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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF10865A_low_290 (Length: 245)
Name: NF10865A_low_290
Description: NF10865A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF10865A_low_290 |
 |  |
|
| [»] chr5 (60 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr6 (57 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr1 (49 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr3 (79 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr8 (73 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr7 (63 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr4 (59 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0622 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0240 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0251 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0692 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0116 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0034 (3 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0011 (5 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0044 (3 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0032 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0673 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0480 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0234 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0078 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0037 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0008 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0359 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr2 (56 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0023 (3 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0021 (4 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0001 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0395 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0103 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0028 (3 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0383 (3 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0190 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0302 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0124 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0162 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0106 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0083 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0761 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0315 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0025 (3 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0003 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold1140 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0031 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0597 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0338 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold1404 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0195 (4 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0138 (6 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0107 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0018 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0218 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0141 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0407 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0132 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0465 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0184 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0076 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0012 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0447 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0068 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold1753 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0434 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0610 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0026 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0213 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0396 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0009 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0051 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0022 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0104 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0462 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0467 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0413 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0039 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0269 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0225 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0498 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0750 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0483 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0266 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0215 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0109 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0342 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1560 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0589 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0120 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0004 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0183 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0772 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0150 (4 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0014 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0808 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0092 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0058 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0244 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0158 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0125 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold2147 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0507 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0095 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1734 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0346 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0066 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0521 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0243 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0456 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0090 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0327 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1752 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0016 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 60)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21652877 - 21652690
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21652877 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
21652778 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21652777 |
aagaaaacatgttcatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
21652690 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Original strand, 21392874 - 21393061
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21392874 |
gtacaaggactccataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaaaacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
21392973 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21392974 |
aagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
21393061 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 11582564 - 11582747
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11582564 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaaga |
11582663 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11582664 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
11582747 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1170129 - 1169949
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1170129 |
gactcgataacgcgacaacaatccaaaattttcacctcaatatataggagaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
1170030 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1170029 |
catgtccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
1169949 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 7424367 - 7424548
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
7424367 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
7424464 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7424465 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacccatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
7424548 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Original strand, 20710823 - 20711009
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
20710823 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggagaacacccaattatattgattatctccacaacattcgcattatc |
20710922 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| || || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20710923 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatcacaca-tcacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
20711009 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Original strand, 28258286 - 28258474
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
28258286 |
gtacaaggactcgataatgcgacgacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattacctccacaaca-ttgcattatc |
28258384 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaa-catgattatcaataatcaac-aatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || || ||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
28258385 |
aagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaatcatgattatcattaatcaacaaatgtcattcaacat |
28258474 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17473360 - 17473177
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17473360 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaaga |
17473261 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17473260 |
aaacatgcttatacacaattaaatcatagtattcaccatcacactccaacatgattatcaataatcaacaacatcattcaacat |
17473177 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1221319 - 1221139
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1221319 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaacttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
1221221 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1221220 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
1221139 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22368072 - 22367892
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22368072 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
22367974 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22367973 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
22367892 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 11341326 - 11341507
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
11341326 |
aaggactcaataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
11341423 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| || || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11341424 |
aaacatgctcatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
11341507 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21075077 - 21074897
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
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| T |
21075077 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
21074979 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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| T |
21074978 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcgttcaacat |
21074897 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
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Target Start/End: Complemental strand, 4201554 - 4201373
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Q |
| |
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4201457 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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4201456 |
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T |
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Target: chr5; HSP #14
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Target Start/End: Original strand, 23513486 - 23513669
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161 |
Q |
| |
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatatccacaaca-ttgcattatcaaga |
23513584 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattca-caataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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23513585 |
aaacatgcccacacacaaatagatcatagtaatcaccattcacacaataacttgattatcaacaatcaacaatgtcattcaacat |
23513669 |
T |
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Target: chr5; HSP #15
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Target Start/End: Complemental strand, 24184681 - 24184501
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164 |
Q |
| |
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|
| T |
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gactcgataatgcgacaacaatacacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
24184582 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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|
|
| T |
24184581 |
catgtccatacacaaccaaatcatggaattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
24184501 |
T |
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Target: chr5; HSP #16
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Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25192586 - 25192404
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161 |
Q |
| |
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| T |
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aaggactcgataatgcgacaacaaac-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaaga |
25192488 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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| T |
25192487 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacctcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
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T |
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Target: chr5; HSP #17
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Target Start/End: Original strand, 11044 - 11219
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165 |
Q |
| |
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| T |
11044 |
actcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaac |
11141 |
T |
 |
| Q |
166 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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| T |
11142 |
atgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
11219 |
T |
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Target: chr5; HSP #18
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
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| T |
9732252 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaa |
9732155 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9732154 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
9732074 |
T |
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Target: chr5; HSP #19
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Target Start/End: Original strand, 16534999 - 16535178
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
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| T |
16534999 |
gacttgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
16535097 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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||||| |||| ||| || ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
16535098 |
catgcccatatacaatcaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
16535178 |
T |
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Target: chr5; HSP #20
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Target Start/End: Complemental strand, 22884771 - 22884588
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161 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatca-ttgcattatcaaga |
22884673 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaat-aacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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22884672 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacatcaacatgatcatcaataatccacaatgttattcaacat |
22884588 |
T |
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Target: chr5; HSP #21
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Query Start/End: Original strand, 66 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29192203 - 29192028
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165 |
Q |
| |
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|
| T |
29192203 |
actcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaac |
29192106 |
T |
 |
| Q |
166 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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|||| || || |||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29192105 |
atgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
29192028 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
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Q |
| |
|
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|
| T |
110572 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatacaggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
110474 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| || ||||||||||||| || || | | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
110473 |
aaacatgcccatacacaatcaaatcatagtattcaccatcacacctcaacatgattattaataatcaacaatgtcatccaacat |
110390 |
T |
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Target: chr5; HSP #23
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actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
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Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4863961 |
actcaataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaac |
4864059 |
T |
 |
| Q |
166 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4864060 |
atgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
4864140 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
10779767 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatatatgataacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
10779669 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| ||||| |||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10779668 |
aaacatgccc--acacaaataaatcataatattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
10779587 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
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|
| T |
18779583 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatatatgacgacaaccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
18779486 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaa-catgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18779485 |
aaacatgtccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacccatcaatcatgattatcgataatcaacaatgtcattcaacat |
18779401 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
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aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
43445244 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaat-aacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || | | ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
43445243 |
aaacatgcccatacacaaataa-tcatagtattcaccatcatcacatcaacatgatcatcaataatccacaatgatattcaacat |
43445160 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21234994 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
21234897 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| || || | | ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21234896 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacat |
21234813 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
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gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
23510676 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttctacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatc |
23510774 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatg |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | |||| ||| |||||| |||| || ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23510775 |
aagaaaacatgcccacatgcaattaaatcatagcattc---atcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatg |
23510849 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
20615305 |
gactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaa |
20615402 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
238 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| || || | | ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20615403 |
catgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaataatcaacaatgtcat |
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T |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24595191 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
24595288 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaa |
242 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24595289 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcattcaa |
24595367 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
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Target Start/End: Original strand, 21649523 - 21649702
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164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21649523 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggataacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
21649621 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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||||| ||| | || ||| |||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
21649622 |
catgcccattcataattaaatcatagtattcatcattacacatcaacatgattatcaataatcaacgatgtcattcaacat |
21649702 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 23327643 - 23327822
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161 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
23327643 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
23327740 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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||||||| | || ||||||| |||||||||||| || || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23327741 |
aaacatgtcc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
23327822 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 25425312 - 25425490
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161 |
Q |
| |
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|
|
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25425312 |
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25425409 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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|| ||||| || || |||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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25425490 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #34
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Target Start/End: Complemental strand, 35792719 - 35792544
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164 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
35792621 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
241 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
35792620 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacactccaacatgattatcaataatcaacaacatcattca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 37051677 - 37051855
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| Q |
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
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|
| T |
37051677 |
gactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaa |
37051774 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| || || | | ||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||| |
|
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catgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacgtaattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacat |
37051855 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #36
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Target Start/End: Original strand, 19498490 - 19498659
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| Q |
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Q |
| |
|
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| T |
19498490 |
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19498587 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtc |
236 |
Q |
| |
|
|| ||||| || || |||||| ||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
19498588 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21933748 - 21933570
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| Q |
62 |
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161 |
Q |
| |
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| T |
21933748 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
21933651 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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|
| T |
21933650 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attagcaataatcaacaatgtcactcaacat |
21933570 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21939918 - 21939740
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| Q |
62 |
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161 |
Q |
| |
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|
|
| T |
21939918 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
21939821 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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|
|
| T |
21939820 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attagcaataatcaacaatgtcactcaacat |
21939740 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 35580944 - 35581122
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| Q |
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
35580944 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
35581041 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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|
|
| T |
35581042 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attagcaataatcaacaatgtcactcaacat |
35581122 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 37010752 - 37010574
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| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
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|
| T |
37010752 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
37010655 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| ||||||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
37010654 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcgtcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacat |
37010574 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27185301 - 27185121
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65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gactcgataatgcgacaacaatc-acaattctcaccacaatatataggacaatacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
27185203 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||| ||| |||||| ||||| | ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
27185202 |
catgtctatacacaattaaatcatagcattcatcttcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacat |
27185121 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 60 - 245
Target Start/End: Original strand, 19404268 - 19404454
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159 |
Q |
| |
|
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| T |
19404268 |
acaaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgttcatctccaccacatttgcattatcaa |
19404367 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataac-ccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
19404368 |
gaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
19404454 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 60 - 242
Target Start/End: Original strand, 23453638 - 23453821
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60 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
159 |
Q |
| |
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|
|
| T |
23453638 |
acaaggactcaataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaa |
23453737 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaa |
242 |
Q |
| |
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|
| T |
23453738 |
gaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcaccacatcaacatgatcatcaaaaaccaacaatgtcattcaa |
23453821 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 60 - 242
Target Start/End: Original strand, 23465143 - 23465326
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60 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
159 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
23465143 |
acaaggactcaataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaa |
23465242 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaa |
242 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| || ||| ||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
23465243 |
gaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcaccacatcaacatgatcatcaaaaaccaacaatgtcattcaa |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 25901911 - 25901741
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164 |
Q |
| |
|
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|
| T |
25901911 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctcctcaaca-ttgcattactaagaaaa |
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T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
237 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||||||| || || | | ||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25901813 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaataattaacaatgtca |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #46
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Query Start/End: Original strand, 70 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11213183 - 11213010
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gataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgc |
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Q |
| |
|
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| T |
11213183 |
gataatgcgaca-caatc-acaattttcaacacaatatataggacgacacccaattatattgttcatcacaacatcatttgcattatcaagaaaacatgc |
11213086 |
T |
 |
| Q |
170 |
tcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
| || ||| || |||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11213085 |
ccgcacacaattagatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
11213010 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
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gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11338341 |
gtacaaagactcgataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggaca-attccatatatattgatcatctccacaacatttgcattatc |
11338243 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataac-ccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
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Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
11338242 |
aagaaaacatgtccatacataatcaaatcataagattcatcatcactacatcaacatgattatcaataatcaacaaggtcattcaacat |
11338154 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 196
Target Start/End: Original strand, 27008705 - 27008834
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| |
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| T |
27008705 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccaccaca-ttgcattaccaagaaaa |
27008802 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattca |
196 |
Q |
| |
|
||||| |||| || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
27008803 |
catgcccatatacagttaaatcatagtattca |
27008834 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 222
Target Start/End: Original strand, 24474367 - 24474443
Alignment:
| Q |
146 |
atttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaa |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| || || ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24474367 |
atttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaa |
24474443 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 163
Target Start/End: Original strand, 7727296 - 7727369
Alignment:
| Q |
90 |
caattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7727296 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccataacatttgcattatcaagaaa |
7727369 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1169837 - 1169801
Alignment:
| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1169837 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
1169801 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17473064 - 17473028
Alignment:
| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17473064 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
17473028 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 43445049 - 43445013
Alignment:
| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43445049 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
43445013 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 160
Target Start/End: Original strand, 3672685 - 3672780
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
3672685 |
gactcgataatgcgatatcacatcacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaagtatattgatcatctccacaacaattgcattatcaag |
3672780 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 115
Target Start/End: Original strand, 24470996 - 24471045
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggaca |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
24470996 |
gactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaatatataggaca |
24471045 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 163
Target Start/End: Original strand, 23492722 - 23492794
Alignment:
| Q |
90 |
caattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23492722 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccacaacattt-cattatcaagaaa |
23492794 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 32967608 - 32967547
Alignment:
| Q |
102 |
caatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32967608 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
32967547 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 37189561 - 37189501
Alignment:
| Q |
102 |
caatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
162 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
37189561 |
caatataaaggacaacctccaaatatattgatcatttccacaacatttgcatcatcaagaa |
37189501 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 163
Target Start/End: Original strand, 431149 - 431221
Alignment:
| Q |
91 |
aattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| | |||||| | |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
431149 |
aattttcacaacaatacaaaggacaacttccaaatatattgatcacctccacaacatttgcattatcaagaaa |
431221 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 162
Target Start/End: Original strand, 28888649 - 28888709
Alignment:
| Q |
102 |
caatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
162 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | |||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28888649 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgatcatatccactacatttgcattatcaagaa |
28888709 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 57)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Original strand, 18431322 - 18431509
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18431322 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
18431421 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18431422 |
aagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
18431509 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18004448 - 18004261
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18004448 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttccacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
18004349 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18004348 |
aagaaaacatgtccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
18004261 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25646302 - 25646115
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25646302 |
gtacaaggacttgataatgcgacaacaatccacaatttccacctcaatatataggacaacacccaattttattgattatctccacaacatttgcattatc |
25646203 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
25646202 |
aaggaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaataatgtcattcaacat |
25646115 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 35017152 - 35016969
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35017152 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaaga |
35017054 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35017053 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagcattcatcatcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
35016969 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15736656 - 15736469
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15736656 |
gtacacggactcgataatgcgaccacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatc |
15736557 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15736556 |
aagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
15736469 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 18569280 - 18569462
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18569280 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaaga |
18569378 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
18569379 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttattcaacat |
18569462 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27655555 - 27655375
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
27655555 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatttccacaaca-ttgcattatcaaga |
27655457 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27655456 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
27655375 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 62 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18088182 - 18088003
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18088182 |
aaggactcgataatgcaacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
18088084 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaa |
242 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18088083 |
aaacatgcccacacacaaataaatcatagtattcaccatcacccatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaa |
18088003 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 31627134 - 31627314
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31627134 |
gactcgataatgcgacaccaattcacaattttcaccacaatatataggacaatccccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
31627233 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| || |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31627234 |
catgtccatacacaaacaaatcatagtattcatcaccacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
31627314 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 32897419 - 32897599
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| | | ||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
32897419 |
gactcgataatgcgacaacaattcccaattttcaccacaatatataggacaactctcaattttattgatcatctccacaacatttacattatcaagaaaa |
32897518 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| |||| ||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32897519 |
catgcccatacacaaataattcatggtattcatcatcacacattaatatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
32897599 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 66 - 244
Target Start/End: Original strand, 11214836 - 11215014
Alignment:
| Q |
66 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
165 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11214836 |
actctataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatttccacaaca-ttgcattatcaagaaaac |
11214934 |
T |
 |
| Q |
166 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattca-caataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaaca |
244 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||| |||||||||||| || | || || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11214935 |
atgcccacacacaaatagatcatagtattcaccattcacacaataacttgattatcaacaatcaacaatgtcattcaaca |
11215014 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16827346 - 16827164
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16827346 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgtattatcaaga |
16827248 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| || || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16827247 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
16827164 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 16230278 - 16230456
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
16230278 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaa |
16230375 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16230376 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
16230456 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 23976263 - 23976443
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23976263 |
aaggactcgataatgcggcaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagc |
23976361 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23976362 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcagcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
23976443 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 33316050 - 33315870
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
33316050 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
33315952 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
33315951 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacatccacatgattatcaataatcaaccatgtcatgcaacat |
33315870 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 16105254 - 16105435
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16105254 |
gactcgataacgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
16105353 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaa-catgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| | || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16105354 |
catgcccatacacaattaaatcatagtattcatcaccacacatcaatcatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
16105435 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 4989591 - 4989771
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
4989591 |
aaggactcgataatgcgacaacaattaacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
4989689 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||| |||||| || || | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
4989690 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagcattcaccatcacacctcaacatgattatcaataatcaacaatgtcatccaacat |
4989771 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 66 - 245
Target Start/End: Original strand, 25174253 - 25174428
Alignment:
| Q |
66 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
165 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
25174253 |
actcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacactcaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaac |
25174350 |
T |
 |
| Q |
166 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25174351 |
atgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
25174428 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13622589 - 13622401
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13622589 |
gtacacggactcgataatgcaaccacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaactcccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
13622490 |
T |
 |
| Q |
158 |
aag-aaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
13622489 |
aagaaaaacatgtccatacacaaataaatcatagtattcatcaccacacattatcatgattattactaatcaacaacatcattcaacat |
13622401 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 18775907 - 18776084
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18775907 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
18776005 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| |||| || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
18776006 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattc---atcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacat |
18776084 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 16239057 - 16239241
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaa-tccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
160 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16239057 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacaccaaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaag |
16239155 |
T |
 |
| Q |
161 |
aaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattca-caataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||| || || |||||| |||| ||||||| || | || || |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16239156 |
aaaacatgcccacacacaaatagatcatcgtattcaccattcacacaataacttgattatcaacaatcaataatgtcattcaacat |
16239241 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1659182 - 1658999
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1659182 |
aaggactcgataatgtgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
1659084 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattca-caataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || | | ||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
1659083 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcatcacatcaacatggtcatcaataatcaacaatgttattcaacat |
1658999 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 10487573 - 10487751
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
10487573 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
10487670 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
10487671 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacat |
10487751 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16377754 - 16377576
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16377754 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
16377657 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16377656 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacat |
16377576 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16385078 - 16384900
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16385078 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
16384981 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16384980 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacat |
16384900 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 23151956 - 23152135
Alignment:
| Q |
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23151956 |
gactcgataatgcgacaataatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatactgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
23152054 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||| | | |||||||||||| | || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23152055 |
catgctcattcacaattgaatcatagtattcatcctcacacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
23152135 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
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| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | |||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
14628079 |
aaggactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagg |
14627982 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14627981 |
aaacatgcccatacacaattacatcataacattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
14627898 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 235
Target Start/End: Original strand, 15861425 - 15861593
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
15861425 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattt-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaggaaa |
15861521 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgt |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||| |||||||||||| || ||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15861522 |
catgctcacacacaaataaatcatagtattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaacaatcaacaatgt |
15861593 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 65 - 214
Target Start/End: Original strand, 18128981 - 18129129
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
18128981 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccgattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaaggaaa |
18129079 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatg |
214 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
18129080 |
catgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacattaacatg |
18129129 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17343754 - 17343578
Alignment:
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62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
17343754 |
aaggactcgataatgcgacaacaatacacaatatcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagc |
17343656 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| || || | |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
17343655 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacataataacttgattatcaacaatcaacaatatcattca |
17343578 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19984671 - 19984493
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19984671 |
gactagataattcgacaacaatc-acaattt-ctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatttccacatcatttgcattatcaagaaaa |
19984574 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19984573 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacat |
19984493 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 18397622 - 18397803
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18397622 |
gactcgataatgcgacaacaatctacaattttcaccacaatatatagggcaactcccaattatattgattatccccacaacattttcattatcaagaaaa |
18397721 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| || ||| || ||| ||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18397722 |
catgtccatacacaatcaattcataatactcatcatcaccacatcaatatgatcatcaatactcaacaatgtcattcaacat |
18397803 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #33
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Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16557483 - 16557304
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| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16557483 |
aaggactcgataatacgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaagtatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
16557386 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| || || ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16557385 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttaccaataatcaacaatgtcatccaacat |
16557304 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16650713 - 16650534
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| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16650713 |
aaggactcgataatacgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaagtatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
16650616 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| || || ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16650615 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttaccaataatcaacaatgtcatccaacat |
16650534 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
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Target Start/End: Complemental strand, 13016260 - 13016123
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13016260 |
gtacaaggactcgataatgcgactacaatccataattttcacctcaatatataggtctatatccaattatattgattacctccacaaca-ttgcattatc |
13016162 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattca |
196 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
13016161 |
aagaaaacatgcccatacacaattaattcatagtattca |
13016123 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29870943 - 29870763
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| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacc-caattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
29870943 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacaacaccaccattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaag |
29870846 |
T |
 |
| Q |
161 |
aaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||| | || ||||||| |||||||||||| | || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
29870845 |
aaaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcctcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcatccaacat |
29870763 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Original strand, 23993858 - 23994032
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
23993858 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
23993955 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
241 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||||||||| || || || ||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
23993956 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacaacaacttgattatcaacaatcaacaatatcattca |
23994032 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 26088532 - 26088710
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| | |||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
26088532 |
gactcgataatgcaacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaag |
26088629 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
26088630 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcatccaacat |
26088710 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 66 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18825225 - 18825049
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| Q |
66 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
165 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||| |||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
18825225 |
actcgataatgcgacaacaaac-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattattcatctccacatcatt-gcattatcaagaaa-c |
18825129 |
T |
 |
| Q |
166 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| || || | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
18825128 |
atgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacctcaacatgattatcaataatcaacaatttcattcaacat |
18825049 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 66 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18843286 - 18843109
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| Q |
66 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
165 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| | ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
18843286 |
actcgataatgcgacgacaaac-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattataatgttcatctccacatcatt-gcattatcaagaaaac |
18843189 |
T |
 |
| Q |
166 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||| ||||||||||||| || || | | |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
18843188 |
atgctcatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacctcaacatgattatcaaaaatcaacaattttattcaacat |
18843109 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #41
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Query Start/End: Original strand, 62 - 183
Target Start/End: Original strand, 19609191 - 19609310
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| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
19609191 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
19609288 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataa |
183 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
19609289 |
aaacatgcccatacacaaataa |
19609310 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 22430944 - 22431124
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22430944 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaatttaaaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
22431042 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| || || ||| ||| |||||| ||| | || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
22431043 |
catgtccacacacaattaaatcatagcattaatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattctacat |
22431124 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #43
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Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1651420 - 1651239
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| Q |
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
1651420 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgatcatctccacaacatt-gcattaccaagg |
1651323 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| || |||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
1651322 |
aaacatgtccacacacaattatatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacat |
1651239 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #44
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164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1554536 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattt-ctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccgcatcatttgcattatcaagaaaa |
1554633 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaat |
233 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
1554634 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaat |
1554703 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #45
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65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16084112 |
gactcgataatgcgaaaacaattcacaattttctccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
16084211 |
T |
 |
| Q |
165 |
catg |
168 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
16084212 |
catg |
16084215 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
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103 |
aatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataa |
202 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||||||||||||||| | || | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || | |
|
|
| T |
25745763 |
aataaataggacaacacccaattatattgttcatctacacatcatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatca |
25745664 |
T |
 |
| Q |
203 |
cc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25745663 |
ccacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
25745620 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
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| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
22227111 |
aaggactcgaaaatgcgacaacaattcacaatctcaaactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
22227013 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||| || || ||||||| ||| |||| ||| || || | | ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22227012 |
aaacatatccacacacaaataaatcaaagtactcatcatcacacgtcaacatatttatcagtaatcaacaatgtcatccaacat |
22226929 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #48
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Query Start/End: Original strand, 60 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 28196255 - 28196147
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60 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
159 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || |||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
28196255 |
acaaagactcgataatgcgacaacactccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaccaattgcattatcaa |
28196156 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaaaacatg |
168 |
Q |
| |
|
|||| |||| |
|
|
| T |
28196155 |
gaaatcatg |
28196147 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 65 - 168
Target Start/End: Original strand, 22866864 - 22866967
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22866864 |
gactcaataatgcgaaatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaataaattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
22866963 |
T |
 |
| Q |
165 |
catg |
168 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
22866964 |
catg |
22866967 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 25368827 - 25368728
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaa-ttttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
25368827 |
gactcgataatgcgacatcactccacaaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaagaaa |
25368728 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 163
Target Start/End: Original strand, 15738945 - 15739043
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | ||||||||| ||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15738945 |
gactcgataatgcgacatcacttcacaatttttaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattaccaagaaa |
15739043 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 123
Target Start/End: Original strand, 18741146 - 18741203
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaa |
123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
18741146 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaa |
18741203 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 245
Target Start/End: Original strand, 1554828 - 1554864
Alignment:
| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1554828 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
1554864 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 211 - 245
Target Start/End: Original strand, 16084923 - 16084957
Alignment:
| Q |
211 |
catgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16084923 |
catgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
16084957 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 163
Target Start/End: Original strand, 33323532 - 33323605
Alignment:
| Q |
90 |
caattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
33323532 |
caattttcacaacaatataaaggacatcttccaaatatattgatcatctccacaacattcgcattatcaagaaa |
33323605 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 35137399 - 35137326
Alignment:
| Q |
90 |
caattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
35137399 |
caattttcacaacaatataaaggacatcttccaaatatattgatcatctccacaacattcgcattatcaagaaa |
35137326 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 16889183 - 16889122
Alignment:
| Q |
102 |
caatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | |||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16889183 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacatcatttgcattatcaagaaa |
16889122 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 49)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22407676 - 22407489
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22407676 |
gtacaaggactggataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
22407577 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22407576 |
aagaaaacatgcccatacacaaataattcatagtattcatcatcatacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
22407489 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Original strand, 49966331 - 49966518
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49966331 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttccacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
49966430 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49966431 |
aagaaaacatgtccataaacaaataaatcatagtattcatcatcacacattatcatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
49966518 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2422445 - 2422265
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2422445 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaactttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccaccacatttgcattatcaagaaaa |
2422346 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2422345 |
catgcccatacacaaataaatcataatattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcgacaatgtcattcaacat |
2422265 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 62 - 243
Target Start/End: Original strand, 41210732 - 41210913
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41210732 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccttaatatataggacaacacctaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaaga |
41210831 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaac |
243 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| |||||||||||| || || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41210832 |
aaacatggccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaacaatcaacaatgtcattcaac |
41210913 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 18506043 - 18506225
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18506043 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccgcaacattagcattatcaaga |
18506142 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||| |||| || || ||| ||| |||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18506143 |
aaa-atgcccacacacaagtaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
18506225 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20826696 - 20826518
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
20826696 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaa |
20826599 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20826598 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
20826518 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 22365441 - 22365624
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22365441 |
aaggactcgataatgcgacaacaatacacaatatcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
22365539 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattca-caataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||| ||| |||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22365540 |
aaacatgttcatacacaattaaatcatagcattcatcattatcacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacat |
22365624 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 35523894 - 35523723
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35523894 |
gactcgataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
35523795 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
237 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| || |||||| ||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35523794 |
catgtccatacgcaaccaa-tcatagaattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
35523723 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 37845939 - 37845760
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37845939 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgtttacctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
37845841 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||| | || ||| |||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37845840 |
catgcccattcataattaaatcatagtattcatcattacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
37845760 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 44036373 - 44036194
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44036373 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatgtataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
44036275 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||| ||| |||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44036274 |
catgctcattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
44036194 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15862908 - 15862727
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
15862908 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-acaatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgaatatctccacaacatt-gcattatcaagg |
15862811 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| || ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15862810 |
aaacatgcccacacacaatcaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
15862727 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 21858246 - 21858425
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21858246 |
gactcgataatgcaacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgtttacctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
21858344 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||| | || ||| |||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21858345 |
catgcccattcataattaaatcatagtattcatcattacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
21858425 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 22034535 - 22034714
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
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| T |
22034535 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
22034632 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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|
|
| T |
22034633 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
22034714 |
T |
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Target: chr1; HSP #14
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Target Start/End: Complemental strand, 22250430 - 22250247
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161 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||| |
|
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| T |
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22250332 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattca-caataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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|
|
| T |
22250331 |
aaacatgttcatacacaattaaatcatagtattcaccattcacacaataacttgattatcaacaatcaacaatgtcattcaacat |
22250247 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
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Target Start/End: Complemental strand, 20895169 - 20894991
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161 |
Q |
| |
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|
|
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aaggactcgataatgccacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacacaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
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T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
241 |
Q |
| |
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|
|
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20895070 |
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20894991 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
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161 |
Q |
| |
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aaggactcgataatgcgacaacaaacaacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
22352912 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattca-caataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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|||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || | ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
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|
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22352913 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcattacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacat |
22352997 |
T |
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Target: chr1; HSP #17
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62 |
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161 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
17147468 |
aaggactcgataatgcaacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccac-aca-ttgcattatcaaga |
17147565 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| |||||||||||| | || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17147566 |
aaacatgtccacacacaattaaatcatagtattcatcaacacacatcaacatgattctcaataatcaacaatgtcattcaacat |
17147649 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
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| Q |
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161 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||| |
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|
| T |
7642068 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgatgatctccacaacatt-gtattatcaaga |
7641971 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||| | || || |||||| |||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
7641970 |
aaacatacccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttattcaacat |
7641889 |
T |
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Target: chr1; HSP #19
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65 |
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164 |
Q |
| |
|
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|
| T |
20526808 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaactttctccacaatatataggacaccacccagttatattgttcatctccacatgatttacattatcaagaaga |
20526906 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
20526907 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
20526987 |
T |
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Target: chr1; HSP #20
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Target Start/End: Complemental strand, 21651412 - 21651231
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62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
21651412 |
aaggactcgataatacgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
21651315 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | ||||||| |||||||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21651314 |
caacatgcccatgcacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcatccaacat |
21651231 |
T |
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Target: chr1; HSP #21
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Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 35053532 - 35053709
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
35053532 |
gactcaataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
35053630 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| |||| || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
35053631 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattc---atcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacat |
35053709 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
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170 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| |
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| T |
20444442 |
ataatgcgacaacaatc-ataattttctccacaatatataggacaatacccaattatattgttcatctccacatgatttgcattatcaagaaaacatgcc |
20444540 |
T |
 |
| Q |
171 |
catacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||| | ||| ||| |||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20444541 |
cattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
20444615 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
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71 |
ataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgct |
170 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20530207 |
ataatgcgacaacaatc-ataattttctccacaatatataggacaatacccaattatattgttcatctccacatgatttgcattatcaagaaaacatgcc |
20530305 |
T |
 |
| Q |
171 |
catacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||| | ||| ||| |||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20530306 |
cattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
20530380 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5676074 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
5675976 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||| || ||||||||| ||| | || ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5675975 |
catgtctatatacaatcaattcatagtatccaccttcacacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #25
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
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|
| T |
18061085 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggactacacccaattatattgattatatccacaaca-ttgcattaccaagg |
18060988 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattca-caataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || | | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
18060987 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcatcacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttattcaacat |
18060903 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #26
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
51451299 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
51451396 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||| ||| |||||| |||||| || || | | ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
51451397 |
gaacatgcccataaacaattaaatcatagcattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacat |
51451480 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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164 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
21716895 |
gactcgataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgctcatctccacaacatttgcattatcaaaaaaa |
21716994 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || |||||| ||||| || || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21716995 |
catgtccatacacaaccaaatcatagaattcatcatcacatatcaacatgattatc---aatcaacaatgtcattcaacat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #28
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41218143 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacattatttgcattatcaagaaaa |
41218241 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaa |
229 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||| |||||| ||||| || ||| ||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
41218242 |
catgctcatacacaattaaatcatagaattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
17003511 |
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17003608 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||| ||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
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|
| T |
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aaacatgccc--acacaaataaatcatagaattcatcatcccacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacat |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
22226667 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
22226765 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataac-ccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||| |||||||||||| || || | |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
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22226766 |
aaacatgcccacacacaaataaatcatagtattcatcatcacataaataacttgattatcaacaatcaacaatatcattca |
22226846 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
45050370 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
45050467 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| |||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
45050468 |
aaacatgtccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacat |
45050551 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 22029383 - 22029563
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| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacc-caattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22029383 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacaacaccaccattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaag |
22029480 |
T |
 |
| Q |
161 |
aaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||| | || ||||||| |||||||||||| | || ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22029481 |
aaaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcctcacacatcaacatatttatcaatagtcaacaatgtcattcaacat |
22029563 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #33
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Query Start/End: Original strand, 65 - 229
Target Start/End: Original strand, 20930163 - 20930327
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20930163 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccataatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
20930261 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaat-aactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaa |
229 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| | || |||||||||||| | | ||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20930262 |
catgctcatacacaattaaaatcatagtattcatcaccgcacatcaacatgattatcaacaatcaa |
20930327 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
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Target Start/End: Original strand, 41393138 - 41393319
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| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
41393138 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcagtatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaaca-ttgcattatcaagg |
41393235 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||| | || || || |||||| ||||| || || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41393236 |
aaacatgtctacacacagttacatcatagcattcatcatcacacatcaacacgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
41393319 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #35
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Query Start/End: Original strand, 65 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 9785707 - 9785551
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9785707 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacactcaattatattgttcctctccacatcatttgcattatcaagaaag |
9785609 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaa |
222 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
9785608 |
catgcacatacacaattaaatcatagtattcatcatcgcacatcaacatgattatcaa |
9785551 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #36
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
18602518 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
18602421 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattca |
196 |
Q |
| |
|
||||| || || || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18602420 |
catgcccacacacagttaaatcatagtattca |
18602389 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #37
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Query Start/End: Original strand, 65 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 5073775 - 5073646
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| | |||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
5073775 |
gactcgataatgcgacaccaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
5073678 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattca |
196 |
Q |
| |
|
||||| || || || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
5073677 |
catgcccacacacagttaaatcatagtattca |
5073646 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #38
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Query Start/End: Original strand, 100 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20122098 - 20122004
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| Q |
100 |
ctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattc |
195 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| || || || ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
20122098 |
ctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaacatgcccacacacagttaaatcatagtattc |
20122004 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
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Target Start/End: Complemental strand, 51657805 - 51657695
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| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
51657805 |
gtacaaagactcgataatgcaacatcacttcacaattttcaccacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatc |
51657706 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatg |
168 |
Q |
| |
|
| |||| |||| |
|
|
| T |
51657705 |
atgaaatcatg |
51657695 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
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Target Start/End: Complemental strand, 38035070 - 38034997
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| Q |
90 |
caattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38035070 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
38034997 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #41
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| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20253257 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
20253293 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 22836723 - 22836628
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
22836723 |
gactcgataatgcgacatcacctcataattttcacaacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatttccacaacaattgcattaccaag |
22836628 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
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Target Start/End: Original strand, 27673543 - 27673641
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || |||| |||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
27673543 |
gactcgataatgcgacaccacctcacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccaaaacaattgtattatcaagaaa |
27673641 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 36357786 - 36357713
Alignment:
| Q |
90 |
caattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36357786 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccatatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
36357713 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22031078 - 22031010
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| Q |
177 |
caaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| || || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22031078 |
caaataaatcatagtattcctcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
22031010 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 245
Target Start/End: Original strand, 22353108 - 22353144
Alignment:
| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22353108 |
aacatgattatcaataatcaacaatatcattcaacat |
22353144 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 51657644 - 51657608
Alignment:
| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51657644 |
aacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
51657608 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 20956416 - 20956341
Alignment:
| Q |
88 |
cacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
20956416 |
cacaattttcacaacaatatagaggacaactttcaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaagaaa |
20956341 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 163
Target Start/End: Original strand, 19601911 - 19601972
Alignment:
| Q |
102 |
caatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
19601911 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgatgatctccacaacatttgcattgtcaagaaa |
19601972 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 79)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 59 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6148315 - 6148129
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| Q |
59 |
tacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatca |
158 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
6148315 |
tacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatgtaggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttacattatca |
6148216 |
T |
 |
| Q |
159 |
agaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6148215 |
agaaaacaagcccatacacaaataaatcatagtattcaccattacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
6148129 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 13816200 - 13816383
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| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13816200 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattctcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaaga |
13816299 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| | | |||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13816300 |
aaacatgcccacacacaattgaatcatagcattcaccatcacccatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
13816383 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16183489 - 16183297
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaat----atataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcat |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16183489 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttacacctcaatcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatcatttgcat |
16183390 |
T |
 |
| Q |
154 |
tatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16183389 |
tgtcaagaaaacatgctcatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
16183297 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19572242 - 19572059
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19572242 |
aaggactcgataatgtgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaaga |
19572143 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| | | |||||| ||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19572142 |
aaacatggccacacacaattgaatcatagcattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
19572059 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22145740 - 22145562
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22145740 |
gactcgataatgcgataacaatccacaattttcacctcaatatataggacac-acccaattatattgattatctccacaac-tttgcattatcaagaaaa |
22145643 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| | ||| | | ||| |||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22145642 |
catgcccctacaccattaattcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttattcaacat |
22145562 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15860617 - 15860435
Alignment:
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161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
15860519 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| |||||||||| | || || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15860518 |
aaacatgtccacacacaattaaatcatagtatttatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcatccaacat |
15860435 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
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Query Start/End: Original strand, 62 - 245
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| Q |
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161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16819597 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
16819694 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16819695 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
16819776 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Original strand, 17099397 - 17099585
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58 |
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157 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gtacaaggactcgataatgcgtcagcaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
17099496 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataac-ccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||| || | ||| ||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17099497 |
aagaaaacatgtccataaacaatcaaattataagattcatcatcactacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
17099585 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 18909378 - 18909557
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| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18909378 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
18909475 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||| | || || |||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18909476 |
aaacatccacacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
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Query Start/End: Original strand, 65 - 243
Target Start/End: Original strand, 8630538 - 8630715
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| Q |
65 |
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164 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
8630538 |
gactcgataatgcaacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaga |
8630636 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaac |
243 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
8630637 |
catgcacatacacaaataaatcatagtattcatcatcacacattatcatgattatcaataatcaacaaagtcattcaac |
8630715 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
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Target Start/End: Complemental strand, 50113602 - 50113420
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| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50113602 |
gtacaaggactcgataatgcaacaacaatccacaa-tttcacctcaatatataggaca----acaattatattgattacctccacaacatttgcattatc |
50113508 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50113507 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatcactcatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
50113420 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
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Target Start/End: Complemental strand, 8269870 - 8269691
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161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8269870 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
8269773 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
8269772 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttattcaacat |
8269691 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 8276981 - 8276802
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| Q |
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8276981 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
8276884 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
8276883 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttattcaacat |
8276802 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17957802 - 17957623
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| Q |
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
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|
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17957802 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatgtccacatcatttgcattatcaagaaaa |
17957704 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
17957703 |
catgtccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgacattcaacat |
17957623 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
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165 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22273737 |
actcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaac |
22273834 |
T |
 |
| Q |
166 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22273835 |
atgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
22273912 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
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164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33340534 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
33340632 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33340633 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
33340713 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
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Target Start/End: Original strand, 35122377 - 35122557
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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gactcgataatgcgacaacaattcataattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
35122476 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || |||||| ||||| || || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35122477 |
catgtccatacacaaccaaatcatagaattcatcatcacacatcaacatgattgtcaataatcaacaatgtcattcaacat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
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164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |
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|
| T |
53769350 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaa |
53769447 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53769448 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |
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|
| T |
319081 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggataacacccaattatattgttcatttccacatcatttgcattatcaagaaaa |
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T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||| | | ||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
318982 |
catgcccatacacgattaaatcataacattcatcatcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2048751 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
2048849 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2048850 |
catgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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T |
 |
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165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||| | ||| ||| |||||||||||| || || ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
19230850 |
catgtccattcacaattaaatcatagtattcattatcacacatcaacataattatcaataatcaacaacgtcattcaacat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25057531 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctctacaacatttgcattatc |
25057629 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| | || ||| |||||||||||| || || ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aagaaaacatgcccattcataattaaatcatagtattcatcattacacatcaatatgattatcaataatcaacaatgtcat |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| |
|
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|
|
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 |
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162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaat-aacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
27839493 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacattaacatgatcatcaacaatcaacattatcattca |
27839573 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
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Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 49230901 - 49231084
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| Q |
62 |
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161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
49230901 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaatctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatca-ttgcattatcaaga |
49230999 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaat-aacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || | | ||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
49231000 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacatcaacatgatcatcaataatccacaatgttattcaacat |
49231084 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 51159945 - 51159766
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65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51159945 |
gactcgataatgcgacaccaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
51159847 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51159846 |
catgtccatacacaattaaatcatagtattcatcctcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
51159766 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
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Target Start/End: Original strand, 30205137 - 30205274
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58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
30205137 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctgaatatattggacaacacccaattatattgattatctccacaac-tttgctttatc |
30205235 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattca |
196 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
30205236 |
aagaaaacatgcacatacacaattaattcatagtattca |
30205274 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
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Target Start/End: Complemental strand, 2450791 - 2450617
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66 |
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165 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
2450791 |
actcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaac |
2450694 |
T |
 |
| Q |
166 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||| ||||||||||| || | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2450693 |
atgcccacac--aaataaatcatagtattccca-tcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
2450617 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
7852499 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttacattatcaagaaaa |
7852597 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| ||||||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7852598 |
catgtccatacacaattaaatcatagtattcctcatcacacatcaacataattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
7852678 |
T |
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Target: chr3; HSP #29
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Target Start/End: Original strand, 14297188 - 14297369
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65 |
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164 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14297188 |
gactcaataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
14297287 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| || ||| || ||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14297288 |
catgtccatactcaatcaaatcataatactcattatcaccacatcaatatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
14297369 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
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Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 14302815 - 14302996
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14302815 |
gactcaataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
14302914 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| || ||| || ||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14302915 |
catgtccatactcaatcaaatcataatactcattatcaccacatcaatatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
14302996 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 19945317 - 19945497
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19945317 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
19945415 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
19945416 |
catgctcatacacaattaaatcatatcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacat |
19945497 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1469121 - 1468943
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| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1469121 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
1469024 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
1469023 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacat |
1468943 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
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Target Start/End: Original strand, 16259732 - 16259911
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16259732 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
16259830 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||||||| || || | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16259831 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacactccaacatgataatcaataatcaacaacatcattcaacat |
16259911 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 30152023 - 30152202
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| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
30152023 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
30152120 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| || || ||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
30152121 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatattaatcaataatcaacaatgtcatccaacat |
30152202 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
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| Q |
66 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
165 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
15469931 |
actcgataatgcgacaataatc-acaattt-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaag-gaac |
15469836 |
T |
 |
| Q |
166 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| || || ||||||| |||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15469835 |
atgcccacacacaaataaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacat |
15469756 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16745639 - 16745459
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| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16745639 |
aaggactcgataatgcgacaaccatc-acaatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
16745542 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| ||||||||||||| | || | | |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
16745541 |
aaacatgcccaaacacaattaaatcatagtattcaccaacacacttcaacatgattaacaataatcaacaa-gtcatgcaacat |
16745459 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
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Target Start/End: Original strand, 14294114 - 14294300
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acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
159 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14294114 |
acaaagactcgataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatacaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaa |
14294213 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataac-ccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| || || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14294214 |
gaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
14294300 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14522775 |
gactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccatatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
14522676 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| || ||||| || ||| || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14522675 |
catgcccatacacaatcaaatcataatactcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
14522594 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
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Query Start/End: Original strand, 65 - 245
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||| |||||| ||| | ||||||||||||| || |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17913717 |
gactagataatgcgaca-caatc-acaattgtcaacacaatatataggacgacatccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
17913620 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
17913619 |
catgtccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgcttatcaataatcaacaatgccattcaacat |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #40
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169 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23491202 |
gataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggaaaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgc |
23491300 |
T |
 |
| Q |
170 |
tcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaa |
242 |
Q |
| |
|
||| | || ||| |||||||||||| || || ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
23491301 |
ccattcataattaaatcatagtattcatcattacacatcaacgtgattatcaataatcaacgatgtcattcaa |
23491373 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 44228115 - 44228297
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62 |
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161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
44228115 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
44228212 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattca-caataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| | | ||| |||||| ||||| || | | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
44228213 |
aaacatgcccatacacgattaaatcatagcattcatcatcatcacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttattcaacat |
44228297 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 53899989 - 53899810
Alignment:
| Q |
65 |
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164 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53899989 |
gactcaataatgcgacaacaattcacaattttcaccacattatataggacaactcccaattatattgatcatctccaccacatttgcattatcaagaaaa |
53899890 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||| || |||||| ||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
53899889 |
catgtccatatacaaccaa-tcatagaattcatcatcacacatcaacataattatcaataatcaacaatatcattcaacat |
53899810 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 15574730 - 15574911
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
15574730 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
15574827 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| |||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15574828 |
aaacatgtccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacat |
15574911 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 60 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11199045 - 11198859
Alignment:
| Q |
60 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
159 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11199045 |
acaaagacttgataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaa |
11198946 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataac-ccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| || || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11198945 |
gaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
11198859 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 60 - 245
Target Start/End: Original strand, 14299741 - 14299927
Alignment:
| Q |
60 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
159 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14299741 |
acaaagactcgataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatacaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaa |
14299840 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataac-ccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| || || | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14299841 |
gaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacctcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
14299927 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17523884 - 17523699
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
17523884 |
gtacaaagactcgataatgcgacaacaatccacggttttcaccccaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccgcaacatgtgcattatc |
17523785 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||| ||| ||| ||||| || ||| || ||| | | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
17523784 |
aagaaatcatgtccatacacaattaattcatactactcatcatcaccaa--atcatgatcatcaataatcaataatgtcattcaacat |
17523699 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 15613749 - 15613930
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
15613749 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattaatcatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
15613846 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| |||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15613847 |
aaacatgtccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacat |
15613930 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 14846131 - 14846034
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| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
14846131 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaag |
14846034 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11062504 - 11062324
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
11062504 |
gactcaataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaa-aaaa |
11062406 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| ||||| || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11062405 |
catgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
11062324 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 197
Target Start/End: Original strand, 10737247 - 10737378
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||| | || | |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10737247 |
gactcgataatgcgacaacaata-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattgtattgttcatcttcacatcatttgcattatcaagaaaa |
10737345 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcac |
197 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
10737346 |
catgcccatacacaaataaatcatagtattcac |
10737378 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12265960 - 12265785
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
12265960 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaaactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
12265862 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
238 |
Q |
| |
|
||||||| || | ||||||| |||||||||| | || || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12265861 |
aaacatgtccacagacaaataaatcatagtatttatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcat |
12265785 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 65 - 174
Target Start/End: Original strand, 5227406 - 5227514
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5227406 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttaatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
5227504 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcata |
174 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
5227505 |
catgctcata |
5227514 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12351312 - 12351132
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12351312 |
gactcgataattcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
12351214 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| | || ||| ||| |||||| ||||| || ||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
12351213 |
catgtccgcacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacaacaacatgatcatcaataatcaacaatgttattccacat |
12351132 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 40938421 - 40938602
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40938421 |
gactcgataatgcgacaccaatttacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccataacatttgcattatcaagaaaa |
40938520 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| ||||| || ||| ||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40938521 |
catgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcaccacatcaacttgatcatcaacaatcaacaatgtcattcaacat |
40938602 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 8305790 - 8305693
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
8305790 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
8305693 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 47786314 - 47786171
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| Q |
102 |
caatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaata |
201 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| || |||||| ||||| || |
|
|
| T |
47786314 |
caatatataggacaactcccaattatattgatcatctccaccacattttcattatcaagaaagcatgtccatacacaatcaaatcataggattcatcatc |
47786215 |
T |
 |
| Q |
202 |
acccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
47786214 |
acacatcaacatgattatcaataatcaacattgtcattcaacat |
47786171 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 196
Target Start/End: Original strand, 55315085 - 55315214
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
55315085 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
55315182 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattca |
196 |
Q |
| |
|
||||| || || || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
55315183 |
catgcccacacacagttaaatcatagtattca |
55315214 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15939930 - 15939748
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| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag- |
160 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
15939930 |
aaggactcaataatgcgacaacaattcacaatttcaacctcaatgtatatgacaacacccaattatattgattatccccataaca-ttgaattatcaagc |
15939832 |
T |
 |
| Q |
161 |
aaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattca-caataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaac |
243 |
Q |
| |
|
||||||||| || | |||||| |||||||||||| || | || | |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
15939831 |
aaaacatgcccacatacaaatagatcatagtattcatcattcacaccataacttgattatcaacaatcaacaaagtcattcaac |
15939748 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18905267 - 18905171
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| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
160 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18905267 |
aaggactcaataatgcgaaaacaatc-acaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaag |
18905171 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
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Target Start/End: Original strand, 45859709 - 45859838
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
45859709 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacatccaattatattgattatcttcacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
45859806 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattca |
196 |
Q |
| |
|
||||| || || || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
45859807 |
catgcccacacacagttaaatcatagtattca |
45859838 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
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Target Start/End: Complemental strand, 16935286 - 16935169
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125 |
tatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaata |
224 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||| || || ||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16935286 |
tatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaata |
16935190 |
T |
 |
| Q |
225 |
atcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16935189 |
atcaacaatgtcatccaacat |
16935169 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12562944 - 12562765
Alignment:
| Q |
68 |
tcgataatgcgacaacaatccacaa-ttttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaaca |
166 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||| | |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12562944 |
tcgataatgcgacaacacttcacaaattttcaccacaatatagaggaaaaattccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaagaaaaca |
12562845 |
T |
 |
| Q |
167 |
tgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataac-ccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|| | ||| ||| || ||||| ||||| || || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12562844 |
tgtccgtacacaatcaaatcataagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
12562765 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 13977101 - 13976970
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctca--atatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
162 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||| | ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| | |
|
|
| T |
13977101 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaa-tgtcaactcaatatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagga |
13977004 |
T |
 |
| Q |
163 |
aacatgctcatacgcaaataactcatagtattca |
196 |
Q |
| |
|
||||||| || || || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
13977003 |
aacatgcccacacacagttaaatcatagtattca |
13976970 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 161
Target Start/End: Original strand, 17138157 - 17138253
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
17138157 |
gactcgataatgcgacatcactttacaattttcacctcaatataaaggacaactcccaactatattgatcatctccacaacaattgaattatcaaga |
17138253 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 196
Target Start/End: Original strand, 41268931 - 41269060
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | | |||| | || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |
|
|
| T |
41268931 |
gactcgataatgcgacaacatttctcaatct-caactcaatacataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagagaa |
41269028 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattca |
196 |
Q |
| |
|
||| | || || || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
41269029 |
catacccacacacagttaaatcatagtattca |
41269060 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 13956269 - 13956138
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctca--atatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
162 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| | |
|
|
| T |
13956269 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaa-tgtcaactcaatatatataggacaacacccaattattttgattatctccacaaca-ttgcattaccaagga |
13956172 |
T |
 |
| Q |
163 |
aacatgctcatacgcaaataactcatagtattca |
196 |
Q |
| |
|
||||||| || || || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
13956171 |
aacatgcccacacacagttaaatcatagtattca |
13956138 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12031364 - 12031271
Alignment:
| Q |
153 |
ttatcaagaaaacatgctcatacgcaaat-aactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||| | ||| | || |||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
12031364 |
ttatcaagaaaacacgcccattcacaatttaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaataatgtcattcaacat |
12031271 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9303791 - 9303755
Alignment:
| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9303791 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
9303755 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 157
Target Start/End: Original strand, 12951743 - 12951835
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
12951743 |
gactcgataatgcgacatcatctcacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatc |
12951835 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 108
Target Start/End: Original strand, 14287780 - 14287828
Alignment:
| Q |
60 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatata |
108 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14287780 |
acaaagactcgataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatata |
14287828 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 162
Target Start/End: Original strand, 15874893 - 15874953
Alignment:
| Q |
102 |
caatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
162 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15874893 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgattatctccacaacatttgcattatcaagaa |
15874953 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 211 - 245
Target Start/End: Original strand, 17937333 - 17937367
Alignment:
| Q |
211 |
catgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17937333 |
catgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
17937367 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 95
Target Start/End: Original strand, 11813553 - 11813586
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattt |
95 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11813553 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattt |
11813586 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 11330442 - 11330382
Alignment:
| Q |
102 |
caatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
162 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11330442 |
caatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccaccacatttgcattatcaagaa |
11330382 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 160
Target Start/End: Original strand, 15516426 - 15516521
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
160 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
15516426 |
gacttgataatgcgacatcaactcaaaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattaccaag |
15516521 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 38812436 - 38812367
Alignment:
| Q |
91 |
aattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
160 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
38812436 |
aattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaag |
38812367 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 12490177 - 12490105
Alignment:
| Q |
91 |
aattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12490177 |
aattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcacctccacaacattttcattatcaagaaa |
12490105 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 153
Target Start/End: Original strand, 39654607 - 39654695
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcat |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
39654607 |
gactcgataatgcaacatcacctcacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcat |
39654695 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 47786339 - 47786311
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaat |
93 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47786339 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaat |
47786311 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 73)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24718887 - 24718704
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24718887 |
aaggactcgataatgtgacaacaatccacaatttccacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaaga |
24718788 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24718787 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
24718704 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Original strand, 25121227 - 25121414
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25121227 |
gtacaaggactcaataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacttccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
25121326 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
25121327 |
aagaaaacatgcccatacacaaataaatcataatattcaccatcacacattaacataattatcaataatcaacaaggtcattcaacat |
25121414 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6775701 - 6775519
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
6775701 |
aaggactcgataatgcaacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
6775603 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6775602 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacccatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
6775519 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3433044 - 3432863
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3433044 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
3432947 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3432946 |
aaacatgcccatacacaaataaatcataatattcaccatcacccatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
3432863 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19994626 - 19994438
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
19994626 |
gtacaaggactcaataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacacaactatattgattatctccatttcatttacattatc |
19994527 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19994526 |
aagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
19994438 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Original strand, 41245348 - 41245535
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
41245348 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggactactcccaattatattgattatctccataacatttgcattatc |
41245447 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41245448 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcttcttcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
41245535 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
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Target Start/End: Complemental strand, 22908956 - 22908772
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tacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatca |
158 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22908956 |
tacaaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatca |
22908858 |
T |
 |
| Q |
159 |
agaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattca-caataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| || | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22908857 |
agaaaacatgcccata--caaataaatcatagcattcatcatcatcacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
22908772 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
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Target Start/End: Complemental strand, 43375051 - 43374870
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Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |
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|
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccac-aca-ttgcattatcaaga |
43374954 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
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|
|
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43374953 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcaacacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
43374870 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
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Target Start/End: Complemental strand, 224631 - 224448
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161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
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224631 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatca-ttgcattatcaaga |
224533 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaat-aacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || | | ||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
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224532 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacatcaacatgatcatcaataatccacaatgttattcaacat |
224448 |
T |
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Target: chr8; HSP #10
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Target Start/End: Complemental strand, 701044 - 700861
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161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
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aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatca-ttgcattatcaaga |
700946 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaat-aacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || | | ||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
700945 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacatcaacatgatcatcaataatccacaatgttattcaacat |
700861 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
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Target Start/End: Complemental strand, 738254 - 738071
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161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |
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|
| T |
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aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatca-ttgcattatcaaga |
738156 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaat-aacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || | | ||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
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| T |
738155 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacatcaacatgatcatcaataatccacaatgttattcaacat |
738071 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
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161 |
Q |
| |
|
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|
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862149 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatca-ttgcattatcaaga |
862051 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaat-aacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || | | ||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
862050 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacatcaacatgatcatcaataatccacaatgttattcaacat |
861966 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
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Target Start/End: Complemental strand, 13664105 - 13663923
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161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
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|
| T |
13664105 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
13664007 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || | | | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
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|
| T |
13664006 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcatcacatcacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacat |
13663923 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
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Target Start/End: Complemental strand, 13723380 - 13723198
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161 |
Q |
| |
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| T |
13723380 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
13723282 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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|||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || | | | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
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|
| T |
13723281 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcatcacatcacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacat |
13723198 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| ||| |
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|
| T |
24930582 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaatttccacctcaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaaggaaa |
24930483 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| | ||| ||| ||| |||||| ||||| || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24930482 |
catgtccctacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
24930401 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20648906 |
gactcgataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatatagaacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
20648807 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||| | ||||| ||| || |||||| ||||| || || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20648806 |
catacccatacacaatcaaatcataggattcatcatcacacatcaacatgattatcaacaatcaacaatgtcatccaacat |
20648726 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
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157 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22322909 |
gtacaaggacttgataatgcgacaataatccataattttcacctcaatatataggacgacacccaattatattgattacctccacaaca-ttgcattatt |
22322811 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatc-aacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22322810 |
aagaaaacatgcccatacacaattaattcatagtattcatcatctcacatcaacatgattatcaataatcaaaaaatgtcattcaacat |
22322722 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24387175 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgtattatcaagaaaa |
24387077 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||| | || ||| |||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24387076 |
catgcccattcataattaaatcatagtattcatcattacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
5236883 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
5236980 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| || || | | ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
5236981 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacat |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16874407 |
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16874310 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| |||||||||||| | || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16874309 |
aaacatgtccacacacaattaaatcatagtattcatcaacacacatcaacatgattctcaataatcaacaatgtcattcaacat |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
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161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
24662715 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
24662618 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| || || | | ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
24662617 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacat |
24662534 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
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Q |
| |
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T |
 |
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162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| || || | | ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
43684440 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacat |
43684523 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
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gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16416945 |
gtacaaagactcgataatgtgacaattatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
16417044 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| || | ||| ||| |||||| ||||| || ||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
16417045 |
aagaaaacatgtccacgcacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaatactcaacaatgttattccacat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
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Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20655491 |
gactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
20655392 |
T |
 |
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catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
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Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| ||||| || || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |
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|
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20655391 |
catgtccatacacaatcaaatcataagattcatcatcacacatcaacatgattatcaacaatcaacaatgtcatccaacat |
20655311 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20568734 - 20568553
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164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaag |
20568635 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| | ||| || ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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20568634 |
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20568553 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20574927 - 20574746
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164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaag |
20574828 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| | ||| || ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20574827 |
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20574746 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 37610059 - 37610239
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| Q |
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164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
37610157 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
37610158 |
tatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacat |
37610239 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
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Target Start/End: Complemental strand, 272671 - 272493
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161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
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272671 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
272574 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
272573 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacat |
272493 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
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161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
643178 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
643275 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
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aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
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161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
828984 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
829081 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
829082 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacat |
829162 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
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Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22089911 - 22089732
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62 |
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161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22089911 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
22089814 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| || || ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22089813 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttaccaataatcaacaatgtcatccaacat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 66 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24108050 - 24107874
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165 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
24108050 |
actcgataatgcgacaaca--ccacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatt-gcattatcaagaaaac |
24107954 |
T |
 |
| Q |
166 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| | ||| ||| ||| ||||||||||||| || || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24107953 |
atgcccgtacacaattaaatcatagtattcaccatcacacctcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
24107874 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15320527 - 15320348
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| Q |
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161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15320527 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattgtattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
15320430 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| || || ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15320429 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttaccaataatcaacaatgtcatccaacat |
15320348 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
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| Q |
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161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
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aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattgtattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
15500799 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| || || ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
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164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29758984 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatgttgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
29759082 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||| | ||| ||| |||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
29759083 |
catgtccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacat |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 245
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ctcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaaca |
166 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || || ||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16195202 |
ctcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctctacatcatttgcattatcaagaaaaca |
16195104 |
T |
 |
| Q |
167 |
tgctcatacgcaa-ataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||| ||| | ||| ||| |||||||||||| || || ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16195103 |
tgcccattcacaatttaaatcatagtattcatcatcacacatcaatatgattatcaataatcaataatgtcattcaacat |
16195024 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #37
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
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22007850 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattca |
196 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||| ||| ||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
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aaacattcccatacacaattaaatcatagaattca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #38
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161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
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aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
24548006 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| |||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
24548007 |
aaacatgtccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacat |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #39
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || || ||| |||||||||||||||||||| |
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|
| T |
270429 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctctacatcatttgcattatcaagaaaa |
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T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaa |
222 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| || || || |||||||||||||| |
|
|
| T |
270528 |
catgcccatacacaattaaatcatagtattcatcatcacacaacaacatgattatcaa |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
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164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || || ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
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T |
 |
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catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaa |
222 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| || || || |||||||||||||| |
|
|
| T |
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catgcccatacacaattaaatcatagtattcatcatcacacaacaacatgattatcaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #41
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| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || || ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
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T |
 |
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catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaa |
222 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| || || || |||||||||||||| |
|
|
| T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #42
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| |
|
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|
|
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 |
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| |
|
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|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
20480365 |
gactcgataatgcgacaacaatc-aca-ttttcaccacaatatataggacaacacctaattatattgttcatctccacaacatttgcattataaagaaaa |
20480462 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||| ||| ||||| |||| || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
20480463 |
catgtctatacacaattaaatcataacattc---atcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacat |
20480541 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 164
Target Start/End: Original strand, 37605685 - 37605783
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37605685 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
37605783 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 60 - 245
Target Start/End: Original strand, 21679889 - 21680075
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| Q |
60 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
159 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| | |||| ||||||| | || ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
21679889 |
acaaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatagatgacaacttccaaatatattgttcatctccaccacatttgcattatcaa |
21679988 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataac-ccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||| ||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21679989 |
gagaacatgtccatacacaatgaaatcataagattcattatcacaacatcgacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
21680075 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 28543628 - 28543806
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28543628 |
gactcgataatgcgacatcaattcacaattatcaccacaatatagaggacaacttccacatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
28543727 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| || ||||| || ||| || ||| | | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
28543728 |
catgttcatacacaatcaaatcataatactcatcatcaccaa--atcatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacat |
28543806 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 16675791 - 16675662
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
16675791 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
16675694 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattca |
196 |
Q |
| |
|
||||| || || || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16675693 |
catgcccacacacagttaaatcatagtattca |
16675662 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17730936 - 17730751
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| Q |
60 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
159 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
17730936 |
acaaagactcgataatgcgacatcaccccacaattttc-ccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattaacaa |
17730838 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataac-ccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| || || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17730837 |
gaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
17730751 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #49
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Query Start/End: Original strand, 132 - 245
Target Start/End: Original strand, 28836353 - 28836463
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| Q |
132 |
attatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaaca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28836353 |
attatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaaca |
28836449 |
T |
 |
| Q |
232 |
atgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
28836450 |
atgtcattcaacat |
28836463 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 65 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21853361 - 21853235
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| | |||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
21853361 |
gactcgataatgcgacagcaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
21853264 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtat |
193 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
21853263 |
catgcccacacacaattaaatcatagtat |
21853235 |
T |
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Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21845956 - 21845830
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
21845956 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatcaacacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
21845859 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtat |
193 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
21845858 |
catgcccacacacaattaaatcatagtat |
21845830 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 16203804 - 16203739
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattg |
131 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16203804 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattg |
16203739 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 18768233 - 18768135
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
18768233 |
gactcgataatgcgacatcacttcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatatttatcatctccacaacaattgcattatcaagaaa |
18768135 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #54
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| Q |
145 |
catttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaac |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16040748 |
catttgcattctcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaac |
16040649 |
T |
 |
| Q |
244 |
at |
245 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
16040648 |
at |
16040647 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
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Target Start/End: Complemental strand, 16042424 - 16042323
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| Q |
145 |
catttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaac |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16042424 |
catttgcattctcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaac |
16042325 |
T |
 |
| Q |
244 |
at |
245 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
16042324 |
at |
16042323 |
T |
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Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
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| Q |
90 |
caattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| | | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39448271 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttcaaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
39448198 |
T |
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Target: chr8; HSP #57
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| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
224337 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
224301 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #58
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| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
700750 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
700714 |
T |
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| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
737960 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
737924 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #60
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| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
861855 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
861819 |
T |
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| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17151324 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
17151288 |
T |
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| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18618149 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
18618185 |
T |
 |
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| Q |
60 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
159 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || ||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
38532336 |
acaaagactcgataatgcgacatcacttcacaatttctaccacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattatattatcaa |
38532435 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaaa |
163 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
38532436 |
gaaa |
38532439 |
T |
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| Q |
102 |
caatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21199608 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
21199547 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #65
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| Q |
102 |
caatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31195719 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgattatctccgcaacatttgcattatcaagaaa |
31195658 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13663812 |
aacatgactatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
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T |
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aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
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Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aacatgactatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
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T |
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aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13722495 |
aacatgactatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
13722459 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #69
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Target Start/End: Complemental strand, 13722643 - 13722607
Alignment:
| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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|
|
| T |
13722643 |
aacatgactatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
13722607 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13722791 - 13722755
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| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13722791 |
aacatgactatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
13722755 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #71
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Query Start/End: Original strand, 209 - 245
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| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13722939 |
aacatgactatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
13722903 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #72
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Target Start/End: Complemental strand, 13723087 - 13723051
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| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
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13723087 |
aacatgactatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #73
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Query Start/End: Original strand, 209 - 245
Target Start/End: Original strand, 38532495 - 38532531
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| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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|||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38532495 |
aacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
38532531 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 63)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
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Target Start/End: Complemental strand, 13867552 - 13867365
Alignment:
| Q |
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157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacttcaatatatagaacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
13867453 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
13867452 |
aagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgttatccaacat |
13867365 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 59 - 245
Target Start/End: Original strand, 44863930 - 44864116
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| Q |
59 |
tacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatca |
158 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
44863930 |
tacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacagcatttgcattatca |
44864029 |
T |
 |
| Q |
159 |
agaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44864030 |
agaaaacatgcccatacacaaataattcatagtattcatcatcacacattagcatgattatcaatgatcaacaatgtcattcaacat |
44864116 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Original strand, 7291540 - 7291726
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| Q |
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gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7291540 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatc |
7291638 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7291639 |
aagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacccatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
7291726 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12545190 - 12545003
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
12545190 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctaaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttccattatc |
12545091 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12545090 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcttcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
12545003 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Original strand, 47288461 - 47288648
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47288461 |
gtacaaggactcgataatgcaacaacaatccacaattttcacctcaaaatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
47288560 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47288561 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcttcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
47288648 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 45453728 - 45453547
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacacca-cccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45453728 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaacttcccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaa |
45453629 |
T |
 |
| Q |
164 |
acatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45453628 |
acatgcccatacacaaataattcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
45453547 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26071743 - 26071557
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| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26071743 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggaccacgcccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
26071644 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| || || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26071643 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatcacaca-tcacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
26071557 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26095530 - 26095344
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26095530 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggaccacgcccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
26095431 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| || || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26095430 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatcacaca-tcacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
26095344 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 369580 - 369760
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
369580 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
369679 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
369680 |
catgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcctttaacat |
369760 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 66 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15952563 - 15952387
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| Q |
66 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
165 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15952563 |
actcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaac |
15952465 |
T |
 |
| Q |
166 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15952464 |
atgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
15952387 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 62 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18981379 - 18981201
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| Q |
62 |
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161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18981379 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
18981282 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaa |
242 |
Q |
| |
|
|||||||| || | ||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18981281 |
aaacatgcccacatacaaataaatcatagtattcaccatcacccatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaa |
18981201 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15823888 - 15823697
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| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15823888 |
gtacaaagactcgataatgcgacaacaattaacaatcttcacctcaatataaaggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
15823789 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtat----tcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
15823788 |
aagaaaacatgtccatacacaaataaatcatagtatatattcaccatcacatattaacatgattatcaataatcaacaatgttatccaacat |
15823697 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Original strand, 142313 - 142501
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| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
142313 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatc |
142412 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || ||| ||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
142413 |
aagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacataatcatcaataatcaacaatgttattcaacat |
142501 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2192169 - 2191987
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62 |
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161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2192169 |
aaggactcgataatgcgacagcaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatcaaga |
2192071 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
2192070 |
aaacatgcccatacaaaaataaatcatagtattcaccatcacactccaacatgattatcaataatcaacaacatcattcaacat |
2191987 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32496025 - 32495845
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32496025 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
32495927 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32495926 |
catgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 112767 - 112588
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
112767 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacatcacccaattatattgttcatctccacatcatttgctttatcaagaaaa |
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T |
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| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
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| T |
112668 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacagtgtcattcaacat |
112588 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
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Target Start/End: Original strand, 2027250 - 2027430
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164 |
Q |
| |
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| T |
2027250 |
gactcgataatgcgacaacaatcacaaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
2027349 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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|
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| T |
2027350 |
cacgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattgaacat |
2027430 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
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164 |
Q |
| |
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| T |
3058741 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaatacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
3058839 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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|
|
| T |
3058840 |
catgctcattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacagtatcattcaacat |
3058920 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
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165 |
Q |
| |
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| T |
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actcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaac |
16417259 |
T |
 |
| Q |
166 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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|
| T |
16417260 |
atgcccacac--aaataaattatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
16417337 |
T |
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Target: chr7; HSP #20
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Target Start/End: Original strand, 13757270 - 13757451
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Q |
| |
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|
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccac-aca-ttgcattatcaaga |
13757367 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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||||||| || || ||| ||| |||||||||||| | || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
13757368 |
aaacatgtccacacacaattaaatcatagtattcatcaacacacatcaacatgattctcaataatcaacaatgtcattcaacat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
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161 |
Q |
| |
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|
| T |
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aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
15442934 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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|
| T |
15442933 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacat |
15442850 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
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Target Start/End: Original strand, 16210471 - 16210652
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161 |
Q |
| |
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| T |
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aaggactcgataatgcaacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacctaattatattgattatctccac-aca-ttgcattatcaaga |
16210568 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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|
| T |
16210569 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccaacacacatcaacatgtttatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
16210652 |
T |
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Target: chr7; HSP #23
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Query Start/End: Original strand, 64 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13038576 - 13038397
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163 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
164 |
acatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
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|
| T |
13038478 |
acatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
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164 |
Q |
| |
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|
| T |
11582311 |
gactcgataatgtgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacactcaattatattgattatctccac-aca-ttgcattatcaagaaaa |
11582214 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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|
| T |
11582213 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcatcaccacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
11582133 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15525957 - 15525774
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| Q |
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161 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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aaggactcgataatgcgacaacgattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
15525859 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattca-caataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
15525858 |
aaacatgcacacacacaaatagatcatagtattcatcattcacataataacttgattatcaacaatcaacaatgtcattcaacat |
15525774 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
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Target Start/End: Original strand, 36051355 - 36051536
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161 |
Q |
| |
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|
| T |
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttctacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccac-aca-ttgcattattaagt |
36051452 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
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|
| T |
36051453 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcaacacacatcaacatgattttcaataatcaacaatgtcattcaacat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
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|
| T |
1938240 |
gactcgataatgcgacaacaattca--attttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
1938143 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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|
|
| T |
1938142 |
catgctcattcataattaaatcataatattcatcattacacatcaacattattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
1938062 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
13912485 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| || || | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
13912484 |
catgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacatttcaacataattatcaataatcaacaatgtcatgcaacat |
13912404 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
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161 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
27103019 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
27102922 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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|||||||| | || ||||||| |||||||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
27102921 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacat |
27102841 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
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161 |
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| |
|
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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|||||||| | || ||||||| |||||||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
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|
| T |
27110269 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacat |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
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Q |
| |
|
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|
|
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T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
27175405 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacat |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
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| |
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|
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T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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|||||||| | || ||||||| |||||||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
38785013 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacat |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
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164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | | |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
11285904 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatataaaggagaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
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T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaat--aacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || |||||| ||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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catgtccatacacaatcaaatcataggattcattatcacacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
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| |
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16480311 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||| || |||||| ||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16480310 |
aaacatgcccatatacaattacatcatagcattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
16480227 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12249584 - 12249403
Alignment:
| Q |
65 |
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164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12249584 |
gactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaactaccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
12249485 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || |||||| ||||| || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12249484 |
catgtccatacacaatcaaatcataggattcattatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
12249403 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 125520 - 125699
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
125520 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcctttgcattatcaagaaaa |
125618 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||| | | | ||| |||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
125619 |
catgcccattcacgattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacat |
125699 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 7821615 - 7821793
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| Q |
62 |
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161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
7821615 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
7821712 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| || || ||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
7821713 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-aatatcaataatcaacaatgtcactcaacat |
7821793 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 7828926 - 7829104
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
7828926 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
7829023 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| || || ||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
7829024 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-aatatcaataatcaacaatgtcactcaacat |
7829104 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 15926058 - 15926237
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15926058 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaag- |
15926155 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||| ||||| || | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15926156 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagcattcatcatcatcacatcacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
15926237 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 12753575 - 12753754
Alignment:
| Q |
65 |
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164 |
Q |
| |
|
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|
| T |
12753575 |
gactcgataatgcgacaacaattcacaattt-caccacaatataaaggacatcttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
12753673 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| || | |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
12753674 |
catgtccatacacaaacaaattatagtactcatctccacacattaacatgattatcaataatcaataatgtcattcaacat |
12753754 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 42057632 - 42057458
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
42057632 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
42057535 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
241 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||||||||| || || || |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
42057534 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacaataacttgattatcaacaatcaacaatatcattca |
42057458 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 3893789 - 3893966
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3893789 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatatatgacaacacccatttatattgttcatctccacaacatttacattatcaagaaaa |
3893887 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| |||| || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
3893888 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattc---atcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacat |
3893966 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Original strand, 11514816 - 11514986
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
11514816 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctcctcaacatt-gcattaccaagaaaa |
11514913 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
237 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||||||| || || | | ||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11514914 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaataattaacaatgtca |
11514986 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30263593 - 30263423
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
30263593 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctcctcaacatt-gcattaccaagaaaa |
30263496 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
237 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||||||| || || | | ||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
30263495 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaataattaacaatgtca |
30263423 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26010663 - 26010482
Alignment:
| Q |
62 |
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161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
26010663 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaaca-ttgcattatcaagg |
26010566 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||| || || || || ||| || ||||| || || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26010565 |
aaacatgtccacacacagttacatcaaagcattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatccacaatgtcattcaacat |
26010482 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18255295 - 18255113
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62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag- |
160 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
18255295 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatccccacaaca-ttacattatcaagc |
18255197 |
T |
 |
| Q |
161 |
aaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattca-caataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaac |
243 |
Q |
| |
|
||||||||| || | |||||| | |||||||||| || | || | |||| |||||||||| ||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
18255196 |
aaaacatgcccacatacaaatagattatagtattcatcattcacaccataacttgattatcaacaatcaacaaagacattcaac |
18255113 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 65 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15761839 - 15761672
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15761839 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattt-ctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctcctcatcatttgcattatcaagaaaa |
15761742 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaat |
233 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15761741 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaat |
15761672 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #48
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Query Start/End: Original strand, 62 - 196
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62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
2436315 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
2436413 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattca |
196 |
Q |
| |
|
||| ||| || || ||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
2436414 |
aaaaatgtccacacacaattaattcatagtattca |
2436448 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #49
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Query Start/End: Original strand, 65 - 196
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
13571525 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataagacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
13571622 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattca |
196 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
13571623 |
catgcccaaacacaattaaatcatagtattca |
13571654 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 25293747 - 25293618
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
25293747 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatcttcacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
25293650 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattca |
196 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
25293649 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattca |
25293618 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 240
Target Start/End: Original strand, 10988303 - 10988479
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62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | |||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
10988303 |
aaggactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaag- |
10988399 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataac-ccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattc |
240 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| |||||||||||| || || ||| ||| |||||||||| |||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
10988400 |
gaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacaccaacaacttgattatcaacaatcaataatatcattc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 245
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60 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccaccca-at-tatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | || || ||||||||| || || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16571568 |
acaaagactcgataatgagacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaactttcatatatatattgatcatctcaacaacatttgcattatc |
16571469 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataac-ccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| || || | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16571468 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacctcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
16571380 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 245
Target Start/End: Original strand, 16594094 - 16594282
Alignment:
| Q |
60 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccaccca-at-tatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | || || ||||||||| || || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16594094 |
acaaagactcgataatgagacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaactttcatatatatattgatcatctcaacaacatttgcattatc |
16594193 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataac-ccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| || || | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16594194 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacctcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
16594282 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 168
Target Start/End: Original strand, 13273431 - 13273539
Alignment:
| Q |
60 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
159 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| | | ||||| ||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
13273431 |
acaaagactcgataatgcgacattacttcacaactttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaa |
13273530 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaaaacatg |
168 |
Q |
| |
|
|||| |||| |
|
|
| T |
13273531 |
gaaatcatg |
13273539 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 168
Target Start/End: Original strand, 15629459 - 15629567
Alignment:
| Q |
60 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
159 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
15629459 |
acaaagactcgataatgcgacgtcacttcacaattttcaccacaatatagaggacaactttcaaatatattgatcatttccacaacaattgtattatcaa |
15629558 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaaaacatg |
168 |
Q |
| |
|
|||| |||| |
|
|
| T |
15629559 |
gaaatcatg |
15629567 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15761547 - 15761511
Alignment:
| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15761547 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
15761511 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 245
Target Start/End: Original strand, 15851163 - 15851199
Alignment:
| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15851163 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
15851199 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 39048042 - 39047982
Alignment:
| Q |
185 |
tcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
39048042 |
tcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
39047982 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 49049277 - 49049169
Alignment:
| Q |
60 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
159 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||| |||||| | ||| ||| ||||| || ||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
49049277 |
acaaagactcgataatgcgacatcaactcacaatttccaccacaatataaaggacaactttcaaatatgttgatcatctccaccacaattgcattatcaa |
49049178 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaaaacatg |
168 |
Q |
| |
|
|||| |||| |
|
|
| T |
49049177 |
gaaatcatg |
49049169 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 245
Target Start/End: Original strand, 15629618 - 15629654
Alignment:
| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15629618 |
aacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
15629654 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 163
Target Start/End: Original strand, 13376423 - 13376461
Alignment:
| Q |
125 |
tatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13376423 |
tatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
13376461 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 9058076 - 9058007
Alignment:
| Q |
91 |
aattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
160 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
9058076 |
aattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaag |
9058007 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 245
Target Start/End: Original strand, 13273590 - 13273626
Alignment:
| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
13273590 |
aacatgatcatcaataatcaacaatgtaattcaacat |
13273626 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 59)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 821646 - 821400
Alignment:
| Q |
14 |
ataataaggctattgaattaccnnnnnnntataataaaggactcgtacaaggactcgataatgcgacaacaat---------------ccacaattttca |
98 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
821646 |
ataataaggctattgaattaccaaaaaaagataataaaggactcgtacaaggactcgataatgcgacaacaattcataattttcacctccacaattttca |
821547 |
T |
 |
| Q |
99 |
cctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaca |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
821546 |
cctcaatatatacgacaacatccaattatattgattatcttcacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacc |
821447 |
T |
 |
| Q |
199 |
ataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
821446 |
atcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
821400 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Original strand, 33738948 - 33739135
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
33738948 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccaaaacatttgcattatc |
33739047 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33739048 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcaccttcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
33739135 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12901240 - 12901060
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12901240 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacgacacccaattatattgatcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
12901141 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| |||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
12901140 |
catgcccatacacaaataattcatagcattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatatcattaaacat |
12901060 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 44054612 - 44054792
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44054612 |
gactcgataatgcgacaacaattcccaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
44054711 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44054712 |
catgcccatacacaaataattcatagtattcatcatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
44054792 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 53909238 - 53909058
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53909238 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatacaggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
53909139 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||| ||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53909138 |
catgcccacacacaattaaatcatagcattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
53909058 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 53706261 - 53706079
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53706261 |
aaggactcgataatgcaataataatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaaga |
53706162 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53706161 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaaca |
53706079 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Original strand, 44345510 - 44345698
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
44345510 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatatgggacaacacccaattatattgattatctccacatcatttgcattatc |
44345609 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44345610 |
aagaaatcatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcttcaccacattaacatgattattaataatcaacaatgtcattcaacat |
44345698 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 16521479 - 16521658
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16521479 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
16521577 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16521578 |
catgcccatacacaaataaatcatagtattcactatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
16521658 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 45460432 - 45460244
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45460432 |
gtacaaggactcaataatgcgacgacaattcacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctctacaacatttgcattatc |
45460333 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||| ||| ||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45460332 |
aagaaaacatgtccgtacacaattaaatcataagattcatcatcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
45460244 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15288479 - 15288298
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15288479 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaaact-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
15288382 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15288381 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacccatcaacatgattatgaataatcaacaatgtcattcaacat |
15288298 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 19999215 - 19999395
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19999215 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagc |
19999313 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19999314 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
19999395 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
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Target Start/End: Complemental strand, 7133924 - 7133737
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157 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
7133924 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacatttcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatc |
7133825 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7133824 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaaatcatagtattcaccatcgcacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
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Q |
| |
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gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaaaatttgcattatcaagaaaa |
8873863 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8873862 |
catgcccatacacaattaaatcataggattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
8873782 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
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|
| T |
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
10642972 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattca-caataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || | | ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
10642973 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcatcacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacat |
10643057 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
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Target Start/End: Original strand, 18167481 - 18167660
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
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18167481 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
18167578 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18167579 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
18167660 |
T |
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Target: chr4; HSP #16
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Target Start/End: Complemental strand, 15295589 - 15295408
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161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |
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|
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aaggactcgataatgcgacaacaattcacaaact-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattctcaaga |
15295492 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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|
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15295491 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacctatcaacatgattatgaataatcaacaatgtcattcaacat |
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T |
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Target: chr4; HSP #17
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164 |
Q |
| |
|
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| T |
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gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccataatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
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T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
110270 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
110350 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
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Target Start/End: Complemental strand, 15274226 - 15274048
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164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |
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|
| T |
15274226 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaa |
15274129 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15274128 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
15274048 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
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Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21961036 - 21960856
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |
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|
| T |
21961036 |
gactcgataatgcaacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcttgattatattgatcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
21960937 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
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catgctcatacacaaataaatcatagtattcatcaccacacattatcatgattatcaataatcaacaatgtcatttaacat |
21960856 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||| |||||||||||| |
|
|
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aaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatt-gcattatcaaga |
9294309 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| || || | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
9294310 |
aaacatgctcatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacctcaacatgattatcaataatcaacaatgttattcaacat |
9294393 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
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Target Start/End: Original strand, 10487358 - 10487539
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
10487455 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| || || | | ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
10487456 |
aaacatgctcatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacat |
10487539 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22356033 - 22355852
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161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22356033 |
aaggactcgataatgcgacaacagttcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattggttatctccacaacatt-gcattatcaaga |
22355936 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| || || | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22355935 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacatgattatcaatattcaacaatgtcattcaacat |
22355852 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 26338173 - 26338352
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161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
26338173 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
26338270 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| || || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26338271 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
26338352 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
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161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13245139 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgaaacccaattatattgattatctccac-aca-ttgcattatcaaga |
13245236 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| |||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13245237 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacaaatcaacatgattatcaataatcaacaatgacattcaacat |
13245320 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
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T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| || || | | ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16329295 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
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165 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
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|
| T |
18246881 |
actcgataatgcgacaaaaaatcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaac |
18246978 |
T |
 |
| Q |
166 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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atgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaat-aacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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|||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| || | | ||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |
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|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
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| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |
|
|
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T |
 |
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162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
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Q |
| |
|
|||||||| || || || ||| |||||||||||| | || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
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79 |
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Q |
| |
|
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|
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179 |
aataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
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Q |
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| || | ||| ||||| || ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30233898 |
atcaaattataagattcatcatcaccacatcaacatgactatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
30233831 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
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Target Start/End: Original strand, 8373042 - 8373223
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63 |
aggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
162 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| | || | |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8373042 |
aggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatcttcacatcatttgcattatcaagag |
8373140 |
T |
 |
| Q |
163 |
aacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| || || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8373141 |
aacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacaccgcaacatgattatcaataaccaacaatgtcattcaacat |
8373223 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
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Target Start/End: Complemental strand, 54119732 - 54119599
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62 |
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161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
54119732 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
54119634 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattca |
196 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
54119633 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattca |
54119599 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
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Target Start/End: Original strand, 14994888 - 14995065
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66 |
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165 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14994888 |
actcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatatagattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaac |
14994986 |
T |
 |
| Q |
166 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattca-caataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||||| |||||| ||||| || | | ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14994987 |
atgccc--acacaaataaatcatagcattcatcatcatcacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacat |
14995065 |
T |
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Target: chr4; HSP #33
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Target Start/End: Original strand, 34393744 - 34393924
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65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
34393744 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgctttatcaagaaaa |
34393842 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
34393843 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacat |
34393924 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
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Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25120589 - 25120410
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25120589 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
25120491 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| || || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
25120490 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcgtcaatgtcattcaacat |
25120410 |
T |
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Target: chr4; HSP #35
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Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5684370 - 5684190
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5684370 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttgtccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
5684272 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5684271 |
catgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacat |
5684190 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18495880 - 18495695
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| Q |
60 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
159 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18495880 |
acaaagactcgataatgcgacatctttccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatcttcacaacatttgcattatcaa |
18495781 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| || ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18495780 |
gaaaacatgtccatacccaatcaaatcataagattcattatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaaca |
18495695 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 15212032 - 15212212
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||| | || | |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15212032 |
gactcgataatgcgacaacaatt-acaattttatccacaatatataggacaacatccgattatattgttcatcttcacatcatttgcattatcaagaaaa |
15212130 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||| ||||| || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15212131 |
catgcccacacacaattaaatcataacattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
15212212 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 13049630 - 13049501
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
13049630 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
13049533 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattca |
196 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
13049532 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattca |
13049501 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 148
Target Start/End: Original strand, 26678732 - 26678817
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| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatt |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
26678732 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-acaatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt |
26678817 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13811103 - 13810995
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| Q |
60 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
159 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
13811103 |
acaaagactcgataatgcgacattacttcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgattatttccacaacaattccattatcaa |
13811004 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaaaacatg |
168 |
Q |
| |
|
|||| |||| |
|
|
| T |
13811003 |
gaaatcatg |
13810995 |
T |
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Target: chr4; HSP #41
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Target Start/End: Complemental strand, 13751769 - 13751694
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| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgat |
133 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
13751769 |
gtacaaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataacacaactcccaattatattgat |
13751694 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
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Target Start/End: Complemental strand, 18294578 - 18294455
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117 |
cacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgat |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||| || ||| ||||||| |
|
|
| T |
18294578 |
cacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcataacattcatcatcacc-----acatgat |
18294484 |
T |
 |
| Q |
217 |
tatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
18294483 |
catcaataatcaacaatgttattcaacat |
18294455 |
T |
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Target: chr4; HSP #43
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121 |
caattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatc |
220 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||||| || ||||||||| || | || |||||||||||| |
|
|
| T |
23271335 |
caattatattaattatcttcacaacatt-gcattaacaagaaaacatgcccacacacaaataaatcgtagtattcatcatcgcacaacaacatgattatc |
23271237 |
T |
 |
| Q |
221 |
aataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
23271236 |
aataatcaacaatgttatccaacat |
23271212 |
T |
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Target: chr4; HSP #44
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43282855 |
gactcgataatgcgacatcacctcacaattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcacctccacaacatttgcattatcaagaaa |
43282757 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr4; HSP #45
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65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||| | | |||| ||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
52266938 |
gactcgataatgcgacatcacttcacaattttcaccacaatatagaggataacttccaaatatattgatcatctctacaacaattgcattatcaagaaa |
52266840 |
T |
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aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8373442 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
8373478 |
T |
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aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18294343 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
18294307 |
T |
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aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19019401 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
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T |
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Target: chr4; HSP #49
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209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #50
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212 |
atgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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5684074 |
atgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
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T |
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caattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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caattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctctacaacatttgcattatcaagaaa |
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T |
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Target: chr4; HSP #52
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138 |
tccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattca-caataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtc |
236 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || | | | | |||||||| || || |||||||||||| |
|
|
| T |
8044021 |
tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcatcacctcaacatgatcataaacaatcaacaatgtt |
8044120 |
T |
 |
| Q |
237 |
attcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
8044121 |
attcaacat |
8044129 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 155
Target Start/End: Original strand, 15043631 - 15043721
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcatta |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
15043631 |
gactcgataatgcgacatcacctcacaattttcacaacaatatagaggacaactttcaaatatattgatcatctccacaacaattgcatta |
15043721 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15110793 - 15110703
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcatta |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
15110793 |
gactcgataatgcgacatcacctcacaattttcacaacaatatagaggacaactttcaaatatattgatcatctccacaacaattgcatta |
15110703 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #55
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Query Start/End: Original strand, 125 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 41167352 - 41167314
Alignment:
| Q |
125 |
tatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41167352 |
tatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
41167314 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 163
Target Start/End: Original strand, 27959759 - 27959820
Alignment:
| Q |
102 |
caatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27959759 |
caatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccactacgtttgcattatcaagaaa |
27959820 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 34197605 - 34197544
Alignment:
| Q |
102 |
caatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | |||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34197605 |
caatataaaggacaacttccaaatatattggtcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
34197544 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 209 - 242
Target Start/End: Original strand, 34394031 - 34394064
Alignment:
| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaa |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34394031 |
aacatgattatcactaatcaacaatgtcattcaa |
34394064 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 245
Target Start/End: Original strand, 26678867 - 26678903
Alignment:
| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
26678867 |
aacataattatcaataatcaacaatgtcatgcaacat |
26678903 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0622 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:
Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 8125 - 8305
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8125 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatatagaacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
8224 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8225 |
catgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
8305 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0240 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:
Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Original strand, 6232 - 6419
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6232 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
6331 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6332 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
6419 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0251 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:
Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15338 - 15154
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
15338 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatc |
15240 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15239 |
aagaaaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
15154 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0692 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:
Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 68 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 861 - 686
Alignment:
| Q |
68 |
tcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacat |
167 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
861 |
tcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattacctccacaacatttgcattatcaagaaatcat |
762 |
T |
 |
| Q |
168 |
gctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaac |
243 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||| ||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
761 |
gcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatttacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaac |
686 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0116 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:
Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 28574 - 28756
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
28574 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
28672 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28673 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
28756 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 245
Target Start/End: Original strand, 28868 - 28904
Alignment:
| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28868 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
28904 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:
Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 78241 - 78424
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
78241 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatcatttgcattatcaaga |
78340 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
78341 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcactatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatttcattcaacat |
78424 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 38903 - 39084
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38903 |
gactcgataatgcaacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
39002 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| || || ||| ||| |||||| ||||| || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39003 |
catgtccacacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
39084 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 88 - 245
Target Start/End: Original strand, 44513 - 44671
Alignment:
| Q |
88 |
cacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactca |
187 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||| ||| ||| |
|
|
| T |
44513 |
cacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgtccacacacaattaaatca |
44612 |
T |
 |
| Q |
188 |
tagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||| ||||| || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
44613 |
taggattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatatcattcaacat |
44671 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:
Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 58 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 256384 - 256199
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
256384 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacattt-cattatc |
256286 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaac-aatgtcattcaac |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
256285 |
aagaaaacatgctcatacacaattaattcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaaatgtcattcaac |
256199 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 73 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 262975 - 262805
Alignment:
| Q |
73 |
aatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctca |
172 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
262975 |
aatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattacctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgctca |
262877 |
T |
 |
| Q |
173 |
tacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaac-aatgtcattcaac |
243 |
Q |
| |
|
||| ||| ||| |||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
262876 |
tacacaattaattcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaaatgtcattcaac |
262805 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 124762 - 124581
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
124762 |
aaggactcgataatgtgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccac-aca-ttgcattatcaaga |
124665 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| |||||||||||| || || | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
124664 |
aaacatgcccacacccaattaaatcatagtattcatcatcacacttcaacatgattatcaataatcaacaaaatcattcaacat |
124581 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 193303 - 193484
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
193303 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccac-aca-ttgcattaacaaga |
193400 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| ||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
193401 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcttcaacacacataaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
193484 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 76163 - 75982
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
76163 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggatgacacccaattatattgattatctccac-aca-ttgcattatcaaga |
76066 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| ||||||||||| || || | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
76065 |
aaacatgtccacactcaattaaatcatagtattcttcatcacacttcaacatgattatcaataatcaacaatttcattcaacat |
75982 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:
Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Original strand, 95006 - 95193
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
95006 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccttaatatatagaacaacactcaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
95105 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
95106 |
aagaaaacatgcccatacacagttaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcatttaacat |
95193 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 66907 - 66778
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
66907 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
66810 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattca |
196 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
66809 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattca |
66778 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 245
Target Start/End: Original strand, 95305 - 95341
Alignment:
| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
95305 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
95341 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:
Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 109553 - 109371
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
109553 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
109455 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
109454 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
109371 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 222
Target Start/End: Original strand, 54330 - 54486
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54330 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
54428 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaa |
222 |
Q |
| |
|
||||| ||| | || ||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54429 |
catgcacattcataattaaatcatagtattcatcattacacattaacatgattatcaa |
54486 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0673 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:
Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2317 - 2129
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
2317 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccacttatattgattatctccacatcatttgcattatc |
2218 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || ||| ||| | |||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2217 |
aagaaaacatgcccacacacaattaaattatagcattcatcatcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
2129 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0480 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:
Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6837 - 6649
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| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6837 |
gtacaaggactcgataatgctacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatcatttgcattatc |
6738 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||| ||| |||||| || || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6737 |
aagaaaacatgcctatacacaattaaatcatagcatccatcatcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
6649 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0234 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:
Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19050 - 18867
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19050 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatgtccacatcatttgcattatcaaga |
18951 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
18950 |
aaacatgcacatgcacaaataaatcatagtattcacaattacacattaacatgattatcaataatcaacaatgttatccaacat |
18867 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18756 - 18720
Alignment:
| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18756 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
18720 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0078 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:
Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 38807 - 38621
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38807 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccataatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatc |
38709 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38708 |
aagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
38621 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 40184 - 40363
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40184 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacagccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
40282 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||| | ||| ||| |||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
40283 |
catgtccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcagcaatgtcattcaacat |
40363 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0037 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:
Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26200 - 26014
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
26200 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctaaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatc |
26102 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| || |||| |||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26101 |
aagaaaacatgtctatacacagataaatcatagtattcatcatcacacattatcatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
26014 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 70873 - 70686
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||| || || ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
70873 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaagtttctcctcaatatataggataacacccatttatattaatcatctccacaacatttgaattatc |
70774 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
70773 |
aagaaatcatgtccatacacaaataaatcatagtattcatcatcacacattatcatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
70686 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:
Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 21351 - 21531
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21351 |
gactcgataatacgacaacaaaccacaattttcacttcagtatataggacaacaccgaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
21450 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21451 |
catgcacatacacaaataaatcatagtattcatcatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
21531 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 129668 - 129538
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
129668 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaacaaaa |
129570 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaat-aactcatagtattc |
195 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| | || ||||||||||| |
|
|
| T |
129569 |
catgcccatacacaattaaaatcatagtattc |
129538 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0359 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:
Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13217 - 13030
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |
|
|
| T |
13217 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccataattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctcaacaacatttgcattgtc |
13118 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13117 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcttcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
13030 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 245
Target Start/End: Original strand, 161 - 197
Alignment:
| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
161 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
197 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 56)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 36892185 - 36891999
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
36892185 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaactcccaattatattgattatctccacaacattttcattatc |
36892086 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| || || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36892085 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatcacaca-tcacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
36891999 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5889765 - 5889585
Alignment:
| Q |
62 |
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161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
5889765 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
5889667 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5889666 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
5889585 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 34822886 - 34823067
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
34822886 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
34822983 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| || || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34822984 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
34823067 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 64 - 245
Target Start/End: Original strand, 24966987 - 24967168
Alignment:
| Q |
64 |
ggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24966987 |
ggactcgataatgcgaccacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
24967086 |
T |
 |
| Q |
164 |
acatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| | ||||| |||||||||||| | || | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
24967087 |
acatgcccatacacgaataaatcatagtattcatcaccacacgttatcatgattatcaataatcaacaacatcattcaacat |
24967168 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3800581 - 3800401
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3800581 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
3800483 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
3800482 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaaccatgtcatgcaacat |
3800401 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21275995 - 21275815
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
21275995 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
21275897 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21275896 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
21275815 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 25600652 - 25600832
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25600652 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaatttttaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccgcaacatttgcattatcaagaaaa |
25600751 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || |||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25600752 |
catgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
25600832 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 12726741 - 12726922
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
12726741 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
12726838 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| || |||||||||| || || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12726839 |
aaacatgcccatacacaattaaatcttagtattcaccatcacacttcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
12726922 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 8942334 - 8942517
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
8942334 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatca-ttgcattatcaaga |
8942432 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaat-aacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || | | ||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
8942433 |
aaacatgctcatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacatcaacatgatcatcaataatccacaatgttattcaacat |
8942517 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 8886832 - 8887011
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8886832 |
gactcgataatgcgataacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
8886930 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8886931 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
8887011 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 66 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19888243 - 19888068
Alignment:
| Q |
66 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
165 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19888243 |
actcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaac |
19888146 |
T |
 |
| Q |
166 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19888145 |
atgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
19888068 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 66 - 245
Target Start/End: Original strand, 21140569 - 21140744
Alignment:
| Q |
66 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
165 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
21140569 |
actcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaag-aaac |
21140666 |
T |
 |
| Q |
166 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21140667 |
atgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
21140744 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 461426 - 461607
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
461426 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccac-aca-ttgcattatcaaga |
461523 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| |||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
461524 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcaacacacatcaacatgattatcaataatcaacaatttcattcaacat |
461607 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 65 - 242
Target Start/End: Original strand, 22862179 - 22862355
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22862179 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacactcaattatattgtttatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
22862277 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaa |
242 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||| ||| |||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
22862278 |
catgctcattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcaacaatttcattcaa |
22862355 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4449698 - 4449519
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4449698 |
gactcgataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaacttccaattatattgatcattttcgcaacatttgcattatcaagaaaa |
4449599 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || |||||| ||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4449598 |
catgtccatacacaaccaa-tcatagaattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
4449519 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12643491 - 12643313
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
12643491 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaa |
12643394 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| || || ||| ||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12643393 |
catggccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
12643313 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14907907 - 14907726
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14907907 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
14907810 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| || || | | ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
14907809 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacat |
14907726 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 20013810 - 20013991
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20013810 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
20013907 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| || || | | ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20013908 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacat |
20013991 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
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Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 23818867 - 23819048
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| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23818867 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
23818964 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| || || | | ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23818965 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacat |
23819048 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
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Query Start/End: Original strand, 66 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 43644442 - 43644264
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66 |
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165 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43644442 |
actcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaac |
43644344 |
T |
 |
| Q |
166 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||| | ||| ||| |||||| ||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
43644343 |
atgcccattcacaattaaatcatagcattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacattgtcattcaacat |
43644264 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25877399 - 25877238
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183 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |
|
|
| T |
25877399 |
aatccacaattttcacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatggccatacacaattaa |
25877301 |
T |
 |
| Q |
184 |
ctcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaac-aatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
25877300 |
ttcatagtattcattatcacacatcaacatgattatcaataatcaacgaatgtcattcaacat |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
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Target Start/End: Complemental strand, 12637633 - 12637453
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacc-caattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
160 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| | |||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |
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| T |
12637633 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggataacaccaccattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaag |
12637536 |
T |
 |
| Q |
161 |
aaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12637535 |
aaaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
12637453 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
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Target Start/End: Original strand, 22273577 - 22273756
Alignment:
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65 |
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164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||| |
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|
| T |
22273577 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcattcgcattatcaagaaaa |
22273675 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22273676 |
catgcacattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacat |
22273756 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
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161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
11232720 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
11232623 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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|||||||| | || ||||||| |||||||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
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|
| T |
11232622 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacat |
11232542 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
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Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22514567 - 22514389
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161 |
Q |
| |
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|
|
| T |
22514567 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
22514470 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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|||||||| | || ||||||| |||||||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
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|
| T |
22514469 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacat |
22514389 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
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Target Start/End: Original strand, 23773225 - 23773404
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161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
23773225 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctcgacaaca-ttgcattatcaaga |
23773322 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
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|||||||| | || ||||||| |||||||||||| || || ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23773323 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttataaataatcaacaatgtcattcaacat |
23773404 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
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Target Start/End: Complemental strand, 24687136 - 24686957
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| Q |
62 |
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161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24687136 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
24687039 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| ||||||| |||||||||||| || || ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
24687038 |
aaacatg--cctacacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttaccaataatcaacaatgtcatccaacat |
24686957 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
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| Q |
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165 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24828034 |
actcgataatgcgacaacaatccacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaac |
24827936 |
T |
 |
| Q |
166 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattca-caataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||||| |||||| ||||| || | | ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
24827935 |
atgccc--acacaaataaatcatagcattcatcatcatcacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacat |
24827857 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #29
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| Q |
65 |
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164 |
Q |
| |
|
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|
| T |
15632088 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattctcaacacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcaattgcattatcaagaaaa |
15632186 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
15632187 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcccacattaacatgattatcaataatcaacgacatcattcaacat |
15632267 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
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Target Start/End: Original strand, 22282810 - 22282989
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||| |
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|
| T |
22282810 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccataatatataggacagcacctaattatattgttcatctccacatcatttgctttatcaagaaaa |
22282908 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22282909 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacat |
22282989 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #31
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| Q |
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161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
28777168 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
28777071 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||| ||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
28777070 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagaattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacat |
28776990 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
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Query Start/End: Original strand, 58 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 22691426 - 22691316
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157 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22691426 |
gtacaaagactcgataatgcgacaacaatccacagttttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatc |
22691327 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatg |
168 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
22691326 |
aagaaaacatg |
22691316 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
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| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22696073 |
gtacaaagactcgataatgcgacaacaatccacagttttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatc |
22695974 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatg |
168 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
22695973 |
aagaaaacatg |
22695963 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #34
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20628864 |
aaggactcgataatgtgacaacaatccactatttcaacctcaatatataggacgatacccaattatattgattatctccac-aca-ttgcattatcaaga |
20628767 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| |||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20628766 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacat---catgattatcaataatcaacaatgacattcaacat |
20628686 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #35
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27260274 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccataatatataggacaactcccaattatattgaccatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
27260373 |
T |
 |
| Q |
165 |
catg |
168 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
27260374 |
catg |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #36
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acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
159 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7320174 |
acaaagactcgataatgcgacaccaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgataatctccacaacatttgcattatcaa |
7320273 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataac-ccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7320274 |
gaaaacatgtccatacaaaatcaaatcataagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
7320360 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #37
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164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6878134 |
gactcgataatgcgaccacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcctttgcattatcaagaaaa |
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T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || ||| |||||| ||||| || || ||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6878233 |
catgtccatacataattaaatcatagcattcatcatcgccacatcaatatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #38
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
269878 |
gactcgataatgcgaccacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcacctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
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T |
 |
| Q |
165 |
catg |
168 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
269978 |
catg |
269981 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #39
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
9654296 |
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9654198 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattca |
196 |
Q |
| |
|
||||| ||| | || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
9654197 |
catgcccattcataattaaatcatagtattca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #40
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
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165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattca |
196 |
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| |
|
||||| || || || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
17397963 |
catgcccacacacagttaaatcatagtattca |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #41
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Target Start/End: Complemental strand, 24572865 - 24572679
Alignment:
| Q |
60 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
159 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24572865 |
acaaagactcgataatgcgataacacttcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccatatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaa |
24572766 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataac-ccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| || ||| | ||||| || || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
24572765 |
gaaaacatgtccatacacaatcaaatcacaagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaaaaatcaacaatgtcattcgacat |
24572679 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22581402 - 22581221
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22581402 |
gactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccatatatattgatcatctccacaacgtttgcattatcaagaaaa |
22581303 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataac-ccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || || ||||| ||||| | || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22581302 |
catgtccatacataatcaaatcataagattcattctcacaacatcaacatgatcatcaacaatcaacaatgtcattcaacat |
22581221 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 245
Target Start/End: Original strand, 28972727 - 28972911
Alignment:
| Q |
60 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
159 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
28972727 |
acaaagactcgataatgcgacaccaatccacaattttcaccacaatatagaggacaacatccatatatattgatcatctccac-acatttgcattactaa |
28972825 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataac-ccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28972826 |
g-aaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacatcgacatgattatcaacaatcaacaatgtcattcaacat |
28972911 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 160
Target Start/End: Original strand, 721162 - 721257
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
721162 |
gactcgataatgcgacatcactacacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattaccaag |
721257 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 112
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| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatatagg |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22692978 |
aaggactcgataatgcaacaacaatccacaatttcaacctcaatatatagg |
22693028 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 112
Target Start/End: Original strand, 22697625 - 22697675
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| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatatagg |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22697625 |
aaggactcgataatgcaacaacaatccacaatttcaacctcaatatatagg |
22697675 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #47
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| Q |
90 |
caattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23822967 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
23822894 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 23824911 - 23824838
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| Q |
90 |
caattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23824911 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
23824838 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
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Target Start/End: Complemental strand, 23832046 - 23831973
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| Q |
90 |
caattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23832046 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
23831973 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 163
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| |||| | |||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22787506 |
gactcgataatgcgacatcaactcacagtcttcaccacaatatagaggacgacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattaccaagaaa |
22787408 |
T |
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Back To:
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Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 19670576 - 19670515
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| Q |
102 |
caatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19670576 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
19670515 |
T |
 |
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Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 24088810 - 24088752
Alignment:
| Q |
102 |
caatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
160 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
24088810 |
caatataaaggacaacttccaattatattgattatctccacaacaattgcattaccaag |
24088752 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #53
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Target Start/End: Complemental strand, 4735 - 4663
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| Q |
90 |
caattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
4735 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaaca-ttgcattatcaagaaa |
4663 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #54
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Query Start/End: Original strand, 148 - 241
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| Q |
148 |
ttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| || || ||| ||| |||||||||||| || || | |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22693040 |
ttgcattaccaaggaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacataataacttgattatcaacaatcaacaatatcattca |
22693133 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #55
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| Q |
148 |
ttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| || || ||| ||| |||||||||||| || || | |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22697687 |
ttgcattaccaaggaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacataataacttgattatcaacaatcaacaatatcattca |
22697780 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 90 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 24296031 - 24295958
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| Q |
90 |
caattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24296031 |
caattttcacaacaatataaaggacaactttcaaatatattgatcatctccaaaacatttgcattatcaagaaa |
24295958 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:
Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 66 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 155821 - 155645
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| Q |
66 |
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165 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
155821 |
actcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaac |
155723 |
T |
 |
| Q |
166 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
155722 |
atgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
155645 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 914 - 735
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| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
914 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
817 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
816 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcatccaacat |
735 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 196
Target Start/End: Original strand, 35023 - 35155
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| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
35023 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
35120 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattca |
196 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
35121 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagttttca |
35155 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:
Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Original strand, 87127 - 87311
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| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
87127 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggagaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcat--tc |
87223 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
87224 |
aagaaaacatgtccatacacaaataaatcgtagtattcatcatcacacattatcatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
87311 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 138286 - 138101
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| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
138286 |
gtacagggactcgataatgcgacaacaatccacaattt-cacttcaatatataggacaacacctaattatattgattatctccacaacatt-gtattatc |
138189 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
138188 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
138101 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 242
Target Start/End: Original strand, 10351 - 10535
Alignment:
| Q |
59 |
tacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatca |
158 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10351 |
tacaaagactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccatatatattgatcatctccacaacatttgcattatca |
10450 |
T |
 |
| Q |
159 |
agaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaa |
242 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| || |||| ||||| || ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10451 |
agaaaacatatccatacacaatcaaagcataagattcattatcaccatatcaacatgattatcaacaatcaacaatgtcattcaa |
10535 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 113
Target Start/End: Original strand, 77069 - 77124
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatatagga |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
77069 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatatagga |
77124 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:
Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 71921 - 71741
Alignment:
| Q |
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
71921 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaattttcaccacaatatataggataactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
71822 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| |||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
71821 |
catgctcatacacaaataattcatagtattcatcatcgcacattaatatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
71741 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0395 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:
Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Original strand, 14364 - 14552
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14364 |
gtacaaggactcgacaatgcgacaacaattcacaattttctcctcaatatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaatatttgcattatc |
14463 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataa-tcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14464 |
aagaaatcatgtctatacacaaataaatcatagtattcatcatcacacattaacatgattatcaataattcaacaatgtcattcaacat |
14552 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0103 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:
Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Original strand, 32268 - 32455
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32268 |
gtacaaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatc |
32367 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||| ||||| || || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32368 |
aagaaaacatgtacatacacaatcaaatcataggattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcgacaatgtcattcaacat |
32455 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:
Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 90353 - 90174
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
90353 |
aaggactcgataatgcgacaa---tccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
90258 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||| |||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
90257 |
aaacatgcccacacacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
90174 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 129075 - 129255
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
129075 |
aaggactcgataatgcgacaacaattaacaatctcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
129173 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||| |||||| || | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
129174 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagcattcaccatcatgcctcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
129255 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 163
Target Start/End: Original strand, 78410 - 78471
Alignment:
| Q |
102 |
caatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
78410 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
78471 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0383 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0383
Description:
Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 1057 - 1236
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1057 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
1155 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| || ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1156 |
catgcccatacacaatcaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
1236 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 5926 - 6103
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5926 |
gactcgataatgcgacaacaatct-caattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
6024 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| |||| || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6025 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattc---atcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacat |
6103 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0383; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 245
Target Start/End: Original strand, 1347 - 1383
Alignment:
| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1347 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
1383 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0190 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:
Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 8771 - 8951
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8771 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
8870 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||||||||| || || ||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8871 |
catgtccatacacaattaattcatagtattcatcatcacacatcatcatgttcatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
8951 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0302 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:
Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 4530 - 4713
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
4530 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-tagcattatcaaga |
4628 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattca-caataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| || | || || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4629 |
aaacatgcccacacacaaatagatcatagtattcaccattcacacaataacttgattatcaacaatcaacaatgtcattcaacat |
4713 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0124 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:
Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3045 - 2866
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3045 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
2948 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2947 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
2866 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23168 - 22997
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23168 |
gactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgctttatcaagaaaa |
23069 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
241 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23068 |
catgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcac-----aacatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
22997 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:
Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27983 - 27802
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
27983 |
aaggactcgataatgggacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccaca-catt-gcattatcaaga |
27886 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| |||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27885 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
27802 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0106 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:
Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 65 - 243
Target Start/End: Original strand, 40291 - 40468
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40291 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaaaacccaattatattgttcatctacacaacatttgcattatcaagaaaa |
40389 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaac |
243 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||| ||| |||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40390 |
catgctcattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaac |
40468 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0083 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:
Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 12891 - 13071
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12891 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
12989 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12990 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcacctcatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
13071 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0761 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:
Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3163 - 2980
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3163 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacactcaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
3065 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattca-caataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||| | || | || ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3064 |
aaacatgcccacacacaaatagatcatagtatttaccattcacacattaacttgattatgaacaatcaacaatgtcattcaacat |
2980 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0315 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:
Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 17340 - 17519
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17340 |
gactcgataatgcgacaacaatcc-caattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
17438 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17439 |
catgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacaactcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
17519 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:
Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 145223 - 145402
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| ||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
145223 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatatgcattattaagaaaa |
145321 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
145322 |
catgcccatacataaataaatcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgttatccaacat |
145402 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 229
Target Start/End: Original strand, 147482 - 147646
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||| | || |||||| ||| |||||||||||||||| |
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| T |
147482 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggaaaacacccaattatattgttcatctccacatcatatgcattatcaagaaaa |
147580 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaa-ataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaa |
229 |
Q |
| |
|
||||| || | ||| ||| |||||||||||| | || ||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
147581 |
catgccaattcacaatttaaatcatagtattcatcaccacacatcaacatgattatcaacaatcaa |
147646 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 245
Target Start/End: Original strand, 145513 - 145549
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| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
145513 |
aacatgattatcaataatcaacaaggtcatttaacat |
145549 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0003 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:
Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
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Target Start/End: Original strand, 5874 - 6049
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66 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
165 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
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| T |
5874 |
actcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaac |
5971 |
T |
 |
| Q |
166 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||| | ||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5972 |
atgcccacac--aaataaattatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
6049 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 217218 - 217041
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
217218 |
gactcgataatgcgacaacaatc-ataattttctccataatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
217120 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaat-aactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaa |
242 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| | || |||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
217119 |
catgcccatacacaattaaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgtttatcaataatcaacaatgtcattcaa |
217041 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1140 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1140
Description:
Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 1873 - 2054
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| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1873 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccac-aca-ttgcattatcaaga |
1970 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| ||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
1971 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcttcaacacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttattcaacat |
2054 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:
Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 63 - 245
Target Start/End: Original strand, 69456 - 69638
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| Q |
63 |
aggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
162 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
69456 |
aggactcgatagtgcgacaacaattcacaattttaaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaa |
69555 |
T |
 |
| Q |
163 |
aacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||| || |||||| ||||| || || ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
69556 |
aacatgtccatacacaatcaaatcataggattcatcatcacacatcatcatgataatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
69638 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 65 - 242
Target Start/End: Original strand, 30768 - 30946
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30768 |
gactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
30867 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaa |
242 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| ||||| || ||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30868 |
catgtccatacacaatcaaatcataacattcattatcaccacatgaacaagatcatcaataatcaacaatgtcattcaa |
30946 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0597 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:
Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 72 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2593 - 2421
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| Q |
72 |
taatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctc |
171 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
2593 |
taatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgtcc |
2495 |
T |
 |
| Q |
172 |
atacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| || ||| ||||||||||||| || || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2494 |
atacacatttaaatcatagtattcaccatcacacatcaatatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
2421 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0338 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:
Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 7485 - 7666
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65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7485 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggaccactcccaattatattgatcatctccaaaacatttgcattatcaagaaaa |
7584 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||| | ||| || ||||| ||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7585 |
catgtccatgcacaatcaaatcataagattcatcatcaccacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
7666 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1404 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:
Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 244 - 427
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| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
244 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-taacattatcaaga |
342 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattca-caataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||| | || || |||||| |||||||||||| || | || || |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
343 |
aaacatacccacacacaaatagatcatagtattcaccattcacacaataacttgattatcaacaatcaataatgtcattcaacat |
427 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 4)
Name: scaffold0195
Description:
Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 8123 - 7943
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8123 |
gactcaataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
8024 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || |||||| ||||| || || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8023 |
catgtccatacacaatcaaatcataggattcattatcacacatcaacacgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
7943 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13512 - 13332
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13512 |
gactcaataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
13413 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || |||||| ||||| || || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13412 |
catgtccatacacaatcaaatcataggattcattatcacacatcaacacgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
13332 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195; HSP #3
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Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 18000 - 18179
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18000 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
18098 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|| || ||| | ||| ||| |||||||||||| | || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18099 |
caagcacatccacaattaaatcatagtattcatcctcacacatcaagatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
18179 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 20084 - 20263
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20084 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
20182 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|| || ||| | ||| ||| |||||||||||| | || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20183 |
caagcacatccacaattaaatcatagtattcatcctcacacatcaagatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
20263 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0138 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 6)
Name: scaffold0138
Description:
Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
14735 |
aaggactcgataatgcgacaaaaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacctaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaag- |
14638 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatg |
234 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| |||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14637 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatg |
14565 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0138; HSP #2
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Target Start/End: Original strand, 28261 - 28370
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tccacaacatttgcattatcaagaaa-acatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgt |
235 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28261 |
tccacatcatttgcattatcaagcaatacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgt |
28360 |
T |
 |
| Q |
236 |
cattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
28361 |
tattcaacat |
28370 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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tccacaacatttgcattatcaagaaa-acatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgt |
235 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40257 |
tccacatcatttgcattatcaagcaatacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgt |
40356 |
T |
 |
| Q |
236 |
cattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
40357 |
tattcaacat |
40366 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0138; HSP #4
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102 |
caatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23862 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgattatctccataacatttgcattatcaagaaa |
23801 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0138; HSP #5
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209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28483 |
aacatgattatcactaatcaacaatgtcattcaacat |
28519 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0138; HSP #6
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aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaa |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aacatgattatcactaatcaacaatgtcattcaa |
40512 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0107 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
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Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
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62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
30041 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
30138 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
30139 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcatccaacat |
30220 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0018 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:
Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 52743 - 52564
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
52743 |
gactcgataatgtgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcattcgcattatcaagaaaa |
52645 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52644 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacaacaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
52564 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 56695 - 56516
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
56695 |
gactcgataatgtgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcattcgcattatcaagaaaa |
56597 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
56596 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacaacaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
56516 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0218 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:
Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6620 - 6439
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
6620 |
aaggactcgataatgcgacaataatccacaatttcaacctcaatatataggacgacgcccaattatattgattatctccac-aca-ttgcattatcaaga |
6523 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| |||||||||||| | || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6522 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcaacacacatcaacaagattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
6439 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0141 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:
Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 25591 - 25772
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || || | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
25591 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatgtcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
25688 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| || || | | ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
25689 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacat |
25772 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 21336 - 21517
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| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| || || | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21336 |
aaggactcgataatgcgataacaatc-accatgtcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
21433 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| || || | | ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21434 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacat |
21517 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0407 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:
Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 73 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 6069 - 5902
Alignment:
| Q |
73 |
aatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctca |
172 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
6069 |
aatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccac-aca-ttgcattatcaagaaaacatgccca |
5972 |
T |
 |
| Q |
173 |
tacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaa |
242 |
Q |
| |
|
|| ||| ||| |||||||||| | || || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5971 |
cacacaattaaatcatagtatttatcatcacacctcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaa |
5902 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0132 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:
Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 41399 - 41579
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41399 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttaatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
41497 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||| | ||| || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41498 |
catgcccattcacaattaagtcatagcactcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
41579 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0465 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:
Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11394 - 11215
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11394 |
gactcgataatgcgacaaaaatc-acaattttctccacaatatataggacaagacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
11296 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||| | || ||| |||||||||||| || || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11295 |
catgcccattcataattaaatcatagtattcaacattacacatcaacaagattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
11215 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0184 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:
Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32660 - 32481
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32660 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacagccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
32562 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||| | ||| ||| |||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
32561 |
catgtccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcagcaatgtcattcaacat |
32481 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 58 - 169
Target Start/End: Original strand, 34037 - 34147
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34037 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccataatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatc |
34135 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgc |
169 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
34136 |
aagaaaacatgc |
34147 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0076 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:
Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 37977 - 38155
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| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
37977 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
38074 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
38075 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacat |
38155 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:
Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 249008 - 248829
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
249008 |
gactcgataatgcaacaaaaatc-acaattttctccacaatatataagacaacacccaattatattgttcattcccacatcatctgcattatcaagaaaa |
248910 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
248909 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
248829 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0447 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0447
Description:
Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 3318 - 3495
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3318 |
gactcgataatgcgacaacaatct-caattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
3416 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| |||| || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
3417 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattc---atcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacat |
3495 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0068 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:
Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 46819 - 46998
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | || |||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
46819 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaat-atattgttcatctccacatcatttgcattatgaagaaaa |
46916 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||| | || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46917 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattaatcatcaccacattaacatgattatcaataattaacaatgtcattcaacat |
46998 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 60267 - 60446
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | || |||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
60267 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaat-atattgttcatctccacatcatttgcattatgaagaaaa |
60364 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||| | || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
60365 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattaatcatcaccacattaacatgattatcaataattaacaatgtcattcaacat |
60446 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1753 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:
Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 154 - 333
Alignment:
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65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| | |||| |||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
154 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaactcccagttatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
252 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||| ||||| || ||| ||||||||| ||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
253 |
tatgtccatacataattaaatcatagtatccaccatcacacatcgacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
333 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0434 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:
Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Original strand, 3352 - 3528
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
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Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3352 |
gactcgataatgcaacaacaatacaaaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatatccacaacatttgcattatcaagaaaa |
3451 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
241 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||| || |||||| |||| || || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3452 |
tatgtccatacacaatcaattcatagcattcctcatcacacatcaacatgattatcgataatcaacaatgtcattca |
3528 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0610 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:
Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 2095 - 1916
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2095 |
gactctataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctcgacaacatttgcattatcaagaaaa |
1996 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaaca |
244 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || |||||| ||||| || || ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1995 |
catgtccatacacaatcaaatcataggattcattatcacacatcaacacgattatcaataatcaacaatgtcactcaaca |
1916 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:
Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Original strand, 106689 - 106867
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
106689 |
aaggactcgataatgcgacaaaaatccacagtttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
106787 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||| |||||||||||| || || | |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
106788 |
aaacatgcccacacacaaataaatcatagtattcatcatcacataataacttgattatcaacaatcaacaatatcattca |
106867 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0213 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:
Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 27714 - 27894
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27714 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
27812 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattca-caataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||||||||| || | || | |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27813 |
catgtccatacacaattaaatcatagtattcaccattcacaaaataacttatttatcaaaaatcaacaatgtcattcaacat |
27894 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0396 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0396
Description:
Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Original strand, 16132 - 16311
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
16132 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatcttcacaaca-ttgcattaccaagg |
16230 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataac-ccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||| |||||||||||| || || | |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16231 |
aaacatgcccacacacaaataaatcatagtattcatcatcacataaataacttgattatcaacaatcaacaatatcattca |
16311 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0396; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 68 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13660 - 13483
Alignment:
| Q |
68 |
tcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacat |
167 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
13660 |
tcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaatat |
13562 |
T |
 |
| Q |
168 |
gctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
| || || ||| ||| |||||| ||||| || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
13561 |
gtccacacccaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattccacat |
13483 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:
Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 270813 - 270994
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| | || |||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
270813 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaaaacccaattatattgttcatctccatatcatttgcattatcaagaaaa |
270911 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaat-aactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| | || ||||||||||| || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
270912 |
catgcccatacacaattaaaaccatagtattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacat |
270994 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 236874 - 237054
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
236874 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaatttccaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcttttgcattatcaagaaaa |
236972 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||| ||||| || ||| |||||| ||||| || || ||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
236973 |
tatgtccatacataattaaatcatagcattcatcatctccacatcaatatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacat |
237054 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0051 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:
Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 73 - 190
Target Start/End: Original strand, 58899 - 59016
Alignment:
| Q |
73 |
aatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctca |
172 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
58899 |
aatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataagacgacacccaattatattgatcatctccgcatcatttgcattatcaagaaaacatgccca |
58998 |
T |
 |
| Q |
173 |
tacgcaaataactcatag |
190 |
Q |
| |
|
||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
58999 |
tacacaaataattcatag |
59016 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:
Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6620 - 6441
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6620 |
aaggactcaataatgcgacaacaattcacaatatcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagg |
6522 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataac-ccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||| ||| |||||||| || || | |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
6521 |
aaacatgcccacacacaaataaatcaaagtattcatcatcacataaataacttgattatcaacaatcaacaatatcattca |
6441 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 106370 - 106297
Alignment:
| Q |
90 |
caattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
106370 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
106297 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 113883 - 113847
Alignment:
| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
113883 |
aacatgattatcaattatcaacaatgtcattcaacat |
113847 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0104 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:
Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Original strand, 51719 - 51897
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
51719 |
aaggaatcaataatgcgacaacaattcacaatatcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
51817 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||| |||||||||||| || || | |||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
51818 |
aaacatgcccacacacaaataaatcatagtattcatcatcacataataacttggttatcaacaatcaacaatatcattca |
51897 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0462 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:
Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 196
Target Start/End: Original strand, 4823 - 4953
Alignment:
| Q |
66 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
165 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4823 |
actcgataacacgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacatcatttgcattatcaagaaaac |
4922 |
T |
 |
| Q |
166 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattca |
196 |
Q |
| |
|
|||| || |||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
4923 |
atgcccacacgcaatcaattcatagtattca |
4953 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0467 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:
Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11504 - 11325
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
11504 |
gactcgataatgcaacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttaatctccacatcatttgcattatcaaggaaa |
11406 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||| || | ||| ||| |||||||||||| || || | | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
11405 |
catgcccacatacaattaaatcatagtattcatcatcacacctcaacatatttatcaataatcaacaatgtcatccaacat |
11325 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0413 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:
Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 9397 - 9291
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
9397 |
aaggactcgataatgctacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacagcacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
9299 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgc |
169 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
9298 |
aaacatgc |
9291 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0039 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:
Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 138 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20692 - 20585
Alignment:
| Q |
138 |
tccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
237 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20692 |
tccacaacacttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataaattatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
20593 |
T |
 |
| Q |
238 |
ttcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
20592 |
ttcaacat |
20585 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 20716 - 20686
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaa |
92 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20716 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaa |
20686 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0269 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0269
Description:
Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 65 - 175
Target Start/End: Original strand, 771 - 880
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
771 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
869 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatac |
175 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |
|
|
| T |
870 |
catgcccatac |
880 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 65 - 175
Target Start/End: Original strand, 15027 - 15136
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15027 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
15125 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatac |
175 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |
|
|
| T |
15126 |
catgcccatac |
15136 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0225 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:
Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 148
Target Start/End: Original strand, 14987 - 15073
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatt |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
14987 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacttcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt |
15073 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0498 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:
Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 229
Target Start/End: Original strand, 7673 - 7837
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| | | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7673 |
gactcgataatacgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatatagttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
7771 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaat-aactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaa |
229 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| | || |||||||||||| | || || |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
7772 |
catgcccatacacaattaaaatcatagtattcatcaccacacaacaacatgattatcaacaatcaa |
7837 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0750 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:
Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6805 - 6634
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6805 |
gactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccacaaaatttgcattatcatgaaaa |
6706 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
241 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6705 |
catgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcac-----aacatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
6634 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0483 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:
Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 4218 - 4092
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||| | || |||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
4218 |
gactcgataatgcgacaagaatc-acaattttctcctcaatatatatgacaacacccgattatattgttcatctccacatcatttgcattaccaagaaaa |
4120 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagta |
192 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
4119 |
catgcgcatacacaattaaatcatagta |
4092 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0266 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:
Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5067 - 4902
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5067 |
gactcgacaatgcgacaataatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
4969 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaa--ataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaa |
229 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| | || |||||||||||| | | ||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
4968 |
catgcccatacacaattaaaaatcatagtattcatcaccgcacatcaacatgattatcaacaatcaa |
4902 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0215 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:
Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17561 - 17380
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
17561 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaatgatattgatcatctccacaaca-ttgcattatcaagg |
17464 |
T |
 |
| Q |
162 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||| | || || || ||| || ||||| || || ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17463 |
aaacatgtctacacacagttacatcacagcattcatcatcacacatcaacacgattatcagtaatcaacaatgtcattcaacat |
17380 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0109 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:
Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 49058 - 48932
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||| | || |||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
49058 |
gactcgataatgcgacaagaatc-acaattttctcctcaatatatatgacaacacccgattatattgttcatctccacatcatttgcattaccaagaaaa |
48960 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaaataactcatagta |
192 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
48959 |
catgcgcatacacaattaaatcatagta |
48932 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0342 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:
Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 179
Target Start/End: Original strand, 4534 - 4648
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
4534 |
gactcgataatgtgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattattttgatcatctccacaacatttgcatcatcaataaaa |
4633 |
T |
 |
| Q |
165 |
catgctcatacgcaa |
179 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |
|
|
| T |
4634 |
tatgtccatacgcaa |
4648 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1560 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:
Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 1263 - 1124
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattt-----tcac-ctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcatta |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
1263 |
aaggactcgataatgcgaccacaattcacaatttcaatctcaatctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcatta |
1165 |
T |
 |
| Q |
156 |
tcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattca |
196 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| || || ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1164 |
ccaaggaaacatgcccacacacaaataaatcatagtattca |
1124 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0589 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0589
Description:
Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 168
Target Start/End: Original strand, 6570 - 6678
Alignment:
| Q |
60 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
159 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
6570 |
acaaagactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgaattatcaa |
6669 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaaaacatg |
168 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
6670 |
gaaaacatg |
6678 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0589; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 245
Target Start/End: Original strand, 6725 - 6765
Alignment:
| Q |
205 |
cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6725 |
catcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
6765 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:
Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 58 - 134
Target Start/End: Original strand, 27260 - 27336
Alignment:
| Q |
58 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgatt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27260 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctcctcaatatataggacaaaacccaattatattgatt |
27336 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 128 - 245
Target Start/End: Original strand, 29942 - 30060
Alignment:
| Q |
128 |
attgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataa-t |
226 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
29942 |
attgatcatctccacaacatttgcattatcataaaatcatgtccatacacaaataaatcatagtattcatcatcacacattaacatgattaccaataatt |
30041 |
T |
 |
| Q |
227 |
caacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30042 |
caacaatgtcattcaacat |
30060 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0004 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:
Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 65 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 197572 - 197482
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattat |
156 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
197572 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattat |
197482 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0183 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:
Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 78 - 238
Target Start/End: Original strand, 5700 - 5857
Alignment:
| Q |
78 |
gacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacc-caattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacg |
176 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
5700 |
gacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacaccaccattatattgattatctcaacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacac- |
5796 |
T |
 |
| Q |
177 |
caaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
238 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| | || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5797 |
-aaataaatcatagtattcatcctcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcat |
5857 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0772 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:
Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 169
Target Start/End: Original strand, 4469 - 4566
Alignment:
| Q |
70 |
gataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgc |
169 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
4469 |
gataatgcgacaacaattctcaatctcgac-tcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaacatgc |
4566 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0150 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 4)
Name: scaffold0150
Description:
Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 163
Target Start/End: Original strand, 20391 - 20489
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
20391 |
gactcgataatgcgacatcaactcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatatccacaacaattgcattatcaagaaa |
20489 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 163
Target Start/End: Original strand, 27220 - 27318
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
27220 |
gactcgataatgcgacatcaactcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatatccacaacaattgcattatcaagaaa |
27318 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0150; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 245
Target Start/End: Original strand, 20541 - 20581
Alignment:
| Q |
205 |
cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
20541 |
catcaacatgatcatcaataatcaacaatatcattcaacat |
20581 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0150; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 245
Target Start/End: Original strand, 27370 - 27410
Alignment:
| Q |
205 |
cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27370 |
catcaacatgatcatcaataatcaacaatatcattcaacat |
27410 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:
Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 241
Target Start/End: Original strand, 145616 - 145794
Alignment:
| Q |
60 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccaccca-at-tatattgattatttccacaacatttgcattatc |
157 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| |||||| | ||| || ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
145616 |
acaaagacttgataatgcgacatcaattcacgattttcaccacaatatagaggacaacttccatatatatattgatcatctccacaacattagcattatc |
145715 |
T |
 |
| Q |
158 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacccattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
145716 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcac-----aacatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
145794 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0808 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0808
Description:
Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 2942 - 2839
Alignment:
| Q |
60 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
159 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || ||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
2942 |
acaaagactcgataatgcgacatcacttcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattttattatcaa |
2843 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaaa |
163 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
2842 |
gaaa |
2839 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0808; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2783 - 2747
Alignment:
| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2783 |
aacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
2747 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0092 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0092
Description:
Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 163
Target Start/End: Original strand, 2114 - 2209
Alignment:
| Q |
68 |
tcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
2114 |
tcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttttattattaagaaa |
2209 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0092; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 245
Target Start/End: Original strand, 2265 - 2301
Alignment:
| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2265 |
aacatgatcatctataatcaacaatgtcattcaacat |
2301 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0058 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:
Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
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Target Start/End: Complemental strand, 71728 - 71655
Alignment:
| Q |
90 |
caattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
71728 |
caattttcacaacaatataaaggacaccttccaattatattgatcatctccacaacattcgcattatcaagaaa |
71655 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0244 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
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Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17797 - 17689
Alignment:
| Q |
138 |
tccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataac-ccattaacatgattatcaataatcaacaatgtc |
236 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || || ||| |||||||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
17797 |
tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcactacatcaacatgatcatcaataatcaacaaagtt |
17698 |
T |
 |
| Q |
237 |
attcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
17697 |
attcaacat |
17689 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 24216 - 24111
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| Q |
138 |
tccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtc |
236 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||| ||||| ||||| || ||| ||| |||||||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
24216 |
tccacatcatttgcattatcaagaaaatatgtccatacacaattaaatcataacattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaaagtt |
24117 |
T |
 |
| Q |
237 |
attcaa |
242 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
24116 |
attcaa |
24111 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0158 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0158
Description:
Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 245
Target Start/End: Original strand, 23905 - 23945
Alignment:
| Q |
205 |
cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23905 |
cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
23945 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0125 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:
Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 245
Target Start/End: Original strand, 34334 - 34442
Alignment:
| Q |
138 |
tccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacaataacc-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtc |
236 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || || ||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34334 |
tccacatcatttgtattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcactacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtt |
34433 |
T |
 |
| Q |
237 |
attcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
34434 |
attcaacat |
34442 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold2147 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold2147
Description:
Target: scaffold2147; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
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Target Start/End: Original strand, 991 - 1030
Alignment:
| Q |
62 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacct |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
991 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacct |
1030 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0507 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:
Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
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Alignment:
| Q |
90 |
caattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
4801 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccacaacattagcattatcaagaaa |
4728 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0095 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:
Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 7114 - 7041
Alignment:
| Q |
90 |
caattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| | | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7114 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttcaaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
7041 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1734 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold1734
Description:
Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 245
Target Start/End: Original strand, 175 - 211
Alignment:
| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
175 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
211 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1734; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 245
Target Start/End: Original strand, 26 - 62
Alignment:
| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
26 |
aacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacat |
62 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0346 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:
Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3118 - 3082
Alignment:
| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3118 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
3082 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0066 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:
Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 245
Target Start/End: Original strand, 53290 - 53326
Alignment:
| Q |
209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53290 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
53326 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0521 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:
Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 162
Target Start/End: Original strand, 7290 - 7387
Alignment:
| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
162 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| |||||| || |||| ||||||||| | || |||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
7290 |
gactcgataatgcgacatcaccccacaatttccacaacaatataaaggacaacatccaaatatattgatcacctctacaacaattacattatcaagaa |
7387 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0243 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:
Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 3739 - 3667
Alignment:
| Q |
91 |
aattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3739 |
aattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcacctccacaacatttgcattatcaagaaa |
3667 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0456 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:
Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 163
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| Q |
120 |
ccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
12943 |
ccaattatattgatcatctccacaacattagcattatcaagaaa |
12986 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0090 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:
Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 6116 - 6021
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| Q |
65 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| || ||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
6116 |
gactcgataatgcaacatcacctcacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaatatattgataatctccacaacaatttcattatcaag |
6021 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0327 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:
Target: scaffold0327; HSP #1
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| Q |
102 |
caatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
4759 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgattatctccacaacatctgcattctcaagaaa |
4820 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1752 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1752
Description:
Target: scaffold1752; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
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209 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
429 |
aacatgatcatcaataatcaacaatatcattcaacat |
465 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:
Target: scaffold0016; HSP #1
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| Q |
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aattttcacctcaatatataggacaccacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
163 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
118049 |
aattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcacctccacaacatttgcattattaagaaa |
117977 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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