View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1088_low_3 (Length: 700)

Name: NF1088_low_3
Description: NF1088
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1088_low_3
NF1088_low_3
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (369-682)||(24458711-24459024)
chr6 (369-692)||(29369246-29369569)
chr6 (369-683)||(33004504-33004819)
chr6 (403-692)||(29371836-29372124)
chr6 (4-339)||(27507481-27507816)
chr6 (367-683)||(2280994-2281310)
chr6 (4-339)||(27524695-27525030)
chr6 (4-339)||(16789897-16790231)
chr6 (3-339)||(22859023-22859357)
chr6 (360-644)||(349252-349534)
chr6 (369-631)||(29924870-29925132)
chr6 (3-339)||(1585238-1585575)
chr6 (4-339)||(11250403-11250727)
chr6 (24-363)||(14075292-14075638)
chr6 (178-369)||(18019133-18019325)
chr6 (152-369)||(33317671-33317888)
chr6 (178-335)||(8613753-8613910)
chr6 (570-683)||(33045715-33045828)
chr6 (368-522)||(33045544-33045699)
chr6 (24-109)||(5754177-5754261)
chr6 (24-109)||(18018976-18019058)
chr6 (288-357)||(19219337-19219406)
chr6 (24-78)||(8614003-8614058)
chr6 (24-78)||(33317955-33318010)
chr6 (630-685)||(25971034-25971089)
chr6 (630-685)||(25975474-25975529)
chr6 (46-78)||(10358260-10358292)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (367-683)||(36437373-36437690)
chr2 (368-692)||(19821947-19822271)
chr2 (368-692)||(19842168-19842492)
chr2 (369-692)||(20890723-20891046)
chr2 (371-692)||(42109205-42109526)
chr2 (369-683)||(27997223-27997538)
chr2 (369-683)||(28098593-28098908)
chr2 (371-682)||(1916543-1916855)
chr2 (369-683)||(35431907-35432222)
chr2 (368-683)||(6123764-6124080)
chr2 (4-339)||(24249165-24249501)
chr2 (31-339)||(30175210-30175518)
chr2 (368-669)||(25647579-25647881)
chr2 (368-683)||(13905381-13905695)
chr2 (368-683)||(207799-208113)
chr2 (369-683)||(26455959-26456273)
chr2 (369-683)||(40605421-40605735)
chr2 (369-683)||(5013301-5013614)
chr2 (368-683)||(1512825-1513140)
chr2 (368-644)||(1273025-1273310)
chr2 (369-669)||(2300884-2301185)
chr2 (369-683)||(13908313-13908628)
chr2 (178-369)||(24228519-24228710)
chr2 (192-353)||(32739318-32739475)
chr2 (570-683)||(184185-184298)
chr2 (570-683)||(2449419-2449532)
chr2 (369-522)||(184314-184468)
chr2 (368-522)||(975850-976004)
chr2 (368-522)||(2449548-2449703)
chr2 (368-562)||(21588876-21589070)
chr2 (570-683)||(976020-976131)
chr2 (227-351)||(24763028-24763151)
chr2 (152-341)||(19617266-19617455)
chr2 (153-233)||(24762007-24762087)
chr2 (24-111)||(24228379-24228465)
chr2 (288-358)||(37443983-37444053)
chr2 (617-685)||(23455676-23455744)
chr2 (288-342)||(15341458-15341512)
chr2 (24-78)||(24761904-24761960)
chr2 (367-403)||(23455401-23455437)
[»] chr1 (47 HSPs)
chr1 (369-682)||(15691525-15691838)
chr1 (368-692)||(48960769-48961092)
chr1 (369-683)||(38210726-38211041)
chr1 (368-683)||(45501019-45501335)
chr1 (3-339)||(42816122-42816458)
chr1 (4-339)||(9456949-9457284)
chr1 (4-339)||(9461046-9461381)
chr1 (369-683)||(39512988-39513303)
chr1 (368-682)||(2047232-2047546)
chr1 (369-682)||(36866644-36866957)
chr1 (388-683)||(29245506-29245802)
chr1 (4-339)||(20778778-20779114)
chr1 (4-339)||(22669391-22669726)
chr1 (368-683)||(2044981-2045296)
chr1 (397-685)||(26211704-26211993)
chr1 (368-683)||(49787091-49787404)
chr1 (4-335)||(20390374-20390704)
chr1 (369-683)||(13926035-13926349)
chr1 (369-683)||(50708927-50709241)
chr1 (369-683)||(48651070-48651382)
chr1 (4-339)||(33282989-33283325)
chr1 (24-370)||(28133870-28134220)
chr1 (4-339)||(14482723-14483059)
chr1 (155-369)||(47666767-47666981)
chr1 (427-683)||(45503325-45503580)
chr1 (4-237)||(22239858-22240092)
chr1 (369-528)||(36461619-36461779)
chr1 (178-358)||(43801670-43801850)
chr1 (152-369)||(636777-636994)
chr1 (152-369)||(35936130-35936347)
chr1 (178-369)||(22613297-22613476)
chr1 (24-303)||(19705628-19705904)
chr1 (570-683)||(7480564-7480677)
chr1 (570-683)||(9533940-9534053)
chr1 (24-269)||(28145354-28145596)
chr1 (570-683)||(42496648-42496761)
chr1 (4-116)||(33262830-33262942)
chr1 (368-522)||(42496777-42496932)
chr1 (368-522)||(9534069-9534224)
chr1 (369-522)||(7480693-7480847)
chr1 (152-358)||(8728478-8728683)
chr1 (3-60)||(20388048-20388105)
chr1 (24-109)||(43801518-43801601)
chr1 (24-109)||(47666642-47666724)
chr1 (24-109)||(22613550-22613632)
chr1 (636-685)||(37891535-37891584)
chr1 (25-78)||(35936414-35936466)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (368-692)||(37983179-37983503)
chr8 (368-692)||(24011590-24011912)
chr8 (359-675)||(18492360-18492675)
chr8 (4-339)||(27879621-27879956)
chr8 (4-339)||(28019802-28020137)
chr8 (3-339)||(21917508-21917845)
chr8 (4-339)||(22129746-22130078)
chr8 (368-683)||(405896-406211)
chr8 (368-683)||(23827811-23828126)
chr8 (369-669)||(18265734-18266035)
chr8 (369-669)||(18274747-18275048)
chr8 (24-369)||(8370406-8370749)
chr8 (4-339)||(27013796-27014129)
chr8 (369-683)||(14994215-14994527)
chr8 (183-369)||(26241834-26242020)
chr8 (4-339)||(27006653-27006986)
chr8 (367-683)||(22729619-22729934)
chr8 (369-683)||(19961680-19961994)
chr8 (368-683)||(41376154-41376468)
chr8 (3-339)||(45533405-45533742)
chr8 (4-237)||(29561783-29562017)
chr8 (178-359)||(25612011-25612192)
chr8 (4-237)||(22646691-22646924)
chr8 (371-623)||(21639991-21640242)
chr8 (192-369)||(26652611-26652787)
chr8 (178-369)||(21970139-21970328)
chr8 (178-369)||(22658798-22658990)
chr8 (178-369)||(2962232-2962423)
chr8 (178-353)||(6431709-6431884)
chr8 (152-342)||(18836177-18836364)
chr8 (25-109)||(6431887-6431970)
chr8 (288-339)||(8781304-8781355)
chr8 (24-78)||(22658663-22658717)
chr8 (24-109)||(2962078-2962162)
chr8 (27-109)||(21970394-21970473)
chr8 (367-403)||(18272787-18272823)
chr8 (367-403)||(27853774-27853810)
chr8 (46-78)||(35520763-35520795)
[»] chr4 (44 HSPs)
chr4 (369-692)||(42347782-42348106)
chr4 (369-692)||(31448188-31448515)
chr4 (368-692)||(53288352-53288677)
chr4 (4-339)||(15815854-15816189)
chr4 (4-339)||(18110176-18110512)
chr4 (4-339)||(2677846-2678182)
chr4 (4-339)||(26532447-26532783)
chr4 (368-669)||(25839384-25839686)
chr4 (368-683)||(28389455-28389770)
chr4 (368-683)||(52682785-52683100)
chr4 (368-678)||(16909113-16909423)
chr4 (368-683)||(21581350-21581665)
chr4 (369-683)||(19514961-19515275)
chr4 (368-683)||(30387763-30388077)
chr4 (4-339)||(5871250-5871586)
chr4 (3-339)||(17299087-17299422)
chr4 (368-683)||(21382702-21383015)
chr4 (368-683)||(41859605-41859920)
chr4 (4-337)||(3356051-3356385)
chr4 (368-683)||(29358946-29359261)
chr4 (4-339)||(38817470-38817805)
chr4 (4-339)||(18163995-18164331)
chr4 (4-339)||(20244770-20245107)
chr4 (178-369)||(15462307-15462498)
chr4 (183-368)||(28917085-28917270)
chr4 (4-339)||(4675083-4675418)
chr4 (155-357)||(11483087-11483289)
chr4 (178-369)||(34976358-34976550)
chr4 (183-369)||(9488352-9488539)
chr4 (152-369)||(4546869-4547090)
chr4 (178-316)||(15651709-15651847)
chr4 (152-350)||(30039784-30039981)
chr4 (4-95)||(15821769-15821861)
chr4 (196-343)||(11421817-11421961)
chr4 (288-358)||(32637300-32637370)
chr4 (24-109)||(11482962-11483044)
chr4 (288-358)||(19374162-19374232)
chr4 (24-109)||(15462579-15462662)
chr4 (24-109)||(15651555-15651639)
chr4 (24-76)||(28916924-28916974)
chr4 (278-358)||(9538774-9538854)
chr4 (617-676)||(8121116-8121175)
chr4 (617-676)||(36895635-36895694)
chr4 (25-109)||(4547127-4547211)
[»] chr3 (42 HSPs)
chr3 (369-692)||(11826532-11826855)
chr3 (370-692)||(33003622-33003941)
chr3 (371-662)||(859921-860213)
chr3 (369-683)||(36946889-36947204)
chr3 (4-339)||(20146688-20147023)
chr3 (369-683)||(13454616-13454930)
chr3 (369-683)||(16651485-16651799)
chr3 (369-595)||(47726776-47727001)
chr3 (368-683)||(4594177-4594492)
chr3 (369-683)||(12260892-12261207)
chr3 (424-683)||(52418583-52418842)
chr3 (369-683)||(36087324-36087637)
chr3 (369-683)||(18198768-18199082)
chr3 (368-683)||(35716374-35716688)
chr3 (369-679)||(26951576-26951886)
chr3 (369-683)||(12825265-12825579)
chr3 (369-683)||(49562143-49562456)
chr3 (369-683)||(38655655-38655970)
chr3 (369-683)||(36091161-36091475)
chr3 (24-369)||(21399600-21399943)
chr3 (369-683)||(31487289-31487601)
chr3 (369-682)||(854641-854955)
chr3 (3-339)||(55427854-55428194)
chr3 (178-369)||(15845841-15846032)
chr3 (368-524)||(43508613-43508769)
chr3 (24-369)||(21035044-21035393)
chr3 (3-339)||(12332044-12332368)
chr3 (4-339)||(12300743-12301066)
chr3 (178-363)||(28088925-28089110)
chr3 (369-580)||(29864559-29864770)
chr3 (178-353)||(25978031-25978207)
chr3 (178-369)||(15316481-15316672)
chr3 (4-315)||(13330000-13330320)
chr3 (570-683)||(26947913-26948026)
chr3 (369-522)||(26948042-26948196)
chr3 (24-107)||(15845677-15845758)
chr3 (271-342)||(26817124-26817195)
chr3 (24-78)||(28089224-28089279)
chr3 (42-78)||(4471885-4471921)
chr3 (288-352)||(14147841-14147905)
chr3 (630-685)||(18256296-18256351)
chr3 (617-676)||(36006257-36006316)
[»] chr7 (48 HSPs)
chr7 (369-683)||(13398146-13398461)
chr7 (368-683)||(5093621-5093937)
chr7 (368-683)||(46909399-46909714)
chr7 (368-683)||(29956528-29956844)
chr7 (4-339)||(2205385-2205720)
chr7 (4-339)||(18407921-18408253)
chr7 (369-673)||(31100199-31100504)
chr7 (4-339)||(18400937-18401269)
chr7 (369-683)||(7893808-7894122)
chr7 (368-683)||(27715995-27716308)
chr7 (368-683)||(32660275-32660589)
chr7 (368-683)||(17696966-17697281)
chr7 (369-683)||(45115881-45116195)
chr7 (368-683)||(16719951-16720267)
chr7 (369-683)||(26168895-26169209)
chr7 (4-237)||(12188748-12188983)
chr7 (367-657)||(20955490-20955780)
chr7 (24-369)||(8465805-8466146)
chr7 (368-683)||(22007031-22007347)
chr7 (4-339)||(30254971-30255307)
chr7 (369-683)||(32038494-32038809)
chr7 (16-339)||(18138482-18138807)
chr7 (3-339)||(15730586-15730923)
chr7 (4-237)||(48807649-48807883)
chr7 (183-369)||(19231694-19231880)
chr7 (152-353)||(47166139-47166340)
chr7 (178-359)||(18258428-18258610)
chr7 (192-369)||(34129379-34129556)
chr7 (207-369)||(41680302-41680464)
chr7 (178-369)||(10666369-10666560)
chr7 (183-369)||(28131368-28131555)
chr7 (4-126)||(19860164-19860287)
chr7 (369-522)||(7889047-7889201)
chr7 (570-683)||(7888918-7889031)
chr7 (194-352)||(18256886-18257047)
chr7 (155-358)||(19392712-19392914)
chr7 (166-353)||(31189671-31189853)
chr7 (271-353)||(24442774-24442856)
chr7 (25-109)||(47166019-47166102)
chr7 (22-78)||(19231966-19232023)
chr7 (24-78)||(18258281-18258336)
chr7 (24-78)||(34129670-34129725)
chr7 (24-78)||(41680205-41680260)
chr7 (30-78)||(28131627-28131675)
chr7 (295-339)||(48807921-48807965)
chr7 (24-78)||(10666214-10666269)
chr7 (304-358)||(42150064-42150118)
chr7 (369-405)||(39703883-39703919)
[»] scaffold0374 (1 HSPs)
scaffold0374 (368-683)||(2022-2337)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (4-339)||(120563-120898)
[»] scaffold0642 (1 HSPs)
scaffold0642 (368-683)||(3450-3765)
[»] scaffold0345 (1 HSPs)
scaffold0345 (368-683)||(13362-13677)
[»] scaffold0105 (1 HSPs)
scaffold0105 (368-683)||(25304-25619)
[»] chr5 (38 HSPs)
chr5 (368-683)||(30090086-30090401)
chr5 (368-683)||(3607671-3607986)
chr5 (368-683)||(20104827-20105141)
chr5 (4-339)||(32732-33068)
chr5 (4-339)||(23546755-23547091)
chr5 (148-369)||(31097622-31097843)
chr5 (3-339)||(24932438-24932775)
chr5 (24-359)||(25804533-25804871)
chr5 (368-683)||(32674949-32675264)
chr5 (6-339)||(12788798-12789132)
chr5 (178-369)||(20941833-20942024)
chr5 (152-369)||(12764270-12764486)
chr5 (152-369)||(12703255-12703470)
chr5 (24-369)||(9810892-9811229)
chr5 (178-335)||(7864741-7864898)
chr5 (178-303)||(22942088-22942213)
chr5 (570-683)||(12655271-12655384)
chr5 (570-683)||(23184056-23184169)
chr5 (570-683)||(23188323-23188436)
chr5 (570-683)||(34761317-34761430)
chr5 (570-683)||(39878151-39878264)
chr5 (178-369)||(5098453-5098642)
chr5 (368-522)||(34761446-34761601)
chr5 (368-522)||(39878280-39878435)
chr5 (368-522)||(12655400-12655554)
chr5 (369-522)||(23184185-23184339)
chr5 (369-522)||(23188452-23188606)
chr5 (183-359)||(39428255-39428431)
chr5 (160-341)||(39536015-39536195)
chr5 (24-78)||(7864594-7864648)
chr5 (617-685)||(38095492-38095560)
chr5 (24-78)||(12764148-12764203)
chr5 (24-109)||(12703133-12703218)
chr5 (627-685)||(37609732-37609790)
chr5 (24-109)||(31097875-31097958)
chr5 (617-685)||(16678746-16678814)
chr5 (30-78)||(39428514-39428562)
chr5 (287-335)||(28719119-28719167)
[»] scaffold0119 (2 HSPs)
scaffold0119 (368-644)||(34190-34467)
scaffold0119 (368-644)||(27781-28066)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (4-213)||(197191-197401)
[»] scaffold1849 (1 HSPs)
scaffold1849 (4-274)||(12-282)
[»] scaffold0097 (4 HSPs)
scaffold0097 (368-683)||(48827-49142)
scaffold0097 (369-683)||(51652-51964)
scaffold0097 (570-683)||(40379-40492)
scaffold0097 (368-522)||(40208-40363)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (369-683)||(45628-45944)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (24-369)||(968-1310)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (155-369)||(73476-73690)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (24-369)||(989-1338)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (3-339)||(2808-3144)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (178-369)||(138013-138204)
scaffold0001 (25-70)||(137850-137894)
[»] scaffold0069 (2 HSPs)
scaffold0069 (178-369)||(32-223)
scaffold0069 (42-109)||(283-349)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (4-237)||(18596-18831)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (183-369)||(7824-8010)
scaffold0686 (25-109)||(7668-7750)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (178-369)||(128302-128493)
scaffold0017 (24-109)||(128558-128641)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (152-358)||(10165-10370)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (4-145)||(32286-32427)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (3-207)||(10134-10345)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (228-359)||(54580-54710)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (178-254)||(38889-38965)
scaffold0037 (24-109)||(38724-38807)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (194-358)||(27357-27516)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (279-342)||(108531-108594)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (152-318)||(39277-39440)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 369 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 24459024 - 24458711
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgt 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24459024 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgttaaaattttcgt 24458925  T
Q  469 gaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaaggg 568  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24458924 gaatcaaagcataatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttatgttactttaacataacatataattttaaaaggg 24458825  T
Q  569 aaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccac 668  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24458824 aaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcatacacattacggaaaacttctttgtacaccac 24458725  T
Q  669 atttgatgcaacat 682  Q
    ||||||||||||||    
T  24458724 atttgatgcaacat 24458711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 369 - 692
Target Start/End: Original strand, 29369246 - 29369569
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgt 468  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29369246 actagaccattaacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcacgtcaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgt 29369345  T
Q  469 gaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaaggg 568  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29369346 gaatcaaaacataatgtcaattatgatagactttgttattgttccataattctaagacgcaatttctgttactttaacataacatataattttaaaaggg 29369445  T
Q  569 aaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccac 668  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29369446 aaactgaagttcgttgacatgcaaataatttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtagaccac 29369545  T
Q  669 atttgatgcaacatcagaataatc 692  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    
T  29369546 atttgatgcaacatcggtataatc 29369569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 369 - 683
Target Start/End: Original strand, 33004504 - 33004819
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33004504 actagaccattgacccatgctaacacacggttcattttaagaagtaaatattcactgtaaaaataaaacaatgtagtgcgcttgaatgtaaaaattgtcg 33004603  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  33004604 tgaatcaaagcataatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttatgttactttaacataacatataattttaaaagg 33004703  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33004704 gaaactgaagtttgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtagacca 33004803  T
Q  668 catttgatgcaacatc 683  Q
    ||||||||||||||||    
T  33004804 catttgatgcaacatc 33004819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 403 - 692
Target Start/End: Original strand, 29371836 - 29372124
Alignment:
Q  403 ttttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagacttt 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29371836 ttttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatcaaagcataatgtcaattacgatagacttt 29371935  T
Q  503 gttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaa 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29371936 gttattgttccataattctaagacgc-gtttctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaataatttcaa 29372034  T
Q  603 taagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccacatttgatgcaacatcagaataatc 692  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  29372035 taagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtagaccacatttgatgcaacatcggtataatc 29372124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Original strand, 27507481 - 27507816
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattg 103  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27507481 tgaaggtaagtcgacatatacagaataagcagcggattaaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgattcgattg 27507580  T
Q  104 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27507581 ttaccttagaacgattggtctgaaaacgatcggtggaatctgcgaaccggaatcacgatcacagccaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 27507680  T
Q  204 aacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaa-cgcgtaacctcaaacttcagcactagg 301  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  ||||| | ||||||||||| |||||   ||||||| ||||||   ||||||||    
T  27507681 aacagtgctcctccaaaagctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagataactagggtttctgcaaaagaacgtaaccgcaaactattgcactagg 27507778  T
Q  302 gttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  27507779 gttctatttatagaactctttatgtgctttgcaagtca 27507816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 367 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 2281310 - 2280994
Alignment:
Q  367 caactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgt 465  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||  |||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2281310 caactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaataagacattgtagttcgcgtgaatctaaaaattgt 2281211  T
Q  466 cgtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaa 565  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||    
T  2281210 cgtgaatcaaagcaaaatgtcaa-taccaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaa 2281112  T
Q  566 gggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacac 665  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  2281111 gggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagac 2281012  T
Q  666 cacatttgatgcaacatc 683  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2281011 cacatttgatgcaacatc 2280994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Original strand, 27524695 - 27525030
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattg 103  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  27524695 tgaaggtaaatcgacatatacagaataagcagcggattaaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaacaagtgattcgattg 27524794  T
Q  104 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27524795 ttaccttagaacgattggtctgaaaacgatcggtggaatctgcgcaccggaatcacgatcacagccaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacagg 27524894  T
Q  204 aacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaa-cgcgtaacctcaaacttcagcactagg 301  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  ||||||| ||||||||||| |||||   ||||||| ||||||   ||||||||    
T  27524895 aacagtgctcctccaaaagctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagaactagggtttctgcaaaagaacgtaaccgcaaactattgcactagg 27524992  T
Q  302 gttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  27524993 gttctatttatagaactctttatgtgctttgcaagtca 27525030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16790231 - 16789897
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattg 103  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16790231 tgaaggtaaatcgacatatacagaataagcagcagaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgattcgattg 16790132  T
Q  104 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 203  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16790131 ttacctt-gaacgattagtctg-aaacgatcggtggaatctgcgaaccggaatcacgatcacagccaagcaaacagcagagcctctatcaagtccacacg 16790034  T
Q  204 aacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaa--aacgcgtaacctcaaacttcagcactag 300  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  ||||||| ||||||||||| |||  ||  ||||||| ||||||   |||||||    
T  16790033 aacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagaactagggtttctgcaaagaatacgtaaccgcaaactattgcactag 16789936  T
Q  301 ggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  16789935 ggttctatttatagaactccttatatgctttgcaagtca 16789897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 339
Target Start/End: Original strand, 22859023 - 22859357
Alignment:
Q  3 ttgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  22859023 ttgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaaaaa---ttcgatttactttccttggatcattacgaattaaaacttgaaccagtgattcgatt 22859119  T
Q  103 gttaccttagaacggttggtctgaaaa-cgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccaca 201  Q
    |||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22859120 gttaccttaattcggttggtctgaaaaacgagcggtggaatctgcgaaccggtatcacgatcacagccaagcaattagcagagcctctatcaagtccaca 22859219  T
Q  202 cgaacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaa-cgcgtaacctcaaacttcagcacta 299  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  |||||||||| |||||||| |||||   ||||||| ||||||   ||||||    
T  22859220 cgaacagtgctcttccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagagcttgggtttctgcaaaagaacgtaaccgcaaactattgcacta 22859317  T
Q  300 gggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  22859318 gggttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 22859357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 360 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 349534 - 349252
Alignment:
Q  360 ttaaacccaactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcat-gtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaa 458  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  349534 ttaaagccaactagaccattgatccgtgctaacgcacatatcattttaaaaagttaatattcaccgtaaaaataaaataatgtagttcgattgaatgtaa 349435  T
Q  459 aaattgtcgtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattat 558  Q
    |||||||   |||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||    
T  349434 aaattgt---gaatcaaaacataatgtcaattaccatatactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaatataacatataat 349338  T
Q  559 tttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacatt 644  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  349337 tttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacatt 349252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 369 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 29925132 - 29924870
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||| || ||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29925132 actagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaattaa-tactcactgaaaaaataagacactgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 29925034  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  29925033 tgaatcaaagcaaaatgtcaattaccataggctttgttattgttccataattctagtacgtagttcttgttactttaacataacatataattttaaaagg 29924934  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaa 631  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29924933 gaaactgaaattcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaa 29924870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 339
Target Start/End: Original strand, 1585238 - 1585575
Alignment:
Q  3 ttgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgatt 102  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  1585238 ttgaaggtaaaacgacattaacagaataagcagcagaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattgaaacttgaaccagtgattcgatt 1585337  T
Q  103 gttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacac 202  Q
    |||||||||||| |   | ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  1585338 gttaccttagaatgaaag-tctgaaaacgatcggtggaatctgcgaactggaatctcgatcacagccaagcaaacagcagagcctctattgagtccacac 1585436  T
Q  203 gaacagtgctcctccaaaac-tcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaa---acgcgtaacctcaaacttcagcact 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  | |||||  |||||| ||||||||||| ||||   |  ||||||| ||||||   |||||    
T  1585437 gaacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaagt--cagagaactagggtttctgcaaagaaaaacgtaaccgcaaactattgcact 1585534  T
Q  299 agggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  1585535 aggtttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 1585575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 11250727 - 11250403
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaa-tttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11250727 tgaaggtaaatcgacataa-cagaataagcagcggaataaaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgattcgatt 11250629  T
Q  103 gttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacac 202  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||            | ||||||||||||||  |||||||||    
T  11250628 gttaccttagaacgattagtctgaagacgatcggtggaatctgcgaactggaatctcgatc------------acagcagagcctctattgagtccacac 11250541  T
Q  203 gaacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaa--aacgcgtaacctcaaacttcagcacta 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |  | ||||  ||||||| ||||||||||| |||  ||   |||||| ||||||   ||||||    
T  11250540 gaacagtgctcctccaaaacctcggtgcaagccaagaagacggaag--tcagagaactagggtttctgcaaggaaaatgtaaccgcaaactattgcacta 11250443  T
Q  300 gggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  11250442 ggtttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 11250403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 14075638 - 14075292
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattgttaccttagaacggttggtc 123  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||| |||||||||||| | |  |     ||    
T  14075638 cagaataagcagcggataaaattttagattttctttccttggatcattacgaattacaa-atgaatcagtgattcgattgttacctcaaagtgtgaaatc 14075540  T
Q  124 tgaaaac-gagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaag-------caaatagcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcct 215  Q
    ||||| | ||  | || ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||       |||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14075539 tgaaagctgaaagttggaatctggaaactggaatcacgatcacagcaaagcaggcaacaagcagcaaagcctctagcaagtccacacgaacagtgctcct 14075440  T
Q  216 ccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttataga 315  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14075439 ccaaaactcggtgctagccaaggaatgagaagtttcagagagctagggtttctcaaaaatgtaaaacctcaaacttcagcactagggttctatttataga 14075340  T
Q  316 actccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcattaa 363  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14075339 actccttgtgtgttctgcaagtcagaagccactgttggacttcattaa 14075292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 178 - 369
Target Start/End: Original strand, 18019133 - 18019325
Alignment:
Q  178 agcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttc-aaaacg 276  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||      
T  18019133 agcaaagcctctagcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcggtgctagccaaggaatcagaagtctcagagagctagggtttcttcaaaaatc 18019232  T
Q  277 cgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcattaaacccaa 369  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  18019233 cgtaacctcaaactttagcactagtattctatttatagaactctttgtgtgctatgcaagtcagaagtcactattggacttcactaagcccaa 18019325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 152 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 33317888 - 33317671
Alignment:
Q  152 ggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttc 251  Q
    ||||||||||||| | |||||||| || || |||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33317888 ggaatcacgatcacaacaaagcaagtaacaaagcctctagcaaacccaaacgaacagtgctcctccaaaactcggtgctagccaaggaatcagaagtttc 33317789  T
Q  252 agagagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactatt 351  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  33317788 agagagctaaggtttctcaaaaacgtgcaacctcaaacttcagcaatagggttctatttatagaacttcttgtgtgctctgcaagtcagaagccactatg 33317689  T
Q  352 ggacttcattaaacccaa 369  Q
    || ||||| ||| |||||    
T  33317688 gggcttcagtaagcccaa 33317671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 178 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8613910 - 8613753
Alignment:
Q  178 agcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgc 277  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||     
T  8613910 agcaaagcctctagcaagtccaaacgaacagtgctcctccaaaactcgttgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctaaggtttctcaaaaacgt 8613811  T
Q  278 gtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaa 335  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8613810 gcaacctcaaacttcagcaatagggttctatttatagaactccttgtgtgctctgcaa 8613753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 570 - 683
Target Start/End: Original strand, 33045715 - 33045828
Alignment:
Q  570 aactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccaca 669  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  33045715 aactgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaatgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccaca 33045814  T
Q  670 tttgatgcaacatc 683  Q
     |||||||||||||    
T  33045815 cttgatgcaacatc 33045828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 368 - 522
Target Start/End: Original strand, 33045544 - 33045699
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || | |||| ||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33045544 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcactgaaaaaataagacactgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 33045643  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattcta 522  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33045644 gtgaatcaaagcaaaatgacaattaccatagactttgttattgttccataattcta 33045699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 109
Target Start/End: Original strand, 5754177 - 5754261
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattgttacct 109  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||| ||||||||||||    
T  5754177 cagaataagcagcggataaaaatttcaattttctttccttggatcattacgaatt-acacatgaatcagtgatccgattgttacct 5754261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 109
Target Start/End: Original strand, 18018976 - 18019058
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattgttacct 109  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||| ||||||||||||    
T  18018976 cagaataagcagcggaaaaaa--ttcgattttctttccttggatcattacgaatt-acacatgaatcagtgattcgattgttacct 18019058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 19219406 - 19219337
Alignment:
Q  288 acttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggactt 357  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||   ||||||||||||    
T  19219406 acttcagcacaagggttctatttatagaactccaagtgtgttctgcaagtcagaatttactattggactt 19219337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 24 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 8614058 - 8614003
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaattt-cgatttactttccttggatcattacgaatt 78  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8614058 cagaataagcagcggataaaaattttcgattttctttccttggatcattacgaatt 8614003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 24 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 33318010 - 33317955
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaattt-cgatttactttccttggatcattacgaatt 78  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33318010 cagaataagcagcggataaaaattttcgattttctttccttggatcattacgaatt 33317955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 630 - 685
Target Start/End: Original strand, 25971034 - 25971089
Alignment:
Q  630 aaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccacatttgatgcaacatcag 685  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||  |||||||    
T  25971034 aaagtgctacacattacggaaaacttctctctagaccacatttgatgtcacatcag 25971089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 630 - 685
Target Start/End: Original strand, 25975474 - 25975529
Alignment:
Q  630 aaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccacatttgatgcaacatcag 685  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||  |||||||    
T  25975474 aaagtgctacacattacggaaaacttctctctagaccacatttgatgtcacatcag 25975529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 78
Target Start/End: Original strand, 10358260 - 10358292
Alignment:
Q  46 tttcgatttactttccttggatcattacgaatt 78  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10358260 tttcgattttctttccttggatcattacgaatt 10358292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 367 - 683
Target Start/End: Original strand, 36437373 - 36437690
Alignment:
Q  367 caactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgt 465  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36437373 caactagaccattgatccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcactgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgt 36437472  T
Q  466 cgtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaa 565  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  36437473 cgtgaatcaaagcataatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttactttaacataacatataattttaaaa 36437572  T
Q  566 gggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacac 665  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36437573 gggaaactgaagttcgttgacatacaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtagac 36437672  T
Q  666 cacatttgatgcaacatc 683  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36437673 cacatttgatgcaacatc 36437690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 368 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 19822271 - 19821947
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19822271 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 19822172  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19822171 tgaatcaaagcataatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcaatttctgttactttaacataacatataattttaaaagg 19822072  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  19822071 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaatcagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattccggaaaacttctttgtagacca 19821972  T
Q  668 catttgatgcaacatcagaataatc 692  Q
    |||||||||||||||| | ||||||    
T  19821971 catttgatgcaacatcggtataatc 19821947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 368 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 19842492 - 19842168
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19842492 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 19842393  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19842392 tgaatcaaagcataatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcaatttctgttactttaacataacatataattttaaaagg 19842293  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  19842292 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaatcagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattccggaaaacttctttgtagacca 19842193  T
Q  668 catttgatgcaacatcagaataatc 692  Q
    |||||||||||||||| | ||||||    
T  19842192 catttgatgcaacatcggtataatc 19842168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 369 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 20891046 - 20890723
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgt 468  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20891046 actagaccattgacgcatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaataatcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgt 20890947  T
Q  469 gaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaaggg 568  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20890946 gaatcaaaccataatgtcaattacgatagattttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttactttaacataacatataattttaaaaggg 20890847  T
Q  569 aaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccac 668  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20890846 aaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaatgtcctacacattacggaaaacttctttgtagaccac 20890747  T
Q  669 atttgatgcaacatcagaataatc 692  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    
T  20890746 atttgatgcaacatcggtataatc 20890723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 371 - 692
Target Start/End: Original strand, 42109205 - 42109526
Alignment:
Q  371 tagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtga 470  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42109205 tagaccattgacccctgctaacacacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgtttgaatgtaaaaattgtcgtga 42109304  T
Q  471 atcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagggaa 570  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42109305 atcaaagcataatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttactttaacataacatataattttaaaagggaa 42109404  T
Q  571 actgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccacat 670  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  42109405 actgaagttcgttgacatgcaaataatttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaggtcctacacattacggaaaacttttttgtagaccacat 42109504  T
Q  671 ttgatgcaacatcagaataatc 692  Q
    ||||||||||||| | ||||||    
T  42109505 ttgatgcaacatcggtataatc 42109526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 369 - 683
Target Start/End: Original strand, 27997223 - 27997538
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27997223 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcactgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 27997322  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  27997323 tgaatcaaagcataaggtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagg 27997422  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27997423 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagttctacacattacggaaaacttctctgtagacca 27997522  T
Q  668 catttgatgcaacatc 683  Q
    |||||||||| |||||    
T  27997523 catttgatgctacatc 27997538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 369 - 683
Target Start/End: Original strand, 28098593 - 28098908
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28098593 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcactgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 28098692  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  28098693 tgaatcaaagcataaggtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagg 28098792  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  28098793 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagttctacacattacggaaaacttctctgtagacca 28098892  T
Q  668 catttgatgcaacatc 683  Q
    |||||||||| |||||    
T  28098893 catttgatgctacatc 28098908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 371 - 682
Target Start/End: Original strand, 1916543 - 1916855
Alignment:
Q  371 tagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtg 469  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1916543 tagaccattgacccgtgctaacgcacgggtcattttaagaagttaatattcactgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattatcgtg 1916642  T
Q  470 aatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaaggga 569  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1916643 aatcaaagaataatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctaagacgcagttcctgttactttaacataacatataattttaaaaggga 1916742  T
Q  570 aactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccaca 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  1916743 aactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacatattatggaaaacttctatgtagaccaca 1916842  T
Q  670 tttgatgcaacat 682  Q
    |||||||||||||    
T  1916843 tttgatgcaacat 1916855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 369 - 683
Target Start/End: Original strand, 35431907 - 35432222
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35431907 actagaccattgaccggtgctaacgcacgggtcattttaagaaataaatattcactgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 35432006  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  35432007 tgaatcaaagcataatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctaaaacgaagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagg 35432106  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacac-aaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacc 666  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||    
T  35432107 gaaactaaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaaagtcctacacattatggaaaacttctctgta-gcc 35432205  T
Q  667 acatttgatgcaacatc 683  Q
    |||||||||||||||||    
T  35432206 acatttgatgcaacatc 35432222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 368 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 6124080 - 6123764
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||| || ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6124080 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaattaa-tactcactgaaaaaataaaacattgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 6123982  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6123981 gtgaatcaaagcaaaatgacaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaag 6123882  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcc-tacacattacggaaaacttctttgtacac 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |     
T  6123881 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataaataagaaaatgaatagtacacaaaaaagtccttacacattacggaaaacttctctgtagat 6123782  T
Q  666 cacatttgatgcaacatc 683  Q
    |||| |||||||||||||    
T  6123781 cacacttgatgcaacatc 6123764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Original strand, 24249165 - 24249501
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaattt-cgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgatt 102  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24249165 tgaaggtaaatcgacatgtacagaataagcagcggaataaaattttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgattcgatt 24249264  T
Q  103 gttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacac 202  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24249265 gttaccttagaacgattggtctgaaaacgatcggtggaatctgcgaaccggaatcacgatcacagccaagcgaatagcagagcctctatcaagtccacac 24249364  T
Q  203 gaacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaa-cgcgtaacctcaaacttcagcactag 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  ||||||| ||||||||||| |||||   |||||||  |||||   |||||||    
T  24249365 gaacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagaactagggtttctgcaaaagaacgtaaccgtaaactgttgcactag 24249462  T
Q  301 ggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  24249463 ggttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 24249501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 31 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 30175518 - 30175210
Alignment:
Q  31 agcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattgttaccttagaacggttggtctgaaaac 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30175518 agcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatatgattgttaccttagaacggttggtctgagaac 30175419  T
Q  131 gagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaa-ctcgatgc 229  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  30175418 gaacggtgaaatttgcgaaccggaatcacgatcacagccaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacgaacagtcctcctccaaaacctcggtgc 30175319  T
Q  230 tagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaa-cgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgc 328  Q
    |||||||| |  | ||||  |||||||||| |||||||| |||||   ||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30175318 tagccaagaagacggaag--tcagagagcttgggtttctgcaaaagaacgtaaccgcaaactgttgcactagggttctatttatagaactccttatgtgc 30175221  T
Q  329 tatgcaagtca 339  Q
    | |||||||||    
T  30175220 tttgcaagtca 30175210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 368 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 25647881 - 25647579
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || | |||| ||| || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25647881 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcactgaaaaaataagacactatagttcgcttgaatgaaaaaattgtc 25647782  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25647781 gtgaatcaaagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctattactttaacataacatataattttaaaag 25647682  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacc 666  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||    
T  25647681 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttttctgtagacc 25647582  T
Q  667 aca 669  Q
    |||    
T  25647581 aca 25647579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 368 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 13905695 - 13905381
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcat-gtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||| || |||  | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13905695 aactataccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaattaa-tactcacagaaaaaataagacactgtaggtcgcttgaatgtaaaaattgtc 13905597  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13905596 gtgaatcaaagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaag 13905497  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacc 666  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  13905496 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacaca-aaaagtcctacatattacggaaaacttctctgtagacc 13905398  T
Q  667 acatttgatgcaacatc 683  Q
    ||| |||||||||||||    
T  13905397 acacttgatgcaacatc 13905381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 368 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 208113 - 207799
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||  ||||||||   |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  208113 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcg 208014  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    |||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  208013 tgaatcaaagcaaaatgtcaa-tatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagg 207915  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  207914 gaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagacca 207815  T
Q  668 catttgatgcaacatc 683  Q
    ||||||||||||||||    
T  207814 catttgatgcaacatc 207799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 369 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 26456273 - 26455959
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| || |||  |||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26456273 actagaccattgacccgtgctaacgcacatgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcg 26456174  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  26456173 tgaatcaaagcataatgtcaa-tatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagtttctgttactttaaaataacatataattttgaaagg 26456075  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26456074 gaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtactacacattacggaaaacttctctgtagacca 26455975  T
Q  668 catttgatgcaacatc 683  Q
    ||||||||||||||||    
T  26455974 catttgatgcaacatc 26455959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 369 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 40605735 - 40605421
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| || |||  |||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40605735 actagaccattgacccgtgctaacgcacatgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcg 40605636  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  40605635 tgaatcaaagcataatgtcaa-tatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagg 40605537  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  40605536 gaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagacca 40605437  T
Q  668 catttgatgcaacatc 683  Q
    ||||||||||||||||    
T  40605436 catttgatgcaacatc 40605421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 369 - 683
Target Start/End: Original strand, 5013301 - 5013614
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgt 468  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||  ||| ||||   |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5013301 actagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataattttcactgaaaaataagacaatgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcgt 5013400  T
Q  469 gaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaaggg 568  Q
    |||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  5013401 gaatcaaagcataatgtcaa-tatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaaggg 5013499  T
Q  569 aaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccac 668  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  5013500 aaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacgaaaaacttctctgtagaccac 5013599  T
Q  669 atttgatgcaacatc 683  Q
    |||||||||||||||    
T  5013600 atttgatgcaacatc 5013614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 368 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 1513140 - 1512825
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||   |||||||| |  |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1513140 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactaaaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtc 1513041  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  1513040 gtgaatcaaagcaaaatgtcaa-taccaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaag 1512942  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacc 666  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  1512941 ggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagacc 1512842  T
Q  667 acatttgatgcaacatc 683  Q
    |||||||||||||||||    
T  1512841 acatttgatgcaacatc 1512825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 368 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 1273310 - 1273025
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaata--------ttca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaa 458  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||        |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1273310 aactagaccattgacccgtgctaacgcacaggtcattttaagaagttaataagttaatattcactggaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaa 1273211  T
Q  459 aaattgtcgtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattat 558  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  1273210 aaattgttgtgaatcaaagcataatgtcaattaccatagacattgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataat 1273111  T
Q  559 tttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacatt 644  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1273110 tttaaaagggaaactgaagtttgttgacatgcatatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacatt 1273025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 369 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 2301185 - 2300884
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| || || | |||| ||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  2301185 actagaccattgacccgtgttaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcactgaaaaaataagacactgtagttcgcttgaatgaaaaaattatcg 2301086  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| || ||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2301085 tgaatcaaagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctattactttaacaaaacatataattttaaaagg 2300986  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  2300985 gaaactgaagttcgttgatatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttttctgtagacca 2300886  T
Q  668 ca 669  Q
    ||    
T  2300885 ca 2300884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 369 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 13908628 - 13908313
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaa-taaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| || |||  |||||||| || ||||| ||| | | |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13908628 actagaccattgacctgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaaataagaaactgtagttcgcatgaatctaaaaattgtc 13908529  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||| |||| |||| ||||| ||||    
T  13908528 gtgaatcaaagcataatgtcaa-tatcaaagactttgtttttgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataatatataattttgaaag 13908430  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacc 666  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||    
T  13908429 ggaaattgaagtttgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttttctatagacc 13908330  T
Q  667 acatttgatgcaacatc 683  Q
    |||||||||||||||||    
T  13908329 acatttgatgcaacatc 13908313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 178 - 369
Target Start/End: Original strand, 24228519 - 24228710
Alignment:
Q  178 agcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgc 277  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||     
T  24228519 agcaaagcctctagcaagtccacacaaacagtgctcctccaaaactcggtgctagccaaggaatcagaagtttcagagagttagggtttctaaaaaacgt 24228618  T
Q  278 gtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcattaaacccaa 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24228619 gtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctctgcaagtcaaaagccactattggacttcattaagcccaa 24228710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 192 - 353
Target Start/End: Original strand, 32739318 - 32739475
Alignment:
Q  192 caagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaactt 291  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  32739318 caagtccacacgaacagt---cctccaaatctcggtgctagccaagaaatcataagtttcagagaactagggtttct-caaaacgtgtaacctaaaactt 32739413  T
Q  292 cagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattgg 353  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  32739414 cagcactagggttctatttgtagaactcctagtgtgctatgcaagtcaaaagtcactattgg 32739475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 570 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 184298 - 184185
Alignment:
Q  570 aactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccaca 669  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  184298 aactgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaatgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccaca 184199  T
Q  670 tttgatgcaacatc 683  Q
     |||||||||||||    
T  184198 cttgatgcaacatc 184185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 570 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 2449532 - 2449419
Alignment:
Q  570 aactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccaca 669  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2449532 aactgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaatgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccaca 2449433  T
Q  670 tttgatgcaacatc 683  Q
     |||||||||||||    
T  2449432 cttgatgcaacatc 2449419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 369 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 184468 - 184314
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || | |||| ||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  184468 actagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcactgaaaaaataagacactgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 184369  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattcta 522  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  184368 tgaatcaaagcaaaatgacaattaccatagactttgttattgttccataattcta 184314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 368 - 522
Target Start/End: Original strand, 975850 - 976004
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || | |||| |||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  975850 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcactgaaaaataagacactgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 975949  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattcta 522  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  975950 tgaatcaaagcaaaatgacaattaccatagactttgttattgttccataattcta 976004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 368 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 2449703 - 2449548
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || | |||| ||| || |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  2449703 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcactgaaaaaataagacactgtagttcacttgaatgtaaaaattgtc 2449604  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattcta 522  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2449603 gtgaatcaaagcaaaatgacaattaccatagactttgttattgttccataattcta 2449548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 368 - 562
Target Start/End: Original strand, 21588876 - 21589070
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||  |||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||| | |     
T  21588876 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaataagacattgtagttcgcgtgaatctaaaaaatttt 21588975  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattatttta 562  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  21588976 gtgaatcaaagcaaaatgtcaa-taccaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataatttta 21589070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 570 - 683
Target Start/End: Original strand, 976020 - 976131
Alignment:
Q  570 aactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccaca 669  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  976020 aactgaagttcgtt--catgcaaatactttcaataagtaagaaaatgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccaca 976117  T
Q  670 tttgatgcaacatc 683  Q
     |||||||||||||    
T  976118 cttgatgcaacatc 976131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 227 - 351
Target Start/End: Original strand, 24763028 - 24763151
Alignment:
Q  227 tgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24763028 tgctagccaaggaatcagaagtttcagagagttagggttttctcaaaacgtgtaacaa-agacttcagcaccagggttctatttatagaactcctagtgt 24763126  T
Q  327 gctatgcaagtcagaagccactatt 351  Q
    ||| ||||||||| ||| |||||||    
T  24763127 gctttgcaagtcaaaagtcactatt 24763151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19617455 - 19617266
Alignment:
Q  152 ggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttc 251  Q
    ||||||||||||| | | |||||| |  |||||||| || ||||||||||| ||| || || ||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19617455 ggaatcacgatcacaactaagcaagttccagagcctgtagcaagtccacacaaacggtacttctccaagtctcggtgctagccaaggaatcagaaatttc 19617356  T
Q  252 agagagctagggtttcttcaaaa-cgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcaga 341  Q
    ||||| ||| |||||||  |||| || |||| |||  |||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||    
T  19617355 agagaactaaggtttctcaaaaaccgtgtaa-ctctgacttcagcacaagtgttctatttatagaacttcaagtgtgttatgcaagtcaga 19617266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 233
Target Start/End: Original strand, 24762007 - 24762087
Alignment:
Q  153 gaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagc 233  Q
    |||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||    
T  24762007 gaatcacgatcacaacaaagcaagcagcagagcctctagcaagtccacacgaacggtgctcctccaagtctcggtgctagc 24762087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 111
Target Start/End: Original strand, 24228379 - 24228465
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattgttacctta 111  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  24228379 cagaataagcagcggataaaattttcgattttctttccttggatcattacgaatt-acacatgaatcagtgattcgattgttacctta 24228465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 37444053 - 37443983
Alignment:
Q  288 acttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttc 358  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| || |||||| ||||    
T  37444053 acttcagcacaagggttcaatttatagaactcctagtgtgctctgcaagtcggaagtcattattgggcttc 37443983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 617 - 685
Target Start/End: Original strand, 23455676 - 23455744
Alignment:
Q  617 aatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccacatttgatgcaacatcag 685  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||  |||||||    
T  23455676 aatactacaaaacaaagtcctacacattacggaaaaattctctgtagactacatttgatgtcacatcag 23455744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 288 - 342
Target Start/End: Original strand, 15341458 - 15341512
Alignment:
Q  288 acttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaa 342  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||    
T  15341458 acttcagcataagggttctatttatagaattcctagtgtgttctgcaagtcagaa 15341512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 78
Target Start/End: Original strand, 24761904 - 24761960
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaattt--cgatttactttccttggatcattacgaatt 78  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24761904 cagaataaatagctgaataaaatttttcgattttctttccttggatcattacgaatt 24761960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Original strand, 23455401 - 23455437
Alignment:
Q  367 caactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcat 403  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23455401 caactaggccattgaaccatgctaacgcacgggtcat 23455437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 47)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 369 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 15691838 - 15691525
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgt 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  15691838 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgttaaaattttcgt 15691739  T
Q  469 gaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaaggg 568  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15691738 gaatcaaagcataatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttatgttactttaacataacatataattttaaaaggg 15691639  T
Q  569 aaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccac 668  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15691638 aaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcatacacattacggaaaacttctttgtacaccac 15691539  T
Q  669 atttgatgcaacat 682  Q
    ||||||||||||||    
T  15691538 atttgatgcaacat 15691525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 368 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 48961092 - 48960769
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48961092 aactagaccattgacccctgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 48960993  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  48960992 tgaatcaaagcataatgtcaattacgataaactttgttattgttccataattctaagacgc-gtttctgttactttaacataacatataattttaaaagg 48960894  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48960893 gaaactgaagttcgttgacatgcaaataatttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtagacca 48960794  T
Q  668 catttgatgcaacatcagaataatc 692  Q
    |||||||||||||||| | ||||||    
T  48960793 catttgatgcaacatcggtataatc 48960769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 369 - 683
Target Start/End: Original strand, 38210726 - 38211041
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38210726 actagaccattgacccgtgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcactgtaaaaataaaacaatgtagttcgtttgaatgtaaaaattgtcg 38210825  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  38210826 tgaatcaaaacataatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctaagacgcagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagg 38210925  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38210926 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtagacca 38211025  T
Q  668 catttgatgcaacatc 683  Q
    ||||||||||||||||    
T  38211026 catttgatgcaacatc 38211041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 368 - 683
Target Start/End: Original strand, 45501019 - 45501335
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45501019 aactagaccatggacccgtgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcactgtaaaaataaaacaatgtagttcgtttgaatgtaaaaattgtc 45501118  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  45501119 atgaatcaaagcataatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctaagacgcagttcctgttacattaacataacatataattttaaaag 45501218  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacc 666  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  45501219 gaaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagacc 45501318  T
Q  667 acatttgatgcaacatc 683  Q
    |||||||||||||||||    
T  45501319 acatttgatgcaacatc 45501335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 3 - 339
Target Start/End: Original strand, 42816122 - 42816458
Alignment:
Q  3 ttgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42816122 ttgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactctccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatatgatt 42816221  T
Q  103 gttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacac 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42816222 gttaccttagaacggttggtctgaaaacgaacggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcacagccaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacac 42816321  T
Q  203 gaacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaa-cgcgtaacctcaaacttcagcactag 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  |||||||||| |||||||| |||||   ||||||| ||||||   |||||||    
T  42816322 gaacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagagcttgggtttctgcaaaagaacgtaaccgcaaactgttgcactag 42816419  T
Q  301 ggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  42816420 ggttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 42816458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 9457284 - 9456949
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattg 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9457284 tgaaggtaaatcgacataaacagaataagcagcggaattaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatatgattg 9457185  T
Q  104 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9457184 ttaccttagaacggttggtctgagaacgaacggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcacagccaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 9457085  T
Q  204 aacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaa-cgcgtaacctcaaacttcagcactagg 301  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  |||||||||| |||||||| |||||   ||||||| ||||||   ||||||||    
T  9457084 aacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagagcttgggtttctgcaaaagaacgtaaccgcaaactgttgcactagg 9456987  T
Q  302 gttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  9456986 gttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 9456949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 9461381 - 9461046
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattg 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9461381 tgaaggtaaatcgacataaacagaataagcagcggaattaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatatgattg 9461282  T
Q  104 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9461281 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgaacggtgaaatatgcgaaccggaatcacgatcacagccaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 9461182  T
Q  204 aacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaa-cgcgtaacctcaaacttcagcactagg 301  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  |||||||||| |||||||| |||||   ||||||| ||||||   ||||||||    
T  9461181 aacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaagaatacggaag--tcagagagcttgggtttctgcaaaagaacgtaaccgcaaactgttgcactagg 9461084  T
Q  302 gttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  9461083 gttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 9461046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 369 - 683
Target Start/End: Original strand, 39512988 - 39513303
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39512988 actagaccattgacccgtgcgttagcacgggtcattttaagaagtaaatatttactgtaaaaataaaacaatatagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 39513087  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    | ||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  39513088 taaatcaaaacatactgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctaagacccagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagg 39513187  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  39513188 aaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataaataagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttatctgtagacca 39513287  T
Q  668 catttgatgcaacatc 683  Q
    ||||||||||||||||    
T  39513288 catttgatgcaacatc 39513303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 368 - 682
Target Start/End: Original strand, 2047232 - 2047546
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||| || ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2047232 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaattaa-tactcactgaaaaaataaaacactgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 2047330  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  2047331 gtgaatcaaagcaaaatgttaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaag 2047430  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacc 666  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |    
T  2047431 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagatc 2047530  T
Q  667 acatttgatgcaacat 682  Q
    ||| ||||||||||||    
T  2047531 acacttgatgcaacat 2047546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 369 - 682
Target Start/End: Original strand, 36866644 - 36866957
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||| || ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36866644 actagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaattaa-tactcactgaaaaaataaaacactgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 36866742  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    |||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  36866743 tgaatcaaagcaaaatgttaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagg 36866842  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  36866843 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagatca 36866942  T
Q  668 catttgatgcaacat 682  Q
    || ||||||||||||    
T  36866943 cacttgatgcaacat 36866957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 388 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 29245802 - 29245506
Alignment:
Q  388 ctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatcaaagcataatgtc 486  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||     
T  29245802 ctaacgcatgggtcattttaagaagttaatattcactggaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatataaaaattatcgtgaatcaaaacataatgtt 29245703  T
Q  487 aaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagggaaactgaagttcgttgac 586  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |   |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29245702 aattaccatagactttgttattgttccataattctagtatttagttcctgttattttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgac 29245603  T
Q  587 atgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccacatttgatgcaacatc 683  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  29245602 atgcaaatagttttaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagatcacatttgatgcaacatc 29245506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Original strand, 20778778 - 20779114
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatt-tcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgatt 102  Q
    |||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20778778 tgaaggcaaatcgacatgtacagaataagcagcggaataaaattctcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgattcgatt 20778877  T
Q  103 gttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacac 202  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20778878 gttaccttagaacgattggtctgaaaacgatcggtggaatctgcgaaccggaatcacgatcacagccaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacac 20778977  T
Q  203 gaacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaa-cgcgtaacctcaaacttcagcactag 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  ||||||| ||||||||||| |||||   ||||||| ||||||   |||||||    
T  20778978 gaacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagaactagggtttctgcaaaagaacgtaaccgcaaactgttgcactag 20779075  T
Q  301 ggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20779076 ggttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 20779114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Original strand, 22669391 - 22669726
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||    
T  22669391 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaaaaaaaattcgatttactttccttggatcattacgaattaagacttgaaccagtgattcgattg 22669490  T
Q  104 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 203  Q
    ||||||||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22669491 ttaccttaattcggttggtctgagaacgaacggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcacagccaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 22669590  T
Q  204 aacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaa-cgcgtaacctcaaacttcagcactagg 301  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  |||||||||| |||||||| |||||   ||||||| ||||||   ||||||||    
T  22669591 aacagtcctcctccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagagcttgggtttctgcaaaagaacgtaaccgcaaactattgcactagg 22669688  T
Q  302 gttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  22669689 gttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 22669726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 368 - 683
Target Start/End: Original strand, 2044981 - 2045296
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| || |||  |||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2044981 aactagaccattgacccgtgctaacgcacatgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtc 2045080  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  2045081 gtgaatcaaagcataatgtcaa-tatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaag 2045179  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacc 666  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  2045180 ggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagacc 2045279  T
Q  667 acatttgatgcaacatc 683  Q
    |||||||||||||||||    
T  2045280 acatttgatgcaacatc 2045296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 397 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 26211993 - 26211704
Alignment:
Q  397 gggtcattttaagaagtaa-atattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatcaaagcataatgtcaaatacga 494  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||| |    
T  26211993 gggtcattttaagaagttatatattaagtgtaaaaataaaacaacttagttcgcttaaatgtaaaaattgtcgtaaatcagatcataatgtcaattacta 26211894  T
Q  495 tagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaat 594  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26211893 tagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatatcattttaaa-gggaaactgaagttcgttgacatgcaaat 26211795  T
Q  595 agtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccacatttgatgcaacatcag 685  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26211794 agtttcaataagtaagaaaatgaatggtacacaaaaaagtcctatacattacggaaaacttctttgtagaccacatttgatgcaacatcag 26211704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 368 - 683
Target Start/End: Original strand, 49787091 - 49787404
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||| || ||| || |||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  49787091 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaattaa-tactcactgaaaaaataagacactgtagtttgcttgaatataaaaattgtc 49787189  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  49787190 gtgaatcaaagcaaaatgccaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacata--attttaaaag 49787287  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacc 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  49787288 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaatatgtaagaaaatgaagagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagacc 49787387  T
Q  667 acatttgatgcaacatc 683  Q
    ||| |||||||||||||    
T  49787388 acacttgatgcaacatc 49787404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 335
Target Start/End: Original strand, 20390374 - 20390704
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattg 103  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20390374 tgaaggtaaatcgacattaacagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgattcgattg 20390473  T
Q  104 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 203  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20390474 ttacctt-gaacgattagtctg-aaacgatcggtgcaatctgcgaaccggaatcacgatcacagccaagcaaacagcagagcctctatcgagtccacacg 20390571  T
Q  204 aacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaa--aacgcgtaacctcaaacttcagcactag 300  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  ||||||| ||||||||||| |||  ||  ||||||| ||||||   |||||||    
T  20390572 aacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagaactagggtttctgcaaagaatacgtaaccgcaaactattgcactag 20390669  T
Q  301 ggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20390670 ggttctatttatagaactccttatgtgctttgcaa 20390704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 369 - 683
Target Start/End: Original strand, 13926035 - 13926349
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||| || ||   |||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  13926035 actagaccattgatccgtgctaacacacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcg 13926134  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||| | ||||||||| ||||| |||||    
T  13926135 tgaattaaagcaaaatgtcaa-taccaaagactttgttattgttccataattctattacgtagttcctgttacttttaaataacatataattttgaaagg 13926233  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13926234 gaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataaataagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtagacca 13926333  T
Q  668 catttgatgcaacatc 683  Q
    ||||||||||||||||    
T  13926334 catttgatgcaacatc 13926349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 369 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 50709241 - 50708927
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcat-gtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||  ||||||||| | |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||   | |    
T  50709241 actagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcattgaaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaaaatttg 50709142  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  50709141 tgaatcaaagcaaaatgtcaa-taccaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagg 50709043  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  50709042 gaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaaaaagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacagaaaacttctctgtagacca 50708943  T
Q  668 catttgatgcaacatc 683  Q
    ||||||||||||||||    
T  50708942 catttgatgcaacatc 50708927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 369 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 48651382 - 48651070
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgt 468  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||  ||||||||    ||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  48651382 actagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactataaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcgt 48651283  T
Q  469 gaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaaggg 568  Q
    |||| |||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||  | | |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  48651282 gaatgaaagcaaaatgtcaa-taccaaagactttgttattgttccataattctagtatgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaaggg 48651184  T
Q  569 aaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccac 668  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||    
T  48651183 aaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacaca-aaaagtcctacacattacggaaaacttctctatagaccac 48651085  T
Q  669 atttgatgcaacatc 683  Q
    |||||||||||||||    
T  48651084 atttgatgcaacatc 48651070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Original strand, 33282989 - 33283325
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattg 103  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  33282989 tgaaggtaaatcgacattaacagaataagcagcggaataacatttcgatttactttccttggatcattacgaattgaaacttgaaccagtgattcgattg 33283088  T
Q  104 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 203  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||| | ||||||||||||  ||||||||||    
T  33283089 ttaccttagaacgattagtctgaaaacgatcgatggaatctgcgaactggaatctcgatcacagccaagcaaacaacagagcctctattgagtccacacg 33283188  T
Q  204 aacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaa--aacgcgtaacctcaaacttcagcactag 300  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |  | ||||  ||||||| ||||||||||| |||  ||  ||||||| ||||||   |||||||    
T  33283189 aacagtgctcctccaaaacctcggtgctaaccaagaagacggaag--tcagagaactagggtttctgcaaggaaaacgtaaccgcaaactattgcactag 33283286  T
Q  301 ggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  33283287 ggttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 33283325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 24 - 370
Target Start/End: Original strand, 28133870 - 28134220
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattgttaccttagaacggttggtc 123  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | | |||| ||||||| ||||||||||||  |||  ||    |    
T  28133870 cagaataagcagcggaa-aaaatttcgattttctttccttggatcattacgaattaca-catgaatcagtgattcgattgttacctc-gaagtgtgaaac 28133966  T
Q  124 tgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcag-------agcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctc 216  Q
    |||||  ||  | || ||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||        |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28133967 tgaaattgaaagctggaatctggaaaccgaaatcacgatcacagcaaagcaagcagcaagcagcaaagcctctagcaagtccacacgaacagtgctcctc 28134066  T
Q  217 caaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaa 316  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28134067 caaaactcggtgctagccaaggaatcggaagtctcagagagctagggtttcttcaaagcgcgcaacgtcaaacttcagcactagggttctatttatagaa 28134166  T
Q  317 ctccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcattaaacccaac 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28134167 ctccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcactaagcccaac 28134220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 14483059 - 14482723
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattg 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  14483059 tgaaggtaaatcgacataaacagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattgaaacttgaaccagtgattcgattg 14482960  T
Q  104 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 203  Q
    |||||||||||  |   |||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  14482959 ttaccttagaa-tgaaagtctgaaaacgatcggtggaatatgcgaactggaatctcgatcacagccaagcaaacagcagagcctctattgagtccacacg 14482861  T
Q  204 aacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttca---aaacgcgtaacctcaaacttcagcacta 299  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  ||||||| ||||||||||| ||   |||   |||||| ||||||   ||||||    
T  14482860 aacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagaactagggtttctgcaaggaaaaatgtaaccgcaaactattgcacta 14482763  T
Q  300 gggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  14482762 ggtttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 14482723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 155 - 369
Target Start/End: Original strand, 47666767 - 47666981
Alignment:
Q  155 atcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcaga 254  Q
    |||||||||| || |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  47666767 atcacgatcacagaaaagcaagcagtagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcggtgctagccaaggaatcggaagtctcaga 47666866  T
Q  255 gagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattgga 354  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47666867 gagctagggtttcttcagagcgcgtaacctcaaactttagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattgga 47666966  T
Q  355 cttcattaaacccaa 369  Q
    ||||| ||| |||||    
T  47666967 cttcactaagcccaa 47666981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 427 - 683
Target Start/End: Original strand, 45503325 - 45503580
Alignment:
Q  427 aaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagac 526  Q
    ||||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  45503325 aaaataagacactgtatttcgcgtgaatctaaaaattgtcgtgaatcaaagcaaaatgtcaa-taccaaagactttgttattgttctataattctagtac 45503423  T
Q  527 gcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacac 626  Q
    | |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45503424 gtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacac 45503523  T
Q  627 aaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccacatttgatgcaacatc 683  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  45503524 aaaaaagtcctacacattacggaaaacttctccgtagaccacatttgatgcaacatc 45503580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 237
Target Start/End: Original strand, 22239858 - 22240092
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattg 103  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  22239858 tgaaggtaaatcgacattaacagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgattcgatcg 22239957  T
Q  104 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 203  Q
    ||||||||||| |  | |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  22239958 ttaccttagaatgaatagtctgaaaacgatcggtggaatctgcgaactggaatctcgatcacagccaagcaaacagcagagcctctattgagtccacacg 22240057  T
Q  204 aacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaag 237  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22240058 aacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaag 22240092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 369 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 36461779 - 36461619
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36461779 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcactgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 36461680  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgc 528  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36461679 tgaatcaaagcataatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaagacgc 36461619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 178 - 358
Target Start/End: Original strand, 43801670 - 43801850
Alignment:
Q  178 agcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgc 277  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43801670 agcaaagcctctagcaagtccacactaacagtgctcctccaaaactcggtgctagccaaggaatcaaaagtttcagagagttagggtttcttcaaaacgc 43801769  T
Q  278 gtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttc 358  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  43801770 gtaacctcaaatttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagtcactattgtacttc 43801850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 152 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 636994 - 636777
Alignment:
Q  152 ggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttc 251  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  636994 ggaatcacgatcacagcaaagcaagcaacaaagcctctagcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcggtgctagccaaggaatcagaagtttc 636895  T
Q  252 agagagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactatt 351  Q
    |||||  ||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  636894 agagaagtagggtttctcaaaaacgtgtaaccaaaaacttcagcactaaggttctatttatagaactcctagtgtgctctgcaagtcagaagtcactatt 636795  T
Q  352 ggacttcattaaacccaa 369  Q
     | ||||||||| |||||    
T  636794 aggcttcattaagcccaa 636777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 152 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 35936347 - 35936130
Alignment:
Q  152 ggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttc 251  Q
    ||||||||||||| | ||||||||  |||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  35936347 ggaatcacgatcacaacaaagcaagcagcaaagcatctagcaagtccatacgaacagtgctcctccaaaactcggtgctagccaaggtatcagaagtttc 35936248  T
Q  252 agagagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactatt 351  Q
    ||||||| |||||||||  |||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  35936247 agagagcaagggtttctcaaaaatgtgcaacatcaaacttcagcactatggttctatttatagaactccttgtgtgctttgcaagtcagaagtcactatt 35936148  T
Q  352 ggacttcattaaacccaa 369  Q
    |||||||| ||| |||||    
T  35936147 ggacttcactaagcccaa 35936130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 178 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22613476 - 22613297
Alignment:
Q  178 agcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgc 277  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22613476 agcaaagcctctagcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcggtgctagccaaggaatcagaagtctcagagagctagggtttcttcaaaacgc 22613377  T
Q  278 gtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcattaaacccaa 369  Q
    |||||||||||||| |||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  22613376 gtaacctcaaactttagc------------gttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagtcactattggacttcactaagcccaa 22613297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 303
Target Start/End: Original strand, 19705628 - 19705904
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattgttaccttagaacggttggtc 123  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  | | |||| ||||||| ||||||||| ||  |||      ||     
T  19705628 cagaataagcagcggaa--aaatttcgattttctttccttggatcattacaaattaca-catgaatcagtgattcgattgttatctc-gaa------gtg 19705717  T
Q  124 tgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaata-------gcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctc 216  Q
    |||||  ||  | || ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  |       ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19705718 tgaaactgaaagctggaatctggaaaccggaatcacgatcacagcaaagcaagcaacaagcagcaaagcctctagcaagtccacacgaacagtgctcctc 19705817  T
Q  217 caaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaacttcagcactagggt 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19705818 caaaactcggtgctagccaaggaatcggaagtctcagagagctagggtttcttcaaatcgcgtaacctcaaacttcagcactagggt 19705904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 570 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 7480677 - 7480564
Alignment:
Q  570 aactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccaca 669  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  7480677 aactgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaatgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccaca 7480578  T
Q  670 tttgatgcaacatc 683  Q
     |||||||||||||    
T  7480577 cttgatgcaacatc 7480564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 570 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 9534053 - 9533940
Alignment:
Q  570 aactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccaca 669  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  9534053 aactgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaatgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccaca 9533954  T
Q  670 tttgatgcaacatc 683  Q
     |||||||||||||    
T  9533953 cttgatgcaacatc 9533940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 269
Target Start/End: Original strand, 28145354 - 28145596
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattgttaccttagaacggttggtc 123  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | | | || |||||||  |||||||||||  |||  ||    |    
T  28145354 cagaataagcagcgcaa-aaaatttcgattttctttccttggatcattacgaattaca-cataaatcagtgatttgattgttacctc-gaagtgtgaaac 28145450  T
Q  124 tgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaact 223  Q
    |||||  ||  | || ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28145451 tgaaactgaaagctggaatctggaaaccggaatcacgatcacagcaaagcaagcagcaaagcctctagcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaact 28145550  T
Q  224 cgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttctt 269  Q
    || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28145551 cggtgctagccaaggaatcggaagtctcagagagctagggtttctt 28145596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 570 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 42496761 - 42496648
Alignment:
Q  570 aactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccaca 669  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  42496761 aactgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaatgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccaca 42496662  T
Q  670 tttgatgcaacatc 683  Q
     |||||||||||||    
T  42496661 cttgatgcaacatc 42496648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 116
Target Start/End: Original strand, 33262830 - 33262942
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattg 103  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  33262830 tgaaggtaaatcgacattaacagaataagcagcggaataacatttcgatttactttccttggatcattacgaattgaaacttgaaccagtgattcgattg 33262929  T
Q  104 ttaccttagaacg 116  Q
    |||||||||||||    
T  33262930 ttaccttagaacg 33262942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 368 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 42496932 - 42496777
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || | |||| ||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42496932 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcactgaaaaaataagacactgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 42496833  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattcta 522  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42496832 gtgaatcaaagcaaaatgacaattaccatagactttgttattgttccataattcta 42496777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 368 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 9534224 - 9534069
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || | |||| ||| || |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9534224 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcactgaaaaaataagacactgtagtttgcttgaatgtaaaaattgtc 9534125  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattcta 522  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9534124 gtgaatcaaagcaaaatgacaattaccatagactttgttattgttccataattcta 9534069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 369 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 7480847 - 7480693
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || | |||| ||| || |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7480847 actagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcactgaaaaaataagacactgtagtttgcttgaatgtaaaaattgtcg 7480748  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattcta 522  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7480747 tgaatcaaagcaaaatgacaattaccatagactttgttattgttccataattcta 7480693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 152 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 8728683 - 8728478
Alignment:
Q  152 ggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttc 251  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||     
T  8728683 ggaatctcgatcacagctaagcaagcagcagagcctctagcaagtccacacaaacggtgctcctctaaatctcggtgctagccaaggaatcagaagtttt 8728584  T
Q  252 agagagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactatt 351  Q
    |||||  ||||||||||| |||||| ||    ||  |||||| ||| ||||||||  ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||   |||||||    
T  8728583 agagaattagggtttcttaaaaacgtgt-tggtctgacttcaacacaagggttctgcttatagaactccaagtgtgctgtgcaagttagatttcactatt 8728485  T
Q  352 ggacttc 358  Q
    || ||||    
T  8728484 gggcttc 8728478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 60
Target Start/End: Original strand, 20388048 - 20388105
Alignment:
Q  3 ttgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttc 60  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20388048 ttgaaggtaaatcgacattaacagaataagcagcggaataaaattttgatttactttc 20388105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 109
Target Start/End: Original strand, 43801518 - 43801601
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattgttacct 109  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||| ||||||||||||    
T  43801518 cagaataagcagcggaaaataatt-cgattttctttccttggatcattacgaatt-acacatgaatcagtgattcgattgttacct 43801601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 24 - 109
Target Start/End: Original strand, 47666642 - 47666724
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattgttacct 109  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  47666642 cagaataagcagcggaaaaa---ttcgattttctttccttggatcattacgaactacacattgaatcagtgattcgattgttacct 47666724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 22613632 - 22613550
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattgttacct 109  Q
    |||||||||||||||||  ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||| ||||||||||||    
T  22613632 cagaataagcagcggaaataa--ttcgattttctttccttggatcattacgaatt-acacatgaatcagtgattcgattgttacct 22613550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 636 - 685
Target Start/End: Original strand, 37891535 - 37891584
Alignment:
Q  636 ctacacattacggaaaacttctttgtacaccacatttgatgcaacatcag 685  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  37891535 ctacacattgcggaaaacttctttgtagaccacatttgatgtcacatcag 37891584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 35936466 - 35936414
Alignment:
Q  25 agaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaatt 78  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  35936466 agaataaccagcgga-taaattttcgattttttttccttggatcattacgaatt 35936414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 368 - 692
Target Start/End: Original strand, 37983179 - 37983503
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  37983179 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatataaaaataaaacaatgtagttcgtttgaatgtaaaaattatcg 37983278  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  37983279 tgaatcaaagcataatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttactttaacataacatataattttaaaagg 37983378  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37983379 gaaactgaagttcgttgacatgcaaataatttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcatacacattacggaaaacttctttgtagacca 37983478  T
Q  668 catttgatgcaacatcagaataatc 692  Q
    |||||||||||||||| | ||||||    
T  37983479 catttgatgcaacatcggtataatc 37983503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 368 - 692
Target Start/End: Original strand, 24011590 - 24011912
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  24011590 aactagaccattgacccatgctaacgcacaggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattttct 24011689  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  24011690 tgaatcaaagcataatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaaaacgcagtttctgttactttaacataacata--attttaaaagg 24011787  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24011788 gaaactgaagttcgttgacatgcaaataatttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcttacacattacggaaaacttctttgtagacca 24011887  T
Q  668 catttgatgcaacatcagaataatc 692  Q
    |||||||||||||||| | ||||||    
T  24011888 catttgatgcaacatcggtataatc 24011912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 359 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 18492675 - 18492360
Alignment:
Q  359 attaaacccaactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaa 458  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18492675 attatacctaactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaaaaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaa 18492576  T
Q  459 aaattgtcgtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattat 558  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  18492575 aaattgtcatgaatcaaagcataatgtcaattacgatagactttgttattgtttcataattctaagacgc-gtttctgttactttaacataacatataat 18492477  T
Q  559 tttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctt 658  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18492476 tttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaataatttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctt 18492377  T
Q  659 tgtacaccacatttgat 675  Q
    |||| ||||||||||||    
T  18492376 tgtagaccacatttgat 18492360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Original strand, 27879621 - 27879956
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27879621 tgaaggtaaatcgacataatcagattaagcagcggaataaaatttcgatttaacttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatatgattg 27879720  T
Q  104 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27879721 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgaacggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcacagccaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 27879820  T
Q  204 aacagtgctcctcc-aaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaa-cgcgtaacctcaaacttcagcactagg 301  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  | ||||  |||||||||| |||||| | |||||   ||||||| ||||||   |||||||     
T  27879821 aacagtgctcctccaaaaactcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagagcttgggtttttgcaaaagaacgtaaccgcaaactattgcactagc 27879918  T
Q  302 gttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  27879919 gttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 27879956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Original strand, 28019802 - 28020137
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28019802 tgaaggtaaatcgacataatcagattaagcagcggaataaaatttcgatttaacttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatatgattg 28019901  T
Q  104 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28019902 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgaacggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcacagccaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 28020001  T
Q  204 aacagtgctcctcc-aaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaa-cgcgtaacctcaaacttcagcactagg 301  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  | ||||  |||||||||| |||||| | |||||   ||||||| ||||||   |||||||     
T  28020002 aacagtgctcctccaaaaactcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagagcttgggtttttgcaaaagaacgtaaccgcaaactattgcactagc 28020099  T
Q  302 gttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  28020100 gttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 28020137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 3 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 21917845 - 21917508
Alignment:
Q  3 ttgaaggtaaatcgacataat-cagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21917845 ttgaaggtaaatcgacataaaacagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgattcgat 21917746  T
Q  102 tgttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccaca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21917745 tgttaccttagaacggttggtctgaaaacgaacggtggaatctgcgaaccggaatcacgatcaaagccaagcaaatagcagagcctctatcaagtccaca 21917646  T
Q  202 cgaacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaa-cgcgtaacctcaaacttcagcacta 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  ||||||| ||  ||||||| |||||   ||||||| ||||||   ||||||    
T  21917645 cgaacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagaacttaggtttctgcaaaagaacgtaaccgcaaactattgcacta 21917548  T
Q  300 gggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  21917547 gggttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 21917508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Original strand, 22129746 - 22130078
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22129746 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaa---aatttcgatttaacttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatatgattg 22129842  T
Q  104 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22129843 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgaacggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcacagccaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 22129942  T
Q  204 aacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaa-cgcgtaacctcaaacttcagcactagg 301  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  |||||||||| |||||||| |||||   ||||||| ||||||   ||||||||    
T  22129943 aacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagagcttgggtttctgcaaaagaacgtaaccgcaaactgttgcactagg 22130040  T
Q  302 gttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  22130041 gttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 22130078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 368 - 683
Target Start/End: Original strand, 405896 - 406211
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcat-gtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || | |||| |||  | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  405896 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaa-aacttaatactcaccgaaaaaataagacactgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtt 405994  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  405995 gtgaatcaaagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaag 406094  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacc 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |    
T  406095 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacgcaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagatc 406194  T
Q  667 acatttgatgcaacatc 683  Q
    ||| |||||||||||||    
T  406195 acacttgatgcaacatc 406211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 368 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 23828126 - 23827811
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||  |||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23828126 aactagaccattgacccatgctaaggcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaataagacattgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtc 23828027  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||  |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  23828026 gtgaatcaaagcaatatgtcaa-taccaaagactttgttattgttccataattctagtacatagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaag 23827928  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacc 666  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  23827927 ggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagacc 23827828  T
Q  667 acatttgatgcaacatc 683  Q
    |||||||||||| ||||    
T  23827827 acatttgatgcatcatc 23827811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 369 - 669
Target Start/End: Original strand, 18265734 - 18266035
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| || || | |||| ||  || |||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18265734 actagacctttgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcgctgaaaaaataagatattgtagttcgcttgaatgaaaaaattgtcg 18265833  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  18265834 tgaatcatagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctattactttaacataacatataattttaaaagg 18265933  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18265934 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagacca 18266033  T
Q  668 ca 669  Q
    ||    
T  18266034 ca 18266035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 369 - 669
Target Start/End: Original strand, 18274747 - 18275048
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| || || | |||| ||  || |||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18274747 actagacctttgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcgctgaaaaaataagatattgtagttcgcttgaatgaaaaaattgtcg 18274846  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  18274847 tgaatcatagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttccttttactttaacataacatataattttaaaagg 18274946  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18274947 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagacca 18275046  T
Q  668 ca 669  Q
    ||    
T  18275047 ca 18275048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 24 - 369
Target Start/End: Original strand, 8370406 - 8370749
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattgttaccttagaacggttggtc 123  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||  | | |||| ||||||| ||||||||||||  |||  ||    |    
T  8370406 cagaataagcagcggaaaataatt-cgattttcttttcttggatcattacgaattaca-catgaatcagtgattcgattgttacctc-gaagtgtgaaac 8370502  T
Q  124 tgaaaac-gagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaac 222  Q
     |||||| ||  | || ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8370503 cgaaaactgaaagctggaatctggaaaccggaatcacgatcacagcaaagcaagcagcaaagcctctagcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaac 8370602  T
Q  223 tcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactcctt 322  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8370603 tcggtgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactcctt 8370702  T
Q  323 gtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcattaaacccaa 369  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||    
T  8370703 gtgtgttatgcaagtcagaagccattattgaacttcactaagcccaa 8370749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Original strand, 27013796 - 27014129
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  27013796 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaaaaa---ttcgatttactttccttggatcattacgaattaaaacttgaaccagtgattcgattg 27013892  T
Q  104 ttaccttagaacggttggtctgaaaa-cgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacac 202  Q
    ||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27013893 ttaccttaattcggttggtctgaaaaacgagcggtggaatctgcgaaccggtatcacgatcacagccaagcaattagcagagcctctatcaagtccacac 27013992  T
Q  203 gaacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaa-cgcgtaacctcaaacttcagcactag 300  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  |||||||||| |||||||| |||||   ||||||| ||||||   |||||||    
T  27013993 gaacagtgctcttccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagagcttgggtttctgcaaaagaacgtaaccgcaaactattgcactag 27014090  T
Q  301 ggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  27014091 ggttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 27014129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 369 - 683
Target Start/End: Original strand, 14994215 - 14994527
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||  |||||||| || |||||||| ||| |  ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  14994215 actagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaataagacact--agttcgcgtgaatctaaaaattgtcg 14994312  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  14994313 tgaatcaaagcataatgtcaa-tatcaaagactttgttattgttccgtaattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagg 14994411  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14994412 gaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagacca 14994511  T
Q  668 catttgatgcaacatc 683  Q
     |||||||||||||||    
T  14994512 tatttgatgcaacatc 14994527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 183 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26242020 - 26241834
Alignment:
Q  183 agcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgcgtaac 282  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26242020 agcctctagcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgcgtaac 26241921  T
Q  283 ctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcattaaacccaa 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  26241920 ctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcactaagcccaa 26241834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Original strand, 27006653 - 27006986
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27006653 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaaaaa---ttcgatttactttccttggatcattacgaattgaaacttgaaccagtgattcgattg 27006749  T
Q  104 ttaccttagaacggttggtctgaaaa-cgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacac 202  Q
    ||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||  |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27006750 ttaccttaattcggttggtctgaaaaacgaacggtggaatctgcgaaccgatatcacgatcacagccaagcaattagcagagcctctatcaagtccacac 27006849  T
Q  203 gaacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaa-cgcgtaacctcaaacttcagcactag 300  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  |||||||||| |||||||| |||||   ||||||| ||||||   |||||||    
T  27006850 gaacagtgctcttccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagagcttgggtttctgcaaaagaacgtaaccgcaaactattgcactag 27006947  T
Q  301 ggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  27006948 ggttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 27006986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 367 - 683
Target Start/End: Original strand, 22729619 - 22729934
Alignment:
Q  367 caactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||  ||||||||   |||||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||||    
T  22729619 caactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaataagacattgtagtttgcgtgaatctaaaaattgtc 22729718  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
     |||||||||||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  22729719 atgaatcaaagcaaaatgtcaa-taccaaagactgtgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaag 22729817  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacc 666  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||    
T  22729818 ggaaattgaatttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacgtaaaacttttctgtagacc 22729917  T
Q  667 acatttgatgcaacatc 683  Q
    |||||||||||||||||    
T  22729918 acatttgatgcaacatc 22729934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 369 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 19961994 - 19961680
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcat-gtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||  ||||||||| | |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||   | |    
T  19961994 actagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcattgaaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatttaaaaaaatttg 19961895  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  19961894 tgaatcaaagcaaaatgtcaa-taccaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagg 19961796  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  19961795 gaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcagcaagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacagaaaacttctctgtagacca 19961696  T
Q  668 catttgatgcaacatc 683  Q
    ||||||||||||||||    
T  19961695 catttgatgcaacatc 19961680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 368 - 683
Target Start/End: Original strand, 41376154 - 41376468
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  | |||  ||||||||   |||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||| |    
T  41376154 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttagaaaagataatattcactgaaaaataaaacactgtagtttgcgtgaatctaaaaattgttg 41376253  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  41376254 tgaatcaaagcaaaatgtcaa-taccaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcttgttactttaaaataacatataattttgaaagg 41376352  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||    
T  41376353 gaaattgaagttcgttgacatgcaaatattttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttttctgtagatca 41376452  T
Q  668 catttgatgcaacatc 683  Q
    || |||||||||||||    
T  41376453 cacttgatgcaacatc 41376468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 339
Target Start/End: Original strand, 45533405 - 45533742
Alignment:
Q  3 ttgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgatt 102  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  45533405 ttgaaggtaaatcgacattaacagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattgaaacttgaaccagtgattcgatt 45533504  T
Q  103 gttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacac 202  Q
    ||||||||||||  |   |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  45533505 gttaccttagaa-tgaaagtctgaaaacgatcggtggaatctgcgaactggaatctcgatcacagccaagcaaacagcagagcctctattgagtccacac 45533603  T
Q  203 gaacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttca---aaacgcgtaacctcaaacttcagcact 298  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  ||||||| ||||||||||| ||   |||  ||||| | ||||||   |||||    
T  45533604 gaacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagaactagggtttctgcaaggaaaaacgtaatcgcaaactattgcact 45533701  T
Q  299 agggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  45533702 aggtttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 45533742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29562017 - 29561783
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattg 103  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29562017 tgaaggtaaatcgacattaacagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgattcgattg 29561918  T
Q  104 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 203  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  29561917 ttaccttagaatgattattctgaaaacgatcggtggaatctgcgaactggaatctcgatcacagccaagcaaatagcagagcctctattgagtccacacg 29561818  T
Q  204 aacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaag 237  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  29561817 aacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaag 29561783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 178 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 25612192 - 25612011
Alignment:
Q  178 agcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgc 277  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25612192 agcaaagcctctagcaagtccacacgaatagtgctcctccaaaactcggtgctagccaaggaatcagaagtctcagagagctagggtttcttcaaaacgc 25612093  T
Q  278 gtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttca 359  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25612092 gtaacctcaaactttagcactaggattctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagtcactattggacttca 25612011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22646924 - 22646691
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattg 103  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22646924 tgaagataaatcgacattaacagaaaaagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgattcgattg 22646825  T
Q  104 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 203  Q
    ||||||||||| | || ||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||| || |||||| ||| ||||||| || |||||||||||  ||||||||||    
T  22646824 ttaccttagaatgattagtctg-aaacgatcggtggaatctgcgaactggagtctcgatcacagccaagcaaacagaagagcctctattgagtccacacg 22646726  T
Q  204 aacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaag 237  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22646725 aacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaag 22646691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 371 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 21640242 - 21639991
Alignment:
Q  371 tagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtga 470  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||  ||||||||   |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21640242 tagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcgtga 21640143  T
Q  471 atcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagggaa 570  Q
    ||||||||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||| ||||||||||  ||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  21640142 atcaaagcaaaatgtcaa-taccaaagactatgttattgttacataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaa 21640044  T
Q  571 actgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagta 623  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21640043 attgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagta 21639991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 192 - 369
Target Start/End: Original strand, 26652611 - 26652787
Alignment:
Q  192 caagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaactt 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  26652611 caagtccacacgaacagtgctcctccaaaaatcggtgctaaccaaggaatcagaagtt-cagagagctagggtttctccaaaacgtgcaacctcaaactt 26652709  T
Q  292 cagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcattaaacccaa 369  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  26652710 tagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctctgcaagtcagaagccactattggacttcactaagcccaa 26652787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 178 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21970328 - 21970139
Alignment:
Q  178 agcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgc 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||  |||||| |||||||||||||| | |||    
T  21970328 agcaaagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcggtgcttgccaaggaattggaagt--cagagaactagggtttcttcagagcgc 21970231  T
Q  278 gtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcattaaacccaa 369  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  21970230 gtaaccttgaactttagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcactaagcccaa 21970139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 178 - 369
Target Start/End: Original strand, 22658798 - 22658990
Alignment:
Q  178 agcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttc-aaaacg 276  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |    
T  22658798 agcaaagcctctagcaagtccacacgaacagtgctcctcaaaaactcggtgctagccaaggaattagaagtttcagagagctagggtttctccaaaaatg 22658897  T
Q  277 cgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcattaaacccaa 369  Q
     | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  22658898 tgcaacctcaaacttcagcattagggttctatttatagaactccttgtgtgctctacaagtcagaagccactattgaacttcattaagcccaa 22658990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 178 - 369
Target Start/End: Original strand, 2962232 - 2962423
Alignment:
Q  178 agcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgc 277  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||     
T  2962232 agcaaagcctctagcaagtccaaacgaacagtgctcctccaaaactcggttctagccaaggaatcagaagtttcagatagctaaggtttctaaaaaacgt 2962331  T
Q  278 gtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcattaaacccaa 369  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  2962332 gcaacctcaaacttcagcaatagggttctatttatagaactccttatgtgctcttcaagtcagaagccactattgggcttcagtaagcccaa 2962423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 178 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 6431884 - 6431709
Alignment:
Q  178 agcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgc 277  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |  |||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||  ||||||     
T  6431884 agcaaagcctctagcaagtccacacgaagagtgctcttttaaaactcggtggtagccaaagaatcagaagtttgagagagttggggtttctcaaaaacgt 6431785  T
Q  278 gtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattgg 353  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  6431784 gcaacatcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctcttcaagtcagaagccactattgg 6431709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18836364 - 18836177
Alignment:
Q  152 ggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttc 251  Q
    |||||| |||||| | ||||||||| ||||| ||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||  | || ||||||||||| ||||||| ||||     
T  18836364 ggaatctcgatcacaacaaagcaaaaagcagcgcctcta-ctagtccactcgaacggtgctcctacaattcccggtgctagccaagcaatcagaggtttg 18836266  T
Q  252 agagagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaa 342  Q
     ||||  ||  ||||||   ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||| ||||    
T  18836265 ggagaattaaagtttctg--aaacgtgtaacctctgacttcagcacaagggttctatttatagaactccaagtgtgttctgcaagttagaa 18836177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 6431970 - 6431887
Alignment:
Q  25 agaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattgttacct 109  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||| ||||||||||||    
T  6431970 agaataagcagcggataaaattttcgattttctttccttggatcattacgaatt-acacatgaatcagtgatccgattgttacct 6431887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 339
Target Start/End: Original strand, 8781304 - 8781355
Alignment:
Q  288 acttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8781304 acttcagcacaagggttctatttatagaactacttgtgtgctttgcaagtca 8781355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 78
Target Start/End: Original strand, 22658663 - 22658717
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaatt 78  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22658663 cagaataagcagcggataaaattttcgattttctttccttggatcattacgaatt 22658717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 109
Target Start/End: Original strand, 2962078 - 2962162
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattgttacct 109  Q
    |||||||| |||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||| ||||||||||||    
T  2962078 cagaataaacagcggataaaattttcgattttctttccttggatcattacgaatt-atacatgaatcagtgatccgattgttacct 2962162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 21970473 - 21970394
Alignment:
Q  27 aataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattgttacct 109  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |   || |||| ||||||| ||||||||||||    
T  21970473 aataagcagcggaa--aaatttcgattttctttccttggatcattacgaact-acacatgaatcagtgattcgattgttacct 21970394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Original strand, 18272787 - 18272823
Alignment:
Q  367 caactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcat 403  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18272787 caactagaccattgacccgtgctaacgcacaggtcat 18272823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Original strand, 27853774 - 27853810
Alignment:
Q  367 caactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcat 403  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27853774 caactagaccatcgacccgtgctaacgcacgggtcat 27853810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 78
Target Start/End: Original strand, 35520763 - 35520795
Alignment:
Q  46 tttcgatttactttccttggatcattacgaatt 78  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35520763 tttcgatttcctttccttggatcattacgaatt 35520795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 44)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 369 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 42348106 - 42347782
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42348106 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcactgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 42348007  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  42348006 tgaatcaaagcataatgtcaattacgatagactttattattgttccataattctaagacgcagtttttgttactttaacataacatataattttaaaagg 42347907  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42347906 gaaactgaagtttgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtagacca 42347807  T
Q  668 catttgatgcaacatcagaataatc 692  Q
    |||||||||||||||| | ||||||    
T  42347806 catttgatgcaacatcggtataatc 42347782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 369 - 692
Target Start/End: Original strand, 31448188 - 31448515
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgt 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31448188 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgt 31448287  T
Q  469 gaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatat--tattttaaaag 566  Q
    ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  | |||||||||    
T  31448288 gaagcaaaacataatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctattactttaacataacatataattttttaaaag 31448387  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaa--gtcctacacattacggaaaacttctttgtaca 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31448388 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaataatttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaaagctcctacacattacggaaaacttctttgtaga 31448487  T
Q  665 ccacatttgatgcaacatcagaataatc 692  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  31448488 ccacatttgatgcaacatcggtataatc 31448515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 368 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 53288677 - 53288352
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53288677 aactagaccactgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcactgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 53288578  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  53288577 gtgaatcaaagcataatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcgatttctgttattttaacataacatataattttaaaag 53288478  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacc 666  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  53288477 ggaaactgaagtacgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaataatacaaaaaaaagtcatacacattacagaaaacttctttgtagacc 53288378  T
Q  667 acatttgatgcaacatcagaataatc 692  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||    
T  53288377 acatttgatgcaacatcggtataatc 53288352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15816189 - 15815854
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15816189 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatatgattg 15816090  T
Q  104 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15816089 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgaacggtggaatctgcgaaccggaatcacgatcacagccaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 15815990  T
Q  204 aacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaa-cgcgtaacctcaaacttcagcactagg 301  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  |||||||||| |||||||| |||||   ||||||| ||||||   ||||||||    
T  15815989 aacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagagcttgggtttctgcaaaagaacgtaaccgcaaactattgcactagg 15815892  T
Q  302 gttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15815891 gttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 15815854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Original strand, 18110176 - 18110512
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattg 103  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18110176 tgaaggtaaatcgacatatacagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgattcgattg 18110275  T
Q  104 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 203  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18110276 ttaccttagaacgattagtctgaaaacgatcggtggaatctgcgaaccggaatcacgatcacagccaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 18110375  T
Q  204 aacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaa--aacgcgtaacctcaaacttcagcactag 300  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  ||||||| ||||||||||| |||  ||  ||||||| ||||||   |||||||    
T  18110376 aacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagaactagggtttctgcaaagaatacgtaaccgcaaactattgcactag 18110473  T
Q  301 ggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  18110474 ggttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 18110512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 2678182 - 2677846
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaattt-cgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgatt 102  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2678182 tgaaggtaaatcgacatgtacagaataagcagcggaataaaattttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgattcgatt 2678083  T
Q  103 gttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacac 202  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2678082 gttaccttagaacgattggtctgaaaacgatcggtggaatctgcgaaccggaatcacgatcacagccaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacac 2677983  T
Q  203 gaacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaa-cgcgtaacctcaaacttcagcactag 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  ||||||| ||||||||||| |||||   ||||||| ||||||   |||||||    
T  2677982 gaacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagaactagggtttctgcaaaagaacgtaaccgcaaactgttgcactag 2677885  T
Q  301 ggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  2677884 ggttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 2677846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 26532783 - 26532447
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaattt-cgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgatt 102  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26532783 tgaaggtaaatcgacatgtacagaataagcagcggaataaaattttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgattcgatt 26532684  T
Q  103 gttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacac 202  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26532683 gttaccttagaatgattggtctgaaaacgatcggtggaatctgcgaaccggaatcacgatcacagccaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacac 26532584  T
Q  203 gaacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaa-cgcgtaacctcaaacttcagcactag 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  ||||||| ||||||||||| |||||   ||||||| ||||||   |||||||    
T  26532583 gaacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagaactagggtttctgcaaaagaacgtaaccgcaaactgttgcactag 26532486  T
Q  301 ggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  26532485 ggttttatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 26532447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 368 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 25839686 - 25839384
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || | |||| ||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25839686 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcactgaaaaaataagacactgtagttcgcttgaatgaaaaaattgtc 25839587  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25839586 gtgaatcaaagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctattactttaacataacatataattttaaaag 25839487  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacc 666  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||    
T  25839486 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttttctgtagacc 25839387  T
Q  667 aca 669  Q
    |||    
T  25839386 aca 25839384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 368 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 28389770 - 28389455
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||  |||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||     
T  28389770 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaataagacattgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtt 28389671  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  28389670 gtgaatcaaagcaaaatgtcaa-taccaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaag 28389572  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacc 666  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||    
T  28389571 ggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtccaacacattacggaaaacttctctgtagacc 28389472  T
Q  667 acatttgatgcaacatc 683  Q
    |||||||||||||||||    
T  28389471 acatttgatgcaacatc 28389455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 368 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 52683100 - 52682785
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| || |||  |||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  52683100 aactagaccattgacccgtgctaacgcacatgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtc 52683001  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  52683000 gtgaatcaaagcataatgtcaa-tatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaag 52682902  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacc 666  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  52682901 ggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagacc 52682802  T
Q  667 acatttgatgcaacatc 683  Q
    |||||||||||||||||    
T  52682801 acatttgatgcaacatc 52682785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 368 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 16909423 - 16909113
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||  |||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16909423 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaataagacattgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtc 16909324  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  16909323 gtgaatcaaagcaaaatatcaa-taccaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaag 16909225  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacc 666  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  16909224 ggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagacc 16909125  T
Q  667 acatttgatgca 678  Q
    ||||||||||||    
T  16909124 acatttgatgca 16909113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 368 - 683
Target Start/End: Original strand, 21581350 - 21581665
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| || || ||| || ||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21581350 aactagaccattgacccgtgctaacgcacatgtcatttaaaaaattaa-tactcactgaaaaaataagacattgtagttcgcttgaatgtaaaaattatc 21581448  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  21581449 gtgaatcaaagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctattactttaacataacatataattttaaaag 21581548  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacc 666  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |    
T  21581549 ggaaactgaagttcattgacatgtaaatagtttcaataaataagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacgggaaacttctctgtagatc 21581648  T
Q  667 acatttgatgcaacatc 683  Q
    ||| |||||||||||||    
T  21581649 acacttgatgcaacatc 21581665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 369 - 683
Target Start/End: Original strand, 19514961 - 19515275
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| || || ||| || ||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19514961 actagaccattgacccgtgctaacgcacatgtcatttaaaaaattaa-tactcaatgaaaaaataagacattgtagttcgcttgaatgtaaaaattatcg 19515059  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19515060 tgaatcaaagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctattactttaacataacatataattttaaaagg 19515159  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||    
T  19515160 gaaactgaagttcattgacatgtaaatagtttcaataaataagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacgggaaacttctctgtagatca 19515259  T
Q  668 catttgatgcaacatc 683  Q
    || |||||||||||||    
T  19515260 cacttgatgcaacatc 19515275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 368 - 683
Target Start/End: Original strand, 30387763 - 30388077
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||  ||||||||   |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30387763 aactagatcattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcg 30387862  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| | ||| ||||||||| ||||| |||||    
T  30387863 tgaatcaaagcaaaatgtcaa-taccaaagactttgttattgttccataattctagcacgtagttcctgttactataaaataacatataattttgaaagg 30387961  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  30387962 aaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagacca 30388061  T
Q  668 catttgatgcaacatc 683  Q
    ||||||||||||||||    
T  30388062 catttgatgcaacatc 30388077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 5871586 - 5871250
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattg 103  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5871586 tgaaggtaaatcgacatatacagaacaagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgattcgattg 5871487  T
Q  104 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 203  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  5871486 ttaccttagaacgataagtctgaaaacgatcggtggaatctgcgaactggaatctcgatcacagccaagcaaacagcagagcctctattgagtccacacg 5871387  T
Q  204 aacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaa--aacgcgtaacctcaaacttcagcactag 300  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  ||||||| ||||||||||| |||  ||  ||||||| ||||||   |||||||    
T  5871386 aacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagaactagggtttctgcaaggaaaacgtaaccgcaaactattgcactag 5871289  T
Q  301 ggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  5871288 gtttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 5871250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 339
Target Start/End: Original strand, 17299087 - 17299422
Alignment:
Q  3 ttgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgatt 102  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17299087 ttgaaggtaaatcgacatcaacagaataagcagcgaaataaaaattcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgattcgatt 17299186  T
Q  103 gttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacac 202  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  17299187 gttacctt-gaacgattagtctg-aagcgatcggtggaatctgcgaaccggaatcacgatcacagccaagcaaacagcagagcctctatcgagtccacac 17299284  T
Q  203 gaacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaa--aacgcgtaacctcaaacttcagcacta 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  ||||||| ||||||||||| |||  ||  ||||||| ||||||   ||||||    
T  17299285 gaacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagaactagggtttctgcaaagaatacgtaaccgcaaactattgcacta 17299382  T
Q  300 gggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  17299383 gggttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 17299422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 368 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 21383015 - 21382702
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||  ||||||||    ||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21383015 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactataaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcg 21382916  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||  | | |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  21382915 tgaatgaaagcaaaatgtcaa-taccaaagactttgttattgttccataattctagtatgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagg 21382817  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  21382816 gaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacaca-aaaagtcctacacattacggaaaacttctctatagacca 21382718  T
Q  668 catttgatgcaacatc 683  Q
    ||||||||||||||||    
T  21382717 catttgatgcaacatc 21382702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 368 - 683
Target Start/End: Original strand, 41859605 - 41859920
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||  |||||||| || |||||||| ||| ||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  41859605 aactagatcattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaataagacactgtcgttcgcgtgaatctaaaaattgtc 41859704  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||  ||  |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  41859705 gtgaatcaaagcataatgtcaa-tatcaaagactttgttattgttccataattctagtacatagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaag 41859803  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacc 666  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||    
T  41859804 ggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcttacacattacgaaaaacttcactgtagacc 41859903  T
Q  667 acatttgatgcaacatc 683  Q
    |||||||||||||||||    
T  41859904 acatttgatgcaacatc 41859920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 337
Target Start/End: Original strand, 3356051 - 3356385
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattg 103  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  3356051 tgaaggtaaatcgacattaacagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaagtagtgattcgattg 3356150  T
Q  104 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 203  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  3356151 ttaccttagaacgattagtctgaaaacgatcggtggaatctgcgaactggaatcttgatcacagccaagcaaacagcagagcctctattgagtccacacg 3356250  T
Q  204 aacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaa--aacgcgtaacctcaaacttcagcactag 300  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  ||||||| ||||||||||| |||  ||  ||||| | ||||||   |||||||    
T  3356251 aacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagaactagggtttctgcaaggaaaacgtaaacgcaaactattgcactag 3356348  T
Q  301 ggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagt 337  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  3356349 gtttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagt 3356385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 368 - 683
Target Start/End: Original strand, 29358946 - 29359261
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcat--gtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgt 465  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||  ||||||||   | |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  29358946 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaa-aagataatattcactggaaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgt 29359044  T
Q  466 cgtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaa 565  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||| || ||||||||||  ||| |||| |||||| ||||| ||||||||| |||||  ||    
T  29359045 cgtgaatcaaagcataatgtcaa-tatcaaagactttgttattatttcataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttggaa 29359143  T
Q  566 gggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacac 665  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29359144 ggcaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacaatacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtagac 29359243  T
Q  666 cacatttgatgcaacatc 683  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29359244 cacatttgatgcaacatc 29359261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 38817805 - 38817470
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattg 103  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  38817805 tgaaggtaaatcgacataatcataataagcagcggaaaaaaatt-cgatttactttccttggatcattacgaattaaaacttgaaccagtgattcgattg 38817707  T
Q  104 ttaccttagaacggttggtctg-aaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacac 202  Q
    ||||||||   ||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  38817706 ttaccttaattcggttggtctgaaaaacgaacgatggaatctgcgaaccgatatcacgatcacagccaagcaattagcaaagcctctatcaagtccacac 38817607  T
Q  203 gaacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaa-cgcgtaacctcaaacttcagcactag 300  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  |||||||||| |||||||| |||||   ||||||| ||||||   |||||||    
T  38817606 gaacagtgctcttccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagagcttgggtttctgcaaaagaacgtaaccgcaaactattgcactag 38817509  T
Q  301 ggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  38817508 ggttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 38817470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 18164331 - 18163995
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattg 103  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18164331 tgaaggtaaatcgacattaacagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattgaaacttgaaccagtgattcgattg 18164232  T
Q  104 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 203  Q
    |||||||||||  |   |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  18164231 ttaccttagaa-tgaaagtctgaaaacgatcggtggaatctgcgaactggaatctcgatcacagccaagcaaacagcagagcctctattgagtccacacg 18164133  T
Q  204 aacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttca---aaacgcgtaacctcaaacttcagcacta 299  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  ||||||| ||||||||||| ||   |||  ||||||| ||||||   ||||||    
T  18164132 aacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagaactagggtttctgcaaggaaaaacgtaaccgcaaactattgcacta 18164035  T
Q  300 gggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    || |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  18164034 ggtttctatttatagaactccctatgtgctttgcaagtca 18163995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 20245107 - 20244770
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattg 103  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20245107 tgaaggtaaatcgacattaacagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgattcgattg 20245008  T
Q  104 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 203  Q
    |||||||| || |  | |||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  20245007 ttaccttaaaatgaatagtctgaaagcgatcggtggaatctgcgaactggaatctcgatcacagccaagcaaacagcagagcctctattgagtccacacg 20244908  T
Q  204 aacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttca---aaacgcgtaacctcaaacttcagcacta 299  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  ||||||| ||||||||||| ||   ||   ||||||| ||||||   ||||||    
T  20244907 aacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagaactagggtttctgcaaggaagaacgtaaccgcaaactattgcacta 20244810  T
Q  300 gggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  20244809 ggtttctatttatagaactccttatgtgcttttcaagtca 20244770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 178 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15462498 - 15462307
Alignment:
Q  178 agcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgc 277  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15462498 agcaaagcctctagcaagtccacacgaacagtgatcctccaaaactcggcgctagccaaggaatcagaagtctcagagagctagggtttcttcaaaacgc 15462399  T
Q  278 gtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcattaaacccaa 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15462398 gtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcactaagcccaa 15462307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 183 - 368
Target Start/End: Original strand, 28917085 - 28917270
Alignment:
Q  183 agcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgcgtaac 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28917085 agcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcggtgctagccaaggaatcggaagtctcagagagctagggtttcttcaaaacgcgtaac 28917184  T
Q  283 ctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcattaaaccca 368  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  28917185 ctcaaactatagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcactaagccca 28917270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Original strand, 4675083 - 4675418
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattg 103  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  4675083 tgaaggtaaatcgacattaacagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattgaaacttgaaccagtgattcaattg 4675182  T
Q  104 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 203  Q
    |||||||||||  |   ||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  4675183 ttaccttagaa-tgaaagtctg-aaacgatcggtggaatctgcgaactggaatctcgatcacagccaagcaaacagcagagcctctattgagtccacacg 4675280  T
Q  204 aacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttca---aaacgcgtaacctcaaacttcagcacta 299  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  ||||||| ||||||||||| ||   |||  ||||||| ||||||   ||||||    
T  4675281 aacagtgctcctccaaaagctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagaactagggtttctgcaaggaaaaacgtaaccgcaaactattgcacta 4675378  T
Q  300 gggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  4675379 ggtttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 4675418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 155 - 357
Target Start/End: Original strand, 11483087 - 11483289
Alignment:
Q  155 atcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcaga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||    
T  11483087 atcacgatcacagcaaagcaagcagcagaacctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcggtgctagccaaggaatcggtagtctcaga 11483186  T
Q  255 gagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattgga 354  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11483187 gagctagggtttcttcagagcgcgtaacctcaaactttagcactagggttttatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattgga 11483286  T
Q  355 ctt 357  Q
    |||    
T  11483287 ctt 11483289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 178 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 34976550 - 34976358
Alignment:
Q  178 agcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaa-cg 276  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |     
T  34976550 agcaaagcctctaacaagtacacacgaacagtgctcctccaaaactcggtgctagccaatgaatcagaagtttcagagagctagggtttttccaaaaact 34976451  T
Q  277 cgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcattaaacccaa 369  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  34976450 tgtaagctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcactaagcccaa 34976358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 183 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 9488539 - 9488352
Alignment:
Q  183 agcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttc-aaaacgcgtaa 281  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||    
T  9488539 agcctctagcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcggtgctagctaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttctccaaaaacgtgcaa 9488440  T
Q  282 cctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcattaaacccaa 369  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||    
T  9488439 cctcaaacttcagcactagggttatatttatagaactctttgtgtgctctgcaagtcagaagtcactattgggcttcagtaagcccaa 9488352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 152 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 4547090 - 4546869
Alignment:
Q  152 ggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcaga--gcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtt 249  Q
    ||||||||||||| | ||||||||  |||| |  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  4547090 ggaatcacgatcacaacaaagcaagcagcaaattgcctctagcaagtccccacgaacagtgctcctccaaagctcggtgctagccaaggaattagaagtt 4546991  T
Q  250 tcagagagctagggtttcttcaaa--acgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccac 347  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  4546990 tcagagagctagggtttctccaaacaacgtgcaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttatgtgctctgcaagtcagaagtcac 4546891  T
Q  348 tattggacttcattaaacccaa 369  Q
    |||||| ||||| ||| |||||    
T  4546890 tattgggcttcagtaagcccaa 4546869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 178 - 316
Target Start/End: Original strand, 15651709 - 15651847
Alignment:
Q  178 agcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgc 277  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||     
T  15651709 agcaaagcctctagcaagtccaaacgaacagtgctcctccaaaactcggttctagccaaggaatcagaagtttcagatagctaaggtttctaaaaaacgt 15651808  T
Q  278 gtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaa 316  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15651809 gcaacctcaaacttcagcaatagggttctatttatagaa 15651847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 152 - 350
Target Start/End: Original strand, 30039784 - 30039981
Alignment:
Q  152 ggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttc 251  Q
    |||||| | |||| ||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30039784 ggaatctcaatcacagctaagcaagcagcagagcctctagcaagtccacatgaacggtactcctccaaatctcggtgctagccaaggaatcagaagtttc 30039883  T
Q  252 agagagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactat 350  Q
    | ||| |||||||||||  |||||| |||| |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  30039884 aaagaactagggtttctcaaaaacgtgtaa-caaagacttcagcactagggttctatttatataactcctagtgtgctctgcaagtcaaaagtcactat 30039981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 15821861 - 15821769
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaattt-cgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtga 95  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15821861 tgaaggtaaatcgacatatacagaataagcagcggaataaaattttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaactagtga 15821769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 196 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 11421961 - 11421817
Alignment:
Q  196 tccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaacttcagc 295  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |  | |||||||||||  || ||| ||||  ||||  ||||||||||  |||||  ||||||  | ||||||||    
T  11421961 tccacacgaacaatgctcctccaattcctggtgctagccaagcgattagaggtttgggagaattagggtttct--aaaacatgtaacca-agacttcagc 11421865  T
Q  296 actagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaag 343  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  11421864 acgagggttctatttatagaactcctagtgtgctctgcaagtcagaag 11421817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 32637370 - 32637300
Alignment:
Q  288 acttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttc 358  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32637370 acttcagcacaagggttatatttatagaactcctaatatgctctgcaagtcagaagtcactattggacttc 32637300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 109
Target Start/End: Original strand, 11482962 - 11483044
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattgttacct 109  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||||||||||||||||||| |  || ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  11482962 cagaataagcagcggaaaaa---ttcgattttctttccttggatcattacgaactacaaattgaatcagtgattcgattgttacct 11483044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 19374232 - 19374162
Alignment:
Q  288 acttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttc 358  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  19374232 acttcagcacaagggttctatttatagaactcctagcgtgttctgcaagtcagaaatcactattggtcttc 19374162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 15462662 - 15462579
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattgttacct 109  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||| ||||||||||||    
T  15462662 cagaataagcagcggaa-aatatttcgattttttttccttggatcattacgaatt-acacatgaatcagtgattcgattgttacct 15462579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 109
Target Start/End: Original strand, 15651555 - 15651639
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattgttacct 109  Q
    |||||||| |||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||| ||||||||||||    
T  15651555 cagaataaacagcggataaaattttcgattttctttccttggatcattacgaatt-atacatgaatcagtgatccgattgttacct 15651639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 76
Target Start/End: Original strand, 28916924 - 28916974
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaa 76  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28916924 cagaataagcagcggaa--aaatttcgattttctttccttggatcattacgaa 28916974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 9538854 - 9538774
Alignment:
Q  278 gtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttc 358  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| || ||||| ||| ||||    
T  9538854 gtaacctccgacttcagcacaagggttctatttatagaacttcttgtgtgttctgaaagtcagcagtcactactgggcttc 9538774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 617 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 8121175 - 8121116
Alignment:
Q  617 aatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccacatttgatg 676  Q
    |||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  8121175 aatactacaaaacaaagtgctacacattacggaaaacttctctgtagaccatatttgatg 8121116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 617 - 676
Target Start/End: Original strand, 36895635 - 36895694
Alignment:
Q  617 aatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccacatttgatg 676  Q
    |||| |||| || ||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  36895635 aatactacaaaacaaagtgctaaacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 36895694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 4547211 - 4547127
Alignment:
Q  25 agaataagcagcgga-ataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattgttacct 109  Q
    ||||||||||||| | | |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||   || |||| ||||||| ||||||||||||    
T  4547211 agaataagcagcgaataaaaaatttcaattttctttcctttgatcattacgaatt-acacatgaatcagtgattcgattgttacct 4547127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 42)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 369 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 11826855 - 11826532
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgt 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  11826855 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgattgaatgtaaaaattatcgt 11826756  T
Q  469 gaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaaggg 568  Q
    ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||     
T  11826755 gaaacaaaacataatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttactttaacataacatataattttaaaagga 11826656  T
Q  569 aaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccac 668  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11826655 aaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtagaccac 11826556  T
Q  669 atttgatgcaacatcagaataatc 692  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    
T  11826555 atttgatgcaacatcggtataatc 11826532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 370 - 692
Target Start/End: Original strand, 33003622 - 33003941
Alignment:
Q  370 ctagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33003622 ctagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtg 33003721  T
Q  470 aatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaaggga 569  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33003722 aatcaaagtataatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattct---acgcagtttctgttactttaacataacatataattttaaaaggga 33003818  T
Q  570 aactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccaca 669  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  33003819 aactgaagttcgttgacatgcaaataatttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcatacacattacggaaaacttctttgtagaccata 33003918  T
Q  670 tttgatgcaacatcagaataatc 692  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
T  33003919 tttgatgcaacatcggtataatc 33003941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 371 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 860213 - 859921
Alignment:
Q  371 tagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcat-gtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtg 469  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860213 tagaccattgacccgtgctaacgtacgggtcattttaagaagtaaatattcatcgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtg 860114  T
Q  470 aatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaaggga 569  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  860113 aatcaaaacataatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagttcctgttactttaacataacatataattttaaaaggga 860014  T
Q  570 aactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgta 662  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  860013 aattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataaataagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcatacacattacggaaaacttctatgta 859921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 369 - 683
Target Start/End: Original strand, 36946889 - 36947204
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36946889 actagaccattgacccgtgctaacgcacaagtcattttcaaaagttaatattcactgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 36946988  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  36946989 tgaatcaaagcataatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagg 36947088  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  36947089 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaaattctctgtagacca 36947188  T
Q  668 catttgatgcaacatc 683  Q
    ||||||||||||||||    
T  36947189 catttgatgcaacatc 36947204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Original strand, 20146688 - 20147023
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20146688 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactctccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatatgattg 20146787  T
Q  104 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20146788 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgaacggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcacagccaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 20146887  T
Q  204 aacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaa-cgcgtaacctcaaacttcagcactagg 301  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |    ||||  |||||||||| |||||||| |||||   ||||||| ||||||   ||||||||    
T  20146888 aacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaagaagaaggaag--tcagagagcttgggtttctgcaaaagaacgtaaccgcaaactattgcactagg 20146985  T
Q  302 gttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20146986 gttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 20147023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 369 - 683
Target Start/End: Original strand, 13454616 - 13454930
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcat-gtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||| || |||| | |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13454616 actagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaattaa-tactcatagaaaaaataagacactgtaggtcgcttgaatgtaaaaattgtcg 13454714  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  13454715 tgaatgaaagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagg 13454814  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  13454815 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacgaaaaacttctctgtagacca 13454914  T
Q  668 catttgatgcaacatc 683  Q
    || |||||||||||||    
T  13454915 cacttgatgcaacatc 13454930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 369 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 16651799 - 16651485
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcat-gtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||| || |||| | |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16651799 actagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaattaa-tactcatagaaaaaataagacactgtaggtcgcttgaatgtaaaaattgtcg 16651701  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16651700 tgaatcaaagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttccacaattctagtacgtagtacctgttactttaacataacatataattttaaaagg 16651601  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16651600 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagacca 16651501  T
Q  668 catttgatgcaacatc 683  Q
    || |||||||||||||    
T  16651500 cacttgatgcaacatc 16651485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 369 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 47727001 - 47726776
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgt 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47727001 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaataagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgt 47726902  T
Q  469 gaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaaggg 568  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47726901 gaatcaaagcataatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaagacgc-gtttctgttactttaacataacatataattttaaaaggg 47726803  T
Q  569 aaactgaagttcgttgacatgcaaata 595  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  47726802 aaactgaagttcgttgacatgcaaata 47726776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 368 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 4594492 - 4594177
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcat-gtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||| || |||| | |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4594492 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaattaa-tactcattgaaaaaataagacaccgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 4594394  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4594393 gtgaatcaaagcaaactgtcaattaccatagattttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaag 4594294  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacc 666  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  4594293 agaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagacc 4594194  T
Q  667 acatttgatgcaacatc 683  Q
    ||| |||||||||||||    
T  4594193 acacttgatgcaacatc 4594177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 369 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 12261207 - 12260892
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||| || ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12261207 actagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaattaa-tactcactgaaaaaataaaacattgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 12261109  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  12261108 tgaatcaaagcaaaatgacaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagg 12261009  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcc-tacacattacggaaaacttctttgtacacc 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |    
T  12261008 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataaataagaaaatgaatagtacacaaaaaagtccttacacattacggaaaacttctctgtagatc 12260909  T
Q  667 acatttgatgcaacatc 683  Q
    ||| |||||||||||||    
T  12260908 acacttgatgcaacatc 12260892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 424 - 683
Target Start/End: Original strand, 52418583 - 52418842
Alignment:
Q  424 gtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaa 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  52418583 gtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtaaatcaaagcataatatcaattaacataaactttgttattgttccataattctag 52418682  T
Q  524 gacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagta 623  Q
     ||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52418683 tacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagta 52418782  T
Q  624 cacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccacatttgatgcaacatc 683  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  52418783 cacaaaaaagtcctatacattacagaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatc 52418842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 369 - 683
Target Start/End: Original strand, 36087324 - 36087637
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgt 468  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||  ||||||||   |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  36087324 actagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaataagacattgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcgt 36087423  T
Q  469 gaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaaggg 568  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  36087424 gaatcaaagcaaaatgtcaa-taccaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaaggg 36087522  T
Q  569 aaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccac 668  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  36087523 aaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtatacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccac 36087622  T
Q  669 atttgatgcaacatc 683  Q
    |||||||||||||||    
T  36087623 atttgatgcaacatc 36087637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 369 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 18199082 - 18198768
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||  |||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18199082 actagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaataagacattgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcg 18198983  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||  |||| ||||||||| ||||| |||||    
T  18198982 tgaatcaaagcaaaatgtcaa-taccaaagacgttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttacattaaaataacatataattttgaaagg 18198884  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18198883 gaaattgaagtttgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagacca 18198784  T
Q  668 catttgatgcaacatc 683  Q
    ||||||||||||||||    
T  18198783 catttgatgcaacatc 18198768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 368 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 35716688 - 35716374
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||  ||||||||   |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||     
T  35716688 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaataagacattgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtca 35716589  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  35716588 tgaatcaaagcaaaatgtcaa-taccaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagg 35716490  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  35716489 gaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacagattacggaaaacttctctgtaaacca 35716390  T
Q  668 catttgatgcaacatc 683  Q
    ||||||||||||||||    
T  35716389 catttgatgcaacatc 35716374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 369 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 26951886 - 26951576
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| || |||  |||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26951886 actagaccattgacctgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcg 26951787  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  26951786 tgaatcaaaacataatgtcaa-tatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagg 26951688  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26951687 gaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagacca 26951588  T
Q  668 catttgatgcaa 679  Q
    ||||||||||||    
T  26951587 catttgatgcaa 26951576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 369 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 12825579 - 12825265
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgt 468  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||   ||   | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12825579 actagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaattaatacttaccgaaaaaataagacactgtagttcacttgaatgtaaaaattgtcgt 12825480  T
Q  469 gaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaaggg 568  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12825479 gaatcaaagcaaaatgtcaattaccatagactttgtttttgttccataattttagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaaggg 12825380  T
Q  569 aaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccac 668  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||| | |||    
T  12825379 aaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattatggaaaatttatctgtagatcac 12825280  T
Q  669 atttgatgcaacatc 683  Q
    | |||||||||||||    
T  12825279 acttgatgcaacatc 12825265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 369 - 683
Target Start/End: Original strand, 49562143 - 49562456
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgt 468  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||  ||||||||  ||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  49562143 actagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcacttaaaaataagacaccgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcat 49562242  T
Q  469 gaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaaggg 568  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  49562243 gaatcaaagcaaaatgtcaa-taccaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcttgttactttaaaataacatataattttgaaaggg 49562341  T
Q  569 aaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccac 668  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  49562342 aaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcatacacattacggaaaacttctctgtagaccac 49562441  T
Q  669 atttgatgcaacatc 683  Q
    |||||||||||||||    
T  49562442 atttgatgcaacatc 49562456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 369 - 683
Target Start/End: Original strand, 38655655 - 38655970
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagta-aatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || || |||| ||| |  |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  38655655 actagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaatataataatcactaaaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtc 38655754  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  38655755 gtgaatcaaagaaaaatgtcaa-taccaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaag 38655853  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacc 666  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  38655854 ggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagacc 38655953  T
Q  667 acatttgatgcaacatc 683  Q
    |||||||||||||||||    
T  38655954 acatttgatgcaacatc 38655970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 369 - 683
Target Start/End: Original strand, 36091161 - 36091475
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || | |  |||||||| || |||||||| ||| |||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  36091161 actagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaatgataatattcactgaaaaaataagacactgtagttcgtgtgaatctaaaaattgtcg 36091260  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    |||||||||| |||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  36091261 tgaatcaaagtataatgtcaa-tatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagg 36091359  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36091360 gaaattgaatttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcatacacattacggaaaacttctttgtagacca 36091459  T
Q  668 catttgatgcaacatc 683  Q
    ||||||||||||||||    
T  36091460 catttgatgcaacatc 36091475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 24 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21399943 - 21399600
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattgttaccttagaacggttggtc 123  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||  | | |||| ||||||| ||||||||||||  |||  ||    |    
T  21399943 cagaataagcagcggaaaataatt-cgattttctttccttggatcattacgaattaca-catgaatcagtgattcgattgttacctc-gaagtgtgaaac 21399847  T
Q  124 tgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcag-------agcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctc 216  Q
    | |||||      ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||        |||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  21399846 taaaaac------tgaaagctggaaaccggaatcacgatcatagcaaagcaagcagcaagcagcaaagcctctagcaagtccacacgaacagtgctcatc 21399753  T
Q  217 caaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaa 316  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21399752 caaaactcggtgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgcgtaaccttaaacttcagcactagggttctatttatagaa 21399653  T
Q  317 ctccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcattaaacccaa 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  21399652 ctccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcactaagcccaa 21399600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 369 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 31487601 - 31487289
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgt 468  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||  ||||||||    ||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31487601 actagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactataaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcgt 31487502  T
Q  469 gaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaaggg 568  Q
    |||| |||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||  | | |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  31487501 gaatgaaagcaaaatgtcaa-taccaaagactttgttattgttccataattctagtatgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaaggg 31487403  T
Q  569 aaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccac 668  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||   || |||||    
T  31487402 aaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacaca-aaaagtcctacacattaccgaaaacttctcaatagaccac 31487304  T
Q  669 atttgatgcaacatc 683  Q
    |||||||||||||||    
T  31487303 atttgatgcaacatc 31487289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 369 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 854955 - 854641
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgt 468  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||  ||||||||   |||||||| ||| |||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  854955 actagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgtgtgaatctaaaaattgtcgt 854856  T
Q  469 gaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccata--attctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||||  ||||||  ||| |||| || ||| ||||| ||||||||| ||||| || |    
T  854855 gaatcaaagcaaaatgttaa-taccaaagactttgttattgttccatataattctagtacgtagttcctattactttaaaataacatataattttgaagg 854757  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacc 666  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  854756 ggaaattgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagacc 854657  T
Q  667 acatttgatgcaacat 682  Q
    ||||||||||||||||    
T  854656 acatttgatgcaacat 854641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 55428194 - 55427854
Alignment:
Q  3 ttgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55428194 ttgaaggtaaatcgacataaacagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgattcgatt 55428095  T
Q  103 gttacc-ttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccaca 201  Q
    |||||| |||||| |  | |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||  | ||||||||||||  ||||||||    
T  55428094 gttacctttagaatgaatagtctgaaaacgatcggtggaatctgcgaactggaatctcgatcacagccaagcaagcaacagagcctctattgagtccaca 55427995  T
Q  202 cgaacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttc----aaaacgcgtaacctcaaacttcagca 296  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  ||||||| ||||||||||| |    ||||  ||||||| ||||||   |||    
T  55427994 cgaacagtgctcctccaaaatctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagaactagggtttctgcaagaaaaaaacgtaaccgcaaactattgca 55427897  T
Q  297 ctagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  55427896 ctaggtttctttttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 55427854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 178 - 369
Target Start/End: Original strand, 15845841 - 15846032
Alignment:
Q  178 agcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgc 277  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15845841 agcaaagcctctagcaagtccacacgaacagtgctcctccgaaactcggtgctagccaaggaatcagaagtctcagagagctagggtttcttcaaaacgc 15845940  T
Q  278 gtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcattaaacccaa 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15845941 gtaacctcaaacttcagcactagggttctctttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcactaagcccaa 15846032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 368 - 524
Target Start/End: Original strand, 43508613 - 43508769
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43508613 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 43508712  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaag 524  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43508713 tgaatcaaaacataatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaag 43508769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 24 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21035393 - 21035044
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattgttaccttagaacggttggtc 123  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||   || |||| ||||||| ||||||||||| | |||  ||    |    
T  21035393 cagaataagcagcggaaaataatt-cgattttctttccttggatcattatgaatt-acacatgaatcagtgattcgattgttacc-tcgaagtgtgaaac 21035297  T
Q  124 tgaaaac-gagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaa-------agcaaatagcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcct 215  Q
    ||||||| ||  | || ||||||  ||||||||||||||||| | |||       |||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21035296 tgaaaactgaaagctggaatctggaaaccggaatcacgatcacaacaaagcaagcagcaagcagcaaagcctctagcaagtccacacgaacagtgctcct 21035197  T
Q  216 ccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttataga 315  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21035196 ccaaaactcggtgctagccaaggaatcggaagtctcagagagctagggtttctccaaaacgcataacctcaaacttcagcactaggattctatttataga 21035097  T
Q  316 actccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcattaaacccaa 369  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  21035096 actccttgtgt-ctatgcaagtcagaagccactattggacttcactaagcccaa 21035044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 12332368 - 12332044
Alignment:
Q  3 ttgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgatt 102  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12332368 ttgaaggtaaatcgacattaacagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgattcgatt 12332269  T
Q  103 gttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacac 202  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||              |||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  12332268 gttaccttagaacgattactctgaaaacgatcggt--------------ggaatctcgatcacagccaagcaaacagcagagcctctattgagtccacac 12332183  T
Q  203 gaacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttca---aaacgcgtaacctcaaacttcagcact 298  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |  | ||||  ||||||| ||||||||||| ||   |||  ||||||| ||||||   |||||    
T  12332182 gaacagtgctcctccaaaacctcggtgccagccaagaagacggaag--tcagagaactagggtttctgcaaggaaaaacgtaaccgcaaactattgcact 12332085  T
Q  299 agggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  12332084 aggtttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 12332044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 12301066 - 12300743
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattg 103  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12301066 tgaaggtaaatcgacattaacagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaactagaaccagtgattcgattg 12300967  T
Q  104 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 203  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||              |||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  12300966 ttaccttagaacgattactctgaaaacgatcggt--------------ggaatctcgatcacagccaagcaaacagcagagcctctattgagtccacacg 12300881  T
Q  204 aacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttca---aaacgcgtaacctcaaacttcagcacta 299  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |  | ||||  ||||||| ||||||||||| ||   |||  ||||||| ||||||   ||||||    
T  12300880 aacagtgctcctccaaaacctcggtgccagccaagaagacggaag--tcagagaactagggtttctgcaaggaaaaacgtaaccgcaaactattgcacta 12300783  T
Q  300 gggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  12300782 ggtttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 12300743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 178 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 28089110 - 28088925
Alignment:
Q  178 agcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgc 277  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  28089110 agcaaagcctctagcaagtccacacaaacagtgctcctccaaaaatcggtgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttctaaaaaacgt 28089011  T
Q  278 gtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcattaa 363  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28089010 gcaacctcaaacttcagcactatggttctatttatagaactcgttgtttgttctgcaagtcagaagccactattgaacttcattaa 28088925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 369 - 580
Target Start/End: Original strand, 29864559 - 29864770
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||| || ||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29864559 actagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaattaa-tactcactgaaaaaataagacactgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 29864657  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  29864658 tgaatcaaagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagg 29864757  T
Q  568 gaaactgaagttc 580  Q
    |||||||||||||    
T  29864758 gaaactgaagttc 29864770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 178 - 353
Target Start/End: Original strand, 25978031 - 25978207
Alignment:
Q  178 agcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttc-aaaacg 276  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  25978031 agcaaagcctctagcaagtccacacgaacagtgttcctcaaaaactcggtgctagtcaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttctccaaaaacg 25978130  T
Q  277 cgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattgg 353  Q
     | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  25978131 tgcaatctcaaacttcagcattagggttctatttatagaactccttgtgtgctctgcaagtcagaagtcacaattgg 25978207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 178 - 369
Target Start/End: Original strand, 15316481 - 15316672
Alignment:
Q  178 agcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgc 277  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  |||||      
T  15316481 agcaaagcctcttgcaagtccacacgaacagtgctcatccaaaactcggtgctagccaaggaatcagaagtttctgagagttaaggtttctcaaaaacat 15316580  T
Q  278 gtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcattaaacccaa 369  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  15316581 gcaacctcaaagttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgttctctgcaattcagaagccactattgggcttcagtaagcccaa 15316672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 13330320 - 13330000
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcga-cataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgatt 102  Q
    |||||| ||||||| | ||| |||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||  | | |||| ||||||| |||||    
T  13330320 tgaaggaaaatcgatcttaaacagaataagcaggggaaaattatttcgattttctttccttggatcattacgaattaca-catgaatcagtgattcgatt 13330222  T
Q  103 gttaccttagaacggttggt-ctgaaaac-gagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcag-------agcctctatca 193  Q
    |||||||  |||  |||  | |||||||| ||  |||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||        |||||||| ||    
T  13330221 gttacctc-gaagtgttaattctgaaaactgaaaggtggaatctggaaaccggaatcacgatcacagcaaagcaagcagcaagcagcaaagcctctagca 13330123  T
Q  194 agtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgc--gtaacctcaaactt 291  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||  |||||||  ||||||| ||||||    
T  13330122 agtccacacgaacagtgttcctccaaaactcggtgctagccaaggaatcagaag-tccagagagctcgggattctcaaaaacgcgagtaacctaaaactt 13330024  T
Q  292 cagcactagggttctatttataga 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13330023 cagcactagggttctatttataga 13330000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 570 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 26948026 - 26947913
Alignment:
Q  570 aactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccaca 669  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  26948026 aactgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaatgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccaca 26947927  T
Q  670 tttgatgcaacatc 683  Q
     |||||||||||||    
T  26947926 cttgatgcaacatc 26947913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 369 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 26948196 - 26948042
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || | |||| ||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26948196 actagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcactgaaaaaataagacactgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 26948097  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattcta 522  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26948096 tgaatcaaagcaaaatgacaattaccatagactttgttattgttccataattcta 26948042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 107
Target Start/End: Original strand, 15845677 - 15845758
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattgttac 107  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||| ||||||||||    
T  15845677 cagaataagcagcggaa-aatatttcgattttctttccttggatcattacgaatt-gcacatgaatcagtgattcgattgttac 15845758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 271 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26817195 - 26817124
Alignment:
Q  271 aaaacgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaa 342  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  26817195 aaaacgtgtaacctctgacttcaacacaagggttctattgatagaactccttgtgtgttctgtaagtcagaa 26817124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 28089279 - 28089224
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaattt--cgatttactttccttggatcattacgaatt 78  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28089279 cagaataagcagcgga-taaaatttttcgattttctttccttggatcattacgaatt 28089224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 4471921 - 4471885
Alignment:
Q  42 aaaatttcgatttactttccttggatcattacgaatt 78  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4471921 aaaatttcgatttcctttccttggatcattacgaatt 4471885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 14147905 - 14147841
Alignment:
Q  288 acttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattg 352  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||  |||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  14147905 acttcagcacaagggttgtatttatagaaatcctattgtgctctacaagtcagaagtcactattg 14147841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 630 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 18256351 - 18256296
Alignment:
Q  630 aaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccacatttgatgcaacatcag 685  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||    
T  18256351 aaagtgctacacattatggaaaacttctctgtagaccacatttgatgtcacatcag 18256296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 617 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 36006316 - 36006257
Alignment:
Q  617 aatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccacatttgatg 676  Q
    |||| |||| || ||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  36006316 aatactacaaaataaagtgctatacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 36006257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 48)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 369 - 683
Target Start/End: Original strand, 13398146 - 13398461
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13398146 actagaccattgacccatgctaacgcacgagtcattttaagaagtaaatattcactgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 13398245  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  13398246 tgaatcaaagcataatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcaatttctgttactttaacataacatataattttaaaagg 13398345  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13398346 gaaactaaagttcgttgacatacaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtagacca 13398445  T
Q  668 catttgatgcaacatc 683  Q
    ||||||||||||||||    
T  13398446 catttgatgcaacatc 13398461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 368 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 5093937 - 5093621
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5093937 aactagaccactgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcactgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 5093838  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  5093837 gtgaatcaaagcataatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcgatttctgttattttaacataacatataattttaaaag 5093738  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacc 666  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  5093737 ggaaactgaagtacgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaataatacaaaaaaaagtcatacacattacagaaaacttctttgtagacc 5093638  T
Q  667 acatttgatgcaacatc 683  Q
    |||||||||||||||||    
T  5093637 acatttgatgcaacatc 5093621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 368 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 46909714 - 46909399
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46909714 aactagaccattgacccgtgctaatgcacgcgtcattttaagaagtaaatattcactgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 46909615  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  46909614 gtgaatcaaagcataatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctaagacgcagttcctgttactttaacataacatataattttaaaag 46909515  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacc 666  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  46909514 ggaaactgaagttcgttgacatgtaaatagtttcaataagtaagaaaatgaataggacacaaaaaa-tcctacacattatggaaaacttctatgtagacc 46909416  T
Q  667 acatttgatgcaacatc 683  Q
    |||||||||||||||||    
T  46909415 acatttgatgcaacatc 46909399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 368 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 29956844 - 29956528
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29956844 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgggtcattttaagaagttaatattcaatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 29956745  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
    || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||   || | || |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29956744 gtaaatcaaagcataatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagatcgtacttcctgttactttaacataacttataattttaaaag 29956645  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacc 666  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  29956644 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagacc 29956545  T
Q  667 acatttgatgcaacatc 683  Q
    |||||||||||||||||    
T  29956544 acatttgatgcaacatc 29956528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 2205720 - 2205385
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2205720 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatatgattg 2205621  T
Q  104 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2205620 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgaacggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcacagccaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 2205521  T
Q  204 aacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaa-cgcgtaacctcaaacttcagcactagg 301  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  |||||||||| |||||||| |||||   ||||||| ||||||   ||||||||    
T  2205520 aacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagagcttgggtttctgcaaaagaacgtaaccgcaaactattgcactagg 2205423  T
Q  302 gttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  2205422 gttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 2205385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 18408253 - 18407921
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  18408253 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaa---aatttcgatttaacttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagttatatgattg 18408157  T
Q  104 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18408156 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgaacggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcacagccaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 18408057  T
Q  204 aacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaa-cgcgtaacctcaaacttcagcactagg 301  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  |||||||||| |||||||| |||||   ||| ||| ||||||   ||||||||    
T  18408056 aacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagagcttgggtttctgcaaaagaacgtcaccgcaaactgttgcactagg 18407959  T
Q  302 gttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  18407958 gttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 18407921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 369 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 31100504 - 31100199
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcat-gtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31100504 actagaccattgacccgtgctaacgcacaggtcattttaagaagttaatattcaccgtaaaaataaaataatatagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 31100405  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    | ||||||||||||| | ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  31100404 taaatcaaagcataacgccaattatcataggctttgttattgttccataattctagtacgtagttcctattactttaacataacatataattttaaaagg 31100305  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  31100304 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtatacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttatctgtagacca 31100205  T
Q  668 catttg 673  Q
    ||||||    
T  31100204 catttg 31100199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 18401269 - 18400937
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18401269 tgaaggtaaatcgccataatcagaataagcagcggaa---aatttcgatttaacttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatatgattg 18401173  T
Q  104 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18401172 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgaacggtgaaatctgcgaatcggaatcacgatcacagccaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 18401073  T
Q  204 aacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaa-cgcgtaacctcaaacttcagcactagg 301  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  |||||||||| |||||||| |||||   ||| ||| ||||||   ||||||||    
T  18401072 aacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagagcttgggtttctgcaaaagaacgtcaccgcaaactgttgcactagg 18400975  T
Q  302 gttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  18400974 gttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 18400937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 369 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 7894122 - 7893808
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| || |||  |||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7894122 actagaccattgacccgtgctaacgcacatgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcg 7894023  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  7894022 tgaatcaaagcataatgtcaa-tatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagg 7893924  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  7893923 gaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagacca 7893824  T
Q  668 catttgatgcaacatc 683  Q
    ||||||||||||||||    
T  7893823 catttgatgcaacatc 7893808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 368 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 27716308 - 27715995
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||| | |   || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27716308 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaattaa-tctcactgaaaaaataagacactgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 27716210  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  27716209 tgaatcaaagcaaaatgtcaattaccatagacgttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagg 27716110  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  27716109 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatcgtttcaataagtaagaaaatgaatagtacaca-aaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagatca 27716011  T
Q  668 catttgatgcaacatc 683  Q
    || |||||||||||||    
T  27716010 cacttgatgcaacatc 27715995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 368 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 32660589 - 32660275
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||  ||||||||   |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  32660589 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcg 32660490  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| | ||| ||||||||| ||||| |||||    
T  32660489 tgaatcaaagcaaaatgtcaa-taccaaagactttgttattgttccataattctagcacgtagttcctgttactataaaataacatataattttgaaagg 32660391  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  32660390 gaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagacca 32660291  T
Q  668 catttgatgcaacatc 683  Q
    ||||||||||||||||    
T  32660290 catttgatgcaacatc 32660275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 368 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 17697281 - 17696966
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| || || ||| || ||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17697281 aactagaccattgacccgtgctaacgcacatgtcatttaaaaaattaa-tactcactgaaaaaataagacattgtagttcgcttgaatgtaaaaattatc 17697183  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17697182 gtgaatcaaagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaag 17697083  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacc 666  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |    
T  17697082 ggaaactgaagttcattgacatgtaaatagtttcaataaataagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacgggaaacttctctgtagatc 17696983  T
Q  667 acatttgatgcaacatc 683  Q
    ||| |||||||||||||    
T  17696982 acacttgatgcaacatc 17696966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 369 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 45116195 - 45115881
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||  |||| ||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  45116195 actagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatactcactgaaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcg 45116096  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| || ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  45116095 tgaatcaaagcaaaatgtcaa-tacgaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctattactttaaaataacatataattttgaaagg 45115997  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  45115996 gaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcatacacattacggaaaacttctctatagacca 45115897  T
Q  668 catttgatgcaacatc 683  Q
    ||||||||||||||||    
T  45115896 catttgatgcaacatc 45115881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 368 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 16720267 - 16719951
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| || || ||| || ||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16720267 aactagaccattgacccgtgctaacgcacatgtcatttaaaaaattaa-tactcactgaaaaaataatacattgtagttcgcttgaatgtaaaaattatc 16720169  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16720168 gtgaatcaaagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaag 16720069  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcc-tacacattacggaaaacttctttgtacac 665  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |     
T  16720068 ggaaactgaagttcattgacatgtaaatagtttcaataaataagaaaatgaatagtacacaaaaaagtccttacacattacggaaaacttctctgtagat 16719969  T
Q  666 cacatttgatgcaacatc 683  Q
    |||| |||||||||||||    
T  16719968 cacacttgatgcaacatc 16719951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 369 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 26169209 - 26168895
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| || ||   |||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26169209 actagaccattgacccgtgctaacacacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcg 26169110  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaagg 567  Q
    |||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  26169109 tgaatcaaagcaaaatgtcaa-tatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagg 26169011  T
Q  568 gaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacca 667  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26169010 gaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagacca 26168911  T
Q  668 catttgatgcaacatc 683  Q
    ||||||||||||||||    
T  26168910 catttgatgcaacatc 26168895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 237
Target Start/End: Original strand, 12188748 - 12188983
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaattt-cgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgatt 102  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12188748 tgaaggtaaatcgacatgtacagaataagcagcggaataaaattttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgattcgatt 12188847  T
Q  103 gttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacac 202  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12188848 gttaccttagaacgattggtctgaaaacgatcggtggaatctgcgaaccggaatcacgatcacagccaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacac 12188947  T
Q  203 gaacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaag 237  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  12188948 gaacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaag 12188983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 367 - 657
Target Start/End: Original strand, 20955490 - 20955780
Alignment:
Q  367 caactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgt 465  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||  |||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20955490 caactagaccattgtcccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaataagacattgtagttcgcgtgaatctaaaaattgt 20955589  T
Q  466 cgtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaa 565  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||    
T  20955590 cgtgaatcaaagcaaaatgtcaa-taccaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaa 20955688  T
Q  566 gggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttct 657  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20955689 gggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttct 20955780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 24 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 8466146 - 8465805
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattgttaccttagaacggttggtc 123  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||  | | |||| ||||||| ||||||||||||  |||  ||    |    
T  8466146 cagaataagcagcggaa--aaatttcaattttctttccttgaatcattacgaattaca-catgaatcagtgattcgattgttacctc-gaagtgtgaaac 8466051  T
Q  124 tgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaact 223  Q
    |||||  ||  | || ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8466050 tgaaactgaaagctggaatctggaaaccggaatcacgatcacagcaaagcaagcagcaaggcctctagcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaact 8465951  T
Q  224 cgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttg 323  Q
    || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8465950 cggtgctagccaaggaatcggaagtctcagagagctagggtttcttcaaagcgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttg 8465851  T
Q  324 tgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcattaaacccaa 369  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  8465850 tgtgctatgcaagtcataagccactattggacttcactaagcccaa 8465805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 368 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 22007347 - 22007031
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaa-taaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgt 465  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||  |||||||| || ||||| ||| | | |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22007347 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaaataagaaactgtagttcgcatgaatctaaaaattgt 22007248  T
Q  466 cgtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaa 565  Q
     |||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||| ||||| |||| |||| ||||| |||    
T  22007247 tgtgaatcaaagcataatgtcaa-tatcaaagactttgttattgttccataattctggtacgtagttcctgttactttaaaataatatataattttgaaa 22007149  T
Q  566 gggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacac 665  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  22007148 gggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagac 22007049  T
Q  666 cacatttgatgcaacatc 683  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22007048 cacatttgatgcaacatc 22007031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 30255307 - 30254971
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattg 103  Q
    |||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  30255307 tgaaggtaaatcaacattaacataataagcagcggaataaaatt-cgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgattagattg 30255209  T
Q  104 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  30255208 ttaccttagaacgattggtctgagaacgatcggtggaatctgcgaaccggaatcacgatcacagccaagcaaacagtagagcctctatcgagtccacacg 30255109  T
Q  204 aacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttc---aaaacgcgtaacctcaaacttcagcacta 299  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  ||||||| |||||||||||||   | ||  ||||||| ||||||   ||||||    
T  30255108 aacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagaactagggtttcttccaaagaaaacgtaaccgcaaactattgcacta 30255011  T
Q  300 gggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  30255010 gaattctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 30254971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 369 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 32038809 - 32038494
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgt 468  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||  ||||||||   |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  32038809 actagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaataagacattgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcgt 32038710  T
Q  469 gaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccata--attctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||||  ||||||  ||| |||| || ||| ||||| ||||||||| ||||| || |    
T  32038709 gaatcaaagcaaaatgttaa-taccaaagactttgttattgttccatataattctagtacgtagttcctattactttaaaataacatataattttgaagg 32038611  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacc 666  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  32038610 ggaaattgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagacc 32038511  T
Q  667 acatttgatgcaacatc 683  Q
    |||||||||||||||||    
T  32038510 acatttgatgcaacatc 32038494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 339
Target Start/End: Original strand, 18138482 - 18138807
Alignment:
Q  16 gacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacga-ttgttaccttagaa 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  18138482 gacataaacagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgattcgatttgttaccttagaa 18138581  T
Q  115 cggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcc 214  Q
    ||     |||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18138582 cgtagaatctgaagacgatcggtggaatctgcaaaccggaatcacgatcacagccaagcaaacagcagagcctctatcaagtccacacgaacattgctcc 18138681  T
Q  215 tccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaa--aacgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctattta 311  Q
    ||||||| |||  ||||||||||| |  | ||||  ||||||| ||||||||||| |||  ||  ||||||| ||||||   ||||||||||||||||||    
T  18138682 tccaaaacctcagtgctagccaagaagacggaag--tcagagaactagggtttctgcaaagaatacgtaaccgcaaactattgcactagggttctattta 18138779  T
Q  312 tagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  18138780 tagaactccttatgtgctttgcaagtca 18138807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15730923 - 15730586
Alignment:
Q  3 ttgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgatt 102  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  15730923 ttgaaggtaaaacgacattaacagaataagcagcagaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattgaaacttgaaccagtgattcgatt 15730824  T
Q  103 gttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacac 202  Q
    |||||||||||| |   | ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  15730823 gttaccttagaatgaaag-tctgaaaacgatcggtggaatctgcgaactggaatctcgatcacagccaagcaaacagcagagcctctattgagtccacac 15730725  T
Q  203 gaacagtgctcctccaaaac-tcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaa---acgcgtaacctcaaacttcagcact 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  | |||||  |||||| ||||||||||| ||||   |  ||||||| ||||||   |||||    
T  15730724 gaacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaagt--cagagaactagggtttctgcaaagaaaaacgtaaccgcaaactattgcact 15730627  T
Q  299 agggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15730626 aggtttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 15730586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 237
Target Start/End: Original strand, 48807649 - 48807883
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattg 103  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48807649 tgaaggtaaatcgacattaacagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgattcgattg 48807748  T
Q  104 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 203  Q
    ||||||||||| |  | |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  48807749 ttaccttagaatgaatagtctgaaaacgatcggtggaatctgcgaactggaatctcgatcacagccaagcaaacagcagagcctctattgagtccacacg 48807848  T
Q  204 aacagtgctcctccaaa-actcgatgctagccaag 237  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  48807849 aacagtgctcctccaaaccctcggtgctagccaag 48807883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 183 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19231880 - 19231694
Alignment:
Q  183 agcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgcgtaac 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19231880 agcctctatcaagtccacacgaacagtggtcctccaaaactcggtgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttctccaaaacgtgtaac 19231781  T
Q  283 ctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcattaaacccaa 369  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  19231780 atcaaactttagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctctgtaagtcagaagccactattggatttcattaagcccaa 19231694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 152 - 353
Target Start/End: Original strand, 47166139 - 47166340
Alignment:
Q  152 ggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttc 251  Q
    ||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47166139 ggaatcacgatcacaacaaagcaagcagcaaagcctctagcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcggtgctagccaaggaatcagaagtttc 47166238  T
Q  252 agagagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactatt 351  Q
    |||||||||||||||||  | || | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  47166239 agagagctagggtttctcaacaatgtgcaacctcaaactttagcactagggttctatttatagaactcctcatgtgctctgcaagtcagaagccactatt 47166338  T
Q  352 gg 353  Q
    ||    
T  47166339 gg 47166340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 178 - 359
Target Start/End: Original strand, 18258428 - 18258610
Alignment:
Q  178 agcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaa-cg 276  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  18258428 agcaaagcctctaacaagtccacacgaataatgctcctccaaaactgggtgctagccaaggaatctgaagtttcagagagctagggtttctccaaaaacg 18258527  T
Q  277 cgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttca 359  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18258528 tgcaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctctgcaagtcagaagtcactattgggcttca 18258610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 192 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 34129556 - 34129379
Alignment:
Q  192 caagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaactt 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  34129556 caagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcggtgctagccaaggaatcagaactttcagagagctaaggtttctcaaaaacgtgcaacctcaaactt 34129457  T
Q  292 cagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcattaaacccaa 369  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  34129456 cagaaataggattctatttatagaactccttgtgtgctctgcaagtcagaagccactattgggcttcagtaagcccaa 34129379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 207 - 369
Target Start/End: Original strand, 41680302 - 41680464
Alignment:
Q  207 agtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaacttcagcactagggttct 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||   |||||||||||||| ||||||||||||    
T  41680302 agtgctcctccaaaactcgatgctagtcaaggaatcaaaagtttcagaaagctagggtttctcaaaaacgtacaacctcaaacttcaacactagggttct 41680401  T
Q  307 atttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcattaaacccaa 369  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  41680402 atttatagaactccttgtgtgctctgcaagtcagaaaccactattggacttcattaagcccaa 41680464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 178 - 369
Target Start/End: Original strand, 10666369 - 10666560
Alignment:
Q  178 agcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgc 277  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||  ||||||     
T  10666369 agcaaagcctctagcaagtctacatgaacagtgctcctccaaaacccggtgctagccaaggaatcataagtttcacagaagtagggtttctcaaaaacgt 10666468  T
Q  278 gtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcattaaacccaa 369  Q
    ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  10666469 gtaaccaaacacttcagcactagggttctatttatagaactcctagtgtgctctgcaagtcagaagtcactattaggcttcattaagcccaa 10666560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 183 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28131555 - 28131368
Alignment:
Q  183 agcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttc-aaaacgcgtaa 281  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||    
T  28131555 agcctctagcaagtccacacgaacaatactcctccaaaactcggtgctagccaatgaatcagaagtttcagagagctaaggtttctccaaaaacgtgtaa 28131456  T
Q  282 cctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcattaaacccaa 369  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||  |||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| |||||    
T  28131455 ccaaaaacttcagcactagggttctatttatagaacttctagcgtgctcagcaagtcaaaagtcactattgggcttcagtaaccccaa 28131368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 19860287 - 19860164
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaat-ttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgatt 102  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19860287 tgaaggtaaatcgacatgtacagaataagcagcggaataaaatattcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgattcgatt 19860188  T
Q  103 gttaccttagaacggttggtctga 126  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  19860187 gttaccttagaacgattggtctga 19860164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 369 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 7889201 - 7889047
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || | |||| ||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7889201 actagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcattttaaaaaattaatactcactgaaaaaataagacattgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 7889102  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattcta 522  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7889101 tgaatcaaagcaaaatgacaattaccatagactttgttattgttccataattcta 7889047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 570 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 7889031 - 7888918
Alignment:
Q  570 aactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccaca 669  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  7889031 aactgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaatgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccaca 7888932  T
Q  670 tttgatgcaacatc 683  Q
     |||||||||||||    
T  7888931 cttgatgcaacatc 7888918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 194 - 352
Target Start/End: Original strand, 18256886 - 18257047
Alignment:
Q  194 agtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaa---cgcgtaacctcaaact 290  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||| |||||    | |||||||| ||||    
T  18256886 agtccacacgaatgttgctcctccaaaactcggtgctagccaaggaatcagaagttgcagggaattagggtttctccaaaaacgtgtgtaacctctaact 18256985  T
Q  291 tcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattg 352  Q
      ||||| | |||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18256986 gtagcacaatggttctatttctagaactcctagtgttctctgcaagtcagaagccactattg 18257047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 155 - 358
Target Start/End: Original strand, 19392712 - 19392914
Alignment:
Q  155 atcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcaga 254  Q
    |||||||||| ||| ||||||  |||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    || |||||||||||||||| ||| ||| | |    
T  19392712 atcacgatcacagctaagcaagcagcatagcctctagcaagtccacgcgaacggtgctcctccaagttccggtgctagccaaggaatctgaaattttaaa 19392811  T
Q  255 gagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattgga 354  Q
    ||   |||||||||  |||||| |||| |  | | |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||| |||| ||||     
T  19392812 gaatcagggtttctcaaaaacgtgtaa-caaagaattcatcacaagggttctatttatagaacacctagtgtgctctacaagtcagaagtcactgttggg 19392910  T
Q  355 cttc 358  Q
    ||||    
T  19392911 cttc 19392914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 353
Target Start/End: Original strand, 31189671 - 31189853
Alignment:
Q  166 agcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtt 265  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |  | |||||||||||  |||||| ||||  || |  |||||||    
T  31189671 agcaaagcaaatatcagagcctcta-ctagtccacacgaacagtgctcctccaattcctggtgctagccaagcgatcagaggttt-ggacaattagggtt 31189768  T
Q  266 tcttcaaaacgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattgg 353  Q
    |||  |||||| ||||||  | |||||||||  ||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||| ||| |||| ||||    
T  31189769 tct--aaaacgtgtaacc-aagacttcagcagaagggttctatttatagaactcttactgtgctttgcaagtcacaagtcactgttgg 31189853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 271 - 353
Target Start/End: Original strand, 24442774 - 24442856
Alignment:
Q  271 aaaacgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattgg 353  Q
    |||||| |||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  24442774 aaaacgtgtaacctttgacttcagcacaagggttctatttatagaactcctaatgtgctatggaagtcagaagtccctattgg 24442856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 109
Target Start/End: Original strand, 47166019 - 47166102
Alignment:
Q  25 agaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattgttacct 109  Q
    ||||||||||| |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||| ||||||||||||    
T  47166019 agaataagcaggggataaaattttcgattttctttccttggatcattacgaatt-acacatgaatcagtgatccgattgttacct 47166102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 22 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 19232023 - 19231966
Alignment:
Q  22 atcagaataagcagcggaataaaattt--cgatttactttccttggatcattacgaatt 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19232023 atcagaataagcagcgga-taaaatttttcgattttctttccttggatcattacgaatt 19231966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 78
Target Start/End: Original strand, 18258281 - 18258336
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaattt--cgatttactttccttggatcattacgaatt 78  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18258281 cagaataagcagcgga-taaaatttttcgattttctttccttggatcattacgaatt 18258336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 34129725 - 34129670
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaattt--cgatttactttccttggatcattacgaatt 78  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34129725 cagaataagcagcgga-taaaatttttcgattttctttccttggatcattacgaatt 34129670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 78
Target Start/End: Original strand, 41680205 - 41680260
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaattt--cgatttactttccttggatcattacgaatt 78  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41680205 cagaataagcagcgga-taaaatttttcgattttctttccttggatcattacgaatt 41680260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 28131675 - 28131627
Alignment:
Q  30 aagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaatt 78  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28131675 aagcagcggataaaattttcgattttctttccttggatcattacgaatt 28131627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 339
Target Start/End: Original strand, 48807921 - 48807965
Alignment:
Q  295 cactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  48807921 cactaggtttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 48807965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 78
Target Start/End: Original strand, 10666214 - 10666269
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcgga-ataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaatt 78  Q
    |||||||||||||| | | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10666214 cagaataagcagcgaataaaaaattttgattttctttccttggatcattacgaatt 10666269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 358
Target Start/End: Original strand, 42150064 - 42150118
Alignment:
Q  304 tctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttc 358  Q
    ||||||||||||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42150064 tctatttatagaacttctagagtgccctgcaagtcagaagccactattgggcttc 42150118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 405
Target Start/End: Original strand, 39703883 - 39703919
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattt 405  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  39703883 actagaccatcgacccgtgctaacgcacgggtcattt 39703919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0374 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0374
Description:

Target: scaffold0374; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 368 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 2337 - 2022
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2337 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcactgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaa-ttgtc 2239  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2238 gtgaatcaaagcataatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctaagacgccgttcctgttactttaacataacatataattctaaaag 2139  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacc 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  2138 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaacaagtaagaaaatgaatagtatacaaaaaagtgctacacattacggaaaacttctctgtagacc 2039  T
Q  667 acatttgatgcaacatc 683  Q
    |||||||||||||||||    
T  2038 acatttgatgcaacatc 2022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 120898 - 120563
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  120898 tgaaggtaaatcgacataatcagaatgagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatatgattg 120799  T
Q  104 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  120798 ttaccttagaacggttggtctgagaacgaacggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcacagccaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 120699  T
Q  204 aacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaa-cgcgtaacctcaaacttcagcactagg 301  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  |||||||||| |||||||| |||||   ||||||| ||||||   ||||||||    
T  120698 aacagtcctcctccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagagcttgggtttctgcaaaagaacgtaaccgcaaactgttgcactagg 120601  T
Q  302 gttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  120600 gttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 120563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0642 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0642
Description:

Target: scaffold0642; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 368 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 3765 - 3450
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||| || ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3765 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaattaa-tactcactgaaaaaataaaacattgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 3667  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  3666 gtgaatcaaagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttctataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaag 3567  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacc 666  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |    
T  3566 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataaataagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagatc 3467  T
Q  667 acatttgatgcaacatc 683  Q
    ||| |||||||||||||    
T  3466 acacttgatgcaacatc 3450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0345 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0345
Description:

Target: scaffold0345; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 368 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 13677 - 13362
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||| || ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13677 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaattaa-tactcactgaaaaaataaaacattgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 13579  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13578 gtgaatcaaagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttctataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaag 13479  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacc 666  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |    
T  13478 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataaataagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagatc 13379  T
Q  667 acatttgatgcaacatc 683  Q
    ||| |||||||||||||    
T  13378 acacttgatgcaacatc 13362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 368 - 683
Target Start/End: Original strand, 25304 - 25619
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||| || ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25304 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaattaa-tactcactgaaaaaataaaacattgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 25402  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25403 gtgaatcaaagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttctataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaag 25502  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacc 666  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |    
T  25503 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataaataagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagatc 25602  T
Q  667 acatttgatgcaacatc 683  Q
    ||| |||||||||||||    
T  25603 acacttgatgcaacatc 25619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 38)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 368 - 683
Target Start/End: Original strand, 30090086 - 30090401
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcat-gtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||| || |||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30090086 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaattaa-tactcatagaaaaaataagacactgtaggtcgcttgaatgtaaaaattgtc 30090184  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  30090185 gtgaatcaaagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagtacctgttactttaacataacatataattttaaaag 30090284  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacc 666  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  30090285 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagacc 30090384  T
Q  667 acatttgatgcaacatc 683  Q
    ||| |||||||||||||    
T  30090385 acacttgatgcaacatc 30090401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 368 - 683
Target Start/End: Original strand, 3607671 - 3607986
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcat-gtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||| || |||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3607671 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaattaa-tactcatagaaaaaataagacactgtaggtcgcttgaatgtaaaaattgtc 3607769  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  3607770 gtgaatgaaagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaag 3607869  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacc 666  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  3607870 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacgaaaaacttctctgtagacc 3607969  T
Q  667 acatttgatgcaacatc 683  Q
    ||| |||||||||||||    
T  3607970 acacttgatgcaacatc 3607986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 368 - 683
Target Start/End: Original strand, 20104827 - 20105141
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcat-gtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||| || |||  | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20104827 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaattaa-tactcacagaaaaaataagacactgtaggtcgcttgaatgtaaaaattgtc 20104925  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20104926 gtgaatcaaagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaag 20105025  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacc 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  20105026 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacac-aaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagacc 20105124  T
Q  667 acatttgatgcaacatc 683  Q
    ||| |||||||||||||    
T  20105125 acacttgatgcaacatc 20105141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 33068 - 32732
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaattt-cgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgatt 102  Q
    |||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33068 tgaaggcaaatcgacatgtacagaataagcagcggaataaaattttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgattcgatt 32969  T
Q  103 gttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacac 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32968 gttaccttagaacgattggtctgaaaacgattggtggaatctgcgaaccggaatcacgatcacagccaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacac 32869  T
Q  203 gaacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaa-cgcgtaacctcaaacttcagcactag 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  |||||||||| |||||||| |||||   ||||||| ||||||   |||||||    
T  32868 gaacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagagcttgggtttctgcaaaagaacgtaaccgcaaactattgcactag 32771  T
Q  301 ggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  32770 ggttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 32732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 23547091 - 23546755
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattg 103  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  23547091 tgaaggtaaatcgaaatgaacagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgattcgatag 23546992  T
Q  104 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacg 203  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  23546991 ttaccttagaacgattagtctgaaaacgatcggtggaatctgcgaactggaatctagatcaaagccaagcaaacagcagagcctctattgagtccacacg 23546892  T
Q  204 aacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaa--aacgcgtaacctcaaacttcagcactag 300  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  ||||||| ||||||||||| |||  ||  ||||||| ||||||   |||||||    
T  23546891 aacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagaactagggtttctgcaaggaaaacgtaaccgcaaactattgcactag 23546794  T
Q  301 ggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  23546793 gtttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 23546755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 148 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31097843 - 31097622
Alignment:
Q  148 aaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaag 247  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  31097843 aaccggaatcacgatcacagcaaagcaagcagcaaagcctctagcaagtccacacgaacagtgctcctccgaaactcggtgctagccaaggaatcaaaag 31097744  T
Q  248 tttcagagagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  31097743 tttcagagagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaacttcttgtgtgttatgcaagtcagaagccgc 31097644  T
Q  348 tattggacttcattaaacccaa 369  Q
    |||||||||||| ||| |||||    
T  31097643 tattggacttcactaagcccaa 31097622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 339
Target Start/End: Original strand, 24932438 - 24932775
Alignment:
Q  3 ttgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgatt 102  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  24932438 ttgatggtaaatcgacattaacagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattgaaacttgaaccagtgattcgatt 24932537  T
Q  103 gttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacac 202  Q
    ||||||||||||  |   |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  24932538 gttaccttagaa-tgaaagtctgaaaacgatcggtggaatctgcgaactggaatctcgatcacagccaagcaaacagcagagcctctattgagtccacac 24932636  T
Q  203 gaacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttca---aaacgcgtaacctcaaacttcagcact 298  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  ||||||| ||||||||||| ||   |||  ||||||| ||||||   |||||    
T  24932637 gaacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagaactagggtttctgcaaggaaaaacgtaaccgcaaactattgcact 24932734  T
Q  299 agggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  24932735 aggtttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 24932775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 24 - 359
Target Start/End: Original strand, 25804533 - 25804871
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattgttaccttagaacggttggtc 123  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | | |||| ||||||| ||||||||||||  |||  ||    |    
T  25804533 cagaataagcagcggaa--aaatttcgattttctttccttggatcattacgaattaca-catgaatcagtgattcgattgttacctc-gaagtgtgaaac 25804628  T
Q  124 tgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcag-------agcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctc 216  Q
    |||||  ||  | || ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||        |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25804629 tgaaactgaaagctggaatctggaaaccggaatcacgatcacagcaaagcaagcagcaagcagcaaagcctctagcaagtccacacgaacagtgctcctc 25804728  T
Q  217 caaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaa 316  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25804729 caaaactcggtgctaaccaaggaatcggaagtctcagagagctagggtttcttcaaagcgcgtaacctcaaacctcagcactagggttctatttatagaa 25804828  T
Q  317 ctccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttca 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804829 ctccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttca 25804871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 368 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 32675264 - 32674949
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| || |||  |||||||| || |||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||||||    
T  32675264 aactagaccatagacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaataagactctatagttcgcgtgaatctaaaaattgtc 32675165  T
Q  467 g-tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaa 565  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||    
T  32675164 gatgaatcaaaacataatgtcaa-tatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaa 32675066  T
Q  566 gggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacac 665  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||    
T  32675065 gggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacaca-aaaagtcctacacattatggaaaacttctctgtagac 32674967  T
Q  666 cacatttgatgcaacatc 683  Q
    ||||||||||||||||||    
T  32674966 cacatttgatgcaacatc 32674949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 339
Target Start/End: Original strand, 12788798 - 12789132
Alignment:
Q  6 aaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattgtt 105  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12788798 aaggtaaatcgacatta-cagaataagcagcagaataaaatctcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgattcgattgtt 12788896  T
Q  106 accttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacgaa 205  Q
    ||||||||| |  | |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12788897 accttagaatgaatagtctgaaaacgatcggtggaatctgcgaactggaatttcgatcacagccaagcaaacagcagagcctctattgagtccacacgaa 12788996  T
Q  206 cagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttca---aaacgcgtaacctcaaacttcagcactagg 301  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  ||||||| ||||||||||| ||   |||  ||||||| ||||||   ||||||||    
T  12788997 cagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagaactagggtttctgcaaggaaaaacgtaaccgcaaactattgcactagg 12789094  T
Q  302 gttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  12789095 tttctatttatagaactccttatgtgctttgcaagtca 12789132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 178 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20942024 - 20941833
Alignment:
Q  178 agcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgc 277  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20942024 agcaaagcctctagcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcggtgctagccaaggaatcagaagtctcaaagagctagggtttcttcaaaacgc 20941925  T
Q  278 gtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcattaaacccaa 369  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20941924 gtaacctcaaacttcagcactggggttatatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcattaagcccaa 20941833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 152 - 369
Target Start/End: Original strand, 12764270 - 12764486
Alignment:
Q  152 ggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttc 251  Q
    ||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12764270 ggaatcacgatcacaacaaagcaagcagcaaagcctcta-caagtccaaacgaacagtgctcctcaaaaactcggtgctagccaaggaatcagaagtttc 12764368  T
Q  252 agagagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactatt 351  Q
    ||||||||| |||||||  |||| | | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12764369 agagagctaaggtttctcaaaaatgtgcaacctcaaacttcagtaatagggttctatttatagaactccttgtgtgctctgcaagtcagaagccactatt 12764468  T
Q  352 ggacttcattaaacccaa 369  Q
    || ||||| ||| |||||    
T  12764469 gggcttcagtaatcccaa 12764486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 152 - 369
Target Start/End: Original strand, 12703255 - 12703470
Alignment:
Q  152 ggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttc 251  Q
    ||||||||||||| | |||||||   |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12703255 ggaatcacgatcacaacaaagcagc-agcaaagcctcta-caagtccaaacgaacagtgctcctccaaaactcggtgctagccaaggaatcagaagtttc 12703352  T
Q  252 agagagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactatt 351  Q
    ||||||||| |||||||  |||| | | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12703353 agagagctaaggtttctcaaaaatgtgcaacctcaaacttcagtaatagggttctatttatagaactccttgtgtgctctgcaagtcagaagccactatt 12703452  T
Q  352 ggacttcattaaacccaa 369  Q
    || ||||| ||| |||||    
T  12703453 gggcttcagtaagcccaa 12703470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 369
Target Start/End: Original strand, 9810892 - 9811229
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaattt-cgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattgttaccttagaacggttgg- 121  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  | | |||| ||||||| ||||||||||||  |||  || |      
T  9810892 cagaataagcagcggataaaaattttcgattttctttccttggatcattacgaattaca-catgaatcagtgatccgattgttacctc-gaagtgtggaa 9810989  T
Q  122 tctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaa 221  Q
    ||||||| |      ||||| |||  ||| ||||||||||||| | |||||||   |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9810990 tctgaaagc------tgaaaactggaaactggaatcacgatcacaacaaagcagc-agcaaagcctcta-caagtccaaacgaacagtgctcctccaaaa 9811081  T
Q  222 ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactcct 321  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| | | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  9811082 ctcggtgctagccaaggaatcaaaagtttcagagagctaaggtttctcaaaaatgtgcaacctcaaacttcagtaatagggttctatttatagaactcct 9811181  T
Q  322 tgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcattaaacccaa 369  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  9811182 tgtgtgctctgcaagtcagaagccactattgggcttcagtaagcccaa 9811229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 178 - 335
Target Start/End: Original strand, 7864741 - 7864898
Alignment:
Q  178 agcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgc 277  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||     
T  7864741 agcaaagcctctagcaagtccaaacgaacagtgctcctccaaaactcgttgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctaaggtttctcaaaaacgt 7864840  T
Q  278 gtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaa 335  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7864841 gcaacctcaaacttcagcaatagggttctatttatagaactccttgtgtgctctgcaa 7864898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 178 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22942213 - 22942088
Alignment:
Q  178 agcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgc 277  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22942213 agcaaagcctctagcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcggtgctagccaaggaatcggaagtctcagagagctagggtttcttcaaaacgc 22942114  T
Q  278 gtaacctcaaacttcagcactagggt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  22942113 gtaacctcaaacttcagcactagggt 22942088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 570 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 12655384 - 12655271
Alignment:
Q  570 aactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccaca 669  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12655384 aactgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaatgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccaca 12655285  T
Q  670 tttgatgcaacatc 683  Q
     |||||||||||||    
T  12655284 cttgatgcaacatc 12655271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 570 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 23184169 - 23184056
Alignment:
Q  570 aactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccaca 669  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  23184169 aactgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaatgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccaca 23184070  T
Q  670 tttgatgcaacatc 683  Q
     |||||||||||||    
T  23184069 cttgatgcaacatc 23184056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 570 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 23188436 - 23188323
Alignment:
Q  570 aactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccaca 669  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  23188436 aactgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaatgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccaca 23188337  T
Q  670 tttgatgcaacatc 683  Q
     |||||||||||||    
T  23188336 cttgatgcaacatc 23188323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 570 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 34761430 - 34761317
Alignment:
Q  570 aactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccaca 669  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  34761430 aactgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaatgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccaca 34761331  T
Q  670 tttgatgcaacatc 683  Q
     |||||||||||||    
T  34761330 cttgatgcaacatc 34761317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 570 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 39878264 - 39878151
Alignment:
Q  570 aactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccaca 669  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  39878264 aactgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaatgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccaca 39878165  T
Q  670 tttgatgcaacatc 683  Q
     |||||||||||||    
T  39878164 cttgatgcaacatc 39878151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 178 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 5098642 - 5098453
Alignment:
Q  178 agcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgc 277  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||     
T  5098642 agcaaagcctctagcaagtccacacaaacaatgctcctccaaatctcggtgctagctaaagaatcaaaagtttcagagaactagggtttctcaaaaacgt 5098543  T
Q  278 gtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcattaaacccaa 369  Q
    |||| |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  5098542 gtaa-caaagacttcagcacta-ggttctatttatagaactcctagtgtgctctgcaagtcagaagtcactattggacttcagtaagcccaa 5098453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 368 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 34761601 - 34761446
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || | |||| ||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34761601 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcactgaaaaaataagacactgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 34761502  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattcta 522  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34761501 gtgaatcaaagcaaaatgacaattaccatagactttgttattgttccataattcta 34761446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 368 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 39878435 - 39878280
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || | |||| ||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39878435 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcactgaaaaaataagacactgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 39878336  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattcta 522  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39878335 gtgaatcaaagcaaaatgacaattaccatagactttgttattgttccataattcta 39878280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 368 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 12655554 - 12655400
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || | |||| |||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12655554 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcactgaaaaataagacactgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 12655455  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattcta 522  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12655454 tgaatcaaagcaaaatgacaattaccatagactttgttattgttccataattcta 12655400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 369 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 23184339 - 23184185
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || | |||| ||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23184339 actagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcactgaaaaaataagacactgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 23184240  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattcta 522  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23184239 tgaatcaaagcaaaatgacaattaccatagactttgttattgttccataattcta 23184185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 369 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 23188606 - 23188452
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 467  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || | |||| ||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23188606 actagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcactgaaaaaataagacactgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcg 23188507  T
Q  468 tgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattcta 522  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23188506 tgaatcaaagcaaaatgacaattaccatagactttgttattgttccataattcta 23188452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 183 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 39428431 - 39428255
Alignment:
Q  183 agcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaac-gcgtaa 281  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||| |||||  |  |||    
T  39428431 agcctctagcaagtccacacgaacggtgctcatccaagtctcggtgctagccaaggaataaaaagttttagagaactagggtttctccaaaaatgtataa 39428332  T
Q  282 cctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttca 359  Q
    ||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  39428331 cca-agacttcagcaccagggttctatttatagaactccttgtgtgttctgcaagtcagaagtcactattgggcttca 39428255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 160 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 39536195 - 39536015
Alignment:
Q  160 gatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagct 259  Q
    ||||| ||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||   |||| ||||||| ||| |||||  ||||||| |  | |    
T  39536195 gatcacagctaagcaagcagcagagcctctagcaagtccacacaaacggtgcttctccaggtctcggtgctagctaagcaatcaacagtttcatattgtt 39536096  T
Q  260 agggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcaga 341  Q
    |||||||||  |||||| ||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  39536095 agggtttctaaaaaacgtgtaac-tctgacttcagcacaagggttctatttatagaactccaagtgtgctatgcaagtcaga 39536015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 78
Target Start/End: Original strand, 7864594 - 7864648
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaatt 78  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7864594 cagaataagcagcggataaaattttcgattttctttccttggatcattacgaatt 7864648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 617 - 685
Target Start/End: Original strand, 38095492 - 38095560
Alignment:
Q  617 aatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccacatttgatgcaacatcag 685  Q
    |||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||    
T  38095492 aatactacaaaacaaagtgctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgtcacatcag 38095560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 24 - 78
Target Start/End: Original strand, 12764148 - 12764203
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaattt-cgatttactttccttggatcattacgaatt 78  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12764148 cagaataagcagcggataaaaattttcgattttctttccttggatcattacgaatt 12764203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 109
Target Start/End: Original strand, 12703133 - 12703218
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaattt-cgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattgttacct 109  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||| ||||||||||||    
T  12703133 cagaataagcagcggataaaaattttcaattttctttccttggatcattacgaatt-acacatgaatcagtgatccgattgttacct 12703218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 627 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 37609790 - 37609732
Alignment:
Q  627 aaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccacatttgatgcaacatcag 685  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||    
T  37609790 aaaaaagtgttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgtcacatcag 37609732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 31097958 - 31097875
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattgttacct 109  Q
    ||||||||||||||||| |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||| ||||||||||||    
T  31097958 cagaataagcagcggaaaattatt-cgattttctttccttggatcattacgaatt-acacatgaatcagtgattcgattgttacct 31097875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 617 - 685
Target Start/End: Original strand, 16678746 - 16678814
Alignment:
Q  617 aatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccacatttgatgcaacatcag 685  Q
    |||| |||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||    
T  16678746 aatactacaaaacaaagtgctacacattacgaaaaacttctctgtagaccacatttgatgtcacatcag 16678814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 39428562 - 39428514
Alignment:
Q  30 aagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaatt 78  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39428562 aagcagcggataaaattttcgattttctttccttggatcattacgaatt 39428514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 335
Target Start/End: Original strand, 28719119 - 28719167
Alignment:
Q  287 aacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaa 335  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  28719119 aacttcaacacaagagttctatttatagaactacttgtgtgctctgcaa 28719167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0119
Description:

Target: scaffold0119; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 368 - 644
Target Start/End: Original strand, 34190 - 34467
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34190 aactagacaattgacccgtgctaacgcacgggtcattttaagaagttaatattcactggcaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtt 34289  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  34290 gtgaatcaaagcataatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatttaattttaaaag 34389  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacatt 644  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34390 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaactcctacacatt 34467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 368 - 644
Target Start/End: Original strand, 27781 - 28066
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaata--------ttca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaa 458  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||        |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27781 aactagaccattgacccgtgctaacgcacaggtcattttaagaagttaataagttaatattcactggaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaa 27880  T
Q  459 aaattgtcgtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattat 558  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  27881 aaattgttgtgaatcaaagcataatgtcaattaccatagacattgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataat 27980  T
Q  559 tttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacatt 644  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27981 tttaaaagggaaactgaagtttgttgacatgcatatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacatt 28066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 175; Significance: 7e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Original strand, 197191 - 197401
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataat-cagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  197191 tgaaggtaaatcgacataaaacagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaaattgaaccagtgataagatt 197290  T
Q  103 gttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacac 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  197291 gttaccttagaacggttggtctgaaaacgaacggtggaatctgcgaaccggaatcacgatcacagccaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacac 197390  T
Q  203 gaacagtgctc 213  Q
    |||||||||||    
T  197391 gaacagtgctc 197401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1849 (Bit Score: 174; Significance: 3e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold1849
Description:

Target: scaffold1849; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 282 - 12
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaattt-cgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgatt 102  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  282 tgaaggtaaatcgacatgtacagaataagcagcggaataaaattttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgattcgatt 183  T
Q  103 gttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacac 202  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  182 gttaccttagaacgattggtctgaaaacgatcggtggaatctgcgaaccggactcacgatcacagccaagcaaatagcagagcctctatcaggtccacac 83  T
Q  203 gaacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaa 274  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  ||||||| ||||||||||| |||||    
T  82 gaacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaag--tcagagaactagggtttctgcaaaa 12  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 173; Significance: 1e-92; HSPs: 4)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 368 - 683
Target Start/End: Original strand, 48827 - 49142
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||  |||||||| || |||||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||||    
T  48827 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaataagacactgtagtttgcgtgaatctaaaaattgtc 48926  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaag 566  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||| ||||||||||  | | |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| || |    
T  48927 gtgaatcaaagcataatgtcaa-tatcaaagactttgttattgtttcataattctagtaggtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaatg 49025  T
Q  567 ggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacacc 666  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  49026 ggaaattgaagttcgttgacatggaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaattcctacacattacggaaaacttctctgtagacc 49125  T
Q  667 acatttgatgcaacatc 683  Q
    |||||||||||||||||    
T  49126 acatttgatgcaacatc 49142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 369 - 683
Target Start/End: Original strand, 51652 - 51964
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgt 468  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| || |||  ||||||||   |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  51652 actagaccattgacccgtgctaatgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactaaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaagttgtcgt 51751  T
Q  469 gaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaaggg 568  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||  | | |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  51752 gaatcaaagcaaaatgtcaa-taccaaagactttgttattgttccataattctagtaagtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaaggg 51850  T
Q  569 aaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccac 668  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||    
T  51851 aaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaacgaatagtacac-aaaaagtcctacacattacggaaaacttctctatagaccac 51949  T
Q  669 atttgatgcaacatc 683  Q
    |||||||||||||||    
T  51950 atttgatgcaacatc 51964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 570 - 683
Target Start/End: Original strand, 40379 - 40492
Alignment:
Q  570 aactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacaccaca 669  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  40379 aactgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaatgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccaca 40478  T
Q  670 tttgatgcaacatc 683  Q
     |||||||||||||    
T  40479 cttgatgcaacatc 40492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 368 - 522
Target Start/End: Original strand, 40208 - 40363
Alignment:
Q  368 aactagaccattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || | |||| ||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40208 aactagaccattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcactgaaaaaataagacactgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtc 40307  T
Q  467 gtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattcta 522  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40308 gtgaatcaaagcaaaatgacaattaccatagactttgttattgttccataattcta 40363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 369 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 45944 - 45628
Alignment:
Q  369 actagaccattgacccatgc--taacgcacgggtcattttaagaagtaaatattca-tgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgt 465  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||  ||||||| || | |  |||||||| || |||||||| ||| | |||||| | ||||| ||||||||||    
T  45944 actagaccattgacccgtgcgttaacgcacatgtcatttaaaaatgataatattcactgaaaaaataagacactttagttcacgtgaatctaaaaattgt 45845  T
Q  466 cgtgaatcaaagcataatgtcaaatacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttaatttaacataacatattattttaaaa 565  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||    
T  45844 cgtgaatcaaagcataatgtcaa-tatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaa 45746  T
Q  566 gggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtacac 665  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  45745 gggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagac 45646  T
Q  666 cacatttgatgcaacatc 683  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45645 cacatttgatgcaacatc 45628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 170; Significance: 7e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 24 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1310 - 968
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattgttaccttagaacggttggtc 123  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  | | |||| ||||||| |||||||||||||| |  | | | ||    
T  1310 cagaataagcagcggaaaataatttcgattttccttcct-ggatcattacgaattaca-catgaatcagtgattcgattgttaccttaaagtgatagttc 1213  T
Q  124 tgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaact 223  Q
    || ||||    |||| || |||  ||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1212 tggaaactgaaggtggaagctggaaaccggaatcacgatcacagcaaagcaagcagcaaagcctctagcaagtccatacgaacagtgctcctccaaaact 1113  T
Q  224 cgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttg 323  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1112 cggtgctagccaaggaatcataagtt-cagagagctcgggattctccaaaacgcgtaacctcaaactttagcactagggttctatttatagaactccttg 1014  T
Q  324 tgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcattaaacccaa 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  1013 tgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcactaagcccaa 968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 167; Significance: 4e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 155 - 369
Target Start/End: Original strand, 73476 - 73690
Alignment:
Q  155 atcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcaga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  73476 atcacgatcacagcaaagcaagcagcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcggtgctagccaaggaatcggaagtctcaga 73575  T
Q  255 gagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattgga 354  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73576 gagctagggtttcttcagagcgcgtaacctcaaactttagcactagggttttatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattgga 73675  T
Q  355 cttcattaaacccaa 369  Q
    ||||| ||| |||||    
T  73676 cttcactaagcccaa 73690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 165; Significance: 7e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 24 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1338 - 989
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattgttaccttagaacggttggtc 123  Q
    |||||||||||||||||  ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||  | | |||| ||||||| ||||||||||||  |||  ||    |    
T  1338 cagaataagcagcggaaataa--ttcgattttctttccttggatcattacgaattaca-catgaatcagtgattcgattgttacctc-gaagtgtgaaac 1243  T
Q  124 tgaaaac-gagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcag-------agcctctatcaagtccacacgaacagtgctcct 215  Q
    ||||||| ||  | || ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||        |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1242 tgaaaactgaaagctggaatctggaaaccggaatcacgatcacagcaaagcaagcagcaagcagcaaagcctctagcaagtccacacgaacagtgctcct 1143  T
Q  216 ccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttataga 315  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1142 ccaaaactcggtgctagccaaggaatcggaagtctcagagagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaactttagcactagggttctatttataga 1043  T
Q  316 actccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcattaaacccaa 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  1042 actccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcactaagcccaa 989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 339
Target Start/End: Original strand, 2808 - 3144
Alignment:
Q  3 ttgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaattt-cgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgat 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2808 ttgaaggtaaatcgacatatacagaataagcagcagaataaaattttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgattcgat 2907  T
Q  102 tgttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccaca 201  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  2908 tgttacctt-gaaagattagtctgaaa-cgatcggtggaatctgcgaaccggaatcacgatcacagccaagcaaaaagcagagactctatcaagtccaca 3005  T
Q  202 cgaacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttc--aaaacgcgtaacctcaaacttcagcact 298  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||  | ||||| ||||||||||| |  | ||  ||||||| ||||||   |||||    
T  3006 cgaacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaagaagacggaag--tgagagaactagggtttctgcgaagaatacgtaaccgcaaactattgcact 3103  T
Q  299 agggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtca 339  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  3104 agggttctatttatataactccttatgtgctttgcaagtca 3144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 160; Significance: 7e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 178 - 369
Target Start/End: Original strand, 138013 - 138204
Alignment:
Q  178 agcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgc 277  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  138013 agcaaagcctctagcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcggtgctagccaaggaatcagaagtctcagagagctagagtttcttcaaaaagc 138112  T
Q  278 gtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcattaaacccaa 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  138113 gtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcactaagcccaa 138204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 70
Target Start/End: Original strand, 137850 - 137894
Alignment:
Q  25 agaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcat 70  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  137850 agaataagcagcggaa-aatatttcgattttctttccttggatcat 137894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 152; Significance: 4e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 178 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 223 - 32
Alignment:
Q  178 agcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgc 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||    
T  223 agcaaagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcggtgttagccaaggaatcggaagtctcagagagctagggtttcttcagagcgc 124  T
Q  278 gtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcattaaacccaa 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  123 gtaacctcaaactttagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcactaagcccaa 32  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 349 - 283
Alignment:
Q  42 aaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattgttacct 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |   || |||| ||||||| ||||||||||||    
T  349 aaaatttcgattttctttccttggatcattacgaact-acacgtgaatcagtgatccgattgttacct 283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 237
Target Start/End: Original strand, 18596 - 18831
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattg-gaacttgaaccagtgatacgatt 102  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  18596 tgaaggtaaatcgacattaacagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaatttagaacttgaactagtgattcgatt 18695  T
Q  103 gttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacac 202  Q
    |||||||||||| |  | |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  18696 gttaccttagaatgaatagtctgaaaacgatcggtggaatctgcgaactggaatctcgatcacagccaagcaaacagcagagcctctattgagtccacac 18795  T
Q  203 gaacagtgctcctccaaaa-ctcgatgctagccaag 237  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  18796 gaacagtgctcctccaaaacctcggtgctagccaag 18831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 183 - 369
Target Start/End: Original strand, 7824 - 8010
Alignment:
Q  183 agcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgcgtaac 282  Q
    ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7824 agcctttagcaagtccatacaaacagtgctcctccaaaactcggtgctagccaaggaatcagaagtctcagagagctagggtttcttcaaaacacgtaac 7923  T
Q  283 ctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcattaaacccaa 369  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  7924 atcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtatgctatgcaagtcagaagccactattgcacttcactaagcccaa 8010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 109
Target Start/End: Original strand, 7668 - 7750
Alignment:
Q  25 agaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattgttacct 109  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||| ||||||||||||    
T  7668 agaataagcagcggaaaataatt-cgattttctttccttggatcattacgaatt-acacatgaatcagtgattcgattgttacct 7750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 178 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 128493 - 128302
Alignment:
Q  178 agcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgc 277  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  128493 agcaaagcctctagcaagtccacacgaacagcactccttcaaaactcggtgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttctccaagacgt 128394  T
Q  278 gtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttcattaaacccaa 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  128393 gtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaattccttatgtgctctgcaagttagaagtcactattggacttcattaagcccaa 128302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 128641 - 128558
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattgttacct 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | || |||| ||||||| ||||||||||||    
T  128641 cagaataagcagcg-aataaaatttcgattttctctccttggatcattacgaattag-acatgaatcagtgattcgattgttacct 128558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 152 - 358
Target Start/End: Original strand, 10165 - 10370
Alignment:
Q  152 ggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttc 251  Q
    ||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10165 ggaatcacgatcacaacaaagcaagcagcagagcctctagcaagtccacacgaacggtactcctccaaatctcggtgctagccaaggaatcagaagtttc 10264  T
Q  252 agagagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactatt 351  Q
    ||||| |||||||||||  |||| | |||| |  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  10265 agagaactagggtttctaaaaaatgtgtaa-caaagacttcagcactagggttctacttatagaactcctagtgtgctttgcaagtcagaagtcactatt 10363  T
Q  352 ggacttc 358  Q
    || ||||    
T  10364 ggccttc 10370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 110; Significance: 5e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 32286 - 32427
Alignment:
Q  4 tgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattg 103  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32286 tgaaggtaaatcgacattaacagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgattcgattg 32385  T
Q  104 ttaccttagaacggttggtctgaaaacgagcggtgaaatctg 145  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||| ||||| ||||||    
T  32386 ttaccttagaatgattagtctgaaaacgatcggtggaatctg 32427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10345 - 10134
Alignment:
Q  3 ttgaaggtaaatcgacataatcagaataagcagcggaataaaa-tttcgatttacttt-ccttgg-atcatta-cgaattggaacttgaaccagtgatac 98  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||| |    
T  10345 ttgatggtaaatcgacattaacagaataagcagcggaataaaaatttcgatttacttttccttggtatcattaacgaattgaagcttgaaccagtgattc 10246  T
Q  99 gattgttaccttagaacggttggtctg-aaaacg-agcggtgaaatc-tgcgaaccggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctcta-tcaa 194  Q
    ||||||||||||||||  |   ||||| |||||| | ||||| |||| ||||||| |||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |  |    
T  10245 gattgttaccttagaa-tgaaagtctgaaaaacgaatcggtggaatcttgcgaactggaatctcgatcacagccaagcaaacagcagagcctctatttga 10147  T
Q  195 gtccacacgaaca 207  Q
    |||||||||||||    
T  10146 gtccacacgaaca 10134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 228 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 54710 - 54580
Alignment:
Q  228 gctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtg 327  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||  |||||| ||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  54710 gctagccaaggaatcaaaagttttagagaactagggtttctcaaaaacgtgtaacca-agacttcaacactagggttctatttatagaaatcctagtgtg 54612  T
Q  328 ctatgcaagtcagaagccactattggacttca 359  Q
    || ||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  54611 ctttgcaagtcagaaatcactattgggcttca 54580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 61; Significance: 8e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 178 - 254
Target Start/End: Original strand, 38889 - 38965
Alignment:
Q  178 agcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcaga 254  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  38889 agcaaagcctctagcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcggtgctagccaaggaatcagaagtctcaga 38965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 109
Target Start/End: Original strand, 38724 - 38807
Alignment:
Q  24 cagaataagcagcggaataaaatttcgatttactttccttggatcattacgaattggaacttgaaccagtgatacgattgttacct 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||| ||||||||||||    
T  38724 cagaataagcagcggaa-aaattttcgattttctttccttggatcattacgaatt-acacatgaatcagtgattcgattgttacct 38807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 27516 - 27357
Alignment:
Q  194 agtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttcagagagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaacttca 293  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||  | || |||||||||||  |||||| |||| |||||  |||||||||   |||||| |||||   | ||||||    
T  27516 agtccacacgaacggtgcttctccaagccccggtgctagccaagcgatcagaggtttgagagaattagggtttc---aaaacgtgtaacaa-atacttca 27421  T
Q  294 gcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaagccactattggacttc 358  Q
    |||| |||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||    
T  27420 gcacaagggttctatttatagaaattctagtgtgctctgcaagtcag-agtcactattgggcttc 27357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Original strand, 108531 - 108594
Alignment:
Q  279 taacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaactccttgtgtgctatgcaagtcagaa 342  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  108531 taacctctgacttcagcacaagggttctatttatagaactccttatgtgttatgtaagtcagaa 108594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 318
Target Start/End: Original strand, 39277 - 39440
Alignment:
Q  152 ggaatcacgatcatagcaaagcaaatagcagagcctctatcaagtccacacgaacagtgctcctccaaaactcgatgctagccaaggaatcagaagtttc 251  Q
    |||||| |||||| | ||| ||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||  |||||| | ||     
T  39277 ggaatctcgatcacaacaatgcaaacagtagagcctcta-ctagtccacacgaacagtgctcctccaattcccggtgctagccaagcgatcagagggttg 39375  T
Q  252 agagagctagggtttcttcaaaacgcgtaacctcaaacttcagcactagggttctatttatagaact 318  Q
     |||   |||||||  || |||||| ||||| ||  | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  39376 ggaggattagggtt--tttaaaacgtgtaacatctgaattcagcacaagggttctattgatagaact 39440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University