766210 - 1766153
Alignment:
Q  135 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | |||| ||||||||    
T  1766210 ccccacaagtgggcggttggattggtcccctcggattagtcggtacttgaatcggata 1766153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 175
Target Start/End: Original strand, 21373789 - 21373885
Alignment:
Q  82 gtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 175  Q
    |||| |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||    
T  21373789 gtgccaatttcggtgggctaagtctatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgagattggtcctcacggattagtc 21373885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 22264675 - 22264622
Alignment:
Q  31 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtg 84  Q
    |||| ||||||||||||||||| |   ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22264675 ttggaatcttggagtttgctcctctcaaggtctcagattcgattccctctggtg 22264622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 3951188 - 3951096
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttggg-atcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 98  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |   | ||||| |||||| ||  ||||| ||||||||||||||||    
T  3951188 tttggggttggtctagtggttggcttggggatcttggagtgtgctcctctcaaagtctcgggttcgcttttctctgatgctaatttcggtggg 3951096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 62)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8484858 - 8484670
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  8484858 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagttc 8484759  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8484758 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 8484670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 38684209 - 38684395
Alignment:
Q  8 ttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattca 107  Q
    |||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||    
T  38684209 ttggggttggcccagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcca 38684308  T
Q  108 tacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38684309 tacagagcttgctctggctttaaacgggcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 38684395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 11926699 - 11926510
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  11926699 tttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttagattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 11926600  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11926599 atacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 11926510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15641302 - 15641115
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| | |    
T  15641302 tttggggttagcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaagtcc 15641203  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15641202 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggata 15641115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 27498928 - 27498740
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  27498928 tttggggttgacctagtggttggcttggaatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 27498829  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27498828 atacatagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 27498740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 32059637 - 32059449
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  32059637 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccttctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 32059538  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  32059537 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggata 32059449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 33709692 - 33709512
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||    
T  33709692 gttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacag 33709593  T
Q  113 agcttgctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||    |||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33709592 agagctctggctttaaacgggacccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 33709512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19456389 - 19456220
Alignment:
Q  24 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--g 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||  |    
T  19456389 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgat-ccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 19456291  T
Q  122 gctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19456290 gctttaaacggggccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 19456220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 192
Target Start/End: Original strand, 18207231 - 18207395
Alignment:
Q  31 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||||||||||    
T  18207231 ttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctccggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgttctggctttaa 18207330  T
Q  129 atg-gccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    | | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18207331 acgaggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 18207395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 30485828 - 30486016
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||| | |    
T  30485828 tttggggttggcccagcggttggcttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattcactctggtgtcaatttcggtgggctaagtcc 30485927  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30485928 atacagagcttgctctggctttaaacgatgcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcaattcttggatcggata 30486016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 13038651 - 13038464
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |||    
T  13038651 tttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggctaagttc 13038552  T
Q  107 atacagagcttg-ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||  |  ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  13038551 atacagagcaagtatggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 13038464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 13108646 - 13108459
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |||    
T  13108646 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggctaagttc 13108547  T
Q  107 atacagagcttg-ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||  | ||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  13108546 atacagagcaagtctgcctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 13108459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 192
Target Start/End: Original strand, 37495058 - 37495242
Alignment:
Q  18 cctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagctt 117  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| | ||||||||||||    
T  37495058 cctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggctaagtccatacagagctt 37495157  T
Q  118 g--ctggctttaaatggccc--------cccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |  ||||||||||| | |||        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37495158 gctctggctttaaacgcccccccccccgcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 37495242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 192
Target Start/End: Original strand, 42193490 - 42193671
Alignment:
Q  12 tgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcataca 111  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |  |||||    
T  42193490 tgttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgcttccccagaggtctcaggttcgatttcctctgatgccaatttcggtgggctaagtctataca 42193589  T
Q  112 gagcttgc--tggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||| ||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  42193590 gagtttgctttggctttaaatgg-accccgcaagtgggcggtggggttggtcctctcggattagtcgattcttggatcagata 42193671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 34310142 - 34310330
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| | |    
T  34310142 tttggggttggcctagtggtcggcttggaatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggctaagtcc 34310241  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || |||||  |||||| ||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  34310242 atacagagcttgctctggctttaaacgggacccccataagtggacggtgggattggtcccctcgaattaatcgattcttggatcggata 34310330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 36954818 - 36955006
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||| | |    
T  36954818 tttggggttggcctagtggttgccttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattccctctggttctaatttcggcgtgctaagtcc 36954917  T
Q  107 atacagagcttgc--tggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  36954918 atacagagtttgctttggctttaaatgggccccccgcaagtggactgtgggattagtcccctcatattagtcgattcttggatcggata 36955006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 31288137 - 31287955
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||     
T  31288137 gttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcatgttcgattccctttggtgccaatttcggtgggttaagtccatacaa 31288038  T
Q  113 agcttgc--tggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||  || |||||||  || ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||  |||||||| ||||||    
T  31288037 agcttgctttgactttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtctcctcgaattagtcggttcttggaccggata 31287955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 11465098 - 11464917
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    |||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||    
T  11465098 gttggcctagtgattggcttgaaatcttggagtttgctcctccaaatgtctcaggttcgatttcctctggtgccaattttggtgggctaagttcatacag 11464999  T
Q  113 agctt--gctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||   ||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  11464998 agcttactctggctttaaacggggccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 11464917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19145608 - 19145421
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |   ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  || | |    
T  19145608 tttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtatgctcctctcaaggtctccggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc-aagtcc 19145510  T
Q  107 atacagagcttg---ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  19145509 atacagagctttgctctggctttaaatggtcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttggttcttggatcggata 19145421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 7085815 - 7085635
Alignment:
Q  15 tggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagag 114  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||| | |||||||||    
T  7085815 tggcttagtggttggcttgggatcttggagttttctcctccagaggtctccggttcgattccctctagtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagag 7085716  T
Q  115 cttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||  ||| |||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7085715 cttgctctgactttaaacggggtccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttgaatcggata 7085635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 6014471 - 6014289
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  6014471 gttggcctagtgattggcttgggatcttggagtttgcttctccagagatctcaggttcgattacttctggtgccaatttcggtgggttaagtccatacag 6014372  T
Q  113 agcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||  |||||||||||  ||  || ||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  6014371 agcttgctctggctttaaacggggtccacgcaagtgggcggtgagattagtcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 6014289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 4603777 - 4603965
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||| | |    
T  4603777 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaagatctcaagttcgattccttctggtgccaatttcgatgggctaagtcc 4603876  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||| |  |||||||||||  || |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  4603877 atacagagctcgctctggctttaaacggggcccctgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggata 4603965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23270719 - 23270531
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||| |||| | ||| |||||||||||| ||| | |    
T  23270719 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcatccaaaggtctcaagttcgatttcctccgatgccaatttcggtgggctaagtcc 23270620  T
Q  107 atacagagcttgc--tggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  23270619 atacagagcttgctttggctttaaacggagcccccgcaaatggacggtgggattggtcccctcggattagttgattcttggattggata 23270531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 10869756 - 10869574
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    |||||| | ||||||  |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||| | || || |    
T  10869756 gttggcatggtggttgacttgcgatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccatctggttccaatttcggtgggctaagtccacactg 10869657  T
Q  113 agcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||  |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  10869656 agcttgctctggctttaaatggggcctccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggttcttggatcggata 10869574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 25586932 - 25587085
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  25586932 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 25587031  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaa--atggccccccgcaagtgggcggtgggat 156  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  | | |||||| |||||||||||| ||||    
T  25587032 atacagagcttgctctggctttaaacaggaccccccccaagtgggcggtcggat 25587085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 15971313 - 15971144
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||| ||| | ||||||     
T  15971313 gttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctgatgtcaatttcggtgggctaagtccatacat 15971214  T
Q  113 agcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaatt 179  Q
    ||||||  ||| |||||||  || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  15971213 agcttgctctgactttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgagattgatcccctcggattaatcaatt 15971144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 38631158 - 38630988
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| | |    
T  38631158 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcagattcgattccctctggtgccaatttcgatgggctaagtcc 38631059  T
Q  107 atacagagcttgctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||                | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  38631058 atacagagc---------------aggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattaatcgattcttggatcggata 38630988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 27487752 - 27487563
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| || | |||||| |||||||||||  ||| | |    
T  27487752 tttggggttggcctagtggttgatttgggattttggagtttgctcttccagaggtctcaggtttgatcccatttggtgccaatttcggtggactaagtcc 27487653  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  || ||||||||   || |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27487652 atacagagcttgctctagctttaaacgggggcccttgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 27487563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12398628 - 12398457
Alignment:
Q  24 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||||  |||    
T  12398628 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctatggtgtcaatttcggtggcctaagttcatacagagcttgctctg 12398529  T
Q  122 gctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||| ||||| ||||| ||| |||  |||||||  ||||||||| |||||    
T  12398528 gctttaaatggggcccccgcaaatggacggtgagattgatcctctcaaattagtcggttcttggattggata 12398457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 1827727 - 1827616
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| | |    
T  1827727 tttggggttgacctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgataccaatttcggtgggttaagtcc 1827628  T
Q  107 atacagagcttg 118  Q
    ||||||||||||    
T  1827627 atacagagcttg 1827616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 22392701 - 22392876
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||| | || ||    
T  22392701 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctc---tgccaatttcggtgggct-aagtc 22392796  T
Q  107 atacagagcttgctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
     |     |||  |||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  22392797 tt-----gct--ctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcagattagtcgatttttggatcggata 22392876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 25750808 - 25750622
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcg--attccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 104  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  25750808 tttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttggatattccttctggtgccaatttcggtgggttaagt 25750709  T
Q  105 tcatacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
     |||| ||||||||  ||||| ||||  || ||||  |||||||| |||| ||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  25750708 ccatatagagcttgctctggc-ttaacgggacccc--caagtggggggtgagattggtcccttcagattagtcgattcttggatcggata 25750622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 157
Target Start/End: Original strand, 15931059 - 15931211
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || | |    
T  15931059 tttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgcttcttcacaagtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggct-aagtcc 15931157  T
Q  107 atacagagcttgct--ggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggatt 157  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||  || | | ||||||||||||||||||||    
T  15931158 atacagagcctgctctggctttaaacagggctctcgcaagtgggcggtgggatt 15931211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12317347 - 12317164
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| |||| |||| | |||||||  ||||||||||||||||        
T  12317347 tttggggttggcctagtggttggcttggaatcttggagtttgctcctcttgaggtctcgggtttgatttcatctggtgtcaatttcggtgggttaa---- 12317252  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaa-atggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
     | |||||||||  ||| ||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12317251 gtccagagcttgctctgactttaagcgggccccccgcaagtgggtggtgggattgat-ccctcggattagtcaattcttagatcggata 12317164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 58 - 188
Target Start/End: Original strand, 5049188 - 5049320
Alignment:
Q  58 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtggga 155  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||| |||  ||| |||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||    
T  5049188 aggtctcagattcaattccctctggtaccaatttcgatggtctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacgggcccccgcaaatggacggtggga 5049287  T
Q  156 ttgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 188  Q
    ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  5049288 ttggtcccatcgaattagtcgattcttggatcg 5049320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 192
Target Start/End: Original strand, 35425082 - 35425201
Alignment:
Q  76 cctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggatta 172  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||| | ||||||||||| |||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  35425082 cctctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagctcgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcctctcggatta 35425181  T
Q  173 gtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  35425182 gtcgattcttggatcggata 35425201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Original strand, 34049822 - 34049981
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||           | |||||| ||| | |    
T  34049822 tttggggttgggctagtagttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccttc-----------taggtgggctaagtcc 34049910  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagt 174  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  34049911 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtggtcggtaggattggtcccctcggattagt 34049981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 21236553 - 21236371
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| ||||  |||||||||  |||||||||| |||| |||  ||||||  |||| ||| | |||||||    
T  21236553 gttggcttagtagttcgcttaggatcttggagttttctccttcagaggtcttcggttcgattctctctagtgtcaatttcaatgggctaagtccatacag 21236454  T
Q  113 agcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    || || ||  | ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  21236453 agttttctctgactttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattagtcccctcagattagtcgattcttgaatcggata 21236371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 192
Target Start/End: Original strand, 22693065 - 22693123
Alignment:
Q  134 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22693065 cccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 22693123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 87 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9659428 - 9659320
Alignment:
Q  87 aatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttg 183  Q
    |||||||||||| ||| | |||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||    
T  9659428 aatttcggtgggctaagtccatacacagcttgctctggctttaaatgggccccccgcaagtggacggtgggattggtcccttcggattagttgattcttg 9659329  T
Q  184 gatcggata 192  Q
    ||| |||||    
T  9659328 gatgggata 9659320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 41351186 - 41351113
Alignment:
Q  119 ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41351186 ctggctttaaacggggctccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 41351113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 115
Target Start/End: Original strand, 7151346 - 7151437
Alignment:
Q  24 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagc 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  7151346 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctcaagaggtcttaggttcgactccctctggcgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagc 7151437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 26009451 - 26009277
Alignment:
Q  17 gcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagct 116  Q
    ||||||||||| | |||||||||  |||||| |||| | | |||| || ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| | ||| |||||||    
T  26009451 gcctagtggttggtttgggatctcagagtttactcctcgaaaggtttccggttcgattccctttggtgccaatttcagtgggctaagtccatgcagagct 26009352  T
Q  117 t--gctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 188  Q
    |   |||||||||||  || ||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  26009351 tactctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtagtgggattagtcccctcggattagtcggttcttgaatcg 26009277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 13659312 - 13659254
Alignment:
Q  134 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13659312 cccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattaatcgattcttggatcggata 13659254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 10399773 - 10399957
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||| |  || || | ||||||| ||||| |||||| || ||||||| |||| ||| | |    
T  10399773 tttggtgttggtctagtggttgactttggatcttggagtttgcttcttcaaagatttcaggtttgattctctctggcgccaatttcgatgggctaagtcc 10399872  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttc-ccctcggattagtcaattcttggatc 187  Q
    |||| |||| ||  ||| |||||||  || |||||| |||||| ||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||    
T  10399873 atacggagcatgctctgactttaaacggggcccccgtaagtggacggtgggattggtcaccctcgaattagtcgattcttggatc 10399957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 190
Target Start/End: Original strand, 5067392 - 5067447
Alignment:
Q  135 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcgga 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5067392 ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctctgattagtcgattcttggatcgga 5067447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 28614667 - 28614495
Alignment:
Q  21 agtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg-- 118  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||| ||| ||| || |||||||||||||| |||||| ||  |||| ||||| | ||| | |||||| ||||||      
T  28614667 agtggttggcttgagatcttagagtttgttcctccaaagatctcaggttcgattacctctgatgtcaatt-cggtgagataagtccatacaaagcttgtt 28614569  T
Q  119 ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||| ||||||| ||   ||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  28614568 ctgactttaaacgggatcccgcagatggacggtgggattgatcccctcgaattagtcgatttttggatcggata 28614495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 192
Target Start/End: Original strand, 36895438 - 36895613
Alignment:
Q  20 tagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagctt-- 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |   |||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| || | |||||| |||||      
T  36895438 tagtgattagcttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtttcatgttcgattccctctggtaccaatttcggt-ggtcaagtccatacaaagctttg 36895536  T
Q  118 -gctggctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
      |||||||  || |   || |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  36895537 ctctggcttagaacgtagccgccgcaagtgggcggggggattgttctcctcgaattagtcggttcttggatcggata 36895613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 97
Target Start/End: Original strand, 37397713 - 37397803
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgg 97  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||    
T  37397713 tttggggttggtctagtggttggcttgtgatcttggagtttgctcctccaaaggtctaaggtttgattccccctggtgtcaattttggtgg 37397803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 930682 - 930495
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctc-tggtgctaatttcggtgggttaaatt 105  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||| || ||||||||||| |   | |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||  |||||    
T  930682 tttggggttggcccagtggttggcttgagattttagagtttgctcctctcaaagtctcaggttcgattcccacttggtgccaatttcggt-ggacaaatt 930584  T
Q  106 catacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||| ||||||||  |||||  ||    ||| ||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  930583 catacatagcttgctccggcttagaacaagccctcgcaagtggacagtgtgattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggata 930495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 84
Target Start/End: Original strand, 5067301 - 5067378
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtg 84  Q
    ||||| ||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  5067301 tttggagttggtctagtggttgacttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggttcgattttctctggtg 5067378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Original strand, 40330639 - 40330724
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 98  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |   |||||||| |||| |||| || |||||||||||||| ||||    
T  40330639 gttggcttagtggttagcttgagatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaagttcaattctctatggtgctaatttcgttggg 40330724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 15485489 - 15485317
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtgg-ttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 105  Q
    ||||| |||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||| |   |||||||||||||||||||| |||   | |||||||||||||||| |     
T  15485489 tttggggttggcctagcgggttggcttgggaccttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattccc-ctgacaccaatttcggtgggttaagtc 15485391  T
Q  106 catacagagct---tgctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 175  Q
    |||||| | ||   | |||||||||||| ||  ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||    
T  15485390 catacaaaactatgttctggctttaaatggggtccccgcaagtggatggtgggattggacccctcggattagtc 15485317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 17015593 - 17015428
Alignment:
Q  24 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgctggc 123  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| ||| | |||||   ||||  ||||    
T  17015593 ggttggcttgagatcttgaagtttcctctttcagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcattgggataagtccatac-ttgctt--tggc 17015497  T
Q  124 tttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||| ||  ||||||||||  ||||| ||| || | ||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  17015496 tttaaacggatccccgcaagtaagcggtaggaatggtaccctcggattaattaattcttgaatcggata 17015428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 3715106 - 3715055
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaga 58  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  3715106 tttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccaga 3715055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 10631340 - 10631298
Alignment:
Q  150 gtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10631340 gtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 10631298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 98
Target Start/End: Original strand, 21589349 - 21589387
Alignment:
Q  60 gtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21589349 gtctcaggttcgattccctctggtgccaatttaggtggg 21589387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 8 - 45
Target Start/End: Original strand, 19230476 - 19230513
Alignment:
Q  8 ttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagt 45  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19230476 ttggggttggcctagtggttagtttgggatcttggagt 19230513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 22253342 - 22253233
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||| |   || |||||||||||| |  |||| |||| ||||||| |||| ||| | |    
T  22253342 tttggggttggtctagtggttggcttgggatctttgactttgctcctctctagatctcaggttcgactttctctagtgccaatttcgatgggctaagtcc 22253243  T
Q  107 atacagagct 116  Q
    ||||| ||||    
T  22253242 atacaaagct 22253233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 192
Target Start/End: Original strand, 42006868 - 42006921
Alignment:
Q  139 gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||  |||||| |||||||||    
T  42006868 gcaagtgggcggtggaattgttccacttggattagttgattctttgatcggata 42006921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Original strand, 16616126 - 16616186
Alignment:
Q  14 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgatt 74  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | || |||||| |||||||    
T  16616126 ttggcttagtagttggcttgggatcttggagtttgctcctctaaagatctcagattcgatt 16616186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 51
Target Start/End: Original strand, 42006793 - 42006837
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctc 51  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  42006793 tttggggttgggctagtggttggcttgagatcttggagtttgctc 42006837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 68)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 7766918 - 7766736
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  7766918 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggctaagtccatacag 7766819  T
Q  113 agcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||  ||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7766818 agcttgctctgactttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttgaatcggata 7766736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 4621434 - 4621246
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  4621434 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 4621335  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4621334 atacagagcttgctctggctttaaacggggtccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 4621246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 24674393 - 24674581
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  24674393 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 24674492  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24674493 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgtattagtcgattcttggatcggata 24674581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 24122023 - 24122211
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  24122023 tttggggttggcttagtggttggcttgggatcttggggtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 24122122  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24122123 atacagagcttgctctggctttaaacggggctcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 24122211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 46607810 - 46607998
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  46607810 tttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 46607909  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  46607910 atacagagcttgctctgactttaaaaggcccccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcggtccttggatcggata 46607998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15059599 - 15059411
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  15059599 tttggggttggcctagtggttggcttggaatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 15059500  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  ||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  15059499 atacagagcttgctctggctttaaacggggtccccgcaagtgggcggtgagattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 15059411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 27455063 - 27454873
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||| | |    
T  27455063 tttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattcactctgatgccaatttcggtgagctaagtcc 27454964  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaatgg---ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27454963 atacagagcttgctctggctttaaacgggccccccccgcatgtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 27454873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 190
Target Start/End: Original strand, 8077647 - 8077832
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  8077647 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 8077746  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcgga 190  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  8077747 atacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctc-gattaatcgattattggatcgga 8077832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 7197443 - 7197256
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |      
T  7197443 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtggg-taagtca 7197345  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||| | | |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  7197344 atacagaccttgctctggctttaaacgaggcccctgcaagtgggcggtgagattggtcccctcggattagtcgattcatggatcggata 7197256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 30677176 - 30677364
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  30677176 tttggggttgacctagtggttggtttgggatctaggagtttgctcctccaaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 30677275  T
Q  107 atacagagcttgc--tggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||| ||||||    
T  30677276 atacagagcttgctttggctttaaatgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcggttcttggaccggata 30677364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 34778342 - 34778527
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||   | |    
T  34778342 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtaccaattttggtgggtt---tcc 34778438  T
Q  107 atacagagcttgc--tggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  34778439 atacagagtttgctttggctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattggtccccttggattagtcgattcttggatcggata 34778527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Original strand, 17935777 - 17935957
Alignment:
Q  15 tggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagag 114  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||| | |||||||||    
T  17935777 tggcatagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccttctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagag 17935876  T
Q  115 cttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
     |||  |||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17935877 tttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcgatgggattggtccactcggattagtcgattcttggatcggata 17935957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9500530 - 9500364
Alignment:
Q  29 gcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggcttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  9500530 gcttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggcttt 9500431  T
Q  127 aaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9500430 aaacggagcccccacaagtgggcggtgagattggtctcttcggattagtcgattcttggatcggata 9500364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 168201 - 168389
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  168201 tttggagttggcctagtggttggcttgggatcttagagtttgctctttcaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagttc 168300  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||  || | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| || ||||||    
T  168301 atacagagcttgttctgactttaaacgggactcccgctagtggccggtgggattggtcccctcggattagttagttcttagaccggata 168389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 192
Target Start/End: Original strand, 7578419 - 7578597
Alignment:
Q  17 gcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagct 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||    
T  7578419 gcctagtggttggcttgggatcttggagtttgttcctccagaggtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaaagct 7578518  T
Q  117 tg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||  ||| |||||||  || ||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  7578519 tgctctgactttaaacggggccctcgcaagtgggtggtgggattggttccctcggattagttgatttttggatcggata 7578597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 1378904 - 1379085
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| | |||||||    
T  1378904 gttggcttagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaagtctcatgttcgatttcctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacag 1379003  T
Q  113 agcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    | ||||  ||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  1379004 aacttgctctggctttaaacgggcccccgcaagtggacggtgagattggtcccctcagattagtcgattcttagatcggata 1379085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 23734116 - 23734305
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||||  |||| ||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| | |    
T  23734116 tttggggttggtttagtagttggcttgggatcttagaatttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtgggctaagtcc 23734215  T
Q  107 atacagagcttgc--tggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||| ||||  || |||||||   ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  23734216 atacagagtttgctatgcctttaaacggggccccccgcaagtgggcggtgaaattggtcccctcagattagtcgattcttgaatcggata 23734305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 23741308 - 23741497
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||||  |||| ||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| | |    
T  23741308 tttggggttggtttagtagttggcttgggatcttagaatttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtgggctaagtcc 23741407  T
Q  107 atacagagcttgc--tggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||| ||||  || |||||||   ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  23741408 atacagagtttgctatgcctttaaacggggccccccgcaagtgggcggtgaaattggtcccctcagattagtcgattcttgaatcggata 23741497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 45859218 - 45859052
Alignment:
Q  29 gcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggcttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||  |||||  || |||||    
T  45859218 gcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacatcgcttgctcttgcttt 45859119  T
Q  127 aaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||  || |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  45859118 aaacagggcccccgcaagtgggtggtaggattggtcccctcggattagttgattattggatcggata 45859052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Original strand, 7946855 - 7947011
Alignment:
Q  18 cctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagctt 117  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |  |||||||||||    
T  7946855 cctagtggttggcttgagatcttgaagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtctatacagagctt 7946954  T
Q  118 g--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggatta 172  Q
    |  || |||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||    
T  7946955 gctctcgctttaaatggggccccgcaagtgggtggtgagattggtcccctcagatta 7947011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 32729545 - 32729732
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |   | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  || | |    
T  32729545 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctctcaaagtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggtggg-caagtcc 32729643  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |  ||||||||||||    
T  32729644 atacagagcttgctctggctttaaatggggtccccgcaagtgggcggtgggattgatccccttggattagtcggtctttggatcggata 32729732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 21726735 - 21726917
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    |||| ||||||||||   ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| | |||| ||    
T  21726735 gttgacctagtggttgatttgggttcttgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcgatgggttaagtccatatag 21726834  T
Q  113 agcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||  || ||||||||  || ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  21726835 agcttgttctagctttaaacgggtcccccacaagtgggcggtggggttgatcccctcagattaatcgattcttggatcggata 21726917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 37351643 - 37351462
Alignment:
Q  22 gtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--- 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||       
T  37351643 gtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaatgtctcaggttcgattccttctgatgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctc 37351544  T
Q  119 --------ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
            ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  37351543 tggaagctctggctttaaacgggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggata 37351462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 18646853 - 18647041
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |      
T  18646853 tttggggttgacctagtggttggcttgtgatctttgagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtct 18646952  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||| || |||  ||||||||||| ||  |||| | |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  18646953 atacaaagtttgctctggctttaaacggagcccctgtaagtgggcggtgagattgatcccctcgaattagtcgattcttgaatcggata 18647041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 36156061 - 36155897
Alignment:
Q  31 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgc--tggctttaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || | ||| ||||||||||  | | |||||    
T  36156061 ttgggatcttggagtttgctcctccagaggtgtcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggccaagtccatgcagagcttgctttagttttaa 36155962  T
Q  129 a-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |  || |||||||| |||||||||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  36155961 acagggcccccgcaggtgggcggtgggattggtcccttcaaattagtcgattcttggatcggata 36155897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 33905690 - 33905519
Alignment:
Q  24 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||||||| |||  |||    
T  33905690 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtatcaatttcggtgggttaagtccatacagagtttgttctg 33905591  T
Q  122 gctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||  || || ||| |||||| ||||||||||| |||||||  |||  || |||||| |||||||||    
T  33905590 gctttaaacggggcctccgtaagtggacggtgggattgatcccctcaaatttatcgattctttgatcggata 33905519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 23232455 - 23232304
Alignment:
Q  14 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacaga 113  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| | ||||||||    
T  23232455 ttggcctagtggttgacttgggatcttgaagtttgctcttccagaggtttcaggttcgattccctctggcgccaatttcggtgggctaagtccatacaga 23232356  T
Q  114 gcttg------ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattg 158  Q
    |||||      |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  23232355 gcttgcaagctctggctttaaatgggacccccgcaagtgggtggtgggattg 23232304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 46113599 - 46113495
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| | |    
T  46113599 tttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtaccaatttcggtgggctaagtcc 46113500  T
Q  107 ataca 111  Q
    |||||    
T  46113499 ataca 46113495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 2272344 - 2272532
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| ||| |||    
T  2272344 tttggggttggcctagtggttgacttgggatcttagagtttgctcctacagaggtctcaggtttgattccctctgatgccaatttcgctgggctaagttc 2272443  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||| || |||  ||| |||||||  || ||||  |||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||  |||||||||    
T  2272444 atacaaagtttgctctgactttaaacggggcccctacaagggggcggtaggattgatcccatcggattagtcgattctaagatcggata 2272532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 55 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8254901 - 8254761
Alignment:
Q  55 cagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggt 151  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  8254901 cagaggtctcaggttcgattatctctggtgtcaatttcggtgggctaagttcatacagaacttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggt 8254802  T
Q  152 gggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||| |||||| | ||||||| ||||||| ||||||||    
T  8254801 gggattgatccccttgaattagtcgattcttgaatcggata 8254761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8779909 - 8779745
Alignment:
Q  31 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgctg--gctttaa 128  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| | ||| |||  |||||||||||| ||| | |||||| ||||| ||   |||||||    
T  8779909 ttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcagcttcgatttcttctagtgtcaatttcggtgggctaagtccatacacagcttactctagctttaa 8779810  T
Q  129 atggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    | ||  ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  8779809 acggggcccccacaagtaggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttagatcggata 8779745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 20487387 - 20487297
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgg 97  Q
    ||||| |||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20487387 tttggggttggtttagtggttggctcgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgg 20487297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 25496685 - 25496503
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |   |||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||| |  || |||    
T  25496685 tttggcgttggcctagtgattggcttgggatcttggagattgctcctcttaaggtctcaagttcgattccctctagtgcctatttcggtgag-caagttc 25496587  T
Q  107 atacagagcttgctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||  |||||| ||||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  25496586 atattgagcttactggcttaaaatggggctccgcaagtggacggtgggattgatcccct--gattagtctgtacttggatcggata 25496503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 29057534 - 29057364
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||  |||| ||    
T  29057534 tttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctgctccaaaggtctcaggttcgattccctcttgtgccaatttcgatgg--taaagtc 29057437  T
Q  107 -atacagagcttg--ctggcttt-aaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 175  Q
     ||||||||||||  |||||||| ||  || ||||||||| |||||| || ||||| |||||||  |||||||    
T  29057436 tatacagagcttgctctggctttcaacgggacccccgcaaatgggcgatgtgattggtcccctcaaattagtc 29057364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 192
Target Start/End: Original strand, 32930748 - 32930937
Alignment:
Q  6 gtttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 105  Q
    |||||| |||| |||||||||| | |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||| |||||| ||| |     
T  32930748 gtttggggttgacctagtggttggtttggaatcttggagtttactccttcagaggtctcaagttcgatttcctctggtgcccattttggtgggctaagtc 32930847  T
Q  106 catacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||  ||  ||| ||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| || |||||| ||| |||||    
T  32930848 catgcagagcttgctctggctttaaacggggtccctgcaagtggatggtgggattgatcccctcagattaatcgattcttagattggata 32930937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 14258617 - 14258538
Alignment:
Q  14 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcg 93  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  14258617 ttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgttcctccagatgtctctggttcgattccctctggtaccaatttcg 14258538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 192
Target Start/End: Original strand, 48699889 - 48699947
Alignment:
Q  134 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48699889 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccttcggattagtcgattcttggatcggata 48699947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 25237180 - 25237095
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 98  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25237180 gttggcctaatggttagtttgggatcttggagtttgcttctctcaaggtctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtggg 25237095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18533921 - 18533733
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||| | ||||||||  |||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||| || ||||| |||| |||| ||||||| |||  ||| | |    
T  18533921 tttggggttgacatagtggttgacttgagatcttagagtttgctcctccagaggtatcagatttgattctctctagtgccaatttcgatggactaagtcc 18533822  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||| ||||||||  ||| |||||||  || |||| |||||||||| ||||||||| |||||||  |||| || |||||| |||||||||    
T  18533821 atatagagcttgttctgactttaaacggggcccctgcaagtgggccgtgggattggtcccctcatattaatcgattcttagatcggata 18533733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 1486420 - 1486608
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| | |   ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| | |    
T  1486420 tttggggttgacctagtggttggcttgggatcttggagt--gctactctcaaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcgatggg-taagtcc 1486516  T
Q  107 atacagagctt---gctggctttaaatgg---ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||    ||| |||  || ||   |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||  | |||||||||||||    
T  1486517 atacagagctttgctctgacttagaacggggcccccccgcaagtggacggtgggatcggtcccctccgattagtcggtccttggatcggata 1486608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 99
Target Start/End: Original strand, 24216978 - 24217070
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 99  Q
    ||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |   ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  24216978 tttggggttgacctagtggttgacttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattacctttggtgccaatttcggtgggt 24217070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 26513226 - 26513161
Alignment:
Q  123 ctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 188  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26513226 ctttaaacgggcccccacaagtgggcggtgggaatggtcccctcggattagtcgattcttggatcg 26513161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 79
Target Start/End: Original strand, 1818734 - 1818806
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctc 79  Q
    ||||| |||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  1818734 tttggggttggcctggtagttggcttaggatcttggagtttgctcttccagaggtttcaggttcgattccctc 1818806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 58 - 181
Target Start/End: Original strand, 2537749 - 2537870
Alignment:
Q  58 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtggg 154  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||| ||  | ||     ||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||| |||    
T  2537749 aggtctcaggtttgattccatttggtgccaatttcggtgggctatgtcca-----agcttgctttggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggaggg 2537843  T
Q  155 attgttcccctcggattagtcaattct 181  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2537844 attggtcccctcggattagtcagttct 2537870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 63 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 40146027 - 40145890
Alignment:
Q  63 tcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaa------gtgggcggtggg 154  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||| ||| | |||||||||||||||  | |||||||||| ||||| |||      ||||| |||| |    
T  40146027 tcaggttcgatttcctctagtgccaatttatgtgggctaagtccatacagagcttgctctgactttaaatgggcccccacaaccacaagtgggtggtgag 40145928  T
Q  155 attgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
     ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40145927 tttggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 40145890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 87 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 45331739 - 45331630
Alignment:
Q  87 aatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattctt 182  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||  | |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  45331739 aatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctttggctttaaacggggctccccgcaagtggacggtgggattaatcccctcagattaatcgattctt 45331640  T
Q  183 ggatcggata 192  Q
    | ||||||||    
T  45331639 gaatcggata 45331630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 192
Target Start/End: Original strand, 22910001 - 22910059
Alignment:
Q  134 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  22910001 cccccgcaagtgggcggtgggatttgtcccctcggattagtcgatacttcgatcggata 22910059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 192
Target Start/End: Original strand, 35138118 - 35138176
Alignment:
Q  134 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  35138118 cccccgcaagtgggcggtgggattgattccctcggattagtcggtccttggatcggata 35138176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 19034569 - 19034492
Alignment:
Q  21 agtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 98  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||| | | |||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  19034569 agtggttggtttgggatcttggagtttgttcctcaaaaggtttcaggttcgattatctctggtgccaatttcggtggg 19034492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 95
Target Start/End: Original strand, 1378745 - 1378833
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggt 95  Q
    ||||| ||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  ||||||||  |||||||||    
T  1378745 tttggggttggtctagtggttgacttggaatcttggagtttactcctccaaaggtctcatgttcgattttctctggtgtcaatttcggt 1378833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 192
Target Start/End: Original strand, 27159205 - 27159273
Alignment:
Q  124 tttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||    
T  27159205 tttaaacgggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcagattagtcgatctttggatcggata 27159273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 192
Target Start/End: Original strand, 16539659 - 16539795
Alignment:
Q  58 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagctt---gctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtggg 154  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||  || | ||||||||||||   ||||||||  || ||  ||| | ||||||| ||||||    
T  16539659 aggtctcaggtttgattccctctggtgccaattttggtggg-caagtccatacagagctttgcgctggcttagaacggggccctgtaagtgggtggtggg 16539757  T
Q  155 attgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||| |||||||  ||||||| || |||| ||||||||    
T  16539758 attggtcccctcaaattagtcgatacttgtatcggata 16539795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 192
Target Start/End: Original strand, 23041655 - 23041710
Alignment:
Q  137 ccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23041655 ccgcaagtggacagtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 23041710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 116
Target Start/End: Original strand, 39964534 - 39964621
Alignment:
Q  29 gcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagct 116  Q
    ||||| || |||||||| |||||| |   |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  39964534 gcttgcgaccttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtgggctgagttcacacagagct 39964621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 97
Target Start/End: Original strand, 1138579 - 1138669
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgg 97  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |   |||||| |||||||| || |||| |||| |||||||||||    
T  1138579 tttggggttgacctagtggttggcttgagatcttggagtgtgctcctctcaaggtcttaggttcgaatctctctagtgccaatttcggtgg 1138669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 98
Target Start/End: Original strand, 16899557 - 16899594
Alignment:
Q  61 tctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16899557 tctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggg 16899594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 52
Target Start/End: Original strand, 47091690 - 47091735
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcc 52  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  47091690 tttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcc 47091735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 52
Target Start/End: Original strand, 6776150 - 6776189
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcc 52  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6776150 gttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcc 6776189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 98
Target Start/End: Original strand, 52135130 - 52135221
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 98  Q
    ||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||  |   | |||||||||||||||  |||| |||| |||| |||||||    
T  52135130 tttggggttggtctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcatctcaatgtctcaggttcgattatctctagtgccaattccggtggg 52135221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 12877003 - 12876965
Alignment:
Q  134 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggatta 172  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  12877003 cccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcggatta 12876965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 192
Target Start/End: Original strand, 47091751 - 47091809
Alignment:
Q  134 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||  |||  ||||| |||||||||||||||||    
T  47091751 cccccgcaagtggggggtgggattggtccattcgatttagtaaattcttggatcggata 47091809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 192
Target Start/End: Original strand, 50202680 - 50202733
Alignment:
Q  138 cgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  50202680 cgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattaatcgattctt-gatcggata 50202733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Original strand, 809228 - 809313
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 98  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||| |   |||||||||||| |||| || || |||  ||||||||||||    
T  809228 gttggcctcgtggttggtttgggatcttggagtttactcctcttaaggtctcaggtttgattacccctagtgtcaatttcggtggg 809313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 192
Target Start/End: Original strand, 5315478 - 5315519
Alignment:
Q  151 tgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5315478 tgggattggtcccctcggataagtcgattcttggatcggata 5315519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 192
Target Start/End: Original strand, 14603947 - 14603984
Alignment:
Q  155 attgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14603947 attggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 14603984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 15581188 - 15581119
Alignment:
Q  29 gcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 98  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | | ||||||||||||| |||| | | |||||| |||||||||||    
T  15581188 gcttgggaccttggagtgtgctcctctaaaggtctcaggttcaattctccccggtgctgatttcggtggg 15581119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 192
Target Start/End: Original strand, 52135261 - 52135314
Alignment:
Q  139 gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||  |||||||||||||||    
T  52135261 gcaagtggacggtgggattggtcccctcatattagtcggttcttggatcggata 52135314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 43770031 - 43769975
Alignment:
Q  135 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggat 191  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  43770031 ccccacaaatgggcggtgggattggtcccttcgaattagtcgattctaggatcggat 43769975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 57)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 4718649 - 4718837
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  4718649 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 4718748  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4718749 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 4718837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 28193478 - 28193666
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |    
T  28193478 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagtcc 28193577  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28193578 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccctacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 28193666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 34237852 - 34237664
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  34237852 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 34237753  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34237752 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 34237664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 39349260 - 39349448
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  39349260 tttggggttggcccagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 39349359  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39349360 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttggatcggata 39349448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3734820 - 3734632
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  3734820 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 3734721  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3734720 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcagtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 3734632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 191
Target Start/End: Original strand, 2618190 - 2618377
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| | |    
T  2618190 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttgggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggctaagtcc 2618289  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggat 191  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2618290 atacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggat 2618377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Original strand, 21603241 - 21603422
Alignment:
Q  14 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacaga 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||   ||||||||    
T  21603241 ttggcctagtggttggcttgggatcttagagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggtgggctaagcccatacaga 21603340  T
Q  114 gcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21603341 gcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 21603422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 19471613 - 19471802
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| | ||| | |    
T  19471613 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaattttggtgagctaagtcc 19471712  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  19471713 atacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgatgggattggtcccctcgaattagtcgatacttggatcggata 19471802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 19542537 - 19542726
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| | ||| | |    
T  19542537 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaattttggtgagctaagtcc 19542636  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  19542637 atacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgatgggattggtcccctcgaattagtcgatacttggatcggata 19542726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19590159 - 19589970
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| | ||| | |    
T  19590159 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaattttggtgagctaagtcc 19590060  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  19590059 atacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgatgggattggtcccctcgaattagtcgatacttggatcggata 19589970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15259603 - 15259416
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  15259603 tttggggttggtctagtggttggtttgggatcttggattttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 15259504  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggat 191  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || |||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15259503 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgtaattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggat 15259416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8765701 - 8765535
Alignment:
Q  29 gcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggcttt 126  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  8765701 gcttgagatcttggagtttgctcccccagagatctcaggttcgattccctctggtgccaatttcgatgggctaagtccatacagagcttgctctggcttt 8765602  T
Q  127 aaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||  || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8765601 aaacggggctcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 8765535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 20305912 - 20306100
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||| | |    
T  20305912 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttagagtttgctcctccaaaggtctcagtttcgattccttctggtgccaatttcgatgggctaagtcc 20306011  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  20306012 atacagagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgatccttggatcggata 20306100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 21092545 - 21092733
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||| | |    
T  21092545 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttagagtttgctcctccaaaggtctcagtttcgattccttctggtgccaatttcgatgggctaagtcc 21092644  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  21092645 atacagagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgatccttggatcggata 21092733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 32879283 - 32879471
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  32879283 tttggggttggtctagtggttgacttgggatcttcgagtttggtcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagttc 32879382  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||  || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  32879383 atacagagcttgctctgacattaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggattggata 32879471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 264596 - 264409
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |      
T  264596 tttggcgttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtct 264497  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| || ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  264496 atacatagcttgctctggctttaaacgggcccccacaaatgggcggtgagattgatcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 264409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 651325 - 651512
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |      
T  651325 tttggcgttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtct 651424  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| || ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  651425 atacatagcttgctctggctttaaacgggcccccacaaatgggcggtgagattgatcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 651512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 837060 - 837247
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |      
T  837060 tttggcgttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtct 837159  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| || ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  837160 atacatagcttgctctggctttaaacgggcccccacaaatgggcggtgagattgatcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 837247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 42643315 - 42643127
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| | |    
T  42643315 tttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcagattcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtcc 42643216  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  ||| ||| |||  ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  42643215 atacagagcttgctctgtcttgaaacgggggccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgcattagttgattcttggatcggata 42643127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 27746532 - 27746348
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| | |    
T  27746532 tttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagtcc 27746433  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagt-gggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 188  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27746432 atacagagcttgctctggctttaaaaggggccccacaagtggggcgatggaattagtcccctcggattagtcgattcttggatcg 27746348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 42328009 - 42328196
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||| | |    
T  42328009 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagttt-ctcctccagaggtgtcaggtttgattccctctgttgccaatttcggtgggctaagtcc 42328107  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||| ||||||| || |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  42328108 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccacaagtggacgatgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 42328196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 192
Target Start/End: Original strand, 14632975 - 14633146
Alignment:
Q  24 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |  ||||||||||||  |||    
T  14632975 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtctatacagagcttgctctg 14633074  T
Q  122 gctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||| || ||  |  || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  14633075 gctttgaacggagcgtccacaagtgggcggtgggattggtccccttggattagtcgattcttggatcggata 14633146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 28088296 - 28088478
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| | |||||||    
T  28088296 gttggcttagtggttgacttgggatcttggagtttgttcatccagaggtctcagattcgattccctttggtgtcaatttcggtgggttaagtccatacag 28088395  T
Q  113 agcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||  ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  28088396 agcttgctctgactttaaatggggcctccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcagaatagtcgattcttggatcggata 28088478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 4698914 - 4698732
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    ||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |||  ||    
T  4698914 gttggcccagcggttggtttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatgaag 4698815  T
Q  113 agcttg--ctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    | ||||  ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  4698814 aacttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcatggattggata 4698732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 192
Target Start/End: Original strand, 20469943 - 20470108
Alignment:
Q  29 gcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggcttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| | |||| ||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  20469943 gcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctagagccaatttagatgggctaagtccatacagagcttgctctggcttt 20470042  T
Q  127 aaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||  |  ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  20470043 aaacagagcccccgcaagtgggcggtgggattggt-tcctcggattagtcgatttttggatcggata 20470108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 26169039 - 26168862
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| ||||||  ||| ||| ||||||||||||  || |||||||||    
T  26169039 gttggcctagtggtttgcttgggatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaggtttgattcctcctgatgccaatttcggtggg-caagttcatacag 26168941  T
Q  113 agcttg--ctggctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 188  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| | || ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26168940 agcttgttctggctttaaatgagcccctcgcaagtgggggatgagattggtcccctcggagtagtcgattcttggatcg 26168862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 7558140 - 7557960
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| | |    
T  7558140 tttggggttggcctagtagttagcttgggatcttggagtttgctcctccagaagtctcagattcgatttcctctggtgccaattttggtgggctaagtcc 7558041  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
           |||||  ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||    
T  7558040 -------gcttgttctggctttaaacggacccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgatttttgcatcggata 7557960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 158
Target Start/End: Original strand, 18532111 - 18532265
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||| ||| | |    
T  18532111 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctcagatgtcaatttcggtgggctaagtcc 18532210  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattg 158  Q
    ||||||| ||||  |||| ||||||  || |||| |||||||||||||| |||||    
T  18532211 atacagaacttgctctggatttaaacggggcccctgcaagtgggcggtgagattg 18532265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 58 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 6953153 - 6953021
Alignment:
Q  58 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtggg 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||| |||||||||    
T  6953153 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagttggcggtggg 6953054  T
Q  155 attgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 188  Q
    |||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  6953053 attggt-ccctcggattagtcgattcttggatcg 6953021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 34610869 - 34610696
Alignment:
Q  22 gtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--c 119  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||| |  ||||||||||||  |    
T  34610869 gtggttggcttaggattttggagtttgttcatccagatgtctgaggttcgattccctctgatgccaatttcggtggtctaagtctatacagagcttgctc 34610770  T
Q  120 tggctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  34610769 tggctttaaacgagcccctcgcaagtgggcggtagaattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 34610696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 192
Target Start/End: Original strand, 2166727 - 2166888
Alignment:
Q  31 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaa 128  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||| || || ||| | |||||||||||||  ||||||||||    
T  2166727 ttgggatcttggagtttgcttctccaaaggtctcaggttcgattccctc--gtgccaatttcagtaggctaagtccatacagagcttgctctggctttaa 2166824  T
Q  129 atggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| || ||| |||||    
T  2166825 ataagaccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgattttttgattggata 2166888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 192
Target Start/End: Original strand, 24018398 - 24018575
Alignment:
Q  19 ctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg 118  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||  ||  |||||| ||||| ||| | |||||||||||||    
T  24018398 ctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctgaggttcgatttcctctaatgtcaatttcagtgggctaagtccatacagagcttg 24018497  T
Q  119 --ctggctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
      ||||||||||| ||  | |||| ||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||  |||||||| ||||||    
T  24018498 ctctggctttaaacgggcctccccacaagtgggcggtgagattggtccccttgaattagtcggttcttggaccggata 24018575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 192
Target Start/End: Original strand, 25248407 - 25248538
Alignment:
Q  61 tctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||| | ||||||||| |||||  ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  25248407 tctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtaggctaagt-catacagagtttgctctggctttaaacgggccctcgcaagtgggcggtgggattg 25248505  T
Q  159 ttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
     |||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  25248506 gtcccctcggattagtcgatt-tttgatcggata 25248538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 182
Target Start/End: Original strand, 21667560 - 21667731
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  21667560 gttggtctagtggttggcttggaatcttggaggttgctcctccaaagatttcaggttcgatttcctttggtgctaatttcggtgggctaagtccatacag 21667659  T
Q  113 agcttg--ctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattctt 182  Q
    ||||||  ||| ||||||| ||  |  ||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||| ||||||    
T  21667660 agcttgctctgcctttaaacggagcatccgcaagtgggcggtggaattggt-ccctcagattagtcgattctt 21667731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 188
Target Start/End: Original strand, 28964037 - 28964220
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||| ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||| |   |||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  28964037 tttggggttggtctagtggttggtttgagatcttagagtttgctcctcttaaggtttcatgttcgattccatctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 28964136  T
Q  107 atacagagct-tg-ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 188  Q
    |||| ||||| || |||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  28964137 atacggagctatgtctggctttaaacggggcccccgcaagtgggc-gtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttagatcg 28964220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 34694773 - 34694576
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  34694773 tttggggttggtctagtggttgacttgtgatcttggagtttgctcctctcaaggtcttaggttcgattccatctggtgccaatttcggtggg-caaattc 34694675  T
Q  107 atacagagc-ttgct--ggctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgcgttt 200  Q
    ||||| ||| |||||  |||||  || ||   ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  | |||||||||||||||| ||||    
T  34694674 atacaaagctttgctccggcttagaacggaatccccctctagtggacggtgggattggtcccctcagattagtctgtccttggatcggataacgagttt 34694576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 2639478 - 2639420
Alignment:
Q  134 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2639478 cccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 2639420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 188
Target Start/End: Original strand, 10292108 - 10292242
Alignment:
Q  56 agaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtg 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | | | ||| ||||| |||||  ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||    
T  10292108 agaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcagtgggctgagtccat-cagagattgctctggctttaaacggggcccccacaagtgggcggtg 10292206  T
Q  153 ggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 188  Q
    |||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  10292207 ggattggtcccttcggattagttgattcttggatcg 10292242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 158
Target Start/End: Original strand, 24999289 - 24999392
Alignment:
Q  58 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtggg 154  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| | |||| ||| |||||| ||||||||  |||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  24999289 aggtcttaggttcgattccctctgatgccaattttgatgggctaagttcatatagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtggg 24999388  T
Q  155 attg 158  Q
    ||||    
T  24999389 attg 24999392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 36848946 - 36848759
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||||| ||||||||  |||||| | |||||||||||||| |   |||| | || ||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  36848946 tttggggttggcatagtggttgacttgggtttttggagtttgctcctctcaaggttttagattccatttcctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 36848847  T
Q  107 atacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||| ||| |||||  |||||||||||   | || ||||||||||||||||||  |||||||  |||||||  || ||||||||||||    
T  36848846 atacggagtttgctcgggctttaaatgaggcaccacaagtgggcggtgggattagtcccctcaaattagtcggtttttggatcggata 36848759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 8042658 - 8042834
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||       |||||| ||||| |||||| ||  | |    
T  8042658 tttggggttgacctagtgcttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaagtctcaggttcga-------tggtgccaattttggtgggctatgtcc 8042750  T
Q  107 atacagagcttgctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||  |||||||| ||  ||||||||||| | |||| | |||| ||  |||||||||||||||    
T  8042751 atacagagtttgctggcttttaatgg-tccccgcaaatgaacggtgggattggt-cccttgaattaatcggttcttggatcggata 8042834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 34639391 - 34639295
Alignment:
Q  19 ctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagctt 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  34639391 ctagtggttggcttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggctcga-tccctctggtgccaatttcggtggg-taagtccatacagagctt 34639295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 188
Target Start/End: Original strand, 18128568 - 18128701
Alignment:
Q  58 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg---ctggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgg 153  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  18128568 aggtcttagattcgattctctctggtgccaatttcggtgggcgaa-tccataaagagctttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgg 18128666  T
Q  154 gattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 188  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||    
T  18128667 gattggtcctctcagattagtcggttcttggatcg 18128701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 175
Target Start/End: Original strand, 12312965 - 12313020
Alignment:
Q  120 tggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 175  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12312965 tggctttaaatgggcccccacaagtgggcggtgggattgatcccctcgaattagtc 12313020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 192
Target Start/End: Original strand, 13749187 - 13749248
Alignment:
Q  131 ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  13749187 ggccccccgcaagtgggcagtggaattggtcccctcggattagtcagtccttggatcagata 13749248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Original strand, 15974916 - 15974999
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 98  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |   |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  15974916 gttggcctagtggtta-cttgggatcttggagtatgctcctctcaaggtctcaagttcgattccc-ctagtgcaaatttcggtggg 15974999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Original strand, 41070771 - 41070856
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 98  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | |   |||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  41070771 gttggcctagtggttgacttgggatcttggagtgtgctactctcaaggtctcaagttcgattccctttggtgtcaatttcggtggg 41070856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 94
Target Start/End: Original strand, 3794801 - 3794882
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcgg 94  Q
    |||| |||| ||||| |||| |||||||| |||||||||| |   |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  3794801 gttgacctaatggttggcttaggatcttgaagtttgctcctctcaaggtctcatgttcggttccctctggtgccaatttcgg 3794882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 8387641 - 8387550
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgc-tcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 98  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  8387641 tttggggttggcctagtggttgtcttgagatcttagagtttgcttctctcag-ggtctcaagttcgatttcctctggtgccaattttggtggg 8387550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 3403693 - 3403521
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    |||||||| | |||| || || |||||||||||||||||  |   |||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||  || | ||||||     
T  3403693 gttggccttggggttggcctgagatcttggagtttgctcatctcaaggtcttatgttcgattccatctggtgccaatttcggtggg-caagtccatacaa 3403595  T
Q  113 agct---tgctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattctt 182  Q
    | ||   |  ||||||||||| || ||| || |||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  3403594 aactttgttttggctttaaatggggccctcgtaagtgggcggtgaggttggtcccctcgaattagtcaattctt 3403521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 192
Target Start/End: Original strand, 33747016 - 33747074
Alignment:
Q  134 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| | | |||||||||||| || |||||||||||||    
T  33747016 cccccgcaagtggacggtggaattggttctctcggattagtcgatccttggatcggata 33747074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 63 - 188
Target Start/End: Original strand, 1219409 - 1219537
Alignment:
Q  63 tcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgt 159  Q
    ||||||||||||||||||| |   |||||| ||||| ||| | ||||||||  |||  ||||||||||| ||  |||||  ||||||||||| |||| |     
T  1219409 tcaggttcgattccctctgatatcaatttcagtgggctaagtccatacagaatttgttctggctttaaacggggcccccataagtgggcggtaggatcgg 1219508  T
Q  160 tcccctcggattagtcaattcttggatcg 188  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  1219509 tcccttcggattagtcgattcttagatcg 1219537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 192
Target Start/End: Original strand, 16990722 - 16990775
Alignment:
Q  139 gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||  | |||||||||||||    
T  16990722 gcaagtgggcggtgggactggtccccttggattagtcggtccttggatcggata 16990775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 35690131 - 35690055
Alignment:
Q  11 gtgttggcctagtggt--tagcttgggatcttggagtttgctcccccaga-ggtctcaggttcgattccctctggtg 84  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||| || ||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  35690131 gtgttggcctagtggtattggcttgggatctgggtgtttgctcctcctcaaggtctcaggttcgattctctctggtg 35690055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 119 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 42332094 - 42332025
Alignment:
Q  119 ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 188  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||| | |||||| |||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  42332094 ctggctttaaacggtcctccgcaagtgggcgttaggattggtcccttcagataagtcaattattggatcg 42332025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 134 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 43817816 - 43817759
Alignment:
Q  134 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggat 191  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||||  |||| || |||||||||||||||    
T  43817816 cccccgcaagtgggcggtggaattggtctcctcaaattaatcgattcttggatcggat 43817759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 102
Target Start/End: Original strand, 6536579 - 6536623
Alignment:
Q  58 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaa 102  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6536579 aggtctcaggttcaattctctctggtgccaatttaggtgggttaa 6536623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 71)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 33696470 - 33696288
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||    
T  33696470 gttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacag 33696371  T
Q  113 agcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33696370 agcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgagattggtcctctcggattagtcaattcttggatcggata 33696288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 32986197 - 32986385
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  32986197 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 32986296  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  32986297 atacagagcttgctctgactttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggaatagtcgattcttggatcggata 32986385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 34844955 - 34844767
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  34844955 tttggggttggcctagtggtttgcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 34844856  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34844855 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 34844767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 40059049 - 40058861
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  40059049 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 40058950  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40058949 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 40058861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 52983619 - 52983807
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| | |    
T  52983619 tttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggctaagtcc 52983718  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52983719 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 52983807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19660729 - 19660541
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||| ||| | |    
T  19660729 tttggagttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattctctctgatgcaaatttcggtgggataagtcc 19660630  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19660629 atacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttggatcggata 19660541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 27528986 - 27528804
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||    
T  27528986 gttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacag 27528887  T
Q  113 agcttg--ctggcttta-aatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||  ||||||||| |  || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27528886 agcttgctctggctttatacggggcccccgcaagtgggcggtgagattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 27528804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 46714392 - 46714581
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcga-ttccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||| |     
T  46714392 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttccctttggtgccaatttcggtgggctaagtc 46714491  T
Q  106 catacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||||  || ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46714492 catacagagcttgcccttgctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcaattcttgaatcggata 46714581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 5609399 - 5609211
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  5609399 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcattcagtggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 5609300  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5609299 atacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtggacggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttggatcggata 5609211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 20566349 - 20566538
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggt-ctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |     
T  20566349 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtgatcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggcaaagtc 20566448  T
Q  106 catacagagcttg--ctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  20566449 catacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcgctgggattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggata 20566538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 54127539 - 54127351
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |      
T  54127539 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcaattccctcttgtgccaatttcggtgggctaagtct 54127440  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  54127439 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggttcttggaccggata 54127351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 25852214 - 25852403
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  25852214 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 25852313  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||   || ||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  25852314 atacagagcttgctctggctttaaaacgggaccctcgcaagtgggcaatgggattggtcccctcggattagtcggttcttggaccggata 25852403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 45787900 - 45787713
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| | |    
T  45787900 tttggggttggcctagtggttggcttggaatcttgga-tttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctgatgccaatttcagtgggctaagtcc 45787802  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  45787801 atacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 45787713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 20078159 - 20077993
Alignment:
Q  29 gcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggcttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  20078159 gcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattcccactggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggcttt 20078060  T
Q  127 aaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||  || |||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20078059 aaacggggcccccgtaagtgggcggtgggattagttccctcggattagtcgattcttggatcggata 20077993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 44343513 - 44343702
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttag-cttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 105  Q
    ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |     
T  44343513 tttggggttgggctagtggtttggcttgggatcttggagtttgctcccccaaaggactcaagttcgattccctctggtgctaattttggtgggctaagtc 44343612  T
Q  106 catacagagcttgct--ggctttaaatggccc-cccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||||||  | ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  44343613 catacagagcttgctctgactttaaacggggctcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttgaatcggata 44343702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 35229174 - 35229356
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||| ||| | ||||||     
T  35229174 gttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccttct-atgccaatttcggtgggctaagtccatacat 35229272  T
Q  113 agcttg--ctggctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||  ||| ||||||| ||  |||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  35229273 agcttgctctgactttaaacgggtccccccacaagtgagcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 35229356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 192
Target Start/End: Original strand, 49287872 - 49288045
Alignment:
Q  21 agtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgc- 119  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| |  ||||     
T  49287872 agtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaaaatttgct 49287971  T
Q  120 -tggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
     |||||||||| || | |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  49287972 atggctttaaacgggctcccgcaagtgggcgctgagattggtcccctcggattagtcgattcttggatcagata 49288045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 51535619 - 51535809
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg----ttaaattcat 108  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    |||| | |||    
T  51535619 gttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccacaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggctaattaagtccat 51535718  T
Q  109 acagagcttg-----ctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||     |||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  51535719 acagagcttgcagctctggctttaaacggggcccccagcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttagatcggata 51535809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 7392143 - 7391974
Alignment:
Q  24 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||  |||    
T  7392143 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggt-ggttaagtccatacagagtttgctctg 7392045  T
Q  122 gctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  7392044 gctttaaatgggacccccatagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcggttcttcgattggata 7391974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 36131707 - 36131519
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| | |    
T  36131707 tttggggttggcatagtggtttgcttgggattttggagttcgttcctccagatgtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggtggcctaagtcc 36131608  T
Q  107 atacagagcttgc--tggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||||  || |||||||  || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||| ||||    
T  36131607 atacagagcttgctatgactttaaacgggacccccgtaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattattagatcagata 36131519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 13873492 - 13873321
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||    
T  13873492 tttggggttggcctagtggtttgcttgggatcttggagtttgctccttcaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtaggctaagttc 13873393  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 175  Q
    |||||||| |||  || |||| |||  || |||||||||||||| ||||| |||| ||| || |||||||||    
T  13873392 atacagagtttgctctagcttcaaacagggcccccgcaagtgggtggtggaattgatcctctgggattagtc 13873321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 22625261 - 22625154
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| | |||||||    
T  22625261 gttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttactcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaagtccatacag 22625162  T
Q  113 agcttgct 120  Q
    ||||||||    
T  22625161 agcttgct 22625154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 186
Target Start/End: Original strand, 32942370 - 32942552
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||| | |    
T  32942370 tttggggttggtctagtggttggcttgagatcttggagtttactcctccagaggtttaaggttcgattctctctgatgccaatttcggtgggctaagtcc 32942469  T
Q  107 atacagagctt--gctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggat 186  Q
    |||||||||||   ||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||    
T  32942470 atacagagcttactctggctttaaacggcccccccacaagtggacggtgggattggtcccctcggataaatcgattcttggat 32942552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 188
Target Start/End: Original strand, 34835529 - 34835713
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |   |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |    
T  34835529 tttggggttggtctagtggttggcttgggatcttagagtttgctcctcttaaggtctcatgttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtcc 34835628  T
Q  107 atacagagct-tg-ctggctttaaat--ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 188  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  34835629 atacggagctatgtctggctttaaatagggccccccgcaagtgggc-gtgagattggtcccctcggattagtcgattcttagatcg 34835713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 192
Target Start/End: Original strand, 34723848 - 34723987
Alignment:
Q  56 agaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtg 152  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||||  ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||    
T  34723848 agaggcctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaaagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtg 34723947  T
Q  153 ggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34723948 ggattggtcctctcggattagtcgattcttggatcggata 34723987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 151
Target Start/End: Original strand, 33992632 - 33992773
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||     
T  33992632 gttgacctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacat 33992731  T
Q  113 agcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggt 151  Q
    ||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  33992732 agcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggt 33992773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 186
Target Start/End: Original strand, 1985843 - 1986017
Alignment:
Q  14 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacaga 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| | ||||||||    
T  1985843 ttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgcgaatttcgatgggctaagtccatacaga 1985942  T
Q  114 g----cttgctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggat 186  Q
    |    ||  ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| ||||||||||    
T  1985943 gtaaact--ctggctttaaacggagcccccacaagtgggcggtggaattggt-ctatcggattagtcgattcttggat 1986017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 35674938 - 35674786
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| | |    
T  35674938 tttggggttggccaagtggttggcttgggatcttggagtttgctcttccaaaggtcacaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaagtcc 35674839  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggat 156  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||  || |||||||||||||||||| ||||    
T  35674838 atacagagcttgctctgcctttaaacggggcccccgcaagtgggcggttggat 35674786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 188
Target Start/End: Original strand, 32990488 - 32990619
Alignment:
Q  60 gtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggat 156  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  32990488 gtctcaggttcgattccctttagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggat 32990587  T
Q  157 tgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 188  Q
    || |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  32990588 tggtcccctcggactagtcgattcttggatcg 32990619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18875700 - 18875526
Alignment:
Q  20 tagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgc 119  Q
    |||||||| | ||||||| || ||||||| | |  || || ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  18875700 tagtggttggtttgggattttagagtttgtttcttcaaagatctcaggttcgattccctctgatgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgc 18875601  T
Q  120 t--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |  ||||||||| || ||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18875600 tctggctttaaacgggcccccacaagtgggtagtgggattgatcccctcggattagtcaatttttggatcagata 18875526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 192
Target Start/End: Original strand, 27574356 - 27574506
Alignment:
Q  45 tttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgca 141  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||  | | ||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||    
T  27574356 tttgctcctccataggtctcaggttcgattttctcttattccaatttcggtaggctaaattcatacagagcttgctctggctttaaaaggggcccccgca 27574455  T
Q  142 agtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27574456 agtgggcggtgagtttggtcccctcggattaatcaattcttggatcggata 27574506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 118
Target Start/End: Original strand, 2351020 - 2351124
Alignment:
Q  14 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacaga 113  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||| |||||| |    
T  2351020 ttggcctagtggttggcttggaatcttgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtcgactaaatccatacata 2351119  T
Q  114 gcttg 118  Q
    |||||    
T  2351120 gcttg 2351124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 58 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9517787 - 9517650
Alignment:
Q  58 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtggg 154  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||||||||||||  | ||||||| ||  |||||||| ||||| |||| |    
T  9517787 aggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcagtgggctaagtccatacagagcttgctctgactttaaacggggcccccgcaggtgggtggtgag 9517688  T
Q  155 attgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9517687 attggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 9517650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12500231 - 12500068
Alignment:
Q  31 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| ||| | |||||| ||||||  ||||||||||    
T  12500231 ttgggatcttggagtttgctccttcaaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcaatgggctaagtccatacatagcttgctctggctttaa 12500132  T
Q  129 a-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |  || ||||||||||||||||||   |||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12500131 acgggacccccgcaagtgggcggtaaaattgat-ctctcggattagtcaattcttggaccggata 12500068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 43719262 - 43719154
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| | |    
T  43719262 tttggggttggtctagtggttggtttgagatcttggagtttgctcctccagaggtttcaggttcgattctctctagtgctaatttcggtgggctaagtcc 43719163  T
Q  107 atacagagc 115  Q
    |||||||||    
T  43719162 atacagagc 43719154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 188
Target Start/End: Original strand, 13550214 - 13550392
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| | ||||| |    
T  13550214 gttggcctagtggttgacttgagatctgggagtttgctcctctagaggtctcaggcctaattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccataccg 13550313  T
Q  113 agctt--gctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 188  Q
    |||||   |||||||||||  ||  |||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  13550314 agcttactctggctttaaacggggtccccacaagtgggcggtaggataggtcccctcggattaatcgattcttggatcg 13550392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 55961932 - 55961767
Alignment:
Q  14 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacaga 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||            |||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||    
T  55961932 ttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctt-----------cctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaga 55961844  T
Q  114 gcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 188  Q
    |||||  ||| ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||| | || |||||||| || ||||||| ||||    
T  55961843 gcttgctctgactttaaacggggccccacaagtgggcggtgggattggttccttcggattaatcgattcttgaatcg 55961767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 30879338 - 30879175
Alignment:
Q  31 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaa 128  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||  ||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| || |||  ||||||||||    
T  30879338 ttgggatcttgtagtttgctccttcatgggttttaggtttgattccctctggtgccaatttcgatgggttaaatccatacaaagtttgctctggctttaa 30879239  T
Q  129 atggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    | ||   || |||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||| ||||    
T  30879238 agggggtcctgcaagtggacggtgggattggttccctcagattaatcgattcttggatcagata 30879175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 13584445 - 13584338
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    ||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| | |||| ||    
T  13584445 gttggcctagtggttggcctgagatattggagtttgctcctccaaaagtctcaagttcgattccctctggtgtcaatttcgatgggctaagtccatagag 13584346  T
Q  113 agcttgct 120  Q
    ||||||||    
T  13584345 agcttgct 13584338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 20527198 - 20527048
Alignment:
Q  39 ttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaatggcccc 136  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||| ||| | |||| ||||||||   | | ||||||  |  ||    
T  20527198 ttggagtttgttcctccagaggtctcaagtttgattccctctggcgccaatttcggtgggctaagtccatatagagcttgatttcggtttaaacagggcc 20527099  T
Q  137 ccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatc 187  Q
    ||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||| |||||||    
T  20527098 ccgtaagtgggcggtaggattggtctcctcggattagtcgatttttggatc 20527048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 21387635 - 21387496
Alignment:
Q  54 ccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcgg 150  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||  ||||| |||||| ||| |  ||||||||||||  |||||||||||  ||  ||||||||||||||||    
T  21387635 ccagagatctcaggttcgattccctatagtgtcaattttggtgggctaagtctatacagagcttgctctggctttaaacgggatccccgcaagtgggcgg 21387536  T
Q  151 tgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||  || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21387535 tggg--tggtcccctcggattagtcgattattggatcggata 21387496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 192
Target Start/End: Original strand, 4064990 - 4065048
Alignment:
Q  134 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  4064990 cccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgatttttggatcggata 4065048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 192
Target Start/End: Original strand, 23639758 - 23639812
Alignment:
Q  138 cgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23639758 cgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 23639812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 192
Target Start/End: Original strand, 23645416 - 23645470
Alignment:
Q  138 cgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23645416 cgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 23645470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 41621793 - 41621684
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |   |||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||  |||| |    
T  41621793 tttggggttggcctaatggttggcttgagatcttggagtttgctcctctcaaggtctcatgtttgatttcctctggtgccaattttggtggg-caaatcc 41621695  T
Q  107 atacagagctt 117  Q
    |||||||||||    
T  41621694 atacagagctt 41621684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 25969673 - 25969512
Alignment:
Q  33 gggatcttggagtttgctcccccagaggtctcag--gttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaa 128  Q
    |||||||||||||||||||| |   ||||| |||  ||| ||||||| ||||||| |||||||||||   || | |||||||| ||||||  ||||||||    
T  25969673 gggatcttggagtttgctcctctcaaggtcccagaggttggattccccctggtgccaatttcggtggcc-aagtccatacagaacttgctctggctttaa 25969575  T
Q  129 atggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    | || |||||| ||||| |||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  25969574 acgggcccccgtaagtgagcggtgggattggt-ccctcgaattagtcgattcttgaatcggata 25969512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 80
Target Start/End: Original strand, 42245746 - 42245819
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctct 80  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||    
T  42245746 tttggggttggcctagtggttgacttgggatcttagagtttgctcctctaaaggtctcgggttcgattccctct 42245819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 192
Target Start/End: Original strand, 52494623 - 52494676
Alignment:
Q  139 gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  52494623 gcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 52494676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 4911928 - 4912114
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    |||||| ||||||||  |||  ||||||||||||||||     ||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||  | |||| ||    
T  4911928 gttggcttagtggttgacttaagatcttggagtttgcttttttagaagtttcaggttcgattccctctggtgttaattttggtggcctatgtccatatag 4912027  T
Q  113 agcttgct------ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||      ||||||||| ||  |||||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||| ||||||||||| ||||    
T  4912028 agcttgcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggtggtgtgattgatccccccgaattagtcgattcttggatcagata 4912114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9978576 - 9978518
Alignment:
Q  134 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||| |||||||||    
T  9978576 cccccgcaagtgggcggtgggattggtcccatcggattagttgattcttagatcggata 9978518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 43719154 - 43719096
Alignment:
Q  134 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43719154 cccccgaaagtgggcggtgggattggtcatctcggattagtcgattcttggatcggata 43719096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 59
Target Start/End: Original strand, 34722170 - 34722222
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagag 59  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34722170 tttggggttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagag 34722222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 55158409 - 55158354
Alignment:
Q  135 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcgga 190  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  55158409 ccccgcaaatgggtggtgggattggtcccctcggattagtcgatttttggatcgga 55158354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 192
Target Start/End: Original strand, 33289180 - 33289242
Alignment:
Q  130 tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33289180 tggccccctacaagtggacggtgagattagtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 33289242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 3392811 - 3392759
Alignment:
Q  58 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcataca 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  3392811 aggtctcaggttcgatttcctctggtgttaatttcggtggg-aaaattcataca 3392759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 22488145 - 22488037
Alignment:
Q  87 aatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttg 183  Q
    |||||||||||  ||| | |||| ||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||  | ||||    
T  22488145 aatttcggtggactaagtccatatagagcttgttctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcggtgggattgatcccctcaaattagtcggtccttg 22488046  T
Q  184 gatcggata 192  Q
    |||||||||    
T  22488045 gatcggata 22488037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 22630332 - 22630292
Alignment:
Q  58 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22630332 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtggg 22630292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23131497 - 23131445
Alignment:
Q  140 caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  23131497 caagtgggcggtaggattggtcccctcgaattagtcgattcttcgatcggata 23131445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Original strand, 37302623 - 37302675
Alignment:
Q  140 caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  37302623 caagtgggcgatgggattggtcccttcggattagtcgattcttgaatcggata 37302675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 58 - 97
Target Start/End: Original strand, 38740901 - 38740940
Alignment:
Q  58 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgg 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  38740901 aggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgg 38740940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 91
Target Start/End: Original strand, 38869797 - 38869860
Alignment:
Q  29 gcttgggatcttggagtttgctcccccaga-ggtctcaggttcgattccctctggtgctaattt 91  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38869797 gcttgggatctgggagtgtgctcctcctcaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattt 38869860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 4585793 - 4585732
Alignment:
Q  120 tggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattctt 182  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||| ||||||    
T  4585793 tggctttaaacgggcccccgcaagtgggcggt-ggattggtcctttcggattagtcgattctt 4585732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 9646280 - 9646242
Alignment:
Q  137 ccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 175  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  9646280 ccgcaagtgggcagtgggattgatcccctcggattagtc 9646242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 188
Target Start/End: Original strand, 13017843 - 13017897
Alignment:
Q  134 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 188  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  | |||||||||    
T  13017843 cccccgcaagtgggcagtgggattggtccactcggattagtcggtccttggatcg 13017897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 13716513 - 13716459
Alignment:
Q  138 cgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||    
T  13716513 cgcaagtgggcggtgggattggtcctcttggattggtcagttcttgaatcggata 13716459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 12710189 - 12710250
Alignment:
Q  17 gcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccct 78  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| | |   |||||||||||||||||||||    
T  12710189 gcctagtggttggtttgggatcttggagtatgcttctcttaaggtctcaggttcgattccct 12710250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 192
Target Start/End: Original strand, 12824535 - 12824588
Alignment:
Q  139 gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  12824535 gcaagtggacggtgggattggtctcatcgaattagtcgattcttggatcggata 12824588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 98
Target Start/End: Original strand, 28635726 - 28635795
Alignment:
Q  30 cttgggatcttggagtttgctcccccag-aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 98  Q
    |||||||||| ||||| |||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  28635726 cttgggatctgggagtgtgctcctcctggaggtcttaggttcgattctctctggtgccaatttgggtggg 28635795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 135 - 192
Target Start/End: Original strand, 51595153 - 51595210
Alignment:
Q  135 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||| |||||| |||| || | |||||||| || ||||||||||||||||    
T  51595153 ccccgcaagtggacggtggaattgatctcttcggattaatcgattcttggatcggata 51595210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 48
Target Start/End: Original strand, 10125783 - 10125823
Alignment:
Q  8 ttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttg 48  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  10125783 ttggagttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttg 10125823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 17637912 - 17637861
Alignment:
Q  140 caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  17637912 caagtgggcggtgatattggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggata 17637861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0576 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0576
Description:

Target: scaffold0576; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 5279 - 5091
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  5279 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 5180  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5179 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 5091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 65)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 44946250 - 44946062
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| | |    
T  44946250 tttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagtcc 44946151  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44946150 atacagaacttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 44946062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 11941407 - 11941219
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||| | |    
T  11941407 tttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattccctatggtgccaattttggtgggttaagtcc 11941308  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11941307 atacagagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 11941219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 33827770 - 33827582
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| | |    
T  33827770 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagattgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcgttgggctaagtcc 33827671  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  33827670 atacagagcttgctctggctttaaacgggacccctgcaagtgggcggtgggattggtccccttggattagtcgattcttggatcggata 33827582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 15037959 - 15038147
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| | |    
T  15037959 tttggggttggcctagtggttgactcgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagtcc 15038058  T
Q  107 atacagagcttgc--tggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  15038059 atacagagcttgctttggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggata 15038147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 17324766 - 17324952
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  17324766 tttggggttggcctagtggttggtttggtatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 17324865  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||  ||||||| |||||| |||||||||    
T  17324866 atacagagcttgctctggctttaaatgggcccccacaagtgggcggtgggattagtcccctcaaattagtcgattctt-gatcggata 17324952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 44976351 - 44976172
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| | |    
T  44976351 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggggtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggctaagtcc 44976252  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattctt 182  Q
    |||||||| |||  |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  44976251 atacagagtttgctctggctttaaacggggctccccgcaagtgggcggtgggattgatcccttcggattagtcgattctt 44976172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 25293172 - 25293347
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||        
T  25293172 gttggtctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctcgagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagttcat---- 25293267  T
Q  113 agcttgctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25293268 agct--ctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgatgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 25293347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 30467027 - 30466839
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||| | |    
T  30467027 tttggggttggcctagtggttggtttgggatattggagtttgttcctctagaggtctcaggttcgattctctctgctgccaatttcggtgggctaagtcc 30466928  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30466927 atacagagcttgctctggctttaaaccgggcccccgcaagtgggcagtgggattggtcccttcggattagtcgattcttggatcggata 30466839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 24196004 - 24196190
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  24196004 tttggggttggcctagtggttggcttgggattttggggttcgctcctccagaggtttcaggttcgattccctctggtgcaaatttcggtgggctaagtcc 24196103  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  24196104 atacagaacttgctctggctttaaacgg-gccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattttttgattggata 24196190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 19054025 - 19054214
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| || ||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | |    
T  19054025 tttggggtgggcctagtgattggcttgagatcttggagtctgctcctccaaaggtctcaggtttgattccttctggtgttaacttcggtgggctaagtcc 19054124  T
Q  107 atacagagcttgc--tggctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19054125 atacagagcttgctttggctttaaatggaaccccccgcaagtgggcggtgggattggtccgctcggattagtcgattcttggatcagata 19054214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 10582174 - 10582018
Alignment:
Q  20 tagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg- 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||     
T  10582174 tagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgc 10582075  T
Q  119 -ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 175  Q
     || |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  10582074 tctagctttaaacgggccctcgcaagtgggc-gtgggattggtcccctcgaattagtc 10582018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 192
Target Start/End: Original strand, 35171831 - 35171988
Alignment:
Q  38 cttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggcc 134  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||| | |||||||||||||  |||||||||||  || |    
T  35171831 cttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggcaccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggc 35171930  T
Q  135 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  35171931 ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttgaatcggata 35171988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 43374505 - 43374339
Alignment:
Q  24 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||| ||||||  |||    
T  43374505 ggttggcttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtttatacaaagcttgctctg 43374406  T
Q  122 gctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||     |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43374405 gctttaa----gcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccttcggattagtcgattcttggatcggata 43374339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 4567634 - 4567438
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  4567634 tttggggttggcctagtagttggcttgggatcttgaagtttgctccttcagaagtctcaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtgggctaaatcc 4567535  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgt--------tcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||        ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4567534 atacagagcttgttctggctttaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattgtgggattggtcctctcggattagtcaattcttggatcggata 4567438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 34516589 - 34516423
Alignment:
Q  23 tggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgctg- 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||     |||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||      
T  34516589 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtttcaggttcgattc-----ggtggtaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctct 34516495  T
Q  122 -gctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
     |||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34516494 cgctttaaacgggcccctgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 34516423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 36242492 - 36242321
Alignment:
Q  24 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 121  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||  |||||||||  |||    
T  36242492 ggttggcttgggatcttgaaatttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccagccagagcttgctctg 36242393  T
Q  122 gctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  36242392 gctttaaacggggtccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattaatcgattcttggatcggata 36242321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 41313992 - 41314179
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |      
T  41313992 tttggggttgccgtagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtct 41314091  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||| |||||||||    
T  41314092 atacagagcttgctctgactttaaacgggatcccgcaagtggacggtgggattggtcccctcagattaatcgattcttcgatcggata 41314179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 41329843 - 41330030
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| ||| | |    
T  41329843 tttggggttggcctagtggttagtttgggatcttagagtttgctcctccaaaggtttcagattcgattccctctggtgccaattttggcgggctaagtcc 41329942  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  |||||||| ||||||    
T  41329943 ata-agagcttgctctggctttaaatggggcccccacaagtgggcggtgagattggtcccctcagattagtcggttcttggaccggata 41330030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 145
Target Start/End: Original strand, 27290598 - 27290729
Alignment:
Q  17 gcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagct 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  27290598 gcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattcccttcggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagct 27290697  T
Q  117 tg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtg 145  Q
    ||  |||||||||||  |||||||||||||||    
T  27290698 tgctctggctttaaacgggccccccgcaagtg 27290729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 2140633 - 2140495
Alignment:
Q  54 ccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcg 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    | | |||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2140633 ccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgg----agtccatacagagcttgctctggctttaaatgggcccccccgcaagtgggcg 2140538  T
Q  150 gtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2140537 gtgggattggtcccctcggattagtcgattattggatcggata 2140495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8192548 - 8192361
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  || | |    
T  8192548 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatgtcggtggg-caagtcc 8192450  T
Q  107 atacagagctt---gctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||| |||||||    |||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  8192449 atatagagctttgctctggcttagaacggcccctcgcaagtgggcggtgggattgggcccctcggattagtcggtccttggatcggata 8192361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 192
Target Start/End: Original strand, 8258913 - 8259085
Alignment:
Q  23 tggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ct 120  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||| | |||||||| ||||  ||    
T  8258913 tggttagtttgagatcttggagtttgctcctccagatgtctcaggttcgattccctctgacgccaattttggtgggttaagtccatacagatcttgttct 8259012  T
Q  121 ggctttaa-atggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||   || ||||||||||| ||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8259013 ggctttaatcggggcccccgcaagtaggcggtgggattagttccttcggattagtcgattcttggatcggata 8259085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 36390763 - 36390578
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||| | |    
T  36390763 tttggggttggcctagtggttggtttgggatct--gagtttgcttctccaaaggtctcaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtggactaagtcc 36390666  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| || |||| ||||||||    
T  36390665 atacaaagcttgctctgactttaaatgggacccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcggatcagtcgatacttgaatcggata 36390578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 192
Target Start/End: Original strand, 5394034 - 5394205
Alignment:
Q  24 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 121  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| | ||||||||| |||  |||    
T  5394034 ggttggcttgagatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcgatgggctaagtccatacagagtttgctctg 5394133  T
Q  122 gctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
     |||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  | ||| |||||||||    
T  5394134 actttaaatggggccgccgcaagtgggcggtgggattggtccgttcggattagtcggtccttagatcggata 5394205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 185
Target Start/End: Original strand, 1191530 - 1191694
Alignment:
Q  24 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 121  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||| ||| | ||||||||| |||  |||    
T  1191530 ggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgtttccctctagtaccaatttcggtgggctaagtccatacagagtttgctctg 1191629  T
Q  122 gctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttgga 185  Q
    |||||||| ||   ||||| |||||  |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1191630 gctttaaacggtgtccccgaaagtgaacggtggaattgttcccctcgaattagtcgattcttgga 1191694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 27269547 - 27269353
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgct------aatttcggtgggtt 100  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| | | |||| | ||||| ||||||||||||||        |||||||||||| |    
T  27269547 tttggggttggcatagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctctaaaggttttaggtttgattccctctggtgtcggtgtcaatttcggtgggct 27269448  T
Q  101 aaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggccc-cccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    || | |||| ||| ||||||  |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  27269447 aagtccatatagaacttgctctggctttaaacagccctcccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttggataggata 27269353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 192
Target Start/End: Original strand, 13266507 - 13266677
Alignment:
Q  24 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 121  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||  ||| | |||||||||||||  |||    
T  13266507 ggttggcttgagatcttggaatttgctcctttagaggtctcatgttcgattcactctggtgccaattccggtggactaagtccatacagagcttgctctg 13266606  T
Q  122 gctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||   |||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  13266607 gctttaaacggggccccgcaagtgggtaatgggattggtcccctcaaattagtcgattcttggatcggata 13266677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 98
Target Start/End: Original strand, 32845091 - 32845182
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 98  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32845091 tttggggttggcctagtagttagcttgggatcttggagtttgctcctccaaaagtttcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggg 32845182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 18976622 - 18976548
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctg 81  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  18976622 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcatgttcgattccctctg 18976548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Original strand, 4852558 - 4852643
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttc 92  Q
    ||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4852558 tttggggttgacctagtggttgacttggaatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttc 4852643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 192
Target Start/End: Original strand, 45271401 - 45271572
Alignment:
Q  24 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 121  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||||||||||  |||    
T  45271401 ggttggcttgggatcttagagtttgcttctccagaggtttcatgttcgattccctctggtgccaatttcagtgggctaagtccatacagagcttgctctg 45271500  T
Q  122 gctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||| |   |||| ||||||| |||| | ||||| |||||||  ||||||| |||||| ||| |||||    
T  45271501 gctttaaacgaagcccctgcaagtgagcggagagattgatcccctcaaattagtcgattctttgattggata 45271572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 192
Target Start/End: Original strand, 28668946 - 28669061
Alignment:
Q  80 tggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtca 176  Q
    |||||| |||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  28668946 tggtgccaatttcggtggactaagtccatacagagcttgctttggctttaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg 28669045  T
Q  177 attcttggatcggata 192  Q
    ||| ||||||||||||    
T  28669046 atttttggatcggata 28669061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 58 - 192
Target Start/End: Original strand, 3943791 - 3943928
Alignment:
Q  58 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggccc-cccgcaagtgggcggtggg 154  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| || ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||  | |||||||||||| ||||||    
T  3943791 aggtctcagattcgattttctctggtgccaatttcggttggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggctcccgcaagtgggtggtggg 3943890  T
Q  155 attgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||    
T  3943891 attggtccccttggattagtcggttattggatcggata 3943928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 23787196 - 23787056
Alignment:
Q  16 ggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagc 115  Q
    |||||||||||| | |||  || ||||| |||||| |  || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||     
T  23787196 ggcctagtggttggtttgaaattttggaatttgcttctacaaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtgggctaaatccatacagagt 23787097  T
Q  116 ttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgg 153  Q
    |||  ||| |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  23787096 ttgctctgactttaaatgggacctccgcaagtgggcggtgg 23787056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18976521 - 18976464
Alignment:
Q  135 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  18976521 ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 18976464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 19606036 - 19605951
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 98  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19606036 gttgccctagtggttggcttgggatcttggagtgcgctcctctcaaggtctcaggttcgattccctctaatgctaatttcggtggg 19605951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 6714471 - 6714387
Alignment:
Q  14 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 98  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |   |||||||||||||    
T  6714471 ttggcctaatggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccatctagcattaatttcggtggg 6714387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 190
Target Start/End: Original strand, 14946779 - 14946964
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||| |   |||| | ||||||||||  ||||||||  |||||| ||||| ||| | |    
T  14946779 tttggagttggcctagtggttgacttgagatcttgaagtttgctcctctcaaggttttaggttcgattttctctggtgtcaatttcagtgggctaagtcc 14946878  T
Q  107 atacagagct-tg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcgga 190  Q
    |||| ||||| ||  || |||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  14946879 atacggagctatgctctagctttaaacggaccccc-caagtaggcagtgggattggtcccctcagattagtcagtttttggatcgga 14946964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 192
Target Start/End: Original strand, 29361578 - 29361736
Alignment:
Q  31 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgc--tggctttaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||| ||  |||||||||||  ||| | ||    ||||||||  |||||||||    
T  29361578 ttgggatcttggagtttgctcctccaaagatctcaggt-cgatttcctctgatgtcaatttcggtggactaagtcca----gagcttgccgtggctttaa 29361672  T
Q  129 atggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    | ||  |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  29361673 acggagccccgcaagtgggcagtgggattgatctcctcggattaattgattcctggatcggata 29361736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 192
Target Start/End: Original strand, 18692090 - 18692148
Alignment:
Q  134 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  18692090 cccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcgtattagtcgattcttggatcggata 18692148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 192
Target Start/End: Original strand, 31778114 - 31778219
Alignment:
Q  94 gtgggttaaattcatacagagcttgct------ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggat 186  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||      ||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  31778114 gtgggttaagttcatacagagcttgcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtggacggtgagattggtcctctcagattagtcagttcttggat 31778213  T
Q  187 cggata 192  Q
    ||||||    
T  31778214 cggata 31778219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 40997535 - 40997434
Alignment:
Q  19 ctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg 118  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| || || | |||||||||| | ||| |  ||||||||||||    
T  40997535 ctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcatgttcaattccccctagtaccaatttcggtgagataagtcaatacagagcttg 40997436  T
Q  119 ct 120  Q
    ||    
T  40997435 ct 40997434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 192
Target Start/End: Original strand, 19174817 - 19174950
Alignment:
Q  61 tctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagctt---gctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggatt 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||  | ||||||||||||    |||||||  || ||  ||||| || ||||||||||||||    
T  19174817 tctcaggttcgattccttctggtgccaatttcggtggg-taggtccatacagagctttgctctggcttagaacggagccccgtaaatgggcggtgggatt 19174915  T
Q  158 gttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    | ||||||||||||| ||  | |||||||||||||    
T  19174916 gatcccctcggattaatcggtccttggatcggata 19174950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 188
Target Start/End: Original strand, 19849847 - 19850017
Alignment:
Q  21 agtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct 120  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||| | | |||  ||||| | |||  ||| |  ||||||||||||||    
T  19849847 agtggttggtttgagatcttggagtttgctcctccaaaggtcttaagttcgattccttttagtgtcaattttgatggactaagtctatacagagcttgct 19849946  T
Q  121 --ggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 188  Q
      |||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||  |||| || ||||||||||||    
T  19849947 ctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcggtgagattggtcctctcaaattaatcgattcttggatcg 19850017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 192
Target Start/End: Original strand, 14486955 - 14487013
Alignment:
Q  134 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  14486955 cccctgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggata 14487013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 44929913 - 44929855
Alignment:
Q  134 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  44929913 cccccgcaagtggacggtgggattggtccccttgaattagtcgattcttggatcggata 44929855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 918896 - 918782
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcg---attccctctggtgctaatttcggtgggttaaa 103  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |  ||||||||| |||||   ||||||||| |||| ||||||| |||| |||     
T  918896 tttggggttgacctagtggttggcttgggattttgaagtttgctcctct-gaggtctcaagttcgtcgattccctcttgtgccaatttcgttgggctaag 918798  T
Q  104 ttcatacagagcttgc 119  Q
    | ||||||||||||||    
T  918797 tccatacagagcttgc 918782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 4618876 - 4618795
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcgg 94  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |   |||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  4618876 gttggcctagtggttggcttggaatcttggagtatgctcctctcaaggtttcaggttcgatttcccctggtgccaatttcgg 4618795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 28194308 - 28194239
Alignment:
Q  29 gcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 98  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |   |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  28194308 gcttgggatcttggagtgtgctcctcttaaggtcttaggttcgattctctctggtgccaatttcggtggg 28194239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 191
Target Start/End: Original strand, 4852660 - 4852716
Alignment:
Q  135 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggat 191  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  4852660 ccccgcaagtggacggtggaattggtcccctcggattaatcgattcttggatcggat 4852716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 192
Target Start/End: Original strand, 39957891 - 39957946
Alignment:
Q  137 ccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  39957891 ccgcaagtgggcgatgggattggttccctcggattagtcgattcttggattggata 39957946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 185
Target Start/End: Original strand, 44610139 - 44610220
Alignment:
Q  107 atacagagcttgctg--gctttaaatggcccccc-gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttgga 185  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||    
T  44610139 atacagagcttgctctagctttaaatggggcccctgcaagtgggcggtgggattggtcccatcggattagtcggttcttgga 44610220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 19525539 - 19525428
Alignment:
Q  61 tctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgctggctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtgggattgt 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  || | ||||||  || |  |||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||     
T  19525539 tctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtggg-caagtccatacaatgc-taatggctttaaatgaggcccccgcaagtgggtggtgagattgg 19525442  T
Q  160 tcccctcggattag 173  Q
    |||||| |||||||    
T  19525441 tccccttggattag 19525428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 5608202 - 5608118
Alignment:
Q  36 atcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct 120  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||  |||||||| ||||||||  ||||| |||||| ||| | |||| ||||||||||    
T  5608202 atcttggaatttgctccttcagaggtctcatattcgattctctctggtgtcaattttggtgggctaagtccatatagagcttgct 5608118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 32526282 - 32526211
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccct 78  Q
    ||||| |||||| ||||||||   ||||||||||| |||||||||| |   |||||||||||||||||||||    
T  32526282 tttggagttggcttagtggttgatttgggatcttgaagtttgctcctctcaaggtctcaggttcgattccct 32526211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 3405343 - 3405265
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaattt 91  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||| | |||||  |   ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  3405343 gttgacctagtggttgacttgggatcttggaatgtgctcatctcaaggtcacaggttcgattccctctggtgccaattt 3405265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9401028 - 9400970
Alignment:
Q  134 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |  |||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  9401028 cccccgcaagtgggcagtgggattggtttccttagattagtcgattcttggatcggata 9400970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 33569876 - 33569842
Alignment:
Q  57 gaggtctcaggttcgattccctctggtgctaattt 91  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33569876 gaggtctcaggttcgattctctctggtgctaattt 33569842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 73
Target Start/End: Original strand, 44610090 - 44610140
Alignment:
Q  23 tggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgat 73  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  44610090 tggttggcttgagatcttggagtttgctcttccaaaggtctcaggttcgat 44610140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 192
Target Start/End: Original strand, 45132417 - 45132475
Alignment:
Q  134 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||| ||||||||| || |||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  45132417 cccccacaagtgggcagtaggattggtcctctcggattaatcgattcttggatcggata 45132475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 117
Target Start/End: Original strand, 29698164 - 29698256
Alignment:
Q  24 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagctt 117  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |   |||||||| |||  ||| |||||||||  ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  29698164 ggttggcttgggatcttggaatttgctcctctcaaggtctcaagttttatttcctctggtgtcaatttcggtggg-caagttcatacagagctt 29698256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 6714360 - 6714304
Alignment:
Q  136 cccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||| |||||||||| |||||    
T  6714360 cccgcaagtggacggtgagattggtcccctcaaattagtcgattcttggattggata 6714304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 12086146 - 12086106
Alignment:
Q  58 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 98  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12086146 aggtctcgggttcgattccctccggtgctaatttaggtggg 12086106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 192
Target Start/End: Original strand, 27290730 - 27290762
Alignment:
Q  160 tcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27290730 tcccctcggattagtcgattcttggatcggata 27290762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 182
Target Start/End: Original strand, 32845206 - 32845254
Alignment:
Q  134 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattctt 182  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||    
T  32845206 cccctgcaagtgggcggtgggattggtcccttcgaattagtcgattctt 32845254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0623 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0623
Description:

Target: scaffold0623; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 1253 - 1066
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| | |    
T  1253 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaagtcc 1154  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  1153 atacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgattctt-gatcggata 1066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0366 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0366
Description:

Target: scaffold0366; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9496 - 9309
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| | |    
T  9496 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaagtcc 9397  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  9396 atacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgattctt-gatcggata 9309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0366; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 12197 - 12019
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| | |    
T  12197 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctggagccaatttcggtgggctaagtcc 12098  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttg 183  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  12097 atacagagcttgctctggctttaaatggggccccacaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcaattcttg 12019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 7506 - 7318
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| | |    
T  7506 tttggggttggcctagtagttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctccggtgccaatttcggtgggctaagtcc 7407  T
Q  107 atacagagctt--gctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||   |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7406 atacagagctttctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 7318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 40325 - 40512
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  40325 tttggggttggcctagtggttggcttaggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 40424  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40425 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcggattagtcgattcttggatcggata 40512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 10890 - 10704
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| | |    
T  10890 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctggagccaatttcggtgggctaagtcc 10791  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10790 atacagagcttgctctggctttaaatggggccccacaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcaattctt-gatcggata 10704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 192
Target Start/End: Original strand, 161831 - 161997
Alignment:
Q  29 gcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggcttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  161831 gcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggcttt 161930  T
Q  127 aaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  161931 taatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcagata 161997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 53061 - 52880
Alignment:
Q  14 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacaga 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||    
T  53061 ttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggcttcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggcaaaatccatacaga 52962  T
Q  114 gcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||  |||||||||||  || |||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  52961 gcttgctctggctttaaacggggcccccgcaggtgggcggtaggattggtcctctcggattagtcgattcttgaatcggata 52880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 97563 - 97375
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  97563 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttgtagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 97464  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||  || ||||| ||||||    
T  97463 atacagagcttgctctgactttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcctctcgtattagtcggtttttggaccggata 97375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 41841 - 41654
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| || | ||| | |    
T  41841 tttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctcttgttccaatttcgttgtgctaagtcc 41742  T
Q  107 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || |||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  41741 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccctgcaagtgggcaatgggattggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggata 41654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 192
Target Start/End: Original strand, 39131 - 39280
Alignment:
Q  46 ttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaatggc-cccccgcaa 142  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  | |||||||| ||||  ||||||||||| ||  |||||||||    
T  39131 ttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctatgtccatacagaacttgttctggctttaaacggggcccccgcaa 39230  T
Q  143 gtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  39231 gtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcagata 39280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 8604 - 8513
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 98  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  8604 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattatctctggtgccaatttcggtggg 8513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8513 - 8460
Alignment:
Q  139 gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  8513 gcaagtgggcggtgggattggtccgctcggattagtcgattcttagatcggata 8460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 192
Target Start/End: Original strand, 32342 - 32475
Alignment:
Q  61 tctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtgggatt 157  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  32342 tctcaggttcgatttcctctggagccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaatgtggcccccgcaagtgggtggtgggatt 32441  T
Q  158 gttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    | |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  32442 ggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggata 32475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Original strand, 66769 - 66942
Alignment:
Q  14 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacaga 113  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| |             
T  66769 ttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcacgttcgattccttctggtgccaattttggtgggctaagt--------c 66860  T
Q  114 gcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  66861 gcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggata 66942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 192
Target Start/End: Original strand, 20246 - 20409
Alignment:
Q  31 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| ||| | |||||| ||||||  ||||||||||    
T  20246 ttgggatcttggagtttgctccttcaaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcaatgggctaagtccatacatagcttgctctggctttaa 20345  T
Q  129 a-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |  || ||||||||||||||||||   |||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20346 acgggacccccgcaagtgggcggtaaaattgat-ctctcggattagtcaattcttggaccggata 20409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0460 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0460
Description:

Target: scaffold0460; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 8376 - 8286
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgg 97  Q
    ||||| |||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8376 tttggggttggtttagtggttggctcgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgg 8286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0717 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0717
Description:

Target: scaffold0717; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 149 - 1
Alignment:
Q  13 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 112  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||| |||| ||| | |||||||    
T  149 gttggcctagtggttggcttgtgatcttggagtttgctcgtccagaggtctcaggttcgattccctcttatgtcaatttcgatgggctaagtccatacag 50  T
Q  113 agcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattg 158  Q
    || |||  || ||||||||  || ||||| || ||||||||||||||||    
T  49 agtttgctctagctttaaacggggcccccacatgtgggcggtgggattg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 29332 - 29152
Alignment:
Q  14 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacaga 113  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||| || ||| |   |||||| ||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||| || | ||||||||    
T  29332 ttggcctagtggttggcttggaatcttgaagtgtgttcctctcaaggtcttaggttcgattcccgctgatgccattttcggtcggt-aagtccatacaga 29234  T
Q  114 gcttg---ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||    ||||||| |||||| ||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  29233 gctttgctctggcttaaaatggacccccgcaaatggacagtgggattggtcccctcagattagtcagtccttggatcggata 29152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 27776 - 27958
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 106  Q
    ||||| ||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||| | |    
T  27776 tttggggttggtctagtggttggtttgggattttggagtttgctcctctcaaggtctcgggttcgattccctgtggtgccaatttgagtgggctaagtcc 27875  T
Q  107 atacagagcttgctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    ||||  ||||     ||||||||| |  | ||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  27876 atacgaagct---atgctttaaatagggcgccgcaagtgggtggtgagatttgtcccctcggattagtcggttcttggatcagata 27958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1175 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1175
Description:

Target: scaffold1175; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 2524 - 2435
Alignment:
Q  106 catacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 192  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||| ||||||||    
T  2524 catacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtccgtccttgaatcggata 2435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 12944 - 12884
Alignment:
Q  14 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgatt 74  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  12944 ttggcctagtggttgacttgggatcttggagttcgctcctccagagatctcaggttcgatt 12884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 26740 - 26650
Alignment:
Q  7 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgg 97  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||   | |||||||||| ||| ||||| ||||  ||| |||||||||||    
T  26740 tttggggttggcctactggttggcttaggatcttggagtttgcttttcaagaggtctcatgtttgattctctcttatgccaatttcggtgg 26650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 91
Target Start/End: Original strand, 11557 - 11620
Alignment:
Q  29 gcttgggatcttggagtttgctccccca-gaggtctcaggttcgattccctctggtgctaattt 91  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11557 gcttgggatctgggagtgtgctcctcctcgaggtctcaggttcgattctctctggtgttaattt 11620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University