View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10855A_low_419 (Length: 233)

Name: NF10855A_low_419
Description: NF10855A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10855A_low_419
NF10855A_low_419
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (20-219)||(46272-46472)
[»] chr8 (52 HSPs)
chr8 (20-219)||(15961130-15961330)
chr8 (20-219)||(18997698-18997898)
chr8 (20-219)||(30473915-30474115)
chr8 (20-219)||(44832217-44832417)
chr8 (20-219)||(6299051-6299251)
chr8 (20-219)||(10477935-10478135)
chr8 (20-219)||(32110892-32111092)
chr8 (20-219)||(995846-996046)
chr8 (20-219)||(18175379-18175579)
chr8 (20-219)||(39257441-39257641)
chr8 (20-219)||(40026798-40026998)
chr8 (20-219)||(11725188-11725388)
chr8 (19-219)||(28274244-28274445)
chr8 (21-218)||(18210656-18210854)
chr8 (20-219)||(18841902-18842102)
chr8 (20-219)||(28582853-28583053)
chr8 (20-206)||(35122353-35122540)
chr8 (22-219)||(44836907-44837105)
chr8 (20-219)||(18568863-18569063)
chr8 (20-219)||(24408874-24409074)
chr8 (38-219)||(19240661-19240843)
chr8 (38-219)||(19313845-19314027)
chr8 (28-219)||(19412829-19413022)
chr8 (19-219)||(11142459-11142666)
chr8 (41-219)||(24004779-24004958)
chr8 (20-182)||(39997726-39997889)
chr8 (100-219)||(23353688-23353808)
chr8 (21-219)||(25875322-25875530)
chr8 (157-219)||(18481929-18481991)
chr8 (171-219)||(39997660-39997708)
chr8 (171-216)||(6299290-6299335)
chr8 (171-216)||(10477851-10477896)
chr8 (171-216)||(11142379-11142424)
chr8 (171-216)||(11725104-11725149)
chr8 (171-216)||(18175295-18175340)
chr8 (171-216)||(18997614-18997659)
chr8 (171-216)||(19240578-19240623)
chr8 (171-216)||(19313762-19313807)
chr8 (171-216)||(19412750-19412795)
chr8 (171-216)||(23353846-23353891)
chr8 (171-216)||(24408793-24408838)
chr8 (171-216)||(30474153-30474198)
chr8 (171-216)||(32111131-32111176)
chr8 (171-216)||(35122585-35122630)
chr8 (171-216)||(39997578-39997623)
chr8 (171-216)||(44832457-44832502)
chr8 (171-216)||(44836822-44836867)
chr8 (171-213)||(18210893-18210935)
chr8 (171-216)||(996085-996130)
chr8 (171-216)||(18841827-18841872)
chr8 (171-216)||(25875567-25875612)
chr8 (171-216)||(28582775-28582820)
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (20-219)||(21804603-21804803)
chr7 (20-219)||(38163370-38163570)
chr7 (20-219)||(42242185-42242385)
chr7 (20-218)||(3840672-3840871)
chr7 (20-219)||(27138559-27138759)
chr7 (20-219)||(33916978-33917178)
chr7 (20-219)||(31373454-31373654)
chr7 (20-219)||(17178268-17178469)
chr7 (20-219)||(21341821-21342021)
chr7 (20-219)||(21669979-21670179)
chr7 (20-219)||(24924077-24924277)
chr7 (20-219)||(16376576-16376776)
chr7 (20-219)||(21656626-21656826)
chr7 (20-219)||(43933575-43933775)
chr7 (21-219)||(15109697-15109896)
chr7 (20-219)||(40968889-40969089)
chr7 (20-219)||(13786168-13786368)
chr7 (20-219)||(27903448-27903648)
chr7 (21-219)||(21753524-21753723)
chr7 (20-182)||(39030283-39030446)
chr7 (169-219)||(31096698-31096748)
chr7 (171-216)||(15109930-15109975)
chr7 (171-216)||(3840912-3840957)
chr7 (171-216)||(16376812-16376857)
chr7 (171-216)||(17178508-17178553)
chr7 (171-216)||(21341735-21341780)
chr7 (171-216)||(21656545-21656590)
chr7 (171-216)||(21669893-21669938)
chr7 (171-216)||(21804842-21804887)
chr7 (171-216)||(27138798-27138843)
chr7 (171-216)||(31373368-31373413)
chr7 (171-216)||(33917217-33917262)
chr7 (171-216)||(42242424-42242469)
chr7 (173-216)||(43933815-43933858)
chr7 (171-216)||(21753760-21753805)
chr7 (171-216)||(24923996-24924041)
chr7 (171-216)||(27903686-27903731)
chr7 (171-216)||(31096613-31096658)
[»] chr6 (30 HSPs)
chr6 (20-219)||(12597296-12597496)
chr6 (20-219)||(19997663-19997863)
chr6 (20-219)||(33645940-33646140)
chr6 (20-219)||(28099628-28099828)
chr6 (20-219)||(2266766-2266974)
chr6 (20-219)||(10584759-10584959)
chr6 (20-219)||(17202430-17202630)
chr6 (20-213)||(13533771-13533965)
chr6 (20-219)||(2005426-2005626)
chr6 (20-218)||(15044721-15044920)
chr6 (20-219)||(3592891-3593091)
chr6 (56-219)||(17594814-17594979)
chr6 (93-219)||(8539598-8539725)
chr6 (93-219)||(25448747-25448874)
chr6 (20-114)||(1405594-1405688)
chr6 (25-128)||(33035523-33035626)
chr6 (171-217)||(10584996-10585042)
chr6 (171-216)||(2266682-2266727)
chr6 (171-216)||(12597535-12597580)
chr6 (171-216)||(15044637-15044682)
chr6 (171-216)||(17202346-17202391)
chr6 (171-216)||(17594731-17594776)
chr6 (171-216)||(19997578-19997623)
chr6 (171-216)||(28099868-28099913)
chr6 (171-216)||(33645856-33645901)
chr6 (171-216)||(2005346-2005391)
chr6 (171-216)||(3589062-3589107)
chr6 (171-216)||(3592085-3592130)
chr6 (171-216)||(3592810-3592855)
chr6 (171-216)||(25448663-25448708)
[»] chr5 (42 HSPs)
chr5 (20-219)||(10729473-10729673)
chr5 (20-219)||(20874686-20874886)
chr5 (20-219)||(34107369-34107569)
chr5 (20-219)||(34110650-34110850)
chr5 (20-219)||(38246896-38247096)
chr5 (20-219)||(16526337-16526537)
chr5 (25-219)||(17373200-17373395)
chr5 (24-219)||(33570342-33570538)
chr5 (20-219)||(2398973-2399171)
chr5 (36-219)||(14141154-14141338)
chr5 (20-219)||(1395987-1396187)
chr5 (20-219)||(5479194-5479394)
chr5 (20-219)||(20655080-20655280)
chr5 (28-219)||(27647928-27648120)
chr5 (25-219)||(29275622-29275817)
chr5 (20-219)||(33375760-33375962)
chr5 (31-219)||(6940545-6940734)
chr5 (20-219)||(24223195-24223395)
chr5 (20-219)||(25099267-25099467)
chr5 (20-219)||(25158357-25158557)
chr5 (44-219)||(1394541-1394717)
chr5 (52-218)||(17913740-17913907)
chr5 (20-139)||(40177120-40177239)
chr5 (171-216)||(1395905-1395950)
chr5 (171-216)||(2399210-2399255)
chr5 (171-216)||(5479113-5479158)
chr5 (171-216)||(6940768-6940813)
chr5 (171-216)||(10729712-10729757)
chr5 (171-216)||(14141377-14141422)
chr5 (171-216)||(16526577-16526622)
chr5 (171-216)||(17373434-17373479)
chr5 (171-216)||(20874602-20874647)
chr5 (171-216)||(24223434-24223479)
chr5 (171-216)||(27647843-27647888)
chr5 (171-216)||(33570578-33570623)
chr5 (171-216)||(34107608-34107653)
chr5 (171-216)||(34110564-34110609)
chr5 (171-216)||(38247135-38247180)
chr5 (171-216)||(40177031-40177076)
chr5 (171-216)||(1394750-1394795)
chr5 (171-216)||(25158594-25158639)
chr5 (171-216)||(33375678-33375723)
[»] chr4 (41 HSPs)
chr4 (20-219)||(16917919-16918119)
chr4 (20-219)||(52434622-52434822)
chr4 (20-219)||(30824953-30825153)
chr4 (20-219)||(53143293-53143493)
chr4 (20-219)||(12090490-12090691)
chr4 (20-219)||(37651664-37651864)
chr4 (20-219)||(31966000-31966200)
chr4 (20-219)||(16904983-16905183)
chr4 (20-219)||(46256032-46256232)
chr4 (20-219)||(33139502-33139702)
chr4 (20-219)||(44376110-44376310)
chr4 (20-219)||(45977021-45977221)
chr4 (20-219)||(31628518-31628718)
chr4 (20-219)||(35760579-35760779)
chr4 (20-219)||(41387124-41387324)
chr4 (38-219)||(45782478-45782660)
chr4 (20-219)||(37590835-37591035)
chr4 (20-219)||(48118565-48118762)
chr4 (20-219)||(52098221-52098422)
chr4 (20-219)||(39058388-39058588)
chr4 (20-219)||(47142831-47143031)
chr4 (22-219)||(54624955-54625146)
chr4 (51-217)||(50229768-50229936)
chr4 (29-83)||(50229712-50229766)
chr4 (171-216)||(12090730-12090775)
chr4 (171-216)||(16905218-16905263)
chr4 (171-216)||(16918158-16918203)
chr4 (171-216)||(30825192-30825237)
chr4 (171-216)||(31966239-31966284)
chr4 (171-216)||(39058622-39058667)
chr4 (171-216)||(45977264-45977309)
chr4 (171-216)||(47143070-47143115)
chr4 (171-216)||(48118802-48118847)
chr4 (171-216)||(52098460-52098505)
chr4 (171-216)||(52434538-52434583)
chr4 (171-216)||(53143534-53143579)
chr4 (171-216)||(54624877-54624922)
chr4 (96-143)||(34684603-34684650)
chr4 (174-216)||(50229979-50230021)
chr4 (171-216)||(41387040-41387085)
chr4 (171-216)||(44376347-44376392)
[»] chr3 (42 HSPs)
chr3 (20-219)||(3898420-3898620)
chr3 (20-219)||(12264198-12264398)
chr3 (20-219)||(38653958-38654158)
chr3 (20-219)||(43363642-43363842)
chr3 (20-219)||(49672560-49672760)
chr3 (20-219)||(1941751-1941951)
chr3 (20-219)||(21098302-21098502)
chr3 (20-219)||(34121353-34121553)
chr3 (20-219)||(49506380-49506580)
chr3 (25-219)||(54073025-54073220)
chr3 (20-219)||(4584465-4584665)
chr3 (20-219)||(20671247-20671447)
chr3 (20-219)||(26948796-26948996)
chr3 (20-219)||(36076485-36076685)
chr3 (22-219)||(31488409-31488607)
chr3 (20-219)||(39146438-39146638)
chr3 (20-219)||(45557915-45558115)
chr3 (31-219)||(24119205-24119394)
chr3 (20-219)||(49478206-49478406)
chr3 (20-219)||(55041614-55041820)
chr3 (20-172)||(40014684-40014837)
chr3 (21-143)||(26051334-26051457)
chr3 (146-219)||(26052236-26052309)
chr3 (20-91)||(6460199-6460269)
chr3 (171-216)||(1941990-1942035)
chr3 (171-216)||(3898336-3898381)
chr3 (171-216)||(12264113-12264158)
chr3 (171-216)||(20671164-20671209)
chr3 (171-216)||(21098217-21098262)
chr3 (171-216)||(26052349-26052394)
chr3 (171-216)||(26948687-26948732)
chr3 (171-216)||(31488327-31488372)
chr3 (171-216)||(34121269-34121314)
chr3 (171-216)||(38654198-38654243)
chr3 (171-216)||(43363881-43363926)
chr3 (171-216)||(49478122-49478167)
chr3 (171-216)||(49672476-49672521)
chr3 (171-216)||(55041858-55041903)
chr3 (173-216)||(36076723-36076766)
chr3 (171-216)||(24119124-24119169)
chr3 (171-216)||(39146361-39146406)
chr3 (171-216)||(45558153-45558198)
[»] chr2 (31 HSPs)
chr2 (20-219)||(41663235-41663435)
chr2 (20-219)||(41664508-41664708)
chr2 (20-219)||(6120550-6120750)
chr2 (20-219)||(18351549-18351749)
chr2 (20-219)||(44902080-44902279)
chr2 (20-219)||(19596394-19596594)
chr2 (20-215)||(20544827-20545023)
chr2 (20-219)||(31424007-31424207)
chr2 (20-219)||(42441958-42442162)
chr2 (20-219)||(8700259-8700459)
chr2 (20-219)||(36279485-36279685)
chr2 (22-219)||(26231292-26231490)
chr2 (22-218)||(34007742-34007939)
chr2 (20-219)||(42055197-42055395)
chr2 (20-219)||(999262-999462)
chr2 (30-219)||(16214822-16215012)
chr2 (20-149)||(27944827-27944956)
chr2 (20-143)||(692233-692356)
chr2 (171-216)||(19596634-19596679)
chr2 (171-216)||(6120465-6120510)
chr2 (171-216)||(16214739-16214784)
chr2 (171-216)||(18351465-18351510)
chr2 (171-216)||(26231527-26231572)
chr2 (171-216)||(31423922-31423967)
chr2 (171-216)||(34007980-34008025)
chr2 (171-216)||(41663150-41663195)
chr2 (171-216)||(42441874-42441919)
chr2 (171-216)||(999500-999545)
chr2 (171-216)||(36279723-36279768)
chr2 (171-216)||(41664424-41664469)
chr2 (171-216)||(44901996-44902041)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (20-219)||(4266379-4266579)
chr1 (20-219)||(34888717-34888917)
chr1 (20-219)||(38913778-38913978)
chr1 (20-219)||(50151058-50151258)
chr1 (20-219)||(2951397-2951597)
chr1 (20-200)||(1231813-1231994)
chr1 (22-219)||(7333942-7334140)
chr1 (20-219)||(9216029-9216229)
chr1 (20-219)||(23482738-23482938)
chr1 (20-219)||(35614065-35614265)
chr1 (20-219)||(18706540-18706739)
chr1 (20-219)||(38444629-38444829)
chr1 (29-219)||(39727978-39728169)
chr1 (28-215)||(35614818-35615005)
chr1 (20-215)||(52687145-52687340)
chr1 (20-219)||(18855264-18855463)
chr1 (20-149)||(50326070-50326199)
chr1 (20-144)||(31018231-31018355)
chr1 (32-219)||(19764593-19764782)
chr1 (80-219)||(19768462-19768602)
chr1 (84-219)||(2590333-2590468)
chr1 (22-106)||(5061335-5061419)
chr1 (20-83)||(29942153-29942216)
chr1 (171-216)||(1231723-1231768)
chr1 (171-216)||(2951636-2951681)
chr1 (171-216)||(4266295-4266340)
chr1 (171-216)||(18706773-18706818)
chr1 (171-216)||(19764814-19764859)
chr1 (171-216)||(19768380-19768425)
chr1 (171-216)||(23482972-23483017)
chr1 (171-216)||(35613982-35614027)
chr1 (171-216)||(35614732-35614777)
chr1 (171-216)||(38914017-38914062)
chr1 (171-216)||(52036310-52036355)
chr1 (174-216)||(7333861-7333903)
chr1 (171-216)||(38444547-38444592)
chr1 (171-216)||(52687381-52687426)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (20-219)||(149081-149281)
scaffold0022 (171-216)||(149318-149363)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (23-219)||(19345-19542)
[»] scaffold0836 (1 HSPs)
scaffold0836 (21-141)||(5310-5430)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (20-141)||(6092-6213)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (20-141)||(6102-6223)


Alignment Details
Target: scaffold0031 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 46472 - 46272
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  46472 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 46373  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46372 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 46273  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  46272 g 46272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 52)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15961330 - 15961130
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15961330 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 15961231  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15961230 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 15961131  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  15961130 g 15961130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18997898 - 18997698
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18997898 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 18997799  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18997798 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 18997699  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  18997698 g 18997698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 30473915 - 30474115
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  30473915 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 30474014  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30474015 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 30474114  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  30474115 g 30474115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 44832217 - 44832417
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  44832217 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 44832316  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44832317 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 44832416  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  44832417 g 44832417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 6299051 - 6299251
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  6299051 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 6299150  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6299151 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcctttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 6299250  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  6299251 g 6299251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10478135 - 10477935
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  10478135 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcacaaatatatgcagatgttggaattcgaa 10478036  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10478035 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 10477936  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  10477935 g 10477935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 32110892 - 32111092
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  32110892 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggttccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 32110991  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32110992 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 32111091  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  32111092 g 32111092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 995846 - 996046
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  995846 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcatatgttggaattcgaa 995945  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  995946 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaacttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 996045  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  996046 g 996046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18175579 - 18175379
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18175579 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 18175480  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18175479 cctcagacaccacacttattcaccaaaaaaatattaattattatcaaacgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 18175380  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  18175379 g 18175379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 39257641 - 39257441
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39257641 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaatttgaa 39257542  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39257541 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 39257442  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  39257441 g 39257441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 40026998 - 40026798
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40026998 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagataatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaatttgaa 40026899  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40026898 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 40026799  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  40026798 g 40026798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11725388 - 11725188
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  11725388 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtctcaaatatatgcagatgttggaattcgaa 11725289  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11725288 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 11725189  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  11725188 g 11725188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 219
Target Start/End: Original strand, 28274244 - 28274445
Alignment:
Q  19 atcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttga 118  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  28274244 atcatatacattgtagatgtagcagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatacgcagatgttggaattcga 28274343  T
Q  119 acctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattatt 217  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28274344 acctcatacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattatt 28274443  T
Q  218 gg 219  Q
    ||    
T  28274444 gg 28274445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 218
Target Start/End: Original strand, 18210656 - 18210854
Alignment:
Q  21 catatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaac 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18210656 catatacattgtagatatagtagacaaaaataaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtctcaaatatatgcagatgttggaatttgaac 18210755  T
Q  121 ctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18210756 ctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttatttccttcttttgttaaagttatatgtcaatgttatattattg 18210854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18842102 - 18841902
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18842102 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaataaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtccaaaatatatgcagatgttggaattcgaa 18842003  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
     |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18842002 tctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaattgtatgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 18841903  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  18841902 g 18841902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28583053 - 28582853
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  28583053 tcatatacattgtagatgtagtagataaaaacaaatctcaatgtatatcaaagagaatgaaatatgtggtctcaaatatatgcagatgttggaattcgaa 28582954  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28582953 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatataattg 28582854  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  28582853 g 28582853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 206
Target Start/End: Original strand, 35122353 - 35122540
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  35122353 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtccaaaatatatgcagatgttggaattcgaa 35122452  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaat 206  Q
     |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35122453 tctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttattaaaattatatgtcaat 35122540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 44837105 - 44836907
Alignment:
Q  22 atatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacc 121  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44837105 atatacattgtagatgtagtagacaaaaataaatctcaatacatatcaaagagaataaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaattcgaacc 44837006  T
Q  122 tcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  44837005 tcagacaccacgcttattcaccttaaaaatattaatttttatcaattgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatctcaatgttaaattattgg 44836907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18569063 - 18568863
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18569063 tcatatacattgtagatgttgtagacaaaaacatatctcaatgcatatcaaagagaataaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 18568964  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattca-ccaaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18568963 cctcaaacaccacacttattcatcttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 18568864  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  18568863 g 18568863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24409074 - 24408874
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24409074 tcatatacattgtagatgtagtagataaaaacaaatcttaatgcatatcaaagataatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 24408975  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24408974 catcatacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 24408875  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  24408874 g 24408874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 38 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19240843 - 19240661
Alignment:
Q  38 tagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacaccacgctta 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19240843 tagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacactta 19240744  T
Q  138 ttcac-caaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 219  Q
    |||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19240743 ttcacgttaaaaatattaatttttatcaatggtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 19240661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 38 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19314027 - 19313845
Alignment:
Q  38 tagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacaccacgctta 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19314027 tagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacactta 19313928  T
Q  138 ttcac-caaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 219  Q
    |||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19313927 ttcacgttaaaaatattaatttttatcaatggtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 19313845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19413022 - 19412829
Alignment:
Q  28 attgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagac 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19413022 attgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagac 19412923  T
Q  128 accacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattc-ttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 219  Q
    |||||  |||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19412922 accacagttattcaccttaaaaatattaatttttatccatcgtgtgttacttcattctttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 19412829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11142666 - 11142459
Alignment:
Q  19 atcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttga 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  11142666 atcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgctcccaaatatatgcagatgttggaattcga 11142567  T
Q  119 acctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatatta------ttttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattat 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  11142566 acctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcagtgttat 11142467  T
Q  212 attattgg 219  Q
    ||||||||    
T  11142466 attattgg 11142459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 41 - 219
Target Start/End: Original strand, 24004779 - 24004958
Alignment:
Q  41 tagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacaccacgcttattc 140  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  24004779 tagacaaaatcaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgcagatgttgaaattcgaacctcagacaccacacttattc 24004878  T
Q  141 acc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 219  Q
    |||  |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24004879 accttaaaaatattaatttttatcaatcatgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 24004958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 39997889 - 39997726
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  39997889 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgtatatcaaagagaatgaaatatgtggttccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 39997790  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcatt 182  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39997789 cctcagacaccacacttattcacctttaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcatt 39997726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 219
Target Start/End: Original strand, 23353688 - 23353808
Alignment:
Q  100 tgcagatgttggaatttgaacctcagacaccacgcttattcacca-aaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattat 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23353688 tgcagatgttggaattcgaacctcagacaccccacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatggtgtgttacttcattcttttgttaaaattat 23353787  T
Q  199 atgtcaatattatattattgg 219  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  23353788 atgtcaatgttatattattgg 23353808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 219
Target Start/End: Original strand, 25875322 - 25875530
Alignment:
Q  21 catatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaac 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||      |||||||||| ||||||| ||||    
T  25875322 catatacatcgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatattaaagagaataaaacatgtgctccc-----tatgcagatgctggaattcgaac 25875416  T
Q  121 ctcagacacc--------------acgcttattcacca-aaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaa 205  Q
    ||||||||                || ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25875417 ctcagacatattaaagagaataaaacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaa 25875516  T
Q  206 tattatattattgg 219  Q
    | ||||||||||||    
T  25875517 tgttatattattgg 25875530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 157 - 219
Target Start/End: Original strand, 18481929 - 18481991
Alignment:
Q  157 ttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 219  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18481929 ttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 18481991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 39997708 - 39997660
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39997708 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgtcaatgttatattattgg 39997660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 6299290 - 6299335
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  6299290 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 6299335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10477896 - 10477851
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  10477896 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 10477851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11142424 - 11142379
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  11142424 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 11142379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11725149 - 11725104
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  11725149 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 11725104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18175340 - 18175295
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  18175340 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 18175295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18997659 - 18997614
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  18997659 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 18997614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19240623 - 19240578
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  19240623 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 19240578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19313807 - 19313762
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  19313807 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 19313762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19412795 - 19412750
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  19412795 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 19412750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 23353846 - 23353891
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  23353846 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 23353891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24408838 - 24408793
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  24408838 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 24408793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 30474153 - 30474198
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  30474153 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 30474198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 32111131 - 32111176
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  32111131 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 32111176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 35122585 - 35122630
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  35122585 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 35122630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 39997623 - 39997578
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  39997623 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 39997578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 44832457 - 44832502
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  44832457 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 44832502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 44836867 - 44836822
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  44836867 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 44836822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 213
Target Start/End: Original strand, 18210893 - 18210935
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatat 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  18210893 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatat 18210935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 996085 - 996130
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||    
T  996085 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttgtattat 996130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18841872 - 18841827
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||    
T  18841872 tgttacttcattcttttgtaaaaattatacgttaatgttatattat 18841827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 25875567 - 25875612
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  25875567 tgttacttcattattttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 25875612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28582820 - 28582775
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||    
T  28582820 tgttacttcattcttttgtaaaaattgtatgttaatgttatattat 28582775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 21804603 - 21804803
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21804603 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 21804702  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21804703 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 21804802  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  21804803 g 21804803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 38163370 - 38163570
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  38163370 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 38163469  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38163470 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 38163569  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  38163570 g 38163570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 42242185 - 42242385
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  42242185 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 42242284  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42242285 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 42242384  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  42242385 g 42242385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 20 - 218
Target Start/End: Original strand, 3840672 - 3840871
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  3840672 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 3840771  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3840772 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 3840871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 27138559 - 27138759
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  27138559 tcatatacattctagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 27138658  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27138659 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 27138758  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  27138759 g 27138759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 33916978 - 33917178
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  33916978 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 33917077  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33917078 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttatttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 33917177  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  33917178 g 33917178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31373654 - 31373454
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  31373654 tcatatacattgtagatataatagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttgaaattcgaa 31373555  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31373554 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtattacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 31373455  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  31373454 g 31373454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 17178268 - 17178469
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  17178268 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaattcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 17178367  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc--aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattatt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17178368 cctcagacaccacacttattcaccaaaaaaaatattaatttttatcaatcgggtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattatt 17178467  T
Q  218 gg 219  Q
    ||    
T  17178468 gg 17178469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21342021 - 21341821
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21342021 tcatatacattgtagatataatagacaaaaataaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtagtctcaaatatatgcagatgttggaattcgaa 21341922  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21341921 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 21341822  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  21341821 g 21341821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21670179 - 21669979
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21670179 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 21670080  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21670079 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 21669980  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  21669979 g 21669979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24924277 - 24924077
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24924277 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgtagatgttggaatttgaa 24924178  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24924177 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaaattttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 24924078  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  24924077 g 24924077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 16376576 - 16376776
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16376576 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 16376675  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16376676 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 16376775  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  16376776 g 16376776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21656826 - 21656626
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21656826 tcatatacactgtagatgaagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 21656727  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21656726 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 21656627  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  21656626 g 21656626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 43933575 - 43933775
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  43933575 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaaaaaatctcaatgcatataaaagagaataaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 43933674  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43933675 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 43933774  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  43933775 g 43933775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 219
Target Start/End: Original strand, 15109697 - 15109896
Alignment:
Q  21 catatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaac 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15109697 catatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaac 15109796  T
Q  121 ctcagacaccacgcttattca-ccaaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 219  Q
    |||||||||||| |||||||| |  |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15109797 ctcagacaccacacttattcatcttaaaagtattaatttttatcaattgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 15109896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 40969089 - 40968889
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  40969089 tcatatacattgtagatgtagtagacacaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 40968990  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40968989 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 40968890  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  40968889 g 40968889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13786368 - 13786168
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  13786368 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 13786269  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13786268 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgcgtcttacttcatttttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 13786169  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  13786168 g 13786168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 27903448 - 27903648
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  27903448 tcatatatattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 27903547  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  27903548 cctcatacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttaccaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattctatgtcaatgttatattattg 27903647  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  27903648 g 27903648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 219
Target Start/End: Original strand, 21753524 - 21753723
Alignment:
Q  21 catatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaac 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  |||| ||||    
T  21753524 catatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtctcaaatatatgcagatgttaaaattcgaac 21753623  T
Q  121 ctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 219  Q
    || ||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21753624 cttagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 21753723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 182
Target Start/End: Original strand, 39030283 - 39030446
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  39030283 tcatatatattgtagatgtagtagacaaaaacaaatttcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 39030382  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcatt 182  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  39030383 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcatt 39030446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31096748 - 31096698
Alignment:
Q  169 tgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31096748 tgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 31096698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 15109930 - 15109975
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  15109930 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatattatattat 15109975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 3840912 - 3840957
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  3840912 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 3840957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 16376812 - 16376857
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  16376812 tgttacttcattattttgtaaaaattatatgtcaatgttatattat 16376857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 17178508 - 17178553
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  17178508 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 17178553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21341780 - 21341735
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  21341780 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 21341735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21656590 - 21656545
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  21656590 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 21656545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21669938 - 21669893
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  21669938 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 21669893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 21804842 - 21804887
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  21804842 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 21804887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 27138798 - 27138843
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  27138798 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 27138843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 31373413 - 31373368
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  31373413 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 31373368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 33917217 - 33917262
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  33917217 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 33917262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 42242424 - 42242469
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  42242424 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 42242469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 216
Target Start/End: Original strand, 43933815 - 43933858
Alignment:
Q  173 ttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  43933815 ttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 43933858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 21753760 - 21753805
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  21753760 tgttacttcattattttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 21753805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24924041 - 24923996
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||    
T  24924041 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatgttat 24923996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 27903686 - 27903731
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  27903686 tgttacttcattattttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 27903731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 31096658 - 31096613
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||    
T  31096658 tgttacttcattcttttgtaagaattatatgttaatgttatattat 31096613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 30)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 12597296 - 12597496
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  12597296 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 12597395  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12597396 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 12597495  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  12597496 g 12597496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19997863 - 19997663
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  19997863 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 19997764  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19997763 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 19997664  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  19997663 g 19997663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 33646140 - 33645940
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  33646140 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggttccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 33646041  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33646040 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 33645941  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  33645940 g 33645940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 28099628 - 28099828
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  28099628 tcatatacattgtagatataatagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgctgatgttggaattcgaa 28099727  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28099728 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 28099827  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  28099828 g 28099828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 2266974 - 2266766
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  2266974 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 2266875  T
Q  120 cctcagacac--------cacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatatta 210  Q
    ||||||||||        |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2266874 cctcagacaccacgacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatatta 2266775  T
Q  211 tattattgg 219  Q
    |||||||||    
T  2266774 tattattgg 2266766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 10584759 - 10584959
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  10584759 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatcttaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 10584858  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10584859 cctcagacactacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 10584958  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  10584959 g 10584959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17202630 - 17202430
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  17202630 tcatatacattgtagatgtagtagacaaatacaaatcacaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 17202531  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17202530 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 17202431  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  17202430 g 17202430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13533965 - 13533771
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  13533965 tcatatacattgtagatgtagtagataaaaacaaatctcaatgtatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 13533866  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatat 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13533865 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatat 13533771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 2005626 - 2005426
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  2005626 tcatatacattgtagatgcagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcttaaatatatgcagatgttggaattcgaa 2005527  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2005526 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 2005427  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  2005426 g 2005426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15044920 - 15044721
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15044920 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaataaatttcaatgcatatcaaagagaataaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 15044821  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15044820 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgttttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 15044721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3593091 - 3592891
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  3593091 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatccaagagaatgaaatatgtgatcccaaatatattcagatgttggaattcgaa 3592992  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  3592991 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatgaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatctcaatgttatattattg 3592892  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  3592891 g 3592891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 56 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17594979 - 17594814
Alignment:
Q  56 ctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacaccacgcttattcacca-aaaaatatta 154  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  17594979 ctcaatgcatatcaaagaaaatgaaatatgtggtcccaaatatatggagatgttgaaattcaaacttcagacaccacacttattcaccttaaaaatatta 17594880  T
Q  155 t-tttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 219  Q
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17594879 aatttttatcaatcgtatgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 17594814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 93 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8539725 - 8539598
Alignment:
Q  93 aaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacaccacgcttattcacca-aaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgtta 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8539725 aaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgtta 8539626  T
Q  192 aaattatatgtcaatattatattattgg 219  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8539625 aaattatatgtcaatgttatattattgg 8539598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 93 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25448874 - 25448747
Alignment:
Q  93 aaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaa-atattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgtta 191  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25448874 aaatatatgtagatgttggaattcgaaactcagacaccacgcttattcaccaaaaatatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcatttttttgtta 25448775  T
Q  192 aaattatatgtcaatattatattattgg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25448774 aaattatatgtcaatattatattattgg 25448747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Original strand, 1405594 - 1405688
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaat 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1405594 tcatatacattgtagatgtagtagataaaaacaaatctcaatgtatattaaagagaatgaaatatgtgatcccaaatatatgcagatgttggaat 1405688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 33035626 - 33035523
Alignment:
Q  25 tacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctca 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  33035626 tacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatgtcaaagagaataaaacatgtggtctcaaatatatgcagatgctggaattcgaatctca 33035527  T
Q  125 gaca 128  Q
    ||||    
T  33035526 gaca 33035523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Original strand, 10584996 - 10585042
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattatt 217  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  10584996 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatt 10585042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2266727 - 2266682
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  2266727 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 2266682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 12597535 - 12597580
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  12597535 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 12597580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15044682 - 15044637
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  15044682 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 15044637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17202391 - 17202346
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  17202391 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 17202346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17594776 - 17594731
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  17594776 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 17594731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19997623 - 19997578
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  19997623 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 19997578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 28099868 - 28099913
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  28099868 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 28099913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33645901 - 33645856
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  33645901 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 33645856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2005391 - 2005346
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  2005391 tgttacttcattattttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 2005346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3589107 - 3589062
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  3589107 tgttacttcactcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 3589062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3592130 - 3592085
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  3592130 tgttatttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 3592085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3592855 - 3592810
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||    
T  3592855 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttgtattat 3592810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25448708 - 25448663
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  25448708 tgttactttattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 25448663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 42)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 10729473 - 10729673
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  10729473 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatccaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 10729572  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10729573 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 10729672  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  10729673 g 10729673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20874886 - 20874686
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  20874886 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 20874787  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20874786 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 20874687  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  20874686 g 20874686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 34107369 - 34107569
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  34107369 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 34107468  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34107469 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 34107568  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  34107569 g 34107569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34110850 - 34110650
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  34110850 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 34110751  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34110750 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 34110651  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  34110650 g 34110650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 38246896 - 38247096
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  38246896 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 38246995  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38246996 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 38247095  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  38247096 g 38247096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 16526337 - 16526537
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16526337 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 16526436  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16526437 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcgttcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 16526536  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  16526537 g 16526537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 25 - 219
Target Start/End: Original strand, 17373200 - 17373395
Alignment:
Q  25 tacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17373200 tacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctca 17373299  T
Q  125 gacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17373300 gacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 17373395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 33570342 - 33570538
Alignment:
Q  24 atacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33570342 atacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcataccaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctc 33570441  T
Q  124 agacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 219  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33570442 agacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 33570538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 2398973 - 2399171
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  2398973 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 2399072  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2399073 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatc--gtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 2399170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 36 - 219
Target Start/End: Original strand, 14141154 - 14141338
Alignment:
Q  36 tatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacaccacgct 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14141154 tatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgct 14141253  T
Q  136 tattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 219  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14141254 tattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgccaatattatattattgg 14141338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1396187 - 1395987
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  1396187 tcatatacattgcagatgtagcagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatctgcagatgttggaattcgaa 1396088  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1396087 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcagtcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 1395988  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  1395987 g 1395987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5479394 - 5479194
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  5479394 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaataaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgatcccaaatatatgtagatgttggaattcgaa 5479295  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5479294 cctcagacactacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 5479195  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  5479194 g 5479194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 20655080 - 20655280
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  20655080 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 20655179  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20655180 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaattgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 20655279  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  20655280 g 20655280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27648120 - 27647928
Alignment:
Q  28 attgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagac 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  27648120 attgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatacagatgttggaattcgaacctcagac 27648021  T
Q  128 accacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 219  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  27648020 accacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattgttgg 27647928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 25 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29275817 - 29275622
Alignment:
Q  25 tacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctca 124  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29275817 tacattgtagatgtaatagacaaaaacaaatttcaatgcatatcaaagagaatgaaacatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctca 29275718  T
Q  125 gacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 219  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29275717 gacaccacacttattcaccttaaaaatattaacttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 29275622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 33375962 - 33375760
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggt--cctaaatatatgcagatgttggaatttg 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||| |    
T  33375962 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtgtcccaaatatatgcagatgttggaattcg 33375863  T
Q  118 aacctcagacaccacgcttattcacca-aaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33375862 aacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattat 33375763  T
Q  217 tgg 219  Q
    |||    
T  33375762 tgg 33375760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 31 - 219
Target Start/End: Original strand, 6940545 - 6940734
Alignment:
Q  31 gtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacacc 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6940545 gtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcatacacc 6940644  T
Q  131 acgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 219  Q
    || ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6940645 acacttattcacctgaaaaatattaatttttatcaatcgtatgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaacgttatattattgg 6940734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 24223195 - 24223395
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24223195 tcatatacatcgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatgaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 24223294  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  24223295 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattactctttaccaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaagtatatgtcaatgtgatattattg 24223394  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  24223395 g 24223395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 25099267 - 25099467
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  25099267 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctgaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcacaaatatatgcagatgttggaattcgaa 25099366  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25099367 cctcaggcaccacacttattcgccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 25099466  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  25099467 g 25099467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 25158357 - 25158557
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  25158357 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctgaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcacaaatatatgcagatgttggaattcgaa 25158456  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25158457 cctcaggcaccacacttattcgccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 25158556  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  25158557 g 25158557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 44 - 219
Target Start/End: Original strand, 1394541 - 1394717
Alignment:
Q  44 acaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacaccacgcttattcacc 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  1394541 acaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcaaacaccacacttgttcacc 1394640  T
Q  144 -aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 219  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  1394641 ttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaatttatatgtcaatgttatattattgg 1394717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17913907 - 17913740
Alignment:
Q  52 aaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaat 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||  ||||||    
T  17913907 aaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgtagatgttggaattcgaacctcaaataccacacttattcaccttaaaaat 17913808  T
Q  151 attattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17913807 attaatctttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 17913740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 40177239 - 40177120
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  40177239 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatataaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 40177140  T
Q  120 cctcagacaccacgcttatt 139  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  40177139 cctcagacaccacgcttatt 40177120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1395950 - 1395905
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  1395950 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 1395905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 2399210 - 2399255
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  2399210 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 2399255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5479158 - 5479113
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  5479158 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 5479113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 6940768 - 6940813
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  6940768 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 6940813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 10729712 - 10729757
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  10729712 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 10729757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 14141377 - 14141422
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  14141377 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 14141422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 16526577 - 16526622
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  16526577 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 16526622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 17373434 - 17373479
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  17373434 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 17373479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20874647 - 20874602
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  20874647 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 20874602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 24223434 - 24223479
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  24223434 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 24223479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27647888 - 27647843
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  27647888 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 27647843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 33570578 - 33570623
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  33570578 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 33570623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 34107608 - 34107653
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  34107608 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 34107653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34110609 - 34110564
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  34110609 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 34110564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 38247135 - 38247180
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  38247135 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 38247180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40177076 - 40177031
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  40177076 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 40177031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 1394750 - 1394795
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||    
T  1394750 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatggtaatgttatattat 1394795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 25158594 - 25158639
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  25158594 tgttacttcattattttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 25158639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33375723 - 33375678
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  33375723 tgttacttcattattttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 33375678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 41)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 16917919 - 16918119
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16917919 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 16918018  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16918019 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 16918118  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  16918119 g 16918119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 52434822 - 52434622
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  52434822 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 52434723  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52434722 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 52434623  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  52434622 g 52434622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 30824953 - 30825153
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  30824953 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggttccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 30825052  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30825053 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 30825152  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  30825153 g 30825153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 53143293 - 53143493
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  53143293 tcatatacattgtagatataatagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 53143392  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53143393 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 53143492  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  53143493 g 53143493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 12090490 - 12090691
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  12090490 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgtagatgttggaattcgaa 12090589  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattc-accaaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttca-ttcttttgttaaaattatatgtcaatattatattatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12090590 cctcagacaccacgcttattcaaccaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcatttcttttgttaaaattatatgtcaatattatattatt 12090689  T
Q  218 gg 219  Q
    ||    
T  12090690 gg 12090691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 37651864 - 37651664
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  37651864 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatgaaagagaatgaaatatgtggtctcaaatatatgcagatgttggaattcgaa 37651765  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37651764 cctcaaacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 37651665  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  37651664 g 37651664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 31966000 - 31966200
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| || || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  31966000 tcatatacattgtagatttattatacataaataaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 31966099  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31966100 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 31966199  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  31966200 g 31966200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 16904983 - 16905183
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16904983 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 16905082  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16905083 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaattgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatataattg 16905182  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  16905183 g 16905183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 46256232 - 46256032
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  46256232 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattggaa 46256133  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46256132 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtatcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 46256033  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  46256032 g 46256032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 33139502 - 33139702
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  33139502 tcatatacattgtagatttagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaattaaatatgttgtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 33139601  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||  |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33139602 cctcagacaccacatttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtattacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 33139701  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  33139702 g 33139702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 44376110 - 44376310
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  44376110 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcacaaatatatgcagatgttggaattcgaa 44376209  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44376210 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 44376309  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  44376310 g 44376310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 45977021 - 45977221
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45977021 tcatatacatcgtagatgtagtagataaaaataaatatcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaattcgaa 45977120  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45977121 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaattgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 45977220  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  45977221 g 45977221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 31628518 - 31628718
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  31628518 tcatatacattgtagatgttgtagacaaaaacatatctcaatgcatatcaaagagaattaaatatgtggtctcaaatatatgcagatgttggaattcgaa 31628617  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattca-ccaaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31628618 cctcatacaccacacttattcatcttaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 31628717  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  31628718 g 31628718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 35760779 - 35760579
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  35760779 tcatatacattgtagatatagtagataaaaataaatctcaatgtatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 35760680  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||| |||||||  |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  35760679 cctcaaacaccacaattattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatataattg 35760580  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  35760579 g 35760579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 41387324 - 41387124
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||    
T  41387324 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgcagatgctgaaattcgaa 41387225  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41387224 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcgatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 41387125  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  41387124 g 41387124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 38 - 219
Target Start/End: Original strand, 45782478 - 45782660
Alignment:
Q  38 tagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacaccacgctta 137  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45782478 tagtagacaaaaataaatctcaatatatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgaagatgttggaatttgaacctcagacaccacactta 45782577  T
Q  138 ttcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 219  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45782578 ttcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 45782660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 37590835 - 37591035
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  37590835 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaatcaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgcagatgttgaaattcgaa 37590934  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37590935 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcatgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 37591034  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  37591035 g 37591035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 48118565 - 48118762
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  48118565 tcatatacattgtagat---gtagacaaaaataaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 48118661  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48118662 cctcaaacaccacacgtattcaccttaaaaatattaatttttaccaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 48118761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 52098221 - 52098422
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  52098221 tcatatacactgtaaatatagtagacaaaaataaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcaaa 52098320  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatatt-attttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattatt 217  Q
    | |||||||| || ||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52098321 cttcagacacaacacttattcaccttaaaaatattaaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattatt 52098420  T
Q  218 gg 219  Q
    ||    
T  52098421 gg 52098422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 39058388 - 39058588
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||    
T  39058388 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaattttaatatatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatcaagatgttggaattcgaa 39058487  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39058488 cctcagataccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcatgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 39058587  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  39058588 g 39058588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 47142831 - 47143031
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  47142831 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgacatatgtggtctcaaatatatgcagatgttagaattcgaa 47142930  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  47142931 cctcagacaccatgcttattcaccttaaaaatattaatttttatcgattgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatctcaatgttaaattattg 47143030  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  47143031 g 47143031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 54625146 - 54624955
Alignment:
Q  22 atatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacc 121  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54625146 atatacattgtagacgtagtagacaaaaacaaatcttaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacc 54625047  T
Q  122 tcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 219  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||      ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54625046 tcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatca------tgttacttcattc-tttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 54624955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 51 - 217
Target Start/End: Original strand, 50229768 - 50229936
Alignment:
Q  51 caaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||  |||||    
T  50229768 caaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaacatgtggtccaaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccatacttattcaccttaaaaa 50229867  T
Q  150 tatt-attttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattatt 217  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50229868 tattaattttttatcaatagtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattatt 50229936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 83
Target Start/End: Original strand, 50229712 - 50229766
Alignment:
Q  29 ttgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaata 83  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50229712 ttgtagatgtagtagacaaaaaaaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaata 50229766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 12090730 - 12090775
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  12090730 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 12090775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 16905218 - 16905263
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  16905218 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 16905263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 16918158 - 16918203
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  16918158 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 16918203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 30825192 - 30825237
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  30825192 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 30825237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 31966239 - 31966284
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  31966239 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 31966284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 39058622 - 39058667
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  39058622 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 39058667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 45977264 - 45977309
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  45977264 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 45977309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 47143070 - 47143115
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  47143070 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 47143115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 48118802 - 48118847
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  48118802 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 48118847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 52098460 - 52098505
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  52098460 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 52098505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 52434583 - 52434538
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  52434583 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 52434538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 53143534 - 53143579
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  53143534 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 53143579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 54624922 - 54624877
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  54624922 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 54624877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 143
Target Start/End: Original strand, 34684603 - 34684650
Alignment:
Q  96 tatatgcagatgttggaatttgaacctcagacaccacgcttattcacc 143  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  34684603 tatatgcagaggttggaattcgaacctcagacaccccacttattcacc 34684650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 216
Target Start/End: Original strand, 50229979 - 50230021
Alignment:
Q  174 tacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  50229979 tacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 50230021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41387085 - 41387040
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  41387085 tgttacttcattattttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 41387040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 44376347 - 44376392
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  44376347 tgttacttcattattttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 44376392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 42)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3898620 - 3898420
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3898620 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatattaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaatttgaa 3898521  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3898520 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 3898421  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  3898420 g 3898420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12264398 - 12264198
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  12264398 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 12264299  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12264298 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 12264199  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  12264198 g 12264198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 38653958 - 38654158
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  38653958 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 38654057  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38654058 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 38654157  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  38654158 g 38654158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 43363642 - 43363842
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  43363642 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 43363741  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43363742 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 43363841  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  43363842 g 43363842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 49672760 - 49672560
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  49672760 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 49672661  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49672660 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 49672561  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  49672560 g 49672560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 1941751 - 1941951
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  1941751 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 1941850  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1941851 cctcagacatcacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 1941950  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  1941951 g 1941951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21098502 - 21098302
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21098502 tcatatacattgtagatataatagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 21098403  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21098402 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 21098303  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  21098302 g 21098302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34121553 - 34121353
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  34121553 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatacgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 34121454  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34121453 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 34121354  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  34121353 g 34121353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 49506380 - 49506580
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  49506380 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 49506479  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49506480 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtggtacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 49506579  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  49506580 g 49506580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 25 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 54073220 - 54073025
Alignment:
Q  25 tacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54073220 tacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctca 54073121  T
Q  125 gacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 219  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54073120 gacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 54073025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 4584465 - 4584665
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4584465 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaatttgaa 4584564  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4584565 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 4584664  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  4584665 g 4584665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20671447 - 20671247
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  20671447 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 20671348  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20671347 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 20671248  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  20671247 g 20671247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26948996 - 26948796
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  26948996 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 26948897  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26948896 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaacttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 26948797  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  26948796 g 26948796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 36076485 - 36076685
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  36076485 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatattaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 36076584  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    | ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36076585 cttcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 36076684  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  36076685 g 36076685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31488607 - 31488409
Alignment:
Q  22 atatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacc 121  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31488607 atatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgttgtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacc 31488508  T
Q  122 tcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 219  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31488507 tcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttactttattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 31488409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 39146638 - 39146438
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  39146638 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaataaatctcaatgcatatcaaagagaataaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 39146539  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39146538 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 39146439  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  39146438 g 39146438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 45557915 - 45558115
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||    
T  45557915 tcatatatattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaagtatatgcagatgttgaaattcgaa 45558014  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45558015 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtattacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 45558114  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  45558115 g 45558115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24119394 - 24119205
Alignment:
Q  31 gtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacacc 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24119394 gtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatattaaagataatgaaatatatggtcccaaatatatgcagatgttggaattcaaacctcagacacc 24119295  T
Q  131 acgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 219  Q
    || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24119294 acacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 24119205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 49478406 - 49478206
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  49478406 tcatttacattgtagacgtagtagataaaaacaaatctcaatacatatcaaagataatgaaatatgtggtcccaaatatatgcaaatgttggaattcgaa 49478307  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49478306 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttattaaaattatatgtcaatgttatattattg 49478207  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  49478206 g 49478206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 55041614 - 55041820
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  55041614 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggttccaaatatatgcagatgtttgaattcgaa 55041713  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatatta------ttttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattata 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55041714 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatttttatcaatcgtgtgttacttcactcttttgttaaaattatatgtcaatgttata 55041813  T
Q  213 ttattgg 219  Q
    |||||||    
T  55041814 ttattgg 55041820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Original strand, 40014684 - 40014837
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  40014684 tcatatacattgtagatataataaacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 40014783  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtg 172  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40014784 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtg 40014837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 143
Target Start/End: Original strand, 26051334 - 26051457
Alignment:
Q  21 catatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggt-cctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||| |||    
T  26051334 catatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtccccaaatatatgctgaggttggaattcgaa 26051433  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  26051434 cctcagacaccacgcttattcacc 26051457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 146 - 219
Target Start/End: Original strand, 26052236 - 26052309
Alignment:
Q  146 aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26052236 aaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 26052309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 91
Target Start/End: Original strand, 6460199 - 6460269
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcc 91  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6460199 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatacatatcaaa-agaataaaatatgtggtcc 6460269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 1941990 - 1942035
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  1941990 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 1942035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3898381 - 3898336
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  3898381 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 3898336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12264158 - 12264113
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  12264158 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 12264113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20671209 - 20671164
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  20671209 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 20671164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21098262 - 21098217
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  21098262 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 21098217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 26052349 - 26052394
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  26052349 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 26052394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26948732 - 26948687
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  26948732 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 26948687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 31488372 - 31488327
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  31488372 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 31488327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34121314 - 34121269
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  34121314 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 34121269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 38654198 - 38654243
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  38654198 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 38654243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 43363881 - 43363926
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  43363881 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 43363926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 49478167 - 49478122
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  49478167 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 49478122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 49672521 - 49672476
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  49672521 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 49672476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 55041858 - 55041903
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  55041858 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 55041903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 216
Target Start/End: Original strand, 36076723 - 36076766
Alignment:
Q  173 ttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  36076723 ttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 36076766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24119169 - 24119124
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||    
T  24119169 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaaagttatattat 24119124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 39146406 - 39146361
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  39146406 tgttacttcattattttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 39146361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 45558153 - 45558198
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  45558153 tgttacttcatttttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 45558198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 31)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 41663435 - 41663235
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  41663435 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 41663336  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41663335 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 41663236  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  41663235 g 41663235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 41664708 - 41664508
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  41664708 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 41664609  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41664608 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 41664509  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  41664508 g 41664508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6120750 - 6120550
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  6120750 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 6120651  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6120650 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaactatatgtcaatattatattattg 6120551  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  6120550 g 6120550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18351749 - 18351549
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18351749 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 18351650  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18351649 cctcaaacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 18351550  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  18351549 g 18351549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 44902279 - 44902080
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  44902279 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 44902180  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44902179 cctcagacaccacgcttattcacaaaaaaaatataatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 44902080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 19596394 - 19596594
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  19596394 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatattaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 19596493  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  19596494 cctcagacaccacgcttattcaccttaaaaatattaatttttatcaattgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttaaattattg 19596593  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  19596594 g 19596594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20545023 - 20544827
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  20545023 tcatatacattgtagatatggtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttagaattcgaa 20544924  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatta 215  Q
    ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20544923 cctaaaacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtggtacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatta 20544827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31424207 - 31424007
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  31424207 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgtagatgttggaattcgaa 31424108  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31424107 cctcatacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaattgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 31424008  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  31424007 g 31424007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 42442162 - 42441958
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttgg------aa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      ||    
T  42442162 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 42442063  T
Q  114 tttgaacctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattata 212  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42442062 ttcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatc--gtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattata 42441965  T
Q  213 ttattgg 219  Q
    |||||||    
T  42441964 ttattgg 42441958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8700459 - 8700259
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  8700459 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatttcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 8700360  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||| |||||||  || ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8700359 cctcatacaccacattttttcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 8700260  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  8700259 g 8700259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 36279485 - 36279685
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  36279485 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatatcaatgtatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 36279584  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
     |||||| ||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36279585 tctcagataccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 36279684  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  36279685 g 36279685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 219
Target Start/End: Original strand, 26231292 - 26231490
Alignment:
Q  22 atatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacc 121  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  26231292 atatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatttcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtctcaaatatattcagatgttggaattcgaacc 26231391  T
Q  122 tcagacaccacgcttattca-ccaaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 219  Q
    ||||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26231392 tcagacaccacacttattcatcttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 26231490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 218
Target Start/End: Original strand, 34007742 - 34007939
Alignment:
Q  22 atatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacc 121  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  34007742 atatccattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtagtcccaaatatatgccgatgttggaattcgaacc 34007841  T
Q  122 tcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34007842 tcagacaccacacttatccaccttaaaaatattaatttttataaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 34007939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 42055395 - 42055197
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  42055395 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaataggtgatcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 42055296  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||    
T  42055295 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaagat--tatgtcaatgttatattattg 42055198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 999262 - 999462
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  999262 tcatatactttgtagatgtagtagataaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgtagatgttggaattcgaa 999361  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  999362 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 999461  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  999462 g 999462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16215012 - 16214822
Alignment:
Q  30 tgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacac 129  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||  ||||    
T  16215012 tgtagatgtagtagacaaaaataaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtccaaaatatatgcaaatgtaggaattcgaacctctaacac 16214913  T
Q  130 cacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 219  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  16214912 cacacttattcaccttaaaaatattaatttttattaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcagtgttacattattgg 16214822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 149
Target Start/End: Original strand, 27944827 - 27944956
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  27944827 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 27944926  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27944927 cctcagacaccacgcttattcacaaaaaaa 27944956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Original strand, 692233 - 692356
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  692233 tcatatacattgtaaatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatatggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 692332  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc 143  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  692333 cctcagacaccacacttattcacc 692356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 19596634 - 19596679
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19596634 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgttaatgttatattat 19596679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6120510 - 6120465
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  6120510 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 6120465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16214784 - 16214739
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  16214784 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 16214739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18351510 - 18351465
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  18351510 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 18351465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 26231527 - 26231572
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  26231527 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 26231572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 31423967 - 31423922
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  31423967 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 31423922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 34007980 - 34008025
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  34007980 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 34008025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41663195 - 41663150
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  41663195 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 41663150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 42441919 - 42441874
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  42441919 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 42441874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 999500 - 999545
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  999500 tgttacttcattattttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 999545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 36279723 - 36279768
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  36279723 tgttatttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 36279768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41664469 - 41664424
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||    
T  41664469 tgttacttcattcttttataaaaattatatgttaatgttatattat 41664424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 44902041 - 44901996
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  44902041 tgttaattcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 44901996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4266579 - 4266379
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  4266579 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 4266480  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4266479 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 4266380  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  4266379 g 4266379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 34888717 - 34888917
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  34888717 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 34888816  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34888817 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 34888916  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  34888917 g 34888917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 38913778 - 38913978
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  38913778 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 38913877  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38913878 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 38913977  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  38913978 g 38913978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 50151258 - 50151058
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  50151258 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 50151159  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50151158 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 50151059  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  50151058 g 50151058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 2951397 - 2951597
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  2951397 tcatatacattgtaaatataataaacaaaaaaaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 2951496  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2951497 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 2951596  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  2951597 g 2951597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 1231994 - 1231813
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  1231994 tcatatacattgtaaatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 1231895  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1231894 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatat 1231813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 22 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7334140 - 7333942
Alignment:
Q  22 atatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacc 121  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  7334140 atatagatggtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcaaacc 7334041  T
Q  122 tcagacaccacgcttattcacca-aaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 219  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7334040 tcagacaccacacttattcaccataaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 7333942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 9216229 - 9216029
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  9216229 tcatatacattgtagatatagtagataaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 9216130  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9216129 cctcagacaccacacttatttaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 9216030  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  9216029 g 9216029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 23482738 - 23482938
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  23482738 tcatatacattgtagatgtagtagacaaatacaaatctcaatgcatatcaaagagcatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 23482837  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23482838 cctcatacaccacacttattcacctgaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaacgttatattattg 23482937  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  23482938 g 23482938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 35614265 - 35614065
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  35614265 tcatatacattgtaaatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 35614166  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    | | ||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  35614165 cttaagacaccacacttattcacctgaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgtcatattattg 35614066  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  35614065 g 35614065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 18706540 - 18706739
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18706540 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatcttaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcc-aaatatatgcagatgttggaattcgaa 18706638  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18706639 cctcatacaccacacttattcacctgaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgtaacttcattcttttgttaaaattatatgtcaacgttatattattg 18706738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 38444829 - 38444629
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  38444829 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttgaaattcgaa 38444730  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    | ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38444729 cttcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaataatgtgttacttcattcttttgataaaattatatgtcaatgttatattattg 38444630  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  38444629 g 38444629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 29 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 39728169 - 39727978
Alignment:
Q  29 ttgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagaca 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39728169 ttgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagaca 39728070  T
Q  129 ccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 219  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39728069 ccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 39727978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 35615005 - 35614818
Alignment:
Q  28 attgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagac 127  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35615005 attgtaaatgtagtagacaaaaacaaatcttaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtctcaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagac 35614906  T
Q  128 accacgcttattcaccaaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatta 215  Q
    ||||| |||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  35614905 accacacttatttaccttaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgtcatatta 35614818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 52687145 - 52687340
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  52687145 tcatatacattgtagatgtagtatacaaaaacaaatctcaatgcctatgaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaatccgaa 52687244  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatta 215  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  52687245 cctca-acaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcatttttttattaaaattatatgtcaatgttatatta 52687340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 18855264 - 18855463
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||    
T  18855264 tcatatacattgtagatgcagtagacaaat-caaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgtagatgttgaaattcgaa 18855362  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18855363 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcatgtattacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 18855462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 50326199 - 50326070
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  50326199 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 50326100  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50326099 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaa 50326070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 144
Target Start/End: Original strand, 31018231 - 31018355
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  31018231 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 31018330  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacca 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  31018331 cctcagacaccacgcttattcacca 31018355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 32 - 219
Target Start/End: Original strand, 19764593 - 19764782
Alignment:
Q  32 tagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacacca 131  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  19764593 tagatgtagtatacaaaaacaaatctcaatgcatattaaaaagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcaaatgtttgaattcgaacctcagacacca 19764692  T
Q  132 cgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaat-attatattattgg 219  Q
    | ||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  19764693 cacttattcaccttaaaaatattaatttttatgaatcgtgtgttacttcattattttgttaaaattacatgtcaatgtttatattattgg 19764782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19768602 - 19768462
Alignment:
Q  80 aatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacaccacgcttattcacca-aaaaatattattttttatcaatcgtgtgttactt 178  Q
    |||||||||| | ||||| ||| |||||||| | || |||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19768602 aatatgtggttccaaatacatgtagatgttgaatttcgaacctcagacaccacacttattcatcttaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttactt 19768503  T
Q  179 cattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19768502 cattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 19768462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 84 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 2590468 - 2590333
Alignment:
Q  84 tgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacaccacgcttattcacca-aaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcatt 182  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  2590468 tgtggttccaaatatatgcagatgttcgaattc-aacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcatt 2590370  T
Q  183 cttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2590369 cttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 2590333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 5061419 - 5061335
Alignment:
Q  22 atatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagat 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5061419 atatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagat 5061335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 29942216 - 29942153
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaata 83  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29942216 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaata 29942153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1231768 - 1231723
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  1231768 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 1231723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 2951636 - 2951681
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  2951636 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 2951681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4266340 - 4266295
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  4266340 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 4266295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 18706773 - 18706818
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  18706773 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 18706818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 19764814 - 19764859
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  19764814 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 19764859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19768425 - 19768380
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  19768425 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 19768380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 23482972 - 23483017
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  23482972 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 23483017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35614027 - 35613982
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  35614027 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaattttatattat 35613982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35614777 - 35614732
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  35614777 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 35614732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 38914017 - 38914062
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  38914017 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 38914062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 52036310 - 52036355
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  52036310 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 52036355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7333903 - 7333861
Alignment:
Q  174 tacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  7333903 tacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 7333861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 38444592 - 38444547
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  38444592 tgttaattcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 38444547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 52687381 - 52687426
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  52687381 tgttgcttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 52687426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 149081 - 149281
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  149081 tcatataaattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 149180  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 218  Q
    | ||| |||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  149181 catcaaacacaacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaacgttatattattg 149280  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  149281 g 149281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 149318 - 149363
Alignment:
Q  171 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  149318 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 149363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19542 - 19345
Alignment:
Q  23 tatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacct 122  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19542 tatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatattaaagataattaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacct 19443  T
Q  123 cagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 219  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19442 cagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 19345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0836 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0836
Description:

Target: scaffold0836; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 141
Target Start/End: Original strand, 5310 - 5430
Alignment:
Q  21 catatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaac 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5310 catatacattgtagatataatagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaac 5409  T
Q  121 ctcagacaccacgcttattca 141  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5410 ctcagacaccacgcttattca 5430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 141
Target Start/End: Original strand, 6092 - 6213
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  6092 tcatatacattgtagatgttgtagacaaaaacatatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtctcaaatatatgcagatgttggaattcgaa 6191  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattca 141  Q
    ||||| ||||||| ||||||||    
T  6192 cctcaaacaccacacttattca 6213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 141
Target Start/End: Original strand, 6102 - 6223
Alignment:
Q  20 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  6102 tcatatacattgtagatgttgtagacaaaaacatatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtctcaaatatatgcagatgttggaattcgaa 6201  T
Q  120 cctcagacaccacgcttattca 141  Q
    ||||| ||||||| ||||||||    
T  6202 cctcaaacaccacacttattca 6223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University