View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1087_low_4 (Length: 321)

Name: NF1087_low_4
Description: NF1087
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1087_low_4
NF1087_low_4
[»] chr3 (22 HSPs)
chr3 (80-321)||(19920141-19920382)
chr3 (80-321)||(2364264-2364505)
chr3 (80-321)||(7312763-7313004)
chr3 (83-321)||(10323483-10323721)
chr3 (90-321)||(34332727-34332958)
chr3 (104-321)||(40930440-40930657)
chr3 (114-314)||(7032339-7032527)
chr3 (118-256)||(29523722-29523860)
chr3 (118-256)||(11203844-11203982)
chr3 (118-242)||(12342217-12342340)
chr3 (118-242)||(33496572-33496696)
chr3 (118-263)||(26770959-26771104)
chr3 (118-251)||(2755867-2756000)
chr3 (103-191)||(7031059-7031147)
chr3 (118-251)||(17097858-17097991)
chr3 (114-251)||(20532031-20532168)
chr3 (104-264)||(963132-963292)
chr3 (118-200)||(36801108-36801190)
chr3 (127-232)||(15312617-15312722)
chr3 (104-251)||(3140863-3141010)
chr3 (97-191)||(16178952-16179046)
chr3 (142-200)||(35214404-35214462)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (80-321)||(30732226-30732467)
chr5 (80-321)||(12825186-12825427)
chr5 (80-321)||(42513707-42513948)
chr5 (84-321)||(27117073-27117310)
chr5 (90-321)||(23238381-23238612)
chr5 (104-321)||(35983703-35983920)
chr5 (90-321)||(28535587-28535818)
chr5 (105-320)||(42928143-42928358)
chr5 (104-321)||(31641523-31641739)
chr5 (104-215)||(8228037-8228148)
chr5 (90-200)||(19255155-19255265)
chr5 (114-256)||(27767063-27767205)
chr5 (103-242)||(8300173-8300312)
chr5 (80-147)||(12820035-12820102)
chr5 (103-242)||(25857415-25857554)
chr5 (118-256)||(33385351-33385489)
chr5 (118-256)||(10776789-10776928)
chr5 (118-290)||(26072917-26073089)
chr5 (118-256)||(18359069-18359207)
chr5 (114-251)||(27165934-27166071)
chr5 (104-210)||(33169669-33169775)
chr5 (158-264)||(24407993-24408099)
[»] chr1 (9 HSPs)
chr1 (80-321)||(11909017-11909258)
chr1 (80-311)||(51052467-51052698)
chr1 (80-321)||(35541036-35541277)
chr1 (80-321)||(6050590-6050831)
chr1 (118-263)||(47623047-47623192)
chr1 (103-242)||(16917800-16917939)
chr1 (118-256)||(43388392-43388530)
chr1 (155-241)||(28351776-28351862)
chr1 (118-242)||(37191201-37191325)
[»] chr8 (16 HSPs)
chr8 (80-321)||(8299790-8300031)
chr8 (80-321)||(7924373-7924614)
chr8 (84-321)||(172094-172331)
chr8 (90-319)||(13396385-13396614)
chr8 (90-321)||(32266561-32266790)
chr8 (104-321)||(41665281-41665498)
chr8 (90-321)||(9922598-9922829)
chr8 (80-256)||(2170329-2170505)
chr8 (103-242)||(20824306-20824445)
chr8 (118-241)||(17699507-17699630)
chr8 (114-256)||(13200144-13200286)
chr8 (118-256)||(37434157-37434295)
chr8 (118-185)||(34137011-34137078)
chr8 (100-200)||(5181677-5181777)
chr8 (80-200)||(43270437-43270557)
chr8 (87-165)||(2529880-2529958)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (80-321)||(105755-105996)
[»] chr7 (10 HSPs)
chr7 (80-321)||(4938040-4938281)
chr7 (90-321)||(11277164-11277395)
chr7 (114-321)||(235349-235556)
chr7 (90-321)||(47876980-47877211)
chr7 (104-321)||(29967986-29968202)
chr7 (104-321)||(37919555-37919772)
chr7 (90-321)||(17720632-17720863)
chr7 (80-251)||(18532615-18532786)
chr7 (142-200)||(25619508-25619566)
chr7 (118-256)||(37254783-37254921)
[»] chr4 (15 HSPs)
chr4 (80-321)||(23642503-23642744)
chr4 (80-293)||(13270831-13271044)
chr4 (83-319)||(47418794-47419030)
chr4 (80-321)||(47685807-47686048)
chr4 (105-321)||(15740233-15740449)
chr4 (104-321)||(19755278-19755495)
chr4 (104-321)||(19784311-19784528)
chr4 (90-321)||(1828452-1828683)
chr4 (114-321)||(7403934-7404145)
chr4 (118-256)||(12697838-12697976)
chr4 (118-242)||(11587189-11587313)
chr4 (118-256)||(45472686-45472824)
chr4 (114-242)||(55725677-55725805)
chr4 (118-256)||(20002750-20002888)
chr4 (119-200)||(8361126-8361207)
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (80-291)||(4552156-4552367)
chr2 (90-321)||(41207013-41207244)
chr2 (118-242)||(28252745-28252869)
chr2 (97-200)||(15917658-15917761)
chr2 (114-200)||(12645557-12645643)
chr2 (80-251)||(14439739-14439910)
chr2 (143-242)||(38604365-38604464)
chr2 (118-200)||(17764995-17765077)
chr2 (105-260)||(40176680-40176835)
[»] chr6 (15 HSPs)
chr6 (90-321)||(2553634-2553865)
chr6 (114-321)||(21168220-21168427)
chr6 (104-298)||(18651169-18651363)
chr6 (90-293)||(24767364-24767567)
chr6 (84-208)||(12734116-12734240)
chr6 (118-321)||(15958725-15958928)
chr6 (114-256)||(21630084-21630226)
chr6 (103-200)||(17579114-17579211)
chr6 (103-242)||(17573646-17573785)
chr6 (118-265)||(17606302-17606449)
chr6 (80-251)||(20883015-20883186)
chr6 (143-251)||(14372973-14373081)
chr6 (118-242)||(10577240-10577364)
chr6 (114-242)||(33185457-33185585)
chr6 (104-242)||(13937711-13937849)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (80-252)||(11186-11358)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (118-321)||(3277-3480)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 22)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 80 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 19920382 - 19920141
Alignment:
Q  80 ccacagatagaatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgttt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19920382 ccacagatagaatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgttt 19920283  T
Q  180 atgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggt 279  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19920282 atgccaaattaagtccatatgatggtgtaactggggcttctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggt 19920183  T
Q  280 aaccagagccatctgtctatcactgattcctgcaaagaaact 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19920182 aaccagagccatctgtctatcactgattcctgcaaagaaact 19920141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 80 - 321
Target Start/End: Original strand, 2364264 - 2364505
Alignment:
Q  80 ccacagatagaatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgttt 179  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2364264 ccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagtagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgttt 2364363  T
Q  180 atgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2364364 atgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggt 2364463  T
Q  280 aaccagagccatctgtctatcactgattcctgcaaagaaact 321  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2364464 aaccagagccatctgtctaacactgattcctgcaaagaaact 2364505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 80 - 321
Target Start/End: Original strand, 7312763 - 7313004
Alignment:
Q  80 ccacagatagaatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgttt 179  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7312763 ccacagacagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggtacctgttt 7312862  T
Q  180 atgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7312863 atgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggt 7312962  T
Q  280 aaccagagccatctgtctatcactgattcctgcaaagaaact 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7312963 aaccagagccatctgtctatcactgattcctgcaaagaaact 7313004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 83 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 10323721 - 10323483
Alignment:
Q  83 cagatagaatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatg 182  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10323721 cagatagaatgccacgagttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagtagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatg 10323622  T
Q  183 ccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaac 282  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  10323621 ccaaattaagtccatactatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatatcatagactccacgtactgaatacccatcagcttgattaggtaac 10323522  T
Q  283 cagagccatctgtctatcactgattcctgcaaagaaact 321  Q
     |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  10323521 tagagccatctatctaacactgaatcctgcaaagaaact 10323483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 90 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 34332958 - 34332727
Alignment:
Q  90 aatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaatt 189  Q
    |||||| || ||| ||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34332958 aatgccacggtttgccaaattattttttgtaggtaatcgatctctcagaagttgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaatt 34332859  T
Q  190 aagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagcc 289  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  34332858 aactccatattatgatgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcataggctccacgtacataatacccaccatcctgattaggtaaccaaagcc 34332759  T
Q  290 atctgtctatcactgattcctgcaaagaaact 321  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  34332758 atctgtctgacactgattcctgcaaagaaact 34332727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 104 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 40930657 - 40930440
Alignment:
Q  104 ccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatg 203  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| || ||    
T  40930657 ccaaattattttttgtaggtaaccaatccctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgtcaaactaactccatgttttg 40930558  T
Q  204 gtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagccatctgtctatcact 303  Q
     || ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||| |||||||| | | |||||    
T  40930557 atgcaactgaggttgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacagaatacacaccatcctgatttggtaaccaaagccatctatttgtcact 40930458  T
Q  304 gattcctgcaaagaaact 321  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  40930457 gattcttgcaaagaaact 40930440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 7032339 - 7032527
Alignment:
Q  114 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactgg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||  || |||| ||||                
T  7032339 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaattttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaatta------------ 7032426  T
Q  214 ggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagccatctgtctatcactgattcctgca 313  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||  || |   |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  7032427 ggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaacaaaatacccaccgtccagaattaataaccaaagccatctatctatcaccgattcctgca 7032526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 29523860 - 29523722
Alignment:
Q  118 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggct 217  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||| || || |  || || |    
T  29523860 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgaacatgaggtt 29523761  T
Q  218 gctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacag 256  Q
    | |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||    
T  29523760 gttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaacag 29523722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 256
Target Start/End: Original strand, 11203844 - 11203982
Alignment:
Q  118 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggct 217  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||| || || |  || || |    
T  11203844 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaagtatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgaacatgaggtt 11203943  T
Q  218 gctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacag 256  Q
    | ||||||||||||||||  ||||| || ||||| ||||    
T  11203944 gttcctgtgatgtcaacaaatcatatacaccacgaacag 11203982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12342340 - 12342217
Alignment:
Q  118 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggct 217  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | | | |||||||||||||||||||| |||||||| || || |  || || |    
T  12342340 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaactttta-aagaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgaacatgaggtt 12342242  T
Q  218 gctcctgtgatgtcaacatgtcata 242  Q
    | |||||||||||||||| ||||||    
T  12342241 gttcctgtgatgtcaacaagtcata 12342217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 242
Target Start/End: Original strand, 33496572 - 33496696
Alignment:
Q  118 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggct 217  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||  || || |  || || |    
T  33496572 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaatgatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatattgatgaacatgaggtt 33496671  T
Q  218 gctcctgtgatgtcaacatgtcata 242  Q
    | |||||||||||||||| ||||||    
T  33496672 gttcctgtgatgtcaacaagtcata 33496696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26771104 - 26770959
Alignment:
Q  118 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggct 217  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||  | |||||||  || |    
T  26771104 gtaggtaaacgatccctcaaaagccgccaagtaagaatagagactttaagaggagcctgtttatgccacattaactccatatttggatgtaactaaggat 26771005  T
Q  218 gctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaataccc 263  Q
    | |||||| |||| | ||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  26771004 gttcctgtaatgttagcatgtcatacacaccacgaactgaataccc 26770959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 251
Target Start/End: Original strand, 2755867 - 2756000
Alignment:
Q  118 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggct 217  Q
    ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||  ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||  ||| |    
T  2755867 gtaggtaaccggtccctcagcaaacgccaagcaaatatagacactttcaaaggtacctgtttgtgccaaatcaactccatattttgatgtaacatgggtt 2755966  T
Q  218 gctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacg 251  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||    
T  2755967 gttcctgcgatgtcaacatatcatacacaccacg 2756000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 7031147 - 7031059
Alignment:
Q  103 accaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaa 191  Q
    |||||||||  ||| |||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| | ||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  7031147 accaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagacgccaagcaaggatagaaagttttaaaggaacctgtttatgccaaattaa 7031059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 17097991 - 17097858
Alignment:
Q  118 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggct 217  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||| ||||| | |    ||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| |    
T  17097991 gtaggtaaccgatccatcaacagtcgctaagcaaagatagagactttcacatatgcctgtttatgccaaattaactccacattttgatgtaaatggggtt 17097892  T
Q  218 gctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacg 251  Q
    | || || |||||||||| |||||| || |||||    
T  17097891 gttcatgcgatgtcaacaagtcatacacaccacg 17097858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 20532168 - 20532031
Alignment:
Q  114 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactgg 213  Q
    |||||||||||| || ||| | || |||||||||| ||  ||| ||||||| | | ||||||  |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||     
T  20532168 ttttgtaggtaatcgttccattagcagtcgccaaggaaaaataaatactttcaaatggaccttcttatgccaaattaattccatattttgatgtaaatga 20532069  T
Q  214 ggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacg 251  Q
    || ||||| || ||||||| ||||||||| || |||||    
T  20532068 ggatgctcatgggatgtcagcatgtcataaacaccacg 20532031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 963292 - 963132
Alignment:
Q  104 ccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatg 203  Q
    |||||||  |||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||  ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  963292 ccaaattttgtttagtaggtaaccggtccctcagcaaacgccaagcaaaaatagacactttcaaaggcacctgtttgtgccaaatcaactccatattttg 963193  T
Q  204 gtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaataccca 264  Q
     ||||||  ||| || ||||| || |||| ||| ||||| || ||||| || | |||||||    
T  963192 atgtaacatgggttgttcctgcgaagtcagcatatcatacacaccacgaaccgtataccca 963132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 36801190 - 36801108
Alignment:
Q  118 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatatt 200  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||| |  || |||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  36801190 gtaggtaaacgatccctcagcagttgccaagcaaggatataaacttttaagggaacctatttatgctaaattaactccatatt 36801108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 232
Target Start/End: Original strand, 15312617 - 15312722
Alignment:
Q  127 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtg 226  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||  ||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||  || ||||| |    
T  15312617 cgattcctcagcagtcaccaagcaaatatatagacttttagaggtacctgtttatgccaaattaactccaaattttgatgtaaatgggtatgttcctgcg 15312716  T
Q  227 atgtca 232  Q
    ||||||    
T  15312717 atgtca 15312722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 251
Target Start/End: Original strand, 3140863 - 3141010
Alignment:
Q  104 ccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatg 203  Q
    |||||||  |||| ||||||||||| |||||||| |   |||||||||  ||||| ||||| | ||| |||||||| | |||||| || |||||||| ||    
T  3140863 ccaaattttgtttagtaggtaaccggtccctcagtaaatgccaagcaaatatagacactttcaaaggcacctgtttgtaccaaatcaactccatattttg 3140962  T
Q  204 gtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacg 251  Q
     ||||||  ||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||    
T  3140963 atgtaacatgggttgttcctgcgatgtgaacatatcatacacaccacg 3141010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Original strand, 16178952 - 16179046
Alignment:
Q  97 cgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaa 191  Q
    |||||| |||||||   ||| |||||||  |||||| |||  || ||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16178952 cgatttgccaaattctctttagtaggtagacgatccttcatcaggcgccacgcaaaaatagatactttaagaggtacctgtttatgccaaattaa 16179046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 35214462 - 35214404
Alignment:
Q  142 cgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatatt 200  Q
    |||||| |||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  35214462 cgccaaacaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccagattaactccatatt 35214404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 80 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 30732467 - 30732226
Alignment:
Q  80 ccacagatagaatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgttt 179  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  30732467 ccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaagatagatactttgagaggaacctgttt 30732368  T
Q  180 atgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30732367 atgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggt 30732268  T
Q  280 aaccagagccatctgtctatcactgattcctgcaaagaaact 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30732267 aaccagagccatctgtctatcactgattcctgcaaagaaact 30732226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 80 - 321
Target Start/End: Original strand, 12825186 - 12825427
Alignment:
Q  80 ccacagatagaatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgttt 179  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  12825186 ccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatacatactttgagaggaacttgttt 12825285  T
Q  180 atgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12825286 atgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtgcagaatacccatcatcatgattaggt 12825385  T
Q  280 aaccagagccatctgtctatcactgattcctgcaaagaaact 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12825386 aaccagagccatctgtctatcactgattcctgcaaagaaact 12825427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 80 - 321
Target Start/End: Original strand, 42513707 - 42513948
Alignment:
Q  80 ccacagatagaatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgttt 179  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42513707 ccacagatagaatgtcacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgttt 42513806  T
Q  180 atgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggt 279  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42513807 atgccaaattaagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggt 42513906  T
Q  280 aaccagagccatctgtctatcactgattcctgcaaagaaact 321  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  42513907 aaccagagccatctgtctaacactgagtcctgcaaagaaact 42513948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 84 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 27117310 - 27117073
Alignment:
Q  84 agatagaatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgc 183  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27117310 agatagaatgccacggtttaccaaattaagttttgtgggtaaccggtccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgc 27117211  T
Q  184 caaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaacc 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27117210 caaattaagtccatattatggtgtaactggatctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcattattaggtaacc 27117111  T
Q  284 agagccatctgtctatcactgattcctgcaaagaaact 321  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27117110 atagccatctgtctatcactgattcctgcaaagaaact 27117073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 90 - 321
Target Start/End: Original strand, 23238381 - 23238612
Alignment:
Q  90 aatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaatt 189  Q
    |||||| || ||| ||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  23238381 aatgccacggtttgccaaattacttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtctccaagcaaggatagaaactttgagaggaacctatttatgccaaatt 23238480  T
Q  190 aagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagcc 289  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23238481 aactccatattatggtgtaactggggttgctcctgtgatgttagcatatcatagactccacgtacagagtacccatcatcatgattaggtacccaaagcc 23238580  T
Q  290 atctgtctatcactgattcctgcaaagaaact 321  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23238581 atctgtctgtcactgattcctgcaaagaaact 23238612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 104 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 35983920 - 35983703
Alignment:
Q  104 ccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatg 203  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||| || ||    
T  35983920 ccaaattattttttgtaggtaaccgattcctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtgtaagccaaattaactccatgttttg 35983821  T
Q  204 gtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagccatctgtctatcact 303  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||| |||| ||| |||||    
T  35983820 atgtaactgaggctgctcctgtgatgtcagcatgtcataggctccacgtacagagtacccaccatcctgatttggtaaccaaagctatctatctgtcact 35983721  T
Q  304 gattcctgcaaagaaact 321  Q
    |||||||| || ||||||    
T  35983720 gattcctgtaatgaaact 35983703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 90 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 28535818 - 28535587
Alignment:
Q  90 aatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaatt 189  Q
    |||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  28535818 aatgccacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagaaactttgagaggaacctgtgtatgccaaatt 28535719  T
Q  190 aagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagcc 289  Q
    || ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||| | |||| ||| | |||||||| ||||    
T  28535718 aactccatgttttgatgtaactgaggctgctcctgtgatgtcagcatgtcataggctccatgtacagagtacctaccatcctgagttggtaaccaaagcc 28535619  T
Q  290 atctgtctatcactgattcctgcaaagaaact 321  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  28535618 atctatctgtcattgattcctgcaatgaaact 28535587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 105 - 320
Target Start/End: Original strand, 42928143 - 42928358
Alignment:
Q  105 caaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatgg 204  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||  |     
T  42928143 caaattattttttgtagttaaccgatccctcagaagccgccaaacaaggatagagactttgagaggaacctgtttataccaaattaactccatatttgga 42928242  T
Q  205 tgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagccatctgtctatcactg 304  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| | |||||| ||| ||||||    
T  42928243 tgtaactggggctgttcctgcgatgtcagcatgtcatagactccacgtacagaatacccaccatcctgatttggtaaccacaaccatctatctgtcactg 42928342  T
Q  305 attcctgcaaagaaac 320  Q
    ||||||| ||| ||||    
T  42928343 attcctgtaaaaaaac 42928358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 104 - 321
Target Start/End: Original strand, 31641523 - 31641739
Alignment:
Q  104 ccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatg 203  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| || ||    
T  31641523 ccaaattattttttgtaggtaaccgatccctcagtagtctccatgcaaggatagaaacttt-agaggaacctgtgtatgccaaattaactccatgttttg 31641621  T
Q  204 gtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagccatctgtctatcact 303  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| || ||||| |||||||| ||| | |||||||| | |||||| ||| |||||    
T  31641622 atgtaagtgaggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatatgctccacgaacggaatatccatcatcctgagttggtaaccaaatccatctatctgtcact 31641721  T
Q  304 gattcctgcaaagaaact 321  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  31641722 gattcctgcaatgaaact 31641739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 215
Target Start/End: Original strand, 8228037 - 8228148
Alignment:
Q  104 ccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatg 203  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  8228037 ccaaattacttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtctccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgtcaaattaactccatattatg 8228136  T
Q  204 gtgtaactgggg 215  Q
    ||||||||||||    
T  8228137 gtgtaactgggg 8228148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19255265 - 19255155
Alignment:
Q  90 aatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaatt 189  Q
    |||||| | |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  19255265 aatgccacaatttgccaaattattttttgtaggtaaccgatccctcagaaaccgccaagcaaggatagatactttgagagaaatctgtttatgccaaatt 19255166  T
Q  190 aagtccatatt 200  Q
    || ||||||||    
T  19255165 aactccatatt 19255155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 256
Target Start/End: Original strand, 27767063 - 27767205
Alignment:
Q  114 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactgg 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||| || || |  ||     
T  27767063 ttttgtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatataaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgaacatga 27767162  T
Q  214 ggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacag 256  Q
    || || |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||    
T  27767163 ggttgttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaacag 27767205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8300312 - 8300173
Alignment:
Q  103 accaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattat 202  Q
    |||||||||  ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  8300312 accaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaaacaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatttt 8300213  T
Q  203 ggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcata 242  Q
    | || |  || || || |||||||||||||||| ||||||    
T  8300212 gatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacaggtcata 8300173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 80 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 12820102 - 12820035
Alignment:
Q  80 ccacagatagaatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaa 147  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12820102 ccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcataagtcgccaa 12820035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25857554 - 25857415
Alignment:
Q  103 accaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattat 202  Q
    |||||||||  ||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  25857554 accaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatttt 25857455  T
Q  203 ggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcata 242  Q
    | || |   | || || |||||||||||||||| ||||||    
T  25857454 gatgaacaagaggttgttcctgtgatgtcaacaagtcata 25857415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 33385489 - 33385351
Alignment:
Q  118 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggct 217  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |  || |||||||||||||||||||| |||||||| || || |  || || |    
T  33385489 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaagggaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgaatatgaggtt 33385390  T
Q  218 gctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacag 256  Q
    | |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||    
T  33385389 gttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaacag 33385351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 256
Target Start/End: Original strand, 10776789 - 10776928
Alignment:
Q  118 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatat-tatggtgtaactggggc 216  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  || |||||||||||||||||||| ||||||| | || || |  || ||     
T  10776789 gtaggtaaacgatccctcagcagtcgccaagcaaggatagaaacttttaagggaacctgtttatgccaaattaactccatatatttgatgaacatgaggt 10776888  T
Q  217 tgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacag 256  Q
    || |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||    
T  10776889 tgttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacggacag 10776928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 290
Target Start/End: Original strand, 26072917 - 26073089
Alignment:
Q  118 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggct 217  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||||  ||||| | ||| || | ||||||||||||||| |||| ||| || || || |||||||    
T  26072917 gtaggtaatcgatccctcaacagtcgccaaacaaagatagggactttcaaaggaacatatttatgccaaattaactccaaattttgatgcaaatggggct 26073016  T
Q  218 gctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagcca 290  Q
    | ||||| ||||||| || |||||| || ||||| || | ||||||| |||  ||||| |||||||| |||||    
T  26073017 gttcctgcgatgtcagcaagtcatacacaccacggaccgtatacccaacattctgattcggtaaccaaagcca 26073089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18359207 - 18359069
Alignment:
Q  118 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggct 217  Q
    |||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| || || |  || || |    
T  18359207 gtaggtaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaggattgaaacttttaaaggaacctgtttatgctagattaactccatattttgatgaacatgaggtt 18359108  T
Q  218 gctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacag 256  Q
    | ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  18359107 gttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacag 18359069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 27166071 - 27165934
Alignment:
Q  114 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactgg 213  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||   ||||||| | | |||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| || ||||| | |    
T  27166071 ttttataggtaaacgatccttcagcgttcgccaaacgaagatagagacttttagaggtacctgttggtgccaaattaattccatattttgatgtaaattg 27165972  T
Q  214 ggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacg 251  Q
    || || |||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  27165971 ggttgttcctgtgatgccaacatgtcataaacaccacg 27165934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 210
Target Start/End: Original strand, 33169669 - 33169775
Alignment:
Q  104 ccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatg 203  Q
    |||||||  |||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||  ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  33169669 ccaaattttgtttagtaggtaaccggtccctcagcaaacgccaagcaaaaatagacactttcaaaggcacctgtttgtgccaaatcaactccatattttg 33169768  T
Q  204 gtgtaac 210  Q
     ||||||    
T  33169769 atgtaac 33169775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 264
Target Start/End: Original strand, 24407993 - 24408099
Alignment:
Q  158 atactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacaga 257  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||| || |||||| | || ||||||  ||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |     
T  24407993 atactttcaaaggtacctgtttatgccaaatcaactccatactttgatgtaacatgggttgttcctgcgatgtcaacatatcatacacaccacgaaccgt 24408092  T
Q  258 ataccca 264  Q
    |||||||    
T  24408093 ataccca 24408099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 9)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 80 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 11909258 - 11909017
Alignment:
Q  80 ccacagatagaatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgttt 179  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  11909258 ccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaatgatagatactttgagaggaacctgttt 11909159  T
Q  180 atgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11909158 atgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtatagaatacccatcatcatgattaggt 11909059  T
Q  280 aaccagagccatctgtctatcactgattcctgcaaagaaact 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11909058 aaccagagccatctgtctatcactgattcctgcaaagaaact 11909017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 80 - 311
Target Start/End: Original strand, 51052467 - 51052698
Alignment:
Q  80 ccacagatagaatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgttt 179  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51052467 ccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgttt 51052566  T
Q  180 atgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51052567 atgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggt 51052666  T
Q  280 aaccagagccatctgtctatcactgattcctg 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51052667 aaccagagccatctgtctatcactgattcctg 51052698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 80 - 321
Target Start/End: Original strand, 35541036 - 35541277
Alignment:
Q  80 ccacagatagaatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgttt 179  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35541036 ccacagatagaatgccacgatttgccaaattatgttttgtgggtaaccgatccctcagtagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgttt 35541135  T
Q  180 atgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35541136 atgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgaacagaatacccatcatcatgattaggt 35541235  T
Q  280 aaccagagccatctgtctatcactgattcctgcaaagaaact 321  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  35541236 aaccagagccatctgtctaacactgattcctgcaaaaaaact 35541277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 80 - 321
Target Start/End: Original strand, 6050590 - 6050831
Alignment:
Q  80 ccacagatagaatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgttt 179  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6050590 ccacagatagaatgccacaatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgttt 6050689  T
Q  180 atgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggt 279  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6050690 atgccaaattaagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggt 6050789  T
Q  280 aaccagagccatctgtctatcactgattcctgcaaagaaact 321  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  6050790 aaccagagccatctgtctaacactgagtcctgcaaagaaact 6050831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 118 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 47623192 - 47623047
Alignment:
Q  118 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatg-gtgtaactggggc 216  Q
    |||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||| ||     
T  47623192 gtaggtaagcggtccctcaaaagccgccaagcaagaatagatactttgagaggtacctgtttatgccaaattaattccata-tatgaatgtaactgaggt 47623094  T
Q  217 tgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaataccc 263  Q
    || ||||||||||||| ||||||||| || ||| | || ||||||||    
T  47623093 tgttcctgtgatgtcagcatgtcatacaccccatggactgaataccc 47623047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16917939 - 16917800
Alignment:
Q  103 accaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattat 202  Q
    |||||||||  ||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  16917939 accaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatttt 16917840  T
Q  203 ggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcata 242  Q
    | || |   | || || |||||||||||||||| ||||||    
T  16917839 gatgaacaagaggttgttcctgtgatgtcaacaagtcata 16917800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 256
Target Start/End: Original strand, 43388392 - 43388530
Alignment:
Q  118 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggct 217  Q
    |||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||| || || |  ||  | |    
T  43388392 gtaggtaaacgatccctcaacaatcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgaacatgaagtt 43388491  T
Q  218 gctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacag 256  Q
    | |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||    
T  43388492 gttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaacag 43388530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 241
Target Start/End: Original strand, 28351776 - 28351862
Alignment:
Q  155 tagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcat 241  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  28351776 tagagactttcagagggaccggtttatgccaaattaactccatattttgatgtgaatggggatactccagtgatgtcaacatgtcat 28351862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 37191325 - 37191201
Alignment:
Q  118 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggct 217  Q
    |||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||| | ||||| | | | ||| |||||||||| ||||| |||||||| || || |  || || |    
T  37191325 gtaggtaatcgatctctcaacagccgccaagcaaggatataaacttttaaatgaaccagtttatgccagattaactccatattttgatgaacatgaggtt 37191226  T
Q  218 gctcctgtgatgtcaacatgtcata 242  Q
    | || ||||||||||||||||||||    
T  37191225 gttcatgtgatgtcaacatgtcata 37191201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 16)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 80 - 321
Target Start/End: Original strand, 8299790 - 8300031
Alignment:
Q  80 ccacagatagaatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgttt 179  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8299790 ccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagtagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgttt 8299889  T
Q  180 atgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggt 279  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8299890 atgccaaattaagtccaaattatggtgtaattggggctactcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggt 8299989  T
Q  280 aaccagagccatctgtctatcactgattcctgcaaagaaact 321  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8299990 aaccagagccatctgtctaacactgattcctgcaaagaaact 8300031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 80 - 321
Target Start/End: Original strand, 7924373 - 7924614
Alignment:
Q  80 ccacagatagaatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgttt 179  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7924373 ccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgttt 7924472  T
Q  180 atgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggt 279  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7924473 atgccaaattaagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggt 7924572  T
Q  280 aaccagagccatctgtctatcactgattcctgcaaagaaact 321  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  7924573 aaccagagccatctgtctaacactgagtcctgcaaagaaact 7924614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 84 - 321
Target Start/End: Original strand, 172094 - 172331
Alignment:
Q  84 agatagaatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgc 183  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  172094 agatagaatgtcacggtttaccaaattaagttttgtgggtaaccggtccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgc 172193  T
Q  184 caaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaacc 283  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  172194 caaattaagtccattttatggtgtaactggttctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcattattaggtaacc 172293  T
Q  284 agagccatctgtctatcactgattcctgcaaagaaact 321  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  172294 atagccatctgtctatcactgattcctgcaaagaaact 172331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 90 - 319
Target Start/End: Original strand, 13396385 - 13396614
Alignment:
Q  90 aatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaatt 189  Q
    |||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13396385 aatgccacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgatctctcaggagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacttgtttatgccaaatt 13396484  T
Q  190 aagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagcc 289  Q
    || ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||    
T  13396485 aactccatatgatgatgtaattggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagaccccacgtacagaatacccaccctcctgattaggtaaccaaagcc 13396584  T
Q  290 atctgtctatcactgattcctgcaaagaaa 319  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13396585 atctgtctgtcactgattcctgcaaagaaa 13396614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 90 - 321
Target Start/End: Original strand, 32266561 - 32266790
Alignment:
Q  90 aatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaatt 189  Q
    |||||| || ||| ||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32266561 aatgccacggtttgccaaattacttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtctccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaatt 32266660  T
Q  190 aagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagcc 289  Q
    || |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| |||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  32266661 aactccaaattatggtgtaactgtggttgctcttgtgaagtcagca--tcataggctccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtacccaaagcc 32266758  T
Q  290 atctgtctatcactgattcctgcaaagaaact 321  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32266759 atctgtctgacactgattcctgcaaagaaact 32266790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 104 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 41665498 - 41665281
Alignment:
Q  104 ccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatg 203  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  41665498 ccaaattattttttgtaggtaactgatctcttaggaatcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatatgatg 41665399  T
Q  204 gtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagccatctgtctatcact 303  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| | || | |||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  41665398 atgtaattggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagaccccacatacagaatacccaccctcctaattaggtaaccaaagtcatctgtctgtcact 41665299  T
Q  304 gattcctgcaaagaaact 321  Q
    |||||||| |||||||||    
T  41665298 gattcctgtaaagaaact 41665281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 90 - 321
Target Start/End: Original strand, 9922598 - 9922829
Alignment:
Q  90 aatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaatt 189  Q
    |||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  9922598 aatgccacggtttgccaaattatcttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgtcatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtgtatgccaaatt 9922697  T
Q  190 aagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagcc 289  Q
    || ||||  || || ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||| |||||||||| ||| | |||||||| | ||    
T  9922698 aactccaagttttgatgtaagtgaggctgctcctgtgatgtcagcatgtcataggctccacgaacggaaaacccatcatcctgagttggtaaccaaatcc 9922797  T
Q  290 atctgtctatcactgattcctgcaaagaaact 321  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  9922798 atctatctgtcactgattcctgcaatgaaact 9922829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 80 - 256
Target Start/End: Original strand, 2170329 - 2170505
Alignment:
Q  80 ccacagatagaatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgttt 179  Q
    ||||||||||||| || || | |||||||||   ||| |||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  2170329 ccacagatagaatcccacgttctaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacggtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgttt 2170428  T
Q  180 atgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacag 256  Q
    |||||| ||||| |||||||| || || |  || || || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  2170429 atgccagattaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacggacag 2170505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 242
Target Start/End: Original strand, 20824306 - 20824445
Alignment:
Q  103 accaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattat 202  Q
    |||||||||  ||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  20824306 accaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatttt 20824405  T
Q  203 ggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcata 242  Q
    | || |  || || || |||||||||||||||| ||||||    
T  20824406 gatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacaagtcata 20824445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 241
Target Start/End: Original strand, 17699507 - 17699630
Alignment:
Q  118 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggct 217  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  || |||||||||||||||||||| |||||||| || || |  || || |    
T  17699507 gtaggtaaacgatccctcagcagtcgccaagcaaggatagaaacttttaagggaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgaacatgaggtt 17699606  T
Q  218 gctcctgtgatgtcaacatgtcat 241  Q
    | || ||||||||||||| |||||    
T  17699607 gttcatgtgatgtcaacaagtcat 17699630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 256
Target Start/End: Original strand, 13200144 - 13200286
Alignment:
Q  114 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactgg 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| || || |  ||     
T  13200144 ttttgtaggtaaacgatccctcaatagctgccaagcaaggattgaaacttttagaggaacctgtttatgccaaactaactccatattttgatgaacatga 13200243  T
Q  214 ggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacag 256  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  13200244 ggttgttcctgtgatgtcaacatatcatacacaccacgaacag 13200286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 256
Target Start/End: Original strand, 37434157 - 37434295
Alignment:
Q  118 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggct 217  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| | ||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |  || || |    
T  37434157 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaagaatagagacttttaaaggaacatgtttatgccaaattaactccatattttgatgaacatgaggtt 37434256  T
Q  218 gctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacag 256  Q
    | |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||    
T  37434257 gttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaacag 37434295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 34137078 - 34137011
Alignment:
Q  118 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgcca 185  Q
    |||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  34137078 gtaggtaaacgatccatcataagccgccaagcaagaatagagactttgagaggtacctgtttatgcca 34137011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 200
Target Start/End: Original strand, 5181677 - 5181777
Alignment:
Q  100 tttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatat 199  Q
    |||| |||||||  |||||| |||||  ||||||||||  | |||||| |||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  5181677 tttatcaaattatcttttgttggtaaatgatccctcagccgccgccaaacaagaatatagacttttagaggcacctgtttatgccaaattatctccatat 5181776  T
Q  200 t 200  Q
    |    
T  5181777 t 5181777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 200
Target Start/End: Original strand, 43270437 - 43270557
Alignment:
Q  80 ccacagatagaatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgttt 179  Q
    |||||||||||||  | || | |||||||||   ||| ||||| || |||||| |||  |||||||||| ||||||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  43270437 ccacagatagaatctcacgttctaccaaatttgttttagtaggcaaacgatccttcaacagtcgccaagtaaggatagaaacttttaaaggaacctgttt 43270536  T
Q  180 atgccaaattaagtccatatt 200  Q
    |||||| || || ||||||||    
T  43270537 atgccagatgaactccatatt 43270557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 165
Target Start/End: Original strand, 2529880 - 2529958
Alignment:
Q  87 tagaatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttg 165  Q
    |||||| || |||| |||||||||   |||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| || ||||||    
T  2529880 tagaattccacgatctaccaaattgtattttgtaggtaagcgatccctcaatagccgccaagcaaggattgaaactttg 2529958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 80 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 105996 - 105755
Alignment:
Q  80 ccacagatagaatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgttt 179  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  105996 ccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgttt 105897  T
Q  180 atgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggt 279  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  105896 atgccaaattaagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggt 105797  T
Q  280 aaccagagccatctgtctatcactgattcctgcaaagaaact 321  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  105796 aaccagagccatctgtctaacactgagtcctgcaaagaaact 105755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 10)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 80 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 4938281 - 4938040
Alignment:
Q  80 ccacagatagaatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgttt 179  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4938281 ccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgttt 4938182  T
Q  180 atgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggt 279  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4938181 atgccaaattaagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggt 4938082  T
Q  280 aaccagagccatctgtctatcactgattcctgcaaagaaact 321  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  4938081 aaccagagccatctgtctaacactgagtcctgcaaagaaact 4938040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 90 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 11277395 - 11277164
Alignment:
Q  90 aatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaatt 189  Q
    |||||| || ||| ||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11277395 aatgccacggtttgccaaattatttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaatt 11277296  T
Q  190 aagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagcc 289  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  11277295 aactccatattatggtgtaactggggttgctcctgtgatgtcagcatatcatagactccacgtacagagtacccatcatcatgattaggtacccaaagcc 11277196  T
Q  290 atctgtctatcactgattcctgcaaagaaact 321  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11277195 atctgtctgtcactgattcctgcaaagaaact 11277164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 114 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 235556 - 235349
Alignment:
Q  114 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactgg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  235556 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagagactttgagatgaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgtaactgg 235457  T
Q  214 ggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagccatctgtctatcactgattcctgca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| |    
T  235456 ggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccaccatcctgatttggtaaccaaagtcatctatctgtcactgattcctgta 235357  T
Q  314 aagaaact 321  Q
    | ||||||    
T  235356 aggaaact 235349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 90 - 321
Target Start/End: Original strand, 47876980 - 47877211
Alignment:
Q  90 aatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaatt 189  Q
    |||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47876980 aatgccacggtttgccaaattattttttgtaggtaactgatctctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaatt 47877079  T
Q  190 aagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagcc 289  Q
    || ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| || |    
T  47877080 aactccctattttgatgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcataaactccacgtacataatacccaccatcctgattaggtaaccaaagtc 47877179  T
Q  290 atctgtctatcactgattcctgcaaagaaact 321  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  47877180 atctgtctgtcactgattcctgcaaggaaact 47877211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 104 - 321
Target Start/End: Original strand, 29967986 - 29968202
Alignment:
Q  104 ccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatg 203  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  29967986 ccaaattacttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtcctcaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatg 29968085  T
Q  204 gtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagccatctgtctatcact 303  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  29968086 gtgtaactggggttgctcctgtgatgtcagcatatcataggctccacgtacagagta-ccatcatcatgattaggtacccaaagccatctgtctgtcact 29968184  T
Q  304 gattcctgcaaagaaact 321  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29968185 gattcctgcaaagaaact 29968202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 104 - 321
Target Start/End: Original strand, 37919555 - 37919772
Alignment:
Q  104 ccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatg 203  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||| |||    
T  37919555 ccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttataccaaattaacttcatatgatg 37919654  T
Q  204 gtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagccatctgtctatcact 303  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| | || || |||||||| || |||||| ||| | |||||    
T  37919655 atgtaattggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatatactccacgcacagaatacccaccctcctgtttaggtaatcaaagccatatgtttgtcact 37919754  T
Q  304 gattcctgcaaagaaact 321  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37919755 gattcctgcaaagaaact 37919772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 90 - 321
Target Start/End: Original strand, 17720632 - 17720863
Alignment:
Q  90 aatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaatt 189  Q
    |||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  17720632 aatgccacggtttgccaaattatcttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtgtatgccaaatt 17720731  T
Q  190 aagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagcc 289  Q
    || ||||  || || ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||| | |||||||| | ||    
T  17720732 aactccaagttttgatgtaagtgaggctgctcctgtgatgtcagcatgtcataggctccacgaacggaatacccatcatcctgagttggtaaccaaatcc 17720831  T
Q  290 atctgtctatcactgattcctgcaaagaaact 321  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  17720832 atctatctgtcactgattcctgcaatgaaact 17720863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 251
Target Start/End: Original strand, 18532615 - 18532786
Alignment:
Q  80 ccacagatagaatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgttt 179  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||| |   ||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| | ||| ||||||||    
T  18532615 ccacagatagaattccacgttctaccaaaattgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatataaacttttaaaggaacctgttt 18532714  T
Q  180 atgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacg 251  Q
    |||| | ||||| |||||||| || || |  || || || || ||||||||||||| |||||| || |||||    
T  18532715 atgcgagattaactccatattttgatgaacatgaggttgttcatgtgatgtcaacaagtcatatacaccacg 18532786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 200
Target Start/End: Original strand, 25619508 - 25619566
Alignment:
Q  142 cgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatatt 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25619508 cgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccatattaactccatatt 25619566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 256
Target Start/End: Original strand, 37254783 - 37254921
Alignment:
Q  118 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggct 217  Q
    |||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||| || ||||| | ||  |||||||||||||| ||||| |||||||| || || |  || || |    
T  37254783 gtaggtaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaggattgaaacttttaaagtaacctgtttatgccagattaactccatattttgatgaacatgaggtt 37254882  T
Q  218 gctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacag 256  Q
    | ||| |||||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  37254883 gttcccgtgatgtcaacatgtcgtatacaccacgaacag 37254921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 80 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 23642744 - 23642503
Alignment:
Q  80 ccacagatagaatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgttt 179  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23642744 ccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgttt 23642645  T
Q  180 atgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggt 279  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23642644 atgccaaattaagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggt 23642545  T
Q  280 aaccagagccatctgtctatcactgattcctgcaaagaaact 321  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  23642544 aaccagagccatctgtctaacactgagtcctgcaaagaaact 23642503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 80 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13271044 - 13270831
Alignment:
Q  80 ccacagatagaatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgttt 179  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13271044 ccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgttt 13270945  T
Q  180 atgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggt 279  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13270944 atgccaaattaagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggt 13270845  T
Q  280 aaccagagccatct 293  Q
    ||||||||||||||    
T  13270844 aaccagagccatct 13270831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 83 - 319
Target Start/End: Original strand, 47418794 - 47419030
Alignment:
Q  83 cagatagaatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatg 182  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47418794 cagatagaatgccacgagttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagtagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatg 47418893  T
Q  183 ccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaac 282  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  47418894 ccaaattaagtccatactatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatatcatagactccacgtactgaatacccatcagcttgattaggtaac 47418993  T
Q  283 cagagccatctgtctatcactgattcctgcaaagaaa 319  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  47418994 cagagccatctatctaacactgaatcctgcaaagaaa 47419030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 80 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 47686048 - 47685807
Alignment:
Q  80 ccacagatagaatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgttt 179  Q
    ||||||||| |||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47686048 ccacagataaaatgccacggtttgccaaattatgttttgtaggtaaccgatctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgttt 47685949  T
Q  180 atgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggt 279  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47685948 atgtcaaattaagtccagattatggtgtaacttgggctgctcttgtgatgtcagcatgtcgtagactccacgaacagaatacccatcatcatgattaggt 47685849  T
Q  280 aaccagagccatctgtctatcactgattcctgcaaagaaact 321  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47685848 aaccaaagccatctgtctatcaccgattcctgcaaagaaact 47685807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 105 - 321
Target Start/End: Original strand, 15740233 - 15740449
Alignment:
Q  105 caaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatgg 204  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15740233 caaattattttttgtaggtaaccgatctcgcaaaagtctccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattatgg 15740332  T
Q  205 tgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagccatctgtctatcactg 304  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  15740333 tgtaactggggctgctcctatgatgtcaacatatcatagactccacgtacagaatacccaccatcatgattaggtaaccaaagccatctgtctgtcactg 15740432  T
Q  305 attcctgcaaagaaact 321  Q
    |||||||||||||||||    
T  15740433 attcctgcaaagaaact 15740449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 104 - 321
Target Start/End: Original strand, 19755278 - 19755495
Alignment:
Q  104 ccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatg 203  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  19755278 ccaaattattttttgtaggtaaccgatctctcaggagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatatgatg 19755377  T
Q  204 gtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagccatctgtctatcact 303  Q
     || || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  19755378 atgaaattggggctgctcttgtgatgtcagcatgtcatagaccccacgtacagaatacccaccctcctgattaggtaaccaaagccatctgtctgtcact 19755477  T
Q  304 gattcctgcaaagaaact 321  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19755478 gattcctgcaaagaaact 19755495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 104 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 19784528 - 19784311
Alignment:
Q  104 ccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatg 203  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  19784528 ccaaattattttttgtaggtaaccgatctctcaggagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatatgatg 19784429  T
Q  204 gtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagccatctgtctatcact 303  Q
     || || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  19784428 atgaaattggggctgctcttgtgatgtcagcatgtcatagaccccacgtacagaatacccaccctcctgattaggtaaccaaagccatctgtctgtcact 19784329  T
Q  304 gattcctgcaaagaaact 321  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19784328 gattcctgcaaagaaact 19784311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 90 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 1828683 - 1828452
Alignment:
Q  90 aatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaatt 189  Q
    |||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||| ||| | ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1828683 aatgccacggtttgccaaattagtttttgtaggtaacctatctcgcaatagtctccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaatt 1828584  T
Q  190 aagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagcc 289  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  1828583 aactccatattatgatgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatatcataggctccacgtacggaatacccaccatcatgattaggtaaccaaagcc 1828484  T
Q  290 atctgtctatcactgattcctgcaaagaaact 321  Q
    || ||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  1828483 atttgtcagtcactgaatcctgcaaagaaact 1828452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 114 - 321
Target Start/End: Original strand, 7403934 - 7404145
Alignment:
Q  114 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactgg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | || ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  7403934 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagagactttgaaatgaacttgtttatgccaaattaacttcatattttgatgtaactgg 7404033  T
Q  214 ggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaataccca----tcatcatgattaggtaaccagagccatctgtctatcactgattcc 309  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||| |||||||| | |||||| | | ||||||||||     
T  7404034 ggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacagaatacccaccatgcatcctgatttggtaaccataaccatctatttgtcactgattct 7404133  T
Q  310 tgcaaagaaact 321  Q
    ||||| ||||||    
T  7404134 tgcaaggaaact 7404145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 256
Target Start/End: Original strand, 12697838 - 12697976
Alignment:
Q  118 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggct 217  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| | |||||| || || |  || || |    
T  12697838 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaatttcatattttgatgaacatgaggtt 12697937  T
Q  218 gctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacag 256  Q
    | |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||    
T  12697938 gttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaacag 12697976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 11587313 - 11587189
Alignment:
Q  118 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatgg-tgtaactggggc 216  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||| |||    
T  11587313 gtaggtaaacgattcctcagaagccgccaagcaagaatagatactttgataggtatctatttatgccaaattaactccata-gatggatgcaactgaggc 11587215  T
Q  217 tgctcctgtgatgtcaacatgtcata 242  Q
    || ||||||||||||| |||||||||    
T  11587214 tgttcctgtgatgtcagcatgtcata 11587189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 45472824 - 45472686
Alignment:
Q  118 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggct 217  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||| || || |  || ||      
T  45472824 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaaacaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgaacatgaggtg 45472725  T
Q  218 gctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacag 256  Q
    | |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||    
T  45472724 gttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaacag 45472686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 55725805 - 55725677
Alignment:
Q  114 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactgg 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |  |  ||     
T  55725805 ttttgtaggtaagcgatccctcaatagccgccaagcaaggattgaaacttttagaggaacttgtttatgccaaattaactccatattttgataaacatga 55725706  T
Q  214 ggctgctcctgtgatgtcaacatgtcata 242  Q
    || || ||||||||||||||||| |||||    
T  55725705 ggttgttcctgtgatgtcaacatatcata 55725677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 256
Target Start/End: Original strand, 20002750 - 20002888
Alignment:
Q  118 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaac-tggggc 216  Q
    |||||||| ||||||||||  || |||||||||| |||||| ||||| | | | |||||||||||||||||||| |||||||| || | |||| || ||     
T  20002750 gtaggtaaacgatccctcaacagccgccaagcaatgatagaaacttttaaaagaacctgtttatgccaaattaactccatattttgat-taacatgaggt 20002848  T
Q  217 tgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacag 256  Q
    || || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  20002849 tgttcgtgtgatgtcaacatgtcataaacaccacgaacag 20002888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 119 - 200
Target Start/End: Original strand, 8361126 - 8361207
Alignment:
Q  119 taggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatatt 200  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |  || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8361126 taggtaaacgattcctcagcagtcgccaaacaaggatagaaacttttaagggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 8361207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 80 - 291
Target Start/End: Original strand, 4552156 - 4552367
Alignment:
Q  80 ccacagatagaatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgttt 179  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  4552156 ccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttaagaggaacctattt 4552255  T
Q  180 atgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4552256 atgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggt 4552355  T
Q  280 aaccagagccat 291  Q
    |||| |||||||    
T  4552356 aaccggagccat 4552367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 90 - 321
Target Start/End: Original strand, 41207013 - 41207244
Alignment:
Q  90 aatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaatt 189  Q
    |||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41207013 aatgccacgatttgccaaattattttttgtaggtaaccgatccctcagaagccgccaagcaaggatagagactttgagaggaacctgtttatgccaaatt 41207112  T
Q  190 aagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagcc 289  Q
    || ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||| ||||  |||||||| | ||    
T  41207113 aactccatatttggatgtaactgaggatgttcctgcgatgtcagcatgtcataaactccacatactgaatacccaccatcctgatctggtaaccacaacc 41207212  T
Q  290 atctgtctatcactgattcctgcaaagaaact 321  Q
    |||| |||  ||||||||||||||| ||||||    
T  41207213 atctatctgccactgattcctgcaaggaaact 41207244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 118 - 242
Target Start/End: Original strand, 28252745 - 28252869
Alignment:
Q  118 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatg-gtgtaactggggc 216  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||  |||||||| |||    
T  28252745 gtaggtaagcgatccctcaaaagccgccaagcaagaatagatacttttagaggtacctgtttatgccaaattaattccata-gatgaatgtaactgaggc 28252843  T
Q  217 tgctcctgtgatgtcaacatgtcata 242  Q
    || ||||||||||||| |||||||||    
T  28252844 tgttcctgtgatgtcagcatgtcata 28252869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 200
Target Start/End: Original strand, 15917658 - 15917761
Alignment:
Q  97 cgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtcca 196  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||| ||||| |||| ||||||| ||||||| || |    
T  15917658 cgatttgccaaattaacttttgtaggtaaacgatccctcagcagtccccaagcaaggatacagactttcagaggaacctatttatgcgaaattaactcaa 15917757  T
Q  197 tatt 200  Q
    ||||    
T  15917758 tatt 15917761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 200
Target Start/End: Original strand, 12645557 - 12645643
Alignment:
Q  114 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatatt 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12645557 ttttgtaggtaagcgatccctcaatagccgccaagcaaggattgaaacttttagagaaacctgtttatgccaaattaactccatatt 12645643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 251
Target Start/End: Original strand, 14439739 - 14439910
Alignment:
Q  80 ccacagatagaatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgttt 179  Q
    ||||||||||||| || || | |||||||||   ||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| | |||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  14439739 ccacagatagaatcccacgttctaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgtcaagccaagatagaaacttttaaaggaacctgttt 14439838  T
Q  180 atgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacg 251  Q
    |||||| ||||| |||||| | || || |  || ||  | ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14439839 atgccagattaactccatagtttgatgaacatgaggtcgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacg 14439910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 38604464 - 38604365
Alignment:
Q  143 gccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcata 242  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || || || |  || || |||||||||||||||||||||||    
T  38604464 gccatgcaaggattgaaacttttagaggtacttgtttatgccagattaactccatattttgatgaaaattaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcata 38604365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 17765077 - 17764995
Alignment:
Q  118 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatatt 200  Q
    ||||||||  |||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||| |||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  17765077 gtaggtaaatgatccctcaatagccgccaagcaagaatagagactttaagaggagcctgtttatgccatattaactccatatt 17764995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 260
Target Start/End: Original strand, 40176680 - 40176835
Alignment:
Q  105 caaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatgg 204  Q
    |||||| | ||| |||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||| ||||| | ||| |||||||| ||     
T  40176680 caaattgactttagtaggtaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaggactgaaacttttagaggtacctgtttgtgccagactaactccatattttga 40176779  T
Q  205 tgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaata 260  Q
    || |  || || || |||||||||||||| | |||||| || ||| | ||||||||    
T  40176780 tgaatatgaggttgttcctgtgatgtcaataagtcatataccccatgaacagaata 40176835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 15)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 90 - 321
Target Start/End: Original strand, 2553634 - 2553865
Alignment:
Q  90 aatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaatt 189  Q
    |||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2553634 aatgccacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgatctttcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaatt 2553733  T
Q  190 aagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagcc 289  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    
T  2553734 aactccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtcagcatatcatagactccacgtacagaatacccaccatcatgattaggtaatcaaagcc 2553833  T
Q  290 atctgtctatcactgattcctgcaaagaaact 321  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2553834 atctgtctgtcactgattcctgcaaagaaact 2553865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 114 - 321
Target Start/End: Original strand, 21168220 - 21168427
Alignment:
Q  114 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactgg 213  Q
    |||||||||||| |||||   || ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21168220 ttttgtaggtaatcgatcttgcaaaagtctccaagctaggatagatactttgagaggaacctatttatgccaaattaactccatattatggtgtaactgg 21168319  T
Q  214 ggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagccatctgtctatcactgattcctgca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  21168320 ggctgctcctgtgatgtcaacatatcatagactccacgtacagaatacccaccatcatgattaggtaaccaaagccatctgtctgtcactgattcctgca 21168419  T
Q  314 aagaaact 321  Q
    ||||||||    
T  21168420 aagaaact 21168427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 104 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18651363 - 18651169
Alignment:
Q  104 ccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatg 203  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  18651363 ccaaattattttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagagactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattttg 18651264  T
Q  204 gtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagccatctgtcta 298  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  18651263 atctaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccatgtacagaatacccaccatcctgatttggtaaccacaaccatctatcta 18651169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 24767567 - 24767364
Alignment:
Q  90 aatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaatt 189  Q
    |||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  24767567 aatgccacgatttgccaaattattttttgtaggtaaccgatccctaagaagtcgtcaagcaaggatagagactttgataggaacctgtttatgcaaaatt 24767468  T
Q  190 aagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagcc 289  Q
    || |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||    
T  24767467 aactccatattttgatgtaactagggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgtacagaatacctatcatcctgatttggtaaccatagcc 24767368  T
Q  290 atct 293  Q
    ||||    
T  24767367 atct 24767364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 84 - 208
Target Start/End: Original strand, 12734116 - 12734240
Alignment:
Q  84 agatagaatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgc 183  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12734116 agatagaatgccacgggttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgc 12734215  T
Q  184 caaattaagtccatattatggtgta 208  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||    
T  12734216 caaattaaatccatattatgatgta 12734240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 15958928 - 15958725
Alignment:
Q  118 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggct 217  Q
    ||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||  | ||||||||  | |    
T  15958928 gtaggtaaatgatccctcaaaagccgccaagcaagaatagagactttaagaggaacctgtttatgccatattaacttcatatttggatgtaactgaagtt 15958829  T
Q  218 gctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagccatctgtctatcactgattcctgcaaaga 317  Q
    | ||||||||||||| ||||||| | || || || || ||||||||| || | ||||  |||||||| | |||||| ||   || |||||||||||||||    
T  15958828 gttcctgtgatgtcagcatgtcagacacaccgcgaactgaatacccaccaccttgatccggtaaccacaaccatctatcaggcaatgattcctgcaaaga 15958729  T
Q  318 aact 321  Q
    ||||    
T  15958728 aact 15958725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21630226 - 21630084
Alignment:
Q  114 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactgg 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || |  ||     
T  21630226 ttttgtaggtaaacgatccctcaatagtcgccaaacaaggatagaaacttttaaaggaacctggttatgccaaattaactccatattttgatgaacatga 21630127  T
Q  214 ggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacag 256  Q
    || || |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||    
T  21630126 ggttgttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaacag 21630084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 103 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 17579211 - 17579114
Alignment:
Q  103 accaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatatt 200  Q
    |||||||||  ||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17579211 accaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 17579114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17573785 - 17573646
Alignment:
Q  103 accaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattat 202  Q
    |||||||||  ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  17573785 accaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaatcttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatttt 17573686  T
Q  203 ggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcata 242  Q
    | |  |  || || || |||||||||||||||| ||||||    
T  17573685 gataaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacaagtcata 17573646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 17606449 - 17606302
Alignment:
Q  118 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggct 217  Q
    ||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||| || || |  || |  |    
T  17606449 gtaggtaaatgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgaacatgagatt 17606350  T
Q  218 gctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccat 265  Q
    | |||||||||||||||| |||||| || ||||| |||| ||| ||||    
T  17606349 gttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaacagtataaccat 17606302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 20883186 - 20883015
Alignment:
Q  80 ccacagatagaatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgttt 179  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||| ||   ||| |||||||| | ||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| | ||| |||| |||    
T  20883186 ccacagatataatgccacgatctaccaagttcgatttagtaggtaaacaatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctattt 20883087  T
Q  180 atgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacg 251  Q
    |||||| ||||| |||||||| || || |  || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20883086 atgccagattaactccatattttgatgaacatgtggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacg 20883015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14373081 - 14372973
Alignment:
Q  143 gccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcata 242  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |   |||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  14373081 gccaagcaagaatagatacttttagaggtacctgtttatgccaaattaaatccatagaagaatgtaactgaggctgttcctgggatgtcagcatgtcata 14372982  T
Q  243 gactccacg 251  Q
     || |||||    
T  14372981 caccccacg 14372973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 10577364 - 10577240
Alignment:
Q  118 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggct 217  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| | ||| |||||||||||||||||||| || ||||| || || |  || || |    
T  10577364 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatataaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactctatattttgatgaacatgaggtt 10577265  T
Q  218 gctcctgtgatgtcaacatgtcata 242  Q
    | |||||||||||||| | ||||||    
T  10577264 gttcctgtgatgtcaaaaagtcata 10577240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 242
Target Start/End: Original strand, 33185457 - 33185585
Alignment:
Q  114 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactgg 213  Q
    |||| ||||||| || ||||| || | ||| |||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |  ||||| |||    
T  33185457 ttttataggtaatcgttccctaagcattcgtcaagcaaaaatagagactttcagagggacatgtttatgccaaattaattccaagttttaatgtaaatgg 33185556  T
Q  214 ggctgctcctgtgatgtcaacatgtcata 242  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  33185557 agatgctcctatgatgtcaacatgtcata 33185585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 242
Target Start/End: Original strand, 13937711 - 13937849
Alignment:
Q  104 ccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatg 203  Q
    |||||||  |||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||  ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  13937711 ccaaattttgtttagtaggtaaccggtccctcagcaaacgccaagcaaaaatagacactttcaaaggcacctgtttgtgccaaatcaactccatattttg 13937810  T
Q  204 gtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcata 242  Q
     ||||||  ||| || ||||| || |||||||| |||||    
T  13937811 atgtaacatgggttgttcctgcgaagtcaacatatcata 13937849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 80 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 11358 - 11186
Alignment:
Q  80 ccacagatagaatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgttt 179  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11358 ccacagatagaatgccacggtttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctgagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgttt 11259  T
Q  180 atgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgt 252  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11258 atgccaaattaagtccagattatggtgtagctgggtctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacgt 11186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 118 - 321
Target Start/End: Original strand, 3277 - 3480
Alignment:
Q  118 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggct 217  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  3277 gtaggtaaccgatctctcaaaagtctccaagcaaggatagaaactttaagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattatggtgtaactagggtt 3376  T
Q  218 gctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacgtacagaatacccatcatcatgattaggtaaccagagccatctgtctatcactgattcctgcaaaga 317  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  3377 gctcctgtgatgtcagcatatcatagactccacgtactgagtacccatcatcatggttaggtacccaaagccatctgtctgtcactgattcctgtaaaga 3476  T
Q  318 aact 321  Q
    ||||    
T  3477 aact 3480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University